BR112013005664A2 - ácidos nucleicos que se ligam a sdf-1 e uso dos mesmos no tratamento de câncer - Google Patents

ácidos nucleicos que se ligam a sdf-1 e uso dos mesmos no tratamento de câncer Download PDF

Info

Publication number
BR112013005664A2
BR112013005664A2 BR112013005664-9A BR112013005664A BR112013005664A2 BR 112013005664 A2 BR112013005664 A2 BR 112013005664A2 BR 112013005664 A BR112013005664 A BR 112013005664A BR 112013005664 A2 BR112013005664 A2 BR 112013005664A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
sdf
nucleic acid
cancer
seq
acid molecule
Prior art date
Application number
BR112013005664-9A
Other languages
English (en)
Other versions
BR112013005664B8 (pt
BR112013005664B1 (pt
Inventor
Werner Purschke
Florian Jarosch
Dirk Eulberg
Sven Klussmann
Klaus Buchner
Christian Maasch
Nicole Dinse
Dirk Zboralski
Original Assignee
Noxxon Pharma Ag
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Noxxon Pharma Ag filed Critical Noxxon Pharma Ag
Publication of BR112013005664A2 publication Critical patent/BR112013005664A2/pt
Publication of BR112013005664B1 publication Critical patent/BR112013005664B1/pt
Publication of BR112013005664B8 publication Critical patent/BR112013005664B8/pt

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/69Boron compounds
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7076Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines containing purines, e.g. adenosine, adenylic acid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7105Natural ribonucleic acids, i.e. containing only riboses attached to adenine, guanine, cytosine or uracil and having 3'-5' phosphodiester links
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/12Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/115Aptamers, i.e. nucleic acids binding a target molecule specifically and with high affinity without hybridising therewith ; Nucleic acids binding to non-nucleic acids, e.g. aptamers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/16Aptamers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/351Conjugate
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/30Special therapeutic applications
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/30Special therapeutic applications
    • C12N2320/31Combination therapy

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

ÁCIDOS NUCLEICOS QUE SE LIGAM A SDF-1 E USO DOS MESMOS NO TRATAMENTO DE CÂNCER. A presente invenção refere-se a uma molécula de ácido nucleico capaz de se ligar a SDF-1, preferencialmente, capaz de inibir SDF-1, em que a molécula de ácido nucleico é para uso em um método para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, para uso em um método para p tratamento de um indivíduo sofrendo de uma doença ou distúrbio ou em risco de desenvolver uma doença ou distúrbio com uma terapia adjunta, ou para uso como um medicamento para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, sendo que a doença ou distúrbio é câncer.

