CN108048597A - 与水稻抗旱相关的snp分子标记及其应用 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及生物分子标记领域，具体公开了与水稻抗旱相关的SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记来自LOC_Os03g20680基因，该SNP分子标记位于水稻第3染色体11,700,160bp位置，碱基为T或A。所述SNP分子标记与水稻干旱胁迫条件下的株高显著相关，位点基因型为A/A的水稻品种在干旱胁迫导致的株高降低的程度显著低于位点基因型为T/T的水稻品种，即位点基因型为A/A的水稻品种的抗旱性显著的优于即位点基因型为T/T的水稻品种。同时依据此SNP位点设计了PCR引物，引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。利用本发明的SNP分子标记可用于水稻抗旱育种，加速水稻抗旱新种质的创制和水稻抗旱分子育种的进程。

Description

与水稻抗旱相关的SNP分子标记及其应用
技术领域
本发明涉及生物分子标记领域，具体地说，涉及与水稻抗旱相关的SNP分子标记及其应用。
背景技术
水稻是世界上最重要的三大粮食作物之一，是世界2/3人口的主要食物来源。随着人口与经济的快速增长，粮食生产面临着巨大的发展压力，而水稻安全生产对于中国的可持续发展至关重要。近年来，我国气候变化异常，极端天气频发，其中干旱胁迫已成为威胁水稻生产的重要障碍因素之一，对我国水稻生产带来了严重威胁。如何有效解决水稻生产用水需求与干旱缺水之间日益尖锐的矛盾是我国粮食安全面临的最严峻挑战。生产实践证明，培育和种植节水抗旱水稻品种是减少干旱损失最经济有效的措施。发掘水稻抗旱性状相关基因，开发与抗旱性状紧密相关的分子标记，通过分子标记辅助选择利用新基因或与已知优良基因进行聚合对于培育抗旱水稻品种具有重要意义。
关联分析(Association analysis)是以连锁不平衡为基础，利用群体在自然选择和人工选择中发生的重组和遗传多样性来鉴定目标性状的功能位点或功能基因的方法，又可称为连锁不平衡分析(LD mapping)。与传统的双亲连锁分析相比，关联分析具有花费时间短、精度准和效率高的优点。能够发掘同一QTL位点在群体中所有的等位基因型，极大提高了功能基因在育种改良中的实用价值。随着高通量测序技术的发展，全基因组关联分析(GWAS)已经成为重要农艺性状相关特别是多基因控制的数量性状QTL/基因鉴定的重要方法。
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)主要是指由于单个核苷酸的变异而引起基因组水平上的DNA序列多态性，包括单碱基的转换、颠换、缺失和插入等形式。SNP在水稻基因组中的分布相当广泛，随着高通量测序技术的进步，SNP已经成为了新一代的分子标记。根据SNP在基因组中分布的位置可以分为基因编码区SNP(cSNP)、基因间SNP(iSNP)和基因周边SNP(pSNP)，其中cSNP(功能标记)是根据功能基因内部引起表型性状变异的多态性基序开发出来的一种新型分子标记。由于来自基因内的功能性基序，此类标记不需要进一步验证就可以在不同的遗传背景下或者不同的水稻种质资源中确定目标等位基因的有无。
发明内容
为了解决现有技术中存在的问题，本发明的目的是提供一种与水稻抗旱相关的SNP分子标记及其应用。
为了实现本发明目的，本发明的技术方案如下：
第一方面，本发明提供一种与水稻抗旱相关的SNP分子标记，所述分子标记来自LOC_Os03g20680基因，位于水稻第3染色体11,700,160bp位置，碱基为T或A。研究发现，干旱胁迫对碱基为A的水稻品种株高的影响显著低于碱基为T的水稻品种。
进一步地，所述SNP分子标记及其两端的侧翼序列组成的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示，所述SNP分子标记在SEQ ID NO.1所示核苷酸序列的第421bp处存在T/A突变。
进一步地，本发明提供用于检测所述SNP分子标记的特异性引物，其特征在于，包括：
正向引物：5’-ATGGCGTCGAGGCAGGACA-3’；
反向引物：5’-TTGTCGGTGGCGTCGTCGT-3’。
需要说明的是，含有所述特异性引物的试剂或试剂盒也属于本发明的保护范围。
第二方面，本发明提供了所述SNP分子标记在鉴定水稻抗旱性水平中的应用，包括以下步骤：
1)提取待测水稻样品的基因组DNA；
