CN109942689B - 表位 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及表位。本发明涉及包含抗原表位的多肽、包含该多肽的变态反应的诊断试剂盒和诊断用组合物、以及使用该多肽的变态反应的诊断方法和治疗方法、包含该多肽的药物组合物、以及去除或降低了包含该多肽的抗原的原料或加工品。本发明进而涉及用于判定对象物中有无抗原的检测仪。
Description
技术领域
本发明涉及包含抗原表位的多肽。本发明还涉及包含该多肽的变态反应的诊断试剂盒和诊断用组合物、以及使用该多肽的变态反应的诊断方法和治疗方法。本发明还涉及包含该多肽的药物组合物、及去除或降低了该多肽的原料或加工品。本发明进而涉及去除或降低了该多肽的加工品的制造方法。本发明进而还涉及用于判定对象物中有无包含该多肽的抗原的检测仪。
背景技术
在变态反应患者的血液和组织中,产生特定的抗原(以下也称为变应原)特异性的IgE抗体。由于通过该IgE抗体与特定抗原的相互作用所产生的生理学结果而引起变态反应。抗原在广义上是指引起变态反应症状的食品/食材等,在狭义上是指特异性的IgE抗体所结合的、食品/食材等中所含的蛋白质(以下也称为变应原成分)。
现有的变态反应检查试剂中,大多是简单地将变应原候选食品/食材等磨碎来制作抗原试剂(专利文献1)。因此,在现有的抗原试剂中所含的大多数蛋白质中,对于与IgE抗体的结合,在只有超过能判定为阳性反应阈值含量的蛋白质是变应原成分的情况下,能在变态反应检测中检测出阳性反应,诊断效率不能说是足够高的状态。
对于变应原候选食品/食材等,虽然启示出几种变应原成分,作为检测试剂盒也已商品化,但为了提高变态反应检测的可靠性,需要全面地特定变应原成分,结果通过测定上述变应原成分进行的患者检测率仍然远远不够。
另一方面,由于变应原特异性IgE抗体识别变应原成分中的作为特定氨基酸序列的表位并与其结合,因此通过使用包含表位的多肽而能够进行考虑了交叉性(或也称为交叉抗原性)的诊断。然而,尽管对于变应原成分解析至表位的例子有少数几个(非专利文献1),但目前还是极少的。另外,利用了表位的变态反应的诊断试剂盒在现阶段在市场上也不存在。
现有技术文献
专利文献
专利文献1:日本特开2002-286716
非专利文献
非专利文献1:Matsuo,H.,et al.,J.Biol.Chem.,(2004),Vol.279,No.13,pp.12135-12140
发明内容
发明要解决的问题
本发明提供包含抗原表位的多肽。本发明还提供包含该多肽的变态反应的诊断试剂盒、诊断用组合物、及诊断方法。本发明还提供包含该多肽的药物组合物、及去除或降低了包含该多肽的抗原的原料或加工品。本发明进而涉及该去除或降低了抗原的加工品的制造方法。本发明进而还提供用于判定对象物中有无包含该多肽的抗原的检测仪。
用于解决问题的方案
本发明人等为了解决上述课题,对作为针对小麦的变态反应的形态之一的、作为小麦依赖运动诱发的过敏反应(WDEIA:Wheat-dependent exercise-inducedanaphylaxis)的主要的抗原的ω-5麦醇溶蛋白的表位进行了深入研究。其结果,成功地发现了表位。
由于表位具有相对较短的氨基酸序列,因此只要在不同的变应原成分中存在相同的氨基酸序列,则该IgE抗体就能与多个变应原成分结合。由于在不同的变应原成分中存在共通的表位,结果由于变态反应患者的IgE抗体与两者结合,因此该抗原具有交叉性。因此,通过本发明所特定的表位能够进行包括交叉性在内的变态反应的诊断、治疗、及包含该表位的多个变应原成分的检测等。
基于该见解而完成了本发明。即,在其它方式中,本发明可以如下所述。
[1]一种多肽,其与变态反应患者的IgE抗体特异性结合,包含选自由序列号1~14组成的组中的至少一个氨基酸序列。
[2]根据[1]所述的多肽,其中,氨基酸残基数为500以下。
[3]一种变态反应的诊断试剂盒,其包含[1]或[2]所述的多肽中的至少一个。
[4]一种诊断用组合物,其为变态反应的诊断用组合物,其包含[1]或[2]所述的多肽中的至少一个作为抗原。
[5]一种提供用于诊断对象的变态反应的指标的方法,其包括以下的工序:
(i)使由对象得到的试样与抗原接触,此处该试样是包含IgE抗体的溶液;
(ii)检测由对象得到的试样中的IgE抗体与该抗原的结合;
(iii)在检测出对象的IgE抗体与该抗原的结合时,提供对象为变态反应的指标;
此处该抗原是[1]或[2]所述的多肽中的至少一个。
[6]一种药物组合物,其包含[1]或[2]所述的多肽中的至少一个。
[7]根据[6]所述的药物组合物,其用于治疗变态反应。
[8]一种用于判定对象物中有无抗原的检测仪,其特征在于,包含与[1]或[2]所述的多肽中的至少一个结合的抗体。
[9]一种原料或加工品,其特征在于,其是去除或降低了抗原的原料或加工品,该抗原是[1]或[2]所述的多肽中的至少一个。
[10]一种去除或降低了抗原的加工品的制造方法,其具有如下步骤:在该加工品的制造过程中对去除或降低了抗原的情况进行确认,此处该抗原是[1]或[2]所述的多肽中的至少一个。
[11]一种用于判定有无成为对象物变态反应原因的抗原的检测仪,其特征在于,其包含引物,所述引物包含编码[1]所述的多肽的核酸的一部分碱基序列和/或其一部分互补链。
[12]一种[1]或[2]所述的多肽中的至少一个在制造变态反应的诊断药或治疗药中的应用。
[13]一种诊断对象的变态反应的方法,其包括以下的工序:
(i)使由对象得到的试样与抗原接触;
(ii)检测由对象得到的试样中的IgE抗体与该抗原的结合;
(iii)在检测出对象的IgE抗体与该抗原的结合时,判断对象为变态反应;
此处该抗原是[1]或[2]所述的多肽中的至少一个。
[14]一种诊断对象的变态反应的方法,其包括对对象给予[1]或[2]所述的多肽中的至少一个。
[15]一种治疗变态反应的方法,其包括对需要进行变态反应治疗的患者给予[1]或[2]所述的多肽中的至少一个。
发明的效果
根据本发明,可以提供包含抗原表位的新型多肽。通过利用本发明的多肽,从而可以提供变态反应的高灵敏度的诊断试剂盒、诊断用组合物、及诊断方法、包含该多肽的药物组合物、用于判定对象物中有无包含该多肽的抗原的检测仪、以及去除或降低了该多肽的原料或加工品、及其加工品的制造方法。
附图说明
图1是示出相对于在制作的肽阵列中的具有序列号6和序列号13的氨基酸序列的肽的斑点的、使用了人血清的化学发光的测定结果的图。P1~P3表示使用了WDEIA患者1~3的血清的情况,N1和N2表示使用了健康人1和2的血清的情况。
图2是示出利用重叠的方法确定了普通小麦ω-5麦醇溶蛋白的全长氨基酸序列(UniProt登录号:Q402I5、序列号51)中的、具有作为序列号15和23中的作为表位发挥作用的最少氨基酸数的肽(序列号22和29)的结果的图。横轴的数值表示利用吸光度计测定450nm的显色强度而得到的值(Abs.)。P1表示使用了患者1的血清的情况。
图3是示出利用丙氨酸扫描的方法,对于序列号22和29研究用于抗原性表达的重要位点的结果的图。横轴的数值表示利用吸光度计测定450nm的显色强度而得到的值(Abs.)。图中,双波浪线表示省略了值的情况,P1表示使用了患者1的血清的情况,N1和N2表示使用了健康人1和2的血清的情况,2nd表示仅使用了作为第二抗体的抗人IgE抗体的情况。
具体实施方式
以下对本发明进行具体地说明,但本发明不限定于这些。
只要本说明书中没有特别定义,与本发明相关而使用的科学术语和技术术语就具有本领域技术人员通常理解含义。
本说明书中变态反应是指:在被某抗原致敏的生物体中再次进入该抗原时所引起的、使生物体表现出不良情况的变态反应的状态。在与抗原接触后或者摄取了该抗原的情况,可以产生变态反应。此处接触是指与物体接触,尤其针对人体是指附着于皮肤、粘膜(眼、口唇等)等上。另外,摄取是指摄入体内,是指通过吸入、经口等的手段摄入。将通常在摄取食物时产生的变态反应特别称为食物变态反应。在优选的方式中变态反应可以是食物变态反应。食物中的变态反应的大多数与IgE抗体相关,IgE抗体与肥大细胞、嗜碱性粒细胞等结合。抗原再次进入变态反应患者的体内时,该抗原与结合了肥大细胞、嗜碱性粒细胞等的IgE抗体相结合,产生IgE抗体-抗原相互作用的生理学效果。作为这些生理学效果,可列举出:组胺、5-羟色胺、肝素、嗜酸性粒细胞趋化因子或各种白三烯等的释放。这些释放物质引发由于IgE抗体与特定的抗原的组合而产生的变态反应。详细而言,IgE抗体识别作为特定的抗原中的特定的氨基酸序列的表位并与其结合,由该抗原导致的变态反应通过上述路径而体现出。
