CN108085400B

CN108085400B - 白来航鸡红羽致因突变基因型的鉴定及专用标记

Info

Publication number: CN108085400B
Application number: CN201711484211.7A
Authority: CN
Inventors: 杨宁; 李光奇; 吴桂琴; 孙从佼; 孙皓; 石凤英
Original assignee: HUADU YUKOU FOWLS INDUSTRY Co Ltd; China Agricultural University
Current assignee: HUADU YUKOU FOWLS INDUSTRY Co Ltd; China Agricultural University
Priority date: 2017-12-29
Filing date: 2017-12-29
Publication date: 2019-09-10
Anticipated expiration: 2037-12-29
Also published as: CN108085400A

Abstract

本发明公开了白来航鸡红羽致因突变及其标记与检测方法。本发明提供了检测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型的物质在鉴定待测白来航鸡与洛岛红公鸡的杂交后代羽毛颜色性状中的应用；红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位。本发明的实验证明，本发明发现一个SNP位点，通过该SNP位点可以实现红羽致因突变基因型鉴定，利用该方法，成功鉴别白来航品系鸡红羽致因突变基因型。利用该鉴别方法，方便快捷，可以快速培育红羽致因突变纯合型新品系，从而应用到生产100%红羽表型的红羽粉壳蛋鸡新配套系培育，节省培育成本和时间，增加品种效益。

Description

白来航鸡红羽致因突变基因型的鉴定及专用标记

技术领域

本发明属于基因检测领域，尤其涉及白来航鸡红羽致因突变基因型的鉴定及专用标记。

背景技术

白来航鸡是世界上著名的蛋用型品种，广泛应用于新配套系的培育，在家禽育种工作中具有重大贡献。白来航蛋鸡全身羽毛为白色，属于显性白羽。前人研究表明，白来航鸡PMEL17 基因第10 外显子上的9 bp 插入突变是显性白羽性状形成的主要原因，所对应的等位基因为I（Kerje S, Sharma P U, Kim H, et al. The Dominant white, Dun andSmoky color variants in chicken are associated with insertion/deletionpolymorphisms in the PMEL17 gene.[J]. Genetics, 2004, 168(3):1507-1518.）。显性等位基因I 会抑制黑色素合成，因此，白来航鸡与其他有色羽鸡杂交时，显性白基因I会抑制其他色素基因表达，从而使携带该基因的个体全身羽毛呈现白色。

在生产上发现，白来航品系中部分鸡只与洛岛红等公鸡杂交时后代母鸡表现为红羽，推测此部分白来航鸡羽色基因存在突变，可以抑制显性白基因I的作用，当其与洛岛红等有色羽公鸡杂交时，后代母鸡有色羽基因得以显现，表现为红色。因此，定位该白来航群体中与红羽相关的致因突变位点，进而利用分子标记辅助选择技术对该突变位点基因型进行鉴定、筛选和纯化，通过建系扩群，培育出红羽致因突变纯合型的白来航新品系，用于培育满足市场需求的红羽新品种配套系是十分必要的。

鸡羽色受多基因调控，多个与红色羽色相关的基因或者突变已经被定位，影响真黑色素和褐黑色素相对分布的E扩展基因座编码的MC1R基因（melanocortin 1-receptor）第 33 位（C/Y）和第 244 位（L/P）的突变导致鸡全身一致的红-黄羽色（Takeuchi S，Suzuki H，Yabuuchi M，et al，Molecular cloning and sequence analysis of chickmelanocortin-1receptor gene[J].Biochim Biophys Acta，1996，1306（2-3）：122-126）。SOX10（SRY (sex determiningregion Y)-box 10）基因上游14 kb处8.3 kb的缺失可以导致鸡深褐色羽表型（Gunnarsson U, Kerje S, Bed'Hom B, et al. The Dark brownplumage color in chickens is caused by an 8.3-kb deletion upstream of SOX10.[J]. Pigment Cell & Melanoma Research, 2011, 24(2):268–274）。然而，这些突变位点均不能在北京市华都峪口禽业有限责任公司白来航品系中检测出来，说明该白来航群体存在其他突变位点与红羽相关。

白来航鸡携带与红羽相关的基因突变位点，但是并不表现出红羽表型，只能通过与洛岛红等有色羽公鸡杂交推测该母鸡是否携带红羽致因突变，而公鸡只能根据其全同胞母鸡的推测结果进行推测。这种传统方法不能准确区分红羽致因突变纯合型和杂合型个体。

发明内容

本发明的第一个目的是提供检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型(红羽SNP位点的基因型)的物质的用途。

