CN105734160A - 畜禽肉猪牛羊源性成分pcr鉴定用引物体系及pcr鉴定方法与试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种畜禽肉中猪、牛、羊源性成分鉴定用的引物体系以及PCR鉴定方法与试剂盒。根据动物线粒体DNA 16S rRNA基因的差异位点,设计特异性引物,见序列表SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6。PCR鉴定方法,包括提取待测样本DNA,PCR扩增。试剂盒,包括SEQ ID NO.1?6。本发明引物均仅对各自物种目标片段进行特异性扩增,不会与其他物种发生反应,检测灵敏度较高,能有效鉴别出畜禽肉中的猪、牛、羊源性成分,该方法快速、灵敏、实用;若将该引物体系配合相关的试剂可以制成试剂盒,为工业化生产及应用提供可能,具有良好的应用前景。
Description
技术领域
本发明属于分子生物学领域,具体涉及畜禽肉中猪、牛、羊源性PCR鉴定用的引物体系及PCR鉴定方法与试剂盒,适用于上述三种动物肉类源性快速检测与真假鉴别。
背景技术
肉与肉制品质量安全问题一直以来是全社会共同关注的热点话题。随着市场上猪肉和牛肉、羊肉价格差距的拉大,一些不法商家或个人为了追求自身利益,使用相对廉价的猪肉,通过各种手段的深加工,冒充牛肉、羊肉制品进行销售,严重侵犯了消费者的合法权益,更直接影响着消费者的健康。近年来,随着“牛肉膏”、假冒牛、羊肉卷等事件的多次曝光,对食品中原料肉进行掺假、掺杂检测显得尤为重要。而传统的以经验为主的鉴别方法已远不能满足科学监管的需要,因此,建立快速、准确的畜禽肉中猪、牛、羊肉源性成分鉴定方法势在必行。对食品进行动物源性成分鉴定,有利于维护消费者利益,避免假冒伪劣食品的出现,也有利于肉类产业健康发展。
聚合酶链式反应(PCR)技术由于其操作简便、快速高效等特点,已逐步成为肉类种属鉴定的核心方法,在国内外肉类掺假研究中得到广泛应用,并取得创新性成果。许多学者根据不同物种基因序列的差异位点设计特异性引物,利用PCR反应实现食品中特征基因片段的指数级扩增,继而通过电泳检测鉴别食品中可能的物种来源。而在目标基因的选择上,动物线粒体基因组DNA序列具有种内高度保守性和物种特异性,且由于拷贝数多而在食品加工过程未完全降解,因此其多态性位点是设计肉类成分定性检测的首选靶点。
近年来根据线粒体基因组DNA序列差异位点设计物种特异性引物,建立PCR以及实时荧光PCR方法在国外已有相关报道,而在国内目前仅有少数文献报道了使用PCR技术对肉类来源的鉴别,且其扩增序列多数基于动物基因组中的微卫星序列,方法的灵敏度受到基因组DNA提取效率的影响很大,而且所涉及到的物种覆盖面少,检测范围窄,是否能够精确的从若干混合的肉类中检测出牛源性、羊源性或猪源性成分还有待于进一步考证。
目前,基于线粒体DNA 16S rRNA 基因建立畜禽肉中猪牛羊源性成分鉴别的方法还未见相关报道。建立能够鉴别大量常见物种包括猪、牛、羊、兔、鸽、鹌鹑、鸡、鸭以及鹅等动物肉中猪牛羊源性成分的引物体系以及PCR方法,是提高肉品真假鉴别效率的有效途径之一,对打击假冒伪劣,维护市场秩序,提升食品安全监管能力具有重要意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种畜禽肉猪、牛、羊源性鉴别用引物体系和PCR鉴定方法及试剂盒,利用该引物体系和方法可快速准确的检测畜禽肉中猪、牛、羊源性成分,并可对牛、羊肉真伪和掺假进行识别。
本发明为了解决其技术问题所采用的技术方案是:
一种畜禽肉中猪牛羊三种肉类源性成分PCR鉴定用引物体系,由下列引物对组成:
(1)对猪16S rRNA 基因进行扩增生成猪特异性扩增片段的引物对Ⅰ:
正向引物序列为:CTCAACAAATTCACCAACAT,
反向引物序列为:GTGCGAGGAGAAAGGC;
(2)对牛16S rRNA 基因进行扩增生成牛特异性扩增片段的引物对Ⅱ:
正向引物序列为:AAGGAATAACAACAATCTC,
反向引物序列为:AGTGATTTGACTTGTGGG;
(3)对羊16S rRNA 基因进行扩增生成羊特异性扩增片段的引物对Ⅲ:
正向引物序列为:CCAGCAATAACATTAGCC,
反向引物序列为:CTTTGAATCTTTCCTGGGT。
