CN105061592A - 用于预防和/或治疗呼吸道感染的单价、二价和三价抗人呼吸道合胞病毒(hrsv)纳米抗体构建体 - Google Patents
用于预防和/或治疗呼吸道感染的单价、二价和三价抗人呼吸道合胞病毒(hrsv)纳米抗体构建体 Download PDFInfo
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Abstract
提供针对和/或可以特异性结合hRSV的蛋白F的氨基酸序列,以及包含一个或多个所述氨基酸序列或基本上由一个或多个所述氨基酸序列组成的化合物或构建体,且特别是蛋白和多肽。由本发明提供的氨基酸序列、多肽和治疗性化合物和组合物显示提高的稳定性、较低的免疫原性和/或提高的关于hRSV的蛋白F的亲和性和/或抗体亲抗原性。本发明还涉及所述氨基酸序列、多肽、化合物或构建体用于预防性和/或治疗性目的的用途。
Description
本申请是申请日为2010年6月7日、发明名称为“用于预防和/或治疗呼吸道感染的单价、二价和三价抗人呼吸道合胞病毒(HRSV)纳米抗体构建体”的中国专利申请No.201080024764.4的分案申请。
发明领域
本发明涉及针对和/或可以特异性结合(如本文定义)hRSV的蛋白F的氨基酸序列,以及包括一种或多种所述氨基酸序列或基本上由一种或多种所述氨基酸序列组成的化合物或构建体,且特别是蛋白和多肽(在本文中也分别称为“本发明的氨基酸序列”、“本发明的化合物”、“本发明的构建体”、和“本发明的多肽”)。
本发明还涉及编码所述氨基酸序列和多肽的核酸(在本文也称为“本发明的核酸”或“本发明的核苷酸序列”);制备所述氨基酸序列和多肽的方法;表达或能够表达所述氨基酸序列或多肽的宿主细胞;包含所述氨基酸序列、多肽、化合物或构建体、核酸和/或宿主细胞的组合物,且特别是药物组合物;和所述氨基酸序列、多肽、化合物或构建体、核酸、宿主细胞和/或组合物,特别地对预防和/或治疗目的,如本文所提及的预防和/或治疗目的的应用。
通过本文进一步的描述,本发明的其他方面、实施方案、优势和应用将会变得清楚。
背景技术
人呼吸道合胞病毒(hRSV)是副黏液病毒科(Paramyxoviridae)家族的成员并且是具有两种主要表面糖蛋白的包膜病毒,所述两种主要表面糖蛋白形成病毒颗粒的刺突。这些糖蛋白的其中之一(蛋白G)是介导病毒结合细胞表面的附着蛋白。另一种糖蛋白(蛋白F或融合蛋白)介导病毒和细胞膜的融合,让病毒核壳体进入细胞质。抑制由G或F糖蛋白介导的步骤阻抑感染周期的起始阶段并中和病毒感染性。所以,针对G或F的抗体,其分别抑制它们各自的活性,可以中和病毒感染性并可以保护免受hRSV感染。F蛋白是高度保守的并形成三聚体刺突,其在激活下发生构象变化。
hRSV是婴儿和非常小的儿童中的严重下呼吸道感染(细支气管炎(bronchiolitis)和肺炎(pneumonia))的主要原因,并在冬季月份期间引发年度流行病。该病毒还在老年人中引发实质性疾病负担,并且患心肺病症和/或免疫抑制疾病的成人也有患严重hRSV病的危险。免疫反应并不能预防重复感染。
没有现有的疫苗来预防hRSV感染。市场上现有的唯一药物产品是针对病毒糖蛋白其中之一(蛋白F)的人源化的单克隆抗体其在有患严重hRSV感染极高风险的儿童中预防性地使用。的限制性应用至少部分地归因于这种产品的高成本。显然存在对用于预防和或治疗由hRSV引起的感染的改进的和/或便宜的预防性和/或治疗性试剂的需要。
发明内容
本发明提供氨基酸序列(也称为“本发明的氨基酸序列”)、多肽(也称为“本发明的多肽”)和治疗性化合物和组合物,它们针对hRSV的蛋白F,并且除了其它有利性质(诸如,例如,改善制备容易性和/或降低商品成本)以外,与现有技术的氨基酸序列和抗体相比,它们具有改进的预防、治疗和/或药理学性质。这些改进的和有利的性质将从本文中的进一步描述中变得清楚。非限制性地,本发明提供的氨基酸序列、多肽和治疗性化合物和组合物可以显示改善的稳定性,较小的免疫原性,改善的与hRSV的蛋白F的结合,改善的对于hRSV的蛋白F的亲和性和/或抗体亲抗原性(avidity),改善的中和hRSV(如本文定义)的功效和/或效力,增加的对于hRSV的蛋白F的选择性和/或它们可以能够部分或优选完全阻断hRSV的蛋白F与靶宿主细胞和/或其膜的相互作用。它们可以能够通过调节、抑制和/或预防hRSV感染性,通过调节、抑制和/或预防hRSV与靶宿主细胞(的细胞膜)融合,和/或通过调节、抑制和/或预防hRSV进入靶宿主细胞(如本文定义)来中和hRSV。它们可以与不同的hRSV毒株和/或不同hRSV逃避突变型交叉反应和/或能够中和不同的hRSV毒株和/或不同hRSV逃避突变型。
在第一方面,本发明提供许多氨基酸残基片段(如本文定义),它们特别适合于结合hRSV的蛋白F上的特定表位。这些氨基酸残基片段可以存在于和/或可以结合到本发明的氨基酸序列中,特别是以这样的方式结合,即,使得它们形成本发明氨基酸序列的抗原结合位点(的一部分)。所获得的氨基酸序列应该能够与hRSV的蛋白F上的特定表位结合,所述特定表位位于hRSV的蛋白F上的抗原位点II(即hRSV的蛋白F的氨基酸残基250-275)中,形成hRSV的蛋白F上的抗原位点II的一部分,或与hRSV的蛋白F上的抗原位点II重叠(即在一级结构或三级结构中)或与hRSV的蛋白F上的抗原位点II紧邻(即在一级结构或三级结构中)。
因此,在一方面,本发明提供氨基酸序列,其包含至少一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明提供包含两个以上氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中一个片段选自以下:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于本发明的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
甚至更优选地,本发明的氨基酸序列包含三个以上氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中第一氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);或
第二氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且第三氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
包含这些特定氨基酸残基片段中的一个或多个的氨基酸序列已经显示改善的性质,诸如例如改善的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力。
本发明的氨基酸序列可以特别是结构域抗体(或适合用作结构域抗体的氨基酸序列),单结构域抗体(或适合用作单结构域抗体的氨基酸序列),"dAb"(或适合用作dAb的氨基酸序列)或(如本文所定义,并且包括但不限于VHH序列);其它单可变结构域,或它们中任一种的任何适当的片段。
在该方面,本发明的氨基酸序列可以基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
这些优选的互补性决定区(CDR2序列)也称为“本发明的CDR2”。
优选地,本发明的氨基酸序列可以基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:102;或
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且CDR1或CDR3中至少一种选自:
-选自由以下组成的组的CDR1:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);或
和/或
-选自由以下组成的组的CDR3:
e)SEQIDNO:121;或
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
甚至更优选地,本发明的氨基酸序列可以基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中:
-CDR1选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR2选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;或
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR3选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在特殊方面,本发明的氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102。优选地,本发明的氨基酸序列或包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
本发明还提供许多人源化氨基酸序列,其特别适合于结合hRSV的蛋白F。本发明的氨基酸序列在施用于人受试者时显示出减小的免疫原性。另外,本发明的氨基酸序列与它们相应的野生型氨基酸序列相比,显示出其他改善的性质,诸如例如改善的关于hRSV的蛋白F的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力(如2009年6月5日由埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)提交的标题为“Aminoacidsequencesdirectedagainstenvelopeproteinsofavirusandpolypeptidescomprisingthesameforthetreatmentofviraldiseases(用于治疗病毒疾病的针对病毒包膜蛋白的氨基酸序列和包含其的多肽)”的PCT申请PCT/EP2009/056975中所述)。
因此,在另一方面,本发明提供选自以下的氨基酸序列:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105(所述位置根据Kabat编号确定)具有谷氨酰胺(Gln,Q);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明的氨基酸序列包含SEQIDNO:60-76或基本上由SEQIDNO:60-76组成。
在另一方面,本发明提供选自以下的氨基酸序列:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
本发明的优选氨基酸序列包含SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一或基本上由SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一组成。
在另一方面,本发明提供选自以下的氨基酸序列:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明的氨基酸序列包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成。在另一优选方面,本发明的氨基酸序列包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成。
在另一方面,本发明提供选自以下的氨基酸序列:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明的氨基酸序列包含SEQIDNO:146-153或基本上由SEQIDNO:146-153组成。
在另一方面,本发明提供选自以下的氨基酸序列:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
本发明的优选氨基酸序列包含SEQIDNO’s:146-149和151-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-149和151-153之一组成。
本发明提供许多序列最优化的氨基酸序列和/或其在稳定性研究期间保存时表现出增加的稳定性并特别适合于结合hRSV的蛋白F。本发明的氨基酸序列显示减少的N端焦谷氨酸(pyroglutamate)翻译后修饰并因此具有增加的产物稳定性。另外,本发明的氨基酸序列与它们相应的亲本氨基酸序列相比,显示出其他改善的性质,诸如例如较小的免疫原性,改善的关于hRSV的蛋白F的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力(如2009年6月5日由埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)提交的标题为“Aminoacidsequencesdirectedagainstenvelopeproteinsofavirusandpolypeptidescomprisingthesameforthetreatmentofviraldiseases(用于治疗病毒疾病的针对病毒包膜蛋白的氨基酸序列和包含其的多肽)”的PCT申请PCT/EP2009/056975中所述)。
因此,在本发明的一方面,提供选自以下的氨基酸序列和/或
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO’s:138-141和154-157之一或基本上由SEQIDNO’s:138-141和154-157之一组成。
由本发明提供的氨基酸序列和优选地采用基本分离的形式(如本文所定义)、或形成本发明的蛋白或多肽(也称为“本发明的多肽”或“本发明的蛋白”)的一部分,其可以包括一种或多种本发明的氨基酸序列或或基本上由一种或多种本发明的氨基酸序列或 组成,并且其可以任选地还包括一种或多种其它的氨基酸序列或 (全部任选地通过一个或多个适当的接头连接)。
因此,在另一方面,本发明还涉及蛋白或多肽(在本文中也分别称为“本发明的多肽”),其包括一种或多种本发明的氨基酸序列和/或 (或其合适片段)或基本上由一种或多种本发明的氨基酸序列和/或 (或其合适片段)组成。
例如,且不限制地,一种或多种本发明的氨基酸序列或可以在这样的蛋白或多肽中用作结合单元,以便分别提供本发明的单价、多价或多互补位(multiparatopic)多肽,全如本发明所述。本发明因此还涉及作为单价构建体的多肽,其包含本发明的氨基酸序列或或基本上由本发明的氨基酸序列或组成。本发明因此还涉及这样的多肽,其为多价多肽,诸如,例如,二价或三价多肽。本发明还涉及这样的多肽,其为多互补位多肽,例如,双互补位或三互补位多肽。
在优选的方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个本发明的氨基酸序列和/或或基本上由至少两个本发明的氨基酸序列和/或组成(如上所述)。
在一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自包含至少一个选自以下的氨基酸残基片段的氨基酸序列:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或 或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自包含两个以上氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中一个片段选自以下:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于组成所述多价多肽的一部分的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
优选的多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自包含三个以上氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中第一氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);或
第二氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且第三氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:102;或
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且CDR1或CDR3中的至少一种选自:
-选自由以下组成的组的CDR1:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);或
和/或
-选自由以下组成的组的CDR3:
e)SEQIDNO:121;或
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选地,多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中:
-CDR1选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR2选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;或
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR3选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在特殊的方面,多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102,优选包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:60-76组成的组。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76组成的组。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:65和76组成的组。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:60-76组成的组。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76组成的组。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:65和76组成的组。
优选的本发明多价多肽包含三个具有SEQIDNO:62的氨基酸序列或或基本上由其组成。另一种优选的本发明多价多肽包含三个具有SEQIDNO:65的氨基酸序列或或基本上由其组成。另一种优选的本发明多价多肽包含三个具有SEQIDNO:76的氨基酸序列或 或基本上由其组成。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:146-153组成的组。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:146-149和151-153组成的组。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:146-153组成的组。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:146-149和151-153组成的组。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少一个氨基酸序列或 或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:138-141和154-157组成的组。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自由SEQIDNO’s:138-141和154-157组成的组。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:77-79和158;
b)与SEQIDNO’s:77-79和158之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和/或在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明的三价多肽包含SEQIDNO’s:77-79和158之一或基本上由SEQIDNO’s:77-79和158之一组成。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:78和79;
b)与SEQIDNO’s:78和79之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和/或在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明的三价多肽包含SEQIDNO’s:78或79或基本上由SEQIDNO’s:78或79组成。
在另一特殊方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:77的氨基酸序列组成。在另一特殊方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:78的氨基酸序列组成。在另一特殊方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:79的氨基酸序列组成。在另一特殊方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:158的氨基酸序列组成。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:159-161;
b)与SEQIDNO’s:159-161之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明的三价多肽包含SEQIDNO’s:159-161之一或基本上由SEQIDNO’s:159-161之一组成。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:159-161;
b)与SEQIDNO’s:159-161之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述多肽与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:159,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:160,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:161,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明的三价多肽包含SEQIDNO:159-161或基本上由SEQIDNO:159-161组成。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:142-145和162-165;
b)与SEQIDNO’s:142-145和162-165之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的第一氨基酸序列或在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明的三价多肽包含SEQIDNO’s:142-145和162-165之一或基本上由SEQIDNO’s:142-145和162-165之一组成。
具有这些序列的多肽显示作为预防、治疗和/或药理学活性试剂使用的有利性质,诸如例如,改善的稳定性,较小的免疫原性,改善的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力。
本发明还涉及化合物或构建体,和特别地涉及蛋白或多肽(在本文中也称为“本发明的化合物”),其包括一个或多个本发明的氨基酸序列、和/或多肽(或其适当的片段)或基本上由一个或多个本发明的氨基酸序列、和/或多肽(或其适当的片段)组成,并且任选地还包括一个或多个其它基团、残基、结构部分或结合单元。如通过本本文进一步的公开内容,对于熟练的技术人员将变得清楚的是,所述其它基团、残基、结构部分、结合单元或氨基酸序列可以为或可以不为本发明的氨基酸序列、或多肽(和/或为其中存在本发明的氨基酸序列、 或多肽的化合物或构建体)提供其它的官能性,并且可以改变或可以不改变本发明的氨基酸序列、和/或多肽的特性。
也在本发明范围内的是,使用本发明的氨基酸序列和/或多肽的部分、片段、类似物、突变体、变体、等位基因和/或衍生物,和/或使用包含一个或多个所述部分、片段、类似物、突变体、变体、等位基因和/或衍生物或基本由其组成的蛋白或多肽,只要这些是适合本文所设计的应用的。所述部分、片段、类似物、突变体、变体、等位基因和/或衍生物通常包含用于针对hRSV的蛋白F上的抗原位点II进行结合的功能性抗原-结合位点(的至少一部分);并且更优选地能够特异性结合于hRSV的蛋白F上的抗原位点II,并且甚至更优选地能够以如本文定义的亲和性(适当测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)结合于hRSV的蛋白F上的抗原位点II。所述部分、片段、类似物、突变体、变体、等位基因和/或衍生物通常应该还具有如本文中定义的hRSV中和功效和/或效力。所述部分、片段、类似物、突变体、变体、等位基因、衍生物、蛋白和/或多肽的一些非限制性的实例通过本文的进一步描述将变得清楚。本发明的另外的片段或多肽也可以通过适当地组合(即,通过连接或遗传融合)如本文所述的一个或多个(更小的)部分或片段进行提供。
本发明还涉及编码本发明的氨基酸序列、本发明的和/或本发明的多肽(或其合适片段)的核酸或核苷酸序列。这样的核酸也在本文中称为“本发明的核酸”并可以例如采用遗传构建体形式,如本文中进一步所述。因此,本发明还涉及采用遗传构建体形式的核酸或核苷酸序列。
本发明还涉及表达(或在适当的环境下能够表达)本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽和/或本发明的化合物或构建体的宿主或宿主细胞,和/或包含本发明的核酸的宿主或宿主细胞。通过本文进一步的描述,所述宿主或宿主细胞的一些优选而非限制性的实例将变得清楚。
本发明还涉及一种产品或组合物,所述产品或组合物包含或包括至少一种本发明的氨基酸序列(或其适当的片段)、至少一种本发明的 至少一种本发明的多肽,至少一种本发明的化合物或构建体、至少一种本发明的单价构建体和/或至少一种本发明的核酸、以及任选地所述组合物本身已知的一种或多种其它成分,即,取决于所述组合物的目的用途。例如,这样的产品或组合物可以是药物组合物(如本文所述)或兽医用组合物。通过本发明进一步的描述,所述产品或组合物的一些优选而非限制性的实例将变得清楚。
本发明还涉及用于制备本文中所述的氨基酸序列、多肽、核酸、宿主细胞、产品和组合物的方法。
本发明还涉及本文所述的氨基酸序列、多肽、化合物、核酸、宿主细胞、产品和组合物的应用和用途,以及涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的呼吸道感染的方法。通过本发明进一步的描述,一些优选的但非限制性的应用和用途将变得清楚。
本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物一般可以用于阻断hRSV的蛋白F与靶宿主细胞和/或其膜的相互作用,中和hRSV(不同hRSV毒株和/或逃避突变型),调节、抑制和/或预防(不同hRSV毒株和/或逃避突变型的)hRSV感染,调节、抑制和/或预防(不同hRSV毒株和/或逃避突变型)与靶宿主细胞(的细胞膜)的融合和/或调节、抑制和/或预防hRSV进入(不同hRSV毒株和/或逃避突变型的)靶宿主细胞。
同样地,本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物可以用于预防和/或治疗与hRSV感染相关的疾病和病症。基于本文中的公开内容,这样的与hRSV感染相关的疾病和病症的实例对于技术人员应该是清楚的,并且例如包括以下疾病和病症:呼吸系疾病(respiratoryillness),上呼吸道感染(upperrespiratorytractinfection),下呼吸道感染(lowerrespiratorytractinfection),细支气管炎(bronchiolitis)(肺中小气道炎症),肺炎(pneumonia),呼吸困难(dyspnea),咳嗽,(复发性)哮鸣(wheezing)和哮喘(asthma)。
因此,本发明还涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的呼吸系疾病,上呼吸道感染,下呼吸道感染,细支气管炎(肺中小气道炎症),肺炎,呼吸困难,咳嗽,(复发性)哮鸣和/或哮喘的方法,所述方法包括向有此需要的受试者施用药物活性量的至少一种本发明的氨基酸序列、本发明的 本发明的多肽、本发明的化合物或构建体或本发明的单价构建体、或本发明的组合物。
本发明还涉及本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体或本发明的单价构建体在制备用于预防和/或治疗呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和/或哮喘的药物组合物的用途;和/或在本文中所述一种或多种方法中使用的用途。
本发明还涉及本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体或本发明的单价构建体,其用于预防和/或治疗呼吸系疾病,上呼吸道感染,下呼吸道感染,细支气管炎(肺中小气道炎症),肺炎,呼吸困难,咳嗽,(复发性)哮鸣和/或哮喘。
由本文中的进一步公开内容,本发明的氨基酸序列、多肽和化合物和组合物的其他应用和用途对于技术人员将变得清楚。
附图简述
图1:竞争ELISA:Fab与纯化的结合RSV的和NumaxFab竞争与FTM-蛋白的结合,如在实施例8中所述。 202A5是结合流感HA的无关
图2:单价、二价和三价纳米抗体与FTM-蛋白的结合,如在实施例10中所述。
图3A和B:单价、二价和三价构建体中和Long和B-1RSV毒株的功效(RSV中和),如在实施例11中所述。
图4:用浓度范围在约2μM到6nM的单价7B2(A),15H8(B),NC41(C)和浓度范围在约20nM-100pM的三价RSV400(D),RSV404(E),RSV407(F)和RSV403(G)进行的对RSVLong和逃避突变型R7C2/1;R7C2/11和R7.936/4的中和测定。仅关于单价的数据进行曲线拟合。
图5:由具有不同接头长度的三价NC41中和RSVLong和RSVB-1毒株,如在实施例15中所述。
图6:在选定的NC41变体中引入的人源化残基的示意图。点表示存在野生型残基;字母对应于人源化残基。编号根据Kabat进行。
图7:本发明的优选人源化序列的比对。
图8:通过单价和三价人源化NC41变体中和hRSVLong和B-1毒株。在图8A中,通过两种所述三价人源化NC41变体(RSV414和RSV426)的中和与它们相应的单价进行比较。图8B显示通过三价NC41变体(RSV414,RSV426和RSV427)的中和。
图9:通过RSV407和RSV434中和hRSVLong(A)和B-1(B)毒株。
图10:如实施例21中所述在棉鼠模型中的RSV407的功效测试(预防性)。在RSV感染(第0天)前24小时(第-1天)用不同浓度的RSV407鼻内施用于大鼠。病毒滴度(左,平均值±sem,n=6)和病毒RNA水平(右)在肺灌洗液中,在病毒血症(viremia)峰水平时,即感染后第4天确定(在双尾斯氏t检验对比未处理中*=P<0.05)。
图11:如实施例21中所述在棉鼠模型中的RSV434的功效测试(治疗性)。大鼠在第0天用RSV感染并在第2天和第3天用0,1,2,4或20mg/kg的RSV434通过鼻内滴注治疗(n=6)。鼻内(A)和肺灌洗液(B)中的病毒滴度在病毒血症(viremia)峰水平(感染后第4天)时确定。水平线显示检测极限
发明详述
在本描述、实施例和权利要求中:
a)除非另外指明或限定,所用的所有术语具有它们在本领域内的通用意思,其对于熟练的技术人员应该是清楚的。例如,参考在WO08/020079的第46页的段落a)中提及的标准手册。
b)除非另外指明,术语“免疫球蛋白序列”,“序列”,“核苷酸序列”和“核酸”如在WO08/020079的第46页的段落b)中所述。
c)除非另外指明,所有没有具体详细描述的方法、步骤、技术和操作可以以本身已知的方式进行并且已经进行,这对于熟练的技术人员是清楚的。例如,仍旧参考标准手册,参考本发明所提及的公知背景技术,和参考其中所引用的其它参考文献;以及参考例如下述综述Presta,Adv.DrugDeliv.Rev.(高级药物递送综述)2006,58(5-6):640-56;Levin和Weiss,Mol.Biosyst.2006,2(1):49-57;Irving等,J.Immunol.Methods(免疫学方法杂志),2001,248(1-2),31-45;Schmitz等,Placenta,2000,21增刊.A,S106-12,Gonzales等,TumourBiol.(肿瘤生物学),2005,26(1),31-43,其描述了用于蛋白质加工的技术,诸如亲和力成熟,和用于提高蛋白如免疫球蛋白的特异性和其他需要的特性的其他技术。
d)氨基酸残基按照标准的三字母或一字母的氨基酸密码显示。参考在WO08/020079的第48页上的表A-2。
e)当认为核苷酸序列或氨基酸序列分别“包括”另一个核苷酸序列或氨基酸序列,或“基本由”另一个核苷酸序列或氨基酸序列“组成”时,其具有在WO08/020079的第51-52页上的段落i)给出的意义。
f)术语“(以)基本上分离的形式(存在)”具有在WO08/020079的第52和53页上的段落j)中给出的意义。
g)术语“结构域”和“结合结构域”具有在WO08/020079的第53页上的段落k)中给出的意义。
h)术语“抗原决定簇”和“表位”在本文中还可以互换地使用,具有在WO08/020079的第53页上的段落l)中给出的意义。
i)如在WO08/020079的第53页上的段落m)中进一步所述,对于特定的抗原决定簇、表位、抗原或蛋白(或对于至少其的一部分、片段或表位)可以(特异性)结合、具有亲和性和/或具有特异性的氨基酸序列(诸如本发明的纳米抗体、抗体、多肽,或通常为抗原结合蛋白或多肽或其片段)认为是“针对(against或directedagainst)”所述抗原决定簇、表位、抗原或蛋白。
j)术语“特异性”具有在WO08/020079的第53-56页上的段落n)中给出的意义;并且如本文提及是指特定的抗原-结合分子或抗原-结合蛋白(诸如本发明的或多肽)分子可以结合的许多不同类型的抗原或抗原决定簇的数目。一种抗原-结合蛋白的特异性可以依据亲和性和/或抗体亲抗原性(avidity)而确定。亲和性,如在WO08/020079(结合在本文中作为参考)的第53-56页中所述,其还描述用于测量在抗原结合分子(如本发明的或多肽)和相关抗原之间的结合的一些优选的技术。典型地,抗原-结合蛋白(诸如本发明的氨基酸序列、和/或多肽)将以10-5-10-12摩尔/升或更小、并且优选地10-7-10-12摩尔/升或更小并且更优选地10-8-10-12摩尔/升的解离常数(KD)(即,以105-1012升/摩尔或更大、并且优选地107-1012升/摩尔或更大、且更优选地108-1012升/摩尔的缔合常数(KA))而结合它们的抗原。任何大于104摩尔/升的KD值(或任何小于104M-1的KA值)升/摩尔通常认为指示非特异性结合。优选地,本发明的单价免疫球蛋白序列将以小于500nM、优选地小于200nM、更优选地小于10nM诸如例如10和5nM之间的亲和性与理想的抗原结合。抗原-结合蛋白与抗原或抗原决定簇的特异性结合可以以本身已知的任何适当的方法确定,其包括,例如,斯卡查德分析和/或竞争结合检测,诸如放射性免疫测定(RIA)、酶免疫测定(EIA)和夹心式(sandwich)竞争测定,和本领域本身已知的其不同的变化;以及本文提及的其它技术。如技术人员清楚的,并且如在WO08/020079的第53-56页上所述,解离常数可以是实际的或表观解离常数。确定解离常数的方法对于熟练的技术人员应该是清楚的,并且例如,包括WO08/020079的第53-56页上提及的技术。
k)本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的半衰期通常可以如在WO08/020079的第57页上的段落o)所述,并且如在其中提及的是指所述氨基酸序列、化合物或多肽的血清浓度在体内减少50%所花费的时间,例如,由于所述氨基酸序列、化合物或多肽的降解和/或通过天然机制对所述氨基酸序列、化合物或多肽的清除或螯合(sequestration)。本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的体内半衰期可以以本身已知的任何方式确定,诸如通过药物动力学分析。适当的技术对于本领域熟练的技术人员应该是清楚的,并且可以通常例如在WO08/020079的第57页上的段落o)所述。如在WO08/020079的第57页上的段落o)所述,半衰期可以使用参数如t1/2-α,t1/2-β和曲线下面积(AUC)表示。例如,参考下述实验部分,以及标准手册,诸如Kenneth,A等:药物的化学稳定性:药剂师手册(ChemicalStabilityofPharmaceuticals:AHandbookforPharmacists)和Peters等,药物动力学分析:实践方法(Pharmacokineteanalysis:APracticalApproach)(1996)。还参考"药物动力学(Pharmacokinetics)",MGibaldi和DPerron,MarcelDekker出版,第2综述版(2ndRev.edition)(1982)。术语“半衰期增加”或“增加的半衰期”也如WO08/020079的第57页段落o)所定义,并且特别是指t1/2-β的增加,具有或不具有t1/2-α和/或AUC或二者的增加。
l)关于靶标或抗原,术语在所述靶标或抗原上的“相互作用位点”意指在所述靶标或抗原上的位点、表位、抗原决定簇、部分、结构域或氨基酸残基片段,其是所述靶标或抗原的用于结合受体或其他结合配偶体的位点、催化位点、分解位点、别构相互作用的位点、参与多聚体化(如同源多聚体化或异源多聚体化)的位点;或是在所述靶标或抗原上的参与所述靶标或抗原的生物学作用或机制的任何其他位点、表位、抗原决定簇、部分、结构域或氨基酸残基片段。更一般地,“相互作用位点”可以是在所述靶标或抗原上的本发明的氨基酸序列或多肽可以与之结合的任何位点、表位、抗原决定簇、部分、结构域或氨基酸残基片段,以致调节(如本文定义)所述靶标或抗原(和/或其中涉及所述靶标或抗原的任何途径、相互作用、信号传导、生物学机制或生物学作用)。
m)认为这样的氨基酸序列或多肽是对第一靶标或抗原“特异性的”:即,与第二靶标或抗原相比较,当与第一抗原以是所述氨基酸序列或多肽与第二靶标或抗原结合的亲和力的至少10倍、如至少100倍、且优选至少1000倍、且多至10000倍或更多的亲和力(如上述,且适当表示为KD值、KA值、koff-速率和/或kon-速率)结合时。例如,氨基酸序列或多肽可以以比所述氨基酸序列或多肽与所述第二靶标或抗原结合的KD小至少10倍、如小至少100倍、且优选小至少1000倍、如小10000倍或者甚至更小的KD值结合所述第一靶标或抗原。优选地,当氨基酸序列或多肽与第二靶标或抗原相比较对第一靶标或抗原是“特异性的”时,它针对(如本文定义)所述第一靶标或抗原,但是不针对所述第二靶标或抗原。
n)术语“交叉阻断(cross-block)”,“(被)交叉阻断的(cross-blocked)”和“交叉阻断(cross-blocking)”在本文可以互换使用,用来意指氨基酸序列或其他结合试剂(如本发明的多肽)干扰本发明的其他氨基酸序列或结合试剂与给定靶标的结合的能力。本发明的氨基酸序列或其他结合试剂能够干扰另一种对靶标的结合的程度,且因此其能否被认为是本发明所述的交叉阻断的,可以使用竞争结合测定法确定。一种特别适当的定量交叉阻断测定法使用Biacore机器,其可以使用表面等离子体共振技术测量相互作用的程度。另一种适当的定量交叉阻断测定法使用基于ELISA的方法来测量氨基酸序列或其他结合试剂之间对于它们与所述靶标的结合的竞争。
以下概括描述用于确定氨基酸序列或其他结合试剂是否交叉阻断或按照本发明能够交叉阻断的适当的Biacore测定法。应该理解,所述测定法可以与本文所述的任何氨基酸序列或其他结合试剂一起使用。按照供应商的建议使用Biacore机器(例如,Biacore3000)。因此,在一种交叉阻断测定法中,使用标准胺偶联化学将目标蛋白偶联到CM5Biacore芯片上,以产生由所述靶标包被的表面。典型地,200-800个共振单位的靶标将被偶联到芯片上(易于给出可测量水平的结合但是易于被所用的测试试剂的浓度饱和的量)。将两种待检测它们彼此交叉阻断的能力的测试氨基酸序列(称为A*和B*)以结合位点1:1摩尔比例混合在适当的缓冲液中,以产生测试混合物。当基于结合位点计算浓度时,假设氨基酸序列的分子量是氨基酸序列的总分子量除以所述氨基酸序列上的靶标结合位点的数目。测试混合物中每种氨基酸序列的浓度应该足够高,足以易于饱和所述氨基酸序列关于捕获在Biacore芯片上的靶标分子的结合位点。在所述混合物中的氨基酸序列处于相同的摩尔浓度(基于结合),且所述浓度典型地为1.00–1.5微摩尔(基于结合)。还制备仅包含A*和仅包含B*的分开的溶液。在这些溶液中的A*和B*应该处在与在所述测试混合物中相同的缓冲液中和相同的浓度。将测试混合物通过靶标-包被的Biacore芯片,且记录结合的总量。然后,以这样的方式处理芯片,以在不损坏芯片-结合的靶标的条件下去除结合的氨基酸序列。典型地,这通过用30mMHCl处理芯片60秒进行。然后,将仅有A*的溶液通过靶标-包被的表面,并记录结合的量。同样处理芯片,以在不损坏芯片-结合的靶标的条件下去除所有结合的氨基酸序列。然后,将仅有B*的溶液通过靶标-包被的表面,并记录结合的量。接着计算A*和B*混合物的最大理论结合,且为每种氨基酸序列在单独通过靶标表面时的结合的总和。如果实际记录的混合物的结合小于该理论最大值,则该两种氨基酸序列彼此是交叉阻断的。因此,通常,按照本发明的交叉阻断的氨基酸序列或其他结合试剂是一种将在上述Biacore交叉阻断测定法中与靶标结合的氨基酸序列或结合试剂,以致在该测定法中且在存在本发明的第二氨基酸序列或其他结合试剂时,所记录的结合是组合的两种氨基酸序列或结合试剂的最大理论结合(如上文定义)的80%-0.1%(例如,80%-4%),特别地是最大理论结合的75%-0.1%(例如,75%-4%),且更特别地是最大理论结合的70%-0.1%(例如,70%-4%)。上述Biacore测定法是用来确定氨基酸序列或其他结合试剂彼此是否是按照本发明交叉阻断的主要测定法。在很少的情形中,特定的氨基酸序列或其他结合试剂可能不与通过胺化学偶联到CM5Biacore芯片上的靶标结合(这通常在靶标上的相关结合位点通过与芯片的偶联而被遮蔽或破坏时发生)。在这样的情形中,交叉阻断可以使用标记形式的靶标,例如N端His-标记的形式确定。以这种特定的形式,抗-His氨基酸序列将被偶联到Biacore芯片上,然后将His-标记的靶标通过芯片表面,并被所述抗-His氨基酸序列捕获。交叉阻断分析将基本上按照上述进行,除了在每次芯片再生循环之后,新的His-标记的靶标将被重新负载到抗-His氨基酸序列包被的表面上。除了使用N端His-标记的靶标给出的实例之外,可以备选地使用C端His-标记的靶标。此外,本领域已知的各种其他标记和标记结合蛋白组合可以用于这样的交叉阻断分析(例如,具有抗-HA抗体的HA标记;具有抗-FLAG抗体的FLAG标记;具有链霉抗生物素蛋白的生物素标记)。
下述概括描述用于确定针对靶标的氨基酸序列或其他结合试剂是否如本文所定义那样交叉阻断或能够交叉阻断的ELISA测定法。应该理解,所述测定法可以与本文所述的任何氨基酸序列(或其他结合试剂,如本发明的多肽)一起使用。本测定法的一般原理是使得针对所述靶标的氨基酸序列或结合试剂包被到ELISA平板的孔上。将过量的量的第二潜在交叉阻断的抗-靶标氨基酸序列添加到溶液中(即,不与ELISA平板结合)。然后将有限量的靶标添加到孔中。所述包被的氨基酸序列和溶液中的氨基酸序列竞争与有限量的靶标分子的结合。洗涤平板,以去除未与包被的氨基酸序列结合的过量的靶标,且还去除第二溶液相氨基酸序列以及在所述第二溶液相氨基酸序列和靶标之间形成的任何复合物。然后,使用适于检测所述靶标的试剂测量结合的靶标的量。相对于在不存在第二溶液相的氨基酸序列的条件下所述包被的氨基酸序列可以结合的靶标分子的数量,溶液中能够交叉阻断所包被的氨基酸序列的氨基酸序列将能够引起所述包被的氨基酸序列可以结合的靶标分子的数量的减少。在其中选择第一氨基酸序列如Ab-X作为固定的氨基酸序列的情形中,它被包被到ELISA平板的孔上,之后使用适当的封闭溶液来封闭该平板,以最小化随后添加的试剂的非特异性结合。然后,将过量的量的第二氨基酸序列即Ab-Y添加到该ELISA平板中,以致每孔Ab-Y靶标结合位点的摩尔数比在包被所述ELISA平板的过程中每孔所用的Ab-X靶标结合位点的摩尔数高至少10倍。然后,加入靶标,以致每孔加入的靶标的摩尔数比用于包被每孔的Ab-X靶标结合位点的摩尔数低至少25倍。在适当的温育时间之后,洗涤ELISA平板,且加入用于检测所述靶标的试剂,以测量由所述包被的抗-靶标氨基酸序列(在该情形中为Ab-X)特异结合的靶标的量。关于该测定法的背景信号定义为在使用所述包被的氨基酸序列(在该情形中为Ab-X)、第二溶液相氨基酸序列(在该情形中为Ab-Y)、仅有靶标缓冲剂(即,无靶标)和靶标检测试剂的孔中获得的信号。关于该测定法的阳性对照信号定义为在使用所述包被的氨基酸序列(在该情形中为Ab-X)、仅有第二溶液相氨基酸序列缓冲剂(即,无第二溶液相氨基酸序列)、靶标和靶标检测试剂的孔中获得的信号。该ELISA测定法可以以这样的方式运行,以使得阳性对照信号是背景信号的至少6倍。为了避免由选择哪种氨基酸序列用作包被氨基酸序列和哪种用作第二(竞争剂)氨基酸序列导致的任何假象(例如,Ab-X和Ab-Y之间对于靶标的显著不同的亲和力),该交叉阻断测定法可以以两种形式运行:1)形式1是其中Ab-X是包被到ELISA平板上的氨基酸序列,Ab-Y是在溶液中的竞争氨基酸序列,和2)形式2是其中Ab-Y是包被到ELISA平板上的氨基酸序列,Ab-X是在溶液中的竞争氨基酸序列。如果在形式1或在形式2中,与在不存在溶液相抗-靶标氨基酸序列的条件下(即,阳性对照孔)获得的靶标检测信号相比较,所述溶液相抗-靶标氨基酸序列能够引起靶标检测信号(即,由所述包被的氨基酸序列结合的靶标的量)减少60%-100%,特别地70%-100%,且更特别地80%-100%,则Ab-X和Ab-Y被定义为是交叉阻断的。
o)如果氨基酸序列对于这两种不同的抗原或抗原决定簇是特异性的(如本文定义),则认为氨基酸序列对于两种不同的抗原或抗原决定簇(如例如来自哺乳动物的两个不同物种的血清白蛋白,如例如人血清白蛋白和食蟹猴(cyno)血清白蛋白,如例如hRSV的不同毒株的蛋白F,如例如hRSV的不同逃避突变型的蛋白F)是“交叉反应的”。
p)如本文进一步所述,中氨基酸残基总数可以在110-120区间,优选112-115,并且最优选113。然而,应该注意的部分、片段、类似物或衍生物(如本文进一步所述)不特别局限于它们的长度和/或大小,只要这样的部分、片段、类似物或衍生物满足本发明列出的深层要求,并且还优选地适于本文所述的目的;
q)如在WO08/020079(结合在本文作为参考)的第58和第59页的段落q)中进一步所述,的氨基酸残基按照Kabat等(“免疫学目的蛋白的序列(Sequenceofproteinsofimmunologicalinterest)”,美国公众健康服务中心(USPublicHealthServices),NIHBethesda,MD,PublicationNo.91)给出的关于VH结构域的通用编号方式进行编号,这种编号方式在Riechmann和Muyldermans,免疫学方法杂志(J.Immunol.Methods)2000年6月23日;240(1-2):185-195的文章中用于来自骆驼科动物的VHH结构域(例如,参见该公布的图2),并且因此的FR1包括位置1-30的氨基酸残基,的CDR1包括位置31-35的氨基酸残基, 的FR2包括位置36-49的氨基酸,的CDR2包括位置50-65的氨基酸残基,的FR3包括位置66-94的氨基酸残基, 的CDR3包括位置95-102的氨基酸残基,以及,的FR4包括位置103-113的氨基酸残基。
r)在本发明的上下文中,“(病毒的)靶宿主细胞”通常是指特定的细胞,其是或来自活的受试体并且对于所述病毒的感染敏感。
s)术语“病毒的感染性”,用于本文时,指当暴露于所述病毒时,实际上被所述病毒所感染的活的受试者的比例。
t)术语“病毒的中和”,用于本文时,指通过中和化合物与病毒体的结合来调节和/或减少和/或预防和/或抑制病毒的感染性(如本文定义),如使用适合的体外、细胞或体内测定法(诸如例如由Anderson等1985(J.Clin.Microbiol.(临床微生物学杂志)22:1050-1052)和1988(J.Virol.(病毒学杂志)62:4232-4238所述的微量中和测定法),这些测定法的改进诸如例如实施例6中所述的那些;如例如由Johnson等1997(J.Inf.Dis.(传染病杂志)176:1215-1224)所述的空斑数减少测定法,及其改进和本文中提及的那些)所测量的。具体地,“中和(病毒)(neutralizing(avirus))”或“中和(病毒)(toneutralize(avirus))”可以意为调节、减少、防止或抑制病毒的感染性(如本文定义),如使用适合的体外、细胞或体内测定法(如本文提及的那些)所测量的,与在相同的条件下,但不存在本发明的氨基酸序列、或多肽的情况下,在相同的测定法中,病毒的正常(即天然存在)的感染性(如本文定义)相比,所述调节、减少、防止或抑制病毒的感染性至少1%,优选地至少5%,如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%或更多。
u)术语“本发明的氨基酸的效力”、“本发明的的效力”、“本发明的多肽的效力”、和/或“本发明的化合物或构建体的效力”,用于本文中时,指所述本发明的氨基酸、本发明的本发明的多肽、和/或本发明的化合物或构建体中和具体病毒(诸如例如hRSV),调节、抑制和/或预防病毒感染性,调节、抑制和/或预防病毒与靶宿主细胞(的细胞膜)融合,和/或调节、抑制和/或预防病毒进入靶宿主细胞(如本文定义)的能力。所述效力可以通过本领域中已知或本文中所述的任何合适的测定法,诸如例如实施例部分中所述的微量中和测定法和/或要点t)中提及的测定法来测定。
v)术语“病毒附着”,用于本文中时,是病毒(例如hRSV)与靶宿主细胞直接(例如通过与病毒受体的相互作用)或间接(例如通过介导一种或多种其他蛋白或分子与病毒受体的相互作用)附着。
w)术语“病毒融合”,用于本文中时,是病毒(例如hRSV)与靶宿主细胞直接(例如通过与靶宿主细胞的膜化合物相互作用)或间接(例如通过介导一种或多种其他蛋白或分子与靶宿主细胞的膜化合物的相互作用)的融合。
x)术语“病毒进入”用于本文时,包括完成病毒体附着于靶宿主细胞和/或病毒融合于靶宿主细胞所需要的任何病毒介导的生物学途径。
y)“氨基酸残基片段”意指彼此邻近或彼此紧密邻近,即处于氨基酸序列的一级或三级结构的两个或更多氨基酸残基。在本发明的上下文中,“氨基酸残基片段”应该(至少部分地)负责本发明的氨基酸序列、 多肽、化合物或构建体与hRSV的蛋白F上的抗原位点II的结合。
z)当比较两种氨基酸序列(或两种CDR序列)时,术语“氨基酸差异”是指分别与a),c)或e)的氨基酸残基片段(或CDR序列)相比,在b),d)或f)中指定的氨基酸残基片段(或CDR序列)的位置上的单个氨基酸残基的插入、缺失或置换;这被理解为分别与a),c)或e)的氨基酸残基片段相比,b),d)和f)的氨基酸残基片段(或CDR序列)可以包含1个、2个或最多3个这样的氨基酸差异。
“氨基酸差异”可以是任何一个、两个或最多三个置换、缺失和/或插入,或它们的任何组合,其改善本发明的氨基酸序列的性质,或至少不将本发明的氨基酸序列的所需性质或所需性质的平衡或组合损伤过多。在这方面,与包括所述一个或多个氨基酸残基片段但没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失和/或插入的氨基酸序列相比,所获得的本发明的氨基酸序列应当至少以相同、大约相同或更高的亲和性结合hRSV的蛋白F,所述亲和性通过表面等离子共振测量;和/或与包括所述一个或多个氨基酸残基片段但没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失和/或插入的氨基酸序列相比,所获得的本发明的氨基酸序列应当至少具有相同、大约相同或更高的效力。本领域技术人员通常能够基于本文中的公开内容和任选地在有限程度常规实验(这可以例如包括引入有限数量的可能的置换、缺失或插入并且确定它们对如此获得的氨基酸序列的性质的影响)后,确定和选择适当的置换、缺失和/或插入,或它们的合适组合。
例如,并取决于用于表达本发明的氨基酸序列的宿主生物体,这样的缺失和/或置换可以以这样的方式来设计,所述方式是去除一个或多个用于翻译后修饰的位点(诸如一个或多个糖基化位点),这是属于本领域中技术人员能力范围内的。
在本发明的优选方面,“氨基酸差异”是氨基酸置换。氨基酸置换可以是任何一个、两个或最多三个置换,其改善本发明的氨基酸序列的性质,或至少不将本发明的氨基酸序列的所需性质或所需性质的平衡或组合损伤过多。在这方面,与包括所述一个或多个氨基酸残基片段但没有所述一个、两个或最多三个置换的氨基酸序列相比,所获得的本发明的氨基酸序列应当至少以相同、大约相同或更高的亲和性结合hRSV的蛋白F,所述亲和性通过表面等离子共振测量;和/或与包括所述一个或多个氨基酸残基片段但没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失和/或插入的氨基酸序列相比,所获得的本发明的氨基酸序列应当至少具有相同、大约相同或更高的效力。本领域技术人员通常能够基于本文中的公开内容和任选地在有限程度常规实验(这可以例如包括引入有限数量的可能的置换并且确定它们对如此获得的的性质的影响)后,确定和选择适当的置换。
所述一个或多个氨基酸残基片段中的氨基酸置换可以是保守氨基酸置换。“保守”氨基酸置换一般是这样的氨基酸置换,其中氨基酸残基被具有相似化学结构的另一种氨基酸残基取代,并且其对获得的氨基酸序列的功能、活性或其它生物学特性几乎没有或者基本上没有影响。这种保守氨基酸置换是本领域内公知的,例如WO04/037999,GB-A-3357768,WO98/49185,WO00/46383和WO01/09300中可知;并且可以基于WO04/037999以及WO98/49185和其中所引用的其它参考文献的相关教导而选择这种置换的(优选)类型和/或结合。
所述保守置换优选地是这样的置换,即,其中下列组(a)–(e)内的一个氨基酸被同组内的另一氨基酸残基置换:(a)小的脂肪族、非极性或弱极性的残基:Ala,Ser,Thr,Pro和Gly;(b)极性、带负电荷的残基及其(不带电荷的)酰胺:Asp,Asn,Glu和Gln;(c)极性、带正电荷的残基:His,Arg和Lys;(d)大的脂肪族、非极性残基:Met,Leu,Ile,Val和Cys;以及(e)芳族残基:Phe,Tyr和Trp。
特别优选的保守置换如下:Ala置换成Gly或置换成Ser;Arg置换成Lys;Asn置换成Gln或置换成His;Asp置换成Glu;Cys置换成Ser;Gln置换成Asn;Glu置换成Asp;Gly置换成Ala或置换成Pro;His置换成Asn或置换成Gln;Ile置换成Leu或置换成Val;Leu置换成Ile或置换成Val;Lys置换成Arg,置换成Gln或置换成Glu;Met置换成Leu,置换成Tyr或置换成Ile;Phe置换成Met,置换成Leu或置换成Tyr;Ser置换成Thr;Thr置换成Ser;Trp置换成Tyr;Tyr置换成Trp;和/或Phe置换成Val,置换成Ile或置换成Leu。
所述一个或多个氨基酸残基片段中的氨基酸置换可以为氨基酸序列提供关于结合hRSV的蛋白F的增加的亲和性。这可以通过技术诸如随机诱变或定点诱变和/或本身已知的其他亲和性成熟技术,诸如例如WO09/004065,WO05/003345,WO06/023144,EP527809,EP397834中描述的那些来进行。
非限制性地,用于置换CDRs中的氨基酸残基的规则(部分或完全遵循的规则)可以如下所示(即用具有类似侧链化学性质的氨基酸置换):
-K被以下置换:R;
-R被以下置换:K;
-A被以下置换:S或T;
-S被以下置换:A或T;
-T被以下置换:A或S;
-I被以下置换:L或V;
-L被以下置换:I或V;
-V被以下置换:I或L;
-F被以下置换:Y;
-Y被以下置换:F;
-N被以下置换:D;
-D被以下置换:N;
-Q被以下置换:E;
-E被以下置换:Q;
-G被以下置换:A;
-M被以下置换:L;
-H,C,W和P保持不变。
此外,也是非限制性的,用于置换CDRs中的氨基酸残基的规则(部分或完全遵循的规则)可以备选地如下所示用于置换位置27至35和位置50至58(使用Kabat编号系统),
其中对于位置27至35:
-位置27(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:F;G;R;S;F,G,R,S中的2个;F,G,R,S中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置28(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:A;I;S;T;A,I,S,T中的2个;A,I,S,T中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置29(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:F;G;L;S;F,G,L,S中的2个;F,G,L,S中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置30(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;G;S;T;D,G,S,T中的2个;D,G,S,T中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置31(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;I;N;S;T;D,I,N,S,T中的2个;D,I,N,S,T中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置32(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;N;Y;D,N,Y中的2个;或它们全部,优选它们全部;
-位置33(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:A;G;T;V;A,G,T,V中的2个;A,G,T,V中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置34(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:I;M;或它们全部,优选它们全部;
-位置35(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:A;G;S;A,G,S中的2个;或它们全部,优选它们全部;
并且对于位置50至58(如果原始氨基酸序列在位置52a(使用Kabat编号)具有氨基酸序列),
-位置50(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:A;C;G;S;T;A,C,G,S,T中的2个;A,C,G,S,T中的3个;A,C,G,S,T中的4个;或它们全部,优选它们全部;
-位置51(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:I;
-位置52(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:N;R;S;T;N,R,S,T中的2个;N,R,S,T中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置52a(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:R;S;T;W;R,S,T,W中的2个;R,S,T,W中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置53(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;G;N;S;T;D,G,N,S,T中的2个;D,G,N,S,T中的3个;D,G,N,S,T中的4个;或它们全部,优选它们全部;
-位置54(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;G;或它们全部,优选它们全部;
-位置55(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;G;S;D,G,S中的2个;或它们全部,优选它们全部;
-位置56(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:I;N;R;S;T;I,N,R,S,T中的2个;I,N,R,S,T中的3个;I,N,R,S,T中的4个;或它们全部,优选它们全部;
-位置57(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:T;
-位置58(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;H;N;S;Y;D,H,N,S,Y中的2个;D,H,N,S,Y中的3个;D,H,N,S,Y中的4个;或它们全部,优选它们全部;
并且其中对于位置50至58(如果原始氨基酸序列在位置52a(使用Kabat编号)不具有氨基酸序列),
-位置50(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:A;G;R;S;T;A,G,R,S,T中的2个;A,G,R,S,T中的3个;A,G,R,S,T中的4个;或它们全部,优选它们全部;
-位置51(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:I;
-位置52(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:N;S;T;N,S,T中的2个;或它们全部,优选它们全部;
-位置53(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:N;R;S;T;Y;N,R,S,T,Y中的2个;N,R,S,T,Y中的3个;N,R,S,T,Y中的4个;或它们全部,优选它们全部;
-位置54(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;G;R;S;D,G,R,S中的2个;D,G,R,S中的3个;或它们全部,优选它们全部;
-位置55(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:G;
-位置56(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:G;N;R;S;T;D,N,R,S,T中的2个;D,N,R,S,T中的3个;D,N,R,S,T中的4个;或它们全部,优选它们全部;
-位置57(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:T;
-位置58(使用Kabat编号)的原始氨基酸残基被以下置换:D;N;T;Y;D,N,T,Y中的2个;D,N,T,Y中的3个;或它们全部,优选它们全部。