Description

“o 11123 Relatório Descritivo da Patente de Invenção para "ÁCIDOS NU- CLEICOS QUE SE LIGAM A SDF-1 E USO DOS MESMOS NO TRATA- MENTO DE CÂNCER".
Campo da Invenção A presente invenção refere-se a moléculas de ácido nucleico que se ligam ao fator 1 derivado de células do estroma - quimiocina CXC (SDF-1), métodos para o tratamento de câncer, e seu uso na fabricação de um medicamento. Antecedentes da Invenção . 10 O fator 1 derivado de células do estroma [abreviação: SDF-1, si- É nônimos, CXCL12, PBSF (fator de estimulação de crescimento de células as pré-B), TPAR-1 (gene 1 reprimido por TPA), SCYB12, TLSF (fator de estimu- À lação de células de linfoma tímico), hiRH (intercrina humana reduzida em : ' hepatomas)] é uma quimiocina CXC angiogênica que não contém o motivo ELR típico das quimiocinas tipo IL-8 (Salcedo, Wasserman e outros, 1999; Salcedo e Oppenheim 2003), mas se liga e ativa o receptor acoplado à pro- teina G CXCRA4. Como um resultado de combinação alternativo, há duas formas de SDF-1, SDF-1a (69 aminoácidos, SEQ ID NO: 1) e SDF-18 (SEQ ID NO: 2), que, comparada a SDF-1a carrega cinco aminoácidos adicionais noterminal C (Shirozu, Nakano e outros, 1995).
A conservação da sequência de aminoácido entre SDF-1 de di- ferentes espécies é notável: SDF-1a humano (SEQ. ID NO: 1) e SDF-1a mu- rinho (SEQ ID NO: 3) são virtualmente idênticos. Há somente uma única mudança conservativa de V para | na posição 18 (Shirozu, Nakano e outros, 1995) Como o receptor de SDF-1 CXCR4 é amplamente expresso em leucócitos, as células dendríticas maduras, células endoteliais, células cere- brais, e megacariócitos, as atividades de SDF-1 são pleiotrópicas. Essa qui- miocina, mais do que qualquer outra identificada até agora, exibe a mais ampla faixa de funções biológicas. Os efeitos funcionais mais significativos de SDF-1 são: - Atuar no órgão-alvo e acoplar células epiteliais a sítios neovas-
oo 2/1123 culares na parte coroide da retina; - SDF-1 é exigido para manter as células-tronco e células proge- nitoras, por exemplo, células progenitoras hematopoiéticas (geralmente CD34+) na medula óssea do adulto; - SDF-1 suporta a proliferação de células pré-B e aumenta o crescimento de células progenitoras B de medula óssea e induz a migração específica de células pré- e pró-B, enquanto não agindo como um quimioa- traente significativo para células maduras; - SDF-1 é um dos quimioatraentes de células T mais eficazes; e £ 10 - SDF-1 e seu receptor CXCR4 são essenciais para o desenvol- f vimento embrionário.
e e Os níveis de expressão alterados de SDF-1 ou seu receptor É CXCRA4 ou respostas alteradas em direção às moléculas estão associados : . com muitas doenças humanas, tal como retinopatia (Brooks, Caballero e outros, 2004; Butler, Guthrie e outros, 2005; Meleth, Agron et al. 2005); cân- cer de mama (Muller, Homey e outros, 2001 ; Cabioglu, Sahin e outros, 2005), ovários (Scotton, Wilson e outros 2002), pâncreas (Koshiba, Hosotani e outros, 2000), tiroide (Hwang, Chung e outros, 2003) e nasofaringe (Wang, Wu e outros 2005); glioma (Zhou, Larsen e outros 2002); neuroblastoma (Geminder, Sagi-Assif e outros, 2001); leucemia linfocítica crônica de células B (Burger, Tsukada e outros, 2000); síndrome WHIM (WHIM é uma abrevia- ção para Warts, Hipogamaglobulinemia, Infecções, Síndrome de Mielocate- xia) (Gulino, Moratto e outros, 2004; Balabanian, Lagane e outros, 2005b; Kawai, Choi e outros, 2005); síndromes de deficiência imunológica (Arya, Ginsberg e outros, 1999; Marechal, Arenzana-Seisdedos e outros, 1999; So- riano, Martinez e outros, 2002); neovascularização patológica (Salvucci, Yao e outros, 2002; Yamaguchi, Kusano e outros, 2003; Grunewald, Avraham e outros, 2006); inflamação (Murdoch 2000; Fedyk, Jones e outros, 2001; Wang, Guan e outros, 2001); esclerose múltipla (Krumbholz, Theil e outros, 2006); artrite reumatoide / osteoartrite (Buckley, Amft e outros, 2000; Kanbe, Takagishi e outros, 2002; Grassi, Cristino e outros, 2004).
Os tumores (incluindo malignidades e neoplasias sólidas e he-
o 3123 matológicas) são não somente massas de células cancerosas: infiltração de tumores com células imunes é uma característica de câncer. Muitos cânce- res humanos têm uma rede de quimiocina complexa que influencia na ex- tensão e fenótipo desse infiltrado, bem como o crescimento do tumor, sobre- vida, migração e angiogênese. A maior parte dos tumores sólidos contém células do estroma não malignas. De fato, as células do estroma às vezes são de maior número que as células de câncer. As células do estroma pre- dominantes que são encontradas em cânceres são macrófagos, linfócitos, células endoteliais e fibroblastos.
. 10 As células de diferentes tipos de câncer têm perfis diferentes de : expressão de receptor de quimiocina, mas o receptor de SDF-1 CXCRA4 é nas mais geralmente encontrado em células tumorais de camundongos e de hu- f manos: células tumorais de ao menos 23 tipos diferentes de cânceres hu- : : manos de origem epitelial, mesenquimal e hematopoiética que expressam CXCRA4 (Balkwill 2004) com SDF-1 sendo o único ligante conhecido para CXCRA. À parte da medula óssea e tecido linfoide secundário, onde ele é constitutivamente expresso, SDF-1 é encontrado em sítios de tumor primário em linfomas (Corcione, Ottonello e outros, 2000) e tumores de cérebro tanto de linhagem neuronal quanto de linhagem astrocítica. Ademais, ele está pre- senteem altos níveis em câncer de ovário (Scotton, Wilson e outros, 2002) e câncer pancreático (Koshiba, Hosotani e outros, 2000), bem como em sítios de metástase em câncer de mama (Muller, Homey e outros, 2001) e câncer de tiroide (Hwang, Chung e outros, 2003), neuroblastoma e malignidades hematológicas (Geminder, Sagi-Assif e outros, 2001).
Além de CXCRA, outro receptor de SDF-1 foi identificado: RDC1/CXCR7 (Balabanian, Lagane e outros, 2005a, Burns, Summers e ou- tros, 2006). Estudos in vitro e in vivo com linhagens de células de câncer de próstata sugerem que alterações na expressão de CXCR7/RDC1 estão as- sociados com atividades adesivas e invasivas aprimoradas em adição a uma vantagem de sobrevida. Estudos in vitro e in vivo mostraram que ambos os receptores para SDF-1, ou seja, CXCR4 e CXCR7 promovem o crescimento de tumor, por exemplo, câncer de mama, glioblastomas, câncer de ovário,
feseata 4/1123 neuroblastoma, câncer de pulmão, colorretal e câncer de próstata (Burns e outros, 2006; Li e outros, 2008; Scotton e outros, 2002; Yang e outros, 2008; Zagzag e outros, 2008). A expressão de CXCR4 e CXCR7 assim parece ser uma carac- terística geral de vários tumores. O problema que dá suporte à presente invenção é fornecer mei- os que especificamente interagem com SDF-1, sendo que os meios são a- dequados para a prevenção e/ou tratamento de câncer. Outro problema que dá suporte à presente invenção é fornecer - 10 meios que suportem a terapia de câncer, sendo que tal terapia de câncer À tipicamente faz uso de quimioterapia e/ou radiação. ias. Um problema adicional que dá suporte à presente invenção é ] fornecer meios que seja adequados para usar uma terapia adjunta no trata- oc mento de câncer.
Um problema ainda adicional que dá suporte à presente inven- ção é fornecer um meio que seja capaz de quimiossensibilizar um paciente que sofre de câncer e/ou quimiossensibilizar células que formam ou são par- te de um câncer.
Esses e outros problemas que dão suporte à presente invenção são resolvidos pelo assunto das reivindicações independentes em anexo. As modalidades preferenciais podem ser obtidas a partir das reivindicações de- pendentes.
Mais especificamente, o problema que dá suporte à presente in- venção é resolvido em um primeiro aspecto que é também a primeira moda- —lidadedo primeiro aspecto, por uma molécula de ácido nucleico capaz de se ligar a SDF-1, preferencialmente capaz de inibir SDF-1, onde a molécula de ácido nucleico é para uso em um método para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, para uso em um método para o tratamento de um indivíduo que sofre de uma doença ou distúrbio ou que está em risco de desenvolver a doença ou distúrbio como uma terapia adjunta, ou para uso como um medicamento para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, onde a doença ou distúrbio é câncer.
a 5/123 Em uma segunda modalidade do primeiro aspecto que é tam- bém uma modalidade da primeira modalidade do primeiro aspecto, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematológico, onde preferencialmente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que consiste em leucemia e mieloma.
Em uma terceira modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da segunda modalidade do primeiro aspecto, a leucemia é selecionada a partir do grupo que compreende leucemia linfoide crônica e leucemia mieloide aguda. . 10 Em uma quarta modalidade do primeiro aspecto, que é também À uma modalidade da segunda modalidade do primeiro aspecto, o mieloma é A mieloma múltiplo. f Em uma quinta modalidade do primeiro aspecto que é também + , uma modalidade da primeira modalidade do primeiro aspecto, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de tumores sólidos, onde preferencial- mente os tumores sólidos são selecionados a partir do grupo que compreen- de glioblastoma, câncer colorretal, câncer de mama, linfoma, câncer de prós- tata, câncer pancreático, câncer renal, câncer de ovário e câncer de pulmão.
Em uma sexta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta e quinta modalidade do primeiro aspecto, a terapia adjunta sensibiliza o indivíduo, onde o indiví- duo sensibilizado é mais responsivo a uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
Em uma sétima modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da sexta modalidade do primeiro aspecto, a terapia para o tratamento e/ou prevenção das doenças ou distúrbios compreende adminis- trar um agente farmaceuticamente ativo adicional e/ou irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celular.
Em uma oitava modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da sétima modalidade do primeiro aspecto, o agente far- maceuticamente ativo adicional é selecionado a partir do grupo que compre- ende um anticorpo, um agente alquilante, um antimetabólito, um alcaloide de
FA 6/123 planta, um terpenoide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Metotrexato, Tamoxifeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexame- tasona, Flurouracil e Prednisona. Em uma nona modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da oitava modalidade do primeiro aspecto, o anticorpo é selecionado a partir do grupo que compreende Rituximabe, Ofatumumabe, Cetuximabe, Ibritumomabe-Tiuxetano, Tositumomabe, Trastuzumabe, Beva- cizumabe, e Alentuzumabe.
Em uma décima modalidade do primeiro aspecto que é também — 10 uma modalidade da oitava modalidade do primeiro aspecto, o agente alqui- Â lante é selecionado a partir do grupo que compreende cisplatina, carboplati- Es na, oxaliplatina, mecloretamina, ciclofosfamida, clorambucil, doxorrubicina, : doxorrubicina lipossomal, bendamustina, temozolomida e Melfalano. e : Em uma décima primeira modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da oitava modalidade do primeiro aspecto, o anti- metabólito é selecionado a partir do grupo que compreende purina- azatioprina, mercaptopurina, fludarabina, pentostatina, e cladribina.
Em uma décima segunda modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da oitava modalidade do primeiro aspecto, o ter- penoide de planta é selecionado a partir do grupo que compreende um taxa- no mais preferencialmente selecionado a partir do grupo que compreende Docetaxel, Paclitaxel, podofilotoxina e epotilona.
Em uma décima terceira modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da oitava modalidade do primeiro aspecto, o inibi- dor de topoisomerase é selecionado a partir do grupo que compreende camptotecina, irinotecano e mitoxantrona.
Em uma décima quarta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda e décima terceira modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico é ca- paz de bloquear a interação entre SDF-1 e um receptor de SDF-1, onde o receptor de SDF-1 é selecionado a partir do grupo que compreende CXCR4
FE ' 7/123 e CXCR7.
Em uma décima quinta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, décima terceira e décima quarta modalidade do primeiro aspecto, o tratamento ou prevenção da doença ou distúrbio é causado pela molécula de ácido nuclei- co inibindo a interação entre SDF-1 e um receptor de SDF-1.
Em uma décima sexta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, décima Ô terceira, décima quarta e décima quinta modalidade do primeiro aspecto, a ás molécula de ácido nucleico é selecionada a partir do grupo que compreende f uma molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo B, uma molécu- " ' la de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C, uma molécula de ácido —nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A e uma molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo D.
Em uma décima sétima modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima sexta modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo B compreende uma extensão central de nucleotídeos, onde a extensão central de nucleotídeos compreende a seguinte sequência de nucleotídeo: 5' GUGUGAUCUAGAUGUADWGGCUGWUCCUAGUYAGG 3' (SEQ ID NO: 52). Em uma décima oitava modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima sétima modalidade do primeiro aspecto, a extensão central de nucleotídeos compreende a seguinte sequência de nucleotídeo: 5' GUGUGAUCUAGAUGUADUGGCUGAUCCUAGUCAGG 3' (SEQ ID NO: 53). Em uma décima nona modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima sétima e da décima oitava modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do
Ea 81123 tipo B compreende na direção 5' -> 3' uma primeira extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos, e uma segunda extensão terminal de nucleotídeos.
Em uma vigésima modalidade do primeiro aspecto que é tam- bém uma modalidade da décima sétima e da décima oitava modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo B compreende na direção 5' -> 3' uma segunda extensão terminal de nucleotí- deos, a extensão central de nucleotídeos, e uma primeira extensão terminal de nucleotídeos. 2 10 Em uma vigésima primeira modalidade do primeiro aspecto que À é também uma modalidade da décima nona e vigésima modalidade do pri- Es. meiro aspecto, a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende É uma sequência de nucleotídeo de 5' XIX2SVNS 3' e a segunda extensão o terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' BVBSX3X,3', onde X está ou ausente ou é A, X> é G, Xs é C e X, está ou ausente ou é U; ou X; está ausente, X- está ou ausente ou é G, X; está ou ausente ou é C e X, está ausente.
Em uma vigésima segunda modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima nona, vigésima e vigésima primeira modalidade do primeiro aspecto, preferencialmente a vigésima primeira, a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' X;X>CRWG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotí- deos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' KRYSX3X, 3', onde X, está ausente ou é A, X> é G, X; é C e X, está ou ausen- teouéU.
Em uma vigésima terceira modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima nona, vigésima, vigésima primeira e vigésima segunda modalidade do primeiro aspecto, preferencialmente a vi- gésima primeira e a vigésima segunda, a primeira extensão terminal de nu- cleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeos de 5' X;X2CGUG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' UACGX3X, 3', onde X, está ou ausente ou é A, X2 é G, Xgé C, e X, está ou au- sente ou é U, preferencialmente a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' AGCGUG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotí- deo de 5' UACGCU 3º.
Em uma vigésima quarta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima nona, vigésima e vigésima primeira -— 10 modalidade do primeiro aspecto, preferencialmente a vigésima primeira, a : primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de asa! nucleotídeo de 5' XX>SSBS 3' e a segunda extensão terminal de nucleotí- À deos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' BVSSX;X, 3, E onde X, está ausente, X, está ou ausente ou é G, X; está ou au- senteouéC,eX, está ausente, preferencialmente a primeira extensão ter- minal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' GCGUG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5º UACGC 3. Em uma vigésima quinta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima sexta, décima sétima, décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigésima ter- ceira e vigésima quarta modalidade do primeiro aspecto, a molécula de áci- do nucleico que se liga a SDF-1 do tipo B compreende uma sequência de nucleotídeo de acordo com qualquer uma dentre SEQ ID NO: 5 a SEQ ID NO:20eSEQIDNO:22aSEQID NO: 28, preferencialmente qualquer uma dentre SEQ ID NO: 5 a SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 22 e SEQ ID NO: 28, mais preferencialmente qualquer uma dentre SEQ ID NO: 22 e SEQ ID NO: 28. Em uma vigésima sexta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima sexta modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C compreende
ESSSSo À 10/123 uma extensão central de nucleotídeos, sendo que a extensão central de nu- cleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de GGUYAGGGCU- HRXAAGUCGG (SEQ ID NO: 108), onde X, está ou ausente ou é A.
Em uma vigésima sétima modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da vigésima sexta modalidade do primeiro aspec- to, a extensão central de nucleotídeos compreende uma sequência de nu- cleotídeo de 5º GGUYAGGGCUHRAAGUCGG 3' (SEQ ID NO: 109), 5' GGUYAGGGCUHRAGUCGG 3' (SEQ ID NO: 110) ou 5º GGUUAGGG- CUHGAAGUCGG 3' (SEQ ID NO: 111), preferencialmente 5' GGUUAGGG- À CUHGAAGUCGG 3' (SEQ ID NO: 111). ias Em uma vigésima oitava modalidade do primeiro aspecto que é H também uma modalidade da vigésima sexta e da vigésima sétima modalida- oo de do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C compreende na direção 5' -> 3' uma primeira extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos, e uma segunda extensão terminal de nucleotídeos.
Em uma vigésima oitava modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da vigésima sexta e vigésima sétima modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C compreende na direção 5' -> 3' uma primeira extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos, e uma segunda extensão terminal de nucleotídeos.
Em uma vigésima nona modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da vigésima sexta e da vigésima sétima modalida- de do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C compreende na direção 5' -> 3' uma segunda extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos, e uma primeira extensão terminal de nucleotídeos.
Em uma trigésima modalidade do primeiro aspecto que é tam- bém uma modalidade da vigésima oitava e da vigésima nona modalidade do primeiro aspecto, a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende ea 11/1283 uma sequência de nucleotídeo de 5' RKSBUSNVGR 3' (SEQ ID NO: 138) e a segunda extensão de nucleotídeo compreende uma sequência de nucleo- tídeo de 5! YYNRCASSMY 3' (SEQ ID NO: 139), preferencialmente, a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' RKSBUGSVGR 3' (SEQ ID NO: 140) e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' YCNRCASSMY 3' (SEQ ID NO: 141). Em uma trigésima primeira modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da vigésima oitava e da vigésima nona modali- dade do primeiro aspecto, a primeira extensão terminal de nucleotídeos À compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' XsSSSV 3' e a segunda isa. extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotí- É deo de 5' BSSSXs 3', onde Xs está ou ausente ou é S, eo preferencialmente, a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5º SGGSR 3' e a segunda extensão de terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucle- otídeo de 5' YSCCS 3'. Em uma trigésima segunda modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da vigésima oitava e da vigésima nona modali- dadedo primeiro aspecto, (a) a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' GCCGG 3' e a segunda extensão ter- minal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5 CCGGC 3'; ou (b) a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' CGUGCGCUUGAGAUAGG 3' (SEQ ID NO: 220) e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' CUGAUUCUCACG 3' (SEQ ID NO: 221); ou (c) a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' UGAGAUAGG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5 CUGAUUCUCA 3' (SEQ ID NO: 222); ou
Sana 121123 (d) a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' GAGAUAGG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' CUGAUUCUC 3".
Em uma trigésima terceira modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da vigésima sexta, vigésima sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, e trigésima segunda modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C compreende uma sequência de nucleotídeo de acordo com qualquer uma dentre SEQ ID NO: 95 a SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 112 a Í SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 223 e SEQ ID NO: 224, E preferencialmente qualquer um dentre SEQ ID NO: 120, SEQ ID F NO: 128, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: ssa 223 e SEQ ID NO: 224.
Em uma trigésima quarta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da décima sexta modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A compreende uma extensão central de nucleotídeos, onde a extensão central de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' AAAGYRACAHGUMAA- — XAUGAAAGGUA C 3' (SEQ ID NO: 74), onde X, está ou ausente ou é A.
Em uma trigésima quinta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da trigésima quárta modalidade do primeiro aspec- to, a extensão central de nucleotídeos compreende uma sequência de nu- cleotídeo de 5' ARAG YRAC AHGUM AAUGAAAGGUARC 3' (SEQ ID NO: 75) ouS AAAGYRACAHGUMAAAUGAAAGGUARC 3' (SEQ ID NO: 76), ou 5' AMAGYAACAHGUCAAUGAAAGGUARC 3'(SEQ ID NO: 77), preferenci- almente a extensão central de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5º ANMAGYAACAHGUCAAUGAAAGGUARC 3' (SEQ ID NO: 77).
Em uma trigésima sexta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da trigésima quarta e da trigésima quinta modali- dade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1
Pacanaea 13/123 o | do tipo A compreende na direção 5' -> 3' uma primeira extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos, e uma segunda extensão terminal de nucleotídeos. Em uma trigésima sétima modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da trigésima quarta e da trigésima quinta modali- dade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A compreende na direção 5' -> 3' uma segunda extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos, e uma primeira extensão terminal de nucleotídeos.
Em uma trigésima oitava modalidade do primeiro aspecto que é . também uma modalidade da trigésima sexta e da trigésima sétima modali- PER dade do primeiro aspecto, a primeira extensão terminal de nucleotídeos É compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' X;XoNNBV 3' e a segunda E extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleoti- deode5' BNBNX3X, 3", onde X, está ou ausente ou é R, Xré S, Xsé S e X, está ou au- sente ou é Y; ou X, está ausente, X> está ou ausente ou é S, X; está ou ausente ou é S; e X, está ausente.
Em uma trigésima nona modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da trigésima sexta, da trigésima sétima e da trigé- sima oitava modalidade do primeiro aspecto, preferencialmente a trigésima oitava modalidade do primeiro aspecto, a primeira extensão terminal de nu- cleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5 RSHRYR 3 ea segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeos de 5' YRYDSY 3', preferencialmente, a primeira extensão ter- minal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5 GCUGUG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' CGCAGC 3.
Em uma quadragésima modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da trigésima sexta, trigésima sétima e trigésima oitava, preferencialmente a trigésima oitava modalidade do primeiro aspecto,
o 14/123 a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' X-BBBS 3', e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' SBBVX; 3', onde X, está ou ausente ou é S e X; está ou ausente ou é S; preferencialmente, a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' CUGUG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotí- deo de 5º CGCAG 3'; ou a primeira extensão terminal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' GCGUG 3, e a segunda extensão ter- Á minal de nucleotídeos compreende uma sequência de nucleotídeo de 5' a. CGCGC 3. : Em uma quadragésima primeira modalidade do primeiro aspecto ass que é também uma modalidade da trigésima quarta, trigésima quinta, trigé- sima sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona e quadragési- ma modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A compreende uma sequência de nucleotídeo de acordo com qualquer uma dentre SEQ ID NO: 60 a SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 78 a SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 84 a SEQ ID NO: 87, SEQ ID NO: 89 a SEQ IDNO: 94,e SEQ ID NO: 145, preferencialmente qualquer uma dentre SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 78, SEQ ID NO: 84, e SEQ ID NO: 146, mais preferencialmente qualquer uma dentre SEQ ID NO: 84 e SEQ ID NO: 146.
Em uma quadragésima segunda modalidade do primeiro aspec- toque 6é também uma modalidade da décima sexta modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo D com- preende uma sequência de nucleotídeo de acordo com qualquer uma dentre SEQ ID NO: 142 a SEQ ID NO: 144. Em uma quadragésima terceira modalidade do primeiro aspecto — queé também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quin- ta, sexta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, décima terceira, décima quarta, décima quinta, décima sexta, décima sétima,
A aaraes 15/123 décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigésima terceira, vigésima quarta, vigésima quinta, vigésima sexta, vigési- ma sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, trigésima segunda, trigésima terceira, trigésima quarta, trigésima quinta, tri- gésima sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona, quadragé- sima, quadragésima primeira e quadragésima segunda modalidade do pri- meiro aspecto, o SDF-1 é SDF-1 humano, onde preferencialmente o SDF-1 humano é SDF-1 humano alfa ou beta, mais preferencialmente o SDF-1 hu- mano é SDF-1 humano alfa. Em uma quadragésima quarta modalidade do primeiro aspecto À que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quin- E ta, sexta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, : décima terceira, décima quarta, décima quinta, décima sexta, décima sétima, ME décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigésima terceira, vigésima quarta, vigésima quinta, vigésima sexta, vigési- ma sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, trigésima segunda, trigésima terceira, trigésima quarta, trigésima quinta, tri- gésima sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona, quadragé- sima, quadragésima primeira, quadragésima segunda e quadragésima ter- r 20 ceiramodalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico compre- ende uma modificação, onde a modificação é preferencialmente uma porção de alto peso molecular e/ou onde a modificação preferencialmente permite modificar as características da molécula de ácido nucleico em termos de tempo de residência no corpo humano ou de animal, preferencialmente o corpohumano.
Em uma quadragésima quinta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da quadragésima quarta modalidade do pri- meiro aspecto, a modificação é selecionada a partir do grupo que compre- ende uma porção HES, uma porção PEG, modificações biodegradáveis e combinações dessas.
Em uma quadragésima sexta modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da quadragésima quinta modalidade do pri-
Dessnães 16/1283 meiro aspecto, a modificação é uma porção PEG consistindo de um PEG linear ou ramiíficado, onde preferencialmente o peso molecular do PEG linear ou ramificado é de aproximadamente 20.000 a 120.000 Da, mais preferenci- almente de aproximadamente 30.000 a 80.000 Da e mais preferencialmente aproximadamente 40.000 Da.
Em uma quadragésima sétima modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da quadragésima quinta modalidade do pri- meiro aspecto, a modificação é uma porção HES, onde preferencialmente o peso molecular da porção HES é de aproximadamente 10.000 a 200.000 Da, mais preferencialmente de aproximadamente 30.000 a 170.000 Da e mais À preferencialmente aproximadamente 150.000 Da.
E. Em uma quadragésima oitava modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da quadragésima quarta, quadragésima Essas quinta, quadragésima sexta e quadragésima sétima modalidade do primeiro aspecto, a modificação é acoplada à molécula de ácido nucleico via um li- gante, onde preferencialmente o ligante é um ligante bioestável ou biodegra- dável.
Em uma quadragésima nona modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da quadragésima quarta, quadragésima quinta, quadragésima sexta, quadragésima sétima e quadragésima oitava modalidade do primeiro aspecto, a modificação é acoplada à molécula de ácido nucleico no nucleotídeo 5"-terminal da molécula de ácido nucleico e/ou no nucleotídeo 3'-terminal da molécula de ácido nucleico e/ou a um nucleotí- deo da molécula de ácido nucleico entre o nucleotídeo 5'-terminal da molé- culade ácido nucleico e o nucleotídeo 3'-terminal da molécula de ácido nu- cleico.
Em uma quinquagésima modalidade do primeiro aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, décima terceira, décima quarta, décima quinta, décima sexta, décima sétima, décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigé- sima terceira, vigésima quarta, vigésima quinta, vigésima sexta, vigésima
Eat 171123 sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, trigé- sima segunda, trigésima terceira, trigésima quarta, trigésima quinta, trigési- ma sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona, quadragésima, quadragésima primeira, quadragésima segunda, quadragésima terceira, —quadragésima quarta, quadragésima quinta, quadragésima sexta, quadragé- sima sétima, quadragésima sétima, quadragésima oitava e quadragésima nona modalidade do primeiro aspecto, os nucleotídeos da molécula de ácido nucleico ou os nucleotídeos formando a molécula de ácido nucleico são L- nucleotídeos.
Em uma quinquagésima primeira modalidade do primeiro aspec- É to que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, o quinta, sexta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segun- É da, décima terceira, décima quarta, décima quinta, décima sexta, décima mESEL sétima, décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigésima terceira, vigésima quarta, vigésima quinta, vigésima sex- ta, vigésima sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, trigésima segunda, trigésima terceira, trigésima quarta, trigésima quinta, trigésima sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona, quadragésima, quadragésima primeira, quadragésima segunda, quadragé- sima terceira, quadragésima quarta, quadragésima quinta, quadragésima sexta, quadragésima sétima, quadragésima sétima, quadragésima oitava, quadragésima nona e quinquagésima modalidade do primeiro aspecto, a molécula de ácido nucleico é uma molécula de ácido L-nucleico.
O problema que dá suporte à presente invenção é resolvido em um segundo aspecto que é também a primeira modalidade do segundo as- pecto, por uma composição farmacêutica compreendendo como um primeiro agente farmaceuticamente ativo a molécula de ácido nucleico de acordo com qualquer uma dentre a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sé- tima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, décima tercei- ra, décima quarta, décima quinta, décima sexta, décima sétima, décima oita- va, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigésima terceira, vigésima quarta, vigésima quinta, vigésima sexta, vigésima sétima,
A 18/123 vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, trigésima se- gunda, trigésima terceira, trigésima quarta, trigésima quinta, trigésima sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona, quadragésima, quadragé- sima primeira, quadragésima segunda, quadragésima terceira, quadragési- ma quarta, quadragésima quinta, quadragésima sexta, quadragésima séti- ma, quadragésima sétima, quadragésima oitava, quadragésima nona, quin- quagésima e quinquagésima primeira modalidade do primeiro aspecto, e opcionalmente um constituinte adicional, onde o constituinte adicional é se- lecionado a partir do grupo que compreende um excipiente farmaceutica- mente aceitável, um carreador farmaceuticamente aceitável e um agente  farmaceuticamente ativo adicional, e onde a composição farmacêutica é pa- Is. ra uso em um método para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou ' distúrbio, ou para uso em um método para o tratamento de um indivíduo que ear sofre de uma doença ou distúrbio ou que está em risco de desenvolver uma doença ou distúrbio como uma terapia adjunta, ou para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, onde a doença ou distúrbio é cân- cer.
Em uma segunda modalidade do segundo aspecto que é tam- bém uma modalidade da primeira modalidade do segundo aspecto, a terapia adjunta sensibiliza o indivíduo, onde o indivíduo sensibilizado é mais respon- sivo a uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
Em uma terceira modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da segunda modalidade do segundo aspecto, a terapia pa- ra o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio compreende adminis- trar um agente farmaceuticamente ativo adicional e/ou irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celular.
Em uma quarta modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda e terceira modalidade do segundo aspecto, o agente farmaceuticamente ativo adicional é um agente farmaceu- ticamente ativo selecionado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente alquilante, um antimetabólito, um alcaloide de planta, preferenci- almente vincristina, um terpenoide de planta, um inibidor de topoisomerase,
Foo 19/1238 Leucovorina, Metotrexato, Tamoxigeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezo- mibe, Dexametasona, Flurouracil e Prednisona.
Em uma quinta modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da quarta modalidade do segundo aspecto, o anticorpo é selecionado a partir do grupo que compreende Rituximabe, Ofatumumabe, Cetuximabe, Ibritumomabe-Tiuxetano, Tositumomabe, Trastuzumabe, Beva- cizumabe e Alentuzumabe.
Em uma sexta modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da quarta modalidade do segundo aspecto, o agente alqui- lante é selecionado a partir do grupo que consiste em cisplatina, carboplati- É na, oxaliplatina, mecloretamina, ciclofosfamida, clorambucil, doxorrubicina, E doxorrubicina lipossomal, bendamustina, temozolomida e Meifalano. ô Em uma sétima modalidade do segundo aspecto que é também eo uma modalidade da quarta modalidade do segundo aspecto, o antimetabólito é selecionado a partir do grupo que compreende purina-azatioprina, mercap- topurina, fludarabina, pentostatina, e cladribina.
Em uma oitava modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da quarta modalidade do segundo aspecto, o terpenoide de planta é selecionado a partir do grupo que compreende um taxano mais pre- ferencialmente selecionado a partir do grupo que compreende Docetaxel, Paclitaxel, podofilotoxina e epotilona.
Em uma nona modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da quarta modalidade do segundo aspecto, o inibidor de topoisomerase é selecionado a partir do grupo que compreende camptoteci- na, irinotecano e mitoxantrona.
Em uma décima modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, séti- ma, oitava e nona modalidade do segundo aspecto, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematológico, onde preferencial- mente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo de leucemia e mieloma. | Em uma décima primeira modalidade do segundo aspecto que é
Fado 20/123 também uma modalidade da décima modalidade do segundo aspecto, a leu- cemia é selecionada a partir do grupo que compreende leucemia linfoide crônica e leucemia mieloide aguda.
Em uma décima segunda modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da décima modalidade do segundo aspecto, o mie- loma é mieloma múltiplo.
Em uma décima terceira modalidade do segundo aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava e nona modalidade do segundo aspecto, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de tumores sólidos, onde preferencial- : mente os tumores sólidos são selecionados a partir do grupo que compreen- E de glioblastoma, câncer colorretal, câncer de mama, linfoma, câncer de prós- À tata, câncer pancreático, câncer renal, câncer de ovário e câncer de pulmão. aa O problema que dá suporte à presente invenção é resolvido em umterceiro aspecto que é também a primeira modalidade do terceiro aspec- to, por um medicamento compreendendo uma ou várias dosagens unitárias de ao menos um primeiro agente farmaceuticamente ativo, onde o primeiro agente farmaceuticamente ativo é uma molécula de ácido nucleico capaz de se ligar a SDF-1, como definido em qualquer uma dentre a primeira, segun- da, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, oitava, nona, décima, décima pri- meira, décima segunda, décima terceira, décima quarta, décima quinta, dé- cima sexta, décima sétima, décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigésima terceira, vigésima quarta, vigésima quinta, vigésima sexta, vigésima sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, trigésima segunda, trigésima terceira, trigésima quarta, trigésima quinta, trigésima sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona, quadragésima, quadragésima primeira, quadragésima se- gunda, quadragésima terceira, quadragésima quarta, quadragésima quinta, quadragésima sexta, quadragésima sétima, quadragésima sétima, quadra- —gésima oitava, quadragésima nona, quinquagésima e quinquagésima primei- ra modalidade do primeiro aspecto, onde o medicamento é para uso em um método para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, ou
FO 211123 para uso em um método para o tratamento de um indivíduo que sofre de uma doença ou distúrbio ou que está em risco de desenvolver uma doença ou distúrbio como uma terapia adjunta, ou para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, onde a doença ou distúrbio é câncer.
Em uma segunda modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da primeira modalidade do terceiro aspecto, a terapia ad- junta sensibiliza o indivíduo, onde o indivíduo sensibilizado é mais responsi- vo a uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
Em uma terceira modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da segunda modalidade do terceiro aspecto, a terapia para o tratamento e/ou prevenção das doenças ou distúrbio compreende adminis- E trar um agente farmaceuticamente ativo adicional e/ou irradiar o indivíduo À elou cirurgia e/ou terapia celular. eee Em uma quarta modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da primeira, da segunda e da terceira modalidade, prefe- rencialmente a primeira modalidade, do terceiro aspecto, o medicamento compreende um agente farmaceuticamente ativo adicional, preferencialmen- te uma ou várias dosagens unitárias de um agente farmaceuticamente ativo adicional, onde o agente farmaceuticamente ativo adicional é selecionado a partirdo grupo que compreende um anticorpo, um agente alquilante, um an- timetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vincristina, um terpe- noide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Metotrexato, Tamoxifeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona e Flu- rouracil.
Em uma quinta modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da terceira modalidade do terceiro aspecto, o medicamento compreende o agente farmaceuticamente ativo adicional, preferencialmente uma ou várias dosagens unitárias do agente farmaceuticamente ativo adi- cional, onde o agente farmaceuticamente ativo adicional é selecionado a —partirdo grupo que compreende um anticorpo, um agente alquilante, um an- timetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vincristina, um terpe- noide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Metotrexato,
ad 221123 Tamoxifeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Flu- rouracil e Prednisona.
Em uma sexta modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do terceiro aspecto, o anticorpo é selecionado a partir do grupo que compreende Rituximabe, Ofa- tumumabe, Cetuximabe, Ibritumomabe-Tiuxetano, Tositumomabe, Trastu- zumabe, Bevacizumabe e Alentuzumabe.
Em uma sétima modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do terceiro aspecto, o agente alquilante é selecionado a partir do grupo que consiste em cisplatina, É carboplatina, oxaliplatina, mecloretamina, ciclofosfamida, clorambucil, doxor- Ns rubicina, doxorrubicina lipossomal, bendamustina, temozolomida e Melfala- ; no.
F NEEaL Em uma oitava modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do terceiro aspecto, o antimetabólito é selecionado a partir do grupo que compreende purina- azatioprina, mercaptopurina, fludarabina, pentostatina, e cladribina.
Em uma nona modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do terceiro aspecto, o terpenoide de planta é selecionado a partir do grupo que compreende um taxano mais preferencialmente selecionado a partir do grupo que compreen- de Docetaxel, Paclitaxel, podofilotoxina e epotilona.
Em uma décima primeira modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do terceiro as- —pecto,o inibidor de topoisomerase é selecionado a partir do grupo que com- preende camptotecina, irinotecano e mitoxantrona.
Em uma décima primeira modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona e décima modalidade do terceiro aspecto, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematológico, onde pre- ferencialmente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que compreende leucemia e mieloma.
a 23/123 Em uma décima segunda modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da décima primeira modalidade do terceiro aspec- to, a leucemia é selecionada a partir do grupo que compreende leucemia linfoide crônica e leucemia mieloide aguda.
Em uma décima terceira modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da décima primeira modalidade do terceiro aspec- to, o mieloma é mieloma múltiplo.
Em uma décima quarta modalidade do terceiro aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona e décima modalidade do terceiro aspecto, o câncer é À um câncer selecionado a partir do grupo de tumores sólidos, onde preferen- E cialmente os tumores sólidos são selecionados a partir do grupo que com- À preende glioblastoma, câncer colorretal, câncer de mama, linfoma, câncer de 2 próstata, câncer pancreático, câncer renal, câncer de ovário e câncer de pulmão.
O problema que dá suporte à presente invenção é resolvido em um quarto aspecto que é também a primeira modalidade do quarto aspecto, pelo uso de uma molécula de ácido nucleico como definido em qualquer uma dentre a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, décima terceira, décima quarta, décima quinta, décima sexta, décima sétima, décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigésima terceira, vi- gésima quarta, vigésima quinta, vigésima sexta, vigésima sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, trigésima segunda, tri- gésima terceira, trigésima quarta, trigésima quinta, trigésima sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona, quadragésima, quadragésima pri- meira, quadragésima segunda, quadragésima terceira, quadragésima quar- ta, quadragésima quinta, quadragésima sexta, quadragésima sétima, qua- dragésima sétima, quadragésima oitava, quadragésima nona, quinquagési- mae quinquagésima primeira modalidade do primeiro aspecto, para a fabri- cação de um medicamento para o tratamento e/ou prevenção de uma doen- ça ou distúrbio, ou para uso em um método para o tratamento de um indiví-
ra 24/1123 duo que sofre de uma doença ou distúrbio ou que está em risco de desen- volver uma doença ou distúrbio como uma terapia adjunta, onde a doença ou distúrbio é câncer.
Em uma segunda modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da primeira modalidade do quarto aspecto, a terapia adjun- ta sensibiliza o indivíduo, onde o indivíduo sensibilizado é mais responsivo a uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
Em uma terceira modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da segunda modalidade do quarto aspecto, a terapia para o tratamento e/ou prevenção das doenças ou distúrbios compreende adminis- : trar um agente farmaceuticamente ativo adicional e/ou irradiar o indivíduo EE e/ou cirurgia e/ou terapia celular.
É Em uma quarta modalidade do quarto aspecto que é também EE uma modalidade da primeira, segunda e terceira modalidade, preferencial- mente a primeira modalidade, do quarto aspecto, o medicamento é usado em combinação com um agente farmaceuticamente ativo adicional, o medi- camento é usado em combinação com um agente farmaceuticamente ativo adicional, onde o agente farmaceuticamente ativo adicional é um agente farmaceuticamente ativo selecionado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente alquilante, um antimetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vincristina, um terpenoide de planta, um inibidor de topoi- somerase, Leucovorin, Metotrexato, Tamoxifeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Flurouracil e Prednisona.
Em uma quinta modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da terceira modalidade do quarto aspecto, o agente farma- ceuticamente ativo adicional é um agente farmaceuticamente ativo adicional selecionado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente al- quilante, um antimetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vin- cristina, um terpenoide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Metotrexato, Tamoxifeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexame- tasona, Flurouracil e Prednisona. | Em uma sexta modalidade do quarto aspecto que é também ooo 25/123 uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do quarto aspecto, o an- ticorpo é selecionado a partir do grupo que compreende Rituximabe, Cetu- ximabe, Ibritumomabe-Tiuxetano, Tositumomabe, Trastuzumabe, Bevacizu- mabe e Alentuzumabe.
Em uma sétima modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do quarto aspecto, o a- gente alquilante é selecionado a partir do grupo que consiste em cisplatina, carboplatina, oxaliplatina, mecloretamina, ciclofosfamida, clorambucil, doxor- rubicina, doxorrubicina lipossomal, bendamustina, temozolomida e Meilfala- no.
