CN105647966A - 一种以棉花幼胚为受体接种trv病毒诱导基因沉默方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种以棉花幼胚为受体接种TRV病毒诱导内源基因沉默的方法,步骤如下:(1)将目的基因插入TRV病毒载体中,制备重组载体,然后转化农杆菌,制得转化后的农杆菌;(2)取棉花种子,经脱绒、灭菌后,经萌发后去除萌发种子的内、外皮,幼胚放入含有赤霉素的MS液体培养基中,制得待侵染胚;(3)培养转化后的农杆菌,制得农杆菌侵染液,制得侵染液,将待侵染胚浸入侵染液中,暗培养,经共培养后,栽种到灭菌的营养土中,进行营养土培养,即可。本发明首次以棉花幼胚作为受体接种TRV病毒,不对幼胚进行破坏性处理,不产生任何损伤,克服了接种病毒时对棉苗造成机械损伤的缺点。
Description
技术领域
本发明涉及一种以棉花幼胚为受体接种TRV病毒诱导内源基因沉默的方法,属于植物基因工程技术领域。
背景技术
陆地棉全基因组测序已完成,产生海量DNA序列信息,深入研究这些序列的功能尤为迫切。传统的基因功能研究手段主要以遗传转化为基础,但棉花的转化效率低,转化过程繁琐且对受体基因型的依赖性较强,严重限制棉花功能基因组研究的发展。
病毒介导的基因沉默(virusinducedgenesilencing,VIGS)是一种快速、高效、高通量的反向遗传学技术,其原理是利用重组病毒抑制植物内源基因的表达,通过表型及生理数据的分析鉴定基因功能。VIGS技术克服传统研究方法需要依赖遗传转化的局限性,近几年在棉花基因功能研究中得到广泛应用。其中,烟草脆裂病毒(tobaccorattlevirus,TRV)载体是棉花中应用最为广泛VIGS载体。虽然VIGS沉默起效快、效率高,但该技术在具体实验操作中的不足之处亦很明显,如接种病毒的方式多利用注射器渗透子叶或摩擦破坏叶表皮接种,对棉苗造成损伤;接种时间一般在子叶完全平展后,因此,不能用来研究发育较早期的基因功能;接种病毒时所需农杆菌侵染液制备量大,实验成本高;接种过程耗时长等。对VIGS技术体系中的不足之处进行改良,可使该技术在棉花基因功能研究中发挥更大作用。
发明内容
本发明针对现有技术的不足,提供一种无损伤、沉默时间更早、成本更低、操作更简便的转化方法,即以棉花幼胚为受体的TRV病毒诱导基因沉默的方法。
一种以棉花幼胚为受体的TRV病毒诱导基因沉默的方法,步骤如下:
(1)将目的基因插入TRV病毒载体中,制备重组载体,然后转化农杆菌,制得转化后的农杆菌;
(2)取棉花种子,经脱绒、灭菌后,经萌发后去除萌发种子的内、外皮,幼胚放入含有2.5~3.5mg/LGA3(赤霉素)的MS液体培养基中,25~30℃,120rpm/min暗培养6~10h,制得待侵染胚;
(3)培养步骤(1)制得的转化后的农杆菌,制得农杆菌侵染液,然后加入农杆菌侵染液质量百分比0.15~0.25%的表面活性剂,制得侵染液,将步骤(2)制得的待侵染胚浸入侵染液中,22~28℃,100~150rpm/min,暗培养20~40分钟,去除多余侵染液,经共培养后,栽种到灭菌的营养土中,进行营养土培养,即可。
根据本发明优选的,所述步骤(1)中的目的基因为棉花GhCLA1基因,核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。
根据本发明优选的,所述步骤(1)中的重组载体,为将目的基因用限制性内切酶EcoRI和KpnI双酶切后,连接入同样经限制性内切酶EcoRI和KpnI酶切后的TRV病毒载体中。
根据本发明优选的,所述步骤(1)中的转化为冻融法转化。
根据本发明优选的,所述步骤(1)中的病毒载体TRV载体系统,包含TRV1和TRV2载体;农杆菌为GV3101。
根据本发明优选的,所述步骤(2)中脱绒为采用浓硫酸脱绒,灭菌为采用质量浓度为15%的双氧水浸泡0.5~1.5h,然后用大量的无菌水冲洗。
根据本发明优选的,所述步骤(2)中萌发为在灭菌水中25~30℃浸泡15~18h。
根据本发明优选的,所述步骤(3)中农杆菌侵染液的制备步骤如下:
将转化后的农杆菌涂布在含有50mg/L卡那霉素、50mg/L庆大霉素、50mg/L利福平的LB固体培养基上,25~30℃暗培养2~3天;挑取单克隆接入含有相同浓度抗生素的LB液体培养基中,25~30℃振荡过夜培养,制得液体培养物;