本发明通过比对分析猪、牛、羊、兔、鸽、鹌鹑、鸡、鸭以及鹅九种动物线粒体DNA16S rRNA 基因的差异性位点,设计猪、牛、羊的特异性PCR引物对,其仅对相应的物种总DNA模板有扩增信号,对其它物种没有目的扩增信号,因此能够快速准确的对猪、牛、羊进行定性检测。
本发明还提供了一种猪肉、牛肉、羊肉的PCR鉴定方法。以样品总DNA为模板,利用所述引物对Ⅰ、引物对Ⅱ和引物对Ⅲ分别进行PCR扩增实验,反应结束后根据1.5%琼脂糖凝胶电泳判定结果,所述样品总DNA模板来自猪、牛、羊、兔、鸽、鹌鹑、鸡、鸭以及鹅肌肉样品的混合,或上述各物种肌肉样品的一种。
所述PCR扩增实验中特定的反应体系为20 μL体系:2×PCR Mix 10 ul,10 μmol/L正向引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ 0.3μL,10 μmol/L反向引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ 0.3μL,模板DNA 1 μL,双蒸灭菌水8.4 μL。
所述PCR扩增实验中特定的反应程序为:先进行95℃ 预变性5 min;然后95℃变性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸 60 s,进行30个循环;最后72℃延伸10min。
本发明所述鉴定方法中进行琼脂糖凝胶电泳结束后判定结果时,判定依据为:所述引物对Ⅰ、引物对Ⅱ和引物对Ⅲ分别扩增出的DNA片段大小,其中
猪物种的引物对Ⅰ扩增出的DNA片段大小为126bp,126 bp扩增片段见以下序列划线部分:
ACCAAAGCTAGCTCAACATATTAAACAAATACAAAAATACACCAAAATAAAATAAAACATTCACCTAACACTAAAGTATAGGAGATAGAAATTTTTATCCTGACGCTATAGAGATAGTACCGTAAGGGAAAGATGAAAGAATAAAATAAAAGTAAAAAAAAGCAAAGATTACCCCTTCTACCTTTTGCATAATGGTTTAACCAGAAAAAATCTAACAAAGAGAACTTTAGCTAGATACCCCGAAACCAGACGAGCTACCTATGAGCAGTTTAAAAGAACCAACTCATCTATGTGGCAAAATAGTGAGAAGACTTGTAGGTAGAGGTGAAAAGCCTAACGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCGAGAAAGAATTTTAGTTCAACCTTAAAAATACCCCAAAAACCCTAAATTCCAATGTATTTTTAAGAGATAGTCTAAAAAGGTACAGCTTTTTAGAAACGGATACAACCTTGACTAGAGAGTAAAATCTTAATACTACCATAGTAGGCCTAAAAGCAGCCATCAATTGAGAAAGCGTTAAAGCTCAACAAATTCACCAACATAATCCCAAAAACTAATAACAAACTCCTAGCCCAATACCGGACTAATCTA TTGAAACATAGAAGCAATAATGTTAATATGAGTAACAAGAAGCCTTTCTCCTCGCACACGCTTACATCAGTAACTAATAATATACTGATAATTAACAATCAATAAACCAAAACAACACTAAAGCGTTTATTAATTATATTGTTAACCCAACACAGGAGTGCACCAAGGAAAGATTAAAAGAAGTAAAAGGAACTCGGCAAACACAAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCTAGCATTACTAGTATTAGAGGCAATGCCTGCCCAGTGACACCAGTTTAACGGCCGCGGTATTCTGACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTCCAAATAAGGACTTGTATGAATGGCCACACGAGGGTTTTACTGTCTCTTACTTCCAATCAGTGAAATTGACCTTCCCGTGAAGAGGCGGGAATAAAAAAATAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTTAATTAACTATTCCAAAAGTTAAACAATTCAACCACAAAGGGATAAAACATAACTTAACATGGACTAGCAATTTCGGTTGGGGTGACCTCGGAGTACAAAAAACCCTCCGAGTGATTTTAATCTAGACAAACCAGTCAAAATAACCATAACATCACTTATTGATCCAAAATTTTGATCAACGGAACAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCTATTCTAGAGTTCCTATCGACAATAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACACCCAAATGGTGCAACCGCTATTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAATCCAGGTCGGTTTCTATCTATTATAAATTTCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAAATGGGACCAACCTCACAAACGCGTCTCAGAGATAATTAATGATATAATCTTAACCTAATTAACTCATAATAAATCCAGCCCTAGAACAGGGCAC。
牛物种的引物对Ⅱ扩增出的DNA片段大小为108bp,108bp扩增片段见以下序列划线部分:
ACTAGACCTAGCCCAAAGATACCCTCTCGACTAAACAACCAAGATAGAATAAAACAAAACATTTAATCCCAATTTAAAGTATAGGAGATAGAAATCTAAGTACGGCGCTATAGAGAAAGTACCGCAAGGGAACGATGAAAGAAAAAAACTAAAAGTATAAAAAAGCAAAGATTACCCCTTGTACCTTTTGCATAATGAATTAACTAGTATAAGACTTAACAAAATGAATTTTAGCTAAGCAGCCCGAAACCAGACGAGCTACTCACAAACAGTTTACCAAGAACTAACTCATCTATGTGGCAAAATAGTGAGAAGATTTGTAAGTAGAGGTGACATGCCTAACGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCAGAAAATGAATCTAAGTTCAGCTTTAAAGATACCAAAAATTCAAATAAACCCCACTGTAGCTTTAAAAGTTAGTCTAAAAAGGTACAGCCTTTTAGAAACGGATACAACCTTGACTAGAGAGTAAAATTTAACACTACCATAGTAGGCCTAAAAGCAGCCATCAATTAAGAAAGCGTTAAAGCTCAACAACAAAAATTAAATAGATTCCAACAACAAATGATTAACTCCTAGCCCCAATACTGGACTAATCTATTATAGAATAGAAGCAATAATGTTAATATGAGTAACAAGAAAAATTTTCTCCTTGCATAAGTCTAAGTCAGTGCCTGATAATACTCTGACCACTAACAGTCAATAAAAATAATCCAACAATAAACAATTTATTGATTATACTGTTAACCCAACACAGGAGTGCATCTAAGGAAAGATTAAAAGAAGTAAAAGGAACTCGGCAAACACAAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCCAGCATTCCCAGTATTGGAGGCATTGCCTGCCCAGTGACAACTGTTTAACGGCCGCGGTATCCTGACCGTGCAAAGGTAGCATAATCATTTGTTCTCTAAATAAGGACTTGTATGAATGGCCGCACGAGGGTTTTACTGTCTCTTACTTCCAATCAGTGAAATTGACCTTCCCGTGAAGAGGCGGGAATGCACAAATAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTTAACTAACCAACCCAAAGAGAATAGATTTAACCATTAAGGAATAACAACAATCTCCATGAGTTGGTAGTT