CN101065486A - 多功能和多价的血管生成抑制剂 - Google Patents

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Abstract

由融合蛋白构成的多功能和多价的血管生成抑制剂，该融合蛋白包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的多肽，以及包含寡聚化结构域和具有功能活性的血管生成过程的抑制剂或调节物的多肽，其中所述寡聚化结构域和抑制剂或调节物被蛋白酶敏感区分开。所述抑制剂适用于治疗和预防有血管生成过程发生的病理过程，例如癌症、风湿性关节炎或银屑病。

Description

多功能和多价的血管生成抑制剂
发明领域
本发明涉及有效作为多功能和多价的血管生成抑制剂的融合蛋白，其包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的多肽，以及包含寡聚化结构域和具有功能活性的血管生成过程的抑制剂或调节物的多肽，其中所述寡聚化结构域和抑制剂或调节物被蛋白酶敏感区分开。本发明还涉及用于生产所述融合蛋白的基因和载体构建体。
发明背景
血管生成是导致器官或组织中从预先存在的血管形成新血管的生物学过程。血管生成起始于由内皮细胞分泌的蛋白酶造成的基底膜(basalmembrane)分解，由所述内皮细胞的迁移和增殖所继续，最终形成腔、基底膜和周围细胞的包围。
在健康成体中，在正常生理条件下不发生血管生成，例外为与雌性月经周期和伤口愈合相关的现象。然而，血管生成过程的不平衡导致病理失调的发展，例如风湿性关节炎、银屑病、巴尔通氏体病(bartonellosis)、移植器官排斥、出血和眼部新血管形成(失明的最常见原因之一)、糖尿病性视网膜病变、早产儿视网膜病变、黄斑变性、新生血管性青光眼、视网膜静脉阻塞、视网膜动脉阻塞、翼状胬肉、红变、角膜新血管形成、实体肿瘤、血管瘤和肿瘤增殖和转移，以及其它。
血管生成还在肿瘤的渐进生长和转移中起到重要作用。肿瘤必须持续刺激新毛细血管的发生才能够生长。肿瘤中新产生的血管为恶性细胞进入循环并且在远处形成转移提供途径。如果此血管生成活性可以被抑制或消除，那么尽管肿瘤存在，其也不能发展。
出于此原因，不同的研究小组正在寻找抑制血管生成的化合物(血管生成抑制剂或抗血管生成剂)，其作为治疗剂治疗和预防与血管生成过程一起发生的病理过程。
关于肿瘤，没有新血管形成肿瘤将不能生长或转移至另一器官的观点已被接受，因此血管生成转换成肿瘤发展的早期事件。已描述了干扰不同水平上的血管生成途径的几种抗血管生成策略：阻断生长因子活性；抑制细胞外基质(ECM)蛋白酶；直接引导内皮细胞(EC)；过度调节内源抑制剂，等等。由于内源血管生成抑制剂似乎是无毒的和非免疫原性剂，它们在癌症治疗中受到了特别的关注。已经鉴定了至少10种内源血管生成抑制剂[0′Reilly，M.S.et al，Cell，88：277-285，1997]，其中最著名的是血管抑素(angiostatin)和内皮抑素(endostatin)。
内皮抑素(ES)是内皮细胞迁移和血管生成抑制剂，并且已经证明它们在动物模型中减少肿瘤生长。参与所述作用的机理还不清楚，尽管已经提出它们参与细胞表面受体结合(整合素和硫酸类肝素、VEGFR-2)、金属蛋白酶和ECM成分。ES衍生自胶原XV和XVIII的NC1结构域，从该结构域其以三聚体的形式被蛋白水解释放，并且它们被转化称为约20kDa的单体内皮抑素。在NC1的N末端尾端有一约60个氨基酸残基的三聚化结构域，该结构域通过含有不同蛋白酶敏感位点的柔性铰链区与具有约180个氨基酸残基的ES模块相连，在蛋白水解后释放内皮抑素。
Boehm et al.[Nature，390：404(1997)]描述了使用被移植了若干肿瘤(Lewis肺癌、纤维肉瘤和黑色素瘤)的小鼠作为实验模型。如果未使用ES治疗小鼠，所述肿瘤生长快速，造成该动物的死亡。相反，小鼠在肿瘤发生后接受ES治疗，观察到肿瘤体积减小直至几乎达到显微镜可查大小。对携带有肿瘤的小鼠进行循环ES治疗造成动物模型中肿瘤的完全消退。然而，ES的临床试验未报道显著的肿瘤生长抑制，并且很少观察到肿瘤消退。不幸地，这不是孤立的例子，其它包括不同抗血管生成分子的临床试验也让人失望，无论在动物模型中的抗肿瘤作用是多么显著。在本文中，组合若干抗血管生成抑制剂来治疗人类癌症似乎是合理的。或者，提高的生物学活性(ES+血管抑素)和针对肿瘤的作用[ES+RGD(精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸)]可能潜在地增强肿瘤生长抑制。
另一方面，已经在体内和体外证实了具有抗血管生成活性的抗层粘连蛋白抗体(L36)的单链Fv(scFv)片断的治疗潜力。结果显示与细胞关联的基质的形态发生潜力的改变是防止体内与肿瘤相关的血管形成的有效方法。
尽管直至目前的努力，依然需要开发有效用作治疗剂的血管生成抑制剂化合物，所述治疗剂治疗或预防有血管生成发生的病理过程。
发明的简要描述
本发明涉及提供具有抗血管生成活性的化合物，其潜在地用作预防和/或治疗有血管生成发生的病理过程的治疗剂，所述病理过程例如银屑病、风湿性关节炎、视网膜病变、癌症等等。
本发明提供的技术方案基于融合蛋白，该融合蛋白潜在地用作多功能和多价的血管生成抑制剂，其包含(a)多肽，所述多肽包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的区域，以及(b)多肽，所述多肽包含寡聚化结构域和具有功能活性的血管生成过程的抑制剂或调节物区域，其中所述寡聚化结构域和抑制剂或调节物区域被蛋白酶敏感区分开。
通过构建几种蛋白质的嵌合物的方式来说明本发明。融合蛋白之一(参见实施例)包含抗层粘连蛋白抗体(L36)的单链Fv(scFv)片断和胶原XVIII的NC1结构域，NC1结构域包含三聚体化结构域和通过柔性铰链肽结合的内皮抑素(ES)，所述柔性铰链肽含有蛋白酶敏感位点，在蛋白水解切割后释放单体ES。在肿瘤周围微环境中蛋白酶水平提高，因此所述融合蛋白原位释放ES单体和scFv三聚体。通过遗传修修饰的人细胞以功能活性形式分泌所述融合蛋白。完整形式的分子量约为210kDa，其表明，在生理条件下，单个亚基以非共价方式共价缔合产生三聚体结构。所述三聚体融合蛋白显著抑制内皮细胞响应生长因子迁移的能力，以及当内皮细胞生长在Matrigel底物上时，其发育成毛细血管型小管的能力。用几种不同的蛋白酶类似地处理所述融合蛋白。数据显示组织蛋白酶L、胰弹性蛋白酶和几种基质金属蛋白酶(MMP)产生ES型单体和三聚体抗体片断(scFv)。当所述融合蛋白由遗传修饰的产MMP的肿瘤细胞产生时而不是由遗传修饰的不产MMP的肿瘤细胞产生时，融合蛋白进一步正确地加工。这些结果开辟了使用此类型融合蛋白的治疗癌症的新基因治疗策略的途径，此类型融合蛋白构成了新一代血管生成抑制剂的部分，该抑制剂有效作为治疗与所述血管生成不平衡相关的疾病的治疗剂。
因此，本发明的一方面涉及基因构建体，其包含可操作地连接的至少一个核酸序列(A)和核酸序列(B)，其中所述第一核酸序列(A)的3’末端与所述第二核酸序列(B)的5’末端相连，所述核酸序列(A)包含编码识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的多肽的核酸序列，所述核酸序列(B)包含编码特定多肽的核酸序列，所述特定多肽包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区。
另一方面，本发明涉及包含所述基因构建体的表达盒(cassette)，可操作地与表达控制序列连接。
另一方面，本发明涉及包含所述基因构建体或所述表达盒的重组载体。
另一方面，本发明涉及包含所述基因构建体、或所述表达盒、或所述重组载体的宿主细胞。
另一方面，本发明涉及可通过表达包含在所述基因构建体中的核酸序列而获得的融合蛋白。所述融合蛋白通常含有多肽(A’)和多肽(B’)，多肽(A’)包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的区域，多肽(B’)包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区。
另一方面，本发明涉及药物组合物，其或者包含所述融合蛋白和至少一种药物可接受的赋形剂，或者包含包含本发明基因构建体的载体或本发明的表达盒以及任选地包含，至少一种药物可接受的赋形剂。