取1mL液体培养物扩繁至100mL含有上述相同浓度抗生素且附加了10mM的MES和20μM乙酰丁香酮的LB液体培养基中,25~30℃过夜培养;25℃,4500rpm离心菌体,将菌体重悬在含有10mMMgCl2,10mMMES(2-(N-吗啉)乙磺酸),200μMAS(乙酰丁香酮)的MS液体培养基中,调整OD600=1.5,22~28℃,暗处理2.5~3h,制得农杆菌侵染液。
根据本发明优选的,所述步骤(3)中表面活性剂为SilwetL-77。
根据本发明优选的,所述步骤(3)中共培养为在共培养培养基中于22~28℃暗培养2~3天;共培养培养基为含有200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基;
进一步优选的,所述含有200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基为将200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基浸润4~7层滤纸制得。
根据本发明优选的,所述步骤(3)中营养土培养为将生根后的幼苗在22~25℃,14h光照/10h黑暗的条件下,与营养土中培养,即可。
上述MS液体培养基,每升组分如下:
NH4NO31650mg、KNO31900mg、KH2PO4170mg、CaCl2·2H2O440mg、MgSO4·7H2O440mg、FeSO4·7H2O27.85mg、Na2-EDTA37.25mg、MnSO4·4H2O22.3mg、ZnSO4·7H2O8.6mg、H3BO36.2mg、KI0.83mg、Na2MoO4·2H2O0.25mg、CuSO4·5H2O0.025mg、CoCl2·6H2O0.025mg、肌醇100mg、盐酸硫胺素(VB1)10mg、盐酸吡哆醇(VB6)1mg、烟酸1mg。
LB固体培养基,每升组分如下:
胰蛋白胨10g、酵母提取物5g、Nacl10g、10g/L琼脂粉,pH=7.0;高压蒸汽灭菌20min。
LB液体培养基,每升组分如下:
胰蛋白胨10g、酵母提取物5g、Nacl10g,pH=7.0;高压蒸汽灭菌20min。
有益效果
1、本发明首次以棉花幼胚作为受体接种TRV病毒,诱导基因沉默;该方法不对幼胚进行破坏性处理,不产生任何损伤,克服了接种病毒时对棉苗造成机械损伤的缺点;
2、本发明采用浸泡幼胚接种方式,操作简单,有效缩短接种时间;
3、采用本发明的技术对棉花进行基因沉默实验,第一片真叶即可发生基因沉默,可用于棉花发育早期基因的功能研究。
附图说明
图1是侵染后的棉苗生长2个月时的白化表型照片;
图中:左图为GhCLA1基因沉默棉株,叶片和茎部可见明显的白化表型;右图为对照,未出现白化现象;
图2是一步法RT-PCR检测沉默植株不同组织中病毒RNA的累积情况的电泳检测结果照片;
RT-PCR结果显示,在侵染苗的根、茎、叶、子叶中均能扩增出明亮的特异性条带,说明TRV病毒可全株扩散,未接种病毒的对照株中未扩增出任何产物。
图3是利用QualiPlateKitforCry1Ab/Cry1Ac试剂盒检测棉株中BT蛋白的含量的柱状图。
具体实施方式
下面结合实施例对本发明的技术方案做进一步阐述,但本发明所保护范围不限于此。
生物材料来源:
TRV载体的构建参考XiquanGao等论文Agrobacterium-MediatedVirus-InducedGeneSilencingAssayInCotton(Journalofvisualizedexperiments,8/20/2011,URL:http://www.jove.com/details.php?id=2938)中的内容进行制备;
供试棉花品种为coker312和鲁棉研37号,购自临清鲁壹种业有限公司;
农杆菌GV3101感受态购自华越洋生物科技有限公司;
实施例1
棉花GhCLA1基因(cloroplastosalterados1gene)编码1-deoxyxylulose5-phosphate合成酶,参与叶绿体发育过程。GhCLA1基因沉默产生明显的白化表型,在VIGS体系中被广泛用作基因沉默的标记性状。本实施例中,以幼胚为受体接种TRV病毒诱导棉花GhCLA1基因沉默,具体方法如下:
(1)将目的基因插入病毒载体TRV2中,制备重组载体,然后转化农杆菌,制得转化后的农杆菌:
目的基因的制备:提取棉花叶片总RNA,反转录后获得cDNA,用GhCLA1基因特异引物(F1:5,-GCGGAATTCCACAACATCGATGATTTAG-3’;R1:5’-CGGGGTACCATGATGAGTAGATTGCAC-3’)扩增GhCLA1基因中约400bp的片段。
所述PCR扩增体系为(总体积50μl):
所述PCR扩增程序如下:
