CN107873028B - 用作cdk9抑制剂的多环酰胺衍生物 - Google Patents
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Abstract
提供了一系列具有化学式(I)的新颖的吡啶或嘧啶衍生物，这些衍生物抑制CDK9并且可以用于治疗过度增生性疾病。具体地，这些化合物在以下增生性疾病的治疗中是有用的，该增生性疾病是如癌症，包括恶性血液病，如急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤和实体瘤例如乳癌、肺癌、成神经细胞瘤和结肠癌。A是C(R5)或N；R5是H、C1‑3烷基、CN或卤素；R2是任选地取代的3‑7元杂环烷基或3‑7元环烷基；R4是(A)或(B)，其中X和Y与它们附接于其上的原子一起形成任选地取代的、饱和的或部分饱和的5至7元杂环烷基环，除了桥氮外，该杂环烷基环可以包含一个或两个选自N、O、和S的杂原子；J是N或CR11；并且R11是H或C1‑3烷基。
Description
本发明涉及用于在某些疾病特别是增生性疾病如癌症的治疗中、以及在用于治疗增生性疾病的药物的制备中使用的某些吡啶或嘧啶衍生物，涉及新颖的吡啶或嘧啶衍生物并且涉及其制备方法，连同包含它们作为活性成分的药物组合物。
细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶(CDK)代表在结合至细胞周期蛋白调节配偶体上时变得有活性的一个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的家族。CDK/细胞周期蛋白复合物被首先鉴定为调节物细胞周期进程。然而，最近，CDK/细胞周期蛋白复合物也已经被牵涉在转录和mRNA加工中。CDK9/PTEFb(正相转录延伸因子b)使RNA聚合酶II(RNAP II)的大亚基的羧基-端结构域(CTD)，主要是Ser-2磷酸化，调节转录伸长。CDK9的抑制和转录阻遏导致快速消耗短寿命的mRNA转录物和相关蛋白(包括Mcl1和c-myc)，导致诱导高度取决于这些存活蛋白的肿瘤细胞的细胞凋亡。因此靶向转录CDK(包括CDK9)代表一种用于治疗高度取决于这些不稳定促活蛋白的肿瘤类型的治疗策略，该肿瘤类型包括但不局限于，恶性血液病，如急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤(Burkitt’s lymphoma)、滤泡性淋巴瘤以及实体瘤例如乳癌、肺癌、成神经细胞瘤和结肠癌。CDK9抑制剂还可以具有在其他疾病适应症，包括心脏、病毒学、炎症和疼痛中的治疗效用。
在此披露了一系列新颖的吡啶或嘧啶基衍生物，这些衍生物抑制CDK9并且可以用于治疗过度增生性疾病。具体地，这些化合物在以下增生性疾病的治疗中是有用的，该增生性疾病是如癌症，包括恶性血液病，如急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤和实体瘤例如乳癌、肺癌、成神经细胞瘤和结肠癌。
图1是(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例14)的形式A的代表性X射线粉末衍射图。
图2是(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例14)的形式A的代表性DSC/TGA热像图。
图3是(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例25)的形式A的代表性X射线粉末衍射图。
图4是(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例25)的形式A的代表性DSC/TGA热像图。
图5是(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(实例86)的形式B的代表性X射线粉末衍射图。
图6是(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(实例86)的形式B的代表性DSC/TGA热像图。
图7是(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例2)的形式B的代表性X射线粉末衍射图。
图8是(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例2)的形式B的代表性DSC/TGA热谱图。
发明说明
根据本发明的一个方面提供了具有化学式I的化合物：
其中：
A是C(R5)或N；
R5是H、C1-3烷基、CN或卤素；
R2是3-7元杂环烷基或3-7元环烷基；
可任选地被一至三个取代基取代，这些取代基独立地
选自由以下各项组成的组：R10、OR10、SR10、S(O)R10、S(O)2R10、C(O)R10、C(O)OR10、OC(O)R10、OC(O)OR10、NH2、NHR10、N(R10)2、NHC(O)H、NHC(O)R10、NR10C(O)H、NR10C(O)R10、NHS(O)2R10、NR10S(O)2R10、NHC(O)OR10、NR10C(O)OR10、NHC(O)NH2、NHC(O)NHR10、NHC(O)N(R10)2、NR10C(O)NH2、NR10C(O)NHR10、NR10C(O)N(R10)2、C(O)NH2、C(O)NHR10、C(O)N(R10)2、C(O)NHOH、C(O)NHOR10、C(O)NHS(O)2R10、C(O)NR10S(O)2R10、S(O)2NH2、S(O)2NHR10、S(O)2N(R10)2、S(O)2NHC(O)OR10、S(O)2NR10C(O)OR10、C(O)H、C(O)OH、OH、CN、NO2、F、Cl、Br和I；其中一个或多个环CH2基团可以任选地被相应数目的-C(O)基团替代，一个或多个环硫或环氮原子可以任选地被氧化以形成S-氧化物或N-氧化物；
R10，在每次出现时，独立地是选自下组，该组由以下各项组成：3至6元环烷基或杂环烷基基团、C1-6烷基、-O-C1-6烷基、C1-6烷基-O-C1-6烷基、NH2、C(O)NH2、C(O)H、C(O)OH、OH、CN、NO2、F、Cl、Br以及I；其中两个R10基团连同它们附接至其上的原子一起可以形成3至6元环烷基或杂环烷基基团；并且每个上述R10烷基、环烷基以及杂环烷基基团可以进一步被一个或两个独立地选自以下项的取代基取代
CN、OH、卤素、C1-3烷基、-O-C1-3烷基、NH2、NH-C1-3烷基、和NHC(O)-C1-3烷基。
R4是
其中X和Y与该它们附接至其上的原子一起形成5至7元杂环烷基环，该环除了桥氮之外可以包含一个或两个选自N、O、以及S的杂原子，该环可以是饱和的或部分饱和的；其中一个或两个环CH2基团可以任选地被相应数目的-C(O)基团替代、一个或多个环硫或氮原子可以任选地被氧化以形成S-氧化物或N-氧化物并且其中该环在环碳上可以被一个或两个R10取代基取代或在环氮上可以被R12取代基取代；
J是N或CR11；
R11是H、C1-3烷基；并且
R12，在每次出现时，独立地选自由以下各项组成的组：3至6元环烷基或杂环烷基基团、C1-6烷基、C1-6烷基-O-C1-6烷基、C(O)NH2、C(O)H；其中R12烷基、环烷基和杂环烷基基团可以进一步被一个或两个取代基取代，这些取代基独立地选自：CN、OH、和卤素、C1-3烷基、NH2、和NH-C1-3烷基、NHC(O)-C1-3烷基，或其药学上可接受的盐。
具有化学式(I)的化合物由于它们抑制CDK9活性的能力是有用的并且因此在单独地或部分通过CDK9介导的疾病或医学病症的治疗中也是有用的。
具有化学式(I)的化合物可以用于治疗过度增生性疾病。具体地，这些化合物在以下增生性疾病的治疗中是有用的，该增生性疾病是如癌症，包括恶性血液病，例如但不限于急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤以及实体瘤，例如但不限于乳癌、包括非鳞状和鳞状亚型的肺癌(包括但不限于非小细胞肺癌(NSCLC))、成神经细胞瘤和结肠癌。
本发明还涉及用于制造所述化合物的方法、涉及包含它们的药物组合物、并且涉及它们在制造用于在温血动物例如人中产生抗-增生作用的药物中的用途。同样根据本发明提供了使用所述化合物或其药学上可接受的盐治疗癌症的方法。
为了使本发明可以更容易理解，首先定义了某些术语。另外的定义贯穿详细说明给出。
前述书面说明书被认为是足以使得本领域的技术人员能够实践这些实施例。前述描述和实例详述了某些实施例并且描述了诸位发明人所期望的最佳模式。然而，将会了解的是无论前述内容可以如何详述出现在本文中，能以许多方式实践这些实施例并且权利要求书包括其任何等效物。
在详细描述本发明之前，应理解的是本发明不限于特定的组合物或方法步骤，因为这些组合物或方法步骤可以变化。如在本说明书和所附权利要求书中使用的，单数形式“一个”、”一种”和”该”包括复数指代物，除非上下文明确地指示其他的情况。术语”一个”(或”一种”)、连同术语”一个或多个/一种或多种”和”至少一个/一种”在此可以互换地使用。
此外，当在此使用时”和/或”被理解为这两个指定的特征或组分每一者与或不与另一者的特定披露。因此，术语“和/或”如在词组如“A和/或B”中使用时在此旨在包括“A和B”、“A或B”、“A”(单独)、以及“B”(单独)。同样，术语“和/或”如在词组如“A、B和/或C”中使用时是旨在涵盖以下方面中的每一者：A、B、和C；A、B、或C；A或C；A或B；B或C；A和C；A和B；B和C；A(单独)；B(单独)；以及C(单独)。
除非另外定义，否则在此使用的所有技术和科学术语具有如本披露所属领域的普通技术人员通常理解的相同含义。例如，生物医学与分子生物学简明词典(ConciseDictionary of Biomedicine and Molecular Biology)，Juo、Pei-Show，第2版，2002，CRC出版社；细胞与分子生物学词典(The Dictionary of Cell and Molecular Biology)第3版，1999，学术出版社(AcademicPress)；以及生物化学和分子生物学牛津词典(OxfordDictionary Of Biochemistry And Molecular Biology)，修订版，2000，牛津大学出版社(Oxford UniversityPress)为技术人员提供在本披露中使用的许多术语的通用词典注释。
单位、前缀和符号是以它们的国际单位系统(Système International deUnites)(SI)接受形式表示。数值范围包括限定该范围的数字。
应当理解，无论在什么情况下在此用语言“包含”描述方面时，也提供了用“由……组成”和/或“主要由……组成”描述的其他类似方面。
术语“抑制”、“阻止”、以及“阻遏”在此可互换地使用，并且指生物活性的任何统计学显著的降低，包括活性的完全阻止。例如，“抑制”可以指生物活性的约10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或100％的降低。
细胞增生可以使用本领域公认的技术测定，其测量的细胞分裂速率，和/或经历细胞分裂的细胞群中细胞的分数、和/或由于终末分化或细胞死亡(例如，胸苷掺入)自细胞群的细胞损失的速率。
术语“受试者”是指应该接受具体治疗的任何动物(例如，哺乳动物)，包括但不限于人类、非人类灵长动物、啮齿类、以及类似物。典型地，术语“受试者”和“患者”在此关于人类受试者可互换地使用。
术语“药物组合物”是指一种制剂，该制剂处于允许该活性成分具有生物活性的形式，并且不包含另外的、对其将要给予的受试者具有不可接受的毒性的组分。这样的组合物可以是经消毒的。
术语如“治疗(treating)”或“治疗(treatment)”或“治疗(to treat)”或“减轻(alleviating)”或“减轻(alleviate)”是指(1)使得诊断的病理性病症或障碍的治愈、减缓、减轻症状、和/或停止进展的治疗措施以及(2)防止和/或减缓所靶向的病理学病症或障碍的发展的预防性或防止性措施。因此，需要治疗的那些包括已具有障碍的那些；倾向于具有以下障碍的那些；以及在他们中需要预防障碍的那些。在某些方面，如果患者显示例如，总的、部分的、或瞬时的某一类型的癌症的缓解，则根据本披露的这些方法针对癌症成功地“治疗”了该受试者。
术语“癌症”、“肿瘤”、“癌性”、和“恶性”指或描述在哺乳动物中典型地是特征为不受控制的细胞生长的生理病症。癌症的实例包括但不限于，血液学系统恶性肿瘤，如急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤以及实体瘤例如乳癌、肺癌、成神经细胞瘤和结肠癌。
术语“细胞毒剂”如在此使用的是广泛定义的并且是指抑制或阻止细胞的功能和/或造成细胞破坏(细胞死亡)、和/或施加抗肿瘤/抗增生作用的一种物质。例如，细胞毒性试剂直接或间接防止赘生性肿瘤细胞的发育、成熟、或扩散。该术语还包括仅引起抑制细胞生长效应并且不仅仅是细胞毒性效应的此类试剂。该术语包括如下指出的化疗剂，连同其他HER2拮抗剂、抗血管生成剂、酪氨酸激酶抑制剂、蛋白激酶A抑制剂，细胞因子家族的成员、放射性同位素、以及毒素如细菌、真菌、植物或动物来源的酶促活性毒素。
术语“化学治疗剂”是包括天然或合成的化学化合物的术语“细胞毒剂”的子集。
在根据本披露的这些方法中，本披露的化合物可以给予患者以便促进对于癌症的积极治疗响应。术语对于癌症治疗的“积极治疗响应”指的是与该疾病相关的症状的一种改善。
例如，疾病的改善可以表征为一种完全响应。术语“完全响应”是指通过任何先前的标准化测试结果不存在临床上可检测的疾病。可替代地，一种疾病的改善可以被归类为部分响应。“积极治疗响应”涵盖从本披露的化合物的给予得到的癌症的进展和/或持续时间的减少或抑制，癌症的严重性的减少或改善、和/或其一种或多种症状的改善。
在具体方面中，此类术语是指给予本披露的化合物之后以下一种、两种或三种或更多种结果：
(1)癌细胞群的稳定、减少或消除；
(2)癌症生长的稳定或减少；
(3)癌症形成受损；
(4)原发性、区域性和/或转移性癌症的根除、移出，或控制；
(5)死亡率的减少；
(6)无疾病、无复发、无进展、和/或总存活数、持续时间、或速率的增加；
(7)响应或处于缓解期的患者的响应速率、响应耐久性或数目的增加；
(8)住院率的降低，
(9)住院时间的降低，
(10)癌症的尺寸维持并且不增加或增加少于10％、优选小于5％、优选小于4％、优选小于2％，以及
(11)处于缓解期患者的数目的增加。
(12)否则治疗癌症要求的辅助治疗(如，化疗或激素治疗)的数目的减少。
临床响应可以使用筛选技术评定，如PET、磁共振成像(MRI)扫描、x-射线照相成像、计算机断层成像(CT)扫描、流式细胞计量术或荧光活化细胞分选仪(FACS)分析、组织学、宏观病理学、和血液化学，包括但不限于可通过ELISA、RIA、层析、以及类似物检测的变化。除了这些积极治疗响应之外，正经受疗法的受试者可以经历与该疾病相关的症状的改进的有益效果。
在本说明书中，如在术语中所使用的前缀Cx-y如Cx-y烷基和类似物(其中x和y是整数)表示在该基团中存在的碳原子的数值范围；例如，C1-4烷基包括C1烷基(甲基)、C2烷基(乙基)、C3烷基(丙基和异丙基)和C4烷基(丁基、1-甲基丙基、2-甲基丙基、以及叔丁基)。
除非明确规定，基团的键合原子可以是该基团的任何适合的原子；例如，丙基包括丙-1-基和丙-2-基。
如在此所使用的，短语“任选取代的”是指该取代是任选的并且因此可能对于该指定基团是被取代或未被取代的。在取代是所希望的情况下，在该指定基团上任何数目的氢可以被选自所指出的取代基替代，条件是不超过具体取代基上的原子的正常化合价，并且该取代导致一种稳定的化合物。
在一个方面中，当具体基团被指定为可任选地被“一个或多个”取代基取代时，该具体基团可以是未取代的。在另一个方面中，该具体基团可以带有一个取代基。在另一个方面中，该具体的取代基可以带有两个取代基。在又另一个方面中，该具体基团可以带有三个取代基。在又另一个方面中，该具体基团可以带有四个取代基。在另一个方面中，该具体基团可以带有一个或两个取代基。在又另一个方面，该具体的基团可以是未取代的、或可以带有一个或两个取代基。
如在此使用的，术语“烷基”是指具有指定数目碳原子的直链和支链饱和烃基两者。提及单独的烷基基团如“丙基”是特定针对仅仅直链形式的并且提及单独的支链烷基基团，例如“异丙基”是特定针对仅仅支链形式。在一个方面中，“烷基”可以是“C1-4烷基”。在另一个方面中，“烷基”和“C1-4烷基”可以是“C1-3烷基”。在另一个方面中，“烷基”、“C1-4烷基”、和“C1-3烷基”可以是甲基。一种类似惯例适用于其他上位术语，例如“烯基”和“炔基”。
“环烷基”是一个包含3至7个碳原子的单环的饱和的或部分不饱和的烷基环。环烷基的说明性实例包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基和环庚基。
“杂环烷基”是包含3至7个环原子的饱和的或部分饱和的单环，其中1、2、3或4个环原子是选自氮、硫或氧，该环可以被碳或氮地连接，其中一个-CH2-基团可以任选地被一个-C(O)-替代；其中环氮或环硫原子是任选地氧化的以形成一个或多个N-氧化物或S氧化物(即亚砜和砜)；其中环–NH是任选地被乙酰基、甲酰基、甲基或甲磺酰基取代的；并且其中环是任选地被一个或多个卤素取代的。“5-或6-元杂环烷基”的说明性实例包括，咪唑啉基、吡唑烷基、哌嗪基、哌啶基、吡咯烷基、噁嗪基、吗啉基、六氢嘧啶基、以及硫代吗啉基。
对于任何R基团(R1至R12)或用于此类基团的任何部分或取代基适合的值包括：
对于C1-4烷基：甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、2-甲基丙基以及叔丁基；
对于C1-6烷基：C1-4烷基、戊基、2,2-二甲基丙基、3-甲基丁基以及己基；
对于C3-7环烷基：环丙基、环丁基、环戊基环己基、以及环庚基；
对于卤素(halo)或卤素(halogen)：氟、氯、溴和碘；
对于杂环烷基：吡咯烷基、哌啶基、N-乙酰哌啶基、N-甲基哌啶基、N-甲酰基哌嗪基、N-甲磺酰基哌嗪基、单哌嗪基(homopiperazinyl)、哌嗪基、氮杂环丁烷基、氧杂环丁烷基、吗啉基、吡喃基、二氢-2H-吡喃基、四氢呋喃基、2,5-二氧咪唑烷基、以及2,2-二甲基-1,3-二氧戊环基。
应该指出，对于在说明书中使用的术语给出的实例不是限制性的。
如在此所使用的，短语“有效量”意指一种化合物或组合物的足以显著和积极改变有待治疗的症状和/或病症(例如，提供积极临床响应)的量。用于一种药物组合物中的活性成分的有效量将随着正在被治疗的具体病症、该病症的严重性，治疗的持续时间、同步治疗的性质，该一种或多种使用的具体的活性成分，一种或多种所使用的药学上可接受的赋形剂/载体、以及主治医生的知识和专业技能内的类似因素而变化。
具体地，用于在癌症治疗中使用的具有化学式(I)的化合物的一个有效量是足以对症减轻在温血动物例如人中癌症和骨髓增生性疾病的症状的量，以减缓癌症和骨髓增生性疾病的进展，或减少患有癌症和骨髓增生性疾病的患者中症状恶化的风险。
如在此使用，短语“离去基团”旨在是指易于通过一种亲核体例如胺亲核体，和醇亲核体或硫醇基亲核体可替换的基团。适合的离去基团的实例包括卤素(如氯和溴)、以及磺酰基氧基基团，如甲磺酰基氧基和甲苯-4-磺酰基氧基。
如在此所使用的，术语“药学上可接受的”是指在合理的医学判断的范围，适合用于与人类和动物的组织接触而不产生过度毒性、刺激、过敏反应、或其他问题或并发症，同时具有相称的合理受益/风险比的那些化合物、材料、组合物、和/或剂型。
如在此所使用的，术语“保护基团”旨在是指用来防止选定的反应性基团(如羧基、氨基、羟基、和巯基基团)免于经历不希望的反应的那些基团。
用于羟基基团的适合的保护基团的说明性实例包括但不限于酰基基团；链烷酰基基团如乙酰基；芳酰基基团，例如苯甲酰基；甲硅烷基基团，如三甲基甲硅烷基；和芳基甲基基团，如苄基。用于上述羟基保护基团的脱保护条件将必然随着所选择的保护基团变化。因此，例如，酰基基团(例如，链烷酰基或芳酰基基团)可以例如通过与适合的碱(例如碱金属氢氧化物，例如氢氧化锂或氢氧化钠)水解被去除。可替代地，甲硅烷基(如三甲基甲硅烷基)可以例如由氟化物或水性酸被去除；或芳基甲基基团(如苄基基团)可以例如通过在催化剂(例如-钯-碳)存在下的氢化被去除。
氨基基团的适合的保护基团的说明性实例包括但不限于酰基基团；链烷酰基基团如乙酰基；烷氧基羰基基团，如甲氧基羰基、乙氧基羰基以及叔-丁氧基羰基；芳基甲氧基羰基基团，如苄氧基羰基；以及芳酰基基团，如苯甲酰。以上氨基保护基团的脱保护条件必须随着所选择的保护基团而变化。因此，例如，酰基基团(例如，链烷酰基或烷氧基羰基基团或芳酰基基团)可以例如通过用适合的碱(例如碱金属氢氧化物，例如氢氧化锂或氢氧化钠)水解被去除。可替代地，酰基基团如(叔-丁氧基羰基基团)可以例如通过用合适的酸(如盐酸、硫酸、磷酸或三氟乙酸)处理被去除，并且芳基甲氧基羰基基团(如苄氧基羰基基团)可以例如通过在催化剂(如-钯-碳)上氢化或通过用路易斯酸(例如三氯化硼)处理被去除。用于伯氨基基团的合适的替代保护基团，是例如邻苯二甲酰氯基团，该基团可以通过用烷基胺(例如二甲基氨基丙胺或者2-羟乙胺)或用肼处理去除。
该保护基团可以在该合成的任何方便的阶段使用在化学领域熟知的常规技术被去除，或者它们可以在随后的反应步骤或处理过程中被去除。
为了说明性目的，提及取代基“R”，以下取代基定义是指所指示的结构：
在本发明中应当理解的是具有化学式(I)的化合物或其盐可以展现互变异构现象并且在本说明书内的化学式图可以仅代表可能的互变异构形式之一。应理解的是本发明涵盖具有CDK9抑制活性的任何互变异构形式，并且不应仅限于在该化学式图中所采用的任一互变异构形式。
还应理解的是某些具有化学式(I)的化合物及其盐能以溶剂化连同非溶剂化形式(例如，水合形式)存在。应理解的是本发明涵盖了具有CDK9抑制活性的所有此类溶剂化物的形式。
该具有化学式(I)的化合物还可以作为可体内水解的酯类被提供。含有羧基或羟基基团的具有化学式(I)的化合物的体内可水解的酯是，例如在人类或动物体内分离以产生母体酸或醇的药学上可接受的酯。这种酯可以通过例如静脉内给予测试动物该受测的化合物并且随后检查该测试动物的体液而鉴定。
用于羧基的合适的药学上可接受的酯包括C1-6烷氧基甲基酯，例如甲氧基甲基酯，C1-6烷酰基氧基甲基酯例如新戊酰氧基甲基酯，酞基酯，C3-8环烷基羰基氧基C1-6烷基，酯例如1-环己基羰基氧基乙基酯，(1,3-二氧杂环戊烯-2-酮)基甲基酯，例如(5-甲基-1,3-二氧杂环戊烯-2-酮)基甲基，以及C1-6烷氧基羰基氧基乙基酯，例如1-甲氧基羰基氧基乙基；并且可以在本发明的化合物的任何羧基基团上形成。
用于羟基的适合的药学上可接受的酯包括无机酯如磷酸酯(包括氨基磷酸环状酯)以及α-酰氧基烷基醚以及作为酯体内水解的结果分解以给出该母体羟基基团的相关化合物。α-酰氧基烷基醚的实例包括乙酰氧基甲氧基和2,2-二甲基丙酰氧基甲氧基。对于羟基的体内可水解的酯的选择包括C1-10链烷酰基，例如乙酰基、苯甲酰基、苯乙酰基、被取代的苯甲酰基和苯乙酰基；C1-10烷氧基羰基(以给出烷基碳酸酯)，例如乙氧羰基；二-C1-4烷基氨甲酰基和N-(二-C1-4烷基氨基乙基)-N-C1-4烷基氨甲酰基(以给出氨基甲酸酯)；二-C1-4烷基氨基乙酰基和羧基乙酰基。苯乙酰基和苯甲酰基上的环取代基的实例包括氨甲基、C1-4烷基氨基甲基和二-(C1-4烷基)氨甲基、以及吗啉基或哌嗪基，其从环氮原子经由亚甲基连接基团连接到苯甲酰基环的3-或4-位。其他令人关注的体内可水解的酯包括，例如，RAC(O)OC1-6烷基-CO-，其中RA是例如，苄氧基-C1-4烷基、或苯基。此类酯中的苯基上的合适的取代基包括，例如4-C1-4烷基哌嗪-C1-4烷基、哌嗪-C1-4烷基和吗啉代-C1-4烷基。
具有化学式(I)的化合物可以形成稳定的药学上可接受的酸或碱的盐，并且在此类情况下给予作为盐的化合物可以是适当的。酸加成盐的实例包括乙酸盐、己二酸盐、抗坏血酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、碳酸氢盐、重硫酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、胆碱、柠檬酸盐、氨基磺环己基、二亚乙基二胺、乙磺酸盐、延胡索酸盐、谷氨酸、乙醇酸盐、半硫酸盐、2-羟基乙基磺酸盐、庚酸盐、己酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、羟基马来酸盐、乳酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、甲磺酸盐、葡甲胺、2-萘磺酸盐、硝酸盐、草酸盐、扑酸酯、过硫酸盐、苯基乙酸甲酯、磷酸盐、二磷酸盐、苦味酸盐、三甲基乙酸盐、丙酸盐、奎尼酸盐(quinate)、水杨酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、氨基磺酸盐、氨基苯磺酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、甲苯磺酸盐(氢呋喃对甲苯磺酸盐)、三氟乙酸盐、以及十一酸盐。碱盐的实例包括铵盐；碱金属的盐，例如钠、锂以及钾的盐；碱土金属盐，如铝、钙和镁的盐；与有机碱，例如二环己胺盐和N-甲基-D-葡糖胺的盐；和与氨基酸如精氨酸、赖氨酸、鸟氨酸、等等的盐。而且，碱性含氮-基团可以被用如下试剂季铵化，此类试剂是如：低级烷基卤化物，比如甲基、乙基、丙基、以及丁基卤化物；二烷基硫酸酯如二甲基、二乙基、二丁基硫酸酯；二戊基硫酸酯；长链卤化物如癸基、月桂基、肉豆寇基和硬脂基卤化物；芳烷基卤化物，如苄基溴化物以及其他。非毒性-生理上可接受-的盐是优选的，尽管其他盐可以是有用的，如在分离或纯化该产物中是有用的。
这些盐可以是通过常规手段形成的，例如通过使该产物的游离碱形式与一个或多个当量的适当的酸在溶剂或介质(其中这些盐是不可溶的)、或在溶剂(如水，其是在真空中或通过冷冻干燥或通过现有的盐的阴离子与另一种阴离子在适合的离子交换树脂上交换去除)进行反应。
具有化学式(I)的化合物具有手性中心，并且因此作为立体异构体存在。应理解的是本发明涵盖了所有的此类立体异构体，包括对映异构体和非对映异构体。就具有化学式(I)的化合物能以光学活性形式或外消旋形式存在而言，本发明在其定义中包括其具有上述活性的任何此类光学活性形式或外消旋形式。本发明涵盖了具有如在此所定义的活性的所有此类立体异构体。
该光学活性形式的合成可以通过领域中熟知的有机化学标准技术进行，例如通过从光学活性起始材料合成或通过拆分外消旋形式。外消旋体可以使用已知程序分成单独的对映异构体(参见，例如，高级有机化学(Advanced Organic Chemistry)：第3版：作者JMarch，第104-107页)。一种适合的程序包括通过外消旋材料与手性助剂的反应形成非对映异构体衍生物，接着分离这些非对映异构体(例如通过层析法)并且然后分离该辅助种类。类似地，上述活性可以使用下文中所称的标准实验室技术评估。
因此，贯穿本说明书，当提及具有化学式(I)的化合物时，应理解的是术语化合物包括在人类或动物中抑制CDK9活性的立体异构体、立体异构体的混合物、以及多晶型物。
立体异构体可以使用常规技术，例如层析或分步结晶进行分离。对映异构体可以通过例如通过分步结晶、拆分或HPLC分离一种外消旋体而分离。非对映异构体可以通过借助于非对映异构体的不同物理特性的分离，例如通过分步结晶、HPLC或快速层析而分离。可替代地，特定的立体异构体可以从手性起始材料在不引起外消旋作用或差向异构的条件下通过手性合成、或通过衍生化用手性试剂制成。
当提供特定的立体异构体时(无论是通过分离、通过手性合成、或通过其他方法提供)，它是有利地实质上与相同化合物的其他立体异构体的分离而提供。在一个方面中，含有具有化学式(I)的化合物的具体的立体异构体的混合物可以包含按重量计小于30％，特别是小于20％，并且更特别是小于10％的相同化合物的一种或多种其他立体异构体。在另一个方面中，包含具有化学式(I)的化合物的具体的立体异构体的混合物可以包含按重量计小于6％，特别是小于3％，并且更特别是小于2％的该化合物的一种或多种其他立体异构体。在另一个方面中，包含具有化学式(I)的化合物的具体立体异构体的混合物可以包含按重量计小于1％，特别是小于0.5％，并且更特别是小于0.3％，并且仍更特别是小于0.1％的该化合物的一种或多种其他立体异构体。当该分离的立体异构体的绝对构型是未确定时，立体异构体可以通过制备或分离方法区分。例如，分离的立体异构体可以通过它们的洗脱时间区分并表示，例如，异构体1、异构体2等。
根据本发明，本发明的化合物以许多结构上不同形式的存在。在本发明的一些方面，本发明的目的是提供一种基本上纯的晶体形式。
本发明的一些结构形式可以提供许多优点。例如，本发明的化合物的一些形式可以更容易处理和储存。本发明的化合物的其他形式可以是更容易表征的，因为它以良好定义的状态存在。此外，本发明的化合物可以更容易以可重现的方式合成并且由此更容易在全规模生产中处理。
当提供特定的多形性形式时，它有利地实质上与该同一化合物的其他多晶型分离而提供。在一个方面中，含有具有化学式(I)的化合物的具体的多形性形式的混合物可以包含按重量计小于30％，特别是小于20％，并且更特别是小于10％的相同化合物的一种或多种其他多形性形式。在另一个方面中，含有具有化学式(I)的化合物的具体的多形性形式的混合物可以包含按重量计小于6％，特别是小于3％，并且更特别是小于2％的该化合物的一种或多种其他多形性形式。在另一个方面中，包含具有化学式(I)的化合物的具体的多形性形式的混合物可以包含按重量计小于1％，特别是小于0.5％，并且更特别是小于0.3％，并且仍更特别是小于0.1％的该化合物的一种或多种其他多形性形式。
本发明的这些化合物可以通过在X射线粉末衍射图中的主要峰的位置和强度表征，但也可以通过常规的FT-IR光谱法表征。这些可以用于将一种晶体形式与该化合物的其他晶体形式区分。本发明的这些化合物的特征在于是高度结晶的，即具有比其他形式更高的结晶度。使用表述“任何其他形式”是指在现有技术中披露的其无水物、水合物、溶剂化物、以及其多晶型物或无定形形式。化合物的任何其他形式的实例包括，但不局限于，其无水物、一水合物、二-水合物、倍半水合物、三水合物、醇化物，例如甲醇化物和乙醇化物，以及多晶型物或无定形形式。
本发明的化合物还可以通过其晶胞进行表征。根据本发明制备的本发明的化合物可以通过XRPD(一种本身已知的技术)分析。
在该化合物中水的量可以通过热重分析(一种本身已知的技术)确定。
本发明的另外的实施例是如下。这些另外的实施例涉及具有化学式(I)的化合物及其药学上可接受的盐。在适当情况下，可以与上文或下文中定义的任何一项定义、权利要求或实施例一起使用此类特定取代基。
A
在一个方面中，A是C(R5)。
R5
在本发明的一个方面中，R5是卤素。
在本发明的一个方面中，R5是氯。
在本发明的一个方面中，R5是氟。
在本发明的一个方面中，R5是氰基。
R2
在一个方面中，R2是3-7元环烷基。
在另一个方面中，R2是被NHCOR10或R10取代的3-7元环烷基。
在另一个方面中，R2是被NHCOR10取代的环己基。
在另一个方面中，R2是被R10取代的环丙基。
在另一个方面中，R2是3-7元杂环烷基。
在另一个方面中，R2是被NHCOR10取代在3-7元杂环烷基。
在另一个方面中，R2是哌啶基。
在另一个方面中，R2是环丁基。
在另一个方面中，R2是被R10取代的环丁基。
R4
在一个方面中，R4是
在另一个方面中，R4是
J
在一个方面中J是C(R11)并且R11是H。
X和Y
在一个方面中，X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
在一个方面中，X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成包含另外的杂原子的6元杂环烷基环，该杂原子是氧。
在一个方面中，X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成包含另外的杂原子的6元杂环烷基环，该杂原子是氮。
在一个方面中，X和Y连同它们附接至其上的原子形成6元杂环烷基环，其中一个CH2是被两个甲基基团取代的。
在一个方面中，X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
在一个方面中，X和Y连同它们附接至其上的原子形成5元杂环烷基环，其中一个CH2是被两个甲基基团取代的。
在一个方面中，X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成7元杂环烷基环。
在一个方面中，X和Y连同它们附接至其上的原子形成7元杂环烷基环，其中一个CH2是被两个甲基基团取代的。
在一个方面中
A是C(R5)；
R2是3-7元环烷基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是卤素；
R2是3-7元环烷基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是3-7元环烷基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是环己基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R2是3-7元环烷基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
A是C(R5)；
R5是卤素；
R2是环己基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是环己基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
J是C(R11)并且R11是H
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成吡啶基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
J是C(R11)并且R11是H
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成哌啶基环，其中一个环碳可以被一个或两个R10取代基取代。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
J是C(R5)并且R5是H
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成哌嗪基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
J是C(R5)并且R5是H
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成吗啉基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
J是C(R5)并且R5是H
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成吡咯烷基，其中一个CH2被两个甲基基团取代。
A是C(R5)；
R2是3-7元环烷基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成7元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是卤素；
R2是3-7元环烷基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成7元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是3-7元环烷基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成7元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是环己基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成7元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R4是
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成7元杂环烷基环。
在一个方面中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成7元杂环烷基环。
在另一个方面中，本发明提供了一种选自以下各项的化合物：
(R)-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)哌啶-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
顺式-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺；
(R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)哌啶-3-甲酰胺；顺式-3-羟基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-((S)-2-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺；
(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
顺式-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺；
顺式-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺；
反式-3-羟基-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-(2-氰基乙酰胺基)环己烷甲酰胺；
叔丁基((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸酯；
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)-3-甲基氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺；
(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-((S)-2-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺；
(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氰基-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺；
(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环戊烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢-[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(3-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(顺式-3-羟基环丁烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺；
(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
顺式-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺；
反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)-3-(2-羟基乙酰胺基)环己烷甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(7-羟基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(4-羟基丁基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺；
(1R,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺；并且
(1S,3S)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺。
该具有化学式(I)的化合物由于它们抑制CDK9活性的能力是有用的。这些化合物还有用于治疗患者中的癌症。在根据本发明的那些方面中，可以向患有癌症的患者给予具有化学式I的化合物或其药学上可接受的盐，该癌症是如恶性血液病，包括急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤以及实体瘤例如乳癌、肺癌、成神经细胞瘤和结肠癌。
这些具有化学式(I)的化合物已经显示出抑制CDK9活性，如通过基于下文中描述的测定进行测定所证明的。虽然具有化学式(I)的化合物的药理学特性随着结构变化可以改变，典型的具有化学式(I)的化合物在IC50浓度(实现50％抑制的浓度)或低于10μM的水平的剂量下具有CDK9抑制活性。
CDK9激酶测定
在Km下的ATP浓度
在体外使用迁移率变动测定在Caliper LC3000读取器(Caliper/珀金埃尔默公司(PerkinElmer))上确定CDK9的活性，其测量磷酸化和未磷酸化的荧光肽底物的荧光并且计算比率值来确定百分比周转。在存在和不存在该感兴趣的化合物下确定肽的磷酸化。将酶/底物/腺苷三磷酸腺苷(ATP)混合物(3nM CDK9/CycT1，6μMATP、1.5μM CDK9肽底物(FITC-X-GSRTPMY-NH2(X：ε氨基己酸))，50mM HEPES(pH 7.2)、1mM二硫苏糖醇、0.01％吐温20，50μg/mL牛血清白蛋白(最终测定浓度))(5μl)与2μl的化合物在25℃下预孵育持续15分钟。将反应用5μl的24mM MgCl2(10mM最终测定浓度)在缓冲液(50mM HEPES(pH7.2)、1mM二硫苏糖醇、0.01％吐温20，50μg/mL牛血清白蛋白(最终测定浓度)中起始并且在25℃下孵育持续90分钟并且通过添加5μl由65mM HEPES(pH 7.2)、35.5mM EDTA、0.227％涂层(Coatin)试剂3(Caliper/珀金埃尔默公司)、以及0.003％吐温组成的停止混合物使反应停止。磷酸化和未磷酸化的底物通过Caliper LC3000读取器(Caliper/珀金埃尔默公司)在由以下项组成的分离缓冲液存在下检测：100mM HEPES(pH 7.2)，15.8mM EDTA、0.1％涂层试剂3(Caliper/珀金埃尔默公司)、0.015％Brij-35，5％DMSO、以及5.6mM MgCl2。CDK9的酶是从卡尔纳生物科学公司(Carna Biosciences)(目录编号04-110)得到的，CDK9肽底物是从国际公司(Intonation)(波士顿，马萨诸塞州；定制)得到的。
使用标准曲线拟合方法来计算IC50值，其中最大信号被定义为在83.3mM EDTA下来自抑制反应的周转并且最小信号被定义为在0.83％DMSO下来自该反应的周转。
高ATP浓度
高ATP测定以相同的、具有以下修改的方式进行：CDK9最终测定浓度是1.5nM，并ATP最终测定浓度是5mM。
MCF7pSer2RNAPII MOA测定
这是确定CDK9抑制剂在乳癌细胞系MCF7中，在Ser2位点上对RNA聚合酶II(RNAPII)的磷酸化作用的免疫荧光测定。在第一天，将2500MCF7细胞/孔接种于在384-孔黑壁透明底板中的30μl生长培养基(RPMI+10％FBS+1％L-Glu+P/S)中，在37℃孵育箱内孵育板过夜。在第二天，将细胞用CDK9抑制剂(7点剂量响应，范围从3μM至0.004μM)、使用ECHO液体处理器(Labcyte公司)处理。在37℃的孵育箱处理6小时之后，将这些细胞用30μl/孔7.4％多聚甲醛在室温下固定15分钟；将这些细胞用PBS洗涤两次，然后用0.3％TritonX/PBS在室温下透性化5分钟。在用PBS洗涤细胞之后，将这些细胞用1:2000稀释的抗-Ser2Phospho-RNA pol II抗体(Covance MMS-129R)在3％FBS/0.1％PBST中在4℃下孵育过夜。在第二天，将细胞用0.1％PBST洗涤两次，然后与1:1000稀释的Alexa Fluor 488山羊-抗-小鼠抗体(生命技术公司(Life Technologies)A-11001)和1:4000稀释的DAPI在室温下在黑暗中孵育。孵育一小时后，将细胞用0.1％PBST洗涤两次，并且用PBS洗涤一次。将这些板密封且在Acumen eX3微孔板细胞计数器(TTP莱伯泰科公司(TTP Labtech)上读取来评估每个孔中的磷酸化水平。使用基因数据分析软件来计算IC50值(DMSO对照为最大值并且11μMDinaciclib对照为最小值)。
MV411半胱天冬酶活性测定
这是用于测量在急性髓细胞白血病细胞系MV411中用CDK9抑制剂处理6小时之后诱导半胱天冬酶活性的细胞测定。在第一天，将3000MV411细胞/孔接种在384-孔白色板中的50μl生长培养基(IMDM+10％FBS+2％L-Glu+P/S)中，在37℃孵育箱中孵育板过夜。在第二天，将细胞用CDK9抑制剂通过ECHO处理(10点剂量响应，范围从31.5μM降至0.001μM)。在37℃的孵育箱内孵育6小时之后，将25μl的半胱天冬酶-Glo 3/7试剂(普洛麦格公司(Promega))/孔添加至每个孔中，并且将板在室温下在黑暗中孵育30分钟。将这些板在Infinite M200酶标仪(帝肯公司(Tecan))上以100ms积分时间进行读数。使用基因数据分析软件来计算EC50值(DMSO对照为最小值并且11μM Dinaciclib对照为最大值)。
表I提供了用于这些测定的数据。
表I
在一个方面中，在此提供了一种具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，用作一种药剂。
在另一个方面中，在此提供了一种具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，在制造用于治疗或预防以下项中至少一项的药物中的用途：恶性血液病，如急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤以及实体瘤例如乳癌、肺癌、成神经细胞瘤和结肠癌。
在另一个方面中，在此提供了一种具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，在制造用于治疗癌症的药物中的用途。
在另一个方面中，在此提供了一种具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，在制造用于在温血动物例如人中产生抗增生性和/或促凋亡作用的药物中的用途。
在另一个方面中，在此提供了一种具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，在制造用于在温血动物(例如人)中产生CDK9抑制作用的药物中的用途。
在另一个方面中，在此提供了用于治疗或预防以下项中至少一项的方法：恶性血液病例如急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤以及实体瘤例如乳癌、肺癌、成神经细胞瘤和结肠癌。
在另一个方面中，在此提供了一种用于在温血动物例如人中产生抗增生和/或促凋亡作用的方法，所述方法包括向所述动物给予一个有效量的具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐。
在另一个方面中，在此提供了在温血动物例如人中产生CDK9抑制作用的方法，所述方法包括向所述动物给予一个有效量的具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐。
在另一个方面中，在此提供了用于在温血动物例如人中治疗癌症的方法，所述方法包括向所述动物给予一个有效量的具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐。
在另一个方面中，在此提供了一种具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，用于在以下项中至少一项的治疗中使用：恶性血液病例如急性髓细胞白血病、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤以及实体瘤例如乳癌、肺癌、成神经细胞瘤和结肠癌。
在另一个方面中，在此提供了一种药物组合物，该药物组合物包含一种具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，以及至少一种药学上可接受的载体、稀释剂、或赋形剂。
本发明的这些组合物可以处于适于口服使用的形式(例如作为片剂、锭剂、硬或软胶囊，水性或油性悬浮液、乳液、可分散的粉剂或颗粒剂、糖浆或酏剂)，适用于局部使用的形式(例如作为乳膏、软膏、凝胶、或水性或油性溶液或悬浮液)，适用于通过吸入给药的形式(例如作为精细分散粉末或液体气雾剂)，适用于通过吹入给药的形式(例如作为精细分散粉末)或适用于肠胃外给药的形式(例如作为无菌水性或油性溶液，用于静脉内、皮下、肌肉或肌内给药或作为栓剂用于直肠给药)。
本发明的这些组合物可以通过常规程序使用本领域众所周知的常规药物赋形剂获得。因此，旨在用于口服使用的组合物可以包含，例如，一种或多种着色剂、甜味剂、调味剂和/或防腐剂。
用于片剂配制品的适合的药学上可接受的赋形剂包含，例如惰性稀释剂，如乳糖、碳酸钠、磷酸钙或碳酸钙；造粒和崩解剂，例如玉米淀粉或海藻酸；粘合剂，如淀粉；润滑剂，例如硬脂酸镁、硬脂酸或滑石；防腐剂，如乙基或丙基对羟基苯甲酸酯；和抗氧化剂，如抗坏血酸。片剂配制品可以是未包衣的或包衣的，以改变它们的崩解和活性成分随后在胃肠道的吸收或改进它们的稳定性和/或外观，在任一情况，使用常规包衣剂以及本领域熟知的程序。
用于口服使用的组合物可以处于以下形式：硬胶囊，其中该活性成分是与惰性的固体稀释剂(例如、碳酸钙、磷酸钙或高岭土)混合的，或软胶囊，其中该活性成分是与水或油(例如花生油、液体石蜡、或橄榄油)混合的。
水性悬浮液通常包含呈精细粉末形式或呈纳米或微粉化颗粒形式的活性成分，连同一种或多种悬浮剂，例如羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、羟丙基甲基纤维素、海藻酸钠、聚乙烯-吡咯烷酮、黄蓍胶和阿拉伯胶；分散剂或湿润剂如卵磷脂或环氧烷与脂肪酸的缩合产物(例如聚氧化乙烯硬脂酸酯)、或氧化乙烯与长链脂肪醇的缩合产物(例如十七亚乙基氧基鲸蜡醇)、或氧化乙烯与衍生自脂肪酸和己糖醇的偏酯的缩合产物(如聚氧乙烯山梨醇单油酸酯)、或环氧乙烷与长链脂肪醇的缩合产物(例如十七亚乙基氧基鲸蜡醇)、或氧化乙烯与衍生自脂肪酸和己糖醇的偏酯的缩合产物(如聚氧乙烯山梨醇单油酸酯)、或氧化乙烯与衍生自脂肪酸和己糖醇酐的偏酯的缩合产物(例如聚乙烯失水山梨醇单油酸酯)。该水性悬浮液还可以包含一种或多种防腐剂如乙基或丙基对羟基苯甲酸酯；抗氧化剂，如抗坏血酸；着色剂；调味剂；和/或甜味剂，如蔗糖、糖精或阿斯巴甜。
油性悬浮液可以通过将该活性成分悬浮于植物油例如落花生油、橄榄油、芝麻油或椰子油或在矿物油如液体石蜡中配制。该油性悬浮液还可以包含增稠剂，例如蜂蜡、硬石蜡或鲸蜡醇。甜味剂(如以上列出的那些)以及调味剂可以被添加以提供适口的口服制剂。这些组合物可以通过添加抗氧化剂(如抗坏血酸)保存。
适合于通过添加水制备水性悬浮液的可分散粉末和颗粒总体上包含该活性成分连同分散剂或润湿剂、悬浮剂以及一种或多种防腐剂。适合的分散剂或湿润剂和悬浮剂通过以上已经提及的那些示例。另外的赋形剂(如甜味剂、调味剂和着色剂)也可以存在。
本发明的这些药物组合物还可以处于水包油乳液的形式。该油状相可以是植物油(如橄榄油或落花生油)或矿物油(例如像液体石蜡)或这些中任一项的混合物。适合的乳化剂可以是，例如天然存在的树胶(例如阿拉伯胶或黄芪胶)、天然存在的磷脂(如大豆、卵磷脂)、衍生自脂肪酸和己糖醇酐的酯或偏酯(例如失水山梨醇单油酸酯)和所述偏酯与环氧乙烷的缩合产物如聚氧乙烯失水山梨醇单油酸酯。这些乳剂还可以包含甜味剂、调味剂和防腐剂。
糖浆和酏剂可以用甜味剂如甘油、丙二醇、山梨醇、阿斯巴甜(aspartame)或蔗糖配制，并且还可以包含缓和剂、防腐剂、调味剂和/或着色剂。
药物组合物还可以处于无菌注射的水性或油性悬浮液的形式，其可以根据已知的程序使用上面已经提及的一种或多种适当的分散剂或湿润剂和悬浮剂配制。无菌可注射制剂也可以是在非毒性的、胃肠外可接受的稀释剂或溶剂(例如在1,3-丁二醇溶液)中的无菌可注射溶液或悬浮液。
用于通过吸入给药的组合物可以是处于常规加压气溶胶的形式，被安排为或者作为包含精细分散固体的气溶胶或液体液滴分配该活性成分。可以使用常规气溶胶喷射剂如挥发性氟化的烃或烃并且将气溶胶装置方便地安排为分配计量的量的活性成分。
对于配制品进一步的信息，读者可参考培格曼出版社1990的综合药物化学数据库(Comprehensive Medicinal Chemistry)(科温汉施(Corwin Hansch)；编辑部)，第5卷第25.2章。
结合一种或多种赋形剂以产生单一剂型的活性成分的量将必然变化，这取决于该治疗的主体和具体给药途径。例如，旨在用于口服给药至人类的配制品将总体上包含，例如从0.5mg至4g的活性试剂，混配适当的和方便的量的赋形剂，该赋形剂可以从约5至约98重量百分比的该总组合物变化。剂量单位形式将通常包含约1mg至约500mg的活性成分。对于给药途径和给药方案的进一步的信息，读者可参考培格曼出版社1990的综合药物化学数据库(Comprehensive Medicinal Chemistry)(科温汉施(Corwin Hansch)；编辑部)，第5卷第25.3章。
如以上所陈述的，具体的疾病状态的治疗性或预防性治疗所需的剂量大小将必然改变，这取决于所治疗的主体，给药途径和正在治疗的疾病的严重性。可以采用在0.1-50mg/kg范围内的每日剂量。因此，最佳剂量可以由正在治疗任何具体患者的医师确定。
本发明的这些化合物可以进一步与治疗有效量的一种或多种治疗癌症的试剂组合来给予，其中这些试剂的实例包括，例如辐射、烷化剂、血管生成抑制剂、抗体、抗代谢药、抗有丝分裂剂、抗增生剂、抗病毒剂、极光激酶抑制剂、细胞死亡活化剂(例如，Bcl-2、Bcl-xL、Bcl-w、Bfl-1、或Mcl-1的抑制剂)、死亡受体途径的活化剂、Bcr-Abl激酶抑制剂、BET(溴结构域蛋白)抑制剂、BiTE(双特异性T细胞接合器)抗体、抗体药物偶联物、生物应答调节剂、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂、细胞周期抑制剂、环氧合酶-2抑制剂、DVD(双重可变结构域抗体)、白血病病毒癌基因同系物(ErbB2)受体抑制剂、生长因子抑制剂、热休克蛋白(HSP)-90抑制剂、组蛋白脱乙酰基酶(HDAC)抑制剂、激素疗法、免疫药、细胞凋亡蛋白的抑制剂(IAP)、嵌入抗生素、激酶抑制剂、驱动蛋白抑制剂、Jak2抑制剂、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白抑制剂、微小RNA、丝裂原激活胞外信号-调节的激酶抑制剂、多价结合蛋白、非甾体抗炎药(NSAID)、聚ADP(腺苷二磷酸)-核糖聚合酶(PARP)抑制剂、铂化疗剂、polo样激酶(Plk)抑制剂、磷酸肌醇-3激酶抑制剂、蛋白体抑制剂、嘌呤类似物、嘧啶类似物、受体酪氨酸激酶抑制剂、etinoids/deltoids植物生物碱、小抑制核糖核酸酸类(siRNA)、拓扑异构酶抑制剂、泛素连接酶抑制剂、以及类似物，以及这些试剂的一种或多种组合。
烷化剂包括六甲蜜胺、AMD-473、AP-5280、阿帕齐醌(apaziquone)、苯达莫司汀、brostallicin、白消安、顺铂、卡铂、卡波醌、卡莫司汀(BCNU)、苯丁酸氮芥、
(拉莫司汀、VNP 40101M)、环磷酰胺、达卡巴嗪、雌莫司汀、福莫司汀、葡膦酰胺、异环磷酰胺、KW-2170、洛莫司汀(CCNU)、马磷酰胺(mafosfamide)、美法仑、二溴甘露醇、二溴卫矛醇、尼莫司汀、氮芥氮氧化物、亚硝基脲、奥沙利铂、雷莫司汀、替莫唑胺、塞替派、
(苯达莫司汀)、曲奥舒凡、rofosfamide以及类似物。
血管生成抑制剂包括内皮-特异性受体、(系结层-2)抑制剂((Tie-2)inhibitor)、表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂、胰岛素生长因子-2受体(IGFR-2)抑制剂、基质金属蛋白-2(MMP-2)抑制剂、基质金属蛋白-9(MMP-9)抑制剂、血小板衍生的生长因子受体(PDGFR)抑制剂、血小板反应蛋白类似物、血管内皮生长因子受体酪氨酸激酶(VEGFR)抑制剂、ALK抑制剂以及类似物。