另一方面，本发明涉及所述融合蛋白、或所述基因构建体、或所述表达盒或所述重组载体，在制备药物组合物中的用途，所述药物组合物预防、治疗、阻碍或最小化血管生成的发展。
另一方面，本发明涉及所述融合蛋白、或所述基因构建体、或所述表达盒或所述重组载体，在制备药物组合物中的用途，所述药物组合物治疗和/或预防有血管生成发生的病理过程。
附图的简要描述
图1是制图表示，显示不同浓度的scFv形式的重组单克隆抗体(L36)[抗层粘连蛋白单克隆抗体L36的单链Fv片断]和二聚体Fc-ES融合蛋白(ES结构域和免疫球蛋白的Fc片断之间的融合蛋白)的单独治疗和联合治疗对毛细血管形态发生的作用。
图2说明本发明提供的融合蛋白的生产及其蛋白水解加工。图2A示意性地显示基因α1(胶原XVIII)和NC1结构域编码序列。图2B示意性地显示包含连接肽、三聚体化结构域、铰链肽和ES结构域的所述NC1结构域。图2C示意性地显示由scFv形式的重组抗层粘连蛋白单克隆抗体(L36)和胶原XVIII的NC1结构域形成的融合蛋白或嵌合体。图2D显示所述融合蛋白蛋白水解加工的结果，观察到三聚体和单体ES抗体的形成。
图3A示意性地显示scFv形式的抗体的基因结构，以及几种含有(或不含有)ES结构域编码序列的基因构建体。图3B显示纯化的融合蛋白的Western印迹分析的结果；用抗myc单克隆抗体(mAb)和/或抗ES mAb进行所述免疫印迹[泳道1：L36scFv，泳道2：L36scFv-NC1ES-，泳道3：L36scFv-NC1ES+，泳道4：NC1，泳道5：ES]。
图4A显示scFv-NC1ES-在11,000rpm和20℃时的沉淀平衡梯度(1mg/ml在磷酸缓冲的盐溶液(PBS)中)。空心圆代表数据，三条实线代表单体scFv(37,148Da)、二聚体(74,296Da)和三聚体(111,444Da)的理论梯度。在所述图4A的上方嵌图中，显示融合蛋白L36scFv-NC1ES-(1mg/ml在PBS缓冲液中)在42,000rpm和20℃时的沉淀速率。图4B是显示固定在塑料支持物上的层粘连蛋白结合亲和力的图[在融合蛋白L36scFv-NC1ES-(三聚体)的情况下大于在L36scFv(单体)的情况下]。图4C是显示在典型Matrigel分析中，内皮细胞分化(响应不同的scFv或L36scFv-NC1ES-浓度)的剂量依赖调节的图。每一个点代表两个孔的平均值+/-标准差。图4D显示用不同蛋白酶(MMPs、猪胰弹性蛋白酶和组织蛋白酶L)处理融合蛋白L36scFv-NC1ES-的结果。
图5显示L36scFv-NC1ES+(图5A)和NC1(图5B)的沉淀速度的分布。图5C显示使用表明浓度的L36scFv-NC1ES+和NC1获得的饱和曲线。图5D是代表在典型Matrigel分析中，内皮细胞分化(响应L36scFv、L36scFv-NC1ES+、NC1或Fc-ES的不同浓度)的剂量依赖调节的图。每一个点代表两个孔的平均值+/-标准差。图5E是显示在HUVEC内皮细胞分析中通过L36scFv(L36)、NC1、L36scFv-NC1ES+或Fc-ES(ES)的调节[PBS被用作对照]。
图6A显示用不同蛋白酶(MMPs、猪胰弹性蛋白酶和组织蛋白酶L)处理L36scFv-NC1ES+的结果，而图6B显示对NC1进行同样处理的结果。如实施例中的描述(参见材料和方法部分)，将纯化的蛋白与不同的蛋白酶一起孵育指明的时间，并且使用SDS-PAGE方法(图6C)或者通过使用抗内皮抑素mAb的Western印迹方法分析反应混合物。在所述图的左侧指明分子量的迁移距离和NC1标志物。图6A和6B的空箭头表明蛋白水解产物。
发明的详细描述
一方面，本发明涉及基因构建体，下文称为本发明的基因构建体，其包含可操作地连接的至少：
a)第一核酸序列(A)，其包含编码识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的多肽；以及
b)第二核酸序列(B)，其包含编码特定多肽的核酸序列，所述特定多肽包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区，其中，所述第一核酸序列(A)的3’末端与所述第二核酸序列(B)的5’末端相连。
所述核酸序列(A)包含编码识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的多肽。参与血管生成过程的分子的说明性例子包括细胞外基质(ECM)蛋白，血管生成因子，细胞膜受体等等。ECM蛋白包括胶原、蛋白聚糖、纤维连接蛋白、层粘连蛋白、腱蛋白(tenascin)、巢蛋白和血小板反应蛋白。在一特定实施方案中，所述参与血管生成过程的分子是层粘连蛋白，例如哺乳动物层粘连蛋白，例如大鼠、小鼠或人层粘连蛋白。血管生成因子包括血管内皮生长因子(VEGF)家族等等。所述血管生成因子的受体例如VEGF受体2(VEGFR-2)、整合素等等，可同样地被包括在参与血管生成的细胞膜受体中。
事实上包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的区域的任何多肽均可被用于本发明，例如抗体，例如单克隆或多克隆抗体，其识别参与血管生成过程的分子，或者例如含有识别所述参与血管生成过程的分子的抗体重组片断，例如，其重组单链形式(单链Fv片断或scFv)、双功能的(双价小分子抗体)、完全的(Fab+Fc)等等；尽管如此，在一特定实施方案中，核酸序列(A)编码源自抗层粘连蛋白mAb L36的重组单链抗体(scFv)(实施例1)，其含有通过接头与mAbL36的可变轻链区(VL)融合的单克隆抗体L36的可变重链区(VH)(图2C)，其中VL编码序列的3’末端与所述接头编码序列的5’末端相连，并且编码所述接头的核苷酸序列的3’末端与VL编码序列的5’末端相连，所述接头例如包含G4S序列的肽，所述mAb L36的可变轻链区(VL)序列已被Sanz L et al.描述[Cancer Immunology and Immunotherapy，2001Dec；50(10)557-65]。
mAb L36识别不同动物物种的层粘连蛋白，例如来自小鼠、大鼠、人等等，因为其与在不同动物物种中非常保守的区域相互作用[Sanz Let al.EMBO J 2003，Vol.22(7)：1508-1517]。
由于其特性，所述识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的多肽，例如抗体，以其任何形式(scFv、双功能的或完全的)，可以识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域，并且可以将与所述多肽融合的抗血管生成多肽导向参与血管生成过程的分子，例如，ECM蛋白、血管生成因子、细胞膜受体等等，并且阻断所述分子的功能活性区域。
所述核酸序列(B)包含编码特定多肽的核苷酸序列，所述特定多肽包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域(i)和所述血管生成过程中的功能活性区域(ii)之间的蛋白酶敏感区。
寡聚化结构域是使得寡聚体(例如，肽或蛋白的二聚体、三聚体、四聚体等等)能够形成的结构域。事实上，任何寡聚化结构域，例如二聚体化、三聚体化或四聚体化结构域等等，均可被用于本发明的实践，所述寡聚化结构域存在于不同的蛋白中，真核或原核来源，能够被重组表达并且形成包含该蛋白的蛋白寡聚体。在一特定实施方案中，所述寡聚化结构域是三聚体化结构域，例如胶原XVIII或胶原XV的NC1结构域的三聚体化结构域。
血管生成过程中的功能活性区域包含血管生成过程中的任何具有功能活性的肽或蛋白，例如血管生成过程中的抑制物或调节物肽或蛋白。事实上，本发明可以使用任何血管生成过程中的具有功能活性的肽或蛋白；尽管如此，在一特定实施方案中，所述血管生成过程中的功能活性区域包含哺乳动物内皮抑素(ES)，例如存在于胶原XV或胶原XVIII的NC1结构域的ES。
蛋白酶敏感区存在于所述寡聚化结构域(i)和所述血管生成过程中的功能活性区域(ii)之间，并且包含对蛋白酶作用敏感的多肽序列。尽管对任何蛋白酶敏感的任何多肽序列都可被用于本发明中，实践中所述蛋白酶是只在肿瘤周围表达的蛋白酶是优选的，其使得本发明的融合蛋白被“加工”，产生多肽三聚体分子，其能够识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区。因此，在一特定实施方案中，所述蛋白酶敏感区包含存在于胶原XV或胶原XVIII的NC1结构域中的铰链区，该铰链区位于三聚体化结构域和所述NC1结构域的ES结构域或区之间，因为所述区域对只在肿瘤周围表达的蛋白酶的作用敏感。