成为本发明的对象的变态反应只要是相对于所使用的包含表位的抗原的变态反应就没有特别限定。这样的变态反应还可以包含相对于禾本科、十字花科、蔷薇科、番木瓜科、豆科、葡萄科、胡桃科、大戟科、苋科、凤梨科、茄科、天门冬科、葫芦科、芸香科、柏科、或桦木科的植物、或发菌科的菌类的变态反应。作为禾本科的植物,可列举出:小麦属的普通小麦(学名Triticum aestivum)、一粒小麦(学名Triticum monococcum)、野生型二粒小麦(学名Triticum dicoccoides)、乌拉尔图小麦(学名Triticum urartu)、山羊草属的节节麦(学名Aegilops tauschii)、山羊草属单芒山羊草(学名Aegilops uniaristata)、偃麦草属的长穗偃麦草(学名Thinopyrum elongatum)、新麦草属的新麦草(学名Psathyrostachysjuncea)、高粱属的高粱(学名Sorghum bicolor)等;作为十字花科的植物,可列举出:芸薹属的欧洲油菜(学名Brassica napus)、萝卜属的萝卜(学名Raphanus sativus)等;作为蔷薇科的植物,可列举出:樱桃属的甜樱桃(学名Prunus avium)、梅(学名Prunus mume)、桃属的桃(学名Prunus persica)、苹果属的苹果(学名Malus domestica)等;作为番木瓜科的植物,可列举出:番木瓜属的番木瓜(学名Carica papaya)等;作为豆科的植物,可列举出:木豆属的木豆(学名Cajanus cajan)、豇豆属的红豆(学名Vigna angularis)、大豆属的大豆(学名Glycine max)、野生大豆(学名Glycine soja)、菜豆属的菜豆(学名Phaseolusvulgaris)、鹰嘴豆属的鹰嘴豆(学名Cicer arietinum)等;作为葡萄科的植物,可列举出:葡萄属的酿酒葡萄(学名Vitis vinifera)等;作为胡桃科的植物,可列举出:胡桃属的普通胡桃(学名Juglans regia)等;作为大戟科的植物,可列举出:木薯属的木薯(学名Manihotesculenta)、橡胶树属的橡胶树(学名Hevea brasiliensis)等;作为苋科的植物,可列举出:藜属的藜麦(学名Chenopodium quinoa)、菠菜属的菠菜(学名Spinacia oleracea)等;作为凤梨科的植物,可列举出:凤梨属的菠萝(学名Ananas comosus)等;作为茄科的植物,可列举出茄属的马铃薯(学名Solanum tuberosum)等;作为天门冬科的植物,可列举出:天门冬属的芦笋(学名Asparagus officinalis)等;作为葫芦科的植物,可列举出:甜瓜属的甜瓜(学名Cucumis melo)等;作为芸香科的植物,可列举出:柑橘属的甜橙(学名Citrussinensis)、克莱门柚(学名Citrus clementina)等;作为柏科的植物,可列举出:柳杉属的日本柳杉(学名Cryptomeria japonica)等;作为桦木科的植物,可列举出:桦木属的白桦(学名Betula platyphylla)等;作为发菌科的菌类,可列举出:曲霉属的黄曲霉(学名Aspergillus turcosus)等。
本说明书中小麦的变态反应是指:具有以属于小麦族(学名Triticeae)的植物中所含的蛋白质等作为抗原所产生的变态反应的状态。小麦族可列举出例如普通小麦、密穗小麦(学名Triticum compactum)、硬粒小麦(学名Triticum durum)等小麦属(学名Triticum)、节节麦等山羊草属(学名Aegilops)、长穗偃麦草等偃麦草属(学名Thinopyrum)。在优选的方式中,相对于小麦的变态反应可以是已知作为主要的抗原与ω-5麦醇溶蛋白相关的小麦依赖运动诱发变态反应。
以下,本说明书中抗原是指引发变态反应的物质,也称为变应原成分。抗原优选为蛋白质。
在本说明书中蛋白质是指:具有通过肽键连接氨基酸而成的结构的分子。蛋白质中所含的氨基酸的数量没有特别限定。在本说明书中“多肽”的术语还指具有氨基酸通过肽键连接而成的结构的分子。多肽中所含的氨基酸的数量没有特别限定。“多肽”是包含“蛋白质”的概念。另外,有时将2~50个左右的氨基酸通过肽键连接而成的多肽特别称为肽。另外,关于氨基酸可为光学突变体的情况,若没有特别明确表示则表示L体。本说明书中使用的蛋白质、多肽或肽的氨基酸序列的标记法基于标准用法和本领域中惯用的标记法,用氨基酸的单字母标记来表示,左方向为氨基末端方向,并且右方向为羧基末端方向。需要说明的是,在氨基酸的单字母标记中,X只要是具有能与两端的氨基酸结合的氨基和羧基的物质即可,特别地表示可以是20种天然的氨基酸中任一种。
本说明书中,“置换为其它氨基酸”是指:针对原始序列的氨基酸置换为不同的氨基酸的意思。在优选的方式中,置换是保守性置换。保守性置换是指:通过将特定的氨基酸残基置换为具有类似的物理化学特征的残基,但只要是不使涉及原始序列的结构的特征发生实质性改变就可以是任何置换,例如,置换氨基酸只要不破坏存在于原始序列中的螺旋、或不破坏表征原始序列的其它种类的二级结构就可以是任何置换。以下,对于氨基酸残基的保守性置换,按能置换的残基分类并加以示例,但能置换的氨基酸残基不限定于以下记载的方式。
A组:亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸、丙氨酸、蛋氨酸
B组:天冬氨酸、谷氨酸
C组:天冬酰胺、谷氨酰胺
D组:赖氨酸、精氨酸、
E组:丝氨酸、苏氨酸
F组:苯丙氨酸、酪氨酸
非保守性置换的情况,可以将上述种类中某1个组分与其它种类的组分进行交换。例如,为了排除预料之外的糖链修饰而可以将上述B、D、E组的氨基酸置换为除此以外的组的氨基酸。或者,为了防止在三级结构中折叠而使蛋白质中缺失半胱氨酸、或置换为其它氨基酸。或者,还可以考虑到作为有关氨基酸的疏水性/亲水性的指标的氨基酸的亲水指数(J.Kyte和R.Doolittle,J.Mol.Biol.,Vol.157,p.105-132,1982)来置换氨基酸,以保持亲水性/疏水性的平衡或为了使合成容易进行而提高亲水度。
作为其它方式,还可以进行如下置换:向比原始氨基酸的位阻少的氨基酸的置换,例如由F组向A、B、C、D、E组的置换;从带有电荷的氨基酸向不带有电荷的氨基酸的置换,例如由B组向C组的置换。通过这样的置换,会使IgE抗体的结合性提高。
在本说明书中,2个氨基酸序列的同一性%可以通过视觉性检测和数学计算来确定。另外,还可以使用计算机程序来确定同一性%。作为这样的计算机程序,例如可列举出:BLAST、FASTA(Altschul等人、J.Mol.Biol.,215:403-410(1990))和ClustalW等。特别是,通过BLAST程序进行的同一性检索的各种条件(参数)被Altschul等人(Nucl.Acids.Res.,25,p.3389-3402,1997)记载,可以从美国生物技术信息中心(NCBI)、日本DNA数据库(DDBJ)的网站公共地获得(BLAST手册、Altschul等人NCB/NLM/NIH Bethesda,MD20894;Altschul等人)。另外,还可以使用遗传信息处理软件GENETYX Ver.7(GENETYX CORPORATION)、DNASISPro(Hitachi Software Engineering Co.,Ltd.)、Vector NTI(Infomax)等程序来确定。
抗原表位
对于ω-5麦醇溶蛋白,如实施例1和2所示,确定了表位及对于在该表位内与变态反应患者的IgE抗体的结合性重要的氨基酸。
对于本发明,作为包含与变态反应患者的IgE抗体特异性结合的氨基酸序列的多肽,提供选自由以下(1)~(6)组成的组中的多肽。
(1)包含选自由序列号6和13组成的组中的至少一个氨基酸序列的多肽。
(2)包含XEXPXXQ(序列号1)、优选包含QEXPXXQ(序列号2)、更优选包含QEXPXQQ(序列号3)、进一步优选包含QXEXPXXQ(序列号4)、最优选包含FPQXEXPXXQ(序列号5)的氨基酸序列的多肽。
