CN107727874B - 使用先前检验的残余材料反射检验样本 - Google Patents

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Abstract

本申请涉及使用先前检验的残余材料反射检验样本。本文中公开的实施方式涉及进行自动测定的方法和系统，并且具体涉及在自动仪器上对样本进行连续测定。

Description

使用先前检验的残余材料反射检验样本
本申请是分案申请，原申请的申请日为2013年3月13日，中国申请号为201380030559.2，国际申请号为PCT/US2013/031072，发明名称为“使用先前检验的残余材料反射检验样本”。
技术领域
本文中公开的实施方式涉及进行诸如核酸检验测定的连续、自动测定的方法和系统。
背景技术
样本的分子检验自动化已经愈加普遍，部分原因是因为自动化可以减少从样本收集到得到结果的时间量，可以最小化实验变异性并且可以减少对训练有素的技术人员的需求。除了在诊断学领域中的益处，处理和检验样本的自动化已经推进了高通量检验。样品和或样本处理的自动设备通常包括硬件和耗材。因此，期望最大化分子检验的自动化，同时最小化所用耗材的量。
描述的实施方式提供改进的自动样品和/或样本检验，其可以有利地用于临床和研究环境中。
发明内容
本技术涉及进行如核酸检验测定的连续测定的方法和系统。一些实施方式涉及在自动仪器上进行的一个或多个样品的连续测定。在本文所提出的技术的一些实施方式中，提供进行多个样本自动测定的方法，其允许在自动仪器上测定多个样品的提高的可靠性和易用性。所述方法可包括a)提供被配置以根据一个或多个各自测定工作流程接收和处理多个样本的自动仪器，所述样本来自一种或多种目标分析物的多个样品；b)提供多个所要检验的样本；c)自动将所要检验的多个样本的每一个的第一部分转移至包含用于第一目标分析物的第一检验的试剂的各自多个第一容器；d)自动对多个样本的所述部分进行第一检验，以根据第一测定工作流程确定第一目标分析物的存在；e)从多个样本中选择子集样本，其中确定了第一目标分析物的存在；f)自动将来自e)的所选样本子集的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的第二容器，以根据第二测定工作流程确定第二目标分析物的存在；和g)自动对所选样本子集的第二部分进行第二检验。
在一些实施方式中，多个样本的每一个包括来自各自多个样品的分离核酸的预处理溶液。在一些实施方式中，自动仪器自动处理多个样品以获得包含分离核酸的各自多个样本。
在一些实施方式中，对于每一个样本，样本和包含用于第一检验的试剂的第一容器位于第一检验条板上，并且使得步骤f)进一步包括将样本的第二部分自动转移至位于第二检验条板上的包含用于第二检验的试剂的第二容器。
在一些实施方式中，步骤e)进一步包括e1)确认用于第二检验的多个第一检验条板的子集；和e2)对于子集中每一个第一检验条板，提供包括容器的相应第二检验条板，所述容器包含用于第二分析物的第二检验的试剂。
在一些实施方式中，第二检验条板包括至少一个移液器头。在一些实施方式中，方法包括在步骤f)之前，将附加液体添加至样本。
在一些实施方式中，对于每一个样本，样本、第一容器和用于第二容器的插孔位于单个检验条板上。在一些实施方式中，方法包括，在步骤e)之前的步骤d1)和d2)，d1)确认用于第二分析物检验的多个第一检验条板的子集；和d2)对于子集中的每一个检验条板，在所述插孔中提供包含用于第二检验的试剂的第二容器。
在一些实施方式中，方法包括，在步骤f)之前，提供移液器头的步骤，所述移液器头被配置以将样本的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的第二容器。
在一些实施方式中，移液器头可以是例如未用过的移液器头或洗过的移液器头。在一些实施方式中，方法包括在步骤f)之前，将附加液体添加至包含的样本的步骤。
在一些实施方式中，第一或检验包括选自以下的反应：聚合酶链式反应(PCR)、转录介导的扩增(TMA)、寡核苷酸连接测定(OLA)、连接酶链式反应(LCR)、滚环扩增(RCA)、链置换扩增(SDA)和杂交反应。
在一些实施方式中，方法进一步包括将检验条板上的确认标记与存储在仪器上的一套测定-特异性确认数据相比较的步骤。
本文还提出用于对来自各自多个样品的多个样本进行自动测定的系统，所述系统包括被配置以根据一个或多个测定工作流程接收和处理多个样本的自动仪器；所述仪器包含多个检验条板；处理器；存储容量；和进行自动测定的程序，所述程序包括指令a)提供被配置以根据一个或多个测定工作流程接收和处理多个样本的自动仪器，所述仪器包含多个检验条板；b)自动将每一个样本的第一部分转移至包含用于第一检验的试剂的各自多个第一容器；c)进行第一检验以确定第一目标分析物的存在；d)自动将样本或选择的样本子集的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的各自第二容器；和e)进行样本或所选样本子集的第二部分的第二检验，以确定第二目标分析物的存在。
在以上系统的一些实施方式中，程序进一步包括自动从多个样品中分离核酸以获得包含分离核酸的各自多个样本的指令。
在以上系统的一些实施方式中，对于每一个样本，样本和包含用于第一检验的试剂的第一容器位于第一检验条板上，且其中步骤e)包括自动将提取的核酸溶液的一部分转移至位于第二检验条板上的第二主混合管。
在以上系统的一些实施方式中，对于每一个样本，样本、第一容器和用于第二容器的插孔位于单个检验条板上，其中程序包括用于以下步骤的指令：d1)确认用于第二分析物检验的多个第一检验条板的子集；和d2)对于子集中的每一个检验条板，在插孔中提供包含用于第二检验的试剂的相应第二容器。
本文中还提出对多个样品进行反射(reflex)检验的方法，所述方法包括a)提供多个所要检验的样品；b)处理多个样品以获得各自多个样本；c)将所要检验的多个样本的每一个的第一部分转移至各自多个第一容器，所述容器包含用于第一目标分析物的第一检验的试剂；d)对多个样本的所述部分进行第一检验以确定第一目标分析物的存在；e)从多个样本中选择子集样本，其中确定了用于反射检验的第一目标分析物的存在；f)将来自e)的所选样本子集的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的第二容器，以确定第二目标分析物的存在；和g)对所选样本子集的第二部分进行第二检验。
在以上方法的一些实施方式中，第一检验包括用于同步检测抗二甲氧基苯青霉素的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和金黄色葡萄球菌的检验，且其中第二检验包括用于检测莫匹罗星抗性的决定子的检验。在一些实施方式中，莫匹罗星抗性的决定子包括mupA基因。