因此在一特定和优选的实施方案中，所述核酸序列(B)包含编码哺乳动物胶原XVIII的NC1结构域或哺乳动物胶原XV的NC1结构域的核苷酸序列。如已知的，所述胶原XVIII(和胶原XV)的NC1结构域包含三聚体化结构域和由铰链肽连接的ES结构域(图2B)。所述胶原XV和XVIII的NC1结构域的序列已知；出于说明的目的，Sasaki etal.之前已经公开了胶原XVIII的NC1结构域的序列[Sasaki et al.Structure，function and tissue forms of the C-terminal globular domain ofcollagen XVIII containing the angiogenesis inhibitor endostatin(含有血管生成抑制剂内皮抑素的胶原XVIII的C-末端球形结构域的结构、功能和组织形式).EMBO J.1998Aug 3；17(15)：4249-56]。实施例1描述获得包含编码小鼠胶原XVIII的NC1结构域的区域的核苷酸序列。
可以使用任何与胶原XVIII的NC1结构域相似的其它结构域来实践本发明，所述结构域包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区，优选的，该区域对在肿瘤周围表达的蛋白酶敏感。
通常，核酸序列(A)不直接与核酸序列(B)融合，但是在由核酸序列(A)和(B)编码的多肽之间引入柔性结合肽(或分隔肽)是优选的。因此，如果需要，本发明的基因构建体还可以额外含有第三核酸序列(C)，该核酸序列(C)含有编码位于所述核酸序列(A)和(B)之间的柔性结合肽的核苷酸序列，其中所述核酸序列(C)的5’末端与所述核酸序列(A)的3’末端连接，并且所述核酸序列(C)的3’末端与所述核酸序列(B)的5’末端连接。优选地，所述分隔肽(C)是具有结构柔性的肽。事实上，可以使用具有结构柔性的任何肽。以说明的方式，所述柔性多肽可以含有重复的氨基酸残基，特别是Gly和Ser残基，或者任何其它合适的氨基酸残基重复。事实上，本发明中可以使用任何定义柔性结合肽的肽序列。柔性结合蛋白的说明性实例包括例如Gly-Ser-Pro-Gly(GSPG)或序列(Gly-Ser)4等序列。尽管如此，在一特定实施方案中，所述柔性结合蛋白包含序列Leu-Glu-Gly-Ala-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Ser-Ser-Gly-Ser-Asp-Gly-Ala-Ser-Gly-Ser。因此，在一特定实施方案中，本发明的基因构建体除所述核酸序列(A)和(B)外，还包含第三核酸序列(C)，该第三核酸序列(C)包含编码肽Leu-Glu-Gly-Ala-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Ser-Ser-Gly-Ser-Asp-Gly-Ala-Ser-Gly-Ser的核苷酸序列。
并且，为了辅助分离和纯化通过本发明方法获得的融合蛋白，本发明的基因构建体可以含有，如果需要的话，编码能够用于融合蛋白分离或纯化目的的肽的核酸序列。因此，在一特定实施方案中，如果需要的话，本发明的基因构建体包括核酸序列(D)，其含有编码能够用于分离或纯化目的的肽的核酸序列，该序列被称为标签肽。所述核酸序列(D)可以位于不改变任何由所述核酸序列(A)和(B)表达的多肽的功能的任何位置。以说明的方式，可以将所述核酸序列(D)置于所述核酸序列(B)的3’末端的下游。事实上，可以使用任何能够使得融合蛋白分离或纯化的肽或肽序列，例如，多组氨酸序列、能够被抗体识别的肽序列，例如标签肽等等，例如源自热病毒的血凝素的表位或C-myc表位等等，所述抗体是可以用于通过免疫亲和层析来纯化得到的融合蛋白。
可以通过使用本领域公知的方法获得本发明的基因构建体[Sambrook et al.，″Molecular cloning，a Laboratory Manual(分子克隆实验手册)″，2nd ed.，Cold Spring Harbor Laboratory Press，N.Y.，1989Vol1-3]。所述本发明的基因构建体可以包括可操作地连接的调节序列，因此构成表达盒，所述调节序列调节编码由核酸序列(A)和(B)编码的多肽的核酸序列的表达。如本说明书中所用，表述“可操作地连接”指在表达控制或调节序列的控制下，在正确的开放阅读框中表达由核酸序列(A)和(B)，及合适的条件下的(C)编码的多肽。
因此，另一方面，本发明提供表达盒，其包含与表达控制序列可操作地连接的本发明的基因构建体，所述表达控制序列是编码本发明融合蛋白的核苷酸序列的表达控制序列，本发明融合蛋白的核苷酸序列包含(a)识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的多肽，以及(b)多肽，其包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区。控制序列是控制和调节所述融合蛋白的转录、合适时的翻译的序列，并且其包括启动子序列、编码转录调节物的序列、核糖体结合序列(RBS)和/或转录终止子序列。在一特定实施方案中，所述表达控制序列在诸如细菌等原核细胞和有机体中起作用，而在另一实施方案中，所述表达控制序列在真核细胞和有机体中起作用，例如昆虫细胞、植物细胞、哺乳动物细胞等等。可以存在于本发明提供的表达盒中的启动子的实例包括人巨细胞病毒(hCMV)启动子等等。
优选地，所述表达盒还包含编码使得能够选择被所述表达盒转化的宿主细胞的动机或表型的标志物或基因。可以存在于本发明表达盒中的所述标志物的说明性例子包括抗生素抗性基因、毒性化合物抗性基因、以及一般地所有使得能够选择遗传转化植物的那些基因。
可以将本发明的基因构建体或本发明提供的表达盒插入到合适的载体中。因此，另一方面，本发明涉及诸如表达载体的载体，其包含所述的本发明基因构建体或所述的表达盒。载体的选择依赖于随后要向其引入所述载体的宿主细胞。以说明的方式，要向其中引入所述核酸序列的载体可以是质粒或载体，当被引入宿主细胞中时，其被整合到所述细胞的基因组中或不整合。可以通过本领域技术人员已知的常规方法得到所述载体[Sambrok et al，1989，如上文所引用]。在一特定实施方案中，所述重组载体是用于转化动物细胞的载体。
可以使用所述载体转化、转染或感染能够被所述载体转化、转染或感染的细胞。所述细胞可以是原核或真核细胞。因此，另一方面，本发明涉及被本发明提供的载体转化、转染或感染的宿主细胞。因此，所述被转化、转染或感染的细胞包含本发明的基因构建体、或所述表达盒或本发明提供的载体。可以通过本领域技术人员已知的常规方法得到转化、转染或感染的细胞[Sambrok et al，1989，如上文所引用]。在一特定实施方案中，所述细胞是已经被合适载体转化、转染或感染的动物细胞，所述转化、转染或感染的动物细胞能够表达本发明提供的融合蛋白，因此所述载体可被用于在动物细胞中表达本发明提供的融合蛋白。
可以使用本发明的基因构建体生产融合蛋白，该融合蛋白包含(a)多肽(A’)，其包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的区域，和(b)多肽(B’)，其包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区。
因此，另一方面，本发明涉及生产本发明提供的所述融合蛋白的方法，其包含在使得所述融合蛋白能够产生的条件下生长本发明提供的细胞或有机体。优化所述细胞或有机体培养的条件取决于所使用的细胞或有机体。如果需要，生产本发明提供的感兴趣产物的方法还包括分离和纯化所述融合蛋白。
另一方面，本发明涉及通过包含在本发明基因构建体中的核酸序列的表达而获得的融合蛋白。更具体地，本发明提供融合蛋白，其包含：
(a)多肽(A’)，其包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的区域，以及
(b)多肽(B’)，其包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区。
参与血管生成过程的分子的说明性例子包括ECM蛋白、血管生成因子、细胞膜受体等等。ECM蛋白包括胶原、蛋白聚糖、纤维连接蛋白、层粘连蛋白、腱蛋白、巢蛋白和血小板反应蛋白。在一特定实施方案中，所述参与血管生成过程的分子是层粘连蛋白，例如哺乳动物层粘连蛋白，例如大鼠、小鼠或人层粘连蛋白。