(3)包含PXQXXPQQ(序列号8)、优选包含PQQXXPQQ(序列号9)、更优选包含FPXQXXPQQ(序列号10)、进一步优选包含PXQXXPQQH(序列号11)、最优选包含FPXQXXPQQH(序列号12)的氨基酸序列的多肽。
(4)包含相当于QEFPQQQ(序列号22)的第1、3、5、6位的氨基酸中的任意1个、2个、3个、或4个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。优选包含相当于序列号22的第3、5、6位的氨基酸中的任意1个、2个、或3个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。更优选包含相当于序列号22的第3、5位的氨基酸中的任意1个或2个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。进一步优选包含相当于QQEFPQQQ(序列号46)的第2、4、6、7位的氨基酸中的任意1个、2个、3个、或4个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。最优选包含相当于FPQQEFPQQQ(序列号47)的第4、6、8、9位的氨基酸中的任意1个、2个、3个、或4个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。
(5)包含相当于PQQQPPQQ(序列号29)的第2、4、5位的氨基酸中的任意1个、2个、或3个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。优选包含相当于序列号29的第4、5位的氨基酸中的任意1个或2个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。更优选包含相当于FPQQQPPQQ(序列号48)的第3、5、6位的氨基酸中的任意1个、2个、或3个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。进一步优选包含相当于PQQQPPQQH(序列号49)的第2、4、5位的氨基酸中的任意1个、2个、或3个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。最优选包含相当于FPQQQPPQQH(序列号50)的第3、5、6位的氨基酸中的任意1个、2个、或3个氨基酸置换为其它氨基酸、优选置换为丙氨酸的氨基酸序列的多肽。
(6)包含选自由序列号7和序列号14组成的组中的至少一个氨基酸序列的多肽。
其中,前述(1)~(6)序列的多肽可以是不包含与普通小麦的ω-5麦醇溶蛋白的全长氨基酸序列(序列号51)相同的突变体的多肽,或可以是不包含与普通小麦的ω-5麦醇溶蛋白的全长氨基酸序列(序列号51)具有90%以上、80%以上或70%以上的同一性的突变体的多肽。
需要说明的是,序列号6和13分别相当于普通小麦的ω-5麦醇溶蛋白的全长氨基酸序列(序列号51)的氨基酸221~235(序列号6)和161~175(序列号13)。
对于上述(2)和(3)的多肽,X所示的残基是:利用实施例1所示的丙氨酸扫描的方法(非专利文献1),即使置换为丙氨酸也维持了与变态反应患者的IgE抗体的结合性的位点的氨基酸残基。对于这样的位点,本领域技术人员公知的是即使在置换为其它任意的氨基酸的情况下,维持与该IgE抗体的结合性的可能性也高。
上述(1)~(6)的多肽的长度没有特别限定。在优选的方式中,上述(1)~(6)的多肽的长度可以是1000个氨基酸以下、700个氨基酸以下、500个氨基酸以下、300个氨基酸以下、200个氨基酸以下、100个氨基酸以下、50个氨基酸以下、30个氨基酸以下、20个氨基酸以下、10个氨基酸以下、或5个氨基酸以下。
上述(1)~(6)的多肽可以利用肽的固相合成等化学合成的方法来制备。或者,包含表位的多肽可以通过如下方式得到:本领域技术人员通过公知的基因重组技术以重组蛋白质的形式表达,此外本领域技术人员利用公知的蛋白质纯化方法进行分离/纯化。
诊断试剂盒/诊断方法
本发明提供一种用于诊断对象的变态反应的指标的方法,其包括以下的工序:
(i)使由对象得到的试样与抗原接触,此处该试样是包含IgE抗体的溶液;
(ii)检测由对象得到的试样中的IgE抗体与该抗原的结合;
(iii)在检测出对象的IgE抗体与该抗原的结合时,提供对象为变态反应的指标;
此处该抗原为上述(1)~(6)的多肽中的至少一个多肽,或为借助或不借助间隔物连接2个以上的上述(1)~(6)的多肽而成的多肽。
以下,将上述(1)~(6)的多肽中的至少一个多肽、或借助或不借助间隔物连接2个以上的上述(1)~(6)的多肽而成的多肽在本说明书中记为“包含上述(1)~(6)的抗原”。间隔物的种类没有特别限定,本领域技术人员可以使用通常使用的方法来连接多个肽。间隔物例如可以是Acp(6)-OH等的烃链。
由对象得到的试样是包含从对象中采取的Ig抗体、特别是IgE抗体的溶液。这样的溶液例如包含血液、唾液、痰、清鼻涕、尿、汗、泪。对于由对象得到的试样,在与包含上述(1)~(6)的抗原接触之前,还可以实施用于提高试样中的IgE抗体浓度的预处理。作为试样的预处理,例如可以包括从血液中得到血清、血浆。进而,还可以对作为与包含上述(1)~(6)的抗原的结合部分的Fab部分进行纯化。在特别优选的方式中,上述工序(i)通过使抗原与由对象得到的血清中的IgE抗体接触来进行。
IgE抗体可以是IgE抗体本身,还可以是结合了IgE抗体的肥大细胞等。
由对象得到的试样与包含上述(1)~(6)的抗原的接触及其结合的检测可以利用已知的方法来进行。这样的方法例如可以使用基于酶联免疫吸附试验(ELISA:Enzyme-Linked Immunosorvent Assay)、夹心免疫测定法、免疫印迹法、免疫沉淀法、免疫色谱法进行的检测。这些方法均是:通过使对象的IgE抗体与包含上述(1)~(6)的抗原接触并结合,使酶标记的第二抗体作用于与包含上述(1)~(6)的抗原特异性结合的IgE抗体,加入酶的底物(通常为显色试剂或者发光试剂)来检测酶反应的产物,由此来检测包含上述(1)~(6)的抗原与对象的IgE抗体的结合。或者是检测荧光标记的第二抗体的方法。或者,还可以使用通过表面等离子体共振(SPR)等能够评价包含上述(1)~(6)的抗原与IgE抗体的结合的测定方法进行的检测。还可以将包含多种上述(1)~(6)的抗原特异性IgE抗体混合。
包含上述(1)~(6)的抗原可以是固定于载体的状态。在此情况下在上述工序(i)和(ii)中可以利用ELISA、夹心免疫测定法、免疫色谱法、表面等离子体共振等,上述工序(i)通过使由对象得到的试样与固定了包含上述(1)~(6)的抗原的面接触来进行。另外,还可以利用使对象的IgE抗体固定于载体的状态的物质,利用上述方法来检测与包含上述(1)~(6)的抗原的结合。
包含上述(1)~(6)的抗原可以是未固定于载体的状态。在此情况下,在上述工序(i)和(ii)中,可以利用流式细胞仪等,能够通过激光确认IgE抗体所结合的包含上述(1)~(6)的抗原的存在。该方法例如可列举出嗜碱性粒细胞活化试验(BAT),其是如下方法:通过在与包含上述(1)~(6)的抗原的接触而使嗜碱性粒细胞活化时出现的表面抗原CD203c进行检测。另外,还可列举出组胺释放试验(HRT):通过使包含上述(1)~(6)的抗原进而与试样中的血细胞接触,来调查是否释放组胺。
包含上述(1)~(6)的抗原是与变态反应患者的IgE抗体特异性结合的抗原。因此,在检测出对象的IgE抗体与该抗原结合时,提供对象为变态反应的指标。
本发明还提供诊断试剂盒,其含有包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个的变态反应。本发明的诊断试剂盒可以用于:提供用于诊断上述变态反应的指标的方法、或用于下述诊断方法。本发明的诊断试剂盒除了含有包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个之外,还可以包含经酶标记的抗IgE抗体以及成为该酶的底物的显色底物或发光底物。另外,还可以使用经荧光标记的抗IgE抗体。在本发明的诊断试剂盒中,还可以以将包含上述(1)~(6)的抗原固定于载体的状态提供。本发明的诊断试剂盒此外还可与有关用于诊断的步骤的说明书、包含该说明的包装一起来提供。
