CN108441555A - 三条环状rna在系统性红斑狼疮生物标志物中的应用 - Google Patents

三条环状rna在系统性红斑狼疮生物标志物中的应用 Download PDF

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Abstract

本发明提供了三条环状RNA在系统性红斑狼疮生物标志物中的应用,其中三条环状RNA分别为circ0082688、circ0082689、circ0054189,碱基序列分别为SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3。与健康对照者全血相比,三条环状RNA在系统性红斑狼疮患者血浆中显著高表达,并证实系统性红斑狼疮患者全血circ0082688、circ0082689、circ0054189表达水平显著高于健康对照者。且本发明制备了筛查三条环状RNA的引物,为研究系统性红斑狼疮的发病机制提供新的思路,也为三条环状RNA的早期诊断提供了新的靶标。

Description

三条环状RNA在系统性红斑狼疮生物标志物中的应用
技术领域
本发明属于天然核糖核苷酸的用途,并且更具体地,涉及三条环状RNA在系统性红斑狼疮生物标志物中的应用。
背景技术
系统性红斑狼疮是一种病因不明的,以免疫性炎症为突出表现的系统性自身免疫病,好发于育龄期妇女。血清中出现以抗核抗体为代表的多种自身抗体和多器官受累是其两个主要临床特征。该病临床表现复杂,病程迁延反复,复发与缓解交替,且此病免疫功能紊乱和发病关键环节等致病机制尚不清楚。SLE患者在全世界范围内不断增长,据我国流行病学的初步统计,目前我国的SLE患者约有86~130万,严重危害人类健康。临床研究证实,早期诊断和适当的治疗可以阻断或延缓疾病的进程,防止SLE患者出现不可逆的组织器官损伤,有效提高患者的生活质量。
目前,SLE的临床诊断主要依据临床表现和实验室检查,尤其是自身抗体的检测。由于SLE可累多人体多个组织和器官,临床表现不一且多不典型,患者就诊的科室也不同,这给临床诊断造成了很大障碍,极易造成漏诊和误诊,因此实验室检查往往成为SLE诊断的重要依据。但现有的所有SLE诊断的特异性实验室检测指标均存在检测敏感性差、不能有效的监测病情和评估预后等不足。因此,寻找敏感、特异的新型诊断标记物对于SLE的早期发现、病情监测和预后评估具有重要的临床意义。
发明内容
本发明的目的是提供一种三条环状RNA在系统性红斑狼疮生物标志物中的应用,三条引物分别为circ0082688、circ0082689、circ0054189。
本发明的另一个目的是提供检测三条环状RNA(即circ0082688、circ0082689、circ0054189)的引物。
本发明利用环状RNA(circRNA)表达谱芯片技术,通过差异分析,筛选到三条在系统性红斑狼疮患者全血中显著高表达的circRNA,即circ0082688、circ0082689、circ0054189,其转录区域分别位于7、7、2号染色体,全长分别为11151bp、3373bp、6204bp,circ0082688的碱基序列如SEQ ID NO.1所示,circ0082689的碱基序列如SEQ ID NO.2所示,circ0054189的碱基序列如SEQ ID NO.3所示。与健康人群全血相比,circ0082688、circ0082689、circ0054189在系统性红斑狼疮患者全血中显著高表达。在大样本荧光定量PCR实验中进一步证实系统性红斑狼疮患者全血circ0082688、circ0082689、circ0054189表达水平显著高于健康对照者和类风湿关节炎患者。circ0082688、circ0082689、circ0054189将为进一步研究系统性红斑狼疮的发病机制提供新的思路,也为系统性红斑狼疮的早期诊断提供了新的靶标。
本发明提供了鉴别可能患有系统性红斑狼疮对象的方法及其引物序列结构。
所述方法包括检测来自所述对象的样品中的circ0082688、circ0082689、circ0054189量,其中较高量的circ0082688、circ0082689、circ0054189与所述对象患有系统性红斑狼疮的概率成正相关关系。
本发明的有益效果有:1)提出了circ0082688、circ0082689、circ0054189的用途;2)circ0082688、circ0082689、circ0054189是一些新型生物标志物,区别于传统生物标志物,不仅稳定、微创、易于检测,且定量精确,将大大提高疾病诊断的敏感性和特异性。circ0082688、circ0082689、circ0054189在系统性红斑狼疮的全血和健康对照者全血中表达量存在差异,因此,circ0082688、circ0082689、circ0054189具有成为系统性红斑狼疮诊断标志物的应用前景。
附图说明
图1为circRNA芯片检测结果图;
图2为使用circ0082688、circ0082689、circ0054189筛查引物对系统性红斑狼疮患者和健康对照者全血样品表达量筛查的结果图;
图3为肺系统性红斑狼疮患者全血样本circ0082688、circ0082689、circ0054189表达量与系统性红斑狼疮病人疾病严重程度相关性图;
图4为ROC曲线分析图。
具体实施方式
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类具有稳定闭合环状结构的内源性RNA分子,在哺乳动物中普遍存在,具有丰度高、结构稳定和组织特异性表达等特征。近年研究表明,circRNA可在转录及转录后水平调控基因表达功能,与多种疾病的发生及发展密切相关。随着circRNA研究的进一步深入,越来越多的证据表明circRNA表达谱会随着疾病进程发生变化。研究已经证实全血中存在着几百种circRNAs,这些circRNA分子性质稳定,含量丰富且不会降解,易于定量检测,并存在着显著的疾病特异性。全血circRNA作为疾病诊断和预后分子标志物不仅创伤小,方法便捷,还能改进疾病诊断,预后估计、疗效及复发预测的准确度。目前已有文献报道,circRNA可以作为癌症诊断标志物,但尚未见有关全血circRNA作为系统性红斑狼疮诊断标志物的报道。
下面结合具体实验步骤对本发明进行进一步描述。
实施例1:系统性红斑狼疮患者与健康对照者全血的circ0082688、circ0082689、circ0054189芯片表达分析
一、对象和方法
1.对象
江西省南昌大学第一附属医院风湿免疫科收治的系统性红斑狼疮患者3例,全为女性。SLE患者均符合美国风湿病学会(ACR)1997年制订的SLE诊断标准,且无合并其它风湿性、代谢性和内分泌疾病。健康对照者3例为同期于南昌大学第一附属医院保健科体检者,排除炎症性疾病,感染性疾病和自身免疫性疾病,年龄与性别比例与病例研究对象相匹配。
2.方法
(1)样本采集:清晨采集研究对象空腹静脉血,EDTA抗凝,取250微升全血加入到750微升TRIzol LS中混匀,-80℃保存备用。
(2)全血总RNA提取:按Qiagen公司的RNA提取试剂盒(RNeasy Micro Kit,货号74004)说明书提取研究对象全血的总RNA。
(3)对样品RNA进行Cy5荧光标记(委托上海康成生物工程有限公司进行“ArrayStar Human CircRNA Microarray V1.0Service”进行标记服务)
(4)circ0082688、circ0082689、circ0054189表达谱分析:根据试剂盒操作步骤,将每个样本的总RNA采用RNase R处理,去除线性RNA分子,然后采用随机引物扩增、反转录为荧光标记的cRNA,然后在芯片上杂交,洗片后,在扫描仪上扫描。提取circRNA芯片原始数据,用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理,寻找2组样本间差异表达的circRNA,通过倍数变化(Fold Change)和P值进行筛选,采用t检验方法,差异circRNA的标准为肺结核组与健康对照组表达比值≥1.5倍且P<0.05。
3.结果
关于系统性红斑狼疮患者全血的circ0082688、circ0082689、circ0054189芯片聚类分析见图1。芯片筛查发现多条表达上调和表达下调的circRNAs。其中circ0082688、circ0082689、circ0054189在系统性红斑狼疮患者全血中表达显著上调,鉴于其可能在系统性红斑狼疮的全血中存在特异性高表达,本申请通过以下实施例采用大规模样本进行验证。
实施例2:实时荧光定量PCR检测circ0082688、circ0082689、circ0054189在系统性红斑狼疮患者全血中的表达
