CN102625708A - Pi3激酶抑制剂及其用途 - Google Patents

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拉塞尔·C·彼得
尤斯温德·辛格
阿瑟·F·克卢格
霍尔木兹·马兹迪亚斯尼
朱振东
乔立新
凯文·孔茨
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Abstract

本发明提供化合物、其组合物及其使用方法。

Description

PI3激酶抑制剂及其用途
相关申请案的交叉参考
本申请案主张2009年9月9日申请的美国临时申请案第61/240,947号和2010年8月6日申请的美国临时申请案第61/371,396号的优先权,各案的全部内容都以引用的方式并入本文中。
技术领域
本发明涉及适用作PI3激酶抑制剂的化合物。本发明也提供包含本发明化合物的医药学上可接受的组合物和使用所述组合物治疗各种病症的方法。
背景技术
近年来,对与疾病有关的酶和其它生物分子的结构的更好的了解极大地帮助了新型治疗剂的寻找。一类已成为广泛研究的目标的重要的酶为磷脂酰肌醇3-激酶超家族。
磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)属于PI3K相关激酶的大家族。PI3K使脂质分子而非蛋白质磷酸化,并因此被称为脂质激酶。具体说来,PI3K使磷脂酰肌醇的肌醇环的3′-OH位磷酸化。I类PI3K特别值得关注,并且基于序列同源性和底物特异性将其进一步分成IA类与IB类激酶。IA类PI3K含有p85调节亚单元,所述p85调节亚单元与p110α、p110β或p110δ催化亚单元形成杂二聚体。这些激酶通常称为PI3Kα、PI3Kβ和PI3Kδ且由受体酪氨酸激酶活化。IB类PI3K含有p110γ催化亚单元且通常称为PI3Kγ。PI3Kγ由杂三聚G蛋白活化。PI3Kα和PI3Kβ具有广泛的组织分布,而PI3Kδ和PI3Kγ主要在白细胞中表达。
II类和III类PI3K不如I类PI3K知名和研究充分。II类包含三种催化同功异型物:C2α、C2β和C2γ。C2α和C2β在整个身体内表达,而C2γ仅限于肝细胞。尚未鉴别出II类PI3K的调节亚单元。III类PI3K以p150调节亚单元与Vps34催化亚单元的杂二聚体形式存在,且认为其与蛋白质运输有关。
磷脂酰肌醇4-激酶(PI4K)与PI3K密切相关,其使磷脂酰肌醇的4′-OH位磷酸化。在四种已知的PI4K同功异型物中,PI4KA(也称为PI4KIIIα)与PI3K的关系最密切。
除经典PI3激酶外,还存在一组“PI3K相关激酶”,有时称为IV类PI3K。IV类PI3K含有类似于PI3K和PI4K的催化核心。PI3K超家族的这些成员为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶且包括共济失调毛细管扩张症突变型(ATM)激酶、共济失调毛细管扩张症和Rad3相关(ATR)激酶、DNA依赖性蛋白激酶(DNA-PK)和雷帕霉素(Rapamycin)的哺乳动物目标(mTOR)。
多种疾病与由如上所述的激酶介导的事件引发的异常细胞反应相关联。所述疾病包括(但不限于)自体免疫性疾病、发炎性疾病、增生性疾病、骨病、代谢疾病、神经疾病和神经退化性疾病、癌症、心血管疾病、过敏症和哮喘、阿尔茨海默氏病(Alzheimer′sdisease)和激素相关疾病。因此,仍然需要找到适用作治疗剂的PI3K和相关酶的抑制剂。
发明内容
1.本发明化合物的概述:
在某些实施例中,本发明提供一种或一种以上PI3激酶的不可逆抑制剂及其偶联物。在一些实施例中,所述化合物包括式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e的化合物:
Figure BDA0000158388020000021
Figure BDA0000158388020000031
Figure BDA0000158388020000051
或其医药学上可接受的盐,其中各变量如本文所定义和描述。
2.化合物和定义:
本发明的化合物包括上文所概述的化合物,且按本文中所揭示的类别、子类和种类进一步加以说明。除非另外指示,否则如本文所用,以下定义应适用。出于本发明的目的,化学元素是根据元素周期表,CAS版本,化学与物理手册(Handbook of Chemistry andPhysics),第75版来标识。另外,有机化学的一般原理描述于“有机化学(OrganicChemistry)”,托马斯索瑞尔(Thomas Sorrell),大学科学书籍出版社(University ScienceBooks),索萨利托(Sausalito):1999;和“马奇的高等有机化学(March′s Advanced OrganicChemistry)”,第5版,史密斯M.B.(Smith,M.B.)和马奇J.(March,J.)编,约翰威立出版公司(John Wiley & Sons),纽约(New York):2001中,这些文献的全部内容都以引用的方式并入本文中。
如本文所用的术语“脂肪族”或“脂肪族基”意谓完全饱和或含有一个或一个以上不饱和单元的取代或未取代的直链(即未具支链)或具支链烃链,或者完全饱和或含有一个或一个以上不饱和单元但不为芳香族基的单环烃或双环烃(本文中也称为“碳环”、“碳环基”、“环脂肪族基”或“环烷基”),其具有单个连接点与分子的其余部分相连接。除非另外说明,否则脂肪族基含有1-6个脂肪族碳原子。在一些实施例中,脂肪族基含有1-5个脂肪族碳原子。在其它实施例中,脂肪族基含有1-4个脂肪族碳原子。在其它实施例中,脂肪族基含有1-3个脂肪族碳原子,且在其它实施例中,脂肪族基含有1-2个脂肪族碳原子。在一些实施例中,“碳环基”(或“环脂肪族基”或“碳环”或“环烷基”)是指完全饱和或含有一个或一个以上不饱和单元但非芳香族基的单环C3-C8烃,其具有单个连接点与分子的其余部分相连接。适合的脂肪族基包括(但不限于)取代或未取代的直链或具支链烷基、烯基、炔基和其混杂基(hybrid),例如(环烷基)烷基、(环烯基)烷基或(环烷基)烯基。
如本文所用的术语“桥接双环”是指具有至少一个桥(bridge)的任何饱和或部分不饱和双环系统,即碳环或杂环。如IUPAC所定义,“桥”为连接两个桥头(bridgehead)的未具支链原子链或原子或价键,其中“桥头”为环系统中键接于三个或三个以上骨架原子(不包括氢)的任何骨架原子。在一些实施例中,桥接双环基团具有7-12个环成员和0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子。所述桥接双环基团为此项技术中众所周知的,且包括下文阐述的基团,其中各基团在任何可取代碳原子或氮原子处连接于分子的其余部分。除非另外说明,否则桥接双环基团任选经一个或一个以上如关于脂肪族基所阐述的取代基取代。或者或另外,桥接双环基团的任何可取代氮任选经取代。示范性桥接双环包括:
Figure BDA0000158388020000061
Figure BDA0000158388020000071
术语“低碳数烷基”是指C1-4直链或具支链烷基。示范性低碳数烷基为甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基和叔丁基。
术语“低碳数卤烷基”是指经一个或一个以上卤素原子取代的C1-4直链或具支链烷基。
术语“杂原子”意谓氧、硫、氮、磷或硅中的一者或一者以上(包括氮、硫、磷或硅的任何氧化形式;任何碱性氮的季铵化形式或;杂环的可取代氮,例如N(如在3,4-二氢-2H-吡咯基中)、NH(如在吡咯烷基中)或NR+(如在N-经取代的吡咯烷基中))。
如本文所用的术语“不饱和”意谓部分具有一个或一个以上不饱和单元。
如本文所用的术语“二价C1-8(或C1-6)饱和或不饱和直链或具支链烃链”是指如本文中所定义的直链或具支链二价亚烷基、亚烯基和亚炔基链。
术语“亚烷基”是指二价烷基。“亚烷基链”为聚亚甲基,即-(CH2)n-,其中n为正整数,优选为1到6、1到4、1到3、1到2、或2到3。经取代的亚烷基链为一个或一个以上亚甲基的氢原子经取代基置换的聚亚甲基。适合取代基包括下文关于经取代的脂肪族基所描述的取代基。
术语“亚烯基”是指二价烯基。经取代的亚烯基链为含有至少一个双键且一个或一个以上氢原子经取代基置换的聚亚甲基。适合取代基包括下文关于经取代的脂肪族基所描述的取代基。
如本文所用的术语“亚环丙基”是指具有以下结构的二价环丙基:
Figure BDA0000158388020000072
术语“卤素”意谓F、Cl、Br或I。
单独使用或如在“芳烷基”、“芳烷氧基”或“芳氧基烷基”中作为较大部分的一部分使用的术语“芳基”是指总共具有5到14个环成员的单环或双环系统,其中所述系统中的至少一个环为芳香族环且其中所述系统中的每个环都含有3到7个环成员。术语“芳基”与术语“芳基环”可互换使用。在本发明某些实施例中,“芳基”是指包括(但不限于)苯基、联苯、萘基、蒽基等的芳香族环系统,其可带有一个或一个以上取代基。如本文中所用,术语“芳基”的范围内也包括芳香族环与一个或一个以上非芳香族环稠合而成的基团,例如二氢茚基、邻苯二甲酰亚胺基、萘酰亚胺基、菲啶基或四氢萘基等。
单独使用或作为例如“杂芳烷基”或“杂芳烷氧基”等较大部分的一部分使用的术语“杂芳基”和“杂芳-”是指如下基团:其具有5到10个环原子,优选5、6或9个环原子;环阵列(cyclic array)中共用6、10或14个π电子;且除碳原子外,还具有1到5个杂原子。术语“杂原子”是指氮、氧或硫,且包括氮或硫的任何氧化形式和碱性氮的任何季铵化形式。杂芳基包括(但不限于)噻吩基、呋喃基、吡咯基、咪唑基、吡唑基、三唑基、四唑基、噁唑基、异噁唑基、噁二唑基、噻唑基、异噻唑基、噻二唑基、吡啶基、哒嗪基、嘧啶基、吡嗪基、吲哚嗪基、嘌呤基、萘啶基和蝶啶基。如本文所用的术语“杂芳基”和“杂芳-”也包括杂芳香族环与一个或一个以上芳基环、环脂肪族环或杂环稠合而成的基团,其中连接基团或连接点在杂芳香族环上。非限制性实例包括吲哚基、异吲哚基、苯并噻吩基、苯并呋喃基、二苯并呋喃基、吲唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、喹啉基、异喹啉基、噌啉基、酞嗪基、喹唑啉基、喹喔啉基、4H-喹嗪基、咔唑基、吖啶基、吩嗪基、吩噻嗪基、吩噁嗪基、四氢喹啉基、四氢异喹啉基和吡啶并[2,3-b]-1,4-噁嗪-3(4H)-酮。杂芳基可为单环或双环的。术语“杂芳基”与术语“杂芳基环”或“杂芳香族基”可互换使用,其中任一术语都包括任选取代的环。术语“杂芳烷基”是指经杂芳基取代的烷基,其中烷基和杂芳基部分独立地任选经取代。
如本文所用的术语“杂环”与“杂环基”可互换使用,且是指饱和或部分不饱和且除碳原子外还具有一个或一个以上、优选1到4个如上所定义的杂原子的稳定5到7元单环或7-10元双环杂环部分。当关于杂环的环原子而使用时,术语“氮”包括经取代的氮。举例来说,在具有0-3个选自氧、硫或氮的杂原子的饱和或部分不饱和环中,氮可为N(如在3,4-二氢-2H-吡咯基中)、NH(如在吡咯烷基中)或+NR(如在N-经取代的吡咯烷基中)。
杂环可在任何杂原子或碳原子处连接于其侧基,由此产生稳定结构,且任何环原子都可任选经取代。所述饱和或部分不饱和杂环基的实例包括(但不限于)四氢呋喃基、四氢噻吩基、吡咯烷基、哌啶基、吡咯啉基、四氢喹啉基、四氢异喹啉基、十氢喹啉基、噁唑烷基、哌嗪基、二噁烷基、二氧戊环基、二氮杂卓基(diazepinyl)、氧氮杂卓基(oxazepinyl)、硫氮杂卓基、吗啉基和奎宁环基。术语“杂环”、“杂环基”和“杂环部分”在本文中可互换使用,且也包括杂环与一个或一个以上芳基环、杂芳基环或环脂肪族环稠合而成的基团,例如吲哚啉基、3H-吲哚基、色满基、菲啶基或四氢喹啉基,其中连接基团或连接点在杂环上。杂环基可为单环或双环的。术语“杂环基烷基”是指经杂环基取代的烷基,其中烷基和杂环基部分独立地任选经取代。
如本文所用的术语“部分不饱和”是指环部分包括至少一个双键或三键。术语“部分不饱和”意图涵盖具有多个不饱和位点的环,但不打算包括如本文中所定义的芳基或杂芳基部分。
如本文所述,本发明的化合物可含有“任选取代”的部分。一般说来,术语“经取代”前面无论是否存在术语“任选”,都意谓指定部分的一个或一个以上氢经适合取代基置换。除非另外指示,否则“任选取代”的基团可在此基团的每个可取代位置处都具有适合取代基,且当任何既定结构中的超过一个位置可经超过一个选自指定群组的取代基取代时,每个位置处的取代基可相同或不同。本发明预想的取代基组合优选为会形成稳定或化学上可行的化合物的取代基组合。如本文所用的术语“稳定”是指化合物在经历允许其制备、检测以及在某些实施例中允许其回收、纯化以及用于一个或一个以上本文中所揭示的目的的条件时实质上不发生改变。
“任选取代”的基团的可取代碳原子上的适合单价取代基独立地为卤素;-(CH2)0-4R°;-(CH2)0-4OR°;-O(CH2)0-4R°、-O-(CH2)0-4C(O)OR°;-(CH2)0-4CH(OR°)2;-(CH2)0-4SR°;-(CH2)0-4Ph,其可经R°取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1Ph,其可经R°取代;-CH=CHPh,其可经R°取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1-吡啶基,其可经R°取代;-NO2;-CN;-N3;-(CH2)0-4N(R°)2;-(CH2)0-4N(R°)C(O)R°;-N(R°)C(S)R°;-(CH2)0-4N(R°)C(O)NR°2;-N(R°)C(S)NR°2;-(CH2)0-4N(R°)C(O)OR°;-N(R°)N(R°)C(O)R°;-N(R°)N(R°)C(O)NR°2;-N(R°)N(R°)C(O)OR°;-(CH2)0-4C(O)R°;-C(S)R°;-(CH2)0-4C(O)OR°;-(CH2)0-4C(O)SR°;-(CH2)0-4C(O)OSiR°3;-(CH2)0-4OC(O)R°;-OC(O)(CH2)0-4SR-、SC(S)SR°;-(CH2)0-4SC(O)R°;-(CH2)0-4C(O)NR°2;-C(S)NR°2;-C(S)SR°;-SC(S)SR°、-(CH2)0-4OC(O)NR°2;-C(O)N(OR°)R°;-C(O)C(O)R°;-C(O)CH2C(O)R°;-C(NOR°)R°;-(CH2)0-4SSR°;-(CH2)0-4S(O)2R°;-(CH2)0-4S(O)2OR°;-(CH2)0-4OS(O)2R°;-S(O)2NR°2;-(CH2)0-4S(O)R°;-N(R°)S(O)2NR°2;-N(R°)S(O)2R°;-N(OR°)R°;-C(NH)NR°2;-P(O)2R°;-P(O)R°2;-OP(O)R°2;-OP(O)(OR°)2;SiR°3;-(C1-4直链或具支链亚烷基)O-N(R°)2;或-(C1-4直链或具支链亚烷基)C(O)O-N(R°)2,其中各R°可如下文所定义经取代且独立地为氢、C1-6脂肪族基、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph、-CH2-(5-6元杂芳基环)或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和环、部分不饱和环或芳基环,或不管以上定义,两个R°在独立出现时连同其插入原子一起形成具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-12元饱和单环或双环、部分不饱和单环或双环或芳基单环或双环,所述环可如下文所定义经取代。
R°(或由两个R°在独立出现时连同其插入原子一起形成的环)上的适合单价取代基独立地为卤素、-(CH2)0-2R·、-(卤基R·)、-(CH2)0-2OH、-(CH2)0-2OR·、-(CH2)0-2CH(OR·)2;-O(卤基R·)、-CN、-N3、-(CH2)0-2C(O)R·、-(CH2)0-2C(O)OH、-(CH2)0-2C(O)OR·、-(CH2)0-2SR·、-(CH2)0-2SH、-(CH2)0-2NH2、-(CH2)0-2NHR·、-(CH2)0-2NR· 2、-NO2、-SiR· 3、-OSiR· 3、-C(O)SR·、-(C1-4直链或具支链亚烷基)C(O)OR·或-SSR·,其中各R·未经取代或在前面有“卤基”的情况下仅经一个或一个以上卤素取代,且独立地选自C1-4脂肪族基、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和环、部分不饱和环或芳基环。R°的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O和=S。
“任选取代”的基团的饱和碳原子上的适合二价取代基包括以下:=O(“氧代基”)、=S、=NNR* 2、=NNHC(O)R*、=NNHC(O)OR*、=NNHS(O)2R*、=NR*、=NOR*、-O(C(R* 2))2-3O-或-S(C(R* 2))2-3S-,其中各R*在独立出现时选自氢、可如下文所定义经取代的C1-6脂肪族基,或未取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和环、部分不饱和环或芳基环。与“任选取代”的基团的邻位可取代碳结合的适合二价取代基包括:-O(CR* 2)2-3O-,其中各R*在独立出现时选自氢、可如下文所定义经取代的C1-6脂肪族基,或未取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和环、部分不饱和环或芳基环。
R*的脂肪族基上的适合取代基包括卤素、-R·、-(卤基R·)、-OH、-OR·、-O(卤基R·)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR·、-NH2、-NHR·、-NR· 2或-NO2,其中各R·未经取代或在前面有“卤基”的情况下仅经一个或一个以上卤素取代,且独立地为C1-4脂肪族基、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和环、部分不饱和环或芳基环。
“任选取代”的基团的可取代氮上的适合取代基包括
Figure BDA0000158388020000101
Figure BDA0000158388020000102
Figure BDA0000158388020000103
Figure BDA0000158388020000104
Figure BDA0000158388020000105
Figure BDA0000158388020000106
Figure BDA0000158388020000108
、 
Figure BDA00001583880200001010
Figure BDA00001583880200001011
,其中各自独立地为氢、可如下文所定义经取代的C1-6脂肪族基、未取代的-OPh,或未取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和环、部分不饱和环或芳基环,或不管以上定义,两个在独立出现时连同其插入原子一起形成未取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-12元饱和单环或双环、部分不饱和单环或双环或芳基单环或双环。
Figure BDA0000158388020000111
的脂肪族基上的适合取代基独立地为卤素、-R·、-(卤基R·)、-OH、-OR·、-O(卤基R·)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR·、-NH2、-NHR·、-NR· 2或-NO2,其中各R·未经取代或在前面有“卤基”的情况下仅经一个或一个以上卤素取代,且独立地为C1-4脂肪族基、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph,或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和环、部分不饱和环或芳基环。
如本文所用的术语“医药学上可接受的盐”是指在合理医学判断的范围内,适于与人类和低等动物的组织接触使用而没有不当毒性、刺激、过敏反应等,且与合理效益/风险比相称的盐。医药学上可接受的盐为此项技术中众所周知的。举例来说,S.M.伯格(S.M.Berge)等人在医药科学杂志(J.Pharmaceutical Sciences),1977,66,1-19(以引用的方式并入本文)中详细描述了医药学上可接受的盐。本发明化合物的医药学上可接受的盐包括衍生自适合无机酸和有机酸以及无机碱和有机碱的盐。医药学上可接受的无毒酸加成盐的实例为氨基与例如盐酸、氢溴酸、磷酸、硫酸和过氯酸等无机酸形成的盐,或者与例如乙酸、草酸、顺丁烯二酸、酒石酸、柠檬酸、丁二酸或丙二酸等有机酸形成的盐,或通过使用此项技术中所使用的其它方法(例如离子交换)形成的盐。其它医药学上可接受的盐包括己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙烷磺酸盐、甲酸盐、反丁烯二酸盐、葡庚糖酸盐、甘油磷酸盐、葡糖酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢碘酸盐、2-羟基-乙烷磺酸盐、乳糖酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、顺丁烯二酸盐、丙二酸盐、甲烷磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、磷酸盐、特戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、丁二酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、对甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等。
衍生自适当碱的盐包括碱金属盐、碱土金属盐、铵盐和N+(C1-4烷基)4盐。代表性碱金属盐或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等。适当时,其它医药学上可接受的盐包括无毒铵、季铵以及使用例如卤离子、氢氧根、羧酸根、硫酸根、磷酸根、硝酸根、低碳数烷基磺酸根和芳基磺酸根等平衡离子所形成的胺阳离子。
除非另外说明,否则本文中所描绘的结构也意图包括此结构的所有异构(例如对映异构、非对映异构和几何(或构象)异构)形式;例如关于各不对称中心的R和S构型、Z和E双键异构体以及Z和E构象异构体。因此,本发明化合物的单一立体化学异构体以及对映异构体、非对映异构体和几何(或构象)异构体混合物在本发明的范围内。除非另外说明,否则本发明化合物的所有互变异构形式都在本发明的范围内。另外,除非另外说明,否则本文所描绘的结构也意图包括不同之处仅在于存在一个或一个以上富集同位素的原子的化合物。举例来说,具有本发明结构且包括以氘或氚置换氢或以富集13C或14C的碳置换碳的化合物在本发明的范围内。所述化合物适用作例如分析工具、生物分析中的探针或本发明的治疗剂。在某些实施例中,所提供化合物的弹头部分R1包含一个或一个以上氘原子。
如本文所用的术语“不可逆”或“不可逆抑制剂”是指能够以实质上不可逆的方式共价键接于PI3激酶的抑制剂(即化合物)。也就是说,可逆抑制剂能够与PI3激酶结合(但一般不能形成共价键),因此可与PI3激酶解离,而不可逆抑制剂一旦形成共价键,就会保持实质上结合于PI3激酶。不可逆抑制剂通常显示时间相关性,由此抑制程度随着抑制剂与酶接触的时间而增加。在某些实施例中,不可逆抑制剂一旦形成共价键就会保持实质上结合于PI3激酶,且保持结合的时间长于蛋白质的寿命。
所属领域技术人员已知鉴别化合物是否充当不可逆抑制剂的方法。所述方法包括(但不限于)化合物对PI3激酶的抑制特征的酶动力学分析;对在抑制剂化合物存在下修饰的蛋白质药物目标使用质谱分析;不连续暴露(也称为“洗脱(washout)”)实验;和使用标记,例如经放射性标记的抑制剂,以显示酶的共价修饰;以及所属领域技术人员已知的其它方法。
所属领域技术人员应认识到,某些反应性官能团可充当“弹头(warhead)”。如本文所用的术语“弹头”或“弹头基”是指一种存在于本发明化合物上的官能团,其中此官能团能够共价结合于目标蛋白质的结合袋中存在的氨基酸残基(例如半胱氨酸、赖氨酸、组氨酸或其它能够经共价修饰的残基),由此不可逆地抑制所述蛋白质。应了解,如本文所定义和描述的-L-Y基团提供所述弹头基用于共价且不可逆地抑制蛋白质。
如本文所用的术语“抑制剂”定义为以可测量的亲和力结合于和/或抑制PI3激酶的化合物。在某些实施例中,抑制剂的IC50和/或结合常数小于约50μM,小于约1μM,小于约500nM,小于约100nM,小于约10nM或小于约1nM。
如本文所用的术语“可测量的亲和力”和“可测量地抑制”意谓在包含本发明化合物或其组合物和PI3激酶的样品与缺乏所述化合物或其组合物的包含PI3激酶的同等样品之间PI3激酶活性的可测量的变化。
3.示范性实施例的描述:
如本文所述,本发明提供一种或一种以上PI3激酶的不可逆抑制剂。包含指定为R1的弹头基的所述化合物包括如本文所述的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e的化合物。不希望受任何特定理论束缚,相信所述R1基团(即弹头基)特别适于共价结合于PI3激酶的结合结构域中的关键半胱氨酸残基。所属领域技术人员应了解,PI3激酶和其突变体(包括(但不限于)Glu542、Glu545和His1047(萨姆斯(Samuels)等人,科学(Science)(2004)304:552))的结合结构域中具有半胱氨酸残基。不希望受任何特定理论束缚,相信弹头基接近相关半胱氨酸会有利于弹头基对所述半胱氨酸进行共价修饰。
作为由本发明的不可逆抑制剂进行共价修饰的目标的PI3激酶家族成员的半胱氨酸残基包括下表1中所概述的半胱氨酸残基,其中“目标”是指相关蛋白质;“序列代号”是指根据瑞士生物信息学研究所(the Swiss Institute of Bioinformatics)的ExPASy蛋白质组研究服务器(www.expasy.org)的残基编号方案;“序列”是指包括相关半胱氨酸的目标氨基酸序列的标识部分;且“残基编号”是指如序列代号中所阐述的半胱氨酸残基编号。
表1.
Figure BDA0000158388020000131
如由上表1显而易见,相关半胱氨酸残基也可通过包括相关半胱氨酸的目标氨基酸序列的标识部分来描述。因此,在某些实施例中,一个或一个以上以下特征适用:
PI3K-α的Cys862的特征在于Cys862为嵌入PI3K-α的氨基酸序列QCKGGLKGALQFNSHTLHQW中的半胱氨酸;
MTOR的Cys2243的特征在于Cys2243为嵌入MTOR的氨基酸序列PHCDTLHALIRDYREKKKIL中的半胱氨酸;
PI3K-α的Cys838的特征在于Cys838为嵌入PI3K-α的氨基酸序列LPYGCLS中的半胱氨酸;
PI3K-γ的Cys869的特征在于Cys869为嵌入PI3K-γ的氨基酸序列LPYGCI S中的半胱氨酸;
PI3K-δ的Cys815的特征在于Cys815为嵌入PI3K-δ的氨基酸序列TPYGCLP中的半胱氨酸;
1A类PI3K-β的Cys841的特征在于Cys841为嵌入1A类PI3K-β的氨基酸序列LPYGCLA中的半胱氨酸;
2类PI3K-β的Cys1119的特征在于Cys1119为嵌入2类PI3K-β的氨基酸序列VIFRCFS中的半胱氨酸;
DNA-PK的Cys3683的特征在于Cys3683为嵌入DNA-PK的氨基酸序列NKDSKPPGNL KECSPWMSDF中的半胱氨酸;
ATM-激酶的Cys2770的特征在于Cys2770为嵌入ATM-激酶的氨基酸序列SQRSGVLEWCTGTVPIGEFL中的半胱氨酸;
ATM-激酶的Cys2753的特征在于Cys2770为嵌入ATM-激酶的氨基酸序列RNTETRKRKLTICTYKVVPL中的半胱氨酸;
PI4KA的Cys1840的特征在于Cys1840为嵌入PI4KA的氨基酸序列TAPGCGVIECIPDCTSRDQL中的半胱氨酸;
PI4KA的Cys1844的特征在于Cys1844为嵌入PI4KA的氨基酸序列TAPGCGVIECIPDCTSRDQL中的半胱氨酸;和/或
PI4KA的Cys1797的特征在于Cys1797为嵌入PI4KA的氨基酸序列GQKISWQAAIFKVGDDCRQD中的半胱氨酸。
另外,应了解某些半胱氨酸残基在PI3激酶家族成员中为保守的。所述半胱氨酸残基以Cys群组表示,如下表1-a中所阐述。因此,出于清楚的目的,下表1-a例示说明保守性半胱氨酸残基的分组。
表1-a.
在某些实施例中,本发明的化合物包括特征在于所提供的化合物共价修饰PI3-激酶α的Cys862残基,由此不可逆地抑制PI3激酶-α的弹头基。
在一些实施例中,本发明的化合物包括特征在于所提供的化合物共价修饰以下一者或一者以上的弹头基:PI3K-α的Cys862、MTOR的Cys2243、PI3K-α的Cys838、PI3K-γ的Cys869、PI3K-δ的Cys815、1A类PI3K-β的Cys841、2类PI3K-β的Cys1119、DNA-PK的Cys3683、ATM-激酶的Cys2770、ATM-激酶的Cys2753、PI4KA的Cys1840、PI4KA的Cys1844或PI4KA的Cys1797。
鉴别在PI3K家族成员中的保守半胱氨酸。具体说来,PI3Kγ的Cys869对应于PI3Kα的Cys838、PI3Kδ的Cys815、1类PI3Kβ的Cys841和2类PI3Kβ的Cys1119。在某些实施例中,本发明的化合物包括特征在于所提供的化合物靶向以下每一者由此不可逆地抑制这些激酶中每一者的弹头基:PI3Kγ的Cys869、PI3Kα的Cys838、PI3Kδ的Cys815、1类PI3Kβ的Cys841和2类PI3Kβ的Cys1119。
因此,在一些实施例中,R1弹头基的特征在于如下文所定义和描述的-L-Y部分能够共价结合于半胱氨酸残基,由此不可逆地抑制酶。在某些实施例中,半胱氨酸残基为PI3激酶α的Cys862残基。在一些实施例中,半胱氨酸残基为以下任一者:PI3K-α的Cys862、MTOR的Cys2243、PI3K-α的Cys838、PI3K-γ的Cys869、PI3K-δ的Cys815、1A类PI3K-β的Cys841、2类PI3K-β的Cys1119、DNA-PK的Cys3683、ATM-激酶的Cys2770、ATM-激酶的Cys2753、PI4KA的Cys1840、PI4KA的Cys1844或PI4KA的Cys1797。在其它实施例中,半胱氨酸残基为以下任一者:PI3Kγ的Cys869、PI3Kα的Cys838、PI3Kδ的Cys815、1类PI3Kβ的Cys841或2类PI3Kβ的Cys1119。所属领域技术人员应认识到,如本文中所定义的多种弹头基适于此共价键接。所述R1基团包括(但不限于)本文中所描述和下表4中所描绘的基团。
在某些实施例中,本发明提供包含一个或一个以上具有半胱氨酸残基CysX的PI3激酶的偶联物,其中CysX共价且不可逆地键接于抑制剂,从而维持对PI3激酶的抑制,其中CysX选自PI3K-α的Cys862、MTOR的Cys2243、PI3K-α的Cys838、PI3K-γ的Cys869、PI3K-δ的Cys815、1A类PI3K-β的Cys841、2类PI3K-β的Cys1119、DNA-PK的Cys3683、ATM-激酶的Cys2770、ATM-激酶的Cys2753、PI4KA的Cys1840、PI4KA的Cys1844或PI4KA的Cys1797。
在某些实施例中,本发明提供一种式C的偶联物:
                  CysX-修饰剂(modifier)-抑制剂部分
                                 C
其中:
CysX选自PI3K-α的Cys862、MTOR的Cys2243、PI3K-α的Cys838、PI3K-γ的Cys869、PI3K-δ的Cys815、1A类PI3K-β的Cys841、2类PI3K-β的Cys1119、DNA-PK的Cys3683、ATM-激酶的Cys2770、ATM-激酶的Cys2753、PI4KA的Cys1840、PI4KA的Cys1844或PI4KA的Cys1797;
修饰剂为由弹头基与PI3激酶的CysX共价键接所得到的二价基团;
弹头基为能够共价结合于CysX的官能团;且
抑制剂部分为在PI3激酶的活性位点结合的部分。
在某些实施例中,本发明提供一种包含具有半胱氨酸残基Cys862的PI3K-α的偶联物,其中Cys862共价且不可逆地键接于抑制剂,从而维持对PI3K-α的抑制。
在某些实施例中,本发明提供一种式C-1的偶联物:
                      Cys862-修饰剂-抑制剂部分
                                C-1
其中:
Cys862为PI3K-α的Cys862;
修饰剂为由弹头基与PI3K-α的Cys862共价键接所得到的二价基团;
弹头基为能够共价结合于Cys862的官能团;且
抑制剂部分为在PI3K-α的活性位点结合的部分。
在一些实施例中,本发明提供一种包含具有半胱氨酸残基的PI3激酶的偶联物,其中所述半胱氨酸为保守半胱氨酸,其为PI3Kγ的Cys869、PI3Kα的Cys838、PI3Kδ的Cys815、1类PI3Kβ的Cys841或2类PI3Kβ的Cys1119。在某些实施例中,本发明提供一种式C-2的偶联物:
                     CysX1-修饰剂-抑制剂部分
                                C-2
其中:
CysX1为以下任一者或一者以上:PI3Kγ的Cys869、PI3Kα的Cys838、PI3Kδ的Cys815、1类PI3Kβ的Cys841或2类PI3Kβ的Cys1119;
修饰剂为由弹头基与PI3激酶的CysX1共价键接所得到的二价基团;
弹头基为能够共价结合于CysX1的官能团;且
抑制剂部分为在PI3激酶的活性位点结合的部分。
在某些实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式I-i:
其中波状键指示经由修饰剂连接偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式I-i的环A1、环B1、T1、R2、R3、q和r基团各自如下文关于式I所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在其它实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式II-i、II-i-a、II-i-b、II-i-c、II-i-d、II-i-e或II-i-f:
Figure BDA0000158388020000172
Figure BDA0000158388020000181
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式II-i-a、II-i-b、II-i-c、II-i-d、II-i-e、II-i-f、II-i-g和II-i-h的X2、Y2、Z2
Figure BDA0000158388020000182
环A2、环B2、环C1、环C2、环D2、T2、T3、R4和R5基团各自如下文关于式II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g和II-h所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式II-i-c和II-i-d的化合物特别对PI3Kγ的Cys869有选择性。在某些实施例中,式II-i-c和II-i-d的化合物为泛PI3K抑制剂。
在其它实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式III-i:
Figure BDA0000158388020000183
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式III-i的环A3、X、R6、R7和R8基团各自如下文关于式III所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在其它实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式IV-i:
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式IV-i的X、R9、R10和R11基团各自如下文关于式IV所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在其它实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式V-i-a或V-i-b:
Figure BDA0000158388020000192
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式V-i-a和V-i-b的环A5、环B5、R12、R13、R14和n基团各自如下文关于式V-a和V-b所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在其它实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式VI-i-a或VI-i-b:
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式VI-i-a和VI-i-b的环A6、R15、R16和R17基团各自如下文关于式VI-a和VI-b所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式VII-i:
Figure BDA0000158388020000202
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式VII-i的环A7、环B7、环C7、环D7、T7和R18基团各自如下文关于式VII所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式VIII-i:
Figure BDA0000158388020000211
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式VIII-i的环A8、环B8、环C8、环D8、T8、R19和R20基团各自如下文关于式VIII所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式IX-i:
Figure BDA0000158388020000212
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式IX-i的环A9、T9、R24、R25和z基团各自如下文关于式IX所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式X-i:
Figure BDA0000158388020000221
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式X-i的环A10、环B10、环C10、T10、R21、R22和k基团各自如下文关于式X所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式XI-i:
Figure BDA0000158388020000222
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式XI-i的X11、环A11、环B11、环C11、T11、R23和w基团各自如下文关于式XI所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,偶联物C、C-1或C-2中任一者的抑制剂部分具有式XII-i:
Figure BDA0000158388020000231
其中波状键指示连接到偶联物C的CysX、偶联物C-1的Cys862或偶联物C-2的CysX1的连接点,且其中式XII-i、XII-i-a、XII-i-b、XII-i-c、XII-i-d和XII-i-e的环A8、环B8、环C8、环D8、T8、R19和R20基团各自如下文关于式XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-I-a、C-I-b和C-I-c中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000241
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A1、环B1、T1、R2、R3、q和r基团各自如下文关于式I所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-II-1、C-II-a-1、C-II-b-1、C-II-c-1、C-II-d-1、C-II-e-1、C-II-f-1、C-II-g-1、C-II-h-1、C-II-2、C-II-a-2、C-II-b-2、C-II-c-2、C-II-d-2、C-II-e-2、C-II-f-2、C-II-g-2、C-II-h-2、C-II-3、C-II-a-3、C-II-b-3、C-II-c-3、C-II-d-3、C-II-e-3、C-II-f-3、C-II-g-3和C-II-h-3中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000242
Figure BDA0000158388020000251
Figure BDA0000158388020000261
Figure BDA0000158388020000271
Figure BDA0000158388020000281
Figure BDA0000158388020000291
其中CysX、Cys862、Cys869和CysX1各自如本文所述,且所述偶联物的修饰剂、X2、Y2、Z2、环A2、环B2、环C1、环C2、环D2、T2、T3、R4和R5基团各自如下文关于式II-a、II-b、II-c、II-d、II-e和II-f所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-III-a、C-III-b和C-III-c中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000292
Figure BDA0000158388020000301
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A3、X、R6、R7和R8基团各自如下文关于式III所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-IV-a、C-IV-b和C-IV-c中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000302
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、X、R9、R10和R11基团各自如下文关于式IV所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在一些实施例中,本发明提供式C-V-a-1、C-V-b-1、C-V-a-2、C-V-b-2、C-V-a-3和C-V-b-3中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000311
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A5、环B5、R12、R13、R14和n基团各自如下文关于式V-a和V-b所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在一些实施例中,本发明提供式C-VI-a-1、C-VI-b-1、C-VI-a-2、C-VI-b-2、C-VI-a-3和C-VI-b-3中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000322
Figure BDA0000158388020000331
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A6、R15、R16和R17基团各自如下文关于式VI-a和VI-b所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-VII-a、C-VII-b和C-VII-c中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000341
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A7、环B7、环C7、环D7、T7和R18基团各自如下文关于式VII所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-VIII-a、C-VIII-b和C-VIII-c中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000342
Figure BDA0000158388020000351
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A8、环B8、环C8、环D8、T8、R19和R20基团各自如下文关于式VIII所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-IX-a、C-IX-b和C-IX-c中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000352
Figure BDA0000158388020000361
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A9、T9、R24、R25和z基团各自如下文关于式IX所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-X-a、C-X-b和C-X-c中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000362
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A10、环B10、环C10、T10、R21、R22和k基团各自如下文关于式X所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-XI-a、C-XI-b和C-XI-c中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000381
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、X11、环A11、环B11、环C11、T11、R23和w基团各自如下文关于式XI所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式C-XII-1、C-XII-a-1、C-XII-b-1、C-XII-c-1、C-XII-d-1、C-XII-e-1、C-XII-2、C-XII-a-2、C-XII-b-2、C-XII-c-2、C-XII-d-2、C-XII-e-2、C-XII-3、C-XII-a-3、C-XII-b-3、C-XII-c-3、C-XII-d-3和C-XII-e-3中任一者的偶联物:
Figure BDA0000158388020000382
Figure BDA0000158388020000391
Figure BDA0000158388020000401
Figure BDA0000158388020000411
Figure BDA0000158388020000421
其中CysX、Cys862和CysX1各自如本文中所述,且所述偶联物的修饰剂、环A12、环B12、环C12、环D12、T12和T13基团各自如下文关于式XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在其它实施例中,偶联物C、C-1、C-2、C-I-a、C-I-b、C-I-c、C-II-1、C-II-a-1、C-II-b-1、C-II-c-1、C-II-d-1、C-II-e-1、C-II-f-1、C-II-g-1、C-II-h-1、C-II-2、C-II-a-2、C-II-b-2、C-II-c-2、C-II-d-2、C-II-e-2、C-II-f-2、C-II-g-2、C-II-h-2、C-II-3、C-II-a-3、C-II-b-3、C-II-c-3、C-II-d-3、C-II-e-3、C-II-f-3、C-II-g-3、C-II-h-3、C-III-a、C-III-b、C-III-c、C-IV-a、C-IV-b、C-IV-c、C-V-a-1、C-V-b-1、C-V-a-2、C-V-b-2、C-V-a-3、C-V-b-3、C-VI-a-1、C-VI-b-1、C-VI-a-2、C-VI-b-2、C-VI-a-3、C-VI-b-3、C-VII-a、C-VII-b、C-VII-c、C-VIII-a、C-VIII-b、C-VIII-c、C-IX-a、C-IX-b、C-IX-c、C-X-a、C-X-b、C-X-c、C-XI-a、C-XI-b、C-XI-c、C-XII-1、C-XII-a-1、C-XII-b-1、C-XII-c-1、C-XII-d-1、C-XII-e-1、C-XII-2、C-XII-a-2、C-XII-b-2、C-XII-c-2、C-XII-d-2、C-XII-e-2、C-XII-3、C-XII-a-3、C-XII-b-3、C-XII-c-3、C-XII-d-3和C-XII-e-3中任一者的修饰部分选自下表2中所阐述的修饰部分。示范性修饰剂进一步包括由表3或表4中所见的弹头部分与PI3激酶的半胱氨酸共价键接所得到的任何二价基团。应了解,以下示范性修饰剂显示为与CysX的氢硫基偶联的形式。
表2.与CysX偶联的示范性修饰剂:
Figure BDA0000158388020000431
Figure BDA0000158388020000441
Figure BDA0000158388020000451
在某些实施例中,本发明提供式I化合物:
Figure BDA0000158388020000452
或其医药学上可接受的盐,其中:
环A1为任选取代的选自以下的基团:8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环B1选自苯基、3-8元饱和或部分不饱和碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R1为弹头基;
T1为二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
q和r各自独立地为0-4;且
R2和R3各自独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
在某些实施例中,式I的环A1基团为任选取代的选自以下的基团:8-10元双环芳基环或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环A1为任选取代的具有2-4个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一个实施例中,环A1为9H-嘌呤基。
在某些实施例中,式I的环B1基团为任选取代的选自以下的基团:苯基、3-8元饱和或部分不饱和碳环,或具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环B1为任选取代的苯基。
在某些实施例中,式I的T1基团为二价具支链C1-6烃链,其中T1的一个或一个以上亚甲基单元经-O-、-S-或-N(R)-置换。在一些实施例中,T为二价直链C1-6烃链,其中T1的一个或一个以上亚甲基单元经-O-、-S-或-N(R)-置换。
在某些实施例中,本发明提供式II化合物:
Figure BDA0000158388020000471
或其医药学上可接受的盐,其中:
X2为CH或N;
Y2和Z2在价数允许时独立地为CR4、C、NR5、N、O或S;
Figure BDA0000158388020000472
在价数允许时表示单键或双键;
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R5为-R、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R或-C(O)N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当环C1不存在时,T3直接连接于T2。另外,应了解,当环D2不存在时,R1直接连接于T3
在某些实施例中,Y2为S且Z2为CR4。在某些实施例中,Y2为CR4且Z2为S。在某些实施例中,Y2为N且Z2为NR5。在某些实施例中,Y2为NR5且Z2为N。
在某些实施例中,本发明提供式II-a或II-b的化合物:
Figure BDA0000158388020000481
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当环C1不存在时,T3直接连接于T2。另外,应了解,当环D2不存在时,R1直接连接于T3
在某些实施例中,式II-a或II-b的环B2基团为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B2为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B2为1H-吲唑基、苯并咪唑基或吲哚基。在某些实施例中,环B2为1H-吲唑基。在某些实施例中,环B2基团为取代或未取代的苯基。在某些实施例中,环B2为经取代的苯基。在某些实施例中,环B2为苯酚。在一些实施例中,环B2为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在一些实施例中,环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环B2为吡啶基。在某些实施例中,环B2为任选取代的嘧啶基。在某些实施例中,环B2
Figure BDA0000158388020000501
在某些实施例中,式II-a或II-b的环A2基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A2为任选取代的吗啉基。在某些实施例中,环A2为未取代的吗啉基。在一些实施例中,环A2为任选取代的四氢吡喃基。在某些实施例中,A2为:
Figure BDA0000158388020000502
在某些实施例中,环A2为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A2为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A2为桥接双环N-吗啉基。在某些实施例中,A2为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020000511
在某些实施例中,环A2具有下式:
Figure BDA0000158388020000512
其中:
v、j、p和g独立地为1、2或3。
在一些实施例中,环A2为任选取代的选自以下的(稠合或螺稠合)双环:
Figure BDA0000158388020000513
在某些实施例中,式II-a或II-b的T2基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T2为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T2为-CH2-或-CH2CH2-。在其它实施例中,T2为-C(O)-。在某些实施例中,T2为-C≡C-或-CH2C≡C-。在某些实施例中,T2为共价键。在一些实施例中,T2为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。在某些实施例中,T2为C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
在某些实施例中,式II-a或II-b的环C1基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C1为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环C1为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C1为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C1为苯基。在一些实施例中,环C1为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C1为环己基。在某些实施例中,环C1不存在。在一些实施例中,环C1为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,式II-a或II-b的T3基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T3为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T3为-CH2-或-CH2CH2-。在某些实施例中,T3为-C(O)-。在某些实施例中,T3为共价键。
在某些实施例中,式II-a或II-b的环D2基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环D2为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环D2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环D2为四氢吡啶基。在一些实施例中,环D2为苯基。在一些实施例中,环D2为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环D2为环己基。在某些实施例中,环D2不存在。在一些实施例中,环D2为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a1)R1选自本文所述的实施例;
b1)环A2选自上文关于式II-a和II-b所述的实施例;
c1)环B2选自上文关于式II-a和II-b所述的实施例;
d1)T2选自上文关于式II-a和II-b所述的实施例;
e1)环C1选自上文关于式II-a和II-b所述的实施例;
f1)T3选自上文关于式II-a和II-b所述的实施例;和
g1)环D2选自上文关于式II-a和II-b所述的实施例。
在一些实施例中,式II-a或II-b的
Figure BDA0000158388020000521
Figure BDA0000158388020000522
在一些实施例中,在一些实施例中,
Figure BDA0000158388020000525
在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a2)环A2为任选取代的吗啉基;
b2)环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
Figure BDA0000158388020000531
Figure BDA0000158388020000532
Figure BDA0000158388020000533
Figure BDA0000158388020000534
包含具有约9到约11个原子的如本文所定义的间隔基。在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a2)、b2)、c2)和d2),以及e2)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a3)环A2为任选取代的吗啉基;
b3)环B2为任选取代的选自吲唑基、氨基嘧啶基或苯酚的基团:
Figure BDA0000158388020000535
Figure BDA0000158388020000536
Figure BDA0000158388020000537
Figure BDA0000158388020000538
包含具有约9到约11个原子的间隔基。在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a3)、b3)、c3)和d3),以及e3)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a4)环A2为任选取代的吗啉基;
b4)环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
c4)T2为共价键、亚甲基或C3-5烃链,其中T2的两个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d4)环C1为苯基,或任选取代的具有1-2个氮的6元饱和杂环、部分不饱和杂环或芳香族杂环;
e4)T3为共价键、-C(O)-;和
f4)环D2不存在或为苯基。
在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a4)、b4)、c4)、d4)、e4)和f4),以及g4)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a5)环A2为任选取代的吗啉基;
b5)环B2为任选取代的选自吲唑基、苯酚或氨基嘧啶的基团:
c5)T2为共价键、亚甲基或C4烃链,其中T2的两个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d5)环C1为苯基、哌嗪基、哌啶基或四氢吡啶基;
e5)T3为共价键或-C(O)-;和
f5)环D2不存在或为苯基。
在一些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a5)、b5)、c5)、d5)、e5)和f5),以及g5)R1选自本文所述的实施例。
在某些实施例中,所提供的式II-a或II-b的化合物具有以下结构中一者:
Figure BDA0000158388020000541
Figure BDA0000158388020000551
Figure BDA0000158388020000571
在某些实施例中,本发明提供式II-a-i或II-b-i的化合物:
Figure BDA0000158388020000572
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1、R4、R、环B2和T2如上文关于式II-a和II-b所定义且如本文中的类别和子类中所述;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环;且
环C1不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
在一些实施例中,本发明提供式II-c或II-d的化合物:
Figure BDA0000158388020000581
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C2为氢或任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
在某些实施例中,式II-c或II-d的环B2基团为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B2为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B2为1H-吲唑基、苯并咪唑基或吲哚基。在某些实施例中,环B2为1H-吲唑基。在某些实施例中,环B2基团为取代或未取代的苯基。在某些实施例中,环B2为经取代的苯基。在某些实施例中,环B2为苯酚。在一些实施例中,环B2为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在一些实施例中,环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环B2为吡啶基。在某些实施例中,环B2为任选取代的嘧啶基。在某些实施例中,环B2
Figure BDA0000158388020000591
在某些实施例中,式II-c或II-d的环A2基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A2为任选取代的吗啉基。在某些实施例中,环A2为未取代的吗啉基。在一些实施例中,环A2为任选取代的四氢吡喃基。在某些实施例中,A2为:
Figure BDA0000158388020000592
Figure BDA0000158388020000601
在某些实施例中,环A2为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A2为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A2为桥接双环N-吗啉基。在某些实施例中,A2为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020000602
在某些实施例中,环A2具有下式:
Figure BDA0000158388020000603
其中:
v、j、p和g独立地为1、2或3。
在一些实施例中,环A2为任选取代的选自以下的(稠合或螺稠合)双环:
在某些实施例中,式II-c或II-d的T2基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T2为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T2为-CH2-。在某些实施例中,T2为共价键。
在某些实施例中,式II-c或II-d的环C2基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C2为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环C2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C2为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C2为苯基。在一些实施例中,环C2为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C2为环己基。在某些实施例中,环C2为氢。在一些实施例中,T2为共价键且环C2为氢。在一些实施例中,环C2为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,本发明提供式II-e或II-f的化合物:
Figure BDA0000158388020000611
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R5为R、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R或-C(O)N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当式II-e或II-f的环C1不存在时,T3直接连接于T2。另外,应了解,当环D2不存在时,R1直接连接于T3
在某些实施例中,式II-e或II-f的环B2基团为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B2为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B2为1H-吲唑基、苯并咪唑基或吲哚基。在某些实施例中,环B2为1H-吲唑基。在某些实施例中,环B2基团为取代或未取代的苯基。在某些实施例中,环B2为经取代的苯基。在某些实施例中,环B2为苯酚。在一些实施例中,环B2为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在一些实施例中,环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环B2为吡啶基。在某些实施例中,环B2为任选取代的嘧啶基。在某些实施例中,环B2
Figure BDA0000158388020000621
在某些实施例中,式II-e或II-f的环A2基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A2为任选取代的吗啉基。在某些实施例中,环A2为未取代的吗啉基。在一些实施例中,环A2为任选取代的四氢吡喃基。在某些实施例中,A2为:
Figure BDA0000158388020000631
在某些实施例中,环A2为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A2为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A2为桥接双环N-吗啉基。在某些实施例中,A2为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020000632
在某些实施例中,环A2具有下式:
其中:
v、j、p和g独立地为1、2或3。
在一些实施例中,环A2为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020000642
在某些实施例中,式II-e或II-f的T2基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T2为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T2为-CH2-或-CH2CH2-。在其它实施例中,T2为-C(O)-。在某些实施例中,T2为-C≡C-或-CH2C≡C-。在某些实施例中,T2为共价键。在一些实施例中,T2为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。在某些实施例中,T2为C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
在某些实施例中,式II-e或II-f的环C1基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C1为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环C1为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C1为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C1为苯基。在一些实施例中,环C1为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C1为环己基。在某些实施例中,环C1不存在。在一些实施例中,环C1为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,式II-e或II-f的T3基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T3为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T3为-CH2-或-CH2CH2-。在某些实施例中,T3为-C(O)-。在某些实施例中,T3为共价键。
在某些实施例中,式II-e或II-f的环D2基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环D2为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环D2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环D2为四氢吡啶基。在一些实施例中,环D2为苯基。在一些实施例中,环D2为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环D2为环己基。在某些实施例中,环D2不存在。在一些实施例中,环D2为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,本发明提供式II-e-i或II-f-i的化合物:
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1、R5、R、环B2和T2如上文关于式II-e和II-f所定义且如本文中的类别和子类中所述;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环;且
环C1不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当式II-e-i或II-f-i的环C1不存在时,R1直接连接于T2
在某些实施例中,本发明提供式II-g或II-h的化合物:
Figure BDA0000158388020000661
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环,具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当式II-g或II-h的环C1不存在时,T3直接连接于T2。另外,应了解,当环D2不存在时,R1直接连接于T3
在某些实施例中,式II-g或II-h的环B2基团为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B2为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B2为1H-吲唑基、苯并咪唑基或吲哚基。在某些实施例中,环B2为1H-吲唑基。在某些实施例中,环B2基团为取代或未取代的苯基。在某些实施例中,环B2为经取代的苯基。在某些实施例中,环B2为苯酚。在一些实施例中,环B2为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在一些实施例中,环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环B2为吡啶基。在某些实施例中,环B2为任选取代的嘧啶基。在某些实施例中,环B2
在某些实施例中,式II-g或II-h的环A2基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A2为任选取代的吗啉基。在某些实施例中,环A2为未取代的吗啉基。在一些实施例中,环A2为任选取代的四氢吡喃基。在某些实施例中,A2为:
Figure BDA0000158388020000672
在某些实施例中,环A2为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A2为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A2为桥接双环N-吗啉基。在某些实施例中,A2为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020000682
在某些实施例中,环A2具有下式:
Figure BDA0000158388020000683
其中:
v、j、p和g独立地为1、2或3。
在一些实施例中,环A2为任选取代的选自以下的(稠合或螺稠合)双环:
Figure BDA0000158388020000691
在某些实施例中,式II-g或II-h的T2基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T2为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T2为-CH2-或-CH2CH2-。在其它实施例中,T2为-C(O)-。在某些实施例中,T2为-C≡C-或-CH2C≡C-。在某些实施例中,T2为共价键。在一些实施例中,T2为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。在某些实施例中,T2为C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
在某些实施例中,式II-g或II-h的环C1基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C1为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环C1为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C1为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C1为苯基。在一些实施例中,环C1为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C1为环己基。在某些实施例中,环C1不存在。在一些实施例中,环C1为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,式II-g或II-h的T3基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T3为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T3为-CH2-或-CH2CH2-。在某些实施例中,T3为-C(O)-。在某些实施例中,T3为共价键。
在某些实施例中,式II-g或II-h的环D2基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环D2为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环D2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环D2为四氢吡啶基。在一些实施例中,环D2为苯基。在一些实施例中,环D2为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环D2为环己基。在某些实施例中,环D2不存在。在一些实施例中,环D2为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a1)R1选自本文所述的实施例;
b1)环A2选自上文关于式II-g和II-h所述的实施例;
c1)环B2选自上文关于式II-g和II-h所述的实施例;
d1)T2选自上文关于式II-g和II-h所述的实施例;
e1)环C1选自上文关于式II-g和II-h所述的实施例;
f1)T3选自上文关于式II-g和II-h所述的实施例;和
g1)环D2选自上文关于式II-g和II-h所述的实施例。
在一些实施例中,式II-g或II-h的
Figure BDA0000158388020000701
在一些实施例中,
Figure BDA0000158388020000703
Figure BDA0000158388020000704
在一些实施例中,
Figure BDA0000158388020000705
Figure BDA0000158388020000706
在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a2)环A2为任选取代的吗啉基;
b2)环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
Figure BDA0000158388020000707
Figure BDA0000158388020000708
Figure BDA0000158388020000709
Figure BDA00001583880200007010
包含具有约9到约11个原子的如本文所定义的间隔基。在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a2)、b2)、c2)和d2),以及e2)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a3)环A2为任选取代的吗啉基;
b3)环B2为任选取代的选自吲唑基、氨基嘧啶基或苯酚的基团;
Figure BDA0000158388020000711
Figure BDA0000158388020000712
Figure BDA0000158388020000713
Figure BDA0000158388020000714
包含具有约9到约11个原子的间隔基。在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a3)、b3)、c3)和d3),以及e3)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a4)环A2为任选取代的吗啉基;
b4)环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
c4)T2为共价键、亚甲基或C3-5烃链,其中T2的两个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d4)环C1为苯基,或任选取代的具有1-2个氮的6元饱和杂环、部分不饱和杂环或芳香族杂环;
e4)T3为共价键、-C(O)-;和
f4)环D2不存在或为苯基。
在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a4)、b4)、c4)、d4)、e4)和f4),以及g4)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a5)环A2为任选取代的吗啉基;
b5)环B2为任选取代的选自吲唑基、苯酚或氨基嘧啶的基团;
c5)T2为共价键、亚甲基或C4烃链,其中T2的两个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d5)环C1为苯基、哌嗪基、哌啶基或四氢吡啶基;
e5)T3为共价键或-C(O)-;和
f5)环D2不存在或为苯基。
在一些实施例中,所提供的式II-g或II-h的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a5)、b5)、c5)、d5)、e5)和f5),以及g5)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,II-a、II-b、II-e、II-f、II-g或II-h骨架到弹头基的反应性部分的长度或原子数目有助于对PI3Kα的Cys-862进行选择性修饰。应了解,所述长度(即原子数目)使弹头基的反应性部分接近PI3Kα的Cys-862以实现共价修饰。如本文所用的术语“骨架”是指a)通过去除能够结合于或接近配体结合位点的配体的氢而产生的基团;或b)通过截短配体药效团,使得所述骨架能够结合于或接近配体结合位点而产生的所述药效团的一部分。II-a、II-b、II-e、II-f、II-g或II-h骨架如下所示。
Figure BDA0000158388020000721
应了解,式II-a、II-b、II-e、II-f、II-g和II-h的
Figure BDA0000158388020000722
基团充当所述骨架与R1弹头的反应性部分之间的间隔基。术语“间隔基”是指分隔且定向所连接的分子的其它部分,以使化合物顺利地与酶活性位点中的官能团相互作用的基团。如本文所使用,间隔基分隔骨架与R1的反应性部分且使其定向于活性位点内,以使其可顺利地与PI3Kα活性位点内所存在的官能团形成相互作用且使R1可与Cys-862反应。应了解,间隔基以连接于骨架的第一原子为起点且以弹头的反应中心(例如,如以下结构中标识为原子11的反应性碳中心)为终点。
在一些实施例中,间隔基长度为约7个原子到约13个原子。在一些实施例中,间隔基长度为约8个原子到约12个原子。在一些实施例中,间隔基长度为约9个原子到约11个原子。出于计数间隔基长度的目的,当间隔基中存在环时,环自一端到另一端算作三个原子。举例来说,下文所示的
Figure BDA0000158388020000731
基团的间隔基部分的长度应理解为11个原子。波状线指示连接于骨架的连接点。
Figure BDA0000158388020000732
在一些实施例中,间隔基长度为约到约
Figure BDA0000158388020000734
在一些实施例中,间隔基长度为约
Figure BDA0000158388020000735
到约在一些实施例中,间隔基长度为约
Figure BDA0000158388020000737
到约为避免产生疑问且出于说明的目的,下文随间隔基长度显示示范性化合物。
Figure BDA0000158388020000739
10个原子的间隔基        11个原子的间隔基
在一些实施例中,本发明提供式III化合物:
Figure BDA0000158388020000741
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
X为O或S;
R6为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R7为任选取代的C1-6脂肪族基;
R8为氢或-NHR′;
R′独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基;且
环A3为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个氮的8-10元双环杂芳基环。
在某些实施例中,本发明提供选自式III-a、III-b和III-c的式III化合物:
Figure BDA0000158388020000742
其中R1、R6、R7、R8和X各自如上文关于式III所定义且如本文所述。
在某些实施例中,式III的X基团为O。在其它实施例中,式III的X基团为S。
在某些实施例中,式III的R6基团为任选取代的苯基。在一些实施例中,R6为经R°取代的苯基。在其它实施例中,R6为经氰基取代的C1-6烷基取代的苯基。在一些实施例中,R6为经-C(CH3)2CN取代的苯基。
在一些实施例中,式III的R7基团为任选取代的C1-6烷基。在其它实施例中,R7为C1-3烷基。在某些实施例中,R7为甲基、乙基、丙基或环丙基。
在某些实施例中,式III的R8基团为氢。
在某些实施例中,式III的环A3基团为苯基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、萘基或喹啉基。
在一些实施例中,本发明提供式IV化合物:
Figure BDA0000158388020000751
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
X为O或S;
R9为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R10为任选取代的C1-6脂肪族基;
R11为氢或-NHR′;且
R′独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基。
在某些实施例中,式IV的X基团为O。在其它实施例中,式IV的X基团为S。
在某些实施例中,式IV的R9基团为任选取代的苯基。在一些实施例中,R9为经R°取代的苯基。在其它实施例中,R9为经氰基取代的C1-6烷基取代的苯基。在一些实施例中,R9为经-C(CH3)2CN取代的苯基。
在一些实施例中,式IV的R10基团为任选取代的C1-6烷基。在其它实施例中,R10为C1-3烷基。在某些实施例中,R10为甲基、乙基、丙基或环丙基。
在某些实施例中,式IV的R4基团为氢。
在一些实施例中,本发明提供式V-a或V-b的化合物:
Figure BDA0000158388020000761
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
R12为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、-(CH2)m-(3-7元饱和或部分不饱和碳环)、-(CH2)m-(7-10元饱和或部分不饱和双环碳环)、-(CH2)m-(具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环)、-(CH2)m-(具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环)、-(CH2)m-苯基、-(CH2)m-(8-10元双环芳基环)、-(CH2)m-(具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环),或-(CH2)m-(具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环);
R13和R14各自独立地为-R″、卤素、-NO2、-CN、-OR″、-SR″、-N(R″)2、-C(O)R″、-CO2R″、-C(O)C(O)R″、-C(O)CH2C(O)R″、-S(O)R″、-S(O)2R″、-C(O)N(R″)2、-SO2N(R″)2、-OC(O)R″、-N(R″)C(O)R″、-N(R″)N(R″)2、-N(R″)C(=NR″)N(R″)2、-C(=NR″)N(R″)2、-C=NOR″、-N(R″)C(O)N(R″)2、-N(R″)SO2N(R″)2、-N(R″)SO2R″或-OC(O)N(R″)2
R″各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个R″基团连同其所连接的氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
m为0到6且包括0和6的整数;
n各自独立地为0、1或2;
环A5为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环B5不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当环B5不存在时,R1直接连接于环A5
在某些实施例中,式V-a和V-b的R12基团为氢。在一些实施例中,R12为C1-6脂肪族基。在某些实施例中,R12为C1-6烷基。在一些实施例中,R12为甲基。在某些实施例中,R12为任选取代的苯基。在一些实施例中,R12为经一个或一个以上卤素取代的苯基。在某些实施例中,R12为二氯苯基。在一些实施例中,R12为芳烷基或杂芳烷基。在某些实施例中,R12为任选取代的苯甲基。在一些实施例中,R12为任选取代的选自以下的基团:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,式V-a的R12基团为氢。在某些实施例中,式V-b的R12基团为经取代的苯基。
在一些实施例中,式V-a和V-b的环A5为任选取代的具有1-2个氮的6元杂环。在某些实施例中,环A5为哌啶环。在某些实施例中,环A5为哌嗪环。在一些实施例中,环A5为任选取代的具有1-2个氮的6元杂芳基环。在某些实施例中,环A5为吡啶环。在某些实施例中,环A5为嘧啶环。在某些实施例中,环A5为吡嗪环。在某些实施例中,环A5为哒嗪环。
在一些实施例中,环A5为任选取代的苯基。在一些实施例中,环A5为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在某些实施例中,环A5为四氢异喹啉环。
在一些实施例中,式V-a和V-b的环B5为任选取代的具有1-2个氮的6元杂环。在某些实施例中,环B5为哌啶环。在某些实施例中,环B5为哌嗪环。在一些实施例中,环B5为任选取代的具有1-2个氮的6元杂芳基环。在某些实施例中,环B5为吡啶环。在某些实施例中,环B5为嘧啶环。在某些实施例中,环B5为吡嗪环。在某些实施例中,环B5为哒嗪环。在一些实施例中,环B5为苯基。在一些实施例中,环B5为3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环B5为环己基。
在某些实施例中,式V-a和V-b的n为0。在一些实施例中,n为1。在其它实施例中,n为2。
在一些实施例中,本发明提供式V-a-i或V-b-i的化合物:
Figure BDA0000158388020000781
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1、R12、R13、R14、R″、m和n如上文关于式V-a和V-b所定义且如本文中的类别和子类中所述;且
环A5为任选取代的具有1-2个氮的6元杂环或杂芳基环。
在一些实施例中,本发明提供式VI-a或VI-b的化合物:
Figure BDA0000158388020000791
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
R15为氢或C1-6烷基;
R16为氢或任选取代的选自C1-6烷基、C1-6烷氧基或(C1-6亚烷基)-R18的基团;或
R15和R16连同插入碳一起形成任选取代的选自以下的环:3-7元碳环,或具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环;
R17为氢或C1-6烷基;
R18为3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环A6不存在或为任选取代的选自以下的基团:具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。
在某些实施例中,式VI-a和VI-b的R15为氢。在一些实施例中,R15为C1-6烷基。在一些实施例中,R15为甲基。
在一些实施例中,式VI-a和VI-b的R16为氢。在一些实施例中,R16为C1-6烷基。在某些实施例中,R16为甲基。
在一些实施例中,式VI-a和VI-b的R17为氢。在一些实施例中,R17为C1-6烷基。在某些实施例中,R17为甲基。
在一些实施例中,式VI-a和VI-b的环A6为具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环。在一些实施例中,环A6为具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环A6为具有两个氮的5元杂芳基环。在某些实施例中,环A6为吡唑基。
在某些实施例中,式VI-a或VI-b的环A6不存在。应了解,当在式VI-a中环A6不存在时,R1共价连接于苯并吗啉环的吗啉氮的间位。应了解,当在式VI-b中环A6不存在时,R1可连接于苯并吗啉环上的任何位置,且苯并吗啉环的价数由氢或任选存在的取代基来满足。
在某些实施例中,本发明提供式VII化合物:
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A7为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R18为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B7为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T7为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C7为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环D7不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当式VII的环D7不存在时,R1直接连接于T7
在某些实施例中,式VII的环B7基团为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B7为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B7为1H-吲唑基、苯并咪唑基或吲哚基。在某些实施例中,环B7为1H-吲唑基。在某些实施例中,环B7基团为取代或未取代的苯基。在某些实施例中,环B7为经取代的苯基。在某些实施例中,环B7为苯酚。在某些实施例中,环B7为经-NHCOCH3、-NHCOCH2CH3、-NHCO2CH2CH2OH、-NHCONHCH3或-NHCONH(吡啶基)取代的苯基。在某些实施例中,环B7为经-NHCO2CH3、-NHCONHCH2CH3、-NHCONHCH2CH2F、-NHCONHCH(CH3)2、-NHCONH(3-吡啶基)或-NHCONH(4-吡啶基)取代的苯基。在某些实施例中,环B7在一些实施例中,环B7为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在一些实施例中,环B7为任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环B7为吡啶基。在某些实施例中,环B7为任选取代的嘧啶基。在某些实施例中,环B7
Figure BDA0000158388020000821
在某些实施例中,式VII的环A7基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A7为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A7为任选取代的吗啉基。在某些实施例中,环A7为未取代的吗啉基。在一些实施例中,环A7为任选取代的四氢吡喃基。在某些实施例中,A7为:
Figure BDA0000158388020000822
在某些实施例中,环A7为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A7为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A7为桥接双环N-吗啉基。在某些实施例中,A7为任选取代的具有以下结构的环:
在某些实施例中,环A7具有下式:
Figure BDA0000158388020000832
其中:
v、j、p和g独立地为1、2或3。
在一些实施例中,环A7为任选取代的选自以下的(稠合或螺稠合)双环:
Figure BDA0000158388020000833
在某些实施例中,式VII的T7基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T7为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T7为-CH2-。在某些实施例中,T7为共价键。在某些实施例中,T7为-C(O)-或-CH2C(O)-。
在某些实施例中,式VII的环C7基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C7为哌嗪环或哌啶环。在某些实施例中,环C7为哌啶基。在某些实施例中,环C7经一个或一个以上氧代基取代。在某些实施例中,环C7为任选经一个或一个以上氧代基取代的硫代吗啉。在一些实施例中,环C7为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C7为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C7为苯基。在一些实施例中,C7为任选取代的具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环C7为吡啶基。在一些实施例中,环C7为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C7为环己基。在一些实施例中,环C7为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,式VII的环D7基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环D7为哌嗪环或哌啶环。在某些实施例中,环D7为哌啶基。在某些实施例中,环D7经一个或一个以上氧代基取代。在某些实施例中,环D7为任选经一个或一个以上氧代基取代的硫代吗啉。在某些实施例中,环D7
Figure BDA0000158388020000841
在一些实施例中,环D7为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环D7为四氢吡啶基。在一些实施例中,环D7为苯基。在一些实施例中,D7为任选取代的具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环D7为吡啶基。在一些实施例中,环D7为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环D7为环己基。在某些实施例中,环D7不存在。在一些实施例中,环D7为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,所提供的式VII化合物为:
Figure BDA0000158388020000842
在某些实施例中,本发明提供式VIII化合物:
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A8为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R19和R20独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B8为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T8为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C8为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环D8不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当式VIII的环D8不存在时,R1直接连接于T8