本发明提供的检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型的物质在鉴定待测白来航鸡红羽致因突变基因型中的应用；

或检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型的物质（在制备鉴定待测白来航鸡红羽致因突变基因型产品中的应用；

或检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型的物质在鉴定待测白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡红羽性状中的应用；

所述红羽致因突变位点（红羽SNP位点）为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位。

本发明还提供了检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型的物质在选育红羽致因突变纯合基因型或红羽致因突变杂合基因型的白来航鸡中的应用；

或检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型的物质在选育杂交后代母鸡为红羽的白来航鸡中的应用。

上述应用中，所述红羽致因突变基因型为AA、GG或AG；

或所述红羽致因突变基因型为红羽致因突变纯合基因型或红羽致因突变杂合基因型；

或所述红羽致因突变位点为序列1第380位。

上述应用中，所述检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型的物质如下1）或2）：

1）为成套引物，所述成套引物由序列表中序列2所示的单链DNA分子和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成；

2）含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒。

本发明的第二个目的是提供一种检测待测白来航鸡红羽致因突变基因型的方法。

本发明提供的方法，为检测待测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型为AA、GG或AG，

若所述待测白来航鸡基因组DNA中红羽致因突变基因型为GG，则所述待测白来航为红羽致因突变纯合基因型；

若待测白来航母鸡基因组DNA中红羽致因突变基因型为AA，则所述待测白来航为非红羽致因突变基因型；

若待测白来航母鸡基因组DNA中红羽致因突变基因型为AG，则所述待测白来航为红羽致因突变杂合基因型。

或，本发明还提供了一种鉴定待测白来航的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡红羽性状的方法，为检测待测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG，

若所述待测白来航鸡基因组DNA中红羽SNP位点的基因型为GG，则所述待测白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为红羽性状；

若待测白来航母鸡基因组DNA中红羽SNP位点的基因型为AA，则所述待测白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡为红羽性状和非红羽性状；

若待测白来航母鸡基因组DNA中红羽SNP位点的基因型为AG，则所述待测白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为非红羽性状。

本发明的第三个目的是提供一种选育红羽致因突变纯合基因型的白来航鸡的方法。

本发明提供的方法，为检测待测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型为AA、GG或AG，选择基因型为GG的白来航鸡进行选育，得到目的白来航鸡。

或本发明还提供一种选育红羽致因突变纯合型白来航鸡纯系的方法，包括如下步骤：将所述基因型为GG的白来航鸡母鸡和基因型为GG的白来航鸡公鸡扩繁（例如，经过四个世代的选育），得到红羽致因突变纯合型白来航鸡纯系。

本发明的第四个目的是提供一种选育杂交后代母鸡为红羽的待测白来航鸡的方法。

本发明提供的方法，为检测待测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型为AA、GG或AG，选择基因型为GG的白来航鸡进行纯繁，得到目的白来航鸡。

上述方法中，

所述检测待测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型为AA还是GG还是AG的方法为如下A）或B）：

A）直接测序，分析测序结果中的红羽致因突变基因型为AA还是GG还是AG；

B）用由序列表中序列2所示的单链DNA分子和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成的所述成套引物对待测白来航鸡基因组DNA进行PCR扩增，对所述PCR扩增产物进行测序，分析测序结果中的红羽致因突变基因型为AA还是GG还是AG。

本发明的第五个目的是提供一种鉴定待测白来航鸡红羽致因突变基因型的物质或选育红羽致因突变纯合基因型的白来航鸡的物质或选育杂交后代母鸡为红羽的白来航鸡的物质。

本发明提供的鉴定待测白来航鸡红羽致因突变基因型的物质或选育红羽致因突变纯合基因型的白来航鸡的物质或选育杂交后代母鸡为红羽的白来航鸡的物质，为上述应用中的所述检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型的物质。

上述中，

所述待测白来航鸡为母鸡或公鸡；

或，所述杂交后代为所述待测白来航鸡的母鸡与洛岛红鸡杂交的后代；

或所述杂交后代为所述待测白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交的后代；

或所述杂交后代为所述待测白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中的母鸡。

红羽致因突变纯合型为待测白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡均为红羽。

红羽致因突变杂合型为待测白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡为红羽和非红羽并存。

上述待测白来航鸡为北京市华都峪口禽业有限责任公司白来航品系。

通过北京市华都峪口禽业有限责任公司白来航品系母鸡与洛岛红公鸡杂交，根据杂交后代羽色表型筛选出携带红羽致因突变的个体和不携带红羽致因突变的个体，利用全基因组重测序技术对携带红羽致因突变的个体和不携带红羽致因突变的个体进行测序分析，比较两组个体基因组序列，定位红羽致因突变位点，并根据突变位点的位置信息进行引物设计，通过不同的个体进行检测、验证。