之后可以将这样确定的一个或多个潜在有效的置换(或其组合)引入所述CDR序列(以任何本身已知的方式,如本文进一步描述),并且可以检测获得的氨基酸序列对hRSV的蛋白F的亲和性,和/或其它所需性质,诸如例如改善的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力。如此,通过有限程度的试错,基于本文的公开内容,本领域技术人员可以确定CDRs中其它适当的置换(或其适当组合)。
包括具有一个、两个或最多三个置换、插入或缺失的氨基酸残基片段的氨基酸序列,和编码其的核酸序列可以以任何本身已知的方式,例如使用WO08/020079的第103页和第104页上提及的一种或多种技术来提供。
获得的本发明的氨基酸序列应该优选以如本文中定义的亲和性(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)来结合hRSV的蛋白F和/或以如本文中定义的功效和/或效力来中和hRSV。
aa)当比较两个氨基酸序列时,术语“氨基酸差异”是指与第二个氨基酸序列相比较,在第一个氨基酸序列的某个位置上插入、缺失或置换单个氨基酸残基;应当理解,两个氨基酸序列可以含有一个、两个或最多三个这样的氨基酸差异。
“氨基酸差异”可以是氨基酸序列中,即在一个或多个构架区中或在一个或多个CDRs中(其可以在本发明的CDR中(即在CDR2中)或在另一个CDR中(即在CDR1,CDR2或CDR3中))的任何一个、任何两个或最多任何三个置换、缺失或插入,或它们的任何组合,其改善本发明的氨基酸序列的性质,或至少不将本发明的氨基酸序列的所需性质或所需性质的平衡或组合损伤过多。在这方面,与没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失或插入的氨基酸序列相比,所获得的本发明的氨基酸序列应当至少以相同、大约相同或更高的亲和性结合hRSV的蛋白F,所述亲和性通过表面等离子共振测量;和/或与没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失和/或插入的氨基酸序列相比,所获得的本发明的氨基酸序列应当至少具有相同、大约相同或更高的效力。本领域技术人员通常能够基于本文中的公开内容和任选地在有限程度常规实验(这可以例如包括引入有限数量的可能的置换、缺失或插入并且确定它们对如此获得的氨基酸序列的性质的影响)后,确定和选择适当的置换、缺失或插入,或它们的合适组合。
在本发明的一个方面,“氨基酸差异”是氨基酸置换。氨基酸置换可以是在一个或多个构架区中或一个或多个CDRs中(其可以在本发明的CDR中(即在CDR2中)或在另一个CDR中(即在CDR1,CDR2或CDR3中))的任何一个、两个或最多三个置换,或它们的任何组合,其改善本发明的氨基酸序列的性质,或至少不将本发明的氨基酸序列的所需性质或所需性质的平衡或组合损伤过多。在这方面,与没有所述一个、两个或最多三个置换的氨基酸序列相比,所获得的本发明的氨基酸序列应当至少以相同、约相同或更高的亲和性结合hRSV的蛋白F,所述亲和性通过表面等离子共振测量;和/或与没有所述一个、两个或最多三个置换的氨基酸序列相比,所获得的本发明的氨基酸序列应当至少具有相同、大约相同或更高的效力。本领域技术人员通常能够基于本文中的公开内容和任选地在有限程度常规实验(这可以例如包括引入有限数量的可能的置换并且确定它们对如此获得的氨基酸序列的性质的影响)后,确定和选择适当的置换。
如上所述,所述置换、插入或缺失可以在一个或多个构架区中和/或在一个或多个CDR中。如上所讨论(见以上要点z)),在一个或多个CDR中的氨基酸置换可以是任何置换,诸如“保守置换”(如本文定义),其可以由特定规则推动(如本文定义),和/或它可以将改善的性质引入所获得的氨基酸序列。
当这些置换、插入或缺失是在一个或多个构架区中进行的时候,它们可以在一个或多个标志残基(如例如在WO08/020079中所定义;表A-3至A-8)处和/或在构架残基中一个或多个其它位置处进行,尽管在标志残基处的置换、插入或缺失通常是较不优选的(除非这些是如本文所述的适当的人源化置换)。作为非限制性的实例,置换例如可以是保守置换(如本文所述)和/或氨基酸残基可以被天然存在于另一个VHH结构域中相同位置的另一个氨基酸残基替换(参见WO08/020079,表A-5至A-8),尽管本发明通常不限于此。
(优选)在一个或多个构架区中进行的置换、插入或缺失可以是人源化置换(即将天然存在的VHH序列的氨基酸序列中(和具体地在构架区中)的一个或多个氨基酸残基取代为在来自人的常规4-链抗体的VH结构域中相应位置处存在的一个或多个氨基酸残基)。基于本文公开的内容,一些优选但是非限制性的人源化置换(及其适当组合)对于本领域技术人员是清楚的。通过将在a)中定义的本发明的氨基酸序列之一的构架区序列和一个或多个紧密相关的人VH序列的相应构架序列进行比较,可以确定潜在有效的人源化置换,之后可以将如此确定的一个或多个潜在有效的人源化置换(或其组合)引入在a)中定义的本发明的所述氨基酸序列(以本身已知的任何方式,如本文进一步描述),并且可以检测获得的人源化氨基酸序列与hRSV的蛋白F的亲和性、稳定性、表达容易性和水平、和/或本文定义的其它理想性质。如此,通过有限程度的试错,基于本文的公开内容,本领域技术人员可以确定其它适当的人源化置换(或其适当组合)。
所述人源化置换应该这样选择,以致所得到的人源化的氨基酸序列和/或仍然保留如本文所定义的的有利特性。基于本文的公开内容,并且任选地在有限程度的常规实验(这可以例如包括引入有限数量的可能的人源化置换,并且确定它们对这样获得的的特性的影响)之后,熟练的技术人员通常能够确定并选择适当的人源化置换或适当的人源化置换的组合。
一般地,作为人源化的结果,本发明的氨基酸序列和/或可以变得更加“人-样”,同时仍然保留如本发明所述的本发明的的有利特性。结果,与相对应的天然存在的VHH结构域相比,这样人源化的氨基酸序列和/或可以具有一些优点,诸如减小的免疫原性。同样,基于本发明的公开内容,并且任选在有限程度的常规实验之后,熟练的技术人员应该能够选择人源化置换或适当的人源化置换组合,其最优化或获得一方面在通过人源化置换提供的有利特性和另一方面在天然存在的VHH结构域的有利特性之间的理想的或适当的平衡。
本发明的氨基酸序列和/或可以在任何构架残基处被适当人源化,诸如在一个或多个标志残基处(如本文所定义)或在一个或多个其它构架残基处(即,非标志残基)或它们的任何适当的组合。关于“P,R,S-103组”或“KERE组”(如WO08/020079中定义)的的一个优选的人源化置换是将Q108置换成L108。
取决于用于表达本发明的氨基酸序列、或多肽的宿主生物体,所述缺失和/或置换也可以以这样的方式设计,所述方式去除一个或多个翻译后修饰的位点(诸如一个或多个糖基化位点),这应该在本领域技术人员的能力范围内。备选地,可以设计置换或插入,以引入一个或多个附着官能团(如本文所述)的位点,例如,以允许位点-特异性的聚乙二醇化(pegylation)(同样如本文所述)。
从在WO08/020079的表A-5–A-8中提供的关于VHH熵和VHH可变性的数据可以看出,在构架区中的一些氨基酸残基比其它的更保守。通常,尽管本发明在其最广泛意义上不限于此,优选在较不保守的位置进行任何置换、缺失或插入。此外,通常,氨基酸置换优于氨基酸缺失或插入。
用于本文所述的多肽的任何氨基酸置换还可以基于Schulz等,蛋白质结构原理(PrinciplesofProteinStructure),Springer-Verlag,1978研究的不同物种的同源蛋白之间的氨基酸变异频率的分析,基于Chou和Fasman,生物化学(Biochemistry)13:211,1974和高级酶学(Adv.Enzymol.),47:45-149,1978研究的结构形成潜力的分析,和基于Eisenberg等,美国国家科学院学报(Proc.Nad.Acad.Sci.USA)81:140-144,1984;Kyte和Doolittle;分子生物学杂志(JMolec.Biol.).157:105-132,1981,以及Goldman等,物理化学综述年刊(Ann.Rev.Biophys.Chem.).15:321-353,1986研究的蛋白中疏水模式的分析,所有这些通过引用完全结合于此。在本文描述和上文引用的公知背景技术中给出关于的一级、二级和三级结构的信息。此外,出于这一目的,例如,Desmyter等,自然结构生物学(NatureStructuralBiology),卷3,9,803(1996);Spinelli等,自然结构生物学(NaturalStructuralBiology)(1996);3,752-757;和Decanniere等,结构(Structure),卷7,4,361(1999)给出来自美洲驼(llama)的VHH结构域的晶体结构。关于在常规VH结构域中形成VH/VL界面的一些氨基酸残基和在这些位置的潜在的骆驼源化(camelizing)置换的其它信息可以在上文引用的现有技术中找到。
具有一个、两个或最多三个置换、插入或缺失的氨基酸序列和/或 以及编码其的核酸序列,可以以本身已知的任何方式,例如使用在WO08/020079的第103页和104页上提及的一种或多种技术来提供。
获得的本发明的氨基酸序列和/或应该优选以如本文中定义的亲和性(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)来结合hRSV的蛋白F;和/或以如本文中定义的功效和/或效力来中和hRSV。
bb)当比较两个多肽时,术语“氨基酸差异”是指与第二个多肽相比较,在第一个多肽的某个位置上插入、缺失或置换单个氨基酸残基;应当理解,两个多肽可以含有一个、两个或最多三个这样的氨基酸差异。
“氨基酸差异”可以是多肽中,即在一个或多个构架区中或在一个或多个CDRs中(其可以在本发明的CDR中(即在CDR2中)或在另一个CDR中(即在CDR1,CDR2或CDR3中))的任何一个、任何两个或最多任何三个置换、缺失或插入,或它们的任何组合,其改善本发明的多肽的性质,或至少不将本发明的多肽的所需性质或所需性质的平衡或组合损伤过多。在这方面,与没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失或插入的多肽相比,所获得的本发明的多肽应当至少以相同、大约相同或更高的亲和性结合hRSV的蛋白F,所述亲和性通过表面等离子共振测量;和/或与没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失和/或插入的多肽相比,所获得的本发明的多肽应当至少具有相同、大约相同或更高的效力。获得的多肽应该优选以如本文中定义的亲和性(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)来结合hRSV的蛋白F;和/或以如本文中定义的功效和/或效力来中和hRSV。本领域技术人员通常能够基于本文中的公开内容和任选地在有限程度常规实验(这可以例如包括引入有限数量的可能的置换、缺失或插入并且确定它们对如此获得的多肽的性质的影响)后,确定和选择适当的置换、缺失或插入,或它们的合适组合。
在本发明的一个方面,“氨基酸差异”是氨基酸置换。氨基酸置换可以是在构架区中或一个或多个CDRs中(其可以在本发明的CDR中(即存在于CDR2中)或在另一个CDR中(即在CDR1,CDR2或CDR3中))的任何一个、任何两个或最多任何三个置换,或它们的任何组合,其改善本发明的多肽的性质,或至少不将本发明的多肽的所需性质或所需性质的平衡或组合损伤过多。在这方面,与没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失或插入的多肽相比,所获得的本发明的多肽应当至少以相同、约相同或更高的亲和性结合hRSV的蛋白F,所述亲和性通过表面等离子共振测量;和/或与没有所述一个、两个或最多三个置换、缺失和/或插入的多肽相比,所获得的本发明的多肽应当至少具有相同、大约相同或更高的效力。获得的多肽应该优选以如本文中定义的亲和性(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)来结合hRSV的蛋白F;和/或以如本文中定义的功效和/或效力来中和hRSV。本领域技术人员通常能够基于本文中的公开内容和任选地在有限程度常规实验(这可以例如包括引入有限数量的可能的置换并且确定它们对如此获得的多肽的性质的影响)后,确定和选择适当的置换。
如上所述,所述置换、插入或缺失可以在一个或多个构架区中和/或在一个或多个CDR中。如上所讨论(见要点z)),在CDR中的置换、插入或缺失可以是任何可能的置换、插入或缺失,诸如“保守置换”(如本文定义),其可以由特定规则推动(如本文定义),和/或它可以将改善的性质引入所获得的多肽。
当这些置换、插入或缺失是在一个或多个构架区中进行的时候,它们可以在一个或多个标志残基(如例如在WO08/020079中所定义;表A-3至A-8)处和/或在构架残基中一个或多个其它位置处进行,尽管在标志残基处的置换、插入或缺失通常是较不优选的(除非这些是如本文所述的适当的人源化置换)。作为非限制性的实例,置换例如可以是保守置换(如本文所述)和/或氨基酸残基可以被天然存在于另一个VHH结构域中相同位置的另一个氨基酸残基替换(参见WO08/020079,表A-5至A-8),尽管本发明通常不限于此。
(优选)在一个或多个构架区中进行的置换、插入或缺失可以是人源化置换。基于本文公开的内容,一些优选但是非限制性的人源化置换(及其适当组合)对于本领域技术人员是清楚的。通过将在a)中定义的本发明的多肽中包含的氨基酸序列之一的构架区序列和一个或多个紧密相关的人VH序列的相应构架序列进行比较,可以确定潜在有效的人源化置换,之后可以将如此确定的一个或多个潜在有效的人源化置换(或其组合)引入在a)中定义的所述本发明的多肽(以本身已知的任何方式,如本文进一步描述),并且可以检测获得的多肽序列与hRSV的蛋白F的亲和性、稳定性、表达容易性和水平、和/或本文定义的其它理想性质。如此,通过有限程度的试错,基于本文的公开内容,本领域技术人员可以确定其它适当的人源化置换(或其适当组合)。
所述人源化置换应该这样选择,以致所得到的人源化的多肽序列仍然保留如本文所定义的多肽中包含的的有利特性。基于本文的公开内容,并且任选地在有限程度的常规实验(这可以例如包括引入有限数量的可能的人源化置换,并且确定它们对这样获得的多肽中包含的 的特性的影响)之后,熟练的技术人员通常能够确定并选择适当的人源化置换或适当的人源化置换的组合。
一般地,作为人源化的结果,本发明的多肽可以变得更加“人-样”,同时仍然保留如本发明所述的多肽中包含的本发明的的有利特性。结果,与包含相对应的天然存在的VHH结构域的多肽相比,这样人源化的多肽可以具有一些优点,诸如减小的免疫原性。同样,基于本发明的公开内容,并且任选在有限程度的常规实验之后,熟练的技术人员应该能够选择人源化置换或适当的人源化置换组合,其最优化或获得一方面在通过人源化置换提供的有利特性和另一方面在天然存在的VHH结构域的有利特性之间的理想的或适当的平衡。
本发明的多肽可以在任何构架残基处被适当人源化,诸如在一个或多个标志残基处(如本文所定义)或在一个或多个其它构架残基处(即,非标志残基)或它们的任何适当的组合。关于“P,R,S-103组”或“KERE组”的的一个优选的人源化置换是将Q108置换成L108。
取决于用于表达本发明的多肽的宿主生物体,所述缺失和/或置换也可以以这样的方式设计,所述方式去除一个或多个翻译后修饰的位点(诸如一个或多个糖基化位点),这应该在本领域技术人员的能力范围内。备选地,可以设计置换或插入,以引入一个或多个附着官能团(如本文所述)的位点,例如,以允许位点-特异性的聚乙二醇化(pegylation)(同样如本文所述)。
从在WO08/020079的表A-5–A-8中提供的关于VHH熵和VHH可变性的数据可以看出,在构架区中的一些氨基酸残基比其它的更保守。通常,尽管本发明在其最广泛意义上不限于此,优选在较不保守的位置进行任何置换、缺失或插入。此外,通常,氨基酸置换优于氨基酸缺失或插入。
用于本文所述的多肽的任何氨基酸置换还可以基于Schulz等,蛋白质结构原理(PrinciplesofProteinStructure),Springer-Verlag,1978研究的不同物种的同源蛋白之间的氨基酸变异频率的分析,基于Chou和Fasman,生物化学(Biochemistry)13:211,1974和高级酶学(Adv.Enzymol.),47:45-149,1978研究的结构形成潜力的分析,和基于Eisenberg等,美国国家科学院学报(Proc.Nad.Acad.Sci.USA)81:140-144,1984;Kyte和Doolittle;分子生物学杂志(JMolec.Biol.).157:105-132,1981,以及Goldman等,物理化学综述年刊(Ann.Rev.Biophys.Chem.).15:321-353,1986研究的蛋白中疏水模式的分析,所有这些通过引用完全结合于此。在本文描述和上文引用的公知背景技术中给出关于的一级、二级和三级结构的信息。此外,出于这一目的,例如,Desmyter等,自然结构生物学(NatureStructuralBiology),卷3,9,803(1996);Spinelli等,自然结构生物学(NaturalStructuralBiology)(1996);3,752-757;和Decanniere等,结构(Structure),卷7,4,361(1999)给出来自美洲驼(llama)的VHH结构域的晶体结构。关于在常规VH结构域中形成VH/VL界面的一些氨基酸残基和在这些位置的潜在的骆驼源化(camelizing)置换的其它信息可以在上文引用的现有技术中找到。
具有一个、两个或最多三个置换、插入或缺失的多肽,以及编码其的核酸序列,可以以本身已知的任何方式,例如使用在WO08/020079的第103页和104页上提及的一种或多种技术来提供。
获得的本发明的多肽应该优选以如本文中定义的亲和性(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)来结合hRSV的蛋白F和/或以如本文中定义的功效和/或效力来中和hRSV。
cc)给出附图、序列表和实验部分/实施例只是进一步举例说明本发明,并且不应该被以任何方式解释为或者认为限制本发明和/或附上的权利要求的范围,除非本文中另外明确指明。
为了与其在hRSV的蛋白F上的表位结合,氨基酸序列通常将在其氨基酸序列内包含一个或多个氨基酸残基、或一个或多个氨基酸残基片段(如本文定义;即,每个“片段”包括彼此相邻或彼此紧邻的两个以上氨基酸残基,即,处于该氨基酸序列的一级或三级结构中),通过其本发明的氨基酸序列可以与其在hRSV的蛋白F上的表位结合。这些氨基酸残基或氨基酸残基片段由此形成结合hRSV的蛋白F上的表位的“位点”(本文还称为“抗原结合位点”;如本文中进一步定义)。
本发明提供许多氨基酸残基片段(如本文定义),它们特别适合于结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II(关于hRSVF蛋白中抗原位点的描述参考Lopez等1998,J.virol.(病毒学杂志)72:6922-6928)。这些氨基酸残基片段可以存在于和/或可以结合到本发明的氨基酸序列中,特别是以这样的方式,即,使得它们形成本发明氨基酸序列的抗原结合位点(的一部分)。获得的氨基酸序列应该与hRSV的蛋白F上的特定表位结合,所述特定表位位于hRSV的蛋白F上的抗原位点II中,形成hRSV的蛋白F上的抗原位点II的一部分,或与hRSV的蛋白F上的抗原位点II重叠(即在一级结构或三级结构中)或与hRSV的蛋白F上的抗原位点II紧邻(即在一级结构或三级结构中)。而且,获得的本发明的氨基酸序列应该优选是这样的,即它们可以与竞争来结合hRSV的蛋白F;和/或是这样的,即它们可以与结合在hRSV的蛋白F的相同表位或结合位点,或者结合邻近所述结合位点的表位和/或与所述结合位点重合的表位。
本发明提供氨基酸残基片段(SEQIDNO:102),其特别适合于结合hRSV的蛋白F。该氨基酸残基片段(或如本文中定义的SEQIDNO:102的变体)可以存在于,和/或可以引入本发明的氨基酸序列中,特别是以这样的方式,即,使得它们形成本发明的氨基酸序列的抗原结合位点(的一部分)。生成了氨基酸残基片段作为重链抗体或VHH序列(NC41;SEQIDNO:5)的CDR2序列,其针对hRSV的蛋白F产生并以文库方法进一步修饰以产生人源化的NC41(如实施例部分中所述)。更特别地,NC41的CDR2的位置6处的甘氨酸(Gly,G)残基置换为天冬氨酸(Asp,D)残基。意外地,关于包含该氨基酸残基片段(SEQIDNO:102)的氨基酸序列观察到改善的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力。该氨基酸残基片段(或SEQIDNO:102的变体,如本文定义)在本文中也称为“本发明的CDR2序列”。
因此,在一方面,本发明提供氨基酸序列,其包含至少一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明提供包含两个或更多氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中一个片段选自以下:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于本发明的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
甚至更优选地,本发明的氨基酸序列包含三个以上氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中第一氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);或
第二氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且第三氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
包含以上特定氨基酸残基片段中的一个或多个的氨基酸序列显示改善的性质诸如例如改善的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力。
更具体地,包括一个或多个以上特定氨基酸残基片段的本发明的氨基酸序列可以以这样的亲和性(适当测量和/或表示为KD-值(实际的或表观的),KA-值(实际的或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地作为IC50值,如本发明进一步所述)与hRSV的蛋白F结合,优选是这样的,即它们:
-以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选15nM-1nM或甚至10nM-1nM或更小的解离常数(KD)结合hRSV的蛋白F;
和/或是这样的,即它们:
-以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率结合hRSV的蛋白F;
和/或是这样的,即它们:
-以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率结合hRSV的蛋白F;
对于本发明的氨基酸序列与hRSV的蛋白F结合的一些优选的IC50值将从本发明的进一步描述和实施例中变得清楚。
确定IC50的测定法包括竞争测定法诸如竞争ELISA(例如与或其Fab片段竞争)或更优选中和测定法诸如由Anderson等(1985,J.Clin.Microbiol.(临床微生物学杂志)22:1050-1052;1988,J.Virol.(病毒学杂志)62:4232-4238)所述的微量中和测定法,这些测定法的改进诸如例如实施例6中所述的那些;或如例如由Johnson等(1997,J.Inf.Dis.(传染病杂志)176:1215-1224)所述的空斑数减少测定法,及其改进。
例如,在与的Fab片段的竞争测定法中,本发明的氨基酸序列可以具有1nM-100nM,优选10nM-50nM,或更小的IC50值。
例如,在关于hRSVLong的微量中和测定法中(诸如例如实施例6中所述的),本发明的氨基酸序列可以具有100nM-1000nM,优选100nM-500nM,或更小的IC50值。
应该注意到,本发明不限于本发明的氨基酸序列的来源(或用于表达其的本发明的核苷酸序列的来源),也不限于产生或获得(或已经产生或获得)本发明的氨基酸序列或核苷酸序列的方法。因此,本发明的氨基酸序列可以是天然存在的氨基酸序列(来自任何适当的物种)或合成的或半合成的氨基酸序列。
应该注意到,本发明在其最广泛意义上不限于这些氨基酸残基片段在本发明的氨基酸序列中可能具有的特定的结构作用或功能,只要这些氨基酸残基片段允许本发明的氨基酸序列以某种亲和性和/或效力(如本文定义)与hRSV的蛋白F上的抗原位点II结合。因此,一般地,本发明在其最广泛意义上包括任何这样的氨基酸序列,所述氨基酸序列能够与hRSV的蛋白F上的抗原位点II结合,并且包括一个或多个本文所定义的氨基酸残基片段(并且特别地,两个或更多个所述氨基酸残基片段的适当组合),其通过一个或多个其它氨基酸序列彼此适当连接,以致整个氨基酸序列形成能够结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II的结合结构域和/或结合单位。
这样的氨基酸序列可以例如是适当的“蛋白支架”,所述蛋白支架包括如本文中定义的至少一个氨基酸残基片段(即,作为其抗原结合位点的一部分)。用于呈递氨基酸序列的适当的支架对于熟练的技术人员将是清楚的,并且例如,包括,但不限于,基于或来源于免疫球蛋白的结合支架,来源于蛋白质A结构域的蛋白支架(诸如AffibodiesTM),淀粉酶抑肽(tendamistat),纤连蛋白,脂笼蛋白,CTLA-4,T-细胞受体,设计的锚蛋白重复序列,高亲和性多聚体(avimers)和PDZ结构域(Binz等2005,Nat.Biotech(自然生物技术),23:1257),和基于DNA或RNA的结合结构部分,包括但不限于DNA或RNA适体(Ulrich等,2006,组合化学高通量筛选(CombChemHighThroughputScreen)9(8):619-32)。
同样地,包括一个或多个如本文中关于本发明的氨基酸序列所定义的氨基酸序列片段的任何本发明的氨基酸序列优选是这样的,以致其可以特异性结合(如本文所定义)hRSV的蛋白F,并且更特别地是这样的,以致其可以以如本文所限定的亲和性(适当测量和/或表示为KD-值(实际的或表观的),KA-值(实际的或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地作为IC50值,如本文进一步所述)与hRSV的蛋白F结合。包括一个或多个如本文中关于本发明的氨基酸序列所定义的氨基酸序列片段的任何本发明的氨基酸序列优选是这样的,以致其可以以如本文所限定的效力(如本文中限定的合适测定法测量的)中和hRSV。
此外,本领域技术人员还清楚,可以将关于本发明的氨基酸序列定义的一个或多个CDR“嫁接”到其它“支架”上,包括但不限于人支架或非免疫球蛋白支架。关于该CDR嫁接的适当支架和技术对于本领域技术人员是清楚的,并且在本领域中是公知的,参见例如US7,180,370,WO01/27160,EP0605522,EP0460167,US7,054,297,Nicaise等,蛋白质科学(ProteinScience)(2004),13:1882-1891;Ewert等,方法(Methods),2004年10月;34(2):184-199;Kettleborough等,蛋白质工程(ProteinEng.)1991年10月;4(7):773-783;O’Brien和Jones,分子生物学方法(MethodsMol.Biol.)2003:207:81-100;和Skerra,分子识别杂志(J.Mol.Recognit.)2000:13:167-187,和Saerens等,分子生物学杂志(J.Mol.Biol.)2005年9月23日;352(3):597-607,和其中引用的其它参考文献。例如,本身已知的用于将小鼠或大鼠CDR嫁接到人构架和支架上的技术可以以类似的方式使用,以提供包括一个或多个关于本发明的氨基酸序列本文定义的CDR序列和一个或多个人构架区域或序列的嵌合蛋白。
在一个具体但非限制性的方面中,本发明的氨基酸序列可以是包括免疫球蛋白折叠的氨基酸序列,或可以是在适当条件(诸如生理条件)下能够形成免疫球蛋白折叠(即,通过折叠)的氨基酸序列。其中特别参考Halaby等(1999,蛋白质工程杂志(J.ProteinEng.)12:563-71)的综述。优选地,当正确折叠以形成免疫球蛋白折叠时,所述氨基酸残基片段可以能够适当地形成用于结合hRSV的蛋白F上的特定抗原位点II的抗原结合位点;并且更优选地能够以如本文中所定义的亲和性(适当地测量和/或表示为KD-值(实际的或表观的),KA-值(实际的或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地作为IC50值,如本发明进一步所述)结合hRSV的蛋白F的抗原位点II。
在另一个具体但非限制性的方面,本发明的氨基酸序列是免疫球蛋白序列。具体地,但非限制性地,本发明的氨基酸序列可以是基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成的氨基酸序列;或是所述氨基酸序列的任何适当的仍结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II的片段。
在本发明的这种氨基酸序列中,构架序列可以是任何适当的构架序列,适当的构架序列的实例对于本领域技术人员是清楚的(例如基于标准手册以及进一步描述和本发明提及的现有技术)。
所述构架序列优选是免疫球蛋白构架序列或(例如,通过人源化或骆驼源化)已经从免疫球蛋白构架序列衍生的构架序列(的适当组合)。例如,该构架序列可以是衍生于轻链可变结构域(例如,VL-序列)和/或衍生于重链可变结构域(例如,VH-序列)的构架序列。当本发明的氨基酸序列是重链可变结构域序列时,它可以是来源于常规四链抗体的重链可变结构域序列(诸如,不限于,来源于人抗体的VH序列),或是来源于所谓的“重链抗体”(如本发明所定义)的所谓的VHH-序列(如本发明所定义)。在一个特别优选的方面,所述构架序列是衍生于VHH-序列的构架序列(其中所述构架序列可以任选地已被部分或完全人源化)或者是已经骆驼源化的(如本发明所定义)常规VH序列。
关于重链抗体及其可变结构域的一般描述,特别参考本文引用的现有技术,以及在WO08/020079的第59页上提及的现有技术和国际申请WO06/040153的第41-43页上提及的参考文献列表,所述现有技术和参考文献通过参考结合于此。
构架序列可以优选是这样的,以致本发明的氨基酸序列是结构域抗体(或适合用作结构域抗体的氨基酸序列);是单结构域抗体(或适合用作单结构域抗体的氨基酸序列);是"dAb"(或适合用作dAb的氨基酸序列);是(包括但不限于VHH序列)。再次,适当的构架序列对于本领域技术人员是清楚的,例如,基于标准手册和本文提及的更多的公开内容现有技术。
具体地,本发明氨基酸序列中存在的构架序列可以含有一个或多个标志残基(如在WO08/020079(表A-3至A-8)中定义),以使本发明的氨基酸序列是这些构架序列(的适当组合)的一些优选但非限制性的实例将从本文进一步的公开内容(参见例如表A-6)中变得清楚。通常,(特别是VHH序列和部分人源化的)可以特别地通过在一个或多个构架序列中存在一个或多个“标志残基”来表征(如例如在WO08/020079中第61页第24行至第98页第3行进一步描述)。
如本文已经所述,可以认为的氨基酸序列和结构----然而,不限于此----包括4个构架区或“FR’s”,其在本领域和本文中分别称为“构架区1”或“FR1”;“构架区2”或“FR2”;“构架区3”或“FR3”;和“构架区4”或“FR4”;所述构架区由3个互补性决定区或“CDR’s”中断,其在本领域分别称为“互补性决定区1”或“CDR1”;“互补性决定区2”或“CDR2”;和“互补性决定区3”或“CDR3”。在本发明的中存在的一些优选的构架序列和CDR’s(及其组合)如本文所述。
因此,通常,可以定义为具有下述(通用)结构的氨基酸序列:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4
其中FR1-FR4分别是指构架区1-4,并且其中CDR1-CDR3分别是指互补性决定区1-3,并且其中一个或多个标志残基如本文进一步定义。
在该方面,本发明的氨基酸序列可以基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
这些优选的互补性决定区(CDR2序列)也称为“本发明的CDR2”。
优选地,本发明的氨基酸序列可以基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且CDR1或CDR3中至少一种选自:
-选自由以下组成的组的CDR1:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);或
和/或
-选自由以下组成的组的CDR3:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
甚至更优选地,本发明的氨基酸序列可以基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中:
-CDR1选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);或
且
-CDR2选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR3选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在特殊方面,本发明的氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102。
在另一特殊方面,本发明的氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自以下的氨基酸残基片段(CDR序列):
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
c)SEQIDNO:121;
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选地,本发明的氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102和至少两个氨基酸残基片段(CDR序列),其中一个片段选自由a)和b)中定义的氨基酸残基片段组成的组且其中另一个片段选自由c)和d)中定义的氨基酸残基片段组成的组。
在另一个特殊方面,本发明的氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102和至少一种选自SEQIDNO:98和SEQIDNO:121的氨基酸残基片段(CDR序列)。
优选地,本发明的氨基酸序列或包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
CDR1,CDR2,和CDR3序列的优选组合也显示在表A-6中。
本发明的氨基酸序列可以基本上由衍生于常规四链抗体的重链可变结构域序列组成,或者可以基本上由衍生于重链抗体的重链可变结构域序列组成。本发明的氨基酸序列可以基本上由结构域抗体(或适合用作结构域抗体的氨基酸序列),单结构域抗体(或适合用作单结构域抗体的氨基酸序列),"dAb"(或适合用作dAb的氨基酸序列)或组成。
关于(单)结构域抗体的一般描述,还参考以上引用的现有技术,以及EP0368684。关于术语“dAb’s”,参考例如Ward等(1989,自然(Nature)341:544-6),Holt等,2003,生物技术趋势(TrendsBiotechnol.)21:484-490;以及例如WO06/030220,WO06/003388和DomantisLtd.其它公开的专利申请。还应当注意,尽管因为它们不是哺乳动物来源而在本发明的情形中较不优选,单结构域抗体或单可变结构域可以衍生于某些鲨鱼种类(例如,所谓的“IgNAR结构域”,参见例如WO05/18629)。
特别地,本发明的氨基酸序列可以基本上由(如本文定义)或其适当片段组成或者可以是(如本文定义)或其适当片段。[注意: 为埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)的注册商标。]
可以定义为具有下述(通用)结构的氨基酸序列:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4
其中FR1-FR4分别是指构架区1-4,并且其中CDR1-CDR3分别是指互补性决定区1-3,并且其中一个或多个标志残基如WO08/020079(表A-3至A-8)所定义。
更特别地,可以定义为具有下述(通用)结构的氨基酸序列:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4
其中FR1-FR4分别是指构架区1-4,并且其中CDR1-CDR3分别是指互补性决定区1-3,并且其:
i)与SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157(见表A-4)的至少一个氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性,其中为了确定氨基酸同一性的程度的目的,忽略形成CDR序列的氨基酸残基。在这一方面,还参考表A-6,其列出了SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157(见表A-4)的的构架1序列(SEQIDNO’s:81-97和166),构架2序列(SEQIDNO’s:99-100),构架3序列(SEQIDNO’s:103-120和167-168)和构架4序列(SEQIDNO’s:123和169);
并且其中:
ii)优选地,在按照Kabat编号的位置11,37,44,45,47,83,84,103,104和108的一个或多个氨基酸残基选自WO08/020079的表A-3至表A-8中提及的标志残基。
为了进一步概括描述参考本文中引用的现有技术,诸如例如WO08/020079(第16页)中所述。
所述可以以任何适当的方式获得,并且来源于任何适当的来源,并且例如,可以是天然存在的VHH序列(即,来自于适当的骆驼(Camelid)物种)或合成的或半合成的氨基酸序列。
同样地,所述可以以任何适当的方式获得,并且来源于任何适当的来源,并且例如,可以是天然存在的VHH序列(即,来自于适当的骆驼(Camelid)物种)或合成的或半合成的氨基酸序列,包括但不限于“人源化的”(如本文所定义)“骆驼源化的”(如本文所定义)免疫球蛋白序列(并且特别是骆驼源化的重链可变结构域序列),以及已经通过下列技术获得的诸如亲和性成熟(例如,起始于合成的、随机的或天然存在的免疫球蛋白序列),CDR移植,镶盖术,组合来源于不同的免疫球蛋白序列的片段,利用重叠的引物进行的PCR装配,以及熟练的技术人员公知的加工免疫球蛋白序列的类似技术;或前述任一项的任何适当的组合,这如本文进一步描述。此外,当包括VHH序列时,所述可以适当地被人源化,如本文进一步所述,以便提供一个或多个本发明的进一步(部分或完全)人源化的类似地,当 包括合成的或半合成的序列(诸如部分人源化的序列)时,所述可以任选地进一步适当地被人源化,同样如本文所述,同样以便提供一个或多个本发明的进一步(部分或完全)人源化的
特别地,人源化的可以是如前述段落中关于概括定义的氨基酸序列,但是其中存在至少一个这样的氨基酸残基(并且特别地,在至少一个构架残基中),所述氨基酸残基是人源化的取代和/或对应人源化的取代(如本文所定义)。基于本文公开的内容,对于熟练的技术人员,一些优选的、而非限制性的人源化取代(及其适当的组合)将变得清楚。另外,或者备选地,通过比较天然存在的VHH序列的构架区序列与一个或多个紧密相关的人VH序列的相对应的构架序列,可以确定其它潜在有用的人源化取代,此后,可以将由此确定的一个或多个潜在有用的人源化取代(或其组合)引入到所述VHH序列中(以本身已知的任何方式,如本文进一步所述),并且可以检测所得到的人源化的VHH序列对靶标的亲和性、稳定性、表达的容易性和水平、和/或其它需要的特性。以这种方式,通过利用有限程度的试错,熟练的技术人员基于本文公开的内容可以确定其它适当的人源化取代(或其适当的组合)。此外,基于前述内容,(的构架区)可以是部分人源化的或完全人源化的。
在这方面,本发明的一些优选是这样的其特异性结合(如本文进一步所述)hRSV的蛋白F,并且其:
i)是具有SEQIDNO:5(见表A-1)的氨基酸序列的人源化变体;和/或
ii)与SEQIDNO:5(见表A-1)的至少一个氨基酸序列和/或SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157(见表A-4)的至少一个氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性,其中为了确定氨基酸同一性程度的目的,忽略形成CDR序列的氨基酸残基;
并且其中:
iii)优选地,在依据Kabat编号的位置11,37,44,45,47,83,84,103,104和108的一个或多个氨基酸残基选自WO08/020079的表A-3至表A-8中提及的标志残基。
本发明提供许多人源化的和/或序列最优化的氨基酸序列和/或 其特别适合于结合hRSV的蛋白F。因此,在本发明的一方面,提供选自以下的氨基酸序列和/或
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO’s:60-76之一或基本上由SEQIDNO’s:60-76之一组成。
在另一方面,本发明提供选自以下的氨基酸序列和/或
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
本发明的优选氨基酸序列和/或包含SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一或基本上由SEQIDNO:62,65,67,68,75和76之一组成。
在另一方面,本发明提供选自以下的氨基酸序列和/或
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选地,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成。在另一优选方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成。在另一优选方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成。
本发明还提供许多人源化的和/或序列最优化的氨基酸序列和/ 其选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO’s:146-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
在另一方面,本发明提供选自以下的氨基酸序列和/或
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
本发明的优选氨基酸序列和/或包含SEQIDNO’s:146-149和151-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-149和151-153之一组成。
本发明的氨基酸序列和/或在施用于人受试者时显示出减小的免疫原性。另外,本发明的氨基酸序列和/或与它们相应的亲本氨基酸序列相比,显示出改善的关于hRSV的蛋白F的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)(如2009年6月5日由埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)提交的标题为“Aminoacidsequencesdirectedagainstenvelopeproteinsofavirusandpolypeptidescomprisingthesameforthetreatmentofviraldiseases(用于治疗病毒疾病的针对病毒包膜蛋白的氨基酸序列和包含其的多肽)”的PCT申请PCT/EP2009/056975中所述)。
在生成本发明的纳米抗体的过程中,通过RP-HPLC检测到氨基末端上高水平的焦谷氨酸(pGlu)。在发酵后检测到大于15%的pGlu水平,并且在稳定性研究期间,pGlu水平在保存时稳定增加。这样的修饰导致终产物的异质性并需要避免。控制/防止pGlu形成因此对于保持治疗性蛋白处在其规定的规范内是关键的。具有N端谷氨酸的蛋白需要特殊的液体剂型和/或保存条件,由此最小化焦谷氨酸的形成。
在本发明中,N端的pGlu翻译后修饰通过将N端谷氨酸(E)[HOOC-(CH2)2–蛋白]改变为天冬氨酸(D)[HOOC-CH2–蛋白]来消除,这导致增加的产物稳定性。因此,本发明还涉及如上所述的氨基酸序列和纳米抗体,其中位置1处的谷氨酸(所述位置根据Kabat编号确定)改变为天冬氨酸。
本发明提供许多序列最优化的氨基酸序列和/或其在稳定性研究期间内在保存时显示增加的稳定性。因此,在本发明的一方面,提供选自以下的氨基酸序列和/或
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO’s:138-141和154-157之一或基本上由SEQIDNO’s:138-141和154-157之一组成。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO’s:146-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成,其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
优选地,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:138或基本上由SEQIDNO:138组成。在另一优选方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:139或基本上由SEQIDNO:139组成。在另一优选方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:140或基本上由SEQIDNO:140组成。在另一优选方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:141或基本上由SEQIDNO:141组成。在另一优选方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO’s:154-157之一或基本上由SEQIDNO’s:154-157之一组成。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
在另一方面,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中位置1(Glu)已经改变为Asp。
优选地,本发明的氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
本发明的氨基酸序列和/或与它们相应的野生型氨基酸序列相比,显示出改善的性质,诸如例如改善的稳定性、减小的免疫原性、改善的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力(如2009年6月5日由埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)提交的标题为“Aminoacidsequencesdirectedagainstenvelopeproteinsofavirusandpolypeptidescomprisingthesameforthetreatmentofviraldiseases(用于治疗病毒疾病的针对病毒包膜蛋白的氨基酸序列和包含其的多肽)”的PCT申请PCT/EP2009/056975中所述)。
更具体地,本发明的氨基酸序列和/或可以以这样的亲和性(适当测量和/或表示为KD-值(实际的或表观的),KA-值(实际的或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地作为IC50值,如本发明进一步所述)与hRSV的蛋白F结合,优选是这样的,即它们:
-以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选15nM-1nM或甚至10nM-1nM或更小的解离常数(KD)结合hRSV的蛋白F;
和/或是这样的,即它们:
-以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率结合hRSV的蛋白F;
和/或是这样的,即它们:
-以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率结合hRSV的蛋白F;
对于本发明的氨基酸序列与hRSV的蛋白F结合的一些优选的IC50值将从本发明的进一步描述和实施例中变得清楚。
确定IC50的测定法包括竞争测定法诸如竞争ELISA(例如与或其Fab片段竞争)或更优选中和测定法诸如由Anderson等(1985,J.Clin.Microbiol.(临床微生物学杂志)22:1050-1052;1988,J.Virol.(病毒学杂志)62:4232-4238)所述的微量中和测定法,这些测定法的改进诸如例如实施例6中所述的那些;或如例如由Johnson等(1997,J.Inf.Dis.(传染病杂志)176:1215-1224)所述的空斑数减少测定法。
例如,在与的Fab片段的竞争测定法中,本发明的氨基酸序列可以具有1nM-100nM,优选10nM-50nM,或更小的IC50值。
例如,在关于hRSVLong的微量中和测定法中(诸如例如实施例6中所述的),本发明的氨基酸序列可以具有100nM-1000nM,优选100nM-500nM,或更小的IC50值。
由本发明提供的氨基酸序列和优选地采用基本分离的形式(如本文所定义)、或形成本发明的多肽(也称为“本发明的多肽”或“本发明的构建体”,二者可交替使用)的一部分,其可以包括一种或多种本发明的氨基酸序列或或基本上由一种或多种本发明的氨基酸序列或组成,并且其可以任选地还包括一种或多种其它的氨基酸序列或(全部任选地通过一个或多个适当的接头连接)。
因此,在另一方面,本发明还涉及多肽(在本文中也称为“本发明的多肽”),其包括一种或多种本发明的氨基酸序列或(或其合适的片段)或基本上由一种或多种本发明的氨基酸序列或(或其合适的片段)组成。
由本发明的氨基酸序列或起始,设计/选择和/或制备本发明的多肽的方法在本发明中还称为“格式化”所述的本发明的氨基酸序列或并且组成本发明的多肽的一部分的本发明的氨基酸被或 认为是“格式化的”或采用所述的本发明的多肽的“格式”。基于本发明的公开内容,熟练的技术人员将清楚本发明的氨基酸序列或 可以被格式化的方法实例以及所述格式的实例;并且所述格式化的氨基酸序列或形成本发明的另一个方面。
例如,和非限制性地,所述一个或多个本发明的氨基酸序列或 可以用作这样的多肽中的结合单元,所述蛋白质或多肽可以任选地含有一个或多个另外的可以用作结合单元的氨基酸序列(即,针对hRSV的蛋白F上的相同或另一个表位和/或针对一个或多个不同于hRSV的蛋白F的其它抗原、蛋白质或靶标),以便分别提供单价、多价、多互补位(multiparatopic)或多特异性的本发明的多肽,全如本发明所述。本发明因此还涉及一种多肽,其为包含本发明的氨基酸序列或或基本上由本发明的氨基酸序列或组成的单价多肽或构建体。本发明因此还涉及一种多肽,其为多价多肽或构建体,诸如,例如,二价或三价多肽或构建体。本发明还涉及一种多肽,其为多特异性多肽或构建体,例如,双特异性或三特异性多肽或构建体。本发明因此还涉及一种多肽,其为多互补位多肽或构建体,诸如,例如,双互补位或三互补位多肽或构建体。
因此,在一个优选但非限制性的方面,本发明的氨基酸序列或 包括至少一个其它的氨基酸序列或以提供包括至少两个、诸如两个、三个、四个、五个或更多个氨基酸序列或的本发明的多肽,其中所述氨基酸序列或可以任选地通过一个或多个接头序列(如本发明所定义)连接。包括两个或更多个氨基酸序列或 的本发明的多肽(其中至少一个,和优选全部,是本发明的氨基酸序列或),在本发明中还将称为本发明的“多价”多肽,并且在所述多肽中存在的氨基酸序列或还将在本发明中称为处于“多价格式”。例如,本发明的“二价”多肽包括2个氨基酸序列和/或 其任选地通过一个接头序列连接,而本发明的“三价”多肽包括3个氨基酸序列和/或其任选地通过两个接头序列连接;等等;其中在所述多肽中存在的至少一个氨基酸序列和/或并且多至在所述多肽中存在的所有氨基酸序列和/或是本发明的氨基酸序列和/或
在本发明的多价多肽中,所述两个或更多个氨基酸序列或可以是相同的或不同的,并且可以针对同一抗原或抗原决定簇(例如,针对相同部分或表位或者针对不同部分或表位),或可以备选地针对不同的抗原或抗原决定簇;或它们的任何适当的组合。例如,本发明的二价多肽可以包括:(a)两个相同的氨基酸序列或(b)针对蛋白或抗原的第一抗原决定簇的第一氨基酸序列或和针对所述蛋白或抗原的同一抗原决定簇的第二氨基酸序列或所述第二氨基酸序列或不同于所述第一氨基酸序列或(c)针对所述蛋白或抗原的第一抗原决定簇的第一氨基酸序列或和针对所述蛋白或抗原的另一个抗原决定簇的第二氨基酸序列或或(d)针对第一蛋白或抗原的第一氨基酸序列或和针对第二蛋白或抗原(即,与所述第一抗原不同)的第二氨基酸序列或类似地,本发明的三价多肽可以,例如但不限于此,包括(a)三个相同的氨基酸序列或(b)针对抗原的第一抗原决定簇的两个相同的氨基酸序列或和针对同一抗原的不同抗原决定簇的第三氨基酸序列或(c)针对抗原的第一抗原决定簇的两个相同的氨基酸序列或和针对不同于所述第一抗原的第二抗原的第三氨基酸序列或(d)针对第一抗原的第一抗原决定簇的第一氨基酸序列或针对所述第一抗原的第二抗原决定簇的第二氨基酸序列或和针对不同于所述第一抗原的第二抗原的第三氨基酸序列或或(e)针对第一抗原的第一氨基酸序列或针对不同于所述第一抗原的第二抗原的第二氨基酸序列或和针对不同于所述第一和第二抗原的第三抗原的第三氨基酸序列或
在优选的方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)本发明的氨基酸序列或(如上所述)或基本上由至少两个(优选相同的)本发明的氨基酸序列或(如上所述)组成。
在一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自至少包含选自以下的氨基酸残基片段的氨基酸序列:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或 或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自包含两个或更多氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中一个片段选自以下:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于形成所述多价多肽的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
优选的多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自包含三个以上氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中第一氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
第二氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且第三氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或 或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或 或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:102;或
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且CDR1或CDR3中至少一种选自:
-选自由以下组成的组的CDR1:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
-选自由以下组成的组的CDR3:
e)SEQIDNO:121;或
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选地,多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中:
-CDR1选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR2选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;或
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR3选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在特殊的方面,多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102。
在另一个特殊的方面,多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自以下的氨基酸残基片段(CDR序列):
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选地,多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102和至少两个氨基酸残基片段(CDR序列),其中一个片段选自由c)和d)中定义的氨基酸残基片段组成的组且其中另一个片段选自由e)和f)中定义的氨基酸残基片段组成的组。
在特殊的方面,多价(诸如二价或三价)多肽可以包含至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)或至少三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自SEQIDNO:98和SEQIDNO:121的氨基酸残基片段(CDR序列);或所述氨基酸序列或至少包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)本发明的氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)本发明的氨基酸序列或组成(如上所述)。在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)本发明的氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)本发明的氨基酸序列或组成(如上所述)。在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)本发明的氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)本发明的氨基酸序列或组成(如上所述)。
本发明还提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:60-76之一。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:65和76。
本发明还提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:146-153之一。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L),和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
本发明的优选多肽包含至少两个相同的氨基酸序列或或基本上由至少两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:146-149和151-153。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或 包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:60-76之一。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:65和76之一。
本发明还提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或 或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:146-153之一。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
本发明的优选多肽包含至少三个相同的氨基酸序列或或基本上由至少三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:146-149和151-153。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选三价多肽,其包含至少三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由至少三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
本发明还提供如上所述的多价多肽,优选二价或三价多肽,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在这方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少一个氨基酸序列或纳 或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:75或基本上由SEQIDNO:75组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:147或基本上由SEQIDNO:147组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:149或基本上由SEQIDNO:149组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:153或基本上由SEQIDNO:153组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供多价多肽,优选二价或三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是二价多肽并包含两个相同的氨基酸序列或或基本上由两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:60-76之一。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是二价多肽并包含两个相同的氨基酸序列或或基本上由两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是二价多肽并包含两个相同的氨基酸序列或或基本上由两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:65和76。
本发明还提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或 或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是二价多肽并包含两个相同的氨基酸序列或或基本上由两个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:146-153之一。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