在某些实施例中,式VIII的环B8基团为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B8为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B8为1H-吲唑基、苯并咪唑基或吲哚基。在某些实施例中,环B8为1H-吲唑基。在某些实施例中,环B8基团为取代或未取代的苯基。在某些实施例中,环B8为经取代的苯基。在一些实施例中,环B8为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在一些实施例中,环B8为任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环B8为吡啶基。在某些实施例中,环B8为任选取代的嘧啶基。在某些实施例中,环B8
Figure BDA0000158388020000861
在某些实施例中,式VIII的环A8基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A8为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A8为任选取代的吗啉基。在某些实施例中,环A8为未取代的吗啉基。在一些实施例中,环A8为任选取代的四氢吡喃基。在某些实施例中,A8为:
Figure BDA0000158388020000862
Figure BDA0000158388020000871
在某些实施例中,环A8为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A8为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A8为桥接双环N-吗啉基。在某些实施例中,A8为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020000872
在某些实施例中,环A8具有下式:
Figure BDA0000158388020000873
其中:
v、j、p和g独立地为1、2或3。
在一些实施例中,环A8为任选取代的选自以下的(稠合或螺稠合)双环:
在某些实施例中,式VIII的T8基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T8为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T8为-CH2-。在某些实施例中,T8为共价键。在某些实施例中,T8为-C(O)-。
在某些实施例中,式VIII的环C8基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C8为哌嗪环或哌啶环。在某些实施例中,环C8为哌啶基。在某些实施例中,环C8经一个或一个以上氧代基取代。在某些实施例中,环C8为任选经一个或一个以上氧代基取代的硫代吗啉。在一些实施例中,环C8为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C8为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C8为任选取代的苯基。在某些实施例中,环C8为未取代的苯基。在某些实施例中,环C8为经甲基取代的苯基。在某些实施例中,环C8
Figure BDA0000158388020000882
在一些实施例中,C8为任选取代的具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环C8为吡啶基。在一些实施例中,环C8为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C8为环己基。在一些实施例中,环C8为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,式VIII的环D8基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环D8为哌嗪环或哌啶环。在某些实施例中,环D8为哌啶基。在某些实施例中,环D8经一个或一个以上氧代基取代。在某些实施例中,环D8为任选经一个或一个以上氧代基取代的硫代吗啉。在某些实施例中,环D8
Figure BDA0000158388020000883
在一些实施例中,环D8为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环D8为四氢吡啶基。在一些实施例中,环D7为苯基。在一些实施例中,D8为任选取代的具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环D8为吡啶基。在一些实施例中,环D8为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环D8为环己基。在某些实施例中,环D8不存在。在一些实施例中,环D8为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,本发明提供式IX化合物:
Figure BDA0000158388020000891
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
T9为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环A9不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R24和R25独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;且
z为0、1或2。
所属领域技术人员应了解,当环A9不存在时,R1直接连接于T9
在一些实施例中,式IX的R24为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2。在一些实施例中,R24为-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2或-NRSO2R。在某些实施例中,R24为-NRC(O)R。在某些实施例中,R24为-NHC(O)(吡啶基)。
在一些实施例中,式IX的R25为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2。在一些实施例中,R25为-OR或-N(R)2。在某些实施例中,R25为-OCH3
在某些实施例中,式IX的T9基团为二价饱和直链C1-6烃链,其中T9的1-3个亚甲基单元经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换。在一些实施例中,T9为二价饱和直链C5烃链,其中T9的1-3个亚甲基单元经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换。在一些实施例中,T9为二价饱和直链C5烃链,其中T9的3个亚甲基单元经-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。在一些实施例中,T9为二价饱和直链C1-3烃链,其中T9的1-3个亚甲基单元经-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。在某些实施例中,T9为-OCH2CH2NHC(O)-。在某些实施例中,T9为共价键。在某些实施例中,T9为-C(O)-。在某些实施例中,T9为-O-。在某些实施例中,T9为-OCH2CH2-。
在一些实施例中,式IX的环A9为任选取代的具有1-2个氮的6元杂环。在某些实施例中,环A9为哌啶环。在某些实施例中,环A9为哌嗪环。在一些实施例中,环A9为任选取代的具有1-2个氮的6元杂芳基环。在某些实施例中,环A9为吡啶环。在某些实施例中,环A9为嘧啶环。在某些实施例中,环A9为吡嗪环。在某些实施例中,环A9为哒嗪环。在一些实施例中,环A9为任选取代的苯基。在一些实施例中,环A9为未取代的苯基。在一些实施例中,环A9为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在某些实施例中,环A9为四氢异喹啉环。在某些实施例中,环A9不存在。
在一些实施例中,式IX化合物具有式IX-a:
Figure BDA0000158388020000911
其中R1、T9、A9、R25和R如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,本发明提供式X化合物:
Figure BDA0000158388020000912
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
R21和R22各自独立地为-R″、卤素、-NO2、-CN、-OR″、-SR″、-N(R″)2、-C(O)R″、-CO2R″、-C(O)C(O)R″、-C(O)CH2C(O)R″、-S(O)R″、-S(O)2R″、-C(O)N(R″)2、-SO2N(R″)2、-OC(O)R″、-N(R″)C(O)R″、-N(R″)N(R″)2、-N(R″)C(=NR″)N(R″)2、-C(=NR″)N(R″)2、-C=NOR″、-N(R″)C(O)N(R″)2、-N(R″)SO2N(R″)2、-N(R″)SO2R″或-OC(O)N(R″)2
R″各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个R″基团连同其所连接的氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
k各自独立地为0、1或2;
环A10为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环B10为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T10为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C10不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当式X的环C10不存在时,R1直接连接于T10
在一些实施例中,式X的环A10为任选取代的具有1-2个氮的6元杂环。在某些实施例中,环A10为哌啶环。在某些实施例中,环A10为哌嗪环。在一些实施例中,环A10为任选取代的具有1-2个氮的6元杂芳基环。在某些实施例中,环A10为吡啶环。在某些实施例中,环A10为嘧啶环。在某些实施例中,环A10为吡嗪环。在某些实施例中,环A10为哒嗪环。
在一些实施例中,式X的环B10为任选取代的具有1-2个氮的6元杂环。在某些实施例中,环B10为哌啶环。在某些实施例中,环B10为哌嗪环。在一些实施例中,环B10为任选取代的具有1-2个氮的6元杂芳基环。在某些实施例中,环B10为吡啶环。在某些实施例中,环B10为嘧啶环。在某些实施例中,环B10为吡嗪环。在某些实施例中,环B10为哒嗪环。在某些实施例中,环B10为经烷氧基取代的苯基、吡啶、嘧啶、吡嗪或哒嗪。在某些实施例中,环B10为经甲氧基取代的吡啶。
在某些实施例中,式X的T10基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T10为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T10为-CH2-。在某些实施例中,T10为共价键。在某些实施例中,T10为-C(O)-。在某些实施例中,T10为-NHSO2-。在某些实施例中,T10为-SO2-。
在某些实施例中,式X的环C10基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C10为哌嗪环或哌啶环。在某些实施例中,环C10为哌啶基。在一些实施例中,环C10为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C10为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C10为苯基。在一些实施例中,C10为任选取代的具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环C10为吡啶基。在一些实施例中,环C10为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C10为环己基。在一些实施例中,环C10为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,式X的k为0。在一些实施例中,k为1。在其它实施例中,k为2。
在某些实施例中,本发明提供式XI化合物:
Figure BDA0000158388020000931
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
X11为CH或N;
环A11为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R23各自独立地为-Ra、卤素、-NO2、-CN、-ORb、-SRb、-N(Rb)2、-C(O)Ra、-CO2Ra、-C(O)C(O)Ra、-C(O)CH2C(O)Ra、-S(O)Ra、-S(O)2Ra、-C(O)N(Ra)2、-SO2N(Ra)2、-OC(O)Ra、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)N(Ra)2、-N(Ra)C(=NRa)N(Ra)2、-C(=NRa)N(Ra)2、-C=NORa、-N(Ra)C(O)N(Ra)2、-N(Ra)SO2N(Ra)2、-N(Ra)SO2Ra或-OC(O)N(Ra)2
Ra各自独立地为氢、C1-6脂肪族基、苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个Ra基团连同其所连接的氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
Rb各自独立地为氢、C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环;或
同一氮上的两个Rb基团连同其所连接的氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
w为0、1或2;
环B11为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T11为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C11不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当环C11不存在时,R1直接连接于T11
在一些实施例中,式XI的环A11为任选经R23取代的苯基。在某些实施例中,环A11为经一或两个R23基团取代的苯基。在某些实施例中,环A11为经两个R23基团取代的苯基。在某些实施例中,环A11为二甲氧基苯基。在一些实施例中,环A11为任选经R23取代的具有1-2个氮的6元杂环。在某些实施例中,环A11为哌啶环。在某些实施例中,环A11为哌嗪环。在一些实施例中,环A11为任选经R23取代的具有1-2个氮的6元杂芳基环。在某些实施例中,环A11为吡啶环。在某些实施例中,环A11为嘧啶环。在某些实施例中,环A11为吡嗪环。在某些实施例中,环A11为哒嗪环。在一些实施例中,环A11为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在某些实施例中,环A11为7-氮杂吲哚。在某些实施例中,环A11为任选经R23取代的吲哚。在某些实施例中,环A11为6-羟基吲哚。
在一些实施例中,式XI的环B11为任选取代的具有1-2个氮的6元杂环。在某些实施例中,环B11为哌啶环。在某些实施例中,环B11为哌嗪环。在一些实施例中,环B11为任选取代的具有1-2个氮的6元杂芳基环。在某些实施例中,环B11为吡啶环。在某些实施例中,环B11为嘧啶环。在某些实施例中,环B11为吡嗪环。在某些实施例中,环B11为哒嗪环。在某些实施例中,环B11为苯基。
在某些实施例中,式XI的T11基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T11为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T11为-CH2-。在某些实施例中,T11为共价键。在某些实施例中,T11为-C(O)-。
在一些实施例中,式XI的环C11为任选取代的具有1-2个氮的6元杂环。在某些实施例中,环C11为哌啶环。在某些实施例中,环C11为哌嗪环。在一些实施例中,环C11为任选取代的具有1-2个氮的6元杂芳基环。在某些实施例中,环C11为吡啶环。在某些实施例中,环C11为嘧啶环。在某些实施例中,环C11为吡嗪环。在某些实施例中,环C11为哒嗪环。在某些实施例中,环C11为苯基。
在某些实施例中,式XI的w为0。在一些实施例中,w为1。在其它实施例中,w为2。
在某些实施例中,本发明提供式XII化合物:
Figure BDA0000158388020000961
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
X12为CR26或N;
Y12为CR27或N;
Z12为CR28或N;
其中X12、Y12和Z12中至少一者为N;
环A12为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R26、R27和R28独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B12为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T12为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T12的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C12不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接或螺双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环:
T13为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T13的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D12不存在或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
所属领域技术人员应了解,当式XII的环C12不存在时,T13直接连接于T12。另外,应了解,当环D12不存在时,R1直接连接于T13
在某些实施例中,式XII的环B12基团为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B12为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B12为1H-吲唑基、苯并咪唑基或吲哚基。在某些实施例中,环B12为1H-吲唑基。在某些实施例中,环B12基团为取代或未取代的苯基。在某些实施例中,环B12为经取代的苯基。在某些实施例中,环B12为苯酚。在一些实施例中,环B12为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在一些实施例中,环B12为任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环B12为吡啶基。在某些实施例中,环B12为任选取代的嘧啶基。在某些实施例中,环B12
Figure BDA0000158388020000981
在某些实施例中,式XII的环A12基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A12为任选取代的吗啉基。在某些实施例中,环A12为未取代的吗啉基。在一些实施例中,环A12为任选取代的四氢吡喃基。在某些实施例中,A12为:
Figure BDA0000158388020000982
在某些实施例中,环A12为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A12为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A12为桥接双环N-吗啉基。在某些实施例中,A12为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020000991
在某些实施例中,环A12具有下式:
Figure BDA0000158388020000992
其中:
v、j、p和g独立地为1、2或3。
在一些实施例中,环A12为任选取代的选自以下的(稠合或螺稠合)双环:
Figure BDA0000158388020000993
在某些实施例中,式XII的T12基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T12为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T12为-CH2-或-CH2CH2-。在其它实施例中,T12为-C(O)-。在某些实施例中,T12为-C≡C-或-CH2C≡C-。在某些实施例中,T12为共价键。
在某些实施例中,式XII的环C12基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C12为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环C12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C12为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C12为苯基。在一些实施例中,环C12为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C12为环己基。在某些实施例中,环C12不存在。在一些实施例中,环C12为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接或螺双环。
在某些实施例中,式XII的T13基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T13为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T13为-CH2-或-CH2CH2-。在某些实施例中,T13为-C(O)-。在某些实施例中,T13为共价键。
在某些实施例中,式XII的环D12基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环D12为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环D12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环D12为四氢吡啶基。在一些实施例中,环D12为苯基。在一些实施例中,环D12为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环D12为环己基。在某些实施例中,环D12不存在。在一些实施例中,环D12为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,式XII化合物具有式XII-a:
Figure BDA0000158388020001001
其中环A12、环B12、T12、环C12、T13和环D12如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
所属领域技术人员应了解,当式XII-a的环C12不存在时,T13直接连接于T12。另外,应了解,当环D12不存在时,R1直接连接于T13
在某些实施例中,式XII-a的环B12基团为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B12为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。在一些实施例中,环B12为1H-吲唑基、苯并咪唑基或吲哚基。在某些实施例中,环B12为1H-吲唑基。在某些实施例中,环B12基团为取代或未取代的苯基。在某些实施例中,环B12为经取代的苯基。在某些实施例中,环B12为苯酚。在一些实施例中,环B12为具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。在一些实施例中,环B12为任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环。在某些实施例中,环B12为吡啶基。在某些实施例中,环B12为任选取代的嘧啶基。在某些实施例中,环B12
Figure BDA0000158388020001011
在某些实施例中,式XII-a的环A12基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。在一些实施例中,环A12为任选取代的吗啉基。在某些实施例中,环A12为未取代的吗啉基。在一些实施例中,环A12为任选取代的四氢吡喃基。在某些实施例中,A12为:
Figure BDA0000158388020001012
在某些实施例中,环A12为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A12为任选取代的具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环。在某些实施例中,环A12为桥接双环N-吗啉基。在某些实施例中,A12为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020001021
在某些实施例中,环A12具有下式:
Figure BDA0000158388020001022
其中:
v、j、p和g独立地为1、2或3。
在一些实施例中,环A12为任选取代的具有以下结构的环:
Figure BDA0000158388020001023
Figure BDA0000158388020001024
在某些实施例中,式II-a或II-b的T12基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T12为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T12为-CH2-或-CH2CH2-。在其它实施例中,T12为-C(O)-。在某些实施例中,T12为-C≡C-或-CH2C≡C-。在某些实施例中,T12为共价键。在一些实施例中,T12为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T12的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。在某些实施例中,T12为C3烃链,其中T12的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
在某些实施例中,式II-a或II-b的环C12基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环C12为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环C12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环C12为四氢吡啶基。在一些实施例中,环C12为苯基。在一些实施例中,环C12为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环C12为环己基。在某些实施例中,环C12不存在。在一些实施例中,环C12为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接或螺双环。
在某些实施例中,式II-a或II-b的T13基团为二价饱和直链C1-6烃链。在一些实施例中,T13为二价饱和直链C1-3烃链。在一些实施例中,T13为-CH2-或-CH2CH2-。在某些实施例中,T13为-C(O)-。在某些实施例中,T13为共价键。
在某些实施例中,式II-a或II-b的环D12基团为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。在一些实施例中,环D12为哌嗪环或哌啶环。在一些实施例中,环D12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元部分不饱和杂环。在某些实施例中,环D12为四氢吡啶基。在一些实施例中,环D12为苯基。在一些实施例中,环D12为任选取代的3-7元饱和或部分不饱和碳环。在某些实施例中,环D12为环己基。在某些实施例中,环D12不存在。在一些实施例中,环D12为具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环。
在某些实施例中,式XII-a化合物具有式XII-a-i:
Figure BDA0000158388020001031
其中环A12、环B12、T12、环C12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式XII-a化合物具有式XII-a-ii:
Figure BDA0000158388020001041
其中环A12、环B12、环C12、环D12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式XII-a化合物具有式XII-a-iii:
Figure BDA0000158388020001042
其中环A12、环B12、T12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式XII化合物具有式XII-b:
Figure BDA0000158388020001043
其中环A12、环B12、T12、环C12、T13、环D12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式XII-b化合物具有式XII-b-i:
Figure BDA0000158388020001051
其中环A12、环B12、T12、环C12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式XII化合物具有式XII-c或XII-d:
Figure BDA0000158388020001052
其中环A12、环B12、T12、环C12、T13、环D12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式XII-c或XII-d的化合物具有式XII-c-i或XII-d-i:
Figure BDA0000158388020001053
其中环A12、环B12、T12、环C12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式XII化合物具有式XII-e:
Figure BDA0000158388020001061
其中环A12、环B12、T12、环C12、T13、环D12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,式XII-e化合物具有式XII-e-i:
Figure BDA0000158388020001062
其中环A12、环B12、T12、环C12和R1如上文所定义且如本文中的类别和子类中所述。
在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a1)R1选自本文所述的实施例;
b1)环A12选自上文关于式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所述的实施例;
c1)环B12选自上文关于式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所述的实施例;
d1)T12选自上文关于式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d及XII-e所述的实施例;
e1)环C12选自上文关于式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所述的实施例;
f1)T13选自上文关于式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所述的实施例;和
g1)环D12选自上文关于式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所述的实施例。
在一些实施例中,式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的
Figure BDA0000158388020001071
Figure BDA0000158388020001072
在一些实施例中,
Figure BDA0000158388020001073
在一些实施例中,
Figure BDA0000158388020001075
在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a2)环A12为任选取代的吗啉基;
b2)环B12为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
Figure BDA0000158388020001077
Figure BDA0000158388020001078
包含具有约9到约11个原子的间隔基。在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a2)、b2)、c2)和d2),以及e2)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a3)环A12为任选取代的吗啉基;
b3)环B12为任选取代的选自吲唑基、氨基嘧啶基或苯酚的基团:
Figure BDA00001583880200010711
Figure BDA00001583880200010712
Figure BDA00001583880200010713
包含具有约9到约11个原子的如本文所定义的间隔基。在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a3)、b3)、c3)和d3),以及e3)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a4)环A12为任选取代的吗啉基;
b4)环B12为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
c4)T12为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T12的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d4)环C12为苯基,或任选取代的具有1-2个氮的6元饱和杂环、部分不饱和杂环或芳香族杂环;
e4)T13为共价键、-C(O)-;和
f4)环D12不存在或为苯基。
在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a4)、b4)、c4)、d4)、e4)和f4),以及g4)R1选自本文所述的实施例。
在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a5)环A12为任选取代的吗啉基;
b5)环B12为任选取代的选自吲唑基、苯酚或氨基嘧啶的基团;
c5)T12为共价键、亚甲基或C3烃链,其中T12的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d5)环C12为苯基、哌嗪基、哌啶基或四氢吡啶基;
e5)T13为共价键或-C(O)-;和
f5)环D12不存在或为苯基。
在一些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:上文所述的a5)、b5)、c5)、d5)、e5)和f5),以及g5)R1选自本文所述的实施例。
在某些实施例中,所提供的式XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物具有以下结构中一者:
Figure BDA0000158388020001091
如上文大体上定义,式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e的R1基团为弹头基。在某些实施例中,R1为-L-Y,其中:
L为共价键或二价C1-8饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中L的一个、两个或三个亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-NR-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-S-、-SO-、-SO2-、-C(=S)-、-C(=NR)-、-N=N-或-C(=N2)-置换;
Y为氢、任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,或具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-10元单环或双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,且其中所述环经1-4个Re基团取代;且
Re各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基,或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,其中:
Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且
Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
在某些实施例中,L为共价键。
在某些实施例中,L为二价C1-8饱和或不饱和直链或具支链烃链。在某些实施例中,L为-CH2-。
在某些实施例中,L为共价键、-CH2-、-NH-、-CH2NH-、-NHCH2-、-NHC(O)-、-NHC(O)CH2OC(O)-、-CH2NHC(O)-、-NHSO2-、-NHSO2CH2-、-NHC(O)CH2OC(O)-或-SO2NH-。
在某些实施例中,L为二价C1-8烃链,其中L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-置换。在某些实施例中,L为二价C1-8烃链,其中L的至少两个亚甲基单元经-C(O)-置换。在一些实施例中,L为-C(O)CH2CH2C(O)-、-C(O)CH2NHC(O)-、-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)-或-C(O)CH2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)-。
在某些实施例中,L为二价C1-8烃链,其中L的至少一个亚甲基单元经-S(O)2-置换。在某些实施例中,L为二价C1-8烃链,其中L的至少一个亚甲基单元经-S(O)2-置换且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-置换。在某些实施例中,L为二价C1-8烃链,其中L的至少一个亚甲基单元经-S(O)2-置换且L的至少两个亚甲基单元经-C(O)-置换。在一些实施例中,L为-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)-或-S(O)2CH2CH2NHC(O)-。
在一些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。
在某些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。
在一些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-置换,且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。
如上所述,在某些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键。所属领域技术人员应认识到,此类双键可存在于烃链主链内,或可在主链“外”,且因此形成亚烷基。举例来说,此类具有亚烷基具支链链的L基团包括-CH2C(=CH2)CH2-。因此,在一些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个亚烷基双键。示范性L基团包括-NHC(O)C(=CH2)CH2-。
在某些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-置换。在某些实施例中,L为-C(O)CH=CH(CH3)-、-C(O)CH=CHCH2NH(CH3)-、-C(O)CH=CH(CH3)-、-C(O)CH=CH-、-CH2C(O)CH=CH-、-CH2C(O)CH=CH(CH3)-、-CH2CH2C(O)CH=CH-、-CH2CH2C(O)CH=CHCH2-、-CH2CH2C(O)CH=CHCH2NH(CH3)-或-CH2CH2C(O)CH=CH(CH3)-或-CH(CH3)OC(O)CH=CH-。
在某些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-OC(O)-置换。
在一些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。在一些实施例中,L为-CH2OC(O)CH=CHCH2-、-CH2-OC(O)CH=CH-或-CH(CH=CH2)OC(O)CH=CH-。
在某些实施例中,L为-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)(C=N2)C(O)-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-NRC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NRC(O)-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-CH2CH2NRC(O)-或-CH2NRC(O)亚环丙基-,其中R各自独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基。
在某些实施例中,L为-NHC(O)CH=CH-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)(C=N2)C(O)-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-NHC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NHC(O)-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-CH2CH2NHC(O)-或-CH2NHC(O)亚环丙基-。
在一些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个三键。在某些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个三键且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-C(=S)-、-C(=NR)-、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。在一些实施例中,L具有至少一个三键且L的至少一个亚甲基单元经-N(R)-、-N(R)C(O)-、-C(O)-、-C(O)O-或-OC(O)-或-O-置换。
示范性L基团包括-C≡C-、-C≡CCH2N(异丙基)-、-NHC(O)C≡CCH2CH2-、-CH2-C≡C-CH2-、-C≡CCH2O-、-CH2C(O)C≡C-、-C(O)C≡C-或-CH2OC(=O)C≡C-。
在某些实施例中,L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L的一个亚甲基单元经亚环丙基置换且L的一或两个其它亚甲基单元独立地经-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换。示范性L基团包括-NHC(O)-亚环丙基-SO2-和-NHC(O)-亚环丙基-。
如上文大体上定义,Y为氢、任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,或具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-10元单环或双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,且其中所述环经1-4个Re基团取代,Re各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基或C1-6脂肪族基,其中Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
在某些实施例中,Y为氢。
在某些实施例中,Y为任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。在一些实施例中,Y为任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6烯基。在其它实施例中,Y为任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6炔基。在一些实施例中,Y为C2-6烯基。在其它实施例中,Y为C2-4炔基。
在其它实施例中,Y为经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6烷基。所述Y基团包括-CH2F、-CH2Cl、-CH2CN和-CH2NO2
在某些实施例中,Y为具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的饱和3-6元单环,其中Y经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。
在一些实施例中,Y为具有1个选自氧或氮的杂原子的饱和3-4元杂环,其中所述环经1-2个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。示范性所述环为环氧化物和氧杂环丁烷环,其中各环经1-2个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。
在其它实施例中,Y为具有1-2个选自氧或氮的杂原子的饱和5-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。所述环包括哌啶和吡咯烷,其中各环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y为
Figure BDA0000158388020001131
其中R、Q、Z和Re各自如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y为哌嗪。
在一些实施例中,Y为饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y为环丙基、环丁基、环戊基或环己基,其中各环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y为其中Re如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y为任选经卤素、CN或NO2取代的环丙基。
在某些实施例中,Y为具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和3-6元单环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。
在一些实施例中,Y为部分不饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。在一些实施例中,Y为环丙烯基、环丁烯基、环戊烯基或环己烯基,其中各环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y为
Figure BDA0000158388020001133
其中Re各自如上文所定义和本文所述。
在某些实施例中,Y为具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和4-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y选自:
Figure BDA0000158388020001134
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述。
在某些实施例中,Y为具有0-2个氮的6元芳香族环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y为苯基、吡啶基或嘧啶基,其中各环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述。
在一些实施例中,Y选自:
Figure BDA0000158388020001141
其中Re各自如上文所定义和本文所述。
在其它实施例中,Y为具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环,其中所述环经1-3个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述。在一些实施例中,Y为具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元部分不饱和或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述。示范性所述环为异噁唑基、噁唑基、噻唑基、咪唑基、吡唑基、吡咯基、呋喃基、噻吩基、三唑基、噻二唑基和噁二唑基,其中各环经1-3个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述。在某些实施例中,Y选自:
Figure BDA0000158388020001142
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述。
在某些实施例中,Y为具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re如上文所定义和本文所述。根据另一方面,Y为具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的9-10元双环部分不饱和或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re如上文所定义和本文所述。示范性所述双环包括2,3-二氢苯并[d]异噻唑,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re如上文所定义和本文所述。
如上文大体上定义,Re基团各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基,或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,其中Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
在某些实施例中,Re为任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。在其它实施例中,Re为氧代基、NO2、卤素或CN。
在一些实施例中,Re为-Q-Z,其中Q为共价键且Z为氢(即Re为氢)。在其它实施例中,Re为-Q-Z,其中Q为二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一或两个亚甲基单元任选且独立地经-NR-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-S-、-O-、-C(O)-、-SO-或-SO2-置换。在其它实施例中,Q为具有至少一个双键的二价C2-6直链或具支链烃链,其中Q的一或两个亚甲基单元任选且独立地经-NR-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-S-、-O-、-C(O)-、-SO-或-SO2-置换。在某些实施例中,Re基团的Z部分为氢。在一些实施例中,-Q-Z为-NHC(O)CH=CH2或-C(O)CH=CH2
在某些实施例中,Re各自独立地选自氧代基、NO2、CN、氟、氯、-NHC(O)CH=CH2、-C(O)CH=CH2、-CH2CH=CH2、-C≡CH、-C(O)OCH2Cl、-C(O)OCH2F、-C(O)OCH2CN、-C(O)CH2Cl、-C(O)CH2F、-C(O)CH2CN或-CH2C(O)CH3
在某些实施例中,Re为适合离去基,即经历亲核置换的基团。“适合离去基”为易经引入的所需化学部分(例如相关半胱氨酸的硫醇部分)置换的化学基团。适合离去基为此项技术中众所周知的,例如参见“高等有机化学(Advanced Organic Chemistry)”,杰瑞马奇(Jerry March),第5版,第351-357页,约翰威立出版公司(John Wiley and Sons),纽约(N.Y)。所述离去基包括(但不限于)卤素、烷氧基、磺酰氧基、任选取代的烷基磺酰氧基、任选取代的烯基磺酰氧基、任选取代的芳基磺酰氧基、酰氧基和重氮部分。适合离去基的实例包括氯、碘、溴、氟、乙酰氧基、甲烷磺酰氧基(甲磺酰氧基)、甲苯磺酰氧基、三氟甲磺酰氧基、硝基-苯磺酰氧基(硝基苯磺酰氧基)和溴-苯基磺酰氧基(溴苯磺酰氧基)。
在某些实施例中,-L-Y的以下实施例和组合适用:
(a)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(b)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(c)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-置换,且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(d)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-置换;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(e)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-OC(O)-置换;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(f)L为-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)(C=N2)-、-NRC(O)(C=N2)C(O)-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-NRC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NRC(O)-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-CH2CH2NRC(O)-或-CH2NRC(O)亚环丙基-;其中R为H或任选取代的C1-6脂肪族基;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(g)L为-NHC(O)CH=CH-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)(C=N2)-、-NHC(O)(C=N2)C(O)-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-NHC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NHC(O)-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-CH2CH2NHC(O)-或-CH2NHC(O)亚环丙基-;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(h)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个亚烷基双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(i)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个三键且L的一或两个其它亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(j)L为-C≡C-、-C≡CCH2N(异丙基)-、-NHC(O)C≡CCH2CH2-、-CH2-C≡C-CH2-、-C≡CCH2O-、-CH2C(O)C≡C-、-C(O)C≡C-或-CH2OC(=O)C≡C-;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(k)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L的一个亚甲基单元经亚环丙基置换且L的一或两个其它亚甲基单元独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或
(l)L为共价键且Y选自:
(i)经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6烷基;
(ii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6烯基;或
(iii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6炔基;或
(iv)具有1个选自氧或氮的杂原子的饱和3-4元杂环,其中所述环经1-2个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(v)具有1-2个选自氧或氮的杂原子的饱和5-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001171
其中R、Q、Z和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(vii)饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(viii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和3-6元单环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(ix)部分不饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xi)具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和4-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001182
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xiii)具有0-2个氮的6元芳香族环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001183
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xv)具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环,其中所述环经1-3个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001184
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xvii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re如上文所定义和本文所述;
(m)L为-C(O)-且Y选自:
(i)经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6烷基;或
(ii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6烯基;或
(iii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6炔基;或
(iv)具有1个选自氧或氮的杂原子的饱和3-4元杂环,其中所述环经1-2个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(v)具有1-2个选自氧或氮的杂原子的饱和5-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001191
其中R、Q、Z和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(vii)饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(viii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和3-6元单环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(ix)部分不饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001192
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xi)具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和4-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001193
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xiii)具有0-2个氮的6元芳香族环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001201
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xv)具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环,其中所述环经1-3个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001202
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xvii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re如上文所定义和本文所述;
(n)L为-N(R)C(O)-且Y选自:
(i)经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6烷基;或
(ii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6烯基;或
(iii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6炔基;或
(iv)具有1个选自氧或氮的杂原子的饱和3-4元杂环,其中所述环经1-2个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(v)具有1-2个选自氧或氮的杂原子的饱和5-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001203
其中R、Q、Z和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(vii)饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(viii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和3-6元单环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(ix)部分不饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xi)具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和4-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001212
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xiii)具有0-2个氮的6元芳香族环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001213
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xv)具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环,其中所述环经1-3个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001214
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xvii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re如上文所定义和本文所述;
(o)L为二价C1-8饱和或不饱和直链或具支链烃链;且Y选自:
(i)经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6烷基;
(ii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6烯基;或
(iii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6炔基;或
(iv)具有1个选自氧或氮的杂原子的饱和3-4元杂环,其中所述环经1-2个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(v)具有1-2个选自氧或氮的杂原子的饱和5-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001221
其中R、Q、Z和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(vii)饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(viii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和3-6元单环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(ix)部分不饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001222
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xi)具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和4-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001223
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xiii)具有0-2个氮的6元芳香族环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001231
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xv)具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环,其中所述环经1-3个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001232
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xvii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re如上文所定义和本文所述;
(p)L为共价键、-CH2-、-NH-、-C(O)-、-CH2NH-、-NHCH2-、-NHC(O)-、-NHC(O)CH2OC(O)-、-CH2NHC(O)-、-NHSO2-、-NHSO2CH2-、-NHC(O)CH2OC(O)-或-SO2NH-;且Y选自:
(i)经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6烷基;或
(ii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6烯基;或
(iii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6炔基;或
(iv)具有1个选自氧或氮的杂原子的饱和3-4元杂环,其中所述环经1-2个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(v)具有1-2个选自氧或氮的杂原子的饱和5-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001241
其中R、Q、Z和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(vii)饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(viii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和3-6元单环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(ix)部分不饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001242
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xi)具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和4-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001243
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xiii)具有0-2个氮的6元芳香族环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001244
其中Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xv)具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环,其中所述环经1-3个Re基团取代,其中Re基团各自如上文所定义和本文所述;或
Figure BDA0000158388020001245
Figure BDA0000158388020001251
其中R和Re各自如上文所定义和本文所述;或
(xvii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代,其中Re如上文所定义和本文所述。
(q)L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L的两个或三个亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
在某些实施例中,式I的Y基团选自下表3中所阐述的基团,其中各波状线指示连接分子的其余部分的连接点。
表3.示范性Y基团:
Figure BDA0000158388020001271
Figure BDA0000158388020001281
其中Re各自独立地为适合离去基、NO2、CN或氧代基。
在某些实施例中,R1为-C≡CH、-C≡CCH2NH(异丙基)、-NHC(O)C≡CCH2CH3、-CH2-C≡C-CH3、-C≡CCH2OH、-CH2C(O)C≡CH、-C(O)C≡CH或-CH2OC(=O)C≡CH。在一些实施例中,R1选自-NHC(O)CH=CH2、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)2或-CH2NHC(O)CH=CH2
在一些实施例中,R1长度为6-12个原子。在某些实施例中,R1长度为6-9个原子。在某些实施例中,R1长度为10-12个原子。在某些实施例中,R1长度为至少8个原子。
在某些实施例中,R1为-C(O)CH2CH2C(O)CH=C(CH3)2、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CH(环丙基)、-C(O)CH2CH2CO)CH=CHCH3、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH2CH3或-C(O)CH2CH2C(O)C(=CH2)CH3。在某些实施例中,R1为-C(O)CH2NHC(O)CH=CH2、-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3或-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)C(=CH2)CH3。在某些实施例中,R1为-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=C(CH3)2、-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3或-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CH2。在某些实施例中,R1为-C(O)(CH2)3NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3或-C(O)(CH2)3NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CH2
在某些实施例中,R1选自下表4中所阐述的基团,其中各波状线指示连接分子的其余部分的连接点。
表4:示范性R 1 基团
Figure BDA0000158388020001291
Figure BDA0000158388020001301
Figure BDA0000158388020001311
Figure BDA0000158388020001321
Figure BDA0000158388020001331
Figure BDA0000158388020001351
Figure BDA0000158388020001361
其中Re各自独立地为适合离去基、NO2、CN或氧代基。
在某些实施例中,R1选自:
Figure BDA0000158388020001362
Figure BDA0000158388020001371
Figure BDA0000158388020001381
在某些实施例中,R1选自:
Figure BDA0000158388020001382
Figure BDA0000158388020001391
示范性式I化合物阐述于下表5中:
表5.示范性式I化合物
Figure BDA0000158388020001401
在某些实施例中,本发明提供选自上表5中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式II-a化合物阐述于下表6中:
表6.示范性式II-a化合物
Figure BDA0000158388020001402
Figure BDA0000158388020001411
Figure BDA0000158388020001421
Figure BDA0000158388020001431
Figure BDA0000158388020001471
Figure BDA0000158388020001481
Figure BDA0000158388020001491
Figure BDA0000158388020001501
Figure BDA0000158388020001511
Figure BDA0000158388020001521
Figure BDA0000158388020001531
Figure BDA0000158388020001541
Figure BDA0000158388020001551
Figure BDA0000158388020001561
Figure BDA0000158388020001571
Figure BDA0000158388020001581
Figure BDA0000158388020001591
Figure BDA0000158388020001611
Figure BDA0000158388020001621
Figure BDA0000158388020001631
Figure BDA0000158388020001641
Figure BDA0000158388020001651
Figure BDA0000158388020001661
Figure BDA0000158388020001671
Figure BDA0000158388020001681
在某些实施例中,本发明提供选自上表6中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式II-c化合物阐述于下表7中:
表7.示范性式II-c化合物
Figure BDA0000158388020001691
在某些实施例中,本发明提供选自上表7中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式II-g化合物阐述于下表8中:
表8.示范性式II-g化合物
Figure BDA0000158388020001701
Figure BDA0000158388020001711
在某些实施例中,本发明提供选自上表8中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式III化合物阐述于下表9中:
表9.示范性式III化合物
Figure BDA0000158388020001712
Figure BDA0000158388020001721
Figure BDA0000158388020001731
在某些实施例中,本发明提供选自上表9中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式V化合物阐述于下表10中:
表10.示范性式V化合物
Figure BDA0000158388020001741
Figure BDA0000158388020001751
Figure BDA0000158388020001761
Figure BDA0000158388020001771
Figure BDA0000158388020001781
在某些实施例中,本发明提供选自上表10中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式VI化合物阐述于下表11中:
表11.示范性式VI化合物
Figure BDA0000158388020001782
Figure BDA0000158388020001791
Figure BDA0000158388020001801
Figure BDA0000158388020001811
Figure BDA0000158388020001821
在某些实施例中,本发明提供选自上表11中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式VII化合物阐述于下表12中:
表12.示范性式VII化合物
Figure BDA0000158388020001822
Figure BDA0000158388020001831
Figure BDA0000158388020001841
在某些实施例中,本发明提供选自上表12中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式VIII化合物阐述于下表13中:
表13.示范性式VIII化合物
Figure BDA0000158388020001852
在某些实施例中,本发明提供选自上表13中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式IX化合物阐述于下表14中:
表14.示范性式IX化合物
Figure BDA0000158388020001862
Figure BDA0000158388020001871
在某些实施例中,本发明提供选自上表14中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式X化合物阐述于下表15中:
表15.示范性式X化合物
Figure BDA0000158388020001872
在某些实施例中,本发明提供选自上表15中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式XI化合物阐述于下表16中:
表16.示范性式XI化合物
Figure BDA0000158388020001881
Figure BDA0000158388020001891
在某些实施例中,本发明提供选自上表16中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
示范性式XII化合物阐述于下表17中:
表17.示范性式XII化合物
Figure BDA0000158388020001892
Figure BDA0000158388020001901
Figure BDA0000158388020001921
Figure BDA0000158388020001931
Figure BDA0000158388020001941
Figure BDA0000158388020001951
Figure BDA0000158388020001961
Figure BDA0000158388020001981
在某些实施例中,本发明提供选自上表17中所描绘的化合物的任何化合物或其医药学上可接受的盐。
制备所提供的化合物的一般方法
在某些实施例中,所提供的式I化合物一般根据方案1制备。
方案1
Figure BDA0000158388020001991
其中PG为氨基保护基且各变量如本文所定义和描述。
通过在高温(40-100℃)下用亚硫酰氯处理,使经取代的2-氨基苯甲酸(sch-1a)转化为其酰氯。接着使中间物与过量苯胺sch-1b在CHCl3中在回流下反应,得到化合物sch-1c。在回流下用含氯乙酰氯的乙酸处理后,可获得化合物sch-1d。接着中间物sch-1d可与巯基嘌呤在碱(即K2CO3)存在下反应,形成sch-1e。接着去除保护基且可引入弹头基,得到化合物sch-1f。
在某些实施例中,所提供的式II-a化合物一般根据方案2制备。
方案2
Figure BDA0000158388020002001
其中M为硼酸或锡烷基。
通过使吗啉与经取代的2,4-二氯噻吩并[3,2-d]嘧啶在甲醇中于室温下反应来制备化合物sch-2a。在低温下用丁基锂处理sch-2a并接着添加DMF之后,可引入甲酰基。用哌嗪-1-甲酸叔丁酯对sch-2b进行还原胺化,产生sch-2c。在钯催化下使sch-2c与硼酸或锡烷基化合物偶合,得到化合物sch-2d。接着去除boc基团且可引入弹头基,得到化合物sch-2e。
在另一实施例中,式II-a化合物可如方案3中所述来制备。
方案3
Figure BDA0000158388020002002
其中M为硼酸或锡烷基,且R1P为R1的前体。
通过在低温下用n-BuLi将经取代的4-(2-氯噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基)吗啉去质子化,接着用碘处理来制备中间物sch-3a。在钯催化下使sch-3a与硼酸或锡烷基化合物进行选择性偶合,得到化合物sch-3b。再次在钯催化下在较高温度下与另一硼酸或锡烷基化合物偶合,得到化合物sch-3c。在最后步骤中,R1P基团转化为弹头基R1,如sch-3d中所示。
在某些实施例中,所提供的式II-c化合物一般根据方案4制备。
方案4
Figure BDA0000158388020002011
其中M为硼酸或锡烷基,且R1P为R1的前体。
化合物sch-4a是根据方案2和方案3制备。在钯催化下使sch-4a与硼酸或锡烷基化合物偶合,得到化合物sch-4b。接着在最后步骤中使R1P基团转化为弹头基R1,得到sch-4c。
在某些实施例中,所提供的式III或IV的化合物一般根据方案5制备。
方案5
Figure BDA0000158388020002012
使具有适于在最后步骤中转化为弹头基R1的R基团的化合物Sch-5a与胺反应,形成化合物sch-5b。接着利用还原剂还原硝基(即氢化),得到化合物sch-5c,所述化合物sch-5c在用光气或ClC(O)OCCl3处理之后形成环状脲sch-5d。在相转移条件下用烷基碘化物将所述脲烷基化,形成化合物sch-5e。在最后步骤中,将R基团转化为WH基团R1,得到sch-5f或sch-5g。
在某些实施例中,所提供的式V-a或V-b的化合物一般根据方案6制备。
方案6
Figure BDA0000158388020002021
通过添加经单保护的哌嗪到4-氯喹啉-6-甲酸甲酯中来制备化合物sch-6a。用金属氢化物试剂(例如氢化锂铝)还原sch-6a,得到化合物sch-6b,可用例如戴斯-马丁高碘烷(Dess-Martin periodinate)等氧化剂氧化所述化合物sch-6b,得到化合物sch-6c。在例如哌啶等碱存在下使sch-7c与噻唑烷-2,4-二酮或2-(2,6-二氯苯基氨基)噻唑-4(5H)-酮缩合,得到烯烃sch-6d。用例如HCl等酸脱除sch-6d的保护基,得到sch-6e。在最后步骤中,可使用氨基酸偶合来连接弹头基R,得到化合物sch-6f。
在某些实施例中,所提供的式VI-a化合物一般根据方案7制备。
方案7
Figure BDA0000158388020002031
其中R1P为R1的前体。
通过添加胺到经取代的丙烯酸酯来制备化合物Sch-7a。在碱(即TEA)存在下用乙基丙二酰氯处理sch-7a,得到化合物sch-7b,所述化合物sch-7b用碱处理后环化且在脱羧后形成化合物sch-7c。接着用溴处理化合物sch-7c,接着添加硫脲和DIPEA,得到氨基噻唑sch-7d。接着通过与亚硝酸正丁酯和CuBr2反应,将氨基转化为溴基。在布赫瓦尔德条件(Buchwald condition)下使所得溴噻唑sch-7e与3,4-二氢-2H-苯并[b][1,4]噁嗪(sch-7f)偶合,得到化合物sch-7g。在最后步骤中,接着将R1P基团转化为弹头基R1,得到化合物sch-7h。
在某些实施例中,所提供的式VII化合物一般根据方案8制备。
方案8
Figure BDA0000158388020002032
其中M为硼酸或锡烷基,且R1P为R1的前体。
通过添加肼到2,4,6-三氯嘧啶-5-甲醛,接着以吗啉置换氯基来制备化合物sch-8a。用芳基硼酸酯或锡烷处理sch-8a,得到化合物sch-8b。在最后步骤中,接着将R1P基团转化为弹头基R1,得到化合物sch-8c。
在某些实施例中,所提供的式IX化合物一般根据方案9制备。
方案9
Figure BDA0000158388020002041
其中M为酸、酰氯、磺酰氯、异氰酸酯等,L为离去基(例如卤基、甲磺酸酯基、甲苯磺酸酯基),且R1P为R1的前体。
通过使芳基与氨基偶合来制备化合物sch-9a。用化合物sch-9a的苯酚置换离去基,得到化合物sch-9b。在最后步骤中,接着将R1P基团转化为弹头基R1,得到化合物sch-9c。
在某些实施例中,所提供的式XI化合物一般根据方案10制备。
方案10
Figure BDA0000158388020002042
其中M为硼酸或锡烷基,L为离去基(例如甲磺酸酯基或甲苯磺酸酯基)且R1P为R1的前体。
通过使B11基团与吡唑并嘧啶骨架偶合来制备化合物sch-10a。进行铃木偶合(Suzukicoupling)或斯蒂尔偶合(Stille coupling),得到化合物sch-10b。在最后步骤中,接着将R1P基团转化为弹头基R1,得到化合物sch-10c。
在某些实施例中,所提供的式XII化合物一般根据方案11制备。
方案11
其中X和Y独立地为N或CH,M为硼酸或锡烷基,L为硼酸或锡烷基且R1P为R1的前体。
首先进行铃木偶合或斯蒂尔偶合,得到化合物sch-11a,且再进行铃木偶合或斯蒂尔偶合,得到化合物sch-11b。在最后步骤中,接着将R1P基团转化为弹头基R1,得到化合物sch-11c。
4.用途、调配和投药
医药学上可接受的组合物
根据另一实施例,本发明提供一种包含本发明化合物或其医药学上可接受的衍生物和医药学上可接受的载剂、佐剂或媒剂的组合物。本发明组合物中化合物的量为有效地显著抑制生物样品或患者中的PI3激酶或其突变体(例如Glu542、Glu545和His1047)的量。在某些实施例中,本发明组合物中化合物的量为有效地显著抑制生物样品或患者中的PI3激酶或其突变体的量。在某些实施例中,本发明的组合物经调配以供投予需要此组合物的患者。在一些实施例中,本发明的组合物经调配以经口投予患者。
如本文所用的术语“患者”意谓动物,优选为哺乳动物,且最优选为人类。
术语“医药学上可接受的载剂、佐剂或媒剂”是指不会破坏与其一起调配的化合物的药理学活性的无毒载剂、佐剂或媒剂。可用于本发明组合物中的医药学上可接受的载剂、佐剂或媒剂包括(但不限于)离子交换剂、氧化铝、硬脂酸铝、卵磷脂、血清蛋白(例如人类血清白蛋白)、缓冲物质(例如磷酸盐)、甘氨酸、山梨酸、山梨酸钾、饱和植物脂肪酸的偏甘油酯混合物、水、盐或电解质(例如硫酸鱼精蛋白)、磷酸氢二钠、磷酸氢钾、氯化钠、锌盐、胶状二氧化硅、三硅酸镁、聚乙烯基吡咯烷酮、基于纤维素的物质、聚乙二醇、羧甲基纤维素钠、聚丙烯酸酯、蜡、聚乙烯-聚氧丙烯嵌段聚合物、聚乙二醇和羊毛脂。
“医药学上可接受的衍生物”意谓本发明化合物的任何无毒盐、酯、酯的盐或其它衍生物,其在投予接受者后能够直接或间接地提供本发明化合物或其抑制性活性代谢物或残余物。
如本文所用的术语“其抑制性活性代谢物或残余物”意谓其代谢物或残余物也为PI3激酶或其突变体(例如Glu542、Glu545和His1047)的抑制剂。
本发明的组合物可经口、不经肠、通过吸入喷雾、局部、经直肠、经鼻、经颊、经阴道或经由植入式储积器投予。如本文所用的术语“不经肠”包括皮下、静脉内、肌肉内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内和颅内注射或输注技术。所述组合物优选经口、腹膜内或静脉内投予。本发明组合物的无菌可注射形式可为水性或油性悬浮液。这些悬浮液可根据此项技术中已知的技术,使用适合分散剂或湿润剂和悬浮剂来调配。无菌可注射制剂也可为不经肠可接受的无毒稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液或悬浮液,例如1,3-丁二醇中的溶液。可采用的可接受的媒剂和溶剂包括水、林格氏溶液(Ringer′s solution)和等渗氯化钠溶液。此外,无菌不挥发性油常常用作溶剂或悬浮介质。
为此,可采用任何无刺激性的不挥发性油,包括合成单酸甘油酯或二酸甘油酯。例如油酸等脂肪酸和其甘油酯衍生物适用于制备注射剂,医药学上可接受的天然油也适用,例如橄榄油或蓖麻油,尤其其聚氧乙烯化型式。这些油溶液或悬浮液也可含有长链醇稀释剂或分散剂,例如羧甲基纤维素或通常用于调配医药学上可接受的剂型(包括乳液和悬浮液)的类似分散剂。其它常用表面活性剂,例如吐温(Tweens)、司盘(Spans)和其它常用于制造医药学上可接受的固体、液体或其它剂型的乳化剂或生物利用率增强剂,也可用于调配目的。
本发明的医药学上可接受的组合物可以任何经口可接受的剂型来经口投予,所述剂型包括(但不限于)胶囊、片剂、水性悬浮液或溶液。在经口使用的片剂的状况下,常用的载剂包括乳糖和玉米淀粉。通常也添加润滑剂,例如硬脂酸镁。对于以胶囊形式经口投予,适用的稀释剂包括乳糖和干玉米淀粉。当需要水性悬浮液供经口使用时,将活性成分与乳化剂和悬浮剂组合。必要时也可添加某些甜味剂、调味剂或着色剂。
或者,本发明的医药学上可接受的组合物可以供直肠投药的栓剂形式投予。这些组合物可通过将药剂与适合非刺激性赋形剂混合来制备,所述赋形剂在室温下为固体,但在直肠温度下为液体,且因此将在直肠中熔融,从而释放药物。所述物质包括可可脂、蜂蜡和聚乙二醇。
本发明的医药学上可接受的组合物也可局部投予,尤其在治疗目标包括局部施用易于接近的区域或器官(包括眼睛、皮肤或下肠道的疾病)时。易于制备适合局部调配物用于这些区域或器官的每一者。
下肠道的局部施用可用直肠栓剂调配物(参见上文)或适合灌肠剂调配物来实现。也可使用局部透皮贴片。
对于局部施用,所提供的医药学上可接受的组合物可调配成含有活性组分悬浮或溶解于一种或一种以上载剂中的适合软膏。用于局部投予本发明化合物的载剂包括(但不限于)矿物油、液体矿脂、白矿脂、丙二醇、聚氧乙烯、聚氧丙烯化合物、乳化蜡和水。或者,所提供的医药学上可接受的组合物可调配成含有活性组分悬浮或溶解于一种或一种以上医药学上可接受的载剂中的适合洗剂或乳膏。适合载剂包括(但不限于)矿物油、脱水山梨糖醇单硬脂酸酯、聚山梨醇酯60、十六烷基酯蜡、鲸蜡硬脂醇、2-辛基十二醇、苯甲醇和水。
对于眼科使用,所提供的医药学上可接受的组合物可调配成于pH值经调整的等渗无菌生理盐水中的微米尺寸化悬浮液,或优选调配成于pH值经调整的等渗无菌生理盐水中的溶液,其含或不含例如氯苄烷铵等防腐剂。或者,对于眼科使用,医药学上可接受的组合物可调配成软膏,例如矿脂。
本发明的医药学上可接受的组合物也可通过鼻气雾剂或吸入来投予。这些组合物是根据医药调配技术中众所周知的技术来制备,且可采用苯甲醇或其它适合防腐剂、增强生物利用率的吸收促进剂、碳氟化合物和/或其它常规增溶剂或分散剂制成于生理盐水中的溶液。
最优选本发明的医药学上可接受的组合物经调配以供经口投予。所述调配物可与食物一起或不与食物一起投予。在一些实施例中,本发明的医药学上可接受的组合物不与食物一起投予。在其它实施例中,本发明的医药学上可接受的组合物与食物一起投予。
可与载剂物质组合制备呈单一剂型的组合物的本发明化合物的量将视所治疗的宿主、特定投药模式而变化。优选所提供的组合物应经调配,以便每天可向接受这些组合物的患者投予每公斤体重在0.01-100mg之间剂量的抑制剂。
也应了解,用于任何特定患者的具体剂量和治疗方案都将取决于多种因素,包括所用特定化合物的活性、年龄、体重、一般健康状况、性别、饮食、投药时间、排泄速率、药物组合和治疗医师的判断以及所治疗特定疾病的严重程度。组合物中本发明化合物的量也将取决于组合物中的特定化合物。
化合物和医药学上可接受的组合物的用途
本文所述的化合物和组合物一般适用于抑制一种或一种以上酶的激酶活性。
受本文所述的化合物和组合物抑制且本文所述的方法可适用的激酶的实例包括PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、1A类PI3Kβ(PI3Kβ)、2类PI3Kβ(PI3KC2β)、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα,或其突变体。
本发明中用作PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体的抑制剂的化合物的活性可在体外、体内或细胞系中进行分析。体外分析包括测定对磷酸化活性和/或后续功能结果或者活化的PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体的ATP酶活性的抑制作用的分析。替代体外分析定量抑制剂结合于PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα的能力。抑制剂结合可通过对抑制剂进行放射性标记,接着使其结合,分离抑制剂/PI3Kα、抑制剂/PI3Kγ、抑制剂/PI3Kδ、抑制剂/PI3Kβ、抑制剂/PI3KC2β、抑制剂/mTOR、抑制剂/DNA-PK、抑制剂/ATM激酶或抑制剂/PI4KIIIα复合物且测定所结合放射性标记的量来测量。或者,抑制剂结合可通过执行将新型抑制剂与结合于已知放射性配体的PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα一起培育的竞争实验来测定。下文实例中阐述用于分析本发明中用作PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体的抑制剂的化合物的详细条件。
不希望受任何特定理论束缚,相信所提供的包含弹头部分的化合物在抑制PI3激酶或其突变体方面比式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头基或完全不存在(即为氢)的相应化合物有效。举例来说,式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物在抑制PI3激酶或其突变体(例如Glu542、Glu545和His1047)方面可比式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头部分或不存在的相应化合物有效。
在针对PI3激酶或其突变体的IC50方面,如上文所揭示的所提供的包含弹头部分的化合物可比式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头部分或不存在的相应化合物有效。式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物相较于式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头部分的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的相应化合物的所述比较效力可通过标准时间相关性分析方法来测定,例如下文实例部分中详细描述的分析方法。在某些实施例中,式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物明显比式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头部分或不存在的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的相应化合物有效。在一些实施例中,式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物明显比式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头部分或不存在的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI□b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的相应化合物有效,其中所述效力是在约1分钟、约2分钟、约5分钟、约10分钟、约20分钟、约30分钟、约1小时、约2小时、约3小时、约4小时、约8小时、约12小时、约16小时、约24小时或约48小时后观测到。在一些实施例中,式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物的效力为式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头部分或不存在的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的相应化合物的约1.5倍、约2倍、约5倍、约10倍、约20倍、约25倍、约50倍、约100倍或甚至约1000倍中的任一者。举例来说,已发现在PI3KαHTRF分析中,化合物II-a-16的效力为其可逆对应物IIR-a-16的约35倍。
所提供的共价抑制剂优于非共价抑制剂的其它实例显示于下表18和19中。“A”表示≤10nM;“B”表示10-100nM;且“C”表示100-1000nM。
表18.
