WO2022172994A1 - オリゴヌクレオチドの製造方法 - Google Patents

オリゴヌクレオチドの製造方法 Download PDF

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WO2022172994A1
WO2022172994A1 PCT/JP2022/005362 JP2022005362W WO2022172994A1 WO 2022172994 A1 WO2022172994 A1 WO 2022172994A1 JP 2022005362 W JP2022005362 W JP 2022005362W WO 2022172994 A1 WO2022172994 A1 WO 2022172994A1
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formula
ring
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PCT/JP2022/005362
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敦彦 早川
泰介 市丸
聡 井上
大輔 高橋
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味の素株式会社
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    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D513/00Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having nitrogen and sulfur atoms as the only ring hetero atoms, not provided for in groups C07D463/00, C07D477/00 or C07D499/00 - C07D507/00
    • C07D513/02Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having nitrogen and sulfur atoms as the only ring hetero atoms, not provided for in groups C07D463/00, C07D477/00 or C07D499/00 - C07D507/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D513/04Ortho-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D279/00Heterocyclic compounds containing six-membered rings having one nitrogen atom and one sulfur atom as the only ring hetero atoms
    • C07D279/021,2-Thiazines; Hydrogenated 1,2-thiazines
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    • C07H21/04Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
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    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Definitions

  • the present invention relates to a method for producing oligonucleotides.
  • the phosphoramidite method and the H-phosphonate method are widely used as methods for producing oligonucleotides.
  • a phosphoramidite (compound (1)) and a nucleoside (compound (2)) are condensed to have a phosphite ester bond.
  • An oligonucleotide (compound (4)) is obtained by synthesizing an oligonucleotide precursor (compound (3)) and then oxidizing the oligonucleotide precursor.
  • the "compound represented by formula (1)" may be abbreviated as "compound (1)”.
  • Compounds represented by other formulas, groups represented by other formulas, etc. may also be abbreviated.
  • DMTr represents a 4,4'-dimethoxytrityl group
  • i-Pr represents an isopropyl group
  • CE represents a 2-cyanoethyl group
  • Base and Base' represent an optionally protected nucleobase.
  • R represents a protecting group or solid support.
  • nucleosides instead of nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (for example, oligonucleotides having a thiophosphate ester bond) may be condensed. Further, in the phosphoramidite method, instead of oxidizing the oligonucleotide precursor, sulfuration of the oligonucleotide precursor may be performed.
  • H-phosphonate (compound (5)) and pivaloyl chloride (PivCl) are reacted to form an activated H-phosphonate (compound ( 6)), condensing it with a nucleoside (compound (7)) to synthesize an oligonucleotide precursor having a phosphonate ester bond (compound (8)), and then oxidizing the oligonucleotide precursor An oligonucleotide (compound (9)) is obtained by doing so.
  • DMTr represents 4,4′-dimethoxytrityl
  • N(Et) 3 represents triethylamine
  • Base and Base′ represent an optionally protected nucleobase
  • Piv represents a pivaloyl group
  • R represents a protecting group or solid support.
  • nucleosides instead of nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (for example, oligonucleotides with thiophosphate ester bonds) may be condensed. Also, in the H-phosphonate method, instead of oxidizing the oligonucleotide precursor, sulfuration of the oligonucleotide precursor may be performed.
  • H-phosphonate (compound 1) and nucleoside (compound 2) are synthesized in the presence of a large amount of triphenylphosphine and a large amount of 2,2'-dipyridyl disulfide, as shown by the following formula. is disclosed to condense and oxidize to produce a dinucleotide (compound 4).
  • DMTr represents 4,4′-dimethoxytrityl
  • Th represents a thymine base
  • PPh 3 represents a triphenylphosphine
  • Ac represents an acetyl group.
  • Non-Patent Document 2 and Patent Document 1 do not disclose a method for producing an oligonucleotide
  • benzoisothiazolone is produced by triethyl phosphite (P(OEt) 3 ) as represented by the following formula. ) derivative (compound 1) (in other words, oxidation of triethyl phosphite (P(OEt) 3 ) by the benzisothiazolone derivative (compound 1) to give triethyl phosphate (O ⁇ P(OEt) 3 ).
  • forming is disclosed.
  • iodine is widely used as an oxidizing agent for oxidizing an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond (for example, the compound represented by formula (3) above).
  • iodine is widely used as an oxidizing agent for oxidizing an oligonucleotide precursor having a phosphonate ester bond (for example, the compound represented by the above formula (8)).
  • the present inventors have found that when iodine is used as an oxidizing agent for oligonucleotide precursors with phosphite linkages, the phosphite linkage sites of the precursors interact with the oxidizing agent to decompose. It was found that a by-product formed by In addition to phosphite or phosphonate linkages, oxidation of oligonucleotide precursors having thiophosphate linkages with iodine converts the thiophosphate linkages to phosphate linkages, forming It was found that a by-product (hereinafter sometimes referred to as "desulfurized product”) is generated.
  • the present invention has been made in view of the circumstances described above, and an object of the present invention is to provide an oligonucleotide capable of suppressing the formation of the above-mentioned deletion product or desulfurization product compared to the case of using iodine. It is to provide a manufacturing method.
  • a method for producing an oligonucleotide having a phosphate ester bond by oxidizing an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond or a phosphonate ester bond with an oxidizing agent comprising:
  • the oxidizing agent has the formula (I):
  • R 1a represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group
  • Ring A represents a 5- or 6-membered unsaturated heterocyclic ring
  • m represents an integer of 0 to 3
  • m R 2a each independently represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group, and when m is an integer of 2 or more, adjacent Two R 2a 's may form an optionally substituted condensed ring together with ring A.
  • R 1b represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group
  • Ring B represents a 6-membered aromatic hydrocarbon ring or a 5- or 6-membered aromatic heterocycle
  • n represents an integer of 0 to 5
  • Each of the n R 2b independently represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group, and when n is an integer of 2 or more, adjacent Two R 2b 's may form an optionally substituted bicyclic condensed aromatic heterocyclic ring together with ring B.
  • a compound represented by (excluding 2,2-dipyridyl disulfide) The method according to [1] above.
  • R 1c represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group
  • p represents 0 or 1
  • R 2c represents a hydrogen atom, an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group
  • Ring C represents a 6-membered aromatic hydrocarbon ring, a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocyclic ring, or a 10-membered bicyclic condensed aromatic heterocyclic ring containing a nitrogen atom
  • q represents an integer of 0 to 4
  • q R 3c each independently represent an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group.
  • the compound represented by the formula (Ic) is 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one, 2-isopropylisothiazolo[5,4-b]pyridine- 3(2H)-one, 2-isopropylisothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one, 2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-phenyl-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 2-(2,6-dimethylphenyl)-5-nitro-1,2-benzothiazol-3(2H)-one , 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-(4-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H) -one, 2-[1-methyl-1-(2-pyridyl)ethyl
  • the compound represented by formula (Ic) is 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one, 2-isopropylisothiazolo[5,4-b]pyridine- 3(2H)-one, 2-isopropylisothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one, 2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-phenyl-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 2-(2,6-dimethylphenyl)-5-nitro-1,2-benzothiazol-3(2H)-one , 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H
  • the compound represented by the formula (Ib) is 2,2'-dibenzothiazolyl disulfide, 2-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid, 3-(2-benzothiazolyldithio ) propanoic acid, 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide, 2,2′-dibenzoxazolyl disulfide, 5,5′-di(1,2,3-triazolyl) disulfide, 5,5′-dithiobis(1- phenyl-1H-tetrazole), 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide), 4,4′-dipyridyl disulfide, 3-(2-pyridyldithio)propanoic acid, 2,2′-dithiobis(1H-imidazole ), and 2,2′-dithiobis(1-methyl-1H-imidazole).
  • an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond or a phosphonate ester bond (1) an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensation of a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide with a phosphoramidized nucleoside, nucleotide or oligonucleotide; or (2) an oligonucleotide and , which is an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensation with a phosphoramidite, the method according to any one of [1] to [9].
  • a method for producing an oligonucleotide by one-pot synthesis comprising: The one-pot synthesis is In a solution containing a non-polar solvent, a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) having a hydrophobic protecting group, a hydroxyl group protected with a temporary protecting group removable under acidic conditions, and phosphoramidated Further, an oligo which is condensed with a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) and has a phosphite ester bond and a hydrophobic protecting group and the hydroxyl group is protected by a temporary protecting group removable under acidic conditions step (1) of forming a nucleotide precursor (c); A quenching agent (i) for the phosphoramidated nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) is added to the solution after step (1) to quench the phosphoramidated nucleoside,
  • step (3) of forming an oligonucleotide (d) protected with a temporary protecting group step (4) of adding a quenching agent (ii) for the oxidizing agent to the solution after step (3) to quench the oxidizing agent; adding an acid to the solution after step (4) to remove the temporary protecting group removable under acidic conditions of the oligonucleotide (d), resulting in an oligonucleotide having an unprotected hydroxyl group and a hydrophobic protecting group;
  • R 1a represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group
  • Ring A represents a 5- or 6-membered unsaturated heterocyclic ring
  • m represents an integer of 0 to 3
  • m R 2a each independently represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group, and when m is an integer of 2 or more, adjacent Two R 2a 's may form an optionally substituted condensed ring together with ring A.
  • R 1b represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group
  • Ring B represents a 6-membered aromatic hydrocarbon ring or a 5- or 6-membered aromatic heterocycle
  • n represents an integer of 0 to 5
  • Each of the n R 2b independently represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group, and when n is an integer of 2 or more, adjacent Two R 2b 's may form an optionally substituted bicyclic condensed aromatic heterocyclic ring together with ring B.
  • a compound represented by (excluding 2,2-dipyridyl disulfide) The method according to [12] above.
  • R 1c represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group
  • p represents 0 or 1
  • R 2c represents a hydrogen atom, an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group
  • Ring C represents a 6-membered aromatic hydrocarbon ring, a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocyclic ring, or a 10-membered bicyclic condensed aromatic heterocyclic ring containing a nitrogen atom
  • q represents an integer of 0 to 4
  • q R 3c each independently represent an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group.
  • the compound represented by the formula (Ic) is 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one, 2-isopropylisothiazolo[5,4-b]pyridine- 3(2H)-one, 2-isopropylisothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one, 2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-phenyl-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 2-(2,6-dimethylphenyl)-5-nitro-1,2-benzothiazol-3(2H)-one , 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-(4-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H) -one, 2-[1-methyl-1-(2-pyridyl)ethyl
  • the compound represented by formula (Ic) is 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one, 2-isopropylisothiazolo[5,4-b]pyridine- 3(2H)-one, 2-isopropylisothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one, 2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-phenyl-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 2-(2,6-dimethylphenyl)-5-nitro-1,2-benzothiazol-3(2H)-one , 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one, 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H
  • the compound represented by the formula (Ib) is 2,2'-dibenzothiazolyl disulfide, 2-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid, 3-(2-benzothiazolyldithio ) propanoic acid, 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide, 2,2′-dibenzoxazolyl disulfide, 5,5′-di(1,2,3-triazolyl) disulfide, 5,5′-dithiobis(1- phenyl-1H-tetrazole), 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide), 4,4′-dipyridyl disulfide, 3-(2-pyridyldithio)propanoic acid, 2,2′-dithiobis(1H-imidazole ), and 2,2′-dithiobis(1-methyl-1H-imidazole).
  • the quenching agent (ii) is an organophosphorus compound.
  • the organic phosphorus compound is at least one selected from the group consisting of phosphines, phosphite triesters, phosphite esters, phosphonite diesters and phosphinate esters. .
  • the organic phosphorus compound is a phosphine.
  • the one-pot synthesis further comprises step (6) of adding a base to the solution after step (5) after step (5) and before step (7), above [12] to [24 ]
  • step (6) of adding a base to the solution after step (5) after step (5) and before step (7), above [12] to [24 ] The method according to any one of
  • oligonucleotide precursor (c) is an oligonucleotide precursor having a thiophosphate ester bond in addition to a phosphite ester bond the method of.
  • R 1n represents an optionally substituted phenyl group
  • p′ represents 0, ring C′′ represents a 10-membered bicyclic condensed aromatic heterocycle containing a nitrogen atom
  • q ' indicates 0, or
  • R 1n represents an optionally substituted phenyl group
  • p′ represents 0, ring C′′ represents a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocycle
  • q′ represents 1
  • R 3n represents a C 1-6 perfluoroalkyl group
  • R 1n represents an optionally substituted phenyl group
  • p′ represents 1, ring C′′ represents a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocycle
  • q′ represents 0, or
  • R 1n represents a pyridyl group substituted with one C 1-6 alkyl group
  • p′ represents 0, ring C′′ represents a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocyclic ring
  • q ' indicates 0.
  • the compound represented by the formula (In) is 2-phenylisothiazolo[5,4-b]quinolin-3(2H)-one, 2-phenyl-5-trifluoromethylisothiazolo[5, 4-b]pyridin-3(2H)-one, 2-phenyl-2H-1,2-benzothiazin-3(4H)-one, or 2-(4-methyl-2-pyridinyl)isothiazolo[5,4- b]
  • the compound according to the above [27] which is pyridin-3(2H)-one.
  • oligonucleotides by suppressing the production of the above-mentioned deletion products or desulfurization products compared to the case of using iodine.
  • C ab means having a carbon number of a or more and b or less (a and b are integers).
  • halogen atom means a fluorine atom, a chlorine atom, a bromine atom or an iodine atom.
  • hydrocarbon group includes, for example, an aliphatic hydrocarbon group, an araliphatic hydrocarbon group, a monocyclic saturated hydrocarbon group, an aromatic hydrocarbon group, and the like. includes monovalent groups and divalent groups such as alkyl groups, alkenyl groups, alkynyl groups, cycloalkyl groups, aryl groups, aralkyl groups and alkylene groups.
  • alkyl (group) may be linear or branched.
  • Alkyl (group) includes an alkyl group having 1 or more carbon atoms, preferably a C 1-10 alkyl group, more preferably a C 1-6 if there is no particular limitation on the carbon number range. is an alkyl group. Specific examples include methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, sec-butyl, tert-butyl, pentyl, hexyl and the like.
  • alkenyl (group) may be linear or branched.
  • Alkenyl (group) includes, for example, a C 2-6 alkenyl group and the like. Specific examples include vinyl, 1-propenyl, allyl, isopropenyl, butenyl, isobutenyl and the like.
  • alkynyl (group) may be linear or branched.
  • Alkynyl (group) includes, for example, a C 2-6 alkynyl group and the like. Specific examples include ethynyl, 1-propynyl, 2-propynyl, 1-butynyl, 2-butynyl, 3-butynyl, 1-pentynyl, 2-pentynyl, 3-pentynyl, 4-pentynyl, 1-hexynyl, 2- Hexynyl, 3-hexynyl, 4-hexynyl, 5-hexynyl and the like.
  • cycloalkyl (group) means a cyclic alkyl group, and includes, for example, a C 3-8 cycloalkyl group, preferably a C 3-6 cycloalkyl group. Specific examples thereof include cyclopropyl, cyclobutyl, cyclopentyl, cyclohexyl, cycloheptyl, cyclooctyl and the like.
  • aryl (group) means a monocyclic or polycyclic (condensed) aromatic hydrocarbon group, such as phenyl, 1-naphthyl, 2-naphthyl, biphenylyl, 1-anthryl and C 6-14 aryl groups such as , 2-anthryl and the like. Among them, a C 6-10 aryl group is more preferred, and phenyl is particularly preferred.
  • heteroaryl refers to a monocyclic or polycyclic (condensed) aromatic ring containing heteroatoms selected from nitrogen, sulfur and oxygen atoms in addition to carbon atoms. group heterocyclic group.
  • Heteroaryl groups include, for example, 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl groups and 8- to 14-membered fused polycyclic heteroaryl groups.
  • heteroaryl includes, for example, thienyl, furyl, pyrrolyl, imidazolyl, pyrazolyl, thiazolyl, isothiazolyl, oxazolyl, isoxazolyl, pyridyl, (pyridine-N- oxid)-yl, pyrazinyl, pyrimidinyl, pyridazinyl, 1,2,4-oxadiazolyl, 1,3,4-oxadiazolyl, 1,2,4-thiadiazolyl, 1,3,4-thiadiazolyl, triazolyl, tetrazolyl, triazinyl, etc. mentioned.
  • the "heteroaryl group” includes a (pyridin-N-oxide)-yl group represented by the following formula (where * indicates the bonding position).
  • the "5- or 6-membered monocyclic nitrogen-containing heteroaryl (group)” includes, for example, the above-mentioned “5- or 6-membered monocyclic heteroaryl (group)” Examples include those containing at least one or more nitrogen atoms as atoms.
  • 8- to 14-membered condensed polycyclic heteroaryl includes, for example, benzothiophenyl, benzofuranyl, benzimidazolyl, benzoxazolyl, benzisoxazolyl, benzothiazolyl, benzisothiazolyl, ryl, benzotriazolyl, imidazopyridinyl, thienopyridinyl, furopyridinyl, pyrrolopyridinyl, pyrazolopyridinyl, oxazolopyridinyl, thiazolopyridinyl, imidazopyrazinyl, imidazopyrimidinyl, thienopyrimidinyl, furopyrimidinyl, pyrrolopyrimidinyl, pyrazolopyrimidinyl, oxazolopyrimidinyl, thiazolopyrimidinyl, pyrazolotriazinyl,
  • the "8- to 14-membered condensed polycyclic nitrogen-containing heteroaryl (group)” includes, for example, the aforementioned “8- to 14-membered condensed polycyclic heteroaryl (group)", Examples include those containing at least one or more nitrogen atoms as ring-constituting atoms.
  • aralkyl (group) includes C 7-20 aralkyl groups, preferably C 7-16 aralkyl groups (C 6-10 aryl-C 1-6 alkyl groups). Specific examples thereof include benzyl, 1-phenylethyl, 2-phenylethyl, 1-phenylpropyl, naphthylmethyl, 1-naphthylethyl, 1-naphthylpropyl and the like.
  • alkylene (group) may be linear or branched.
  • the “alkylene (group)” includes an alkylene group having 1 or more carbon atoms, preferably a C 1-10 alkylene group, more preferably a C 1-6 alkylene group, unless the carbon number range is particularly limited. It is an alkylene group. Specific examples include methylene, ethylene, propylene, butylene, pentylene and hexylene.
  • alkoxy (group) may be linear or branched.
  • Alkoxy (group) includes an alkoxy group having 1 or more carbon atoms, preferably a C 1-10 alkoxy group, more preferably a C 1-6 alkoxy group when there is no particular limitation on the carbon number range. It is an alkoxy group. Specific examples thereof include methoxy, ethoxy, propoxy, isopropoxy, butoxy, isobutoxy, sec-butoxy, tert-butoxy, pentyloxy, hexyloxy and the like.
  • acyl (group) may be linear or branched.
  • Examples of “acyl (group)” include C 1-6 alkanoyl group, C 7-13 aroyl group and the like.
  • Specific examples of “acyl (group)” include formyl, acetyl, n-propionyl, isopropionyl, n-butyryl, isobutyryl, pivaloyl, valeryl, hexanoyl, benzoyl, naphthoyl, levulinyl and the like.
  • “Acyl (group)” may be substituted.
  • the term "6-membered aromatic hydrocarbon ring” means a benzene ring.
