CN102816866A - 一种检测肠道病毒rna的方法及试剂盒 - Google Patents

一种检测肠道病毒rna的方法及试剂盒 Download PDF

Info

Publication number
CN102816866A
CN102816866A CN2012103159307A CN201210315930A CN102816866A CN 102816866 A CN102816866 A CN 102816866A CN 2012103159307 A CN2012103159307 A CN 2012103159307A CN 201210315930 A CN201210315930 A CN 201210315930A CN 102816866 A CN102816866 A CN 102816866A
Authority
CN
China
Prior art keywords
rna
solution
magnetic bead
extracts
test kit
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN2012103159307A
Other languages
English (en)
Other versions
CN102816866B (zh
Inventor
戴立忠
邓中平
黄河
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Sansure Biotech Inc
Original Assignee
Sansure Biotech Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Sansure Biotech Inc filed Critical Sansure Biotech Inc
Priority to CN201210315930.7A priority Critical patent/CN102816866B/zh
Publication of CN102816866A publication Critical patent/CN102816866A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN102816866B publication Critical patent/CN102816866B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明提供一种提取纯化和检测EV RNA(肠道病毒RNA)的方法,并提供一种相应的检测EV RNA的试剂盒。本发明提供的试剂盒中包括含磁珠的RNA提取溶液、和含用于靶多核苷酸扩增的上游引物EV-F、下游引物EV-R和用于靶多核苷酸检测的探针EV-P的PCR反应液。本发明提供的试剂盒可检测出EV RNA,包括EV71、CA16及其他常见肠道病毒类型,但不能检测出非EV病原体,说明本发明试剂盒具有很好的特异性;另外,本发明选择了吸附效果好、易于纯化的磁珠法提取RNA,可以获得高纯度和高得率的核酸,大大提高了检测灵敏度、准确度和稳定性,其检测下限即灵敏度可达200copies/ml,检测范围(试剂盒的定量线性范围)为2.00E+02~2.00E+08copies/ml。

