CN108707654A - 鹧鸪早期性别pcr鉴定试剂盒、应用及方法 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及一种鹧鸪早期性别PCR鉴定试剂盒及应用,以及利用该试剂盒对鹧鸪进行早期性别鉴定的方法。所述试剂盒主要包括PCR扩增引物和PCR反应试剂,所述PCR扩增引物序列如下:上游引物:5'‑GTTACTGATTCGTCTACGAGA‑3'下游引物:5'‑ATTGAAATGATCCAGTGCTTG‑3'。本发明的有益效果主要体现在:本发明提供了通过分子手段对鹧鸪进行早期性别鉴定的途径,与其他方法如翻肛鉴别、腹腔镜检、粪便类固醇检测及核型相比,具有准确性高、操作简便、成本低、对动物伤害小等优点,对推动鹧鸪良种选育和产业化具有十分重要的意义。

Description

鹧鸪早期性别PCR鉴定试剂盒、应用及方法
(一)技术领域
本发明涉及一种鹧鸪早期性别PCR鉴定试剂盒及应用,以及利用该试剂盒对鹧鸪进行早期性别鉴定的方法。
(二)背景技术
鹧鸪(Francolinus pintadeanus)又称石鸡,隶属于鸟纲、鸡形目、雉科、鹧鸪属。目前市场上人工养殖的鹧鸪都是美国鹧鸪,具有生长快,繁殖力强,肉厚骨细,味道鲜美,营养丰富,含脂肪少等特点,且有壮阳补肾、化痰下气等药性作用,被视为珍禽野味。已与鹌鹑、火鸡、鸵鸟一同成为我国特禽养殖生产的重要的组成部分。鹧鸪是一种单态性鸟,其雌雄外貌形态差别甚微,不像家鸡、山鸡等其他禽类从外形上可以区分开。
因此有必要研究一种利用分子手段对鹧鸪进行性别鉴定的方法。
(三)发明内容
本发明目的是提供一种鹧鸪早期性别PCR鉴定试剂盒及应用,以及利用该试剂盒对鹧鸪进行早期性别鉴定的方法,采用分子手段对鹧鸪进行性别鉴定。
本发明采用的技术方案是:
一种鹧鸪早期性别PCR鉴定试剂盒,主要包括PCR扩增引物和PCR反应试剂,所述PCR扩增引物序列如下:
上游引物:5'-GTTACTGATTCGTCTACGAGA-3'
下游引物:5'-ATTGAAATGATCCAGTGCTTG-3'。
本发明试剂盒关键在于引物序列的选定,PCR试剂可采用本领域常规试剂。
本发明利用CHD基因的特异引物对鹧鸪的染色体解螺旋蛋白DNA结合基因基因(chromo-helicase-DNA binding gene,CHD)上的同源序列进行特异性扩增,从而对鹧鸪的性别进行了鉴定,获得了较好的结果。
鸟类的CHD基因位于性染色体Z和W上,其在鹧鸪等鸟类的两条性染色体上内含子的长度不同,导致该基因在两条性染色体上的长度不同,也证明了CHD基因用于雌雄的判定较为准确。因此,根据CHD基因内含子在Z和W染色体上不同,设计出特定的DNA分子扩增引物,扩增该基因的不同长度片段,成为了本发明鹧鸪性别鉴定的理论依据。
本发明还涉及所述试剂盒在鹧鸪早期性别鉴定中的应用。
本发明还涉及利用所述试剂盒对鹧鸪进行早期性别鉴定的方法,所述方法包括:
(1)提取初生鹧鸪羽毛DNA;
(2)以提取获得的DNA为模板,采用PCR扩增引物进行PCR扩增;
所述PCR扩增引物序列如下:
上游引物:5'-GTTACTGATTCGTCTACGAGA-3';
下游引物:5'-ATTGAAATGATCCAGTGCTTG-3';
(3)PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,若仅扩增获得1条566bp的特异性条带,则判断为雄性鹧鸪;若扩增获得566bp和416bp的2条特异性条带,则判断为雌性鹧鸪。
PCR反应程序如下:98℃预变性2min;98℃变性10S,53.1℃退火30S,72℃延伸30S,共30个循环;72℃延伸2min;4℃保存。
本发明的有益效果主要体现在:本发明提供了通过分子手段对鹧鸪进行早期性别鉴定的途径,与其他方法如翻肛鉴别、腹腔镜检、粪便类固醇检测及核型相比,具有准确性高、操作简便、成本低、对动物伤害小等优点,对推动鹧鸪良种选育和产业化具有十分重要的意义。
(四)附图说明
图1为PCR扩增产物电泳图;
图2为解剖验证图。
(五)具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围并不仅限于此:
实施例1:
1材料与方法
1.1样品采集
拔取初生鹧鸪尾部带有毛囊的新生羽毛1~2根;放入2ml离心管,-20℃冷冻保存,用于分子实验鉴别其性别。同时作解剖学辅助鉴定。
1.2羽毛处理
取每羽的1~2根带毛囊的羽毛,用75%乙醇清洗干净,用镊子挤出下根部1~2mm处的羽髓于EP管中,之后按照TIANGEN公司的组织基因组提取试剂盒的步骤提取DNA。
1.3DNA样品浓度测定
分别用超微量紫外分光光度计Nandrop2000和1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测所提取DNA的浓度、纯度及完整性。
1.4引物设计与合成
选择利用以下2对引物分别对鹧鸪性别基因CHD进行特异性扩增,引物序列为:
F:5'-GTTACTGATTCGTCTACGAGA-3',
R:5'-ATTGAAATGATCCAGTGCTTG-3'。
1.6PCR扩增
以所提取鹧鸪羽毛DNA为模板进行PCR扩增。PCR反应体系25uL:模板5uL,上、下游引物各2uL,PCR-Mix 12.5uL,灭菌去离子水3.5uL。PCR反应程序:98℃预变性2min;98℃变性10S,53.1℃退火30S,72℃延伸30S,共30个循环;72℃延伸2min;4℃保存。取2.5uL PCR扩增产物用于1.5%琼脂糖凝胶电泳检测。
1.7性腺观察的形态学鉴定
对未知性别的10只鹧鸪经羽毛DNAPCR检测后解剖作性腺观察的形态学鉴定,依据雄性个体的性腺睾丸雌性个体性腺卵巢为标准判定标准,然后将PCR性别鉴定结果与性腺解剖后观察结果作符合率比较,判定准确率。
2结果
2.1PCR产物电泳结果
利用该组合引物,从未知性别的鹧鸪的基因组DNA样本中扩增出相应的片段,所有雌性个体表现为两条带,所有雄性个体表现为一条带。结果见图1:1、2、3、4、5号是雄性鹧鸪(ZZ),扩增出1条566bp左右的特异性条带;5、6、7、8、9、10号是雌性鹧鸪(ZW),扩增出2条特异性条带,其中1条566bp,另1条416bp,扩增结果与解剖学验证相吻合。解剖结果见图2。
按照上述方法,鉴定了300只鹧鸪,准确率达100%。
序列表
<110> 浙江大学
<120> 鹧鸪早期性别PCR鉴定试剂盒、应用及方法
<160> 2
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 21
<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<400> 1
gttactgatt cgtctacgag a 21
<210> 2
<211> 21
<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<400> 2
attgaaatga tccagtgctt g 21