一、对象与方法
1.对象
(1)系统性红斑狼疮组:收集江西省南昌大学第一附属医院风湿免疫科系统性红斑狼疮患者74例,男7例,女67例,平均年龄(40.5±14.5)岁。SLE患者均符合美国风湿病学会(ACR)1997年制订的SLE诊断标准,且无合并其它风湿性、代谢性和内分泌疾病。
(2)健康对照组:收集同期南昌大学第一附属医院进行体检的健康人43例,其中男7例,女36例,平均年龄(43.9±13.0)岁。所有对象均排除炎症性疾病,感染性疾病和自身免疫性疾病;排除孕妇或哺乳期妇女。
2.方法
(1)样本采集:采集研究对象空腹静脉血,EDTA抗凝,取250微升全血加入到750微升TRIzol LS中混匀,-80℃保存备用。
(2)全血总RNA提取及cDNA合成:按Trizol LS试剂说明书提取全血样本总RNA,DEPC处理过的蒸馏水溶解。
1)基因组DNA的去除
依次加入表1中的试剂,并混匀(配置反应液均在冰上操作)。
表1基因组DNA去除所用试剂及剂量
反应条件:42℃,2min。
2)逆转录反应
配置逆转录体系,依次加入表2中的试剂,并混匀(配置反应液均在冰上操作)。
表2逆转录体系所用试剂及剂量
反应条件:37℃,15min;85℃,5sec。
逆转录所得cDNA立即用于实时荧光定量PCR(qRT-PCR)反应或于-80℃保存。
(3)实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证:采用SYBR法进行实时荧光定量PCR检测,检测步骤及反应条件参照试剂盒说明书(Premix Ex TaqTM,大连宝生物TaKaRa公司)进行。
circ0082688上游引物序列:5’-TGCCGTATCGATGGCAATTC-3’;
下游引物序列5’-ATAGCTCAGGTGGTCAACGC-3’。
circ0082689上游引物序列:5’-GTCCCCAAACACTCTTAGCCA-3’;
下游引物序列5’-CACACTCAGGTTGTGTTCGG-3’。
circ0054189上游引物序列:5’-AGCACACAAACTCCCTGACA-3’;
下游引物序列5’-CACCTTCGAGGGAATAGCTG-3’。
内参甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)基因上游引物为:5'-GCACCGTCAAGGCTGAGAAC-3';
下游引物为5'-TGGTGAAGACGCCAGTGGA-3'。
qRT-PCR反应(配置反应液均在冰上操作,每个样本重复3次),所用试剂及剂量见表3。
表3 qRT-PCR反应所用试剂及剂量
加样结束后,将PCR反应板置于ABI 7500PCR扩增仪上检测。
反应条件:95℃30sec(1个循环);95℃5sec(40个循环);60℃30sec。
溶解曲线:95℃15sec;60℃1min;95℃15sec。
取平均Ct值做为该样本最后Ct值,以GAPDH基因作为内参基因,计算2-△△Ct值反映circZFY表达水平。
3.结果
qRT-PCR检测结果显示,系统性红斑狼疮组患者全血circ0082688、circ0082689、circ0054189的表达水平均显著高于健康对照组,差异有统计学意义(P<0.01),见附图2。系统性红斑狼疮患者补体水平降低,降低的程度提示疾病的活动度,相关性分析结果显示,系统性红斑狼疮组患者全血circ0082688的表达水平与补体C3呈负相关,即表达水平越高,患者病情活动度越高(见附图3)。系统性红斑狼疮可累及多个系统,其中血液系统也常常受累,表现为外周血细胞数量的减少,减少的程度,提示疾病病情严重程度,相关性分析结果显示,系统性红斑狼疮组患者全血circ0082688与单核细胞数量呈负相关;系统性红斑狼疮组患者全血circ0082689与白细胞、单核细胞、中性粒细胞数量呈负相关;系统性红斑狼疮组患者全血circ0054189与白细胞、中性粒细胞数量呈负相关(见附图3)。为了评估全血中circ0082688、circ0082689、circ0054189的诊断价值,绘制了系统性红斑狼疮患者区别于健康对照者的ROC曲线,见附图4。曲线下面积(AUC)显示,全血circ0082688+circ0082689+circ0054189在用于区别系统性红斑狼疮和健康人群时,具有较好的诊断价值(AUC=0.774)。最佳临界点的灵敏度为49.30%,特异度为100.00%,以证明circ0082688+circ0082689+circ0054189能特异地作为系统性红斑狼疮患者诊断的分子标志物。
序列表
<110> 南昌大学第一附属医院
<120> 三条环状RNA在系统性红斑狼疮生物标志物中的应用
<141> 2018-05-31
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 11151
<212> DNA
<213> 人类(Homo sapiens)
<400> 1
ctttctattt tgggattgca atatgcctct tcaataagtt ccatgttgtc caaatcctcc 60
catttgcctc tatccaagaa ttgccatcga tacggcaaat ggaaatgaac tctatggcac 120
ttatctgaaa taaaaacata aaggagtaag atagctgggc aatacacagc atgccctagc 180
cttgtggttg tcaacaggtg tggtgctgcc cactgacctg ggaacattct gaaatgtgtg 240
gtggagtctg ttttttcagt gccggcatgc ctgagcattt agatacagaa acactttttg 300
cattttatta tatacattgc tatgatttaa atgtctgtcc cttctaaaac tcttgttaca 360
acttaatcgc caatgtgata gtattgagcg gtaaggcctt taagaggtga ctgggtcata 420
gataaatgga ttaatgggtg tatgggttat catgagagtg gaactggtgg ctttataaga 480
ggaagcgaga cctgagctag catggtcagc ccccttgcca tgtgatgccc tgcagcacct 540
caggactctg cagtccccac cagcaagaag gccctcatca gatgcaggcc cttgacaacc 600
tggacttctc agcctccata taggtaagac ataaattcct tttctttata aattatccag 660
tttcaggtac tctgttataa gcaacaaaat ggactaagac atacatcttc cttctttatg 720
tctcactttt taacaggacc ttactttttt ttttgagaca gggtctcact gtcacccagg 780
ctggggtata gtggcacaat cacggctcac tgcagcctca acctcccagg ctcaggtgat 840
cctcccatct cagcctcctc agtagctggg attacaggtg tgcaccacca cacagctaat 900
ttttgtattt tttgtagaga caaggtttca ccatgttggc caggctagtc tcgaacttct 960
ggcctcaagt gatccaccca tcttggcctc ccaaagtgct gggattacaa gtgtgagcca 1020
ccacacctgg caatttttta gaaatatgta tgttgatggt ttatatcatc tatgaacttt 1080
atttaatgag agtaagaagc tgattatgcg aaggtcaaag gtctcatcac tgcagggggc 1140
agtctgactc ctcaatatca ctctctgtgt ggcaggtgga cgggcagaga tcacagcaaa 1200
gatggagcca gattcatccc taccagaaat ccatcccaac ccaacacgtc caactgaagg 1260
caggtcagca gcatggttac aggctccttg catctcttct ggctaacaac atgctcactc 1320
cttccctgac actctcccac caacatccac acaatggccc agacctatgg gttccggtga 1380