抗代谢药包括
(培美曲塞二钠、LY 231514、MTA)、5-阿扎胞苷、
(卡培他滨)、卡莫氟、
(克拉屈滨)、氯法拉滨、阿糖胞苷、阿糖胞苷十八烷基磷酸盐、阿糖胞嘧啶、地西他滨、去铁胺、去氧氟尿苷、依氟鸟氨酸、EICAR(5-乙炔基-1-β-D-呋喃核糖基咪唑-4-甲酰胺)、依诺他滨、乙炔基胞苷、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶单独地或与叶酸组合、
(吉西他滨)、羟基脲、
(美法仑)、巯基嘌呤、6-巯基嘌呤核苷、甲氨蝶呤、麦考酚酸、奈拉滨、诺拉曲塞、十八烷基磷酸盐(ocfosfate)、吡利曲索(pelitrexol)、喷司他丁、pemextred、雷替曲塞、利巴韦林、triapine、三甲曲沙、S-1、噻唑呋林(tiazofurin)、替加氟、TS-1、阿糖腺苷、UFT以及类似物。
Bcl-2蛋白抑制剂包括ABT-199、AT-101((-)棉子酚)、
(G3139或奥利默森(Bcl-2-靶向反义寡核苷酸))、IPI-194、IPI-565、N-(4-(4-((4’-氯(1,1'-联苯基)-2-基)甲基)哌嗪-1-基)苯甲酰基)-4-(((1R)-3-(二甲氨基)-1-(苯基硫烷基)甲基)丙基)氨基)-3-硝基苯磺酰胺)(ABT-737)、N-(4-(4-((2-(4-氯苯基)-5,5-二甲基-1-环己-1-烯-1-基)甲基)哌嗪-1-基)苯甲酰基)-4-(((1R)-3-(吗啉-4-基)-1-((苯基硫烷基)甲基)丙基)氨基)-3-((三氟甲基)磺酰基)苯磺酰胺(ABT-263)、GX-070(奥巴克拉)以及类似物。
溴结构域蛋白抑制剂包括I-BET762、OTX-015、CPI-203、LY294002以及类似物。
CDK抑制剂包括BMI-1040、BMS-032、BMS-387、CVT-2584、黄酮吡多(flavopyridol)、GPC-286199、MCS-5A、PD0332991、PHA-690509、塞利西利(seliciclib)(CYC-202、R-核抑制剂(roscovitine))、ZK-304709以及类似物。
EGFR抑制剂包括EGFR抗体、ABX-EGF、抗-EGFR免疫脂质体、EGF-疫苗、EMD-7200、
(西妥昔单抗)、HR3、IgA抗体、
(吉非替尼)、
(埃罗替尼或OSI-774)、TP-38、EGFR融合蛋白、
(拉帕替尼)、AZD9291、以及类似物。
ALK抑制剂包括克唑替尼、色瑞替尼、以及类似物。
ErbB2受体抑制剂包括CP-724-714、CI-1033(卡奈替尼)、
(曲妥珠单抗)、
(拉帕替尼)、
(2C4、帕妥珠单抗)、TAK-165、GW-572016(ionafarnib)、GW-282974、EKB-569、PI-166、dHER2(HER2疫苗)、APC-8024(HE-2疫苗)、抗-HER/2neu双特异性抗体、B7.her2IgG3(作为HER2双官能的双特异性抗体)、mAB AR-209、mAB2B-1以及类似物。
抗体药物偶联物包括抗-CD22-MC-MMAF、抗-CD22-MC-MMAE、抗-CD22-MCC-DM1、CR-011-vcMMAE、PSMA-ADC、MEDI-547、SGN-19Am SGN-35、SGN-75以及类似物。
驱动蛋白抑制剂包括Eg5抑制剂，如AZD4877、ARRY-520；CENPE抑制剂，如GSK923295A以及类似物。
MEK抑制剂包括ARRY-142886、ARRY-438162、PD-325901，PD-98059，selumitinib、以及类似物。
铂化疗剂包括顺铂、
(奥沙利铂)、依他铂、洛铂、奈达铂、
(卡铂)、沙铂、吡铂以及类似物。
VEGFR抑制剂包括AVASTIN(贝伐单抗)、ABT-869、AEE-788、ANGIOZYMETM(抑制血管生成的核酶(核酶制药公司(Ribozyme Pharmaceuticals)(博尔德，科罗拉多州(Boulder,Colo.))和凯龙(埃默里维尔，加利福尼亚州(Emeryville,Calif.))、阿西替尼(AG-13736)、AZD-2171、CP-547,632、IM-862、MACUGEN(培加他尼)，
(索拉非尼、BAY43-9006)、帕唑帕尼(GW-786034)、瓦他拉尼(PTK-787、ZK-222584)、
(舒尼替尼SU-11248)、阿柏西普(VEGF-trap)，ZACTIMATM(凡德他尼、ZD-6474)、GA101、奥法木单抗、ABT-806(mAb-806)、ErbB3特异性抗体、BSG2特异性抗体、DLL4特异性抗体和C-met特异性抗体、以及类似物。
抗肿瘤抗生素包括嵌入抗生素阿柔比星、放线菌素D、氨柔比星、安那霉素、阿霉素、
(博来霉素)、柔红霉素、
或
(脂质体阿霉素)、依沙芦星、表柔比星、glarbuicin、
(伊达比星)、丝裂霉素C、奈莫柔比星、新制癌菌素、培洛霉素、吡柔比星、利拜卡霉素、stimalamer、链佐星、
(戊柔比星)、司他丁以及类似物。
DNA修复机制的抑制剂如CHK激酶；DNA-依赖性蛋白激酶抑制剂；聚(ADP-核糖)聚合酶的抑制剂(PARP抑制剂),包括ABT-888(veliparib)、奥拉帕尼(olaparib)、KU-59436、AZD-2281，AG-014699，BSI-201，BGP-15，INO-1001，ONO-2231以及类似物；和Hsp90抑制剂，如坦螺旋霉素和瑞他霉素。
蛋白酶体抑制剂包括
(硼替佐米)、卡非佐米、MG132、NPI-0052、PR-171以及类似物。
免疫药的实例包括干扰素和其他免疫增强剂。干扰素包括干扰素α、干扰素α-2a、干扰素α-2b、干扰素β、干扰素γ-1a、
(干扰素γ-1b)或干扰素γ-n1，它们的组合以及类似物。其他试剂包括
(IFN-α)、BAM-002(氧化的谷胱甘肽)、
(他索纳明)、
(托西莫单抗)、
(阿仑单抗)、CTLA4(细胞毒性淋巴细胞抗原4)、氨烯咪胺(decarbazine)、地尼白介、依帕珠单抗、
(来格司亭)、香菇多糖、白细胞α干扰素、咪喹莫特、MDX-010(抗CTLA-4)、黑素瘤疫苗、mitumomab、莫拉司亭、MYLOTARGTM(吉姆单抗奥佐米星)、
(非格司亭)、OncoVAC-CL、
(奥戈伏单抗)、pemtumomab(Y-muHMFG1)、
(西普鲁塞(sipuleucel)-T)、沙格司亭、西佐喃、替西白介素、
(卡介苗)、乌苯美司、
(免疫治疗药、Lorus药物)、Z-100(Maruyama的特异物质(SSM))、WF-10(四氯十氧化物(TCDO))、
(阿地白介素)、
(胸腺法新)、
(达珠单抗)、
(90Y-替伊莫单抗)以及类似物。
嘧啶类似物包括阿糖胞苷(ara C或阿拉伯糖苷C)、胞嘧啶阿拉伯糖苷、去氧氟尿苷、
(氟达拉滨)、5-FU(5-氟尿嘧啶)、氟尿苷、
(吉西他滨)、
(雷替曲塞)、TROXATYLTM(三乙酰尿苷油沙他滨)以及类似物。
抗有丝分裂剂包括巴他布林、埃坡霉素D(KOS-862)、N-(2-((4-羟基苯基)氨基)吡啶-3-基)-4-甲氧基苯磺酰胺、伊沙匹隆(BMS 247550)、紫杉醇、
(多西紫杉醇)、PNU100940(109881)、帕妥匹隆、XRP-9881(拉罗他赛(larotaxel))、长春氟宁、ZK-EPO(合成埃博霉素)以及类似物。
此外，具有化学式(I)的化合物可以与其他化学治疗剂组合，如ABRAXANETM(ABI-007)、ABT-100(法尼基转移酶抑制剂)、
(Ad5CMV-p53疫苗)、
或
(洛伐他汀)、
(聚I：聚C12U、合成的RNA)、
(依昔舒林)、
(帕米膦酸)、阿格拉滨(arglabin)、L-天冬酰胺酶、阿他美坦(1-甲基-3,17-二酮-雄甾-1,4-二烯)、
(他扎罗汀)、AVE-8062(风车子抑碱(combreastatin)衍生物)BEC2(米托莫单抗(mitumomab))、恶液质素或cachexin(肿瘤坏死因子)、康维辛(canvaxin)(疫苗)、
(癌症疫苗)、
(西莫白介素(celmoleukin))、
(二盐酸组胺)、
(人类乳头状瘤病毒疫苗)、
(C：
(环磷酰胺)；H：
(多柔比星)；O：长春新碱
P：泼尼松)、CYPATTM(醋酸环丙孕酮)、风车子抑碱A4P、DAB(389)EGF(通过His-Ala接头与人表皮生长因子融合的白喉毒素的催化域和转运域)或TransMID-107RTM(白喉毒素)、达卡巴嗪、更生霉素、5,6-二甲基咕吨酮-4-乙酸(DMXAA)、恩尿嘧啶、EVIZONTM(角鲨胺乳酸酯)、
(T4N5脂质体洗剂)、海绵内酯、DX-8951f(依沙替康甲磺酸盐)、enzastaurin、EPO906(埃坡霉素B)
(四价人乳头状瘤病毒(类型6、11、16、18)重组疫苗)、
GMK(神经节苷脂结合疫苗)、
(前列腺癌疫苗)、常山酮、组氨瑞林、羟基脲、伊班膦酸、IGN-101IL-13-PE38、IL-13-PE38QQR(贝辛白介素(cintredekinbesudotox))、IL-13-假单胞菌外毒素、干扰素α、干扰素γ、JUNOVANTM或MEPACTTM(米伐木肽)、氯那法尼、5,10-亚甲基四氢叶酸酯、米替福新(十六烷基胆碱磷酸)、
(AE-941)、
(三甲葡糖醛)、
(喷司他丁)、
(核糖核酸酶)、
(黑素瘤疫苗治疗)、
(IL-2疫苗)、ORATHECINTM(卢比替康)、
(抗体细胞药物)、
单抗(鼠单克隆抗体)、紫杉醇、PANDIMEXTM(由含20(S)原人参二醇(aPPD)和20(S)原人参三醇(aPPT)的人参得到的苷元皂苷)、帕尼单抗、
(研究中的癌症疫苗)、培门冬酶、PEG干扰素、苯妥帝尔、丙卡巴肼、瑞马司他(rebimastat)、
(卡妥索单抗)、
(来那度胺)、RSR13(乙法昔罗)、
LA(兰瑞肽)、
(阿维A)、星形孢菌素(星孢链霉素)、他波司他(PT100)、
(贝沙罗汀)、
(DHA紫杉醇)、
(坎磷酰胺(canfosfamide)、TLK286)、temilifene、
(替莫唑胺)、替米利芬、沙利度胺、
(STN-KLH)、thymitaq(2-氨基-3,4-二氢-6-甲基-4-氧代-5-(4-吡啶硫基)喹唑啉二盐酸盐)、TNFERADETM(腺病毒载体：DNA载体含有该基因对肿瘤坏死因子α)、
或
(波生坦)、维甲酸(全反维A酸)、粉防己碱、
(三氧化二砷)、
UKRAIN(由较大的白屈菜植物得到的生物碱衍生物)、vitaxin(抗-αVβ3抗体)、
(莫特沙芬钆)、XINLAYTM(阿曲生坦)、XYOTAXTM(聚谷氨酸紫杉醇)、
(曲贝替定)、ZD-6126、
(右雷佐生)、
(唑来膦酸)、佐柔比星以及类似物。
在此，当使用术语“组合”时，应理解的是这是指同时、分开或顺序给药。在本发明的一个实施例中，“组合”是指同时给药。在本发明的另一个实施例中，“组合”是指单独给药。在本发明的另一个实施例中，“组合”是指顺序给药。在顺序或分开给药时，给予该第二组分的延迟不应该使得失去该组合的有益作用。此类组合产物在上文描述的剂量范围内采用本发明的这些化合物、或其药学上可接受的盐、以及在其批准的剂量范围内的其他药物活性试剂。该联合疗法可以提供“协同作用”并且证明是“协同的”，即，当这些活性成分一起使用时所实现的效果将是大于分开使用这些化合物产生的效果的总和。在以下情况下可以达到协同作用，该活性成分是：(1)同时以组合的单位剂量配制品共配制和给予或递送的；(2)作为分开的配制品通过交替或平行递送的；或(3)通过一些其他方案。当以交替治疗递送时，当这些化合物是例如，通过分开的注射器的不同注射顺序地给予或递送时，可以达到一种协同作用。总体上，在交替治疗过程中，顺序地，即连续地给予每种活性成分的有效的剂量，而在联合疗法中，一起给予两种或更多种活性成分的有效剂量。
在以上提到的本发明的这些药物组合物、过程、方法、用途、药物、和制造特征中的任一项中，在此描述的本发明的这些化合物的替代实施例中的任一项同样适用。
在本发明另一个方面中，具有化学式(I)的化合物是根据以下通用途径制备的。
途径A
一些具有化学式(I)的化合物可以从另一种具有化学式(I)的化合物获得；例如，如果含有氨基基团、通过酰化(在本领域中熟知的条件下)，其中A、R2、和R4是如对于化学式(I)中所定义。
注意，适当的保护基团可以用于任何途径，如本领域中熟知的那些：例如，对于氨基：叔丁氧基羰基或(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)；对于羟基：叔丁基二甲基甲硅烷基或四氢吡喃-2-基。脱保护条件是本领域众所周知的。
途径B
其他具有化学式(I)的化合物可以通过使具有化学式(II)的化合物：
其中L是卤素原子(例如氯)或三氟甲磺酸盐基团与具有化学式(III)的化合物反应制备：
该反应可以在本领域的技术人员熟知的标准条件下进行，例如在钯源(例如四(三苯基膦)钯(0)或乙酸钯(II))、可任选地膦配体(例如Xantphos)、以及适合的碱(例如碳酸铯)存在下进行。
具有化学式(II)的化合物可以通过使具有化学式(IV)的化合物
与具有化学式(V)的化合物反应制备R4-L
Y是硼酸、硼酸酯或三氟硼酸钾基团(例如硼酸、硼酸频哪醇酯、或三氟硼酸钾)并且L是卤素原子(例如氯或溴)或三氟甲磺酸盐基团。该反应可以在本领域的技术人员熟知的标准条件下进行，例如在钯源和膦配体(例如四(三苯基膦)钯(0)、[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)(也称为Pd(dppf)Cl2)、以及适合的碱(例如碳酸铯或磷酸钾)存在下进行。
可替代地，具有化学式(II)的化合物可以通过使具有化学式(XIV)的化合物
与具有化学式(IX)的化合物反应制备：R4-Y
Y是硼酸、硼酸酯或三氟硼酸钾基团(例如硼酸、硼酸频哪醇酯、或三氟硼酸钾)，L1和L2是卤素原子或三氟甲磺酸盐基团，其中L1在该偶联反应过程中反应性小于L2，例如其中L1是氯并且L2是碘。该反应可以在本领域的技术人员熟知的标准条件下进行，例如在钯源和膦配体(例如第二代XPhos预催化剂、以及适合的碱(例如磷酸钾))存在下进行。
可替代地，具有化学式(II)的化合物可以通过使具有化学式(XIV)与具有化学式(XII)：R4-H的化合物通过例如描述于实例中间体50中的“C-H活化”反应进行反应来制备：其中L1和L2是卤素原子或三氟甲磺酸盐基团，其中L1在该偶联反应过程中反应性小于L2，例如其中L1是氯并且L2是碘。
途径C
一些具有化学式(I)的化合物例如可以通过使具有化学式(VI)的化合物
与具有化学式(VII)的化合物反应制备：
用于此反应的适合的偶联试剂包括例如，1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺、O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(还称为HATU)、TBTU(2-(1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基异脲四氟硼酸盐)，1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐离子或1-丙烷膦酸酐(T3P)，优选1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺或1-丙烷膦酸酐(T3P)。
该反应是在适合的碱的存在下方便地进行的。适合的碱是，例如，有机胺碱(例如像，吡啶、2,6-二甲基吡啶、三甲基吡啶、4-二甲基氨基吡啶、三乙胺、N-甲基吗啉、二氮杂二环[5.4.0]十一碳-7-烯、二异丙基乙胺、或例如，碱金属或碱土金属碳酸盐或氢氧化物，例如碳酸钠、碳酸钾、碳酸钙、氢氧化钠或氢氧化钾；
具有化学式(VI)的化合物可以通过使具有化学式(VIII)的化合物
与具有化学式(IX)的化合物反应制备：R4-Y
L是卤素原子(例如碘或溴)或三氟甲磺酸盐基团。
Y是硼酸、硼酸酯或三氟硼酸钾基团(例如硼酸、硼酸频哪醇酯、或三氟硼酸钾)
该反应可以在本领域的普通技术人员熟知的标准条件下进行，例如在钯源和膦配体，(例如四(三苯基膦)钯(0)、[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)(也称为Pd(dppf)Cl2)、以及适合的碱(例如碳酸铯或碳酸钾)的存在下进行。
具有化学式(VIII)的化合物可以通过使具有化学式(X)的化合物通过与氨反应(如描述于实例2和86中)制备
L是卤素原子(例如碘或溴)或三氟甲磺酸盐基团。
应理解的是具有化学式(VIII)的化合物可以转化成另一种具有化学式(VIII)化合物，例如在实例39中所示的(6-氨基-4-氯烟酸腈的制备)。
途径D
其他具有化学式(I)的化合物例如可以通过使具有化学式(XI)的化合物与具有化学式(IX)R4-Y的化合物反应制备：
L是卤素原子(例如碘、溴或氯)或三氟甲磺酸盐基团。
Y是硼酸、硼酸酯或三氟硼酸钾基团(例如硼酸、硼酸频哪醇酯、或三氟硼酸钾)
该反应可以在本领域的技术人员熟知的标准条件下进行，例如在钯源和膦配体(例如：第二代XPhos预催化剂(也称为氯(2-二环己基膦基-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯基)[2-(2'-氨基-1,1'-联苯基)]钯(II))、或[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II))和适合的碱(例如磷酸钾或碳酸铯)存在下进行。
可替代地，具有化学式(I)的化合物例如可以通过具有化学式(XI)的化合物与具有化学式(XII)R4-H的化合物反应，通过如描述于实例7或22中的“C-H活化”反应制备。
具有化学式(XI)的化合物可以通过使具有化学式(VIII)的化合物
L是卤素原子(例如碘、溴或氯)或三氟甲磺酸盐基团。
与具有化学式(VII)的化合物反应制备：
用于此反应的适合的偶联试剂包括例如，O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐、HATU、TBTU(2-(1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基异脲四氟硼酸盐)或1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐离子，优选1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺和1-丙烷膦酸酐(T3P)。
该反应是在适合的碱的存在下方便地进行的。适合的碱是，例如，有机胺碱(例如像，吡啶、2,6-二甲基吡啶、三甲基吡啶、4-二-甲基氨基吡啶、三乙胺、N-甲基吗啉、二氮杂二环[5.4.0]十一碳-7-烯、二异丙基乙胺、或例如，碱金属或碱土金属碳酸盐或氢氧化物，例如碳酸钠、碳酸钾、碳酸钙、氢氧化钠或氢氧化钾。应理解的是任何具有化学式(XI)的化合物可以转化为另一种具有化学式(XI)的化合物，例如通过如在实例39或75中的氨基基团的酰化。
途径E
一些具有化学式(I)的化合物例如可以通过使具有化学式(XIII)的化合物与具有化学式(V)R4-L的化合物反应制备：
Y是硼酸、硼酸酯或三氟硼酸钾基团(例如硼酸、硼酸频哪醇酯、或三氟硼酸钾)
L是卤素原子(例如碘或溴)或三氟甲磺酸盐基团。
该反应可以在本领域的技术人员熟知的标准条件下进行，例如在钯源和膦配体(例如四(三苯基膦)钯(0)、[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)(也称为Pd(dppf)Cl2)、以及适合的碱(例如碳酸铯或磷酸钾)存在下进行。
具有化学式(XIII)的化合物例如可以通过具有化学式(XI)的化合物的反应制备，如描述于实例16中的。
途径F
一些具有化学式(I)的化合物例如可以通过使具有化学式(XV)的化合物“环化”反应制备：
其中R40是
其中X1和Y1是这样定义的，如(XV)是在该环化反应中的前体，其条件是X1和Y1连同该它们附接至其上的原子不形成环。例如，X1或Y1可以是氢。
该“环化”反应可以在本领域普通技术人员所熟知的标准条件下进行。作为示例，实例78和82描述了此种“环化”反应的具体实例。
具有化学式(XV)的化合物可以通过对于制造具有化学式(I)的化合物描述的类似于途径A至E的途径获得。作为实例，通过与途径D类比，具有化学式(XV)的化合物可以通过使具有化学式(XI)化合物与具有化学式(XVI)：R40-Y的化合物反应制备：
L是卤素原子(例如碘、溴或氯)或三氟甲磺酸盐基团。
Y是硼酸、硼酸酯或三氟硼酸钾基团(例如硼酸、硼酸频哪醇酯、或三氟硼酸钾)。
可替代地，具有化学式(XV)的化合物例如可以通过使具有化学式(XI)的化合物与具有化学式(XVII)R40-H的化合物反应，通过“C-H激活”反应制备。
该反应可以在本领域技术人员熟知的标准条件下进行，如在途径D中所描述的
具有化学式(IX)R4-Y的化合物，其中Y是硼酸、硼酸酯或三氟硼酸钾基团(例如硼酸、硼酸频哪醇酯、或三氟硼酸钾)是对于具有化学式(I)的化合物的一些合成途径中的关键的中间体。
从具有化学式(V)R4-L的化合物合成具有化学式(IX)的化合物的方法，其中L是卤素原子(例如碘、溴或氯)或三氟甲磺酸盐基团，包括金属化/硼基化反应(如在实例23和85中所展示的)以及钯-催化的硼化(如通过实例14所展示的)。
具有化学式(V)R4-L的化合物是典型地从具有化学式|(XII)R4-H的化合物通过卤化反应可得的。
具有化学式(IX)R4-Y的化合物，其中Y是硼酸、硼酸酯或三氟硼酸钾基团(例如硼酸、硼酸频哪醇酯、或三氟硼酸钾)还可以直接从具有化学式(XII)R4-H的化合物，通过‘C-H活化’反应(如实例49中所展示的)可得。典型的条件使用铱催化剂(典型地是甲氧基(环辛二烯)铱(I)二聚体)以及配体((典型地是4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶基或3,4,7,8-四甲基-1,10-菲咯啉)与硼来源(典型地是4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷)在惰性溶剂(典型地是THF或二噁烷)中在约50℃至90℃下。
应理解的是本发明化合物中的这些不同环取代基中的某些可以将通过标准芳香取代反应引入或在以上提及的这些方法之前或紧随其后通过常规官能团修饰产生，并且照原样包括在本发明的方法的方面中。此类反应和修饰包括，例如，通过芳香族取代反应、取代基的还原、取代基的烷基化和取代基的氧化引入取代基。用于此类规程的试剂和反应条件是在化学领域熟知的。芳香取代反应的具体实例包括使用浓硝酸引入硝基基团，使用例如酰卤以及路易斯酸(如三氯化铝)在弗里德尔-克拉夫茨条件下引入酰基基团；使用烷基卤化物以及路易斯酸(如三氯化铝)在弗里德尔-克拉夫茨条件下引入烷基基团；以及卤素基团的引入。修饰的具体实例包括例如通过用镍催化剂催化氢化或用铁在盐酸存在下同时加热处理而还原硝基基团为氨基基团；氧化烷硫基为烷基亚磺酰基或烷基磺酰基。
还将会了解的是在此提及的一些反应中可能有必要/令人希望的是保护化合物中的任何敏感基团。其中保护是必要的或令人希望的情况以及用于保护的适当方法是本领域的普通技术人员已知的。常规保护基团可以根据标准实践使用(出于说明，参见T.W.格林(Green)，有机合成中的保护基团(Protective Groups in OrganicSynthesis)，约翰·威利父子出版公司(JohnWiley and Sons)，1991)。因此，如果反应物包括基团，例如氨基、羧基或羟基，可能所希望的是在此处所提及的某些反应中保护该基团。
用于氨基或烷氨基基团的适合的保护基是例如，酰基基团，例如链烷酰基基团，例如乙酰基、烷氧基羰基基团，例如甲氧基羰基、乙氧基羰基或叔-丁氧基羰基基团、芳基甲氧基羰基基团，例如苄氧基羰基、或芳酰基基团，例如，苯甲酰基。用于以上保护基团的脱保护条件必然随着保护基团的选择而变化。因此，例如，酰基基团(例如，链烷酰基或烷氧基羰基基团或芳酰基基团)可以例如通过用适合的碱(例如碱金属氢氧化物，例如氢氧化锂或氢氧化钠)水解被去除。可替代地，酰基基团如(叔-丁氧基羰基基团)可以例如通过用合适的酸(如盐酸、硫酸、或磷酸或三氟乙酸)处理被去除，并且芳基甲氧基羰基基团(如苄氧基羰基基团)可以例如通过在催化剂(如-钯-碳)上氢化或通过用路易斯酸(例如三(三氟乙酸)硼)处理被去除。用于伯氨基基团的合适的替代保护基团是，例如，邻苯二甲酰基团，该基团可以通过用烷基胺(例如二甲基氨基丙胺)或用肼处理被去除。
用于羟基基团的适合的保护基是，例如，酰基基团，例如链烷酰基基团，例如乙酰基、芳酰基基团、例如苯甲酰基、或芳基甲基基团，例如苄基。使以上保护基团脱保护的条件将必然随着保护基团的选择而变化。因此，例如，酰基基团(例如，链烷酰基或芳酰基基团)可以例如通过与适合的碱(例如碱金属氢氧化物，例如氢氧化锂或氢氧化钠)水解被去除。可替代地，芳基甲基基团如苄基基团可以通过例如在催化剂(如钯碳)上的氢化被去除。
用于羧基基团的适合的保护基是，例如，酯化基团，例如甲基或乙基基团，该基团可以例如通过用碱(如氢氧化钠)水解被去除，或例如叔丁该基团，其可以例如通过用酸(例如有机酸，诸如三氟乙酸)处理去除，或例如苄基基团，其可以例如通过在催化剂(如钯碳)上的氢化被去除。
该保护基团可以在该合成的任何方便的阶段使用在化学领域中熟知的常规技术被去除。
根据本发明的另一个方面，提供了一种药物组合物，该药物组合物包含具有化学式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，该盐是如在此关于药学上可接受的稀释剂或载体所定义的。
应理解的是具有化学式(I)的化合物可以通过从具有化学式(I)的化合物的混合物分离(例如手性分离)获得；对于实例9和2、41和42、43和14、59和60、61和62、64和65，68和69、70和71，72和73、79和80、83和84。
一些具有化学式(II)、(V)、(VI)、(IX)、(XI)、(XII)、(XIII)、(XV)、(XVI)和(XVII)的化合物是新颖的。
(1S,3R)-3-(乙酰胺基)环己烷甲酸是一些具有化学式(I)的化合物的合成中的关键中间体。以下途径(以下示意性的，描述于实例85中)，给出对映异构体纯的形式的这种关键中间体的获得，是新颖的并且有用的。
(1S,3R)-3-(乙酰胺基)环己烷甲酸
这种途径基于3-氨基环己基甲酸异丙基酯(使用诺维信(Novozym)435)酶的对映选择性酰化，如以下所展示的：
实例
本披露的多个方面可以通过参考以下非限制性实例进一步定义，这些实例详细描述了本披露的某些化合物和中间体的制备以及用于使用本披露的化合物的方法。本领域普通技术人员应当清楚的是可以实践对于材料和方法两者的许多修改而不偏离本披露的范围。
除非另行说明：
(i)操作在环境温度下进行，即在17℃至25℃的范围内并且在惰性气体如氮气气氛下进行，除非另行说明；
(ii)蒸发通过旋转蒸发或使用Genevac设备或Biotage v10蒸发器在真空中进行并且处理(work-up)程序在通过过滤去除残余固体之后进行；
(iii)快速层析法纯化在自动化Teledyne Isco
Rf或TeledyneIsco
上使用预装的RediSep Rf GoldTM硅胶柱(20-40μm，球形颗粒)，GraceResolvTM筒(
二氧化硅)或Silicycle筒(40-63μm)进行。
(iv)制备型层析法经吉尔森(Gilson)制备型HPLC仪用UV收集进行；可替代地，制备型层析法经沃特斯自动纯化HPLC-MS仪用MS和UV引发收集进行；
(v)手性制备型层析法经吉尔森仪用UV收集(233注射器/部分收集器、333&334泵、155UV检测器)或Varian Prep Star仪(2xSD1泵、325UV检测器、701级分收集器)、带有用吉尔森305注射运行的泵进行；可替代地，手性制备型层析法经沃特斯制备型100SFC-MS仪用MS-和UV引发收集或经Thar MultiGram III SFC仪用UV收集进行。
(vi)产率(当存在时)不一定是可获得的最大值；
(vii)一般而言，具有化学式I的终末-产物的结构通过核磁共振(NMR)谱确认；NMR化学位移值是以δ级测量的[质子磁共振光谱使用Bruker Avance 500(500MHz)或BrukerAvance 400(400MHz)仪测定]；测量在环境温度下进行,除非另行说明；使用以下缩写：s，单峰；d，二重峰；t，三重峰；q，四重峰；m，多重峰；dd，双二重峰；ddd，双二重峰的双重峰；dq，双四重峰；dt，双三重峰；tt，三三重峰；p，五重峰；br，宽峰信号。
(viii)一般而言，具有化学式I的终-末产物在液相层析法之后还通过质谱法来表征(LCMS或UPLC)；如下进行UPLC：使用配备有沃特斯SQ质谱仪的沃特斯UPLC(柱温度40，UV＝220-300nm，质谱＝具有阳性/阴性转换的ESI)以1mL/min流速使用97％A+3％B至3％A至97％B的溶剂系统进行1.50min(连同平衡回到起始条件等的总运行时间1.70分钟)，其中A＝在水中0.1％甲酸(用于酸工作)或在水中0.1％氨(用于碱工作)B＝乙腈。对于酸分析使用的柱是沃特斯Acquity HSS T31.8μm 2.1x 50mm，对于碱分析使用的柱是沃特斯AcquityBEH 1.7μm 2.1x 50mm。可替代地，如下进行UPLC：使用配备有沃斯特SQ质谱仪的沃特斯UPLC(柱温度30，UV＝210-400nm、质谱＝具有阳性/阴性转换的ESI)以1mL/min的流速使用2％至98％B的溶剂梯度进行1.5分钟(连同平衡回到起始条件的总运行时间：2min)，其中A＝在水中0.1％甲酸并且B＝在乙腈中0.1％的甲酸(用于酸工作)或A＝在水中0.1％氢氧化铵；并且B＝乙腈(用于碱工作)。对于酸分析使用的柱是沃特斯Acquity HSS T3 1.8μm2.1x 30mm，对于碱分析使用的柱是沃特斯Acquity BEH C18 1.7μm 2.1x 30mm；如下进行LCMS：使用装配有沃特斯ZQ ESCi质谱仪和Phenomenex Gemini–NX(5μm x2.1mm)柱的沃特斯Alliance HT(2795)以1.1mL/min的流速，95％A至95％B进行4min，具有0.5min的保持时间。将改性剂保持在恒定的5％C(50:50乙腈:0.1％甲酸的水)或D(50:50乙腈:水0.1％氢氧化铵)，取决于它是酸性或碱性方法。应理解的是，除非另外指明，否则仅报道最具特征的质量峰，四舍五入到较低单位。典型地，当存在一个原子的若干同位素时，仅报道最常见的同位素(例如35Cl、79Br、12C……)
(ix)离子交换的纯化总体上是使用SCX-2(Biotage)筒进行。
(x)中间体纯度通过薄层层析、质谱的、HPLC(高效液相层析)和/或NMR分析来评估；
(xi)旋光度以度测量；
(xii)XRPD分析使用Bruker D4衍射仪进行，该衍射仪可商购自布鲁克AXS公司(BrukerAXS Inc.TM)(麦迪逊，威斯康星州)。该XRPD光谱通过将用于分析的材料样品(约20mg)安装在单硅晶体晶片支架上(例如，布鲁克硅零背景X射线衍射样品架)并且借助于显微镜载片将该样品铺展成薄层获得。将该样品以30转/分钟旋转(以改善计数统计)并且用由在40kV和40mA下操作的铜制长细聚焦管产生的具有1.5406埃(即，约1.54埃)的波长的X射线来照射。以θ-θ模式中在从2°至40°的2-θ的范围内，使样品每0.02°的2-θ增量(连续扫描模式)暴露1秒。该运行时间是31分钟41秒。本领域技术人员理解XRPD 2θ值可以在合理的范围内变化，例如在±0.1°2θ范围内。本领域技术人员理解，当出于各种各样的原因(包括例如优选的取向)，对于基本上相同的晶体形式进行测量时，XRPD强度可以变化。XRPD的原理描述于出版物，例如，像Giacovazzo,C.等人，(1995)，晶体学基础(Fundamentals ofCrystallography)，牛津大学出版社；詹金斯(Jenkins)，R.和斯奈德(Snyder)，R.L.(1996)，X射线粉末衍射法介绍(Introduction to X-Ray Powder Diffractometry)，约翰威立父子公司(John Wiley&Sons)，纽约；以及奎布(Klug)，H.P.&亚历山大(Alexander)，L.E.，(1974)、X-射线衍射程序(X-ray Diffraction Procedures)，约翰·威利父子出版公司(John Wileyand Sons)，纽约。因为相对强度是较不可靠的并且使用以下定义代替数值。
在衍射图中发现的一些另外的非常弱的峰已经被省略。
(xiii)使用TA仪(型号Q1000)进行DSC。将样品(大约2mg)称量到铝样品盘中并且转移到该DSC。将该仪器用氮气以50mL/min吹扫并且使用10℃/min的动态加热速率收集在25℃与300℃之间的数据。对于根据标准方法制备的样品，使用可获得自TA
(纽卡斯尔，特拉华州)的Q SERIESTM Q1000DSC热量计进行DSC分析。将该仪器用氮气以50mL/min吹扫并且使用10℃/分钟的动态加热速率收集在25℃与300℃之间的数据。将热数据使用标准软件，例如，来自TA
的通用v.4.5A进行分析。
(xiv)热重法分析(TGA)：使用TA仪(型号Q5000)进行TGA。将样品(大约5mg)放入铝样品盘中并且插入到TGA炉内。将该仪器用氮气以50mL/min吹扫并且使用10℃/min的动态加热速率收集在25℃与300℃之间的数据。将热数据使用标准软件，例如，来自TA
的通用v.4.5A进行分析。
(xv)使用以下缩写：
第二代XPhos(或X-Phos)预催化剂氯(2-二环己基膦基-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯基)[2-(2'-氨基-1,1'-联苯基)]钯(II)
第三代RuPhos预催化剂
(2-二环己基膦基-2',6'-二异丙氧基-1,1'-联苯基)[2-(2'-氨基-1,1'-联苯基)]钯(II)甲磺酸盐
aq. 水性
atm 大气压
BuLi 正-丁基锂
CDCl3 氘-氯仿
CD3OD 氘-甲醇
CDI 羰基-二咪唑
Conc. 浓缩的
DCM 二氯甲烷
DIPEA N,N-二-异丙基乙基胺
DMA N，N-二甲基乙酰胺
DMF N,N-二甲基甲酰胺
DMSO 二甲基亚砜
DMSO-d6 氘-二甲基亚砜
dppf 1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁
DSC 差示扫描量热法
EtOH 乙醇
EtOAc 乙酸乙酯
HATU 1-[双(二甲氨基)亚甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓3-氧化物六氟磷酸盐
h 小时
IPA/iPrOH 异丙醇
MeCN 乙腈
MeOH 甲醇
MTBE 甲基-叔丁基醚
NBS N-溴代琥珀酰亚胺
NIS N-碘代琥珀酰亚胺
NMP N-甲基吡咯烷
PdCl2(dppf) [1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]-二氯钯(II)
Pd(P(Cy)3)2Cl2 双(三环己基膦)二氯钯(II)
r.t. 室温
SCX/SCX-2 强阳离子交换层析法
SEM-Cl 2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基氯化物
SFC 超临界流体层析
TBS/TBDMS 叔丁基二甲基甲硅烷基
TBS-Cl 叔丁基二甲基甲硅烷基氯化物
TEA 三乙胺
TFA 三氟乙酸
TGA 热重法分析
THF 四氢呋喃
TMEDA 四甲基乙二胺
Xantphos 4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基呫吨
XRPD X射线粉末衍射
实例1：(R)-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)哌啶-3-甲酰胺
将TFA(2mL，26.0mmol)逐滴添加至在DCM(5mL)中的(R)-叔丁基3-((5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-哌啶-1-甲酸酯(0.40g，0.52mmol)中。将所得混合物在室温下搅拌1，之后在减压下浓缩。将所得粗产物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μm二氧化硅、30mm直径、100mm长度)使用水(含有0.1％碳酸铵)以及MeCN的渐减极性混合物作为洗脱液进行纯化。将含有所希望的化合物的部分进行浓缩为干燥以提供(R)-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)哌啶-3-甲酰胺(22.0mg，11.7％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CD3OD,22℃)1.41-1.52(1H,m),1.57-1.68(2H,m),1.85-1.94(5H,m),2.48-2.57(2H,m),2.68-2.76(1H,m),2.80-2.89(3H,m),2.97-3.03(1H,m),3.78-3.84(2H,m),7.04(1H,s),8.10(1H,s),8.29(1H,s)，未观察到酰胺以及哌啶NH。m/z:ES+[M+H]+360。
用于制备起始材料(R)-叔丁基3-((5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-哌啶-1-甲酸酯的程序描述如下：
3-(2,5-二氯吡啶-4-基)-5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶的制备
在氮气下将碳酸铯(3.24g，9.95mmol)添加到3-溴-5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶(500mg，2.49mmol)、(2,5-二氯吡啶-4-基)硼酸(3.34g，17.4mmol)、Pd(dppf)Cl2·CH2Cl2(203mg，0.25mmol)、二噁烷(10mL)、以及水(1mL)中。将所得混合物在90℃下搅拌2h。将该反应混合物在减压下浓缩为干燥并且再溶解在EtOAc(50mL)中，之后是顺序地用水(2x20mL)和饱和水性氯化钠(50mL)洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，在石油醚中0至25％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯部分进行浓缩为干燥，以提供3-(2,5-二氯吡啶-4-基)-5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶(500mg，75.0％)，为棕色固体。m/z:ES+[M+H]+268。
(R)-叔丁基3-((5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-哌啶-1-甲酸酯的制备
在氮气下将3-(2,5-二氯吡啶-4-基)-5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶(460mg，1.72mmol)添加至(R)-叔丁基3-氨甲酰基哌啶-1-甲酸酯(470mg，2.06mmol)、Pd(PPh3)4(198mg，0.17mmol)、碳酸铯(1.68g，5.15mmol)、Xantphos(199mg，0.34mmol)、和二噁烷(8mL)中。将所得混合物在120℃下搅拌2h。然后将该反应混合物过滤，并且将所得滤液通过快速硅胶层析，在石油醚中0至50％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供(R)-叔丁基-3-((5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-哌啶-1-甲酸酯(400mg，50.7％)，为黄色的油。m/z:ES+[M+H]+460。
实例2：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
在0℃下将乙酰氯(1.0mL，14.5mmol)逐滴添加到在DCM(58.5mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(2.46g，6.59mmol)和吡啶(6.40mL，79.1mmol)混合物中。在45min之后，将该混合物用饱和水性碳酸氢钠和饱和水性氯化钠进行洗涤，之后是经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得深琥珀色油通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％甲醇的洗脱梯度进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(经三个步骤2.6g，93％产率)，为淡米色泡沫状固体。(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺通过分析型SFC条件(参见下文)的分析确定这种材料包含98％的(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(Rt＝1.42分钟)和2％的(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(Rt＝2.42min)。将这种材料通过制备型SFC条件(Chiralpak IA柱，5μm，30mm直径，250mm长度，40℃柱温，100巴出口压力，120mL/min的流速)，用CO2中含0.1％二甲基乙胺的40％甲醇洗脱进行纯化，以除去(1R,3S)对映异构体。将用于较快洗脱对映异构体的产物部分在减压下进行浓缩以提供2.3g琥珀色-粉红色固体。将该固体通过快速硅胶(塞(plug))层析、在乙酸乙酯中0至10％MeOH的洗脱梯度再纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(2.25g)，为白色泡沫状固体。将该产物用20mL的乙腈处理并将所得混合物加温至回流条件，之后允许冷却至室温。添加另外的乙腈(约5mL)并且将该过程重复直到所有固体溶解。将所得淡黄色溶液冷却至室温，且形成了沉淀。在1h之后，将沉淀过滤并且用乙腈洗涤，之后是在真空下在-65℃下干燥持续1h。将该固体冷却至室温以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(1.76g)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.97-1.17(1H,m),1.20-1.38(3H,m),1.68-1.94(9H,m),1.96-2.07(2H,m),2.54-2.68(1H,m),2.80(2H,t),3.46-3.65(1H,m),4.14(2H,t),7.73(1H,d),7.76(1H,s),8.14(1H,s),8.38(1H,s),10.57(1H,s)。m/z:ES+[M+H]+416。
分析型SFC条件：
旋光度：
实例2的这些晶体是通过XRPD进行分析的并且将结果进行列表并且在图7中出示。固体的XRPD证实该固体包含实例2形式B。
实例2形式B主峰在下表1中示出：
| 峰 | 2θ | 强度％ |
| 1 | 21.2 | 100.0(vs) |
| 2 | 27.4 | 88.7(vs) |
| 3 | 20.5 | 76.4(vs) |
| 4 | 13.6 | 74.4(vs) |
| 5 | 21.6 | 58.1(vs) |
| 6 | 5.5 | 45.7(vs) |
| 7 | 26.7 | 43.8(vs) |
| 8 | 16.1 | 41.4(vs) |
| 9 | 6.8 | 37.0(vs) |
| 10 | 22.8 | 35.3(vs) |
根据本发明，提供了晶体形式，形式B，它具有在约2-θ＝5.5°，6.8°，13.6°，16.1°，20.5°，21.2°，21.6°，22.8°，26.7°，27.4°下的特异峰的X射线粉末衍射图。
自实例2获得的这些晶体(形式B)通过热技术进行分析。DSC分析表明形式B具有几个热事件，包括具有在150℃的开始点以及在153℃的峰的放热事件，随后是具有在201℃开始点以及在202℃的峰的熔融。TGA表明形式B在从22℃加热至150℃时展现出约4.5％的质量损失。代表性DSC/TGA热谱图示于图8中。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
5-氯-4-碘吡啶-2-胺的制备
将该反应分流到4个分开的密封微波反应容器中，各自包含750mg(2.95mmol)的5-氯-2-氟-4-碘吡啶，8.4mL的浓缩的水性氢氧化铵、和7.5mL的NMP。将这些反应容器各自在100℃下加热17h。然后将合并的批次用水稀释(50mL)并用EtOAc萃取(3x 120mL)。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩以提供淡黄色的油。将该油装载到20gSCX-2柱上并且用DCM、MeOH和在MeOH中1％NH3顺序地洗脱。将碱性的部分进行浓缩，以提供所希望的产物，为无色固体(2.9g，99％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)6.21(2H,s),7.05(1H,s),7.93(1H,s).m/z:ES+[M+H]+255。
5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺的制备
将碳酸铯(13.4g，41.2mmol)和PdCl2(dppf)CH2Cl2(0.94g，1.2mmol)顺序地添加到被脱气的5-氯-4-碘吡啶-2-胺(4.19g，16.5mmol)、3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并-[1,5-a]吡啶(5.72g，23.1mmol)、1,4-二噁烷(141mL)和水(23.5mL)的混合物中。将生成的红色混合物加温至95℃并且变澄清。伴随剧烈搅拌形成一些沉淀物，该沉淀逐渐大部分地再溶解。在4h后，添加另一个800mg的硼酸酯；在另一个40分钟之后，将该反应冷却至室温并且在这些条件下搅拌18h。然后将该混合物用乙酸乙酯稀释，并且分离各层。将有机层用饱和水性氯化钠洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得到的油通过快速硅胶层析，在乙酸乙酯中0至10％的甲醇的洗脱梯度进行纯化。将产物部分合并，在减压下浓缩，并且将所得残余物在1:1的DCM:己烷中剧烈搅拌持续20分钟。然后将该混合物用己烷稀释并用己烷洗涤物过滤。将所得固体在真空下进行干燥，以给出5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺(2.79g，68.1％)，为淡橙色-米色针状物。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.74-1.88(2H,m),1.96-2.06(2H,m),2.76(2H,t),4.12(2H,t),6.03(2H,br.s),6.43(1H,s),7.63(1H,s),7.94(1H,s).m/z:ES+[M+H]+249。
顺式-3-(叔丁氧基羰基氨基)环己烷甲酸的制备
向5升固定容器中装入顺式-3-氨基环己烷甲酸(100g，698mmol；购自TCI)、水(900mL)、1,4-二噁烷(900mL)和N-乙基-N-异丙基丙烷-2-胺(487mL，2793mmol)。在室温搅拌下持续5分钟后，将该混合物冷却至0℃。然后将二-叔丁基二碳酸酯(168g，768mmol)分部分添加至该反应混合物中，允许其在添加该最终部分之后加温至室温。然后将该反应混合物冷却至0℃并且添加2M水性HCl以调节pH至2。在每个50mL部分的2M水性HCl添加之间观察到微弱(<5℃)的放热。将该反应混合物用EtOAc萃取(2x 500mL)，并且将合并的有机层用水洗涤(400mL)，并用硫酸钠干燥。将该混合物过滤，并且将滤液在减压下浓缩，以在干燥过夜后提供顺式-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(170g，100％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)0.95-1.33(4H,m),1.37(9H,s),1.64-1.75(2H,m),1.79(1H,d),1.94(1H,d),2.22(1H,tt),3.13-3.26(1H,m),6.72(1H,d),12.01(1H,s).m/z:ES+[M+Na]+266。
(S)-1-苯基乙铵(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯的制备
使用类似于WO 2011/1106112中描述的程序，将顺式-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(49.9g，166mmol)添加到1L圆底烧瓶中并且溶解在乙醇(400mL)中。将该混合物在室温下搅拌直到所有起始材料溶解。添加(S)-1-苯基乙胺(23.6mL，183mmol)；将该混合物在室温下搅拌直到逐渐形成白色沉淀。然后将该反应混合物加热至80℃直到获得澄清溶液。然后将该反应加热器关闭，并且允许该反应混合物冷却至室温。在室温下搅拌另一个16h之后，将所得混合物过滤以给出白色固体。将该固体重新溶解在乙醇(150mL)中并且加热至80℃直到获得澄清溶液。然后将该反应加热器关闭，并且允许该反应混合物冷却至室温。过滤提供了白色固体(14.6g)，将其使用相同的程序再次从乙醇(100mL)中再结晶以提供(S)-1-苯基乙铵(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯(12.5g，20.7％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)0.98-1.23(4H,m),1.26(3H,d),1.38(9H,s),1.66-1.84(3H,m),1.95(1H,m),2.21(1H,m),3.21(1H,m),4.00(1H,q),6.72(1H,m),7.16-7.23(1H,m),7.30(2H,m),7.34-7.4(2H,m)，NH3 +未观察到。
(1S,3R)-3-(叔丁氧基羰基氨基)环己烷甲酸的制备
将(S)-1-苯基乙铵(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷-甲酸酯(9.85g，27.0mmol)悬浮在250mL EtOAc中，并将该有机层用0.5M HCl(2x 125mL)进行洗涤。将有机层进行收集，并且将合并的水层用EtOAc(300mL)萃取。将合并的有机层用水(2x 500mL)和饱和水性氯化钠(500mL)进行洗涤，之后是经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。然后将所得固体在真空下干燥，以给出(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(5.5g，84％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)0.99-1.35(4H,m),1.38(9H,s),1.68-1.85(3H,m),1.96(1H,d),2.23(1H,tt),3.15-3.30(1H,m,被水峰部分地阻挡),6.72(1H,d),12.01(1H,s)。
对映体纯度的代表性测定：
将HATU(0.413g，1.09mmol)添加至(4-甲氧基苯基)甲胺(0.142mL，1.09mmol)、(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(0.240g，0.99mmol)、DIPEA(0.345mL，1.97mmol)以及DMF(1.980mL)的溶液中。该亮黄色溶液经30分钟变为混合物并且然后用乙酸乙酯稀释并且顺序地用水，饱和水性碳酸氢钠、以及饱和水性氯化钠进行洗涤。然后将有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在DCM中等度5％甲醇洗脱纯化，以提供叔丁基((1R,3S)-3-((4-甲氧基苄基)氨基甲酰基)环己基)氨基甲酸酯(0.30g，84％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.97-1.14(1H,m),1.15-1.32(3H,m),1.38(9H,s),1.56-1.84(4H,m),2.12-2.29(1H,m),3.14-3.28(1H,m),3.73(3H,s),4.17(2H,br.d),6.70-6.77(1H,m),6.87(2H,d),7.14(2H,d),8.16(1H,t).m/z:ES+[M+H]+363。
将以这种方式制备的样品随后通过如下分析型SFC条件分析：
保留时间(s)：
3.33min，叔丁基((1R,3S)-3-((4-甲氧基苄基)氨基甲酰基)环己基)氨基甲酸酯5.21min，叔丁基((1S,3R)-3-((4-甲氧基苄基)氨基甲酰基)环己基)氨基甲酸酯
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
(还称为实例31a)
在0℃下将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(1.12mL，8.44mmol)添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(2.01g，8.24mmol)在DCM(50mL)中的溶液中。将反应保持在这些条件下持续100分钟。在这个时间期间，将5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺(1.64g，6.59mmol)、吡啶(2.1mL，26.4mmol)和DCM(20mL)合并于单独的烧瓶中。将所得混合物温和地加温(约40℃)直到所有固体溶解。然后将所得溶液冷却至0℃，此时形成均匀的淡黄色混合物。将此混合物经由套管迅速添加到先前制备的(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸以及1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺的溶液中，得到更深的黄色溶液。允许该反应加温至室温过夜，并且然后蒸发至干燥。然后将该灰色混合物继续到下一个步骤而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+474。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐的制备
(还称为实例31b)
在0℃下将在二噁烷(4M；10mL，40mmol)中的盐酸添加至在DCM(5mL)和甲醇(5mL)中的粗((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(3.12g，6.59mmol)的混合物中。该混合物变为琥珀色溶液。在1h后，将琥珀色溶液在减压下进行浓缩，并且将所得残余物在真空下干燥，成为米色/灰色泡沫状固体。将这种材料继续到下一个步骤而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+374。
实例3：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
在氮气下在21℃下将乙酸酐(0.016mL，0.17mmol)添加至在DCM(1mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(47mg，0.14mmol)和三乙胺(0.023mL，0.17mmol)中。将所得到的溶液在这些条件下搅拌持续60h。将该反应混合物直接装载到二氧化硅上并且通过快速硅胶层析，在DCM中1％至10％MeOH的洗脱梯度纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(43mg，81％)，为白色固体。1HNMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.07-1.23(1H,m),1.37-1.53(3H,m),1.87-2.03(8H,m),2.03-2.11(2H,m),2.25(1H,d),2.39-2.51(1H,m),3.06(2H,t),3.88(1H,dtq),4.20(2H,t),5.40(1H,d),7.10(1H,dd),7.80(1H,s),8.17(1H,dd),8.32(1H,s),8.35(1H,s).m/z:ES+[M+H]+382。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
