CN110373474A

CN110373474A - 陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记及其应用

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Publication number: CN110373474A
Application number: CN201910596208.7A
Authority: CN
Inventors: 王继卿; 罗玉柱; 赵孟丽; 胡江; 刘秀; 李少斌; 郝志云
Original assignee: Gansu Agricultural University
Current assignee: Gansu Agricultural University
Priority date: 2019-07-03
Filing date: 2019-07-03
Publication date: 2019-10-25
Anticipated expiration: 2039-07-03
Also published as: CN110373474B

Abstract

本发明公开了一种陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记，其位于KRTAP27‑1基因上，具有3个等位基因A、B和C，存在3个优势基因型AA、AB和AC，等位基因A、B和C的核苷酸序列分别如序列表中SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示；本发明还提供了遗传标记的扩增引物对和应用。本发明中KRTAP27‑1基因的基因型对羊绒纤维直径极显著影响(P<0.01)，AB基因型个体的羊绒纤维直径最大，极显著高于AC和AA基因型个体，AC和AA基因型个体间的羊绒纤维直径无显著差异(P>0.05)。因此，对陇东绒山羊的羊绒直径进行分子选种时，应淘汰AB基因型个体，选留AC和AA基因型个体，以降低陇东绒山羊的羊绒细度。

Description

陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记及其应用

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，尤其涉及一种陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记及其应用。

背景技术

山羊绒是由山羊皮肤中的次级毛囊形成的无髓毛纤维。羊绒纤维具有轻便柔软、弹性好、光泽良好、保暖性强等特点，因而被称为“软黄金”，其价格高于马海毛和羊毛，在纺织工业中具有重要作用。在羊绒性状中，产绒量、平均纤维直径和绒层高度是最重要的指标，直接决定了羊绒的质量和价格。

角蛋白相关蛋白(Keratin-associated proteins，KAPs；其编码基因为KRTAPs)和角蛋白(Keratins)是羊毛和羊绒纤维的主要结构成分，决定了羊绒纤维的理化特性。KAPs蛋白具有高含量的半胱氨酸或甘氨酸/酪氨酸残基，根据其氨基酸组成，可以将KAPs蛋白分为三大类：高硫KAPs蛋白(high-sulfur KAPs，HS-KAPs)，其特点是半胱氨酸含量低于30％；超高硫KAPs蛋白(ultra-high-sulfur KAPs，UHS-KAPs)，其特点是半胱氨酸的含量超过30％；高甘氨酸/酪氨酸KAPs蛋白(high glycine/tyrosine KAPs，HGT-KAPs)，其特点是甘氨酸和酪氨酸的含量在35～60％之间。

在人类基因组中已发现来自25个家族的80多个KRTAPs基因，绵羊上已鉴定得到来自13个家族的29个KRTAPs基因，但是在山羊基因组中仅鉴定得到了来自10个家族的14个KRTAPs基因。这表明山羊基因组中还有大量的KRTAPs基因有待进一步鉴定。研究表明，在山羊和绵羊基因组上发现的这些KRTAPs基因中，部分基因的核苷酸序列变异显著影响了羊毛或者羊绒性状。例如在绵羊中，KRTAP1-2、KRTAP6-1、KRTAP6-3、KRTAP8-2、KRTAP22-1和KRTAP26-1基因的SNPs与包括产毛量、羊毛直径在内的许多羊毛性状有关；在山羊上，KRTAP8-2、KRTAP13-1、KRTAP15-1、KRTAP20-1、KRTAP20-2和KRTAP24-1基因的核苷酸序列变异显著影响了羊绒重量、羊绒长度和羊绒细度等羊绒纤维性状。这表明，鉴定新的山羊KRTAPs基因、研究基因的核苷酸序列变异及其对羊绒纤维性状的影响在绒山羊生产实践中具有重要意义，这将为绒山羊的遗传改良提供理论依据和指导。

发明内容

本发明的目的在于提供一种陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记及其应用，通过研究KRTAP27-1基因及其核苷酸序列变异对陇东绒山羊羊绒纤维性状的影响，为绒山羊的遗传改良提供理论依据和指导。