在其它方式中,上述诊断试剂盒包含有关变态反应的伴侣诊断药。伴侣诊断药是指:为了确定可期待药物效果的患者或为了确定药物具有严重的副作用风险的患者、或者为了最优化使用了药物的治疗而用于研究该药物的反应性而使用的药物。此处治疗的最优化是指:例如包括:用法容量的确定、给药中止的判断、使用何种变应原成分来进行免疫耐受的确认等。
本发明还提供含有包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个的变态反应的诊断用组合物。本发明的诊断用组合物可以用于下述诊断方法。本发明的诊断用组合物还可以根据需要与本发明的抗原一起包含通常使用的药学上可接受的载体、添加剂。
在一个方式中,本发明提供“体外(in vitro)”诊断对象的变态反应的方法,其包括以下的工序:
(i)使由对象得到的试样与抗原接触;
(ii)检测由对象得到的试样中的IgE抗体与该抗原的结合;
(iii)在检测出对象的IgE抗体与该抗原的结合时,判断对象为变态反应;
此处该抗原是作为包含上述(1)~(6)的抗原而确定的蛋白质中的至少一个。此处(i)和(ii)的各工序如针对提供用于诊断变态反应指标的方法的各工序说明来进行。
在其它方式中,本发明提供“体内(in vivo)”诊断对象的变态反应的方法,其包括对对象给予包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个。该方法可以以皮肤试验的形式进行,其特征在于,将包含上述(1)~(6)的抗原用于皮肤。皮肤测试中包含如下形式:对皮肤上施用诊断用组合物之后、以不出血程度地轻微抓伤,使皮肤浸透抗原再观察皮肤反应的点刺试验(prick test);施用了诊断用组合物的基础上轻挠皮肤再观察反应的划痕试验(scratch test);对皮肤施用霜、软膏等形式的诊断用组合物再观察反应的肤斑试验(Patch test);对皮内给予包含上述(1)~(6)的抗原再观察反应的皮内测试;等。在使用了包含上述(1)~(6)的抗原的部分的皮肤出现肿胀等的皮肤反应时,诊断为该对象具有变态反应。此处,用于皮肤的包含上述(1)~(6)的抗原的量例如可以是每1次100μg以下的用量。
对于变态反应的诊断,经常进行以确定抗原为目的的负荷试验。包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个可以作为用于诊断是否为变态反应的负荷试验的有效成分来使用。此处,作为用于负荷试验的变应原成分,可以是经表达纯化的多肽,例如可以是如将日本柳杉花粉抗原的在水稻中基因转化,在米内表达了该抗原蛋白质的花粉米那样在食品/食材中进行了表达的物质。
在其它方式中,本发明提供用于诊断变态反应的包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个。
在其它方式中,本发明提供包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个在制造变态反应的诊断药中的应用。
在该项目中,成为诊断或检测对象的变态反应可以是包含上述(1)~(6)的抗原的变态反应。即,变态反应的检测不仅可以是单一的包含上述(1)~(6)的抗原的变态反应的检测,还可以是检测包括交叉性在内的变态反应的检测。
药物组合物/治疗方法
本发明提供含有包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个的药物组合物。在一个方式中,上述的药物组合物用于治疗变态反应。变态反应的治疗是指增加即使进入体内也不会发病的抗原的极限量,最终实现在通常的抗原摄取量下不会发病的状态(缓解)。
本发明还提供一种治疗变态反应的方法,其包括对需要进行变态反应治疗的患者给予包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个。
在其它方式中,本发明提供用于治疗变态反应的包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个。进而在其它方式中本发明提供包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个在制造变态反应的治疗药中的应用。
对于变态反应的治疗,通常进行脱敏疗法,其目的在于通过向患者给予抗原来诱导免疫耐受。包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个可以作为用于针对变态反应的脱敏疗法的有效成分来使用。此处,作为用于脱敏疗法的变应原成分,可以是经表达纯化的多肽,例如可以是如花粉米那样在食品/食材中进行了表达的物质。
本发明的药物组合物可以通过通常的给药途径进行给药。通常的给药途径例如包括经口、舌下、经皮、皮内、皮下、血液内、鼻腔内、肌肉内、腹腔内、直肠内的给药。
本发明的药物组合物可以使用根据需要与本发明的包含上述(1)~(6)的抗原一起通过常规方法添加了通常使用的药学上允许的佐剂、赋形剂、或者各种添加剂(例如稳定剂、助溶剂、乳浊化剂、缓冲剂、储存剂、着色剂等)而成的药物组合物。药物组合物的剂型可以由本领域技术人员根据给药途径而适宜选择。也可以是例如:片剂、胶囊剂、糖浆剂、舌下片、注射剂、鼻腔内喷雾剂、膏剂、溶液剂、霜剤、露剂等形式。本发明的药物组合物的给药量、给药次数和/或给药期间可以由医师根据给药途径、症状、年龄、体重等患者的特性等适宜选择。例如是成人的情况下,也可以以每1次100μg以下的用量给药。给药间隔可以是例如每天1次、每周1次、每月2次或者3个月1次左右。给药期间可以为例如数周~数年。在给药期间内,也可以是梯度地增加给药量的给药方法。
在该项目中,成为治疗对象的变态反应可以是包含上述(1)~(6)的抗原的变态反应。即,变态反应的治疗不仅可以是单一的包含上述(1)~(6)的抗原的变态反应,还可以是治疗包括交叉性在内的变态反应的情况。
检测仪
本发明提供针对包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个的抗体的检测仪。
该抗体可以利用常规方法来制作。例如,可以通过用包含上述(1)~(6)的抗原对兔子等哺乳动物进行免疫来制作。该抗体可以是Ig抗体、多克隆抗体、单克隆抗体、或它们的抗原结合片段(例如,Fab、F(ab’)2、Fab’)。
另外,上述检测仪中,还可以以该抗体与载体结合的形式来提供。载体只要是能用于检测抗体与包含上述(1)~(6)的抗原的结合的载体就没有特别限定。本领域技术人员可以利用公知的任何载体。另外,包含上述(1)~(6)的抗原的抗体优选为上述“抗原表位”的项目中记载的针对表位的抗体。由此,能够制成可检测出包括交叉性在内的检测仪。
作为调查有无含有包含上述(1)~(6)的抗原的方法,例如可列举出以下的方法。
·使包含制得的抗体的检测仪与由原料/加工品等得到的试样接触,并使用例如ELISA法来检测该抗体与试样中的包含上述(1)~(6)的抗原的结合,在检测出该抗体与包含上述(1)~(6)的抗原的结合的情况下,判断为知对象原料/加工品等中残留有该抗原的方法。
·使原料/加工品等渗入滤纸等中,使抗体溶液发生反应从而检测出其中所含的包含上述(1)~(6)的抗原的方法。
在本发明的其它方式中,包括特征在于包含与表位对应的引物的、用于判定对象物中有无包含变态反应的上述(1)~(6)的抗原的检测仪。非限定性地,上述引物例如可以是以包含编码上述(1)~(6)中确定的氨基酸序列的核酸的一部分碱基序列和/或其一部分互补链的方式设计而成的引物。作为具体的方式,抗原为ω-5麦醇溶蛋白时,以包含ω-5麦醇溶蛋白基因的全长碱基序列(EMBL-Bank/ENA登录号:BAE20328.1、序列号52)的一部分碱基序列和/或序列号52的碱基序列的互补链的一部分的方式设计上述引物。例如,以具有序列号52的碱基序列的5’末端或中央部分的序列和/或序列号52的碱基序列的互补链的5’末端的序列、或者以具有序列号52所示的碱基序列的5’末端的序列和/或序列号52的碱基序列的互补链的5’末端或中央部分的序列的、优选为12碱基、15碱基、20碱基、25碱基的碱基序列的方式设计。另外,上述引物可以是:在编码包含作为上述(1)~(6)中确定的氨基酸序列的表位的蛋白质的核酸中,以成为编码该表位的部分的上游侧的区域的碱基序列或编码其表位的部分的互补链的上游侧的区域的碱基序列的方式设计而成的引物。此处,抗原为ω-5麦醇溶蛋白时的表位在全长序列中的位点如在上述“抗原表位”的项目中所确定的那样。另外,特别是将mRNA作为对象的情况,还可以具有多腺嘌呤尾的互补引物。
