CN106226273A - 一种microRNA的快速检测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种microRNA的快速检测方法,属于生物检测技术领域,该microRNA的快速检测方法根据待测靶标microRNA的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列,而后在单链DNA序列两端分别修饰荧光基团和荧光淬灭基团,从而获得与待测靶标microRNA相对应的Taqman探针,而后将患者血清、RNase‑free水、DSN酶、Taqman探针和RNA酶抑制剂按照一定的比例在特定的条件下进行反应,在激光的激发作用下,检测出反应液的荧光强度,即得到待测靶标microRNA的检测结果,该检测方法大大缩短了四个心肌损伤标志物的检测时间,在保证检测质量的基础上,提高了检测效率。
Description
技术领域
本发明涉及生物检测领域,尤其涉及一种microRNA的快速检测方法。
背景技术
急性心肌梗死是冠状动脉急性、持续性缺血缺氧所引起的心肌坏死。临床上多有剧烈而持久的胸骨后疼痛,休息及硝酸酯类药物不能完全缓解,伴有血清心肌酶活性增高及进行性心电图变化,可并发心律失常、休克或心力衰竭,常可危及生命。该病在欧美最为常见,美国每年约有150万人发生心肌梗死。中国近年来呈明显上升趋势,每年新发至少50万,现患至少200万。
由此可见,急性心肌梗死的早期检测是尤为重要的,在现有的研究中,急性心肌梗死的早期检测包括对microRNA-499的检测、microRNA-208b的检测、microRNA-1的检测以及microRNA-133a的检测。
现有技术中,对上述四个心肌损伤标志物的检测通常需要采用1小时的microRNA的抽提、1.5小时的逆转录以及1.5小时的Real-time PCR(荧光定量聚合酶链反应),一个心肌损伤标志物的检测时间至少要4个小时,从检测开始到得到检测结果的时间很长,众所周知的,对人体疾病的检测,时间的长短尤为重要;另外,现有技术中,对上述四个心肌损伤标志物的检测步骤也较为繁琐,工作量非常大;漫长的检测过程不仅仅会让病人等待的更为烦躁,也让检测的医护人员感到身心俱疲。
发明内容
针对上述存在的问题,本发明提供一种microRNA的快速检测方法,应用于急性心肌梗死的四个心肌损伤标志物的检测中,以克服采用现有技术中的检测方法检测microRNA-499、microRNA-208b、microRNA-1以及microRNA-133a这四个心肌损伤标志物导致检测时间很长、工作量较大的问题,从而大大缩短了上述四个心肌损伤标志物的检测时间,并且简化了上述四个心肌损伤标志物的检测方法,在保证检测质量的基础上,提高了检测效率。
为了实现上述目的,本发明采取的技术方案为:
一种microRNA的快速检测方法,其中,包括:
备料:准备好患者血清、RNase-free水、浓度为19~21uM/uL(如:19uM/uL、20uM/uL、21uM/uL)的RNA酶抑制剂以及浓度为0.19~0.21uM/uL(如:0.19uM/uL、0.20uM/uL、0.21uM/uL)的DSN酶;
设计探针:根据待测靶标microRNA的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列,而后在所述单链DNA序列两端分别修饰荧光基团和荧光淬灭基团,获得浓度为195~205nmol/uL(如:195nmol/uL、198nmol/uL、200nmol/uL、203nmol/uL、205nmol/uL)的Taqman探针;
反应:将所述患者血清、所述RNase-free水、所述DSN酶、所述Taqman探针和所述RNA酶抑制剂按照100:278:2:20:1的配比进行混合,在60~80℃(如:60℃、65℃、70℃、75℃、80℃)的反应温度下反应25~35分钟(如:25min、28min、30min、32min、35min);
检测:根据相应Taqman探针设置反应所需的激发波长和发射波长,使用全自动酶标仪检测反应步骤中的反应液的荧光强度,即得到所述患者血清中的microRNA的检测结果。
上述的microRNA的快速检测方法,其中,所述患者血清的收集包括:获取患者的静脉血4~6mL(如:4mL、4.5mL、5mL、5.5mL、6mL),以3000rpm离心10min,分离血清用于检测。