本发明的优选多肽包含两个氨基酸序列或或基本上由两个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:146-149和151-153。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含两个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由两个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
本发明还提供如上所述的二价多肽,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在这方面,本发明还提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或 或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少一个氨基酸序列或 或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:75或基本上由SEQIDNO:75组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:147或基本上由SEQIDNO:147组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:149或基本上由SEQIDNO:149组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:153或基本上由SEQIDNO:153组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供二价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是三价多肽并包含三个相同的氨基酸序列或或基本上由三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:60-76之一。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是三价多肽并包含三个相同的氨基酸序列或或基本上由三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是三价多肽并包含三个相同的氨基酸序列或或基本上由三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:65和76之一。
本发明还提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或 或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽是三价多肽并包含三个相同的氨基酸序列或或基本上由三个相同的氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:146-153之一。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
本发明的优选多肽包含三个氨基酸序列或或基本上由三个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:146-149和151-153。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含三个(优选相同的)氨基酸序列或或基本上由三个(优选相同的)氨基酸序列或 组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
本发明的优选多价多肽包含三个具有SEQIDNO:62的氨基酸序列或或基本上由三个具有SEQIDNO:62的氨基酸序列或 组成。本发明的另一优选多价多肽包含三个具有SEQIDNO:65的氨基酸序列或或基本上由三个具有SEQIDNO:65的氨基酸序列或组成。本发明的另一优选多价多肽包含三个具有SEQIDNO:76的氨基酸序列或或基本上由三个具有SEQIDNO:76的氨基酸序列或组成。本发明的另一优选多价多肽包含三个具有SEQIDNO:75的氨基酸序列或或基本上由三个具有SEQIDNO:75的氨基酸序列或组成。本发明的另一优选多价多肽包含三个具有SEQIDNO:147的氨基酸序列或或基本上由三个具有SEQIDNO:147的氨基酸序列或组成。本发明的另一优选多价多肽包含三个具有SEQIDNO:149的氨基酸序列或或基本上由三个具有SEQIDNO:149的氨基酸序列或组成。本发明的另一优选多价多肽包含三个具有SEQIDNO:153的氨基酸序列或或基本上由三个具有SEQIDNO:153的氨基酸序列或组成。
本发明还提供如上所述的三价多肽,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在这方面,本发明还提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或 或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自以下:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明的多肽包含至少一个氨基酸序列或 或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:75或基本上由SEQIDNO:75组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:147或基本上由SEQIDNO:147组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:149或基本上由SEQIDNO:149组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:153或基本上由SEQIDNO:153组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其包含至少一个氨基酸序列或或基本上由至少一个氨基酸序列或组成,所述氨基酸序列或包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:77-79和158;
b)与SEQIDNO’s:77-79和158之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和/或在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选的方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:77-79和158;
b)与SEQIDNO’s:77-79和158之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO’s:77-79和158之一或基本上由SEQIDNO’s:77-79和158之一组成。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO:78和79;
b)与SEQIDNO’s:78和79之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和/或在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO:78和79;或
b)与SEQIDNO’s:78和79之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO:78或基本上由SEQIDNO:78组成。另一优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO:79或基本上由SEQIDNO:79组成。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:159-161;
b)与SEQIDNO’s:159-161之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO’s:159-161之一或基本上由SEQIDNO’s:159-161之一组成。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:159-161;
b)与SEQIDNO’s:159-161之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
在另一优选方面,本发明提供三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:159-161;
b)与SEQIDNO’s:159-161之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述多肽与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:159,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:160,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:161,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO’s:159-161之一或基本上由SEQIDNO’s:159-161之一组成。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的 中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:77的氨基酸序列组成。在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:78的氨基酸序列组成。在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:79的氨基酸序列组成。在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO’s:158-161之一组成。
在生成本发明的多肽的过程中,通过RP-HPLC检测到氨基端上高水平的焦谷氨酸(pGlu)。在发酵后检测到大于15%的pGlu水平并且pGlu水平在稳定性研究期间内在保存时稳定增加。这样的修饰导致终产物的异质性并需要避免。控制/防止pGlu形成因此对于保持治疗性蛋白处在其规定的规范内是关键的。具有N端谷氨酸的蛋白需要特殊的液体剂型和/或保存条件,由此最小化焦谷氨酸的形成。
在本发明中,N端的pGlu翻译后修饰通过将N端谷氨酸(E)[HOOC-(CH2)2–蛋白]改变为天冬氨酸(D)[HOOC-CH2–蛋白]来消除,这导致增加的产物稳定性。因此,本发明还涉及如上所述的多肽,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
本发明提供许多序列最优化的多肽,其在稳定性研究期间内在保存时显示增加的稳定性。因此,本发明提供如上所述的三价多肽,其中第一氨基酸(谷氨酸)已经改变为天冬氨酸。
在一方面,本发明提供选自以下多肽的三价多肽:
a)SEQIDNO’s:142-145和162-165;
b)与SEQIDNO’s:142-145和162-165之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的第一氨基酸序列或在位置1具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO:142或基本上由SEQIDNO:142组成。另一优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO:143或基本上由SEQIDNO:143组成。另一优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO:144或基本上由SEQIDNO:144组成。另一优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO:145或基本上由SEQIDNO:145组成。另一优选的本发明三价多肽包含SEQIDNO’s:162-165之一或基本上由SEQIDNO’s:162-165之一组成。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:77或基本上由SEQIDNO:77组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:78或基本上由SEQIDNO:78组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:79或基本上由SEQIDNO:79组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:158或基本上由SEQIDNO:158组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:159或基本上由SEQIDNO:159组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:160或基本上由SEQIDNO:160组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:161或基本上由SEQIDNO:161组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸(Glu1Asp)。
在另一个优选的方面,本发明提供三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:142的氨基酸序列组成。在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:143的氨基酸序列组成。在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:144的氨基酸序列组成。在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO:145的氨基酸序列组成。在另一优选方面,本发明的多肽基本上由SEQIDNO’s:162-165之一组成。
具有如上所述的氨基酸序列和多肽序列的多肽已经显示作为预防、治疗和/或药理学活性试剂使用的有利性质,诸如例如,改善的稳定性,较小的免疫原性,改善的结合特征(适当地测量和/或表示为KD-值(实际或表观的),KA-值(实际或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地表示为IC50值,如本文进一步所述)、关于hRSV的蛋白F的改善的亲和性和/或改善的抗体亲抗原性和/或改善的中和hRSV的功效和/或效力。
更具体地,本发明的多肽和化合物可以以这样的亲和性(适当测量和/或表示为KD-值(实际的或表观的),KA-值(实际的或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地作为IC50值,如本发明进一步所述)与hRSV的蛋白F结合,优选是这样的,即它们:
-以100nM-0.1nM或更小,优选10nM-0.1nM或更小,更优选1nM-0.1nM或更小的解离常数(KD)结合hRSV的蛋白F;
和/或是这样的,即它们:
-以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率结合hRSV的蛋白F;
和/或是这样的,即它们:
-以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,更优选5x10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率结合hRSV的蛋白F;
对于本发明的多肽与hRSV的蛋白F结合的一些优选的IC50值将从本发明的进一步描述和实施例中变得清楚。
确定IC50的测定法包括竞争测定法诸如竞争ELISA(例如与或其Fab片段竞争)或更优选中和测定法诸如由Anderson等(1985,J.Clin.Microbiol.(临床微生物学杂志)22:1050-1052)所述的微量中和测定法,这些测定法的改进,如实施例6中所述的;或如由Johnson等(1997,J.Inf.Dis.(传染病杂志)176:1215-1224)所述的空斑数减少测定法。
例如,在与的竞争测定法中,本发明的多肽可以具有1nM-100nM,优选10nM-50nM,或更小的IC50值。
例如,在关于hRSV毒株Long的微量中和测定法中(诸如例如实施例6中所述的),本发明的多肽可以具有10pM-1000pM,优选10pM-250pM,更优选50pM-200pM或更小的IC50值。在微量中和测定法中,本发明的多肽可以具有与使用获得的IC50值相比至少相同和优选更佳,至少10倍更佳,优选20倍更佳,更优选50倍更佳,甚至更优选60、70、80倍或更多倍更佳的IC50值。
本发明还涉及单价多肽或构建体(也称为“本发明的单价多肽”或“本发明的单价构建体”),其包含一种本发明的氨基酸序列或或基本上由一种本发明的氨基酸序列或组成。优选的本发明的单价构建体包含SEQIDNO’s:60-76之一,诸如SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一,诸如例如SEQIDNO’s:65或75;SEQIDNO’s:138-141之一;SEQIDNO’s:146-153之一;或SEQIDNO’s:154-157之一;或基本上由上述之一组成。这样的单价构建体,以及本发明的氨基酸序列和 可以用于制备本发明的多肽,诸如例如上述本发明的多价多肽。
本发明的多肽通常可以通过这样的方法制备,所述方法包括将本发明的氨基酸序列、或单价构建体任选地通过一个或多个适当的接头适当地连接到一个或多个另外的本发明的氨基酸序列、或单价构建体上的至少一个步骤,以提供本发明的多肽。本发明的多肽还可以通过这样的方法制备,所述方法通常至少包括下述步骤:提供编码本发明的多肽的核酸,以适当方式表达所述核酸,和回收所表达的本发明的多肽。这样的方法可以例如,基于本发明进一步所述的方法和技术,以本身已知的方式进行,这对于熟练的技术人员将是清楚的。
用于制备本发明的多价、多互补位和/或多特异性氨基酸或多肽的方法可以至少包括将本发明的两种以上单价氨基酸序列或单价构建体和例如一个或多个接头以适合的方式连接在一起的步骤。单价构建体(和接头)可以通过本领域已知的任何方法连接并且如本文进一步所述。优选的技术包括连接编码单价构建体(和接头)的核酸序列从而制备表达多价、多互补位和/或多特异性氨基酸序列或多肽的遗传构建体。用于连接氨基酸序列或核酸序列的技术对于技术人员是清楚的,并且还参考标准手册,如上述提及的,Sambrook等.和Ausubel等,以及下面的实施例。
因此,本发明还涉及本发明的氨基酸序列、或单价构建体在制备本发明的多价多肽中的应用。用于制备多价多肽的方法应该包括将本发明的氨基酸序列、或单价构建体任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的本发明的氨基酸序列、或单价构建体上。所述氨基酸序列、或单价构建体然后作为结合结构域或结合单元用于提供和/或制备多价多肽,所述多价多肽包含两个(例如,在二价多肽中)、三个(例如,在三价多肽中)或更多(例如,在多价多肽中)结合单元。在这一方面中,所述氨基酸序列、和单价构建体可以作为结合结构域或结合单元用于提供和/或制备本发明的多价多肽和优选地二价或三价多肽,其包含两个、三个或更多结合单元。优选地,所述结合结构域或结合单元通过接头连接,以使得与分子间结合相比,所述多价多肽优选展示分子内结合。还优选地,所述多价多肽可以同时结合RSV的F蛋白上的两个或全部三个结合位点。
因此,本发明还涉及本发明的氨基酸序列或(如上所述)在制备多价多肽中的应用。用于制备多价多肽的方法应该包括将本发明的氨基酸序列或任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的本发明的氨基酸序列或上。
在优选的方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:60-76之一或基本上由SEQIDNO’s:60-76之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;或
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一或基本上由SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成。在另一优选方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成。
在优选的方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:146-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:146-149和151-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-149和151-153之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明涉及选自以上的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的氨基酸(谷氨酸)已经改变为天冬氨酸。
在这方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述多价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:138或基本上由SEQIDNO:138组成。在另一优选方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:139或基本上由SEQIDNO:139组成。在另一优选方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:140或基本上由SEQIDNO:140组成。在另一优选方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:141或基本上由SEQIDNO:141组成。在另一优选方面,用于制备多价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:154-157之一或基本上由SEQIDNO’s:154-157之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:75或基本上由SEQIDNO:75组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:147或基本上由SEQIDNO:147组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:149或基本上由SEQIDNO:149组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:153或基本上由SEQIDNO:153组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用:其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,并且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备多价多肽中的应用,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
本发明还涉及两个本发明的氨基酸序列和/或(如上所述)在制备二价多肽中的应用。用于制备所述二价多肽的方法应该包括任选地通过接头连接本发明的氨基酸序列和/或
因此,在优选的方面,本发明涉及两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括任选地通过接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在优选的方面,用于制备二价多肽的两个氨基酸序列包含SEQIDNO’s:60-76之一或基本上由SEQIDNO’s:60-76之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括任选地通过接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在另一优选方面,本发明涉及两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括任选地通过接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在优选的方面,所述用于制备二价多肽的两个氨基酸序列包含SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一或基本上由SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括任选地通过接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在另一优选方面,本发明涉及两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括任选地通过接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在另一优选的方面,本发明涉及两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备二价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:146-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备二价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:146-149和151-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-149和151-153之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的两个(优选相同的)氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的两个(优选相同的)氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的两个(优选相同的)氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的两个(优选相同的)氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的两个(优选相同的)氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;或
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明涉及选自以上的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的氨基酸(谷氨酸)已经改变为天冬氨酸。
在这方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述二价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选方面,用于制备二价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:138或基本上由SEQIDNO:138组成。在另一优选方面,用于制备二价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:139或基本上由SEQIDNO:139组成。在另一优选方面,用于制备二价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:140或基本上由SEQIDNO:140组成。在另一优选方面,用于制备二价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:141或基本上由SEQIDNO:141组成。在另一优选方面,用于制备二价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:154-157或基本上由SEQIDNO’s:154-157组成。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:75或基本上由SEQIDNO:75组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:147或基本上由SEQIDNO:147组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:149或基本上由SEQIDNO:149组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:153或基本上由SEQIDNO:153组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用:其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备二价多肽中的应用,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
本发明还涉及三个本发明的氨基酸序列和/或(如上所述)在制备三价多肽中的应用。用于制备所述三价多肽的方法应该包括任选地通过一个或两个接头连接本发明的氨基酸序列和/或
在优选的方面,本发明涉及三个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列)在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括任选地通过一个或两个接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在优选的方面,用于制备三价多肽的三个氨基酸序列包含SEQIDNO’s:60-76之一或基本上由SEQIDNO’s:60-76之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及三个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列)在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括任选地通过一个或两个接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在另一优选方面,本发明涉及三个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列)在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括任选地通过一个或两个接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在优选的方面,用于制备三价多肽的三个氨基酸序列包含SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一或基本上由SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及三个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列)在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括任选地通过一个或两个接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在另一优选方面,本发明涉三两个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列)在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括任选地通过一个或两个接头使所述氨基酸序列彼此连接。
在优选的方面,用于制备三价多肽的三个氨基酸序列包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成。在另一优选方面,用于制备三价多肽的三个氨基酸序列包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成。
在另一优选的方面,本发明涉及三个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列)在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或两个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备三价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:146-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及三个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列)在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或两个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及三个(优选相同的)选自以下的氨基酸序列)在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或两个接头连接到至少一个另外的氨基酸序列上。
在优选的方面,用于制备三价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:146-149和151-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-149和151-153之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的三个(优选相同的)氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的三个(优选相同的)氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的三个(优选相同的)氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的三个(优选相同的)氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的三个(优选相同的)氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:62在制备SEQIDNO:77中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:62的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的具有SEQIDNO:62的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:65在制备SEQIDNO:78中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:65的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的具有SEQIDNO:65的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:76在制备SEQIDNO:79中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:76的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的具有SEQIDNO:76的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:75在制备SEQIDNO:158中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:75的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的具有SEQIDNO:75的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:147在制备SEQIDNO:159中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:147的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的具有SEQIDNO:147的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:149在制备SEQIDNO:160中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:149的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的具有SEQIDNO:149的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:153在制备SEQIDNO:161中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:153的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的具有SEQIDNO:153的氨基酸序列上。
在另一优选方面,本发明涉及选自以上的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的氨基酸(谷氨酸)已经改变为天冬氨酸。
在这方面,本发明涉及选自以下的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
用于制备所述三价多肽的方法应该包括将所述氨基酸序列任选地通过一个或多个接头连接到至少两个另外的氨基酸序列上。
在优选方面,用于制备三价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:138或基本上由SEQIDNO:138组成。在另一优选方面,用于制备三价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:139或基本上由SEQIDNO:139组成。在另一优选方面,用于制备三价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:140或基本上由SEQIDNO:140组成。在另一优选方面,用于制备三价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO:141或基本上由SEQIDNO:141组成。在另一优选方面,用于制备三价多肽的氨基酸序列包含SEQIDNO’s:154-157之一或基本上由SEQIDNO’s:154-157之一组成。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:75或基本上由SEQIDNO:75组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:147或基本上由SEQIDNO:147组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:149或基本上由SEQIDNO:149组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:153或基本上由SEQIDNO:153组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用:其中一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
在另一优选方面,本发明涉及包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成的氨基酸序列在制备三价多肽中的应用,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:138在制备SEQIDNO:142中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:138的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的氨基酸序列(优选SEQIDNO:5)上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:139在制备SEQIDNO:143中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:139的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的氨基酸序列(优选SEQIDNO:62)上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:140在制备SEQIDNO:144中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:140的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的氨基酸序列(优选SEQIDNO:65)上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:154在制备SEQIDNO:162中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:154的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的氨基酸序列(优选SEQIDNO:75)上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:155在制备SEQIDNO:163中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:155的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的氨基酸序列(优选SEQIDNO:147)上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:156在制备SEQIDNO:164中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:156的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的氨基酸序列(优选SEQIDNO:149)上。
在另一优选方面,本发明涉及SEQIDNO:157在制备SEQIDNO:165中的应用。用于制备该多价多肽的方法应该包括将具有SEQIDNO:157的氨基酸序列通过15GS(SEQIDNO:128)接头连接至至少两个另外的氨基酸序列(优选SEQIDNO:153)上。
包含至少两个氨基酸序列和/或的本发明的多肽,其中至少一个氨基酸序列或针对第一抗原(即,针对hRSV的蛋白F),并且至少一个氨基酸序列或针对第二抗原(即,不同于hRSV的蛋白F),还叫作本发明的“多特异性”多肽,并且存在于所述多肽中的氨基酸序列或在本文中还叫作处于“多特异性形式”。因此,例如,本发明的“双特异性”多肽是包括至少一个针对第一抗原(即hRSV的蛋白F)的本发明的氨基酸序列或和至少一个针对第二抗原(即,不同于hRSV的蛋白F)的其它氨基酸序列或的多肽,而本发明的“三特异性”多肽是这样的多肽,即,其包括至少一个针对第一抗原(即hRSV的蛋白F)的氨基酸序列或至少一个针对第二抗原(即,不同于hRSV的蛋白F)的其它氨基酸序列或和至少一个针对第三抗原(即,不同于hRSV的蛋白F和所述第二抗原二者)的氨基酸序列或等等。
因此,以其最简单的形式,本发明的双特异性多肽是本发明的二价多肽(如本文所定义),其包括针对hRSV的蛋白F的本发明的第一氨基酸序列或和针对第二抗原的第二氨基酸序列或其中所述第一和第二氨基酸序列或可以任选地通过接头序列(如本文所定义)而连接;而以其最简单形式存在的本发明的三特异性多肽是本发明的三价多肽(如本文所定义),其包括针对hRSV的蛋白F的本发明的第一氨基酸序列或针对第二抗原的第二氨基酸序列或和针对第三抗原的第三氨基酸序列或其中所述第一、第二和第三氨基酸序列或可以任选地通过一个或多个,并且特别是两个接头序列连接。
在一个特定方面,本发明的多肽是三价、双特异性多肽。以其最简单形式存在的本发明的三价、双特异性多肽可以是本发明的三价多肽(如本文定义),其包括两个相同的针对HRSV的蛋白F的氨基酸序列或 和针对另一个抗原的第三氨基酸序列或其中所述第一、第二和第三氨基酸序列或可以任选地通过一个或多个、和特别是两个接头序列连接。
本发明的多特异性多肽的优选而非限制性的实例包括至少一个本发明的氨基酸序列或和至少一个提供增加的半衰期的 所述的一些优选而非限制性的实例包括针对血清蛋白的 所述血清蛋白诸如人血清白蛋白、甲状腺素结合蛋白、(人)转铁蛋白、血纤蛋白原、免疫球蛋白如IgG、IgE或IgM、或WO04/003019中列出的一种其它血清蛋白。
例如,对于在小鼠中的实验,可以使用针对小鼠血清白蛋白(MSA)的而对于药物应用,可以使用针对人血清白蛋白的
本发明的另一个实施方案是如上文所述的多肽构建体,其中所述至少一个(人)血清蛋白是(人)血清白蛋白、(人)血清免疫球蛋白、(人)甲状腺素结合蛋白、(人)转铁蛋白、(人)血纤蛋白原等中的任一种。
因此,在一个特定方面,本发明的多肽是双特异性多肽,其包括针对hRSV的蛋白F的本发明的第一氨基酸序列或和针对(人)血清白蛋白的第二氨基酸序列或其中所述第一和第二氨基酸序列或可以任选地通过接头序列连接。
在另一个特定方面,本发明的多肽是三价、双特异性多肽,其包括两个相同的针对hRSV的蛋白F的本发明的氨基酸序列或和针对(人)血清白蛋白的第三氨基酸序列或其中所述第一、第二和第三氨基酸序列或可以任选地通过一个或多个、且特别是两个接头序列连接。
在另一个特定方面,本发明的多肽是四价、双特异性多肽,其包括三个相同的针对hRSV的蛋白F的本发明的氨基酸序列或和针对(人)血清白蛋白的第四氨基酸序列或其中所述第一、第二、第三和第四氨基酸序列或可以任选地通过一个或多个、且特别是两个或三个接头序列连接。
按照本发明的一个具体而非限制性的方面,除了一个或多个本发明的氨基酸序列或之外,本发明的多肽包含至少一个针对人血清白蛋白的这些针对人血清白蛋白的可以如在上文引用的埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)的申请中(参见例如W04/062551)概括描述。一些特别优选的提供增加的半衰期且可以用于本发明的多肽中的包括WO06/122787中公开的纳米抗体ALB-1至ALB-10(参见表II和III),其中ALB-8(WO06/122787中的SEQIDNO:62)是特别优选的。
在另一个方面中,本发明涉及一种化合物或构建体,并且特别是一种蛋白或多肽(在本发明中还称为“本发明的化合物”),其包括一个或多个本发明的氨基酸序列、和/或多肽(或其适当的片段)或基本上由一个或多个本发明的氨基酸序列、和/或多肽(或其适当的片段)组成,并且任选地还包括一个或多个其它基团、残基、结构部分或结合单元。如通过本发明进一步的公开内容,对于熟练的技术人员将变得清楚的,所述其它基团、残基、结构部分、结合单元或氨基酸序列可以为或可以不为本发明的氨基酸序列、或多肽(和/或为其中存在本发明的氨基酸序列、或多肽的化合物、构建体或多肽)提供其它的官能性,并且可以修饰或可以不修饰本发明的氨基酸序列、和/或多肽的特性。
例如,所述基团、残基、结构部分或结合单元可以是化学基团、残基、结构部分,其自身可以是或可以不是生物学活性和/或药理学活性的。例如,并且不限于,所述基团可以连接到一个或多个本发明的氨基酸序列、 和/或多肽上,以提供本发明的氨基酸序列、和/或多肽的“衍生物”,如本发明进一步所述。
也在本发明范围内的是这样的化合物或构建体,其包括一个或多个本发明所述的衍生物或基本上由其组成,并且任选地还包括任选地通过一个或多个接头连接的一个或多个其它基团、残基、结构部分或结合单元。优选地,所述一个或多个其它基团、残基、结构部分或结合单元是氨基酸序列。
在上述化合物、构建体或多肽中,所述一个或多个本发明的氨基酸序列、和/或多肽以及所述一个或多个基团、残基、结构部分或结合单元可以彼此直接连接和/或通过一个或多个适当的接头或间隔体连接。例如,当所述一个或多个基团、残基、结构部分或结合单元是氨基酸序列时,所述接头可以也是氨基酸序列,以致所得到的化合物、构建体或多肽是融合(蛋白)或融合(多肽)。
本发明的化合物或构建体可以包括本发明的氨基酸序列、或多肽,所述氨基酸序列、或多肽在其氨基末端、在其羧基末端、或者在其氨基末端和其羧基末端两端融合至少一个其它氨基酸序列,即,以提供包括所述本发明的氨基酸序列、或多肽和一个或多个其它氨基酸序列的融合蛋白。
所述一个或多个其它氨基酸序列可以是任何适宜的和/或理想的氨基酸序列。所述其它氨基酸序列可以或可以不变化、改变或另外影响所述本发明的氨基酸序列、或多肽的(生物学)特性,并且可以或可以不为本发明的氨基酸序列、、或多肽加入其它的官能性。优选地,所述其它氨基酸序列是这样的,以致它赋予本发明的氨基酸序列、 或多肽一种或多种理想的特性或官能性。
这样的氨基酸序列的实例是熟练的技术人员所清楚的,并且通常可以包括基于常规抗体及其片段(包括但不限于ScFv’s和单结构域抗体)的用于肽融合的所有氨基酸序列。例如,参考Holliger和Hudson,自然生物技术(NatureBiotechnology),23,9,1126-1136(2005)的综述。
例如,与本发明的氨基酸序列、或多肽本身相比,所述氨基酸序列可以是这样的氨基酸序列,即,其增加本发明的化合物的半衰期、溶解性、或吸收,减少本发明的化合物的免疫原性或毒性,消除或减弱本发明的化合物的不理想的副作用,和/或赋予本发明的化合物其它有利的特性和/或减少本发明的化合物的不理想特性。所述氨基酸序列的一些非限制性实例为血清蛋白,诸如人血清白蛋白(参见,例如WO00/27435)或半抗原分子(例如被循环抗体识别的半抗原,参见例如WO98/22141)。
所述其它的氨基酸序列还可以提供第二结合位点,所述结合位点可以针对任何理想的蛋白、多肽、抗原、抗原决定簇或表位(包括但不限于针对本发明的氨基酸序列或的相同的蛋白、多肽、抗原、抗原决定簇或表位,或者不同的蛋白、多肽、抗原、抗原决定簇或表位)。例如,所述其它氨基酸序列可以提供针对血清蛋白(诸如例如,人血清白蛋白或另一种血清蛋白,诸如IgG)的第二结合位点,以提供增加的血清半衰期。这样的氨基酸序列例如包括在WO91/01743,WO01/45746和WO02/076489中描述的以及小肽和结合蛋白,和在WO03/002609和WO04/003019中描述的dAb’s。还参考Harmsen等,Vaccine(疫苗),23(41);4926-42,2005,以及埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)的EP0368684,以及WO08/028977,WO08/043821,WO08/043822,和WO08/068280。
这样的氨基酸序列可以特别针对血清白蛋白(和更具体地人血清白蛋白)和/或针对IgG(和更具体地人IgG)。例如,该氨基酸序列可以是针对(人)血清白蛋白的氨基酸序列和可以结合(人)血清白蛋白上的氨基酸残基(其不参与血清白蛋白与FcRn的结合(参见例如WO06/0122787))的氨基酸序列和/或能够结合血清白蛋白上的不形成血清白蛋白的结构域III的一部分的氨基酸残基(再次参见例如WO06/0122787)的氨基酸序列;具有或可以提供增加的半衰期的氨基酸序列(例如,参见WO08/028977);与来自至少一个哺乳动物物种的、并且特别是与至少一个灵长类物种的血清白蛋白交叉反应的针对人血清白蛋白的氨基酸序列(诸如但不限于,来自猕猴属(Macaca)的猴子(诸如,并且特别地,食蟹猴(食蟹猴(Macacafascicularis))和/或恒河猴(恒河猴(Macacamulatta)))和狒狒(豚尾狒狒(Papioursinus)),同样参考WO08/028977);可以以pH不依赖方式结合血清白蛋白的氨基酸序列(参见,例如WO08/043821),和/或是条件粘合剂的氨基酸序列(例如,参见WO08/043822)。
根据另一个实施方案,所述一个或多个其它氨基酸序列可以包括常规4-链抗体(且特别是人抗体)和/或重链抗体的一个或多个部分、片段或结构域。例如,尽管通常较不优选,本发明的氨基酸序列、或多肽可以再次任选地通过接头序列(包括但不限于其它(单)结构域抗体,诸如Ward等描述的dAb’s)连接至常规(优选人)VH或VL结构域或VH或VL结构域的天然或合成的类似物。
因此,在本发明的化合物或构建体中,所述一个或多个其它基团、残基、结构部分或结合单元可以选自由以下组成的组:结构域抗体,适合用作结构域抗体的氨基酸序列,单结构域抗体,适合用作单结构域抗体的氨基酸序列,"dAb’s",适合用作dAb的氨基酸序列,或
在本发明的一个具体方面,与相对应的本发明的氨基酸序列、 或多肽相比,包括至少一个本发明的氨基酸序列、或多肽的本发明的化合物、构建体或多肽可以具有增加的半衰期。基于本文进一步的公开内容,这些化合物、构建体和多肽的一些优选但不限制性的实例对于本领域技术人员将变得清楚,并且例如包括已经被化学修饰以增加其半衰期(例如,通过聚乙二醇化方式)的本发明的氨基酸序列、 或多肽;或包括至少一个与增加本发明的氨基酸序列、或多肽的半衰期的至少一个结构部分(并且特别是至少一个氨基酸序列)连接的本发明的氨基酸序列、或多肽的本发明的化合物。基于本发明进一步的公开内容,包括所述半衰期延长结构部分的本发明的化合物的实例对于熟练的技术人员将变得清楚;并且例如,包括,但不限于,这样的化合物,其中所述一个或多个本发明的氨基酸序列、或多肽适当地连接一个或多个血清蛋白或其片段(诸如血清白蛋白或其适当的片段)或连接一个或多个可以结合血清蛋白的结合单元(诸如,例如, 或(单)结构域抗体,其可以结合血清蛋白诸如血清白蛋白,血清免疫球蛋白,诸如IgG,或转铁蛋白);其中本发明的氨基酸序列、 或多肽连接至Fc部分(诸如人Fc)或其适当部分或其片段的化合物;或其中一个或多个本发明的氨基酸序列、或多肽适当地连接至一个或多个可以结合血清蛋白的小蛋白或肽(诸如,非限制性地,在WO91/01743,WO01/45746,WO02/076489中描述的蛋白和肽)的化合物。
所述至少一个氨基酸序列、或多肽也可以任选地通过接头序列连接至一个或多个(优选人)CH1,CH2和/或CH3结构域。例如,也例如可以使用连接至适当CH1结构域的氨基酸序列、或多肽–与适当的轻链一起–以产生类似于常规Fab片段或F(ab’)2片段的抗体片段/结构,但是其中一个或(在F(ab’)2片段的情况下)一个或两个常规VH结构域已经被本发明的氨基酸序列、或多肽替代。此外,两个氨基酸序列或可以(任选地通过接头)连接至CH3结构域以提供具有增加的体内半衰期的构建体。
根据一个特定方面,一个或多个本发明的氨基酸序列、或多肽可以(任选地通过适当接头或铰链区)连接至一个或多个恒定结构域(例如,2或3个恒定结构域,其可以用作Fc部分的一部分/形成Fc部分),连接至Fc部分和/或连接至赋予本发明的氨基酸序列、或多肽一种或多种效应子功能和/或可以赋予结合一个或多个Fc受体的能力的一个或多个抗体部分、片段或结构域。例如,为此目的,并且不限于此,所述一个或多个另外的氨基酸序列可以包括抗体的一个或多个CH2和/或CH3结构域,其诸如来自重链抗体(如本文所述)和更优选来自常规人4-链抗体;和/或可以形成Fc区域(的一部分),其例如来自IgG(例如来自IgG1,IgG2,IgG3或IgG4),来自IgE或来自另一种人Ig诸如IgA,IgD或IgM。例如,WO94/04678描述了包括骆驼VHH结构域或其人源化衍生物的重链抗体(即,)的重链抗体,其中骆驼科动物(Camelidae)CH2和/或CH3结构域已经被人CH2和CH3结构域替换,以便提供由2个重链组成的免疫球蛋白,所述重链各自包含和人CH2和CH3结构域(但是无CH1结构域),所述免疫球蛋白具有由CH2和CH3结构域提供的效应子功能,并且所述免疫球蛋白可以在不存在任何轻链的情况下发挥作用。可以适当地连接至本发明的氨基酸序列、或多肽以便提供效应子功能的其它氨基酸序列对于本领域技术人员是清楚的,并且可以基于所需的效应子功能进行选择。例如,参考WO04/058820,WO99/42077,WO02/056910和WO05/017148以及Holliger和Hudson,同前所述的综述;和WO09/068628。与相对应的本发明的氨基酸序列、 或多肽相比,本发明的氨基酸序列、或多肽与Fc部分偶联也可以导致增加的半衰期。对于一些应用,使用赋予增加的半衰期而无任何生物学显著效应子功能的Fc部分和/或恒定结构域(即,CH2和/或CH3结构域)也可以是适当的或者甚至是优选的。熟练的技术人员应该清楚具有增加的体内半衰期的包括一个或多个氨基酸序列、或多肽和一个或多个恒定结构域的其它适当的构建体,并且例如,其可以包括与CH3结构域连接的氨基酸序列、或多肽,任选地通过接头序列连接。通常,具有增加的半衰期的任何融合蛋白或衍生物将优选具有大于50kD的分子量,50kD是肾吸收的截留值。
在另一个具体但非限制性方面,为了形成本发明的化合物,一个或多个本发明的氨基酸序列、或多肽可以连接(任选地通过适当的接头或铰链区)至天然存在、合成或半合成的恒定结构域(或其类似物,变体,突变体,部分或片段),其具有降低的(或基本上无)自缔合成二聚体的趋势(即,与天然存在于常规4-链抗体中的恒定结构区相比)。该单体(即,非自缔合的)Fc链变体或其片段对于本领域技术人员是清楚的。例如,Helm等,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)19962717494)描述可以用于本发明的多肽链的单体Fc链变体。
此外,这种单体Fc链变体优选是这样的,以致它们仍能够结合补体或相关的Fc受体(取决于衍生它们的Fc部分),和/或是这样的,以致它们仍具有衍生它们的Fc部分的一些或所有效应子功能(或以仍适合于目的用途的降低的水平)。备选地,在本发明的这种多肽链中,单体Fc链可以用于赋予多肽链以增加的半衰期,在该情形中单体Fc链也可以不具有或基本上不具有效应子功能。
通常,具有增加的半衰期的本发明的氨基酸序列、或多肽(或包含其的化合物、构建体)优选具有的半衰期是相对应的本发明的氨基酸序列、或多肽本身的半衰期的至少1.5倍,优选至少2倍,诸如至少5倍,例如至少10倍或大于20倍。例如,与相对应的本发明的氨基酸序列、或多肽本身相比较,具有增加的半衰期的本发明的氨基酸序列、化合物、构建体或多肽可以具有增加多于1小时、优选多于2小时、更优选多于6小时、诸如多于12小时、或甚至多于24、48或72小时的半衰期。
在本发明一个优选但非限制性的方面,本发明的这种氨基酸序列、化合物、构建体或多肽在人中显示至少约12小时,优选至少24小时,更优选至少48小时,还更优选至少72小时以上的血清半衰期。例如,本发明的化合物或多肽可以具有至少5天(诸如约5至10天),优选至少9天(诸如约9至14天),更优选至少约10天(诸如约10至15天),或至少约11天(诸如约11至16天),更优选至少约12天(诸如约12至18天或更多),或超过14天(诸如约14至19天)的半衰期。
所述其它氨基酸序列还可以形成信号序列或前导序列,其引导本发明的氨基酸序列、或多肽在合成后从宿主细胞中分泌(例如,以提供本发明的多肽的前体-(pre-)、原-(pro-)或前原-(prepro-)形式,这取决于用来表达本发明的多肽的宿主细胞)。
所述其它氨基酸序列还可以形成这样的序列或信号,即,所述序列或信号允许本发明的氨基酸序列、或多肽导向和/或透过或进入特定的器官、组织、细胞、或者细胞的部分或区室,和/或所述序列或信号允许本发明的氨基酸序列、或多肽透过或穿过生物屏障诸如细胞膜、细胞层诸如上皮细胞层。所述氨基酸序列的适当的实例对于熟练的技术人员是清楚的,并且例如包括但不限于,上文提及的“Peptrans”载体,Cardinale等描述的序列,以及本身已知的可以用来将本发明的和多肽表达或生产为所谓的“细胞内抗体”的氨基酸序列和抗体片段,例如,如在WO94/02610,WO95/22618,US7,004,940,WO03/014960,WO99/07414;WO05/01690;EP1512696;和Cattaneo,A.&Biocca,S.(1997)细胞内抗体:开发和应用(IntracellularAntibodies:DevelopmentandApplications).Landes和Springer-Verlag;和在Kontermann,方法(Methods)34,(2004),163-170,以及本发明所述的其它参考文献中所述。
这样的蛋白、多肽、化合物或构建体也可以处于基本分离的形式(如本文定义)。
本发明的化合物或多肽通常可以通过这样的方法制备,所述方法包括将所述一个或多个本发明的氨基酸序列、单价构建体和/或多肽任选地通过一个或多个适当的接头适当地连接到所述一个或多个其它基团、残基、结构部分或结合单元上的至少一个步骤,以提供本发明的化合物或多肽。本发明的多肽还可以通过这样的方法制备,所述方法通常至少包括下述步骤:提供编码本发明的多肽的核酸,以适当方式表达所述核酸,和回收所表达的本发明的多肽。例如,基于本发明进一步所述的方法和技术,这样的方法可以以本身已知的方式进行,这对于熟练的技术人员将是清楚的。
用于多价和/或多特异性多肽或构建体的适当的间隔体或接头对于本领域技术人员是清楚的,并且可以通常是本领域用于连接氨基酸序列的任何接头或间隔体。优选地,所述接头或间隔体适合用于构建意欲用于药物用途的蛋白质或多肽。
一些特别优选的间隔体包括本领域中用于连接抗体片段或抗体结构域的间隔体和接头。这些包括上文所引用的公知背景技术中提及的接头,以及例如在本领域中用于构建双抗体或ScFv片段的接头(在这一方面,然而,应该注意,尽管在双抗体和在ScFv片段中,所用的接头序列应该具有某种长度、某种程度的柔性以及允许相关的VH和VL结构域靠近在一起形成完整的抗原-结合位点的其它特性,但是,由于每一氨基酸序列或 本身形成完整的抗原-结合位点,所以对于用于本发明的多肽的接头的长度和柔性没有特别的限制)。
例如,接头可以是适当的氨基酸序列,并且特别是1-50、优选1-30、诸如1-10个氨基酸残基的氨基酸序列。所述氨基酸序列的一些优选实例包括gly-ser接头,例如,(glyxsery)z型的,诸如例如(gly4ser)3或(gly3ser2)3,如在WO99/42077中所述,铰链样区域如天然存在的重链抗体的铰链区或类似的序列(如在WO94/04678中所述)。
一些其他特别优选的接头是聚丙氨酸(如AAA),以及在表A-7中提及的接头,其中GS15是特别优选的。
其它适宜的接头通常包括有机化合物或聚合物,特别是适用于药用蛋白的那些。例如,聚(乙二醇)结构部分已经用来连接抗体结构域,参见例如WO04/081026。