À Em uma oitava modalidade do quarto aspecto que é também sa. uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do quarto aspecto, o an- f timetabólito é selecionado a partir do grupo que compreende purina- e azatioprina, mercaptopurina, fludarabina, pentostatina, e cladribina.
Em uma nona modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do quarto aspecto, o terpenoi- de de planta é selecionado a partir do grupo que compreende um taxano, mais preferencialmente selecionado a partir do grupo que compreende Do- cetaxel, Paclitaxel, podofilotoxina e epotilona.
Em uma décima primeira modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do quarto aspec- to, o inibidor de topoisomerase é selecionado a partir do grupo que compre- ende camptotecina, irinotecano e mitoxantrona.
Em uma décima primeira modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da quarta e da quinta modalidade do quarto aspec- to, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematoló- gico, onde preferencialmente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que compreende leucemia e mieloma.
Em uma décima segunda modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da décima primeira modalidade do quarto aspecto, a leucemia é selecionada a partir do grupo que compreende leucemia linfoi- de crônica e leucemia mieloide aguda.
aaa 26/123 Em uma décima terceira modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da décima primeira modalidade do quarto aspecto, o mieloma é mieloma múltiplo.
Em uma décima quarta modalidade do quarto aspecto que é também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona e décima modalidade do quarto aspecto, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de tumores sólidos, onde preferen- cialmente os tumores sólidos são selecionados a partir do grupo que com- preende glioblastoma, câncer colorretal, câncer de mama, linfoma, câncer de próstata, câncer pancreático, câncer renal, câncer de ovário e câncer de f pulmão. na O problema que dá suporte à presente invenção é resolvido em É um quinto aspecto que é também a primeira modalidade do quinto aspecto, ee por um método para o tratamento de um indivíduo que sofre ou está em ris- code desenvolver câncer, onde o método compreende: - uma etapa (a) de administrar ao indivíduo uma quantidade far- maceuticamente eficaz de uma molécula de ácido nucleico capaz de se ligar a SDF-1 como definido em qualquer uma dentre a primeira modalidade do quarto aspecto, pelo uso de uma molécula de ácido nucleico como definido em qualquer uma dentre a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, décima ter- ceira, décima quarta, décima quinta, décima sexta, décima sétima, décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima primeira, vigésima segunda, vigé- sima terceira, vigésima quarta, vigésima quinta, vigésima sexta, vigésima sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigésima, trigésima primeira, trigé- sima segunda, trigésima terceira, trigésima quarta, trigésima quinta, trigési- ma sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigésima nona, quadragésima, quadragésima primeira, quadragésima segunda, quadragésima terceira, quadragésima quarta, quadragésima quinta, quadragésima sexta, quadragé- sima sétima, quadragésima sétima, quadragésima oitava, quadragésima no- na, quinquagésima e quinquagésima primeira modalidade do primeiro aspec- to. | dd 27/1123 Em uma segunda modalidade do quinto aspecto que é também uma modalidade da primeira modalidade do quinto aspecto, o método com- preende: - uma etapa (b) de irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celular e/ou administrar uma quantidade farmaceuticamente eficaz de um agente farmaceuticamente ativo adicional ao indivíduo, onde o agente far- maceuticamente ativo adicional é um agente farmaceuticamente ativo sele- cionado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente alqui- lante, um antimetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vincristi- na, um terpenoide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Me- É totrexato, Tamoxifeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexameta- Nas sona, Flurouracil, e Prednisona.
É Em uma terceira modalidade do quinto aspecto que é também ERES uma modalidade da segunda modalidade do quinto aspecto, a quantidade farmaceuticamente eficaz de uma molécula de ácido nucleico capaz de se ligar a SDF-1 como definido em qualquer uma dentre a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, oitava, nona, décima, décima primeira, décima segunda, décima terceira, décima quarta, décima quinta, décima sexta, décima sétima, décima oitava, décima nona, vigésima, vigésima pri- meira, vigésima segunda, vigésima terceira, vigésima quarta, vigésima quin- ta, vigésima sexta, vigésima sétima, vigésima oitava, vigésima nona, trigési- ma, trigésima primeira, trigésima segunda, trigésima terceira, trigésima quar- ta, trigésima quinta, trigésima sexta, trigésima sétima, trigésima oitava, trigé- sima nona, quadragésima, quadragésima primeira, quadragésima segunda, —quadragésima terceira, quadragésima quarta, quadragésima quinta, quadra- gésima sexta, quadragésima sétima, quadragésima sétima, quadragésima oitava, quadragésima nona, quinquagésima e quinquagésima primeira mo- dalidade do primeiro aspecto é administrada como uma terapia adjunta ou parte de uma terapia adjunta.
Em uma quarta modalidade do quinto aspecto que é também uma modalidade da terceira modalidade do quinto aspecto, a terapia adjunta sensibiliza o indivíduo, onde o indivíduo sensibilizado é mais responsivo a oo 28/123 uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
Em uma quinta modalidade do quinto aspecto que é também uma modalidade da quarta modalidade do quinto aspecto, a terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio compreende administrar um agente farmaceuticamente ativo adicional e/ou irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celular como executado na etapa (b).
Em uma sexta modalidade do quinto aspecto que é também uma modalidade da segunda, terceira, quarta e da quinta modalidade do quinto aspecto, o anticorpo é selecionado a partir do grupo que compreende Ritu- ximabe, Cetuximabe, lbritumomabe-Tiuxetano, Tositumomabe, Trastuzuma- Í be, Bevacizumabe e Alentuzumabe.
e Em uma sétima modalidade do quinto aspecto que é também É uma modalidade da segunda, terceira, quarta e da quinta modalidade do ur quinto aspecto, o agente alquilante é selecionado a partir do grupo que con- siste em cisplatina, carboplatina, oxaliplatina, mecloretamina, ciclofosfamida, clorambucil, doxorrubicina, doxorrubicina lipossomal, bendamustina, temozo- lomida e Melfalano.
Em uma oitava modalidade do quinto aspecto que é também uma modalidade da segunda, terceira, quarta e da quinta modalidade do quinto aspecto, o antimetabólito é selecionado a partir do grupo que com- preende purina-azatioprina, mercaptopurina, fludarabina, pentostatina, e cla- dribina.
Em uma nona modalidade do quinto aspecto que é também uma modalidade da segunda, terceira, quarta e da quinta modalidade do quinto aspecto, o terpenoide de planta é selecionado a partir do grupo que compre- ende um taxano, mais preferencialmente selecionado a partir do grupo que compreende Docetaxel, Paclitaxel, podofilotoxina e epotilona.
Em uma décima primeira modalidade do quinto aspecto que é também uma modalidade da segunda, terceira, quarta e da quinta modalida- dedo quinto aspecto, o inibidor de topoisomerase é selecionado a partir do grupo que compreende camptotecina, irinotecano e mitoxantrona. | Em uma décima primeira modalidade do quinto aspecto que é eo 29/123 também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona e décima modalidade do quinto aspecto, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematológico, onde pre- ferencialmente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que compreende leucemia e mieloma.
Em uma décima segunda modalidade do quinto aspecto que é também uma modalidade da décima primeira modalidade do quinto aspecto, a leucemia é selecionada a partir do grupo que compreende leucemia linfoi- de crônica e leucemia mieloide aguda.
Em uma décima terceira modalidade do quinto aspecto que é É também uma modalidade da décima primeira e da décima segunda modali- Ee dade do quinto aspecto, o mieloma é mieloma múltiplo. : Em uma décima quarta modalidade do quinto aspecto que é E também uma modalidade da primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sex- ta, sétima, oitava, nona e décima modalidade do quinto aspecto, o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de tumores sólidos, onde preferen- cialmente os tumores sólidos são selecionados a partir do grupo que com- preende glioblastoma, câncer colorretal, câncer de mama, linfoma, câncer de próstata, câncer pancreático, câncer renal, câncer de ovário e câncer de pulmão.
Como não desejam estar limitados por qualquer teoria, os pre- sentes inventores concluíram que as moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção inibem a ligação de SDF-1 a seus receptores de SDF-1 e assim, direta ou indiretamente, são usadas para o tratamento de câncer. Ademais, os presentes inventores concluíram que as moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção são adequadas para blo- quear a interação de SDF-1 com os receptores de SDF-1 CXCR4 e CXCR7, respectivamente. Até agora, a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF- 1 de acordo com a presente invenção não pode ser vista como antagonista deCXCR4eCXCR7, respectivamente.
Como para as várias doenças, condições e distúrbios que po- dem ser tratados ou prevenidos através do uso de moléculas de ácido nucle-
E 30/123 | ico de acordo com a presente invenção ou composições, preferencialmente composições farmacêuticas compreendendo as mesmas, sabe-se que tais doenças, condições e distúrbios são aqueles que são descritos aqui, incluin- do e em particular, aqueles descritos e apresentados na parte introdutória do presente pedido. As respectivas passagens formam uma parte integrada da presente descrição ensinando a adequabilidade das moléculas de ácido nu- cleico para a prevenção e tratamento, respectivamente, para as ditas doen- ças, condições e distúrbios.
Como usado aqui, o termo SDF-1 refere-se a qualquer SDF-1 incluindo, mas não limitado a SDF-1 de mamífero. Preferencialmente, o SDF-1 de mamífero é selecionado a partir do grupo que compreende ca- E. mundongo, rato, coelho, hamster, macaco e SDF-1 humano. Mais preferen- Ú cialmente, o SDF-1 é SDF-1 humano também chamado de SDF-1a (SEQ ID se NO: 1) e/ou SDF-18 (SEQ ID NO: 2), mais preferencialmente SDF-1 humano também como SDF-1a (SEQ ID NO: 1).
O SDF-1 age através de dois receptores diferentes, os recepto- res CXCR4 e RDC1/CXCR7 (Balabanian, Lagane e outros, 2005a, Summers e outros, 2006) (ver a parte introdutória do presente pedido). A expressão elevada de CXCR4 e CXCR7 foi mostrada para vários tipos de câncer, como descrito aqui.
Como o SDF-1 age através de dois receptores diferentes, um tratamento de uma doença ou distúrbio relacionado a SDF-1 por um com- posto específico para um dos dois receptores de SDF-1 CXCR4 e CXCR7: (a) deveria ser menos eficaz devido aos dois receptores de SDF- 1 diferentes expressos nas células, preferencialmente células de câncer; (b) é limitado a uma população distinta de células, preferencial- mente a uma população distinta de células de câncer, devido aos receptores de SDF-1 individuais expressos nas células.
Câncer é um termo para neoplasmas malignos, um grupo gran- dee heterogêneo de doenças no qual as células exibem crescimento des- controlado, invasão e frequentemente metástase, onde as células de câncer se espalham para outras localizações no corpo, os nódulos linfáticos regio-
ad 31/123 nais ou sítios do corpo distantes como cérebro, osso, fígado, ou outros ór- gãos.
Essas três propriedades malignas do câncer diferenciam os tumores malignos dos tumores benignos, onde, como usado aqui, o termo câncer deveria também abranger tumores malignos que, por sua vez, são também chamados aqui de tumores.
Os tumores malignos estão em duas categorias com base em sua origem: tumores hematológicos e tumores sólidos.
Os tu- mores hematológicos são tipos de câncer que afetam o sangue, medula ós- sea, e nódulos linfáticos.
Os tumores sólidos são formados por um cresci- mento anormal de células de tecido do corpo que não o sangue, medula ós- seaecélulaslinfáticas.
Á As formas preferenciais de câncer são as seguintes: Ee Carcinoma adrenocortical Ê Cânceres relacionados à AIDS tal como Sarcoma de Kaposi e E Linfoma Câncer anal Câncer de apêndice Tumor Teratoide/Rabdoide atípico Carcinoma basocelular Câncer do duto biliar, Extra-hepático Câncer de bexiga Câncer nos ossos Osteossarcoma Histiocitoma fibroso maligno Glioma de hastes do cérebro Tumor no cérebro tal como astrocitomas, tumores no cérebro e medula espinhal, glioma de hastes do cérebro, tumor teratoide/rabdoide atí- pico do sistema nervoso central, tumores embrionários do sistema nervoso central, craniofaringioma, ependimoblastoma, ependimoma, meduloblasto- ma, meduloepitelioma, tumores parenquimais pineais de diferenciação in- termediária, tumores neuroectodérmicos primitivos supratentoriais e pineo- blastoma Câncer de mama da 32/123 Tumores brônquicos Tumor carcinoide Carcinoma de sítio primário desconhecido Câncer do sistema nervoso central tal como tumor teratoi- de/rabdoide atípico e linfoma Câncer cervical Câncer infantil Cordoma Distúrbios mieloproliferativos crônicos Câncer de cólon Á Câncer colorretal luas Craniofaringioma E Linfoma de células T cutâneas + Tumores embrionários Câncer endometrial Ependimoblastoma Ependimoma Câncer esofageal Estesioneuroblastoma Família de tumores de Sarcoma de Ewing Tumor de células germinativas extracranianas Tumor de células germinativas extragonadais Câncer do duto biliar extra-hepático Câncer no olho ta! como melanoma intraocular e retinoblastoma Histiocitoma fibroso dos ossos Osteossarcoma Câncer de vesícula Câncer gástrico (estômago) Tumor carcinoide gastrointestinal Tumores estromais gastrointestinais (GIST) Tumor de células germinativas (extracranianas, extragonadais ou ovarianas)
pa 33/123 Tumor trofoblástico gestacional Glioma Leucemia de células pilosas Câncer de cabeça e pescoço Câncer de coração Câncer hepatocelular (fígado) Histiocitose Câncer hipofaringeal Melanoma intraocular Tumores de células das ilhotas (pâncreas endócrino) Á Sarcoma de Kaposi ss.
Câncer dos rins Á Histiocitose de células de Langerhans 2 Câncer laringeal! Leucemia tal como leucemia linfoblástica aguda (abrev.
ALL), leucemia mieloide aguda (abrev.
AML), leucemia linfocítica crônica (abrev.
CLL), leucemia mielógena crônica (abrev.
CML) e leucemia de células pilo- sas Câncer da cavidade oral e bábios Câncer de fígado (primário) Carcinoma lobular in situ (LCIS) Câncer de pulmão Linfoma tal como linfoma relacionado à AIDS, Burkitt, micose fungoide e Síndrome de Sézary, Hodgkin, Não Hodgkin e leucemia do sis- tema nervoso central primário (abrev.
SNC) Macroglobulinemia Histiocitoma fibroso maligno de ossos e Osteossarcoma Meduloblastoma Meduloepitelioma Melanoma Carcinoma de células de Merkel Mesotelioma o 34/123 Câncer escamoso metastático de pescoço com sítio primário o- culto Carcinoma de linha média envolvendo gene NUT Câncer de boca Síndromes de neoplasia endócrina múltipla Mieloma múltiplo Micose fungoide Síndromes mielodisplásicas Neoplasmas mielodisplásicos/mieloproliferativos Distúrbios mieloproliferativos Ô Câncer do sino paranasal e cavidade nasal Ee Câncer nasofaringeal É Neuroblastoma FeeeA Câncer de células não pequenas do pulmão Câncer oral Câncer da cavidade oral Câncer orofaringeal Osteossarcoma e histiocitoma fibroso maligno dos ossos Câncer dos ovários Câncer pancreático Papilomatose Paraganglioma Câncer do sino paranasal e da cavidade nasal Câncer de paratireoide Câncer do pênis Câncer faringea!l Feocromocitoma Tumores parenquimais pineais de diferenciação intermediária Pineoblastoma e tumores neuroectodérmicos primitivos supra- tentoriais Tumor da pituitária Neoplasma de células do plasma/mieloma múltiplo
Fo 35/123 Blastoma pleuropulmonar, infantil Linfoma do sistema nervoso central primário (abrev.
SNC) Câncer de próstata Câncer retal Câncer de células renais (rins) Câncer de células transicionais, pélvis renal e ureter Retinoblastoma Rabdomiossarcoma Câncer das glândulas salivares Sarcoma tal como a família de tumores de Sarcoma de Ewing, Á Sarcoma de Kaposi, Sarcoma dos tecidos moles, sarcoma uterino E A Câncer de pele tal como melanoma, carcinoma de células de É Merkel e não-melanoma a Câncer de pequenas células do pulmão Câncer do intestino delgado Sarcoma de tecidos moles Carcinoma de células escamosas Câncer de células escamosas do pescoço Câncer do estômago (gástrico) Tumores neuroectodérmicos primitivos supratentoriais Linfoma de células T Câncer testicular Câncer de garganta Timoma e carcinoma tímico Câncer de tireoide Câncer de células transicionais da pélvis renal e ureter Tumor trofoblástico, gestacional Câncer uretral Câncer uterino, endometrial Sarcoma uterino Câncer vaginal Câncer vulvar | pessseas 36/123 Macroglobulinemia de Waldenstrôm Tumor de Wilms O eixo SDF-1 — CXCR4 mostrou desempenhar uma função na mobilização de células-tronco incluindo células-tronco cancerosas, vasculo- gênese, crescimento de tumor e metástase. O receptor de SDF-1 CXCR4 é expresso em uma variedade de cânceres e malignidades hematológicas in vivo como é CXCR7 (Maksym, Tarnowski e outros, 2009; Wang, Shiosawa e outros, 2008; Miao, Lucker e outros, 2007). O sinal de crescimento e invasão para células tumorais é SDF-1, em particular, se as células expressam os receptores para SDF-1 (Batchelor e outros, 2007; Zhu e outros, 2009; Xu e outros, 2009; Kozin e outros, 2010).
- CXCRA4, bem como SDF-1, são induzidos por hipóxia (Ceradini e Ê outros, 2004). Junto com VEGF, eles representam um eixo sinergístico po- ea tente que inicia e mantém as vias angiogênicas/vasculogênicas (Kryczek e outros, 2005). A função em vasculogênese é suportada pela evidência de que SDF-1 atrai células progenitoras endoteliais expressando CXCRA4 a par- tir da circulação (Sengupta e outros, 2005). O recrutamento mediado por SDF-1 — CXCRA4 de células derivadas da medula óssea que suportam a vas- cularização pode também ser a razão para a recorrência de glioblastoma após terapia de irradiação (Kioi e outros, 2010). Como demonstrado por Kioi e outros em um modelo de xenoenxerto de camundongo de glioblastoma intracraniano multiforme (abrev. GBM), o tratamento de paciente com GBM com alta dose de radiação é menos eficaz devido ao recrutamento induzido por irradiação de células derivadas da medula óssea (abrev. BMDCs). O bloqueio da interação de SDF-1 e seu receptor CXCR4 pelo antagonista de CXCR4 AMD3100 impediu o influxo de BMDCs no tumor irradiado (Kioi e outros, 2010). Em 2010, Tseng e outros apresentaram dados com um mode- lo em ratos de gliblastoma, um modelo que simula intimamente GBM huma- no, que além de CXCR4 e CXCR7, está envolvido no recrutamento induzido porirradiação de BMDCs. Nesse estudo, o antagonista de CXCR7 CCX2206 impediu o influxo de BMDCs no tumor irradiado (Tseng e outros, 2010). De acordo com esses e como as moléculas de ácido nucleico de acordo com a da 37/123 presente invenção são capazes de bloquear a interação de ambos SDF-1 e CXCRA4 e SDF-1 e CXCR7, espera-se que o efeito na sobrevida após a radi- ação seja melhor do que o mostrado para o uso de um dos antagonistas CXCR4 e CXCR7 sozinho.
Em adição, SDF-1 induz a secreção de VEGF, enquanto VEGF aumenta a expressão de CXCR4 (Salcedo e outros, 1999) e sinais de angio- gênese. Então, a inibição do eixo SDF-1 — CXCR4 pode reduzir ou prevenir o crescimento de tumor através da inibição de angiogênese/vasculogênese ou com monoterapia ou particularmente, em combinação com outros agen- tes antivasculares tal como inibidores de VEGF. ; Ademais, sugere-se que a “atuação no órgão-alvo' de células Ho cancerosas expressando CXCR4 para órgãos expressando SDF-1 direciona É as células metastáticas preferencialmente para o fígado, medula óssea, NESS. pulmão e nódulos linfáticos (Alsayed e outros, 2007; Burger & Peled, 2009) e entãooeixo SDF-1- CXCR4 desempenha uma função na metástase. Portanto, a inibição do eixo SDF-1 — CXCR4 e o eixo SDF-1 — CXCR7 com somente um composto tal como a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 de acordo com a presente invenção deveria ser eficaz no tratamento de câncer e/ou tumores, em particular, uma ampla faixa de tumores hematológicos e sólidos ou como monoterapia ou em combinação com outros tratamentos tais como, mas não limitados à terapia com fárma- cos, terapia celular, irradiação e cirurgia. Ademais, em comparação com um composto que se liga e inibe um dos receptores de SDF-1 CXCR4 e CXCR7, a inibição do eixo SDF-1 — CXCR4 e do eixo SDF-1 — CXCR7 com somente um composto tal como a molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 de acordo com a presente invenção deveria ser mais eficaz no tratamento de câncer e/ou tumores, em particular, uma ampla faixa de tumores hematoló- gicos e sólidos ou como monoterapia ou em combinação com outros trata- mentos tal como, mas não limitados à terapia com fármacos, terapia celular, irradiação e cirurgia.
Está dentro da presente invenção que a terapia com fármacos compreende o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio por ra 38/123 um fármaco, preferencialmente um agente farmaceuticamente ativo, mais preferencialmente um agente farmaceuticamente ativo como definido aqui. Como preferencialmente usado aqui, em terapia celular também chamada de terapia de células, o tecido processado dos órgãos, embriões, oufetosde animais, tal como ovelha ou vacas, é injetado em um indivíduo que sofre ou está em risco de desenvolver uma doença ou distúrbio, onde preferencialmente a doença ou distúrbio é câncer e a terapia celular é uma forma de tratamento de câncer. Na teoria, os cânceres não hematológicos podem ser curados se inteiramente removidos por cirurgia. Quando o câncer metastiza para outros Á sítios no corpo antes da cirurgia, a excisão cirúrgica completa é geralmente ea. impossível. Exemplos de procedimentos cirúrgicos ou cirurgia para câncer É incluem mastectomia para câncer de mama, prostatectomia para câncer de 1 próstata, e cirurgia de câncer de pulmão para câncer de não pequenas célu- las do pulmão. O objetivo da cirurgia pode ser ou a remoção somente do tumor, ou do órgão inteiro. A cirurgia é frequentemente combinada com ou- tros tratamentos ou terapias para o câncer, tal como quimioterapia e radia- ção. A cirurgia de câncer pode ser usada para alcançar um ou mais objeti- vos. Tais objetivos podem incluir, mas não estão limitados à prevenção de câncer, diagnóstico, estadiamento, tratamento primário, redução de volume e sintomas de alívio ou efeitos colaterais.
A radioterapia (também chamada de terapia de raios X ou irradi- ação) é o uso de radiação ionizante para matar células cancerosas. A radio- terapia é usada no campo médico para tratar quase todo tipo de tumor sóli- do. A irradiação é também usada para tratar leucemia e linfoma. A radiotera- pia lesiona ou destrói as células na área que está sendo tratada danificando seu material genético, tornando impossível que essas células continuem a crescem e se dividir. A dose de radiação em cada sítio depende de um nú- mero de fatores, incluindo a radiossensibilidade de cada tipo de câncer e se há tecidos e órgãos próximos que podem ser danificados por radiação. O Á objetivo da radioterapia é danificar o maior número possível de células can- cerosas, enquanto limitando prejudicar o tecido saudável próximo.
. É 39/123 Adicionalmente, uma molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 de acordo com a presente invenção é preferencial se o efeito fisioló- gico do eixo SDF — CXCRA4 e/ou eixo SDF-1 - CXCR7 está relacionado a | níveis de plasma mais altos de SDF-1. Por exemplo, agentes terapêuticos particulares, tal como paclitaxel e bevacizumabe, produzem uma avaliação dos níveis de SDF-1 no plasma, que têm um efeito negativo na terapia de tumor liberando mais células progenitoras endoteliais derivadas de medula óssea ou estimulando o crescimento, invasividade ou metástase (Shaked, Henke e outros, 2008; Xu, Duda e outros, 2009). Nesse caso, a coaplicação deum ácido nucleico que se liga a SDF-1 melhorará os efeitos de níveis ele- À vados de SDF-1 no plasma. isa. Ademais, a inibição do eixo SDF-1 — CXCR4 e/ou eixo SDF-1 — É CXCR7 por uma molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 de acordo Er com a presente invenção melhorará os efeitos antitumorais de outros agen- tes terapêuticos rompendo as interações adesivas entre células estromais com leucemia e outras células cancerosas que conferem sobrevida e resis- tência a fármacos para essas terapias (Jin e outros, 2008; Nervi e outros, 2009). Tal uso de molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 é conhe- cido como um processo conhecido como quimiossensibilização.
A sensibilização de células tumorais à quimioterapia ou radiote- rapia é conhecida como 'quimiossensibilização' ou 'radiossensibilização', respectivamente. Tal 'quimiossensibilização' ou “radiossensibilização', prefe- rencialmente pelas moléculas de ácido nucleico, de acordo com a presente invenção, sensibiliza o indivíduo que sofre de uma doença ou distúrbio, onde —oindivíduo sensibilizado é mais responsivo a uma terapia para o tratamento elou prevenção da doença ou distúrbio, onde preferencialmente a doença ou distúrbio é câncer. Tal tratamento usado junto com um tratamento primário, preferencialmente um tratamento de câncer, é uma terapia adjunta de acor- do com a presente invenção e também chamado de terapia adjunta. O pro- pósito de tal terapia adjunta é ajudar um tratamento primário, preferencial mente um tratamento de câncer primário. Portanto, a inibição do eixo SDF-1 — CXCRA4 e/ou SDF-1 — CXCR7 será particularmente eficaz ao tratar uma
Miscsa 40/123 E ampla faixa de tumores hematológicos e sólidos ou como monoterapia ou em combinação com outros tratamentos, tal como, mas não limitados à tera- pia com fármacos, terapia celular, irradiação e cirurgia.
Por esses meios e em vista do envolvimento descrito de SDF-1 —ereceptores de SDF-1 — tal como CXCR4 e CXCR7 - a ligação a SDF-1 e a interação entre SDF-1 e moléculas de ácido nucleico inibindo receptor de SDF-1, de acordo com a presente invenção, podem ajudar a atenuar tais doenças, onde a inibição de SDF-1 pelas moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 de acordo com a presente invenção leva à quimiossensibi- lização de células malignas a serem tratadas por quimioterapia, redução ou Ê inibição de crescimento e invasividade, inibição de angiogênese/vasculogê- EE nese, inibição de metástase e/ou inibição de níveis elevados de SDF-1 no É plasma derivados da resposta do hospedeiro à quimioterapia.
A Ademais, a presente invenção é baseada na conclusão surpre- endente de que é possível gerar moléculas de ácido nucleico se ligando es- pecificamente e com alta afinidade a SDF-1, inibindo e antagonizando assim os efeitos de SDF-1, em particular, os efeitos de SDF-1 em seus receptores tal como CXCRA4 e CXCR7. Um antagonista a SDF-1 é uma molécula que se liga a SDF-1, tal como as moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 de acordo com a presente invenção, e inibe a função de SDF-1, preferencialmente em um ensaio in vitro ou em um modelo in vivo, como descrito nos Exemplos.
Está dentro da presente invenção que o ácido nucleico de acor- do com a presente invenção é uma molécula de ácido nucleico.
Os termos | 25 ácido nucleico e molécula de ácido nucleico são usados aqui de uma manei- ra sinônima, se não indicado ao contrário.
Ademais, tais ácido nucleicos são preferencialmente também chamados aqui de moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção, os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção, os ácidos nucleicos inventivos ou as moléculas de ácido —nucleicoinventivas.
As características do ácido nucleico de acordo com a presente invenção, como descrito aqui, podem ser realizadas em qualquer aspecto da a 41/123 ! presente invenção, onde o ácido nucleico é usado, ou sozinho ou em qual- quer combinação.
Como descrito aqui em mais detalhes, os presentes inventores identificaram um número de diferentes moléculas de ácido nucleico que se ligama SDF-1, onde as moléculas de ácido nucleico podem ser caracteri- zadas em termos de extensões de nucleotídeos que são também chamados aqui de Caixas (ver Exemplo 1). Como experimentalmente mostrado nos Exemplos 5 a 11, os inventores poderiam demonstrar surpreendentemente em vários sistemas que as moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF- 1são adequadas para o tratamento de câncer e realmente capazes de tratar | câncer.
. Os diferentes tipos de moléculas de ácido nucleico que se ligam ] a SDF-1 compreendem três extensões diferentes de nucleotídeos: a primeira O extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos e a segunda extensão terminal de nucleotídeos. Em geral, as moléculas de áci- do nucleico da presente invenção compreendem em sua extremidade 5' e extremidade 3' as extensões terminais de nucleotídeos: a primeira extensão terminal de nucleotídeos e a segunda extensão terminal de nucleotídeos (também chamado de extensão 5'-terminal de nucleotídeos e a extensão 3'- terminal de nucleotídeos). A primeira extensão terminal de nucleotídeos e a segunda extensão terminal de nucleotídeos podem, em princípio devido à sua complementariedade base, hibridizar entre si, onde mediante a hibridi- zação, uma estrutura de fita dupla é formada. Entretanto, tal hibridização não é necessariamente realizada na molécula sob condições fisiológicas e/ou não fisiológicas. As três extensões de nucleotídeos de moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 — a primeira extensão terminal de nucleotí- deos, a extensão central de nucleotídeos e a segunda extensão terminal de nucleotídeos — são dispostas entre si na direção 5' -> 3: a primeira extensão terminal de nucleotídeos — a extensão central de nucleotídeos — a segunda extensão terminal de nucleotídeos. Entretanto, alternativamente, a segunda extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos e a primeira extensão terminal de nucleotídeos são dispostas entre si na direção
EA 42/123 5->3, As diferenças nas sequências das caixas definidas ou extensões entre as diferentes moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 influ- enciam na atividade de ligação a SDF-1. Com base na análise de ligação dasdiferentes moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 da presen- te invenção, a extensão central e os nucleotídeos formando o mesmo são individualmente e mais preferencialmente em sua integridade essenciais à ligação a SDF-1 humano.
Os termos 'extensão' e “extensão de nucleotídeo' são usados aquideuma maneira sinônima, se não indicado ao contrário.
: Em uma modalidade preferencial, o ácido nucleico de acordo 2 com a presente invenção é uma molécula de ácido nucleico única. Em uma É modalidade adicional, a molécula de ácido nucleico única está presente co- DGENAS mo várias das moléculas de ácido nucleico únicas ou como várias das espé- ciesde moléculas de ácido nucleico únicas.
Os versados na técnica sabem que a molécula de ácido nucleico de acordo com a invenção consiste preferencialmente de nucleotídeos que são covalentemente ligados entre si, preferencialmente através de ligações fosfodiéster.
Está dentro da presente invenção que os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção compreendem dois ou mais extensões ou parte(s) desses podem, em princípio, hibridizar entre si. Mediante tal hibridi- zação, uma estrutura de fita dupla é formada. Os versados na técnica sabem que tal hibridização pode ou não ocorrer, particularmente, sob condições in vitroouinvivo. Também, no caso de tal hibridização, não é necessariamente o caso em que a hibridização ocorre ao longo do comprimento inteiro das duas extensões onde, ao menos com base nas regras para pareamento ba- se, tal hibridização e assim formação de uma estrutura de fita dupla podem, em princípio, ocorrer. Como preferencialmente usado aqui, uma estrutura de fita dupla é uma parte de uma molécula de ácido nucleico ou uma estrutura formada por dois ou mais extensões separados ou dois extensões espacial- mente separados de uma fita simples de uma molécula de ácido nucleico,
A 43/123 onde ao menos um, preferencialmente dois ou mais pares de base existem, ou seja, pareamento de bases preferencialmente de acordo com as regras de pareamento de bases de Watson-Crick.
Os versados na técnica sabem também que outro pareamento de bases tal como o pareamento de bases de Hoogsten pode existir na forma de estrutura de fita dupla.
Sabe-se tam- bém que a característica de que duas extensões hibridizam preferencialmen- te indica que se assume que tal hibridização acontece devido à complemen- tariedade base das duas extensões.
Em uma modalidade preferencial, o termo disposição, como u- sado aqui, significa a ordem ou sequência de características estruturais ou À funcionais ou elementos descritos aqui em conjunto com os ácidos nucleicos e descritos aqui.
É Os versados na técnica sabem que os ácidos nucleicos de acor- ao do com a presente invenção são capazes de se ligar a SDF-1. Sem desejar estar limitado a qualquer teoria, os presentes inventores assumem que a ligação a SDF-1 resulta de uma combinação de características ou elementos estruturais tridimensionais da molécula de ácido nucleico reivindicada, que são causados por orientação e padrões de dobragem da sequência primária de nucleotídeos formando tais características ou elementos, onde preferen- cialmente tais características ou elementos são a primeira extensão terminal de nucleotídeos, a extensão central de nucleotídeos e a segunda extensão terminal de nucleotídeos de moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 . Está evidente que a característica ou elemento individual pode ser formado por várias sequências individuais diferentes, cujo grau de variação pode variar dependendo da estrutura tridimensional que tal elemento ou ca- racterística tem que formar.
A característica de ligação geral do ácido nuclei- co reivindicado resulta da interação dos vários elementos e características, respectivamente, que, por fim, resulta na interação do ácido nucleico reivin- dicado com seu alvo, isto é, SDF-1. Novamente sem estar limitado a qual- — quer teoria, a extensão central de nucleotídeos que é característico para os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 parece ser importante para mediar a ligação das moléculas de ácido nucleico reivindicada com SDF-1. Conse-
Pee Ee 44/123 . quentemente, os ácidos nucleicos, de acordo com a presente invenção, são adequados para a interação com SDF-1. Também, os versados na técnica sabem que os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção são an- tagonistas a SDF-1. Como esses ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção são adequados para o tratamento e prevenção, respectivamente, de qualquer doença ou condição que está associada com SDF-1 ou causada por ele. Tais doenças e condições podem ser obtidas a partir da técnica an- terior que estabelece que SDF-1 está envolvido ou associado com as ditas doenças e condições, respectivamente, e que está incorporado aqui por re- ferência fornecendo o raciocínio científico para o uso terapêutico dos ácidos Á nucleicos de acordo com a invenção. 1 EE Os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção devem : também compreender ácidos nucleicos que são essencialmente homólogos EE às sequências particulares descritas aqui. O termo “substancialmente homó- logo' deve ser entendido de modo que a homologia seja ao menos 75%, pre- ferencialmente 85%, mais preferencialmente 90%, e mais preferencialmente mais do que 95%, 96%, 97%, 98% ou 99%.
A porcentagem real de nucleotídeos homólogos presentes no á- cido nucleico de acordo com a presente invenção dependerá do número total de nucleotídeos presente no ácido nucleico. A modificação percentual pode ser baseada no número total de nucleotídeos presentes no ácido nucleico.
A homologia entre as duas moléculas de ácido nucleico pode ser determinada como conhecido pelos versados na técnica. Mais específica- mente, um algoritmo de comparação de sequência pode ser usado para cal- —cularahomologia de sequência percentual para a sequência(s) de teste em relação à sequência de referência, com base nos parâmetros de programa designados. A sequência de teste é preferencialmente a sequência ou molé- cula de ácido nucleico que é homologa ou a ser testada se é homologa, se se for, em qual grau, a uma molécula de ácido nucleico diferente, onde tal molécula de ácido nucleico diferente é também chamada de sequência de referência. Em uma modalidade, a sequência de referência é uma molécula de ácido nucleico, como descrita aqui, preferencialmente uma molécula de
O 45/123 * - ácido nucleico tendo uma sequência de acordo com qualquer uma dentre a SEQ ID NO: 5 a SEQ ID NO: 225, mais preferencialmente uma molécula de ácido nucleico tendo uma sequência de acordo com qualquer uma dentre SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 128, SEQ ID —NO:129,SEQID NO: 134, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 223, SEQ ID NO: 224, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 143, e SEQ ID NO: 144. O alinhamento ótimo de sequências para comparação po- de ser conduzido, por exemplo, pelo algoritmo de homologia local de Smith & Waterman (Smith & Waterman, 1981) pelo algoritmo de alinhamento de homologia de Needleman & Wunsch (Needleman & Wunsch, 1970), pela Ô busca por método de similaridade de Pearson & Lipman (Pearson & Lipman, o 1988), por implementações computadorizadas desses algoritmos (GAP, À BESTFIT, FASTA, e TFASTA em Wisconsin Genetics Software Package, Eee Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, Wis.), ou por inspeção visual.
Um exemplo de um algoritmo que é adequado para determinar a identidade de sequência percentual é o algoritmo usado na ferramenta de busca de alinhamento local básica (em seguida “BLAST”), ver, por exemplo, Altschul e outros (Altschul e outros, 1990 e Altschul e outros, 1997). O soft- ware para executar análises BLAST está publicamente disponível através do Centro Nacional para Informação de Biotecnologia (em seguida “NCBI”). Os parâmetros padrão usados na determinação da identidade de sequência u- sando o software disponível a partir de NCBI, por exemplo, BLASTN (para sequências de nucleotídeo) e BLASTP (para sequências de aminoácido) são descritos em McGinnis e outros (McGinnis e outros, 2004).
Os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção devem também compreender ácidos nucleicos que têm um certo grau de identidade em relação aos ácidos nucleicos descritos aqui e definidos por suas sequên- cias de nucleotídeo. Mais preferencialmente, a presente invenção também compreende aquelas moléculas de ácido nucleico que têm uma identidade de ao menos 75%, preferencialmente 85%, mais preferencialmente 90% e mais preferencialmente mais do que 95%, 96%, 97%, 98% ou 99% em rela-
Ea, 46/123 à. ”C a ção aos ácidos nucleicos descritos aqui e definidos por sua sequência de nucleotídeo ou uma parte dessa.
O termo ácido nucleico da invenção ou ácido nucleico de acordo com a presente invenção deve também compreender aqueles ácidos nuclei- coscompreendendo sequências de ácidos nucleicos descritas aqui ou parte dessas, tal como, por exemplo, um metabólito ou derivado do ácido nucleico de acordo com a presente invenção, preferencialmente até o grau em que os ácidos nucleicos ou as ditas partes estão envolvidos ou são capazes de se ligar a SDF-1. Tal ácido nucleico pode ser derivado dos descritos aqui, por exemplo, por truncamento.
O truncamento pode estar relacionado a qualquer À uma ou ambas as extremidades dos ácidos nucleicos como descrito aqui. is Também, o truncamento pode estar relacionado à sequência interna de nu- ; cleotídeos, isto é, pode estar relacionado ao nucleotídeo(s) entre o nucleotí- pes deo 5' e 3' terminal, respectivamente.
Ademais, o truncamento deve com- —preender a deleção de, no mínimo, um único nucleotídeo a partir da sequên- cia dos ácidos nucleicos descritos aqui.
O truncamento pode também estar relacionado a mais de uma extensão do ácido nucleico da invenção, onde a extensão pode ter comprimento de no mínimo um nucleotídeo.
A ligação de um ácido nucleico de acordo com a presente invenção pode ser determinada pelos versados na técnica usando experimentos de rotina ou usando ou ado- tando um método, como descrito aqui, preferencialmente como descrito aqui na parte de exemplos.
Os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção podem ou ser ácidos D-nucleicos ou ácidos L-nucleicos.
Preferencialmente, os áci- dos nucleicos da invenção são ácidos L-nucleicos.
Em adição, é possível que uma ou várias partes do ácido nucleico estejam presentes como ácidos D-nucleicos ou ao menos uma ou várias partes dos ácidos nucleicos são ácidos L-nucleicos.
O termo “parte” dos ácidos nucleicos deve significar no mínimo um nucleotídeo.
Tais ácidos nucleicos são geralmente chamados —aquide ácidos D- e L-nucleicos, respectivamente.
Então, em uma modalida- de particularmente preferencial, os ácidos nucleicos de acordo com a pre- sente invenção consistem de L-nucleotídeos e compreendem ao menos um
EMESSSEbA 47/1283 ds Fe D-nucleotídeo. Tal D-nucleotídeo é preferencialmente acoplado a uma parte diferente das extensões que definem os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção, preferencialmente aquelas partes desses, onde uma inte- ração com outras partes do ácido nucleico está envolvida. Preferencialmen- te, tal D-nucleotídeo é acoplado a um término de qualquer um das extensões e de qualquer ácido nucleico de acordo com a presente invenção, respecti- vamente. Em uma modalidade preferencial adicional, tais D-nucleotídeos podem agir como um espaçador ou um ligante, preferencialmente modifica- ções de acoplamento tal como PEG e HES aos ácidos nucleicos de acordo coma presente invenção. : Está também dentro da presente invenção que cada uma e ..-.. qualquer das moléculas de ácido nucleico descritas aqui em sua integridade ' em termos de sua sequência(s) de ácido nucleico estão limitadas à sequên- Sea cia(s) de nucleotídeo particular. Em outras palavras, os termos “compreen- dendo” ou “compreende” devem ser interpretados em tal modalidade no sen- tido de conter ou consistir de.
Está também dentro da presente invenção que os ácidos nuclei- cos de acordo com a presente invenção são parte de um ácido nucleico mais longo, onde esse ácido nucleico mais longo compreende várias partes onde aomenos uma tal parte é um ácido nucleico, ou uma parte desse, de acordo com a presente invenção. As outras parte(s) desses ácidos nucleicos mais longos podem ser qualquer uma ou vários ácidos D-nucleicos ou ácidos L- nucleicos. Qualquer combinação pode ser usada em conjunto com a presen- te invenção. Essas outras partes do ácido nucleico mais longo podem exibir —uma função que é diferente da ligação, preferencialmente da ligação a SDF-
1. Uma função possível é permitir a interação com outras moléculas, onde tais outras moléculas são preferencialmente diferentes de SDF-1, tal como, por exemplo, para imobilização, reticulação, detecção ou amplificação. Em uma modalidade adicional da presente invenção, os ácidos nucleicos de a- —cordocom a invenção compreendem, como porções individuais ou combina- das, vários dos ácidos nucleicos da presente invenção. Tal ácido nucleico compreendendo vários dos ácidos nucleicos da presente invenção é também f 48/123 abrangido pelo termo ácido nucleico mais longo.
Os ácidos L-nucleicos, como usados aqui, são ácidos nucleicos que consistem de L-nucleotídeos, preferencialmente consistindo completa- mente de L-nucleotídeos.
Os ácidos D-nucleicos, como usados aqui, são ácidos nucleicos que consistem de D-nucleotídeos, preferencialmente, consistindo completa- mente de D-nucleotídeos.
Os termos ácido nucleico e molécula de ácido nucleico são usa- dos aqui de uma maneira intercambiável, se não explicitamente indicado ao contrário. É Também, se não indicado ao contrário, qualquer sequência de .-. nucleotídeo é apresentada aqui na direção 5' -> 3.
À Como preferencialmente usado aqui, qualquer posição de um a nucleotídeo é determinada ou referida em relação à extremidade 5' de uma sequência, uma extensão ou uma subextensão. Consequentemente, um se- gundo nucleotídeo é o segundo nucleotídeo contado a partir da extremidade 5' da sequência, extensão e subextensão, respectivamente. Também, de acordo com esses, um penúltimo nucleotídeo é o segundo nucleotídeo con- tado a partir da extremidade 3' de uma sequência, extensão e subextensão, respectivamente.
Independente se o ácido nucleico da invenção consiste em D- nucleotídeos, L-nucleotídeos ou uma combinação de ambos com a combi- nação sendo, por exemplo, uma combinação aleatória ou uma sequência definida de extensões consistindo de ao menos um L-nucleotídeo e ao me- nos um ácido D-nucleico, o ácido nucleico pode consistir de desoxirribonu- cleotídeo(s), ribonucleotídeo(s), ou combinações desses.
' Projetar os ácidos nucleicos da invenção como ácido L-nucleico é vantajoso por várias razões. Os ácidos L-nucleicos são enantiômeros de ácidos nucleicos ocorrendo naturalmente. Os ácidos D-nucleicos, entretanto, não são muito estáveis em soluções aquosas e particularmente m sistemas biológicos ou amostras biológicas devido à presença amplamente difundida de nucleases. As nucleases naturalmente ocorrendo, particularmente nucle- :
ases de células animais, não são capazes de degradar ácidos L-nucleicos. Por causa disso, a meia-vida biológica do ácido L-nucleico é significativa- mente aumentada em tal sistema, incluindo o corpo animal e humano. Devi- do à ausência de degradabilidade de ácido L-nucleico, nenhum produto de degradação de nuclease é gerado e assim nenhum efeito colateral surgindo dele é observado. Esse aspecto delimita o ácido L-nucleico de todos os ou- tros compostos que são usados na terapia de doenças e/ou distúrbios envol- vendo a presença de SDF-1. Os ácidos L-nucleicos que se ligam especifi- camente a uma molécula-alvo através de um mecanismo diferente do pare- amento de bases de Watson Crick, ou aptâmeros que consistem parcial ou : completamente de L-nucleotídeos, particularmente com aquelas partes do Nas aptâmero que estão envolvidas na ligação do aptâmero à molécula-alvo, são É também chamadas spiegelmers. Os aptâmeros e spiegelmers, como tal, são aa conhecidos pelos versados na técnica e são, entre outros, descritos no The Aptamer Handbook' (eds. Klussmann, 2006).
Está também dentro da presente invenção que os ácidos nuclei- cos da invenção, independente se eles estão presentes como ácidos D- nucleicos, ácidos L-nucleicos ou ácidos D,L-nucleicos ou se eles são DNA ou RNA, podem estar presentes como ácidos nucleicos de fita simples ou de fitadupla. Tipicamente, os ácidos nucleicos da invenção são ácidos nuclei- cos de fita simples que exibem estruturas secundárias definidas devido à sequência primária e podem assim também formar estruturas terciárias. Os ácidos nucleicos da invenção, entretanto, podem também ser fita dupla no sentido de que duas fitas que são complementares ou parcialmente com- plementares entre si são hibridizados entre si.
