CN106604734A - 取代的核苷、核苷酸和其类似物 - Google Patents

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Abstract

本文公开了核苷、核苷酸类似物，合成核苷酸类似物的方法和使用一种或多种核苷和/或核苷酸类似物治疗疾病和/或病况，例如丝状病毒科病毒感染的方法。

Description

取代的核苷、核苷酸和其类似物
通过引用任何优先权申请并入
国外或国内优先权要求标识于例如与本申请一起提交的申请数据表或请求中的任何和所有申请均根据37 CFR 1.57和法条4.18和20.6通过引用并入本文。
背景
领域
本申请涉及化学、生物化学和药学的领域。更具体地，本文公开了核苷、核苷酸和核苷酸类似物；包含一种或多种核苷、核苷酸和/或核苷酸类似物的药物组合物和合成其的方法。本文还公开了用核苷、核苷酸和/或核苷酸类似物单独或与一种或多种其它药剂以组合疗法治疗疾病和/或病况的方法。
描述
核苷类似物为已显示在体外和体内均发挥抗病毒和抗癌活性的一类化合物，且因此已经是用于治疗病毒感染的广泛研究的主题。核苷类似物通常为治疗上无活性的化合物，其由宿主或病毒酶转化为其相应的活性抗代谢物，所述抗代谢物进而可抑制参与病毒或细胞增殖的聚合酶。活化通过多种机制(诸如一种或多种磷酸酯基团的添加和/或与其它代谢过程组合)发生。
概述
本文公开的一些实施方案涉及改善和/或治疗丝状病毒科(Filoviridae)病毒感染的方法，其可包括向鉴定为患有丝状病毒科病毒感染的对象给药有效量的一种或多种式(I)化合物或其药学上可接受的盐或包含一种或多种式(I)化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物。本文所述的其它实施方案涉及使用一种或多种式(I)化合物或其药学上可接受的盐制备用于改善和/或治疗丝状病毒科病毒感染的药物。本文所述的其它实施方案涉及一种或多种式(I)化合物或其药学上可接受的盐或包含一种或多种式(I)化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物，其可用于改善和/或治疗丝状病毒科病毒感染。
本文公开的一些实施方案涉及改善和/或治疗丝状病毒科病毒感染的方法，其可包括使感染丝状病毒科病毒的细胞与有效量的一种或多种本文所述化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)或包含一种或多种本文所述化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物接触。本文所述的其它实施方案涉及使用一种或多种本文所述化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)制备用于改善和/或治疗丝状病毒科病毒感染的药物，所述改善和/或治疗丝状病毒科病毒感染可包括使感染丝状病毒科病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。本文所述的其它实施方案涉及一种或多种本文所述化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)或包含一种或多种本文所述化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物，其可用于通过使感染丝状病毒科病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触来改善和/或治疗丝状病毒科病毒感染。
本文公开的一些实施方案涉及抑制丝状病毒科病毒复制的方法，其可包括使感染丝状病毒科病毒的细胞与有效量的一种或多种本文所述化合物(例如式(I)化合物或前述化合物的药学上可接受的盐)或包含一种或多种本文所述化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物接触。本文所述的其它实施方案涉及使用一种或多种本文所述化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)制备用于抑制丝状病毒科病毒复制的药剂，所述抑制丝状病毒科病毒复制可包括使感染丝状病毒科病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。本文所述的其它实施方案涉及一种或多种本文所述化合物(例如式(I)化合物或前述化合物的药学上可接受的盐)或包含一种或多种本文所述化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物，其可用于通过使感染丝状病毒科病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触来抑制丝状病毒科病毒复制。在一些实施方案中，所述丝状病毒科病毒可以是埃博拉病毒和/或马尔堡病毒。
详述
丝状病毒科家族病毒为包膜、反义（negative sense）、单链、线形RNA病毒的家族。丝状病毒科家族的三个属为：埃博拉病毒属、马尔堡病毒属和“奎瓦病毒属（Cuevavirus）”(不确定的)。埃博拉病毒属的五种已认识的种是埃博拉病毒（EBOV）、雷斯顿埃博拉病毒（REBOV）、苏丹埃博拉病毒（SEBOV）、塔伊森林埃博拉病毒（TAFV）和邦地布优埃博拉病毒（BEBOV）。马尔堡病毒属的两种已认识的种是马尔堡病毒（MARV）和Ravn病毒（RAVV）。埃博拉病毒属和马尔堡病毒属是高度感染性和传染性的。两种病毒都通过与被感染人的血液、体液和/或组织直接接触传播。埃博拉病毒属和马尔堡病毒属还可以通过处理患病或死亡被感染野生动物传播。埃博拉出血热（EHF）由埃博拉病毒属感染引起。马尔堡病毒疾病（MVD）是由马尔堡病毒属引起的人类疾病，并引起马尔堡病毒出血热（MHF）。
定义
除非另有定义，否则本文所用的所有技术和科学术语均具有如本领域普通技术人员通常理解的相同的含义。除非另有说明，否则本文中所提及的所有专利、申请、公开的申请和其它公开均以其整体通过引用并入。除非另有说明，否则在本文术语存在多种定义的情况下，以本部分中的定义为准。
如本文所用，任何“R”基团，诸如但不限于R1、R2、R3、R4、R5A、R5B、R6A、R6B、R6C、R6D、R6E、R6F、R6G、R6H、R7A、R7B、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、RA1、RA2、RA3和RA4代表可连接至指定原子的取代基。R基团可被取代或未取代。如果两个“R”基团被描述为“结合在一起”，则R基团和其所连接的原子可形成环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂环。例如，但不限于，如果NRaRb基团的Ra和Rb指示为“结合在一起”，则意味着其与彼此共价键合以形成环：
另外，如果两个“R”基团被描述为与其连接的一个或多个原子“结合在一起”以形成环作为替代方案，则R基团不限于先前定义的变量或取代基。
每当基团被描述为“任选地取代”时，该基团可未取代或被一个或多个指定取代基取代。同样，当基团被描述为“未取代或被取代”时，如果被取代，则一个或多个取代基可选自一个或多个指定取代基。如果未指定取代基，则意味着所指定的“任选地取代”或“被取代”的基团可被一个或多个单独地且独立地选自以下的基团取代：烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)、(杂环基)烷基、羟基、烷氧基、酰基、氰基、卤素、硫代羰基、O-氨基甲酰基、N-氨基甲酰基、O-硫代氨基甲酰基、N-硫代氨基甲酰基、C-酰胺基、N-酰胺基、S-磺酰胺基、N-磺酰胺基、C-羧基、O-羧基、异氰酸根合、氰硫基、异硫氰基、硝基、叠氮基、甲硅烷基、烃硫基(sulfenyl)、亚磺酰基、磺酰基、卤代烷基、卤代烷氧基、三卤代甲磺酰基、三卤代甲磺酰胺基、氨基、单取代的氨基和二取代的氨基。
如本文所用，其中“a”和“b”为整数的“Ca至Cb”是指烷基、烯基或炔基中的碳原子数目，或环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂环基的环中的碳原子数目。即烷基、烯基、炔基、环烷基的环、环烯基的环、芳基的环、杂芳基的环或杂环基的环可含有“a”至“b”(包括a、b)个碳原子。因此，例如，“C1至C4烷基”是指具有1至4个碳的所有烷基，即CH3-、CH3CH2-、CH3CH2CH2-、(CH3)2CH-、CH3CH2CH2CH2-、CH3CH2CH(CH3)-和(CH3)3C-。如果关于烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂环基未指定“a”和“b”，则假定这些定义中所述的最宽范围。
如本文所用，“烷基”是指包含完全饱和(无双键或三键)烃基的直链或支链烃链。烷基可具有1至20个碳原子(每当其在本文中出现时，数值范围诸如“1至20”是指给定范围中的各整数；例如“1至20个碳原子”意味着烷基可由1个碳原子、2个碳原子、3个碳原子等直至且包括20个碳原子组成，尽管本定义也涵盖其中未指定数值范围的术语“烷基”的出现)。烷基也可以是具有1至10个碳原子的中型烷基。烷基也可以是具有1至6个碳原子的低级烷基。化合物的烷基可命名为“C1-C4烷基”或类似名称。仅通过实例的方式，“C1-C4烷基”指示在烷基链中存在一至四个碳原子，即烷基链选自甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基和叔丁基。典型烷基包括但不限于甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。烷基可被取代或未取代。
如本文所用，“烯基”是指在直链或支链烃链中含有一个或多个双键的烃基。烯基可未取代或被取代。
如本文所用，“炔基”是指在直链或支链烃链中含有一个或多个三键的烃基。炔基可未取代或被取代。
如本文所用，“环烷基”是指完全饱和(无双键或三键)单环或多环烃环体系。当由两个或更多个环组成时，环可以稠合方式连接在一起。环烷基可在一个或多个环中含有3至10个原子或在一个或多个环中含有3至8个原子。环烷基可未取代或被取代。典型环烷基包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基和环辛基。
如本文所用，“环烯基”是指在至少一个环中含有一个或多个双键的单环或多环烃环体系；尽管如果存在超过一个双键，则双键不能形成遍及所有环的完全非定域π电子系统(否则基团将为如本文所定义的“芳基”)。当由两个或更多个环组成时，环可以稠合方式连接在一起。环烯基可在一个或多个环中含有3至10个原子或在一个或多个环中含有3至8个原子。环烯基可未取代或被取代。
如本文所用，“芳基”是指具有遍及所有环的完全非定域π电子系统的碳环(全部为碳)单环或多环芳族环体系(包括其中两个碳环共享化学键的稠合环体系)。芳基中的碳原子数目可变化。例如，芳基可以是C6-C14芳基、C6-C10芳基或C6芳基。芳基的实例包括但不限于苯、萘和薁(azulene)。芳基可被取代或未取代。
如本文所用，“杂芳基”是指单环、双环和三环芳族环体系(具有完全非定域π电子系统的环体系)，其含有一个或多个杂原子(例如1至5个杂原子)，即除碳之外的元素，包括但不限于氮、氧和硫。杂芳基的一个或多个环中的原子数目可变化。例如，杂芳基可在一个或多个环中含有4至14个原子、在一个或多个环中含有5至10个原子或在一个或多个环中含有5至6个原子。此外，术语“杂芳基”包括稠合环体系，其中两个环(诸如至少一个芳基环与至少一个杂芳基环，或至少两个杂芳基环)共享至少一个化学键。杂芳基环的实例包括但不限于呋喃、呋呫、噻吩、苯并噻吩、酞嗪、吡咯、噁唑、苯并噁唑、1,2,3-噁二唑、1,2,4-噁二唑、噻唑、1,2,3-噻二唑、1,2,4-噻二唑、苯并噻唑、咪唑、苯并咪唑、吲哚、吲唑、吡唑、苯并吡唑、异噁唑、苯并异噁唑、异噻唑、三唑、苯并三唑、噻二唑、四唑、吡啶、哒嗪、嘧啶、吡嗪、嘌呤、喋啶、喹啉、异喹啉、喹唑啉、喹喔啉、噌啉和三嗪。杂芳基可被取代或未取代。
如本文所用，“杂环基”或“杂脂环基”是指三元、四元、五元、六元、七元、八元、九元、十元直至18元单环、双环和三环环体系，其中碳原子与1至5个杂原子一起构成所述环体系。然而，杂环可任选地含有一个或多个以使得遍及所有环不存在完全非定域π电子体系的方式定位的不饱和键。杂原子为除碳之外的元素，包括但不限于氧、硫和氮。杂环可进一步含有一个或多个羰基或硫代羰基官能团，以便使该定义包括氧代体系和硫代体系，诸如内酰胺、内酯、环状酰亚胺、环状硫代酰亚胺和环状氨基甲酸酯。当由两个或更多个环组成时，环可以稠合方式连接在一起。此外，杂环基或杂脂环基中的任何氮可季铵化。杂环基或杂脂环基团可未取代或被取代。此类“杂环基”或“杂脂环基”基团的实例包括但不限于1,3-二氧杂环己烯、1,3-二氧杂环己烷、1,4-二氧杂环己烷、1,2-二氧杂环戊烷、1,3-二氧杂环戊烷、1,4-二氧杂环戊烷、1,3-氧杂硫杂环己烷、1,4-氧杂硫杂环己二烯、1,3-氧杂硫杂环戊烷、1,3-二硫杂环戊烯、1,3-二硫杂环戊烷、1,4-氧杂硫杂环己烷、四氢-1,4-噻嗪、2H-1,2-噁嗪、顺丁烯二酰亚胺、琥珀酰亚胺、巴比妥酸(barbituric acid)、硫代巴比妥酸、二氧代哌嗪、乙内酰脲、二氢尿嘧啶、三氧杂环己烷、六氢-1,3,5-三嗪、咪唑啉、咪唑烷、异噁唑啉、异噁唑烷、噁唑啉、噁唑烷、噁唑烷酮、噻唑啉、噻唑烷、吗啉、环氧乙烷、哌啶N-氧化物、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吡咯烷酮、吡咯烷二酮、4-哌啶酮、吡唑啉、吡唑烷、2-氧代吡咯烷、四氢吡喃、4H-吡喃、四氢噻喃、硫代吗啉、硫代吗啉亚砜、硫代吗啉砜及其苯并稠合的类似物(如，苯并咪唑啉酮、四氢喹啉和3,4-亚甲基二氧苯基)。
如本文所用，“芳烷基”和“芳基(烷基)”是指作为取代基经由低级亚烷基连接的芳基。芳基(烷基)的低级亚烷基和芳基可被取代或未取代。实例包括但不限于苄基、2-苯基(烷基)、3-苯基(烷基)和萘基(烷基)。
如本文所用，“杂芳烷基”和“杂芳基(烷基)”是指作为取代基经由低级亚烷基连接的杂芳基。杂芳基(烷基)的低级亚烷基和杂芳基可被取代或未取代。实例包括但不限于2-噻吩基(烷基)、3-噻吩基(烷基)、呋喃基(烷基)、噻吩基(烷基)、吡咯基(烷基)、吡啶基(烷基)、异噁唑基(烷基)、咪唑基(烷基)和其苯并稠合的类似物。
“(杂脂环基)烷基”和“(杂环基)烷基”是指作为取代基经由低级亚烷基连接的杂环或杂脂环基。(杂脂环基)烷基的低级亚烷基和杂环基可被取代或未取代。实例包括但不限于四氢-2H-吡喃-4-基(甲基)、哌啶-4-基(乙基)、哌啶-4-基(丙基)、四氢-2H-硫代吡喃-4-基(甲基)和1,3-硫杂环己烷-4-基(甲基)。
“低级亚烷基”为直链-CH2-链基团，其形成经由其末端碳原子连接分子片段的键。实例包括但不限于亚甲基(-CH2-)、亚乙基(-CH2CH2-)、亚丙基(-CH2CH2CH2-)和亚丁基(-CH2CH2CH2CH2-)。低级亚烷基可通过用“取代”的定义下所列的一个或多个取代基替代低级亚烷基的一个或多个氢而进行取代。
如本文所用，“烷氧基”是指式-OR，其中R为本文定义的烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。烷氧基的非限制性列表为甲氧基、乙氧基、正丙氧基、1-甲基乙氧基(异丙氧基)、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、苯氧基和苯甲酰氧基。烷氧基可被取代或未取代。
如本文所用，“酰基”是指作为取代基经由羰基连接的氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂脂环基、芳烷基、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。实例包括甲酰基、乙酰基、丙酰基、苯甲酰基和丙烯基。酰基可被取代或未取代。
如本文所用，“羟基烷基”是指其中一个或多个氢原子被羟基替代的烷基。示例性羟基烷基包括但不限于2-羟基乙基、3-羟基丙基、2-羟基丙基和2,2-二羟基乙基。羟基烷基可被取代或未取代。
如本文所用，“卤代烷基”是指其中一个或多个氢原子被卤素替代的烷基(例如单卤代烷基、二卤代烷基和三卤代烷基)。此类基团包括但不限于氯甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、1-氯-2-氟甲基和2-氟异丁基。卤代烷基可被取代或未取代。
如本文所用，“卤代烷氧基”是指其中一个或多个氢原子被卤素替代的-O-烷基(例如单卤代烷氧基、二卤代烷氧基和三卤代烷氧基)。此类基团包括但不限于氯甲氧基、氟甲氧基、二氟甲氧基、三氟甲氧基、1-氯-2-氟甲氧基和2-氟异丁氧基。卤代烷氧基可被取代或未取代。
“烃硫基”是指“-SR”基团，其中R可以是氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。烃硫基可被取代或未取代。
“亚磺酰基”是指“-S(=O)-R”基团，其中R可与关于烃硫基所定义的相同。亚磺酰基可被取代或未取代。
“磺酰基”是指“SO2R”基团，其中R可与关于烃硫基所定义的相同。磺酰基可被取代或未取代。
“O-羧基”基团是指“RC(=O)O-”基团，其中R可以是氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)，如本文所定义。O-羧基可被取代或未取代。
术语“酯”和“C-羧基”是指“-C(=O)OR”基团，其中R可与关于O-羧基所定义的相同。酯和C-羧基可被取代或未取代。
“硫代羰基”是指“-C(=S)R”基团，其中R可与关于O-羧基所定义的相同。硫代羰基可被取代或未取代。
“三卤代甲磺酰基”是指“X3CSO2-”基团，其中各X为卤素。
“三卤代甲磺酰胺基”是指“X3CS(O)2N(RA)-”基团，其中各X为卤素，且RA为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。
如本文所用，术语“氨基”是指-NH2基团。
如本文所用，术语“羟基”是指-OH基团。
“氰基”基团是指“-CN”基团。
如本文所用，术语“叠氮基”是指-N3基团。
“异氰酸根合”基团是指“-NCO”基团。
“氰硫基”基团是指“-CNS”基团。
“异硫氰基”基团是指“-NCS”基团。
“巯基”基团是指“-SH”基团。
“羰基”基团是指C=O基团。
“S-磺酰胺基”基团是指“-SO2N(RARB)”基团，其中RA和RB 可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。S-磺酰胺基可被取代或未取代。
“N-磺酰胺基”基团是指“RSO2N(RA)-”基团，其中R和RA可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。N-磺酰胺基可被取代或未取代。
“O-氨基甲酰基”基团是指“-OC(=O)N(RARB)”基团，其中RA 和RB可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。O-氨基甲酰基可被取代或未取代。
“N-氨基甲酰基”基团是指“ROC(=O)N(RA)-”基团，其中R和RA可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。N-氨基甲酰基可被取代或未取代。
“O-硫代氨基甲酰基”基团是指“-OC(=S)-N(RARB)”基团，其中RA和RB可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。O-硫代氨基甲酰基可被取代或未取代。
“N-硫代氨基甲酰基”基团是指“ROC(=S)N(RA)-”基团，其中R和RA可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。N-硫代氨基甲酰基可被取代或未取代。
“C-酰胺基”是指“-C(=O)N(RARB)”基团，其中RA和RB可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。C-酰胺基可被取代或未取代。
“N-酰胺基”是指“RC(=O)N(RA)-”基团，其中R和RA可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、(杂芳基)烷基或(杂环基)烷基。N-酰胺基可被取代或未取代。
如本文所用，术语“卤素原子”或“卤素”意味着元素周期表第7列中的任一种放射稳定原子，诸如氟、氯、溴和碘。
在未指定取代基数目的情况下(例如卤代烷基)，可存在一个或多个取代基。例如，“卤代烷基”可包含一个或多个相同或不同的卤素。作为另一个实例，“C1-C3烷氧基苯基”可包含含有一、二或三个原子的一个或多个相同或不同的烷氧基。
如本文所用，除非另外指明，否则关于任何保护基、氨基酸和其它化合物的缩写均根据其常见用法、公认缩写或IUPAC-IUB生物化学命名委员会(参见Biochem. 11:942-944(1972))。
术语“核苷”在本文中以以本领域技术人员所理解的其普通意义使用，且是指由连接至杂环碱或其互变异构体(诸如经由嘌呤碱的位置9或嘧啶碱的位置1连接)的任选地取代的戊糖部分或修饰的戊糖部分组成的化合物。实例包括但不限于包含核糖部分的核糖核苷和包含脱氧核糖部分的脱氧核糖核苷。修饰的戊糖部分为其中氧原子已被碳替代和/或碳已被硫或氧原子替代的戊糖部分。“核苷”为可具有被取代的碱和/或糖部分的单体。另外，核苷可被并入更大的DNA和/或RNA聚合物和寡聚物。在一些情况下，所述核苷可以是核苷类似药物。
术语“核苷酸”在本文中以本领域技术人员所理解的其普通意义使用，且是指磷酸酯结合至戊糖部分(例如在5'-位置)的核苷。
如本文所用，术语“杂环碱”是指任选地取代的含氮杂环基，其可连接至任选地取代的戊糖部分或修饰的戊糖部分。在一些实施方案中，杂环碱可选自任选地取代的嘌呤-碱、任选地取代的嘧啶-碱和任选地取代的三唑-碱(例如1,2,4-三唑)。术语“嘌呤-碱”在本文中以本领域技术人员所理解的其普通意义使用，且包括其互变异构体。类似地，术语“嘧啶-碱”在本文中以本领域技术人员所理解的其普通意义使用，且包括其互变异构体。任选地取代的嘌呤-碱的非限制性列表包括嘌呤、腺嘌呤、鸟嘌呤、次黄嘌呤、黄嘌呤、别黄嘌呤、7-烷基鸟嘌呤(例如7-甲基鸟嘌呤)、咖啡因、咖啡碱、尿酸和异鸟嘌呤。嘧啶-碱的实例包括但不限于胞嘧啶、胸腺嘧啶、尿嘧啶、5,6-二氢尿嘧啶和5-烷基胞嘧啶(例如5-甲基胞嘧啶)。任选地取代的三唑碱的实例为1,2,4-三唑-3-甲酰胺。杂环碱的其它非限制性实例包括二氨基嘌呤、8-氧代-N6-烷基腺嘌呤(例如8-氧代-N6-甲基腺嘌呤)、7-去氮黄嘌呤、7-去氮鸟嘌呤、7-去氮腺嘌呤、N4,N4-桥亚乙基胞嘧啶、N6,N6-桥亚乙基-2,6-二氨基嘌呤、5-卤代尿嘧啶(例如5-氟尿嘧啶和5-溴尿嘧啶)、假异胞嘧啶、异胞嘧啶、异鸟嘌呤，和美国专利5,432,272和7,125,855中所述的其它杂环碱，所述专利出于公开额外杂环碱的有限目的通过引用并入本文。在一些实施方案中，杂环碱可任选地被胺或一种或多种烯醇保护基取代。
术语“-N-连接的氨基酸”是指经由主链氨基或单取代的氨基连接至指定部分的氨基酸。当氨基酸以-N-连接的氨基酸连接时，作为主链氨基或单取代的氨基的一部分的氢之一不存在且氨基酸经由氮连接。N-连接的氨基酸可被取代或未取代。
术语“-N-连接的氨基酸酯衍生物”是指其中主链羧酸基团已转化为酯基的氨基酸。在一些实施方案中，酯基具有选自以下的式：烷基-O-C(=O)-、环烷基-O-C(=O)-、芳基-O-C(=O)-和芳基(烷基)-O-C(=O)-。酯基的非限制性列表包括以下的取代和未取代的形式：甲基-O-C(=O)-、乙基-O-C(=O)-、正丙基-O-C(=O)-、异丙基-O-C(=O)-、正丁基-O-C(=O)-、异丁基-O-C(=O)-、叔丁基-O-C(=O)-、新戊基-O-C(=O)-、环丙基-O-C(=O)-、环丁基-O-C(=O)-、环戊基-O-C(=O)-、环己基-O-C(=O)-、苯基-O-C(=O)-、苯甲基-O-C(=O)-和萘基-O-C(=O)-。N-连接的氨基酸酯衍生物可被取代或未取代。
术语“-O-连接的氨基酸”是指经由来自其主链羧酸基团的羟基连接至指定部分的氨基酸。当氨基酸以-O-连接的氨基酸连接时，作为来自其主链羧酸基团的羟基的一部分的氢不存在且氨基酸经由氧连接。O-连接的氨基酸可被取代或未取代。
如本文中所用，术语“氨基酸”是指任何氨基酸(标准氨基酸和非标准氨基酸)，包括但不限于α-氨基酸、β-氨基酸、γ-氨基酸和δ-氨基酸。合适的氨基酸的实例包括但不限于丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。合适的氨基酸的额外实例包括但不限于鸟氨酸、羟丁赖氨酸(hypusine)、2-氨基异丁酸、去氢丙氨酸、γ-氨基丁酸、瓜氨酸、β-丙氨酸、α-乙基-甘氨酸、α-丙基-甘氨酸和正亮氨酸。
术语“干扰素”以本领域技术人员通常理解的意义用于本文。几种类型的干扰素是本领域技术人员已知的，例如1型干扰素、2型干扰素和3型干扰素。实例的非限制性列表包括：α干扰素、β干扰素、δ干扰素、γ干扰素、λ干扰素、ω干扰素、τ干扰素、x干扰素、共有干扰素(consensus interferons)和脱唾液酸干扰素(asialo-interferons)。干扰素可以是聚乙二醇化的（pegylated）。1型干扰素的实例包括干扰素α1A、干扰素α1B、干扰素α2A、干扰素α2B、聚乙二醇化干扰素α2a（PEGASYS, Roche）、重组干扰素α2a(ROFERON, Roche)、吸入干扰素α2b(AERX, Aradigm)、聚乙二醇化干扰素α2b(ALBUFERON, Human Genome Sciences/Novartis, PEGINTRON, Schering)、重组干扰素α2b(INTRON A, Schering)、聚乙二醇化干扰素α2b(PEG-INTRON, Schering, VIRAFERONPEG, Schering)、干扰素β1a(REBIF,Serono, Inc. 和Pfizer)、共有干扰素α(INFERGEN, Valeant Pharmaceutical)。2型干扰素的实例包括干扰素γ1、干扰素γ2和聚乙二醇化干扰素γ；且3型干扰素的实例包括干扰素λ1、干扰素λ2和干扰素λ3。
术语“硫代磷酸酯(phosphorothioate)”和“硫代磷酸酯(phosphothioate)”是指通式的化合物、其质子化形式(例如和)和其互变异构体(诸如)。
如本文中所用，术语“磷酸酯”以本领域技术人员所理解的其普通意义使用，且包括其质子化形式(例如和)。如本文所用，术语“单磷酸酯”、“二磷酸酯”和“三磷酸酯”以本领域技术人员所理解的其普通意义使用，且包括质子化形式。
如本文所用，术语“保护基(protecting group)”和“保护基(protectinggroups)”是指添加至分子中以防止分子中的现有基团经历不希望的化学反应的任何原子或原子团。保护基基团的实例描述于T. W. Greene和P. G. M. Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis，第3版. John Wiley & Sons, 1999，和J.F.W. McOmie,Protective Groups in Organic Chemistry Plenum Press, 1973中，其两者均出于公开合适保护基的有限目的通过引用并入本文。保护基基团可以使得其对某些反应条件稳定并在适宜阶段容易使用本领域已知的方法去除的方式选择。保护基的非限制性列表包括苄基；取代的苄基；烷基羰基和烷氧基羰基(例如叔丁氧基羰基(BOC)、乙酰基或异丁酰基)；芳基烷基羰基和芳基烷氧基羰基(例如苄氧基羰基)；取代的甲基醚(例如甲氧基甲基醚)；取代的乙基醚；取代的苄基醚；四氢吡喃基醚；甲硅烷基(例如三甲基甲硅烷基、三乙基甲硅烷基、三异丙基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基、三异丙基甲硅烷氧基甲基、[2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲基或叔丁基二苯基甲硅烷基)；酯(例如苯甲酸酯)；碳酸酯(例如甲氧基甲基碳酸酯)；磺酸酯(例如甲苯磺酸酯或甲磺酸酯)；非环状缩酮(例如二甲基缩醛)；环状缩酮(例如1,3-二氧杂环己烷、1,3-二氧杂环戊烷和本文所述的环状缩酮)；非环状缩醛；环状缩醛(例如本文中所述的环状缩醛)；非环状半缩醛；环状半缩醛；环状二硫代缩酮(例如1,3-二噻烷或1,3-二硫杂环戊烷)；原酸酯(例如本文所述的原酸酯)；和三芳基甲基(例如三苯甲基；单甲氧基三苯甲基(MMTr)；4,4'-二甲氧基三苯甲基(DMTr)；4,4',4"-三甲氧基三苯甲基(TMTr)；和本文中所述的三芳基甲基)。
术语“药学上可接受的盐”是指对其所给药的生物体不引起显著刺激且不消除化合物的生物活性和特性的化合物的盐。在一些实施方案中，所述盐为化合物的酸加成盐。药学盐可通过使化合物与无机酸(诸如氢卤酸(例如氢氯酸或氢溴酸)、硫酸、硝酸和磷酸)反应而获得。药学盐也可通过使化合物与有机酸(诸如脂族或芳族羧酸或磺酸，例如甲酸、乙酸、丁二酸、乳酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、抗坏血酸、烟碱酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸、水杨酸或萘磺酸)反应而获得。药学盐也可通过使化合物与碱反应以形成盐(诸如铵盐；碱金属盐，诸如钠或钾盐；碱土金属盐，诸如钙或镁盐；有机碱(诸如二环己胺、N-甲基-D-葡糖胺、三(羟甲基)甲胺、C1-C7烷基胺、环己胺、三乙醇胺、乙二胺)的盐；和与氨基酸(诸如精氨酸和赖氨酸)形成的盐)而获得。
除非另有明确规定，否则本申请中所用、尤其随附权利要求中所用的术语和短语和其变型应解释为开放性的(相比于限制性)。作为前述的实例，术语“包括”应理解为意味着“包括，不限于”、“包括但不限于”等；如本文所用，术语“包含”与“包括”、“含有”或“其特征在于”同义且为包括性的或开放性的且不排除额外、未列出的要素或方法步骤；术语“具有”应解释为“至少具有”；术语“包括”应解释为“包括但不限于”；术语“实例”用于提供所讨论项的示例性情况，并非其穷举性或限制性列表；且术语如“优选地”、“优选的”、“期望的”或“所需的”和类似含义的词语的使用不应理解为意指某些特征对于结构或功能是关键的、必需的或甚至重要的，而反而仅意欲强调可用于或可不用于特定实施方案中的替代或其它特征。另外，术语“包含”应与短语“至少具有”或“至少包括”同义解释。当在方法的上下文中使用时，术语“包含”意味着该方法至少包括所述步骤，而且可包括额外步骤。当在化合物、组合物或装置的上下文中使用时，术语“包含”意味着该化合物、组合物或装置至少包括所述特征或组分，而且可包括额外特征或组分。同样，除非另外明确说明，否则与连接词“和”关联的一组项目不应理解为需要那些项目中的各自和每一者均存在于群组中，而反而应理解为“和/或”。类似地，除非另外明确说明，否则与连接词“或”关联的一组项目不应理解为在该群组中需要相互排他性，而反而应理解为“和/或”。
关于本文中实质上任何复数和/或单数术语的使用，本领域技术人员可将复数解释为单数和/或将单数解释为复数，这对于上下文和/或申请而言是适当的。为了清楚起见，本文中可明确阐述各种单数/复数排列。不定丝词“一个/种(a)”或“一个/种(an)”不排除复数。单一处理程序或其它单元可满足权利要求中所述的几项的功能。某些措施叙述于相互不同的从属权利要求中的唯一事实并不表明这些措施的组合不能有利地使用。权利要求中的任何引用符号不应解释为限制范围。
应理解，在本文所述的具有一个或多个手性中心的任何化合物中，如果未明确指定绝对立体化学，则各中心可独立地具有R构型或S构型或其混合构型。因此，本文提供的化合物可以是对映异构纯的、对映异构富集的、外消旋混合物、非对映异构纯的、非对映异构富集的或立体异构混合物。另外，应理解，在本文所述的具有一个或多个双键(其产生可定义为E或Z的几何异构体)的任何化合物中，各双键可独立地为E或Z或其混合。
同样，应理解，在所述的任何化合物中，还意欲包括所有互变异构形式。例如，意欲包括磷酸酯和硫代磷酸酯基团的所有互变异构体。硫代磷酸酯的互变异构体的实例包括以下：、、和。此外，意欲包括本领域中已知的杂环碱的所有互变异构体，包括天然和非天然嘌呤碱和嘧啶碱的互变异构体。
应理解，在本文所公开的化合物价数未填满的情况下，则价数将用氢或其同位素(例如氢-1(氕)和氢-2(氘))填充。
应理解，本文所述的化合物可同位素标记。用同位素诸如氘取代可提供由更大代谢稳定性导致的某些治疗优势，例如增加的体内半衰期或降低的剂量需求。如化合物结构中代表的各化学元素可包括所述元素的任何同位素。例如，在化合物结构中，氢原子可明确公开或理解为存在于化合物中。在可存在氢原子的化合物的任何位置处，氢原子可以是氢的任何同位素，包括但不限于氢-1(氕)和氢-2(氘)。因此，除非上下文另外明确指示，否则本文中提及化合物涵盖所有潜在同位素形式。
应理解，本文所述的方法和组合包括结晶形式(也称为多晶型物，其包括化合物的相同元素组成的不同晶体堆积排列)、非晶形相、盐、溶剂合物和水合物。在一些实施方案中，本文所述的化合物以与药学上可接受的溶剂(诸如水、乙醇等)的溶剂化形式存在。在其它实施方案中，本文所述的化合物以非溶剂化形式存在。溶剂合物含有化学计量或非化学计量的量的溶剂，且可在结晶过程期间与药学上可接受的溶剂(诸如水、乙醇等)形成。当溶剂为水时形成水合物，或当溶剂为醇时形成醇合物。另外，本文提供的化合物可以非溶剂化以及溶剂化形式存在。一般而言，出于本文提供的化合物和方法的目的，溶剂化形式被视为等效于非溶剂化形式。
在提供数值范围的情况下，应理解，范围的上限和下限以及上限和下限之间的各中间值涵盖于实施方案内。
使用方法
本文公开的一些实施方案涉及治疗和/或改善由丝状病毒科病毒引起的感染的方法，所述方法可包括向对象给药有效量的一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物。本文公开的其它实施方案涉及治疗和/或改善由丝状病毒科病毒引起的感染的方法，所述方法可包括向鉴定为患有病毒感染的对象给药有效量的一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物。
本文所述的一些实施方案涉及使用一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)制备用于改善和/或治疗由丝状病毒科病毒引起的感染的药物，所述改善和/或治疗由丝状病毒科病毒引起的感染可包括向感染该病毒的对象给药有效量的一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)。本文所述的其它实施方案涉及一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)，其可用于通过向对象给药有效量的一种或多种本文所述化合物来改善和/或治疗由丝状病毒科病毒引起的感染。
本文公开的一些实施方案涉及改善和/或治疗由丝状病毒科病毒引起的感染的方法，所述方法可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)或包含一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物接触。本文所述的其它实施方案涉及使用一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)制备用于改善和/或治疗由丝状病毒科病毒引起的感染的药物，所述改善和/或治疗由丝状病毒科病毒引起的感染可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。本文所述的其它实施方案涉及一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)，其可用于通过使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触来改善和/或治疗由丝状病毒科病毒引起的感染。
本文公开的一些实施方案涉及抑制丝状病毒科病毒复制的方法，所述方法可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)或包含一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物接触。本文中所述的其它实施方案涉及使用一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)制备用于抑制丝状病毒科病毒复制的药物，所述抑制丝状病毒科病毒复制可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。本文所述的其它实施方案涉及本文所述的化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)，其可用于通过使感染丝状病毒科病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触而抑制该病毒复制。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可抑制丝状病毒科病毒的RNA依赖性RNA聚合酶，且因此抑制RNA复制。在一些实施方案中，可通过使感染丝状病毒科病毒的细胞与本文所述的化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)接触来抑制丝状病毒科病毒的聚合酶。
埃博拉病毒属是丝状病毒科病毒家族的成员。在一些实施方案中，本文所述的化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可改善和/或治疗埃博拉病毒属感染。在其它实施方案中，一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可制备成用于改善和/或治疗由埃博拉病毒属引起的感染的药物，所述改善和/或治疗由埃博拉病毒属引起的感染可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。在其它实施方案中，一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可用于改善和/或治疗由埃博拉病毒属引起的感染，所述改善和/或治疗由埃博拉病毒属引起的感染可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。如本文所述，几种埃博拉病毒属是已知的（例如EBOV、REBOV、SEBOV、TAFV和BEBOV）。在一些实施方案中，本文所述化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可有效抵抗超过一种埃博拉病毒属的种，诸如2、3、4和/或5个种。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可有效抵抗埃博拉病毒，且由此改善埃博拉病毒感染的一种或多种症状。感染埃博拉病毒的对象所显现的症状的实例包括重度出血热、不适、发热、发冷、关节痛、肌痛、胸痛、恶心、虚弱、腹痛、腹泻、呕吐、体重下降、咽炎、喉咙痛、咳嗽、呼吸困难、打嗝、头痛、烦乱、意识模糊、疲劳、抑郁、突然发作、昏迷、斑丘疹、瘀点、紫癜、瘀癍、血肿、多器官功能障碍综合征（MODS）、血压过低、弥散性血管内凝血、局部组织坏死、肾功能受损、肝功能受损、白细胞计数低、血小板低、肝酶升高和出血（内部和/或外部，包括从鼻、口、直肠、眼和/或耳出血）。
马尔堡病毒属也是丝状病毒属家族的成员。在一些实施方案中，本文所述化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可改善和/或治疗马尔堡病毒属感染。在其它实施方案中，一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可制备成用于改善和/或治疗由马尔堡病毒属引起的感染的药物，所述改善和/或治疗由马尔堡病毒属引起的感染可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。在其它实施方案中，一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可用于改善和/或治疗由马尔堡病毒属引起的感染，所述改善和/或治疗由马尔堡病毒属引起的感染可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。MARV和RAVV是两种已知的马尔堡病毒属病毒。在一些实施方案中，本文所述化合物（例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐）可有效抵抗MARV和/或RAVV。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可有效抵抗马尔堡病毒属，且由此改善马尔堡病毒属感染的一种或多种症状。马尔堡病毒属感染的症状包括重度出血热、发热、头痛、不适、肌酸、肌痛、关节酸、关节痛、喉咙痛、虚弱、红眼症、皮疹、腹泻、腹痛、抽筋、恶心、胸痛、咳嗽、体重下降、呕吐、眼深凹、面无表情、嗜睡、皮疹、便血、吐血、从穿刺部位出血、意识模糊、易怒、攻击性、睾丸炎和出血（内部和/或外部，包括从鼻、口、直肠、眼和/或耳出血）。
埃博拉出血热（EHF）是由埃博拉病毒感染引起的疾病；且马尔堡病毒出血热（MHF）是由马尔堡病毒感染引起的疾病。埃博拉出血热和马尔堡病毒出血热都是严重并经常是致命疾病。在一些实施方案中，本文所述化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可改善和/或治疗EHF和/或MHF。在其它实施方案中，一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可制备成用于改善和/或治疗EHF和/或MHF的药物，所述改善和/或治疗EHF和/或MHF可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。在其它实施方案中，一种或多种本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)可用于改善和/或治疗EHF和/或MHF，所述改善和/或治疗EHF和/或MHF可包括使感染该病毒的细胞与有效量的一种或多种所述化合物接触。
用于测定治疗和/或改善丝状病毒科病毒感染的方法的有效性的各种指标是本领域技术人员已知的。合适指标的实例包括但不限于病毒载荷降低、病毒复制减少、血清转化时间减少(患者血清中病毒检测不到)、临床结果中发病率或死亡率降低和/或其它疾病反应指标。其它指标包括一种或多种总体生活质量健康指标，诸如疾病持续时间减少、疾病严重度减轻、恢复至正常健康和正常活动的时间减少和一种或多种症状缓解时间减少。在一些实施方案中，与作为未治疗对象的对象相比，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可导致一种或多种前述指标的降低、缓解或积极指示。
在一些实施方案中，与未治疗对象或安慰剂治疗对象中的标记物水平相比，有效量的式(I)化合物或其药学上可接受的盐可使肝纤维化标记物水平降低至少约10%、至少约20%、至少约25%、至少约30%、至少约35%、至少约40%、至少约45%、至少约50%、至少约55%、至少约60%、至少约65%、至少约70%、至少约75%或至少约80%或更多。测量血清标记物的方法是本领域技术人员已知的且包括使用对给定血清标记物特异性的抗体的基于免疫学的方法，例如酶联免疫吸附测定法(ELISA)、放射免疫测定法等。标记物实例的非限制性列表包括使用已知方法测量血清丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)、碱性磷酸酶(ALP)、γ-谷氨酰转肽酶(GGT)和总胆红素(TBIL)的水平。一般而言，小于约45IU/L(国际单位/升)的ALT水平、10-34IU/L范围内的AST、44-147IU/L范围内的ALP、0-51IU/L范围内的GGT、0.3-1.9mg/dL范围内的TBIL被视为正常。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐的有效量可以是将ALT、AST、ALP、GGT和/或TBIL水平有效降低至视为正常水平的量。
在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可导致与未治疗对象相比，与丝状病毒科病毒感染相关的一种或多种症状的长度和/或严重度降低。表1提供相比于未治疗对象，使用式(I)化合物或其药学上可接受的盐获得的百分比改善的一些实施方案。实例包括以下：在一些实施方案中，相比于针对丝状病毒科病毒感染（例如马尔堡病毒）未治疗的对象所经历的疾病持续时间，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可导致疾病持续时间降低约10%至约30%的范围；且在一些实施方案中，相比于针对埃博拉病毒感染未治疗的对象所经历的相同症状的严重度，式(I)化合物或其药学上可接受的盐导致症状(诸如本文所述症状之一)的严重度降低25%。定量副作用和/或症状的严重度的方法是本领域技术人员已知的。
表1
副作用的数目 一种或多种副作用的严重度 疾病的持续时间 一种或多种症状的严重度
低10% 低10% 低10% 低10%
低25% 低25% 低25% 低25%
低40% 低40% 低40% 低40%
低50% 低50% 低50% 低50%
低60% 低60% 低60% 低60%
低70% 低70% 低70% 低70%
低80% 低80% 低80% 低80%
低90% 低90% 低90% 低90%
低约10%至约30% 低约10%至约30% 低约10%至约30% 低约10%至约30%
低约20%至约50% 低约20%至约50% 低约20%至约50% 低约20%至约50%
低约30%至约70% 低约30%至约70% 低约30%至约70% 低约30%至约70%
低约20%至约80% 低约20%至约80% 低约20%至约80% 低约20%至约80%
在一些实施方案中，化合物可以是式(I)化合物或其药学上可接受的盐，其中R1A可以为氢。在其它实施方案中，化合物可以是式(I)化合物，其中式(I)化合物可以为单、二或三磷酸酯，或前述化合物的药学上可接受的盐。在其它实施方案中，化合物可以是式(I)化合物，其中式(I)化合物可以为硫代单磷酸酯、α-硫代二磷酸酯或α-硫代三磷酸酯，或前述化合物的药学上可接受的盐。在一些实施方案中，可用于改善和/或治疗丝状病毒科病毒感染和/或抑制丝状病毒科病毒复制的式(I)化合物或其药学上可接受的盐可以是段落[0111]-[0171]所述的任一实施方案中所提供的任一实施方案。
如本文所用，“对象”是指作为治疗、观察或实验目标的动物。“动物”包括冷血和温血脊椎动物和无脊椎动物，诸如鱼、甲壳类动物、爬行动物和尤其哺乳动物。“哺乳动物”包括但不限于小鼠、大鼠、兔、豚鼠、狗、猫、绵羊、山羊、牛、马、灵长类动物(诸如猴、黑猩猩和猿，和尤其人类)。在一些实施方案中，对象为人类。
如本文所用，术语“治疗(treating)”、“治疗(treatment)”、“治疗(therapeutic)”或“疗法(therapy)”未必意味着疾病或病况的完全治愈或消除。疾病或病况的任何不期望的病征或症状在任何程度上的任何缓解可被视为治疗和/或疗法。此外，治疗可包括可恶化患者的总体健康或外观感觉的行动。
术语“治疗有效量”和“有效量”用于指示引发指定生物或医学反应的活性化合物或药物的量。例如，化合物的有效量可以是预防、缓解或改善疾病症状或延长所治疗对象的存活期所需的量。该反应可发生于组织、系统、动物或人类中且包括所治疗疾病的病征或症状的缓解。鉴于本文提供的公开内容，有效量的确定完全在本领域技术人员的能力范围内。本文所公开的化合物作为剂量所需的有效量将取决于给药途径、所治疗的动物类型(包括人类)和考虑的特定动物的身体特征。可定制剂量以实现所需作用，但将取决于诸如以下的因素：体重、膳食、平行药物和药学领域技术人员认识到的其它因素。
如本领域技术人员所显而易见，待给药的有用体内剂量和特定给药模式将根据年龄、体重、病痛的严重度和所治疗哺乳动物物种、所用特定化合物和使用这些化合物的特定用途而变化。有效剂量水平(即实现所需结果所必需的剂量水平)的确定可由本领域技术人员使用常规方法(例如人类临床试验和体外研究)而实现。
根据所需作用和治疗适应症，剂量可广泛变化。或者，如本领域技术人员所理解，剂量可基于患者的体表面积并进行计算。尽管确切剂量将基于药物来确定，但在大多数情况下，可进行关于剂量的一些归纳。用于成人患者的日剂量方案可以是例如0.01mg至3000mg的各活性成分、优选1mg至700mg(例如5至200mg)的口服剂量。剂量可以是单一剂量或在一日或多日期间内给予的一系列两次或更多次剂量，如对象所需要。在一些实施方案中，将化合物给药连续疗法的时段，例如一周或更长，或数月或数年。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐的给药频率可小于另一药剂的给药频率。在一些实施方案中，采用式(I)化合物或其药学上可接受的盐的治疗方案的总时间可小于采用另一药剂的治疗方案的总时间。
在其中已针对至少一些病况确立化合物的人类剂量的情况下，可使用那些相同剂量或在所确立的人类剂量的约0.1%至500%、更优选约25%至250%的剂量。在未确立人类剂量的情况下，如新发现的药物组合物的情况下，合适人类剂量可从ED50或ID50值或源自体外或体内研究的其它适当值推断，如通过动物中的毒性研究和效力研究所定性。
在药学上可接受的盐的给药的情况下，剂量可以作为游离碱计算。如本领域技术人员所理解，在某些情况下，可能必需以超过或甚至远远超过上述优选剂量范围的量给药本文所公开的化合物以便有效且积极地治疗特别侵袭性的疾病或感染。
剂量和间隔时间可个别地进行调节以提供足以维持调节作用或最小有效浓度(MEC)的活性基团的血浆水平。MEC将因各化合物而变化，但可从体外数据估算。实现MEC所需的剂量将取决于个体特征和给药途径。然而，可使用HPLC测定或生物测定来测定血浆浓度。给药间隔时间也可使用MEC值来确定。组合物应使用使血浆水平在10-90%、优选30-90%且最优选50-90%的时间维持高于MEC的方案给药。在局部给药或选择性摄取的情况下，药物的有效局部浓度可能与血浆浓度无关。
应注意，主治医师会知道如何且何时由于毒性或器官功能障碍而终止、中断或调整给药。相反，主治医师也会知道如果临床反应不充足(排除毒性)，则将治疗调整至较高水平。管控目标病症中给药剂量的幅度将随所治疗病况的严重度和给药途径而变化。病况的严重度可例如部分地通过标准预后评估方法来评估。此外，剂量和可能的剂量频率也将根据个体患者的年龄、体重和反应而变化。兽医学中可使用与上述讨论的程序类似的程序。
可使用已知方法针对效力和毒性来评估本文公开的化合物。例如，特定化合物或共享某些化学基团的化合物亚组的毒理学可通过测定针对细胞系(诸如哺乳动物细胞系，优选为人类细胞系)的体外毒性来确定。此类研究的结果通常可预测动物(诸如哺乳动物，或更具体地，人类)中的毒性。或者，特定化合物在动物模型(诸如小鼠、大鼠、兔或猴)中的毒性可使用已知方法来确定。特定化合物的效力可使用几种公认方法(诸如体外方法、动物模型或人类临床试验)来确定。当选择测定效力的模型时，技术人员可通过现有技术的状态指导来选择适当模型、剂量、给药途径和/或方案。
如本文所述，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可具有中和磷酸根或硫代磷酸根的电荷的一个或多个基团。通过中和磷酸根或硫代磷酸根上的电荷，可由于化合物的亲脂性提高而促进细胞膜的渗透。一旦吸收且摄入细胞内，则与磷连接的基团可以容易通过酯酶、蛋白酶和/或其它酶去除。在一些实施方案中，与磷连接的基团可通过简单水解去除。在细胞内，因此释放的磷酸根然后可通过细胞酶代谢成二磷酸根或活性三磷酸根。同样，硫代磷酸根可代谢成α-硫代二磷酸根或α-硫代三磷酸根。此外，在一些实施方案中，改变本文所述化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)上的取代基可通过减少不期望效应(诸如异构化)而有助于维持此类化合物的效力。
在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐的硫代单磷酸酯的磷酸化可以是立体选择性的。例如，式(I)化合物的硫代单磷酸酯可被磷酸化以得到就5'-O-磷原子而言(R)或(S)非对映异构体富集的α-硫代二磷酸酯和/或α-硫代三磷酸酯化合物。例如，α-硫代二磷酸酯和/或α-硫代三磷酸酯化合物的就5'-O-磷原子而言(R)和(S)构型之一相比于就5'-O-磷原子而言(R)或(S)构型的另一者的量可以> 50%、≥ 75%、≥ 90%、≥ 95%或≥ 99%的量存在。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐的磷酸化可导致形成在5'-O-磷原子处具有(R)-构型的化合物。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐的磷酸化可导致形成在5'-O-磷原子处具有(S)-构型的化合物。
在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可充当RNA合成的链终止剂。例如，式(I)化合物可在2'-碳位置含有使得一旦化合物并入RNA链中则观察不到进一步延长的基团。例如，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可含有非氢2'-碳修饰，诸如任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基或任选地取代的C2-6炔基。
在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可具有增强的代谢和/或血浆稳定性。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可更耐受水解和/或更耐受酶促转化。例如，相比于结构相同、但O1为OH，RA、R2A、R5A、Ra1和Ra2各自为氢且R3A和R4A各自为OH的化合物，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可具有增强的代谢稳定性，增强的血浆稳定性，可更耐受水解和/或可更耐受酶促转化。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可具有改善的特性。实例特性的非限制性列表包括但不限于生物半衰期延长、生物利用度增加、效力增强、体内反应持续、给药间隔时间增加、给药量减少、细胞毒性降低、治疗疾病病况所需量减少、病毒载荷降低、血清转化(即病毒在患者血清中变得检测不到)的时间减少、持续病毒性反应增强、临床结果中发病率或死亡率降低、个体依从性提高、肝病况(诸如肝纤维化、肝硬化和/或肝癌)减轻和与其它药物的相容性。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可具有大于24小时的生物半衰期。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐的生物半衰期可大于结构相同，但O1为OH、RA、R2A、R5A、Ra1和Ra2各自为氢且R3A和R4A各自为OH的化合物。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐的抗病毒活性可强于结构相同，但O1为OH，RA、R2A、R5A、Ra1和Ra2各自为氢且R3A和R4A各自为OH的化合物。
另外，在一些实施方案中，存在中和磷酸根或硫代磷酸根电荷的一个或多个基团可通过抑制化合物的降解来提高其稳定性。此外，在一些实施方案中，存在中和磷酸根或硫代磷酸根电荷的一个或多个基团可使得化合物更耐受体内裂解且提供持久延长的效力。在一些实施方案中，中和磷酸根或硫代磷酸根电荷的一个或多个基团可通过使化合物更亲脂来促进式(I)化合物渗透细胞膜。在一些实施方案中，中和磷酸根或硫代磷酸根电荷的一个或多个基团可具有改善的口服生物利用度、改善的水性稳定性和/或降低的副产物相关毒性的风险。在一些实施方案中，出于比较目的，式(I)化合物可与结构相同，但O1为OH，RA、R2A、R5A、Ra1和Ra2各自为氢且R3A和R4A各自为OH的化合物进行比较。
组合疗法
在一些实施方案中，本文公开的化合物(诸如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与一种或多种用于治疗、改善和/或抑制丝状病毒科病毒感染的额外药剂组合使用。
在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可与一种或多种额外药剂一起以单一药物组合物的形式给药。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可与一种或多种额外药剂以两种或更多种单独的药物组合物的形式给药。例如，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可以一种药物组合物的形式给药，且额外药剂中的至少一种可以第二药物组合物的形式给药。如果存在至少两种额外药剂，则额外药剂中的一种或多种可在包含式(I)化合物或其药学上可接受的盐的第一药物组合物中，且一种或多种其它额外药剂中的至少一种可在第二药物组合物中。
当使用式(I)化合物或其药学上可接受的盐、或包含式(I)化合物或其药学上可接受的盐和一种或多种额外药剂的药物组合物时的一种或多种给药量和一种或多种给药时程在本领域技术人员的知识内。式(I)化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种额外药剂的给药顺序可改变。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可在所有额外药剂之前给药。在其它实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可在至少一种额外药剂之前给药。在其它实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可与一种或多种额外药剂同时给药。在其它实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可在给药至少一种额外药剂之后给药。在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可在给药所有额外药剂之后给药。
在一些实施方案中，与一种或多种额外药剂组合的式(I)化合物或其药学上可接受的盐的组合可导致累加效应。在一些实施方案中，与一种或多种额外药剂组合使用的式(I)化合物或其药学上可接受的盐的组合可导致协同效应。在一些实施方案中，与一种或多种额外药剂组合使用的式(I)化合物或其药学上可接受的盐的组合可导致强协同效应。在一些实施方案中，与一种或多种额外药剂组合的式(I)化合物或其药学上可接受的盐的组合不是拮抗的。
如本文所用，术语“拮抗的”意味着化合物组合的活性小于组合中化合物活性的总和(当各化合物的活性个别地(即作为单一化合物)测定时)。如本文所用，术语“协同效应”意味着化合物组合的活性大于组合中化合物的个别活性的总和(当各化合物的活性个别地测定时)。如本文所用，术语“累加效应”意味着化合物组合的活性约等于组合中化合物的个别活性的总和(当各化合物的活性个别地测定时)。
相比于给药一种或多种额外药剂而不给药式(I)化合物或其药学上可接受的盐时实现相同治疗结果所需的量，组合利用式(I)化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种额外药剂的潜在优势可以是有效治疗本文所公开的疾病病况(例如丝状病毒科病毒感染)的一种或多种额外药剂的一种或多种所需量降低。例如，对于治疗马尔堡病毒感染，组合使用的额外药剂(包括其药学上可接受的盐)的量可小于当作为单一疗法给药时实现相同病毒载荷降低所需的额外药剂(包括其药学上可接受的盐)的量。组合利用式(I)化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种额外药剂的另一潜在优势为，相比于化合物作为单一疗法给药时的障碍，使用两种或更多种具有不同作用机制的化合物可对耐药性病毒株系的发展产生更高的障碍。
组合利用式(I)化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种额外药剂的其它优势可包括式(I)化合物或其药学上可接受的盐和其一种或多种额外药剂之间的交叉抗性很小至无交叉抗性；用于消除式(I)化合物或其药学上可接受的盐和一种或多种额外药剂的途径不同；式(I)化合物或其药学上可接受的盐和一种或多种额外药剂之间的重叠毒性很小至无重叠毒性；对细胞色素P450的影响很小至无显著影响；式(I)化合物或其药学上可接受的盐和一种或多种额外药剂之间的药代动力学相互作用很小至无药物动力学相互作用；实现持续病毒反应的对象百分比大于化合物作为单一疗法给药时的对象百分比和/或实现持续病毒反应的治疗时间短于化合物作为单一疗法给药时的治疗时间。
对于治疗丝状病毒科病毒感染，可与式(I)化合物或其药学上可接受的盐或包含式(I)化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物组合使用的额外药剂的实例描述于本文中。可组合用于治疗丝状病毒科病毒感染的化合物的实例包括干扰素（例如本文描述的那些，例如干扰素α2b和/或IFN-β治疗）、 三唑核苷、(2S,3S,4R,5R)-2-(4-氨基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-7-基)-5-(羟基甲基)吡咯烷-3,4-二醇(BCX 4430, BioCryst)、5-氟-2-氧代-1H-吡嗪-3-甲酰胺 (T-705, favipiravir)、十六烷基氧基丙基-西多福韦(brincidofovir, CMX001)、AVI-7537 (PMOplus低聚物，其直接结合至病毒VP24转录RNA(GCC+ATG GT+T TT+T TC+T C+AG G), Sarepta疗法), AVI-7288 (PMOplus低聚物，其直接结合至核蛋白（NP）转录的病毒RNA，结合平衡常数为6.5 10-12M (CC+T GCC C+TT TGT+TCT+AGT+TG), Sarepta疗法)、ZMapp (MB-003 (Pettitt, J.,等, Sci Transl Med (2013年8月21日) 5(199):199ra113)和ZMab (Qiu, X.,等, Sci Transl Med (2012年6月13日) 4(138):138ra81, Mapp Pharmaceuticals的组合疗法)和TKM-埃博拉(抗埃博拉病毒RNAi疗法(Geisbert, T.W.等, The Lancet (2010年5月29日) 375(9729):1896-1905), TekmiraPharmaceuticals)。
化合物
本文公开的一些实施方案涉及式(I)化合物或其药学上可接受的盐的方法和/或用途：
其中：B1A可以是任选地取代的杂环碱或具有保护的氨基的任选地取代的杂环碱；--------可不存在或可以是单键，条件是两个--------均不存在或两个--------均为单键；当两个--------均不存在时，则Z1可不存在，O1可以是OR1A，R3A可选自氢、卤素、OH、OC(=O)R"A和任选地取代的O-连接的氨基酸，R4A可选自氢、OH、卤素、N3、-OC(=O)R"B、任选地取代的O-连接的氨基酸和NR"B1R"B2，或R3A和R4A可以均为经由羰基连接以形成5元环的氧原子；当--------各自为单键时，则Z1可以是，O1可以是O，R3A可以是O；R4A可选自氢、OH、卤素、N3、-OC(=O)R"B、任选地取代的O-连接的氨基酸和NR"B1R"B2；且R1B可选自O-、OH、-O-任选地取代的C1-6烷基、、、、、任选地取代的N-连接的氨基酸和任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物；Ra1和Ra2可独立地为氢或氘；RA可以是氢、氘、未取代的C1-3烷基、未取代的C2-4烯基、未取代的C2-3炔基或氰基；R1A可选自氢、任选地取代的酰基、任选地取代的O-连接的氨基酸、、和；R2A可以是氢、叠氮基（N3）、卤素、未取代的C1-4烷基、未取代的C2-4烯基、未取代的C2-4炔基、卤素(C1-6烷基)、-(CH2)1-6N3、-(CH2)1-6NH2、-(CH2)1-6-环A或-CN；R5A可选自氢、卤素、OH、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；R6A、R7A和R8A可独立地选自不存在、氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基、任选地取代的芳基、任选地取代的杂芳基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)、任选地取代的*–(CR15AR16A)p–O–C1-24 烷基、任选地取代的*–(CR17AR18A)q–O–C1-24 烯基、、、、、和；或R6A可以是且R7A可不存在或可以是氢；或R6A和R7A可一起形成选自以下的基团：任选地取代的和任选地取代的，其中连接至R6A和R7A的氧、磷与该基团形成六元至十元环体系；R9A可独立地选自任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基、NR30AR31A、任选地取代的N-连接的氨基酸和任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物；R10A和R11A可独立地为任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物；R12A和R13A可独立地不存在或为氢；R14A可以是O-、OH或甲基；各R15A、各R16A、各R17A和各R18A可独立地为氢、任选地取代的C1-24烷基或烷氧基；R19A、R20A、R22A、R23A、R2B、R3B、R5B和R6B可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基和任选地取代的芳基；R21A和R4B可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的-O-C1-24烷基、任选地取代的-O-芳基、任选地取代的-O-杂芳基和任选地取代的-O-单环杂环基；R24A和R7B可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的-O-C1-24烷基、任选地取代的-O-芳基、任选地取代的-O-杂芳基、任选地取代的-O-单环杂环基和；R25A、R26A、R29A、R8B和R9B可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基和任选地取代的芳基；R27A1和R27A2可独立地选自-C≡N、任选地取代的C2-8有机基羰基、任选地取代的C2-8烷氧基羰基和任选地取代的C2-8有机基氨基羰基；R28A可选自氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基和任选地取代的C3-6环烯基；R30A和R31A可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基和任选地取代的芳基(C1-4烷基)；R"A和各R"B可独立地为任选地取代的C1-24烷基；各R"B1和各R"B2可独立地为氢或任选地取代的C1-6烷基；环A可以是任选地取代的单环杂芳基或任选地取代的单环杂环基；m和w可独立地为0或1；p和q可独立地为1、2或3；r和s可独立地为0、1、2或3；t和v可独立地为1或2；u和y可独立地为3、4或5；且Z1A、Z2A、Z3A、Z4A、Z1B和Z2B可独立地为氧(O)或硫(S)。
式(I)化合物可以是核苷、核苷酸(包括单磷酸酯、二磷酸酯、三磷酸酯、硫代单磷酸酯、α-硫代二磷酸酯和/或α-硫代三磷酸酯)或核苷酸前药。在一些实施方案中，--------可均不存在，Z1可不存在，O1可以是OR1A，R3A可选自氢、卤素、OH、-OC(=O)R"A和任选地取代的O-连接的氨基酸，R4A可选自OH、卤素、-OC(=O)R"B和任选地取代的O-连接的氨基酸，或R3A与R4A可以均为经由羰基连接以形成5元环的氧原子。
当两个------均不存在时，可将各种取代基连接至式(I)的5'位置。在一些实施方案中，R1A可以是氢。在其它实施方案中，R1A可以是任选地取代的酰基。例如，R1A可以是-C(=O)R39A，其中R39A可选自任选地取代的C1-12烷基、任选地取代的C2-12烯基、任选地取代的C2-12炔基、任选地取代的C3-8环烷基、任选地取代的C5-8环烯基、任选地取代的C6-10芳基、任选地取代的杂芳基、任选地取代的杂环基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)、任选地取代的杂芳基(C1-6烷基)和任选地取代的杂环基(C1-6烷基)。在一些实施方案中，R39A可以是取代的C1-12烷基。在其它实施方案中，R39A可以是未取代的C1-12烷基。在一些实施方案中，R1A可以是-C(=O)-未取代的C1-4烷基。在一些实施方案中，Ra1和Ra2可以均为氢。在其它实施方案中，Ra1可以是氢且Ra2可以是氘。在其它实施方案中，Ra1和Ra2可以均为氘。
在其它实施方案中，R1A可以是任选地取代的O-连接的氨基酸。合适的O-连接的氨基酸的实例包括丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。合适氨基酸的额外实例包括但不限于鸟氨酸、羟丁赖氨酸、2-氨基异丁酸、去氢丙氨酸、γ-氨基丁酸、瓜氨酸、β-丙氨酸、α-乙基-甘氨酸、α-丙基-甘氨酸和正亮氨酸。在一些实施方案中，O-连接的氨基酸可具有结构，其中R40A可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C1-6卤代烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C6芳基、任选地取代的C10芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)；且R41A可以是氢或任选地取代的C1-4烷基；或R40A和R41A可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。本领域技术人员理解，当R1A为任选地取代的O-连接的氨基酸时，式(I)的R1AO-的氧为任选地取代的O-连接的氨基酸的一部分。例如，当R1A为时，用“*”标记的氧为式(I)的R1AO-的氧。
当R40A被取代时，R40A可被一个或多个选自以下的取代基取代：N-酰胺基、巯基、烷硫基、任选地取代的芳基、羟基、任选地取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在一些实施方案中，R40A可以是未取代的C1-6烷基，诸如本文所述的那些。在一些实施方案中，R40A可以是氢。在其它实施方案中，R40A可以是甲基。在一些实施方案中，R41A可以是氢。在其它实施方案中，R41A可以是任选地取代的C1-4烷基，诸如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一些实施方案中，R41A可以是甲基。根据针对R40A和R41A选择的基团，R40A和R41A连接的碳可以是手性中心。在一些实施方案中，R40A和R41A连接的碳可以是(R)-手性中心。在其它实施方案中，R40A和R41A连接的碳可以是(S)-手性中心。
合适的的实例包括以下：、、、、、、和。
在一些实施方案中，R1A可以是。在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为氢。在其它实施方案中，R6A和R7A可均不存在。在其它实施方案中，R6A和R7A的至少一个可不存在。在其它实施方案中，R6A和R7A的至少一个可以是氢。本领域技术人员理解，当R6A和/或R7A不存在时，一个或多个结合的氧将具有负电荷。例如，当R6A不存在时，与R6A结合的氧将具有负电荷。在一些实施方案中，Z1A可以是O(氧)。在其它实施方案中，Z1A可以是S(硫)。在一些实施方案中，R1A可以是单磷酸酯。在其它实施方案中，R1A可以是单硫代磷酸酯。
在一些实施方案中，R1A可以是；R6A可以是；R7A可不存在或为氢；R12A和R13A可独立地不存在或为氢；R14A可以是O-、OH或甲基；且m可以是0或1。在一些实施方案中，m可以是0，且R7A、R12A和R13A可独立地不存在或为氢。在其它实施方案中，m可以是1，且R7A、R12A和R13A可独立地不存在或为氢；且R14A可以是O-、OH或甲基。在一些实施方案中，m可以是1，且R7A、R12A和R13A可独立地不存在或为氢；且R14A可以是O-或OH。在其它实施方案中，m可以是1，且R7A、R12A和R13A可独立地不存在或为氢；且R14A可以是甲基。本领域技术人员理解，当m为0时，R6A可以是二磷酸酯基(当Z1A为氧时)或α-硫代二磷酸酯基(当Z1A为硫时)。同样，本领域技术人员理解，当m为1时，R6A可以是三磷酸酯基(当Z1A为氧时)或α-硫代三磷酸酯基(当Z1A为硫时)。
在一些实施方案中，当R1A为时，R6A和R7A之一可以是氢，且R6A和R7A的另一个可选自任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基、任选地取代的芳基、任选地取代的杂芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)。在一些实施方案中，R6A和R7A之一可以是氢，且R6A和R7A中的另一个可以是任选地取代的C1-24烷基。在其它实施方案中，R6A和R7A均可独立地选自任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基、任选地取代的芳基、任选地取代的杂芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)。在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为任选地取代的C1-24烷基。在其它实施方案中，R6A和R7A可以均为任选地取代的C2-24烯基。在一些实施方案中，R6A和R7A可独立地为任选地取代的选自以下的基团：肉豆蔻油基、肉豆蔻基、棕榈油基、棕榈基、sapienyl、油基、反油醇基(elaidyl)、十八烯基(vaccenyl)、十八碳二烯基(linoleyl)、α-十八碳三烯基(α-linolenyl)、二十碳四烯基(arachidonyl)、二十碳五烯基(eicosapentaenyl)、二十二碳烯基(erucyl)、二十二碳六烯基(docosahexaenyl)、辛酰基(caprylyl)、辛基(capryl)、月桂基、硬脂基、二十烷基、二十二烷基、二十四烷基和二十六烷基。
在一些实施方案中，R6A和R7A中的至少一个可以是*–(CR15AR16A)p–O–C1-24 烷基。在其它实施方案中，R6A和R7A可以均为*–(CR15AR16A)p–O–C1-24 烷基。在一些实施方案中，各R15A和各R16A可以均为氢。在其它实施方案中，R15A和R16A中的至少一个可以是任选地取代的C1-24烷基。在其它实施方案中，R15A和R16A中的至少一个可以是烷氧基(例如苯甲酰氧基)。在一些实施方案中，p可以是1。在其它实施方案中，p可以是2。在其它实施方案中，p可以是3。
在一些实施方案中，R6A和R7A中的至少一个可以是*–(CR17AR18A)q–O–C2-24 烯基。在其它实施方案中，R6A和R7A可以均为*–(CR17AR18A)q–O–C2-24 烯基。在一些实施方案中，各R17A和各R18A可以均为氢。在其它实施方案中，R17A和R18A中的至少一个可以是任选地取代的C1-24烷基。在一些实施方案中，q可以是1。在其它实施方案中，q可以是2。在其它实施方案中，q可以是3。当R6A和R7A中的至少一个为*–(CR15AR16A)p–O–C1-24 烷基或*–(CR17AR18A)q–O–C2-24 烯基时，C1-24烷基可选自辛酰基、辛基、月桂基、肉豆蔻基、棕榈基、硬脂基、二十烷基、二十二烷基、二十四烷基和二十六烷基，且C2-24烯基可选自肉豆蔻油基、棕榈油基、sapienyl、油基、反油醇基(elaidyl)、十八烯基、十八碳二烯基、α-十八碳三烯基、二十碳四烯基、二十碳五烯基、二十二碳烯基和二十二碳六烯基。
在一些实施方案中，当R1A为时，R6A和R7A中的至少一个可选自、和；且R6A和R7A中的另一个可选自不存在、氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基、任选地取代的芳基、任选地取代的杂芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)。
在一些实施方案中，R6A和R7A中的至少一个可以是或。在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为。当R6A和R7A中的一个或两个为时，R19A和R20A可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基和任选地取代的芳基；且R21A可选自氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的-O-C1-24烷基、任选地取代的-O-芳基、任选地取代的-O-杂芳基和任选地取代的-O-单环杂环基。在一些实施方案中，R19A和R20A可以是氢。在其它实施方案中，R19A和R20A中的至少一个可以是任选地取代的C1-24烷基或任选地取代的芳基。在一些实施方案中，R21A可以是任选地取代的C1-24烷基。在一些实施方案中，R21A可以是未取代的C1-4烷基。在其它实施方案中，R21A可以是任选地取代的芳基。在其它实施方案中，R21A可以是任选地取代的-O-C1-24烷基、任选地取代的-O-芳基、任选地取代的-O-杂芳基或任选地取代的-O-单环杂环基。在一些实施方案中，R21A可以是未取代的-O-C1-4烷基。
在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为。当R6A和R7A中的一个或两个为时，R22A和R23A可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基和任选地取代的芳基；R24A可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的-O-C1-24烷基、任选地取代的-O-芳基、任选地取代的-O-杂芳基和任选地取代的-O-单环杂环基；s可以是0、1、2或3；且Z4A可独立地为O(氧)或S(硫)。在一些实施方案中，R22A和R23A可以是氢。在其它实施方案中，R22A和R23A中的至少一个可以是任选地取代的C1-24烷基或任选地取代的芳基。在一些实施方案中，R24A可以是任选地取代的C1-24烷基。在一些实施方案中，R24A可以是未取代的C1-4烷基。在其它实施方案中，R24A可以是任选地取代的芳基。在其它实施方案中，R24A可以是任选地取代的-O-C1-24烷基、任选地取代的-O-芳基、任选地取代的-O-杂芳基或任选地取代的-O-单环杂环基。在其它实施方案中，R24A可以是。在一些实施方案中，R24A可以是未取代的-O-C1-4烷基。在一些实施方案中，Z4A可以是O(氧)。在其它实施方案中，Z4A可以是S(硫)。在一些实施方案中，s可以是0。在其它实施方案中，s可以是1。在其它实施方案中，s可以是2。在其它实施方案中，s可以是3。在一些实施方案中，s可以是0且R24A可以是。在一些实施方案中，R6A和R7A中的一个或两个可以是任选地取代的异丙基氧基羰基氧基甲基(POC)。在一些实施方案中，R6A和R7A各自可以是任选地取代的异丙基氧基羰基氧基甲基(POC)基团，且形成任选地取代的双(异丙基氧基羰基氧基甲基)(双(POC))前药。在其它实施方案中，R6A和R7A中的一个或两个可以是任选地取代的新戊酰基氧基甲基(POM)。在一些实施方案中，R6A和R7A各自可以是任选地取代的新戊酰基氧基甲基(POM)基团，且形成任选地取代的双(新戊酰基氧基甲基)(双(POM))前药。
在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为。当R6A和R7A中的一个或两个为时，R27A1和R27A可独立地为-C≡N或任选地取代的选自以下的取代基：C2-8有机基羰基、C2-8烷氧基羰基和C2-8有机基氨基羰基；R28A可选自氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基和任选地取代的C3-6环烯基；且t可以是1或2。在一些实施方案中，R27A1可以是-C≡N且R27A2可以是任选地取代的C2-8烷氧基羰基，诸如-C(=O)OCH3。在其它实施方案中，R27A1可以是-C≡N且R27A2可以是任选地取代的C2-8有机基氨基羰基，例如–C(=O)NHCH2CH3和–C(=O)NHCH2CH2苯基。在一些实施方案中，R27A1和R27A2可以均为任选地取代的C2-8有机基羰基，诸如-C(=O)CH3。在一些实施方案中，R27A1和R27A2可以均为任选地取代的C1-8 烷氧基羰基，例如–C(=O)OCH2CH3和–C(=O)OCH3。在一些实施方案(包括本段落中所述的那些)中，R28A可以是任选地取代的C1-4烷基。在一些实施方案中，R28A可以是甲基或叔丁基。在一些实施方案中，t可以是1。在其它实施方案中，t可以是2。
在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为任选地取代的芳基。在一些实施方案中，R6A和R7A中的至少一个可以是任选地取代的芳基。例如，R6A和R7A可以均为任选地取代的苯基或任选地取代的萘基。当取代时，取代的芳基可被1、2、3个或超过3个取代基取代。当存在超过两个取代基时，取代基可以是相同或不同的。在一些实施方案中，当R6A和R7A中的至少一个为取代的苯基时，取代的苯基可以是对位、邻位或间位取代的苯基。
在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为任选地取代的芳基(C1-6烷基)。在一些实施方案中，R6A和R7A中的至少一个可以是任选地取代的芳基(C1-6烷基)。例如，R6A和R7A可以均为任选地取代的苄基。当取代时，取代的苄基可被1、2、3个或超过3个取代基取代。当存在超过两个取代基时，取代基可以是相同或不同的。在一些实施方案中，芳基(C1-6烷基)的芳基可以是对位、邻位或间位取代的苯基。
在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为。在一些实施方案中，R6A和R7A中的至少一个可以是。在一些实施方案中，R25A可以是氢。在其它实施方案中，R25A可以是任选地取代的C1-24烷基。在其它实施方案中，R25A可以是任选地取代的芳基(例如任选地取代的苯基)。在一些实施方案中，R25A可以是C1-6烷基，例如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊基(支链和直链)和己基(支链和直链)。在一些实施方案中，w可以是0。在其它实施方案中，w可以是1。在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为任选地取代的S-酰基硫代乙基(SATE)且形成任选地取代的SATE酯前药。
在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为。在一些实施方案中，R6A和R7A中的至少一个可以是。在一些实施方案中，R26A可以是氢。在其它实施方案中，R26A可以是任选地取代的C1-24烷基。在其它实施方案中，R26A可以是任选地取代的芳基，例如任选地取代的苯基。在一些实施方案中，R26A可以是任选地取代的C1-6烷基。在一些实施方案中，R26A可以是未取代的C1-6烷基。在一些实施方案中，y可以是3。在其它实施方案中，y可以是4。在其它实施方案中，y可以是5。
在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为。在一些实施方案中，R6A和R7A中的至少一个可以是。在一些实施方案中，R29A可以是氢。在其它实施方案中，R29A可以是任选地取代的C1-24烷基。在一些实施方案中，R29A可以是C1-4烷基，诸如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在其它实施方案中，R29A可以是任选地取代的芳基，诸如任选地取代的苯基或任选地取代的萘基。在一些实施方案中，R6A和R7A可以均为任选地取代的间二氧杂环戊烯酮基团且形成任选地取代的间二氧杂环戊烯酮前药。
在一些实施方案中，R6A和 R7A可一起形成任选地取代的。例如，R1A可以是任选地取代的。当被取代时，环可被取代1、2、3次或超过3次。当被多个取代基取代时，取代基可以是相同或不同的。在一些实施方案中，当R1A为时，环可被任选地取代的芳基和/或任选地取代的杂芳基取代。合适杂芳基的实例为吡啶基。在一些实施方案中，R6A和R7A可一起形成任选地取代的，诸如，其中R32A可以是任选地取代的芳基、任选地取代的杂芳基或任选地取代的杂环基。在一些实施方案中，R6A和R7A可形成任选地取代的环状1-芳基-1,3-丙基酯(HepDirect)前药基团。
在一些实施方案中，R6A和R7A可一起形成任选地取代的，其中连接至R6A和R7A的氧、磷和该基团形成六元至十元环体系。任选地取代的的实例包括、、和。在一些实施方案中，R6A和R7A可形成任选地取代的环水杨醇基（cyclosaligenyl）(cycloSal)前药。
在一些实施方案中，R6A和R7A可相同。在一些实施方案中，R6A和R7A可不同。
在一些实施方案中，Z1A可以是氧。在其它实施方案中，Z1A可以是硫。
在一些实施方案中，R1A可以是。在一些实施方案中，R8A可选自不存在、氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基和任选地取代的C3-6环烯基；且R9A可独立地选自任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基和任选地取代的C3-6环烯基。
在一些实施方案中，R8A可以是氢，且R9A可以是任选地取代的C1-6烷基。合适C1-6烷基的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊基(支链和直链)和己基(支链和直链)。在其它实施方案中，R8A可以是氢，且R9A可以是NR30AR31A，其中R30A和R31A可独立地选自氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基和任选地取代的C3-6环烯基以及任选地取代的芳基(C1-4烷基)。在一些实施方案中，R30A和R31A之一可以是氢且R30A和R31A中的另一个可以是任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基、任选地取代的C2-6炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基和任选地取代的苄基。
在一些实施方案中，R8A可不存在或为氢；且R9A可以是任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物。在其它实施方案中，R8A可以是任选地取代的芳基；且R9A可以是任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物。在其它实施方案中，R8A可以是任选地取代的杂芳基；且R9A可以是任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物。在一些实施方案中，R9A可选自丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸、缬氨酸和其酯衍生物。任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物的实例包括以下物质的任选地取代的形式：N-丙氨酸异丙酯、N-丙氨酸环己酯、N-丙氨酸新戊酯、N-缬氨酸异丙酯和N-亮氨酸异丙酯。在一些实施方案中，R9A可具有结构，其中R33A可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)和任选地取代的卤代烷基；R34A可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C1-6卤代烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C6芳基、任选地取代的C10芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)；且R35A可以是氢或任选地取代的C1-4烷基；或R34A和R35A可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。
当R34A被取代时，R34A可被一个或多个选自以下的取代基取代：N-酰胺基、巯基、烷硫基、任选地取代的芳基、羟基、任选地取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在一些实施方案中，R34A可以是未取代的C1-6烷基，诸如本文所述的那些。在一些实施方案中，R34A可以是氢。在其它实施方案中，R34A可以是甲基。在一些实施方案中，R33A可以是任选地取代的C1-6烷基。任选地取代的C1-6烷基的实例包括以下基团的任选地取代的变体：甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊基(支链和直链)和己基(支链和直链)。在一些实施方案中，R33A可以是甲基或异丙基。在一些实施方案中，R33A可以是乙基或新戊基。在其它实施方案中，R33A可以是任选地取代的C3-6环烷基。任选地取代的C3-6环烷基的实例包括以下基团的任选地取代的变体：环丙基、环丁基、环戊基和环己基。在一些实施方案中，R33A可以是任选地取代的环己基。在其它实施方案中，R33A可以是任选地取代的芳基，诸如苯基和萘基。在其它实施方案中，R33A可以是任选地取代的芳基(C1-6烷基)。在一些实施方案中，R33A可以是任选地取代的苄基。在一些实施方案中，R33A可以是任选地取代的C1-6卤代烷基，例如CF3。在一些实施方案中，R35A可以是氢。在其它实施方案中，R35A可以是任选地取代的C1-4烷基，诸如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一些实施方案中，R35A可以是甲基。在一些实施方案中，R34A和R35A可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。任选地取代的C3-6环烷基的实例包括以下基团的任选地取代的变体：环丙基、环丁基、环戊基和环己基。根据针对R34A和R35A所选的基团，R34A和R35A连接的碳可以是手性中心。在一些实施方案中，R34A和R35A连接的碳可以是(R)-手性中心。在其它实施方案中，R34A和R35A连接的碳可以是(S)-手性中心。
在一些实施方案中，当R1A为时，Z2A可以是O(氧)。在其它实施方案中，当R1A为时，Z2A可以是S(硫)。在一些实施方案中，当R1A为时，式(I)化合物可以是任选地取代的磷酰氨酸酯（phosphoroamidate）前药，诸如任选地取代的磷酰氨酸芳基酯前药。
在一些实施方案中，R1A可以是。在一些实施方案中，R10A和R11A可以均为任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物。在一些实施方案中，R10A和R11A可独立地选自丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸、缬氨酸和其酯衍生物。在一些实施方案中，R10A和R11A可以是以下物质的任选地取代的形式：N-丙氨酸异丙酯、N-丙氨酸环己酯、N-丙氨酸新戊酯、N-缬氨酸异丙酯和N-亮氨酸异丙酯。在一些实施方案中，R10A和R11A可独立地具有结构，其中R36A可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)和任选地取代的卤代烷基；R37A可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C1-6卤代烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C6芳基、任选地取代的C10芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)；且R38A可以是氢或任选地取代的C1-4烷基；或R37A和R38A可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。
当R37A被取代时，R37A可被一个或多个选自以下的取代基取代：N-酰胺基、巯基、烷硫基、任选地取代的芳基、羟基、任选地取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在一些实施方案中，R37A可以是未取代的C1-6烷基，诸如本文所述的那些。在一些实施方案中，R37A可以是氢。在其它实施方案中，R37A可以是甲基。在一些实施方案中，R36A可以是任选地取代的C1-6烷基。任选地取代的C1-6烷基的实例包括以下基团的任选地取代的变体：甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊基(支链和直链)和己基(支链和直链)。在一些实施方案中，R36A可以是甲基或异丙基。在一些实施方案中，R36A可以是乙基或新戊基。在其它实施方案中，R36A可以是任选地取代的C3-6环烷基。任选地取代的C3-6环烷基的实例包括以下基团的任选地取代的变体：环丙基、环丁基、环戊基和环己基。在一些实施方案中，R36A可以是任选地取代的环己基。在其它实施方案中，R36A可以是任选地取代的芳基，诸如苯基和萘基。在其它实施方案中，R36A可以是任选地取代的芳基(C1-6烷基)。在一些实施方案中，R36A可以是任选地取代的苄基。在一些实施方案中，R36A可以是任选地取代的C1-6卤代烷基，例如CF3。在一些实施方案中，R38A可以是氢。在其它实施方案中，R38A可以是任选地取代的C1-4烷基，诸如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一些实施方案中，R38A可以是甲基。在一些实施方案中，R37A和R38A可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。任选地取代的C3-6环烷基的实例包括以下基团的任选地取代的变体：环丙基、环丁基、环戊基和环己基。根据针对R37A和R38A所选的基团，R37A和R38A连接的碳可以是手性中心。在一些实施方案中，R37A和R38A连接的碳可以是(R)-手性中心。在其它实施方案中，R37A和R38A连接的碳可以是(S)-手性中心。
合适的和基团的实例包括以下：
、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、和。
在一些实施方案中，R10A和R11A可相同。在一些实施方案中，R10A和R11A可不同。
在一些实施方案中，Z3A可以是O(氧)。在其它实施方案中，Z3A可以是S(硫)。在一些实施方案中，当R1A为时，式(I)化合物可以是任选地取代的膦酸二酰胺前药。
戊糖环的4'位置可存在各种取代基。在一些实施方案中，R2A可以是未取代的C1-4烷基。未取代的C1-4烷基包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在其它实施方案中，R2A可以是未取代的C2-4烯基，诸如乙烯基、丙烯基和丁烯基。在其它实施方案中，R2A可以是未取代的C2-4炔基，例如乙炔基、丙炔基和丁炔基。在其它实施方案中，R2A可以是卤素(C1-6烷基)，例如-(CH2)0-5(CR2A1R2A2)卤素，其中R2A1和R2A2可以独立地为氢或卤素，条件是R2A1和R2A2 的至少一个是卤素。卤素(C1-6烷基)的实例为-(CH2)1-6卤素、-(CH2)0-5(CH)(卤素)2和-(CH2)0-5-C(卤素)3。在一些实施方案中，卤素(C1-6烷基)可以是-(CH2)1-6F或-(CH2)1- 6Cl。在其它实施方案中，卤代烷基可以是-(CH2)0-5CHF2或-(CH2)0-5CF3。在一些实施方案中，卤素(C1-6烷基)可以是氟甲基。在一些实施方案中，R2A可以是-CHF2。在其它实施方案中，R2A可以是-CF3。在其它实施方案中，R2A可以是C1-6叠氮基烷基。例如，R2A可以是叠氮基甲基、叠氮基乙基、叠氮基丙基、叠氮基丁基、叠氮基戊基或叠氮基己基。在一些实施方案中，R2A可以是C1-6氨基烷基。例如，R2A可以是氨基甲基、氨基乙基、氨基丙基、氨基丁基、氨基戊基或氨基己基。在其它实施方案中，R2A可以是卤素。例如，R2A可以是氟(F)或氯(Cl)。在其它实施方案中，R2A可以是氢。在其它实施方案中，R2A可以是叠氮基（N3）。在一些实施方案中，R2A可以是-(CH2)1-6环A。如本文所述，在一些实施方案中，环A可以是任选地取代的单环杂芳基（例如5或6元任选地取代的杂芳基）。在其它实施方案中，环A可以是任选地取代的单环杂环基，例如5或6元任选地取代的杂环基。在其它实施方案中，R2A可以是-CN。