TCGGTTGGGGTGACCTCGGAGAATAAAAAATCCTCCGAGCGATTTTAAAGACTAGACCCACAAGTCAAATCACTCTATCGCTCATTGATCCAAAAACTTGATCAACGGAACAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCTATTCAAGAGTCCATATCGACAATAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCTGATGGTGCAACCGCTATCAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGTAATCCAGGTCGGTTTCTATCTATTACGTATTTCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAAATAAGGCCAACTTTAAATCAAGCGCCTTAAGACAACCAATGATAACATCTCAACTGACAACACAAAACCCTGCCCTAGAACAGGGCTTA。
羊物种的引物对Ⅲ扩增出的DNA片段大小为229bp,229bp扩增片段见以下序列划线部分:
ACTATACCTAGCCCAAAATCTCCCACTCTCCAGTTTAAATAACTAAATTAATTAAAATAAAACATTTACCCTAATTAAAGTATAGGAGATAGAAATTCTAAACACGGCGCTATAGAGAAAGTACCGCAAGGGAATGATGAAAGAAAAAAATCATAGTACAAAAAAGCAAAGATTAACCCTTGTACCTTTTGCATAATGAATTAACGAGCAAAAAACTTAACAAAACGAATTTTAGCTAAGTAACCCGAAACCAGACGAGCTACTTATAGACAGTTTATTAGAACCAACTCATCTATGTGGCAAAATAGTGAGAAGATCCATAAGTAGAGGTGACATGCCTAACGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCAGAAAATGAATTTTAGTTCAGCTTTAAAGATACCAAAAATACAAATAAATCCCACTGTATCTTTAAAAGTTAGTCTAAAAAGGTACAGCCTTTTAGAAATGGGTACAACCTTCACTAGAGAGTAAGATCTAAAAATACCATAGTAGGCCTAAAAGCAGCCATCAATTAAGAAAGCGTTAAAGCTCAACAACAATAGTATTATTAATCCCAGCAATAACATTAGCCAACTCCTAGATTTAATACTG GACTATTCTATTACTAAATAGAAGAATAATGTTAATATGAGTAACAAGAAATATTTTCTCCTCGCACAAGTTTAAGT CAGTAACTGATAATACCCTGACCGTTAACAGTAAATAAAAATAACCCAACAATAAATGATTTATTACTTATACTGTT AACCCAACACAGGAGTGCACCCAGGAAAGATTCAAAGAAGTAAAAGGAACTCGGCAAACACTAAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCCAGCATCCCTAGTATTGGAGGCACTGCCTGCCCAGTGACTAAACGTTAAACGGCCGCGGTATTCTGACCGTGCAAAGGTAGCATAATCATTTGTTCTCTAAATAAGGACTTGTATGAATGGCCACACGAGGGTTTTACTGTCTCTTACTTCCAATCAGTGAAATTGACCTCCCCGTGAAGAGGCGGGGATAAATCAACAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTTAACTAAGTAACTCAAGGAAAATAAATTCAACCACCAAGGGATAACAACACTCCTTATGAGTTAACAGTTTCGGTTGGGGTGACCTCGGAGAACAGAAAATCCTCCGAGCGATTTTAAAGACTAGACTAACAAGTCAAACCAAACCATCGCTTATTGATCCAAAAACTTGATCAACGGAACAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCTATTCAAGAGTCCATATCGACAATAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACACCCCGATGGTGCAACCGCTATCAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGTAATCCAGGTCGGTTTCTATCTGTTATGTATTTCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAAATAAGGCCAACTTTAACAAAGCGCCTTAAACCAATTAATGACTTTATCTTAATTAATTTCACAACAAAACCTGCCCTAGAAAAGGGCCCA。
分别使用猪肉、牛肉、羊肉、兔肉、鸽肉、鹌鹑肉、鸡肉、鸭肉以及鹅肉来源的DNA模板,对引物进行特异性验证和比较,三种目标肉类均在设计位置观察到特异性条带,未见明显非特异性扩增。
将猪肉、牛肉、羊肉、兔肉、鸽肉、鹌鹑肉、鸡肉、鸭肉和鹅肉来源的DNA模板以及双蒸灭菌水按照1:1:1:1:1:1:1:1:1:1等比例混合,对引物特异性进行研究,三种目标肉类引物仅与对应肉类DNA发生扩增反应,均与其它肉类DNA无交叉反应。
将157.67ng/ul猪肉来源DNA模板原液、141.46ng/ul牛肉来源DNA模板原液以及206.52ng/ul羊肉来源DNA模板原液,分别进行10倍梯度稀释,并进行灵敏度检测,目标DNA稀释104倍后,均仍可观察到微弱的特异性扩增,检测灵敏度达到皮克级。
本发明又提供了一种畜禽肉中猪牛羊源性PCR鉴定用试剂盒,包括所述引物对Ⅰ、引物对Ⅱ和引物对Ⅲ。可以将本发明所述引物体系以及相关试剂组装成试剂盒,以方便使用。其中所述相关试剂可以为本发明中所述的特定PCR反应体系中除了总DNA模板以外的其他试剂,也可以为其他适用的除样品总DNA模板以外的试剂。此外本发明试剂盒中还包括有实施本发明所需的基本用具。
本发明的试剂盒可以由多个隔断所形成,以容纳固定一个或多个如管或小瓶的容器。这些容器可以分别装有本发明中各物种的引物对。根据需要该引物可以是冻干形式或者溶于缓冲液中的状态。
本发明所述试剂盒可用于单物种总DNA模板以及多物种混合总DNA模板进行猪肉、牛肉、羊肉源性鉴定。所述试剂盒尤其适用于牛、羊肉掺假判定。
本发明的有益效果是:通过使用本发明的引物体系,可以有效检测多种畜禽肉中猪、牛、羊源性成分,检测方法快速简单,准确性高,检测灵敏度达到皮克级,不仅能为检测牛源性和羊源性食品提供新的方法,而且能够抵御牛、羊肉掺假,维护消费者利益;此外该引物体系还能配合相关试剂制成试剂盒,方便使用,具有较好的应用前景和良好的社会效益。
附图说明
图1是以本发明所述猪16S rRNA 基因引物对Ⅰ作为引物进行PCR扩增所得琼脂糖凝胶电泳图。1:空白;2:9种畜禽肉混合样;3:羊肉;4:牛肉;5:猪肉;6:兔肉;7:鸽肉;8:鹌鹑肉;9:鸡肉;10:鸭肉;11:鹅肉;12:DL 2000 DNA marker;
图2是以本发明所述牛16S rRNA 基因引物对Ⅱ作为引物进行PCR扩增所得琼脂糖凝胶电泳图。1:空白;2:9种畜禽肉混合样;3:羊肉;4:牛肉;5:猪肉;6:兔肉;7:鸽肉;8:鹌鹑肉;9:鸡肉;10:鸭肉;11:鹅肉;12:DL 2000 DNA marker;
图3是以本发明所述羊16S rRNA 基因引物对Ⅲ作为引物进行PCR扩增所得琼脂糖凝胶电泳图。1:空白;2:9种畜禽肉混合样;3:羊肉;4:牛肉;5:猪肉;6:兔肉;7:鸽肉;8:鹌鹑肉;9:鸡肉;10:鸭肉;11:鹅肉;12:DL 2000 DNA marker;
图4是以本发明所述引物对Ⅰ灵敏度检测琼脂糖凝胶电泳图。1:稀释10倍;2:稀释102倍;3:稀释103倍;4:稀释104倍;5:稀释105倍;6:DL 2000 DNA marker;