本文中还提出对样品进行反射检验的方法，所述方法包括a)提供所要检验的样品；b)处理样品以获得各自样本；c)将所要检验的样本的第一部分转移至包含用于第一目标分析物的第一检验的试剂的第一容器；d)对样本的第一部分进行第一检验以确定第一目标分析物的存在；f)如果在样本的第一部分中检测到第一目标分析物，则将样本的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的第二容器以确定第二目标分析物的存在；和g)对样本的第二部分进行第二检验。
在以上方法的一些实施方式中，第一检验包括用于同步检测抗二甲氧基苯青霉素的金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的检验，且其中第二检验包括用于检测莫匹罗星抗性的决定子的检验。在一些实施方式中，莫匹罗星抗性的决定子包括mupA基因。
附图说明
图1显示根据一种实施方式的检验条板。
图2显示根据一种实施方式的检验条板。
图3显示根据一种实施方式的放置于条板载体中的多个检验条板。
具体实施方式
本文所用的标题部分只是用于编排目的，不理解为以任何方式限制所描述的主题。本申请中所引用的所有文献和类似资料，包括但不限于专利、专利申请、文章、书籍、协议和互联网网页，不管此类文献和类似资料的形式如何，都以全文通过引用明确并入本文，用于任何目的。在并入的文献和相似资料的一种或多种以其与本申请中对术语的定义相矛盾这样的方式对该术语定义或使用的情况下，以本申请为准。虽然结合各种实施方式来描述本教导，但并无意图将本教导限制于此类实施方式。相反，如本领域技术人员将理解的，本教导涵盖了各种替代、修改和等同物。
能够并行处理和检验多个样品和/或样本的自动诊断仪器已经得到描述。这些设备可以有利地用于高通量中以推进样品和/或样本制备和检验。举例来说，自动诊断仪器可以制备用于核酸扩增测定等诊断测定的样本，以及进行扩增和检测。
就本质而言，诊断检验是假设驱动的。当实施假设驱动的检验，如检验样本的特定分析物时，检验的结果可以导致期望检验另一个目标，即，反射检验。然而，很多时候其仅仅有用于检验原始样本的子集，且检验所有的样本将不节省成本。举例来说，在临床环境中，可能期望检验一种或多种病原体的样品。如果检验揭示了特定病原体的存在，可期望进行进一步的检验，例如，确定抗生素抗性决定子的存在。例如从样品的分析物检验为阳性、指示特定病原体存在的患者中获得用于进一步检验的附加样品，可能是困难的且可能延迟期望的进一步检验。除了获得用于检验的多个样品的潜在困难之外，如果正在检验多个样品，将从用于检验(例如，核酸检验)的样品制备而来的患者样品或样本转移至新的反应容器的手动途径可能容易出错，并且为效率低下和劳动密集型的。进一步，当样品需要在检验之前处理时，期望最小化处理相关的成本(例如试剂等)。因此，对以自动方式进行反射检验的改进方法存在很大的需求。
因此，“反射检验”是指随后的检验(例如第二检验)，其基于先前的检验(例如第一检验)获得的结果进行。第一检验和反射检验的非限制性实施例包括，例如抗二甲氧基苯青霉素的金黄色葡萄球菌MRSA和二甲氧基苯青霉素敏感的金黄色葡萄球菌(MSSA)的第一检验。对于MRSA或MSSA检验为阳性的样本，也可能期望确定样本是否包含莫匹罗星(抗生素)抗性的决定子。由于莫匹罗星抗性通常只与MRSA或MSSA阳性的样本有关，检验MRSA和MSSA阴性样本的莫匹罗星抗性常常不节省成本。在本文公开的实施方式中有用的各种检验和反射检验在下面进一步详细讨论。
本文提出的方法和系统有利地使用来自初始检验的残余材料而不需要从患者获得的新样品。例如，使用已经得到高度处理且需要少许的额外努力来实施反射检验的残余材料可能是尤其有利的。
样品和样本
本文中公开的实施方式可用于使用自动分子测定检验样品。如本文所使用的，术语“样品”可以指来自以下一个或任何数量的来源的临床样品或样本：包括，但不限于，几乎任何生物体的体液(包括，但不限于，血液、尿、血清、淋巴、唾液、肛门和阴道分泌物、汗、腹膜液、胸膜液、渗出液、腹水、脓性分泌物、灌洗液、引流液、刷片细胞学样品、活检组织、外植医疗设备、感染导管、脓、生物膜和精液)，以及发现用在本发明中的哺乳动物样本，尤其是人的样本，及环境样本(包括，但不限于，空气、农业、水和土壤样本)。此外，样本可以取自食品处理，其可同时包括投入样本(例如，谷粒、奶或动物尸体)、处理中间步骤中的样本以及准备供给消费者的完成的食品。
在一些实施方式中，样本由样品制备而来，且检验在样本上进行。例如，在一些实施方式中，样品可得到处理以便获得适合于分子检验的样本。在一些实施方式中，样品可以直接测定，且在检验之前没有被预处理。例如，“直接样本”为从对象中收集并使用本文中公开的方法检验的样品，而不用分离或培养来自样品的细菌，或不用在检验之前处理样品来分离核酸。因此，直接样本在筛选之前总体上只最低程度地进行处理。在一些实施方式中，本文中公开的样品得到处理以便获得适合于检验的样本。例如，包含细胞的样品在检验之前可得到处理以溶解细胞并释放细胞成分，如核酸、蛋白质等等。在一些实施方式中，样品可得到处理以产生包含分离核酸的样本。如本文所使用的，短语“分离核酸”是指从一种或多种细胞成分中纯化核酸。技术人员应理解，经处理以从其中“分离核酸”的样本可包含除核酸之外的成分和杂质。包含分离核酸的样本可使用任何本领域已知的可接受的方法由样品制备而来。例如，可以使用已知的溶解剂溶解细胞，并且可从其他细胞成分中纯化或部分纯化核酸。提取DNA和RNA的合适的试剂和方案可分别在美国专利申请公开第US2010-0009351号和第US2009-0131650号中找到，其中每一个都通过引用全部并入到本文中。在核酸检验(例如，下面进一步详细讨论的扩增和杂交方法)中，所提取的核酸溶液可直接添加至试剂(例如，以液体、与底物结合、以冻干形式或诸如此类，如下面进一步详细讨论的)，并且需要根据本文公开的实施方式来进行检验。
在一些实施方式中，本文所述的检验，例如第一检验和反射检验，是确定样品或样本中目标分析物存在的检验。如本文所使用的，术语“目标分析物”可指各种类型的感兴趣的分析物，包括，例如目标核酸、目标蛋白质或其他感兴趣的目标分子。在一些实施方式中，本文所述的设备和方法用于进行反射检验，以确定目标核酸的存在，尽管技术人员应理解本文中公开的实施方式可容易地适应其他类型的目标分析物的检验。