2)以待测水稻样品的基因组DNA为模板，利用前述特异性引物进行PCR扩增反应，获得扩增产物片段；
3)检测PCR扩增产物片段的第421bp处的碱基种类，判断样品的抗旱性水平，位点基因型为A/A的水稻品种的抗旱性显著优于位点基因型为T/T的水稻品种。
进一步地，步骤2)中PCR反应使用的扩增体系以20μL计为：
PCR反应的条件为：
①95℃预变性2分钟；
②98℃变性10秒，53℃退火15秒，68℃延伸30秒，共33个循环；
③68℃保温5分钟。
进一步地，本发明还提供了所述SNP分子标记在水稻抗旱性状1改良及分子育种中的应用。
本发明的有益效果在于：
利用本发明所提供的SNP分子标记能够对水稻的抗旱性进行评价，该SNP位点与水稻的抗旱性(株高)显著相关。该SNP位点可以作为功能性分子标记，筛选抗旱性强的水稻资源和品种，在水稻抗旱分子育种中发挥重要作用。
附图说明
图1为本发明的SNP分子标记引物对在部分种质资源中基因组DNA的扩增结果。
具体实施方式
下面结合实施例对本发明做进一步的解释说明。需要理解的是以下实施例的给出仅是为了起到说明的目的，并不是用于对本发明的范围进行限制。本领域的技术人员在不背离本发明的宗旨和精神的情况下，可以对本发明进行各种修改和替换。
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。
实施例1与水稻干旱胁迫条件下株高调控基因紧密连锁的SNP分子标记的获得与鉴定
一、与水稻干旱胁迫条件下株高调控基因紧密连锁的SNP分子标记的获得
1、从本课题组已深度测序的3000份全球水稻核心种质资源(3K RGP.The 3,000Rice Genome Project[J].GigaScience,2014,3:7)中，根据生育期、基因型、地理来源和水稻类型等特点，并结合其他农艺性状如株高、结实率等来筛选具有丰富遗传变异的水稻材料582份作为试验材料，其中包括籼稻372份、粳稻172份、Aro 16份、Aus14份以及Admixed 8份。
2、2015年12月将全部材料种植在海南三亚中国农业科学院作物科学研究所南繁基地，考察582份种质资源在正常灌溉和干旱胁迫条件(移栽后35-40天左右开始断水-幼穗分化初期)下株高等性状。根据株高(PH)数据计算得出同一材料在干旱胁迫(D)条件下株高与正常灌溉条件下(C)株高的比值[＝PH(D)/PH(C)]，以株高的比值来评价干旱胁迫对水稻生长的影响，同时利用株高比值来进行全基因组关联分析(GWAS)。
3、通过全基因组关联分析发掘一个与水稻株高干旱胁迫和对照比值显著相关的SNP位点，该SNP位点位于第3号染色体上的11,700,160bp位置。该SNP位于基因LOC_Os03g20680的编码区，该基因编码一个晚期胚胎富集蛋白，作为一个非生物胁迫诱导基因，在水稻对盐和干旱的耐受方面起重要作用。当该SNP为A时，编码苏氨酸(Thr)，株高比值较高，即干旱胁迫对株高的抑制较小，具有较强的抗旱性，当该SNP为T是，编码丝氨酸(Ser)，株高比值都相对较低，即干旱胁迫对株高的抑制较大，抗旱性较差。
4、针对此SNP位点设计了引物，如表1所示。
表1引物序列
引物名称 引物序列(5’-3’)
正向引物 ATGGCGTCGAGGCAGGACA
反向引物 TTGTCGGTGGCGTCGTCGT
检测与水稻干旱胁迫条件下株高调控基因紧密连锁的SNP分子标记(第3号染色体上的11,700,160bp位置)基因型的方法：提取水稻基因组DNA，以基因组DNA为模板，采用正向引物和反向引物进行PCR扩展，PCR反应产物用1％的琼脂糖凝胶进行检测(图1)。将PCR扩展产物进行测序，检测与水稻干旱胁迫条件下株高调控基因紧密连锁的SNP分子标记位点基因型为T/T还是A/A。
其中，PCR反应体系为：
PCR反应程序为：
①95℃预变性2分钟；
②98℃变性10秒，53℃退火15秒，68℃延伸30秒，共33个循环；
③68℃保温5分钟。
实施例2水稻种质资源在干旱胁迫和正常灌溉条件下株高的测定
本实施例从种质资源中随机选取92份水稻种质资源为材料，与2016年12月将全部材料种植在海南三亚中国农业科学院作物科学研究所南繁基地，考察92份种质资源在正常灌溉和干旱胁迫条件(移栽后35-40天左右开始断水-幼穗分化初期)下株高等性状。根据株高(PH)数据计算得出同一材料在干旱胁迫(D)条件下株高与正常灌溉条件下(C)株高的比值[＝PH(D)/PH(C)]。
表2 92份水稻种质资源株高数据及SNP基因型统计
实施例3与水稻干旱胁迫条件下株高调控基因紧密连锁的SNP分子标记的应用
待测样本为：实施例2表2中的水稻材料。