Description

一种检测肠道病毒RNA的方法及试剂盒
技术领域
本发明提供一种提取纯化和检测肠道病毒(Enterovirus,EV)RNA的方法,本发明中EV RNA包括肠道病毒71型(Enterovirus71,EV71)、柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CA16)及其他常见肠道病毒类型,并提供一种相应的检测EV RNA的试剂盒。
背景技术
实时荧光PCR技术(FQ-PCR)把PCR、分子杂交和光化学融为一体,使PCR扩增和产物分析的全过程均在单管封闭条件下进行。实时荧光PCR技术与其它检测技术相比具有以下优势:(1)与免疫学检测比较,其具有更高的灵敏度,从理论上讲只要有一个基因拷贝就可以检测出来。(2)根据各种病原体独特的保守基因序列设计引物,能够保证PCR反应的高度特异性,避免交叉反应。(3)能对病毒进行定量检测,可反映出患者体内病原体拷贝数的高低和复制情况。定量检测有助于判断病原体感染与疾病发生和发展的关系,探讨药物对病原体的作用,了解感染疾病病人用药后病情的变化情况。这对理解发病机制和预测抗病毒治疗的有效性十分关键。(4)可扩大检测人群的范围,适用于大规模的流行病调查。对如手足口病这类自然感染率极高的病原微生物尤其适用。(5)将PCR敏感性与探针特异性相结合,在很大程度上改变了传统PCR的缺陷,缩短了反应时间,简化了操作步骤。(6)全过程均在单管封闭条件下进行,避免了由于样本间交叉引起的假阴性和环境污染。(7)实时检测技术可连续不断的检测PCR过程中荣耀信号的变化,避免了传统PCR的“平台期效应”,并且模板的定量不通过终产物,而由Ct值算出,准确性和灵敏性都有提高。
目前,国内已有多种基于实时荧光定量PCR技术检测EV-RNA的试剂盒应用于临床检测中,这些试剂盒所提供的EV-RNA提取方法主要是酚-氯仿法和柱提取法。该类试剂盒存在很多不足之处:1)检测灵敏度低,约在1000copie/ml左右;检测范围窄,一般在1.00E+03copie/ml~1.00E+07copie/ml之间,对于临床高值(大于5.00E+07copie/ml)和低值(小于1.00E+03copie/ml)的样本无法检测;2)无法覆盖肠道病毒的所有病毒类型,存在一定的漏检现象;3)酚-氯仿法是最经典的RNA提取方法,但是操作繁琐,对于设备和人员操作要求高,低病毒载量的标本检出率低,且所用试剂具有一定的毒性;柱提取方法无需高速离心,但是需频繁更换离心管,用时长,特异性较差;4)无法有效去除样本中的PCR抑制物(如全血、痰液等),体系中一般没有阳性内对照(即内标),无法预防假阴性;5)国外试剂成本和耗材成本太高,很难在临床广泛开展。
磁珠(免疫磁珠)法是近年发展迅速且被广泛应用的一种核酸提取方法,其优于传统方法的特点可以总结为以下几点:其系列试剂不含氯仿、苯酚等毒性大的有机溶剂;提取纯化的核酸质量好、产量高;提取步骤更简单,不需要离心,易于实现自动化;这些优点使其有替代其它核酸提取和纯化方法的发展趋势。但在现有技术中,并未见有磁珠法用于提取纯化和检测EV RNA的相关报道。
发明内容
本发明的目的在于解决现有肠道病毒荧光定量PCR检测试剂盒的缺陷,提供一种RNA提取得率高、检测灵敏度高、检测范围宽而准确的EV核酸荧光PCR检测试剂盒,可以对咽拭子、粪便等未知样本中的EV-RNA进行快速、准确检测,检测结果可用于EV感染的辅助诊断。
本发明用磁珠法提取样本核酸,采用实时荧光定量PCR技术,以EV基因组的高度保守区域为扩增靶目标,设计特异性引物及TaqMan探针,在实时荧光PCR仪上通过PCR扩增对EV RNA进行定性检测。
本发明提供一种检测EV RNA的方法,其中使用磁珠法提取和纯化EV RNA。
在本发明中,所述磁珠是生物科学和纳米材料科学二者结合的产品。它运用纳米技术对超顺磁性纳米颗粒的表面进行改良和修饰后,制备成超顺磁性氧化硅纳米磁珠;该磁珠能在微观界面上与核酸分子特异性地识别和高效结合。它利用氧化硅纳米微球的超顺磁性,在Chaotropic盐(盐酸胍、异硫氰酸胍等)和外加磁场的作用下,能将血液、动物组织、食品、病原微生物等样本中的DNA和RNA分离出来,可应用于临床疾病诊断、输血安全、法医学鉴定、环境微生物检测、食品安全检测、分子生物学研究等多种领域。在本发明中,所述磁珠可经商购获取。
在优选的情况下,本发明结合使用磁珠法和实时荧光PCR技术提取纯化和检测EVRNA。