((1R,3S)-3-((4-溴吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在0℃下将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(0.574mL，4.33mmol)添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(1.01g，4.16mmol；根据实例2制备的)在DCM(40mL)中的溶液中。在1.5h之后，经由套管添加4-溴吡啶-2-胺(0.6g，3.47mmol)和吡啶(1.12mL，13.9mmol)在DCM(33.0mL)中的混合物。允许所得到的黄色混合物加温至室温并且在这些条件下搅拌持续72h。将现在的白色混合物过滤，用冷DCM洗涤液漂洗，并且将白色沉淀在真空下在-70℃下干燥持续30分钟以提供95％纯度的((1R,3S)-3-((4-溴吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.38g，100％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.99-1.35(4H,m)1.38(9H,s)1.68-1.80(3H,m)1.88(1H,d)2.53-2.64(1H,m)3.15-3.35(1H,m)6.76(1H,d)7.34(1H,dd)8.21(1H,d)8.33(1H,d)10.63(1H,s).m/z:ES+[M+H]+398。
((1R,3S)-3-((4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在氮气下在21℃下将第二代XPhos预催化剂(9.88mg，0.01mmol)一次性添加到((1R,3S)-3-((4-溴吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(100mg，0.25mmol)、3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(93mg，0.38mmol)、磷酸钾(160mg，0.75mmol)、1,4-二噁烷(2mL)、和水(0.2mL)的被脱气的混合物中。将所得混合物在100℃下搅拌16h。将该反应混合物用EtOAc(10mL)稀释，并且连序地用饱和NaHCO3(10mL)洗涤。将该水层用EtOAc(2x 10mL)萃取，并且将合并的有机层用Na2SO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出粗产物。将该粗产物通过快速硅胶层析，20％到80％EtOAc/庚烷的洗脱梯度纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供((1R,3S)-3-((4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(70.0mg，63.4％)，为白色粉末。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.12(1H,d),1.21-1.33(3H,m),1.39(9H,s),1.76(3H,s),1.82-1.95(3H,m),2.00(2H,d),2.59(1H,s),2.97(2H,t),3.89(1H,s),4.12(2H,t),6.75(1H,s),7.19(1H,dd),7.85(1H,s),8.22(2H,d),10.32(1H,s).m/z:ES+[M+H]+440。
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
在氮气下在21℃下将在二噁烷(4M；0.199mL，0.80mmol)中的HCl逐滴添加至在DCM(2mL)中的叔丁基((1R,3S)-3-((4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸酯(70mg，0.16mmol)中。将所得混合物在21℃下搅拌16h。添加MeOH(1mL)，并且将该混合物通过离子交换层析，使用SCX-2柱直接进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M的NH3进行洗脱，并且将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(47mg，87％)，为白色结晶固体。1H NMR(400MHz,CD3OD,30℃)0.95-1.08(1H,m),1.2-1.4(3H,m),1.76-1.91(5H,m),1.99(3H,dtt),2.44(1H,ddd),2.61(1H,tt),2.95(2H,t),3.25(1H,s),4.07(2H,t),7.11(1H,dd),7.74(1H,s),8.07-8.16(2H,m),NH2峰没有观察到.m/z:ES+[M+H]+340。
实例4：顺式-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺
在氮气下在21℃下将在二噁烷(4M；0.388mL，1.55mmol)中的HCl添加到在DCM(3mL)中的顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(143mg，0.31mmol)中。将所得悬浮液在21℃下搅拌持续30分钟。添加MeOH(1mL)并且将混合物在21℃下搅拌16h。将该混合物浓缩并且然后用EtOAc(25mL)和饱和水性NaHCO3(25mL)稀释。将各层进行分离并且将该水层用EtOAc(25mL)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，50％到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到顺式-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺(24.0mg，22.3％)，为淡黄色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.88-1.94(2H,m),2.05-2.15(3H,m),2.2-2.31(2H,m),2.62-2.73(3H,m),2.93(2H,t),4.18-4.31(3H,m),7.81(1H,s),7.88(1H,s),8.23(1H,s),8.26(1H,d).m/z:ES+[M+H]+347。
用于制备起始材料顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的程序描述如下：
顺式-叔丁基二甲基甲硅烷基3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸酯的制备
将顺式-3-羟基环丁烷甲酸(300mg，2.58mmol)溶解在DCM(17.2mL)中。顺序地添加叔丁基氯二甲基硅烷(818mg，5.43mmol)和1H-咪唑(369mg，5.43mmol)，并且将该溶液放置在氮气下。允许该反应在室温下搅拌16h。将该混合物用乙酸乙酯稀释(100mL)并且用1N水性HCl(30mL)、水(30mL)、以及饱和水性氯化钠(40mL)洗涤，之后是经硫酸镁干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出顺式-叔丁基二甲基甲硅烷基3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸酯(802mg，90％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)0.03(6H,s),0.26(6H,s),0.88(9H,s),0.94(9H,d),2.11-2.21(2H,m),2.43-2.63(3H,m),4.07-4.17(1H,m)。
顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸的制备
将碳酸钾(644mg，4.66mmol)添加到顺式-叔丁基二甲基甲硅烷基3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸酯(803mg，2.33mmol)在THF(15mL)和水(3mL)中的溶液中。将所得混合物在室温下搅拌20h。将该反应混合物用水稀释并且用EtOAc洗涤。将该水层用0.1N水性HCl酸化并用EtOAc萃取(x2)。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并且浓缩，以给出粗的产物，该产物不经纯化用于下一步骤。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)0.00(6H,s),0.84(9H,s),2.09-2.29(2H,m),2.36-2.66(3H,m),3.97-4.23(1H,m),CO2H未观察。
3-(5-氯-2-氟吡啶-4-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(500mg，2.02mmol)、5-氯-2-氟-4-碘吡啶(432mg，1.68mmol)、第二代XPhos预催化剂(132mg，0.17mmol)和磷酸钾(1069mg，5.03mmol)悬浮于二噁烷(5mL)和水(0.50mL)中。将该反应通过使氮气鼓泡穿过该反应混合物持续5分钟脱气，之后加热至90℃。将反应保持在这些条件下持续20h并且然后用水(20mL)和EtOAc(20mL)稀释。将各层进行分离并且将该水层用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机层用饱和水性氯化钠(20mL)洗涤，用MgSO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，20％到80％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯部分蒸发至干燥，以提供3-(5-氯-2-氟吡啶-4-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(440mg，104％)，为奶油色结晶固体。将这种材料继续到下一个步骤而无需进一步纯化。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.87-1.96(2H,m),2.08-2.16(2H,m),2.83(2H,t),4.23(2H,t),6.82(1H,d),7.80(1H,s),8.23(1H,s).m/z:ES+[M+H]+252。
5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺的制备
将3-(5-氯-2-氟吡啶-4-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(440mg，1.49mmol)和氢氧化铵(2.0mL，51mmol)合并并且密封进微波管中。将该反应在微波反应器中加热至150℃持续2h并冷却至室温。将该反应混合物用EtOAc(25mL)和水(25mL)稀释。将各层进行分离并且将该水层用EtOAc(3x 25mL)萃取。将有机层合并并用饱和水性氯化钠(25mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，用在庚烷中50％EtOAc并然后在DCM中10％MeOH洗脱进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺(80mg，22％)，为已经表征的白色固体，(参见实例3，中间体)
顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的制备
在氮气下在21℃下将N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(0.167mL，0.94mmol)添加到在DMF(1mL)中顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸(79mg，0.34mmol)和2-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶-3-基)-1,1,3,3-四甲基异脲六氟磷酸盐(V)(179mg，0.47mmol)中。将所得到的溶液在21℃下搅拌持续10分钟。将5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺(78mg，0.31mmol)在DMF(1mL)添加至该溶液中并且将所得混合物在21℃下搅拌16h。继续搅拌72h并且添加另外的顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸(79mg，0.34mmol)、2-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶-3-基)-1,1,3,3-四甲基异脲六氟磷酸盐(V)(179mg，0.47mmol)和N-乙基-N-异丙基丙烷-2-胺(0.167mL，0.94mmol)。将该混合物搅拌另一个24h，之后添加EtOAc(20mL)和饱和水性碳酸氢钠(20mL)。将各层分离，并且将有机层进行用水(20mL)和饱和水性氯化钠(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将该粗残余物立即继续到下一个步骤并且假定回收为定量的。m/z:ES+[M+H]+461。
实例5：(R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)哌啶-3-甲酰胺
在20℃下将TFA(1mL，13mmol)添加至在DCM(2mL)中的(R)-叔丁基3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-哌啶-1-甲酸酯(90mg，0.20mmol)中。将所得混合物在室温下搅拌1h并且然后在减压下浓缩。将所得粗产物通过制备型HPLC(XBridge Prep C18 OBD柱，5μm二氧化硅，19mm直径，150mm长度)，使用水(包含0.05％NH3)以及MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分蒸发至干燥以提供(R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)哌啶-3-甲酰胺(18.0mg，25.6％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,23℃)1.30-1.47(1H,m),1.52-1.62(2H,m),1.76-1.90(3H,m),1.97-2.07(2H,m),2.52-2.62(2H,m),2.69(1H,t),2.75-2.87(3H,m),2.91-3.01(1H,m),4.14(2H,t),7.77(1H,s),8.15(1H,s),8.37(1H,s),10.84(1H,s)，哌啶NH未观察。m/z:ES+[M+H]+360。
用于制备该起始材料(R)-叔丁基3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)哌啶-1-甲酸酯的程序描述如下：
3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-哌啶-1-甲酸叔丁基酯的制备
在20℃下将吡啶(0.10mL，1.3mmol)添加到在DCM(2mL)中的1-(叔丁氧基羰基)哌啶-3-甲酸(74mg，0.32mmol)和1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(0.050mL，0.64mmol)中。将所得混合物在室温下搅拌持续20分钟。然后将5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺(80mg，0.32mmol；根据实例4制备的)添加到该混合物中。将所得混合物在室温下搅拌持续1h。将该反应混合物在减压下浓缩并且用DCM(100mL)进行稀释，之后是顺序地用0.1M HCl(2x 25mL)、饱和水性碳酸氢钠(25mL)、以及饱和水性氯化钠(2x 25mL)洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型TLC(石油醚:EtOAc＝10:1)纯化，以提供3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-哌啶-1-甲酸叔丁基酯(100mg，67.6％)，为黄色固体。m/z:ES+[M+H]+460。
实例6：顺式-3-羟基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺
在氮气下在21℃下将在二噁烷(4M；0.388mL，1.55mmol)中的HCl添加到在DCM(3mL)和MeOH(1mL)中的顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(132mg，0.31mmol)中。将所得到的悬浮液在21℃下搅拌持续3h，之后将该混合物在减压下进行浓缩。将所得残余物用EtOAc(25mL)和饱和水性碳酸氢钠(25mL)稀释。然后将各层进行分离并且将该水层用EtOAc(25mL)萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗固体用Et2O进行研磨并在真空下干燥，以给出顺式-3-羟基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(35.0mg，36.1％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.89-2.01(2H,m),2.08(3H,ddd),2.28(2H,ddd),2.67(3H,tq),3.08(2H,t),4.23(3H,dt),7.10(1H,dd),7.81(1H,s),7.83(1H,s),8.19(1H,dd),8.33(1H,s).m/z:ES+[M+H]+313。
用于制备起始材料顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的程序描述如下：
顺式-N-(4-溴吡啶-2-基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酰胺的制备
在氮气下在21℃下将N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(0.461mL，2.60mmol)添加到在DMF(3mL)中的顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸(220mg，0.95mmol；如在实例4中制备)和2-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶-3-基)-1,1,3,3-四甲基异脲六氟磷酸盐(V)(494mg，1.30mmol)中。将所得溶液在21℃下搅拌持续10分钟，之后添加4-溴吡啶-2-胺(150mg，0.87mmol)，并且将所得混合物在21℃下搅拌16h。继续搅拌72h，并且添加另外的顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸(79mg，0.34mmol)、2-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶-3-基)-1,1,3,3-四甲基异脲六氟磷酸盐(V)(179mg，0.47mmol)和N-乙基-N-异丙基丙烷-2-胺(0.167mL，0.94mmol)。将该混合物搅拌另外24h，并且然后添加EtOAc(25mL)和饱和水性碳酸氢钠溶液(25mL)。将各层分离，并且将有机层用水(2x25mL)和饱和氯化钠水(2x 25mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到顺式-N-(4-溴吡啶-2-基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酰胺(96mg，29％)，为无色的油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)0.06(6H,s),0.89(9H,s),1.11-1.18(1H,m),2.23-2.31(2H,m),2.54-2.58(2H,m),4.15-4.26(1H,m),7.18(1H,dd),7.82(1H,s),8.06(1H,dd),8.49(1H,d).m/z:ES+[M+H]+385(79Br同位素)，387(81Br同位素)。
顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的制备
在氮气下在21℃下将第二代XPhos预催化剂(19.40mg，0.02mmol)添加到在二噁烷(2mL)和水(0.2mL)中的顺式-N-(4-溴吡啶-2-基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酰胺(95mg，0.25mmol)、3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(73.4mg，0.30mmol)和磷酸钾(157mg，0.74mmol)的脱气的混合物中。将所得混合物在100℃下搅拌16h。将该反应混合物用EtOAc稀释(25mL)并且顺序地用饱和水性碳酸氢钠(10mL)、水(10mL)、以及饱和水性氯化钠(10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，30％到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(60.0mg，57.1％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)0.05(6H,s),0.89(9H,s),1.9-2.01(2H,m),2.02-2.12(2H,m),2.25-2.33(2H,m),2.5-2.62(3H,m),3.08(2H,t),4.21(3H,t),7.09(1H,dd),7.76(1H,s),7.80(1H,s),8.18(1H,dd),8.33(1H,s).m/z:ES+[M+H]+427。
实例7：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-溴-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.20g，0.53mmol)、5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶(47mg，0.38mmol)、碳酸铯(0.14g，0.42mmol)、三乙胺(0.11mL，0.76mmol)、三苯基膦(0.02g，0.06mmol)和二乙酰氧基钯(6.85mg，0.0300mmol)悬浮于1,4-二噁烷(5mL)中并且密封在微波管中。将该反应在微波反应器中加热至100℃持续16h并然后冷却至室温。将该反应在减压下浓缩并且将粗产物通过离子交换层析，使用SCX-2柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯的部分蒸发至干燥。将所得粗产物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18OBD柱，5μ二氧化硅、50mm直径、100mm长度)使用水(含有1％NH3)以及MeCN的渐减极性混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.069g，44％)，为黄色胶质。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)0.95-1.16(1H,m),1.19-1.39(3H,m),1.78(3H,s),1.83-1.97(2H,m),2.55-2.68(1H,m),2.84(2H,s),3.18(2H,dd),3.31(3H,s),3.57(1H,dt),3.83(2H,s),4.08(1H,q),7.13(1H,s),7.75(1H,d),8.16(1H,s),8.47(1H,s),10.70(1H,s).m/z:ES+[M+H]+417(13C,35Cl同位素次级峰)。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-溴-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
4-溴-3-氯吡啶-2-胺的制备
在-78℃下经30分钟的时间在氮下将溶解于DMF(20mL)中的N-氯-琥珀酰亚胺(3.70g，27.7mmol)溶液逐滴添加至在DMF(50mL)中的4-溴吡啶-2-胺(4.40g，25.4mmol)中。然后允许所得悬浮液加温至室温。在这些条件下搅拌持续24h后，将该反应混合物用Et2O(50mL)进行稀释并且用1M的水性NaOH(2x 50mL)、水(50mL)、以及饱和的水性氯化钠(25mL)顺序地洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，在DCM中0至25％的EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到4-溴-5-氯吡啶-2-胺(2.30g，43.7％)，为膏状固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)6.35(2H,s),6.82(1H,s),8.01(1H,s)。
((1R,3S)-3-((4-溴-5-氯吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将溶解在DCM(20mL)中的(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(1.50g，6.15mmol；根据实例2制备的)的溶液在0℃下用1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(0.976mL，7.38mmol)进行处理。将该混合物在室温下搅拌1.5h，之后顺序地添加4-溴-5-氯吡啶-2-胺(1.02g，4.92mmol)和吡啶(0.594mL，7.38mmol)。将所得溶液在室温下搅拌16h。将该反应混合物用DCM(25mL)稀释，并且用水(2x 25mL)和饱和水性氯化钠(25mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物通过离子交换层析，使用SCX-2柱进行纯化。将所希望的产物使用甲醇从该柱进行洗脱中以提供((1R,3S)-3-((4-溴-5-氯吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(2.34g，110％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.12(1H,dd),1.22-1.32(3H,m),1.38(9H,s),1.72(3H,dd),1.83-1.94(2H,m),2.11(1H,dt),8.48(1H,s),8.50(1H,s),10.77(1H,s),没有观察到一个质子.m/z:ES-[M-H]-430。
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-溴-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐的制备
在空气中将在二噁烷(4M；5.89mL、23.6mmol)中的HCl添加到在MeOH(7.01mL)中的((1R,3S)-3-((4-溴-5-氯吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.20g，2.77mmol)中。将所得溶液在环境温度下搅拌16h。将该反应混合物蒸发以提供(1S,3R)-3-氨基-N-(4-溴-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐，为白色固体。将其不经进一步纯化用于下一步骤。m/z:ES+[M+H]+332(35Cl 79Br同位素)，334(35Cl 81Br和37Cl 79Br同位素)。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-溴-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
在室温下在氮气下将乙酸酐(0.259mL，2.74mmol)逐滴添加至在DCM(8.44mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(4-溴-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.760g，2.28mmol)、4-二甲基氨基吡啶(0.014g，0.11mmol)和三乙胺(0.987mL，7.08mmol)。将所得溶液在室温下搅拌过夜，之后用饱和水性NH4Cl(50mL)淬灭并用DCM(2x 50mL)萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-溴-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.96g，95％)，为白色固体。将该产物用于下一步骤中而无需进一步纯化。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.23-1.41(4H,m),1.67-1.85(4H,m),2.39(3H,tt),2.75-2.92(1H,m),3.53(1H,dtd),7.59-7.83(1H,m),8.50(2H,dd),10.80(1H,d).m/z:ES+[M+H]+374(35Cl 79Br同位素)，376(35Cl 81Br和37Cl 79Br同位素)。
实例8：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
在室温下将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-溴-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.100g，0.27mmol；如在实例7中制备的)一次性添加至3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪(0.067g，0.27mmol)、第二代X-Phos预催化剂(0.021g，0.03mmol)、磷酸钾(0.170g，0.80mmol)、1,4-二噁烷(2.270mL)和水(0.454mL)的脱气的混合物中。将所得混合物在室温下搅拌持续16h并且然后蒸发至干燥，之后是通过离子交换层析使用SCX-2筒纯化。将所希望的产物使用在MeOH中的1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯的部分蒸发至干燥，以得到粗(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺，为黄色胶质。将该半纯的产物通过制备型HPLC(沃特斯XBridgePrep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.017g，16％)，为白色胶质。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.21-1.32(1H,m),1.4-1.53(3H,m),1.95(1H,s),1.96(3H,s),2.06(1H,d),2.39-2.48(2H,m),2.7-2.85(3H,m),3.74(1H,dt),4.34(2H,t),4.53-4.68(2H,m),7.93(1H,d),8.05(1H,s),8.48(1H,d),8.58(1H,s),10.62(1H,s).m/z:ES+[M+H]+418(12C,35Cl同位素)，419(13C,35Cl同位素次级峰)。
用于制备该起始材料3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪的程序描述如下：
1,2-二氢吡唑-3-酮的制备
在0℃下向丙-2-炔酸甲酯(150g，1785.7mmol)在MeOH(1500mL)中的溶液中逐滴添加水合肼(89.2g，1784.0mmol)。将该反应在室温下搅拌持续30分钟。添加饱和水性氯化钠(400mL)，并且然后在真空下去除甲醇。将该水层用EtOAc(3x 500mL)萃取，并且将合并的有机层用Na2SO4进行干燥并在减压下浓缩，以提供1,2-二氢吡唑-3-酮(99.5g，66％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+85。
6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪的制备
向1,2-二氢吡唑-3-酮(99.5g，1184mmol)在DMF(4000mL)中的溶液中添加K2CO3(560.0g，4057mmol)，并且将该混合物在130℃下加热持续1h。然后添加1,3-二溴丙烷(143.4mL，1421mmol)，并且将该混合物在130℃下搅拌持续2h并且然后浓缩。将所得残余物在DCM(2000mL)和水(2000mL)之间分配。将有机层分离并且将该水层用DCM(3x 1000mL)进行萃取。将合并的有机萃取物用Na2SO4进行干燥并进行浓缩以给出6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪(83.0g，56.8％)，为黄色的油。1H NMR(300MHz,CDCl3,30℃)2.18-2.11(2H,m),4.13-4.05(2H,m),4.19-4.16(2H,m),5.37-5.37(1H,m),7.21-7.20(1H,m)。
3-碘-6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪的制备
向在CH3CN(1500mL)中的6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪(83.0g，669.3mmol)的溶液中添加N-碘代琥珀酰亚胺(155.0g，688.8mmol)。将该混合物在室温下搅拌1h，之后缓慢倾倒进剧烈搅拌的水(1000mL)中。添加饱和水性硫代硫酸钠(500mL)，并且将所得混合物用乙酸乙酯(2x 800mL)进行萃取。将合并的有机层用水进行洗涤，用Na2SO4干燥，并在减压下浓缩。将所得的残余物通过硅胶柱层析(石油醚:EtOAc＝1:1)纯化，以给出3-碘-6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪(105.0g，62.2％)，为黄色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,30℃)2.19-2.12(2H,m),4.10-3.98(2H,m),4.34-4.31(2H,m),7.28(1H,m).m/z:ES+[M+H]+251。
3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪的制备
向在THF(1000mL)中的3-碘-6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪(105g，420mmol)的溶液中添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(126mL，630mmol)。将该混合物冷却至5℃。然后添加异丙基镁氯化锂(410mL，420mmol)，并且将该混合物在5℃搅拌3h。通过添加MeOH(500mL)淬灭该反应并且然后浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在石油醚中等度50％乙酸乙酯洗脱纯化，以提供淡黄色的油。从庚烷(100mL)中结晶产生3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪(38.6g，36.7％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.21(12H,s),2.15-2.12(2H,m),4.06-4.03(2H,m),4.31-4.29(2H,m),7.32(1H,m).m/z:ES+[M+H]+251。
实例9：(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
以及
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例2)
在0℃下将乙酰氯(0.280mL，3.93mmol)添加至顺式-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.639g，1.71mmol；对映异构体的比例未知，如在实例2中从5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺以及顺式-3-(叔丁氧基羰基氨基)环己烷甲酸制备的、对映异构体的比例未知)在DCM(14.1mL)和吡啶(2.77mL，34.2mmol)中的溶液中。30min之后，将该淡黄色反物倾倒进DCM和饱和水性碳酸氢钠中。将各层分离，并且将有机层用饱和水性氯化钠洗涤并且经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，0至20％在EtOAc中的甲醇洗脱梯度纯化。将产物部分在减压下进行浓缩以提供半纯产物，为白色固体。将该物质进一步通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18柱，5μm，30mm直径，100mm长度)，用在水(含有0.2％氢氧化铵，在pH 10下)中60％至80％甲醇作为洗脱液洗脱纯化。将产物部分在减压下浓缩为干燥，以给出顺式-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺，对映异构体的比例未知，为白色固体(403mg)。
将这种材料用DCM转移到圆底烧瓶中并且在减压下浓缩为白色固体。将该固体吸收在约10mL的MeCN中并且加温至回流条件。将该溶液冷却，并且迅速开始形成沉淀。在10分钟之后，将该混合物放入冷冻机中。在2h后，将该混合物加温至室温，并且剧烈搅拌过夜。然后将该白色混合物过滤，首先用MeCN并且然后用己烷洗涤。将所得沉淀物在真空下在60℃下干燥持续30min以提供159mg的晶体固体(薄片)。
通过分析型SFC条件(参见在实例2中的条件)分析这种固体，确定它为60.5％e.e.(主要组分＝实例2)。将这种材料的一部分(112mg)通过制备型SFC条件(Chiralpak IA柱，5μm，21.2mm直径，250mm长度，40℃柱温，100巴出口压力，75mL/min的流速)，用在CO2中40％含0.1％二甲基乙胺的甲醇洗脱进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(70mg，67％，实例2)，为白色泡沫状固体和(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(13.2mg，11.8％，实例9)，为白色泡沫状固体。
(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺：
1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.99-1.17(1H,m),1.19-1.37(3H,m),1.70-1.90(9H,m),1.96-2.08(2H,m),2.54-2.68(1H,m),2.80(2H,t),3.46-3.68(1H,m),4.14(2H,t),7.73(1H,d),7.76(1H,s),8.14(1H,s),8.38(1H,s),10.57(1H,s).m/z:ES+[M+H]+416。
分析型SFC条件：
旋光度：
实例10：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将在DCM(2mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.093g，0.26mmol)用三乙胺(0.079mL，0.57mmol)随后用乙酸酐(0.029mL，0.31mmol)进行处理。将反应混合物在室温下搅拌持续0.5h并且然后用水洗涤。将该有机层通过快速硅胶层析，0至10％在DCM中MeOH的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.075g，72％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.09-1.22(1H,m),1.38-1.58(2H,m),1.88-2.03(6H,m),2.26(1H,d),2.43-2.56(1H,m),2.69(2H,p),3.14-3.21(2H,m),3.49(1H,s),3.87(1H,dtt),4.21(2H,t),5.59(1H,d),8.14(1H,s),8.22(1H,s),8.33(1H,s),8.43(1H,s).m/z:ES+[M+H]+402。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
3-碘-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在室温下将5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-甲酸(0.75g，4.93mmol)溶解于DMF(4mL)中的溶液用N-碘琥珀酰亚胺(1.331g，5.92mmol)和碳酸氢钠(0.497g，5.92mmol)进行处理。将该混合物在室温下搅拌15h。将该反应在60℃下搅拌持续另外的16h并且然后在减压下浓缩。将所得残余物溶解于EtOAc(50mL)中并用水(2x 50mL)洗涤。将该有机层在减压下浓缩，并且将该粗产物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供3-碘-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.88g，76％)，为米色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)2.53-2.6(2H,m),2.69-2.79(2H,m),4.04-4.19(2H,m),7.46(1H,s).m/z:ES+[M+H]+235。
3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在4℃下将3-碘-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.800g，3.42mmol)和2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.954g，5.13mmol)溶解于THF(8mL)中并且然后用在THF(1.3M；2.63mL，3.42mmol)中的异丙基氯化镁氯化锂复合物逐滴处理。将该混合物在4℃搅拌2h并且然后在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.67g，84％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.29(12H,s),2.60(2H,p),2.91-3.02(2H,m),4.05-4.19(2H,m),7.77(1H,s).m/z:ES+[M+H]+235。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在氮气气氛下将1-氯-N,N,2-三甲基丙烯基胺(1.149mL，8.68mmol)添加至在冰浴中冷却的(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(1.41g，5.79mmol；根据实例2制备的)在DCM(25mL)中的搅拌溶液中。将所得混合物在环境温度下搅拌1h。加入5-氯-4-碘吡啶-2-胺(1.47g，5.79mmol；根据实例2制备的)和吡啶(0.702mL，8.68mmol)，并且将所得混合物在环境温度下搅拌16h。通过添加饱和水性NH4Cl(50mL)淬灭该反应。将所得混合物用DCM(3x 75mL)进行萃取，并且将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将产生的淡黄色固体用Et2O(10mL)成浆并过滤，以产生((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.79g，3.73mmol，64.4％)，为奶油色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.04-1.18(1H,m),1.24-1.41(2H,m),1.44(9H,s),1.92(2H,dq),2.00(1H,d),2.28(1H,d),2.31-2.41(1H,m),3.27-3.62(2H,m),4.44(1H,s),7.80(1H,s),8.19(1H,s),8.81(1H,s).m/z:ES-[M-H]-478。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在21℃下将3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.14g，0.58mmol)、((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.18g，0.38mmol)、第二代X-Phos预催化剂(0.03g，0.04mmol)和磷酸氢二钾(0.200g，1.15mmol)溶解在1,4-二噁烷(4mL)和水(0.8mL)中。将该混合物在21℃搅拌18h。然后将该混合物在40℃下加热持续17h，然后在50℃下持续2h。将该混合物用EtOAc(30mL)稀释并且然后用水(10mL)洗涤。将该有机层在减压下浓缩，并且将生成的粗产物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.119g，67.5％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.04-1.17(1H,m),1.34-1.41(2H,m),1.44(9H,s),1.89-2.03(4H,m),2.29(1H,d),2.33-2.44(1H,m),2.69(2H,p),3.14-3.21(2H,m),3.45-3.59(1H,m),4.17-4.24(2H,m),4.44(1H,s),7.93(1H,s),8.15(1H,s),8.23(1H,s),8.33(1H,s).m/z:ES+[M+H]+460。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐的制备
向((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.12g，0.26mmol)溶解在DCM(3mL)中的溶液中添加HCl(在二噁烷中4M；1.294mL，5.17mmol)。将该混合物在室温下搅拌持续30分钟，之后在减压下进行浓缩。将所得粗产物直接用于下一步骤中。m/z:ES+[M+H]+360。
实例11：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
在室温下，向((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.072g，0.15mmol)悬浮于DCM(3mL)中的混合物中添加HCl(在二噁烷中4M；0.756mL，3.03mmol)。该混合物变为溶液，将该溶液在室温下搅拌持续30分钟。将该反应在减压下进行浓缩以产生粗(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐，为固体。将该粗产物溶解于DCM(2mL)中，并且将所得溶液在室温下顺序地用三乙胺(0.047mL，0.33mmol)和乙酸酐(0.017mL，0.18mmol)处理。将反应混合物在室温下搅拌持续30分钟并且然后在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在庚烷中50％至100％EtOAc，然后在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.056g，88％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.08(1H,d),1.29(4H,q),1.78(1H,s),1.91(3H,s),2.61(2H,s),3.57(1H,dt),4.08-4.27(4H,m),4.89(2H,s),7.74(1H,d),7.88(1H,s),8.01(1H,s),8.39(1H,s),10.59(1H,s),11.90(1H,s).m/z:ES+[M+H]+418。
用于制备起始材料((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的程序描述如下：
3-碘-6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪的制备
将溶解于DMF(4mL)中的6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-甲酸(0.750g，4.46mmol)用N-碘琥珀酰亚胺(1.204g，5.35mmol)和碳酸氢钠(0.450g，5.35mmol)在室温下进行处理。将该混合物在70℃搅拌4h并且然后冷却至室温。在60h后，将该混合物在减压下进行浓缩，并且将所得残余物溶解于EtOAc(70mL)中并用水洗涤(2x 70mL)。将该有机层在减压下浓缩，并且将生成的粗产物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供3-碘-6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪(0.90g，81％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)3.98-4.06(2H,m),4.07-4.15(2H,m),4.65(2H,s),7.53(1H,s).m/z:ES+[M+H]+251。
3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪的制备
将3-碘-6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪(0.850g，3.40mmol)和2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.949g，5.10mmol)在4℃下溶解于THF(8mL)中。将所得溶液用在THF(1.3M；2.61mL，3.40mmol)中的异丙基氯化镁氯化锂复合物进行逐滴处理。将该反应混合物在4℃搅拌5h，之后在减压下进行浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪(0.80g，95％)，为无色胶质。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.29(12H,s),4.08(2H,dd),4.17-4.23(2H,m),4.96(2H,s),7.74(1H,s).m/z:ES+[M+H]+251。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪(0.094g，0.38mmol)、叔丁基((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸酯(0.120g，0.25mmol；如在实例10中制备的)、第二代X-Phos预催化剂(0.020g，0.03mmol)和磷酸氢二钾(0.131g，0.75mmol)在50℃下溶解在1,4-二噁烷(4mL)和水(0.800mL)中。将该混合物在50℃下搅拌1h并且然后用EtOAc(30mL)稀释。将所得混合物用水(10mL)进行洗涤，并且将有机层在减压下进行浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.081g，68％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.22-1.35(4H,m),1.38(9H,s),1.75(3H,s),1.90(1H,d),2.54-2.63(1H,m),4.12-4.26(4H,m),4.90(2H,s),5.75(1H,s),6.76(1H,d),7.89(1H,s),8.01(1H,s),8.39(1H,s),10.58(1H,s).m/z:ES+[M+H]+476。
实例12：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(130mg，0.31mmol)、(6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)硼酸盐酸盐(145mg，0.77mmol)、氢氧化钡(211mg，1.23mmol)和PdCl2(dppf)(22mg，0.030mmol)悬浮于二噁烷(2mL)和水(0.4mL)中并且密封到微波管中。将该反应在微波反应器中加热至75℃并且维持在这些条件下持续2h，之后冷却至室温。将该反应混合物用甲醇洗涤物过滤，并且然后将该滤液在减压下浓缩。将所得粗产物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μm硅胶，19mm直径，100mm长度)，使用水(包含1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(21.3mg，17.2％)，为固体。1HNMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.09(1H,d),1.30(3H,q),1.78(5H,s),1.91(1H,d),2.57-2.73(4H,m),2.85(2H,t),3.58(1H,dd),4.16(2H,t),7.55(1H,s),7.75(1H,d),8.35(1H,s),8.42(1H,s),10.67(1H,s).m/z:ES+[M+H]+402。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺和(6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)硼酸盐酸盐的程序描述如下：
5-甲氧基-3,4-二氢-2H-吡咯的制备
将吡咯烷-2-酮(85g，1000mmol)和Me2SO4(126g，1000mmol)在室温下搅拌持续30分钟，并且然后将该混合物在60℃搅拌6h。将该混合物在0℃缓慢倾倒入三乙胺(140mL)在DCM中的溶液中，并且在这些条件下搅拌持续15分钟。添加水，并且分离各层。将该有机层用MgSO4进行干燥并在减压下在室温下进行浓缩，以产生5-甲氧基-3,4-二氢-2H-吡咯，将其直接用于下一步骤中而无需进一步纯化。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)2.03-1.95(2H,m),2.43-2.39(2H,m),3.64-3.60(2H,m),3.76(3H,s).