根据以上，本文中提供的实施方式有利地提供了自动检验样品和样本的目标分析物的改进方法。该方法用于对多个样本进行自动测定。在一些实施方式中，方法可a)提供被配置以根据一个或多个各自测定工作流程接收和处理多个样本的自动仪器，所述样本来自一种或多种目标分析物的多个样品；b)提供多个所要检验的样本；c)自动将所要检验的多个样本的每一个的第一部分转移至包含用于第一目标分析物的第一检验的试剂的各自多个第一容器；d)自动对所述多个样本的所述部分进行第一检验，以根据第一测定工作流程确定第一目标分析物的存在；e)从多个样本中选择子集样本，其中确定了第一目标分析物的存在；f)自动将来自e)的所选样本子集的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的第二容器，以根据第二测定工作流程确定第二目标分析物的存在；和g)自动对所选样本子集的第二部分进行第二检验。
在本文公开的实施方式中有用的自动仪器可包括，例如美国专利第8,133,671号、美国专利申请公开第2009-0111059号中描述的那些，其通过引用全部并入本文中。然而，技术人员应理解，本文公开的实施方式可以容易地适应任何合适的样品和/或样本处理和检验自动系统。可期望的是，自动系统被配置以使得能够根据一个或多个工作流程处理或检验多个样本。如本文所使用的，术语“工作流程”、“测定工作流程”、“测定”、“测定方案”、“检验”和类似术语是指处理样品和/或样本的程序。在典型实施方式中，工作流程可包括样本制备步骤，如细胞溶解、核酸提取、核酸纯化、核酸消化、核酸修饰、蛋白质提取、蛋白质纯化等等。本文公开的实施方式中有用的核酸提取的几种方法是本领域已知的。核酸提取的示例性讨论可在例如美国专利申请公开第2009-0131650号、美国专利申请公开第2010-0009351号和美国专利申请公开第2006-016623311/281,247号中找到，其通过引用全部并入本文中。同样，蛋白质提取的示例性讨论可在例如美国专利第8,053,239号和第6,864,100号中找到，其通过引用全部并入本文中。
在一些典型实施方式中，工作流程还可包括核酸扩增反应。在一些典型实施方式中，工作流程可进一步包括数据分析程序。
如上所述，在一些实施方式中，所测定或分析的样本的一部分(例如第一部分，和在某些情况下，第二部分)被转移至包含用于检验的试剂的容器。如本文所使用的，术语“容器”是指任何类型的能够容纳样本的物体，包括，但不限于，管、微量滴定板中的容器等等。在一些实施方式中，容器位于检验条板中。如本文所使用的，术语“检验条板”或“试剂条板”是指容纳一种或多种用于自动测定的消耗性成分的包装。因此，通过实施自动样品和/或样本制备的装置，检验条板可以被配置而使用，这样的装置描述在例如国际专利申请公开第WO 09/054870号中，其通过引用全部并入本文中。
在典型实施方式中，检验条板可包括容器，如管、孔等，用于容纳预处理的样本，包含从样品中获得的分离核酸的溶液。典型地，检验条板还可包括容纳用于分子检验如核酸检验的试剂(例如用于核酸扩增的试剂，如在本文的别处所进一步详细讨论的)的容器。在一些实施方式中，检验条板可包括进行样本制备和容纳试剂以及其他耗材如移液器头的附加容器。在一些实施方式中，检验条板或试剂条板包括一个或多个被配置以接受包含测定试剂的反应容器的插孔或孔口。因此，在一些实施方式中，本文所述的包含用于测定的试剂的容器是单件的或是与检验条板成整体，而在一些实施方式中，本文所述的包含用于测定的试剂的容器不与检验条板成整体，但适于扣入检验条板中的插孔或孔口中。在美国专利D618820、D637737中和2011年9月30日提交的名称为“UNITZED REAGENT STRIP(组合的试剂条板)”的美国临时专利申请第61/541,991号中，图1和图2阐述了本文公开的实施方式中有用的检验条板或试剂条板的非限制性实施例，其中的每一个均通过引用并入本文中。图1和图2图示了本文公开的实施方式中有用的示例性检验条板/试剂条板。
自动仪器可包括或被配置以接收例如在底座中的一个或多个条板载体，每个条板载体或支架能够容纳多个检验条板，以及任选地管，例如用于携带样品的管。在典型实施方式中，检验条板安置在自动仪器容纳的一个或多个条板载体或支架中。本文公开的实施方式中有用的示例性条板载体或支架公开在例如美国专利申请公开第2009-0136386号中，尽管技术人员应理解可使用如本文所述的适于与自动系统一起使用的各种其他配置的条板容纳器或支架。在一些实施方式中，检验条板载体或支架被配置以容纳多个检验条板或试剂条板，例如在各种道中。例如，检验条板载体可包含2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或更多条道，其被配置以容纳任意2-24个各自检验条板或试剂条板。
在本文公开的方法中，根据对样本进行的第一检验的结果，进行反射检验。如果来自第一检验的结果揭示进行反射(随后)检验的可期望性，则根据本文公开的方法，第一检验程序之后剩余的样本的第二(或残余)部分自动转移至包含用于反射(随后)检验的试剂的第二容器。样本第二部分的自动转移可以以许多方法学中的任何一种进行。例如，在一些实施方式中，包含第一检验之后的样本剩余或残余部分的容器可转移至第二检验条板，在这之后，样本的至少一部分接着自动转移至包含用于第二检验的试剂的容器。在一些实施方式中，样本第二部分自动从第一检验条板直接转移至安置在第二检验条板中的第二主混合管。在一些实施方式中，样本第二部分可自动从第一检验条板直接转移至安置于第一检验条板的第二容器。应理解，尽管下面更加详细地描述了几种实施方式，但自动将所提取的核酸溶液转移至第二主混合管的任何合适的方法学均可根据本文提供的方法进行。
转移至新的检验条板
在某些实施方式中，对于每一个样本，样本和包含用于第一检验的试剂的容器或管位于单个检验条板，例如第一检验条板上，且自动转移样本一部分的步骤涉及自动将样本的第二部分转移至位于第二、独立的检验条板上的第二主混合管。
在一些实施方式中，第一和第二检验条板位于单独的条板载体或支架中。作为一个非限制性实施例，第一检验条板可安置于第一条板载体的第1-6道中，以及第二检验条板可安置于第二条板载体的第1-6道中。图3显示了安置于条板载体中的检验条板的实例。
在一些实施方式中，第一和第二检验条板位于同一条板载体中。作为一个非限制性实施例，第一检验条板安置于第1、3、5、7、9和11道中，且相应的第二检验条板可放置于同一条板载体的第2、4、6、8、10和12道中。作为另一个非限制性实施例，第一检验条板可安置于第1-6道中，且相应的第二检验条板可安置于同一条板载体的第7-12道中。将理解，可使用第一和第二检验条板的任何合适的安置配置。在一些实施方式中，自动仪器可在每个检验条板上使用确认标记如条形码、RFID码等，以确认第一和/或第二检验条板的位置。在一些实施方式中，方法进一步包括将检验条板上的确认标记、检验条板中的容器或样品管与存储在仪器上的一套测定特异性的确认数据相比较的步骤。