  • the "6-membered aromatic hydrocarbon ring” forms part of the condensed ring
  • the "6-membered aromatic hydrocarbon ring” means a benzene ring forming part of the condensed ring. do.
  • 5- or 6-membered aromatic heterocyclic ring includes, for example, thiophene ring, furan ring, 1H-pyrrole ring, imidazole ring, pyrazole ring, thiazole ring, isothiazole ring, oxazole ring, isoxazole ring, 1,2,4-oxadiazole ring, 1,3,4-oxadiazole ring, 1,2,4-thiadiazole ring, 1,3,4-thiadiazole ring, triazole ring, tetrazole ring, pyridine ring , pyridine-N-oxide ring, pyrazine ring, pyrimidine ring, pyridazine ring, triazine ring and the like.
  • aromatic heterocycle includes pyridine-N-oxide ring.
  • the "4- to 8-membered nitrogen-containing heterocyclic ring” includes, for example, azetidine ring, pyrrolidine ring, pyrroline ring, 2H-pyrrole ring, piperidine ring, piperazine ring, azacycloheptane ring, azacyclooctane ring , 1H-pyrrole ring, imidazole ring, pyrazole ring, thiazole ring, isothiazole ring, oxazole ring, isoxazole ring, 1,2,4-oxadiazole ring, 1,3,4-oxadiazole ring, 1, 2,4-thiadiazole ring, 1,3,4-thiadiazole ring, triazole ring, tetrazole ring, pyridine ring, pyridine-N-oxide ring, pyrazine ring, pyrimidine ring, pyridazine ring, tria
  • the "5- or 6-membered nitrogen-containing heterocyclic ring” includes, for example, the above-mentioned “4- to 8-membered nitrogen-containing heterocyclic ring” having 5 or 6 ring-constituting atoms. be done.
  • the "6-membered nitrogen-containing aromatic heterocyclic ring” includes, for example, pyridine ring, pyridine-N-oxide ring, pyrazine ring, pyrimidine ring, pyridazine ring, triazine ring and the like.
  • the "bicyclic condensed nitrogen-containing heterocyclic ring” includes, for example, pyrrolidine ring, decahydroisoquinoline ring, decahydroquinoline ring, benzothiophene ring, benzofuran ring, isobenzofuran ring, benzimidazole ring, benzo oxazole ring, benzisoxazole ring, benzothiazole ring, benzisothiazole ring, benzotriazole ring, indole ring, isoindole ring, 1H-indazole ring, purine ring, isoquinoline ring, 5,6,7,8-tetrahydro isoquinoline ring, quinoline ring, 5,6,7,8-tetrahydroquinoline ring, phthalazine ring, pteridine ring, naphthyridine ring, quinoxaline ring, quinazoline ring, cinn
  • the "bicyclic condensed aromatic heterocyclic ring” includes, for example, a benzothiophene ring, a benzofuran ring, an isobenzofuran ring, a benzimidazole ring, a benzoxazole ring, a benzisoxazole ring, a benzothiazole ring, a benzo isothiazole ring, benzotriazole ring, indole ring, isoindole ring, 1H-indazole ring, purine ring, isoquinoline ring, 5,6,7,8-tetrahydroisoquinoline ring, quinoline ring, 5,6,7,8 -tetrahydroquinoline ring, phthalazine ring, pteridine ring, naphthyridine ring, quinoxaline ring, quinazoline ring, cinnoline ring and the like.
  • the "bicyclic condensed aromatic heterocycle” includes one ring that is an aromatic heterocycle and the other ring that is a non-aromatic heterocyclic ring or a non-aromatic hydrocarbon ring. Also included are certain bicyclic fused rings (eg, 5,6,7,8-tetrahydroisoquinoline rings).
  • the "nitrogen atom-containing 10-membered bicyclic condensed aromatic heterocycle” includes, for example, 5,6,7,8-tetrahydroisoquinoline ring, quinoline ring and the like.
  • a perchloroalkyl group e.g., trichlor
  • a "perchloroalkyl group” means an alkyl group in which all hydrogen atoms are substituted with chlorine atoms.
  • perfluoroalkyl group means an alkyl group in which all hydrogen atoms are substituted with fluorine atoms.
  • the "substituent” includes, for example, the above-mentioned halogen atom, alkyl group, aralkyl group, alkoxy group, acyl group, alkenyl group, alkynyl group, cycloalkyl group, aryl group, hydroxyl group, nitro cyano group, guanidyl group, carboxy group, alkoxycarbonyl group (the alkoxy moiety is the same as the alkoxy group), sulfo group, phospho group, alkylsulfanyl group (the alkyl moiety is the same as the alkyl group), alkylsulfinyl group (alkyl part is the same as the alkyl group), alkylsulfonyl group (the alkyl part is the same as the alkyl group), amino group, monoalkylamino group (the alkyl part is the same as the alkyl group), dialkylamino group (the alkyl part is the
  • the "hydroxyl-protecting group” is not particularly limited, and known protecting groups can be used.
  • the protecting group include methyl group, benzyl group, p-methoxybenzyl group, tert-butyl group, methoxymethyl group, 2-methoxyethyl group, 2-tetrahydropyranyl group, 2-ethoxyethyl group, 2- Cyanoethyl group, (2-cyanoethoxy)methyl group, 1-(2-cyanoethoxy)ethyl group, bis(2-acetoxyethoxy)methyl (ACE) group, (2-nitrobenzyl)oxymethyl (NBOM) group, ( 2-(trimethylsilyl)ethoxy)methyl (SEM) group, 1-(2-cyanoethoxy)ethyl group, 2-((4-methylphenyl)sulfonyl)ethoxymethyl (TEM) group, tert-butyldithiomethyl (DTM) group, ((2-(methylthio)phenyl-N
  • the "temporary protecting group for a hydroxyl group removable under acidic conditions” includes, for example, a trityl group, a 9-phenyl-9-xanthenyl group, a 9-phenyl-9-thioxanthenyl group, a 1,1-bis (4-Methoxyphenyl) -1-phenylmethyl group (herein sometimes referred to as “4,4'-dimethoxytrityl group”) and other bis (C 1-6 alkoxy) trityl groups, 1-( and mono(C 1-18 alkoxy)trityl groups such as 4-methoxyphenyl)-1,1-diphenylmethyl group (which may be referred to as “4-monomethoxytrityl group” in this specification).
  • the temporary protective group is preferably 4,4'-dimethoxytrityl group or 4-monomethoxytrityl group, more preferably 4,4'-dimethoxytr
  • the "amino-protecting group” is not particularly limited, and known protecting groups can be used.
  • the protecting group include pivaloyl group, pivaloyloxymethyl group, acetyl group, trifluoroacetyl group, phenoxyacetyl group, 4-isopropylphenoxyacetyl group, 4-tert-butylphenoxyacetyl group, benzoyl group and isobutyryl group.
  • (2-hexyl)decanoyl group dimethylformamidinyl group, 1-(dimethylamino)ethylidene group, and 9-fluorenylmethyloxycarbonyl group.
  • protecting group for a phosphate group is not particularly limited, and known protecting groups can be used.
  • Phosphate protecting groups include, for example: 2-cyanoethyl group represented by the following formula (Pg-1), 2-[2-(4,4′-dimethoxytrityloxy)ethylsulfonyl]ethyl group represented by the following formula (Pg-2), [3-(4,4′-dimethoxytrityloxy)-2,2-di(ethoxycarbonyl)]propyl group represented by the following formula (Pg-3), [3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)-2,2-di(N-methylcarbamoyl)]propyl group represented by the following formula (Pg-4).
  • the phosphate group-protecting group is preferably a 2-cyanoethyl group.
  • Me represents a methyl group
  • Et represents an ethyl group
  • DMTr represents a 4,4'-dimethoxytrityl group
  • * represents a bonding position with a phosphate group.
  • hydrophobic protecting group for example, a protecting group described as “anchor” in WO 2017/104836 can be used.
  • the hydrophobic protecting group is preferably a protecting group represented by the following formula (Pg-5): **L-Y-Z (Pg-5) [In the formula, ** indicates the position of attachment to the group to be protected; L is a single bond, or formula (Pg-i-1) or (Pg-i-2):
  • R 1p and R 2p each independently represent a C 1-22 hydrocarbon group
  • L 1 represents an optionally substituted divalent C 1-22 hydrocarbon group, and —CH 2 — in the divalent C 1-22 hydrocarbon group may be replaced with a linker
  • R 4p represents a C 1-22 alkylene group
  • R 3p and R 5p each independently represent a hydrogen atom or a C 1 -22 alkyl group, or R 3p and R 5p together may form a ring).
  • Y represents a single bond, an oxygen atom, or NR (R represents a hydrogen atom, an alkyl group or an aralkyl group); and Z represents formulas (Pg-ii-1) to formulas (Pg-ii-5 ) either:
  • Ring A' represents a benzene ring
  • Ring B' represents a cyclohexane ring
  • Ring D' represents a naphthalene ring or a bicyclic condensed aromatic heterocycle
  • R 6p is a hydrogen atom, or when R b is a group represented by the following formula ( Pg -iii), R 6p of ring A' or ring B' is may represent a single bond or -O- to form a condensed ring together with ring A' or ring B' and ring C'
  • k represents an integer of 1 to 4
  • Ring C' represents a benzene ring: j represents an integer from 0 to 4; j Q are each independently as defined above; j R 9p each independently represents a hydrocarbon group in which a linear aliphatic hydrocarbon group having 10 or more carbon atoms is bonded via a single bond or a linker; R 8p represents a hydrogen atom, or represents a single bond or -O- together with R 6p of ring A' or ring B' to form a condensed ring together with ring A' or ring B' and ring C' may form Ring C' is, in addition to j QR 9p , a halogen atom, a C 1-6 alkyl group optionally substituted with a halogen atom, and a C 1-6 alkoxy group optionally substituted with a halogen atom It may have a substituent selected from the group consisting of ), or R a and R b together form an oxo group;
  • ring A', ring C', R6p and R8p form a condensed ring
  • ring A' and ring C' each represent a benzene ring portion in the condensed ring.
  • ring B', ring C', R 6p and R 8p form a condensed ring
  • ring C' represents a benzene ring moiety in the condensed ring
  • ring B' represents a cyclohexane ring moiety in the condensed ring.
  • the linear aliphatic hydrocarbon group having 10 or more carbon atoms is preferably a group selected from a linear C 10-40 alkyl group and a linear C 10-40 alkenyl group, more preferably linear C 10-40 alkyl group, more preferably linear C 10-30 alkyl group, particularly preferably linear C 12-28 alkyl group, most preferably linear is a C 14-26 alkyl group.
  • hydrocarbon group in which a linear aliphatic hydrocarbon group having 10 or more carbon atoms is bonded via a single bond or a linker is preferably a linear C 10-40 alkyl group, 1 to 3 benzyl group in which a linear C 10-40 alkyl group is bonded via —O—, or cyclohexylmethyl in which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are bonded via —O— is the base.
  • L 1 is a divalent C 1-22 hydrocarbon group; and L 2 is a single bond.
  • L 1 is an ethylene group
  • L 1 is an ethylene group
  • L 1 is an ethylene group
  • L 1 is an optionally substituted phenylene group
  • L represented by formula (Pg-i-1) is particularly preferably a succinyl group.
  • L represented by formula (Pg-i-2) in formula (Pg-5) will be described.
  • L 1 in formula (Pg-i-2) is preferably a divalent C 6-10 aromatic hydrocarbon group, more preferably a phenylene group.
  • L 2 in formula (Pg-i-2) is preferably a single bond.
  • a preferred combination of L 1 and L 2 in formula (Pg-i-2) is a combination in which L 1 is a divalent C 6-10 aromatic hydrocarbon group and L 2 is a single bond.
  • a more preferred combination of L 1 and L 2 in formula (Pg-i-2) is a combination in which L 1 is a phenylene group and L 2 is a single bond.
  • R 1p and R 2p in formula (Pg-i-2) are each independently preferably a C 1-22 alkyl group, more preferably a C 1-10 alkyl group.
  • a preferred embodiment of L represented by formula (Pg-i-2) is R 1p and R 2p are each independently a C 1-22 alkyl group; L 1 is a divalent C 6-10 aromatic hydrocarbon group; and L 2 is a group that is a single bond.
  • R 1p and R 2p are each independently a C 1-10 alkyl group; L 1 is a phenylene group; and L 2 is a group that is a single bond.
  • R is preferably a hydrogen atom, a C 1-6 alkyl group or a C 7-16 aralkyl group, more preferably a hydrogen atom, methyl, ethyl or It is benzyl, more preferably a hydrogen atom.
  • Y is preferably a single bond, an oxygen atom or NR, more preferably a single bond or an oxygen atom.
  • R 6p is preferably a hydrogen atom.
  • R a and R b are preferably hydrogen atoms or together form an oxo group.
  • a preferred embodiment of Z represented by formula (Pg-ii-1) is R a and R b are hydrogen atoms; R 6p is a hydrogen atom; k is an integer from 1 to 3; the k Q's are —O—; and the k R 7p 's are each independently a linear C 10-40 alkyl group, is the base.
  • R a and R b are hydrogen atoms;
  • R 6p is a hydrogen atom;
  • k is an integer from 1 to 3;
  • k Q are —O—;
  • k R 7p are each independently a benzyl group to which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are bonded via —O— , or a cyclohexylmethyl group in which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are linked via —O—, is the base.
  • R a is a hydrogen atom
  • R 6p is a hydrogen atom
  • k is an integer from 1 to 3
  • k R 7p are each independently a linear C 10-40 alkyl group
  • R b is of formula (Pg-iii) (formula in which * is a binding position, j is an integer of 0 to 3, j Qs are -O-, and j R 9p are each independently a linear C 10- 40 is an alkyl group
  • R 8p is a hydrogen atom. is the base.
  • R a is a hydrogen atom
  • k is an integer from 1 to 3
  • k R 7p are each independently a linear C 10-40 alkyl group
  • R b is of formula (Pg-iii) (formula in which * is a binding position, j is an integer of 0 to 3, j Qs are -O-, and j R 9p are each independently a linear C 10- 40 alkyl group, and R 8p represents a single bond or -O- together with R 6p to form a condensed ring with ring A' and ring C'.)
  • R 8p represents a single bond or -O- together with R 6p to form a condensed ring with ring A' and ring C'.
  • Z represented by formula (Pg-ii-1) is R a and R b together form an oxo group; R 6p is a hydrogen atom; k is an integer from 1 to 3; the k Q's are —O—; and the k R 7p 's are each independently a linear C 10-40 alkyl group, is the base.
  • Z represented by formula (Pg-ii-1) is R a and R b together form an oxo group;
  • R 6p is a hydrogen atom;
  • k is an integer from 1 to 3;
  • k number of Q is -O-;
  • k R 7p are each independently a benzyl group in which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are bonded via —O—, or 1 to 3 linear C 10 -40 alkyl group is a cyclohexylmethyl group bonded via -O-, is the base.
  • a preferred embodiment of Z represented by formula (Pg-ii-2) is R 6p is a hydrogen atom; k is an integer from 1 to 3; k Q are —O—; and k R 7p are each independently a linear C 10-40 alkyl group, 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups is a benzyl group bonded via -O-, or a cyclohexylmethyl group bonded via -O- with 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups, is the base.
  • R 6p is preferably a hydrogen atom.
  • R a and R b are preferably hydrogen atoms or together form an oxo group.
  • a preferred embodiment of Z represented by formula (Pg-ii-3) is R a and R b are hydrogen atoms; R 6p is a hydrogen atom; k is an integer from 1 to 3; the k Q's are —O—; and the k R 7p 's are each independently a linear C 10-40 alkyl group, is the base.
  • R a and R b are hydrogen atoms;
  • R 6p is a hydrogen atom;
  • k is an integer from 1 to 3;
  • k Q are —O—;
  • k R 7p are each independently a benzyl group to which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are bonded via —O— , or a cyclohexylmethyl group in which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are linked via —O—, is the base.
  • R a is a hydrogen atom
  • R 6p is a hydrogen atom
  • k is an integer from 1 to 3
  • k R 7p are each independently a linear C 10-40 alkyl group
  • R b is of formula (Pg-iii) (formula in which * is a binding position, j is an integer of 0 to 3, j Qs are -O-, and j R 9p are each independently a linear C 10- 40 is an alkyl group
  • R 8p is a hydrogen atom. is the base.
  • R a is a hydrogen atom; k is an integer from 1 to 3; and k R 7p are each independently a linear C 10-40 alkyl group; and R b is of formula (Pg-iii) (formula in which * is a binding position, j is an integer of 0 to 3, j Qs are -O-, and j R 9p are each independently a linear C 10- 40 alkyl group, and R 8p represents a single bond or -O- together with R 6p to form a condensed ring with ring B' and ring C'). , is the base.
  • R a and R b together form an oxo group
  • R 6p is a hydrogen atom
  • k is an integer from 1 to 3
  • the k Q's are —O—
  • the k R 7p 's are each independently a linear C 10-40 alkyl group, is the base.
  • R a and R b together form an oxo group
  • R 6p is a hydrogen atom
  • k is an integer from 1 to 3
  • k number of Q is -O-
  • k R 7p are each independently a benzyl group in which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are bonded via —O—, or 1 to 3 linear C 10 -40 alkyl group is a cyclohexylmethyl group bonded via -O-, is the base.
  • a preferred embodiment of Z represented by formula (Pg-ii-4) is Ring D' is a naphthalene ring; R a and R b are hydrogen atoms; k is an integer from 1 to 3; k Q′ are —O—; and k R 7p are each independently a linear C 10-40 alkyl group, 1 to 3 linear C 10-40 alkyl the group is a benzyl group linked via -O-, or a cyclohexylmethyl group linked via -O- with 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups, is the base.
  • Z represented by formula (Pg-ii-4) is ring D' is an indole ring; R a and R b are hydrogen atoms; k is 1; Q′ is a single bond; and R 7p is a linear C 10-40 alkyl group, benzyl in which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are bonded via —O— or a cyclohexylmethyl group to which 1 to 3 linear C 10-40 alkyl groups are attached via —O—; and R 7p is a group attached to the nitrogen atom of the indole ring be.
  • a preferred embodiment of Z represented by formula (Pg-ii-5) is u is 1 or 2; and R 10p is a C 4-10 perfluoroalkyl group.
  • Z is preferably a group represented by formula (Pg-ii-1), formula (Pg-ii-2) or formula (Pg-ii-3).