上述的microRNA的快速检测方法,其中,当所述待测靶标microRNA为microRNA-499时,所述Taqman探针为:5'-Cy3-TTAAAC ATCACT GCAAGT CTT AA–BHQ2-3';
其中,Cy3染料的激发波长为550nM,发射波长为570nM,且检测步骤中的激发波长和发射波长与所述Cy3染料的激发波长和发射波长相同。
上述的microRNA的快速检测方法,其中,当所述待测靶标microRNA为microRNA-208b时,所述Taqman探针为:5'-TAMRA-ACAAAC CTT TTG TTC GTC TTAT-Eclipse-3';
其中,TAMRA染料的激发波长为542nM、发射波长为568nM,且检测步骤中的激发波长和发射波长与所述TAMRA染料的激发波长和发射波长相同。
上述的microRNA的快速检测方法,其中,当所述待测靶标microRNA为microRNA-1时,所述Taqman探针为:5'-Cy5-ATACATACT TCT TTACAT TCC A-BHQ-3';
其中,Cy5染料的激发波长为649nM,发射波长670nM,且检测步骤中的激发波长和发射波长与所述Cy5染料的激发波长和发射波长相同。
上述的microRNA的快速检测方法,其中,当所述待测靶标microRNA为microRNA-133a时,所述Taqman探针为:5'-FAM-CAG CTG GTT GAA GGG GAC CAAA-Eclipse-3';
其中,FAM染料的激发波长492nM、发射波长518nM,且检测步骤中的激发波长和发射波长与所述FAM染料的激发波长和发射波长相同。
上述技术方案具有如下优点或者有益效果:
本发明提供的microRNA的快速检测方法,根据待测靶标microRNA的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列,而后在单链DNA序列两端分别修饰荧光基团和荧光淬灭基团,从而获得与待测靶标microRNA相对应的Taqman探针,而后将患者血清、RNase-free水、DSN酶、Taqman探针和RNA酶抑制剂按照一定的比例在特定的条件下进行反应,在激光的激发作用下,检测出反应液的荧光强度,即得到待测靶标microRNA的检测结果,该检测方法极为简单,且用时较少,从而克服了采用现有技术中的检测方法检测microRNA-499、microRNA-208b、microRNA-1以及microRNA-133a这四个心肌损伤标志物导致检测时间很长、工作量较大的问题,大大缩短了上述四个心肌损伤标志物的检测时间,在保证检测质量的基础上,提高了检测效率。
附图说明
通过阅读参照以下附图对非限制性实施例所作的详细描述,本发明及其特征、外形和优点将会变得更加明显。在全部附图中相同的标记指示相同的部分。并未刻意按照比例绘制附图,重点在于示出本发明的主旨。
图1是本发明实施例1提供的microRNA-499的快速检测方法中不同浓度的microRNA-499标准品荧光强度的变化示意图;
图2是本发明实施例1提供的microRNA-499的快速检测方法中microRNA-499标准品浓度与荧光强度的相关性示意图;
图3是本发明实施例2提供的microRNA-208b的快速检测方法中不同浓度的microRNA-208b标准品荧光强度的变化示意图;
图4是本发明实施例2提供的microRNA-208b的快速检测方法中microRNA-208b标准品浓度与荧光强度的相关性示意图;
图5是本发明实施例3提供的microRNA-1的快速检测方法中不同浓度的microRNA-1标准品荧光强度的变化示意图;
图6是本发明实施例3提供的microRNA-1的快速检测方法中microRNA-1标准品浓度与荧光强度的相关性示意图;
图7是本发明实施例4提供的microRNA-133a的快速检测方法中不同浓度的microRNA-133a标准品荧光强度的变化示意图;
图8是本发明实施例4提供的microRNA-133a的快速检测方法中microRNA-133a标准品浓度与荧光强度的相关性示意图;
具体实施方式
下面结合具体的实施例对本发明作进一步的说明,但是不作为本发明的限定。
实施例1:
本发明实施例1提供的microRNA的快速检测方法包括:
备料:准备好患者血清、RNase-free水、浓度为20uM/uL的RNA酶抑制剂以及浓度为0.2uM/uL的DSN酶;