戊糖环的2'位置也可存在多种取代基。在一些实施方案中，R4A可以是OH。在其它实施方案中，R4A可以是-OC(=O)R"B，其中R"B可以是任选地取代的C1-24烷基。在一些实施方案中，R4A可以是-OC(=O)R"B，其中R"B可以是未取代的C1-4烷基。在其它实施方案中，R4A可以是卤素。在一些实施方案中，R4A可以是F。在其它实施方案中，R4A可以是Cl。在一些实施方案中，R4A可以是N3。在一些实施方案中，R4A可以是NR"B1R"B2。例如，R4A可以是NH2。其它实例可以是单取代的C1-6烷基-胺或二取代的C1-6烷基-胺。在其它实施方案中，R4A可以是氢(H)。
在其它实施方案中，R4A可以是任选地取代的O-连接的氨基酸，诸如O-连接的α-氨基酸。在一些实施方案中，O-连接的氨基酸可具有结构，其中R42A可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C1-6卤代烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C6芳基、任选地取代的C10芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)；且R43A可以是氢或任选地取代的C1-4烷基；或R42A和R43A可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。
当R42A被取代时，R42A可被一个或多个选自以下的取代基取代：N-酰胺基、巯基、烷硫基、任选地取代的芳基、羟基、任选地取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在一些实施方案中，R42A可以是未取代的C1-6烷基，诸如本文所述的那些。在一些实施方案中，R42A可以是氢。在其它实施方案中，R42A可以是甲基。在一些实施方案中，R43A可以是氢。在其它实施方案中，R43A可以是任选地取代的C1-4烷基，诸如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一些实施方案中，R43A可以是甲基。根据针对R42A和R43A所选择的基团，R42A和R43A连接的碳可以是手性中心。在一些实施方案中，R42A和R43A连接的碳可以是(R)-手性中心。在其它实施方案中，R42A和R43A连接的碳可以是(S)-手性中心。
合适的的实例包括以下：、、、、、、、、、、和。
在一些实施方案中，R5A可以是氢。在其它实施方案中，R5A可以是卤素，包括F和Cl。在其它实施方案中，R5A可以是任选地取代的C1-6烷基。例如，R5A可以是以下基团的取代或未取代的形式：甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊基(支链或直链)和己基(支链或直链)。在一些实施方案中，R5A可以是卤素取代的C1-6烷基，诸如-CH2F。在其它实施方案中，R5A可以是任选地取代的C2-6烯基。在一些实施方案中，R5A可以是任选地取代的C2-6炔基。例如，R5A可以是乙炔基。在一些实施方案中，R5A可以是羟基(OH)。
多种取代基可以存在于戊糖环的1'-位置。在一些实施方案中，RA可以是氢。在一些实施方案中，RA可以是氘。在其它实施方案中，RA可以是未取代的C1-3烷基（例如甲基、乙基、正丙基和异丙基）。在其它实施方案中，RA可以是未取代的C2-3烯基（例如乙烯基、丙烯基（支链或直链）和丁烯基（支链或直链））。在一些实施方案中，RA可以是未取代的C2-3炔基（例如乙炔基和丙炔基（支链或直链））。在其它实施方案中，RA可以是未取代的氰基。
在一些实施方案中，--------可均不存在，使得式(I)化合物具有以下结构：。当--------均不存在时，3'位置可存在各种基团。在一些实施方案中，R3A可以是氢。在其它实施方案中，R3A可以是卤素。例如，R3A可以是氟(F)或氯(Cl)。在其它实施方案中，R3A可以是OH。在一些实施方案中，R3A可以是-OC(=O)R"A，其中R"A可以是任选地取代的C1-24烷基。在一些实施方案中，R3A可以是-OC(=O)R"A，其中R"A可以是未取代的C1-4烷基。在其它实施方案中，R3A可以是任选地取代的O-连接的氨基酸，诸如任选地取代的O连接的α-氨基酸。任选地取代的O-连接的氨基酸可具有结构：，其中R44A可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C1-6卤代烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C6芳基、任选地取代的C10芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)；且R45A可以是氢或任选地取代的C1-4烷基；或R44A和R45A可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。
当R44A被取代时，R44A可被一个或多个选自以下的取代基取代：N-酰胺基、巯基、烷硫基、任选地取代的芳基、羟基、任选地取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在一些实施方案中，R44A可以是未取代的C1-6烷基，诸如本文所述的那些。在一些实施方案中，R44A可以是氢。在其它实施方案中，R44A可以是甲基。在一些实施方案中，R45A可以是氢。在其它实施方案中，R45A可以是任选地取代的C1-4烷基，诸如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一些实施方案中，R45A可以是甲基。根据针对R44A和R45A所选择的基团，R44A和R45A连接的碳可以是手性中心。在一些实施方案中，R44A和R45A连接的碳可以是(R)-手性中心。在其它实施方案中，R44A和R45A连接的碳可以是(S)-手性中心。
合适的的实例包括以下：、、、、、、、、、、和。
在一些实施方案中，R3A和R4A可各自为经由羰基连接以形成5元环的氧原子。
在一些实施方案中，R2A可以是氟且R3A可以是氟。在一些实施方案中，R2A可以是氟且R4A可以是氟。在一些实施方案中，R2A可以是氟，R3A可以是氟且R5A可以是任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基。在一些实施方案中，R2A可以是氟，R4A可以是氟且R5A可以是任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基。在一些实施方案中，R2A可以是氟，R3A可以是氟且R4A可以是OH或-OC(=O)R"B。在一些实施方案中，R2A可以是氟，R3A可以是OH或-OC(=O)R"A且R4A可以是氟。在一些实施方案中，R4A和R5A可各自为F。在一些实施方案中，R2A可以是*-(CH2)1-6卤素(例如-CH2F)，R3A可以是OH、-OC(=O)R"A或任选地取代的O-连接的氨基酸且R4A可以是OH。在一些实施方案中，R2A可以是-(CH2)1-6卤素(例如-CH2F)，R3A可以是OH、-OC(=O)R"A或任选地取代的O-连接的氨基酸，R4A可以是OH且R5A可以是未取代的C1-6烷基。在一些实施方案中，R2A可以是-(CH2)1-6N3(诸如-CH2N3)，R3A可以是OH且R4A可以是氟。在其它实施方案中，R2A可以是叠氮基，R3A可以是OH且R4A可以是氟。
在一些实施方案中，--------各自可以是单键，使得式(I)化合物具有以下结构：。当--------各自为单键时，R3A可以是氧(O)。在一些实施方案中，当--------各自为单键时，R1B可以是O-或OH。在其它实施方案中，当--------各自为单键时，R1B可以是-O-任选地取代的C1-6烷基。例如，R1B可以是-O-未取代的C1-6烷基。
在一些实施方案中，当--------各自为单键时，R1B可以是。在其它实施方案中，R1B可以是。例如，R1B可以是任选地取代的异丙基氧基羰基氧基甲基氧基或任选地取代的新戊酰基氧基甲基氧基。在其它一些实施方案中，R1B可以是。任选地取代的S-酰基硫代乙基 (SATE)为基团的实例。在其它实施方案中，R1B可以是任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物，诸如任选地取代的N连接的α-氨基酸或任选地取代的N连接的α-氨基酸酯衍生物。
本文描述了任选地取代的N-连接的氨基酸和任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物的实例。在一些实施方案中，R1B可选自丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸、缬氨酸和其酯衍生物。在一些实施方案中，R1B可以是以下物质的任选地取代的形式：N-丙氨酸异丙酯、N-丙氨酸环己酯、N-丙氨酸新戊酯、N-缬氨酸异丙酯和N-亮氨酸异丙酯。在一些实施方案中，R1B可具有结构，其中R10B可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)和任选地取代的卤代烷基；R11B可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C1-6卤代烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C6芳基、任选地取代的C10芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)；且R12B可以是氢或任选地取代的C1-4烷基；或R11B和R12B可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。
如本文所述，R11B可被取代。取代基的实例包括一个或多个选自以下的取代基：N-酰胺基、巯基、烷硫基、任选地取代的芳基、羟基、任选地取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在一些实施方案中，R11B可以是未取代的C1-6烷基，诸如本文所述的那些。在一些实施方案中，R11B可以是氢。在其它实施方案中，R11B可以是甲基。在一些实施方案中，R10B可以是任选地取代的C1-6烷基。在一些实施方案中，R10B可以是甲基、乙基、异丙基或新戊基。在其它实施方案中，R10B可以是任选地取代的C3-6环烷基。任选地取代的C3-6环烷基的实例包括以下基团的任选地取代的变体：环丙基、环丁基、环戊基和环己基。在一些实施方案中，R10B可以是任选地取代的环己基。在其它实施方案中，R10B可以是任选地取代的芳基(诸如苯基和萘基)。在其它实施方案中，R10B可以是任选地取代的芳基(C1-6烷基)，例如任选地取代的苄基。在一些实施方案中，R10B可以是任选地取代的C1-6卤代烷基，例如CF3。在一些实施方案中，R12B可以是氢。在其它实施方案中，R12B可以是任选地取代的C1-4烷基，诸如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一些实施方案中，R12B可以是甲基。在一些实施方案中，R11B和R12B可一起形成任选地取代的C3-6环烷基。根据针对R11B和R12B所选择的基团，R11B和R12B连接的碳可以是手性中心。在一些实施方案中，R11B和R12B连接的碳可以是(R)-手性中心。在其它实施方案中，R11B和R12B连接的碳可以是(S)-手性中心。
合适的基团的实例包括以下：
和。
在一些实施方案中，R1B可以是。在一些实施方案中，R9B可以是氢。在其它实施方案中，R9B可以是任选地取代的C1-24烷基。在其它实施方案中，R9B可以是任选地取代的芳基，例如任选地取代的苯基。在一些实施方案中，R9B可以是任选地取代的C1-6烷基。在一些实施方案中，R9B可以是未取代的C1-6烷基。在一些实施方案中，u可以是3。在其它实施方案中，u可以是4。在其它实施方案中，u可以是5。
在一些实施方案中，Z1B可以是氧(O)。在其它实施方案中，Z1B可以是S(硫)。
多种任选地取代的杂环碱可连接至戊糖环。在一些实施方案中，任选地取代的杂环碱的一个或多个胺和/或氨基可被合适保护基保护。例如，氨基可通过将胺和/或氨基转化为酰胺或氨基甲酸酯来进行保护。在一些实施方案中，任选地取代的杂环碱可包括改善化合物的溶解性的基团(例如–(CH2)1-2–O-P(=O)(OW1A)2)。在一些实施方案中，任选地取代的杂环碱或具有一个或多个受保护氨基的任选地取代的杂环碱可具有以下结构之一：
和；
其中：RA2可选自氢、卤素和NHRJ2，其中RJ2可选自氢、-C(=O)RK2和-C(=O)ORL2；RB2可以是卤素或NHRW2，其中RW2可选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的 C2-6烯基、任选地取代的C3-8环烷基、-C(=O)RM2和-C(=O)ORN2：RC2可以是氢或NHRO2，其中RO2可选自氢、-C(=O)RP2和-C(=O)ORQ2；RD2可选自氢、氘、卤素、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的 C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；RE2可选自氢、羟基、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-8环烷基、-C(=O)RR2和-C(=O)ORS2；RF2可选自氢、卤素、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；Y2和Y3可独立地为N(氮)或CRI2，其中RI2可选自氢、卤素、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；W1可以是NH、–NCH2-OC(=O)CH(NH2)-CH(CH3)2或–(CH2)1-2–O-P(=O)(OW1A)2，其中W1A可选自不存在、氢和任选地取代的C1-6烷基；RG2可以是任选地取代的C1-6烷基；RH2可以是氢或NHRT2，其中RT2可独立地选自氢、-C(=O)RU2和-C(=O)ORV2；且RK2、RL2、RM2、RN2、RP2、RQ2、RR2、RS2、RU2和RV2可独立地选自氢、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、C3-6环烯基、C6-10芳基、杂芳基、杂环基、芳基(C1-6烷基)、杂芳基(C1-6烷基)和杂环基(C1-6烷基)。在一些实施方案中，上文所示的结构可通过用选自“取代”定义中所提供的取代基列表的取代基替代一个或多个氢来进行修饰。在B1A的一些实施方案中，氢可用氘替代。本领域技术人员理解当W1A不存在时，氧原子将具有结合的负电荷。在一些实施方案中，碱上的取代基可导致形成式（I）化合物的盐。
在一些实施方案中，B1A可以是任选地取代的嘌呤碱。在其它实施方案中，B1A可以是任选地取代的嘧啶碱。在一些实施方案中，B1A可以是。在其它实施方案中，B1A可以是。在其它实施方案中，B1A可以是，诸如。在其它实施方案中，B1A可以是，其中W1可以是–NCH2-OC(=O)CH(NH2)-CH(CH3)2或–(CH2)1-2–O-P(=O)(OW1A)2。在一些实施方案中，B1A可以是，例如或。在其它实施方案中，RD2可以是氢。在其它实施方案中，B1A可以是。在一些实施方案中，RB2可以是NH2。在其它实施方案中，RB2可以是NHRW2，其中RW2可以是-C(=O)RM2或–C(=O)ORN2。在其它实施方案中，B1A可以是。在一些实施方案中，B1A可以是。
在一些实施方案中，当R2A为卤素(诸如氟)；--------均不存在；Z1不存在；O1为OR1A；B1A选自任选地取代的、任选地取代的 、任选地取代的、任选地取代的 、任选地取代的和任选地取代的 ，其中Ra2为任选地取代的C1-6烷基或任选地取代的C3-6环烷基，Ra3和Ra4 独立地选自氢、未取代的C1-6烷基、未取代的C3-6烯基、未取代的C3-6炔基和未取代的C3-6环烷基，Ra5为NHRa8，且Ra6为氢、卤素或NHRa9；Ra7为NHRa10；Ra8选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-6烯基、任选地取代的C3-6环烷基、–C(=O)Ra11和–C(=O)ORa12；Ra9选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-6烯基、任选地取代的C3-6环烷基、–C(=O)Ra13和–C(=O)ORa14；Ra10选自氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-6烯基、任选地取代的C3-6环烷基、–C(=O)Ra15和–C(=O)ORa16；Xa1为N或–CRa17；Ra17选自氢、卤素、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；Ra11、Ra12、Ra13、Ra14、Ra15和Ra16独立地选自C1-6 烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-6 环烷基、C3-6 环烯基、C6-10 芳基、杂芳基、杂环基、芳基(C1-6 烷基)、杂芳基(C1-6 烷基)和杂环基(C1-6 烷基)时；则R3A选自氢、卤素和任选地取代的O-连接的氨基酸；且R4A选自OH、卤素、-OC(=O)R"A和任选地取代的O-连接的氨基酸；或则R4A为任选地取代的O-连接的氨基酸；且R3A选自氢、卤素、OH、-OC(=O)R"A和任选地取代的O-连接的氨基酸；或则R3A和R4A均为经由羰基连接以形成5元环的氧原子；或则R1A为，其中R6A和R7A独立地为(其中s为1、2或3)、或；或则R1A为，其中R6A和R7A结合在一起形成选自以下的基团：任选地取代的和任选地取代的，其中连接至R6A和R7A的氧、磷和该基团形成六元至十元环体系。在一些实施方案中，当R2A为卤素(诸如氟)；--------各自为单键时；则R4A为-OC(=O)R"B或任选地取代的O-连接的氨基酸。在一些实施方案中，当R2A为未取代的C1-4烷基、未取代的C2-4烯基、未取代的C2-4炔基、-(CH2)1-6卤素或-(CH2)1-6N3；--------均不存在；Z1不存在；O1为OR1A；R3A为OH、-OC(=O)R"A或任选地取代的O-连接的氨基酸；且R4A为卤素时；则R5A选自任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基。在一些实施方案中，当R2A为未取代的C1-4烷基、未取代的C2-4烯基、未取代的C2-4炔基、-(CH2)1-6卤素或-(CH2)1-6N3；--------均不存在；Z1不存在；O1为OR1A；R4A为卤素；且R5A为H或卤素时；则R3A为H或卤素。在一些实施方案中，当R2A为未取代的C1-4烷基、未取代的C2-4烯基、未取代的C2-4炔基、-(CH2)1-6卤素或-(CH2)1-6N3；--------均不存在；Z1不存在；O1为OR1A；R3A为OH、-OC(=O)R"A或任选地取代的O-连接的氨基酸；R4A为卤素；R5A为H或卤素；且R1A为时，则R6A和R7A中的至少一个为，其中R21A独立地选自任选地取代的-O-杂芳基和任选地取代的-O-单环杂环基；或则R6A和R7A中的至少一个为，其中s为1、2或3；或则R6A和R7A中的至少一个为，其中s为0且R24A为任选地取代的-O-杂芳基或任选地取代的-O-单环杂环基。在一些实施方案中，当R2A为未取代的C1-4烷基、未取代的C2-4烯基、未取代的C2-4炔基、-(CH2)1-6卤素或-(CH2)1-6N3；--------均不存在；Z1不存在；O1为OR1A；R3A为OH、-OC(=O)R"A或任选地取代的O-连接的氨基酸；R4A为卤素；R5A为H或卤素；且R1A为时；则R8A为，其中R21A独立地选自任选地取代的-O-杂芳基和任选地取代的-O-单环杂环基；或则R8A为，其中s为1、2或3；或则R8A为，其中s为0且R24A为任选地取代的-O-杂芳基、任选地取代的-O-单环杂环基或。在一些实施方案中，当--------均不存在；Z1不存在；O1为OH；R2A为甲基；R3A为OH时；则R4A为卤素、-OC(=O)R"B或任选地取代的O-连接的氨基酸。在一些实施方案中，当--------均不存在；Z1不存在；O1为OR1A；R2A为卤素(例如F)；R3A为OH或-OC(=O)R"A；R4A为卤素(例如F)；且R5A为甲基、乙基或乙烯基时；则R1A不可选自H、和，其中R8A为未取代的芳基；R9A为且Z2A为氧。在一些实施方案中，例如，当R3A为卤素(诸如氟)且R4A为OH时，R1A不为氢(H)。在一些实施方案中，例如，当R4A为卤素(诸如氟)且R3A为OH时，则R1A不为，其中Z1A为O且R6A为。在一些实施方案中，R2A不为氢(H)。在一些实施方案中，R2A不为卤素。在一些实施方案中，R2A不为氟(F)。在一些实施方案中，R2A不为-CN。在一些实施方案中，R2A不为-CHF2。在一些实施方案中，R2A不为-CF3。在一些实施方案中，R5A不为氢或卤素。在一些实施方案中，R5A不为-OH。在一些实施方案中，R4A不为氢(H)。在一些实施方案中，R4A不为卤素。在一些实施方案中，R4A不为氟(F)。在一些实施方案中，R4A不为氯(Cl)。在一些实施方案中，R2A不为未取代的C1-4烷基。在一些实施方案中，R2A不为未取代的C2-4烯基。在一些实施方案中，R2A不为未取代的C2-4炔基。在一些实施方案中，R2A不为-(CH2)1-6卤素。在一些实施方案中，R2A不为-(CH2)1-6N3。在一些实施方案中，当R5A为氟时，R4A不为氢。在一些实施方案中，R6A不为任选地取代的芳基。在一些实施方案中，R6A不为未取代的芳基。在一些实施方案中，R9A不为N-丙氨酸异丙酯。在一些实施方案中，R5A不为任选地取代的C1-6烷基。例如，R5A不为未取代的C1-6烷基，诸如甲基。在一些实施方案中，B1A不为任选地取代的尿嘧啶，例如卤素取代的尿嘧啶。在一些实施方案中，当R1A为氢、任选地取代的酰基、，其中R6A可以是或，其中R8A为未取代或取代的苯基或未取代或取代的萘基且R9A为任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯；R2A为氟，R3A为OH或-C(=O)-未取代或取代的苯基；R4A为氟；且R5A为C1-4烷基(诸如甲基)时；则B1A不可为任选地取代的嘧啶碱，诸如或。在一些实施方案中，当R1A为，R2A为H，R3A为OH且R4A为OH或卤素(诸如F)时，则R5A不为任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基或任选地取代的C2-6炔基。在一些实施方案中，式(I)和/或(II)化合物或前述化合物的药学上可接受的盐不为以下文献中的化合物或前述化合物的药学上可接受的盐：WO 2013/092481(2012年12月17日提交)、U.S.2014/0178338(2013年12月17日提交)、U.S.2013/0164261(2012年12月20日提交)、WO 2014/100505(2013年12月19日提交)、WO 2013/096679(2012年12月20日提交)、WO 2013/142525(2013年3月19日提交)、WO 2014/209983(2014年6月24日提交)、WO 2014/209979(2014年6月24日提交)和/或U.S.2015/0105341(2014年10月9日提交)。
式(I)化合物或其药学上可接受的盐的实例包括但不限于：
和
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
式(I)化合物或其药学上可接受的盐的额外实例包括但不限于：
和
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可选自：
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可选自：
和
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，式(I)化合物或其药学上可接受的盐可选自：
和
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
药物组合物
本文所述的一些实施方案涉及药物组合物，其可包含有效量的一种或多种本文所述化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)和药学上可接受的载体、稀释剂、赋形剂或其组合。在一些实施方案中，药物组合物可包含式(I)化合物或其药学上可接受的盐的单一非对映异构体(例如单一非对映异构体以与其它非对映异构体的总浓度相比超过99%的浓度存在于药物组合物中)。在其它实施方案中，药物组合物可包含式(I)化合物或其药学上可接受的盐的非对映异构体的混合物。例如，药物组合物可包含与其它非对映异构体的总浓度相比>50%、≥ 60%、≥ 70%、≥ 80%、≥ 90%、≥ 95%或≥ 98%的浓度的一种非对映异构体。在一些实施方案中，药物组合物包含式(I)化合物或其药学上可接受的盐的两种非对映异构体的1：1混合物。
术语“药物组合物”是指一种或多种本文公开的化合物与其它化学组分(诸如稀释剂或载体)的混合物。药物组合物有利于将化合物给药至生物体。药物组合物也可通过使化合物与无机或有机酸(诸如氢氯酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸和水杨酸)反应而获得。药物组合物通常针对特定预期给药途径来定制。药物组合物适于人类和/或兽医应用。
术语“生理学上可接受”定义不废除化合物的生物活性和特性的载体、稀释剂或赋形剂。
如本文所用，“载体”是指促进化合物并入细胞或组织中的化合物。例如，但不限于，二甲亚砜(DMSO)为促进多种有机化合物摄入对象的细胞或组织中的常用载体。
如本文所用，“稀释剂”是指药物组合物中缺乏药理学活性、但可以是药学上必需或期望的成分。例如，可使用稀释剂来提高质量对于制备和/或给药而言太小的强效药物的体积。其也可以是用于溶解待通过注射、摄入或吸入而给药的药物的液体。本领域中的常见稀释剂形式为缓冲水溶液，诸如但不限于模拟人类血液组成的磷酸盐缓冲盐水。
如本文所用，“赋形剂”是指添加至药物组合物中以向组合物提供(不限于)体积、稠度、稳定性、粘合能力、润滑、崩解能力等的惰性物质。“稀释剂”为一种类型的赋形剂。
本文所述的药物组合物可本身给药至人类患者，或以其中其与其它活性成分(如组合疗法中)或载体、稀释剂、赋形剂或其组合混合的药物组合物的形式给药至人类患者。适当制剂取决于所选给药途径。配制和给药本文所述化合物的技术是本领域技术人员已知的。
本文公开的药物组合物可以本身已知的方式(例如借助常规混合、溶解、粒化、制糖衣、水飞、乳化、囊封、截留或制锭方法)制备。另外，以有效实现其预期目的的量包含活性成分。本文公开的医药组合中所用的许多化合物可以作为与药学上相容的抗衡离子的盐提供。
本领域中存在多种给药化合物的技术，包括但不限于经口、直肠、局部、气溶胶、注射和肠胃外递送，包括肌肉内、皮下、静脉内、髓内注射、鞘内、直接室内、腹膜内、鼻内和眼内注射。
也可以局部而非全身方式给药化合物，例如经由将化合物直接注射至感染区域中，通常以药性持久或持续释放制剂形式。此外，可用靶向药物递送系统(例如用组织特异性抗体包衣的脂质体)给药化合物。脂质体将靶向至器官且由器官选择性吸收。
如果期望，组合物可在可容纳有一种或多种含有活性成分的单位剂型的包装或分配器中呈现。包装可例如包含金属或塑料箔，诸如泡罩包装。包装或分配器可随附给药说明书。包装或分配器也可随附与容器关联、管制药品的制备、使用或销售的政府机构指定的形式的通知书，所述通知书反映该机构批准该药物形式用于人类或兽医给药。此类通知书可以例如是美国食品和药物管理局(U. S. Food and Drug Administration)批准的处方药物标签或批准的药品说明书。也可制备可包含在相容医药载体中配制的本文所述化合物的组合物，将其置于适当容器中，且针对指定病况的治疗进行标记。
合成
式(I)化合物和本文所述的那些可以多种方式制备。式(I)化合物和用于合成式(I)化合物的起始材料的一些实例的通用合成途径显示于方案1、2、3和4中且描述于本文中。本文所示且所述的途径仅仅是说明性的且不意欲、也不解释为以任何方式限制权利要求的范围。本领域技术人员将能够基于本文的公开内容来认识到公开合成的修改且设计替代途径；所有此类修改和替代途径均在权利要求的范围内。
式(I)化合物可使用本领域技术人员已知的多种方法制备。方法的实例显示于方案1、2、3和4中。合适的含磷前体可商业上获得或通过本领域技术人员已知的合成方法制备。含磷前体的通用结构的实例显示于方案1、2、3和4中，且包括氯磷酸酯和硫代氯磷酸酯。合适的氯磷酸酯和硫代氯磷酸酯可商购和/或可以合成制备。
方案1
如方案1中所示，其中4'-位置为卤代烷基的式(I)化合物可由核苷(例如式(A)的核苷)制备。在方案1中，Ra、R3a、R4a、R5a和B1a可与如本文中关于式(I)所述的RA、R3A、R4A、R5A和B1A相同，且PG1为合适保护基。羟基烷基可使用本领域技术人员已知的合适条件在戊糖环的4'位处形成。用于形成羟基烷基的合适条件的实例包括使用2-碘酰基苯甲酸(IBX)甲醛水溶液和硼氢化钠。式(B)化合物可使用一种或多种合适试剂转化为卤代烷基，例如使用咪唑、三苯基膦和碘转化为碘化物；使用三氟化二乙基氨基硫(DAST)转化为氟化物；或使用二氯乙烯(DCE)中的三苯基膦和四氯化碳转化为氯化物。
方案2
其中R2A为C1-6叠氮基烷基的式(I)化合物可由核苷(例如式(A)的核苷)制备。在方案2中，Ra、R3a、R4a、R5a和B1a可与如本文关于式(I)所述的RA、R3A、R4A、R5A和B1A相同，PG2可以是合适的保护基且LG2可以是合适的离去基团。核苷的5'-位置可使用本领域技术人员已知的方法氧化成醛。合适的氧化条件包括但不限于Moffatt氧化、Swern氧化和Corey-Kim氧化；且合适的氧化剂包括但不限于戴斯-马丁氧化剂(Dess-Martin periodinane)、IBX(2-碘酰基苯甲酸)、TPAP/NMO(过钌酸四丙基铵/N-甲基吗啉N-氧化物)、Swern氧化试剂、PCC(氯铬酸吡啶鎓)、PDC(重铬酸吡啶鎓)、过碘酸钠、科林氏试剂(Collin's reagent)、硝酸铈铵CAN、水中的Na2Cr2O7、硅藻土上的Ag2CO3、热的乙二醇二甲醚水溶液中的HNO3、O2-吡啶CuCl、Pb(OAc)4-吡啶和过氧化苯甲酰-NiBr2。可将羟基甲基添加至戊糖环的4'位置且将醛还原为醇。可使用甲醛和碱(诸如氢氧化钠)经由缩合反应添加羟基甲基。添加羟基甲基后，可使用还原剂进行具有4'-羟基甲基的中间体化合物的还原。合适的还原剂的实例包括但不限于NaBH4和LiAlH4。合适的离去基团(诸如三氟甲磺酸酯基)可通过替代连接至4'-位置的羟基甲基中的氢来形成，且连接至5'-位置的氧可用合适的保护基进行保护(例如通过与碱B1a环化，或用单独的保护基)。离去基团可以使用金属叠氮化物试剂(例如叠氮化钠)用叠氮基替代。4'-位置的C1-6叠氮基烷基可还原成C1-6氨基烷基。可利用本领域技术人员已知的多种还原剂/条件。例如，叠氮基可经由氢化(例如H2-Pd/C或HCO2NH4-Pd/C)、Staudinger反应、NaBH4/CoCl2•6 H2O、Fe/NH4Cl或Zn/NH4Cl还原成氨基。
方案3
方案4
具有连接至戊糖环的5'-位置的含磷基团的式(I)化合物可使用多种本领域技术人员已知的各种方法制备。方法的实例显示于方案3和4中。在方案3和方案4中，Ra、R2a、R3a、R4a、R5a和B1a可与如本文关于式(I)所述的RA、R2A、R3A、R4A、R5A和B1A相同。含磷前体可偶联至核苷，例如式(B)化合物。在偶联含磷前体之后，可在合适条件下裂解任何离去基团，诸如水解。可使用本领域技术人员已知的方法(例如使用焦磷酸盐)添加其它含磷基团。如果期望，在添加各含磷基团期间可使用一种或多种碱。合适碱的实例描述于本文中。
在一些实施方案中，醇盐可使用有机金属试剂(诸如格氏试剂(Grignardreagent))从式(C)化合物产生。醇盐可与含磷前体偶联。合适的格氏试剂是本领域技术人员已知的且包括但不限于氯化烷基镁和溴化烷基镁。在一些实施方案中，可使用适当的碱。合适的碱的实例包括但不限于胺碱，诸如烷基胺(包括单、二和三-烷基胺(例如三乙胺))、任选地取代的吡啶(例如三甲基吡啶)和任选地取代的咪唑(例如N-甲基咪唑)。或者，可将含磷前体添加至核苷且形成亚磷酸酯。可使用本领域技术人员已知的条件将亚磷酸酯氧化为磷酸酯。合适的条件包括但不限于间氯过氧苯甲酸(MCPBA)和碘作为氧化剂和水作为氧供体。
当式(I)化合物具有作为硫的Z1A、Z2A或Z3A时，硫可以本领域技术人员已知的多种方式添加。在一些实施方案中，硫可以是含磷前体的一部分，例如或。或者，硫可使用硫化试剂添加。合适的硫化剂是本领域技术人员已知的，且包括但不限于元素硫、劳森试剂、环八硫(cyclooctasulfur)、3H-1,2-苯并二硫杂环戊烯-3-酮-1,1-二氧化物(Beaucage试剂)、3-((N,N-二甲基氨基亚甲基)氨基)-3H-1,2,4-二噻唑-5-硫酮(DDTT)和双(3-三乙氧基甲硅烷基)丙基-四硫化物(TEST)。
如本文所述，在一些实施方案中，R3A和R4A各自可以是氧原子，其中氧原子通过羰基连接在一起。-O-C(=O)-O-基团可使用本领域技术人员已知的方法来形成。例如，其中R3A和R4A均为羟基的式(I)化合物可用1,1'-羰基二咪唑(CDI)处理。
在一些实施方案中，戊糖环的2'-位置和/或3'-位置可具有连接的任选地取代的-O-酰基，例如-OC(=O)R”A。任选地取代的-O-酰基可使用本领域技术人员已知的多种方法在2'-和/或3'-位置形成。作为实例，其中2'-位置和3'-位置各自具有连接的羟基的式(I)化合物可用烷基酸酐(例如乙酸酐和丙酸酐)或烷基酰氯(例如乙酰氯)处理。如果期望，可使用催化剂促进反应。合适的催化剂的实例为4-二甲基氨基吡啶(DMAP)。或者，任选地取代的-O-酰基可通过使烷基酸(例如乙酸和丙酸)在碳二亚胺或偶联剂存在的情况下反应而在2'-和3'-位置形成。碳二亚胺类的实例包括但不限于N,N'-二环己基碳二亚胺 (DCC)、N,N'-二异丙基碳二亚胺 (DIC)和1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基) 碳二亚胺(EDC)。
为了减少副产物的形成，连接至戊糖环的一个或多个基团可用一种或多种合适的保护基保护和/或B1a上存在的任何-NH和/或NH2基团可用一种或多种合适的保护基保护。例如，如果2'-位置和/或3'-位置为一个或多个羟基，则一个或多个羟基可用合适的保护基诸如三芳基甲基和/或硅烷基保护。三芳基甲基的实例包括但不限于三苯甲基、单甲氧基三苯甲基(MMTr)、4,4'-二甲氧基三苯甲基(DMTr)、4,4',4"-三甲氧基三苯甲基(TMTr)、4,4',4"-三-(苯甲酰基氧基)三苯甲基(TBTr)、4,4',4"-三(4,5-二氯邻苯二甲酰亚氨基)三苯甲基(CPTr)、4,4',4"-三(乙酰丙氧基(levulinyloxy))三苯甲基(TLTr)、对甲氧苯基-1-萘基苯基甲基、二-邻甲氧苯基-1-萘基甲基、对甲苯基二苯基甲基、3-(咪唑基甲基)-4,4'-二甲氧基三苯甲基、9-苯基呫吨-9-基(Pixyl)、9-(对甲氧基苯基)呫吨-9-基(Mox)、4-癸基氧基三苯甲基、4-十六烷基氧基三苯甲基、4,4'-双十八烷基三苯甲基、9-(4-十八烷基氧基苯基)呫吨-9-基、1,1'-双(4-甲氧基苯基)-1'-芘基甲基、4,4',4"-三-(叔丁基苯基)甲基(TTTr)和4,4'-二-3,5-己二烯氧基三苯甲基。合适的甲硅烷基的实例描述于本文中且包括三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、三异丙基甲硅烷基(TIPS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)、三异丙基甲硅烷氧基甲基和[2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲基。或者，R3A和/或R4A可通过单一非手性或手性保护基进行保护，例如通过形成原酸酯、环状缩醛或环状缩酮来进行保护。合适的原酸酯包括甲氧基亚甲基缩醛、乙氧基亚甲基缩醛、2-氧杂亚环戊基原酸酯、二甲氧基亚甲基原酸酯、1-甲氧基亚乙基原酸酯、1-乙氧基亚乙基原酸酯、亚甲基原酸酯、苯酞原酸酯1,2-二甲氧基亚乙基原酸酯和α-甲氧基亚苄基原酸酯；合适的环状缩醛包括亚甲基缩醛、亚乙基缩醛、叔丁基亚甲基缩醛、3-(苄基氧基)丙基缩醛、亚苄基缩醛、3,4-二甲氧基亚苄基缩醛和对乙酰氧基亚苄基缩醛；且合适的环状缩酮包括1-叔丁基亚乙基缩酮、1-苯基亚乙基缩酮、亚异丙基缩酮、亚环戊基缩酮、亚环己基缩酮、亚环庚基缩酮和1-(4-甲氧基苯基)亚乙基缩酮。
实施例
额外实施方案在以下实施例中进一步详细公开，所述实施例不意欲以任何方式限制权利要求的范围。
实施例1
化合物1
向1-1 (100.0 g, 378.7 mmol)于吡啶(750 mL)中的溶液中添加DMTrCl (164.9 g,487.8 mmol)。将溶液在室温下搅拌15小时。添加MeOH (300mL)，并在减压下将混合物浓缩至干燥。将残余物溶解于EA中并用水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将残余物溶解于DCM (500mL)中。向该溶液中添加咪唑(44.3g, 650.4mmol)和TBSCl(91.9g, 609.8mmol)。将混合物在室温下搅拌14小时。将溶液用NaHCO3和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩，以得到作为淡黄色固体的粗产物。将粗产物(236.4g, 347.6mmol)溶解于80% HOAc水溶液(500mL)中。将混合物在室温下搅拌15小时。将混合物用EA稀释，并用NaHCO3溶液和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并基于硅胶柱色谱法(DCM中的1-2% MeOH)纯化，以得到作为淡黄色固体的1-2 (131.2 g, 91.9%)。ESI-MS: m/z 802 [M+H]+。
在室温下，向1-2 (131.2 g, 346.9 mmol)于无水CH3CN (1200 mL)中的溶液中添加IBX (121.2g, 432.8mmol)。将混合物回流3小时，然后冷却至0℃。过滤沉淀物，并浓缩滤液，以得到作为黄色固体的粗醛(121.3g)。将醛溶解于1,4-二氧杂环己烷(1000mL)中。添加37% CH2O(81.1mL，1.35mmol)和2M NaOH水溶液(253.8mL，507.6mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时，然后用AcOH中和至pH=7。向溶液中添加EtOH (400mL)和NaBH4 (51.2g,1.35mol)。将混合物在室温下搅拌30分钟，用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应物。用EA萃取混合物。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM中的1-3% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的1-3 (51.4 g, 38.9%)。
在0℃下，向1-3 (51.4 g, 125.9 mmol)于无水DCM (400 mL)中的溶液中添加吡啶(80mL)和DMTrCl(49.1g, 144.7mmol)。将反应物在室温下搅拌14小时，然后用MeOH(30mL)处理。去除溶剂，并通过硅胶柱色谱法(DCM中的1-3% MeOH)来纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的单-DMTr保护的中间体(57.4g, 62.9%)。将中间体(57.4g, 82.8mmol)溶解于CH2Cl2(400mL)中，并添加咪唑(8.4g, 124.2mmol)、TBDPSCl(34.1g, 124.2mmol)。将混合物在室温下搅拌14小时。滤出沉淀物，并将滤液用盐水洗涤并用Na2SO4干燥。去除溶剂，以得到作为白色固体的残余物(72.45g)。将残余物溶解于80% HOAc水溶液(400mL)中。将混合物在室温下搅拌15小时。将混合物用EA稀释并用NaHCO3溶液和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并通过硅胶柱色谱法(DCM中的1-2% MeOH)来纯化，以得到作为白色固体的1-4 (37.6 g,84.2%)。
在0℃下，向1-4 (700 mg, 1.09 mmol)于无水二氯甲烷中的溶液中添加戴斯-马丁试剂(919mg, 2.16mmol)。将混合物在室温下搅拌30分钟。将反应物用饱和碳酸氢钠和硫代硫酸钠溶液淬灭，并用EA萃取。浓缩有机层，以得到粗醛，其未经纯化即用于下一步骤中。在0℃下，将MePPh3Br (3.88 g, 10.87 mmol)于无水THF中的溶液用叔-BuOK(9.81mL，9.81mmol)于THF中的溶液处理。将混合物温热至室温持续1小时。冷却至0℃持续1小时之后，添加醛(700mg, 1.09mmol)于THF中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用饱和氯化铵溶液淬灭并用EA萃取。通过柱色谱法纯化有机层，以得到1-5 (167 mg, 30%)。
在室温下，向1-5 (450 mg, 0.69 mmol)于MeOH (10 mL)中的溶液中添加Pd/C(200mg)。在室温下，在H2(气球)下，将反应混合物搅拌1小时。然后过滤混合物并浓缩滤液，以得到作为白色固体的粗1-6 (440 mg, 97.1%)。
将1-6 (317 mg, 0.49 mmol)、TPSCl (373 mg, 1.23 mmol)、DMAP (150 mg,1.23 mmol)和TEA (124 mg, 1.23 mmol)于无水MeCN中的溶液在室温下搅拌过夜。将反应物用NH3•H2O淬灭，然后在室温下搅拌3小时。在减压下去除溶剂。通过柱色谱法纯化残余物，以得到1-7 (200 mg, 63%)。
在室温下向1-7 (280 mg, 0.44 mmol)于MeOH (10 mL)中的溶液中添加NH4F(1.0g, 27.0mmol)。将混合物回流12小时。过滤混合物，并浓缩滤液。在硅胶柱(DCM中的10%MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的化合物1 (81 mg, 63.3%)。ESI-MS: m/z291.8 [M+H]+。
实施例2
化合物2
在0℃下，向2-1 (2.5 g, 4.04 mmol)于DMF中的溶液中添加NaH (170mg, 4.24mmol，60%纯度)。将混合物在室温下搅拌3小时。在室温下添加NaI(6.1g, 40.4mmol)并搅拌3小时。将反应物用水稀释并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩，以得到作为黄色固体的2-2 (1.7 g, 94%)。
在0℃下，向2-2 (1.7 g, 3.81 mmol)于THF (5 mL)中的溶液中添加2M NaOH溶液(4.5mL)。将溶液在室温下搅拌2小时。将混合物调节至pH=7，并在减压下浓缩。将混合物分配于DCM和水之间。将DCM层用高真空干燥，以得到作为白色固体的2-3 (1.2 g, 68%)，其未经进一步纯化即使用。
向2-3 (1.2 g, 2.58 mmol)于EtOH (20 mL)中的溶液中添加NH4COOH (650mg,7.75mmol)和Pd/C(120mg)。在室温下，在H2(30psi)下将混合物搅拌1.5小时。过滤悬浮液，并在低压下浓缩滤液。在硅胶柱(DCM 中的0.5% TEA和1% MeOH)上纯化残余物，以得到2-4(545 mg, 62%)。ESI-MS: m/z 361.2 [M + 23]+。
将化合物2-4溶解于80% HCOOH水溶液(20mL)中并在20℃下保持18小时。冷却至室温后，在真空中去除溶剂，并将残余物与甲苯(3 x 25 mL)共同蒸发。将残余物溶解于水(3mL)中并添加浓NH4OH水溶液(1mL)。在20℃下2小时后，在真空中去除溶剂。通过快速色谱法(使用DCM 中甲醇的5至50%梯度)纯化残余物，以得到作为白色固体的纯化化合物2 (14mg)。
实施例3
化合物4
将化合物4-1 (5.0 g, 8.5 mmol)和2-氨基-6-氯嘌呤(3.0 g, 17.7 mmol)与无水甲苯共浓缩3次。在0℃下，向混合物于无水MeCN(50mL)中的搅拌悬浮液中添加DBU(7.5g,49mmol)。将混合物在0℃下搅拌15分钟，并在0℃下逐滴添加TMSOTf(15g, 67.6mmol)。将混合物在0℃下搅拌15分钟，然后加热至70℃过夜。将混合物冷却至室温并用EA(100mL)稀释。将溶液用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，然后在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/EA：15/1至3/1)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的4-2 (2.5 g, 46.3%)。
在N2下，向4-2 (10 g, 15.7 mmol)、AgNO3(8.0g, 47mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(10mL)于无水DCM (20mL)中的溶液中以小份添加MMTrCl(14.5g, 47mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。过滤混合物，并将滤液用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/ME=20/1至8/1)纯化残余物，以得到作为黄色固体的4-3 (10 g, 70 %)。
在0℃下，向3-羟基-丙腈(3.51g, 49.4mmol)于无水THF(100mL)中的溶液中添加NaH (2.8g, 70mmol)，并将混合物在室温下搅拌30分钟。在0℃下，向混合物中添加4-3(8.5 g, 9.35 mmol)于无水THF (100 mL)中的溶液，并将反应混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭，并用EA(100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=100/1至20/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的4-4 (4.5 g,83%)。
将化合物4-4 (1.5g, 2.6 mmol)与无水吡啶共浓缩3次。向4-4于无水吡啶(30mL)中的冰冷溶液中添加TsCl(1.086g, 5.7mmol)，并将反应混合物在0℃下搅拌1小时。将反应物用水淬灭，并用EA(80mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=100/1至15/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的4-5 (1.4 g, 73%)。
向4-5 (4.22 g, 5.7 mmol)于丙酮(60 mL)中的溶液中添加NaI(3.45g,23mmol)，并将混合物回流过夜。将反应物通过饱和Na2S2O3水溶液淬灭，然后用EA(100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=100/1至15/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的4-6 (4 g, 73%)。
向4-6 (4.0 g, 5.8 mmol)于无水THF (60 mL)中的溶液中添加DBU(3.67g,24mmol)，并将混合物在60℃下搅拌过夜。将混合物用EA(80mL)稀释。将溶液用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=100/1至20/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的4-7 (2 g, 61%)。
向4-7 (500 mg, 0.89 mmol)于无水DCM (20 mL)中的冰冷溶液中添加I2(500mg,1.97mmol)于无水DCM (20mL)中的溶液和AgF(618mg, 4.9mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时。将反应物用饱和Na2S2O3和NaHCO3水溶液淬灭，并用DCM (50mL)萃取混合物。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥并浓缩，以得到作为黄色固体的粗4-8 (250mg, 粗产物)。
向粗4-8 (900 mg, 1.28 mmol)于无水DCM (50 mL)中的溶液中添加DMAP(1.0g,8.2mmol)和BzCl(795mg, 5.66mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过制备型TLC(DCM/MeOH=15：1)纯化残余物，以得到作为白色固体的4-9 (300mg, 26%)。
向粗4-9 (750 mg, 0.82 mmol)于无水HMPA (20 mL)中的溶液中添加NaOBz (1.2g, 8.3 mmol)和15-丝醚-5 (1.8 g, 8.3 mmol)。将混合物在60℃下搅拌2天。将混合物用EA稀释，并将溶液用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过制备型TLC(PE/EA=1：1)纯化残余物，以得到作为白色固体的粗4-10 (550 mg, 73%)。
将粗4-10 (550 mg, 0.6 mmol)溶解于NH3/MeOH (7N, 50mL)中。将混合物在室温下搅拌过夜。浓缩混合物，并通过硅胶柱(DCM/MeOH 100/1至20/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的4-11 (62 mg, 17%)。ESI-MS: m/z 598.0 [M+H]+。
将4-11 (12 mg)于80%甲酸(0.5mL)中的溶液在室温下静置3.5小时，然后浓缩。将残余物与MeOH/甲苯在小瓶中共同蒸发4次，然后在40℃下用EtOAc研磨。用移液管去除EtOAc溶液，并将研磨步骤重复几次。将剩余固体溶解于MeOH中。将溶液浓缩并干燥，以得到作为灰白色固体的化合物4 (4.7 mg)。ESI-MS: m/z 326.6 [M+H]+。
实施例4
化合物5
向5-1 (1.2 g; 4.3 mmol)于二氧杂环己烷(30 mL)中的溶液中添加对甲苯磺酸一水合物(820 mg; 1 eq.)和原甲酸三甲酯(14 mL; 30 eq.)。将混合物在室温下搅拌过夜。然后将混合物用甲醇氨中和并蒸发溶剂。在硅胶柱上使用CH2Cl2-MeOH溶剂体系(4-10%梯度)进行纯化，产生5-2 (1.18 g, 87%)。
向5-2 (0.91 g; 2.9 mmol)于无水THF (20 mL)中的冰冷溶液中添加异丙基氯化镁(2.1mL; 2M，在THF中)。将混合物在0℃下搅拌20分钟。逐滴添加氯磷酸酯试剂(2.2g;2.5eq.)于THF(2mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭并在室温下搅拌10分钟。然后将混合物用水和CH2Cl2稀释，并分离两个层。将有机层用水、半饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在硅胶柱上使用CH2Cl2-iPrOH溶剂体系(4-10%梯度)纯化经蒸发的残余物，以产生5-3的Rp/Sp混合物(1.59g; 93%)。
将5-3 (1.45g; 2.45mmol)与80% HCOOH水溶液(7mL)的混合物在室温下搅拌1.5小时。蒸发溶剂，并与甲苯共同蒸发。将获得的残余物溶解于MeOH中，用Et3N(3滴)处理并蒸发溶剂。在硅胶柱上使用CH2Cl2-MeOH溶剂体系(4-10%梯度)进行纯化，产生化合物5的Rp/Sp混合物(950mg; 70%)。31P-NMR (DMSO-d6): δ 3.52, 3.37。MS: m/z = 544 [M-1]。
实施例5
化合物6
将化合物32-1 (5 g, 8.79 mmol)与无水吡啶共同蒸发。向32-1于无水吡啶中的冰冷溶液(15mL)中添加TsCl(3.43g, 17.58mmol)，并在0℃下搅拌1小时。通过LCMS和TLC检查反应物。将反应物用H2O淬灭，并用EA萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。化合物6-1 (6.35 g, 100%)直接用于下一步骤中。
向6-1 (31.77g, 43.94 mmol)于丙酮(300 mL)中的溶液中添加NaI(65.86g,439.4mmol)，并加热至回流过夜。通过LCMS检查反应物。将反应物用饱和Na2S2O3溶液淬灭并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM 中的MeOH，1%至6%)纯化残余物，以得到作为白色固体的6-2 (11.5g, 38%)。
向6-2 (11.5 g, 16.94 mmol)于干燥THF (120 mL)中的溶液中添加DBU(12.87g,84.68mmol)，并加热至60℃。将反应物搅拌过夜并通过LCMS检查。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭并用EA萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至5%)纯化残余物，以得到作为白色固体的6-3 (5.5 g, 54%)。
向6-3 (500 mg, 0.90 mmol)于干燥DCM (20 mL)中的冰冷溶液中添加I2 (500mg, 1.97 mmol)于干燥DCM (20 mL)中的溶液和AgF(618mg, 4.9mmol)。将反应物搅拌3小时，并通过LCMS检查。将反应物用饱和Na2S2O3溶液和饱和NaHCO3溶液淬灭，并将混合物用DCM萃取。将有机层通过无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发，以得到粗6-4 (420 mg, 66%)。
向粗6-4 (250 mg, 0.36 mmol)于干燥DCM (8 mL)中的溶液中添加DMAP(0.28g,2.33mmol)、TEA(145mg, 1.44mmol)和BzCl(230mg, 1.62mmol)于DCM (2mL)中溶液。将反应物搅拌过夜并通过LCMS检查。将混合物用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤。在低压下蒸发有机层。通过制备型TLC纯化残余物，以得到粗6-5 (150 mg, 46%)。
向粗6-5 (650 mg, 0.72 mmol)于干燥HMPA (20 mL)中的溶液中添加NaOBz(1.03 g, 7.2 mmol)和15-丝醚-5 (1.59 g, 7.2 mmol)。将反应物在60℃下搅拌2天。将混合物用H2O稀释，并用EA萃取。在低压下蒸发有机层。通过制备型TLC纯化残余物，以得到6-6(210 mg, 32.4%)。ESI-MS: m/z: 900.4 [M+H]+。
将6-6 (25 mg)和BuNH2 (0.8 mL)的混合物在室温下搅拌过夜。将混合物蒸发并在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-15%梯度)纯化，以产生6-7 (15 mg, 91%)。
将ACN (0.25 mL)中的6-7 (15 mg, 0.02 mmol)和4 N HCL/二氧杂环己烷(19 μL)中的混合物在室温下搅拌45分钟。将混合物用MeOH稀释，并蒸发。用MeCN处理粗残余物，并过滤固体，以产生化合物6 (7 mg)。MS: m/z = 314 [M-1]。
实施例6
化合物7
将7-1 (170 mg, 0.19 mmol)和甲醇氨(7 N;3mL)的混合物在室温下搅拌8小时，浓缩并在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-11%梯度)进行纯化，以得到7-2 (100 mg, 90%)。
通过与吡啶、随后与甲苯共同蒸发使化合物7-2无水。以6小时时间间隔，向7-2(24 mg, 0.04 mmol)和N-甲基咪唑 (17 μL, 5 eq.)于乙腈 (1 mL)中的溶液中以2份添加氯磷酸酯(50mg, 3.5eq.)。将混合物在室温下搅拌1天并蒸发。在二氧化硅(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-12%梯度)进行纯化，产生7-3 (10 mg, 28%)。
将7-3 (9 mg, 0.01 mmol)于80%甲酸中的溶液在室温下搅拌3小时。将混合物蒸发并在二氧化硅(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (5-15%梯度)进行纯化，以得到化合物7 (3 mg,50%). MS: m/z = 624 [M-1]。
实施例7
化合物8
向8-1 (80 mg; 015 mmol)于无水THF (2 mL)中的冰冷溶液中添加异丙基氯化镁(0.22mL; 2M，在THF中)。将混合物在0℃下搅拌20分钟。逐滴添加氯磷酸酯试剂(0.16g;0.45mmol)于THF(0.5mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭并在室温下搅拌10分钟。用水和CH2Cl2稀释混合物，并分离两个层。将有机层用水、半饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在硅胶柱上用CH2Cl2-MeOH溶剂体系(2-10%梯度)纯化经蒸发的残余物，以产生8-2的Rp/Sp混合物(102mg; 80%)。
将EtOH (3 mL)中的8-2 (100 mg; 0.12 mmol)和10% Pd/C (10 mg)的混合物在H2气氛下搅拌1.5小时。将混合物通过硅藻土垫过滤，蒸发并在硅胶柱上用CH2Cl2-MeOH溶剂体系(4-10%梯度)纯化，以产生化合物8的Rp/Sp混合物(52mg, 74%)。MS：m/z=584[M-1]。
实施例8
化合物9
将9-1 (1.2 g, 4.3 mmol)、PTSA一水合物(0.82 g, 1 eq.)和原甲酸三甲酯(14 mL,30 eq.)于二氧杂环己烷(30 mL)中的混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用7N NH3/MeOH中和并通过过滤去除白色固体。将残余物溶解于THF(10mL)中并用80% AcOH水溶液(5mL)处理。将混合物在室温下保持45分钟，然后蒸发。在硅胶(25g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化残余物，以得到9-2 (1.18 g, 87%)。
在THF(3mL)中用9-2 (93 mg, 0.29 mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.44 mmol)与DIPEA (0.2 mL)、BopCl (147 mg)和3-硝基-1,2,4-三唑 (66 mg)制备化合物9-3 (137 mg, 75%)。用CH2Cl2/异-PrOH溶剂体系(3-10%梯度)完成纯化。
将9-3 (137 mg)于80% HCOOH水溶液中的溶液在室温下搅拌2小时，然后浓缩。将残余物与甲苯共同蒸发，然后与含有少量Et3N(2滴)的MeOH共同蒸发。在二氧化硅(25g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化，得到化合物9 (100 mg, 77%). MS: m/z = 1175 (2M-1)。
实施例9
化合物10
将化合物10-1 (50 g, 86.0 mmol)和6-Cl-鸟嘌呤(16.1 g, 98.2 mmol)与无水甲苯共同蒸发3次。在0℃下向10-1于MeCN中的溶液(200mL)中添加DBU (39.5g, 258.0mmol)。将混合物在0℃下搅拌30分钟，然后在0℃下逐滴添加TMSOTf (95.5g, 430.0mmol)。将混合物在0℃下搅拌30分钟。将混合物加热至70℃，并搅拌过夜。将溶液冷却至室温并用EA(100mL)稀释。用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤溶液。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，10%至40%)上纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的10-2 (48.0g, 收率：88.7%)。ESI-MS: m/z 628 [M+H]+。
在N2下，向10-2 (48.0 g, 76.4 mol)、AgNO3 (50.0 g, 294.1 mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(40mL)于无水DCM (200mL)的溶液中以小份添加MMTrCl(46.0g, 149.2mmol)。在室温下，在N2下，将混合物搅拌3小时。通过TLC监测反应。过滤混合物，并用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤过滤器。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的EA，5%至50%)纯化残余物，以得到粗10-3 (68 g, 98%). ESI-MS: m/z 900.1 [M+H]+。
在0℃下将钠(8.7g, 378.0mmol)溶解于干燥EtOH (100 mL)中，并缓慢温热至室温。将化合物10-3 (68.0 g, 75.6 mmol)用新鲜制备的NaOEt溶液处理，并在室温下搅拌过夜。通过TLC监测反应，并在低压下浓缩混合物。将混合物用H2O(100mL)稀释，并用EA(3×100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至5%)纯化残余物，以得到作为黄色固体的10-4 (34.0 g, 75.2%)。ESI-MS: m/z598 [M+H]+。
将化合物10-4 (32.0 g, 53.5 mmol)与无水吡啶共同蒸发3次。在0℃下，向10-4于无水吡啶(100mL)中的冰冷溶液中逐滴添加吡啶(50 mL)中的TsCl (11.2 g, 58.9mmol)。将混合物在0℃下搅拌18小时。通过LCMS检查反应物(约70%为所需产物)。用H2O淬灭反应物，并在低压下浓缩溶液。将残余物溶解于EA(100mL)中，并用饱和NaHCO3溶液洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至5%)纯化残余物，以得到作为黄色固体的粗10-5 (25.0 g, 62.2%)。ESI-MS: m/z 752 [M+H]+。
向10-5 (23.0 g, 30.6 mmol)于丙酮(150 mL)中的溶液中添加NaI (45.9 g,306.0 mmol)和TBAI (2.0 g)并回流过夜。通过LCMS监测反应物。反应完成后，在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EA(100mL)中，用盐水洗涤，并经无水Na2SO4干燥。在低压下蒸发有机溶液。通过硅胶柱色谱法(DCM: MeOH=100:1至20:1)纯化残余物，以得到粗产物。向粗产物于干燥THF (200 mL)中的溶液中添加DBU(14.0g, 91.8mmol)，并加热至60℃。将混合物搅拌过夜并通过LCMS检查。将反应物用饱和NaHCO3淬灭，并用EA(100mL)萃取溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至5%)纯化残余物，以得到作为黄色固体的10-6 (12.0 g, 67.4%)。ESI-MS: m/z 580 [M+H]+。
在0℃下，向10-6 (8.0 g, 13.8 mmol)于干燥MeCN (100 mL)中的冰冷溶液中添加NIS (3.9 g, 17.2 mmol)和TEA•3HF (3.3 g, 20.7 mmol)。将混合物在室温下搅拌18小时并通过LCMS检查。反应完成后，将反应物用饱和Na2SO3和饱和NaHCO3溶液淬灭。用EA萃取溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，10%至50%)纯化残余物，以得到作为固体的10-7(7.2 g, 72.0%)。ESI-MS: m/z 726 [M+H]+。
在0℃下，向粗10-7 (7.2 g, 9.9 mmol)于干燥DCM (100 mL)中的溶液中添加DMAP (3.6 g, 29.8 mmol)和BzCl (2.8 g, 19.8 mmol)。将混合物搅拌过夜并通过LCMS检查。用饱和NaHCO3溶液洗涤混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，10%至30%)纯化残余物，以得到作为固体的10-8 (8.0 g, 86.4%)。ESI-MS: m/z 934 [M+H]+。
向10-8 (7.5 g, 8.0 mmol)于干燥DMF (100 mL)中的溶液中添加NaOBz (11.5g, 80.0 mmol)和15-丝醚-5 (15.6 mL)。将混合物在90℃下搅拌36小时。将混合物用H2O(100mL)稀释，并用EA(3×150mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，10%至30%)纯化残余物，以得到作为固体的粗10-9 (6.0 g,80.0%)。ESI-MS: m/z 928 [M+H]+。
将化合物10-9 (4.0 g, 4.3 mmol)与无水甲苯共同蒸发3次，并在室温下用NH3/MeOH (50mL, 4N)处理。将混合物在室温下搅拌18小时。通过LCMS监测反应物，并在低压下浓缩混合物。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，30%至50%)纯化残余物，以得到作为固体的10-10 (1.9 g, 71.7%)。ESI-MS: m/z 616 [M+H]+。
将化合物10-10(300.0mg, 0.49mmol)与无水甲苯共同蒸发3次，并溶解于MeCN(2mL)中。将混合物在0℃下、在MeCN(1mL)中用NMI(120.5mg, 1.47mmol)和氯磷酸酯试剂(338.1mg, 0.98mmol)处理。将混合物在室温下搅拌18小时。通过LCMS监测反应物。将混合物用10% NaHCO3溶液稀释并用EA萃取。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，30%至50%)纯化残余物，以得到作为固体的10-11 (240 mg, 53.3%)。ESI-MS: m/z 925 [M+H]+。
将化合物10-11 (240.0 mg, 0.26 mmol)用80% AcOH (10mL)处理，并将混合物在室温下搅拌18小时。通过LCMS监测反应物。在低压下浓缩混合物。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至3%)纯化残余物，以得到作为固体的化合物10 (87.6 mg, 51.7%)。ESI-MS: m/z 653 [M+H]+。
实施例10
化合物12
在0℃下，向12-1 (20.0 g, 81.3 mmol)、咪唑 (15.9 g, 234.0 mmol)、PPh3 (53.5g, 203.3 mmol)和吡啶(90 mL)于无水THF (100 mL)中的搅拌悬浮液中逐滴添加I2 (41.3g, 162.6 mmol)于THF (150 mL)中的溶液。将混合物缓慢温热至室温并搅拌14小时。将反应物用饱和Na2S2O3水溶液(150mL)淬灭并用THF/EA(1/1)(100mL×3)萃取。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将残余物从EtOH再结晶，以提供作为白色固体的纯12-2 (23g, 79%)。
在室温下，向12-2 (23 g, 65 mmol)于无水MeOH (200 mL)中的搅拌溶液中添加MeOH (50 mL)中的NaOCH3(10.5g, 195mmol)。将混合物在60℃下搅拌3小时，并用干冰淬灭。固体沉淀并通过过滤去除。在低压下浓缩滤液。在硅胶柱(DCM中的MeOH，1%至10%)上纯化残余物，以提供作为白色泡沫固体的12-3 (13.1 g, 92.5%)。
在0℃下，向12-3 (12.0 g, 53 mmol)于无水CH3CN中的搅拌溶液中添加TEA•3HF(8.5 g, 53 mmol)和NIS (10.2 g, 63.6 mmol)。将混合物搅拌30分钟，并缓慢温热至室温。将混合物再搅拌30分钟。将固体通过过滤去除，并用DCM洗涤，以得到作为黄色固体的12-4 (14 g, 73%)。ESI-MS: m/z 373.0 [M+H]+。
在室温下，向12-4 (12.0 g, 32 mmol)和DMAP (1.2 g, 9.6 mmol)于吡啶(100mL)中的搅拌溶液中添加Bz2O (21.7 g, 96 mmol)。将混合物在50℃下搅拌16小时。将所得溶液用水淬灭，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的50% EA)上纯化粗产物，以得到作为白色固体的12-5 (15 g, 81%)。ESI-TOF-MS: m/z 581.0 [M+H]+。
通过添加TFA(48mL)将氢氧化四丁铵(288mL, 作为54-56%水溶液，576mmol)调节至pH~4。用12-5 (14 g, 24 mmol)于DCM (200 mL)中的溶液处理所得溶液。在剧烈搅拌下逐份添加间氯过苯甲酸(30 g, 60-70%, 120 mmol)，并将混合物搅拌过夜。将有机层分离并用盐水洗涤。将所得溶液经硫酸镁干燥并在减压下浓缩。将残余物通过柱色谱法纯化，以得到12-6 (7.5 g, 68%)。
将化合物12-6 (5.0 g, 10.6 mmol)用7N NH3•MeOH (100 mL)处理，并将混合物搅拌5小时。然后将混合物在低压下浓缩至干燥。用DCM洗涤残余物，并过滤固体，以得到作为白色泡沫的12-7 (2.1 g, 75%)。ESI-MS: m/z 263.0 [M+H]+。
在0℃下，向12-7 (2.1 g, 8.0 mmol)于吡啶中的溶液中逐滴添加TIDPSCl (2.5g, 8.0 mmol)，并在室温下搅拌12小时。将溶液用水淬灭，并在低压下浓缩至干燥。通过柱色谱法(PE中的EA，10%至50%)纯化粗产物，以得到作为白色泡沫的纯12-8 (1.6 g, 40%)。
将12-8 (1.5 g, 3.0 mmol)和IBX (1.69 g, 6.0 mmol)于无水CH3CN (10 mL)中的溶液在80℃下搅拌3小时。将混合物冷却至室温并过滤。将滤液在低压下浓缩至干燥。通过柱色谱法(PE中的EA，2%至50%)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的纯12-9 (1.2 g,80%)。ESI-MS: m/z 503.0 [M+H]+。
将化合物12-9 (500 mg, 1 mmol)溶解于干燥THF (8 mL)中。在室温下添加溴化乙炔镁(8mL, 环己烷中的0.5M溶液)。30分钟后，添加额外的溴化乙炔镁(8mL)。将混合物放置30分钟，然后用氯化铵的饱和溶液淬灭。用EA萃取产物。将有机萃取物用盐水洗涤，干燥并浓缩。通过硅胶快速色谱法(在EA中)纯化残余物，以去除暗色。将黄色化合物溶解于THF(3mL)中并用TBAF(1mL, THF中的2M溶液)处理30分钟。蒸发溶剂，并将残余物在Biotage筒（cartridge）(25g)上进行硅胶色谱法。用水饱和的EA用于等度洗脱。通过TLC在DCM:MeOH(9:1 v:v)中分析各级分。将仅含有具有高Rf的异构体的级分浓缩，以得到纯化合物12(110 mg). MS: 285.1 [M-1]。
实施例11
化合物13
将化合物12 (57 mg, 0.2 mmol)溶解于含有N-甲基咪唑(40uL)的CH3CN(2mL)中。添加氯磷酸酯试剂(207mg, 0.6mmol)，并将混合物在40℃下保持过夜。将混合物分配于水和EA之间。将有机层分离，用盐水洗涤，干燥并蒸发。通过硅胶色谱法(DCM中的甲醇的0%至15%的梯度)分离产物。获得化合物13 (46mg, 39%)。MS: m/z 593.9 [M-1]。
实施例12
化合物14
在室温下向14-1 (5.0 g, 19.53 mmol)于无水MeCN中的搅拌溶液中添加IBX(7.66g,27.34mmol)。将混合物在80℃下加热12小时，然后缓慢冷却至室温。过滤后，浓缩滤液，以得到粗14-2 (4.87 g, 98%)。
在-78℃下，在N2下，向14-2 (4.96 g, 19.53 mmol)于无水THF中的溶液中逐滴添加溴化甲基镁(19.53mL, 58.59mmol)。将混合物缓慢温热至室温，并搅拌12小时。将混合物用饱和NH4Cl溶液淬灭，并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的14-3 (4.37 g, 83%)。
在0℃下，向14-3 (4.37 g, 16.19 mmol)于无水DCM (20 mL)中的溶液中添加DMAP(3.95g, 32.38mmol)、TEA(4.91g, 48.56mmol)和BzCl(6.80g, 48.56mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用饱和NaHCO3溶液(30mL)淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的粗14-4 (5.3 g, 87%)。
在0℃下，向14-4 (3.0 g, 8.02 mmol)和Ac2O (4.91 g, 48.13 mmol)于乙酸(10mL)中的溶液中添加浓H2SO4 (98%, 2.41 g, 24.06 mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。将溶液倒入冰水(30mL)中，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的14-5 (2.3 g, 81%)。
在0℃下，在N2下，向6-Cl-鸟嘌呤(560 mg, 3.31 mmol)和14-5 (1.11 g, 2.76mmol)于无水MeCN (5 mL)中的搅拌溶液中添加DBU(1.27g, 8.28mmol)。将混合物在室温下搅拌30分钟。将混合物冷却至0℃，并在15分钟内缓慢添加TMSOTf(2.45g, 11.04mmol)。然后将混合物在30分钟内温热至室温。将混合物在60℃下加热4小时。然后将混合物倒入冰水(30mL)中并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的14-6 (800 mg, 70%)。
向14-6 (839 mg, 1.64 mmol)、MMTrCl (1.46 g, 4.75 mmol)和AgNO3 (697 mg,4.1 mmol)于DCM (10 mL)中的溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(794mg, 6.56mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。用饱和NaHCO3溶液(20mL)淬灭反应物。过滤后，用DCM (3×20mL)萃取滤液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的14-7 (1.3 g, 72.5%)。
将3-羟基丙烯腈(4.13g, 5.82mmol)溶解于无水THF(10mL)中。将溶液在0℃下用NaH (464mg, 11.6mmol)处理，并缓慢温热至室温，并搅拌30分钟。缓慢添加14-7 (912 mg,1.16 mmol)于无水THF (5 mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水(40mL)淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的14-8 (600 mg, 85%)。
在0℃下，向14-8 (6.20 g, 10.86 mmol)于无水吡啶(10 mL)中的溶液中逐滴添加TsCl (4.54 g, 23.89 mmol)于无水吡啶(10 mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌30分钟。将混合物用水(30mL)淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的14-9 (6.0 g, 76%)。
向14-9 (6.0 g, 8.28 mmol)于丙酮(30 mL)中的溶液中添加NaI(4.97g,33.12mmol)，并回流过夜。在减压下蒸发混合物。将残余物溶解于EA(50mL)中，并用饱和NaHCO3溶液(30mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的14-10 (5.43 g, 96.4%)。
向14-10 (5.0 g, 7.34 mmol)于无水THF (20 mL)中的溶液中添加DBU(4.49g,29.37mmol)，并在60℃下搅拌过夜。将混合物缓慢冷却至室温。将混合物用水(30mL)淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的14-11 (3.5 g, 85%)。
在0℃下，向14-11 (3.5 g, 6.33 mmol)和AgF (4.42 g, 34.81 mmol)于无水DCM(20 mL)中的溶液中逐滴添加碘(3.54g, 13.93mmol)于无水DCM (5mL)中的溶液。将混合物搅拌3小时。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液(40mL)洗涤并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的粗14-12 (1.37g, 31%)。
向14-12 (1.37 g, 1.96 mmol)于无水DMF (15 mL)中的溶液中添加苯甲酸钠(2.82g, 19.60mmol)和15-丝醚-5 (4.31 g, 19.60 mmol)，并在90℃下搅拌3天。将混合物用水(30mL)淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过HPLC分离纯化残余物，以得到14-13 (250 mg, 20%). ESI-MS: m/z: 694 [M+H]+。
将14-13 (250 mg, 0.36 mmol)于液体氨中的混合物在高压玻璃容器中在室温下保持过夜。然后蒸发氨，并在硅胶(10g柱)上使用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化残余物，以得到14-14 (180 mg, 85%)。
在THF(2mL)中由14-14 (99 mg)与异-PrMgCl (0.11 mL)和氯磷酸酯试剂(94mg)制备化合物14 (85 mg, 56%)，随后脱保护。MS: m/z = 627 [M+1]。
实施例13
化合物15
在室温下向15-1 (260 mg, 1 mmol)、PPh3 (780 mg,3mmol)和吡啶(0.5 mL)于无水THF (8 mL)中的溶液中添加I2(504mg, 2mmol)，并将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物用EtOAc稀释并用1M HCl溶液洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的15-2 (190 mg, 85%)。
在室温下向15-2 (190 mg, 0.52 mmol)于THF (4 mL)中的溶液中添加DBU(760mg, 5mmol)，并将混合物在50℃下加热过夜。将混合物用EtOAc稀释，并用水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的15-3 (75 mg, 52%)。
在室温下向15-3 (200 mg, 0.82 mmol)于MeCN(无水，4mL)中的溶液中添加NIS(337 mg, 1.5 mmol)和TEA•3HF (213 mg, 1.25 mmol)，并将混合物在室温下搅拌7小时。将反应物用饱和Na2SO3溶液和饱和NaHCO3水溶液淬灭。用EA萃取混合物。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的15-4 (300 mg, 62%)。
在0℃下，向15-4 (194 mg, 0.5 mmol)于吡啶(5 mL)中的溶液中添加BzCl(92mg,0.55mmol)。将混合物在室温下搅拌5小时，并将反应物用水淬灭。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的15-5 (397 mg, 81%)。
在室温下，向15-5 (1.05 g, 2.13 mmol)于DCM (12 mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL)和Bu4NOH (1mL)的混合物，随后添加间-CPBA (1.3 g,6mmol)。将混合物在室温下搅拌5小时。将混合物用饱和Na2SO3溶液和NaHCO3水溶液洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的15-6(450 mg, 63%)。
将化合物15-6 (250 mg, 0.65 mmol)溶解于NH3/MeOH (5mL)中。将混合物在室温下搅拌5小时，然后在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色粉末的化合物15 (120 mg, 66%)。ESI-MS: m/z 279.0 [M+H]+。
实施例14
化合物16
在0℃下，将钠(6.0g, 261.2mmol)溶解于干燥EtOH (400 mL)中并缓慢温热至室温。在0℃下，将化合物14-7 (32.0 g, 43.5 mmol)用新鲜制备的NaOEt溶液处理，并将混合物在室温下搅拌过夜。通过TLC和LCMS监测反应物。反应完成后，在低压下浓缩混合物。将混合物用H2O(40mL)淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，0.5%至2%)纯化残余物，以得到作为白色固体的16-1 (20.0g, 76.6%)。
将化合物16-1 (20.0 g, 33.3 mmol)与无水吡啶共同蒸发3次。在0℃下，向16-1于无水吡啶中的冰冷溶液(100mL)中添加TsCl(9.5g, 49.9mmol)。添加后，将反应物在20℃下搅拌12小时，并通过LCMS监测。将反应物用H2O淬灭，并在低压下浓缩。将残余物溶解于EA(50mL)中。用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，0.5%至2%)纯化残余物，以得到作为黄色固体的16-2(20.0 g, 80%)。
向16-2 (20.0 g, 26.5 mmol)于丙酮(100 mL)中的溶液中添加NaI(31.8g,212mmol)，并加热至回流过夜。通过LCMS检查反应物。反应完成后，在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EA(50mL)中。将溶液用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，0.5%至2%)纯化残余物，以得到粗产物。向粗产物于干燥THF (60 mL)中的溶液中添加DBU(16.2g, 106mmol)，并加热至60℃。将混合物搅拌过夜并通过LCMS检查。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，0.5%至2%)纯化残余物，以得到作为黄色固体的16-3 (12.0 g, 77.9%)。
在0℃下，向16-3 (11.0 g, 18.9 mmol)于干燥MeCN (100 mL)中的冰冷溶液中添加NIS (5.4 g, 23.7 mmol)和NEt3•3HF (3.0 g, 18.9 mmol)。将混合物在室温下搅拌4小时，并通过LCMS检查。反应完成后，将反应物用饱和Na2SO3溶液和饱和NaHCO3溶液淬灭。用EA(3×100mL)萃取溶液。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，12%至50%)纯化残余物，以得到16-4 (11.0 g, 79.9%)。
向16-4 (10.0 g, 13.7 mmol)于干燥DMF (100 mL)中的溶液中添加NaOBz (19.8g, 137 mmol)和15-丝醚-5 (30.2 g, 137 mmol)。将反应物在90℃下搅拌48小时，并用EA稀释。将溶液用水和盐水洗涤，并经MgSO4干燥。在低压下蒸发有机层，并通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，12%至50%)纯化残余物，以得到16-5 (8.0 g, 80.0%)。
将化合物16-5 (6.0 g, 8.3 mmol)与无水甲苯共同蒸发3次，并在室温下用MeOH中的NH3(4N, 50 mL)处理。将反应物在室温下搅拌18小时。通过LCMS监测反应物。反应完成后，在低压下浓缩混合物。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，20%至50%)纯化残余物，以得到16-6 (4.5 g, 87.8%). ESI-MS: m/z 617.9 [M+H]+。
向16-6 (25 mg, 0.07 mmol)和NMI (46 μL, 8 eq.)于乙腈(0.7 mL)中的冰冷混合物中添加氯磷酸酯试剂(73mg, 3eq.)并在室温下搅拌过夜。添加额外量的NMI(46uL)和氯磷酸酯试剂(73mg)并继续搅拌1天。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭，用EtOAc和水稀释。将有机层分离并用NaHCO3水溶液、水和盐水洗涤，然后干燥(Na2SO4)。在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化残余物，以产生化合物16 (18 mg, 40%). MS: m/z =655 [M+1]。
实施例15
化合物18
在0℃下，向化合物15 (139 mg, 0.5 mmol)于吡啶(5 mL)中的溶液中添加BzCl(92mg,0.55mmol)。将混合物在室温下搅拌5小时，用EtOAc稀释并用1N HCl溶液洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的18-1 (274 mg, 79%)。
在0℃下，向18-1 (490 mg, 1 mmol)、DMAP (244 mg, 2 mmol)和TEA (205 mg,2.1 mmol)于MeCN (10 mL)中的溶液中添加TPSCl(604mg, 2mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时，然后在室温下添加NH4OH水溶液。将混合物搅拌0.5小时，用EtOAc稀释并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的18-2 (250 mg, 41%)。
将化合物18-2 (250 mg, 0.51 mmol)溶解于NH3/MeOH (15mL)中。将混合物在室温下搅拌5小时，然后在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM中的5% DCM)纯化残余物，以得到作为白色粉末的化合物18 (95 mg, 66%)。ESI-MS: m/z 278.1 [M+H]+。
实施例16
化合物20
在-78℃下，在N2下，向化合物20-1 (30 g, 0.08 mol)于无水THF (300 mL)中的溶液中逐滴添加三-叔丁氧基氢化铝锂(120mL, 0.12mol)的溶液。将混合物在-20℃下搅拌1小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭，然后过滤。用EA(3×300mL)萃取滤液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的10% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的20-2 (26 g, 86%)。
在-20℃下，在N2下，向PPh3 (37.7 g, 0.144 mol)于DCM (100 mL)中的搅拌溶液中添加化合物20-2 (27 g, 0.072 mol)。将混合物在室温下搅拌15分钟后，在N2下添加CBr4(42g, 0.129mol)，同时维持反应温度于-25和-20℃之间。然后将混合物在低于-17℃下搅拌20分钟。将硅胶添加至溶液，然后通过快速硅胶柱分离纯化，以得到粗油产物。通过硅胶柱(PE中的EA，2%至20%)纯化粗产物，以得到作为无色油的20-3 (α-异构体, 17 g, 55%)。
将6-Cl-鸟嘌呤(11.6 g, 68.8 mmol)和叔-BuOK (8.2 g, 73 mmol)于叔-BuOH(200 mL)和MeCN (150 mL)中的混合物在35℃下搅拌30分钟，然后在室温下添加MeCN(100mL)中的20-3 (10 g, 22.9 mmol)。将混合物在50℃下加热过夜。将反应物用NH4Cl(5g)于水(40mL)中的溶液淬灭，并过滤混合物。在低压下蒸发滤液。通过硅胶柱(PE中的20%EA)纯化残余物，以得到作为黄色固体的20-4 (6 g, 42%)。
向20-4 (12.5 g, 23.8 mol)于DCM (50 mL)中的溶液中添加AgNO3(8.1g,47.6mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(5.77g, 47.6mmol)和MMTrCl(11g, 35.7mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用MeOH (5ml)淬灭，过滤并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为黄色固体的中间体(16g, 86%)。在0℃下，向HOCH2CH2CN(4.7 g, 66 mmol)于THF (200 mL)中的溶液中添加NaH (3.7g, 92mmol)。将混合物在室温下搅拌30分钟。添加中间体(10.5g, 13mmol)于THF(50mL)中的溶液，并将反应混合物在室温下搅拌12小时。将反应物用MeOH (2mL)淬灭，用EA(100mL)稀释并用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为黄色固体的20-5 (5.8 g, 77%)。
向PPh3 (7.0 g, 26.6 mmol)于无水吡啶(100 mL)中的溶液中添加I2(6.3g,24.9mmol)，并在室温下搅拌30分钟。用20-5 (9.5 g, 16.6 mmol)于吡啶(40 mL)中的溶液处理混合物。将混合物在室温下搅拌过夜。用饱和Na2S2O3溶液淬灭反应物并用EA萃取混合物。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为黄色固体的20-6 (7 g, 66%)。
向20-6 (7.5 g, 11 mmol)于干燥THF (50 mL)中的溶液中添加DBU(5.4g,33mmol)，并将混合物加热至回流持续4小时。将混合物用EA(3×100mL)稀释，并用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的20-7 (4.0 g, 67%)。
在室温下，向20-7 (3.0 g, 5.4 mmol)于无水MeCN (20 mL)中的冰冷溶液中添加TEA•3HF (0.65 g, 4.1 mmol)和NIS (1.53 g, 6.78 mmol)，并将反应混合物在室温下搅拌2小时。将混合物用EA(50mL)稀释，并用饱和Na2S2O3溶液和NaHCO3水溶液洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。通过制备型HPLC(水中的0.1% HCOOH和MeCN)纯化残余物以分离两种异构体(约1：1)。NOE显示极性异构体为作为白色固体的20-8 (0.6 g,16%)。
在0℃下，向20-8 (0.7 g, 1 mmol)于干燥吡啶(10 mL)中的溶液中添加BzCl(147mg, 1.05mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时。然后将混合物用EA稀释，并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的20-9 (0.65 g, 81%)。
向20-9 (0.65 g, 0.8 mmol)于干燥DMF (40 mL)中的溶液中添加NaOBz (1.15g, 8 mmol)和15-丝醚-5 (1.77 g, 8 mmol)。将混合物在100℃下搅拌48小时。在低压下蒸发溶剂，并将残余物溶解于EA(30mL)中，并用水和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的20-10 (500mg, 78%)。
将NH3/MeOH (7N, 100 mL)中的化合物20-10 (400 mg, 0.5 mmol)在室温下搅拌18小时。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的20-11 (220 mg, 63%)。ESI-MS: m/z 590.3 [M+H]+。
将化合物20-11 (59 mg, 0.1 mmol)溶解于甲醇中的50% TFA(10mL)中，并将混合物在室温下保持2小时。蒸发溶剂且与甲醇/甲苯混合物共同蒸发以去除痕量酸。将残余物悬浮于CH3CN(1mL)中并离心。将沉淀物用CH3CN(1mL)洗涤并干燥。获得作为无色固体的化合物20 (21mg, 65%)。MS: m/z 316.2 [M-1]。
实施例17
化合物21
以与化合物7相同的方式，由乙腈(2mL)中的21-1 (50 mg)与氯磷酸酯试剂(0.14g)和NMI(0.1mL)制备化合物21 (15 mg, 16%)。MS: m/z = 643 [M+1]。
实施例18
化合物22
以与化合物7相同的方式，由乙腈(2mL)中的22-1 (50 mg)与氯磷酸酯试剂(0.14g)和NMI(0.1mL)制备化合物22 (30 mg, 32%)。MS: m/z = 615 [M+1]。
实施例19
化合物23
在0℃(干冰/丙酮浴)下，向化合物15 (60 mg, 0.22 mmol)于无水THF (2.0 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(0.142mL, 1.73mmol)，随后添加溶解于THF(2mL)中的(环己氧基-L-丙氨酸基)氯磷酸苯酯(235mg, 0.68mmol)的溶液。将所得溶液在0℃下搅拌1小时，并经接下来1小时将温度升至10℃。将反应物在10℃下放置3小时。将混合物冷却至0至5℃，用EA稀释，并添加水(5ml)。用H2O和盐水洗涤溶液。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其溶解于25% CH3CN/H2O中。在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水纯化化合物，随后冻干，得到白色泡沫。将产物再溶解于EtOAc中，用50%柠檬酸水溶液洗涤，经无水MgSO4干燥并过滤。将滤液在真空中浓缩，并冻干，以得到化合物23的两种异构体(Rp/Sp)(6.3mg)。MS m/z 586.05 (M-H).