事实上本发明可以使用包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的区域的任何多肽，例如识别参与血管生成过程的分子的诸如单克隆抗体的抗体，或者识别所述参与血管生成过程的分子的所述抗体的重组片断，例如，识别参与血管生成过程的分子的抗体的单链Fv(scFv)片断，或者识别参与血管生成过程的分子的双特异性抗体或双价小分子抗体，或者以其完全重组形式(Fab+Fc)；尽管如此，在一特定实施方案中，包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域的区域的所述核酸序列(A’)是源自抗层粘连蛋白mAb L36的重组scFv(实施例1)，其含有通过接头与mAb L36的可变轻链区(VL)融合的单克隆抗体L36的可变重链区(VH)(图2C)，其中VL编码序列的3’末端与编码所述接头的序列的5’末端相连，并且编码所述接头的核苷酸序列的3’末端与VL编码序列的5’末端相连，所述接头例如包含G4S序列的肽，所述mAb L36的可变轻链区(VL)序列已被Sanz L etal.公开[Cancer Immunology and Immunotherapy，2001 Dec；50(10)557-65]。目前已知，mAb L36识别来自不同动物物种的层粘连蛋白，例如小鼠、大鼠、人等等，因为其与在不同动物物种中非常保守的区域发生相互作用[Sanz L et al.EMBO J 2003，Vol.22(7)：1508-1517]。
所述多肽(A’)识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区域，并且可以将与所述多肽融合的抗血管生成肽导向参与血管生成过程的分子，例如ECM蛋白、血管生成因子、细胞膜受体等等，并且阻断所述分子的功能活性区域。
多肽(B’)包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区。如前所述，所述寡聚化结构域事实上可以是能够使得肽或蛋白的寡聚体形成的任何结构域，并且该结构域能够被重组表达并且形成包含其的蛋白的蛋白寡聚体，所述寡聚体例如二聚体、三聚体、四聚体等等。尽管如此，在一特定实施方案中，所述寡聚化结构域是三聚体化结构域，例如哺乳动物胶原XVIII或胶原XV的NC1结构域的三聚体化结构域。
血管生成过程中的功能活性区域包含任何在血管生成过程中具有功能活性的肽或蛋白，例如血管生成过程的抑制物或调节物肽或蛋白。事实上，本发明可以使用任何在血管生成过程中具有功能活性的肽或蛋白；尽管如此，在一特定实施方案中，所述血管生成过程中的功能活性区域包含哺乳动物内皮抑素(ES)，例如存在于胶原XV或胶原XVIII的NC1结构域中的ES。
蛋白酶敏感区存在于所述寡聚化结构域(i)和所述血管生成过程中的功能活性区域(ii)之间，并且包含对蛋白酶作用敏感的多肽序列。尽管事实上本发明可以使用对任何蛋白酶作用敏感的任何多肽序列，所述蛋白酶优选为只在肿瘤周围表达的蛋白酶，其使得本发明的融合蛋白被“加工”，产生在血管生成过程中具有功能活性的肽或蛋白的单体(例如ES)，以及能够识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的多肽三聚体分子(例如scFv)。因此，在一特定实施方案中，所述蛋白酶敏感区包含存在于哺乳动物胶原XV或XVIII的NC1结构域中的铰链区，该铰链区位于三聚体化结构域和所述NC1结构域的ES结构域或区之间，因为所述区域对只在肿瘤周围表达的蛋白酶的作用敏感。
如已知的，所述胶原XVIII(和胶原XV)的NC1结构域包含三聚体化结构域和由铰链肽连接的ES结构域(图2B)。因此在一特定和优选的实施方案中，本发明的融合蛋白包含多肽(B’)，其包含胶原XV的NC1结构域或胶原XVIII的NC1结构域，所述NC1结构域含有三聚体化结构域和由所述NC1结构域的铰链肽连接的所述NC1结构域的ES结构域。所述胶原XV和XVIII的NC1结构域的序列已知；以说明的方式，Sasaki et al.之前已经公开了胶原XVIII的NC1结构域的序列[Sasaki et al.Structure，function and tissue forms of the C-terminalglobular domain of collagen XVIII containing the angiogenesis inhibitorendostatin(含有血管生成抑制剂内皮抑素的胶原XVIII的C-末端球形结构域的结构、功能和组织形式).EMBO J.1998 Aug3；17(15)：4249-56]。
因此，以说明的方式，在一特定实施方案中，本发明提供融合蛋白，其包含：
(i)选自完整mAb L36、双功能形式的mAb L36和重组scFv的多肽，该重组scFv含有通过柔性肽与mAb L36轻链(VL)的可变区融合的mAb L36重链(VH)的可变区；和
(ii)包含哺乳动物胶原XVIII的NC1结构域的多肽(B’)。
然而，为了获得多功能和多价的血管生成抑制剂的目的，可以将其它任何与哺乳动物胶原XVIII的NC1结构域相似的结构域用于本发明的实践，所述结构域包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区，优选地，在肿瘤周围表达的蛋白酶敏感区。
如果需要的话，本发明提供的融合蛋白还可以含有第三多肽(C’)和/或(b)肽(D’)，多肽(C’)含有位于所述多肽(A’)和(B’)之间的柔性结合肽的氨基酸序列，肽(D’)辅助融合蛋白的分离和纯化。
如前所述，事实上所述多肽(C’)可以包含定义柔性结合肽的任何肽序列。柔性结合肽的说明性例子包括诸如序列Gly-Ser-Pro-Gly或序列(Gly-Ser)4等序列。尽管如此，在一特定实施方案中，所述柔性结合肽包含序列Leu-Glu-Gly-Ala-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Ser-Ser-Gly-Ser-Asp-Gly-Ala-Ser-Gly-Ser。
为了辅助本发明融合蛋白的分离和纯化，如果需要的话，本发明的融合蛋白可以类似地含有，能够用于融合蛋白的分离或纯化目的的肽(D’)，例如标签肽。所述肽(D’)可以位于融合蛋白中不改变多肽(A’)和(B’)功能的任何位置，例如，所述肽(D’)可以位于多肽(B’)之后。事实上，可以使用任何能够使得融合蛋白分离或纯化的肽或肽序列，例如，多组氨酸序列、能够被抗体识别的肽序列，例如标签肽等等，例如源自热病毒的血凝素的表位或C-myc表位等等，所述抗体是可以用于通过免疫亲和层析来纯化得到的融合蛋白的抗体，。
本发明提供的融合蛋白包含多肽(A’)和多肽(B’)，多肽(A’)包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的多肽，多肽(B’)包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区。作为此融合的结果和由于某些只在肿瘤周围表达的蛋白酶的作用，所述融合蛋白被“加工”，产生在血管生成过程中具有功能活性的肽或蛋白质的单体(例如ES)，和能够识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的多肽三聚体分子(例如scFv)。由于几种联合途径以联合的方式攻击血管生成过程，本发明因此提供多功能和多价的血管生成抑制剂化合物。
因此，由于其自身的特征，本发明的融合蛋白可以用于治疗和/或预防血管生成过程的发展，并且因此，用于治疗和/或预防有血管生成发展的病理过程。
因此，另一方面，本发明涉及药物组合物，其包含本发明提供的融合蛋白和至少一种药物可接受的赋形剂，或者包含含有本发明基因构建体的载体或本发明的表达盒和任选至少一种药物可接受的赋形剂。
在一特定实施方案中，本发明的药物组合物包含治疗有效量的至少一种本发明提供的融合蛋白。如本说明书中所用，表述“治疗有效量”指经计算以产生期望效果的本发明融合蛋白的量，并且通常在其它原因中，由所述融合蛋白自身的特征和要得到的治疗效果来决定。
在另一特定实施方案中，本发明提供的药物组合物是意欲用于基因治疗的组合物，其包含含有本发明基因构建体或本发明表达盒的本发明提供的病毒或非病毒载体。以说明的方式，所述载体可以是诸如基于逆转录病毒、腺病毒等的病毒载体，或者非病毒的，例如DNA-脂质体、DNA-聚合物、DNA-聚合物-脂质体复合体等等[参见″NonviralVectors for Gene Therapy(用于基因治疗的非病毒载体)″，edited byHuang，Hung and Wagner，Academic Press(1999)]。可以通过常规方法将所述包含本发明基因构建体或所述表达盒的载体直接给予人或动物。或者所述载体可被用于离体(ex vivo)转化、转染或感染细胞，并且随后将它们移植到人或动物体内以获得期望的治疗效果，所述细胞例如哺乳动物细胞，包括人细胞。