gctgctcccc tcaccaaccc catgttcctc ctgggcagcc agatcctcac ttctctcatc 1440
actccaagca cacgctgcct gccctgtctt tgctggtgcc tgccaccacc gggaacgcca 1500
cccacaccct ctccctacct gtcaacagcc tatgtgaggt tctgctatat ccacacagag 1560
aagtgtcatg agaggacagg gagaaaggag agaaaaagaa tgagaagctc tttgcactgt 1620
gacatgcagc tagctacctc tgagatattt gctctaaggc aggaagatag agaacaaggt 1680
gcagaatgcc tctatttggg taaaaaatag aaaaaaaagt aagtttagac atattctaac 1740
taaacacaca cacatgcaca tattatttct tgcagaggga acctggtaac tggagacaaa 1800
gttataagca aagacttctg tcattttggc atgttttgaa ctttgaacca caagaagata 1860
taatatattc caaaaattat acatctaatt aagtgaaaaa ggtagaaagc catgctagcg 1920
tgcctgtgta aggaaactga acagacacat acccttgtac acgtatacag tctcgatgaa 1980
aggatattca aagaatggat aattatggct gtttcttgga ggggacttga gttctggaga 2040
aaactggtgt gagggcgact tatttcttac tgagtgtcct ttgtacattt ttaatttgta 2100
tttcaaaata ataatgaaac tagctaattt gatacttgaa aaaaattaaa attttctaaa 2160
attgtgtgca ttctttcagg cacatctcaa tgccacttct ttcccaggct ctgcaaaagc 2220
acctggtggg ggaagtccca tggaggaggg tgggagggtg cctgggattg tgtgatcagg 2280
tatggggccg agcagacagg gcagaagaga gtgccaggct gagaggactg agggaacaag 2340
gtggggacac ccaagcaagg aaactcctct aagtgcaaca aggctgaaaa cagccacacc 2400
agggactgaa gatctcctaa cttgtccagt ttgaacatgg acagctcact aggtcaggaa 2460
cctcttgaac tctctcaagc aggtgtgtac acaacagata attaaagggc tgggccagga 2520
aagacaaata gctatggtcc aaggtcacaa ccaaccagtt cctgttccct ccctgaaagg 2580
cattagagga aatgatcagg gatgagagca gaaggccacc ccagggcatc ccagtagtca 2640
aatgctatac ctacaaaccc caggcacagg tgtactatgg acagcctgag acaggatctc 2700
cctgcaaaca ggcacatcct ggggaaggtg cactccttag ggccctccag gctgatgctt 2760
cctcaggaag gacatggggg ccaggggaat gcactataat caaacagcag gcctgaggct 2820
tccgttctga aacaaagctg agctatagac cacactgttc acagctggaa ggtgcccagg 2880
acaggaggca ccaggtaagc cactgcagcc acagcagctg gtgagagcct agtcccagca 2940
cagcggtaga gacataaggt cctttccctt gtcctggtct tcctgtcccc tttctcaact 3000
tcttttcccg ccttctaatg ttccctacct cacgttggca ttccaggggc tttctaggac 3060
gtgagtcata gaaatcaaat caatttggca gacaaaacac cacatccacc ccagcccttc 3120
ctccctatag tccttgaaat aacaggccag agagaataat aaatccaaaa gcactggaaa 3180
acaataaaaa ataccatcaa aagaccagaa ttattcaaga attgctaaaa ctatggagca 3240
atgagaatca aatagatata aaaagaagag agaaaaatgc agacaaaatg tgcagaacat 3300
accacagaag tagaaaagat ctggggtcat cacagattca gagtcagatg aagccaggag 3360
caagaacgat acccaggcca atcccaatga gaacaatggg agcccctggc agaggcactc 3420
ccttccccta acttgcttgt gtgaaggaag cttgctgtgc acttcctagt taaactaagt 3480
gtgaatataa gggttagagc aagagaaaag caaatgagac ggccaccaaa gcccccgtcc 3540
cagtcctagg ctacatgcca gcctcccacc tcaccaagca ggaccttctg cctcttcccc 3600
accatcacta gaatgagggc ctggaatcca aatcagcccc atggaaatca accaacaggt 3660
atacgggatt ctcaagcacc aacgtgacag acaaccaaga gtcgctcaac acatgaagga 3720
aaacaattca aagagaggca gcaactcaca cagaaacagc gatacctaag gacagaatga 3780
tcagagttaa gagaacaagt attcacagct agacttcaac ctaaaagcct agcccctgaa 3840
acttctagga aaacaccata agagaaaaca ttctgtaggc ttagaatagg caaatatttt 3900
taggatacaa aaaacacaaa ccataaaaga aaaaaaatat tatctggaca ccactattaa 3960
aatacctgta cactataaag gaaataaaca tgaaagactg gaaggatata tcttcagtat 4020
aaatcatata caaaacacaa ctcaataaga gatcaaataa cccaataaaa atgggtataa 4080
ctgtcactaa agaccaatac tgtatgattc catttatatg aaatattcaa gcaaatctat 4140
agagatggaa ccttcatctg tagtcatcag gagctggggg gagggaagac tgctaatgaa 4200
gacggggtta ctttgggggt gttgaaaatg ttttcatatt gcctatgatg atggctgccc 4260
aattctgtgt taatattaca tatgtaagtg gacttcaaaa agttcatgga aaacggaatt 4320
aaaagataaa aaatataaac tttatttctc aatataagct ccatcaagtt caggacactt 4380
ttgtaaaaga cgataccagc catttagtcc acccataaag aaccaagggt cctaggaatt 4440
taaccatgtc aatccagtct tttttctaca ttattaactg aagaaaaatg ggtgcccttt 4500
aaagattttt tttctttttt ttttttagac agagtttcac tctgtcgccc aggctggagt 4560