实施例20
化合物24
在0℃(干冰/丙酮浴)下，向化合物15 (100 mg, 0.36 mmol)于无水THF (3.0 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(236μL, 2.87mmol)，随后添加氯磷酸酯溶液(329mg,1.08mmol，溶解于2mL THF中)。将溶液在0℃下搅拌1小时，将反应温度在接下来1小时期间升至10℃，并将溶液在10℃下放置接下来4小时。将混合物冷却至0至5℃，用EA稀释，并添加水(15mL)。用H2O、50%柠檬酸水溶液和盐水洗涤溶液。将有机层分离，经无水MgSO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其溶解于25% CH3CN/H2O中。在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水纯化残余物，随后冻干，以得到化合物24的两种异构体的混合物(17.5mg)。MSm/z 546.05 (M-H)。
实施例21
化合物25和26
在0℃下，向25-1 (0.47 g, 0.65 mol)于DCM (3 mL)中的溶液中添加AgNO3(0.22g,1.29mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(0.15g, 1.29mmol)和MMTrCl(0.3g, 0.974mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。过滤混合物，并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤过滤器。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到作为白色固体的25-2 (0.55, 85%)。
向25-2 (0.5 g, 0.5 mmol)于干燥DMF (10 mL)中的溶液中添加NaOBz (0.72 g,5 mmol)和15-丝醚-5 (0.9 mL)。将混合物在95℃下搅拌72小时。将混合物用EA稀释，并用水和盐水洗涤。将有机相经MgSO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的10% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的25-3 (0.3 g, 60%)。
将NH3/MeOH (30 mL)中的化合物25-3 (0.3 g, 0.3 mmol)在室温下搅拌18小时。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的25-4 (145 mg, 56%)。ESI-LCMS: m/z 890.5 [M+H]+。
在0至5℃(冰/水浴)下，向25-4 (161 mg, 0.16 mmol)于无水CH3CN (2.0 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(118μL, 2.87mmol)，随后添加25-5的溶液(186mg,0.54mmol，溶解于2mL CH3CN中)。将溶液在0至5℃下搅拌4小时。将混合物用EA稀释，并添加水(15mL)。用H2O、50%柠檬酸水溶液和盐水洗涤溶液。将有机层分离，经无水MgSO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其在硅胶上用0至40% EA/己烷纯化，以得到作为较快洗脱的异构体的25-6 (82.6 mg)和作为较慢洗脱的异构体的25-7 (106 mg)。
将化合物25-6 (82.6 mg, 0.07 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl (35μL)。将混合物在室温下搅拌1小时，并添加无水EtOH(100μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发3次。将残余物溶解于50% CH3CN/H2O中，并在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水纯化，随后冻干，以得到化合物25 (19.4 mg). 1H NMR(CD3OD-d4, 400 MHz) δ 7.9 (s, 1H), 7.32-7.28 (t, J = 8.0 Hz, 2H), 7.2-7.12 (m,3H), 6.43 (d, J = 17.6 Hz, 1H), 4.70-4.63 (m, 2H), 4.55-4.4 (m, 3H), 3.94-3.9(m, 1H), 1.79-1.67 (m, 4H), 1.53-1.49 (m, 1H), 1.45-1.22 (m, 15H);31P NMR(CD3OD-d4) δ 4.06 (s); ESI-LCMS: m/z = 655.2 [M+H]+, 653.15 [M-H]-。
将化合物25-7 (100 mg, 0.083 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(50μL)。遵循用于获得化合物25的程序，获得化合物26(31.8 mg)。1H NMR (CD3OD-d4, 400 MHz) δ 7.93 (s, 1H), 7.33-7.29 (m, 2H), 7.24-7.14 (m, 3H), 6.41 (d, J = 17.6 Hz, 1H), 4.70-4.60 (m, 2H), 4.54-4.49 (m,2H), 4.44-4.39 (m, 1H), 3.92-3.89 (m, 1H), 1.77-1.66 (m, 4H), 1.54-1.24 (m,16H);31P NMR (CD3OD-d4) δ 3.91 (s); ESI-LCMS: m/z = 655.2 [M+H]+, 653.1 [M-H]-。
实施例22
化合物27和28
在0℃下，向4-1 (50 g, 84.8 mmol)和2-氨基-6-氯嘌呤(28.6 g, 169.2 mmol)于无水MeCN (500 mL)中的搅拌悬浮液中添加DBU (77.8g, 508mmol)。将混合物在0℃下搅拌30分钟，并在0℃下逐滴添加TMSOTf (150.5g, 678mmol)。将混合物在室温下搅拌20分钟，直至形成澄清溶液。将混合物在90-110℃下搅拌过夜。将混合物冷却至室温并用EA稀释。用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤溶液。将有机层经Na2SO4干燥，然后在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/EA=2/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-1 (30 g, 55.5%)。
向27-1 (30 g, 47.1 mmol)于无水DCM (300 mL)中的溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(30mL)、AgNO3(24g, 141.4mmol)和MMTrCl(43.6g, 141.4mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。过滤混合物，并用水和盐水洗涤滤液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/EA=4/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-2 (35 g, 82%)。
向27-2 (35 g, 38.5 mmol)于无水EtOH (150 mL)中的搅拌溶液中添加EtONa于EtOH中的溶液(2N, 150mL)。将混合物在室温下搅拌过夜，然后在低压下浓缩。将残余物溶解于EA(200mL)中并用水和盐水洗涤溶液。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=100/2)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-3 (19 g, 81%)。
将化合物27-3 (19 g, 31.3 mmol)与无水吡啶共浓缩3次。在0℃下，向27-3于无水吡啶中的冰冷溶液(120mL)中逐滴添加TsCl (6.6g, 34.6mmol)于吡啶(40mL)中的溶液。将混合物在0℃下搅拌16小时。用水淬灭混合物，并浓缩反应混合物。将残余物再溶解于EA(200mL)中。用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤，并浓缩滤液。通过硅胶柱(DCM/MeOH=100/1)纯化残余物，以得到作为黄色固体的27-4 (16 g,67 %)。
向27-4 (15 g, 19.7 mmol)于丙酮(100 mL)中的溶液中添加NaI(30g,197mmol)。将混合物回流过夜，然后在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=100/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-5 (9 g, 63.7%)。
向27-5 (8 g, 11.2 mmol)于无水THF (60 mL)中的溶液中添加DBU(5.12g,33.5mmol)，并将混合物在60℃下加热过夜。将混合物用EA稀释，并用水和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤，并浓缩滤液。通过硅胶柱(PE/丙酮=4/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-6 (5.7 g, 86%)。1H-NMR (CD3OH, 400MHz) δ = 8.18 (s, 1H), 7.17-7.33 (m, 12H), 6.80 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 5.98 (s, 1H), 5.40 (d, J = 8.6 Hz,1H), 3.87 (m, 5H), 3.75 (s, 3H), 2.69 (s, 1H), 1.05 (s, 3H)。
向27-6 (4.44 g, 7.5 mmol)于无水MeCN (45 mL)中的冰冷溶液中添加TEA•3HF(1.23 g, 7.6 mmol)和NIS (2.16 g, 9.5 mmol)。将混合物在室温下搅拌2-3小时。用饱和Na2SO3和NaHCO3溶液淬灭反应物。用EA(3×100mL)萃取混合物。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/丙酮=100/2)纯化残余物，获得作为白色固体的27-7(4.4g, 79.8%)。
在0℃下，向27-7 (5.36 g, 7.3 mmol)于无水DCM (50 mL)中的溶液中添加DMAP(3.6g, 29.8mmol)和BzCl(3.1g, 22.1mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤混合物。浓缩有机层，并通过硅胶柱(PE/EA=5/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-8 (5.6 g, 81.3%)。
向27-8 (5.0 g, 5.3 mmol)于无水DMF (150 mL)中的溶液中添加NaOBz(7.64g,53mmol)和15-丝醚-5(14g, 68mmol)。将混合物在90-100℃下搅拌48小时。将混合物用EA稀释，并用水和盐水洗涤。浓缩有机层，并通过硅胶柱(PE/EA=5/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-9 (3.9 g, 78.5%)。
将MeOH中的NH3中的化合物27-9(7N, 60mL)在室温下搅拌18小时。在低压下浓缩混合物。通过硅胶柱(DCM/丙酮=50/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-10 (500 mg,74.7%)。ESI-MS: m/z 626.3 [M+H]+。
在0至5℃下，向27-10 (350 mg, 0.56 mmol)于无水吡啶(4 mL)中的溶液中添加咪唑(50mg, 0.72mmol)和TBSCl(108mg, 0.72mmol)，并在室温下搅拌15小时。用无水EtOH(0.5mL)淬灭反应物。将溶液在减压下浓缩至干燥。将残余物溶解于EA(150mL)中，并用水、饱和NaHCO3和盐水洗涤。将合并的有机层经Na2SO4干燥，过滤并在低压下蒸发。通过硅胶柱(己烷中的10-30% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的27-11 (338 mg, 81.8%)。
在N2下，向化合物27-11 (328mg, 0.44mmol)、AgNO3(226mg, 1.33mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(0.59mL, 4.84mmol)于无水DCM (4mL)中的溶液中添加MMTrCl(410mg,1.33mmol)。在室温下，在N2下，将混合物搅拌过夜，并通过TLC监测至完成。将混合物通过预装填硅藻土的过滤器过滤，并将滤液用水、50%柠檬酸水溶液和盐水洗涤。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，过滤并在低压下浓缩。通过硅胶柱(己烷中的EA， 0%至30%)纯化残余物，以得到27-12 (337 mg)。
在0至5℃下，向27-12 (337 mg, 0.33 mmol)于无水THF (4 mL)中的溶液中添加TBAF的1.0M溶液(0.66ML, 0.66mmol)。将反应物缓慢温热至室温并搅拌1小时。将混合物用硅胶淬灭并过滤。蒸发溶剂，以得到粗产物，将其通过硅胶柱(己烷中的EA，0%至50%)纯化，以得到27-13 (188 mg)。
在0-5℃(冰/水浴)下，向27-13 (180 mg, 0.16 mmol)于无水CH3CN (2.5 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(132μL, 1.6mmol)，随后添加(环己氧基-L-丙氨酸基)氯磷酸苯酯溶液(207mg, 0.6mmol，溶解于2mL CH3CN中)。将溶液在室温下搅拌2.5小时，并将混合物用EA稀释，随后添加水(15mL)。用H2O、50%柠檬酸水溶液和盐水洗涤溶液。将有机层分离，经无水MgSO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其在硅胶上使用0至40%EA/己烷纯化，以得到27-14 (75.8 mg)和作为较慢洗脱异构体的27-15 (108 mg)。
将化合物27-14 (76 mg, 0.063 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃(冰/水浴)下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(47μL)。将混合物在室温下搅拌40分钟，并添加无水EtOH (200μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发3次。将残余物溶解于50% CH3CN/H2O中，在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水纯化，并冻干，以得到化合物27 (26.6 mg). ESI-LCMS: m/z = 663.3 [M+H]+。
将化合物27-15 (108 mg, 0.089 mmol)溶解于无水CH3CN(0.7mL)中，并在0至5℃(冰/水浴)下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(67μL)。将混合物在室温下搅拌60分钟，并添加无水EtOH (200μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发3次。将残余物溶解于50% CH3CN/H2O中，在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水纯化，并冻干，以得到化合物28 (40.3 mg). ESI-LCMS: m/z = 663.2 [M+H]+。
实施例23
化合物30和31
在0℃下，向预甲硅烷化的6-Cl-鸟嘌呤(使用HMDS和(NH4)2SO4)(25.2g, 150mmol)于DCE(300mL)中的混合物中添加30-1 (50 g, 100 mmol)和TMSOTf (33.3 g, 150 mmol)。将混合物在70℃下搅拌16小时，然后在低压下浓缩。将残余物再溶解于EA中，并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE/EA=2/1)上纯化残余物，以得到作为白色固体的纯30-2 (45 g, 73%)。
向30-2 (45 g, 73.4 mmol)于EtOH (73 mL)中的溶液中添加EtONa(1N, 在EtOH中，360mL)。将混合物在室温下搅拌16小时。然后将混合物浓缩，以得到残余物，将其通过硅胶柱(DCM/MeOH=10/1)纯化，以得到作为白色固体的纯30-3 (19 g, 83%)。
在0℃下，向30-3 (19 g, 61.1 mmol)于吡啶(120 mL)中的溶液中逐滴添加TIPDSCl2(19.2g, 61mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时，然后在低压下浓缩。将残余物再溶解于EA中，并用饱和NaHCO3水溶液洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=20/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的纯30-4 (22 g, 65%)。
在0℃下，向30-4 (22 g, 39.8 mmol)于DMF/吡啶(5/1, 100 mL)中的溶液中逐滴添加TMSCl(12.9g, 119mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时，然后用异丁酰氯(5.4g,50mmol)处理。将混合物在室温下搅拌3小时，然后通过NH4OH淬灭。在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EA(200mL)中。用饱和NaHCO3水溶液洗涤溶液，然后干燥有机层并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=50/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的纯30-5 (15 g,60%)。
在0℃下，向30-5 (15 g, 24.1 mmol)于DCM (100 mL)中的溶液中添加PDC(13.5g, 26mmol)和Ac2O(9.8g, 96mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。通过饱和NaHCO3水溶液淬灭反应物，然后用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将残余物溶解于无水THF(100mL)中。在-78℃下，向TMSCCH (12g, 112mmol)于THF(200mL)中的溶液中添加正-BuLi(2.5N, 44mL)。将混合物在-78℃下搅拌15分钟并在0℃下搅拌15分钟。将混合物在-78℃下用粗酮于THF中的溶液处理并在-30℃下搅拌2小时。将反应物通过饱和NH4Cl水溶液淬灭，然后通过EA萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/EA=10/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的纯30-6 (3.1 g, 18%)。
在-78℃下，向30-6 (7 g, 7.5 mmol)和吡啶(1.4 g, 17 mmol)于DCM (35 mL)中的溶液中添加DAST(5.6g, 35mmol)。将混合物在-78℃下搅拌3小时。将反应物通过饱和NaHCO3水溶液淬灭，然后用EA萃取。将合并的有机层经无水干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/EA=10/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的纯30-7 (3.1 g, 18%)。
将饱和NH3/MeOH (100mL)中的化合物30-7 (4.1g, 5.7mmol)在室温下搅拌16小时，并在低压下浓缩。将残余物再溶解于无水DCM (300mL)中，并在N2下用AgNO3(27.0g,160mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(22mL)和MMTrCl(23.0g, 75.9mmol)以小份处理。将混合物在室温下搅拌16小时。过滤混合物，并用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤滤液。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/EA=10/1)纯化残余物，以得到纯中间体。将中间体溶解于TBAF/THF的溶液(1N, 20mL)中。将混合物在室温下搅拌2小时，然后在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM/MeOH=50/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的纯30-8 (3.0 g,86%)。
在0℃下，向30-8 (3.0 g, 4.9 mmol)于THF (50 mL)中的溶液中添加咪唑(840mg, 12mmol)、PPh3(3.2g, 12mmol)和I2(2.4g, 9.2mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。将反应物通过饱和Na2S2O3水溶液淬灭，然后用EA萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/EA=2/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的粗30-9(4.2g, >100%，含有TPPO)。
向粗30-9于无水THF(30mL)中的溶液中添加DBU(2.7g, 18mmol)，并加热至80℃。将混合物搅拌1小时并通过LCMS检查。将混合物通过水淬灭，并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤，并在低压下浓缩滤液。通过硅胶柱(PE/EA=2/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的30-10 (2.0 g, 69%)。
在0℃下，向30-10 (2.0 g, 3.38 mmol)于无水MeCN (15 mL)中的冰冷溶液中添加NIS (777 mg, 3.5 mmol)和NEt3•3HF (536 g, 3.3 mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时并通过LCMS检查。完成后，将混合物通过饱和Na2SO3和饱和NaHCO3溶液淬灭并用EA萃取。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(PE/EA=10/1至3/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的30-11 (2.1 g, 84.0%)。
在0℃下，向粗30-11 (2.1 g, 2.85 mmol)于无水DCM (100 mL)中的溶液中添加DMAP(490mg, 4mmol)和BzCl(580mg, 4mmol)。将混合物搅拌过夜并通过LCMS检查。用饱和NaHCO3溶液洗涤反应物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(PE/EA=8/1至3/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的30-12 (2.0 g, 83.4%)。
向30-12 (2.0 g, 2.4 mmol)于无水DMF (60 mL)中的溶液中添加NaOBz(3.3g,23.0mmol)和15-丝醚-5(5.11g, 23mmol)。将混合物在110℃下搅拌36小时。通过水淬灭反应物，并用EA萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE/EA=5/1至3/1)纯化残余物，以得到作为白色固体的30-13 (830 mg, 42.0%)。ESI-MS: m/z836.11 [M+H]+。
将30-13 (831mg, 1.0 mmol)于无水正丁胺(4 mL)中的溶液在室温下、在N2气氛下搅拌3小时。通过TLC监测反应物。在真空中蒸发溶剂，并通过硅胶柱(DCM中的MeOH，0%至10%)纯化残余物，以得到粗产物，将其使用硅胶柱再纯化，以得到作为淡粉红色固体的30-14 (563mg)。
在0至5℃下，向30-14 (560 mg, 0.89 mmol)于无水吡啶(5 mL)中的溶液中添加咪唑(78.6mg, 1.16mmol)和TBSCl(202mg, 1.34mmol)。将混合物在室温下搅拌15小时。通过添加无水EtOH (0.3mL)来淬灭反应物。将溶液在减压下浓缩至干燥，并与甲苯共同蒸发3次。将残余物溶解于EA(150mL)中，并用水、饱和NaHCO3和盐水洗涤。将合并的有机层经Na2SO4干燥，过滤并在低压下蒸发。通过硅胶柱(己烷中的0-20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的30-15 (303 mg)。
在N2下，向30-15 (303mg, 0.41mmol)、AgNO3(208mg, 1.23mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(0.55mL, 4.51mmol)于无水DCM (4mL)中的溶液中添加MMTrCl(378mg, 1.3mmol)。在室温下，在N2下，将混合物搅拌过夜，并通过TLC监测。将混合物通过预装填硅藻土的过滤器过滤，并将滤液用水和50%柠檬酸水溶液以及盐水洗涤。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，过滤并在低压下浓缩。通过硅胶柱(己烷中的EA，0%至30%)纯化残余物，以得到30-16 (374mg, 90%)。
在0至5℃下，向30-16 (374 mg, 0.37 mmol)于无水THF (4 mL)中的溶液中添加TBAF的1.0M溶液(0.74mL, 0.74mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。将混合物用硅胶淬灭并过滤。蒸发溶剂，以得到粗产物，将其通过硅胶柱(己烷中的EA，0%至50%)纯化，以得到30-17 (265 mg)。
在0-5℃(冰/水浴)下，向30-17 (187.5 mg, 0.16 mmol)于无水CH3CN (2.5 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(136μL, 1.66mmol)，随后添加(环己氧基-L-丙氨酸基)氯磷酸苯酯的溶液(214mg, 0.62mmol，溶解于0.5mL CH3CN中)。将溶液在室温下搅拌3小时，然后用EA稀释，随后添加水(15mL)。用H2O、50%柠檬酸水溶液和盐水洗涤溶液。将有机层分离，经无水MgSO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其在硅胶上用0至40%EA/己烷纯化，以得到30-18(单一异构体)(108mg)。后一级分的洗脱得到作为玻璃状固体的30-19(单一异构体) (120mg)。
将化合物30-18 (108mg, 0.089 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃(冰/水浴)下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(67μL)。将混合物在室温下搅拌40分钟，并添加无水EtOH (200μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发3次。将残余物溶解于50% CH3CN/H2O中，在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水纯化，随后冻干，以得到作为白色泡沫的化合物30(26.6 mg)。1H NMR (CD3OD-d4, 400 MHz) δ 7.89 (s, 1H), 7.33-7.29 (m, 2H), 7.20-7.13 (m, 3H), 7.17 (m, 1H), 6.62 (d, J = 15.6 Hz, 1H), 5.39 (t, J = 25.2 Hz,1H), 4.75-4.42 (m, 6H), 3.92 (t, J = 8.8 Hz, 1H), 3.24 (d, J = 5.6 Hz, 1H),1.76-1.51 (m, 5H), 1.45-1.25 (m, 12H);31P NMR (CD3OD-d4) δ 4.04 (s); ESI-LCMS:m/z = 665.2 [M+H]+。
使用30-19，根据针对化合物30所述的程序获得化合物31 (44.4mg, 单一异构体)。1H NMR (CD3OD-d4, 400 MHz) δ 7.93 (s, 1H), ), 7.32 (t, J = 8.0 Hz, 1H),7.24 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.16 (t, J = 7.6 Hz, 1H), 6.61 (d, J = 16.0 Hz,1H), 4.68-4.60 (m, 2H), 4.54-4.39 (m, 3H), 3.93-3.89 (m, 1H), 3.24 (d, J =5.6 Hz, 1H), 1.75-1.5 (m, 5H), 1.48-1.23 (m, 12H); 19F NMR (CD3OD-d4) δ -122.95(s), -155.84-155.99 (m); 31P NMR (CD3OD-d4) δ 3.94 (s); ESI-LCMS: m/z = 665.15[M+H]+。
实施例24
化合物32
在0℃下，向3-羟基丙腈(27g, 0.15mol)于THF(150mL)中的溶液中添加NaH (8.4g,0.21mol)，并将混合物在室温下搅拌1小时。将THF(100mL)中的化合物10-3 (27 g, 0.03mol)在0℃下用该混合物处理。将合并的混合物在室温下搅拌6小时。将反应物用H2O淬灭，并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将残余物通过柱色谱法纯化，以得到32-1 (9.38 g, 55%)。
在室温下，向32-1 (1 g, 1.76 mmol)和TsOH (1 g, 5.28 mmol)于DMF (4 mL)和丙酮(8 mL)中的溶液中添加2,2-二甲氧基丙烷(1.8g, 17.6mmol)。将混合物加热至50℃持续3小时。将反应物用H2O(50mL)淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将残余物通过柱色谱法纯化，以得到32-2 (520 mg, 87%)。
在室温下，向32-2 (10.0 g, 29.6 mmol)于吡啶(100 mL)中的搅拌溶液中添加TBSCl(53.4g, 35.6mmol)，并将混合物搅拌5小时。在低压下浓缩混合物，并将残余物溶解于EA(100mL)中。用水和盐水洗涤溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将粗产物与甲苯共同蒸发3次。向无水粗产物(2.0g, 4.43mmol)于DCM (30mL)中的溶液中添加DMTrCl(2.24g, 6.65mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(1.07g, 8.86mmol)和AgNO3(1.5g,8.86mmol)。将混合物搅拌1.5小时。过滤混合物，并用0.5N HCl溶液洗涤滤液。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以得到粗黄色固体。将粗黄色固体(7.2g,10mmol)用NH4F(7.2g, 200mmol)于MeOH (50mL)中的溶液处理，并将混合物加热至50℃持续8小时。在低压下浓缩混合物。通过硅胶柱纯化残余物，以得到32-3 (4.8 g, 80%)。
在室温下，向32-3 (200 mg, 0.33 mmol)于DCM (5 mL)中的溶液中添加TFA•Py(40 mg, 0.328 mmol)、DMSO (0.15 mL)和DCC (191 mg, 0.99 mmol)。将混合物搅拌6小时，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到产物。在室温下向产物(0.2g,0.328mmol)和HCHO(0.2mL)于1,4-二氧杂环己烷(2mL)中的溶液中添加NaOH (0.4mL, 2M)。将混合物搅拌5小时。然后将混合物用NaBH4(24mg, 0.66mmol)处理，并搅拌3小时。将混合物用EA(20mL)稀释，并用盐水洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到32-4 (125 mg, 60%)。
在-78℃下，向32-4 (4 g, 6.25 mmol)于DCM (40 mL)中的溶液中添加吡啶(10mL)和BzCl (920mg, 15.6mmol)。将混合物缓慢温热至室温。通过LCMS监测反应物。将混合物用H2O(40mL)淬灭，并用DCM (3×50mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到32-5 (3.25 g, 70%)。
向32-5 (5.75 g, 7.7 mmol)于DCM (20 mL)中的溶液中添加DMTrCl(3.58g,11.1mmol)、2,4,6-三甲基-吡啶(1.87g, 15.4mmol)和AgNO3(2.63g, 15.4mmol)，并搅拌3小时。过滤混合物，并用0.5N HCl溶液洗涤滤液。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到32-6 (6.25 g, 80%)。
在室温下向32-6 (4.3 g, 4.23 mmol)于MeOH (40 mL)中的溶液中添加NaOMe(0.82g, 12.6mmol)，并搅拌3小时。在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EA(30mL)中并用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到32-7 (2.89 g, 75%)。
在-35℃下，向32-7 (0.5 g, 0.54 mmol)和吡啶(0.478 g, 5.4 mmol)于DCM (4mL)中的溶液中缓慢添加Tf2O(0.201g, 0.713mmol)于DCM (3mL)中的溶液。将混合物缓慢温热至-5℃。通过LCMS监测反应物。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭，并用DCM (3×20mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到产物。向产物的溶液中添加THF中的TBAF(25mL, 1N)，并将混合物在室温下搅拌5小时。通过LCMS监测反应物。在低压下浓缩混合物，并通过制备型HPLC纯化残余物，以得到32-8 (221 mg, 45%). ESI-MS: m/z 914.4 [M+H]+。
将化合物32-8 (2.14 g)溶解于80% HCOOH (10mL)中并在室温下搅拌过夜。将溶剂蒸发至干燥，并将残余物从甲醇中结晶两次。将晶体溶解于THF和36% HCl 4:1 v/v的混合物中并放置过夜。蒸发溶剂，并通过RP HPLC在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上分离核苷。使用具有0.1% HCOOH的0至60%的甲醇的线性梯度进行洗脱。获得化合物32(370mg, 48%)。MS: m/z 316.2 [M-1]。
实施例25
化合物17
将17-1 (25mg, 0.04mmol)于80% HCOOH水溶液中的溶液在室温下保持3小时。将混合物浓缩，并与甲苯共同蒸发。在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化粗残余物，以产生17-2 (8 mg, 54%)。
将17-2 (8 mg, 0.02 mmol)于乙腈(0.4 mL)中的混合物与NMI(15mL, 8eq.)和氯磷酸酯试剂在室温下搅拌过夜。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭，用EtOAc和水稀释。将有机层分离，用NaHCO3水溶液、水和盐水洗涤，并干燥(Na2SO4)。在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化残余物，以产生化合物17 (9 mg, 66%). MS: m/z = 683 [M+1]。
实施例26
化合物35
在室温下，在N2下，向32-2 (5.0 g, 14.83 mmol)于无水吡啶(50 mL)中的搅拌溶液中添加TBSCl(3.33g, 22.24mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时，并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到35-1 (5.69 g, 85.1%)。
在室温下，向PPh3(2.76g, 10.6mmol)和DIAD(2.15g, 10.6mmol)于二氧杂环己烷(20mL)中的溶液中添加EtOH (0.49g, 10.6mmol)。搅拌30分钟后，添加35-1 (2.4 g, 5.3mmol)于二氧杂环己烷(10 mL)中的溶液。将溶液在室温下搅拌过夜。反应完成后，用饱和NaHCO3溶液淬灭反应物。用EA(3×40mL)萃取溶液。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的10% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的35-2(2 g, 78.4%)。
在0℃下，在N2下，向35-2 (8 g, 16.9 mmol)于二氯甲烷(60 mL)中的溶液中以小份添加AgNO3(5.67g, 33.4mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(4.03g, 33.4mmol)和MMTrCl(7.7g,25mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。通过TLC监测反应物。完成后，过滤混合物。用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤滤液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到作为白色固体的35-3 (10 g, 80%)。
向35-3 (10 g, 13.3 mmol)于甲醇 (100 mL)中的溶液中添加NH4F(10g,270mmol)，并加热至回流过夜。在低压下浓缩混合物。通过硅胶色谱法(EA中的50% PE)纯化残余物，以得到作为白色固体的35-4 (5g, 59%)。
在室温下，在N2下，向35-4 (4 g, 6.27 mmol)和DCC (3.65 g, 18.8 mmol)于无水DMSO (40 mL)中的溶液中添加TFA•Py (1.21 g, 6.27 mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水(100mL)淬灭，并用EA(200mL)稀释。过滤后，用饱和NaHCO3溶液洗涤过滤器。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将残余物(4g, 6.27mmol)溶解于二氧杂环己烷(40mL)中，并在室温下添加37%甲醛(4mL)，随后添加2N NaOH溶液(8mL)。将混合物在30℃下搅拌过夜。在5℃下分份添加NaBH4(0.7g, 18.9mmol)，并将混合物在室温下搅拌30分钟。用水淬灭反应物，并用EA(3×50mL)萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的20% EA)上纯化残余物，获得作为白色固体的35-5(2.5 g, 60%)。
在-78℃下，向35-5 (2.29 g, 3.43 mmol)于吡啶(5 mL)和DCM (20 mL)中的溶液中添加BzCl(0.53g, 3.77mmol)并在室温下搅拌过夜。将混合物用水淬灭，并用DCM (3×40mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到35-6 (1.62 mg, 62% )。
在0℃下，在N2下，向35-6 (1.62 g, 2.1 mmol)于二氯甲烷(20 mL)中的溶液中以小份添加AgNO3(714mg, 4.2mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(508mg, 4.2mmol)和MMTrCl(970mg,3.2mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。通过TLC监测反应物。过滤后，用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤过滤器。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到作为白色固体的35-7 (2 g, 91.3%)。
在室温下向35-7 (2.1 g, 2 mmol)于MeOH (30 mL)中的溶液中添加NaOMe(220mg, 4mmol)并搅拌1小时。如TLC所指示全部起始材料消失后，将反应物用干冰淬灭，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的35-8 (1.3 g,69%)。
在-20℃下，向35-8 (1.3 g, 1.38 mmol)于无水DCM (15 mL)和吡啶(1 mL)中的溶液中逐滴添加Tf2O(585mg, 2.07mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时，并用DCM (150mL)稀释。将溶液用水和盐水依次洗涤。将有机溶液经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在室温下，将残余物(1.48g)溶解于无水THF(15mL)中，并用TBAF(3mL, 1M，在THF中)处理。将混合物搅拌过夜。将反应物用饱和NaHCO3水溶液淬灭，并用EA(3×60mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的35-9 (1.25 g, 96%)。ESI-LCMS: m/z 942.4 [M+H]+。
将化合物35-9 (0.55g, 0.58 mmol)添加至冰冷80% TFA水溶液(5mL)中并在5℃下保持过夜。在5℃下在减压下浓缩混合物。将稠油状残余物与甲苯共同蒸发几次并在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-15%梯度)纯化，以产生化合物35 (75 mg, 36%). MS: m/z =358 [M+1]。
实施例27
化合物36
以与化合物7相同的方式，用乙腈(1.5mL)中的化合物15 (48 mg)与氯磷酸酯试剂(0.14g)和NMI(0.17mL)制备化合物36 (8 mg, 10%)。通过RP-HPLC(30-100% B，A：水中的50mM TEAA，B：MeCN中的50mM TEAA)完成纯化。MS: m/z = 665 [M-1]。
实施例28
化合物38
向38-1 (17 g, 65.9 mmol)和2,2-二甲氧基丙烷(34.27 g, 329.5 mmol, 5 eq.)于丙酮(200 mL)中的溶液中添加对甲苯磺酸一水合物(11.89 g, 62.6 mmol, 0.95 eq.)。将混合物在室温下搅拌过夜。用饱和NaHCO3水溶液淬灭反应物。将混合物过滤，并经无水Na2SO4干燥。浓缩滤液，以得到38-2 (19 g, 97%)。
在室温下，向38-2 (6 g, 20.1 mmol)于无水CH3CN (80 mL)中的溶液中添加IBX(7.05g, 25.2mmol，1.25eq.)。将混合物回流1小时，并冷却至0℃。过滤沉淀物，并浓缩滤液，以得到作为黄色固体的粗38-3 (6 g 100%)。
将化合物38-3 (6 g 20.1 mmol)溶解于1,4-二氧杂环己烷(60mL)中。在10℃下添加37% HCHO(6mL, 69mol)和2M NaOH水溶液(12mL, 24mmol，1.2eq.)。将混合物在室温下搅拌过夜，并用AcOH中和至pH=7。将混合物在10℃下用NaBH4(1.53g, 40.2mmol，2eq.)处理。将混合物在室温下搅拌30分钟，然后用饱和NH4Cl水溶液淬灭。用EA萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的1-3% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的38-4 (3.5 g, 53 %)。
在-30℃下，向38-4 (3.5 g, 10.7 mmol)于无水吡啶(60 mL)中的溶液中逐滴添加无水DCM (8 mL)中的DMTrCl (3.6 g, 10.7 mmol, 1 eq.)。将混合物在室温下搅拌过夜。将溶液用MeOH处理，并在低压下浓缩至干燥。通过柱色谱法(DCM中的0.5-2% MeOH)纯化残余物，以得到作为黄色固体的38-5 (3 g, 45%)。
在N2气氛下，向38-5 (2.5 g, 4 mmol)于无水CH2Cl2 (30 mL)中的溶液中添加AgNO3 (0.816 g, 4.8 mmol, 1.2 eq.)、咪唑 (0.54 g, 8 mmol, 2 eq.)和TBDPSCl(1.18 g, 4.8 mmol, 1.2 eq.)。将混合物在室温下搅拌14小时。经由过滤去除沉淀物，并用盐水洗涤滤液，并经Na2SO4干燥。在减压下去除溶剂，以得到作为黄色固体的粗38-6 (3.4g, 100%)。
将化合物38-6 (4 g, 4.6 mmol)溶解于80% HOAc水溶液(50mL)中。将混合物在室温下搅拌3小时。将溶液用MeOH处理，并浓缩至干燥。通过柱色谱法(DCM中的1-2% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的38-7 (1.2 g, 45%)。
在氮气气氛下，在0℃下，向38-7 (1 g, 1.77 mmol)于无水DCM (15 mL)中的溶液中添加戴斯-马丁氧化剂(1.12g, 2.65mmol, 1.5eq.)。将反应物在室温下搅拌2.5小时。将溶液通过添加4% Na2S2O3淬灭并用4%碳酸氢钠水溶液(50mL)洗涤。将混合物再搅拌15分钟。将有机层用盐水洗涤，并在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(己烷中的20% EtOAc)纯化残余物，以得到作为白色固体的38-8 (0.7 g, 70%)。
在氮气气氛下，在-70℃下，向氯化甲基三苯基鏻(2.95g, 8.51mmol, 4eq.)于无水THF(20mL)中的溶液中逐滴添加正-BuLi(3.2mL, 8.1mmol, 3.8eq.)。将混合物在0℃下搅拌1小时。在氮气气氛下，在0℃下，逐滴添加38-8 (1.2 g, 2.13 mmol)于无水THF (3mL)中的溶液。将溶液在0℃下搅拌2小时。将反应物用NH4Cl淬灭并用EtOAc萃取。将有机层用盐水洗涤并在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(己烷中的20% EtOAc)纯化粗产物，以得到作为白色固体的38-9 (0.9 g, 75%)。
在氮气气氛下，在-70℃下，向38-9 (0.85 g, 1.43 mmol)于无水THF (50 mL)中的溶液中添加正-BuLi(5.7mL, 14.3mmol, 10eq.)。将混合物在-70℃下搅拌2小时。将反应物用NH4Cl淬灭并用EtOAc萃取。将有机层用盐水洗涤并在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(己烷中的20% EtOAc)纯化粗产物，以得到作为白色固体的38-10 (0.4 g, 50%)。
在室温下，向38-10 (0.4 g, 0.714 mmol)于无水CH3CN (30 mL)中的溶液中添加TPSCl(0.433g, 1.43mmol, 2eq.)、DMAP(0.174g, 1.43mmol, 2eq.)和TEA(1.5mL)。将混合物在室温下搅拌3小时。添加NH4OH (3mL)，并将混合物搅拌1小时。将混合物用EA(150mL)稀释，并用水、0.1M HCl和饱和NaHCO3水溶液洗涤。将有机层用盐水洗涤并在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化粗产物，以得到作为黄色固体的38-11 (0.2 g,50%)。
将化合物38-11 (1.35 g, 1.5 mmol)溶解于80% HOAc水溶液(40mL)中。将混合物在60℃下搅拌2小时，并浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化粗产物，以得到作为白色固体的化合物38 (180 mg, 35%)。ESI-MS: m/z 282.1 [M+H]+。
实施例29
化合物39
在室温下，向环戊酮(6.0 g, 71 mmol)于MeOH (60 mL)中的溶液中添加TsOH•H2O(1.35 g, 7.1 mmol)和三甲氧基甲烷(8 mL)。将溶液在室温下搅拌2小时。用NaOMe淬灭反应物，并用己烷(30mL)萃取混合物。将有机层干燥并浓缩，以得到粗1,1-二甲氧基环戊烷(9.2g)，将其溶解于1,2-二氯乙烷(50mL)中。在室温下，向上述溶液中添加38-1 (5.0 g,19.38 mmol)和TsOH•H2O (0.36 g, 1.9 mmol)。将混合物在60℃下搅拌4小时。将反应物用TEA淬灭并在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的1% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的39-1 (4.77 g, 76%)。
在0℃下，向39-1 (4.77 g, 14.73 mmol)于无水DCM (50 mL)中的溶液中添加DMP(6.56g, 15.6mmol)。将溶液在室温下搅拌10小时并浓缩至干燥。将残余物悬浮于PE(30mL)和DCM (5mL)中，并沉淀固体。过滤后，浓缩滤液，以得到作为泡沫的粗39-2 (4.78 g,100%)。
将粗39-2 (4.77 g, 14.73 mmol)再溶解于无水1,4-二氧杂环己烷(50mL)中。在0℃下，向溶液中添加CH2O水溶液(37%，3.6mL)和NaOH水溶液(2M，11.3mL)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物在0℃下用NaBH4(1.48g, 40mmol)处理并搅拌0.5小时。用水淬灭反应物，并用EA萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的40% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的39-3 (2.6 g, 49.9%)。
在-35℃下，向39-3 (5.0 g, 14.1 mmol)于吡啶(5.6 g, 71 mmol)和DCM (100mL)中的搅拌溶液中逐滴添加Tf2O(8.7g, 31.2mmol)。将混合物缓慢温热至0℃并搅拌2小时。用0.5M HCl水溶液淬灭混合物并分离DCM层。将有机相经无水Na2SO4干燥，并浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的20% EA)上纯化粗产物，以得到39-4 (4.5 g, 52%)。
在0℃下，将39-4 (4.5 g, 7.28 mmol)溶解于无水THF(50mL)中。将溶液用NaH(60%，在矿物油中，0.32g, 8mmol, 1.1eq.)分份处理，并将混合物在室温下搅拌8小时。将反应物用水淬灭，并用EA(3×60mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以得到粗产物，其直接用于下一步骤。向粗产物(2.0g, 3.6mmol)于MeCN(10mL)中的溶液中添加LiCl(4.0g, 13mmol)。将反应进行过夜。添加NaOH水溶液(1N, ~ 2 eq.)，并将混合物搅拌1小时。将混合物分配于饱和NH4Cl溶液和EA之间。在减压下浓缩有机层，并在硅胶柱(PE中的20% EA)上纯化粗产物，以得到作为白色固体的39-6 (0.6 g, 46 %)。ESI-MS: m/z 395.0 [M+Na]+。
将化合物39-6 (3.0 g, 8.06 mmol)与甲苯(30mL)共同蒸发。在0℃下向39-6(3.0 g, 8.06 mmol)、DMAP (98 mg, 0.80 mmol)和TEA (2.3 mL, 2 eq.)于DCM (30mL)中的溶液中添加Bz2O(1.82g, 8.06mmol)并搅拌3小时。将反应物用1.0M HCl淬灭，并用DCM萃取。将DCM层经高真空泵干燥，以得到粗39-7 (3.3 g, 80.9%)。
向39-7 (400 mg, 0.84 mmol)于无水CH3CN (3 mL)中的溶液中添加TPSCl(507mg, 1.68mmol)、TEA(169mg, 1.68mmol)和DMAP(207mg, 1.68mmol)，并将混合物在室温下搅拌2小时。通过TLC确定反应的完成。在室温下添加铵溶液(3.0mL)，并将溶液搅拌2小时。将混合物用1.0M HCl溶液洗涤，并用DCM萃取。将DCM层经Na2SO4干燥并浓缩至干燥。通过柱色谱法纯化粗产物，以提供39-8 (250 mg, 63%)。
将80%甲酸(3 mL)中的化合物39-8 (250 mg, 0.53 mmol)在室温下搅拌3小时。通过TLC确定反应的完成。在低压下浓缩混合物。通过柱色谱法纯化粗产物，以得到39-9 (130mg, 66%)。
将化合物39-9 (270 mg, 0.73 mmol)溶解于MeOH/NH3(10mL)中，并将溶液搅拌6小时。在低压下浓缩混合物。用DCM洗涤粗产物，并冻干溶液，以得到化合物39 (118 mg,52%)。ESI-MS: m/z 328.3 [M+H +Na]+。
实施例30
化合物40
将化合物40-1 (3.0 g, 8.42 mmol)与甲苯(30mL)共同蒸发。在0℃下，向40-1 (3.0g, 8.42 mmol)、DMAP (103 mg, 0.84 mmol)和TEA (2.5 mL, 2 eq.)于DCM (30 mL)中的溶液中添加Bz2O(2.01g, 8.42mmol)并搅拌3小时。将溶液用1.0M HCl淬灭并用DCM萃取。将DCM层经高真空泵干燥，以得到粗40-2 (3.3 g, 85%)。
向40-2 (200 mg, 0.43 mmol)于无水CH3CN (2 mL)中的溶液中添加TPSCl(260mg, 0.86mmol)、TEA(95mg, 0.94mmol)和DMAP(106.4mg, 0.86mmol)，并将混合物在室温下搅拌2小时。通过TLC确定反应的完成。在室温下添加铵溶液(1.33mL)，并搅拌2小时。将混合物用1.0M HCl溶液洗涤，并用DCM萃取。将DCM层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。通过柱色谱法纯化残余物，以提供40-3 (150 mg, 75%)。
将80%甲酸(2mL)中的化合物40-3 (100 mg, 0.21 mmol)在室温下搅拌3小时。通过TLC确定反应的完成。在低压下浓缩混合物，并将残余物通过柱色谱法纯化，以得到40-4(50 mg, 58%)。
将化合物40-4 (270 mg, 0.68 mmol)溶解于MeOH/NH3(10mL)中，并将所得溶液搅拌6小时。在低压下浓缩混合物。用DCM洗涤粗产物，并冻干溶液，以得到化合物40 (105 mg,53.8%). ESI-MS: m/z 290.4 [M+H]+ 。
实施例31
化合物41
将化合物41-1 (3.0 g, 8.87 mmol)与甲苯(30mL)共同蒸发。在0℃下，向41-1 (3.0g, 8.87 mmol)、DMAP (108mg, 0.88 mmol)和TEA (2.5 mL, 2 eq.)于DCM (30 mL)中的溶液中添加Bz2O(2.01g, 8.87mmol)。将溶液搅拌3小时。将反应物用1.0M HCl溶液淬灭，并用DCM萃取。将DCM层经高真空泵干燥，以得到作为固体的粗41-2 (3.5 g, 85%)。
向41-2 (200 mg, 0.45 mmol)于无水CH3CN (2 mL)中的溶液中添加TPSCl(260mg, 0.90mmol)、TEA(99mg, 0.99mmol)和DMAP(106.4mg, 0.90mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。通过TLC确定反应的完成。在室温下添加铵溶液(1.33mL)，并将混合物搅拌2小时。将混合物用1.0M HCl溶液洗涤，并用DCM萃取。将DCM层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。通过柱色谱法纯化粗产物，以提供41-3 (150 mg, 75%)。
将80%甲酸(2mL)中的化合物41-3 (100 mg, 0.23 mmol)在室温下搅拌3小时。通过TLC确定反应的完成。在低压下浓缩混合物。通过柱色谱法纯化粗产物，以得到41-4 (50mg, 58%)。
将化合物41-4 (270 mg, 0.72 mmol)溶解于MeOH/NH3(10mL)中，并将溶液搅拌6小时。在低压下浓缩混合物。用DCM洗涤粗产物，并冻干溶液，以得到化合物41 (105 mg,53.8%). ESI-MS: m/z 675.4 [2M+H]+。
实施例32
化合物42
向42-1 (600 mg, 1.29 mmol)于无水CH3CN (4 mL)中的溶液中添加DMAP(315mg,2.59mmol)、TEA(391mg, 3.87mmol)和TPSCl(782mg, 2.58mmol)。将混合物在N2下搅拌3小时。添加NH3于THF(2mL)中的溶液，并搅拌1小时。将反应物用饱和NH4Cl溶液淬灭，并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。将残余物通过柱色谱法纯化，以提供作为白色泡沫固体的42-2 (370 mg, 62%)。
将甲醇铵中的化合物42-2 (370 mg, 1.48 mmol)在室温下搅拌4小时。将溶液浓缩至干燥，以得到作为白色固体的化合物42 (200 mg, 91%)。ESI-MS: m/z 275.9 [M+H]+。
实施例33
化合物43
向双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.6mmol, 由双(POC)磷酸盐(0.2g)和Et3N(83μL)制备)于THF中的溶液中添加43-1 (74 mg, 0.2 mmol)。将混合物蒸发并通过与吡啶、随后与甲苯共同蒸发使其无水。将残余物溶解于无水THF(2mL)中。添加二异丙基乙胺(0.35mL; 10eq.)，随后添加BOP-Cl (0.25 g; 5 eq.)和3-硝基-1,2,4-三唑 (0.11 g; 5eq.)。将混合物在室温下搅拌90分钟，用EtOAc稀释，用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在二氧化硅(10g柱)上使用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化残余物，以产生50 mg (37%) 43-2。
将43-2 (40 mg; 0.06 mmol)于80% HCOOH水溶液中的溶液在45℃下加热8小时。将混合物蒸发，与甲苯共同蒸发，并在二氧化硅(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化，以产生化合物43(35 mg ,91%). MS: m/z = 619 [M+1]。
实施例34
化合物44
遵循用于制备43-2的类似程序，由40-1制备化合物44-2。在二氧化硅(10g柱)上用己烷/EtOAc(35-100%梯度)纯化残余物，以产生44-2 (0.45 g, 75%)。
将44-2 (0.40 g; 0.6 mmol)于80% HCOOH水溶液(15mL)中的溶液在45℃下加热8小时。将混合物蒸发，与甲苯共同蒸发，并在二氧化硅(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化，以产生化合物44 (0.27 g, 75%). MS: m/z = 603 [M+1]。
实施例35
化合物45
在0℃下，向45-1 (3.0 g, 4.7 mmol)于CH3CN/吡啶(15 mL/20 mL)中的溶液中缓慢添加BzCl(0.67g, 4.7mmol)。在10℃下将混合物搅拌12小时。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭并用DCM萃取。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，2%至50%)上纯化残余物，以产生作为固体的45-2 (2.6 g, 72%)。
向45-2 (1.0 g, 1.35 mmol)于吡啶(8 mL)中的溶液中添加DMTrCl(0.64g,1.9mmol)。将混合物在20-35℃下搅拌过夜。通过LCMS和TLC监测反应物。将反应物用MeOH淬灭，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到45-3 (1.5 g)，其不经进一步纯化即使用。
向45-3 (1.5 g, 1.35 mmol)于MeOH/THF (1/1,10mL)中的溶液中添加NaOMe(0.11g, 2.0mmol)，并在40℃下搅拌3小时。通过TLC监测反应物。将反应物用干冰淬灭，并在低压下浓缩至干燥。将残余物溶解于DCM (100mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，2%至50%)上纯化残余物，以提供45-4 (1.0 g,79%)。
在0℃下，向45-4 (950 mg, 1.02 mmol)于DCM (5 mL)中的溶液中缓慢添加吡啶(241mg, 3.05mmol)和Tf2O(344mg, 1.22mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。通过TLC和LCMS确定反应的完成。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭，并用DCM (3×60mL)萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以得到粗45-5 (1.08 g, 1.02 mmol)，其不经进一步纯化即使用。
向45-5 (1.08 g, 1.02 mmol)于THF (6 mL)中的溶液中添加TBAF(0.8g,3mmol)，并在30-40℃下搅拌12小时。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭，并用EA(3×60mL)萃取。将溶液经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的EA，2%至50%)纯化残余物，以提供45-6 (0.62 g, 65%)。
将45-6 (0.55 g, 0.59 mmol)于TFA (90%, 5 mL)中的混合物在50-60℃下搅拌16小时。将混合物用MeOH处理，并在低压下浓缩。通过制备型HPLC纯化残余物，以提供化合物45 (60 mg, 31%). ESI-MS: m/z 324.0 [M+H]+。
实施例36
化合物46
向双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.33mmol, 由110mg双(POC)磷酸盐和46μL Et3N制备)于THF中的溶液中添加46-1 (91 mg, 0.11 mmol)。将混合物蒸发并通过与吡啶、随后与甲苯共同蒸发使其无水。将残余物溶解于无水THF(1.5mL)中，并在冰浴中冷却。添加二异丙基乙胺(0.19mL, 10eq.)，随后添加BOP-Cl(0.14g, 5eq.)和3-硝基-1,2,4-三唑(63mg, 5eq.)。将混合物在0℃下搅拌90分钟，用EtOAc(30mL)稀释，用饱和NaHCO3水溶液、盐水洗涤并干燥(Na2SO4)。在二氧化硅(10g柱)上使用CH2Cl2/异-PrOH溶剂体系(2-10%梯度)纯化残余物，以获得46-2 (13 mg, 10%)和46-3 (95 mg, 58%)。
将46-2和46-3 (分别为13mg和95mg)于80% HCOOH水溶液(3mL)中的溶液在室温下搅拌3小时，然后蒸发并与甲苯共同蒸发。在二氧化硅(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化残余物，以获得化合物46，收率为(42mg, 94%)。MS: m/z=628 [M+1]。
实施例37
化合物47
将化合物47-1 (320 mg, 0.51 mmol)溶解于CH3COOH/THF/H2O(4/2/1)的混合物(7mL)中，并将混合物在50℃下搅拌2小时。将溶液浓缩至干燥，并通过制备型HPLC纯化残余物，以得到作为白色固体的化合物47 (38mg, 31 %)。ESI-MS: m/z 296.9 [M + H+Na]+。
实施例38
化合物48
在0℃下，向48-1 (30.0 g, 116 mmol)于无水吡啶(240 mL)中的搅拌溶液中分份添加TIPDSCl(54.98g, 174mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。将反应物用水淬灭，并在低压下浓缩至干燥。将残余物用EA稀释，并用水和盐水洗涤。将有机相经硫酸钠干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的50% EA)上纯化残余物，以得到48-2 (58 g, 99%)。
在0℃下向48-2 (20.0 g, 40 mmol)于无水DCM (200 mL)中的搅拌溶液中逐滴添加DHP(33.6g, 400mmol)和TFA(6.84g, 60mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。通过添加2N NaOH溶液将溶液调节至pH=8。将混合物用饱和NaHCO3水溶液洗涤，并用DCM (100mL)萃取。将有机相经无水硫酸钠干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的20% EA)上纯化残余物，以得到48-3 (16 g, 68%)。
向48-3 (41 g, 70 mmol)于无水MeOH (400 mL)中的溶液中添加NH4F(51.88g,140mmol)。将混合物回流1小时，然后在真空中浓缩。在硅胶柱(DCM中的10% MeOH)上纯化残余物，以得到48-4 (23.1 g, 96%)。
在0℃下，向48-4 (23.1 g, 67.54 mmol)于无水吡啶(200 mL)中的搅拌溶液中分份添加咪唑(6.89g, 101.32mmol)和TBSCl(10.92g, 74.29mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。将溶液用水淬灭，并浓缩至干燥。将残余物用EA稀释，并用水和盐水洗涤。将有机相经无水硫酸钠干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱上纯化残余物，以得到48-5 (23 g, 74%)。
在0℃下，在N2下，向48-5 (27.56 g, 60.44 mmol)于无水MeCN (560 mL)中的溶液中添加DMAP(18.43g, 151.1mol)和PhOCSCl(14.55g, 84.61mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜，并将反应物用水淬灭。用EA萃取混合物。将有机相用无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将残余物在硅胶柱上纯化，用PE中的30% EA洗脱，以提供48-6 (23 g, 64%)。
向48-6 (14.5 g, 24.5 mmol)于无水甲苯(700 mL)中的溶液中添加甲苯(10 mL)中的AIBN(1.21g, 7.3mmol)和Bu3SnH (10.73g, 36.74mmol)。将N2鼓泡入溶液中持续30分钟。将混合物温热至135℃持续2小时。添加饱和CsF水溶液，并将混合物搅拌1小时。将混合物用EA(150mL)稀释，并依次用水、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。在低压下去除有机层。在硅胶柱(PE中的30% EA)上纯化残余物，以提供48-7 (10.5 g, 97%)。
向48-7 (21 g, 47.73 mmol)于无水MeOH (200 mL)中的溶液中添加NH4F(35.32g, 950mmol)。将混合物回流1小时，并在真空中浓缩。在硅胶柱(DCM中的20% MeOH)上纯化残余物，以得到48-8 (14 g, 90%)。
在室温下，在N2气氛下，将TFA•Py (2.37g, 12.27mmol)添加至48-8 (4 g, 12.27mmol)和DCC (7.58 g, 36.81 mmol)于无水DMSO (40 mL)中的混合物中。将混合物在室温下搅拌2小时。在室温下添加37%甲醛(10mL, 115mmol)，并搅拌15分钟，随后用2N NaOH(20mL, 40mmol)处理。将混合物在30℃下搅拌过夜并用AcOH中和至pH=7。在5℃下分份添加NaBH4(1.87g, 49.08mmol)，并将混合物在室温下搅拌30分钟。用EtOAc(3×100mL)萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的48-9 (2 g, 46%)。
在0℃下，在N2下，向48-9 (2 g, 5.62 mmol)于无水CH3CN (8 mL)中的溶液中添加DCM溶液(2mL)中的吡啶(10mL)和BzCl(0.79g, 5.62mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭，并在低压下浓缩。将残余物用EA(50mL)稀释，并依次用水和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的3% MeOH)上纯化残余物，以提供48-10 (1.6 g, 62%)。
在0℃下，在N2下，向48-10 (1.6 g, 3.48 mmol)于无水吡啶(16 mL)中的溶液中添加MMTrCl(1.61g, 5.22mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭，并在真空中浓缩。将残余物用EA(50mL)稀释，并依次用水和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并在低压下浓缩，以得到粗48-11 (2.55 g, 100%)，其不经进一步纯化即使用。
向48-11 (2.55 g, 3.48 mmol)于无水MeOH (50 mL)中的溶液中添加NaOCH3(0.28g, 5.23mmol)。将混合物在45℃下搅拌2小时，通过使用干冰鼓泡至pH=7并浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的2% MeOH)上纯化残余物，以得到48-12 (0.93 g, 42%)。
在-30℃下，向48-12 (0.93 g, 1.48 mmol)于无水DCM (10 mL)中的溶液中添加吡啶(1.17g, 14.8mmol)。逐滴添加DCM (3 mL)中的Tf2O(0.63g, 2.22mmol)。将混合物在-30℃至0℃下搅拌20分钟并在0℃下搅拌10分钟。用水淬灭反应物，并用DCM (3×100mL)萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以提供粗48-13 (1.13 g, 100%)，其不经进一步纯化即使用。
向48-13 (1.13 g, 1.48 mmol)于无水THF (10 mL)中的溶液中添加TBAF(3.86g,14.8mmol)。将混合物在30℃下搅拌2小时。将反应物用水淬灭，并用EtOAc(3×100mL)萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的3% MeOH)上纯化残余物，以得到47-1 (0.42 g, 45%)。
在室温下，向47-1 (50 mg, 0.079 mmol)于无水CH3CN (1 mL)中的溶液中添加TPSCl(48.07mg, 0.16mmol)、DMAP(19.36mg, 0.16mmol)和NEt3(0.2mL)。将混合物在室温下搅拌3小时。添加28%氨水(0.4mL)，并将混合物搅拌1小时。将混合物用EA(150mL)稀释，并依次用水、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到48-14 (40 mg, 80%)。
将化合物48-14 (320 mg, 0.51 mmol)溶解于80% HCOOH (6mL)中，并在10℃下将混合物搅拌1小时。在低压下浓缩混合物，并通过制备型HPLC纯化残余物，以得到作为白色固体的化合物48 (43mg, 31 %)。ESI-MS: m/z 273.9 [M+H]+, 547.1 [2M+H]+。
实施例39
化合物49
在25℃下，向49-1 (20.0 g, 70.2 mmol)于无水吡啶(200 mL)中的溶液中添加咪唑(19.1g, 280mmol)和TBSCl(42.1g, 281mmol)。将溶液在25℃下搅拌15小时，然后在减压下浓缩至干燥。将残余物溶解于EtOAc中，然后过滤。将滤液浓缩至干燥，以得到TBS保护的衍生物(36.4g, 99%)。将TBS保护的衍生物(36.5g, 71.1mmol)溶解于THF(150mL)中。添加H2O(100mL)，然后添加AcOH (300mL)。将溶液在80℃下搅拌13小时。将反应物冷却至室温，然后在减压下浓缩至干燥，以得到作为白色固体的49-2 (31.2 g, 61%)。
向49-2 (31.2 g, 78.2 mmol)于无水吡啶(300 mL)中的溶液中添加Ac2O(11.9g,117.3mmol)。将混合物在25℃下搅拌18小时。添加MMTrCl(72.3g, 234.6mmol)和AgNO3(39.9g, 234.6mmol)，并将溶液在25℃下搅拌15小时。添加H2O以淬火反应物并将溶液在减压下浓缩至干燥。将残余物溶解于EtOAc中，并用水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其通过硅胶(DCM:MeOH = 200:1至50:1)纯化，以得到MMTr保护的胺衍生物(35.2g, 63%)。将MMTr保护的胺衍生物(35.2g, 49.3mmol)溶解于NH3/MeOH (300mL)中。将混合物在25℃下搅拌20小时。将溶液蒸发至干燥，并通过硅胶柱(DCM: MeOH = 100:1至50:1)纯化，以得到作为黄色固体的49-3 (28.6 g, 87%)。
在0℃下，向49-3 (12.0 g, 17.9 mmol)于无水DCM (200 mL)中的溶液中添加戴斯-马丁氧化剂(11.3g, 26.8mmol)。将混合物在0℃下搅拌2小时，然后在室温下搅拌2小时。将混合物用饱和NaHCO3和Na2S2O3溶液淬灭。将有机层用盐水(2x)洗涤并经无水Na2SO4干燥。蒸发溶剂，以得到醛(12.6g)，其直接用于下一步骤中。向醛(12.6 g, 18.0 mmol)于1,4-二氧杂环己烷(120 mL)中的溶液中添加37% HCHO(11.6g, 144mmol)和2N NaOH水溶液(13.5mL, 27mmol)。将混合物在25℃下搅拌过夜。添加EtOH (60mL)和NaBH4(10.9g,288mmol)，并将反应物搅拌30分钟。将混合物用饱和NH4Cl水溶液淬灭，然后用EA萃取。将有机层经Na2SO4干燥，并通过硅胶柱色谱法(DCM: MeOH = 200:1至50:1)纯化，以得到作为黄色固体的49-4 (7.5g, 59%)。
在0℃下，向49-4 (3.8 g, 5.4 mmol)于DCM (40 mL)中的溶液中添加吡啶(10mL)和DMTrCl(1.8g, 5.4mmol)。将溶液在25℃下搅拌1小时。添加MeOH (15mL)，并浓缩溶液。通过硅胶柱色谱法(DCM: MeOH = 200:1至50:1)纯化残余物，以得到作为黄色固体的MMTr保护的衍生物(3.6g, 66%)。向MMTr保护的衍生物(3.6g, 3.6mmol)于无水吡啶(30mL)中的溶液中添加TBDPSCl(2.96g, 10.8mmol)和AgNO3(1.84g, 10.8mmol)。将混合物在25℃下搅拌15小时。将混合物过滤并浓缩。将混合物溶解于EtOAc中，并用盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，然后通过硅胶柱色谱法(DCM: MeOH = 200:1至50:1)纯化，以得到作为固体的TBDPS保护的衍生物(3.8g, 85.1%)。向TBDPS保护的衍生物(3.6g, 2.9mmol)于无水DCM (50mL)中的溶液中添加无水DCM (18mL)中的Cl2CHCOOH (1.8mL)。将混合物在-78℃下搅拌1小时。在-78℃下添加Cl2CHCOOH (3.6mL)。将混合物在-10℃下搅拌30分钟。将混合物用饱和NaHCO3水溶液淬灭，并用DCM萃取。将有机层经Na2SO4干燥，然后通过硅胶柱色谱法(DCM:MeOH = 200:1至50:1)纯化，以得到49-5 (2.2 g, 80%)。
向49-5 (800 mg, 0.85 mmol)于无水DCM (20 mL)中的冰冷溶液中逐滴添加吡啶(336mg, 4.25mmol)和Tf2O(360mg, 1.28mmol)。将反应混合物在0℃下搅拌15分钟。将反应物通过冰水淬灭并搅拌30分钟。将混合物用EtOAc萃取，用盐水(50mL)洗涤，并经MgSO4干燥。蒸发溶剂，以得到粗双(三氟甲磺酸酯)衍生物。向无水DMF(35mL)中的双(三氟甲磺酸酯)衍生物(790mg, 0.73mmol)中添加LiCl(302mg, 7.19mmol)。将混合物加热至40℃，并搅拌过夜。通过LCMS确定反应的完成。将溶液用盐水洗涤并用EtOAc萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥，并在硅胶柱(DCM/MeOH = 100:1)上纯化残余物，以得到49-6 (430 mg, 61%)。
向MeOH (85 mL)中的49-6 (470 mg, 0.49 mmol)中添加NH4F(8.1g, 5.92mmol)，并将溶液加热至回流过夜。将混合物过滤并将滤液浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM/MeOH=20：1)上纯化残余物，以得到作为白色固体的二醇(250mg, 84%)。将甲酸(5mL)中的二醇(130mg,0.21mmol)在25℃下搅拌过夜。将溶液浓缩至干燥，并将MeOH(30mL)中的残余物在70℃下搅拌过夜。通过LCMS和HPLC确定反应的完成。去除溶剂，并用EtOAc洗涤粗产物，以得到作为白色固体的化合物49 (58 mg, 81%)。1H NMR (DMSO-d 6 , 400 MHz) δ10.73 (br, 1H), 7.98(s,1H), 6.58 (br, 2H), 6.08 (q, J = 4.8, 9.2 Hz,2H), 5.64 (dt, J= 5.6,52.8Hz,1H), 5.40 (m, 1H), 4.52 (m, 1H), 3.80-3.82 (m, 2H), 3.64 (q, 2H). ESI-MS:m/z 333.8 [M +H]+, 666.6 [2M +H]+。
实施例40
化合物50
将化合物50-1 (5.0g, 8.5 mmol)和6-氯嘌呤(3.0 g, 17.7mmol)与无水甲苯共同蒸发3次。在0℃下，向50-1和6-氯嘌呤于无水MeCN(50mL)中的搅拌悬浮液中添加DBU(7.5g,49mmol)。将混合物在0℃下搅拌15分钟，并在0℃下逐滴添加TMSOTf (15g, 67.6mmol)。将混合物在0℃下搅拌15分钟，直至形成澄清溶液。将混合物加热至70℃，并搅拌过夜。通过LCMS监测反应物。将混合物冷却至室温并用EA(100mL)稀释。将溶液用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，6%至50%)上纯化残余物，以提供作为白色泡沫的50-2 (2.5 g, 46.3%)。
在高压釜中，在40至60℃下，将化合物50-2 (3.0 g, 4.8 mmol)用MeOH中的NH3(8N, 20mL)处理12小时。在低压下蒸发混合物，并在硅胶柱(EA中的MeOH，0至10%)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的50-3 (1.0 g, 71%)。
向50-3 (4.3 g, 14.8 mmol)于丙酮/DMF (4/1, 40 mL)中的溶液中添加TsOH•H2O (8.4 g, 0.044 mol)和2,2-二甲氧基丙烷(30 g, 0.296 mol)，并将混合物在60-70℃下搅拌12小时。在低压下浓缩混合物，并在硅胶柱(PE中的EA，50%至100%)上纯化残余物，以得到50-4 (5.0 g, 83%)。
向50-4 (10.5 g, 31.7 mmol)于吡啶(50 mL)中的溶液中添加TBSCl(5.3g,34.9mmol)，并将混合物在室温下搅拌12小时。在低压下去除溶剂，并将残余物溶解于DCM(100mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以提供50-5 (8.4 g, 60%)，其不经进一步纯化即使用。
将化合物50-5 (8.4 g, 18.8 mmol)与吡啶共同蒸发。向50-5 (8.4 g, 18.8mmol)于吡啶(35 mL)中的搅拌溶液中添加MMTrCl(8.1g, 26.4mmol)。在30-40℃下，在N2下，将混合物搅拌12小时。将混合物在低压下浓缩，并将残余物溶解于DCM (150mL)中。将溶液用饱和NaHCO3溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，10%至20%)上纯化残余物，以提供作为固体的50-6 (10.8 g, 80%)。
在室温下，向50-6 (11.5 g, 0.016 mol)于THF (100 mL)中的溶液中添加TBAF(4.62g, 0.018mol)，并将混合物搅拌4小时。在低压下蒸发溶剂，并将混合物溶解于DCM(150mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，50%至100%)上纯化残余物，以提供50-7 (8.8 g, 91%). ESI-MS: m/z 604.4 [M+H]+。
在0℃下，向50-7 (4.4 g, 7.3 mmol)于二氧杂环己烷(50 mL)中的溶液中添加DCC(4.5g, 21.9mmol)、DMSO(2.5mL)、TFA•Py (1.48 g, 7.65 mmol)。将混合物缓慢温热至室温并搅拌4小时。通过LCMS确定反应的完成。在低压下浓缩混合物。在硅胶柱上纯化残余物，以得到50-8 (4.4 g, 7.3 mmol)，其不经进一步纯化即使用。
向50-8于二氧杂环己烷中的溶液(40mL)中添加水(20mL)、HCHO(37%，7mL)和NaOH(1N, 15mL)。将溶液在室温下搅拌过夜。将混合物用NaBH4(1.1g, 29.2mmol)缓慢处理，并搅拌30分钟。通过缓慢添加HCl(1M)溶液将混合物调节至pH=7-8，并用EA(150mL)萃取。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱上纯化残余物，以得到45-1(3.0 g, 65%). ESI-MS: m/z 633.9 [M+H]+。
在-30℃下，向45-1 (1.5 g, 2.37 mmol)于无水吡啶(30 mL)中的溶液中添加DMTrCl(3.6g, 10.7mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将溶液用MeOH淬灭，并在低压下浓缩。将残余物通过柱色谱法纯化，以得到作为黄色固体的50-9 (3 g, 45%)。
向50-9 (1.1 g, 1.18 mmol)于吡啶(10 mL)中的溶液中添加咪唑(0.24g,3.53mmol)和TBSCl(0.35g, 2.35mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。在低压下蒸发溶剂，并将残余物溶解于EA(50mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的30% EA)上纯化残余物，以提供50-10 (0.83 g, 67%)。
在-70℃下，向50-10 (1.1 g, 1.05 mmol)于DCM (12 mL)中的溶液中添加Cl2CHCOOH (0.5mL)并搅拌1小时。在-70℃下用DCM (10 mL)中的Cl2CHCOOH (1mL)处理溶液，并将混合物在-70~-10℃下搅拌20分钟。通过LCMS确定反应的完成。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭，并用DCM (3×40mL)萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，15%至30%)上纯化残余物，以提供50-11 (0.58 g, 74%)。
在-30℃下，向50-11 (200 mg, 0.268 mmol)和吡啶(53 mg, 0.67 mmol)于无水DCM (5 mL)中的溶液中添加Tf2O(90mg, 0.32mmol)。将混合物搅拌1小时，并缓慢温热至室温。通过TLC确定反应的完成。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭，并用DCM (3×30mL)萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。粗50-12 (200 mg, 0.27 mmol)经进一步纯化即使用。
向50-12 (200 mg, 0.27 mmol)于DMF (5 mL)中的溶液中添加LiCl(45mg,1.07mmol)，并在30-40℃下搅拌12小时。在低压下蒸发溶剂，并将残余物溶解于DCM (10mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。粗50-13不经进一步纯化即使用。
将50-13 (245 mg, 0.32 mmol)和TBAF (200 mg, 0.7 mmol)于THF中的混合物在30℃下搅拌1小时。将混合物在低压下浓缩，并将残余物溶解于DCM (15mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，2%至50%)上纯化残余物，以提供50-14 (150 mg, 72%). ESI-MS: m/z 652.3 [M+H]+。
将化合物50-14 (0.2 mmol)溶解于甲醇中的50% TFA(10mL)中，并将混合物在室温下保持过夜。蒸发溶剂并与甲醇/甲苯混合物共同蒸发以去除痕量酸。将残余物溶解于甲醇中的20%三乙胺中，保持15分钟并蒸发。通过RP HPLC在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上分离产物。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至60%的甲醇的线性梯度来洗脱。将相应级分合并，浓缩并冻干3次以去除过量缓冲液。获得化合物50。MS: m/z338.0 [M-1]。
实施例41
化合物51
在0℃下，向51-1 (12.3 g, 19.9 mmol)于DMF (50 mL)中的溶液中添加NaH (800mg,20mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时。将混合物用CsF(30.4g, 200mmol)处理，然后在室温下搅拌3小时。将反应物用水淬灭，并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的20% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的51-2 (4.1g, 61%)。
在0℃下，向51-2 (4.1 g, 12.1 mmol)于THF (120 mL)中的溶液中添加NaOH溶液(1N, 13mL)。将混合物在室温下搅拌3小时。将溶液用0.5M HCl水溶液中和至pH ~7。将混合物分配于EA和水之间。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的30% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的51-3 (3.1 g, 72%)。ESI-MS:m/z 379.1[M + Na]+。