Claims (4)

1.一种鹧鸪早期性别PCR鉴定试剂盒,主要包括PCR扩增引物和PCR反应试剂,其特征在于,所述PCR扩增引物序列如下:
上游引物:5'-GTTACTGATTCGTCTACGAGA-3'
下游引物:5'-ATTGAAATGATCCAGTGCTTG-3'。
2.权利要求1所述试剂盒在鹧鸪早期性别鉴定中的应用。
3.利用权利要求1所述试剂盒对鹧鸪进行早期性别鉴定的方法,所述方法包括:
(1)提取初生鹧鸪羽毛DNA;
(2)以提取获得的DNA为模板,采用PCR扩增引物进行PCR扩增;
所述PCR扩增引物序列如下:
上游引物:5'-GTTACTGATTCGTCTACGAGA-3';
下游引物:5'-ATTGAAATGATCCAGTGCTTG-3';
(3)PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,若仅扩增获得1条566bp的特异性条带,则判断为雄性鹧鸪;若扩增获得566bp和416bp的2条特异性条带,则判断为雌性鹧鸪。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于PCR反应程序如下:98℃预变性2min;98℃变性10S,53.1℃退火30S,72℃延伸30S,共30个循环;72℃延伸2min;4℃保存。
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Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110616257A (zh) * 2019-09-29 2019-12-27 信阳农林学院 一种无损鉴定单性态禽类早期性别的pcr方法
CN113265455A (zh) * 2021-05-19 2021-08-17 嘉应学院 一种美国鹧鸪性别快速鉴定方法及引物组
CN117535392A (zh) * 2023-11-27 2024-02-09 广州动物园 一种用于鉴定天鹅性别的rpa引物、试剂盒及应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107354219A (zh) * 2017-08-23 2017-11-17 广州长隆集团有限公司香江野生动物世界分公司 一种鉴定企鹅性别的方法及试剂盒
CN108315443A (zh) * 2018-04-03 2018-07-24 辽宁大学 一种准确简便鉴定沼泽山雀性别的引物及鉴定方法

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107354219A (zh) * 2017-08-23 2017-11-17 广州长隆集团有限公司香江野生动物世界分公司 一种鉴定企鹅性别的方法及试剂盒
CN108315443A (zh) * 2018-04-03 2018-07-24 辽宁大学 一种准确简便鉴定沼泽山雀性别的引物及鉴定方法

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110616257A (zh) * 2019-09-29 2019-12-27 信阳农林学院 一种无损鉴定单性态禽类早期性别的pcr方法
CN113265455A (zh) * 2021-05-19 2021-08-17 嘉应学院 一种美国鹧鸪性别快速鉴定方法及引物组
CN117535392A (zh) * 2023-11-27 2024-02-09 广州动物园 一种用于鉴定天鹅性别的rpa引物、试剂盒及应用
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