可以通过任何适合的给药方法给予本发明的药物组合物，例如口服或肠胃外给药。可以用于制备本发明提供的药物组合物的赋形剂依赖于，在其它因素中，所述药物组合物的给药方法。可以在Tratado deFarmacia Galenica，C.Fauli i Trillo，Luzan 5，S.A.de Ediciones，1993中找到不同活性成分给药方法、要使用的赋形剂和生产它们的过程的综述。
另一方面，本发明类似地涉及本发明提供的融合蛋白、或本发明的基因构建体或本发明提供的表达盒或本发明提供的重组载体在制备预防、治疗、阻碍或最小化血管生成发展的药物组合物中的用途。
另一方面，本发明涉及本发明提供的融合蛋白、或本发明的基因构建体或本发明提供的表达盒或本发明提供的重组载体在制备治疗和/或预防有血管生成的病理过程的药物组合物中的用途。有血管生成的病理过程的说明性、非限制性的例子包括癌症、血管瘤、风湿性关节炎、银屑病、巴尔通氏体病、移植器官排斥、出血、眼部新血管形成(失明的最常见原因之一)、视网膜病变(糖尿病性或早期视网膜病变等)、黄斑变性、新生血管性青光眼、视网膜静脉阻塞、视网膜动脉阻塞、翼状胬肉、红变或角膜新血管形成。在一特定实施方案中，本发明的融合蛋白、本发明的基因构建体、本发明提供的表达盒或本发明提供的重组载体在治疗癌症中尤其有用，包括治疗实体肿瘤和肿瘤增殖和转移。
以下实施例可用于说明本发明，但不应被认为是限制本发明的范围。
                           实施例1
设计、表达和由抗体片断和胶原XVIII寡聚物组成的血管生成抑制剂
制备了能够表达以下产物的几种基因构建体(图3A)：
-抗层粘连蛋白单克隆抗体L36(L36scFv)的单链Fv片断，
-称为L36scFv-NC1ES-的融合蛋白，其由通过柔性连接肽(接头)与小鼠胶原XVIII的NC1结构域中存在的三聚体化结构域(残基10至60)融合的L36scFv组成。
-称为L36scFv-NC1ES+的融合蛋白，其由通过所述接头与小鼠胶原XVIII的NC1结构域(残基10至325)融合的L36scFv组成。
-小鼠胶原XVIII的NC1结构域(残基10至315)(NC1)，以及
-来自小鼠胶原XVIII的NC1结构域的内皮抑素(残基130至315)，其以三聚体形式被蛋白水解释放，随后该三聚体被转化成为约20kDa的单体ES(图2A和图2B)。
出于辅助蛋白的免疫检测的目的，制备的基因构建体还含有编码标签的序列，特别是编码his6myc的序列，所述标签被连接到不同蛋白的C-末端尾端。
所述基因构建体被克隆到哺乳动物表达载体中，处于含有人制瘤素M信号序列的人巨细胞病毒(hCMV)启动子的控制之下[Sanz L et alGene Therapy(2002)15：1049]。ES(位置130-315)和小鼠NC1(1-315)的表达载体被用作对照。
所述重组蛋白被用于Matrigel中的毛细血管结构分析以及细胞迁移分析，目的为评价其作为抗血管生成剂的潜力。
                         I.材料和方法
细胞和培养条件
在补充有10％胎牛血清(FBS)的Dulbecco改良的Eagle培养液(DMEM)(Life Technologies，Gaithersburg，MD，U.S.A.)中培养HEK-293细胞(人肾上皮；ATCC CRL-1573)，HT-1080细胞(人纤维肉瘤；ATCCCCL-121)和B16-F10细胞(小鼠黑素瘤；ATCC CRL-6475)。
由B.Gimenez博士(Instituto de Investigaciones Biomedicas，Madrid，Spain)提供的原代人脐带静脉内皮细胞被培养在含有10％FBS、50μg/ml来自牛垂体的内皮细胞生长补充物(ECGS)和100μg/ml肝素(Sigma Biosciences，St.Louis，MO，U.S.A.)的Ham′s F12K培养液(Life Technologies)中。
由E.W.Ades博士(Center for Disease Control，Atlanta，GA，U.S.A.)提供的人微血管内皮细胞株HMEC-1(Ades EW et al.，1992，Journal ofInvestigative Dermatology，99：683-690)被培养在含有10％FBS、10ng/ml EGF(内皮生长因子)和1mg/ml氢化可的松(Sigma Biosciences)的MCBD 131培养液(Lif Technologies)中。
表达载体构建
从由B.Olsen博士(Harvard Medical School，Boston，MA，U.S.A.)提供的来自小鼠的α1克隆mc3b(胶原XVIII)[Oh et al.Genomics.1994Feb；19(3)：494-9]中使用引物对1和2(参见表1，其含有用于载体构建体以及随后证实载体序列的不同引物的序列)用聚合酶链式反应(PCR)扩增NC1结构域的序列，NC1结构域的序列含有编码连接肽、三聚体化结构域、铰链肽和ES结构域的序列(图2B)。
                          表1
                       寡核苷酸序列
序号    序列(5’-3’)
1.      ATTCAGATCTTGGGCAGGTGAGGAT
2.      TTCATGACCTCTTTCTCCAAAGCGGCCGCTAAACTAT
3.      ATATAGCGCGGCCGCGAATTCAGATCTTGGGCAGGTGAGGAT
4.      TAGAAGGCACAGTCGAGG
5.      TCTGGCTCCAAGTCTGGC
6.      AATTCAGGCGCCGGTGGATCTGGTGGCTCCTCTGGCTCAGACGGAGCG
        TCGGGTTCGCGA
7.      GATCTCGCGAACCCGACGCTCCGTCTGAGCCAGAGGAGCCACCAGATC
        CACCGGCGCCTG
8.      CGATACA
9.      GATCTGTAT
10.     CCTAGATCTTGCTCATACTCATCAGGACTTTCAG
11.     GTCCTAGGTGCGGCCGCGAAT
12.     ATAGTTTAGCGGCCGCCTCATTGCCCGTGCCTCTCAG
用引物对2和3(表1)再次扩增PCR产物，并且用NotI切割得到的PCR产物，连接到质粒pCR3.1-L36[Sanz L et al Gene Therapy(2002)15：1049]的NotI位点上，以得到质粒pCR3.1-L36-NC1。使用引物4和5(表1)检查序列。
为制备称为L36scFv-NCES+(图3A)的基因构建体，用“柔性肽连接体”(“柔性接头”)Leu-Glu-Gly-Ala-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Ser-Ser-Gly-Ser-Asp-Gly-Ala-Ser-Gly-Ser[LEGAGGSGGSSGSDGASGS](图2B和2C)替换连接胶原三螺旋体与NC1三聚体化结构域的“连接肽”，其负责从母体胶原XVIII释放NC1结构域，所述替换的目的是防止可能的L36scFv的氨基末端的NC1结构域的切除，因所述“肽连接体”对不同金属蛋白酶(MMPs)的作用敏感。因此，含有编码所述“柔性连接肽”(“柔性接头”)的寡核苷酸对(引物6和7)(表1)被连接到pCR3.1-L36-NC1的EcoRI-BglII位点，得到质粒pCR3.1-L36-linker-NC1。
通过从质粒pCR3.1-L36-linker-NC 1(含有全部L36scFv)除去ClaI-BglII片断并且插入含有NruI位点的寡核苷酸对(引物8和9)(表1)构建质粒pCR3.1-NC1。