Os ácidos nucleicos da invenção podem ser modificados. Tais modificações podem estar relacionadas ao nucleotídeo simples do ácido nu- cleico e são bem conhecidos na técnica. Os exemplos para tal modificação são descritos, entre outros, por Venkatesan e outros (Venkatesan, Kim e outros, 2003) e Kusser (Kusser, 2000). Tal modificação pode ser um átomo H, um átomo F ou um grupo O-CH3 ou NH2 na posição 2' do nucleotídeo individual do qual o ácido nucleico consiste. Também, o ácido nucleico de acordo com a presente invenção pode compreender ao menos um nucleotí- deo de LNA.
Em uma modalidade, o ácido nucleico de acordo com a presen- te invenção consiste em nucleotídeos de LNA.
Em uma modalidade, os ácidos nucleicos de acordo com a pre- sente invenção podem ser um ácido nucleico multiparte.
O ácido nucleico muiltiparte, como usado aqui, é um ácido nucleico que consiste em ao menos duas fitas de ácido nucleico separadas.
Ao menos duas fitas de ácido nucle- ico formam uma unidade funcional onde a unidade funcional é um ligando a uma molécula-alvo.
Ao menos duas fitas de ácido nucleico podem ser deri- vadas de qualquer um dos ácidos nucleicos da invenção ou clivando-se a  molécula de ácido nucleio para gerar duas fitas ou sintetizando-se um ácido E nucleico correspondente a uma primeira parte da invenção, isto é, ácido nu- É cleico geral e outro ácido nucleico correspondente à segunda parte do ácido ESSA nucleico geral.
Sabe-se que ambas a clivagem e a síntese podem ser apli- cadas para gerar um ácido nucleico multiparte, onde há mais de duas fitas, como exemplificado acima.
Em outras palavras, ao menos duas fitas de áci- do nucleico separadas são tipicamente diferentes de duas fitas complemen- tares e hibridizando entre si, embora um certo grau de complementariedade entre ao menos duas ditas fitas de ácido nucleico separadas possa existir e onde tal complementariedade pode resultar na hibridização das ditas fitas separadas.
Finalmente, está também dentro da invenção que uma estrutura circular, isto é, completamente fechada para os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção é realizada, isto é, que os ácidos nucleicos de a- cordo com a presente invenção são fechados em uma modalidade, prefe- rencialmente através de uma ligação covalente, onde mais preferencialmen- te, tal ligação covalente é feita entre a extremidade 5' e a extremidade 3' das sequências de ácido nucleico, como descrito aqui ou qualquer derivado des- sa.
Uma possibilidade de determinar as constantes de ligação das moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção é o uso dos métodos como descrito no Exemplo 3 e 4 que confirma a conclusão acima que os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção exibem uma faixa de valor Kp favorável.
Uma medida apropriada de modo a expressar a intensidade da ligação entre a molécula de ácido nucleico individual e o alvo que está no presente caso, SDF-1 é o valor assim chamado KD que, como tal /ométodo para sua determinação é conhecido pelos versados na técnica.
Preferencialmente, o valor Ko mostrado pelos ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção está abaixo de 1 uM.
Um valor Kp de aproximadamente 1 uM é dito como sendo característico para uma ligação não específica de um ácido nucleico a um alvo.
Como será conhecido pelos versados na técnica, o valor Kpy de um grupo de compostos, tal como os áci- : dos nucleicos de acordo com a presente invenção, está dentro de uma certa E faixa.
O Ko mencionado acima de aproximadamente 1 uM é um limite supe- Â rior preferencial para o valor Kp.
O limite inferior para o Kp de ácidos nuclei- aNas cos de ligação ao alvo pode ser no mínimo aproximadamente 10 picomola- res ou pode ser maior.
Está dentro da presente invenção que os valores Kp de ácidos nucleicos individuais se ligando a SDF-1 estão preferencialmente dentro dessa faixa.
As faixas preferenciais podem ser definidas escolhendo qualquer primeiro número dentro dessa faixa e qualquer segundo número dentro dessa faixa.
Os valores Kp superiores preferenciais são 250 nM e 100 nM,os valores Kçp inferiores preferenciais são 50 nM, 10 nM, 1 nM, 100 pM e 10 pM.
O valor Kp superior mais preferencial é 2,5 nM, o valor Kp inferior mais preferencial é 100 pM.
Em adição às propriedades de ligação das moléculas de ácido nucleico de acordo com apresente invenção, as moléculas de ácido nucleico de acordocom a presente invenção inibem a função da respectiva molécula- alvo que é no presente caso, SDF-1. A inibição da função de SDF-1, por e- xemplo, o estímulo dos respectivos receptores, como descrito anteriormente, é alcançada por ligação de moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção a SDF-1 e formando um complexo de uma molécula de ácido nucleico de acordo com a presente invenção e MCP-1 e SDF-1. Tal complexo de uma molécula de ácido nucleico e SDF-1 não pode estimular os receptores que normalmente são estimulados por SDF-1. Consequente-
mente, a inibição da função de receptor por moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção é independente do respectivo receptor que pode ser estimulado por SDF-1, mas resulta de impedir o estímulo do recep- tor por MCP-1 e SDF-1 pelas moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção.
Uma possibilidade de determinar a constante inibidora das mo- léculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção é o uso dos métodos descritos no Exemplo 5 e 6 (para CXCR4 e CXCR7, respectiva- mente) que confirma a conclusão acima de que os ácidos nucleicos de acor- docom a presente invenção exibem uma constante inibidora favorável que É permite o uso dos ditos ácidos nucleicos em um esquema de tratamento te- - rapêutico. Uma medida apropriada de modo a expressar a intensidade do É efeito inibidor da molécula de ácido nucleico individual na interação do alvo EE que é no presente caso, SDF-1 e o respectivo receptor, é a assim chamada concentração inibitória máxima (abrev. ICso) que como tal, bem como o mé- todo para sua determinação, são conhecidos pelos versados na técnica.
Preferencialmente, o valor ICso mostrado pelas moléculas de á- cido nucleico de acordo com a presente invenção está abaixo de 1 uM. Um valor IC50 de aproximadamente 1 uM é dito característico para uma inibição não específica de funções alvo por uma molécula de ácido nucleico. Como será conhecido pelos versados na técnica, o valor IC50 de um grupo de compostos, tal como as moléculas de ácido nucleico de acordo com a pre- sente invenção, está dentro de uma certa faixa. O ICso mencionado acima de aproximadamente 1 uM é um limite superior preferencial para o valor ICso. O limite inferior para o ICso de moléculas de ácido nucleico de ligação ao alvo pode ser de no mínimo 10 picomolares ou pode ser maior. Está dentro da presente invenção que os valores ICso de ácidos nucleicos individuais se ligando a SDF-1 é preferencialMente dentro dessa faixa e qualquer segundo número dentro dessa faixa. Os valores ICs9 Superiores preferenciais são 250 nMe100nM, os valores Cs, inferiores preferenciais são 50 nM, 10 nM, 1 NM, 100 pM e 10 pM. O valor ICs5 superior mais preferencial é 2,5 nM, o va- lor IC59 inferior mais preferencial é 100 pM.
As moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente in- venção podem ter qualquer comprimento já que elas são ainda capazes de se ligar à molécula-alvo. Sabe-se que há comprimentos preferenciais dos ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção. Tipicamente, o com- primento está entre 15 e 20 nucleotídeos. Os versados na técnica sabem que qualquer inteiro entre 15 e 120 é um comprimento possível para os áci- dos nucleicos de acordo com a presente invenção. As faixas mais preferen- ciais para o comprimento dos ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção são comprimentos de aproximadamente 20 a 100 nucleotídeos, aproximadamente 20 a 80 nucleotídeos, aproximadamente 20 a 60 nucleotí- É deos, aproximadamente 20 a 50 nucleotídeos e aproximadamente 29 a 450 . nucleotídeos.
É Está dentro da presente invenção que os ácidos nucleicos des- SaNas critos aqui compreendem uma porção que preferencialmente é uma porção de alto peso molecular e/ou que preferencialmente permite modificar as ca- racterísticas do ácido nucleico em termos, entre outros, do tempo de resi- dência no corpo animal, preferencialmente o corpo humano. Uma modalida- de particularmente preferencial de tal modificação é PEGilação e HESilação dos ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção. Como usado aqui, PEG representa poli(etileno glicol) e HES para hidroxietil amido. A PEGIla- ção, como preferencialmente usada aqui, é a modificação de um ácido nu- cleico de acordo com a presente invenção, onde tal modificação consiste em uma porção PEG que é acoplada a um ácido nucleico de acordo com a pre- sente invenção. HESilação, como preferencialmente usada aqui, é a modifi- cação de um ácido nucleico de acordo com a presente invenção onde tal modificação consiste em uma porção HES que é acoplada a um ácido nucle- ico de acordo com a presente invenção. Essas modificações, bem como o processo de modificar um ácido nucleico usando tais modificações, são des- critas no pedido de patente europeia EP 1 306 382, cuja descrição é aqui incorporada por referência. No caso de PEG ser tal porção de alto peso molecular, o peso molecular é preferencialmente aproximadamente 20.000 a aproximadamente
120.000 Da, mais preferencialmente de aproximadamente 30.000 a aproxi- madamente 80.000 Da e mais preferencialmente aproximadamente 40.000 Da. No caso de HER ser tal porção de alto peso molecular, o peso molecular é preferencialmente de aproximadamente 50 a aproximadamente 1000 KDa, mais preferencialmente de aproximadamente 100 a aproximadamente 700 kDa, e mais preferencialmente de 200 a 500 kDa. HES exibe uma substitui- ção molar de 0,1 a 1,5, mais preferencialmente de 1 a 1,5 e exibe uma a- mostra de substituição expressa como a relação C2/C6 de aproximadamente 0,1 a 15, preferencialmente de aproximadamente 3 a 10. O processo de mo- dificação HES é, por exemplo, descrito no pedido de patente alemã DE 1 É 2004 006 249.8, cuja descrição é aqui incorporada por referência.
= A modificação pode, em princípio, ser feita nas moléculas de á- ' cido nucleico da presente invenção em qualquer posição dessas. Preferen- ea cialmente, tal modificação é feita ou no nucleotídeo 5'-terminal, nucleotídeo 3-terminal e/ou em qualquer nucleotídeo entre o 5' nucleotídeo e o 3' nucle- otídeo da molécula de ácido nucleico.
A modificação e preferencialmente, a porção PEG e/ou HES, pode ser acoplada à molécula de ácido nucleico da presente invenção ou direta ou indiretamente, preferencialmente através de um ligante. Está tam- bém dentroda presente invenção que a molécula de ácido nucleico de acor- do com a presente invenção compreende uma ou mais modificações, prefe- rencialmente uma ou mais dentre a porção PEG e/ou HES. Em uma modali- dade, a molécula de ligante individual acopla mais de uma porção PEG ou HES a uma molécula de ácido nucleico de acordo com a presente invenção.
O ligante usado em conjunto com a presente invenção pode ser ou linear ou ramificado. Esse tipo de ligantes é conhecido pelos versados na técnica e é descrito ainda nos pedidos de patente WO 2005/074993 e WO 2003/035665.
Em uma modalidade preferencial, o ligante é um ligante biode- gradável. O ligante biodegradável permite modificar as características do ácido nucleico de acordo com a presente invenção em termos, entre outros, do tempo de residência no corpo de um animal, preferencialmente, em um corpo humano, devido à liberação da modificação do ácido nucleico de acor-
do com a presente invenção. O uso de um ligante biodegradável pode permi- tir um melhor controle do tempo de residência do ácido nucleico de acordo com a presente invenção. Uma modalidade preferencial de tal ligante biode- gradável é um ligante biodegradável como descrito, mas não limitado, a pe- didos de patente internacionais WO 2006/052790, WO 2008/034122, WO 2004/092191 e WO 2005/099768.
Está dentro da presente invenção que a modificação ou grupo de modificação é uma modificação biodegradável, onde a modificação bio- degradável pode ser acoplada à molécula de ácido nucleico da presente in- venção, ou direta ou indiretamente, preferencialmente através de um ligante. A modificação biodegradável permite modificar as características do ácido : nucleico de acordo com a presente invenção em termos, entre outros, do : tempo de residência em um corpo animal, preferencialmente em um corpo eee humano, devido à liberação ou degradação da modificação do ácido nucleico de acordo com a presente invenção. O uso da modificação biodegradável pode permitir um melhor controle do tempo de residência do ácido nucleico de acordo com a presente invenção. Uma modalidade preferencial de tal modificação biodegradável é biodegradável como descrito, mas não restrito aos pedidos de patente internacional WO 2002/065963, WO 2003/070823, WO 2004/113394 e WO 2000/41647, preferencialmente em WO2000/41647, página 18, linhas 4 a 24. , Além das modificações descritas acima, outras modificações po- dem ser usadas para modificar as características dos ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção, onde tais outras modificações podem ser selecionadas a partir do grupo de proteínas, lipídios tal como colesterol e cadeias de açúcar tal como amilase, dextrano, etc.
Sem estar limitado por qualquer teoria, parece que ao modificar os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção com porção de alto peso molecular tal como um polímero e mais particularmente a um ou vários dos polímeros descritos aqui, que são preferencialmente fisiologicamente aceitáveis, a excreção cinética é mudada. Mais particularmente, parece que devido ao peso molecular aumentado de tais ácidos nucleicos da invenção modificados e devido aos ácidos nucleicos da invenção não sendo submeti- dos a metabolismo, particularmente quando na forma L, a excreção de um corpo animal, preferencialmente de um corpo de mamífero e mais preferen- cialmente de um corpo humano, é diminuída.
Como a excreção ocorre tipi- camente viaosrins, os presentes inventores assumem que a taxa de filtra- ção glomerular dos ácidos nucleicos assim modificados é significativamente reduzida comparada aos ácidos nucleicos não tendo esse tipo de modifica- ção de alto peso molecular que resulta em um aumento no tempo de resi- dência no corpo de animal.
Em conjunto com esse, é particularmente notável que, apesar de tal modificação de alto peso molecular, a especificidade dos ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção não é afetada de uma " maneira prejudicial.
Então, os ácidos nucleicos de acordo com a presente É invenção têm, entre outros, a característica surpreendente, que normalmente aa não pode ser esperada de compostos farmaceuticamente ativos, tal que uma formulação farmacêutica fornecendo uma liberação sustentada não é neces- sariamente exigida para fornecer uma liberação sustentada dos ácidos nu- cleicos de acordo com a presente invenção.
De preferência, os ácidos nucle- icos de acordo com a presente invenção em sua forma modificada compre- endendo uma porção de alto peso molecular, podem já ser usados como uma formulação de liberação sustentada como eles agem, devido à sua mo- dificação, já como se eles fossem liberados a partir de uma formulação de liberação sustentada.
Então, as modificações das moléculas de ácido nuclei- co, de acordo com a presente invenção como descritas aqui, e assim as mo- léculas de ácido nucleico modificadas de acordo com a presente invenção e qualquer composições compreendendo as mesmas podem fornecer uma farmacocinética distinta e preferencialmente controlada e biodistribuição dessa.
Isso também inclui o tempo de residência na circulação e distribuição a tecidos.
Tais modificações são ainda descritas no pedido de patente WO
2003/035665. Entretanto, está dentro da presente invenção que os ácidos nu- cleicos de acordo com a presente invenção não compreendem qualquer mo- dificação e particularmente nenhuma modificação de alto peso molecular tal como PEGilação e HESilação.
Tal modalidade é particularmente preferencial quando o ácido nucleico de acordo com a presente invenção mostra a distri- buição preferencial para qualquer órgão-alvo ou tecido no corpo ou quando uma folga rápida do ácido nucleico de acordo com a presente invenção do corpo após a administração é desejada.
Os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção, como descrito aqui, com um perfil de distribuição prefe- rencial a qualquer órgão-alvo ou tecido no corpo permitiriam o estabeleci- mento de concentrações locais eficazes no tecido alvo, enquanto mantendo a concentração sistêmica dos ácidos nucleicos baixa.
Isso permitiria o uso de baixas doses que não são somente benéficas a partir de um ponto de vista econômico, mas também reduzem a exposição desnecessária de ou- : tros tecidos ao agente ácido nucleico, reduzindo assim o potencial risco de À efeitos colaterais.
A folga rápida dos ácidos nucleicos de acordo com a pre- EEE sente invenção do corpo após a administração deve ser desejada, entre ou- tros, no caso de imagiologia in vivo ou exigências de dosagem terapêutica específica usando os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção ou medicamentos compreendendo os mesmos.
Os ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção, e/ou os antagonistas de acordo com a presente invenção podem ser usados para a geração ou fabricação de um medicamento.
Tal medicamento ou composi- ção farmacêutica de acordo com a presente invenção contém ao menos um dos ácidos nucleicos da invenção selecionados a partir do grupo de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 , opcionalmente junto com compostos far- maceuticamente ativos adicionais, onde o ácido nucleico da invenção age preferencialmente como o próprio composto farmaceuticamente ativo.
Tais medicamentos compreendem em modalidades preferenciais ao menos um carreador farmaceuticamente aceitável.
Tal carreador pode ser, por exem- plo, água, tampão, PBS, solução de glicose, preferencialmente uma solução equilibrada de sa! e glicose a 5%, amido, açúcar, gelatina, ou qualquer outra substância carreadora aceitável.
Tais carreadores são geralmente conheci- dos pelos versados na técnica.
Os versados na técnica sabem que quais- quer modalidades, usos e aspectos relacionados ao medicamento da pre-
sente invenção são também aplicáveis à composição farmacêutica da pre- sente invenção e vice versa.
A indicação, doenças e distúrbios para o tratamento e/u preven- ção dos quais os ácidos nucleicos, as composições farmacêuticas e medi- camentos de acordo com ou preparados de acordo com a presente invenção resultam do envolvimento, ou direto ou indireto, de SDF-1 no respectivo me- canismo patogenético.
É claro, como os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 de a- cordo com a presente invenção, interagem ou se ligam a SDF-1 humano ou murinho, um versado na técnica geralmente entenderá que os ácidos nuclei- cos que se ligam a SDF-1 de acordo com a presente invenção podem ser : facilmente usados para o tratamento, prevenção e/ou diagnóstico de qual- Â quer doença como descrito aqui de humanos e animais.
Em conjunto com E esses, sabe-se que as moléculas de ácido nucleico de acordo com a presen- te invenção podem ser usadas para o tratamento e prevenção de quaisquer das doenças, distúrbios ou condições descritos aqui, independente do modo de ação que dá suporte a tal doença, distúrbio e condição.
Em seguida, o raciocínio para o uso das moléculas de ácido nu- cCleico de acordo com a presente invenção em conjunto com as várias doen- ças, distúrbios e condições é fornecido, tornando assim a aplicabilidade te- rapêutica, preventiva e diagnóstica reivindicada das moléculas de ácido nu- cleico de acordo com a presente invenção plausível.
De modo a evitar qual- quer repetição desnecessária, dever-se-ia saber que devido ao envolvimento do eixo SDF-1 — receptor de SDF-1 como descrito em conjunto com ele, o dito eixo pode se abordado pelas moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção tal que o efeito terapêutico, preventivo e diagnósti- co é alcançado.
Dever-se-ia saber ainda que as particularidades das doen- ças, distúrbios e condições dos pacientes e qualquer detalhe do regime de tratamento descrito em conjunto com esses podem ser submetidos a moda- lidades preferenciais do presente pedido.
Para malignidades hematológicas, em particular, há considerável evidência de que as células de leucemia podem ser protegidas de terapias convencionais (quimioterapia combinada com vários agentes-alvo, tal como anticorpos específicos ou inibidores de quinase) dentro dos microambientes de tecido particulares, chamados de nichos. Tais nichos são encontrados particularmente na medula óssea, onde eles podem abrigar células malignas que são capazes de se expandir e produzir uma reincidência após a terapia inicial (Burger e Kipps, 2002; Burger e Burkle, 2007; Meads e outros, 2008; Burger, Ghia e outros, 2009). Essa preservação de células malignas durante a quimioterapia é grande devido ao contato direto entre as células malignas e as células estromais (Lagneaux, Delforge e outros, 1998; Kurtova, Balakri- shnan e outros, 2009; Damiano, Cress e outros, 1999), entretanto, na com- plexidade desse microambiente, há múltiplos sinais celulares e moleculares : que podem levar à resistência que podem levar à resistência das células ' malignas à quimioterapia. Apesar dessa complexidade, está claro que as So células estromais produzem a quimiocina SDF-1 e que ambas as células normais e malignas que expressam CXCRA4 migram e são mantidas em tais nichos. Essa via molecular que é chave para essa interação é demonstrada pelo fato de que a inibição específica dessa interação é suficiente para libe- rar tanto células normais quanto células malignas dos nichos (Broxmeyer, Orschell e outros, 2005; Devine, Flomenberg e outros, 2004; Azab, Runnels e outros, 2009). Em adição ao enfraquecimento da interação com os nichos, mostrou-se para numerosas malignidades hematológicas que o rompimento do eixo SDF-1 — CXCR4 resulta em aumento da vulnerabilidade das células a outras terapias, então chamadas de 'quimiossensibilização”. Essa quimios- sensibilização foi descrita para mieloma múltiplo (Azab, Runnels e outros, 2009) e várias leucemias agudas e crônicas (Dillman, Veldwijk e outros, 2009; Lagneaux, Delforge e outros, 1998).
Então, o uso de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 de acor- do com a presente invenção para romper a sinalização cruzada entre as cé- lulas malignas e seu meio para sensibilizá-las a outras terapias é uma estra- tégia atraente para o tratamento de malignidades hematológicas. Exemplos de terapias que podem ser aprimoradas pela combinação com ácidos nucle- icos que se ligam a SDF-1 de acordo com a presente invenção incluem os seguintes, mas não limitados a Fludarabina, Ciclofosfamida, Rituxano, Clo- rambucil, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Melfalano, Imatinibe ou Nilotinibe.
A descrição anterior enfatizou a função de células estromais da medula óssea e nichos de medula óssea na proteção de células malignas a partir dos efeitos de quimioterapia ou outras terapias direcionadas para ma- lignidades hematológicas.
Entretanto, há evidência de interações similares ocorrendo localmente dentro de tumores sólidos como uma grande propor- ção das células em tumores sólidos não sejam células cancerosas, mas de preferência, células estromais, imunes ou vasculares derivadas do hospedei- ro que interagem intimamente com as células tumorais.
Muitos tipos diferen- : tes de tumores sólidos expressam receptores CXCRA4 (Engl, Relja e outros, É 2006; Múller, Homey e outros, 2001; Koshiba, Hosotani e outros, 2000, Eh- ae tesham, Stevenson, e outros, 2008; Zeelenberg, Ruuls-Van Stalle e outros, 2003; Sauer, Seidler e outros, 2005; Su, Zhang e outros, 2005) e/ou CXCR7 (Burns, Summers e outros 2006; Miao e outros, 2007; Wang e outros, 2008; : Zheng, Li e outros, 2010) ou constitutivamente ou em resposta à hipóxia ou vários tratamentos.
As células malignas podem usar essa via de sinalização para sobrevida e migração por ativação de Akt e Erk.
O SDF-1 pode ser pro- duzido pelas próprias células malignas ou pelas células estromais dentro do tumor.
Mais uma vez nesse ambiente complexo, o mecanismo exato pelo qual as células tumorais crescem e escapam da quimioterapia ou outras a- bordagens terapêuticas não é claramente definido.
Entretanto, está claro que o eixo SDF-1 — CXCR4 e o eixo SDF-1 — CXCR7 desempenham uma função importante.
Por exemplo, a inibição de CXCR4 sensibiliza linhagens de célu- las de glioma à quimioterapia in vitro (Redjal e outros, 2006) e a alta expres- são de CXCR4 é preditiva de resultado pobre em câncer de mama (Holm, Abreo e outros, 2008; Mizell, Smith e outros, 2009) e cânceres gastrointesti- nais (Schimanski e outros, 2008). Então, o uso de ácidos nucleicos que se ligama SDF-1 de acordo com a presente invenção para inibir a ação de SDF-1 ou em receptor CXCR4 ou em receptor CXCR7 em uma ampla varie- dade de tumores sólidos aprimorará a terapia atual de tornar as células mais vulneráveis à terapia ou por ação direta ou bloqueando interações com ou- tras células no tumor. Em adição aos aspectos acima, CXCR4 também conduz sinais que são cruciais para o recrutamento e retenção de células derivadas da medula óssea pró-angiogênicas e imunossupressoras (BMDCs). Essa via pode então ser também usada para angiogênese independente de VEGF. Como uma consequência, o bloqueio do eixo SDF-1 — CXCR4 para sensibi- lizar tumores à terapia anti-VEGF ou radiação emergiu como um tratamento de estratégia atraente para cânceres sólidos.
Entretanto, há uma preocupação de que o bloqueio de CXCR4 possa não ser suficiente para bloquear os efeitos de SDF-1, que pode tam- bém se ligar a CXCR7 em células cancerosas ou estromais. Por exemplo, CXCR7 foi recentemente relatado como expresso em células tumorais no EE cérebro e como mediando efeitos antiapoptóticos, e também mostrou-se re- gulara invasão, angiogênese e crescimento de tumor de carcinomas hepa- tocelulares humanos. Em tais casos, a ação de ácidos nucleicos que se |li- À gam a SDF-1 para bloquear a ação de SDF-1 tanto em receptores CXCR4 quando em receptores CXCR7 em um único agente forneceria uma eficácia particular comparada a bloqueadores de receptor específicos.
O medicamento de acordo com a presente invenção pode ser usado em combinação com um medicamento adicional ou um agente farma- ceuticamente ativo adicional, onde o medicamento adicional ou o agente farmaceuticamente ativo adicional danifica, destrói e/ou marca as células cancerosas. Se a molécula de ácido nucleico de acordo com a presente in- venção for usada com um medicamento adicional ou um agente farmaceuti- camente ativo adicional, a terapia que é baseada na molécula de ácido nu- cleico é preferencialmente uma terapia adjunta à terapia que faz uso ou é baseada no medicamento ou agente farmaceuticamente ativo. Tal medica- mento ou agente farmaceuticamente ativo são preferencialmente seleciona- dosapartir,mas não restritos, ao grupo que compreende: (a) anticorpos tais como Rituximabe (alvo: CD20), Cetuximabe (alvo: receptor do fator de crescimento epidérmico), Ibritumomabe-Tiuxetano
(alvo: CD20), tositumomabe (alvo: CD20), Trastuzumabe (alvo: HER2/neu), Bevacizumabe (alvo: VEGF), Alentuzumabe (alvo: CD52); (b) agentes alquilantes tais como cisplatina, carboplatina, oxali- platina, mecloretamina, ciclofosfamida, clorambucil, Doxorrubicina, Doxorru- — bicinalipossomal, bendamustina, Melfalano, temozolomida; (c) antimetabólitos tal como purina-azatioprina, mercaptopurina, fludarabina, pentostatina, cladribina; (d) alcaloides de planta tal como alcaloides da vinca, terpenoides de planta tal como taxanos, preferencialmente Docetaxel, Paclitaxel, podofi- lotoxina, epotilona; (e) inibidores de topoisomerase tal como camptotecina, irinote- : cano, mitoxantrona; Â (f) e outros tais como Leucovorina, Metotrexato, Tamoxifeno, So- Eee rafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Flurouracil e Predni- sona.
Outros agentes que podem ser usados como um agente farma- E ceuticamente ativo adicional no tratamento de câncer são bem conhecidos na técnica e incluem, mas não estão limitados a fármacos imunossupresso- res, citocinas, e fármacos citostáticos (para referência: “Allgemeine und Spe- ziellePharmakologie und Toxikologie 2011”, editor: Thomas Karow; Pulheim, Alemanha). Tais agentes bem conhecidos na técnica são usados no trata- mento de câncer de acordo com o padrão atual de cuidado para a população de pacientes com câncer particular.
Sabe-se que os agentes farmaceuticamente ativos especificados acima podem ser usados em conjunto com qualquer aspecto da presente invenção que faz uso de tal agente farmaceuticamente ativo.
O medicamento ou o agente farmaceuticamente ativo tem ou pode fornecer a função de quimioterapia.
Alternativa ou adicionalmente à quimioterapia, a radioterapia pode ser usada.
O medicamento de acordo com a presente invenção, em combi- nação com ou sem o medicamento adicional ou agente farmaceuticamente ativo adicional, e com ou sem radioterapia, pode ser usado para o tratamen-
to e/ou prevenção de câncer, preferencialmente (a) câncer hematológico, onde mais preferencialmente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que consiste em leucemia e mieloma.
(b) tumores sólidos, onde mais tumores sólidos são seleciona- dos a partir do grupo que consiste em glioblastoma, câncer colorretal, câncer de mama, linfoma, câncer de próstata, câncer pancreático, câncer de pul- mão, câncer renal, e câncer de ovário. .
Preferencialmente, o câncer de mama é selecionado a partir do grupo que consiste em câncer de mama HER2-negativo avançado.
Preferencialmente, a leucemia é selecionada a partir do grupo " que consiste em leucemia linfoide crônica e leucemia mieloide aguda. Í Preferencialmente, o mieloma é selecionado a partir do grupo E que consiste em mieloma múltiplo.
O medicamento adicional preferencial ou agente farmaceutica- mente ativo adicional para o tratamento de glioblastoma é radioterapia ou quimioterapia com temozolomida ou terapia com bevacizumabe. O medica- mento adicional ou agente farmaceuticamente ativo adicional preferencial; para o tratamento de câncer colorretal é selecionado a partir do grupo que consiste em flurouracil, Leucovorin, Oxaliplatina, Irinotecano, e bevacizuma- be.
O medicamento adicional ou um agente farmaceuticamente ativo adicional preferencial para o tratamento de câncer de mama HER2-negativo avançado é selecionado a partir do grupo que consiste em Doxorrubicina, —Paclitaxel, Docetaxel, Metotrexato, Flurouracil, Bevacizumabe, Tamoxifeno e inibidores de aromatase.
O medicamento adicional ou um agente farmaceuticamente ativo adicional preferencial para o tratamento de leucemia linfoide crônica é sele- cionado a partir do grupo que compreende fludarabina, ciclofosfamida, ritu- ximabe, Clorambucil, alentuzumabe, vincristina, pentostatina, mitoxantrona, doxorrubicina, cladribina, e bendamustina.
O medicamento adicional ou um agente farmaceuticamente ativo adicional preferencial para o tratamento de mieloma múltiplo é selecionado a partir do grupo que compreende Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Melfalano, Ciclofosfamida, doxorrubicina lipossomal, e prednisona.
Em uma modalidade do medicamento da presente invenção, tal medicamento é para uso em combinação com outros tratamentos para qual- quer das doenças descritas aqui, particularmente aquelas para as quais o medicamento da presente invenção será usado.
A “terapia de combinação” (ou “coterapia”) inclui a administração de um medicamento da invenção e ao menos um segundo agente ou agente adicional como parte de um regime de tratamento específico destinado a fornecer o efeito benéfico a partir da coação desses agentes terapêuticos, . isto é, o medicamento da presente invenção e o dito segundo agente ou a- À gente adicional.
O efeito benéfico da combinação inclui, mas não está limita- Raso do à coação farmacocinética ou farmacodinâmica resultante da combinação de agentes terapêuticos.
A administração desses agentes terapêuticos em combinação tipicamente é executada ao longo de um período de tempo defi- nido (geralmente minutos, horas, dias, ou semanas dependendo da combi- nação selecionada). A “terapia de combinação” pode ser, mas geralmente não é des- tinadaa abranger a administração de dois ou mais desses agentes terapêu- ticos como parte de regimes de monoterapia separados.
A “terapia de com- binação” é destinada a abranger a administração desses agentes terapêuti- cos de uma maneira sequencial, isto é, onde cada agente terapêutico é ad- ministrado em um tempo diferente, bem como a administração desses agen- testerapêuticos, ou ao menos dois dos agentes terapêuticos, de uma manei- ra substancialmente simultânea.
Substancialmente, a administração simultã- nea pode ser executada, por exemplo, através da administração a um indiví- duo de uma única cápsula tendo uma razão fixa de cada agente terapêutico ou em múltiplas cápsulas únicas para cada um dos agentes terapêuticos.
A administração sequencial ou substancialmente simultânea de cada agente terapêutico pode ser efetuada por qualquer via apropriada inclu- indo, mas não limitada a vias tópicas, vias orais, vias intravenosas, vias in-
tramusculares, e absorção direta através de tecidos da membrana mucosa. Os agentes terapêuticos podem ser administrados pela mesma via ou por vias diferentes. Por exemplo, um primeiro agente terapêutico da combinação selecionada pode ser administrado por injeção, enquanto os outros agentes terapêuticos da combinação podem ser administrados topicamente.
Alternativamente, por exemplo, todos os agentes terapêuticos podem ser administrados topicamente ou todos os agentes terapêuticos po- dem ser administrados por injeção. A sequência na qual os agentes terapêu- ticos são administrados não é estreitamente crucial, a menos que notado de outra forma. A “terapia de combinação” pode também abranger a adminis- tração dos agentes terapêuticos como descrito acima em combinação adi- : cional com outros ingredientes biologicamente ativos. Quando a terapia de Í combinação compreende ainda um tratamento sem fármaco, este pode ser Sa conduzido em qualquer tempo adequado contanto que um efeito benéfico a partir da coação da combinação dos agentes terapêuticos e do tratamento E: sem fármaco seja alcançado. Por exemplo, em casos apropriados, o efeito F benéfico é ainda alcançado quando o tratamento sem fármaco é temporari- amente removido da administração dos agentes terapêuticos, talvez por dias ou até semanas.
Como descrito em termos gerais acima, o medicamento de a- cordo com a presente invenção pode ser administrado, em princípio, de qualquer forma conhecida pelos versados na técnica. Uma via preferencial de administração é administração sistêmica, mais preferencialmente por administração parenteral, preferencialmente por injeção. Alternativamente, o medicamento pode ser administrado localmente. Outras vias de administra- ção compreendem intramuscular, intraperitoneal, e subcutânea, via oral, in- tranasal, intratecal, ou pulmonar com preferência dada à via de administra- ção que é a menos invasiva, enquanto assegurando eficácia.
A administração parenteral é geralmente usada para injeções — subcutâneas, intramusculares ou intravenosas e infusões. Adicionalmente, uma abordagem para a administração parenteral emprega a implantação de sistemas de liberação lenta ou de liberação sustentada, que assegura que um nível constante de dosagem é mantido, que são bem conhecidos pelos versados na técnica.
Ademais, medicamentos preferenciais da presente invenção po- dem ser administrados na forma intranasal via o uso tópico de veículos in- tranasais adequados, inalantes ou por vias transdérmicas, usando aquelas formas de emplastros de pele transdérmicos bem conhecidos pelos versa- dos na técnica.
Para ser administrado na forma de um sistema de liberação F transdérmica, a administração de dosagem, é claro, será contínua ao invés de intermitente por todo o regime de dosagem.
Outras preparações tópicas preferenciais incluem cremes, pomadas, loções, aerossóis e géis.
Os indivíduos que responderão favoravelmente ao método da r invenção incluem indivíduos médicos e veterinários geralmente, incluindo É seres humanos e pacientes humanos.
Dentre os indivíduos para quem os aaa métodos e dispositivos da invenção são úteis estão gatos, cães, grandes Ê 15 animais, aves tal como galinhas, e similares. . O medicamento da presente invenção compreenderá geralmente : uma quantidade eficaz do componente(s) ativo(s) da terapia, incluindo, mas não limitado a uma molécula de ácido nucleico da presente invenção, dissol- vido ou disperso em um meio farmaceuticamente aceitável.
Os meios ou carreadores farmaceuticamente aceitáveis incluem quaisquer e todos os sol- ventes, meios de dispersão, revestimentos, agentes antibacterianos e anti- fúngicos, agentes isotônicos e de retardamento de absorção e similares.
O uso de tais meios e agentes para substâncias farmaceuticamente ativas é bem conhecido na técnica.
Ingredientes ativos suplementares podem tam- bém ser incorporados no medicamento da presente invenção.
Em um aspecto adicional, a presente invenção está relacionada a uma composição farmacêutica.
Tal composição farmacêutica compreende ao menos um dos ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção e preferencialmente um ligante farmaceuticamente aceitável.
Tal ligante pode ser qualquer ligante usado e/ou conhecido na técnica.
Mais particularmente, tal ligante é qualquer ligante como discutido em conjunto com a fabricação do medicamento descrito aqui.
Em uma modalidade adicional, a composição farmacêutica compreende um agente farmaceuticamente ativo adicional.
A preparação de um medicamento e de uma composição farma- cêutica será conhecida pelos versados na técnica face à presente descrição.
Tipicamente, tais composições podem ser preparadas como injetáveis, ou como soluções líquidas ou suspensões; formas sólidas adequadas para so- lução em líquido ou suspensão em líquido antes da injeção; como comprimi- dos ou outros sólidos para administração oral; como cápsulas de liberação ao longo do tempo; ou em qualquer outra forma atualmente usada, incluindo colírios, cremes, loções, pomadas, inalantes e similares.
O uso de formula- ções estéreis, tal como lavagens à base de solução salina, por cirurgiões, médicos ou profissionais de assistência médica para tratar uma área particu- lar no campo de operação pode também ser particularmente útil.
As compo- ro sições podem também ser entregues via microdispositivos, micropartículas " ou esponja.
À 15 Mediante a formulação, um medicamento será administrado de Te uma maneira compatível com a formulação de dosagem, e em tal quantida- de como farmacologicamente eficaz.
As formulações são facilmente adminis- E tradas em uma variedade de formas de dosagem, tal como o tipo de solu- ções injetáveis descritas acima, mas cápsulas de liberação de fármacos e similares podem ser empregadas.
O medicamento da invenção pode também ser administrado em : formas de dosagem oral como comprimidos ou cápsulas de liberação contro- lada e sustentada, pílulas, pós, grânulos, elixires, tinturas, suspensões, xa- ropes, e emulsões.
Os supositórios são vantajosamente preparados a partir deemulsões graxas ou suspensões.
A composição farmacêutica ou medicamento pode ser esteriliza- do e/ou conter adjuvantes, tal como agentes conservantes, estabilizantes, umectantes ou emulsificantes, promotores de solução, sais para regular a pressão osmótica e/ou tampões.
Em adição, eles podem conter outras subs- tâncias terapeuticamente valiosas.
As composições são preparadas de a- cordo com métodos de misturação convencionais, granulação, ou revesti- mento, e tipicamente contêm aproximadamente 0,1% a 75%, preferencial-
mente aproximadamente 1% a 50% do ingrediente ativo.
E As composições líquidas, particularmente injetáveis podem, por exemplo, ser preparadas por dissolução, dispersão, etc. O composto ativo é dissolvido ou misturado com um solvente farmaceuticamente puro tal como, porexemplo, água, solução salina, dextrose aquosa, glicerol, etanol, e simi- lares, para formar assim a solução injetável ou suspensão. Adicionalmente, formas sólidas adequadas para dissolução em líquido antes da injeção po- dem ser formuladas.
Os medicamentos e moléculas de ácido nucleico, respectiva- mente, da presente invenção podem também ser administrados na forma de sistemas de liberação de lipossoma, tal como pequenas vesículas unilamela- . res, grandes vesículas unilamelares e vesículas multilamelares. Os liposso- : mas podem ser formados a partir de uma variedade de fosfolipídios, conten- e do colesterol, estearilamina, ou fosfatidilcolinas. Em algumas modalidades, . 15 uma película de componentes lipídicos é hidratada com uma solução aquosa é de fármaco para formar uma camada de lipídio encapsulando o fármaco, o : que é bem conhecido pelos versados na técnica. Por exemplo, as moléculas de ácido nucleico descritas aqui podem ser fornecidas como um complexo com um composto lipofílico ou composto de alto peso molecular não imuno- gênico construído usando métodos conhecidos na técnica. Adicionalmente, “os lipossomas podem apresentar tais moléculas de acido nucleico em sua superfície para direcionar e carregar agentes citotóxicos internamente para mediar a morte celular. Um exemplo de complexos associados a ácido nu- cleico é fornecido na Patente US. No. 6.011.020.
Os medicamentos e moléculas de ácido nucleico, respectiva- mente, da presente invenção podem ser acoplados com polímeros solúveis como carreadores de fármaco direcionáveis. Tais polímeros podem incluir polivinilpirrolidona, copolímero de pirano, poli-hidroxipropil-metacrilamida- fenol, poli-hidroxietilaspanamidafenol, ou polietileno-oxidopolilisina substituí- da com resíduos de palmitoil. Ademais, os medicamentos e moléculas de ácido nucleico, respectivamente, da presente invenção podem ser acoplados a uma classe de polímeros biodegradáveis úteis em alcançar a liberação controlada de um fármaco, por exemplo, ácido polilático, poliepsilon capro- plactona, ácido poli-hidróxi butírico, poliortoésteres, poliacetais, poli-di- hidropiranos, policianoacrilatos e copolímeros de bloco reticulados ou anfipá- ticos de hidrogéis.
Se desejado, a composição farmacêutica e medicamento, res- pectivamente, a serem administrados podem também conter quantidades menores de substâncias auxiliares não tóxicas tal como agentes umectantes ou emulsificantes, agentes de tamponamento de pH, e outras substâncias tal como, por exemplo, acetato de sódio, e oleato de trietanolamina.
O regime de dosagem utilizando as moléculas de ácido nucleico e medicamentos, respectivamente, da presente invenção é selecionado de E acordo com uma variedade de fatores incluindo tipo, espécie, idade, peso, À sexo e condição médica do paciente, a gravidade da condição a ser tratada, ea a via de administração, a função renal e hepática do paciente, e o aptâmero A 15 particular ou o sal desse empregado. Um médico ou veterinário versado na f técnica pode prontamente determinar e prescrever a quantidade eficaz do F fármaco exigida para impedir, opor ou interromper o progresso da condição. Os níveis eficazes de plasma do ácido nucleico de acordo com a presente invenção preferencialmente estão na faixa de 500 fM a 200 uM, preferencialmente de 1 nM a 20 uM, mais preferencialmente de 5 nM a 20 HM, mais preferencialmente 50 nM a 20 uM no tratamento de qualquer uma das doenças descritas aqui. As moléculas de ácido nucleico e medicamentos, respectiva- mente, da presente invenção podem ser preferencialmente administrados emuma única dose diária, a cada segundo ou terceiro dia, semanalmente, a cada segunda semana, em uma única dose mensal ou a cada terceiro mês. Está dentro da presente invenção que o medicamento como descrito aqui constitui a composição farmacêutica descrita aqui. Em um aspecto adicional, a presente invenção refere-se a um método para o tratamento de um indivíduo que está em necessidade de tal tratamento, onde o método compreende a administração de uma quantidade farmaceuticamente ativa de ao menos um dos ácidos nucleicos de acordo com a presente invenção. Em uma modalidade, o indivíduo sofre de uma doença ou está em risco de desenvolver tal doença, onde a doença é qual- quer uma das descritas aqui, particularmente qualquer das doenças descri- tas em conjunto com o uso de qualquer um dos ácidos nucleicos de acordo coma presente invenção para a fabricação de um medicamento.
Como preferencialmente usado aqui, o termo “tratamento' com- preende em uma modalidade preferencial adicional ou alternativamente pre- venção e/ou acompanhamento.
Como preferencialmente usado aqui, os termos “doença' e “dis- túrbio' devem ser usados de uma maneira intercambiável, se não indicado ao contrário. " Como usado aqui, o termo “compreende' é preferencialmente É não destinado a limitar o assunto seguido ou descrito por tal termo. Entretan- e to, em uma modalidade alternativa, o termo 'compreende' deve ser entendi- p 15 dono sentido de conter e assim como limitando o assunto seguido ou descri- É to por tal termo.
E As várias SEQ ID NOs, a natureza química das moléculas de á- cido nucleico de acordo com a presente invenção e as moléculas alvo SDF-1 como usadas aqui, a sequência real dessas e o número de referência interno são resumidos na seguinte tabela. Deve-se notar que os ácidos nucleicos foram caracterizados no aptâmero, isto é, nível de ácido D-nucleico (D-RNA) com o D-SDF-1 humano biotinilado (SEQ ID NO: 4) ou no nível de spiegel- mer, isto é, ácido L-nucleico (L-RNA) com a configuração natural de SDF-1, o L-SDF-1 (SDF-1 humano a, SEQ ID NO: 1). Os diferentes ácidos nucleicos compartilham um nome de referência interno, mas uma SEQ ID NOs: para a molécula de D-RNA (aptâmero) e uma SEQ ID NOs: para a molécula de L- RNA (spiegelmer), respectivamente. Tabela 1 Ee me e ALQIVARLKNNNRQVCIDPKLKWIQEYLEKALNK | SDF-1 humano/macaco/gato
L- peptídeo KPVSLSYRCPCRFFESHVARANVKHLKILNTPNC | SDF-18 humano/macaco/gato ALQIVARLKNNNRQVCIDPKLKWIQEYLEKALNK-
RFKM LQIVARLKNNNRQVCIDPKLKWIQEYLEKALNK SDF-1 murino D- peptídeo KPVSLSYRCPCRFFESHVARANVKHLKILNTPNC | hu D-SDF-1 biotinilado ALQIVARLKNNNRQVCIDPKLKWIQEYLEKALNK- RFK-Biotin a aa asda
GAUCCUAGUCAGGUACGCU e ea ELO ni GAUCCUAGUCAGGUACGCU essa GAUCCUAGUCAGGUGCGCU ess = e GAUCCUAGUCAGGUGCGC — ce Esse
GAUCCUAGUCAGGUGCGC Fest
GAUCCUAGUCAGGUGCCC e RE
GAUCCUAGUCAGGGACGEC aa EE
GAUCCUAGUCAGGUACGC GAUCCUAGUCAGGUACGC
CUAGUCAGGUAUGC Fes
GAUCCUAGUUAGGUACGC CUAGUCAGGUACGC
[ssa in no: TrnaPeptiaso Tsequenia O TReterindiamtema |
CUAGUCAGGUACG as fe
GUCAGGUAC A a com
GUCAGGUA E Se eee em
CAGGU 2 CAGG e
E AGUCAGGUACGC É AGUCAGGCGCGC
AGUCAGGGCGC a do
AGUCAGGGCCC Da dnADo
AGUCAGGGGCC
AGUCAGGGGGC 28 L-RNA 5-40 kDa-PEG- 193-G2-012-5-PEG, GCEGUGEUGUGAUCUAGAUGUAUUGGCUGAUCCU | NOX-A12
AGUCAGGUACGC e Esse e
UAGUCAGGUACGCU Im ee mera
VUAGUCAGGUACGCU
EI Ao Peptídeo Interna
GCU [ae — Jana — ocauoeuGuaAUCUAGAUGUAAUEGOUGAUCCUAGUCAGEGACEO (19203002 | * las fomna [ccuGGUGUGAUCUAGAUGUAGAGGOUGAUCOLAGUCAGSUACOS | 193.s5.002 | — ss lema [ccuecueucAUCUAGAVGUAGUGSCUGUUCCUAGUCAGGLALGO | 82:55 002. | Á [20 — Josna — oceuceuGueAUCLAGAUGUAGUGCUGAUCcUAGuUAGGUACES | 193.01-002. | | [e Josna — ocuecueucavCUAGAUGLAGUEGCUGAUCOuAGUCAGEUACS — |155:0c2.00a | ! | [15 — Jeso — juccueueavcuAGAUGUAGUAGCUGALDCUAGUCAGEUA — — L1ss.cz.00s | les — forma LoueueavcuacaGuAGueGcuGavcuaeuenseu — L1ssc2.00 | E ao Peptídeo Interna les — Jem — [aueueauCUAGAUGUAGUEGCUGAUOCUAGUCASS — raacaoor | [a — JorNA — [GoGUGGUGUEACUAGAUGUALMGGOUGAUCCUAGUCAGEUACSC | 193-02.012. | lat —loma — cosceusueaveuAGAUGUAUUEECUGAUCALAGUcABaCSe — 1s3:02.014 | [e lona ccccueueruCcuAGAUGUALUEGCUGAUCOLAGUCAGEBCC — 193:02.015 | [so — Jana — ascosueuerUCUAGAUGUALUGECUGAUCCUAGUCAGGAC — 193:2.0%6 | muia-1 Fo fee — E mula-2