具体的,在一个实施方式中,本发明所述方法包括如下步骤,步骤A,裂解病毒:每支离心管加入含磁珠的RNA提取溶液和待测样本,混匀后离心;EV阴性对照和EV阳性对照参照与待测样本相同的方法作RNA提取和纯化处理;步骤B,磁珠吸附核酸:每管加入含4-羟乙基哌嗪乙磺酸和氯化钠的RNA提取溶液Ⅱ,混匀后静置;步骤C,去除杂质:经离心后将离心管置于磁珠分离器上进行磁珠分离,再缓慢将溶液吸出;步骤D,洗涤:每管加入含曲拉通和氯化钠的RNA提取溶液Ⅲ和含矿物油的RNA提取溶液Ⅳ,混匀后离心,将离心管置于磁珠分离器上进行磁珠分离,静置分层后将液体吸出丢弃;步骤E,RNA洗脱:加入含Tris-HCl和EDTA的RNA洗脱液将离心管壁上的磁珠洗脱到管底,混匀并静置后将离心管再次置于磁珠分离器上,然后将从磁珠上洗脱下来的RNA吸至新的灭菌离心管中;步骤F,荧光PCR分析:将洗脱磁珠后的待测样本RNA、EV阴性对照、EV阳性对照中均加入含PCR反应缓冲液、脱氧核糖核苷三磷酸、引物、探针的PCR反应液和含mMLV酶和H-Taq DNA聚合酶的EV酶混合液,在荧光定量PCR扩增仪上进行PCR反应,并分析结果。
本发明还提供一种检测EV RNA的试剂盒,包括含磁珠的RNA提取溶液、和含用于靶多核苷酸扩增的上游引物EV-F、下游引物EV-R和用于靶多核苷酸检测的探针EV-P的PCR反应液;其中,上游引物EV-F的碱基序列为5’-CCC TGA ATG CGG CTA ATC CTA-3’;下游引物EV-R的碱基序列为5’-CAC GGA CAC CCA AAG TAG TCG G-3’;探针EV-P的碱基序列为5’FAM-CGC TGC AGA GTT GCC CGT TAC GAC-BHQ13’。
本发明中EV RNA包括EV71、CA16及其他常见肠道病毒类型,在本发明的试剂盒中,发明人寻找出EV基因组的通用、保守序列而设计出用于靶多核苷酸扩增和检测的引物和探针序列,为EV RNA的实时荧光PCR检测检测提供了保障。
在本发明所述试剂盒中,优选的是,所述试剂盒中还包括内标,所述内标即为一段长为92碱基对的人工合成DNA序列插入pUC18T载体的重组体,即质粒,其碱基序列为5’-ATCTTGCCACGAACGCTAAACGGCACTCTGTCATCCAGTTTTGCTGACTCACGATCAACGCTCGAGTGGTGCAATCTCAATTATGTCATCAG-3’。
在本发明一个具体实施方式中,所述试剂盒中包括如下组分,①RNA提取溶液Ⅰ:包含十二烷基硫酸钠、曲拉通、异硫氰酸胍和100~400μg/ml的磁珠;②RNA提取溶液Ⅱ:含4-羟乙基哌嗪乙磺酸和氯化钠;③RNA提取溶液Ⅲ:含曲拉通和氯化钠;④RNA提取溶液Ⅳ:含矿物油;⑤RNA洗脱液:含Tris-HCl和EDTA;⑥内标:如上所述的可选择使用的内标;⑦PCR反应液:包括5×PCR反应缓冲液,脱氧核糖核苷三磷酸,用于靶多核苷酸扩增的上、下游引物EV-F与EV-R,用于靶多核苷酸检测的探针EV-P,用于内标扩增和检测的上、下游引物IC-F与IC-R和探针IC-P;⑧EV酶混合液:含mMLV酶和H-Taq DNA聚合酶;⑨EV阳性对照:标定已知浓度的慢病毒,其浓度为1.00~5.00E+05 copie/ml;和⑩EV阴性对照:灭菌生理盐水。
在本发明的上述试剂盒中,用于靶多核苷酸扩增的上、下游引物EV-F与EV-R和用于靶多核苷酸检测的探针EV-P的序列是本发明的核心;而用于内标扩增的上、下游引物IC-F与IC-R和用于内标检测的探针IC-P均可以据内标的碱基序列而任意选择。在本发明中,例如,上游引物IC-F为:5’-ATCTTGCCACGAACGCTAAACGGCA-3’;下游引物IC-R为:5’-CTGATGACATAATTGAGATTGCACC-3’;探针IC-P为:5’HEX-CTGTCATCCAGTTTTGCTGACTCACGATC-BHQ13’。
在上述试剂盒中,更为优选的是,①RNA提取溶液Ⅰ:由十二烷基硫酸钠0.2~1.0%(质量/体积)、曲拉通1.0~4.0%(体积/体积),异硫氰酸胍0.2~1.0mol/L和100~400μg/ml的磁珠组成。②RNA提取溶液Ⅱ:包括4-羟乙基哌嗪乙磺酸100~300mmol/L、氯化钠100~300mmol/L,溶液Ⅱ的pH为6.5±0.2;③RNA提取溶液Ⅲ:含曲拉通0.1~1.0%(体积/体积)和氯化钠100~300mmol/L。⑤RNA洗脱液:含Tris-HCl0.8~1.2mol/L和EDTA0.1~1.0mol/L;⑦PC R反应液:包括5×PCR反应缓冲液10μl,0.2mmol/L脱氧核糖核苷三磷酸,0.2~0.4μmol/L的用于靶多核苷酸扩增的上、下游引物EV-F与EV-R,0.2~0.4μmol/L的用于靶多核苷酸检测的探针EV-P,0.1~0.2μmol/L的用于内标扩增的上、下游引物IC-F与IC-R,0.05~0.2μmol/L的用于内标检测的探针IC-P;⑧EV酶混合液:包括mMLV酶10~150U/μl和1~10U/μl的H-TaqDNA聚合酶。