图5是以本发明所述引物对Ⅱ灵敏度检测琼脂糖凝胶电泳图。1:稀释10倍;2:稀释102倍;3:稀释103倍;4:稀释104倍;5:稀释105倍;6:DL 2000 DNA marker。
图6是以本发明所述引物对Ⅲ灵敏度检测琼脂糖凝胶电泳图。1:稀释10倍;2:稀释102倍;3:稀释103倍;4:稀释104倍;5:稀释105倍;6:DL 2000 DNA marker。
图1-6中DL 2000 DNA marker为标准核酸分子量标签,该标签自下向上以此为100bp、250bp、500bp、750bp、1000bp、2000bp。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明做进一步的说明。
以下实施例所使用的主要材料、试剂与仪器具体如下:
样品:新鲜猪肉、牛肉、羊肉、兔肉、鸽肉、鹌鹑肉、鸡肉、鸭肉以及鹅肉购于超市和农贸市场。
试剂:离心柱式组织基因组DNA抽提试剂盒(北京天根生化科技有限公司);2×PCRMix(南京博尔迪公司);电泳上样缓冲液等PCR生化反应试剂(宝生物工程(大连)有限公司);琼脂糖(Promega公司);引物合成由上海生工生物工程有限公司完成;DNA测序由上海华大基因科技有限公司完成。
仪器和设备:PCR仪(德国EPPENDORF公司);凝胶成像系统(基因有限公司);核酸蛋白检测仪(德国EPPENDORF公司);高速冷冻离心机(日本日立)。
实施例1
特异性引物体系的设计:根据GenBank上公布的猪、牛、羊、兔、鸽、鹌鹑、鸡、鸭以及鹅九种动物线粒体DNA 16S rRNA 基因序列,经BLAST比对分析,针对各物种特异性碱基位点利用Primer Premier5.0软件筛选出猪、牛、羊特异性引物对。各引物如下所述:
对猪16S rRNA 基因进行扩增生成猪特异性扩增片段的引物对Ⅰ:
正向引物序列为:CTCAACAAATTCACCAACAT(SEQ ID NO.1),
反向引物序列为:GTGCGAGGAGAAAGGC(SEQ ID NO.2);
对牛16S rRNA 基因进行扩增生成牛特异性扩增片段的引物对Ⅱ:
正向引物序列为:AAGGAATAACAACAATCTC(SEQ ID NO.3),
反向引物序列为:AGTGATTTGACTTGTGGG(SEQ ID NO.4);
对羊16S rRNA 基因进行扩增生成羊特异性扩增片段的引物对Ⅲ:
正向引物序列为:CCAGCAATAACATTAGCC(SEQ ID NO.5),
反向引物序列为:CTTTGAATCTTTCCTGGGT(SEQ ID NO.6)。
实施例2
(1)各物种肌肉总DNA提取:将新鲜猪肉、牛肉、羊肉、兔肉、鸽肉、鹌鹑肉、鸡肉、鸭肉以及鹅肉分别充分搅碎混匀,采用上述离心柱式组织基因组DNA抽提试剂盒提取DNA,提取好的总DNA样品分别溶于100ul洗脱液TE中,1%琼脂糖凝胶电泳检测,核酸蛋白测定仪测定260nm和280nm处吸光度值,计算DNA浓度和纯度,-20℃保存备用。
(2)采用实施例1中的3对引物,分别以上述猪肉、牛肉、羊肉DNA为模板,以其它动物肌肉DNA为对照,以无核酸的双蒸灭菌水为阴性对照,建立PCR检测体系。
(3)20 μL反应体系的配制:2×PCR Mix 10 ul,10 μmol/L正向引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ 0.3μL,10 μmol/L反向引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ 0.3μL,模板1 μL,双蒸灭菌水8.4 μL。
(4)PCR反应程序的制定:先进行95℃ 预变性5 min;然后95℃变性 30 s,60℃退火30 s,72℃延伸 60 s,进行30个循环;最后72℃延伸10min。
(5)琼脂糖凝胶电泳:取(4)中所得PCR扩增产物,经1.5%琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图1至图3所示:
其中图1是分别采用九种动物肌肉DNA为模板,以猪线粒体DNA 16S rRNA 基因的引物对Ⅰ作为引物进行PCR扩增所得到的DNA条带。结果显示猪物种特异引物对Ⅰ仅对猪肉DNA 模板特异扩增出126bp大小的条带,而其它物种DNA模板无扩增。