为实现上述目的，本发明采用的技术方案是：

本发明的第一个目的是提供一种陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记，其位于KRTAP27-1基因上，所述KRTAP27-1基因具有3个等位基因A、B和C，存在3个优势基因型AA、AB和AC，所述等位基因A、B和C的核苷酸序列分别如序列表中SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQID No.3所示。

本发明的第二个目的是提供用于检测权利要求1所述的遗传标记的引物对，所述引物对的核苷酸序列为：

上游引物：5'-ACTCAATCAAGGATTTTCAC-3'，

下游引物：5'-GCAGATTCTTCACTCAGTAGG-3'。

优选地，所述上游引物和下游引物的浓度均为0.5μM。

本发明的第三个目的是提供一种陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记的筛选方法，包括以下步骤：

(1)提取陇东绒山羊血液中的基因组DNA；

(2)进行PCR扩增反应；

所述PCR扩增反应体系为：采用20μL反应体系，包括1.0μL的DNA模板，2.0μL的10×PCR buffer，上下游引物各0.5μM，0.3μL的150μM dNTPs，0.2μL的0.5U Taq DNApolymerase和15.5μL的ddH₂O；所述上下游引物的核苷酸序列如下：

上游引物：5'-ACTCAATCAAGGATTTTCAC-3'，

下游引物：5'-GCAGATTCTTCACTCAGTAGG-3'；

PCR扩增的条件为：94℃预变性5分钟，94℃变性30秒，60℃退火30秒，72℃延伸30秒，共35个循环，72℃下最终延伸5分钟。

(3)对PCR扩增产物进行SSCP鉴定，当基因型为AB时，山羊个体的羊绒纤维直径最大；当基因型为AC和AA时，山羊个体的羊绒纤维直径最小；

所述基因型AB，在KRTAP27-1基因c.413处为C/C，c.495处为C/T；

所述基因型AA，在KRTAP27-1基因c.413处为C/C，c.495处为C/C；

所述基因型AC，在KRTAP27-1基因c.413处为C/T，c.495处为C/C；

本发明的第四个目的是提供一种陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记在选留细羊绒的陇东绒山羊中的应用。

相比于现有技术的缺点和不足，本发明具有以下有益效果：本发明以陇东绒山羊为研究对象，鉴别出了陇东绒山羊KRTAP27-1基因，通过PCR-SSCP检测分析，在陇东绒山羊中发现了3个等位基因A、B和C和3种优势基因型AA、AB和AC，发现KRTAP27-1基因型对羊绒直径有极显著影响(P<0.01)，AB基因型个体的羊绒纤维直径最大(13.6μm)，极显著高于AC和AA基因型个体，AC和AA基因型个体间的羊绒纤维直径无显著差异(P>0.05)。因此，对陇东绒山羊的羊绒直径进行分子选种时，应淘汰AB基因型个体，选留AC和AA基因型个体，以降低陇东绒山羊的羊绒细度。因此，本发明提供的遗传标记能够用于选育羊绒直径小的陇东绒山羊。

附图说明

图1是本发明实施例1提供的陇东绒山羊KRTAP27-1基因和10个以前鉴别的其它KRTAPs基因在山羊1号染色体上的位置。

图2是本发明实施例1提供的陇东绒山羊KRTAP27-1基因的SSCP检测结果。

图3是本发明实施例1提供的基于氨基酸序列构建的山羊、绵羊和人类HS-KAPs的系统进化树。

图4是本发明实施例1提供的陇东绒山羊KRTAP27-1和β-actin基因在7种陇东绒山羊组织中的RT-PCR检测结果。图中，M：marker；1和8：皮肤；2和9：心脏；3和10：肝脏；4和11：脾脏；5和12：肺脏；6和13：肾脏；7和14：背最长肌。

图5是本发明实施例1提供的陇东绒山羊KRTAP27-1中AA、AB和AC3个基因型的表达量。

具体实施方式

为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合附图及实施例，对本发明进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明，并不用于限定本发明。

实施例1

1.材料和方法

1.1试验材料

(1)在甘肃省环县钰生绒山羊繁育公司，以8只陇东绒山羊公羊为父本，对陇东绒山羊母羊进行人工授精配种。在所产后代中，随机选择253只陇东绒山羊作为试验对象，当这些羊只达到周岁时，在梳绒季节，现场测定产绒量和绒层高度(背中线处测定)，并在背中线处采集羊绒纤维样品用于试验测定羊绒直径。然后对每只绒山羊静脉采血8ml，加入ACD抗凝剂，采用苯酚-氯仿法提取血液基因组DNA。