表19.
PI3K路径
磷脂酰肌醇3-激酶路径是一条对众多细胞功能(包括细胞周期进程、增殖、运动性、代谢和存活)产生影响的重要信号传导路径(马隆(Marone)等人,生物化学与生物物理学学报(Biochim.Biophys.Acta)(2008)1784:159-185)。在IA类PI3K情况下受体酪氨酸激酶的活化或在IB类PI3Kγ情况下G蛋白的活化会引起磷脂酰肌醇-(4,5)-二磷酸的磷酸化,产生膜结合的磷脂酰肌醇-(3,4,5)-三磷酸。磷脂酰肌醇-(3,4,5)-三磷酸通过结合激酶的普列克底物蛋白(pleckstrin)-同源(PH)结构域来促进多种蛋白激酶自细胞质转移到质膜。
作为PI3K的下游目标的激酶包括磷脂酰肌醇依赖性激酶1(PDK1)和Akt(也称为蛋白激酶B或PKB)。所述激酶磷酸化,接着使涉及例如GSK3、mTOR、PRAS40、FKHD、NF-κB、BAD、卡斯蛋白酶-9(Caspase-9)和其它介体等介体的多个其它路径活化或失活。这些路径与例如细胞周期进程、细胞存活和细胞凋亡、细胞生长、转录、翻译、代谢、脱颗粒和细胞运动等许多细胞过程有关。
PI3K路径的一种重要负反馈机制为PTEN,其为催化磷脂酰肌醇-(3,4,5)-三磷酸脱磷酸形成磷脂酰肌醇-(4,5)-二磷酸的磷酸酶。在所有实体肿瘤中有超过60%,PTEN突变成无活性形式,允许PI3K路径组成性活化。因为许多癌症为实体肿瘤,所以此类观测结果证明,靶向PI3K本身或PI3K路径中的个别下游激酶提供一种有望减轻或甚至消除许多癌症中的失调,并因此恢复正常细胞功能和行为的方法。
I类PI3激酶
因为PI3激酶(“PI3K”)与细胞生长、增殖和细胞存活相关,所以已长期研究其在癌症发病机制中的作用。在恶性疾病中最常观测到的PI3K信号传导失常为PTEN功能丧失或减弱以及PI3Kα突变。PTEN使磷脂酰肌醇-(3,4,5)-三磷酸脱磷酸,且因此其为PI3K的负调节剂。PTEN功能丧失引起PI3K的组成性活性,且与神经胶质瘤、黑色素瘤、前列腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌、乳癌和结肠直肠癌以及白血病有关。
在30%以上的实体肿瘤中观测到编码PI3Kα的PIK3CA基因突变。PIK3CA也在许多癌症中扩增。组成性活性PI3Kα形式的表达允许细胞在次最佳条件下存活和迁移,导致肿瘤形成和转移。PI3Kα过度表达和/或PI3Kα突变与许多癌症有关,包括(但不限于)卵巢癌、子宫颈癌、肺癌、结肠直肠癌、胃癌、脑癌、乳癌和肝细胞癌。
PI3Kβ也与癌发生有关。PI3Kβ的丧失会阻碍小鼠胚胎纤维母细胞的细胞生长(贾(Jia)等人,自然(Nature)(2008)454:776-779)。在前列腺上皮中研究PI3Kβ在由PTEN丧失所引起的肿瘤形成中的作用。在前列腺中除去PI3Kβ阻断前列腺前部中由PTEN丧失所驱动的肿瘤形成。PI3Kβ为治疗实体肿瘤的重要目标。
除直接作用外,相信IA类PI3K(例如PI3Kα和PI3Kβ)的活化,例如借助于受体酪氨酸激酶、GPCR系统或整合素的配体依赖性或配体不相关活化,促成在信号传导路径的上游发生的肿瘤形成事件(瓦拉(Vara)等人,癌症治疗评述(Cancer Treatment Reviews)(2004)30:193-204)。所述上游信号传导路径的实例包括多种肿瘤中导致PI3K介导的路径活化的受体酪氨酸激酶Erb2的过度表达(哈拉雷(Harari)等人,癌基因(Oncogene)(2000)19:6102-6114),和致癌基因Ras的过度表达(考夫曼-翟(Kauffmann-Zeh)等人,自然,(1997)385:544-548)。另外,IA类PI3K可间接促进由各种下游信号传导事件所引起的肿瘤形成。举例来说,PTEN肿瘤抑制子磷酸酶催化磷脂酰肌醇-(3,4,5)-三磷酸再转化成磷脂酰肌醇-(4,5)-二磷酸的作用的丧失经由使PI3K介导的磷脂酰肌醇-(3,4,5)-三磷酸的产生失调而与众多的肿瘤相关(辛普森(Simpson)和帕森斯(Parsons),实验细胞研究(Exp.CellRes.)(2001)264:29-41)。此外,相信其它PI3K介导的信号传导事件的作用的增强例如通过活化Akt而促进多种癌症(尼科尔森(Nicholson)和安德森(Anderson),细胞信号传导(Cellular Signalling)(2002)381-395)。
除在肿瘤细胞中介导增殖和存活信号传导的作用外,还充分证明IA类PI3K酶也将经由其在肿瘤相关的基质细胞中的功能而促进肿瘤形成。举例来说,已知PI3K信号传导在回应于例如VEGF等促血管生成因子而介导内皮细胞中的血管生成事件中起重要作用(阿彼德(Abid)等人,动脉硬化、血栓形成与血管生物学(Arterioscler.Thromb.Vasc.Biol.)(2004)24:294-300)。因为I类PI3K酶也与运动性和迁移相关(索耶尔(Sawyer),调研药物专家评论(Expert Opinion Investig.Drugs)(2004)1-19),所以PI3K抑制剂应经由抑制肿瘤细胞侵袭和转移来提供治疗益处。
另外,I类PI3K酶在调节免疫细胞中起重要作用,其中PI3K活性促进发炎性细胞的促肿瘤形成作用(考森斯(Coussens)和韦伯(Werb),自然,(2002)420:860-867)。这些发现表明,I类PI3K酶的药理学抑制剂应具有治疗各种形式的癌症疾病的治疗价值,所述癌症疾病包含例如癌瘤和肉瘤等实体肿瘤以及白血病和淋巴恶性疾病。具体说来,I类PI3K酶的抑制剂应具有治疗例如乳癌、结肠直肠癌、肺癌(包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌和细支气管肺泡癌)和前列腺癌以及胆管癌、骨癌、膀胱癌、头颈癌、肾癌、肝癌、胃肠组织癌、食道癌、卵巢癌、胰腺癌、皮肤癌、睾丸癌、甲状腺癌、子宫癌、子宫颈癌和外阴癌以及白血病(包括ALL和CML)、多发性骨髓瘤和淋巴瘤的治疗价值。
PI3K与细胞和器官尺寸的控制有关联。PI3Kα的过度表达会导致小鼠的心脏增大(盐井(Shioi)等人,欧洲分子生物学学会杂志(EMBO J.)(2000)19:2537-2548)。当在PI3K下游的Akt/PKB过度表达时,可见到心脏尺寸甚至增加更多。通过用mTOR抑制剂雷帕霉素(rapamycin)治疗可逆转此现象,表明Akt/PKB信号传导是经由mTOR起作用来控制心脏尺寸。
虽然IA类PI3K(例如PI3Kα)控制心脏尺寸,但缺乏PI3Kγ的小鼠显示对心脏尺寸不起作用。然而,PI3Kγ显示其影响心脏收缩性。在横向主动脉缩窄(TAC)模型中,缺乏PI3Kγ的小鼠呈现纤维化和腔室扩张,导致急性心力衰竭。经显示,PI3Kγ和PI3Kδ还调节局部缺血/再灌注损伤后的梗塞尺寸(度卡斯(Doukas)等人,美国国家科学院院刊(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)(2006)103:19866-19871)。举例来说,经显示,用PI3Kγ/δ双重抑制剂TG100-115处理动物减少发炎性反应和水肿形成,且目前正在临床试验中针对急性心肌梗塞进行研究。
PI3Kγ和PI3Kδ主要在白细胞中表达。虽然经由基因敲除(knockout)研究,PI3Kγ和PI3Kδ与慢性炎症和过敏症相关,但在基因敲除小鼠中无法研究PI3Kα和PI3Kβ,因为缺乏PI3Kα和PI3Kβ的小鼠在胚胎发育期间死亡。PI3Kγ基因敲除的小鼠呈现对于发炎性反应来说重要的细胞(例如嗜中性白细胞、巨噬细胞、肥大细胞、树突状细胞和粒细胞)的迁移减弱。肥大细胞因在表面上表达IgE的高亲和力受体而成为过敏性反应、哮喘和异位性皮炎中的主要效应细胞。另外,防止PI3Kγ基因敲除的小鼠发生全身性过敏反应。PI3Kδ无活性的小鼠也呈现IgE介导的发炎性反应减弱,且其肥大细胞呈现迁移缺陷。
与PI3Kγ和PI3Kδ有关的发炎性疾病包括(但不限于)类风湿性关节炎、全身性红斑狼疮、动脉粥样硬化、急性胰炎、牛皮癣和慢性阻塞性肺病(COPD)。
II类PI3激酶
II类PI3K的特征为C端C2同源结构域。II类包含三个催化同功异型物:C2α、C2β和C2γ。C2α和C2β在整个身体内表达,而C2γ仅限于肝细胞。尚未鉴别出II类PI3K的调节亚单元。据报导,多种刺激物可活化II类PI3K,包括趋化因子(MCP-1)、细胞因子(瘦素(leptin)和TNFa)、LPA、胰岛素以及EGF受体、PDGF受体和SCF受体。已表明PI3KC2β可能与LPA诱导的卵巢和子宫颈癌细胞迁移有关(马夫斯(Maffucci)等人,细胞生物学杂志(J. Cell.Biol.)(2005)169:789-799)。
PI4激酶
磷脂酰肌醇4-激酶(“PI4K”)与PI3K密切相关,所述PI4K使磷脂酰肌醇的4′-OH位磷酸化。在四种已知的PI4K同功异型物中,又称PI4KIIIα的PI4KA与PI3K最密切相关。PI4KIIIα主要在神经系统中表达,且主要定位于内质网、细胞核和质膜。在质膜上,PI4KIIIα与涉及细胞骨架重塑和膜起泡的离子通道相关联(金(Kim)等人,欧洲分子生物学学会杂志,(2001)20:6347-6358)。
IV类PI3激酶
雷帕霉素的哺乳动物目标(mTOR)是一种由生长因子和养分利用率调节的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。mTOR负责协调蛋白质合成、细胞生长和增殖。有关mTOR信号传导的大部分知识都是基于对其配体雷帕霉素的研究。雷帕霉素首先结合于12kDa的亲免素(immunophilin)FK506结合蛋白(FKBP 12)且此复合物抑制mTOR信号传导(郑(Tee)和布兰尼斯(Blenis),细胞与发育生物学研讨文辑(Seminars in Cell and Developmental Biology.)2005,16,29-37)。mTOR蛋白由以下组成:催化激酶结构域、FKBP12-雷帕霉素结合(FRB)结构域、C末端附近的假定阻遏结构域和N末端处多达20个串联重复的HEAT基元,以及FRAP-ATM-TRRAP(FAT)和FAT C末端结构域(黄(Huang)和郝格顿(Houghton),药理学新见(Curr.Opin.in Pharmacology)(2003)3:371-377)。mTOR激酶是细胞生长的关键调节物,且经显示可调节多种细胞功能,包括翻译、转录、mRNA转换、蛋白质稳定性、肌动蛋白细胞骨架重组和自体吞噬(吉辛托(Jacinto)和霍尔(Hall),自然评论:分子细胞生物学(Nat.Rev.Mol.Cell Bio.)(2005)4:117-126)。mTOR激酶整合来自生长因子(例如胰岛素或类胰岛素生长因子)与养分(例如氨基酸和葡萄糖)的信号,以调节细胞生长。mTOR激酶由生长因子经由PDK-Akt路径活化。哺乳动物细胞中mTOR激酶的最充分表征的功能是经由两种路径调节翻译,即活化核糖体S6K1以增强带有5′末端寡嘧啶段(TOP)的mRNA的翻译,和抑制4E-BP1以进行CAP依赖性mRNA翻译。
目前有大量证据表明,在癌症中mTOR上游的路径常被活化(维范克(Vivanco)和索耶尔斯(Sawyers),自然评论:癌症(Nat.Rev.Cancer)(2002)2:489-501;比耶斯提(Bjornsti)和郝格顿,自然评论:癌症,(2004)4:335-348;猪木(Inoki)等人,自然遗传学(NatureGenetics)(2005)37:19-24)。举例来说,在不同人类肿瘤中突变的PI3K路径组分包括生长因子受体的活化突变以及PI3K和Akt的扩增和/或过度表达。另外,有证据证明内皮细胞增殖也可能取决于mTOR信号传导。内皮细胞增殖是由PI3K-Akt-mTOR信号传导路径的血管内皮细胞生长因子(VEGF)活化来刺激(丹斯(Dancey),调研药物专家评论(Expert Opinion on Investigational Drugs),2005,14,313-328)。另外,相信mTOR激酶信号传导经由对低氧诱导因子-lα(HIF-lα)表达的作用来部分控制VEGF合成(哈德森(Hudson)等人,分子细胞生物学(Mol.Cell.Biol.)(2002)22:7004-7014)。因此,肿瘤血管生成可能以下列两种方式取决于mTOR激酶信号传导:经由肿瘤和基质细胞的低氧诱导的VEGF合成;以及VEGF经由PI3K-Akt-mTOR信号传导刺激内皮增殖和存活。
这些发现表明,mTOR激酶的药理学抑制剂应具有治疗各种形式的癌症疾病的治疗价值,所述癌症包含例如癌瘤和肉瘤等实体肿瘤以及白血病和淋巴恶性疾病。除肿瘤形成外,有证据证明mTOR激酶在一系列错构瘤综合症中起作用。近来研究显示例如TSCl、TSC2、PTEN和LKBl等肿瘤抑制蛋白紧密地控制mTOR激酶信号传导。这些肿瘤抑制蛋白的丧失会因mTOR激酶信号传导升高而引起一系列错构瘤病状(郑和布兰尼斯,细胞与发育生物学研讨文辑,2005,29-37)。已与mTOR激酶调节异常建立分子联系的综合症包括皮捷二氏综合症(Peutz-Jeghers syndrome,PJS)、考登氏病(Cowden disease)、布莱如三氏综合症(Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndrome,BRRS)、普洛提斯综合症(Proteussyndrome)、莱杜二氏病(Lhermitte-Duclos disease)和TSC(猪木等人,自然遗传学(2005)37:19-24)。患有这些综合症的患者的多个器官中特征性地发展良性错构肿瘤。
近来的研究揭露了mTOR激酶在其它疾病中的作用(伊斯顿(Easton)和郝格顿,治疗目标专家评论(Exp.Opin.Ther.Targets)(2004)8:551-564)。已证明雷帕霉素是一种通过抑制抗原诱导的T细胞、B细胞增殖和抗体产生来起作用的有效免疫抑制剂,且因此mTOR激酶抑制剂也可为有用的免疫抑制剂。抑制mTOR的激酶活性也可适用于预防再狭窄,此可控制血管中的正常细胞回应于在血管疾病治疗中引入支架而引起的不当增殖(莫里斯(Morice)等人,新英格兰医学杂志(New Engl.J.Med.)(2002)346:1773-1780)。此外,雷帕霉素类似物依维莫司(everolimus)可降低心脏同种异体移植血管病变的严重程度和发病率(伊森(Eisen)等人,新英格兰医学杂志,(2003)349:847-858)。mTOR激酶活性升高与心脏肥大有关,心脏肥大作为心力衰竭的主要风险因子,具有临床重要性,且为心肌细胞的细胞尺寸增大导致的结果(郑和布兰尼斯,细胞与发育生物学研讨文辑,2005,29-37)。因此,预期mTOR激酶抑制剂也可用于预防和治疗除癌症外的多种疾病。
经显示,对mTOR与PI3K进行双重抑制对于使可造成各种癌症的细胞增殖停止尤其有效。mTOR与PI3Kα的双重抑制剂(称为PI-103)显示更有效地阻断神经胶质瘤细胞增殖(范(Fan)等人,细胞周期(Cell Cycle)(2006)5:2301-2305)。当使用作为mTOR抑制剂的雷帕霉素与作为纯PI3Ka抑制剂的PIK90的组合疗法时见到类似作用。这些结果表明组合mTOR抑制剂与PI3Kα抑制剂用于胶质母细胞瘤以及使用PI3Kα与mTOR的双重抑制剂的基本原理。
另一mTOR-PI3K双重抑制剂为咪唑并[4,5-c]喹啉,称为NVP-BEZ235(麦拉(Maira)等人,分子癌症治疗学(Mol.Cancer Ther.)(2008)7:1851-1863)。NVP-BEZ235显示有效地减小带有PC3M肿瘤的小鼠中的肿瘤尺寸且在神经胶母细胞瘤模型中实现肿瘤停滞。另外,NVP-BEZ235与护理标准品替莫唑胺(temozolomide)组合给药在神经胶母细胞瘤模型中引起肿瘤退化,而对体重增加无显著作用,表明mTOR-PI3Kα双重抑制剂在组合给与时可增强其它抗癌剂的功效。NVP-BEZ235目前处于癌症治疗的临床试验中。
DNA依赖性蛋白激酶(DNA-PK)是一种与DNA缔合时活化的细胞核丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。生物化学和遗传学数据揭露此激酶由大型催化亚单元(称为DNA-PKcs)和调节组分(称为Ku)构成。经显示,DNA-PK是DNA双链断裂(DSB)修复机构与V(D)J重组装置的关键组分。另外,近来的工作发现DNA-PK组分与多种其它过程(包括染色质结构的调节和端粒维持)有关(史密斯(Smith)和杰克森(Jackson),基因与发育(Genes andDev.)(1999)13:916-934)。
DNA DSB被视作细胞可能会遭遇的最致命病变。为对抗由DNA DSB造成的严重威胁,真核细胞已进化出数个机制来介导其修复。在高等真核生物中,这些机制的主要机制为DNA非同源末端接合(NHEJ),也称为非常规重组。DNA-PK在此路径中起关键作用。DNA-PK活性增加已在体外与体内予以证明,且与肿瘤细胞对IR和双官能烷基化剂的抗性有关(穆勒(Muller)等人,血液学(Blood)(1998)92:2213-2219;赛泽(Sirzen)等人,欧洲癌症杂志(Eur.J.Cancer)(1999)35:111-116)。因此,已提出DNA-PK活性增加为细胞和肿瘤抗性机制。因此,用小分子抑制剂抑制DNA-PK可证明对过度表达被视作抗性机制的肿瘤有效。
鉴于DNA-PK涉及DNA修复过程且DNA-PK的小分子抑制剂显示使培养的哺乳动物细胞对放射线和化学品敏感,因此特定DNA-PK抑制药物的一种应用将为充当增强癌症化学疗法与放射疗法的功效的药剂。也可证明DNA-PK抑制剂适用于治疗逆转录病毒介导的疾病。举例来说,已证明丧失DNA-PK活性会严重地抑制逆转录病毒整合的过程(丹尼尔(Daniel)等人,科学(Science)(1999)284:644-7)。
ATM基因编码属于PI3K超家族且使蛋白质而非脂质磷酸化的370kDa蛋白质。此蛋白质C末端处的350个氨基酸的激酶结构域是具有指定功能的唯一ATM区段。细胞暴露于电离辐射(IR)会引发ATM激酶活性且此功能是使细胞周期停滞于G1、S和G2期所需的(希洛(Shiloh)和卡斯坦(Kastan),癌症研究进展(Adv.Cancer Res.)(2001)83:209-254)。真核细胞感知DNA链断裂的机制尚未可知,但IR后迅速诱导ATM激酶活性表明其在哺乳动物细胞中信号转导的早期阶段起作用(拜因(Banin)等人,科学,(1998)281:1674-1677;坎曼(Canman)等人,科学,(1998)281:1677-1679)。转染的ATM是在IR处理细胞后并入更多磷酸的磷酸化蛋白(林(Lim)等人,自然,(2000)404:613-617),此表明ATM激酶自身是通过翻译后修饰来活化。已提出通过抑制ATM来治疗赘瘤,尤其与p53功能降低有关的癌症(摩根(Morgan)等人,分子细胞生物学(Mol.Cell Biol.)(1997)17:2020-2029;哈特威尔(Hartwell)和卡斯坦,科学,(1994)266:1821-1828;卡斯坦,新英格兰医学杂志(1995)333:662-663;WO 98/56391)。
靶向两种或两种以上PI3K的药剂被称作泛PI3K抑制剂。在某些实施例中,所提供的化合物抑制PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶、PI4KIIIα和/或PI3K超家族另一成员中的一者或一者以上。在一些实施例中,所提供的化合物抑制PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶、PI4KIIIα和/或PI3K超家族另一成员或其突变体(例如Glu542、Glu545和His1047)中的两者或两者以上,且因此其为泛PI3K抑制剂。在某些实施例中,泛PI3K抑制剂抑制PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ和PI3Kβ中的两者或两者以上。在某些实施例中,泛PI3K抑制剂抑制PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ和PI3Kβ中的三者或三者以上。在某些实施例中,泛PI3K抑制剂抑制PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ和PI3Kβ。
渥曼青霉素(Wortmannin)是作为泛PI3K抑制剂的天然产物。除经典PI3K外,渥曼青霉素还抑制DNA-PK、mTOR、ATR、ATM、PI4K和polo样激酶(PLK)。虽然渥曼青霉素本身毒性过大而不用于治疗,但已发现渥曼青霉素的修饰型式显示比渥曼青霉素低的毒性。一种此类化合物为PX-866,其在约10mg/kg下减弱小鼠中肿瘤异种移植物的生长(伊勒(Ihle)等人,分子癌症治疗学(2004)3:763-772)。
IC87114是一种选择性PI3Kγ抑制剂,其在炎症模型中显示对嗜中性白细胞迁移(萨图(Sadhu)等人,免疫学杂志(J.Immunol.)(2003)170:2647-2654)和嗜中性白细胞中TNF1α刺激的弹性蛋白酶胞外分泌(萨图等人,生物化学与生物物理学研究通讯(Biochem.Biophys.Res.Commun.)(2003)308:764-769)具有作用。经显示,IC87114也抑制急性骨髓性白血病细胞增殖和存活(比尔罗特(Billottet)等人,癌基因(2006)25:6648-6659)。
TGX-221是一种选择性PI3Kβ抑制剂,且为泛PI3K抑制剂LY294002的类似物(杰克森等人,自然医学(Nat.Med.)(2005)11:507-514)。经显示,TGX-221干扰血小板中压力诱导的磷脂酰肌醇-3,4-二磷酸产生和整合素αIIbβ3介导的粘附。这些结果表明TGX-221或其它PI3Kβ抑制剂在体内可具有抗血栓作用。
PI-103是一种泛PI3K抑制剂且呈现PI3K/mTOR双重抑制作用。经显示,PI-103减少小鼠异种移植模型中神经胶质瘤、乳房、卵巢和子宫颈肿瘤细胞的增殖(雷诺德(Raynaud)等人,癌症研究(Cancer Res.)(2007)67:5840-5850)。
AS-252424、AS-604850和AS-605240是已用于阻断嗜中性白细胞趋化性的选择性PI3Kγ抑制剂。经显示,这些化合物在类风湿性关节炎模型中使关节破坏发展减到最小(坎普斯(Camps)等人,自然医学(2005)11:936-943)。
ZSTK474是一种所选择的能够阻断肿瘤生长的PI3K抑制剂。ZSTK474在小鼠异种移植模型中呈现强抗肿瘤活性(矢口(Yaguchi)等人,美国国家癌症研究会杂志(J.Natl.Cancer Inst.)(2006)98:545-556)。
XL765与XL147是作为PI3K/mTOR双重抑制剂的喹喔啉化合物,其在异种移植模型中显示作为单一药剂以及与标准化学疗法组合均有功效。两种化合物目前均处于治疗实体肿瘤的临床试验中。
SF1126是已进入临床试验中用以靶向细胞生长、增殖和血管生成的泛PI3K抑制剂。已证明SF1126在多种小鼠癌症模型(包括前列腺癌、乳癌、卵巢癌、肺癌、多发性骨髓瘤、脑癌和其它癌症)中有望具有体内活性。
I型神经纤维瘤病(NF1)是一种显性遗传的人类疾病,每2500-3500个个体中有一个患此病。数个器官系统受到影响,包括骨、皮肤、虹膜和中枢神经系统,表现为学习困难和神经胶质瘤。NF1的标志是周边神经系统形成良性肿瘤(神经纤维瘤),不同患者之间肿瘤的数目和尺寸变化极大。神经纤维瘤是由许旺细胞(Schwann cell)、神经元、纤维母细胞和其它细胞构成的非均质肿瘤,其中许旺细胞为主要(60%-80%)细胞类型。PI3K与NF1有关(杨(Yang)等人,临床研究杂志(J.Clin.Invest.)116:2880(2006))。
神经鞘瘤是几乎完全由许旺样细胞构成的周边神经肿瘤,且通常在II型神经纤维瘤病(NF2)肿瘤抑制基因中具有突变。90%的NF2患者会形成双侧前庭神经鞘瘤和/或脊髓神经鞘瘤。变大的神经鞘瘤可挤压相邻结构,引起耳聋和其它神经问题。通过外科手术去除这些肿瘤存在困难,常常会使患者的发病率增加。PI3K也与NF2有关,此表明PI3K抑制剂可用于治疗NF2相关病症。参见伊凡斯(Evans)等人,临床癌症研究(Clin.CancerRes.)15:5032(2009);詹姆斯(James)等人,分子细胞生物学(Mol.Cell.Biol.)29:4250(2009);李(Lee)等人,欧洲癌症杂志(Eur.J.Cancer)45:1709。
如本文所用的术语“治疗”是指逆转、减轻如本文所述的疾病或病症或其一种或一种以上症状、延迟其发作或抑制其发展。在一些实施例中,可在出现一种或一种以上症状后投予治疗。在其它实施例中,可在不存在症状时投予治疗。举例来说,可在症状发作前对易患病的个体投予治疗(例如根据症状史,和/或根据遗传或其它易感性因素)。也可在症状消除后继续治疗,例如以防止或延迟其复发。
所提供的化合物是PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα中一者或一者以上的抑制剂,且因此适用于治疗一种或一种以上与PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα中一者或一者以上有关的病症。因此,在某些实施例中,本发明提供一种用于治疗PI3Kα介导、PI3Kγ介导、PI3Kδ介导、PI3Kβ介导、PI3KC2β介导、mTOR介导、DNA-PK介导、ATM介导和/或PI4KIIIα介导的病症的方法,其包含向有需要的患者投予本发明化合物或其医药学上可接受的组合物的步骤。
如本文所用的术语“PI3Kα介导”、“PI3Kγ介导”、“PI3Kδ介导”、“PI3Kβ介导”、“PI3KC2β介导”、“mTOR介导”、“DNA-PK介导”、“ATM介导”和/或“PI4KIIIα介导”的病症、疾病和/或病状意谓已知PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体中一者或一者以上起作用的任何疾病或其它有害病状。因此,本发明的另一实施例涉及治疗一种或一种以上已知PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体中一者或一者以上起作用的疾病或减轻其严重程度。
在一些实施例中,本发明提供一种用于治疗一种或一种以上病症、疾病和/或病状的方法,其中所述病症、疾病或病状为癌症、神经退化性病症、血管生成病症、病毒性疾病、自体免疫性疾病、发炎性病症、激素相关疾病、与器官移植有关的病状、免疫缺陷病症、破坏性骨胳病症、增生性病症、感染性疾病、与细胞死亡有关的病状、凝血酶诱发的血小板凝集、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、肝病、涉及T细胞活化的病理性免疫病状、心血管病症或CNS病症。
可根据本发明的方法治疗的疾病和病状包括(但不限于)患者的癌症、神经纤维瘤病、眼部血管生成、中风、糖尿病、肝肿大、心血管疾病、阿尔茨海默氏病、囊肿性纤维化、病毒性疾病、自体免疫性疾病、动脉粥样硬化、再狭窄、牛皮癣、过敏性病症、炎症、神经病症、血管生成病症、激素相关疾病、与器官移植有关的病状、免疫缺陷病症、破坏性骨胳病症、增生性病症、感染性疾病、与细胞死亡有关的病状、凝血酶诱发的血小板凝集、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、肝病、涉及T细胞活化的病理性免疫病状和CNS病症。在一个实施例中,用本发明化合物和医药学上可接受的载剂、佐剂或媒剂治疗人类患者,其中所述化合物的存在量可显著抑制PI3激酶活性。
本发明的化合物适用于治疗选自以下的增生性疾病:良性或恶性肿瘤、脑癌、肾癌(例如肾细胞癌(RCC))、肝癌、肾上腺癌、膀胱癌、乳癌、胃癌、胃肿瘤、卵巢癌、结肠癌、直肠癌、前列腺癌、胰腺癌、肺癌、阴道癌、子宫内膜癌、子宫颈癌、睾丸癌、泌尿生殖道癌、食道癌、喉癌、皮肤癌、骨癌或甲状腺癌、肉瘤、神经胶母细胞瘤、神经母细胞瘤、多发性骨髓瘤或胃肠癌,尤其结肠癌或结肠直肠腺瘤或头颈部肿瘤、表皮过度增殖、牛皮癣、前列腺增生、瘤形成、上皮特征的瘤形成、腺瘤、腺癌、角化棘皮瘤、表皮样癌、大细胞癌、非小细胞肺癌、淋巴瘤(包括例如非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin′sLymphoma,NHL)和霍奇金氏淋巴瘤(又称霍奇金氏或霍奇金氏病))、乳腺癌、滤泡性癌、未分化性癌、乳头状癌、精原细胞瘤、黑色素瘤或白血病。其它疾病包括考登氏综合症、莱杜二氏病和布宗二氏综合症(Bannayan-Zonana syndrome)或PI3K/PKB路径异常活化的疾病。
在某些实施例中,本发明提供一种用于治疗I型神经纤维瘤病(NF1)、II型神经纤维瘤病(NF2)、许旺细胞瘤(例如恶性周围神经鞘膜瘤(malignant peripheral nerve sheathtumor,MPNST′s))或神经鞘瘤(Schwannoma)或者减轻其严重程度的方法。
本发明的化合物适用于治疗发炎性或阻塞性气管疾病,从而例如减少组织损伤、气管炎症、支气管过度反应、重塑或疾病发展。本发明适用的发炎性或阻塞性气管疾病包括任何类型或起源的哮喘,包括内因性(非过敏性)哮喘和外因性(过敏性)哮喘、轻度哮喘、中度哮喘、重度哮喘、支气管哮喘、运动诱发的哮喘、职业性哮喘和细菌感染后诱发的哮喘。也应了解,哮喘的治疗涵盖治疗例如小于4岁或5岁、显示喘息症状以及经诊断或可诊断为“喘息婴儿”的个体,此类个体为受到主要医学关注的确定的患者类别且现通常鉴别为初期或早期哮喘患者。
哮喘治疗中的防治功效将由例如急性哮喘或支气管收缩发作的症状发作的频率或严重程度降低、肺功能改善或气管过度反应改善来证明。其可进一步由对其它症状疗法(例如在症状发作时用于或意图限制或中断症状发作的疗法,例如消炎药或支气管扩张药)的需求降低来证明。对哮喘的防治益处可在倾向于“晨间肺功能下降(morningdipping)”的个体中尤其明显。“晨间肺功能下降”为公认的哮喘综合症,为相当大百分比的哮喘患者所共有且特征为例如在约上午4到6点之间(即在通常实质上远离任何预先投予的症状哮喘疗法的时刻)哮喘发作。
本发明的化合物可用于本发明适用的其它发炎性或阻塞性气管疾病和病状,且所述发炎性或阻塞性气管疾病和病状包括急性肺损伤(ALI)、成人/急性呼吸窘迫综合症(ARDS)、慢性阻塞性肺病、气管疾病或肺病(COPD、COAD或COLD),包括慢性支气管炎或与其相关的呼吸困难、肺气肿以及继其它药物疗法(尤其其它吸入药物疗法)后发生的气管过度反应加剧。本发明也适用于治疗任何类型或起源的支气管炎,包括(但不限于)急性、花生仁吸入性、卡他性(catarrhal)、格鲁布性(croupus)、慢性或结核性支气管炎。本发明适用的其它发炎性或阻塞性气管疾病包括任何类型或起源的肺尘埃沉着病(肺部的发炎性、通常职业性疾病,常伴随慢性或急性气管阻塞且由重复吸入粉尘引起),包括例如矾土沉着病、碳末沉着病、石绵沉着病、石末沉着病、驼鸟毛尘肺、铁质沉着症、硅粉沉着病、烟末沉着病和棉屑沉着病。
关于消炎活性,尤其关于对嗜曙红细胞活化的抑制作用,本发明的化合物也适用于治疗嗜曙红细胞相关病症,例如嗜曙红细胞增多症,尤其嗜曙红细胞相关的气管病症(例如包括肺组织的病态嗜曙红细胞浸润),包括嗜曙红细胞过多(因为其影响气管和/或肺),以及例如吕弗勒氏综合症(Loffler′s syndrome)、嗜曙红细胞性肺炎、寄生虫(尤其后生动物)侵染(包括热带嗜曙红细胞增多症)、支气管肺曲霉病、结节性多动脉炎(包括丘施二氏综合症(Churg-Strauss syndrome))、嗜曙红细胞性肉芽肿和由药物反应引起的影响气管的嗜曙红细胞相关病症引起或伴随的嗜曙红细胞相关气管病症。
本发明的化合物也适用于治疗发炎性或过敏性皮肤病状,例如牛皮癣、接触性皮炎、异位性皮炎、斑秃、多形性红斑、疱疹样皮炎、硬皮病、白癜风、过敏性血管炎、荨麻疹、大疱性类天疱疮、红斑狼疮、天疱疮、后天性大疱性表皮松解症和其它发炎性或过敏性皮肤病状。
本发明的化合物也可用于治疗例如具有发炎性组分的疾病或病状的其它疾病或病状,例如治疗眼睛疾病和病状(例如结膜炎、干燥性角膜结膜炎和春季结膜炎)、影响鼻子的疾病(包括过敏性鼻炎)和涉及自体免疫反应或具有自体免疫组分或病因的发炎性疾病,包括自体免疫性血液病症(例如溶血性贫血、再生障碍性贫血、纯红细胞性贫血和特发性血小板减少症)、全身性红斑狼疮、类风湿性关节炎、多软骨炎、硬皮病、韦格纳肉芽肿病(Wegener granulamatosis)、皮肌炎、慢性活动性肝炎、重症肌无力、史蒂芬强森综合症(Steven-Johnson syndrome)、特发性口炎性腹泻(idiopathic sprue)、自体免疫性发炎性肠病(例如溃疡性结肠炎和克罗恩氏病(Crohn′s disease))、内分泌性眼病变、格雷夫氏病(Grave′s disease)、肉状瘤病、肺泡炎、慢性过敏性肺炎、多发性硬化症、原发性胆汁性肝硬化症、葡萄膜炎(前部和后部)、干燥性角膜结膜炎和春季角膜结膜炎、间质性肺纤维化、牛皮癣性关节炎和肾小球肾炎(存在和不存在肾病综合症,例如包括特发性肾病综合症或微小变化肾病变)。
可根据本发明方法治疗的心血管疾病包括(但不限于)再狭窄、心脏肥大、动脉粥样硬化、心肌梗塞、缺血性中风和充血性心力衰竭。
可根据本发明方法治疗的神经退化性疾病包括(但不限于)阿尔茨海默氏病、帕金森氏病(Parkinson′s disease)、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病(Huntington′s disease)和大脑缺血,以及由外伤性损伤、谷氨酸神经毒性和低氧引起的神经退化性疾病。
本发明的化合物适用于抑制血管生成。血管生成是指新血管生长,且为许多病理性病状的重要促成因素。举例来说,充分证明血管生成在促进和支持实体肿瘤生长和存活中的作用。血管生成也促成其它病理性病状,例如牛皮癣和哮喘,以及眼睛的病理性病状,例如湿型年龄相关黄斑变性(AMD)、糖尿病性视网膜病变、糖尿病性黄斑水肿和早产儿视网膜病变。PI3K蛋白促进血管生成(格劳贝拉(Graupera)等人,自然(2008)453(7195):662-6),且因此本发明化合物例如通过局部投予本发明化合物而提供抑制血管生成,例如以治疗与眼部血管生成有关的眼病的益处。本发明的化合物可调配用于局部投药。举例来说,不可逆抑制剂可经调配以供局部传递到肺(例如以气雾剂形式,例如干燥散剂或液体调配物)用于治疗哮喘;调配成乳膏、软膏、洗剂等以供局部施用于皮肤以治疗牛皮癣;或调配成眼用调配物以供局部施用于眼睛以治疗眼部疾病。此类调配物将含有本发明抑制剂和医药学上可接受的载剂。也可存在其它组分,例如防腐剂以及增大调配物粘度的试剂,例如天然或合成聚合物。眼用调配物可呈任何适合的形式,例如液体、软膏、水凝胶或粉末。本发明的化合物可连同另一治疗剂(例如抗VEGF剂,例如兰尼单抗(ranibizumab)(一种结合VEGFA的抗体的Fab片段),或如以下进一步描述的另一抗血管生成化合物)投予。
此外,本发明提供本文所定义的化合物或其医药学上可接受的盐或水合物或溶剂化物的用途,其是用于制备用于治疗增生性疾病、发炎性疾病或阻塞性呼吸道疾病、心血管疾病、神经病、血管生成病症或通常与移植相关联发生的病症的药剂。
根据本发明方法的化合物和组合物可使用有效治疗癌症、自体免疫性病症、增生性病症、发炎性病症、神经退化性病症或神经病症、血管生成病症、精神分裂症、骨相关病症、肝病或心脏病或者减轻其严重程度的任何量和任何投药途径来投予。所需要的确切量将视个体的物种、年龄和一般情况、感染的严重程度、特定药剂、其投药模式等而在不同个体之间有所变化。本发明的化合物优选调配为单位剂型以便于投药和剂量均一。如本文所用的表述“单位剂型”是指适用于待治疗的患者的药剂的物理个别单位。然而,应了解,本发明化合物和组合物的总日用量应由主治医生在合理医学判断的范围内决定。用于任何特定患者或生物体的特定有效剂量将取决于多种因素,包括所治疗的病症和此病症的严重程度;所用特定化合物的活性;所用特定组合物;患者的年龄、体重、一般健康状况、性别和饮食;所用特定化合物的投药时间、投药途径和排泄速率;治疗持续时间;与所用特定化合物组合或同时使用的药物,和医学技术中众所周知的类似因素。如本文所用的术语“患者”意谓动物,优选为哺乳动物,且最优选为人类。
本发明的医药学上可接受的组合物可视所治疗的感染的严重程度而经口、经直肠、不经肠、脑池内、阴道内、腹膜内、局部(以散剂、软膏或滴剂形式)、经颊(以经口或经鼻喷雾形式)等投予人类和其它动物。在某些实施例中,本发明的化合物可以每天每公斤个体体重约0.01mg到约50mg且优选约1mg到约25mg的剂量经口或不经肠每天一次或一次以上投予,以获得所需治疗作用。
在一些实施例中,每天向有需要的患者投予所提供的组合物一次。不希望受任何特定理论束缚,相信对于每天向有需要的患者投予一次,一种或一种以上PI3激酶的不可逆抑制剂的较长作用持续时间特别有利于治疗与一种或一种以上PI3激酶有关的病症。在某些实施例中,每天向有需要的患者投予所提供的组合物至少一次。在其它实施例中,每天向有需要的患者投予所提供的组合物两次、三次或四次。
在某些实施例中,式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e的化合物在投予患者时例如一般提供比式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头部分或不存在的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的相应化合物长的作用持续时间。举例来说,式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物在投予患者时可提供比式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的R1部分替换为非弹头部分或不存在的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的相应化合物长的作用持续时间。
在HCT116洗脱实验中,将化合物II-a-16、II-a-33、II-a-36、II-a-27、II-a-43、II-a-49、II-a-50、II-a-53、II-a-54和II-a-55与可逆抑制剂GSK-615和GDC-941相比较。研究结果显示于图1中。包含弹头部分的不可逆抑制剂抑制PI3Kα的持续时间实质上比可逆抑制剂GSK-615和GDC-941长。在多种情况下,所提供的不可逆抑制剂抑制PI3Kα至少4小时。在一些情况下,所提供的不可逆抑制剂抑制PI3Kα至少8小时。不希望受任何特定理论束缚,相信所提供的不可逆抑制剂在体外的作用持续时间相比相应可逆抑制剂的延长将转化成体内作用持续时间的延长。
Figure BDA0000158388020002241
用作本文实例中的参考化合物的其它可逆抑制剂包括以下:
Figure BDA0000158388020002242
供经口投药的液体剂型包括(但不限于)医药学上可接受的乳液、微乳液、溶液、悬浮液、糖浆和酏剂。除活性化合物外,液体剂型还可含有此项技术中常用的惰性稀释剂,例如水或其它溶剂、增溶剂和乳化剂,例如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苯甲酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲酰胺、油(尤其棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄榄油、蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氢糠醇、聚乙二醇和脱水山梨糖醇脂肪酸酯、及其混合物。除惰性稀释剂外,经口组合物也可包括例如湿润剂、乳化剂和悬浮剂、甜味剂、调味剂和芳香剂等佐剂。
可注射制剂(例如无菌可注射的水性或油性悬浮液)可根据已知技术,使用适合分散剂或湿润剂和悬浮剂来调配。无菌可注射制剂也可为于不经肠可接受的无毒稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液、悬浮液或乳液,例如于1,3-丁二醇中的溶液。可采用的可接受的媒剂和溶剂为水、林格氏溶液(U.S.P.)和等渗氯化钠溶液。此外,无菌不挥发性油常用作溶剂或悬浮介质。为此,可采用任何无刺激性不挥发性油,包括合成单酸甘油酯或二酸甘油酯。此外,使用例如油酸等脂肪酸制备注射剂。
可注射调配物可例如通过经由细菌截留过滤器过滤或通过并入杀菌剂来杀菌,呈无菌固体组合物形式,所述组合物可在使用前溶解或分散于无菌水或其它无菌可注射介质中。
为延长本发明化合物的作用,常常需要减慢自皮下或肌肉内注射的化合物的吸收。此可使用水溶性差的结晶或非晶形物质的液体悬浮液来实现。化合物的吸收速率则取决于其溶解速率,而溶解速率又可能取决于晶体尺寸和结晶形式。或者,通过将化合物溶解或悬浮于油性媒剂中来延缓不经肠投予的化合物形式的吸收。可注射的储积形式是通过在例如聚丙交酯-聚乙交酯等生物可降解聚合物中形成化合物的微胶囊基质来制造。视化合物与聚合物的比率和所用特定聚合物的性质而定,可控制化合物的释放速率。其它生物可降解聚合物的实例包括聚(原酸酯)和聚(酸酐)。储积式可注射调配物也通过将化合物覆埋于与身体组织相容的脂质体或微乳液中来制备。
供直肠或阴道投药的组合物优选为栓剂,其可通过将本发明化合物与适合非刺激性赋形剂或载剂(例如可可脂、聚乙二醇或栓剂蜡)混合来制备,这些赋形剂或载剂在周围温度下为固体,但在体温下为液体,且因此在直肠或阴道腔中熔融并释放活性化合物。
供经口投药的固体剂型包括胶囊、片剂、丸剂、散剂和颗粒剂。在这些固体剂型中,活性化合物与至少一种医药学上可接受的惰性赋形剂或载剂混合,所述赋形剂或载剂例如为柠檬酸钠或磷酸二钙,和/或a)例如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露糖醇和硅酸等填充剂或增量剂;b)例如羧甲基纤维素、海藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和阿拉伯胶等粘合剂;c)例如甘油等保湿剂;d)例如琼脂、碳酸钙、马铃薯或木薯淀粉、海藻酸、某些硅酸盐和碳酸钠等崩解剂;e)例如石蜡等溶解延迟剂;f)例如季铵化合物等吸收促进剂;g)例如十六醇和单硬脂酸甘油酯等湿润剂;h)例如高岭土和膨润土等吸附剂;和i)例如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、十二烷基硫酸钠等润滑剂,及其混合物。在胶囊、片剂和丸剂的情况下,剂型也可包含缓冲剂。
使用例如乳糖(lactose或milk sugar)以及高分子量聚乙二醇等赋形剂,类似类型的固体组合物也可用作软和硬填充明胶胶囊中的填充剂。固体剂型片剂、糖衣药丸、胶囊、丸剂和颗粒剂可用例如肠溶衣和医药调配技术中众所周知的其它包衣等包衣和外壳来制备。其可任选含有乳浊剂,且也可具有仅或优先在肠道的某一部分任选以延迟方式释放活性成分的组成。可使用的包埋组合物的实例包括聚合物质和蜡。使用例如乳糖以及高分子量聚乙二醇等赋形剂,类似类型的固体组合物也可用作软和硬填充明胶胶囊中的填充剂。
使用一种或一种以上如上所述的赋形剂,活性化合物也可呈微囊封形式。固体剂型片剂、糖衣药丸、胶囊、丸剂和颗粒剂可用例如肠溶衣、控释包衣和医药调配技术中众所周知的其它包衣等包衣和外壳来制备。在所述固体剂型中,活性化合物可与例如蔗糖、乳糖或淀粉等至少一种惰性稀释剂混合。如在正常实践中,所述剂型也可包含除惰性稀释剂以外的其它物质,例如制片润滑剂和其它制片助剂,例如硬脂酸镁和微晶纤维素。在胶囊、片剂及丸剂的情况下,剂型也可包含缓冲剂。其可任选含有乳浊剂,且也可具有仅或优先在肠道的某一部分任选以延迟方式释放活性成分的组成。可使用的包埋组合物的实例包括聚合物质和蜡。
供局部或透皮投予本发明化合物的剂型包括软膏、糊剂、乳膏、洗剂、凝胶、散剂、溶液、喷雾、吸入剂或贴片。将活性组分在无菌条件下与医药学上可接受的载剂和任何需要的防腐剂或可能需要的缓冲剂混合。眼用调配物、滴耳剂和滴眼剂也涵盖在本发明的范围内。另外,本发明涵盖使用透皮贴片,这些透皮贴片的附加优势在于提供化合物到体内的控制传递。所述剂型可通过将化合物溶解或分配于适当介质中而制得。也可使用吸收增强剂来增加化合物穿过皮肤的通量。可通过提供速率控制膜或通过将化合物分散于聚合物基质或凝胶中来控制速率。
根据一实施例,本发明涉及一种抑制生物样品中蛋白激酶的活性的方法,其包含使所述生物样品与本发明化合物或包含所述化合物的组合物接触的步骤。
根据另一实施例,本发明涉及一种抑制生物样品中PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体(例如Glu542、Glu545和His1047)的活性的方法,其包含使所述生物样品与本发明化合物或包含所述化合物的组合物接触的步骤。在某些实施例中,本发明涉及一种不可逆地抑制生物样品中PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体的活性的方法,其包含使所述生物样品与本发明化合物或包含所述化合物的组合物接触的步骤。
如本文所用的术语“生物样品”包括(但不限于)细胞培养物或其提取物;自哺乳动物获得的活组织检查材料或其提取物;以及血液、唾液、尿、粪便、精液、眼泪或其它体液或其提取物。
抑制生物样品中蛋白激酶或选自PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体的蛋白激酶的活性适用于达到所属领域技术人员已知的多个目的。所述目的的实例包括(但不限于)输血、器官移植、生物标本储存和生物分析。
本发明的另一实施例涉及一种抑制患者中的蛋白激酶活性的方法,其包含向所述患者投予本发明化合物或包含所述化合物的组合物的步骤。
根据另一实施例,本发明涉及一种抑制患者中PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体(例如Glu542、Glu545和His1047)中一者或一者以上的活性的方法,其包含向所述患者投予本发明化合物或包含所述化合物的组合物的步骤。根据某些实施例,本发明涉及一种不可逆地抑制患者中PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体(例如Glu542、Glu545和His1047)中一者或一者以上的活性的方法,其包含向所述患者投予本发明化合物或包含所述化合物的组合物的步骤。在其它实施例中,本发明提供一种用于治疗有需要的患者的由PI3Kα、PI3Kγ、PI3Kδ、PI3Kβ、PI3KC2β、mTOR、DNA-PK、ATM激酶和/或PI4KIIIα或其突变体(例如Glu542、Glu545和His1047)中一者或一者以上介导的病症的方法,其包含向所述患者投予本发明化合物或其医药学上可接受的组合物的步骤。所述病症在本文中详细描述。
视待治疗的特定病状或疾病而定,通常投予以治疗此病状的其它治疗剂也可存在于本发明组合物中。如本文所用,通常投予以治疗特定疾病或病状的其它治疗剂称为“适于所治疗的疾病或病状”。
本发明的化合物也可用以有利地与其它抗增生化合物组合。所述抗增生化合物包括(但不限于):芳香酶抑制剂;抗雌激素剂;拓扑异构酶I抑制剂;拓扑异构酶II抑制剂;微管活性化合物;烷基化化合物;组蛋白脱乙酰基酶抑制剂;诱导细胞分化过程的化合物;环加氧酶抑制剂;MMP抑制剂;mTOR抑制剂;抗赘生性抗代谢物;铂化合物;靶向/降低蛋白质或脂质激酶活性的化合物和其它抗血管生成化合物;靶向、降低或抑制蛋白质或脂质磷酸酶的活性的化合物;性腺释素激动剂;抗雄激素剂;甲硫氨酸氨基肽酶抑制剂;基质金属蛋白酶抑制剂;双膦酸盐;生物反应调节剂;抗增生抗体;肝素酶抑制剂;Ras致癌同功异型物的抑制剂;端粒酶抑制剂;蛋白酶体抑制剂;用于治疗血液科恶性疾病的化合物;靶向、降低或抑制Flt-3的活性的化合物;Hsp90抑制剂,例如17-AAG(17-烯丙基氨基格尔德霉素(17-allylaminogeldanamycin),NSC330507)、17-DMAG(17-二甲氨基乙基氨基-17-去甲氧基-格尔德霉素,NSC707545)、IPI-504、CNF1010、CNF2024、CNF1010(来自康福玛医药公司(Conforma Therapeutics));替莫唑胺
Figure BDA0000158388020002281
纺锤体驱动蛋白抑制剂(kinesin spindle inhibitor),例如来自葛兰素史克公司(GlaxoSmithKline)的SB715992或SB743921,或来自康拜那托雷克斯公司(CombinatoRx)的喷他脒(pentamidine)/氯丙嗪(chlorpromazine);MEK抑制剂,例如来自艾瑞生物医药公司(Array BioPharma)的ARRY142886、来自阿斯特捷利康公司(AstraZeneca)的AZD6244、来自浦菲泽公司(Pfizer)的PD181461,和甲酰四氢叶酸(leucovorin)。如本文所用的术语“芳香酶抑制剂”是指抑制雌激素产生,例如底物雄烯二酮和睾固酮分别转化成雌酮和雌二醇的化合物。所述术语包括(但不限于)类固醇,尤其阿他美坦(atamestane)、依西美坦(exemestane)和福美司坦(formestane),且尤其非类固醇,尤其氨鲁米特(aminoglutethimide)、罗谷亚胺(roglethimide)、吡鲁米特(pyridoglutethimide)、曲洛司坦(trilostane)、睾内酯(testolactone)、酮康唑(ketokonazole)、伏氯唑(vorozole)、法屈唑(fadrozole)、阿那曲唑(anastrozole)和来曲唑(letrozole)。依西美坦以商品名AromasinTM出售。福美司坦以商品名LentaronTM出售。法屈唑以商品名AfemaTM出售。阿那曲唑以商品名ArimidexTM出售。来曲唑以商品名FemaraTM或FemarTM出售。氨鲁米特以商品名OrimetenTM出售。包含作为芳香酶抑制剂的化学治疗剂的本发明组合尤其适用于治疗激素受体阳性肿瘤,例如乳房肿瘤。
如本文所用的术语“抗雌激素剂”是指在雌激素受体水平上拮抗雌激素作用的化合物。所述术语包括(但不限于)他莫昔芬(tamoxifen)、氟维司群(fulvestrant)、雷洛昔芬(raloxifene)和雷洛昔芬盐酸盐。他莫昔芬以商品名NolvadexTM出售。雷洛昔芬盐酸盐以商品名EvistaTM出售。可投予商品名为FaslodexTM的氟维司群。包含作为抗雌激素剂的化学治疗剂的本发明组合尤其适用于治疗雌激素受体阳性肿瘤,例如乳房肿瘤。
如本文所用的术语“抗雄激素剂”是指能够抑制雄激素的生物作用的任何物质,且包括(但不限于)比卡鲁胺(bicalutamide)(CasodexTM)。如本文所用的术语“性腺释素激动剂”包括(但不限于)阿巴瑞克(abarelix)、戈舍瑞林(goserelin)和乙酸戈舍瑞林。可投予商品名为ZoladexTM的戈舍瑞林。
如本文所用的术语“拓扑异构酶I抑制剂”包括(但不限于)拓扑替康(topotecan)、吉马替康(gimatecan)、伊立替康(irinotecan)、喜树碱(camptothecian)和其类似物9-硝基喜树碱和大分子喜树碱偶联物PNU-166148。伊立替康可例如以其例如按商标CamptosarTM出售的形式投予。拓扑替康以商品名HycamptinTM出售。
如本文所用的术语“拓扑异构酶II抑制剂”包括(但不限于)蒽环霉素(anthracycline),例如多柔比星(doxorubicin)(包括脂质体调配物,例如CaelyxTM)、柔红霉素(daunorubicin)、表柔比星(epirubicin)、伊达比星(idarubicin)和奈莫柔比星(nemorubicin);蒽醌米托蒽醌(mitoxantrone)和洛索蒽醌(losoxantrone);和鬼臼脂素(podophillotoxine)依托泊苷(etoposide)和替尼泊苷(teniposide)。依托泊苷以商品名EtopophosTM出售。替尼泊苷以商品名VM 26-Bristol出售。多柔比星以商品名AcriblastinTM或AdriamycinTM出售。表柔比星以商品名FarmorubicinTM出售。伊达比星以商品名ZavedosTM出售。米托蒽醌以商品名Novantron出售。
术语“微管活性剂”是指使微管稳定、使微管失去稳定性的化合物和微管聚合抑制剂,包括(但不限于)紫杉烷(taxane),例如太平洋紫杉醇(paclitaxel)和多烯紫杉醇(docetaxel);长春花生物碱,例如长春碱(vinblastine)或硫酸长春碱、长春新碱(vincristine)或硫酸长春新碱、长春氟宁(vinflunine)和长春瑞宾(vinorelbine);迪斯德莫来(discodermolide);秋水仙碱(cochicine)和埃坡霉素(epothilone)及其衍生物。太平洋紫杉醇以商品名TaxolTM出售。多烯紫杉醇以商品名TaxotereTM出售。硫酸长春碱以商品名Vinblastin R.PTM出售。硫酸长春新碱以商品名FarmistinTM出售。
如本文所用的术语“烷基化剂”包括(但不限于)环磷酰胺(cyclophosphamide)、异环磷酰胺(ifosfamide)、美法仑(melphalan)或亚硝基脲(nitrosourea)(BCNU或盖德尔(Gliadel))。环磷酰胺以商品名CyclostinTM出售。异环磷酰胺以商品名HoloxanTM出售。
术语“组蛋白脱乙酰基酶抑制剂”或“HDAC抑制剂”是指抑制组蛋白脱乙酰基酶且具有抗增生活性的化合物。其包括(但不限于)辛二酰基苯胺异羟肟酸(SAHA)。
术语“抗赘生性抗代谢物”包括(但不限于)5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil)或5-FU、卡培他滨(capecitabine)、吉西他滨(gemcitabine)、DNA去甲基化合物(例如5-氮杂胞苷(5-azacytidine)和地西他滨(decitabine))、甲氨蝶呤(methotrexate)和依达曲沙(edatrexate),以及叶酸拮抗剂,例如培美曲塞(pemetrexed)。卡培他滨以商品名XelodaTM出售。吉西他滨以商品名GemzarTM出售。
如本文所用的术语“铂化合物”包括(但不限于)卡铂(carboplatin)、顺铂(cis-platin)、顺铂(cisplatinum)和奥沙利铂(oxaliplatin)。卡铂可例如以其例如按商标CarboplatTM出售的形式投予。奥沙利铂可例如以其例如按商标EloxatinTM出售的形式投予。
如本文所用的术语“靶向/降低蛋白质或脂质激酶活性或蛋白质或脂质磷酸酶活性的化合物;或其它抗血管生成化合物”包括(但不限于)以下蛋白质酪氨酸激酶和/或丝氨酸和/或苏氨酸激酶抑制剂或脂质激酶抑制剂,例如a)靶向、降低或抑制血小板源性生长因子受体(PDGFR)的活性的化合物,例如靶向、降低或抑制PDGFR的活性的化合物,尤其抑制PDGF受体的化合物,例如N-苯基-2-嘧啶-胺衍生物,例如伊马替尼(imatinib)、SU101、SU6668和GFB-111;b)靶向、降低或抑制纤维母细胞生长因子受体(FGFR)的活性的化合物;c)靶向、降低或抑制类胰岛素生长因子受体I(IGF-IR)的活性的化合物,例如靶向、降低或抑制IGF-IR的活性的化合物,尤其抑制IGF-I受体的激酶活性的化合物,或靶向IGF-I受体或其生长因子的胞外结构域的抗体;d)靶向、降低或抑制Trk受体酪氨酸激酶家族的活性的化合物或蝶素B4(ephrin B4)抑制剂;e)靶向、降低或抑制AxI受体酪氨酸激酶家族的活性的化合物;f)靶向、降低或抑制Ret受体酪氨酸激酶的活性的化合物;g)靶向、降低或抑制Kit/SCFR受体酪氨酸激酶的活性的化合物,例如伊马替尼;h)靶向、降低或抑制作为PDGFR家族的一部分的C-kit受体酪氨酸激酶的活性的化合物,例如靶向、降低或抑制c-Kit受体酪氨酸激酶家族的活性的化合物,尤其抑制c-Kit受体的化合物,例如伊马替尼;i)靶向、降低或抑制c-Abl家族成员、其基因融合产物(例如BCR-Abl激酶)和突变体的活性的化合物,例如靶向、降低或抑制c-Abl家族成员和其基因融合产物的活性的化合物,例如N-苯基-2-嘧啶-胺衍生物,例如伊马替尼或尼罗替尼(nilotinib)(AMN107);PD180970;AG957;NSC 680410;PD173955,来自帕克戴维斯公司(ParkeDavis);或达沙替尼(dasatinib)(BMS-354825);j)靶向、降低或抑制蛋白激酶C(PKC)家族和丝氨酸/苏氨酸激酶Raf家族的成员,MEK、SRC、JAK、FAK、PDK1、PKB/Akt和Ras/MAPK家族成员,和/或周期素依赖性激酶(CDK)家族成员的活性的化合物,包括星形孢菌素(staurosporine)衍生物,例如米哚妥林(midostaurin);其它化合物的实例包括UCN-01、沙芬戈(safingol)、BAY 43-9006、苔藓抑素1(Bryostatin 1)、哌立福辛(Perifosine);伊莫福辛(llmofosine);RO 318220和RO 320432;GO 6976;莱斯(lsis)3521;LY333531/LY379196;异喹啉(isochinoline)化合物;FTI;PD184352或QAN697(P13K抑制剂)或AT7519(CDK抑制剂);k)靶向、降低或抑制蛋白酪氨酸激酶抑制剂的活性的化合物,例如靶向、降低或抑制蛋白酪氨酸激酶抑制剂的活性的化合物,包括甲磺酸伊马替尼(GleevecTM)或替伏汀(tyrphostin),例如替伏汀A23/RG-50810;AG 99;替伏汀AG213;替伏汀AG 1748;替伏汀AG 490;替伏汀B44;替伏汀B44(+)对映异构体;替伏汀AG 555;AG 494;替伏汀AG 556、AG 957和阿达斯汀(adaphostin)(4-{[(2,5-二羟基苯基)甲基]氨基}-苯甲酸金刚烷基酯;NSC 680410,阿达斯汀);l)靶向、降低或抑制受体酪氨酸激酶的表皮生长因子家族(EGFR1、ErbB2、ErbB3、ErbB4,呈均二聚体或杂二聚体形式)和其突变体的活性的化合物,例如靶向、降低或抑制表皮生长因子受体家族的活性的化合物,尤其抑制EGF受体酪氨酸激酶家族成员(例如EGF受体、ErbB2、ErbB3和ErbB4)或结合于EGF或EGF相关配体的化合物、蛋白质或抗体、CP 358774、ZD 1839、ZM 105180;曲妥珠单抗(trastuzumab)(HerceptinTM)、西妥昔单抗(cetuximab)(ErbituxTM)、易瑞沙(Iressa)、它赛瓦(Tarceva)、OSI-774、Cl-1033、EKB-569、GW-2016、E1.1、E2.4、E2.5、E6.2、E6.4、E2.11、E6.3或E7.6.3,和7H-吡咯并-[2,3-d]嘧啶衍生物;和m)靶向、降低或抑制c-Met受体的活性的化合物,例如靶向、降低或抑制c-Met的活性的化合物,尤其抑制c-Met受体的激酶活性的化合物,或靶向c-Met的胞外结构域或结合于HGF的抗体。
其它抗血管生成化合物包括关于活性具有例如与蛋白质或脂质激酶抑制作用无关的另一机制的化合物,例如沙力度胺(thalidomide)(ThalomidTM)和TNP-470。
靶向、降低或抑制蛋白质或脂质磷酸酶的活性的化合物为例如磷酸酶1、磷酸酶2A或CDC25的抑制剂,例如冈田井酸(okadaic acid)或其衍生物。
诱导细胞分化过程的化合物包括(但不限于)视黄酸、α-生育酚、γ-生育酚或δ-生育酚或者α-生育三烯酚、γ-生育三烯酚或δ-生育三烯酚。
如本文所用的术语环加氧酶抑制剂包括(但不限于)Cox-2抑制剂、5位经烷基取代的2-芳基氨基苯基乙酸和衍生物,例如塞内昔布(celecoxib)(CelebrexTM)、罗非昔布(rofecoxib)(VioxxTM)、依托昔布(etoricoxib)、伐地昔布(valdecoxib)或5-烷基-2-芳基氨基苯基乙酸,例如5-甲基-2-(2′-氯-6′-氟苯胺基)苯基乙酸,罗美昔布(lumiracoxib)。
如本文所用的术语“双膦酸盐”包括(但不限于)依替酮酸(etridonic acid)、氯膦酸(clodronic acid)、替鲁罗酸(tiludronic acid)、帕米膦酸(pamidronic acid)、阿仑膦酸(alendronic acid)、伊班膦酸(ibandronic acid)、利塞膦酸(risedronic acid)和唑来膦酸(zoledronic acid)。依替酮酸以商品名DidronelTM出售。氯膦酸以商品名BonefosTM出售。替鲁罗酸以商品名SkelidTM出售。帕米膦酸以商品名ArediaTM出售。阿仑膦酸以商品名FosamaxTM出售。伊班膦酸以商品名BondranatTM出售。利塞膦酸以商品名ActonelTM出售。唑来膦酸以商品名ZometaTM出售。术语“mTOR抑制剂”是指抑制雷帕霉素的哺乳动物目标(mTOR)且具有抗增生活性的化合物,例如西罗莫司(sirolimus)
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依维莫司(CerticanTM)、CCI-779和ABT578。
如本文所用的术语“肝素酶抑制剂”是指靶向、降低或抑制硫酸肝素降解的化合物。所述术语包括(但不限于)PI-88。如本文所用的术语“生物反应调节剂”是指淋巴因子或干扰素。
如本文所用的术语“Ras致癌同功异型物(例如H-Ras、K-Ras或N-Ras)的抑制剂”是指靶向、降低或抑制Ras的致癌活性的化合物;例如“法呢基转移酶抑制剂”,例如L-744832、DK8G557或R115777(ZarnestraTM)。如本文所用的术语“端粒酶抑制剂”是指靶向、降低或抑制端粒酶的活性的化合物。靶向、降低或抑制端粒酶的活性的化合物尤其为抑制端粒酶受体的化合物,例如端粒抑素(telomestatin)。
如本文所用的术语“甲硫氨酸氨基肽酶抑制剂”是指靶向、降低或抑制甲硫氨酸氨基肽酶的活性的化合物。靶向、降低或抑制甲硫氨酸氨基肽酶的活性的化合物包括(但不限于)苯胍麦(bengamide)或其衍生物。
如本文所用的术语“蛋白酶体抑制剂”是指靶向、降低或抑制蛋白酶体的活性的化合物。靶向、降低或抑制蛋白酶体的活性的化合物包括(但不限于)硼替佐米(Bortezomib)(VelcadeTM)和MLN 341。
如本文所用的术语“基质金属蛋白酶抑制剂”或(“MMP”抑制剂)包括(但不限于)胶原蛋白肽模拟和非肽模拟抑制剂、四环素衍生物,例如异羟肟酸酯肽模拟抑制剂巴马司他(batimastat)和其口服生物可用类似物马立马司他(marimastat)(BB-2516)、普啉司他(prinomastat)(AG3340)、美他司他(metastat)(NSC 683551)、BMS-279251、BAY 12-9566、TAA211、MMI270B或AAJ996。
如本文所用的术语“用于治疗血液科恶性疾病的化合物”包括(但不限于)FMS样酪氨酸激酶抑制剂,其为靶向、降低或抑制FMS样酪氨酸激酶受体(Flt-3R)的活性的化合物;干扰素、1-β-D-阿糖呋喃胞嘧啶(ara-c)和白消安(bisulfan);以及ALK抑制剂,其为靶向、降低或抑制多形性淋巴瘤激酶的化合物。
靶向、降低或抑制FMS样酪氨酸激酶受体(Flt-3R)的活性的化合物尤其为抑制Flt-3R受体激酶家族成员的化合物、蛋白质或抗体,例如PKC412、米哚妥林、星形孢菌素衍生物、SU11248和MLN518。
如本文所用的术语“HSP90抑制剂”包括(但不限于)靶向、降低或抑制HSP90的固有ATP酶(ATPase)活性的化合物;经由泛素蛋白酶体路径降解、靶向、降低或抑制HSP90客户蛋白(client protein)的化合物。靶向、降低或抑制HSP90的固有ATP酶活性的化合物尤其为抑制HSP90的ATP酶活性的化合物、蛋白质或抗体,例如17-烯丙基氨基-17-去甲氧基格尔德霉素(17AAG)(一种格尔德霉素衍生物);其它格尔德霉素相关化合物;根赤壳菌素(radicicol)和HDAC抑制剂。
如本文所用的术语“抗增生抗体”包括(但不限于)曲妥珠单抗(HerceptinTM)、曲妥珠单抗-DM1、艾比特思(erbitux)、贝伐单抗(bevacizumab)(AvastinTM)、利妥昔单抗(rituximab)PRO64553(抗CD40)和2C4抗体。抗体意谓完整单克隆抗体、多克隆抗体、由至少两种完整抗体形成的多特异性抗体,和抗体片段,只要其显示所需生物活性即可。
为治疗急性骨髓性白血病(AML),本发明的化合物可与标准白血病疗法组合使用,尤其与用于治疗AML的疗法组合使用。具体说来,本发明的化合物可与例如法呢基转移酶抑制剂和/或其它适用于治疗AML的药物(例如柔红霉素、阿霉素、Ara-C、VP-16、替尼泊苷、米托蒽醌、伊达比星、卡铂(Carboplatinum)和PKC412)组合投予。
其它抗白血病化合物包括例如Ara-C,其为一种嘧啶类似物且为去氧胞苷的2′-α-羟基核糖(阿拉伯糖苷)衍生物。也包括次黄嘌呤、6-巯基嘌呤(6-MP)和磷酸氟达拉滨(fludarabine phosphate)的嘌呤类似物。靶向、降低或抑制组蛋白脱乙酰基酶(HDAC)抑制剂的活性的化合物(例如丁酸钠和辛二酰基苯胺异羟肟酸(SAHA))抑制称为组蛋白脱乙酰基酶的酶的活性。具体HDAC抑制剂包括MS275、SAHA、FK228(以前称为FR901228)、曲古抑菌素A(Trichostatin A)和US 6,552,065中所揭示的化合物,包括(但不限于)N-羟基-3-[4-[[[2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)-乙基]-氨基]甲基]苯基]-2E-2-丙烯酰胺或其医药学上可接受的盐,和N-羟基-3-[4-[(2-羟乙基){2-(1H-吲哚-3-基)乙基]-氨基]甲基]苯基]-2E-2-丙烯酰胺或其医药学上可接受的盐,尤其乳酸盐。如本文所用的生长抑素(somatostatin)受体拮抗剂是指靶向、治疗或抑制生长抑素受体的化合物,例如奥曲肽(octreotide)和SOM230。肿瘤细胞破坏方法是指例如电离辐射等方法。上文和下文所提到的术语“电离辐射”意谓以电磁射线(例如X射线和γ射线)或粒子(例如α粒子和β粒子)形式存在的电离辐射。电离辐射提供于(但不限于)放射疗法中且为此项技术中所知。参见海尔曼(Hellman),放射疗法原理(Principles of Radiation Therapy),癌症-肿瘤学原理与实践(Cancer,Principles and Practice of Oncology),德维塔(Devita)等人编,第4版,第1卷,第248-275页(1993)。
也包括EDG结合剂和核糖核苷酸还原酶抑制剂。如本文所用的术语“EDG结合剂”是指调节淋巴细胞再循环的一类免疫抑制剂,例如FTY720。术语“核糖核苷酸还原酶抑制剂”是指嘧啶或嘌呤核苷类似物,包括(但不限于)氟达拉滨和/或阿糖胞苷(cytosine arabinoside)(ara-C)、6-硫鸟嘌呤(6-thioguanine)、5-氟尿嘧啶、克拉屈滨(cladribine)、6-巯基嘌呤(尤其与ara-C组合针对ALL)和/或喷司他丁(pentostatin)。核糖核苷酸还原酶抑制剂尤其为羟基脲或2-羟基-1H-异吲哚-1,3-二酮衍生物。
也包括尤其针对VEGF的化合物、蛋白质或单克隆抗体,例如1-(4-氯苯胺基)-4-(4-吡啶基甲基)酞嗪或其医药学上可接受的盐、1-(4-氯苯胺基)-4-(4-吡啶基甲基)酞嗪丁二酸盐;AngiostatinTM;EndostatinTM;邻氨基苯甲酰胺;ZD4190;ZD6474;SU5416;SU6668;贝伐单抗;或抗VEGF抗体或抗VEGF受体抗体,例如rhuMAb和RHUFab;VEGF适体,例如麦可根(Macugon);FLT-4抑制剂、FLT-3抑制剂、VEGFR-2 IgGI抗体、血管生成酶(Angiozyme)(RPI 4610)和贝伐单抗(AvastinTM)。
如本文所用的光动力疗法是指使用称为感光化合物的某些化学物质来治疗或预防癌症的疗法。光动力疗法的实例包括用例如VisudyneTM和卟吩姆钠(porfimer sodium)等化合物进行治疗。
如本文所用的血管生成抑制性类固醇是指阻断或抑制血管生成的化合物,例如阿奈可他(anecortave)、曲安西龙(triamcinolone)、氢皮质酮(hydrocortisone)、11-α-表氢化可的松(11-α-epihydrocotisol)、皮甾酮(cortexolone)、17α-羟孕酮、皮质固酮、去氧皮质固酮、睾固酮、雌酮和地塞米松(dexamethasone)。
含有皮质类固醇的植入物是指例如肤轻松(fluocinolone)和地塞米松等化合物。
其它化学治疗化合物包括(但不限于)植物碱、激素化合物和拮抗剂;生物反应调节剂,优选为淋巴因子或干扰素;反义寡核苷酸或寡核苷酸衍生物;shRNA或siRNA;或混杂化合物或具有其它或未知作用机制的化合物。
本发明的化合物也适用作共治疗化合物,供与例如消炎药物、支气管扩张药物或抗组胺药物等其它药物组合使用,尤其用于治疗阻塞性或发炎性气管疾病,例如前文所提到的疾病,例如用作所述药物的治疗活性的增效剂,或用作减少所述药物的所需剂量或潜在副作用的方式。本发明的化合物可与其它药物混合于固定医药组合物中,或其可在其它药物之前、与其它药物同时或在其它药物之后单独投予。因此,本发明包括如前文所述的本发明化合物与消炎药物、支气管扩张药物、抗组胺药物或抗咳嗽药物的组合,所述本发明化合物与所述药物处于相同或不同医药组合物中。
适合消炎药包括类固醇,尤其糖皮质类固醇,例如布地缩松(budesonide)、二丙酸倍氯米松(beclamethasone dipropionate)、丙酸氟替卡松(fluticasone propionate)、环索奈德(ciclesonide)或糠酸莫米他松(mometasone furoate);非类固醇糖皮质激素受体激动剂;LTB4拮抗剂,例如LY293111、CGS025019C、CP-195543、SC-53228、BIIL 284、ONO4057、SB 209247;LTD4拮抗剂,例如孟鲁司特(montelukast)和扎鲁司特(zafirlukast);PDE4抑制剂,例如西洛司特(cilomilast)(
Figure BDA0000158388020002341
葛兰素史克公司)、罗氟司特(Roflumilast)(拜克古尔登公司(Byk Gulden))、V-11294A(纳普公司(Napp))、BAY19-8004(拜耳公司(Bayer))、SCH-351591(先灵葆雅公司(Schering-Plough))、阿罗茶碱(Arofylline)(欧米洛宝达发玛公司(Almirall Prodesfarma))、PD189659/PD168787(帕克戴维斯公司)、AWD-12-281(艾斯塔医学公司(Asta Medica))、CDC-801(塞尔基因公司(Celgene))、SeICID(TM公司)、CC-10004(塞尔基因公司)、VM554/UM565(弗纳利斯公司(Vernalis))、T-440(坦贝公司(Tanabe))、KW-4490(日本协和发酵工业株式会社(KyowaHakko Kogyo));A2a激动剂;A2b拮抗剂;和β-2肾上腺素受体激动剂,例如舒喘宁(albuterol)(沙丁氨醇(salbutamol))、异丙喘宁(metaproterenol)、叔丁喘宁(terbutaline)、沙美特罗(salmeterol)、非诺特罗(fenoterol)、丙卡特罗(procaterol)且尤其福莫特罗(formoterol)和其医药学上可接受的盐。适合的支气管扩张药包括抗胆碱或抗蕈毒碱化合物,尤其异丙托溴铵(ipratropium bromide)、氧托溴铵(oxitropium bromide)、噻托铵盐(tiotropium salt)和CHF 4226(奇耶斯公司(Chiesi))和格隆铵(glycopyrrolate)。
适合抗组胺药物包括盐酸西替利嗪(cetirizine hydrochloride)、乙酰氨基苯酚(acetaminophen)、反丁烯二酸氯马斯汀(clemastine fumarate)、异丙嗪(promethazine)、氯雷他定(loratidine)、地氯雷他定(desloratidine)、盐酸苯海拉明(diphenhydraminehydrochloride)和盐酸非索非那定(fexofenadine hydrochloride)、阿伐斯汀(activastine)、阿司咪唑(astemizole)、氮拉斯汀(azelastine)、依巴斯汀(ebastine)、依匹斯汀(epinastine)、咪唑斯汀(mizolastine)和特非那丁(tefenadine)。
本发明化合物与消炎药的其它有用组合是与趋化因子受体拮抗剂的组合,所述拮抗剂例如为CCR-1、CCR-2、CCR-3、CCR-4、CCR-5、CCR-6、CCR-7、CCR-8、CCR-9和CCR10、CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR4、CXCR5、尤其CCR-5拮抗剂,例如先灵葆雅公司拮抗剂SC-351125、SCH-55700和SCH-D,以及武田公司(Takeda)拮抗剂,例如氯化N-[[4-[[[6,7-二氢-2-(4-甲基苯基)-5H-苯并-环庚烯-8-基]羰基]氨基]苯基]-甲基]四氢-N,N-二甲基-2H-吡喃-4-铵(TAK-770)。
由编码号、通用名或商品名标识的活性化合物的结构可自标准目录“默克索引(TheMerck Index)”的现行版本或自例如国际专利(例如IMS世界公开案)等数据库获得。
本发明的化合物也可与已知治疗方法(例如投予激素或放射)组合使用。在某些实施例中,所提供的化合物用作放射增敏剂,尤其用于治疗对放射疗法敏感性差的肿瘤。
本发明的化合物可单独投予,或与一种或一种以上其它治疗性化合物组合投予,可能的组合疗法采取固定组合的形式或本发明化合物与一种或一种以上其它治疗性化合物彼此交错或独立地投予,或固定组合与一种或一种以上其它治疗性化合物组合投予。此外或另外,本发明的化合物可尤其与化学疗法、放射疗法、免疫疗法、光线疗法、外科干预或这些疗法的组合组合投予来治疗肿瘤。如上所述,在其它治疗策略的情况下,同样可采用长期疗法与辅助疗法。其它可能的治疗为在肿瘤消退后维持患者状态的疗法,或甚至例如处于危险中的患者的化学预防疗法。
所述其它药剂可作为多次给药方案的一部分,与含有本发明化合物的组合物分开投予。或者,所述药剂可作为单一剂型的一部分,与本发明化合物一起混合在单一组合物中。如果两种活性剂是作为多次给药方案的一部分投予,那么其可同时、依序或彼此间隔一段时间(通常彼此间隔5小时)提供。
如本文所用的术语“组合”和相关术语是指同时或依序投予本发明的治疗剂。举例来说,本发明的化合物可与另一治疗剂以个别单位剂型同时或依序投予,或以单一单位剂型一起投予。因此,本发明提供包含本发明化合物、另一治疗剂和医药学上可接受的载剂、佐剂或媒剂的单一单位剂型。