gcagtggcac ggtctcggct caccgcaacc tccacctccc gggttcaagt gactttcctg 4620
cctcatcctc ccaagtagct gtgattacag gtatgtgcca ccacacccag ctaatttttg 4680
tatttttagt agagacaggg tttcaccatg ttggccaggc gggtctcaaa ctcctgacct 4740
caagtgatcc acctgcctcg gcctctcaaa gtgctgagat tacaggcatg agccaccatg 4800
accgacctaa agatttttaa gattagaaaa caaaaagaag tcagaaagag ccaaatcagg 4860
actgtaaagt gaatgcctac agatttccca ttgaaactct tgcaaaattg cccttgattg 4920
atgaggaatg agcagcagcc ttgtggtggt ggagaaggac cctctggtga agctttctgg 4980
gcattttttt gctaaagttt tggctttctc aagacactct catcataagc agatgttatt 5040
gctctttggc cctctagaaa gccaacaagt aaaatgtctt cagcatctca aaaaactgtt 5100
gctgtgactt ctgctcctga tcacttctgc tgtgactggg ccacttcccc cttttaggag 5160
ccattgcttt gtctccagga tcctactggt aaagccatgt tccatctcct gttacaactc 5220
ttcagagaaa tgcttcagga tcttgatacc acttgtttaa aatttccatt caaagttctg 5280
ctcttgtctg cagctgatcc aggcagaatg gttttggcac tcatagagtg gaaagtttgc 5340
tcaaatttaa tttttaattt ttctggcaga ctgtataaac tgaactaatc aagatgtctg 5400
gtgtcagtta ctgtttgtgc tgttaatcac tggtcttcaa ttaaggaaca aacaacatta 5460
attttttttc tcacaaattg atgtgcatag ctccatcttt aacattctct catcccttct 5520
taaaatgact tactcattta taaactgatt tctttgggac attgtcctca taaacttttt 5580
tgtaaagcat caatgatttt gtcattctgc cacccaagag tcaccattaa tttgatattt 5640
gttcttgctt caactgcagc aaaattcatg ttgctttgat aggggctctt tccaaattga 5700
tgtcttatcc ttcttagtgc ctcaaactag atcctcttca gatatgttat tacaagttag 5760
tatgaattta ttttggtgca aaacttttga actccatgca taattttttc ataatatgca 5820
ttttccacaa actttctgaa gacccctttt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt 5880
gtgtgtaaag ctgttatata aaaaataggc aaaagatttg agtagatact tcacagaaaa 5940
tatacagatg ccccaaaagt acatgtaaat aaaagttaaa catcattaat catcagggaa 6000
atgcaaatta aaaccacgag acatcatcac tcactgatta gaatggctaa aacttaaaag 6060
acaatgccaa gtgttagcaa gaatatacaa taactgaaac tctcacacgt tgctggtggg 6120
aacataaaat attattatct attttggaag acagtttggc agtttcttac aaagtcaatc 6180
acatgacata acccagtaac tatgtctgtc ttttacccaa gagaaatgga aacatatatc 6240
cacatgaaaa cttatacata aatatttata gaagttgtat ttgtaaaagc caaaaactgg 6300
caacaaccca aatgttcatc aacatatgaa tggataaaca aattgcagtc aatcatgcaa 6360
tggaatacta ctgtgcaata aaaagaaaca aatgattgat atgccagcat gactgaatct 6420
caaaaacatg ctgatgagag aagccaggca caagataata cactgtatga ttccatgtat 6480
gtgaaattct agaaaaggca aatctaatct atagtgacaa aaagtagatc aggggtttcc 6540
tgggcgtgac aaactagggg gtgaggatta attataaagg agcataaaac aatgtttttg 6600
gagggggttc catatcttga tggtagagat ggttacatga gcatatatac ttatcaaaac 6660
tcagtataca tttaaaatgg tacactttag cttgtgtaaa ctatagctca gtaatattgc 6720
tttcagaata cacatatata tgtgtgtgta tatatatata gctcatattc cttgacctat 6780
cattccattc cccagaatct atctatggaa atactcacat atatgtactt caatgctcaa 6840
tggaacatca ttataatcaa ctactacaca cttgttttta aaatgaggtg gactttcaca 6900
tactgacatg gaaaaaaaat ctccaagata caatgttaag atgcagattg aataataaca 6960
ttatcacatg ctcctatctg tttaaaaaca tataaaacaa atatcacaac cacacgggaa 7020
gtgtttacct ttgggcaaag acgatggagg acttcatgct tcactctgta ttactgaact 7080
gttttacaga gtgaaagtat tcattaattg cttgggtaat ttttaaaaac tgaaaatgaa 7140
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tcaaagccca ggacagcatt taagaagaaa acaaaggttt agtgaaaata cagacaggca 7260
catgcacacc agaattgctg cttctgataa aaaagagatc actggattgt tcactggatc 7320
aatacagaaa aaaaacccca atttaaacaa ctactcatcc tccaagagct aacacaagtg 7380
tttccttcgc agtgaggtcc tttccagttt ctaagggagc tctcagccta tcatcaccct 7440
tatctttgtt cccaccaggc tgagcagttc cctgtcctgt gcaggtctgt gacctcatgc 7500
taagctgacc aaggctcaat acttgacact catttggtgc atgaaccagt tatgttccca 7560
aaaatgatcc acatttaatt tctgaaaact caaagaattg ctaccatctt caactcccca 7620
acaaaatacc ttcagaattg gtttggccaa agtgccaagc cctgatcctc tccggatggg 7680
gtagaggttt ggtagggggt gacttcagag cacagctctg ggaatgacaa gcagttaccc 7740