本发明的实验证明，本发明发现一个SNP位点，通过该SNP位点可以实现红羽致因突变基因型鉴定，利用该方法，成功鉴别白来航品系公母鸡红羽致因突变基因型，鉴定准确率达到100%；解决了无法用传统测交方法判断公鸡红羽致因突变基因型的问题，提高了公鸡使用价值。利用该鉴别方法，方便快捷，可以快速培育红羽致因突变纯合型新品系，从而应用到生产100%红羽表型的红羽粉壳蛋鸡新配套系培育，节省培育成本和时间，增加品种效益。

具体实施方式

下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。

下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。

下述实施例中鸡翅静脉采血和酚仿法均为本领域的常规操作。

红羽为全身羽毛红色。

实施例1、白来航鸡红羽致因突变的发现及其扩增引物的制备与方法的建立

一、白来航鸡红羽致因突变的发现

1、提取待测鸡的基因组DNA

利用2000只北京市华都峪口禽业有限责任公司白来航品系母鸡与洛岛红公鸡杂交，统计杂交后代羽色表型，选取后代母鸡数大于5只且100%为红羽的白来航母鸡9只作为红羽组，选取后代母鸡数大于5只且100%为白羽的白来航母鸡9只作为白羽组；该两组作为待测鸡。

对待测鸡进行鸡翅静脉采血，用抗凝剂进行抗凝处理后经裂解、蛋白酶消化处理，然后采用酚仿法提取基因组DNA，以灭菌双蒸水溶解后备用，得到红羽组各只鸡基因组DNA和白羽组各只鸡基因组DNA。

2、重测序

对红羽组各只鸡基因组DNA和白羽组各只鸡基因组DNA采用Illumina HiSeq 4000测序仪进行重测序。

对重测序数据进行数据分析，具体分析步骤为：

1）利用NGS QC Toolkit对原始reads进行质量控制，剔除质量较低和含有接头或者引物的reads。

2）利用Burrows Wheeler Aligner(BWA)软件将质控后的reads比对到galGal4参考基因组上。

3）利用Picard软件标记并删除PCR重复。

4）利用SAMtools工具将每个个体的两个DNA文库的比对结果进行统计，组成这个个体的最终比对结果。

5）利用GATK软件从测序数据中进行SNP calling，根据SNP多态性进行固定指数分析（Fst），确定两组之间的显著差异区间。

6）对显著差异区间内的SNP进行验证，确定该白来航品系红羽致因突变SNP分子标记，以下简称红羽SNP。

该红羽SNP位点为NCBI（Gallus_gallus-4.0版本序列信息）中公布的鸡参考基因组11号染色体正义链第18,288,303位脱氧核苷酸，也为序列1第380位；且该红羽SNP位点的核苷酸为A或G；该红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG。

该红羽SNP位点在常染色体。

二、白来航鸡红羽致因突变的扩增引物的设计合成

根据上述一发现的红羽SNP位置信息设计引物，由深圳华大基因科技服务有限公司进行合成，其中：

正向引物F：5'- CAGTGAGGGCAACCAGAG -3'（序列2）

反向引物R：5'- CGGAAGGCATAGATCAGG -3'（序列3）

三、用白来航鸡红羽SNP位点鉴定待测白来航鸡红羽致因突变基因型的方法建立

1、提取待测白来航母鸡的基因组DNA（上述一红羽组和白羽组）

2、PCR扩增

以上述1得到的待测白来航鸡的基因组DNA为模板，用上述二设计的正向引物F和反向引物R进行PCR扩增，得到PCR扩增产物（序列1）。

上述20μL PCR扩增体系如下：

2×PCR Mix

（北京全式金生物技术有限公司

，AS111-03） 10μL；

ddH₂O 7.7μL；

正向引物F 0.4μL；

反向引物R 0.4μL；

DNA模板 1.5μL 。

上述PCR反应程序如下：

① 94℃ 5min

② 94℃ 30sec

③ 52.5℃ 30sec

④ 72℃ 30sec

⑤ Goto ② for 32 cycles

⑥ 72℃ 10min

⑦ 4℃保存

3、测序及分析

将上述PCR产物进行DNA Sanger测序，序列为序列1。

结果如下：红羽组9个白来航母鸡基因组中红羽SNP位点的基因型均为GG，其为红羽致因突变纯合型个体，即红羽组9个白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡100%为红羽；

白羽组9个白来航母鸡基因组中红羽SNP位点的基因型均为AA，其不携带红羽致因突变，即白羽组9个白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡100%为非红羽。