为了构建质粒pCR3.1-ES，从质粒pCR3.1-NC1用引物对2和10(表1)扩增鼠内皮抑素(ES)模块(NC1结构域的残基130至315)[Sasakiet al.Structure，function and tissue forms of the C-terminal globulardomain of collagen XVIII containing the angiogenesis inhibitor endostatin(含有血管生成抑制剂内皮抑素的胶原XVIII的C-末端球形结构域的结构、功能和组织形式).EMBO J.1998Aug 3；17(15)：4249-56]。将经BglII/NotI切割的PCR片断连接到经BglII/NotI消化的质粒pCR3.1-NC1中。使用引物4(表1)检查序列。
用引物对11和12(表1)从质粒pCR3.1-NC1扩增存在于NC1结构域中的三聚体化结构域[Sasaki et al.Structure，function and tissue formsof the C-terminal globular domain of collagen XVIII containing theangiogenesis inhibitor endostatin(含有血管生成抑制剂内皮抑素的胶原XVIII的C-末端球形结构域的结构、功能和组织形式).EMBO J.1998Aug 3；17(15)：4249-56]。经NotI消化的PCR片段被连接到经NotI消化的质粒pCR3.1-L36中，以得到质粒pCR3.1-L36-Trimer。使用引物4(表1)检查序列。
细胞转染
使用基于lipofectamine(Life Technologies)的系统用合适的表达载体(pCR3.1、pCR3.1-L36、pCR3.1-L36-Trimer、pCR3.1-ES、pCR3.1-NC1或pCR3.1-L36-linker-NC1)转染HEK-293，HT-1080和B16-F10细胞。为了制备稳定的细胞株，在含有0.5mg/ml、0.6mg/ml或3mg/ml G-418(Life Technologies)的DMEM中选择转染的HEK-293、HT-1080和B16-F10细胞。在使用溴化3-(4，5-二甲基噻唑-2-基)-2，5-二苯基四氮唑(MTT，Promega)的分析中连续4天每日分析经不同载体转导的母体肿瘤细胞的增殖。通过SDS-PAGE[Sanz L et al.Gene Therapy(2002)15：1049]，ELISA[Sanz L. et al Gene Therapy(2002)15：1049]和使用抗myc(Life Technologies)或抗内皮抑素(Upstate Biotechnology，LakePlacid，NY，U.S.A.)的mAbs(单克隆抗体)的Western印迹(免疫印迹)方法分析短时间和稳定的细胞群的上清液以确定蛋白的表达。
重组蛋白的表达和纯化
稳定转染的HEK-293细胞被用在无血清的条件培养液中。向培养液中加入蛋白酶(抑肽酶、乌苯美司(bestatin)、亮抑蛋白酶肽、胃酶抑素A和E-64)抑制剂(Sigma Biosciences)的组合物(“鸡尾酒”)以减少蛋白水解。用10,000MWCO Vaflow 50过滤器(Vivascience AG，Germany)浓缩(x10)培养液(约1L)，用PBS(磷酸缓冲盐水)透析，pH 7.4并且上样到1mL HisTrap HP柱(Amersham Biosciences，Uppsala，Sweden)上。含有ES的蛋白被再次在1mL HiTrap Heparin HP柱(Amersham Biosciences)上纯化。用线性梯度的0.1-2.0NaCl进行洗脱。用PBS透析纯化的蛋白并且将其储存在-20℃。ES Fc-结构域(Fc-ES)融合蛋白[Cuo CJ et al.J Cell Biol.2001152：1233]由K.Javaherian博士(Boston Children′s Hospital，Boston，MA，U.S.A.)提供。所述Fc-ES融合蛋白是二聚体融合蛋白(在ES结构域和免疫球蛋白的Fc片段之间)，并且阻断毛细血管形态生成。
分析离心
在20℃、在装备有UV-可视光学系统的Optima XL-A分析超离心机(Beckman-Coulter Inc.)中使用具有Epon炭的3mm双部分中心件的An50Ti转子进行离心实验。在三个连续的速度(5,000、6,000和11,000rpm)在短柱(23μl)中分析低速下的沉降平衡，并且在280nm波长处取得平衡的图像(20小时后)。关注实验中可溶形式的蛋白质物质的保留。沉降速度对照实验在45小时的时间间隔中未显示任何聚集。高速离心(42,000rpm下5小时)后测量参考信号。使用EQASSOC程序得到由完整细胞的表观重量表示的平均分子量[Minton，A.P.(1994)in ModernAnalytical Ultracentrifugation(现代分析超离心)(Schuster，T.，and Laue，T.，eds)，pp.81-93，Birkhauser Boston，Inc.，Cambridge，MA]。在42,000rpm下进行沉降速率实验，并且在280nm处取得吸光度图像。使用如SEDFIT程序中执行的连续分布c(s)Lamm方程模型来计算沉降系数[P.Schuck.Size-Distribution Analysis of Macromolecules by SedimentationVelocity Ultracentrifugation and Lamm Equation Modeling(通过沉降速度超离心和Lamm方程建模的大分子尺寸分布分析).BiophysicalJournal 78(2000)，pp.1606-1619]。根据惯常条件校正这些实验沉降值以使用SEDNTERP程序得到对应的s20，w[T.M.Laue，B.D.Shah，T.M.Ridgeway and S.L. Pelletier，Computer-aided interpretation of analyticalsedimentation data for proteins(蛋白质分析沉降数据的计算机辅助解释).In：S.E.Harding，AJ.Rowe and J.C.Horton，Editors，AnalyticalUltracentrifugation in Biochemistry and Polymer Science(生物化学和聚合物科学中的超离心)，Royal Society of Chemistry，Cambridge，UK(1992)，pp.90-125]。使用SEDFIT程序的附加流体力学分析(即，摩擦系数比例的计算)以得到c(M)分布[P.Schuck.Size-Distribution Analysisof Macromolecules by Sedimentation Velocity Ultracentrifugation andLamm Equation Modeling(通过沉降速度超离心和Lamm方程建模的大分子尺寸分布分析).Biophysical Journal 78(2000)，pp.1606-1619]。
在分析胶上的过滤层析
在室温下通过使用Superdex 200 10/300GL柱的AKTA FPLC系统进行这些实验。以0.5-1.0mg/mL的浓度注入PBS中的不同重组蛋白(L36scFv、L36scFv-NC1ES-、L36scFv-NC1ES+和NC1)样品各0.1mL，并且以流速0.5ml/min分离。使用高和低分子量标志物(Amersham)校正该柱。洗脱体积与排除体积的比和标志物的分子量被设置成指数曲线，使用该曲线来计算样品的分子量。
蛋白酶
从Oncogene Research Products(San Diego，CA，U.S.A.)得到人MMP-1和MMP-9基质金属蛋白酶(MMP)，从Calbiochem(San Diego，CA，U.S.A.)得到人MMPs，MMP-3、MMP-8和MMP-14(MT1-MMP)。从Calbiochem得到人组织蛋白酶L和猪胰弹性蛋白酶。
蛋白水解加工
将浓度为0.6μM的重组蛋白L36scFv-NC1ES-、L36scFv-NC1ES+和NC1在37℃下与以下成分一起孵育10分钟：
-10nM人组织蛋白酶L，在50mM醋酸钠、pH 5.5、硫苏糖醇(DTT)2mM、5mM乙二胺四乙酸(EDTA)中(用于人组织蛋白酶L的处理)；
-25nM猪胰弹性蛋白酶在50mM醋酸钠、pH 6.0中(用于猪弹性蛋白酶的处理)；和
-25nM金属蛋白酶，在50mM Tris-HCl、pH 7.5、10mM CaCl2、150mM NaCl、0.05％Brij-35、50μM ZnSO4中(用于使用金属蛋白酶的处理)。