可与载剂物质组合产生单一剂型的本发明化合物与另一治疗剂(在包含如上所述的另一治疗剂的组合物中)两者的量都将视所治疗的宿主和特定投药模式而变化。优选地,本发明的组合物应经调配,以便每天可投予每公斤体重0.01-100mg之间的剂量的本发明物质。
在包含另一治疗剂的组合物中,所述另一治疗剂与本发明化合物可协同起作用。因此,所述组合物中另一治疗剂的量将小于仅利用所述治疗剂的单药疗法中所需的量。在所述组合物中,每天可投予每公斤体重0.01-100mg之间的剂量的另一治疗剂。
本发明组合物中所存在的另一治疗剂的量将不超过包含此治疗剂作为唯一活性剂的组合物中通常所投予的量。当前所揭示的组合物中另一治疗剂的量优选将在包含此药剂作为唯一治疗活性剂的组合物中通常所存在的量的约50%到100%的范围内。
本发明化合物或其医药组合物也可并入组合物中,以供涂布例如假体、人工瓣膜、血管移植物、支架和导管等植入式医疗装置。举例来说,已使用血管支架来解决再狭窄(损伤后血管壁再变窄)。然而,使用支架或其它植入式装置的患者存在形成血块或血小板活化的风险。这些不想要的作用可通过用包含激酶抑制剂的医药学上可接受的组合物预先涂布所述装置来预防或减轻。用本发明化合物涂布的植入式装置为本发明的另一实施例。
5.探针化合物
在某些方面中,本发明的化合物可系链到可检测部分以形成探针化合物。在一个方面中,本发明的探针化合物包含如本文所述的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的不可逆激酶抑制剂、可检测部分以及将抑制剂连接于可检测部分的系链部分。
在一些实施例中,所述本发明的探针化合物包含通过二价系链部分-Tp-系链到可检测部分Rp的所提供的式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物。系链部分可经由分子上的任何可取代碳或氮或者经由R1连接于式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物。所属领域技术人员应了解,当系链部分连接于R1时,R1是表示为R1′的二价弹头基。
在某些实施例中,所提供的探针化合物选自下式任一者:XIII、XIV、XIV-a、XIV-b、XIV-c、XIV-d、XIV-e、XIV-f、XIV-g、XIV-h、XV、XVI、XVII-a、XVII-b、XVIII-a、XVIII-b、XIX、XX、XXI、XXII、XXIII、XXIV、XXIV-a、XXIV-b、XXIV-c、XXIV-d和XXIV-e:
Figure BDA0000158388020002381
Figure BDA0000158388020002391
Figure BDA0000158388020002401
其中各变量如上文关于式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所定义且如本文中的类别和子类中所述,R1′为二价弹头基,Tp为二价系链部分;且Rp为可检测部分。
在一些实施例中,Rp为选自一次标记或二次标记的可检测部分。在某些实施例中,Rp为选自荧光标记(例如荧光染料或荧光团)、质量标签、化学发光基团、发色团、电子致密基团或能量转移剂的可检测部分。
如本文所用的术语“可检测部分”与术语“标记”和“报导体”可互换使用,且是指能够进行检测的任何部分,例如一次标记和二次标记。可使用定量(绝对、近似或相对地)所研究的系统中的可检测部分的方法来测量可检测部分的存在。在一些实施例中,所述方法是所属领域技术人员众所周知的,且包括定量报导体部分(例如标记、染料、光交联剂、细胞毒性化合物、药物、亲和标记、光亲和标记、反应性化合物、抗体或抗体片段、生物材料、纳米粒子、自旋标记、荧光团、含金属部分、放射性部分、量子点、新颖官能团、与其它分子共价或非共价相互作用的基团、光笼蔽部分(photocaged moiety)、可光化辐射激发部分、配体、可光异构化部分、生物素、生物素类似物(例如生物素亚砜)、并有重原子的部分、可化学裂解的基团、可光裂解的基团、氧化还原活性剂、同位素标记部分、生物物理探针、磷光基团、化学发光基团、电子致密基团、磁性基团、嵌入基团、发色团、能量转移剂、生物活性剂、可检测标记和上述的任何组合)的任何方法。
一次标记,例如放射性同位素(例如氚、32P、33P、35S、14C、123I、124I、125I或131I)、质量标签(包括(但不限于)稳定同位素(例如13C 、2H、17O、18O、15N、19F和127I))、正电子发射同位素(例如11C、18F、13N、124I和15O)和荧光标记,是产生可在无进一步修饰下检测的信号的报导体基团。可检测部分可通过包括(但不限于)以下的方法来分析:荧光、正电子发射断层摄影法、SPECT医学成像、化学发光、电子自旋共振、紫外/可见光吸收光谱分析、质谱分析、核磁共振、磁共振、流式细胞术、自动放射照相术、闪烁计数、磷成像和电化学方法。
如本文所用的术语“二次标记”是指需要存在第二中间物产生可检测信号的部分,例如生物素和各种蛋白质抗原。对于生物素,二次中间物可包括抗生蛋白链菌素-酶偶联物。对于抗原标记,二次中间物可包括抗体-酶偶联物。一些荧光基团充当二次标记,因为其在非辐射荧光共振能量转移(FRET)的过程中将能量转移到另一基团,且所述第二基团会产生所检测的信号。
如本文所用的术语“荧光标记”、“荧光染料”和“荧光团”是指吸收确定激发波长的光能且发射不同波长的光能的部分。荧光标记的实例包括(但不限于):艾丽莎公司氟染料(Alexa Fluor dye)(艾丽莎氟350、艾丽莎氟488、艾丽莎氟532、艾丽莎氟546、艾丽莎氟568、艾丽莎氟594、艾丽莎氟633、艾丽莎氟660和艾丽莎氟680)、AMCA、AMCA-S、BODIPY染料(BODIPY FL、BODIPY R6G、BODIPY TMR、BODIPY TR、BODIPY 493/503、BODIPY 530/550、BODIPY 558/568、BODIPY 564/570、BODIPY576/589、BODIPY 581/591、BODIPY 630/650、BODIPY 650/665)、羧基若丹明6G(Carboxyrhodamine 6G)、羧基-X-若丹明(ROX)、瀑布蓝(Cascade Blue)、瀑布黄(CascadeYellow)、香豆素(Coumarin)343、花青染料(Cyanine dye)(Cy3、Cy5、Cy3.5、Cy5.5)、丹酰(Dansyl)、达坡(Dapoxyl)、二烷氨基香豆素、4′,5′-二氯-2′,7′-二甲氧基-荧光素、DM-NERF、伊红(Eosin)、藻红(Erythrosin)、荧光素、FAM、羟基香豆素、IRDye(IRD40、IRD 700、IRD 800)、JOE、丽丝胺若丹明B(Lissamine rhodamine B)、马里那蓝(MarinaBlue)、甲氧基香豆素、萘并荧光素(Naphthofluorescein)、俄勒冈绿(Oregon Green)488、俄勒冈绿500、俄勒冈绿514、太平洋蓝(Pacific Blue)、PyMPO、芘、若丹明B、若丹明6G、若丹明绿、若丹明红、罗多尔绿(Rhodol Green)、2′,4′,5′,7′-四溴砜-荧光素、四甲基-若丹明(TMR)、羧基四甲基若丹明(TAMRA)、得克萨斯红(Texas Red)、得克萨斯红-X、5(6)-羧基荧光素、2,7-二氯荧光素、N,N-双(2,4,6-三甲基苯基)-3,4:9,10-苝双(二甲酰亚胺)、HPTS、乙基伊红、DY-490XL MegaStokes、DY-485XL MegaStokes、阿第伦达克绿(Adirondack green)520、ATTO 465、ATTO 488、ATTO 495、YOYO-1,5-FAM、BCECF、二氯荧光素、若丹明110、若丹明123、YO-PRO-1、SYTOX绿、钠绿、SYBR绿I、艾丽莎氟500、FITC、Fluo-3、Fluo-4、荧光-祖母绿(fluoro-emerald)、YoYo-1 ssDNA、YoYo-1dsDNA、YoYo-1、SYTO RNASelect、德维萨(Diversa)绿-FP、龙绿(Dragon Green)、艾瓦绿(EvaGreen)、冲浪绿EX(Surf Green EX)、光谱绿(Spectrum Green)、纽罗曲斯(NeuroTrace)500525、NBD-X、米托泰克(MitoTracker)绿FM、莱索泰克(LysoTracker)绿DND-26、CBQCA、PA-GFP(活化后)、WEGFP(活化后)、FlASH-CCXXCC、单体阿射弥(Azami)绿、阿射弥绿、绿色荧光蛋白(GFP)、EGFP(坎贝尔钱(Campbell Tsien)2003)、EGFP(帕特森(Patterson)2001)、枫绿(Kaede Green)、7-苯甲氨基-4-硝基苯并-2-氧杂-1,3-二唑、Bexl、多柔比星、荧光绿(Lumio Green)和萨普格罗(SuperGlo)GFP。
如本文所用的术语“质量标签”是指能够使用质谱分析(MS)检测技术根据质量独特地检测到的任何部分。质量标签的实例包括电泳释放标签,例如N-[3-[4′-[(对甲氧基四氟苯甲基)氧基]苯基]-3-甲基甘油酮基]异哌啶甲酸、4′-[2,3,5,6-四氟-4-(五氟苯氧基)]甲基苯乙酮和其衍生物。这些质量标签的合成和效用描述于美国专利4,650,750、4,709,016、5,360,8191、5,516,931、5,602,273、5,604,104、5,610,020和5,650,270中。质量标签的其它实例包括(但不限于)核苷酸、双去氧核苷酸、具有不同长度和碱基组成的寡核苷酸、寡肽、寡糖和其它具有不同长度和单体组成的合成聚合物。在适当质量范围(100-2000道尔顿(Dalton))内的多种中性与带电有机分子(生物分子或合成化合物)也可用作质量标签。稳定同位素(例如13C、2H、17O、18O和15N)也可用作质量标签。
如本文所用的术语“化学发光基团”是指在不加热下因发生化学反应而发光的基团。举例来说,鲁米诺(luminol)(5-氨基-2,3-二氢-1,4-酞嗪二酮)与如过氧化氢(H2O2)的氧化剂在碱和金属催化剂存在下反应,产生激发态产物(3-氨基邻苯二甲酸酯,3-APA)。
如本文所用的术语“发色团”是指吸收可见光波长、紫外波长或红外波长的光的分子。
如本文所用的术语“染料”是指含有发色团的可溶性有色物质。
如本文所用的术语“电子致密基团”是指当用电子束照射时散射电子的基团。所述基团包括(但不限于)钼酸铵、次硝酸铋、碘化镉、碳酰肼、氯化铁六水合物、六亚甲基四胺、无水三氯化铟、硝酸镧、乙酸铅三水合物、柠檬酸铅三水合物、硝酸铅、过碘酸、磷钼酸、磷钨酸、铁氰化钾、亚铁氰化钾、钌红、硝酸银、“浓”蛋白银(Ag分析:8.0-8.5%)、四苯基卟吩银(S-TPPS)、氯金酸钠、钨酸钠、硝酸铊、氨基硫脲(TSC)、乙酸铀酰、硝酸铀酰和硫酸氧钒。
如本文所用的术语“能量转移剂”是指贡献出能量或接受来自另一分子的能量的分子。仅举例来说,荧光共振能量转移(FRET)是偶极-偶极耦合过程,通过此过程,荧光供体分子的激发态能量非辐射性地转移到未激发的受体分子,接着所述受体分子荧光发射较长波长的贡献能量。
如本文所用的术语“并有重原子的部分”是指并有通常比碳重的原子的离子的基团。在一些实施例中,所述离子或原子包括(但不限于)硅、钨、金、铅和铀。
如本文所用的术语“光亲和标记”是指一种标记,其具有在曝光时与对所述标记具有亲和力的分子形成键联的基团。
如本文所用的术语“光笼蔽部分”是指在某些波长下光照时共价或非共价结合其它离子或分子的基团。
如本文所用的术语“可光异构化部分”是指在光照时自一种异构形式变成另一异构形式的基团。
如本文所用的术语“放射性部分”是指核自发地放出核辐射,例如α、β或γ粒子的基团;其中α粒子为氦核,β粒子为电子,且γ粒子为高能光子。
如本文所用的术语“自旋标记”是指含有显示不成对电子自旋的一个原子或一组原子的分子(即稳定顺磁性基团),在一些实施例中,所述分子通过电子自旋共振谱分析进行检测,且在其它实施例中其连接于另一分子。所述自旋标记分子包括(但不限于)硝酰基和氮氧化物,且在一些实施例中为单一自旋标记或双自旋标记。
如本文所用的术语“量子点”是指胶状半导体纳米晶体,在一些实施例中,其可在近红外线中进行检测且具有极高量子产率(即在适度光照时非常明亮)。
所属领域技术人员将认识到,可检测部分可经由适合取代基连接于所提供的化合物。如本文所用的术语“适合取代基”是指能够共价连接于可检测部分的部分。所述部分是所属领域技术人员众所周知的,且包括含有例如羧酸酯部分、氨基部分、硫醇部分或羟基部分等的基团。应了解,所述部分可直接连接于所提供的化合物,或经由系链基团(例如二价饱和或不饱和烃链)连接于所提供的化合物。
在一些实施例中,可检测部分经由点击化学(click chemistry)连接于所提供的化合物。在一些实施例中,所述部分经由叠氮化物与炔烃任选在铜催化剂存在下进行1,3-环加成来连接。使用点击化学的方法为此项技术中所已知,且包括罗斯托夫采夫(Rostovtsev)等人,应用化学国际版(Angew.Chem.Int.Ed.)2002,41,2596-99,和孙(Sun)等人,生物偶联化学(Bioconjugate Chem.),2006,17,52-57所述的方法。在一些实施例中,提供预备点击(click ready)抑制剂部分且使其与预备点击-Tp-Rp部分反应。如本文所用的“预备点击”是指含有叠氮化物或炔烃以用于点击化学反应的部分。在一些实施例中,预备点击抑制剂部分包含叠氮化物。在某些实施例中,预备点击-Tp-Rp部分包含用于无铜点击化学反应中的变形环辛炔(strained cyclooctyne)(例如使用贝斯肯(Baskin)等人,美国国家科学院院刊,2007,104,16793-16797中所述的方法)。
在某些实施例中,预备点击抑制剂部分具有以下各式中一者:
Figure BDA0000158388020002441
Figure BDA0000158388020002451
其中变量如上文关于式II-a、V-a和V-b所定义和本文中所描述,XT为-O-、-NH-或-NMe-,且f在每次出现时独立地为1、2或3。
示范性预备点击抑制剂包括:
Figure BDA0000158388020002461
在一些实施例中,预备点击-Tp-Rp部分具有下式:
Figure BDA0000158388020002462
包括使用环辛炔的示范性反应(参见斯勒顿(Sletten)和博托兹(Bertozzi),有机化学通讯(Org.Lett.)10:3097-3099(2008))如下所示,其中预备点击抑制剂部分与预备点击-Tp-Rp部分经由[3+2]-环加成来接合:
Figure BDA0000158388020002471
在一些实施例中,可检测部分Rp选自:标记、染料、光交联剂、细胞毒性化合物、药物、亲和标记、光亲和标记、反应性化合物、抗体或抗体片段、生物材料、纳米粒子、自旋标记、荧光团、含金属部分、放射性部分、量子点、新颖官能团、与其它分子共价或非共价相互作用的基团、光笼蔽部分、可光化辐射激发部分、配体、可光异构化部分、生物素、生物素类似物(例如生物素亚砜)、并有重原子的部分、可化学裂解的基团、可光裂解的基团、氧化还原活性剂、同位素标记部分、生物物理探针、磷光基团、化学发光基团、电子致密基团、磁性基团、嵌入基团、发色团、能量转移剂、生物活性剂、可检测标记或其组合。
在一些实施例中,Rp为生物素或其类似物。在某些实施例中,Rp为生物素。在某些其它实施例中,Rp为生物素亚砜。
在另一实施例中,Rp为荧光团。在另一实施例中,荧光团选自艾丽莎氟染料(艾丽莎氟350、艾丽莎氟488、艾丽莎氟532、艾丽莎氟546、艾丽莎氟568、艾丽莎氟594、艾丽莎氟633、艾丽莎氟660和艾丽莎氟680)、AMCA、AMCA-S、BODIPY染料(BODIPYFL、BODIPY R6G、BODIPY TMR、BODIPY TR、BODIPY 493/503、BODIPY 530/550、BODIPY 558/568、BODIPY 564/570、BODIPY 576/589、BODIPY 581/591、BODIPY630/650、BODIPY 650/665)、羧基若丹明6G、羧基-X-若丹明(ROX)、瀑布蓝、瀑布黄、香豆素343、花青染料(Cy3、Cy5、Cy3.5、Cy5.5)、丹酰、达坡、二烷氨基香豆素、4′,5′-二氯-2′,7′-二甲氧基-荧光素、DM-NERF、伊红、藻红、荧光素、FAM、羟基香豆素、IRDye(IRD40、IRD 700、IRD 800)、JOE、丽丝胺若丹明B、马里那蓝、甲氧基香豆素、萘并荧光素、俄勒冈绿488、俄勒冈绿500、俄勒冈绿514、太平洋蓝、PyMPO、芘、若丹明B、若丹明6G、若丹明绿、若丹明红、罗多尔绿、2′,4′,5′,7′-四溴砜-荧光素、四甲基-若丹明(TMR)、羧基四甲基若丹明(TAMRA)、得克萨斯红、得克萨斯红-X、5(6)-羧基荧光素、2,7-二氯荧光素、N,N-)双(2,4,6-三甲基苯基)-3,4:9,10-苝双(二甲酰亚胺)、HPTS、乙基伊红、DY-490XL MegaStokes、DY-485XL MegaStokes、阿第伦达克绿520、ATTO 465、ATTO 488、ATTO 495、YOYO-1,5-FAM、BCECF、二氯荧光素、若丹明110、若丹明123、YO-PRO-1、SYTOX绿、钠绿、SYBR绿I、艾丽莎氟500、FITC、Fluo-3、Fluo-4、荧光-祖母绿、YoYo-1 ssDNA、YoYo-1 dsDNA、YoYo-1、SYTO RNASelect、德维萨绿-FP、龙绿、艾瓦绿、冲浪绿EX、光谱绿、纽罗曲斯500525、NBD-X、米托泰克绿FM、莱索泰克绿DND-26、CBQCA、PA-GFP(活化后)、WEGFP(活化后)、FlASH-CCXXCC、单体阿射弥绿、阿射弥绿、绿色荧光蛋白(GFP)、EGFP(坎贝尔钱2003)、EGFP(帕特森2001)、枫绿、7-苯甲氨基-4-硝基苯并-2-氧杂-1,3-二唑、Bexl、多柔比星、荧光绿或萨普格罗GFP。
如上文大体上描述,所提供的探针化合物包含系链部分-Tp-,其将不可逆抑制剂连接于可检测部分。如本文所用的术语“系链剂”或“系链部分”是指任何二价化学间隔基,其包括(但不限于)共价键、聚合物、水溶性聚合物、任选取代的烷基、任选取代的杂烷基、任选取代的杂环烷基、任选取代的环烷基、任选取代的杂环基、任选取代的杂环烷基烷基、任选取代的杂环烷基烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的杂环烷基烯基烷基、任选取代的酰胺部分、醚部分、酮部分、酯部分、任选取代的氨基甲酸酯部分、任选取代的腙部分、任选取代的肼部分、任选取代的肟部分、二硫化物部分、任选取代的亚胺部分、任选取代的磺酰胺部分、砜部分、亚砜部分、硫醚部分或其任何组合。
在一些实施例中,系链部分-Tp-选自共价键、聚合物、水溶性聚合物、任选取代的烷基、任选取代的杂烷基、任选取代的杂环烷基、任选取代的环烷基、任选取代的杂环烷基烷基、任选取代的杂环烷基烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基和任选取代的杂环烷基烯基烷基。在一些实施例中,系链部分为任选取代的杂环。在其它实施例中,杂环选自氮丙啶、环氧乙烷、环硫化物、氮杂环丁烷、氧杂环丁烷、吡咯啉、四氢呋喃、四氢噻吩、吡咯烷、吡唑、吡咯、咪唑、三唑、四唑、噁唑、异噁唑、环氧乙烯、噻唑、异噻唑、二硫杂环戊烷、呋喃、噻吩、哌啶、四氢吡喃、硫杂环己烷(thiane)、吡啶、吡喃、硫代吡喃、哒嗪、嘧啶、吡嗪、哌嗪、噁嗪、噻嗪、二硫杂环己烷和二噁烷。在一些实施例中,杂环为哌嗪。在其它实施例中,系链部分任选经取代。在其它实施例中,水溶性聚合物为PEG基团。
在其它实施例中,系链部分使可检测部分与激酶抑制剂部分之间在空间上足够分离。在其它实施例中,系链部分是稳定的。在另一实施例中,系链部分实质上不影响可检测部分的反应。在其它实施例中,系链部分使探针化合物在化学上稳定。在其它实施例中,系链部分使探针化合物具有足够溶解性。
在一些实施例中,系链部分-Tp-(例如水溶性聚合物)在一端与所提供的不可逆抑制剂偶合且在另一端与可检测部分Rp偶合。在其它实施例中,水溶性聚合物经由所提供的不可逆抑制剂的官能团或取代基偶合。在其它实施例中,水溶性聚合物经由报导体部分的官能团或取代基偶合。
在一些实施例中,用于系链部分-Tp-中的亲水性聚合物的实例包括(但不限于):聚烷基醚和其经烷氧基封端的类似物(例如聚氧乙二醇、聚氧乙二醇/丙二醇和其经甲氧基或乙氧基封端的类似物、聚氧乙二醇,后者也称为聚乙二醇或PEG);聚乙烯吡咯烷酮;聚乙烯烷基醚;聚噁唑啉、聚烷基噁唑啉和聚羟烷基噁唑啉;聚丙烯酰胺、聚烷基丙烯酰胺和聚羟烷基丙烯酰胺(例如聚羟丙基甲基丙烯酰胺和其衍生物);聚丙烯酸羟烷基酯;聚唾液酸和其类似物、亲水性肽序列;多糖和其衍生物,包括葡聚糖和葡聚糖衍生物,例如羧甲基葡聚糖、硫酸葡聚糖、氨基葡聚糖;纤维素和其衍生物,例如羧甲基纤维素、羟烷基纤维素;甲壳素和其衍生物,例如壳聚糖、丁二酰壳聚糖、羧甲基甲壳素、羧甲基壳聚糖;透明质酸和其衍生物;淀粉;海藻酸盐;硫酸软骨素;白蛋白;普鲁兰糖(pullulan)和羧甲基普鲁兰糖;聚氨基酸和其衍生物,例如聚谷氨酸、聚赖氨酸、聚天冬氨酸、聚天冬酰胺;顺丁烯二酸酐共聚物,例如:苯乙烯顺丁烯二酸酐共聚物、二乙烯基乙基醚顺丁烯二酸酐共聚物;聚乙烯醇;其共聚物、其三元共聚物、其混合物,和上述各物的衍生物。在其它实施例中,水溶性聚合物为任何结构形式,包括(但不限于)线性、叉状或具支链状。在其它实施例中,多官能聚合物衍生物包括(但不限于)具有两个末端的线性聚合物,各末端键接于相同或不同的官能团。
在一些实施例中,水聚合物包含聚(乙二醇)部分。在其它实施例中,聚合物的分子量具有宽广的范围,包括(但不限于)在约100Da与约100,000Da或约100,000Da以上之间。在其它实施例中,聚合物的分子量在约100Da与约100,000Da之间,包括(但不限于)约100,000Da、约95,000Da、约90,000Da、约85,000Da、约80,000Da、约75,000Da、约70,000Da、约65,000Da、约60,000Da、约55,000Da、约50,000Da、约45,000Da、约40,000Da、约35,000Da、30,000Da、约25,000Da、约20,000Da、约15,000Da、约10,000Da、约9,000Da、约8,000Da、约7,000Da、约6,000Da、约5,000Da、约4,000Da、约3,000Da、约2,000Da、约1,000Da、约900Da、约800Da、约700Da、约600Da、约500Da、约400Da、约300Da、约200Da和约100Da。在一些实施例中,聚合物的分子量在约100Da与50,000Da之间。在一些实施例中,聚合物的分子量在约100Da与40,000Da之间。在一些实施例中,聚合物的分子量在约1,000Da与40,000Da之间。在一些实施例中,聚合物的分子量在约5,000Da与40,000Da之间。在一些实施例中,聚合物的分子量在约10,000Da与40,000Da之间。在一些实施例中,聚(乙二醇)分子为具支链聚合物。在其它实施例中,具支链链PEG的分子量在约1,000Da与约100,000Da之间,包括(但不限于)约100,000Da、约95,000Da、约90,000Da、约85,000Da、约80,000Da、约75,000Da、约70,000Da、约65,000Da、约60,000Da、约55,000Da、约50,000Da、约45,000Da、约40,000Da、约35,000Da、约30,000Da、约25,000Da、约20,000Da、约15,000Da、约10,000Da、约9,000Da、约8,000Da、约7,000Da、约6,000Da、约5,000Da、约4,000Da、约3,000Da、约2,000Da和约1,000Da。在一些实施例中,具支链链PEG的分子量在约1,000Da与约50,000Da之间。在一些实施例中,具支链链PEG的分子量在约1,000Da与约40,000Da之间。在一些实施例中,具支链链PEG的分子量在约5,000Da与约40,000Da之间。在一些实施例中,具支链链PEG的分子量在约5,000Da与约20,000Da之间。实质上水溶性主链的以上清单绝非详尽的且仅用于说明,且在一些实施例中,具有上述品质的聚合物适用于本文所述的方法和组合物中。
所属领域技术人员应了解,当-Tp-Rp经由R1弹头基连接于式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物时,则所得系链部分包含R1弹头基。如本文所用的短语“包含弹头基”意谓由式XIII、XIV、XIV-a、XIV-b、XIV-c、XIV-d、XIV-e、XIV-f、XIV-g、XIV-h、XV、XVI、XVII-a、XVII-b、XVIII-a、XVIII-b、XIX、XX、XXI、XXII、XXIII、XXIV、XXIV-a、XXIV-b、XXIV-c、XXIV-d或XXIV-e的-R1′-Tp-形成的系链部分经弹头基取代或者具有此类弹头基并入系链部分中。举例来说,由-R1′-Tp-形成的系链部分可经-L-Y弹头基取代,其中所述基团如本文所述。或者,由-R1′-Tp-形成的系链部分具有弹头基并入系链部分中的适当特征。举例来说,由-R1′-Tp-形成的系链部分可包括一个或一个以上不饱和单元和任选存在的取代基和/或杂原子,其组合时可产生能够共价修饰本发明激酶的部分。所述-R1-Tp-系链部分描绘于下文中。
在一些实施例中,-R1′-Tp-系链部分的亚甲基单元经二价-L-Y′-部分置换,得到式XIII-i、XIV-i、XIV-a-i、XIV-b-i、XIV-c-i、XIV-d-i、XIV-e-i、XIV-f-i、XIV-g-i、XIV-h-i、XV-i、XVI-i、XVII-a-i、XVII-b-i、XVIII-a-i、XVIII-b-i、XIX-i、XX-i、XXI-i、XXII-i、XXIII-i、XXIV-i、XXIV-a-i、XXIV-b-i、XXIV-c-f、XXIV-d-i或XXIV-e-i的化合物:
Figure BDA0000158388020002511
Figure BDA0000158388020002531
Figure BDA0000158388020002541
其中各变量如上文关于式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所定义且如本文中的类别和子类中所述,且Y′为上文定义的Y基团的二价型式且如本文中的类别和子类中所述。
在一些实施例中,-R1′-T-系链部分的亚甲基单元经-L(Y)-部分置换,得到式XIII-ii、XIV-ii、XIV-a-ii、XIV-b-ii、XIV-c-ii、XIV-d-ii、XIV-e-ii、XIV-f-ii、XIV-g-ii、XIV-h-ii、XV-ii、XVI-ii、XVII-a-ii、XVII-b-ii、XVIII-a-ii、XVIII-b-ii、XIX-ii、XX-ii、XXI-ii、XXII-ii、XXIII-ii、XXIV-ii、XXIV-a-ii、XXIV-b-ii、XXIV-c-ii、XXIV-d-ii或XXIV-e-ii的化合物:
Figure BDA0000158388020002542
Figure BDA0000158388020002551
Figure BDA0000158388020002561
Figure BDA0000158388020002571
Figure BDA0000158388020002581
其中各变量如上文关于式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所定义,且如本文中的类别和子类中所述。
在一些实施例中,系链部分经L-Y部分取代,得到式XIII-iii、XIV-iii、XIV-a-iii、XIV-b-iii、XIV-c-iii、XIV-d-iii、XIV-e-iii、XIV-f-iii、XIV-g-iii、XIV-h-iii、XV-iii、XVI-iii、XVII-a-iii、XVII-b-iii、XVIII-a-iii、XVIII-b-iii、XIX-iii、XX-iii、XXI-iii、XXII-iii、XXIII-iii、XXIV-iii、XXIV-a-iii、XXIV-b-iii、XXIV-c-iii、XXIV-d-iii或XXIV-e-iii的化合物:
Figure BDA0000158388020002611
Figure BDA0000158388020002621
其中各变量如上文关于式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d和XII-e所定义,且如本文中的类别和子类中所述。
在某些实施例中,系链部分-Tp-具有以下结构中一者:
在一些实施例中,系链部分-Tp-具有以下结构:
Figure BDA0000158388020002623
在其它实施例中,系链部分-Tp-具有以下结构:
Figure BDA0000158388020002624
在某些其它实施例中,系链部分-Tp-具有以下结构:
Figure BDA0000158388020002625
在其它实施例中,系链部分-Tp-具有以下结构:
Figure BDA0000158388020002631
在一些实施例中,系链部分-Tp-具有以下结构:
Figure BDA0000158388020002632
在一些实施例中,-Tp-Rp具有以下结构:
在其它实施例中,-Tp-Rp具有以下结构:
在某些实施例中,-Tp-Rp具有以下结构:
Figure BDA0000158388020002635
在一些实施例中,式XIII、XIV、XIV-a、XIV-b、XIV-c、XIV-d、XIV-e、XIV-f、XIV-g、XIV-h、XV、XVI、XVII-a、XVII-b、XVIII-a、XVIII-b、XIX、XX、XXI、XXII、XXIII、XXIV、XXIV-a、XXIV-b、XXIV-c、XXIV-d或XXIV-e的探针化合物是衍生自表5-17的任何化合物。
在某些实施例中,探针化合物为以下结构中一者:
Figure BDA0000158388020002641
应了解,许多-Tp-Rp试剂可购得。举例来说,大量生物素标记试剂可得自例如赛默科技公司(Thermo Scientific),其具有不同系链剂长度。所述试剂包括NHS-PEG4-生物素和NHS-PEG12-生物素。
在一些实施例中,类似于上文所例示的结构的探针结构是使用如本文所述的预备点击抑制剂部分和预备点击-Tp-Rp部分制备。
在一些实施例中,所提供的探针化合物共价修饰激酶的磷酸化构象。在一个方面中,激酶的磷酸化构象为激酶的活性或无活性形式。在某些实施例中,激酶的磷酸化构象为所述激酶的活性形式。在某些实施例中,探针化合物可渗透细胞。
在一些实施例中,本发明提供一种用于测定患者中所提供的不可逆抑制剂(即式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物)对激酶的占用率的方法,其包含提供一种或一种以上自投予至少一剂所述不可逆抑制剂化合物的患者获得的组织、细胞类型或其溶解产物;使所述组织、细胞类型或其溶解产物与探针化合物(即式XIII、XIV、XIV-a、XIV-b、XIV-c、XIV-d、XIV-e、XIV-f、XIV-g、XIV-h、XV、XVI、XVII-a、XVII-b、XVIII-a、XVIII-b、XIX、XX、XXI、XXII、XXIII、XXIV、XXIV-a、XXIV-b、XXIV-c、XXIV-d或XXIV-e的化合物)接触以共价修饰所述溶解产物中存在的至少一种激酶;和测量探针化合物共价修饰的所述激酶的量,以相较于所述探针化合物对所述激酶的占用率,测定所述式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物对所述激酶的占用率。在某些实施例中,所述方法进一步包含调整式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物的剂量以增加对激酶的占用率的步骤。在某些其它实施例中,所述方法进一步包含调整式I、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的化合物的剂量以降低对激酶的占用率的步骤。
如本文所用的术语“占用率”或“占用”是指所提供的共价抑制剂化合物对激酶的修饰程度。所属领域技术人员应了解,最好投予可能达到对激酶的所需有效占用率的最低剂量。
在一些实施例中,待修饰的激酶为PI3K。在某些实施例中,待修饰的激酶为PI3K-α。在某些实施例中,待修饰的激酶为PI3K-γ。在一些实施例中,待修饰的激酶为PI3K-β或PI3K-δ。在其它实施例中,待修饰的激酶为mTOR、DNA-PK、ATM激酶或PI4KA。
在一些实施例中,探针化合物包含用于测定占用率的不可逆抑制剂。
在一些实施例中,本发明提供一种用于评估所提供的不可逆抑制剂在哺乳动物中的功效的方法,其包含向所述哺乳动物投予所提供的不可逆抑制剂;向自所述哺乳动物分离的组织或细胞或其溶解产物投予所提供的探针化合物;测量探针化合物的可检测部分的活性;和将可检测部分的活性与标准比较。
在其它实施例中,本发明提供一种用于评估所提供的不可逆抑制剂在哺乳动物中的药效学的方法,其包含向所述哺乳动物投予所提供的不可逆抑制剂;向一种或一种以上自所述哺乳动物分离的细胞类型或其溶解产物投予本文提供的探针化合物;和在投予抑制剂后的不同时间点测量探针化合物的可检测部分的活性。
在其它实施例中,本发明提供一种用于体外标记蛋白激酶的方法,其包含使所述蛋白激酶与本文所述的探针化合物接触。在一个实施例中,接触步骤包含将蛋白激酶与本文提供的探针化合物一起培育。
在某些实施例中,本发明提供一种用于体外标记蛋白激酶的方法,其包含使一种或一种以上表达所述蛋白激酶的细胞或组织或其溶解产物与本文所述的探针化合物接触。
在某些其它实施例中,本发明提供一种用于检测经标记的蛋白激酶的方法,其包含通过电泳法分离蛋白质,所述蛋白质包含经本文所述的探针化合物标记的蛋白激酶;以及通过荧光来检测探针化合物。
在一些实施例中,本发明提供一种用于在体外评估所提供的不可逆抑制剂的药效学的方法,其包含将所提供的不可逆抑制剂与目标蛋白激酶一起培育;添加本文提供的探针化合物到目标蛋白激酶中;和测定经探针化合物修饰的目标的量。
在某些实施例中,探针化合物通过结合于亲和素(avidin)、抗生蛋白链菌素(streptavidin)、中性链亲和素(neutravidin)或生物素连接蛋白(captavidin)来进行检测。
在一些实施例中,探针通过蛋白质印迹法(Western blot)进行检测。在其它实施例中,探针通过ELISA进行检测。在某些实施例中,探针通过流式细胞术进行检测。
在其它实施例中,本发明提供一种用不可逆抑制剂探测激酶组(kinome)的方法,其包含将一种或一种以上细胞类型或其溶解产物与经生物素标记的探针化合物一起培育以产生经生物素部分修饰的蛋白质;消化蛋白质;用亲和素或其类似物捕捉;和进行多维LC-MS-MS以鉴别经探针化合物修饰的蛋白激酶和所述激酶的加合位点(adductionsite)。
在某些实施例中,本发明提供一种用于测量细胞中蛋白质合成的方法,其包含将细胞与目标蛋白质的不可逆抑制剂一起培育;在特定时间点形成细胞的溶解产物;和将所述细胞溶解产物与本发明探针化合物一起培育以测量在较长时间段内游离蛋白质的出现。
在其它实施例中,本发明提供一种用于确定哺乳动物中的给药时间表以使目标蛋白激酶的占用率达到最大的方法,其包含分析一种或一种以上自投予所提供的式II、II、II-a、II-b、II-c、II-d、II-e、II-f、II-g、II-h、III、IV、V-a、V-b、VI-a、VI-b、VII、VIII、IX、X、XI、XII、XII-a、XII-b、XII-c、XII-d或XII-e的不可逆抑制剂的哺乳动物分离(来源于例如脾细胞、周边B细胞、全血、淋巴结、肠组织或其它组织)的细胞类型或其溶解产物,其中所述分析步骤包含使所述一种或一种以上组织、细胞类型或其溶解产物与所提供的探针化合物接触,和测量经探针化合物共价修饰的蛋白激酶的量。
附图说明
图1描绘在HCT116细胞中在“洗脱(washout)”实验中所提供的化合物与已知可逆抑制剂GSK-615和GDC-941相比较的结果。
图2描绘在PC3细胞中在“洗脱”实验中化合物II-a-16与已知可逆抑制剂GDC-941相比较的结果。
图3描绘在“洗脱”实验中化合物II-a-144和II-a-148与三种可逆参考化合物相比较的结果。
图4描绘MS分析,证实PI3Kα经化合物II-a-45共价修饰。
图5描绘MS分析,证实PI3Kα经化合物II-a-49共价修饰。
图6描绘MS分析,证实PI3Kα经化合物II-a-3共价修饰。
图7描绘MS分析,证实PI3Kα经化合物II-a-144共价修饰。
图8描绘MS分析,证实PI3Kα经化合物II-a-148共价修饰。
图9描绘在胰蛋白酶消化后进行的MS分析,证实PI3Kα上的肽853NSHTIMQIQCK863经化合物II-a-3共价修饰。
图10描绘MS/MS分析,证实PI3Kα上的Cys-862经化合物II-a-3共价修饰。
图11描绘在胰蛋白酶消化后进行的MS分析,证实PI3Kα上的肽853NSHTIMQIQCK863经化合物II-a-144共价修饰。
图12描绘MS/MS分析,证实PI3Kα上的Cys-862经化合物II-a-144共价修饰。
图13描绘与已知可逆抑制剂GDC-941相比较,经II-a-3处理的小鼠脾中的p-AKTSer473含量。
图14描绘在SKOV3肿瘤生长抑制实验中利用II-a-3和II-a-148与利用已知可逆抑制剂GDC-941以及太平洋紫杉醇(paclitaxel)相比较的结果。
图15描绘在SKOV3细胞中II-a-148与已知可逆抑制剂GDC-941的剂量反应目标占用率数据的比较。
图16描绘MS分析,证实PI3Kα经化合物XII-54共价修饰。
具体实施方式
范例
如以下实例中所描述,在某些示范性实施例中,根据以下一般程序制备化合物。应了解,虽然一般方法描绘了某些本发明化合物的合成,但以下一般方法和所属领域技术人员已知的其它方法可应用于如本文所述的所有化合物和这些化合物中每一者的子类和种类。
以下实例中所用的化合物编号对应于上文表5-17中所示的化合物编号。
实例1
Figure BDA0000158388020002691
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-2):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020002701
步骤1a:4-(2-氯噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基)吗啉(中间物1a)
Figure BDA0000158388020002702
向2,4-二氯噻吩并[3,2-d]嘧啶(2.0g,9.7mmol)于30ml MeOH中的溶液中添加1.9ml吗啉。在室温下搅拌1小时后,过滤反应混合物;用水和甲醇洗涤固体,得到2.0g标题化合物。MS m/z:256.0,258.1(M+1)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:7.78(1H,d,J=5.48Hz),7.38(1H,d,J=5.48Hz),4.02(4H,t,J=4.80Hz),3.85(4H,t,J=4.82Hz)。
步骤1b:2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲醛(中间物1b)
Figure BDA0000158388020002703
在-78℃下向中间物1a(1.02g,4.0mmol)于30ml THF中的悬浮液中缓慢添加LiHMDS(1.0N,6.0ml,6.0mmol)。在-78℃下搅拌反应混合物1小时,添加DMF(0.5ml),且反应混合物经2小时升温到室温。用NH4Cl水溶液淬灭反应且在真空下去除THF。添加50ml份的EtOAc且用NaHCO3水溶液和盐水洗涤混合物。分离有机层且经Na2SO4干燥。去除溶剂后,粗产物经历硅胶色谱法(洗脱剂:EtOAc/己烷)。总共获得0.6g标题化合物(60%)。MS m/z:284.2(ES+,M+1)。
步骤1c:4-((2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物1c)
Figure BDA0000158388020002711
将中间物1b(0.40g,1.5mmol)、哌嗪-1-甲酸叔丁酯和0.2ml乙酸溶解于12ml二氯乙烷中。在室温下搅拌混合物2小时。添加NaBH(OAc)3(0.54g,2.5mmol)到反应混合物中,且在室温下搅拌所得混合物10小时。添加20ml NaHCO3水溶液和10ml DCM。分离有机层且经Na2SO4干燥。去除溶剂后,粗产物经历硅胶色谱法(洗脱剂:EtOAc/己烷3∶7)。总共获得0.30g标题化合物。MS m/z:454.2(ES+,M+1)。
步骤1d:4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物1d)
将中间物1c(0.14g,0.31mmol)、4-(三甲基锡烷基)-1H-吲唑(0.10g,0.37mmol)及四(三苯基膦)钯(35mg,0.03mmol)溶解于5ml甲苯中。使溶液脱气且用N2吹扫。在密封小瓶中将反应混合物加热到135℃,维持40小时。在真空下去除溶剂且通过硅胶色谱法(洗脱剂:EtOAc/己烷5∶5)纯化残余物。总共获得0.10g标题化合物。MS m/z:536.1(M+1)。
或者,中间物1d可通过使用4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼戊环-2-基)-1H-吲唑替代4-(三甲基锡烷基)-1H-吲唑在标准铃木偶合条件下来制备。
步骤1e:4-(2-(1H-吲唑-4-基)-6-(哌嗪-1-基甲基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基)吗啉(中间物1e)
Figure BDA0000158388020002721
将中间物1d(100mg,0.18mmol)溶解于3ml 4N HCl的二噁烷溶液中,且在室温下搅拌反应物3小时。去除溶剂后,倒入3ml份的DCM,接着蒸发至干。重复此添加DCM、接着蒸发的过程3次,得到白色固体且直接用于下一步骤中。MS m/z:436.2(M+H+)。
步骤1f:1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-2)
Figure BDA0000158388020002722
在-40℃下,在搅拌下向中间物1e(10mg,0.02mmol)和丙烯酸(2.0mg,0.025mmol)于1.0ml无水乙腈中的溶液中添加HATU(9.1mg,0.024mmol)和DIEA(15mg,0.1mmol)。在约-10℃下搅拌反应混合物10分钟。添加10ml份的EtOAc和5ml NaHCO3水溶液。分离有机层且经Na2SO4干燥。去除溶剂后,粗产物经历硅胶色谱法(洗脱剂:EtOAc/己烷9∶1)。总共获得6mg标题化合物。MS m/z:490.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:9.01(1H d,J=0.88Hz),8.27(1H d,J=7.32Hz),7.58(1H d,J=7.0Hz),7.51(1H t,J=6.84Hz),7.39(1H,s),6.56(1H dd,J=10.56,16.96Hz),6.32(1H d,16.96Hz),5.70(1H d,10.52Hz),4.09(4H,m),3.93(6H,m),3.79(2H,s),3.62(2H,s),2.60(4H,s)。
以类似方式,使用中间物1e且与丙烯酰氯(2.5当量)偶合,制备1-(4-((2-(1-丙烯酰基-1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-14):
MS m/z:544.1(M+H+)。
以类似方式,使用中间物1e且与CDI偶合,制备(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)(1H-咪唑-1-基)甲酮(II-a-15):
Figure BDA0000158388020002732
MS m/z:530.2(M+H+)。
以类似方式,使用(中间物1e且在TEA存在下与2-氯乙烷磺酰氯偶合,制备4-(2-(1H-吲唑-4-基)-6-((4-(乙烯基磺酰基)哌嗪-1-基)甲基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基)吗啉(II-a-1):
Figure BDA0000158388020002741
MS m/z:526.2(M+H+)。
以类似方式,通过使中间物1e与适当酸偶合来制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020002742
N-(4-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-117):MS:m/z 609.2(ES+)。
以类似方式,通过使中间物1e与适当磺酰氯偶合来制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020002751
N-(4-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基磺酰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-118):MS:m/z 645.2(ES+)。
实例2
Figure BDA0000158388020002752
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-36):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
步骤2a:(E)-4-氧代庚-5-烯酸(中间物2a)
Figure BDA0000158388020002753
在-78℃下向丁二酸酐(0.50g,5.0mmol)于20.0ml无水THF中的溶液中缓慢添加1-丙烯基溴化镁(0.5M的THF溶液,18.0mL,9.0mmol)。在-78℃下搅拌反应混合物1小时。添加1N HCl(9.0ml)水溶液且混合物缓慢升温到室温。利用1N HCl将pH值调到约3。接着在真空下去除THF且利用DCM萃取剩余水溶液(3×20mL)。有机层经Na2SO4干燥,过滤且去除溶剂。通过硅胶色谱法(洗脱剂:EtOAc/己烷1∶1)纯化残余物,得到酸。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:6.90(1H dq,J=6.88Hz,16.0Hz),6.15(1H dq,J=16.0Hz,1.68Hz),2.87(2H t,J=6.64Hz),2.67(2H t,J=6.64Hz),1.91(3H dd,J=1.44Hz,6.84Hz)。
步骤2b:(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-36)
Figure BDA0000158388020002761
根据步骤1f中所述的程序,使用HATU,通过使上文所获得的(E)-4-氧代庚-5-烯酸与中间物1e偶合来制备标题化合物。MS m/z:560.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.886(1H bt),8.228(1H dd),7.667(1H dt),7.514(1H t),7.47(1H,m),6.86(1H dq),6.13(1H dq),4.01(4H,bt),3.92(2H,s),3.84(4H,bt),3.49(4H,dt),2.77(2H,bt),2.55(2H,bt),1.865(3H,dd)。
以类似方式,通过使中间物1e与遵循步骤2a产生的适当酸偶合来制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020002771
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-5-甲基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-43):MS m/z:560.3(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.885(1H t),8.23(1H dd),7.67(1H dt),7.515(1H s),7.472(1H,q),6.096(1H bt),5.846(1H bt),4.01(4H,t),3.93(1H,s),3.84(4H,t),3.5(4H,dt),2.93(2H,t),2.52(6H,m)。
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-8,8-二甲基-1,5-二氧代壬-6-炔-2-基氨基甲酸(S)-叔丁酯(II-a-51):MS m/z:729.3(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002781
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-8,8-二甲基-1,5-二氧代壬-6-烯-2-基氨基甲酸(S)-叔丁酯(II-a-52):MS m/z:731.3(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002782
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-甲基庚-6-烯-1,5-二酮(II-a-14):MS m/z:574.2(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.89(1H bt),8.23(1H d),7.67(1H dt),7.51(1H,s),7.47(1H q),6.06(1H bt),5.85(1H,m),4.01(4H,bt),3.92(2H,s),3.84(4H,bt),3.48(4H,bs),2.75(2H,t),2.31(2H,t),1.78(3H,s),1.71(2H,m)。
Figure BDA0000158388020002791
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)辛-6-烯-1,5-二酮(II-a-22):MS m/z:574.2(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.88(1H m),8.225(1H dd),7.67(1H dt),7.51(1H,s),7.47(1H q),6.85(1H dq),6.09(1H,dq),4.01(4H,bt),3.92(2H,s),3.84(4H,bt),3.48(4H,bm),2.58(2H,t),2.3(2H,t),1.85(3H,dd),1.69(2H,m)。
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氯乙酮(II-a-145):MS:m/z 514.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020002801
丁-2-烯酸(E)-2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙酯(II-a-146):MS:m/z 562.3(ES+)。
N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙氧基)丙烯酰胺(II-a-147):MS:m/z 563.3(ES+)
Figure BDA0000158388020002811
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-5-亚甲基庚烷-1,4-二酮(II-a-86)。MS:m/z 574.9(ES+)。
Figure BDA0000158388020002812
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-5-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-149)。MS:m/z 574.8(ES+)。
Figure BDA0000158388020002813
(E)-4-(二甲氨基)-N-(1-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌啶-4-基)丁-2-烯酰胺(II-a-150)。MS:m/z 599.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020002821
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)庚-1,4-二酮(IIR-a-36):经由在氢气下使用5%Pd/C于MeOH中对II-a-36进行氢化来制备标题化合物。MS:m/z 562.3(ES+)。
以类似于实例1和2中所示的方式,使用2-氨基嘧啶-5-硼酸与中间物1c偶合,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020002822
(E)-1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-112):MS:m/z 537.3(ES+)。
以类似于实例1和2中所示的方式,使用1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基硼酸与中间物1c偶合,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020002831
(E)-1-(4-((4-(N-吗啉基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-114):MS:m/z 560.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020002832
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2,2,3,3-四氟-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-157)。MS:m/z 646.1(ES+)。
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-7-甲氧基-5-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-161)。MS:m/z 604.8(ES+)。
Figure BDA0000158388020002842
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-3)。MS:m/z 574.2(ES+)。
实例3
Figure BDA0000158388020002851
N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺(II-a-6):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
步骤3a:2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(中间物3a)
Figure BDA0000158388020002852
根据步骤1f中所述的程序,使用HATU,通过使BOC-Gly-OH与中间物1e偶合来制备标题化合物。MS m/z:593.2(M+H+)。
步骤3b:1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氨基乙酮盐酸盐(中间物3b)
Figure BDA0000158388020002861
通过步骤1e中所述的脱除BOC的程序来制备标题化合物。MS m/z:493.2(M+H+)。
步骤3c:N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺(II-a-6)
Figure BDA0000158388020002862
根据步骤1f中所述的程序,使用HATU,通过使丙烯酸与中间物3b偶合来制备标题化合物。MS m/z:547.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:9.01(1H d,J=0.92Hz),8.28(1H d,J=7.32Hz),7.59(1H d,J=7.32Hz),7.51(1H t,J=7.32Hz),7.40(1H,s),6.75(1H,s),6.25(2H m),5.70(1H d,10.52Hz),4.11(6H,m),3.91(6H,m),3.72(2H,t),3.51(2H,t),2.60(4H,s)。
以类似方式,使用中间物3b且与4-氧代-庚-5-烯酸(来自步骤2a)偶合,制备(E)-N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-16):
Figure BDA0000158388020002871
MS m/z:617.2(M+H+)。
以类似方式,通过使中间物3b与根据步骤2a产生的适当酸偶合来制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020002872
N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-5-甲基-4-氧代己-5-烯酰胺(II-a-33):MS m/z:617.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002881
N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-6-甲基-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-41):MS m/z:631.2(M+H+)。
通过以中间物1e为原料且根据先前实例中所述的程序或程序组合来制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020002882
N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基磺酰基)乙基)丙烯酰胺(II-a-13):MS m/z:597.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002891
(E)-N-(4-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-4-氧代丁基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-19):MS m/z:645.3(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002892
N-(4-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-4-氧代丁基)丙烯酰胺(II-a-20):MS m/z:575.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002901
N-(4-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-羰基)苯甲基)丙烯酰胺(II-a-21):MS m/z:623.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002902
(E)-N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基磺酰基)乙基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-23):MS m/z:667.1(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002911
N-(2-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺(II-a-32):MS m/z:604.3(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.89(1H s),8.42(1H t),8.23(1H d),7.97(1H t),7.67(1H,d),7.52(1H s),7.47(1H t),6.32(1H,q),6.2(1H,dd),5.62(1H,dd),3.92(14H,m),3.48(4H,m)。
N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-N-甲基丙烯酰胺(II-a-44):MS m/z:561.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002921
(E)-N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-4-(二甲氨基)丁-2-烯酰胺(II-a-56):MS m/z:604.2(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.89(1H s),8.23(1H d),8.14(1H t),7.67(1H d),7.515(1H,s),7.47(1H t),6.56(1H dt),6.17(1H,dt),4.02(6H,m),3.93(2H,s),3.84(4H,bt),3.49(4H,bs),2.98(2H,bd),2.14(6H,s)。
Figure BDA0000158388020002922
(±)-顺-N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-羰基)环己基)丙烯酰胺:MS m/z:615.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002931
(±)-反-N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-羰基)环己基)丙烯酰胺:MS m/z:615.3(M+H+)。
(±)-顺-N-(3-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-羰基)环己基)丙烯酰胺:MS m/z:615.3(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002941
(±)-顺-N-(4-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-羰基)环己基)丙烯酰胺:MS m/z:615.3(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002942
(±)-反-N-(4-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-羰基)环己基)丙烯酰胺:MS m/z:615.3(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.88(1H s),8.23(1H d),7.98(1H d),7.67(1H,d),7.5(1H s),7.47(1H,t),6.2(1H,q),6.06(1H,dd),5.55(1H,dd),4.01(4H,bt),3.92(2H,s),3.84(4H,bt),3.52(5H,dm),2.09(1H,s),1.76(4H,bdd),1.42(2H,bq),1.24(2H,bq)。
实例4
Figure BDA0000158388020002951
(E)-1-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-50):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020002952
步骤4a:4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物4a)
Figure BDA0000158388020002961
将中间物1c(305mg,0.67mmol)、3-羟基苯基硼酸(139mg,1.0mmol)、四(三苯基膦)钯(51mg,0.067mmol)和碳酸钠(214mg,2mmoL)溶解于甲苯/乙醇/水(6mL/3.6mL/1.8mL)中。对溶液进行脱气且用N2吹扫。在密封小瓶中将反应混合物加热到120℃,维持1小时。在真空下去除溶剂且通过硅胶色谱法(洗脱剂:EtOAc/己烷5:5)纯化残余物。总共获得360mg呈黄色泡沫状的标题化合物。MS m/z:512.3(M+1)。
步骤4b:3-(4-(N-吗啉基)-6-(哌嗪-1-基甲基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-2-基)苯酚盐酸盐(中间物4b)
Figure BDA0000158388020002962
将中间物4a(360mg,0.7mmol)溶解于500μL 4N HCl和DCM(5mL)中;在室温下搅拌反应物3小时。去除溶剂后,得到白色固体(350mg)且直接用于下一步骤中。MS m/z:412.1(M+H+)。
步骤4c:(E)-1-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-50)
Figure BDA0000158388020002971
根据步骤1f中所述的程序,使用HATU,通过使来自步骤2a的(E)-4-氧代庚-5-烯酸与中间物4b偶合来制备标题化合物。MS m/z:536.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:9.45(1H s,),7.85(2H m,),7.39(1H s,),7.26(1H t,),6.86(2H,m),6.13(1Hdd,),3.97(4H,bt),3.89(2H,s),3.85(4H,bt),3.48(4H,bt),2.76(2H,t),2.54(2H,t),1.86(3H,dd)。
以类似方式,通过使中间物4b与根据步骤2a制备的5-甲基-4-氧代己-5-烯酸偶合来制备1-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-5-甲基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-49)。
Figure BDA0000158388020002972
MS m/z:536.2(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:9.5(1H s),7.84(2H m),7.39(1H s),7.26(1H t),6.85(1H,m),6.09(1H s),5.845(1H bs),3.97(4H,bt),3.9(1H,s),3.88(4H,bt),3.49(4H,dt),2.925(2H,t),2.5(6H,m)。
通过以中间物4b为原料且根据先前实例中所述的程序或程序组合来制备以下化合物:
N-(2-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基磺酰基)乙基)丙烯酰胺(II-a-25):MS m/z:573.2(M+H+)。
(E)-N-(2-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基磺酰基)乙基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-26):MS m/z:643.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002991
N-(2-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基磺酰基)乙基)-6-甲基-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-28):MS m/z:657.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020002992
(E)-N-(2-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-37):MS m/z:593.3(M+H+)。
Figure BDA0000158388020003001
N-(2-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺(II-a-38):MS m/z:523.2(M+H+)。
根据以上程序,使用苯基硼酸替代3-羟基苯基硼酸来制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003002
1-(4-((4-(N-吗啉基)-2-苯基噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-17):MS m/z:450.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020003003
(1H-咪唑-1-基)(4-((4-(N-吗啉基)-2-苯基噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)甲酮(II-a-18):MS m/z:490.2(M+H+)。
实例5
N-(2-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)乙基)丙烯酰胺(II-a-8):根据如下所述的方案制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003012
在0℃下向2,2-二甲氧基乙胺(1.0当量)于二氯甲烷中的溶液中缓慢添加丙烯酰氯(1.2当量)。将三乙胺(2.5当量)缓慢引入反应混合物中。反应物升温到室温,维持1小时。在真空下去除溶剂且残余物直接用于下一步骤中。
在室温下向来自步骤1e的产物(20mg,0.04mmol)、自以上获得的N-(2,2-二甲氧基乙基)丙烯酰胺(13.5mg,0.08mmol)于0.2ml乙酸和1.0ml乙腈中的溶液中添加NaBH3CN(5.5mg,0.085mmol)。搅拌反应10小时,且通过添加乙酸乙酯(10ml)来处理,接着用NaHCO3水溶液洗涤。通过制备型HPLC(含有0.1%TFA的25%到90%CH3CN水溶液)来纯化粗残余物,得到8.0mg呈TFA盐形式的标题化合物。MS m/z:533.2(M+1)。
实例6
N-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)-N-甲基丙烯酰胺(II-a-39):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
步骤6a:(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲醇(中间物6a)
Figure BDA0000158388020003031
在0℃下向1b(5g,17.6mmol)于MeOH(50mL)中的溶液中逐份添加NaBH4(0.98g,26.4mmol)且在室温下搅拌5小时。反应完成(由TLC监测)后,在减压下去除挥发物,残余物溶解于水中且用DCM(3×75mL)萃取。用水洗涤合并的有机相,经无水Na2SO4干燥,且在真空中浓缩,得到呈淡黄色固体状的中间物6a(3g,60%)。TLC:80%EtOAc/己烷(Rf:0.3);1H-NMR(CDCl3,200MHz):δ7.21(s,1H),4.98(s,2H),4.0(t,J=4.2Hz,4H),3.83(t,J=4.8Hz,4H);质量:286[M++1]。
步骤6b:甲烷磺酸(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲酯(中间物6b)
Figure BDA0000158388020003032
在0℃下,经10分钟的时间,向中间物6a(1g,3.5mmol)于DCM(10mL)中的溶液中添加TEA(1.06g,10.5mmol),接着添加甲磺酰氯(0.48g,4.2mmol)。在室温下搅拌反应混合物1小时。反应完成(由TLC监测)后,添加水(25mL),用DCM(2×50mL)萃取。合并的有机相经无水Na2SO4干燥,且在真空中浓缩。通过硅胶柱色谱法(50%EtOAc/己烷)纯化粗化合物,得到呈黄色固体状的中间物6b(0.8g,62%)。TLC:80%EtOAc/己烷(Rf:0.6);1H-NMR(CDCl3,500MHz)(SAV-A9008-009):δ7.39(s,1H),5.46(s,2H),4.0(t,J=4.5Hz,4H),3.84(t,J=5.0Hz,4H),3.05(s,3H);质量:364[M++1];Mp:151.4℃。
步骤6c:1-(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-N-甲基甲胺(中间物6c)
在室温下搅拌中间物6b(0.24g,0.67mmol)、2M甲胺的THF溶液(2.0ml,4.0mmol)和DIEA(0.35ml,2.0mmol)于THF(5mL)中的溶液2小时。LC-MS显示完全转化成产物。在真空中去除溶剂且粗物质直接用于下一步骤中。MS m/z:299.1(M+1)。
步骤6d:(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基(甲基)氨基甲酸叔丁酯(中间物6d)