下列情形包括在本发明范围内:所用的接头的长度、柔性程度和/或其他特性(尽管不是关键的,由于它通常是用在ScFv片段中的接头)可以对本发明最终的多肽的特性具有一些影响,包括但不限于针对hRSV的蛋白F、或针对一种或多种其他抗原的亲和性、特异性或抗体亲抗原性。基于本文的公开内容,任选地在一些有限的常规实验之后,熟练的技术人员应该能够确定用于本发明的特异性多肽的最佳接头。
下列情形也在本发明范围内:所用接头赋予本发明的多肽一种或多种其它有利特性或官能性,和/或提供用于形成衍生物和/或用于官能团附着的一个或多个位点(例如,如本文关于本发明的氨基酸序列、化合物和多肽的衍生物的描述)。例如,包含一个或多个带电荷氨基酸残基的接头可以提供提高的亲水特性,而形成或包含小的表位或标记的接头可以用于检测、鉴定和/或纯化目的。并且,基于本文的公开内容,任选地在一些有限的常规实验之后,熟练的技术人员应该能够确定用于本发明的特异性多肽的最佳接头。
最后,当两个或更多个接头用于本发明的多肽时,这些接头可以相同或不同。并且,基于本文的公开内容,任选地在一些有限的常规实验之后,熟练的技术人员应该能够确定用于本发明的特异性多肽的最佳接头。
通常,为了使表达和生产容易,本发明的多肽将是线性多肽。然而,本发明在其最广泛意义上不限于此。例如,当本发明的多肽包括三个以上氨基酸序列或时,可以利用具有三个或更多个“臂”的接头连接它们,所述每个“臂”与氨基酸序列或连接,以提供“星形”的构建体。尽管通常较不优选,但是还可以使用环形的构建体。
从本文的公开内容清楚的是,本发明的范围还包括使用如本文定义的本发明的氨基酸序列、或多肽的部分或片段,或两个以上部分或片段的组合,并且特别是SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的氨基酸序列和SEQIDNO’s:77-79,142-145和158-165的多肽的部分或片段。因此,根据本发明的一个实施方案,术语“本发明的氨基酸序列”、“本发明的”和“本发明的多肽”在其最广泛意义上还涵盖这些部分或片段。
通常,本发明的氨基酸序列、或多肽(包括其变体,如本文中定义)的这些部分或片段具有与本发明相应的全长氨基酸序列或 的氨基酸序列相比在N末端的一个或多个氨基酸残基、在C末端的一个或多个氨基酸残基、一个或多个连续的内部氨基酸残基、或它们的任何组合已经被缺失和/或去除的氨基酸序列。
所述部分或片段优选是这样的,以致它们可以以如本文定义的亲和性(适当测量和/或表示为KD-值(实际的或表观的),KA-值(实际的或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地作为IC50值,如本发明进一步所述)结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II。
具体地,氨基酸序列、多肽和部分或片段优选是这样的,以致它们:
-以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选10nM-1nM或更小的解离常数(KD)结合hRSV的蛋白F;
和/或是这样的,以致它们:
-以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1或更大的kon-速率结合hRSV的蛋白F;
和/或是这样的,以致它们:
以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更小的koff速率结合hRSV的蛋白F。
针对hRSV的蛋白F的部分或片段的亲和性可以以本身已知的方式,例如利用本文中描述的测定来确定。
这样的部分或片段通常应该还具有如本文中定义的hRSV中和功效和/或效力。
任何部分或片段优选是这样的,以使其包含相应的本发明的全长氨基酸序列、或多肽的至少10个连续氨基酸残基,优选至少20个连续氨基酸残基,更优选至少30个连续氨基酸残基,诸如至少40个连续氨基酸残基。
此外,任何部分或片段优选是这样的,以使它包含CDR’s中至少一个(并且优选至少CDR3或其部分)和至少一个其它CDR(即,CDR1或CDR2)或至少其部分,它们优选通过适当的构架序列或至少其部分连接。更优选地,任何部分或片段是这样的,以致它包含CDR’s中至少一个(并且优选至少CDR3或其部分)和其余两个CDR的至少一部分,它们同样优选通过适当构架序列或至少其部分连接。
根据另一个特别优选但非限制性的实施方案,该部分或片段包括相应的本发明全长的至少CDR3,诸如FR3,CDR3和FR4,即如例如国际申请WO03/050531(Lasters等)中所述。
如以上已经提及,还可以将两个或更多个这些部分或片段(即,来自相同或不同的本发明的氨基酸序列或)组合,即以提供本发明氨基酸序列、或多肽的其它部分或片段(如本文定义)。还例如可以将本发明的氨基酸序列、或多肽的一个或多个部分或片段与人VH结构域的一个或多个部分或片段组合。
根据一个优选的实施方案,所述部分或片段与SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的氨基酸序列或之一或与SEQIDNO’s:77-79,142-145和158-165的多肽之一具有至少50%,优选至少60%,更优选至少70%,还更优选至少80%,诸如至少90%,95%或99%以上的序列同一性程度。
所述部分和片段和编码它们的核酸序列可以以本身已知的任何方式提供和任选地组合。例如,这些部分或片段可以通过将终止密码子插入编码全长的本发明的氨基酸序列、或多肽的核酸,然后以本身已知的方式(例如,如本文所述)表达如此获得的核酸来获得。备选地,编码这些部分或片段的核酸可以如下获得:适当地限制性酶切编码全长的本发明的氨基酸序列、或多肽的核酸,或以本身已知的方式合成该核酸。使用本身已知的用于肽合成的技术也可以提供部分或片段。
本发明在其最广泛意义上还包括本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的衍生物。这样的衍生物通常可以通过本发明的氨基酸序列、化合物或多肽和/或形成本发明的氨基酸序列、 化合物或多肽的一个或多个氨基酸残基的修饰而获得,并且特别是通过化学和/或生物学(例如,酶促)修饰获得。
熟练的技术人员应该清楚这样的修饰的实例,以及氨基酸序列、 序列、化合物或多肽序列中可以以这样的方式修饰的氨基酸残基的实例(即,在蛋白骨架上但是优选地在侧链上),可以用来引入所述修饰的方法和技术以及所述修饰的潜在用途和优点。
例如,这样的修饰可以包括向本发明的氨基酸序列、化合物或多肽内或向本发明的氨基酸序列、化合物或多肽上引入(例如,通过共价连接或以其它适当的方式)一个或多个官能团、残基或结构部分,并且特别是赋予本发明的氨基酸序列、化合物或多肽一种或多种理想的特性或官能性的一个或多个官能团、残基或结构部分。熟练的技术人员应该清楚所述官能团的实例。
例如,所述修饰可以包括引入(例如,通过共价结合或以任何其它适当的方式)一个或多个这样的官能团,即,所述官能团增加本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的半衰期、溶解性和/或吸收,减少本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的免疫原性和/或毒性,消除或减弱本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的任何不理想的副作用,和/或赋予本发明的氨基酸序列、化合物或多肽其它的有利特性和/或减少本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的不理想特性;或者两种以上上述的任何组合。所述官能团的实例以及引入所述官能团的技术的实例应该为熟练的技术人员清楚,并且通常可以包括上文引用的综合背景技术中提及的所有官能团和技术,以及本身已知的用于修饰药物蛋白并且特别用于修饰抗体或抗体片段(包括ScFv’s和单结构域抗体)的官能团和技术,关于其的参考文献例如参考雷明顿药物科学(Remington′sPharmaceuticalSciences),第16版,MackPublishingCo.,Easton,PA(1980)。例如,所述官能团可以直接连接(例如共价地)到本发明的氨基酸序列、化合物或多肽上,或者任选地通过适当的接头或间隔体连接,这也为熟练的技术人员所清楚。
关于增加半衰期和/或减少药物蛋白的免疫原性最广泛应用的一种技术包括适当的药用聚合物诸如聚(乙二醇)(PEG)或其衍生物(诸如甲氧基聚(乙二醇)或mPEG)的附着。一般地,可以应用聚乙二醇化作用的任何适当的形式,诸如本领域中用于抗体和抗体片段(包括但不限于(单)结构域抗体和ScFv’s)的聚乙二醇化作用;例如,参考Chapman,自然生物技术(Nat.Biotechnol.),54,531-545(2002);Veronese和Harris,高级药物递送综述(Adv.DrugDeliv.Rev.)54,453-456(2003),Harris和Chess,自然药物发现综述(Nat.Rev.Drug.Discov.),2,(2003)以及在WO04/060965中。用于蛋白聚乙二醇化的各种试剂还可以商购,例如从美国Nektar治疗公司(NektarTherapeutics)购得。
优选地,应用定向聚乙二醇化,特别是通过半胱氨酸-残基(参见例如Yang等,蛋白质工程(ProteinEngineering),16,10,761-770(2003)。例如,为了这一目的,PEG可以附着到在本发明的氨基酸序列、化合物或多肽中天然存在的半胱氨酸残基上,本发明的氨基酸序列、 化合物或多肽可以这样进行修饰,以适当地引入一个或多个用于PEG附着的半胱氨酸残基,或者可以将包括一个或多个用于PEG附着的半胱氨酸残基的氨基酸序列融合到本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的N-端和/或C-端,所有均应用本身为熟练的技术人员所了解的蛋白质加工技术。
优选地,对于本发明的氨基酸序列、化合物或多肽,使用具有大于5000,诸如大于10,000并且小于200,000,诸如小于100,000;例如在20,000-80,000范围内的分子量的PEG。
另一种通常较不优选的修饰包括N-连接的或O-连接的糖基化,通常作为共翻译和/或翻译后修饰的一部分,其取决于为表达本发明的氨基酸序列、化合物或多肽所用的宿主细胞。
还有另一种修饰可以包括引入一种或多种可检测的标记或其它信号-产生基团或结构部分,其取决于所标记的本发明的氨基酸序列、 化合物或多肽的目的用途。适宜的标记以及附着、使用和检测它们的技术是熟练的技术人员所清楚的,并且例如包括但不限于,荧光标记(诸如荧光素、异硫氰酸酯、罗丹明、藻红蛋白、藻蓝蛋白、别藻蓝蛋白、邻苯二醛(o-phthaldehyde)、以及荧光胺和荧光素金属诸如152Eu或其它来自镧系的金属),磷光性标记、化学发光标记或生物发光标记(诸如鲁米那、异鲁米诺、theromaticacridinium酯、咪唑、acridinium盐、草酸酯、二氧杂环丁烷(dioxetane)或GFP及其类似物),放射性-同位素(诸如3H,125I,32P,35S,14C,51Cr,36Cl,57Co,58Co,59Fe,和75Se),金属、金属螯合物或金属阳离子(例如金属阳离子诸如99mTc,123I,111In,131I,97Ru,67Cu,67Ga,和68Ga,或其它特别适合用于体内、体外或原位诊断和成像的金属或金属阳离子,诸如(157Gd,55Mn,162Dy,52Cr,和56Fe)),以及发色团和酶(诸如苹果酸脱氢酶、葡萄球菌核酸酶、△-V-类固醇异构酶、酵母醇脱氢酶、α-磷酸甘油脱氢酶、丙糖磷酸异构酶、生物素-抗生物素蛋白过氧化酶、辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、天冬酰胺酶、葡糖氧化酶、β-半乳糖苷酶、核糖核酸酶、脲酶、过氧化氢酶、葡萄糖-VI-磷酸脱氢酶、葡糖淀粉酶和乙酰胆碱酯酶)。其它适宜的标记为熟练的技术人员所清楚,并且例如包括可以应用NMR或ESR光谱检测的结构部分。
例如,这样标记的本发明的氨基酸序列、化合物或多肽可以用于体外、体内或原位检测(包括本身已知的免疫检测,诸如ELISA,RIA,EIA和其它“夹心式检测”等),以及体内诊断和成像目的,这取决于特定的标记的选择。
熟练的技术人员应该清楚,另一种修饰可以包括引入螯合基团,例如以螯合上文提到的金属或金属阳离子中的一种。例如,适当的螯合基团包括但不限于二乙烯三胺五乙酸(DTPA)或乙二胺四乙酸(EDTA)。
还有另一种修饰可以包括引入作为特异性结合对诸如生物素-(链霉)抗生物素蛋白结合对的一部分的官能团。这样的官能团可以用来将本发明的氨基酸序列、化合物或多肽与另一种蛋白、多肽或化学化合物结合,所述另一种蛋白、多肽或化学化合物与所述结合对的另一半结合,即,通过形成所述结合对来结合。例如,本发明的氨基酸序列、化合物或多肽可以缀合到生物素上,并且连接到与抗生物素蛋白或链霉抗生物素蛋白缀合的另一种蛋白、多肽、化合物或载体上。例如,这样缀合的氨基酸序列、化合物或多肽可以用作报道子,例如在产生可检测的信号的试剂与抗生物素蛋白或链霉抗生物素蛋白缀合的诊断系统中用作报道子。例如,这种结合对还可以用来将本发明的氨基酸序列、化合物或多肽与载体结合,所述载体包括适用于药物目的的载体。一个非限制性的实例是Cao和Suresh,药物靶向杂志(JournalofDrugTargetting),8,4,257(2000)所述的脂质体制剂。这种结合对还可以用来将治疗活性剂与本发明的氨基酸序列、化合物或多肽结合。
熟练的技术人员应该清楚其它潜在的化学和酶促修饰。这种修饰还可以为研究目的引入(例如,为了研究功能-活性关系)。例如,参考Lundblad和Bradshaw,生物技术和应用生物化学(Biotechnol.Appl.Biochem.),26,143-151(1997)。
优选地,所述衍生物是这样的,以致它们以如本发明所定义(即如关于所述氨基酸序列、多肽或化合物本身所定义)的亲和性(适当测量和/或表示为KD-值(实际的或表观的),KA-值(实际的或表观的),kon-速率和/或koff-速率,或备选地为IC50值,如本发明进一步所述)与hRSV的蛋白F结合。这样的衍生物通常应该也具有如本文中定义的hRSV中和功效和/或效力。
如上文提及,本发明还涉及基本上由至少一个本发明的氨基酸序列、化合物或多肽组成或包括至少一个本发明的氨基酸序列、 化合物或多肽。“基本上由……组成”意指本发明的蛋白质或多肽的氨基酸序列与本发明的氨基酸序列、化合物或多肽完全相同,或者与本发明氨基酸序列、化合物或多肽相对应,其将有限数目的氨基酸残基,诸如1-20个氨基酸残基,例如1-10个氨基酸残基并且优选地1-6个氨基酸残基,诸如1,2,3,4,5或6个氨基酸残基添加到所述氨基酸序列、化合物或多肽的氨基末端、羧基末端或者氨基末端和羧基末端两端。
所述氨基酸残基可以变化或者可以不变化、改变或者另外影响本发明的所述氨基酸序列、化合物或多肽的(生物学)特性,并且可以或者可以不为所述氨基酸序列、化合物或多肽添加其它的官能性。例如,所述氨基酸残基:
a)可以包括N-端Met残基,例如,作为在异源宿主细胞或宿主生物体内表达的结果;
b)可以形成信号序列或前导序列,当合成时其引导所述氨基酸序列、化合物或多肽从宿主细胞中分泌。适宜的分泌性前导肽应该是熟练的技术人员所清楚的,并且可以如本文进一步所述的。通常,这样的前导序列与所述氨基酸序列、化合物或多肽的N端连接,尽管本发明在其最广泛意义上不限于此;
c)可以形成这样的序列或信号,即,所述序列或信号允许所述氨基酸序列、化合物或多肽导向和/或透过或进入特异性的器官、组织、细胞、或者细胞的部分或区室,和/或所述序列或信号允许所述氨基酸序列、化合物或多肽透过或穿过生物屏障诸如细胞膜、细胞层诸如上皮细胞层、肿瘤包括实体瘤、或血脑屏障。所述氨基酸序列的实例对于熟练的技术人员是清楚的。一些非限制性的实例是在WO03/026700和Temsamani等,生物学治疗的专家观点(ExpertOpin.Biol.Ther.),1,773(2001);Temsamani和Vidal,今日药物发现(DrugDiscov.Today),9,1012(004)以及Rousselle,药理学和实验治疗学杂志(J.Pharmacol.Exp.Ther.),296,124-131(2001)中所述的小肽载体(“Pep-trans载体”),和由Zhao等,程序性细胞死亡(Apoptosis),8,631-637(2003)所述的膜易位体序列。例如,用于抗体片段细胞内靶向的C端和N端氨基酸序列由Cardinale等,方法(Methods),34,171(2004)所述。关于细胞内靶向的其它适宜的技术包括所谓的“细胞内抗体(intrabody)”的表达和/或应用,所述“细胞内抗体”包括本发明的氨基酸序列、化合物或多肽,如下文所提及;
d)可以形成“标记”,例如允许或促进所述氨基酸序列、化合物或多肽的纯化的氨基酸序列或残基,例如使用针对所述序列或残基的亲和技术进行纯化。然后,所述序列或残基可以被去除(例如,通过化学或酶促裂解),以提供氨基酸序列、化合物或多肽(为了这一目的,所述标记可以任选地通过可裂解的接头序列与所述氨基酸序列、化合物或多肽序列连接或包含可裂解的基序)。这种残基的一些优选的但非限制性的实例是多组氨酸残基、谷胱甘肽(glutatione)残基以及myc-标记诸如AAAEQKLISEEDLNGAA(SEQIDNO:111);
e)可以是已经被官能化和/或可以作为官能团附着的位点的一个或多个氨基酸残基。适宜的氨基酸残基和官能团应该是熟练的技术人员所清楚的,并且包括但不限于,本文关于本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的衍生物提及的氨基酸残基和官能团。
本发明还涉及用于制备本文中所述的氨基酸序列、多肽、化合物、核酸、宿主细胞、产品和组合物的方法。
本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和核酸可以以本身已知的方式制备,熟练的技术人员应该从本文的进一步描述中而清楚。例如,本发明的氨基酸序列、和多肽可以以本身已知用于制备抗体且特别是用于制备抗体片段(包括但不限于(单)结构域抗体和ScFv片段)的任何方式制备。制备所述氨基酸序列、多肽和核酸的一些优选但非限制性的方法包括本发明所述的方法和技术。
用于制备本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、或本发明的单价构建体的方法可以包括以下步骤:
-在适宜的宿主细胞或宿主生物体(本文还叫作“本发明的宿主”)中或在另一种适宜的表达系统中,表达编码所述本发明的氨基酸序列、或多肽的核酸(本文还叫作“本发明的核酸”),任选地接着进行:
-分离和/或纯化这样获得的本发明的氨基酸序列、或多肽。特别地,这样的方法可以包括下列步骤:
-在某种条件下培养和/或维持本发明的宿主,所述条件是这样的,以致所述本发明的宿主表达和/或生产至少一种本发明的氨基酸序列、 和/或多肽;
任选地接着进行:
-分离和/或纯化这样获得的本发明的氨基酸序列、或多肽。
因此,本发明还涉及编码本发明的氨基酸序列、多肽或单价构建体的核酸或核苷酸序列(在本文中还称为“本发明的核酸”或“本发明的核苷酸序列”)。本发明的核酸可以是单链或双链DNA或RNA的形式,并且优选地是双链DNA形式。例如,本发明的核苷酸序列可以是基因组DNA、cDNA或合成的DNA(诸如具有特别适用于在要用的宿主细胞或宿主生物体中表达的密码子应用的DNA)。
按照本发明的一个实施方案,本发明的核酸是基本上分离的形式,如本发明所定义。本发明的核酸还可以是这样的形式,即,存在于载体中和/或是载体的一部分,诸如例如质粒、黏端质粒或YAC,其也可以是基本上分离的形式。
基于关于本文给出的本发明的氨基酸序列、和/或多肽的信息,本发明的核酸可以以本身已知的方法制备或获得,和/或可以从适当的天然来源分离。并且,熟练的技术人员应该清楚,为了制备本发明的核酸,还有一些核苷酸序列,诸如至少一种编码氨基酸序列或的核苷酸序列,以及例如编码一种或多种接头的核酸,可以以适当的方法连接在一起。
用于产生本发明的核酸的技术应该是熟练的技术人员所清楚的,并且例如可以包括但不限于,自动DNA合成;位点定向诱变;将两个或多个天然存在的和/和合成的序列(或者其两个或更多个部分)结合,引入引起剪截表达产物表达的突变;引入一个或多个限制性位点(例如,以产生可以使用适宜的限制性酶容易地消化和/或连接的盒和/或区),和/或通过PCR反应的方法引入突变,所述PCR反应使用一个或多个“错配”引物。这些以及其它技术应该是熟练的技术人员所清楚的,并且参考也参见上文提及的标准手册,诸如Sambrook等和Ausubel等,以及下文的实施例。
本发明的核酸还可以是这样的形式,即,存在于遗传构建体中和/或是遗传构建体的一部分,这对于本领域的技术人员应该是清楚的。这样的遗传构建体通常包括至少一种本发明的核酸,其任选地与本身已知的一个或多个遗传构建体元件连接,诸如例如一个或多个适宜的调节元件(诸如适当的启动子、增强子、终止子、等等)和本文提到的其它遗传构建体元件。包括至少一种本发明的核酸的所述遗传构建体在本文也叫作“本发明的遗传构建体”。
本发明的遗传构建体可以是DNA或RNA,并且优选地是双链DNA。本发明的遗传构建体还可以是适于要用的宿主细胞或宿主生物体的转化的形式,适于结合到要用的宿主细胞的基因组DNA中的形式,或者适于在要用的宿主生物体中独立复制、维持和/或遗传的形式。例如,本发明的遗传构建体可以是载体形式,诸如例如质粒、黏端质粒、YAC、病毒载体或转座子。特别地,所述载体可以是表达载体,即,可以提供体外和/或体内表达的载体(例如,在适宜的宿主细胞、宿主生物体和/或表达系统中)。
在一个优选的但非限制性的实施方案中,本发明的遗传构建体包括:
a)至少一种本发明的核酸;其可操作性地连接
b)一个或多个调节元件,诸如启动子和任选地适宜的终止子;
并且任选地还有
c)本身已知的一个或多个其它遗传构建体元件;
其中术语“调节元件”、“启动子”、“终止子”和“可操作性地连接”具有它们在本领域中的通用意思(如本发明进一步所述);并且其中存在于遗传构建体中的所述“其它元件”,例如,可以是3’-或5’-UTR序列、前导序列、选择标记、表达标记/报道子基因、和/或可以促进或增加转化或整合(效率)的元件。用于所述遗传构建体的这些和其它适宜的元件对于熟练的技术人员应该是清楚的,并且例如可能取决于所用的构建体的类型;要用的宿主细胞或宿主生物体;本发明的目的核苷酸序列表达的方式(例如,通过组成型的、瞬时的或可诱导的表达);和/或要用的转化技术。例如,本身已知用于抗体和抗体片段(包括但不限于(单)结构域抗体和ScFv片段)表达和生产的调节序列、启动子和终止子可以以基本上相似的方式使用。
优选地,在本发明的遗传构建体中,所述至少一种本发明的核酸和所述调节元件,以及任选地所述一个或多个其它元件,彼此“可操作性地连接”,这通常意指它们彼此是功能性关系。例如,如果所述启动子能够起始或者另外控制/调节编码序列的转录和/或表达,那么启动子被视为与编码序列“可操作性地连接”(其中所述编码序列应该理解为“受控于”所述启动子)。一般地,当两个核苷酸序列可操作性地连接时,它们应该在相同的方向,并且通常还在同一阅读框中。它们通常还应该基本上邻接,尽管这也可以不是必需的。
优选地,本发明的遗传构建体的调节元件以及其它元件是这样的,即,它们能够在要用的宿主细胞或宿主生物体内提供它们需要的生物学功能。
例如,在要用的宿主细胞或宿主生物体中,启动子、增强子或终止子应该是“可操作的”,这意味着(例如)所述启动子应该能够起始或者另外控制/调节与其可操作性地连接(如本文所定义)的核苷酸序列――例如,编码序列――的转录和/或表达。
一些特别优选的启动子包括但不限于,本身已知用于在本发明提及的宿主细胞中表达的启动子;并且特别是用于在细菌细胞中表达的启动子,诸如本文提及的那些和/或在实施例中所用的那些。
选择标记应该是这样的,即,其允许――即,在适当的选择条件下――已经(成功地)转化了本发明的核苷酸序列的宿主细胞和/或宿主生物体与没有(成功地)转化的宿主细胞/生物体区分开来。所述标记的一些优选的但非限制性的实例是提供针对抗生素(诸如卡那霉素或氨苄青霉素)的抗性的基因,提供温度耐受性的基因,或者在培养基中不存在某些因子、化合物和/或(食物)成分时允许所述宿主细胞或宿主生物体维持的基因,所述因子、化合物和/或(食物)成分是未转化的细胞或生物体生存所必需的。
前导序列应该是这样的,以致――在要用的宿主细胞或宿主生物体中――其允许理想的翻译后修饰和/或以致其将转录的mRNA导向细胞的理想部分或细胞器。前导序列还可以允许从所述细胞分泌表达产物。同样地,前导序列可以是在所述宿主细胞或宿主生物体中可操作的任何原-(pro-)、前-(pre-)或前原-(prepro-)序列。对于在细菌细胞中表达,前导序列可以不是必需的。例如,本身已知用于抗体和抗体片段(包括但不限于单结构域抗体和ScFv片段)表达和生产的前导序列可以以基本上相似的方式使用。
表达标记或报道子基因应该是这样的,即,――在宿主细胞或宿主生物体中――其允许检测所述遗传构建体(其上存在的基因或核苷酸序列)的表达。表达标记任选地还可以允许表达产物的定位,例如,定位在细胞的特定部分或细胞器中和/或在多细胞生物体的特定细胞、组织、器官或部分中。所述报道子基因还可以表达为与本发明的氨基酸序列、或多肽融合的蛋白融合体。一些优选的但非限制性的实例包括荧光蛋白如GFP。
适宜的启动子、终止子和其它元件的一些优选的但非限制性的实例包括可以用于在本发明提及的宿主细胞中表达的那些;并且特别是适用于在细菌细胞中表达的那些,诸如本发明提及的那些和/或在下述实施例中所用的那些。关于可以存在于/用于本发明的遗传构建体的启动子、选择标记、前导序列、表达标记和其它元件的一些(其它)非限制性的实例――诸如终止子、转录和/或翻译增强子和/或结合因子――参考上文提及的通用手册,诸如Sambrook等和Ausubel等,以及WO95/07463,WO96/23810,WO95/07463,WO95/21191,WO97/11094,WO97/42320,WO98/06737,WO98/21355,US-A-7,207,410,US-A-5,693,492和EP1085089中给出的实例。其它实例对于熟练的技术人员应该是清楚的。参考也参见上文引用的公知背景技术和本文引用的其它参考文献。
本发明的遗传构建体通常可以通过将本发明的核苷酸序列与上文所述的一个或多个其它元件适当地连接而提供,例如应用上文提及的通用手册诸如Sambrook等和Ausubel等中所述的技术。
通常,本发明的遗传构建体通过将本发明的核苷酸序列插入到本身已知的适当的(表达)载体中而获得。适当的表达载体的一些优选的但非限制性的实例是下述实施例中所用的那些,以及本文提及的那些。
本发明的核酸和/或本发明的遗传构建体可以用于转化宿主细胞或宿主生物体,即,用于表达和/或生产本发明的氨基酸序列、或多肽。适当的宿主或宿主细胞是熟练的技术人员所清楚的,并且例如可以是任何适当的真菌的、原核的或真核的细胞或细胞系,或者任何适当的真菌的、原核的或真核的生物体,例如:
-细菌菌株,其包括但不限于革兰氏-阴性菌株,诸如大肠杆菌(Escherichiacoli)菌株;变形菌属(Proteus)菌株,例如奇异变形菌(Proteusmirabilis)菌株;假单胞菌属(Pseudomonas)菌株,例如荧光假单胞菌(Pseudomonasfluorescens)菌株;以及革兰氏-阳性菌株,诸如芽孢杆菌属(Bacillus)菌株,例如枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)菌株或短芽孢杆菌(Bacillusbrevis)菌株;链霉菌属(Streptomyces)菌株,例如浅青紫链霉菌(Streptomyceslividans)菌株;葡萄球菌属(Staphylococcus)菌株,例如肉葡萄球菌(Staphylococcuscarnosus)菌株;以及乳球菌属(Lactococcus)菌株,例如乳酸乳球菌(Lactococcuslactis)菌株;
-真菌细胞,其包括但不限于来自下列各项物种的细胞:木霉属(Trichoderma),例如Trichodermareesei的物种;脉孢菌属(Neurospora),例如粗糙脉孢菌(Neurosporacrassa);粪壳属(Sordaria),例如大孢粪壳(Sordariamacrospora);曲霉菌(Aspergillus),例如黑曲霉(Aspergillusniger)或酱油曲霉(Aspergillussojae);或其它丝状真菌;
-酵母细胞,其包括但不限于来自下列各项物种的细胞:酵母属(Saccharomyces),例如酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae);裂殖酵母属(Schizosaccharomyces),例如粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomycespombe);毕赤酵母属(Pichia),例如巴斯德毕赤酵母(Pichiapastoris)或Pichiamethanolica;汉逊酵母属(Hansenula),例如多形汉逊酵母(Hansenulapolymorpha);克鲁维酵母属(Kluyveromyces),例如乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyceslactis);Arxula,例如Arxulaadeninivorans;Yarrowia,例如Yarrowialipolytica;
-两栖类细胞或细胞系,诸如爪蟾卵母细胞(Xenopusoocytes);
-来源于昆虫的细胞或细胞系,诸如衍生于鳞翅目(lepidoptera)的细胞/细胞系,包括但不限于贪夜蛾(Spodoptera)SF9和Sf21细胞,或者衍生于果蝇属(Drosophila)的细胞/细胞系,诸如Schneider和Kc细胞;
-植物或植物细胞,例如在烟草(tobacco)植物中;和/或
-哺乳动物细胞或细胞系,例如来源于人的细胞或细胞系、来源于哺乳动物的细胞或细胞系,包括但不限于CHO-细胞、BHK-细胞(例如BHK-21细胞),以及人细胞或细胞系,诸如HeLa,COS(例如COS-7)和PER.C6细胞;
以及本身已知的用于表达和生产抗体及抗体片段(包括但不限于(单)结构域抗体和ScFv片段)的所有其它宿主或宿主细胞,这对于熟练的技术人员应该是清楚的。参考还参见上文引用的公知背景技术,以及例如WO94/29457;WO96/34103;WO99/42077;Frenken等,(1998),见上;Riechmann和Muyldermans,(1999),见上;vanderLinden,(2000),见上;Thomassen等,(2002),见上;Joosten等,(2003),见上;Joosten等,(2005),见上;以及本文所引用的其它参考文献。
本发明的氨基酸序列、和多肽还可以被引入多细胞生物体的一个或多个细胞、组织或器官中并且在其中表达,例如用于预防和/或治疗目的(例如,作为基因治疗)。为了这一目的,可以将本发明的核苷酸序列以任何适当的方式引入到细胞或组织中,例如照原样(例如使用脂质体)或者在它们插入到适当的基因治疗载体(例如,衍生于反转录病毒诸如腺病毒,或者细小病毒诸如腺伴随病毒)中之后。同样对于熟练的技术人员应该是清楚的,这样的基因治疗可以在体内进行和/或在患者体内原位进行,其通过给患者或患者的特定细胞或特定组织或器官施用本发明的核酸或者编码其的适当的基因治疗载体而进行;或者适宜的细胞(通常取自要治疗的患者的身体,诸如移植的淋巴细胞、骨髓吸出物或活组织切片)可以用本发明的核苷酸序列在体外进行处理,然后适当地(重新)引入回到所述患者的身体内。所有这些可以使用熟练的技术人员公知的基因治疗载体、技术和递送系统进行,例如,在下列各项中所述:Culver,K.W.,“基因治疗(GeneTherapy)”,1994,p.xii,MaryAnnLiebert,公司,出版,纽约,N.Y);Giordano,自然F医学(NatureFMedicine)2(1996),534-539;Schaper,循环研究(Circ.Res)79(1996),911-919;Anderson,科学(Science)256(1992),808-813;Verma,自然(Nature)389(1994),239;Isner,柳叶刀(Lancet)348(1996),370-374;Muhlhauser,循环研究(Circ.Res.)77(1995),1077-1086;Onodera,血液学(Blood)91;(1998),30-36;Verma,基因治疗(GeneTher.)5(1998),692-699;Nabel,纽约科学院年刊(Ann.N.Y.Acad.Sci.):811(1997),289-292;Verzeletti,人类基因治疗(Hum.GeneTher.)9(1998),2243-51;Wang,自然医学(NatureMedicine)2(1996),714-716;WO94/29469;WO97/00957,US5,580,859;US5,5895466;或Schaper,现代生物技术观点(CurrentOpinioninBiotechnology)7(1996),635-640。例如,在本领域中已描述ScFv片段(Afanasieva等,基因治疗(GeneTher.),10,1850-1859(2003))和双抗体(Blanco等,免疫学杂志(J.Immunol.),171,1070-1077(2003))的原位表达。
对于氨基酸序列、或多肽在细胞中的表达,它们还可以作为所谓的“细胞内抗体”表达,例如在WO94/02610,WO95/22618,US-A-7004940;WO03/014960中所述;在Cattaneo,A.和Biocca,S.(1997)细胞内抗体:开发和应用(IntracellularAntibodies:DevelopmentandApplications).Landes和Springer-Verlag;和在Kontermann,方法(Methods)34,(2004),163-170中所述。
例如,本发明的氨基酸序列、和多肽还可以在转基因哺乳动物的乳中产生,例如在兔、母牛、山羊或绵羊的乳中(对于将转基因引入哺乳动物的通用技术参见例如US6,741,957,US6,304,489和US6,849,992),在植物中或植物的部分中产生,所述植物部分包括但不限于它们的叶、花、果实、种子、根或turbers(例如在烟草、玉米、大豆或苜蓿中)中,或者例如在蚕家蚕(Bombixmori)的蛹中。
此外,本发明的氨基酸序列、和多肽还可以在不含细胞的表达系统中表达和/或生产,并且这样的系统的适当的实例应该是熟练的技术人员所清楚的。一些优选的但非限制性的实例包括在麦芽胚系统中的表达;在兔网织红细胞裂解物中表达;或者在大肠杆菌(E.coli)Zubay系统中表达。
如上文提及,应用的一个优点在于,基于此的多肽可以通过在适宜的细菌系统中表达而制备,并且适宜的细菌表达系统、载体、宿主细胞、调节元件等对熟练的技术人员是清楚的,例如参考上文引用的参考文献。然而,应该注意,本发明在其最广泛意义上并不限于在细菌系统中表达。
优选地,在本发明中,应用(体内或体外)表达系统,诸如细菌表达系统,其以适于药用的形式提供本发明的多肽,并且所述表达系统也是熟练的技术人员所清楚的。熟练的技术人员还应该清楚,适于药用的本发明的多肽可以使用肽合成技术制备。
对于工业规模的生产,用于或包含的蛋白治疗物的(工业)生产的优选的异源宿主包括大肠杆菌、巴斯德毕赤酵母(Pichiapastoris)、酿酒酵母(S.cerevisiae)的菌株,其适用于大规模表达/生产/发酵,并且特别适用于大规模药物表达/生产/发酵。所述菌株的适当的实例是熟练的技术人员所清楚的。所述菌株以及生产/表达系统也可从公司诸如Biovitrum(Uppsala,瑞典)获得。
备选地,哺乳动物细胞系,特别是中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,可以用于大规模表达/生产/发酵,并且特别用于大规模药物表达/生产/发酵。并且,所述表达/生产系统也可从上文提及的一些公司获得。
具体的表达系统的选择部分取决于特定的翻译后修饰的需要,更具体地是糖基化的需要。生产包含的重组蛋白,对于所述重组蛋白糖基化是理想的或者必需的,将使得应用具有将所表达的蛋白糖基化的能力的哺乳动物表达宿主成为必要。在这一方面,熟练的技术人员应该清楚,获得的糖基化模式(即,附着的残基的种类、数量和位置)将取决于表达所用的细胞或细胞系。优选地,使用人细胞或细胞系(即,形成基本上具有人糖基化模式的蛋白),或者使用另一种哺乳动物细胞系,其可以提供基本上和/或功能上与人糖基化作用相同的糖基化模式或者至少模拟人糖基化作用。一般地,原核宿主诸如大肠杆菌不具有将蛋白糖基化的能力,并且应用更低等真核细胞诸如酵母通常导致与人糖基化作用不同的糖基化模式。不过,应该理解,所有前述宿主细胞和表达系统可以用于本发明,这取决于要获得的理想的氨基酸序列、或多肽。
因此,按照本发明的一个非限制性实施方案,本发明的氨基酸序列、或多肽被糖基化。按照本发明的另一个非限制性实施方案,本发明的氨基酸序列、或多肽未被糖基化。
按照本发明的一个优选的但非限制性的实施方案,本发明的氨基酸序列、或多肽在细菌细胞中生产,特别是在适于大规模药物生产的细菌细胞,诸如上文提及的菌株的细胞中生产。
按照本发明另一个优选的但非限制性的实施方案,本发明的氨基酸序列、或多肽在酵母细胞中生产,特别是在适于大规模药物生产的酵母细胞,诸如上文提及的物种的细胞中生产。
按照本发明另一个优选的但非限制性的实施方案,本发明的氨基酸序列、或多肽在哺乳动物细胞中生产,特别是在人细胞或人细胞系的细胞中,并且更特别是在适于大规模药物生产的人细胞或人细胞系的细胞中,诸如上文提及的细胞系中生产。
当应用在宿主细胞中的表达来生产本发明的氨基酸序列、和多肽时,本发明的氨基酸序列、和多肽可以在细胞内产生(例如,在细胞溶质中,在外周胞质或在内含体中),然后从宿主细胞分离,并且任选地进一步纯化;或者可以在细胞外产生(例如,在培养所述宿主细胞的培养基中),然后从培养基分离,并且任选地进一步纯化。当使用真核宿主细胞时,由于细胞外生产极大地促进进一步的分离以及获得的氨基酸序列、多肽和蛋白的下游处理,所以通常优选细胞外生产。除了少数种类的蛋白诸如毒素和溶血素之外,细菌细胞诸如上文提及的大肠杆菌的菌株一般不向细胞外分泌蛋白,并且在大肠杆菌内的分泌生产是指蛋白穿过内膜易位到外周胞质空间。外周胞质生产相对于细胞溶质生产提供一些优点。例如,在通过特异的信号肽酶将分泌信号序列裂解之后,所分泌的产物的N-端氨基酸序列可以与天然基因产物相同。此外,在外周胞质中比在细胞质中似乎存在少得多的蛋白酶活性。另外,由于在外周胞质中更少的污染蛋白,所以蛋白纯化更简单。另一个优点是,由于外周胞质提供比细胞质更加氧化性的环境,所以可以形成正确的二硫键。在大肠杆菌中过量表达的蛋白通常在不溶的聚集体,即所谓的内含体中发现。这些内含体可以位于细胞溶质中或在外周胞质中;从这些内含体回收生物活性蛋白需要变性/重折叠步骤。许多重组蛋白,包括治疗性蛋白,是从内含体回收的。备选地,熟练的技术人员应该清楚,可以使用细菌的重组菌株,其已被遗传修饰,以分泌理想的蛋白,并且特别是本发明的氨基酸序列、或多肽。
因此,按照本发明的一个非限制性实施方案,本发明的氨基酸序列、或多肽是在细胞内产生并且从宿主细胞分离,并且特别是从细菌细胞或者从细菌细胞中的内含体中分离的氨基酸序列、或多肽。按照本发明的另一个非限制性的实施方案,本发明的氨基酸序列、 或多肽是在细胞外产生并且从培养宿主细胞的培养基中分离的氨基酸序列、或多肽。
与这些宿主细胞一起使用的一些优选的但非限制性的启动子包括,
-用于在大肠杆菌中表达:lac启动子(及其衍生物,诸如lacUV5启动子);阿拉伯糖启动子;噬菌体λ的左向-(PL)和右向(PR)启动子;trp操纵子的启动子;杂合lac/trp启动子(tac和trc);T7-启动子(更具体地是T7-噬菌体基因10的启动子)以及其它T-噬菌体启动子;Tn10四环素抗性基因的启动子;上述启动子的工程变体,其包括一个或多个拷贝的外来调节操纵基因序列;
-用于在酿酒酵母中表达:组成型:ADH1(醇脱氢酶1),ENO(烯醇化酶),CYC1(异-1细胞色素c),GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶);PGK1(磷酸甘油酸激酶),PYK1(丙酮酸激酶);调节型:GAL1,10,7(半乳糖代谢酶),ADH2(醇脱氢酶2),PHO5(酸性磷酸酶),CUP1(铜金属硫蛋白);异源型:CaMV(花椰菜花叶病毒35S启动子);
-用于在毕赤酵母(Pichiapastoris)中表达:AOX1启动子(醇氧化酶I);
-用于在哺乳动物细胞中表达:人巨细胞病毒(hCMV)即时早期增强子/启动子;人巨细胞病毒(hCMV)即时早期启动子变体,其包含两个四环素操纵基因序列,以致所述启动子可以受Tet抑制基因调节;单纯疱疹病毒胸苷激酶(TK)启动子;劳斯肉瘤病毒长末端重复(RSVLTR)增强子/启动子;来自于人、黑猩猩、小鼠或大鼠的延伸因子1α(hEF-1α)启动子;SV40早期启动子;HIV-1长末端重复启动子;β-肌动蛋白启动子;
与这些宿主细胞一起使用的一些优选的但非限制性的载体包括:
-用于在哺乳动物细胞中表达的载体:pMAMneo(Clontech),pcDNA3(Invitrogen),pMC1neo(Stratagene),pSG5(Stratagene),EBO-pSV2-neo(ATCC37593),pBPV-1(8-2)(ATCC37110),pdBPV-MMTneo(342-12)(ATCC37224),pRSVgpt(ATCC37199),pRSVneo(ATCC37198),pSV2-dhfr(ATCC37146),pUCTag(ATCC37460)和1ZD35(ATCC37565),以及基于病毒的表达系统,诸如基于腺病毒的那些;
-用于在细菌细胞中表达的载体:pET载体(Novagen)和pQE载体(Qiagen);
-用于在酵母或其它真菌细胞中表达的载体:pYES2(Invitrogen)和毕赤表达载体(Invitrogen);
-用于在昆虫细胞中表达的载体:pBlueBacII(Invitrogen)和其它杆状病毒载体;
-用于在植物或植物细胞中表达的载体:例如基于花椰菜花叶病毒或烟草花叶病毒的载体,适宜的农杆菌(Agrobacterium)菌株,或基于Ti-质粒的载体。
与这些宿主细胞一起使用的一些优选的但非限制性的分泌序列包括:
-用于细菌细胞诸如大肠杆菌:PelB,Bla,OmpA,OmpC,OmpF,OmpT,StII,PhoA,PhoE,MalE,Lpp,LamB等;TAT信号肽,溶血素C-端分泌信号;
-用于酵母:α-交配因子前原-序列(α-matingfactorprepro-sequence),磷酸酶(pho1),转化酶(Suc),等;
-用于哺乳动物细胞:在靶点蛋白是真核起源的情形中固有的信号(indigenoussignal);鼠Igκ-链V-J2-C信号肽;等。
用于转化本发明的宿主或宿主细胞的适宜的技术对熟练的技术人员是清楚的,并且可以取决于要用的宿主细胞/宿主生物体和要用的遗传构建体。参考也参见上文提及的手册和专利申请。
转化后,可以进行检测并且选择已经成功转化了本发明的核苷酸序列/遗传构建体的那些宿主细胞或宿主生物体的步骤。例如,这可以是基于存在于本发明的遗传构建体中的选择标记的选择步骤,或者是包括检测本发明的氨基酸序列的步骤,例如,使用特异的抗体进行。
转化的宿主细胞(其可以是稳定的细胞系的形式)或宿主生物体(其可以是稳定的突变系或株系的形式)形成本发明的另一方面。
优选地,这些宿主细胞或宿主生物体是这样的,以致它们表达或者(至少)能够表达(例如,在适宜的条件下)本发明的氨基酸序列、 或多肽(并且在宿主生物体的情形中:在它的至少一种细胞、部分、组织或器官中)。本发明还包括本发明的宿主细胞或宿主生物体的其它世代、后代和/或子代,例如,其可以通过细胞分裂或者通过有性或无性生殖获得。
为了生产/获得本发明的氨基酸序列、或多肽的表达,所述转化的宿主细胞或转化的宿主生物体通常可以在本发明(理想的)氨基酸序列、或多肽得到表达/生产的条件下保持、维持和/或培养。适宜的条件对熟练的技术人员是清楚的,并且通常取决于所用的宿主细胞/宿主生物体,以及取决于控制本发明的(相关)核苷酸序列表达的调节元件。此外,参考参见在上文关于本发明的遗传构建体段落中提及的手册和专利申请。
一般地,适宜的条件可以包括使用适宜的培养基,存在适宜的食物来源和/或适宜的营养素,使用适当的温度,并且任选地存在适当的诱导因子或化合物(例如,在本发明的核苷酸序列在可诱导启动子的控制下的情形中);所有这些可以由熟练的技术人员选择。此外,在这样的条件下,本发明的氨基酸序列可以以组成型方式、以瞬时方式、或者只在适当地诱导时表达。
熟练的技术人员还应该清楚,本发明的氨基酸序列、或多肽可以(首先)以不成熟的形式(如上文提及)产生,其然后可以进行翻译后修饰,这取决于所用的宿主细胞/宿主生物体。并且,本发明的氨基酸序列、或多肽可以被糖基化,这也取决于所用的宿主细胞/宿主生物体。
然后,本发明的氨基酸序列、或多肽可以从宿主细胞/宿主生物体和/或从培养所述宿主细胞或宿主生物体的培养基中分离,这使用本身已知的蛋白分离和/或纯化技术,诸如(制备级)层析和/或电泳技术、差别沉淀技术、亲和技术(例如,使用与本发明的氨基酸序列、 或多肽融合的特异性的、可裂解的氨基酸序列)和/或制备级免疫学技术(即,使用针对要被分离的氨基酸序列的抗体)进行。
本发明还涉及一种产品或组合物,所述产品或组合物包含或包括至少一种本发明的氨基酸序列(或其适当的片段)、至少一种本发明的 至少一种本发明的多肽,至少一种本发明的化合物或构建体、至少一种本发明的单价构建体和/或至少一种本发明的核酸、以及任选地一种或多种所述组合物本身已知的其它成分,即,取决于所述组合物的目的用途。例如,这样的产品或组合物可以是药物组合物(如本文所述)、兽医用组合物或用于诊断用途的产品或组合物(同样如本文所述)。通过本发明进一步的描述,所述产品或组合物的一些优选而非限制性的实例将变得清楚。
通常,对于药物应用,本发明的氨基酸序列、和多肽可以配制成药物制剂或组合物,其包括至少一种本发明的氨基酸序列、 或多肽和至少一种药用载体、稀释剂或赋形剂和/或辅药,并且任选地一种或多种其它药物活性多肽和/或化合物。通过非限制性实例的方式,这样的制剂可以是适于下列各项的形式:口服给药,肠胃外给药(诸如通过静脉内、肌内或皮下注射或静脉内输注),局部给药,通过吸入、皮肤贴片、植入物、栓剂给药,等等。所述适宜的给药形式――其可以是固体、半固体或液体,取决于给药的方式――以及制备其所用的方法和载体,对熟练的技术人员是清楚的,并且在本文中进一步描述。
因此,在另一个方面中,本发明涉及一种药物组合物,其包含至少一种本发明的氨基酸、至少一种本发明的至少一种本发明的化合物或构建体或至少一种本发明的多肽,以及至少一种适当的载体、稀释剂或赋形剂(即,适于药用),以及任选地一种或多种其它活性物质。
通常,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽可以以本身已知的任何适当的方法配制和施用,例如,关于其的参考文献参见上文引用的公知背景技术(并且特别参见WO04/041862,WO04/041863,WO04/041865,WO04/041867和WO08/020079),以及参见标准手册,诸如雷明顿药物科学(Remington’sPharmaceuticalSciences),第18版,Mack出版公司,美国(1990),雷明顿,制药科学和实践(Remington,theScienceandPracticeofPharmacy),第21版,LippincottWilliams和Wilkins(2005);或治疗抗体手册(HandbookofTherapeuticAntibodies)(S.Dubel编),Wiley,Weinheim,2007(见例如第252-255页)。
例如,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽可以本身已知的用于常规抗体及抗体片段(包括ScFv’s和双抗体)和其它药物活性蛋白的任何方法配制和施用。所述制剂以及制备其的方法对于熟练的技术人员是清楚的,并且例如,包括适于肠胃外给药(例如静脉内、腹膜内、皮下、肌内、腔内、动脉内或鞘内给药)或适于局部(及透皮的或皮内)给药的制剂。
例如,用于肠胃外给药的制剂可以是适于输注或注射的无菌溶液、混悬液、分散液或乳剂。例如,用于所述制剂的适宜的载体或稀释剂包括但不限于,WO08/020079的第143页中提及的那些。通常优选水性溶液或混悬液。
本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽还可以使用基因治疗递送方法进行施用。参见,例如,U.S.专利号5,399,346,其完全结合作为参考。使用递送的基因治疗方法,转染了编码本发明的氨基酸序列、或多肽的基因的原代细胞另外可以用组织特异性启动子转染,以靶向特定的器官、组织、移植物、肿瘤或细胞,并且另外可以使用用于亚细胞定位表达的信号和稳定序列进行转染。
因此,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽可以全身施用,例如,口服地,与药用赋形剂诸如惰性稀释剂或可同化的食用载体结合。它们可以包封在硬壳或软壳的明胶胶囊中,可以压缩成片剂,或者可以直接与患者日常饮食的食物结合。对于口服治疗性施用,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽可以与一种或多种赋形剂结合,并且以可吸收的片剂、口腔片剂、药片、胶囊、酏剂、混悬剂、糖浆、糯米纸囊剂等形式使用。所述组合物和制剂应该包含至少0.1%的本发明的氨基酸序列、化合物、构建体或多肽。当然,它们在所述组合物和制剂中的百分数可以变化,并且可以便利地在所给单位剂型重量的约2-约60重量%之间。本发明的氨基酸序列、化合物、构建体或多肽在这样的治疗有效组合物中的量是这样的,以致获得有效的剂量水平。
所述片剂、药片、丸剂、胶囊等还可以包含粘合剂、赋形剂、崩解剂、润滑剂和甜味剂或者调味剂,例如WO08/020079的第143-144页提及的那些。当单位剂型是胶囊时,除上述类型的物质之外,它还可以包含液体载体,诸如植物油或聚乙二醇。各种其它物质可以作为涂层存在,或者另外修饰所述固体单位剂型的物理形式。例如,片剂、丸剂、或胶囊可以用明胶、蜡、紫胶或糖等包被。糖浆或酏剂可以包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽,作为甜味剂的蔗糖或果糖,作为防腐剂的对羟基苯甲酸甲酯和对羟基苯甲酸丙酯类,染料和调味剂诸如樱桃或橙味调味剂。当然,在制备任何单位剂型中所用的任何物质都应该是药学可接受的,并且在所用的量上基本上无毒。另外,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽可以结合在缓释制剂和装置中。
用于口服给药的制备物和制剂还可以被提供以肠衣,所述肠衣允许本发明的构建体抵抗胃环境,并且进入肠内。更一般地,用于口服给药的制备物和制剂可以适当地配制成用于递送到胃肠道的任何需要的部分。另外,适宜的栓剂可以用于递送到胃肠道内。
本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽还可以通过输注或注射进行静脉内或腹膜内施用,如在WO08/020079的第144和第145页上进一步所述。
对于局部给药,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽可以以纯的形式应用,即,在它们是液体的情形中。然而,通常理想地将它们作为与皮肤病学可接受的载体结合的组合物或制剂施用到皮肤上,所述载体可以是固体或液体,如在WO08/020079的第145页上进一步所述。
通常,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽在液体组合物诸如洗液中的浓度约0.1-25重量-%,优选地约0.5-10重量-%。在半固体或固体组合物诸如凝胶或粉剂中的浓度约0.1-5重量-%,优选地约0.5-2.5重量-%。
在优选的方面中,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽和/或包含其的组合物被施用于肺组织。在本发明的情形中,为了本发明的目的,“肺组织(pulmonarytissue)”等价于肺组织(lungtissue)或肺(lung)。肺包含2个不同的区:传导区和呼吸区,在其中存在呼吸道和血管区室(见例如,“肺药物递送(PulmonaryDrugDelivery)”,由KarolineBechtold-Peters和HenrikLuessen编辑,2007,ISBN978-3-87193-322-6第16-28页)。
对于肺递送,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽可以以纯的形式应用,即当它们是液体或干粉时应用。然而,优选将它们作为包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽和适用于肺递送的载体的组合物或制剂施用于肺组织。因此,本发明还涉及包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽和适用于肺递送的载体的药物组合物。适用于肺递送的载体是本领域已知的。
本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽也可以作为纯药的微粒或纳米粒进行施用,所述微粒或纳米粒具有有利于肺递送的粒径和分布。
因此,本发明还涉及适合用于本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽的肺递送并且适合于包含其的组合物的应用的药物装置。该装置可以是用于包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽的液体的吸入器(例如精细固体颗粒的混悬液或小滴)。优选地,该装置是包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽的气溶胶。所述装置也可以是包含以干粉形式存在的本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽的干粉吸入器。
在优选的方法中,向肺组织的施用通过吸入本发明的氨基酸序列、 化合物、构建体和/或多肽和/或在气溶胶云状物中包含其的组合物进行。根据本发明,吸入气溶胶云状物可以通过吸入器装置进行。所述装置应该在哺乳动物的吸入循环的适合时刻,从包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽(和/或包含其的组合物)的制剂产生需要粒径(分布)的气溶胶云状物,其包含正确剂量的本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽(“肺药物递送(Pulmonarydrugdelivery)”,Bechtold-Peters和Luessen,编辑,ISBN978-3-87193-322-6,第125页)。
在本发明的上下文中,“气溶胶”意为精细固体颗粒或液体小滴(或其组合)在气体中的混悬剂,其中对于本发明的目的,所述颗粒和/或小滴包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽。
所述装置应该在哺乳动物的吸入循环的适合时刻,从所述制剂产生需要粒径(分布)的气溶胶云状物,其包含正确剂量的本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽。应该考虑下面的4项要求(制剂,粒径,时间和剂量)(“肺药物递送(PulmonaryDrugDelivery)”,Bechtold-Peters和Luessen,编辑,见上文,第125页和第126页):
-在所述装置中使用的制剂可以从在喷雾器中使用的水溶液或混悬液到在定量定压式吸入器中使用的基于推进剂的溶液或混悬液或甚至用于干粉吸入器的特别加工的粉末混合物而变化。所有这些不同的制剂需要关于气溶胶产生的不同原理,这强调了装置和制剂的相互依赖性;
-由于气溶胶颗粒沉积的位点取决于它们的(空气动力学)大小和速度,并且气溶胶云状物的需要的粒径根据沉积物在肺中的需要位点变化,这与施用的治疗目的相关;
-由于气溶胶云状物可以被调节从而在由哺乳动物产生的吸入循环的不同时刻释放,因此优选对于本发明的药剂(沉积在肺的外周部分),所述气溶胶在吸入循环的起点释放;
-剂量可以变化得相当大,并且可以例如对于人,从数微克变化到数百微克或甚至数毫克,例如约多到约10-100毫克。
各种吸入系统例如在综述(“肺药物递送(PulmonaryDrugDelivery)”,Bechtold-Peters和Luessen,编辑,见上文)的第129页到第148页上描述,并且包括,但不限于,喷雾器,定量定压式吸入器,定量定压式液体吸入器和干粉吸入器。也可以使用考虑了关于受控的吸入机动操纵的最优和个性化的呼吸模式的装置(见在“肺药物递送(PulmonaryDrugDelivery)”(Bechtold-Peters和Luessen,编辑,见上文)的第157页上的技术)。
然而,所述装置不仅对于本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽的肺递送是重要的,而且正确的制剂对于获得有效的递送是关键的。这原则上可以通过使用下述方法中的一项获得:
-施用包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽的水溶液或混悬液(例如滴鼻剂)到鼻腔中;
-雾化包含本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽的水溶液或混悬液;
-通过液化的推进剂雾化;和
-分散干粉。
因此,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽的制剂必须根据所选择的吸入装置使用和调整。适合的制剂,即赋形剂加上本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和/或多肽,例如在“肺药物递送(PulmonaryDrugDelivery)”(Bechtold-Peters和Luessen,编辑,见上文)的第IV章中描述。在这方面,还参考2010年2月12日由埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)提交的美国临时申请No.US61/303,447,标题为“用于制备气溶胶的方法和组合物”(“Methodsandcompositionsforthepreparationofaerosols”)。
在治疗中使用所需要的本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽的量不仅关于选定的特定氨基酸序列、化合物、构建体或多肽变化,还根据施用路径、被治疗的病症的性质和患者的年龄和病症变化,并且最终根据住院医师或临床医师判断变化。此外,本发明的氨基酸序列、化合物、构建体和多肽的剂量根据靶宿主细胞、肿瘤、组织、移植物或器官变化。
理想的剂量可以便利地以单一剂量或作为在适当的时间间隔施用的分剂量而存在,例如,作为每天2、3、4次或更多次的亚剂量。所述亚剂量本身可以进一步分割,例如,分割成许多次不连续的宽松间隔的施用;诸如从吸入器多次吸入,或者通过使用多滴到眼睛中。
施用方案可以包括长期的、日常的治疗。“长期”意指至少2周,并且优选地数周、数月或数年的持续时间。在这一剂量范围的必要的修改可以由本领域的普通技术人员仅仅使用本文的教导所给的常规实验而确定。参见雷明顿药物科学(Remington’sPharmaceuticalSciences)(Martin,E.W.,第4版),Mack出版公司,Easton,PA。在任何并发症情形中,剂量还可以由个别医生进行调整。
本发明还涉及本文所述的氨基酸序列、多肽、化合物、核酸、宿主细胞、产品和组合物的应用和用途,以及涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的呼吸道感染的方法。通过本发明进一步的描述,一些优选的但非限制性的应用和用途将变得清楚。
本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物可以一般用于阻断hRSV的蛋白F与靶宿主细胞和/或其膜的相互作用,中和hRSV(不同hRSV毒株和/或逃避突变型),调节、抑制和/或预防(不同hRSV毒株和/或逃避突变型的)hRSV感染,调节、抑制和/或预防(不同hRSV毒株和/或逃避突变型)与靶宿主细胞(的细胞膜)的融合和/或调节、抑制和/或预防hRSV进入(不同hRSV毒株和/或逃避突变型的)靶宿主细胞。
在一方面,与在相同条件但不存在本发明的氨基酸序列、或多肽的条件下hRSV的蛋白F与靶宿主细胞和/或其膜的相互作用相比,本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物可以阻断hRSV的蛋白F与靶宿主细胞和/或其膜的相互作用至少1%,优选至少5%,诸如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%以上,其以任何本身已知的合适方式,例如利用本文中所述的测定之一来测量。
在另一方面,与在相同条件但不存在本发明的氨基酸序列、 或多肽的条件下的hRSV中和相比,本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物中和hRSV感染至少1%,优选至少5%,诸如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%以上,其以任何本身已知的合适方式,例如利用本文中所述的测定之一来测量。
在本发明的上下文中,“调节”(“modulating”或“tomodulate”)通常意指减少、防止或抑制病毒感染、融合和/或病毒的进入和/或减少、防止或抑制由hRSV的蛋白F介导的生物学途径,如使用适当的体外、细胞或体内测定法(诸如本文提及的那些)测量的。特别地,“调节”(“modulating”或“tomodulate”)可以意指与在相同条件但不存在本发明的氨基酸序列、或多肽的条件下,在相同测定中的正常(即天然存在的)病毒感染、融合和/或病毒的进入和/或由hRSV的蛋白F介导的正常(即天然存在的)生物学途径相比较,减少、防止或抑制病毒感染、融合和/或病毒的进入和/或减少、防止或抑制由hRSV的蛋白F介导的生物学途径至少1%,优选至少5%,诸如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%或更多,如使用适当的体外、细胞或体内测定法(诸如本文提及的那些)测量的。
在一方面,与在相同条件但不存在本发明的氨基酸序列、或多肽的条件下的感染相比,本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物可以调节、抑制和/或预防hRSV感染至少1%,优选至少5%,诸如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%以上,其以任何本身已知的合适方式,例如利用本文中所述的测定之一来测量。
术语“病毒进入”用于本文时,包括完成病毒体附着于靶宿主细胞和/或病毒融合于靶宿主细胞所需要的任何病毒介导的生物学途径。本发明包括可以是完成病毒体附着于靶宿主细胞和/或病毒融合于靶宿主细胞所需要的任何病毒-介导的生物学途径的病毒进入,可以通过本发明的氨基酸序列、多肽和/或化合物的特异性结合来进行调节和/或减少和/或预防和/或抑制,如使用适合的体外、细胞或体内测定法(如本文提及的那些)所测量的。具体地,可以通过hRSV的蛋白F介导的病毒进入,可以通过本发明的氨基酸序列、多肽和/或化合物与hRSV的蛋白F特异性结合而被调节、减少、防止或抑制,如使用适合的体外、细胞或体内测定法(如本文提及的那些)所测量的,其与在相同的条件下,在不存在本发明的氨基酸序列、多肽和/或化合物的情况下的相同测定法中,可以通过hRSV的蛋白F介导的正常(即,天然存在)的病毒进入(如本文定义)比较,被调节、减少、防止或抑制至少1%,优选地至少5%,如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%以上。因此,还包括病毒附着和/或病毒融合可以通过本发明的氨基酸序列、多肽和/或化合物与hRSV的蛋白F特异性结合来进行调节和/或减少和/或防止和/或抑制,如使用适合的体外、细胞或体内测定法(如本文提及的那些)所测量的。具体地,可以通过hRSV的蛋白F介导的病毒附着和/或病毒融合,可以通过本发明的氨基酸序列、 多肽和/或化合物与hRSV的蛋白F特异性结合来进行调节、减少、防止或抑制,如使用适合的体外、细胞或体内测定法(如本文提及的那些)所测量的,其与在相同条件下,但是不存在本发明的氨基酸序列、 多肽和/或化合物的情况下,在相同的测定法中,可以由hRSV的蛋白F介导的正常(即天然存在的)病毒附着和/或病毒融合相比,被调节、减少、防止或抑制至少1%,优选地至少5%,如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%以上。