[6 Tuna Tanaouancacevaaueaaeo | [ss lena — [aaccacavevcmueaaa So | lo Íusna [ecuvaceccuameees lr Jura Joeuvcsccuaemenes le lusa fesuvasescuesmevess [se lua esuvaseccuvemaaes Interna leo — fusna — [GOVGUGAMAGCAACAUGUCAAUIGAAAGGLAGCCGCAGO | 192.210.001 | lei fuga [ecUGUGAMAGUACAUGUOMAUGAMAGGUARCCACAGO [152.040 — | — le ema [ocveuGAAGUMCAOGUCAUGARAGGUMACCGCAGO tanto — | | le fumna — [ocueuGAmGUArCACOUCMUGArAGUArccAcASS one | : les fuma — ecueuAMAGUACANGUCAnUGAAGGLARCUAcASS T1s2ero — | [ lee — uma — ÍcoueucamcuncArGUCArUGARAGGLAnCCAÇASO 192.010 — | : lee jura TocuAUGAMAGUACAUGUCAAUIGAMAGGUARCCALAGO —[1szaita — |
NO: terna [95 Juma [arnovracaMGUMAAUGAMMGSUARO | nronFomuaz|
[eo [ema — [sueamocancavoucAruGAMADauAGccso — [raaranos | ler fura [usocacavGuEAAmBuADDs — razaranos | ler fuma — — omacomoaveuemueaceUASoo — ra2a1000s | les Jura — — cousa oCMcADGUCANUGAMGGUAGCC GAS — razarDDos — | les — fura — — ccocaarocrMcAUGUEANUGAMGGUAOaGESo — razaments | lee Tuma — — [scosmmecancauGueMUGAcGLAGcaSo egaroais | E Ro terna
Ê : lee lema — succamocrcaveucArvGAMeuAÇEaDS aaarooe | : : [ez uma — foccomocAncADGUCANUGAMeGUAGCESCO 1saatoaes | : les fuma — — [occoarGCMNCAUGUCAAUIGAAGGUAGDGEES — 1saronas | les — uma — — [ovecusocececuuAGOGCUAGAAUcECcuacaBSAs [tara — [ee —Íuma — — [acauGCGAGUUAGGACUAGArUCEBUCGACACSOU [1a1.0saot — | ler lima — — [oueuuGCGGABGULAGEGCLAGAAGUCEGUCAGCAGEAS [tara — | DM a
GCCAACACG IE rama aaa
AUUCUCACG CCAGUCACG
ER Taro Peptídeo terna [12 — fuga — [eueuvcccsceuuasoecuuGrrcucosccescasÇas |1sra1
PR E RSA PP E PS
PP E PA [109 — furNA — [ecuvaGGGCUHRK;AGUCGE: XzAorabeert — | nmocFómuia| [100 lima — [ocuvaceecumRAeSa o nmeeramuenz| le emo esuvaseeeummaaes o necramues|
À [13 Juma — [oncavacoGOUUAGGCULArASUcBBCuGALveue — ranaaaas — | E [14 liga — [eceuvaseccuvAraucecueaeu franco | Eee | Peptídeo Interna Ins lima — foceuscerseuuAsGGCuAGAAGUCAUcGAcADSo — rarnaca — | [118 firma — [cosscenceuvaGEBCuAGA GuCaGuEBncos — raras — | [119 lugna — [cscerseuuascouAsarucsauescos — rorosams — | [120 fuma — JcossaceuvAsGcuaGAeuDasucs — Jrsrnaoor | [122 fuga — [ccecesuvaaccuamsucsaaes — iorosom | l122 lima — [ccosseuuaeacumeaacuesenese — Írsrnaoms |
[122 — Jena — [osscescuvacascuaaeuesaceess — |1ornsczazos | [126 Jima — [uscuccesceuuacacuasMsucasccuacasea — Lisszont ae a EI Peptídeo Interna : : : : : GCCCEGEUECAGEGCAUCOGC6E
AGAGCUGAUCCCGCUCAGGUGAG Eee
AGGACAGAGCUGAUCCCGCUCAG MA ea
GCGUGAAAGCAACAUGUCAAUGAAAGGUAGCCGCGEC Ea ao Peptídeo [148 fora ccusuaameuancaceucAauGAMeGUARDOBAGO — nseFro —
[150 lona [ccucuacuARcarcucaruGAMaSuacuacAss — Tasso — [158 forma /ecuaveameuAcAvGUCArUGArADGUAcCaDAS asa — [156 lona — /ccuscermascercAUGUCARUGAMMBGUAGCoGEAGO — rsa.nto | [159 orna — [ccueuersasuAncAUGUCAAUGAmGGUAGOGEASo — fasso [1560 forma LnsceuaameuAcACOUAAUIGAoGUADcAcSeu faso — | EE E a
: ídeo : [161 forma — uGueanaGCANcAUGUCANVGAMBGUADEESEA [raras — | | [162 fora ;euernascascAGUCAUGArGGIABDDBS [raras — | [162 lorwa [usamnccracaveucaruGaraDaUAÇOeS [rararenos — [165 lorna [aracomcaDeucAUEAGUASO o [tara [108 fora ;eceusamecacauGucArUGArASUAGceSaSe —rezaraaos | [167 fora /ececenmecarcaueucaruaArASGUAGcaGeSo regatas | [19 forma — ccocarnccracAUGUCANuGAMeSUADED Se rogareara | [1690 forma ceuermaccaacauGucanuGAmGBuAGCe os rszaraans — | [174 forma [euecarnGMcAvGUCARUGAMeSIAGScSe — rzareois — [172 ora [cccermaccacauGUeravArGaUAGe Sus — regata — | Eme
Peptídeo
CCAACACG Fr em
UUCUCACG E TSE
CAGUCACG [12 lesma [accouemeceuuaseBcucerasucoscusacaçeu eas | : : [166 forna — |eveuuccesssuuAeGcuusarsuDaBcosacAEAs frner :
E | NO: Peptídeo [166 forna —ouccusuesccucasCcuAGArGUCaBOuGCAGEAS [toras [00 lorna uacavasSCaUUAEBCLUAMmeUceBcusauMe Des — Hranaons | [110 forna — LoncavASSGAUUAGEGCUUAMGUCaBCUGALEDe — sao | [22 osna — csccuvasscuuamsuceacuenTe o [ias | [152 lona — LocouescsreULAGEGCuAGArGUCGSUCGACADSE —sasane | [160 Josna LcovecoeasSuuAGECLAGArGUDaGueAcAS — rennsans | [165 forna — cesceacGUUADEGCLAGArsUCaGuOGAcES ratos — [166 lorna — ;cecocensSuuAGEBCLAGATGUDEEuCEcas emnsans | [167 esrna —cesceceuuAGSCLAGArSUCBEuesaas rernson | [160 forma LceccceuuAEacunGAeucemuees o rrenan | [160 orna — casaceuuAGECLAGAreucaue rerosoro — [290 erva «coscssuunceccuasaasuceesaas — istosoim — [o Íorna loccessuuassocuasan suas — isrosoas —
| [a Jorna occoceuvaceccuacAeueeneco — Jranosoas — las fora |ccoscecuuaeccuAGAnSUCeSaasss — ronosammasa | E AE a IE Peptídeo [os Íorna ccoosceuuasescuasAneuaacases — rornsoraass | [20 Íorna cescessuvaeGcuAGaeucaanenes — rannaoaezes | [290 lorna — scuscececeuuaceacuasaGuaGnuacase — rarezas — | — leo forma [cuccescecuuaeGcuAGMGucBacuecas — rorezoss — | : : la lorna — JccoscesuvaescuaGansuesanceee — Íanazos — : ; las Jorna ceocesseuuacecuAGanucsacaaees Tasnazaneste
GUGCAGGGCAUCCGCG
AGAGCUGAUCCCGCUCAGGUGAG Eee e
AGGACAGAGCUGAUCCCGCUCAG UAAGGAAACUCGGUCUGAUGCGGUAGCGCUGUGCAGAGCU |trole
ERR TOO Peptídeo [220 gn Tosuececuversames leer fuma Jevervvevece Esc tal soca O E O ea
225 |LRNA |5-40kDa-PEG- revNOX-A12
CGCAUGGACUGAUCCUAGUCGGUUAUGUAGAUCUAGUGUGG
UGCG A presente invenção é ainda ilustrada pelas figuras, exemplos e a listagem de sequência a partir dos quais características, modalidades e vantagens adicionais podem ser obtidas, onde: A FIG. 1 mostra um alinhamento de sequências de moléculas de ácidonucleico que se ligam a SDF-1 do “tipo A”. As Figuras 2A e 2B mostram derivados da molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 192-A10-001 (moléculas de ácido nucleico que E se ligam a SDF-1 do “tipo A”). f A FIG. 3 mostra um alinhamento de sequências de moléculas de ssa 10 ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do “tipo B”. As Figuras 4A e 4B mostram derivados de moléculas de ácido ss£ nucleico que se ligam a SDF-1 193-C2-001 e 193-G2-001 (moléculas de áci- do nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo B). : A FIG. 5 mostra um alinhamento de sequências de moléculas de —ácidonucleico que se ligam a SDF-1 do “tipo O”. A FIG. 6 mostra derivados da molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 190-A3-001 (moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do “tipo C”). As Figuras 7A e 7B mostram derivados da molécula de ácido —nucleico que se liga a SDF-1 190-D5-001 (moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do “tipo O”). A FIG. 8 mostra derivados da molécula de ácido nucleico que se liga a SDF-1 197-B2 (moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do “tipo C”). A FIG. 9 mostra ainda moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 que são, em adição a outras moléculas de ácido nucleico de ligação a a SDF-1, também chamadas de moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do “tipo D”.
A FIG. 10 mostra a eficácia de spiegelmers que se ligam a SDF- 1 193-G2-012-5-PEG (também chamados de NOX-A12), 197-B2-006-5'- PEG, 191-D5-007-5-PEG e 191-A10-008-5-PEG em um ensaio de quimio- taxia com a linhagem de células de leucemia em células T humanas Jurkat ondeascélulassão permitidas a migrar em direção a 0,3 nM de SDF-1 hu- mano pré-incubado a 37ºC com várias quantidade de spiegelmers 193-G2- 012-5-PEG, 197-B2-006-5-PEG, 191-D5-007-5-PEG e 191-A10-008-5"- PEG, representados como porcentagem de controle sobre a concentração de spiegelmers 193-G2-012-5"-PEG, 197-B2-006-5"-PEG, 191-D5-007-5"- PEGe191-A10-008-5-PEG. A FIG. 11A mostra a eficácia do spiegelmer que se liga a SDF-1 h NOX-A12 em um ensaio de quimiotaxia com a linhagem de células ALL pré- É B Nalm-6, onde as células foram deixadas migrar em direção a 0,3 nM de se SDF-1 humano pré-incubadas a 37ºC com várias quantidades de spiegelmer ; 15 NOX-A12 representadas como a porcentagem de controle sobre a concen- É tração de spiegelmer NOX-A12.
. A FIG. 11B mostra a eficácia do spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 em um ensaio de quimiotaxia com a linhagem de células de linfo- ma em monócitos humanas leucêmicos U937, onde as células foram deixa- dasmigrarem direção a 3 nM de SDF-1 humano pré-incubadas a 37ºC com várias quantidades de spiegelmer NOX-A12 representadas como a porcen- tagem de controle sobre a concentração de spiegelmer NOX-A12.
A FIG. 12 mostra a eficácia do spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 em um ensaio de quimiotaxia com a linhagem de células de leu- cemiapré-B BV-173, onde as células foram deixadas migrar em direção a 3 nM de SDF-1 humano pré-incubadas a 37ºC com várias quantidades de spi- egelmer NOX-A12 representadas como a porcentagem de controle sobre a concentração de spiegelmer NOX-A12.
A FIG. 13 mostra a eficácia de spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 em um ensaio de complementação com células CHO estavelmen- te expressando CXCR7 e B-arrestina ambos fundidos a um fragmento de B- galactosidase, onde CXCR7 das células foi ativado em direção a 10 nM de
SDF-1 humano pré-incubado a 37ºC com várias quantidades de spiegelmer NOX-A12 representado como porcentagem de controle sobre a concentra- ção de spiegelmer NOX-A12.
A FIG. 14 mostra a inibição de brotamento induzido por SDF-1 por spiegelmer que se liga a SDF-1 humano 193-G2-012-5-PEG (também chamado de NOX-A12) e por spiegelmer de controle PEGilado em ensaio de brotamento de anel aórtico, onde os anéis da aorta de ratos foram embebi- dos em matriz de colágeno e incubados por 6 dias com SDF-1 com ou sem spiegelmers (a: controle; b: 10 nM SDF-1; c: 10 nM SDF-1 + 1 uM de spie- gelmer que se liga a SDF-1 humano 193-G2-012-5"-PEG; d: 10 nM SDF-1 + 1 uM de spiegelmer de controle PEGilado). " A FIG. 15 mostra a inibição de brotamento induzido por SDF-1 F por spiegelmer que se liga a SDF-1 humano 193-G2-012-5"-PEG (também oo chamado de NOX-A12) e por spiegelmer de controle PEGilado em ensaio de brotamento de anel aórtico, onde os índices de brotamento são mostrados sã. como média +/- SD para 5 anéis por condição (*: o valor para SDF-1 é signi- ficativamente diferente do controle (teste de Mann-Whitney; p = 0,008); **: o : valor para SDF-1 + spiegelmer que se liga a SDF-1 humano 193-G2-012-5"- PEG é significativamente diferente do valor para SDF-1 (teste de Mann- Whitney;p=0,028).
A FIG. 16 mostra a eficácia de spiegelmer que se liga a SDF-1 humano NOX-A12 para sensibilizar células RPMI-8226 MM a F-ara-A (Flu- darabina), onde as células MS-5 murinas confluentes secretando SDF-1 fo- ram incubadas com spiegelmer que se liga a SDF-1 humano NOX-A12 ou —comrevNOX-A12 não funcional e subsequentemente cocultivadas com célu- las RPMI-8226 MM; as células foram tratadas com 1 uM de F-ara-A por 40 horas e a viabilidade celular foi medida por citometria de fluxo usando Rea- gente ViaCount. As barras de erro indicam SD, N = 5, * p = 0,0134, ** p= 0,0003 (duas caudas, teste-t não pareado).
A FIG. 17 mostra a eficácia de spiegelmer que se liga a SDF-1 humano NOX-A12 para inibir a proliferação de células Jurkat em cocultura om células MS-5 estromais, onde as células MS-5 estromais murinas secre-
tando SDF-1 foram incubadas com concentrações crescentes de spiegelmer que se liga a SDF-1 humano NOX-A12; as células Jurkat foram adicionadas à camada de células MS-5 confluentes e as contagens de células foram me- didas após 40 horas por citometria de fluxo usando Reagente ViaCount.
As barras de erro indicam SD, N = 4, *** p = 0,0008 (duas caudas, teste-t não pareado). As Figuras 18A e 18B mostram a eficácia de spiegelmer que se liga a SDF-1 humano NOX-A12 para reverter a adesão dose-dependente de SDF-1 de células Jurkat à fibronectina, onde as células Jurkat foram incuba- dascom SDF-1 sozinho (A), com SDF-1 e concentrações crescentes de spi- egelmer que se liga a SDF-1 humano NOX-A12 ou com SDF-1 e concentra- E ções crescentes de spiegelmer de controle revNOX-A12 (B) por 30 minutos  e semeadas em placas revestidas com fibronectina por 15 minutos; as célu- Maas las foram subsequentemente removidas por lavagem com meios e as células : 15 acopladas foram quantificadas usando Reagente Cell Titer Glo.
As barras de É erro indicam SD. | Exemplo 1: Ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 humano.
Em seguida, os termos “ácido nucleico' e “molécula de ácido nu- cleico' são usados aqui de uma maneira sinônima, se não indicado ao con- trário.
Ademais, os termos “extensão' e “extensão de nucleotídeo' são usa- dos aqui de uma maneira sinônima, se não indicado ao contrário.
As moléculas de ácido L-nucleico que se ligam a SDF-1 e as respectivas sequências de nucleotídeo são representadas nas Figuras 1 a 9. Os ácidos nucleicos foram caracterizados no aptâmero, isto é, nível do ácido —D-nucleico usando ensaios de ligação “Pull-down" competitivos ou diretos com D-SDF-1 humano biotinilado (protocolo, ver Exemplo 3). Os spiegel- mers foram testados com a configuração natural de SDF-1 (L-SDF-1) por medição de ressonância plasmônica de superfície usando instrumento Bia- core 2000 (protocolo, ver Exemplo 5) e um ensaio de quimiotaxia in vitro da — cultura de células (protocolo, ver Exemplo 4). As moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 exibem di- ferentes motivos de sequência, três tipos principais são definidos nas Figu-
ras 1, 2A e 2B (Tipo A), Figuras 3, 4A e 4B (Tipo B), Figuras 5, 4, 7A, 7TBe 8 E (tipo CO). As moléculas de ácido nucleico exibem diferentes motivos de se- quência.
Para a definição de motivos de sequência de nucleotídeo, as abre- viações IUPAC para nucleotídeos ambíguos são usadas: Ss forte GoucC; WwW fraco AouU; R purina GouA; Y pirimidina CouU; K ceto GouU; M imino AoucC; B não A CouUVouG; E D não C AouGouU; á H não G A ou C ou U; Fe V não U AouCouG; N todos A ou G ou C ou U lee Se não indicado ao contrário, qualquer sequência de ácido nu- cleico ou sequência de extensões e caixas, respectivamente, é indicada na . direção 5 ->3'. Moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo A Como descrito na FIG. 1, todas as sequências de moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo A compreendem uma extensão central de nucleotídeos que é flanqueado pelo primeiro (5'-)terminal e a se- gunda extensão (3'-)terminal de nucleotídeos (também chamados de primei- ra extensão terminal de nucleotídeos e segunda extensão terminal de nucle- —otídeos), onde ambos as extensões podem hibridizar entre si.
Entretanto, tal hibridização não é necessariamente dada na molécula.
Em seguida, os termos “moléculas de ácido nucleico que se li- gam a SDF-1 do tipo A” e “ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A” ou “moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo A" são usados —aquide uma maneira sinônima, se não indicado ao contrário.
As sequências das caixas ou extensões definidos de nucleotí- deos podem ser diferentes entre os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A que influencia a afinidade de ligação a SDF-1. Com base na análi- d se da ligação de diferentes ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 resumi- dos como ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A, a extensão cen- tral de nucleotídeos e suas sequências de nucleotídeo, como descrito em seguida, são individualmente e mais preferencialmente em sua integridade essenciais para a ligação a SDF-1. A extensão central de nucleotídeos de todas as sequências de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A compartilham a sequência (Fórmula 1 Tipo A, SEQ ID NO: 74), onde X, está ou ausente ou é 'A'. Se 'A' estiver ausente, a sequência do nucleotídeo central pode ser resumida como Fórmula 2 Tipo A, : CAHGUMAA-UGAAAGGUARC), SEQ ID NO: 75). O ácido nucleico que se i liga a SDF-1 191-A6 (sequência de nucleotídeo central: Aiaaa [GUAAAAUGAAAGGUAAC], SEQ ID NO: 54) carregando o nucleotídeo adi- E 15 cional “A' dentro da sequência de nucleotídeo central e ainda se ligando a É SDF-1 faz concluir uma sequência de nucleotídeo central alternativa (AA) ; AGYRACAHGUMAAAUGAAAGGUARC) Fórmula 3 Tipo A, SEQ ID NO: 76). De forma exemplificada para todos os outros ácidos nucleicos dos ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A, o ácido nucleico que se liga a SDF-1do tipo A 192-A10-001 foi caracterizado por sua afinidade de ligação a SDF-1 humano.
A constante de ligação de equilíbrio Kp foi determinada usando o ensaio de ligação “Pull-down" (Kp = 1,5 nM) e por medição de res- sonância plasmônica de superfície (Kpy = 1,0 nM). O ICs9 (concentração inibi- tória para 50%) de 0,12 nM para 192-A10-001 foi medida usando um ensaio de quimiotaxia in vitro de cultura celular.
Consequentemente, todos os áci- dos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A, como descrito na FIG. 1, fo- ram analisados em um ensaio de ligação de “Pull-down" competitivo versus 192-A10-001. Os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A 192-B11 e 192-C10 mostraram afinidades de ligação iguais a 192-A10-001 nesses experimentos de competição.
A afinidade de ligação mais fraca foi determi- nada para os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A 192-G10, 192-F10, 192-C9, 192-E10, 192-D11, 192-G11, 192-H11 e 191-A6. Os áci-
dos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A 192-D10, 192-E9 e 192-H9 E têm afinidade de ligação muito mais fraca do que 192-A10-001.
Como mencionado acima, os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A 192-B11 e 192-C10 exibem afinidade de ligação a SDF-1 iguala192-A10-001. Entretanto, eles mostram leves diferenças na sequên- cia de nucleotídeos da extensão central de nucleotídeos. Então, a sequência consenso das três moléculas que se ligam a SDF-1 com quase a mesma afinidade pode ser resumida pela sequência de nucleotídeo (Fórmula 4 tipo A, SEQ ID NO: 77), onde a sequência de nucleotídeo da extensão central de nucleotídeos de 192-A10- 001 (sequência de nucleotídeo: [MMAGCAACAUGUCAAUGAAAGGUAGC) p SEQ ID NO: 84) representa a sequência de nucleotídeo com a melhor afini- dade de ligação de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1. Fes Cinco ou seis dos seis nucleotídeos da extensão 5"-terminal " 15 (também chamado de primeira extensão terminal) de ácidos nucleicos que Í se ligam a SDF-1 do tipo A podem hibridizar para os respectivos cinco ou i seis nucleotídeos dos seis nucleotídeos da extensão 3'-terminal (também chamado de segunda extensão terminal) para formar uma hélice terminal. Embora esses nucleotídeos estejam disponíveis em várias posições, os dife- rentes nucleotídeos permitem a hibridização de cinco ou seis dos seis nucle- otídeos das extensões 5"- e 3'-terminal. As extensões 5"-terminal e 3”- terminal de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A, como mostrado na FIG. 1, podem ser resumidos em uma fórmula genérica para a extensão 5'-terminal (RSHRYR', Fórmula 5-5' tipo A) e para a extensão 3'-terminal (YRYDSY', Fórmula 5-3' tipo A). Os derivados truncados do ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A 192-A10-001 foram analisados em um ensaio de ligação “Pull-down” competitivo versus a molécula original 192-A10-001 e 192-A10-008 (FIG. 2A e 2B). Esses experimentos mostraram que uma redu- ção dos seis nucleotídeos terminais (extremidade 5": GCUGUG; extremidade 3: CGCAGC) de 192-A10-001 para cinco nucleotídeos (extremidade 5': CUGUG; extremidade 3: CGCAG) do derivado 192-A10-002 poderia ser feita sem redução da afinidade de ligação. Entretanto, o truncamento para quatro nucleotídeos terminais (extremidade 5º: UGUG; extremidade 3": CG- CA; 192-A10-003) ou menos (192-A10-004/ -005/ -006/ -007) levou à afini- dade de ligação a SDF-1 reduzida (FIG. 2A). As extensões 5'-terminal e 3”- terminal determinados com um comprimento de cinco e quatro nucleotídeos dos derivados de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A 192-A10-001, como mostrado nas Figuras 2A e 2B, podem ser descritos em uma fórmula genérica para a extensão 5"-terminal (X2BBBS', Fórmula-6-5' tipo A) e da extensão 3'-terminal (SBBVX3'; Fórmula-6-3' tipo A), onde X, está ou ausen- te ou é “S' e X; está ou ausente ou é “S”. A sequência de nucleotídeo das extensões 5'-terminal e 3”- terminal tem uma influência na afinidade de ligação de ácidos nucleicos que : se ligam a SDF-1 do tipo A. Isso não é somente mostrado pelos ácidos nu- : cleicos 192-F10 e 192-E10, mas também por derivados de 192-A10-001 2 (FIG. 2B). A extensão centra! de 192-F10 e 192-E10 são idênticos a 192-B11 : 15 e192-C10, mas compreendem leves diferenças na extremidade 3' da exten- É são 5'-terminal e na extremidade 5' da extensão 3"-terminal resultando em E afinidade de ligação reduzida.
A substituição de nucleotídeos 5'-terminal e 3-terminal “CUGUG* e “CGCAG' do ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A 192-A10-002 por “GCGCG' e “CGCGC' (192-A10-015) resultou em uma afinidade de ligação reduzida, onde as substituições por “GCGUG' e “CGCGC' (192-A10-008) resultaram na mesma afinidade de ligação como mostrado para 192-A10- 002 (Fig. 2B). Adicionalmente, nove derivados de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A 192-A10-001 (192-A10-014/-015/-016/ -017/-018/-019/ - 020/-021/-022/ -023) dotados de quatro nucleotídeos 5'-terminal e 3”- terminal respectivamente foram testados como aptâmeros para sua afinida- de de ligação versus 192-A10-001 ou seu derivado 192-A10-008 (ambos têm a afinidade de ligação idêntica a SDF-1). Todas as moléculas mostraram afinidade de ligação a SDF-1 mais fraca ou muito mais fraca como 192-A10- 001 (seis nucleotídeos formando uma hélice terminal) ou como 192-A10-008 com cinco nucleotídeos terminais, respetivamente (FIG. 2B). Consequente- mente, a sequência e o número de nucleotídeos das extensões 5'-terminal e
3'-terminal são essenciais para uma ligação eficaz a SDF-1. Como mostrado para os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A 192-A10-002 e 192-A10-008, a combinação preferencial de extensões 5-terminal e 3- terminal são /CUGUG' e /CGCAG' (extensões 5'-terminal e 3'-terminal de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A 192-A10-002) e “GCGUG' e 'CGCGC' (extensões 5'-terminal e 3'-terminal de ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A 192-A10-008). Entretanto, combinando-se as extensões 5'-terminal e 3-terminal de todos os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A, a fórmula ge- néricapara a extensão 5'-terminal de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A é X:XaNNBV' (Fórmula-7-5' tipo A) e a fórmula genérica para a s extensão 3'-terminal de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo A é : 'BNBNX3X,' (Fórmula-7-3' tipo A), onde To X, é 'R' ou está ausente, X- é 'S', Xçé 'S e X é Y' ou está au- |: 15 sente, É ou . X: está ausente, X, é 'S' ou está ausente, X; é 'S' ou está au- sente e X, está ausente.
De modo a prolongar o tempo de residência de plasma do spie- gelmerin vivo, os spiegelmers 192-A10-008 foram covalentemente acopla- dos a uma porção de 40 kDa de polietileno glicol (PEG) na extremidade 5' como descrito no capítulo 2. A porção PEG não teve influência na potência dos spiegelmers em inibir a quimiotaxia induzida por SDF-1. Moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo B Como descrito na FIG. 3, todas as sequências de ácidos nuclei- cos que se ligam a SDF-1 do tipo B compreendem uma extensão central de nucleotídeos que é flanqueado por extensões 5'-terminal e 3--terminal (tam- bém chamados de primeiro e segunda extensão terminal de nucleotídeos) que podem hibridizar entre si.
Entretanto, tal hibridização não é necessaria- —mentedada na molécula.
Em seguida, os termos “moléculas de ácido nucleico que se li gam a SDF-1 do tipo B' e “ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo B'
ou 'moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo B' são usados aqui de uma maneira sinônima se não indicado ao contrário. As sequências das caixas ou extensões definidos podem ser di- ferentes entre os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 que influenciam a afinidade de ligação a SDF-1. Com base na análise de ligação dos diferentes ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1, a extensão central de nucleotídeos e suas sequências de nucleotídeo, como descrito em seguida, são individual- mente e mais preferencialmente em sua integridade essenciais para ligação a SDF-1.
A extensão central de nucleotídeos de todas as sequências iden- tificadas de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-C2-001, 193-G2- - 001, 193-F2-001, 193-G1-002, 193-D2-002, 193-A1-002, 193-D3-002, 193- f B3-002, 193-H3-002, 193-E3-002 e 193-D1-002 compartilham a sequência es EUSUGAUCUAGAUGUADWGGCUGWUCCUAGUYAGG|Fórmula-1 tipo B, ê 15 SEQID NO: 52). Os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G2-001, F 193-C2-001 e 193-F2-001 que diferem em uma posição da extensão central E de nucleotídeos (sequência consenso de extensão central de nucleotídeos: (Fórmula-2 tipo B, SEQ ID NO: 53) foram analisados em um ensaio de ligação “Pull-down" competitivo versus o ácido nucleico que se liga a SDF-1 192-A10-001 (Kp de 1,5 nM terminado em um énsaio de ligação “pull-down”, ICs9 de 0,12 nM). Cada um dos ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G2-001, 193-C2- 001 e 193-F2 mostrou ligação superior a SDF-1 humano em comparação ao ácido nucleico que se liga a SDF-1 192-A10-001, onde a afinidade de liga- çãode193-G2-001 é tão boa quanto a de 193-C2-001 e 193-F2-001 (FIG. 3). Os dados sugerem que a diferença na sequência de nucleotídeo da ex- tensão central de nucleotídeos de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G2-001, 193-C2-001 e 193-F2-001 não teve influência na afinidade de ligação a SDF-1. Os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G1-002, 193-D2-002, 193-A1-002, 193-D3-002, 193-B3-002, 193-H3-002, 193-E3- 002 e 193-D1-002 mostraram ligação reduzida a SDF-1 humano em compa- ração ao ácido nucleico que se liga a SDF-1 193-G2-001. O ácido nucleico que se liga à SDF-1 193-G2-001 foi caracterizado por sua afinidade de liga- ção a SDF-1 humano. A constante de ligação em equilíbrio Kp foi determina- da usando o ensaio de ligação “pull-down” (Kp = 0,3 nM). A ICso (concentra- ção inibitória para 50%) de 0,08 nM para 193-G2-001 foi medida usando um ensaiode quimiotaxia in vitro de cultura celular.
Quatro, cinco ou seis nucleotídeos dos seis nucleotídeos da ex- tensão 5'-terminal de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 podem hibridi- zar aos respectivos quatro, cinco ou seis dos seis nucleotídeos da extensão 3'- terminal de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 para formar uma héli- ceterminal. Embora os nucleotídeos sejam variáveis em várias posições, os : diferentes nucleotídeos permitem a hibridização para quatro, cinco ou seis Í nucleotídeos dos seis nucleotídeos das extensões 5'-terminal e 3'-terminal. raânc As extensões 5'-terminal e 3'-terminal de ácidos nucleicos que se ligam a . 15 SDF-1, como mostrado na FIG. 3, podem ser resumidos em uma fórmula Ê genérica para a extensão 5"-terminal (XIX>»GCRWG' onde X, É 'A' ou está E ausente, X> é 'G') e da extensão 3'-terminal (KRYSCX3X,' onde X; é “GG, Xa é 'U' ou está ausente). Os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G1- 002, 193-D2-002, 193-A1-002 e 193-D3-002 têm afinidades de ligação a SDF-1mais fracas embora eles compartilhem a extensão central idêntico de nucleotídeos com 193-C2-001, 193-G2-001 e 193-F2-001 (Fig. 3). As propri- edades de ligação desfavoráveis de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G1-002, 193-D2-002, 193-A1-002 e 193-D3-002 podem ser devido ao número de nucleotídeos e sequência das extensões 5"-terminal e 3'-terminal. Os derivados truncados dos ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G2-001 e 193-C2-001 foram analisados em um ensaio de ligação “pull-down" competitivo versus 193-G2-001 e 193-G2-012, respectivamente (Fig. 4A e 4B). Esses experimentos mostraram que uma redução dos seis nucleotídeos terminais (extremidade 5: AGCGUG; extremidade 3: UACG- CU) de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G2-001 e 193-C2-001 para cinco nucleotídeos (extremidade 5": GCGUG; extremidade 3: UACGC) levam a moléculas com afinidade de ligação similar (193-C2-002 e 193-G2-
012). A constante de dissociação em equilíbrio Kp foi determinada usando o ensaio de ligação “pull-down” (Kp = 0,3 nM). Um truncamento para quatro (extremidade 5º: CGUG; extremidade 3": UACG; 193-C2-003) ou menos nu- cleotídeos (193-C2-004, 193-C2-005, 193-C2-006, 193-C2-007) resultou em uma afinidade de ligaçãoa SDF-1 reduzida, que foi medida usando o ensaio de ligação “pull-down" de competição (FIG. 44). A sequência de nucleotídeo dos cinco nucleotídeos terminais na extremidade 5' e na extremidade 3", respectivamente, tem uma influência na afinidade de ligação de ácidos nu- cleicos que se ligam a SDF-1. A substituição de nucleotídeos 5'-terminal e 3-terminal GCGUG' e VACGC' (193-C2-002, 193-G2-12) por 'GCGCG' e “CGCGC' (193-G2-013) resultou em uma afinidade de ligação reduzida.
Adi- . cionalmente, os quatro derivados diferentes do ácido nucleico que se liga a À SDF-1 193-G2-001 com uma hélice terminal com um comprimento de quatro Pass nucleotídeos de pareamento de bases (193-G2-014/ -015/ -016/ -017) foram t 15 testados.
Todos eles mostraram afinidade de ligação a SDF-1 reduzida (FIG. ] 4B). Então, a sequência e o comprimento dos nucleotídeos 5'-terminal e 3- . terminal são essenciais para uma ligação eficaz a SDF-1. As extensões 5"- terminal e 3-terminal com um comprimento de cinco e quatro nucleotídeos dos derivados de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-C2-003 e 193- G2-012, como mostrado nas Figuras 4A e 4B, podem ser descritos em uma fórmula genérica para a extensão 5-terminal (X;X2SSBS'), onde X; está ausente, X, está ou ausente ou é “G, e da extensão 3-terminal (BVSSX3X,), e onde X; está ou ausente ou é 'C' e X, está ausente.
Como mostrado para os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 193-G2-001 e 193- C2-01e seus derivados 193-G2-012 e 193-C2-002, a combinação preferen- cial de extensões 5'-terminal e 3'-terminal é XX2GCGUG' (extensão 5'- terminal) e VACGCX3X,' (extensão 3'-terminal), onde X; é ou 'A' ou está ausente, X; é 'G' e X; é C' e X, é 'U' ou está ausente.
Entretanto, combinando-se as extensões 5'-terminal e 3'-terminal de todos os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 testados, a fórmula ge- nérica para a extensão 5"-terminal de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 é XX0SVNS' e a fórmula genérica para a extensão 3'-terminal de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 é "BVBSX3X,', onde X, é 'A' ou está ausente, X> é 'G', Xg é “C' e Xa é “U' ou está au- sente; ou X, está ausente, X> é 'G' ou está ausente, X; é “C' ou está ausentee X, está ausente.
De modo a prolongar o tempo de residência em plasma do spie- gelmer in vivo, o spiegelmer 193-G2-012 foi covalentemente acoplado a uma porção de 40 kDA de polietileno glicol (PEG) na extremidade 5' como descri- to no capítulo 2 (molécula de ácido nucleico PEGilada: 193-G2-012-5-PEG também chamada de NOX-A12). O spiegelmer PEGilado NOX-A12 foi anali- sado em cultura celular em um ensaio de quimiotaxia in vitro e uma inibição k de quimiotaxia induzida por SDF-1 foi determinada (ICso de 0,2 nM). O spie- : gelmer PEGilado NOX-A12 foi analisado por medição Biacore e uma cons- - tante de ligação (Kp) de 0,2 nM foi determinada. á 15 Moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo C É Como representado na FIG. 12, todas as sequências de ácidos É nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C compreendem uma extensão cen- tral de nucleotídeo que é flanqueado por extensões 5'-terminal e 3'-terminal (também chamado de primeira extensão terminal e segunda extensão termi- nalde nucleotídeos) que podem hibridizar entre si. Entretanto, tal hibridiza- ção não é necessariamente dada na molécula.
Em seguida, os termos 'moléculas de ácido nucleico que se li- gam a SDF-1 do tipo C' e ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C' ou 'moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo C' são usados —aquideuma maneira sinônima, se não indicado ao contrário.
As sequências das caixas ou extensões definidos podem ser di- ferentes entre os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo que influen- cia a afinidade de ligação a SDF-1. Com base na análise de ligação dos dife- rentes ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 resumidos como ácidos nucle- icos que se ligam a SDF-1 do tipo C, a extensão central de nucleotídeos e sua sequência de nucleotídeo como descrita em seguida são individualmen- te e mais preferencialmente em sua integridade essenciais para a ligação a
SDF-1.
As extensões centrais de nucleotídeos de todas as sequências identificadas de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C comparti- lham a sequência (Fórmula-1 tipo C, SEQ IDNO:108), onde X, está ou ausente ou é 'A'. Com a exceção do ácido nu- cleico que se liga a SDF-1 197-D1, a extensão central de nucleotídeos de todas as sequências de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C compartilham a sequência de nucleotídeo (Fórmula-2 tipo C, SEQ ID NO: 109). O ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 197-D1 (extensão central de nucleotídeos: (SEQ ID NO: 56) com a falta de um nucleotídeo “A' dentro da " extensão central de nucleotídeos e ainda se ligando a SDF-1 faz concluir É uma extensão central alternativo de nucleotídeos o [ER-AGUCGG], Fórmula-3 tipo C, SEQ ID NO: 110). Inicialmente, todos os F 15 ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C, como descritos na FIG. 5, E foram resumidos em um ensaio de ligação “pull-down” competitivo versus o . ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo A 192-A10-001 (KD = 1,5 nM de- terminado por ensaio “pull-down” e por medições de ressonância plasmônica de superfície; ICso = 0,12 nM). Os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C 191-D5-001, 197-B2, 190-A3-001, 197-H1, 197-H3 e 197-E3 mostra- ram afinidades de ligação mais fracas do que 192-A10-001 em experimentos de competição. A afinidade de ligação muito mais fraca foi determinada para 191-A5, 197-B1, 197-D1, 197-H2 e 197-D2 (FIG. 5). As moléculas ou deriva- dos dessas foram ainda caracterizados por ensaios de ligação “pull-down” competitivos, medições de ressonância plasmônica e um ensaio de quimio- taxia in vitro. O ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 191-D5-001 foi caracterizado por sua afinidade de ligação a SDF-1 humano, onde a cons- tante de ligação em equilíbrio Kp foi determinada por medição de ressonân- cia de superfície plasmônica (KD = 0,8 nM). O ICso (concentração inibitória para50%)de 0O,2nM para 191-D5-001 foi medido usando ensaio de quimio- taxia in vitro de cultura celular. A afinidade de ligação do ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 197-B2 para SDF-1 humano foi determinada por medição de ressonância plasmônica de superfície (KD = 0,9 nM), seu 1Cso (concentração inibitória para 50%) de 0,2 nM foi analisada em um ensaio de quimiotaxia in vitro de cultura celular. Esses dados indicam que ácidos nu- cleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C 191-D5-001 e 197-B2 têm a afinida- dedeligaçãoaSDF-1 similar (Figuras 5eB8).
O ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 190-A3-001 compreende uma extensão 5'-terminal de 17 nucleotídeos (CGUGCGCUU- GAGAUAGG', SEQ ID NO: 220) e uma extensão 3'-terminal de 12 nucleoti- deos (CUGAUUCUCACG', SEQ ID NO: 221), onde, por outro lado, os qua- tro nucleotídeos na extremidade 5' da extensão 5'-terminal e os quatro nu- cleotídeos na extremidade 3' da extensão 3”-terminal podem hibridizar entre : si para formar uma hélice terminal. Alternativamente, os nucleotídeos “U- : GAGA' na extensão 5"-terminal podem hibridizar para os nucleotídeos “U- E CUCA" na extensão 3”-terminal para formar uma hélice terminal. Uma redu- ção para nove nucleotídeos da extensão 5'-terminal (UGAGAUAGG”') e pa- E ra dez (CUGAUUCUCA', SEQ ID NO: 222) nucleotídeos da extensão 3"- terminal (CUGAUUCUC') da molécula 190-A3-001 não tem uma influência i na afinidade de ligação a SDF-1 (190-A3-003; FIG. 13). Uma redução para oito nucleotídeos da extensão 5'-terminal (GAGAUAGG') e para nove nu- cleotídeos da extensão 3'-terminal ((CUGAUUCUC') da molécula 190-A3- 001 não tem uma influência na afinidade de ligação a SDF-1 (190-A3-004; FIG. 6). A constante de ligação em equilíbrio Ky de 190-A3-004 foi determi- nada usando o ensaio de ligação “pull-down” (Kp = 4,6 nM) e por medição de ressonância plasmônica de superfície (Kpy = 4,7 nM). O ICsº5 (concentração inibitória para 50%) de 0,1 nM para 190-A3-004 foi medido usando um en- saio de quimiotaxia in vitro de cultura celular. Entretanto, o truncamento para dois nucleotídeos na extensão 5'-terminal leva a uma redução muito forte da afinidade de ligação (190-A3-007; FIG. 6). Os ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C 191-D5- 001,197-B2 e 197-H1 (extensão central de nucleotídeos: [AGAAGUCGG], SEQ ID 57), 197-H3/191-A5 (extensão central de nucleoti- deos: [EGUUAGGGCUCGAAGUCGG|, SEQ ID NO: 58) e 197-E3/197-B1 |
(extensão central de nucleotídeos: [ESUDAGGGCUUGAAGUCGG], SEQ ID NO: 59) compartilham uma extensão central quase idêntico de nucleotídeos (fórmula-4 tipo C; sequência de nucleotídeo: SEQ ID NO: 111). 191-D5-001, 197-B2 e 197-H1 não comparti- lhamuma extensão 5'-terminal e 3'-terminal (197-H3 e 197-E3 têm as exten- sões 5'- e 3'-terminal idênticos a 197-B2). Entretanto, os respectivos dez (197-B2, 197-E3, 197-H3) ou nove dos dez (191-D5-001, 197-H1) nucleoti- deos da extensão 5'-terminal podem hibridizar para os respectivos dez (197- B2, 197-E3, 197-H3) ou nove dos dez (191-D5-001, 197-H1) nucleotídeos da extensão 3'-terminal (FIG. 5). Assim, a extensão 5'-terminal dos ácidos nu- cleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C 197-B2, 191-D5-001, 197-H1, 197-E3 : e 197-H3 como mencionado acima mais 191-A5, 197-B1, 197-H2, 197-D1 e É 197-D2 compreendem uma sequência de nucleotídeo genérica comum de "a 'RKSBUSNVGR' (Fórmula-5-5' tipo C, SEQ ID NO: 138). A extensão 3'- ; 15 terminal dos ácidos nucleicos que se ligam a C SDF-1 do tipo C 197-B2, . 191-D5-001, 197-H1, 197-E3, e 197-H3, como mencionado acima, mais 191- . A5, 197-B1, 197-H2, 197-D1 e 197-D2 compreendem uma sequência de nu- cleotídeo genérica comum de “YYNRCASSMY" (Fórmula-5-3' tipo C, SEQ ID NO: 139), onde as extensões 5'-terminal e 3'-terminal dos ácidos nucleicos que seligamaSDF-1do tipo C 197-B2, 191-D5-001, 197-H1, 197-E3 e 197- H3 são preferenciais.
Essas extensões 5*- e 3"-terminal dos ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C 197-B2, 191-D5-001, 197-H1, 197-E3 e 197- H3 podem ser resumidos na fórmula genérica 'RKSBUGSVGR' (Fórmula-6- 5' tipo C; extensão 5'-terminal, SEQ ID NO: 140) e YWVCNRCASSMY' (Fórmu-
la-6-3'tipoC; extensão 3'-terminal, SEQ ID NO: 141). Os derivados truncados do ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 191-D5-001 foram construídos e testados em um ensaio de ligação “pull-down" competitivo versus a molécula original 191-D5-001 (FIG. 7A, FIG. 7B). Primeiro, o comprimento das extensões 5'-terminal e 3'-terminal foram — encurtados de dez nucleotídeos (191-D5-001) cada para sete nucleotídeos cada (191-D5-004) como representado na FIG. 14A, onde nove dos dez (191-D5-001) ou seis dos sete nucleotídeos (191-D5-004) da extensão 5-
terminal e da extensão 3'-terminal, respectivamente, podem hibridizar entre si.
A redução para sete nucleotídeos da extensão 5"-terminal e 3"-terminal respectivamente (onde seis dos sete nucleotídeos podem hibridizar entre si) levou à afinidade de ligação a SDF-1 reduzida (191-D5-004). As extensões terminais do ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 191-D5-004 foram modificados, sendo que o nucleotídeo de não pareamento 'A' dentro da ex- tensão 3'-terminal de 191-D5-004 foi substituído por um “C* (191-D5-005). Essa modificação levou a um aprimoramento de ligação.
Esse derivado, áci- do nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 191-D5-005, mostrou ligação a SDF-1 similar a 191-D5-001. O truncamento adicional da extensão 5"- e 3- terminal para cinco nucleotídeos respectivamente levou a uma molécula com - um comprimento de 29 nucleotídeos totais (191-D5-007). Por causa das si- milaridades de 191-D5-001 e dos ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do o tipo C 197-B2, 191-D5-001, 197-H1, 191-A5, 197-H3, 197-B1, 197-E3, 197- : 15 D1,197-H2 e 197-D2 e por causa dos dados mostrados para 191-D5-007, : assume-se que a extensão 5"- e 3"-terminal pode, em princípio, ser truncada -. para cinco nucleotídeos, sendo que a sequência de nucleotídeo /“CGGGA' para a extensão 5'-terminal e “UCCCG' para a extensão 3-terminal foi testa- da com sucesso (ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 191-D5-007). O ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 191-D5-007 surpreendente- mente se liga um pouco melhor a SDF-1 do que 191-D5-001 (determinado no nível do aptâmero usando o ensaio de ligação de competição). A cons- tante de ligação em equilíbrio Ky de 191-D5-007 foi determinada usando o ensaio de ligação “pull-down” (Kp = 2,2 nM) e por medição de ressonância —plasmônica de superfície (Kp = 0,8 nM). O ICs,5 (concentração inibitória para 50%) de 0,1 nM para 191-D5-007 foi medido usando um ensaio de quimiota- xia in vitro de cultura celular.
O truncamento adicional para ambas as exten-
sões terminais para quatro nucleotídeos (191-D5-010, FIG. 7A). Além disso, derivados do ácido nucleico que se liga a SDF-1 do tipo C 191-D5-001 (191-D5-017/ -024/ -029) dotado de extensões 5'- e 3”- terminal dos respectivos quatro nucleotídeos também mostraram afinidade de ligação a SDF-1 reduzida no ensaio de ligação “pull-down" de competição versus 191-D5-007 (Fig. 7B). Extensões 5'- e 3-terminal alternativas com um comprimento de respectivamente cinco nucleotídeos foram adicionalmente testadas (191-D5-017-29a, 191-D5-017-29b, 191-D5-019-29a, 191-D5-024- 29a, 191-D5-024-29b). A fórmula genérica desses derivados para a exten- são5-terminal é XsSSSV' (Fórmula-7-5' tipo C) e para a extensão 3'-stretch é “BSSSXs' (Fórmula-7-3' tipo C), onde Xs está ausente ou é S', Duas das cinco variantes testadas mostraram afinidade de ligação a SDF-1 idêntica a 191-D5-007 (191-D5-024-29a, 191-D5-024-29b; FIG. 7B). As sequências das extensões 5'-terminal e 3'-terminal de derivados de 191-D5-001, que mostraram a melhor afinidade de ligação a SDF-1 e compreendem uma ex- tensão 5'-terminal e 3'-terminal de cinco nucleotídeos respectivamente (191- D5-007, 191-D5-024-29a, 191-D5-024-29b), podem ser resumidas em uma fórmula genérica (extensão 5'-terminal: “SGGSR', Fórmula-B8-5' tipo C; ex- o tensão 3'-terminal: YSCCS', Fórmula-8-3' tipo C. . 15 Os derivados truncados do ácido nucleico que se liga a SDF-1 é do tipo C 197-B2 foram analisados em um ensaio de ligação “pull-down" : competitivo versus a molécula original 197-B2 e 191-D5-007 (FIG. 7). Usan- do-se o ensaio de ligação “pull-down"” competitivo versus 191-D5-007, reve- lou-se que 197-B2 tem a mesma afinidade de ligação a SDF-1 que 191-D5-
007.As extensões 5'-e 3-terminal foram encurtadas sem perda de afinidade de ligação de dez nucleotídeos (197-B2) cada para cinco nucleotídeos cada (197-B2-005)onde os nucleotídeos da extensão 5'-terminal e da extensão 3'- terminal podem hibridizar completamente entre si. Se a extensão 5'-terminal ('GCGGG') e 3-terminal ((CCUGC”) de 197-B2-005 fosse substituída por “GCCGG' (extensão 5'-terminal) e por “CCGGC' (extensão 3'-terminal) de 197-B2-006, a afinidade de ligação a SDF-1 persistiu completamente. Como 197-B2 e 191-D5-001 (e seus derivados) compartilham a sequência de nu- cleotídeo central idêntica e vários derivados de 191-D5 com extensões 5'- e 3'-terminal com um comprimento de respectivamente quatro nucleotídeos foram testados, um truncamento adicional da extensão 5'-terminal e 3'- terminal foi omitido. Dois derivados adicionais que foram projetados compre- endem seis nucleotídeos nas extremidades 5' e 3' (extensões 5'- e 3”-
; terminal), respectivamente. A afinidade de ligação a SDF-1 de ambas as mo- léculas (197-B2-006-31a e 197-B2-006-31b) é a mesma mostrada para 191- D5-007 e 197-B2-006 (FIG. 15). As sequências das extensões 5"-terminal e 3'-terminal de derivados de 197-B2 que mostraram a melhor afinidade de ligaçãoa SDF-1e compreendem uma extensão 5'-terminal e 3-terminal de cinco nucleotídeos respectivamente podem ser resumidas em uma fórmula genérica (extensão 5'-terminal: “GCSGG', Fórmula-9-5' tipo C; extensão 3'- terminal: CCKGC', Fórmula-9-3' tipo O). Combinando-se as extensões 5'- e 3"-terminal de derivados trun- cados de ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 do tipo C 191-D5-001 (ex- tensão 5'-terminal: “SGGSR', Fórmula-8-5' tipo C; extensão 3'-terminal: YSCCS', Fórmula-8-3' tipo C) e 197-B2 (extensão 5-terminal: “GCSGG'”, Í Fórmula-9-5' tipo C; extensão 3'-terminal: /CCKGC', Fórmula-9-3' tipo O), a ” fórmuia genérica preferencial comum para a extensão 5'-terminal e a exten- E 15 são 3-terminal é “SSSSR' (extensão 5'-terminal, Fórmula-10-5' tipo CO) e É 'YSBSS' (extensão 3'-terminal: Fórmula-10-3' tipo OC).
: De modo a prolongar o tempo de residência em plasma do spie- gelmer in vivo, os spiegelmers 197-B2-006 e 191-D5-007 foram acoplados a uma porção de 40 kDa de polietileno glico! (PEG) em suas extremidades 5", como descrito no capítulo 2. Os spiegelmers PEGilados 197-B2-006 e 191- D5-007 foram analisados em cultura celular em uma quimiotaxia in vitro. À porção PEG não tem influência na potência de spiegelmers de inibirem a quimiotaxia induzida por SDF-1. : Moléculas de ácido nucleico que se ligam a SDF-1 do tipo D Adicionalmente, três ácidos nucleicos que se ligam a SDF-1 adi- cionais que não compartilham os motivos de ligação a SDF-1 do “tipo A', do “tipo B' e do “tipo C' foram identificados e chamados aqui de “tipo D'. Eles foram analisados como aptâmeros usando o ensaio de ligação “pull-down” (FIG. 9).
Entende-se que qualquer das sequências mostradas na FIG. 1a 9 são moléculas de ácido nucleico de acordo com a presente invenção, in- cluindo aquelas formas truncadas dessas, mas também incluindo aquelas formas estendidas sob a condição de que, entretanto, as moléculas de ácido nucleico assim truncadas e estendidas, respectivamente, são ainda capazes de se ligar ao alvo.
Exemplo 2: Síntese e derivação de aptâmeros e spiegelmers Síntese em pequena escala Aptâmeros e spiegelmers foram produzidos por síntese de fase sólida com um sintetizador ABI 394 (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) de 2'TBDMS RNA usando química de fosforamidita (Damha e Ogilvie, 1993). rA(N-Bz)-, rC(Ac)-, rG(N-ibu)-, e rU- fosforamiditas na configuração D eLforam adquiridas a partir de ChemGenes, Wilmington, MA.
Os aptâmeros e spiegelmers foram purificados por eletroforese em gel.
Síntese em grande escala mais modificação É Os spiegelmers foram produzidos por síntese de fase sólida com a um sintetizador ÁktaPilot100 (Amersham Biosciences; General Electric Heal- E 15 thcare, Freiburg) de 2 TBDMS RNA usando química de fosforamidita chemis- á try (Damha e Ogilvie, 1993). L-rA(N-Bz)-, L-rC(Ac)-, L-rG(N-ibu)-, e L-rU- fos- : foramíiditas foram adquiridos a partir de ChemGenes (Wilmington, MA, USA). O 5'-amino-modificador foi adquirido a partir de American International Che- micals Inc. (Framingham, MA, USA). A síntese de spiegelmers foi iniciada emCPG respectivamente modificado por L-riboG; L-riboC, L-riboA, L-riboU de tamanho de poro 1000 À (Link Technology, Glasgow, UK). Para acoplar (15 min por ciclo), 0,3 M de benziltiotetrazol (American International Chemicals Inc., Framingham, MA, USA) em acetonitrilo, e 3,5 equivalentes da respecti- va solução de 0,2 M de fosforamidita em acetonitrilo foram usados.