本发明在对EV所有已知基因型的基因组序列进行比对的基础上,在EV的最保守区域设计了两对引物和探针,经定量PCR优化,筛选出扩增效果最好的一对引物和探针,可检测出EV所有已知基因型,但不能检测出非EV病原体,说明本发明试剂盒具有很好的特异性。另外,本发明对EV-RNA的提取方法进行了比较和优化,选择了吸附效果好、易于纯化的磁珠法提取RNA,可以获得高纯度和高得率的核酸,大大提高了检测灵敏度、准确度和稳定性,其检测下限即灵敏度可达200copie/ml,检测范围(试剂盒的定量线性范围)为2.00E+02~2.00E+08copies/ml。
另外,在本发明的一种优选实施方式中,在样本提取过程中增加了内标,利用内标监控RNA提取和PCR反应过程,监控反应体系是否有效,防止样本检测假阴性。
本发明中,在荧光PCR扩增结束后,经仪器自带软件自动分析样本的Ct值,可为灵敏、早期诊断肠道病毒感染提供可靠的实验证据。
附图说明
图1A示出了本发明提供的一个EV阳性对照和一个EV阴性对照其本身的扩增曲线图;
图1B示出了本发明提供的一个加在EV阳性对照中的内标和一个加在EV阴性对照中的内标的内标扩增曲线图;
图2A示出了本发明提供的十个EV阳性样本的扩增曲线图;
图2B示出了本发明提供的十个EV近似病原体(分别为:腺病毒、流感病毒、EB病毒、巨细胞病毒、肺炎支原体、解脲脲原体、结核杆菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、白色念球菌)的扩增曲线图。
具体实施方式
以下仅为本发明的优选实施方式,本发明的保护范围并不局限于此,任何本领域的技术人员在本发明公开的技术范围内,可很容易进行的改变或变化都涵盖在本发明的保护范围之内。因此,本发明的保护范围应以权利要求书的保护范围为准。
实施例1
本实施例提供一种肠道病毒通用型核酸检测试剂盒(检测EV RNA的试剂盒),它包括如下组分:
①RNA提取溶液Ⅰ:由十二烷基硫酸钠0.2~1.0%(质量/体积)、曲拉通1.0~4.0%(体积/体积),异硫氰酸胍0.2~1.0mol/L和100~400μg/ml的磁珠组成;
②RNA提取溶液Ⅱ:包括4-羟乙基哌嗪乙磺酸100~300mmol/L、氯化钠100~300mmol/L,溶液ⅡpH值为6.5±0.2;
③RNA提取溶液Ⅲ:曲拉通0.1~1.0%(体积/体积)、氯化钠100~300mmol/L;
④RNA提取溶液Ⅳ:矿物油;
⑤RNA洗脱液:Tris-HCl0.8~1.2mol/L、EDTA0.1~1.0mol/L;
⑥内标(阳性内对照):一段长为92碱基对的人工合成DNA序列插入pUC18T载体的重组体,即质粒,浓度为1.00E+03~1.00E+06copies/ml;其碱基序列为:5’-ATCTTGCCACGAACGCTAAACGGCACTCTGTCATCCAGTTTTGCTGACTCACGATCAACGCTCGAGTGGTGCAATCTCAATTATGTCATCAG-3’
⑦PCR反应液:5×PCR反应缓冲液10μl(购买mMLV酶时附带的),0.2mmol/L脱氧核糖核苷三磷酸,0.2~0.4μmol/L的用于靶多核苷酸扩增的上、下游引物EV-F与EV-R,0.2~0.4μmol/L的用于靶多核苷酸检测的探针EV-P,0.1~0.2μmol/L的用于内标扩增的上、下游引物IC-F与IC-R,0.05~0.2μmol/L的用于内标检测的探针IC-P,
所述用于靶多核苷酸扩增和检测的上下游引物及探针,其碱基序列分别为:
上游引物EV-F:5’-CCC TGA ATG CGG CTA ATC CTA-3’;
下游引物EV-R:5’-CAC GGA CAC CCA AAG TAG TCG G-3’;
探针EV-P:5’FAM-CGC TGC AGA GTT GCC CGT TAC GAC-BHQ13’;
针对92碱基的序列设计了非竞争性内标的引物及探针,其碱基序列分别为:
上游引物IC-F:5’-ATCTTGCCACGAACGCTAAACGGCA-3’;