然后将等分试样在还原条件下、在十二烷基硫酸钠存在下、在12％的聚丙烯酰胺胶(SDS-PAGE)中电泳。用硝酸银(Sigma BioScience)将胶染色，或者使用小鼠抗ES mAb进行Western印迹。
Matrigel中的管形成分析
对于毛细血管样结构(CLS)形成分析，在预先冷冻的72-孔Terasaki板(Nunc，Roskilde，Denmark)上制备基于Matrigel的膜基质(BectonDickinson，Bedford，MA，U.S.A.)，2μl/孔，然后在37℃下固化30分钟。在10μl补充有0.5％FBS的合适培养液中接种3×103ECs(HMEC-I或HUVEC)，所述培养液位于凝胶化的基质上。调整每孔中培养液的总体积至25μl，与此同时，制备细胞并且在用5％CO2润湿的气氛下在37℃下孵育16小时。通过在铺板细胞时向经Matrigel包被的板中加入15μl纯化的重组蛋白来确定分析重组蛋白(L36scFv、L36scFv-NC1ES-、L36scFv-NC1ES+、NC1和ES)对管形成的抑制作用，所述重组蛋白根据使用的细胞株(HMEC-1或HUVEC)在适合的培养液中被稀释至不同浓度(图5D)。实验设三个平行。
数字图像分析
使用SPOT照相机(Diagnostics Instruments，Inc.)从Axiovert 100显微镜(Carl Zeiss，Germany)得到每一个孔的数字图像，并且储存为328×256像素8位灰度的BMP图像。使用基于Matlab 5.3的新的AD软件处理图像[Sanz，L.et al.Microvasc Res.2002May；63(3)：335]。
细胞迁移分析
对于EC迁移研究，用无血清的培养液中的浓度为1.25μg/ml的Matrigel在4℃下过夜包被具有孔尺寸3.0μm和直径6.5mm的聚对苯二甲酸乙二醇酯过滤器插入物(Becton Dickinson)。在20μg/ml纯化的蛋白(L36scFv、L36scFv-NC1ES-、ES、NC1和L36scFv-NC1ES+)存在下、5％CO2润湿的气氛中、37℃下、在无血清的培养液中预孵育HUVEC细胞(1.5×105)30分钟，然后将其转移至上部区室中。向底部区室中加入含有血清的培养液600μl。16小时后，用PBS中的1％戊二醛固定细胞，然后用0.1％结晶紫染色并且在显微镜下观察。
                             II.结果
在内皮管形成分析中内皮抑素和抗层粘连蛋白抗体(L36)的scFv的联
                             合作用
已经证明寡聚ES调节依赖细胞外基质(ECM)的内皮细胞(EC)形态发生[Cuo CJ et al.J Cell Biol.2001 152：1233]。在将细胞铺板至Matrigel上的时候，用Fc-ES形式的二体ES处理显著抑制向管状结构的装配，保持EC分散并且显示与塑料上细胞相似的形态。这些形态变化与当用L36scFv处理EC培养物时观察到的类似(图1)。
            融合蛋白L36scFv-ES的设计和表达
ES源自胶原XVIII的NC1结构域，其以三体形式被蛋白水解释放并且随后转化成约20kDa的单体ES(图2A和2B)。构建了表达不同蛋白的不同嵌合基因。
在一特定实施方案中，构建了称为L36scFv-NC1ES+的嵌合基因，由融合到小鼠胶原XVIII的NC1结构域(残基10至315)的抗层粘连蛋白mAb L36的scFv构成(图2C和3A)。在胶原XVIII的NC1N-末端尾端，存在约60个氨基酸残基的三具体化结构域，通过约70个氨基酸残基的柔性铰链区，大约与约180个氨基酸残基的ES模块连接，该铰链区约含有对蛋白酶敏感的若干位点，蛋白酶在蛋白水解切割后释放单体ES(图2B)。连接胶原三螺旋和NC1三聚体化结构域的“连接肽”对不同MMPs的作用敏感，其负责从母体胶原XVIII释放NC1结构域。因此，为防止L36的氨基末端的NC1结构域的可能切割，用17个氨基酸的“柔性接头”替换所述“连接肽”(图2B和2C)。
类似地，在另一特定实施方案中，构建了称为L36scFv-NC1ES-的嵌合基因，其比前一个基因短，含有L36scFv的编码序列、所述柔性接头以及仅含有NC1的三聚体化结构域(图3A)。
his6myc标签被连接到融合蛋白的C-末端尾端以辅助免疫检测。
将基因构建体克隆至适合的哺乳动物载体中，处于含有人制瘤素M的主要序列的hCMV启动子的控制之下。ES(位置130-315)和小鼠NC1(1-315)的表达载体被用作对照(图3A)。
在HEK 293细胞中建立稳定细胞株，并且纯化条件培养液的融合蛋白。Western印迹分析显示纯化蛋白的迁移模式与预测分子量的一致(图3B)[泳道1：L36scFv，泳道2：L36scFv-NC1ES-、泳道3：L36scFv-NC1ES+、泳道4：NC1、和泳道5：ES]。
在还原条件下，抗myc mAb 9E10产生具有分子量(MW)明显为26、36、67.5和22kDa的单条带(图3B)，其分别对应单体L36scFv、三体L36scFv、L36scFv-NC1和单体ES的计算MW 28.8、37.6、65.6和23.8kDa。在使用含有NC1结构域的蛋白的Western印迹分析中，mAb 9E10识别对应单体ES的约24kDa的单一条带和对应未加工蛋白的39-44kDa的双条带(图3B)。双条带中的两条条带在使用抗ESmAb(Upstate Biotechnology，Lake Placid，NY 12946，USA)的Western印迹中均为阳性。双条带可能由于翻译后修饰或内部蛋白折叠作用。
抗ES mAb还显影出24kDa条带和具有分子量明显约23kDa的另外的条带，其可能对应未标记的ES型单体(图3B)。通过使用L36scFv-NC1Es+蛋白的Western印迹分析，抗ES mAb识别67.5kDa的未加工的融合和未被mAb 9E10检测到的24kDa条带，其对应加工的ES结构域(图3B)。当用抗ES mAb显影时，纯化的ES显示为22-23kDa的双条带(图3B)。
             融合蛋白L36scFv-NC1Es-的表征
通过胶过滤的分析层析方法和使用相同样品的分析离心实验来评价不同融合蛋白的寡聚化状态。通过IMAC(固化的金属亲和层析)纯化融合蛋白L36scFv-NC1ES-，该融合蛋白被以基本上单一的峰(总面积的90％)从胶过滤柱洗脱，洗脱体积对应分子量109kDa，表明该蛋白是三聚体。沉降速率也显示质量为112kDa的主要单一峰，并且沉降平衡经验导致可以调整为三聚体物质但不可以调整为单体或二聚体的质量分布(图4A)。作为整体，这些结果显示融合蛋白L36scFv-NC1ES-的三聚体性质，该性质是由NC1三聚体化结构域给予的特性，因为如胶过滤和沉降速率实验所显示，L36scFv在相同条件下是单体(数据未显示)。三聚体L36scFv(L36scFv-NC1ES-)对固化在塑料上的层粘连蛋白更强的结合亲和力，并且在阻断EC在Matrigel底物上的分化中比单体更有效的多(图4B和4C)。
为了实验的目的，有必要在蛋白酶存在下保持融合蛋白L36scFv-NC1ES-稳定且有功能。因此，测定在与已知活性酶摩尔浓度的各种蛋白酶一起孵育后其功能性。蛋白酶包括几种类型蛋白酶的代表，即，半胱氨酸蛋白酶家族的组织蛋白酶L；金属蛋白酶家族的MMP-1，MMP-3；MMP-8；MMP-9、MMP-14，以及丝氨酸蛋白酶家族的胰弹性蛋白酶。如图4D所示，在大部分测试蛋白酶的存在下，三聚体L36scFv(L36scFv-NC1ES-)未被切割。MMP-14部分切割三聚体(L36scFv-NC1ES-)，但是尽管在反应4小时后，通过ELISA依然检测到功能活性的抗体，只有组织蛋白酶L完全降解融合蛋白L36scFv-NC1ES-。
          融合蛋白L36scFv-NC1Es+的表征
排阻层析显示纯化的融合蛋白L36scFv-NC1ES+以分子量约210kDa的主要峰和表观分子量约117kDa的另一峰洗脱，分子量约210kDa的峰与三聚体一致，分子量约117kDa的峰可能对应缺失ES的部分的片断(图5A)。沉降速率也鉴别出分子量181kDa和83kDa的两种。
重组NC1蛋白以分子量约123kDa的主要峰和其它较小峰洗脱，主要峰对应三聚体种类，较小峰中的一个具有分子量19kDa，对应ES单体(图5B)。通过沉降速率实验鉴别出具有分子量116kDa的主要种类。这些数据表明重组NC1蛋白主要是三聚体，但是是异源的，这有可能由于降解，此结果与在重组NC1蛋白中观察到类似异源性的其它研究者得到的结果一致[Sasaki T.et al.EMBO J.199817：4249-56]。