Solven- tese reagentes padrão adicionais para a síntese de oligonucileotídeo foram adquiridos a partir de Biosolve (Valkenswaard, NL). Os spiegelmers foram sintetizados DMT-ON; após desproteção, eles foram purificados via RP- HPLC preparativo (Wincott F. eoutros, 1995) usando meio Source15RPC (Amersham). O grupo 5/DMT foi removido com 80% de ácido acético (90 min em temperatura ambiente). Subsequentemente, 2 M de solução aquosa de NaOAc foram adicionados e o spiegelmer foi dessalinizado por filtração de fluxo tangencial usando uma membrana de celulose regenerada de 5 K (Mil-
lipore, Bedford, MA). PEGilação De modo a prolongar o tempo de residência em plasma do spie- gelmer in vivo, os spiegelmers foram covalentemente acoplados a uma por- —çãode40kDa de polietileno glicol (PEG) na extremidade 5'. Para PEGilação (para detalhes técnicos do método para PEGila- ção, ver pedido de patente europeia EP 1 306 382), os spiegelmers 5'-amino modificados purificados foram dissolvidos em uma mistura de H2O (2,5 ml), DMF (5 ml), e tampão A (5 ml; preparado misturando-se ácido cítrico e HO [7g], ácido bórico [3,54 g], ácido fosfórico [2,26 mil], e 1 M de NaOH [343 ml] e adicionando-se água até um volume final de 1L; pH = 8,4 foi ajustado com 1 M de HCI). É O pH da solução de spiegelmer foi levado para 8,4 com 1 M de ã NaOH.
Então, 40 kDa de éster NHS de PEG (JenKem Technology USA Inc., Allen, TX) foram adicionados a 37ºC a cada 30 min em seis porções de 0,25 see equivalentes até um rendimento máximo de 75 a 85% ser alcançado.
O pH da mistura reacional foi mantido em 8 a 8,5 com 1 M de NaOH durante a Í adição do éster NHS de PEG.
A mistura reacional foi blindada com 4 mL de solução de ureia (8 M),e4mbL de tampão B (0,1 M de acetato de trietilamônio em H20) e aque- cida a 95ºC por 15 min.
O spiegelmer PEGilado foi então purificado por RP- HPLC com meio Source 15RPC (Amersham), usando um gradiente de ace- tonitrilo (tampão B; tampão C: 0,1 M de acetato de trietilamônio em acetoni- trilo). PEG em excesso eluído em tampão C a 5%, spiegelmer PEGilado em tampãoCa10- 15%. As frações de produto com uma pureza de > 95% (como avaliado por HPLC) foram combinadas e misturadas com 40 mL de NaOAc a 3 M.
O spiegelmer PEGilado foi dessalinizado por filtração de fluxo tangencial (membrana de celulose regenerada de 5 K, Millipore, Bedford, MA). Exemplo 3: Determinação de constantes de ligação (ensaio de ligação “Pull-down") Ensaio de ligação “pull-down”" direto
A afinidade de aptâmeros a D-SDF-1 humano biotinilado foi me- dida em um ensaio de ligação “pull-down” a 37ºC. Os aptâmeros foram mar- cados com 5'*-fosfato por T4 polinucleotídeo quinase (Invitrogen, Karlsruche, Alemanha) usando ATP marcado com [y-*?P] (Hartmann Analytic, Braunsch- weig, Alemanha). A radioatividade específica de aptâmeros marcados foi
200.000 a 800.000 cpm/mol. Os aptâmeros foram incubados após a desna- turação e renaturação em concentração de 10, 20, 30 ou 40 pM a 37ºC em tampão de seleção (20 mM Tris-HCI pH 7,4; 137 mM NaCl; 5 MM KCI; 1 mM MgCl; 1 MM CaClo; 0,1% [peso/vol] Tween-20) junto com quantidades vari- adasde D-SDF-1 humano biotinilado por 4 a 12 horas de modo a alcançar o equilíbrio em concentrações baixas. O tampão de seleção foi suplementado com 10 ug/ml de albumina de soro humano (Sigma-Aldrich, Steinheim, Ale- É manha), e 10 pg/ml de RNA de levedura (Ambion, Austin, USA) de modo a . impedir a absorção de parceiros de ligação com supeifícies usadas de plás- E 15 tico ou matriz de imobilização. A faixa de concentração de D-SDF-1 humano biotinilado foi ajustada de 8 pM para 100 nM; o volume de reação total foi 1 : mL. Peptídeo e complexos peptídeo-aptâmero foram imobilizados em 1,5 ul. de partículas de streptavidina Ultralink Plus (Pierce Biotechnology, Rockford, USA), que foram pré-equilibradas com tampão de seleção e ressuspensas em um volume total de 6 ul. As partículas foram mantidas em suspensão por 30 min na respectiva temperatura em um termomisturador. A radioativi- dade imobilizada foi quantificada em um contador de cintilação após desa- coplar o sobrenadante e lavagem apropriada. A porcentagem de ligação foi plotada contra a concentração de D-SDF-1 biotinilado e as constantes de dissociação foram obtidas usando algoritmos de software (GRAFIT; Eritha- cus Software; Surrey U.K.) assumindo-se estequiometria 1:1.
Ensaio de ligação “pull-down” competitivo De modo a comparar diferentes aptâmeros de ligação a D-SDF- 1, um ensaio de competição competitivo foi executado. Para esse propósito, o aptâmero mais afim disponível foi radioativamente marcado (ver acima) e serviu como referência. Após a desnaturação e renaturação, ele foi incubado a 37ºC com D-SDF-1 humano biotinilado em 1 mL de tampão de seleção em condições que resultaram em torno de 5 a 10% de ligação com o peptídeo após a imobilização e lavagem em agarose NeutrAvidin ou streptavidina Ul- tralink Plus (ambos de Pierce) sem competição.
Um excesso de variantes de aptâmero D-RNA não marcado renaturado e desnaturado foi adicionado em diferentes concentrações (por exemplo, 2, 10 e 50 nM) com o aptâmero de referência marcado para reações de ligação paralela.
Os aptâmeros a serem testados competiram com o aptâmero de referência para ligação ao alvo, diminuindo assim o sinal de ligação em dependência de suas características de ligação.
O aptâmero que se concluiu ser mais ativo neste ensaio poderia então servir como uma nova referência para análise comparativa de varian-
tes de aptâmero adicionais.
Exemplo 4: Análise de ligação por medição de ressonância
É plasmônica de superfície
" O instrumento Biacore 2000 (Biacore AB, Uppsala, Suécia) foi À 15 usado para analisar a ligação de spiegelmers a SDF-1a humano.
Quando o f acoplamento de SDF1-a humano foi alcançado via grupos amina, o SDF-1a E humano foi dialisado contra água por 1 a 2 h (ésteres de celulose misturados VSWP, Millipore, tamanho de poros, 0,025 uM) para remover as aminas in- terferentes.
Chips sensores CM4 (Biacore AB, Uppsala, Suécia) foram ativa- dos antes do acoplamento de proteína por uma injeção de 35 ul. de uma diluição 1:1 de 0,4 M de NHS e 0,1 M de EDC em um fluxo de 5 ulL/min.
O MCP-1 humano ou SDF-1a humano foi então injetado em concentrações de 0,1 a 1,5 pg/ml em um fluxo de 2 uL/min até que a resposta do instrumento estivesse na faixa de 1000 a 2000 RU (unidades relativas). Os ésteres NHS foram desativados por injeção de 35 ul de solução de cloridrato de etanola- mina (pH 8,5) em um fluxo de 5 uL/min.
O chip sensor foi primado duas ve- zes com tampão de ligação e equilibrado a 10 uL/min por 1 a 2 horas até a linha de base aparecer estável.
Para todas as proteínas, os parâmetros ciné- ticos e constantes de dissociação foram avaliados por uma série de injeções de spiegelmer em concentrações de 1000, 500, 250, 126, 62,5, 31,25 e O NM em tampão de seleção (Tris-HCl, 20 mM; NaCl, 137 mM; KCl, 5 mM; CaCl, 1 MM; MgCk, 1 MM; Tween20, 0,1% [w/v]; pH 7,4). Em todos os experimen-
tos, a análise foi executada a 37º C usando o comando Kinject definindo um tempo de associação de 180 e um tempo de dissociação de 360 segundos em um fluxo de 10 uL/min. A análise de dados e o cálculo das constantes de dissociação (Kp) foi feita com o software BlAevaluation 3.0 (BIACORE AB, Uppsala, Suécia) usando o algoritmo de ajuste estequiométrico Langmuir
11. Exemplo 5: Análise da inibição de quimiotaxia induzida por SDF- 1 por spiegelmers de ligação a SDF-1 A linhagem de células de leucemia de células T humanas Jurkat, alinhagem de células de linfoma de monócitos leucêmico U937, a linhagem de células de leucemia de células pré-B humanas BV-173 e a linhagem de células ALL pré-B humanas Nalm-6 expressam CXCRA4. Enquanto as células À Jurkat não expressam CXCR7, as linhagens de leucemia BV-173 e U-937 . foram testadas positivas para a expressão de CXCR7. Todas as células fo- ; 15 ram obtidas a partir do DSMZ (Braunschweig). Todas as linhagens celulares a foram cultivadas a 37ºC e CO, a 5% em meio RPMI 1640 com Glutamax a (Invitrogen, Karlsruhe, Alemanha) que contém soro bovino fetal a 10%, 100 unidades/mL. de penicilina e 100 ug/mL de estreptomicina (Invitrogen, Karls- ruhe, Alemanha). Um dia antes do experimento, as células foram semeadas em um frascoT175novocom uma densidade de 0,3 x 10º/mL (Jurkat, U937, BV-173) ou 0,75 x 10º/mL (Nalm-6), respectivamente. Para o experimento, as células foram centrifugadas (5 min a 300 g), ressuspensas, contadas e lavadas uma vez com 15 mL de HBH (solução salina balanceada de Hanks contendo 1 mg/mL de albumina de soro bovino e20mM de HEPES; Invitrogen, Karlsruhe, Alemanha). Então, as células foram ressuspensas em 1,33 x 10º/mL (Jurkat, U937, BV-173) ou 2,67 x 10º/mL (Nalm-6), respectivamente. As células foram então deixadas migrar através das membranas porosas das placas de filtro por três horas em dire- ção a uma solução contendo SDF-1 e várias quantidades de spiegelmer. As soluções de estimulação (SDF-1 + várias concentrações de spiegelmer) fo- ram constituídas como soluções 10X em uma placa de 96 tubos de baixo perfil de 0,2 mL. 212 uL de HBH foram pipetados nos compartimentos inferi-
ores da placa de transporte e 23,5 ul. das soluções de estimulação foram =| adicionados.
Todas as condições foram constituídas como triplicatas.
Após 20 a 30 min, a placa de filtro foi inserida na placa contendo as soluções de estimulação e 75 ul de uma suspensão de células com 1,33 x 10º/mL ou 267 x 10mL, respectivamente, foram adicionados às cavidades da placa de filtro (1 x 10º ou 2 x 10º células/cavidade). As células foram então deixa- das migrar por 3 h a 37ºC.
Para calibração, 0, 10 e 30 ul da suspensão ce- lular foram adicionados a 235, 225 e 205 ul de HBH, respectivamente, em cavidades de uma placa com 96 cavidades separadas.
Após 3 horas de in- cubação,a placa de inserção foi removida e 30 ul de solução de trabalho de resazurin (400 uM em PBS) foram adicionados às cavidades inferiores e às cavidades da placa de calibração.
As placas foram então incubadas a 37ºC f por 2,5 h.
Após incubação, 100 ul de cada cavidade foram então transferido para uma piaca preta com 96 cavidades.
Para avaliação, os valores de fluorescência foram corrigidos pa- E ra fluorescência de fundo (nenhuma célula na cavidade). Então, a diferença E entre as condições experimentais com e sem SDF-1 foi calculada.
O valor para a amostra sem spiegelmer (SDF-1 somente) foi ajustado para 100% e os valores para as amostras com spiegelmer foram calculados como porcen- tagem desse.
Para a curva de dose-resposta, os valores percentuais foram plotados contra a concentração de spiegelmer e o valor ICs5 (concentração de spiegelmer na qual 50% da atividade sem spiegelmer está presente) foi determinado graficamente a partir da curva resultante.
Resultados Verificou-se que o SDF-1 humano estimula a migração de célu- las Jurkat de uma maneira dose-dependente com metade da estimulação máxima em aproximadamente 0,3 nM.
Verificou-se que o SDF-1 humano estimula a migração de célu- las da linhagem de células de linfoma de monócitos leucêmicos humanos U937 de uma maneira dose-dependente, com metade da estimulação máxi- ma em aproximadamente 3 nM.
Verificou-se que o SDF-1 humano estimula a migração de célu-
las da linhagem de células de leucemia de células pré-B humanas BV-173 de uma maneira dose-dependente, com metade da estimulação máxima em aproximadamente 3 nM.
Verificou-se que o SDF-1 humano estimula a migração de célu- lasdalinhagem de células ALL pré-B humanas Nalm-6 de uma maneira do- se-dependente, com metade da estimulação máxima em aproximadamente 0,3 nM.
Quando as células foram deixadas migrar em direção a uma so- lução contendo SDF-1 humano mais concentrações crescentes de spiegel- mers que se ligam a SDF-1, a inibição dose-dependente foi observada. Os respectivos ICs9 dos spiegelmers testados como especificado no Exemplo 1 foram determinados em células Jurkat de linhagem de células de leucemia À de células T humanas. Por exemplo, para o spiegelmer que se liga a SDF-1 e NOX-A12 (também chamado de 193-G2-012-5"-PEG), um 1Cs,9 de 0,2 nM foi . 15 determinado (FIG. 10). Quando um spiegelmer de controle não específico foi usado ao invés de spiegelmers que se ligam a SDF-1, nenhum efeito inibitó- rio foi observado até 1 uM.
A inibição da quimiotaxia induzida por SDF-1 por spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 foi também observada em três outros tipos de cé- lulasde leucemia diferentes: a linhagem de células de linfoma de monócitos leucêmicos humanos U937 (FIG. 11B), a linhagem de células de leucemia de células pré-B humanas BV-173 (FIG. 12) e a linhagem de células ALL pré-B humanas Nalm-6 (FIG. 11A). Ademais, tem-se evidência de que as células de leucemia linfocítica crônica primária migram em direção a SDF-1 equea quimiotaxia dependente de SDF-1 é eficazmente bloqueada por NOX-A12.
As linhagens de leucemia BV-173 e U-937 foram testadas positi- vas também para a expressão de CXCR7. A potência do spiegelmer que se liga a SFD-1 NOX-A12 de bloquear a interação de SDF-1 e CXCR7 foi de- terminada como mostrado no Exemplo 6.
Exemplo 6: Inibição da ativação de CXCR7 pelo spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12
Além de CXCRA, o SDF-1 também se liga ao receptor de quimi- ocina CXCR7. O potencial inibidor do spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX- A12 em direção a CXCR7 foi testado em um ensaio de complementação com células CHO expressando estavelmente CXCR7 e B-arrestina ambos fundidosa um fragmento de B-galactosidase (PathHunterTM - B-arrestin as- say, DiscoveRX, CA, USA). Mediante SDF-1, a B-arrestina de ligação com- plexou com CXCR7 e assim levou à complementação e ativação da B- galactosidase que foi medida com um substrato de quimioluminescência.
Método Células de B-arrestina CXCR7 humanas CHO-K1 expressas por PathHunter foram colocadas em placas por 48 horas em meio OCC? e esti- muladas com 10 nM de SDF-1 e várias concentrações de spiegelmer que se Á liga a SDF-1 NOX-A12 por 90 minutos.
Após a estimulação, o sinal foi detec- SJ tado usando o Kit de Detecção PathHunter e o protocolo recomendado do fabricante (DiscoveRX, CA, USA). fã.
Resultados A estimulação de B-galactosidase e, portanto, a ativação de CX- : CR7 com 10 nM de SDF-1 humano foi eficazmente bloqueada por spiegel- mer que se liga a SDF-1 NOX-A12 com um ICs,o de 5,4 nM (FIG. 13). Exemplo 7: Análise funcional de spiegelmer que se liga a SDF-1 humano 193-G2-012-5-PEG em um ensaio de brotamento de anel aórtico Para testar se o spiegelmer que se liga a SDF-1 193-G2-012-5"- PEG é funcional também em um ensaio de cultura de órgão para angiogê- nese padrão, os ensaios de brotamento de anel aórtico foram executados.
Esse ensaio, no qual o comprimento e a abundância de extensões tipo va- sos dos explantes são avaliados, se tornou o modelo de cultura de órgão mais amplamente usado para angiogênese (Auerbach e outros, 2003). Já se mostrou que o SDF-1 induz brotamento nesse tipo de ensaio (Salcedo e ou- tros, 1999). As aortas de ratos foram cortadas em anéis, embebidos em uma matriz de colágeno e incubados com SDF-1 e SDF-1 mais spiegelmer que se liga a SDF-1 humano 193-G2-012-5'-PEG ou SDF mais um spiegelmer de controle PEGilado não funcional que não se liga a SDF-1. Após 6 a 7 dias, o brotamento (isto é, crescimento de células endoteliais) foi analisado tirando- se fotos e determinando-se um índice de brotamento.
Método As aortas de ratos machos foram obtidas a partir de Bagheri Life Sciences (Berlin, Alemanha). As aortas foram preparadas recentemente e transportadas em gelo em meio MCDB 131 (Invitrogen, Karlsruhe, Alema- nha) e 2,5 ul de fungizona (Cambrex, USA).
Para um experimento, uma única aorta foi transferida para um prato de cultura celular junto com o meio e o tecido conjuntivo residual foi removido. Então, a aorta foi cortada com um bisturi em anéis de aproxima- damente 1 a 2 mm de comprimento. Os anéis foram lavados intensivamente À (ao menos cinco vezes) em meio 199 (Invitrogen, Karlsruhe, Alemanha) e E então colocados em cavidades de uma placa com 24 cavidades, contendo i 15 450 ul de solução de colágeno por cavidade. Essa solução de colágeno foi Á preparada misturando-se 1,12 mL de meio 199 10X (Invitrogen, Karlsruhe, À Alemanha), 1,12 mL de tampão de colágeno 10X (0,05 N NaOH, 200 mM HEPES, 260 mM NaHCO; ) e 0,6 m! de Glutamina a 200 mM. Os anéis fo- ram orientados de modo que as bordas cortadas estavam perpendiculares ao fundo da cavidade. O colágeno foi deixado solidificar incubando-se as placas por ao menos uma hora a 37ºC. Então, 1 ml de meio MCDB131 com adições (SDF-1 e spiegelmers) foi adicionado por cavidade. Os anéis foram então incubados a 37ºC por seis a sete dias. Como controle para brotamen- to, os experimentos foram adicionalmente feitos com VEGF (fator de cresci- mento endotelial vascular).
O brotamento foi documentado tirando-se fotos com uma câme- ra digital. Em alguns casos, os anéis foram fixados pela adição de 1 mL de paraformaldeído a 10% e armazenados a 2-8ºC para mais documentação. As fotos foram analisadas com o software de processamento de imagem Scionlimage. Após a calibração com a ajuda de uma foto tirada a partir de um micrômetro de estágios, uma linha foi desenhada a uma distância de 0,33 mm de uma borda de um anel. Um histograma ao longo dessa linha foi gerado pelo software, os histogramas foram impressos e os picos (represen- tados brotamentos cruzando a linha) foram contados. Esse número foi toma- do como o índice de brotamento. Quatro a cinco anéis por condição foram avaliados. A análise estatística foi executada com WinSTAT para Excel. Resultados Poder-se-ia demonstrar que o SDF-1 induz brotamento e que esse efeito poderia ser bloqueado com spiegelmer que se liga a SDF-1 hu- mano 193-G2-012-5"-PEG. Nenhum bloqueio de brotamento induzido por SDF-1 foi observado pelo spiegelmer de controle PEGilado não funcional (FIG. 14615). Exemplo 8: Efeito do spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 na quimiossensibilização de células de leucemia À Há evidência considerável de que células de leucemia podem nã ser protegidas a partir de quimioterapias convencionais pela interação entre seus receptores CXCR4 com SDF-1 secretado por células estromais dentro a de microambientes de tecido particulares tal como o nicho de medula óssea (abrev. BM). Então, o direcionamento do eixo CXCR4 - SDF-1 usando o spi- Í egelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 é uma abordagem atraente para romper os efeitos protetores de células estromais secretando SDF-1 para sensibilizar células de leucemia em direção à subsequente quimioterapia.
De modo a simular a interação in vivo do microambiente BM com células de leucemia, um sistema de cocultura in vitro com células MS-5 es- tromais BM murinas e a linhagem de células de mieloma múltiplo (abrev. MM) RPMI 8226 foi estabelecido. O objetivo do experimento foi mostrar se o —spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 sensibiliza as células MM em co- cultura com células estromais para efeitos de agentes quimioterápicos. As células MS-5 estromais secretando SDF-1 foram incubadas com spiegeimer que se liga a SDF-1 NOX-A12 ou o revNOX-A12 não funcional. A linhagem de células MM RPMI-8226 foi adicionada à camada de células estromais confluentes. As células foram então incubadas com o agente quimioterápico F ara A (Flurarabina) por 40 horas e a viabilidade celular foi medida.
Método
A linhagem de células estromais murinas MS-5 (ACC 441) foi adquirida a partir de DSMZ, a linhagem de celuas de mieloma múltiplo RPM! 8226 (CCL-155) foi adquirida a partir de ATCC. A linhagem de células de mieloma múltiplo RPMI 8226 foi mantida em meio RPMI 1640 GlutaMAX (In- vitrogen) suplementado com FBS a 10% (Biochrom) e penicilina-estrepto- micina, as celulas MS-5 foram cultivadas em MEM alfa GlutaMAX (Invitro- gen) com FBS a 10% e penicilina-estroptomicina. Para experimentos de co- cultura de quimiossensibilização, as células MS-5 estromais foram semea- das no dia antes em placas com 24 cavidades (as oito cavidades internas) em uma concentração de 8 x 10/mL/cavidade em meio MEM alfa GlutaMAX (+ FBS a 10%) e incubadas a 37ºC em CO; a 5%. A camada de células es- tromais confluentes foi lavada e 0,5 mL de meio RPMI 1640 (+ FBS a 1%) É foram adicionados às cavidades. O spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX- o A12 ou revNOX-A12 foi subsequentemente adicionado às cavidades até uma concentração final de 100 nM e incubado por quatro horas. 3,5 x 10º fo células RPMI 8226 em meio RPMI 1640 (+ FBS a 1%) foram adicionadas à camada de células estromais. Quatro horas mais tarde, 1 uM de F-ara-A É (Sigma Aldrich) foi adicionado às células quando indicado. Após 40 horas de incubação, as células foram coletadas em tubos de 15 mL, primeiro o sobre- nadante foi colhido e então as células acopladas foram tripsinizadas incluin- do células MS-5. As células coletadas foram lavadas com PBS (BSA a 1%) e ressuspensas em 2 mL de PBS (+ BSA a 1%). 150 ul da suspensão de cé- lulas foram transferidos para uma placa com 96 cavidades em forma de U e então incubadas com 50 ul de Reagente ViaCount (Millipore) por 15 minu- tos em temperatura ambiente. A viabilidade celular e o número de células foram determinados por citometria de fluxo usando o Guava EasyCyte 6HT/2L (Millipore).
Resultados A viabilidade celular de células RPMI-8226 cocultivadas com cé- lulas MS-5 estromais foi somente levemente afetada pelo spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12. 1 uM de F-ara-A não mostrou efeito significativo na viabilidade de células RPMI-8826. Entretanto, quando NOX-A12 e F-ara-A foram combinados, uma diminuição sinergística da viabilidade celular foi ob- servada (FIG. 16). Assim, verificou-se que o spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 sensibiliza a linhagem de céluias MM RPMI-8826 em direção ao tratamento do agente quimioterápico F-ara-A quando cocultivadas com a linhagem de células estromais BM MS 5. A viabilidade de células estromais MS-5 não é nem afetada por F-ara-A nem por NOX-A12 (dados não mostra- dos). Esses resultados demonstram uma prova de princípio no potencial de NOX-A12 em romper os efeitos protetores de SDF-1 secretado por células estromais BM.
Exemplo 9: Efeito do spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 na proliferação de células de leucemia O objetivo do experimento foi mostrar se o spiegelmer que se |i- À ga a SDF-1 NOX-A12 tem um impacto na proliferação de células de leuce- E mia em cocultura com células estromais da medula óssea (abrev.
BM). As células MS-5 estromais murinas secretando SDF-1 foram incubadas com o spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 ou o spiegelmer não funcional revNOX-A12. A linhagem de células T leucêmicas Jurkat foi adicionada à É camada de células estromais confluentes e incubadas por 40 horas a 37ºC e CO, a 5%. Os número de células foram quantificados por citometria de fluxo usandoo Guava EasyCyte e reagente ViaCount.
Método A linhagem de células estromais murinas MS-5 (ACC 441) foi adquirida a partir de DSMZ e foi cultivada em MEM alfa GutaMAX (Invitro- gen) com FBS a 10% e penicilina-estreptomicina.
Para experimentos de co- cultura de proliferação, as células MS-5 estromais foram semeadas no dia antes em placas com 24 cavidades (as oito cavidades internas) em uma concentração de 8 x 10º/mL/cavidade em meio MEM alfa GlutaMAX (+ FBS a 10%) e incubadas a 37ºC em CO, a 5%. A camada de células estromais confluentes foi lavada e 0,5 mL de meio RPMI 1640 (+ FBS a 1%) foi adicio- nada às cavidades.
O spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 ou spiegel- mer revNOX-A12 foi subsequentemente adicionado às cavidades até uma concentração final de 100 nM e incubadas por quatro horas. 2 x 10º de célu-
las Jurkat (fase de crescimento logarítmico; lavadas uma vez) em meio RP- MI 1640 (+ FBS a 1%) foram adicionadas à camada de células estromais confluentes e incubadas por 48 horas a 37ºC com CO, a 5%. As células fo- ram então coletadas em tubos de 15 mL, as células acopladas foram tripsini- zadas incluindo células MS-5. As células coletadas foram lavadas duas ve- zes com PBS (+ BSA a 1%). 150 uL dessa suspensão celular foram transfe- ridos para uma placa com 96 cavidades em forma de U e então incubados com 50 ul de reagente ViaCount (Millipore) por 15 minutos em temperatura ambiente.
A viabilidade celular e o número de células foram determinados porcitometria de fluxo usando Guava EasyCyte 6HT/2L.
Resultados Enquanto 1 nM de spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 í não mostrou nenhum efeito no número de células Jurkat após 40 horas de Pr cultivo, o número de células foi reduzido até 20%, quando as células MS-5 estromais foram pré-incubadas com 10 ou 100 nM de spiegelmer que se liga -.. a SDF-1 NOX-A12 (FIG. 17). Assim, o SDF-1 secretado por células estro- mais estimula aparentemente a proliferação de células Jurkat.
A indução  dependente de SDF-1 de proliferação pode ser bloqueada por spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 levando à detecção de menos quantidade de célulasleucêmicas.
Exemplo 10: Efeito de spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 nas propriedades adesivas de células leucêmicas.
A interação de células leucêmicas com proteínas de matriz ex- tracelular (abrev.
ECM) desempenha uma função crucial na patogênese leu- cemia.
Então, testou-se o efeito do spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX- A12 na adesão de células de leucemia na fibronectina de proteina ECM.
À estimulação da linhagem de células T de leucemia Jurkat com SDF-1 levou a uma modulação dose-dependente de adesão à fibronectina.
Métodos A linhagem de células de leucemia de células T Jurkat (ACC 282) adquirida a partir de DSMZ foi mantida em meio RPMI 1640 GlutaMAX (Invitrogen) suplementado com FBS a 10% (Biochrom) e penicilina-estrepto-
micina. Para os experimentos de adesão, as placas de cultura com 96 cavi- dades foram incubadas com 10 ug/mL de fibronectina humana (R&D Sys- tems) em PBS por 2 horas a 37ºC. As placas foram lavadas duas vezes com 100 ul de PBS e subsequentemente bloqueadas com PBS-BSA (0,1%) por duas horasa37ºC.As cavidades foram então lavadas com meio RPMI. As células Jurkat da fase de crescimento logarítmico foram lavadas com meio RPMI (+ BSA a 0,1%) e incubadas com várias concentrações de SDF-1 hu- mano (R&D Systems) e NOX-A12 por 15 minutos a 37ºC. NOX-A12 e SDF-1 foram pré-incubados por 30 minutos. 1 x 105 células Jurkat estimuladas fo- ram semeadas em placas com 96 cavidades revestidas com Fibronectina e incubadas por 30 minutos. As placas foram então lavadas cinco vezes com meio RPMI. As células acopladas foram quantificadas usando Reagente Cell A Titer Glo (Promega). As placas foram misturadas por dois minutos, seguidas S por incubação em temperatura ambiente por 10 minutos. O número de célu- lasfoiquantificado por sinal de luminescência relativo. T- Resultados As concentrações baixa a média de SDF-1 (1 a 10 nM) diminuí- À ram a adesão de células Jurkat à fibronectina, enquanto as concentrações mais altas (30 a 300 nM) aumentaram as propriedades adesivas das células Jurkat(FIG.18A). Verificou-se que o spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX- A12 reverte esse efeito, o spiegelmer de controle revNOX-A12 (FIG. 18B). Assim, o spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 tem um impacto no rom- pimento de interações de células leucêmicas com seu ambiente ECM prote- tor. Ademais, esse exemplo explica o desacoplamento dependente do spie- gelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 de células hematopoiéticas do nicho de medula óssea.
Exemplo 11: Rompimento da interação de células de mieloma múltiplo com o ambiente de medula óssea in vivo melhorando assim a sen- sibilidade das células de mieloma múltiplo à terapia.
O eixo SDF-1/CXCR4 desempenho uma função principal na atu- ação no órgão-alvo e tráfego de células de mieloma múltiplo (abrev. MM) para a medula óssea (abrev. BM). Então, a desadesão de células MM do meio BM circundante através da inibição de SDF-1 melhora a sensibilidade das MM a agentes terapêuticos.
Azab e outros publicaram um protocolo para testar a potência do inibidor de CXCR4 AMD3100 de romper a interação de células MM com o ambiente BM in vivo que afeta a localização das células MM, que, por sua vez, melhora a sensibilidade das células MM à quimiotera- pia.
Eles relataram que o bloqueio do receptor de SDF-1 CXCR4 pelo anta- gonista específico de CXCR4 levou a um rompimento da interação de célu- las MM com o ambiente BM in vivo, para melhorar a sensibilidade das célu- las MM à terapia, e como um resultado, para intensificar a redução de tumor induzida por bortezomibe (Azab e outros, 2009). Com base nesse protocolo (Azab e outros, 2009), o spiegelmer que se liga a SDF-1 NOX-A12 é testado quanto a sua potência para romper a interação de células MM com o ambi- h ente BM in vivo, melhorando assim a sensibilidade das células MM à terapia. 5 Para o modelo animal MM severo, camundongos imunodeficien- tes combinados (SCID) são usados onde células Luc+/GFP+ MM.1S (2 x =. 10º/camundongo) são injetadas na veia da cauda de camundongos SCID.
Após 3 a 4 semanas, a progressão suficiente do tumor é detectada por ima- É giologia de bioluminescência (para o protocolo, ver Azab e outros, 2009). Os camundongos são aleatoriamente divididos em 4 grupos: grupo 1, camun- dongos de controle (veículo recebido: 5% glicose); grupo 2, camundongos tratados de dois em dois dias com 20 mg/kg de injeção subcutânea de NOX- A12; grupo 3, camundongos tratados com injeção de bortezomibe intraperi- toneal de 0,5 mg/kg duas vezes por semana; grupo 4, camundongos trata- dos com injeção de bortezomibe intraperitoneal de 0,5 mg/kg duas vezes por semana e de dois em dois dias com 20 mg/kg de injeção subcutânea de NOX-A12. A localização das células tumorais MM na medula óssea é de- terminada in vivo por microscopia confocal usando anticorpo anti-SDF mar- cado com fluorescência (para protocolo, ver Azab e outros, 2009), onde a administração de NOX-A12 leva à mobilização de células MM da medula Óssea para o sangue (como determinado por citometria de fluxo ex vivo; pa- ra protocolo, ver Azab e outros, 2009) e para uma redução do crescimento de tumor quando administrado junto com bortezomibe (por detecção de bio- luminescência in vivo; para protocolo, ver Mitsiades e outros, 2003; Mitsia- des e outros, 2004). Os efeitos mais fortes no crescimento de tumor por bor- tezomibe mais NOX-A12 em comparação ao tratamento com bortezomibe sozinho suportam os dados do Exemplo 8 mostrando efeitos positivos de NOX-A12 na quimiossensibilização de células MM.
Referências Os dados bibliográficos completos dos documentos citados aqui estão, se não indicados ao contrário, em seguida, onde a descrição das ditas referências é incorporada aqui por referência.
Alsayed Y., Ngo H., e outros (2007) Mechanisms of regulation of CXCRA/SDF-1 (CXCL12)-dependent migration and homing in multiple mye- : loma.
Blood 109(7): 2708 a 2717. . Altschul S.F., Gish W., e outros (1990) Basic local alignment —searchtool.
J Mol Biol. 215(3): 403 a 410. esc Altschul S.F., Madden T.L., e outros (1997) Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs.
Nucleic Í Acids Res. 25(17): 3389 a 3402. Arya S.K., Ginsberg C.C., e outros (1999) In vitro phenotype of SDF1 gene mutant that delays the onset of human immunodeficiency virus disease in vivo.
J Hum Viro! 2(3): 133 a 138. Auerbach R., Lewis R., e outros (2003) Angiogenesis assays: a critical overview.
Clin Chem. 49(1): 32 a 40. Review.
Azab A.K., Runnels J.M., e outros (2009) CXCR4 inhibitor —AMD3100 disrupts the interaction of multiple myeloma cells with the bone marrow microenvironment and enhances their sensitivity to therapy.
Blood. 113(18): 4341 a 4351. Batchelor T.T., Sorensen A.G., e outros (2007) AZD2171, a pan- VEGF receptor tyrosine kinase inhibitor, normalizes tumor vasculature and —alleviates edema in glioblastoma patients.
Cancer Cell. 11(1): 83 a 95. Balabanian K., Lagane B., e outros (2005) The chemokine SDF- 1/CXCL12 binds to and signals through the orphan receptor RDC1 in T
Iymphocytes. J Biol Chem 280(42): 35760 a 35766 Balabanian, K., Lagane B., e outros (2005) WHIM syndromes with different genetic anomalies are accounted for by impaired CXCR4 de- sensitization to CXCL12. Blood 105(6): 2449 a 2457.
Balkwill F. (2004) Cancer and the chemokine network. Nat Rev Cancer 4(7): 540 a 550.
Brooks H.L. Jr., Caballero S. Jr., e outros (2004) Vitreous levels of vascular endothelial growth factor and stromal-derived factor 1 in patients with diabetic retinopathy and cystoid macular edema before and after intra- ocular injection of triamcinolone. Arch Ophthalmo! 122(12): 1801 a 1807. Broxmeyer H.E., Orschell C.M., (2005) Rapid mobilization of mu- rine and human hematopoietic stem and progenitor cells with AMD3100, a É CXCRA4 antagonist. J Exp Med. 201(8): 1307 a 1318. :) Buckley C.D., Amft N., e outros (2000) Persistent induction of the chemokine receptor CXCR4 by TGF-beta 1 on synovial T cells contributes to = their accumulation within the rheumatoid synovium. J Immunol 165(6): 3423 E a 3429.
Burger J.A., Búrkle A, e outros (2007) The CXCR4 chemokine receptor in acute and chronic leukaemia: a marrow homing receptor and po- tentialtherapeutic target. Br J Haematol. 137(4): 288 a 296.
Burger J.A., Ghia P., e outros (2009) The microenvironment in mature B-cell malignancies: a target for new treatment strategies. Blood. 114(16): 3367 a 3375. Review.
Burger J.A., Kipps T.J. e outros (2002) Chemokine receptors and —stromalcells in the homing and homeostasis of chronic Iymphocytic leukemia B cells. Leuk Lymphoma. 43(3):461 a 466.
Burger J.A. e Peled A. (2009) CXCR4 antagonists: targeting the microenvironment in leukemia and other cancers. Leukemia 23(1): 43 a 52.
Burger J.A., Tsukada N,, e outros (2000) Blood-derived nurse- like cells protect chronic Iymphocytic leukemia B cells from spontaneous apoptosis through stromal cell-derived factor-1. Blood. 96(8): 2655 a 2663. Burns J.M., Summers B.C., e outros (2006) A novel chemokine receptor for SDF-1 and I-TAC involved in cell survival, cell adhesion, and tu- mor development. J Exp Med 203(9): 2201 a 2213.
Butler J.M., Guthrie S.M., e outros (2005) SDF-1 is both neces- sary and sufficient to promote proliferative retinopathy. J Clin Invest 115(1): 86as3.
Cabioglu, N., Sahin A., e outros (2005) Chemokine receptor CXCRA4 expression in breast cancer as a potential predictive marker of iso- lated tumor cells in bone marrow. Clin Exp Metastasis 22(1): 39 a 46.
Ceradini D.J., Kulkarni A.R., e outros (2004) Progenitor cell traf- fickingis regulated by hypoxic gradients through HIF-1 induction of SDF-1. Nat Med. 10(8): 858 a 864.
Corcione A., Ottonello L., e outros (2000) Stromal cell-derived Í factor-1 as a chemoattractant for follicular center lIymphoma B cells. J Natl ” Cancer Inst 92(8): 628 a 635. E 15 Damha M.J., Ogilvie KK., e outros (1993) Oligoribonucleotide É synthesis. The silyl-phosphoramidite method. Methods Mol Biol. 20: 81 a : 114.
Damiano J.S., Cress A.E., e outros (1999) Cell adhesion media- ted drug resistance (CAM-DR): role of integrins and resistance to apoptosis in human myeloma cell lines. Blood. 93(5): 1658 a 1667.
Devine S.M., Flomenberg N., e outros (2004) Rapid mobilization of CD34+ cells following administration of the CXCRA4 antagonist AMD3100 to patients with multiple myeloma and non-Hodgkin's !Iyvmphoma. J Clin On- col. 22(6): 1095 a 1102.
Dillmann F., Veldwilk M.R., e outros (2009) Plerixafor inhibits chemotaxis toward SDF-1 and CXCR4-mediated stroma contact in a dose- dependent manner resulting in increased susceptibility of BCR-ABL+ cell to Imatinib and Nilotinib. Leuk Lymphoma. 50(10): 16.
Ehtesham M., Stevenson C.B., e outros (2008) Preferential e- —xpression of chemokine receptor CXCR4 by highly malignant human gliomas and its association with poor patient survival. Neurosurgery. 63(4):E820 Engl T., Relja B., e outros (2006) CXCR4 chemokine receptor mediates prostate tumor cell adhesion through alpha5 and beta3 integrins. Neoplasia. 8(4): 290 a 301.
Fedyk E.R., Jones D., e outros (2001) Expression of stromal- derived factor-1 is decreased by IL-1 and TNF and in dermal wound healing.
Jlmmunol. 166(9): 5749 a 5754.
Geminder H., Sagi-Assif O., e outros (2001) A possible role for CXCRA and its ligand, the CXC chemokine stromal cell-derived factor-1, in the development of bone marrow metastases in neuroblastoma. J Immunol 167(8): 4747 a 4757.
Grassi F., Cristino S., e outros (2004) CXCL12 chemokine up- regulates bone resorption and MMP-9 release by human osteoclasts: CXCL12 levels are increased in synovial and bone tissue of rheumatoid ar- À thritis patients. J Cell Physio! 199(2): 244 a 251. st Grunewald M., Avraham |., e outros (2006) VEGF-induced adult —neovascularization: recruitment, retention, and role of accessory cells. Cell = 124(1): 175 a 189. : Gulino, A.V., Moratto D., e outros (2004) Altered leukocyte re- sponse to CXCL12 in patients with warts hypogammaglobulinemia, infec- tions, myelokathexis (WHIM) syndrome. Blood 104(2): 444 a 452.
Holm N.T., Abreo F., e outros (2009) Elevated chemokine recep- tor CXCR4 expression in primary tumors following neoadjuvant chemothe- rapy predicts poor outcomes for patients with locally advanced breast cancer (LABC). Breast Cancer Res Treat. 113(2): 293 a 299. Epub 13 de fevereiro de 2008.
Hwang J.H., Chung H.K,, e outros (2003) CXC chemokine recep- tor 4 expression and function in human anaplastic thyroid cancer cells. J Clin Endocrinol Metab 88(1): 408 a 416.
Jin L., Tabe Y., e outros (2008) CXCRA4 up-regulation by imatinib induces chronic myelogenous leukemia (CML) cell migration to bone marrow stroma and promotes survival of quiescent CML cells. Mol Cancer Ther 7(1): 48 a 58.
Kanbe K., Takagishi K., e outros (2002) Stimulation of matrix metalloprotease 3 release from human chondrocytes by the interaction of : stromal cell-derived factor 1 and CXC chemokine receptor 4. Arthritis Rheum 46(1): 130 a 137. Kawai T., Choi U., e outros (2005) Enhanced function with de- creased internalization of carboxy-terminus truncated CXCRA4 responsible for WHIM syndrome. Exp Hemato! 33(4): 460 a 468.
Kioi M., Vogel H., e outros (2010) Inhibition of vasculogenesis, but not angiogenesis, prevents the recurrence of glioblastoma after irradia- tion in mice. J Clin Invest 120(3): 694 a 705.
Klussmann S. (2006). The Aptamer Handbook — Functional Oli- gonucleotides and their Applications. Edited by S. Klussmann. WILEY-VCH, Weinheim, Germany, ISBN 3-527-31059-2.
F Koshiba T., Hosotani R., e outros (2000) Expression of stromal cell-derived factor 1 and CXCR4 ligand receptor system in pancreatic cancer: : 15 a possible role for tumor progression. Clin Cancer Res 6(9): 3530 a 3535. É Kozin S.V., Kamoun W.S,., e outros (2010) Recruitment of mye- : loid but not endothelial precursor cells facilitates tumor regrowth after local irradiation. Cancer Res 70(14): 5679 a 5685. Krumbholz M., Theil D., e outros (2006) Chemokines in multiple —sclerosis: CXCL12 and CXCL13 up-regulation is differentially linked to CNS immune cell recruitment. Brain 129: 200 a 211.
Kryczek |., Lange A., e outros (2005) CXCL12 and vascular en- dothelial growth factor synergistically induce neoangiogenesis in human ova- rian cancers. Cancer Res 65(2): 465 a 472.
Kurtova A.V., Balakrishnan K., e outros (2009) Diverse marrow stromal cells protect CLL cells from spontaneous and drug-induced apopto- sis: development of a reliable and reproducible system to assess stromal cell adhesion-mediated drug resistance. Blood. 114(20):4441 a 4450.
Kusser W. (2000) Chemically modified nucleic acid aptamers for invitro selections: evolving evolution. J Biotechnol 74(1): 27 a 38.
Lagneaux L., Delforge A., e outros (1998) Chronic Iymphocytic leukemic B cells but not norma! B cells are rescued from apoptosis by con-
tact with normal bone marrow stromal cells. Blood. 91(7):2387 a 2396. Li JK. Yu L., e outros (2008) Inhibition of CXCRA activity with AMD3100 decreases invasion of human colorectal cancer cells in vitro. World J Gastroentero! 14(15): 2308 a 2313 Maksym R.B., Tarnowski M., e outros (2009) The role of stromal- derived factor-1--CXCR7 axis in development and cancer. Eur J Pharmacol. 625(1-3): 31 a 40. Review. Marechal V., Arenzana-Seisdedos F., e outros (1999) Opposite effects of SDF-1 on human immunodeficiency virus type 1 replication. J Virol 73(5):3608a3615. McGinnis S., Madden T.L. e outros (2004) BLAST: at the core of a powerful and diverse set of sequence analysis tools. Nucleic Acids Res. : 32(Web Server issue): W20-5. ! Meads M.B., Hazlehurst L.A., e outros (2008) The bone marrow õ 15 microenvironment as a tumor sanctuary and contributor to drug resistance. É Clin Cancer Res. 14(9): 2519 a 2526. Review. õ Meleth A.D., Agron E., e outros (2005) Serum inflammatory markers in diabetic retinopathy. Invest Ophthalmo! Vis Sci 46(11): 4295 a
4301. Miao, Z., Luker K.E., e outros (2007) CXCR7 (RDC1) promotes breast and lung tumor growth in vivo and is expressed on tumor-associated vasculature. Proc Nat! Acad Sci U S A 104(40): 15735 a 15740. Mitsiades C.S., Mitsiades N.S., e outros (2003) Fluorescence imaging of multiple myeloma cells in a clinically relevant SCID/NOD in vivo — model: biologic and clinical implications. Cancer Res. 63(20):6689 a 6696. Mitsiades C.S., Mitsiades N., e outros (2004) Focus on multiple myeloma. Cancer Cell. 6(5):439 a 444. Review. Mizell J., Smith M., e outros (2009) Overexpression of CXCRA4 in primary tumor of patients with HER-2 negative breast cancer was predictive ofa poor disease-free survival: a validation study. Ann Surg Oncol. 16(10): 2711 a 2716. Muller, A., Homey B., e outros (2001) Involvement of chemokine receptors in breast cancer metastasis. Nature 410(6824): 50 a 56. Murdoch, C. (2000) CXCR4: chemokine receptor extraordinaire. Immunol Rev 177: 175 a 184. Needleman and Wunsch (1970) A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequence of two proteins. J Mol Biol. 48(3):443 a 453. Nervi B., Ramirez P., e outros (2009) Chemosensitization of acu- te myeloid leukemia (AML) following mobilization by the CXCR4 antagonist AMD3100. Blood. 113(24): 6206 a 6214. Epub 2 de dezembro de 2008. Pearson and Lipman (1988) Improved tools for biological se- quence comparison. Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 85: 2444 Redjal N., Chan J.A,, e outros (2006) CXCRA4 inhibition synergi- À zes with cytotoxic chemotherapy in gliomas. Clin Cancer Res. 12(22): 6765 a - 6771. : 15 Salcedo R., Wasserman K., e outros (1999) Vascular endothelial : growth factor and basic fibroblast growth factor induce expression of CXCR4 . on human endothelial cells: In vivo neovascularization induced by stromal- derived factor-1alpha. Am J Pathol 154(4): 1125 a 1135. Salcedo, R. and Oppenheim J.J. (2003) Role of chemokines in —angiogenesis: CXCL12/SDF-1 and CXCR4 interaction, a key regulator of en- dothelial cell responses. Microcirculation 10(3-4): 359 a 370. Salvucci O., Yao L., e outros (2002) Regulation of endothelial cell branching morphogenesis by endogenous chemokine stromal-derived factor-
1. Blood 99(8): 2703 a 2711. Saur D., Seidler B., e outros (2005) CXCR4 expression increas- es liver and lung metastasis in a mouse mode! of pancreatic cancer. Gastro- enterology. 129(4):1237 a 1250. Schimanski C.C., Galle P.R., e outros (2008) Chemokine recep- tor CXCR4-prognostic factor for gastrointestinal tumors. World J Gastroente- rol. 14(30): 4721 a 4724. Scotton C.J., Wilson J.L., e outros (2002) Multiple actions of the chemokine CXCL12 on epithelial tumor cells in human ovarian cancer. Can-
cer Res. 62(20): 5930 a 5938. Sengupta N., Caballero S., e outros (2005) Preventing stem cell incorporation into choroidal neovascularization by targeting homing and at- tachment factors.
Invest Ophthalmo! Vis Sci. 46(1): 343 a 438. Shaked Y., Henke E., e outros (2008) Rapid chemotherapy- induced acute endothelial progenitor cell mobilization: implications for antian- giogenic drugs as chemosensitizing agents.
Cancer Cell. 14(3): 263 a 273. Shirozu M., Nakano T., e outros (1995) Structure and chromo- somal localization of the human stromal cell-derived factor 1 (SDF1) gene.
Genomics 28(3): 495 a 500. Smith e Waterman (1981), Adv.
Appl.
Math. 2: 482 Soriano A., Martinez C., e outros (2002) Plasma stromal cell- À derived factor (SDF)-1 levels, SDF1-3'A genotype, and expression of CXCR4 e on T Iymphocytes: their impact on resistance to human immunodeficiency " 15 virustype1 infection and its progression.
J Infect Dis 186(7): 922 a 931. Á Su L., Zhang J, e outros (2005) Differential expression of CXCR4 E is associated with the metastatic potential of human non-small cell lung can- cer cells.
Clin Cancer Res. 11(23): 8273 a 8280. Tseng D., Lartey F. e outros (2010) J.K., Yu L., e outros (2008) (MS108) Inhibition of SDF-1/CXCR7 radiosensitizes ENU induced glioblastomas in the rat. 56th Annual Meeting Radiation Research Society, a 29 de setembro de 2010, Grand Wailea Resort Hotel and Spa, Maui, Hawaii, USA.
Venkatesan N., Kim S.J., e outros (2003) Novel phosphoramidite 25 building blocks in synthesis and applications toward modified oligonucleo- tides.
Curr Med Chem 10(19): 1973 a 1991. Wang J., Shiozawa Y., e outros (2008) The role of CXCR7/RDC1 as a chemokine receptor for CXCL12/SDF-1 in prostate cancer.
J Biol Chem 283(7); 4283 a 4294. Epub 5 de dezembro de 2007. Wang J., Guan E., e outros (2001) Role of tyrosine phosphoryla- tion in ligand-independent sequestration of CXCRA4 in human primary mono- | cytes-macrophages.
J Biol Chem 276(52): 49236 a 49243.
Wang N., Wu Q.L., e outros (2005) Expression of chemokine re- ceptor CXCRA4 in nasopharyngeal carcinoma: pattern of expression and cor- relation with clinical outcome.
J Trans! Med 3: 26. Xu L., Duda D.G., e outros (2009) Direct evidence that bevaci- zumab, an antVEGF antibody, up-regulates SDF 1alpha, CXCRA, CXCL6, and neuropilin 1 in tumors from patients with rectal cancer.
Cancer Res. 69(20):7905 a 7910. Yamaguchi J., Kusano K.F., e outros (2003) Stromal cell-derived factor-1 effects on ex vivo expanded endothelial progenitor cell recruitment forischemic neovascularization.
Circulation 107(9): 1322 a 1328. Yang J., Zhang B. e outros (2008) Breast cancer metastasis suppressor 1 inhibits SDF-1alpha-induced migration of non-small cell lung A cancer by decreasing CXCR4 expression.
Cancer Lett 269(1):46 a 56. - Zagzag D., Esencay M., e outros (2008) Hypoxia- and vascular : 15 endothelial growth factor-induced stromal cell-derived factor-1alpha/CXCR4 expression in glioblastomas: one plausible explanation of Scherer's structu- À res.
Am J Patho! 173(2): 545 a 560. Zeelenberg 1.S., Ruuls-Van Stalle L., e outros (2003) The chem- okine receptor CXCRA4 is required for outgrowth of colon carcinoma micrometastases.
Cancer Res. 63(13): 3833 a 3839. Zheng K,, Li H.Y., e outros (2010) Chemokine receptor CXCR7 regulates the invasion, angiogenesis and tumor growth of human hepatocel- lular carcinoma cells.
J Exp Clin Cancer Res. 29:31. Zhou Y., Larsen P.H., e outros (2002) CXCR4 is a major chemo- kine receptor on glioma cells and mediates their survival.
J Biol Chem 277(51): 49481 a 49487. Zhu A.X., Sahani D.V., e outros (2009) Efficacy, safety, and po- tential biomarkers of sunitinib monotherapy in advanced hepatocellular carci- noma: a phase Il study.
J Clin Oncol 27(18): 3027 a 3035. As características da presente invenção descritas na específica- ção, as reivindicações e/ou os desenhos podem ser separadamente e em | combinação material para realizar a invenção em suas várias formas.