下游引物IC-R:5’-CTGATGACATAATTGAGATTGCACC-3’;
探针IC-P:5’HEX-CTGTCATCCAGTTTTGCTGACTCACGATC-BHQ13’;
⑧EV酶混合液:mMLV酶10~150U/μl,1~10U/μl H-Taq DNA聚合酶;
⑨EV阳性对照:标定已知浓度的慢病毒,其浓度为1.00~5.00E+05 copie/ml。
⑩EV阴性对照:灭菌生理盐水。
从附图1A、1B可以看出,EV阳性对照本身有S型扩增曲线,可明显判为阳性;而EV阴性对照本身扩增曲线平直,与阈值线无交点,没有Ct值(No Ct),可明显判为阴性。加入EV阳性对照中的内标和加入EV阴性对照中的内标的内标扩增曲线均为S型,可明显判为阳性。说明本试剂盒阴、阳性对照和内标可以监测提取过程和反应体系,避免假阴性结果。
实施例2
本实施例提供上述实施例1所述试剂盒用于检测咽拭子等未知样本中EV-RNA的操作步骤:
一、试剂准备
1)按比例取相应量的RNA提取溶液Ⅰ(200μl~1ml/人份)及内标(1μl/人份)充分混匀成RNA提取溶液1-mix,瞬时离心后备用。
2)根据待测样本、EV阴性对照、EV阳性对照的数量,按比例取相应量的PCR反应液(43μl/人份)及EV酶混合液(2μl/人份),充分混匀成PCR-mix,瞬时离心后备用。
二、RNA提取操作
1)裂解病毒:每管加入200μl~1ml RNA提取溶液1-mix,然后加入100μl~1ml待测样本(如咽拭子),盖上管盖,震荡混匀10秒钟,瞬时离心;EV阴性对照和EV阳性对照参照与待测样本相同方法作RNA提取和纯化处理;
2)磁珠吸附核酸:每管加入50~400μl RNA提取溶液Ⅱ,震荡混匀10秒钟后,室温静置10~30分钟;
3)去除杂质:瞬时离心后,将离心管置于磁珠分离器上进行磁珠分离,2~5分钟后缓慢将溶液吸出;
4)洗涤:每管加入400μl~1ml RNA提取溶液Ⅲ和100~500μl RNA提取溶液Ⅳ,震荡混匀3~7秒钟,瞬时离心后将离心管再次置于磁珠分离器上进行磁珠分离;
5)2~5分钟后,上清液分为两层,将吸头插入离心管底部,从底部开始缓慢将液体完全吸出丢弃,静置1~3分钟后,将管底残余液体完全吸出丢弃;
6)加入10~100ul RNA洗脱液,将离心管壁上磁珠洗脱到管底,吸打混匀3~4次,室温静置5~30分钟后将离心管再次置于磁珠分离器上2~5分钟,然后将从磁珠上洗脱下来的RNA吸至新的1.5ml灭菌离心管中;
7)每个反应管加入45μl的PCR-mix,吸取已经洗脱磁珠后的待测样本RNA、EV阴性对照、EV阳性对照各5μl加入PCR-mix中,盖好管盖。
三、荧光PCR反应与结果分析(在荧光定量PCR扩增仪上进行)
1)将PCR反应管放入扩增仪样品槽,按对应顺序设置待测样本名称。
2)荧光检测通道选择:选择FAM通道(Reportere:FAM,Quencher:None)检测EV;选择HEX或VIC通道(Reporter:VIC,Quencher:None)检测内标。
3)荧光定量PCR反应条件见表1:
表1
Figure BDA00002078084600061
4)结果分析
反应结束后,仪器自动保存结果,可以利用仪器自带的软件进行自动分析,也可以手动调节基线的开始值、结束值以及阈值进行分析,然后记录样本Ct值和结果。扩增曲线与阈值线的交点,称为Ct值(即cycle threshold,指PCR反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数值);仪器软件根据各样本Ct值大小,可以判断检测结果。对于测定Ct值≤36(Ct值>0)的样本,报告为EV RNA阳性;对于测定显示无Ct值的样本,同时内标检测为阳性(Ct值≤36),报告为EV RNA阴性;对于测定Ct值>36的样本,同时内标检测为阳性(Ct值≤36),报告为低于检测下限。若内标Ct值>36或内标显示无Ct值,则该样本的检测结果无效,应查找并排除原因,并对此样本进行重复试验。
从附图2A、2B可以看出,十个CA16阳性样本均有S型扩增曲线,可明显判为阳性;而十个CA16近似病原体:腺病毒、流感病毒、EB病毒、巨细胞病毒、肺炎支原体、解脲脲原体、结核杆菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、白色念球菌的扩增曲线都平直,与阈值线无交点,没有Ct值(No Ct),均可明显判为阴性。说明本试剂盒的特异性好,可以检出CA16基因型样本,而非CA16样本均检测为阴性。