例如,将由试样得到的DNA或mRNA作为模板,并使用前述引物,通过包含RT-PCR的聚合酶链式反应(PCR:Polymerase Chain Reaction)来扩增DNA,对于经扩增的DNA的序列中是否包含编码上述(1)~(6)中确定的氨基酸序列的核酸进行判断,由此判断有无包含上述(1)~(6)的抗原。另外,以mRNA作为对象通过PCR进行扩增的方法可以示例出RACE法等。在经扩增的DNA中3种可能的开放阅读框(ORF:open reading frame)所编码的氨基酸序列之一包含上述(1)~(6)中确定的氨基酸序列(例如,序列号1或8)时,判断为具有抗原。DNA未被扩增的情况,判断为不具有抗原。作为具体的方式,抗原为ω-5麦醇溶蛋白时,通过对在将经扩增的DNA中3种可能的开放阅读框所编码的氨基酸序列与序列号22或29进行比较,来判断抗原的有无。DNA未被扩增的情况,判断为不具有抗原。
在一个方式中,上述检测仪用于调查原料或加工品生产线中等的对象物中有无含有包含上述(1)~(6)的抗原。原料可以是食材,还可以是化妆品原料、药物原料等。加工品可以是食用加工品,还可以是化妆品、药物等。上述检测仪可以用作作为原料包含的生物物种的探索用,可以用作由制造商进行的生产线和出货前产品的品质检测用,还可以用作由食用者或使用者自身进行的对象原料/加工品有无包含抗原的确认用。
变应原去除原料等
本发明提供一种原料或加工品,其特征在于,去除或降低了包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个。
在原料或加工品中去除或降低本发明的抗原的方法不受限定。抗原的去除或降低只要可去除或降低包含上述(1)~(6)的抗原就可以利用任何的方法来进行。
去除或降低了包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个可以通过去除或降低了抗原整体来实现,或者还可以通过从抗原蛋白质中切断或去除上述(1)~(6)中确定的序列部分来实现。“去除”包括上述(1)~(6)中确定的序列部分的所有或一部分的缺失和突变。
例如,去除或降低了包含上述(1)~(6)的抗原的原料可以使用基因敲除技术来制备敲除了包含上述(1)~(6)的抗原的表达的原料。基因敲除技术可以使用转基因等本领域技术人员公知的方法中的任一种。
去除或降低了包含上述(1)~(6)的抗原的加工品可以是如使用了纯化肽作为原料的奶粉那样、使用了去除或降低了包含上述(1)~(6)的抗原的原料的加工品。使用通常的原料的情况,在加工品的制备前或制备后进行去除或降低包含上述(1)~(6)的抗原的处理。使用了通常的原料的加工品时,作为去除或降低包含上述(1)~(6)的抗原的方法,可列举出:通过高压处理和中性盐溶液进行的洗脱、高温蒸汽等的去除原料中的蛋白质成分的方法;进行通过高热处理和酸处理的水解/变性/氨基酸修饰(侧链的化学修饰/脱离等)的方法。作为切断包含上述(1)~(6)的抗原的方法,可列举出进行用特定的消化酶来切断的处理的方法。
变应原去除加工品的制造方法
本发明提供一种去除或降低了抗原的加工品的制造方法,其具有在该加工品的制造过程中对去除或降低了抗原的情况进行确认的步骤,此处该抗原是包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个。
在该制造方法中,去除或降低了抗原是指:去除或降低了包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个、或从前述抗原中切断或去除了上述(1)~(6)中确定的序列部分的意思。
在加工品的制造过程中对去除或降低了抗原的情况进行确认的方法没有特别限定,可以使用能检测出包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个的任何方法。例如,通过包含在该加工品的制造过程中产生的材料的试样与包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个的抗体的结合性,可以确认该加工品中有无该多肽或抗原的存在。这种方法的详细内容如在上述“诊断试剂盒/诊断方法”的项目中记载的那样。即,对于上述制造方法,可以将在上述“诊断试剂盒/诊断方法”的项目中的“对象的IgE抗体”置换为“包含上述(1)~(6)的抗原中的至少一个的抗体”,将在上述“诊断试剂盒/诊断方法”的项目中的“抗原”置换为“包含在加工品的制造过程中产生的材料的试样”,为了对在加工品的制造过程中去除或降低了抗原的情况进行确认而使用在上述“诊断试剂盒/诊断方法”的项目中记载的方法。另外,还可以使用在上述“检测仪”的项目中记载的检测仪。
[实施例]
以下对本发明的实施例进行说明。本发明的保护范围不限定于这些实施例。
实施例1:表位的鉴定
ω-5麦醇溶蛋白的表位
对于ω-5麦醇溶蛋白,依据以下的步骤进行了表位的鉴定。
(A)表位作图(1)
通过与普通小麦的ω-5麦醇溶蛋白的全长氨基酸序列(序列号51)对应的重叠肽(长度:15氨基酸)的文库进行了表位作图。
使合成的各肽每10个氨基酸地移位(shift)。即各肽分别与前面的肽和后面的肽具有5个氨基酸的重复。
为了制备肽阵列,使用了Intavis CelluSpots(商标)技术。即通过以下的步骤制备了肽阵列:(1)在氨基修饰纤维素盘上使用自动化合成装置(Intavis MultiPep RS)来合成目标肽,(2)使前述氨基修饰纤维素盘溶解而得到纤维素结合肽溶液,(3)在实施了涂布的载玻片上点滴前述纤维素结合肽。各步骤的详细内容如下所述。
(1)肽的合成
在384孔合成板中的氨基修饰纤维素盘上,利用9-芴基甲氧基羰基(Fmoc)化学反应阶段性地进行了肽合成。即,使氨基键合有Fmoc基团的氨基酸在二甲基甲酰胺(DMF)中的N,N’-二异丙基碳二亚胺(DIC)和1-羟基苯并三唑(HOBt)的溶液中活化,滴加在前述纤维素盘上并使前述Fmoc基团键合氨基酸与纤维素盘上的氨基键合(偶联剂),利用乙酸酐对未反应的氨基进行加帽并利用DMF进行清洗,进而用哌啶进行处理并利用DMF进行清洗,从与纤维素盘上的氨基键合的氨基酸的氨基上去除了Fmoc基团。针对与前述纤维素盘上的氨基键合的氨基酸,通过反复进行上述偶联剂、加帽、和Fmoc基团的去除,由此使氨基末端延伸而进行了肽合成。
(2)氨基修饰纤维素盘的溶解
将结合了在上述“(1)肽的合成”中得到的目标肽的纤维素盘转移至96孔板中,为了进行氨基酸侧链的脱保护,用三氟乙酸(TFA)、二氯甲烷、三异丙基硅烷(TIPS)和水的侧链脱保护混合液进行处理。然后,将经脱保护的纤维素结合肽溶解在TFA、全氟甲磺酸(TFMSA)、TIPS和水的混合液中,利用叔四丁基甲醚(TBME)使其沉淀,再悬浮在二甲基亚砜(DMSO)中,与NaCl、柠檬酸钠和水的混合液混合,得到点玻片用肽溶液。
(3)纤维素结合肽溶液的斑点
使用Intavis多肽芯片点样仪将在上述“(2)氨基修饰纤维素盘的溶解”中得到的点玻片用肽溶液点滴在Intavis CelluSpots(商标)载玻片上,使其干燥而制备了肽阵列。
使用前述肽阵列,对于各肽片段是否利用抗原抗体反应与WDEIA患者血清中的IgE抗体结合进行了测定。测定依据以下的步骤进行。
(1)将肽在5%脱脂乳/PBST溶液(包含0.1%非离子表面活性剂Tween 20的PBS缓冲剂)中、在室温下振荡1小时。
(2)在2%血清/5%脱脂乳/PBST溶液中、在室温下振荡1小时。
(3)用PBST溶液清洗5分钟(×3次)。
(4)添加抗人IgE抗体-HRP(1:10000、5%脱脂乳/PBST溶液),在室温下振荡1小时。
(5)用PBST溶液清洗5分钟(×3次)。
(6)添加Pierce ECL Plus Western Blotting Substrate(Thermo公司制),在室温下振荡5分钟。
(7)使用Amersham Imager 600,测定实施了上述(1)~(6)的处理的肽的化学发光。