提取待测水稻的基因组DNA，按照实施例1中所述的方法检测待测水稻基因组DNA中与水稻干旱胁迫条件下株高调控基因紧密连锁的SNP分子标记，即第3染色体11,700,160bp位置的基因型。测序结果表明(表2)，92个水稻材料中有65个材料在该SNP位点的基因型为T/T，27个材料在该SNP位点的基因型为A/A，同时发现该SNP位点基因型为T/T的材料的平均株高比值(干旱胁迫/正常灌溉)为0.774，基因型为A/A的材料的平均株高比值为0.946，该SNP位点基因型为A/A的水稻材料的抗旱性(干旱胁迫对株高的生长抑制较小)显著的强于基因型为T/T的水稻品种。通过该SNP分子标记对92份水稻种质资源进行检测，发现该标记能够明确的鉴定出哪些种质资源的株高受干旱胁迫的抑制较小，哪些种质资源的株高受干旱胁迫的抑制较大，该SNP位点可以作为功能性分子标记，筛选抗旱性较强的水稻资源和品种，在水稻抗旱分子育种中发挥重要作用。
应当理解的是，对上述实施例所用试剂或原料的用量进行等比例扩大或者缩小后的技术方案，与上述实施例的实质相同。
虽然，上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述，但在本发明基础上，可以对之作一些修改或改进，这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此，在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进，均属于本发明要求保护的范围。
序列表
<110> 中国农业科学院作物科学研究所
中国农业科学院深圳生物育种创新研究院
<120> 与水稻抗旱相关的SNP分子标记及其应用
<141> 2018-01-15
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 758
<212> DNA
<213> 水稻(Oryza sativa)
<400> 1
atggcgtcga ggcaggacag gagggaggcg cgggccgagg ccgacgcgcg gcgcgcggcg 60
gaggagatcg cgcgggcgcg ggacgagcgc gtcatgcagg cggaggtgga cgcccggtcg 120
gccgcggacg agatcgcccg cgcccgcgcc gaccgcggcg ccgccacgat gggcgccgac 180
accgcccacc acgccgccgg cggcggcggc atcctggaga gcgtgcagga gggcgccaag 240
tcgttcgtga gcgccgtcgg gcgcacgttc ggcggcgcga gggacaccgc cgcggagaag 300
acctcccaga cggcggacgc cacccgggac aagctcggcg agtacaagga ctacaccgcc 360
gacaaggccc gcgagaccaa cgacagcgtc gcgcggaaga cgaacgagac ggcggacgcc 420
tcccgtgaca agctcggcga gtacaaggac tacaccgccg acaagacccg ggagaccaag 480
gacgccgtgg cgcagaaggc gagcgacgcc tccgaggcga ccaagaacaa gctgggcgag 540
tacaaggacg cgctggccag gaagacgcgc gacgccaagg acaccaccgc gcagaaggcg 600
acggagttca aggacggcgt gaaggcgacg gcgcaggaga cgagggacgc caccgccgac 660
acggcgagga aggccaagga cgccaccaag gacaccaccc agaccgccgc cgacaaggcc 720
agggagacgg ccgccaccca cgacgacgcc accgacaa 758
<210> 2
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artioposthia triangulata)
<400> 2
atggcgtcga ggcaggaca 19
<210> 3
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artioposthia triangulata)
<400> 3
ttgtcggtgg cgtcgtcgt 19