6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑的制备
向5-甲氧基-3,4-二氢-2H-吡咯(粗)在DCM(200mL)中的溶液中添加MeOH(800mL)和氨基乙醛二甲基乙缩醛(105g，1000mmol)。将该混合物在60℃搅拌6h，之后在减压下浓缩，以给出N-(2,2-二甲氧基乙基)-3,4-二氢-2H-吡咯-5-胺(82g，48％)。将该粗产物溶解在甲酸(400mL)中并且在回流下搅拌17h，之后在减压下浓缩，以提供6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(46g，90％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)2.51-2.44(2H,m),2.69-2.65(2H,m),3.91-3.88(2H,m),6.84(1H,s),7.02(1H,s)。
(6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)硼酸盐酸盐的制备
在-78℃下向6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(60g，560mmol)在无水THF(700mL)中的搅拌溶液中添加n-BuLi(250mL，625mmol)，并且将该混合物于此温度下搅拌1h。在-78℃下添加三异丙基硼酸盐(115g，610mmol)，并且然后允许该混合物加温至室温过夜。将该反应冷却至0℃，并且添加水性HCl(1M；1000mL)。将该反应在减压下浓缩以去除四氢呋喃。将剩余水层的pH通过小心添加浓HCl调整至2，并且将沉淀进行收集并干燥，以提供(6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)硼酸盐酸盐(42g，40％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)2.64-2.49(2H,m),3.08(2H,t),4.19(2H,t),7.92(1H,s),8.84(2H,s),14.34(1H,s).m/z:ES+[M+H]+153。
3-氨基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将(3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1g、2.08mmol；如在实例10中制备的)在环境温度下悬浮于DCM(15mL)中。将在二噁烷(2.61mL，10.42mmol)中的HCl(4M)添加至该溶液中并且将所得混合物搅拌16h。然后将该反应混合物装载到50g SCX柱并且用DCM、MeOH、以及在MeOH种1％NH3顺序地洗脱。将碱性部分在减压下浓缩，以给出3-氨基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺，为无色无定形固体(782mg，99％)。m/z:ES+[M+H]+380。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
在环境温度下将乙酸酐(0.214mL，2.27mmol)添加至(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(782mg，2.06mmol)和三乙胺(0.632mL，4.53mmol)在DCM(10mL)中的搅拌溶液中。将该反应混合物搅拌持续5天，之后过滤并且用DCM洗涤，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(480mg，55％)，为无色固体。将液体浓缩并且通过快速硅胶层析，20％到60％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到更多(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(193mg，22％)，为无色结晶固体(组合的产率：77％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.01-1.17(1H,m),1.18-1.39(3H,m),1.68-1.84(2H,m),1.78(3H,s),1.89(1H,m),2.51(2H,m),3.48-3.65(1H,m),7.74(1H,d),8.38(1H,s),8.71(1H,s),10.66(1H,s).m/z:ES+[M+H]+422。
实例13：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
向((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.042g，0.090mmol)溶解在DCM(2mL)中的溶液中添加HCl(在二噁烷中4M；0.429mL，1.72mmol)。将该混合物在室温下搅拌2h，之后在减压下浓缩，以给出粗制的固体(33mg)。将该固体溶解在DCM(2mL)和三乙胺(0.026mL，0.19mmol)中。然后添加乙酸酐(9.6μL，0.10mmol)。将该混合物在室温下搅拌持续30min并且然后在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，以(在DCM中10％MeOH)，0至100％EtOAc洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.027g，74％)，为无色的干膜。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.09-1.24(1H,m),1.41-1.56(3H,m),1.87-2.04(6H,m),2.25(1H,d),2.51(4H,s),2.9-2.98(2H,m),3.73(2H,s),3.87(1H,dtd),4.26(2H,t),5.60(1H,d),7.84(1H,s),8.11(1H,s),8.25(1H,d),8.30(1H,s).m/z:ES+[M+H]+431。
用于制备起始材料((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的程序描述如下：
3-溴-5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪的制备
在20℃下将HCl(在二噁烷中4M；3.31mL、13.24mmol)一次性添加到在DCM(6mL)中的3-溴-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-5(4H)-甲酸叔丁基酯(0.400g，1.32mmol)中。将所得混合物在20℃下搅拌持续60分钟。形成白色固体。将该混合物在减压下浓缩，并且将所得残余物再溶解在甲酸(12.7mL，331mmol)中并且用甲醛(0.64mL，8.6mmol)处理。将此新混合物在100℃下加热8h，之后在减压下进行浓缩。将所得残余物溶解于EtOAc(25mL)中并且然后用饱和水性碳酸氢钠(2x 25mL)洗涤；然后将合并的水层用EtOAc(2x 25mL)萃取。将合并的有机层在减压下进行浓缩，并且将所得粗制残余物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供3-溴-5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪(0.185g，64.7％)，为无色的油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)2.45(3H,s),2.75-2.85(2H,m),3.48(2H,s),4.05-4.15(2H,m),7.35(1H,s).m/z:ES+[M+H]+218(81Br同位素)。
5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪的制备
将3-溴-5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪(0.185g，0.860mmol)、4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-二(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(0.435g，1.71mmol)、乙酸钾(0.294g，3.00mmol)和Pd(P(Cy)3)2Cl2(0.063g，0.090mmol)悬浮在DMA(3mL)中。将该反应加热至80℃持续5h，然后加热至90℃持续16h。将该反应混合物冷却至室温，并且然后用水(20mL)稀释并用EtOAc(20mL)萃取。将合并的有机物在减压下进行浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，在庚烷中0至100％DCM，随后在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪(0.20g，89％)，为无色的油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.29(12H,s),2.52(3H,s),2.88-2.92(2H,m),3.80(2H,s),4.22(2H,t),7.72(1H,s).m/z:ES+[M+H]+264。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.200g，0.42mmol；如在实例10中制备的)、5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪(0.197g，0.750mmol)、第二代X-Phos预催化剂(0.033g，0.040mmol)和磷酸氢二钾(0.218g，1.25mmol)在45℃下溶解在1,4-二噁烷(4mL)和水(0.800mL)中。将该混合物在45℃下搅拌18h。添加更多的第二代X-Phos预催化剂(0.033g，0.04mmol)，并且将温度上升至60℃持续1h。将该反应混合物冷却并使其穿过SCX-2柱。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯部分在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷，然后在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.054g，27％)。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.04-1.19(1H,m),1.44(12H,s),1.87-2.02(3H,m),2.29(1H,d),2.33-2.46(1H,m),2.53(3H,s),2.95-3(2H,m),3.50(1H,s),3.76(2H,s),4.28(2H,t),4.52(1H,s),7.85(1H,s),8.12(2H,s),8.26(1H,s).m/z:ES+[M+H]+489。
实例14：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
向(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(111mg，0.290mmol)、三乙胺(0.084mL，0.60mmol)和N，N-吡啶-4-胺(1.748mg，0.01mmol)在DCM(10mL)里的搅拌溶液中添加乙酸酐(0.032mL，0.34mmol)。将反应混合物在室温下搅拌4h然后通过离子交换层析使用SCX-2柱纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1MNH3从该柱进行洗脱，并且将含产物部分在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(86mg，70％)，为白色固体(形式A)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.09(1H,d),1.28(9H,s),1.78(6H,s),1.90(1H,d),2.62(1H,s),2.89(2H,s),3.57(1H,dt),3.95(2H,s),7.73(1H,d),7.99(1H,s),8.25(1H,s),8.33-8.36(1H,m),10.53(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
旋光度
方法1：将该标题材料(10mg)溶解在1mL的乙腈中并且将澄清溶液在室温下经3天缓慢蒸发。所得固体发现是处于晶体形式A的实例14。
方法2：将标题材料(10mg)添加至0.1mL乙腈中，并且将所得悬浮液在环境温度下搅拌持续18h并且然后空气干燥3天。所得固体发现是处于晶体形式A的实例14。
晶体形式A通过XRPD分析并且结果在以下制表并且在图1中示出。该固体的XRPD证实该固体包含唯一的形式A，具有在约2-θ＝5.9°，7.0°，9.4°，10.5°，11.5°，11.7°，17.6°，18.0°，20.2°以及21.0°下的特异峰的X射线粉末衍射图。实例14形式A主峰
| 峰 | 2θ | 强度％ |
| 1 | 5.9 | 83.1(vs) |
| 2 | 7.0 | 100.0(vs) |
| 3 | 9.4 | 69.8(vs) |
| 4 | 10.5 | 71.7(vs) |
| 5 | 11.5 | 59.6(vs) |
| 6 | 11.7 | 59.4(vs) |
| 7 | 17.6 | 53.7(vs) |
| 8 | 18.0 | 61.0(vs) |
| 9 | 20.2 | 77.3(vs) |
| 10 | 21.0 | 88.7(vs) |
将根据实例14获得的晶体(形式A)通过热技术分析。DSC分析表明形式A以191°开始点以及193°的峰熔融。TGA表明形式A展现在从22℃至200℃加热时约1.6％的质量损失。代表性DSC/TGA热谱图示于图2中。
用于制造实例14的替代程序在实例85中描述。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
乙基2,2-二甲基-3-(1H-吡唑-1-基)丙酸乙酯的制备
将在DMA(200mL)中的1H-吡唑(20g，293.78mmol)、3-溴-2,2-二甲基丙酸乙基酯(61.4g，293.78mmol)和碳酸铯(144g，440.68mmol)在80℃下搅拌16h。然后将该混合物倾倒入水(400mL)中并用乙酸乙酯(150mL)萃取。将该有机层在减压下进行浓缩以给出无色的油。将此油通过快速硅胶层析，在庚烷中10％至40％乙酸乙酯的洗脱梯度纯化。将产物部分在减压下进行浓缩以提供2,2-二甲基-3-(1H-吡唑-1-基)丙酸乙酯(46.0g，80.0％)，为无色的油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)0.97(6H,s),1.02(3H,t),3.93(2H,q),4.10(2H,s),6.00(1H,t),7.16(1H,d),7.26(1H,d).m/z:(ES+)[M+H]+＝197。
2,2-二甲基-3-(1H-吡唑-1-基)丙酸的制备
在室温下将水性氢氧化钠(5M；94mL，46mmol)分部分添加至溶解于甲醇(250mL)中的2,2-二甲基-3-(1H-吡唑-1-基)丙酸乙酯(46g，234mmol)搅拌溶液中。在添加过程允许该混合物放热至37℃。将所得到的溶液在这些条件下搅拌持续30分钟并且然后冷却至室温，之后在减压下浓缩到1/3体积。将此新溶液用浓HCl进行酸化至约pH 3。从该混合物中分离出无色油。将该烧瓶在冰浴中旋涡，并且结晶出无色固体。允许将该混合物在室温下静置过夜，并且将该固体通过过滤进行分离，并且在减压下干燥，以提供2,2-二甲基-3-(1H-吡唑-1-基)丙酸(30.0g，76％)，为无色结晶固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.05(6H,s),4.23(2H,s),6.21(1H,t),7.35-7.44(1H,m),7.54-7.67(1H,m),12.41(1H,br s).m/z:(ES+)[M+H]+＝169。
5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-酮的制备
在-78℃下经20分钟的时间在氮下将己烷(9.03mL，24.38mmol)中的n-BuLi逐滴添加到在2-甲基四氢呋喃(40mL)中的2,2-二甲基-3-(1H-吡唑-1-基)丙酸(2g，11.89mmol)中。将所得到的悬浮液在-78℃下搅拌持续15分钟，并且然后将该反应在大约-45℃搅拌1h，然后允许加温至15℃，之后将该反应缓慢淬灭到冰冷的饱和氯化铵(100mL)上。将该反应混合物用EtOAc(100mL)稀释并且将氯化铵层分离并且用EtOAc(50mL)再萃取一次。将合并的有机物层用饱和水性氯化钠(50mL)洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤并蒸发，以给出5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-酮(0.970g，54.3％)，为淡黄色油，其在静置时结晶。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.29(6H,s),4.36(2H,s),6.77(1H,d),7.89(1H,d).m/z:ES+[M+H]+151。
5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
将水合肼(4.13mL，85.23mmol)添加至5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-酮(2.56g，17.1mmol)溶解在2,2'-氧基二乙醇(48.5mL，511mmol)中的搅拌溶液中。将所得溶液在180℃下搅拌1h。将氢氧化钾(3.35mL，59.7mmol)小心地添加到该混合物中并且将所得悬浮液在150℃下搅拌2h。在冷却至室温后，将该反应混合物用水(50mL)进行稀释、并且将pH用稀释的水性HCl(2N)调节至4.5。用Et2O(5x 50mL)萃取后，将合并的有机层用水(2x 20mL)并且然后用饱和水性氯化钠(20mL)洗涤。将有机层用MgSO4进行干燥，过滤并在减压下浓缩，以给出5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.922g，39.7％)，为澄清的黄色油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.21(6H,s),2.61(2H,s),3.80(2H,s),5.82-5.93(1H,m),7.41(1H,d)。
3-溴-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在23℃下将N-溴代琥珀酰亚胺(1166mg，6.55mmol)添加至5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(892mg，6.55mmol)溶解在DCM(10mL)中的搅拌溶液中。将所得混合物在23℃下搅拌16h，之后用DCM(20mL)稀释并且用水(2x 20mL)和饱和水性氯化钠(20mL)顺序地洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出3-溴-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1394mg，99％)，为黄色的油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.23(6H,s),2.58(2H,s),3.83(2H,s),7.35(1H,s)。
5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
将Pd(P(Cy)3)2Cl2(0.247g，0.33mmol)添加到在DMA(7mL)中的4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-二(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(1.70g，6.69mmol)、3-溴-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.720g，3.35mmol)和乙酸钾(1.150g，11.72mmol)中。将所得悬浮液脱气并且在85℃下搅拌5h。然后将二氯[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]钯DCM加合物(0.273g，0.33mmol)添加到该反应混合物中，并且在这些条件下继续搅拌持续18h，之后将该反应混合物冷却至室温。将该反应混合物用EtOAc(20mL)稀释并且用水(2x 15mL)、以及饱和水性氯化钠(15mL)顺序地洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，在庚烷中0至50％EtOAc洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.458g，52.2％)，为膏状固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.24(6H,s),1.27(12H,s),2.79(2H,s),3.87(2H,s),7.76(1H,s)。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(433mg，0.83mmol)、((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(360mg，0.75mmol；如在实例10中制备的)、第二代X-Phos预催化剂(59.0mg，0.08mmol)和磷酸氢二钾(392mg，2.25mmol)溶解在1,4-二噁烷(4mL)和水(0.8mL)中并且在50℃下搅拌5h。将该反应混合物冷却至室温，并且然后通过离子交换层析，使用SCX-2柱纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯部分在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(188mg，51.3％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,23℃)1.25(12H,d),1.37(7H,s),1.74(3H,s),1.87(1H,d),2.52-2.62(1H,m),2.88(2H,s),3.18-3.29(1H,m),3.93(2H,s),6.80(1H,d),7.99(1H,s),8.24(1H,s),8.32-8.35(1H,m),10.56(1H,s).m/z:ES+[M+H]+488。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(186mg，0.380mmol)溶解在二噁烷中的HCl(4M；0.810mL，3.24mmol)和MeOH(5mL)中并且在室温下搅拌18h。将该反应混合物通过离子交换层析，使用SCX-2柱纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(114mg，77％)，为白色固体，将其直接用于下一步骤中。m/z:ES+[M+H]+388。
实例15：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
在室温下在氮气下将乙酸酐(0.021mL，0.22mmol)逐滴添加至在DCM(1mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.066g，0.18mmol)、4-二甲基氨基吡啶(1.141mg，9.34μmol)和三乙胺(0.081mL，0.58mmol)中。将所得溶液在室温下搅拌2h，之后是用饱和水性NH4Cl淬灭(10mL)。将所得混合物用DCM(2x 10mL)进行萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将产生的白色固体通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将各部分蒸发至干燥，以提供半纯产物，将该产物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μm硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)以及MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进一步纯化。将包含所希望的化合物的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(9.80mg，12.6％)。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.13(1H,dd),1.31-1.52(4H,m),1.87-1.95(2H,m),1.96(4H,s),2.20(3H,dd),2.39-2.5(1H,m),3.39-3.45(2H,m),4.16(2H,t),4.81(1H,s),5.49(1H,d),7.79(1H,s),8.14(1H,s),8.19(1H,s),8.30(1H,s).m/z:ES+[M+H]+417。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
3-碘-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶的制备
在室温在氮气下将N-碘琥珀酰亚胺(0.581g，2.58mmol)添加到乙腈(5mL)中的4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶(0.265g，2.15mmol)中。将所得溶液在室温下搅拌1h，之后添加水(20mL)。继续搅拌持续1.5h，并且然后将该反应混合物用MTBE(3x 20mL)萃取。将合并的有机层顺序地用2M水性NaOH(20mL)、Na2S2O3溶液(20mL，10％w/v)，和饱和水性氯化钠(20mL)进行洗涤，之后是经MgSO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供3-碘-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶(0.155g，28.9％)，为白色结晶固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)2.16(2H,q),3.32-3.44(2H,m),3.98(1H,s),4.12(2H,t),7.24(1H,s).m/z:ES+[M+H]+250。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在4℃下将3-碘-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶(0.150g，0.600mmol)和2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.184mL，0.9mmol)溶解于THF(4mL)中。然后逐滴添加在THF(1.3M；2.78mL，3.61mmol)中的异丙基氯化镁氯化锂复合物。将所得混合物在4℃下搅拌16h，然后加入另外的在THF(1.3M；2.78mL，3.61mmol)中的异丙基氯化镁氯化锂复合物和2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.184mL，0.90mmol)。将该反应在这些条件下进行搅拌持续1h并且然后在减压下浓缩。将所得残余物再溶解于EtOAc(20mL)中并且用饱和水性NH4Cl(25mL)、水(20mL)、和饱和氯化钠(20mL)顺序地洗涤。将合并的水层用DCM(2x 20mL)洗涤。将合并的有机层用Na2SO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出粗3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶，将其在50℃下添加到溶解在1,4-二噁烷(4mL)和水(0.8mL)中的((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.160g，0.33mmol；如在实例10中制备的)、第二代X-Phos预催化剂(0.026g，0.03mmol)和磷酸三钾(0.175g，1.00mmol)中。将所得混合物在50℃下搅拌2h并且然后在80℃下搅拌16h。将该反应混合物在减压下浓缩并且将所得残余物再溶解在DCM(20mL)中并用水(20mL)洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤并且在减压下浓缩，以给出粗产物，将其通过快速硅胶层析，在庚烷中0至30％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.082g，52％)，为黄色胶质。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.44(12H,s),1.82-2.46(8H,m),3.27-3.36(3H,m),4.12(3H,t),5.33(1H,d),7.80(1H,s),8.13(1H,s),8.19(1H,s),8.20(1H,s).m/z:ES+[M+H]+475。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺三盐酸盐的制备
在室温下在空气中将叔丁基((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸酯(0.086g，0.18mmol)和在二噁烷(4M；0.362mL，1.45mmol)中的HCl溶解在甲醇(2mL)中。将所得溶液在室温下搅拌3h，之后在减压下进行浓缩。将所得材料(66mg)直接用于下一步骤中而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+375。
实例16：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
向(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(65mg，0.39mmol)、三乙胺(0.054mL，0.39mmol)和N，N-吡啶-4-胺(1.123mg，9.19μmol)在DCM(5mL)里的搅拌溶液中添加乙酸酐(0.021mL，0.22mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1h。将该粗产物通过离子交换层析使用SCX-2柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将这些部分蒸发，以得到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(60.0mg，82.0％)，为无色油，将其进行从醚/庚烷混合物中结晶以提供白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.10(1H,t),1.29(9H,s),1.79(6H,s),1.85-1.94(1H,m),2.57-2.66(1H,m),2.93(2H,s),3.58(1H,dt),3.90(2H,s),7.21(1H,dd),7.74(1H,d),7.96(1H,s),8.18-8.24(2H,m),10.32(1H,s).m/z:ES+[M+H]+396。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
((1R,3S)-3-((4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将((1R,3S)-3-((4-溴吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.50g，3.77mmol；如在实例3中制备的)、乙酸钾(1.11g，11.3mmol)、4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-二(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(1.44g，5.65mmol)和PdCl2(dppf)(0.276g，0.380mmol)装入到烧瓶中。添加1,4-二噁烷(30mL)，并且将该混合物在90℃下在氮气下加热持续3h。允许该混合物冷却，并将固体通过过滤去除。添加乙酸乙酯(100mL)和水(50mL)，并且分离各层。将该水层用EtOAc(2x 50mL)萃取，并且将合并的有机层用Na2SO4进行干燥并在减压下浓缩，以提供粗产物，((1R,3S)-3-((4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(2.76g)，为深棕色油。将此油直接用于下一步骤而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+446。
((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将二氯[1,1'-双(二-叔丁基膦基)二茂铁]钯(II)(45.5mg，0.07mmol)添加至((1R,3S)-3-((4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(518mg，0.70mmol)、3-溴-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(150mg，0.70mmol；如在实例14中制备的)和磷酸三钾(444mg，2.09mmol)在1,4-二噁烷(5mL)和水(0.5mL)的脱气的溶液中。将所得混合物在90℃下搅拌持续18h并且然后通过离子交换层析，使用SCX-2柱纯化。将所希望的产物使用在MeOH中的1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯的部分在减压下进行浓缩，以给出为棕色油的粗产物。将此油通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(100mg，31.6％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+454。
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(93mg，0.21mmol)溶解在二噁烷中的HCl(4M；0.436mL，1.74mmol)和MeOH(5mL)中，并且将该反应混合物在室温下搅拌18h。然后将该反应混合物通过离子交换层析，使用SCX-2柱纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将这些部分在减压下浓缩。将所得粗产物进一步通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％(在甲醇中7N氨)的洗脱梯度纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(68.0mg，94％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+354。
实例17：(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(108mg，0.28mmol)添加到1-羟基环丙烷甲酸(35mg，0.34mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.28mmol；根据实例16制备的)、以及三乙胺(0.12mL，0.85mmol)在DMF(1mL)中的溶液中。将该反应混合物在50℃下加热持续4h并且然后冷却至室温。将该反应混合物直接通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，19mm直径，100mm长度)，使用水(包含1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺(92mg，74％)，为固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)0.74(2H,m),0.85-1.01(2H,m),1.15-1.27(9H,m),1.44(1H,q),1.61-1.77(3H,m),1.79-1.87(1H,br.d),2.52-2.59(1H,m),2.86(2H,s),3.54-3.63(1H,m),3.83(2H,s),6.10(1H,s),7.12-7.16(1H,m),7.57(1H,d),7.90(1H,s),8.13-8.16(2H,m),10.27(1H,s).m/z:ES+[M+H]+438。
实例18：N-((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺
将HATU(77mg，0.20mmol)添加到氧杂环丁烷-3-甲酸(25mg，0.24mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(72mg，0.20mmol；根据实例16制备的)、以及三乙胺(0.085mL，0.61mmol)在DMF(1mL)中的溶液中。将该混合物在室温下搅拌持续4h，并且然后直接通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，19mm直径，100mm长度)，使用水(包含1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供N-((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺(17mg，19％)，为固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.06-1.17(1H,m),1.26-1.39(9H,m),1.77-1.86(3H,m),1.91-1.94(1H,brd),2.57-2.7(1H,m),2.93(2H,s),3.54-3.76(2H,m),3.90(2H,s),4.4-4.71(4H,m),7.21(1H,dd),7.82(1H,d),7.96(1H,s),8.21-8.24(2H,m),10.33(1H,s).m/z:ES+[M+H]+438。
实例19：N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺
将HATU(118mg，0.31mmol)添加到氧杂环丁烷-3-甲酸(32mg，0.31mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.26mmol；根据实例14制备的)、以及三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMA(2mL)中的溶液中。将该混合物在室温下搅拌16h，之后用水(20mL)淬灭。然后将该混合物用DCM萃取(50mL)，并且将有机层用饱和水性氯化钠(50mL)进行洗涤，之后是穿过相分离筒。将合并的有机物用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺(39mg，32％)，为固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.06-1.14(1H,m),1.62-1.75(9H,m),1.72-1.81(3H,m),1.92(1H,br.d)，2.59-2.7(1H,m)，2.90(2H,s)，3.56-3.73(2H,m)，3.95(2H,s)，4.53-4.66(4H,m)，7.80(1H,d)，8.00(1H,s)，8.25(1H,s)，8.35(1H,s)，10.56(1H,s)。m/z:ES+[M+H]+472。
实例20：(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-((S)-2-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(78mg，0.21mmol)添加到(S)-2-羟基丙酸(19mg，0.21mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(80mg，0.21mmol；根据实例14制备的)、以及三乙胺(0.086mL，0.62mmol)在DMF(1mL)中的溶液中。将该混合物在室温下搅拌持续1h，并且然后直接通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，19mm直径，100mm长度)，使用水(包含1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-((S)-2-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺(56mg，59％)，为固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.14-1.21(3H,m),1.23-1.54(10H,m),1.66-1.91(4H,m),2.56-2.70(1H,m),2.90(2H,s),3.53-3.72(1H,m),3.87-3.97(3H,m),5.37(1H,d),7.49(1H,d),8.00(1H,s),8.25(1H,s),8.35(1H,s),10.55(1H,s).m/z:ES+[M+H]+460。
实例21：(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(78mg，0.21mmol)添加到1-羟基环丙烷甲酸(25mg，0.25mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(80mg，0.21mmol；根据实例14制备的)、以及三乙胺(0.086mL，0.62mmol)在DMF(1mL)中的溶液中。将该混合物在50℃下加热3h，然后冷却至室温。将该反应混合物直接通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)，使用水(包含1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺(25mg，26％)，为固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)0.72-0.85(2H,m),0.94-1.08(2H,m),1.23-1.49(9H,m),1.47-1.58(1H,m),1.67-1.84(3H,m),1.87(1H,br.d),2.57-2.66(1H,m),2.90(2H,s),3.60-3.71(1H,m),3.95(2H,s),6.16(1H,s),7.62(1H,d),8.01(1H,s),8.26(1H,s),8.35(1H,s),10.55(1H,s).m/z:ES+[M+H]+472。
实例22：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(800mg，1.90mmol；根据实例12制备的)、6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(825mg，5.69mmol)、乙酸钯(171mg，0.76mmol)和乙酸钾(372mg，3.79mmol)悬浮在DMA(15mL)中并且密封到微波管中。将该管脱气并且用氮气吹扫(3x)。然后将该反应经受微波条件(150℃，16h)中并冷却至室温。将反应混合物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶、30mm直径、100mm长度)，使用水(包含1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩。将所得淡棕色固体使用EtOAc/庚烷重结晶并且在真空下干燥以给出(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(180mg，22％)，为白色固体。将滤液在减压下浓缩，以提供第二批次(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(118mg，14％)。1HNMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.03-1.16(1H,m),1.19-1.41(9H,m),1.72-1.81(6H,m),1.91(1H,br.d),2.57-2.68(1H,m),2.71(2H,s),3.50-3.62(1H,m),3.91(2H,s),7.51(1H,s),7.75(1H,d),8.28(1H,s),8.42(1H,s),10.66(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
4,4-二甲基吡咯烷-2-硫酮的制备
将劳维森试剂(Lawesson's Reagent)(9.83g，24.30mmol)添加至4,4-二甲基吡咯烷-2-酮(5.0g，44.19mmol)在甲苯(100mL)中的搅拌溶液中。在氮气下将所得混合物在回流条件下加热持续4.5h。然后将该混合物冷却至室温，并且维持在这些条件下持续18h，之后在减压下浓缩，以提供黄色固体。将该固体溶解于DCM中，添加二氧化硅，并且将该混合物进行过滤。将滤液在减压下浓缩以提供黄色油。将此油通过快速硅胶层析，用DCM洗脱纯化，以提供4,4-二甲基吡咯烷-2-硫酮(2.8g，48％)，为无色结晶固体。将不纯的部分在减压下进行浓缩以提供第二批次4,4-二甲基吡咯烷-2-硫酮，为乳/淡黄色晶体(3.1g，55％)。尽管稍微较低的纯度，此第二批次的材料也是适合用于后续的步骤中。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.19(6H,s),2.70(2H,s),3.36(2H,s),7.75(1H,br.s)。
3,3-二甲基-5-(甲硫基)-3,4-二氢-2H-吡咯氢碘酸盐的制备
在室温下将在MTBE(2M；42.7mL，85.4mmol)中的碘甲烷添加至4,4-二甲基吡咯烷-2-硫酮(2.76g，21.3mmol)在iPrOH(45mL)中的搅拌溶液中。随时间形成了白色沉淀物。将该反应在室温下搅拌持续18h并且然后过滤。将所收集的固体用Et2O进行洗涤并且然后干燥以提供3,3-二甲基-5-(甲硫基)-3,4-二氢-2H-吡咯，作为氢碘酸盐(4.3g，75％)。将这种材料继续至下一阶段而无需进一步纯化。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,27℃)1.17(6H,s),2.74(3H,s),3.10(2H,s),3.72(2H,s),12.3(1H,br.s)。
N-(2,2-二甲氧基乙基)-3,3-二甲基-3,4-二氢-2H-吡咯-5-胺氢碘酸盐的制备
在室温下将2,2-二甲氧基乙胺(1.82mL，16.7mmol)添加到3,3-二甲基-5-(甲硫基)-3,4-二氢-2H-吡咯氢碘酸盐(4.32g，15.9mmol)于乙醇(40mL)中的搅拌悬浮液中。在添加该胺时该氢碘酸盐溶解。将所得混合物在回流条件下加热(使用漂白洗涤器)持续4.5h，并且然后去除加热。在另一个18h反应之后，将该混合物在减压下进行浓缩以提供粗制N-(2,2-二甲氧基乙基)-3,3-二甲基-3,4-二氢-2H-吡咯-5-胺氢碘酸盐(5.35g，102％)，为无色结晶固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.12(6H,s),2.58-2.7(2H,m),3.34(8H,s),3.37(2H,d),4.51(1H,m),9.35(2H,br.s)。
6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑的制备
在室温下将盐酸(4M；5mL，20mmol)添加至N-(2,2-二甲氧基乙基)-3,3-二甲基-3,4-二氢-2H-吡咯-5-胺氢碘酸盐(5.35g，16.3mmol)在1,4-二噁烷(50mL)中的搅拌溶液中。将所得混合物在90℃下加热3h。然后将该混合物冷却至室温并且在这些条件下搅拌2.5天，之后在减压下浓缩，以提供深棕色焦油。将此混合物溶解于DCM中并且用Et2O稀释。将氨水(28％-30％；2.8mL)添加至该搅拌混合物中。将各层进行分离，并且该有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩以提供6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(2.32g，100％)，为褐色的油。1H NMR(400MHz,CDCl3,21℃)1.28(6H,s),2.70(2H,s),3.69(2H,s),6.84(1H,d),7.03(1H,d)。
实例23：(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺
将(R)-四氢呋喃-3-甲酸(0.036g，0.31mmol)、HATU(0.118g，0.31mmol)和三乙胺(0.11mL，0.77mmol)一起在DMF(2mL)中在氮气下搅拌持续20分钟。然后添加(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.100g，0.26mmol；根据实例14使用如下文所描述制备的5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑制备的)，并且将该混合物搅拌持续另一个30分钟。将该反应在减压下浓缩，并且将该混合物通过快速C18层析法，在含有1％水性NH4OH的水中20％至60％MeCN的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺(0.113g，90％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.05-1.2(1H,m),1.20-1.38(9H,sm),1.79(3H,br.d),1.86-2.03(3H,m),2.56-2.63(1H,m),2.81-2.91(3H,m),3.52-3.78(4H,m),3.83(1H,t),3.95(2H,s),7.83(1H,d),7.99(1H,s),8.25(1H,s),8.34(1H,s),10.53(1H,s).m/z:ES+[M+H]+486。
用于制备5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(已经描述于实例14中，中间体)的替代程序描述如下：3-碘-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在室温下在氮气下将NIS(1.646g，7.32mmol)分部分地添加至在乙腈(40mL)中的5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.906g，6.65mmol；根据实例14制备的)中。将所得混合物在23℃下搅拌18h。将该反应混合物用EtOAc(50mL)稀释并且用水(40mL)、水性硫代硫酸钠(10g，在30mL中)、以及饱和水性氯化钠(20mL)顺序地洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出粗产物(1.59g，91％)，为橙色的油。将此油在减压下通过蒸馏来纯化(0.12毫巴)，并且在140℃的头部温度下收集。这种方式收集的馏出物提供3-碘-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1.38g，79％)，为无色液体。可替代地，将该碘化物继续到下一个步骤而无需蒸馏。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.30(6H,s),2.63(2H,s),3.94(2H,s),7.47(1H,s)。
5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在氮气下在-78℃下将在THF(1.3M；1.69mL，2.20mmol)中的异丙基氯化镁氯化锂复合物经10分钟逐滴添加至在THF(5mL)中的3-碘-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.444g，1.69mmol)中。将所得混合物在-78℃下搅拌持续45分钟。然后将2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.473g，2.54mmol)逐滴添加到该反应混合物中，保持内部温度在-78℃。一旦添加完成，允许该反应混合物经18h加温至室温。然后将该反应混合物在减压下浓缩并且用EtOAc(40mL)稀释。将所得混合物用饱和水性氯化铵(20mL)、水(20mL)、以及饱和水性氯化钠(20mL)顺序地进行洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩以提供基于NMR分析约13mol％戴斯-碘(des-iodo)起始材料污染的5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.41g，93％)，为蜡质固体。用庚烷研磨提供纯的5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.24g，55％)，为白色固体。
实例24：(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺
将(S)-四氢呋喃-3-甲酸(0.036g，0.31mmol)、HATU(0.12g，0.31mmol)和三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMF(2mL)中的溶液在氮气下搅拌持续20分钟。然后添加在DMF(1mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.10g，0.26mmol；根据实例14使用如实例23中描述的制备的5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑制备)，并且将所得混合物在这些条件下搅拌持续30分钟。将该混合物在减压下浓缩，并且将所得残余物通过快速C18层析，在含有1％NH4OH的水中20％至60％MeCN的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺(0.10g，81％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.05-1.16(1H,m),1.21-1.41(9H,m),1.72-1.83(3H,m),1.87-2.04(3H,m),2.57-2.66(1H,m),2.82-2.91(3H,m),3.54-3.77(4H,m),3.83(1H,t),3.95(2H,s),7.83(1H,d),7.99(1H,s),8.25(1H,s),8.35(1H,s),10.54(1H,s).m/z:ES+[M+H+]486。
实例25：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将四(三苯基膦)钯(0)(0.13g，0.12mmol)和Xantphos(0.13g，0.23mmol)一起一次性添加到((1R,3S)-3-氨甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.670g，2.76mmol)、3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.61g，2.3mmol)，碳酸铯(1.88g，5.76mmol)和1,4-二噁烷(26mL)的脱气的混合物中。将所得到的亮黄色混合物通过浸没在已预热至120℃的油浴中维持在回流条件下。在20h后，将该反应进行冷却，用50％饱和水性氯化钠稀释，并且用乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出粗((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁酯，为浅黄色固体。添加在二噁烷(4M；10mL，40mmol)和DCM(5mL)中的盐酸，得到透明的橙色溶液，该溶液迅速变得浑浊并且是黄色。将甲醇(约3mL)滴定到反应物中直到该混合物变为大部分澄清。15分钟之后，将该橙色混合物在减压下浓缩，以提供橙色固体。将吡啶(3.7mL，46mmol)连同DCM(19mL)一起添加到这个固体中。注意到略微放热，并且将反应物浸没在水浴中。然后逐滴添加乙酸酐(0.43mL，4.6mmol)。在另一个10分钟之后，添加另一个200μL的乙酸酐。在另一个30分钟之后，添加另一个600μL的酸酐和6mL的吡啶。将反应保持在这些条件下持续另一个45分钟并且然后倾倒进饱和水性碳酸氢钠和乙酸乙酯中。将各层进行分离并且将该水层用乙酸乙酯进行萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得橙色残余物通过快速硅胶层析，在己烷中50％至100％EtOAc随后在乙酸乙酯中0以20％甲醇的洗脱梯度进行纯化，并且将纯的部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.89g，94％)，为淡黄色泡沫状固体。1H NMR(DMSO-d6,27℃):1.00-1.16(1H,m),1.22-1.40(9H,m),1.74-1.81(6H,m),1.83-1.94(1H,m),2.55-2.68(1H,m),2.93(2H,s),3.49-3.65(1H,m),3.94(s,2H),7.75(1H,d),7.88(1H,d),8.28(1H,d),8.30(1H,d),10.46(1H,s).m/z:ES+[M+H]+414。
方法1：将在EtOAc中实例25的浆料(381mg)在室温下搅拌持续18h，然后过滤并且用冷EtOAc洗涤以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(149mg)，为作为实例25形式A已知的结晶白色固体。
方法2：将大约5g实例25吸收在1:1:1的己烷:DCM:丙酮(约20mL)中并且然后在减压下进行浓缩以给出轻微半透明凝胶。然后将这种凝胶用少量的相同的溶剂(约5mL)进行处理，并且剧烈搅拌持续10分钟直到形成均匀的白色混合物且无凝胶可见。将此混合物用在己烷中30％丙酮洗涤物过滤，并且将沉淀物在真空下在50℃下干燥以提供实例25形式A，为白色固体。
通过XRPD分析实例25的晶体(形式A)并且将结果在以下列表并在图3中示出。该固体的XRPD证实该固体包含形式A。
实例25形式A的主峰在下表2中示出：
| 峰 | 2θ | 强度％ |
| 1 | 8.8 | 100.0(vs) |
| 2 | 10.1 | 18.0(s) |
| 3 | 11.5 | 35.8(vs) |
| 4 | 18.9 | 23.5(s) |
| 5 | 20.0 | 28.7(vs) |
| 6 | 20.5 | 28.1(vs) |
| 7 | 21.8 | 28.3(vs) |
| 8 | 22.8 | 25.8(vs) |
| 9 | 23.9 | 23.9(s) |
| 10 | 25.2 | 23.9(s) |
根据本发明，提供了晶体形式，形式A，它具有在约2-θ＝8.8°，10.1°，11.5°，18.9°，20.0°，20.5°，21.8°，22.8°，23.9°以及25.2°下特异峰的X射线粉末衍射图。
通过热技术分析根据方法1和2获得的晶体(形式A)。DSC分析表明形式A以194°开始点以及197°的峰熔融。TGA表明形式A展现在从22℃至100℃加热时约1.4％的质量损失。代表性DSC/TGA热谱图示于图4中。
用于制造(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的替代程序描述于实例86中
用于制备起始材料叔丁基((1R,3S)-3-氨甲酰基环己基)氨基甲酸酯和3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的程序描述如下：
3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在21℃将2-氯-5-氟-4-碘吡啶(1.00g，3.88mmol)、5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1.53g，5.83mmol；根据实例23制备)，第二代XPhos预催化剂(0.31g，0.39mmol)以及磷酸氢二钾(2.03g，11.65mmol)溶解于脱气的二噁烷(10mL)和水(2mL)中。将反应混合物在80℃下搅拌3h，并且然后将该混合物冷却，用EtOAc(30mL)稀释，并且用水(10mL)洗涤。将该有机层在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在庚烷中0至50％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1.00g，97％)，为白色固体。1H NMR(500MHz,CDCl3,27℃)1.36(6H,s),2.95(2H,d),3.97(2H,s),7.31(1H,d),7.94(1H,d),8.20(1H,d).m/z:ES+[M+H]+266。
(顺式)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯的制备
在0℃下将苄基溴(12.4mL，104mmol)作为在DMF(10mL)中的溶液逐滴添加至顺式-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(19.5g，80.0mmol，根据实例2中间体制备)、碳酸铯(33.9g，104mmol)以及DMF(80mL)的脱气的混合物中。除去冰浴，并且将该反应在这些条件下搅拌18h。然后将该混合物用等体积的乙酸乙酯稀释并且用乙酸乙酯洗涤物过滤。将有机层用50％饱和水性氯化钠(3x)并且然后用饱和水性氯化钠洗涤。然后将有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得淡黄色的油通过快速硅胶层析，在己烷中0至30％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供顺式-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯(25.4g，95％)，为澄清无色油，其在静置时凝固成白色固体。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.98-1.34(4H,m),1.38(9H,s),1.67-1.78(2H,m),1.84(1H,d),1.99(1H,d),2.35-2.49(1H,m),3.17–3.31(1H,s),5.09(2H,s),6.76(1H,d),7.30-7.42(5H,m).m/z:ES+[M+Na]+356。
(1S,3R)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯和(1R,3S)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯的制备
将顺式-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯(25.4g，76.2mmol)通过制备型SFC条件(柱：Lux直链淀粉-2，5μm，21.2mm直径、250mm长度，40℃柱温，80mL/min的流速)，用在CO2中10％的异丙醇洗脱来拆分，以提供(1S,3R)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯(11.5g，45％)，为白色固体和(1R,3S)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯(11.5g，45％)，为白色固体。
(1S,3R)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯
1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.96-1.34(4H,m),1.37(9H,s),1.68-1.88(3H,m),1.98(1H,d),2.37-2.48(1H,m),3.16-3.32(1H,m),5.09(2H,s),6.59-6.84(1H,m),7.26-7.50(5H,m).m/z:ES+[M+Na]+356。
旋光度：
(1R,3S)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯
1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.95-1.34(4H,m),1.37(9H,s),1.68-1.78(2H,m),1.84(1H,d),1.98(1H,d),2.36-2.48(1H,m),3.17-3.34(1H,m),5.09(2H,s),6.76(1H,d),7.30-7.41(5H,m).m/z:ES+[M+Na]+356。
旋光度：
分析型SFC条件：
保留时间：
0.66分钟，(1S,3R)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯
0.96分钟，(1R,3S)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯
e.e.