ctcccacaag tggaatgaag gagcctcttc caacttacct tgaaagctac aacttttccg 7800
gatatggtac aaacagatct gatcaccctc ctcctggcta agagtgtttg gggacacaga 7860
acctgaactg tcttttcttt ctgcaaagaa acaccacaaa gatatgtcag cttctgatat 7920
ggggtataaa agagagttaa agaggattca ttcagttctc tgcacaaaag tgggcaacgc 7980
aagctcacaa agccctatcg tgtttggggt gaaagtgctc ctacacaggt ggatcctcta 8040
ctttttagtg acaggctggc agcctgacgc cacatggctg cttgccagat ccaggactcc 8100
atgaagggga ctcctttctc aactctcgct gtccattcaa ttcactagga gacccattta 8160
aaaacacaag tgcctgattc tgccctagac tgacttcact ccagactgac tgaatcagaa 8220
cctccagggg tgggacttgg gacacttttg taataagggg agaaccattg tcttacatgt 8280
tgaggcatct tacaattcct tctatgccta aggttgtgat gacccctgag ggcaaacaga 8340
gggctaattt tataaactag atttgaagct atatagcaaa cattcattaa tgaactatca 8400
gaattgggta ctaataccaa gacaagagta ataaaaagaa agtccacatt tcaaaatgaa 8460
gcccctttaa ttaattttag gttaattatc aggatcttaa tataaaaagg gcacataaat 8520
cctttctatt ttacctttac tagcaccatg ccaatgagtc tttacctatg acatttaccc 8580
tcacccagct aaccccaatg agcacataaa attaatttgc aatccctatt tagtgtcacc 8640
tgtcgttatt catcttccct tttcttttta taagcccctg agatacttca ctcaaaatct 8700
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gctgacatca ctggcagtgg atccctcctc cctttctgac aaggctataa tccaactgta 8820
ttcaaggctg taagatactc ctaaagatct atttaataca aaacctgtct acttctagga 8880
ttcctacaac tgaaagaaat caacaaaaca taattgaaga caatgtaaag aaaaaacaaa 8940
ttcaaaagac aacttttaaa tataaaagtc aggtacaatt agagtggtgc ttttgtttgc 9000
aggtagtcct ggcatgcaac tgacattcta ggaagtgctc tattaaaatt gtagccacca 9060
ctacagctga gagggtttga ttctgctctg aggggaggca tgtctcagct tcgccaagga 9120
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tgcttattaa ataaaaatct ctgttcaaaa tctgcctgtc actaaacctg acagtctttt 9360
ttaaaaaata agtatcctag cacactcatt cattcaacaa atgtcagagt acctactgtg 9420
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agcattccta actttgggtt cctccctgaa gagcatgctc tcgtgggggt gaagataggg 9660
gtgactgcac agggggagga gccaagtctc ccatttcagt gcagactagg cccatccaga 9720
attcactcac catcaatacc aattcacatt tgtctaggat ggcatgcttg atcaagtcta 9780
tgatttcaac ttatcctcac ccccgcactc cctgccttgt taggaaagca tcatcaactc 9840
cattttacta aaagcagcac cagacttgcc caaagtcaca cattccatgt aatggctagc 9900
tggaatccgg gaacccccag cccaggacct cccgtgctcc ccaccagcct taccactccc 9960
caccagcctt accagaagtc ccctgtggga caaaaagagg aggcactctg ctgggggcag 10020
agctcttatt cttgatgtca tgtgcatttc tataaatggt aggcagcctg ctcaccaggt 10080
ctgagctcat acccaacttc tccaattttt ccagattctc agaattagag aaatcatggg 10140
atctcttaca gctagtgcca aacttgcatt ccccctgtaa aaaatactgg cagatatgga 10200
gcttgatgca ctgcttttga aaggcacaag agccgtgggg tccatctcct ttgttgtaat 10260
gttggcaaat ctgttgacag agagggaaaa aaccaccagt tcaggaaggt ctcacacgac 10320
accacctccc cagtggccag tccactggtg agaaaggggc ttcacaagct gtgattccat 10380
catccacaca gaacacagct attacatccc tcactctaga tgacggctgc taacaaatgc 10440
ccttggctaa aaggggaacg aaatggaaag gagactgcac agaatcagcc cctccactgg 10500
gaaaatccaa gaacttcaaa gtgactagag ctgctccttt cacatgagac aatgcaaatc 10560
aaatggctac atcctaagga cctctacaat ctacctatac tcttcccaca ctgactcatc 10620
aactctccct tccccaagcc ccagttttct ctgagctctc ttttctacaa ttcaaagtca 10680
aagaggctct gagggcttaa agcatcttag agaaggccaa ataccaccct ttcatttctc 10740
aatggagcac actgagaggc tcagagaagt taaagaatca gccctagtcg cacagctatc 10800
catggcatct gtgtgatgtt tgtggaactg ggttgttggc aaagctggcc cttgaacttc 10860
actgctcctt ctgctccaca ttccaaattt ctgcaggtgg aaaccagacc agagatcacc 10920
aagggcccac ccattccact cccagtcatt acatttccca agacacagga atgtccccag 10980
ggagctgtgg aacccagact tcccctggca ctcacttctg gcaaaagcca ggggtcgttc 11040
tgaaacaaga gttggcatag ctcattatag ctcaggtggt caacgccatg agttctcagc 11100
acactcaggt tgtgttcggt tgtcaagctg tgactattcc tacagttctt c 11151
<210> 2
<211> 3373
<212> DNA