在这方面,与在相同条件但不存在本发明的氨基酸序列、或多肽的条件下进入靶宿主细胞相比,本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物调节、抑制和/或防止hRSV进入靶宿主细胞至少1%,优选至少5%,诸如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%以上,其以本身已知的任何适当的方式测量,例如利用本文中所述的测定之一来测量。
与在相同条件但不存在本发明的氨基酸序列、或多肽的条件下hRSV与靶宿主细胞(的细胞膜)的融合相比,本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物调节、抑制和/或预防hRSV与靶宿主细胞(的细胞膜)的融合至少1%,优选至少5%,诸如至少10%或至少25%,例如至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,或90%以上,其以任何本身已知的合适方式,例如利用本文中所述的测定之一来测量。
与单价氨基酸序列或相比,本发明的多价(诸如二价或三价)多肽已经显示出关于hRSV的不同基因型、亚型、病毒逃避突变型和/或毒株的提高的亲和性和/或提高的交叉反应性。在一方面,本发明的多价(诸如二价或三价)多肽可以结合不同的RSV毒株(诸如例如Long,A-2和/或B-1)。在另一方面,本发明的多价(诸如二价或三价)多肽可以结合不同的hRSV逃避突变型(诸如例如Lopez等1998,J.Virol.(病毒学杂志)72:6922-6928中所述)和/或特异于抗原位点II、抗原位点IV-VI或两种抗原位点的组合的逃避突变型。
因此,本发明还涉及本发明的多价(例如三价、二价)多肽,和/或包含其的药物组合物用于结合和/或中和不同hRSV毒株的用途。在优选方面,使用二价人源化和/或序列最优化的NC41(诸如例如包含选自SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的两个的二价多肽)。在另一优选方面,使用三价人源化和/或序列最优化的NC41 (诸如例如包含选自SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的三个 的三价多肽)。在另一优选方面,使用SEQIDNO’s:77-79,142-145和158-165之一。
本发明还涉及本发明的多价(例如三价、二价)多肽,和/或包含其的药物组合物用于结合和/或中和一种或多种hRSV逃避突变型的用途。在优选方面,使用二价人源化的NC41(诸如例如包含选自SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的两个的二价多肽)。在另一优选方面,使用三价人源化的NC41(诸如例如包含选自SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的三个的三价多肽)。在另一优选方面,使用SEQIDNO’s:77-79,142-145和158-165之一。
本发明还涉及预防和/或治疗至少一种病毒性疾病的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者施用药物活性量的本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体和/或包括其的药物组合物。
同样地,本发明的氨基酸序列、多肽、化合物和组合物可以用于预防和/或治疗与hRSV感染相关的疾病和病症。基于本发明公开的内容,这样的与hRSV感染相关的疾病和病症的实例对于熟练的技术人员将是清楚的,并且例如包括下述疾病和病症:呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和哮喘。
因此,本发明还涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和/或哮喘的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者施用药物活性量的至少一种本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体或本发明的单价构建体、或本发明的组合物。
本发明还涉及本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体或本发明的单价构建体在制备用于预防和/或治疗呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和/或哮喘的药物组合物中的用途;和/或用在一种或多种本文中所述方法中的用途。
本发明还涉及本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体或本发明的单价构建体,其用于预防和/或治疗呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和/或哮喘。
在本发明的上下文中,术语“预防和/或治疗”不但包括预防和/或治疗疾病,而且通常包括预防所述疾病的发作,减缓或逆转疾病进程,防止或减缓与所述疾病相关的一种或多种症状的发作,减少和/或减轻与所述疾病相关的一种或多种症状,减少所述疾病和/或与之相关的任何症状的严重性和/或持续时间,和/或防止所述疾病的严重性和/或与之相关的任何症状的进一步增加,防止、减少或逆转由所述疾病引起的任何生理损害以及通常对被治疗的患者有益的任何药理作用。
待治疗的受试者可以是任何温血动物,但是特别是哺乳动物,并且更特别是人类。熟练的技术人员应该清楚,待治疗的受试者特别是患有或者有危险患有本文提及的疾病和病症的人。
更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者施用药物活性量的本发明的多价(例如三价或二价)多肽或化合物、和/或包含其的药物组合物。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者施用药物活性量的本发明的二价化合物或多肽。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者施用药物活性量的二价人源化和/或序列最优化的NC41(诸如例如包含选自SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的两个的二价多肽)。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者施用药物活性量的本发明的三价化合物或多肽。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者施用药物活性量的三价人源化的NC41(诸如例如包含选自SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的三个的三价多肽)。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者施用药物活性量的SEQIDNO’s:77-79,142-145和158-165之一。
更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、和/或包含其的药物组合物。
在另一个方面中,本发明涉及免疫治疗的方法,并且特别涉及被动免疫治疗的方法,所述方法包括给患有或者有危险患有本文提及的疾病和病症的受试者施用药物活性量的本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体和/或包括其的药物组合物。
在上述方法中,本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽和/或包含其的组合物可以以任何适当的方式施用,这取决于要用的特定的药物制剂或组合物。因此,例如,本发明的氨基酸序列、 和/多肽和/或包含其的组合物可以口服、腹膜内(例如,静脉内、皮下、肌内、或者通过避开胃肠道的任何其它施用途径)、鼻内、透皮地、局部施用,通过栓剂、通过吸入方式施用,这也取决于要用的特定药物制剂或组合物。临床医生能够选择适当的施用途径和用于所述施用的适当的药物制剂或组合物,这取决于要预防或治疗的疾病或病症以及临床医生公知的其它因素。
因此,一般地,根据本发明所述的氨基酸序列、化合物或构建体和多肽和/或包含其的组合物可以以任何适合的方式施用;例如,但不限于此,根据本发明所述的氨基酸序列、化合物或构建体和多肽和包含其的组合物可以通过鼻内和/或通过吸入和/或通过任何其它适合的肺递送形式施用;用于肺递送和/或鼻内递送和/或通过吸入本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽进行递送的方法对于技术人员是公知的,并且例如在下列文献中描述:BingheWang,TerunaSiahaan和RichardSoltero(编辑WileyInterScience(JohnWiley&Sons))的手册“DrugDelivery:PrinciplesandApplications(药物递送:原理和应用)”;在埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)的题为“多肽和蛋白的鼻内递送(Intranasaldeliveryofpolypeptidesandproteins)”的国际申请WO08/049897中;在RosenfeldG.C.,Loose-MitchellD.S.“药理学PreTestTM自我评价和综述(PharmacologyPreTestTMSelf-AssessmentandReview)”(第11版);和在LippincottWilliams&Wilkins,纽约;ShlaferM.McGraw-Hill医药学出版分社,纽约的“药理学(Pharmacology)”(第3版);YangK.Y.,GraffL.R.,CaugheyA.B.BlueprintsPharmacology,Blackwell出版。
因此,本发明还涉及用于施用有效量的本发明氨基酸序列、 化合物或构建体和/或多肽和/或包含其的组合物的方法,其中所述方法包括向肺组织施用所述氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽和/或包含其的组合物。在所述方法中,所述氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽和/或包含其的组合物可以通过肺递送领域已知的任何方法进行施用,如例如通过使用吸入器或鼻内递送装置或气溶胶进行。
在本发明的优选方面中,所述氨基酸序列,化合物或构建体和/或多肽结合和/或中和在肺组织中存在的病毒。优选地,在用于肺递送的所述方法中,至少5%,优选地至少10%,20%,30%,40%,更优选地至少50%,60%,70%,和甚至更优选地至少80%以上的本发明氨基酸序列,化合物或构建体和/或多肽在至少24小时,优选地至少48小时更优选地至少72小时内在肺组织中是稳定的。
已经令人惊奇地发现,本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽在肺组织中具有长期持续的稳定性。例如,已经发现针对hRSV的在肺中在至少48小时内仍旧是具有功能的(见由埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)在2009年6月5日提交的PCT/EP2009/056975,标题为“用于治疗病毒疾病的针对病毒包膜蛋白的氨基酸序列和包含其的多肽(Aminoacidsequencesdirectedagainstenvelopeproteinsofavirusandpolypeptidescomprisingthesameforthetreatmentofviraldiseases)”)。因此,考虑到本发明的氨基酸序列、 化合物或构建体和/或多肽的估计的长期持续的稳定性,认为具有治疗间隔如一天一次,每2天一次,每3天一次,每4天一次,每5天一次,每6天一次或每周一次的本发明实施方案是可能的。
因此,本发明涉及用于将本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽递送给受试者的肺组织而不失活的方法,所述方法包括向所述受试者经肺施用本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽的步骤。
本发明还涉及用于预防和/或治疗hRSV感染的方法,所述方法包括给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体和/或包含其的药物组合物。
更具体地,本发明涉及用于预防和/或治疗呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和/或哮喘的方法,所述方法包括给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的本发明的氨基酸序列、本发明的本发明的多肽、本发明的化合物或构建体和/或包含其的药物组合物。
更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的本发明的多价(例如三价、二价)多肽或化合物、和/或包含其的药物组合物。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的本发明的二价化合物或多肽。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的二价人源化的NC41(诸如例如包含选自SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的两个的二价多肽)。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的三价化合物或多肽。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的本发明的三价人源化的NC41(诸如例如包含选自SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的三个的三价多肽)。更具体地,本发明可以涉及用于预防和/或治疗由hRSV引起的感染的方法,所述方法包括,给需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的SEQIDNO’s:77-79,142-145和158-165之一。
此外,例如,但不限于此,根据本发明所述的氨基酸序列、 化合物或构建体和多肽和包含其的组合物可以通过肌内和/或通过任何适合递送到脑内的形式,如允许所述氨基酸序列、多肽、化合物或构建体和包含其的组合物运送穿过血脑屏障的任何适合的递送形式进行施用。用于将本发明的氨基酸序列和/或多肽肌内递送和/或任何递送到脑的适合形式对于技术人员是公知的,并且例如在下列文献中描述:BingheWang,TerunaSiahaan和RichardSoltero(编辑WileyInterScience(JohnWiley&Sons))的手册“DrugDelivery:PrinciplesandApplications(药物递送:原理和应用)(2005)”;在RosenfeldG.C.,Loose-MitchellD.S.“药理学PreTestTM自我评价和综述(PharmacologyPreTestTMSelf-AssessmentandReview)”(第11版);和在LippincottWilliams&Wilkins,纽约;ShlaferM.McGraw-Hill医药学出版分社,纽约的“药理学(Pharmacology)”(第3版);YangK.Y.,GraffL.R.,CaugheyA.B.BlueprintsPharmacology,Blackwell出版。
本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽和/或包含其的组合物按照治疗方案进行施用,所述治疗方案适于预防和/或治疗要被预防或治疗的疾病或病症。临床医生通常能够确定适宜的治疗方案,这取决于下列因素,诸如要被预防或治疗的疾病或病症,要被治疗的疾病的严重性和/或其症状的严重性,要用的本发明的特定的氨基酸序列、 化合物或构建体或多肽,要用的特定的施用途径和药物制剂或组合物,患者的年龄、性别、体重、饮食、综合病况,以及临床医生公知的类似因素。
一般地,所述治疗方案包括以一种或多种药物有效量或剂量施用一种或多种本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽,或者包含其的一种或多种组合物。施用的具体量或剂量由临床医生确定,同样基于上文引用的因素来确定。
通常,对于预防和/或治疗本文提及的疾病和病症,并且取决于要治疗的具体疾病或病症,要用的特定的本发明的氨基酸序列、化合物和构建体和多肽的功效,具体的施用途径和使用的特定的药物制剂或组合物,本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和多肽一般以每天每kg体重1克-1微克的量施用,优选地每天每kg体重0.1克-10微克,最优选地每天每kg体重0.01克-100微克,诸如每天每kg体重约0.1,0.5,1,2,5或10毫克,作为单一的每日剂量连续施用(例如,通过输注)或者在一天内作为多次分剂量施用。本发明的包含半衰期延长结构部分的氨基酸序列、化合物或构建体和多肽可以以每kg体重1毫克-100毫克,优选地每kg体重1毫克-50毫克,诸如每kg体重约10,15,20或30毫克的量每月施用一次或两次。临床医生通常能够确定适宜的日常剂量,这取决于本文提及的因素。还应该清楚,在具体的情形中,临床医生可以选择偏离这些量,例如,基于上文引用的因素以及他的专业判断。一般地,关于施用量的一些指导可从通过基本上相同的途径通常施用的相当的针对相同靶标施用的常规抗体或抗体片段的量而获得,但是要考虑亲和性/抗体亲抗原性、功效、生物分布、半衰期以及熟练的技术人员公知的类似因素的不同。
当所述氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽和/或包含其的组合物施用于肺组织时,所述治疗方案可以是每天一次或两次,优选地每天一次,或每2,3,4,5,6,或7天一次。
通常,在上述方法中,将使用单一的本发明的氨基酸序列、 化合物或构建体,或多肽。然而,使用组合的两种或更多种本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和/或多肽也在本发明范围之内。
本发明的氨基酸序列、化合物或构建体和多肽还可以与一种或多种其它药物活性化合物或成分(principles)组合应用,即,作为组合治疗方案,其可以或者可以不引起增效效应。并且,基于上文所引用的因素及其专业判断,临床医生能够选择所述的其它化合物或成分,以及适宜的组合治疗方案。
特别地,本发明的氨基酸序列、化合物或构建体、和多肽可以与其它药物活性化合物或成分组合应用,所述其它药物活性化合物或成分是或者能够用于预防和/或治疗本文所引用的疾病和病症,结果可以或不可以获得增效效应。所述化合物和成分的实例,以及施用其的途径、方法和药物制剂或组合物是临床医生所清楚的。
具体地,本发明的氨基酸序列、化合物或构建体,和多肽可以与其它药物活性化合物或成分组合使用,所述其它药物活性化合物或成分是或可以用于预防和/或治疗本文提及的疾病和病症,其结果是可以或可以不获得增效作用。所述化合物和成分,以及施用其的路径、方法和药物制剂和组合物的实例对于临床医生是清楚的。
当两种或更多种物质或成分用作组合治疗方案的一部分时,它们可以通过相同的施用途径或者通过不同的施用途径在基本上相同的时间或在不同时间(例如,基本上同时地、连续地、或者按照备选方案)施用。当所述物质或成分通过相同的施用途径同时施用时,它们可以作为不同的药物制剂或组合物或者作为组合的药物制剂或组合物的一部分进行施用,这是熟练的技术人员所清楚的。
此外,当两种或更多种活性物质或成分作为组合治疗方案的一部分使用时,每一物质或成分可以以相同的量施用,并且按照与当所述化合物或成分单独使用时相同的方案施用,并且所述组合应用可以或可以不引起增效效应。然而,当所述两种或更多种活性物质或成分的组合应用引起增效效应时,还可以可能地减少要施用的一种、多种或全部物质或成分的量,同时仍旧获得理想的治疗作用。例如,这可以用于避免、限制或减少当以它们的常规用量使用时与一种或多种所述物质或成分的应用相关的任何不需要的副作用,同时仍旧获得理想的药物或治疗效果。
按照本发明所用的治疗方案的效果可以以本身已知的用于所涉及的疾病或病症的任何方式进行确定和/或遵循,这是临床医生所清楚的。在适当的并且基于病例/病例基础的情形中,临床医生还应该能够改变或改进特定的治疗方案,以便获得理想的治疗效果,以避免、限制或减少不需要的副作用,和/或实现一方面获得理想的治疗效果与另一方面避免、限制或减少不理想的副作用之间的适当的平衡。
通常,应该遵循所述治疗方案,直到获得理想的治疗效果和/或持续维持所述理想的治疗效果之久。并且,这可以由临床医生确定。
在另一方面中,本发明涉及本发明的氨基酸序列、化合物或构建体或多肽在制备用于预防和/或治疗至少一种病毒性疾病的药物组合物中的应用;和/或用于一种或多种本文所提及的治疗方法中的应用。
待治疗的受试者可以是任何温血动物,但是特别是哺乳动物,并且更特别是人类。熟练的技术人员应该清楚,待治疗的受试者特别是患有或者有危险患有本文提及的疾病和病症的人。
本发明还涉及本发明的氨基酸序列、化合物或构建体或多肽在制备用于预防和/或治疗至少一种可以通过给患者施用本发明的氨基酸序列、化合物或构建体或多肽而得到预防和/或治疗的疾病或病症的药物组合物中的应用。
更特别地,本发明涉及本发明的氨基酸序列、化合物或构建体或多肽在制备用于预防和/或治疗病毒性疾病、且特别是用于预防和治疗本发明列出的一种或多种疾病和病症的药物组合物的应用。
同样地,在这样的药物组合物中,所述一种或多种本发明的氨基酸序列、化合物或构建体或多肽还可以适当地与一种或多种其它活性成分如本发明提及的那些组合。
基于本文的公开内容,本发明的氨基酸序列、多肽、核酸、遗传构建体以及宿主与宿主细胞的其它应用是熟练的技术人员所清楚的。例如,并且不限于,本发明的氨基酸序列可以连接在适当的载体或固体支持物上,以提供一种可以以本身已知的从包含病毒的包膜蛋白的组合物和制备物中纯化病毒的包膜蛋白的方式使用的介质。包括适当的可检测标记的本发明的氨基酸序列的衍生物也可以用作(定性或定量)确定病毒的包膜蛋白在组合物或制备物中存在的标记,或作为选择性检测病毒的包膜蛋白在细胞或组织表面存在的标记(例如,与适当的细胞分选技术结合)。
现在,将通过下述非限制性的优选方面、实施例和附图进一步描述本发明:
在整个本申请中引用的所有参考文献(包括文献参考,授权专利,公开的专利申请,和同时待审的专利申请)的完整内容通过参考明确地结合于此,特别是关于上文引用的教导。
方面
方面A-1.氨基酸序列,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F并至少包含选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面A-2.根据方面A-1的氨基酸序列,其包含两个以上氨基酸残基片段的氨基酸序列,其中一个片段选自以下:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于本发明的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
方面A-3.根据方面A-1或A-2的氨基酸序列,其包含三个以上氨基酸残基片段,其中第一氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
第二氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且第三氨基酸残基片段选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面A-4.根据方面A-1至A-3中任一项的氨基酸序列,其特异性结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II和/或与竞争结合hRSV的蛋白F。
方面A-5.根据方面A-1至A-4中任一项的氨基酸序列,其是天然存在的氨基酸序列(来自任何合适的物种)或合成或半合成的氨基酸序列。
方面A-6.根据方面A-1至A-5中任一项的氨基酸序列,其包括免疫球蛋白折叠或在适当条件下能够形成免疫球蛋白折叠。
方面A-7.根据方面A-1至A-6中任一项的氨基酸序列,其是免疫球蛋白序列。
方面A-8.根据方面A-1至A-7中任一项的氨基酸序列,其是天然存在的免疫球蛋白序列(来自任何合适的物种)或合成或半合成的免疫球蛋白序列。
方面A-9.根据方面A-1至A-8中任一项的氨基酸序列,其是人源化的免疫球蛋白序列、骆驼化的免疫球蛋白序列或已经通过诸如亲和性成熟的技术获得的免疫球蛋白序列。
方面A-10.根据方面A-1至A-9中任一项的氨基酸序列,其基本上由重链可变结构域序列(例如VH-序列)组成。
方面A-11.根据方面A-1至A-10中任一项的氨基酸序列,其基本上由源自常规四链抗体的重链可变结构域序列组成或基本上由源自重链抗体的重链可变结构域序列组成。
方面A-12.根据方面A-1至A-11中任一项的氨基酸序列,其基本上由结构域抗体(或适合于作为结构域抗体使用的氨基酸序列)、单结构域抗体(或适合于作为单结构域抗体使用的氨基酸序列)、"dAb"(或适合于作为dAb使用的氨基酸序列)或(包括但不仅限于VHH序列)组成。
方面A-13.根据方面A-1至A-12中任一项的氨基酸序列,其基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面A-14.根据方面A-13的氨基酸序列,其基本上由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中CDR2选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:102;或
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且CDR1或CDR3中至少一种选自:
-选自由以下组成的组的CDR1:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和/或
-选自由以下组成的组的CDR3:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面A-15.根据方面A-13或A-14中任一项的氨基酸序列,其由4个构架区(分别为FR1-FR4)和3个互补性决定区(分别为CDR1-CDR3)组成,其中:
-CDR1选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR2选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR3选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面A-16.根据方面A-1至A-15中任一项的氨基酸序列,其至少包含SEQIDNO:102。
方面A-17.根据方面A-16的氨基酸序列,其至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自以下的氨基酸残基片段(CDR序列):
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面A-18.根据方面A-16或A-17中任一项的氨基酸序列,其至少包含SEQIDNO:102和选自以下的CDR1序列:
a)SEQIDNO:98;和
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和选自以下的CDR3序列:
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面A-19.根据方面A-16至A-18中任一项的氨基酸序列,其至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自SEQIDNO:98和SEQIDNO:121的氨基酸残基片段(CDR序列)。
方面A-20.根据方面A-16至A-19中任一项的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
方面A-21.根据方面A-1至A-20中任一项的氨基酸序列,其基本上由组成,所述
a)与SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的至少一个氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性,其中为了确定氨基酸同一性的程度的目的,忽略形成CDR序列的氨基酸残基;
且其中:
b)优选地,在按照Kabat编号的位置11,37,44,45,47,83,84,103,104和108的一个或多个氨基酸残基选自WO08/020079的表A-3至表A-8中提及的标志残基。
方面A-22.根据方面A-1至A-21中任一项的氨基酸序列,其基本上由人源化的组成。
方面A-23.根据方面A-22的氨基酸序列,其基本上由人源化的 组成,所述可以结合(如本文中进一步定义)hRSV的蛋白F并且:
i)是SEQIDNO:5的氨基酸序列(见表A-1)的人源化变体;和/或
ii)与SEQIDNO:5的氨基酸序列(见表A-1)和/或SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的至少一个氨基酸序列(见表A-4)具有至少80%的氨基酸同一性,其中为了确定氨基酸同一性的程度的目的,忽略形成CDR序列的氨基酸残基;
且其中:
iii)优选地,在按照Kabat编号的位置11,37,44,45,47,83,84,103,104和108的一个或多个氨基酸残基选自WO08/020079的表A-3至表A-8中提及的标志残基。
方面A-24.根据方面A-1至A-23中任一项的氨基酸序列,其处于基本分离的形式。
方面A-25.根据方面A-1至A-24中任一项的氨基酸序列,其施用于受试者,其中所述氨基酸序列不天然存在于所述受试者中。
方面A-26.根据方面A-1至A-25中任一项的氨基酸序列,其可以以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选10nM-1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面A-27.根据方面A-1至A-26中任一项的氨基酸序列,其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面A-28.根据方面A-1至A-27中任一项的氨基酸序列,其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面A-29.根据方面A-1至A-28中任一项的氨基酸序列,其可以以100nM-1000nM,优选100nM-500nM,或更小的IC50值中和hRSV(例如,如在关于hRSVLong的微量中和测定法中测量的(诸如例如实施例6中所述))。
方面B-1.其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,其中CDR2选自:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面B-2.根据方面B-1的其中CDR2选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:102;或
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且CDR1或CDR3中至少一种选自:
-选自由以下组成的组的CDR1:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和/或
-选自由以下组成的组的CDR3:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面B-3.根据方面B-1或B-2中任一项的其中:
-CDR1选自由以下组成的组:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR2选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且
-CDR3选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面B-4.根据方面B-1至B-3中任一项的其至少包含SEQIDNO:102。
方面B-5.根据方面B-4的其至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自以下的CDR序列:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面B-6.根据方面B-4或B-5中任一项的其至少包含SEQIDNO:102和选自以下的CDR1序列:
a)SEQIDNO:98;和
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和选自以下的CDR3序列:
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面B-7.根据方面B-4至B-6中任一项的其至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自SEQIDNO:98和SEQIDNO:121的CDR序列。
方面B-8.根据方面B-4至B-7中任一项的其包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
方面B-9.根据方面B-1至B-8中任一项的其处于基本分离的形式。
方面B-10.根据方面B-1至B-9中任一项的其可以以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选10nM-1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面B-11.根据方面B-1至B-10中任一项的其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面B-12.根据方面B-1至B-11中任一项的其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面B-13.根据方面B-1至B-12中任一项的其可以以100nM-1000nM,优选100nM-500nM,或更小的IC50值中和hRSV(例如,如在关于hRSVLong的微量中和测定法中测量的(诸如例如实施例6中所述))。
方面B-14.根据方面B-1至B-13中任一项的其是天然存在的(来自任何合适的物种)或合成或半合成的
方面B-15.根据方面B-1至B-14中任一项的其是VHH序列、部分人源化的VHH序列、完全人源化的VHH序列、骆驼化的重链可变结构域或已经通过诸如亲和性成熟的技术获得的
方面B-16.根据方面B-1至B-15中任一项的其是部分人源化的
方面B-17.根据方面B-1至B-16中任一项的其是完全人源化的
方面B-18.根据方面B-1至B-17中任一项的其基本上由人源化的组成,所述可以结合(如本文中进一步定义)hRSV的蛋白F并且:
i)是SEQIDNO:5的氨基酸序列(见表A-1)的人源化变体;和/或
ii)与SEQIDNO:5的氨基酸序列(见表A-1)和/或SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157的至少一个氨基酸序列(见表A-4)具有至少80%的氨基酸同一性,其中为了确定氨基酸同一性的程度的目的,忽略形成CDR序列的氨基酸残基;
且其中:
iii)优选地,在按照Kabat编号的位置11,37,44,45,47,83,84,103,104和108的一个或多个氨基酸残基选自WO08/020079的表A-3至表A-8中提及的标志残基。
方面C-1:氨基酸序列,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面C-2:根据方面C-1的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:60-76之一或基本上由SEQIDNO:60-76之一组成。
方面C-3:氨基酸序列,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面C-4:根据方面C-3的氨基酸序列,其选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面C-5:根据方面C-3或C-4中任一项的氨基酸序列,其包含SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一或基本上由SEQIDNO:60-76之一组成。
方面C-6:氨基酸序列,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面C-7:根据方面C-6的氨基酸序列,其选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面C-8:氨基酸序列,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面C-9:根据方面C-8的氨基酸序列,其包含SEQIDNO’s:146-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
方面C-10:氨基酸序列,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面C-11:根据方面C-10的氨基酸序列,其选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面C-12:根据方面C-10或C-11中任一项的氨基酸序列,其包含SEQIDNO’s:146-149和151-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-149和151-153之一组成。
方面C-13:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-14:根据方面C-13的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中2个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-15:根据方面C-14的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中3个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-16:根据方面C-15的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中4个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-17:根据方面C-16的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中5个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-18:根据方面C-17的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中6个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-19:根据方面C-18的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中7个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-20:根据方面C-19的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中8个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-21:根据方面C-20的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中9个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-22:根据方面C-21的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中10个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-23:根据方面C-22的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面C-24:根据方面C-13的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面C-25:根据方面C-13的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面C-26:根据方面C-25的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面C-27:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面C-28:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面C-29:根据方面C-8的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面C-30:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成。
方面C-31:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成。
方面C-32:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成。
方面C-33:氨基酸序列,其包含SEQIDNO’s:146-153:76中的任一个或基本上由SEQIDNO’s:146-153:76中的任一个组成。
方面C-34.根据方面C-1至C-33中任一项的氨基酸序列,其可以以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选10nM-1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面C-35.根据方面C-1至C-34中任一项的氨基酸序列,其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面C-36.根据方面C-1至C-35中任一项的氨基酸序列,其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面C-37.根据方面C-1至C-36中任一项的氨基酸序列,其可以以100nM-1000nM,优选100nM-500nM,或更小的IC50值中和hRSV(例如,如在关于hRSVLong的微量中和测定法中测量的(诸如例如实施例6中所述))。
方面C-38:根据方面C-1至C-37中任一项的氨基酸序列,其特异性结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II和/或与竞争结合hRSV的蛋白F。
方面D-1.其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面D-2:根据方面D-1的其包含SEQIDNO’s:60-76之一或基本上由SEQIDNO’s:60-76之一组成。
方面D-3.其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面D-4:根据方面D-3的任一项的其选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面D-5:根据方面D-3或D-4中任一项的其包含SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一或基本上由SEQIDNO:60-76之一组成。
方面D-6.其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面D-7:根据方面D-6的任一项的其选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面D-8.其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面D-9:根据方面D-8的其包含SEQIDNO’s:146-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
方面D-10.其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面D-11:根据方面D-10的其选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面D-12:根据方面D-10或方面D-11中任一项的其包含SEQIDNO’s:146-149和151-153之一或基本上由SEQIDNO’s:146-149和151-153之一组成。
方面D-13:其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-14:根据方面D-13的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中2个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-15:根据方面D-14的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中3个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-16:根据方面D-15的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中4个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-17:根据方面D-16的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中5个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-18:根据方面D-17的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中6个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-19:根据方面D-18的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中7个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-20:根据方面D-19的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中8个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-21:根据方面D-20的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中9个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-22:根据方面D-21的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中10个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-23:根据方面D-22的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面D-24:根据方面D-13的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面D-25:根据方面D-8的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面D-26:根据方面D-20的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面D-27:其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面D-28:其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面D-29:根据方面D-13的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面D-30:其包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成。
方面D-31:其包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成。
方面D-32:其包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成。
方面D-33:其包含SEQIDNO’s:146-153中的任一种或基本上由SEQIDNO’s:146-153中的任一种组成。
方面D-34.根据方面D-1至D-33中任一项的其可以以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选10nM-1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面D-35.根据方面D-1至D-34中任一项的其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面D-36.根据方面D-1至D-35中任一项的其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面D-37.根据方面D-1至D-36中任一项的其可以以100nM-1000nM,优选100nM-500nM,或更小的IC50值中和hRSV(例如,如在关于hRSVLong的微量中和测定法中测量的(诸如例如实施例6中所述))。
方面D-38:根据方面D-1至D-37中任一项的其特异性结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II和/或与竞争结合hRSV的蛋白F。
方面W-1:根据方面A-1至A-29和C-1至C-38中任一项的氨基酸序列,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,其中所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定)。
方面W-2:氨基酸序列,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面W-3:根据方面W-2的氨基酸序列,其包含SEQIDNO’s:138-141和154-157之一或基本上由SEQIDNO’s:138-141和154-157之一组成。
方面W-4:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-5:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-6:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-7:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-8:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:75或基本上由SEQIDNO:75组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-9:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:147或基本上由SEQIDNO:147组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-10:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:149或基本上由SEQIDNO:149组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-11:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:153或基本上由SEQIDNO:153组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-12:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-13:根据方面W-12的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中2个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-14:根据方面W-13的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中3个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-15:根据方面W-14的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中4个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-16:根据方面W-15的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中5个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-17:根据方面W-16的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中6个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-18:根据方面W-17的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中7个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-19:根据方面W-18的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中8个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-20:根据方面W-19的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中9个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-21:根据方面W-20的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中10个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-22:根据方面W-21的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-23:根据方面W-12的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-24:根据方面W-12的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-25:根据方面W-24的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-26:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-27:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面W-28:根据方面W-2或W-3的氨基酸序列,其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面W-29:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:138或基本上由SEQIDNO:138组成。
方面W-30:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:139或基本上由SEQIDNO:139组成。
方面W-31:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:140或基本上由SEQIDNO:140组成。
方面W-32:氨基酸序列,其包含SEQIDNO:141或基本上由SEQIDNO:141组成。
方面W-33:氨基酸序列,其包含SEQIDNO’s:154-157中任一种或基本上由SEQIDNO’s:154-157中任一种组成。
方面W-34.根据方面W-1至W-33中任一项的氨基酸序列,其可以以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选10nM-1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面W-35.根据方面W-1至W-34中任一项的氨基酸序列,其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面W-36.根据方面W-1至W-35中任一项的氨基酸序列,其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面W-37.根据方面W-1至W-36中任一项的氨基酸序列,其可以以100nM-1000nM,优选100nM-500nM,或更小的IC50值中和hRSV(例如,如在关于hRSVLong的微量中和测定法中测量的(诸如例如实施例6中所述))。
方面W-38:根据方面W-1至W-37中任一项的氨基酸序列,其特异性结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II和/或与竞争结合hRSV的蛋白F。
方面X-1:根据方面B-1至B-18和D-1至D-38中任一项的纳米抗体,其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,其中所述纳米抗体在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定)。
方面X-2:其针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F,选自以下:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面X-3:根据方面X-2的其包含SEQIDNO’s:138-141和154-157之一或基本上由SEQIDNO’s:138-141和154-157之一组成。
方面X-4:其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-5:其包含SEQIDNO:62或基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-6:其包含SEQIDNO:65或基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-7:其包含SEQIDNO:76或基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-8:其包含SEQIDNO:75或基本上由SEQIDNO:75组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-9:其包含SEQIDNO:147或基本上由SEQIDNO:147组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-10:其包含SEQIDNO:149或基本上由SEQIDNO:149组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-11:其包含SEQIDNO:153或基本上由SEQIDNO:153组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-12:其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-13:根据方面X-12的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中2个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-14:根据方面X-13的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中3个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-15:根据方面X-14的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中4个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-16:根据方面X-15的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中5个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-17:根据方面X-16的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中6个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-18:根据方面X-17的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中7个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-19:根据方面X-18的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中8个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-20:根据方面X-19的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中9个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-21:根据方面X-20的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中10个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-22:根据方面X-21的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-23:根据方面X-12的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-24:根据方面X-12的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-25:根据方面X-24的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-26:其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-27:其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面X-28:根据方面X-2的其包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面X-29:其包含SEQIDNO:138或基本上由SEQIDNO:138组成。