Claims (1)

  1. REIVINDICAÇÕES
    1. Molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1, pre- ferencialmente capaz de inibir SDF-1, caracterizada pelo fato de que a molé- cula de ácido L-nucleico é para uso em um método para o tratamento e/ou — prevenção de uma doença ou distúrbio, para uso em um método para o tra- tamento de um indivíduo que sofre de uma doença ou distúrbio ou que está em risco de desenvolver uma doença ou distúrbio como uma terapia adjunta, ou para uso como um medicamento para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, em que a doença ou distúrbio é câncer.
    2. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematológico e tumores sólidos, em que preferencial- mente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que compre- ende leucemia e mieloma e os tumores sólidos são selecionados do grupo compreendendo glioblastoma, câncer coloretal, câncer de mama, linfoma, câncer de próstata, câncer pancreático, câncer renal, câncer de ovário e câncer de pulmão.
    3. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com a reivindicação 1 ou 2, caracterizada pelo fato de que a terapia adjunta sensibiliza o indiví- duo,em que o indivíduo sensibilizado é mais responsivo a uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
    4, Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com a reivindicação 3, caracterizada pelo fato de que a terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio compreende administrar um agente farmaceutica- mente ativo adicional e/ou irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celu- lar.
    5. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com a reivindicação 4, caracterizada pelo fato de que o agente farmaceuticamente ativo adicional é selecionado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente alquilante, um antimetabólito, um alcaloide de planta, um terpenoide de plan- ta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Metotrexato, Tamoxifeno, So- rafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Flurouracil e Predni-
    sona.
    6. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 5, caracterizada pelo fato de que a molécula de ácido nucleico é capaz de bloquear a interação entre SDF-1 e um receptor de SDF-l, em que o receptor de SDF-1 é selecionado a partir do grupo que compreende CXCR4 e CXCR7.
    7. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizada pelo fato de que compreende na di- reção 5'->3' uma primeira extensão terminal de nucleotídeos, uma extensão central de nucleotídeos e uma segunda extensão terminal de nucleotídeos, ou uma segunda extensão terminal de nucleotídeos, uma extensão central de nucleotídeo e uma primeira extensão terminal de nucleotídeos, em que a molécula de ácido L-nucleico é selecionada do grupo compreendendo uma molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-
    15. 1dotipoB, uma molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C, molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo A e molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo D, em que a extensão central de nucleotídeos da molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo B compreende a seguinte se- quencia de nucleotídeos: 5' GUGUGAUCUAGAUGUADWGGCUGWUCCUAGUYAGG 3' (SEQ ID NO: 52), e em que a primeira extensão terminal de nucleotídeos da molécu- la de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo B compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' X1X2SVNS 3' e a segunda extensão termi- nal de nucleotídeos da molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo B compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' X1X2SVNS 3', em que X1 é ausente ou É A, X2é G, X3 é C e X4 é ausente ou é U; ou X1 é ausente, X2 é ausente ou é G, X3 é ausente ou é C e X4 é ausente; em que a extensão central de nucleotídeos da molécula de ácido
    L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende a seguinte se- quencia de nucleotídeo: GGUYAGGGCUHRXAAGUCGG (SEQ.ID.No. 108), em que XA é ausente ou é A, e em que a primeira extensão terminal de nucleotídeos da molécu- lade ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' RKSBUSNVGR 3' (SEQ ID NO: 138) e a se- gunda extensão terminal de nucleotídeos da molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleo- tídeo de 5" YYNRCASSMY 3' (SEQ ID NO: 139), ou em que a primeira extensão terminal de nucleotídeos da molécu- la de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' XSSSSV 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos da molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' BSSSXS 3', em queXS é ausente ou é S, ou em que a primeira extensão terminal de nucleotídeos da molécu- la de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5" CGUGCGCUUGAGAUAGG 3' (SEQ ID NO: 220) e a segunda extensão terminal de nucleotídeos da molécula de ácido L- —nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' CUGAUUCUCACG 3' (SEQ ID NO: 221), ou em que a primeira extensão terminal de nucleotídeos da molécu- la de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' UGAGAUAGG 3' e a segunda extensão ter- minal de nucleotídeos da molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' CU- GAUUCUCA 3' (SEQ ID NO: 222), ou em que a primeira extensão terminal de nucleotídeos da molé- cula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' GAGAUAGG 3' e a segunda extensão terminal de nucleotídeos da molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' CU- GAUUCUC 3' (SEQ ID NO: 222), em que a extensão central de nucleotídeos da molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo A compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5º AMAGYRACAHGUMAAXAUGAAAGGUARC 3' (SEQ ID NO: 74), em que XA é ausente ou é A, e em que a primeira extensão terminal de nucleotídeos da molécu- lade ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo A compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' X1X2NNBV 3' e a segunda extensão termi- nal de nucleotídeos da molécula de ácido L-nucleico ligada a SDF-1 do tipo A compreende uma sequencia de nucleotídeo de 5' BNBNX3X4 3, em que X1 é ausente ou é R, X2é S, X3 é S e X4 é ausente ou Y,ou X1 é ausente, X2 é ausente ou é S, X3 é ausente ou S e X4 é ausente, e em que a molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF- 1 do tipo D compreende uma sequencia de nucleotídeo de acordo com qual- querumadasSEQIDNO:142aSEQIDNO:144.
    8. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com a reivindicação 7, caracterizada pelo fato de que a molécula de ácido L-nucleico que se liga a SDF-1 do tipo B compreende uma sequência de nucleotídeo de acordo com qualquer uma dentre SEQ ID NO: 5a SEQ ID NO: 20 e SEQ ID NO: 22 aSEQIDNO:28, preferencialmente qualquer uma dentre SEQ ID NO: 5a SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 22 e SEQ ID NO: 28, mais preferencialmente qualquer uma dentre SEQ ID NO: 22 e SEQ ID NO: 28.
    9. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com a reivindicação 7, caracterizada pelo fato de que a molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo C compreende uma sequência de nucleotídeo de acor-
    do com qualquer uma dentre SEQ ID NO: 95 a SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 112 a SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 223 e SEQ ID NO: 224, preferencialmente qualquer um dentre SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 223eSEQIDNO:224.
    10. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com a reivindicação 7, caracterizada pelo fato de que a molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 do tipo A compreende uma sequência de nucleotídeo de acor- do com qualquer uma dentre SEQ ID NO: 60 a SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 78aSEQID NO: 82, SEQ ID NO: 84 a SEQ ID NO: 87, SEQ ID NO: 89 à SEQ ID NO: 94, e SEQ ID NO: 145, preferencialmente qualquer uma dentre SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 78, SEQ ID NO: 84, e SEQ ID NO: 146, mais preferencialmente qualquer uma dentre SEQ ID NO: 84 e SEQ ID NO: 146.
    11. Molécula de ácido L-nucleico, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 10, caracterizada pelo fato de que a molécula de áci- do L-nucleico compreende uma modificação, em que a modificação é prefe- rencialmente uma porção de alto peso molecular e/ou onde a modificação preferencialmente permite modificar as características da molécula de ácido L-nucleico em termos de tempo de residência no corpo humano ou de ani- mal, preferencialmente o corpo humano.
    12. Composição farmacêutica, caracterizada pelo fato de que compreende como um primeiro agente farmaceuticamente ativo a molécula de ácido L-nucleico como definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 11 e opcionalmente um constituinte adicional, em que o constituinte adicional é selecionado a partir do grupo que compreende um excipiente farmaceuti- camente aceitável, um veículo farmaceuticamente aceitável e um agente farmaceuticamente ativo adicional, e onde a composição farmacêutica é pa- ra uso em um método para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, ou para uso em um método para o tratamento de um indivíduo que sofre de uma doença ou distúrbio ou que está em risco de desenvolver uma doença ou distúrbio como uma terapia adjunta, ou para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, em que a doença ou distúrbio é cân- cer.
    13. Composição farmacêutica, de acordo com a reivindicação 12, caracterizada pelo fato de que a terapia adjunta sensibiliza o indivíduo, em que o indivíduo sensibilizado é mais responsivo a uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
    14. Composição farmacêutica, de acordo com a reivindicação 13, caracterizada pelo fato de que a terapia para o tratamento e/ou preven- ção da doença ou distúrbio compreende administrar um agente farmaceuti- camente ativo adicional e/ou irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celular.
    15. Composição farmacêutica, de acordo com qualquer uma das reivindicações 12 a 14, caracterizada pelo fato de que o agente farmaceuti- camente ativo adicional é um agente farmaceuticamente ativo selecionado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente alquilante, um an- timetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vincristina, um terpe- noide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorina, Metotrexato, Tamoxigeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Flu- rouracil e Prednisona.
    16. Composição farmacêutica, de acordo com qualquer uma das reivindicações 12 a 15, caracterizada pelo fato de que o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematológico e tumores sólidos, em que preferencialmente o câncer hematológico é selecionado a partir do gru- po de leucemia e mieloma e os tumores sólidos são selecionados do grupo compreendendo glioblastoma, câncer coloretal, câncer de mama, linfoma, câncer de próstata, câncer pancreático, câncer renal, câncer ovariano e cân- cer de pulmão.
    17. Medicamento, caracterizado pelo fato de que compreende uma ou várias dosagens unitárias de ao menos um primeiro agente farma- ceuticamente ativo, em que o primeiro agente farmaceuticamente ativo é uma molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1, como definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 11, em que o medicamento é para uso em um método para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, ou para uso em um método para o tratamento de um indivíduo que —sofrede uma doença ou distúrbio ou que está em risco de desenvolver uma doença ou distúrbio como uma terapia adjunta, ou para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, em que a doença ou distúrbio é cân- cer.
    18. Medicamento, de acordo com a reivindicação 17, caracteri- zado pelo fato de que a terapia adjunta sensibiliza o indivíduo, em que o in- divíduo sensibilizado é mais responsivo a uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
    19. Medicamento, de acordo com a reivindicação 18, caracteri- zado pelo fato de que a terapia para o tratamento e/ou prevenção das doen- ças ou distúrbio compreende administrar um agente farmaceuticamente ativo adicional e/ou irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celular.
    20. Medicamento, de acordo com qualquer uma das reivindica- ções 17 a 19, caracterizado pelo fato de que o medicamento compreende o agente farmaceuticamente ativo adicional, preferencialmente uma ou várias dosagens unitárias do agente farmaceuticamente ativo adicional, em que o agente farmaceuticamente ativo adicional é selecionado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente alquilante, um antimetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vincristina, um terpenoide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Metotrexato, Tamoxifeno, Sorafe- —nibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Flurouracil e Prednisona.
    21. Medicamento, de acordo com a reivindicação 17 ou 18, ca- racterizado pelo fato de que o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematológico e tumores sólidos, em que preferencialmente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que compreende leu- cemiae mieloma e os tumores sólidos são selecionados do grupo compre- endendo glioblastoma, câncer coloretal, câncer de mama, linfoma, câncer de próstata, câncer pancreático, câncer renal, câncer ovariano e câncer de pulmão.
    22. Uso de uma molécula de ácido L-nucleico como definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado pelo fato de que é para a fabricação de um medicamento para o tratamento e/ou prevenção de uma doença ou distúrbio, ou para uso em um método para o tratamento de um indivíduo que sofre de uma doença ou distúrbio ou que está em risco de desenvolver uma doença ou distúrbio como uma terapia adjunta, em que a doença ou distúrbio é câncer.
    23. Uso, de acordo com a reivindicação 22, caracterizado pelo fatode que a terapia adjunta sensibiliza o indivíduo, em que o indivíduo sen- sibilizado é mais responsivo a uma terapia para o tratamento e/ou prevenção da doença ou distúrbio.
    24. Uso, de acordo com a reivindicação 23, caracterizado pelo fato de que a terapia para o tratamento e/ou prevenção das doenças ou dis- túrbios compreende administrar um agente farmaceuticamente ativo adicio- nal e/ou irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celular.
    25. Uso, de acordo com a reivindicação 22 ou 23, caracterizado pelo fato de que o medicamento é usado em combinação com um agente farmaceuticamente ativo adicional, o medicamento é usado em combinação comum agente farmaceuticamente ativo adicional, em que o agente farma- ceuticamente ativo adicional é um agente farmaceuticamente ativo selecio- nado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente alquilante, um antimetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vincristina, um terpenoide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Metotrexa- to, Tamoxifeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexametasona, Flurouracil e Prednisona.
    26. Uso, de acordo com qualquer uma das reivindicações 22 a 25, caracterizado pelo fato de que o câncer é um câncer selecionado a partir do grupo de câncer hematológico e tumores sólidos, em que preferencial- mente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que compre- ende leucemia e mieloma e os tumores sólidos são selecionados do grupo compreendendo glioblastoma, câncer coloretal, câncer de mama, linfoma,
    câncer de próstata, câncer pancreático, câncer renal, câncer ovariano e cân- cer de pulmão.
    27. Método para o tratamento de um indivíduo que sofre ou está em risco de desenvolver câncer, caracterizado pelo fato de que compreende: - uma etapa (a) de administrar ao indivíduo uma quantidade far- maceuticamente eficaz de uma molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 como definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 11.
    28. Método, de acordo com a reivindicação 27, caracterizado pe- lo fato de que compreende: - uma etapa (b) de irradiar o indivíduo e/ou cirurgia e/ou terapia celular e/ou administrar uma quantidade farmaceuticamente eficaz de um agente farmaceuticamente ativo adicional ao indivíduo, em que o agente farmaceuticamente ativo adicional é um agente farmaceuticamente ativo se- lecionado a partir do grupo que compreende um anticorpo, um agente alqui- Jlante, um antimetabólito, um alcaloide de planta, preferencialmente vincristi- na, um terpenoide de planta, um inibidor de topoisomerase, Leucovorin, Me- totrexato, Tamoxifeno, Sorafenibe, Lenalidomida, Bortezomibe, Dexameta- sona, Flurouracil, e Prednisona.
    29. Método, de acordo com a reivindicação 28, caracterizado pe- lo fatode que a quantidade farmaceuticamente eficaz de uma molécula de ácido L-nucleico capaz de se ligar a SDF-1 como definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 11 é administrada como uma terapia adjunta ou parte de uma terapia adjunta.
    30. Método, de acordo com a reivindicação 29, caracterizado pe- lo fato de que a terapia adjunta sensibiliza o indivíduo, em que o indivíduo sensibilizado é mais responsivo a uma terapia para o tratamento e/ou pre- venção da doença ou distúrbio.
    31. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 27 a 30, caracterizado pelo fato de que o câncer é um câncer selecionado a partirdo grupo de câncer hematológico e tumores sólidos, em que preferen- cialmente o câncer hematológico é selecionado a partir do grupo que com- preende leucemia e mielomaos e tumores sólidos são selecionados do grupo compreendendo glioblastoma, câncer coloretal, câncer de mama, linfoma, câncer de próstata, câncer pancreático, câncer renal, câncer ovariano e cân- cer de pulmão.
BR112013005664A 2010-09-09 2011-09-09 Ácidos nucleicos que se ligam a sdf-1 e uso dos mesmos no tratamento de câncer BR112013005664B8 (pt)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP10009397.0 2010-09-09
EP10009397 2010-09-09
PCT/EP2011/004554 WO2012031773A1 (en) 2010-09-09 2011-09-09 Sdf-1 binding nucleic acids and the use thereof in cancer treatment