  • the protecting group (Pg-5) is preferably L is a succinyl group or a group represented by formula (Pg-i-2) (wherein R 1p and R 2p are each independently C 1-10 alkyl L 1 is a divalent phenylene group, and L 2 is a single bond.), and YZ is a 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyloxy group, 3,5-bis(docosyloxy)benzyloxy group, 3,5-bis[3′,4′,5′-tris(octadecyloxy)benzyloxy]benzyloxy group, 3,4,5-tris[3′, 4′,5′-tris(octadecyloxy)benzyloxy]benzyloxy group, 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzylamino group, 2,4-bis(docosyloxy)benzylamino group, 3,5-bis (docosyloxy)benzylamino group
  • the protecting group (Pg-5) is more preferably L is a succinyl group, and YZ is a 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyloxy group, a 3,5-bis(docosyloxy)benzyloxy group, 3,5-bis[3′, 4′,5′-tris(octadecyloxy)benzyloxy]benzyloxy group, 3,4,5-tris[3′,4′,5′-tris(octadecyloxy)benzyloxy]benzyloxy group, 3,4 , 5-tris(octadecyloxy)benzylamino group, 2,4-bis(docosyloxy)benzylamino group, 3,5-bis(docosyloxy)benzylamino group, bis(4-docosyloxyphenyl)methylamino group, 4 -Methoxy-2-[3',4',5'-tris(octadecyloxy
  • the protecting group (Pg-5) is more preferably L is a succinyl group, and YZ is a 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyloxy group, a 3,4,5-tris(octadecyloxy)cyclohexylmethyloxy group, 3,5-bis (docosyloxy)cyclohexylmethyloxy group, 3,5-bis[3',4',5'-tris(octadecyloxy)cyclohexylmethyloxy]cyclohexylmethyloxy group, 3,4,5-tris[3',4' ,5′-tris(octadecyloxy)cyclohexylmethyloxy]cyclohexylmethyloxy group, 3,4,5-tris(octadecyloxy)cyclohexylmethylamino group, 2,4-bis(docosyloxy)cyclohexylmethylamino group, 3,5 -bis(docosyloxy)
  • the protecting group (Pg-5) is particularly preferably L is a succinyl group, and YZ is a 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyloxy group, a 3,4,5-tris(octadecyloxy)cyclohexylmethyloxy group or a phenyl(2,3 ,4-tris(octadecyloxy)phenyl)methylamino group, or LY is a succinyl-1,4-piperazinediyl group, and Z is 3,4,5-tris( octadecyloxy)benzoyl group.
  • the protecting group (Pg-5) is most preferably L is a succinyl group, and YZ is a 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyloxy group or a 3,4,5-tris(octadecyloxy)cyclohexylmethyloxy group or LY is a succinyl-1,4-piperazinediyl group and Z is a 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl group.
  • the protecting group (Pg-5), and the compounds used to form it, are prepared by known methods (e.g., WO2017/104836, WO2019/131719, WO2020/235658, It can be formed or manufactured by a method described in Japanese Patent Publication No. 2021/039935 or International Publication No. 2021/198883) or a method analogous thereto.
  • solid-phase support is not particularly limited as long as it is used for solid-phase synthesis of oligonucleotide synthesis in the relevant field, and examples thereof include glass beads, resin beads, and the like. mentioned.
  • the support or resin used as a solid phase carrier can be any support or resin known in the art and suitable for use in solid phase synthesis.
  • Said supports or resins include, for example, polystyrene supports (which may be further functionalized with, for example, p-methylbenzyl-hydrylamine), diatomaceous earth-encapsulated polydimethylacrylamide (pepsin K), silica, microparticles, Examples include porous glass, amphipathic polystyrene-polyethylene glycol (PEG) resin, PEG-polyamide, PEG-polyester resin, Wang-PEG resin, Rink-amide PEG resin, and the like. Said support or resin may be modified. Modified supports or resins include, for example, long chain alkylamino Controlled Pore Glass (lcaa CPG) and the like.
  • nucleoside which is a constituent unit of an oligonucleotide, means that a nucleobase is a sugar (for example, 2-deoxyribose, ribose, and a divalent organic group at the 2- and 4-position carbon atoms).
  • nucleobase is not particularly limited as long as it is used for the synthesis of nucleic acids. and purine bases such as adenyl group (adenine base) and guanyl group (guanine base).
  • optionally protected nucleobase means that, for example, an amino group, a carbonyl group, etc. in the nucleobase may be protected.
  • the optionally protected nucleobase is preferably a nucleobase the amino group of which may be protected with the aforementioned amino group-protecting group, more preferably a nucleobase having no amino group, or the aforementioned amino group. It is a nucleobase having an amino group protected with a group-protecting group.
  • carbonyl groups such as phenol, 2,5-dichlorophenol, 3-chlorophenol, 3,5-dichlorophenol, 2-formylphenol, 2-naphthol, 4-methoxyphenol, 4-chlorophenol, 2-nitrophenol , 4-nitrophenol, 4-acetylaminophenol, pentafluorophenol, 4-pivaloyloxybenzyl alcohol, 4-nitrophenethyl alcohol, 2-(methylsulfonyl)ethanol, 2-(phenylsulfonyl)ethanol, 2-cyanoethanol , 2-(trimethylsilyl)ethanol, dimethylcarbamic acid chloride, diethylcarbamic acid chloride, ethylphenylcarbamic acid chloride, 1-pyrrolidinecarboxylic acid chloride, 4-morpholinecarboxylic acid chloride, diphenylcarbamic acid chloride, etc., to obtain a carbonyl Groups can be protected.
  • nucleobase as used herein means that a nucleobase is a substituent (e.g., a halogen atom, an alkyl group, an aralkyl group, an alkoxy group, an acyl group, an alkoxyalkyl group, a hydroxyl group, an amino group, a monoalkylamino, a dialkylamino , carboxy, cyano, nitro, etc.) substituted modified nucleobases (e.g., 8-bromoadenyl, 8-bromoguanyl, 5-bromocytosyl, 5-iodocytosyl, 5-bromouracil, 5-iodo uracil group, 5-fluorouracil group, 5-methylcytosyl group, 8-oxoguanyl group, hypoxanthinyl group, etc.) are also included.
  • a substituent e.g., a halogen atom, an alkyl group, an aralkyl
  • “Sugar” in the present specification also includes amino sugar in which the hydroxyl group is replaced by an amino group, and ribose in which the 2-position hydroxyl group is replaced by a halogen atom.
  • amino sugars include, for example, 2-deoxyribose in which the 3-position hydroxyl group is replaced by an amino group, ribose in which the 3-position hydroxyl group is replaced by an amino group, and 3-position hydroxyl group is replaced by an amino group and the 2-position hydroxyl group is replaced by an amino group.
  • amino sugars include, for example, 2-deoxyribose in which the 3-position hydroxyl group is replaced by an amino group, ribose in which the 3-position hydroxyl group is replaced by an amino group, and 3-position hydroxyl group is replaced by an amino group and the 2-position hydroxyl group is replaced by an amino group.
  • examples thereof include ribose substituted with halogen (in the following formula, Xs represents a halogen atom).
  • 2-deoxyribose or ribose in which the 2- and 4-position carbon atoms are bonded by a divalent organic group 2-deoxyribose or ribose in which the 3- and 5-position carbon atoms are bonded by a divalent organic group
  • Examples of ribose, or 2-deoxyribose or ribose in which the 3- and 4-position carbon atoms are bonded by a divalent organic group include the following compounds.
  • R represents a hydrogen atom, an optionally substituted hydrocarbon group, an optionally substituted hydroxyl group, or an optionally substituted amino group
  • R′ represents a hydrogen atom or a hydroxyl group
  • the hydroxyl group ( -OH ) in the phosphate group is replaced with a group (e.g., a protected phosphorus acid group) are also included in the "phosphate group".
  • phosphite ester bond refers to a bond represented by the following formula (P1-1), or represented by the following formula (P1-2) in which the oxygen atom in the bond is replaced with NH. (In the formula below, * indicates the bonding position).
  • phosphonate ester bond refers to a bond represented by the following formula (P2-1), or represented by the following formula (P2-2) in which the oxygen atom in the bond is replaced with NH. represents a bond (in the following formula, * indicates a bond position).
  • phosphate ester bond refers to a bond represented by the following formula (P3-1), or represented by the following formula (P3-2) in which the oxygen atom in the bond is replaced with NH. represents a bond (in the following formula, * indicates a bond position).
  • thiophosphate bond refers to a bond represented by the following formula (P4-1), or represented by the following formula (P4-2) in which the oxygen atom in the bond is replaced with NH. represents a bond (in the following formula, * indicates a bond position).
  • nucleotide means a compound in which a phosphate group is bound to a nucleoside.
  • the description of the phosphate group is as described above.
  • oligonucleotide means a compound in which one or more nucleotides are linked to a nucleoside.
  • the "oligonucleotide” includes not only oligonucleotides having a phosphate ester bond represented by the formula (P3-1), but also oligonucleotides having a phosphate ester bond represented by the formula (P3-2). Nucleotides, oligonucleosides having a thiophosphate ester bond represented by the above formula (P4-1), and oligonucleosides having a thiophosphate ester bond represented by the above formula (P4-2) are also included.
  • the number of nucleosides in the oligonucleotide in the present invention is not particularly limited, it is preferably 2-50, more preferably 2-30.
  • phosphoramidite refers to a phosphite diester monoamide (P(OR) 2 (NR 2 ), and each of the four R's independently represents an optionally substituted alkyl group. , said NR 2 may be combined with each other to form a cyclic amino group).
  • phosphoramidated nucleoside refers to a group represented by —X n —P(OR)(NR 2 ) in a nucleoside (wherein X n represents an oxygen atom or NH , the three Rs each independently represent an optionally substituted alkyl group, and the NR 2 may combine with each other to form a cyclic amino group).
  • X n represents an oxygen atom or NH
  • the three Rs each independently represent an optionally substituted alkyl group, and the NR 2 may combine with each other to form a cyclic amino group.
  • the term “phosphoramidated nucleotide” refers to a group represented by —X n —P (OR) (NR 2 ) in a nucleotide (wherein X n represents an oxygen atom or NH , the three Rs each independently represent an optionally substituted alkyl group, and the NR 2 may combine with each other to form a cyclic amino group).
  • X n represents an oxygen atom or NH
  • the three Rs each independently represent an optionally substituted alkyl group, and the NR 2 may combine with each other to form a cyclic amino group.
  • X n represents an oxygen atom or NH
  • the three Rs each independently represent an optionally substituted alkyl group
  • the NR 2 may combine with each other to form a cyclic amino group.
  • phosphoramidated oligonucleotide refers to a group represented by —X n —P(OR)(NR 2 ) in an oligonucleotide (wherein X n is an oxygen atom or NH , and each of the three Rs independently represents an optionally substituted alkyl group, and the NR 2 is two Rs that are bonded to each other to form a cyclic amino group).
  • X n is an oxygen atom or NH
  • each of the three Rs independently represents an optionally substituted alkyl group
  • the NR 2 is two Rs that are bonded to each other to form a cyclic amino group
  • oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond means a precursor in which the phosphate ester bond in the oligonucleotide is replaced with a phosphite ester bond. Oligonucleotides with phosphate ester linkages can be produced by oxidizing this precursor.
  • Oligonucleotide precursors with phosphite ester linkages are preferably phosphorous acid, obtained by condensation of (1) nucleosides, nucleotides or oligonucleotides with phosphoramidized nucleosides, nucleotides or oligonucleotides or (2) an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensing an oligonucleotide with a phosphoramidite.
  • Oligonucleotide precursors with phosphite ester linkages are more preferably obtained by condensation of nucleosides, nucleotides or oligonucleotides with phosphoramidated nucleosides, nucleotides or oligonucleotides, phosphite ester linkages is an oligonucleotide precursor having
  • Oligonucleotide precursors having a phosphite ester bond are more preferably protected with a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) having a hydrophobic protecting group and a temporary protecting group in which the hydroxyl group is removable under acidic conditions.
  • nucleosides, nucleotides or oligonucleotide precursors with phosphite ester linkages obtained by condensation with nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (b) which are polymorphic and phosphoramidized.
  • the condensation includes condensation in which the oligonucleotide chain is extended in the direction from the 3′ end to the 5′ end (hereinafter referred to as “3′-5′ condensation”) and oligonucleotide chain extension in the direction from the 5′ end to the 3′ end.
  • Any condensation hereinafter referred to as “5′-3′ condensation” that extends the nucleotide chain may be used.
  • Preferred nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (a) and phosphoramidized nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (b) in each of 3′-5′ condensation and 5′-3′ condensation are described below in order. do.
  • nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) is, for example, the formula (a-I):
  • r represents an integer of 0 or more; r + 1 Base 1 each independently represents a nucleobase that may be protected; r+1 X n1 each independently represent an oxygen atom or NH; r+1 X n2 each independently represents a hydrogen atom, a halogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a divalent organic group that binds to the 2- and 4-position carbon atoms; r R 10 each independently represents an oxygen atom or a sulfur atom; r R p1 each independently represents a phosphate-protecting group; Pg is **L-Y-Z (wherein ** represents the bonding position with X n1 ), **L-Y-Sp (wherein ** represents the bonding position with X n1 , and Sp indicates a solid phase support) or a solid phase support; is. ] and compounds represented by (ie, nucleosides or oligonucleotides).
  • compound (aI) is a nucleoside, and when r is 1 or more, compound (aI) is an oligonucleotide.
  • r is preferably 49 or less, more preferably 29 or less, still more preferably 19 or less, particularly preferably 4 or less, and most preferably 2 or less.
  • the amino group of Base 1 which is a nucleobase, is preferably protected with a protecting group.
  • the amino group-protecting group include the aforementioned amino group-protecting groups, and the amino group-protecting group of Base 1 is preferably an acetyl group, a phenoxyacetyl group, a 4-isopropylphenoxyacetyl group, a benzoyl group, isobutyryl group, (2-hexyl)decanoyl group, dimethylformamidinyl group, and ⁇ NC(R 11 )—N(R 12 )(R 13 ) (wherein R 11 represents a methyl group; , R 12 and R 13 each independently represent a C 1-6 alkyl group, or R 11 and R 12 together represent a 5- or 6-membered nitrogen-containing group together with the carbon and nitrogen atoms to which they are attached. may form a heterocyclic ring).
  • compound (aI) has a plurality of amino groups, the number of amino-protecting
  • the halogen atom of Xn2 is preferably a fluorine atom or a chlorine atom, more preferably a fluorine atom.
  • the optionally protected hydroxyl-protecting group of X n2 includes, for example, the hydroxyl-protecting groups described above, preferably a methyl group, a 2-methoxyethyl group, a triethylsilyl group, a triisopropylsilyl group, or a tert -butyldimethylsilyl group, (2-cyanoethoxy)methyl group and 1-(2-cyanoethoxy)ethyl group.
  • the "divalent organic group bonded to the 2-position carbon atom and the 4-position carbon atom" of Xn2 is not particularly limited as long as it bonds to the 2-position carbon atom and the 4-position carbon atom of the nucleoside.
  • the divalent organic group include an optionally substituted C 2-7 alkylene group, —O—, —NR 33 — (R 33 represents a hydrogen atom or a C 1-6 alkyl group), -S-, -CO-, -COO-, -OCONR 34 - (R 34 represents a hydrogen atom or a C 1-6 alkyl group) and -CONR 35 - (R 35 represents a hydrogen atom or a C 1-6 alkyl group and a divalent organic group composed of an optionally substituted C 1-7 alkylene group, and the like.
  • the “divalent organic group bonded to the 2-position carbon atom and the 4-position carbon atom” includes an optionally substituted C 2-7 alkylene group, —OR i — (R i is bonded to the 4-position carbon atom a C 1-6 alkylene group), -O-NR 33 -R j - (R j represents a C 1-6 alkylene group bonded to the 4-position carbon atom, and R 33 has the same meaning as defined above), - OR k -OR l - (R k represents a C 1-6 alkylene group and R l represents a C 1-6 alkylene group that bonds and bridges with the 4-position carbon atom) is preferred, and -OR i - (R i has the same meaning as above), —O—NR 33 —R j — (R j and R 33 have the same meaning as above), —OR k —OR l — (R k and R l has the same meaning as above) is more preferred.
  • the “divalent organic group bonded to the 2- and 4-position carbon atoms” includes —O—CH 2 —, —O—CH 2 —CH 2 —, —O—NR 33 —CH 2 —(R 33 has the same meaning as above), -O-CH 2 -O-CH 2 - is more preferred, -O-CH 2 -, -O-CH 2 -CH 2 -, -O-NH-CH 2 -, —O—N(CH 3 )—CH 2 — and —O—CH 2 —O—CH 2 — (each of which the left side binds to the 2-position carbon atom and the right side binds to the 4-position carbon atom) are further preferable.
  • Each of r+1 X n2 is independently preferably a hydrogen atom, a halogen atom, or an optionally protected hydroxyl group, more preferably a hydrogen atom, a fluorine atom, or an optionally protected hydroxyl group.
  • Examples of the r number of R p1 include the aforementioned phosphoric acid group-protecting group, preferably a 2-cyanoethyl group.
  • compound (aI) is a nucleoside or oligonucleotide supported on a solid support.
  • Pg is preferably **LYZ (in the formula, ** indicates the binding position with Xn1 ) or a solid phase carrier, more preferably **LYZ.
  • the definitions and explanations of L, Y and Z are the same as the definitions and explanations of L, Y and Z for protecting group (Pg-5) above.
  • the phosphoroamidated nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) is, for example, the formula (bI):
  • s represents an integer of 0 or more; s + 1 Base 2 each independently represents a nucleic acid base that may be protected; s+1 X n3 each independently represent an oxygen atom or NH; s+1 X n4 each independently represents a hydrogen atom, a halogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a divalent organic group that binds to the 2- and 4-position carbon atoms; Q′′ represents a temporary protecting group removable under acidic conditions for the hydroxyl group; s R 14 each independently represents an oxygen atom or a sulfur atom; s+1 R p2 each independently represent a phosphate-protecting group; and R 15 and R 16 each independently represent an alkyl group or form together with an adjacent nitrogen atom It represents a 5- or 6-membered saturated cyclic amino group, and such a saturated cyclic amino group may have one oxygen atom or one sulfur atom as a ring-constituting atom in addition to the nitrogen atom.
  • Base 2 each independently represents
  • compound (bI) When s is 0, compound (bI) is a phosphoramidated nucleoside, and when s is 1 or more, compound (bI) is a phosphoramidite oligonucleotide. be.
  • s is preferably 49 or less, more preferably 29 or less, still more preferably 19 or less, particularly preferably 4 or less, and most preferably 2 or less.
  • the amino group of Base 2 which is a nucleobase, is preferably protected with a protecting group.
  • the protecting group the -LYZ group described above can be used in addition to the protecting group for the amino group described above.
  • compound (bI) has a plurality of
  • Xn4 in the formula (bI) is the same as the description of Xn2 in the formula (aI).
  • Each of s+1 X n4 is independently preferably a hydrogen atom, a halogen atom, or an optionally protected hydroxyl group, more preferably a hydrogen atom or an optionally protected hydroxyl group.
  • R p2 in formula (b-I) above is the same as the description of R p1 in formula (a-I) above.
  • Examples of s+1 R p2 include the aforementioned phosphate group-protecting groups, preferably a 2-cyanoethyl group.
  • R 15 and R 16 in the above formula (bI) are each independently preferably a C 1-10 alkyl group or a 5- or 6-membered saturated group formed together with adjacent nitrogen atoms. It is a cyclic amino group, more preferably a C 1-10 alkyl group, still more preferably a C 1-6 alkyl group.
  • Compound (aI) and compound (bI) can be produced by a known method (eg, the method described in International Publication No. 2017/104836) or a method analogous thereto.
  • An oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensation of compound (aI) and compound (bI) is a compound represented by the following formula (cI) (the following formula The definitions and explanations for the symbols (cI) are as described above).
  • compound (cI) is an oligonucleotide precursor supported on a solid support.
  • Pg is preferably **LYZ (in the formula, ** indicates the binding position with Xn1 ) or a solid phase carrier, more preferably **LYZ.
  • At least one of s R 14 and r R 10 is preferably a sulfur atom.
  • nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) is, for example, the formula (a-I'):
  • r represents an integer of 0 or more; r + 1 Base 1 each independently represents a nucleobase that may be protected; r X n1 each independently represents an oxygen atom or NH; r+1 X n2 each independently represents a hydrogen atom, a halogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a divalent organic group that binds to the 2- and 4-position carbon atoms; X n5 represents a hydroxyl group or an amino group; r R 10 each independently represents an oxygen atom or a sulfur atom; r R p1 each independently represents a phosphate-protecting group; Pg is **L-Y-Z (in the formula, ** indicates the bonding position with the oxygen atom), **L-Y-Sp (wherein, ** indicates the bonding position with X n1 , and Sp indicates a solid phase support) or a solid phase support; are the same. ] and compounds represented by (ie, nucleosides or oligonu).
  • Xn5 in formula (aI') is preferably a hydroxyl group.
  • the explanation of the symbols other than X n5 is the same as the explanation of the symbols in the above formula (aI).
  • Pg in the formula (aI') is **LY-Sp (wherein ** represents the binding position with X n1 and Sp represents the solid phase carrier) or a solid phase carrier
  • compound (aI') is a nucleoside or oligonucleotide supported on a solid support.
  • Pg is preferably **LYZ (in the formula, ** indicates the bonding position with an oxygen atom) or a solid phase carrier, more preferably **LYZ.
  • nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) is, for example, the formula (b-I'):
  • s represents an integer of 0 or more; s + 1 Base 2 each independently represents a nucleic acid base that may be protected; s X n3 each independently represent an oxygen atom or NH; s+1 X n4 each independently represents a hydrogen atom, a halogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a divalent organic group that binds to the 2- and 4-position carbon atoms; X n6 represents a hydroxyl group protected with a temporary protecting group removable under acidic conditions, or an amino group protected with a temporary protecting group removable under acidic conditions; s R 14 each independently represents an oxygen atom or a sulfur atom; s+1 R p2 each independently represent a phosphate protecting group; and R 15 and R 16 each independently represent an alkyl group or form together with an adjacent nitrogen atom It represents a 5- or 6-membered saturated cyclic amino group, and such a saturated cyclic amino group may have one oxygen atom or one sulfur atom as a ring
  • Xn6 is preferably a hydroxyl group protected with a temporary protecting group removable under acidic conditions.
  • the explanation of the symbols other than Xn6 is the same as the explanation of the symbols in the above formula (bI).
  • Compound (a-I') and compound (b-I') can be produced by a known method (eg, the method described in International Publication No. 2017/104836) or a method analogous thereto.
  • An oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensation of compound (a-I') and compound (b-I') has the following formula (c-I'):
  • r represents an integer of 0 or more; r + 1 Base 1 each independently represents a nucleobase that may be protected; r+1 X n1 each independently represent an oxygen atom or NH; r+1 X n2 each independently represents a hydrogen atom, a halogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a divalent organic group that binds to the 2- and 4-position carbon atoms; r R 10 each independently represents an oxygen atom or a sulfur atom; r R p1 each independently represents a phosphate-protecting group; s represents an integer of 0 or more; s + 1 Base 2 each independently represents a nucleic acid base that may be protected; s X n3 each independently represent an oxygen atom or NH; s+1 X n4 each independently represents a hydrogen atom, a halogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a divalent organic group that binds to the 2- and 4-position carbon atoms;
  • Pg in the formula (cI′) is **LY-Sp (wherein ** indicates the binding position with X n1 and Sp indicates a solid phase carrier) or a solid phase carrier
  • compound (cI') is an oligonucleotide precursor supported on a solid support.
  • Pg is preferably **LYZ (in the formula, ** indicates the bonding position with an oxygen atom) or a solid phase carrier, more preferably **LYZ.
  • At least one of r R 10 and s R 14 is preferably a sulfur atom.
  • an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensing an oligonucleotide with a phosphoramidite will be explained.
  • the precursor include formula ( ⁇ -I) or formula ( ⁇ -I′):
  • t represents an integer of 1 or more, t + 1
  • Base 1 each independently represents a nucleobase that may be protected
  • t+1 X n1 each independently represents an oxygen atom or NH
  • t+1 X n2 each independently represents a hydrogen atom, a halogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a divalent organic group that binds to the 2- and 4-position carbon atoms
  • t R 10 each independently represents an oxygen atom or a sulfur atom
  • t R p1 and R p3 each independently represent a phosphate group-protecting group
  • R p4 represents an alkyl group having a protected amino group, or a protecting group for a phosphate group
  • Pg is **L-Y-Z (in the formula, ** indicates the bonding position with X n1 or the bonding position with the oxygen atom), **L-Y-Sp (wherein ** is X n1 , and Sp indicates a solid phase support) or a
  • Pg in the formula ( ⁇ -I) or formula ( ⁇ -I′) is **LY-Sp (wherein ** represents the binding position with Xn1 , and Sp represents the solid phase carrier ) or a solid phase support, compound ( ⁇ -I) or compound ( ⁇ -I′) is an oligonucleotide precursor supported on the solid phase support.
  • Pg is preferably **LYZ (in the formula, ** indicates the bonding position with an oxygen atom) or a solid phase carrier, more preferably **LYZ.
  • t is preferably 49 or less, more preferably 29 or less, still more preferably 19 or less, particularly preferably 4 or less, and most preferably 2 or less.
  • Examples of the "phosphate group-protecting group" of R p3 and R p4 include the aforementioned phosphate group-protecting groups.
  • R p3 is preferably a 2-cyanoethyl group.
  • the "protected amino group” in the "alkyl group having a protected amino group” of R p4 includes, for example, an amino group protected by the aforementioned amino group-protecting group.
  • the “alkyl group having a protected amino group” for R p4 is preferably a C 1-6 alkyl group having a protected amino group, more preferably a 6-(trifluoroacetylamino)hexyl group.
  • R p4 is preferably a 2-cyanoethyl group or a 6-(trifluoroacetylamino)hexyl group. Descriptions of other symbols are as described above.
  • oligonucleotide precursor having a phosphonate ester bond means a precursor in which the phosphate ester bond in the oligonucleotide is replaced with a phosphonate ester bond. Oligonucleotides with phosphate ester linkages can be produced by oxidizing this precursor.
  • Oligonucleotide precursors with phosphonate ester linkages are preferably nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (a) with hydrophobic protecting groups and H - oligonucleotide precursors with phosphonate ester linkages obtained by condensation with phosphonates (B).
  • the H-phosphonate (B) may be used in the form of a salt such as triethylamine salt.
  • the condensation may be either 3'-5' condensation or 5'-3' condensation.
  • Preferred nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (a) and H-phosphonates (B) for 3'-5' condensation and 5'-3' condensation, respectively, are described in order.
  • nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) is preferably compound (aI) as described above.
  • the H-phosphonate (B) includes, for example, compounds represented by the following formula (BI) (definition and explanation of symbols in the following formula (BI) are , the same as the definition and explanation of the symbols in the formula (bI).).
  • Compound (BI) can be produced by a known method (eg, the method described in Acta Biochimica Polonica. 1998, 45, 907-915.) or a method analogous thereto.
  • the oligonucleotide precursor having a phosphonate ester bond obtained by condensation of the compound (aI) and the compound (BI) is a compound represented by the following formula (C-I) (the following formula (C -I) is the same as the definition and explanation of the symbols in formula (cI) above).
  • compound (C-I) is an oligonucleotide precursor supported on a solid support.
  • Pg is preferably **LYZ (in the formula, ** indicates the binding position with Xn1 ) or a solid phase carrier, more preferably **LYZ.
  • At least one of s R 14 and r R 10 is preferably a sulfur atom.
  • nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) is preferably the aforementioned compound (a-I').
  • the H-phosphonate (B) includes, for example, compounds represented by the following formula (BI′) (definition and explanation of the symbols of the following formula (BI′) are , the same as the definitions and explanations of the symbols in the above formula (bI′)).
  • Compound (BI') is produced by a known method (for example, the method described in Phosphorus Chemistry II. Topics in Current Chemistry, vol 361. Springer, Cham. Recent Advances in H-Phosphonate Chemistry) or a method analogous thereto. be able to.
  • An oligonucleotide precursor having a phosphonate ester bond obtained by condensation of compound (aI') and compound (BI') is a compound represented by the following formula (CI') (
  • the definitions and explanations of the symbols in the formula (C-I') are the same as the definitions and explanations of the symbols in the formula (c-I').).
  • Pg in the formula (C-I') is **LY-Sp (wherein ** represents the binding position with Xn1 and Sp represents a solid phase carrier) or a solid phase carrier
  • compound (CI) is an oligonucleotide precursor supported on a solid support.
  • Pg is preferably **LYZ (in the formula, ** indicates the bonding position with an oxygen atom) or a solid phase carrier, more preferably **LYZ.
  • At least one of r R 10 and s R 14 is preferably a sulfur atom.
  • one-pot synthesis refers to a synthesis consisting of multiple steps, including a step of synthesizing an intermediate and a step of synthesizing the desired final product, wherein the synthesis does not isolate said intermediate. means.
  • the "step of synthesizing an intermediate” may be one or two or more.
  • a compound represented by (excluding 2,2-dipyridyl disulfide) to oxidize an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond or a phosphonate ester bond to obtain an oligo having a phosphate ester bond It is characterized by producing nucleotides.
  • Compound (I) may be used alone or in combination of two or more.
  • Oxidizing Agent Compound (I) (excluding 2,2-dipyridyl disulfide), which is an oxidizing agent used in the production method of the present invention, will be described below.
  • R 1 in the formula (I) is a halogen atom
  • R 2 in the formula (I) is an optionally substituted aryl group or a substituted is a good heteroaryl group.
  • R 1 in the formula (I) is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or a substituted is an optionally substituted heteroaryl group
  • R 2 in the above formula (I) is an optionally substituted aryl group or an optionally substituted heteroaryl group.
  • R 1 and R 2 in the above formula (I) form an optionally substituted heterocyclic ring together with the sulfur atom and oxygen atom to which they are attached.
  • R 1 in formula (I) is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group; ), together with the sulfur atom and nitrogen atom to which they are attached, form an optionally substituted heterocyclic ring, or ( 2 ) R 1 and R 3 in the formula ( I) together with the nitrogen atom to which they are attached form an optionally substituted heterocyclic ring, and R 2 in the above formula (I) is an optionally substituted aryl group or an optionally substituted hetero It is an aryl group.
  • X 1 is —N(—R 3 )—, and R 1 is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted a heteroaryl group, and R 2 and R 3 form an optionally substituted heterocyclic ring together with the sulfur atom and nitrogen atom to which they are attached (herein referred to as "compound (IA)") described), and in the above formula (I), X 1 is a sulfur atom, and R 1 is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group, and R 2 is an optionally substituted aryl group or an optionally substituted heteroaryl group (excluding 2,2-dipyridyl disulfide) (hereinafter referred to as compounds ( IB)”) is preferred.
  • X 1 is a sulfur atom or -N(-R 3 )-, R 1 is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group;
  • R 2 is an optionally substituted aryl group or an optionally substituted heteroaryl group, and when X 1 is -N(-R 3 )-, R 2 and R 3 are preferably compounds (excluding 2,2-dipyridyl disulfide) that form an optionally substituted heterocyclic ring together with the sulfur atom and nitrogen atom to which they are attached.
  • compound (IA) and compound (IB) will be described below.
  • R 1 in formula (I) is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group, preferably an optionally substituted C 1-10 alkyl group, an optionally substituted phenyl group, an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group, or an optionally substituted 8-14 is a membered fused polycyclic heteroaryl group.
  • R 2 and R 3 in formula (I) form an optionally substituted heterocyclic ring together with the sulfur atom and nitrogen atom to which they are attached.
  • Compound (Ia) is preferably a compound represented by the following formula (Ia). Compound (Ia) may be used alone or in combination of two or more.
  • R 1a in the formula (Ia) is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group, preferably optionally substituted It is a C 1-10 alkyl group, an optionally substituted phenyl group, or an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group.
  • Ring A in the formula (Ia) is a 5- or 6-membered unsaturated heterocyclic ring.
  • n in the above formula (Ia) is an integer of 0 to 3
  • m R 2a are each independently an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron It is an withdrawing group, preferably an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, or an electron withdrawing group.
  • "m is 0" means that R2a is absent.
  • the 5- or 6-membered unsaturated heterocyclic ring for ring A is a ring represented by any one of the following formulas (r2) to (r4) [the symbols in the formulas are defined as described above. ]. Note that R 2a is omitted in the following formulas (r2) to (r4).
  • the condensed ring formed by two adjacent R 2a and ring A is preferably a bicyclic or tricyclic condensed ring, more preferably a bicyclic condensed ring.
  • Examples of the condensed ring include rings represented by any one of the following formulas (r5) to (r25).
  • the fused ring may be substituted.
  • Compound (Ia) is preferably a compound represented by the following formula (Ic).
  • R 1c in the formula (Ic) is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group, preferably optionally substituted It is a C 1-6 alkyl group, an optionally substituted phenyl group, or an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group.
  • R 1c is preferably selected from the group consisting of (1) an optionally substituted phenyl group and an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group; a C 1-6 alkyl group optionally substituted with 1 or 2 substituents, (2) a phenyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group, or (3) 5- or 6-membered optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; is a monocyclic heteroaryl group.
  • R 1c is preferably (1) a group consisting of an optionally substituted phenyl group and an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group a C 1-6 alkyl group optionally substituted with 1 or 2 substituents selected from (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; or (3) 1 to 1 selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group It is a pyridyl group optionally substituted with 4 substituents.
  • R 1c is preferably (1) a C 1-6 alkyl group optionally substituted with 1 or 2 pyridyl groups, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom and a nitro group; or (3) an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, and a nitro group. It is a pyridyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents.
  • R 1c is preferably (1) a C 1-6 alkyl group optionally substituted with 1 or 2 pyridyl groups, (2) a phenyl group optionally substituted with 1 or 2 C 1-6 alkyl groups, or (3) a pyridyl group (especially a 2-pyridyl group or a 4-pyridyl group) is.
  • R 1c is preferably (1) a C 1-6 alkyl group, (2) a phenyl group optionally substituted with 1 or 2 substituents selected from the group consisting of a C 1-6 alkyl group, a C 1-6 alkoxy group and a halogen atom, or (3) 1 C A pyridyl group substituted with a 1-6 alkyl group (eg, 4-methyl-2-pyridyl group) is.
  • p in the above formula (Ic) is 0 or 1, preferably 0;
  • p is 0 means that —CH(R 2c )— in formula (Ic) does not exist.
  • R 2c in the formula (Ic) is a hydrogen atom, an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group, preferably a hydrogen atom or a substituted may be a C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, or an electron-withdrawing group.
  • Ring C in the formula (Ic) is a 6-membered aromatic hydrocarbon ring, a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocycle, or a 10-membered bicyclic condensed aromatic heterocycle containing a nitrogen atom.
  • the ring C is preferably a 6-membered aromatic hydrocarbon ring (i.e., benzene ring) or a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocyclic ring, more preferably a benzene ring or It is a pyridine ring, more preferably a pyridine ring.
  • the ring C is preferably a benzene ring, a pyridine ring or a quinoline ring.
  • q in the formula (Ic) is an integer of 0 to 4, preferably an integer of 0 to 2, more preferably 0 or 1.
  • q is 0
  • R3c is absent.
  • each of the q R 3cs in the formula (Ic) are each independently an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group.
  • each of the q R 3cs is preferably an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, or It is an electron-withdrawing group, more preferably a halogen atom or a nitro group, still more preferably a nitro group.
  • q R 3c are each independently preferably an electron-withdrawing group, more preferably a halogen atom, a C 1-6 perfluoroalkyl group or a nitro group , more preferably a C 1-6 perfluoroalkyl group or a nitro group, particularly preferably a trifluoromethyl group.
  • Suitable compounds (Ic) include the following compounds. Each of the following compounds may be used alone or in combination of two or more.
  • R 1c is (1) optionally substituted with 1 or 2 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted phenyl group and an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group; a good C 1-6 alkyl group, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; or (3) 1 to 1 selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group
  • R 1c is (1) a C 1-6 alkyl group optionally substituted with 1 or 2 pyridyl groups, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom and a nitro group; or (3) an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, and a nitro group.
  • a pyridyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents
  • p is 0,
  • Ring C is a benzene ring or a pyridine ring
  • q is an integer from 0 to 2
  • a compound in which q R 3c are each independently a halogen atom or a nitro group (referred to herein as “compound (Ic-iii)”).
  • R 1c is (1) optionally substituted with 1 or 2 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted phenyl group and an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group; a good C 1-6 alkyl group, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; or (3) 1 to 1 selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group
  • R 1c is (1) a C 1-6 alkyl group, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom and a nitro group; or (3) an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, and a nitro group.
  • a pyridyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents
  • p is 0 or 1
  • Ring C is a benzene ring, a pyridine ring or a quinoline ring
  • q is an integer from 0 to 2
  • a compound in which q R 3c are each independently a halogen atom, a C 1-6 perfluoroalkyl group or a nitro group referred to herein as “compound (Ic-iii′)”).
  • Preferable specific examples of the compound (Ic) include compounds represented by any one of the following formulas (Ic-1) to (Ic-17).
  • compound (Ic) is preferably 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-1)), 2-isopropyl isothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-2)), 2-isopropylisothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic -3)), 2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one (compound (Ic-4)), 5-nitro-2-phenyl-1,2-benzothiazol- 3(2H)-one (compound (Ic-5)), 2-(2,6-dimethylphenyl)-5-nitro-1,2-benzothiazol-3(2H)-one (compound (Ic-6) ), 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3 (compound (Ic-6) ), 5-
  • compound (Ic) is preferably 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-1)), 2 - isopropylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-2)), 2-isopropylisothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-3)), 2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3(2H)-one (compound (Ic-4)), 5-nitro-2-phenyl-1,2-benzo Thiazol-3(2H)-one (compound (Ic-5)), 2-(2,6-dimethylphenyl)-5-nitro-1,2-benzothiazol-3(2H)-one (compound (Ic- 6)), 5-nitro-2-(2-pyridyl)-1,2-benzothiazol-3 (compound (Ic-6)), 5-nitro
  • compound (Ic) is preferably 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-1)), 2 -isopropylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-2)), 5-nitro-2-phenyl-1,2-benzothiazol-3(2H)-one ( Compound (Ic-5)), 2-phenylisothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one (Compound (Ic-10)), 2-phenylisothiazolo[5,4-b]quinoline -3(2H)-one (compound (Ic-11)), 2-phenyl-5-trifluoromethylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-12)) , 2-phenyl-2H-1,2-benzothiazin-3(4
  • compound (Ic) is preferably 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-1)), 2 - isopropylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-2)), 2-phenylisothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-10)), 2-phenylisothiazolo[5,4-b]quinolin-3(2H)-one (compound (Ic-11)), 2-phenyl-5-trifluoromethylisothiazolo[5, 4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-12)), 2-phenyl-2H-1,2-benzothiazin-3(4H)-one (compound (Ic-13)), 2- (2,6-dimethylphenyl)isothiazolo[5,4
  • compound (Ic) is most preferably 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-1)).
  • R 1 in formula (I) is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group, preferably an optionally substituted C 1-10 alkyl group, an optionally substituted phenyl group, an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group, or an optionally substituted 8-14 is a membered fused polycyclic heteroaryl group.
  • R 2 in formula (I) above is an optionally substituted aryl group or an optionally substituted heteroaryl group, preferably an optionally substituted phenyl group, substituted is an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group, or an optionally substituted 8- to 14-membered condensed polycyclic heteroaryl group.