<213> 人类(Homo sapiens)
<400> 2
cttgaaagct acaacttttc cggatatggt acaaacagat ctgatcaccc tcctcctggc 60
taagagtgtt tggggacaca gaacctgaac tgtcttttct ttctgcaaag aaacaccaca 120
aagatatgtc agcttctgat atggggtata aaagagagtt aaagaggatt cattcagttc 180
tctgcacaaa agtgggcaac gcaagctcac aaagccctat cgtgtttggg gtgaaagtgc 240
tcctacacag gtggatcctc tactttttag tgacaggctg gcagcctgac gccacatggc 300
tgcttgccag atccaggact ccatgaaggg gactcctttc tcaactctcg ctgtccattc 360
aattcactag gagacccatt taaaaacaca agtgcctgat tctgccctag actgacttca 420
ctccagactg actgaatcag aacctccagg ggtgggactt gggacacttt tgtaataagg 480
ggagaaccat tgtcttacat gttgaggcat cttacaattc cttctatgcc taaggttgtg 540
atgacccctg agggcaaaca gagggctaat tttataaact agatttgaag ctatatagca 600
aacattcatt aatgaactat cagaattggg tactaatacc aagacaagag taataaaaag 660
aaagtccaca tttcaaaatg aagccccttt aattaatttt aggttaatta tcaggatctt 720
aatataaaaa gggcacataa atcctttcta ttttaccttt actagcacca tgccaatgag 780
tctttaccta tgacatttac cctcacccag ctaaccccaa tgagcacata aaattaattt 840
gcaatcccta tttagtgtca cctgtcgtta ttcatcttcc cttttctttt tataagcccc 900
tgagatactt cactcaaaat ctaggtctat gggaccccga aggtcatctc cctctctccc 960
gacgatggtg actgctcttg cagctgacat cactggcagt ggatccctcc tccctttctg 1020
acaaggctat aatccaactg tattcaaggc tgtaagatac tcctaaagat ctatttaata 1080
caaaacctgt ctacttctag gattcctaca actgaaagaa atcaacaaaa cataattgaa 1140
gacaatgtaa agaaaaaaca aattcaaaag acaactttta aatataaaag tcaggtacaa 1200
ttagagtggt gcttttgttt gcaggtagtc ctggcatgca actgacattc taggaagtgc 1260
tctattaaaa ttgtagccac cactacagct gagagggttt gattctgctc tgaggggagg 1320
catgtctcag cttcgccaag gaataaccag cacccaagac agcgcccagc atgtggcaag 1380
cacacaaagg tgctgaatga aagagtgggt aacagaatgg ccagccaatg gctgatactg 1440
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cccacaagag gtactcaaga aatgcttatt aaataaaaat ctctgttcaa aatctgcctg 1560
tcactaaacc tgacagtctt ttttaaaaaa taagtatcct agcacactca ttcattcaac 1620
aaatgtcaga gtacctactg tgggccaggc actgtctagg tgctggagat gagcagggaa 1680
caaagcaaat ttacaatggc tcaaaaactc tacttattga tgtcaggaat acagccaatg 1740
ccataattaa ggtatgcttc tttcactcat tttgtaaaat cagaatacaa cacaaggaat 1800
gctccccaga gctgtgcagc acagcattcc taactttggg ttcctccctg aagagcatgc 1860
tctcgtgggg gtgaagatag gggtgactgc acagggggag gagccaagtc tcccatttca 1920
gtgcagacta ggcccatcca gaattcactc accatcaata ccaattcaca tttgtctagg 1980
atggcatgct tgatcaagtc tatgatttca acttatcctc acccccgcac tccctgcctt 2040
gttaggaaag catcatcaac tccattttac taaaagcagc accagacttg cccaaagtca 2100
cacattccat gtaatggcta gctggaatcc gggaaccccc agcccaggac ctcccgtgct 2160
ccccaccagc cttaccactc cccaccagcc ttaccagaag tcccctgtgg gacaaaaaga 2220
ggaggcactc tgctgggggc agagctctta ttcttgatgt catgtgcatt tctataaatg 2280
gtaggcagcc tgctcaccag gtctgagctc atacccaact tctccaattt ttccagattc 2340
tcagaattag agaaatcatg ggatctctta cagctagtgc caaacttgca ttccccctgt 2400
aaaaaatact ggcagatatg gagcttgatg cactgctttt gaaaggcaca agagccgtgg 2460
ggtccatctc ctttgttgta atgttggcaa atctgttgac agagagggaa aaaaccacca 2520
gttcaggaag gtctcacacg acaccacctc cccagtggcc agtccactgg tgagaaaggg 2580
gcttcacaag ctgtgattcc atcatccaca cagaacacag ctattacatc cctcactcta 2640
gatgacggct gctaacaaat gcccttggct aaaaggggaa cgaaatggaa aggagactgc 2700
acagaatcag cccctccact gggaaaatcc aagaacttca aagtgactag agctgctcct 2760
ttcacatgag acaatgcaaa tcaaatggct acatcctaag gacctctaca atctacctat 2820
actcttccca cactgactca tcaactctcc cttccccaag ccccagtttt ctctgagctc 2880
tcttttctac aattcaaagt caaagaggct ctgagggctt aaagcatctt agagaaggcc 2940
aaataccacc ctttcatttc tcaatggagc acactgagag gctcagagaa gttaaagaat 3000
cagccctagt cgcacagcta tccatggcat ctgtgtgatg tttgtggaac tgggttgttg 3060
gcaaagctgg cccttgaact tcactgctcc ttctgctcca cattccaaat ttctgcaggt 3120
ggaaaccaga ccagagatca ccaagggccc acccattcca ctcccagtca ttacatttcc 3180