将化合物51-3 (0.2 mmol)溶解于80% HCOOH (10mL)中，并将混合物在45℃下加热24小时。蒸发溶剂并与甲醇/甲苯混合物共同蒸发以去除痕量酸。将残余物溶解于甲醇中的20%三乙胺中，保持15分钟并蒸发。通过硅胶色谱法(DCM中的甲醇，5%至20%的梯度)分离化合物51 (68%)。MS: m/z 289.0 [M-1]。
实施例42
化合物52
将52-2 (1.2 g; 4 mmol)和NaI (0.6 g; 4 mmol)于丙酮(13 mL)中的混合物在室温下搅拌1小时。添加化合物52-1 (1 g; 3 mmol)和K2CO3 (2.07 g; 45 mmol)。将混合物在室温下搅拌24小时。过滤沉淀物，并蒸发滤液。在二氧化硅(25g柱)上用己烷/EtOAc(30-100%梯度)纯化残余物，产生作为无色泡沫的52-3 (1.14 g; 64%)。
向双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(2.3mmol, 由双(POC)磷酸盐(0.75g)和Et3N(0.32mL)制备)于THF中的溶液中添加52-3 (1.14 g; 1.9 mmol)。将混合物蒸发并通过与吡啶、随后与甲苯共同蒸发使其无水。将残余物溶解于无水THF(20mL)中，并在冰浴中冷却。添加二异丙基乙胺(1.0mL; 2eq.)，随后添加BOP-Cl(0.72g; 1.5eq.)和3-硝基-1,2,4-三唑(0.32g; 1.5eq.)。将混合物在0℃下搅拌90分钟，用EtOAc稀释，用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并干燥(Na2SO4)。在二氧化硅(25g柱)上用CH2Cl2/异-PrOH (3-10%梯度))纯化残余物，以产生52-4(1.2g, 70%)。
将52-4 (1.2 g; 1.3 mmol)于80% HCOOH水溶液中的溶液在室温下搅拌2小时，然后浓缩。将残余物与甲苯、然后与含有少量Et3N(2滴)的MeOH共同蒸发。在二氧化硅(25g柱)上用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化，产生52-5 (0.96 g, 85%)。
向52-5 (0.52 g; 0.57 mmol)于EtOH (25 mL)中的溶液中添加HCl (4 N/二氧杂环己烷; 0.29 mL, 2 eq.)和10% Pd/C (25 mg)。将混合物在H2下(常压)下搅拌1小时。通过经由硅藻土垫过滤来去除催化剂，并蒸发滤液，以产生作为其HCl盐的化合物52 (4.2 g;96%). MS: m/z = 732 [M+1]。
实施例43
化合物53
遵循用于制备52-4的程序，以相同方式在THF (5 mL)中由53-1 (0.16 g; 0.49 mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.74 mmol)与DIPEA (0.34 mL)、BopCl (250mg)和3-硝基-1,2,4-三唑 (112 mg)制备化合物53-2 (0.20 g, 64%)。
将53-2 (0.20 g; 0.31 mmol)于80% HCOOH水溶液中的溶液在室温下搅拌2小时，然后浓缩。将残余物与甲苯、然后与含有少量Et3N(2滴)的MeOH共同蒸发。在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化，随后在Synergi Hydro RP柱250×30mm(Phenomenex P/N00G-4375-U0-AX)上使用H2O与ACN(均含有50mM TEAA)进行5轮RP-HPLC纯化。梯度为20分钟内25-75% ACN，24mL/min，254nM检测。产物在16.0分钟时洗脱。合并并冻干纯级分。通过将产物溶解于DMSO(2mL)中并将产物进样至仅使用H2O和ACN的同一柱上来去除TEAA。合并并冻干纯级分，以产生化合物53 (18 mg). MS: m/z = 1197 (2M+1)。
实施例44
化合物54
在0℃下，向2-甲氧基乙醇 (97 mmol; 7.7 mL)于二氯甲烷(DMC) (100 mL)中的冰冷溶液中添加氯甲酸氯甲酯(112mmol; 10.0mL)，随后添加吡啶(9.96mL)。在室温下搅拌过夜后，将混合物用0.5M HCl洗涤两次，随后用水和碳酸氢钠水溶液洗涤。将混合物经硫酸镁干燥，过滤，在真空中蒸发并在真空中蒸馏，以提供作为无色油的54-2 (13.0g)。
将化合物54-2 (5.7 g)添加至碘化钠(21.07g)于丙酮(45mL)中的溶液中。在40℃下搅拌2.5小时后，将混合物在冰中冷却，过滤并在真空中蒸发。将残余物溶解于二氯甲烷中，用碳酸氢钠水溶液和硫代硫酸钠水溶液洗涤，经硫酸镁干燥，过滤并在真空中蒸发，以得到作为54-3的淡黄色油的54-3 (8.5g)，其不经进一步纯化即使用。
将磷酸(晶体，2.4g)和三乙胺(6.6mL)于苯甲醇(13g; 12.5mL)中的混合物在室温下搅拌，直至磷酸完全溶解。添加三氯乙腈(17.2g; 11.94mL)，并将混合物在室温下搅拌18小时。在减压下去除溶剂和过量三氯乙腈。将残余物溶解于水(约200mL)中，并用乙醚(3×50mL)洗涤水溶液。冻干后获得作为淡黄色半固体的苄基磷酸(三乙胺盐)(7.15g)。将苄基磷酸(TEA盐，1.6 g)于MeOH (90 mL)和水 (30 mL)中的溶液在室温下用Dowex 50WX2-400(“153mL”沉降树脂)处理18小时。通过过滤去除树脂，并将碳酸银粉末(1.25g)添加至滤液中。在80℃下加热悬浮液1小时后，在减压下去除所有溶剂至干燥。固体不经进一步纯化即使用。
向苄基磷酸(银盐)中添加干燥乙腈(25 mL)，随后添加54-3 (3.12 g; 12 mmol)。将悬浮液在室温下搅拌过夜。通过过滤去除固体后，通过硅胶色谱法、使用己烷/乙酸乙酯(3:1 v:v)作为洗脱液来纯化产物，以得到作为无色液体的54-4 (860mg, 50%)。
将化合物54-4 (750 mg; 1.65 mmol)溶解于甲醇(10mL)中。添加Pd/碳(85mg)和TEA(1 eq.)。将烧瓶装填氢气持续1小时。过滤催化剂，并在真空中去除溶剂，以得到54-5(三乙铵盐)(510mg)，其不经进一步纯化即立即使用。
将化合物54-6 (320 mg; 0.9 mmol)和54-5 (510 mg, 1.35 mmol; 1.5x)与吡啶共同蒸发两次，并与甲苯共同蒸发两次。在0℃下，将化合物54-5和54-6溶解于THF(8mL)中。添加二异丙基乙胺(DIPEA) (0.62 mL; 4 eq.)、双(2-氧代-3-噁唑烷基)次膦酰氯 (Bop-Cl) (0.45 g; 2 eq.)、硝基三唑 (0.2 g, 2 eq.)。将混合物在0℃下保持2小时，然后用EA(50mL)稀释。然后将混合物用饱和碳酸氢钠(2×50mL)萃取并经硫酸钠干燥。在真空中去除有机溶剂。通过快速色谱法、使用己烷中的EA的10%至100%梯度纯化残余物，以得到纯化的54-7 (430 mg, 0.6 mmol)。
将纯化的54-7溶解于80% HCOOH水溶液(20mL)中并在45℃下保持18小时。冷却至室温后，在真空中去除溶剂。将残余物与甲苯(3×25mL)共同蒸发。通过快速色谱法、使用DCM中的甲醇的0至20%梯度来纯化残余物，以得到纯化的化合物54 (200 mg , 0.3 mmol).1H-NMR (CDCl3): δ 9.28 (s, 1H), 7.54 (d, 1H), 5.95 (s, 1H), 5.65-5.81 (m, 5H),(d, 2H), 4.76 (dd, 2H), 4.44-4.46 (m, 1H), 4.35-4.40 (m, 5H), 4.22 (2H), 4.04(1H), 3.65 (t, 4H), 3.39 (6H), 1.8 (s, 1H), 1.24 (s, 3H). 31P-NMR (CDCl3): δ -4.09 ppm。
实施例45
化合物55
在THF (4 mL)中由55-1 (0.21 g; 0.35 mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.54 mmol)与DIPEA (0.18 mL)、BopCl (178 mg)和3-硝基-1,2,4-三唑 (80 mg)制备化合物55-2 (158 mg, 50%)。
将55-2 (158 mg)于乙腈(1 mL)和HCl (4 N/二氧杂环己烷; 85 μL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。将反应物用MeOH淬灭并浓缩。在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/异-PrOH (3-10%梯度)纯化残余物，以得到化合物55 (85 mg, 76%). MS: m/z = 656 [M+1]。
实施例46
化合物56
在-30℃下，向49-3 (300 mg, 0.4 mmol)和吡啶(80 mg, 1.0 mmol)于DCM (5 mL)中的溶液中逐滴添加Tf2O(136mg, 0.48mol)于DCM (1mL)中的溶液。将混合物在-30℃至0℃下搅拌20分钟。将反应物用水淬灭，并用DCM (20mL)萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥并蒸发，以得到粗56-1 (352.8 mg, 0.4 mmol)，其不经进一步纯化即使用。
向56-1 (352.8 mg, 0.4 mmol)于DMF (5 mL)中的溶液中添加NaI (480mg,3.2mmol)。将混合物在30℃下搅拌10小时。将反应物用水淬灭，并用DCM (20mL)萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。通过制备型TLC(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到56-2 (270 mg, 31%)。
向56-2 (600 mg, 0.7 mmol)于无水甲苯(30 mL)中的溶液中添加甲苯(10 mL)中的AIBN (34 mg, 0.21 mmol)和Bu3SnH (307.7 mg, 1.05 mmol)。将混合物用N2鼓泡30分钟，并加热至135℃持续2小时。将混合物用饱和CsF水溶液处理，然后搅拌2小时。用EA(100mL)稀释混合物。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的10% EA)上纯化残余物，以得到56-3和副产物(400mg, 72%)。
将56-3 (400 mg, 0.55 mmol)于90 % TFA (10 mL)中的混合物在50℃下搅拌4小时。通过LCMS监测反应物。将混合物用MeOH (5ml)处理，并在减压下浓缩。通过制备型HPLC纯化残余物，以得到化合物56 (46 mg, 27%). ESI-MS: m/z 306.1 [M+H]+。
实施例47
化合物57
使用针对从52-3制备52-4所述的方法，以相同方式在THF (2.5 mL)中由57-1 (0.11g; 0.18 mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.35 mmol)与DIPEA (0.15mL)、 BopCl (114 mg)和3-硝基-1,2,4-三唑 (51 mg)制备化合物57-2 (120 mg, 72%)。
使用针对化合物55所述的方法，由乙腈(0.1 mL)和4 N HCl/二氧杂环己烷(8 μL)中的57-2 (25 mg)制备化合物57 (14 mg, 77%)。MS: m/z = 658 [M+1]。
实施例48
化合物60
向尿嘧啶(21 g, 188 mmol)于无水MeCN (200 mL)中的搅拌溶液中添加BSA(110g,541mmol)，并将混合物回流2小时。然后将混合物冷却至室温并用60-1(55 g, 93.2 mmol)和TMSOTf (145 g, 653 mmol)处理。将混合物回流过夜。起始材料消失后，将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭，并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的20% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的60-2 (38 g, 70%)。
将化合物60-2 (35 g, 0.06 mol)在室温下用MeOH中的NH3(7N,200mL)处理。将混合物在室温下搅拌24小时。通过LCMS确定反应的完成。在低压下浓缩混合物，并用DCM洗涤残余物，以得到作为白色固体的60-3 (13 g, 81%)。
在室温下向环戊酮(6 g, 8.33 mmol)和三甲氧基甲烷(8 mL)于MeOH (60 mL)中的溶液中添加TsOH (1.35g, 7.1mmol)，并将混合物搅拌2小时。将所得混合物用NaOMe(0.385g, 7.12mmol)淬灭，并用正己烷(30mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以得到1,1-二甲氧基环戊烷。向60-3 (30 g, 0.11mol)和1,1-二甲氧基环戊烷(57g, 0.44 mol)于1,2-二氯乙烷(200 mL)中的溶液中添加TsOH (2.1g, 0.011mol)，并将混合物加热至60℃过夜。将反应物用三乙胺淬灭，并在低压下浓缩至干燥。用MeOH洗涤残余物，以得到60-4 (30 g, 82%)。
在室温下，向60-4 (10 g, 30 mmol)于无水CH3CN (100 mL)中的溶液中添加IBX(8.4 g, 30 mmol, 1.05 eq.)。将混合物回流12小时，然后冷却至0℃。通过过滤去除沉淀物，并浓缩滤液，以得到作为黄色固体的粗60-5 (10 g, 100%)。
将粗60-5 (10 g, 30 mmol)溶解于1,4-二氧杂环己烷(100mL)中。在室温下，添加37% HCHO(10mL)和2N NaOH水溶液(20mL)。将混合物在室温下搅拌过夜，并调节至pH=7。在0℃下，用NaBH4(4.44g, 120mmol)处理混合物。将反应物在室温下搅拌30分钟，然后用饱和NH4Cl水溶液淬灭。用EA萃取混合物。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。通过硅胶柱色谱法(DCM中的1-3% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的60-6 (5.5 g, 50%)。
在-70℃下，向60-6 (5.0 g, 13.8 mmol)和吡啶(5 mL)于DCM (20 mL)中的搅拌溶液中逐滴添加Tf2O(8.5g, 30.3mmol)。将溶液缓慢温热至0℃，在0℃下搅拌0.5小时，并用HCl(0.5M)洗涤。将DCM层在低压下浓缩至干燥，并在硅胶柱上纯化残余物，以得到作为白色固体的60-7 (4.5 g, 52 %)。
向60-7 (3.0 g, 4.8 mmol)于MeCN (10 mL)中的溶液中添加TBAF(5.0g,19.2mmol)。将反应进行过夜。通过HPLC和LCMS监测反应物。添加氢氧化钠水溶液(1N ~2eq.)，并将溶液搅拌1小时。将混合物分配于饱和氯化铵溶液和EA之间。将有机层分离并在减压下浓缩。在硅胶柱上纯化粗产物，以得到作为白色固体的60-8 (0.8 g, 46 %)。ESI-MS: m/z 367.0 [M+H]+, 389.0 [M + Na]+。
将化合物60-8 (0.2 mmol)溶解于80% HCOOH (10mL)中，并将混合物在45℃下加热24小时。蒸发溶剂并与甲醇/甲苯混合物共同蒸发以去除痕量酸。将残余物溶解于甲醇中的20%三乙胺中，保持15分钟并蒸发。通过硅胶色谱法(DCM中的甲醇的5%至20%的梯度)分离化合物60 (65-68%)。MS: m/z 321.0 [M-1]。
实施例49
化合物63
将化合物45 (30 mg, 0.09 mmol), PTSA一水合物(18 mg, 1 eq.),和原甲酸三甲酯(0.3 mL; 30 eq.)于二氧杂环己烷(1 mL)中的混合物在室温下搅拌1天。将反应物用NH3/MeOH中和，然后过滤。将滤液溶解于THF (0.5 mL)和80% AcOH水溶液(0.25mL)的混合物中。将溶液在室温下保持1小时，然后蒸发。在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (4-15%梯度))纯化残余物，以产生63-1 (30 mg, 91%)。
使用用于由52-3制备52-4的方法，以相同方式在THF (1 mL)中由63-1 (30 mg,0.08 mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.12 mmol)与DIPEA (56 μL)、BopCl (40 mg)和3-硝基-1,2,4-三唑 (18 mg)制备化合物63-2 (28 mg, 52%)。用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)完成纯化。
使用用于制备52-5的方法，由63-2 (24 mg)制备化合物63 (15 mg, 67%)。用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)完成纯化。MS: m/z = 636 [M+1]。
实施例50
化合物64
以与63-1相同的方式在二氧杂环己烷(0.5 mL)中由化合物50 (17 mg)和原甲酸三甲酯(0.15 mL)与PTSA一水合物(9 mg)制备化合物64-1 (8 mg, 40%)。
以与63-2相同的方式，以相同方式在THF (0.4 mL)中由64-1 (8 mg, 0.02 mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.036 mmol)与DIPEA (14 μL)、BopCl (10mg)和3-硝基-1,2,4-三唑 (5 mg)制备化合物64-2 (10 mg, 72%)。
以与63相同的方式由64-2 (24 mg)制备化合物64 (15 mg, 67%)。MS: m/z = 652[M+1]。
实施例51
化合物65
用NaI处理市售碳酸氯甲基甲酯(5.0g)，以得到65a (5.38 g)。如针对化合物54所述，将苄基磷酸盐(银盐)与65a反应以产生纯化的65b (1.5 g)。1H-NMR (CD3CN): δ 7.39-7.42(m, 5H), 5.60 (d, 4H), 5.11 (d, 2H), 3.8 (s, 6H). 31P-NMR (CD3CN): δ - 4.47ppm。将化合物65b (415 mg; 1.7 mmol)脱保护，以得到65-1 (三乙铵盐)(510mg)，其不经进一步纯化即立即使用。使化合物54-6 (320 mg; 0.9 mmol)和65-1 (510 mg)反应为纯化的65-2 (400 mg)。将化合物65-2 (230 mg)脱保护，以得到纯化的化合物65 (250 mg)。使用化合物54的制备中所述的方法进行前述反应。1H-NMR (CDCl3): δ 9.00 (s, 1H), 7.55(d, 1H), 5.93 (s, 1H), 5.81 (d, 1H), 5.66-5.75 (m, 4H), 4.76 (dd, 2H), 4.37-4.46 (m, 2H), 4.15 (d, 2H), 3.86 (t, 6H), 3.70 (d, 6H), 1.65 (s, 6H), 1.25(s, 3H). 31P-NMR (CDCl3): δ - 4.13 ppm。
实施例52
化合物66
由1,3-二甲氧基丙-2-醇制备化合物66a。1H-NMR (CDCl3) δ 5.73 (s,2H) , 5.03-5.06 (m,1H), 3.59 (d,4H), 3.38 (s,6H)。向苄基磷酸盐(银盐)(5mmol)中添加无水ACN(25mL)，随后添加66a (3.12 g; 12 mmol)。将悬浮液在60℃下加热18小时。通过过滤去除固体后，通过硅胶色谱法、使用己烷/EA (3: 1)作为洗脱液来纯化产物，以提供作为无色液体的66b (540mg, 50%)。1H-NMR (CD3CN): δ 7.39-7.42 (m, 5H), 5.61 (d, 4H), 5.10(d, 2H), 4.97-5.01 (m, 2H), 3.50-3.52 (m, 8H), 3.30 (s, 6H), 3.28 (s, 6H).31P-NMR (CD3CN): δ - 4.42 ppm。将化合物66b (540 mg; 1.0 mmol)脱保护，以得到66-1(三乙铵盐)，其不经进一步纯化即立即使用。使化合物54-6 (285 mg; 0.8 mmol)和66-1反应，以得到纯化的66-2 (300 mg)。将化合物66-2 (300 mg)脱保护，以得到纯化的化合物66(290 mg)。使用化合物54的制备中所述的方法进行前述反应。1H-NMR (CDCl3): δ 9.35 (s,1H), 7.56 (d, 1H), 6.1 (s, 1H), 5.66-5.82 (m, 5H), 5.04 (s, 1H), 4.76 (dd,2H), 4.60 (d, 1/2H), 4.37-4.48 (m, 2H), 4.22 (d, 2H), 4.06 (s, 1H), 3.58 (s,8H), 3.57 (s, 12H), 1.93 (s, 1H), 1.23 (s, 3H). 31P-NMR (CDCl3): δ - 4.08 ppm。
实施例53
化合物67
使用针对化合物44所述的方法，以相同方式在THF (1 mL)中由54-6 (0.18 g, 0.5mmol)和双(乙酰基氧基甲基)磷酸三乙铵(1.0mmol)与DIPEA(0.35mL)、BopCl(0.25g)和3-硝基-1,2,4-三唑(0.11g)制备化合物67-1 (180 mg, 62%)。用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)完成纯化。
使用针对化合物44所述的方法，由67-1 (85 mg)制备化合物67 (60 mg, 78%)。MS: m/z = 1027 (2M-1)。
实施例54
化合物68
在0℃下，在氮气下，向68-1 (15 g, 50.2 mmol)于无水吡啶(180 mL)中的溶液中添加BzCl(23.3g, 165.5mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物用EA稀释并用NaHCO3水溶液洗涤。将有机层用无水Na2SO4干燥，并浓缩至干燥。将有机层干燥并浓缩，以得到残余物，将其通过硅胶柱色谱法(PE中的15% EtOAc)纯化，以得到作为白色固体的68-2 (27 g,93.5%)。
将化合物68-2 (27g, 47 mmol)溶解于90% HOAc(250mL)中并加热至110℃。将混合物在110℃下搅拌过夜。去除溶剂并用EA稀释。用NaHCO3水溶液和盐水洗涤混合物。将有机层干燥并浓缩，以得到粗68-3。
将化合物68-3溶解于NH3/MeOH (600mL)中并搅拌过夜。浓缩溶剂，以得到残余物，将其通过硅胶柱色谱法(DCM中的5% MeOH)纯化，以得到作为白色固体的68-4 (12 g,99%)。
在室温下，向68-4 (15 g, 56.8 mmol)于无水吡啶(200 mL)中的溶液中添加咪唑(7.7g, 113.6mmol)和TBSCl(9.4g, 62.5mmol)。将混合物搅拌过夜，并去除溶剂并用EA稀释。将混合物用NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层干燥并浓缩，以得到粗68-5。
在室温下，向68-5于无水DCM (200 mL)中的溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(6.8g,56.8mmol)、MMTrCl(17.8g, 56.8mmol)和AgNO3(9.6g, 56.8mmol)。将混合物搅拌过夜。过滤混合物，并用NaHCO3水溶液和盐水洗涤滤液。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以得到残余物，将其通过硅胶柱色谱法(PE中的5% EA)纯化，以得到68-6 (32 g, 87%)。
在室温下，将化合物68-6 (32 g, 49.2 mmol)溶解于TBAF于THF中的溶液(1M，4eq.)中。将混合物搅拌过夜，并去除溶剂。将混合物用EA稀释并用水洗涤。将有机层干燥并浓缩，以得到粗产物，将其通过硅胶柱色谱法(PE中的33% EA)纯化，以得到68-7 (21 g,79%)。
向68-7 (21 g, 38.8 mmol)于DCM (200 mL)中的溶液中添加吡啶(9.2mL,116.4mmol)。将溶液冷却至0℃并以一份添加戴斯-马丁氧化剂(49g, 116.4mmol)。将混合物在室温下搅拌4小时。将反应物用Na2S2O3溶液和碳酸氢钠水溶液淬灭。将混合物搅拌15分钟。将有机层分离，用稀盐水洗涤，并在减压下浓缩。将残余物溶解于二氧杂环己烷(200mL)中，并将溶液用37%甲醛水溶液(20mL, 194mmol)和2N氢氧化钠水溶液(37.5mL, 77.6mmol)处理。将混合物在室温下搅拌过夜并添加NaBH4(8.8g, 232.8mmol)。在室温下搅拌0.5小时后，用冰水去除过量氢氧化钠水溶液。将混合物用EA稀释。将有机相用盐水洗涤，经硫酸镁干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的4% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的68-8 (10 g, 50.5%)。
将化合物68-8 (4.8 g, 8.5 mmol)与甲苯共同蒸发两次。将残余物溶解于无水DCM (45mL)和吡啶(6.7g, 85mmol)中。将溶液冷却至0℃并经10分钟逐滴添加三氟甲磺酸酐(4.8g, 18.7mmol)。在该温度下，将反应物搅拌40分钟。TLC(PE中的50% EA)显示反应完成。通过柱色谱法(PE中的EA，0至20%)纯化混合物，以得到作为褐色泡沫的68-9 (6.1 g,86.4%)。
将化合物68-9 (6.1 g, 7.3 mmol)溶解于MeCN(25mL)中。将混合物在室温下用TBAF于THF中的溶液(1M, 25mL)处理。将混合物搅拌过夜。添加THF中的TBAF(1M, 15mL)并搅拌4小时。将混合物用氢氧化钠水溶液(1N, 14.6mmol)处理并搅拌1小时。将反应物在0℃下用水(50mL)淬灭并用EA萃取。将有机层干燥并浓缩，以得到粗产物，将其通过硅胶柱色谱法(PE中的50% EA)纯化，以得到68-10 (2.1 g, 50.6%)。
在室温下，向68-10 (1.5 g, 2.6 mmol)于无水吡啶(15 mL)中的溶液中添加咪唑(530mg, 7.8mmol)和TBSCl(585mg, 3.9mmol)。将混合物搅拌2小时。去除溶剂并用EA稀释。将混合物用NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层干燥并浓缩，以得到残余物，将其通过硅胶柱色谱法(PE中的10% EA)纯化，以得到68-11(1.5 g, 84.5%)。
在室温下，向68-11 (1.5 g, 2.2 mmol)于无水CH3CN (11 mL)中的溶液中添加DMAP(671mg, 5.5mmol)、TEA(555mg, 5.5mmol)和TPSCl(1.66g, 5.5mmol)。将反应物在室温下搅拌过夜。添加NH4OH (10mL)，并将混合物搅拌2小时。将混合物用EA稀释并用NaHCO3溶液洗涤。将有机层干燥并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化残余物，以得到粗68-12，将其通过制备型TLC纯化，以得到作为白色固体的68-12 (1.2 g, 80%)。
将68-12 (1.2 g, 1.76 mmol)于80% HCOOH (60 mL)中的溶液搅拌4小时。在低压下去除溶剂。将粗产物溶解于MeOH (40mL)中并搅拌过夜。浓缩溶剂，以得到粗产物，将其通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，10%)纯化，以得到作为白色固体的化合物68 (480 mg,92%)。ESI-MS: m/z 591 [2M+H]+。
实施例55
化合物69
在0℃下，向68-8 (2.63 g, 4.64 mmol)于无水吡啶/DCM中的溶液中添加Tf2O(3.27g,11.59mmol)。将混合物在室温下搅拌40分钟。在减压下去除溶剂，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到69-1 (2.60 g, 67%)。
在0℃下，向69-1 (2.65 g, 3.19 mmol)于无水DMF中的溶液中添加氢化钠(153mg, 3.82mmol)，持续1小时。溶液不经纯化即用于下一步骤中。在室温下用LiCl(402mg, 9.57mmol)处理溶液。将混合物在室温下搅拌12小时。将反应物用饱和氯化铵溶液淬灭并用EA萃取。将有机层经Na2SO4干燥并在低压下浓缩，以得到粗69-2。
在室温下，向69-2 (1.81 g, 3.19 mmol)于无水THF (20 mL)中的溶液中添加1NNaOH (4mL, 3.83mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将反应物用饱和碳酸氢钠溶液淬灭并用EA萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法纯化残余物，以得到69-3。(1.34 g, 72%)。
向69-3 (925 mg, 1.58 mmol)于二氯甲烷(10 mL)中的溶液中添加TBSCl(713mg,4.75mmol)和咪唑(323mg, 4.74mmol)，并在室温下搅拌过夜。将混合物用EA(20mL)稀释，并用盐水洗涤。将有机相在低压下浓缩，以得到粗产物。通过柱色谱法纯化残余物，以得到69-4 (1.0 g, 90%)。
向69-4 (1.24 g, 1.78 mmol)于无水乙腈(10 mL)中的溶液中添加TPSCl(1.34g,4.45mmol)、DMAP(543mg, 4.45mmol)和TEA(450mg, 4.45mmol)，并将混合物在室温下搅拌3小时。在减压下去除溶剂，并将残余物溶解于EA(30mL)中。将溶液用盐水洗涤，用无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶上纯化残余物，以得到作为白色固体的69-5 (1.0 g, 81%)。
将化合物69-5 (1.0 g, 1.43 mmol)用80% HCOOH (10mL)处理，并在室温下搅拌过夜。在减压下去除溶剂，并在硅胶上使用CH2Cl2中的5% MeOH纯化残余物，以得到化合物69(264 mg, 60%). ESI-MS: m/z 311.9 [M+H]+。
实施例56
化合物70
苄基磷酸盐(银盐)和市售异丁酸氯甲酯(5.0g)产生纯化的70a (3.84 g). 1H-NMR(CD3CN): δ 7.39-7.42 (m, 5H), 5.60 (d, 4H), 5.09 (d, 2H), 1.94-1.96 (m, 2H),1.12-1.17 (m, 12H). 31P-NMR (CD3CN): δ - 4.03 ppm。将化合物70a (780 mg; 2.0mmol)脱保护，以得到70-1 (三乙铵盐)，其不经进一步纯化即立即使用。将化合物54-6(356 mg; 1.0 mmol)和70-1反应以得到纯化的70-2 (230 mg)。将化合物70-2 (230 mg)脱保护以产生纯化的化合物70 (80 mg, 0.14 mmol)。使用化合物54和66的制备中所述的方法进行前述反应。1H-NMR (CDCl3): δ 8.25 (s, 1H), 7.55 (d, 1H), 5.93 (s, 1H),5.81 (d, 1H), 5.66-5.75 (m, 4H), 4.76 (dd, 2H), 4.37-4.46 (m, 2H), 4.15 (d,2H), 3.86 (t, 6H), 3.70 (d, 6H), 1.65 (s, 6H), 1.25 (s, 3H). 31P-NMR (CDCl3):δ - 4.41 ppm。
实施例57
化合物71
由丙酮(6 mL)中的52-1 (0.33 g)和71-1 (0.34 g)与NaI (0.19 g)和K2CO3 (0.69g)制备化合物71-2 (0.34 g, 60%)。
以相同方式在THF (5 mL)中由71-2 (0.25g, 0.45mmol)和双(乙氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.9mmol)与DIPEA(0.35mL)、BopCl(0.25g)和3-硝基-1,2,4-三唑(0.11g)制备化合物71-3 (0.28 g, 74%)。用己烷/EtOAc(30-100%梯度)完成纯化。
将71-3 (0.28 g, 0.33 mmol)于80% AcOH水溶液中的溶液在45℃下加热4小时，然后浓缩。将残余物与甲苯、然后与含有少量Et3N(2滴)的MeOH共同蒸发。在硅胶(10g柱)上用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化，产生71-4 (0.22 g, 84%)。
在0℃下，向71-4 (148 mg, 0.18 mmol)于EtOAc (0.6 mL)中的溶液中添加4NHCl/二氧杂环己烷(0.5mL)，并将混合物在室温下保持1小时。添加乙醚且化合物71沉淀。将混合物过滤并用乙醚洗涤，以得到化合物71 (100 mg, 75%)。使用化合物52的制备中所述的方法进行前述反应。MS: m/z=704 [M+1]。
实施例58
化合物33
将化合物33-1 (50 g, 86.0 mmol)和6-Cl-鸟嘌呤(16.1 g, 98.2 mmol)与无水甲苯共同蒸发3次。在0℃下，向33-1 (50 g, 86.0 mmol)和6-Cl-鸟嘌呤(16.1 g, 98.2 mmol)于MeCN (200 mL)中的溶液中添加DBU(39.5g, 258.0mmol)。将混合物在0℃下搅拌30分钟，并在0℃下逐滴添加TMSOTf(95.5g, 430.0mmol)。将混合物在0℃下搅拌30分钟，直至观察到澄清溶液。将混合物加热至70℃，并搅拌过夜。将溶液冷却至室温并用EA(100mL)稀释。将溶液用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的EA，10%至40%)纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的33-2 (48.0 g, 88.7%)。ESI-MS: m/z 628 [M+H]+。
在N2下，向33-2 (48.0 g, 76.4 mol)、AgNO3(50.0g, 294.1mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(40mL)于无水DCM (200mL)的溶液中以小份添加MMTrCl(46.0g, 149.2mmol)。在室温下，在N2下，将混合物搅拌3小时。通过TLC确定反应的完成。过滤后，用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤滤液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的EA，5%至50%)纯化残余物，以得到粗33-3 (68 g, 98%). ESI-MS: m/z 900.1 [M+H]+。
在0℃下将钠(8.7g, 378.0mmol)溶解于干燥EtOH (100mL)中，并缓慢温热至室温。将化合物33-3 (68.0 g, 75.6 mmol)用新鲜制备的NaOEt溶液处理，并在室温下搅拌过夜。通过TLC和LCMS确定反应的完成。将混合物在低压下浓缩，用H2O(100mL)稀释，并用EA(3×100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至5%)纯化残余物，以得到作为黄色固体的33-4 (34.0 g, 75.2%)。ESI-MS: m/z598 [M+H]+。
将化合物33-4 (32.0 g, 53.5 mmol)与无水吡啶共同蒸发3次。在0℃下，向33-4(32.0 g, 53.5 mmol)于无水吡啶(100 mL)中的冰冷溶液中逐滴添加TsCl (11.2 g, 58.9mmol)于吡啶(50 mL)中的溶液。将混合物在0℃下搅拌18小时。通过LCMS监测反应物，并用H2O淬灭。将溶液在低压下浓缩，并将残余物溶解于EA(100mL)中，并用饱和NaHCO3溶液洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至5%)纯化残余物，以得到作为黄色固体的粗33-5 (25.0 g, 62.2%)。ESI-MS: m/z 752 [M+H]+。
向33-5 (23.0 g, 30.6 mmol)于丙酮(150 mL)中的溶液中添加NaI(45.9g,306.0mmol)和TBAI(2.0g)，并将混合物回流过夜。通过LCMS确定反应的完成。将混合物在低压下浓缩，并将残余物溶解于EA(100mL)中。将溶液用盐水洗涤，并经无水Na2SO4干燥。在低压下蒸发有机溶液，并通过硅胶柱色谱法(DCM: MeOH=100:1至20:1)纯化残余物，以得到粗产物。向粗产物于干燥THF(200mL)中的溶液中添加DBU(14.0g, 91.8mmol)，并将混合物加热至60℃并搅拌过夜。通过LCMS监测反应物。用饱和NaHCO3溶液淬灭反应物，并用EA(100mL)萃取溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至5%)纯化残余物，以得到作为黄色固体的33-6 (12.0 g, 67.4%)。ESI-MS: m/z580 [M+H]+。
在0℃下，向33-6 (8.0 g, 13.8 mmol)于无水MeCN (100 mL)中的冰冷溶液中添加NIS (3.9 g, 17.2 mmol)和TEA•3HF (3.3 g, 20.7 mmol)。将混合物在室温下搅拌18小时，并通过LCMS检查反应物。反应完成后，用饱和Na2SO3溶液和饱和NaHCO3溶液淬灭反应物。用EA(3×100mL)萃取溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，10%至50%)纯化残余物，以得到作为固体的33-7 (7.2 g, 72.0%)。ESI-MS:m/z 726 [M+H]+。
在0℃下，向33-7 (7.2 g, 9.9 mmol)于干燥DCM (100 mL)中的溶液中添加DMAP(3.6g, 29.8mmol)和BzCl(2.8g, 19.8mmol)。将混合物搅拌过夜并通过LCMS检查。用饱和NaHCO3溶液洗涤混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，10%至30%)纯化残余物，以得到作为固体的33-8 (8.0 g, 86.4%)。ESI-MS: m/z934 [M+H]+。
向33-8 (7.5 g, 8.0 mmol)于干燥DMF (100 mL)中的溶液中添加NaOBz(11.5g,80.0mmol)和15-丝醚-5(15.6mL)。将混合物在90℃下搅拌36小时。将混合物用H2O(100mL)稀释，并用EA(3×150mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，10%至30%)纯化残余物，以得到作为固体的粗33-9 (6.0 g, 80.0%)。ESI-MS: m/z 928 [M+H]+。
将化合物33-9 (4.0 g, 4.3 mmol)与无水甲苯共同蒸发3次，并在室温下用NH3/MeOH (50mL, 4N)处理。将混合物在室温下搅拌18小时。通过LCMS确定反应的完成。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，30%至50%)纯化残余物，以得到作为固体的产物33-10 (1.9 g, 71.7%)。ESI-MS: m/z 616 [M+H]+。
将化合物33-10 (300.0 mg, 0.49 mmol)与无水甲苯共同蒸发3次，并溶解于MeCN(2mL)中。在0℃下，将混合物用MeCN(1mL)中的NMI(120.5mg, 1.47mmol)和氯磷酸酯试剂(326.3mg, 0.98mmol)处理。将混合物在室温下搅拌18小时并通过LCMS监测。将混合物用10% NaHCO3溶液稀释并用EA(3×30mL)萃取。通过硅胶柱色谱法(PE中的EA，30%至50%)纯化残余物，以得到作为固体的33-11 (210 mg, 47.5%)。ESI-MS: m/z 913.0 [M+H]+。
将化合物33-11 (210 mg, 0.26 mmol)用80% AcOH (15mL)处理，并将混合物在室温下搅拌18小时。通过LCMS确定反应的完成。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱色谱法(DCM中的MeOH，1%至30%)纯化残余物，以得到作为固体的化合物33 (71.8 mg, 48.7%)。ESI-MS: m/z 641.3 [M+H]+。
实施例59
化合物75
将1-5 (317 mg, 0.49 mmol)、TPSCl (373 mg, 1.23 mmol)、DMAP (150 mg, 1.23mmol)和TEA (124 mg, 1.23 mmol)于无水MeCN中的混合物溶液在室温下搅拌过夜。将混合物用铵溶液处理，然后在室温下搅拌3小时。在减压下去除溶剂，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到75-1 (200 mg, 63%)。
将75-1 (286 mg, 0.45 mmol)和氟化铵(500mg, 13.5mmol)于甲醇(10mL)中的溶液回流过夜。在减压下去除溶剂并在硅胶上纯化残余物，以得到化合物75 (75 mg, 57%).ESI-MS: m/z 289.9 [M+H]+。
实施例60
化合物76
在THF (10 mL)中由52-3 (0.88 g, 1.48 mmol)和双(异丁酰基氧基甲基)磷酸三乙铵(3mmol)与DIPEA(1.05mL)、BopCl(0.76g)和3-硝基-1,2,4-三唑(0.34g)制备化合物76-1(0.44 g, 34%)。用己烷/EtOAc(5-100%梯度)完成纯化。由76-1 (0.44 g)制备化合物76-2(0.43 g, 85%)；并在H2气氛下由EtOH (10 mL)中的76-2 (0.22 g)与10% Pd/C (10 mg)、4N HCl/二氧杂环己烷(132 μL)制备化合物76 (0.19 g, 98%)。使用化合物52的制备中所述的方法进行前述反应。MS: m/z = 700 [M+1]。
实施例61
化合物77
在0℃下，在N2下，向77-1 (2.0 g, 7.12 mmol)于吡啶(20 mL)中的搅拌溶液中添加TMSCl(3.86g, 35.58mmol)。将混合物缓慢温热至室温并搅拌2小时。添加PivCl(1.71g,14.23mmol)，并将混合物搅拌24小时。在低压下蒸发溶剂，并将残余物溶解于EA(50mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以得到粗产物。将粗产物溶解于MeOH (20mL)中并添加NH4F(1.4g, 37.86mmol)。将混合物回流2小时。去除溶剂，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-2 (2.2 g, 85%)。
向77-2 (8.5 g, 23.28mmol)和1,1-二甲氧基环戊烷(2 mL)于DMF(15mL)和环戊酮(6mL)的混合物中的溶液中添加TsOH (6.63g, 34.93mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。将反应物用三乙胺淬灭，并在低压下浓缩。通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-3 (6.5g, 65%)。
在室温下，向77-3 (6.0 g, 13.92 mmol)于无水MeOH (60 mL)中的搅拌溶液中添加MeONa(2.25g, 41.76mmol)。将混合物搅拌12小时，然后用HOAc中和。在低压下浓缩混合物，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-4 (4.4 g, 92%)。
在室温下，在N2下，向77-4 (5.0 g, 14.40 mmol)于无水吡啶(50 mL)中的搅拌溶液中添加TBSCl (3.24g, 21.61mmol)，并将混合物搅拌过夜。在低压下浓缩混合物，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-5 (5.44 g, 82%)。
在室温下，在N2下，向77-5 (5.0 g, 10.84 mmol)于无水DCM (50 mL)中的搅拌溶液中添加MMTrCl(5.01g, 16.26mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(5mL)和AgNO3(2.76g,16.26mmol)，并将混合物搅拌2小时。通过过滤去除沉淀物，并在低压下浓缩滤液。通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-6 (7.1 g, 89%)。
在室温下，在N2下，向77-6 (7.1 g, 9.68 mmol)于无水THF (70 mL)中的搅拌溶液中添加TBAF(5.05g, 19.37mmol)，并将混合物搅拌4小时。在低压下浓缩混合物，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-7 (5.1 g, 87%)。
在室温下，在N2下，向77-7 (3.2 g, 5.17 mmol)和吡啶(2.04 g, 25.85 mmol)于无水DCM (30 mL)中的搅拌溶液中添加DMP(3.28g, 7.75mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时。将反应物用饱和Na2S2O3溶液淬灭，并用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法纯化残余物，以得到醛(1.8g)。在室温下，向醛(1.8g, 2.92mmol)于二氧杂环己烷(29.2mL)中的搅拌溶液中添加37% HCHO (2.36g,29.17mmol)和1N LiOH (1.6mL, 2.34mmol)。将混合物在室温下搅拌1.5小时。用HOAc中和溶液。将混合物用EtOH (15mL)和NaBH4(1.66g, 43.8mmol)处理，并在室温下搅拌2小时。将混合物用水淬灭，并在低压下浓缩。通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-8 (2.01 g,61%)。
在室温下，在N2下，向77-8 (200 mg, 0.31 mmol)于无水DCM (2 mL)中的搅拌溶液中添加TBDPSCl(170mg, 0.62mmol)和咪唑(42mg, 0.62mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物用DCM (10mL)稀释并用盐水洗涤。在低压下浓缩有机相，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-9 (175 mg, 64%)。
在室温下，在N2下，向77-9 (270 mg, 0.304 mmol)于无水DCM (2 mL)中的搅拌溶液中添加BzCl(63mg, 0.61mmol)、DMAP(74mg, 0.61mmol)和TEA(61mg, 0.61mmol)。将混合物在室温下搅拌，直至起始材料消失。在低压下蒸发混合物，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-10 (250 mg, 83.3%)。
在室温下，将THF(5mL)中的化合物77-10 (300 mg, 0.302 mmol)用TBAF(0.61mL,0.61mmol, 1M, 在THF中)和HOAc(0.2mL)的溶液处理。将混合物在室温下搅拌12小时。在低压下浓缩混合物，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-11 (170 mg, 75%)。
在室温下，在N2下，向77-11 (400 mg, 0.531 mmol)于无水DCM (4 mL)中的搅拌溶液中添加Tf2O(299mg, 1.06mmol)和吡啶(84mg, 1.06mmol)。将混合物在室温下搅拌，直至起始材料消失。在低压下浓缩混合物，并通过柱色谱法纯化残余物，以得到77-12 (401mg, 85%)。
在室温下，在N2下，将化合物77-12 (500 mg, 0.564 mmol)用THF中的TBAF(1.0M,2mL)处理。将混合物用水(20mL)稀释并用DCM萃取。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的77-13 (150 mg,40.8%)。ESI-MS: m/z 652.1 [M+H]+。
将化合物77-13 (50 mg)溶解于80% HCOOH (10mL)中，并将混合物在45℃下加热24小时。蒸发溶剂并与甲醇/甲苯共同蒸发以去除痕量酸。将残余物溶解于甲醇中的20%三乙胺中，保持15分钟，然后蒸发。通过硅胶色谱法、以DCM中的甲醇的0%至15%的梯度分离化合物77 (18 mg, 75%)。MS: m/z 312.5 [M-1]。
实施例62
化合物78
由市售3-羟基氧杂环丁烷(5.0 g)制备化合物78a。1H-NMR (CDCl3) δ 5.73 (s,2H) ,5.48-5.51 (m,1H), 4.90 (d,2H), 4.72 (d, 2H)。由78a制备化合物78b (8.0 g)。1H-NMR(CDCl3) δ 5.95 (s,2H) , 5.48-5.51 (m,1H), 4.90 (d,2H), 4.72 (d, 2H)。将苄基磷酸盐(银盐)与78b (8.0 g)反应以产生纯化的78c (1.92 g)。1H-NMR (CD3CN): δ 7.39-7.42 (m, 5H), 5.62 (d, 4H), 5.39-5.42 (m, 2H), 5.15 (d, 2H), 4.80-4.83 (m,4H), 4.56-4.60 (m, 4H). 31P-NMR (CD3CN): δ - 4.55 ppm。将化合物78c脱保护，以得到78-1 (三乙铵盐)，其不经进一步纯化即立即使用。将化合物54-6 (356 mg; 1.0 mmol)和78-1反应以得到纯化的78-2 (230 mg)。将化合物78-2 (230 mg )脱保护，以产生纯化的化合物78 (12.5 mg, 0.02 mmol)。使用化合物54的制备中所述的方法进行前述反应。1H-NMR(CDCl3): δ 8.25 (s, 1H), 7.54 (d, 1H), 5.90 (s, 1H), 5.81 (d, 1H), 5.66-5.75(m, 4H), 5.44-5.49 (m, 2H), 4.88-4.92 (m, 5H), 4.61-4.78 (m, 5H), 4.37-4.46(m, 2H), 4.21 (s, 1H), 3.49 (s, 1H), 1.25 (s, 3H). 31P-NMR (CDCl3): δ - 4.28ppm。
实施例63
化合物83
如化合物44的制备中所述，以相同方式在THF (2 mL)中由化合物83-1 (90 mg; 0.1mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.2 mmol)与DIPEA (87 μL)、BopCl(44 mg)和3-硝基-1,2,4-三唑 (29 mg)制备化合物83-2 (70 mg, 58%)。用己烷/EtOAc以20-80%梯度完成纯化。
如化合物55的制备中所述，由乙腈(0.6mL) 和4N HCl/二氧杂环己烷(50μL)中的83-2 (70 mg)制备化合物83 (25 mg, 64%)。MS: m/z = 658 [M+1]。
实施例64
化合物84
如化合物44的制备中所述，在THF (1 mL)中由84-1 (52 mg; 0.08mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.16 mmol)与DIPEA (74 μL)、BopCl (51 mg)和3-硝基-1,2,4-三唑 (23 mg)制备化合物84-2 (69 mg, 90%)。用己烷/EtOAc以20-100%梯度完成纯化。
如化合物44的制备中所述，由84-2 (65 mg)制备化合物84 (27 mg, 62%)。MS: m/z = 626 [M+1]。
实施例65
化合物85
将76-2和乙酸酐于吡啶中的混合物在室温下搅拌过夜，然后浓缩并在硅胶(10g柱)上使用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化，以产生85-1 (12 mg, 69%)。
在H2气氛下，以与化合物52相同的方式，由EtOH (0.5mL)中的85-1 (12 mg)与10%Pd/C(1mg)、4N HCl/二氧杂环己烷(7μL)制备化合物85 (10 mg, 92%)。MS: m/z=742 [M+1]。
实施例66
化合物86和87
在0℃下，将新鲜制备的干燥EtOH中的EtONa (2N, 150mL)添加至20-4 (13.67 g,17.15 mmol)于EtOH (50 mL)中的溶液中。将混合物在室温下搅拌1小时，然后在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为黄色固体的86-1 (10 g, 98%)。
在室温下，向PPh3(2.73g, 10.4mol)于无水吡啶(60mL)中的溶液中添加I2(2.48g,9.76mmol)，并将反应混合物在室温下搅拌30分钟。添加86-1 (3.9 g, 6.51 mmol)于吡啶(10 mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用饱和Na2S2O3溶液和NaHCO3水溶液淬灭，然后用EA(100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱(DCM中的2% MeOH)纯化残余物，以得到作为黄色固体的86-2 (3.0 g, 75%)。
向86-2于干燥THF (300 mL)中的溶液中添加DBU(14.0g, 91.8mmol)，并将混合物加热至回流持续3小时。在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EA(100mL)中并用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的86-3 (0.6 g, 37.5%)。
在0℃下，向86-3 (2.0 g, 3.44 mmol)于无水MeCN (20 mL)中的冰冷溶液中添加NIS (0.975 g, 4.3 mmol)和TEA•3HF (0.82 g, 5.16 mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将反应物用饱和Na2SO3和NaHCO3水溶液淬灭，然后在低压下浓缩。将残余物溶解于EA(50mL)中，用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的86-4 (1.5 g, 60%)。
在0℃下，向86-4 (1 g, 1.37 mmol)于干燥吡啶(100 mL)中的溶液中添加BzCl(0.23g, 1.65mmol)。将反应物搅拌30分钟并通过LCMS检查。将混合物在低压下浓缩并将残余物溶解于EA(50mL)中。将溶液用盐水洗涤。将有机层经MgSO4干燥，并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(PE中的10% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的86-5 (0.9 g, 78%)。
向86-5 (2 g, 2.4 mmol)于干燥DMF (40 mL)中的溶液中添加NaOBz(3.46g,24mmol)和15-丝醚-5(4.5mL)。将混合物在95℃下搅拌72小时。然后将混合物用EA(100mL)稀释，并用水和盐水洗涤。将有机相经MgSO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的15%EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的86-6 (1.5 g, 75%)。
将NH3/MeOH (150mL)中的化合物86-6 (1.35 g, 1.64 mmol)在室温下搅拌18小时。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的86-7 (0.9 g, 90%)。ESI-MS: m/z 618.3 [M+H]+。
在室温下，向86-7 (99 mg, 0.16 mmol)于DCM (1.0 mL)中的溶液中添加三乙胺(92.7μL, 0.64mmol)。将混合物冷却至0至5℃(冰/水浴)，并将新鲜制备且蒸馏的二氯磷酸异丙酯(36.6μL, 0.2mmol, 根据Reddy等人, J. Org. Chem. (2011) 76 (10):3782-3790的程序制备)添加至混合物中。将混合物在0至5℃(冰/水浴)下搅拌15分钟，随后添加N-甲基咪唑(26.3μL, 0.32mmol)。然后将混合物在0至5℃下搅拌1小时。TLC显示86-7不存在。添加EA(100mL)，随后添加水。用H2O、饱和NH4Cl水溶液和盐水洗涤有机层。将有机层分离，经无水MgSO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其在硅胶上用0至10% 异PrOH/DCM纯化，以得到86-a和86-b的混合物(61.5mg)。
将86-a和86-b的混合物(61.5mg, 0.085mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃(冰/水浴)下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(64μL)。将混合物在室温下搅拌40分钟，并添加无水EtOH (200μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发3次。将残余物溶解于50%CH3CN/H2O中，在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水纯化，随后冻干，以得到化合物86 (1.8 mg)和化合物87 (14.5 mg)。
化合物86: 1H NMR (CD3OD-d4, 400 MHz) δ 8.0 (s, 1H), 6.69 (d, J = 16.0Hz, 1H),5.9-5.6 (br s, 1H), 4.94-4.85 (m, 1H), 4.68-4.52 (m, 3H), 1.49-1.3(m, 12H); 19F NMR (CD3OD-d4) δ -122.8 (s), -160.06 (s);; 31P NMR (CD3OD-d4) δ -7.97 (s). ESI-LCMS: m/z = 450.1 [M+H]+; 化合物87:1H NMR (CD3OD-d4, 400 MHz) δ7.96 (s, 1H), 6.68 (s, 1H), 6.69 (d, J = 16.8 Hz, 1H), 6.28-6.1 (br s, 1H),4.81-4.5 (m, 4H), 1.45-1.39 (m, 12H); 31P NMR (CD3OD-d4) δ -5.84 (s). ESI-LCMS: m/z = 450. [M+H]+。
实施例67
化合物88和89
在室温下向88-1 (150 mg, 0.24 mmol)于DCM (2.0 mL)中的溶液中添加三乙胺(141μL, 2.0mmol)。将混合物冷却至0至5℃(冰/水浴)，并添加新鲜制备且蒸馏的二氯磷酸异丙酯(45μL, 0.26mmol, 根据Reddy等人, J. Org. Chem. (2011) 76 (10):3782-3790的程序制备)。将混合物在0至5℃(冰/水浴)下搅拌15分钟，随后添加N-甲基咪唑(40μL,0.49mmol)。将混合物在0至5℃下搅拌1小时。TLC显示起始材料88-1不存在。添加EA(100mL)，随后添加水。用H2O、饱和NH4Cl水溶液和盐水洗涤有机层。将有机层分离，经无水MgSO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其在硅胶上用0至10% 异PrOH/DCM纯化，以得到88-2a (16.9mg, 较快洗脱的异构体)和88-2b (72.7mg, 较慢洗脱的异构体)。
使用本文所述的程序将化合物88-2a和88-2b脱保护。获得化合物88 (7.3mg, 来自88-2a的单一异构体(16.5mg, 0.0235mmol))和化合物89 (29.0mg。来自88-2b的单一异构体(72.7mg, 0.1mmol))。
化合物88: 1H NMR (CD3OD-d4, 400 MHz) δ 7.94 (s, 1H), 6.32 (s, 1H),6.00-5.9 (br s, 1H), 4.9-4.487 (m, 1H), 4.83-4.77 (m, 1H), 4.65-4.50 (m, 3H),1.45-1.39 (s, 9H), 1.2 (s, 3H),; 19F NMR (CD3OD-d4) δ -120.3 (s); 31P NMR(CD3OD-d4) δ -5.19 (s); ESI-LCMS: m/z = 448.05 [M+H]+。化合物89: 1H NMR (CD3OD-d4, 400 MHz) δ 7.98 (s, 1H), 6.34 (s, 1H), 5.78-5.64 (br s, 1H), 4.95-4.48(m, 2H), 4.62-4.52 (m, 3H), 1.48-1.42 (s, 9H), 1.1 (s, 3H),; 19F NMR (CD3OD-d4)δ -121.3 (s); 31P NMR (CD3OD-d4) δ -7.38 (s); ESI-LCMS: m/z = 448.05 [M+H]+。
实施例68
化合物90
在0至5℃(冰/水浴)下，向90-1 (532 mg, 1.84 mmol)于无水CH3CN (8.0 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(2.0mL, 24.36mmol)，随后添加新鲜制备且蒸馏的二氯磷酸异丙酯的溶液(0.5mL, 2.84mmol)。将溶液在室温下搅拌15小时。将混合物用EA、随后用水(15mL)稀释。用H2O、50%柠檬酸水溶液和盐水洗涤溶液。将有机层分离，经无水MgSO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到残余物，将其在硅胶上用0至8% MeOH/DCM纯化，以得到粗产物(72mg)。在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水再纯化粗产物，随后冻干，以得到化合物90(43.6 mg). MS: m/z = 395.05 [M+H]+, 393.0 [M-H]-, 787.05.0 [2M - H]-。
实施例69
化合物96
将干燥51 (0.05 mmol)溶解于PO(OMe)3 (0.7 mL)和吡啶(0.3 mL)的混合物中。将混合物在真空中在浴温42℃下蒸发15分钟，然后冷却至室温。添加N-甲基咪唑(0.009mL,0.11mmol)，随后添加POCl3 (9ul, 0.11 mmol)，并将混合物在室温下保持20-40分钟。将反应通过LCMS控制并通过96的出现来监测。在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上、通过RP HPLC进行分离。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至30%的甲醇的线性梯度来洗脱。将相应级分合并，浓缩并冻干3次以去除过量缓冲液，以产生化合物96。MS: m/z369.0 [M-1]。
实施例70
化合物97和98
将干燥51 (0.05 mmol)溶解于PO(OMe)3 (0.7 mL)和吡啶(0.3 mL)的混合物中。将混合物在真空中在浴温42℃下蒸发15分钟，然后冷却至室温。添加N-甲基咪唑(0.009mL,0.11mmol)，随后添加PSCl3(9μL,0.11mmol)，并将混合物在室温下保持20-40分钟。将反应通过LCMS控制并通过核苷5'-硫代磷酸酯的出现来监测。反应完成之后，添加焦磷酸四丁铵盐(150mg)，随后添加DMF(0.5mL)，以得到均质溶液。在环境温度下1.5小时后，用水(10mL)淬灭反应物。在使用具有Q Sepharose High Performance的柱HiLoad 16/10的AKTAExplorer上、通过IE色谱法分离作为非对映异构体的混合物的5'-三磷酸酯。以50mM TRIS缓冲液(pH 7.5)中的0至1N NaCl的线性梯度完成分离。将含有硫代三磷酸酯的级分合并，浓缩，并在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC脱盐。使用50mM三乙铵缓冲液中的0至30%的甲醇的线性梯度进行经20分钟的洗脱，流量为10 mL/min。收集化合物97和98。在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上，在7分钟内，在含有0%至25%乙腈的线性梯度的50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中完成分析型RP HPLC。化合物97: RT 5.50min。31P NMR: δ +42.45(1P, d), -6.80 (1P, d), -23.36 (1P, q). MS: m/z 544.9 [M-1]。化合物98: RT 6.01 min。31P NMR: δ +41.80(1P, d), -6.57 (1P, d), -23.45 (1P,q). MS: m/z 544.9 [M-1]。
实施例71
化合物99
向99a (0.31 g, 0.8 mmol)于无水甲醇 (2 mL)中的溶液中添加10% Pd/C(30mg)，并将混合物在H2气氛下搅拌1小时。完成后，过滤混合物，并用甲醇洗涤催化剂滤饼。合并洗涤液和滤液。在真空中去除溶剂，以得到作为半固体的99b (252mg)，其不经进一步纯化即使用。1H NMR (CDCl3, 400 MHz) δ 5.57 (d, J = 13.6 Hz, 4H), 4.23 (q, J = 7.2 Hz,4H), 1.30 (t, J = 7.2 Hz, 6H), 31P NMR (CDCl3) δ- 4.64 (s)。
向双(EOC)磷酸三乙铵(0.7mmol, 由213mg 99b和0.2mL TEA制备)于THF(3mL)中的溶液中添加99-1 (160 mg, 0.45 mmol)，随后添加二异丙基乙胺(0.33mL, 1.8mmol)、BOP-Cl(229mg, 0.9mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑(103mg, 0.9mmol)。将混合物在室温下搅拌90分钟。将混合物用EtOAc稀释并用水和盐水洗涤。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，并过滤。将滤液在真空中浓缩为白色固体，在硅胶柱(CH3OH:DCM; 9.5:0.5)上纯化，以得到99-2 (189 mg, 66 %)。
将99-2 (180 mg, 0.28 mmol)于80% HCOOH (7 mL)中的溶液在45℃下加热6小时。蒸发溶剂，然后与甲苯共同蒸发3次。在硅胶柱上使用DCM中的0至10% MeOH纯化残余物，以便在冻干后获得作为白色泡沫的化合物99 (97.3 mg)。MS: m/z = 575.1 [M+H]+。
实施例72
化合物100
由市售2-(2-甲氧基乙氧基)-乙醇(11.56 mL)制备化合物100a。获得作为澄清无色油的化合物100a (13.5 g)。1H-NMR (CDCl3) δ 5.73 (s, 2H), 4.38-4.40 (m, 2H), 3.74-3.77 (m, 2H), 3.64-3.67 (m, 2H), 3.54-3.57 (m, 2H), 3.39 (s, 3H)。由100a制备化合物100b (9.6 g)，并且其作为澄清、略带颜色的油获得。1H-NMR (CDCl3) δ 5.96 (s,2H), 4.38-4.40 (m, 2H), 3.74-3.77 (m, 2H), 3.64-3.67 (m, 2H), 3.54-3.57 (m,2H), 3.39 (s, 3H)。将苄基磷酸盐(银盐)和100b (2.4 g)反应并产生纯化的100c (1.02g)。1H-NMR (CD3CN): δ 7.39-7.42 (m, 5H), 5.60 (d, 4H), 5.11 (d, 2H), 4.27-4.29(m, 4H), 3.65-3.67 (m, 4H), 3.56 (t, 4H), 3.46 (t, 4H), 3.30 (s, 6H). 31P-NMR(CD3CN): δ - 4.55 ppm。将化合物100c (620 mg; 1.15 mmol)脱保护，以得到100-1 (三乙铵盐)，其不经进一步纯化即立即使用。将化合物54-6 (356 mg; 1.0 mmol)和100-1反应，以得到纯化的100-2 (250 mg)。将化合物100-2 (250 mg)脱保护，以产生纯化的化合物100 (110 mg , 0.14 mmol)。使用化合物54的制备中所述的方法进行前述反应。1H-NMR(CDCl3): δ 8.62 (s, 1H), 7.54 (d, 1H), 5.96 (s, 1H), 5.64-5.79 (m, 5H), 4.76(dd, 2H), 4.37-4.46 (m, 6H), 4.25 (d, 2H), 3.86 (s, 1H), 3.75 (t, 4H), 3.70(t, 4H), 3.58 (t, 4H), 3.38 (s, 6H), 1.65 (s, 6H), 1.25 (s, 3H). 31P-NMR(CDCl3): δ - 3.90 ppm。
实施例73
化合物104
将化合物44 (0.010g, 0.016mmol)添加至生理盐水溶液(3mL, pH 7.3)中，并在加热块中在37℃下储存6天。通过制备型HPLC使用Synergi 4u Hydro-RP柱(Phenomenex, 00G-4375-U0-AX)用H2O(0.1%甲酸)和ACN(0.1%甲酸)溶剂(20分钟内，0-65%梯度)纯化混合物。化合物在13.0分钟时洗脱。将纯级分合并和冻干，以产生化合物104 (0.005g, 63%). MS:m/z = 487 [M+1]。
实施例74
化合物102
将102-1 (45 mg, 0.06 mmol)和丁胺(0.4 mL)的混合物在室温下保持过夜，然后蒸发。在硅胶上(10g柱)用CH2Cl2/MeOH (4-12%梯度)纯化粗残余物，以产生作为无色玻璃的102-2 (20mg, 56%)。
向102-2 (20 mg, 0.03 mmol)于ACN (0.5 mL)中的溶液中添加二氧杂环己烷中的4N HCl(35μL)。将混合物在室温下搅拌4小时，然后用MeOH淬灭。将残余物用ACN处理，以产生作为灰白色固体的化合物102 (9mg, 80%)。MS m/z=328[M+1]。
实施例75
化合物105
向105-1 (50 g, 203 mmol)于无水吡啶(200 mL)中的溶液中添加TBDPS-Cl(83.7g,304mmol)。将反应在室温下进行过夜。在低压下浓缩溶液，以得到残余物，将其分配于乙酸乙酯和水之间。将有机层分离，用盐水洗涤，经硫酸镁干燥，并在减压下浓缩，以得到作为白色泡沫的5'-OTBDPS醚(94g)。
向5'-OTBDPS醚(94.0g, 194.2mmol)于无水DCM (300mL)中的溶液中添加硝酸银(66.03g, 388.4mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(235mL, 1.94mol)。将混合物在室温下搅拌。15分钟后，将混合物冷却至0℃，并以一份添加单甲氧基三苯甲基氯化物(239.3g,776.8mmol)。在室温下搅拌过夜后，经硅藻土过滤混合物，并用TBME稀释滤液。依次用1M柠檬酸、稀盐水和5%碳酸氢钠洗涤溶液。将有机溶液经硫酸钠干燥并在真空下浓缩，以得到作为黄色泡沫的完全保护的中间体。
将完全保护的中间体溶解于甲苯(100mL)中，并将溶液在减压下浓缩。将残余物溶解于无水THF(250mL)中，并用TBAF(60g, 233mmol)处理。将混合物在室温下搅拌2小时，并在减压下去除溶剂。将残余物溶解于乙酸乙酯中并将溶液首先用饱和碳酸氢钠洗涤，然后用盐水洗涤。经硫酸镁干燥后，在真空中去除溶剂并通过柱色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的105-2 (91 g, 86.4%)。
向105-2 (13.5 g, 26 mmol)于DCM (100 mL)中的溶液中添加吡啶(6.17mL,78mmol)。将溶液冷却至0℃，并以一份添加戴斯-马丁氧化剂(33.8g, 78mmol)。将反应混合物在室温下搅拌4小时，并通过添加Na2S2O3溶液(4%)和碳酸氢钠水溶液(4%)淬灭(将溶液调节至pH 6，~150 mL)。将混合物搅拌15分钟。将有机层分离，用稀盐水洗涤，并在减压下浓缩。将残余物溶解于二氧杂环己烷(100mL)中，并将溶液用37%甲醛水溶液(21.2g, 10eq.)和2N氢氧化钠水溶液(10eq.)处理。将反应混合物在室温下搅拌过夜。在室温下搅拌0.5小时之后，用饱和NH4Cl(约150mL)去除过量的氢氧化钠水溶液。将混合物在减压下浓缩，并将残余物分配于乙酸乙酯和5%碳酸氢钠之间。将有机相分离，用盐水洗涤，经硫酸镁干燥，并浓缩。通过柱色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的105-3 (9.2 g,83.6%)。
将化合物105-3 (23 g, 42.0 mmol)与甲苯共同蒸发两次。将残余物溶解于无水DCM (250mL)和吡啶(20mL)中。将溶液冷却至0℃并经10分钟逐滴添加三氟甲磺酸酐(24.9g, 88.1mmol)。在该温度下，将反应物搅拌40分钟。通过TLC (PE: EA= 2:1和DCM:MeOH= 15:1)监测反应物。完成后，在0℃下用水(50mL)淬灭反应混合物。将混合物搅拌30分钟，并用EA萃取。将有机相经Na2SO4干燥并经由硅胶垫过滤。在减压下浓缩滤液，并通过柱色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为褐色泡沫的105-4 (30.0 g, 88.3%)。
在0℃下，在氮气气氛下，向105-4 (4.4 g, 5.42mmol)于无水DMF (50 mL)中的搅拌溶液中添加NaH (260mg, 6.5mmol)。将溶液在室温下搅拌1.5小时。溶液未经任何进一步后处理即用于下一步骤中。
在0℃下，在氮气气氛下，向搅拌溶液中添加NaN3(1.5g, 21.68mmol)，并在室温下将所得溶液搅拌1.5小时。将反应物用水淬灭，用EA萃取，用盐水洗涤并经MgSO4干燥。浓缩的有机相不经进一步纯化即用于下一步骤。
在室温下，向105-6 (3.0 g, 5.4 mmol)于无水1,4-二氧杂环己烷(18 mL)中的溶液中添加NaOH (5.4mL, 2M，在水中)。将反应混合物在室温下搅拌3小时。将反应物用EA稀释，用盐水洗涤并经MgSO4干燥。在硅胶柱(PE中的30% EA)上纯化浓缩的有机相，以得到作为白色泡沫的105-7 (2.9 g, 93%)。
在室温下将化合物105-7 (520 mg, 0.90 mmol)溶解于80% HCOOH (20mL)中。将混合物搅拌3小时，并通过TLC监测。去除溶剂并用MeOH和甲苯处理残余物3次。添加NH3/MeOH，并将反应混合物在室温下搅拌5分钟。将溶剂浓缩至干燥并通过柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的化合物105 (120 mg, 44.4%)。ESI-LCMS: m/z 302.0 [M+H]+ ,324.0[M + Na]+。
实施例76
化合物106
在25℃下，在N2气氛下，向105-7 (1.1 g, 2.88 mmol)于无水DCM (10 mL)中的搅拌溶液中添加MMTrCl(1.77g, 5.76mmol)、AgNO3(1.47g, 8.64mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(1.05g, 8.64mmol)。将反应物回流12小时。添加MeOH (20mL)并去除溶剂至干燥。在硅胶柱(PE中的20% EA)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的106-1 (1.6 g, 85.1%)。
在室温下，向106-1 (800 mg, 0.947 mmol)于无水MeCN (10 mL)中的搅拌溶液中添加TPSCl(570mg, 1.89mmol)、DMAP(230mg, 1.89mmol)和TEA(190mg, 1.89mmol)。将混合物搅拌12小时。添加NH4OH (25mL)并将混合物搅拌2小时。去除溶剂，并在硅胶柱上纯化作为黄色泡沫的残余物。通过制备型TLC进一步纯化，得到作为白色固体的106-2 (700 mg,87.1%)。
在室温下，将化合物106-2 (300 mg, 0.355 mmol)溶解于80% HCOOH (5mL)中。将混合物搅拌3小时，并通过TLC监测。然后去除溶剂并用MeOH和甲苯处理残余物(3次)。添加NH3/MeOH并将混合物在室温下搅拌5分钟。去除溶剂并通过柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的化合物106 (124 mg, 82.6%)。ESI-LCMS: m/z 301.0 [M+H]+ , 601.0[2M+H]+。
实施例77
化合物108
在0℃下，向108-1 (20 g, 77.5 mmol)、PPh3 (30 g, 114.5 mmol)、咪唑 (10 g, 147mmol)和吡啶(90 mL)于无水THF (300 mL)中的搅拌悬浮液中逐滴添加I2 (25 g, 98.4mmol)于THF (100 mL)中的溶液。将混合物温热至室温(RT)并在室温下搅拌10小时。通过MeOH (100mL)淬灭反应物。去除溶剂，并将残余物再溶解于乙酸乙酯(EA)和THF (2 L, 10:1)的混合物中。将有机相用饱和Na2S2O3水溶液洗涤，并用EA和THF的混合物(2 L, 10:1)萃取水相。将有机层合并并浓缩，以得到残余物，将其在硅胶柱(DCM中的0-10% MeOH)上纯化，以得到作为白色固体的108-2 (22.5 g, 78.9%)。1H NMR: (DMSO-d 6, 400 MHz) δ11.42(s, 1H), 7.59 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 5.82 (s, 1H), 5.63 (d, J = 8.0 Hz, 1H),5.50 (s, 1H), 5.23 (s, 1H), 3.77-3.79 (m, 1H), 3.40-3.62 (m, 3H), 0.97 (s,3H)。
在室温下，在N2下，向108-2 (24.3 g, 66.03 mmol)于无水MeOH (240 mL)中的搅拌溶液中添加NaOMe (10.69g, 198.09mmol)。将混合物回流3小时。去除溶剂，并将残余物再溶解于无水吡啶(200mL)中。在0℃下，向混合物中添加Ac2O (84.9g, 833.3mmol)。将混合物温热至60℃并搅拌10小时。去除溶剂，并将残余物用DCM稀释，用饱和NaHCO3和盐水洗涤。将有机层浓缩并在硅胶柱(PE中的10-50% EA)上纯化，以得到作为白色固体的108-3(15 g, 70.1%)。1H NMR: (CDCl3, 400 MHz) δ8.82 (s, 1H), 7.23 (d, J = 2.0 Hz,1H), 6.54 (s, 1H), 5.85 (s, 1H), 5.77 (dd, J = 8.0, 2.0 Hz, 1H), 4.69 (d, J =2.4 Hz, 1H), 4.58 (d, J = 2.8Hz, 1H), 2.07 (d, J = 5.2Hz, 6H), 1.45 (s, 3H)。
向108-3 (15 g, 46.29 mmol)于无水DCM (300 mL)中的冰冷溶液中添加AgF(29.39g, 231.4mmol)。将无水DCM (1.0L)中的I2 (23.51g, 92.58mmol)逐滴添加至溶液中。将反应混合物在室温下搅拌5小时。将反应物用饱和Na2S2O3和NaHCO3淬灭，并用DCM萃取。将有机层分离，干燥并蒸发至干燥。在硅胶柱(PE中的10-30% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的108-4 (9.5 g, 43.6%)。1H NMR: (甲醇-d4, 400 MHz) δ7.52 (d, J =8.0 Hz, 1H), 6.21 (s, 1H), 5.80 (d, J = 17.2 Hz, 1H), 5.73 (d, J = 8.0 Hz,1H), 3.58 (s, 1H), 3.54 (d, J = 6.8 Hz, 1H), 2.17 (s, 3H), 2.09 (s, 3H), 1.58(s, 3H)。
向108-4 (7.0 g, 14.89 mmol)于无水DMF (400 mL)中的溶液中添加NaOBz(21.44g, 148.9mmol)和15-丝醚-5(32.75g, 148.9mmol)。将反应混合物在130℃下搅拌6小时。去除溶剂，用EA稀释并用水和盐水洗涤。将有机层蒸发并在硅胶柱(PE中的10-30%EA)上纯化，以得到108-5 (2.8 g, 40.5%). ESI-MS: m/z 444.9 [M - F + H] +。
将108-5 (4.0 g; 8.6 mmol)和液体氨的混合物在高压不锈钢容器中在室温下保持过夜。然后蒸发氨，并在二氧化硅(50g柱)上用CH2Cl2/MeOH溶剂混合物(4-12%梯度)纯化残余物，以产生作为无色泡沫的化合物108 (2.0g; 84%收率)。ESI-MS: m/z 275.1 [M-H] -。
实施例78
化合物109和110
将干燥化合物108 (14 mg, 0.05 mmol)溶解于PO(OMe)3 (0.750 mL )和吡啶(0.5mL)的混合物中。将混合物在浴温42℃下在真空中蒸发15分钟，然后冷却至室温。添加N-甲基咪唑(0.009mL, 0.11mmol)，随后添加POCl3(0.009mL, 0.1mmol)。将混合物在室温下保持45分钟。添加三丁胺(0.065mL, 0.3mmol)和焦磷酸N-四丁基铵盐(100mg)。添加干燥DMF(约1 mL)，以得到均质溶液。在1小时内，将反应物用2M乙酸铵缓冲液(1mL, pH=7.5)淬灭，用水(10mL)稀释并装填至具有Q Sepharose High Performance的柱HiLoad 16/10上。以50mM TRIS缓冲液(pH 7.5)中的0至1N的NaCl的线性梯度完成分离。含有化合物109的级分在60%缓冲液B处洗脱，而含有化合物110的级分在80%缓冲液B处洗脱。浓缩相应部分，并通过RP HPLC在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上纯化残余物。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至30%的甲醇的线性梯度来洗脱。将相应级分合并，浓缩并冻干3次以去除过量缓冲液。化合物109: P31-NMR (D20): -3.76 (s); MS: 378.2 [M-1]. 化合物110: P31-NMR (D20): -9.28(d, 1H, Pα), -12.31(d, 1H, Pγ), -22.95(t, 1H, Pβ);MS 515.0 [M-1]。
实施例79
化合物112
如针对化合物2所述，使用氯磷酸新戊酯试剂合成化合物112 (36 mg, 63%)。MS:572.6 [M-1]。
实施例80
化合物116和117
将干燥化合物108 (14 mg, 0.05 mmol)溶解于PO(OMe)3 (0.750 mL)和吡啶(0.5 mL)的混合物中。将混合物在浴温42℃下在真空中蒸发15分钟，然后冷却至室温。添加N-甲基咪唑(0.009mL, 0.11mmol)，随后添加PSCl3(0.01mL, 0.1mmol)。将混合物在室温下保持1小时。添加三丁胺(0.065mL, 0.3mmol)和焦磷酸N-四丁基铵盐(200mg)。添加干燥DMF (约1mL)，以得到均质溶液。在2小时内，将反应物用2M乙酸铵缓冲液(1mL, pH=7.5)淬灭，用水(10mL)稀释并装填至具有Q Sepharose High Performance的柱HiLoad 16/10上。以50mMTRIS缓冲液(pH 7.5)中的0至1N的NaCl的线性梯度完成分离。含有化合物116和117的级分在80%缓冲液B处洗脱。浓缩相应级分，并通过RP HPLC在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上纯化残余物。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至20%的甲醇的线性梯度来洗脱。收集两个峰。将相应级分合并，浓缩，并冻干3次以去除过量缓冲液。峰1(极性更高)：31P-NMR (D2O): +42.68(d, 1H, Pα), -9.05(d, 1H, Pγ), -22.95(t, 1H, Pβ); MS 530.9.0 [M-1]。峰2(极性更低)：31P-NMR (D2O): +42.78(d, 1H, Pα), -10.12(bs, 1H, Pγ), -23.94(t, 1H, Pβ);和MS 530.9.0 [M-1]。
实施例81
化合物118和121
通过RP-HPLC分离化合物5的非对映异构体。在Synergi Hydro RP 30 x 250 m 4u颗粒柱(Phenomenex PN 00G-4375-U0-AX)上经26分钟的H2O中的10-43% ACN的梯度洗脱化合物121 (29.5分钟)和化合物118 (30.1分钟)。冻干纯级分，以产生白色粉末。化合物121: 31P-NMR (DMSO-d6) 3.448 ppm; MS: m/z: 544 M-1; 化合物118: 31P-NMR (DMSO-d6) 3.538ppm; MS: m/z: 544 M-1。
实施例82
化合物120和119
通过RP-HPLC分离化合物8的非对映异构体。在Synergi Hydro RP 30x250 m 4u颗粒柱(Phenomenex PN 00G-4375-U0-AX)上经26分钟的H2O中的25-52% ACN的梯度洗脱化合物119 (24.8分钟)和化合物120 (25.3分钟)。冻干纯级分，以产生白色粉末。化合物119: 31P-NMR (DMSO-d6) 3.492 ppm; MS: m/z: 584 M-1。化合物120: 31P-NMR (DMSO-d6) 3.528ppm; MS: m/z: 584 M-1。
实施例83
化合物122, 双锂盐
使用与制备化合物2类似的程序使用丙氨酸苄酯盐酸盐合成化合物122-1。LCMS: m/z592 [M-1]-。
向122-1 (1.1 g, 1.85 mmol)于二氧杂环己烷(15 mL)和水 (3 mL)中的溶液中添加乙酸三乙铵水溶液(2M, 2mL, 4mmol)，随后添加Pd-C (10%, 100 mg)。将混合物氢化(气球)2小时，并通过HPLC监测。滤出催化剂，并将滤液浓缩至干燥。将残余物悬浮于过氯酸锂于丙酮中的3%溶液(25mL)中。通过过滤分离固体，用丙酮冲洗并在真空中干燥，以得到化合物122 (双锂盐)(731mg, 90%)。LCMS: m/z 426 [M-1]-。
实施例84
化合物151
通过与吡啶、随后与甲苯共同蒸发而使化合物108 (40 mg, 0.14 mmol)和双(新戊酰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.21mmol, 由80mg双(新戊酰基氧基甲基)磷酸盐和30μL Et3N制备)无水。将蒸发的残余物溶解于无水THF(2mL)中，并在冰浴中冷却。添加二异丙基乙胺(73μL, 3eq.)、BopCl (71mg, 2eq.)和3-硝基-1,2,4-三唑(32mg, 2eq.)。将混合物在0℃下搅拌90分钟。然后将混合物用EtOAc稀释，用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤并干燥(Na2SO4)。在硅胶柱上用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化，随后是RP-HPLC纯化(A: 水, B: MeCN)，产生化合物151 (13 mg, 16%). MS: m/z = 1167 (2M-1)。
实施例85
化合物159
向双(异丙基氧基羰基氧基乙基-1)磷酸三乙铵(0.28mmol, 由100mg双(异丙基氧基羰基氧基乙基-1)磷酸盐和40μL Et3N制备)于THF中的溶液中添加159-1 (60 mg, 0.18mmol)。蒸发混合物并通过与吡啶、随后与甲苯共同蒸发使其无水。将蒸发的残余物溶解于无水THF(2.5mL)中，并在冰浴中冷却。添加二异丙基乙胺(94μl，3eq.)，随后添加BOP-Cl(92 mg, 2 eq.)和3-硝基-1,2,4-三唑 (41 mg, 2 eq.)。将混合物在0℃下搅拌90分钟，用EtOAc稀释并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并干燥(Na2SO4)。在硅胶柱上用CH2Cl2/异-PrOH (3-10%梯度)纯化残余物，以产生159-2 (19 mg, 17%)。