因此，在一些实施方式中，使用者可选择一个或多个第一检验条板用于第二反射检验，并将一个或多个所选的检验条板转移至包含第二检验条板的新支架中，所述第二检验条板具有包含用于第二反射检验的试剂的容器。在一些实施方式中，使用者可选择第一检验条板中的一个或多个用于第二反射检验，且自动仪器或使用者可将样本的第二部分转移至位于第二、独立的检验条板载体或支架中的第二检验条板。在一些实施方式中，第一检验中使用的样品管或检验条板上的确认标记可进入自动仪器，这些信息可用以当样本在第二或反射检验期间处理时追踪它们。因此，在上述方法的一些实施方式中，方法可包括，在将样本第二部分转移至第二容器之前，确认多个第一检验条板的子集用于进一步检验，例如用于第二检验；和对于子集中的每个第一检验条板，提供相应的第二检验条板。第二检验条板可包括含有用于第二检验的试剂的第二容器。在某些实施方式中，第二检验条板还可包括至少一个移液器头。
转移至同一检验条板
在某些实施方式中，对于每一个样本，样本溶液和包含用于第一检验的试剂的第一容器位于第一检验条板上，且转移所提取的核酸溶液的一部分的步骤包括将所提取的核酸溶液的一部分转移至包含用于第二检验的试剂的第二容器，所述第二容器也位于第一检验条板上。
在上述方法的一些实施方式中，方法可包括，在将样本第二部分转移至第二容器之前的步骤：确认多个样本的子集用于进一步检验，例如用于第二或反射检验；和对于确认用于进一步检验的每个样本，在第一检验条板上提供包含用于第二或反射检验的试剂的相应第二容器。在典型实施方式中，第一检验条板被配置有开放的位置，例如插孔或容器，其适于将附加主混合管添加至条板。例如，如图2中所示，检验条板可以是4扣条板，其允许使用者将反射主混合液添加至开放的位置。在一些实施方式中，在进行第二或反射检验之前，检验条板由使用者安排于新的检验条板容纳器或支架中。
技术人员将理解，期望最小化来自第一检验的试剂与来自第二或反射检验的试剂交叉污染的风险。因此，在一些实施方式中，在进行反射检验之前，耗材如移液器头可被替换和/或使用检验条板中残余的缓冲液清洁。因此，在某些实施方式中，方法包括将样本第二部分转移至第二容器之前，提供移液器头的步骤。在一些实施方式中，移液器头是未用过的移液器头。在一些实施方式中，移液器头是使用过的头，其已经得到洗涤以减少或防止来自之前液体转移的污染。在某些实施方式中，方法包括，在将样本第二部分转移至第二容器之前，洗涤在第一检验期间使用过的移液器头的步骤。
在第二反射检验之前样本的处理和/或检验期间，可能发生样本的蒸发。因此，样本蒸发可降低反射检验的性能。本文公开的实施方式提供蒸发的解决方案——其通过使用固定体积的缓冲液例如洗涤缓冲液或核酸洗脱缓冲液来添加至残余的样本以确保有足够的体积来进一步处理例如在第二或反射检验中的残余样本。因此，在一些实施方式中，方法包括，在进行第二或反射检验之前，将附加液体添加至残余样本的步骤。仅作为实例，在一些实施方式中，样本的初始体积范围可从1μL至1ml，且优选地为介于10μL和200μL之间，例如25-75μL。在一些实施方式中，样本的约5μL-25μL，例如10-20μL的第一部分被移除用于第一检验。作为实例，在一些实施方式中，12.5μL的初始样本用在第一检验中。为了确保足够的样本体积可用于第二检验，在一些实施方式中，在将样本第二部分转移至包含用于第二或反射检验的试剂的容器之前，可添加附加体积为0.5μL、1μL、2μL、3μL、4μL、5μL、6μL、7μL、8μL、9μL、10μL、12μL、14μL、16μL、18μL、20μL、25μL、30μL、35μL、40μL、45μL、50μL、55μL、60μL、65μL、70μL、75μL、80μL、85μL、90μL、95μL、100μL、120μL、140μL、160μL、180μL、200μL、300μL、400μL、500μL或超过500μL的附加液体以增加液体体积。因此，将溶液添加至剩余或残余样本可补偿在溶液转移至第二主混合液之前可能发生的蒸发。在一些实施方式中，相对于在第一整份试样转移至第一主混合液之后剩余的所提取核酸溶液的体积，等于0.1％、1％、2％、3％、4％、5％、6％、7％、8％、9％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、100％、120％、140％、160％、180％、200％、250％、300％、350％、400％或更多的体积可被添加，以增加液体体积并补偿在溶液转移至具有用于第二检验的试剂的容器之前可能发生的蒸发。
核酸检验(NAT)测定和用于NAT的试剂
如以上所讨论的，本文所述的检验可包括例如核酸检验。在一些实施方式中，检验包括样本中目标核酸序列的检验。几种形式的核酸检验在本文公开的实施方式中有用，包括，但不限于，涉及核酸扩增反应的检验。几种核酸扩增反应是已知的，并可用来根据本文公开的实施方式确定目标核酸的存在。核酸扩增的方法可包括，但不限于：聚合酶链式反应(PCR)、链置换扩增(SDA)，例如多重置换扩增(MDA)、环介导的等温扩增(LAMP)、连接酶链式反应(LCR)、免疫扩增和各种基于转录的扩增程序，包括转录介导的扩增(TMA)、基于核酸序列的扩增(NASBA)、自我维持的序列复制(3SR)和滚环扩增。参见，例如Mullis，“Processfor Amplifying,Detecting,and/or Cloning Nucleic Acid Sequences(扩增、检测和/或克隆核酸序列的方法)”，美国专利第4,683,195号；Walker，“Strand DisplacementAmplification(链置换扩增)”，美国专利第5,455,166号；Dean等，“Multipledisplacement amplification(多重置换扩增)”，美国专利第6,977,148号；Notomi等，“Process for Synthesizing Nucleic Acid(合成核酸的方法)”，美国专利第6,410,278号；Landegren等，美国专利第4,988,617号，“Method of detecting a nucleotide changein nucleic acids(检测核酸中核苷酸变化的方法)”；Birkenmeyer，“Amplification ofTarget Nucleic Acids Using Gap Filling Ligase Chain Reaction(使用间隙填充连接酶链式反应扩增目标核酸)”，美国专利第5,427,930号；Cashman，“Blocked-PolymerasePolynucleotide Immunoassay Method and Kit(阻断聚合酶多核苷酸免疫测定方法和试剂盒)”，美国专利第5,849,478号；Kacian等，“Nucleic Acid Sequence AmplificationMethods(核酸序列扩增方法)”，美国专利第5,399,491号；Malek等，“Enhanced NucleicAcid Amplification Process(增强的核酸扩增方法)”，美国专利第5,130,238号；Lizardi等，BioTechnology,6:1197(1988)；Lizardi等，美国专利第5,854,033号，“Rolling circlereplication reporter systems(滚环复制报告系统)”。在一些实施方式中，例如连续地进行所列的核酸扩增方法的两种或更多种。