caagacacag gaatgtcccc agggagctgt ggaacccaga cttcccctgg cactcacttc 3240
tggcaaaagc caggggtcgt tctgaaacaa gagttggcat agctcattat agctcaggtg 3300
gtcaacgcca tgagttctca gcacactcag gttgtgttcg gttgtcaagc tgtgactatt 3360
cctacagttc ttc 3373
<210> 3
<211> 6204
<212> DNA
<213> 人类(Homo sapiens)
<400> 3
cttggcagta ttctgtcagg gagtttgtgt gctggaatag caacaggtaa cttttgcatt 60
tgtcttgcat aatcaaaaag ccctggtaaa ttatgggaat aaagctgaga agctttacct 120
ataaagaaaa acagatatga cataaaagct aataataaat agtaacaatt gtaaggtatt 180
taaaaactaa tatacttacc agatattgat agcaagcaat tgttcattac atacaaccat 240
gtacaccttc gagggaatag ctgattaaaa aaaggcacaa agtttacaaa gaataataca 300
taatggcaat gtaaatctgt acacagtaat cacgtaagct gtcttatcta caggtcagtt 360
ctttaaaagt aaattatttt taacataaat taactttatc aaggattcaa accaagatga 420
tatatataca tacatattta tgtgagagaa aaaataaatt aggctaaatt ttagcctaaa 480
cacgatatga tcagctcaag tctcccttat gattaagggc tatgtaaccc caaactatgc 540
agggaataac aacattttca aacaacatct attcctttat tttggttctg gggttgaata 600
agattctcct ctctactcct cccaaaatag acgtatctag gcacaatatg cattctaggg 660
tgtatgatac aggaaaaagc atcatggtgt agtggaacac aggatacaga aacactaggt 720
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tatatatata tatgaaattt attactaaaa tttagtacca taagaactga gaggcatctc 840
tggaagcctg aaagtggtca caacttagag caaagaaaaa ggaatttcat ggaacacaat 900
ctatatattt aaaaaaaaat actctcatta agacatttcg ttatgcgtat cagtggtttt 960
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cttggacctc accccagatc tactgaagca agaagttctg aaggaggacc caggaatcta 1080
tggtttaact aggcctccaa gtaattctga ggcagactga agtttgagag ccactgatgt 1140
acataattag acatcctgat ttaacaacct ttgttgctgg gtttgctctg gcaattccta 1200
caactaagtt actccaaaac taattgagat gagagaatgg aatagagagg acccaggggt 1260
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atgggactga ataactaaaa gagaaaaggt aataataaaa gggaggagaa acaaagtaac 1380
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tctccaaaca actaaaatgt ggcattgcca atacagtttt ttaatttgta aaatgtgcct 1500
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aaaaattcac aacaaaattg ggacttcatt ggctatactg aaaaaatcag gtagagaagg 1620
ggcaatgact tattccagac cacatatcag tacgtgttat caaagtagca agatacagat 1680
ttttatttaa ttcagtgttg aactgggttt tcatacacat atccactaaa aaagtatctg 1740
atactacatc gatggtttac tataaaatta tatacttcca aatgtaagta ggtttgctta 1800
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ctggagtgca gtggcgcgat ctccgctcac tgcaagctcc gcctcccagg ttcacgccct 2040
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ctagattttc aatgctttct tcctttagtg agttaggttc taggtgaaat gatcagttta 2340
ataaataaga atataacagt taagaagggt agcttctata ttctgcctag actcatatat 2400
ctgttttatc aatgattgtg tgatcttggg taatttactg aatctctgtc tcagtgttct 2460
tatctgtaaa acagaatacc tgtatctcat agagctgaat agtaattaaa caagatactc 2520
cttgtaaagc acttagaaga gtgctgagta ctgaataaat gttagctata aataataaaa 2580
gcagataaaa aactttaaat caggaccctg attagtgtca tcttctcact tttcagaatc 2640
ttcccctatt tagtaggctc acgccaccct gtttcctata aagtctagag aaaatcaacc 2700
taatcatcaa tttcacagta agatgaaaaa ttcaggctcc acatatacta attctttact 2760
cttataggct ccctctagga gggaaaaatg tttcctttga agggcaatgt ttcaaaaaaa 2820
attactctag taatgtaatt caaatgctaa agcaactaag aagggaagtt attgcagact 2880
ggggctaggt gtggttgatg ggtgccttct ctcaagagtc ctggccaggc ctggtgactc 2940
acacctgtaa tcccagcact gggtgggtaa ggcagaagga ctgctggagc ccagaagttt 3000
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gggcattgtg gcatgtggct gtagtcccag ctactgagaa cgctgaggtg ggtcacttga 3120
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accaatatta tttttggata tctcattata cccaataaaa atatgaccac ctttgaatta 3360
tttactaatt attataatta caagatcctt ttcctccctt tccctgttct taggcacttt 3420
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aggatcttgc tagaaaattt gatttaaaaa atgaagatga aactgtttag tcatgaataa 3540