(2)选择3岁、健康无病、处于羊绒生长期的陇东绒山羊母羊3只，屠宰后立即采集皮肤、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌7个组织样品，将该样品置于液氮罐中带回实验室，存放在-80℃冰箱中保存。

1.2陇东绒山羊KRTAP27-1基因鉴别及多态性检测

1.2.1引物设计与PCR扩增

应用GenBank的BLAST功能，以人类KRTAP27-1基因的编码区序列(GenBank登录号：AB096937)作为模板，在山羊基因组ASM170441v1(www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/ASM170441v1)中进行同源性搜索。在搜索结果中，与人类KRTAP27-1基因序列相似性最高的核苷酸片段被假定为山羊的KRTAP27-1基因序列。然后以该序列作为模板设计引物，扩增山羊KRTAP27-1基因的整个编码区序列，引物在大连宝生物有限责任公司合成。

上游引物：5'-ACTCAATCAAGGATTTTCAC-3'，

下游引物：5'-GCAGATTCTTCACTCAGTAGG-3'。

PCR扩增反应体系：采用20μL反应体系，包括1.0μL的DNA模板(约50ng/μl)，2.0μL的10×PCR buffer、各0.5μM的上下游引物、0.3μL的150μMdNTPs、0.2μL的0.5U Taq DNApolymerase和15.5μL的ddH₂O。

PCR扩增的条件：94℃预变性5分钟，94℃变性30秒，60℃退火30秒，72℃延伸30秒，共35个循环，72℃下最终延伸5分钟。然后用1.0％琼脂糖凝胶电泳检测PCR的扩增产物。

1.2.2SSCP多态性检测

取2.0μL的上述PCR扩增产物，加入10μL变性缓冲液(98％甲酰胺，10mM乙二胺四乙酸(EDTA)，0.025％溴酚蓝和0.025％二甲苯蓝)，105℃变性8分钟后立即置于冰水混合物中冷却，上样于16cm×18cm、10％的聚丙烯酰胺凝胶(丙烯酰胺：双丙烯酰胺＝37.5：1)上，在210V电压、16.5℃(采用加热制冷循环器和温控室两种方法以保证缓冲液恒温)、0.5×TBE缓冲液中电泳20小时。电泳结束后，对聚丙烯酰胺凝胶进行银染显色，判定个体基因型。

1.3陇东绒山羊KRTAP27-1等位基因序列测定及核苷酸序列分析

测序方法因纯合子和杂合子而异。如果个体的SSCP条带是纯合子，用PCR扩增产物直接测序。如果SSCP条带是杂合子，采用切胶方法进行测序。序列测定由北京基因组学研究所完成。为保证测序结果的准确性，每种基因型选择3个不同的个体进行测序。

用MEGA 5.0软件对核苷酸序列进行比对、翻译和构建系统进化树。用GenBank的在线BLAST软件(http://www.ncbi.nlm.nih.goc/)搜索同源性。

1.4陇东绒山羊KRTAP27-1基因的RT-PCR检测

按照RNA提取试剂盒说明书，提取所采集的皮肤、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌7个组织样品的总RNA。用2％琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度法分别检测RNA的质量和浓度。用Takara的PrimeScript^TM RT Reagent Kit(gDNA Eraser)反转录生成cDNA。在KRTAP27-1基因编码区内设计特异性引物用于RT-PCR扩增，上游引物为5'-TCGGCAGTGTTGGAGTGTGT-3'，下游引物为5'-GGACAAGACTTCGCCATGTTGC-3'。以山羊的β-actin基因作为内参基因，其上游引物为5'-AGCCTTCCTTCCTGGGCATGGA-3'，下游引物为5'-GGACAGCACCGTGTTGGCGTAGA-3'。RT-PCR的扩增体系中除了将1.2.1中的DNA模板换成cDNA外，其它成分及扩增条件均与1.2.1中PCR扩增一致，用1.0％的琼脂糖凝胶电泳检测RT-PCR扩增产物。