>98％，(1S,3R)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯
97.5％，(1R,3S)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯
用于制备(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(已经描述在实例2，中间体中)的替代程序描述如下：
将(1S,3R)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯(11.5g，34.6mmol)、钯碳(10wt％；3.68g，34.5mmol)、以及甲醇(86mL)的经脱气的混合物经受氢气气氛(1个大气压的、气球)。在18h之后，将该混合物用甲醇洗涤物进行过滤。将滤液浓缩为轻微混浊的淡灰色油。将此油吸收在乙酸乙酯中，用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得白色油状固体在真空下加热直到所有气泡由溶剂蒸发停止。冷却至室温提供了(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(8.4g，99％)，为白色固体(参见实例2，中间体，用于表征)。
旋光度：
((1R,3S)-3-胺甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在40℃下将羰基-二咪唑(6.44g，39.74mmol)添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(3.22g，13.3mmol)在DMF(30mL)中的溶液中。将所得混合物在40℃下搅拌4h。然后将该反应混合物冷却至0℃，并且一次性添加乙酸铵(7.15g，92.7mmol)同时剧烈搅拌。这之后是气体释放并且产生泡沫。将少量(约2mL)的DCM沿烧瓶的侧面添加以便分裂开该泡沫并且防止它到达该烧瓶开口。逐渐将这种泡沫通过该反应混合物重吸收，允许其加温至室温过夜。在这些条件下总的18h之后，将该反应混合物倾倒入冰水中，并且将所得混合物在这些条件下搅拌持续5分钟，之后用水洗涤物过滤。将所得沉淀物在真空下在80℃下干燥持续2h，之后冷却至室温。然后将真空干燥持续18h，以提供((1R,3S)-3-胺甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯(2.76g，86％)，为白色蓬松固体。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.99-1.31(4H,m),1.38(9H,s),1.58-1.85(4H,m),2.06-2.19(1H,m),3.14-3.26(1H,m),6.63(1H,brs),6.73(1H,d),7.17(1H,br s).m/z:ES+[M+Na]+265。
旋光度：
实例26：顺式-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺
在室温下在氮气气氛下将在THF中的四丁基氟化铵(1M；0.154mL，0.15mmol)添加至顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(68mg，0.15mmol)在THF(3mL)中的搅拌溶液中。将该反应混合物在这些条件下搅拌2h并且然后使用SCX柱，用DCM、MeOH、以及在MeOH中1％的NH3顺序地洗脱进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)，使用水(含有1％NH3)以及MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化，以提供顺式-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺(43mg，85％)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.30(6H,s),2.05(2H,qd),2.28-2.43(2H,m),2.71-2.85(1H,m),2.95(2H,s),3.91(2H,s),3.98(1H,q),5.13(1H,d),7.17-7.26(1H,m),7.98(1H,s),8.21(1H,dd),8.25(1H,s),10.30(1H,s).m/z:ES+[M+H]+327。
用于制备起始材料顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的程序描述如下：
顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的制备
将顺式-N-(4-溴吡啶-2-基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酰胺(365mg，0.800mmol；根据实例6制备的)、5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3-二氧戊环-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(185mg，0.700mmol；根据实例23制备的)、磷酸钾(446mg，2.10mmol)和第二代XPhos预催化剂(55mg，0.070mmol)在室温下悬浮于1,4-二噁烷(4mL)和水(0.80mL)中。将所得混合物脱气，用氮气吹扫，并且然后加热至85℃持续18h。将该反应混合物冷却至室温，并且在EtOAc(50mL)和水(25mL)之间分配。将各层进行分离并且将该水层用EtOAc(2x 50mL)和DCM(50mL)萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得橙色胶质通过快速硅胶层析，用0到40％EtOAc/庚烷洗脱进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩以提供顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(68mg，22％)，为无色结晶固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,22℃)0.06(6H,s),0.89(9H,s),1.36(6H,s),2.22-2.38(2H,m),2.49-2.67(3H,m),3.02(2H,s),3.93(2H,s),4.15-4.35(1H,m),7.11(1H,dd),7.82(1H,s),7.92(1H,s),8.17(1H,d),8.30(1H,s).m/z:ES+[M+H]+441。
实例27：顺式-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺
在室温下在氮气气氛下将在THF中的四丁基铵氟化物(1M；0.21mL，0.21mmol)添加至顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(101mg，0.210mmol)在THF(3mL)中的搅拌溶液中。将所得到的溶液在这些条件下搅拌持续18h。将该反应混合物使用SCX柱，用DCM、MeOH、以及在MeOH中1％NH3顺序地洗脱进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将产物部分在减压下浓缩，并且将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯SunFire柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)，使用水(含有0.1％甲酸)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进一步纯化。将含有所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以给出顺式-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺(35mg，45％)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.29(6H,s),2.04(2H,qd),2.37(2H,qd),2.77(1H,ddd),2.92(2H,s),3.96(2H,s),3.96-4.02(1H,m),5.14(1H,d),8.02(1H,s),8.29(1H,s),8.34(1H,d),10.51(1H,s).m/z:ES+[M+H]+361。
用于制备起始材料顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的程序描述如下。
顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的制备
在室温下将在乙酸乙酯中的T3P(50重量％；2.85mL，4.79mmol)添加至5-氯-4-碘吡啶-2-胺(610mg，2.40mmol；根据实例2制备的)、顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸(552mg，2.40mmol；根据实例4中制备的)和吡啶(0.78mL，9.6mmol)在EtOAc(10mL)中的搅拌溶液中。将所得溶液在室温下搅拌18h。通过添加饱和水性氯化铵(30mL)淬灭该反应。将各层进行分离并且将该水层用EtOAc(3x 50mL)萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(1.07g，96％)，为奶油色结晶固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,21℃)0.06(6H,s),0.89(9H,s),2.23-2.35(2H,m),2.47-2.64(3H,m),4.17-4.32(1H,m),7.95(1H,bs),8.18(1H,s),8.86(1H,s).m/z:ES+[M+H]+467。
顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺的制备
在室温下将顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(461mg，0.840mmol)、5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(200mg，0.76mmol；根据实例23制备的)、磷酸钾(486mg，2.29mmol)和第二代XPhos预催化剂(60.0mg，0.08mmol)悬浮于1,4-二噁烷和水中。将所得混合物脱气，用氮气吹扫，并且在85℃下加热过夜。将该反应冷却至室温，并且在EtOAc(50mL)和水(25mL)之间分配。将各层进行分离并且将该水层用EtOAc(3x 50mL)萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得橙色胶质通过快速硅胶层析，用0到40％EtOAc/庚烷洗脱进行纯化。将产物部分蒸发至干燥，以得到顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(101mg，28％)，为无色结晶固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,21℃)0.06(6H,s),0.89(9H,s),1.35(6H,s),2.24-2.45(2H,m),2.5-2.74(3H,m),2.98(2H,s),3.96(2H,s),4.18-4.24(1H,m),7.77(1H,s),8.14(1H,s),8.23(1H,s),8.29(1H,s).m/z:ES+[M+H]+475。
实例28：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺
将装有(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-氯嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.34mmol)、3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(84mg，0.34mmol)、二氯[1,1'-双(二-叔丁基膦基)二茂铁]钯(II)(11mg，0.020mmol)和磷酸钾(215mg，1.01mmol)的烧瓶抽空并且用氮回填(3x)。添加脱气的1,4-二噁烷(1mL)，随后是水(0.2mL)，并且将该混合物加热至90℃并保持在这些条件下持续18h。然后将该反应物在减压下浓缩，并且将所得残余物在饱和水性碳酸氢钠(20mL)和乙酸乙酯(20mL)之间分配。将各层进行分离并且将该水层用乙酸乙酯(2x 20mL)进行萃取。将该合并的有机层用饱和水性氯化钠(20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。将所得的残余物通过柱层析法在碱性氧化铝上、在庚烷中0至100％(在EtOAc中10％MeOH)的洗脱梯度纯化以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺(55mg，43％)，为棕褐色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.01-1.38(4H,m),1.76-2.02(11H,m),2.62-2.69(1H,m),3.10(2H,t),3.52-3.61(1H,m),4.13(2H,t),7.74(1H,d),7.96(1H,s),8.21(1H,d),8.75(1H,d),10.72(1H,s).m/z:ES+[M+H]+383。
用于制备该起始材料(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-氯嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
((1R,3S)-3-((6-氯嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将1-氯-N,N,2-三甲基丙烯基胺(3.26mL，24.7mmol)添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(5.00g，20.6mmol；如在实例2中制备的)在DCM(50mL)中的溶液中，并且将所得混合物在室温下搅拌90min。然后添加6-氯嘧啶-4-胺(2.66g，20.6mmol)和吡啶(2.0mL，25mmol)，并且将所得混合物在这些条件下搅拌持续18h。用饱和水性碳酸氢钠(50mL)淬灭该反应，并且分离各层。将该水层用DCM(2x 50mL)萃取，并且将合并的有机层用饱和水性氯化钠洗涤并且经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在庚烷中0至100％(在乙酸乙酯中10％甲醇)洗脱进行纯化。将产物部分合并且在减压下进行浓缩以给出((1R,3S)-3-((6-氯嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.0g，14％)，为白色固体。m/z:ES-[M-H]-353。
(1S,3R)-3-氨基-N-(6-氯嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐的制备
将在二噁烷中的盐酸(4M；0.655mL，21.6mmol)添加到((1R,3S)-3-((6-氯嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(900mg，2.54mmol)在甲醇(5mL)中的溶液中，并且将所得混合物在室温下搅拌过夜。然后将该混合物用甲苯(10mL)稀释并在减压下浓缩，以给出(1S,3R)-3-氨基-N-(6-氯嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(880mg，106％)，为白色固体，将其直接用于下一阶段中而无需进一步纯化。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-氯嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺的制备
在0℃下将乙酰氯(0.11mL，1.5mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(6-氯嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺(0.217g，0.85mmol)、吡啶(0.69mL，8.5mmol)、和DCM(7.7mL)的混合物中。30min之后，添加另一个200μL的乙酰基氯化物。另一个30min的最终时间将其再次重复。然后将该反应用饱和水性碳酸氢钠淬灭并用乙酸乙酯萃取(2x)。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中10％至100％的乙酸乙酯然后在乙酸乙酯中0至15％甲醇的洗脱梯度纯化以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-氯嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺(0.22g，87％)，为灰白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)0.99-1.16(1H,m),1.18-1.38(3H,m),1.72-1.84(6H,m),1.85-1.97(m,1H),2.58-2.73(1H,m)3.50-3.64(1H,m)7.76(1H,d)8.12(1H,d)8.74(1H,d)11.18(1H,s).m/z:ES+[M+H]+297。
实例29：反式-3-羟基-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺
将在二噁烷中的盐酸(4M；0.085mL，0.34mmol)添加到反式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺(29mg，0.070mmol)在MeOH(1mL)中的溶液中，并且将所得混合物在室温下搅拌2h。将该混合物在减压下浓缩，并且将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，50mm直径，100mm长度)，使用水(包含1％NH3)以及MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供反式-3-羟基-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺(10mg，47％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CD3OD,30℃)1.93-2.05(2H,m),2.07-2.18(2H,m),2.26(2H,m),2.60(2H,m),3.17-3.28(3H,m),4.21(2H,t),4.49(1H,p),8.06(1H,s),8.33(1H,d),8.71(1H,d).m/z:ES+[M+H]+314。
用于制备起始材料反式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺的程序描述如下：
反式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(6-氯嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺的制备
将1-氯-N,N,2-三甲基丙烯基胺(0.383mL，2.89mmol)添加到反式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸(0.667g，2.89mmol；根据实例4制备的，用顺式-3-羟基环丁烷甲酸取代反式-3-羟基环丁烷甲酸)在DCM(10mL)中的溶液中，并且将所得混合物在室温下搅拌持续1.5h。然后添加6-氯嘧啶-4-胺(0.25g，1.93mmol)和吡啶(0.23mL，2.9mmol)并且将该混合物在室温下搅拌过夜。将该反应用饱和水性碳酸氢钠淬灭(50mL)，并且分离各层。将该水层用DCM(2x 50mL)萃取。将该合并的有机层用饱和水性氯化钠洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，0至100％乙酸乙酯/庚烷的洗脱梯度纯化。将含有产物的部分合并，在减压下进行浓缩以给出反式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(6-氯嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺(0.230g，35％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)0.00(6H,s),0.84(9H,s),2.10(2H,m),2.38-2.45(2H,m),3.21(1H,t),4.44(1H,p),8.14(1H,s),8.71(1H,s),11.13(1H,sbr).m/z:ES+[M+H]+342。
反式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺的制备
将反式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(6-氯嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺(100mg，0.29mmol)、3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(73mg，0.29mmol)、二氯-[1,1'-双(二-叔丁基膦基)二茂铁]钯(II)(9.5mg，0.01mmol)和磷酸钾(186mg，0.88mmol)装入到烧瓶中，并且将该烧瓶抽空并且用氮回填(3x)。然后添加脱气的1,4-二噁烷(1mL)，并且将该混合物加热至90℃并保持在这些条件下持续2h。将该反应在减压下浓缩，并且将所得残余物在饱和水性碳酸氢钠(20mL)和乙酸乙酯(20mL)之间分配。将各层进行分离并且将该水层用乙酸乙酯(2x 20mL)进行萃取。将该合并的有机层用饱和水性氯化钠(20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在庚烷中0至100％EtOAc的洗脱梯度纯化，以给出反式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺(29mg，23％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)0.00(6H,s),0.89(9H,s),1.91-1.99(2H,m),2.08(2H,m),2.29(2H,m),2.63(2H,m),3.01-3.10(1H,m),3.23(2H,t),4.21(2H,t),4.52-4.63(1H,m),8.08(1H,s),8.31(1H,d),8.43(1H,s br),8.73(1H,d).m/z:ES+[M+H]+428。
实例30：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺
在室温下在氮气下将乙酸酐(0.038mL，0.41mmol)逐滴添加至粗(1S,3R)-3-氨基-N-(6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺盐酸盐(0.120g，0.308mmol)、4-二甲基氨基吡啶(2.07mg，0.02mmol)、和三乙胺(0.15mL，1.1mmol)在DCM(2mL)中的溶液中。将所得溶液在室温下搅拌4h。然后将该反应混合物用饱和水性NH4Cl淬灭(10mL)，用DCM(2x 10mL)萃取，并且将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺(0.066g，55％)，为白色固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.02-1.12(1H,m),1.25-1.37(9H,m),1.76-1.88(6H,m),1.90-1.96(1H,m),2.61-2.67(1H,m),2.95(2H,s),3.54-3.61(1H,m),3.92(2H,s),7.76(1H,br d),8.03(1H,d),8.15(1H,d),8.73(1H,dd),10.75(1H,sbr).m/z:ES+[M+H]+397。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺盐酸盐的程序描述如下：
((1R,3S)-3-((6-溴嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在氮气下在0℃下将1-氯-N,N,2-三甲基丙烯基胺(0.46mL，3.5mmol)逐滴添加至(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(699mg，2.87mmol；根据实例2制备的)在DCM(10mL)中的溶液中。将所得溶液在0℃下搅拌1.5h。然后添加6-溴嘧啶-4-胺(400mg，2.30mmol)和吡啶(0.28mL，3.5mmol)，并且将该反应混合物在室温下搅拌过夜。将粗反应混合物在减压下进行浓缩。然后向所得固体中添加DCM。然后将所得混合物过滤，并且将所得沉淀物通过快速硅胶层析，在DCM中0至2％MeOH的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供((1R,3S)-3-((6-溴嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(605mg，66％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+399
((1R,3S)-3-((6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将第二代XPhos预催化剂(0.039g，0.050mmol)添加到5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.18g，0.60mmol；根据实例23制备的)、((1R,3S)-3-((6-溴嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.20g，0.50mmol)和磷酸三钾(0.262g，1.50mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(2mL)中的脱气的混合物中。将混合物脱气并在90℃下在氮气下搅拌2h。然后将该反应混合物在减压下浓缩，并且将所得残余物吸收在水(20mL)中。将所得混合物用EtOAc(2x 20mL)和DCM(20mL)顺序地进行萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供((1R,3S)-3-((6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.18g，79％)，为奶油色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.06-1.13(1H,m),1.35(6H,s),1.41-1.50(12H,m),1.87-1.96(3H,m),2.26-2.37(1H,d),2.38-2.44(1H,m),3.04(2H,s),3.44-3.58(1H,m)3.93(2H,s),4.44-4.52(1H,m),8.00(1H,br s),8.13(1H,s),8.18(1H,d),8.72(1H,dm/z:ES+[M+H]+455。
(1S,3R)-3-氨基-N-(6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺盐酸盐的制备
在室温下在空气中将((1R,3S)-3-((6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.160g，0.35mmol)和在二噁烷中的盐酸(4M；0.71mL，2.8mmol)溶解在甲醇(2mL)中。将所得溶液在室温下搅拌16h。将该反应混合物在减压下浓缩，并且将得到的粗品(1S,3R)-3-氨基-N-(6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺盐酸盐(0.120g，88％)继续到下一个步骤而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+355。
实例31：(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-(2-氰基乙酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例2制备的)、2-氰乙酸(31.4mg，0.37mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和NaHCO3和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在己烷中80％至100％的EtOAc洗脱进行纯化，以提供(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-(2-氰基乙酰胺基)环己烷甲酰胺(51mg，35％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.04-1.19(1H,m),1.21-1.39(3H,m),1.73-1.88(5H,m),1.93(1H,br d),1.99-2.10(2H,m),2.56-2.68(1H,m),2.80(2H,t),3.52-3.64(3H,m),4.14(2H,t),7.76(1H,s),8.14(1H,s),8.19(1H,d),8.38(1H,s),10.59(1H,s).m/z:ES+[M+H]+441。
旋光度：
实例31a：((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯
在0℃下将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(0.344g，2.57mmol)逐滴添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(0.611g，2.51mmol；根据实例2制备的)在DCM(12mL)中的搅拌的溶液中。将所得混合物在0℃下搅拌1.5h。然后逐滴添加5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺(0.50g，2.0mmol；根据实例2制备的)和吡啶(0.65mL，8.0mmol)在DCM(18mL)中的溶液。该无色反应混合物变为黄色。移除冰浴，并且将该反应保持在这些条件下持续18h。
然后如下重复这种相同反应：在0℃下将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(1.032g，7.72mmol)逐滴添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(1.8g，7.5mmol)在DCM(30mL)中的搅拌的溶液中。将所得混合物在0℃下搅拌1.5h。然后逐滴添加5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-胺(1.5g，6.0mmol)和吡啶(2.0mL，24mmol)在DCM(50mL)中的溶液。该无色反应混合物变为黄色。移除冰浴，并且将该反应保持在这些条件下持续18h。然后将两个反应合并并且用MeOH(10mL)稀释，以溶解沉淀。将所得溶液用饱和水性氯化钠进行洗涤，并且将该有机层用Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩为最小体积。将所得溶液通过快速硅胶层析，在己烷中50％至80％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(2.6g，68％)，为固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.04-1.21(1H,m),1.38-1.52(12H,m),1.87-2.19(7H,m),2.31(1H,br d),2.36-2.49(m,1H),2.95(2H,t),3.45-3.61(m,1H),4.24(2H,t),4.34-4.52(1H,m),7.92(s,1H).m/z(ES+),[M+H]+＝474。
实例31b：(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将在二噁烷中的盐酸(4M；3.2mL，13mmol)添加到叔丁基((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸酯(1g，2.11mmol)在MeOH(4mL)和DCM(4mL)中的搅拌的悬浮液中。反应悬浮液变成澄清溶液。将该反应在室温下搅拌2h并且然后在减压下浓缩为作为二盐酸盐分离的(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.91g，97％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.12-1.39(3H,m),1.50(1H,q),1.77-1.90(4H,m),1.90-2.10(4H,m),2.57-2.69(1H,m),2.81(2H,t),2.95-3.09(1H,m),4.14(2H,t),7.77(1H,s),7.99-8.21(4H,m),8.39(1H,s),10.67(1H,s).另外的HCl质子在5.61ppm处的宽单峰。m/z(ES+),[M+H]+＝374。
实例32：(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例31b制备的)、1-羟基环丙烷甲酸(34mg，0.34mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和水性NaHCO3和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中80％至100％EtOAc的洗脱梯度进行纯化，以提供(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺(61mg，40％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.00-1.09(m,2H),1.19-1.31(1H,m),1.34-1.40(2H,m),1.42-1.59(3H,m),1.88-2.17(7H,m),2.30(1H,br d),2.44-2.58(1H,m),2.83(1H,s),2.90-2.99(2H,m),3.83-3.95(1H,m),4.24(2H,t),6.83(1H,d),7.94(1H,s),8.19(1H,s),8.27(1H,s),8.46(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+458。
旋光度：
实例33：(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺
将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例31b制备的)、(R)-四氢呋喃-3-甲酸(43mg，0.37mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和水性碳酸氢钠和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中80％至100％EtOAc的洗脱梯度进行纯化，以提供(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺(77mg，49％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.10-1.29(1H,m),1.36-1.58(3H,m),1.84-2.04(5H,m),1.85-2.05(5H,m),2.06-2.21(4H,m),2.25(1H,br d),2.41-2.55(1H,m),2.82-2.97(4H,m),3.76-3.99(4H,m),4.23(2H,t),5.66(1H,d),7.92(1H,s),8.13(1H,s),8.21-8.33(2H,m).m/z:ES+[M+H]+472。
旋光度：
实例34：N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-环己基)-3-甲基氧杂环丁烷-3-甲酰胺
将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例31b制备的)、3-甲基氧杂环丁烷-3-甲酸(43mg，0.37mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和水性碳酸氢钠和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中80％至100％EtOAc的洗脱梯度进行纯化，以提供N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-环己基)-3-甲基氧杂环丁烷-3-甲酰胺(71mg，45％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.17-1.33(1H,m),1.42-1.62(6H,m),1.86-2.16(7H,m),2.21-2.34(1H,m),2.44-2.57(1H,m),2.90-2.99(1H,m),3.89-4.02(1H,m),4.24(2H,t),4.46(2H,d),4.84-4.89(2H,m),5.86(1H,d),7.91(1H,s),8.09(1H,br s),8.19(1H,s),8.28(1H,s).m/z:ES+[M+H]+472。
旋光度：
实例35：(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺
将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例31b制备的)、(S)-四氢呋喃-2-甲酸(43mg，0.37mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和NaHCO3和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中80％至100％EtOAc的洗脱梯度进行纯化，以提供(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺(41mg，26％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.12-1.26(1H,m),1.35-1.57(3H,m),1.79-2.15(10H,m),2.20-2.35(2H,m),2.41-2.53(1H,m),2.94(2H,t),3.81-3.96(3H,m),4.23(2H,t),4.33(1H,dd),6.60(1H,d),7.92(1H,s),8.26(2H,s),8.36(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+472。
旋光度：
实例36：(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺
将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例31b制备的)、(R)-四氢呋喃-2-甲酸(43mg，0.37mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和水性碳酸氢钠和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中80％至100％EtOAc的洗脱梯度进行纯化，以提供(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺(55mg，35％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.13-1.37(1H,m),1.37-1.58(3H,m),1.82-2.17(11H,m),2.20-2.36(2H,m),2.51(1H,br s),2.90-3.00(1H,m),3.81-3.98(3H,m),4.25(2H,t),4.33(1H,dd),6.62(1H,d),7.96(1H,s),8.26(1H,s),8.27-8.31(1H,s),8.78(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+472。
旋光度：
实例37：(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-((S)-2，-2-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例31b制备的)、(S)-2-羟基丙酸(0.033g，0.37mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和水性碳酸氢钠和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18C18柱，5μ硅胶，19mm直径，150mm长度)使用水(含有0.2％氢氧化铵，pH 10)以及MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含产物的部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-((S)-2,-2-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺(0.066g，44％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.15-1.31(1H,m),1.39-1.59(6H,m),1.87-2.17(8H,m),2.28(1H,br d),2.48-2.61(1H,m),2.96(2H,t),3.84-3.98(1H,m),4.20-4.28(3H,m),6.43(1H,d),7.95(1H,s),8.25(1H,s),8.33(1H,s),8.96(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+446。
旋光度：
实例38：(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺
将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例31b制备的)、(S)-四氢呋喃-3-甲酸(43mg，0.37mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和水性碳酸氢钠和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中80％至100％EtOAc的洗脱梯度进行纯化，以提供(S)-N-((1R，3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺(70mg，44％)。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.09-1.26(m,1H),1.38-1.59(m,3H),1.87-2.05(m,5H),2.07-2.21(m,4H),2.29(1H,d),2.38-2.58(1H,m),2.82-2.99(4H,m),3.78-4.00(4H,m),4.24(2H,t),5.63(1H,d),7.92(1H,s),8.25(1H,s),8.27(1H,s),8.40(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+472。
旋光度：
实例39：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氰基-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(195mg，0.57mmol；根据实例14制备的)、(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-氯-5-氰基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(184mg，0.57mmol)、碳酸铯(561mg，1.72mmol)、二噁烷(4.3mL)和水(1.4mL)合并于100-mL圆底烧瓶中以给出无色的溶液。将该溶液用氮气吹扫持续15分钟，并且添加第二代X-Phos预催化剂(33mg，0.04mmol)。将该反应在95℃下在氮气下加热持续1小时，然后冷却并且用DCM(50mL)稀释。将该有机层用水(2x 25mL)洗涤，之后是在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速柱层析，在DCM中0至10％甲醇的洗脱梯度进行纯化。将产物部分在减压下浓缩，并且将所得残余物通过反相HPLC(15gRediSep RfGold(R)反相HP C18柱，Teledyne Isco公司，10-40μ硅胶)，在水中0至80％乙腈的洗脱梯度进行再纯化。将产物部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氰基-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(59mg，24％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.99-1.19(1H,m),1.21-1.40(9H.m),1.73-1.84(6H,m),1.90(1H,br s),2.60-2.73(1H,m),2.95(2H,s),3.49-3.67(1H,m),3.97(2H,s),7.74(1H,d),8.12(1H,s),8.31(1H,s),8.72(1H,s),10.90(1H,s).m/z:ES+[M+H]+421。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-氯-5-氰基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
6-氨基-4-氯烟酸腈的制备
将二氰基锌(0.57g，4.8mmol)、5-溴-4-氯吡啶-2-胺(1.00g，4.82mmol)、四(三苯基膦)钯(0)(0.28g，0.24mmol)以及DMF(12mL)的经脱气混合物经受微波条件(170℃，2分钟)。将反应冷却并通过快速硅胶层析，在己烷中0至70％乙酸乙酯的洗脱梯度直接进行纯化。将产物部分合并且在减压下浓缩。将所得黄色油使用刚才描述的相同的条件进行再纯化以提供6-氨基-4-氯烟酸腈(0.47g，64％)，为灰白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)6.63(1H,s),7.34(2H,br s),8.38(1H,s).13C NMR(75MHz,DMSO-d6,27℃)95.59(1C,s)107.12(1C,s)116.17(1C,s)143.41(1C,s)154.87(1C,s)162.32(1C,s).m/z:ES+[M+H]+154。
((1R,3S)-3-((4-氯-5-氰基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在室温下将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(0.23mL，1.7mmol)添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(310mg，1.27mmol；根据实例2制备的)在DCM(5.5mL)中的溶液中，得到无色溶液。将反应保持在这些条件下持续2h，并且在0℃下将此反应物直接添加到6-氨基-4-氯烟酸腈(178mg，1.16mmol)和吡啶(0.37mL，4.6mmol)在DCM(11mL)中的溶液中。允许该反应加温至室温并且维持在这些条件下持续18h。然后将该反应用DCM稀释并且用水以及饱和水性氯化钠洗涤，经硫酸镁干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％甲醇的洗脱梯度进行纯化。将所得材料通过快速硅胶层析，在己烷中0至100％乙酸乙酯的洗脱梯度进行再纯化，以提供叔丁基((1R,3S)-3-((4-氯-5-氰基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸酯(330mg，75％)，为白色固体。m/z:ES+[M+Na]+401。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-氯-5-氰基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
在氮气下将在二噁烷中的盐酸(4M；1.5mL，44mmol)添加到叔丁基((1R,3S)-3-((4-氯-5-氰基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸酯(330mg，0.87mmol)在MeOH(2.9mL)中的溶液中，以给出无色溶液。在2h之后，将该反应在减压下浓缩，以给出白色固体(302mg)。将该固体溶解在DCM(4.8mL)中并且添加三乙胺(0.61mL，4.4mmol)和乙酸酐(123μL，1.31mmol)。将该反应在室温下搅拌持续2h并且然后用DCM稀释。将该反应混合物用水(30mL)、以及饱和水性氯化钠(30mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％甲醇，然后在乙酸乙酯中等度10％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-氯-5-氰基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(184mg，66％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+321。
实例40：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
实例41以及42的混合物，比率未知
将乙酸酐(0.20mL，2.2mmol)添加至(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(670mg，1.79mmol)、三乙胺(0.52mL，3.8mmol)和N,N-二甲基吡啶-4-胺(11mg，0.09mmol)在DCM(10mL)中的搅拌溶液中。将反应混合物在室温下搅拌18h。将该混合物通过离子交换层析使用SCX柱纯化，并且将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱中洗脱。将产物部分在减压下进行浓缩。将所得粗产物通过快速硅胶层析进行，使用在庚烷中0至100％EtOAc随后是在EtOAc中等度10％MeOH的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(693mg，93％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.05-1.11(1H,m),1.23(3H,d),1.27-1.38(3H,m),1.72-1.81(6H,m),1.89(1H,br d),2.52-2.63(1H,m),2.67(1H,dd),3.13-3.19(1H,m),3.20-3.28(1H,m),3.50-3.63(1H,m),3.76(1H,dd),4.27-4.37(1H,m),7.75(1H,d),8.00(1H,s),8.27(1H,s),8.35(1H,s),10.55(1H,s).m/z:ES+[M+H]+416.
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-酮的制备
在氮气下在-78℃下经20分钟的时间将在己烷中的正丁基锂(1.6M；49.9mL，79.8mmol)逐滴添加至2-甲基-3-(1H-吡唑-1-基)丙酸(4.92g，31.9mmol)在THF(150mL)中的溶液中。将所得悬浮液在-78℃下搅拌持续15分钟。然后将该反应混合物加温至-45℃并且保持在这些条件下持续30min，之后允许加温至15℃。然后将该反应缓慢倾倒入冰冷的饱和水性NH4Cl(100mL)中。将该混合物用Et2O(100mL)进行稀释，将这些相分离并且将该水层用Et2O(50mL)进行萃取。将合并的有机层用饱和水性氯化钠(50mL)洗涤，用MgSO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。所得到的油通过快速硅胶层析，在庚烷中0至50％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以得到5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-酮(1.3g，30％)，为无色的油。1H NMR(400MHz,CDCl3,21℃)1.45(3H,d),3.27-3.38(1H,m),4.09(1H,dd),4.74(1H,dd),6.65(1H,d),7.79(1H,d)。
5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
将水合肼(2.28mL，47.0mmol)添加至5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-酮(1.28g，9.40mmol)在二乙二醇(26.8mL，282mmol)中的搅拌的溶液中。将所得溶液在180℃下搅拌1小时。然后允许该反应混合物稍微冷却。将氢氧化钾(1.85g，32.9mmol)小心地添加到该混合物中，并且将所得悬浮液在150℃下搅拌2h。然后允许该混合物冷却，然后用水稀释，用稀2M HCl酸化至pH 4.5，并用Et2O(5×30mL)萃取。将合并的有机层用水(3×20mL)和饱和水性氯化钠(20mL)进行洗涤，用MgSO4干燥，过滤，并在减压下浓缩以给出5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.98g，86％)，为澄清无色油。1H NMR(500MHz,CDCl3,30℃)1.28(3H,d),2.39-2.54(1H,m),2.99-3.16(2H,m),3.66-3.76(1H,m),4.23-4.33(1H,m),5.92(1H,d),7.48(1H,d)。
3-碘-5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在室温下在氮气下将NIS(1.81g，8.04mmol)分部分地添加到在乙腈(15mL)中的5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.89g，7.31mmol)中。将该反应混合物在23℃下搅拌18h。将该反应混合物用EtOAc(20mL)稀释并且用水(20mL)和饱和水性氯化钠(10mL)顺序地洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤并且在减压下浓缩，以给出3-碘-5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1.8g，99％)，为橙色油。1H NMR(500MHz,CDCl3,30℃)1.28(3H,d),2.43(1H,dd),3.00(1H,dd),3.06-3.14(1H,m),3.79(1H,dd),4.36(1H,dd),7.46(1H,s).m/z:ES+[M+H]+249。
5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在0℃下经5分钟的时间在氮下将在THF中的异丙基氯化镁氯化锂复合物(1.3M；6.85mL，8.91mmol)逐滴添加到在THF(20mL)中的3-碘-5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1.7g，6.9mmol)中。将所得混合物在0℃下搅拌持续30分钟。然后将2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(2.10mL，10.3mmol)逐滴添加到该混合物中，保持内部温度在0℃。然后允许该反应混合物加温至室温过夜，之后是用EtOAc(50mL)稀释并且用饱和水性NH4Cl(50mL)、水(50mL)、以及饱和水性氯化钠(50mL)顺序地洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤并蒸发，以给出5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1.5g，87％)，为淡棕色结晶的油。1H NMR(400MHz,CDCl3,22℃)1.26(3H,d),1.29(12H,s),2.57(1H,dd),3.01-3.22(2H,m),3.64-3.75(1H,m),4.27(1H,ddd),7.76(1H,s)。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将第二代XPhos预催化剂(0.25g，0.31mmol)添加到5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1.03g，3.75mmol)，((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.5g，3.13mmol；根据实例10制备的)以及磷酸氢二钾(1.63g，9.38mmol)在1,4-二噁烷(15mL)和水(3mL)的脱气的混合物中。将所得混合物进行脱气并且在90℃下在氮气下搅拌18h。然后允许该反应混合物冷却至室温，用EtOAc(100mL)稀释并且用水(100mL)和饱和水性氯化钠(50mL)顺序地洗涤。将该有机萃取物用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.0g，69％)，为黄色泡沫。1H NMR(400MHz,DMSO,30℃)1.07-1.12(1H,m),1.70-1.82(3H,m),1.85-1.93(1H,m),2.53-2.62(1H,m),2.66(1H,dd),3.11-3.18(1H,m),3.19-3.29(1H,m),3.76(1H,dd),4.32(1H,dd),6.76(1H,d),8.00(1H,s),8.27(1H,s),8.34(1H,s),10.52(1H,s).m/z:ES+[M+H]+474。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.11g，2.34mmol)溶解于DCM(20mL)中。添加三氟乙酸(1.8mL，23mmol)并且将该反应混合物在室温下搅拌18h。将该反应通过离子交换层析，使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.68g，77％)，为白色固体。m/z：ES+[M+H]+]+374。
实例41和42∶(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1和异构体2
纯对映异构体。对于实例41和42该甲基的构型是未知的，但是在实例41对比实例42中是相反的
将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(670mg，1.79mmol；实例40)通过制备型HPLC来(ChiralTechnologies IA柱，20μm硅胶，100mm直径，250mm长度)，使用庚烷/EtOH/MeOH的70/15/15混合物作为洗脱液和450mL/min的流速进行拆分，将含有所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以给出(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较快洗脱的异构体1(356mg，48％)和(1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较慢洗脱的异构体2(348mg，47％)。
实例41：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.05-1.15(1H,m),1.25(3H,d),1.26-1.39(3H,m),1.72-1.83(6H,m),1.90(1H,brd),2.55-2.62(1H,m),2.67(1H,dd),3.11-3.19(1H,m),3.21-3.28(1H,m),3.51-3.62(1H,m),3.76(1H,dd),4.27-4.37(1H,m),7.75(1H,dbr),8.00(1H,s),8.27(1H,s),8.35(1H,s),10.55(1H,s).m/z:ES+[M+H]+416。
实例42∶(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.08-1.13(1H,m),1.24(3H,d),1.25-1.36(3H,m),1.62-1.85(6H,m),1.91(1H,br d),2.52-2.61(1H,m),2.67(1H,dd),3.13-3.19(1H,m),3.21-3.29(1H,m),3.51-3.60(1H,m),3.76(1H,dd),4.32(1H,dd),7.74(1H,d),7.98(1H,s),8.28(1H,s),8.34(1H,s),10.54(1H,s)。
分析型反相手性条件：
实例43：(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
以及
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例14)
将第二代XPhos预催化剂(0.019g，0.02mmol)和碳酸铯(0.464g，1.42mmol)添加到5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(1.6mL，0.50mmol，作为在二噁烷中0.106g/mL溶液；根据实例14制备的)、顺式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.20g，0.47mmol；根据实例10和12制备的，用(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸替代顺式-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(在实例2，中间体中制备)并且用乙酸酸酐替代乙酰基氯化物)、1,4-二噁烷(2.6mL)，和水(0.52mL)的被脱气的溶液中。将所得混合物物浸没在设定在85℃的预热的油浴中。在3h后，将另一个300μL的5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑原液(0.106g/mL，在二噁烷中)添加到现在的浅橙色反应中。将该反应保持在此温度下持续另一个45min并且然后冷却至室温。将该反应用饱和水性氯化钠稀释并用乙酸乙酯(x2)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得黄色残余物通过快速硅胶层析，在己烷中10％至100％乙酸乙酯然后在乙酸乙酯中0至20％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以提供用少量频哪醇二醇污染的顺式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.147g，72％)，为灰白色固体。
将这种材料使用SFC条件(柱：(S,S)Whelk-O1，5μm，21.2mm直径，250mm长度，40℃柱温，100巴出口压力，75mL/min的流速)，用在CO2中30％异丙醇洗脱拆分为其对映异构体，以提供实例14，(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.053g，26％)，为白色泡沫状固体和实例43，(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.061g，30％)，为白色泡沫状固体。
(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例43)：
1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.05(1H,d),1.22-1.40(9H,m),1.78(6H,s),1.90(1H,d),2.56-2.69(1H,m),2.89(2H,s),3.47-3.65(1H,m),3.95(2H,s),7.74(1H,br d),7.99(1H,s),8.25(1H,s),8.35(1H,s),10.54(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
分析型SFC条件：
对于(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(实例43)的旋光度
实例44：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将乙酸酐(0.022mL，0.23mmol)添加至(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(70mg，0.19mmol)、三乙胺(0.056mL，0.40mmol)、以及N，N-二甲基吡啶-4-胺(1.2mg，9.5μmol)在DCM(10mL)中的搅拌溶液中。将反应混合物在室温下搅拌4h，并且将粗反应物通过离子交换层析使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1MNH3从该柱进行洗脱，并且将含产物部分在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行进一步纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(44mg，56％)，为固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.04(6H,s),1.06-1.15(1H,m),1.32-1.38(3H,m),1.66-1.82(6H,m),1.83-1.94(3H,m),2.58-2.64(1H,m),2.78(2H,s),3.54-3.62(1H,m),4.14(2H,t),7.16(1H,dd),7.76(1H,d),7.84(1H,s),8.18(1H,s),8.24(1H,d),10.34(1H,s).m/z:ES+[M+H]+410。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
1-(4-乙氧基-4-氧代丁基)-1H-吡唑-5-甲酸乙基酯的制备
将4-溴丁酸乙基酯(10mL，71mmol)添加到1H-吡唑-5-甲酸乙基酯(9.9g，71mmol)和碳酸钾(11.7g，84.8mmol)在DMF(70mL)中的搅拌的混合物中。将该混合物在室温下搅拌24h。添加水并且将该混合物用乙酸乙酯(3x)萃取。将合并的有机层用水(2x)进行洗涤，用MgSO4干燥，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在戊烷中20％乙酸乙酯洗脱进行纯化，以提供所希望的1-(4-乙氧基-4-氧代丁基)-1H-吡唑-5-甲酸乙基酯(9.0g，50％)，为固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.24(3H,t),1.38(3H,t),2.11-2.25(2H,m),2.25-2.38(2H,m),4.12(2H,q),4.34(2H,q),4.63(2H,t),6.83(1H,d),7.47(1H,d).m/z:ES+[M+H]+255。还分离出1-(4-乙氧基-4-氧代丁基)-1H-吡唑-3-甲酸乙基酯(8g，44.5％)。
4-氧代-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-5-甲酸乙基酯的制备
将叔丁醇钾(1.39g，12.4mmol)添加到1-(4-乙氧基-4-氧代丁基)-1H-吡唑-5-甲酸乙基酯(2.1g，8.3mmol)在甲苯(20mL)中的搅拌溶液中。将该混合物在室温下搅拌持续10分钟并且然后加温至110℃，导致形成厚的沉淀。将该混合物在这些条件下加热持续30分钟并且然后冷却至室温，之后用稀HCl酸化并用乙酸乙酯(3x)萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出4-氧代-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-5-甲酸乙基酯(1.7g，99％)，为固体。m/z:ES+[M+H]+209。
6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡啶-4(5H)-酮的制备
将氯化锂(0.458g，10.8mmol)添加至4-氧代-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-5-甲酸乙基酯(1.5g，7.2mmol)在DMSO(15mL)中的搅拌溶液中。将该混合物在120℃下加热24h，然后冷却至室温。添加水，并且将该混合物用乙酸乙酯(3x)进行萃取。将合并的有机层合并并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在庚烷中50％乙酸乙酯洗脱进行纯化，以给出6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡啶-4(5H)-酮(0.90g，92％)，为固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)2.26-2.45(2H,m),2.65-2.75(2H,m),4.35-4.45(2H,m),6.87(1H,d),7.55(1H,d)。
5,5-二甲基-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡啶-4(5H)-酮的制备
在0℃下将氢化钠(在矿物油中60wt％；705mg，17.6mmol)添加到6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡啶-4(5H)-酮(800mg，5.88mmol)在DMF(5.0mL)中的溶液中。将该混合物在这些条件下搅拌10分钟并且然后添加碘甲烷(1.10mL，17.6mmol)。移除冰浴，并且将该反应保持在这些条件下持续18h。添加水，并且将该混合物用稀的水性盐酸酸化至pH 7。然后将该反应用醚(3x)萃取，并且将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在庚烷中30％乙酸乙酯洗脱进行纯化，以提供5,5-二甲基-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡啶-4(5H)-酮(800mg，83％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.27(6H,s),2.06-2.26(2H,m),4.32-4.5(2H,m),6.86(1H,d),7.54(1H,d).m/z:ES+[M+H]+165。
5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将水合肼(1.18mL，24.4mmol)添加至溶解在二乙二醇(10mL，105mmol)中的5,5-二甲基-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡啶-4(5H)-酮(800mg，4.87mmol)的搅拌溶液中。将所得溶液在180℃下搅拌1小时。然后将该反应从热移出并且将氢氧化钾(957mg，17.1mmol)小心地添加到该混合物中。将所得悬浮液在170℃下搅拌2h。在冷却之后，将该反应混合物用水稀释，用稀释的水性盐酸(2N)酸化至pH 5，并用Et2O(5x 50mL)萃取。将合并的有机层用水(2x20mL)进行洗涤并且然后用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩，以给出5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(650mg，89％)，为固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.05(6H,s),1.66-1.97(2H,m),2.57(2H,s),4.15(2H,t),5.92-5.94(1H,m),7.44(1H,d)。
3-碘-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
在23℃下将NIS(1.07gmg，4.76mmol)添加至溶解于乙腈(10mL)中的5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(650mg，4.33mmol)的搅拌溶液中。将所得混合物在23℃下搅拌16h。然后将该反应混合物用EtOAc(20mL)稀释并且用水(2x 20mL)、以及饱和水性氯化钠(20mL)顺序地洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出粗3-碘-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(1.1g，92％)，为固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.07(6H,s),1.80(2H,t),2.43(2H,s),4.24(2H,t),7.48(1H,s)。
((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将二氯[1,1'-双(二-叔丁基膦基)二茂铁]钯(II)(44mg，0.070mmol)添加至((1R,3S)-3-((4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(300mg，0.67mmol；根据实例16制备的)、3-碘-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(242mg，0.88mmol)、和磷酸三钾(429mg，2.02mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1mL)中的脱气的溶液中。将所得混合物在90℃下搅拌18h。将粗反应进行冷却并且通过离子交换层析，使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中的1M NH3从该柱进行洗脱，并且将含产物的部分在减压下进行浓缩，以给出为棕色油的粗产物。将该粗产物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩以提供((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(170mg，54％)，为固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.03(6H,s),1.04-1.15(1H,m),1.21-1.41(12H,m),1.72-1.81(3H,m),1.83-1.92(3H,m),2.53-2.62(1H,m),2.65-2.69(2H,m),4.16(2H,t),6.76(1H,br d),7.76(1H,d),8.19(1H,d),8.29(1H,d),10.43(1H,s).在3.3ppm处在HOD峰基线之下宽(1H)多重峰。m/z:ES+[M+H]+468。
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将三氟乙酸(1mL)添加至在DCM(10mL)中的((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(170mg，0.36mmol)中。将所得混合物在室温下搅拌6h。然后将该反应在减压下浓缩，并且将所得残余物使用SCX柱经受离子交换层析。将所希望的产物使用在MeOH中2M NH3从该柱进行洗脱。将产物部分在减压下浓缩，并且将所得残余物通过快速硅胶层析，用在DCM中7％(在甲醇中1％的氨)洗脱纯化，以提供(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(70mg，52％)，为固体。m/z:ES+[M+H]+368。
实例45：(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺
将HATU(118mg，0.31mmol)添加到(S)-四氢呋喃-2-甲酸(0.03mL，0.31mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.26mmol；根据实例14制备的)和三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMA(2mL)中的溶液中。将反应混合物在室温下搅拌持续16h并且然后用水(20mL)淬灭。将该混合物用DCM(50mL)萃取，并且将有机层用盐水(50mL)进行洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将含有所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺(59mg，47％)，为白色固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.19-1.36(9H,s),1.49(1H,q),1.70(1H,d),1.74-1.89(6H,m),2.02-2.16(1H,m),2.58-2.68(1H,m),2.90(2H,s),3.63(1H,dd),3.75(1H,q),3.89(1H,q),3.95(2H,s),4.17(1H,dd),7.60(1H,d),8.00(1H,s),8.26(1H,s),8.31-8.38(1H,m),10.55(1H,s).m/z:ES+[M+H]+486。