Publications (3)

Publication Number Publication Date
BR112013005664A2 true BR112013005664A2 (pt) 2020-08-04
BR112013005664B1 BR112013005664B1 (pt) 2021-11-03
BR112013005664B8 BR112013005664B8 (pt) 2023-04-25

Family

ID=44653255

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BR112013005664A BR112013005664B8 (pt) 2010-09-09 2011-09-09 Ácidos nucleicos que se ligam a sdf-1 e uso dos mesmos no tratamento de câncer

Country Status (15)

Country Link
US (3) US20130310442A1 (pt)
EP (1) EP2613789B1 (pt)
JP (1) JP6243736B2 (pt)
KR (1) KR101937939B1 (pt)
CN (1) CN103108641B (pt)
AU (1) AU2011300818B2 (pt)
BR (1) BR112013005664B8 (pt)
CA (1) CA2810950C (pt)
DK (1) DK2613789T3 (pt)
ES (1) ES2678497T3 (pt)
HK (1) HK1184699A1 (pt)
MX (1) MX357770B (pt)
RU (1) RU2679495C2 (pt)
SG (2) SG10201506725QA (pt)
WO (1) WO2012031773A1 (pt)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SG10201506725QA (en) * 2010-09-09 2015-10-29 Noxxon Pharma Ag Sdf-1 binding nucleic acids and the use thereof in cancer treatment
US11371045B2 (en) * 2016-04-15 2022-06-28 Noxxon Pharma Ag Method of modulating the number and the distribution of tumor-infiltrating leukocytes in tumors
KR20230031285A (ko) 2020-06-26 2023-03-07 라퀄리아 파마 인코포레이티드 레티노이드와 암 치료제의 병용 요법이 효과적인 암 환자를 선별하는 방법 및 레티노이드와 암 치료제의 병용 의약

Family Cites Families (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6011020A (en) 1990-06-11 2000-01-04 Nexstar Pharmaceuticals, Inc. Nucleic acid ligand complexes
US5840867A (en) 1991-02-21 1998-11-24 Gilead Sciences, Inc. Aptamer analogs specific for biomolecules
US5582981A (en) 1991-08-14 1996-12-10 Gilead Sciences, Inc. Method for identifying an oligonucleotide aptamer specific for a target
JP4974408B2 (ja) 1998-03-24 2012-07-11 中外製薬株式会社 血管形成抑制剤
ATE525477T1 (de) * 1998-03-30 2011-10-15 Northwest Biotherapeutics Inc Therapeutische und diagnostische anwendungen welche auf der rolle von cxcr-4 in der tumorgenese basieren
US6395029B1 (en) 1999-01-19 2002-05-28 The Children's Hospital Of Philadelphia Sustained delivery of polyionic bioactive agents
US20020037543A1 (en) * 2000-06-26 2002-03-28 Atkins Harold L. Purging of cells using viruses
US6652886B2 (en) 2001-02-16 2003-11-25 Expression Genetics Biodegradable cationic copolymers of poly (alkylenimine) and poly (ethylene glycol) for the delivery of bioactive agents
US20060019917A1 (en) * 2001-05-18 2006-01-26 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of stromal cell-derived factor-1 (SDF-1) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
KR100635703B1 (ko) 2001-06-07 2006-10-17 케모센트릭스, 인크. 세포 이동성 검사
US7468253B2 (en) 2001-06-07 2008-12-23 Chemocentryx, Inc. Method for multiple chemokine receptor screening for antagonists using RAM assay
EP1306382A1 (de) 2001-10-26 2003-05-02 Noxxon Pharma AG Modifizierte L-Nukleinsäure
ES2346640T4 (es) 2001-10-26 2011-04-26 Noxxon Pharma Ag Ácido l-nucleico modificado.
EP2138575B8 (en) 2002-02-20 2013-07-24 Mersana Therapeutics, Inc. Conjugates comprising a biodegradable polymer and uses therefor
EP1608318A4 (en) * 2003-03-27 2009-07-29 Univ Emory CXCR4 ANTAGONISTS AND METHODS OF USE
EP1620450A4 (en) 2003-04-13 2011-01-19 Enzon Pharmaceuticals Inc POLYMER OLIGONUCLEOTIDE PRODRUGS
GB0314472D0 (en) 2003-06-20 2003-07-23 Warwick Effect Polymers Ltd Polymer
ES2741524T3 (es) 2004-03-23 2020-02-11 Ascendis Pharma Gmbh Profármaco polimérico con un enlazador autoinmolador
WO2006052790A2 (en) 2004-11-05 2006-05-18 The Children's Hospital Of Philadelphia Biodegradable linkers for molecular therapies
EP1883651A1 (en) * 2005-05-26 2008-02-06 Rappaport Family Institute For Research in the Medical Sciences Polypeptides and compositions comprising same and methods of using same for treating cxcr4 associated medical conditions
JP2009504788A (ja) * 2005-08-19 2009-02-05 ジェンザイム・コーポレーション 化学療法の強化方法
MX2009000656A (es) 2006-07-18 2009-03-25 Noxxon Pharma Ag Acidos nucleicos que se fijan a sdf-i.
WO2008018641A1 (en) * 2006-08-11 2008-02-14 Ono Pharmaceutical Co., Ltd. Monoclonal antibodies against stromal derived factor-1 (sdf-1)
MX2009002859A (es) 2006-09-15 2009-03-30 Enzon Pharmaceuticals Inc Enlazadores biodegradables a base de ester impedido para suministro de oligonucleotidos.
CA2672944A1 (en) * 2006-12-22 2008-07-03 Ablynx N.V. Amino acid sequences directed against chemokines and polypeptides comprising the same for the treatment of chemokine-related diseases and disorders
DK2190991T3 (da) 2007-08-06 2020-02-10 Noxxon Pharma Ag SDF-1-Bindende nucleinsyrer og anvendelsen deraf
SG10201506725QA (en) * 2010-09-09 2015-10-29 Noxxon Pharma Ag Sdf-1 binding nucleic acids and the use thereof in cancer treatment

Also Published As

Publication number Publication date
US10093934B2 (en) 2018-10-09
JP6243736B2 (ja) 2017-12-06
RU2679495C2 (ru) 2019-02-11
CN103108641A (zh) 2013-05-15
EP2613789A1 (en) 2013-07-17
MX357770B (es) 2018-07-24
DK2613789T3 (en) 2018-07-23
BR112013005664B8 (pt) 2023-04-25
BR112013005664B1 (pt) 2021-11-03
CN103108641B (zh) 2016-01-13
EP2613789B1 (en) 2018-04-18
WO2012031773A1 (en) 2012-03-15
US20130310442A1 (en) 2013-11-21
CA2810950A1 (en) 2012-03-15
AU2011300818B2 (en) 2015-11-12
US9387221B2 (en) 2016-07-12
US20160355821A1 (en) 2016-12-08
KR20130114094A (ko) 2013-10-16
AU2011300818A1 (en) 2013-03-07
SG188220A1 (en) 2013-04-30
JP2013540725A (ja) 2013-11-07
MX2013002722A (es) 2013-06-28
KR101937939B1 (ko) 2019-01-11
ES2678497T3 (es) 2018-08-13
RU2013115739A (ru) 2014-10-20
SG10201506725QA (en) 2015-10-29
HK1184699A1 (zh) 2014-01-30
US20160095875A1 (en) 2016-04-07
CA2810950C (en) 2023-02-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2018201241B2 (en) Multi-target modulation for treating fibrosis and inflammatory conditions
ES2663404T3 (es) Ácidos nucleicos de unión a SDF-1
KR101589442B1 (ko) 에스디에프-1 결합형 핵산 및 이의 용도
US20210023116A1 (en) Treatment of cancer by systemic administration of dbait molecules
PT1675954E (pt) Ácidos nucleicos úteis para induzir letalidade em células tumorais
EA026309B1 (ru) Нуклеиново-кислотные модуляторы clec-2
US10093934B2 (en) SDF-1 binding nucleic acids and the use thereof in cancer treatment
AU2018314236A1 (en) RNA aptamers against transferrin receptor (TfR)
US20230146246A1 (en) Method of Modulating the Number and the Distribution of Tumor-Infiltrating Leukocytes in Tumors

Legal Events

Date Code Title Description
B06F Objections, documents and/or translations needed after an examination request according [chapter 6.6 patent gazette]
B07D Technical examination (opinion) related to article 229 of industrial property law [chapter 7.4 patent gazette]

Free format text: DE ACORDO COM O ARTIGO 229-C DA LEI NO 10196/2001, QUE MODIFICOU A LEI NO 9279/96, A CONCESSAO DA PATENTE ESTA CONDICIONADA A ANUENCIA PREVIA DA ANVISA. CONSIDERANDO A APROVACAO DOS TERMOS DO PARECER NO 337/PGF/EA/2010, BEM COMO A PORTARIA INTERMINISTERIAL NO 1065 DE 24/05/2012, ENCAMINHA-SE O PRESENTE PEDIDO PARA AS PROVIDENCIAS CABIVEIS.

B07E Notification of approval relating to section 229 industrial property law [chapter 7.5 patent gazette]
B06U Preliminary requirement: requests with searches performed by other patent offices: procedure suspended [chapter 6.21 patent gazette]
B06A Patent application procedure suspended [chapter 6.1 patent gazette]
B09A Decision: intention to grant [chapter 9.1 patent gazette]
B16A Patent or certificate of addition of invention granted [chapter 16.1 patent gazette]

Free format text: PRAZO DE VALIDADE: 20 (VINTE) ANOS CONTADOS A PARTIR DE 09/09/2011, OBSERVADAS AS CONDICOES LEGAIS. PATENTE CONCEDIDA CONFORME ADI 5.529/DF, QUE DETERMINA A ALTERACAO DO PRAZO DE CONCESSAO.

B25D Requested change of name of applicant approved

Owner name: TME PHARMA AKTIENGESELLSCHAFT (DE)