因此，可以用该红羽SNP位点的基因型判断待测白来航母鸡的红羽致因突变基因型，具体方法如下：

提取待测白来航鸡的基因组DNA，直接测序获得红羽SNP位点的基因型，或用如下方法获得红羽SNP位点的基因型：

用上述二的正向引物F和反向引物R进行PCR扩增，测序PCR扩增产物，分析PCR扩增产物中的红羽SNP位点的基因型；

若待测白来航鸡基因组中的红羽SNP位点的基因型为GG，则该待测白来航鸡为红羽致因突变纯合型个体；

若待测白来航鸡基因组DNA中红羽SNP位点的基因型为AA，则该待测白来航鸡为非红羽致因突变个体；

若待测白来航鸡基因组DNA中红羽SNP位点的基因型为AG，则待测白来航鸡为红羽致因突变杂合型个体。

红羽致因突变基因型为红羽致因突变纯合型或红羽致因突变杂合型：

上述红羽致因突变纯合型为基因组中红羽SNP位点的基因型为GG，该红羽致因突变纯合型白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为红羽性状；

上述红羽致因突变杂合型为基因组中红羽SNP位点的基因型为AG，该红羽致因突变杂合型白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡为红羽性状和非红羽性状。

上述非红羽致因突变基因型为基因组中红羽SNP位点的基因型为AA，该非红羽致因突变型白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为非红羽性状。

因此，可以通过检测白来航鸡的红羽SNP位点的基因型判断，该白来航鸡的母鸡与红羽公鸡杂交后代母鸡的红羽性状：

若白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型为GG，则该白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为红羽性状；

若白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型为AG，则该白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡为红羽性状和非红羽性状。

若白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型为AA，则该白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为非红羽性状。

由于红羽SNP位点位于常染色体，因此，GG型和GA型白来航母鸡的全同胞公鸡也可以用上述方法进行红羽致因突变基因型判定。

实施例2、用白来航鸡红羽SNP位点鉴定待测白来航鸡红羽致因突变基因型

一、用白来航鸡红羽SNP位点鉴定待测白来航母鸡红羽致因突变基因型

1、提取基因组DNA

提取1573只待测白来航母鸡的基因组DNA。

2、PCR扩增

分别以1573只待测白来航母鸡的基因组DNA作为模板，用实施例1中上述三的方法进行PCR扩增，得到各个待测鸡的PCR扩增产物。

3、测序及分析

将上述各个待测鸡的PCR扩增产物进行DNA Sanger测序分析，该PCR的测序结果为序列1，根据序列1第380位的位点，即红羽SNP位点的基因型进行如下判断：

若待测白来航母鸡基因组中的红羽SNP位点的基因型为GG，则该待测白来航母鸡为红羽致因突变纯合型个体；

若待测白来航母鸡基因组DNA中红羽SNP位点的基因型为AA，则该待测白来航母鸡为非红羽致因突变型个体；

若待测白来航母鸡基因组DNA中红羽SNP位点的基因型为AG，则待测白来航母鸡为红羽致因突变杂合型个体。

结果如下：

1573只待测白来航母鸡中962只红羽SNP位点的基因型为GG，判断这些母鸡为红羽致因突变纯合型个体，则该白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为红羽性状；

1573只待测白来航母鸡中19只红羽SNP位点的基因型为AA，判断这些母鸡为非红羽致因突变型个体，则该白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为非红羽性状；

1573只待测白来航母鸡中592只红羽SNP位点的基因型为AG，判断这些母鸡为红羽致因突变杂合型个体，则该白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡为红羽性状和非红羽性状。

实验验证：

将上述SNP鉴定中962只红羽致因突变纯合型母鸡个体与洛岛红公鸡杂交，检测其杂交后代，得到3620只母鸡，其中红羽的为3620只。

将上述SNP鉴定中592只红羽致因突变杂合型母鸡个体与洛岛红公鸡杂交，检测其杂交后代，得到2557只母鸡，其中红羽的为1182只，非红羽的1075只。

将上述SNP鉴定中19只非红羽致因突变型母鸡个体与洛岛红公鸡杂交，检测其杂交后代，得到61只母鸡，其中红羽的为0只，非红羽的61只。

从上述杂交结果可以看出，与本发明的SNP位点鉴定结果一致，因此，可以看出，红羽SNP位点可以用来鉴定待测白来航鸡的红羽致因突变基因型，为培育后代红羽品种提供依据。