95℃预变性3min;95℃变性30s,59℃退火30s,72℃延伸40s,32个循环;72℃延伸10min。
病毒载体TRV2-GhCLA1的构建与农杆菌转化:将棉花GhCLA1基因中的400bp左右片段用EcoRI和KpnI限制性内切酶酶切后,连入同样酶切的病毒载体TRV2中,构建TRV2-GhCLA1重组载体,利用冻融法转化农杆菌GV3101;TRV1载体利用同样方法转化农杆菌GV3101。
(2)无菌幼胚的制备与预培养:
选取饱满、种子活力高的棉种用浓硫酸脱绒,大量流水冲洗干净,直至没有酸味。用15%的双氧水浸泡棉种1h,期间晃动5次。灭菌水冲洗6次,浸泡在无菌水中2h,再用灭菌水冲洗3次,28℃浸泡18h。种子萌发后,无菌环境下将棉种的内、外种皮剥去,注意不要损伤子叶和胚根,放入含有3mg/LGA3的MS液体培养基中,28℃,120rpm/min暗培养8h。
(3)接种病毒及培养:
培养步骤(1)制得的转化后的农杆菌,制备农杆菌侵染液,然后加入农杆菌侵染液质量百分比0.2%的表面活性剂SilwetL-77,制得侵染液,将步骤(2)制得的待侵染胚浸入侵染液中,28℃,120rpm/min,暗培养20分钟,去除多余侵染液,经共培养后,栽种到灭菌的营养土中,进行营养土培养,即可。
侵染液的制备与接种:将步骤(1)中经TRV2-GhCLA1和TRV1转化后的农杆菌菌种涂布在含50mg/L卡那霉素、50mg/L庆大霉素、50mg/L利福平的LB固体培养基上,28℃暗培养2天。挑取单克隆,接种到5mL含有相同抗生素的LB液体培养基中,28℃,180rpm振荡培养过夜。取1mL液体培养物扩繁至100mL含有上述抗生素,且另外附加了10mMMES和20μM乙酰丁香酮的LB液体培养基中,28℃,180rpm振荡培养过夜。25℃,5000rpm转速,离心收集菌体,将菌体重悬在含有100mMMES、10mMMgCl2、200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基中。利用分光光度计调整浓度为OD600=1.5,在黑暗处放置3h。TRV1农杆菌侵染液的制备与TRV2-GhCLA1相同。将制备好的TRV1和TRV2-GhCLA1农杆菌侵染液等体积混匀,加入0.2wt%的表面活性剂SilwetL-77。将用GA3预培养后的棉花幼胚浸入上述制备好的农杆菌侵染液中,25℃,120rpm/min,暗培养30分钟,对棉花幼胚进行接种。
接种后的培养:接种后,将幼胚放在灭菌滤纸上,吸去多余侵染液。在培养皿中铺放5层灭菌滤纸,用含有200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基浸湿滤纸,将幼胚平铺在培养皿中,25℃暗培养2天。将长出胚根的幼胚移栽到经过高温灭菌的培养土里,23℃,光照时间为14/10h光暗周期的气候室中培养。培养期间,需保持环境温度不超过24℃。
(4)沉默株的表型观察与分子检测:
培养18天,棉株刚长出的真叶和茎即可出现明显的白化表型,该表型可持续4~5个月(如图1所示)。分别提取白化植株的子叶、真叶、茎和根的总RNA,利用TRV2载体中的特异性序列设计引物(F2:5’-TGGAGTTGAAGAGTTATTACCGAAGG-3’;R2:5’-CCGGAATTCGAAACTCAAATGCTACCAA-3’),进行一步法RT-PCR,检测接种后病毒RNA的累积情况。
RT-PCR结果显示,在子叶、真叶、茎和根组织提取的RNA样品中,均能扩增出明亮的特异性条带,而在未接种的对照株中没有任何扩增产物。RT-PCR的结果说明,对棉花幼胚进行接种后,病毒RNA可在棉苗不同部位扩散累积(如图2所示)。
实施例2
(1)将目的基因Cry1Ab/Ac插入病毒载体TRV2中,制备重组载体,然后转化农杆菌,制得转化后的农杆菌:
目的基因的制备:利用Cry1Ab/Ac基因特异引物PCR扩增转基因抗虫棉(鲁棉研37号)中的Cry1Ab/Cry1Ac基因(基因序列如SEQIDNO.2所示)中的440bp左右的片段。所用引物为F3(5’-CCGGAATTCAACAGCGCCTTGACCACAGC-3’)和R3(5’-CGGGGTACCGGGCAGAACCACGGAAGC-3’)。
所述PCR扩增体系如下(总体系50μl):
所述PCR扩增程序如下:
95℃预变性3min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸40s,32个循环;72℃延伸10min。