其结果,确认了不包含已知表位的、在斑点No.1的肽(序列号6)和斑点No.2的肽(序列号13)上结合了患者特异性IgE抗体(图1)。这些肽分别相当于普通小麦的ω-5麦醇溶蛋白的全长氨基酸序列(序列号51)的氨基酸221~235和161~175。
(B)表位作图(2):重叠(overlapping)
以通过上述(A)结合了患者特异性血清中IgE抗体的肽的序列(序列号6和13)为基础,在该肽的序列以及普通小麦的ω-5麦醇溶蛋白的全长氨基酸序列(序列号51)中的添加了该肽的前后的序列而成的序列中,制作重叠肽片段(长度:10氨基酸)的文库,进行了表位作图。
使合成的各肽每10个氨基酸地移位。即各肽分别与前面的肽和后面的肽具有9个氨基酸的重复。
文库按照以下的步骤制作。即通过如下方式制作:(1)在氨基修饰树脂上利用自动化合成装置(Intavis MultiPep RS)来合成目标肽,(2)从前述氨基修饰树脂上洗脱肽。各步骤的详细内容如下所述。
(1)肽的合成
在96孔板中的氨基修饰树脂上,利用与上述(A)同样的方法合成了目标肽。在合成的目标肽的氨基末端,夹持源自Fmoc-Acp(6)-OH的氨基己酸作为间隔物来结合生物素。
(2)肽从氨基修饰树脂上的洗脱
对于得到的结合了目标肽的前述氨基修饰树脂,用TFA、TIPS和水的混合液进行处理,由此从前述氨基修饰树脂上洗脱了肽。然后,用TBME将该肽沉淀,得到目标肽并制作了文库。
通过使用前述文库,对于各肽片段是否利用抗原抗体反应与患者血清中的IgE抗体结合进行了测定,并计算出与结合了患者的IgE抗体的肽共通的序列,由此确认具有作为表位发挥作用的最少氨基酸序列的肽。测定依据以下的步骤并利用ELISA法进行。
(1)用PBST溶液将文库的生物素结合肽制成10μg/ml,在涂布有抗生物素的ELISA板中、在室温下振荡1小时。
(2)用PBST溶液进行清洗。
(3)在1%脱脂乳/PBST溶液中、在室温下振荡1小时。
(4)在2%血清/1%脱脂乳/PBST溶液中、在室温下振荡1小时。
(5)用PBST溶液进行清洗。
(6)添加抗人IgE抗体-HRP(1:10000、1%脱脂乳/PBST溶液),在室温下振荡1小时。
(7)用PBST溶液进行清洗。
(8)添加TMB ELISA(Thermo公司制)20μL,在室温下振荡15分钟。
(9)添加2M硫酸20μL,使酶反应停止。
(10)测定了450nm的吸光度。
将对于以序列号6为基础制作的文库中的、普通小麦的ω-5麦醇溶蛋白的部分序列QFPQQQFPQQEFPQQQQFPQQQIAR(序列号15)利用重叠的方法得到的测定结果以及对于以序列号13为基础制作的文库中的、普通小麦的ω-5麦醇溶蛋白的部分序列QFLQQQQFPQQQPPQQHQFPQQQL(序列号23)利用重叠的方法得到的测定结果分别示于图2。各图的横轴表示各自的吸光度。
其结果,对于序列号15,观察到:具有序列号18和20、特别是序列号20的氨基酸序列的多肽与患者的IgE抗体较强的结合。对于序列号17和19,观察到与患者的IgE抗体的结合稍弱。对于序列号16和21,未观察到与患者的IgE抗体的结合。其结果,鉴定出:作为与序列号17~20共通的序列的序列号22是作为表位发挥作用的最少氨基酸序列(图2)。
对于序列号23,观察到:具有序列号25和26、特别是序列号26的氨基酸序列的多肽与患者的IgE抗体较强的结合。对于序列号27,观察到与患者的IgE抗体的结合稍弱。对于序列号24和28,未观察到与患者的IgE抗体的结合。其结果,可鉴定为:作为与序列号25~27共通的序列的序列号29是作为表位发挥作用的最少氨基酸序列(图2)。
另一方面,图2所示的序列号43~45的氨基酸序列是ω-5麦醇溶蛋白的已知的表位(非专利文献1),但在该试验中与患者的IgE抗体的反应性差。
(C)表位作图(3):丙氨酸扫描
对于通过上述(B)鉴定出的序列号22的氨基酸序列和序列号29的氨基酸序列,利用被称为丙氨酸扫描的方法(非专利文献1),对于利用与上述(B)同样的方法制备分别在序列号6和序列号13的氨基酸序列中从氨基末端侧起将每1个氨基酸置换为丙氨酸而成的肽片段的文库,利用与上述(B)同样的方法对于各肽片段是否与患者及健康人血清中的IgE抗体结合进行了测定。对于通过丙氨酸置换而使与患者的IgE抗体的结合性丧失或者减少、发生与健康人的IgE抗体的结合性的位点的氨基酸,判断为用于表达原始抗原性是重要的氨基酸、或对原始抗原性的表达产生影响的氨基酸。另外,对于即使通过丙氨酸置换也维持了与患者的IgE抗体的结合性、也不发生与健康人的IgE抗体的结合性的位点的氨基酸,判断为用于表达原始抗原性是不重要且能置换的氨基酸。通过该解析,发现用于表达原始抗原性重要的共通序列。
分别将对于序列号22的氨基酸序列进行的丙氨酸扫描的结果和对于序列号29的氨基酸序列进行的丙氨酸扫描的结果示于图3。各图的横轴表示各自的吸光度。
其结果,对于序列号22,分别将第4位和第7位的氨基酸置换为丙氨酸的序列号33和30与患者的IgE抗体的结合性丧失或者减少。序列号33进而还发生了与健康人的IgE抗体的结合性,序列号30进而也发生了与作为第二抗体的抗人IgE抗体的结合性。此外,将第2位的氨基酸置换为丙氨酸的序列号34与患者的IgE抗体的结合性增大,但发生了与健康人的IgE抗体的结合性。因此,表明:这些第2位、第4位和第7位的氨基酸是用于表达原始抗原性的特别重要的氨基酸。另外,分别将第1位和第6位的氨基酸置换为丙氨酸的序列号35和31与患者的IgE抗体的结合性稍微减少,但发生的与健康人的IgE抗体、与作为第二抗体的抗人IgE抗体的结合性程度相对较低,因此将这些氨基酸判断为对表达原始抗原性产生影响的氨基酸。需要说明的是,将第3位的氨基酸置换为丙氨酸的序列号7维持了与患者的IgE抗体的结合性,也几乎未发生与健康人的IgE抗体、与作为第二抗体的抗人IgE抗体的结合性。此外,将第5位的氨基酸置换为丙氨酸的序列号32与患者的IgE抗体的结合性减少,但未发生与健康人的IgE抗体、与作为第二抗体的抗人IgE抗体的结合性。因此,将这些第3位和第5位的氨基酸判断为能置换的氨基酸。进而值得注意的是,序列号7与患者的IgE抗体的结合性显著地增大(图3)。
对于序列号29,分别将第1位、第3位和第6~8位的氨基酸置换为丙氨酸的序列号42、40和38~36与患者的IgE抗体的结合性丧失,表明这些氨基酸是用于表达原始抗原性特别重要的氨基酸。序列号40进而还发生了与作为第二抗体的抗人IgE抗体的结合性。另外,将第2位的氨基酸置换为丙氨酸的序列号41与患者的IgE抗体的结合性的减少的程度相对较低,判断为对表达原始抗原性产生影响的氨基酸。分别将第4位和第5位的氨基酸置换为丙氨酸的序列号39和14维持了与患者的IgE抗体的结合性,也未发生与健康人的IgE抗体的结合性,因此判断为能置换的氨基酸。进而值得注意的是,序列号14与患者的IgE抗体的结合性显著地增大(图3)。
实施例2:以氨基酸序列为基础的交叉性的研究
对于序列号6和13的多肽,用上述(C)来确定与患者的IgE抗体的结合性重要的氨基酸,由各自得到序列号1和8(以下有时记为密钥序列)。将序列号6和序列号13作为查询序列,将作为密钥序列的序列号1和序列号8作为各自的PHI模型序列,通过在PHI-BLAST的初始设定参数中的PHI-BLAST进行解析,进行了以氨基酸序列为基础的交叉性的研究。
其结果,在将序列号6作为查询序列,将作为密钥序列的序列号1作为PHI模型序列时,检测出普通小麦、一粒小麦等禾本科植物;欧洲油菜、萝卜等十字花科植物;甜樱桃、桃等蔷薇科植物;番木瓜等番木瓜科植物;木豆、大豆等豆科植物;酿酒葡萄等葡萄科植物;胡桃等胡桃科植物;木薯、橡胶树等大戟科植物;藜麦、菠菜等苋科植物;菠萝等凤梨科植物;马铃薯等茄科植物;芦笋等天门冬科植物;甜瓜等葫芦科植物;甜橙、克莱门柚等芸香科植物;日本柳杉等柏科植物;白桦等桦木科植物;土曲霉等菌类的蛋白质。该结果表明:序列号1不仅可用于物种间的检测,而且还能用于检测跨越了属、植物界的抗原的交叉性。
将序列号13作为查询序列,将作为密钥序列的序列号8作为PHI模型序列时,检测出上述的禾本科植物、十字花科植物、蔷薇科植物、番木瓜科植物、豆科植物、葡萄科植物、胡桃科植物、大戟科植物、苋科植物、凤梨科植物、茄科植物、天门冬科植物、葫芦科植物、芸香科植物、柏科植物、桦木科植物、菌类等的蛋白质。该结果表明:序列号8能用于检测跨越了物种间、属的抗原的交叉性。
序列表
<110> 朋友股份有限公司(HOYU CO., LTD.)