1.5陇东绒山羊KRTAP27-1基因的qRT-qPCR检测

qRT-qPCR扩增体系：采用20μL的反应体系，包括10μL GreenPCR MasterMix(Takara)、0.8μL引物，2μL cDNA和7.2μL ddH₂O。

qRT-qPCR扩增条件：95℃预变性5分钟，95℃变性15秒，60℃退火34秒，72℃延伸30秒，共40个循环，以山羊β-actin基因作为参考基因，其引物序列与RT-PCR一致，每个反应进行3次重复。用2^-ΔΔCT方法计算KRTAP27-1不同基因型在皮肤组织中的表达量。

1.6相关性分析

用IBM SPSS Statistics 24.0的一般线性混合效应模型(General Liner Mixed-effect Models，GLMMs)分析KRTAP27-1基因型对产绒量、绒层高度和羊绒直径3种羊绒性状的影响。进行多重比较时使用Bonferroni校正以较少分析误差。

相关性分析结果表明，父本(配种公羊)和性别对羊绒性状有极显著的影响(P<0.01)，但出生等级(单羔和双羔)对羊绒性状没有显著影响(P>0.05)。因此在GLMMs模型中，将基因型和性别作为固定效应，父本作为随机效应。由于所有陇东绒山羊均处于同一饲养条件，其羊绒性状均在周岁时被测定，因此在分析模型中未考虑环境和年龄因素。分析模型如下：

Y＝μ+Genotype+Gender+Sire+e

其中，Y为羊绒性状表型值，μ为群体均值，Genotype为基因型，Gender为性别，Sire为父本(配种公羊)，e为随机误差。

2.结果

2.1陇东绒山羊KRTAP27-1基因鉴定及核苷酸序列变异分析

以人类KRTAP27-1基因的编码区序列(GenBank登录号：AB096937)作为模板，用GenBank的BLAST程序在山羊基因组ASM170441v1中进行同源性搜索。结果显示，在山羊1号染色体上(nt3968607-3969209)有一个603bp的开放阅读框(ORF)，这个片段与人KRTAP27-1基因编码区序列有78％的同源性。该片段附近有10个以前鉴定的山羊KRTAPs基因，包括KRTAP11-1、KRTAP7-1、KRTAP8-1、KRTAP8-2、KRTAP20-2、KRTAP20-1、KRTAP13-1、KRTAP13-3、KRTAP15-1和KRTAP24-1，如图1所示，图1中竖线表示KRTAPs基因的位置，竖线下的数字代表基因的名字，例如11-1表示KRTAP11-1，箭头代表基因的转录方向。

PCR-SSCP结果显示，在253只陇东绒山羊中发现了A、B和C3个等位基因和AA、BB、AB、AC和BC 5种基因型(图2)。在研究的253只山羊中，等位基因A、B和C的频率分别为71.28％、23.90％和4.82％。基因型AA、BB、AB、AC和BC的频率分别是51.81％、3.62％，32.93％，8.03％和3.61％。等位基因A、B和C的核苷酸序列分别如序列表中SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3所示，测序结果显示，在3个等位基因中存在2个单核苷酸多态性(SNPs)，一个是非同义突变(c.413C/T)引起了p.Ala138Val氨基酸的改变，另一个是同义突变(c.495C/T)。

基于已鉴定的人类、山羊和绵羊的HS-KAPs氨基酸序列，构建了系统进化树(图3)，图3中，山羊、绵羊和人类的KAPs序列分别用符号g、s和h表示，分支上的数字表示自展值。构建系统发育树所用到的KAPs序列及其GenBank登录号分别是：NM_001285774(gKAP3-1)、NM_001285767.1(gKAP11-1)、AY510115(gKAP13-1)、JX426138(gKAP13-3)、X01610(sKAP1-1和sKAP1-4)、HQ897975(sKAP1-2)、NM_001159761(sKAP1-3)、P02443(sKAP2-1)、U60024(sKAP2-3)、M21099(sKAP3-1)、M21100(sKAP3-2)、M21103(sKAP3-3)、HQ595352(sKAP11-1)、JN377429(sKAP13-3)、JX112014(sKAP24-1)、KX644903(sKAP26-1)、NM_030967.2(hKAP1-1)、NM_030966.1(hKAP1-3)、NM_001257305.1(hKAP1-4)、NM_031957.1(hKAP1-5)、NM_001123387.1(hKAP2-1)、NM_033032.2(hKAP2-2)、NM_001165252.1(hKAP2-3)、NM_033184.3(hKAP2-4)、NM_031958.1(hKAP3-1)、NM_031959.2(hKAP3-2)、NM_033185.2(hKAP3-3)、NM_175858.2(hKAP11-1)、NM_181599.2(hKAP13-1)、NM_181621.3(hKAP13-2)、NM_181622.2(hKAP13-3)、NM_181600.1(hKAP13-4)、NM_181623.2(hKAP15-1)、NM_001146182.1(hKAP16-1)、NM_181624.1(hKAP23-1)、NM_001085455.2(hKAP24-1)、NM_001128598.1(hKAP25-1)、NM_203405.1(hKAP26-1)和AB096937.1(hKAP27-1)。