atcattactt atatattttt ctttccattt tatttgtaat caatttattt ttatttttat 3600
tttgttttga gatggagtct cactccgttg cccaggctgg agtgcagtgg cgtgatctcg 3660
gctcactgca acctccgcct cccgggttta agtgattctc ctgtctcagc ctcctgagta 3720
gctgggacta cagctgcaca tgaccatgct tggctaattt ttgtattttt aatagggacg 3780
gggtttcacc ttatttgtta ggctggtgtc gaactcctga cctcaggtga ccacccacct 3840
cggcctccca aagtgctggg attacaggca tgagccacca cggccggcct tgtaatcgat 3900
ttatattgat aaaagaatta gtcacacatc ccgaaggcac cccaaactca gtatgaccaa 3960
attgaaagca ttaccattct cttcaaatca acacatcctt cagtatacta tactccatct 4020
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ctgaattgta ccctttaagt gggtgaactg tatgatatgt gaattatatc tcgataaaac 4740
tgtttttgaa aaatatcttt tcccctctgt tctctacctt tgccctgaat taacactctt 4800
ttaccatttg accatggttt ctagtctcat ctctcaccgt actgcaaaca gatatttcta 4860
aaacacaggt ctgttccatc agcatagtac accaagctct ggtgtttggc ttctgcctgc 4920
ctacccagct ccatctattg ttaccattct gtactccagt caaatgccca gtcattgttc 4980
ccaaacttgc catgctattt cacatctcta tgccatcatg cttatcctgt ctgtgtgaca 5040
aacttctatt catcataatt taaggtccat ctcaaatgcc tctactcatc tccccacagg 5100
aggtgctggt gacatccacc tctgtggcca atatcttata ctcattccta atatgacatc 5160
taatcctgag tgctgtagtt actggtttat acacctgttt tccctattag atcatgagct 5220
tctcaagggt atggactagt cctgttaacc tgtcttcagt atctggtaat tagaacatgc 5280
tccagaaggt tttttttttg aggtggagtt tcacttttgt tgcccaggct ggagtgcaat 5340
ggcgtaatct cggctcactg taacctcctc ctcccgggtt caagtgactc tcctgtctca 5400
gccttcgaag cagttgggat tataggcaca ggccaccatg cccagctaat ttttatattt 5460
tttagtagag acagggtttc accatgttgg ccaggctggt ctcgaactcc tgacctcagg 5520
tgatctgcct gccttggcct cacaaagtgc tgggattaca ggcgtgagcc accatgctcg 5580
gcgtcatgag gattttaaga ataaaagacg ctggggtggg gtggctcata tctataatcc 5640
cagcacttga ggccaggagt tccagaccag catgggcaac atggtgaaac cctatctcta 5700
ctaaaaacac aaaaattagc caggcatggt ggctcatgtc tataatccca gcacactggg 5760
aggccgaggc gggcagatca cctgaggtca ggagttcaag accagcctgg ccaacatggt 5820
gaaaccctgt ctctactaaa aacacaaaaa ttggctgggc gtggtggtgc gtgcctctac 5880
tcccagctac ttgggaggct gaggcatgag aattgcttga aactggttgc agtgagccga 5940
gatcacacca ctgcactgca gcctgggcaa caagagtgag acttggtctc aaaaaacaaa 6000
acaaaacaaa acaaaaaaga ataaaagagg cagcaagtca tgaaactgaa ccttatttct 6060
ggtctaatgt gtacttatgg taacttaaaa attaaaaaaa aaaagaatat acaaaataac 6120
atacctgttc cattgatgtt tcatgaagtt cattaagatt gagggtataa atcccttctt 6180
cggcaccaaa tatcaagtac tgat 6204

Claims (10)

1.三条环状RNA在系统性红斑狼疮生物标志物中的应用,其特征在于,三条环状RNA分别为circ0082688、circ0082689、circ0054189,所述circ0082688的碱基序列如SEQ IDNO.1所示,所述circ0082689的碱基序列如SEQ ID NO.2所示,所述circ0054189的碱基序列如SEQ ID NO.3所示。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述circ0082688长11151bp,位于人类的第7条染色体上,所述circ0082689长3373bp,位于人类的第7条染色体上,所述circ0054189长6204bp,位于人类的第2条染色体上。
3.如权利要求1或2所述的应用,其特征在于,包括检测被检测对象的样品中的circ0082688、circ0082689、circ0054189含量,其中所述circ0082688、circ0082689、circ0054189的量与所述被检测对象患有系统性红斑狼疮的概率成正相关关系。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述circ0082688、circ0082689、circ0054189的含量是从被检测对象的全血样品中确定的。
5.一种引物,其特征在于,所述引物用于获得被检测对象的全血的circ0082688的表达量,所述circ0082688长11151bp,位于人类的第7条染色体上,所述circ0082688的碱基序列如SEQ ID NO.1所示。
6.如权利要求5所述的引物,其特征在于,所述引物由以下序列构成:
上游引物序列:5’-TGCCGTATCGATGGCAATTC-3’;
下游引物序列:5’-ATAGCTCAGGTGGTCAACGC-3’。
7.一种引物,其特征在于,所述引物用于获得被检测对象的全血的circ0082689的表达量,所述circ0082689长3373bp,位于人类的第7条染色体上,所述circ0082689的碱基序列如SEQ ID NO.2所示。
8.如权利要求7所述的引物,其特征在于,所述引物由以下序列构成:
上游引物序列:5’-GTCCCCAAACACTCTTAGCCA-3’;
下游引物序列:5’-CACACTCAGGTTGTGTTCGG-3’。
9.一种引物,其特征在于,所述引物用于获得被检测对象的全血的circ0054189的表达量,所述circ0054189长6204bp,位于人类的第2条染色体上,所述circ0054189的碱基序列如SEQ ID NO.3所示。
10.如权利要求9所述的引物,其特征在于,所述引物由以下序列构成:上游引物序列:5’-AGCACACAAACTCCCTGACA-3’;下游引物序列:5’-CACCTTCGAGGGAATAGCTG-3’。
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