<120> 表位
<130> FA1621-18097
<150> JP2017-242849
<151> 2017-12-19
<160> 52
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (5)..(6)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (1)..(1)
<223> The 'Xaa' at location 1 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (3)..(3)
<223> The 'Xaa' at location 3 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (5)..(5)
<223> The 'Xaa' at location 5 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (6)..(6)
<223> The 'Xaa' at location 6 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 1
Xaa Glu Xaa Pro Xaa Xaa Gln
1 5
<210> 2
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (5)..(6)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (3)..(3)
<223> The 'Xaa' at location 3 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (5)..(5)
<223> The 'Xaa' at location 5 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (6)..(6)
<223> The 'Xaa' at location 6 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 2
Gln Glu Xaa Pro Xaa Xaa Gln
1 5
<210> 3
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (3)..(3)
<223> The 'Xaa' at location 3 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (5)..(5)
<223> The 'Xaa' at location 5 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 3
Gln Glu Xaa Pro Xaa Gln Gln
1 5
<210> 4
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (6)..(7)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (2)..(2)
<223> The 'Xaa' at location 2 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (4)..(4)
<223> The 'Xaa' at location 4 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (6)..(6)
<223> The 'Xaa' at location 6 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (7)..(7)
<223> The 'Xaa' at location 7 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 4
Gln Xaa Glu Xaa Pro Xaa Xaa Gln
1 5
<210> 5
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (8)..(9)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (4)..(4)
<223> The 'Xaa' at location 4 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (6)..(6)
<223> The 'Xaa' at location 6 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (8)..(8)
<223> The 'Xaa' at location 8 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (9)..(9)
<223> The 'Xaa' at location 9 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 5
Phe Pro Gln Xaa Glu Xaa Pro Xaa Xaa Gln
1 5 10
<210> 6
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 6
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro
1 5 10 15
<210> 7
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 7
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Glu Ala Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro
1 5 10 15
<210> 8
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (4)..(5)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (2)..(2)
<223> The 'Xaa' at location 2 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (4)..(4)
<223> The 'Xaa' at location 4 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (5)..(5)
<223> The 'Xaa' at location 5 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 8
Pro Xaa Gln Xaa Xaa Pro Gln Gln
1 5
<210> 9
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (4)..(5)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (4)..(4)
<223> The 'Xaa' at location 4 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (5)..(5)
<223> The 'Xaa' at location 5 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 9
Pro Gln Gln Xaa Xaa Pro Gln Gln
1 5
<210> 10
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (5)..(6)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (3)..(3)
<223> The 'Xaa' at location 3 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (5)..(5)
<223> The 'Xaa' at location 5 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (6)..(6)
<223> The 'Xaa' at location 6 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 10
Phe Pro Xaa Gln Xaa Xaa Pro Gln Gln
1 5
<210> 11
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (4)..(5)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (2)..(2)
<223> The 'Xaa' at location 2 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (4)..(4)
<223> The 'Xaa' at location 4 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (5)..(5)
<223> The 'Xaa' at location 5 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 11
Pro Xaa Gln Xaa Xaa Pro Gln Gln His
1 5
<210> 12
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<220>
<221> MOD_RES
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> MOD_RES
<222> (5)..(6)
<223> Xaa可以为任意氨基酸
<220>
<221> UNSURE
<222> (3)..(3)
<223> The 'Xaa' at location 3 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (5)..(5)
<223> The 'Xaa' at location 5 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<220>
<221> UNSURE
<222> (6)..(6)
<223> The 'Xaa' at location 6 stands for Gln, Arg, Pro, or Leu.