将159-2 (19 mg, 0.03 mmol)于80% HCOOH水溶液中的溶液在室温下搅拌90分钟，然后浓缩。将残余物与甲苯、然后与含有少量Et3N(1滴)的MeOH共同蒸发。在硅胶柱上用CH2Cl2/MeOH (4-10%梯度)纯化，产生化合物159 (5 mg, 26%). MS: m/z = 629 [M-1]。
实施例86
化合物160
将苄基氧基羰基-L-缬氨酸(55 mg, 0.22 mmol)于THF (1 mL)和CDI (36 mg, 0.22mmol)中的混合物在室温下搅拌1.5小时，然后在40℃下搅拌20分钟。在80℃下，将溶液添加至化合物44 (122 mg, 0.2 mmol)和DMAP (3 mg, 0.03 mmol)于DMF (1.5 mL)和TEA(0.75 mL)中的混合物。将混合物在80℃下搅拌1小时。冷却后，将混合物浓缩，并将残余物分配于叔丁基甲基醚和水之间。将有机层用0.1N柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并干燥(Na2SO4)。在硅胶柱上用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化残余物，以产生作为无色泡沫的160-1 (83 mg, 50%)。
向160-1 (83 mg, 0.1 mmol)于EtOH中的溶液中添加HCl(4N, 在二氧杂环己烷中; 50 μL, 2 eq.)和10% Pd/C (5 mg)。将混合物在H2气氛(常压)下搅拌1小时。通过经由硅藻土垫过滤来去除催化剂，并蒸发滤液，以产生作为白色固体的化合物160 (50 mg)。MS:m/z = 702 [M+1]。
实施例87
化合物113
将化合物5-2 (32 mg, 0.1 mmol)溶解于干燥THF (3 mL)中并在0℃下添加溴化异丙基镁于THF中的2M溶液(0.1mL)。将反应物在室温下放置1小时，并添加(异丙基-L-丙氨酸基)硫代氯磷酸苯酯(0.3mmol)。将混合物在室温下放置过夜。LSMS分析显示约20%的未反应的起始材料。添加相同量的格氏试剂(Grignard reagent)和硫代氯磷酸酯，并将混合物在37℃下加热4小时。用NH4Cl淬灭反应物。将产物用EA萃取，用盐水洗涤，经Na2SO4干燥并蒸发。将所得油溶解于80%甲酸(4mL)中并蒸发1小时。通过RP HPLC在Synergy 4u Hydro-RP柱(Phenominex)上以水中的30%至95%的甲醇的梯度纯化化合物113，产生无色固体。化合物113 (7mg, 收率12.5%)。MS 560.0 (M-H)。
实施例88
化合物125
将化合物125-1 (109 mg)溶解于80% HCOOH (15mL)中并在室温下保持3小时，然后蒸发。将残余物在室温下用NH3/MeOH处理1小时以去除含有甲酰基的副产物。蒸发后，使用甲醇通过结晶来纯化化合物125以产生化合物125 (52 mg, 86%)。MS: 339.6 [M-1], 679.7(2M-1)。
实施例89
化合物148
在室温下用90% HOAc (150 mL)处理化合物148-1 (15.0 g, 25.55 mmol)。将混合物在110℃下搅拌12小时，然后在低压下浓缩。将残余物溶解于DCM中并将溶液用盐水洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥，然后在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的148-2 (11.0 g, 88.9%)。
将化合物148-2 (12.0 g, 24.79 mmol)在室温下用MeOH中的NH3 (200 mL, 7 M)处理。将溶液在室温下搅拌12小时，然后在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的10% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的148-3 (6.5 g, 95.0%)。
在0℃下，向148-3 (4.3 g, 15.58 mmol)、PPh3 (8.16 g, 31.15 mmol)、咪唑(2.11 g, 31.15 mmol)和吡啶(15 mL)于无水THF (45 mL)中的搅拌悬浮液中逐滴添加I2(7.91g, 31.15mmol)于THF(100mL)中的溶液。将混合物缓慢温热至室温并搅拌过夜。用MeOH (100mL)淬灭混合物。在低压下去除溶剂，并将残余物再溶解于EA和THF的混合物(0.2L, 10:1)中。用饱和Na2S2O3水溶液(2x)洗涤有机相。用EA和THF的混合物(0.2 L, 10:1,2x)萃取水相。将浓缩的有机相经无水Na2SO4干燥。在硅胶柱(DCM中的0-10% MeOH)上纯化残余物，以产生作为白色固体的148-4 (5.1 g, 85.0%)。
在室温下，在N2下，将化合物148-4 (800 mg, 2.07 mmol)溶解于DBU (4 mL)和THF (4 mL)的混合物中。将溶液在室温下搅拌1小时。将混合物用HOAc中和，并用EA和THF的混合物(10:1, 40 mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，并经无水Na2SO4干燥。将浓缩的有机相通过柱色谱法(DCM中的0-10% MeOH)纯化，以得到作为白色固体的148-5 (240 mg, 44.9%)。
在N2下，向148-5 (1.20 g, 4.65 mmol)于无水MeCN (12 mL)中的冰冷溶液中添加NIS (1.57 g, 6.97 mmol)和TEA•3HF (1.12 g, 6.97 mmol)。将混合物在室温下搅拌5小时。将反应物用饱和NaHCO3溶液淬灭，并用EA(3×100mL)萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发至干燥。在硅胶柱(DCM中的0-5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的148-6 (0.91 g, 48.6%)。
在室温下，向148-6 (1.2 g, 2.97 mmol)于无水DCM (12 mL)中的搅拌溶液中依次添加BzCl(0.83g, 5.94mmol)、TEA(0.6g, 5.94mmol)和DMAP(0.72g, 5.94mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。将反应物用水淬灭并用EA(3×60mL)萃取。在低压下浓缩有机相。通过柱色谱法(DCM中的0-5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的148-7 (1.2 g,66.2%)。
将氢氧化四丁基铵(25.78mL, 51.78mmol)用TFA(4.3mL)中和至pH=4，并将溶液添加至148-7 (1.09 g, 2.14 mmol)于DCM (30 mL)中的溶液中。在剧烈搅拌下逐份添加间-CPBA (1.85 g, 10.74 mmol)，并将混合物搅拌12小时。将混合物用EA(100mL)稀释，并用饱和碳酸氢钠洗涤。在低压下浓缩有机相。通过柱色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的148-8 (350 mg, 41.1%)。
在室温下用MeOH中的NH3处理化合物148-8 (280 mg, 0.704 mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。在低压下浓缩混合物。通过柱色谱法(DCM中的0-10% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的化合物148 (110 mg, 53.1%)。ESI-LCMS: m/z 295.1 [M+H]+。
实施例90
化合物150
向150-1 (10 g, 42 mmol)于无水MeCN (200 mL)中的冰冷溶液中添加TEA•3HF (10g, 62.5 mmol)和NIS (28 g, 126 mmol)。将混合物在室温下搅拌1.5小时，并通过LCMS监测。在反应完成之后，在低压下浓缩混合物。通过硅胶柱色谱法(DCM中的15% MeCN)纯化残余物，以得到作为黄色固体的150-2 (12 g, 74%)。
向150-2 (22 g, 57 mmol)于无水DCM (200 mL)中的溶液中添加DMAP (21 g,171 mmol)和BzCl (17.6 g, 125 mol)。将混合物在室温下搅拌5小时，并通过LCMS监测。将溶液用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤，并用EA萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的150-3 (30 g, 88%)。
向150-3 (6.5 g, 11 mmol)于无水DMF (270 mL)中的溶液中添加NaOBz (15.8g, 110 mmol)和15-丝醚-5 (29 g, 132 mmol)。将混合物在95℃下搅拌48小时。通过过滤去除沉淀物，并在低压下去除有机溶剂。将残余物溶解于EA(200mL)中，并用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为油的150-4 (3 g粗产物，46.1%)。
将化合物150-4 (3 g, 粗产物)用MeOH中的NH3(120mL, 7M)处理。将混合物搅拌3小时，并通过TLC监测。在低压下浓缩溶液。通过硅胶柱色谱法(DCM中的10%异丙醇)纯化残余物，以得到作为白色固体的150-5 (1.0 g, 67%)。1H-NMR (CD3OD, 400MHz) δ= 1.19(s,3H), 3.76-3.82 (m, 2H), 4.02 (d, J = 19.8 Hz, 1H), 5.70 (d, J = 8.07 Hz, 1H),6.27 (s, 1H), 7.89 (d, J = 8.07 Hz, 1H)。
将化合物150-5 (100 mg, 0.36 mmol)与甲苯共同蒸发3次。在0℃下，向150-5(100 mg, 0.36 mmol)于MeCN (1.0 mL)和NMI (295 mg, 3.6 mmol)的混合物中的搅拌溶液中添加150-C (255.6 mg, 0.72 mmol, 如下所述制备)于MeCN(0.5mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭，并用EA(20mL)稀释。用水和盐水洗涤有机层。将有机层经无水Na2SO4干燥。在低压下浓缩有机相。在硅胶柱(DCM中的5% 异-PrOH)上纯化残余物，以得到粗产物。通过制备型HPLC(水和MeCN中的0.1% HCOOH)纯化产物，以得到作为白色固体的化合物150 (46.7 mg, 23.3%)。ESI-LCMS: m/z 618 [M + Na]+。
在-78℃下，向150-A (2.0 g, 13.16 mmol)和萘-1-酚(1.89g, 13.16mmol)于无水DCM (100mL)中的搅拌溶液中逐滴添加TEA (1.33 g, 13.16 mmol)于DCM (20 mL)中的溶液。添加之后，将混合物逐渐温热至室温并搅拌2小时。将溶液冷却至-78℃，并添加DCM(20 mL)中的 (S)-2-氨基丙酸异丙酯盐酸盐(2.20g, 13.16mmol)，随后逐滴添加DCM(20mL)中的TEA(2.66g, 26.29mmol)。将混合物逐渐温热至室温，并搅拌2小时。在低压下去除有机溶剂。将残余物溶解于甲基-丁基醚中。过滤沉淀物，并在低压下浓缩滤液。在硅胶柱(无水DCM)上纯化残余物，获得作为无色油的150-C (1.0 g, 24.8%)。
实施例91
化合物152和153
在0℃下，向150-5 (300 mg, 1.08 mmol)和NMI (892 mg,10mmol)于无水MeCN (4 mL)中的溶液中逐滴添加152-C (736 mg, 2.17 mmol,如下所述制备)于无水MeCN(1mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭并用EA(30mL)稀释。用水和盐水洗涤有机层。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(DCM中的异PrOH，1%至5%)纯化残余物，以得到粗化合物152 (276 mg, 粗产物)。通过制备型HPLC(水和MeCN中的0.1%HCOOH)纯化粗化合物152 (96 mg)，以得到作为白色固体的纯化合物152 (46 mg, 47.9%)。ESI-LCMS: m/z 560 [M - F]+。
在0℃下，向化合物152 (180 mg, 0.31 mmol)于无水吡啶(6 mL)中的溶液中逐滴添加乙酸酐(158mg, 1.54mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将溶液用水淬灭并在低压下浓缩。将残余物溶解于EA(10mL)中并用盐水洗涤。经无水Na2SO4干燥有机层。在低压下浓缩有机相。通过硅胶柱(DCM中的异-PrOH，1%至3%)纯化残余物，以得到粗化合物153 (172mg)。通过制备型HPLC(水和MeCN中的0.1% HCOOH)纯化粗化合物153，以得到作为白色固体的纯化合物153 (46 mg, 23.8%)。ESI-LCMS: m/z 602.3 [M - F]+。
使用与150-C的制备类似的程序，使用150-A (2.00 g, 13.16 mmol)和4-氯苯酚(1.68 g, 13.16 mmol)制备化合物152-C (1.02 g, 23%, 无色油)。
实施例92
化合物165
向165-1 (5 g, 0.02 mol)、环戊酮(5.25 g, 0.06 mol, 4.5 eq.)和三甲氧基甲烷(6.52 g, 0.06 mol, 3 eq.)于MeCN (80 mL)中的溶液中添加TSOH•H2O (1.95 g, 0.01mol)。将混合物在80℃下加热过夜。在低压下浓缩混合物。通过柱色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色油的165-2 (3.8 g, 60%)。
在室温下，向165-2 (5 g, 0.16 mol)于MeCN (50 mL, 无水)中的溶液中添加IBX(5.33 g, 0.019 mol, 1.11 eq.)。将混合物在80℃下加热5小时。将混合物冷却至室温并过滤。浓缩滤液，以得到165-3 (4.5g, 纯度：90%)。
在室温下，向165-3 (5 g, 0.016 mol)和CH2O (3.6 mL)于1,4-二氧杂环己烷(50mL)中的溶液中添加NaOH溶液(11.3mL, 2N)。将混合物在室温下搅拌5小时。在0℃下添加NaBH4 (1.48g, 0.038mol)，并搅拌1小时。将反应物用H2O(30mL)淬灭并用EA(3×30mL)萃取。将有机层通过盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的50%EA)纯化残余物，以得到作为白色油的165-4 (2.1 g, 38%)。
在-35℃下，向165-4 (3 g, 0.0088 mol)和吡啶(3.51 mL, 5 eq.)于DCM (27mL)中的搅拌溶液中添加Tf2O(3.27mL, 0.019mol)。将混合物缓慢温热至0℃并在0℃下搅拌2小时。将混合物用饱和NaHCO3溶液洗涤，并用DCM (3×30mL)萃取。将有机层分离并通过盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的5% EA)纯化残余物，以得到作为白色油的165-5 (2.65 g, 39%)。
在0℃下，向165-5 (12.3 g, 0.02 mol)于DMF (20 mL)中的溶液中添加NaH(0.977g, 0.024mol)。将混合物在室温下搅拌3小时。将混合物用LiCl(2.6g, 0.062mol)处理，然后搅拌2小时。将反应物用H2O(20mL)淬灭并用EA(3×30mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色油的165-6 (3.11 g, 45%)。
在0℃下，向165-6 (12 g, 0.035 mol)于THF (120 mL)中的溶液中添加NaOH溶液(38.8mL, 0.038mol)，并在室温下搅拌3小时。将混合物用HCl(1.0N)溶液调节至pH=7，并用EA(3×80mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的165-7 (7.58 g, 60%)。
将165-7 (3 g, 8.0 mmol)与甲苯(30mL)共同蒸发。在0℃下，向165-7 (3 g)、DMAP (100 mg)和TEA (2.5 mL, 2 eq.)于DCM (30 mL)中的溶液中添加Bz2O(2.01g,1eq.)。将混合物在室温下搅拌3小时。将反应物用H2O淬灭，并用DCM (3×30mL)萃取。将DCM层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的5% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的165-8 (3.1 g, 80%)。
向165-8 (200 mg, 0.43 mmol)于CH3CN (2 mL, 无水)中的溶液中添加TPSCl(260mg, 2eq.)、TEA(0.13mL)和DMAP(106.4mg, 2eq.)。将混合物在室温下搅拌2小时。
将混合物用NH3•H2O (33%, 1.33 mL)处理，并在室温下搅拌2小时。将反应物用1NHCl(30mL)淬灭，并用DCM (3×30mL)萃取。将DCM层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的165-9 (85 mg, 50%)。
将165-9 (100 mg, 0.216 mmol)用HCOOH (7mL, 80%)处理，并在室温下搅拌3小时。在低压下浓缩混合物。通过柱色谱法(PE中的90% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的165-10 (51 mg, 60%)。
在-60℃下，将165-10 (270 mg, 0.68 mmol)用MeOH中的NH3(10mL)处理。将混合物温热至室温。将混合物在室温下搅拌6小时。在低压下浓缩混合物。通过反相HPLC纯化残余物，以得到作为白色固体的165 (60 mg, 30%)。
实施例93
化合物169
在室温下，向106 (200 mg, 0.67 mmol)于无水吡啶(5 mL)中的溶液中添加TBSCl(120mg, 0.8mmol)。将混合物搅拌过夜，并将反应混合物用EA稀释。用NaHCO3水溶液和盐水洗涤混合物。将有机层干燥，过滤并浓缩，以得到残余物，将其通过硅胶柱色谱法(DCM中的5% MeOH至DCM中的25% MeOH)纯化，以得到作为白色固体的169-1 (153 mg, 55%)。
在室温下，向169-1 (54 mg, 0.13 mmol)于无水DCM (2 mL)中的溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(95μL, 0.78mmol)、DMTrCl(262mg, 0.78mmol)和AgNO3(66mg, 0.39mmol)。将混合物搅拌过夜，然后用DCM (5ml)稀释。将混合物通过预装填的硅藻土漏斗过滤，并将滤液用NaHCO3水溶液、1.0M柠檬酸溶液、然后盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以得到残余物。通过硅胶柱色谱法(PE中的25% EA至100% EA)纯化残余物，以得到169-2 (83.5 mg, 63.6%)。
在冰浴温度下，向169-2 (83 mg, 0.081 mmol)于THF (1 mL)中的溶液中添加TBAF于THF中的1M溶液(0.122 mL, 0.122 mmol)。将混合物搅拌1.5小时。将混合物用EA稀释，并用水和盐水洗涤。将有机层干燥并浓缩，以得到粗产物，将其通过硅胶柱色谱法(DCM至DCM中的5% MeOH)纯化，以得到作为白色泡沫的169-3 (66.6 mg, 91%)。
将169-3 (66.6 mg, 0.074 mmol)与甲苯和THF共同蒸发(3x)。添加双(POC)磷酸盐(33mg, 0.96mmol)，然后与甲苯共同蒸发(3x)。将混合物溶解于无水THF(1.5mL)中并在冰浴(0至5℃)中冷却。依次添加3-硝基-1,2,4-三唑 (13 mg, 0.11 mmol)、二异丙基乙胺(54 μL, 0.3 mmol)和BOP-Cl (28 mg, 0.11 mmol)。将混合物在0至5℃下搅拌2小时，用EtOAc稀释，用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在二氧化硅(10g柱)上用CH2Cl2:异-PrOH (4-10%梯度)纯化残余物，以得到作为白色固体的169-4 (68mg, 76%)。
将169-4 (68 mg, 0.07 mmol)溶解于80% HCOOH中。将混合物在室温下搅拌2小时。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。将残余物溶解于50% CH3CN/H2O中，在反相HPLC(C18)上使用CH3CN和H2O纯化。冻干产物，以得到作为白色泡沫的169 (4.8 mg, 14%)。ESI-LCMS: m/z = 613.1 [M+H]+, 1225.2 [2M+H]+。
实施例94
化合物145
在室温(18℃)下，将AA-1 (2.20 g, 3.84 mmol)溶解于80% HCOOH (40mL)中。将混合物在室温下搅拌12小时。在低压下去除溶剂。通过柱色谱法使用己烷中的50% EA纯化残余物，以得到作为白色固体的AA-2 (1.05 g, 91.3%)。
在室温(16℃)下，在N2气氛下，向AA-2 (1 g, 3.32 mmol)于无水吡啶(20 mL)中的搅拌溶液中添加TBSCl(747mg, 4.98mmol)和咪唑(451mg, 6.64mmol)。将混合物在室温下搅拌4小时。将所得溶液在减压下浓缩至干燥，并将残余物溶解于EA(100mL)中。将溶液用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤，并经无水MgSO4干燥。将溶液浓缩至干燥，并在硅胶柱上使用己烷中的20% EA纯化残余物，以得到作为白色固体的AA-3 (1.4 g, 79.5%)。
在室温(15℃)下，向AA-3 (1.50 g, 2.83 mmol, 1.00 eq.)于无水CH3CN (28mL)中的搅拌溶液中添加TPSCl (1.71 g, 5.80 mmol, 2.05 eq.)、DMAP (691.70 mg,5.66 mmol, 2.00 eq.)和TEA (573.00 mg, 5.66 mmol, 2.00 eq.)。将混合物搅拌2小时。添加NH3.H2O (20 mL)，并将混合物搅拌3小时。用EA(3×60mL)萃取混合物。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的30% EA)上纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的AA-4 (2.3 g, 粗产物)。
在室温(15℃)下，在N2气氛下，向AA-4 (1.90 g, 2.34 mmol)于无水DCM (20 mL)中的搅拌溶液中添加DMTrCl(1.82g, 3.49mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(1.00g, 8.25mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。添加MeOH (20ml)。过滤混合物并将滤液浓缩至干燥。将残余物溶解于EA(80mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的AA-5 (1.4 g, 粗产物)。
将AA-5 (2.40 g, 2.60 mmol)溶解于TBAF(10mL, 1M，在THF中)。将混合物在室温(15℃)下搅拌30分钟。将混合物浓缩至干燥，并将残余物溶解于EA(60mL)中。将溶液用盐水洗涤，经MgSO4干燥并在减压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的AA (1.50 g, 95.8%)。ESI-MS: m/z 625.3 [M + Na]+。
在室温(15℃)下，在N2气氛下，向AA (60.0 mg, 99.57 μmol, 1.00 eq.)于吡啶(1 mL)中的溶液中以一份添加异丁酸酐(31.50mg, 199.13μmol, 2.00eq.)。将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物浓缩，并将残余物分配于EA和水之间。将合并的有机相用水和盐水洗涤，并经无水Na2SO4干燥。过滤混合物并将滤液浓缩至干燥。通过硅胶色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以提供作为白色固体的145-1 (59.00 mg, 79.77%)。
将145-1 (57.00 mg, 76.74 μmol, 1.00 eq.)溶解于80% CH3COOH (8mL)中。将溶液在室温(15℃)下搅拌12小时。将混合物浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的2.5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的145 (23.00 mg, 68.05%)。ESI-MS: m/z 441.2 [M+H]+, 463.2[M+Na]+。
实施例95
化合物170
以与145-1类似的方式使用吡啶(1mL)中的AA (60.00 mg, 99.57 μmol, 1.00 eq.)和丙酸酐(25.92 mg, 199.13 μmol, 2.00 eq.)制备170-1。170-1 (白色固体，56.00 mg,78.69%)。
以与145类似的方式使用170-1 (54.00 mg, 75.55 μmol, 1.00 eq.)制备170。170 (白色泡沫，18.00mg, 57.78%)。ESI-MS: m/z 413.1 [M+H]+。
实施例96
化合物171
以与145-1类似的方式使用吡啶(1mL)中的AA (62.00 mg, 102.89 μmol, 1.00 eq.)和戊酸酐(38.32mg, 205.77μmol, 2.00eq.)制备171-1。171-1 (白色固体，60.00mg,75.65%)。
以与145类似的方式使用171-1 (75.00 mg, 97.30 μmol, 1.00 eq.)制备171。171 (白色泡沫，28.00mg, 61.43%)。ESI-MS: m/z 469.2 [M+H]+。
实施例97
化合物146
以与169-4类似的方式，以类似方式在THF (0.4 mL)中由146-1 (50 mg, 0.087 mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸盐(58mg, 0.175mmol)与DIPEA (75 μL, 0.52mmol)、BOP-Cl (66.2 mg, 0.26 mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑 (30 mg, 0.26 mmol)制备146-2 (40.7 mg, 53%)。
将146-2 (40 mg, 0.045 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(34μL, 0.135mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时。添加无水EtOH (200μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。在二氧化硅(10g柱)用MeOH/CH2Cl2(5-7%梯度)纯化残余物并冻干，得到作为白色泡沫的146 (15.4 mg, 76%)。ESI-LCMS: m/z = 614.15 [M+H]+, 1227.2 [2M+H]+。
实施例98
化合物172
将172-1 (100 mg, 0.174 mmol)与无水吡啶(3x)、甲苯(3x)和CH3CN(3x)共同蒸发，并在高真空下干燥过夜。将172-1溶解于CH3CN(2mL)中。在0至5℃下添加质子海绵(112mg,0.52mmol)、POCl3(49uL, 0.52mmol)。将混合物在0至5℃下搅拌3小时，以得到中间体172-2。向该溶液中添加L-丙氨酸异丙酯盐酸盐(146mg, 0.87mmol)和TEA(114uL, 1.74mmol)。将混合物在0至5℃下搅拌4小时。将混合物在0至5℃下搅拌2小时，然后用EtOAc稀释。将混合物用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在二氧化硅(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH (0-7%梯度)纯化残余物，以得到作为白色固体的172-3 (67 mg, 43.7%)。
将172-3 (65 mg, 0.074 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(55μL, 0.22mmol)。将混合物在室温下搅拌1.5小时。添加第二部分的二氧杂环己烷中的4N HCl(15μl)，并将混合物在室温下搅拌2小时。添加无水EtOH(300μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。将残余物溶解于50% CH3CN/H2O中，在反相HPLC(C18)上用CH3CN和水纯化，并冻干，以得到作为白色泡沫的172 (9 mg, 20%)。ESI-LCMS: m/z = 608.15 [M+H]+, 1215.3 [2M+H]+。
实施例99
化合物173
在-75℃下，经1小时将173-1 (4.7 g, 11.2 mmol;根据Villard等人, Bioorg. Med. Chem. (2008) 16:7321-7329的程序制备)和Et3N(3.4mL, 24.2mmol)于THF(25mL)中的溶液逐滴添加至N,N-二氯磷酸二异丙酯(1.0mL, 5.5mmol)于THF(35mL)中的搅拌溶液中。将混合物在室温下搅拌4小时。过滤混合物，并浓缩滤液。在硅胶柱上用EtOAc/己烷(2-20%梯度)纯化油状残余物，以得到173-3 (1.4 g, 26%)。
向173-2 (50 mg, 0.08 mmol)和173-3 (110 mg, 0.11 mmol)于CH3CN (1.0 mL)中的溶液中添加5-(乙硫基)四唑(0.75mL, 0.16mmol; 0.25M, 在CH3CN中)。将混合物在室温下搅拌1小时。将混合物冷却至-40℃，并添加3-氯过氧苯甲酸(37mg, 0.16mmol)于CH2Cl2(0.3mL)中的溶液。经1小时将混合物温热至室温。用7% Na2S2O3于饱和NaHCO3水溶液中的溶液淬灭反应物。用EtOAc稀释混合物，并分离层。将有机层用盐水洗涤并用Na2SO4干燥。蒸发溶剂，并在硅胶柱上用EtOAc/己烷(30-100%梯度)纯化残余物，以得到173-4 (52 mg,45%)。
将173-4 (52 mg, 0.036 mmol)于MeCN (0.5 mL)和HCl (45 μL; 4 N，在二氧杂环己烷中)中的溶液在室温下搅拌20小时。用MeOH淬灭反应物，并蒸发溶剂。将残余物与甲苯共同蒸发并在硅胶柱上用MeOH/CH2Cl2(4-10%梯度)纯化，以得到173 (14 mg, 51%)。ESI-LCMS: m/z = 702 [M+H]+。
实施例100
化合物174
通过与吡啶蒸发而使174-1 (0.14 g, 0.24 mmol; 根据2007年12月28日提交的WO2008/082601中所述的程序制备)和173-2 (120 mg, 0.2 mmol)的混合物无水，然后溶解于吡啶(3mL)中。在-15℃下逐滴添加新戊酰氯(48μl)。将混合物在-15℃下搅拌2小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭并用CH2Cl2稀释。将有机层用盐水洗涤并用Na2SO4干燥。蒸发溶剂，并在硅胶柱上用EtOAc/己烷(30-100%梯度)纯化残余物，以得到174-2 (50 mg, 24%)。
将174-2 (43 mg; 0.04 mmol)于CCl4(0.8mL)、L-缬氨酸异丙酯盐酸盐(20mg,0.12mmol)和Et3N(33μl，0.24mmol)中的混合物在室温下搅拌2小时。用EtOAc稀释混合物。将混合物用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。蒸发溶剂，并将残余物在硅胶柱上用异-PrOH/CH2Cl2(2-10%梯度)纯化为174-3 (35 mg, 75%)。
将174-3 (35 mg, 0.03 mmol)于MeCN (0.4 mL)和HCl(40μL; 4N, 在二氧杂环己烷中)中的溶液在室温下搅拌4小时。采用添加MeOH淬灭反应物，并蒸发溶剂。将残余物与甲苯共同蒸发并在硅胶柱上用MeOH/CH2Cl2(4-10%梯度)纯化，以得到174 (11 mg, 56%).ESI-LCMS: m/z = 655 [M+H]+。
实施例101
化合物175
在室温(17℃)下，在N2气氛下，向AA (300.0 mg, 497.83 μmol)于无水吡啶(0.5 mL)中的搅拌溶液中添加DMTrCl(337.36mg, 995.66μmol)。将溶液在50℃至60℃下搅拌12小时。将混合物在减压下浓缩至干燥，并将残余物溶解于EA(40mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水MgSO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱上使用PE中的20% EA纯化残余物，以得到作为白色固体的175-1 (300 mg, 66.59%)。
在室温(18℃)下，在N2气氛下，向175-1 (100.00 mg, 110.50 μmol)于无水吡啶(0.5 mL)中的搅拌溶液中添加DMAP(6.75mg, 55.25μmol)、DCC(22.80mg, 110.50μmol)和正辛酸(31.87mg, 221.00μmol)。将溶液在室温下搅拌12小时。将溶液在减压下浓缩至干燥。在硅胶柱上使用PE中的15% EA纯化残余物，以得到作为白色泡沫的175-2 (98.00 mg,86.0%)。
在室温(16℃)下将175-2 (90.00 mg, 87.28 μmol)溶解于80% CH3COOH (20mL)中。将混合物在室温下搅拌12小时。将反应物用MeOH淬灭，并将混合物浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的175 (33.00 mg, 88.7%)。ESI-MS: m/z 427.2 [M+H]+。
实施例102
化合物176
在20℃下，在N2下，向BB-1 (500.00 mg, 0.87 mmol)于无水吡啶(1 mL)中的搅拌溶液中添加TBSCl(236.5mg, 1.57mmol)。将溶液在50℃至60℃下搅拌12小时。将溶液在减压下浓缩至干燥。将残余物溶解于EA(50mL)中。将溶液用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤，并经无水MgSO4干燥。过滤溶液并将滤液浓缩至干燥。在硅胶柱上纯化残余物，以得到作为白色固体的BB-2 (510.00 mg, 85.06%)。
在室温下，向BB-2 (430.00 mg, 625.15 mmol)于无水MeCN (6 mL)中的搅拌溶液中添加TPSCl(368.65mg, 1.25mmol)、DMAP(152.75mg, 1.25mmol)和TEA(126.52mg,1.25mmol)。将混合物搅拌2小时。添加NH4OH (8mL)，并将混合物搅拌3小时。用EA(3×40mL)萃取混合物。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的25% EA)上纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的BB-3 (500mg粗产物)。
在室温(15℃)下，在N2气氛下，向BB-3 (500mg粗产物，0.72mmol)于无水DCM(7mL)中的搅拌溶液中添加DMTrCl(365mg, 1.0mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(305mg,2.5mmol)以及AgNO3(184mg, 1.08mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。添加MeOH (5mL)。过滤混合物并将滤液浓缩至干燥。将残余物溶解于EA(50mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的BB-4 (500 mg, 70.3%)。
将BB-4 (1.00 g, 1.01 mmol)溶解于TBAF(5mL, 1M, 在THF中)中，并在室温下搅拌30分钟。用EA(100mL)稀释混合物。将混合物用水和盐水洗涤，并经无水MgSO4干燥。将有机相浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的30% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的BB(0.80 g, 91.5%)。ESI-MS: m/z 873.7 [M+1]+。
在室温(18℃)下，在N2气氛下，向BB (100.00 mg, 114.29 μmol)于无水吡啶(1.5mL)中的溶液中添加DMAP(2.79mg, 22.86μmol)、DCC(70.75mg, 342.88μmol)和正辛酸(49.45mg, 342.88μmol)。将溶液在室温下搅拌12小时。将溶液在减压下浓缩至干燥。在硅胶柱上使用PE中的15% EA纯化残余物，以得到作为白色泡沫的176-1 (95.00 mg,83.03%)。
在室温(15℃)下，将176-1 (110.00 mg, 109.87 μmol)溶解于80% CH3COOH(25mL)中。将混合物搅拌12小时。将反应物用MeOH淬灭，并将溶液浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的176 (30.00 mg, 64.03%)。ESI-MS: m/z 427.2 [M+H]+。
实施例103
化合物177
以与143-1类似的方式使用BB (250.0 mg, 276.25 μmol)、(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基-丁酸(360.11 mg, 1.66 mmol)和TEA (83.86 mg, 828.75 μmol)制备177-1。177-1 (白色泡沫，220.0mg, 72.12%)。
以与143-2类似的方式使用177-1 (230.00 mg, 208.29 μmol, 1.00 eq.)制备177-2。177-2 (白色泡沫，80.00mg, 77.66%)。
以与143类似的方式使用177-2 (100.00 mg, 200.20 μmol, 1.00 eq.)制备177。177 (白色固体，56mg, 59.57%)。ESI-MS: m/z 400.0 [M+H]+, 422.1[M+Na]+; 799.1 [2M+H]+, 821.2[2M+Na]+。
实施例104
化合物178
在0℃(冰/水浴)下，向178-1 (100 mg, 0.175 mmol)于无水CH3CN (2.0 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑 (0.14 mL, 1.4 mmol)。添加178-2的溶液(220mg, 0.53mmol, 溶解于0.5mL CH3CN中)(根据Bondada, L.等人, ACS Medicinal Chemistry Letters (2013) 4(8):747-751中所述的通用程序制备)。将溶液在0至5℃下搅拌1小时，然后在室温下搅拌16小时。将混合物冷却至0至5℃，用EA稀释，随后添加水(5ml)。将溶液用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用MgSO4干燥。在二氧化硅(10g柱)上用EA/己烷 (25-100%梯度)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的178-3 (56.4 mg, 33.7 %)。
将178-3 (56mg, 0.0585 mmol)溶解于无水CH3CN(0.7mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(44μL,0.176mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。添加二氧杂环己烷中的4N HCl(20μL)。将混合物在室温下搅拌2小时。添加无水EtOH (100μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。在二氧化硅(10g柱)上用MeOH/CH2Cl2(1-7%梯度)纯化残余物并冻干，以得到作为白色泡沫的178 (27.6 mg, 69%)。ESI-LCMS: m/z = 685.2[M+H]+。
实施例105
化合物179
在0℃下，向179-1 (1.92 g, 27.3 mmol)、PPh3 (1.43 g, 54.7 mmol)、EtOH (0.25g, 54.7 mmol)于无水二氧杂环己烷(20 mL)中的搅拌溶液中逐滴添加DIAD(1.11g,54.7mmol)。将溶液在25℃下搅拌15小时。将反应物用水淬灭并用EA萃取。用水和盐水洗涤混合物。将有机层经Na2SO4干燥并过滤。将滤液在真空中浓缩至干燥，并在硅胶柱(DCM中的2%至5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的179-2 (1.43 g, 71%)。
在0℃下，向179-2 (1.43 g, 19.6 mmol)于DMF (15 mL)中的搅拌溶液中添加TEA(0.59g, 58.8mmol)和DMTrCl(0.99g, 29.4mmol)。将溶液在25℃下搅拌12小时。将混合物用MeOH (1mL)处理，并用EA稀释。用水和盐水洗涤溶液。将有机层经无水NaSO4干燥，并浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的2% MeOH)上纯化残余物，以得到作为黄色固体的179-3 (1.13g, 56%)。
向179-3 (1.13 g, 1.1mmol)于无水吡啶(10 mL)中的搅拌溶液中添加TBDPSCl(0.91g, 3.3mmol)和AgNO3(0.61g, 3.3mmol)。将混合物在25℃下搅拌15小时。通过过滤去除固体，并用EA(50mL)稀释滤液。将溶液用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的2% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的179-4 (1.22g, 88 %)。
在-78℃下，向179-4 (1.22 g, 1.0 mmol)于无水DCM (15 mL)中的搅拌溶液中添加Cl2CHCOOH (0.6mL)。将混合物在-20℃下搅拌1小时。将反应物用饱和NaHCO3水溶液淬灭，并用DCM萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的2%MeOH)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的179-5 (0.52 g, 56%)。
在0℃下，向179-5 (0.52 g, 0.5 mmol)于无水DCM (15 mL)和吡啶(0.21 g, 2.5mmol)中的搅拌溶液中逐滴添加DCM (1mL)中的Tf2O(0.30g, 1.0mmol)。将混合物在0℃下搅拌15分钟。用冰水淬灭反应物。将有机层分离并用水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩，以得到作为黄色泡沫的179-6（442 mg粗产物)。
向179-6 (442 mg, 0.4 mmol)于无水DMF (5 mL)中的搅拌溶液中添加NaN3(131mg, 2.0mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。将反应物用水淬灭并通过EA(20mL,2x)萃取。将有机层用水洗涤并经Na2SO4干燥。将有机相在减压下蒸发至干燥。在硅胶柱(DCM中的1% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的179-7 (352 mg, 88%)。
将179-7 (352 mg, 0.35 mmol)和NH4F (392 mg, 10.6 mmol)于MeOH (10 mL)的混合物在80℃下搅拌12小时。将混合物冷却至室温。通过过滤去除固体。在减压下浓缩溶剂。在硅胶柱(DCM中的2%至5% MeOH)上纯化残余物，以得到粗179-8 (151 mg)。通过制备型HPLC(水和CH3CN中的0.1% NH4HCO3)纯化粗产物，以得到作为白色固体的179-8 (71.5 mg,32%)。MS: m/z 641[M+H]+。
通过与甲苯蒸发而使179-8 (64 mg, 0.1 mmol)和双(新戊酰基氧基甲基)磷酸盐的混合物无水后，将其溶解于CH3CN(1mL)中并冷却至0℃。添加BopCl (40 mg, 0.15 mmol)和NMI (40 μL, 0.5 mmol)。将混合物在0℃下搅拌2小时。添加EtOAc，并将混合物用0.5N柠檬酸水溶液、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，然后用Na2SO4干燥。去除溶剂，并将残余物在硅胶柱上用CH2Cl2中的3% 异-PrOH纯化为179-9 (38 mg, 40%)。
将179-9 (30 mg, 0.03 mmol)于CH3CN (0.3 mL)和HCl(30μL; 4N，在二氧杂环己烷中)中的溶液在室温下搅拌100分钟。用EtOH淬灭反应物，并蒸发混合物。在硅胶柱上用异-PrOH/CH2Cl2 (3-10%梯度)纯化粗残余物，以产生179 (10 mg, 50%). ESI-LCMS: m/z =681 [M+H]+。
实施例106
化合物180
在0至5℃下，向BB (100 mg, 0.114 mmol)于无水CH3CN (2 mL)中的溶液中逐滴添加双-SATE-氨基磷酸酯(62.2mg, 0.14mmol)于CH3CN(1mL)中的溶液，随后逐滴添加CH3CN中的5-乙硫基-1H-四唑(0.25M; 0.56 mL, 0.14 mmol)。在0至5℃下，在Ar下，将混合物搅拌2小时。添加77% 间-CPBA (49 mg, 0.22 mmol)于DCM (1 mL)中的溶液，并在0至5℃下，在Ar下，将混合物搅拌2小时。将混合物用EtOAc(50mL)稀释，用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3和盐水洗涤，并用MgSO4干燥。过滤混合物并在真空中蒸发溶剂。在二氧化硅(10g柱)上用EA/己烷(10-100%梯度)纯化残余物，以得到作为白色固体的180-1 (72 mg, 50.8 %)。
将180-1 (72 mg, 0.056 mmol)溶解于无水CH3CN(1.0mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(87μL,0.35mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。通过LCMS观察中间体180-2。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。将获得的残余物再溶解于80%HCOOH (2mL)中。将混合物在室温下搅拌4.5小时。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。添加无水EtOH (3×5mL)。将残余物溶解于50% CH3CN/H2O中，在反相HPLC(C18)上使用CH3CN和H2O纯化，并冻干，以得到作为白色泡沫的180 (19.2 mg)。ESI-LCMS: m/z = 669.2[M+H]+, 1337.25 [2M+H]+。
实施例107
化合物181
以与169-4相同的方式，以相同方式在THF (1.5 mL)中由BB (100 mg, 0.114 mmol)和双(叔丁氧基羰基氧基甲基)磷酸盐(83mg, 0.35mmol)与DIPEA (126 μL, 0.69 mmol)、BOP-Cl (87 mg, 0.34 mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑 (39 mg, 0.34 mmol )制备181-1 (98mg, 72.6 %)。
以与146相同的方式，由181-1 (98 mg, 0.083 mmol)制备181 (30.2 mg, 60%)。ESI-LCMS: m/z = 609.15 [M+H]+, 1217.3 [2M+H]+。
实施例108
化合物182和183
如2014年6月27日公开的PCT公开WO 2014/96680中所述制备化合物182, 182aa,182ab和183。182: ESI-LCMS: m/z 554.0 [M+H]+; 182aa和182ab: 较快洗脱的非对映异构体 - 31P NMR 67.1, LC/MS 552 [M–1]。较慢洗脱的非对映异构体 - 31P NMR 67.9,LC/MS 552 [M–1]. 183: ESI-MS: m/z 576.9 [M+H]+。
实施例109
化合物186-201
如2014年6月27日公开的PCT公开WO 2014/96680中所述制备化合物186-201。186:ESI-LCMS: m/z 593.0 [M+H]+。187: ESI-LCMS: m/z 614.1 [M+H]+。188: ESI-LCMS: m/z582.1 [M+H]+。189: ESI-LCMS: m/z 596.1 [M+H]+。190: ESI-LCMS: m/z 672.0 [M+H]+。191: ESI-LCMS: m/z 589.0 [M+H]+。192: ESI-LCMS: m/z 606.0 [M+H]+。193: ESI-LCMS:m/z 604.1 [M+H]+。194: ESI-LCMS: m/z 568 [M+H]+, 590 [M+Na]+。195: ESI-LCMS: m/z680 [M+H]+。196: ESI-LCMS: m/z 578.0 [M+Na]+。197: ESI-MS: m/z 633.1 [M+H]+。198:ESI-LCMS: m/z 604 [M+Na]+, 582 [M+H]+。199: ESI-LCMS: m/z 582.0 [M+H]+。200:ESI-LCMS: m/z 618 [M+Na]+。201: ESI-LCMS: m/z 568.1 [M+H]+。
实施例110
化合物204
用于制备化合物204的方法提供于2009年8月4日提交的WO 2010/015643中。
实施例111
化合物206
将206-1 (1.0 g, 3.53 mmol)与无水吡啶共同蒸发3次以去除H2O。在0℃下，向206-1于无水吡啶中的冰冷溶液(9mL)中逐滴添加吡啶(3mL)中的TsCl(808mg, 4.24mmol)，并将混合物在0℃下搅拌18小时。通过LCMS监测反应物，然后用H2O淬灭。在低压下浓缩后，将残余物溶解于EA(50mL)中。用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下蒸发滤液，并通过硅胶柱色谱法(DCM中的1% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的206-2 (980 mg, 63 %)。
向206-2 (980 mg, 2.24 mmol)于丙酮(10 mL)中的溶液中添加NaI(1.01g,6.73mmol)，并将混合物加热至回流过夜。通过LCMS监测反应物。在反应完成之后，在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EA(50mL)中。将溶液用盐水洗涤，并经无水Na2SO4干燥。在低压下蒸发溶液，并通过硅胶柱色谱法(DCM中的1% MeOH)纯化残余物，以得到作为固体的206-3(700 mg, 79 %)。
向206-3 (700 mg, 1.78 mmol)于干燥THF (9 mL)中的溶液中添加DBU(817mg,5.34mmol)，并将混合物加热至60℃。将混合物搅拌过夜，并通过LCMS监测。将反应物用饱和NaHCO3淬灭并用EA(3×50mL)萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下蒸发滤液，并通过硅胶柱色谱法(DCM中的1% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的206-4 (250mg, 53 %)。
向206-4 (250 mg, 0.94 mmol)于干燥MeCN (5mL)中的冰冷溶液中添加NEt3·3HF (151 mg, 0.94 mmol)和NIS (255 mg, 1.13 mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时，并通过LCMS检查。将反应物用饱和Na2S2O3和饱和NaHCO3溶液淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM中的2%丙酮)纯化残余物，以得到206-5 (170 mg, 44 %)。
向206-5 (270 mg, 0.65 mmol)于干燥DCM (4 mL)中的溶液中添加DMAP(158.6mg, 1.3mmol)和BzCl(137mg, 0.98mmol)。将混合物在室温下搅拌4-5小时，并通过LCMS检查。将混合物用CH2Cl2稀释，并用饱和NaHCO3溶液和盐水洗涤。在低压下蒸发有机层，并通过硅胶柱色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为固体的206-6 (290 mg, 86%)。
向206-6 (900 mg, 1.74 mmol)于干燥DMF (45 mL)中的溶液中添加NaOBz(2.5g,17.4mmol)和15-丝醚-5(4.5g, 20.9mmol)。将混合物在90-100℃下搅拌48小时。将混合物用EA(100mL)稀释，并用盐水洗涤。在低压下蒸发有机层，并通过硅胶柱色谱法(PE中的20%EA)纯化残余物，以得到作为固体的206-7 (500 mg, 56 %)。
在室温下，向206-7 (500 mg, 0.98 mmol)于无水CH3CN (5 mL)中的溶液中添加TPSCl(741mg, 2.45mmol)、DMAP(299.6mg, 2.45mmol)和NEt3(248mg, 2.45mmol)，并将混合物搅拌过夜。然后将混合物用THF中的NH3 (5mL)处理，然后再搅拌30分钟。用EA(100mL)稀释混合物。用0.5% AcOH溶液洗涤溶液。将有机溶剂经无水MgSO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM中的2%丙酮)纯化粗产物，以得到作为白色固体的206-8 (257 mg,51.6 %)。ESI-MS: m/z 509 [M+H]+。
将206-8 (80 mg, 0.16 mmol)溶解于正丁胺(3mL)中。将混合物在室温下保持过夜并蒸发。将残余物从甲醇中结晶，以得到206 (30 mg)。在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC纯化母液。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至30%的甲醇的线性梯度来洗脱。将相应级分合并，浓缩并冻干3次以去除过量缓冲液，以产生额外的206 (13 mg)。206 (总收率43mg, 73%)。MS: m/z 299.7 [M-1]-。
实施例112
化合物207
将207-1 (30 mg, 0.1 mmol)溶解于CH3CN (2 mL)和N-甲基咪唑(200 uL)的混合物中。添加氯磷酸酯(100mg, 0.3mmol)，并将混合物在室温下保持5天。将混合物分配于水和EA之间。将有机层分离，用盐水洗涤，干燥并蒸发。通过硅胶色谱法以DCM中的甲醇的3%至10%的梯度分离氨基磷酸酯。将相应级分浓缩，并在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC再纯化。使用DCM中的甲醇的3%至95%的线性梯度(含有0.1%甲酸)进行洗脱。获得作为混合物Rp和Rs 异构体的207 (9mg, 16%)。MS: m/z 562.1[M-1]-。
实施例113
化合物211
在-78℃下，向211-1 (23.0 g, 39.5 mmol)于无水甲苯(200 mL)中的溶液中逐滴添加DAST(31.9g, 198mmol)，并将溶液在-78℃下搅拌3小时。将混合物用饱和NaHCO3淬灭，用EA(2×200mL)萃取并用无水Na2SO4干燥。将溶液在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的50%EA)上纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的211-2 (16.5 g, 71%)。
将211-2 (16.0 g, 27.4 mmol)和NH4F (3.0 g, 82.2 mmol)于甲醇(100 mL)中的混合物在70℃下搅拌12小时。冷却反应物，并通过过滤去除盐。将滤液在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的3% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的211-3 (5.1 g,69.0%)。
在0℃下，向211-3 (4.1 g, 15.2 mmol)、PPh3 (8.0 g, 30.4 mmol)、咪唑 (2.1g, 30.4 mmol)和吡啶(18.2 mL)于无水THF (40 mL)中的搅拌悬浮液中逐滴添加I2(5.8g,22.8mmol)于THF(20mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌12小时。用MeOH (100mL)淬灭反应物，并在减压下去除溶剂。在硅胶柱(DCM中的4% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的纯211-4 (4.4 g, 77%)。ESI-MS: m/z 381.1 [M+1]+。
在室温下，向211-4 (2.5 g, 0.7 mmol)于无水THF (3 mL)中的搅拌溶液中添加DBU(2.1g, 14mmol)，并将混合物在室温下搅拌1小时。将反应物用HOAc淬灭，并用2-Me-四氢呋喃稀释。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的211-5 (1.1 g, 68.9%)。
在0℃下，向211-5 (800 mg, 3.17 mmol)于无水CH3CN (10 mL)中的搅拌溶液中添加TEA•3HF (510 mg, 3.17 mmol)和NIS (785 mg, 3.49 mmol)。将混合物搅拌30分钟，逐渐温热至室温，并搅拌1小时。将混合物用饱和NaHCO3溶液和Na2S2O3溶液淬灭，并用EA(2×20mL)萃取。将有机层用无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱上纯化残余物，以得到作为黄色固体的纯211-6 (695 mg, 57.9%)。
在0℃下，向211-6 (650 mg, 1.63 mmol)于吡啶(3 mL)中的搅拌溶液中添加BzCl(507mg, 3.59mmol)，并在室温下搅拌12小时。将混合物用水淬灭，并在减压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的50% EA)上纯化残余物，以产生作为白色泡沫的211-7 (550 mg, 67%)。
将氢氧化四丁铵(9mL, 作为54-56%水溶液，72mmol)用TFA中和至pH~4 (1.5 mL)，并将混合物添加至211-7 (375 mg, 0.75 mmol)于DCM (9 mL)中的溶液中。在剧烈搅拌下，分份添加间氯过苯甲酸(924 mg, 60-70%, 3.75 mmol)，并将混合物搅拌过夜。将混合物用盐水洗涤，经硫酸镁干燥并在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的211-8 (230 mg, 78.8%)。ESI-MS: m/z 393.1 [M+1]+。
将211-8 (120 mg, 0.24 mmol)用7N NH3•MeOH (20 mL)处理，并搅拌5小时。将混合物在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的15%丙-2-醇)上纯化残余物，以产生作为白色固体的211 (53 mg, 60.2%)。ESI-MS: m/z 288.8 [M+1]+。
实施例114
化合物212a和212b
在0℃下，向212-1 (0.47 g, 0.65 mol)于DCM (3 mL)中的溶液中添加AgNO3(0.22g,1.29mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(0.15g, 1.29mmol)和MMTrCl(0.3g, 0.974mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。过滤混合物，并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤过滤器。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，以得到作为白色固体的212-2 (0.55, 85%)。
向212-2 (0.5 g, 0.5 mmol)于干燥DMF (10 mL)中的溶液中添加NaOBz(0.72g,5mmol)和15-丝醚-5(0.9mL)。将混合物在95℃下搅拌72小时。将混合物用EA稀释，并用水和盐水洗涤。将有机相经MgSO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的10% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的212-3 (0.3 g, 60%)。
将NH3/MeOH (30 mL)中的212-3 (0.3 g, 0.3 mmol)在室温下搅拌18小时。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的212-4(145 mg, 56%)。ESI-LCMS: m/z 890.5 [M+H]+。
在0至5℃(冰/水浴)下，向212-4 (161 mg, 0.16 mmol)于无水CH3CN (2.0 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(118μL, 2.87mmol)，随后添加212-5的溶液(186mg,0.54mmol, 溶解于2mL CH3CN中)。将溶液在0至5℃下搅拌4小时。将混合物用EA稀释，并添加水(15mL)。用H2O、50%柠檬酸水溶液和盐水洗涤溶液。将有机层分离，经无水MgSO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液以得到残余物，将其在硅胶上用0至40% EA/己烷纯化，以得到作为较快洗脱的异构体的212-6 (82.6 mg)和作为较慢洗脱的异构体的212-7 (106 mg)。
将212-6 (82.6 mg, 0.07 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(35μL)。将混合物在室温下搅拌1小时，并添加无水EtOH (100μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发3次。将残余物溶解于50% CH3CN/H2O中，并在反相HPLC(C18)上使用乙腈和水纯化，随后冻干，以得到212a (19.4 mg)。ESI-LCMS: m/z =655.2 [M+H]+, 653.15 [M-H]-。
将212-7 (100 mg, 0.083 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(50μL)。遵循用于获得212a的程序，获得212b (31.8 mg)。ESI-LCMS: m/z = 655.2 [M+H]+, 653.1 [M-H]-。
实施例115
化合物213
在0℃下，在N2下，向核苷(300mg, 1.09mmol)和质子海绵(467mg, 2.18mmol)于无水CH3CN(5mL)中的溶液中逐滴添加磷酰氯(330 mg, 2.18 mmol)于无水CH3CN (1 mL)中的溶液。将混合物在0℃下搅拌30分钟，并在0℃下添加(S)-2-氨基丙酸乙酯的盐酸盐(998mg,6.52mmol)和三乙胺(1.5mL, 10.87mmol)。将混合物在30℃下搅拌过夜。将反应物用水淬灭并用EA(3×20mL)萃取。在低压下浓缩有机层，并通过反相HPLC纯化残余物，以得到作为白色固体的213 (20 mg, 3%)。ESI-LCMS: m/z 535 [M-F]+。
实施例116
化合物214
将核苷(140mg, 0.42mmol)溶解于正丁胺(0.5mL)中。将混合物在室温下保持2小时，然后蒸发胺。将残余物溶解于EtOAc中，并将有机层用10%柠檬酸洗涤两次，经Na2SO4干燥并蒸发。通过硅胶柱色谱法以DCM中的0%至12%的甲醇的线性梯度经10个柱体积纯化残余物。将含有产物的级分浓缩并在室温下用80% HCOOH处理1小时。将混合物蒸发至干燥，并悬浮于CH3CN中。将沉淀物分离，用CH3CN(1mL)洗涤并干燥，以产生214 (27 mg, 50%). MS: m/z326.5 [M-1]-。
实施例117
化合物216
在0℃下，向216-1 (3.0 g, 18.0 mmol)和POCl3 (1.35 g, 9.0 mmol)于DCM (80 mL)中的溶液中逐滴添加DCM (20mL)中的TEA(3.6g, 36.0mmol)。将混合物在0℃下搅拌2小时。在0℃下，逐滴添加五氟苯酚(1.65g, 9.0mmol)和TEA(0.9g, 9.0mmol)于DCM (20mL)中的溶液，并将混合物在0℃下搅拌15小时。反应完成之后，在减压下将混合物浓缩。将残余物通过TBME洗涤并过滤。在减压下浓缩滤液，并通过硅胶色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的216-2 (2.7 g, 62.7%)。ESI-MS: m/z 491.1 [M+1]+。
在0℃下，向1-((3aR,4R,6S,6aS)-6-氟-6-(羟基甲基)-2-甲氧基-3a-甲基四氢呋喃并[3,4-d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(150 mg, 0.47 mmol)于无水THF (2 mL)中的搅拌溶液中逐滴添加叔-BuMgCl的溶液(0.46mL, 1M, 在THF中)。将混合物在室温下搅拌40分钟，并再冷却至0℃。添加216-2的溶液(462 mg, 0.94 mmol)，并将混合物在室温下搅拌4小时。将混合物用H2O淬灭，并用EA萃取。将有机层经Na2SO4干燥并在减压下浓缩。在硅胶柱(PE中的50% EA)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的216-3 (230mg,78%)。
将216-3 (230 mg, 0.37 mmol)溶解于80% HCOOH水溶液(20mL)中，并将混合物在室温下搅拌24小时。在低压下去除溶剂。在硅胶柱上纯化残余物，以得到粗产物，将其通过RP HPLC(HCOOH体系)纯化，以得到作为两种P-异构体的混合物的216(75 mg, 33%). ESI-TOF-MS: m/z 583.0 [M+H]+。
实施例118
化合物218
将218-1 (30 mg, 0.1 mmol)溶解于CH3CN (2 mL)和N-甲基咪唑(200 uL)的混合物中。添加氯磷酸酯(100mg, 0.3mmol)，并将混合物在40℃下保持过夜。将温度升高至65℃并加热1小时。将混合物分配于水和EA之间。将有机层分离，用盐水洗涤，干燥并蒸发。在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC纯化叠氮基-氨基磷酸酯。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的30至100%的甲醇的线性梯度进行洗脱。将叠氮基-氨基磷酸酯(8mg)溶解于吡啶/Et3N (3 mL, 8:1 v/v)中并冷却至0℃。将H2S气体鼓泡通过溶液10分钟，并将反应物在室温下保持1小时。蒸发溶剂，并通过RP HPLC分离残余物。将相应级分合并，浓缩并冻干3次以去除过量缓冲液，以提供作为混合物Rp和Rs 异构体的218(1.2 mg)。MS: m/z 544.1 [M+1]+。
实施例119
化合物219
在室温下向IBX (133.33 g, 476 mmol)于干燥CH3CN (2 L)中的溶液中添加219-1(100.0 g, 216 mol)。将混合物回流并搅拌12小时。过滤混合物，并在低压下浓缩滤液，以得到作为黄色油的219-2 (90.0g, 90.4%)。
将219-2 (50.0 g, 108.70 mmol)与无水甲苯共同蒸发两次以去除H2O。在-78℃下，经20分钟将溴化乙炔镁(800mL, 400.0mmol)逐滴添加至73-2于THF中的溶液(500mL)中。将混合物在-78℃下搅拌约10分钟。当耗尽起始材料时，去除冰-丙酮冷却浴。将混合物在搅拌下用饱和NH4Cl溶液淬灭，然后温热至室温。将混合物用EA萃取，通过硅藻土过滤并用盐水洗涤。将合并的有机相经无水Na2SO4干燥，过滤并在低压下浓缩，以得到作为深黄色油的粗219-3 (48.0g, 收率：90.8%)。
将219-3 (200.0 g, 411.52 mmol)溶解于无水CH2Cl2(2000mL)中，然后在室温下添加DMAP (100.41 g, 823.05 mmol)和Et3N (124.94 g, 1.23 mol)。在0℃下用苯甲酰氯(173.46g, 1.23mol)处理混合物。在室温下搅拌12小时后，用H2O淬灭反应物。将合并的水相用DCM萃取。将合并的有机相经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下蒸发至干燥，以得到黑色油。通过柱色谱法，使用PE中的7%-20% EA作为洗脱液纯化油，以得到黄色油。将残余物用CH3OH研磨并过滤。在真空中浓缩滤饼，以得到作为白色固体的219-4 (30.0g, 36.4%)。
将尿嘧啶(34.17g, 305.08mmol)与无水甲苯共同蒸发两次以去除H2O。在室温下，向尿嘧啶于无水MeCN中的搅拌悬浮液(150mL)中添加N,O-BSA (123.86 g, 610.17 mmol)。将混合物回流1.5小时，然后冷却至室温。添加219-4 (90 g, 152.54 mmol, 其与无水甲苯共同蒸发两次以去除H2O)。然后在室温下添加TMSOTf(237.05g, 1.07mol)。将混合物加热至70℃，然后搅拌过夜，然后通过LCMS监测。将混合物冷却至室温，并用饱和NaHCO3溶液淬灭。用EA萃取溶液。将有机层经Na2SO4干燥，然后在低压下浓缩。使用硅胶柱，用PE中的10%-50% EA洗脱来纯化残余物，以得到作为白色固体的219-5 (45g, 50.9%)。
将219-5 (50 g, 86.21 mmol)在室温下用MeOH中的NH3(1L)处理，然后搅拌48小时。在低压下浓缩混合物，并通过柱色谱法(DCM中的10% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的219-6 (12.6 g, 54.55%)。
向环戊酮(100 g, 1.189 mmol)和原甲酸三甲酯(150 mL)于MeOH (600 mL)中的溶液中添加TsOH·H2O (1.13 g, 5.9 mmol)，并将混合物在室温下搅拌30分钟。用NaOMe(0.32g, 5.9mmol)和H2O淬灭反应物，并通过正己烷萃取溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，然后在低压下浓缩。将环戊基二甲氧基缩醛和219-6 (20 g, 74.63 mmol)溶解于DCE(200mL)中，然后用TsOH•H2O (0.71 g, 3.73 mmol)处理。将混合物在50℃下搅拌12小时，然后在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM中的1-10% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的219-7 (15.4 g, 61.8% )。
将219-7 (20.0 g, 0.06 mol)与无水吡啶共同蒸发三次以去除H2O。在0℃下，向219-7于无水吡啶中的冰冷溶液(100mL)中添加TsCl(22.8g, 0.12mol)，并将混合物搅拌过夜并通过LCMS和TLC监测。将反应物用H2O淬灭并用EA萃取。将有机相经无水NaSO4干燥并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM: MeOH=100:1至15:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的219-8 (20.0 g, 69.0%)。
向219-8 (20.0 g, 0.04 mol)于丙酮(200 mL)中的溶液中添加NaI(31.0g,0.2mol)，并加热至回流过夜并通过LCMS监测。将混合物用饱和Na2S2O3溶液淬灭并用EA萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥并在低压下蒸发。通过硅胶柱色谱法(DCM: MeOH=100:1至15:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的219-9 (15.0 g, 83.3%)。
在N2下，向密封管中的二氧杂环己烷(60 mL)中的219-9 (30.0 g, 0.068 mol)中添加CuBr(4.9g, 0.034mol)、异-Pr2NH(13.6 g, 0.135 mol)和(CH2O)n(5.1 g, 0.17mol)。将混合物在回流下加热16小时。将混合物用EtOAc稀释，并用饱和NH4Cl溶液和盐水洗涤。将溶液经无水MgSO4干燥并在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM: MeOH=100:1至15:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的219-10 (10.0 g, 32.3%)。
将219-10 (10 g, 21.83 mmol)在室温下用H2O中的HCOOH (80%)处理。将溶液在60℃下搅拌2小时，然后在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的1%-10% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的219-11 (5.1 g, 58.55%)。
在室温下，将219-11 (5 g, 12.79 mmol)溶解于无水MeOH (100mL)中并用NaOMe(4.83g, 89.5mmol)处理。将溶液在60℃下搅拌36小时。将混合物用CO2淬灭，然后在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的0-10% MeOH)纯化残余物，以得到作为黄色固体的219-12(2.3 g, 68.05%)。1H-NMR (CDCl3, 400 MHz) δ = 7.29 (d, J = 8 Hz 1H), 6.10 (s,1H), 5.71 (d, J = 8 .0 Hz 1H), 5.18 (t, J = 6.4 Hz, 1H), 4.79-4.84 (m, 1H),4.61 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 4.39 (s, 1H), 3.45 (s, 1H)。
在N2下，向219-12 (1.5 g, 5.68 mmol)于无水MeCN (15 mL)中的冰冷溶液中添加NIS (1.66 g, 7.39 mmol)和TEA•3HF (0.73 g, 4.55 mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。将反应物用饱和NaHCO3和饱和Na2SO3溶液淬灭，并用EA(3×100mL)萃取。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下蒸发至干燥。在硅胶柱(DCM中的0-5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为黄色固体的219-13 (1.08 g, 46.2%)。
在室温下，向219-13 (1 g, 2.44 mmol)于无水DCM (10 mL)中的搅拌溶液中添加DMAP (0.60 g, 4.88 mmol)和Et3N (0.74g, 7.32 mmol)。将混合物在0℃下用苯甲酰氯(0.79g, 5.61mmol)处理，然后在室温下搅拌3小时。将反应物用水淬灭，并用EA(3×60mL)萃取。在低压下浓缩有机相，并通过柱色谱法(DCM中的0-10% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的219-14 (0.9 g, 59.6%)。
将Bu4NOH (55%，在H2O中，13.74mL)用TFA处理(以调节至pH=3-4)。将混合物冷却至室温。在室温下，向219-14 (0.9 g, 1.46 mmol)于DCM (9 mL)中的溶液中添加间-CPBA(80%, 1.57g, 7.28mmol)。将混合物在25℃下搅拌48小时。用饱和NaHCO3水溶液洗涤混合物。将有机层通过无水Al2O3柱，并在低压下浓缩溶液。通过硅胶柱(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为黄色固体的219-15 (0.26 g, 35.1%)。
将219-15 (0.25 g, 0.49 mmol)溶解于NH3/MeOH (5mL, 7M)中，并在室温下，在N2下，将混合物搅拌24小时。在室温下在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的219-16 (100 g, 67.75%)。1H-NMR (CD3OD, 400 MHz)δ = 7.83 (d, J = 8 Hz 1H), 6.29 (s, 1H), 5.67 (d, J =6.0 Hz 1H), 5.12 (t, J =6.8 Hz, 1H), 4.99-5.01 (m, 1H), 4.38 (d, J = 19.6 Hz 1H), 3.74-3.81 (m, 2H),3.35 (s, 1H)。
将219-16 (100 mg, 0.33 mmol)与甲苯共同蒸发三次以去除H2O。在0℃下，向219-16 (100 mg, 0.33 mmol)于MeCN (1.0 mL)和NMI (271 mg, 3.3 mmol)的混合物中的搅拌溶液中添加219-C (216.5 mg, 0.66 mmol)于MeCN (0.5 mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜，然后用水淬灭反应物。用EA(20mL)稀释混合物，并将有机层用水和盐水洗涤，并经无水Na2SO4干燥。在低压下浓缩有机相，并在硅胶柱(DCM中的5% 异-PrOH)上纯化残余物，以得到粗产物。通过制备型HPLC(水和MeCN中的0.1% HCOOH)纯化粗产物，以得到作为白色固体的219 (35.6 mg, 19.0%)。ESI-LCMS: m/z 592 [M+Na]+。
在-78℃下，向219-A (2.0 g, 13.16 mmol)和苯酚(1.22 g, 13.16 mmol)于无水DCM (100 mL)中的搅拌溶液中逐滴添加TEA (1.33 g, 13.16 mmol)于DCM (20 mL)中的溶液。将混合物逐渐温热至室温，然后搅拌2小时。将溶液再冷却至-78℃，并添加DCM (20mL)中的(S)-2-氨基丙酸异丙酯盐酸盐(2.20g, 13.16mmol)，随后逐滴添加DCM (20mL)中的TEA(2.66g, 26.29mmol)。将混合物逐渐温热至室温，然后搅拌2小时。在低压下去除有机溶剂，并将残余物溶解于甲基-丁基醚中。过滤沉淀物，并在低压下浓缩滤液。在硅胶柱(无水DCM)上纯化残余物，以得到作为无色油的219-C (0.9 g, 22.3%)。
实施例120
化合物220
将干燥核苷(0.05mmol)溶解于PO(OMe)3 (0.7 mL)和吡啶(0.3 mL)的混合物中。将混合物在42℃下在真空中蒸发15分钟，然后冷却至室温。添加N-甲基咪唑(0.009mL,0.11mmol)，随后添加POCl3(0.009mL, 0.11mmol)。将混合物在室温下保持20-40分钟并通过LCMS监测220的形成。将反应物用水淬灭并在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC分离。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至30%的甲醇的线性梯度来洗脱。将相应级分合并，浓缩，并冻干3次以去除过量缓冲液。MS: m/z 396.5 [M-1]-。
实施例121
化合物223
在-78℃下，经25分钟将223-1 (16.70 g, 0.363 mol)和TEA (36.66 g, 0.363 mol)于CH2Cl2 (150 mL)中的溶液逐滴添加至POCl3 (55.65 g, 0.363 mol)于DCM (100 mL)中的搅拌溶液中。将混合物在室温下搅拌2小时后，将三乙胺盐酸盐过滤，并用CH2Cl2(100mL)洗涤。在低压下浓缩滤液，并在高真空(~10 mm Hg)下用牛头馏分收集器(cow-headfraction collector)蒸馏残余物。在45℃(蒸馏头温度)之间收集作为无色液体的223-2(30.5g, 50%收率)。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ = 4.44 (dq, J=10.85, 7.17 Hz, 2 H),1.44 - 1.57 (m, 3 H); 31P-NMR (162 MHz, CDCl3) δ = 6.75 (br. s., 1 P)。
在室温下，向227-A (93 mg, 0.15 mmol)于CH2Cl2 (1 mL)中的搅拌悬浮液中添加TEA(61mg, 0.15mmol)。将混合物冷却至-20℃，然后用223-2 (35mg, 0.21mmol)溶液逐滴处理10分钟的时段。将混合物在该温度下搅拌15分钟，然后用NMI(27mg, 0.33mmol)处理。将混合物在-20℃下搅拌，然后缓慢温热至室温。将混合物搅拌过夜。将混合物悬浮于EA(15mL)中，用盐水(10mL)洗涤并经无水硫酸钠干燥。在低压下浓缩溶液，并通过色谱法(DCM: MeOH=100:1)纯化残余物，以得到作为固体的223-3 (60mg, 收率：56%)。
将223-3 (60 mg, 0.085 mmol)于80% AcOH水溶液(2mL)中的溶液在室温下搅拌2小时。将混合物在减压下浓缩，并通过硅胶柱(DCM/MeOH=50/1洗脱)和制备型HPLC纯化残余物，以得到作为白色固体的223 (23 mg, 62%)。ESI-MS: m/z 436.3 [M+H]+。
实施例122
化合物224
使用与223-2的制备类似的程序使用异丁醇(23.9 g, 322.98 mmol)和POCl3 (49.5g, 322.98 mmol)的溶液制备224-2。获得作为无色液体的224-2 (26g, 42%收率)。1H-NMR(400 MHz, CDCl3) δ = 4.10 (dd, J=9.04, 6.39 Hz, 2 H), 2.09 (dq, J=13.24,6.67, 6.67, 6.67, 6.67 Hz, 1 H), 1.01 (d, J=6.62 Hz,6H); 31P-NMR (162 MHz,CDCl3) δ = 7.06 (br. s., 1 P)。
在室温下，向227-A (310 mg, 0.5 mmol)于CH2Cl2 (3 mL)中的搅拌悬浮液中添加TEA(202mg, 2mmol)。将混合物冷却至-20℃，然后用224-2 (134 mg, 0.7 mmol)处理。将混合物在该温度下搅拌15分钟，然后用NMI(90mg, 1.1mmol)处理。将混合物在-20℃下搅拌1小时，然后缓慢温热至室温过夜。将混合物悬浮于EA(15mL)中，用盐水(10mL)洗涤并经无水硫酸钠干燥。在低压下浓缩有机相，并通过硅胶柱(DCM: MeOH=100:1)纯化残余物，以得到作为固体的224-3 (310mg, 收率：84%)。
将224-3 (310 mg, 0.43 mmol)于80% AcOH水溶液(4mL)中的溶液在室温下搅拌2小时。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱(DCM/MeOH=50/1洗脱)和制备型HPLC纯化残余物，以得到作为白色固体的224 (79 mg, 50%)。ESI-MS: m/z 464.0 [M+H]+。
实施例123
化合物225
使用与223-2的制备类似的程序，使用异丙醇(21 g, 350 mmol)和POCl3 (53.6 g,350 mmol)的溶液来制备225-2。获得作为无色液体的225-2 (40.5g, 65%收率)。1H-NMR(400 MHz, CDCl3) δ = 4.94 - 5.10 (m, 1 H), 1.48 (d, J=6.17 Hz,6H); 31P- NMR(162 MHz, CDCl3) δ = 5.58 (br. s., 1 P)。
使用与224-3的制备类似的程序，使用225-2 (124 mg, 0.7 mmol)和227-A (310mg, 0.5 mmol)制备225-3。获得作为固体的225-3 (300 mg, 83%)。
使用与224的制备类似的程序，使用80% AcOH水溶液(4mL)中的225-3 (300 mg,0.41 mmol)来制备225。获得作为白色固体的225 (80 mg, 43%)。ESI-MS: m/z 450.0 [M+H]+。
实施例124
化合物227
在-70℃下，向POCl3 (2.0 g, 13 mmol)于无水DCM (10 mL)中的搅拌溶液中添加1-萘酚(1.88g, 13mmol)，并在-70℃下逐滴添加DCM (3mL)中的TEA (1.31 g, 13 mmol)。将混合物逐渐温热至室温并搅拌1小时。获得粗227-1。
在-70℃下，向(S)-2-氨基丙酸异丙酯盐酸盐(2.17g, 13mmol)于DCM (10mL)中的搅拌溶液中添加粗227-1。在-70℃下，将TEA(2.63g, 26mmol)逐滴添加至搅拌的溶液中。将混合物逐渐温热至室温并搅拌2小时。通过LCMS监测反应物并用正丙胺淬灭。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱(PE:MTBE = 5:1~1:1)纯化残余物，以得到纯227-2 (1.6 g, 35%)。
在0℃下，向227-A (300 mg, 0.337 mmol)和NMI (276 mg, 3.37 mmol)于无水CH3CN (4 mL)中的溶液中添加227-2 (240 mg, 0.674 mol, 在DCM (5mL)中)。将混合物在室温下搅拌10小时。通过LCMS监测反应物。将反应物用水淬灭，并用CH2Cl2 (3 x 20 mL)萃取。将有机相经无水MgSO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶(PE:EA = 5:1~2:1)纯化残余物，以得到227-3 (380 mg, 93%)。
将227-3 (380 mg, 0.314 mmol)溶解于CH3COOH (80%，8mL)中，并在40-50℃下搅拌2.5小时。通过LCMS监测反应物。在低压下浓缩混合物，并通过色谱法(PE:EA = 1:1~EA)纯化残余物，以得到粗227。通过制备型HPLC(中性体系，NH4HCO3)纯化粗产物，以得到作为白色固体的纯227 (70 mg, 80%)。ESI-MS: m/z 665.1 [M+H]+。
实施例125
化合物228
在-70℃下，向POCl3(2.0g, 13mmol)于无水DCM (10mL)中的搅拌溶液中添加1-萘酚(1.88g, 13mmol)，并在-70℃下逐滴添加DCM (3mL)中的TEA(1.31g, 13mmol)的。将混合物逐渐温热至室温，并搅拌1小时。获得228-1的粗溶液。
在-70℃下，向(S)-2-氨基丙酸异丁酯盐酸盐(2.35g, 13mmol)于DCM (20mL)中的搅拌溶液中添加TEA(2.63g, 26mmol)和228-1的粗溶液。将混合物逐渐温热至室温，并搅拌2小时。通过LCMS监测反应物并用正丙胺淬灭。在低压下蒸发溶剂，并通过色谱法(PE:MTBE= 5:1~1:1)纯化残余物，以得到纯228-2 (1.8 g, 37%)。