Figure BDA0000158388020003041
将粗中间物6c、Boc2O(0.22g,1.0mmol)和TEA(0.2ml)溶解于10ml二氯甲烷中且搅拌溶液10小时。LC-MS显示完全转化成产物。在真空中去除溶剂且粗物质直接用于下一步骤中。MS m/z:399.1(M+1)。
步骤6e:(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-yl)甲基(甲基)氨基甲酸叔丁酯(中间物6e)
Figure BDA0000158388020003042
根据实例4步骤4a中所述的程序,通过使3-羟基苯基硼酸与中间物6d偶合来制备标题化合物。获得0.19g标题化合物。MS m/z:457.1(M+1)。
步骤6f:3-(6-((甲基氨基)甲基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-2-基)苯酚(中间物6f)
Figure BDA0000158388020003051
根据实例1步骤1e中所述的程序,用4N HCl处理中间物6e,得到标题化合物。MS m/z:357.1(M+1)。
步骤6g:N-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)-N-甲基丙烯酰胺(II-a-39)
Figure BDA0000158388020003052
根据步骤1f中所述的程序,使用HATU,通过使丙烯酸与中间物6f偶合来制备标题化合物。MS m/z:411.1(M+H+)。
以类似方式,使用中间物6f,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003053
N-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)-N-甲基乙烯磺酰胺(II-a-29):MS m/z:447.1(M+H+)。
Figure BDA0000158388020003061
(±)-4-丙烯酰胺基-N-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)-N-甲基环己烷甲酰胺(II-a-35):MS m/z:536.2(M+H+)。
(E)-N-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)-N-甲基-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-40):MS m/z:481.2(M+H+)。
以类似方式,在铃木偶合步骤(步骤6e)中使用2-氨基嘧啶-5-硼酸,且在酰胺形成(步骤6g)中使用适当羧酸,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003071
N-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)-N,7-二甲基-5-氧代辛-6-烯酰胺(II-a-174)。MS:m/z 510.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003072
4-丙烯酰胺基-N-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)-N-甲基苯甲酰胺(II-a-175)。MS:m/z 531.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003081
N-(4-((((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)(甲基)氨基)甲基)苯基)丙烯酰胺(II-a-176)。以类似方式,使用N-(4-(氯甲基)苯基)丙烯酰胺替代酸,制备标题化合物。MS:m/z 517.1(ES+)。
N-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲氧基)苯基)丙烯酰胺(II-a-172)。经由光延反应(Mitsunobu reaction),使中间物6a与N-(4-羟基苯基)丙烯酰胺反应,接着与2-氨基嘧啶-5-硼酸进行铃木反应,来制备标题化合物。MS:m/z 490.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003091
N-(4-(((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲氧基)甲基)苯基)丙烯酰胺(II-a-173)。经由烷基化反应,使中间物6a与N-(4-(氯甲基)苯基)丙烯酰胺反应,接着与2-氨基嘧啶-5-硼酸进行铃木反应,来制备标题化合物。MS:m/z 502.1(ES+)。
实例7
1-(4-(1-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌啶-4-羰基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-31):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003101
步骤7a:4-(1-((2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌啶-4-羰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物7a)
Figure BDA0000158388020003102
在室温下在惰性氛围下,向中间物1b(0.2g,0.7mmol)和4-(哌啶-4-羰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.25g,0.8mmol)于DCE(20mL)中的悬浮液中添加原甲酸三甲酯(0.22g,2.1mmol)。搅拌反应混合物1小时且添加NaBH(OAc)3(0.22g,1.06mmol)。反应完成(由TLC监测)后,添加水且用DCM(2×10mL)萃取。用水、盐水洗涤有机层,经无水Na2SO4干燥且在真空中浓缩。通过柱色谱法(5%MeOH/DCM)纯化粗化合物,得到呈灰白色固体状的中间物7a(0.25g,64%)。TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.2);1H-NMR(CDCl3,200MHz):δ7.12(s,1H),3.99(t,J=4.0Hz,4H),3.90-3.78(m,6H),3.64-3.55(m,2H),3.50-3.38(m,6H),3.10-2.96(m,2H),2.8(s,1H),2.60-2.40(m,1H),2.25-1.85(m,4H),1.75-1.60(m,2H),1.46(s,9H);质量:565[M++1]。
步骤7b:4-(1-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌啶-4-羰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物7b)
在室温下向中间物7a(0.5g,0.8mmol)于甲苯(12.5mL)、EtOH(7.5mL)、H2O(3.5mL)中的搅拌溶液中添加吲唑硼酸(0.43g,1.7mmol)、Na2CO3(0.31g)和Pd(PPh)3Cl2(0.06g,0.09mmol)。用氩气对反应混合物进行脱气,持续1小时,且在140℃下搅拌16小时。反应完成(由TLC监测)后,使反应混合物分配于DCM与水之间。分离有机层,经无水Na2SO4干燥且在真空中浓缩。通过柱色谱法(5%MeOH/DCM)纯化粗化合物,得到呈灰白色固体状的中间物7b(0.3g,52%)。TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.3);1H-NMR(CDCl3,500MHz):δ9.0(s,1H),8.27(d,J=7.0Hz,1H),7.58(d,J=8Hz,1H),7.50(t,J=7.5Hz,1H),7.34(s,1H),4.09(t,J=4.5Hz,4H),3.93(t,J=4.5Hz,4H),3.85(s,2H),3.6(bs,2H),3.50-3.40(m,6H),3.07(d,J=11.5Hz,2H),2.5(t,J=5.0Hz,1H),2.17(t,J=11.5Hz,2H),2.04-1.94(m,2H),1.70(d,J=13Hz,2H),1.47(s,9H);质量:647[M++1];MP:139℃。
步骤7c:1-(4-(1-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌啶-4-羰基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-31)
根据实例1步骤1e中所述的程序,用4N HCl处理中间物7b,得到脱除boc的胺盐酸盐。
在-10℃下向以上盐酸盐(0.05g,0.09mmol)于DCM(10mL)中的搅拌溶液中添加DIPEA(0.03g,0.27mmol),接着添加丙烯酰氯(0.007g,0.08mmol)。在-10℃下搅拌反应混合物1小时。反应完成(由TLC监测)后,用水淬灭反应物且用DCM(2×5mL)萃取。有机层经无水Na2SO4干燥且在真空中浓缩。通过柱色谱法(5%MeOH/DCM)纯化粗化合物,得到呈灰色固体状的标题化合物(0.02g,50%)。TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.2);1H-NMR(CDCl3,500MHz):δ9.01(s,1H),8.27(d,J=7.0Hz,1H),7.58(d,J=8.0Hz,1H),7.5(t,J=7.5Hz,1H),7.35(s,1H),6.62-6.52(m,1H),6.33(d,J=16.5Hz,1H),5.76(d,J=10.5Hz,1H),4.09(t,J=10.5Hz,4H),3.93((t,J=10.5Hz,4H),3.86(s,2H),3.78-3.49(m,8H),3.08(d,J=11.5Hz,2H),2.58-2.50(m,1H),2.18(t,J=10.5Hz,2H),2.05-1.95(m,2H),1.71(d,J=12.5Hz,2H);质量:601[M++1]。
以类似方式,在步骤7b中使用3-羟基苯基硼酸替代4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼戊环-2-基)-1H-吲唑,制备(1-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌啶-4-基)(4-丙烯酰基-哌嗪-1-基)甲酮(II-a-34):
Figure BDA0000158388020003121
TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.5);1H-NMR(CDCl3,500MHz):δ8.0(d,J=8.0Hz,1H),7.91(s,1H),7.33(t,J=7.5Hz,1H),7.27(d,J=9.5Hz,1H),6.92(dd,J=2.0,7.5Hz,1H),6.54(dd,J=2.5,10Hz,1H),6.32(d,J=16.5Hz,1H),5.73(d,J=9.5Hz,1H),5.0(bs,1H),4.05(t,J=4.5Hz,4H),3.89(t,J=4.5Hz,4H),3.6(s,2H),3.75-3.50(m,2H),3.05(d,J=11.5Hz,2H),2.58-2.48(bs,1H),2.17(t,J=11.5Hz,2H),1.97(q,J=12Hz,2H),1.70(d,J=12.5Hz,2H);质量:577[M++1]。
实例8
Figure BDA0000158388020003131
(E)-1-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)庚-5-烯-1,4-二酮:根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003132
步骤8a:4-(2-氯-6-碘噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基)吗啉(中间物8a)
在-78℃下,经30分钟的时间,向中间物1a(5g,0.019mol)于THF(100mL)中的搅拌溶液中添加n-BuLi(2.5g,0.03mol),在-40℃下搅拌2小时,接着在-78℃下添加含碘(9.9g,0.03mol)的THF(5mL)。在室温下搅拌反应混合物8小时。反应完成(由TLC监测)后,用饱和氯化铵(100mL)淬灭反应且用EtOAc(4×200mL)萃取。用硫代硫酸钠溶液洗涤有机层,经无水Na2SO4干燥且在真空中浓缩。用乙醚洗涤粗产物,得到呈灰白色固体状的中间物8b(7g,94%)。TLC:30%乙酸乙酯/己烷(Rf:0.3);1H-NMR(CDCl3,500MHz):δ7.57(s,1H),3.94-3.91(m,4H),3.85-3.80(m,4H);质量:382[M++1],MP:173.5℃。
步骤8b:4-(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸叔丁酯(中间物8b)
Figure BDA0000158388020003141
在室温下向4-(2-氯-6-碘噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基)吗啉(中间物8a)(0.57g,1.5mmol)于甲苯(10mL)、EtOH(6.0mL)、H2O(3.0mL)中的搅拌溶液中添加4-(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸叔丁酯(0.5g,1.6mmol)、Na2CO3(0.7g)和Pd(PPh)3Cl2(56mg,0.08mmol)。用氩气对反应混合物进行脱气且在40℃下搅拌3小时。LC-MS显示转化完全:MS m/z:437.1(M+1)。反应混合物直接用于下一步骤中。
步骤8c:4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸叔丁酯(中间物8c)
在室温下向来自步骤8b的反应混合物中添加3-羟基苯基硼酸(0.35g,2.5mmol)、Na2CO3(1.0g)和Pd(PPh)3Cl2(30mg,0.04mmol)。用氩气对反应混合物进行脱气且在130℃下搅拌3小时。接着通过添加50ml乙酸乙酯来处理反应物,且用水和盐水洗涤。分离有机层且经Na2SO4干燥。去除溶剂后,粗产物经历硅胶色谱法(洗脱剂:EtOAc/己烷1∶1到4∶1),得到标题化合物。MS m/z:495.1(M+1)。
步骤8d:(E)-1-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-45)
Figure BDA0000158388020003151
通过根据实例4步骤4b和4c中所述的程序制备标题化合物。MS m/z:519.1(M+H+)。
在以上反应中,当使用TFA脱除Boc保护基时,获得2,2,2-三氟乙酸(E)-4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1-(4-氧代庚-5-烯酰基)哌啶-3-基酯(II-a-46)作为副产物:
Figure BDA0000158388020003152
MS m/z:632.3(M+H+)。
通过以中间物8b为原料且根据先前实例中所述的程序或程序组合来制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003153
(E)-1-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)辛-6-烯-1,5-二酮(II-a-60):MS m/z:557.2(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.9(1H s),8.23(1H d),7.67(1H d),7.61(1H,d),7.48(1H t),6.88(1H,m),6.51(1H,dt),6.11(1H,dm),4.19(2H,bd),4.02(4H,bt),3.84(4H,bt),3.7(2H,m),2.62(3H,q),3.9(2H,dt),1.86(3H,dt),1.75(2H,m)。
Figure BDA0000158388020003161
(E)-N-(2-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-氧代乙基)-5-氧代辛-6-烯酰胺(II-a-61):MS m/z:614.2(M+H+)。
以类似方式,在步骤8b中使用适合硼酸与中间物8a偶合,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003162
1-(4-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲酰基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-57):MS m/z:580.2(M+H+)。
1-(5-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)异吲哚啉-2-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-27):质量:485[M++1]。
Figure BDA0000158388020003172
1-(4-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-58):质量:528[M++1]。
Figure BDA0000158388020003173
1-(4-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-78):质量:552[M++1]。
Figure BDA0000158388020003181
N-(3-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基)丙烯酰胺(II-a-64):质量:473[M++1]。
Figure BDA0000158388020003182
(E)-N-(3-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-79):质量:543[M++1]。
Figure BDA0000158388020003191
N-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基)丙烯酰胺(II-a-65):质量:473[M++1]。
Figure BDA0000158388020003192
(E)-N-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-80):质量:543[M++1]。
Figure BDA0000158388020003201
1-(6-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-66):质量:499[M++1]。
Figure BDA0000158388020003202
(E)-1-(7-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-67):质量:569[M++1]。
Figure BDA0000158388020003211
(E)-1-(5-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)异吲哚啉-2-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-68):质量:555[M++1]。
Figure BDA0000158388020003212
N-(1-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌啶-4-基)丙烯酰胺(II-a-81):质量:542[M++1]。
以类似方式,在步骤8b中使用适合硼酸/硼酸酯,在步骤8c中使用适合硼酸/硼酸酯,且在酰胺形成(步骤8d)中使用适合羧酸,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003221
(E)-1-(4-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌嗪-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-102):MS:m/z 598.8(ES+)。
Figure BDA0000158388020003222
1-(7-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-106):MS:m/z 499.0(ES+)。
Figure BDA0000158388020003223
(E)-1-(6-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-108):MS:m/z 569.0(ES+)。
Figure BDA0000158388020003231
N-(2-(6-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺(II-a-121):MS:m/z 556.8(ES+)。
Figure BDA0000158388020003232
N-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基)-6-甲基-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-122):MS:m/z 539.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003233
(E)-N-(1-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌啶-4-基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-109):MS:m/z 612.8(ES+)。
Figure BDA0000158388020003241
1-(4-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-78):MS:m/z 552.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020003242
N-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基)丙烯酰胺(II-a-107):MS:m/z 497.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020003243
N-(3-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基)丙酰胺(IIR-a-64):MS:m/z 475.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003251
(E)-N-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(II-a-115):MS:m/z 567.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020003252
N-(1-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌啶-4-基)丙烯酰胺(II-a-110):MS:m/z 566.8(ES+)。
Figure BDA0000158388020003253
N-(3-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-3-氧代丙基)丙烯酰胺(II-a-95):MS:m/z 544.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003261
(E)-1-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-6-苯基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-135):MS:m/z 605.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003262
N-(4-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-144):MS:m/z 592.1(ES+)。
N-(2-(8-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-3,4-二氢喹啉-1(2H)-基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺(II-a-124):MS:m/z 556.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003271
N-(2-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯甲基氨基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺(II-a-128):MS:m/z。
Figure BDA0000158388020003272
N-(1-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)苯基)哌啶-4-基)丙酰胺(IIR-a-81):通过在氢气下用5%Pd/C于MeOH中对II-a-81进行氢化来制备标题化合物。MS:m/z 544.2(ES+)。
以类似方式,使用2-氨基-嘧啶-4-硼酸替代吲唑-4-硼酸用于铃木偶合步骤(步骤6e),制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003273
N-(4-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-156)。MS:m/z 569.2(ES+)。
N-(5-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)-2-氯苯基)丙烯酰胺(II-a-159)。MS:m/z 603.0(ES+)。
Figure BDA0000158388020003282
N-(3-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-171)。MS:m/z 569.2(ES+)。
1-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-165)。MS:m/z 534.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003291
1-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(II-a-166)。MS:m/z 548.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003292
N-(4-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-169)。以类似于II-a-165的方式,通过最初在铃木偶合中使用2-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼戊环替代氯基经吗啉置换的反应来制备标题化合物。MS:m/z 545.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003293
N-(4-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-164)。以类似于II-a-156的方式,通过最初在铃木偶合中使用2-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼戊环替代氯基经吗啉置换的反应来制备标题化合物。MS:m/z 566.2(ES+)。
实例9
Figure BDA0000158388020003301
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-环丙基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-55):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
步骤9a:5-(二乙氧基磷酰基)-4-氧代戊酸(中间物9a)
在-78℃下向甲基膦酸二乙酯(0.76g,5.0mmol)于20ml THF中的溶液中缓慢添加n-BuLi(2.5N,5.0mmol)。在-78℃下搅拌反应混合物1小时。在-78℃下将含丁二酸酐(0.50g,5.0mmol)的5.0ml无水THF缓慢引入反应物中。在-78℃下搅拌反应混合物1小时。添加1N HCl水溶液(5.0ml)且混合物升温到室温。接着在真空下去除THF且通过DCM(3×10mL)萃取剩余水溶液。有机层经Na2SO4干燥,过滤且去除溶剂。通过硅胶色谱法(洗脱剂:EtOAc/MeOH 20∶1)纯化残余物,得到酸9a。MS m/z:253.1(M+1);1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:4.15(4H m),3.18(1H s),3.13(1H s),2.95(2H t,J=6.44Hz),2.63(2H t,J=6.40Hz),1.33(6H m)。
步骤9b:5-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2,5-二氧代戊基膦酸二乙酯(中间物9b)
Figure BDA0000158388020003311
根据步骤1f中所述的程序,使用HATU,通过使酸9a与中间物1e(来自实例1)偶合来制备标题化合物。MS m/z:670.3(M+1)。
步骤9c:(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-环丙基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-55)
Figure BDA0000158388020003312
在室温下向中间物9b(25mg,0.04mmol)和环丙烷甲醛(28mg,0.4mmol)于THF/H2O(1.5ml/1.0ml)中的溶液中添加Na2CO3(25mg,0.25mmol)。搅拌反应混合物10小时且通过1N HCl淬灭到约PH 5。通过制备型HPLC(含有0.1%TFA的25%到90%CH3CN水溶液)来纯化粗残余物,得到10.0mg呈TFA盐形式的标题化合物。MS m/z:586.2(M+1);1H NMR(400MHz,CDCl3,MeOD):δ:8.41(1H d,J=0.88Hz),7.83(1H d,J=6.84Hz),7.61(1H d,J=8.24Hz),7.44(1H,s),7.38(1H t,J=7.32Hz),6.21(1H dd,J=10.1,15.6Hz),6.06(1H d,15.6Hz),3.79(8H,m),3.56(4H,m),2.69(6H,m),2.43(3H,m),0.83(2H,m),0.51(2H,m)。
以类似方式,用适当醛处理中间物9b,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003321
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)辛-5-烯-1,4-二酮(II-a-53):MS m/z:574.3(M+1)。1H NMR(400MHz,CDCl3,MeOD):δ:8.76(1H d,J=0.92Hz),8.07(1H d,J=7.32Hz),7.53(1H d,J=8.24Hz),7.40(1H dd,J=7.36Hz,8.28Hz),7.30(1H,s),6.88(1H dt,J=6.4Hz,16.04Hz),6.04(1H d,16.04Hz),4.01(4H m),3.84(4H m),3.79(2H,m),3.52(2H,m),2.83(2H,m),2.51(6H,m),2.16(2H,m),0.99(3H,t,J=7.32Hz)。
Figure BDA0000158388020003331
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-7-甲基辛-5-烯-1,4-二酮(II-a-54):MS m/z:588.1(M+1)。
Figure BDA0000158388020003332
7-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-4,7-二氧代庚-2-烯基(甲基)氨基甲酸(E)-叔丁酯(II-a-24):MS m/z:689.3(M+1)。
Figure BDA0000158388020003341
N1-((E)-7-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-4,7-二氧代庚-2-烯基)-N5-(15-氧代-19-((3aS,4S,6aR)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)-4,7,10-三氧杂-14-氮杂十九烷基)戊二酰胺(VIII-a-2):MS m/z:1117.5(M+1)。
Figure BDA0000158388020003342
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-7-异丙氧基庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-62):MS m/z:618.3(M+1)。1H NMR(400MHz,CDCl3,MeOD):δ:8.57(1H,s),8.03(1H d,J=7.36Hz),7.63(1H d,J=8.24Hz),7.56(1H,s),7.44(1H,t,J=7.80Hz),6.81(1H,dt,J=6.34Hz,16.04Hz),6.27(1H dt,J=2.06Hz,16.04Hz),4.11(8H,m),3.86(4H,m),3.7-3.6(5H,m),2.87(4H,m),2.75(2H,m),2.55(2H,m),1.09(6H,d,J=5.96Hz)。
Figure BDA0000158388020003351
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)壬-5-烯-1,4-二酮(II-a-63):MS m/z:588.3(M+1).1H NMR(400MHz,CDCl3,MeOD):δ:8.61(1H,s),8.04(1H d,J=7.36Hz),7.61(1H d,J=8.24Hz),7.52(1H,s),7.44(1H,t,J=7.80Hz),6.82(1H,dt,J=6.88Hz,16.04Hz),6.03(1H d,J=16.04Hz),4.08(6H,m),3.86(4H,m),3.63(4H,m),2.84(2H,m),2.78(2H,m),2.69(2H,m),2.54(2H,m),2.12(2H,m),1.39(2H,m),0.83(3H,t)。
以类似方式,在40-60℃下用适当酮处理中间物9b,制备1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-5-亚环丁基戊-1,4-二酮(II-a-82):
Figure BDA0000158388020003352
MS m/z:586.1(M+1)。
以类似方式,使用适当醛或酮,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003361
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-5-(氧杂环丁烷-3-亚基)戊-1,4-二酮(II-a-113):MS:m/z 588.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003362
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-苯基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-116):MS:m/z 622.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003371
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(1H-咪唑-2-基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-125):MS:m/z 612.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003372
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(噻吩-2-基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-126):MS:m/z 628.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003381
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-129):MS:m/z 626.3(ES+)。
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(1-甲基-1H-咪唑-5-基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-130):MS:m/z 626.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003391
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-7,7-二甲基辛-5-烯-1,4-二酮(II-a-131):MS:m/z 602.3(ES+)。
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(吡啶-3-基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-132):MS:m/z 623.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003401
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(吡啶-2-基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-133):MS:m/z 623.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003402
(E)-1-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-7-苯基庚-6-烯-1,5-二酮(II-a-137):MS:m/z 619.2(ES+)
Figure BDA0000158388020003411
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-邻甲苯基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-138):MS:m/z 636.3(ES+)
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪基)-6-对甲苯基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-139):MS:m/z 636.3(ES+)
Figure BDA0000158388020003421
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(2-氟苯基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-140):MS:m/z 640.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003422
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(吡啶-4-基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-141):MS:m/z 623.3(ES+)
Figure BDA0000158388020003431
(Z)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-7,7,7-三氟-6-苯基庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-158)。MS:m/z 690.2(ES+)。
以类似方式,在步骤9a中使用乙基膦酸二乙酯且在最终缩合步骤中使用适当醛,来制备以下化合物:
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-5-甲基-6-(吡啶-2-基)己-5-烯-1,4-二酮(II-a-167)。MS:m/z 637.0(ES+)。
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-5-甲基-6-苯基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-168)。MS:m/z 636.0(ES+)。
Figure BDA0000158388020003442
(E)-1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-(1H-咪唑-2-基)-5-甲基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-170)。MS:m/z 626.0(ES+)。
实例10
1-(4-(3-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)丙-2-炔基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-47):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003452
步骤10a:4-(3-(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)丙-2-炔基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物10a)
在室温下向中间物8a(1.0g,2.6mmol)、4-(丙-2-炔基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(880mg,3.8mmol)于THF(40mL)中的搅拌溶液中添加TEA(16mL),接着添加Pd(PPh3)2Cl2(184mg,0.26mmol),用氩气脱气30分钟且添加CuI(496mg,2.6mmol)到反应混合物中。再用氩气对反应混合物进行脱气30分钟。使所得反应混合物回流3小时。反应完成(由TLC监测)后,用DCM稀释反应混合物。用水洗涤有机层,且经无水Na2SO4干燥,并在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱法(20%EtOAc/己烷)纯化粗物质,得到中间物10a(0.60g)。质量:478[M++1]。
步骤10b:4-(3-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)丙-2-炔基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物10b)
根据实例8步骤8c中所述的程序制备标题化合物。MS m/z:536.2(M+H+)。
步骤10c:1-(4-(3-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)丙-2-炔基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-47)
根据实例1步骤1e和1f中所述的程序制备标题化合物。MS m/z:490.1(M+H+)。
以类似方式,在步骤10a中使用适合炔烃与中间物8a偶合,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003462
(E)-1-(4-(3-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)丙-2-炔基)哌嗪-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-48):MS m/z:560.2(M+H+)。
Figure BDA0000158388020003471
1-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙炔基)哌啶-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-70):质量:475[M++1];TLC:50%乙酸乙酯/己烷(Rf:0.6);1H NMR(500MHz,CDCl3):δ7.96(d,J=7.5Hz,1H),7.93(s,1H),7.46(s,1H),7.32(t,J=7.5Hz,1H),6.93(dd,J=2.0Hz,1H),6.63-6.55(m,1H),6.29(dd,J=1.5,17.0Hz,1H),5.70(dd,J=2.0,10.5Hz,1H),4.10-3.77(m,10H),3.03-2.96(m,1H),2.0-1.95(m,2H),1.85-1.65(m,2H)。
1-(4-羟基-4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙炔基)哌啶-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-69):TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.6);1H NMR(500MHz,DMSO-d6):δ9.50(s,1H),7.83(t,J=8.5Hz,2H),7.66(s,1H),7.27(t,J=8.5Hz,1H),6.89-6.79(m,2H),6.10(dd,J=8.5Hz,1H),6.04(s,1H),5.67(dd,J=8.5Hz,1H),3.97(t,J=8.5Hz,4H),3.79(t,J=8.5Hz,6H),3.58-3.45(m,2H),1.98-1.90(m,2H),1.80-1.73(m,2H);质量:491[M++1]。
Figure BDA0000158388020003481
(E)-1-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙炔基)哌啶-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-89):MS:m/z 545.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020003482
1-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙炔基)哌啶-1-基)-5-甲基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-103):MS:m/z 545.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020003483
(E)-1-(4-羟基-4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙炔基)哌啶-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-104):MS:m/z 561.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020003491
1-(4-羟基-4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙炔基)哌啶-1-基)-5-甲基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-105):MS:m/z 561.8(ES+)。
以类似于II-a-69的方式,在铃木偶合步骤中使用吲唑-4-硼酸,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003492
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙炔基)-4-羟基哌啶-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-101):MS:m/z 515.0(ES+)。
以类似方式,经由对适当前体中的炔烃进行氢化且与适当羧酸形成酰胺,制备以下化合物:
1-(4-羟基-4-(2-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙基)哌啶-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-111):MS:m/z 495.1(ES+)。
(E)-1-(4-羟基-4-(2-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)乙基)哌啶-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-123):MS:m/z 565.8(ES+)。
实例11
Figure BDA0000158388020003502
2-(6-(1-丙烯酰基-1H-吡唑-4-基)-2H-苯并[b][1,4]噁嗪-4(3H)-基)-6,6-二甲基-6,7-二氢噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(VI-1):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
合成中间物11-I:
Figure BDA0000158388020003511
步骤II-I-a:3-氨基-3-甲基丁酸乙酯盐酸盐(11-I-a):
在-70℃下向3-甲基丁-2-烯酸乙酯(15g,117mmol)于EtOH(40mL)中的溶液中添加液氨(80mL),且在高压釜(200Psi)中于45℃下搅拌反应混合物16小时。反应完成(由TLC监测)后,通过N2吹扫来去除过量氨,冷却到0℃且添加HCl的二噁烷溶液(pH 2)。在0℃下搅拌反应混合物30分钟,在减压下去除挥发物且用乙醚洗涤所得固体,得到呈白色固体状的11-I-a盐酸盐(10g,58.8%);TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.1);1H-NMR(DMSO d6,200MHz):δ8.33(bs,1H),4.09(q,J=7.0Hz,2H),2.70(s,2H),1.33(s,6H),1.20(t,J=7.0Hz,3H);质量:146[M++1]。
步骤11-I-b:3-(乙基2-氨甲酰基乙酰基)-3-甲基丁酸乙酯(11-I-b):
在0℃下向化合物11-I-a(11g,68.9mmol)于DCM(150mL)中的溶液中添加TEA(38.1mL,275mmol)和乙基丙二酰氯(8.8mL,68.9mmol)。在室温下搅拌反应混合物3小时。反应完成(由TLC监测)后,用水淬灭反应且用DCM(2×200mL)萃取。用1N HCl(100mL)、饱和NaHCO3(100mL)洗涤合并的有机层,经无水Na2SO4干燥且在真空中浓缩,得到呈褐色糖浆状的11-I-b(11g,62%)。TLC:30%EtOAc/己烷(Rf:0.3);1H-NMR(CDCl3,200MHz):δ4.28-4.07(m,4H),3.24(s,2H),2.74(s,2H),1.45(s,6H),1.35-1.20(m,6H);质量:260[M++1]。
步骤11-I-c和11-I-d:6,6-二甲基哌啶-2,4-二酮(11-I-d):
向化合物11-I-b(11g,42.6mmol)于甲苯(120mL)中的搅拌溶液中添加含NaOEt(4.34g,63.9mmol)的甲苯(30mL),且在80℃下搅拌反应混合物4小时。反应完成(由TLC监测)后,用水淬灭反应且用乙醚(100mL)萃取水层。分离有机层;用1N HCl酸化水层且用DCM(2×200mL)萃取。合并的有机层经Na2SO4干燥,且在真空中浓缩。将所得粗11-I-c溶解于1%H2O/ACN(80mL)中且回流3小时。反应完成(由TLC监测)后,在减压下去除挥发物且用乙醚洗涤所得残余物,得到呈灰白色固体状的11-I-d(3.2g,53.3%)。TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.3);1H-NMR(CDCl3+DMSO-d6,200MHz):δ7.28(bs,NH),3.21(s,2H),2.56(s,2H),1.34(s,6H);质量:142[M++1]。
步骤11-I-e:2-氨基-6,7-二氢-6,6-二甲基噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(11-I-e):
向化合物11-I-d(3.2g,22.7mmol)于THF(100mL)中的搅拌溶液中添加Br2(1.13mL,22.7mmol),且在室温下搅拌反应混合物10分钟,接着添加硫脲(1.72g,22.7mmol)和DIPEA(12mL,68.0mmol)。在80℃下搅拌反应混合物2小时。反应完成(由TLC监测)后,用水淬灭反应且用EtOAc(2×150mL)萃取。合并的有机层经Na2SO4干燥,在真空中浓缩且用乙醚洗涤粗残余物,得到呈黄色固体状的11-I-e(2.5g,56%)。TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.2);1H-NMR(DMSO d6,200MHz):δ7.63(bs,2H),7.17(bs,1H),2.61(s,2H),1.22(s,6H);质量:198[M++1]。
中间物11-I:2-溴-6,7-二氢-6,6-二甲基噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮
在室温下向化合物11-I-e(2.5g,12.7mmol)于乙腈(70mL)中的溶液中添加CuBr2(2.26g,10.15mmol)和亚硝酸叔丁酯(1.3g,12.8mmol)。在室温下搅拌反应混合物2小时。反应完成(由TLC监测)后,用1N HCl淬灭反应且用DCM(2×150mL)萃取。合并的有机层经Na2SO4干燥,在真空中浓缩且用乙醚洗涤粗残余物,得到呈褐色固体状的11-I(2g,60%);TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.5);1H-NMR(CDCl3,500MHz):δ5.48(bs,NH),3.02(s,2H),1.4(s,6H);质量:283[M++Na]。
合成中间物11-II:
Figure BDA0000158388020003521
4-溴-1-(1-乙氧基乙基)-1H-吡唑(11-II-a):
向4-溴-1H-吡唑(3g,20.4mmol)、乙基乙烯基醚(1.76g,24.5mmol)于DCM(30mL)中的溶液中添加HCl(4M的二噁烷溶液,0.16mL),且在室温下搅拌反应混合物3小时。反应完成(由TLC监测)后,用饱和NaHCO3溶液中和反应物且用DCM(3×100mL)萃取。合并的有机层经无水Na2SO4干燥且在真空中浓缩,得到呈无色液体状的11-II-a(4.46g,89%)。TLC:30%EtOAc/己烷(Rf:0.7);1H-NMR(CDCl3,200MHz):δ7.60(s,1H),7.46(s,1H),5.46(q,J=6.0Hz,1H),3.55-3.25(m,2H),1.63(d,J=6.0Hz,3H),1.15(t,J=7.2Hz,3H);质量:221[M++2]。
1-(1-乙氧基乙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼戊环-2-基)-1H-吡唑(11-II):
在室温下向化合物11-II-a(600mg,2.73mmol)于二噁烷(15mL)中的溶液中添加KOAc(800mg,8.2mmol)、双(频那醇根基)二硼(1.39g,5.4mmol)还Pd(dppf)Cl2(0.06g,0.08mmol)。通过用氩气净化30分钟对反应混合物进行脱气且在50℃下搅拌16小时。反应完成(由TLC监测)后,用H2O淬灭反应且用EtOAc(3×100mL)萃取。合并的有机层经无水Na2SO4干燥,且在真空中浓缩。通过柱色谱法(15%EtOAc/己烷)纯化粗化合物,得到呈灰白色固体状的11-II(500mg,68.5%)。TLC:30%EtOAc/己烷(Rf:0.4);1H-NMR(CDCl3,200MHz):δ7.90(s,1H),7.79(s,1H),5.56(q,J=6.0Hz,1H),3.55-3.25(m,2H),1.63(d,J=6.0Hz,3H),1.35(s,12H),1.15(t,J=7.2Hz,3H);质量:267[M++1]。
2-(6-(1-丙烯酰基-1H-吡唑-4-基)-2H-苯并[b][1,4]噁嗪-4(3H)-基)-6,6-二甲基-6,7-二氢噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(VI-1):
根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物:
Figure BDA0000158388020003531
2-(6-溴-2,3-二氢苯并[b][1,4]噁嗪-4-基)-6,7-二氢-6,6-二甲基噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(11-III):
在室温下向化合物11-I(2.7g,10.3mmol)于乙腈(100mL)中的溶液中添加Cs2CO3(6.71g,20.6mmol)、Xanthophos(476mg,0.82mmol)和Pd(OAc)2(139mg,0.61mmol)。通过用氩气净化对反应混合物进行脱气,且添加含6-溴-3,4-二氢-2H-苯并[b][1,4]噁嗪(2.31g,10.3mmol)的乙腈。在室温下对反应混合物进行脱气45分钟且在85℃下脱气16小时。反应完成(由TLC监测)后,经由硅藻土垫过滤反应混合物,用5%MeOH/DCM洗涤且在真空中浓缩滤液。通过用乙醚洗涤来纯化粗化合物,得到呈褐色固体状的化合物11-III(3.24g,80%)。TLC:EtOAc(Rf:0.4);1H-NMR(CDCl3,200MHz):δ8.24(d,J=2.2Hz,1H),7.14(dd,J=2.4,8.8Hz,1H),6.83(d,J=9.0Hz,1H),5.29(bs,NH),4.38-4.30(m,2H),4.10-4.02(m,2H),2.90(s,2H),1.40(s,6H);质量:394.5[M++1];MP:154.7℃。
2-(6-(1-(1-乙氧基乙基)-1H-吡唑-4-基)-2H-苯并[b][1,4]噁嗪-4(3H)-基)-6,6-二甲基-6,7-二氢噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(11-IV):
在室温下向化合物11-III(2.0g,5.0mmol)于THF(70mL)中的溶液中添加硼酸酯11-II(3.37g,12.7mmol)、Na2CO3(1.6g,15.2mmol)、TBAB(653mg,20.3mmol)和Pd(PPh3)4(470mg,0.4mmol)。通过用氩气净化45分钟对反应混合物进行脱气且在100℃下搅拌36小时。反应完成(由TLC监测)后,在减压下去除挥发物且添加水。用DCM(3×100mL)萃取水层,合并的有机层经无水Na2SO4干燥且在真空中浓缩。通过柱色谱法(3%MeOH/DCM)纯化粗化合物,得到呈褐色固体状的11-IV(850mg,37%)。TLC:5%MeOH/DCM(Rf:0.4);1H-NMR(CDCl3,200MHz):δ8.03(s,1H),7.75(d,J=8.4Hz,2H),7.20(d,J=2.4,8.4Hz,1H),6.95(d,J=8.4Hz,1H),5.55(q,J=6.0Hz,1H),5.26(bs,1H),4.40-4.30(m,2H),4.25-4.15(m,2H),3.55-3.35(m,2H),2.90(s,2H),1.73(d,J=6.0Hz,3H),1.43(s,6H),1.15(t,J=7.2Hz,3H);质量:476[M++Na]和382[M-71]。
2-(6-(1H-吡唑-4-基)-2H-苯并[b][1,4]噁嗪-4(3H)-基)-6,6-二甲基-6,7-二氢噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(11-V):
在0℃下向化合物11-IV(0.85g,1.87mmol)于DCM(10mL)中的溶液中添加HCl/二噁烷(2mL),且在室温下搅拌反应混合物2小时。反应完成(由TLC监测)后,在减压下去除挥发物且先后用二异丙醚和20%EtOAc/己烷洗涤残余物,得到呈灰白色固体状的11-V(600mg,84%)。TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.3);1H-NMR(DMSO d6,200MHz):δ8.28(d,J=8.4Hz,1H),7.98(s,1H),7.53(s,1H),7.3(dd,J=2.2,8.4Hz,1H),6.94(d,J=8.4Hz,1H),4.35-4.25(m,2H),4.14-4.05(m,2H),2.83(s,2H),1.28(s,6H)。质量:382[M++1]。
2-(6-(1-丙烯酰基-1H-吡唑-4-基)-2H-苯并[b][1,4]噁嗪-4(3H)-基)-6,6-二甲基-6,7-二氢噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(VI-1):
在室温下向以上化合物11-V(0.01g,0.024mmol)于DCM(1.0mL)中的搅拌溶液中添加TEA(0.008g,0.08mmol),接着添加丙烯酰氯(0.0025g,0.029mmol)。搅拌反应混合物0.5小时。在真空中去除溶剂。通过制备型HPLC(含有0.1%TFA的25%到90%CH3CN水溶液)纯化粗化合物,得到7.0mg标题化合物。MS m/z:436.0(M+1)。
实例12
Figure BDA0000158388020003551
N-(3-(4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-2-基)苯基)丙烯酰胺(II-c-1):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003552
步骤12a:3-(4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-2-基)苯基氨基甲酸叔丁酯(中间物12a)
Figure BDA0000158388020003553
根据实例4步骤4a中所述的程序,通过使中间物1a与3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼戊环-2-基)苯基氨基甲酸叔丁酯偶合来制备中间物12a。MS m/z:413.3(M+1)。
步骤12b:N-(3-(4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-2-基)苯基)丙烯酰胺(II-c-1)
通过根据实例1步骤1e和1f中所述的程序制备标题化合物。MS m/z:367.2(M+H+)。
实例13
Figure BDA0000158388020003561
N-(3-羟基-5-(6-((4-(甲基磺酰基)哌嗪-1-基)甲基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-2-基)苯基)丙烯酰胺(II-c-2):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003562
利用4H HCl脱除中间物1c的保护基,接着用甲磺酰氯处理,得到化合物13a。经铃木偶合,将化合物13a转化成13b。化合物13b还原成胺14c。接着使14c与丙烯酸/HATU反应,得到化合物II-c-2。
实例14
Figure BDA0000158388020003571
(Z)-5-((4-(4-((E)-4-氧代庚-5-烯酰基)哌嗪-1-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-2):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
步骤14a:4-(4-(叔丁氧羰基)哌嗪-1-基)喹啉-6-甲酸甲酯
向含4-氯喹啉-6-甲酸甲酯(根据WO 2007099326合成)(1.5g,6.8mmol)的异丙醇(30mL)中添加n-Boc-哌嗪(1.3g,7.0mmol),且将溶液加热到90℃,维持3天。反应物冷却到周围温度,过滤且通过旋转蒸发来去除溶剂。通过二氧化硅色谱法(DCM/EtOAc)纯化产物,得到标题化合物(0.51g,1.4mmol)。1H NMR(d6DMSO)δppm:8.78(d,J=5.1Hz,1H),8.66(d,J=1.9Hz,1H),8.14(dd,J=8.7,1.9Hz,1H),8.02(d,J=8.7Hz,1H),3.91(s,3H),3.64-3.58(m,4H),3.20-3.14(m,4H),1.43(s,9H);m/z 372(M+1)。
步骤14b:4-(6-(羟基甲基)喹啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向冷却到0℃的含4-(4-(叔丁氧羰基)哌嗪-1-基)喹啉-6-甲酸甲酯(0.51g,1.4mmol)的THF(10mL)中添加氢化锂铝(0.10g,2.7mmol)且搅拌反应30分钟。通过添加过量水来淬灭反应且用EtOAc(3×30mL)萃取产物。干燥(MgSO4)合并的有机物,过滤,且通过旋转蒸发来去除溶剂,得到呈黄色油状的标题化合物(0.45g,1.3mmol)。1H NMR(d6DMSO)δppm:8.64(d,J=5.0Hz,1H),7.94(d,J=0.9Hz,1H),7.89(d,J=8.7Hz,1H),7.62(dd,J=8.3,1.9Hz,1H),6.97(d,J=5.0Hz,1H),5.38(dd,J=6.0,5.5Hz,1H),4.67(d,J=6.0Hz,1H),3.63-3.57(m,4H),3.14-3.08(m,4H),1.43(s,9H)。m/z 344(M+1)。
步骤14c:4-(6-甲酰基喹啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向含4-(6-(羟基甲基)喹啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.45g,1.3mmol)的DCM(10mL)中添加戴斯-马丁高碘烷(0.62g,1.5mmol)。在周围温度下搅拌溶液过夜。过滤溶液且通过旋转蒸发来去除挥发物。通过二氧化硅色谱法(DCM/EtOAc)纯化产物,得到呈黄色泡沫状的标题化合物(0.31g,0.91mmol)。1H NMR(d6DMSO)δppm:10.20(s,1H),8.80(d,J=5.0Hz,1H),8.62(dd,J=1.4,0.9Hz,1H),8.06(s,1H),8.05(s,1H),7.10(d,J=5.0Hz,1H),3.67-3.62(m,4H),3.24-3.21(m,4H),1.44(s,9H)。m/z 342(M+1)。
步骤14d:4-(6-((2,4-二氧代噻唑烷-5-亚基)甲基)喹啉-4-基)哌嗪-1-甲酸(Z)-叔丁酯
将4-(6-甲酰基喹啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.11g,0.31mmol)、噻唑烷-2,4-二酮(37mg,0.31mmol)、哌啶(25mg,0.31mmol)和乙酸(19mg,0.31mmol)组合于微波小瓶中且添加乙醇(2mL)。在微波中于150℃下加热溶液30分钟。冷却反应物,且通过用乙醇清洗进行的真空过滤来收集呈黄色固体状的标题化合物(55mg,0.12mmol)。1H NMR(d6DMSO)δppm:8.74(d,J=5.0Hz,1H),8.20(d,J=1.8Hz,1H),8.04-8.01(m,2H),7.89(dd,J=8.7,1.8Hz,1H),7.06(d,J=5.0Hz,1H),3.68-3.63(m,4H),3.20-3.16(m,4H),1.43(s,9H)。m/z 441(M+1)。
步骤14e:(Z)-5-((4-(4-((E)-4-氧代庚-5-烯酰基)哌嗪-1-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-2)
将4-(6-((2,4-二氧代噻唑烷-5-亚基)甲基)喹啉-4-基)哌嗪-1-甲酸(Z)-叔丁酯(55mg,0.13mmol)溶解于甲醇(1mL)中且添加4N HCl的二噁烷溶液(2mL)。在LC-MS显示转化完成后,通过旋转蒸发来去除挥发物。将残余物溶解于DCM(3mL)和二异丙基乙胺(0.3mL)中且分成三份。向一份中添加(E)-4-氧代庚-5-烯酸(5.0mg,0.035mmol)和HATU(15mg,0.039mmol)且搅拌溶液20分钟。将溶液倒入水中且用乙酸乙酯洗涤。在旋转蒸发器上浓缩水层且通过HPLC(MeCN/H2O)纯化残余物,得到标题化合物。1H NMR(d6DMSO)δppm:8.68-8.65(m,1H),8.37-8.32(m,1H),8.12-8.01(m,2H),7.20-7.16(m,1H),6.92-6.82(m,1H),6.16-6.12(m,1H),4.02-3.70(m,8H),3.20-2.58(m,4H),1.90-1.84(m,2H),1.25-1.20(m,3H)。m/z 465(M+1)。
以类似方式,自4-(6-甲酰基喹啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(步骤15c的产物)制备(Z)-1-(4-(6-((2-(2,6-二氯苯基氨基)-4-氧代噻唑-5(4H)-亚基)甲基)喹啉-4-基)哌嗪-1-基)-6-甲基庚-6-烯-1,5-二酮(V-3):
Figure BDA0000158388020003591
将4-(6-甲酰基喹啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.17g,0.50mmol)、2-(2,6-二氯苯基氨基)噻唑-4(5H)-酮(WO 2006132739)(0.13g,0.50mmol)和哌啶(0.040g,0.50mmol)组合于微波小瓶中且添加乙醇(2mL)。在微波中于150℃下加热溶液30分钟。在旋转蒸发器上去除挥发物且通过二氧化硅色谱法(EtOAc/MeOH)纯化残余物。将经纯化的物质溶解于MeOH中且用4N HCl的二噁烷溶液处理。搅拌1小时后,通过旋转蒸发来去除挥发物。将残余物溶解于EtOAc中且用饱和NaHCO3溶液洗涤。干燥(MgSO4)溶液,过滤且通过旋转蒸发来去除溶剂。将残余物溶解于DCM/二异丙基乙胺中且分成三份。向一份中添加6-甲基-5-氧代庚-6-烯酸(23mg,0.15mmol)和EDC(29mg,0.15mmol)。搅拌溶液过夜,接着通过二氧化硅色谱法(EtOAc/MeOH)纯化,得到标题化合物。1H NMR(CDCl3)δppm:8.83(d,J=5.0Hz,1H),8.19(d,J=8.7Hz,1H),8.13(d,J=1.3Hz,1H),7.91(s,1H),7.72(dd,J=8.7,1.9Hz,1H),7.37(d,J=7.8Hz,2H),7.07(dd,J=8.3,7.7Hz,1H),6.87(d,J=5.0Hz,1H),6.05(s,1H),5.82(d,J=0.9Hz,1H),3.69-3.60(m,4H),3.20-3.08(m,4H),2.91(dd,J=17.2,16.1Hz,2H),2.49(dd,J=18.3,18.3Hz,2H),2.10-2.02(m,2H),1.90(s,3H)。m/z 622(M+1)。