载体的构建与转化:将制备的Cry1Ab/Cry1Ac基因片段经EcoRI和KpnI双酶切后连入同样双酶切的病毒载体TRV2中,制备重组载体TRV2-Cry1Ab/Ac,利用冻融法转化农杆菌GV3101,制得转化后的农杆菌。未经改造的TRV1载体同样利用冻融法转化农杆菌GV3101,作为阳性对照;
(2)无菌幼胚的制备与预培养:
选取饱满、种子活力高的棉种用浓硫酸脱绒,大量流水冲洗干净。用15%的双氧水浸泡棉种1h,期间晃动4次。灭菌水冲洗6次,浸泡在无菌水中2h,再用灭菌水冲洗5次,在灭菌水中28℃浸泡18h。种子萌发后,无菌环境下将棉种的内、外种皮剥去,注意不要损伤子叶和胚根,放入含有3mg/LGA3植物激素的MS液体培养基中,28℃,120rpm/min暗培养8h。
(3)接种病毒及培养:
培养步骤(1)制得的转化后的农杆菌,制备农杆菌侵染液,然后加入农杆菌侵染液质量百分比0.2%的表面活性剂,制得侵染液,将步骤(2)制得的待侵染胚浸入侵染液中,25℃,120rpm/min,暗培养30分钟,去除多余侵染液,经共培养后,栽种到灭菌的营养土中,按常规方法培养即可。
侵染液的制备与接种:将步骤(1)中经TRV2-GhCLA1和TRV1转化后的农杆菌菌种涂布在含50mg/L卡那霉素、50mg/L庆大霉素、50mg/L利福平的LB固体培养基上,28℃暗培养2天。挑取单克隆,接种到5mL含有相同抗生素的LB液体培养基中,28℃,180rpm振荡培养过夜。取1mL液体培养物扩繁至100mL含有上述抗生素,且另外附加了10mMMES和20μM乙酰丁香酮的LB液体培养基中,28℃,180rpm振荡培养过夜。室温,5000rpm转速,离心收集菌体,将菌体重悬在含有100mMMES、10mMMgCl2、200uM乙酰丁香酮的MS液体培养基中。利用分光光度计调整浓度为OD600=1.5,在黑暗处放置3h。TRV1、TRV2农杆菌侵染液的制备与TRV2-Cry1Ab/Ac相同。将制备好的TRV1分别与TRV2和TRV2-Cry1Ab/Ac农杆菌侵染液等体积混匀,制成对照侵染液和实验侵染液,分别加入0.2wt%的表面活性剂SilwetL-77。将GA3预培养后的棉花幼胚分别浸入上述制备好的对照侵染液(TRV1和TRV2)和实验侵染液(TRV1和TRV2-Cry1Ab/Ac)中,25℃,120rpm/min,暗培养30分钟,对棉花幼胚进行接种。
接种后的培养:接种后,将幼胚放在灭菌滤纸上,吸去多余侵染液。在培养皿中铺放5层灭菌滤纸,用含有200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基浸湿滤纸,将幼胚平铺在培养皿中,25℃暗培养2天。将长出胚根的幼胚移栽到经过高温灭菌的培养土里,23℃,光照时间为14/10h光暗周期的气候室中培养。培养期间,需保持环境温度不超过26℃。
(4)分子检测:
Cry1Ab/Ac蛋白的ELISA检测:培养2月后,用ENVIROLOGIX公司的QualiPlateKitforCry1Ab/Cry1Ac试剂盒检测棉株种的BT蛋白含量。实验步骤如下:
分别取对照组和实验组棉株(每组10株)的倒3叶,约0.15克,记录重量,用液氮研磨,研细的粉末加到4mL样品提取液PBST(PBS缓冲液加入0.05wt%的Tween-20)中,4℃过夜提取。
4℃,8000rpm,离心10min,将上清液转至干净离心管,测量上清液体积。将上清液稀释到合适的浓度,备用。取50ulCry1Ab/AcEnzymeconjugate加入酶标板中,再加入50ul稀释后的上清液。为制作标准曲线,加入50ul试剂盒提供的Cry1Ab/AcPositivecontrol。每样品3重复。常温避光孵育2h。用PBST洗板4次。加入substrate显色底物100μl,常温避光反应15-30min,加入stopsolution反应终止液100μl,用酶标仪测定450nm的OD值,换算为BT蛋白的含量(单位为ng/g鲜重)。结果见图3。实验组(VIGS)叶片BT蛋白的含量明显低于对照组(CK),说明VIGS病毒侵染棉花幼胚后,可有效诱发转录后基因沉默,导致BT蛋白含量降低。
对比例
选用完全平展的子叶作为侵染对象,利用注射器渗透子叶法,接种TRV病毒诱发棉花GhCLA1基因沉默。侵染载体的制备和侵染液的制备同实施例1。
选择发育成熟、颗粒饱满的棉种200粒,浸入水中,28℃培养过夜催芽。将棉种播种到培养土中。28℃,光照/黑暗14/10h周期,培养10~20天。待子叶完全平展后,用注射器针尖轻轻划破子叶背面表皮,利用1mL注射器将配置好的农杆菌侵染液压渗入子叶中。侵染后的棉苗用塑料膜覆盖保湿,放置在25℃培养室中,暗培养1~2天。随后,对侵染后的棉苗进行正常培养。培养2周后,观察棉苗白化的情况。