在0℃下，向227-A (300 mg, 0.337 mmol)和NMI (276 mg, 3.37 mmol)于无水CH3CN (4 mL)中的溶液中添加228-2 (249mg, 0.674mol, 在DCM (5mL)中)。将混合物在室温下搅拌10小时。通过LCMS监测反应物，然后用H2O淬灭。用CH2Cl2(3×20mL)萃取混合物。将有机相经无水MgSO4干燥，并在低压下浓缩。通过色谱法，使用PE:EA = 5:1~2:1作为洗脱液纯化残余物，以得到228-3 (360 mg, 87%)。
将228-3 (360 mg, 0.294 mmol)溶解于CH3COOH (80%，8mL)中，并在40-50℃下搅拌2.5小时。通过LCMS监测反应物，然后用MeO淬灭。在低压下浓缩混合物，并通过色谱法，使用PE:EA = 1:1作为洗脱液纯化残余物，以产生粗228。通过制备型HPLC(中性体系，NH4HCO3)纯化产物，以得到作为白色固体的228 (70 mg, 75%)。ESI-MS: m/z 679.2 [M+H]+。
实施例126
化合物229
在-70℃下，向POCl3 (2.0 g, 13 mmol)于无水DCM (10 mL)中的搅拌溶液中添加苯酚(1.22g, 13mmol)，并在-70℃下逐滴添加DCM (3mL)中的TEA(1.31g, 13mmol)。将混合物逐渐温热至室温，并搅拌1小时。获得229-1的粗溶液。
使用与228的制备类似的程序，使用229-2 (205mg, 0.674mol, 在DCM (5mL)中，获自(S)-2-氨基丙酸异丙酯盐酸盐和229-1 )和227-A (300 mg, 0.337 mmol)制备229。获得作为白色固体的229 (50 mg, 74%)。ESI-MS: m/z 615.2 [M+H]+。
实施例127
化合物230
使用与228的制备类似的程序，使用230-2 (214mg, 0.674mol, 在DCM (5mL)中，获自(S)-2-氨基丙酸异丁酯盐酸盐和230-1)和227-A (300 mg, 0.337 mmol)制备230。获得作为白色固体的230 (70 mg, 87%)。ESI-MS: m/z 629.2 [M+H]+。
实施例128
化合物231
使用与228的制备类似的程序使用231-2 (223 mg, 0.674 mol, 在DCM (5mL)中，获自(S)-2-氨基丙酸环戊酯盐酸盐和231-1)和227-A (300 mg, 0.337 mmol)制备231。获得作为白色固体的231 (62 mg, 71%)。ESI-MS: m/z 641.2 [M+H]+。
实施例129
化合物232
使用与228的制备类似的程序使用232-2 (223mg, 0.674mol, 在DCM (5mL)中，获自(S)-2-氨基丙酸3-戊酯盐酸盐和232-1)和227-A (300 mg, 0.337 mmol)制备232。获得作为白色固体的232 (42 mg, 60%)。ESI-MS: m/z 643.2 [M+H]+。
实施例130
化合物233
在-78℃下，将磷酰三氯(1.00g, 6.58mmol)和5-喹啉(955mg, 6.58mmol)于无水DCM(50mL)中的搅拌溶液用TEA (665 mg, 6.58 mmol)于DCM (10 mL)中的溶液处理。将混合物逐渐温热至室温，并搅拌2小时。将溶液冷却至-78℃，然后用(S)-2-氨基丙酸新戊酯盐酸盐(1.28g, 6.58mmol)处理。在-78℃下逐滴添加TEA(1.33g, 13.16mmol)。将混合物逐渐温热至室温，并搅拌2小时。在低压下浓缩混合物，并将残余物溶解于甲基-丁基醚中。滤出沉淀物，并在低压下浓缩滤液。通过硅胶柱(纯AcOEt)纯化残余物，以得到作为无色油的233-1(500mg, 20%)。
在0℃下，向233-2 (300 mg, 0.337mmol)和NMI (276.6 mg, 3.37 mmol)于无水CH3CN (0.9 mL)中的溶液中逐滴添加CH3CN (0.3 mL)中的233-1 (388 mg, 1.011 mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭，并用EtOAc萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水硫酸钠干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的33% EA)纯化残余物，以得到作为黄色粉末的233-3 (300mg, 71.9%)。
将233-3 (300 mg, 0.243 mmol)溶解于80% CH3COOH (3mL)中，并将混合物在60℃下搅拌2.5小时。将混合物分配于AcOEt和水之间。将有机层相通过盐水洗涤，经硫酸钠干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为黄色粉末的233(81mg, 粗产物)。通过RP HPLC纯化粗产物(81mg)，以得到作为白色固体的233 (28.7mg,17.1%)。ESI-LCMS: m/z 694.1 [M+H]+。
实施例131
化合物234
使用与233-1的制备类似的程序，使用磷酰三氯(2.00g, 13.16mmol)、1-萘酚(1.882g,13.16mmol)和(S)-2-氨基丙酸新戊酯盐酸盐(2.549g, 13.16mmol)制备234-1。获得作为无色油的234-1 (600 mg, 12%)。
在室温下，将234-2 (230 mg 0.26 mmol)和NMI (212 mg 2.60 mmol)于无水CH3CN (1 mL)中的溶液用234-1 (300 mg 0.78 mmol)于无水CH3CN (0.5 mL)中的溶液处理。将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭并用EA(3×20mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，通过无水硫酸钠干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(CH2Cl2中的CH3OH，1%至5%)纯化残余物，以得到作为白色固体的234-3 (300 mg, 93%)。
将234-3 (300 mg, 0.24 mmol)溶解于CH3COOH (80%，5mL)中。将混合物在60℃下搅拌2.5小时。将混合物用EA(30mL)稀释并用盐水洗涤。将有机相经无水硫酸钠干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(CH2Cl2中的CH3OH，1%至5%)纯化残余物，以得到粗234 (105 mg)。通过HPLC(水和CH3CN中的0.1% NH4HCO3)纯化粗产物，以得到作为白色固体的234 (45 mg,26%)。ESI-LCMS: m/z 693.2 [M+H]+。
实施例132
化合物235
在-78℃下，将235-1 (2.00 g, 13.99 mmol)和235-2 (2.00 g, 13.99 mmol)于无水DCM (8 mL)中的搅拌溶液用TEA (3.11 g, 30.8 mmol)于DCM (20 mL)中的溶液逐滴处理。将混合物在-78℃下搅拌2小时，然后逐渐温热至室温。在低压下去除有机溶剂，并将残余物溶解于甲基-丁基醚中。滤出沉淀物，并在低压下浓缩滤液。在硅胶柱(干燥DCM)上纯化残余物，以得到作为无色油的235-3 (1g, 20.96%)。
将235-4 (260 mg, 0.29 mmol)与甲苯共同蒸发3次以去除H2O。将干燥的235-4用MeCN(0.8mL)和NMI(240mg, 2.9mmol)处理，然后搅拌10分钟。将混合物用235-3 (291 mg,0.87 mmol)于MeCN (0.4 mL)中的溶液处理，然后在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的75% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的235-5 (300 mg, 86%)。
将235-5 (300 mg, 0.25 mmol)用CH3COOH (5mL, 80%)处理，并在50℃下搅拌3小时。将混合物用EA稀释。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(PE中的67% EA)纯化残余物，以得到粗235，将其通过HPLC纯化。将产物通过冻干干燥，以得到作为白色固体的235 (30 mg, 18.5%)。ESI-LCMS: m/z 643 [M+H]+。
实施例133
化合物247
将247-1 (50 mg, 0.13 mmol)溶解于80%甲酸(3mL)中并在50℃下加热过夜。蒸发溶剂，与水共同蒸发以去除酸。将残余物溶解于甲醇和三乙胺的混合物(3 mL, 4:1 v:v)中。0.5小时后，蒸发溶剂。从水中冻干核苷以产生247 (40 mg, 97%). MS: m/z 315.5 [M-1]。
实施例134
化合物248
在0℃下，在N2气氛下，向248-1 (15.0 g, 50.2 mmol)于无水吡啶(180 mL)中的搅拌溶液中添加BzCl(23.3g, 165.5mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物用EA稀释并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层用无水Na2SO4干燥并过滤。将有机相在低压下浓缩至干燥。通过柱色谱法(PE中的15% EtOAc)纯化残余物，以得到作为白色固体的248-2(27 g, 93.5%)。
将248-2 (27.0 g, 47 mmol)溶解于90% HOAc(250mL)中。将混合物在110℃下搅拌12小时。在减压下去除溶剂。将残余物用EA稀释并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下浓缩有机相，以得到作为淡黄色固体的粗248-3(21.7 g, 粗产物)。
将248-3 (21.7 g, 45.9 mmol)用NH3/MeOH (600mL)处理，并在室温下搅拌12小时。在减压下浓缩溶剂，以得到粗产物。通过柱色谱法(DCM中的5% MeOH)纯化粗产物，以得到作为白色固体的248-4 (12 g, 99%)。
在室温下，向248-4 (15.0 g, 56.8 mmol)于无水吡啶(200 mL)中的搅拌溶液中添加咪唑(7.7g, 113.6mmol)和TBSCl(9.4g, 62.5mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。在减压下去除溶剂。将残余物用EA稀释并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下浓缩有机相，以得到作为淡黄色固体的粗248-5 (21.3g, 粗产物)。
在室温下，向248-5 (21.3g, 粗产物)于无水DCM (200mL)中的搅拌溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(6.8g, 56.8mmol)、MMTrCl(17.8g, 56.8mmol)和AgNO3(9.6g,56.8mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。通过过滤去除固体，并用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤滤液。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的5% EA)纯化残余物，以得到作为淡黄色固体的248-6 (32 g, 87%)。
在室温下，将248-6 (32 g, 49.2 mmol)溶解于TBAF于THF中的溶液(1M, 4.0eq.)中。将混合物在室温下搅拌12小时。在减压下去除溶剂。将残余物用EA稀释并用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的33% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的248-7 (21.0 g, 79%)。
在0℃下，向248-7 (21.0 g, 38.8 mmol)于无水DCM (200 mL)中的搅拌溶液中添加吡啶(9.2mL, 116.4mmol)和戴斯-马丁氧化剂(49g, 116.4mmol)。将混合物在室温下搅拌4小时。将反应物用饱和Na2S2O3溶液和饱和NaHCO3水溶液淬灭。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩，以得到粗产物(21.0g)。
将粗产物(21.0g, 粗产物)溶解于二氧杂环己烷(200mL)中并用37%甲醛水溶液(20mL, 194mmol)和2.0N氢氧化钠水溶液(37.5mL, 77.6mmol)处理。将混合物在室温下搅拌12小时。用NaBH4(8.8g, 232.8mmol)处理溶液。在室温下搅拌0.5小时后，用冰水淬灭反应物。将混合物用EA稀释并用盐水洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的4% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的248-8 (10.0 g, 50.5%)。
将248-8 (4.8 g, 8.5 mmol)与甲苯共同蒸发(2x)。将残余物溶解于无水DCM(45mL)和吡啶(6.7g, 85mmol)中。将溶液冷却至0℃。经10分钟逐滴添加三氟甲磺酸酐(4.8g, 18.7mmol)。在0℃下，经40分钟将混合物搅拌并通过TLC (PE: EA= 1:1)监测。用CH2Cl2(50mL)稀释混合物。用饱和NaHCO3溶液洗涤溶液。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE: EA = 100:0-4:1)纯化残余物，以得到作为褐色泡沫的248-9 (6.1 g, 86.4%)。
将248-9 (6.1 g, 7.3 mmol)溶解于MeCN(25mL)中。在室温下添加TBAF于THF中的溶液(1M, 25mL)。将混合物在室温下搅拌12小时。添加TBAF于THF中的溶液(1M, 15mL)，并将混合物搅拌4小时。用NaOH水溶液(1N, 14.6mmol)处理混合物并将混合物搅拌1小时。将反应物用水淬灭并用EA萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的248-10 (2.1 g, 50.6%)。
在室温下，将248-10 (700 mg, 1.23 mmol)溶解于80% HCOOH (40mL)中。将混合物在室温下搅拌2小时。将反应物用MeOH (40mL)淬灭并搅拌12小时。在低压下浓缩溶剂，并通过柱色谱法(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的248 (210 mg,57.7%)。ESI-MS: m/z 296.9 [M+H]+。
实施例135
化合物250
将250-1 (120 g, 0.26 mol)和IBX (109 g, 0.39 mol)于CH3CN (2.0 L)中的混合物加热至回流并搅拌12小时。冷却至室温后，过滤混合物。将滤液在低压下浓缩至干燥。
将250-2 (130g, 粗产物，0.26mol)与无水甲苯共同蒸发(3x)。在-78℃下，经30分钟将乙烯基溴化镁(700mL, 0.78mol, 1.0N, 在THF中)逐滴添加至250-2于THF中的溶液(300mL)中，并将混合物在室温下搅拌约1小时。当如TLC所确定的起始材料耗尽时，将混合物倒入饱和NH4Cl溶液中。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。
向上述残余物(170g, 粗产物，0.346mol)于无水CH2Cl2中的溶液中添加TEA(105g,1.04mol)、DMAP(84g, 0.69mol)和苯甲酰氯(146g, 1.04mol)，并在室温下搅拌12小时。将混合物用CH2Cl2稀释并用饱和NaHCO3水溶液洗涤。将合并的水相用DCM (100mL)萃取。将合并的有机相经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下蒸发至干燥。通过柱色谱法使用PE中的EA(10%至50%)纯化残余物，以得到250-3 (107 g, 52%)。
将尿嘧啶(与甲苯共同蒸发(2x))和NOBSA(81.4g, 0.4mol)和CH3CN(150mL)的混合物搅拌至回流1.5小时。冷却至室温后，用250-3 (59 g, 0.1 mol)和TMSOTf (155 g,0.7 mol)处理混合物。将混合物加热至60-70℃并搅拌12小时。冷却至室温后，将混合物倒入饱和NaHCO3溶液中，并沉淀固体。过滤后，获得作为白色固体的纯250-4 (40g, 69%)。
在0℃下，向250-4 (50 g, 0.086 mol)、K2CO3 (17.8 g, 0.13 mol)于DMF (50mL)中的溶液中添加PMBCl(16g, 0.1mol)，并在室温下搅拌12小时。将反应物用水淬灭，并用EA(3×100mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩，以得到250-5 (65 g)。
将250-5 (65 g, 0.086 mol)和NaOMe (16.8 g, 0.3 mol)于MeOH:DCM (500 mL,v:v = 4:1)中的混合物在室温下搅拌2.5小时。将反应物用CO2(固体)淬灭并在低压下浓缩。将残余物溶解于EA(200mL)中。将溶液用水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的4% MeOH)纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的250-6 (25g, 75%)。
在冰浴中向250-6 (25.5 g, 0.065 mol)于DMF (60 mL)中的混合物中添加NaH(10.5g, 0.26mol, 60%，在煤油中)、BnBr(36.3g, 0.21mol)并在室温下搅拌12小时。用NH4Cl(水溶液)淬灭反应物，并用EA(150mL)稀释混合物。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶(PE中的15% EA)纯化残余物，以得到250-7 (20 g, 46%)。
在室温下向250-7 (20 g, 0.03 mol)和NMMO (7 g, 0.06 mol)于THF:H2O (100mL, v:v = 5:1)中的溶液中添加OsO4(2.6g, 0.01mol)，并在室温下搅拌24小时。将反应物用饱和Na2S2O3溶液淬灭，并用EA(3×80mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。
在室温下，向二醇产物(0.03mol)于MeOH:H2O:THF (v:v:v = 170 mL:30 mL:50mL)中的溶液中添加NaIO4(9.6g, 0.045mol)，并在室温下搅拌2小时。过滤后，过滤器直接用于下一步骤。
将前述溶液在0℃下用NaBH4(1.8g, 0.048mol)处理，并在室温下搅拌30分钟。用HCl(1N)溶液淬灭反应物。用EA(3×60mL)萃取混合物。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶(PE中的25% EA, TLC: PE:EA = 2:1, Rf = 0.6)纯化残余物，以得到250-8 (12g, 61%，经3个步骤)。
在0℃下，向250-8 (14 g, 21 mmol)和DMAP (5.1 g, 42 mmol)于DCM (60 mL)中的溶液中添加MsCl(3.1g, 27mmol)，并在室温下搅拌40分钟。用饱和NaHCO3溶液淬灭反应物。将有机相用HCl(0.2N)溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶(PE中的25% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的Ms-产物(14g, 90%)。
将Ms-产物(41g, 55mmol)用TBAF(Alfa，1N, 在THF中，500mL)处理，并在70-80℃下搅拌3天。在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EA(200mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的25% EA)纯化残余物，以得到250-9(9.9 g, 27%)。
向250-9 (6.3 g, 9.45 mmol)于CAN:H2O (v:v = 3:1, 52 mL)中的溶液中添加CAN(15.5g, 28.3mmol)，并在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭并用EA(3×80mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的25% EA)纯化残余物，以得到作为黄色油的250-10 (3.6 g, 71 %)。
在-70℃下，向250-10 (2.4 g, 4.4 mmol)于无水DCM (10 mL)中的溶液中添加BCl3(1N, 30mL)，并在-70℃下搅拌2小时。在-70℃下，用MeOH淬灭反应物。在35℃下，在低压下直接浓缩混合物。通过柱色谱法(PE中的50% EA至100% EA)纯化残余物，以得到250-11(1.2 g, 86%). ESI-MS: m/z 277.1 [M+H]+。
在0℃下，向PPh3(3.37g, 12.8mmol)于吡啶(15mL)中的溶液中添加I2(3.06g,12mmol)，并在室温下搅拌30分钟，直至出现橙色。将混合物冷却至0℃，并用吡啶(5 mL)中的250-11 (2.2 g, 8 mmol)处理，并在室温下在N2下搅拌12小时。将反应物用Na2S2O3(饱和，30mL)淬灭，并用EA(3×60mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的1%至2% MeOH)纯化残余物，以得到作为淡黄色泡沫的250-12 (1.8 g, 58%)。
将250-12 (1.35 g, 3.5 mmol)和DBU (1.06 g, 7 mmol)于THF:CH3CN (v:v =10mL:5 mL)中的混合物在60-70℃下搅拌2小时。将混合物用EA(50mL)稀释，并用HCl(0.2N)溶液调节至pH=7-8。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将残余物通过柱色谱法纯化，以得到250-13 (0.5 g, 55%)。
在0℃下，向250-13 (670 mg, 2.6 mmol)于CH3CN (6 mL)中的溶液中添加NIS(730 mg, 3.25 mmol)和3HF·TEA (335 mg, 2.1 mmol)，并在室温下搅拌2小时。将反应物用NaHCO3(饱和)溶液和Na2S2O3(饱和)溶液淬灭，并用EA(3×30mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的50% EA和DCM中的2% MeOH)纯化残余物，以得到作为褐色油的250-14 (1.2 g, 80%)。
在0℃下，向250-14 (1.0 g, 2.47 mmol)、DMAP (0.75 g, 6.2 mmol)和TEA(0.75 g, 7.42 mmol)于DCM (10 mL)中的溶液中添加DCM (1 mL)中的BzCl(1.15g,8.16mmol)，并在室温下搅拌12小时。用NaHCO3(水)溶液淬灭反应物。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到250-15 (850 mg, 85%)。
将250-15 (600 mg, 1 mmol)、BzONa (1.45 g,10mmol)和15-丝醚-5 (2.2 g,10mmol)于DMF (25 mL)中的混合物在90-100℃下搅拌24小时。用EA(20mL)稀释混合物。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为淡黄色泡沫的250-16 (275 mg, 37%)。
将250-16 (250 mg, 0.41 mmol)于NH3·MeOH (7 N, 5 mL)中的混合物在室温下搅拌15小时。在低压下直接浓缩混合物。通过柱色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物并通过制备型HPLC再纯化，以得到作为白色固体的250 (33 mg, 25%)。ESI-MS: m/z 295.1 [M+H]+。
实施例136
化合物126
在25℃下，在N2气氛下，向126-1 (3.0 g, 11.15 mmol)于无水吡啶(90 mL)中的溶液中添加咪唑(3.03g, 44.59mmol)和TBSCl(6.69g, 44.59mmol)。将溶液在25℃下搅拌15小时。将溶液在减压下浓缩至干燥。将残余物溶解于EA中。将溶液用饱和NaHCO3和盐水洗涤，并经无水MgSO4干燥。在低压下去除溶剂，以得到作为白色固体的粗126-2 (4.49 g, 90%)。
在0℃下，向126-2 (3.5g, 7.04mmol)于EA和EtOH的混合物(1:1, 55 mL)中的搅拌溶液中添加TsOH (10.7g, 56.34mmol)。将混合物在30℃下搅拌8小时。添加水(30mL)，并去除溶液，直至干燥。在硅胶柱(DCM中的10% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的126-3 (1.75 g, 65%)。
在25℃下，在N2下，向126-3 (3.4 g, 8.88 mmol)于无水吡啶(17 mL)中的溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(4.3g, 35.51mmol)、AgNO3(5.50g, 35.51mmol)和MMTrCl(8.02g,26.63mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。添加MeOH (20mL)，并低压下去除溶剂至干燥。在硅胶柱(PE中的10% EA)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的126-4 (5.76 g, 70%)。
在-78℃下，向126-4 (2.0 g, 2.16 mmol)于无水DCM (10 mL)中的溶液中逐滴添加Cl2CHCOOH (2.8g, 21.57mmol)。将混合物温热至-10℃并在该温度下搅拌20分钟。在-10℃下用饱和NaHCO3淬灭反应物。将混合物用DCM萃取，用盐水洗涤，并经无水MgSO4干燥。在低压下浓缩溶液。在硅胶柱(PE中的10% EA)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的126-5(0.99 g, 70%)。
向126-5 (3.5 g, 5.34 mmol)于无水DMSO (35 mL)中的搅拌溶液中添加DCC(3.30 g, 16.03 mmol)和Py•TFA (1.03 g, 5.34 mmol)。将混合物在30℃下搅拌1小时。将反应物在0℃下用冷水淬灭，并用EA(3×60mL)萃取。过滤沉淀物。将有机层用盐水洗涤(3x)并经无水MgSO4干燥。在低压下浓缩有机相，以得到作为黄色油的粗126-6 (3.5 g)。
向126-6 (3.5 g, 5.34 mmol)于MeCN (35 mL)中的搅拌溶液中添加37% HCHO(11.1mL)和TEA(4.33g, 42.7mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将混合物用EtOH(26mL)和NaBH4(3.25g, 85.5mmol)处理，然后搅拌30分钟。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EA(3×60mL)萃取。将有机层经无水MgSO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的10% EA至PE中的50% DCM)纯化残余物，以得到作为白色固体的126-7 (1.46 g, 40%)。
在-35℃下，在N2气氛下，向126-7 (1.85 g, 2.7 mmol)于吡啶(24 mL)和DCM(9.6 mL)中的搅拌溶液中添加DMTrCl(1.3g, 3.9mmol)。将溶液在25℃下搅拌16小时。将混合物用MeOH (15mL)处理并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的EA，10%至30%)纯化残余物，以得到作为白色固体的126-8 ( 1.60 g, 60 %)。
向126-8 (1.07 g, 1.08 mmol)于无水吡啶(5 mL)中的溶液中添加AgNO3(0.65g,3.79mmol)和TBDPSCl(1.04g, 3.79mmol)。将混合物在25℃下搅拌16小时。在减压下去除溶剂。将残余物溶解于EA(50mL)中。用盐水洗涤所得溶液。将有机层经无水MgSO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的10% EA)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的126-9 (0.93g, 70%)。
在-78℃下，向126-9 (1 g, 0.82 mmol)于无水DCM (13.43 mL)中的搅拌溶液中添加Cl2CHCOOH (2.69mL)。将混合物在-10℃下搅拌20分钟。将反应物用饱和NaHCO3水溶液淬灭并用DCM萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的MeOH，0.5%至2%)纯化有机相，以得到作为固体的126-10 (0.48 g, 65%)。
在-35℃下，向126-10 (0.4 g, 0.433 mmol)于无水DCM (2.7 mL)中的冰冷溶液中逐滴添加吡啶(171mg, 2.17mmol)和Tf2O(183mg, 0.65mmol)。将混合物在-10℃下搅拌20分钟。将反应物用冰水淬灭并搅拌30分钟。用DCM (3×20mL)萃取混合物。将有机相用盐水(100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩，以得到粗126-11 (0.46 g)，其不经进一步纯化即用于下一步骤。
向126-11 (0.46 g, 0.43 mmol)于无水DMF (2.5 mL)中的溶液中添加NaN3(42mg, 0.65mmol)。将混合物在30℃下搅拌16小时。将溶液用水稀释并用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE中的EA，5%至15%)上纯化残余物，以得到作为固体的126-12 (0.31 g, 70%)。
在70℃下，向126-12 (0.31 g, 0.33 mmol)于MeOH (5 mL)中的溶液中添加NH4F(0.36g, 9.81mmol)。将混合物在该温度下搅拌24小时。将混合物蒸发至干燥。在硅胶柱(DCM中的MeOH，0.5%至2.5%)上纯化残余物，以得到作为白色固体的126-13 (117 mg,60%)。
将126-13 (300 mg, 0.50 mmol)溶解于80% HOAc(20mL)中。将混合物在55℃下搅拌1小时。将反应物用MeOH淬灭并在低压下浓缩。通过制备型HPLC纯化残余物，以得到作为白色固体的126 (100 mg, 61.3 %)。ESI-LCMS: m/z 325.1 [M+H]+。
实施例137
化合物137
在0℃(冰/水浴)下，向146-1 (80 mg, 0.14 mmol)于无水CH3CN (2.0 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(0.092mL, 1.12mmol)。然后添加(异丙氧基-L-丙氨酸基)氯磷酸苯酯的溶液(128mg, 0.42mmol, 溶解于CH3CN(0.5mL)中)(根据McGuigan等人, J. Med. Chem.(2008) 51:5807-5812中所述的通用程序制备)。将溶液在0至5℃下搅拌，然后在室温下搅拌16小时。将混合物冷却至0至5℃，用EA稀释，随后添加水(5ml)。将溶液用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用MgSO4干燥。在二氧化硅(10g柱)上用EA/己烷(25-100%梯度)纯化残余物，以得到作为泡沫的137-1 (57.3 mg, 49 %)。
将137-1 (57.3 mg, 0.07 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(68μL, 0.27mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时，并添加无水EtOH (100μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。将残余物在二氧化硅(10g柱)上用MeOH/CH2Cl2(1-7%梯度)纯化并冻干，以得到作为白色泡沫的137 (27.8 mg, 72%)。ESI-LCMS: m/z = 571.1 [M+H]+, 1141.2 [2M+H]+。
实施例138
化合物138
以与169-4相同的方式，在THF (1.5 mL)中由146-1 (100 mg, 0.174 mmol)和双(叔丁氧基羰基氧基甲基)磷酸盐(126 mg, 0.35 mmol)与DIPEA (192 μL, 1.04 mmol)、BOP-Cl(133 mg, 0.52 mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑 (59 mg, 0.52 mmol )制备138-1 (68.4 mg,44.7 %)。
以与146相同的方式，由138-1 (68 mg, 0.077 mmol)制备138 (31.4 mg, 67%)。ESI-LCMS: m/z = 627.15 [M+Na]+, 1219.25 [2M+H]+。
实施例139
化合物139
向146-1 (100 mg, 0.175 mmol)于无水CH3CN (2 mL)中的溶液中添加CH3CN中的5-乙硫基-1H-四唑(0.25M; 0.84 mL, 0.21 mmol)。在0至5℃下逐滴添加CH3CN(1mL)中的双-SATE-氨基磷酸酯(95mg, 0.21mmol)。在0至5℃下，在Ar下，将混合物搅拌2小时。添加77%间-CPBA (78 mg, 0.35 mmol)于DCM (1 mL)中的溶液，并在0至5℃下，在Ar下，将混合物搅拌2小时。将混合物用EtOAc(50mL)稀释，用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3和盐水洗涤，并用MgSO4干燥。过滤混合物并在真空中蒸发溶剂。在二氧化硅(10g柱)上用EA/己烷 (20-100%梯度)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的139-1 (105 mg, 63.6 %)。
将139-1 (105 mg, 0.112 mmol)溶解于无水CH3CN(0.8mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(84μL, 0.334mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。添加无水EtOH (100μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。在二氧化硅(10g柱)上用MeOH/CH2Cl2(1-7%梯度)纯化残余物并冻干，以得到作为白色泡沫的139 (42.7 mg, 57%)。ESI-LCMS: m/z = 692.15 [M+Na]+, 1339.30 [2M+H]+。
实施例140
化合物143
向N-Boc-L-缬氨酸(620.78 mg, 2.86 mmol)和TEA (144.57 mg, 1.43 mmol)于无水THF (2.5 mL)中的溶液中添加BB (250.00 mg, 285.73 μmol)。将混合物与吡啶和甲苯共同蒸发以去除水。将残余物溶解于THF(2.5mL)中。在室温(18℃)下，添加DIPEA(369.28mg,2.86mmol)，随后添加BOP-Cl (363.68 mg, 1.43 mmol)和3-硝基-1H-1,2,4-三唑 (162.95mg, 1.43 mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时，然后用EA(40mL)稀释。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的30% EA)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的143-1 (220mg, 粗产物)。
将143-1 (250.0 mg, 232.73 μmol)溶解于80% CH3COOH (30ml)中。将溶液加热至50℃并搅拌12小时。将反应物用MeOH淬灭，并将溶液浓缩至干燥。在硅胶柱(DCM中的5%MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的143-2 (80.00 mg, 68.82%)。
在室温(19℃)下，将143-2 (78.00 mg, 156.16 μmol)溶解于HCl/二氧杂环己烷(1.5mL)和EA(1.5mL)中。将混合物在室温下搅拌30分钟。将溶液在低压下浓缩至干燥。通过制备型HPLC纯化残余物，以得到作为白色固体的143 (23 mg, 31.25%)。ESI-MS: m/z400.20 [M+H]+,799.36[2M+H]+。
实施例141
化合物154
根据Lefebre等人, J. Med. Chem. (1995) 38:3941-3950(其出于描述154-1的制备的有限目的通过引用并入本文)中所述的程序制备154-1。
使用与制备155-6的程序类似的程序使用155-5和154-1制备154-2 (0.33 g, 0.5mmol)。获得作为白色固体的154-2。使用与用于制备155的程序类似的程序，使用154-2来制备154 (130 mg)。1H-NMR (CDCl3): 7.40 (d, 1H), 6.1 (s, 1H), 5.83 (d, 1H), 4.3(t, 2H), 4.1-4.2 (m, 6H), 3.2 (t, 4H), 1.69 (s, 4H), 1.3 (s, 3H), 1.23 (s,18H); 31P-NMR (CDCl3): -2.4 ppm。
实施例142
化合物155
在0℃下，向硫氢化钠(4.26g, 76.0mmol)于EtOH (100mL)中的溶液中逐滴添加叔丁酰氯(76.2mmol; 9.35mL)，并将混合物在室温下搅拌1小时。添加2-(2-氯乙氧基)乙醇(57mmol; 6.0 mL)和TEA (21 mL, 120 mmol)的溶液，并将混合物在回流下加热60小时。将混合物过滤，然后浓缩至小体积。将残余物溶解于EA中，然后用水、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机相经Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。分离粗产物(10.0g)并通过硅胶快速柱色谱法使用己烷中0至100% EA的梯度纯化5克，以得到作为澄清、无色油的155-3 (4.5 g,22 mmol)。1H-NMR ( CDCl3): 3.70-3.74 (m, 2H), 3.5-3.65 (m, 4H), 3.1 (t, 2H),1.25 (s, 9H)。
在-78℃下，在氩气下，经1小时将155-3 (4.5 g; 21.8 mmol)和三乙胺(6.7 mL,87.2 mmol)于四氢呋喃 (50 mL)中的溶液逐滴添加至二氯磷酸N,N-二异丙酯(2.0mL,10.9mmol)于THF(50mL)中的搅拌溶液中。将混合物在室温下搅拌2小时，然后用EA(200mL)稀释。将混合物用饱和NaCl水溶液洗涤并经Na2SO4干燥。过滤后，在减压下蒸发滤液，以得到浅黄色油。通过快速柱色谱法使用己烷中的EA(0-5%)(含有5%三乙胺)的梯度纯化，提供作为澄清、无色油的155-4 (2.5 g, 4.25 mmol)。1H-NMR (CDCl3): 3.70-3.82 (m, 4H),3.57-3.65 (m, 10H), 3.1 (t, 4H), 1.25 (s, 18H), 1.17 (t, 12H); 31P-NMR(CDCl3): 148.0 ppm。
将155-5 (285 mg, 0.9 mmol)和DCI (175 mg, 1.5 mmol)与ACN共同蒸发两次，然后溶解于ACN(5mL)中。添加ACN(4mL)中的155-4 (790 mg, 1.35 mmol)，并通过TLC监测反应物。15分钟后，添加叔丁基氢过氧化物(0.5mL，癸烷中的5.5M溶液)，并将混合物搅拌10分钟。将混合物用EA(25mL)稀释，用饱和NaHCO3水溶液和饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩。通过快速柱色谱法使用己烷中的EA(0-100%)的梯度纯化，以提供作为白色固体的155-6 (0.17 g, 0.22 mmol)。将155-6溶解于80% HCOOH水溶液(5mL)中。在室温下30分钟后，去除溶剂并与甲苯共同蒸发两次。将残余物溶解于甲醇(10mL)中并添加TEA(0.2mL)。在室温下2分钟后，在真空中去除溶剂。通过快速柱色谱法使用DCM中的甲醇(0-15%)的梯度纯化，提供155 (90 mg). 1H-NMR (CDCl3): 7.40 (d, 1H), 6.1 (s, 1H),5.83 (d, 1H), 4.3 (t, 2H), 4.1-4.2 (m, 6H), 3.70-3.82 (m, 4H), 3.57-3.65 (m,4H), 3.1 (t, 4H) 1.61 (s, 8H), 1.3 (s, 3H), 1.23 (s, 18H). 31P-NMR (CDCl3): -1.55 ppm。
实施例143
化合物156
使用与制备155-3的程序类似的程序使用4-氯丁醇制备156-1 (6.0 g, 31.6 mmol)。获得作为澄清、无色油的156-1。1H-NMR (CDCl3): 3.67 (s, 2H), 2.86 (m, 2H), 1.65(m, 4H), 1.25 (s, 9H)。
使用与用于制备155-4的程序类似的程序制备156-2 (2.14 g, 4.0 mmol)。获得作为澄清、无色油的156-2。1H-NMR (CDCl3): 3.67 (m, 6H), 2.86 (t, 4H), 1.65 (m,8H), 1.25 (s, 18H), 1.17 (t, 12H). 31P-NMR (CDCl3): 143.7 ppm。
使用与制备155-6的程序类似的程序使用155-5和156-2制备156-3 (0.23 g,0.22 mmol)。获得作为白色固体的156-3。使用与用于制备155的程序类似的程序，使用156-3来制备156 (170 mg)。1H-NMR (CDCl3): 7.40 (d, 1H), 6.1 (s, 1H), 5.83 (d, 1H),4.3 (t, 2H), 4.1-4.2 (m, 6H), 2.8 (t, 4H), 1.78 (m, 4H), 1.69 (s, 8H), 1.3(s, 3H), 1.23 (s, 18H). 31P-NMR (CDCl3): -1.56 ppm。
实施例144
化合物161
通过与吡啶、随后与甲苯共同蒸发而使161-1 (109 mg, 0.39 mmol)和双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(0.6mmol, 由195mg双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸盐和85μL Et3N制备)无水。将残余物溶解于无水THF(3mL)中，并在冰浴中冷却。添加二异丙基乙胺(0.2 mL, 3 eq.)、BopCl (190 mg, 2 eq.)和3-硝基-1,2,4-三唑 (81 mg, 2 eq.)，并将混合物在0℃下搅拌90分钟。将混合物用EtOAc稀释，用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并干燥(Na2SO4)。在硅胶柱上用CH2Cl2/异-PrOH (4-10%梯度)纯化，随后进行RP HPLC纯化(A：水中的0.1% HCOOH，B：MeCN中的0.1% HCOOH)，产生161 (28 mg, 12%). 1H-NMR (CDCl3): δ7.24 (d, 1H), 6.6 (br, 1H), 5.84 (d, 1H), 5.65-5.73 (m, 4H), 4.94 (m, 2H),4.38 (m, 2H), 4.1 (b, 1H), 2.88 (d, 1H), 1.47 (d, 3H), 1.33 (m, 12H)。
实施例145
化合物269
在常压下，经10% Pd/C将106 (30 mg, 0.1 mmol)在MeOH中氢化。滤出催化剂并在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC纯化滤液。使用50 mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至20%的MeOH的线性梯度来洗脱。将相应级分合并，浓度并冻干（3x）以去除过量缓冲液以产生269 (17 mg, 63%)。ESI-LCMS: m/z =275.2 [M+H]+, 297.1 [M+Na]+。
实施例146
化合物275
向280(50 mg, 0.16 mmol)和N-甲基咪唑 (50 μL, 0.64 mmol)于乙腈(1.5 mL)中的冰冷溶液中添加275-1 (0.1 g, 0.28 mmol)于乙腈(0.15 mL)中的溶液。将混合物在5℃下搅拌1小时。用EtOH淬灭反应物，并浓缩混合物。将蒸发的残余物分配于EtOAc和柠檬酸(0.5N)之间。将有机层用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，然后用Na2SO4干燥。通过RP-HPLC (A:水, B: MeCN)纯化，产生作为白色粉末的275(30 mg, 30%)。MS: m/z 625 [M+1]。
实施例147
化合物157
使用针对制备54-2 所述的程序，由市售3-羟基氧杂环丁烷(5.0 g)制备化合物157-1(5.6 g)。1H-NMR (CDCl3) δ 5.73 (s,2H) , 5.48-5.51 (m,1H), 4.90 (d,2H), 4.72 (d,2H)。
使用针对制备54-3 所述的程序，由157-1制备化合物157-2(8.0 g)。1H-NMR(CDCl3) δ 5.95 (s,2H) , 5.48-5.51 (m,1H), 4.90 (d,2H), 4.72 (d, 2H)。
如针对制备54-4所述使苄基磷酸盐(银盐)和157-2 (8.0 g)反应，以产生纯化的157-3 (1.92 g). 1H-NMR (CD3CN): δ 7.39-7.42 (m, 5H), 5.62 (d, 4H), 5.39-5.42(m, 2H), 5.15 (d, 2H), 4.80-4.83 (m, 4H), 4.56-4.60 (m, 4H). 31P-NMR (CD3CN):δ - 4.55 ppm.。
将化合物157-3 (970 mg, 2.16 mmol)溶解于含有三乙胺的甲醇(0.3mL,2.16mmol)中。在室温下3小时后，在真空中去除溶剂，以得到粗157-4，其不经进一步纯化即使用。
将化合物157-5 (400 mg; 1.2 mmol)和157-4 (900 mg, 2.16 mmol; 1.5×)与吡啶(2×)和甲苯(2×)共同蒸发，然后在0℃下溶解于THF(8mL)中。添加二异丙基乙胺(DIPEA) (0.82 mL; 4 eq.)、双(2-氧代-3-噁唑烷基)次膦酰氯 (Bop-Cl) (0.6 g; 2eq.)、硝基三唑 (0.266 g, 2 eq.)。将混合物在0℃下保持2小时。将混合物用EA(50mL)稀释并用饱和碳酸氢钠(2×50mL)萃取并经硫酸钠干燥。在真空中去除溶剂。通过快速色谱法使用己烷中的EA 的10%至100%梯度纯化残余物，以得到纯化的157-6 (175 mg, 0.6mmol)。
将纯化的157-6溶解于80% HCOOH水溶液(20mL)中并在20℃下保持1小时。冷却至室温后，在真空中去除溶剂，并将残余物与甲苯(3×25mL)共同蒸发。通过快速色谱法使用DCM中的MeOH的0至20%梯度纯化残余物，以得到纯化的157 (26 mg). ESI-LCMS: m/z589.6 [M-H]-。
实施例148
化合物158
将核苷158-1 (来自Wuxi)(44mg, 0.15mmol)溶解于磷酸三甲酯(2mL)和干燥吡啶(0.5mL)的混合物中。将混合物在42℃下在真空中蒸发15分钟，然后冷却至室温。添加N-甲基咪唑(0.027mL, 0.33mmol)，随后添加POCl3(0.027mL, 0.3mmol)。将混合物保持在室温下。通过LC/MS以0-50%梯度监测反应物。4小时后，反应完成。用2M乙酸三乙铵缓冲液(2mL)(pH7.5)(TEAA)淬灭反应物。在制备型HPLC(Phenomenex Synergi 4u Hydro-RP250x21.2mm)上使用50mM TEAA中的0-30% ACN的梯度分离158-2。
通过与干燥吡啶重复共同蒸发(3x)来干燥化合物158-2 (三乙铵盐；45mg,0.1mmol)。将158-2溶解于干燥吡啶(1 mL)中且经2.5小时将溶液逐滴添加至二异丙基碳二亚胺(63 mg, 0.5 mmol)于吡啶(4 mL)中的沸腾溶液中。将混合物在回流下加热1小时。冷却至25℃后，将反应物用2M TEAA缓冲液(2mL)淬灭并在25℃下保持1小时。将溶液浓缩至干燥，并通过与甲苯(3×2mL)共同蒸发来去除残余吡啶。在制备型HPLC(Phenomenex Synergi4u Hydro-RP 250x21.2mm)上使用50mM TEAA中的0-30% ACN的梯度分离158-3。
在室温下，在氩气下，将化合物158-3 (三乙铵盐；26mg, 0.045mmol)溶解于干燥DMF (0.5 mL)中。向搅拌的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(40uL, 0.22mmol)，随后添加碳酸氯甲酯异丙酯(35mg, 0.22mmol)。将混合物在65℃下搅拌18小时。将混合物蒸发至干燥，并通过二氧化硅柱使用CH2Cl2中的MeOH的0-15%梯度纯化残余物。合并具有158的级分，并将混合物浓缩至干燥，以得到158 (2.3 mg). ESI-LCMS: m/z 467.5 [M-H]-。
实施例149
化合物276
在0℃(冰/水浴)下，向276-1 (180 mg, 0.16 mmol)于无水CH3CN (2.0 mL)中的搅拌溶液中添加N-甲基咪唑(53.4μL, 0.65mmol)。添加根据通用程序(McGuigan等人, J. Med. Chem. (2008) 51:5807-5812)制备的(环己基氧基-L-丙氨酸基)氯磷酸苯酯(101mg,0.29mmol)溶解于CH3CN(0.5mL)中的溶液。将溶液在0至5℃下搅拌3小时。在0℃(冰/水浴)下添加N-甲基咪唑(50μL)，随后添加(环己基氧基-L-丙氨酸基)氯磷酸苯酯(52mg, 溶解于0.5mL CH3CN中)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物冷却至0至5℃并用EA稀释。添加水(5mL)。将溶液用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用MgSO4干燥。在二氧化硅(10g柱)上用DCM/MeOH (0-10%梯度)纯化残余物，以得到作为泡沫的276-2 (96.8 mg, 64%)。
将化合物276-2 (95 mg, 0.11 mmol)溶解于无水CH3CN(0.5mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(77μL, 0.3mmol)。将混合物在室温下搅拌30分钟，并添加无水EtOH (100μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。将残余物在RP-HPLC上用H2O/CH3CN(50-100%梯度)纯化并冻干，以得到作为白色泡沫的276 (37.7 mg, 52.5%)。ESI-LCMS: m/z = 653.2 [M+H]+, 1305.4 [2M+H]+。
在-78℃下，在N2下，持续30分钟向276-A (56 g, 0.144 mol)于无水THF (600mL)中的溶液中逐滴添加三-叔丁氧基氢化铝锂溶液(216mL, 1M, 0.216mol)。将溶液在-78℃至0℃下搅拌1小时。将反应物用饱和NH4Cl溶液淬灭并用EA(3×200mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，以得到作为无色油的276-B (52 g, 92%)。
在-20℃下，在N2下，向PPh3 (45.7 g, 0.174 mol)于CH2Cl2 (200 mL)中的搅拌溶液中添加276-B (34 g, 0.087 mol)。将混合物搅拌15分钟。逐滴添加CBr4(58g,0.174mol)，同时在N2流下将温度维持在-25℃和-20℃之间。然后在低于-17℃下将混合物搅拌20分钟。用硅胶处理混合物。将溶液通过冷硅胶柱过滤并用冷洗脱液(PE:EA=50:1至4:1)洗涤。将合并的滤液在室温下在减压下浓缩，以得到粗油产物。通过硅胶柱(PE:EA=50:1至4:1)纯化残余物，以得到作为无色油的276-C (α-异构体, 24 g, 61%)。 1H-NMR (CDCl3,400 MHz), δ= 8.16 (d, J = 6.8 Hz, 2H), 8.01 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.42-7.62(m, 6H), 6.43 (s, 1H), 5.37 (d, J = 4.4 Hz, 1H), 4.68-4.86 (m, 3H), 1.88 (s,3H)。
将6-Cl-鸟苷(80.8 g, 0.478 mol)和叔-BuOK (57 g, 0.509 mol)于叔-BuOH (1L)中的混合物在30-35℃下搅拌30分钟。在室温下添加276-C (72g, 0.159mol, 在MeCN中，500mL)并将混合物加热至70℃并搅拌3小时。将反应物用饱和NH4Cl溶液淬灭，并用EA(3×300mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下蒸发。通过硅胶柱(PE:EA = 4:1至2:1)纯化残余物，以得到276-D (14 g, 16%)。1H-NMR (CDCl3, 400 MHz) δ7.93-8.04(m, 4H), 7.90 (s, 1H), 7.30-7.50 (m, 6H), 6.53 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 6.36 (s,1H), 5.35 (s, 2H), 5.06-5.10 (m, 1H), 4.81-4.83 (m, 1H), 4.60-4.64 (m, 1H),1.48 (s, 3H)。
向276-D (14 g, 25.9 mmol)于DCM (15 mL)中的溶液中添加AgNO3(8.8g,51.8mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(6.3g, 51.8mmol)以及MMTrCl(12.1g, 38.9mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。用MeOH (5mL)淬灭反应物。过滤后，将过滤器用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE:EA = 10:1至3:1)纯化残余物，以得到276-E(16 g, 80%). 1H-NMR (CDCl3, 400 MHz) δ = 8.05-8.07 (m, 4H), 7.93 (s, 1H),7.18-7.57 (m, 18H), 6.77 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 6.71 (s, 1H), 5.86 (s, 1H), 5.6(s, 1H), 4.77 (d, J =10.0 Hz, 1H), 4.67-4.76 (m, 1H), 4.55-4.59 (m, 1H), 3.75(s, 1H), 1.06 (s, 3H)。
在70℃下将钠(170mg, 7.38mmol)溶解于干燥EtOH (5mL)中，并将溶液冷却至0℃。在0℃下分份添加276-E (1 g, 1.23 mmol)。将混合物在室温下搅拌8小时。将混合物用CO2中和至pH 7.0，并在低压下浓缩。通过制备型HPLC(10% CH3CN/H2O)纯化残余物，以得到作为黄色固体的276-1 ( 0.4 g, 53%)。ESI-MS: m/z 616 [M+H]+。
实施例150
化合物222
在N2下，向221-9 (300 mg, 0.50 mmol)于MeOH (30 mL)中的溶液中添加湿Pd/C(300mg, 10%)。在25℃下，在H2(1 atm)下，将混合物搅拌1.5小时。将悬浮液过滤，然后在低压下浓缩，以得到作为白色固体的粗222-1 (307 mg)。
将化合物222-1 (307 mg, 0.48 mmol)溶解于NH3/MeOH (30mL, 7M)中。在室温下，在N2下，将混合物搅拌24小时，然后在低压下浓缩。通过制备型HPLC(水和MeCN中的0.1%HCOOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的222-2 (30mg, 21%，经2个步骤)。
将化合物222-2 (91 mg, 0.31 mmol)与甲苯共同蒸发3次以去除H2O。在0℃下，向222-2 (91 mg, 0.31 mmol)于MeCN (0.5 mL)和NMI (254 mg, 3.90 mmol)的混合物中的搅拌溶液中添加222-C (203 mg, 0.66 mmol)于MeCN (0.5 mL)中的溶液。将混合物在室温下搅拌过夜，然后在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以获得粗222，将其通过制备型HPLC(水和MeCN中的0.1% HCOOH)纯化，以得到作为白色固体的222 (30mg, 17%)。ESI-MS: m/z 540.1 [M-F]+。
实施例151
化合物226
向226-1 (50 g, 204.9 mmol)于干燥吡啶(400 mL)中的冰冷溶液中逐滴添加TIPDSCl(70.78g, 225.4mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时，然后在低压下浓缩。通过色谱法使用PE中的20% EA纯化残余物，以产生作为白色固体的226-2 (111.5 g, 100%)。
在室温下向226-2 (50 g, 103 mmol)于无水CH3CN (400 mL)中的溶液中添加IBX(43g, 153mmol)。将混合物回流过夜并通过TLC (PE:EA=1:1)监测。滤出沉淀物，并浓缩滤液，以得到作为白色固体的粗226-3 (50 g, 99%)。
在-78℃下，向三甲基甲硅烷基乙炔(20 g, 200 mmol)于无水THF (400 mL)中的溶液中逐滴添加 正-BuLi (80 mL, 200 mL)。将混合物在-78℃下搅拌30分钟，然后温热至室温持续10分钟。在-78℃下，将THF (100 mL)中的化合物226-3 (30 g, 60 mmol)逐滴添加至混合物中。将混合物在-78℃下搅拌1小时，然后缓慢温热至室温。将混合物搅拌20分钟，然后在-78℃下用饱和NH4Cl溶液淬灭反应物。将混合物用EA稀释。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(PE中的15% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的226-4 (14g, 50%)。
在N2下将化合物226-4 (14 g, 24 mmol)溶解于无水甲苯(100mL)中并冷却至-78℃。在-78℃下逐滴添加DAST(19g, 120mmol)并继续搅拌1.5小时。将混合物用EA稀释并倒入饱和NaHCO3溶液中。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的226-5 (12g, 81%)。
将226-5 (12 g, 20 mmol)和NH4F (11 g, 30 mmol)于MeOH (150 mL)中的混合物回流2小时。冷却至室温后，在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱色谱法(DCM中的5%MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的226-6 (3.1 g, 58%)。
向226-6 (3.1 g, 11.6 mmol)于干燥Py (50 mL)中的溶液中添加咪唑(3.1g,46.4mmol)和TBSCl(5.2g, 34.8mmol)。将混合物在50-60℃下搅拌3小时。将混合物在低压下浓缩，并将残余物溶解于EA(100mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的226-7 (5g,86%)。
向226-7 (4.5 g, 9 mmol)于1,4-二氧杂环己烷(45 mL)中的溶液中添加CuBr(643 mg, 4.5 mmol)、二环己胺(3.3 g, 18 mmol)和低聚甲醛 (675 mg, 22.5 mmol)。将混合物回流24小时，然后冷却至室温。用饱和NH4Cl溶液淬灭反应物。用EA(3×100mL)萃取混合物。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(PE中的15% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的226-8 (2.0g, 43%)。
将226-8 (2 g, 4 mmol)和NH4F (2.2 g, 60 mmol)于MeOH (20 mL)中的混合物回流过夜。冷却至室温后，在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱色谱法(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的226-9 (946 mg, 83%)。
在0℃下，向226-9 (946 mg, 3.33 mmol)、PPh3 (1.3 g, 5 mmol)、咪唑 (453mg, 6.66 mmol)和吡啶(3 mL)于无水THF (12 mL)中的搅拌悬浮液中逐滴添加I2(1g,4.33mmol)于THF(4mL)中的溶液。将混合物温热至室温并搅拌16小时。将反应物用饱和Na2S2O3水溶液淬灭并用EA(3×60mL)萃取。将有机层经Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的2% MeOH至DCM中的5% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的226-10(2.1g, 粗产物)。
向226-10 (2.1 g, 5.3 mmol)于THF (15 mL)中的溶液中添加DBU(15g,100mmol)并将混合物搅拌30分钟。将混合物用EA稀释并用乙酸中和。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM中的1.5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的226-11 (800mg, 90%)。
向226-11 (800 mg, 3 mmol)于干燥MeCN (1.5 mL)中的冰冷溶液中添加NEt3•3HF (484 mg, 3 mmol)和NIS (1.68 g, 7.5 mmol)。将混合物在室温下搅拌30分钟，并通过LCMS监测反应物。将反应物用饱和Na2S2O3和饱和NaHCO3溶液淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的25% EA)纯化残余物，以提供作为白色固体的226-12 (850 mg, 68%)。
向226-12 (850 mg, 2 mmol)于干燥DCM (10 mL)中的溶液中添加DMAP(488mg,4mmol)和BzCl(422mg, 3mol)。将混合物在室温下搅拌4-5小时，并通过LCMS监测反应物。将混合物用CH2Cl2(40mL)稀释，并用饱和NaHCO3溶液洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下蒸发滤液，并通过硅胶柱色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的226-13 (900 mg, 87%)。
用TFA将氢氧化四丁铵(21mL, 作为54-56%水溶液，~ 42 mmol, 24eq.)调节至pH~ 4 (~ 3.5 mL)，并将溶液用226-13 (900 mg, 1.7 mmol)于DCM (21 mL)中的溶液处理。在剧烈搅拌下逐份添加间氯过苯甲酸(2.1 g, 60-70%, ~ 8.75 mmol, ~ 5 eq.)，并将混合物搅拌过夜。将混合物用CH2Cl2(30mL)稀释，并用饱和NaHCO3溶液洗涤。将有机层用盐水洗涤，经无水硫酸镁干燥并在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的40-70% EA)纯化残余物，以得到作为油的226-14。通过TLC(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到纯226-14 (350 mg50%)。
用MeOH中的7N NH3 (15mL)处理化合物226-14 (350 mg, 0.86 mg)。将混合物搅拌2-3小时并通过TLC监测。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶柱色谱法(DCM中的5%异丙醇)纯化残余物，以得到作为白色固体的226-15 (250 mg, 96%)。1H NMR (CD3OD, 400 M Hz) δ= 7.75 (d, J = 7.9 Hz, 1H), 6.60-6.35 (m, 1H), 5.72 (d, J = 8.2 Hz, 1H),5.37-5.25 (m, 1H), 5.17-5.06 (m, 1H), 5.04-4.94 (m, 1H), 4.59-4.29 (m, 1H),3.87-3.70 (m, 2H)。
在-78℃下，向226-16 (3.79 g, 18 mmol)和226-17 (3 g, 18 mmol)于无水DCM(60 mL)中的搅拌溶液中逐滴添加TEA(4g, 39mmol)于DCM (40mL)中的溶液，并将混合物搅拌2小时。在低压下浓缩混合物，并将残余物溶解于甲基-丁基醚中。通过过滤去除沉淀物，并浓缩滤液，以得到粗产物。通过干燥柱色谱法(无水DCM)纯化残余物，以得到作为无色油的纯226-18 (3g, 54%)。
将化合物226-15 (200 mg, 0.66 mmol)与甲苯共同蒸发3次以去除H2O。用MeCN(1.5 mL)和NMI (541 mg, 6.6 mmol)处理化合物226-15。将混合物在室温下搅拌，然后添加MeCN (0.5 mL)中的226-18 (403 mg, 1.32 mmol)。通过硅胶柱(DCM中的5% 异PrOH)纯化残余物，以得到粗产物，将其通过HPLC(水和MeCN中的0.1% HCOOH)纯化，以得到226 (33mg, 9%)。ESI-LCMS: m/z 594 [M+Na]+。
实施例152
化合物277和278
在室温下，向2000mL圆底烧瓶中置入278-1 (100 g, 384.20 mmol, 1.00 eq.)于N,N-二甲基甲酰胺(1000 mL)中的溶液。以几批添加NaH (11.8 g, 491.67 mmol, 1.20 eq.)并将混合物在0℃下搅拌0.5小时。在0℃下添加(溴甲基)苯(78.92g, 461.44mmol, 1.20eq.)并将溶液在室温下搅拌过夜。用水淬灭反应物。将溶液用EA(2000mL)稀释，用NaCl水溶液(3×500mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶柱用EA:PE (1:10)纯化粗产物，以产生278-2 (105 g, 78%)。
向1000mL圆底烧瓶中置入278-2 (100 g, 285.38 mmol, 1.00 eq.)、乙酸(300mL)和水 (100 mL)。将溶液在室温下搅拌过夜。然后将混合物用EA(2000mL)稀释，用NaCl水溶液(2×500mL)和碳酸氢钠水溶液(3×500mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。获得作为淡黄色油的粗278-3 (64 g)。ESI MS m/z: 333 [M+Na]+。
向5000mL圆底烧瓶中置入278-3 (140 g, 451.11 mmol, 1.00 eq.)于MeOH (500mL)中的溶液。添加过碘酸钠(135.2g, 632.10mmol, 1.40eq.)于水(1000mL)中的溶液。将溶液在室温下搅拌1小时，然后用EA(2000mL)稀释，用NaCl饱和溶液(3×500mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。将固体在烘箱中在减压下干燥，以产生作为黄色油的粗278-4 (97 g)。
在室温下，向3000mL圆底烧瓶中置入278-4 (100 g, 359.32 mmol, 1.00 eq.)于四氢呋喃 (500 mL)中的溶液。添加水(500mL)。在0℃下，向混合物中添加NaOH溶液(600mL,2N, 在水中)，随后添加甲醛水溶液(240mL, 37%)。将溶液在室温下搅拌过夜。将混合物用EA(1500mL)稀释，用NaCl饱和溶液(3×500mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶柱用EA:PE (1:1)纯化粗产物，以得到作为白色固体的278-5 (52.5 g, 47%)。ESI MS m/z: 333 [M+Na]+。
在室温下，向3000mL圆底烧瓶中置入278-5 (76 g, 244.89 mmol, 1.00 eq.)于乙腈(1500 mL)中的溶液。在0℃下，以几批添加NaH (6.76 g, 281.67 mmol, 1.15 eq.)。将溶液在0℃下搅拌15分钟，然后添加(溴甲基)苯(48.2g, 281.82mmol, 1.15eq.)。将溶液在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭，用EA(3000mL)稀释，用NH4Cl水溶液(3×500mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶柱用EA:PE (1:5)纯化粗产物，以产生作为黄色油的278-6 (50 g, 51%)。ESI MS m/z: 423 [M+Na]+。
在室温下，向250mL圆底烧瓶中置入三氟化二乙基氨基硫(6.6mL, 2.00eq.)于甲苯(10mL)中的溶液。在0℃下添加甲苯(120mL)中的278-6 (10 g, 24.97 mmol, 1.00eq.)。在60℃下，在油浴中，将溶液搅拌3小时。将混合物冷却至0℃，用EA(300mL)稀释，用NaCl饱和溶液(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶柱用EA:PE (1:5)纯化粗产物，以得到作为黄色油的278-7 (5000 mg, 50%)。ESI MS m/z: 425 [M+Na]+。
向用N2惰性气氛吹扫并维持的250mL 3颈圆底烧瓶中置入乙酸(80 mL)中的278-7(10 g, 23.61 mmol, 1.00 eq., 95%)。添加乙酸酐(6mL)和硫酸(0.05mL)。将溶液在室温下搅拌2小时。然后将混合物用EA(500mL)稀释，用水(3×200mL)和碳酸氢钠水溶液(3×200mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶柱用EA:PE (1:10~1:5)纯化粗产物，以产生作为黄色油的278-8 (6 g, 54%)。ESI MS m/z: 469 [M+Na]+。
向经吹扫的50mL圆底烧瓶中置入278-8 (4 g, 8.96 mmol, 1.00 eq.)、10% Pd-C催化剂(4 g)于MeOH/DCM (25 mL/25 mL)中的溶液。向该混合物中以~ 3个大气压引入H2(气体)。将溶液在室温下搅拌48小时。通过过滤收集固体，并将溶液在减压下浓缩，以得到作为无色油的278-9 (0.7 g, 29%)。
向25mL圆底烧瓶中置入吡啶(8 mL)中的278-9 (2000 mg, 7.51 mmol, 1.00eq.)、Ac2O (8 mL)、4-二甲基氨基吡啶(183.2 mg, 0.20 eq.)。将溶液在室温下搅拌3小时。反应物为饱和碳酸氢钠溶液。将溶液用EA(200mL)稀释，用NaCl饱和溶液(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶柱用EA:PE (1:7)纯化粗产物，以产生作为白色固体的278-10 (1500mg, 57%)。ESI MS m/z: 373 [M+Na]+。
在室温下，向25mL圆底烧瓶中置入278-10 (300 mg, 0.86 mmol, 1.00 eq.)于二氯甲烷(3 mL)中的溶液。在室温下添加三甲基硅烷甲腈(169 mg, 1.70 mmol, 2.00 eq.)，随后在0℃下添加四氯锡烷(223mg, 0.86mmol, 1.00eq.)。将溶液在0℃下搅拌3小时。用饱和碳酸氢钠溶液淬灭反应物。将溶液用DCM (50mL)稀释，用NaCl饱和溶液(2×10mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。将粗产物通过硅胶柱用PE:EA (5:1)纯化，以得到作为黄色油的278-11 (110 mg, 40%)。1H-NMR (400MHz, CDCl3): δ ppm 5.67~5.75(m, 2H),4.25~4.78(m, 5H), 2.19(s, 3H), 2.14(s, 3H), 2.10(s, 3HI)。
向25mL圆底烧瓶中置入四氯甲烷(5 mL)中的278-11 (200 mg, 0.63 mmol, 1.00eq.)、NBS (223 mg, 1.25 mmol, 2.00 eq.)。将溶液在回流下经250W钨灯加热3小时，然后冷却至室温。用饱和碳酸氢钠溶液淬灭反应物。将溶液用EA(100mL)稀释，用NaCl饱和溶液(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶柱用PE:EA (7:1)纯化粗产物，以得到作为黄色油的278-12 (120 mg, 48%)。1H-NMR (400MHz, CDCl3): δ ppm 6.03(d, J=4.8Hz, 1H), 5.90(d, J=4.8Hz, 1H), 4.29-4.30(m, 4H), 2.25(s, 3H), 2.15(s, 3H), 2.25(s, 3H)。
向用氩气惰性气氛吹扫并维持的25mL圆底烧瓶中置入N-(2-氧代-1,2-二氢嘧啶-4-基)苯甲酰胺(54.3 mg, 2.00 eq.)和(NH4)2SO4 (5 mg)于HMDS (3 mL)中的溶液。在油浴中在120℃下，将溶液搅拌过夜。将溶液在真空中浓缩，并在Ar下将残余物溶解于DCE(1mL)中。添加278-12 (50 mg, 0.13 mmol, 1.00 eq.)于MeCN (1 mL)中的溶液，随后添加AgOTf(32.5 mg, 1.00 eq.)。将溶液在10mL密封管中在80℃下搅拌3小时。冷却至室温后，将溶液用EA(50mL)稀释，用饱和碳酸氢钠溶液(3×10mL)和饱和NaCl溶液(2×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶柱用DCM:MeOH (15:1)纯化粗产物，以产生作为黄色油的278-13 (30 mg, 45%)。ESI MS m/z: 428 [M+H]+。
向25mL圆底烧瓶中置入278-13 (100 mg, 0.23 mmol, 1.00 eq.)于ACN (3 mL)中的溶液。添加4-二甲基氨基吡啶(28.5 mg, 0.23 mmol, 1.00 eq.)和TEA (71 mg, 0.70mmol, 3.00 eq.)，随后添加TPSCl(212.8mg, 0.70mmol, 3.00eq.)。将溶液在室温下搅拌3小时，然后在真空中浓缩。获得作为黄色油的粗278-14 (200 mg)。
向25mL圆底烧瓶中置入278-14 (140 mg, 0.10 mmol, 1.00 eq.)于ACN (3 mL)和氢氧化铵(3mL)中的溶液。在油浴中在35℃下，将溶液搅拌4小时。将混合物在真空下浓缩。将粗产物通过制备型HPLC(制备型HPLC-020)纯化：柱，XBridge Prep C18 OBD柱, 19*150 mm 5um 13nm；流动相：具有0.05% TFA的水和ACN(8分钟内35.0%至48.0% ACN)；检测器：nm，以产生作为白色固体的278 (21.3 mg, 25%)。ESI MS m/z: 301.1 [M+1]+。
向25mL圆底烧瓶中置入278-13 (50 mg, 0.12 mmol, 1.00 eq.)、饱和NH4OH(2mL)和1,4-二氧杂环己烷(2mL)的溶液。将溶液在室温下搅拌2小时。在减压下浓缩之后，将粗产物通过制备型HPLC纯化[(制备型HPLC-020)：柱：XBridge Prep C18 OBD柱，19*150mm 5um 13nm；流动相：具有0.05% TFA的水和ACN(8分钟内35.0% ACN直至48.0% ACN)；检测器：nm]，以产生作为白色固体的277 (13.6 mg, 39%)。ESI MS m/z: 299.9 [M-1]-。
实施例153
化合物279
将核苷279-1 (100 mg, 0.26 mmol)溶解于正丁胺(2mL)中并在室温下放置2小时。蒸发溶剂，并在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC纯化残余物。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的10%至60%的MeOH的线性梯度来洗脱。将相应级分合并，浓缩并冻干(3x)以去除过量缓冲液并产生279 (20 mg, 25%). MS: m/z 308 [M-1]。
实施例154
化合物280
在-40℃下，经30分钟的时段向280-1 (43.6%，在二氯甲烷中，345.87g, 1.16mol)于无水DCM (1.0L)中的搅拌溶液中逐滴添加2-(三苯基亚膦基)丙酸乙酯(400g, 1.100mol)。将混合物温热至25℃并搅拌12小时。将混合物在减压下浓缩。将残余物悬浮于TMBE(2.0L)中。通过过滤去除固体。在减压下浓缩滤液。在硅胶柱(PE中的1.2% EA)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的280-2 (191.3 g, 80.26%)。1H-NMR (400 Hz, CDCl3), δ = 6.66 (dd, J= 6.8, 8.0 Hz, 1H), 4.81-4.86 (m, 1H), 4.11-4.21 (m, 3H), 3.60 (t, J = 8.4Hz, 1H), 1.87 (d, J = 1.2 Hz, 3H), 1.43 (s, 3H), 1.38 (s, 3H), 1.27 (t, J =6.8 Hz, 3H)。
在0-5℃下，向280-2 (100 g, 0.47 mol)于丙酮(2.0 L)中的搅拌溶液中分份添加KMnO4(90g, 0.57mol)。将混合物在0-5℃下搅拌2小时。使用饱和亚硫酸钠溶液(600mL)淬灭反应物。2小时后，形成无色悬浮液。通过过滤去除固体。用EA(300mL)洗涤滤饼。用EA(3×300mL)萃取滤液。将有机相经无水Na2SO4干燥。在减压下浓缩有机相，以得到作为固体的粗280-3 (50 g, 43.4%)。
在0℃下，向280-3 (50.0 g, 0.20 mol)和三乙胺(64.0 g, 0.63 mol)于无水DCM(1.0 L)中的搅拌溶液中添加亚硫酰氯(36.0 g, 0.31 mol)。30分钟后，将混合物用二氯甲烷(500mL)稀释并用冷水(1.0L)和盐水(600mL)洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥。在减压下浓缩有机相，以得到作为褐色油的粗产物。在0℃下，向无水乙腈中的粗产物中添加TEMPO催化剂(500mg)和NaHCO3(33.87g, 0.40mol)。在0℃下，持续20分钟逐滴添加次氯酸钠溶液(10-13%, 500 mL)。将溶液在25℃下搅拌1小时。浓缩有机相，并用二氯甲烷萃取水相(3x)。将有机相经无水Na2SO4干燥。在减压下去除溶剂，以得到作为黄色油的280-4 (53.0 g,85.48 %)。
在25℃下，向280-4 (62.0 g, 0.20 mol)于无水二氧杂环己烷(1.5 L)中的搅拌溶液中添加TBACl(155.4g, 0.50mol)。将溶液在100℃下搅拌10小时。将混合物冷却至25℃，并用2,2-二甲氧基丙烷(700mL)处理，随后用浓HCl(12N, 42mL)处理。将混合物在25℃下搅拌3小时，然后在减压下浓缩，以得到作为褐色油的粗280-5 (45.5g, 粗产物)，其不经进一步纯化即用于下一步骤。
将粗280-5 (45.5 g, 171 mmol)溶解于EtOH (500 mL)和浓HCl(12N, 3.0mL)的混合物中。将混合物在25℃下搅拌16小时。在减压下去除溶剂。将残余物与甲苯共同蒸发(3x)，以得到作为褐色油的粗280-6 (24.6g, 粗产物)，其用于下一步骤。
在0℃下，持续40分钟向粗280-6 (24.6g, 粗产物)和DMAP(4.8g, 40.0mmol)于无水吡啶(800mL)中的搅拌溶液中逐滴添加苯甲酰氯(84.0g, 0.60mol)。将混合物在25℃下搅拌12小时，然后在低压下浓缩。将残余物溶解于EA(1.5L)中。用1.0M HCl溶液(400mL)和盐水(800mL)洗涤溶液。将有机相经无水Na2SO4干燥。在减压下去除溶剂，以得到褐色固体。将固体悬浮于MeOH (600mL)中。过滤后，用MeOH洗涤滤饼。在减压下干燥滤饼，以得到作为白色固体的280-7 (40.0 g, 75.0%)。
在-78℃下，在N2下，经30分钟的时段向280-7 (7.0 g, 18.04 mmol)于无水THF(70 mL)中的搅拌溶液中逐滴添加三-叔丁氧基氢化铝锂的溶液(27mL, 1.0M,27.06mmol)。将混合物在-20℃下搅拌1小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EA稀释。过滤后，用EA萃取滤液。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE中的5% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的280-8 (6.8 g, 96.7%)。
在-20℃下，在N2下，向PPh3(1.34g, 5.12mmol)于CH2Cl2(5mL)中的搅拌溶液中添加280-8 (1.0 g, 2.56 mmol)。将混合物搅拌15分钟后，分份添加CBr4(1.96g,5.89mmol)，同时在N2流下将反应温度维持在-25℃和-20℃之间。添加完成后，将混合物在低于-17℃下搅拌20分钟。用硅胶处理反应物。过滤后，用CH2Cl2洗涤硅胶垫。将合并的滤液通过硅胶柱(PE中的EA，2%至25%)纯化，以得到作为无色油的280-9 (α-异构体, 0.5 g,43.4%)。
在搅拌下，向0.25L三颈圆底烧瓶中装入6-氯-9H-嘌呤-2-胺(5.5 g, 34.75mmol)，随后装入无水叔-BuOH (45mL)。在室温下，在N2流下，向该溶液中分份添加叔丁醇钾(3.89g, 32.58mmol)。30分钟后，在25℃下，经5分钟的时段添加280-9 (4.92 g, 10.86mmol)于无水乙腈(30 mL)中的溶液。将混合物缓慢加热至50℃并搅拌12小时。将混合物用固体NH4Cl和水处理，然后通过硅藻土短垫过滤。用EA洗涤垫，并用1.0M HCl水溶液中和滤液。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。在减压下浓缩有机相。通过硅胶柱(PE中的EA，2%至20%)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的280-10 (1.7 g, 28.9%)。1H-NMR (400MHz,DMSO-d6) δ = 8.37 (s, 1H), 8.07-8.01 (m, 2H), 7.93-7.87 (m, 2H), 7.75-7.69(m, 1H), 7.65-7.53 (m, 3H), 7.41 (t, J=7.8 Hz, 2H), 7.13 (s, 2H), 6.37(d, J=19.3 Hz, 1H), 6.26-6.13 (m, 1H), 4.86-4.77 (m, 1H), 4.76-4.68 (m, 2H), 1.3(d, J=20 Hz, 3 H)。
在25℃下，将化合物280-10 (700 mg, 1.29 mmol)溶解于MeOH中的4% HCl(25mL)中。将混合物在50℃下搅拌12小时。在减压下去除溶剂。通过柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的280-11 (401 mg, 59.2%)。
在25℃下，将化合物280-11 (250 mg, 0.477 mmol)用MeOH中的7.0M NH3(25mL)处理并搅拌18小时。在低压下去除溶剂。通过制备型HPLC(NH4HCO3体系)纯化残余物，以得到作为白色固体的280 (85 mg, 56.4%)。MS: m/z 315.7 [M+H]+, 630.5 [2M+H]+。
实施例155
化合物281
在室温下，向281-1 (3.00 g, 5.23 mmol)于无水DCM (36 mL) 中的搅拌溶液中添加PDC (3.94 g, 10.46 mmol)、Ac2O (5.34 g, 52.30 mmol)和2-甲基丙-2-醇(7.75 g,104.60 mmol)。将混合物在室温下搅拌15小时。将混合物装填在非常短的硅胶柱上并用EA洗脱。将含产物的级分合并并在减压下浓缩。通过柱色谱法（PE中的20%EA）纯化残余物以得到作为白色泡沫的281-2 (2.40 g, 71.3%)。
向281-2 (2.00 g, 3.26 mmol)于 DCM (30 mL)中的搅拌溶液中添加TFA (15mL)。将混合物在室温下搅拌1.5小时。在减压下浓缩混合物以得到281-3 (1.00 g, 粗产物)，其未经进一步纯化即用于下一步骤中。
将粗281-3 (1.00 g, 粗产物)溶解于甲苯(25 mL)和MeOH (20 mL)的混合物中。添加TMS-重氮甲烷(2 M, 3.17 mL)。搅拌2小时后，在室温下在减压下浓缩混合物。将残余物用EA (25 mL)稀释，用水(25 mL)洗涤，经无水MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化残余物以得到作为白色固体的281-4 (451 mg, 43.2%)。浓缩水相以得到作为白色固体的281-3 (500 mg, 50.0%)。
在室温下，向281-4 (451 mg, 1.37 mmol)于无水CD3OD (18 mL)的溶液中添加NaBD4 (344 mg, 8.22 mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。将反应物用CD3OD (0.2 mL)淬灭并用AcOH (0.2 mL)中和。在减压下浓缩混合物。通过柱色谱法(DCM中的4% MeOH)纯化残余物以得到作为白色固体的281-5 (410 mg, 98.7%)。
在室温下，向281-5 (410 mg, 1.35 mmol)于吡啶(2.5 mL)中的搅拌溶液中添加咪唑(459 mg, 6.75 mmol)和TBSCl (610 mg, 4.05 mmol)。将混合物在60℃下搅拌10小时。在减压下浓缩混合物。将残余物用EA (20 mL)稀释并用盐水(20 mL)洗涤。将有机层经MgSO4干燥并过滤。在减压下浓缩滤液。通过柱色谱法(PE中的10% EA)纯化残余物以得到作为白色固体的281-6 (440 mg, 61.3%)。
在室温下，向281-6 (440 mg, 827 μmol)于无水MeCN (4 mL)的溶液中添加DMAP(253 mg, 2.07 mmol)、Et3N (209.32 mg, 2.07 mmol)和2,4,6-三异丙基苯-1-磺酰氯(626.50 mg, 2.07 mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。添加NH3·H2O (2 mL)并将混合物搅拌1小时。将混合物用EA (20 mL)稀释并用饱和NH4Cl水溶液(20 mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。在减压下浓缩滤液。通过柱色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化残余物以得到粗产物。通过TLC (DCM中的10% MeOH)纯化粗产物以得到作为白色固体的281-7 (420mg, 95.63%)。