二、用白来航鸡红羽SNP位点鉴定待测白来航公鸡红羽致因突变基因型及应用

由于红羽SNP位点位于常染色体，因此，GG型和GA型白来航母鸡的全同胞公鸡也可以用上述一的方法进行红羽致因突变基因型判定，选留GG型白来航公鸡。

将GG型白来航公鸡与所有GG型白来航母鸡个体进行扩繁和选育，经过四个世代的选育后得到红羽致因突变纯合型白来航鸡纯系，红羽SNP位点的基因型为GG型。

序列表

<110> 北京市华都峪口禽业有限责任公司

<120> 白来航鸡红羽致因突变基因型的鉴定及专用标记

<160> 3

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 846

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223>

<400> 1

cagtgagggc aaccagagca acgccacggc cggggccgga ggtgcctggt gccaggggct 60

ggacatcccc aatgagctct tcctgacgct ggggctggtg agcctggtgg agaacctgct 120

ggtggtggcc gccatcctca agaacaggaa tctgcactcg cccatgtact acttcatctg 180

ctgcctggcc gtctccgaca tgctggtgag cgtcagcaac ctggccgaga cgctcttcat 240

gctgctgatg gagcacggcg tgctggtgat ccgcgccagc atcgtccgcc acatggacaa 300

tgtcatcgac atgctcatct gcagctccgt cgtgtcctcc ctctccttcc tgggggtcat 360

cgccgtggac cgctacatca ccatcttcta tgcgctgcgc taccacagca tcatgacgct 420

gcagcgcgcc gtggtcacca tggccagcgt ctggctggcc agcaccgtct ccagcaccgt 480

cttaatcacc tactaccgca acaacgccat cctgctctgc ctcattggct tcttcctctt 540

catgctggtc ctcatgctgg tgctctacat tcacatgttc gcgctggcgt gccaccacgt 600

gcgcagcatc tccagccagc agaagcagcc caccatctac cgcaccagca gcctgaaggg 660

agccgtcacg ctcaccatcc tgctgggagt cttcttcatc tgctgggggc ccttcttctt 720

ccacctcatc ctcatcgtca cctgccccac caaccccttc tgcacctgct tcttcagcta 780

tttcaacctc ttcctcatcc tcatcatctg caattcagtg gtcgatcccc tgatctatgc 840

cttccg 846

<210> 2

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223>

<400> 2

cagtgagggc aaccagag 18

<210> 3

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223>

<400> 3

cggaaggcat agatcagg 18

Claims

1.检测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型的物质在鉴定白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡为红羽的白来航鸡基因型中的应用，所述红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位，所述红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG。

2.检测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型的物质在制备鉴定白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡为红羽的白来航鸡基因型的产品中的应用，所述红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位，所述红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG。

3.检测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型的物质在鉴定待测白来航的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡红羽性状中的应用，所述红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位，所述红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG。

4.检测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型的物质在选育白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡为红羽的白来航鸡纯系中的应用，所述红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位，所述红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG。

5.根据权利要求1-4任一所述的应用，其特征在于：

所述检测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型的物质如下1)或2)：

1)为成套引物，所述成套引物由序列表中序列2所示的单链DNA分子和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成；

2)含有成套引物的PCR试剂或试剂盒，所述成套引物由序列表中序列2所示的单链DNA分子和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成。

6.一种鉴定待测白来航的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡红羽性状的方法，为检测待测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG，

若待测白来航母鸡基因组DNA中红羽SNP位点的基因型为AG，则所述待测白来航鸡的母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡仅为非红羽性状，

所述红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位。

7.一种选育白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡为红羽的突变纯合基因型的白来航鸡的方法，为检测待测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG，选择基因型为GG的白来航鸡进行选育，得到目的白来航鸡，所述红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位。

8.一种选育白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代中母鸡为红羽的突变纯合型白来航鸡纯系的方法，包括如下步骤：将所述基因型为GG的白来航鸡母鸡和基因型为GG的白来航鸡公鸡扩繁，得到目的白来航鸡纯系，所述红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位。

9.一种选育白来航母鸡与洛岛红公鸡杂交后代母鸡为红羽的待测白来航鸡的方法，为检测待测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型为AA、GG或AG，选择基因型为GG的白来航鸡，得到目的白来航鸡，所述红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位。

10.根据权利要求7-9任一所述的方法，其特征在于：

所述检测待测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型为AA还是GG还是AG的方法为如下A)或B)：

A)直接测序，分析测序结果中的红羽SNP位点的基因型为AA还是GG还是AG；

B)用权利要求5中的所述成套引物对待测白来航鸡基因组DNA进行PCR扩增产物，对所述PCR扩增产物进行测序，分析测序结果中的红羽SNP位点的基因型为AA还是GG还是AG。