方面X-30:其包含SEQIDNO:139或基本上由SEQIDNO:139组成。
方面X-31:其包含SEQIDNO:140或基本上由SEQIDNO:140组成。
方面X-32:其包含SEQIDNO:141或基本上由SEQIDNO:141组成。
方面X-33:其包含SEQIDNO’s:154-157中任一种或基本上由SEQIDNO’s:154-157中任一种组成。
方面X-34:根据方面X-1至X-33中任一项的其可以以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选10nM-1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面X-35:根据方面X-1至X-34中任一项的其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面X-36:根据方面X-1至X-35中任一项的其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面X-37:根据方面X-1至X-36中任一项的其可以以100nM-1000nM,优选100nM-500nM,或更小的IC50值中和hRSV(例如,如在关于hRSVLong的微量中和测定法中测量的(诸如例如实施例6中所述))。
方面X-38:根据方面X-1至X-37中任一项的其特异性结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II和/或与竞争结合hRSV的蛋白F。
方面E-1:多肽,其包含一个或多个根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列和/或一个或多个根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的或基本上由上述氨基酸序列和/或组成,任选地还包含任选地通过一个或多个肽接头连接的一个或多个其他氨基酸结合单元。
方面E-2:根据方面E-1的多肽,其中所述一个或多个其他结合单元是免疫球蛋白序列。
方面E-3:根据方面E-1或E-2中任一项的多肽,其中所述一个或多个其他结合单元选自由以下组成的组:结构域抗体,适合用作结构域抗体的氨基酸序列,单结构域抗体,适合用作单结构域抗体的氨基酸序列,"dAb’s",适合用作dAb的氨基酸序列,或
方面E-4:根据方面E-1至E-3中任一项的多肽,其中所述一个或多个氨基酸序列是免疫球蛋白序列。
方面E-5:根据方面E-1至E-4中任一项的多肽,其中其中所述一个或多个氨基酸序列选自由以下组成的组:结构域抗体,适合用作结构域抗体的氨基酸序列,单结构域抗体,适合用作单结构域抗体的氨基酸序列,"dAb’s",适合用作dAb的氨基酸序列,或
方面E-6:根据方面E-1至E-5中任一项的多肽,其包含一个或多个根据方面B-1至B-18,D-1至D-8和X-1至X-38中任一项的或基本上由其组成,且其中所述一个或多个其他结合单元是
方面E-7:根据方面E-1至E-6中任一项的多肽,其是多价构建体。
方面E-8:根据方面E-7的多价多肽,其包含至少两个根据方面A-1至A-29和C-1至C-38中任一项的氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18和D-1至D-38中任一项的和/或至少一个根据方面W-1至W-38中任一项的氨基酸序列和/或至少一个根据方面X-1至X-38中任一项的 或基本上由上述组成。
方面E-9:根据方面E-8的多价多肽,其中所述至少两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-10:根据方面E-7至E-9中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-11:根据方面E-7至E-10中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于本发明的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
方面E-12:根据方面E-7至E-11中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
包含第二氨基酸残基片段,其选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和包含第三氨基酸残基片段,其选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-13:根据方面E-7至E-12中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102。
方面E-14:根据方面E-7至E-13中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自以下的氨基酸残基片段(CDR序列):
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-15:根据方面E-7至E-14中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和选自以下的CDR1:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和选自以下的CDR3序列:
c)SEQIDNO:121;
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-16:根据方面E-7至E-15中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自SEQIDNO:98和SEQIDNO:121的氨基酸残基片段(CDR序列)。
方面E-17:根据方面E-7至E-16中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
方面E-18:根据方面E-7至E-17中任一项的多价多肽,其中所述至少两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-19:根据方面E-7至E-9中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-20:根据方面E-19的多价多肽,其中所述至少两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-21:根据方面E-20的多价多肽,其包含至少两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少两个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:60-76之一。
方面E-22:根据方面E-7至E-9中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-23:根据方面E-22的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-24:根据方面E-22或E-23中任一项的多价多肽,其中所述至少两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-25:根据方面E-24的多价多肽,其包含至少两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少两个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一。
方面E-26:根据方面E-7至E-9中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-27:根据方面E-26的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-28:根据方面E-26或E-27中任一项的多价多肽,其中所述至少两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-29:根据方面E-28的多价多肽,其包含至少两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少两个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:65和76。
方面E-30:根据方面E-7至E-9中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-31:根据方面E-30的多价多肽,其中所述至少两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-32:根据方面E-31的多价多肽,其包含至少两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少两个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:146-153之一。
方面E-33:根据方面E-7至E-9中任一项的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-34:根据方面E-33的多价多肽,其包含至少两个氨基酸序列和/或或基本上由至少两个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-35:根据方面E-33或E-34中任一项的多价多肽,其中所述至少两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-36:根据方面E-35的多价多肽,其包含至少两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少两个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75,76,147,149和153之一。
方面E-37:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
方面E-38:根据方面E-37的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面E-39:根据方面E-37的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-40:根据方面E-37的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-41:根据方面E-40的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-42:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面E-43:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面E-44:根据方面E-37的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少两个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面E-45:根据方面E-7的多价多肽,其包含至少三个根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的或基本上由至少三个根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的组成。
方面E-46:根据方面E-45的多价多肽,其中所述至少三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-47:根据方面E-45或E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-48:根据方面E-45或E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于本发明的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
方面E-49:根据方面E-45或E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:98;和
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
第二氨基酸残基片段,其选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;和
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和第三氨基酸残基片段,其选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-50:根据方面E-45至E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102。
方面E-51:根据方面E-45至E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自以下的氨基酸残基片段(CDR序列):
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-52:根据方面E-45至E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和选自以下的CDR1:
a)SEQIDNO:98;和
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和选自以下的CDR3序列:
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-53:根据方面E-45至E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自SEQIDNO:98和SEQIDNO:121的氨基酸残基片段(CDR序列)。
方面E-54:根据方面E-45至E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
方面E-55:根据方面E-47至E-53中任一项的多价多肽,其中所述至少三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-56:根据方面E-45至E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-57:根据方面E-56的多价多肽,其中所述至少三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-58:根据方面E-57的多价多肽,其包含至少三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:60-76之一。
方面E-59:根据方面E-45或E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-60:根据方面E-59的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-61:根据方面E-59或E-60中任一项的多价多肽,其中所述至少三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-62:根据方面E-61的多价多肽,其包含至少三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一。
方面E-63:根据方面E-45或E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-64:根据方面E-63的多价多肽,其包含至少三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-65:根据方面E-63或E-64中任一项的多价多肽,其中所述至少三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-66:根据方面E-65的多价多肽,其包含至少三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:65和76。
方面E-67:根据方面E-45或E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-68:根据方面E-67的多价多肽,其中所述至少三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-69:根据方面E-68的多价多肽,其包含至少三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:146-153之一。
方面E-70:根据方面E-45或E-46中任一项的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-71:根据方面E-70的多价多肽,其包含至少三个氨基酸序列和/或或基本上由至少三个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-72:根据方面E-70或E-71中任一项的多价多肽,其中所述至少三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-73:根据方面E-72的多价多肽,其包含至少三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个相同的氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75,76,147,149和153之一。
方面E-74:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少三个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
方面E-75:根据方面E-74的多价多肽,其包含至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面E-76:根据方面E-74的多价多肽,其包含至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-77:根据方面E-74的多价多肽,其包含至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-78:根据方面E-77的多价多肽,其包含至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-79:多价多肽,其包含至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面E-80:多价多肽,其包含至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面E-81:根据方面E-74的多价多肽,其包含至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或或基本上由至少三个具有SEQIDNO:5的氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面E-82:根据方面E-7至E-9中任一项的多价多肽,其包含至少一个选自以下的氨基酸序列和/或或基本上由至少一个选自以下的氨基酸序列和/或组成:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-83:根据方面E-82的多价多肽,其包含至少一个选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一的氨基酸序列和/或或基本上由至少一个选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一的氨基酸序列和/或 组成。
方面E-84:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-85:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:62的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:62的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-86:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:65的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:65的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-87:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:76的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:76的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-88:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:75的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:75的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-89:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:147的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:147的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-90:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:149的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:149的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-91:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:153的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:153的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-92:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-93:根据方面E-92的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-94:根据方面E-92的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-95:根据方面E-92的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-96:根据方面E-95的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-97:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-98:多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-99:根据方面E-92的多价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面E-100:根据方面E-7的二价多肽,其包含两个根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的或基本上由两个根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的 组成。
方面E-101:根据方面E-100的二价多肽,其中所述两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-102:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-103:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于本发明的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
方面E-104:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
第二氨基酸残基片段,其选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和第三氨基酸残基片段,其选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-105:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102。
方面E-106:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自以下的氨基酸残基片段(CDR序列):
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-107:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和选自以下的CDR1:
a)SEQIDNO:98;和
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和选自以下的CDR3序列:
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-108:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自SEQIDNO:98和SEQIDNO:121的氨基酸残基片段(CDR序列)。
方面E-109:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
方面E-110:根据方面E-102至E-109中任一项的二价多肽,其中所述至少两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-111:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-112:根据方面E-111的二价多肽,其中所述两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-113:根据方面E-112的二价多肽,其包含两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由两个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:60-76之一。
方面E-114:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-115:根据方面E-114的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-116:根据方面E-114或E-115中任一项的二价多肽,其中所述两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-117:根据方面E-116的二价多肽,其包含两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由两个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一。
方面E-118:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-119:根据方面E-118的二价多肽,其包含两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由两个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-120:根据方面E-118或E-119中任一项的二价多肽,其中所述两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-121:根据方面E-120的二价多肽,其包含两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由两个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:65和76。
方面E-122:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-123:根据方面E-122的二价多肽,其中所述两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-124:根据方面E-123的二价多肽,其包含两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由两个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:146-153之一。
方面E-125:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-126:根据方面E-125的二价多肽,其包含两个氨基酸序列和/或或基本上由两个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-127:根据方面E-125或E-126中任一项的二价多肽,其中所述两个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-128:根据方面E-127的二价多肽,其包含两个相同的氨基酸序列和/或或基本上由两个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75,76,147,149和153之一。
方面E-129:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或 组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
方面E-130:根据方面E-129的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面E-131:根据方面E-129的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-132:根据方面E-129的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-133:根据方面E-132的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-134:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或 组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面E-135:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或 组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面E-136:根据方面E-129的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的两个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面E-137:根据方面E-100或E-101中任一项的二价多肽,其包含至少一个选自以下的氨基酸序列和/或或基本上由至少一个选自以下的氨基酸序列和/或组成:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-138:根据方面E-137的二价多肽,其包含至少一个选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一的氨基酸序列和/或或基本上由至少一个选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一的氨基酸序列和/或 组成。
方面E-139:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-140:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:62的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:62的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-141:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:65的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:65的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-142:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:76的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:76的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-143:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:75的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:75的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-144:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:147的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:147的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-145:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:149的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:149的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-146:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:153的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:153的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-147:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-148:根据方面E-147的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-149:根据方面E-147的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-150:根据方面E-147的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-151:根据方面E-150的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-152:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-153:二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面E-154:根据方面E-147的二价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面E-155:根据方面E-7的三价多肽,其包含三个根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的或基本上由三个根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的 组成。
方面E-156:根据方面E-155的三价多肽,其中所述三个氨基酸序列和/或相同的。
方面E-157:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-158:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:102;
b)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
且至少一个片段选自:
c)SEQIDNO:98;
d)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义),
由此,与a)和b)之一相对应的氨基酸残基片段应该总是存在于本发明的氨基酸序列中,且由此,第二氨基酸残基片段选自c)、d)、e)和f)之一。
方面E-159:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含一个选自以下的氨基酸残基片段:
a)SEQIDNO:98;和
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
第二氨基酸残基片段,其选自由以下组成的组:
c)SEQIDNO:102;和
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和第三氨基酸残基片段,其选自由以下组成的组:
e)SEQIDNO:121;和
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-160:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102。
方面E-161:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自以下的氨基酸残基片段(CDR序列):
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-162:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和选自以下的CDR1:
a)SEQIDNO:98;和
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义);
和选自以下的CDR3序列:
c)SEQIDNO:121;和
d)与SEQIDNO:121具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段但没有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-163:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或至少包含SEQIDNO:102和至少一个选自SEQIDNO:98和SEQIDNO:121的氨基酸残基片段(CDR序列)。
方面E-164:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或包含SEQIDNO:98,SEQIDNO:102和SEQIDNO:121。
方面E-165:根据方面E-157至E-164中任一项的三价多肽,其中所述三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-166:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-167:根据方面E-166的三价多肽,其中所述三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-168:根据方面E-167的三价多肽,其包含三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由三个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:60-76之一。
方面E-169:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-170:根据方面E-169的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-171:根据方面E-169或E-170中任一项的三价多肽,其中所述三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-172:根据方面E-171的三价多肽,其包含三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由三个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一。
方面E-173:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-174:根据方面E-173的三价多肽,其包含三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由三个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-175:根据方面E-173或E-174中任一项的三价多肽,其中所述三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-176:根据方面E-175的三价多肽,其包含三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由三个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:65和76。
方面E-177:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-178:根据方面E-177的三价多肽,其中所述三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-179:根据方面E-178的三价多肽,其包含三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由三个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:146-153之一。
方面E-180:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或 组成,所述氨基酸序列和/或选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-181:根据方面E-180的三价多肽,其包含三个氨基酸序列和/或或基本上由三个氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-182:根据方面E-180或E-181中任一项的三价多肽,其中所述三个氨基酸序列和/或是相同的。
方面E-183:根据方面E-182的三价多肽,其包含三个相同的氨基酸序列和/或或基本上由三个相同的氨基酸序列和/或组成,所述氨基酸序列和/或选自SEQIDNO’s:62,65,67,68,75,76,147,149和153之一。
方面E-184:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或 组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
方面E-185:根据方面E-184的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面E-186:根据方面E-184的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-187:根据方面E-184的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-188:根据方面E-187的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-189:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或 组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面E-190:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或 组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面E-191:根据方面E-184的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的三个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面E-192:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:62的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:62的三个氨基酸序列和/或组成。
方面E-193:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:65的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:65的三个氨基酸序列和/或组成。
方面E-194:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:76的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:76的三个氨基酸序列和/或组成。
方面E-195:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:75的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:75的三个氨基酸序列和/或组成。
方面E-196:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:147的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:147的三个氨基酸序列和/或组成。
方面E-197:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:149的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:149的三个氨基酸序列和/或组成。
方面E-198:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:153的三个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:153的三个氨基酸序列和/或组成。
方面E-199:根据方面E-155或E-156中任一项的三价多肽,其包含至少一个选自以下的氨基酸序列和/或或基本上由至少一个选自以下的氨基酸序列和/或组成:
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-200:根据方面E-199的三价多肽,其包含至少一个选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一的氨基酸序列和/或或基本上由至少一个选自SEQIDNO’s:138-141和154-157之一的氨基酸序列和/或 组成。
方面E-201:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-202:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:62的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:62的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-203:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:65的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:65的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-204:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:76的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:76的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-205:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:75的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:75的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-206:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:147的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:147的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-207:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:149的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:149的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-208:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:153的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:153的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-209:三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-210:根据方面E-209的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-211:根据方面E-209的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-212:根据方面E-209的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-213:根据方面E-212的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-214:根据方面E-209的三价多肽,其包含具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或或基本上由具有SEQIDNO:5的至少一个氨基酸序列和/或组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面E-215:针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F的三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:77-79和158;
b)与SEQIDNO’s:77-79和158之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和/或在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-216:根据方面E-215的三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:77-79和158;
b)与SEQIDNO’s:77-79和158之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-217:针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F的三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO:78和79;
b)与SEQIDNO’s:78和79之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和/或在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-218:根据方面E-217的三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO:78和79;或
b)与SEQIDNO’s:78和79之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L),在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-219:针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F的三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:159-161;
b)与SEQIDNO’s:159-161之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-220:根据方面E-219的三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:159-161;
b)与SEQIDNO’s:159-161之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-221:根据方面E-219或E-220中任一项的三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:159-161;
b)与SEQIDNO’s:159-161之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的氨基酸序列或在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述多肽与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:159,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:160,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:161,所述多肽中包含的氨基酸序列或优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-222:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
方面E-223:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面E-224:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-225:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-226:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面E-227:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面E-228:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面E-229:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面E-230:三价多肽,其包含SEQIDNO:77或基本上由SEQIDNO:77组成。
方面E-231:三价多肽,其包含SEQIDNO:78或基本上由SEQIDNO:78组成。
方面E-232:三价多肽,其包含SEQIDNO:79或基本上由SEQIDNO:79组成。
方面E-233:三价多肽,其包含SEQIDNO’s:159-161之一或基本上由SEQIDNO’s:159-161之一组成。
方面E-234:针对和/或特异性结合hRSV的蛋白F的三价多肽,其选自以下多肽:
a)SEQIDNO’s:142-145和162-165;
b)与SEQIDNO’s:142-145和162-165之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的多肽,条件是:
i)所述多肽中包含的第一氨基酸序列或在位置1具有天冬氨酸(Asp,D);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的多肽相比,所述多肽以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述多肽具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面E-235:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-236:三价多肽,其包含SEQIDNO:77或基本上由SEQIDNO:77组成,其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-237:三价多肽,其包含SEQIDNO:78或基本上由SEQIDNO:78组成,其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-238:三价多肽,其包含SEQIDNO:79或基本上由SEQIDNO:79组成,其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-239:三价多肽,其包含SEQIDNO:158或基本上由SEQIDNO:158组成,其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-240:三价多肽,其包含SEQIDNO:159或基本上由SEQIDNO:159组成,其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-241:三价多肽,其包含SEQIDNO:160或基本上由SEQIDNO:160组成,其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-242:三价多肽,其包含SEQIDNO:161或基本上由SEQIDNO:161组成,其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-243:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7,8或9,10,11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-244:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-245:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6,7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-246:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-247:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-248:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-249:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,一个或多个(诸如2,3,4,5,6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-250:三价多肽,其包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成,其中在至少一个(优选在两个,更优选在全部三个)形成SEQIDNO:53的一部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln,