Claims (9)

1.一种检测肠道病毒RNA的方法,其中使用磁珠法提取和纯化肠道病毒(EV)RNA。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,结合使用磁珠法和实时荧光PCR技术提取纯化和检测EV RNA。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
步骤A,裂解病毒:每支离心管加入含磁珠的RNA提取溶液和待测样本,混匀后离心;EV阴性对照和EV阳性对照参照与待测样本相同的方法作RNA提取和纯化处理;
步骤B,磁珠吸附核酸:每管加入含4-羟乙基哌嗪乙磺酸和氯化钠的RNA提取溶液Ⅱ,混匀后静置;
步骤C,去除杂质:经离心后将离心管置于磁珠分离器上进行磁珠分离,再缓慢将溶液吸出;
步骤D,洗涤:每管加入含曲拉通和氯化钠的RNA提取溶液Ⅲ和含矿物油的RNA提取溶液Ⅳ,混匀后离心,将离心管置于磁珠分离器上进行磁珠分离,静置分层后将液体吸出丢弃;
步骤E,RNA洗脱:加入含Tris-HCl和EDTA的RNA洗脱液将离心管壁上的磁珠洗脱到管底,混匀并静置后将离心管再次置于磁珠分离器上,然后将从磁珠上洗脱下来的RNA吸至新的灭菌离心管中;
步骤F,荧光PCR分析:将洗脱磁珠后的待测样本RNA、EV阴性对照、EV阳性对照中均加入含PCR反应缓冲液、脱氧核糖核苷三磷酸、引物、探针的PCR反应液和含mMLV酶和H-Taq DNA聚合酶的EV酶混合液,在荧光定量PCR扩增仪上进行PCR反应,并分析结果。
4.一种检测EV RNA的试剂盒,包括含磁珠的RNA提取溶液、和含用于靶多核苷酸扩增的上游引物EV-F、下游引物EV-R和用于靶多核苷酸检测的探针EV-P的PCR反应液;其中,上游引物EV-F的碱基序列为5’-CCC TGA ATG CGG CTA ATC CTA-3’;下游引物EV-R的碱基序列为5’-CAC GGA CAC CCA AAG TAG TCG G-3’;探针EV-P的碱基序列为5’FAM-CGC TGC AGA GTT GCC CGT TAC GAC-BHQ13’。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括内标,所述内标为一段长为92碱基对的人工合成DNA序列插入pUC18T载体的重组体,即质粒,其碱基序列为:5’-ATCTTGCCACGAACGCTAAACGGCACTCTGTCATCCAGTTTTGCTGACTCACGATCAACGCTCGAGTGGTGCAATCTCAATTATGTCATCAG-3’。
6.根据权利要求4或5所述的试剂盒,其特征在于,试剂盒中包括如下组分,
①RNA提取溶液Ⅰ:包含十二烷基硫酸钠、曲拉通、异硫氰酸胍和100~400μg/ml的磁珠;
②RNA提取溶液Ⅱ:含4-羟乙基哌嗪乙磺酸和氯化钠;
③RNA提取溶液Ⅲ:含曲拉通和氯化钠;
④RNA提取溶液Ⅳ:含矿物油;
⑤RNA洗脱液:含Tris-HCl和EDTA;
⑥内标:如上所述的可选择使用的内标;
⑦PCR反应液:包括5×PCR反应缓冲液,脱氧核糖核苷三磷酸,用于靶多核苷酸扩增的上、下游引物EV-F与EV-R,用于靶多核苷酸检测的探针EV-P,用于内标扩增和检测的上、下游引物IC-F与IC-R和探针IC-P;
⑧EV酶混合液:含mMLV酶和H-Taq DNA聚合酶;
⑨EV阳性对照:标定已知浓度的慢病毒,其浓度为1.00~5.00E+05copies/ml;
⑩EV阴性对照:灭菌生理盐水。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,在试剂盒中,
①RNA提取溶液Ⅰ:由十二烷基硫酸钠0.2~1.0%(质量/体积)、曲拉通1.0~4.0%(体积/体积),异硫氰酸胍0.2~1.0mol/L和100~400μg/ml的磁珠组成。
8.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,在试剂盒中,
②RNA提取溶液Ⅱ:包括4-羟乙基哌嗪乙磺酸100~300mmol/L、氯化钠100~300mmol/L,溶液Ⅱ的pH为6.5±0.2;
③RNA提取溶液Ⅲ:含曲拉通0.1~1.0%(体积/体积)和氯化钠100~300mmol/L。
9.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,在试剂盒中,
⑤RNA洗脱液:含Tris-HCl0.8~1.2mol/L和EDTA0.1~1.0mol/L;
⑦PCR反应液:包括5×PCR反应缓冲液10μl,0.2mmol/L脱氧核糖核苷三磷酸,0.2~0.4μmol/L的用于靶多核苷酸扩增的上、下游引物EV-F与EV-R,0.2~0.4μmol/L的用于靶多核苷酸检测的探针EV-P,0.1~0.2μmol/L的用于内标扩增的上、下游引物IC-F与IC-R,0.05~0.2μmol/L的用于内标检测的探针IC-P;
⑧EV酶混合液:包括mMLV酶10~150U/μl和1~10U/μl的H-Taq DNA聚合酶。
CN201210315930.7A 2012-08-30 2012-08-30 一种检测肠道病毒rna的方法及试剂盒 Active CN102816866B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201210315930.7A CN102816866B (zh) 2012-08-30 2012-08-30 一种检测肠道病毒rna的方法及试剂盒