  • Compound (Ib) is preferably a compound represented by formula (Ib) below (excluding 2,2-dipyridyl disulfide). Compound (Ib) may be used alone or in combination of two or more.
  • R 1b in the formula (Ib) is an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group, preferably optionally substituted C 1-10 alkyl group, optionally substituted phenyl group, optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group, or optionally substituted 8- to 14-membered condensed polycyclic group It is a heteroaryl group.
  • R 1b is more preferably (1) an alkyl group substituted with one carboxy group, (2) a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (4) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; solyl group, (5) optionally substituted alkyl group, optionally substituted alkoxy group and 5-(1 , 2,3-triazoly
  • R 1b is more preferably (1) an alkyl group substituted with one carboxy group, (2) a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (4) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; zolyl group, (5) optionally substituted alkyl group, optionally substituted alkoxy group and 5-(1 , 2,3-triazolyl) group, (6) a 1H-tetrazol-5-yl group optional
  • R 1b is particularly preferably (1) a C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzothiazolyl group, which may be (3) substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzimidazolyl group, which may be (4) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzoxazolyl group, which may be (5) substituted with 1 or 2 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6
  • R 1b is most preferably C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 5- (1,2,3-triazolyl) group, 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group, (pyridin-N-oxide)-2-yl group, 4-pyridyl group, or 2-pyridyl group.
  • R 1b is more preferably (1) an alkyl group substituted with one carboxy group, (2) a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (4) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; solyl group, (5) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent selected from the group consisting of
  • R 1b is more preferably (1) a C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzothiazolyl group, which may be (3) substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzimidazolyl group, which may be (4) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzoxazolyl group, which may be (5) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent selected from the group consisting of an optionally substituted
  • R 1b is particularly preferably C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 1- phenyl-1H-tetrazol-5-yl group, (pyridin-N-oxide)-2-yl group, 4-pyridyl group, or 2-pyridyl group.
  • Ring B in the formula (Ib) is a 6-membered aromatic hydrocarbon ring (i.e., benzene ring) or a 5- or 6-membered aromatic heterocyclic ring, preferably a 5- or 6-membered aromatic heterocyclic ring , more preferably a triazole ring, a tetrazole ring, a pyridine ring or a pyridine-N-oxide ring, still more preferably a tetrazole ring, a pyridine ring or a pyridine-N-oxide ring.
  • n in the formula (Ib) is an integer of 0 to 5, and each of the n R 2b is independently an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron It is an attracting group, more preferably an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, or an electron withdrawing group.
  • n is 0
  • R2b is absent.
  • n in the formula (Ib) is an integer of 2 or more, two adjacent R 2b together with ring B are an optionally substituted bicyclic condensed aromatic heterocyclic ring (preferably substituted optionally substituted benzimidazole ring, optionally substituted benzoxazole ring, or optionally substituted benzothiazole ring).
  • 2-benzothiazolyl group which may be (2) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; zolyl group, (4) optionally substituted alkyl group, optionally substituted alkoxy group and 5-(1 , 2,3-triazolyl) group, (5) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group and an optionally substituted
  • the group (r1) is more preferably (1) 1 to 4 selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group 2-benzothiazolyl group optionally substituted with one substituent, (2) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; zolyl group, (4) optionally substituted alkyl group, optionally substituted alkoxy group and 5-(1 , 2,3-triazolyl) group, (5) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent selected from the group consisting of an optionally substituted alky
  • the group (r1) is more preferably from (1) an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of (2) substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzimidazolyl group, which may be (3) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzoxazolyl group, which may be (4) substituted with 1 or 2 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group
  • the group (r1) is particularly preferably a 2-benzothiazolyl group, a 2-benzimidazolyl group, a 2-benzoxazolyl group, a 5-(1,2,3-triazolyl) group, a 1-phenyl- 1H-tetrazol-5-yl group, (pyridin-N-oxide)-2-yl group, 4-pyridyl group or 2-pyridyl group, most preferably 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2- benzoxazolyl group, 5-(1,2,3-triazolyl) group, 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group, or (pyridin-N-oxide)-2-yl group.
  • the group (r1) is preferably (1) an optionally substituted alkyl group, optionally substituted a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an alkoxy group and an electron-withdrawing group; (2) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; solyl group, (4) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group and an optionally substituted
  • the group (r1) is more preferably selected from (1) an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group
  • 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of (2) substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group
  • 2-benzimidazolyl group which may be (3) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group
  • 2-benzoxazolyl group which may be (4) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group and an optionally substituted pheny
  • the group (r1) is particularly preferably a 2-benzothiazolyl group, a 2-benzimidazolyl group, a 2-benzoxazolyl group, a 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group, a (pyridine-N -oxid)-2-yl, 4-pyridyl, or 2-pyridyl, most preferably 2-benzothiazolyl, 2-benzimidazolyl, 2-benzoxazolyl, 1-phenyl-1H-tetrazole -5-yl group or (pyridin-N-oxide)-2-yl group.
  • Suitable compounds (Ib) include the following compounds. Each of the following compounds may be used alone or in combination of two or more.
  • R 1b is (1) an alkyl group substituted with one carboxy group, (2) a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (4) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; zolyl group, (5) optionally substituted alkyl group, optionally substituted alkoxy group and 5-(1 , 2,3-triazolyl) group, (6) a 1H-t
  • R 1b is (1) an alkyl group substituted with one carboxy group, (2) a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (4) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; zolyl group, (5) optionally substituted alkyl group, optionally substituted alkoxy group and 5-(1 , 2,3-triazolyl) group, (6) a 1H-
  • R 1b is (1) a C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzothiazolyl group, which may be (3) substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzimidazolyl group, which may be (4) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzoxazolyl group, which may be (5) substituted with 1 or 2 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C
  • a 2-pyridyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents and the group (r1) is (1) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group;
  • 2-benzothiazolyl group which may be (2) substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group;
  • 2-benzimidazolyl group which may be (3) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group;
  • 2-benzoxazolyl group which may be (4) substituted with 1 or 2 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substitute
  • R 1b is a C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 5-(1,2,3-triazolyl) group , 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl, (pyridin-N-oxide)-2-yl, 4-pyridyl, or 2-pyridyl, and group (r1) is 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 5-(1,2,3-triazolyl) group, 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group, (pyridine-N-oxide)-2 -yl group, 4-pyridyl group, or 2-pyridyl group (referred to herein as “compound (Ib-iv)”).
  • R 1b is a C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 5-(1,2,3-triazolyl) group , 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl, (pyridin-N-oxide)-2-yl, 4-pyridyl, or 2-pyridyl, and group (r1) is 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 5-(1,2,3-triazolyl) group, 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group, or (pyridine-N-oxide)- It is a compound having a 2-yl group (sometimes referred to as “compound (Ib-v)” in this specification).
  • R 1b is (1) an alkyl group substituted with one carboxy group, (2) a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (3) a 2-benzimidazolyl group optionally substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , (4) 2-benzoxoxa optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron withdrawing group; zolyl group, (5) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group and an
  • R 1b is (1) a C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzothiazolyl group, which may be (3) substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzimidazolyl group, which may be (4) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group; 2-benzoxazolyl group, which may be (5) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent
  • a 2-pyridyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents, and the group (r1) is (1) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group;
  • 2-benzothiazolyl group which may be (2) substituted with 1 to 5 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group;
  • 2-benzimidazolyl group which may be (3) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group and an electron-withdrawing group;
  • 2-benzoxazolyl group which may be (4) a 1H-tetrazol-5-yl group optionally substituted with one substituent selected from the group consisting of an optionally
  • R 1b is a C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group , (pyridin-N-oxide)-2-yl group, 4-pyridyl group, or 2-pyridyl group, and group (r1) is 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group, (pyridin-N-oxide)-2-yl group, 4-pyridyl group, or 2-pyridyl group (herein referred to as “compound (Ib -iii')").
  • R 1b is a C 1-6 alkyl group substituted with one carboxy group, 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group , (pyridin-N-oxide)-2-yl group, 4-pyridyl group, or 2-pyridyl group, and group (r1) is 2-benzothiazolyl group, 2-benzimidazolyl group, 2-benzoxazolyl group, 1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl group, or (pyridin-N-oxide)-2-yl group (herein referred to as "compound (Ib-iv')" There is).
  • Preferred specific examples of the compound (Ib) include compounds represented by any of the following formulas (Ib-1) to (Ib-12) (Ph in the following formula (Ib-7) is a phenyl group; show).
  • compound (Ib) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (Compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (Compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (Compound (Ib-4)), 2, 2'-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5'-di(1,2,3-triazolyl) disulfide (compound (Ib-6)), 5,5'-dithiobis (1 -phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)), 4,4′-dipyridyl disulfide (com
  • compound (Ib) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2'-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5'-di(1,2,3-triazolyl) disulfide (compound (Ib-6)), 5,5'-dithiobis (1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)), 4,4′-dipyridyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzo
  • compound (Ib) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2′-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5′-dithiobis(1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), 2,2′-dithiobis ( pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)), 4,4′-dipyridyl disulfide (compound (Ib-9)), and 3-(2-pyridyldithio)propanoic acid (compound (Ib-1)), 2-(2-benz
  • compound (Ib) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2'-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5'-di(1,2,3-triazolyl) disulfide (compound (Ib-6)), 5,5'-dithiobis At least one selected from the group consisting of (1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)) and 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)) be.
  • compound (Ib-1) 2,2′-di
  • compound (Ib) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2′-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5′-dithiobis(1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), and 2,2′-dithiobis It is at least one selected from the group consisting of (pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)).
  • compound (Ib) is most preferably 2,2'-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)).
  • Compound (ID), compound (IE), compound (IF) and compound (IG) may be used singly or in combination of two or more.
  • Compound (ID), compound (IE), compound (IF) and compound (IG) are described in order below.
  • Compound (ID) A compound (ID) in which X 1 in the above formula (I) is a single bond will be described.
  • R 1d in the formula (Id) is preferably a chlorine atom.
  • R 2d in the formula (Id) is preferably an optionally substituted heteroaryl group, more preferably an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl with an electron-withdrawing group. group, more preferably a pyridyl group optionally substituted with a nitro group.
  • Suitable compounds (Id) include the following compounds. Each of the following compounds may be used alone or in combination of two or more.
  • R 1d is a chlorine atom
  • R 2d is a 5- or 6-membered monocyclic heteroaryl group optionally substituted with an electron-withdrawing group (this specification Described as “compound (Id-ii)” in the book).
  • a preferred specific example of the compound (Id) is 3-nitro-2-pyridinesulfenyl chloride represented by the following formula (Id-1).
  • R 1e and R 2e each independently represent an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted aryl group, or an optionally substituted heteroaryl group.
  • R 1e and R 2e in the formula (Ie) are each independently preferably an optionally substituted aryl group, more preferably an optionally substituted phenyl group.
  • a preferred specific example of compound (Ie) is (S)-phenyl benzenethiosulfonate represented by the following formula (Ie-1).
  • Ring D represents a 6-membered aromatic hydrocarbon ring or a 5- or 6-membered aromatic heterocycle
  • w represents an integer from 0 to 4
  • w R 1f each independently represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group
  • R 2f represents a hydrogen atom, an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group
  • v represents an integer of 0-3.
  • It is a compound represented by Compound (If) may be used alone or in combination of two or more.
  • Ring D in the formula (If) is preferably a 6-membered aromatic hydrocarbon ring (that is, a benzene ring).
  • w in the formula (If) is preferably an integer of 0 to 2, more preferably 0 or 1.
  • "w is 0" means that R 1f does not exist.
  • Each of w R 1f in the above formula (If) is preferably an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom or nitro is the base.
  • R 2f in the formula (If) is preferably a hydrogen atom, an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, or an electron-withdrawing group , more preferably a hydrogen atom, an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom or a nitro group.
  • v in the above formula (If) is preferably 0.
  • “v is 0” means that —CH 2 — in parentheses in the above formula (If) does not exist.
  • Suitable compounds include the following compounds. Each of the following compounds may be used alone or in combination of two or more.
  • Ring D is a benzene ring
  • w is preferably an integer of 0 to 2
  • w R 1f are each independently an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group can be
  • Ring D is a benzene ring
  • w is preferably an integer of 0 to 2
  • w R 1f are each independently an optionally substituted C 1-6 alkyl group or an optionally substituted C 1-6 alkoxy group , a halogen atom or a nitro group
  • v is an integer from 0 to 3 (referred to herein as "compound (If-ii)").
  • Ring D is a benzene ring
  • w is preferably an integer of 0 or 1
  • R 1f is an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom or a nitro group
  • a preferred specific example of the compound (If) is 3H-2,1-benzoxathiol-3-one represented by the following formula (If-1).
  • Ring E represents a 4- to 8-membered nitrogen-containing heterocyclic ring
  • x represents an integer from 0 to 6
  • x R 1g each independently represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, an oxo group, or an electron-withdrawing group
  • x is an integer of 2 or more
  • two adjacent R 1g together with ring E may form an optionally substituted bicyclic condensed nitrogen-containing heterocyclic ring
  • R 2g is , represents an optionally substituted aryl group or an optionally substituted heteroaryl group.
  • It is a compound represented by Compound (Ig) may be used alone or in combination of two or more.
  • R 2g in the formula (Ig) is preferably an optionally substituted heteroaryl group, more preferably an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic nitrogen-containing heteroaryl group, or It is an optionally substituted 8- to 14-membered condensed polycyclic nitrogen-containing heteroaryl group.
  • R 2g is more preferably (1) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group.
  • optionally substituted 2-pyridyl group or (2) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group It is a 2-benzothiazolyl group which may be substituted.
  • R 2g is particularly preferably (1) 1 to 1 selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom and a nitro group a 2-pyridyl group optionally substituted by 4 substituents, or (2) an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, and a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of a nitro group.
  • R 2g is most preferably a 2-pyridyl group or a 2-benzothiazolyl group.
  • x in the formula (Ig) is an integer of 0-6, preferably an integer of 2-6.
  • x is 0" means that R 1g is absent.
  • x R 1g in the formula (Ig) are each independently preferably optionally substituted C 1-6 alkyl group, optionally substituted C 1-6 alkoxy group, oxo group, halogen an atom, or a nitro group.
  • Ring F represents a 4- to 8-membered nitrogen-containing heterocyclic ring
  • y represents an integer of 0 to 4
  • each of y R 3g independently represents an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group
  • y is an integer of 2 or more
  • two adjacent R 3g may together with ring F form an optionally substituted bicyclic condensed nitrogen-containing heterocyclic ring.
  • y in the formula (r17′) is 0-4.
  • "y is 0" means that R3g is absent.
  • the y R 3g in the formula (r17′) are each independently preferably an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, or Two nitro groups or adjacent R 3g preferably together with ring F form an optionally substituted bicyclic fused nitrogen-containing heterocycle.
  • the bicyclic condensed nitrogen-containing heterocyclic ring preferably has 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group is an isoindole ring optionally substituted with, more preferably consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, and a nitro group It is an isoindole ring optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group.
  • Ring F is preferably a pyrrolidine ring or selected from the group consisting of optionally substituted alkyl groups, optionally substituted alkoxy groups and electron-withdrawing groups together with two adjacent R 3g forms an isoindole ring optionally substituted with 1 to 4 substituents.
  • Ring F is more preferably a pyrrolidine ring, or together with two adjacent R 3g , optionally substituted C 1-6 alkyl group, optionally substituted C 1-6 alkoxy group, halogen It forms an isoindole ring optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of atoms and nitro groups.
  • Suitable compounds (Ig') include the following compounds. Each of the following compounds may be used alone or in combination of two or more.
  • Ring F is a pyrrolidine ring
  • y is an integer from 0 to 4
  • y R 3g are each independently an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group
  • R 2g is an optionally substituted heteroaryl group
  • Ring F is a pyrrolidine ring
  • y is an integer from 0 to 4
  • y R 3g are each independently an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group
  • R 2g is an optionally substituted 5 or a compound that is a 6-membered monocyclic nitrogen-containing heteroaryl group, or an optionally substituted 8- to 14-membered condensed polycyclic nitrogen-containing heteroaryl group (herein referred to as "compound (Ig-ii -a)”).
  • Ring F In the formula (Ig'), Ring F, together with two adjacent R 3g , with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group forming an optionally substituted isoindole ring, and R 2g is an optionally substituted 5- or 6-membered monocyclic nitrogen-containing heteroaryl group, or an optionally substituted 8- to 14-membered is a condensed polycyclic nitrogen-containing heteroaryl group (referred to herein as “compound (Ig-ii-b)”).
  • Ring F is a pyrrolidine ring
  • y is an integer from 0 to 4
  • y R 3g are each independently an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group, or an electron-withdrawing group
  • a 2-pyridyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group
  • a compound that is a benzothiazolyl group referred to herein as “compound (Ig-iii-a)”).
  • Ring F together with two adjacent R 3g , with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group forming an optionally substituted isoindole ring
  • R 2g is (1) a 2-pyridyl group optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group; , or (2) optionally substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted alkyl group, an optionally substituted alkoxy group and an electron-withdrawing group
  • a compound that is a benzothiazolyl group referred to herein as “compound (Ig-iii-b)”).
  • Ring F is a pyrrolidine ring
  • y is an integer from 0 to 4
  • R 3g are each independently an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, or a nitro group
  • R 2g is (1) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom and a nitro group
  • R 2g is (1) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom and a nitro group
  • Ring F is selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, and a nitro group; forming an isoindole ring optionally substituted with 1 to 4 substituents, and R 2g is (1) substituted with 1 to 4 substituents selected from the group consisting of an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom and a nitro group; or (2) an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 1-6 alkoxy group, a halogen atom, and a nitro group
  • a compound that is a 2-benzothiazolyl group optionally substituted with 1 to 4 selected substituents referred to herein as “compound (Ig-iv-b)”.
  • Preferred specific examples of the compound (Ig) include 1-(2-pyridinylthio)-2,5-pyrrolidinedione represented by the following formula (Ig-1), 1- (2-benzothiazolylthio)-2,5-pyrrolidinedione, 2-(2-pyridinylthio)-1H-isoindole-1,3(2H)-dione represented by the following formula (Ig-3), and Examples include 2-(2-benzothiazolylthio)-1H-isoindole-1,3(2H)-dione represented by the following formula (Ig-4).
  • compound (I) is preferably compound (Ia) and/or compound (Ib).
  • compound (Ic) is preferred.
  • compound (I) is preferably compound (Ib) and/or compound (Ic), more preferably compound (Ib-i) and/or compound (Ic-i) is more preferably compound (Ib-ii) and/or compound (Ic-ii), still more preferably compound (Ib-iii) and/or compound (Ic-iii), still more preferably Compound (Ib-iv) and/or compound (Ic-iv), particularly preferably compound (Ib-v) and/or compound (Ic-iv).
  • compound (I) is preferably compound (Ib-i') and/or compound (Ic-i'), more preferably compound (Ib-ii') and/or compound (Ic-ii'), more preferably compound (Ib-iii') and/or compound (Ic-iii'), still more preferably compound (Ib-iv') and/or Compound (Ic-iv').