实例46：(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺
将HATU(118mg，0.31mmol)添加到(R)-四氢呋喃-2-甲酸(0.03mL，0.31mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.26mmol；根据实例14制备的)和三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMA(2mL)中的溶液中。将反应混合物在室温下搅拌持续16h并且然后用水(20mL)淬灭。将该混合物用DCM(50mL)萃取，并且将有机层用饱和水性氯化钠(50mL)进行洗涤，用MgSO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分蒸发至干燥，以得到(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺(61mg，49％)，为白色固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.20-1.37(9H,s),1.49(1H,q),1.70(1H,d),1.75-1.9(6H,m),2.04-2.16(1H,m),2.58-2.68(1H,m),2.90(2H,s),3.58-3.67(1H,m),3.75(1H,q),3.89(1H,q),3.95(2H,s),4.17(1H,dd),7.60(1H,d),8.00(1H,s),8.26(1H,s),8.35(1H,s),10.55(1H,s).m/z:ES+[M+H]+486。
实例47：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(94mg，0.26mmol；根据实例23制备的)添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.25mmol)在1,4-二噁烷(2.1mL)和水(0.4mL)中的溶液中，以给出无色溶液。将该溶液用氮气吹扫持续10min，并且然后添加碳酸铯(244mg，0.75mmol)和第二代XPhos预催化剂(19.6mg，0.02mmol)。将该反应在85℃下加热持续7小时并且然后冷却至室温。将该反应用EtAOcC(50mL)稀释并且然后用水和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层在减压下浓缩，并且将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，用在DCM中0至10％MeOH洗脱进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(37mg，36％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.00-1.16(1H,m),1.27(9H,s),1.78(6H,s),1.85-1.96(1H,m),2.33(3H,s),2.55-2.65(1H,m),2.86(2H,s),3.88-3.97(2H,m),7.75(1H,d),7.82(1H,s),7.98(1H,s),8.13(1H,s),10.45(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+410。
旋光度：
用于制备起始材料(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
4-碘-5-甲基吡啶-2-胺的制备
将在DMSO(17mL)中的2-氟-4-碘-5-甲基吡啶(3.00g，12.7mmol)和浓缩的水性氢氧化铵(3.5mL，90mmol)的白色悬浮液经受微波条件(140℃，4h)并且然后冷却。将该反应用EtOAc和水稀释，并且分离各层。将该水层用EtOAc(3x 50mL)萃取，并且将合并的有机层在减压下进行浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化，以提供4-碘-5-甲基吡啶-2-胺(800mg，27％)，为白色固体。1HNMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)2.13(s,3H)5.81(s,2H)6.99(s,1H)7.75(s,1H).m/z:ES+[M+H]+235。
((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(0.24mL，1.8mmol)添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(321mg，1.32mmol；根据实例2制备的)在DCM(2.8mL)中的溶液中，以给出无色溶液。然后将该溶液在室温下搅拌2h并且在0℃下添加4-碘-5-甲基吡啶-2-胺(281mg，1.2mmol)和吡啶(0.24mL，3.0mmol)在DCM(2.8mL)中的溶液。允许该反应加温至室温并且在这些条件下搅拌3h，之后用DCM稀释并用饱和水性NaHCO3、水、以及饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化，以提供((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(530mg，96％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.02-1.13(1H,m),1.44-1.53(3H,m),1.38(9H,s),1.65-1.80(3H,m),1.87(1H,br d),2.29(3H,s),2.52-2.61(1H,m),3.19-3.34(1H,m),6.78(1H,br d),8.16(1H,s),8.61(1H,s),10.43(1H,s).m/z:ES+[M+H]+460。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将在二噁烷中的盐酸(4M；2.1mL，8.6mmol)添加至在MeOH(4.3mL)中的((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(393mg，0.86mmol)中，以给出无色溶液。将该反应在室温下搅拌4h，以得到白色混合物。将该反应在减压下浓缩，以给出白色固体。添加TEA(0.60mL，4.3mmol)和乙酸酐(0.16mL，1.7mmol)，并且将该反应在室温下搅拌持续1小时。然后将该混合物用DCM稀释，并且用水和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层在减压下浓缩，并且将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，29％)，为透明油。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.04-1.13(1H,m),1.19-1.39(3H,m),1.69-1.81(6H,m),1.86(1H,br d),2.29(3H,s),2.55-2.61(1H,m),3.41-3.62(1H,m),7.75(1H,br d),8.16(1H,s),8.61(1H,s),10.45(1H,s).m/z:ES+[M+H]+402。
实例48：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环戊烷甲酰胺
在氮气下将乙酸酐(0.25mL，2.67mmol)添加至在DCM(10mL)和MeOH(2mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环戊烷甲酰胺(500mg，1.34mmol)和TEA(0.64mL，4.6mmol)中。将所得悬浮液在室温下搅拌6h。然后将该反应混合物用DCM稀释并且用饱和水性氯化铵和水顺序地洗涤，之后经硫酸镁干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC纯化(沃特斯SunFire柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)，使用水(含有0.1％甲酸)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环戊烷甲酰胺(340mg，61％)，为固体。1H NMR(500MHz,DMSO,30℃)1.28(6H,s),1.45-1.51(1H,m),1.62(1H,dt),1.79(3H,s),1.81-1.89(3H,m),2.15(1H,dt),2.90(2H,s),3.00(1H,dq),3.95(2H,s),4.04(1H,dq),7.90(1H,d),8.00(1H,s),8.28(1H,s),8.35(1H,s),10.58(1H,s).m/z:ES+[M+H]+416。
用于制备该起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环戊烷甲酰胺的程序描述如下：
((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环戊基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将T3P(在乙酸乙酯中≥50wt％；2.60mL，4.36mmol)添加到5-氯-4-碘吡啶-2-胺(694mg，2.18mmol；根据实例2制备的)、(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环戊烷甲酸(500mg，2.18mmol)和吡啶(0.71mL，8.7mmol)在EtOAc(10mL)中的溶液中。将所得溶液在室温下搅拌24h。将该反应混合物用饱和水性氯化铵(25mL)稀释并用EtOAc(50mL)萃取。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环戊基)氨基甲酸叔丁基酯(650mg，64％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.39(9H,s),1.46-1.63(2H,m),1.74-183(3H,m),2.04-2.17(1H,m),2.90–3.00(1H,m),3.70-3.84(1H,m),6.73-6.82(1H,m),8.39(1H,s),8.73(1H,s),10.68(1H,s).m/z:ES+[M+H]+466。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环戊基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(665mg，1.95mmol；根据实例23制备的)在氮气下添加至在1,4-二噁烷(20mL)和水(4mL)中的((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环戊基)氨基甲酸叔丁基酯(650mg，1.40mmol)、第二代XPhos预催化剂(110mg，0.14mmol)和磷酸氢二钾(729mg，4.19mmol)中。将所得悬浮液在85℃下搅拌20h。将该反应混合物用EtOAc(50mL)稀释，并且用水(2x 25mL)和饱和水性氯化钠(25mL)顺序地洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用25％到70％EtOAc/庚烷洗脱进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环戊基)氨基甲酸叔丁基酯(600mg，91％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+474。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环戊烷甲酰胺的制备
在氮气下将在二噁烷中的盐酸(4M；1.6mL，6.3mmol)缓慢添加至在DCM(10mL)中的((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环戊基)氨基甲酸叔丁基酯(600mg，1.27mmol)中。将所得悬浮液在室温下搅拌4h并且然后储存在冰箱中持续72小时的时间。然后将该反应混合物用DCM(10mL)稀释并且在氮气下添加MeOH(2mL)、和在二噁烷中的盐酸(4M；1.6mL，6.3mmol)。将所得悬浮液在室温下搅拌持续另外18h并且然后在减压下浓缩。将所得残余物通过离子交换层析，使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1MNH3从该柱洗脱，并且将产物部分在减压下浓缩，以给出(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环戊烷甲酰胺(473mg，99％)，为黄色的油。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,27℃)1.28(6H,s),1.49(1H,dd),1.59(1H,dd),1.73(1H,dd),1.91(2H,q),2.04(1H,td),2.89-2.93(3H,m),3.78-3.83(1H,m),3.95(2H,s),8.00(1H,s),8.27(1H,s),8.34(1H,s)。酰胺NH未观察到；NH2信号假定为是处于宽水峰下。m/z:ES+[M+H]+374。
实例49：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢-[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
在氮气下将甲氧基(环辛二烯)铱(I)二聚体(54mg，0.08mmol)添加到在THF(2mL)中的4,5,6,7-四氢-[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶(100mg，0.81mmol)、4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(312mg，2.44mmol)、以及4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(44mg，0.16mmol)中。将所得混合物在90℃下搅拌3h。当冷却时，获得大约2.3mL包含粗3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢-[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶的反应混合物，为悬浮液。m/z:ES+[M+3H–(C(CH3)2)2]+168。
在氮气下将粗制的3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢-[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶(大约0.3mL的上述反应悬浮液)添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(10mg，0.02mmol；根据实例12制备的)，Cs2CO3(15mg，0.05mmol)和第二代XPhos预催化剂(1.9mg，2.4μmol)在1,4-二噁烷(2mL)和水(0.5mL)中的混合物中。将所得混合物加温至60℃并且保持在这些条件下持续45分钟。然后允许该反应冷却至室温。在单独的烧瓶中，在氮气下将包含粗3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢-[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶(约2.0mL)的剩余悬浮混合物添加至(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(70mg，0.17mmol；根据实例12制备的)、Cs2CO3(325mg，1.00mmol)和第二代XPhos预催化剂(26mg，0.03mmol)在1,4-二噁烷(16mL)和水(4mL)中的混合物中。将所得混合物在60℃下搅拌持续45分钟。然后允许该反应冷却至室温。将两个冷却的反应混合物合并并且然后用饱和水性氯化钠(100mL)稀释。将所得混合物用EtOAc萃取(3x 100mL)，并且将合并的有机层用Na2SO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，使用在石油醚中0至100％EtOAc的洗脱梯度，接着在EtOAc中0至20％MeOH的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，19mm直径，150mm长度)使用水(含有0.8％NH4HCO3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行进一步纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢-[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(20mg，25％)，为白色固体。1H NMR(DMSO-d6,400MHz,21℃)1.00-1.14(1H,m),1.19-1.37(3H,m),1.68-1.81(6H,m),1.81-1.92(3H,m),1.99-2.10(2H,m),2.56-2.70(1H,m),2.82(2H,t),3.51-3.63(1H,m),4.42(2H,t),7.80(1H,d),8.26(1H,s),8.48(1H,s),10.73(1H,s).m/z:ES+[M+H]+417。
实例50：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
在室温下在氮气下将乙酸酐(0.024mL，0.26mmol)逐滴添加至在DCM(2mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.080g，0.22mmol)、4-二甲基氨基吡啶(1mg，11μmol)和三乙胺(0.093mL，0.67mmol)中。将所得溶液在室温下搅拌4h。将该反应混合物用饱和水性氯化铵(10mL)淬灭，用DCM(2x 10mL)萃取，并且将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.070g，79％)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.02-1.21(1H,m),1.22-1.38(9H,m),1.70-1.82(6H,m),1.91(1H,br d),2.54-2.65(1H,m),2.71(2H,s),3.58(1H,dt),4.00(2H,s),7.44(1H,d),7.76(1H,d),8.34(1H,d),8.38(1H,d),10.56(1H,s).m/z:ES+[M+H]+414。
用于制备起始材料为(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑的制备
将6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(0.180g，1.32mmol；根据实例22制备的)、2-氯-5-氟-4-碘吡啶(0.476g，1.85mmol)、碳酸铯(0.474g，1.45mmol)、三乙胺(0.368mL，2.64mmol)、三苯基膦(0.055g，0.21mmol)和二乙酰氧基钯(0.024g，0.11mmol)悬浮于1,4-二噁烷(5mL)中并且密封到微波管中。将该反应经受微波条件(100℃，16h)中并冷却至室温。将该反应混合物用DCM(20mL)稀释并用水(3x 25mL)洗涤。然后将有机层经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在庚烷中0至50％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(0.185g，53％)，作为橙色固体。1H NMR(500MHz,CDCl3,27℃)1.34(6H,s),2.80(2H,s),3.93(2H,s),7.32(1H,d),7.59(1H,d),8.26(1H,d).m/z:ES+[M+H]+266。
((1R,3S)-3-((4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将四(三苯基膦)钯(0)(43mg，0.04mmol)添加到在1,4-二噁烷(6mL)中的3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(100mg，0.38mmol)、((1R,3S)-3-氨甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯(109mg，0.45mmol；根据实例25制备的)，9,9-二甲基-4,5-双(二苯基膦基)呫吨(44mg，0.08mmol)和碳酸铯(368mg，1.13mmol)中。在氮气下将该混合物脱气持续5分钟，并且将所得悬浮液经受微波条件(120℃，3h)。将该反应混合物在水(20mL)和DCM(40mL)之间分配。将各层使用相分离筒分离，并且将有机层吸附到二氧化硅上，并且通过快速硅胶层析，0到60％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供((1R,3S)-3-((4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(142mg，80％)。m/z:ES+[M+H]+472。
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将((1R,3S)-3-((4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.100g，0.21mmol)溶解于DCM(5mL)中并且添加三氟乙酸(0.16mL，2.1mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30min并且然后通过离子交换层析使用SCX柱纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯的部分在减压下进行浓缩，以给出半纯的(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺，为无色胶质(100mg)。将该胶质用于下一步骤而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+372。
实例51：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将乙酸酐(0.088mL，0.93mmol)添加至(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(300mg，0.78mmol；在实例51a中描述的)、三乙胺(0.23mL，1.6mmol)和DCM(10mL)的搅拌的溶液中。将该反应混合物在环境温度下搅拌4h。添加二氧化硅，并且通过在减压下浓缩去除挥发物。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在乙酸乙酯中0.5％甲醇洗脱进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(300mg，90％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.03(6H,s),1.02-1.14(1H,m),1.24-1.38(3H,m),1.72-1.81(6H,m),1.86-1.91(3H,m),2.55-2.64(1H,m),2.69(2H,s),3.52-3.64(1H,m),4.16(2H,t),7.64-7.81(2H,m),8.19(1H,d),8.29(1H,d),10.45(1H,s).m/z:ES+[M+H]+428。
实例51a：(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将TFA(2mL)添加((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.1g，2.27mmol)在DCM(20mL)中的溶液中。将所得混合物在环境温度下搅拌24h，并且然后将反应在减压下进行浓缩。将所得残余物通过离子交换层析，使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中7NNH3从该柱进行洗脱。将纯的产物部分在减压下浓缩，以给出(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.87g，100％)，为固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,22℃)1.01-1.12(7H,m),1.31-1.49(3H,m),1.83-1.99(5H,m),2.14(1H,d),2.35(1H,td),2.66-2.85(3H,m),4.23(2H,t),7.85(1H,d),7.99-8.18(2H,m),8.29(1H,d)。NH2信号未观察到并且被假定为是处于1.66ppm处的宽水峰下。m/z:ES+[M+H]+386。
用于制备起始材料((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的程序描述如下：
5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
在氮气下在0℃下将在THF中异丙基氯化镁氯化锂复合物(1.3M；9.1mL，12mmol)逐滴添加到在THF(20mL)中的3-碘-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(2.5g，9.1mmol；根据实例44制备的)中。将所得混合物在0℃下搅拌持续30分钟。然后逐滴添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(2.8mL，14mmol)，并且去除冰浴。将反应保持在这些条件下持续18h并且然后用Et2O(20mL)稀释。将此新混合物用饱和水性氯化铵(20mL)、水(20mL)、以及饱和水性氯化钠(10mL)顺序地进行洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出粗5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(2.5g，100％)，为油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.06(6H,s),1.29(12H,s),1.79(2H,t),2.74(2H,s),4.16(2H,t),7.72(1H,s)。
3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
在21℃下将2-氯-5-氟-4-碘吡啶(1.55g，6.03mmol)、5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(2.0g，7.2mmol)、第二代XPhos预催化剂(0.48g，0.60mmol)和磷酸氢二钾(3.15g，18.1mmol)溶解于脱气的二噁烷(20mL)和水(1mL)中。将该混合物在90℃下搅拌24h并且然后允许冷却至室温。将该混合物用EtOAc(30mL)稀释，用水(10mL)洗涤，并且将有机层在减压下进行浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在庚烷中0至50％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(1.3g，77％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.10(6H,s),1.89(2H,m),2.68(2H,s),4.26(2H,t),7.27(1H,d),7.80(1H,d),8.23(1H,d).m/z:ES+[M+H]+280。
((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将四(三苯基膦)钯(0)(0.496g，0.43mmol)添加到在1,4-二噁烷(10mL)中的3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(1.2g，4.29mmol)，((1R,3S)-3-氨甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.04g，4.29mmol；根据实例25制备的)，9,9-二甲基-4,5-双(二苯基膦基)呫吨(0.496g，0.86mmol)和碳酸铯(4.19g，12.9mmol)的脱气的混合物中。将所得混合物在氮气下进行脱气持续5分钟，并且然后经受微波条件(120℃；17h)。将该反应混合物在过滤之前用水(20mL)和乙酸乙酯(100mL)稀释。将各层分离，并且将有机层吸附到二氧化硅上，并且通过快速硅胶层析，用在庚烷中等度50％EtOAc洗脱进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.1g，53％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.03(6H,s),1.02-1.14(1H,m),1.20-1.35(3H,m),1.39(9H,s),1.70-1.79(3H,br m),1.82-1.92(3H,m),2.54-2.63(1H,m),2.68(2H,s),4.16(2H,t),6.76(1H,br d),7.76(1H,d),8.19(1H,d),8.29(1H,d),10.43(1H,s).在水峰下的1H多重峰。m/z:ES+[M+H]+486。
实例52：(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(3-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺
在室温下将三氟乙酸(6.5μL，0.080mmol)添加至在DCM(2mL)中的(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙酰胺基)环己烷甲酰胺(0.046g，0.080mmol)中。将所得溶液在室温下搅拌持续1小时。将该粗产物通过离子交换层析，使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱中洗脱并且将纯的部分在减压下进行浓缩，以给出(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(3-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺(0.032g，82％)，为无色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.08-1.21(1H,m),1.34(6H,s),1.35-1.49(3H,m),1.88-1.93(3H,m),2.10-2.37(2H,m),2.36-2.49(2H,m),2.48-2.57(1H,m),2.95(2H,s),3.79-3.92(3H,m),3.95(2H,s),6.56(1H,br d),8.09(1H,s),8.21(1H,s),8.26(1H,s),8.89(1H,s).m/z:ES+[M+H]+460。
用于制备起始材料(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙酰胺基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
甲基3-羟基丙酸甲酯的制备
在0℃下将氧杂环丁烷-2-酮(22mL，350mmol)逐滴添加到MeOH(300mL)和硫酸(5.6mL，104mmol)的搅拌溶液中。在18h之后，将该反应再冷却至10℃，并且分部分地添加碳酸氢钠(18.1g，215mmol)(添加之后pH＝7)。将所得悬浮液在室温下保持搅拌持续30分钟。然后将该混合物过滤，并且将滤液在减压下进行浓缩。将所得残余物用DCM稀释并第二次过滤。将新的滤液蒸发至干燥，以提供3-羟基丙酸甲酯(35g，97％)，为无色的液体。1H NMR(500MHz,CDCl3,24℃)2.41-2.45(1H,m),2.58(2H,t),3.72(3H,s),3.89(2H,t)。
3-(四氢-2H-吡喃-2-基氧)丙酸甲酯的制备
在氮气下将吡啶4-甲基苯磺酸酯(4.22g，16.8mmol)添加到3-羟基丙酸甲酯(35g，336mmol)和3,4-二氢-2H-吡喃(43mL，470mmol)在DCM(500mL)中的溶液中。将该溶液在室温下搅拌持续2.5天。然后将该混合物用饱和水性碳酸氢钠洗涤，并且将有机层经硫酸镁进行干燥并且在减压下浓缩。所得到的油通过快速硅胶层析，用在庚烷中等度15％乙酸乙酯洗脱进行纯化，以提供3-(四氢-2H-吡喃-2-基氧)丙酸乙酯(26g，41％)，为无色的油。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,24℃)1.37-1.46(4H,m),1.54-1.59(2H,m),2.56(2H,t),3.39-3.42(1H,m),3.53-3.63(4H,m),3.68-3.75(1H,m),3.81-3.87(1H,m),4.57(1H,t)。3-(四氢-2H-吡喃-2-基氧)丙酸的制备
将水性氢氧化钠(2N；134mL，268mmol)添加到3-(四氢-2H-吡喃-2-基氧)丙酸甲酯(26g，138mmol)在THF(300mL)中的溶液中。将该混合物在室温下搅拌5h并且然后在减压下浓缩。添加乙酸乙酯(100mL)，并且分离各层。将水层冷却至0℃，并且小心地逐滴添加水性HCl(1N)直到实现pH 3.5。然后将水层用乙酸乙酯(2x 250mL)萃取。将合并的有机层用硫酸镁进行干燥，过滤并且在减压下浓缩，以给出3-(四氢-2H-吡喃-2-基氧)丙酸(24g，98％)，为无色的油。1H NMR(500MHz,CDCl3,24℃)1.45-1.62(4H,m),1.63-1.85(2H,m),2.64-2.68(2H,m),3.52-3.56,(1H,m),3.70-3.74,(1H,m),3.85-3.89(1H,m),3.99-4.03(1H,m),4.62-4.66(1H,m),11.2(1H,br s)。
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙酰胺基)环己烷甲酰胺的制备
将HATU(118mg，0.31mmol)添加到3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙酸(54mg，0.31mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.26mmol；根据实例14制备的)、以及三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMA(2mL)中的溶液中。将所得混合物在环境温度下搅拌16h，之后添加在二噁烷中的HCl(4M；0.52mL，2.1mmol)。将此新混合物在室温下搅拌2h，之后用饱和水性Na2CO3碱化。将所得混合物用水(20mL)进行稀释并用DCM(50mL)萃取。将该有机层用饱和水性氯化钠(50mL)洗涤，之后是穿过相分离筒。将有机部分用MgSO4进行干燥并且在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙酰胺基)环己烷甲酰胺(46mg，33％)，为白色固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.05-1.2(1H,m),1.24-1.51(13H,m),1.52-1.63(1H,m),1.64-1.71(1H,m),1.72-1.83(3H,m),1.88-1.93(1H,m),2.25-2.35(2H,m),2.57-2.7(1H,m),2.90(2H,s),3.38-3.44(1H,m),3.48-3.58(1H,m),3.59-3.64(1H,m),3.74(1H,ddd),3.81(1H,ddt),3.95(2H,s),4.55(1H,d),7.78(1H,d),8.00(1H,s),8.25(1H,s),8.36(1H,s),10.56(1H,s).m/z:ES+[M+H]+544。
实例53：(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(顺式-3-羟基环丁烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(118mg，0.31mmol)添加到顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)环丁烷甲酸(71mg，0.31mmol；根据实例4中制备的)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.26mmol；根据实例14制备的)、以及三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMA(2mL)中的溶液中。将所得混合物在室温下搅拌16h，之后添加四丁基铵氟化物在THF(1M；1.0mL，1.0mmol)中的溶液。将该混合物在室温下搅拌2h，之后用水(20mL)淬灭。将该混合物用DCM(50mL)萃取并且用饱和水性氯化钠(50mL)洗涤，之后是穿过相分离柱筒。将有机部分用MgSO4进行干燥并且在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将产物部分在减压下浓缩，并且将所得残余物通过快速硅胶层析，在EtOAc中0至10％MeOH的洗脱梯度进一步纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-((顺式)-3-羟基环丁烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺(0.037g，53％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.34(6H,s),1.47-1.49(3H,m),1.85-1.99(5H,m),2.10-2.30(4H,m),2.39-2.62(4H,m),2.96(2H,s),3.79-3.86(1H,m),3.95(2H,s),5.90(1H,br d),8.09(1H,s),8.22(1H,s),8.26(1H,s),8.69(1H,s).m/z:ES+[M+H]+486。
实例54：(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺
将在二噁烷中的盐酸(4M；3.2mL，13mmol)添加到((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(600mg，1.27mmol)在DCM(9.5mL)中的溶液中，从而给出黄色悬浮液。添加甲醇(约5mL)，其提供了澄清的黄色溶液。将该反应在室温下搅拌18h并且然后在减压下浓缩，以给出作为二氢氯化物盐的(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(488mg，87％)和灰白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.23-1.36(9H,m),1.50(1H,q),1.77-1.89(2H,m),1.89-2.01(1H,m),2.01-2.09(1H,m),2.56-2.68(1H,m),2.94(2H,s),2.97-3.09(1H,m),3.95(2H,s),7.85-7.93(1H,m),7.98-8.14(3H,m),8.26-8.32(2H,m),10.56(1H,s).1HCl当量假定在5.4ppm处被并入宽单峰中。m/z:ES+[M+H]+372。
用于制备起始材料((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的程序描述如下：
5-氟-4-碘吡啶-2-胺的制备
将浓缩的水性氢氧化铵(26wt％；7.0mL，45mmol)逐滴添加(轻微放热)到2,5-二氟-4-碘吡啶(2.0g，8.30mmol)在DMSO(2mL)中的溶液中，以给出白色悬浮液。将该悬浮液在微波中在140℃下加热4h。将该反应在EtOAc与水之间分配，并且将水层用EtOAc(3x 50mL)萃取。将合并的有机物在减压下浓缩，并且将所得残余物吸附到硅胶上，之后通过快速硅胶层析(在DCM中0至10％的甲醇)进行纯化，以提供5-氟-4-碘吡啶-2-胺(1.3g，66％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,,27℃)5.96(1H,br s)5.96(1H,s)6.92(1H,d)7.77-7.84(1H,m).m/z:ES+[M+H]+239。
((1R,3S)-3-((5-氟-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯
将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(0.62mL，4.7mmol)添加到(1S,3R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(843mg，3.47mmol；根据实例2制备的)在DCM(15mL)中的溶液中。将该无色溶液在室温下搅拌持续1.5h。然后添加5-氟-4-碘吡啶-2-胺(750mg，3.15mmol)和吡啶(0.51mL，6.3mmol)在DCM(15mL)中的溶液。将所得反应在室温下搅拌18h，之后用DCM(200mL)稀释并用水和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以提供((1R,3S)-3-((5-氟-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(827mg，57％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.01-1.19(1H,m),1.18-1.31(3H,m),1.38(9H,s),1.61-1.81(m,3H),1.87(1H,d),2.53-2.62(1H,m),3.16-3.26(1H,m),6.78(1H,brd),8.26(1H,s),8.60(1H,d),10.61(1H,s)。
((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将碳酸铯(2.81g，8.61mmol)和第二代XPhos预催化剂(0.090g，0.11mmol)添加到5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.828g，3.16mmol；根据实例23制备的)，((1R,3S)-3-((5-氟-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.33g，2.87mmol)、二噁烷(24mL)、和水(5mL)的脱气的混合物中。将该反应加热至95℃并且保持在这些条件下持续18h。然后将该反应用EtOAc(250mL)稀释，并且用水和饱和水性氯化钠洗涤，之后经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在己烷中0至100％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(600mg，44％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.03-1.15(1H,obsc.m),1.22-1.32(9H,m),1.38(9H,s),1.69-1.82(3H,m),1.89(1H,br d)2.53-2.64(1H,m),2.93(2H,s),3.21-3.32(1H,m),3.96(2H,s),6.78(1H,d),7.88(1H,d),8.27(1H,d),8.31(1H,d),10.45(1H,s).m/z:ES+[M+H]+472。
实例55：(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(98mg，0.26mmol)添加到1-羟基环丙烷甲酸(32mg，0.31mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(96mg，0.22mmol；根据实例54制备的)、以及三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMF(1.5mL)中的溶液中。将该反应混合物在50℃下加热持续1.75h并且然后允许冷却至室温。在18h之后，将所得混合物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分蒸发至干燥，以得到(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺(33mg，33％)，为白色固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)0.76-0.84(2H,m),0.98-1.04(2H,m),1.29(6H,s),1.30-1.37(3H,m),1.52(1H,q),1.7-1.84(3H,m),1.88(1H,d),2.58-2.67(1H,m),2.94(2H,s),3.63-3.73(1H,m),3.95(2H,s),6.14(1H,br s),7.65(1H,d),7.89(1H,d),8.28(1H,d),8.32(1H,d),10.46(1H,s).m/z:ES+[M+H]+456。
实例56：(1S,3R)-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺
将HATU(118mg，0.31mmol)添加到1-羟基环丙烷甲酸(31.6mg，0.31mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.26mmol)、以及三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMA(2mL)中的溶液中。将该反应在室温下搅拌过夜并且然后通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)，使用水(包含1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺(27mg，22％)，为白色固体。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)0.75-0.82(2H,m),0.93-1.09(2H,m),1.25(6H,s),1.27-1.38(3H,m),1.52(1H,q),1.65-1.93(4H,m),2.53-2.70(1H,m),2.71(2H,s),3.60-3.71(1H,m),3.91(2H,s),6.15(1H,s),7.51(1H,s),7.65(1H,d),8.29(1H,s),8.42(1H,s),10.65(1H,s).m/z:ES+[M+H]+472。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.40g，0.83mmol；根据实例10制备的)、6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(0.200g，1.25mmol；根据实例22制备的)、乙酸钾(0.163g，1.66mmol)和乙酸钯(0.337g，0.33mmol)悬浮在DMA(10mL)中并且密封到微波管中。将该管抽真空并用氮气(3x)吹扫并且然后在150℃下加热16h。将该反应混合物通过离子交换层析，使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯部分在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，0到100％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.20g，49％)，为橙色胶质。1H NMR(400MHz,CDCl3,21℃)1.05-1.19(1H,m),1.33(6H,s),1.40-1.46(12H,m),1.9-2.05(3H,m),2.20-2.47(2H,m),2.78(2H,s),3.46-3.52(1H,m),3.93(2H,s),4.44-4.52(1H,m),7.67(1H,s),8.06(1H,br s),8.28(1H,s),8.29(1H,s).m/z:ES+[M+H]+488。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.25g，0.51mmol)溶解于DCM(5mL)中。添加三氟乙酸(0.39mL，5.1mmol)，并且将该反应混合物室温下搅拌持续30min。然后将该反应混合物通过离子交换层析，使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯的部分在减压下进行浓缩，以给出(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.19g，96％)，为橙色胶质。将该胶质用于下一步骤中而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+388。
实例57：N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺
将HATU(118mg，0.31mmol)添加到氧杂环丁烷-3-甲酸(32mg，0.31mmol)、(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.26mmol；根据实例56制备的)和三乙胺(0.11mL，0.77mmol)在DMA(2mL)中的溶液中。将反应混合物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶、30mm直径、100mm长度)，使用水(包含1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供半纯的产物。将该物质通过快速硅胶层析，在EtOAc中0至10％MeOH的洗脱梯度进一步纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺(13mg，11％)，为白色固体。1HNMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.11-1.29(1H,m),1.32(6H,s),1.36-1.6(3H,m),1.9-2.02(3H,m),2.22-2.31(1H,br d),2.41-2.55(1H,m),2.78(2H,s),3.67(1H,ddd),3.82-3.96(3H,m),4.74-4.9(4H,m),5.75(1H,d),7.64(1H,s),8.27(3H,d).m/z:ES+[M+H]+472。
实例58：顺式-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺
将顺式-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺(0.194g，0.42mmol；根据实例27制备的)、6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑(0.100g，0.62mmol；根据实例22中制备的)、乙酸钾(0.082g，0.83mmol)和乙酸钯(0.168g，0.17mmol)悬浮在DMA(10mL)并且密封到微波管中。将该管抽真空并用氮气吹扫(3x)并且然后加热在150℃下搅拌16h。将该反应混合物用水稀释(20mL)并且用DCM(3x20mL)进行洗涤。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，19mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将产物部分在减压下浓缩，并且将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯孙燃烧柱，5μ硅胶，19mm直径，100mm长度)，使用水(含有0.1％甲酸)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液再纯化。将含有所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以给出顺式-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺(0.016g，11％)，为白色固体。1HNMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.26(6H,s),1.98-2.09(2H,m),2.30-2.40(2H,m),2.72(2H,s),2.74-2.83(1H,m),3.93(2H,s),3.95-4.00(1H,m),5.15(1H,s),7.53(1H,s),8.32(1H,s),8.41(1H,s),10.61(1H,s).m/z:ES+[M+H]+361。
实例59和60∶反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1和异构体2
实例59和60是具有相对反式构型的纯对映异构体。实例59以及60的绝对构型是未知但是是与彼此相反。
在室温下在氮气下将乙酸酐(0.049mL，0.52mmol)逐滴添加至在DCM(2mL)中的反式-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.167g，0.43mmol)、4-二甲基氨基吡啶(2.6mg，0.02mmol)和三乙胺(0.19mL，1.3mmol)中。将所得溶液在室温下搅拌4h。将该反应混合物用饱和水性氯化铵(10mL)淬灭，用DCM(2x 10mL)萃取，并且将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(Chiral Technologies IE柱，20μm硅胶，50mm直径，250mm长度)用在丙酮中等度30％庚烷以120mL/min的洗脱与在210nm的检测进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较快洗脱的异构体1(0.059g，32％)以及反式-3-乙酰氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较慢洗脱的异构体2(0.052g，28％)，为白色固体。
实例59，异构体1：
1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.34(6H,s),1.56-2.00(8H,m),2.01(3H,s),2.48-2.56(1H,m),2.96(2H,s),3.95(2H,s),4.17-4.24(1H,m),5.42-5.49(1H,m),7.96(1H,brs),8.10(1H,s),8.24(1H,s),8.26(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。实例60，异构体2：
1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.34(6H,s),1.48-1.55(1H,m),1.62-1.78(4H,m),1.82-1.90(1H,m),1.94-1.98(2H,m),2.01(3H,s),2.46-2.58(1H,m),2.96(2H,s),3.95(2H,s),4.17-4.26(1H,m),5.45-5.54(1H,br d),8.01(1H,s),8.10(1H,s),8.23(1H,s),8.26(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
分析型反相手性条件：
用于制备起始材料为反式-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
反式-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在氮气下在0℃下将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(1.1mL，8.2mmol)添加到在DCM(20mL)中的反式-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(1.34g，5.50mmol)中。将所得溶液在20℃下搅拌1.5h，并且然后经2分钟逐滴添加5-氯-4-碘吡啶-2-胺(1.40g，5.50mmol；根据实例2制备的)和吡啶(0.67mL，8.2mmol)。将所得溶液搅拌70h。然后将该反应混合物用饱和水性碳酸氢钠(300mL)淬灭，用DCM(3x 30mL)萃取，并且将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出奶油色固体。将该固体通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩以提供(反式-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.99g，37％)，为粉红色固体。1H NMR(500MHz,CDCl3,27℃)1.46(9H,s),1.49-1.55(1H,m),1.61-1.72(4H,m),1.82-1.93(3H,m),2.47-2.52(1H,m),3.89-3.99(1H,br s),4.55-4.59(1H,brs),7.84(1H,br s),8.19(1H,s),8.83(1H,s).m/z:ES+[M+H]+480。
(反式-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将第二代XPhos预催化剂(0.049g，0.06mmol)添加到5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.219g，0.75mmol；根据实例23制备的)、(反式-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.30g，0.63mmol)和磷酸三钾(0.327g，1.88mmol)在1,4-二噁烷(8mL)和水(1.6mL)中的脱气的混合物中。将该混合物脱气并且在90℃下在氮气下搅拌2h。然后将该反应混合物在减压下浓缩并且吸收在水(20mL)中。将所得混合物用EtOAc(2x 20mL)和DCM(20mL)顺序地进行萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩，以提供(反式-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.26g，86％)，为奶油色固体。m/z:ES+[M+H]+488。
反式-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将(反式-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.263g，0.54mmol)溶解于DCM(5mL)中。添加三氟乙酸(0.41mL，5.4mmol)，并且将该反应混合物在室温下搅拌18h。然后将该反应通过离子交换层析，使用SCX柱纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将产物部分在减压下浓缩，以给出反式-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+388。
实例61和62∶反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1和异构体2
实例61和62是具有相对反式构型的纯对映异构体。实例61以及62的绝对构型是未知但是是与彼此相反。
在室温下在氮气下将乙酸酐(0.036mL，0.38mmol)逐滴添加至在DCM(2mL)中的反式-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.119g，0.32mmol)、4-二甲基氨基吡啶(1.9mg，0.02mmol)、和三乙胺(0.14mL，1.0mmol)中。将所得溶液在室温下搅拌4h。将该反应混合物用饱和水性氯化铵(10mL)淬灭，用DCM(2x10mL)萃取，将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(Chiral Technologies IE柱，20μm硅胶，50mm直径，250mm长度)，使用30/70的庚烷/丙酮混合物作为洗脱液，以120mL/min的流速以及在210nm的检测触发器进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较快洗脱的异构体1(0.076g，57％)以及反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较慢洗脱的异构体2(0.056g，42％)。
实例61，异构体1：
1H NMR(400MHz,CDCl3,31℃)1.57-1.96(7H,m),2.01(3H,s),2.04-2.16(2H,m),2.49-2.56(1H,m),2.92(2H,t),4.16-4.23(3H,m),5.46-5.52(1H,m),7.87(1H,s),8.05(1H,br s),8.21(1H,s),8.27(1H,s).在1.50至1.62ppm下3H，由水信号遮蔽。m/z:ES+[M+H]+416。
实例62，异构体2：
1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.45-1.96(10H,m),2.01(3H,s),2.04-2.13(2H,m),2.49-2.58(1H,m),2.92(2H,t),4.16-4.24(3H,m),5.52-5.57(1H,m),7.87(1H,s),8.12(1H,br s),8.21(1H,s),8.26(1H,s).m/z:ES+[M+H]+416。
分析型反相手性条件：
用于制备起始材料反式-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
(反式-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将第二代XPhos预催化剂(0.049g，0.06mmol)添加到3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.186g，0.75mmol)，(反式-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.30g，0.63mmol；根据实例59和60制备的，中间体)和磷酸三钾(0.327g，1.88mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(2mL)中的脱气的混合物中。将该反应混合物脱气并且然后在90℃下在氮气下搅拌2h。将该反应混合物在减压下浓缩并且吸收在水(20mL)中。将所得混合物用EtOAc(2x 20mL)和DCM(20mL)顺序地进行萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，0到70％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供(反式-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.163g，55％)，为奶油色固体。1H NMR(500MHz,CDCl3,27℃)1.46(9H,s),1.48-1.54(1H,m),1.61-1.74(4H,m),1.82-1.97(5H,m),2.05-2.13(2H,m),2.46-2.57(1H,m),2.92(2H,t),3.98(1H,br s),4.21(2H,t),4.60(1H,br s),7.87(2H,s),8.21(1H,s),8.27(1H,s).m/z:ES+[M+H]+474。
反式-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将(反式-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.16g，0.34mmol)溶解于DCM(5mL)中。添加三氟乙酸(0.26mL，3.4mmol)，并且将该反应混合物在室温下搅拌18h。然后将该反应混合物通过离子交换层析，使用SCX柱纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将产物部分在减压下浓缩，以给出反式-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺，为黄色胶质。m/z:ES+[M+H]+374。
实例63：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
在室温下在空气下将乙酸酐(0.032mL，0.34mmol)添加至在DCM(5mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.10g，0.28mmol)、三乙胺(0.12mL，0.84mmol)和N，N-二甲基吡啶-4-胺(2mg，0.01mmol)中。将所得溶液在室温下搅拌2h。将该反应混合物用饱和水性氯化铵(20mL)淬灭并用DCM(2x 20mL)萃取。将合并的有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.047g，42％)，为胶质。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,30℃)1.03-1.15(1H,m),1.23-1.37(3H,m),1.74-1.82(6H,m),1.83-1.94(3H,m),2.00-2.08(2H,m),2.56-2.68(1H,m),2.91(2H,t),3.58-3.61(1H,m),4.15(2H,t),7.73-7.78(2H,m),8.26(1H,d),8.30(1H,d),10.48(1H,s).m/z:ES+[M+H]+400。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将第二代XPhos预催化剂(0.092g，0.12mmol)添加到3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.347g，1.40mmol)、2-氯-5-氟-4-碘吡啶(0.300g，1.17mmol)和磷酸三钾(0.609g，3.50mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(2mL)中的脱气的混合物中。将该混合物脱气并且在90℃下在氮气下搅拌2h。将该反应混合物在减压下浓缩，并且将所得残余物吸收在水(20mL)中。将所得混合物用DCM(3x 20mL)顺序地进行萃取。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，0到60％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(200mg，68％)，为黄色胶质。m/z:ES+[M+H]+252。
((1R,3S)-3-((5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将四(三苯基膦)钯(0)(0.092g，0.080mmol)添加到3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.20g，0.79mmol)、((1R,3S)-3-氨甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.231g，0.95mmol；根据实例25制备的)、9,9-二甲基-4,5-双(二苯基膦基)呫吨(0.092g，0.16mmol)、以及碳酸铯(0.777g，2.38mmol)在1,4-二噁烷(6mL)中的混合物中。将混合物脱气(真空)，用氮气回填，并且将所得悬浮液在120℃下在微波反应器中搅拌2h。将该反应混合物在水(20mL)和DCM(40mL)之间分配并且使用相分离筒分离。将有机物在吸附到二氧化硅上，并且通过快速硅胶层析，0到60％EtOAc/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将包含产物的部分在减压下进行浓缩，以提供((1R,3S)-3-((5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(136mg)。将此材料直接用于下一步骤中而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+458。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将三氟乙酸(0.17mL，2.2mmol)添加到在DCM(5mL)中的((1R,3S)-3-((5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.10g，0.22mmol)中。将所得溶液在室温下搅拌1h。将该粗产物通过离子交换层析，使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱，并且将纯的部分在减压下进行浓缩，以给出(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺，为黄色胶质。将此材料直接用于下一步骤中而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+358。
实例64和65：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1和异构体2的制备
纯对映异构体。对于实例64和65该甲基的构型是未知的，但是在实例64对比实例65中是相反的
在氮气下将第二代XPhos预催化剂(0.056g，0.07mmol)添加到5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.56g，0.85mmol)、(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.30g，0.71mmol；根据实例12制备的)和Cs2CO3(0.695g，2.13mmol)在二噁烷(10mL)和水(2.0mL)中的混合物中。将所得混合物在100℃下搅拌持续30分钟。然后将该反应混合物在减压下浓缩，并且将所得残余物用DCM(100mL)稀释，之后用水(100mL)和饱和水性氯化钠(100mL)顺序地洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得的残余物通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化。将产物部分在减压下浓缩，并且将所得残余物通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，19mm直径，150mm长度)，使用水(包含1％NH4HCO3)以及MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进一步纯化。将产物部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.120g，39％；实例64和65的混合物，比率未知)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+430。
将这种材料通过制备型HPLC(
IA-3柱，5μm硅胶，20mm直径，250mm长度)，使用在己烷(含有0.1％的二乙胺)中30％异丙醇的等度混合物作为洗脱液经23分钟以20mL/min的流速进行拆分。将产物部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺较快洗脱的异构体1(14.3min)(0.045g，38％，实例64)，为白色固体以及(1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较慢洗脱的异构体2(18.8min)(0.045g，38％，实例65)，为白色固体。
实例64，异构体1：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,21℃)1.00-1.14(4H,m),1.19-1.36(3H,m),1.69-1.84(7H,m),1.85-2.10(3H,m),2.37-2.49(1H,m),2.56-2.66(1H,m),2.79-2.90(1H,m),3.49-3.63(1H,m),4.01-4.13(1H,m),4.19-4.30(1H,m),7.75(1H,s),7.79(1H,d),8.12(1H,s),8.39(1H,s),10.61(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
实例65，异构体2：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,21℃)1.01-1.14(4H,m),1.21-1.35(3H,m),1.70-1.83(7H,m),1.83-2.09(3H,m),2.37-2.49(1H,m),2.56-2.63(1H,m),2.79-2.89(1H,m),3.49-3.62(1H,m),4.01-4.14(1H,m),4.19-4.30(1H,m),7.74(1H,s),7.78(1H,d),8.12(1H,s),8.39(1H,s),10.61(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
分析型反相手性条件：
用于制备起始材料5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的程序描述如下：
5-甲基吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
在氮气下将乙酸钯(II)(0.114g，0.51mmol)添加添加到5-溴吡唑并[1,5-a]吡啶(1.00g，5.08mmol)、2,4,6-三甲基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三硼杂环己烷(0.765g，6.09mmol)、碳酸钾(2.10g，15.2mmol)、1,4-二噁烷(10mL)、以及水(1mL)中。将所得混合物在80℃下搅拌1小时。在单独的烧瓶中重复该反应，并且然后将两个反应合并，用EtOAc(100mL)稀释，并且用水(75mL)和饱和水性氯化钠(75mL)顺序地洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在石油醚中0至20％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供5-甲基吡唑并[1,5-a]吡啶(1.1g，82％)，为褐色的油。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,20℃)2.33(3H,s),6.45(1H,d),6.71(1H,dd),7.44(1H,s),7.92(1H,d),8.55(1H,d).m/z:ES+[M+H]+133。
5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将在MeOH(20mL)中的5-甲基吡唑并[1,5-a]吡啶(500mg，3.78mmol)、钯碳(10wt％；250mg)和乙酸(0.217mL，3.78mmol)在20大气压下于氢气氛下并且在80℃下搅拌持续50h。然后在单独的烧瓶中重复该反应。在冷却后，将两个反应通过
过滤，并且将滤液合并在减压下浓缩，以给出粗5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(1.05g，98％)，为褐色油。将该产物直接用于下一个步骤中而无需进一步纯化。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,20℃)1.06(3H,d),1.57-1.72(1H,m),1.84-2.04(2H,m),2.24-2.36(1H,mf),2.81-2.93(1H,m),3.90-4.07(1H,m),4.11-4.19(1H,m),5.95(1H,s),7.33(1H,s)。
3-碘-5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将NIS(1.98g，8.81mmol)添加到在乙腈(2mL)中的5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(1.05g，7.34mmol)中。将所得混合物在室温下搅拌3h，之后在减压下浓缩。然后将所得残余物用EtOAc(100mL)稀释并用水(75mL)和饱和水性氯化钠(2x 75mL)顺序地洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在石油醚中0至30％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩，以提供3-碘-5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(1.0g，52％)，为棕色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,20℃)1.08(3H,d),1.58-1.72(1H,m),1.87-2.01(2H,m),2.07-2.22(1H,m),2.64-2.71(1H,m),3.93-4.06(1H,m),4.10-4.22(1H,m),7.47(1H,s)。