<400> 12
Phe Pro Xaa Gln Xaa Xaa Pro Gln Gln His
1 5 10
<210> 13
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 13
Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 14
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 14
Pro Gln Gln Gln Ala Pro Gln Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 15
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 15
Gln Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
Gln Phe Pro Gln Gln Gln Ile Ala Arg
20 25
<210> 16
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 16
Glu Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro Gln
1 5 10
<210> 17
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 17
Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro
1 5 10
<210> 18
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 18
Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe
1 5 10
<210> 19
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 19
Pro Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln Gln
1 5 10
<210> 20
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 20
Phe Pro Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10
<210> 21
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 21
Gln Phe Pro Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln
1 5 10
<210> 22
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 22
Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln
1 5
<210> 23
<211> 24
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 23
Gln Phe Leu Gln Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln
1 5 10 15
His Gln Phe Pro Gln Gln Gln Leu
20
<210> 24
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 24
Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln His Gln Phe
1 5 10
<210> 25
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 25
Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln His Gln
1 5 10
<210> 26
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 26
Phe Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln His
1 5 10
<210> 27
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 27
Gln Phe Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln
1 5 10
<210> 28
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 候选表位
<400> 28
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln
1 5 10
<210> 29
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 29
Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln
1 5
<210> 30
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 30
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Ala Gln Phe Pro
1 5 10 15
<210> 31
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 31
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Glu Phe Pro Gln Ala Gln Gln Phe Pro
1 5 10 15
<210> 32
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 32
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Glu Phe Pro Ala Gln Gln Gln Phe Pro
1 5 10 15
<210> 33
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 33
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Glu Phe Ala Gln Gln Gln Gln Phe Pro
1 5 10 15
<210> 34
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 34
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Ala Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro
1 5 10 15
<210> 35
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 35
Gln Gln Phe Pro Gln Ala Glu Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro
1 5 10 15
<210> 36
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 36
Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Ala His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 37
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 37
Pro Gln Gln Gln Pro Pro Ala Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 38
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 38
Pro Gln Gln Gln Pro Ala Gln Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 39
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 39
Pro Gln Gln Ala Pro Pro Gln Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 40
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 40
Pro Gln Ala Gln Pro Pro Gln Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 41
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 41
Pro Ala Gln Gln Pro Pro Gln Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 42
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequnece)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 修饰的表位
<400> 42
Ala Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10 15
<210> 43
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 已知的表位
<400> 43
Gln Gln Ile Pro Gln Gln Gln
1 5
<210> 44
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 已知的表位
<400> 44
Gln Gln Leu Pro Gln Gln Gln
1 5
<210> 45
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 已知的表位
<400> 45
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln
1 5
<210> 46
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 46
Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln
1 5
<210> 47
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 47
Phe Pro Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln
1 5 10
<210> 48
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 48
Phe Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln
1 5
<210> 49
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 49
Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln His
1 5
<210> 50
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<223> 表位
<400> 50
Phe Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln His
1 5 10
<210> 51
<211> 439
<212> PRT
<213> 普通小麦(Triticum aestivum)
<400> 51
Met Lys Thr Phe Ile Ile Phe Val Leu Leu Ala Met Ala Met Asn Ile
1 5 10 15
Ala Ser Ala Ser Arg Leu Leu Ser Pro Arg Gly Lys Glu Leu His Thr
20 25 30
Pro Gln Glu Gln Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro Gln Pro Gln Gln
35 40 45
Phe Pro Gln Gln Gln Ile Pro Gln Gln His Gln Ile Pro Gln Gln Pro
50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Leu Gln Gln Gln Gln Ile Pro
65 70 75 80
Gln Gln Gln Ile Pro Gln Gln His Gln Ile Pro Gln Gln Pro Gln Gln
85 90 95
Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln His Gln Ser Pro Gln Gln
100 105 110
Gln Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Lys Leu Pro Gln Gln Glu
115 120 125
Phe Pro Gln Gln Gln Ile Ser Gln Gln Pro Gln Gln Leu Pro Gln Gln
130 135 140
Gln Gln Ile Pro Gln Gln Pro Gln Gln Phe Leu Gln Gln Gln Gln Phe
145 150 155 160
Pro Gln Gln Gln Pro Pro Gln Gln His Gln Phe Pro Gln Gln Gln Leu
165 170 175
Pro Gln Gln Gln Gln Ile Pro Gln Gln Gln Gln Ile Pro Gln Gln Pro
180 185 190
Gln Gln Ile Pro Gln Gln Gln Gln Ile Pro Gln Gln Pro Gln Gln Phe
195 200 205
Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro
210 215 220
Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Ile Ala
225 230 235 240
Arg Gln Pro Gln Gln Leu Pro Gln Gln Gln Gln Ile Pro Gln Gln Pro
245 250 255
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Ser Pro Gln
260 265 270
Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Gln Leu Pro
275 280 285
Gln Lys Gln Phe Pro Gln Pro Gln Gln Ile Pro Gln Gln Gln Gln Ile
290 295 300
Pro Gln Gln Pro Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln
305 310 315 320
Gln Phe Pro Gln Gln Gln Glu Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln
325 330 335
Gln Phe His Gln Gln Gln Leu Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln
340 345 350
Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln
355 360 365
Gln Leu Thr Gln Gln Gln Phe Pro Arg Pro Gln Gln Ser Pro Glu Gln
370 375 380
Gln Gln Phe Pro Gln Gln Gln Phe Pro Gln Gln Pro Pro Gln Gln Phe
385 390 395 400
Pro Gln Gln Gln Phe Pro Ile Pro Tyr Pro Pro Gln Gln Ser Glu Glu
405 410 415
Pro Ser Pro Tyr Gln Gln Tyr Pro Gln Gln Gln Pro Ser Gly Ser Asp
420 425 430
Val Ile Ser Ile Ser Gly Leu
435
<210> 52
<211> 1320
<212> DNA
<213> 普通小麦( Triticum aestivum)
<400> 52
atgaagacct tcatcatatt tgtcctcctt gccatggcga tgaacatcgc cagtgccagt 60
aggctgctaa gccctagagg caaggaattg catactccac aagaacaatt cccccaacaa 120
caacaattcc cccaaccaca acaattcccc caacaacaaa tcccccaaca acatcaaatc 180
ccccagcaac cacaacaatt cccccaacaa caacaattcc tccaacaaca acaaatcccg 240
caacaacaaa tcccccaaca acatcaaatc ccccagcaac cacaacaatt cccccagcaa 300
cagcaattcc cccaacaaca ccaatccccc caacaacaat tcccacaaca acaattcccc 360
caacagaaat tgccgcaaca ggaattccca caacaacaaa tctcccagca accacaacaa 420
ctcccccagc aacaacaaat cccccagcaa ccacaacaat ttctccaaca acaacaattc 480
ccccagcaac aaccccccca acaacatcaa tttccccaac agcaattgcc ccaacaacaa 540
caaatccccc aacaacaaca gatcccccag caaccacaac aaatccccca acaacaacaa 600
atcccccagc aaccacaaca attcccccaa caacaattcc cgcaacaaca atttccccaa 660
cagcaattcc cgcaacagga attcccacaa caacaacaat tcccgcaaca acaaatcgcc 720
cggcaaccac aacaactccc ccaacaacaa caaatccccc agcaaccaca acaatttccc 780
caacaacaac aattccccca gcaacaatca ccccaacaac agcaatttcc ccaacaacaa 840
ttcccccaac aacaacaatt accgcaaaaa caattccccc aaccacaaca aataccccaa 900
caacaacaaa tcccccagca accacaacaa ttcccccagc aacaattccc ccaacaacag 960
caatttcccc aacaacaaga attcccccaa cagcaattcc cgcaacaaca attccaccaa 1020
caacaattac cgcaacaaca atttccccaa caacaattcc cccaacagca attcccccaa 1080
caacaacagt tcccccaaca acaacaatta acgcaacaac aattcccccg gccacaacaa 1140
tcccctgaac aacaacaatt cccccaacaa caattccccc agcaaccacc acaacaattc 1200
ccccaacaac aatttccaat accataccca ccccagcaat cagaagaacc ttccccatac 1260
caacaatatc cacaacaaca accatctggg agcgacgtta taagtatcag tggcctatga 1320
Claims (10)
1.一种多肽,其与变态反应患者的IgE抗体特异性结合,由选自由序列号11、12和25组成的组中的至少一个氨基酸序列组成。
2.一种变态反应的诊断试剂盒,其包含权利要求1所述的多肽中的至少一个。
3.一种变态反应的诊断试剂盒,其特征在于,其为针对由对象得到的包含IgE抗体的溶液的诊断试剂盒,
所述诊断试剂盒包含多肽,所述多肽由选自由序列号11、12和25组成的组中的至少一个氨基酸序列组成。
4.一种诊断用组合物,其为变态反应的诊断用组合物,包含权利要求1所述的多肽中的至少一个作为抗原。
5.一种变态反应的诊断用组合物,其特征在于,其为针对由对象得到的包含IgE抗体的溶液的诊断用组合物,
所述诊断用组合物包含多肽,所述多肽由选自由序列号11、12和25组成的组中的至少一个氨基酸序列组成。
6.权利要求1所述的多肽中的至少一个在通过以下方法制备提供用于诊断对象的变态反应的指标的试剂盒中的用途,所述方法包括以下的工序:
(i)使由对象得到的试样与抗原接触,此处该试样是包含IgE抗体的溶液;
(ii)检测由对象得到的试样中的IgE抗体与该抗原的结合;
(iii)在检测出对象的IgE抗体与该抗原的结合时,提供对象为变态反应的指标;
此处该抗原是权利要求1所述的多肽中的至少一个。
7.多肽通过以下方法在制备提供用于诊断对象的变态反应的指标的试剂盒中的用途,所述方法包括以下的工序:
(i)检测由对象得到的包含IgE抗体的溶液中的IgE抗体与多肽的结合,所述多肽由选自由序列号11、12和25组成的组中的至少一个氨基酸序列组成;
(ii)在检测出对象的IgE抗体与该氨基酸序列的结合时,提供对象为变态反应的指标。
8.一种用于判定对象物中有无选自由序列号11、12和25组成的组中的至少一个氨基酸序列的方法,其特征在于,使用检测仪组合物,所述检测仪组合物包含与权利要求1中所述的多肽的至少一个结合的抗体。
9.一种用于判定有无成为对象物变态反应原因的权利要求1所述的多肽的检测仪组合物,其特征在于,其包含引物,所述引物包含编码权利要求1所述的多肽的核酸的一部分碱基序列和/或其一部分互补链。
10.一种用于判定对象物中有无核酸的方法,其特征在于,使用权利要求9所述的检测仪组合物,所述核酸编码选自由序列号11、12和25组成的组中的至少一个氨基酸序列。
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