设计探针:根据待测靶标microRNA——microRNA-499的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列(TTAAAC ATCACT GCAAGT CTTAA),而后在单链DNA序列两端分别修饰荧光基团(5'-Cy3)和荧光淬灭基团(BHQ2-3'),获得浓度为200nmol/ul的Taqman探针——ProbemicroRNA-499:5'-Cy3-TTA AAC ATCACT GCAAGT CTT AA-BHQ2-3';
反应:将50ul的患者血清、139ul的RNase-free水、1ul的DSN酶、10ul的Taqman探针Probe microRNA-499和0.5ul的RNA酶抑制剂进行混合配置成反应体积,在80℃的反应温度下反应30分钟;
检测:由于Taqman探针Probe microRNA-499中的Cy3染料的激发波长为550nM、发射波长为570nM,故设置反应所需的激发波长为550nM、发射波长570nM,使用全自动酶标仪检测反应步骤中的反应液的荧光强度,即得到患者血清中的microRNA的检测结果。
在本发明实施例1提供的microRNA的快速检测方法中,患者血清的收集包括:获取患者的静脉血5mL,将静脉血放置于4℃冰箱中静置30min,以3000rpm离心10min,而后收集上清液于无菌RNA-free的EP管中,存储于-80℃的冰箱中备用,用于检测。
图1是本发明实施例1提供的microRNA-499的快速检测方法中不同浓度的microRNA-499标准品荧光强度的变化示意图;由图可知,发射波长在570nM左右时,不同浓度的microRNA-499标准品荧光强度均处于峰值,因此,在发射波长为570nM时,可以很好的检测到反应液中的荧光强度。
图2是本发明实施例1提供的microRNA-499的快速检测方法中
microRNA-499标准品浓度与荧光强度的相关性示意图;由图可知,浓度范围在1E-11Mol~1E-6Mol的microRNA-499标准品,荧光强度的变化是呈线性变化的。
实施例2:
本发明实施例2提供的microRNA的快速检测方法包括:
备料:准备好患者血清、RNase-free水、浓度为20uM/uL的RNA酶抑制剂以及浓度为0.2uM/uL的DSN酶;
设计探针:根据待测靶标microRNA——microRNA-208b的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列(ACAAAC CTT TTG TTC GTC TTAT),而后在单链DNA序列两端分别修饰荧光基团(5'-TAMRA)和荧光淬灭基团(Eclipse-3'),获得浓度为200nmol/ul的Taqman探针——Probe microRNA-208b:5'-TAMRA-ACAAAC CTT TTG TTC GTC TTAT-Eclipse-3';
反应:将50ul的患者血清、139ul的RNase-free水、1ul的DSN酶、10ul的Taqman探针Probe microRNA-208b和0.5ul的RNA酶抑制剂进行混合配置成反应体积,在80℃的反应温度下反应30分钟;
检测:由于Taqman探针Probe microRNA-208b中的TAMRA染料的激发波长为542nM、发射波长为568nM,故设置反应所需的激发波长为542nM、发射波长568nM,使用全自动酶标仪检测反应步骤中的反应液的荧光强度,即得到患者血清中的microRNA的检测结果。
在本发明实施例2提供的microRNA的快速检测方法中,患者血清的收集包括:获取患者的静脉血5mL,将静脉血放置于4℃冰箱中静置30min,以3000rpm离心10min,而后收集上清液于无菌RNA-free的EP管中,存储于-80℃的冰箱中备用,用于检测。
图3是本发明实施例2提供的microRNA-208b的快速检测方法中不同浓度的microRNA-208b标准品荧光强度的变化示意图;由图可知,发射波长在568nM左右时,不同浓度的microRNA-208b标准品荧光强度均处于峰值,因此,在发射波长为568nM时,可以很好的检测到反应液中的荧光强度。
图4是本发明实施例2提供的microRNA-208b的快速检测方法中microRNA-208b标准品浓度与荧光强度的相关性示意图;由图可知,浓度范围在1E-12Mol~1E-6Mol的microRNA-208b标准品,荧光强度的变化是呈线性变化的。
实施例3:
本发明实施例3提供的microRNA的快速检测方法包括:
备料:准备好患者血清、RNase-free水、浓度为20uM/uL的RNA酶抑制剂以及浓度为0.2uM/uL的DSN酶;