在室温下，向281-7 (420 mg, 791 μmol于 MeOH (4 mL)中的溶液中添加NH4F(586 mg, 15.83 mmol)。将混合物在90-100℃下搅拌10小时。将混合物过滤并在减压下浓缩滤液。通过柱色谱法(DCM中的10% MeOH)纯化残余物以得到粗产物。通过制备型HPLC（中性条件）纯化粗产物以得到作为白色固体的281 (201 mg, 61.8%收率, 100%氘)。ESI-TOF-MS: m/z 303.1 [M+H]+, 605.2 [2M+H]+。
实施例156
化合物274
向双(POM)磷酸三乙铵(7mmol, 由2.3g双(POM)磷酸盐和1mL Et3N制备)和274-1(1.36 g; 4.2 mmol)的冰冷溶液中添加二异丙基乙胺(3.6mL; 21mmol)、BOP-Cl(2.68g;10.5mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑(1.20g; 10.5mmol)。将混合物在0℃下搅拌2小时。然后将混合物用EtOAc稀释，用1M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤并用Na2SO4干燥。在硅胶柱上用异-PrOH/CH2Cl2溶剂体系(2-12%梯度)纯化蒸发的残余物，以产生274-2 (2.13 g,80%)。
将274-2 (2.13 g)于80% HCOOH水溶液(10mL)中的溶液在45℃下搅拌8小时。将混合物冷却并浓缩，以获得残余物。将残余物与甲苯和含有几滴Et3N的MeOH共同蒸发。在硅胶柱上用MeOH:CH2Cl2 (3-10%梯度)纯化蒸发的残余物，以产生作为白色泡沫的274 (1.1g,56%)。MS: m/z = 565 [M-1]。
实施例157
化合物282
将40-1 (1.78 g, 5 mmol)和化合物A (3.22g, 5.5mmol; 根据WO 2008/82601 A2中提供的程序制备)与吡啶共同蒸发，然后溶解于吡啶(70mL)中。在-15℃下逐滴添加新戊酰氯(1.22mL; 10mmol)，并将混合物在-15℃下搅拌2小时。将混合物用CH2Cl2稀释，用0.5MNH4Cl水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:异-PrOH (4-10% B梯度)纯化蒸发的残余物，以提供282-2 (2.1 g, 50%)。
向282-2 (0.51 g, 0.62 mmol)于CCl4 (6 mL)中的溶液中逐滴添加苄胺(0.34mL, 3.1 mmol)，并将混合物在室温下搅拌1小时。将混合物用EtOAc稀释，用0.5M柠檬酸水溶液、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤并用Na2SO4干燥。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:异-PrOH(4-10% B梯度)纯化蒸发的残余物，以提供 282-3 (0.46 g, 80%)。
将282-3 (130 mg, 0.14 mmol)和80% TFA水溶液(1.5mL)的混合物在室温下搅拌2小时。将混合物蒸发并与甲苯共同蒸发。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:MeOH (4-12% B梯度)纯化残余物，以提供282 (32 mg (37%). MS: m/z = 620 [M+1]+。
实施例158
化合物283
用羰基二咪唑(81mg, 0.5mmol)处理Z-Ala-OH (111.6 mg, 0.5 mmol)于无水THF (2mL)中的溶液。在40℃下，在Ar气氛下，将混合物搅拌1小时。将该溶液添加至44 (200 mg,0.33 mmol)、Et3N (72 μL, 0.5 mmol)和DMAP (4 mg)于DMF (2 mL)中的溶液中。将混合物在室温下搅拌2.5小时。将反应物通过在0至5℃(冰/水浴)下添加1M柠檬酸(2mL)来淬灭并用EA稀释。将有机层分离，用碳酸氢钠和盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并浓缩。通过柱色谱法以40至90% EA-己烷纯化残余物，以得到作为白色泡沫的283-1 (202 mg, 76%)。
向283-1 (50 mg, 0.062 mmol)于无水EtOH (2 mL)中的溶液中添加10% Pd/C(5mg)，随后添加4N HCl (31 μL, 0.124 mmol)，并将混合物在H2气氛下搅拌1小时。反应完成后，将混合物通过硅藻土过滤。用无水EtOH洗涤催化剂滤饼。合并洗涤液和滤液，并在真空中去除溶剂，以得到作为灰白色泡沫的283 (33.3 mg, 79.7%)。MS:m/z = 674.1[M+H]+,1347.2[2M+H]+。
实施例159
化合物284
用羰基二咪唑(81mg, 0.5mmol)处理Z-Gly-OH (105 mg, 0.5 mmol)于无水THF (2mL)中的溶液。将混合物在40℃下搅拌2小时，随后在80℃下在Ar气氛下搅拌30分钟。将该溶液添加至44 (200 mg, 0.33 mmol)、Et3N (72 μL, 0.5 mmol)和DMAP (4 mg)于DMF (2mL)中的溶液中。将混合物在室温下搅拌3小时。将反应物通过在0至5℃(冰/水浴)下添加1M柠檬酸(2mL)来淬灭并用EA稀释。将有机层分离，用碳酸氢钠和盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并浓缩。通过柱色谱法以40至90% EA-己烷纯化残余物，以得到作为灰白色泡沫的284-1(208.5 mg, 79.6%)。
向284-1 (75 mg, 0.094 mmol)于无水EtOH (3 mL)中的溶液中添加10% Pd/C(10mg)，随后添加4N HCl (47 μL, 0.19 mmol)。将混合物在H2气氛下搅拌3小时。反应完成后，将混合物通过硅藻土过滤。用无水EtOH洗涤催化剂滤饼。合并洗涤液和滤液，并在真空中去除溶剂，以得到作为灰白色泡沫的284 (44.3 mg, 71.5%)。MS:m/z = 658.05[M+H]+,1317.05[M+H]+。
实施例160
化合物285
向282-2 (223 mg, 0.27 mmol)于CCl4 (3 mL)中的溶液中添加L-丙氨酸异丙酯盐酸盐(135mg, 0.8mmol)并逐滴添加Et3N(0.22mL, 1.6mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。然后将混合物用CH2Cl2稀释，用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤并用Na2SO4干燥。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:异-PrOH (3-10% B梯度)纯化蒸发的残余物，以提供 285-1 (0.16 g, 62%)。
将285-1 (100 mg, 0.11 mmol)和80% TFA水溶液(3mL)的混合物在室温下搅拌2小时。然后将混合物蒸发并与甲苯共同蒸发。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:MeOH (4-10% B梯度)纯化残余物，以提供 285 (31 mg, 46%). MS:m/z = 644 [M+1]+。
实施例161
化合物286和351
向40-1 (1.08 g, 3.0 mmol)于N,N-二甲基乙酰胺(15 mL)中的溶液中添加CsCO3(1.22g, 3.7mmol)，并将混合物在室温下搅拌15分钟。添加氯甲基磷酸二苄酯(1g,3.0mmol)，并将混合物在40℃下搅拌过夜。冷却后，将混合物用甲基叔丁基醚稀释并用水(3X)和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:异-PrOH (3-10% B梯度)纯化蒸发的粗残余物，以产生286-1 (580 mg, 30%)。
向双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸三乙铵(1.8mmol, 由0.60g双(异丙基氧基羰基氧基甲基)磷酸盐和Et3N制备)于THF中的溶液中添加286-1 (0.58 g, 0.9 mmol)。将混合物蒸发并通过与吡啶、随后甲苯共同蒸发使其无水。将蒸发的残余物溶解于无水THF(9mL)中并在冰浴中冷却。添加二异丙基乙胺(0.94mL, 5.4mmol)，随后添加BOP-Cl (0.69g, 2.7 mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑 (0.31 g, 2.7 mmol)。将混合物在0-5℃下搅拌2小时，用EtOAc稀释，用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:异-PrOH (3-10% B梯度)纯化蒸发的残余物，以产生286-2 (0.77 g, 89%)。
向286-2 (50 mg; 0.05 mmol)于EtOH (2.5 mL)中的溶液中添加10% Pd/C(8mg)，并将混合物在H2(大气压)下搅拌1小时。将混合物通过硅藻土垫过滤并蒸发滤液。将残余物用80% HCOOH水溶液(2.5mL)处理3小时，然后蒸发并通过RP-HPLC(A：50mM TEAA水溶液，B：MeCN中的50mM TEAA)纯化，以提供作为白色固体的286 (22 mg, 44%)。MS:m/z = 713 [M+1]+。
在0℃下，向286 (14 mg, 0.02 mmol)于EtOH (0.3 mL)中的溶液中逐滴添加EtOH中的0.1M EtONa (0.4mL; 0.04mmol)。将混合物温热至室温并将所得白色固体离心。丢弃上清液。将固体用EtOH (0.3mL)处理并离心，以产生351 (8 mg)。MS:m/z = 713 [M+1]+。
实施例162
化合物287
在室温下，向287-1 (300 g, 1.86 mol)于丙酮(4 L)中的搅拌悬浮液中逐滴添加浓H2SO4(56mL)。将混合物在室温下搅拌3小时。将混合物用固体NaHCO3中和并过滤。在减压下蒸发滤液，以得到作为无色油的287-2 (381g, 粗产物)，其不经进一步纯化即用于下一步骤。
在0℃下，向287-2 (380g, 粗产物，1.88mol)于无水DCM (2L)中的搅拌溶液中添加咪唑(191g, 2.82mol)和TBSCl(564g, 3.76mol)。将混合物在室温下搅拌12小时，然后过滤。将滤液浓缩至干燥并通过硅胶柱(PE中的2% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的287-3 (569g, 97%，在2个步骤中)。
在-78℃下，持续3小时向287-3 (150 g, 0.47 mol)于无水THF (2 L)中的溶液中添加DIBAL-H (710mL, 0.71mol, 1.0M, 在甲苯中)。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭，然后过滤。将滤液用EA萃取，并用盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并过滤。将滤液浓缩至干燥。通过硅胶柱(PE中的11% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的287-4 (121 g,80.5%)。
将异丙基三苯基鏻碘化物(422.8g, 0.98mol)悬浮于无水THF(1L)中并冷却至0℃。经0.5小时逐滴添加BuLi溶液(2.5M, 在THF中，391mL, 0.98mol)。将深红色溶液在0℃下维持0.5小时并经2小时缓慢添加THF (1 L)中的287-4 (207.5 g, 0.65 mol)。将混合物温热至环境温度并搅拌12小时。用饱和NaHCO3水溶液淬灭反应物。通过过滤去除沉淀的固体。将滤液用EA稀释，并用盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下浓缩滤液，并通过硅胶色谱法(PE中的10%至30% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的287-5(104.7 g, 47%)。
向287-5 (4.9 g, 14.2 mmol)于无水MeCN (70 mL)中的搅拌溶液中添加IBX(7.9g, 28.4mmol)。将混合物回流2小时。过滤混合物并将滤液浓缩至干燥。通过柱色谱法(PE中的1% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的287-6 (4.6 g, 94.8%)。
在-78℃下，向287-6 (2.0 g, 5.8 mmol)和二氟甲基苯基砜(2.24g, 11.7mmol)于无水DMF(50mL)中的搅拌溶液中逐滴添加LiHMDS(1.0M, 在THF中，11.7mL)。在-78℃下搅拌2小时后，用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应物。然后将混合物在0℃下搅拌30分钟。分离有机相并用EA萃取水相。将合并的有机相用盐水洗涤，经Na2SO4干燥并过滤。将滤液浓缩至干燥。基于硅胶色谱法(PE中的0.25% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的287-7 (1.1 g,32.1%)。1H-NMR (CDCl3, 400 MHz) δ = 8.01-7.97 (m, 2H), 7.74-7.70 (m, 1H), 7.61-7.57 (m, 2H), 5.80 (d, J=1.6 Hz, 1H), 4.26 (d, J=11.2 Hz, 1H), 4.08 (s, 1H),4.03 (d, J=11.2 Hz, 1H), 3.86 (s, 1H), 1.82 (s, 3H), 1.69 (s, 3H), 1.54 (s,3H), 1.41 (d, J=12.4 Hz, 6H), 0.89 (s, 9H), 0.09 (d, J=9.6 Hz, 6H)。
向287-7 (4.0 g, 7.5 mmol)于DMF (80 mL)和H2O (16 mL)中的搅拌溶液中添加Mg(3.6g, 149.8mmol)，随后添加HOAc(13.5g, 224.7mmol)。将混合物在室温下搅拌6小时。将混合物倒入冰水中并过滤。用EA萃取滤液。将合并的有机相用盐水洗涤，经Na2SO4干燥并过滤。将滤液浓缩至干燥，并基于硅胶色谱法(PE中的0.2% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的287-8 (1.12 g, 38%)。1H-NMR (CDCl3, 400 MHz) δ = 5.88-5.74 (m, 2H), 3.98-3.78 (m, 3H), 3.30 (s, 1H), 3.08 (s, 1H), 1.83 (s, 3H), 1.70 (s, 3H), 1.41(s,3H), 1.35 (d, J=23.2 Hz, 6H), 0.90 (d, J=4.4 Hz, 9H), 0.08 (d, J=7.6 Hz, 6H)。
向287-8的溶液(1.12 g, 2.84 mmol)中添加TBAF于THF中的溶液(6mL, 1.0M)，并将混合物在室温下搅拌30分钟。将混合物浓缩至干燥，并通过硅胶柱色谱法(PE中的3% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的287-9 (332 mg, 41.7%)。
在0℃下，向287-9 (415 mg, 1.5 mmol)于无水DCM (7.5 mL)中的溶液中添加Et3N(224mg, 2.2mmol)和BzCl(248mg, 1.7mmol)。将混合物在室温下搅拌4小时。在反应完成之后，将反应物用饱和NaHCO3水溶液淬灭并用DCM萃取。将有机层经Na2SO4干燥并过滤。蒸发滤液，并通过硅胶柱色谱法(PE中的1% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的287-10(441 mg, 77.4%)。
在-78℃下，向287-10 (440 mg, 1.2 mmol)于无水DCM (10 mL)中的搅拌溶液中鼓入O3，直至溶液变成蓝色。然后将反应物用O2鼓泡，直至溶液变为无色。蒸发有机层，以得到287-11 (430mg, 粗产物)，其不经进一步纯化即用于下一步骤。
将90% TFA (6 mL)中的287-11 (441 mg, 1.2 mmol)在室温下搅拌12小时。将混合物在减压下浓缩。经由硅胶色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为无色油的287-12 (404 mg, 97%)。
在0℃下，向287-12 (404 mg, 1.3 mmol)于无水DCM (6 mL)中的溶液中添加Et3N(1.0g, 10.2mmol)、DMAP(44mg, 0.4mmol)和BzCl(1.0g, 7.6mmol)。将混合物在室温下搅拌4小时。将反应物用饱和NaHCO3水溶液淬灭并用DCM萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。蒸发滤液，并通过硅胶柱色谱法(PE中的1% EA)纯化残余物，以得到作为淡黄色泡沫的287-13 (530 mg, 66.2%)。
向尿嘧啶(190mg, 1.7mmol)于氯苯(2.6mL)中的搅拌溶液中添加N, O-双(三甲基甲硅烷基)乙酰胺(680 mg, 3.3 mmol)。将溶液在130℃下搅拌30分钟，然后冷却至环境温度。向287-13 (536 mg, 0.8 mmol)于氯苯中的溶液中缓慢地逐滴添加SnCl4(770mg,3.5mmol)。将混合物加热至回流持续30分钟。将反应物通过饱和NaHCO3水溶液淬灭并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。蒸发滤液，并通过硅胶柱色谱法(PE中的20% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的287-14 (336 mg, 64.6%)。
将287-14 (80 mg, 0.1 mmol)用MeOH中的7.0M NH3处理。将混合物在室温下搅拌12小时。在减压下去除溶剂。通过硅胶柱色谱法(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的287 (36 mg, 90.6%)。ESI-LCMS:m/z 309.09 [M+H]+; 331.07 [M+Na]+。
实施例163
化合物288
在0℃下，向51 (240 mg, 0.8 mmol)于磷酸三甲酯(4mL)中的混合物中添加POCl3(0.18mL, 1.6mmol)，并将混合物在0℃下搅拌90分钟。添加L-丙氨酸异丙酯盐酸盐(0.24g,1.4mmol)和Et3N(0.6mL, 4.3mmol)。将混合物温热至室温并继续搅拌1.5小时。用0.5MTEAA水溶液淬灭反应物，并通过RP-HPLC(A：50mM TEAA水溶液，B：MeCN中的50mM TEAA)纯化混合物，以产生288-1 (75 mg)。
将288-1 (52 mg, 0.1 mmol)、DIPEA (0.11 mL, 0.6 mmol)和异丙基氧基羰基氧基甲基碘 (77 mg, 0.3 mmol)于NMP (1.1 mL)中的混合物在室温下搅拌1小时。将混合物用叔丁基甲基醚稀释，用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤并用Na2SO4干燥。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:MeOH (4-10% B梯度)纯化蒸发的残余物，以产生288 (12 mg, 20%). MS:m/z = 600[M+1]+。
实施例164
化合物289
在0至5℃(冰/水浴)下，向44 (200 mg, 0.33 mmol)于无水DCM (6 mL)中的溶液中添加DMAP (4 mg, 0.033 mmol), N-Cbz-O-苄基-L-丝氨酸(164 mg, 0.5 mmol)和EDC (100mg, 0.52 mmol)。将混合物在室温下搅拌40小时。将混合物使用冰/水浴冷却，用DCM(10mL)稀释，用饱和NH4Cl洗涤，经MgSO4干燥，过滤并浓缩。通过柱色谱法以50至90% EA-己烷纯化残余物，以得到作为白色泡沫的289-1 (187 mg, 62%)。
向289-1 (68.7 mg, 0.075 mmol)于无水EtOH (2.5 mL)中的溶液中添加10% Pd/C(11.4mg)，随后添加4N HCl(38μL,0.15mmol)，并将混合物在H2气氛下搅拌3小时。反应完成后，将混合物通过硅藻土过滤。用无水EtOH洗涤催化剂滤饼。合并洗涤液和滤液，并在真空中去除溶剂，以得到作为灰白色泡沫的289 (40.1 mg, 77.6%)。MS:m/z = 690.1[M+H]+。
实施例165
化合物290
在-78℃下，向化合物B (0.84g, 2mmol; 根据Villard等人, Bioorg. Med. Chem.(2008) 16:7321-7329制备)和Et3N(0.61mL, 4.4mmol)于THF(5mL)中的混合物中逐滴添加N,N-二氯氨基磷酸二异丙酯(184μL, 1mmol)于THF(7mL)中的溶液。将混合物温热并在室温下搅拌2小时。滤出固体。浓缩滤液并在硅胶柱上用己烷+ 1% Et3N:EtOAc (1-20% B梯度)纯化，以产生化合物C (0.38 g)。
向40-1 (53 mg, 0.15 mmol)和化合物C (0.17 g, 0.17 mmol)于MeCN (1 mL)中的混合物添加5-乙硫基-1H-四唑(0.25M, 在MeCN中；1.2mL, 0.3mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时，然后冷却至-40℃。添加MCPBA (77%; 42 mg, 0.19 mmol)于CH2Cl2 (0.5 mL)中的溶液。将混合物温热并在室温下搅拌30分钟。将反应物用4% NaHCO3水溶液中的4%Na2S2O3水溶液(1mL)淬灭并用CH2Cl2稀释。将有机层用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在硅胶柱上用己烷:EtOAc (30-100% B梯度)纯化蒸发的残余物，产生290-1(150 mg, 81%)。
将290-1 (120 mg, 0.1 mmol)于80% TFA水溶液(5mL)中的溶液在室温下保持3小时。将混合物浓缩，并将残余物与甲苯共同蒸发。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:MeOH (4-10% B梯度)纯化粗材料，以得到290 (25 mg, 36%). MS:m/z = 691 [M+1]+。
实施例166
化合物292
向DCC (412 mg, 1.98 mmol)于DMF (1 mL)的混合物中依次添加DMAP (244 mg, 1.98mmol)和Z-Val-OH (502 mg, 1.98 mmol)，随后添加44 (200 mg, 0.183 mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。过滤混合物，并用旋转式蒸发器浓缩滤液，直至其初始体积的½。添加EA，并将混合物用水和盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在真空中浓缩，以得到残余物。通过硅胶用35-95% EA:己烷纯化残余物，以得到作为白色泡沫的292-1 (107 mg, 31.2 %)。
向292-1 (68 mg, 0.064 mmol)于无水EtOH (2.0 mL)中的溶液中添加10% Pd/C(12mg)，随后添加4N HCl(67μl，0.25mmol)。将混合物在H2气氛下搅拌1.5小时。将混合物通过硅藻土过滤，并用无水EtOH洗涤催化剂滤饼。合并洗涤液和滤液。在真空中去除溶剂，以得到作为淡黄色泡沫的292 (41.6 mg, 82%)。MS:m/z = 801.25 [M+H]+。
实施例167
化合物293
向293-1 (40 mg, 0.144 mmol)于DMF (2 mL)中的溶液中添加DCC(65mg, 0.32mmol)、异丁酸(28 μl, 0.32 mmol)和DMAP (18 mg, 0.144 mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。过滤混合物，并使用旋转式蒸发器将滤液浓缩至其初始体积的½。然后将混合物用25% DMF/H2O稀释并在反相HPLC(C18)上使用CH3CN和水纯化。冻干，得到作为白色粉末的293 (17.5mg, 29%)。MS:m/z 416.1 [M+H]+。
实施例168
化合物294
向293-1 (50 mg, 0.18 mmol)于DMF (1.5 mL)中的溶液中添加DCC (93 mg, 0.45mmol)、丙酸(33.4 μl, 0.45 mmol)和DMAP (22 mg, 0.18 mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。过滤混合物，然后使用旋转式蒸发器将滤液浓缩至其初始体积的½。然后将混合物用25% DMF/H2O稀释，并在反相HPLC(C18)上使用CH3CN和水纯化。冻干，得到作为白色粉末的294 (30.2 mg, 43%)。MS:m/z 390.1 [M+H]+, 388.05 [M-H]-。
实施例169
化合物295
向75 (20 mg, 0.073 mmol)于DMF (0.7 mL)中的溶液中添加DCC (37.6 mg, 0.183mmol)、异丁酸(16 μl, 0.183 mmol)和DMAP (9 mg, 0.073 mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。过滤混合物，并使用旋转式蒸发器将滤液浓缩至其初始体积的½。然后将混合物用25%DMF/H2O稀释并在反相HPLC(C18)上使用25-95% CH3CN:水纯化。冻干，得到作为白色粉末的295 (12.1 mg, 38.7%)。MS:m/z 430.15 [M+H]+, 428.10 [M-H]-。
实施例170
化合物296
向75 (20 mg, 0.073 mmol)于DMF (0.7 mL)中的溶液中添加DCC (37.6 mg, 0.183mmol)、丙酸(13.5 μl, 0.183 mmol)和DMAP (9 mg, 0.073 mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。过滤混合物，然后使用旋转式蒸发器将滤液浓缩至其初始体积的½。然后将混合物用25% DMF/H2O稀释，并在反相HPLC(C18)上使用25-95% CH3CN:水纯化。冻干，得到作为白色粉末的296 (14.1 mg, 48%)。MS:m/z 402.1 [M+H]+。
实施例171
化合物297
在-78℃下，向化合物D (0.9g, 6.0mmol; 根据Qing等人, Org. Lett. (2008) 10:545-548制备)和POCl3(0.55mL, 6.0mmol)于二乙醚 (9 mL)中的混合物中添加Et3N(0.84mL, 6.0mmol)。将混合物在2小时内温热至室温。然后过滤混合物，并用Et2O洗涤固体。蒸发合并的滤液，且粗化合物E不经纯化即使用。
在-20℃下，向粗化合物E和L-丙氨酸异丙酯盐酸盐(1.0g, 6.0mmol)于CH2Cl2(15mL)中的溶液中添加Et3N(1.67mL, 1.2mmol)。将混合物温热，并在室温下搅拌2小时。将混合物用己烷稀释并通过二氧化硅垫过滤，将所述二氧化硅垫用CH2Cl2:己烷 1:1充分地洗涤。将合并的滤液浓缩并在二氧化硅柱上用己烷:EtOAc (5-50% B梯度)纯化，以产生化合物F (0.78g, 38%，2个步骤)。
在0℃下，向40-1 (0.36 g, 1.0 mmol)于THF (7.5 mL)中的溶液中添加异丙基氯化镁(2M, 在THF中；0.65mL, 1.3mmol)，并将混合物在0℃下搅拌30分钟。添加化合物F(0.78 g, 2.2 mmol)于THF (2 mL)中的溶液，并将混合物在室温下搅拌2小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭，然后用EtOAc稀释。分离两个层。将有机层用水和盐水洗涤，并经Na2SO4干燥。在硅胶柱上用CH2Cl2:异-PrOH (3-10% B梯度)纯化蒸发的残余物，产生297-1(0.50 g, 74%)。
将297-1 (0.28 g, 0.4 mmol)于80% TFA水溶液(4mL)中的溶液在室温下搅拌4小时。将混合物蒸发，并与甲苯共同蒸发。在二氧化硅柱上用CH2Cl2:MeOH (4-10% B梯度)纯化残余物，以得到297-2 (0.17 g, 68%)。
向297-2 (85 mg, 0.14 mmol)于EtOH (3 mL)和HCl(4N, 在二氧杂环己烷中；35μL, 0.14mmol)中的溶液中添加10% Pd/C(8mg)。将混合物在H2下(大气压)搅拌105分钟。然后将混合物通过硅藻土垫过滤。将蒸发的残余物用Et2O处理，以产生作为白色固体的297(55 mg, 63%)。MS:m/z = 589 [M+1]+。
实施例172
化合物298
将298-1 (120 g, 0.26 mol)和IBX (109 g, 0.39 mol)于CH3CN (2.0 L)中的混合物加热至回流并搅拌12小时。冷却至室温后，过滤混合物。将滤液在低压下浓缩并直接用于下一步骤。
将298-2 (130g, 粗产物，0.26mol)与无水甲苯共同蒸发(3X)以去除H2O。在-78℃下，经30分钟将乙烯基溴化镁(700mL, 0.78mol, 1.0N, 在THF中)逐滴添加至298-2于THF中的溶液(300mL)中。将混合物在25℃下搅拌约1小时并通过LCMS踪迹检查。当起始材料耗尽时，将混合物倒入饱和NH4Cl溶液中，并用EA(3×300mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在低压下浓缩，以得到粗中间体，其不经进一步纯化。
向该粗中间体(170g, 0.346mol)于无水CH2Cl2中的溶液中添加TEA(105g,1.04mol)和DMAP(84g, 0.69mol)，并将混合物在室温下搅拌。在室温下缓慢添加苯甲酰氯(146g, 1.04mol)。在室温下搅拌12小时后，将混合物用CH2Cl2稀释，然后用饱和NaHCO3水溶液洗涤。将合并的水相用DCM (100mL)萃取。将合并的有机相用无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下蒸发至干燥。通过柱色谱法(PE:EA=10:1至5:1)纯化残余物，以得到298-3 (107 g,52%)。
将尿嘧啶(通过甲苯处理两次)和NOBSA(81.4g, 0.4mol)于CH3CN(200mL)中的混合物搅拌至回流1.5小时。将混合物冷却至室温之后，添加CH3CN (100 mL)中的298-3(59g, 0.1mol, 通过甲苯处理)。将混合物用TMSOTf(155g, 0.7mol)处理，然后温热至60-70℃持续12小时。LCMS显示无起始材料剩余。将混合物倒入NaHCO3(饱和)溶液中。所需产物沉淀。过滤之后，获得作为白色固体的纯298-4 (40 g, 69%)。
在0℃下，向298-4 (50 g, 0.086 mol)、K2CO3 (17.8 g, 0.13 mol)于DMF (500mL)中的溶液中添加PMBCl(16g, 0.1mol)，并将混合物在25℃下搅拌12小时。用水淬灭反应物，并用EtOAc(3×150mL)萃取混合物。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。获得粗298-5 (65 g)并直接用于下一步骤。
将298-5 (65 g, 0.086 mol)和NaOMe (16.8 g, 0.3 mol)于MeOH:DCM (4:1,200 mL)中的混合物在室温下搅拌2.5小时。LCMS显示无起始材料剩余。用干冰淬灭反应物。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM:MeOH=50:1至20:1)纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的298-6 (25g, 75%)。
在冰浴下，向298-6 (25.5 g, 0.065 mol)于DMF中的溶液中缓慢添加NaH(10.5g, 0.26mol)，并将混合物搅拌30分钟。添加BnBr(36.3g, 0.21mol)，并将混合物在25℃下搅拌12小时。TLC显示起始材料消失。将反应物通过饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EtOAc(3×100mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA=5:1至 3:1至1:1)纯化残余物，以得到298-7 (20 g, 46%)。
在25℃下，向298-7 (20 g, 0.03 mol)、NMMO (7 g, 0.06 mol)于THF:H2O (5:1,100 mL)中的溶液中添加OsO4(2.6g, 0.01mol)，并将混合物在25℃下搅拌24小时。将反应物用饱和Na2S2O3溶液淬灭并用EtOAc(3×100mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。二醇产物残余物直接用于下一步骤。
向二醇产物(0.03mol)于MeOH:H2O:THF (170 mL:30 mL:50 mL)中的溶液中添加NaIO4(9.6g, 0.045mol)，并将混合物在25℃下搅拌2小时。过滤白色固体后，滤液直接用于下一步骤。
将前述溶液在0℃下用NaBH4(1.8g, 0.048mol)处理，并在25℃下搅拌30分钟。将反应物用HCl(1N)溶液淬灭并调节pH至7-8。用EtOAc(3×50mL)萃取溶液。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA=6:1至4:1)纯化残余物，以得到289-8 (12g, 61%，经3个步骤)。
在0℃下，向298-8 (14 g, 21 mmol)、DMAP (5.1 g, 42 mmol)于DCM (50 mL)中的溶液中添加MsCl(3.1g, 27mmol)，并将混合物在25℃下搅拌40分钟。LCMS显示无起始材料剩余。将反应物通过饱和NaHCO3水溶液淬灭并用DCM (3×100mL)萃取。将溶液用HCl(0.2N)溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA=10:1至5:1)纯化残余物，以得到OMs-产物(14g, 90%)。
将OMs-产物(6.1g, 8.21mmol)溶解于TBAF(Alfa，1N, 在THF中，120mL)中，并将混合物在70-80℃下搅拌3天。LCMS显示50%起始材料转化成所需产物。在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EtOAc(100mL)中。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA=10:1至5:1)纯化残余物，以得到298-9 (1.3 g, 24%)。
向298-9 (6.3 g, 9.45 mmol)于CAN:H2O (v:v = 3:1, 52 mL)中的溶液中添加CAN(15.5g, 28.3mmol)，并将混合物在室温下搅拌过夜。将反应物用水淬灭并用EA(3×80mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的25% EA)纯化残余物，以得到作为黄色油的298-10 (3.6 g, 71 %)。
在0℃下，向298-10 (566 mg, 1.04 mmol)、DMAP (253 mg, 2.07 mmol)和TEA(209 mg, 2.07 mmol)于无水MeCN (6 mL)中的溶液中添加TPSCl(627mg, 2.07mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物用NH3•H2O (10 mL)处理，并在室温下搅拌过夜。TLC显示反应完成。在低压下浓缩溶液。通过硅胶柱色谱法(DCM:MeOH=50:1至20:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的298-11 (300 mg, 49%)。
在-70℃下，向298-11 (200 mg, 0.37 mmol)于无水DCM (0.5 mL)中的溶液中添加BCl3(2.5mL, 1N, 在DCM中)，并将混合物在-70℃下搅拌2小时。TLC显示无材料剩余。将反应物在-70℃下用MeOH淬灭，并直接在40℃下在低压下浓缩。将残余物溶解于H2O中，并用EtOAc洗涤3次。将水相冻干，以得到作为白色固体的298 (91 mg, 89%)。ESI-LCMS:m/z276.1 [M+H]+。
实施例173
化合物299
在20℃下，在N2下，向299-1 (8.2 g, 15.3 mmol)于无水CH3CN (150 mL)中的搅拌溶液中添加IBX(4.7g, 16.8mmol)。将悬浮液加热至90℃~100℃，并在该温度下搅拌1小时。过滤混合物并在减压下浓缩滤液。残余物299-2 (8.2g, 粗产物)不经进一步纯化即用于下一步骤中。
在20℃下，向299-2 (8.2 g, 15.4 mmol)于1,4-二氧杂环己烷(150 mL)中的溶液中添加NaOH水溶液(15.4mL, 2M, 30.8mmol)。将混合物在该温度下搅拌10小时。将溶液用AcOH中和至pH=7，随后在0℃下添加EtOH (50mL)和NaBH4(5.8g, 154.3mmol)。将混合物在该温度下搅拌1小时。将反应物用水(20mL)淬灭，用EA(2×40mL)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤、经无水MgSO4干燥并在低压下浓缩。经由硅胶色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的299-3 (5.5 g, 62.92%)。
将299-3 (480 mg, 0.8 mmol)与甲苯共同蒸发(2x)。将残余物溶解于无水DCM (5mL)和吡啶(671 mg, 85 mmol)中。在0℃下经10分钟逐滴添加Tf2O(481mg, 187mmol)。将混合物在该温度下搅拌40分钟。通过柱色谱法(PE中的20% EA)纯化混合物，以得到作为褐色泡沫的299-4 (602 mg, 86.1%)。
在0℃下，在N2气氛下，向299-4 (602.0 mg, 0.72 mmol)于无水DMF (8 mL)中的溶液中添加NaH (34.8mg, 0.87mmol)。将反应物在20℃下搅拌1小时，然后在0℃下，在N2气氛下添加NaN3(1.59g, 2.5mmol)。将混合物在20℃下搅拌2小时。将反应物在相同温度下用水淬灭，用EA(2×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，经Na2SO4干燥并过滤。将滤液在减压下浓缩至干燥。残余物299-5 (431mg, 粗产物)不经进一步纯化即用于下一步骤中。
在18℃下，向299-5 (431mg, 粗产物)于1,4-二氧杂环己烷(14mL)中的溶液中添加NaOH水溶液(114.4mg, 2M, 2.9mmol)。将混合物在相同温度下搅拌3小时。用EA(20mL)稀释混合物。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，并在低压下浓缩。经由硅胶色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的299-6 (406.0 mg, 47.9%)。
在30℃下，在N2气氛下，向299-6 (406.0 mg, 0.68 mmol)于无水DMF (8 mL)中的溶液中添加TBSCl(198.7mg, 1.3mmol)和咪唑(119.7mg, 1.8mmol)。将溶液在该温度下搅拌3小时。将溶液用EA(20mL)稀释并用水和盐水洗涤。将有机相经MgSO4干燥，并在低压下浓缩。经由硅胶色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的299-7 (405.0mg, 65.28%)。
在30℃下，向299-7 (405.0 mg, 0.57 mmol)于无水CH3CN (6 mL)中的溶液中添加2,4,6-三异丙基苯-1-磺酰氯(343.3mg, 1.13mmol)、DMAP(138.5mg, 1.1mmol)和TEA(114.7mg, 1.1mmol)。将混合物在该温度下搅拌9小时。添加NH3•H2O (4 mL)，并将混合物搅拌3小时。将混合物用EA(20mL)稀释并用盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并在低压下浓缩。经由硅胶色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的299-8 (401.0mg, 粗产物)。
将299-8 (380.0 mg, 0.54 mmol)溶解于80% HCOOH (25mL)中，并将混合物在30℃下搅拌12小时。将反应物用MeOH淬灭，并在减压下浓缩。通过硅胶色谱法(DCM中的10%MeOH)纯化残余物，以得到作为白色泡沫的299 (144.0 mg, 83.93%)。ESI-MS:m/z 319.1[M+H]+; 637.2 [2M+H]+。
实施例174
化合物300
在室温下，向300-1 (30 g, 122.85 mmol)和1,1-二甲氧基环戊烷(86 g, 660.93mmol)于DCE (200 mL)中的溶液中以一份添加TsOH•H2O (2.34 g, 12.29 mmol)。将混合物加热至70℃并搅拌14小时。TLC显示反应完成。将混合物冷却至室温，并在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的1%-10% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的300-2 (25 g,65.6%)。
在室温下，向300-2 (20 g, 64.45 mmol)于无水CH3CN (200 mL)中的溶液中添加IBX(19.85g, 70.9mmol)。将混合物回流18小时，然后冷却至0℃。滤出沉淀物，并浓缩滤液，以得到作为黄色固体的粗300-3 (20 g, 100%)。
在0℃下，向300-3 (20 g, 64.87 mmol)于1,4-二氧杂环己烷(200 mL)中的溶液中添加37% HCHO(20mL)和2.0M NaOH水溶液(40mL)。将混合物在室温下搅拌过夜，然后用AcOH中和至pH=7。在20℃下用NaBH4(4.91g, 129.74mmol)处理溶液。将混合物在室温下搅拌1.0小时，并用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应物。用EA(3 x 200mL)萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM中的1-3% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的300-4 (9 g, 40.8 %)。
在-30℃下，向300-4 (4.5 g, 13.22 mmol)于无水DCM (50 mL)中的冰冷溶液中逐滴添加吡啶(10.46g, 132.20mmol)和Tf2O(8.21g, 29.08mmol)。将混合物在相同温度下搅拌1小时。将反应物用冰水淬灭并用EA(3×60mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE:EA=5:1)上纯化残余物，以得到作为白色固体的300-5 (5 g, 62.57%)。
在0℃下，在N2下，向300-5 (5 g, 8.27 mmol)于无水DMF (25 mL)中的搅拌溶液中添加NaH (396.96mg, 9.92mmol)。将溶液在室温下搅拌2小时。TLC显示反应完成。300-6的溶液不经任何进一步后处理即用于下一步骤中。
在N2气氛下，在0℃下，向300-6(3.75 g, 8.25 mmol)的搅拌溶液中添加NaN3(1.5g, 2.50g, 38.46mmol)。将溶液在室温下搅拌2小时。将反应物用水淬灭并用EA(3×60mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。残余物300-7不经进一步纯化即用于下一步骤中。
在室温下，向300-7 (2.87 g, 8.25 mmol)于无水1,4-二氧杂环己烷(30 mL)中的溶液中添加NaOH (8.25mL, 16.50mmol, 2.0M, 在水中)。将混合物在室温下搅拌3小时。TLC显示反应完成。将混合物用EA稀释。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。在硅胶柱(PE:EA=10:1至2:1)上纯化残余物，以得到作为白色泡沫的300-8 (2 g,66.4%)。1H-NMR (DMSO, 400 MHz), δ= 9.02 (s, 1H), 7.40 (d, J = 8.0 Hz, 1H),5.75-5.77 (m, 1H), 5.57 (d, J = 3.6 Hz, 1H), 5.13-5.16 (m, 1H), 4.90 (d, J =6.4 Hz, 1H), 3.79-3.85 (m, 2H), 5.51-5.56 (m, 2H), 3.06-3.09 (m, 1H), 2.05-2.09 (m, 2H), 1.65-1.75 (m, 6H)。
将300-8 (2 g, 5.47 mmol)溶解于80% HCOOH水溶液(20mL)中，并将混合物加热至60℃持续2小时。在低压下蒸发混合物。将残余物溶解于MeOH中，并用NH3•H2O将pH调节至7~8。将混合物搅拌10分钟，然后在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(DCM:MeOH=20:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的300-9 (1.4 g, 85.5%)。
在120℃下，向300-9 (1.00 g, 3.34 mmol)于DMF (5 mL)中的溶液中添加碳酸二苯酯(157.49mg, 735.20μmol)和NaHCO3(28.06mg, 0.334mmol)。将混合物搅拌16小时。TLC显示反应完成。将混合物冷却至室温并在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(DCM:MeOH=15:1至10:1)纯化残余物，以提供作为黄色固体的300-10 (600. mg, 63.9%)。1H-NMR (DMSO, 400MHz), δ= 8.49 (s, 1H), 7.83 (d, J = 7.2 Hz, 4H), 6.46 (s, 1H), 6.31 (d, J =4.8 Hz, 1H), 5.84 (d, J = 6.8 Hz, 1H), 5.27 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 4.43 (s,1H), 3.53 (d, J = 12.8 Hz, 1H), 3.43 (d, J = 13.2 Hz, 1H), 3.12 (d, J = 11.2Hz, 1H)。
在室温下，向300-10 (2 g, 7.11 mmol)和AgNO3 (1.81 g, 10.67 mmol)于Py(20 mL)中的溶液中以一份添加DMTrCl(3.61g, 10.67mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。TLC显示反应完成。在低压下浓缩混合物，并通过硅胶色谱法(DCM:MeOH = 50:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的300-11 (3 g, 72.3%)。
在室温下，向300-11 (1.5 g, 2.57 mmol)于EtOH (5 mL)中的溶液中以一份添加NaOH (5mL, 2.0N)。将混合物在室温下搅拌0.5小时。TLC显示反应完成。用EA(3×60mL)萃取水相。将有机相用盐水洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩，以提供作为黄色固体的300-12 (1.50 g, 97%)。
在室温下，向300-12 (1.50 g, 2.49 mmol)于Py (6 mL)中的溶液中以一份添加AC2O(3mL)。将混合物在室温下搅拌12小时。TLC显示反应完成。将混合物浓缩，并将残余物溶解于水中。用EA(3×60mL)萃取水相。将合并的有机相用饱和盐水洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(PE:EA=1:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的300-13 (1.5 g, 87.8%)。1H-NMR (CDCl3, 400 MHz), δ= 8.10 (s, 1H), 7.29-7.34(m, 10H), 6.77 (d, J = 8.0 Hz, 4H), 6.36 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 5.36 (d, J =3.6 Hz, 1H), 5.44 (t, J = 4.0 Hz, 1H), 5.32 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 3.80 (s,6H), 3.58 (d, J = 12.8 Hz, 1H), 3.44 (d, J = 12.8 Hz, 1H), 3.29 (s, 2H), 2.10(s, 3H), 1.82 (s, 3H)。
在室温下，向300-13 (500 mg, 729.2 μmol)于MeCN (10 mL)中的溶液中以一份添加DMAP(178.17mg, 1.46mmol)和TPSCl(430.01mg, 1.46mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时。添加NH3/THF(20mL, 饱和)，并将混合物搅拌1小时。将混合物用EA稀释并用水洗涤。将合并的有机相用饱和盐水洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(DCM:MeOH= 50:1)纯化，然后通过制备型HPLC(CH3CN/H2O)纯化，以提供作为黄色固体的300-14 (260 mg, 49.5%)。1H-NMR (MeOD, 400 MHz), δ= 7.60 (d, J = 7.6Hz, 1H), 7.46 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.28-7.36 (m, 7H), 6.89 (d, J = 8.4 Hz,4H), 6.44 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 5.56-5.69 (m, 4H), 3.80 (s, 6H), 3.54 (d, J =13.2 Hz, 1H), 3.39-3.46 (m, 4H), 2.17 (s, 3H), 1.83 (s, 3H)。
将300-14 (440 mg, 642.6 μmol)于NH3:MeOH (5 mL, 7N)中的溶液在室温下搅拌16小时。TLC显示反应完成。将混合物在减压下在40℃下浓缩。通过硅胶色谱法(DCM:MeOH=100:1-20:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的300-15 (290 mg, 75.13%)。1H-NMR(MeOD, 400 MHz), δ= 7.62 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.43 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.23-7.33 (m, 7H), 6.86 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 6.31 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 5.54 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 4.34 (t, J = 4.4 Hz, 1H), 4.27 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 3.78 (s,6H), 3.69 (d, J = 12.8 Hz, 1H), 3.46 (d, J = 12.8 Hz, 1H), 3.41 (s, 2H)。
将300-15 (150 mg, 249.74 μmol)于80%CH3COOH (5 mL)中的溶液在60℃下搅拌2小时。TLC显示反应完成。将混合物用MeOH处理并在减压下在60℃下浓缩。通过硅胶色谱法(DCM中的1-10% MeOH)纯化残余物，以提供作为白色固体的300 (65 mg, 78.5%)。ESI-MS:m/z 299.1 [M+H]+。
实施例175
化合物302
在0℃下，在N2下，经30分钟的时段向302-1 (12 g, 45.42 mmol)于吡啶(100 mL)中的溶液中分份添加DMTrCl(16.16g, 47.69mmol)。将混合物温热至25℃并搅拌16小时。LCMS和TLC(DCM:MeOH=20:1)显示起始材料耗尽。将反应物用MeOH (10mL)淬灭，然后在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(100-200目硅胶，PE:EA=1:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的纯DMTr-302-1 (20 g, 77.7%)。
在0℃下，向DMTr-302-1 (30.00 g, 52.95 mmol)和TBSCl (19.95 g, 132.38mmol, 2.50 eq.)于DCM (200 mL)中的溶液中分份添加咪唑(9.00g, 132.20mmol,2.50eq.)。维持温度低于5℃。将混合物温热至25℃并搅拌16小时。TLC (PE:EA=1:1)显示起始材料耗尽。将反应物通过冰淬灭，然后用DCM (2×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在低压下浓缩。通过色谱法纯化残余物，以得到作为白色固体的纯产物(30.00g, 83.2%)。
将来自前述步骤的产物(30.00g, 44.07mmol)溶解于80% AcOH水溶液(300mL)中，并将混合物在25℃下搅拌16小时。TLC (DCM:MeOH=10:1)显示反应完成。将反应物用饱和NaHCO3水溶液(100mL)淬灭，然后用EA(3×100mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩。通过硅胶柱(DCM:MeOH=50:1~20:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的302-2 (15.5 g, 92.9%)。
在25℃下，在N2下，向302-2 (8.00 g, 21.14 mmol)于MeCN (80 mL)中的溶液中添加IBX(6.51g, 23.25mmol, 1.10eq.)。将混合物加热至81℃持续1小时。LCMS显示起始材料耗尽。过滤混合物，并在真空中浓缩滤液。醛残余物(7.50g, 19.92mmol)不经进一步纯化即用于下一步骤中。
在25℃下，向来自前述步骤的醛(7.5g, 19.9mmol)和甲醛水溶液(7.85mL)于二氧杂环己烷(80mL)中的溶液中以一份添加2.0N NaOH水溶液(19.5mL)。将混合物在25℃下搅拌16小时。TLC显示反应完成。将混合物冷却至0℃，然后用AcOH中和至pH=7。在0℃下，用NaBH4(4.52g, 119.52mmol)处理溶液。将混合物在25℃下搅拌30分钟，并用饱和NH4Cl水溶液(100mL)淬灭反应物。用EA(2×100mL)萃取混合物。将有机相经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(100-200目硅胶，DCM:MeOH=20:1至10:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的302-3 (4.0 g, 49.2%)。
在0℃下，经15分钟的时段向302-3 (4.00 g, 9.79 mmol)于吡啶(20 mL)中的溶液中逐滴添加MMTrCl(3.48g, 10.28mmol)于DCM (20mL)中的溶液。维持温度低于5℃。将混合物温热至25℃并在25℃下搅拌16小时。TLC (DCM:MeOH=10:1)显示起始材料耗尽。将反应物通过MeOH (5mL)淬灭并在真空中浓缩。通过柱(DCM:MeOH=50:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的纯中间体(5.00g, 71.85%)。
在0℃下，经10分钟的时段向上述中间体(5.00g, 7.03mmol)和AgNO3(2.39g,14.06mmol, 2.00eq.)于吡啶(40mL)中的溶液中逐滴添加TBDPSCl(2.90g, 10.55mmol)。将混合物温热至25℃并搅拌16小时。TLC (PE:EA=1:1)显示起始材料耗尽。将反应物用冰淬灭，然后用EA(3×100mL)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(2×50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。将残余物(5.00g, 粗产物)溶解于80% AcOH水溶液(50mL)中，并将混合物在25℃下搅拌2小时。TLC (PE:EA=2:1)显示反应完成。将反应物通过MeOH (5mL)淬灭，然后用DCM (3×100mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水MgSO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶柱(PE:EA=5:1至2:1)纯化残余物，以得到作为黄色固体的302-4 (2.50 g,55%)。
在0℃下，在N2下，向302-4 (400 mg, 618.36 μmol)于DCM (4 mL)中的溶液中以一份添加DMP(393.4mg, 927.54μmol, 1.50eq.)。将混合物在25℃下搅拌2小时。TLC (PE:EA=2:1)显示反应完成。将混合物冷却至0℃并用饱和Na2SO3水溶液(5mL)和NaHCO3水溶液(5mL)淬灭。用DCM (3×10mL)萃取水层。将合并的有机相用饱和盐水(10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(100-200目硅胶，PE:EA =3:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的302-5 (300.00 mg, 75.24%)。
在0℃下，在N2下，向302-5 (500 mg, 775.37 μmol)于吡啶(5 mL)中的溶液中以一份添加盐酸羟胺(215.5mg, 3.10mmol, 4.00eq.)。将混合物在0℃下搅拌30分钟，然后温热至25℃并搅拌4小时。LCMS显示反应完成。将混合物在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(100-200目硅胶，PE:EA=2:1)纯化残余物，以提供作为淡黄色固体的肟(450mg, 87.95%收率)。
在0℃下，向该肟 (450.00 mg, 681.95 μmol)于DCM (5 mL)中的溶液中以一份添加TEA(208.0mg, 2.06mmol)和MsCl(156.0mg, 1.36mmol)。将混合物在25℃下搅拌4小时。TLC (PE:EA=2:1)显示反应完成。通过饱和NaHCO3水溶液(5mL)淬灭反应物，并用DCM (2×20mL)萃取水相。将合并的有机相用饱和盐水(10mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过TLC (PE:EA=2:1)纯化残余物，以提供作为淡黄色固体的302-6 (400 mg,91.4%)。
在0℃下，向302-6 (450.0 mg, 701.10 μmol)、DMAP (171.3 mg, 1.40 mmol)和TEA (212.8 mg, 2.10 mmol)于MeCN (5 mL)中的溶液中以一份添加2,4,6-三异丙基苯-1-磺酰氯(424.7mg, 1.40mmol)。将混合物在25℃下搅拌1小时。TLC (PE:EA=2:1)显示反应完成。将反应物通过饱和NaHCO3水溶液(5mL)淬灭并用EA(2×15mL)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(10mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。将残余物(580.00mg,638.59μmol)溶解于MeCN(5ml)中。在25℃下用一份NH3•H2O (10 mL)处理溶液。将混合物在25℃下搅拌16小时。TLC (PE:EA=1:1)显示反应完成。将混合物用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(10mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(100-200目硅胶，DCM:MeOH=40:1至25:1)纯化残余物，以提供作为淡黄色固体的302-7(350.00 mg, 85.5%)。
在25℃下，向302-7 (350.0 mg, 546.13 μmol)于MeOH (10 mL)中的溶液中以一份添加NH4F(405mg, 10.9mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌2小时。TLC (EA:MeOH=8:1)显示反应完成。将混合物冷却至25℃并在减压下在40℃下浓缩。通过硅胶色谱法(100-200目硅胶，EA:MeOH=20:1至10:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的302。1H NMR (400 MHz,DMSO-d 6), δ =7.59 (d, J=7.28 Hz, 1 H), 7.49 (br. s., 2 H), 7.25 (br. s., 1H), 6.29 (br. s., 1 H), 6.01 (br. s., 1 H), 5.82 (d, J=7.53 Hz, 1 H), 4.60(br. s., 1 H), 3.88 (br. s., 2 H); 19F NMR (376 MHz, DMSO-d 6) d ppm -116.61(br. s., 1 F) -115.98 (br. s., 1 F)。
实施例176
化合物303
在25℃下，在N2下，向K2CO3 (967.5 mg, 7.0 mmol)和TsN3 (552.2 mg, 2.80 mmol)于MeCN (10 mL)中的溶液中以一份添加1-二甲氧基磷酰基丙-2-酮(465.1mg, 2.80mmol)。将混合物在25℃下搅拌2小时。在25℃下，在N2下，以一份添加302-5 (900.0 mg, 1.40 mmol,1.00 eq.)于MeOH (10 mL)中的溶液。将混合物在25℃下搅拌12小时。TLC (PE:EA=2:1)显示反应完成。将混合物倒入水(10mL)中并用EA(2×50mL)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(10mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(100-200目硅胶，PE:EA=5:1至2:1)纯化残余物，以提供作为灰白色固体的303-1 (800 mg, 98.2%)。
在0℃下，在N2下，向303-1 (500 mg, 780.20 μmol)、DMAP (190.6 mg, 1.56mmol)和TEA (236.9 mg, 2.34 mmol)于MeCN (5 mL)中的溶液中以一份添加2,4,6-三异丙基苯-1-磺酰氯(472.8mg, 1.56mmol)。将混合物在0℃下搅拌30分钟，然后温热至25℃并搅拌2小时。TLC (PE:EA=2:1)显示反应完成。将反应物通过水(5mL)淬灭并用EA(2×10mL)萃取。将合并的有机相用HCl水溶液(1mL, 0.5M)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。获得作为淡黄色胶的残余物(650.0mg, 91.83%)，其不经进一步纯化即用于下一步骤中。
在25℃下，向来自前述步骤的残余物(650mg, 716.4μmol)于MeCN(5mL)中的溶液中以一份添加NH3•H2O (5 mL)，并将混合物在25℃下搅拌16小时。TLC (DCM:MeOH=20:1)显示反应完成。用EA(2×20mL)萃取混合物。将合并的有机相用盐水(10mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(100-200目硅胶，PE:EA=1:1)纯化残余物，以提供作为灰白色固体的303-2 (350 mg, 76.35%)。
将303-2 (350.0 mg, 546.98 μmol)和NH4F (405.0 mg, 10.93 mmol)于MeOH (5mL)中的混合物加热至65℃并搅拌2小时。LCMS和TLC (EA:MeOH=10:1)显示反应完成。将混合物冷却至25℃并过滤，并在真空中浓缩滤液。通过硅胶色谱法(300-400目硅胶，EA:MeOH=20:1至10:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的303 (102 mg, 64.93%)。1H-NMR (400MHz, 甲醇-d 4), δ = 7.73 (d, J=7.28 Hz, 1 H), 6.31 - 6.42 (m, 1 H), 5.95 (d, J=7.53 Hz, 1 H), 4.47 (t, J=13.55 Hz, 1 H), 3.92 (d, J=12.55 Hz, 1 H), 3.73 -3.80 (m, 1 H) 3.25 (s, 1 H); 19F NMR (376 MHz, 甲醇-d 4), δ = -115.52 - -112.60(m, 1 F)。
实施例177
化合物304
在0℃下，在N2下，向304-1 (20 g, 66.8 mmol)于无水吡啶(180 mL)中的溶液中添加BzCl(30.9g, 220.3mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将混合物用EA稀释并用饱和NaHCO3水溶液洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤，并将滤液浓缩至干燥。通过硅胶柱色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的304-2 (34.6 g, 90%)。
将304-2 (33 g, 57.3 mmol)溶解于90% CH3COOH (360mL)中并加热至115℃。将混合物在115℃下搅拌12小时。去除溶剂，并用EA稀释残余物。将混合物用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。浓缩滤液，以得到作为白色固体的304-3(26g, 粗产物)。
将304-3 (21 g, 44.5 mmol)溶解于NH3于MeOH中的溶液(400mL, 10M)中。将混合物在25℃下搅拌12小时。将混合物浓缩，以得到残余物，将其通过硅胶柱色谱法(DCM中的5%MeOH)纯化，以得到作为白色固体的304-4 (9.4 g, 80.4%)。1H-NMR (CD3OD, 400MHz) δ =7.90-7.80 (m, 1H), 6.18-6.09 (m, 1H), 5.71 (d, J=8.2 Hz, 1H), 4.26 (dt, J=8.2, 12.0 Hz, 1H), 3.98-3.84 (m, 2H), 3.76 (dd, J =2.8, 12.5 Hz, 1H), 3.33(s, 1H)。
在25℃下，在N2下，向304-4 (9 g, 34.1 mmol)于无水吡啶(60 mL)中的溶液中添加TBSCl(7.7g, 51.1mmol)。将溶液在50℃下搅拌12小时。将混合物在减压下浓缩至干燥。将残余物溶解于EA中。将混合物用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层经MgSO4干燥并在减压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的20% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的304-5 (11 g, 85.5%)。
在25℃下，在N2下，向304-5 (10.2 g, 27 mmol)于CH2Cl2 (100 mL)中的溶液中添加AgNO3(9.2g, 53.9mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(13.1g, 107.8mmol)和MMTrCl(10g,32.3mmol)。将溶液在25℃下搅拌12小时。用MeOH淬灭反应物，并在硅藻土上过滤混合物。用CH2Cl2和H2O稀释滤液。将有机层分离，并用CH2Cl2萃取水相。将合并的有机层用盐水洗涤，经无水MgSO4干燥并过滤。将滤液在减压下浓缩至干燥。通过硅胶色谱法(PE中的25% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的304-6 (15 g, 85.6%)。
在25℃下，将304-6 (10.5 g, 16.1 mmol)溶解于TBAF于THF中的溶液(1M, 60mL)中。将混合物在25℃下搅拌4小时。将混合物用EA萃取，并将合并的层用水和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并过滤。浓缩滤液，以得到粗产物，将其通过硅胶柱色谱法(PE中的30%EA)纯化，以得到作为白色泡沫的304-7 (8.1 g, 93.6%)。
在25℃下，向304-7 (17.0 g, 31.7 mmol)于CH3CN (150 mL)中的溶液中添加IBX(9.7g, 34.9mmol)。将混合物加热至100℃，并将混合物在100℃下搅拌1小时。将混合物冷却至25℃。过滤混合物，并用MeCN洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液，以得到作为黄色固体的残余物(16g, 粗产物)。将残余物(16g, 粗产物)溶解于1,4-二氧杂环己烷(150mL)中，并在25℃下用37%甲醛水溶液(18.5g, 227.5mmol)和NaOH水溶液(2M, 30mL)处理溶液。将混合物在25℃下搅拌12小时。在0℃下添加EtOH (30mL)和NaBH4(10g, 265.7mmol)。在25℃下搅拌1小时后，在0℃下用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应物。用EA稀释混合物。分离有机相并用EA萃取水相。将合并的有机相用盐水洗涤并经无水Na2SO4干燥。在真空中浓缩有机层，以得到残余物，将其通过硅胶色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化，以提供作为白色固体的304-8 (8.1 g,53.1%)。1H-NMR (400MHz, DMSO-d6) δ =11.52 (s, 1H), 7.57 (d, J = 8.2 Hz, 1H),7.46 - 7.22 (m, 13H), 6.90 (d, J =8.8 Hz, 2H), 6.30 (t, J =8.0 Hz, 1H), 5.61(d, J =8.2 Hz, 1H), 5.06 (t, J =5.5 Hz, 1H), 4.92 - 4.86 (m, 1H), 4.61 - 4.51(m, 1H), 3.83 (dd, J =5.1, 12.1 Hz, 1H), 3.74 (s, 3H)。
向304-8 (2.5 g, 4.4 mmol)于无水CH2Cl2 (35 mL)中的冰冷溶液中逐滴添加吡啶(3.5g, 44.1mmol)和Tf2O(3.7g, 13.2mmol)。将混合物在0℃下搅拌40分钟。将反应物用冰水淬灭并搅拌10分钟。用CH2Cl2萃取混合物。将有机层用盐水洗涤并经MgSO4干燥。浓缩有机层，以得到残余物，将其在硅胶柱(PE中的15% EA)上纯化，以得到作为黄色泡沫的304-9(2.6 g, 71%)。
在0℃下，在N2下，向304-9 (1.8 g, 2.2 mmol)于无水DMF (25 mL)中的搅拌溶液中添加NaH (107mg, 2.7mmol)。将溶液在25℃下搅拌1小时。TLC (PE: EA=1:1)显示反应完成。在25℃下向溶液中添加NaI(3.1g, 20.6mmol)。将混合物在25℃下搅拌3小时。TLC (PE:EA=1:1)显示反应完成。将混合物用水稀释并用EA萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。在低压下浓缩滤液，以得到作为黄色固体的304-10 (1.4g, 粗产物)。
将304-10 (1.4g, 粗产物)溶解于1,4-二氧杂环己烷(25mL)中，并在0℃下用NaOH水溶液(2M, 2.7mL)处理混合物。将溶液在25℃下搅拌4小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EA萃取。用盐水洗涤有机层。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。浓缩滤液，以得到粗产物，将其通过硅胶柱色谱法(PE中的40% EA)纯化，以得到304-11 (1.4 g, 94.9%)。
向304-11(1.45 g, 2.1 mmol)于EtOH (10 mL)中的溶液中添加Et3N(434mg,4.3mmol)和Pd/C(101mg, 88.7μmol)。在H2(15psi)下，在25℃下，将混合物搅拌12小时。过滤悬浮液，并在低压下浓缩滤液。在硅胶柱(DCM中的1% MeOH)上纯化残余物，以得到作为黄色固体的304-12 (1.2 g, 97.6%)。
在25℃下，在N2下，向304-12 (930 mg, 1.7 mmol)于无水DMF (10 mL)中的溶液中添加咪唑(287mg, 4.2mmol)和TBSCl(636mg, 4.2mmol)。将溶液在25℃下搅拌5小时。将混合物在减压下浓缩至干燥，并将残余物溶解于EA中。用饱和NH4Cl水溶液和盐水洗涤混合物。将有机层经MgSO4干燥并过滤。将滤液在减压下浓缩至干燥。在硅胶柱(PE中的15% EA)上纯化残余物，以得到作为白色固体的304-13 (968 mg, 86.2%)。
在25℃下，向304-13 (568 mg, 854.4 μmol)于无水CH3CN (8 mL)中的搅拌溶液中添加DMAP(209mg, 1.7mmol)、TPSCl(504mg, 1.7mmol)和TEA(173mg, 1.7mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。添加NH3•H2O (10 mL)，并将混合物搅拌3小时。将混合物用EA萃取并用饱和NH4Cl水溶液和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并过滤。浓缩滤液，以得到残余物，将其在硅胶柱(DCM中的3% MeOH)上纯化，以得到作为黄色泡沫的304-14 (480 mg,84.6%)。1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ = 7.65 - 7.40 (m, 13H), 6.97 (d, J =8.8 Hz,2H), 6.44 (dd, J =6.4, 9.5 Hz, 1H), 5.71 (d, J =7.3 Hz, 1H), 4.76 (dd, J =9.0, 14.4 Hz, 1H), 4.29 (q, J =7.1 Hz, 1H), 3.92 - 3.92 (m, 1H), 3.95 (s,3H), 3.60 (d, J =11.2 Hz, 1H), 3.44 (d, J =11.0 Hz, 1H), 1.66 - 1.55 (m, 3H),0.95 (s, 9H), 0.08 (s, 3H), 0.00 (s, 3H)。
将304-14 (501mg, 753.2 μmol)溶解于80% HCOOH (20mL)中，并将混合物在25℃下搅拌4小时。在低压下去除溶剂，并在硅胶柱(DCM中的6% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的304 (151mg, 71.8%)。ESI-MS:m/z 278.11 [M+H]+,555.18 [2M+H]+。
实施例178
化合物307
向307-1 (120 g, 0.26 mol)于无水MeCN (2 L)中的溶液中添加IBX(109g,0.39mol)。将混合物加热至回流并搅拌18小时。将混合物冷却至0℃并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到作为褐色油的307-2 (142 g)，其不经纯化即用于下一步骤。
在-78℃下，向307-2 (142 g)于无水THF (1.5 L)中的溶液中逐滴添加乙烯基溴化镁(830mL, 0.83mol, 1N)，并将混合物在-78℃下搅拌2小时。在0℃下，通过饱和NH4Cl水溶液(2L)淬灭反应物。在真空中去除THF，并用EtOAc稀释残余物。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，以得到淡褐色油。
在0℃下，向无水DCM中的淡褐色油(2.5L)中添加DMAP(63.5g, 0.52mol)、Et3N(79g, 0.78mol)和BzCl(110g, 0.78mol)，并将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物用DCM(2L)稀释并用饱和NaHCO3水溶液(3L)和盐水(1.5L)洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下蒸发至干燥。通过硅胶柱(PE:EA=20:1~10:1)纯化残余物，以得到作为黄色油的307-3 (112.7 g, 72.3%)。
将尿嘧啶(36.25 g, 323.7 mmol)和N,O-双(三甲基甲硅烷基) 乙酰胺(131.69g, 647.4 mmol)于无水MeCN (180 mL)中的搅拌混合物加热至回流持续2小时，然后冷却至室温。添加307-3 (95.9 g, 161.85 mmol)于无水MeCN (500 mL)中的溶液，随后在0℃下用SnCl4(168.66g, 647.4mmol)逐滴处理。将混合物加热至回流并搅拌2小时。将反应物用饱和NaHCO3水溶液(3L)淬灭并用EtOAc(3×1L)萃取。将有机相用盐水(500mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下蒸发至干燥。通过硅胶柱(PE:EA=20:1~10:1)纯化残余物，以得到作为淡黄色油的307-4 (33 g, 35%)。
将307-4 (33 g, 56.65 mmol)溶解于NH3:MeOH (800 mL, 7 N)中，并将混合物在室温下搅拌过夜。在减压下去除溶剂，并通过柱(DCM中的1% MeOH)纯化残余物，以得到作为淡黄色泡沫的307-5 (12.6 g, 82.4%)。
在0℃下，在N2下，向307-5 (2.57 g, 8.76 mmol)于DMF (20 mL)中的溶液中添加AgNO3(8.93g, 52.56mmol)和咪唑(3.58g, 52.56mmol)，然后以一份添加TBSCl(5.28g,35.04mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。TLC显示反应完成。将残余物倒入冰:水 (w:w= 1:1) (30 mL)中。用EA(3×100mL)萃取水相。将合并的有机相用饱和盐水(3×20mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(柱高度：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE:EA=3:1至2:1)纯化残余物，以提供作为黄色固体的307-6 (3.68 g,80.51%)。
在25℃下，在N2下，向307-6 (3.48 g, 6.67 mmol)和AgNO3 (3.40 g, 20.01mmol)于吡啶(30 mL)中的溶液中以一份添加(氯(4-甲氧基苯基)亚甲基)二苯(4.12 g,13.34 mmol)。将混合物在25℃下搅拌16小时。TLC显示反应完成。将混合物用EA稀释并过滤。将滤液用盐水洗涤并分离。将有机层浓缩至干燥。通过硅胶色谱法(柱高度：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE:EA=10:1至5:1)纯化残余物，以提供作为黄色泡沫的307-7(4.40 g, 83.07%)。
在25℃下，向307-7 (4.30 g, 5.41 mmol)于MeOH (100 mL)中的溶液中以一份添加NH4F(801.55mg, 21.64mmol)。将混合物加热至68℃并搅拌4小时。LCMS踪迹显示反应完成。将混合物冷却到25℃并在减压下浓缩。通过硅胶色谱法(柱高度：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，DCM:MeOH:NH3·H2O=30:1:0.05至10:1:0.05)纯化残余物，以提供作为白色固体的307-8 (3.00 g, 98.04%)。
在0℃下，在N2下，向307-8 (3.00 g, 5.30 mmol)于DMF (30 mL)中的溶液中以一份添加NaH (848mg, 21.20mmol)。将混合物在0℃下搅拌30分钟。在0℃下添加BnBr(3.63g,21.20mmol)，并将混合物在25℃下搅拌16小时。TLC显示反应完成。将混合物倒入冰-水 (w:w = 1:1) (30 mL)中。用EA(3×50mL)萃取水相。将合并的有机相用饱和盐水(3×20mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(柱高度：250mm，直径：100mm，200-300目硅胶，PE:EA=20:1至10:1)纯化残余物，以提供 307-9 (670 mg, 15.1%)。
在-78℃下，持续20分钟将臭氧鼓入307-9 (500 mg, 598.10 μmol)于DCM (8 mL)和MeOH (8mL)中的溶液中。通过O2吹扫过量O3后，在0℃下添加NaBH4(113.13mg,2.99mmol)。将混合物在25℃下搅拌20分钟。TLC显示起始材料耗尽。将混合物浓缩，以得到粗产物，将其通过硅胶色谱法(PE:EA=5:1)纯化，以得到作为黄色固体的307-10 (167.00mg, 33.24%)。
在0℃下，在N2下，向307-10 (216.70 mg, 257.99 μmol)和DMAP (63.04 mg,515.98 μmol)于DCM (2 mL)中的溶液中以一份添加MsCl(44.33mg, 386.98μmol)。将混合物在0℃下搅拌1小时，然后温热至25℃并搅拌1小时。LCMS显示反应完成。将残余物倒入冰-水 (w:w = 1:1) (10 mL)中，并用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(3×10mL)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(柱高度：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE:EA=10:1至5:1)纯化残余物，以提供作为黄色泡沫的甲磺酸盐中间体(167.00mg, 70.51%)。
将甲磺酸化中间体(167mg)溶解于TBAF:THF (10 mL, 1N)中并将混合物加热至回流持续12小时。将混合物缓慢冷却至25℃，并用饱和NH4Cl溶液淬灭。用EA萃取溶液。将合并的有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并浓缩至干燥。通过柱色谱法(EA:PE=5:1-2:1)纯化残余物，以得到307-11 (80 mg, 43.8%)。
将307-11 (80.00 mg, 0.087 mmol)溶解于80% AcOH溶液(5ml)中，并在45℃下搅拌1.0小时。将反应物用饱和Na2HCO3溶液淬灭并用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并浓缩至干燥。通过柱色谱法纯化残余物，以得到作为白色泡沫固体的307-12 (38 mg, 60%)。ESI-MS:m/z 570.4 [M+H]+。
在-78℃下，向307-12 (113.8 mg, 0.2 mmol)于DCM (0.5 mL)中的溶液中添加BCl3/DCM (1.0N)(1mL)，并将混合物在-78℃下搅拌30分钟。将反应物用MeOH淬灭并在低压下浓缩至干燥。通过制备型HPLC用NH3•H2O缓冲液纯化残余物，以得到作为白色固体的307(26 mg, 44%)。
实施例179
化合物311
在0℃下，在N2下，向311-1 (2.00 g, 3.5 mmol)于吡啶(10 mL)和DCM (10 mL)中的混合物中逐滴添加BzCl(496mg, 3.5mmol)。将混合物在0℃下搅拌30分钟，然后在25℃下搅拌6.5小时。用饱和NaHCO3水溶液(80mL)淬灭反应物。用EA(2×100mL)萃取混合物。将有机相用盐水(80mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并过滤。在减压下浓缩滤液。通过硅胶色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以提供作为白色固体的311-2 (1.28 g, 54 %)。
在25℃下，在N2下，向311-2 (680 mg, 1.0 mmol)于DMF (5 mL)中的混合物中添加咪唑(412mg, 6.1mmol)、AgNO3(514mg, 3.0mmol)和TBDPSCl(832mg, 3.0mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应物用饱和NaHCO3水溶液(30mL)淬灭，然后用EA(2×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(2×20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下浓缩。通过硅胶色谱法(PE中的25% EA)纯化残余物，以提供作为白色固体的311-3 (750 mg, 82 %)。
将311-3 (660 mg, 0.7 mmol)溶解于NH3:MeOH (15 mL)中。将混合物在密封管中在25℃下搅拌36小时，然后在减压下浓缩。通过硅胶色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以提供作为白色固体的311-4 (430 mg, 73 %)。1H-NMR (CDCl3, 400MHz) δ = 9.05 (s,1H), 7.81-7.10 (m, 21H), 6.81 (d, J=9.2 Hz, 2H), 6.42 (m, 1H), 6.20 (m, 1H),4.13-4.07 (m, 2H), 3.78-3.60 (m, 5H), 2.55 (s, 1H), 0.90-0.74 (m, 9H)。
在0℃下，在N2下，向311-4 (280 mg, 0.3 mmol)于DCM (3.5 mL)中的混合物中以一份添加戴斯-马丁氧化剂(295mg, 0.7mmol)。将混合物在25℃下搅拌3.5小时。将反应物用饱和NaHCO3水溶液和饱和Na2S2O3水溶液(v:v=1:1, 30 mL)淬灭。用EA(2×20mL)萃取混合物。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以提供作为黄色固体的311-5 (260mg, 粗产物)，其不经进一步纯化即用于下一步骤中。
在0℃下，向甲基-三苯基-鏻溴化物(359mg, 1.0mmol)于无水THF(1mL)中的搅拌溶液中逐滴添加KOBu-t(1mL, 1.0mmol, 1M, 于THF中)。将混合物在25℃下搅拌1小时。在0℃下添加311-5 (260 mg, 0.3 mmol)于无水THF (1 mL)中的溶液。将混合物在25℃下搅拌16小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液(20mL)淬灭并用EA(30mL)萃取。将有机层用盐水(20mL)洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，以得到淡白色固体，将其通过柱色谱法(PE中的10%EA)纯化，以得到作为黄色固体的311-6 (131 mg, 50 %)。1H-NMR (CDCl3, 400MHz) δ =8.40 (s, 1H), 7.55-7.21 (m, 21H), 7.10 (dd, J=1.8, 8.2 Hz, 1H), 6.84 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.37 (dd, J=11.0, 17.4 Hz, 1H), 6.09 (dd, J=7.2, 8.9 Hz, 1H),5.59-5.43 (m, 2H), 5.10-4.92 (m, 2H), 3.85-3.78 (s, 3H), 3.78-3.73 (m, 1H),3.56 (d, J=11.5 Hz, 1H), 0.99 - 0.77 (s, 9H)。