结果显示，山羊KAP27-1的氨基酸序列与人类的KAP27-1序列最先聚为一枝，与绵羊和山羊的其它KAPs序列距离较远。说明山羊KAP27-1的氨基酸序列与人类KAP27-1序列具有最高的序列同源性，这表明本研究鉴定的3个等位基因就是山羊KRTAP27-1基因的等位基因。

2.2山羊KRTAP27-1基因在不同组织和不同基因型中的表达

RT-PCR结果显示，在研究的7个组织中，山羊的KRTAP27-1基因仅在皮肤中表达，在心脏、肝、脾、肺、肾和背最长肌组织中均不表达(图4)。

对于AA、AB和AC 3个优势基因型，比较了它们之间的表达量。qRT-qPCR结果显示，基因型AB和AA之间的表达量差异极显著(P<0.01)，AB和AC之间的表达量差异显著(P<0.05)，而AA和AC之间的表达量没有显著差异(P>0.05)，如图5所示，图5中*表示差异显著(P<0.05)，**表示差异极显著(P<0.01)，无*和**则表示差异不显著(P>0.05)。

2.3 KRTAP27-1基因型与羊绒纤维性状之间的相关性分析

在陇东绒山羊KRTAP27-1基因上发现的5个基因型中，AA、AB和AC的频率高于5％，为优势基因型。BB和BC的基因型频率低于5％。因此，在相关性分析中，只分析了AA、AB和AC3个优势基因型对羊绒纤维性状的影响。相关性分析结果如表1所示，结果表明，KRTAP27-1基因型对羊绒直径有极显著影响(P<0.01)，对羊绒重量和绒层高度无显著影响(P>0.05)。AB基因型个体的羊绒纤维直径最大(13.6μm)，极显著高于AC和AA基因型个体，AC和AA基因型个体间的羊绒纤维直径无显著差异(P>0.05)。

表1 KRTAP27-1基因型与羊绒性状之间的相关性分析

注：同一行内不同大写字母标注表示差异极显著(P<0.01)。

3.结论

山羊KRTAP27-1的基因型对陇东绒山羊的羊绒直径有极显著影响(P<0.01)，AB基因型个体的羊绒纤维直径最大(13.6μm)，极显著高于AC和AA基因型个体，AC和AA基因型个体间的羊绒纤维直径无显著差异(P>0.05)。因此，对陇东绒山羊的羊绒直径进行分子选种时，应淘汰AB基因型个体，选留AC和AA基因型个体，以降低陇东绒山羊的羊绒细度。

以上所述仅为本发明的较佳实施例而已，并不用以限制本发明，凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。