如所预期的，融合蛋白L36scFv-NC1ES+显示对固化在塑料上的层粘连蛋白的结合亲和力稍微高于对重组NC1蛋白的结合亲和力(图5C)。以相同方式，所述融合蛋白L36scFv-NC1ES+(双特异性的)在阻断Matrigel底物上的EC分化中比重组NC1蛋白(单特异性的)更有效的多(图5D)。
图5E包括EC迁移分析的结果，并且显示在L36scFv-NC1ES+的存在下，HUVEC细胞的迁移小于在存在其它分析重组蛋白(L36scFv和NC1)时所达到的，并且与重组ES时所达到的处于同一数量级。融合蛋白L36scFv-NC1ES+的蛋白水解加工。单体ES和多聚体scFv的产生。
为了通过几种蛋白酶来研究ES产生，孵育融合蛋白L36scFv-NC1ES+，并且通过使用抗ES mAb(Upstate Biotechnology，LakePlacid，NY 12946，USA)的Western印迹来分析反应混合物。用五种分析MMPs(MMP-1、MMP-3、MMP-8、MMP-9和MMP-14)处理融合蛋白，在加工蛋白L36scFv-NC1ES+的有效性中观察到所述MMPs之间的显著不同，MMP-3和MMP-14是最有效的。在4小时内观察到融合蛋白L36scFv-NC1ES+的完全加工。主要累积产物是包含20和25kDa之间分子量的多肽(图6A)。MMP-3、MMP-8、MMP-9和MMP-14产生的ES片断在4小时后累积，表明所述MMPs不能降解它们。如图6A所示，弹性蛋白酶和组织蛋白酶L不仅从融合蛋白L36scFv-NC1ES+产生ES型片断，并且这些酶还快速降解这些片断，在4小时孵育后只有少量的ES保留。该蛋白水解加工模式与在未修饰的鼠NC1蛋白中观察到的几乎相同(图6B)。结果表明向含有识别NC1结构域的表位的位点的抗体片断的N-末端尾端的添加，不干扰融合蛋白被蛋白酶的蛋白水解加工，也不干扰ES产生，所述抗体片断例如scFv。
出于研究蛋白酶产生抗体片断(L36scFv)的有效性的目的，在还原条件下对反应混合物进行SDS-PAGE，并且用硝酸银染色。如图6C所示，产生ES的最有效蛋白酶是MMP-14，其还产生L36scFv。产生的L36scFv和ES稳定并且在4小时后累积，表明在这些实验条件下，蛋白酶不能降解它们。三聚体L36scFv的密度和ES的密度之间的关系表明融合蛋白L36scFv-NC1ES+的平衡加工。使用其它MMPs观察到类似结果(数据未显示)。

Claims (27)

1.基因构建体，至少包含可操作地连接的：
a)第一核酸序列(A)，其包含编码识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的多肽的核酸序列；和
b)第二核酸序列(B)，其包含编码多肽的核酸序列，所述多肽包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区，
其中所述第一核酸序列(A)的3’末端与所述第二核酸序列(B)的5’末端相连。
2.如权利要求1所述的基因构建体，其中所述参与血管生成过程的分子是细胞外基质(ECM)蛋白、血管生成因子或细胞膜受体。
3.如权利要求2所述的基因构建体，其中所述参与血管生成过程的分子是哺乳动物层粘连蛋白。
4.如权利要求3所述的基因构建体，其中所述层粘连蛋白是大鼠、小鼠或人层粘连蛋白。
5.如权利要求1所述的基因构建体，其中所述包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的区域的多肽是识别所述参与血管生成过程的分子的抗体、识别所述参与血管生成过程的分子的抗体的单链Fv片断(scFv)或者识别所述参与血管生成过程的分子的双特异性抗体或双价小分子抗体。
6.如权利要求5所述的基因构建体，其中所述参与血管生成过程的分子是细胞外基质(ECM)蛋白、血管生成因子或细胞膜受体。
7.如权利要求5所述的基因构建体，其中所述包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的区域的多肽是识别哺乳动物层粘连蛋白，优选大鼠、小鼠或人层粘连蛋白的抗体的scFv。
8.如权利要求1所述的基因构建体，其中所述第二核酸序列(B)包含编码哺乳动物胶原XV的NC1结构域的核苷酸序列或者编码哺乳动物胶原XVIII的NC1结构域的核苷酸序列，含有对应所述NC1结构域的三聚体化结构域和内皮抑素(ES)的核苷酸序列，以及编码所述NC1结构域的铰链肽的核苷酸序列。
9.如权利要求1所述的基因构建体，除所述核酸序列(A)和(B)外其还包含第三核酸序列(C)，所述第三核酸序列(C)含有编码柔性结合蛋白的核苷酸序列，其中所述第三核酸序列(C)的5′末端与所述第一核酸序列(A)的3′末端连接。
10.表达盒，其包含与表达控制序列可操作地连接的权利要求1-9中任一权利要求所述的基因构建体。
11.重组载体，其包含权利要求1-9中任一权利要求所述的基因构建体，或者权利要求10所述的表达盒。
12.宿主细胞，其包含权利要求1-9中任一权利要求所述的基因构建体，或者权利要求10所述的表达盒，或者权利要求11所述的重组载体。
13.通过包含在权利要求1-9中任一权利要求所述的基因构建体中的核酸序列的表达获得的融合蛋白。
14.融合蛋白，其包含
a)多肽(A’)，其包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的区域；和
b)多肽(B’)，其包含(i)寡聚化结构域，(ii)血管生成过程中的功能活性区域，和(iii)位于所述寡聚化结构域和所述血管生成过程中的功能活性区域之间的蛋白酶敏感区。
15.如权利要求14所述的融合蛋白，其中所述参与血管生成过程的分子是细胞外基质(ECM)蛋白、血管生成因子或细胞膜受体。
16.如权利要求15所述的融合蛋白，其中所述参与血管生成过程的分子是哺乳动物层粘连蛋白，优选大鼠、小鼠或人层粘连蛋白。
17.如权利要求16所述的融合蛋白，其中所述多肽包含识别和阻断参与血管生成过程的分子的功能活性区的区域，是识别所述参与血管生成过程的分子的抗体、识别所述参与血管生成过程的分子的抗体的单链Fv片断(scFv)或者识别所述参与血管生成过程的分子的双特异性抗体或双价小分子抗体。
18.如权利要求17所述的融合蛋白，其中所述参与血管生成过程的分子是细胞外基质(ECM)蛋白、血管生成因子或细胞膜受体，优选哺乳动物层粘连蛋白，更优选大鼠、小鼠或人层粘连蛋白。
19.如权利要求18所述的融合蛋白，其中所述多肽(A’)是识别哺乳动物层粘连蛋白的抗体的scFv，所述哺乳动物层粘连蛋白优选大鼠、小鼠或人层粘连蛋白。
20.如权利要求14所述的融合蛋白，其中所述多肽(B’)包含哺乳动物胶原XV的NC1结构域或者哺乳动物胶原XVIII的NC1结构域。
21.如权利要求14所述的融合蛋白，其包含位于所述多肽(A’)和(B’)之间的第三多肽(C’)，所述第三多肽(C’)包含柔性结合肽的氨基酸序列。
22.获得权利要求13-21中任一权利要求所述的融合蛋白的方法，所述方法包含在使得所述融合蛋白能够产生的条件下培养权利要求12所述的细胞，并且如果需要的话，分离和纯化所述融合蛋白。
23.药物组合物，其包含权利要求13-21中任一权利要求所述的融合蛋白和至少一种药物可接受的赋形剂。
24.药物组合物，其包含包含如权利要求1-9中任一权利要求所述的基因构建体的载体或者如权利要求10所述的表达盒，以及至少一种药物可接受的赋形剂。
25.权利要求13-21中任一权利要求所述的融合蛋白、权利要求1-9中任一权利要求所述的基因构建体、或者权利要求10所述的表达盒、或者权利要求11所述的载体在制备预防、治疗、阻止或最小化血管生成发展的药物组合物中的用途。
26.权利要求13-21中任一权利要求所述的融合蛋白、权利要求1-9中任一权利要求所述的基因构建体、或者权利要求10所述的表达盒、或者权利要求11所述的载体在制备治疗或预防有血管生成发生的病理过程的药物组合物中的用途。
27.如权利要求26所述的用途，其中所述有血管生成发生的病理过程包括癌症、血管瘤、风湿性关节炎、银屑病、巴尔通氏体病、移植器官排斥、出血、眼部新血管形成、视网膜病变、黄斑变性、新生血管性青光眼、视网膜静脉阻塞、视网膜动脉阻塞、翼状胬肉、红变或角膜新血管形成。
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