图2是分别采用九种动物肌肉DNA为模板,以牛线粒体DNA 16S rRNA 基因的引物对Ⅱ作为引物进行PCR扩增所得到的DNA条带。结果显示牛物种特异引物对Ⅱ仅对牛肉DNA模板特异扩增出108bp大小的条带,而其它物种DNA模板无扩增。
图3是分别采用九种动物肌肉DNA为模板,以羊线粒体DNA 16S rRNA 基因的引物对Ⅲ作为引物进行PCR扩增所得到的DNA条带。结果显示羊物种特异引物对Ⅲ仅对羊肉DNA模板特异扩增出229bp大小的条带,而其它物种DNA模板无扩增。
通过上述实验及实验结果可知,当猪、牛、羊的各自引物对均分别与九种动物总DNA模板进行PCR实验时,确定该引物仅对其自身物种的总DNA模板有反应,而对其它八个物种的总DNA模板没有反应,从而以单物种DNA模板方式验证了猪、牛、羊三个物种引物对的特异性。
实施例3
以所述各物种总DNA样品按照一定比例混合后的混合总DNA样品为模板:
(1)混合总DNA样品的处理:将实施例2中九种动物总DNA样品等体积混合,其中每种动物肌肉DNA各占0.1体积,并与0.1体积的双蒸灭菌水混匀,作为混合DNA模板。
(2)采用实施例1的3对引物,以混合DNA为模板,以9种动物肌肉DNA为对照,以无核酸的双蒸灭菌水为阴性对照,建立PCR检测体系。
(3)20 μL反应体系的配制:2×PCR Mix 10 ul,10 μmol/L正向引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ 0.3μL,10 μmol/L反向引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ 0.3μL,混合DNA模板1 μL,双蒸灭菌水8.4 μL。
(4)PCR反应程序的制定:该反应程序同实施例2中的反应程序。
(5)琼脂糖凝胶电泳:该电泳过程同实施例2中的电泳。
所得凝胶成像结果如图1至图3中的2孔所示。该方法以猪、牛、羊三个物种特异性引物分别与混合总DNA模板进行PCR扩增反应,很好的验证了复杂总DNA模板条件下猪、牛、羊特异性引物的有效性和特异性。所述三种特异性引物均能很好的从总DNA混合模板中扩增出其对应物种的特异性大小的条带。
实施例4
以所述猪、牛、羊肌肉DNA分别按照10倍梯度稀释后为模板,进行灵敏度实验。
(1)DNA模板稀释处理:将实施例2中157.67ng/ul猪肉来源DNA模板原液、141.46ng/ul牛肉来源DNA模板原液以及 206.52ng/ul羊肉来源DNA模板原液,分别稀释10倍、102倍、 103倍、104倍和105倍。
(2)分别采用实施例1的3对引物,以不同稀释倍数DNA为模板,建立PCR检测体系。
(3)20 μL反应体系的配制:2×PCR Mix 10 ul,10 μmol/L正向引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ 0.3μL,10 μmol/L反向引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ 0.3μL,经稀释处理的DNA模板1 μL,,双蒸灭菌水8.4 μL。
(4)PCR反应程序的制定:该反应程序同实施例2中的反应程序。
(5)琼脂糖凝胶电泳:该电泳过程同实施例2中的电泳。
所得凝胶成像结果如图4至图6所示。目标DNA稀释104倍后,均仍可观察到微弱的特异性扩增,检测灵敏度达到皮克级。
根据上述实施例2和实施例3中所述的PCR反应体系,本发明所述的引物体系可以配合相关试剂组装成不同组合的试剂盒,可用于畜禽肉中猪、牛、羊源性成分鉴定,尤其适用于牛、羊食品的真伪和掺假鉴别。
虽然,上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述,但在本发明的基础上,可以对之作一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,再不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。
Claims (7)
1.一种畜禽肉中猪牛羊三种肉类源性成分PCR鉴定用引物体系,其特征在于:所述PCR鉴定用引物体系由下列引物对组成:
(1)对猪16S rRNA 基因进行扩增生成猪特异性扩增片段的引物对Ⅰ:
正向引物序列为:CTCAACAAATTCACCAACAT;
反向引物序列为:GTGCGAGGAGAAAGGC;
(2)对牛16S rRNA 基因进行扩增生成牛特异性扩增片段的引物对Ⅱ:
正向引物序列为:AAGGAATAACAACAATCTC;
反向引物序列为:AGTGATTTGACTTGTGGG;
(3)对羊16S rRNA 基因进行扩增生成羊特异性扩增片段的引物对Ⅲ:
正向引物序列为:CCAGCAATAACATTAGCC;
反向引物序列为:CTTTGAATCTTTCCTGGGT。
2.一种利用权利要求1所述的PCR鉴定用引物体系进行畜禽肉中猪牛羊源性PCR鉴定方法,其特征在于:提取待测物种总DNA;将提取的待测物种总DNA样品溶于100ul洗脱液TE中,于-20℃保存备用;以待测物种样品总DNA为模板,利用权利要求1所述引物对Ⅰ、引物对Ⅱ、引物对Ⅲ分别进行PCR扩增实验,反应完毕后将PCR产物取出,利用1.5%的低溶点琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物;所述琼脂糖凝胶电泳结束后判定结果时,判定依据为所述引物对Ⅰ、引物对Ⅱ和引物对Ⅲ分别扩增出的DNA片段大小,其中
当引物对Ⅰ扩增出的DNA片段大小为126bp,判定待测物种为猪物种;126bp扩增片段为:
CTCAACAAAT TCACCAACAT AATCCCAAAA ACTAATAACA AACTCCTAGC CCAATACCGG 60
ACTAATCTAT TGAAACATAG AAGCAATAAT GTTAATATGA GTAACAAGAA GCCTTTCTCC 120
TCGCAC 126;
当引物对Ⅱ扩增出的DNA片段大小为108bp,判定待测物种为牛物种;108bp扩增片段为:
AAGGAATAAC AACAATCTCC ATGAGTTGGT AGTTTCGGTT GGGGTGACCT CGGAGAATAA 60
AAAATCCTCC GAGCGATTTT AAAGACTAGA CCCACAAGTC AAATCACT 108;
当引物对Ⅲ扩增出的DNA片段大小为229bp,判定待测物种为羊物种;229bp扩增片段为:
CCAGCAATAA CATTAGCCAA CTCCTAGATT TAATACTGGA CTATTCTATT ACTAAATAGA 60
AGAATAATGT TAATATGAGT AACAAGAAAT ATTTTCTCCT CGCACAAGTT TAAGTCAGTA 120
ACTGATAATA CCCTGACCGT TAACAGTAAA TAAAAATAAC CCAACAATAA ATGATTTATT 180
ACTTATACTG TTAACCCAAC ACAGGAGTGC ACCCAGGAAA GATTCAAAG 229。
3.根据权利要求2所述的畜禽肉中猪牛羊源性PCR鉴定方法,其特征在于:所述PCR扩增实验的PCR反应体系为:2×PCR Mix10 ul,10 μmol/L所述引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ的正向引物0.3 μL,10 μmol/L所述引物对Ⅰ或引物对Ⅱ或引物对Ⅲ的反向引物0.3 μL,每个物种DNA模板1 μL,双蒸灭菌水8.4 μL。
4.根据权利要求2或3所述的畜禽肉中猪牛羊源性PCR鉴定方法,其特征在于:所述PCR扩增实验的PCR反应程序为:先进行95℃ 预变性5 min;然后95℃变性 30 s,60℃退火30s,72℃延伸 60 s,进行30个循环;最后72℃延伸10min。
5.根据权利要求2或3所述的畜禽肉中猪牛羊源性PCR鉴定方法,其特征在于:所述提取待测物种总DNA的方法是:使用离心柱式组织基因组DNA抽提试剂盒进行提取。
6.一种畜禽肉中猪牛羊源性PCR鉴定用试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括权利要求1所述的引物对Ⅰ、引物对Ⅱ和引物对Ⅲ。
7.如权利要求6所述的畜禽肉中猪牛羊源性PCR鉴定用试剂盒的应用,其特征在于:所述试剂盒用于单物种总DNA模板或多物种总DNA模板进行畜禽肉中猪、牛、羊源性鉴定。
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