5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
在-78℃在氮气下将在己烷中的n-BuLi(2.5M；0.916mL，2.29mmol)逐滴添加到在THF(20mL)中的3-碘-5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.50g，1.91mmol)、2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.532g，2.86mmol)和TMEDA(0.40mL，2.7mmol)中。将所得混合物在-78℃下搅拌1小时。将该反应混合物用饱和水性氯化铵(5mL)淬灭并用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机层用饱和水性氯化钠(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩，以提供基于NMR分析约23mol％5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶污染的5-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.60g，79％)，为黄色胶质。m/z:ES+[M+CH3CN+H]+304。
实例66：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将乙酸酐(0.13mL，1.4mmol)添加至(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(450mg，1.16mmol)、三乙胺(0.34mL，2.4mmol)和DCM(10mL)的搅拌溶液中。将反应混合物在室温下搅拌4h。添加二氧化硅，并且将该混合物在减压下进行浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在乙酸乙酯中0.5％甲醇洗脱纯化，以给出(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(260mg，52％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.05-1.12(1H,m),1.17-1.37(3H,m),1.57-1.66(2H,m),1.69-1.95(11H,m),2.56-2.65(1H,m),2.70-2.77(2H,m),3.50-3.61(1H,m),4.21-4.45(2H,m),7.48(1H,s),7.73(1H,d),8.05(1H,s),8.40(1H,s),10.58(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
1-(5-甲氧基-5-氧代戊烷基)-1H-吡唑-5-甲酸乙基酯的制备
将1H-吡唑-5-甲酸乙基酯(9.9g，71mmol)和碳酸钾(12g，85mmol)在DMF(70mL)中搅拌，并且添加5-溴戊酸甲酯(14g，71mmol)。将该混合物在环境温度下搅拌24h。添加水并且将该混合物用醚(3x)进行萃取。将合并的有机层合并并且用水(2x)洗涤，经硫酸镁干燥，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在戊烷中20％乙酸乙酯洗脱进行纯化，以给出1-(5-甲氧基-5-氧代戊烷基)-1H-吡唑-5-甲酸乙基酯(9g，50.1％)。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.38(3H,t),1.54-1.75(2H,m),1.8-1.95(2H,m),2.34(2H,t),3.65(3H,s),4.34(2H,q),4.58(2H,t),6.83(1H,d),7.46(1H,d).m/z:ES+[M+H]+255。还分离了1-(5-甲氧基-5-氧代戊烷基)-1H-吡唑-3-甲酸乙基酯(7.70g，43％)。
4-氧代-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-5-甲酸甲基酯的制备
将叔丁醇钾(6.29g，56.0mmol)添加到在甲苯(200mL)中的1-(5-甲氧基-5-氧代戊烷基)-1H-吡唑-5-甲酸乙基酯(9.5g，37mmol)中。将该混合物搅拌10分钟然后加温至110℃，得到厚的沉淀。将该混合物加热持续30分钟并且然后允许冷却至室温。将该混合物用稀释的水性HCl(2N)中和至pH 7中并且用乙酸乙酯萃取(3x)。将合并的有机层用硫酸镁进行干燥并在减压下浓缩，以提供该乙酯类似物污染的4-氧代-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-5-甲酸甲酯(8.00g，103％)。将这种材料直接用于下一步骤中而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+209(Me酯)&223(Et酯)。
5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-4-酮的制备
将氯化锂(2.60g，61.2mmol)添加到4-氧代-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-5-甲酸甲酯(8.50g，40.8mmol，该乙酯类似物污染的)在DMSO(50mL)中的溶液中。将该混合物在120℃下加热持续24h并且然后冷却至室温。添加水，并且将该混合物用乙酸乙酯(3x)进行萃取。将合并的有机层在减压下进行浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析纯化，用30％乙酸乙酯/庚烷洗脱，以给出5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-4-酮(3.50g，57％)，为油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.91-2.08(2H,m),2.08-2.28(2H,m),2.76-2.93(2H,m),4.49-4.64(2H,m),6.86(1H,d),7.44(1H,d)。
5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓的制备
将水合肼(5.65mL，117mmol)添加至5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-4-酮(3.5g，23mmol)溶解在二乙二醇(66mL)中的搅拌溶液中。将所得溶液在170℃下搅拌1小时。然后将该反应从热移出并且将氢氧化钾(4.58g，81.6mmol)小心地添加到该混合物中。将所得悬浮液在170℃下搅拌2h并且然后冷却至室温。然后将该反应混合物用水稀释，用稀释的水性盐酸(2N)酸化至pH 5，并且用Et2O(5x 50mL)萃取。将合并的醚层用水(2x 20mL)洗涤，经硫酸镁干燥，过滤，并在减压下浓缩，以给出5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(2.10g，66％)，为固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.61-1.67(2H,m),1.71-1.79(2H,m),1.80-1.87(2H,m),2.62-2.83(2H,m),4.17-4.3(2H,m),5.98(1H,d),7.26(1H,d)。
3-碘-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓的制备
在室温下将NIS(3.47g，15.4mmol)添加至5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(2.10g，15.4mmol)溶解于乙腈(30mL)中的搅拌溶液中。将所得混合物在室温下搅拌16h。然后将该反应混合物用醚(50mL)稀释并且用水(2x 20mL)、以及饱和水性氯化钠(20mL)顺序地洗涤。将该有机层用MgSO4进行干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出3-碘-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(3.3g，82％)，作为橙色的油，该油在静置时固化。将此材料直接用于下一步骤中而无需进一步纯化。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.6-1.72(2H,m),1.73-1.82(2H,m),1.82-1.92(2H,m),2.74-2.83(2H,m),4.25-4.35(2H,m),7.32(1H,s)。
3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓的制备
在氮气下在0℃下将在THF中的异丙基氯化镁氯化锂复合物(1.3M；12.6mL，16.4mmol)经5分钟逐滴添加至在THF(20mL)中的3-碘-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(3.30g，12.6mmol)中。将所得混合物在0℃下搅拌持续30分钟。在0℃下逐滴添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(3.85mL，18.9mmol)，并且然后允许该反应混合物加温至室温过夜。将该反应混合物用醚(20mL)稀释并且用饱和水性氯化铵(20mL)、水(20mL)、以及饱和水性氯化钠(10mL)顺序地进行洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得油吸收在庚烷中，导致形成白色混合物。将此混合物过滤以给出3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(2.00g，61％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.29(12H,s),1.63-1.72(2H,m),1.72-1.8(2H,m),1.80-1.87(2H,m),2.88-3.09(2H,m),4.20-4.33(2H,m),7.56(1H,s)。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将第二代XPhos预催化剂(0.16g，0.21mmol)添加到3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(0.656g，2.50mmol)，(1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(1.00g，2.08mmol；根据实例10制备的)和磷酸三钾(1.09g，6.25mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(2mL)中的脱气的混合物中。将该混合物再次脱气并在85℃下氮气下搅拌24h。允许该反应混合物冷却，并且添加二氧化硅。将此新混合物在减压下进行浓缩，并且将所得残余物通过快速硅胶层析，用在庚烷中50％乙酸乙酯洗脱纯化，以给出((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.70g，69％)，为固体。将这种材料继续到下一个步骤而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+488。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将TFA(2mL)添加至((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(700mg，1.43mmol)在DCM(10mL)中的搅拌溶液中。将该反应在室温下搅拌24h，将挥发物在真空下除去，并且将所得残余物通过离子交换层析，使用SCX柱，用在甲醇中7N的氨洗脱进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(550mg，99％)，为固体。m/z:ES+[M+H]+388。
实例67：N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺
将HATU(166mg，0.44mmol)和DIPEA(0.18mL，1.0mmol)顺序地添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol；根据实例31b制备的)和氧杂环丁烷-3-甲酸(45mg，0.44mmol)在DMF(1.2mL)中的溶液中。将该反应在室温下搅拌3h，之后用饱和水性碳酸氢钠稀释并用EtOAc(3x)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得原胶通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18苯基OBD柱，5μ硅胶，19mm直径，150mm长度)使用水(含有0.2％氢氧化铵，pH 10)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化，以提供N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)-环己基)-氧杂环丁烷-3-甲酰胺(20mg)。
如下设立第二反应：将HATU(140mg，0.37mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(150mg，0.34mmol)、氧杂环丁烷-3-甲酸(45mg，0.44mmol)、DIPEA(0.18mL，1.0mmol)以及DMF(1.2mL)的溶液中。该反应在室温下搅拌3h。将该反应用EtOAc稀释并且用饱和NaHCO3和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，用在己烷中80％至100％的EtOAc梯度洗脱进行纯化，以提供N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺(50mg)，为白色固体。将这种残余物与来自第一反应的产物合并并且通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18苯基OBD柱，5μ硅胶，19mm直径，150mm长度)再纯化，以提供N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺(54mg，17％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.10-1.26(1H,m),1.37-1.68(3H,m),2.17-1.84(7H,m),2.37-2.22(1H,m),2.57-2.43(1H,m),2.95(2H,t),3.67(1H,tt),3.85-4.00(1H,m),4.24(2H,t),4.89-4.78(4H,m),5.52(1H,br d),7.93(1H,s),8.27(1H,s),8.28(1H,s),8.60(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+458。
实例68和69：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1和异构体2
纯对映异构体。对于实例68和69该甲基的构型是未知的，但是在实例68对比69中是相反的
将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(163g，0.379mmol；实例68以及69的混合物，比率未知)使用SFC条件(柱：ChiralpakAS，5μm，21.2mm直径，250mm长度，20mL/min的流速，经7min)，用在CO2中25％的甲醇洗脱进行分离，以给出(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1(3.10min)(65mg，28％，实例68)和(1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(68，29％，实例69)的异构体2(4.09min)，为白色固体。
实例68，异构体1：
1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.05-1.25(4H,m),1.65-1.33(4H,m),1.85-2.09(7H,m),2.15-2.32(2H,m),2.38-2.53(1H,m),2.86-3.03(2H,m),3.70(1H,dd),3.82-3.97(1H,m),4.33(1H,dd),5.47(1H,br d),7.89(1H,s),8.12(1H,br s),8.22(1H,s),8.27(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
实例69，异构体2：
1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.09-1.24(4H,d),1.34-1.58(4H,m),1.86-2.08(7H,m),2.15-2.32(1H,m),2.41-2.51(1H,m),2.86-3.03(1H,m),3.64-3.75(1H,m),3.81-3.95(1H,m),4.33(1H,dd),5.52(1H,br d),7.88(1H,s),8.15-8.21(2H,m),8.27(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
分析型SFC条件：
用于制备起始材料(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
6-甲基吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将二噁烷(32mL)和水(6.0mL)添加至碳酸钾(1.82g，13.2mmol)、2,4,6-三甲基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三硼杂环己烷(1.9mL，13mmol)和6-溴吡唑并[1,5-a]吡啶(1.3g，6.60mmol)中。将反应悬浮液用氮气进行脱气。添加第三代Ru-Phos预催化剂(0.27g，0.33mmol)，并且该反应物浸没在已预热至100℃的油浴中。将反应保持在这些条件下持续4h并且然后冷却至室温。将所得到的混合物过滤，并且将滤液用饱和水性氯化钠进行洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。所得到的油通过快速硅胶层析，在己烷中5％至40％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以给出6-甲基吡唑并[1,5-a]吡啶(0.680g，78％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)2.29(3H,s),6.53(1H,dd),7.07(1H,dd),7.60(1H,d),7.90(1H,d),8.49-8.52(1H,m).m/z:ES+[M+H]+133。
6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将甲醇(45mL)和乙酸(0.5mL)添加至装有6-甲基吡唑并[1,5-a]吡啶(0.71g，5.4mmol)和铂(IV)氧化物(0.12g，0.54mmol)的烧瓶中。将该烧瓶用氮气吹扫，抽空，并且然后经受氢气气氛(气球)。将该反应在35℃下搅拌18h并且然后接着通过
层过滤。将该滤液在减压下浓缩并且然后用二乙醚稀释。将该混合物用饱和水性碳酸氢钠和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩，以给出粗6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.71g，97％)，为灰白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.1(3H,d),1.50(1H,dtd),1.92-2.01(1H,m),2.08-2.27(1H,m),2.64-2.80(1H,m),2.87-2.96(1H,m),3.64(1H,dd),4.27(1H,ddd),5.99(1H,s),7.39(1H,d).m/z:ES+[M+H]+137。
3-碘-6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
在室温下将NIS(1.16g，5.14mmol)添加到6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.70g，5.14mmol)在乙腈(12mL)中的溶液中。将该反应在这些条件下进行搅拌持续18h并且然后用EtOAc稀释。将所得混合物用水进行洗涤，并且将水层用EtOAc(4x 100mL)萃取。将该合并的有机层用饱和水性氯化钠洗涤并且在减压下浓缩。将所得原胶通过快速硅胶层析，在己烷中5％至50％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以给出3-碘-6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(1.10g，82％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3,27℃)1.15(3H,d),1.42-1.61(1H,m),1.90-2.07(1H,m),2.08-2.22(1H,m),2.52-2.60(1H,m),2.75-2.86(1H,m),3.65(1H,dd),4.26(1H,dd),7.49(1H,s).m/z:ES+[M+H]+263。
6-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将四氢呋喃(3mL)添加至装有3-碘-6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.40g，1.53mmol)的烧瓶中。将该反应浸没在冰浴中，并且逐滴加入在THF中的异丙基氯化镁氯化锂复合物(1.3M；1.5mL，2.0mmol)。将该反应维持在0与3℃之间持续30分钟。然后经由注射器添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.426g，2.29mmol)，并且去除冰浴。将反应在这些条件下保持18h并且然后用饱和水性氯化铵稀释。将该混合物在EtOAc(3x)中萃取，并且将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并在减压下浓缩，以提供6-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.186g)。将这种材料用于下一步骤中而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+263。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
实例68以及69的混合物，比率未知
将1,4-二噁烷(5mL)和水(0.63mL)添加至装有(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.23g，0.55mmol；根据实例12制备的)和6-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.19g，0.71mmol)的烧瓶中。将该反应混合物抽成真空并且用氮气吹扫。然后添加碳酸铯(0.444g，1.36mmol)和PdCl2(dppf)(0.040g，0.05mmol)。将该反应设置在预热至95℃的油浴中，并且将该反应在这些条件下保持2h。然后将该反应冷却至室温，并且通过
使用乙酸乙酯洗涤物过滤。将滤液用饱和水性氯化钠进行洗涤，并且将有机层经硫酸钠进行干燥，过滤并在减压下浓缩。将所得到的灰色固体通过快速硅胶层析，在乙酸乙酯中1％至10％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.16g，69％)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.99-1.15(4H,m),1.20-1.33(3H,m),1.37-1.48(1H,m),1.68-1.77(6H,m),1.81-1.92(2H,m),2.10-2.20(1H,m),2.54-2.62(1H,m),2.79-2.87(2H,m),3.48-3.61(1H,m),3.65(1H,dd),4.26(1H,dd),7.73(1H,br d),7.76(1H,s),8.15(1H,s),8.38(1H,s),10.58(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。
实例70和实例71：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1和异构体2的制备
纯对映异构体。对于实例70和71该甲氧基的构型是未知的，但是在实例70对比实例71中是相反的。
将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.22mmol)通过制备型HPLC条件(Chiralpak IA柱，5μm，20mm直径，250mm长度，25℃柱温，15mL/min的流速)，用在己烷中等度50％乙醇经22min洗脱来拆分，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较快洗脱的(10.8min)的异构体1(0.030g，30％)以及(1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较慢洗脱(17.9min)的异构体2(0.030g，30％)，为白色固体。
实例70，异构体1：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,19℃)1.00-1.14(1H,m),1.20-1.34(3H,m),1.72-1.80(6H,m),1.84-1.97(2H,m),2.07-2.19(1H,m),2.56-2.66(1H,m),2.70-2.92(2H,m),3.36(3H,s),3.48-3.63(1H,m),3.93-4.02(1H,m),4.23(2H,d),7.76-7.83(2H,m),8.15(1H,s),8.39(1H,s),10.64(1H,s).m/z:ES+[M+H]+446。
实例71，异构体2：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,19℃)1.00-1.17(1H,m),1.19-1.35(3H,m),1.72-1.80(6H,m),1.85-1.97(2H,m),2.06-2.19(1H,m),2.55-2.63(1H,m),2.71-2.92(2H,m),3.36(3H,s),3.50-3.62(1H,m),3.93-4.02(1H,m),4.23(2H,d),7.76-7.83(2H,m),8.16(1H,s),8.39(1H,s),10.64(1H,s).m/z:ES+[M+H]+446。
分析型SFC条件：
用于制备起始材料(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
6-甲氧基吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将碳酸铯(3.31g，10.2mmol)添加至在甲苯(10mL)中的6-溴吡唑并[1,5-a]吡啶(1.00g，5.08mmol)、MeOH(0.41mL，10mmol)、乙酸钯(0.057g，0.25mmol)和2-(二-1-金刚烷基膦基)-3,6-二甲氧基-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯基(AdBrettPhos；0.14g，0.25mmol)中。将所得混合物在90℃下搅拌2h。在单独的反应中重复以上反应。一旦两个反应冷却，将它们合并，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在石油醚中0至20％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以给出6-甲氧基吡唑并[1,5-a]吡啶(0.83g，55％)，为无色的油。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,27℃)3.82(3H,s),6.54(1H,s),7.01(1H,d),7.61(1H,d),7.87(1H,s),8.38(1H,s)。
6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将6-甲氧基吡唑并[1,5-a]吡啶(0.36g，2.4mmol)和钯碳(10重量％；0.078g，0.73mmol)以MeOH(50mL)在20个大气压下在氢气氛并且在80℃搅拌持续16h。将该混合物通过
垫过滤，并且然后将该滤液在减压下浓缩。将所得残余物用EtOAc(25mL)稀释并且用饱和饱和水性碳酸氢钠(25mL)和饱和水性氯化钠(25mL)顺序地洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩，以提供6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.30g，81％)，为黄色蜡状固体。1H NMR(400MHz,DMSO,20℃)1.85-1.94(1H,m),1.98-2.09(1H,m),2.71-2.78(2H,m),3.32(3H,s),3.89(1H,m),4.02-4.18(2H,m),5.97(1H,d),7.34(1H,d)。
3-碘-5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
将NIS(0.559g，2.48mmol)添加到在乙腈(10mL)中的5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.27g，1.77mmol)中。将所得混合物在室温下搅拌持续30分钟。将该反应混合物在减压下浓缩，并且将所得残余物用EtOAc(25mL)稀释。将此新混合物用水(25mL)和饱和水性氯化钠(25mL)顺序地进行洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在石油醚中0至30％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩以提供3-碘-5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.40g，81％)，为黄色的油。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,21℃)1.78-1.99(1H,m),2.02-2.23(1H,m),2.53-2.60(2H,m),3.34(3H,s),3.82-3.96(1H,m),4.07-4.26(2H,m),7.48(1H,s)。
6-甲氧基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶的制备
在氮气下将n-BuLi(0.805mL，2.01mmol)添加到在冷却至-78℃的THF(20mL)中的3-碘-6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.4g，1.44mmol)、2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.401g，2.16mmol)、以及TMEDA(0.30mL，2.0mmol)中。将所得混合物维持在-78℃下持续1小时。然后将该反应混合物用饱和水性氯化铵(200mL)淬灭，用EtOAc(3x 150mL)萃取，将有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩，以给出具有14wt％戴斯-碘起始材料污染的6-甲氧基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.400g，100％)，为无色胶质(NMR分析)。将这种材料继续到下一个步骤而无需进一步纯化。
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在氮气下将第二代XPhos预催化剂(0.049g，0.06mmol)添加至在二噁烷(10mL)和水(1mL)中的6-甲氧基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(0.387g，1.25mmol)，((1R,3S)-3-((5-氯-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.3g，0.63mmol；根据实例10制备的)和碳酸铯(0.611g，1.88mmol)中。将所得混合物在100℃下搅拌1小时，并且然后将该反应混合物冷却并且用EtOAc(200mL)稀释。将所得混合物进行用水(200mL)和饱和水性氯化钠(200mL)顺序地进行洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在石油醚中0至60％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分在减压下进行浓缩，以提供((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.14g，44％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+504。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将TFA(4mL，51.92mmol)添加到在DCM(10mL)中的((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.14g，0.28mmol)中。将所得混合物在室温下搅拌持续1小时。将该反应在减压下浓缩，以给出为二-三氟乙酸盐和黄色胶质的粗(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.15g，98％)。m/z:ES+[M+H]+404。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
实例70以及71的混合物，比率未知
将乙酸酐(0.023mL，0.25mmol)添加至在DCM(5mL)中的(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(二-三氟乙酸盐；0.15g，0.25mmol)和TEA(0.17mL，1.2mmol)中。将所得混合物在室温下搅拌16h。然后将该反应在减压下浓缩，并且将粗产物通过制备型HPLC(XBridge Prep C18 OBD柱，21.2mm直径，250mm长度)，使用水(包含0.1％NH4HCO3)和MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液进行纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.100g，91％；实例70和71的混合物)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+446。
实例72和实例73：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1和异构体2的制备
纯对映异构体。对于实例72和73该甲氧基的构型是未知的，但是在实例72对比实例73中是相反的
将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(120mg，0.270mmol；根据实例70和71的程序制备的，用6-溴吡唑并[1,5-a]吡啶取代5-溴吡唑并[1,5-a]吡啶)通过制备型HPLC条件(ChiralpakID柱，5μm，20mm直径、250mm长度，25℃柱温，15mL/min的流速)，用在己烷中等度50％乙醇经31min洗脱来拆分，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较快洗脱(16.0min)的异构体1(0.040g，33.3％)以及1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(0.040g，33.3％)较慢洗脱的(24.8min)异构体2，为白色固体。
实例72，异构体1：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,19℃)δ1.03-1.14(1H,m),1.19-1.35(3H,m),1.65-1.84(6H,m),1.84-1.94(1H,m),2.16-2.25(2H,m),2.56-2.66(1H,m),2.83-2.94(1H,m),2.97-3.08(1H,m),3.29(3H,s),3.50-3.63(1H,m),3.82-3.91(1H,m),4.06-4.24(2H,m),7.77(1H,s),7.80(1H,d),8.13(1H,s),8.39(1H,s),10.64(1H,s).m/z:ES+[M+H]+446。
实例73，异构体2：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,19℃)δ1.00-1.14(1H,m),1.19-1.35(3H,m),1.72-1.81(6H,m),1.84-1.92(1H,m),2.16-2.25(2H,m),2.56-2.66(1H,m),2.83-2.93(1H,m),3.03(1H,m),3.29(3H,s),3.48-3.62(1H,m),3.82-3.91(1H,m),4.06-4.24(2H,m),7.77(1H,s),7.80(1H,d),8.13(1H,s),8.39(1H,s),10.64(1H,s).m/z:ES+[M+H]+446。
分析型SFC条件：
实例74：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将乙酸酐(0.11mL，1.1mmol)添加至(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(350mg，0.94mmol)、三乙胺(0.28mL，2.0mmol)和DCM(10mL)的搅拌溶液中。将反应混合物在室温下搅拌4h。添加二氧化硅，并且将所得混合物在减压下进行浓缩。将所得吸附的残余物通过快速硅胶层析，用在乙酸乙酯中0.5％的甲醇洗脱进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(200mg，51％)，为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.03-1.07(1H,m),1.30(3H,m),1.57-1.96(13H,m),2.56-2.62(1H,m),2.68-2.93(2H,m),3.47-3.66(1H,m),4.19-4.4(2H,m),7.49(1H,d),7.73(1H,d),8.09(1H,d),8.32(1H,d),10.48(1H,s).m/z:ES+[M+H]+414。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓的制备
将2-氯-5-氟-4-碘吡啶(1.064g，4.13mmol)、3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(1.30g，4.96mmol；根据实例66制备的)，第二代XPhos预催化剂(0.325g，0.41mmol)和磷酸氢二钾(2.16g，12.4mmol)在21℃下溶解在脱气的二噁烷(20mL)和水(1mL)中。将该混合物在90℃下搅拌24h并且然后冷却。将该混合物用EtOAc(30mL)稀释，用水(10mL)洗涤，并且然后在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在庚烷中0至50％EtOAc的洗脱梯度进行纯化。将产物部分蒸发至干燥以提供3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(0.650g，59％)，为油。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.62-1.94(6H,m),2.77-2.88(2H,m),4.29-4.4(2H,m),7.22(1H,d),7.50(1H,d),8.25(1H,d).m/z:ES+[M+H]+266。
((1R,3S)-3-((5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将四(三苯基膦)钯(0)(0.30g，0.26mmol)添加到3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓(0.700g，2.63mmol)，((1R,3S)-3-氨甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.638g，2.63mmol；根据实例25制备的)，9,9-二甲基-4,5-双(二苯基膦基)呫吨(0.305g，0.53mmol)和碳酸铯(2.58g，7.90mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中的脱气的混合物中。将所得混合物在氮气下吹扫5分钟，并且将所得悬浮液经受微波条件(120℃，17h)。将该反应混合物冷却并且在过滤之前在水(20mL)和乙酸乙酯(100mL)之间分配。将各层分离，并且将有机层在减压下浓缩，吸附到二氧化硅上，并且通过快速硅胶层析，用在庚烷中50％的EtOAc洗脱进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩，以提供粗((1R,3S)-3-((5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.90g，72％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+472。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将TFA(1mL)添加到((1R,3S)-3-((5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(600mg，1.27mmol)在DCM(10mL)中的溶液中。将该混合物在室温下搅拌24h，并且然后将该反应在减压下进行浓缩。将所得的残余物通过离子交换层析法使用SCX柱以及用在甲醇中的7N氨洗脱进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂卓-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(350mg，74％)，为白色固体。m/z:ES+[M+H]+372。
实例75：(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)-3-(2-羟基乙酰胺基)环己烷甲酰胺的制备
将碳酸铯(436mg，1.34mmol)和第二代XPhos预催化剂(35mg，0.04mmol)添加到5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(168mg，0.470mmol；根据实例23制备的)和(1S,3R)-3-(2-羟基乙酰胺基)-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(186mg，0.45mmol)在1,4-二噁烷(3.7mL)和水(0.7mL)的脱气的混合物中，以给出无色溶液。将该反应在85℃下搅拌18h并且然后冷却并用EtOAc(50mL)稀释。将此新混合物用水以及饱和水性氯化钠进行洗涤。将水层用EtOAc(2x 50mL)进行萃取。将合并的有机层用硫酸镁进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析用在DCM中10％MeOH洗脱进行纯化，以提供(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)-3-(2-羟基乙酰胺基)环己烷甲酰胺(78mg，41％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.18-1.38(9H,m),1.46(1H,q),1.65-1.92(4H,m),2.32(3H,s),2.57-2.67(1H,m),2.85(2H,s),3.58-3.72(1H,m),3.78(1H,d),3.93(2H,s),5.36(1H,t),7.54(1H,d),7.77(1H,s),8.07(1H,s),8.13(1H,2),10.27(1H,s).m/z:ES+[M+H]+426。
旋光度：
用于制备起始材料(1S,3R)-3-(2-羟基乙酰胺基)-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将在二噁烷中的盐酸(4M；2mL，8mmol)添加至在MeOH(11mL)中的((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(530mg，1.15mmol；根据实例47制备的)中，以给出无色溶液。将该反应在室温下搅拌2h并且然后在减压下浓缩，以给出作为二盐酸盐的(1S,3R)-3-氨基-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(550mg)，为白色固体。将该固体继续到下一个步骤而无需进一步纯化。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.11-1.36(3H,m),1.49(1H,q),1.76-1.88(2H,m),1.88-1.89(1H,m)2.04(1H,d),2.30(3H,s),2.54-2.67(1H,m),2.94-3.07(1H,m),8.03(3H,br.s),8.17(1H,s),8.61(1H,s),10.58(1H,br.s)。检测到一个HCl等效物、第二个被假定为是埋在5.9ppm处的宽HOD峰下。m/z:ES+[M+H]+360。
(1S,3R)-3-(2-羟基乙酰胺基)-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将HATU(328mg，0.86mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(228mg，0.53mmol)、2-羟基乙酸(66mg，0.86mmol)、TEA(0.24mL，1.7mmol)、DMF(2.8mL)、和DCM(2.8mL)中的混合物中。将该反应在室温下在氮气下搅拌持续5h并且然后在减压下浓缩。将所得残余物吸收于DCM中并用水(4x 25mL)和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠进行干燥，过滤并且在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，用在DCM中0至10％甲醇洗脱纯化，以提供(1S,3R)-3-(2-羟基乙酰胺基)-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(186mg，52％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.17-1.34(3H,m)1.43(1H,q)1.60-1.91(4H,m)2.28(3H,s),2.54-2.69(1H,m),3.56-3.72(1H,m),3.78(2H,d),5.36(1H,t)7.55(1H,d)8.16(1H,s)8.61(1H,s)10.45(1H,s).m/z:ES+[M+H]+418。
实例76：N-((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺的制备
将碳酸铯(247mg，0.76mmol)和第二代XPhos预催化剂(20mg，0.03mmol)添加到5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(90mg，0.25mmol；根据实例23制备的)和N-((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺(112mg，0.25mmol)在1,4-二噁烷(2.1mL)和水(0.4mL)中的脱气的混合物中。将该反应在85℃下搅拌18h，冷却至室温，并且然后用EtOAc(50mL)稀释。将该混合物用水和饱和水性氯化钠洗涤。将合并的水层用EtOAc(2x 50mL)萃取，并且将合并的有机层经硫酸镁干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，用在DCM中10％MeOH洗脱纯化，以获得灰白色固体(72mg)。将这种材料通过快速硅胶层析、在DCM中0至10％甲醇再纯化，以提供N-((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2yl)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺(50mg，44％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.00-1.17(1H,m),1.21-1.37(9H,m)1.68-1.84(3H,m),1.89(1H,br d),2.33(3H,s),2.55-2.67(1H,m),2.84(2H,s),3.53-3.74(2H,m),3.93(2H,s),4.54-4.65(4H,m),7.73-7.84(2H,m),8.07(1H,s),8.14(1H,s),10.28(1H,s).m/z:ES+[M+H]+452。
旋光度：
用于制备起始材料N-((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺的程序描述如下：
N-((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺的制备
将HATU(219mg，0.58mmol)添加到(1S,3R)-3-氨基-N-(4-碘-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺二盐酸盐(228mg，0.53mmol；根据实例75制备的)、氧杂环丁烷-3-甲酸(59mg，0.58mmol)、TEA(0.24mL，1.7mmol)、DCM(2.8mL)和DMF(2.8mL)的溶液中，以给出无色溶液。该反应随时间变成黄色；在室温下4h之后，将该反应在减压下浓缩并且然后用DCM稀释。将该混合物用水洗涤(3x 50mL)、经硫酸钠干燥，过滤，在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速柱层析，用0至10％MeOH和DCM洗脱进行纯化以提供N-((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺(112mg，47％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.99-1.17(1H,m),1.20-1.37(3H,m),1.70-1.83(3H,m),1.84-1.94(1H,m),2.29(3H,s),2.54-2.64(1H,m),3.55-3.73(2H,m),4.54-4.64(4H,m),7.81(1H,d),8.16(1H,s),8.61(1H,s),10.45(1H,s).m/z:ES+[M+H]+444。
实例77：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
向(1S,3R)-3-氨基-N-(5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(150mg，0.42mmol)、三乙胺(0.12mL，0.89mmol)在DCM(10mL)中的搅拌溶液中添加乙酸酐(0.048mL，0.51mmol)。将反应混合物在室温下搅拌4h。添加二氧化硅并且将挥发性物在真空下去除。将残余物通过快速二氧化硅层析，用在乙酸乙酯中0.5％的甲醇洗脱纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(140mg，83％)，为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.04-1.11(1H,m),1.22-1.35(3H,m),1.7-1.94(9H,m),1.99-2.08(2H,m),2.23(3H,s),2.55-2.63(1H,m),2.75(2H,t),3.51-3.61(1H,m),4.13(2H,t),7.62(1H,s),7.72(1H,d),7.96(1H,s),8.16(1H,s),10.27(1H,s).m/z:ES+[M+H]+396。
用于制备起始材料(1S,3R)-3-氨基-N-(5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
((1R,3S)-3-((5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将第二代XPhos预催化剂(86mg，0.11mmol)添加到3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶(324mg，1.31mmol)、((1R,3S)-3-((4-碘-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(500mg，1.09mmol，根据实例47制备的，中间体)和磷酸三钾(569mg，3.27mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1mL)中的脱气的混合物中。将混合物脱气并在85℃下在氮气下搅拌24h。将该反应混合物冷却并且添加二氧化硅。将该混合物在减压下浓缩，并且将所得残余物通过快速硅胶层析，用在庚烷中等度60％乙酸乙酯洗脱进行纯化，以提供((1R,3S)-3-((5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(220mg，45％)，为固体。1H NMR(400MHz,DMSO,30℃)1.05-1.14(1H,m),1.21-1.31(3H,m),1.38(9H,s),1.69-1.94(7H,m),1.96-2.08(2H,m),2.23(3H,s),2.54-2.61(1H,m),2.75(2H,t),4.13(2H,t),6.75(1H,br d),7.62(1H,s),7.96(1H,s),8.16(1H,s),10.25(1H,s).m/z:ES+[M+H]+454。
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将TFA(1mL)添加至在DCM(10mL)中的((1R,3S)-3-((5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(200mg，0.44mmol)中。将该混合物在室温下搅拌24h，并将这些挥发物在减压下去除。将所得的残余物通过离子交换层析法使用SCX柱，用在甲醇中7N的氨洗脱进行纯化。将产物部分在减压下进行浓缩以提供(1S,3R)-3-氨基-N-(5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(150mg，96％)，为白色固体。将此材料直接用于下一步骤中而无需进一步纯化。m/z:ES+[M+H]+354。
实例78：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(7-羟基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
作为羟基构型的未知非对映异构体的混合物是未知。
在0℃下将吡啶三氧化硫(40mg，0.25mmol)添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(4-羟丁)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(100mg，0.23mmol，在实例78a制备的)在2:1DCM:DMSO(4mL)中的溶液中。在0℃2h之后，将该反应混合物用水进行稀释并用乙酸乙酯(3x)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在含有0.2％三乙胺的DCM中0至15％MeOH的洗脱梯度进行纯化，以提供白色固体。将这种固体用在己烷中10％的DCM研磨，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(7-羟基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(74mg，74％)，为白色泡沫状固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.98-1.11(1H,m),1.18-1.41(3H,m),1.70-1.81(6H,m),1.85-2.18(4H,m),2.56-2.66(1H,m),2.67-2.91(2H,m),3.49-3.67(1H,m),4.23-4.40(1H,m),5.54-5.73(1H,m),6.87(1H,d),7.75(1H,d),7.81(1H,s),8.15(1H,s),8.39(1H,s),10.59(1H,s).m/z:ES+[M+H]+432。
实例78a：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(4-羟丁)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将在二噁烷中的盐酸(4M；2.2mL，8.8mmol)添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(300mg，0.44mmol)在甲醇(3mL)中的溶液中。将该反应在室温下搅拌2h并且然后在减压下浓缩。将所得残余物用水(40mL)稀释并且用碳酸氢钠碱化。然后将该混合物用氯化钠饱和并用乙酸乙酯萃取(5x)。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在DCM中0至30％甲醇的洗脱梯度纯化，以提供粗(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(4-羟丁)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(163mg，83％)，为胶质。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.02-1.23(1H,m),1.24-1.47(5H,m),1.52-1.66(2H,m),1.75-1.88(6H,m),1.88-1.97(1H,m),2.59-2.76(3H,m),3.35-3.43(2H,m),3.54-3.68(1H,m),4.25-4.39(1H,m),7.66(0.6H,s),7.79(1H,d),7.92-8.02(0.4H,m),8.12-8.21(1H,m),8.43(1H,s),10.62(1H,s),12.91(0.4H,brs),12.98(0.6H,br s)-2:3比率的吡唑互变异构体。m/z:ES+[M+H]+434。
如下制备用作起始材料的(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺：
1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
将NaH(在矿物油中60％wt；1.85g，46.3mmol)在5℃下经10分钟的时间在氮下分部分添加至在THF(30mL)中的1H-吡唑(3.0g，44.1mmol)中。将所得混合物在5℃下搅拌持续30分钟。然后将SEM-Cl(8.2mL，46mmol)逐滴添加至该反应中。将所得混合物在5℃下搅拌1小时。然后将该反应混合物用水(50mL)稀释并且用Et2O(3x 50mL)顺序地洗涤。将合并的有机层用硫酸镁进行干燥，过滤并且在减压下浓缩，以给出1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(6.5g，78％)，为淡黄色油。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.00(s,9H),0.79-0.95(2H,m),3.48-3.62(2H,m),5.45(2H,s),6.36(1H,t),7.56(1H,d),7.91(1H,d)。
5-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
在氮气下在21℃下将锂镁2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基(2,2,6,6-tetramethylpiperidin-1-ide)二氯化物(25.2mL，27.7mmol)逐滴添加至1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(5g，25mmol)在THF(30mL)中的溶液中。将所得到的悬浮液在21℃下搅拌持续1小时。在1.5h后，将反应冷却至0℃，并且然后添加1,2-二溴-1,1,2,2-四氯乙烷(8.21g，25.2mmol)。去除该冰浴，并且允许该混合物加温至室温；在18h之后，将该反应混合物用饱和水性氯化钠淬灭并用乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中0至40％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供5-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(4.2g，60％)，为褐色的油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.00(9H,s),0.88-0.96(2H,m),3.61(2H,t),5.49(2H,s),6.58(1H,d),7.67(1H,d)。
5-(戊-4-烯-1-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
将第三代Ru-Phos预催化剂(0.247g，0.30mmol)添加到5-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(4.1g，15mmol)、戊-4-烯-1-基硼酸(2.19g，19.2mmol)和碳酸铯(9.64g，29.6mmol)在1,4-二噁烷(120mL)中的脱气的混合物中，并且将该反应在90℃下搅拌18h。将该反应混合物冷却至室温并且然后用水稀释。添加水性碳酸氢钠，并且将所得混合物用乙酸乙酯(3x)进行萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中0至50％乙酸乙酯的洗脱梯度纯化，以提供5-(戊-4-烯-1-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(2.2g，55％)，为淡黄色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.00(9H,s),0.75-0.93(2H,m),1.66-1.88(2H,m),2.15(2H,q),2.61-2.85(2H,m),3.44-3.61(2H,m),4.92-5.22(2H,m),5.43(2H,s),5.89(1H,ddt),6.18(1H,d),7.42(1H,d)。
4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)丁醛的制备
将5-戊-4-烯-1-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(2.14g，8.03mmol)溶解于DCM(40mL)中并且冷却至-78℃。将臭氧鼓泡通过该溶液持续12分钟。然后将该反应使用流氮吹扫臭氧，并且添加三苯基膦(2.11g，8.03mmol)。允许该反应加温至室温并且维持在这些条件下持续18h，之后在减压下进行浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中0至50％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)丁醛(1.34g，62％)，为油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.00(9H,s),0.76-0.94(2H,m),1.81-2.01(2H,m),2.57-2.60(2H,m),2.73(2H,t),3.42-3.64(2H,m),5.43(2H,s),6.20(1H,d),7.43(1H,d),9.74(1H,t)。
4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)丁-1-醇的制备
在0℃下将硼氢化钠(0.372g，9.84mmol)添加至4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)丁醛(1.32g，4.92mmol)在甲醇(20mL)中的搅拌溶液中。将所得混合物在这些条件搅拌1h。然后将该反应用水稀释并用乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得粗产物残余物通过硅胶塞用乙酸乙酯洗脱过滤。将该滤液在减压下浓缩，以给出4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)丁-1-醇(1.1g，85％)，为浅棕色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.00(9H,s),0.86(2H,t),1.43-1.59(2H,m),1.61-1.79(2H,m),2.72(2H,t),3.39-3.64(4H,m),4.43(1H,t),5.42(2H,s),6.16(1H,d),7.42(1H,d).m/z:ES+[M+H]+271。
5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
在0℃下将TBS-Cl(0.94g，6.2mmol)添加至4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)丁-1-醇(1.1g，4.1mmol)以及咪唑(0.85g，12mmol)在DCM(20mL)中的搅拌溶液中，并且将该反应在室温下搅拌18h。将该反应混合物用水稀释并且用EtOAc萃取。将有机层经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中0至40％乙酸乙酯的洗脱梯度纯化，以给出5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(1.5g，96％)，为油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.00(9H,s),0.09(6H,s),0.81-0.89(2H,m),0.92(9H,s),1.49-1.62(2H,m),1.65-1.80(2H,m),2.73(2H,t),3.47-3.61(2H,m),3.67(2H,t),5.43(2H,s),6.15(1H,d),7.42(1H,d).m/z:ES+[M+H]+385。
5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
在0℃下将NIS(0.89g，4.0mmol)添加至5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(1.5g，4.0mmol)在DCM(25mL)中的搅拌溶液中。去除该冰浴，并且将该反应在这些条件下搅拌18h。将该反应混合物用水稀释并且用EtOAc萃取。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中0至50％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以给出5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(1.7g，85％)，为胶质。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.00(9H,s),0.07(6H,s),0.82-0.88(2H,m),0.91(9H,s),1.45-1.74(4H,m),2.75(2H,t),3.48-3.60(2H,m),3.64(2H,t),5.48(2H,s),7.55(1H,s)。
5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
将THF(16mL)添加至5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(800mg，1.57mmol)中。将该反应冷却至0℃，并且逐滴加入在THF中的异丙基氯化镁氯化锂复合物(1.3M；1.57mL，2.04mmol)。将反应保持在这些条件下持续30分钟。然后逐滴添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.48mL，2.3mmol)。允许该反应加温至室温并且然后在这些条件下搅拌18h。将该反应用水稀释并用乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物继续到下一个步骤而无需纯化。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)0.00(9H,s),0.05(6H,s),0.83-0.91(11H,m),1.30(12H,s),1.45-1.55(2H,m),1.55-1.69(2H,m),2.89(2H,t),3.48-3.69(4H,m),5.44(2H,s),7.54(1H,s)。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将第二代XPhos预催化剂(28mg，0.04mmol)添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(300mg，0.71mmol；根据实例12制备的)、5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(472mg，0.92mmol)和Cs2CO3(695mg，2.13mmol)在1,4-二噁烷(4mL)和水(1mL)中的脱气的混合物中。将该反应混合物在90℃下搅拌3h并且然后冷却并用饱和水性氯化钠稀释。将该混合物用乙酸乙酯(2x)萃取并且将合并的有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％甲醇的洗脱梯度纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丁基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(423mg，88％)，为淡黄色胶质(HPLC纯度：91％)。1H NMR(DMSO-d6,27℃)-0.08(6H,s),-0.05--0.02(9H,m),0.75-0.79(9H,m),0.80-0.88(2H,m),1.04-1.16(1H,m),1.20-1.40(5H,m),1.42-1.62(2H,m),1.76(6H,s),1.90(1H,d),2.54-2.67(1H,m),2.76(2H,t),3.40-3.48(2H,m),3.51-3.62(3H,m),5.48(2H,s),7.62(1H,s),7.74(1H,d),8.12(1H,s),8.40(1H,s),10.62(1H,s)。在1.04-1.16ppm处的多重峰是部分被频哪醇杂质遮蔽的。m/z:ES+[M+H]+678。
实例79和80∶(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1和异构体2
纯对映异构体。对于实例79和80该羟基的构型是未知的，但是在实例79对比实例80中是相反的
将(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(180mg，0.32mmol)使用SFC条件(柱：Chiralpak AS，5μm，21.2mm直径，250mm长度，75mL/min的流速，经8分钟)，用在CO2中20％的异丙醇洗脱拆分成非对映异构体的组分，以给出(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较快洗脱的异构体1(49mg，27％)，为清澈膜并给出(1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(4-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的较慢洗脱的异构体2(42mg，22％)，为澄清的膜。
然后如下脱保护每个异构体：将在二噁烷中的盐酸(4M；0.500mL，14.40mmol)逐滴添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1(49mg)或异构体2(42mg)在THF(2mL)中的溶液中。将所得无色溶液在室温下搅拌持续18h并且然后用EtOAc(10mL)稀释。将所得混合物用饱和的水性碳酸氢钠洗涤并用EtOAc(3x)萃取。将合并的有机层在减压下进行浓缩，并且将所得残余物吸附到硅胶上，之后通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以给出(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1(26mg，67％)或异构体2(16mg，48％)，为白色固体。实例79，异构体1：
1H HNMR(300MHz、DMSO-d6，27℃)1.01-1.20(7H，m)，1.20-1.34(3H，m)，1.67-1.85(6H，m)，1.90(1H，d)，2.58-2.66(1H，m)，3.51-3.63(1H，m)，3.88(1H，d)，4.00(1H，d)，4.68(1H，d)，5.53(1H，d)7.75(1H，d)，7.93(1H，s)，8.37(2H，d)，10.52(1H，s)。m/z:ES+[M+H]+446。实例80，异构体2：
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)1.16(7H,m),1.22-1.38(3H,m),1.72-1.83(6H,m),1.89(1H,brd),2.56-2.68(1H,m),3.47-3.66(1H,m),3.88(1H,d),4.00(1H,d),4.68(1H,d)5.53(1H,d)7.75(1H,br d),7.93(1H,s),8.37(2H,s),10.52(1H,s).m/z:ES+[M+H]+446。
分析型SFC条件：
用于制备起始材料(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-醇的制备
将NaBH4(202mg，5.33mmol)添加到5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-酮(400mg，2.66mmol；根据实例14制备的)在MeOH(12mL)中的溶液中，以给出白色混合物。将该反应在这些条件下搅拌持续1小时并且然后用水淬灭。将所得混合物用DCM(25mL)进行萃取并且然后用在氯仿中25％IPA(50mL)进一步萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，在减压下浓缩(405mg，定量)，以提供透明油。1H NMR(500MHz,DMSO-d6,27℃)1.11(6H,s),3.75(1H,d),3.91(1H,d),4.48(1H,d),5.49(1H,d),6.11(1H,d),7.42(1H,s).m/z:ES+[M+H]+153。
4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
将TBS-Cl(501mg，3.33mmol)添加到5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-4-醇(405mg，2.66mmol)、咪唑(362mg，5.32mmol)、和DCM(12mL)的溶液中，以给出白色悬浮液。将该反应在室温下搅拌持续18h并且然后用DCM(100mL)稀释并用水和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩，之后被吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度纯化以提供4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(391mg，55％)，为透明油。m/z:ES+[M+H]+267。
4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-碘-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
将NIS(330mg，1.47mmol)添加到4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(391mg，1.47mmol)在DCM(3mL)中的溶液中，以给出红色溶液。将该反应在室温下在氮气下搅拌持续18h。然后将该反应用DCM(50mL)稀释并用水和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在DCM中0至的10％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以提供4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-碘-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(350mg，61％)，为红色泡沫。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.19(3H,s),0.23(3H,s)0.87(9H,s)1.03(3H,s)1.12(3H,s)3.81(1H,d)3.96(1H,d)4.52-4.63(1H,s)7.47(1H,s).m/z:ES+[M+H]+393。