Claims (10)

1.与水稻抗旱相关的SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记来自LOC_Os03g20680基因，位于水稻第3染色体11,700,160bp位置，碱基为T或A。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记及其两端的侧翼序列组成的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述SNP分子标记在SEQ ID NO.1所示核苷酸序列的第421bp处存在T/A突变。
3.用于检测权利要求1或2所述SNP分子标记的特异性引物，其特征在于，包括：
正向引物：5’-ATGGCGTCGAGGCAGGACA-3’；
反向引物：5’-TTGTCGGTGGCGTCGTCGT-3’。
4.含有权利要求3所述特异性引物的试剂。
5.含有权利要求3所述特异性引物的试剂盒。
6.权利要求5所述的试剂盒在辅助鉴定水稻抗旱性方面的应用。
7.权利要求1或2所述的SNP分子标记在鉴定水稻抗旱性水平中的应用，包括以下步骤：
1)提取待测水稻样品的基因组DNA；
2)以待测水稻样品的基因组DNA为模板，利用权利要求3所述的特异性引物进行PCR扩增反应，获得扩增产物片段；
3)检测PCR扩增产物片段的第421bp处的碱基种类，判断样品的抗旱性水平，位点基因型为A/A的水稻品种的抗旱性显著优于位点基因型为T/T的水稻品种。
8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，步骤2)中PCR反应使用的扩增体系以20μL计为：
9.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，步骤2)中PCR反应的条件为：
①95℃预变性2分钟；
②98℃变性10秒，53℃退火15秒，68℃延伸30秒，共33个循环；
③68℃保温5分钟。
10.权利要求1或2所述的SNP分子标记在水稻抗旱性状改良及分子育种中的应用。
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Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110229812A (zh) * 2019-06-10 2019-09-13 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组T/C SNP标记与应用
CN110229811A (zh) * 2019-06-10 2019-09-13 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组TT/CG SNP标记与应用
CN110684860A (zh) * 2019-06-10 2020-01-14 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组T/G SNP标记与应用
CN110684859A (zh) * 2019-06-10 2020-01-14 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组C/T SNP标记与应用
CN114752573A (zh) * 2022-06-14 2022-07-15 中国农业科学院作物科学研究所 水稻OsGA20ox2蛋白及其编码基因在提高植物抗非生物胁迫中的用途

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1624133A (zh) * 2004-10-28 2005-06-08 华中农业大学 利用水稻干旱诱导基因启动子leap改良植物抗旱性
CN103421104A (zh) * 2012-05-25 2013-12-04 中国科学院上海生命科学研究院 OsLEA3-2提高作物抗逆性的应用
CN103710354A (zh) * 2013-10-31 2014-04-09 河南农业大学 一种旱稻抗旱基因、功能标记及应用
CN106701958A (zh) * 2017-01-13 2017-05-24 云南大学 一种水稻抗旱基因的分子标记及其应用

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1624133A (zh) * 2004-10-28 2005-06-08 华中农业大学 利用水稻干旱诱导基因启动子leap改良植物抗旱性
CN103421104A (zh) * 2012-05-25 2013-12-04 中国科学院上海生命科学研究院 OsLEA3-2提高作物抗逆性的应用
CN103710354A (zh) * 2013-10-31 2014-04-09 河南农业大学 一种旱稻抗旱基因、功能标记及应用
CN106701958A (zh) * 2017-01-13 2017-05-24 云南大学 一种水稻抗旱基因的分子标记及其应用

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
JIANLI DUAN, WEIMING CAI: "OsLEA3-2, an Abiotic Stress Induced Gene of Rice Plays a Key Role in Salt and Drought Tolerance", 《PLOS ONE》 *
SAKAI,H.: "ACCESSION NO. AP014959 REGION: 11699823..11700580，Oryza sativa Japonica Group DNA, chromosome 3, cultivar: Nipponbare, complete sequence", 《GENBANK》 *
郑天清等: "水稻功能基因组育种数据库(RFGB):3K水稻SNP与InDel子数据库", 《科学通报》 *

Cited By (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110229812A (zh) * 2019-06-10 2019-09-13 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组T/C SNP标记与应用
CN110229811A (zh) * 2019-06-10 2019-09-13 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组TT/CG SNP标记与应用
CN110684860A (zh) * 2019-06-10 2020-01-14 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组T/G SNP标记与应用
CN110684859A (zh) * 2019-06-10 2020-01-14 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组C/T SNP标记与应用
CN110229812B (zh) * 2019-06-10 2022-02-22 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组T/C SNP标记与应用
CN110684859B (zh) * 2019-06-10 2022-02-22 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组C/T SNP标记与应用
CN110229811B (zh) * 2019-06-10 2022-03-04 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组TT/CG SNP标记与应用
CN110684860B (zh) * 2019-06-10 2022-03-04 山东省农业科学院作物研究所 TaNCED1基因B基因组T/G SNP标记与应用
CN114752573A (zh) * 2022-06-14 2022-07-15 中国农业科学院作物科学研究所 水稻OsGA20ox2蛋白及其编码基因在提高植物抗非生物胁迫中的用途
CN114752573B (zh) * 2022-06-14 2022-08-12 中国农业科学院作物科学研究所 水稻OsGA20ox2蛋白及其编码基因在提高植物抗非生物胁迫中的用途

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