  • compound (I) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2'-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5'-di(1,2,3-triazolyl) disulfide (compound (Ib-6)), 5,5'-dithiobis (1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)), 4,4′-dipyridyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothi
  • compound (I) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2'-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5'-di(1,2,3-triazolyl) disulfide (compound (Ib-6)), 5,5'-dithiobis (1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)), 4,4′-dipyridyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothi
  • compound (I) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2'-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5'-di(1,2,3-triazolyl) disulfide (compound (Ib-6)), 5,5'-dithiobis (1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)), 2-phenylisothiazolo[5,4- b]
  • compound (I) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2'-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5'-di(1,2,3-triazolyl) disulfide (compound (Ib-6)), 5,5'-dithiobis (1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)), 4,4′-dipyridyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothi
  • compound (I) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothiazolyldithio) propanoic acid (compound (Ib-2)), 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)), 2,2′-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)), 2,2′-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)), 5,5′-dithiobis(1-phenyl-1H-tetrazole) (compound (Ib-7)), 2,2′-dithiobis ( pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)), 4,4′-dipyridyl disulfide (compound (Ib-9)), 3-(2-pyridyldithio)propanoic acid (compound (Ib-1)), 2-(2-benzothi
  • compound (I) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-phenylisothiazolo[5,4-b ] pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-1)), 2-isopropylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-2)), 2-phenyl isothiazolo[4,5-c]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-10)), 2-phenylisothiazolo[5,4-b]quinolin-3(2H)-one (compound (Ic -11)), 2-phenyl-5-trifluoromethylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-12)), 2-phenyl-2H-1,2- benzothiazin-3(4H)-one (compound (Ib-1)), 2-phenyl-2H
  • compound (I) is preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)), 2-phenylisothiazolo[5,4-b ] Pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-1)), 2-phenyl-5-trifluoromethylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-12 )), 2-phenyl-2H-1,2-benzothiazin-3(4H)-one (compound (Ic-13)), 2-(2,6-dimethylphenyl)isothiazolo[5,4-b]pyridine- 3(2H)-one (compound (Ic-14)), 2-(4-methyl-2-pyridinyl)isothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-15)) , 2-(4-methoxyphenyl)iso
  • compound (I) is particularly preferably 2,2′-dibenzothiazolyl disulfide (compound (Ib-1)) and/or 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridine -3(2H)-one (compound (Ic-1)), most preferably 2-phenylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-1)) be.
  • Compound (I) may be a commercially available product or may be produced by a known method.
  • compound (Ib-1) ie, 2,2'-dibenzothiazolyl disulfide, MBTS
  • MBTS 2,2'-dibenzothiazolyl disulfide
  • Compound (Ib) can be produced, for example, by oxidation and coupling of a thiol, as shown in the formula below.
  • oxidizing agents for oxidizing compound (Ib-1s) and compound (Ib-2s) include hydrogen peroxide, iodine, oxygen, N-bromosuccinimide, N-chlorosuccinimide and the like. Only one kind of oxidizing agent may be used, or two or more kinds thereof may be used in combination.
  • the amount of the oxidizing agent used is preferably 1-10 mol, more preferably 1-5 mol, per 1 mol of compound (Ib-1s) and compound (Ib-2s) in total.
  • Compound (Ib-2s) is preferably used in approximately the same amount as compound (Ib-1s).
  • This reaction is carried out in a suitable solvent that does not interfere with the reaction.
  • suitable solvent examples include ester solvents such as ethyl acetate and isopropyl acetate; polar ether solvents such as 1,4-dioxane and tetrahydrofuran; halogen solvents such as dichloromethane and chloroform; Aromatic solvents and the like can be mentioned.
  • the amount of the solvent to be used is preferably 1-20 mL, more preferably 3-10 mL, per 1 mmol of compound (Ib-1s) and compound (Ib-2s) in total.
  • the reaction temperature is preferably -10°C to 50°C, more preferably 0°C to 40°C, and the reaction time is preferably 1 to 24 hours, more preferably 1 to 10 hours.
  • compound (Ib) can be recovered by a known method (eg, extraction, etc.).
  • the recovered compound (Ib) can be purified by known means (eg, recrystallization, chromatography, etc.).
  • This step is a step of synthesizing the acid chloride of compound (Ic-1s). Specifically, compound (Ic-1s) and an excess amount of thionyl chloride (e.g., 10 mol per 1 mol of compound (Ic-1s)) are added to a reactor and refluxed for 1 hour to 1 night. An acid chloride of compound (Ic-1s) is obtained.
  • compound (Ic-1s) and an excess amount of thionyl chloride e.g. 10 mol per 1 mol of compound (Ic-1s)
  • This step is preferably performed under an inert atmosphere (for example, under an argon atmosphere).
  • an inert atmosphere for example, under an argon atmosphere.
  • This step is to synthesize compound (Ic-2s) by reacting an acid chloride of compound (Ic-1s) with an appropriate amine (R 4c —NH 2 ). Specifically, the solid containing the acid chloride of compound (Ic-1s) obtained in step A1, an appropriate amine (R 4c —NH 2 ) and a base are added to an appropriate solvent and reacted to obtain compound (Ic). -2s) is obtained.
  • the base may be either an organic base or an inorganic base, preferably triethylamine.
  • the amounts of R 4c -NH 2 and the base to be used are each preferably about 1 to 1.5 mol per 1 mol of the acid chloride of compound (Ic-1s).
  • This step is performed in an appropriate solvent that does not inhibit the reaction.
  • the solvent include polar ether solvents such as 1,4-dioxane and tetrahydrofuran (THF), with THF being preferred.
  • THF tetrahydrofuran
  • the amount of the solvent to be used is not particularly limited as long as it can dissolve the solid, but it is preferably about 5 to 10 mL per 1 mmol of the acid chloride of compound (Ic-1s).
  • This step is preferably performed at a low temperature (for example, about 0°C). Completion of the reaction can be confirmed by TLC or the like. After completion of the reaction, compound (Ic-2s) can be recovered by known means (eg concentration and extraction).
  • This step is a step of synthesizing compound (Ic-3s) by reacting compound (Ic-2s) with tert-butylthiol. Specifically, compound (Ic-3s) is obtained by reacting compound (Ic-2s) with tert-butylthiol in the presence of a base in an appropriate solvent.
  • the amount of tert-butylthiol to be used is preferably about 1 to 1.5 mol per 1 mol of compound (Ic-2s).
  • Examples of the base used in this step include alkali metal hydroxides such as sodium hydroxide and potassium hydroxide, with sodium hydroxide being preferred.
  • the amount of the base to be used is preferably about 1 to 2 mol per 1 mol of compound (Ic-3s).
  • This step is performed in an appropriate solvent that does not inhibit the reaction.
  • the solvent include amide solvents such as dimethylformamide (DMF), dimethylacetamide, and N-methylpiperidone, with DMF being preferred.
  • the amount of the solvent to be used is not particularly limited as long as it can dissolve the compound (Ic-2s), but it is preferably about 5 to 10 mL per 1 mmol of the compound (Ic-2s).
  • the reaction temperature in this step is about room temperature (eg, 25°C), and the reaction time is, for example, 1 hour to 1 night, preferably about 3 to 20 hours.
  • the compound (Ic-3s) can be recovered by known means (eg solid-liquid separation).
  • This step is a step of synthesizing compound (Ic) in which Y 1c is carbonyl by a ring closure reaction of compound (Ic-3s). This step can be carried out by two methods of steps A4-1 and A4-2 below.
  • Step A4-1 In this step, compound (Ic-3s), dimethylsulfoxide (DMSO), and chlorotrimethylsilane (TMSCl) are added to an appropriate solvent, and the resulting reaction mixture is reacted at about room temperature (eg, 25° C.). , Y 1c is a carbonyl.
  • the amount of DMSO used is preferably about 1-2 mol per 1 mol of compound (Ic-3s).
  • the amount of TMSCl to be used is preferably about 1 to 1.5 mol per 1 mol of compound (Ic-3s).
  • This step is performed in an appropriate solvent that does not inhibit the reaction.
  • the solvent include halogen-based solvents such as chloroform, dichloromethane, and 1,2-dichloroethane, with dichloromethane being preferred.
  • the amount of the solvent to be used is not particularly limited as long as the compound (Ic-3s) can be dissolved therein, but it is preferably about 2 to 5 mL per 1 mmol of the compound (Ic-3s).
  • the reaction time of this step is, for example, 1 hour to 1 night, preferably about 5 to 10 hours.
  • the compound (Ic) wherein Y1c is carbonyl can be recovered by known means (eg solid-liquid separation).
  • the recovered compound (Ic) can be purified by known means (eg, recrystallization, chromatography, etc.).
  • Step A4-2 In this step, compound (Ic-3s) and meta-chloroperbenzoic acid (mCPBA) are reacted in an appropriate solvent to obtain a sulfoxide intermediate, which is then heated to give a compound in which Y 1c is carbonyl. Synthesize (Ic).
  • the amount of mCPBA used is preferably about 1 to 1.5 mol per 1 mol of compound (Ic-3s).
  • the reaction with compound (Ic-3s) and meta-chloroperbenzoic acid (mCPBA) is carried out in an appropriate solvent that does not inhibit the reaction.
  • the solvent include halogen-based solvents such as chloroform, dichloromethane, and 1,2-dichloroethane, with dichloromethane being preferred.
  • the amount of the solvent to be used is not particularly limited as long as the compound (Ic-3s) can be dissolved therein, but it is preferably about 8 to 15 mL per 1 mmol of the compound (Ic-3s).
  • the reaction with compound (Ic-3s) and meta-chloroperbenzoic acid (mCPBA) is preferably carried out at a low temperature (eg, around 0°C).
  • the reaction time is, for example, about 30 minutes to 1 hour.
  • the sulfoxide intermediate can be recovered by known means (eg, extraction followed by concentration and recrystallization, etc.).
  • Compound (Ic) wherein Y1c is carbonyl can be synthesized by heating the recovered sulfoxide intermediate in a suitable solvent that does not inhibit the cyclization reaction.
  • suitable solvent include toluene, xylene, pyridine, and combinations thereof, with a combination of toluene and pyridine being preferred.
  • the reaction temperature is preferably 70°C to 120°C.
  • the synthesized compound (Ic) can be purified by known means (eg, recrystallization, chromatography, etc.).
  • the compound (Ic-2s) (ie, an intermediate for synthesizing compound (Ic) wherein Y1c is carbonyl) can also be produced, for example, by the steps shown below.
  • Step A2' This step is a step of synthesizing compound (Ic-2s) by reacting compound (Ic-1s) with a suitable amine (R 4c —NH 2 ) using a condensing agent.
  • Condensing agents used in this step include, for example, dicyclohexylcarbodiimide (DCC), diisopropylcarbodiimide (DIC), 1-ethyl-3-[3-(dimethylamino)propyl]carbodiimide (EDC) and its hydrochloride (EDC ⁇ HCl), (benzotriazol-1-yloxy) tripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate (PyBop), O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoro Borate (TBTU), 1-[bis(dimethylamino)methylene]-5-chloro-1H-benzotriazolium-3-oxide hexafluorophosphate (HCTU), O-benzotriazole-N,N,N',N '-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HBTU)
  • R 4c —NH 2 and the condensing agent to be used are each preferably about 1 to 5 mol per 1 mol of compound (Ic-1s).
  • a base may be used in this step.
  • the base may be either an organic base or an inorganic base, preferably triethylamine.
  • a base When a base is used, its amount is preferably about 1 to 5 mol per 1 mol of compound (Ic-1s).
  • This step is performed in an appropriate solvent that does not inhibit the reaction.
  • the solvent include polar ether solvents such as 1,4-dioxane and tetrahydrofuran (THF), with THF being preferred.
  • the amount of the solvent to be used is not particularly limited, but is preferably about 1 to 10 mL per 1 mmol of compound (Ic-1s).
  • the reaction temperature in this step is about room temperature (eg, 25°C), and the reaction time is, for example, 1 hour to 1 night, preferably about 3 to 20 hours.
  • This step is preferably performed under an inert atmosphere (for example, under an argon atmosphere). Completion of the reaction can be confirmed by TLC or the like.
  • compound (Ic-2s) can be recovered by known means (eg concentration and extraction).
  • oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond or a phosphonate ester bond (hereinafter referred to as "oligonucleotide (sometimes abbreviated as "precursor") is oxidized.
  • the amount of compound (I) relative to the total oxidizing agent used in the production method of the present invention is preferably 80 mol% or more, more preferably 90 mol% or more.
  • the oxidizing agent more preferably comprises compound (I).
  • the amount of compound (I) used is preferably 1-15 mol, more preferably 1-10 mol, and still more preferably 1-5 mol, per 1 mol of the oligonucleotide precursor.
  • the oligonucleotide precursor is preferably (1) an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensation of a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide with a phosphoramidized nucleoside, nucleotide or oligonucleotide, or (2) an oligonucleotide and an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensation with a phosphoramidite.
  • the oligonucleotide precursor of (1) for example, the compound (cI) (that is, obtained by condensation of the compound (aI) and the compound (bI), phosphorous acid an oligonucleotide precursor having an ester bond), and the compound (cI') (that is, phosphorous acid obtained by condensation of the compound (aI') and the compound (bI') oligonucleotide precursors having an ester bond).
  • the oligonucleotide precursor of (2) include the compound ( ⁇ -I) and the compound ( ⁇ -I').
  • Oligonucleotide precursors with phosphite ester linkages are more preferably obtained by condensation of nucleosides, nucleotides or oligonucleotides with phosphoramidated nucleosides, nucleotides or oligonucleotides, phosphite ester linkages is an oligonucleotide precursor having
  • the oligonucleotide precursor is more preferably a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) having a hydrophobic protecting group, a hydroxyl group protected with a temporary protecting group removable under acidic conditions, and a phosphoramidite nucleosides, nucleotides or oligonucleotide precursors with phosphite linkages obtained by condensation with oligonucleotides (b).
  • the oligonucleotide precursor is particularly preferably the compound (cI) in which Pg is **LYZ (that is, the compound (aI) in which Pg is **LYZ) and Oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond obtained by condensation with the compound (bI)), or the compound (cI') wherein Pg is **LYZ (i.e. , an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond, obtained by condensation of the compound (aI′) and the compound (bI′), wherein Pg is **LYZ. be.
  • the oligonucleotide precursor is preferably an oligonucleotide precursor having a thiophosphate ester bond in addition to a phosphite ester bond or a phosphonate ester bond.
  • an oligonucleotide precursor having a thiophosphate ester bond is oxidized with iodine, a by-product (desulfurized product) obtained by converting the thiophosphate ester bond to a phosphate ester bond is produced. According to the present invention using , the generation of this desulfurized product can be suppressed.
  • Water present in the system acts as a source of oxygen atoms and thus can promote oxidation of the oligonucleotide precursor.
  • the amount of water is preferably 0.5 to 200 mol, more preferably 1 to 100 mol, still more preferably 1 to 50 mol, per 1 mol of the oligonucleotide precursor.
  • the reaction temperature for oxidation of the oligonucleotide precursor is preferably 10 to 50° C., more preferably 15 to 40° C., and the reaction time is preferably 5 minutes to 5 hours, more preferably 30 minutes to 3 hours. be.
  • the oxidation of the oligonucleotide precursor is preferably carried out in a solution containing a non-polar solvent.
  • concentration of oligonucleotide precursors in the solution is not particularly limited as long as they are dissolved in the solvent, but is preferably 1 to 30% by weight.
  • nonpolar solvents examples include halogen solvents such as chloroform, dichloromethane, and 1,2-dichloroethane; aromatic solvents such as benzene, toluene, xylene, and mesitylene; ester solvents such as ethyl acetate and isopropyl acetate; Aliphatic solvents such as pentane, heptane, octane, nonane and cyclohexane; and non-polar ether solvents such as diethyl ether, cyclopentyl methyl ether and tert-butyl methyl ether. Only one type of nonpolar solvent may be used, or two or more types may be used in combination.
  • halogen solvents such as chloroform, dichloromethane, and 1,2-dichloroethane
  • aromatic solvents such as benzene, toluene, xylene, and mesitylene
  • ester solvents such as ethyl
  • the non-polar solvent is preferably at least one selected from the group consisting of halogen solvents, aromatic solvents, ester solvents and aliphatic solvents, more preferably halogen solvents and toluene, still more preferably It is at least one selected from the group consisting of chloroform, dichloromethane and toluene, and particularly preferably dichloromethane.
  • a solution containing a non-polar solvent may further contain an aprotic polar solvent.
  • the aprotic polar solvent include nitrile solvents such as acetonitrile and propionitrile; polar ether solvents such as tetrahydrofuran; and pyridine. Among these, nitrile solvents are preferred, and acetonitrile and pyridine are more preferred.
  • the amount of the aprotic polar solvent used is preferably 10-100 mL, more preferably 10-50 mL, per 100 mL of the non-polar solvent.
  • the production method of the present invention can also be carried out by one-pot synthesis.
  • the one-pot synthesis is In a solution containing a non-polar solvent, a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) having a hydrophobic protecting group, and a hydroxyl group protected with a temporary protecting group removable under acidic conditions, and phosphoramidated condensed with a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b), having a phosphite ester bond and a hydrophobic protecting group, and a hydroxyl group protected with a temporary protecting group removable under acidic conditions step (1) of forming an oligonucleotide precursor (c);
  • a quenching agent (i) for the phosphoramidated nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) is added to the solution after step (1) to quench the phosphoramidated nucleoside, nucleotide
  • step (3) of forming an oligonucleotide (d) protected with a temporary protecting group step (4) of adding a quenching agent (ii) for the oxidizing agent to the solution after step (3) to quench the oxidizing agent; adding an acid to the solution after step (4) to remove the temporary protecting group removable under acidic conditions of the oligonucleotide (d), resulting in an oligonucleotide having an unprotected hydroxyl group and a hydrophobic protecting group; step (5) of forming (e); If necessary, a step (6) of adding a base to the solution after step (5), and a step of adding a polar solvent to the solution containing the oligonucleotide (e) to precipitate the oligonucleotide (e).
  • the oxidizing agent is compound (I) (excluding 2,2-dipyridyl disulfide).
  • intermediates that is, the oligonucleotide precursor (c) obtained in step (1) and the oligonucleotide (d) obtained in step (3)
  • step (1) the oligonucleotide precursor (c) obtained in step (1)
  • step (3) the oligonucleotide (d) obtained in step (3)
  • Step (1) (condensation)
  • a nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) having a hydrophobic protecting group and a hydroxyl group are protected with a temporary protecting group removable under acidic conditions.
  • a group-protected oligonucleotide precursor (c) is formed.
  • the hydrophobic protecting group possessed by the nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) is the protecting group (Pg-5).
  • the description of the protecting group (Pg-5) is as described above.
  • the temporary protective group for the hydroxyl group of the phosphoramidized nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) is preferably a 4,4'-dimethoxytrityl group or a 4-mono It is a methoxytrityl group, more preferably a 4,4'-dimethoxytrityl group.
  • the combination of said nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) used in step (1) and said phosphoroamidated nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) is preferably combined with said compound (aI) A combination with the compound (bI), or a combination of the compound (aI') and the compound (bI'), more preferably Pg is **LYZ a combination of compound (aI) and said compound (bI), or said compound (aI') wherein Pg is **L-Y-Z and said compound (b-I') is a combination of
  • Step (1) is performed in a solution containing a non-polar solvent.
  • nonpolar solvents include halogen solvents such as chloroform, dichloromethane, and 1,2-dichloroethane; aromatic solvents such as benzene, toluene, xylene, and mesitylene; ester solvents such as ethyl acetate and isopropyl acetate; Aliphatic solvents such as pentane, heptane, octane, nonane and cyclohexane; and non-polar ether solvents such as diethyl ether, cyclopentyl methyl ether and tert-butyl methyl ether.