如以上所讨论的，在一些实施方式中，将样本的部分转移至包含用于检验的试剂的容器。例如，在一些实施方式中，转移样本至包含用于如扩增反应等检验或反应的“主混合液”的容器。“主混合液”可包括反应所必需的成分的一些或全部，包括，但不限于酶、寡核苷酸、探针、盐、脱氧核苷三磷酸，其包括聚合酶和多个核苷酸。在一些实施方式中，主混合液可进一步包括具有可检测部分的杂交探针，其中所述探针特异性地与目标核酸(和/或阳性对照目标核酸序列)杂交。在一些实施方式中，可提供比将在反应中使用的浓度更高的主混合液。在一些实施方式中，主混合液以冻干的形式提供，并以将在反应中使用的较高浓度重构。在一些实施方式中，主混合液包含这样的试剂，所述试剂的浓度为反应浓度的至少大约2x，例如2x、2.5x、3x、4x、5x、6x、7x、8x、9x、10x、15x、20x、25x、40x、50x、100x、200x、250x或500x。
在一些实施方式中，当存储在检验条板上的试剂管中时，主混合液可为一个或多个冻干丸的形式，且方法可进一步包括用液体例如本文以上所述的样本的一部分，重构试剂丸，以产生适于处理如检验的反应/试剂的混合溶液。
在一些实施方式中，“主混合液”或可在容器中提供的包括提供关于本文中包含的试剂确认信息的确认标记，如条形码、RFID码等，例如确认容器包含用于检测特定目标分析物的试剂的标记。
仪器和系统
本文中还提出进行自动测定的系统，所述系统包括自动仪器，所述自动仪器被配置以根据本文上述的一个或多个测定工作流程接受和处理多个样品或样本。
系统也可包括处理器；存储容量；和进行自动测定的程序。例如，程序可包括自动仪器的指令，所述自动仪器被配置以根据本文所述的一个或多个测定工作流程接受和处理多个样本。程序可包括如下指令：根据一个或多个工作流程接受和处理多个样本，其中在多个检验条板上提供所述样本；自动地将每一个样本的第一部分转移至各自多个包含用于第一检验的试剂的第一容器；进行第一检验以确定第一目标分析物的存在；自动将样本或选择的样本子集的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的各自第二容器；和对样本或所选样本子集的第二部分进行第二检验，以确定第二目标分析物的存在。
可同时进行多个测定方案的自动仪器是本领域技术人员已知的，且包括，但不限于，BD
Figure GDA0001540326980000111
(Becton Dickinson and Co.,Franklin Lakes,NJ)、
Figure GDA0001540326980000112
(BectonDickinson and Co.,Franklin Lakes,NJ)、VIPER
Figure GDA0001540326980000113
(Becton Dickinson and Co.,Franklin Lakes,NJ)、
Figure GDA0001540326980000114
(Cepheid,Sunnyvale,CA)、ABI PRISM
Figure GDA0001540326980000115
(Applied Biosystems,Foster City,CA)、ROTOR-GENETM(Corbett Research,Sydney,Australia)、
Figure GDA0001540326980000116
(Roche Diagnostics Corp,Indianapolis,IN)、
Figure GDA0001540326980000117
(BioRad Laboratories,Hercules,CA)、
Figure GDA0001540326980000118
(Stratagene,La Jolla,CA)、CFX96TM实时PCR系统(Bio-Rad Laboratories Inc)等等。与本文提供的方法一起使用的典型自动仪器的示例性讨论可在例如美国专利第8,133,671号中找到，其通过引用全部并入本文中。
应理解，本文所述的方法和系统可适用于包括2、3、4或更多个工作站的仪器，其中所述工作站的至少2个受共同的服务资源的支持。例如，具有4个工作站和单个移液器头的仪器仍然可以受本文所述的2指数概念兼容控制。
如本文所使用的，术语存储容量、存储设备、存储等等可指任何信息存储的媒体、设备或手段。存储可包括，但不限于，硬盘驱动、软磁盘、光盘或磁光盘等磁盘驱动设备，RAM或ROM芯片等存储器，以及任何其他用来记录或存储数据的媒体。在一些实施方式中，存储容量连接至处理器，所述处理器发送在获得之后将要记录在存储容量上的信息。在特定的实施方式中，数据通过系统获得并记录在存储容量上。在其他实施方式中，数据通过系统获得，且信息得到第一处理，并且处理过的信息记录在存储容量上。
本文提供的文件和程序可以为任何合适的程序设计语言。在某些实施方式中，ADF利用XML作为格式化文件的机制。进一步，在某些实施方式中，ADF利用Python作为脚本语言来提供使用仪器上可用的常见技术执行结果逻辑的机制。应理解，本文提供的方法和系统中可利用任何合适的文件格式和程序设计语言。在某些实施方式中，文件可加密以防止使用伪造试剂并控制测定运行的特定参数详情。
如本文所使用的，“输入”可以是，例如接收自以下的数据：键盘、滚球、鼠标、语音识别系统或其他能够将信息从使用者传递至计算机的设备。输入设备也可以是与显示器相关联的触屏，在这种情况下使用者通过触摸屏幕回应显示器上的提示。使用者可通过键盘或触屏等输入设备输入文本信息。
本文公开的实施方式用许多其他一般用途或特殊用途计算系统环境或配置来运作。可适于与本发明一起使用的众所周知的计算系统、环境和/或配置的实例包括，但不限于，微控制器、个人计算机、服务器计算机、手提式或膝上型设备、多处理器系统、基于微处理器的系统、可编程的消费电子产品、网络PC、小型计算机、主计算机、包括任何以上系统或设备的分布式计算环境。