设计探针:根据待测靶标microRNA——microRNA-1的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列(ATACATACT TCT TTACAT TCC A),而后在单链DNA序列两端分别修饰荧光基团(5'-Cy5)和荧光淬灭基团(BHQ-3'),获得浓度为200nmol/ul的Taqman探针——ProbemicroRNA-1:5'-Cy5-ATACATACT TCT TTACAT TCC A-BHQ-3';
反应:将50ul的患者血清、139ul的RNase-free水、1ul的DSN酶、10ul的Taqman探针Probe microRNA-1和0.5ul的RNA酶抑制剂进行混合配置成反应体积,在80℃的反应温度下反应30分钟;
检测:由于Taqman探针Probe microRNA-1中的Cy5染料的激发波长为649nM、发射波长为670nM,故设置反应所需的激发波长为649nM、发射波长670nM,使用全自动酶标仪检测反应步骤中的反应液的荧光强度,即得到患者血清中的microRNA的检测结果。
在本发明实施例3提供的的microRNA的快速检测方法中,患者血清的收集包括:获取患者的静脉血5mL,将静脉血放置于4℃冰箱中静置30min,以3000rpm离心10min,而后收集上清液于无菌RNA-free的EP管中,存储于-80℃的冰箱中备用,用于检测。
图5是本发明实施例3提供的microRNA-1的快速检测方法中不同浓度的microRNA-1标准品荧光强度的变化示意图;由图可知,发射波长在670nM左右时,不同浓度的microRNA-1标准品荧光强度均处于峰值,因此,在发射波长为670nM时,可以很好的检测到反应液中的荧光强度。
图6是本发明实施例3提供的microRNA-1的快速检测方法中microRNA-1标准品浓度与荧光强度的相关性示意图;由图可知,浓度范围在1E-11Mol~1E-6Mol的microRNA-1标准品,荧光强度的变化是呈线性变化的。
实施例4:
本发明实施例4提供的microRNA的快速检测方法包括:
备料:准备好患者血清、RNase-free水、浓度为20uM/uL的RNA酶抑制剂以及浓度为0.2uM/uL的DSN酶;
设计探针:根据待测靶标microRNA——microRNA-133a的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列(CAG CTG GTT GAA GGG GAC CAAA),而后在单链DNA序列两端分别修饰荧光基团(5'-FAM)和荧光淬灭基团(Eclipse-3'),获得浓度为200nmol/ul的Taqman探针——Probe microRNA-133a:5'-FAM-CAG CTG GTT GAA GGG GAC CAAA-Eclipse-3';
反应:将50ul的患者血清、139ul的RNase-free水、1ul的DSN酶、10ul的Taqman探针Probe microRNA-133a和0.5ul的RNA酶抑制剂进行混合配置成反应体积,在80℃的反应温度下反应30分钟;
检测:由于Taqman探针Probe microRNA-133a中的FAM染料的激发波长为492nM、发射波长为518nM,故设置反应所需的激发波长为492nM、发射波长518nM,使用全自动酶标仪检测反应步骤中的反应液的荧光强度,即得到患者血清中的microRNA的检测结果。
在本发明实施例4提供的microRNA的快速检测方法中,患者血清的收集包括:获取患者的静脉血5mL,将静脉血放置于4℃冰箱中静置30min,以3000rpm离心10min,而后收集上清液于无菌RNA-free的EP管中,存储于-80℃的冰箱中备用,用于检测。
图7是本发明实施例4提供的microRNA-133a的快速检测方法中不同浓度的microRNA-133a标准品荧光强度的变化示意图;由图可知,发射波长在518nM左右时,不同浓度的microRNA-133a标准品荧光强度均处于峰值,因此,在发射波长为518nM时,可以很好的检测到反应液中的荧光强度。
图8是本发明实施例4提供的microRNA-133a的快速检测方法中microRNA-133a标准品荧光强度的变化示意图;由图可知,浓度范围在1E-10Mol~1E-6Mol的microRNA-133a标准品下,荧光强度的变化是呈线性变化的。