序列表

<110> 甘肃农业大学

<120> 陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记及其应用

<160> 3

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 650

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 1

actcaatcaa ggattttcac aatatgaccc agagacccat ccactcactc aagaacttct 60

acaatgcccc acctctctct gccatcatac atgaatcgaa tgttataaac tttgaagatg 120

gattcttttt acccagcagt tgctacagca agacctggct cctggacaac tttccagaaa 180

cctgccggga aaccaccagc tgcatggtac ctgaagatga acgggaatta cacacagagg 240

agagctgtgt gcaaaatgtc tgtgtctcca gagtcgtcca aacaacttgt tctaattcca 300

ggccctgtga aaacacagca tgccagtcaa gaagttcctc ggcagtgttg gagtgtgttt 360

ctcagccttg ccagtcagaa agtagccagc aaatgtgttc tgtagtccag agctgcctac 420

ctgtgagcaa catggcgaag tcttgtccac ccaagactta tgtgtctaag agttgccaga 480

ctctggactg tgactgtagc cagagccaag ctcagagccc tgaatccagt tcctgtagct 540

ctttggtcta tgtcacacca gagtcacagc tcctggaaac ttctaacact tatgagccaa 600

cttgctgtgt tactggtggt ttataattgc ctactgagtg aagaatctgc 650

<210> 2

<211> 650

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 2

actcaatcaa ggattttcac aatatgaccc agagacccat ccactcactc aagaacttct 60

acaatgcccc acctctctct gccatcatac atgaatcgaa tgttataaac tttgaagatg 120

gattcttttt acccagcagt tgctacagca agacctggct cctggacaac tttccagaaa 180

cctgccggga aaccaccagc tgcatggtac ctgaagatga acgggaatta cacacagagg 240

agagctgtgt gcaaaatgtc tgtgtctcca gagtcgtcca aacaacttgt tctaattcca 300

ggccctgtga aaacacagca tgccagtcaa gaagttcctc ggcagtgttg gagtgtgttt 360

ctcagccttg ccagtcagaa agtagccagc aaatgtgttc tgtagtccag agctgcctac 420

ctgtgagcaa catggcgaag tcttgtccac ccaagactta tgtgtctaag agttgccaga 480

ctctggactg tgactgtagc cagagccaag ctcagagtcc tgaatccagt tcctgtagct 540

ctttggtcta tgtcacacca gagtcacagc tcctggaaac ttctaacact tatgagccaa 600

cttgctgtgt tactggtggt ttataattgc ctactgagtg aagaatctgc 650

<210> 3

<211> 650

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 3

actcaatcaa ggattttcac aatatgaccc agagacccat ccactcactc aagaacttct 60

acaatgcccc acctctctct gccatcatac atgaatcgaa tgttataaac tttgaagatg 120

gattcttttt acccagcagt tgctacagca agacctggct cctggacaac tttccagaaa 180

cctgccggga aaccaccagc tgcatggtac ctgaagatga acgggaatta cacacagagg 240

agagctgtgt gcaaaatgtc tgtgtctcca gagtcgtcca aacaacttgt tctaattcca 300

ggccctgtga aaacacagca tgccagtcaa gaagttcctc ggcagtgttg gagtgtgttt 360

ctcagccttg ccagtcagaa agtagccagc aaatgtgttc tgtagtccag agctgcctac 420

ctgtgagcaa catggtgaag tcttgtccac ccaagactta tgtgtctaag agttgccaga 480

ctctggactg tgactgtagc cagagccaag ctcagagccc tgaatccagt tcctgtagct 540

ctttggtcta tgtcacacca gagtcacagc tcctggaaac ttctaacact tatgagccaa 600

cttgctgtgt tactggtggt ttataattgc ctactgagtg aagaatctgc 650

Claims

1.一种陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记，其特征在于，所述遗传标记位于KRTAP27-1基因上，具有3个等位基因A、B和C，存在3个优势基因型AA、AB和AC，所述等位基因A、B和C的核苷酸序列分别如序列表中SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。

2.一种用于扩增权利要求1所述的陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列如下：

上游引物：5'-ACTCAATCAAGGATTTTCAC-3'，

下游引物：5'-GCAGATTCTTCACTCAGTAGG-3'。

3.如权利要求2所述的用于扩增陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记的引物对，其特征在于，所述上游引物和下游引物的浓度均为0.5μM。

4.一种如权利要求1所述的陇东绒山羊羊绒直径相关的遗传标记的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)提取陇东绒山羊血液中的基因组DNA；

(2)以陇东绒山羊的基因组DNA为模板进行PCR扩增，扩增所用引物对的核苷酸序列如下：

上游引物：5'-ACTCAATCAAGGATTTTCAC-3'，

下游引物：5'-GCAGATTCTTCACTCAGTAGG-3'；

所述基因型AB，在KRTAP27-1基因c.413处为C/C，c.495处为C/T；

所述基因型AA，在KRTAP27-1基因c.413处为C/C，c.495处为C/C；

所述基因型AC，在KRTAP27-1基因c.413处为C/T，c.495处为C/C。

5.一种如权利要求1所述的遗传标记在选留细羊绒的陇东绒山羊中的应用。