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201210315930.7A CN102816866B (zh) 2012-08-30 2012-08-30 一种检测肠道病毒rna的方法及试剂盒

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN102816866A true CN102816866A (zh) 2012-12-12
CN102816866B CN102816866B (zh) 2014-06-25

Family

ID=47301309

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201210315930.7A Active CN102816866B (zh) 2012-08-30 2012-08-30 一种检测肠道病毒rna的方法及试剂盒

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN102816866B (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105385682A (zh) * 2015-12-29 2016-03-09 杭州谷坤生物技术有限公司 快速提取人粪便细菌dna的简易方法

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1589119A1 (en) * 2004-04-19 2005-10-26 Academisch Medisch Centrum Detection of enterovirus RNA and method for reverse transcribing RNA
WO2005100611A2 (en) * 2004-04-19 2005-10-27 Academisch Medisch Centrum Detection of viral nucleic acid and method for reverse transcribing rna
CN101701267A (zh) * 2009-11-26 2010-05-05 戴立忠 乙型肝炎病毒荧光定量pcr检测试剂盒及其应用
CN102154510A (zh) * 2011-02-25 2011-08-17 湖南圣湘生物科技有限公司 丙型肝炎病毒核酸定量检测试剂盒
CN102534051A (zh) * 2012-02-28 2012-07-04 浙江大学 一种肠道病毒检测试剂盒

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1589119A1 (en) * 2004-04-19 2005-10-26 Academisch Medisch Centrum Detection of enterovirus RNA and method for reverse transcribing RNA
WO2005100611A2 (en) * 2004-04-19 2005-10-27 Academisch Medisch Centrum Detection of viral nucleic acid and method for reverse transcribing rna
CN101701267A (zh) * 2009-11-26 2010-05-05 戴立忠 乙型肝炎病毒荧光定量pcr检测试剂盒及其应用
CN102154510A (zh) * 2011-02-25 2011-08-17 湖南圣湘生物科技有限公司 丙型肝炎病毒核酸定量检测试剂盒
CN102534051A (zh) * 2012-02-28 2012-07-04 浙江大学 一种肠道病毒检测试剂盒

Non-Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
《中国医药导刊》 20011231 朱文斯 含内标的荧光PCR-荧光定量PCR 309-310 , *
何小曼: "免疫磁珠分离技术在微生物学检测中的应用", 《中国生物制品学杂志》 *
卫生部: "《手足口病预防控制指南(2009版)》", 《手足口病预防控制指南(2009版)》 *
朱文斯: "含内标的荧光PCR—荧光定量PCR", 《中国医药导刊》 *
肖性龙: "多重荧光PCR与液相芯片高通量病原体检测体系的建立与应用", 《中国博士学位论文全文数据库》 *
肖性龙等: "内标多重荧光RT-PCR 同时检测肠道病毒71 型和柯萨奇病毒", 《微生物学报》 *
阎岩等: "磁珠法和滤膜法提取核酸在手足口病荧光", 《贵州医药》 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105385682A (zh) * 2015-12-29 2016-03-09 杭州谷坤生物技术有限公司 快速提取人粪便细菌dna的简易方法