实例15
Figure BDA0000158388020003601
(E)-N-(4-(6,6-二甲基-4-氧代-4,5,6,7-四氢噻唑并[5,4-c]吡啶-2-基)-3,4-二氢-2H-苯并[b][1,4]噁嗪-6-基)-5-氧代辛-6-烯酰胺(VI-24):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003602
步骤15a:6-硝基-2H-苯并[b][1,4]噁嗪-3(4H)-酮(中间物15a)
在0℃下向2-氨基-4-硝基苯酚(3g,19.4mmol)于DMF(25mL)中的搅拌溶液中添加吡啶(1.6mL,19.4mmol)和氯乙酰氯(1.53mL,19.4mmol)。在室温下搅拌反应混合物1小时,接着添加60%NaH(780mg,19.4mmol)且在室温下再继续搅拌2小时。反应完成(由TLC监测)后,用冰冷的水(150mL)淬灭反应,过滤沉淀的固体且干燥,得到呈灰白色固体状的15a(2g,54%)。TLC:60%乙酸乙酯/己烷(Rf:0.4);1H NMR(500MHz,CDCl3):δ8.05(bs,1H),7.93(d,J=9.0Hz,1H),7.73(s,1H),7.08(d,J=9.0Hz,1H),4.75(s,2H)。
步骤15b:3,4-二氢-6-硝基-2H-苯并[b][1,4]噁嗪(中间物15b)
在0℃下向15a(1.7g,8.85mmol)于THF(30mL)中的搅拌溶液中添加醚合BF3(2.8mL,22.13mmol),在室温下搅拌反应混合物1小时,接着在0℃下在惰性氛围下添加NaHB4(836mg,22.13mmol)。在室温下搅拌反应混合物16小时。反应完成(由TLC监测)后,用EtOAc/H2O稀释反应混合物,且用EtOAc(2×100mL)萃取水层。合并的有机层经无水Na2SO4干燥,且在真空中浓缩。通过乙醚洗涤来纯化所得固体,得到呈灰白色固体状的15b(1g,63%)。TLC:50%乙酸乙酯/己烷(Rf:0.3);1H NMR(500MHz,CDCl3):δ7.56(dd,J=2.5,9.0Hz,1H),7.47(d,J=5.3Hz,1H),6.8(d,J=9.0Hz,1H),4.33(t,J=4.0Hz,2H),3.48-3.44(m,2H);质量:178[M++1]。
步骤15c:6,7-二氢-2-(2,3-二氢-6-硝基苯并[b][1,4]噁嗪-4-基)-6,6-二甲基噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(中间物15c)
在室温下向11-I(1g,3.8mmol)于乙腈(25mL)中的搅拌溶液中添加化合物15b(680mg,3.8mmol)、Xanthophos(176mg,0.3mmol)、Pd(OAc)2(52mg,0.2mmol)和Cs2CO3(2.5g,7.6mmol)。用氩气对反应混合物进行脱气45分钟且在80℃下搅拌6小时。反应完成(由TLC监测)后,在真空中去除挥发物,用水稀释且用DCM(2×100mL)萃取。合并的有机层经无水Na2SO4干燥,且在真空中浓缩。用乙醚洗涤粗残余物,得到呈浅褐色固体状的15c(1g,73%)。TLC:乙酸乙酯(Rf:0.3);1H NMR(200MHz,CDCl3):δ9.32(d,J=2.6Hz,1H),7.94(dd,J=2.6,9.0Hz,1H),7.04(d,J=9.0Hz,1H),5.33(bs,1H),4.46(t,J=4.4Hz,2H),4.07(t,J=4.6Hz,2H),2.95(s,2H)及1.41(s,6H)。
步骤15d:2-(6-氨基-2,3-二氢苯并[b][1,4]噁嗪-4-基)-6,7-二氢-6,6-二甲基噻唑并[5,4-c]吡啶-4(5H)-酮(中间物15d)
向15c(1g,2.7mmol)于EtOAc/MeOH(1∶1,40mL)中的搅拌溶液中添加Pd/C(100mg)。在室温下在氢气氛围(60Psi)下搅拌反应混合物36小时。反应完成(由TLC监测)后,反应混合物经由硅藻土垫过滤,且在真空中浓缩滤液。粗残余物自DCM/己烷再结晶,得到呈灰白色固体状的15d(520mg,57%)。TLC:10%MeOH/DCM(RZf:0.4);1H NMR(500MHz,CDCl3):δ7.34(d,J=3.0Hz,1H),6.76(d,J=8.5Hz,1H),6.42(dd,J=2.5,8.0Hz,1H),5.17(bs,2H),4.25(t,J=4.0Hz,2H),4.11(t,J=5.5Hz,2H),3.5(bs,2H),2.87(s,2H),1.39(s,6H);质量:331[M++1];MP:244.8℃。
步骤15e:(E)-N-(4-(6,6-二甲基-4-氧代-4,5,6,7-四氢噻唑并[5,4-c]吡啶-2-基)-3,4-二氢-2H-苯并]b][1,4]噁嗪-6-基)-5-氧代辛-6-烯酰胺(VI-24)
根据实例1步骤1f中所述的HATU程序,由中间物15d和(E)-5-氧代辛-6-烯酸制备标题化合物。MS m/z:469.1(M+H+);1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:9.89(1H m),8.34(1H d),7.54(1H s),7.25(1H,dd),6.87(2H m),6.115(1H dq),4.25(2H,bt),4.11(2H,bt),2.8(2H,s),2.6(2H,t),2.3(2H,t),1.85(3H,dd),1.8(2H,m),1.28(6H,s)。
通过以中间物15d为原料且根据先前实例中所述的程序或程序组合来制备以下化合物。
Figure BDA0000158388020003621
MS m/z:524.2(ES-)。
实例16
Figure BDA0000158388020003622
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲酰胺(II-a-148):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003631
步骤16a:2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲酸(中间物16a)
Figure BDA0000158388020003632
在氩气下在-78℃下向中间物1a(2.0g,7.8mmol)于40mL无水四氢呋喃中的搅拌溶液中逐滴添加n-BuLi(5mL 2.5N的庚烷溶液,12.5mmol)。在-78℃下再搅拌1小时后,缓慢添加氯甲酸乙酯(15.6mmol)。所得混合物缓慢升温到室温且在室温下搅拌2小时。接着用1N HCl淬灭反应,且用乙酸乙酯萃取粗产物,用水、盐水洗涤,且经无水硫酸钠干燥。过滤并浓缩后,在室温下,使用含LiOH(900mg,37.5mmol)的25mL THF和25mL水对残余物进行碱水解,持续4小时。用1N HCl酸化反应物,且收集1.5g灰白色固体作为所需产物。LC-MS:m/z 299.9(ES+)
步骤16b:2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲酸(中间物16b)
Figure BDA0000158388020003641
在微波条件下在120℃下加热中间物16a(90mg,0.3mmol)、1H-吲唑-4-基硼酸(64mg,0.39mmol)、17mg Pd(PPh3)4于1mL DMA和0.5mL 1M Na2CO3水溶液中的混合物30分钟。用2mL MeOH和1mL水稀释反应混合物,且过滤。添加1N盐酸水溶液和4mL乙腈到滤液中,接着过滤棕色固体并干燥,得到91mg所需酸(80%)。LC-MS:m/z382.1(ES+)。
中间物16c:N-(4-(2-氨基乙基)苯基)丙烯酰胺三氟乙酸盐.
Figure BDA0000158388020003642
在-10℃下,向4-氨基苯乙基氨基甲酸叔丁酯(3.54g,15mmol)和3mL DIPEA于100mL二氯甲烷中的搅拌溶液中添加丙烯酰氯(1.35mL,16.5mmol)。10分钟后,通过添加5mL 1N盐酸水溶液淬灭反应。反应混合物在旋转蒸发器上浓缩,且添加100mL乙酸乙酯。用稀盐酸、水、盐水洗涤混合物且经无水硫酸钠干燥。过滤且浓缩后,残余物再溶解于20mL二氯甲烷中,缓慢添加10mL三氟乙酸。在室温下搅拌反应混合物2小时,且在旋转蒸发器上浓缩到最小体积。缓慢添加乙醚,过滤固体,得到几乎定量产率的所需TFA盐。MS:m/z 191.1(ES+)。
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲酰胺(II-a-148):
向中间物16b(175mg,0.46mmol)、中间物16c(140mg,0.46mmol)、400μl DIPEA于2mL DMA和4mL二氯甲烷中的搅拌溶液中添加含氯化2-氯-1,3-二甲基咪唑锭(100mg,0.60mmol)的1mL二氯甲烷。5分钟后,将反应混合物倒入50mL 1%NaHCO3水溶液中。收集固体且再溶解于20mL DCM-MeOH(体积比3/1)中。去除不溶性物质后,浓缩溶液,得到129mg浅黄色固体。MS:m/z 554.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003652
2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)-N-(4-丙酰胺基苯乙基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲酰胺(IIR-a-148):通过在5%钯/C存在下对II-a-148进行氢化来制备此化合物。MS:m/z 556.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003661
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲酰胺(II-a-162):通过使中间物16b直接与中间物16c反应来制备此化合物。MS:m/z 472.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003662
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲酰胺(II-a-154)。以类似于制备II-a-148的方式,在步骤16b中使用2-氨基嘧啶-5-硼酸来制备标题化合物。MS:m/z 531.0(ES+)。
以类似方式,使用适当胺对应物替代中间物16c,合成以下化合物:
Figure BDA0000158388020003671
(E)-1-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-羰基)哌嗪-1-基)-6-苯基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-142):MS:m/z 636.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003672
N-(4-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-羰基)哌嗪-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-143)。MS:m/z 623.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003681
1-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-羰基)哌嗪-1-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(II-a-160)。MS:m/z 588.2(ES+)。
以类似方式,在步骤16b中使用3-羟基苯基硼酸且在步骤16c中使用适当胺,合成以下化合物:
Figure BDA0000158388020003682
1-(9-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-羰基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一-3-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-119)。MS:m/z 548.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003691
1-(4-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-羰基)哌嗪-1-基)哌啶-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-120)。MS:m/z 617.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003692
N-(4-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-羰基)哌嗪-1-基)苯基)丙烯酰胺(II-a-127)。MS:m/z 571.3(ES+)。
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-(1H-吲唑-4-基)-4-(2-氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚-6-基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-甲酰胺(II-a-151):以类似于关于II-a-148所述的方式,最初使用2-氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚烷替代吗啉来制备标题化合物。MS:m/z 566.2(ES+)。
实例17
N1-(3-(2-丙烯酰胺基-5-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯氧基)丙基)-N5-(15-氧代-19-((3aR,4R,6aS)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)-4,7,10-三氧杂-14-氮杂十九烷基)戊二酰胺(II-a-177):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003711
步骤17a:3-(3-(叔丁氧羰基氨基)丙氧基)-4-硝基苯甲酸甲酯(中间物17a)
Figure BDA0000158388020003712
在氮气下,向3-羟基-4-硝基苯甲酸甲酯(400mg,2.0mmol)、3-羟基丙基氨基甲酸叔丁酯(350mg,2.0mmol)、三苯基膦(530mg,2.0mmol)于6mL无水四氢呋喃中的混合物中添加偶氮二甲酸二异丙酯(0.4mL)。在室温下搅拌所得混合物1小时。浓缩后,通过用庚烷/乙酸乙酯(体积比2/1)进行的柱色谱法来纯化残余物,得到约1.0g微黄色油状物。MS:m/z 255.2(M-Boc,ES+)。产物直接用于下一步骤中。
步骤17b:4-丙烯酰胺基-3-(3-(叔丁氧羰基氨基)丙氧基)苯甲酸(中间物17b)
Figure BDA0000158388020003721
在氢气下将上文所得的粗中间物17a与100mg 10%Pd/C于20mL MeOH中一起搅拌过夜。过滤反应混合物且浓缩,得到泡沫状固体,为所需苯胺(MS:m/z 225.2M-Boc,ES+)。
在-20℃下向上文所得的苯胺(140mg)于4mL二氯甲烷和200μl DIPEA中的溶液中添加丙烯酰氯(40μl)。15分钟后,对反应混合物进行水性处理,且通过用庚烷/乙酸乙酯(体积比3/1)进行的硅胶柱色谱法来纯化,得到120mg白色固体。(MS:279.0M-Boc,ES+)。
在室温下将上文所得的丙烯酰胺(38mg,0.1mol)与0.4mL二噁烷和0.4mL 1NNaOH一起搅拌过夜。用1N HCl中和后,滤出所需酸(18mg)。MS:m/z 265.1(M-Boc,ES+)。
步骤17c:3-(2-丙烯酰胺基-5-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯氧基)丙基氨基甲酸叔丁酯(中间物17c)
Figure BDA0000158388020003722
用1mL 4.0N HCl的二噁烷溶液处理含中间物8c(34mg,67μmol)的1mL二氯甲烷1小时。1小时后,在减压下去除溶剂。将残余物再溶解于1mL DMA中,接着添加23mg中间物17b(63μmol)和200μl DIPEA,接着添加26mg HATU(68μmol)。用30mLEtOAc萃取反应混合物,用水、盐水洗涤,且经Na2SO4干燥。过滤并浓缩后,通过用含5%MeOH的二氯甲烷进行的硅胶柱色谱法来纯化残余物,得到27mg所需中间物17c。MS:m/z 741.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003731
N-(2-(3-氨基丙氧基)-4-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-a-155)。通过用含TFA的二氯甲烷去除中间物17c的Boc基团来制备标题化合物。MS:m/z 641.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003741
N1-(3-(2-丙烯酰胺基-5-(4-(2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯氧基)丙基)-N5-(15-氧代-19-((3aR,4R,6aS)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)-4,7,10-三氧杂-14-氮杂十九烷基)戊二酰胺(XIV-a-3):利用8.8mg II-a-155、在200μL DIPEA存在下的8.0mg经生物素标记的酸、8mg HATU,在0.5mL DMA中制备标题化合物。通过制备型HPLC纯化最终产物。MS:m/z 1183.3(ES+)。
实例18
Figure BDA0000158388020003751
N1-(4-((E)-6-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-3,6-二氧代己-1-烯基)苯甲基)-N5-(15-氧代-19-((3aS,4S,6aR)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)-4,7,10-三氧杂-14-氮杂十九烷基)戊二酰胺(XIV-a-4)。经由如所述的以下中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003752
5-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2,5-二氧代戊基膦酸二乙酯:以类似于关于制备中间物9b所述的方式,使用3-羟基苯基硼酸替代4-吲唑硼酸来制备标题膦酸酯中间物。MS:m/z 646.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003761
4-(6-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-3,6-二氧代己-1-烯基)苯甲基氨基甲酸(E)-叔丁酯:在70℃下加热上述膦酸酯(13mg,20μmol)、4-甲酰基苯甲基氨基甲酸叔丁酯(10mg,40μmol)、碳酸钾(40mg)于1mL DMA和100μl水中的混合物4小时。过滤后,通过制备型HPLC纯化反应混合物,得到10mg呈白色固体状的所需烯酮。MS:m/z 727.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003771
N1-(4-((E)-6-(4-((2-(3-羟基苯基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-3,6-二氧代己-1-烯基)苯甲基)-N5-(15-氧代-19-((3aS,4S,6aR)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)-4,7,10-三氧杂-14-氮杂十九烷基)戊二酰胺(II-a-178)。在室温下用含1mL TFA的1mL二氯甲烷处理烯酮中间物(7.5mg,约10μmol)30分钟。去除溶剂,且将残余物溶解于1mL DMA中,接着添加100μl DIPEA、9mg经生物素标记的酸和9mgHATU。搅拌反应混合物30分钟,接着进行制备型HPLC纯化,得到6mg所需化合物。MS:m/z 1169.4(ES+)。
实例19
N-(2-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-4-羟基哌啶-1-基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺(II-a-134)。根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003782
步骤19a:4-(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸叔丁酯(中间物19a)
Figure BDA0000158388020003783
在-78℃下向中间物1a(2.0g,7.84mmol)于THF(50mL)中的搅拌溶液中添加n-BuLi(1.0g,15.62mmol)且在-10℃下搅拌1小时。在-78℃下添加4-氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(4.6g,23.52mmol)于THF(50mL)中的溶液到反应混合物中且再继续搅拌3小时。原料耗尽(由TLC监测)后,用水(20mL)淬灭反应混合物且用EtOAc(3×75mL)萃取。用水(100mL)、盐水(20mL)洗涤合并的有机萃取物,经无水Na2SO4干燥且在减压下浓缩。通过柱色谱法,用50%EtOAc/己烷洗脱来纯化所得粗化合物,得到中间物19a(2g,57%)。TLC:50%EtOAc/己烷(Rf:0.3)。
步骤19b:4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸叔丁酯(中间物19b)
Figure BDA0000158388020003791
在密封管中,于140℃下向中间物19a(0.5g,1.09mmol)、吲唑-4-硼酸酯(0.53g,2.18mmol)和Na2CO3(0.38g,3.59mmol)于甲苯:EtOH:H2O(23.5mL)中的搅拌混合物中添加Pd(PPh3)2Cl2(0.07g,0.10mmol),用氩气净化1小时且搅拌48小时。原料耗尽(由TLC监测)后,反应物质冷却到室温,用水(20mL)淬灭且用CH2Cl2(2×100mL)萃取。用水(100mL)、盐水(20mL)洗涤合并的有机萃取物,经无水Na2SO4干燥且在减压下浓缩。通过柱色谱法,用50%EtOAc/己烷洗脱来纯化所得粗化合物,得到中间物19b(0.3g,50%)。TLC:75%EtOAc/己烷(Rf:0.7)。1H-NMR(DMSO d6,500MHz):δ13.17(bs,1H),8.89(s,1H),8.22(d,J=7.5Hz,1H),7.66(d,J 8.5Hz,1H),7.50(s,1H),7.46(t,J 8Hz,1H),6.04(s,1H),4.02(t,J 9Hz,2H),3.87-3.80(m,4H),3.22-3.15(m,2H),2.00-1.92(m,2H),1.86(d,J=13Hz,2H)。MS:537[M+H]。
步骤19c:4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)哌啶-4-醇(中间物19c)
Figure BDA0000158388020003792
在0℃下向中间物19b(0.15g,0.27mmol)于CH2Cl2(5mL)中的搅拌溶液中添加4MHCl的二噁烷溶液(2mL)且使其升到室温,搅拌4小时。原料耗尽(由TLC监测)后,在减压下去除挥发物。用EtOAc/己烷洗涤所得残余物,经无水Na2SO4干燥且在减压下浓缩,得到粗中间物19c(0.1g,83%)。其直接用于下一反应中。TLC:100%EtOAc(Rf:0.2)。
步骤19d:N-(2-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-4-羟基哌啶-1-基)-2-氧代乙基)丙烯酰胺
向中间物19c(0.1g,0.22mmol)、2-丙烯酰胺基乙酸(0.029g,0.22mmol)于CH2Cl2(5mL)中的搅拌混合物中添加HATU(0.13g,0.33mmol)、DIPEA(0.085g,0.66mmol)且在室温下搅拌10分钟。接着在室温下再继续搅拌5小时。原料耗尽(由TLC监测)后,用CH2Cl2(40mL)稀释反应混合物且先后用NaHCO3溶液(20mL)、水(2×20mL)和盐水(10mL)洗涤。合并的有机萃取物经无水Na2SO4干燥,且在减压下浓缩。通过柱色谱法,用5%MeOH/CH2Cl2洗脱来纯化所得粗化合物,得到II-a-134(0.025g,20%)。TLC:10%MeOH/CH2Cl2(Rf:0.4)。1H-NMR(DMSO d6,500MHz):δ13.17(s,1H),8.88(s,1H),8.22(d,J=6.5Hz,2H),7.66(d,J=8.5Hz,1H),7.48-7.45(m,2H),6.44-6.38(m,1H),6.11(t,J=5.5Hz,2H),5.61(d,J=12Hz,1H),4.32(d,J=12.5Hz,1H),4.12-4.09(m,2H),4.03-4.01(m,4H),3.85-3.77(m,5H),3.45(t,J=11.5Hz,1H),3.08-2.91(m,3H),1.93-1.91(m,3H)。质量:570[M+Na],548[M+H]。
以类似方式,在酰胺化步骤中使用适当酸和/或在步骤19b中使用不同酮,合成以下化合物:
Figure BDA0000158388020003802
(E)-1-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-4-羟基哌啶-1-基)-6-苯基己-5-烯-1,4-二酮(II-a-136)。MS:m/z 623.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003811
1-(4-(4-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-4-羟基环己基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(II-a-152)。TLC:10%MeOH/CH2Cl2(Rf:0.4)。1H-NMR(CDCl3,500MHz):δ9.02(bs,1H),8.28(s,1H),7.60-7.56(m,1H),7.55-7.45(m 2H),7.36-7.38(m,1H),6.60-6.51(m,1H),6.32-6.25(m,1H),5.71-5.66(m,1H),4.10-4.04(m,4H),3.95-3.90(m,4H),3.70-3.54(m,4H),2.64-2.60(m,2H),2.53-2.41(m,4H),2.17-2.14(m,2H),1.96-1.78(m,5H)。(注意:NMR数据表明化合物为轴异构体与赤道异构体的混合物)。MS:574[M+H]。UPLC纯度:54.35+54.30(非对映异构体的混合物)。
实例20
Figure BDA0000158388020003812
N-((1-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-2-氧杂双环[2.2.2]辛-4-基)甲基)丙烯酰胺(II-a-153)。根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003821
步骤20a:双(4-甲基苯磺酸)(4-(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-4-羟基环己烷-1,1-二基)双(亚甲基)酯(中间物20a)
Figure BDA0000158388020003822
以类似于中间物19a的方式,使用中间物1a和双(4-甲基苯磺酸)(4-氧代环己烷-1,1-二基)双(亚甲基)酯来制备标题化合物。TLC:40%EtOAc/己烷(Rf:0.2)。
步骤20b:4-甲基苯磺酸(1-(2-氯-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-2-氧杂双环[2.2.2]辛-4-基)甲酯(中间物20b)
Figure BDA0000158388020003823
在0℃下向中间物20a(0.6g,0.83mmol)于THF(6mL)中的搅拌溶液中添加叔丁醇钾(0.18g,1.66mmol),且使反应混合物回流5小时。原料耗尽(由TLC监测)后,用H2O(20mL)稀释反应混合物且用EtOAc(2×50mL)萃取。用水(50mL)、盐水(20mL)洗涤合并的有机萃取物,经Na2SO4干燥,且在减压下浓缩,得到中间物20b(0.4g,88%)。TLC:50%MeOH/CH2Cl2(Rf:0.6)。1H-NMR(500MHz CDCl3):δ7.78(d,J=8.5Hz,2H),7.36(d,J=8.5Hz,2H),7.0(s,1H),3.99-3.97(m,4H),3.85-3.80(m,6H),3.76(s,2H),2.46(s,3H),2.19-2.04(m,4H),1.81-1.76(m,2H),1.67-1.55(m,2H)。MS:550[M+H]。
步骤20c:4-甲基苯磺酸(1-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-2-氧杂双环[2.2.2]辛-4-基)甲酯(中间物20c)
Figure BDA0000158388020003831
以类似于中间物19b的方式制备标题化合物。TLC:70%EtOAc/己烷(Rf:0.3)。1H-NMR(500MHz CDCl3):δ9.00(s,1H),8.26(d,J=7.5Hz,1H),8.11(s,1H),7.79(d,J=8.5Hz,2H),7.59-7.55(m,1H),7.37(d,J=8.0Hz,2H),7.23(s,1H),4.13-4.09(m,6H),3.903.82(m,4H),3.78(s,2H),2.47(s,3H),2.24-2.11(m,4H),1.83-1.79(m,2H),1.71-1.69(m,2H)。MS:632[M+H]。
步骤20d:4-(6-(4-(叠氮基甲基)-2-氧杂双环[2.2.2]辛-1-基)-2-(1H-吲唑-4-基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基)吗啉(中间物20d)
Figure BDA0000158388020003832
在室温下向中间物20c(20mg,0.03mmol)于DMF(1mL)中的搅拌溶液中添加NaN3(8.2mg,0.12mmol)且在80℃下搅拌反应混合物12小时。原料耗尽(由TLC监测)后,用H2O(2mL)淬灭反应混合物,且用EtOAc(2×10mL)萃取,用盐水(5mL)洗涤。合并的有机萃取物经无水Na2SO4干燥且在减压下浓缩,得到粗中间物20d(13mg,86%)。TLC:70%EtOAc/己烷(Rf:0.4)。1H-NMR(500MHz CDCl3):δ8.99(s,1H),8.26-8.20(d,J=7.5Hz,1H),7.69-7.61(m,1H),7.59-7.55(m,1H),7.48-7.45(m,1H),4.11-4.09(m,4H),3.93(s,2H),3.91-3.89(m,4H),3.48(s,2H),2.29-2.15(m,4H),1.84-1.69(m,4H)。MS:503[M+H]
步骤20e:(1-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-2-氧杂双环[2.2.2]辛-4-基)甲胺(中间物20e)
Figure BDA0000158388020003841
向中间物20d(0.3g,0.59mmol)于MeOH(3mL)中的搅拌溶液中添加Pd/C(30mg)、乙二胺(0.01mL)且在氢气球压力下在室温下搅拌反应混合物2小时。反应混合物经硅藻土床过滤,用EtOAc洗涤。分离滤液,经无水Na2SO4干燥且在减压下浓缩,得到中间物20e(0.25g,89%)。TLC:70%EtOAc/己烷(Rf:0.1)。1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ9.01(s,1H),8.27(d,J=7.0Hz,1H),7.59-7.26(m,3H),4.11-4.09(m,4H),3.93-3.89(m,6H),2.55(s,2H),2.30-2.14(m,4H),1.79-1.70(m,4H)。
步骤20f:N-((1-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-2-氧杂双环[2.2.2]辛-4-基)甲基)丙烯酰胺(II-a-153)
Figure BDA0000158388020003842
在室温下向中间物20e(0.07g,0.14mmol)于CH2Cl2(2mL)中的搅拌溶液中添加DIPEA(37mg,0.28mmol)。所得反应混合物冷却到-10℃,接着添加丙烯酰氯(13mg,0.14mmol)且搅拌反应混合物5分钟。原料耗尽(由TLC监测)后,用H2O(2×10mL)湿磨反应混合物且用CH2Cl2萃取。合并的有机层经无水Na2SO4干燥,且在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱法,用5%MeOH/CH2Cl2洗脱来纯化所得粗化合物,得到II-a-153(10mg)。TLC:10%MeOH/CH2Cl2(Rf:0.2).。1H-NMR(500MHz CDCl3+CD3OD):δ8.88(s,1H),8.18(d,J=7.5Hz,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.60(t,J=8.0Hz,1H),7.26(s,1H),6.30(d,J=17.0Hz,1H),6.19-6.14(m,1H),5.68(d,J=10.5Hz,1H),4.11-4.09(m,4H),3.92-3.90(m,6H),3.19(s,2H),2.26-2.16(m,4H),1.81-1.76(m,4H)。MS:530[M+H]。
以类似方式,在酰胺形成步骤中使用适当酸,合成以下化合物:
Figure BDA0000158388020003851
(E)-N-((1-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-2-氧杂双环[2.2.2]辛-4-基)甲基)-4-氧代-6-(吡啶-2-基)己-5-烯酰胺(II-a-163)。
1H-NMR(500MHz,CDCl3+CD3OD):δ8.89(s,1H),8.64(d,J=5Hz,1H),8.19(d,J=7.0Hz,1H),7.77(t,J=8.0Hz,1H),7.63-7.60(m,2H),7.53-7.48(m,2H),7.25(s,1H),7.10(d,J=16Hz,1H),6.73(t,J=6.0Hz,1H),4.10(t,J=4.5Hz,4H),3.91-3.90(m,6H),3.12-3.10(m,4H),2.56(t,J=6.5Hz,2H),2.18-2.05(m,4H),1.80-1.75(m,4H)。MS:665[M+H]。
Figure BDA0000158388020003852
(E)-N-((1-(2-(1H-吲唑-4-基)-4-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)-2-氧杂双环[2.2.2]辛-4-基)甲基)-3-(1H-咪唑-5-基)丙烯酰胺(II-a-177)。MS:m/z 597.0(ES+)。
实例21
Figure BDA0000158388020003861
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)-异烟酰胺(XII-2):根据如下所述的步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020003862
步骤21a:2-氯-6-(N-吗啉基)异烟酸(中间物21a)
Figure BDA0000158388020003863
在微波条件下在150℃下将含2,6-二氯异烟酸(1.92g,10mmol)、1mL吗啉(11.5mmol)和3.5mL DIPEA(21.2mmol)的10mL DMA(N,N-二甲基乙酰胺)加热60分钟。接着在减压下蒸发过量溶剂,且将残余物悬浮于10mL乙腈中。添加10mL 1.0N盐酸水溶液进行中和,过滤收集淡白色固体。也自母液获得另一份产物,得到总共1.59g淡白色固体,为所需产物(Y:65%)。LC-MS:m/z 243.2(ES+)。
步骤21b:N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-氯-6-(N-吗啉基)异烟酰胺(中间物21b)
以与实例16中所述相同的方式制备标题中间物。MS:m/z 415.1(ES+)。
步骤21c:N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)-异烟酰胺(XII-2)
在氩气下,将中间物21b(11mg,26μmol)、2-氨基嘧啶5-硼酸(5mg;36μmol)、PdCl2(dppf)2(1mg,5%mol)于600μl DMA和100μl 1M Na2CO3水溶液中的混合物在CEM微波中在135℃下加热60分钟。过滤所得黑色混合物,且通过制备型HPLC纯化,得到8mg呈白色固体状的所需产物。LC-MS:m/z 474.0(ES+)。以类似方式,使用适当硼酸和/或胺,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003881
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-6′-氨基-6-(N-吗啉基)-4′-(三氟甲基)-2,3′-联吡啶-4-甲酰胺(XII-11)。MS:m/z 541.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003882
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-(1H-吲唑-4-基)-6-(N-吗啉基)异烟酰胺(XII-13)。MS:m/z497.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003891
N-(4-丙烯酰胺基苯甲基)-2-(1H-吲唑-4-基)-6-(N-吗啉基)异烟酰胺(XII-14)。MS:m/z483.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003892
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-2-(2-氨基-4-甲基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)异烟酰胺(XII-16)。MS:m/z 488.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003901
N-(4-丙烯酰胺基苯甲基)-2-(2-氨基-4-甲基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)异烟酰胺(XII-17)。MS:m/z 474.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003902
6′-氨基-N-(4-(3-甲基丁-2-烯酰基)苯乙基)-6-(N-吗啉基)-4′-(三氟甲基)-2,3′-联吡啶-4-甲酰胺(XII-9)。MS:m/z 554.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003911
2-(2-氨基嘧啶-5-基)-N-(4-(3-甲基丁-2-烯酰基)苯乙基)-6-(N-吗啉基)异烟酰胺(XII-10)。MS:m/z 487.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003912
2-(2-氨基-4-甲基嘧啶-5-基)-N-(4-(3-甲基丁-2-烯酰基)苯乙基)-6-(N-吗啉基)异烟酰胺(XII-15)。MS:m/z 501.2(ES+)。
实例22
Figure BDA0000158388020003921
N-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)苯基)丙烯酰胺(XII-4):根据如下所述的以下中间物和步骤合成标题化合物。
Figure BDA0000158388020003922
步骤22a:4-(6-氯-4-碘吡啶-2-基)吗啉(中间物22a)
Figure BDA0000158388020003923
在120℃下将含2,6-二氯-4-碘吡啶(2.0g,7.3mmol)、吗啉(700μl,8.0mmol)和1.5mL DIPEA的15mL无水二噁烷加热24小时。浓缩并用乙酸乙酯-水进行常规水性处理后,使反应混合物经历硅胶柱色谱法,用庚烷/乙酸乙酯(体积比6/1)洗脱,得到1.74g呈白色晶体状的所需产物。MS:m/z 325.0(ES+)。
步骤22b:N-(4-((2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)苯基)丙烯酰胺(中间物22b)
Figure BDA0000158388020003931
在80℃下在氩气下将含中间物22a(36mg,110μmol)、N-(4-乙炔基苯基)丙烯酰胺(20mg,120μmol,易自4-乙炔基苯胺和丙烯酰氯获得)、PdCl2(PPh3)2(4mg,5%mol)、CuI(2mg,10%mol)、40μl DIPEA的1mL DMA加热过夜。用乙酸乙酯和水处理后,使反应混合物经历硅胶柱色谱法,用庚烷/乙酸乙酯(体积比3/2)洗脱,得到32mg呈白色固体状的所需产物。MS:m/z 368.1(ES+)。
步骤22c:N-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)苯基)丙烯酰胺(XII-4)
如实例21中所述,使用中间物22b经由铃木偶合制备标题化合物。MS:m/z 427.1(ES+)。
以类似方式,使用适当硼酸和/或适当炔烃,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020003941
10-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2-甲基癸-2-烯-9-炔-4-酮(XII-6)。MS:m/z 420.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003942
10-(2-(1H-吲唑-4-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2-甲基癸-2-烯-9-炔-4-酮(XII-7)。MS:m/z 443.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003943
10-(6′-氨基-6-(N-吗啉基)-4′-(三氟甲基)-2,3′-联吡啶-4-基)-2-甲基癸-2-烯-9-炔-4-酮(XII-8)。MS:m/z 487.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003951
1-(4-((2-(2-氨基-4-甲基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)苯基)-5-甲基己-4-烯-3-酮(XII-18)。MS:m/z 482.1(ES+)。
1-(4-((2-(1H-吲唑-4-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)苯基)-5-甲基己-4-烯-3-酮(XII-19)。MS:m/z 491.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003961
N-(3-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)丙-2-炔基)-7-甲基-5-氧代辛-6-烯酰胺(XII-20)。MS:m/z 463.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003962
1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)苯基)-5-甲基己-4-烯-3-酮(XII-21)。MS:m/z 468.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020003971
N-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)苯基)-4-甲基-2-氧代戊-3-烯酰胺(XII-22)。MS:m/z 483.1(ES+)。
1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)哌啶-1-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(XII-31)。MS:m/z 503.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020003981
1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)哌啶-1-基)-4-甲基戊-3-烯-1,2-二酮(XII-32)。MS:m/z 475.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003982
1-(1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)哌啶-1-羰基)环丙基)-3-甲基丁-2-烯-1-酮(XII-33)。MS:m/z 515.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020003991
1-(1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)乙炔基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)环丙基)-3-甲基丁-2-烯-1-酮(XII-37)。MS:m/z 513.2(ES+)。
实例23
Figure BDA0000158388020003992
1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(XII-1)。根据如下所述的以下中间物和步骤合成标题化合物。
Figure BDA0000158388020004001
步骤23a:4-((2,6-二氯吡啶-4-基)甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物23a)
Figure BDA0000158388020004002
在室温下将2,6-二氯异烟醛(106mg,0.6mmol)、N-Boc-哌嗪(112mg,0.6mmol)和320mg NaBH(OAc)3粉末在5mL二氯甲烷中搅拌1小时。添加3mL饱和NaHCO3水溶液,再搅拌反应混合物30分钟。用二氯甲烷-水进行常规水性处理后,使反应混合物经历硅胶柱色谱法,用庚烷/乙酸乙酯(体积比3/1)洗脱,得到150mg呈无色油状的所需产物。MS:m/z 346.0(ES+);290.0(M-Bu-t,ES+)。
步骤23b:4-((2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物23b)
Figure BDA0000158388020004003
在115℃下将中间物23a(75mg,0.22mmol)、吗啉(60μl,约3当量)于3mL二噁烷中的混合物加热过夜。完全去除溶剂后,通过硅胶柱色谱法,使用庚烷/乙酸乙酯(体积比1/1)作为洗脱剂来纯化残余物,得到所需中间物23b(62mg,71%)。MS:m/z 397.1(ES+)。
步骤23c:1-(4-((2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(中间物23c)
Figure BDA0000158388020004011
在室温下使用含2mL 4N HCl的二噁烷溶液的1.5mL混合溶剂(CH2Cl2/MeOH,体积比2/1)来脱除中间物23b上的Boc基团,持续1小时。去除溶剂后,完全干燥残余物且直接用于下一步骤中。MS:m/z 297.0(ES+)
将6-甲基-4-氧代庚-5-烯酸(10mg,64μmol)和羰基二咪唑(10.5mg,64μmol)在1mLDMA中搅拌1小时,接着添加18mg以上获得的脱除boc的中间物和100μl DIPEA。在室温下搅拌反应混合物过夜,接着通过制备型HPLC纯化,得到15mg中间物23c。MS:m/z 435.2(ES+)。
步骤23d:1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(XII-1)
以与实例21中所述相同的方式,经由与中间物23c进行铃木偶合来制备标题化合物。MS:m/z 494.1(ES+)。
以类似方式,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020004022
1-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲基)哌嗪-1-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(XII-23)。MS:m/z 508.2(ES+)。
实例24
Figure BDA0000158388020004031
N-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲氧基)苯基)丙烯酰胺(XII-5)。经由如下所述的步骤和中间物合成标题化合物。
(2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲醇。以类似于关于中间物21a所述的方式,通过使吗啉与(2,6-二氯-吡啶-4-基)甲醇在二噁烷中反应来制备标题中间物。MS:m/z 229.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004033
N-(4-((2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲氧基)苯基)丙烯酰胺。通过上文获得的醇中间物和N-(4-羟基苯基)丙烯酰胺,经由标准光延反应来制备标题中间物。MS:m/z 374.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004041
N-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)甲氧基)苯基)丙烯酰胺(XII-5)。以与实例21中所述相同的方式,经由与以上获得的中间物进行铃木偶合来制备标题化合物。MS:m/z 433.1(ES+)。
实例25
Figure BDA0000158388020004042
1-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(XII-3)。经由如下所述的步骤和中间物合成标题化合物。
Figure BDA0000158388020004051
4-(2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸叔丁酯。使用中间物21a和N-Boc-四氢吡啶-4-硼酸酯,经由铃木偶合来制备标题中间物。MS:m/z 380.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004052
1-(4-(2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮。使用由先前步骤制备的中间物,经由如实例23中所述的酰胺化反应,制备标题中间物。MS:m/z 432.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004061
1-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(XII-3)。以与实例21中所述相同的方式,经由与以上获得的中间物进行铃木偶合来制备标题化合物。MS:m/z 491.1(ES+)。
以类似方式,在最终HATU偶合中使用不同硼酸和/或各种酸,合成以下化合物。
Figure BDA0000158388020004062
1-(4-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)苯基)哌嗪-1-基)-4-甲基戊-3-烯-1,2-二酮(XII-24)。MS:m/z 528.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004071
1-(4-(2′-(2-氨基嘧啶-5-基)-6′-(N-吗啉基)-3,4′-联吡啶-6-基)哌嗪-1-基)-4-甲基戊-3-烯-1,2-二酮(XII-24)。MS:m/z 529.2(ES+)。
1-(4-(2′-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-甲基-6′-(N-吗啉基)-3,4′-联吡啶-6-基)哌嗪-1-基)-4-甲基戊-3-烯-1,2-二酮(XII-26)。MS:m/z 543.2(ES+)。
1-(4-(2′-(2-氨基嘧啶-5-基)-6′-(N-吗啉基)-3,4′-联吡啶-6-基)哌嗪-1-基)-4-甲基戊-3-烯-2-酮(XII-27)。MS:m/z 515.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004082
1-(4-(2′-(2-氨基嘧啶-5-基)-6′-(N-吗啉基)-3,4′-联吡啶-6-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮(XII-28)。LC-MS:m/z 473.1(ES+)。
1-(4-(2′-(2-氨基嘧啶-5-基)-6′-(N-吗啉基)-3,4′-联吡啶-6-基)哌嗪-1-基)-4-甲基戊-1,2-二酮(XII-29)。MS:m/z 531.2(ES+)。
N-(4-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(XII-46)。MS:m/z 512.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020004092
N-(3-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(XII-47)。MS:m/z 512.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020004101
N-(3-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)苯基)丙烯酰胺(XII-48)。MS:m/z 484.2(ES+)。
1-(4-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)-2-甲基丙-2-烯-1-酮(XII-49)。MS:m/z 511.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004111
1-(4-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)-3-甲基丁-2-烯-1-酮(XII-50)。MS:m/z 525.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004112
N-(4-(2-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-氧代乙基)苯基)丙烯酰胺(XII-51)。MS:m/z 526.2(ES+)。
实例26
N-(4-丙烯酰胺基苯乙基)-5-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-甲酰胺(II-g-1)。以与II-a-154相同的方式,以5,7-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶替代2,4-二氯噻吩并[3,2-d]嘧啶为原料来合成标题化合物。MS:m/z 531.0(ES+)。
类似地,使用5,7-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶替代2,4-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶作为原料,合成以下化合物。
Figure BDA0000158388020004122
N-(4-(4-(5-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-g-2)。以与实例8中所述的II-a-156类似的方式,合成标题化合物。MS:m/z 568.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004131
1-(4-(5-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(II-g-3)。MS:m/z 547.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004132
1-(4-(5-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)哌啶-1-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(II-g-6)。MS:m/z 549.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004133
1-(4-(5-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-5,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(II-g-4)。以与实例8中所述的II-a-169类似的方式,合成标题化合物。MS:m/z 544.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004141
N-(4-(4-(5-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-1,2,3,6-四氢吡啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(II-g-5)。以与实例8中所述的II-a-4类似的方式,合成标题化合物。MS:m/z 544.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004142
1-(4-((5-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲基)哌嗪-1-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(II-g-7)。以与实例2中所述的II-a-3类似的方式,制备标题化合物。MS:m/z 550.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004151
N-(4-((5-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-(N-吗啉基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲氧基)苯基)丙烯酰胺(II-g-8)。以与实例6中所述的II-a-172类似的方式,制备标题化合物。MS:m/z 489.0(ES+)。
实例27
Figure BDA0000158388020004152
(Z)-5-((4-(6-(4-丙烯酰基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-4)。经由如先前实例中所述的HATU偶合,通过使(Z)-5-((4-(6-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(根据WO 2007136940A2合成)与丙烯酸反应来制备标题化合物。MS:m/z 472.0(ES+)。
以类似方式,在制备以上中间物中使用不同硼酸和/或在HATU偶合步骤中使用各种酸,合成以下化合物。
Figure BDA0000158388020004161
(Z)-5-((4-(6-(4-((E)-4-氧代庚-5-烯酰基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-13)。MS:m/z 542.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020004162
(Z)-5-((4-(6-(4-((E)-5-氧代辛-6-烯酰基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-14)。MS:m/z 556.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004171
(Z)-5-((4-(6-(4-(6-甲基-4-氧代庚-5-烯酰基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-18)。MS:m/z 556.1(ES+)。
(Z)-5-((4-(6-(4-(5-亚甲基-4-氧代庚酰基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-20)。MS:m/z 556.8(ES+)。
Figure BDA0000158388020004173
(Z)-5-((4-(4-(4-丙烯酰基哌嗪-1-基)苯基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-11)。MS:m/z 471.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020004181
(Z)-5-((4-(4-(4-((E)-4-氧代庚-5-烯酰基)哌嗪-1-基)苯基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-15)。MS:m/z 541.4(ES+)。
Figure BDA0000158388020004182
(Z)-5-((4-(4-(4-((E)-5-氧代辛-6-烯酰基)哌嗪-1-基)苯基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-16)。Ms:m/z 555.3(ES+)。
(Z)-5-((4-(2-((E)-5-氧代辛-6-烯酰基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-7-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-17)。MS:m/z 526.6(ES+)。
Figure BDA0000158388020004192
(Z)-5-((4-(2-丙烯酰基-1,2,3,4-四氢异喹啉-7-基)喹啉-6-基)亚甲基)噻唑烷-2,4-二酮(V-19)。MS:m/z 442.1(ES+)。
实例28
Figure BDA0000158388020004201
(E)-1-(4-(4-氨基-3-(5-羟基-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(XI-7)。根据下文所述的以下步骤和中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020004202
步骤28a:3-(4-氨基-3-碘-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-甲酸(R)-叔丁酯(中间物28a)
Figure BDA0000158388020004203
在室温下在N2氛围下向3-碘-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺(500mg,1.9mmol)于DMF(10mL)中的搅拌溶液中添加碳酸铯(1.56g,4.7mmol),接着添加3-(甲基磺酰氧基)哌啶-1-甲酸(S)-叔丁酯(535mg,1.9mmol)。将反应混合物加热到80℃且再在此温度下搅拌16小时。反应完成(由TLC监测)后,在减压下去除溶剂,添加水且用乙酸乙酯(2×25mL)萃取。分离有机层,经Na2SO4干燥,且在减压下去除溶剂。通过硅胶柱色谱法[甲醇/DCM:2/98]纯化粗化合物,得到呈褐色固体状的中间物28a(240mg,30%)。TLC:5%MeOH/DCM:乙酸乙酯(1∶1)(Rf:0.3)。1H-NMR(CDCl3,200MHz):δ8.38(s,1H),6.02(bs,2H),4.82-.4.64(1H),4.31-4.02(m,2H),3.44-3.20(m,1H),2.95-2.65(m,1H),2.25-2.08(m,2H),1.95-1.58(m,2H),1.42(s,9H)。MS:m/z=445(M++1)。手性HPLC纯度(SAV-MA8002-56):9.73RT下98.19%(己烷∶乙醇/70∶30中0.1%TFA,流速:1毫升/分钟,奇罗帕克柱(Chiralpak),ADH,250×4.6mm,5μm)[SHCL06I002]。
步骤28b:3-(4-氨基-3-(5-甲氧基-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-甲酸(R)-叔丁酯(中间物28b)
向中间物28a(100mg,0.33mmol)于THF/H2O(8mL)中的搅拌溶液中添加1-(叔丁氧羰基)-5-甲氧基-1H-吲哚-2-基硼酸(150mg,515mmol)、Na2CO3水溶液(106mg)(溶解于极少量的水中)和Pd(TPP)4(10mg)。用氩气净化反应混合物1小时且再回流6小时。由TLC监测反应进展。经由硅藻土垫过滤反应物质,且在真空下浓缩滤液。通过柱色谱法,使用50%EtOAc/己烷来纯化粗化合物,得到呈橙色固体状的化合物3(60mg,38.7%)。TLC:EtOAc/DCM(1∶1)中5%MeOH(Rf:0.5)。1H-NMR(CDCl3,500MHz):δ8.83(s,1H),8.38(s,1H),7.34(d,J=8.4Hz,2H),7.08(s,1H),6.94(d,J=8Hz,1H),6.82(s,1H),5.91(s,2H),4.97-4.91(m,1H),4.32(bs,2H),3.82(s,3H),2.95(bs,2H),2.62(s,1H),2.5(bs,1H),2.32-2.2(m,3H),2.01(d,2H),1.47(s,9H)。
步骤28c:(R)-2-(4-氨基-1-(哌啶-3-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-3-基)-1H-吲哚-5-醇(中间物28c)
在室温下经15分钟的时间,逐滴添加BBr3(4mL)到中间物28b(1.3g,2.8mmol)于DCM(15mL)中的溶液中。在室温下搅拌反应混合物16小时。由TLC监测反应进展。在减压下去除挥发物,用水(pH 7)稀释残余物且用DCM(2×20mL)萃取。合并的有机层经无水Na2SO4干燥且在真空中浓缩,得到呈橙色固体状的化合物4(800mg,80%)。TLC:EtOAc(Rf:0.1)。MS:m/z=350[M++1]
步骤28d:(E)-1-(4-(4-氨基-3-(5-羟基-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(XI-7)
Figure BDA0000158388020004222
在0℃下向中间物28c(300mg,0.86mmol)于DCM(10mL)中的搅拌溶液中添加(E)-4-氧代庚-5-烯酸(122mg,0.86mmol)、HATU(393mg,1.03mmol)和DIPEA(333mg,2.5mmol)。立即由TLC监测反应进展。反应完成后,用冰冷的水淬灭反应混合物且用DCM(3×20mL)萃取。合并的有机层经无水Na2SO4干燥,且在真空中浓缩。通过柱色谱法纯化粗化合物,得到呈灰白色固体状的XI-7(25mg,10%)。TLC:10%MeOH/DCM(Rf:0.3)。1H-NMR(DMSO d6,500MHz):δ11.26(s,1H),8.85(d,J=8Hz,1H),8.6(s,1H),8.26(d,J=8.2Hz,1H),7.67(d,J=7.2Hz,1H),7.25(m,2H),6.86(m,3H),6.7(m,2H),6.15-6.1(m,2H),4.79(bs,1H),4.6-4.52(m,2H),4.28(d,1H),4.13(d,1H),4.02(m,1H),3.62(m,1H),3.08(m,2H),2.78-2.36(m,7H),1.95(dd,1H),1.98(bs,2H),1.8(m,6H),1.7(bs,1H),1.52(bs,1H)。MS:m/z=474[M++1]
以类似方式,在最终步骤中使用不同酸,合成以下化合物。
Figure BDA0000158388020004231
(R)-N-(3-(3-(4-氨基-3-(5-羟基-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)-3-氧代丙基)丙烯酰胺(XI-4)。MS:m/z 475(M+1)。
N-(2-(4-(4-氨基-3-(5-羟基-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)-2-氧代乙基)-N-甲基丙烯酰胺(XI-8)。MS:m/z 475(M+1)。
以类似方式,在步骤28a中使用4-(甲基磺酰氧基)哌啶-1-甲酸叔丁酯,在步骤28b中使用4-氨基-3-甲氧基苯基硼酸且在步骤28c中使用适当酸,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020004241
(E)-1-(4-(4-氨基-3-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)庚-5-烯-1,4-二酮(XI-1)。MS:m/z 479.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004242
1-(4-(4-氨基-3-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)庚-1,4-二酮(XIR-1)。通过对XI-1进行氢化来制备此化合物。MS:m/z 481.2(ES+)。
N-(2-(4-(4-氨基-3-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)-2-氧代乙基)-N-甲基丙烯酰胺(XI-2)。MS:m/z 480.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004252
N-(2-(4-(4-氨基-3-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)-2-氧代乙基)-N-甲基丙酰胺(XIR-2)。通过对XI-2进行氢化来制备此化合物。MS:m/z 482.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020004261
(E)-1-(4-(4-氨基-3-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)-6-苯基己-5-烯-1,4-二酮(XI-3)。MS:m/z 541(ES+)。
Figure BDA0000158388020004262
N-(4-(4-(4-氨基-3-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(XI-6)。MS:m/z 527(ES+)。
实例29
Figure BDA0000158388020004271
(E)-N-(7-甲氧基-8-(2-(4-氧代庚-5-烯酰胺基)乙氧基)-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺(IX-2)。使用下文所述的以下中间物制备标题化合物。