且其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面E-251:三价多肽,其包含SEQIDNO:142或基本上由SEQIDNO:142组成。
方面E-252:三价多肽,其包含SEQIDNO:143或基本上由SEQIDNO:143组成。
方面E-253:三价多肽,其包含SEQIDNO:144或基本上由SEQIDNO:144组成。
方面E-254:三价多肽,其包含SEQIDNO:145或基本上由SEQIDNO:145组成。
方面E-255:三价多肽,其包含SEQIDNO’s:162-165之一或基本上由SEQIDNO’s:162-165之一组成。
方面E-256:根据方面E-1至E-255中任一项的多肽,其可以以100nM-0.1nM或更小,优选10nM-0.1nM或更小,更优选1nM-0.1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面E-257:根据方面E-1至E-256中任一项的多肽,其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面E-258:根据方面E-1至E-257中任一项的多肽,其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,更优选5x10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面E-259:根据方面E-1至E-258中任一项的多肽,其可以以10pM-1000pM,优选10pM-250pM,更优选50pM-200pM或更小的IC50值中和hRSV(例如,如在关于hRSVLong的微量中和测定法中测量的(诸如例如实施例6中所述))。
方面E-260:根据方面E-1至E-259中任一项的多肽,其可以以这样的IC50值中和hRSV(例如,如在关于hRSVLong的微量中和测定法中测量的(诸如例如实施例6中所述)),所述IC50值与使用获得的IC50值相比至少相同和优选更佳,至少10倍更佳,优选20倍更佳,更优选50倍更佳,甚至更优选60、70、80或更多倍更佳。
方面E-261:根据方面E-1至E-260中任一项的多肽,其是多特异性构建体。
方面F-1:单价构建体,其包含根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的一种氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的一种或基本上由根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的一种氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的一种 组成。
方面F-2:根据方面F-1的单价构建体,其中所述氨基酸序列选自由以下组成的组:结构域抗体,适合用作结构域抗体的氨基酸序列,单结构域抗体,适合用作单结构域抗体的氨基酸序列,"dAb’s",适合用作dAb的氨基酸序列,或
方面F-3:单价构建体,其包含根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的一种或基本上由根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的一种组成。
方面F-4:单价构建体,其选自由以下组成的组:SEQIDNO’s:60-76,SEQIDNO’s:138-141和SEQIDNO’s:146-157。
方面F-5:根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体在制备根据方面E-1至E-261中任一项的多价多肽中的用途。
方面F-6:根据方面F-5的单价构建体的用途,其中所述单价构建体作为结合结构域或结合单元用于制备包含两个或更多结合单元的多价构建体。
方面F-7:根据方面F-5或F-6中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,与分子间结合相比,所述多价多肽优选展示分子内结合。
方面F-8:根据方面F-5至F-7中任一项的单价构建体作为结合结构域或结合单元来制备多价构建体的用途,其中所述结合结构域或结合单元通过接头连接,以使得与分子间结合相比,所述多价多肽优选展示分子内结合和/或所述多价多肽可以同时结合hRSV的蛋白F上的全部结合位点。
方面F-9:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-10:根据方面F-9的单价构建体的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:60-76之一组成。
方面F-11:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-12:根据方面F-11的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;或
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-13:根据方面F-11或F-12的单价构建体的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:62,65,67,68,75和76之一组成。
方面F-14:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-15:根据方面F-14的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-16:单价构建体在制备多价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:62组成。
方面F-17:单价构建体在制备多价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:65组成。
方面F-18:单价构建体在制备多价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:76组成。
方面F-19:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-20:根据方面F-19的单价构建体的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
方面F-21:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L);和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-22:根据方面F-21的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-23:根据方面F-21或F-22的单价构建体的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:146-149和151-153之一组成。
方面F-24:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
方面F-25:根据方面F-24的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面F-26:根据方面F-24的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-27:根据方面F-24的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-28:根据方面F-27的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-29:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面F-30:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面F-31:根据方面F-24的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面F-32:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下,
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-33:根据方面F-32的单价构建体的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO’s:138-141和154-157之一组成。
方面F-34:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-35:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-36:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-37:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-38:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:75组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-39:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:147组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-40:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:149组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-41:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:153组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-42:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-43:根据方面F-42的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-44:根据方面F-42的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-45:根据方面F-42的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-46:根据方面F-42的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-47:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-48:根据方面F-5至F-8中任一项的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-49:根据方面F-42的单价构建体在制备多价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面F-50:两个根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途。
方面F-51:根据方面F-50的两个单价构建体在制备二价构建体中的用途,与分子间结合相比,所述二价构建体优选展示分子内结合。
方面F-52:根据方面F-50至F-51中任一项的两个单价构建体作为结合结构域或结合单元来制备二价多肽的用途,其中所述结合结构域或结合单元通过接头连接,以使得与分子间结合相比,所述二价多肽优选展示分子内结合和/或所述二价多肽可以同时结合hRSV的蛋白F上的全部两个结合位点。
方面F-53:根据方面F-50至F-52中任一项的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-54:根据方面F-53的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体是相同的。
方面F-55:根据方面F-53或F-54的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体基本上由SEQIDNO:60-76之一组成。
方面F-56:根据方面F-50至F-52中任一项的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-57:根据方面F-56的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-58:根据方面F-56或F-57的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体是相同的。
方面F-59:根据方面F-58的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体基本上由SEQIDNO:62,65,67,68,75和76之一组成。
方面F-60:根据方面F-50至F-52中任一项的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-61:根据方面F-60的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-62:根据方面F-60或F-61的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体是相同的。
方面F-63:两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:62组成。
方面F-64:两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:65组成。
方面F-65:两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:76组成。
方面F-66:根据方面F-50至F-52中任一项的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-67:根据方面F-66的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体是相同的。
方面F-68:根据方面F-66或F-67的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
方面F-69:根据方面F-50至F-52中任一项的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-70:根据方面F-69的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-71:根据方面F-69或F-70的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体是相同的。
方面F-72:根据方面F-71的两个单价构建体的用途,其中所述两个单价构建体基本上由SEQIDNO:146-149和151-153之一组成。
方面F-73:根据方面F-50至F-52中任一项的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
方面F-74:根据方面F-73的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面F-75:根据方面F-73的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-76:根据方面F-73的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-77:根据方面F-76的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-78:根据方面F-50至F-52中任一项的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面F-79:根据方面F-50至F-52中任一项的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面F-80:根据方面F-73的两个单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面F-81:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下,
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-82:根据方面F-81的单价构建体的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO’s:138-141和154-157之一组成。
方面F-83:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-84:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-85:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-86:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-87:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:75组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-88:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:147组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-89:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:149组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-90:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:153组成,其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-91:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-92:根据方面F-91的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-93:根据方面F-91的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-94:根据方面F-91的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-95:根据方面F-94的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-96:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-97:根据方面F-50至F-52中任一项的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
方面F-98:根据方面F-91的单价构建体在制备二价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu,Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面F-99:三个根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途。
方面F-100:根据方面F-99的三个单价构建体在制备三价构建体中的用途,与分子间结合相比,所述三价构建体优选展示分子内结合。
方面F-101:根据方面F-99至F-100中任一项的三个单价构建体作为结合结构域或结合单元来制备三价多肽的用途,其中所述结合结构域或结合单元通过接头连接,以使得与分子间结合相比,所述三价多肽优选展示分子内结合和/或所述三价多肽可以同时结合hRSV的蛋白F上的全部三个结合位点。
方面F-102:根据方面F-99至F-101中任一项的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:60-76;
b)与SEQIDNO’s:60-76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-103:根据方面F-102的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体是相同的。
方面F-104:根据方面F-102或F-103的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体基本上由SEQIDNO:60-76之一组成。
方面F-105:根据方面F-99至F-101中任一项的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-106:根据方面F-105的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76;
b)与SEQIDNO’s:62,65,67,68,75和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-107:根据方面F-105或F-106的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体是相同的。
方面F-108:根据方面F-107的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体基本上由SEQIDNO:62,65,67,68,75和76之一组成。
方面F-109:根据方面F-99至F-101中任一项的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-110:根据方面F-109的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:65和76;
b)与SEQIDNO’s:65和76之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置54具有天冬氨酸(Asp,D),在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),在位置78具有亮氨酸(Leu,L)和/或在位置83具有精氨酸(Arg,R)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-111:根据方面F-109或F-110的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体是相同的。
方面F-112:三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:62组成。
方面F-113:三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:65组成。
方面F-114:三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,所述单价构建体基本上由SEQIDNO:76组成。
方面F-115:根据方面F-99至F-101中任一项的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-153;
b)与SEQIDNO’s:146-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-116:根据方面F-115的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体是相同的。
方面F-117:根据方面F-115或F-116的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体基本上由SEQIDNO’s:146-153之一组成。
方面F-118:根据方面F-99至F-101中任一项的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-119:根据方面F-118的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下:
a)SEQIDNO’s:146-149和151-153;
b)与SEQIDNO’s:146-149和151-153之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)和在位置108具有亮氨酸(Leu,L)和另外在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和/或在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q),由此当所述氨基酸序列与以下各项具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异时:
-SEQIDNO:146,所述氨基酸序列优选在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:147,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:148,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:149,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R),在位置85具有谷氨酸(Glu,E)和在位置105具有谷氨酰胺(Gln,Q);
-SEQIDNO:151,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R);
-SEQIDNO:152,所述氨基酸序列优选在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
-SEQIDNO:153,所述氨基酸序列优选在位置83具有精氨酸(Arg,R)和在位置85具有谷氨酸(Glu,E);
(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-120:根据方面F-118或F-119的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体是相同的。
方面F-121:根据方面F-120的三个单价构建体的用途,其中所述三个单价构建体基本上由SEQIDNO:146-149和151-153之一组成。
方面F-122:三个根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp。
方面F-123:根据方面F-122的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D。
方面F-124:根据方面F-122的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-125:根据方面F-122的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-126:根据方面F-125的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D。
方面F-127:根据方面F-99至F-101中任一项的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu。
方面F-128:根据方面F-99至F-101中任一项的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu。
方面F-129:根据方面F-122的三个单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面F-130:具有SEQIDNO:62的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:77的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:62的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:62的氨基酸序列连接。
方面F-131:具有SEQIDNO:65的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:78的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:65的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:65的氨基酸序列连接。
方面F-132:具有SEQIDNO:76的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:79的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:76的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:76的氨基酸序列连接。
方面F-133:具有SEQIDNO:75的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:158的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:75的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:75的氨基酸序列连接。
方面F-134:具有SEQIDNO:147的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:159的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:147的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:147的氨基酸序列连接。
方面F-135:具有SEQIDNO:149的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:160的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:149的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:149的氨基酸序列连接。
方面F-136:具有SEQIDNO:153的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:161的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:153的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:153的氨基酸序列连接。
方面F-137:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体选自以下,
a)SEQIDNO’s:138-141和154-157;
b)与SEQIDNO’s:138-141和154-157之一具有不超过3个、优选不超过2个、更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸序列,条件是:
i)所述氨基酸序列在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);和
ii)与不具有3、2、或1个氨基酸差异的氨基酸序列相比,所述氨基酸序列以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述氨基酸序列具有相同、大约相同、或更高的效力(如本文定义)。
方面F-138:根据方面F-137的单价构建体的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO’s:138-141和154-157之一组成。
方面F-139:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-140:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:62组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-141:根据方面F-99至F-101任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:65组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-142:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:76组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-143:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:75组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-144:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:147组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-145:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:149组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-146:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:153组成,其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-147:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7、8或9、10、11、或12个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,且其中位置1处的谷氨酸已经为天冬氨酸。
方面F-148:根据方面F-147的单价构建体在制备三价构建体中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-149:根据方面F-147的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6、7或8个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ser19R,Ile20Leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-150:根据方面F-147的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4或5个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-151:根据方面F-150的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54D,且其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-152:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3或4个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-153:根据方面F-99至F-101中任一项的单价构建体在制备三价多肽中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中1个或更多(诸如2、3、4、5、6或7个)氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu,且其中位置1处的谷氨酸改变为天冬氨酸。
方面F-154:根据方面F-147的单价构建体在制备三价构建体中的用途,其中所述单价构建体基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
方面F-155:具有SEQIDNO:138的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:142的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:138的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:5的氨基酸序列连接。
方面F-156:具有SEQIDNO:139的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:143的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:139的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:62的氨基酸序列连接。
方面F-157:具有SEQIDNO:140的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:144的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:140的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:65的氨基酸序列连接。
方面F-158:具有SEQIDNO:141的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:145的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:141的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:76的氨基酸序列连接。
方面F-159:具有SEQIDNO:154的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:162的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:154的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:75的氨基酸序列连接。
方面F-160:具有SEQIDNO:155的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:163的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:155的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:147的氨基酸序列连接。
方面F-161:具有SEQIDNO:156的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:164的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:156的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:149的氨基酸序列连接。
方面F-162:具有SEQIDNO:157的氨基酸序列在制备具有SEQIDNO:165的三价多肽中的用途,其中具有SEQIDNO:157的氨基酸序列通过15GS接头与至少两个另外的具有SEQIDNO:153的氨基酸序列连接。
方面E-262:根据方面E-1至E-261中任一项的多肽,所述多肽分别与根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应本身相比,具有增长的半衰期。
方面E-263:根据方面E-262的多肽,其中,分别与根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应本身相比,一个或多个其他结合单元为所述多肽提供增长的半衰期。
方面E-264:根据方面E-262或E-263的多肽,其中为所述多肽提供增长的半衰期的所述一个或多个另外的结合单元选自由以下组成的组:血清蛋白或其片段、可以结合血清蛋白的结合单元、Fc部分、和可以结合血清蛋白的小蛋白或肽。
方面E-265:根据方面E-262至E-264中任一项的多肽,其中为所述多肽提供增长的半衰期的所述一个或多个另外的结合单元选自由以下组成的组:人血清白蛋白或其片段。
方面E-266:根据方面E-262至E-265中任一项的多肽,其中为所述多肽提供增长的半衰期的所述一个或多个另外的结合单元选自由以下组成的组:可以结合血清白蛋白(诸如人血清白蛋白)或血清免疫球蛋白(诸如IgG)的结合单元。
方面E-267:根据方面E-262至E-266中任一项的多肽,其中为所述多肽提供增长的半衰期的所述一个或多个另外的结合单元选自由以下组成的组:结构域抗体,适合用作结构域抗体的氨基酸序列,单结构域抗体,适合用作单结构域抗体的氨基酸序列,"dAb’s",适合用作dAb的氨基酸序列,或可以结合血清白蛋白(诸如人血清白蛋白)或血清免疫球蛋白(诸如IgG)的
方面E-268:根据方面E-262至E-267中任一项的多肽,其中为所述多肽提供增长的半衰期的所述一个或多个另外的结合单元是可以结合血清白蛋白(诸如人血清白蛋白)或血清免疫球蛋白(诸如IgG)的
方面E-269:根据方面E-262至E-268中任一项的多肽,所述多肽具有这样的血清半衰期,所述血清半衰期是分别根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应本身的半衰期的至少1.5倍,优选至少2倍,诸如至少5倍,例如至少10倍或大于20倍。
方面E-270:根据方面E-262至E-269中任一项的多肽,所述多肽分别与根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应本身相比,具有增长大于1小时,优选大于2小时,更优选大于6小时,诸如大于12小时,或甚至大于24,48或72小时的血清半衰期。
方面E-271:根据方面E-262至E-270中任一项的多肽,所述多肽在人中具有至少约12小时,优选至少24小时,更优选至少48小时,甚至更优选至少72小时以上;例如,至少5天(诸如约5-10天),优选至少9天(诸如约9-14天),更优选至少约10天(诸如约10-15天),或至少约11天(诸如约11-16天),更优选至少约12天(诸如约12-18天或更多),或大于14天(诸如约14-19天)的血清半衰期。
方面G-1:化合物或构建体,其包含根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的一个或多个氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的一个或多个和/或根据方面E-1至E-271中任一项的一个或多个多肽或基本上由根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的一个或多个氨基酸序列和/或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的一个或多个和/或根据方面E-1至E-271中任一项的一个或多个多肽组成,并任选地还包含任选地通过一个或多个接头连接的一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元。
方面G-2:根据方面G-1的化合物或构建体,其中所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元是氨基酸序列。
方面G-3:根据方面G-1或G-2中任一项的化合物或构建体,其中所述一个或多个接头,如果存在,是一个或多个氨基酸序列。
方面G-4:根据方面G-1至G-3中任一项的化合物或构建体,其中所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元是免疫球蛋白序列。
方面G-5:根据方面G-1至G-4中任一项的化合物或构建体,其中所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元选自由以下组成的组:结构域抗体,适合用作结构域抗体的氨基酸序列,单结构域抗体,适合用作单结构域抗体的氨基酸序列,"dAb’s",适合用作dAb的氨基酸序列,或
方面G-6:根据方面G-1至G-5中任一项的化合物或构建体,其中所述一个或多个本发明的氨基酸序列是免疫球蛋白序列。
方面G-7:根据方面G-1至G-6中任一项的化合物或构建体,其中所述一个或多个本发明的氨基酸序列选自由以下组成的组:结构域抗体,适合用作结构域抗体的氨基酸序列,单结构域抗体,适合用作单结构域抗体的氨基酸序列,"dAb’s",适合用作dAb的氨基酸序列,或
方面G-8:根据方面G-1至G-7中任一项的化合物或构建体,其包含根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的一个或多个或基本上由根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的一个或多个组成,并且其中所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元是
方面G-9:根据方面G-1至G-8中任一项的化合物或构建体,所述化合物或构建体是多价构建体。
方面G-10:根据方面G-1至G-9中任一项的化合物或构建体,所述化合物或构建体是多特异性构建体。
方面G-11:根据方面G-1至G-10中任一项的化合物或构建体,所述化合物或构建体,分别与根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应本身、或根据方面E-1至E-271中任一项的相应多肽本身相比,具有增长的半衰期。
方面G-12:根据方面G-1至G-11中任一项的化合物或构建体,其中,分别与根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应本身、或根据方面E-1至E-271中任一项的相应多肽本身相比,所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元为所述化合物或构建体提供增长的半衰期。
方面G-13:根据方面G-12的化合物或构建体,其中为所述化合物或构建体提供增长的半衰期的所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元选自由以下组成的组:血清蛋白或其片段、可以结合血清蛋白的结合单元、Fc部分、和可以结合血清蛋白的小蛋白或肽。
方面G-14:根据方面G-12或G-13中任一项的化合物或构建体,其中为所述化合物或构建体提供增长的半衰期的所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元选自由以下组成的组:人血清白蛋白或其片段。
方面G-15:根据方面G-12至G-14中任一项的化合物或构建体,其中为所述化合物或构建体提供增长的半衰期的所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元选自由以下组成的组:可以结合血清白蛋白(诸如人血清白蛋白)或血清免疫球蛋白(诸如IgG)的结合单元。
方面G-16:根据方面G-12至G-15中任一项的化合物或构建体,其中为所述化合物或构建体提供增长的半衰期的所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元选自由以下组成的组:结构域抗体,适合用作结构域抗体的氨基酸序列,单结构域抗体,适合用作单结构域抗体的氨基酸序列,"dAb’s",适合用作dAb的氨基酸序列,或可以结合血清白蛋白(诸如人血清白蛋白)或血清免疫球蛋白(诸如IgG)的
方面G-17:根据方面G-12至G-16中任一项的化合物或构建体,其中为所述化合物或构建体提供增长的半衰期的所述一个或多个另外的结合单元是可以结合血清白蛋白(诸如人血清白蛋白)或血清免疫球蛋白(诸如IgG)的
方面G-18:根据方面G-11至G-17中任一项的化合物或构建体,所述化合物或构建体具有这样的血清半衰期,所述血清半衰期是分别根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应 本身、或根据方面E-1至E-271中任一项的相应多肽本身的半衰期的至少1.5倍,优选至少2倍,诸如至少5倍,例如至少10倍或大于20倍。
方面G-19:根据方面G-11至G-18中任一项的化合物或构建体,所述化合物或构建体分别与根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应本身,或根据方面E-1至E-271中任一项的相应多肽本身相比,具有增长大于1小时,优选大于2小时,更优选大于6小时,诸如大于12小时,或甚至大于24,48或72小时的血清半衰期。
方面G-20:根据方面G-11至G-19中任一项的化合物或构建体,所述化合物或构建体在人中具有至少约12小时,优选至少24小时,更优选至少48小时,甚至更优选至少72小时以上;例如,至少5天(诸如约5-10天),优选至少9天(诸如约9-14天),更优选至少约10天(诸如约10-15天),或至少约11天(诸如约11-16天),更优选至少约12天(诸如约12-18天或更多),或大于14天(诸如约14-19天)的血清半衰期。
方面M-1:核酸或核苷酸序列,其编码根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体(所述化合物或构建体是这样的,即其可以通过表达编码其的核酸或核苷酸序列获得)、或根据方面F-1至F-4的单价构建体。
方面M-2:根据方面M-1的核酸或核苷酸序列,其处于遗传构建体形式。
方面M-3:根据方面M-1的核酸或核苷酸序列用于制备遗传构建体的用途,所述核酸或核苷酸序列编码根据方面F-1至F-4的单价构建体,所述遗传构建体编码根据方面E-1至E-271中任一项的多价多肽。
方面M-4:根据方面M-2的核酸或核苷酸序列的用途,其中所述遗传构建体编码多价(诸如二价)构建体。
方面N-1:宿主或宿主细胞,其表达,或在合适的环境下能够表达根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体(所述化合物或构建体是这样的,即其可以通过表达编码其的核酸或核苷酸序列获得)、或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体;和/或所述宿主或宿主细胞包含根据方面M-1或M-2的核酸或核苷酸序列。
方面O-1:组合物,其包含至少一个根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体、根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、或根据方面M-1或M-2的核酸或核苷酸序列。
方面O-2:根据方面O-1的组合物,所述组合物是药物组合物。
方面O-3:根据方面O-1或O-2的组合物,所述组合物是药物组合物,还包含至少一种药用载体、稀释剂或赋形剂和/或辅药,并且任选地包含一种或多种其它药物活性多肽和/或化合物。
方面P-1:用于产生根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体(所述化合物或构建体是这样的,即其可以通过表达编码其的核酸或核苷酸序列获得)、或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、或根据方面O-1至O-3中任一项的组合物的方法,所述方法至少包括以下步骤:
a)在合适的宿主细胞或宿主生物体中或在另一种合适的表达系统中表达根据方面M-1或M-2的核酸或核苷酸序列,
任选地,随后:
b)分离和/或纯化由此获得的根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体(所述化合物或构建体是这样的,即其可以通过表达编码其的核酸或核苷酸序列获得)、或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体。
方面P-2:用于产生根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体(所述化合物或构建体是这样的,即其可以通过表达编码其的核酸或核苷酸序列获得)、或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、或根据方面O-1至O-3中任一项的组合物的方法,所述方法至少包括以下步骤:
a)在这样的条件下培养和/或维持根据方面N-1的宿主或宿主细胞,所述条件使得所述宿主或宿主细胞表达和/或产生至少一种根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体(所述化合物或构建体是这样的,即其可以通过表达编码其的核酸或核苷酸序列获得)、或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、或根据方面O-1至O-3中任一项的组合物,
任选地,随后:
b)分离和/或纯化由此获得的根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体(所述化合物或构建体是这样的,即其可以通过表达编码其的核酸或核苷酸序列获得)、或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、或根据方面O-1至O-3中任一项的组合物。
方面P-3:用于制备根据方面E-7至E-261中任一项的二价或三价多肽的方法,所述方法至少包括以下步骤:使两个或更多根据方面F-1至F-4任一项的单价氨基酸序列或单价构建体和例如一个或多个接头连接。
方面P-4:根据方面P-3的方法,所述方法包括以下步骤:
a)连接两个或更多根据方面M-1的核酸序列,其编码根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体(和还例如编码一个或多个接头和本身已知的遗传构建体的另外一个或多个其他元件的核酸),以获得根据方面M-2的遗传构建体;
b)在合适的宿主细胞或宿主生物体中或在另一种合适的表达系统中表达a)中获得的遗传构建体
任选地,随后:
c)分离和/或纯化由此获得的根据方面E-7至E-261中任一项的二价或三价多肽。
方面Q-1:用于筛选针对hRSV的蛋白F的氨基酸序列的方法,所述方法至少包括以下步骤:
a.提供编码氨基酸序列的核酸序列组、集合或文库;
b.筛选所述核酸序列组、集合或文库,以获得编码这样的氨基酸序列的核酸序列,所述氨基酸序列可以结合病毒包膜蛋白和/或对病毒包膜蛋白具有亲和性并且被交叉阻断或交叉阻断本发明的例如SEQIDNO’s:60-76,138-141和146-157之一(表A-4),或包含至少一个本发明的的多肽或构建体,例如包含SEQIDNO:77-99,142-145和158-165至少之一的多肽或构建体(见表A-5);和
c.分离所述核酸序列,随后表达所述氨基酸序列。
方面R-1:用于预防和/或治疗hRSV感染的方法,所述方法包括向需要所述方法的受试者施用药物活性量的至少一种根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体、根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体和/或根据方面O-1至O-3的组合物。
方面R-2:用于预防和/或治疗呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和哮喘中至少一种的方法,所述方法包括向需要所述方法的受试者施用药物活性量的至少一种根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体、根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体和/或根据方面O-1至O-3的组合物。
方面R-3:用于预防和/或治疗至少一种疾病或病症的方法,所述疾病或病症可以通过向需要所述方法的受试者施用至少一种根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体、根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体和/或根据方面O-1至O-3中任一项的组合物来预防和/或治疗,所述方法包括向需要所述方法的受试者施用药物活性量的至少一种根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体、根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体和/或根据方面O-1至O-3的组合物。
方面R-4:用于免疫治疗的方法,所述方法包括向需要所述方法的受试者施用至少一种根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体、根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体和/或根据方面O-1至O-3的组合物。
方面R-5:根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体、根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体和/或根据方面O-1至O-3的组合物在制备用于预防和/或治疗hRSV感染的药物组合物中的用途;和/或在一个或多种根据方面R-1至R-4的方法中使用的用途。
方面R-6:根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体、根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体和/或根据方面O-1至O-3的组合物,其用于预防和/或治疗呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和哮喘中的至少一种。
方面S-1:根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的和/或根据方面E-1至E-271中任一项的多肽的部分或片段。
方面S-2:根据方面S-1的部分或片段,其可以特异性结合hRSV的蛋白F上的抗原性II和/或与竞争结合hRSV的蛋白F。
方面S-3:根据方面S-1至S-2中任一项的部分或片段,其可以以1000nM-1nM或更小,优选100nM-1nM或更小,更优选10nM-1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面S-4:根据方面S-2至S-3中任一项的部分或片段,其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面S-5:根据方面S-2至S-4中任一项的部分或片段,其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面S-6:化合物或构建体,其包含根据方面S-1至S-5中任一项的一个或多个部分或片段或基本上由根据方面S-1至S-5中任一项的一个或多个部分或片段组成,并且任选地还包含任选通过一个或多个接头连接的一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元。
方面S-7:根据方面S-6的化合物或构建体,其中所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元是氨基酸序列。
方面S-8:根据方面S-6或S-7的化合物或构建体,其中所述一个或多个接头,如果存在,是一个或多个氨基酸序列。
方面S-9:核酸或核苷酸序列,其编码根据方面S-1至S-5中任一项的部分或片段或根据方面S-6至S-8中任一项的化合物或构建体。
方面S-10:组合物,其包含至少一个根据方面S-1至S-5中任一项的部分或片段、根据方面S-6至S-8中任一项的化合物或构建体、或根据方面S-9的核酸或核苷酸序列。
方面T-1:根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列或根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的的衍生物。
方面T-2:根据方面T-1的衍生物,其可以特异性结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II和/或与竞争结合hRSV的蛋白F。
方面T-3:根据方面T-1至T-2中任一项的衍生物,其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面T-4:根据方面T-2至T-3中任一项的衍生物,其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面T-5:根据方面T-2至T-4中任一项的衍生物,其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面T-6:根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体或根据方面E-1至E-271中任一项的多肽的衍生物。
方面T-7:根据方面T-6的衍生物,其可以特异性结合hRSV的蛋白F上的抗原位点II和/或与竞争结合hRSV的蛋白F。
方面T-8:根据方面T-6至T-7中任一项的衍生物,其可以以100nM-0.1nM或更小,优选10nM-0.1nM或更小,更优选1nM-0.1nM或更小的解离常数(KD)特异性结合hRSV的蛋白F。
方面T-9:根据方面T-6至T-8中任一项的衍生物,其可以以104M-1s-1-约107M-1s-1,优选105M-1s-1-107M-1s-1,更优选约106M-1s-1以上的kon-速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面T-10:根据方面T-6至T-9中任一项的衍生物,其可以以10-2s-1(t1/2=0.69s)-10-4s-1(假定具有多天的t1/2的几乎不可逆的复合物),优选10-3s-1-10-4s-1,更优选5x10-3s-1-10-4s-1,或更低的koff速率特异性结合hRSV的蛋白F。