同时,选择发育成熟、颗粒饱满的棉种200粒,利用本发明的方法,对幼胚为受体进行VIGS基因沉默实验。
自棉种28℃浸水催芽始(记做第一天),对两种方法的接种时间等进行对比。结果如表1所示。
表1不同受体的比较
由表1可以看出,本发明首次以棉花幼胚作为受体接种TRV病毒,不对幼胚进行破坏性处理,不产生任何损伤,克服了接种病毒时对棉苗造成机械损伤的缺点;采用浸泡幼胚接种方式,操作简单,有效缩短接种时间。
Claims (10)
1.一种以棉花幼胚为受体的TRV病毒诱导棉花基因沉默的方法,其特征在于,步骤如下:
(1)将目的基因插入TRV病毒载体中,制备重组载体,然后转化农杆菌,制得转化后的农杆菌;
(2)取棉花种子,经脱绒、灭菌后,经萌发后去除萌发种子的内、外皮,幼胚放入含有2.5~3.5mg/LGA3(赤霉素)的MS液体培养基中,25~30℃,120rpm/min暗培养6~10h,制得待侵染胚;
(3)培养步骤(1)制得的转化后的农杆菌,制得农杆菌侵染液,然后加入农杆菌侵染液质量百分比0.15~0.25%的表面活性剂,制得侵染液,将步骤(2)制得的待侵染胚浸入侵染液中,22~28℃,100~150rpm/min,暗培养20~40分钟,去除多余侵染液,经共培养后,栽种到灭菌的营养土中,进行营养土培养,即可。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中的目的基因为棉花GhCLA1基因,核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中的重组载体,为将目的基因用限制性内切酶EcoRI和KpnI双酶切后,连接入同样经限制性内切酶EcoRI和KpnI酶切后的TRV病毒载体中;
优选的,所述步骤(1)中的转化为冻融法转化。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中的病毒载体TRV载体系统,包含TRV1和TRV2载体;农杆菌为农杆菌GV3101。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)中脱绒为采用浓硫酸脱绒,灭菌为采用质量浓度为15%的双氧水浸泡0.5~1.5h;
优选的,所述步骤(2)中萌发为在灭菌水中25~30℃浸泡15~18h。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中农杆菌侵染液的制备步骤如下:
将转化后的农杆菌涂布在含有50mg/L卡那霉素、50mg/L庆大霉素、50mg/L利福平的LB固体培养基上,25~30℃暗培养2~3天;挑取单克隆接入含有相同浓度抗生素的LB液体培养基中,25~30℃振荡过夜培养,制得液体培养物;
取1mL液体培养物扩繁至100mL含有上述相同浓度抗生素且含有10mM的MES和20μM乙酰丁香酮的LB液体培养基中,25~30℃过夜培养;25℃,4500rpm离心菌体,将菌体重悬在含有10mMMgCl2,10mM2-(N-吗啉)乙磺酸,200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基中,调整OD600=1.5,22~28℃,暗处理2.5~3h,制得农杆菌侵染液。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中表面活性剂为SilwetL-77。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中共培养为在共培养培养基中于22~28℃暗培养2~3天;共培养培养基为含有200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述含有200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基为将200μM乙酰丁香酮的MS液体培养基浸润4~7层滤纸制得。
10.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中营养土培养为将生根后的幼苗在22~25℃,14h光照/10h黑暗的条件下,与营养土中培养,即可。
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