Figure BDA0000158388020004272
N-(8-(2-氨基乙氧基)-7-甲氧基-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺。根据专利WO2009091550A2制备标题中间物。
Figure BDA0000158388020004273
(E)-N-(7-甲氧基-8-(2-(4-氧代庚-5-烯酰胺基)乙氧基)-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺(IX-2)。经由以上中间物,使用如先前实例中所述的酰胺形成化学来制备标题化合物。MS:m/z 505(ES+)。以类似方式,使用适当酸与以上中间物反应,制备以下化合物:
Figure BDA0000158388020004281
(E)-N-(7-甲氧基-8-(2-(4-氧代-6-苯基己-5-烯酰胺基)乙氧基)-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺(IX-3)。MS:m/z 567(ES+)。
(E)-N-(7-甲氧基-8-(2-(5-氧代-7-苯基庚-6-烯酰胺基)乙氧基)-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺(IX-4)。MS:m/z 581(ES+)。
Figure BDA0000158388020004291
N-(8-(2-(4-丙烯酰胺基苯甲酰胺基)乙氧基)-7-甲氧基-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺(IX-5)。MS:m/z 554(ES+)。
Figure BDA0000158388020004292
(E)-N-(8-(2-(4-(3-(1H-咪唑-2-基)丙烯酰胺基)苯甲酰胺基)乙氧基)-7-甲氧基-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺(IX-6)。MS:m/z 620.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020004301
N-(8-(2-(2-丙烯酰胺基乙氧基)乙氧基)-7-甲氧基-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺(IX-1)。使用丙烯酸与N-(8-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)-7-甲氧基-2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉-5-基)烟酰胺(其合成描述于专利WO2009091550A2第99页中)反应,制备标题化合物。MS:m/z 479(ES+)。
实例30
Figure BDA0000158388020004302
(E)-1-甲基-3-(4-(4-(N-吗啉基)-1-(1-(4-氧代庚-5-烯酰基)哌啶-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-基)苯基)脲(VII-7)。经由如先前实例中所述的HATU偶合,使用(E)-4-氧代庚-5-烯酸和1-甲基-3-(4-(4-(N-吗啉基)-1-(哌啶-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-基)苯基)脲(根据药物化学杂志(J.Med.Chem.)2009,52(16),5013-5016合成),制备标题化合物。MS:m/z 560.8(ES+)。
以类似方式,使用适当酸或烷基卤化物与关于VII-7相同的中间物反应,制备以下化合物。
Figure BDA0000158388020004311
N-(4-(4-(6-(4-(3-甲基脲基)苯基)-4-(N-吗啉基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(VII-8)。MS:m/z 609.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020004312
N-(4-(2-(4-(6-(4-(3-甲基脲基)苯基)-4-(N-吗啉基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)-2-氧代乙基)苯基)丙烯酰胺(VII-9)。MS:m/z 623.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020004321
N-(4-((4-(6-(4-(3-甲基脲基)苯基)-4-(N-吗啉基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)甲基)苯基)丙烯酰胺(VII-5)。MS:m/z 595.8(ES+)。
Figure BDA0000158388020004322
(E)-1-甲基-3-(4-(4-(N-吗啉基)-1-(1-(4-氧代-6-苯基己-5-烯酰基)哌啶-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-基)苯基)脲(VII-10)。MS:m/z 622.7(ES+)。
Figure BDA0000158388020004331
(E)-1-甲基-3-(4-(4-(N-吗啉基)-1-(1-(5-氧代-7-苯基庚-5-烯酰基)哌啶-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-基)苯基)脲(VII-11)。MS:m/z 636.7(ES+)。
根据类似于药物化学杂志2009,52(16),5013-5016中所述的化学过程,使用2-氨基嘧啶5-硼酸,合成以下两种化合物。
Figure BDA0000158388020004332
N-(4-(4-(6-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(VII-12)。MS:m/z 555.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004341
N-(4-(2-(4-(6-(2-氨基嘧啶-5-基)-4-(N-吗啉基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)哌啶-1-基)-2-氧代乙基)苯基)丙烯酰胺(VII-13)。MS:m/z 569.3(ES+)。
实例31
(E)-N-(4-(N-(2-甲氧基-5-(4-(吡啶-4-基)喹啉-6-基)吡啶-3-基)氨磺酰基)苯基)-5-氧代辛-6-烯酰胺(X-1)。经由HATU偶合反应,通过使(E)-5-氧代辛-6-烯酸与适当苯胺中间物(根据出版的论文ACS药物化学快报(ACS Medicinal Chemistry Letters)2010,1(1),39-43合成)反应,制备标题化合物。MS:m/z 622.2(ES+)。
实例32
Figure BDA0000158388020004351
N-(3-(2-((9H-嘌呤-6-基硫基)甲基)-5-氯-4-氧代喹唑啉-3(4H)-基)-4-甲氧基苯甲基)丙烯酰胺(I-5)。经由HATU偶合,通过使丙烯酸与2-((9H-嘌呤-6-基硫基)甲基)-3-(5-(氨基甲基)-2-甲氧基苯基)-5-氯喹唑啉-4(3H)-酮(根据WO 01/81346合成)反应,制备标题化合物。1H NMR:(DMSO,400MHz):δ3.567(s,3H),4.177(s,2H),4.373(d,2H),5.566(1H,d),6.068(1H,D),6.233(t,1H),7.071-7.775(m,8H),13.55(s,1H)。MS:m/z 534.1(M+1)。
Figure BDA0000158388020004352
(E)-N-(3-(2-((9H-嘌呤-6-基硫基)甲基)-5-氯-4-氧代喹唑啉-3(4H)-基)-4-甲氧基苯甲基)-4-氧代庚-5-烯酰胺(I-6)。以类似方式,使用(E)-4-氧代庚-5-烯酸替代丙烯酸,制备I-6。1H NMR:(DMSO,400MHz):δ2.309(d,3H),2.808(t,2H),3.684(t,2H),3.728(s,3H),4.244(dd,2H),4.420(d,2H),6.662-8.467(m,8H),9.048(s,1H)。MS:m/z 604.1(M+1)。
实例33
Figure BDA0000158388020004361
1-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(XII-30)。经由如下所述的以下中间物和步骤合成标题化合物。
4-(2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(中间物33a)
Figure BDA0000158388020004362
方法A
在CEM微波中于150℃下将4-(6-氯-4-碘吡啶-2-基)吗啉(中间物22a,97mg,0.3mmol)、N-Boc-哌嗪(60mg,0.32mmol)和200μL DIPEA于1mL DMA中的反应混合物加热30分钟。将反应混合物悬浮于EtOAc中,用水洗涤,且经Na2SO4干燥。过滤并浓缩后,通过硅胶柱色谱法,使用庚烷/EtOAc(体积比3/2)作为洗脱剂来纯化残余物,得到15mg所需产物。回收到大部分原料。MS:m/z 383.2(ES+)。
方法B
用氮气净化4-(6-氯-4-碘吡啶-2-基)吗啉(中间物22a,324mg,1.0mmol)、N-Boc-哌嗪(192mg,1.05mmol)、150mg叔丁醇钠(1.5当量)、三(二亚苄基丙酮)二钯(27.2mg,3%mol)于10mL二噁烷中的混合物15分钟,接着添加120μL 0.5M三丁基膦的甲苯溶液。在室温下搅拌所得混合物过周末。接着在减压下去除溶剂,且用EtOAc-水对残余物进行常规处理,且经Na2SO4干燥。过滤并浓缩后,通过硅胶柱色谱法,使用庚烷/EtOAc(体积比3/2)作为洗脱剂来纯化粗产物,得到275mg呈微黄色固体状的所需产物。MS:m/z383.2(ES+)。
1-(4-(2-氯-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(中间物33b)
Figure BDA0000158388020004371
用含0.6mL三氟乙酸的1mL二氯甲烷处理中间物33a(15mg)。30分钟后,蒸发过量TFA和DCM,且在真空中干燥残余物。接着使用如先前实例中所述的HATU偶合,使脱除Boc的中间物与7-甲基-5-氧代辛-6-烯酸反应,得到9mg呈黄色半固体状的中间物33b。MS:m/z 435.1(ES+)。
Figure BDA0000158388020004381
1-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(XII-30)。使中间物33b与2-氨基-5-硼酸在如先前实例中所述的条件下进行铃木偶合,得到XII-30。MS:m/z 494.2(ES+)。
以类似方式,在最终HATU偶合中使用不同环胺和/或各种酸,或在最终步骤中使用烷基化试剂与胺反应,来合成以下化合物。
Figure BDA0000158388020004382
1-(4-(1-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)哌啶-4-基)哌嗪-1-基)-4-甲基戊-3-烯-2-酮(XII-34)。MS:m/z 521.3(ES+)。
Figure BDA0000158388020004391
1-(4-(1-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)哌啶-4-基)哌嗪-1-基)-4-甲基戊-3-烯-1,2-二酮(XII-35)。MS:m/z 535.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004392
1-(1-(9-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-羰基)环丙基)-3-甲基丁-2-烯-1-酮(XII-36)。MS:m/z 560.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004393
1-(1-(2-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2,7-二氮杂螺[3.5]壬烷-7-羰基)环丙基)-3-甲基丁-2-烯-1-酮(XII-38)。MS:m/z 532.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004401
1-(2-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2,7-二氮杂螺[3.5]壬-7-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(XII-39)。MS:m/z 520.2(ES+)。
(E)-1-(2-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2,7-二氮杂螺[3.5]壬-7-基)庚-5-烯-1,4-二酮(XII-40)。MS:m/z 506.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004411
1-(2-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2,7-二氮杂螺[3.5]壬-7-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(XII-41)。MS:m/z 534.3(ES+)。
以类似方式,在最终HATU偶合中使用不同环胺和/或各种酸,或在最终步骤中使用烷基化试剂与胺反应,合成以下化合物(在合成中间物33a中使用方法B(如上文所述))。
Figure BDA0000158388020004412
1-(7-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2,7-二氮杂螺[3.5]壬-2-基)-6-甲基庚-5-烯-1,4-二酮(XII-42)。MS:m/z 520.2(ES+)。
1-(7-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2,7-二氮杂螺[3.5]壬-2-基)-7-甲基辛-6-烯-1,5-二酮(XII-44)。MS:m/z 534.2(ES+)。
N-(4-(2-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)-2,7-二氮杂螺[3.5]壬烷-7-羰基)苯基)丙烯酰胺(XII-52)。MS:m/z 555.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004431
N-(4-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)哌嗪-1-羰基)苯基)丙烯酰胺(XII-53)。MS:m/z 515.2(ES+)。
Figure BDA0000158388020004432
N-(4-(2-(4-(2-(2-氨基嘧啶-5-基)-6-(N-吗啉基)吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)苯基)丙烯酰胺(XII-57)。MS:m/z 529.2(ES+)。
生物实例
使用下文所述的分析来测量所提供的化合物作为PI3激酶抑制剂的生物活性。
实例34
使用以下一般方案分析作为PI3激酶抑制剂的本发明的化合物。
用于评估针对PI3Kα、PI3Kβ和PI3Kγ的活性形式的效力的均相时间分辨荧光 (Homogeneous Time Resolved Fluorescence,HTRF)分析方案
以下方案描述终点竞争结合HTRF分析,其用以测量测试化合物针对活性PI3Kα(p110α/p85α)、PI3Kβ(p110β/p85α)和PI3Kγ(p120γ)酶的固有效力。此分析平台的机理最佳由供应商(密理博公司(Millipore),马萨诸塞州毕莱卡(Billerica,MA))在其以下URL的网站上描述:www.millipore.com/coa/tech1/74jt4z。
简单说来,在使用前约2小时,根据制造商的推荐,制备停止溶液(Stop solution)(停止A#33-007和停止B#33-009;3∶1比率)和检测混合物(Detection Mix)(DMC#33-015与DMA#33-011和DMB#33-013;18∶1∶1比率)。另外,在1X反应缓冲液中制备1X反应缓冲液(自4X缓冲液储备液#33-003得到);来自BPS生物科技公司(BPS Bioscience)(加利福尼亚州圣地亚哥(San Diego,CA))或密理博公司(马萨诸塞州毕莱卡)的PI3Kα、PI3Kβ和PI3Kγ酶以及二-C8-PIP2脂质底物(#33-005)的1.4X储备液;和4X ATP溶液(#A7699西格玛/阿尔德里奇公司(Sigma/Aldrich);密苏里州圣路易斯(St.Louis,MO))。在未经处理的康宁(Corning)(#3573)384孔黑色微量滴定盘(康宁公司,纽约)中,在25℃下将15μLPI3K酶和脂质底物混合物与0.5μL体积的50%DMSO和在50%DMSO中制备的连续稀释化合物一起预先培育30分钟。通过添加5μL ATP溶液来开始脂质激酶反应,在旋转盘式振荡器上混合15秒,且在25℃下培育30-60分钟。接着通过添加5μL停止溶液使反应停止,紧接着添加5μL体积的检测混合物。使停止的反应在室温下平衡1小时和18小时,且在来自拜尔泰克公司(BioTek)(佛蒙特州威努斯基(Winooski,VT))的Synergy4盘式读取器中在λex330-80/λem620-35和λem665-7.5下读取。在各分析结束时,由各孔的荧光发射值计算HTRF比率且由平均对照孔(+/-PI3K酶)确定抑制百分比。接着在来自格拉夫帕德软件公司(GraphPad Software)(加利福尼亚州圣地亚哥)的格拉夫帕德普雷姆软件(GraphPad Prism)中绘出各化合物的抑制百分比值相对于抑制剂浓度的曲线,以由log[抑制剂]对反应的可变斜率模型估算IC50
最佳方案中所用的[试剂]:
[p110α/p85α]=0.5-1.5nM,[ATP]=50μM,[二-C8-PIP2]=10μM
[p110β/p85α]=0.75nM,[ATP]=50μM,[二-C8-PIP2]=10μM
[p120γ]=2-2.5nM,[ATP]=50μM,[二-C8-PIP2]=10μM
(两种酶的ATP KMapp经估算为40-70μM)
针对p110α/p85α-p120γ酶估算的参考抑制剂IC50
LY294002=2-5μM(n=6;公开的IC50=0.7到3μM)
渥曼青霉素=3-13nM(n=5;公开的IC50=2到9nM)
针对p110β/p85α酶估算的参考抑制剂IC50
LY294002=>1μM(n=6;公开的IC50=>1μM)
PIK-75=248nM(n=10;公开的IC50=343nM)
实例35
表20显示所选择的本发明化合物在PI3Kα、PI3Kβ和PI3KγHTRF分析中的活性。活性指定为“A”的化合物提供IC50≤10nM;活性指定为“B”的化合物提供10-100nM的IC50;活性指定为“C”的化合物提供10-1000nM的IC50;且活性指定为“D”的化合物提供IC50≥1000nM。“-”指示值未测定。
表20.PI3K抑制数据
  化合物编号   PI3Kα抑制   PI3Kγ抑制   PI3Kβ抑制
  I-5   D   -   -
  I-6   D   -   -
  GDC-941   B   -   -
  II-a-1   C   C   -
  II-a-2   B   -   -
  II-a-3   C   -   D
  II-a-6   C   D   -
  II-a-13   B   D   -
  II-a-14   B   D   -
  II-a-16   A   D   -
  IIR-a-16   C   D   -
  II-a-17   D   D   -
  II-a-19   B   -   -
  II-a-20   C   -   -
  II-a-21   D   D   -
  II-a-22   B   D   -
  II-a-23   C   D   -
  II-a-24   B   D   -
  II-a-25   B   C   -
  II-a-26   B   C   -
  II-a-27   C   D   -
  II-a-28   C   C   -
  II-a-29   B   C   -
  II-a-31   C   D   -
  II-a-32   C   D   -
  II-a-33   B   D   -
  II-a-34   C   D   -
  II-a-35   C   C   -
  II-a-36   A   D   D
  IIR-a-36   D   -   -
  II-a-37   A   D   -
  II-a-38   B   D   -
  II-a-39   B   D   -
  化合物编号   PI3Kα抑制   PI3Kγ抑制   PI3Kβ抑制
  II-a-40   B   C   -
  II-a-41   D   D   -
  II-a-42   D   D   -
  II-a-43   B   D   D
  II-a-44   D   D   -
  II-a-45   A   C   -
  II-a-46   B   C   -
  II-a-47   B   D   -
  II-a-48   A   D   -
  II-a-49   B   D   -
  II-a-50   A   D   -
  II-a-51   C   D   -
  II-a-52   C   D   -
  II-a-53   A   D   -
  II-a-54   B   D   -
  II-a-55   B   D   D
  II-a-56   C   D   -
  II-a-57   C   D   -
  II-a-58   B   D   -
  II-a-59   D   D   -
  II-a-60   B   -   -
  II-a-61   A   -   -
  II-a-62   B   -   -
  II-a-63   A   -   -
  II-a-64   A   -   -
  IIR-a-64   C   -   -
  II-a-65   A   -   -
  II-a-66   B   -   -
  II-a-67   A   -   -
  II-a-68   A   -   -
  II-a-69   B   -   -
  II-a-70   B   -   -
  II-a-78   C   -   -
  II-a-79   A   -   -
  II-a-80   A   -   -
  II-a-81   B   -   -
  IIR-a-81   C   -   -
  II-a-86   B   -   -
  II-a-89   A   -   -
  II-a-95   D   -   -
  II-a-96   C   -   -
  II-a-97   C   -   -
  II-a-98   C   -   -
  II-a-99   C   -   -
  II-a-100   C   -   -
  II-a-101   C   -   -
  II-a-102   A   -   -
  II-a-103   A   -   -
  II-a-104   A   -   -
  化合物编号   PI3Kα抑制   PI3Kγ抑制   PI3Kβ抑制
  II-a-105   A   -   -
  II-a-106   B   -   -
  II-a-107   C   -   -
  II-a-108   A   -   -
  II-a-109   A   -   -
  II-a-110   C   -   -
  II-a-111   B   -   -
  II-a-112   B   -   C
  II-a-113   D   -   -
  II-a-114   C   -   -
  II-a-115   B   -   -
  II-a-116   B   -   D
  II-a-117   C   -   -
  II-a-118   C   -   -
  II-a-119   C   -   -
  II-a-120   C   -   -
  II-a-121   C   -   -
  II-a-122   B   -   -
  II-a-123   A   -   -
  II-a-124   C   -   -
  II-a-125   C   -   -
  II-a-126   C   -   -
  II-a-127   C   -   -
  II-a-128   C   -   -
  II-a-129   C   -   -
  II-a-130   C   -   -
  II-a-131   C   -   -
  II-a-132   C   -   -
  II-a-133   C   -   -
  II-a-134   C   -   -
  II-a-135   C   -   -
  II-a-136   C   -   -
  II-a-137   B   -   -
  II-a-138   B   -   -
  II-a-139   B   -   -
  II-a-140   B   -   -
  II-a-141   B   -   -
  II-a-142   A   -   -
  II-a-143   C   -   -
  II-a-144   C   -   C
  II-a-145   C   -   -
  II-a-146   D   -   -
  II-a-147   C   -   -
  II-a-148   C   -   D
  IIR-a-148   C   D   D
  II-a-149   C   -   -
  II-a-150   B   -   -
  II-a-151   D   -   -
  II-a-152   C   -   -
  化合物编号   PI3Kα抑制   PI3Kγ抑制   PI3Kβ抑制
  II-a-153   C   -   -
  II-a-154   B   -   -
  II-a-155   B   -   -
  II-a-156   B   -   -
  II-a-157   C   -   -
  II-a-158   B   -   -
  II-a-159   B   -   -
  II-a-160   C   -   D
  II-a-161   C   -   -
  II-a-163   D   -   -
  II-a-164   B   -   C
  II-a-165   B   -   -
  II-a-166   A   -   -
  II-a-167   C   -   -
  II-a-168   C   -   -
  II-a-169   B   C   D
  II-a-170   C   -   -
  II-a-171   A   -   -
  II-a-172   C   -   -
  II-a-173   C   -   -
  II-a-174   B   -   -
  II-a-175   B   -   -
  II-a-176   B   -   -
  II-a-177   C   -   -
  II-g-1   C   -   -
  II-g-2   C   C   -
  II-g-3   C   C   -
  II-g-4   D   -   -
  II-g-5   D   -   -
  II-g-6   C   -   -
  II-g-7   C   -   -
  II-g-8   C   -   -
  V-2   C   D   -
  V-3   C   D   -
  V-4   B   -   -
  V-11   B   -   -
  V-13   A   -   -
  V-14   A   -   -
  V-15   B   -   -
  V-16   A   -   -
  V-17   B   -   -
  V-18   A   -   -
  V-19   B   -   -
  V-20   A   -   -
  VI-1   D   C   -
  VI-24   D   -   -
  VI-25   D   -   -
  VII-5   C   -   -
  VII-7   C   -   -
  化合物编号   PI3Kα抑制   PI3Kγ抑制   PI3Kβ抑制
  VII-8   C   -   -
  VII-9   C   -   -
  VII-10   C   -   -
  VII-11   C   -   -
  VII-12   C   -   -
  VII-13   C   -   -
  IX-1   B   -   -
  IX-2   B   -   -
  IX-3   B   -   -
  IX-4   C   -   -
  IX-5   B   -   -
  IX-6   B   -   -
  X-1   C   -   -
  XI-ref   D   -   -
  XI-1   D   -   -
  XIR-1   D   -   -
  XI-2   D   -   -
  XIR-2   D   -   -
  XI-3   C   -   -
  XI-4   D   -   -
  XI-5   D   -   -
  XI-6   D   -   -
  XI-7   D   -   -
  XI-8   D   -   -
  XII-1   C   -   -
  XII-2   B   -   -
  XII-3   B   -   -
  XII-4   B   -   -
  XII-5   C   -   -
  XII-6   C   -   -
  XII-7   D   -   -
  XII-8   D   -   -
  XII-9   D   -   -
  XII-10   C   -   -
  XII-11   D   -   -
  XII-12   D   -   -
  XII-13   D   -   -
  XII-14   D   -   -
  XII-15   C   -   -
  XII-16   C   -   -
  XII-17   D   -   -
  XII-18   D   -   -
  XII-19   D   -   -
  XII-20   C   -   -
  XII-21   D   -   -
  XII-22   A   -   -
  XII-23   C   -   -
  XII-24   B   -   -
  XII-25   B   -   -
  化合物编号   PI3Kα抑制   PI3Kγ抑制   PI3Kβ抑制
  XII-26   B   -   -
  XII-27   B   -   -
  XII-28   C   -   -
  XII-29   C   -   -
  XII-30   C   -   -
  XII-31   C   -   -
  XII-32   C   -   -
  XII-33   C   -   -
  XII-34   C   -   -
  XII-35   C   -   -
  XII-36   C   -   -
  XII-37   B   -   -
  XII-38   C   -   -
  XII-39   B   -   -
  XII-40   C   -   -
  XII-41   D   -   -
  XII-42   D   -   -
  XII-44   D   -   -
  XII-46   C   -   -
  XII-47   C   -   -
  XII-48   C   -   -
  XII-49   B   -   -
  XII-50   C   -   -
  XII-51   B   -   -
  XII-52   C   -   -
  XII-53   C   -   -
  XII-54   C   -   -
  XIV-a-2   D   D   -
实例36
PI3K HCT116细胞分析
在HCT116结肠癌细胞中分析所选化合物。接种HCT116细胞,保持过夜,接着与不同浓度的抑制剂(5、2、0.5、0.1和0.02μM)一起培育1小时。接着用PBS洗涤细胞,溶解,接着回收蛋白质溶解产物且利用蛋白质印迹法进行分析。
表21显示在PI3K HCT116细胞抑制分析中所选本发明化合物的剂量反应。活性指定为“A”的化合物提供EC50≤20nM;活性指定为“B”的化合物提供20-100nM的EC50;活性指定为“C”的化合物提供100-500nM的EC50;活性指定为“D”的化合物提供500-2000nM的EC50;活性指定为“E”的化合物提供2000-5000nM的EC50;且活性指定为“F”的化合物提供EC50≥5000nM。
表21.PI3K HCT116细胞抑制数据
  化合物编号   PI3K抑制
  GDC-941   C
  II-a-6   E
  II-a-16   C
  II-a-25   B
  II-a-26   B
  II-a-28   B
  II-a-29   C
  II-a-33   B
  II-a-35   C
  II-a-36   A
  II-a-37   B
  II-a-43   A
  II-a-45   C
  II-a-46   C
  II-a-47   C
  II-a-48   B
  II-a-49   A
  II-a-50   A
  II-a-53   B
  II-a-55   B
  GSK-615   A
  V-3   D
实例37
通过蛋白质印迹法测定的在SKOV3细胞中的剂量反应
将SKOV3细胞按12孔盘每孔4×105个细胞的密度接种于SKOV3生长培养基(补充有10%FBS和盘尼西林(pen)/链霉素(strep)的DMEM)中。24小时后,去除培养基且用1ml含有测试化合物和0.1%DMSO的培养基置换,且将细胞放回到恒温箱中,维持1小时。在所述1小时结束时,去除培养基且用PBS洗涤细胞,接着溶解且刮入30ul细胞提取缓冲液(Cell Extraction Buffer)(拜尔索斯公司(Biosource),加利福尼亚州卡马里奥(Camarillo,CA))加完全蛋白酶抑制剂和菲斯托普(PhosStop)磷酸酶抑制剂(罗氏公司(Roche),印第安纳州印第安纳波利斯(Indianapolis,IN))中。
在13,000×g下短暂离心(spin down)细胞碎片1分钟且取上清液作为细胞溶解产物。通过BCA分析(皮尔斯生物技术公司(Pierce Biotechnology),伊利诺伊州罗克福德(Rockford,IL))测定溶解产物的蛋白质浓度,且每孔加载50μg蛋白质到NuPAGE Novex4-12%Bis-Tris凝胶(英杰公司(Invitrogen),加利福尼亚州卡尔斯巴德(Carlsbad,CA))上,接着转移到英姆比隆(Immobilon)PVDF-FL(密理博公司,马萨诸塞州毕莱卡)。
在奥德赛阻断缓冲液(Odyssey Blocking Buffer)(利-克生物科学公司(Li-CorBiosciences),内布拉斯加州林肯市(Lincoln,NE))中阻断印迹1小时,接着在4℃下与小鼠抗Akt抗体(#2920)和兔抗磷酸化Akt(Ser473)抗体(#9271)(细胞信号传导技术公司(CellSignaling Technology),马萨诸塞州波士顿(Boston,MA))一起培育过夜,两种抗体都在PBS/奥德赛缓冲液(1∶1)+0.1%吐温-20中以1∶1000稀释。在PBS+0.2%吐温-20中洗涤印迹3次,历时5分钟,接着在室温下与在PBS/奥德赛缓冲液(1∶1)+0.1%吐温-20中以1∶1000稀释的荧光标记的二次抗体(利-克公司)一起培育1小时。
在PBS+0.2%吐温-20中洗涤印迹2次,历时5分钟,用蒸馏水洗涤1次,接着在奥德赛机器(利-克公司)上扫描。使用奥德赛软件测定谱带强度,且将磷酸化Akt信号相对于样本内的总Akt进行正规化,接着表示为未经处理的磷酸化Akt信号的百分比。
表22显示通过蛋白质印迹法所测定的所选本发明化合物在SKOV3剂量反应分析中的剂量反应。活性指定为“A”的化合物提供EC50≤10nM;活性指定为“B”的化合物提供10-100nM的EC50;活性指定为“C”的化合物提供100-1000nM的EC50;且活性指定为“D”的化合物提供EC50≥1000nM。
表22.通过蛋白质印迹法所测定的SKOV3剂量反应
  化合物编号   免疫印迹
  II-a-3   B
  II-a-14   B
  II-a-22   B
  II-a-36   B
  II-a-64   B
  II-a-89   B
  II-a-112   B
  II-a-116   B
  II-a-142   B
  II-a-148   A
  II-a-154   A
  II-a-156   A
  II-a-172   A
  II-a-173   A
  II-a-176   B
  II-g-3   C
  II-g-6   C
  VII-13   B
  XII-2   D
实例38
通过细胞内蛋白质印迹法(In-Cell Western)测定的在SKOV3细胞中的剂量反应
将SKOV3细胞接种于SKOV3生长培养基(补充有10%FBS和盘尼西林/链霉素的DMEM)中,密度为科斯塔(Costar)#3603黑色96孔透明平底盘每孔中含3×104个细胞。24小时后,去除培养基且用100μl含有测试化合物或对照化合物的培养基置换,且将细胞放回到恒温箱中,维持1小时。在所述1小时结束时,去除培养基且用PBS洗涤细胞1次,接着在室温下固定于含4%甲醛的PBS中,保持20分钟。去除甲醛,且在室温下在温和振荡下用100μl渗透缓冲液(Permeabilization Buffer)(PBS+0.1%曲通(Triton)X-100)洗涤细胞5次,历时5分钟。去除最后一次洗涤液且用150μl奥德赛阻断缓冲液(利-克公司,内布拉斯加州林肯市)置换,且在室温下在温和振荡下培育90分钟。
接着用50μl一次抗体混合物(在奥德赛阻断缓冲液中按1∶100稀释的兔抗磷酸化Akt(Ser473)(细胞信号传导技术公司,马萨诸塞州波士顿)和在奥德赛阻断缓冲液中按1∶5000稀释的小鼠抗微管蛋白(西格玛阿尔德里奇公司,密苏里州圣路易斯))置换阻断缓冲液,且在室温下在温和振荡下培育过夜。
次日早晨,去除抗体混合物,且用PBS+0.1%吐温-20洗涤各孔5次,历时5分钟。用50μl二次抗体混合物(山羊抗兔-IRDye-680和山羊抗小鼠-IRDye-800(利-克公司),两者都在奥德赛阻断缓冲液+0.2%吐温-20中按1∶1000稀释)置换最后一次洗涤液,且在室温下在温和振荡下培育1小时。去除抗体混合物,且用PBS+0.1%吐温-20洗涤各孔5次,历时5分钟,接着用ddH2O洗涤1次。
在奥德赛机器(利-克公司)上扫描盘,其中在两个通道中在强度8下存在3mm的焦点偏移,且使用奥德赛软件分析数据。
表23显示所选本发明化合物在SKOV3细胞内蛋白质印迹分析中的剂量反应。活性指定为“A”的化合物提供EC50≤10nM;活性指定为“B”的化合物提供10-100nM的EC50;活性指定为“C”的化合物提供100-1000nM的EC50;且活性指定为“D”的化合物提供EC50≥1000nM。
表23.SKOV3细胞内蛋白质印迹数据
  化合物编号   细胞内蛋白质印迹法中pAKT的抑制作用
  GDC-941   B
  IX-ref   B
  II-a-36   C
  II-a-37   C
  II-a-45   A
  II-a-14   A
  IIR-a-36   C
  II-a-112   A
  II-a-115   C
  II-a-116   B
  II-a-117   B
  化合物编号   细胞内蛋白质印迹法中pAKT的抑制作用
  II-a-118   C
  II-a-122   C
  II-a-123   B
  II-a-126   A
  II-a-127   A
  II-a-130   B
  II-a-132   B
  II-a-133   B
  II-a-137   B
  II-a-138   C
  II-a-139   C
  II-a-140   C
  II-a-141   C
  II-a-142   B
  II-a-143   A
  II-a-144   C
  II-a-148   B
  II-a-86   A
  IIR-a-148   C
  II-a-161   A
  II-a-3   A
  II-a-163   B
  II-a-164   B
  II-a-173   B
  II-a-174   A
  II-a-175   A
  V-20   B
  X-ref   A
  X-1   A
  XI-ref   B
  XI-3   D
  XII-4   B
  XII-5   B
  XII-39   C
  XII-41   C
  XII-42   C
  XII-46   C
  XII-47   C
  XII-48   C
  XII-49   C
  XII-50   C
  XII-51   B
  XII-52   C
  XII-54   C
  II-g-1   B
  II-g-2   A
  II-g-3   A
  VII-ref   B
  VII-7   C
  化合物编号   细胞内蛋白质印迹法中pAKT的抑制作用
  VII-8   C
  VII-9   C
  VII-12   B
  VII-13   B
实例39
使用HCT116细胞进行的洗脱实验
接种HCT116细胞,保持过夜,接着与5μM(GDC-941)、1μM(GSK-615、II-a-16、II-a-33、II-a-36和II-a-37)或0.5μM(II-a-43、II-a-49、II-a-50、II-a-53、II-a-54和II-a-55)抑制剂一起培育1小时。接着每2小时用PBS洗涤细胞。在每一时间点(t=0、2、4、8和18小时),溶解细胞且回收蛋白质溶解产物,或在细胞培养基中培育细胞到下一时间点。接着通过蛋白质印迹法分析来自每一时间点的蛋白质样品。使用上文所列的化合物进行的此实验的结果描绘于图1中。
实例40
使用PC3细胞进行的洗脱实验
接种PC3细胞,保持过夜,接着与5μM抑制剂一起培育1小时。接着每2小时用PBS洗涤细胞。在每一时间点(t=0、2、4、8和18小时),溶解细胞且回收蛋白质溶解产物,或在细胞培养基中培育细胞到下一时间点。接着通过蛋白质印迹法分析来自每一时间点的蛋白质样品。使用GDC-941和II-a-16进行的此实验的结果描绘于图2中。
实例41
通过细胞内蛋白质印迹法所测定的使用SKOV3细胞进行的洗脱实验
将SKOV3细胞接种于SKOV3生长培养基(补充有10%FBS和盘尼西林/链霉素的DMEM)中,密度为科斯塔#3603黑色96孔透明平底盘每孔中含2.5×104个细胞。一式四份设立盘,其中一个盘各自用于0、1、6和24小时时间点。
24小时后,去除培养基且用100μl含有测试化合物或作为对照物的DMSO的培养基置换,且将细胞放回到恒温箱中,维持1小时。在所述1小时结束时,去除培养基,且用PBS洗涤细胞2次。自三个盘去除PBS,用100μl生长培养基置换,且将盘放回到恒温箱。第四个盘作为0小时时间点,且如关于细胞内蛋白质印迹法剂量反应所述来显现。
第一次洗涤后半小时,自剩余盘去除培养基,用100μl新鲜生长培养基置换,接着将盘放回到恒温箱。第一次洗涤后1小时,将一个盘作为1小时时间点,且如细胞内蛋白质印迹法一般进行显现。以1小时时间间隔将剩余两个盘再洗涤两次,且在第一次洗涤后6小时和24小时,如细胞内蛋白质印迹法一般进行显现。使用II-a-144和II-a-148进行的此实验的结果描绘于图3中。结果显示在自SKOV3细胞去除后II-a-144和II-a-148抑制p-AKT超过6小时。三种可逆参考化合物显示活性即刻恢复。
实例42
PI3K的质谱分析
在相对于蛋白质10倍过量的II-a-45或II-a-49下,培育完整PI3Kα(约翰霍普金斯公司(Johns Hopkins))3小时。用10μl 0.1%TFA稀释样品的等分试样(3μl),接着使用芥子酸(sinapinic acid)作为脱附基质(50∶50的0.1%TFA:乙腈中10mg/ml),经微量C4吸管尖(micro C4ZipTipping)直接转移到MALDI目标上。质谱分析迹线显示于图4和图5中。图4和5的上图显示完整PI3Kα蛋白质(m/z 127,627Da)的质谱迹线。图3和4的下图显示在PI3Kα与II-a-45(mw=518.64)或II-a-49(mw=535.67)一起培育时的质谱迹线。图4的下图中的质心质量(m/z=128,190Da)显示563Da的正质量移位,表明PI3Kα经II-a-45完全修饰。图5的下图中的质心质量(m/z=128,243Da)显示616Da的正质量移位,表明PI3Kα经II-a-49完全修饰。完全修饰PI3Kα的其它化合物包括II-a-16、II-a-33、II-a-36、II-a-37、II-a-43、II-a-50、II-a-53、II-a-54和II-a-55。
实例43
PI3K的质谱分析
在相对于蛋白质10倍过量的II-a-3、II-a-144或II-a-148下,培育完整PI3Kα(密理博公司,14-602)1小时。用15μl 0.2%TFA稀释样品的等分试样(5μl),接着使用芥子酸作为脱附基质(50∶50的0.1%TFA∶乙腈中10mg/ml),经微量C4吸管尖直接转移到MALDI目标上。质谱分析迹线显示于图6、7和8中。图6、7和8的图A显示完整PI3Kα蛋白质(m/z 124,951Da)的质谱迹线。图6、7和8的图B显示在PI3Kα与II-a-3(mw=573.72)、II-a-144(mw=591.69)或II-a-148(mw=553.64)一起培育1小时时的质谱迹线。图6的图B中的质心质量(m/z=125,036Da)显示445Da的质量移位(78%),表明PI3Kα经II-a-3完全修饰。图7的图B中的质心质量(m/z=125,092Da)显示575Da的质量移位(97%),表明PI3Kα经II-a-144完全修饰。图8的图B中的质心质量(m/z=125,063Da)显示472Da的质量移位(85%),表明PI3Kα经II-a-148完全修饰。
实例44
使用实例43中所述的方案,测试式XII的某些化合物。化合物XII-54的质谱分析迹线显示于图16中。上图显示完整PI3Kα蛋白质(m/z=125,291Da)的质谱迹线。下图显示与XII-54(mw=528.62)一起培育1小时的PI3Kα的质谱迹线。质心质量(m/z=125,833Da)显示542Da的质量移位(103%),表明PI3Kα经XII-54完全修饰。以类似方式修饰PI3Kα的其它化合物包括XII-15、XII-18、XII-42、XII-51和XII-52。
实例45
关于II-a-3的胰蛋白酶消化和MS-MS分析
在相对于蛋白质10倍过量的II-a-3下,培育完整PI3Kα(密理博公司,14-602)1小时。反应之后,将4μg对照物和II-a-3处理的PI3Kα在4-12%BT凝胶上电泳分离,接着用考马斯蓝(coomassie blue)蛋白质染色剂染色。接着切下PI3Kα蛋白谱带,且通过用DTT还原蛋白质,用碘乙酰胺对硫醇进行烷基化,接着在37℃水浴中将蛋白凝胶谱带与胰蛋白酶一起培育过夜,进行凝胶内(in-gel)胰蛋白酶消化。接着通过添加三氟乙酸停止消化,且通过用递增量的乙腈(0%、30%和60%)进行声波处理,自凝胶谱带取出肽。接着使用C18吸管尖纯化肽,以α氰基-4-羟基肉桂酸作为脱附基质(50∶50的0.1%TFA:乙腈中10mg/ml),点在MALDI目标盘上,且以反射模式进行分析。图9的图A显示PI3Kα对照物的胰蛋白酶消化曲线,且箭头指示Cys经碘乙酰胺烷基化的肽853NSHTIMQIQCK863的正确质量。图9的图B显示在消化之前经II-a-3处理的PI3Kα的胰蛋白酶消化曲线,且箭头指示Cys经单一II-a-3修饰的肽853NSHTIMQIQCK863的正确质量。两种肽都被选用于MSMS分析以证实所修饰的确切氨基酸。
自对照物和II-a-3处理的PI3Kα选择相关肽用于MSMS分析。图10的图A显示来自对照消化产物的肽853NSHTIMQIQCK863的MSMS谱,其中Cys在消化期间经碘乙酰胺烷基化。图10的图B显示来自经II-a-3处理的PI3Kα消化产物的肽853NSHTIMQIQCK863的MSMS谱,其中Cys经一个II-a-3修饰。b和y离子的比对证实Cys-862为经II-a-3修饰的氨基酸。
实例46
关于II-a-144的胰蛋白酶消化和MS-MS分析
在相对于蛋白质10倍过量的II-a-144下,培育完整PI3Kα(密理博公司,14-602)1小时。反应之后,将4μg对照物和II-a-144处理的PI3Kα在4-12%BT凝胶上电泳分离,接着用考马斯蓝蛋白质染色剂染色。接着切下PI3Kα蛋白谱带,且通过用DTT还原蛋白质,用碘乙酰胺对硫醇进行烷基化,接着在37℃水浴中将蛋白凝胶谱带与胰蛋白酶一起培育过夜,进行凝胶内胰蛋白酶消化。接着通过添加三氟乙酸停止消化,且通过用递增量的乙腈(0%、30%和60%)进行声波处理,自凝胶谱带取出肽。接着使用C18吸管尖纯化肽,以α氰基-4-羟基肉桂酸作为脱附基质(50∶50的0.1%TFA∶乙腈中10mg/ml),点在MALDI目标盘上,且以反射模式进行分析。图11的图A显示PI3Kα对照物的胰蛋白酶消化曲线,且箭头指示Cys经碘乙酰胺烷基化的肽853NSHTIMQIQCK863的正确质量。图11的图B显示在消化之前经II-a-144处理的PI3Kα的胰蛋白酶消化曲线,且箭头指示Cys经单一II-a-144修饰的肽853NSHTIMQIQCK863的正确质量。两种肽都被选用于MSMS分析以证实所修饰的确切氨基酸。
自对照物和II-a-144处理的PI3Kα选择相关肽用于MSMS分析。图12的图A显示来自对照消化产物的肽853NSHTIMQIQCK863的MSMS谱,其中Cys在消化期间经碘乙酰胺烷基化。图12的图B显示来自经II-a-144处理的PI3Kα消化产物的肽853NSHTIMQIQCK863的MSMS谱,其中Cys经一个II-a-144修饰。b和y离子的比对证实Cys-862为经II-a-144修饰的氨基酸。
实例47
HCT-116细胞增殖分析
对于HCT116增殖分析,将每孔3000个细胞接种于96孔盘中的生长培养基(DMEM、10%FBS、1%L-谷氨酰胺、1%盘尼西林(penicillin)/链霉素(streptomycin))中。次日,化合物以10μM和按3倍稀释直到40nM的浓度添加到双重孔中。将盘放回到恒温箱中,维持72小时,接着根据制造商的说明,使用赛尔泰特吉奥试剂(Cell Titer Glo)(普洛麦格公司(Promega),威斯康星州麦迪逊(Madison,WI))使分析显现。
表24.
  化合物编号   EC50(μM)
  GDC-941   1-10
  II-a-36   1-10
  II-a-43   0.1-1
  II-a-49   0.1-1
  II-a-50   0.1-1
  II-a-53   0.1-1
  II-a-55   0.1-1
实例48
SK-OV-3细胞增殖分析
对于SK-OV-3增殖分析,将每孔5000个细胞接种于96孔盘中的生长培养基(DMEM、10%FBS、1%L-谷氨酰胺、1%盘尼西林/链霉素)中。次日,化合物以10μM和按3倍稀释直到40nM的浓度添加到双重孔中。将盘放回到恒温箱中,维持72小时,接着根据制造商的说明,使用赛尔泰特吉奥试剂(普洛麦格公司,威斯康星州麦迪逊)使分析显现。
表25.
  化合物编号   EC50(μM)
  GDC-941   1-10
  II-a-36   0.1-1
  II-a-43   0.1-1
  II-a-49   0.1-1
  II-a-50   0.1-1
  II-a-53   0.1-1
  II-a-55   1-10
实例49
SKOV3细胞中的GI 50 的测定
将SKOV3细胞接种于SKOV3增殖分析培养基(补充有5-10%FBS和盘尼西林/链霉素的DMEM)中,密度为科斯塔#3610白色96孔透明平底盘每孔180μl体积中含5000个细胞,且在潮湿37℃恒温箱中培育过夜。在一个单独盘中建立在10,000到50,000个细胞范围内的标准曲线,且使其粘附于盘,维持4-6小时,此时根据制造商的说明,使用赛尔泰特吉罗试剂(Cell Titer-Glow)(普洛麦格公司,威斯康星州麦迪逊)使盘显现。
次日早晨,在含有1%DMSO的增殖培养基中制备在10,000nM到40nM范围内的3倍化合物稀释液。将20μl各稀释液添加到前一天接种的SKOV3细胞中,产生1000nM到4nM的剂量反应曲线。培育所述细胞96小时,接着用赛尔泰特吉奥试剂显现。
使用在分析开始时产生的标准曲线测定在分析结束时的细胞数目。使用下式计算生长抑制,且通过在格拉夫帕德软件中绘出生长抑制%相对于化合物浓度的对数的曲线,来测定GI50
生长%=100×(T-T0)/(C-T0)
T=在分析结束时的细胞数目
T0=在分析开始时的细胞数目(5000)
C=在分析结束时的DMSO对照物中的细胞数目
生长抑制%=100-生长%
表26显示所选本发明化合物在SKOV3GI50分析中的剂量反应。活性指定为“A”的化合物提供GI50≤10nM;活性指定为“B”的化合物提供10-100nM的GI50;活性指定为“C”的化合物提供100-1000nM的GI50;且活性指定为“D”的化合物提供GI50≥1000nM。
表26.GI 50 数据
  化合物编号   GI50
  II-a-3   B
  II-a-86   B
  II-a-143   C
  II-a-144   C
  II-a-148   B
  II-a-158   C
  II-a-159   C
  II-a-160   B
  II-a-163   C
  II-g-2   C
  VII-8   C
  VII-9   C
  VII-10   B
  VII-11   C
  IX-5   B
实例50
PI3Kα共价抑制剂的体内药效评估
在维韦索斯(Vivisource)(马萨诸塞州沃尔瑟姆(Waltham,MA))进行体内实验。每日1次经腹膜内(I.P.)以100mg/Kg给与裸小鼠(每组n=3)化合物(参考化合物GDC-0941或II-a-3),连续5日。传递最后一次剂量后,在1小时、4小时、8小时和24小时时间点自经处理的动物获取脾。脾立即冷冻于液氮中。样品在-80℃下储存,直到处理成匀浆。如实例52中所述制备匀浆。如实例37中所述,检验匀浆的P-Akt表达。结果显示于图13中。
实例51
体内肿瘤生长抑制
在皮埃蒙特研究中心(Piedmont Research Center)(北卡罗莱纳州三角研究园(Research Triangle Park,NC))进行体内实验。向裸小鼠皮下植入SKOV-3肿瘤。一旦肿瘤尺寸达到约100mm3,动物就按50-100mg/Kg/QD开始接受经口传递的参考化合物GDC-941或经腹膜内传递的II-a-3。持续给药21天。每周测量肿瘤体积两次。图14显示由肿瘤生长抑制分析得到的结果,其中将II-a-3和II-a-148与GDC-941以及太平洋紫杉醇相比较。经II-a-3或GDC-941处理的小鼠中的肿瘤生长抑制显示于图14中。
实例52
体外占用率
如实例37中所述,用GDC-941或II-a-148处理SKOV-3细胞。将150μg蛋白质样品添加到0.2ml管中,且用来自蛋白质A/G盘免疫沉淀试剂盒(Protein A/G Plate IPKit)(皮尔斯生物技术公司,伊利诺伊州罗克福德)的IP缓冲液使体积达到100μl。添加1μM浓度的XIV-a-3或添加50nM的XIV-a-4,且在室温下在摇动下培育管1小时。
用200μlIP缓冲液洗涤来自蛋白质A/G盘免疫沉淀试剂盒的经蛋白质A/G涂布的孔3次。接着用每孔4μl兔抗p110α抗体#4249(细胞信号传导技术公司,马萨诸塞州丹威斯(Danvers,MA))加36μl IP缓冲液涂布所述孔。在室温下在振荡下培育1小时后,用200μl IP缓冲液洗涤所述孔5次,且将与XIV-a-3一起预先培育的蛋白质样品添加到所述孔中。在4℃下在振荡下培育所述孔过夜。
次日早晨,用200μl IP缓冲液洗涤所述孔5次。将最后一次的洗涤液静置5分钟,接着去除。用40μl皮尔斯(Pierce)洗脱缓冲液自盘稀洗脱免疫沉淀物,持续30秒,之后将洗脱液移到含有4μl皮尔斯中和缓冲液的1.5ml管中。将15μl NuPAGE LDS样品缓冲液和6μl NuPAGE样品还原剂(英杰公司,加利福尼亚州卡尔斯巴德)添加到各管中,且在70℃下培育样品5分钟。
将每孔20μl IP洗脱液装载到NuPAGE Novex 4-12%Bis-Tris凝胶(英杰公司)上,在150伏(volt)下跑胶35分钟,接着转移到硝酸纤维素膜。在水中清洗印迹1次,接着在奎提斯(Qentix)溶液1(皮尔斯生物技术公司)中培育2分钟,接着在水中清洗5次。接着在奎提斯溶液2中培育印迹10分钟,在水中清洗5次,接着在奥德赛阻断缓冲液(利-克公司)中阻断1小时。
接着在4℃下将印迹与在PBS/奥德赛缓冲液(1∶1)+0.1%吐温-20中按1∶2500稀释的兔抗p110α抗体(艾托米克公司(Epitomics),加利福尼亚州伯灵格姆(Burlingame,CA))一起培育过夜。在PBS+0.2%吐温-20中洗涤印迹3次,历时5分钟,接着在室温下与在PBS/奥德赛缓冲液(1∶1)+0.1%吐温-20中按1∶1000稀释的抗生蛋白链菌素-艾丽莎氟-680(英杰公司)和按1∶10000稀释的经荧光标记的山羊抗兔-IRDye800(利-克公司)一起培育1小时。
在PBS+0.2%吐温-20中洗涤印迹2次,历时5分钟,用蒸馏水洗涤1次,接着在奥德赛机器(利-克公司,内布拉斯加州林肯市)上扫描。使用奥德赛软件测定谱带强度,且抗生蛋白链菌素(托尔(Tool))信号相对于样品内的总p110α信号进行正规化,接着表示为未经处理的信号的百分比。结果显示于图15中。用不可逆化合物II-a-148观测剂量依赖性目标占用率。II-a-148占用p110α的EC50为约40nM,此与P-AKTSer473EC50非常一致。GDC-941是不与共价探针竞争的可逆化合物。
虽然已描述了多个本发明实施例,但显而易见,可改变基础实例以提供利用本发明化合物和方法的其它实施例。因此,应了解,本发明的范围应由所附权利要求书界定,而不是由借助于实例来说明的特定实施例界定。

Claims (415)

1.一种偶联物,其包含一种或一种以上具有半胱氨酸残基CysX的PI3激酶,其中所述CysX共价且不可逆地键接于抑制剂,以维持对所述PI3激酶的抑制,其中CysX选自PI3K-α的Cys862、MTOR的Cys2243、PI3K-α的Cys838、PI3K-γ的Cys869、PI3K-δ的Cys815、1A类PI3K-β的Cys841、2类PI3K-β的Cys1119、DNA-PK的Cys3683、ATM-激酶的Cys2770、ATM-激酶的Cys2753、PI4KA的Cys1840、PI4KA的Cys1844或PI4KA的Cys1797。
2.根据权利要求1所述的偶联物,其包含一种或一种以上具有选自以下的半胱氨酸残基的PI3激酶:
(a)PI3K-α的Cys862;或
(b)PI3Kγ的Cys869、PI3Kα的Cys838、PI3Kδ的Cys815、1类PI3Kβ的Cys841或2类PI3Kβ的Cys1119中的任一者或一者以上。
3.根据权利要求1所述的偶联物,其中所述偶联物具有式C:
CysX-修饰剂-抑制剂部分
C
其中:
所述CysX选自PI3K-α的Cys862、MTOR的Cys2243、PI3K-α的Cys838、PI3K-γ的Cys869、PI3K-δ的Cys815、1A类PI3K-β的Cys841、2类PI3K-β的Cys1119、DNA-PK的Cys3683、ATM-激酶的Cys2770、ATM-激酶的Cys2753、PI4KA的Cys1840、PI4KA的Cys1844或PI4KA的Cys1797;
所述修饰剂为由弹头基(warhead group)与所述PI3激酶的所述CysX共价键接所产生的二价基团;
所述弹头基为能够共价结合于CysX的官能团;且
所述抑制剂部分为结合所述PI3激酶的活性位点的部分。
4.根据权利要求1所述的偶联物,其中所述偶联物具有式C-1:
Cys862-修饰剂-抑制剂部分
C-1 
其中:
所述Cys862为PI3激酶的Cys862;
所述修饰剂为由弹头基与所述PI3激酶的所述Cys862共价键接所产生的二价基团;
所述弹头基为能够共价结合于Cys862的官能团;且
所述抑制剂部分为结合所述PI3激酶的活性位点的部分。
5.根据权利要求1所述的偶联物,其中所述偶联物具有式C-2:
CysX-修饰剂-抑制剂部分
C-2
其中:
所述CysX为PI3Kγ的Cys869、PI3Kα的Cys838、PI3Kδ的Cys815、1类PI3Kβ的Cys841或2类PI3Kβ的Cys1119中的任一者或一者以上;
所述修饰剂为由弹头基与所述PI3激酶的所述CysX共价键接所产生的二价基团;
所述弹头基为能够共价结合于CysX的官能团;且
所述抑制剂部分为结合所述PI3激酶的活性位点的部分。
6.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式I-i:
其中波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
环A1为任选取代的选自以下的基团:8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环B1选自苯基、3-8元饱和或部分不饱和碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-8元饱和或部分不饱和杂环、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立 地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T1为二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
q和r各自独立地为0-4;且
R2和R3各自独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
7.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式II-i:
Figure FDA0000158388010000031
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
X2为CH或N;
Y2和Z2在价数允许时独立地为CR4、C、NR5、N、O或S;
Figure FDA0000158388010000032
在价数允许时表示单键或双键;
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、 -NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R5为-R、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R或-C(O)N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。 
8.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式II-i-a或II-i-b:
Figure FDA0000158388010000051
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选 自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
9.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式II-i-c或II-i-d:
Figure FDA0000158388010000061
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环:
R4为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧 或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C2为氢或任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
10.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式II-i-e或II-i-f:
Figure FDA0000158388010000071
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R5为R、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R或-C(O)N(R)2; 
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
11.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式 II-i-g或II-i-h:
Figure FDA0000158388010000091
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地
选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环; 
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
12.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式III-i:
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
X为O或S;
R6为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R7为任选取代的C1-6脂肪族基;
R8为氢或-NHR′;
R′独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基;且
环A3为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个氮的8-10元双环杂芳基环。
13.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式IV-i: 
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
X为O或S;
R9为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R10为任选取代的C1-6脂肪族基;
R11为氢或-NHR′;且
R′独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基。
14.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式V-i-a或V-i-b:
Figure FDA0000158388010000112
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
R12为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、-(CH2)m-(3-7元饱和或部分不饱和碳环)、-(CH2)m-(7-10元饱和或部分不饱和双环碳环)、-(CH2)m-(具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环)、-(CH2)m-(具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环)、-(CH2)m-苯基、-(CH2)m-(8-10元双环芳基环)、-(CH2)m-(具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环),或-(CH2)m-(具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环); 
R13和R14各自独立地为-R″、卤素、-NO2、-CN、-OR″、-SR″、-N(R″)2、-C(O)R″、-CO2R″、-C(O)C(O)R″、-C(O)CH2C(O)R″、-S(O)R″、-S(O)2R″、-C(O)N(R″)2、-SO2N(R″)2、-OC(O)R″、-N(R″)C(O)R″、-N(R″)N(R″)2、-N(R″)C(=NR″)N(R″)2、-C(=NR″)N(R″)2、-C=NOR″、-N(R″)C(O)N(R″)2、-N(R″)SO2N(R″)2、-N(R″)SO2R″或-OC(O)N(R″)2
R″各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个R″基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
m为0到6且包括0和6的整数;
n各自独立地为0、1或2;
环A5为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环B5不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
15.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式 VI-i-a或VI-i-b:
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
R15为氢或C1-6烷基;
R16为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6烷基、C1-6烷氧基或(C1-6亚烷基)-R18;或
R15和R16连同插入的碳一起形成任选取代的选自以下的环:3-7元碳环或具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环;
R17为氢或C1-6烷基;
R18为3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且环A6不存在,或为任选取代的选自以下的基团:具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。
16.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式VII-i: 
Figure FDA0000158388010000141
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
环A7为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R18为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B7为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T7为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C7为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或 硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环D7不存在,或为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
17.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式VIII-i:
Figure FDA0000158388010000151
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
环A8为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R19和R20独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B8为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独 立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T8为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;环C8为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环D8不存在,或为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
18.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式IX-i.