  • nonpolar solvent is preferably at least one selected from the group consisting of halogen solvents, aromatic solvents, ester solvents and aliphatic solvents, more preferably selected from the group consisting of halogen solvents and toluene. At least one, more preferably at least one selected from the group consisting of chloroform, dichloromethane and toluene, particularly preferably dichloromethane and/or toluene.
  • the steps after step (1) are similarly carried out in a solution containing a non-polar solvent.
  • a solution containing a non-polar solvent may further contain an aprotic polar solvent.
  • the aprotic polar solvent include nitrile solvents such as acetonitrile and propionitrile; polar ether solvents such as tetrahydrofuran; among these, nitrile solvents are preferred, and acetonitrile is more preferred.
  • the amount of the aprotic polar solvent used is preferably 10-100 mL, more preferably 10-50 mL, per 100 mL of the non-polar solvent.
  • the amount of the phosphoramidized nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) used is, for example, 1 to 10 mol, preferably 1 to 5 mol, per 1 mol of the nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (a) used. is.
  • the concentration of said nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (a) in solution is preferably 1-30% by weight.
  • the reaction temperature in step (1) is not particularly limited as long as the condensation proceeds, but is, for example, 0 to 100°C, preferably 20 to 50°C.
  • the reaction time varies depending on the type of raw materials used, the reaction temperature, etc., and is, for example, 5 minutes to 24 hours.
  • a known activator may be used to promote condensation.
  • activating agents include pyridine trifluoroacetate, tetrazole, 5-ethylthio-1H-tetrazole, 5-benzylthio-1H-tetrazole, 4,5-dicyanoimidazole and the like. Only one activator may be used, or two or more may be used in combination. When an activator is used, the amount used is preferably 0.5 to 10 mol, more preferably 1 to 5 mol, per 1 mol of the phosphoramidized nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b). be.
  • Step (2) Quenching phosphoroamidated nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b))
  • a quenching agent (i) of the phosphoramidated nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) is added to the solution after step (1) to remove the phosphoramidated , nucleosides, nucleotides or oligonucleotides (b).
  • the quenching agent (i) may be used alone or in combination of two or more. Quenching agents (i) include, for example, water, alcohols, phenols and amines.
  • Alcohols that can be used as quenching agent (i) include, for example, methanol, 2-propanol, t-butanol, 2,2,2,-trifluoroethanol, tetrahydrofurfuryl alcohol, furfuryl alcohol, 2,3- optionally halogenated monohydric alcohols such as O-isopropylidene-D-ribofuranose and 3′-O-triisopropylsilyl-thymidine; and optionally halogenated polyhydric alcohols such as ethylene glycol and diethylene glycol. mentioned.
  • Phenols that can be used as the quenching agent (i) include, for example, 4-nitrophenol and pentafluorophenol.
  • Amines that can be used as quenching agents (i) include, for example, morpholine.
  • the amount of quenching agent (i) used is preferably 1 to 20 mol, more preferably 1 ⁇ 10 mol, more preferably 1-5 mol.
  • the quenching agent (i) is preferably water.
  • the subsequent oxidation in step (3) can be facilitated by using water as quenching agent (i).
  • the amount used is preferably 1 to 1 mol of the phosphoramidized nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) used in step (1). 20 mol, more preferably 2 to 15 mol, still more preferably 2 to 10 mol.
  • the temperature of the solution after addition of the quenching agent (i) is not particularly limited as long as the phosphoramidized nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) can be quenched, preferably 5 to 40° C., more preferably. is 15-30°C.
  • the stirring time of the solution after addition of quenching agent (i) varies depending on the type of quenching agent (i) used, temperature, etc., but is, for example, 10 minutes to 3 hours.
  • step (3) (oxidation)
  • compound (I) excluding 2,2-dipyridyl disulfide
  • step (3) compound (I) (excluding 2,2-dipyridyl disulfide) is used as an oxidizing agent to oxidize the phosphite ester bond of the oligonucleotide precursor (c) to form phosphoric acid. It is characterized by conversion to an ester bond.
  • step (3) an oxidizing agent (i.e., compound (I)) is added to the solution after step (2) to oxidize the oligonucleotide precursor (c), resulting in a phosphate ester bond and An oligonucleotide (d) is formed which has a hydrophobic protecting group and whose hydroxyl group is protected with a temporary protecting group that can be removed under acidic conditions. Descriptions of oxidizing agents and oxidation are provided above.
  • the oligonucleotide precursor (c) is preferably an oligonucleotide precursor having a thiophosphate ester bond in addition to a phosphite ester bond.
  • Aromatic amine is preferably added to the solution after step (3).
  • Aromatic amines may be used alone or in combination of two or more. Addition of an aromatic amine can further suppress the formation of defect bodies.
  • the addition of the aromatic amine may be after step (3) and before the addition of the quenching agent in step (4), or the quenching agent (ii) and the aromatic amine may be added simultaneously in step (4). Alternatively, quenching agent (ii) and aromatic amine may be added sequentially in step (4).
  • aromatic amines examples include aniline, 2-chloroaniline, 3-chloroaniline, 2,4-dichloroaniline, 2-fluoroaniline, 4-methoxyaniline, 4-nitroaniline, 2,6-dichloroaniline, 2 , 6-xylidine and the like.
  • Aromatic amines are preferably aniline, 2-chloroaniline, 3-chloroaniline, 2,4-dichloroaniline, 2-fluoroaniline, 4-methoxyaniline, 4-nitroaniline, 2,6-dichloroaniline, 2, At least one selected from the group consisting of 6-xylidine, more preferably 2-chloroaniline and/or 2,6-xylidine, still more preferably 2,6-xylidine (that is, 2,6-dimethylaniline ).
  • the amount of aromatic amine used is preferably 1 to 20 mol, more preferably 1 to 10 mol, and still more preferably 1 to 5 mol, per 1 mol of the oxidizing agent used in step (3). be.
  • Step (4) quenching of oxidizing agent
  • the oxidizing agent quenching agent (ii) is added to the solution after step (3) to quench the oxidizing agent.
  • the quenching agent (ii) may be used alone or in combination of two or more.
  • the quenching agent (ii) is preferably an organophosphorus compound. Only one type of organic phosphorus compound may be used, or two or more types may be used in combination.
  • the organic phosphorus compound is preferably at least one selected from the group consisting of phosphines, phosphite triesters, phosphite esters, phosphonite diesters and phosphinate esters, and more preferably phosphines.
  • phosphines phosphite triesters, phosphite esters, phosphonite diesters and phosphinate esters, and more preferably phosphines.
  • phosphines and the like may be used alone or in combination of two or more.
  • Phosphines are compounds represented by the formula: P(R) 3 (wherein the three R's each independently represent a hydrogen atom, an alkyl group or an aryl group). Phosphines include, for example, triphenylphosphine and methyldiphenylphosphine.
  • a phosphite triester is a compound represented by the formula: P(OR') 3 (wherein the three R's each independently represent an alkyl group or an aryl group).
  • Phosphite triesters include, for example, triethyl phosphite.
  • Phosphite esters have the formula: P(OR')(R) 2 (wherein the two R's each independently represent a hydrogen atom, an alkyl group or an aryl group, and R' is an alkyl group or an aryl It is a compound represented by ).
  • Phosphite esters include, for example, ethoxydiphenylphosphine and the like.
  • Phosphonite diesters have the formula: P(R)(OR') 2, where R represents a hydrogen atom, an alkyl group or an aryl group, and two R' are each independently an alkyl group or (representing an aryl group).
  • Examples of phosphonous diesters include diethoxyphenylphosphine and the like.
  • Phosphinate esters include, for example, 9,10-dihydro-9-oxa-10-phosphaphenanthrene 10-oxide represented by the following formula.
  • the quenching agent (ii) is preferably triphenylphosphine, methyldiphenylphosphine, triethyl phosphite, ethoxydiphenylphosphine, diethoxyphenylphosphine, and 9,10-dihydro-9- It is at least one selected from the group consisting of oxa-10-phosphaphenanthrene 10-oxide, more preferably triphenylphosphine and/or methyldiphenylphosphine, still more preferably triphenylphosphine.
  • the amount of the quenching agent (ii) to be used is sufficient as long as it can quench the surplus of the oxidizing agent in the step (3). It is preferably 1 to 10 mol, more preferably 1 to 5 mol, per 1 mol of phosphoramidized nucleoside, nucleotide or oligonucleotide (b) used in step (1)).
  • the temperature of the solution after addition of the quenching agent (ii) is not particularly limited as long as the oxidizing agent can be quenched, but is preferably 0°C to 50°C, more preferably 10°C to 40°C.
  • the stirring time of the solution after addition of quenching agent (ii) varies depending on the type of quenching agent (ii) used, temperature, etc., but is preferably 5 minutes to 5 hours, more preferably 5 minutes to 2 hours.
  • Step (5) (removal of temporary protecting group)
  • an acid is added to the solution after step (4) to remove temporary protecting groups removable under acidic conditions of said oligonucleotide (d), resulting in unprotected hydroxyl groups and hydrophobic
  • An oligonucleotide (e) with protecting groups is formed. Only one type of acid may be used, or two or more types may be used in combination.
  • the acid is not particularly limited as long as it can remove the temporary protecting group well, and examples thereof include trifluoroacetic acid, dichloroacetic acid, trifluoromethanesulfonic acid, trichloroacetic acid, methanesulfonic acid, hydrochloric acid, acetic acid, p-toluenesulfonic acid and the like. .
  • trifluoroacetic acid, dichloroacetic acid, trifluoromethanesulfonic acid and trichloroacetic acid are more preferred, trifluoroacetic acid, dichloroacetic acid and trifluoromethanesulfonic acid are more preferred, trifluoroacetic acid and trifluoromethane Sulfonic acids are even more preferred, and trifluoroacetic acid is particularly preferred.
  • the amount of acid used is, for example, 1 to 100 mol, preferably 1 to 40 mol, per 1 mol of oligonucleotide (d).
  • the reaction temperature in step (5) is not particularly limited as long as the reaction proceeds, but is, for example, -10°C to 50°C, more preferably 0°C to 40°C.
  • the reaction time varies depending on the oligonucleotide (d) used, the type of acid, the type of nonpolar solvent, the reaction temperature, etc., and is, for example, 5 minutes to 5 hours.
  • a cation scavenger is preferably added to the solution before, during or after removal of the temporary protecting group of oligonucleotide (d). That is, it is preferable to remove the temporary protecting group in the presence of the cation scavenger, or to add the cation scavenger to the reaction solution after removing the temporary protecting group. Only one kind of cation scavenger may be used, or two or more kinds thereof may be used in combination.
  • the cation scavenger is not particularly limited as long as the removed temporary protecting group does not reprotect or undergo a side reaction to the deprotected functional group, but pyrrole, 2-methylpyrrole, 3-methylpyrrole, 2 ,3-dimethylpyrrole, 2,4-dimethylpyrrole and other pyrrole derivatives; , 6,7-dimethylindole, 5-methoxyindole, and other indole derivatives; 2-methylfuran, 2,3-dimethylfuran, 2-methyl-3-(methylthio)furan, menthofuran, and other furan derivatives. can be done.
  • the amount of the cation scavenger to be used is preferably 1-50 mol, more preferably 5-20 mol, per 1 mol of the oligonucleotide (d).
  • Step (6) neutralization
  • the one-pot synthesis includes step (6) of adding a base to the solution after step (5) after step (5) and before step (7). ) may be further included.
  • step (7) solid-liquid separation
  • step (6) neutralization
  • organic bases include pyridine, 2,4,6-trimethylpyridine, benzimidazole, 1,2,4-triazole, N-phenylimidazole, 2-amino-4,6-dimethylpyrimidine, 1,10-phenanthroline. , imidazole, N-methylimidazole, 2-chlorobenzimidazole, 2-bromobenzimidazole, 2-methylimidazole, 2-phenylbenzimidazole, N-phenylbenzimidazole, 5-nitrobenzimidazole and the like.
  • pyridine, 2,4,6-trimethylpyridine, benzimidazole, 1,2,4-triazole, N-phenylimidazole, N-methylimidazole, 2-amino-4,6-dimethylpyrimidine, 1, 10-phenanthroline is preferred
  • pyridine, 2,4,6-trimethylpyridine, benzimidazole, 1,2,4-triazole, N-phenylimidazole are more preferred
  • pyridine, 2,4,6-trimethylpyridine, benzimidazole, 1,2,4-triazole is more preferred
  • pyridine, 2,4,6-trimethylpyridine and benzimidazole are particularly preferred.
  • the amount of base used in step (6) is preferably 1 to 10 mol, more preferably 1 to 3 mol, per 1 mol of acid used in step (5).
  • Step (7) solid-liquid separation
  • a polar solvent is added to the solution containing the oligonucleotide (e) (i.e., the solution after step (5) or, if necessary, the solution after step (6)) to obtain the oligonucleotide (e) is deposited.
  • Polar solvents used in step (7) include, for example, alcohol solvents such as methanol, ethanol and isopropanol; nitrile solvents such as acetonitrile and propionitrile; ketone solvents such as acetone and 2-butanone; polar ether solvents such as dioxane and tetrahydrofuran; amide solvents such as dimethylformamide, dimethylacetamide and N-methylpiperidone; sulfoxide solvents such as dimethylsulfoxide; A polar solvent may use only 1 type and may use 2 or more types together. Among these, nitrile solvents are preferable, and acetonitrile is more preferable.
  • the amount of the polar solvent added in the solid-liquid separation is preferably 1 to 20 mL, more preferably 5 to 20 mL, per 1 mL of the nonpolar solvent contained in the solution. , more preferably 5-10 mL.
  • a precipitation accelerator for example, 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzylpivalate
  • WO 2016/117663 a precipitation accelerator
  • the precipitated oligonucleotide (e) can be recovered by known means such as filtration.
  • the oligonucleotide chain can be extended by repeating the one-pot synthesis including steps (1) to (5) and (7) (preferably steps (1) to (7)).
  • a method for producing an oligonucleotide by repeating such one-pot synthesis is also included in the production method of the present invention.
  • the protecting group eg, phosphate group protecting group, hydrophobic protecting group
  • the resulting oligonucleotide (e) is removed by a known method.
  • the present invention provides novel compounds of the formula (In):
  • R 1n represents an optionally substituted phenyl group
  • p′ represents 0, ring C′′ represents a nitrogen atom-containing 10-membered bicyclic condensed aromatic heterocycle
  • q ' indicates 0,
  • R 1n represents an optionally substituted phenyl group
  • p′ represents 0, ring C′′ represents a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocycle
  • q′ represents 1
  • R 3n represents a C 1-6 perfluoroalkyl group
  • R 1n represents an optionally substituted phenyl group
  • p′ represents 1, ring C′′ represents a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocycle
  • q′ represents 0,
  • R 1n represents a pyridyl group substituted with one C 1-6 alkyl group
  • p′ represents 0, ring C′′ represents a 6-membered nitrogen-containing aromatic heterocyclic ring
  • q ' indicates 0.
  • a compound represented by is also provided.
  • the compound (In) is oxidized to oxidize an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond or a phosphonate ester bond (particularly, an oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond). useful as an agent. Only one compound (In) may be used, or two or more thereof may be used in combination.
  • the "optionally substituted phenyl group” of R 1n is preferably a phenyl group.
  • the “pyridyl group substituted with 1 C 1-6 alkyl group” of R 1n is preferably a pyridyl group substituted with 1 methyl group, more preferably 4-methyl-2-pyridyl is the base.
  • the "nitrogen atom-containing 10-membered bicyclic fused aromatic heterocycle" of ring C" is preferably a quinoline ring.
  • the "6-membered nitrogen-containing aromatic heterocycle” of Ring C" is preferably a pyridine ring.
  • the “C 1-6 perfluoroalkyl group” of R 3n is preferably a trifluoromethyl group.
  • Compound (In) is preferably 2-phenylisothiazolo[5,4-b]quinolin-3(2H)-one (compound (Ic-11)), 2-phenyl-5-trifluoromethylisothiazolo[5 ,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-12)), 2-phenyl-2H-1,2-benzothiazin-3(4H)-one (compound (Ic-13)), or 2-(4-methyl-2-pyridinyl)isothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (compound (Ic-15)).
  • Compound (In) can be prepared by the above-mentioned "method for producing compound (Ic) wherein Y 1c is carbonyl", synthesis examples described later, known methods (e.g., the method described in Supporting Information of Non-Patent Document 2), or It can be manufactured by the method according to.
  • oligonucleotide HO-T-SUC-TOB: deoxythymidin-3′-yl 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzylsuccinate
  • HO-T(S)T-SUC-TOB deoxythymidine-3′-[O -(2-cyanoethyl)]phosphorothionyl deoxythymidin-3′-yl-[3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyl]succinate
  • oligonucleotide precursor DMTrO-G(III)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOB: 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N 2 -isobutyryl-deoxyguanosine-3′- [O-(2-cyanoethyl)]phosphityl N 6 -[1-(dimethylamino)ethylidene]-deoxyadenosine-3′-[O-(2-cyanoethyl)]phosphorothionyl N 4 -benzoyl-deoxycytidine 3′-[ O-(2-cyanoethyl)]phosphorothionyl deoxythymidine-3'-[O-(2-cyanoethyl)]phosphorothionyl deoxythymidin-3'-yl-[3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyl]succinate DMT
  • Synthesis Example 1 Synthesis of oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond . 5.0 mmol), dehydrated dichloromethane (100 mL) and dehydrated acetonitrile (30 mL) were added to prepare a solution. dT-CE phosphoramidite (3.0 g, 4.0 mmol) and triphenylphosphine (270 mg, 1.0 mmol) were then added and the solution was stirred for 30 minutes. Subsequently 5-ethylthio-1H-tetrazole (530 mg, 4.0 mmol) was added and the solution was stirred at room temperature for 45 minutes.
  • 2,2,2-Trifluoroethanol (1.5 mL, 20 mmol) was then added to the solution and stirred at room temperature for 30 minutes, followed by 2,6-dimethylaniline (1.8 mL, 15 mmol) and POS (1.0 g). , 5.1 mmol) was added and the solution was stirred at room temperature for 1.0 hour. After that, 2,3-dimethylfuran (2.1 mL, 20 mmol), trifluoroacetic acid (5.2 mL, 68 mmol), and 2,6-dimethylaniline (83.5 ⁇ L, 0.7 ⁇ mol) were sequentially added, and the solution was brought to room temperature. and stirred for 55 minutes.
  • Example 1 Compound (Ib-1) was added to a 20 mL two-necked flask under an argon oxide atmosphere, and the solid obtained in Synthesis Example 1 (100.0 mg: DMTrO-G (III) A (S) C ( S)T(S)T-SUC-TOB (56.9 mg, 17.4 ⁇ mol), dehydrated dichloromethane (0.9 mL) and dehydrated acetonitrile (0.3 mL) were added to prepare a solution. Water (9 ⁇ L, 0.5 mmol) and compound (Ib-1) (12.1 mg, 36.4 ⁇ mol) were then sequentially added, and the solution was stirred at room temperature for 60 minutes.