综上所述,本发明实施例提供的microRNA的快速检测方法,根据待测靶标microRNA的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列,而后在单链DNA序列两端分别修饰荧光基团和荧光淬灭基团,从而获得与待测靶标microRNA相对应的Taqman探针,而后将患者血清、RNase-free水、DSN酶、Taqman探针和RNA酶抑制剂按照一定的比例在特定的条件下进行反应,在激光的激发作用下,检测出反应液的荧光强度,即得到待测靶标microRNA的检测结果,该检测方法极为简单,且用时较少,从而克服了采用现有技术中的检测方法检测microRNA-499、microRNA-208b、microRNA-1以及microRNA-133a这四个心肌损伤标志物导致检测时间很长、工作量较大的问题,大大缩短了上述四个心肌损伤标志物的检测时间,在保证检测质量的基础上,提高了检测效率。
本领域技术人员应该理解,本领域技术人员结合现有技术以及上述实施例可以实现所述变化例,在此不予赘述。这样的变化例并不影响本发明的实质内容,在此不予赘述。
以上对本发明的较佳实施例进行了描述。需要理解的是,本发明并不局限于上述特定实施方式;任何熟悉本领域的技术人员,在不脱离本发明技术方案作出许多可能的变动和修饰,或修改为等同变化的等效实施例,这并不影响本发明的实质内容。因此,凡是未脱离本发明技术方案的内容,依据本发明的技术实质对以上实施例所做的任何简单修改、等同变化及修饰,均仍属于本发明技术方案保护的范围内。
Claims (6)
1.一种microRNA的快速检测方法,其特征在于,包括:
备料:准备好患者血清、RNase-free水、浓度为19~21uM/uL的RNA酶抑制剂以及浓度为0.19~0.21uM/uL的DSN酶;
设计探针:根据待测靶标microRNA的序列设计出与其完全互补的单链DNA序列,而后在所述单链DNA序列两端分别修饰荧光基团和荧光淬灭基团,获得浓度为195~205nmol/uL的Taqman探针;
反应:将所述患者血清、所述RNase-free水、所述DSN酶、所述Taqman探针和所述RNA酶抑制剂按照100:278:2:20:1的配比进行混合,在60~80℃的反应温度下反应25~35分钟;
检测:根据相应Taqman探针设置反应所需的激发波长和发射波长,使用全自动酶标仪检测反应步骤中的反应液的荧光强度,即得到所述患者血清中的microRNA的检测结果。
2.如权利要求1所述的microRNA的快速检测方法,其特征在于,所述患者血清的收集包括:获取患者的静脉血4~6mL,以3000rpm离心10min,分离血清用于检测。
3.如权利要求1所述的microRNA的快速检测方法,其特征在于,当所述待测靶标microRNA为microRNA-499时,所述Taqman探针为:5'-Cy3-TTAAACATCACT GCAAGT CTTAA–BHQ2-3';
其中,Cy3染料的激发波长为550nM,发射波长为570nM,且检测步骤中的激发波长和发射波长与所述Cy3染料的激发波长和发射波长相同。
4.如权利要求1所述的microRNA的快速检测方法,其特征在于,当所述待测靶标microRNA为microRNA-208b时,所述Taqman探针为:5'-TAMRA-ACA AAC CTT TTG TTC GTCTTAT-Eclipse-3';
其中,TAMRA染料的激发波长为542nM、发射波长为568nM,且检测步骤中的激发波长和发射波长与所述TAMRA染料的激发波长和发射波长相同。
5.如权利要求1所述的microRNA的快速检测方法,其特征在于,当所述待测靶标microRNA为microRNA-1时,所述Taqman探针为:5'-Cy5-ATACATACT TCT TTACAT TCC A-BHQ-3';
其中,Cy5染料的激发波长为649nM,发射波长670nM,且检测步骤中的激发波长和发射波长与所述Cy5染料的激发波长和发射波长相同。
6.如权利要求1所述的microRNA的快速检测方法,其特征在于,当所述待测靶标microRNA为microRNA-133a时,所述Taqman探针为:5'-FAM-CAGCTG GTT GAA GGG GACCAAA-Eclipse-3';
其中,FAM染料的激发波长492nM、发射波长518nM,且检测步骤中的激发波长和发射波长与所述FAM染料的激发波长和发射波长相同。
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