Figure FDA0000158388010000161
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
T9为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个 
以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环A9不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R24和R25独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;且
z为0、1或2。
19.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式X-i:
Figure FDA0000158388010000171
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
R21和R22各自独立地为-R″、卤素、-NO2、-CN、-OR″、-SR″、-N(R″)2、-C(O)R″、-CO2R″、-C(O)C(O)R″、-C(O)CH2C(O)R″、-S(O)R″、-S(O)2R″、-C(O)N(R″)2、 -SO2N(R″)2、-OC(O)R″、-N(R″)C(O)R″、-N(R″)N(R″)2、-N(R″)C(=NR″)N(R″)2、-C(=NR″)N(R″)2、-C=NOR″、-N(R″)C(O)N(R″)2、-N(R″)SO2N(R″)2、-N(R″)SO2R″或-OC(O)N(R″)2
R″各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个R″基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
k各自独立地为0、1或2;
环A10为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环B10为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T10为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C10不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和 碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
20.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式XI-i:
Figure FDA0000158388010000191
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
X11为CH或N;
环A11为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R23各自独立地为-Ra、卤素、-NO2、-CN、-ORb、-SRb、-N(Rb)2、-C(O)Ra、-CO2Ra、-C(O)C(O)Ra、-C(O)CH2C(O)Ra、-S(O)Ra、-S(O)2Ra、-C(O)N(Ra)2、-SO2N(Ra)2、-OC(O)Ra、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)N(Ra)2、-N(Ra)C(=NRa)N(Ra)2、-C(=NRa)N(Ra)2、-C=NORa、-N(Ra)C(O)N(Ra)2、-N(Ra)SO2N(Ra)2、-N(Ra)SO2Ra或-OC(O)N(Ra)2
Ra各自独立地为氢、C1-6脂肪族基、苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10 元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个Ra基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
Rb各自独立地为氢、C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环;或
同一氮上的两个Rb基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
w为0、1或2;
环B11为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T11为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C11不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫 的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
21.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述抑制剂部分具有式XII-i:
Figure FDA0000158388010000211
其中所述波状键指示经由所述修饰剂连接于所述半胱氨酸的连接点;
R1为弹头基;
X12为CR26或N;
Y12为CR27或N;
Z12为CR28或N;
其中X12、Y12和Z12中至少一者为N;
环A12为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R26、R27和R28独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B12为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T12为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T12的一个或一 个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;环C12不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接或螺双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T13为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T13的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D12不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
22.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中偶联于CysX的氢硫基的所述修饰剂选自: 
Figure FDA0000158388010000231
23.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中所述弹头基为式-L-Y的基团,其中:
L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换; 
Y为氢;任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-10元单环或双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,且其中所述环经1-4个Re基团取代;且
Re各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基,或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,其中:
Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一个或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且
Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
24.根据权利要求23所述的偶联物,其中:
L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且
Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
25.根据权利要求24所述的偶联物,其中L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-置换,且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。
26.根据权利要求24所述的偶联物,其中L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-OC(O)-置换。
27.根据权利要求23所述的偶联物,其中L为-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)(C=N2)-、-NRC(O)(C=N2)C(O)-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-NRC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NRC(O)-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-CH2CH2NRC(O)-或-CH2NRC(O)亚环丙基-;其中R为H或任选取代的C1-6脂肪族基;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的 C1-6脂肪族基。
28.根据权利要求27所述的偶联物,其中L为-NHC(O)CH=CH-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)(C=N2)-、-NHC(O)(C=N2)C(O)-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-NHC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NHC(O)-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-CH2CH2NHC(O)-或-CH2NHC(O)亚环丙基-。
29.根据权利要求23所述的偶联物,其中L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个亚烷基双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。
30.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中R1为-L-Y,其中:
L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个三键且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,
Y为氢;任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-10元单环或双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,且其中所述环经1-4个Re基团取代;且
Re各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基,或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,其中:
Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一个或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且
Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
31.根据权利要求30所述的偶联物,其中Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。 
32.根据权利要求31所述的偶联物,其中L为-C≡C-、-C≡CCH2N(异丙基)-、-NHC(O)C≡CCH2CH2-、-CH2-C≡C-CH2-、-C≡CCH2O-、-CH2C(O)C≡C-、-C(O)C≡C-或-CH2OC(=O)C≡C-。
33.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中R1为-L-Y,其中:
L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L的一个亚甲基单元经亚环丙基置换且L的一个或两个其它亚甲基单元独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换;
Y为氢;任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基;或具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-10元单环或双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,且其中所述环经1-4个Re基团取代;且
Re各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基,或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,其中:
Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一个或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且
Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
34.根据权利要求33所述的偶联物,其中Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
35.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中R1为-L-Y,其中:
L为共价键、-C(O)-、-N(R)C(O)-,或二价C1-8饱和或不饱和直链或具支链烃链;且
Y选自以下(i)到(xvii):
(i)经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6烷基;
(ii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6烯基;或
(iii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6炔基;或
(iv)具有1个选自氧或氮的杂原子的饱和3-4元杂环,其中所述环经1-2个Re基团取代;或
(v)具有1-2个选自氧或氮的杂原子的饱和5-6元杂环,其中所述环经1-4个Re 基团取代;或
Figure FDA0000158388010000291
其中R、Q、Z各自;或
(vii)饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代;或
(viii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和3-6元单环,其中所述环经1-4个Re基团取代;或
(ix)部分不饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代;
Figure FDA0000158388010000292
(xi)具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和4-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代;或
(xiii)具有0-2个氮的6元芳香族环,其中所述环经1-4个Re基团取代;或
Figure FDA0000158388010000294
其中Re各自如上文所定义及本文所述;或
(xv)具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环,其中所述环经1-3个Re基团取代;或
Figure FDA0000158388010000295
(xvii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代。
36.根据权利要求35所述的偶联物,其中L为共价键、-CH2-、-NH-、-C(O)-、-CH2NH-、-NHCH2-、-NHC(O)-、-NHC(O)CH2OC(O)-、-CH2NHC(O)-、-NHSO2-、-NHSO2CH2-、-NHC(O)CH2OC(O)-或-SO2NH-。
37.根据权利要求36所述的偶联物,其中L为共价键。
38.根据权利要求35所述的偶联物,其中Y选自:
Figure FDA0000158388010000301
Figure FDA0000158388010000321
其中Re各自独立地选自适合离去基、氧代基、CN或NO2。 
39.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中R1为-L-Y,其中:L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L的两个或三个亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且
Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
40.根据权利要求39所述的偶联物,其中R1为-C(O)CH2CH2C(O)CH=C(CH3)2、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CH(环丙基)、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH2CH3、-C(O)CH2CH2C(O)C(=CH2)CH3、-C(O)CH2NHC(O)CH=CH2、-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3、-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)C(=CH2)CH3、-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=C(CH3)2、-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3、-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CH2、-C(O)(CH2)3NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3或-C(O)(CH2)3NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CH2
41.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中R1的长度为6-12个原子。
42.根据权利要求41所述的偶联物,其中R1的长度为至少8个原子。
43.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中R1选自: 
Figure FDA0000158388010000341
Figure FDA0000158388010000351
Figure FDA0000158388010000361
Figure FDA0000158388010000371
Figure FDA0000158388010000381
Figure FDA0000158388010000391
Figure FDA0000158388010000401
其中Re各自独立地为适合离去基、NO2、CN或氧代基。
44.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中R1选自:
Figure FDA0000158388010000402
Figure FDA0000158388010000411
Figure FDA0000158388010000421
45.根据权利要求2到5中任一权利要求所述的偶联物,其中R1选自:
Figure FDA0000158388010000422
Figure FDA0000158388010000431
46.一种式I化合物,
或其医药学上可接受的盐,其中:
环A1为任选取代的选自以下的基团:8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环B1选自苯基、3-8元饱和或部分不饱和碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R1为弹头基;
T1为二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧 或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
q和各自独立地为0-4;且
R2和R3各自独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
47.根据权利要求46所述的化合物,其中环A1为任选取代的选自以下的基团:8-10元双环芳基环或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
48.根据权利要求47所述的化合物,其中环A1为任选取代的具有2-4个氮原子的8-10元双环杂芳基环。
49.根据权利要求48所述的化合物,其中环A1为9H-嘌呤基。
50.根据权利要求46所述的化合物,其中环B1为任选取代的选自以下的基团:苯基、3-8元饱和或部分不饱和碳环,或具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环。
51.根据权利要求50所述的化合物,其中环B1为任选取代的苯基。
52.根据权利要求46所述的化合物,其中T1为二价具支链C1-6烃链,其中T1的一个或一个以上亚甲基单元经-O-、-S-或-N(R)-置换。
53.根据权利要求46所述的化合物,其中T1为二价直链C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元经-O-、-S-或-N(R)置换。
54.根据权利要求46所述的化合物,其中所述化合物为以下一者: 
Figure FDA0000158388010000451
55.一种式II-a或II-b的化合物,
Figure FDA0000158388010000452
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2; 
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
56.根据权利要求55所述的化合物,其中环B2为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、 氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
57.根据权利要求56所述的化合物,其中环B2为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。
58.根据权利要求57所述的化合物,其中环B2为1H-吲唑基。
59.根据权利要求55所述的化合物,其中环B2为任选取代的苯基。
60.根据权利要求59所述的化合物,其中环B2为苯酚。
61.根据权利要求55所述的化合物,其中环B2为任选取代的吡啶基或嘧啶基。
62.根据权利要求55所述的化合物,其中环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。
63.根据权利要求62所述的化合物,其中环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。
64.根据权利要求63所述的化合物,其中环A2为任选取代的吗啉基。
65.根据权利要求64所述的化合物,其中环A2为未取代的吗啉基。
66.根据权利要求64所述的化合物,其中环A2选自以下:
Figure FDA0000158388010000471
Figure FDA0000158388010000481
67.根据权利要求55所述的化合物,其中环A2为桥接双环N-吗啉基。
68.根据权利要求65所述的化合物,其中环A2选自:
Figure FDA0000158388010000482
69.根据权利要求55所述的化合物,其中环A2选自:
Figure FDA0000158388010000483
70.根据权利要求55所述的化合物,其中T2为二价直链饱和C1-6烃链。
71.根据权利要求70所述的化合物,其中T2为二价直链饱和C1-3烃链。
72.根据权利要求71所述的化合物,其中T2为-CH2-。
73.根据权利要求55所述的化合物,其中T2为共价键。
74.根据权利要求55所述的化合物,其中T2为二价直链不饱和C1-6烃链。 
75.根据权利要求74所述的化合物,其中T2为二价直链不饱和C1-3烃链。
76.根据权利要求75所述的化合物,其中T2为-C≡C-或-CH2C≡C-。
77.根据权利要求55所述的化合物,其中T2为-C(O)-。
78.根据权利要求55所述的化合物,其中T2为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
79.根据权利要求78所述的化合物,其中T2为C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
80.根据权利要求55所述的化合物,其中环C1为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。
81.根据权利要求80所述的化合物,其中环C1为哌嗪环。
82.根据权利要求80所述的化合物,其中环C1为哌啶环。
83.根据权利要求55所述的化合物,其中环C1为四氢吡啶环。
84.根据权利要求55所述的化合物,其中环C1为苯环。
85.根据权利要求55所述的化合物,其中环C1为环己基环。
86.根据权利要求55所述的化合物,其中T3为二价直链饱和C1-6烃链。
87.根据权利要求86所述的化合物,其中T3为二价直链饱和C1-3烃链。
88.根据权利要求87所述的化合物,其中T3为-CH2-或-CH2CH2-。
89.根据权利要求55所述的化合物,其中T3为-C(O)-。 
90.根据权利要求55所述的化合物,其中T3为共价键。
91.根据权利要求55所述的化合物,其中环D2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。
92.根据权利要求91所述的化合物,其中环D2为哌啶基或哌嗪基。
93.根据权利要求91所述的化合物,其中环D2为四氢吡啶基。
94.根据权利要求55所述的化合物,其中环D2为苯基。
95.根据权利要求55所述的化合物,其中环D2不存在。
96.根据权利要求55所述的化合物,其中 选自
Figure FDA0000158388010000502
97.根据权利要求96所述的化合物,其中 
Figure FDA0000158388010000503
包含具有约9到约11个原子的间隔基。
98.根据权利要求55所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a)环A2为任选取代的吗啉基;
b)环B2为任选取代的选自吲唑基、氨基嘧啶基或苯酚的基团;
Figure FDA0000158388010000504
或 
Figure FDA0000158388010000505
Figure FDA0000158388010000506
包含具有约9到约11个原子的间隔基。 
99.根据权利要求55所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a)环A2为任选取代的吗啉基;
b)环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
c)T2为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d)环C1为苯基,或任选取代的具有1-2个氮的6元饱和环、部分不饱和环或芳香族杂环;
e)T3为共价键或-C(O)-;和
f)环D2不存在,或为苯基。
100.根据权利要求55所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a)环A2为任选取代的吗啉基;
b)环B2为任选取代的选自吲唑基、苯酚或氨基嘧啶的基团:;
c)T2为共价键、亚甲基或C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d)环C1为苯基、哌嗪基、哌啶基或四氢吡啶基;
e)T3为共价键或-C(O)-;和
f)环D2不存在,或为苯基。
101.根据权利要求55所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010000511
Figure FDA0000158388010000521
Figure FDA0000158388010000531
Figure FDA0000158388010000541
Figure FDA0000158388010000561
Figure FDA0000158388010000581
Figure FDA0000158388010000591
Figure FDA0000158388010000601
Figure FDA0000158388010000621
Figure FDA0000158388010000631
Figure FDA0000158388010000641
Figure FDA0000158388010000651
Figure FDA0000158388010000661
Figure FDA0000158388010000671
Figure FDA0000158388010000681
Figure FDA0000158388010000701
Figure FDA0000158388010000711
Figure FDA0000158388010000721
Figure FDA0000158388010000731
Figure FDA0000158388010000741
Figure FDA0000158388010000751
Figure FDA0000158388010000761
Figure FDA0000158388010000771
Figure FDA0000158388010000781
Figure FDA0000158388010000791
Figure FDA0000158388010000801
Figure FDA0000158388010000811
102.根据权利要求101所述的化合物,其选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010000812
Figure FDA0000158388010000831
103.一种式II-c或II-d的化合物,
Figure FDA0000158388010000841
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环;
R4为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C2为氢或任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱 和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
104.根据权利要求103所述的化合物,其中环B2为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
105.根据权利要求104所述的化合物,其中环B2为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。
106.根据权利要求105所述的化合物,其中环B2为1H-吲唑基。
107.根据权利要求103所述的化合物,其中环B2为任选取代的苯基。
108.根据权利要求107所述的化合物,其中环B2为苯酚。
109.根据权利要求103所述的化合物,其中环B2为任选取代的吡啶基或嘧啶基。
110.根据权利要求103所述的化合物,其中环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。
111.根据权利要求110所述的化合物,其中环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。
112.根据权利要求111所述的化合物,其中环A2为任选取代的吗啉基。
113.根据权利要求112所述的化合物,其中环A2为未取代的吗啉基。
114.根据权利要求112所述的化合物,其中环A2选自:
Figure FDA0000158388010000861
115.根据权利要求103所述的化合物,其中环A2为桥接双环N-吗啉基。
116.根据权利要求115所述的化合物,其中环A2选自:
Figure FDA0000158388010000862
117.根据权利要求103所述的化合物,其中环A2选自:
118.根据权利要求103所述的化合物,其中T2为二价直链饱和C1-6烃链。
119.根据权利要求118所述的化合物,其中T2为二价直链饱和C1-3烃链。
120.根据权利要求119所述的化合物,其中T2为-CH2-。 
121.根据权利要求103所述的化合物,其中T2为共价键。
122.根据权利要求103所述的化合物,其中T2为二价直链不饱和C1-6烃链。
123.根据权利要求122所述的化合物,其中T2为二价直链不饱和C1-3烃链。
124.根据权利要求123所述的化合物,其中T2为-C≡C-。
125.根据权利要求103所述的化合物,其中环C2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。
126.根据权利要求125所述的化合物,其中环C2为哌嗪环。
127.根据权利要求125所述的化合物,其中环C2为哌啶环。
128.根据权利要求103所述的化合物,其中环C2为四氢吡啶环。
129.根据权利要求103所述的化合物,其中环C2为苯环。
130.根据权利要求103所述的化合物,其中环C2为环己基环。
131.根据权利要求103所述的化合物,其中环C2为氢。
132.根据权利要求103所述的化合物,其中T2为共价键且环C2为氢。
133.根据权利要求103所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010000871
134.一种式II-e或II-f的化合物,
Figure FDA0000158388010000882
II-e    II-f
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R5为R、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R或-C(O)N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳 环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
135.根据权利要求134所述的化合物,其中环B2为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
136.根据权利要求135所述的化合物,其中环B2为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。
137.根据权利要求136所述的化合物,其中环B2为1H-吲唑基。
138.根据权利要求134所述的化合物,其中环B2为任选取代的苯基。
139.根据权利要求138所述的化合物,其中环B2为苯酚。
140.根据权利要求134所述的化合物,其中环B2为吡啶基。
141.根据权利要求134所述的化合物,其中环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。
142.根据权利要求141所述的化合物,其中环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。
143.根据权利要求142所述的化合物,其中环A2为任选取代的吗啉基。
144.根据权利要求143所述的化合物,其中环A2为未取代的吗啉基。
145.根据权利要求143所述的化合物,其中环A2选自: 
146.根据权利要求134所述的化合物,其中环A2为桥接双环N-吗啉基。
147.根据权利要求146所述的化合物,其中环A2选自:
Figure FDA0000158388010000912
148.根据权利要求134所述的化合物,其中环A2选自:
Figure FDA0000158388010000913
149.根据权利要求134所述的化合物,其中T2为二价直链饱和C1-6烃链。 
150.根据权利要求149所述的化合物,其中T2为二价直链饱和C1-3烃链。
151.根据权利要求150所述的化合物,其中T2为-CH2-。
152.根据权利要求134所述的化合物,其中T2为共价键。
153.根据权利要求134所述的化合物,其中T2为二价直链不饱和C1-6烃链。
154.根据权利要求153所述的化合物,其中T2为二价直链不饱和C1-3烃链。
155.根据权利要求154所述的化合物,其中T2为-C≡C-或-CH2C≡C-。
156.根据权利要求134所述的化合物,其中T2为-C(O)-。
157.根据权利要求134所述的化合物,其中T2为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
158.根据权利要求157所述的化合物,其中T2为C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
159.根据权利要求134所述的化合物,其中环C1为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。
160.根据权利要求159所述的化合物,其中环C1为哌嗪环。
161.根据权利要求159所述的化合物,其中环C1为哌啶环。
162.根据权利要求134所述的化合物,其中环C1为四氢吡啶环。
163.根据权利要求134所述的化合物,其中环C1为苯环。
164.根据权利要求134所述的化合物,其中环C1为环己基环。 
165.根据权利要求134所述的化合物,其中T3为二价直链饱和C1-6烃链。
166.根据权利要求165所述的化合物,其中T3为二价直链饱和C1-3烃链。
167.根据权利要求6所述的化合物,其中T3为-CH2-或-CH2CH2-。
168.根据权利要求134所述的化合物,其中T3为-C(O)-。
169.根据权利要求134所述的化合物,其中T3为共价键。
170.根据权利要求134所述的化合物,其中环D2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。
171.根据权利要求170所述的化合物,其中环D2为哌啶基或哌嗪基。
172.根据权利要求170所述的化合物,其中环D2为四氢吡啶基。
173.根据权利要求134所述的化合物,其中环D2为苯基。
174.根据权利要求134所述的化合物,其中环D2不存在。
175.根据权利要求134所述的化合物,其中 
Figure FDA0000158388010000931
选自 
Figure FDA0000158388010000932
176.根据权利要求175所述的化合物,其中 
Figure FDA0000158388010000933
包含具有约9到约11个原子的间隔基。
177.一种式II-g或II-h的化合物, 
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地
选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环; 
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
178.根据权利要求177所述的化合物,其中环B2为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
179.根据权利要求178所述的化合物,其中环B2为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。
180.根据权利要求179所述的化合物,其中环B2为1H-吲唑基。
181.根据权利要求177所述的化合物,其中环B2为任选取代的苯基。
182.根据权利要求181所述的化合物,其中环B2为苯酚。
183.根据权利要求177所述的化合物,其中环B2为任选取代的吡啶基或嘧啶基。
184.根据权利要求177所述的化合物,其中环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。
185.根据权利要求184所述的化合物,其中环A2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。 
186.根据权利要求185所述的化合物,其中环A2为任选取代的吗啉基。
187.根据权利要求186所述的化合物,其中环A2为未取代的吗啉基。
188.根据权利要求186所述的化合物,其中环A2选自以下:
Figure FDA0000158388010000961
189.根据权利要求177所述的化合物,其中环A2为桥接双环N-吗啉基。
190.根据权利要求189所述的化合物,其中环A2选自:
Figure FDA0000158388010000962
191.根据权利要求177所述的化合物,其中环A2选自: 
Figure FDA0000158388010000971
192.根据权利要求177所述的化合物,其中T2为二价直链饱和C1-6烃链。
193.根据权利要求192所述的化合物,其中T2为二价直链饱和C1-3烃链。
194.根据权利要求193所述的化合物,其中T2为-CH2-。
195.根据权利要求177所述的化合物,其中T2为共价键。
196.根据权利要求177所述的化合物,其中T2为二价直链不饱和C1-6烃链。
197.根据权利要求196所述的化合物,其中T2为二价直链不饱和C1-3烃链。
198.根据权利要求197所述的化合物,其中T2为-C≡C-或-CH2C≡C-。
199.根据权利要求177所述的化合物,其中T2为-C(O)-。
200.根据权利要求177所述的化合物,其中T2为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
201.根据权利要求200所述的化合物,其中T2为C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
202.根据权利要求177所述的化合物,其中环C1为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。
203.根据权利要求202所述的化合物,其中环C1为哌嗪环。 
204.根据权利要求202所述的化合物,其中环C1为哌啶环。
205.根据权利要求177所述的化合物,其中环C1为四氢吡啶环。
206.根据权利要求177所述的化合物,其中环C1为苯环。
207.根据权利要求177所述的化合物,其中环C1为环己基环。
208.根据权利要求177所述的化合物,其中T3为二价直链饱和C1-6烃链。
209.根据权利要求208所述的化合物,其中T3为二价直链饱和C1-3烃链。
210.根据权利要求209所述的化合物,其中T3为-CH2-或-CH2CH2-。
211.根据权利要求177所述的化合物,其中T3为-C(O)-。
212.根据权利要求177所述的化合物,其中T3为共价键。
213.根据权利要求177所述的化合物,其中环D2为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。
214.根据权利要求212所述的化合物,其中环D2为哌啶基或哌嗪基。
215.根据权利要求212所述的化合物,其中环D2为四氢吡啶基。
216.根据权利要求177所述的化合物,其中环D2为苯基。
217.根据权利要求177所述的化合物,其中环D2不存在。
218.根据权利要求177所述的化合物,其中 
Figure FDA0000158388010000981
选自 
Figure FDA0000158388010000991
219.根据权利要求218所述的化合物,其中 
Figure FDA0000158388010000992
包含具有约9到约11个原子的间隔基。
220.根据权利要求177所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a)环A2为任选取代的吗啉基;
b)环B2为任选取代的选自吲唑基、氨基嘧啶基或苯酚的基团;
Figure FDA0000158388010000993
为 
Figure FDA0000158388010000994
Figure FDA0000158388010000995
Figure FDA0000158388010000996
包含具有约9到约11个原子的间隔基。
221.根据权利要求177所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a)环A2为任选取代的吗啉基;
b)环B2为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
c)T2为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d)环C1为苯基,或任选取代的具有1-2个氮的6元饱和环、部分不饱和环或芳香族杂环;
e)T3为共价键或-C(O)-;和
f)环D2不存在,或为苯基。
222.根据权利要求177所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a)环A2为任选取代的吗啉基; 
b)环B2为任选取代的选自吲唑基、苯酚或氨基嘧啶的基团;
c)T2为共价键、亚甲基或C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d)环C1为苯基、哌嗪基、哌啶基或四氢吡啶基;
e)T3为共价键或-C(O)-;和
f)环D2不存在,或为苯基。
223.根据权利要求55所述的化合物,其中所述间隔基长度为约7个原子到约13个原子。
224.根据权利要求223所述的化合物,其中所述间隔基长度为约8个原子到约12个原子。
225.根据权利要求224所述的化合物,其中所述间隔基长度为约9个原子到约11个原子。
226.根据权利要求177所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010001001
Figure FDA0000158388010001011
227.一种式III化合物, 
Figure FDA0000158388010001021
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
X为O或S;
R6为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R7为任选取代的C1-6脂肪族基;
R8为氢或-NHR′;
R′独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基;且
环A3为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个氮的8-10元双环杂芳基环。
228.根据权利要求227所述的化合物,其中所述化合物具有式III-a、III-b或III-c:
Figure FDA0000158388010001022
229.根据权利要求227所述的化合物,其中X为O。
230.根据权利要求229所述的化合物,其中R6为任选取代的苯基。
231.根据权利要求230所述的化合物,其中R7为C1-3烷基。
232.根据权利要求231所述的化合物,其中R8为氢。
233.根据权利要求227所述的化合物,其中环A3为苯基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、 萘基或喹啉基。
234.根据权利要求227所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010001031
Figure FDA0000158388010001041
235.一种式IV化合物,
Figure FDA0000158388010001052
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
X为O或S;
R9为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R10为任选取代的C1-6脂肪族基;
R11为氢或-NHR′;且
R′独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基。 
236.根据权利要求235所述的化合物,其中X为O。
237.根据权利要求236所述的化合物,其中R2为任选取代的苯基。
238.根据权利要求237所述的化合物,其中R3为C1-3烷基。
239.根据权利要求238所述的化合物,其中R4为氢。
240.一种式V-a或V-b的化合物,
Figure FDA0000158388010001061
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
R12为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、-(CH2)m-(3-7元饱和或部分不饱和碳环)、-(CH2)m-(7-10元饱和或部分不饱和双环碳环)、-(CH2)m-(具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环)、-(CH2)m-(具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环)、-(CH2)m-苯基、-(CH2)m-(8-10元双环芳基环)、-(CH2)m-(具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环),或-(CH2)m-(具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环);
R13和R14各自独立地为-R″、卤素、-NO2、-CN、-OR″、-SR″、-N(R″)2、-C(O)R″、-CO2R″、-C(O)C(O)R″、-C(O)CH2C(O)R″、-S(O)R″、-S(O)2R″、-C(O)N(R″)2、-SO2N(R″)2、-OC(O)R″、-N(R″)C(O)R″、-N(R″)N(R″)2、-N(R″)C(=NR″)N(R″)2、-C(=NR″)N(R″)2、-C=NOR″、-N(R″)C(O)N(R″)2、-N(R″)SO2N(R″)2、-N(R″)SO2R″或-OC(O)N(R″)2; 
R″各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个R″基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
m为0到6且包括0和6的整数;
n各自独立地为0、1或2;
环A5为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环B5不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
241.根据权利要求240所述的化合物,其中R12为氢。
242.根据权利要求240所述的化合物,其中R12为任选取代的苯基。
243.根据权利要求240所述的化合物,其中R12为卤苯基。 
244.根据权利要求240所述的化合物,其中R12为二氯苯基。
245.根据权利要求240所述的化合物,其中n为0。
246.根据权利要求240所述的化合物,其中环A5为哌啶。
247.根据权利要求240所述的化合物,其中环A5为哌嗪。
248.根据权利要求240所述的化合物,其中环A5为吡啶基、嘧啶基、吡嗪基或哒嗪基。
249.根据权利要求240所述的化合物,其中环B5为哌嗪基。
250.根据权利要求240所述的化合物,其中环B5为环己基。
251.根据权利要求240所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010001081
Figure FDA0000158388010001091
Figure FDA0000158388010001101
Figure FDA0000158388010001111
Figure FDA0000158388010001121
252.一种式VI-a或VI-b的化合物,
Figure FDA0000158388010001122
VI-a    VI-b
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
R15为氢或C1-6烷基;
R16为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6烷基、C1-6烷氧基或(C1-6亚烷基)-R18;或
R15和R16连同插入的碳一起形成任选取代的选自以下的环:3-7元碳环或具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环;
R17为氢或C1-6烷基;
R18为3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环A6不存在,或为任选取代的选自以下的基团:具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环。
253.根据权利要求252所述的化合物,其中R15为甲基。
254.根据权利要求252所述的化合物,其中R16为甲基。
255.根据权利要求252所述的化合物,其中R17为氢。
256.根据权利要求252所述的化合物,其中环A6为具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环。
257.根据权利要求256所述的化合物,其中环A6为吡唑基。
258.根据权利要求252所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组: 
Figure FDA0000158388010001141
Figure FDA0000158388010001151
Figure FDA0000158388010001161
Figure FDA0000158388010001171
259.一种式VII化合物, 
Figure FDA0000158388010001181
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A7为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R18为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B7为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T7为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C7为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或 部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环D7不存在,或为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
260.根据权利要求259所述的化合物,其中环A7为吗啉基。
261.根据权利要求259所述的化合物,其中环B7为任选取代的苯基。
262.根据权利要求261所述的化合物,其中环B7为经-NHCO2CH3、-NHCONHCH2CH3、-NHCONHCH2CH2F、-NHCONHCH(CH3)2、-NHCONH(3-吡啶基)或-NHCONH(4-吡啶基)取代的苯基。
263.根据权利要求261所述的化合物,其中环B7
Figure FDA0000158388010001191
264.根据权利要求259所述的化合物,其中环C7为哌啶基。
265.根据权利要求259所述的化合物,其中T7选自共价键、-CH2-、-C(O)-或-CH2C(O)-。
266.根据权利要求259所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组: 
Figure FDA0000158388010001201
Figure FDA0000158388010001211
Figure FDA0000158388010001221
267.根据权利要求259所述的化合物,其中所述化合物为:
Figure FDA0000158388010001222
268.一种式VIII化合物,
Figure FDA0000158388010001223
VIII
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
环A8为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R19和R20独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B8为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T8为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C8为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环D8不存在,或为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元 饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
269.根据权利要求268所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010001241
270.一种式IX化合物,
Figure FDA0000158388010001251
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
T9为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;环A9不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R24和R25独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;且
z为0、1或2。
271.根据权利要求270所述的化合物,其中所述化合物具有式IX-a, 
272.根据权利要求271所述的化合物,其中R为吡啶基。
273.根据权利要求270所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010001262
274.一种式X化合物,
Figure FDA0000158388010001272
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
R21和R22各自独立地为-R″、卤素、-NO2、-CN、-OR″、-SR″、-N(R″)2、-C(O)R″、-CO2R″、-C(O)C(O)R″、-C(O)CH2C(O)R″、-S(O)R″、-S(O)2R″、-C(O)N(R″)2、-SO2N(R″)2、-OC(O)R″、-N(R″)C(O)R″、-N(R″)N(R″)2、-N(R″)C(=NR″)N(R″)2、-C(=NR″)N(R″)2、-C=NOR″、-N(R″)C(O)N(R″)2、-N(R″)SO2N(R″)2、-N(R″)SO2R″或-OC(O)N(R″)2
R″各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地 选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个R″基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
k各自独立地为0、1或2;
环A10为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环B10为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T10为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C10不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
275.根据权利要求274所述的化合物,其中环A10为任选取代的具有1-2个氮的6元杂 芳基环。
276.根据权利要求275所述的化合物,其中环A10为吡啶基。
277.根据权利要求274所述的化合物,其中所述化合物为:
Figure FDA0000158388010001291
278.一种式XI化合物,
Figure FDA0000158388010001292
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
X11为CH或N;
环A11为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元 饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R23各自独立地为-Ra、卤素、-NO2、-CN、-ORb、-SRb、-N(Rb)2、-C(O)Ra、-CO2Ra、-C(O)C(O)Ra、-C(O)CH2C(O)Ra、-S(O)Ra、-S(O)2Ra、-C(O)N(Ra)2、-SO2N(Ra)2、-OC(O)Ra、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)N(Ra)2、-N(Ra)C(=NRa)N(Ra)2、-C(=NRa)N(Ra)2、-C=NORa、-N(Ra)C(O)N(Ra)2、-N(Ra)SO2N(Ra)2、-N(Ra)SO2Ra或-OC(O)N(Ra)2
Ra各自独立地为氢、C1-6脂肪族基、苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个Ra基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
Rb各自独立地为氢、C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环;或
同一氮上的两个Rb基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
w为0、1或2;
环B11为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T11为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、 -N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C11不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
279.根据权利要求278所述的化合物,其中环A11为经1或2个R23基团取代的苯基。
280.根据权利要求279所述的化合物,其中环A11为二甲氧基苯基。
281.根据权利要求278所述的化合物,其中X11为N。
282.根据权利要求278所述的化合物,其中环B11为哌啶基。
283.根据权利要求278所述的化合物,其中环C11不存在,或为苯基。
284.根据权利要求278所述的化合物,其中T11为共价键或-C(O)-。
285.根据权利要求278所述的化合物,其中所述化合物选自: 
Figure FDA0000158388010001321
Figure FDA0000158388010001331
286.一种式XII化合物,
或其医药学上可接受的盐,其中:
R1为弹头基;
X12为CR26或N;
Y12为CR27或N;
Z12为CR28或N;
其中X12、Y12和Z12中至少一者为N;
环A12为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R26、R27和R28独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、 -CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B12为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T12为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T12的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C12不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接或螺双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T13为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T13的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D12不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。 
287.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-a:
Figure FDA0000158388010001351
288.根据权利要求287所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-a-i:
Figure FDA0000158388010001352
289.根据权利要求287所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-a-ii:
Figure FDA0000158388010001353
290.根据权利要求287所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-a-iii:
Figure FDA0000158388010001354
XII-a-iii。
291.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-b:
292.根据权利要求291所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-b-i:
Figure FDA0000158388010001362
293.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-c或XII-d:
Figure FDA0000158388010001363
294.根据权利要求293所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-c-i或XII-d-i: 
295.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-e:
Figure FDA0000158388010001372
296.根据权利要求295所述的化合物,其中所述化合物具有式XII-e-i:
Figure FDA0000158388010001373
297.根据权利要求286所述的化合物,其中环B12为任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环。
298.根据权利要求297所述的化合物,其中环B12为任选取代的具有2个氮原子的8-10元双环杂芳基环。
299.根据权利要求298所述的化合物,其中环B12为1H-吲唑基。 
300.根据权利要求286所述的化合物,其中环B12为任选取代的苯基。
301.根据权利要求300所述的化合物,其中环B12为苯酚。
302.根据权利要求286所述的化合物,其中环B12为任选取代的吡啶基或嘧啶基。
303.根据权利要求286所述的化合物,其中环A12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和或部分不饱和杂环。
304.根据权利要求303所述的化合物,其中环A12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。
305.根据权利要求304所述的化合物,其中环A12为任选取代的吗啉基。
306.根据权利要求305所述的化合物,其中环A12为未取代的吗啉基。
307.根据权利要求305所述的化合物,其中环A12选自以下:
Figure FDA0000158388010001391
308.根据权利要求286所述的化合物,其中环A12为桥接双环N-吗啉基。
309.根据权利要求308所述的化合物,其中环A12选自:
Figure FDA0000158388010001392
310.根据权利要求286所述的化合物,其中环A12选自:
Figure FDA0000158388010001393
311.根据权利要求286所述的化合物,其中T12为二价直链饱和C1-6烃链。
312.根据权利要求311所述的化合物,其中T12为二价直链饱和C1-3烃链。
313.根据权利要求312所述的化合物,其中T12为-CH2-。
314.根据权利要求286所述的化合物,其中T12为共价键。
315.根据权利要求286所述的化合物,其中T12为二价直链不饱和C1-6烃链。
316.根据权利要求315所述的化合物,其中T12为二价直链不饱和C1-3烃链。
317.根据权利要求316所述的化合物,其中T12为-C≡C-或-CH2C≡C-。 
318.根据权利要求286所述的化合物,其中T12为-C(O)-。
319.根据权利要求286所述的化合物,其中T12为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T12的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
320.根据权利要求319所述的化合物,其中T12为C3烃链,其中T2的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换。
321.根据权利要求286所述的化合物,其中环C12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和杂环。
322.根据权利要求321所述的化合物,其中环C12为哌嗪环。
323.根据权利要求321所述的化合物,其中环C12为哌啶环。
324.根据权利要求286所述的化合物,其中环C12为四氢吡啶环。
325.根据权利要求286所述的化合物,其中环C12为苯环。
326.根据权利要求286所述的化合物,其中环C12为环己基环。
327.根据权利要求286所述的化合物,其中T13为二价直链饱和C1-6烃链。
328.根据权利要求327所述的化合物,其中T13为二价直链饱和C1-3烃链。
329.根据权利要求328所述的化合物,其中T13为-CH2-或-CH2CH2-。
330.根据权利要求286所述的化合物,其中T13为-C(O)-。
331.根据权利要求286所述的化合物,其中T13为共价键。 
332.根据权利要求286所述的化合物,其中环D12为任选取代的具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的6元饱和或部分不饱和杂环。
333.根据权利要求332所述的化合物,其中环D12为哌啶基或哌嗪基。
334.根据权利要求332所述的化合物,其中环D12为四氢吡啶基。
335.根据权利要求286所述的化合物,其中环D12为苯基。
336.根据权利要求286所述的化合物,其中环D2不存在。
337.根据权利要求286所述的化合物,其中 
Figure FDA0000158388010001411
选自 
Figure FDA0000158388010001412
338.根据权利要求337所述的化合物,其中 
Figure FDA0000158388010001413
包含具有约9到约11个原子的间隔基。
339.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a)环A2为任选取代的吗啉基;
b)环B2为任选取代的选自吲唑基、氨基嘧啶基或苯酚的基团;
Figure FDA0000158388010001414
为 
Figure FDA0000158388010001416
Figure FDA0000158388010001417
包含具有约9到约11个原子的间隔基。
340.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征: 
a)环A12为任选取代的吗啉基;
b)环B12为任选取代的具有1-2个氮原子的8-10元双环杂芳基环、任选取代的苯基,或任选取代的具有1-2个氮原子的5-6元杂芳基环;
c)T12为共价键、亚甲基或C2-4烃链,其中T12的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d)环C12为苯基,或任选取代的具有1-2个氮的6元饱和环、部分不饱和环或芳香族杂环;
e)T13为共价键、-C(O)-;和
f)环D12不存在,或为苯基。
341.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物具有选自以下的一个或一个以上、多于一个或所有特征:
a5)环A12为任选取代的吗啉基;
b5)环B12为任选取代的选自吲唑基、苯酚或氨基嘧啶的基团;
c5)T12为共价键、亚甲基或C3烃链,其中T12的一个亚甲基单元经-C(O)NH-置换;
d5)环C12为苯基、哌嗪基、哌啶基或四氢吡啶基;
e5)T13为共价键或-C(O)-;和
f5)环D12不存在,或为苯基。
342.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组:
Figure FDA0000158388010001421
Figure FDA0000158388010001431
Figure FDA0000158388010001441
Figure FDA0000158388010001451
Figure FDA0000158388010001461
Figure FDA0000158388010001471
Figure FDA0000158388010001481
Figure FDA0000158388010001501
Figure FDA0000158388010001511
343.根据权利要求286所述的化合物,其中所述化合物选自由以下组成的群组: 
344.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物,其中R1为-L-Y,其中:L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;Y为氢、任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,或具有0-3个 独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-10元单环或双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,且其中所述环经1-4个Re基团取代;且
Re各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基,或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,其中:
Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一个或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且
Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
345.根据权利要求344所述的化合物,其中:
L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且
Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
346.根据权利要求345所述的化合物,其中L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-置换,且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。
347.根据权利要求345所述的化合物,其中L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个双键且L的至少一个亚甲基单元经-OC(O)-置换。
348.根据权利要求344所述的化合物,其中L为-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)(C=N2)-、-NRC(O)(C=N2)C(O)-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-NRC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NRC(O)-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-CH2CH2NRC(O)-或-CH2NRC(O)亚环丙基-;其中R为H或任选取代的C1-6脂肪族基;且Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。 
349.根据权利要求348所述的化合物,其中L为-NHC(O)CH=CH-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)(C=N2)-、-NHC(O)(C=N2)C(O)-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-NHC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NHC(O)-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-CH2CH2NHC(O)-或-CH2NHC(O)亚环丙基-。
350.根据权利要求344所述的化合物,其中L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个亚烷基双键且L的至少一个亚甲基单元经-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换。
351.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物,其中R1为-L-Y,其中:L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L具有至少一个三键且L的一个或两个其它亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换,
Y为氢、任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,或具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-10元单环或双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,且其中所述环经1-4个Re基团取代;且
Re各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基,或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,其中:
Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一个或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且
Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
352.根据权利要求351所述的化合物,其中Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。 
353.根据权利要求352所述的化合物,其中L为-C≡C-、-C≡CCH2N(异丙基)-、-NHC(O)C≡CCH2CH2-、-CH2-C≡C-CH2-、-C≡CCH2O-、-CH2C(O)C≡C-、-C(O)C≡C-或-CH2OC(=O)C≡C-。
354.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物,其中R1为-L-Y,其中:L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L的一个亚甲基单元经亚环丙基置换且L的一个或两个其它亚甲基单元独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-置换;
Y为氢、任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,或具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-10元单环或双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,且其中所述环经1-4个Re基团取代;且
Re各自独立地选自-Q-Z、氧代基、NO2、卤素、CN、适合离去基,或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基,其中:
Q为共价键或二价C1-6饱和或不饱和直链或具支链烃链,其中Q的一个或两个亚甲基单元任选且独立地经-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-置换;且
Z为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
355.根据权利要求354所述的化合物,其中Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
356.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物,其中R1为-L-Y,其中:L为共价键、-C(O)-、-N(R)C(O)-或二价C1-8饱和或不饱和直链或具支链烃链;且
Y选自以下(i)到(xvii):
(i)经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6烷基;
(ii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6烯基;或
(iii)任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C2-6炔基;或
(iv)具有1个选自氧或氮的杂原子的饱和3-4元杂环,其中所述环经1-2个Re基团取代;或
(v)具有1-2个选自氧或氮的杂原子的饱和5-6元杂环,其中所述环经1-4个Re 基团取代;或
其中R、Q、Z各自;或
(vii)饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代;或
(viii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和3-6元单环,其中所述环经1-4个Re基团取代;或
(ix)部分不饱和3-6元碳环,其中所述环经1-4个Re基团取代;
Figure FDA0000158388010001562
(xi)具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的部分不饱和4-6元杂环,其中所述环经1-4个Re基团取代;或
Figure FDA0000158388010001563
(xiii)具有0-2个氮的6元芳香族环,其中所述环经1-4个Re基团取代;或
Figure FDA0000158388010001564
其中Re各自如上文所定义及本文所述;或
(xv)具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5元杂芳基环,其中所述环经1-3个Re基团取代;或
Figure FDA0000158388010001565
(xvii)具有0-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环饱和环、部分不饱和环或芳基环,其中所述环经1-4个Re基团取代。
357.根据权利要求356所述的化合物,其中L为共价键、-CH2-、-NH-、-C(O)-、-CH2NH-、-NHCH2-、-NHC(O)-、-NHC(O)CH2OC(O)-、-CH2NHC(O)-、-NHSO2-、-NHSO2CH2-、-NHC(O)CH2OC(O)-或-SO2NH-。
358.根据权利要求357所述的化合物,其中L为共价键。
359.根据权利要求356所述的化合物,其中Y选自:
Figure FDA0000158388010001571
Figure FDA0000158388010001581
Figure FDA0000158388010001591
其中Re各自独立地选自适合离去基、CN、NO2或氧代基。
360.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的偶联物,其中R1为-L-Y,其中:L为二价C2-8直链或具支链烃链,其中L的两个或三个亚甲基单元任选且独立地经-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、亚环丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-置换;且
Y为氢或任选经氧代基、卤素、NO2或CN取代的C1-6脂肪族基。
361.根据权利要求360所述的偶联物,其中R1为-C(O)CH2CH2C(O)CH=C(CH3)2、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CH(环丙基)、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH2CH3、-C(O)CH2CH2C(O)C(=CH2)CH3、-C(O)CH2NHC(O)CH=CH2、-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3、-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)C(=CH2)CH3、 -S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=C(CH3)2、-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3、-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CH2、-C(O)(CH2)3NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3或-C(O)(CH2)3NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CH2
362.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的偶联物,其中R1的长度为6-12个原子。
363.根据权利要求361所述的偶联物,其中R1的长度为至少8个原子。
364.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物,其中R1选自
Figure FDA0000158388010001611
Figure FDA0000158388010001621
Figure FDA0000158388010001631
Figure FDA0000158388010001641
Figure FDA0000158388010001651
Figure FDA0000158388010001661
Figure FDA0000158388010001671
其中Re各自独立地为适合离去基、NO2、CN或氧代基。
365.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物,其中R1选自: 
Figure FDA0000158388010001681
Figure FDA0000158388010001691
Figure FDA0000158388010001701
366.根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物,其中R1选自:
Figure FDA0000158388010001702
367.一种组合物,其包含根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物和医药学上可接受的佐剂、载剂或媒剂。
368.根据权利要求367所述的组合物,其与另一治疗剂组合。
369.根据权利要求368所述的组合物,其中所述另一治疗剂为化学治疗剂。
370.一种用于抑制生物样品中一种或一种以上PI3激酶或其突变体的活性的方法,其包含使所述生物样品与根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物或根据 权利要求367所述的组合物接触的步骤。
371.一种用于抑制患者中一种或一种以上PI3激酶或其突变体的活性的方法,其包含对所述患者投予根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物或根据权利要求367所述的组合物的步骤。
372.根据权利要求371所述的方法,其中所述一种或一种以上PI3激酶或其突变体的活性受到不可逆抑制。
373.根据权利要求372所述的方法,其中通过共价修饰以下来不可逆抑制所述一种或一种以上PI3激酶或其突变体的活性:PI3K-α的Cys862、MTOR的Cys2243、PI3K-α的Cys838、PI3K-γ的Cys869、PI3K-δ的Cys815、1A类PI3K-β的Cys841、2类PI3K-β的Cys1119、DNA-PK的Cys3683、ATM-激酶的Cys2770、ATM-激酶的Cys2753、PI4KA的Cys1840、PI4KA的Cys1844或PI4KA的Cys1797。
374.一种用于治疗有需要的患者的PI3Kα介导、PI3Kγ介导、PI3Kδ介导、PI3Kβ介导、PI3KC2β介导、mTOR介导、DNA-PK介导、ATM介导和/或PI4KIIIα介导的病症、疾病或病状的方法,其包含对所述患者投予根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物或根据权利要求367所述的组合物的步骤。
375.根据权利要求374所述的方法,其中所述病症、疾病或病状为癌症、神经退化性病症、血管生成病症、病毒性疾病、自体免疫性疾病、发炎性病症、激素相关疾病、与器官移植有关的病状、免疫缺陷病症、破坏性骨骼病症、增生性病症、感染性疾病、与细胞死亡有关的病状、凝血酶诱发的血小板凝集、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、肝病、涉及T细胞活化的病理性免疫病状、心血管病症或CNS病症。
376.根据权利要求375所述的方法,其中所述增生性病症选自良性或恶性肿瘤、脑癌、肾癌、肝癌、肾上腺癌、膀胱癌、乳癌、胃癌、胃肿瘤、卵巢癌、结肠癌、直肠癌、前列腺癌、胰腺癌、肺癌、阴道癌、子宫内膜癌、子宫颈癌、睾丸癌、泌尿生殖道癌、食道癌、喉癌、皮肤癌、骨癌或甲状腺癌、肉瘤、胶质母细胞瘤、神经母细胞 瘤、多发性骨髓瘤、选自结肠癌或结肠直肠腺瘤的胃肠癌、头颈部肿瘤、表皮过度增殖、牛皮癣、前列腺增生、瘤形成、上皮特征的瘤形成、腺瘤、腺癌、角化棘皮瘤、表皮样癌、大细胞癌、非小细胞肺癌、淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin’s lymphoma)、霍奇金氏病、乳腺癌、滤泡性癌、未分化性癌、乳头状癌、精原细胞瘤、黑色素瘤或白血病。
377.根据权利要求376所述的方法,其中所述病症选自I型神经纤维瘤病、II型神经纤维瘤病、许旺细胞瘤(Schwann cell neoplasm)或神经鞘瘤(Schwannoma)。
378.根据权利要求375所述的方法,其中所述发炎性病症为哮喘、牛皮癣、接触性皮炎、异位性皮炎、斑秃、多形性红斑、疱疹样皮炎、硬皮病、白癜风、过敏性血管炎、荨麻疹、大疱性类天疱疮、红斑狼疮、天疱疮、后天性大疱性表皮松解症、结膜炎、干燥性角膜结膜炎、春季结膜炎、过敏性鼻炎、溶血性贫血、再生障碍性贫血、纯红细胞性贫血、特发性血小板减少症、全身性红斑狼疮、类风湿性关节炎、多软骨炎、硬皮病、韦格纳肉芽肿病(Wegener granulamatosis)、皮肌炎、慢性活动性肝炎、重症肌无力、史蒂芬强森综合症(Steven-Johnson syndrome)、特发性口炎性腹泻、自体免疫性发炎性肠病、内分泌性眼病变、格雷夫氏病(Grave′s disease)、肉状瘤病、肺泡炎、慢性过敏性肺炎、多发性硬化症、原发性胆汁性肝硬化症、葡萄膜炎(前部和后部)、干燥性角膜结膜炎和春季角膜结膜炎、间质性肺纤维化、牛皮癣性关节炎或肾小球肾炎。
379.根据权利要求375所述的方法,其中所述心血管病症为再狭窄、心脏肥大、动脉粥样硬化、心肌梗塞、缺血性中风和充血性心力衰竭。
380.根据权利要求375所述的方法,其中所述神经退化性病症为阿尔茨海默氏病(Alzheimer′s disease)、帕金森氏病(Parkinson′s disease)、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病(Huntington′s disease)以及大脑缺血和由外伤性损伤、谷氨酸神经毒性或低氧引起的神经退化性疾病。
381.根据权利要求375所述的方法,其中所述血管生成病症为眼血管生成。 
382.根据权利要求381所述的方法,其中所述眼血管生成为年龄相关的黄斑变性、糖尿病性视网膜病变、糖尿病性黄斑水肿或早产儿视网膜病变。
383.一种式XIII化合物,
Figure FDA0000158388010001731
其中:
环A1为任选取代的选自以下的基团:8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环B1选自苯基、3-8元饱和或部分不饱和碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R1′为二价弹头基;
T1为二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
q和r各自独立地为0-4;
R2和R3各自独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
TP为二价系链部分(tethering moiety);且
RP为可检测部分。 
384.一种式XIV化合物,
其中:
R1′为二价弹头基;
X2为CH或N;
Y2和Z2在价数允许时独立地为CR4、C、NR5、N、O或S;
Figure FDA0000158388010001742
在价数允许时表示单键或双键;
R1为弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R5为-R、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R或-C(O)N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地
选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换; 
环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
385.一种式XIV-a或XIV-b的化合物,
Figure FDA0000158388010001751
其中:
R1′为二价弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的 1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选 自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
386.一种式XIV-c或XIV-d的化合物,
Figure FDA0000158388010001771
其中:
R1′为二价弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-10元饱和或部分不饱和桥接双环杂环;
R4为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换; 
环C2为氢或任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
387.一种式XIV-e或XIV-f的化合物,
Figure FDA0000158388010001781
其中:
R1′为二价弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧 或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
388.一种式XIV-g或XIV-h的化合物,
Figure FDA0000158388010001791
其中:
R1′为二价弹头基;
环A2为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R4为-R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地
选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B2为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T2为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T2的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C1不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T3为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T3的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D2不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳 环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
389.一种式XV化合物,
Figure FDA0000158388010001811
其中:
R1′为二价弹头基;
X为O或S;
R6为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R7为任选取代的C1-6脂肪族基;
R8为氢或-NHR′;
R′独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基;
环A3为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个氮的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
390.一种式XVI化合物, 
Figure FDA0000158388010001821
其中:
R1′为二价弹头基;
X为O或S;
R9为任选取代的选自以下的基团:苯基、萘基、具有1-2个氮的6元杂芳基环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R10为任选取代的C1-6脂肪族基;
R11为氢或-NHR′;
R′独立地为氢或任选取代的C1-6脂肪族基;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
391.一种式XVII-a或XVII-b的化合物,
Figure FDA0000158388010001822
其中:
R1′为弹头基;
R12为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、-(CH2)m-(3-7元饱和或部分不饱和碳环)、-(CH2)m-(7-10元饱和或部分不饱和双环碳环)、-(CH2)m-(具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环)、-(CH2)m-(具有 1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环)、-(CH2)m-苯基、-(CH2)m-(8-10元双环芳基环)、-(CH2)m-(具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环),或-(CH2)m-(具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环);
R13和R14各自独立地为-R″、卤素、-NO2、-CN、-OR″、-SR″、-N(R″)2、-C(O)R″、-CO2R″、-C(O)C(O)R″、-C(O)CH2C(O)R″、-S(O)R″、-S(O)2R″、-C(O)N(R″)2、-SO2N(R″)2、-OC(O)R″、-N(R″)C(O)R″、-N(R″)N(R″)2、-N(R″)C(=NR″)N(R″)2、-C(=NR″)N(R″)2、-C=NOR″、-N(R″)C(O)N(R″)2、-N(R″)SO2N(R″)2、-N(R″)SO2R″或-OC(O)N(R″)2
R″各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个R″基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
m为0到6且包括0和6的整数;
n各自独立地为0、1或2;
环A5为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;且
环B5不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选 自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
392.一种式XVIII-a或XVIII-b的化合物,
Figure FDA0000158388010001841
其中:
R1′为二价弹头基;
R15为氢或C1-6烷基;
R16为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6烷基、C1-6烷氧基或(C1-6亚烷基)-R18;或
R15和R16连同插入的碳一起形成任选取代的选自以下的环:3-7元碳环或具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环;
R17为氢或C1-6烷基;
R18为3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环A6为任选取代的选自以下的基团:具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。 
393.一种式XIX化合物,
Figure FDA0000158388010001851
其中:
R1′为二价弹头基;
环A7为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R18为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地
选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B7为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T7为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C7为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和 或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环D7不存在,或为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
394.一种式XX化合物,
其中:
R1′为二价弹头基;
环A8为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R19和R20独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧 或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B8为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T8为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;环C8为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
环D8不存在,或为任选取代的选自以下的环:3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
395.一种式XXI化合物, 
其中:
R1′为二价弹头基;
T9为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;环A9不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R24和R25独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;且
z为0、1或2;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
396.一种式XXII化合物, 
Figure FDA0000158388010001891
其中:
R1′为二价弹头基;
R21和R22各自独立地为-R″、卤素、-NO2、-CN、-OR″、-SR″、-N(R″)2、-C(O)R″、-CO2R″、-C(O)C(O)R″、-C(O)CH2C(O)R″、-S(O)R″、-S(O)2R″、-C(O)N(R″)2、-SO2N(R″)2、-OC(O)R″、-N(R″)C(O)R″、-N(R″)N(R″)2、-N(R″)C(=NR″)N(R″)2、-C(=NR″)N(R″)2、-C=NOR″、-N(R″)C(O)N(R″)2、-N(R″)SO2N(R″)2、-N(R″)SO2R″或-OC(O)N(R″)2
R″各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、苯基、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个R″基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;k各自独立地为0、1或2;
环A10为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环; 
环B10为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T10为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C10不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
397.一种式XXIII化合物,
Figure FDA0000158388010001901
其中: 
R1′为二价弹头基;
X11为CH或N;
环A11为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
R23各自独立地为-Ra、卤素、-NO2、-CN、-ORb、-SRb、-N(Rb)2、-C(O)Ra、-CO2Ra、-C(O)C(O)Ra、-C(O)CH2C(O)Ra、-S(O)Ra、-S(O)2Ra、-C(O)N(Ra)2、-SO2N(Ra)2、-OC(O)Ra、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)N(Ra)2、-N(Ra)C(=NRa)N(Ra)2、-C(=NRa)N(Ra)2、-C=NORa、-N(Ra)C(O)N(Ra)2、-N(Ra)SO2N(Ra)2、-N(Ra)SO2Ra或-OC(O)N(Ra)2
Ra各自独立地为氢、C1-6脂肪族基、苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;或
同一氮上的两个Ra基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
Rb各自独立地为氢、C1-6脂肪族基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环,或具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-10元饱和或部分不饱和双环杂环;或
同一氮上的两个Rb基团连同其所连接的所述氮一起形成任选取代的具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-8元饱和环、部分不饱和环或芳香族环;
w为0、1或2;
环B11为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7 元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T11为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环C11不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
398.一种式XXIV化合物,
Figure FDA0000158388010001921
其中:
R1′为二价弹头基;
X12为CR26或N;
Y12为CR27或N;
Z12为CR28或N;
其中X12、Y12和Z12中至少一者为N; 
环A12为任选取代的选自以下的环:具有1或2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-8元饱和或部分不饱和杂环,或具有至少一个氮、至少一个氧和任选存在的1-2个独立地选自氮、氧或硫的额外杂原子的5-15元饱和或部分不饱和桥接或螺双环杂环;
R26、R27和R28独立地为R、卤素、-OR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
R各自独立地为氢或任选取代的选自以下的基团:C1-6脂肪族基、苯基、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元杂环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元单环杂芳基环,或:
同一氮上的两个R基团连同其所连接的所述氮原子一起形成具有1-4个独立地
选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和环、部分不饱和环或杂芳基环;
环B12为任选取代的选自以下的基团:苯基、8-10元双环芳基环、具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T12为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T12的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;
环C12不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接或螺双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
T13为共价键或二价直链或具支链饱和或不饱和C1-6烃链,其中T13的一个或一个以上亚甲基单元任选经-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-置换;且
环D12不存在,或为任选取代的选自以下的环:苯基、3-7元饱和或部分不饱和碳环、7-10元饱和或部分不饱和双环碳环、具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和桥接双环、具有1-2个独立地选自氮、氧或硫的 杂原子的4-7元饱和或部分不饱和杂环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的7-12元饱和或部分不饱和双环杂环、8-10元双环芳基环、具有1-3个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元杂芳基环,或具有1-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的8-10元双环杂芳基环;
TP为二价系链部分;且
RP为可检测部分。
399.根据权利要求392所述的化合物,其中所述化合物具有式XXIV-a,
Figure FDA0000158388010001941
400.根据权利要求398所述的化合物,其中所述化合物具有式XXIV-b,
401.根据权利要求398所述的化合物,其中所述化合物具有式XXIV-c,
Figure FDA0000158388010001943
402.根据权利要求398所述的化合物,其中所述化合物具有式XXIV-d, 
Figure FDA0000158388010001951
403.根据权利要求398所述的化合物,其中所述化合物具有式XXIV-e,
Figure FDA0000158388010001952
404.根据权利要求383到403中任一权利要求所述的化合物,其中TP选自:
Figure FDA0000158388010001953
405.根据权利要求383到403中任一权利要求所述的化合物,其中RP为生物素。 
406.根据权利要求383到403中任一权利要求所述的化合物,其中RP为生物素亚砜。
407.根据权利要求383到403中任一权利要求所述的化合物,其中RP为放射性同位素。
408.根据权利要求383到403中任一权利要求所述的化合物,其中RP为荧光标记。
409.根据权利要求385所述的化合物,其具有以下结构中一者:
Figure FDA0000158388010001961
Figure FDA0000158388010001971
410.一种方法,其包含以下步骤: 
(a)提供一种或一种以上自投予至少一种剂量的根据权利要求383到403中任一权利要求所述的化合物的患者获得的组织、细胞类型或其溶解产物;
(b)使所述组织、细胞类型或其溶解产物与系链于可检测部分以形成探针化合物的根据权利要求46到366中任一权利要求所述的化合物接触,以共价修饰所述组织、细胞类型或其溶解产物中所存在的至少一种蛋白激酶;和
(c)测量经所述探针化合物共价修饰的所述蛋白激酶的量,以相较于所述探针化合物对所述蛋白激酶的占用率,测定根据权利要求46到343中任一权利要求所述的化合物对所述蛋白激酶的占用率。
411.根据权利要求410所述的方法,其进一步包含调整所述化合物的所述剂量以增加对所述蛋白激酶的占用率的步骤。
412.根据权利要求410所述的方法,其进一步包含调整所述化合物的所述剂量以降低对所述蛋白激酶的占用率的步骤。
413.根据权利要求410所述的方法,其中所述测量步骤通过以下一者进行:流式细胞术、蛋白质印迹法(Western blot)或ELISA。
414.根据权利要求134所述的化合物,其中所述间隔基的长度为约7个原子到约13个原子。
415.根据权利要求177所述的化合物,其中所述间隔基的长度为约7个原子到约13个原子。 
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