Also Published As

Publication number Publication date
CN102816866B (zh) 2014-06-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN103725799B (zh) 一种检测风疹病毒rna的方法及试剂盒
CN111778357B (zh) 基于CRISPR/Cas12a的呼吸道合胞病毒核酸快速检测试剂盒及其检测方法
CN101701267B (zh) 乙型肝炎病毒荧光定量pcr检测试剂盒及其应用
CN102154510B (zh) 丙型肝炎病毒核酸定量检测试剂盒
CN102140558A (zh) 一种定量检测乙型肝炎病毒(hbv)的方法及其试剂盒
CN102839169B (zh) 肠道病毒rna提取试剂盒及相应提取纯化肠道病毒rna的方法
CN101684463A (zh) 微量临床样本中核酸的快速提取方法及其试剂盒
CN104846122A (zh) 肠道病毒71型和柯萨奇病毒a16型核酸检测试剂盒(荧光pcr法)
CN103060473B (zh) 一种疱疹类病毒ebv检测试剂盒
CN108624586A (zh) 一种核酸提取试剂盒及其应用方法
CN103710464B (zh) 一种丙型肝炎病毒基因型检测试剂盒
CN103757139A (zh) 犬瘟热、犬细小病毒二重TaqMan MGB荧光定量PCR检测试剂及其检测方法
CN101538619A (zh) 一种戊型肝炎病毒rna检测试剂盒
CN102851394B (zh) 一种检测肠道病毒71型rna的方法及试剂盒
CN101736078A (zh) 一种核酸等温扩增检测结核分枝杆菌活菌的方法及试剂盒
CN102367488B (zh) 肠道病毒三联实时荧光定量rt-pcr检测试剂盒
CN105177181A (zh) 检测乙型肝炎病毒的引物对和荧光探针及试剂盒
CN105420411A (zh) 一种肠道病毒通用型、柯萨奇病毒a16型、肠道病毒71型核酸荧光pcr检测试剂盒
CN105296676A (zh) 一种戊型肝炎病毒荧光定量pcr检测试剂盒及其使用方法
CN102816866B (zh) 一种检测肠道病毒rna的方法及试剂盒
CN102816867B (zh) 一种检测柯萨奇病毒a16型rna的方法及试剂盒
CN101948932B (zh) 滚环扩增加跨缺口荧光定量PCR检测乙型肝炎病毒cccDNA试剂盒
CN105368986A (zh) 一种柯萨奇病毒a16型、肠道病毒71型核酸荧光pcr检测试剂盒
CN115820818A (zh) 一种一步法核酸检测方法及其应用
CN107338326B (zh) 一种精确定量hiv dna的检测试剂盒及其检测方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
ASS Succession or assignment of patent right

Owner name: HUNAN SHENGWEIER MEDICAL INSPECTION CO., LTD.

Free format text: FORMER OWNER: HUNAN SHENGXIANG BIOLOGICAL TECHNOLOGY CO., LTD.

Effective date: 20141119

C41 Transfer of patent application or patent right or utility model
TR01 Transfer of patent right

Effective date of registration: 20141119

Address after: 410012, No. 680, Lu Song Road, Changsha hi tech Development Zone, Hunan

Patentee after: Hunan company limited of Sheng Weier medical test institute

Address before: 410012 No. 198 west slope, Tongzi hi tech Industrial Development Zone, Hunan, Changsha

Patentee before: Sansure Biotech Inc.

ASS Succession or assignment of patent right

Owner name: HUNAN SHENGXIANG BIOLOGICAL TECHNOLOGY CO., LTD.

Free format text: FORMER OWNER: HUNAN SHENGWEIER MEDICAL INSPECTION CO., LTD.

Effective date: 20150526

C41 Transfer of patent application or patent right or utility model
TR01 Transfer of patent right

Effective date of registration: 20150526

Address after: 410012, No. 680, Lu Song Road, hi tech Development Zone, Hunan, Changsha

Patentee after: Sansure Biotech Inc.

Address before: 410012, No. 680, Lu Song Road, hi tech Development Zone, Hunan, Changsha

Patentee before: Hunan company limited of Sheng Weier medical test institute

PE01 Entry into force of the registration of the contract for pledge of patent right

Denomination of invention: Method and kit for detecting EV RNA (enterovirus ribonucleic acid)

Effective date of registration: 20170711

Granted publication date: 20140625

Pledgee: Ningbo free trade zone Terry with equity investment partnership (limited partnership)|Suzhou equity equity investment center (limited partnership)|Ningbo Meishan Bonded Port District, Jun and equity investment partnership (limited partnership)|Chen Bang

Pledgor: Hunan Gene Technology Co.|Hunan San Xiang Biological Technology Co. Ltd.

Registration number: 2017430000042

PE01 Entry into force of the registration of the contract for pledge of patent right
CP03 Change of name, title or address
CP03 Change of name, title or address

Address after: 410205 Changsha province high and New Technology Industrial Development Zone, Lu Pine Road, No. 680, Hunan

Patentee after: Shengxiang Biotechnology Co., Ltd

Address before: 410012, No. 680, Lu Song Road, hi tech Development Zone, Hunan, Changsha

Patentee before: Sansure Biotech Inc.

PC01 Cancellation of the registration of the contract for pledge of patent right

Date of cancellation: 20200217

Granted publication date: 20140625

Pledgee: Suzhou Lirui equity investment center (limited partnership)|Triton equity investment partnership (limited partnership)|JUNHE Tongrui equity investment partnership (limited partnership)|Chenbang

Pledgor: SANSURE BIOTECH Inc.

Registration number: 2017430000042