如本文所使用的，“指令”指处理系统中信息的计算机执行的步骤。指令可在软件、固件或硬件中执行，且包括由系统成分承担的任何类型的程控步骤。
“微处理器”或“处理器”可以是任何常规一般用途单核或多核微处理器，如
Figure GDA0001540326980000121
处理器、
Figure GDA0001540326980000122
CoreTM、8051处理器、
Figure GDA0001540326980000123
处理器或
Figure GDA0001540326980000124
处理器。此外，微处理器可以是任何常规特殊用途微处理器，如数字信号处理器或图形处理器。“处理器”还可指，但不限于，微控制器、现场可编程门阵列(FPGAs)、专用集成电路(ASICs)、复杂可编程逻辑器件(CPLDs)、可编程逻辑阵列(PLAs)、微处理器或其他类似处理设备。
系统由本文中详细讨论的各种模块组成。本领域普通技术人员可以理解，模块的每一个均包括各种子例程、过程、定义语句和宏。模块的每一个典型地分别编译并连接进入单个可执行程序。因此，为了方便描述优选系统的功能性，使用每一个模块的以下描述。因此，每一个模块所经历的过程可任意再分配至其他模块中的一个，在单个模块中结合在一起，或可在例如可共享动态链接库中获得。
系统的某些实施方式可连同各种操作系统如SNOW
Figure GDA0001540326980000125
LINUX、UNIX或MICROSOFT
Figure GDA0001540326980000126
一起使用。
系统的某些实施方式可用任何常规程序设计语言，如程序集、C、C++、BASIC、Pascal或Java来写，并在常规操作系统下运行。
此外，模块或指令可存储在一个或多个可编程存储设备上，如FLASH驱动、CD-ROM、硬磁盘和DVD。一种实施方式包括具有存储在其上的指令的可编程存储设备。
在以上系统的一些实施方式中，系统进一步可包括这样的设备，其用于读入试剂包装如检验条板、含有试剂的容器上的确认标记，以及含有样本或样品的容器上存在的确认标记。应理解，用于读入确认标记的任何合适的设备可在本文提供的系统中使用。同样，可使用与仪器上的设备兼容的任何合适的确认标记。实例包括条形码、QR码、RFID标签、颜色代码等等。在典型的实施方式中，设备可以是条形码阅读器，并且确认标记可包括条形码。
示例性反射测定
作为另一个实例，在阳性MRSA测定之后，可对MRSA检验为阳性的样品进行反射测定，所述反射测定为万古霉素抗性决定子、杀白细胞素(PVL)决定子或通过葡萄球菌蛋白A分型(spa-typing)或检验葡萄球菌盒染色体mec(SCCmec)分型来分类MRSA的反射测定。万古霉素抗性决定子、杀白细胞素(PVL)决定子或通过葡萄球菌蛋白A分型或检验SCCmec来分类MRSA的合适检验是本领域已知的，如以下所例示的：Mak等，J.Clin.Microbiol.(2009)12:4136；Reischl等.Eur.J.Clin.Microbiol.Infect.Dis.(2007)26:131-135；Narukawa等，Tohoku J.Exp.Med.(2009)218:207-213；Chongtrakool等，Antimicrob.AgentsChemother.(2006)50:1001-1012；其每一个通过引用全部并入本文。
作为另一个实例，使用严重腹泻患者的粪便样品，首先检验艰难梭状芽孢杆菌(Clostridium difficile)，可对阳性型进行反射测定以确定毒素亚型，或对阴性型进行反射测定以检验不同的病原体。反过来同样正确，其中检验肠道组的粪便样品可反射至艰难梭状芽孢杆菌检验。艰难梭状芽孢杆菌和毒素亚型的合适检验是本领域已知的，如以下所例示的：Kvach等.J.Clin.Microbiol.(2010)48:109-114；和Northey等，J.Med.Microbio.(2005)54:543-547；其每一个通过引用全部并入本文。
作为另一个实例，使用高烧患者的脑脊液样品，可首先利用总核酸检验来检验样品或样本的病毒感染，并可对阴性型进行第二检验以寻找细菌目标。病毒和细菌感染的合适检验是本领域已知的，如以下所例示的：Mahoney等,J.Clin.Microbiol.(2007)45:2965-2970，和Melendez等.Clin.Microbiol.Infect.(2010)16:1762-1769；其每一个通过引用全部并入本文。
作为另一个实例，使用痰样品，样品或样本可首先检验结核分支杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex)(MTBC)和利福平抗性。如果有阳性，则可进行异烟肼和氟喹诺酮(fluroquinolone)抗性的反射以便确定该菌株是否为MDR或XDR。Mtbc、利福平、异烟肼和氟喹诺酮抗性的合适检验是本领域已知的，如以下所例示的：Somoskovi等.J.Clin.Microbiol.(2003)41:2822-2826；Saribas等，J.Clin.Microbiol.(2003)41:816-818；Rindi等.J.Microbiol.Methods(2003)55:797-800；Ip等，J.Clin.Microbiol.(2006)4:970-975；其每一个通过引用全部并入本文。
作为另一个实例，使用在ICU患者中的支气管肺泡抽出物，可进行KPC/OXA/NDM碳青霉烯酶的初始筛选。如果发现阴性，可进行VIM/IMP筛选。KPC/OXA/NDM检测和VIM/IMP筛选的合适检验是本领域已知的，如以下所例示的：Nordmann等.Clin.Microbiol.Infect.(2002)8:321-331；和Monteiro等.J.Antimicrob.Chemother.(2012)；其每一个通过引用全部并入本文。
作为另一个实例，使用样本，和随后的革兰氏染色或基质辅助激光解析电离(maldi)确认，可对一组抗性标记组进行革兰氏阳性(如果革兰氏为阳性)或革兰氏阴性组(如果革兰氏为阴性)测定。在此所述的反射策略是在另一个用于确认的系统或检验之后。革兰氏阳性和革兰氏阴性筛选的合适检验是本领域已知的，如Carroll等.J.Clin.Microbiol.(2000)5:1753-1757所列示的；其通过引用全部并入本文。