4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在0℃下将在THF中的异丙基氯化镁氯化锂复合物(1.3M；0.89mL，1.2mmol)逐滴添加到4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-碘-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(350mg，0.89mmol)在THF(2.2mL)的溶液中。然后逐滴添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.273mL，1.34mmol)。允许该反应加温至室温并且维持在这些条件下持续18h。然后将该反应用EtOAc(25mL)稀释并且用饱和水性氯化铵以及饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出粗4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(290mg，83％)，为黄色泡沫状固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.00(3H,s),0.19(3H,s),0.81(9H,s),0.92(3H,s),1.17(3H,s),1.22(6H,s),1.24(6H,s),3.70(1H,d),3.91(1H,d),4.47(1H,s),7.55(1H,s).m/z:ES+[M+H]+393。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
将碳酸铯(641mg，1.97mmol)和第二代XPhos预催化剂(52mg，0.07mmol)添加到4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(270mg，0.69mmol)和(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(276mg，0.66mmol；根据实例12制备的)在1,4-二噁烷(5.4mL)和水(1.1mL)中的脱气的混合物中。然后将反应物升温至85℃并保持在这些条件下持续18h，之后用EtOAc稀释，用水、盐水洗涤，在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(180mg，49％)，为黄色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)-0.38(3H,d),0.00(3H,s),0.71(9H,s),1.03-1.47(10H,m),1.76-2.01(7H,m),2.61-2.75(1H,m),3.51-3.72(1H,m),3.96(1H,d),4.06(1H,d),4.87(1H,s),7.79-7.87(2H,m),8.32(1H,s),8.46(1H,s),10.67(1H,br s)。
m/z:ES+[M+H]+560。
实例81：(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺
将碳酸铯(482mg，1.48mmol)和第二代XPhos预催化剂(15mg，0.02mmol)添加到5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(142mg，0.54mmol；根据实例23制备的)、(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(200mg，0.49mmol)、二噁烷(4.1mL)，以及水(0.8mL)的脱气的混合物中。将反应保持在95℃；在4h之后，添加另外的5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(100mg)。将反应保持在这些条件下持续另一个18h，冷却，并且然后用EtOAc(150mL)稀释并用水和饱和水性氯化钠洗涤。然后将有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在己烷中0至100％乙酸乙酯随后在EtOAc中0至10％MeOH的洗脱梯度纯化，以提供米色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)0.98-1.19(1H,t),1.19-1.41(9H,m),1.73-1.83(6H,m),1.90(1H,br d),2.56-2.69(1H,m),2.93(3H,s),3.50-3.64(1H,m),3.94(2H,s),7.75(1H,d),7.88(1H,d),8.28(1H,d)),8.30(1H,d),10.46(1H,s).m/z:ES+[M+H]+414。
旋光度：
用于制备起始材料(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的程序描述如下：
((1S,3R)-3-((5-氟-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将1-氯-N,N,2-三甲基丙-1-烯-1-胺(489μL，3.70mmol)逐滴添加到(1R,3S)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(660mg，2.7mmol；根据实例25制备的，用(1S,3R)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯替代(1R,3S)-苄基3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸酯)在DCM(6.3mL)的溶液中。1小时后，添加5-氟-4-碘吡啶-2-胺(587mg，2.47mmol；根据实例54制备的)和吡啶(400μL，4.9mmol)在DCM(6mL)中的溶液。在18h之后，将该反应用DCM(200mL)进行稀释并用水和饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸附到二氧化硅上，并且通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％甲醇的洗脱梯度纯化，以提供叔丁基((1S,3R)-3-((5-氟-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸酯(1.10g，96％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.02-1.18(1H,m),1.19-1.35(3H,m),1.38(10H,s),1.62-1.81(3H,m),1.82-1.94(1H,m),2.56-2.71(1H,m),3.48-3.59(1H,m),6.78(1H,d),8.25(1H,s),8.60(1H,d),10.59(1H,s).m/z:ES+[M+Na]+486。
(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的制备
在室温下将在二噁烷中的盐酸(4M；2.7mL，11mmol)添加到((1S,3R)-3-((5-氟-4-碘吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(500mg，1.08mmol)在甲醇(8.97mL)中的溶液中。在这些条件下搅拌19h后，将反应在减压下进行浓缩。将三乙胺(750μL，5.4mmol)和乙酸酐(200μL，2.2mmol)添加到所得残余物中。将该反应在这些条件下搅拌持续1小时并且然后用DCM(100mL)稀释。将所得混合物用1N水性HCl、水、以及饱和水性氯化钠进行洗涤。然后将有机层经硫酸钠干燥，过滤，并且在减压下浓缩。将所得残余物吸附到硅胶上并且通过快速硅胶层析，在己烷中0至的100％乙酸乙酯随后在乙酸乙酯中0以10％甲醇的洗脱梯度纯化，以提供(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-碘吡啶-2-基)环己烷甲酰胺(200mg，46％)，为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,27℃)1.00-1.17(1H,m),1.20-1.40(3H,m),1.71-1.82(6H,m),1.83-1.92(1H,m)2.54-2.64(1H,m)3.48-3.58(1H,m)7.76(1H,d)8.25(1H,s)8.61(1H,d)10.61(1H,s).m/z:ES+[M+H]+406。
实例82a：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺的制备
将在二噁烷中的盐酸(4M，0.27mL，1.09mmol)添加到含有7:3比率的(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺和(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.75g，1.1mmol)的未鉴定的吡唑异构体在甲醇(2mL)中的溶液中。在4h之后，将反应储存在冷冻装置中持续6天，并且然后在减压下浓缩。将所得残余物用饱和水性碳酸氢钠碱化并且将所得混合物用乙酸乙酯(x2)进行萃取。将合并的有机层用硫酸钠干燥进行，过滤，并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在乙酸乙酯中0至40％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.48g，98％)，为白色固体。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.49-0.66(m,6H),0.97-1.13(1H,m),1.27(3H,d),1.71-1.83(6H,m),1.89(1H,d),2.54-2.70(3H,m),2.93-3.06(2H,m),3.45-3.66(1H,m),4.34(0.3H,br s),4.45-4.64(0.7H,m),7.54(0.7H,br s),7.74(1H,d),7.87(0.3H,br s),8.08(1H,s),8.39(1H,s),10.55(1H,s),12.77(0.7H,br s),12.89(0.3H,br s).m/z:ES+[M+H]+448。
旋光度：
用于制备(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺和(1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(4-(5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺起始材料混合物的程序描述如下：
1-苄基-1H-吡唑-3-甲酸乙基酯的制备
在0℃下将氢化钠(在矿物油中60wt％；3.14g，78.5mmol)经3min伴随强烈的搅拌分部分添加到1H-吡唑-3-甲酸乙基酯(10g、71.4mmol)、苄基溴(12.7mL，107mmol)以及DMF(100mL)的溶液中。允许该混合物经18h加温至室温并且然后用乙酸乙酯稀释。将所得混合物用水(x3)和饱和水性氯化钠进行洗涤。将有机层然后经硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。将所得的残余物通过快速柱层析法，在己烷中0至50％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供1-苄基-1H-吡唑-3-甲酸乙基酯(11.3g，69％)，为较慢洗脱的琥珀色油。还分离了1-苄基-1H-吡唑-5-甲酸乙基酯(2.69g，16.4％)，为浅琥珀色油。
1-苄基-1H-吡唑-3-甲酸乙基酯：
1H NMR(DMSO-d6,27℃)1.28(3H,t),4.25(2H,q),5.43(2H,s),6.77(1H,d),7.23-7.42(5H,m),7.97(1H,d).m/z:ES+[M+H]+231。
1-苄基-1H-吡唑-3-甲酸的制备
将氢氧化锂(1.3g，56mmol)添加到1-苄基-1H-吡唑-3-甲酸乙基酯(11.3g，49.1mmol)在四氢呋喃(55mL)、水(19mL)、以及甲醇(19mL)中的溶液中。在这些条件下搅拌持续1.5h之后，将该反应倾倒到乙酸乙酯中，并且用水性盐酸(1N；57mL，57mmol)淬灭。将该混合物用饱和水性氯化钠洗涤，并且将有机层进行经硫酸钠干燥，过滤，并且在减压下浓缩，以给出油状白色固体。将该固体吸收在最小量DCM中，然后用在己烷中50％醚进行稀释。剧烈搅拌15分钟之后，将该混合物过滤，以提供1-苄基-1H-吡唑-3-甲酸(3.78g，38％)，为白色结晶固体。
将另外的水性盐酸(1N)添加到该合并的水层中直到混合物在pH 5。然后将合并的水层用乙酸乙酯(x3)萃取，并且将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得固体吸收在己烷中并且剧烈搅拌持续10分钟。在过滤后，将生成的结晶的白色固体在真空下进行干燥，以给出另外的1-苄基-1H-吡唑-3-甲酸(5.3g，53％)，为白色结晶固体。1H NMR(DMSO-d6,27℃)5.40(2H,s),6.69(1H,d),7.22-7.41(5H,m),7.92(1H,d),12.07-13.22(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+203。
1-溴-3-甲基丁-2-烯氯化锂的制备
遵循Samann&Knochel程序(<合成>(Synthesis)，2013，45，1870)，将在火焰干燥烧瓶内的氯化锂(1.78g，42.0mmol)在真空下用热枪干燥持续5min。当冷却时，添加锌粉(5.0g，77mmol)，随后是THF(37mL)。在剧烈搅拌5min之后，添加1,2-二溴乙烷(0.19mL，2.2mmol)并且然后是TMS-Cl(0.39mL，3.1mmol)。允许所得混合物在室温下搅拌持续2min并且然后浸入在水浴中。经30分钟逐滴添加1-溴-3-甲基丁-2-烯(4mL，35mmol)在THF(37mL)中的浅棕色溶液，并且去除该水浴。将该黑色混合物保持在这些条件下持续1.5h并且然后停止搅拌。允许将该混合物经18h沉降，并且然后直接地使用，而无需进一步纯化。
1-苄基-1H-吡唑-3-碳酰氯的制备
将两滴DMF添加到1-苄基-1H-吡唑-3-甲酸(5.26g，26.0mmol)和草酰氯(3.4mL，39mmol)在DCM(100mL)中的混合物中。在4h之后，将现在澄清的淡黄色溶液在减压下进行浓缩，并且将所得黄色-橙色油在真空下伴随加热(热枪)干燥以去除过量的草酰氯。直接使用现在的深橙色/琥珀色油而无需进一步纯化。
1-(1-苄基-1H-吡唑-3-基)-2,2-二甲基丁-3-烯-1-酮的制备
在-78℃下将在THF中的(3-甲基丁-2-烯-1-基)锌(II)溴化物氯化锂(77mL，32.5mmol)(如以上所描述的)逐滴添加到1-苄基-1H-吡唑-3-碳酰氯(5.74g，26.0mmol)在四氢呋喃(53mL)中的黄色溶液中。45分钟之后，将该反应用50％饱和水性氯化钠淬灭，并且将各层进行分离。将水层用乙酸乙酯进行萃取，并且将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得的残余物通过快速柱层析法、在己烷中0至50％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供1-(1-苄基-1H-吡唑-3-基)-2,2-二甲基丁-3-烯-1-酮(5.2g，79％)，为澄清的淡琥珀色油。将不纯的产物部分在减压下浓缩并且使用相同条件再纯化以提供另外的1-(1-苄基-1H-吡唑-3-基)-2,2-二甲基丁-3-烯-1-酮(0.81g，12％)，为淡琥珀色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)1.40(6H,s),5.02(1H,dd),5.07(1H,dd),5.43(2H,s),6.44(1H,dd),6.71(1H,d),7.25-7.40(5H,m),7.89(1H,d).m/z:ES+[M+H]+255。
1-苄基-3-(2,2-二甲基丁-3-烯-1-基)-1H-吡唑的制备
在120℃将一水合肼(5.1mL，67mmol)添加到1-(1-苄基-1H-吡唑-3-基)-2,2-二甲基丁-3-烯-1-酮(3.42g，13.45mmol)和2,2'-氧代双(乙-1-醇)(35mL，369mmol)的溶液中。然后将反应物升温至180℃并且小心地添加水性氢氧化钾(3.8mL，67mmol)并且随后添加8片KOH。1小时后，再添加4片KOH。将反应保持在这些条件下持续另一个2h并且然后冷却至室温并且用水稀释。将该混合物用醚(x3)萃取。将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得的残余物通过柱层析法，在己烷中0至30％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供1-苄基-3-(2,2-二甲基丁-3-烯-1-基)-1H-吡唑(2.72g，84％)，为澄清无色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.96(6H,s),4.85(1H,s),4.88-4.93(1H,m),5.26(2H,s),5.83-5.94(1H,m),6.02(1H,d),7.12-7.17(2H,m),7.22-7.35(3H,m),7.64(1H,d)。2H多重峰是埋在DMSO信号下。m/z:ES+[M+H]+241。3-(1-苄基-1H-吡唑-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇的制备
在-78℃下持续30分钟将臭氧鼓泡通过1-苄基-3-(2,2-二甲基丁-3-烯-1-基)-1H-吡唑(2.7g，11mmol)在甲醇(45mL)中的溶液，以得到淡黄色-绿色溶液。然后添加硼氢化钠(1.1g，28mmol)，并且允许将该反应加温至室温。15分钟之后，添加另一个200mg的硼氢化钠，并且将该反应混合物保持在这些条件下持续另外的20分钟。然后将该反应在减压下浓缩并且用浓缩的水性HCl(4.5mL)淬灭。将所得白色混合物用水和乙酸乙酯进行稀释并且用碳酸钾碱化直至pH 8。将各层进行分离并且将该水层用乙酸乙酯(x3)进行萃取。将合并的有机层用饱和水性氯化钠洗涤并且经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物吸收在DCM中并且通过快速硅胶层析，在己烷中0至100％乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化以提供3-(1-苄基-1H-吡唑-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(2.14g，78％)，为澄清无色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.78(6H,s),2.42(2H,s),3.11(2H,d),4.44(1H,t),5.26(2H,s),6.04(1H,d),7.12-7.19(2H,m),7.23-7.36(3H,m),7.65(1H,d).m/z:ES+[M+H]+245。
2,2-二甲基-3-(1H-吡唑-3-基)丙-1-醇的制备
将3-(1-苄基-1H-吡唑-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(2.10g，8.59mmol)、水性盐酸(1N；3.9mL，3.9mmol)，和在碳上20wt％Pd(OH)2(0.151g，0.21mmol)的脱气的混合物经受氢气氛围并且加热至50℃。在2h之后，将该反应在仍然热时用甲醇洗涤物进行过滤。将澄清的无色滤液在减压下浓缩为淡黄色油，然后将其再次从甲苯(x3)浓缩。这给出淡黄色胶(0.45当量HCl盐)，将其用于下一步骤中而无需进一步纯化。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.79(6H,s),2.55(2H,s),3.11(2H,s),6.18(1H,d),7.70(1H,d),9.63(1H,br s)。未观察到OH和HCl信号。m/z:ES+[M+H]+155。
3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吡唑的制备
在室温下将TBS-Cl(50重量％，在甲苯中；4.5mL，13mmol)逐滴添加到粗2,2-二甲基-3-(1H-吡唑-3-基)丙-1-醇(0.45摩尔HCl盐；1.47g，8.59mmol)和咪唑(1.75g，25.8mmol)在DCM(81mL)中的溶液中。15分钟之后，添加另外1mL的TBS-Cl在甲苯中的溶液。将白色混合物维持在这些条件下持续1.5h并且然后倾倒进饱和水性碳酸氢钠中。将各层进行分离并且将该水层用DCM(2x)进行萃取。将该合并的有机层用饱和水性氯化钠洗涤、经硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将产生的澄清无色的油通过快速硅胶层析，在己烷中0至60％的乙酸乙酯的洗脱梯度进行纯化，以提供3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吡唑(2.13g，92％)，为澄清的淡黄色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.00(s,6H),0.75(6H,s),0.86(9H,s),3.22(2H,s),5.92(1H,br s),7.08-7.67(1H,m),12.35(1H,br s).m/z:ES+[M+H]+269。
3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑化合物和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
以2：3比率分离的、未鉴定的经SEM-保护的异构体
在0℃下将氢化钠(在矿物油中60wt％；0.381g，9.52mmol)一次性添加至3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吡唑(2.13g，7.93mmol)在DMF(11mL)中的溶液中。5min之后，逐滴加入(2-(氯甲氧基)乙基)三甲基硅烷(SEM-Cl；1.8mL，9.5mmol)。10分钟之后，添加另一个100μL的SEM-Cl连同20mg的NaH(在矿物油中60wt％悬浮液)。在最终15分钟之后，将该反应用饱和水性碳酸氢钠淬灭并且用乙酸乙酯进行稀释。将各层分离，并且将有机层用50％饱和水性氯化钠(x2)并且然后用饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩为澄清无色油。将此油通过快速硅胶层析，在己烷中0至20％乙酸乙酯的洗脱梯度纯化，以提供3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑化合物和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的未分离的混合物(2.58g，81.6％)，为2:3比率的、未鉴定的经SEM-保护的异构体，并且是澄清无色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)-0.09-(-0.05)(9H,m),0.02-0.07(6H,m),0.77-0.84(8H,m),0.89(9H,s),2.44(1.2H,s),2.65(0.8H,s),3.23(0.8H,m),3.27(1.2H,m),3.48(2H,t),5.31(1.2H,s),5.40(0.8H,s),6.05(0.6H,d),6.09(0.4H,d),7.40(0.4H,d),7.71(0.6H,d).m/z:ES+[M+H]+399
3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑化合物和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
以2：3比率分离的、未鉴定的经SEM-保护的异构体
将NIS(1.78g，7.91mmol)添加到3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑化合物和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑未鉴定的2:3混合物(2.58g，6.48mmol)在乙腈(34mL)中的溶液中。在18h之后，添加另外1.8g的NIS，并且将该反应加温至50℃。在4h后，添加另外400mg的NIS。在另外4h后，允许将该反应冷却至室温并且维持在这些条件下持续18h。然后将该反应倾倒到50％饱和水性氯化钠中并且用硫代硫酸钠滴定直到所有暗红色-琥珀色消失。将各层进行分离，并且将有机层用饱和水性氯化钠进行洗涤。然后将有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速柱层析，在己烷中0至15％乙酸乙酯的洗脱梯度纯化，以提供3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑化合物和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(2.93g，86％)，为2:3未鉴定的、SEM-保护异构体的混合物并且是浅黄色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)-0.09-(-0.05)(9H,m),0.02-0.06(6H,m),0.76-0.92(17H,m),2.45(1.2H,s),2.71(0.8H,s),3.29-3.32(0.8H,m),3.34-3.37(1.2H,m),3.50(2H,td),5.33(1.2H,s),5.47(0.8H,s),7.56(s,0.4H),7.96(0.6H,s).m/z:ES+[M+H]+525。
3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑化合物和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备
如所示以3:2比率分离的、经SEM-保护的异构体
在-78℃下将在THF中的异丙基氯化镁氯化锂复合物(1.3M；6.45mL，8.39mmol)逐滴添加到3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑化合物和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-碘-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(2.93g，5.59mmol)2:3未鉴定的混合物在THF(40mL)中的溶液中。1小时后，逐滴添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(1.8mL，8.9mmol)，并且允许将该反应在这些条件下搅拌2h。然后将该反应物浸没在冰浴(0℃)中。在另外2h之后，将该反应倾倒进饱和水性氯化铵中。将该混合物用乙酸乙酯(3x)萃取，并且将合并的有机层用硫酸钠进行干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在己烷中0至10％乙酸乙酯的洗脱梯度，经20min进行纯化，以提供3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的已鉴定的3:2混合物(2.37g，80％)，为澄清无色油。1H NMR(DMSO-d6,27℃)-0.09-(-0.05)(9H,m),0.01-0.06(6H,m),0.73-0.84(8H,m),0.87-0.92(9H,m),1.24(12H,s),2.63(1.2H,s),2.85(0.6H,s),3.26(0.8H,s),3.33(1.2H,s),3.50(2H,t),5.33(1.2H,s),5.43(8H,s),7.54(4H,s),7.91(0.6H,s).m/z:ES+[M+H]+525。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺和(1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(4-(5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺的制备
以3:7比率分离的、经SEM-保护的异构体
将PdCl2(dppf)(DCM加合物；0.061g，0.07mmol)和碳酸铯(1.45g，4.46mmol)添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-碘吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.74g，1.49mmol；根据实例12制备的)，3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑和5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的3:2混合物(0.813g，1.55mmol)，1,4-二噁烷(12mL)，以及水(2.5mL)的脱气的混合物中。将该混合物加温至93℃并且保持在这些条件下持续18h。然后将该反应冷却，用乙酸乙酯稀释，并用饱和水性氯化钠洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得黑绿色残余物通过快速硅胶层析，在己烷中50％至100％的乙酸乙酯然后在乙酸乙酯中0至10％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以提供处于3:7比率的未鉴定的经SEM-保护的异构体的(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(3-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺和(1S,3R)-3-乙酰氨基-N-(4-(5-(3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-4-基)-5-氯吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.75g，73％)，为浅琥珀色玻璃状。1H NMR(DMSO-d6,27℃)-0.06-0.02(15H,m),0.61(1.7H,s),0.72(4.3H,s),0.81(6.3H,s),0.84-0.93(4.7H,m),1.04-1.22(1H,m),1.22-1.40(3H,m),1.71-1.87(6H,m),1.88-1.98(1H,m),2.58-2.73(2.4H,m),2.91(0.6H,s),3.12(0.6H,s),3.19(1.4H,s),3.55-3.67(3H,m),5.46(1.3H,s),5.57(0.7H,s),7.66(0.3H,s),7.78(1H,d),8.09(0.7H,s),8.12-8.15(0.3H,s),8.15-8.17(0.7H,s),8.42-8.44(0.7H,s),8.46(0.3H,s),10.64(1H,s).m/z:ES+[M+H]+692。
实例82：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺的制备
未知的对映异构体的混合物，因为羟基构型是未知的。
在0℃下将吡啶三氧化硫(0.30g，1.9mmol)添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.48g，1.1mmol，在实例82a中制备的)在DCM(6.8mL)和二甲亚砜(3.4mL)中的溶液中。将所得溶液维持在这些条件下持续15分钟并且然后将其倾倒到入乙酸乙酯和饱和水性氯化铵中。将各层进行分离并且将有机层用50％饱和水性氯化钠并且然后是100％饱和水性氯化钠进行洗涤。将该有机层用硫酸钠干燥，过滤，并在减压下浓缩。将所得浑浊的残余物吸收在DCM中并且通过快速硅胶层析，在乙酸乙酯中0至40％甲醇的洗脱梯度进行纯化，以提供白色泡沫状固体(460mg)。将该固体通过制备型HPLC(沃特斯XBridge苯基制备型柱，5μ硅胶，19mm直径，100mm长度)，使用水(包含0.2％NH4OH，pH 10)和甲醇的渐减极性的混合物作为洗脱液进一步纯化。将包含所希望的化合物的部分在减压下进行浓缩，以提供(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(255mg，53％)，为白色泡沫状固体。1H NMR(DMSO-d6,27℃)0.99-1.16(4H,m),1.20(3H,s),1.23-1.40(3H,m),1.73-1.83(6H,m),1.89(1H,d),2.56-2.68(1H,m),2.75(1H,d),2.95(1H,d),3.50-3.63(1H,m),5.25(1H,s),6.92(1H,br s),7.75(1H,d),8.04(1H,s),8.25(1H,s),8.36(1H,s),10.56(1H,s).m/z:ES+[M+H]+446。
实例83和84：(1R,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺和(1S，3S)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺的制备
实例83和84是纯的对映异构体。对于实例83和84的绝对构型是未知的，但是是与彼此相反。对于实例83和84两者的相对构型是反式的。
将三乙胺(0.29mL，2.1mmol)和乙酸酐(0.066mL，0.70mmol)添加到在DCM(4mL)中的外消旋反式-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.24g，0.64mmol)中。在搅拌下在室温下持续1小时后，将该混合物用水洗涤并且在减压下浓缩。将所得残余物通过快速硅胶层析，在DCM中0至10％MeOH的洗脱梯度进行纯化，以提供外消旋反式-3-乙酰氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.270g)，为无色油。将外消旋材料通过制备型HPLC(Phenomonex Lux C4柱，20μm硅胶，50mm直径，250mm长度)，使用70/30的庚烷/IPA混合物作为洗脱液以120mL/min进行拆分。将含有异构体1(较快的洗脱)和异构体2(较慢洗脱)的部分蒸发至干燥。将异构体1(114mg)通过制备型HPLC(沃特斯XBridge Prep C18 OBD柱，5μ硅胶，30mm直径，100mm长度)使用水(含有1％NH3)以及MeCN的渐减极性的混合物作为洗脱液再纯化以提供反式-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.081g，31％)的异构体1。
自该第一手性制备型纯化分离反式-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.090g，34％)的异构体2。
实例83，异构体1：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.29(6H,s),1.45-1.83(9H,m),1.86(3H,s),2.71-2.84(1H,m),2.94(2H,s),3.94(2H,s),7.54(1H,d),7.89(1H,d),8.22-8.34(2H,m),10.30(1H,s).m/z:ES+[M+H]+414。
实例84，异构体2：
1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.35(6H,s),1.44-1.92(7H,m),1.95-2.04(4H,m),2.54(1H,s),3.02(2H,s),3.94(2H,s),4.17-4.35(1H,m),5.57(1H,d),8.01(1H,d),8.08(2H,d),8.34(1H,d).m/z:ES+[M+H]+414。
分析型手性条件：
用于制备外消旋反式-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺的程序描述如下：
外消旋反式-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷-1-甲酸的制备
将外消旋反式-3-氨基环己烷甲酸盐酸盐(2.00g，11.1mmol)和N-乙基-N-异丙基丙烷-2-胺(7.9mL，44mmol)在1,4-二噁烷(16mL)和水(16mL)中的溶液冷却至0℃。然后将二-叔丁基二碳酸酯(2.67g，12.25mmol)分部分添加至该反应混合物中，允许其在添加该最终部分之后加温至室温。然后将该反应混合物冷却至0℃，并且添加2M水性盐酸以调节该pH至2。将该反应混合物用EtOAc萃取(2x 200mL)，并且将合并的有机层用水(100mL)洗涤并且经Na2SO4干燥。将所得到的混合物过滤，并且将滤液在减压下进行浓缩。将产生的白色固体在真空下干燥18h，以提供外消旋反式-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷-1-甲酸(2.73g，101％)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,30℃)1.25-1.33(1H,m),1.39(9H,s),1.45-1.61(6H,m),1.71-1.81(1H,m),2.58-2.69(1H,m),3.55(1H,br s),6.71(1H,br s),12.03(1H,br s)。
外消旋反式-(-3-胺甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
在40℃下将CDI(3.14g，19.39mmol)添加到外消旋反式-3-((叔丁氧基羰基)氨基)环己烷甲酸(1.73g，7.11mmol)在DMF(15mL)中的溶液中。将所得混合物维持在这些条件下持续4h。然后将该反应混合物冷却至0℃并且添加乙酸氨盐(3.49g，45.3mmol)。允许该反应混合物加温至室温并且搅拌另外60h。将该反应混合物倾倒入冰水中，并且将所得混合物过滤。将收集的沉淀在真空下干燥，以给出外消旋反式-(3-胺甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.95g，61％)。1H NMR(400MHz,CDCl3,30℃)1.45(9H,s),1.48-1.56(2H,m),1.62-1.78(4H,m),1.79-1.92(2H,m),2.45(1H,dt),3.84(1H,s),4.57(1H,s),5.35(1H,br s),5.66(1H,br s)。
外消旋(反式-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯的制备
将四(三苯基膦)钯(0)(0.094g，0.08mmol)添加到在1,4-二噁烷(6mL)和水(1.2mL)中的外消旋(反式-3-氨甲酰基环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.235g，0.97mmol)、3-(2-氯-5-氟吡啶-4-基)-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(0.215g，0.81mmol，根据实例25中制备)，(9,9-二甲基-9H-氧杂蒽-4,5-二基)双(二苯基磷)(0.094g，0.16mmol)和碳酸铯(0.791g，2.43mmol)中。将所得悬浮液在氮气下脱气持续10分钟，并且然后在100℃下搅拌48h。将该混合物冷却，用水(40mL)稀释，并用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机物蒸发成粗材料。将该粗产物通过快速硅胶层析，0至60％乙酸乙酯/庚烷的洗脱梯度进行纯化。将纯的部分蒸发至干燥，以提供外消旋(反式-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.322g，84％)，为白色泡沫状固体。m/z:ES+[M+H]+472。
外消旋反式-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺的制备
将三氟乙酸(2.3g，20mmol)添加到外消旋(反式-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁基酯(0.322g，0.68mmol)在DCM(10mL)中的溶液中。在15分钟之后，将该反应通过离子交换层析使用SCX柱进行纯化。将所希望的产物使用在MeOH中1M NH3从该柱进行洗脱并且将纯的部分在减压下进行浓缩以提供外消旋反式-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(0.237g，93％)，为白色的干膜。m/z:ES+[M+H]+372。
实例85：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺的制备
在氮气气氛下将5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-胺(56.7g，215.7mmol)和吡啶(0.073L，863mmol)添加到(1S,3R)-3-乙酰胺基环己烷-1-甲酸(49.9g，84％w/w，227mmol)在EtOAc(1L)中的细悬浮液中。然后经1小时缓慢添加1-丙烷膦酸酐(T3P、在EtOAc中≥50wt％；206g，324mmol)。在另外20h的搅拌后，添加水(400mL)，并且将该双相混合物再搅拌10分钟。将该有机层用饱和水性碳酸钠(300mL)和水(300mL)洗涤。将该有机层在减压下浓缩，并且将所得固体吸收于乙腈(300mL)中并在减压下再次浓缩。再次添加乙腈(450mL)，并且将所得悬浮液加热至70℃。添加晶种，并且将厚悬浮液在50℃下搅拌3h。然后将该混合物冷却至20℃并且保持在这些条件下持续3天。将该悬浮液进行过滤，并且将分离出的沉淀物用乙腈(3x 100mL)进行洗涤，并且然后在减压下在45℃下干燥。这产生(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺，为灰白色结晶固体(83.2g，90％)。1HNMR(400MHz,CDCl3,23℃)1.08-1.23(1H,m),1.33(6H,s),1.37-1.57(3H,m),1.86-2.04(6H,m),2.26(1H,d),2.38-2.52(1H,m),2.95(2H,s),3.79-3.92(1H,m),3.94(2H,s),5.51(1H,d),8.09(1H,s),8.12(1H,s),8.22(1H,s),8.24(1H,s).m/z:ES+[M+H]+430。表征与实例14一致。
将自实例85获得的晶体通过XRPD进行分析，证实了该固体仅仅包含先前在实例14中表征的形式A。
用于制备起始材料5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-胺和(1S,3R)-3-乙酰胺基环己烷-1-甲酸的程序描述如下：
顺式-3-(异丙氧基羰基)环己烷氯化铵的制备
将盐酸(在2-丙醇中5至6M；16mL)添加至3-氨基苯甲酸(10g，73mmol)在2-丙醇(100mL)中的悬浮液中。然后添加铑(在Al2O3上5％，0.75g，0.36mmol)，并且使该混合物在100℃下经受氢气氛(8巴)持续3天。添加另外的盐酸(在2-丙醇中5至6M；5mL)，并且将该混合物在70℃下在密封钢容器中搅拌持续另外的2天。然后将该混合物通过
使用2-丙醇(2x 10mL)和水(2x 20mL)洗涤物过滤。将该滤液在减压下浓缩，以给出白色固体。将该固体用2-丙醇(50mL)处理并在减压下再次浓缩，之后悬浮在100mL的热(70℃)乙酸异丙酯中。将该混合物缓慢冷却至20℃并且然后搅拌另外的15分钟。将该混合物过滤，并将收集的固体用乙酸异丙酯(3x 30mL)进行洗涤并且在减压下干燥，以给出顺式-3-(异丙氧基羰基)环己烷氯化铵(7.5g，46％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,D2O,23℃)1.27(6H,d),1.30-1.57(4H,m),1.90-2.14(3H,m),2.28(1H,d),2.52(1H,tt),3.20-3.36(1H,m),5.01(1H,七重峰)。
顺式-异丙基3-氨基环己烷甲酸酯的制备
在20℃下将氢氧化钠(2.72g，68.1mmol)在水(20mL)中的溶液缓慢添加至顺式-3-(异丙氧基羰基)环己烷氯化铵(14.0g，62mmol)在水(50mL)和i-Pr乙酸酯(150mL)中的混合物中直到获得pH 10.9。将该水层用i-Pr乙酸酯(2x 50mL)萃取并且将合并的有机层在减压下进行浓缩。将所得残余物从乙酸异丙酯(2x 20mL)再次浓缩，以提供顺式-异丙基3-氨基环己烷甲酸酯，为无色非粘性油(11.86g，100％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3,20℃)0.83-0.97(1H,m),0.82-1.27(5H,m),1.11(6H,d),1.67-1.82(3H,m),1.93-2.02(1H,m),2.18(1H,tt),2.56(1H,tt),4.88(1H,七重峰)。
(1S,3R)-异丙基3-乙酰胺基环己烷甲酸酯的制备
将诺维信(NOVOZYM)435(3g，购自丹麦的诺维信公司(Novozymes A/S Denmar)(活性10000PLU/g))添加到顺式-异丙基3-氨基环己烷甲酸酯(59.4g，298mmol)在乙酸异丙酯(480mL)中的澄清溶液中。将该混合物在20℃搅拌12h并且然后过滤。将收集的沉淀物用乙酸异丙酯(150mL)洗涤，并且将滤液用水性盐酸(2M；200mL)进行洗涤。将该水层用乙酸异丙酯(3x 150mL)萃取，并且将合并的有机层再次过滤并在减压下浓缩为白色固体(43g)。将该固体吸收在乙酸异丙酯(2x 200mL)中并在减压下再次浓缩。将所得残余物溶解在乙酸异丙酯(400mL)中并且用饱和水性碳酸钠(50mL)洗涤。将该水层用乙酸异丙酯(100mL)萃取，并且将合并的有机层用水(50mL)进行洗涤并在减压下浓缩为白色固体。将该固体吸收在乙酸异丙酯(2x 100mL)中并且再次在减压下再浓缩。将所得残余物用环戊基甲基醚(70mL)和环己烷(140mL)处理。这提供了悬浮液，将其加热至70℃。获得了均匀的溶液，其在冷却至20℃时变成混合物。在50℃下添加晶种。将所得悬浮液搅拌持续2天，随后过滤并用在环己烷中33％环戊基甲基醚(2x 30mL)洗涤该固体。在减压下干燥之后，获得(1S,3R)-异丙基3-乙酰胺基环己烷甲酸酯(26.8g，40％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,20℃)1.01-1.13(1H,m),1.20(6H,d),1.22-1.45(3H,m),1.77-1.93(3H,m),1.94(3H,s),2.12-2.26(1H,m),2.37(1H,tt),3.70-3.91(1H,m),4.96(1H,p),5.67(1H,d)。
分析型SFC条件：
保留时间：
1.9min，(1R,3S)-异丙基3-乙酰胺基环己烷甲酸酯
2.7min，(1S,3R)-异丙基3-乙酰胺基环己烷甲酸酯
e.e.
99.9％，(1S,3R)-异丙基3-乙酰胺基环己烷甲酸酯
(1S,3R)-3-乙酰胺基环己烷甲酸的制备
将水性氢氧化钠(3.8M；3.9mL，14.8mmol)的溶液在氮气气氛下添加至(1S,3R)-异丙基3-乙酰胺基环己烷甲酸酯(1.71g，7.37mmol)在MeOH(3mL)中的溶液中。将该混合物在20℃搅拌1小时，并且然后将水性盐酸的溶液(3.8M；4.5mL)添加至该混合物中，直到实现pH1。添加乙酸乙酯(10mL)，并且分离各层。将水层用乙酸乙酯(4x 10mL)进行萃取。将合并的有机层在40℃下在降低的压力下浓缩。将所得残余物从乙酸乙酯(2x 10mL)再浓缩以提供氯化钠污染的(1S,3R)-3-乙酰胺基环己烷甲酸(1.4g，94％；92wt％)，为白色固体。1H NMR(400MHz,CD3OD,20℃)1.08-1.47(4H,m),1.78-1.99(6H,m),2.12(1H,d),2.3-2.45(1H,m),3.58-3.74(1H,m).m/z:ES+[M+H]+186。
3-溴-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑
在氮气气氛下向反应器中装入5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(79.5g，525mmol；根据实例14制备的)和CH2Cl2(800mL)。经15分钟分部分地添加NBS(95.4g，533mmol)。在添加过程中将该反应温度保持在20℃和23℃。在20℃下搅拌0.5h后，添加水性8wt％Na2SO3溶液(250mL)，并且将该双相混合物在这些条件下搅拌45分钟。将该有机层用饱和水性碳酸钠(1x 250mL，1x 200mL)和水(100mL)洗涤。然后将有机层在30℃和400毫巴下在减压下浓缩。将所得残余物从THF(3x 100mL)再浓缩，以提供3-溴-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(138g，99％；通过NMR强度分析81wt％)，为淡棕色油。将这种材料用于下一步骤中而无需进一步纯化。1H NMR(400MHz,CDCl3,20℃)1.29(6H,s),2.64(2H,s),3.89(2H,s),7.41(1H,s)。
5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑的制备
在-70℃，在氮气气氛下、在装备有温度计的3L的3-颈烧瓶中，将丁基锂(在己烷中2.5M；0.309L、774mmol)的溶液缓慢添加至3-溴-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(137g，516mmol；81wt％)和三异丙基硼酸盐(0.21L，929mmol)在THF(0.7L)和甲苯(0.7L)中的溶液中。在添加过程中将该反应温度保持在-65℃至-70℃。添加完成之后，经10分钟添加2,3-二甲基丁烷-2,3-二醇(91g，774mmol)在甲苯(0.5L)中的溶液。缓慢地允许该混合物在冰浴中达到室温在并且然后搅拌另外18h。将该反应混合物转移到含有10℃冷的饱和水性氯化铵溶液(2.5L)的5L反应器中。将该双相混合物在20℃下搅拌15分钟，并且将该有机层用水(2x 500mL)洗涤，随后在35℃下浓缩，以提供5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑，为淡黄色固体(194g，92％；通过NMR强度分析64wt％)。将这种材料用于下一步骤中而无需进一步纯化。1HNMR(400MHz,CDCl3,20℃)1.21(6H,s),1.26(12H,s),2.77(2H,s),3.84(2H,s),7.74(1H,s).m/z:ES+[M+H]+263。
5-氯-4-碘吡啶-2-胺的制备
将溶解在NMP(200mL)中的5-氯-2-氟-4-碘吡啶(90g，350mmol)添加至浓水性氢氧化铵(aq.26％；298g，4.54mol)的10℃溶液中。在添加过程中将该反应温度保持在低于10℃。将该容器密封并且然后加温至100℃。在18h之后，将该混合物冷却至室温，在这之后获得悬浮液。将该粗混合物与在相同条件下自8g(31mmol)的5-氯-2-氟-4-碘吡啶起始进行的小规模实验中所获得的粗混合物合并。添加MTBE(500mL)和水(200mL)。将各层进行分离并且将该水层用MTBE(2x 250mL)进行萃取。将合并的有机层用水(100mL)进行洗涤并且然后在减压下浓缩为米色固体。将该固体在减压下从MTBE(2x 200mL)再浓缩以去除残余水。然后将该粗制的混合物使用旋转蒸发器溶解在热的(65℃)甲苯(400mL)中。然后允许该混合物缓慢达到45℃，在这之后添加晶种。允许所得到的悬浮液缓慢地冷却至10℃并且然后在这些条件下再搅拌18h。将该悬浮液过滤并且将收集的固体用冰冷的甲苯(2x 70mL)洗涤。这产生5-氯-4-碘吡啶-2-胺(63.8g，65.9％)，为无色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,20℃)6.23(2H,s),7.04(1H,s),7.92(1H,s)。
5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-胺的制备
将碳酸钾(81g，582.6mmol)和Pd(dppf)Cl2(3.41g，4.66mmol)顺序地添加到5-氯-4-碘吡啶-2-胺(59.9g，233mmol)和5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(64wt％；110g，268mmol)在乙腈(500mL)和水(500mL)中的脱气的混合物中。将澄清的淡红色双相混合物加热至50℃。在剧烈搅拌2h之后，添加附加的Pd(dppf)Cl2(1.0g，1.4mmol)，并且将该混合物在这些条件下搅拌另外20h。然后将该混合物冷却至20℃并且添加乙酸乙酯(450mL)。将各层分离，并且将有机层用水(200mL)进行洗涤。然后将Pd-清除剂硅环(SilaMetS)-硫醇、(目录号R51030B；20g)添加该有机层中，并且将混合物在20℃下进一步搅拌2h。然后将该混合物过滤并在减压下浓缩为棕色固体。将该固体溶解在DCM(100mL)中，并且然后将该溶液通过硅胶短垫过滤，用在CH2Cl2中5％的2-丙醇洗脱。将产物部分在减压下进行浓缩以给出棕色固体。添加甲基异丁基酮(MIBK、250mL)，并且将所得悬浮液加热至70℃并且然后缓慢冷却至20℃。将所得到的悬浮液在这些条件下搅拌持续18h并且然后过滤，用甲基异丁基酮(5x 30mL)洗涤，以提供5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-胺，为淡粉色固体(50.7g，193mmol)。1H NMR(400MHz,CDCl3,20℃)1.28(6H,s),2.81(2H,s),3.91(2H,s),4.56(2H,br s),6.41(1H,s),7.83(1H,s),8.03(1H,s).m/z:ES+[M+H]+263。
实例86：(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺的制备
将4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-胺(31.8g，129mmol)和吡啶(43.9mL，517mmol)在氮气气氛下在20℃添加至(1S,3R)-3-乙酰胺基环己烷-1-甲酸(29.9g，136mmol；84wt％，根据实例85制备的)在EtOAc(800mL)中的悬浮液中。经40分钟添加T3P(在EtOAc中≥50wt％；123g，194mmol)，并且将所得混合物在这些条件下搅拌21h。然后添加水(400mL)。将该双相混合物搅拌10分钟，并且分离各层。将该有机层用饱和水性碳酸钠(300mL)和水(300mL)洗涤，之后过滤并且在减压下浓缩以给出深棕色半-固体。添加乙腈(250mL)，并且将该混合物加温至70℃，在这之后获得它的均匀的棕色溶液。允许将该混合物达到60℃，添加另外的乙腈(200mL)，并且将浆液在这些条件下再搅拌2h，之后允许缓慢冷却至20℃。将所得到的悬浮液搅拌3天，随后过滤并且用CH3CN(250mL)洗涤该固体。在干燥之后在减压下在48℃下持续20h，获得(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺(49.2g，119mmol)，为灰白色结晶固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,20℃)1.08-1.23(1H,m),1.33(6H,s),1.37-1.58(3H,m),1.88-1.94(1H,m),1.96-2.01(5H,m),2.26(1H,d),2.38-2.42(1H,m),3.00(2H,s),3.80-3.91(1H,m),3.93(2H,s),5.47(1H,d),8.00(1H,d),8.09-8.17(2H,m),8.31(1H,d).m/z:ES+[M+H]+414。与在实例25中的表征一致
将通过描述于实例86中的程序获得的(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺晶体通过XRPD进行分析。将结果在下面列表并且在图5中示出，证实了该固体仅仅包含形式B。
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺，形式B的主峰在下表3中示出：
| 峰 | 2θ | 强度％ |
| 1 | 8.3 | 100.0(vs) |
| 2 | 11.0 | 12.6(s) |
| 3 | 13.1 | 13.5(s) |
| 4 | 16.6 | 51.0(vs) |
| 5 | 19.4 | 42.7(vs) |
| 6 | 20.4 | 11.7(s) |
| 7 | 22.3 | 68.0(vs) |
| 8 | 27.0 | 17.1(s) |
| 9 | 27.2 | 22.0(s) |
| 10 | 28.6 | 32.1(vs) |
根据本发明，提供了一种晶体形式，形式B，具有在约2-θ＝8.3°，11.0°，13.1°，16.6°，19.4°，20.4°，22.3°，27.0°，27.2°以及28.6°下的特异峰的X射线粉末衍射图。DSC分析指示该形式B以191℃处的开始点以及在193℃的峰熔融。TGA表明形式B在从22℃加热至210℃时展现出约1.6％的质量损失。代表性DSC/TGA热谱图示于图6中。
形式A至形式B的转化率
将100mg的(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺、形式A(分离自实例25)添加20mL小瓶中。向该小瓶中添加2.0mL的丙酮以获得悬浮液。将所得浆液在环境温度下搅拌过周末并且然后在空气中通过蒸发干燥。将所获得的白色固体进行表征并且鉴定为(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺，形式B。
用于制备起始材料4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-胺的程序描述如下：
5-氟-4-碘吡啶-2-胺的制备
向5L钢氢化容器中装入氨水(26％；777g，11.9mol)和2,5-二氟-4-碘吡啶(220g，913mmol)。将该混合物冷却至5℃并且经几分钟缓慢添加NMP(500mL)(气体释放)。将该容器密封并且然后将该反应混合物加热至100℃。在36h之后，将该反应温度降低至90℃，并且将该反应保持在这些条件下持续3.5天。然后将该混合物冷却至5℃，并且添加MTBE(1L)和水(500mL)。将该水层用MTBE(2x 500mL)萃取，并且将合并的有机层用水(200mL)进行洗涤，过滤，并在减压下浓缩。将产生的淡黄色固体从MTBE(2x 500mL)再浓缩，并且然后添加甲苯(400mL)。将所得混合物加热至70℃，并且获得均匀的棕色溶液。缓慢添加庚烷(500mL)。然后允许均匀溶液在水浴中缓慢达到18℃，一旦该混合物达到42℃就添加晶种。将该混合物在这些条件下搅拌过夜。将该悬浮液过滤，并且将收集的固体用庚烷中45％甲苯(200mL)进行洗涤，随后通过在40℃减压下干燥，以提供5-氟-4-碘吡啶-2-胺(111g，51％)，为淡灰色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,20℃)4.52(2H,br s),6.89(1H,d),7.79(1H,s)。
4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-胺的制备
将碳酸钾(63.1g，457mmol)和Pd(dppf)Cl2(2.67g，3.66mmol)在氮气下顺序地添加到5-氟-4-碘吡啶-2-胺(43.5g，182.8mmol)和5,5-二甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑(86g，210mmol；64wt％，根据实例85制备的)在乙腈(400mL)和水(400mL)中的脱气的混合物中。将淡红色双相混合物加热至50℃并且剧烈搅拌5h。将该反应冷却并且然后添加乙酸乙酯(400mL)。将各层分离，并且将有机层用水(200mL)进行洗涤。将Pd-清除剂硅环(SilaMetS)-硫醇、(目录号R51030B，10g)添加到该有机层中，并且然后将该混合物在20℃下搅拌过夜。将该混合物过滤，并且将滤液在减压下浓缩，以提供棕色固体。添加异丙醇(200mL)，并且将该混合物加热至70℃，其给出均匀的深棕色溶液。然后允许该混合物缓慢冷却至20℃并且然后搅拌15h。将所得到的悬浮液进行过滤并且将收集的固体用冷(4℃)异丙醇(3x 30mL)进行洗涤，以提供4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-胺(32g，71％)，为淡棕色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3,20℃)1.34(6H,s),2.91(2H,s),3.95(2H,s),4.30(2H,s),6.51(1H,d),7.89(1H,s),7.93(1H,d).m/z:ES+[M+H]+247。
将在此引用的所有参考文献，包括专利、专利申请、论文、教科书和类似物，以及其中引用的参考文献，在尚未被结合在此的程度上，出于所有目的以其全部内容特此通过引用结合在此。
Claims (43)
1.一种具有化学式I的化合物：
其中：
A是C(R5)或N；
R5是H、C1-3烷基、CN或卤素；
R2是3-7元杂环烷基或3-7元环烷基；任选地被一至三个取代基取代，这些取代基独立地选自由以下各项组成的组：NH2、NHC(O)R10 、NHC(O)OR10和OH；
R10，在每次出现时，独立地是选自下组，该组由以下各项组成：3至6元环烷基或杂环烷基基团、C1-6烷基、-O-C1-6烷基和OH；其中每个上述R10的烷基、环烷基以及杂环烷基基团可以进一步被一个或两个独立地选自以下项的取代基取代：CN、OH和C1-3烷基；
R4是
或
其中X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5至7元杂环烷基环，该环除了桥氮之外可以包含一个或两个选自N和O的杂原子，该环是饱和的；其中该环可以在环碳上被一个或两个R10取代基取代或可以在环氮上被R12取代基取代；
J是N或CR11；并且
R11是H；
R12是C1-6烷基，或其药学上可接受的盐。
2.如权利要求1所述的化合物，其中A是C(R5)。
3.如权利要求2所述的化合物，其中R5是氯。
4.如权利要求2所述的化合物，其中R5是氟。
5.如权利要求1所述的化合物，其中R2是3-7元环烷基。
6.如权利要求1所述的化合物，其中R2是3-7元环烷基，该环烷基被NHCOR10取代。
7.如权利要求6所述的化合物，其中R2选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基和环庚基。
8.如权利要求7所述的化合物，其中R2选自环戊基以及环己基。
9.如权利要求8所述的化合物，其中R2是被NHCOR10取代的环己基。
10.如权利要求1所述的化合物，其中R2是3-7元杂环烷基。
11.如权利要求10所述的化合物，其中R2是被NHCOR10取代的3-7元杂环烷基。
12.如权利要求1所述的化合物，其中R4是
。
13.如权利要求12所述的化合物，其中J是C(R11)。
14.如权利要求13所述的化合物，其中R11是H。
15.如权利要求1所述的化合物，其中X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
16.如权利要求15所述的化合物，其中X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成包含另外的杂原子的6元杂环烷基环，该杂原子是氧。
17.如权利要求15所述的化合物，其中X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成包含另外的杂原子的6元杂环烷基环，该杂原子是氮。
18.如权利要求1所述的化合物，其中X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
19.如权利要求18所述的化合物，其中X和Y连同它们附接至其上的原子形成5元杂环烷基环，其中一个CH2是被两个甲基基团取代的。
20.如权利要求1所述的化合物，其中X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成7元杂环烷基环。
21.如权利要求1所述的化合物，其中：
A是C(R5)；
R2是3-7元环烷基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
22.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是卤素；
R2是3-7元环烷基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
23.如权利要求22所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是3-7元环烷基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
24.如权利要求22所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氟；
R2是3-7元环烷基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
25.如权利要求1所述的化合物，其中：
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是环己基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
26.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是卤素；
R2是3-7元环烷基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
27.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是卤素；
R2是环己基
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
28.如权利要求27所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是环己基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
29.如权利要求1所述的化合物，其中：
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
30.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R4是
；并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
31.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
；
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成6元杂环烷基环。
32.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
；
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成5元杂环烷基环。
33.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
；
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成哌啶环。
34.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
；
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成哌嗪基环。
35.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
；
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成吗啉基环。
36.如权利要求1所述的化合物，其中
A是C(R5)；
R5是氯；
R2是被NHC(O)R10取代的环己基；
R10是C1-6烷基；
R4是
；
J是C(R11)并且R11是H；
并且
X和Y连同它们附接至其上的原子一起形成吡咯烷基，其中一个CH2被两个甲基基团取代。
37.一种选自以下各项的化合物：
(R)-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)哌啶-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
顺式-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺；
(R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)哌啶-3-甲酰胺；
顺式-3-羟基-N-(4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环丁烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡唑并[5,1-b][1,3]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-((S)-2-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺；
(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
顺式-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺；
顺式-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺；
反式-3-羟基-N-(6-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)嘧啶-4-基)环丁烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(6-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)嘧啶-4-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-(2-氰基乙酰胺基)环己烷甲酰胺；
((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氨基甲酸叔丁酯；
(1S,3R)-3-氨基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)-3-甲基氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺；
(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)-3-((S)-2-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺；
(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氰基-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(S)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺；
(R)-N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)四氢呋喃-2-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环戊烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢-[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(3-羟基丙酰胺基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(顺式-3-羟基环丁烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺
(1S,3R)-3-氨基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺；
(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)-3-(1-羟基环丙烷甲酰胺基)环己烷甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
顺式-N-(5-氯-4-(6,6-二甲基-6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-a]咪唑-3-基)吡啶-2-基)-3-羟基环丁烷甲酰胺；
反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
反式-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂䓬-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-甲氧基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氟-4-(5,6,7,8-四氢-4H-吡唑并[1,5-a]氮杂䓬-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)-3-(2-羟基乙酰胺基)环己烷甲酰胺；
N-((1R,3S)-3-((4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-甲基吡啶-2-基)氨甲酰基)环己基)氧杂环丁烷-3-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-甲基-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(7-羟基-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(4-羟基丁基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体1；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的异构体2；
(1R,3S)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺；
(1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(6-羟基-5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺；
(1R,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺；以及
(1S,3S)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷-1-甲酰胺，或其药学上可接受的盐。
38. (1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的一种晶体形式，其特征在于在其X射线粉末衍射图中在2-θ = 约5.5°、6.8°、13.6°、16.1°、20.5°、21.2°、21.6°、22.8°、26.7°、27.4°下的特异峰。
39. (1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(5-氯-4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的一种晶体形式，其特征在于在其X射线粉末衍射图中在2-θ = 约5.9°、7.0°、9.4°、10.5°、11.5°、11.7°、17.6°、18.0°、20.2°和21.0°下的特异峰。
40. (1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的一种晶体形式，其特征在于在其X射线粉末衍射图中在2-θ = 约8.8°、10.1°、11.5°、18.9°、20.0°、20.5°、21.8°、22.8°、23.9°以及25.2°下的特异峰。
41. (1S,3R)-3-乙酰胺基-N-(4-(5,5-二甲基-5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑-3-基)-5-氟吡啶-2-基)环己烷甲酰胺的一种晶体形式，其特征在于在其X射线粉末衍射图中在2-θ = 约8.3°、11.0°、13.1°、16.6°、19.4°、20.4°、22.3°、27.0°、27.2°以及28.6°和25.2°下的特异峰。
42.一种药物组合物，包含如权利要求1-41中任一项所述的化合物。
43.有效量的如权利要求1-41中任一项所述的化合物在制备用于治疗癌症的药物中的用途。
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Legal Events
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| GR01 | Patent grant | ||
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