在27℃下，在N2下，向311-6 (1.50 g, 1.9 mmol)于THF (5 mL)中的溶液中添加9-BBN(0.5M, 22.5mL)。将混合物通过微波加热至70℃并搅拌0.5小时。在0℃下添加饱和NaHCO3水溶液(15mL)和H2O2(7.5mL)。将混合物在27℃下剧烈搅拌1.5小时。用饱和Na2S2O3水溶液(60mL)淬灭反应物。用EA(2×50mL)萃取混合物。将有机层用盐水(80mL)洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥。通过硅胶色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以提供作为白色固体的311-7 (930 mg, 61 %)。
在0℃下，在N2下，向311-7 (1.24 g, 1.5 mmol)于DCM (15 mL)中的溶液中以一份添加戴斯-马丁氧化剂(1.28g, 3.0mmol)。将混合物在27℃下搅拌2小时。用饱和NaHCO3水溶液和饱和Na2S2O3水溶液(v:v=1:1, 60 mL)淬灭反应物。用EA(2×50mL)萃取混合物。将合并的有机相用盐水(80mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以提供作为黄色固体的311-8 (1.21g, 粗产物)。
在0℃下，向甲基-三苯基-鏻溴化物(1.64g, 4.6mmol)于无水THF(5.5mL)中的搅拌溶液中逐滴添加叔-BuOK(1M, 4.4mL)。将混合物在27℃下搅拌1小时。在0℃下，添加311-8 (1.21g粗产物，1.5mmol)于THF(5mL)中的溶液。将混合物在27℃下搅拌12小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液(70mL)淬灭，用EA(2×50mL)萃取。将有机层用盐水(80mL)洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥，以得到淡黄色固体，将其通过柱色谱法(PE中的15% EA)纯化，以得到作为白色固体的311-9 (970 mg, 80 %)。
在27℃下，在N2下，向311-9 (970 mg, 1.2 mmol)于CH3CN (10 mL)中的溶液中添加TPSCl(877mg, 3.0mmol)、DMAP(363mg, 3.0mmol)和TEA(301mg, 3.0mmol)。将混合物在27℃下搅拌1.5小时。添加NH3•H2O (5 mL)，并将反应混合物在27℃下搅拌2小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液(60mL)淬灭，然后用EA(2×40mL)萃取。将合并的有机相用盐水(60mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化残余物，以提供作为白色固体的311-10 (810 mg, 83 %)。
在27℃下，在N2下，向311-10 (500 mg, 0.6 mmol)于MeOH (15 mL)中的溶液中添加NH4F(455mg, 12.3mmol)。将混合物在70℃下搅拌12小时。然后将混合物冷却至室温并过滤。在减压下浓缩滤液。通过硅胶色谱法(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以提供粗311(120mg, 粗产物)。通过制备型HPLC(中性条件)纯化粗产物，以得到作为白色固体的311(86 mg, 45 %)。MS:m/z =304 [M+H]+。
实施例180
化合物312
在室温下，向312-1 (30 g, 122.85 mmol)和1,1-二甲氧基环戊烷(86 g, 660.93mmol)于DCE (200 mL)中的混合物中以一份添加TsOH·H2O (2.34 g, 12.29 mmol)。将混合物加热至70℃并搅拌14小时。将混合物冷却至室温并在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的1%-10% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的312-2 (25 g, 65.6%)。
在室温下，向312-2 (20 g, 64.45 mmol)于无水CH3CN (200 mL)中的溶液中添加IBX(19.85g, 70.9mmol)。将混合物回流18小时，然后冷却至0℃。滤出沉淀物，并浓缩滤液，以得到作为黄色固体的粗312-3 (20 g, 100%)。
在0℃下，向312-3 (20 g, 64.87 mmol)于1,4-二氧杂环己烷(200 mL)中的溶液中添加37% HCHO(20mL)和2.0M NaOH水溶液(40mL)。将混合物在室温下搅拌过夜，然后用AcOH中和至pH=7。在20℃下用NaBH4(4.91g, 129.74mmol)处理溶液。将混合物在室温下搅拌1小时。用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应物。用EA(3×100mL)萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM中的1-3% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的312-4 (9 g, 40.8 %)。
在-30℃下，向312-4 (15.50 g, 45.54 mmol)于无水吡啶(80.00 mL)中的溶液中逐滴添加无水DCM (20.00 mL)中的DMTrCl(18.52g, 54.65mmol)。将混合物在25℃下搅拌过夜。将溶液用MeOH处理并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为黄色固体的312-5 (10.59g, 收率32.56%)。
向312-5 (2.90 g, 4.51 mmol)于CH2Cl2 (20.00 mL)中的溶液中添加AgNO3(1.15g, 6.77mmol)、咪唑(767.60mg, 11.28mmol)和TBDPSCl(1.86g, 6.77mmol)。将混合物在25℃下搅拌14小时。滤出沉淀物，并用水洗涤滤液，并经无水Na2SO4干燥。在低压下去除溶剂。通过硅胶色谱法(PE:EA=5:1)纯化粗残余物，以提供作为黄色固体的312-6 (2.79 g,63.19%)。
将312-6 (2.79 g, 3.17 mmol)溶解于80% HOAc水溶液(50mL)中。将混合物在25℃下搅拌4小时。将溶液用MeOH处理并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(PE:EA=4:1)纯化残余物，以得到作为黄色固体的312-7 (0.9 g, 44%)。
在0℃下，在N2下，向312-7 (1.50 g, 2.59 mmol)于无水DCM (20 mL)中的溶液中添加戴斯-马丁氧化剂(1.32g, 3.11mmol)。将混合物在室温下搅拌4小时。通过添加Na2S2O3/碳酸氢钠饱和水溶液来淬灭反应物。将混合物搅拌15分钟。将有机层分离，用稀盐水洗涤，并在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(PE中的20% EtOAc)纯化粗残余物，以得到作为白色固体的312-8 (1.12g, 收率67.48%)。
在-70℃下，在N2下，向PPh3CH3Br (1.49 g, 4.16 mmol)于无水THF (15 mL)中的溶液中添加正-BuLi(0.41mL, 3.47mmol)。将混合物在0℃下搅拌0.5小时。在0℃下，在N2下，逐滴添加312-8 (800.00 mg, 1.39 mmol)于无水THF (3 mL)中的溶液。将混合物在25℃下搅拌2小时。将反应物用饱和NH4Cl溶液淬灭，并用EtOAc(3×60mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(PE中的20% EtOAc)纯化粗产物，以得到作为白色固体的312-9 (504 mg, 56.78%)。
在室温下，向312-9 (500 mg, 869.96 μmol)于无水CH3CN (10.00 mL)中的溶液中添加2,4,6-三异丙基苯磺酰氯(526.95mg, 1.74mmol)、DMAP(212.57mg, 1.74mmol)和Et3N(1.83g, 18.04mmol)。将混合物在25℃下搅拌1小时。添加NH3•H2O (5.00 mL)，并将混合物搅拌1小时。将混合物用EA萃取并用盐水、0.1M HCl和饱和NaHCO3水溶液洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(EtOAc)纯化残余物，以得到作为黄色固体的312-10 (307 mg, 55.36%)。
在25℃下，在N2下，向312-10 (307 mg, 535.08 μmol)于MeOH (4 mL)中的溶液中添加NH4F(814mg, 20mmol)。将混合物在65℃下搅拌16小时。过滤溶液并蒸发至干燥。通过硅胶柱(EA:MeOH=50:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的312-11 (130 mg, 65.2%)。
在25℃下，在N2下，用HCl:MeOH (6mL, 1N)处理312-11 (108 mg, 322.05 μmol)。将混合物在25℃下搅拌1小时。用EA(3×10mL)萃取水相。将残余水溶液冻干，以提供作为黄色固体的312 (80.00mg, 收率87.65%)。ESI-MS:m/z 270 [M+H]+。
实施例181
化合物313
在25℃下，在N2下，向K2CO3 (2.40 g, 17.35 mmol)和TsN3 (1.37 g, 6.94 mmol)于CH3CN (20 mL)中的混合物中以一份添加1-二甲氧基磷酰基丙-2-酮(1.15g, 6.94mmol)。将混合物在25℃下搅拌2小时。在25℃下，在N2下，以一份添加313-1 (2.00 g, 3.47 mmol)于MeOH (20 mL)中的溶液，并将混合物在25℃下搅拌16小时。将混合物倒入水中并用EtOAc(2×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过制备型HPLC(TFA缓冲液)纯化残余物，以得到作为白色固体的313-2 (1.50 g, 75%)。
在0℃下，向313-2 (600 mg, 1.05 mmol)于干燥CH3CN (60 mL)中的溶液中添加TEA(212mg, 2.10mmol)、DMAP(256mg, 2.10mmol)和2,4,6-三异丙基苯磺酰氯(635mg,2.10mmol)。将混合物在25℃下搅拌1小时。在25℃下添加NH3•H2O(10 mL)。将混合物在25℃下搅拌1小时。将反应物用饱和NH4Cl溶液淬灭，并用EtOAc(2×10mL)萃取。将有机相用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(PE:EA =3:1至0:1)和制备型TLC(DCM:MeOH = 10:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的313-3 (380 mg, 63%)。
将313-3 (300 mg, 0.52 mmol)和NH4F (194 mg, 5.25 mmol)于干燥MeOH (5mL)中的溶液在65℃下搅拌12小时。在低压下浓缩混合物。通过硅胶柱色谱法(DCM:MeOH =50:1至10:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的313-4 (140 mg, 80%)。
将313-4 (100 mg, 0.30 mmol)于1 N HCl:MeOH (5 mL)中的溶液在25℃下搅拌2小时。将混合物在40℃下浓缩。用CH3CN(5×2mL)洗涤残余物，以得到作为白色固体的313(61 mg, 67%)。ESI-LCMS:m/z 268.1 [M+H]+。
实施例182
化合物314
向 N-(叔丁氧基羰基)-L-缬氨酸(8.06 g, 37.1 mmol, 1.5 eq.)于无水ACN (60 mL)中的溶液中添加羰基二咪唑(6.01g, 37.1mmol, 1.5eq.)。将反应物在室温下搅拌1小时，然后冷却至0℃。将44 (14.9 g, 24.7 mmol, 1 eq.)于无水ACN (50 mL)中的溶液添加至N-BOC-缬氨酸咪唑鎓(imidazolide)的冷却溶液中，并将所得溶液用Et3N(6.4mL,49.4mmol, 2eq.)处理。将反应在0℃下进行1小时。将反应物用1M柠檬酸淬灭至pH 2-3(150mL)，搅拌15分钟并用IPAC(200mL)稀释。将有机层分离，依次用水和半饱和碳酸氢钠和水(2x)洗涤。在减压下浓缩有机层，并在温和加热(40℃)下将残余物溶解于MTBE(125mL)中，以提供目标化合物的沉淀物。将固体在0℃下老化过夜并通过过滤分离，以获得作为白色固体的314-1 (18.0 g, 90.9%)。MS:m/z = 802 [M+1]+。
将314-1 (2.4 g, 3 mmol)于IPAC (45 mL)中的搅拌浆液用甲磺酸(0.39 mL,6mmol, 2 eq.)处理，并将混合物在40℃下搅拌。1小时后，添加甲磺酸(2×0.2mL, 6mmol,2eq.)，并将温度升高至50℃。5小时后，将混合物冷却至室温。将固体滤出，用IPAC洗涤并在真空中干燥，以产生314 (2.0 g, 83%)。MS:m/z = 702.2 [M+1]+。
实施例183
三磷酸酯
将干燥核苷(0.05mmol)溶解于PO(OMe)3 (0.7 mL)和吡啶(0.3 mL)的混合物中。将混合物在真空中在浴温(42℃)下蒸发15分钟，然后冷却至室温。添加N-甲基咪唑(0.009mL,0.11mmol)，随后添加POCl3(9μL, 0.11mmol)，并将混合物在室温下保持20-40分钟。将反应通过LCMS控制并根据相应核苷5'-单磷酸酯的出现监测。完成后，添加焦磷酸四丁铵盐(150mg)，随后添加DMF(0.5mL)，以得到均质溶液。在环境温度下1.5小时后，将反应物用水(10mL)稀释并装填至具有Q Sepharose High Performance的柱HiLoad 16/10上。以50mMTRIS缓冲液(pH 7.5)中的0至1N的NaCl的线性梯度完成分离。三磷酸酯在75-80% B时洗脱。浓缩相应级分。在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC实现脱盐。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至30%的甲醇的线性梯度来洗脱。将相应级分合并，浓缩并冻干3次以去除过量缓冲液。根据该程序制备的化合物的实例提供于表2中。
实施例184
化合物315-331
如2012年12月20日提交的美国公布2013/0165400，2012年12月20日提交的PCT公布WO2013/096679和2013年3月19日提交的公布WO 2013/142525中所述制备化合物315-331，所述公布通过引用以其全部并入本文。
实施例185
化合物332和333
如2011年9月19日提交的美国公布2012/0070415中所述制备化合物332和333，所述公布通过引用以其全部并入本文。332: 287 [M+H]+, 573 [2M+H]+; and 333:525.3 [M-1]。
实施例186
化合物346-350
遵循本文所述的一个或多个程序并使用本领域技术人员已知的方法制备化合物346-350。
实施例187
化合物352
向352-1 (1.2 g, 2.09 mmol)于DCE (40 mL)中的溶液中添加TFA(2mL)。将混合物在室温下搅拌1小时。在减压下将混合物浓缩，并通过柱色谱法(DCM中的3% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的352-2 (600 mg, 95.3%)。
在室温下，向352-2 (600 mg, 1.99 mmol)于吡啶(4 mL)中的溶液中添加咪唑(677mg, 9.95mmol)和TBSCl(900mg, 5.97mmol)。将混合物在60℃下搅拌16小时，然后在减压下浓缩。将残余物用EA(40mL)稀释并用盐水(20mL)洗涤。将有机层经无水MgSO4干燥并过滤。在减压下浓缩滤液，并通过柱色谱法(PE中的10% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的352-3 (700 mg, 65.7%)。
向352-3 (700 mg, 1.32 mmol)于DCM (52 mL)中的溶液中添加NIS(356mg,1.58mmol)和TFA(1.3mL)。将混合物在60℃下搅拌3小时。冷却至室温之后，将溶液用DCM(30mL)萃取，用饱和NaHCO3水溶液和盐水(20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并过滤。在减压下浓缩滤液。通过柱色谱法(PE中的10% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的352-4 (400mg, 46.2%)。
将352-4 (327 mg, 498 μmol), Bu3SnH (174 mg, 598 μmol)和2,2'-偶氮双(2,4-二甲基戊腈)(25mg, 100μmol)于THF-d8 (10 mL)中的混合物在90-100℃下搅拌3小时。将混合物在减压下浓缩。并通过柱色谱法(PE中的10% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的352-5 (180 mg, 68.00%)。
在室温下，向352-5 (210 mg, 395 μmol)于无水MeCN (2 mL)中的溶液中添加DMAP(121mg, 989μmol)、Et3N(100mg, 989μmol)和2,4,6-三异丙基苯-1-磺酰氯(299mg,989μmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。添加NH3·H2O (1 mL)，并将混合物搅拌1小时。将混合物用EA(15mL)稀释并用饱和NH4Cl水溶液(15mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。在减压下浓缩滤液，并通过柱色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化残余物，以得到粗产物。通过制备型TLC(DCM中的10% MeOH)纯化粗产物，以得到作为白色固体的352-6 (200 mg,95.42%)。
在室温下，向352-6 (200 mg, 0.38 mmol)于MeOH (2 mL)中的溶液中添加NH4F(210mg, 5.66mmol)。将混合物在90-100℃下搅拌16小时。过滤混合物并在减压下浓缩滤液。通过柱色谱法(DCM中的10% MeOH)纯化残余物，以得到粗产物。通过制备型HPLC(中性条件)纯化粗产物，以得到作为白色固体的352 (70mg, 61.8%收率，78.4%氘)。ESI-TOF-MS:m/z = 302.1 [M+H]+, 603.2 [2M+H]+。
实施例188
化合物353
二磷酸酯353可以使用与制备实施例183的三磷酸酯类似的程序制备，其中用磷酸四丁铵(75mg)替代焦磷酸四丁铵盐并使用0.3mL DMF，以得到均质溶液。
实施例189
化合物354
向354-1 (22.80 g, 99.91 mmol)于无水吡啶(200 mL)中的溶液中添加DMTCl(37.24g, 109.90mmol)，并将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应物用饱和NH4Cl溶液(200mL)淬灭，并用EA(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA = 2:1至0:1)纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的所需产物(43.00g, 72.94mmol)。
在0℃下，向该产物的溶液(20.00g, 37.70mmol)中添加DMF (200.00 mL)中的AgNO3(6.40g, 37.70mmol)和咪唑(5.13g, 75.39mmol)，随后添加TBSCl(8.52g,56.54mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时，然后将混合物在减压下浓缩以去除DMF。将残余物用冰-水(300mL)稀释并用EA(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA = 3:1至1:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的1-[(2R,4S,5R)-5-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-4-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基-四氢呋喃-2-基]嘧啶-2,4-二酮(15.70 g, 24.35mmol)。
将1-[(2R,4S,5R)-5-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基-甲氧基]甲基]-4-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基-四氢呋喃-2-基]嘧啶-2,4-二酮(20.00 g, 31.02 mmol)于AcOH (105g, 1.40 mol)中的溶液在25℃下搅拌1小时。用MeOH (100mL)淬灭反应物，并在减压下浓缩混合物。用水(100mL)稀释残余物。将溶液用固体NaHCO3中和至pH=7，并用EA(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA = 5:1至0:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的354-2 (8.90 g, 20.79 mmol)。
在0℃下，向354-2 (3.42 g, 9.99 mmol)于二氧杂环己烷(15.00 mL)和DMSO(3.00 mL)中的搅拌溶液中添加DCC (6.18 g, 29.97 mmol)和Py·TFA (1.93 g, 9.99mmol)。将混合物在25℃下搅拌2小时。用EA(50mL)稀释溶液，并通过过滤去除固体。用盐水(30mL)洗涤滤液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。残余物不经进一步纯化即用于下一步骤中。
在25℃下，向来自前述步骤的残余物(3.4g)和甲醛(水溶液，3mL)于二氧杂环己烷(20mL)中的溶液中以一份添加2.0M NaOH (水溶液，5mL)。将混合物在25℃下搅拌16小时。将混合物冷却至0℃并用AcOH中和至pH=7。在0℃下用NaBH4(452mg, 11.952mmol)处理溶液。将混合物在25℃下搅拌30分钟，然后用饱和NH4Cl水溶液(100mL)淬灭反应物。用EA(2×100mL)萃取混合物。将有机相经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过柱色谱法(DCM:MeOH =20:1至10:1)纯化残余物，以提供作为白色固体的308-3 (1.43 g, 38.4%)。
在0℃下，向354-3 (1.43 g, 3.84 mmol)于DCM (10.00 mL)中的溶液中添加Tf2O(2.38g, 8.45mmol)和吡啶(1.51g, 19.2mmol)，并将混合物在25℃下搅拌1小时。将反应物在0℃下通过冰-水(20mL)淬灭，然后用DCM (2×30mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM:MeOH =40:1)纯化残余物，以得到作为黄色泡沫的354-4 (1.60 g, 2.14 mmol)。
向354-4 (1.60 g, 2.51 mmol)于DCM (10.00 mL)中的溶液中添加TEA(1.27g,12.57mmol)，并将混合物在25℃下搅拌16小时。将反应物用1.0M HCl溶液淬灭至pH=7，然后用DCM (30mL)萃取。将有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(DCM:MeOH = 40:1至30:1)纯化残余物，以得到作为黄色固体的354-5 (1.10 g,81.07%)。
向354-5 (1.10 g, 2.27 mmol)于DMF (10.00 mL)中的溶液中添加NaN3(441.84mg, 6.80mmol)，并将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应物用H2O(3mL)淬灭，并用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩，以得到作为黄色固体的354-6 (800.00 mg, 92.87%)。
向354-6 (800.00 mg, 2.11 mmol)于THF (20.00 mL)中的溶液中添加NaOH溶液(1.05mL, 2.11mmol, 2.0M)，并将混合物在25℃下搅拌12小时。将混合物用EA(20mL)稀释，并用盐水(15mL)洗涤。将溶液经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩，以得到作为黄色固体的354-7 (821.00 mg, 97.89%)。
向354-7 (596 mg, 1.50 mmol)于DCM (10 mL)中的溶液中添加TBSCl(452.16mg,3.00mmol)和咪唑(306.36mg, 4.50mmol)，并将混合物在25℃下搅拌5小时。用DCM (20mL)稀释混合物。将溶液用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM:MeOH = 40:1至30:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的354-8 (750 mg, 87.93%)。
向354-8 (600 mg, 1.17 mmol)和TEA (296 mg, 2.93 mmol)于CH3CN (10 mL)中的溶液中添加TPSCl(862mg, 2.93mmol)。将混合物加热至40℃持续5小时。将反应物用0.5MHCl溶液淬灭至pH=6。用EA(3×20mL)萃取溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。用NH3/THF(20mL, 10M)处理残余物。将溶液在25℃下搅拌16小时，然后在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM:MeOH = 30:1至20:1)纯化残余物，以得到粗产物(500mg)。通过制备型TLC(DCM:MeOH = 10:1)纯化粗产物，以得到作为白色固体的354-9 (310 mg, 52%)。
在25℃下，向354-9 (310 mg, 606.9 μmol)于THF (5 mL)中的溶液中添加THF中的TBAF (2mL, 1.0M)。将溶液在25℃下搅拌0.5小时。在低压下浓缩混合物。通过制备型HPLC(HCl体系)纯化残余物，以得到作为白色固体的354 (86 mg, 50.2%)。ESI-TOF-MS: m/z = 283.1 [M+H]+, 565.3 [2M+H]+。
实施例190
化合物355和356
在25℃下，向355-1 (394 g, 2.62 mol)和咪唑 (268 g, 3.93 mol)于DMF (3 L)中的溶液中以一份添加TBDPSCl(756.14g, 2.75mol)。将混合物加热至50℃并搅拌12小时。将混合物倒入水/盐水(v:v = 1:1) (6 L)中并搅拌20分钟。用EA(2×4L)萃取混合物。将合并的有机相用饱和盐水(2×4L)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在真空中浓缩，以得到作为黄色固体的355-2 (800g, 粗产物)。
在25℃下，向355-2 (1000 g, 2.57 mol)和2,2-二甲氧基丙烷(450 g, 4.32mol)于DCM (6 L)中的溶液中以一份添加TsOH·H2O (490 g, 2.57 mol)。将混合物搅拌0.5小时。用水(1L)淬灭反应物。将有机层用水(2×4L)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在真空中浓缩，以得到355-3 (1.1kg, 粗产物)，其直接用于下一步骤。
将355-3 (1.0 kg, 2.33 mol)和NH4F (198 g, 5.36 mol)于MeOH (3 L)中的混合物搅拌至回流4小时。蒸发溶剂之后，直接通过硅胶(PE:EA = 1:1)纯化粗产物，以得到粗355-4，将其再结晶(PE:EA = 1:1)，以得到作为白色固体的纯355-4 (170g, 38.4%收率)。1H-NMR (400 MHz, CD3OD), δ = 5.90 (d, J = 4 Hz, 1 H), 4.52 (d, J = 4 Hz, 1H), 4.15 (s, 1 H), 4.0-3.97 (m, 1 H), 3.75-3.65 (m, 2 H), 1.50 (s, 3 H), 1.31(s, 3 H)。
在0℃下，向355-4 (300 g, 1.58 mol)于DMF (4 L)中的溶液中分份添加NaH(83.3g, 3.47mol)，并将混合物在25℃下搅拌1小时。添加BnBr(553g, 3.23mol)，并将混合物在25℃下搅拌1小时。通过NH4Cl(饱和，1L)和水(2L)淬灭反应物。用EA:PE (2 X 3 L, v:v=1:1)萃取溶液。在真空中浓缩合并的有机层。通过硅胶色谱法(PE:EA = 50:1)纯化残余物，以提供作为黄色油的355-5 (505 g, 79.4%)。
在25℃下，向355-5 (330 g, 891 mmol)于MeOH (1500 mL)中的溶液中逐滴添加H2SO4(浓，20mL, 406mmol)。将混合物加热至60℃持续2小时。将混合物冷却至25℃之后，用HCl (2 N, ~160 mL)将混合物pH调节至7-8。用EA(1.5L)稀释溶液。将有机层用H2O(2×1L)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(PE:EA = 5:1)纯化残余物，以提供作为黄色油的纯355-6 (280 g, 78.3%)。
在-10℃下，在N2下，向355-6 (150 g, 435.54 mmol)和DMAP (69.2 g, 566mmol)于DCM (1.5 L)中的溶液中缓慢添加Tf2O(135.2g, 479mmol)。将混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应物用水(600mL)淬灭，并用HCl(1N)调节pH至4-5。将有机层分离，并用NaHCO3(饱和，1L)、盐水(1L)洗涤，并经无水Na2SO4干燥。将溶液在真空中浓缩，以得到作为黄色油的355-7 (207g, 粗产物)。
将355-7 (207 g, 435.50 mmol)和TBAF (1M, 在THF中，870mL)的混合物在60-70℃下搅拌12小时。在低压下蒸发溶剂。将残余物溶解于EA(800mL)中。将溶液用水(3×500mL)、盐水(500mL)洗涤并经无水Na2SO4干燥。在低压下浓缩溶液。通过硅胶色谱法(PE:EA= 20:1)纯化残余物，以提供作为淡黄色油的355-8 (40 g, 25.46%)。1H-NMR (400 MHz,CD3OD) δ = 7.36-7.33 (m, 10H), 5.05 (d, J = 8 Hz, 1 H), 4.87 (m, 0.5 H),4.80-4.70 (m, 1.5 H), 4.62-4.53 (m, 3 H), 4.36-4.30 (m, 1 H), 4.18-4.05 (m, 2H), 3.70-3.53 (m, 2 H), 3.36 (s, 3 H). 19F NMR (376 MHz, CDCl3) δ = -209.48。
在Ar下，向355-8 (50 g, 144.35 mmol)于MeOH (50 mL)中的溶液中添加Pd(OH)2/C(13g, 50% H2O)。将悬浮液在真空下脱气并用H2吹扫几次。在H2(40psi)下，在40℃下，将混合物搅拌8小时。滤出催化剂之后，在真空中浓缩滤液，以得到作为灰色固体的355-9 (23 g, 91%)。
在0℃下，向355-9 (55 g, 331 mmol)和咪唑 (31.55 g, 463.4 mmol)于DCM (1L)中的溶液中缓慢添加TBDPSCl(100g, 364.13mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。用水(100mL)淬灭反应物，然后浓缩混合物。将残余物溶解于EA(500mL)中。将溶液用水(2×500mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(PE:EA = 5:1)纯化残余物，以提供作为无色油的355-10 (74 g, 55%)。
在0℃下，向355-10 (70 g, 173 mmol)于DMF (750 mL)中的溶液中添加NaH(7.61g, 190mmol)，并将混合物在25℃下搅拌1小时。在0℃下，在N2下缓慢添加BnBr(32.55g, 190.33mmol)。将混合物在25℃下搅拌2小时，并用水(1000mL)淬灭反应物。通过EA:PE (v:v = 2:1, 2 X 800 mL)萃取溶液。将有机层分离并用盐水:水 (v:v = 1:1, 2 X500 mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩，以得到作为黄色油的355-11(80g, 粗产物)。
将355-11 (100 g, 202.1 mmol)和NH4F (15 g, 404.3 mmol)于MeOH (2000 mL)中的混合物在65℃下搅拌12小时。将混合物冷却至25℃并在减压下浓缩。将残余物用EA(500mL)稀释并用水(2×500mL)洗涤。将有机相用饱和盐水(500mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过硅胶色谱法(PE:EA = 8:1)纯化残余物，以提供作为黄色油的355-12 (36 g, 69.5%)。
在25℃下，在N2下，向355-12 (36 g, 148.4 mmol)和TEA (22.51 g, 222.4mmol)于DCM (300 mL)中的溶液中逐滴添加BzCl(23g, 163.1mmol)，并将混合物在25℃下搅拌12小时。用水(500mL)淬灭反应物。将有机层分离，通过水(400mL)洗涤和经无水Na2SO4干燥。在减压下浓缩有机层，以得到作为黄色油的355-13 (55g, 粗产物)。
将355-13 (55 g, 152.62 mmol)于TFA:H2O (500 mL, v:v = 9:1)中的混合物在25℃下搅拌30小时。在真空中蒸发溶液。将残余物用EA(200mL)稀释，并用NaHCO3(水溶液，200mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过硅胶(PE:EA = 10:1)纯化残余物，以提供作为黄色油的355-14 (45g, 80.8%收率)。
在25℃下，向355-14 (45 g, 129.9 mmol)于EtOH (500 mL)中的溶液中添加NaBH4(5.41g, 142.9mmol)，并将混合物在25℃下搅拌0.5小时。将反应物用NH4Cl水溶液(500mL)淬灭，并用EA(2×300mL)萃取。将有机层用盐水(300mL)洗涤，并在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA = 2:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的355-15 (42g, 94%收率)。1H-NMR (400 MHz, MeOD), δ = 8.05 (d, J = 7.2 Hz, 2H), 7.65-7.20 (m, 9 H),4.95 (m, 0.5 H), 4.80-4.65 (m, 2 H), 4.53-4.47 (m, 2 H), 4.15-4.07 (m, 1 H),4.00-3.85 (m, 3 H). 19F NMR (376 MHz, MeOD) δ = -196.75。
将355-15 (90 g, 258.4 mmol)于吡啶(500 mL)中的混合物在25℃下用DMTrCl(92g, 271mmol)处理16小时。在真空中蒸发溶剂。将残余物溶解于EA(500mL)中。将溶液用水(2×300mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩，以得到作为黄色固体的355-16(145g, 粗产物)。
向355-16 (145 g, 223 mmol)于MeOH:THF (2000 mL, v:v = 3:1)中的溶液中以一份添加NaOMe(12g, 53.8mmol)。将混合物在25℃下搅拌1小时，并用CO2(固体)淬灭反应物。在低压下浓缩混合物。将残余物溶解于EA(200mL)中。将溶液用水(300mL)和盐水(300mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(PE:EA = 5:1)纯化残余物，以得到作为黄色油的355-17 (85 g, 70%)。
在20℃下，向355-17 (35.0 g, 64 mmol)于吡啶(200 mL)中的溶液中以一份添加TrtCl(21.42g, 76.84mmol)。将混合物在20℃下搅拌15小时。在真空中蒸发溶液。将残余物溶解于EA(300mL)中。用水(2×200mL)洗涤溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过硅胶色谱法(PE:EA = 20:1)纯化残余物，以得到作为黄色油的355-18 (31 g,89.5%)。
在20℃下，向355-18 (31 g, 41.8 mmol)于CH3CN (500 mL)中的溶液中以一份添加IBX(11.7g, 41.8mmol)，并将混合物在80℃下搅拌2小时。将混合物冷却，然后过滤。在低压下浓缩滤液，以得到作为黄色油的355-19 (32g, 粗产物)。
在15℃下，向355-19 (32 g, 40.6 mmol)和CsF (18.53 g, 122 mmol)于THF(300 mL)中的溶液中添加TMSCF3(17.35g, 122mmol)，并将混合物在15℃下搅拌18小时。用MeOH (5mL)淬灭反应物。将溶液用EA(300mL)萃取，并用水(2×200mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA = 8:1)纯化残余物，以得到作为黄色油的355-20 (25 g, 71.7%)。19F NMR (376 MHz, CDCl3) δ = -74.93, -74.95, -186.74, -186.83。
向355-20 (50 g, 58.35 mmol)于THF (50 mL)中的溶液中添加AcOH (200mL,80%)，并将混合物在15℃下搅拌16小时。然后将混合物加热至45℃并搅拌2小时。在真空中蒸发溶剂(在蒸发期间添加MeOH (5×5mL))。通过柱色谱法(PE:EA = 20:1)纯化残余物，以得到作为黄色固体的355-21 (下点（down spot），所需异构体)(7.4g, 22.9%)和作为黄色固体的副产物(17.1g, 52.84%)(上点)。下点：1H-NMR (400 MHz, CDCl3), δ = 7.50-7.25(m, 20 H), 4.85-4.65 (t, 2 H), 4.48-4.40 (m, 1 H), 4.35 (m, 0.5 H), 4.25 (m,0.5 H), 3.75-3.65 (m, 3 H), 3.20 (d, J = 12 Hz, 1 H). 19F-NMR (376 MHz, MeOD),δ = -75.55, -190.067。上点：1H-NMR (400 MHz, CDCl3), δ = 7.50-7.25 (m, 20 H),4.98-4.80 (m, 1 H), 4.67 (d, J = 12 Hz, 1 H), 4.42-4.39 (m, 1 H), 4.33-4.29(m, 1 H), 3.85-3.71 (m, 2 H), 3.65-3.60 (m, 1 H), 3.54-5.52, (m, 2H). 19F-NMR(376 MHz, MeOD), δ = -75.455 (s, 3 F), -189.53 (s, 1F)。
向355-21 (8.50 g, 15.3 mmol)于THF:DMSO (60 mL)中的溶液中添加IBX(4.29g, 15.3mmol)，并将混合物在35℃下搅拌2小时。将溶液缓慢温热至40℃，并将混合物搅拌2小时。过滤混合物，并在减压下浓缩滤液。将残余物用EA(100mL)稀释并用水(100mL)洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA = 25:1)纯化残余物，以得到作为黄色油的355-22 (8.0 g, 75%)。
向355-22 (4.50 g, 8.14 mmol)于吡啶(50 mL)中的溶液中添加Ac2O(2.49g,24.4mmol)。将混合物在15℃下搅拌3小时。用MeOH (1mL)淬灭反应物，并在真空中蒸发溶剂。将残余物溶解于EA(40mL)中。将溶液用水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA = 20:1)纯化残余物，以得到作为无色油的355-23 (4.30 g,88.8%)。1H-NMR (400 MHz, CDCl3), δ = 7.50-7.20 (m, 20 H), 6.45 (d, J = 12 Hz, 1H), 4.90 (m, 0.5 H), 4.77 (m, 0.5 H), 4.70-4.55 (m, 3 H), 3.40 (dd, J = 40Hz, 2 H), 1.79 (s, 3 H). 19F-NMR (376 MHz, MeOD), δ = -73.92 (d, J = 18 Hz,3F), -204.95 (t, 1F)。
在N2气氛下，向355-23 (900 mg, 1.51 mmol)于MeOH (20 mL)中的溶液中添加Pd(OH)2/C(50%，0.6g)。将悬浮液脱气并用H2吹扫(3x)。在H2(40psi)下，在40℃下，将混合物搅拌24小时，然后过滤。在真空中浓缩滤液。通过柱色谱法(PE:EA = 10:1)纯化残余物，以得到作为黄色油的355-24 (300 mg, 39.4%)。
向355-24 (200 mg, 396.5 μmol)于DCM (2 mL)中的溶液中添加TFA(153mg,1.34mmol)和Et3SiH (365mg, 3.14mmol)。将混合物在15℃下搅拌20分钟。直接在真空中蒸发溶剂。通过柱色谱法(PE:EA = 1:1)纯化残余物，以得到作为白色固体的355-25 (100mg, 96%)。
向355-25 (100 mg, 381 μmol)于DCM (2 mL)中的溶液中添加DMAP(46.60mg,381μmol)和TEA(115.8mg, 1.14mmol)。添加BzCl(117.96mg, 839.19μmol)，并将混合物在15℃下搅拌0.5小时。用HCl(0.3N, 10mL)淬灭反应物。将混合物用CH2Cl2(3×10mL)萃取，并用水(10mL)洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE:EA =20:1)纯化残余物，以得到作为黄色油的355-26 (144 mg, 81%)。1H-NMR (400 MHz,CDCl3), δ = 8.12 (d, J = 7.6 Hz, 1 H), 8.04 (d, J = 7.6 Hz, 1 H), 7.70-7.39(m,6H), 6.57 (d, J = 11 Hz, 1 H), 6.02 (dd, J 1 = 22.8 Hz,J2= 4.8 Hz, 1 H),5.28 (dd, J 1 = 52 Hz,J2= 4.4 Hz, 1 H), 4.74 (t, 2 H), 1.96 (s, 3 H). 19F-NMR,(376 MHz, MeOD), δ = -74.18 (d, J = 18.8 Hz, 3 F), -204.08 (t, 1F)。
将尿嘧啶(457.54 mg, 4.08 mmol)和HMDS (3.85 g, 23.86 mmol)的混合物在120℃下搅拌1小时，并在低压下蒸发溶剂。将355-26 (480 mg, 1.02 mmol)溶解于CH3CN(2mL)中，并用上述混合物处理。将混合物置入微波管中，并用TMSOTf(1.60g, 7.19mmol)处理。在微波照射下，将混合物在140℃下加热4小时。用MeOH淬灭反应物，并直接在低压下浓缩混合物。通过柱色谱法(PE:EA = 5:1)纯化残余物，以得到粗产物(2.5g)，将其通过制备型HPLC(TFA)纯化，以得到两种异构体(0.92g)。通过SFC (AD-H_6_30-65 6MIN, OJ(250mm*50mm, 10um), Base-MeOH)纯化残余物之后，获得作为白色固体的355-27a (α-异构体, 470 mg, 22%)和355-27b (β-异构体, 320 mg, 15%)：355-27a (α-异构体): 1H-NMR (400 MHz, CDCl3), δ = 8.63 (s, 1H), 8.20-8.00 (m, 4 H), 7.75-6.95 (m,6H),6.63 (d, J = 20.8 Hz, 1 H), 6.10 (dd, J 1 = 23.6 Hz,J2= 4 Hz, 1 H), 5.86 (d, J= 6.8 Hz, 1 H), 5.47 (d, J = 54 Hz, 1 H), 4.80 (s, 2H). 19F-NMR (376 MHz,MeOD), δ = -73.65 (d, J = 16.4 Hz, 3 F), -212.54 (t, 1F). 355-27b (β-异构体):1H-NMR (400 MHz, CDCl3), δ = 8.48 (s, 1H), 8.15-8.00 (m, 4 H), 7.60-7.25 (m,6H), 6.22 (dd, J 1 = 16 Hz,J2= 6.4 Hz, 1 H), 5.95-5.20 (m, 3 H), 4.80 (s, 2H).19F-NMR (376 MHz, MeOD), δ = -73.31 (d, J = 11 Hz, 3 F), -192.56 (t, 1F)。
将355-27b (180 mg, 344 μmol, 1.0 eq.)于NH3/MeOH (7 M, 5 mL)中的混合物在15℃下搅拌16小时。直接在真空中浓缩溶剂。通过制备型HPLC(中性条件，NH4HCO3)纯化残余物，以得到作为白色固体的356 (86 mg, 79.4%)。ESI-MS: m/z 315.1 [M+H]+。
向355-27b (200 mg, 383 μmol)于CH3CN (2 mL)中的溶液中添加DMAP (116 mg,957 μmol)、TEA (97 mg, 957 μmol)和2,4,6-三异丙基苯磺酰氯 (290 mg, 957 μmol)，并将混合物在15℃下搅拌20分钟。用NH3•H2O (2 mL)处理混合物，并将混合物在15℃下搅拌10分钟。用EA(2×10mL)萃取混合物。将有机相经无水Na2SO4干燥，并在低压下浓缩。将残余物通过柱色谱法(PE:EA = 2:1)纯化并通过制备型TLC(DCM:MeOH = 15:1)再纯化，以得到作为白色固体的355-28 (90 mg, 45%)。
将355-28 (90 mg, 172.61 μmol)于NH3/MeOH (7 M, 3 mL)中的混合物在15℃下搅拌16小时。直接在真空中浓缩溶剂。通过制备型HPLC(HCl条件)纯化残余物，以得到作为白色固体的355 (30 mg, 55%)。ESI-MS: m/z 314.0 [M+H]+。
实施例191
化合物357
在25℃下，用MeOH中的NH3 (50mL, 10M)处理357-1 (2.3 g, 3.0 mmol)。将混合物在25℃下搅拌24小时。将混合物在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的10%-30% EtOAc)纯化残余物，以提供作为白色固体的357-2 (1.5 g, 70.8%)。
在0℃下，在N2下，向357-2 (1.5 g, 2.26 mmol)于无水DCM (15.00 mL)中的搅拌溶液中以一份添加戴斯-马丁氧化剂(1.6g, 3.84mmol)。将混合物在25℃下搅拌1.5小时。在0℃下用饱和Na2S2O3和饱和NaHCO3(v:v = 1:1, 20 mL)淬灭反应物。用DCM (3×30mL)萃取水相。将合并的有机相用饱和盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩，以得到357-3 (1.6g, 粗产物)，其不经进一步纯化即用于下一步骤中。
在0℃下，在N2下，向甲基(三苯基)鏻溴化物(3.4g, 9.4mmol)于无水THF(12mL)中的溶液中逐滴添加正-BuLi(2.5M, 3.8mL)。将混合物在0℃下搅拌1小时。在0℃下，将THF(8mL)中的357-3 (1.55 g, 2.35 mmol)逐滴添加至混合物中。将溶液温热并在25℃下搅拌12小时。用饱和NH4Cl溶液淬灭反应物。用EA(3×50mL)萃取混合物。将合并的有机相用盐水洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过柱色谱法(PE中的10%-20% EtOAc)纯化残余物，以得到作为白色固体的357-4 (1.1 g, 71.05%)。
在25℃下，在N2下，将357-4 (501 mg, 758.9 μmol)以一份溶解于9-BBN(0.5M,15mL)中。将混合物在80℃下在微波中加热30分钟。在0℃下添加饱和NaHCO3水溶液(5mL)和H2O2(30%，2.5mL)。将混合物在25℃下搅拌2小时。在0℃下用饱和Na2S2O3淬灭反应物。用EA和水稀释混合物。用EA反萃取水相。将合并的有机相用盐水洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过柱色谱法(PE中的10%-25% EtOAc)纯化残余物，以得到作为白色固体的357-5 (395 mg, 76.9%)。
在0℃下，向357-5 (360 mg, 531.8 μmol)于无水DCM (4 mL)中的溶液中逐滴添加DCM (1 mL)中的TEA (215 mg, 2.13 mmol)和MsCl (73 mg, 638.26 μmol)。将混合物在25℃下搅拌2小时。将反应物用冰水淬灭并用CH2Cl2萃取。将有机层用盐水洗涤并经无水MgSO4干燥。将溶液过滤并浓缩为作为褐色固体的357-6 (395mg, 粗产物)，其不经进一步纯化即用于下一步骤。
在25℃下，向357-6 (380 mg, 504 μmol)于无水DMF (4 mL)中的溶液中添加NaN3(98mg, 1.51mmol)。将混合物在70℃下搅拌3小时。将反应物用水淬灭并用EA萃取。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥并过滤。在低压下浓缩滤液。通过柱色谱法(PE中的10%-30%EtOAc)纯化残余物，以得到作为白色固体的357-7 (295 mg, 83.5%)。
在25℃下，向357-7 (295 mg, 420.3 μmol)于无水CH3CN (3 mL)中的搅拌溶液中添加DMAP (102.7 mg, 840.6 μmol)、TEA (85.1 mg, 840.6 μmol)和TPSCl (247.9 mg,840.6 μmol)。将混合物在25℃下搅拌3小时。添加NH3·H2O (10 mL, 28%)，并将混合物搅拌1小时。将混合物用EA稀释，并用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在真空中浓缩。通过柱色谱法(DCM中的1%-2% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的357-8 (260 mg,88.3%)。
在25℃下用80% HCOOH (10mL)处理357-8 (240 mg, 342.4 μmol)。将混合物在70℃下搅拌2小时。将反应物冷却至25℃，然后在减压下浓缩。在硅胶柱(DCM中的2%-6% MeOH)上纯化残余物，以得到作为白色固体的357 (85 mg, 79.1%)。ESI-TOF-MS: m/z = 314.9[M+H]+, 629.1 [2M+H]+。
实施例192
化合物358
将358-1 (0.68 g, 1.07 mmol)于AcOH (10 mL)和TFA (0.25 mL)中的溶液在室温下搅拌1小时。蒸发混合物，并将残余物与MeCN和甲苯共同蒸发。在二氧化硅柱上用MeOH:CH2Cl2溶剂体系(2-12%梯度)纯化，提供358-1 (0.32 g, 82%)。
将THF (9 mL)中的358-1 (0.32 g, 0.9 mmol)和LiBH4 (94 mg, 3.6 mmol)的混合物在室温下搅拌2天。用AcOH:EtOH淬灭反应物，并蒸发混合物。在二氧化硅柱上用MeOH:CH2Cl2溶剂体系(4-15%梯度)纯化，提供358-2 (80 mg, 30%)。
将358-2 (80 mg, 0.27 mmol)于吡啶(3 mL)和异丁酸酐(90μL, 0.55mmol)中的混合物在室温下搅拌过夜。蒸发混合物，并将残余物与甲苯共同蒸发。在二氧化硅柱上用EtOAc:己烷溶剂体系(30-100%梯度)纯化，产生作为白色固体的358-3 (72 mg, 61%)。
向358-3 (72 mg, 0.17 mmol)于MeCN (2 mL)中的溶液中添加三异丙基苯基磺酰氯 (102 mg, 0.34 mmol)、DMAP (41 mg, 0.34 mmol)和Et3N (47 μL, 0.34 mmol)。将混合物在室温下搅拌90分钟，然后将氨气快速鼓泡(<1分钟)通过。将混合物搅拌10分钟。将混合物用CH2Cl2稀释，用0.1N HCl、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用Na2SO4干燥。在二氧化硅柱上用MeOH:CH2Cl2溶剂体系(4-12%梯度)纯化，提供358 (46 mg, 60%). MS: m/z =434.00 [M-1]。
实施例193
化合物359
向异丁酸(278 µL, 3 mmol)于THF (5 mL)中的溶液中添加CDI(486mg, 3mmol)。1小时之后，将异丁酸咪唑鎓(imidazolide)的溶液添加至106 (600 mg, 2 mmol)、三乙胺(560 µL, 4 mmol)和DMAP (0.2 mmol)于DMF (5 mL)中的搅拌溶液中。将混合物在室温下放置过夜。将反应物分配于乙酸异丙酯和氯化铵饱和水溶液之间。将有机相用水洗涤并在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的10%至15% MeOH)、随后从异丙醇:己烷(1:2)中结晶来分离作为白色固体的359 (500 mg, 67%)。MS: m/z 371 [M+H]+。
实施例194
化合物360
向360-1 (2.16 g, 4.73 mmol)于ACN (20 mL)中的搅拌溶液中添加三乙胺(1.9mL,15mmol)、DMAP(60mg, 0.5mmol)和异丁酸酐(1.08mL, 6.5mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时，然后分配于乙酸异丙酯和碳酸氢钠饱和水溶液之间。分离有机相，用水洗涤并浓缩。通过柱色谱使用己烷中的25%至50% EA分离作为白色泡沫的360-2 (2.1 g, 84%)。MS: m/z528 [M+H]+。
将360-2 (2.1g, 3.98 mmol)溶解于ACN(15mL)中并将溶液冷却至0℃。将三乙胺(1.1 mL, 8 mmol)和DMAP (537 mg, 4.4 mmol)添加至溶液中，随后添加三异丙基苯磺酰氯(1.33g, 4.4mmol)。将混合物温热至室温，然后搅拌1小时。用氢氧化铵(1mL)淬灭反应物。将混合物在室温下搅拌2小时，用乙酸异丙酯稀释并从铵盐过滤。将滤液用水和碳酸氢钠水溶液洗涤，然后在减压下浓缩。通过柱色谱使用CH2Cl2中的4-10% MeOH分离作为淡黄色泡沫的360-3 (2.1 g, ~100%)。MS: m/z 527 [M+H]+。
将360-3 (1.10 g, 2.09 mmol)溶解于THF(6mL)中。将溶液冷却至0℃并用THF中的1M TBAF溶液(2.1mL, 2.1mmol)处理。将反应进行1小时，然后通过添加氯化铵饱和水溶液来淬灭。用乙酸异丙酯萃取并通过柱色谱法用CH2Cl2中的5-15% MeOH分离作为灰白色泡沫的360 (450 mg, 58%)，MS: m/z 371 [M+H]+。
实施例195
化合物361
将361-1 (400 mg)溶解于NH3/甲醇(10mL)中，并将混合物在环境温度下保持超过2天。蒸发溶剂，并通过硅胶色谱法以CH2Cl2中的3%至20%的MeOH的梯度来纯化残余物。在Synergy4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RP HPLC分离产物混合物。使用50mM乙酸三乙铵缓冲液(pH 7.5)中的0至50%的MeOH的线性梯度来洗脱。收集相应级分，浓缩并冻干(3x)以去除过量缓冲液。通过NOE NMR-实验来证明两种异构体在1'-位的立体化学。具有较短保留时间的化合物为361。MS: m/z 319 [M+1]+, 637[2M+1]+。
实施例196
化合物362
在室温下，用MeOH中的NH3 (7.0M, 150mL)处理362-1 (6.0 g, 14.77 mmol)。将混合物在60℃下搅拌16小时。将混合物在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的5% MeOH)纯化残余物，以得到作为白色固体的362-2 (3.4 g, 90%)。
向362-2 (3.4 g, 13.1 mmol)于无水THF (60 mL)中的搅拌悬浮液中添加吡啶(15 mL)、咪唑 (1.8 g, 26.5 mol)和PPh3 (5.1 g, 19.5 mol)。在0℃下逐滴添加I2 (4.3g, 16.9 mol)于THF (20 mL)中的溶液。将混合物温热至室温并搅拌16小时。将反应物用饱和Na2S2O3水溶液淬灭并用EA(3×100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的40% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的362-3 (4.6g, 粗产物)。
向362-3 (4.6g, 粗产物)于THF(35mL)中的溶液中添加DBU(37.8g, 247mmol)。将混合物在室温下搅拌0.5小时。将混合物用乙酸中和至pH=7并用EA(3×100mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并过滤。在减压下浓缩滤液。通过柱色谱法(PE中的50%EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的362-4 (1.59g, 粗产物，84%纯度)。
在0℃下，向362-4 (1.59g, 粗产物)于无水MeCN(35mL)中的冰冷溶液中添加NEt3•3HF (1.06 g, 6.56 mmol l)和NIS (3.69 g, 16.40 mmol)。将混合物在0℃下搅拌1小时。反应完成之后，将反应物用饱和Na2S2O3水溶液和饱和NaHCO3水溶液淬灭并用EA(3×100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的50% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的362-5 (2.0g, 两种异构体)。
向362-5 (2.0g, 5.15mmol, 两种异构体)于无水DCM (30mL)中的溶液中添加DMAP(1.57g, 12.88mmol)和BzCl(1.27g, 9.01mmol)，并将混合物在室温下搅拌16小时。将反应物用饱和NH4Cl水溶液淬灭并用DCM (3×60mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的25% EA)纯化残余物，以得到粗产物。通过SFC分离(中性条件)进一步纯化粗产物，以得到作为白色固体的362-6 (1.60 g, 63.1%)。
向362-6 (573 mg, 1.16 mmol)于干燥DMF (30 mL)中的溶液中添加NaOBz (1.68g, 11.64 mmol)和15-丝醚-5 (3.08 g, 13.97 mmol)，并将混合物在90-110℃下搅拌24小时。将混合物过滤并用EA(3×20mL)萃取。将有机层用盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并在低压下浓缩。通过柱色谱法(PE中的30% EA)纯化残余物，以得到作为白色固体的362-7(492 mg, 87.20%)。
将362-7 (293 mg, 0.6 mmol)用MeOH中的NH3(30mL, 7.0M)处理。将混合物在60℃下搅拌16小时，然后在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的3%异丙醇)纯化残余物，以得到粗产物。通过制备型HPLC(FA条件)纯化粗产物，以得到作为白色固体的362 (108 mg,53.41%)。ESI-TOF-MS: m/z = 279.1 [M+H]+。
实施例197
化合物363
在室温下，向362-7 (492 mg, 1.01 mmol)于无水CH3CN (8 mL)中的溶液中添加DMAP(308 mg, 2.53 mmol)、Et3N (255 mg, 2.53 mmol)和2, 4, 6-三异丙基苯-1-磺酰氯(765 mg, 2.53 mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。添加NH3于THF中的溶液(4mL, 7.0M)，并将混合物搅拌30分钟。在减压下去除溶剂。用EA稀释残余物。用0.5% AcOH水溶液和盐水洗涤溶液。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并在减压下浓缩。将残余物通过柱色谱法(DCM中的2% MeOH)纯化并通过制备型TLC(DCM中的10% MeOH)进一步纯化，以得到作为白色固体的363-1 (370 mg, 65.6%)。
用MeOH中的NH3(40mL, 7.0M)处理363-1 (370 mg, 0.76 mmol)。将混合物在60℃下搅拌16小时。将混合物在减压下浓缩。通过柱色谱法(DCM中的8%异丙醇)纯化残余物，以得到粗产物。通过制备型HPLC(FA条件)纯化粗产物，以得到作为白色固体的363 (65.6 mg,30.2%)。ESI-TOF-MS: m/z = 278.1 [M+H]+, 555.2 [2M+H]+。
实施例198
化合物364
将364-1 (50 mg, 0.081 mmol)溶解于无水CH3CN(1.0mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(81μL, 0.32mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。蒸发之后，将残余物在硅胶柱上使用15- 30 % EA:DCM纯化，以得到作为白色固体的364 (25.6 mg, 92 %)。ESI-LCMS: m/z = 346.05 [M+H]+。
实施例199
化合物365
在0℃(冰/水浴)下，向364-1 (300 mg, 0.49 mmol)于无水吡啶(3.0 mL)中的搅拌溶液中添加TBDPSCl(0.27mL, 0.97mmol)和DMAP(119mg, 0.97mmol)。将溶液在室温下搅拌16小时。将混合物冷却至0至5℃。将反应物用EtOH (0.3mL)淬灭，用EA(100mL)稀释。将水(50mL)添加至混合物中。将溶液用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用MgSO4干燥。将残余物在二氧化硅上用EA:己烷(10-100%梯度)纯化，以得到作为灰白色泡沫的365-1 (386 mg,93 %)。
向365-1 (300 mg, 0.49 mmol)于无水CH3CN (4.0 mL)中的搅拌溶液中添加365-2 (331.0mg, 0.94mmol, 根据Katritzky等人，Synthesis (2004) 2004(16):2645-2652中所述的程序制备)、DIPEA (0.17 mL, 0.94 mmol)和DMAP (115 mg, 0.94 mmol)。将溶液在70℃下搅拌16小时。将混合物冷却至0至5℃，用EA(100mL)稀释，然后添加水(50mL)。将溶液用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤，并用MgSO4干燥。将残余物在二氧化硅上用EA:己烷(10-100%梯度)纯化，以得到作为黄色泡沫的365-3 (174 mg, 70 %)。
在冰浴温度下，向365-3 (166 mg, 0.153 mmol)于THF (2 mL)中的溶液中添加3TEA•HF (98 μL, 0.61 mmol)和TEA (66 μl, 0.46 mmol)。将混合物在室温下搅拌18小时。将混合物用EA稀释并用水和盐水洗涤。将有机层干燥并浓缩，以得到粗产物，将其通过硅胶柱色谱法EA:己烷(20-100%梯度)纯化，以得到作为白色泡沫的365-4 (106 mg,81.5%)。
在0至5℃(冰水浴)下，向双(POC)磷酸三乙铵(0.36mmol, 由118mg双(POC)磷酸盐和0.5mL TEA制备)于THF(3mL)中的溶液中添加365-4 (102 mg, 0.12 mmol)，随后添加3-硝基-1,2,4-三唑 (48 mg, 0.42 mmol)、二异丙基乙胺(0.11 mL, 0.6 mmol)和BOP-Cl(107 mg, 0.42 mmol)。将混合物搅拌2小时，用EtOAc稀释并用水和盐水洗涤。将有机层分离，经无水Na2SO4干燥并过滤。在真空中浓缩滤液，以得到白色固体，将其在硅胶柱(EA:己烷5至60%)上纯化，以得到作为淡黄色泡沫的365-5 (106mg, 78%)。
将365-5 (102 mg, 0.088 mmol)溶解于无水CH3CN (0.7mL)中，并在0至5℃下添加二氧杂环己烷中的4N HCl(55μL, 0.22mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时，然后添加无水EtOH (100μL)。在室温下蒸发溶剂并与甲苯共同蒸发(3x)。将产物在硅胶柱(EA:己烷15至100%)上纯化，以得到作为白色泡沫的365-6 (60.3mg, 77%)。
将365-6 (40 mg, 0.044 mmol)溶解于无水EtOH (1.3mL)中，脱气(3x)，用H2吹扫，然后添加10% Pd/C (6mg)和二氧杂环己烷中的4N HCl (22μL, 0.089mmol)。将混合物在H2气氛下、在室温下搅拌2小时。将混合物通过硅藻土过滤，并用无水EtOH (1.5mL)洗涤硅藻土。蒸发溶剂，并用无水二乙醚(3×1.5mL)研磨。倾析乙醚层，并将获得的固体在高真空中干燥，以得到作为白色固体的365 (26.8mg, 79.7%，盐酸盐)。ESI-LCMS: m/z = 757.2[M+H]+。
实施例200
化合物366
根据针对365-5所述的程序，从362 (36.5mg, 0.13mmol)和双(POC)磷酸三乙铵(0.26mmol, 由双(POC)磷酸盐(85mg)和TEA(0.5mL)制备)于THF(1mL)中的溶液开始制备366。ESI-LCMS: m/z = 589.0 [M-H]-。
实施例201
式(I)化合物
一些式(I)化合物可市售。对于一些化合物，前述合成是示例性的且可用作制备额外式(I)化合物的起点。额外式(I)化合物的实例显示如下。这些化合物可以多种方式制备，包括本文所示和所述的那些合成方案。本领域技术人员将能够基于本文公开内容而认识到所公开的合成的变型并设计途径；所有此类变型和替代途径均在权利要求的范围内。
实施例202
丝状病毒测定
使用Panchal等, J. Biomolecular Screening (2010) 15(7):755-765中所述的方法，测试式（I）化合物抵抗丝状病毒的活性。本文所述的多种式（I）化合物具有抵抗丝状病毒的活性，活性为EC50 < 25 μM。例如，化合物315具有抵抗埃博拉的EC50 < 25 μM的活性，且化合物106和332均具有抵抗海拉细胞中埃博拉的EC50 < 2 μM。
实施例203
组合研究
组合使用经Zaire工程以在海拉细胞培养体系中表达强化型绿荧光蛋白(EBOV-eGFP)的重组埃博拉病毒（EBOV）测试化合物。在0.5的感染复数（MOI）下进行EBOV感染。在20 μM或100 μM开始，以2倍步骤稀释，在10点滴定中测试化合物。从10 ng/mL的最高浓度开始，以3倍步骤稀释在9浓度下与各化合物一起测试共有干扰素（CIFN）。EBOV感染前18-20小时，用CIFN处理海拉细胞，并且在感染前2小时将化合物添加至细胞。然后培育细胞，没有化合物的作为对照，具有测试化合物或化合物组合的另外培育48小时。通过在福尔马林中固定细胞，在磷酸盐缓冲盐水中洗涤（3x）和通过高内涵成像（high content imaging）评估EBOV-eGFP感染细胞的数目来检查测试化合物组合的直接作用。对单独的化合物和两种测试化合物的固定比组合测定剂量相应曲线。
由Dr. M. Prichard (University of Michigan)提供MacSynergy II软件。该程序允许由两种抑制剂和Bliss独立模型的棋盘格组合（checkerboard combination）生成的所有数据点的药物相互作用的三维检查。从重复数据确定置信界限。如果95%的置信界限（CL）不能覆盖理论加和面积，则两种药物之间的相互作用与加法显著不同。可以确定协同作用或拮抗作用的体积并三维绘图并代表两种药物的浓度的每次改变的协同作用或拮抗作用的相对量。协同作用和拮抗作用体积基于Bliss独立模型，其假定两种化合物独立作用于不同目标。基于Bliss独立模型的一组预测分数反应faAB计算为faAB = faA + faB -faA• faB， faA和faB分别代表化合物A和B在dA和dB的量的可能反应的分数，例如%抑制，并且faAB描述化合物A和B的组合在(dA+dB)的量的%抑制。如果faAB > faA + faB - faA•faB则为Bliss协同作用；如果faAB < faA + faB - faA• faB则为Bliss拮抗作用。95%协同/拮抗作用体积是观察的抑制与基于Bliss独立模型的faAB预测的95%置信界限之间的差异的总和。
MacSynergy II体积描述：<25 μM2% = 加和；25-50 μM2% = 小协同作用；50-100 μM2% = 显著协同作用和>100 μM2% =强协同作用。Infergen®与化合物106的组合、Infergen®与化合物315的组合和Infergen®与化合物332的组合都显示出强协同作用。
尽管为了清楚和理解的目的已借助举例说明和实施例在一些细节方面描述前述内容，但本领域技术人员将理解，可在不背离本公开精神的情况下进行许多和各种修改。因此，应当清楚地理解，本文所公开的形式仅仅是说明性的且并非意欲限制本公开的范围，而是还涵盖属于本发明的真实范围和精神内所有修改和替代方案。

Claims (101)

1.式(I)化合物或其药学上可接受的盐用于制备用于改善或治疗病毒感染的药物的用途，其中式(I)化合物具有以下结构：
其中：
B1A为任选地取代的杂环碱或具有受保护的氨基的任选地取代的杂环碱；
--------不存在或为单键，条件是两个--------均不存在或两个--------均为单键；
当--------均不存在时，则Z1不存在，O1为OR1A，R3A选自：氢、卤素、OH、-OC(=O)R"A和任选地取代的O-连接的氨基酸，R4A选自：氢、OH、卤素、N3、-OC(=O)R"B、任选地取代的O-连接的氨基酸和NR"B1R"B2，或R3A与R4A均为经由羰基连接以形成5元环的氧原子；
当--------各自为单键时，则Z1为，O1为O，R3A为O；R4A选自：氢、OH、卤素、N3、-OC(=O)R"B、任选地取代的O-连接的氨基酸和NR"B1R"B2；且R1B选自：O - 、OH、-O-任选地取代的C1-6烷基、、、、、任选地取代的N-连接的氨基酸和任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物；
Ra1和Ra2独立地为氢或氘；
RA为氢、氘、未取代的C1-3烷基、未取代的C2-4烯基、未取代的C2-3炔基或氰基；
R1A选自：氢、任选地取代的酰基、任选地取代的O-连接的氨基酸、、和；
R2A为氢、叠氮基、卤素、未取代的C1-4烷基、未取代的C2-4烯基、未取代的C2-4炔基、-卤素(CH1-6烷基)、-(CH2)1-6N3、-(CH2)1-6NH2、-(CH2)1-6环A或-CN；
R5A选自：氢、卤素、OH、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；
R6A、R7A和R8A独立地选自：不存在、氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基、任选地取代的芳基、任选地取代的杂芳基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)、任选地取代的*–(CR15AR16A)p–O–C1-24烷基、任选地取代的*–(CR17AR18A)q–O–C1-24烯基、、、、、和；或
R6A为且R7A不存在或为氢；或
R6A和R7A一起形成选自以下的基团：任选地取代的和任选地取代的，其中连接至R6A和R7A的氧、磷和所述基团形成六元至十元环体系；
R9A独立地选自：任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基、NR30AR31A、任选地取代的N-连接的氨基酸和任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物；
R10A和R11A独立地为任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物；
R12A和R13A独立地不存在或为氢；
R14A为O-、OH或甲基；
各R15A、各R16A、各R17A和各R18A独立地为氢、任选地取代的C1-24烷基或烷氧基；
R19A、R20A、R22A、R23A、R2B、R3B、R5B和R6B独立地选自：氢、任选地取代的C1-24烷基和任选地取代的芳基；
R21A和R4B独立地选自：氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的-O-C1-24烷基、任选地取代的-O-芳基、任选地取代的-O-杂芳基和任选地取代的-O-单环杂环基；
R24A和R7B独立地选自：氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的-O-C1-24烷基、任选地取代的-O-芳基、任选地取代的-O-杂芳基、任选地取代的-O-单环杂环基和；
R25A、R26A、R29A、R8B和R9B独立地选自：氢、任选地取代的C1-24烷基和任选地取代的芳基；
R27A1和R27A2独立地选自：-C≡N、任选地取代的C2-8有机基羰基、任选地取代的C2-8烷氧基羰基和任选地取代的C2-8有机基氨基羰基；
R28A选自：氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基和任选地取代的C3-6环烯基；
R30A和R31A独立地选自：氢、任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基和任选地取代的芳基(C1-4烷基)；
R"A和各R"B独立地为任选地取代的C1-24烷基；
各R"B1和各R"B2独立地为氢和任选地取代的C1-6烷基；
环A是任选地取代的单环杂芳基或任选地取代的单环杂环基；
m和w独立地为0或1；
p和q独立地为1、2或3；
r和s独立地为0、1、2或3；
t和v独立地为1或2；
u和y可独立地为3、4或5；且
Z1A、Z2A、Z3A、Z4A、Z1B和Z2B独立地为O或S；
其中所述病毒感染由丝状病毒科病毒引起。
2.权利要求1的用途，其中所述病毒为丝状病毒科家族的成员。
3.权利要求2的用途，其中所述丝状病毒科病毒是埃博拉病毒属。
4.权利要求3的用途，其中所述埃博拉病毒属选自埃博拉病毒（EBOV）、雷斯顿埃博拉病毒（REBOV）、苏丹埃博拉病毒（SEBOV）、塔伊森林埃博拉病毒（TAFV）和邦地布优埃博拉病毒（BEBOV）。
5.权利要求2的用途，其中所述丝状病毒科病毒是马尔堡病毒属。
6.权利要求5的用途，其中所述马尔堡病毒属选自马尔堡病毒（MARV）和Ravn病毒（RAVV）。
7.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为卤素。
8.权利要求7的用途，其中所述卤素为氟。
9.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为未取代的C1-4烷基。
10.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为未取代的C2-4烯基。
11.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为未取代的C2-4炔基。
12.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为卤素（C1-6烷基）。
13.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为-CHF2或-CF3。
14.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为-(CH2)1-6F。
15.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为-(CH2)1-6Cl。
16.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为叠氮基。
17.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为-(CH2)1-6N3。
18.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为氢。
19.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为-(CH2)1-6环A。
20.权利要求1-6中任一项的用途，其中R2A为-CN。
21.权利要求1-20中任一项的用途，其中R4A为氢。
22.权利要求1-20中任一项的用途，其中R4A为OH。
23.权利要求1-20中任一项的用途，其中R4A为卤素。
24.权利要求23的用途，其中所述卤素为F。
25.权利要求23的用途，其中所述卤素为Cl。
26.权利要求1-20中任一项的用途，其中R4A为-OC(=O)R"B或任选地取代的O-连接的氨基酸。
27.权利要求1-26中任一项的用途，其中R5A为氢。
28.权利要求1-26中任一项的用途，其中R5A为卤素。
29.权利要求1-26中任一项的用途，其中R5A为OH。
30.权利要求1-26中任一项的用途，其中R5A为任选地取代的C1-6烷基。
31.权利要求1-26中任一项的用途，其中R5A为任选地取代的C2-6烯基。
32.权利要求1-26中任一项的用途，其中R5A为任选地取代的C2-6炔基。
33.权利要求1-26中任一项的用途，其中--------均不存在。
34.权利要求33的用途，其中R1A为氢。
35.权利要求33的用途，其中R1A为任选地取代的酰基或任选地取代的O-连接的氨基酸。
36.权利要求33的用途，其中R1A为。
37.权利要求36的用途，其中R6A为，R7A不存在或为氢且m为0。
38.权利要求36的用途，其中R6A为，R7A不存在或为氢且m为1。
39.权利要求36的用途，其中R6A和R7A独立地不存在或为氢。
40.权利要求36的用途，其中R6A和R7A独立地为任选地取代的C1-24烷基、任选地取代的C2-24烯基、任选地取代的C2-24炔基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C3-6环烯基、任选地取代的芳基、任选地取代的杂芳基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)。
41.权利要求36的用途，其中R6A和R7A独立地为任选地取代的*–(CR15AR16A)p–O–C1-24烷基或任选地取代的*–(CR17AR18A)q–O–C1-24烯基。
42.权利要求36的用途，其中R6A和R7A独立地为、、或。
43.权利要求36的用途，其中R6A和R7A独立地为或。
44.权利要求36的用途，其中R6A和R7A一起形成选自以下的基团：任选地取代的和任选地取代的，其中连接至R6A和R7A的氧、磷和所述基团形成六元至十元环体系。
45.权利要求36-44中任一项的用途，其中Z1A为O。
46.权利要求36-44中任一项的用途，其中Z1A为S。
47.权利要求33的用途，其中R1A为。
48.权利要求47的用途，其中R8A为任选地取代的芳基。
49.权利要求47的用途，其中R8A为任选地取代的杂芳基。
50.权利要求47-49中任一项的用途，其中R9A为任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物。
51.权利要求50的用途，其中R9A为，其中R33A选自：氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)和任选地取代的卤代烷基；R34A选自：氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C1-6卤代烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C6芳基、任选地取代的C10芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)；且R35A为氢或任选地取代的C1-4烷基；或R34A和R35A一起形成任选地取代的C3-6环烷基。
52.权利要求51的用途，其中R9A选自：
和。
53.权利要求47-52中任一项的用途，其中Z2A为O。
54.权利要求47-52中任一项的用途，其中Z2A为S。
55.权利要求33的用途，其中R1A为。
56.权利要求55的用途，其中R10A和R11A独立地为任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物。
57.权利要求56的化合物，其中R10A和R11A独立地为，其中R36A选自：氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的芳基、任选地取代的芳基(C1-6烷基)和任选地取代的卤代烷基；R37A选自：氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C1-6卤代烷基、任选地取代的C3-6环烷基、任选地取代的C6芳基、任选地取代的C10芳基和任选地取代的芳基(C1-6烷基)；且R38A为氢或任选地取代的C1-4烷基；或R37A和R38A一起形成任选地取代的C3-6环烷基。
58.权利要求57的用途，其中R10A和R11A独立地选自：
和。
59.权利要求55-58中任一项的用途，其中Z3A为O。
60.权利要求55-58中任一项的用途，其中Z3A为S。
61.权利要求33-60中任一项的用途，其中R3A为氢。
62.权利要求33-60中任一项的用途，其中R3A为卤素。
63.权利要求62的用途，其中所述卤素为氟。
64.权利要求62的用途，其中所述卤素为氯。
65.权利要求33-60中任一项的用途，其中R3A为OH。
66.权利要求33-60中任一项的用途，其中R3A为-OC(=O)R"A或任选地取代的O-连接的氨基酸。
67.权利要求33-60中任一项的用途，其中R3A和R4A均为经由羰基连接以形成5元环的氧原子。
68.权利要求1-32中任一项的用途，其中--------各自为单键。
69.权利要求68的用途，其中R1B为O-或OH。
70.权利要求68的用途，其中R1B为-O-任选地取代的C1-6烷基。
71.权利要求68的用途，其中R1B为、、、、任选地取代的N-连接的氨基酸或任选地取代的N-连接的氨基酸酯衍生物。
72.权利要求1-71中任一项的用途，其中RA为氢。
73.权利要求1-71中任一项的用途，其中RA为氘。
74.权利要求1-71中任一项的用途，其中RA为未取代的C1-3烷基。
75.权利要求1-71中任一项的用途，其中RA为未取代的C2-4烯基。
76.权利要求1-71中任一项的用途，其中RA为未取代的C2-3炔基。
77.权利要求1-71中任一项的用途，其中RA为氰基。
78.权利要求1-77中任一项的用途，其中Ra1和Ra2均为氢。
79.权利要求1-77中任一项的用途，其中Ra1和Ra2均为氘。
80.权利要求1-79中任一项的用途，其中B1A选自：
和；
其中：
RA2选自氢、卤素和NHRJ2，其中RJ2选自氢、-C(=O)RK2和-C(=O)ORL2；
RB2为卤素或NHRW2，其中RW2选自：氢、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基、任选地取代的C3-8环烷基、-C(=O)RM2和-C(=O)ORN2；
RC2为氢或NHRO2，其中RO2选自氢、-C(=O)RP2和-C(=O)ORQ2；
RD2选自：氢、氘、卤素、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；
RE2选自：氢、羟基、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C3-8环烷基、-C(=O)RR2和-C(=O)ORS2；
RF2选自：氢、卤素、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；
Y2和Y3独立地为N或CRI2，其中RI2选自：氢、卤素、任选地取代的C1-6烷基、任选地取代的C2-6烯基和任选地取代的C2-6炔基；
W1为NH、–NCH2-OC(=O)CH(NH2)-CH(CH3)2或–(CH2)1-2–O-P(=O)(OW1A)2，其中W1A选自：不存在、氢和任选地取代的C1-6烷基；
RG2为任选地取代的C1-6烷基；
RH2为氢或NHRT2，其中RT2独立地选自：氢、-C(=O)RU2和-C(=O)ORV2；且
RK2、RL2、RM2、RN2、RP2、RQ2、RR2、RS2、RU2和RV2独立地选自：氢、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、C3-6环烯基、C6-10芳基、杂芳基、杂环基、芳基(C1-6烷基)、杂芳基(C1-6烷基)和杂环基(C1-6烷基)。
81.权利要求80的用途，其中B1A为。
82.权利要求80的用途，其中B1A为。
83.权利要求80的用途，其中B1A为。
84.权利要求80的用途，其中B1A为。
85.权利要求80的用途，其中B1A为。
86.权利要求80的用途，其中B1A为。
87.权利要求1-86中任一项的用途，其中所述化合物选自：
和
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
88.权利要求1的用途，其中所述化合物选自：
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
89.权利要求1的用途，其中所述化合物选自：
和
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
90.权利要求1的用途，其中所述化合物选自：
和
，或前述化合物的药学上可接受的盐。
91.权利要求1-90中任一项的用途，其进一步包括使用干扰素。
92.权利要求91的用途，其中所述干扰素是聚乙二醇化干扰素。
93.权利要求91-92中任一项的用途，其中所述干扰素是1型干扰素。
94.权利要求93的用途，其中所述1型干扰素是α-干扰素(IFN-α)。
95.权利要求94的用途，其中所述IFN-α选自聚乙二醇化干扰素-α-2a(PEGASYS®)、聚乙二醇化干扰素-α-2b(PEG-INTRON®)和干扰素alfacon-1 (INFERGEN®)。
96.权利要求93的用途，其中所述干扰素是β-干扰素(IFN-β)。
97.权利要求91-92中任一项的用途，其中所述干扰素是2型干扰素。
98.权利要求91-92中任一项的用途，其中所述干扰素是3型干扰素。
99.权利要求98的用途，其中所述3型干扰素是λ-干扰素(IFN-λ)。
100.权利要求99的用途，其中所述IFN-λ是聚乙二醇化干扰素λ。
101.权利要求1-100中任一项的用途，其进一步包括使用选自三唑核苷、(2S,3S,4R,5R)-2-(4-氨基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-7-基)-5-(羟基甲基)吡咯烷-3,4-二醇、5-氟-2-氧代-1H-吡嗪-3-甲酰胺、十六烷基氧基丙基-西多福韦、AVI-7537、AVI-7288、 ZMapp和TKM-埃博拉的化合物，或前述化合物的药学上可接受的盐。
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