作为另一个实例，使用食品样本或环境样本，可首先进行李斯特菌属(Listeriaspp.)筛选。如果确认了阳性，可进行单核细胞增生李斯特氏菌(L.monocytogenes)的特定反射测定。检测李斯特菌属和单核细胞增生李斯特氏菌的合适检验是本领域已知的，如以下所例示的：Bubert A.App.Environ.Microbiol.(1999)10:4688-4692；和Borucki等，J.Clin.Microbiol.(2003)41:5537-5540；其每一个通过引用全部并入本文。
作为另一个实例，使用水样本或药物环境样本，可进行TVC测定。如果初始测定为阳性，可进行革兰氏阳性或革兰氏阴性的反射测定或针对大肠杆菌或肠道球菌(enterococci)或芽孢杆菌(bacillus)的特定测定。TVC以及革兰氏阳性和革兰氏阴性筛选的合适检验是本领域已知的，如以下所例示的：Ereveeval等，J.Clin.Microbiol.(2003)41:5466-5472；和Carroll等.J.Clin.Microbiol.(2000)5:1753-1757；其每一个通过引用全部并入本文。
另一个示例性实施方式涉及来自患有或怀疑患有囊性纤维化的对象的样品检验。例如，可对来自对象的样本或样品进行第一检验，以检验目标分析物——例如与铜绿假单胞菌(Psuedomonas aeruginosa)和/或洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia cepacia)相关的目标核酸序列——的存在。在本文公开的实施方式中有用的、用于检测铜绿假单胞菌和/或洋葱伯克霍尔德菌的测定的非限制性实施例包括，例如描述在Spilker等.(2004),J.Clin.Microbiol.42(5):2074-2079，和Vonberg等，(2006),J.Med.Micriobiol.55(Pt.6):721-727中的那些。对于任何一种病原体检验为阳性的样本，可进行抗生素抗性决定子的反射检验，例如确定指示四环素、萘啶酮酸、诺氟沙星、氯霉素、环丙沙星等的目标核酸的检验。
应当理解的是，以上所列仅仅旨在提供本文所提供的方法和系统的实例，并可根据初始测定的结果进行任何合适的反射测定。
实施例
对本发明已作了一般的描述，进一步的理解可参考本文提供的一些特定实例而获得，它们仅用于阐述目的，并不意图进行限制。
实施例1
确认用于反射分析的样本
该实施例描述在PCR运行的末尾使用用于样本制备、处理和分析的自动仪器确认用于反射分析的样本。处理每一个均在单独样本管中的一组12个生物样品，以获得各自的含有分离核酸的溶液样本。每个检验条板包含用于细胞溶解的管，其在图1中以“反应管”来表示。检验条板还包含用于三个附加管的位置，在图1中以位置1、2和3来表示。在位置3处为锥形管，其被配置用于容纳最终提取的核酸溶液或包含分离核酸的样本溶液。如图1所示，检验条板还包括在检验条板中用来容纳提取溶液的附加贮器位置、用来容纳废液的废物室和容纳一次性移液器的数个鞘。检验条板在条板的一端还配置有确认标记如条形码。
使用者将提取管放置在位置1中，并将主混合液放置在12个检验条板中每一个的位置2中，所述主混合液用于检测和/或确认抗二甲氧基苯青霉素的金黄色葡萄球菌(MRSA)和金黄色葡萄球菌(包括二甲氧基苯青霉素敏感的金黄色葡萄球菌)，例如BD GENEOHMTMStaphSRTM测定试剂(Becton Dickinson,Franklin Lakes,NJ)。每个样品在反应管中用溶解缓冲液自动处理，且部分所得的液体自动转移至提取管，其中使用提取溶液进行基于小珠的核酸提取，并且最终提取的核酸溶液样本转移至位于位置3的锥形管。每个检验条板的锥形管中所提取的核酸溶液样本的总体积为25μL。所提取的核酸溶液的12.5μL整份试样自动经移液器移转至相邻的主混合管以重构StaphSRTM主混合液。主混合液转移至反应盒用于PCR分析。在PCR之后，12个样本中的6个显示为MRSA或金黄色葡萄球菌阳性，并被确认为莫匹罗星抗性的候选物，因此被选择用于以下实施例中所述的进一步分析。
实施例2
所提取的核酸溶液手动转移至新的检验条板和自动转移至新的主混合管用于反射PCR分析
如实施例1中以上所述，使用MRSA和金黄色葡萄球菌的PCR分析进行样本制备和处理。确认用于莫匹罗星抗性反射分析的样本相应的6个使用过的检验条板的每一个重新安置在新支架的第1-6道中。新的检验条板安置于单独的支架的第1-6道中。附加的15μL洗脱缓冲液添加至每个检验条板中剩余的所提取核酸溶液，所述核酸溶液与来自以上实施例1中进行的StaphSRTM检验中的阳性样本相关。包含得自样品的分离核酸的残余或剩余样本一部分转移至新检验条板位置3。使用者将用于莫匹罗星抗性PCR分析的主混合液放置在6个新检验条板的每一个的位置2中。使用位于新的检验条板上的新移液器，所提取的核酸溶液的12.5μL整份试样自动经移液器移转至相邻的主混合管，以重构用于莫匹罗星抗性PCR分析的主混合液。
反射PCR分析表明，用于反射检验的所选样本子集为莫匹罗星抗性阳性。
实施例3
所提取的核酸溶液自动转移至新的检验条板上的新主混合管用于反射PCR分析
如实施例1中以上所述，使用StaphSRTM测定进行样本处理和检验。确认用于莫匹罗星抗性反射分析的样本相应的6个使用过的检验条板的每一个重新安置于新支架的第1-6道中。新的检验条板安置于单独的支架的第1-6道中。附加的15μL洗脱缓冲液添加至第1-6道中每一个检验条板中剩余的所提取的核酸溶液。使用位于新的检验条板上的新移液器，所提取的核酸溶液的12.5μL整份试样自动经移液器移转至相应的新检验条板上的主混合管，以重构用于莫匹罗星抗性PCR分析的主混合液。
反射PCR分析表明，用于反射检验的所选样本子集为莫匹罗星抗性阳性。
实施例4
所提取的核酸溶液自动转移至同一检验条板上的新主混合管用于反射PCR分析
除了如图2所示使用4扣条板之外，如实施例1中以上所述进行样本处理和MRSA的PCR分析。具体地，以与实施例1-3中使用的检验条板类似的方式配置4扣条板，但条板包括一个用于附加主混合管任选放置的附加位置(“位置4”)。对于确认用于莫匹罗星抗性反射分析的6个样本的每一个，添加附加的15μL洗脱缓冲液至每一个检验条板中剩余的所提取的核酸溶液。使用者将用于莫匹罗星抗性PCR分析的主混合液放置于确认用于反射分析的6个检验条板的每一个的位置4中。使用位于新的检验条板上的新移液器，所提取的核酸溶液的12.5μL整份试样自动经移液器移转至位置4的主混合管，以重构用于莫匹罗星抗性PCR分析的主混合液。如上所述进行核酸扩增。
反射PCR分析表明，用于反射检验的所选样本子集为莫匹罗星抗性阳性。
应理解的是，本发明不限于公开的具体实施方式，因为这些当然是可以变化的。还应理解的是，本文中使用的术语只为描述具体实施方式的目的，而不意图进行限制。