方面T-11:根据方面T-6至T-10中任一项的衍生物,其可以中和hRSV,例如,在关于hRSVLong的微量中和测定法中(诸如例如实施例6中所述),以10pM-1000pM,优选10pM-250pM,更优选50pM-200pM或更小的IC50值中和hRSV。
方面T-12:根据方面T-6至T-11中任一项的衍生物,其可以以这样的IC50值中和hRSV,例如,在关于hRSVLong的微量中和测定法中(诸如例如实施例6中所述),所述IC50值与使用获得的IC50值相比至少相同和优选更佳,至少10倍更佳,优选20倍更佳,更优选50倍更佳,甚至更优选60、70、80或更多倍更佳。
方面T-13:根据方面T-1至T-12中任一项的衍生物,其具有这样的血清半衰期,所述血清半衰期是分别根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应本身、根据方面E-1至E-261中任一项的相应多肽本身、根据方面G-1至G-20中任一项的相应化合物或构建体本身、或根据方面F-1至F-4中任一项的相应单价构建体本身的半衰期的至少1.5倍,优选至少2倍,诸如至少5倍,例如至少10倍或大于20倍。
方面T-14:根据方面T-1至T-13中任一项的衍生物,其分别与根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的相应氨基酸序列本身、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的相应 本身、根据方面E-1至E-261中任一项的相应多肽本身、根据方面G-1至G-20中任一项的相应化合物或构建体本身、或根据方面F-1至F-4中任一项的相应单价构建体本身相比,具有增长大于1小时,优选大于2小时,更优选大于6小时,诸如大于12小时,或甚至大于24,48或72小时的血清半衰期。
方面T-15:根据方面T-1至T-14中任一项的衍生物,其在人中具有至少约12小时,优选至少24小时,更优选至少48小时,甚至更优选至少72小时以上;例如,至少5天(诸如约5-10天),优选至少9天(诸如约9-14天),更优选至少约10天(诸如约10-15天),或至少约11天(诸如约11-16天),更优选至少约12天(诸如约12-18天或更多),或大于14天(诸如约14-19天)的血清半衰期。
方面T-16:根据方面T-1至T-15中任一项的衍生物,其是聚乙二醇化的衍生物。
方面T-17:化合物或构建体,其包含方面T-1至T-16中任一项的一个或多个衍生物或基本上由方面T-1至T-16中任一项的一个或多个衍生物组成,并且任选地还包含任选通过一个或多个接头连接的一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元。
方面T-18:根据方面T-17的化合物或构建体,其中所述一个或多个其他基团、残基、结构部分或结合单元是氨基酸序列。
方面T-19:根据方面T-17或T-18的化合物或构建体,其中所述一个或多个接头,如果存在,是一个或多个氨基酸序列。
方面T-20:核酸或核苷酸序列,其编码根据方面T-1至T-16中任一项的衍生物或根据方面T-17至T-19中任一项的化合物或构建体。
方面T-21:组合物,其包含至少一个根据方面T-1至T-16中任一项的衍生物、根据方面T-17至T-19中任一项的化合物或构建体、或根据方面T-20的核酸或核苷酸序列。
方面U-1:用于施用有效量的根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和/或包含以上各项的组合物的方法,其中所述方法包括将根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和/或包含以上各项的组合物施用于肺组织的步骤。
方面U-2:根据方面U-1的方法,其中根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和/或包含以上各项的组合物通过使用吸入器、鼻内递送装置或气雾剂来施用。
方面U-3:根据方面U-1或U-2中任一项的方法,其中至少5%,优选至少10%,20%,30%,40%,更优选至少50%,60%,70%,和甚至更优选至少80%以上的根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和/或包含以上各项的组合物在肺组织中稳定至少24小时,优选至少48小时,更优选至少72小时。
方面U-4:根据方面U-1至U-3中任一项的方法,其中根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和/或包含以上各项的组合物以纯形式,即,当它们是液体或干燥粉末时施用。
方面U-5:根据方面U-1至U-3中任一项的方法,其中根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和/或包含以上各项的组合物作为组合物或制剂施用于肺组织,所述组合物或制剂包含根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和适合于肺部递送的载体。
方面U-6:药物组合物,其包含根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和适合于肺部递送的载体。
方面U-7:药物装置,其适合于根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体的肺部递送和/或适合于包含以上各项的组合物的使用。
方面U-8:根据方面U-7的药物装置,所述药物装置是液体(例如细小固体颗粒的悬浮液或小滴)的吸入器,其包含根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体。
方面U-9:根据方面U-7的药物装置,所述药物装置是气雾剂,其包含根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的 根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体。
方面U-10:根据方面U-7的药物装置,所述药物装置是干燥粉末吸入器,其包含处于干燥粉末形式的根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体。
方面U-11:用于预防和/或治疗hRSV感染的方法,所述方法包括向需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体和/或包含以上各项的药物组合物。
方面U-12:用于预防和/或治疗呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、(复发性)哮鸣和哮喘中至少一种的方法,所述方法包括向需要所述方法的受试者的肺组织施用药物活性量的根据方面A-1至A-29,C-1至C-38和W-1至W-38中任一项的氨基酸序列、根据方面B-1至B-18,D-1至D-38和X-1至X-38中任一项的根据方面E-1至E-271中任一项的多肽、根据方面G-1至G-20中任一项的化合物或构建体和/或根据方面F-1至F-4中任一项的单价构建体、和/或包含以上各项的药物组合物。
方面V-1:用于预防和/或治疗hRSV感染的方法,所述方法包括向需要所述方法的受试者施用药物活性量的根据方面E-7至E-261中任一项的多价多肽,和/或包含其的药物组合物。
方面V-2:根据方面E-7至E-261中任一项的多价多肽、和/或包含其的药物组合物用于结合和/或中和hRSV的用途。
方面V-3:根据方面E-7至E-261中任一项的多价多肽、和/或包含其的药物组合物用于结合和/或中和不同hRSV毒株的用途。
方面V-4:根据方面E-7至E-261中任一项的多价多肽、和/或包含其的药物组合物用于结合和/或中和一种或多种病毒逃避突变型的用途。
方面V-5:根据方面V-1至V-4中任一项的方法或用途,其中所述多价多肽是二价的。
方面V-6:根据方面V-1至V-4中任一项的方法或用途,其中所述多价多肽是三价的。
方面V-7:根据方面V-1至V-6中任一项的方法或用途,其中所述多价多肽根据方面U-1至U-5和/或U-11至U-12的任一种方法来施用。
方面V-8:用于预防和/或治疗由hRSV病毒引起的感染的方法,所述方法包括向需要所述方法的受试者施用药物活性量的根据方面E-7至E-261中任一项的多价多肽和/或包含其的药物组合物。
方面V-9:根据方面V-8的方法,其中所述多价化合物或构建体选自表A-5(SEQIDNO’s:77-99,138-141和146-157)。
方面V-10:根据方面V-8或V-9中任一项的方法,其中治疗由一种或多种RSV逃避突变型引起的感染。
方面V-11:根据方面V-10的方法,其中所述逃避突变型是特异于抗原位点II的逃避突变型。
方面V-12:根据方面E-7至E-261中任一项的多价多肽、和/或包含其的药物组合物用于结合和/或中和一种或多种不同的RSV逃避突变型的用途。
方面V-13:根据方面V-12的用途,其中所述逃避突变型是特异于抗原位点II的逃避突变型。
方面V-14:根据方面V-8或V-9中任一项的方法,其中治疗由一种或多种hRSV毒株引起的感染。
方面V-15:根据方面V-14的方法,其中所述RSV毒株是Long。
方面V-16:根据方面V-14的方法,其中所述RSV毒株是A-2。
方面V-17:根据方面V-14的方法,其中所述RSV毒株是B-1。
方面V-18:根据方面V-14的方法,其中所述多价多肽结合和/或中和RSV毒株Long和A-2。
方面V-19:根据方面V-14的方法,其中所述多价多肽结合和/或中和RSV毒株Long和B-1。
方面V-20:根据方面V-14的方法,其中所述多价多肽结合和/或中和RSV毒株B-1和A-2。
方面V-21:根据方面V-14的方法,其中所述多价多肽结合和/或中和RSV毒株Long、A-2和B-1。
方面V-22:根据方面E-7至E-261中任一项的多价化合物或构建体、和/或包含其的药物组合物用于结合和/或中和不同的hRSV毒株的用途。
方面V-23:根据方面V-22的用途,其中所述RSV毒株是Long和A-2。
方面V-24:根据方面V-22的用途,其中所述RSV毒株是Long和B-1。
方面V-25:根据方面V-22的用途,其中所述RSV毒株是A-1和B-1。
方面V-26:根据方面V-22的用途,其中所述RSV毒株是Long、A-2和B-1。
实施例
实施例1:免疫
根据标准方案用6次hRSVFTM-(融合蛋白的膜无锚定物形式,70kDa;CorrallT.等人2007,BMC生物技术(BMCBiotechnol.)7:17)的加强对两只美洲驼(156和157)进行免疫。在第六次加强后7天和第六次加强后10天从这些动物中收集血液。
两只美洲驼(212和213)使用1mgRNA-灭活的RSV毒株longA(Hytest,TurkuFinland;#8RSV79)在颈部进行肌内免疫,随后以两周一次的(biweekly)方案进行4次0.5mgRSV的加强。两只美洲驼(206和207)使用1mgRNA-灭活的RSV毒株longA进行肌内免疫,2周后用0.25mgRSV进行加强,随后以两周一次的方案进行3次50μg重组hRSVFTM-NN(融合蛋白的膜无锚定物形式,70kDa:Corral等2007;BMC生物技术(BMCBiotechnol.)7:17)的加强。关于全部免疫,使用Stimune作为佐剂将抗原制备为油-PBS乳剂。在第四次免疫后4天和10天,从这些动物收集血液,而在第四次免疫后4天进行淋巴结活检。关于纳米克隆程序,在最终加强后11天,由美洲驼206和207收集100mL血液。
实施例2:文库构建
根据生产商的说明书使用Ficoll-Hypaque由血液样本制备外周血单核细胞。接下来,由这些细胞以及由淋巴结弓形细胞抽提总RNA并用作起始材料进行RT-PCR以扩增编码基因片段。将这些片段克隆入源自pUC119的噬菌粒载体,所述载体包含LacZ启动子、大肠杆菌噬菌体pIII蛋白编码序列、氨苄青霉素或羧苄青霉素的抗性基因、多克隆位点和gen3前导序列。在编码序列的框架中,该载体编码C末端c-myc标签和(His)6标签。根据标准方法制备噬菌体并保存于4℃用于进一步的使用,制备噬菌体文库156,157,206,207,212和213。
实施例3:使用hRSV的F-蛋白的选择
为了鉴定识别RSV的融合蛋白的使用文库156,157,206,207,212和213关于FTM-NN(Long融合蛋白的膜无锚定物形式,70kDa,;CorralT.等2007,BMC生物技术(BMCBiotechnol.)7:17)进行选择。将FTM-蛋白(25ng/孔)固定在NuncMaxisorpELISA板上。对照包括0μg/mlFTM-。在第一和第二轮的选择中使用胰蛋白酶和(帕立珠单抗(Palivizumab),MedImmune,人源化的单克隆抗体,在Zhao和Sullender2005,病毒学杂志(J.Virol.)79:3962中描述)从FTM-洗脱结合的噬菌体。使用Remicade(英利昔单抗(Infiximab),抗TNF;Centocor)作为的对照。使用100摩尔过量的以便鉴定在RSV上结合位点上特异性结合的用洗脱的来自第一轮选择的产出物,用于第二轮选择。
另外,利用灭活的hRSV毒株Long(Hytest#8RSV79)来进行选择。将FTM-NN蛋白(25ng/孔)或RSV(5-50μg/孔)固定在NuncMaxisorpELISA板上,临近具有0μg/ml抗原的对照。在第一轮选择中,使用胰蛋白酶,(帕利珠单抗,人源化的单克隆抗体,在Zhao和Sullender2005,病毒学杂志(J.Virol).79:396中所述),或101FFab(WO06/050280,人源化的单克隆抗体)将结合的噬菌体从FTM-NN洗脱下来。将来自用或101FFab洗脱的第一轮选择的产出物用于第二轮选择,使用NumaxFab(莫他珠单抗(Motavizumab)或MEDI-524,从帕利珠单抗衍生的第三代人源化的单克隆抗体产物;WO06/050166),或101FFab进行洗脱。将Remicade(英利昔单抗,抗-TNF,也参见WO09/068625)用作的对照,而将OmnitargFab(抗-Her2;内部生成的)用作NumaxFab和101FFab的对照。使用100摩尔过量的NumaxFab或101FFab鉴定特异性结合RSVF-蛋白上的抗原性位点II或IV-VI表位的为了获得特异于抗原性位点IV-VI的使用两种生物素化的肽进行第二轮选择:首先,包含F-蛋白的422-436残基的肽(Long)(Abgent,SanDiego,CA),其含有101F结合表位(Wu等.2007,遗传病毒学杂志(J.Gen.Virol.)88:2719-2723),其次,Mab19的表位的肽模拟物(HWSISKPQ-PEG4-K-生物素)(Chargelegue等.1998,病毒学杂志(J.Virol).72:2040-2056)。
对两轮选择的产出物分析富集系数(相对于对照存在于洗脱物中的噬菌体)。基于这些参数选取最佳选择物用于进一步分析。挑取单个克隆并生长于96深孔板(1ml体积)中,并通过加入IPTG进行诱导用于 表达。根据标准方法制备细胞周质提取物(体积:~80μl)。
对于在RSV中和测定中测试选定的克隆,将来自10ml培养物的周质提取物通过使用IMACPhyTips(PhynexusInc,SanJose,CA)部分纯化。在此,将800μl的周质提取物加载到用固定的金属亲和层析树脂预先填充的Phytips200+柱上,随后在30μl的0.1M甘氨酸-HCl/0.15MNaCl(pH3)中洗脱His-标记的随后将洗脱物用5μl的0.5MTris-HClpH8.5中和。
实施例4:使用纳米克隆技术用RSV的FTM-NN进行选择
根据生产商的说明书,使用Ficoll-Hypaque从血液样品制备外周血单核细胞(PBMCs)。通过FACS分选从PBMCs分离在它们的表面上表达重链抗体的抗原特异性B-细胞(对于纳米克隆(Nanoclone)技术的描述,参见WO06/079372)。在此,将FTM-NN蛋白用AlexaFluor488染料(Invitrogen,Carlsbad,CA;cat.nr.A20000)进行标记,并随后根据生产商的说明书脱盐以去除残余的未缀合的AlexaFluor488染料。
将美洲驼的免疫前(背景对照)和免疫的PBMC用荧光染料缀合的IgG1(常规重链+轻链免疫球蛋白),IgG2-和IgG3(重链免疫球蛋白种类)特异性小鼠单克隆抗体,荧光标记的DH59B抗体(CD172a)(VMRD,Inc.Pullman,WA;批号DH59B;Davis等.1987,Vet.Immunol.Immunopathol.15:337-376)和Alexa488标记的抗原进行染色。包含TOPRO3作为活/死细胞鉴别染料。对IgG1+B-淋巴细胞,单核细胞,嗜中性粒细胞和死细胞进行门控输出(gatedout),并因此从分选中被排除。抗原-特异性(A488+)IgG2-或IgG3阳性B细胞是被分别分选到包含RT-PCR缓冲液的单独PCR板孔中的单个细胞。
对于美洲驼206,获得IgG2/IgG3阳性活细胞总量的1.9%的抗原阳性细胞(1.0%,在免疫前的参照样品中),对于美洲驼207,获得4.2%阳性细胞(0.7%,在免疫前的参照样品中)。通过单细胞RT-PCR和巢式PCR直接从这些B-细胞中扩增重链可变区基因。随后,将PCR产物克隆到衍生自pUC119的TOPO-适应的表达载体中,所述载体包含LacZ启动子,关于氨苄青霉素或羧苄青霉素的抗性基因,多克隆位点和gen3前导序列。与编码序列符合阅读框地,所述载体编码C-端c-my标记和(His)6标记。通过高通量的电穿孔,将克隆的构建体转化到TOP10大肠杆菌(Escherichiacoli)细胞中。将单一克隆培养在96深孔板上(1ml体积)并通过加入IPTG诱导进行表达。通过渗压休克制备周质提取物(体积:~80μl),并在结合ELISA中分析与FTM-的结合。
简而言之,将2μg/ml的FTM-直接固定在Maxisorp微量滴定板上(Nunc)。使用在PBS中的4%Marvel封闭游离结合位点。接下来,使处于100μl2%MarvelPBST中的10μl含有不同克隆的的周质提取物与固定的抗原结合。在温育和洗涤步骤后,使用兔-抗VHH二级抗体(用于周质级分)显示结合。在洗涤步骤后,用HRP-缀合的山羊-抗-兔抗体检测周质级分中的基于与未接受的对照比较的OD值,确定结合特异性。
总而言之,在52个克隆的VHHs中获得8种阳性FTM-NN结合物(4种来自美洲驼206,4种来自美洲驼207)。
实施例5:筛选结合抗原性位点II或IV-VI的
使用测定法(PerkinElmer;Waltham,MA)(Garcia-Barreno等.1989,病毒学杂志(J.Virol).63:925-932;Lopeze等1998,病毒学杂志(J.Virol.)72:6922-6928),分析包含单一的周质提取物对抗原位点II或IV-VI的结合。在该设置中,FTM-NN同时结合和101F的Fabs,允许检测干扰各个抗原性位点II和IV-VI的每一种的结合的在此,将周质提取物加入FTM-NN蛋白(0.3nM)中并温育15分钟。随后,加入生物素化的Fab(0.3nM)和Fab101F缀合的接纳体珠(10μg/ml),并将该混合物温育1小时。随后,加入链霉抗生物素蛋白包被的供体珠(10μg/ml),温育1小时后,在Envision微板阅读器上阅读所述板。将周质提取物稀释25倍,其大致对应40nM的最终浓度。通过滴定mabs18B2(Argene,Varilhes,法国;18042N1902)和2F7(Abcam,剑桥,英国;ab43812)的已知竞争剂来验证该测定法。此外,分析Fab,NumaxFab,和101FFab,其中NumaxFab具有最低的IC50值(8.6E-11M),其次是Fab(5.97E-10M)和101FFab(1.12E-9M)。对于筛选周质提取物(以1/25稀释),使用NumaxFab(40nM)和101FFab(40nM)作为阳性对照,同时将不相关的周质提取物作为阴性对照。将这样的克隆鉴定为击中(hit),所述克隆相对于阴性对照,在中干扰超过75%的与FTM-NN蛋白的结合。在来自所有6头美洲驼的1856个克隆中总共鉴定了341个击中,但是大部分来自美洲驼206和207。此外,在获自纳米克隆选择的8个克隆中,有3个克隆显示竞争。
将竞争剂的正确抗原位点(II或IV-VI)通过生物素化的Fab(2nM)或生物素化的101FFab(3nM)与FTM--NN蛋白(1μg/ml)的结合的竞争ELISA,进行去褶积(deconvolute)。简而言之,将FTM-NN蛋白固定在Maxisorp微量滴定板上(Nunc)并使用处于PBS中的4%Marvel封闭游离结合位点。将周质提取物稀释1/10并与生物素化的Fab混合,之后与固定的FTM-NN蛋白结合。包括针对其他病毒外壳蛋白选择的对照周质级分。容许竞争抗体结合具有或不具有的固定的抗原。温育和洗涤步骤后,通过Extravidin-HRP缀合的二级抗体(西格玛-奥尔德里奇(Sigma-Aldrich),St.Louis,MO;批号E2886)进行检测。基于与未接受 的对照比较的OD值,确定结合特异性。
对所有的击中进行序列分析,并将其根据它们的CDR3序列分类为各个家族(参见2009年6月5日由埃博灵克斯股份有限公司(AblynxN.V.)提交的标题为“Aminoacidsequencesdirectedagainstenvelopeproteinsofavirusandpolypeptidescomprisingthesameforthetreatmentofviraldiseases(用于治疗病毒疾病的针对病毒包膜蛋白的氨基酸序列和包含其的多肽)”的PCT申请PCT/EP2009/056975中的表C-4和A-1)。
实施例6:筛选RSV中和
从所有的6个hRSV文库中,在微量中和测定法中将163个独特序列(鉴定的160个来自噬菌体文库,3个来自纳米克隆)作为部分纯化的蛋白分析其关于RSVLong中和能力。将Hep2细胞以1.5x104细胞/孔的浓度接种到96-孔板的DMEM培养基中,所述培养基包含10%胎牛血清(FCS)并补充以青霉素和链霉素(分别为100U/ml和100μg/ml),并将所述Hep2细胞在37℃在5%CO2气氛下温育24小时。使用的病毒储液称为hRSV毒株long,LongLM-2和LongM2(可交替使用)并且是源自ATCCVR-26的病毒储液,其中F蛋白的序列对应于P12568或M22643。病毒储液已经由ATCC储液传代若干次。验证F-蛋白的序列与P12568相同(见实施例9)。将标准量的hRSV毒株LongLM-2与固定体积的Phytips纯化的 (20μl)的系列稀释物在50μl总体积中在37℃预先温育30分钟。将Hep2细胞的培养基更换为预混合物以允许感染2小时,随后加入0.1ml的测定培养基。在补充了2.5%胎牛血清和青霉素和链霉素(分别为100U/ml和100μg/ml)的DMEM培养基中进行测定。在37℃在5%CO2气氛中将细胞再温育72小时,随后将细胞用在PBS中的0.05%吐温-20洗涤两次,并单用PBS洗涤1次,随后将细胞在4℃用在PBS中的80%冷丙酮(西格玛-奥尔德里奇(Sigma-Aldrich),St.Louis,MO)(100μl/孔)固定20分钟,并静置以完全干燥。接下来,在ELISA型测定法中检测F-蛋白在细胞表面上的存在。其中,将固定的Hep2细胞在室温用在PBS中的2%牛血清白蛋白溶液封闭1小时,接着用(2μg/ml)温育1小时。为了检测山羊抗-人IgG,使用Fcγ片段特异性-HRP(Jackson免疫研究(JacksonImmunoResearch),WestGrove,PA),随后根据标准方法使ELISA显影。
除了包括在筛选中作为阳性对照的前面鉴定的RSV中和 191D3(SEQIDNO:9)和192C4(SEQIDNO:11),5个抗原性位点II克隆显示强RSVLong中和活性:1E4(也称为207D1;SEQIDNO:1),7B2(SEQIDNO:2),NC23(SEQIDNO:3),和同一家族的两个成员15H8(SEQIDNO:4)和NC41(SEQIDNO:5)(表A-1)。抗原性位点IV-VI特异性 中没有一个显示关于hRSVLongLM-2毒株超过非常弱的中和活性。
实施例7:生产hRSV
除了包括在筛选中作为阳性对照的前面鉴定的RSV中和 191D3(SEQIDNO:9)和191E4(SEQIDNO:10),表达、纯化并进一步表征5个新的选自上述筛选的中和(1E4,7B2,15H8,NC23和NC41)以及1个抗原性位点IV-VI(15B3;SEQIDNO:7)。另外,将编码序列重新克隆在衍生自pUC119的表达载体中,所述载体包含LacZ启动子,卡那霉素抗性基因,多克隆位点和OmpA信号肽序列。与 编码序列符合阅读框地,所述载体编码C-端c-myc标记和(His)6标记。
在1L体积的培养物中,在大肠杆菌TG-1细胞中表达c-myc,His6-标记的蛋白。通过加入1mMIPTG诱导表达,并使其在37℃继续3小时。在离心细胞培养物后,通过冻融沉淀物和在dPBS中重悬来制备周质提取物。将这些提取物用作起始物质进行使用HistrapFF粗柱(GEhealthcare,Uppsala,Sweden)的固定金属亲和层析(IMAC)。用250mM咪唑将 从所述柱上洗脱,并随后脱盐到dPBS中。
实施例8:表征hRSV
在ELISA中结合F-蛋白
所有的纯化在针对FTM-NN蛋白和针对hRSV的结合ELISA中显示与F-蛋白的结合。在表B-1中显示关于hRSV结合的结果。简言之,将1μg/mlFTM-NN或5μg/mlhRSV(HytestTurku,芬兰)直接固定在Maxisorp微量滴定板上。将游离结合位点用1%酪蛋白封闭。使纯化的的系列稀释物结合所述抗原1小时。使用兔抗-VHH二级抗体显示结合,并最终用HRP-缀合的山羊-抗-兔抗体进行检测。基于与无关对照比较的OD值确定结合特异性。
在Biacore中结合F-蛋白
为了确定纯化的的精确结合亲和性,使用关于FTM-NN蛋白的表面等离子体共振分析进行动力学分析。对于SensorchipCM5的预温育,将10μg/mlhRSVFTM-蛋白静置120秒。对于通过胺偶联固定,将EDC/NHS用于激活,并将乙醇胺HCl用于失活(Biacore,胺偶联试剂盒)。加入100nM接着加入100nM的通过用BiacoreT100软件v1.1拟合1:1相互作用模型(Langmuir结合模型(Langmuirbindingmodel))进行解离率的评估。将解离率和亲和性常数显示在表B-1中。
与
竞争
在进行基本上如实施例5中所述的方法后,在竞争ELISA中确定纯化的与Mab或生物素化的Fab竞争结合于FTM-NN的能力。图1显示竞争ELISA的代表性实例,其中纯化的 与生物素化的Fab竞争结合于FTM-NN。在表B-1中总结EC50值。
实施例9:独特hRSV毒株的体外微量中和
通过体外微量中和测定法(见实施例6)测试纯化的在不同的A型和B型RSV毒株的中和中的功效。RSVLongLM-2(登记号P12568;ATCCVR-26),RSVA-2(ATCCVR-1540;lotnr.3199840)和RSVB-1(ATCCVR-1580;lotnr.5271356)的病毒储液在Hep2细胞中制备,并随后滴定以确定用在微量中和测定法中的最佳感染剂量。在表B-1中显示不同的纯化的中和功效的结果。尽管识别表位的所有6种 都可以有效地中和A型毒株Long和A-2,但是它们不能中和B-1毒株的感染或在>1μM的浓度才能中和B-1毒株的感染。仅当以μM浓度施用时,101F竞争剂15B3和191E4显示关于B-1毒株的非常弱的中和功效。
通过反转录酶PCR和随后的序列分析证实了不同RSV毒株的各个F-蛋白的序列。简言之,使用RNeasy少量试剂盒(Qiagen,Venlo,荷兰)从RSV-感染的Hep2细胞中分离总RNA,随后使用SuperscriptIII反转录酶试剂盒(Invitrogen,Carlsbad,CA)制备互补DNA。使用在Kimura等.2004(抗病毒研究(AntiviralResearch)61:165-171)中所述的引物,对RSVA毒株的F-蛋白进行扩增和测序。对于RSVB-1毒株F-蛋白的扩增,使用下列引物:
FB1_outer_for:cttagcagaaaaccgtga(SEQIDNO:13);
FB1_outer_rev:tgggttgatttgggattg(SEQIDNO:14);
FB1_seq_1123-for:ggactgatagaggatggta(SEQIDNO:15);
FB1_seq_1526-rev:gctgacttcacttggtaa(SEQIDNO:16)。
RSVB-1毒株的序列对应于登记号P13843,具有另外的点突变Ser540Leu。关于RSVLongM2毒株的序列完全对应报道的序列(登记号M22643)。毒株RSVA-2的序列对应登记号M11486。也见表A-2。
实施例10:构建、生产和表征多价hRSV
通过不同长度和组成的Gly-Ser接头连接的多价构建体通过使用不同引物组的单独的PCR反应(1个关于N-端亚基,1个关于中间亚基(在三价的情形中)和1个关于C-端亚基)来产生,所述引物组包含特异性的限制性位点。类似地,产生了通过Ala-Ala-Ala接头连接的多价构建体。将所有的构建体克隆到衍生自pUC119的表达载体中,所述载体包含LacZ启动子、卡那霉素的抗性基因、多克隆位点和OmpA信号肽序列。与编码序列符合阅读框地,所述载体编码C-端c-myc标记和(His)6标记。在35Gly-Ser-接头存在于多价构建体的情形中,使用衍生自pUC119的表达载体,所述表达载体包含LacZ启动子,卡那霉素的抗性基因和OmpA信号肽序列。紧接信号肽的下游,存在用于插入的多克隆位点,随后是35Gly-Ser接头编码DNA序列和用于克隆第二序列的第二多克隆位点。与得到的 -35Gly-Ser-编码序列符合阅读框地,所述载体编码C-端c-myc标记和(His)6标记。表B-2列出用RSV-特异性产生的多价构建体。多价构建体的序列显示在表A-3中。
对多价RSV构建体进行表达、纯化和进一步表征。在大肠杆菌TG1细胞中进行生产,随后通过IMAC经过His-标记从周质级分中纯化,并脱盐,基本如在实施例7中所述。对于某些三价构建体(例如,RSV401,RSV404,RSV406),在巴斯德毕赤酵母(P.pastoris)中进行生产,随后从培养基级分中纯化。在最终的步骤中对所有的三价进行凝胶过滤以去除可能的二价和单价降解产物。
在关于FTM-蛋白和hRSV二者的ELISA中证实纯化的多价与hRSVF-蛋白的结合(见实施例8)。对于大部分的格式化为二价和三价构建体导致明显但是有限(多到10倍增加)的抗体亲抗原性的效果,例外是多价7B2和NC23,其显示与它们的单价对应体类似的EC50值(如图2中7B2所示)。
实施例11:二价和三价构建体中和hRSV的功效
在关于不同RSV毒株的RSV中和测定法中评估构建体的功效(见实施例6和9)。相对于它们的单价对应体,二价结合抗原性位点II在Long的中和中显示100倍到1000倍的功效显著增加(即,比亲和性的增加高得多),其中IC50值范围在50-380pM,比NumaxFab更好或类似。然而,关于RSVB-1毒株,功效增加并没有那么强,并且二聚体构建体中没有一个比更有效。令人惊奇的是,这可以通过产生三价构建体克服,如在图3中显示。与它们的单价对应体相比,具有三个结合抗原性位点II的三价构建体是关于RSVB-1毒株的至少1000倍更有效的中和剂。
实施例12:单价与Long毒株的逃避突变型的反应性
选择许多如在Lopez等.1998(病毒学杂志(J.Virol).72:6922-6928)中所述并特异于抗原性位点II的逃避突变型(R47F/4,R47F/7,RAK13/4,R7C2/11,R7C2/1)或特异于IV-VI的逃避突变型(R7.936/1,R7.936/4,R7.936/6,R7.432/1)或特异于两者的组合的逃避突变型(RRA3),测试它们与10种单价的反应性,所述包括以前鉴定为不结合抗原性位点II或IV-VI的191C7(SEQIDNO:8)。
根据Lopez等.1998(病毒学杂志(J.Virol).72:6922-6928)进行该测定法。简言之,使用被不同逃避突变型感染的HEp-2细胞的抗原提取物,在ELISA中测试在0.2μg/ml的每种关于参照病毒毒株(Long野生型)毒株以及对照191C7的反应性对吸光度结果进行标准化。将结果显示在表B-3中。
将>75%的反应性显示为实心黑色正方形,深色阴影正方形对应于在75和50%之间的反应性,浅色阴影正方形对应于25-50%的反应性,并且少于25%的反应性由空白正方形指示。一般地,发现已经在以前鉴定为抗原性位点II结合物的(192C4,191D3,191F2,NC23,15H8,7B2和NC41)对抗原性位点II中的典型突变敏感,而已经鉴定为抗原性位点IV-VI结合物的其它实际上对在这些位点中的突变敏感。
实施例13:多价与Long毒株的逃避突变型的反应性
随后,对有限的逃避病毒组分析多种多价构建体以评估结合。根据Lopez等.1998(病毒学杂志(J.Virol).72:6922-6928)进行该测定法。简言之,使用被不同逃避突变型感染的HEp-2细胞的抗原提取物,在ELISA中测试每种对单价以0.1μg/ml,对二价和三价 以0.05μg/ml测试。关于参照病毒毒株(Long野生型)毒株以及对照(191E4;SEQIDNO:10,在该特定的测定法中)的反应性对吸光度结果进行标准化。将结果显示在表B-4中。
将>75%的反应性显示为实心黑色正方形,深色阴影正方形对应于在75和50%之间的反应性,浅色阴影正方形对应于25-50%的反应性,并且少于25%的反应性由空白正方形指示。明显地,与它们的单价对应体相比,与突变体病毒R7C2/11相比,多价构建体显示提高的结合。此外,二互补位构建体RSV403对任一种突变体不敏感。
实施例14:多价对Long毒株的逃避突变型的中和作用
在实施例12和13中,描述了单价与典型的抗原性位点II和/或IV-VIRSV逃避突变型的结合。特异性识别这些抗原位点的 的结合几乎丧失或明显被减少。将这些格式化为二价或三价构建体部分恢复结合活性,但是不是对于所有的三种逃避突变型病毒都是如此。与逃避突变型R7C2/1(在抗原性位点II中的突变K272E)的结合对于任何仅由抗原性位点II结合组成的二价或三价构建体保持低于25%的水平。结合抗原性位点IV-VI的15B3和191E4是仅有的能够在75%以上的水平结合该突变体的(按原样或在二互补位构建体中)。
对该数据的更详细的分析显示当的价态增加时,针对R7C2/1的结合稍稍增加。7B2构建体的结合对于单价、二价(RSV106)和三价(RSV400)形式分别是0,4.4和13%。预期这样低的残余结合水平导致中和RSV的非常高的功效丧失。
在与实施例13所述相同的选定逃避突变型组上评价的中和功效。为此目的,将单价7B2,15H8和NC41与它们各自的三价对应体RSV400,RSV404和RSV407进行比较。其中,在实施例13中,仅对RSV400评估与这些逃避突变型的结合。此外,还对二互补位三价分子RSV403(7B2-15B3-7B2)分析其中和能力。
基本上如在实施例6中所述进行hRSV微量中和测定法。简言之,将Hep2细胞以1.5x104细胞/孔的浓度接种到96-孔板的DMEM培养基中,所述培养基包含10%胎牛血清(FCS)并补充以青霉素和链霉素(分别为100U/ml和100μg/ml),并将所述Hep2细胞在37℃在5%CO2气氛下温育24小时。将不同病毒的病毒储液制备到Hep2细胞中,并随后进行滴定以确定用于微量中和测定法的最佳感染性剂量。将标准量的特异性hRSV毒株与纯化的的系列稀释物在50μl总体积中在37℃预先温育30分钟。将Hep2细胞的培养基用预混合物更换以允许感染2小时,随后加入0.1ml的测定培养基。在补充了2.5%胎牛血清和青霉素和链霉素(分别为100U/ml和100μg/ml)的DMEM培养基中进行测定法。在37℃在5%CO2气氛中将细胞再温育72小时,随后将细胞用在PBS中的0.05%吐温-20洗涤2次,并单用PBS洗涤1次,随后将细胞在4℃用在PBS中的80%冷丙酮(西格玛-奥尔德里奇(Sigma-Aldrich),St.Louis,MO)(100μl/孔)固定20分钟,并静置以完全干燥。接下来,在ELISA型测定法中检测F-蛋白在细胞表面上的存在。其中,将固定的Hep2细胞在室温用在PBS中的5%猪血清白蛋白溶液封闭1小时,接着用抗-F-蛋白多克隆兔血清(Corral等.2007,BMCs生物技术(BMCBiotechnol).7:17)或(2μg/ml)温育1小时。为了检测山羊抗-兔-HRP缀合的抗体或山羊抗-人IgG,使用Fcγ片段特异性-HRP(Jackson免疫研究(JacksonImmunoResearch),WestGrove,PA),随后根据标准方法使ELISA显影。
如在图4A-C中所显示,单价几乎没有针对抗原性位点II逃避突变型病毒R7C2/11和R7C2/1的中和潜力。中和R7.936/4抗原性位点IV-VI变体的功效与中和野生型Long毒株的功效相当。这些数据与实施例12的结合数据一致,并且与在实施例5中关于这些所述的表位作图一致。
然而,三价构建体有效地中和全部3种逃避突变型(图4D-G)。在低到约20nM的浓度观察到最大抑制,而关于多到2μM浓度的单价没有观察到这种抑制水平。R7C2/1的有效中和,几乎与R7C2/11的中和等价,这是最令人惊奇的,因为实施例13显示关于三价分子RSV400结合活性的非常明显的丧失,预期三价分子RSV400导致非常高的中和功效的丧失。也识别抗原性位点II的二价IgG帕利珠单抗在约0.2μM的浓度不能明显地阻断R7C2/1或R7C2/11的复制。在该浓度,不能达到IC50,而R7.936/4和野生型Long病毒以几个nM的IC50被中和(数据未显示)。
实施例15:分析接头长度对NC41三价体(trivalent)效力的影响
为了确定NC41的三价体的接头长度的影响,产生具有从3Ala,9GS,15GS,到20GS接头的不同构建体(分别是RSV408,RSV409,RSV407和RSV410)。所有这四种NC41三价体都能够完全中和RSVB-1和Long毒株(图5)。在RSVLong的中和中没有观察到接头长度的影响,因为所有的构建体都同等有效。与之相对照,具有9GS和3Ala接头的构建体在B-1毒株上具有提高的IC50值,提示15GS的最小接头长度是最大功效所必需的。这可以通过如下观察结果来解释,即二价NC41构建体对于Long已经是非常有效的中和剂,而对于B-1毒株来说,在二价和三价NC41之间的功效差异要大得多(见实施例11)。在RSV408和RSV409中,中等的可接近性可能并非最优。
实施例16:NC41的人源化作用
将NC41的序列与人种系VH3-23进行比对,以便选择适于序列进一步人源化作用的残基。此外,进行硅内(insilico)分析以鉴定潜在易于进行翻译后修饰,如Asp异构化作用的残基,并鉴定可以提高化学稳定性的突变。CDR区和所谓的标志残基,已知其是的稳定性和效力所必需的,被排除在修饰之外。
对于NC41,选择总共11个位置用于突变至相应的人残基:同时引入四种突变(Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gln108Leu),因为预期这些残基不会显著影响功能(基于来自其它的数据)。在这种基本的变体中,使用文库方法诱变其中的七个残基(Ser19Arg,Ile20leu,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln),使在每个位置上存在野生型或相应的人氨基酸,对于所述七个残基并不知道其突变成人对应物是否允许。得到的文库,具有128种理论多样性,通过利用包含简并密码子应用的重叠寡核苷酸序列的基因装配产生,随后将其克隆到源自pUC119的表达载体中,所述表达载体包含LacZ启动子,卡那霉素的抗性基因,多克隆位点和OmpA前导序列。与编码序列符合阅读框地,所述载体编码C端c-myc标记和(His)6标记。在大肠杆菌的周质中生成 (见实施例7)。通过序列分析确认文库的多样性。
产生来自368种单个NC41变体和野生型NC41的周质提取物并进行功能性筛选级联,以便根据功效和稳定性来鉴定最佳人源化的NC41变体。在第一步,在ELISA中测定人源化的NC41变体与RSVLong的RSV结合(Hytest,TurkuFinland;#8RSV79)(见实施例8)。
另外,对阳性结合物分析与感染了RSVB-1毒株的Hep2细胞的结合。在此,将Hep2细胞接种入96孔板中并用RSVB-1毒株感染,基本上按照对于中和测定所述的步骤(见实施例6)进行。三天后将细胞用冰冷的丙酮固定,并在使用不同稀释度的周质提取物的ELISA测定中使用板。使用抗VHH兔多克隆抗体,随后使用山羊抗-兔-HRP缀合抗体,检测与Hep2-B1感染细胞结合的然后根据标准方法进行ELISA显色。
此后,为了确证引入的突变是否影响温度稳定性,将所有结合物的周质提取物加热到74℃2小时,其比野生型NC41的熔解温度高5℃。在ELISA中分析加热前后对RSVLong的结合,取加热后对加热前的结合信号比率作为温度稳定性的量度。
最后,如在实施例8中所述,在Biacore测定中对于Ftm-NN蛋白质测定变体的动力学解离率。
对所有结合物进行测序并根据它们结合RSV的F蛋白的能力进行排列。当分析最强结合物的序列时,在所有情况下都观察到对Gln105(人残基)的明显偏爱。尽管Ile20Leu突变看起来未被充分代表,对于所有其它位置都没有对野生型或人序列的明显偏爱,其中用与野生型NC41相比包含多达10个突变的变异体。引人注目的是,在一个变体中观察到CDR2区域内的额外点突变(Gly54Asp)。这种变体,NC41变体6,显示出所有变体和野生型NC41的最低解离率,导致亲和性提高。
基于序列和功能性数据,选择18种变体(表A-4)作为纯化蛋白进一步表征(图6和7)。产生和纯化所有的变体,并在微量中和测定法中确定RSVLong和B-1的中和功效。尽管大多数变体显示与野生型NC41非常相似的活性,但几种变体显示对Long(2倍)和B-1(6倍)的效力提高,最强的中和剂是NC41变体6,8,917,和18。引人注目的是,变体18在所有11个位置上是最大程度人源化的,在CDR2区中额外引入了Asp54。变体10和11在中和B-1毒株上比NC41更有效,但对于Long毒株并非如此。
如实施例8中所述,对于选定组的NC41变体,在Biacore测定中对于Ftm-NN蛋白质测定动力学结合参数(表B-5)。对于NC41和人源化的NC41变体6,8和17没有观察到计算数据中的显著差异。应当注意所有NC41变体的缔合率都在仪器的检测限度内,但解离率可以排序为v06<v17<NC41<v08。当比较v17和v18时,在CDR2中Gly向Asp的突变(位置54)的影响可以清楚地展现出来,因为这是在这些最大程度人源化变体中的唯一差异。如表B-5中所示,与NC41野生型相比,在两种独立测定中对Long毒株和B-1毒株测试中和作用。在两种测定中,NC41v18对于两种病毒都比NC41更有效,并且在两种测定中,NC41v18都比NC41v17对Long毒株更有效。在第二种测定中还对B-1毒株观察到NC41v18的中和作用提高。
将所有NC41变体都进行热诱导的解折叠以评估引入的突变对蛋白质稳定性的影响。另外在SyproOrange存在下,通过逐步提高温度来测定熔解温度(Tm),所述SyproOrange是一种结合在蛋白质解折叠后暴露的Trp残基的染料。所有变体都显示相对于野生型NC41(69℃)具有提高的Tm,对于变体18来说提高高达9℃。
实施例17:为了表达进一步序列最优化NC41
进一步分析NC41的序列,其目的是最优化在巴斯德毕赤酵母(Pichiapastoris)中表达。NC41变体19-26通过组合人源化位置来设计,所述人源化位置显示在微量中和测定中在不损失效力的条件下是允许(实施例16)。同时引入四个突变(Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu),而三个突变分别并以各种可能的组合检验(Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln)(见表A-4)。将所有构建体克隆到表达载体中并引入巴斯德毕赤酵母菌株XL-33,随后通过定量实时PCR评估毕赤酵母基因组中的参入(incorporations)数量。由各构建体,选择具有1-2个拷贝的一个克隆和具有4个以上拷贝的一个克隆来进行小规模生产,并通过在SDS-PAGE凝胶上的凝胶电泳评估NC41变体相对于野生型的表达产率。NC41变体20,22,24,25和26显示最高表达,其与已经处于低拷贝数的野生型NC41具有类似的表达水平。
将NC41变体22和26重新克隆在大肠杆菌的表达载体中,以生产和纯化Myc-His-标记的纳米抗体(见实施例7)。在微量中和测定中测试两种变体中和RSVLong的效力,如实施例6中所述。两种变体与野生型NC41同等有效(v22和v26的IC50分别为126和310nM)。
实施例18:为了化学稳定性序列最优化RSV407
在生产本发明的纳米抗体和多肽的过程中,(通过RP-HPLC)观察氨基端的焦谷氨酸(pGlu)。在发酵后检测到大于15%的pGlu水平并且pGlu水平在稳定性研究过程中保存时稳定增加。因此,将N-端谷氨酸盐(E)改变为天冬氨酸盐(D)。这将消除N-端的pGlu翻译后修饰的可能性并因此导致增加的产物稳定性。
序列最优化变体的氨基酸序列分别在表A-5(RSV434;SEQIDNO:142)中给出。为了生产该基于来自Invitrogen的可商购系统,利用X-33作为宿主菌株开发毕赤酵母表达系统。该系统利用AOX1启动子驱动的生产并使用α交配分泌肽使分泌到培养基中。
序列最优化的RSV434通过RP-HPLC,SE-HPLC来分析表达水平,并关于RSV中和与亲本分子(RSV407)进行比较。
与RSV407相比,表达水平没有显著差别,并且低和高拷贝数克隆均产生大于1g/L澄清培养基(无细胞)。
在1mlMEPHypercel柱上捕获1ml样品,并通过SE-HPLC和RP-HPLC洗脱和分析。SE-HPLC分析显示单体材料,而RP-HPLC分析,如预期地,清楚地显示缺乏pGlu后峰。
RSV434进一步由培养基纯化,在MEPHyperCell上捕获并通过阴离子交换层析精纯。
hRSV微量中和测定基本上如实施例6中所述地进行。图9显示RSV407及其序列最优化变体RSV434二者对RSVLong和B-1毒株二者的中和。
实施例19:制备人源化的和/或序列最优化的NC41的多价构建体
使用15GS接头(表A-5中所示的序列)将实施例16的NC41人源化变体格式化成三价构建体。如实施例10中所述,生产和纯化三价体。图8A显示三价人源化NC41变体的其中两种与其相应单价对于RSVLong和B-1毒株的中和作用。图8B显示三价NC41变体的RSVLong和B-1毒株的中和作用。由三价NC41变体引起的RSVLong和B-1毒株的中和作用的IC50值显示在表B-7中。与亲本NC41三价体(RSV407)类似地,人源化NC41变体的三价体与相比,是约60倍更加有效的Long中和剂。关于B-1毒株,三价体与Synagis相比,是更加有效的中和剂,但在此与亲本NC41RSV407的三价体相比,也都稍微提高,其处于这样的顺序:RSV427>RSV426>RSV414。因而单价变体对于B-1的效力提高似乎导致了稍微改进的三价体。
基于在实施例17和18中所示的进一步序列最优化,产生大量另外的三价构建体(表B-6)。将所有构建体克隆在巴斯德毕赤酵母表达载体中,转化到毕赤酵母中并进行发酵以测定表达水平、稳定性和效力。在小规模摇瓶表达和发酵二者中,RSV440(变体26)和RSV441(变体22)显示高表达水平。
实施例20:多价构建体的体外功效
在针对31RSV/A和30RSV/B临床分离株的空斑数减少测定法中评估纳米抗体RSV434和Synagis的中和能力。两种抗-RSV化合物以及Synagis均以单浓度40μg/ml来测试。
Synagis和RSV434二者分别关于与PBS对照相比病毒滴度降低至少100倍的87%和97%毒株有效进行(表B-8)。另外,与Synagis相比,RSV434显示更高的中和能力。大多数RSV毒株(84%)被RSV434完全抑制,而显著更少的毒株(20%)被Synagis完全抑制(表B-8)。
实施例21:多价构建体的体内功效
棉鼠模型是RSV的黄金标准模型。在该模型中,使用RSV/Tracy毒株感染棉鼠(第0天)并在感染后4天,在肺灌洗液和鼻清洗液中评估病毒滴度和病毒RNA。在预防性设置中,RSV感染前24小时,鼻内施用RSV407时,观察到显著的和剂量依赖性的病毒负荷减少(图10)。
另外,探索治疗方法,其中在24h或48h感染后使用纳米抗体处理感染的棉鼠,由此模拟RSV感染的人的情形。在两种情形中,观察到病毒复制的显著抑制(表B-9和图11)。
在迄今进行的所有研究中,鼻内递送纳米抗体,以作为肺部递送的模拟。利用该施药途径,肺中可获得9-41%纳米抗体,如在施药后不久关于支气管灌洗液进行的ELISA评估的。
为了克服肺灌洗液中剩余纳米抗体的可能的干扰作用,病毒检测延迟到接种后第7天。在SpragueDawley大鼠中进行的单独的药物动力学研究容许估计纳米抗体在肺中的半衰期为约10.8。在第7天,即最后施药后5-6天,从肺中有效清除纳米抗体,以致不再干扰测定。阳性对照动物的病毒负荷由10E5降至10E2pfu/ml。然而,其仍可能通过使用RSV407处理显示约0.6log的减小(表B-9)。
作为备选的方法,开发定量PCR来检测病毒RNA。在预防性和治疗性实验二者中,观察到RSVRNA的显著减少(表B-9)。
实施例22:RSV逃避突变型的产生
为了鉴别与F-蛋白的关键接触残基,RSVLong逃避突变型的产生在存在以大约它们各自IC90浓度的纳米抗体的条件下培养RSVLong后进行分析。使用单价NC41(5μg/ml)及其三价RSV407(2.5ng/ml)二者,以及双特异性三价RSV413(NC41-15B3-NC41)来验证识别两个不同表位的构建体是否会影响病毒逃避开始的期限。在存在纳米抗体的条件下在Hep2细胞上进行12代Long连续温育后,关于单价NC41的条件观察到病毒生长晕,但意外地关于三价纳米抗体没有观察到病毒生长晕。从重复轮的空斑纯化单病毒储液,其后可以确定潜在逃避变体的F-蛋白的序列。关于NC41,鉴别了两种不同的逃避变体,即具有突变N262Y的NC41/13和包含突变N276Y的NC41/17。
表
表A-1:结合RSVF蛋白的单价的序列
表A-2:F-蛋白序列
表A-3:结合hRSV的多价构建体的氨基酸序列
表A-3:续
表A-3:续
表A-3:续
表A-3:续
表A-3:续
表A-4:人源化和/或序列最优化的NC41变体的序列
表A-4:续
表A-5:结合hRSV的多价人源化和/或序列最优化构建体的氨基酸序列
表A-5:续
表A-5:续
表A-7:接头序列
表B-1:结合hRSVF-蛋白的的特征
表B-2:针对hRSVF-蛋白的多价构建体的命名
表B-3:单价与使用Long毒株的不同逃避突变型感染的HEp-2细胞的抗原提取物的反应性
表B-4:单价和二价与使用Long毒株的不同逃避突变型感染的HEp-2细胞的抗原提取物的反应性
表B-7:由三价NC41变体引起的Long和B-1的中和
表B-8:在针对不同临床分离株的空斑测定中的RSVP434和Synagis的中和能力
表B-9:进行的所有棉鼠实验的总表,其显示在接种后第4天时关于能复制的病毒和病毒RNA的检测(在实验3中,还进行在第7天的检测)
*p<0.05
Claims (25)
1.三价多肽,其包含三个特异性结合hRSV的蛋白F的纳米抗体或基本上由三个特异性结合hRSV的蛋白F的纳米抗体组成,其中所述纳米抗体选自以下:
A)纳米抗体,其中CDR1选自以下(a)或(b):
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段而没有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
并且CDR2选自以下(c)或(d):
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);并且
ii)与包含所述氨基酸残基片段而没有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
并且CDR3选自以下(e)或(f):
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段而没有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
B)选自以下a)至f)的纳米抗体:
a)SEQIDNO:60-76;
b)与SEQIDNO:60-76中的一个具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的纳米抗体,条件是:
i)所述纳米抗体在位置105(所述位置根据Kabat编号确定)具有谷氨酰胺(Gln,Q);并且
ii)与不具有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,所述纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
c)SEQIDNO:146-153;
d)与SEQIDNO:146-153中的一个具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的纳米抗体,条件是:
i)所述纳米抗体在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)并且在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);并且
ii)与不具有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,所述纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
e)SEQIDNO:138-141和154-157;
f)与SEQIDNO:138-141和154-157中的一个具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的纳米抗体,条件是:
i)所述纳米抗体在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);并且
ii)与不具有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,所述纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的)。
2.根据权利要求1的三价多肽,其中所述纳米抗体包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,和/或其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
3.根据权利要求2的三价多肽,其中所述纳米抗体包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
4.包含SEQIDNO:53或基本上由SEQIDNO:53组成的三价多肽,其中在至少一个形成SEQIDNO:53的部分的纳米抗体中,一个或多个氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp,和/或其中第一个谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
5.根据权利要求3的三价多肽,其中在至少一个形成SEQIDNO:53的部分的中,以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln.
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
6.用于制备根据权利要求1至5中任一项的三价多肽的方法,所述方法至少包括将选自以下的三个纳米抗体和例如一个或多个接头连接的步骤:
A)纳米抗体,其中CDR1选自以下(a)或(b):
a)SEQIDNO:98;
b)与SEQIDNO:98具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段而没有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
并且CDR2选自以下(c)或(d):
c)SEQIDNO:102;
d)与SEQIDNO:102具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:
i)所述氨基酸残基片段在位置6(根据Kabat编号确定的位置54)具有天冬氨酸(Asp,D);并且
ii)与包含所述氨基酸残基片段而没有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
并且CDR3选自以下(e)或(f):
e)SEQIDNO:121;
f)与SEQIDNO:121具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的氨基酸残基片段,条件是:与包含所述氨基酸残基片段而没有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或包含所述氨基酸残基片段的纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
B)选自以下a)至f)的纳米抗体:
a)SEQIDNO:60-76;
b)与SEQIDNO:60-76中的一个具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的纳米抗体,条件是:
i)所述纳米抗体在位置105(所述位置根据Kabat编号确定)具有谷氨酰胺(Gln,Q);并且
ii)与不具有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,所述纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
c)SEQIDNO:146-153;
d)与SEQIDNO:146-153中的一个具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的纳米抗体,条件是:
i)所述纳米抗体在位置14具有脯氨酸(Pro,P),在位置19具有精氨酸(Arg,R),在位置20具有亮氨酸(Leu,L)并且在位置108具有亮氨酸(Leu,L)(所述位置根据Kabat编号确定);并且
ii)与不具有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,所述纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的);
e)SEQIDNO:138-141和154-157;
f)与SEQIDNO:138-141和154-157中的一个具有不超过3个,优选不超过2个,更优选不超过1个氨基酸差异的纳米抗体,条件是:
i)所述纳米抗体在位置1具有天冬氨酸(Asp,D)(所述位置根据Kabat编号确定);并且
ii)与不具有所述3、2或1个氨基酸差异的纳米抗体相比,所述纳米抗体以相同、大约相同、或更高的亲和性(所述亲和性如通过表面等离振子共振测量的)结合hRSV的蛋白F和/或所述纳米抗体具有相同、大约相同、或更高的效力(如通过微量中和测定确定的)。
7.根据权利要求6的方法,其中所述纳米抗体包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中一个或多个氨基酸残基已经进行选自以下的突变:Val5Leu,Ala14Pro,Ser19R,Ile20Leu,Glu44Gly,Ala74Ser,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54D,和/或其中位置1处的谷氨酸已经改变为天冬氨酸。
8.根据权利要求6的方法,其中所述纳米抗体包含SEQIDNO:5或基本上由SEQIDNO:5组成,其中以下氨基酸残基已经进行突变:
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Gly54Asp;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Val5Leu,Ala14Pro,Glu44Gly,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln,Gln108Leu和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Gly78Leu,Ala83Arg,Asp85Glu,Arg105Gln和Gly54Asp;
-Glu1Asp和Gly54Asp;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu和Gln108Leu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Ala83Arg;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Asp85Glu;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg和Arg105Gln;
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Asp85Glu和Arg105Gln;或
-Glu1Asp,Ala14Pro,Ser19Arg,Ile20Leu,Gln108Leu,Ala83Arg,Asp85Glu和Arg105Gln。
9.核酸,所述核酸编码根据权利要求1至5中任一项的三价多肽。
10.根据权利要求9的核酸用于制备遗传构建体的用途,所述遗传构建体编码根据权利要求1至5中任一项的三价多肽。
11.宿主或宿主细胞,所述宿主或宿主细胞表达或在合适的条件下能够表达根据权利要求1至5中任一项的多肽和/或包含根据权利要求9的核酸。
12.组合物,所述组合物包含根据权利要求1至5中任一项的多肽或根据权利要求9的核酸。
13.根据权利要求12的组合物,其是药物组合物。
14.药物组合物,所述药物组合物包含根据权利要求1至5中任一项的多肽和适合于肺部递送的载体。
15.用于制备根据权利要求1至5中任一项的多肽或根据权利要求12至14中任一项的组合物的方法,所述方法至少包括以下步骤:
a)在合适的宿主细胞或宿主生物体中或在另一种合适的表达系统中表达根据权利要求9的核酸,
或
在这样的条件下培养和/或维持根据权利要求11的宿主或宿主细胞,所述条件使得所述宿主或宿主细胞表达和/或产生根据权利要求1至5中任一项的多肽或根据权利要求12至14中任一项的组合物。
16.根据权利要求15的方法,其中步骤a)之后是以下步骤:
b)分离和/或纯化由此获得的根据权利要求1至5中任一项的多肽。
17.药物活性量的根据权利要求1至5中任一项的多肽和/或根据权利要求12至14中任一项的组合物用于制备药物的用途,所述药物用于预防和/或治疗有此需要的受试者中的hRSV感染。
18.药物活性量的根据权利要求1至5中任一项的多肽和/或根据权利要求12至14中任一项的组合物用于预防和/或治疗有此需要的受试者中的呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、细支气管炎(肺中小气道炎症)、肺炎、呼吸困难、咳嗽、哮鸣和哮喘中的至少一种的用途。
19.根据权利要求17的用途,其中所述哮鸣是复发性哮鸣。
20.根据权利要求1至5中任一项的多肽和/或根据权利要求12至14中任一项的组合物用于制备药物组合物的用途,所述药物组合物用于预防和/或治疗hRSV感染。
21.根据权利要求1至5中任一项的多肽和/或根据权利要求12至14中任一项的组合物用于制备药物组合物的用途,所述药物组合物用于预防和/或治疗呼吸系疾病、上呼吸道感染、下呼吸道感染、肺炎、呼吸困难、咳嗽、哮鸣和哮喘中的至少一种。
22.根据权利要求20的用途,其中所述哮鸣是复发性哮鸣。
23.适合于肺部递送的药物装置,所述药物装置包含:根据权利要求1至5中任一项的多肽和/或包含所述多肽的组合物。
24.根据权利要求23的药物装置,其是液体用吸入器、气雾剂或干粉剂吸入器。
25.根据权利要求23的药物装置,其是用于细小固体颗粒的悬浮液或小滴的吸入器。
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