除非另外限定，所有本文中使用的技术和科学术语具有与实施方式所属领域的普通技术人员通常理解的相同的意义。尽管与本申请公开的那些方法和材料相似或等效的任何方法和材料也可以用于实施或检验实施方式，但是现在公开的是优选方法和材料。
如本文所使用的，术语“包含(comprising)”与“包括(including)”、“含有(containing)”或“其特征在于(characterized by)”同义，并且是包含性的或开放式的，且不排除额外的未述及的要素或方法步骤。
必须注意的是，如本文和所附的权利要求中所使用的，单数形式“一个(a)”、“一个(an)”以及“所述(the)”包括复数引用，除非在上下文中另外进行了清楚地说明。因此，例如，“方法(a method)”的引用包括多个这样的方法和本领域技术人员已知的其等同物，诸如此类。
本文所有引用的参考文献包括，但不限于，公开和未公开的申请、专利和科学文献，通过引用全部并入本文中并由此成为本说明书的一部分。就通过引用并入的出版物和专利或专利申请与本说明书中包含的公开内容相矛盾而言，本说明书意图代替和/或优先于任何这种矛盾的资料。
与本文公开的实施方式结合描述的方法或算法的步骤可直接体现在硬件、由处理器执行的软件模块或两者的组合中。软件模块可位于RAM存储器、闪速存储器、ROM存储器、EPROM存储器、EEPROM存储器、寄存器、硬磁盘、可换磁盘、CD-ROM、或本领域已知的任何其他形式的存储媒体中。示例性的存储媒体可连接到处理器，如此处理器可以从存储媒体读入信息，并写信息至存储媒体。可供选择地，存储媒体可与处理器成整体。处理器和存储媒体可位于ASIC中。ASIC可位于用户终端中。可供选择地，处理器和存储媒体可作为独立的元件位于在用户终端中。

Claims (18)

1.对多个样品进行自动测定的方法，所述方法包括：
a)提供自动仪器，所述自动仪器被配置以根据一个或多个各自测定工作流接受和处理多个样本，所述多个样本来自一种或多种目标分析物的多个样品；
b)提供所要检验的多个样本；
c)自动将所要检验的多个样本的每一个的第一部分转移至包含用于第一目标分析物的第一检验的试剂的各自多个第一容器；
d)自动对所述多个样本的所述部分进行所述第一检验，以根据第一测定工作流确定第一目标分析物的存在；
e)从确定了所述第一目标分析物存在的多个样本中选择样本子集；
f)自动将来自e)的所选样本子集的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的第二容器，以根据第二测定工作流确定第二目标分析物的存在，其中所述第二目标分析物不同于所述第一目标分析物；和
g)自动对所选样本子集的所述第二部分进行所述第二检验，其中，对于每一个样本，所述样本和包含用于第一检验的试剂的所述第一容器位于第一检验条板上，并且其中步骤f)进一步包括自动将所选样本子集的第二部分转移至位于第二检验条板上的包含用于第二检验的试剂的第二容器。
2.权利要求1所述的方法，其中所述多个样本的每一个包含来自各自多个样品的分离核酸的预处理溶液。
3.权利要求2所述的方法，其中所述自动仪器自动处理所述多个样品以获得包含分离核酸的所述各自多个样本。
4.权利要求1所述的方法，其中步骤e)进一步包括：
e1)确认用于所述第二检验的所述多个第一检验条板的子集；和
e2)对于所述子集中的每一个第一检验条板，提供相应的第二检验条板，所述第二检验条板包括包含用于第二分析物的第二检验的试剂的容器。
5.权利要求4所述的方法，其中所述第二检验条板包括至少一个移液器头。
6.权利要求1所述的方法，其中所述方法包括，在步骤f)之前，将附加液体添加至所述样本。
7.权利要求1所述的方法，其中所述方法包括，在步骤f)之前，提供移液器头的步骤，所述移液器头被配置以将所述样本的所述第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的所述第二容器。
8.权利要求7所述的方法，其中所述移液器头为未用过的移液器头。
9.权利要求7所述的方法，其中所述移液器头为洗涤过的移液器头。
10.权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述第一检验或所述第二检验包括选自以下的反应：聚合酶链式反应(PCR)、转录介导的扩增(TMA)、寡核苷酸连接测定(OLA)、连接酶链式反应(LCR)、滚环扩增(RCA)、链置换扩增(SDA)和杂交反应。
11.权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括将检验条板上的确认标记与存储在所述仪器上的一套测定特异性确认数据相比较的步骤。
12.权利要求1所述的方法，其中所述第一检验包括同步检测抗二甲氧基苯青霉素的金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的检验，且其中所述第二检验包括检测莫匹罗星抗性的决定子的检验。
13.权利要求12所述的方法，其中所述莫匹罗星抗性的决定子包括mupA基因。
14.对来自各自多个样品的多个样本进行自动测定的系统，所述系统包括：
自动仪器，所述自动仪器被配置以根据一个或多个测定工作流接受和处理多个样本；所述仪器包括多个检验条板；
处理器；和
信息存储容量，其中所述自动仪器：
a)自动将每一个样本的第一部分转移至包含用于第一检验的试剂的各自多个第一容器；
b)根据第一测定工作流进行所述第一检验以确定第一目标分析物的存在；
c)自动将每一个样本或选择的样本子集中的每一个样本的第二部分转移至包含用于第二检验的试剂的各自第二容器；和
d)对样本或选择的样本子集的所述第二部分进行第二检验，以根据第二测定工作流确定第二目标分析物的存在，其中所述第二目标分析物不同于所述第一目标分析物，其中，对于每一个样本，所述样本和包含用于第一检验的试剂的所述第一容器位于第一检验条板上，并且其中步骤c)包括自动将每一个样本或选择的样本子集中的每一个样本的第二部分转移至第二检验条板上的包含用于第二检验的试剂的第二容器。
15.权利要求14所述的系统，其中所述自动仪器被指令以自动从所述多个样品中分离核酸以获得包含分离核酸的各自多个样本。
16.权利要求15所述的系统，其中步骤e)包括自动将所述分离的核酸的一部分转移至位于第二检验条板上的第二主混合管。
17.权利要求14所述的系统，其中所述第一检验包括同步检测抗二甲氧基苯青霉素的金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的检验，且其中所述第二检验包括检测莫匹罗星抗性的决定子的检验。
18.权利要求17所述的系统，其中所述莫匹罗星抗性的决定子包括mupA基因。
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