  • Triphenylphosphine (4.6 mg, 18 ⁇ mol) was then added and the solution was stirred for 30 minutes. Subsequently, acetonitrile (10 mL) was added, and the precipitated solid was collected by suction filtration using a Kiriyama funnel, dried, and Piv-TOB and the pentamer oligonucleotide DMTrO-G(O)A. A mixture of (S)C(S)T(S)T-SUC-TOB was obtained (82 mg, 82% yield). In addition, the compound (Ib-1) used the commercial item. m/z: Calcd. 3277.48, Found 1639.75 [M+2H] 2+
  • Example 2 Compound (Ic-1) was added to a 20 mL two-necked flask under an argon oxide atmosphere, and the solid obtained in Synthesis Example 1 (100 mg: DMTrO-G(III)A(S)C(S)T (57 mg as (S)T-SUC-TOB, 17 ⁇ mol), dehydrated dichloromethane (0.9 mL), and dehydrated acetonitrile (0.3 mL) were added to prepare a solution. Water (9 ⁇ L, 0.5 mmol) and compound (Ic-1) (8.0 mg, 35 ⁇ mol) were then sequentially added and the solution was stirred at room temperature for 60 minutes.
  • Triphenylphosphine (4.7 mg, 18 ⁇ mol) was then added and the solution was stirred for 30 minutes. Subsequently, acetonitrile (10 mL) was added, the precipitated solid was collected by suction filtration using a Kiriyama funnel, dried, and Piv-TOB and the pentameric oligonucleotide DMTrO-G(O)A(S ) to give a mixture of C(S)T(S)T-SUC-TOB (83 mg, 83% yield).
  • the compound (Ic-1) used was synthesized by the method described in Supporting Information of Non-Patent Document 2. m/z: Calcd. 3277.48, Found 1639.75 [M+2H] 2+
  • Triphenylphosphine (4.8 mg, 18 ⁇ mol) was then added and the solution was stirred for 30 minutes. Subsequently, acetonitrile (10 mL) was added, and the precipitated solid was collected by suction filtration using a Kiriyama funnel, dried, and Piv-TOB and the pentameric oligonucleotide DMTrO-G(O)A ( A mixture of S)C(S)T(S)T-SUC-TOB was obtained (83 mg, 83% yield). m/z: Calcd. 3277.48, Found 1639.75 [M+2H] 2+
  • Example 1 The solid (10 mg) obtained in Example 1, Example 2 or Comparative Example 1 and 28% by weight aqueous ammonia (5 mL) were placed in an autoclave, heated at 65° C. for 4 hours, and then cooled to room temperature. After removing insoluble matter in the reaction solution with a syringe filter, it was concentrated under reduced pressure with a centrifugal evaporator, and the oligonucleotide DMTrO-G(O)A(S)C(S)T(S)T-OH having a thiophosphate ester bond was obtained. (hereinafter referred to as "the oligonucleotide of interest”) was obtained. m/z: Calcd. 1827.36, Found 1826.34 [MH] -
  • the resulting mixture containing the oligonucleotide of interest and the desulfurized product was analyzed by liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS).
  • LC-MS liquid chromatography-mass spectrometry
  • EIC extracted ion chromatogram
  • Percentage of desulfurized product (%) (peak area of desulfurized product/peak area of target oligonucleotide) x 100
  • the ratio (%) of the desulfurized product was calculated. Table 1 shows the results.
  • Synthesis Example 2 Synthesis of Oligonucleotide Precursor Having Phosphonate Ester Bond HO-T-SUC-TOB (500 mg, 400 ⁇ mol), dT-H-phosphonate TEA salt (568 mg, 800 ⁇ mol) in a 200 mL three-necked flask under an argon atmosphere. , anhydrous dichloromethane (10 mL), and anhydrous pyridine (10 mL) were added to form a solution. Subsequently pivaloyl chloride (0.2 mL, 1.6 mmol) was added and the solution was stirred for 1 hour.
  • Example 3 Using compound (Ic-1), the oligonucleotide precursor (171 mg, 93 ⁇ mol) obtained in Synthesis Example 2, dichloromethane (4.7 mL), and acetonitrile were placed in a 50 mL two-necked flask under an oxidized argon atmosphere. (1.4 mL) was added to prepare a solution. Subsequently, water (60 ⁇ L), compound (Ic-1) (43 mg, 189 ⁇ mol) and diazabicycloundecene (DBU) (55 ⁇ L, 372 ⁇ mol) were added and the solution was stirred at room temperature for 2 hours.
  • DBU diazabicycloundecene
  • Example 4 Using compound (Ib-1), the oligonucleotide precursor (170 mg, 93 ⁇ mol) obtained in Synthesis Example 2, dichloromethane (4.7 mL), and acetonitrile were placed in a 50 mL two-necked flask under an oxidized argon atmosphere. (1.4 mL) was added to prepare a solution. Subsequently, compound (Ib-1) (62 mg, 186 ⁇ mol) and DBU (55 ⁇ L, 372 ⁇ mol) were added and the solution was stirred at room temperature for 2 hours.
  • Non-Patent Document 1 ARKIVOC 2009 (iii) 264-273
  • H-phosphonate compound 1
  • a nucleoside compound 2
  • compound 4 a dinucleotide
  • the obtained solid (10 mg) and 28% by weight aqueous ammonia (5 mL) were placed in an autoclave, heated at 65°C for 4 hours, and then cooled to room temperature. After removing insoluble matter in the reaction solution with a syringe filter, the solution was concentrated under reduced pressure with a centrifugal evaporator, and the obtained concentrate was subjected to LC-MS analysis.
  • the obtained solid (10 mg) and 28% by weight aqueous ammonia (5 mL) were placed in an autoclave, heated at 65°C for 4 hours, and then cooled to room temperature. After removing insoluble matter in the reaction solution with a syringe filter, the solution was concentrated under reduced pressure with a centrifugal evaporator, and the obtained concentrate was subjected to LC-MS analysis.
  • oligonucleotide of interest The amount of the oligonucleotide HO-T(S)T(S)T-OH having an evaluation thiophosphate ester bond (hereinafter referred to as the "oligonucleotide of interest"), and the oligonucleotide of interest and the oxidizing agent (2 ,2′-dipyridyl disulfide or compound (Ib-1)) formed by reaction (hereinafter referred to as “by-product”) was measured as follows, and the amount of by-product was calculated.
  • Synthesis Example 3 Synthesis of 2-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-2)) In a 200 mL eggplant flask, tetrahydrofuran (100 mL), 2-mercaptopropionic acid (10 mmol), and compound ( Ib-1) (20 mmol) was added and the solution was stirred for 24 hours. After that, the solution was filtered, the solvent of the filtrate was distilled off under reduced pressure, and the resulting concentrate was purified by silica gel column chromatography to obtain the desired product (1.6 g).
  • Synthesis Example 4 Synthesis of 3-(2-benzothiazolyldithio)propanoic acid (compound (Ib-3)) Tetrahydrofuran (100 mL), 3-mercaptopropionic acid (10 mmol), and compound ( Ib-1) (20 mmol) was added to prepare a solution and the solution was stirred for 24 hours. After that, the solution was filtered, the solvent of the filtrate was distilled off under reduced pressure, and the resulting concentrate was purified by silica gel column chromatography to obtain the desired product (1.3 g).
  • Synthesis Example 5 Synthesis of 2,2'-dibenzimidazolyl disulfide (compound (Ib-4)) Dichloromethane (150 mL), 2-mercaptobenzimidazole (20 mmol), and triethylamine (22 mmol) were added to a 300 mL round-bottom flask, and then Iodine (11 mmol) was added and the solution was stirred for 3 hours. Thereafter, the solution was filtered, the solvent of the filtrate was distilled off under reduced pressure, and the resulting concentrate was recrystallized using diethyl ether and ethanol to obtain the desired product (2.5 g).
  • Synthesis Example 6 Synthesis of 2,2'-dibenzoxazolyl disulfide (compound (Ib-5)) 2-mercaptobenzoxazole (1.5 g, 10 mmol) and ethyl acetate (18 mL) were added to a 30 mL eggplant flask. , a solution was prepared. Hydrogen peroxide (33% by weight, 489 ⁇ L) was added dropwise to the solution at 0° C. over 60 minutes, then the solution was warmed to room temperature and stirred for 2.5 hours. Water (1.4 mL) was added to the solution and the mixture was stirred for 10 minutes, then the organic layer was separated and the aqueous layer was extracted twice with ethyl acetate (5 mL).
  • Synthesis Example 7 Synthesis of 2,2′-dithiobis(pyridine-N-oxide) (compound (Ib-8)) Into a 100 mL round-bottomed flask, 2-mercaptopyridine-N-oxide (3.8 g, 30 mmol) and water ( 27 mL) was added to prepare a solution. Hydrogen peroxide (33% by weight, 3.2 mL) was added dropwise to the solution at 0° C. over 60 minutes, then the solution was heated to 40° C. and stirred for 1 hour. The solution was filtered to collect a solid, which was washed with methanol and dried under reduced pressure to obtain the target product (1.2 g).
  • Synthesis Example 8 Synthesis of oligonucleotide precursor having a phosphite ester bond. Anhydrous acetonitrile (26 mL) was added to form a solution. Then molecular sieves 3A (1.7 g), triphenylphosphine (227 mg, 867 ⁇ mol), dT-CE phosphoramidite (2.6 g, 3.5 mmol) and 5-ethylthio-1H-tetrazole (452 mg, 3.47 mmol). were sequentially added, and the mixture was stirred at room temperature for 60 minutes. Trifluoroethanol (1.3 mL, 17 mmol) was added to the reaction solution and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes.
  • Examples 5-15 and Comparative Example 2 DMTrO-C(III)T(S)T-SUC-TOB (60 mg, 25 ⁇ mol), dehydrated dichloromethane (1.3 mL) and dehydrated acetonitrile in oxidation flasks using various oxidizing agents. (0.4 mL) was added to prepare a solution. After water (17 ⁇ L) was added to the solution, various oxidizing agents (38 ⁇ mol) shown in Table 3 below were added, and the mixture was stirred at room temperature for 3 hours to oxidize the trimer oligonucleotide DMTrO—C(O). T(S)T-SUC-TOB (hereinafter referred to as "oxidant”) was synthesized.
  • oxidant T(S)T-SUC-TOB
  • the oligonucleotide precursor can be oxidized more efficiently than the 2,2'-dipyridyl disulfide used in .
  • Example 16 Synthesis of DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH using compound (Ib-1) as an oxidizing agent Under an argon atmosphere, HO-T-SUC was placed in a 300 mL two-necked flask. -TOB (351 mg, 284 ⁇ mol), Piv-TOB (350 mg, 350 ⁇ mol), dehydrated dichloromethane (14 mL) and dehydrated acetonitrile (4 mL) were added to prepare a solution.
  • Triphenylphosphine (74.2 mg, 283 ⁇ mol) was then added and the solution was stirred for 30 minutes before the sequential addition of 2,3-dimethylfuran (298 ⁇ L, 2.83 mmol) and trifluoroacetic acid (563 ⁇ L, 7.35 mmol). , the solution was stirred at room temperature for 30 minutes. Further trifluoroacetic acid (86.6 ⁇ L, 1.13 mmol) was added and the solution was stirred at room temperature for 30 minutes. Pyridine (2.0 mL, 25 mmol) and water (120 ⁇ L) were then sequentially added to the solution, and the solution was stirred at room temperature for 60 minutes.
  • Piv-TOB and trimer were produced in the same manner as above, except that the solid obtained above (766 mg) and 2'-OMe-C-CE phosphoramidite were used instead of dT-CE phosphoramidite.
  • a mixture of oligonucleotides HO-Cm(O)T(O)T-SUC-TOB was obtained (875 mg, 98% yield). m/z: Calcd. 2070.17, Found 2071.19 [M+H] +
  • Example 17 Synthesis of DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH using compound (Ic-1) as an oxidizing agent Compound (Ib-1) was changed to compound (Ic-1) An aqueous solution of DMTrO--Af(O)Cm(O)T(O)T--OH was obtained in the same manner as in Example 16 except for the above. m/z: Calcd. 1498.39, Found 1497.37 [MH] -
  • Comparative Example 3 Synthesis of DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH using iodine as an oxidizing agent Under an argon atmosphere, HO-T-SUC-TOB (354 mg, 286 ⁇ mol) and Piv-TOB (351 mg, 352 ⁇ mol) were added, followed by dry dichloromethane (14 mL) and dry acetonitrile (4.2 mL) to prepare a solution. Then dT-CE phosphoramidite (406 mg, 545 ⁇ mol) and 5-ethylthio-1H-tetrazole (70.1 mg, 539 ⁇ mol) were added sequentially and the solution was stirred at room temperature for 45 minutes.
  • Piv-TOB and trimer were produced in the same manner as above, except that the solid obtained above (812 mg) and 2'-OMe-C-CE phosphoramidite were used instead of dT-CE phosphoramidite.
  • a mixture of oligonucleotides HO-Cm(O)T(O)T-SUC-TOB was obtained (893 mg, 94% yield). m/z: Calcd. 2070.17, Found 2071.19 [M+H] +
  • DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH (hereinafter "Oligonucleotide of interest")
  • DMTrO-Af(O)Cm(O)T-OH or DMTrO which is a trimer lacking the second or third residue from the oligonucleotide of interest, respectively -Af(O)T(O)T-OH (hereinafter referred to as "deficiency”) was measured by MS analysis.
  • Example 18 Synthesis of HO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOB using compound (Ic-1) as oxidant (with addition of aromatic amine) HO-T-SUC-TOB (6.4 g, 5.2 mmol), Piv-TOB (13 g, 13 mmol), dehydrated dichloromethane (349 mL) and dehydrated acetonitrile (98 mL) were added to a 3 L three-necked flask under an argon atmosphere. , a solution was prepared.
  • Triphenylphosphine 1. g, 5.2 mmol
  • 2,6-xylidine 5.5 mL, 45 mmol
  • 2,3-dimethylfuran 5.4 mL, 52 mmol
  • trifluoroacetic acid 13.8 mL, 180 mmol
  • Pyridine 43.7 mL, 541 mmol
  • water 2.5 mL
  • DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOB (3.4 mg) obtained above and 28% by weight aqueous ammonia (5 mL) were placed in an autoclave and heated at 65° C. for 4 hours. After that, it was cooled to room temperature. After removing insoluble matter in the reaction solution with a syringe filter, the solution was concentrated under reduced pressure with a centrifugal evaporator to obtain an aqueous solution of DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH. m/z: Calcd. 1498.39, Found 1497.37 [MH] -
  • Example 17 and Example 18 DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH in the aqueous solution obtained in Example 17 and Example 18 (hereinafter referred to as "oligonucleotide of interest” ), and DMTrO-Af(O)Cm(O)T-OH or DMTrO-Af(O)T(O), which are trimers lacking the second or third residue from the oligonucleotide of interest, respectively. ) T—OH (hereinafter referred to as “deleted body”) was measured by MS analysis.
  • Example 19 Synthesis of HO- MeC (O)A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOB using compound (Ib-1) as oxidant HO-T(S)T-SUC-TOB (250 mg, 88 ⁇ mol), dehydrated dichloromethane (4.4 mL) and dehydrated acetonitrile (1.3 mL) were added to the flask to prepare a solution.
  • dG-CE phosphoramidite 149 mg, 176 ⁇ mol
  • 5-ethylthio-1H-tetrazole 23 mg, 0.18 mmol
  • 2,2,2-Trifluoroethanol 38 ⁇ L, 0.53 mmol was then added to the solution and the solution was stirred at room temperature for 30 minutes. Subsequently, water (70 ⁇ L) and compound (Ib-1) (59 mg, 18 mmol) were added and the solution was stirred at room temperature for 60 minutes. After sampling a portion of the solution, 2,3-dimethylfuran (46 ⁇ L, 0.88 mmol) and trifluoroacetic acid (102 ⁇ L, 1.32 mmol) were added sequentially to the solution, and the solution was stirred at room temperature for 80 minutes.
  • Example 20 Synthesis of HO-MeC(O)A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOB using compound (Ib-1) as oxidant ( with addition of aromatic amine)
  • compound (Ib-1) as oxidant (with addition of aromatic amine)
  • 2,6-xylidine 3 mol per 1 mol of compound (Ib-1) was added as an aromatic amine.
  • SUC-TOB was obtained (121 mg).
  • Example 21 Oligonucleotides that are 20-mers (DMTrO-Um(O)Cm(O)Am(O)Am(O)Gm(S)Gm(S)Am(S)Am(S)Gm(S) Am(S)Um(S)Gm(S)Gm(S)Cm(S)Am(S)Um(S)Um(S)Cm(S)Um-OH) (SEQ ID NO: 1) Solid Phase Synthesis Oligonucleotides that are 20-mer mers of the above sequence were synthesized by solid phase synthesis by the phosphoramidite method (in the above sequence, Am represents a 2′-O-methyladenosine residue, Cm represents a 2′ -O- represents a methylcytidine residue, Gm represents a 2'-O-methylguanosine residue, Um represents a 2'-O-methyluridine residue, (O) represents the formula (P3- 1) represents a phosphate este
  • 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O-methyluridine supported at 41 ⁇ mol/g on a porous glass (CPG) solid phase carrier (manufactured by ChemGenes) (solid Amount of phase carrier: 24 mg, amount of 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O-methyluridine: 1 ⁇ mol) was placed in a column equipped with a glass filter, and an oligonucleotide synthesizer (trade name “ nS-8", manufactured by Gene Design), synthesis was carried out from the 3' side to the 5' side.
  • CPG porous glass
  • a mixed solution of 10% by weight acetic anhydride in THF and a THF solution of 1-methylimidazole and pyridine was used as a capping reagent, and a dichloromethane solution of trichloroacetic acid (TCA) was used as a detritylation reagent.
  • TCA trichloroacetic acid
  • an oxidizing agent (1) 0.01 M pyridine solution of compound (Ib-1), (2) 0.1 M pyridine solution of compound (Ic-1), or (3) 0.02 M compound (Ic- The acetonitrile solution of 1) was used.
  • Dehydrated DMF (10 mL) was added to the solid to prepare a diluted solution.
  • dehydrated DMF (2 mL) sodium hydroxide (0.48 g, 12 mmol), and tert-butyl mercaptan (1.4 mL, 12 mmol) were added to a 100 mL flask and stirred under ice-cooling to obtain After the diluent was added dropwise to the resulting mixture, the mixture was warmed to room temperature and stirred for 4 hours. Water (120 mL) was then slowly added dropwise to the mixture under an ice bath.
  • the precipitated solid was collected by filtration, ethanol (400 mL) was added, the mixture was stirred at 100° C., and then the mixture was cooled to room temperature. The solid that precipitated out of the mixture was collected by filtration and the solid obtained was dried under reduced pressure (1.7 g). Also, the filtrate was concentrated under reduced pressure, ethanol (400 mL) was added, the mixture was stirred at 100° C., water (200 mL) was added dropwise, and the mixture was cooled to room temperature. The solid that precipitated out of the mixture was collected by filtration and the resulting solid was dried under reduced pressure (0.85g). The resulting 1.7 g of solid was mixed with 0.85 g of solid, of which 2.0 g was used in the next step.
  • Synthesis Example 10 Synthesis of 2-phenyl-5-trifluoromethylisothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (Compound (Ic-12)) Into a 200 mL flask was added 2-chloro-5- (Trifluoromethyl)pyridine-3-carboxylic acid (2.5 g, 11 mmol) and thionyl chloride (37 mL) were added and the mixture was stirred at 80° C. for 4 hours. After thionyl chloride was distilled off under reduced pressure, toluene (30 mL) was added, and the resulting solution was concentrated under reduced pressure to obtain a concentrate.
  • 2-chloro-5- (Trifluoromethyl)pyridine-3-carboxylic acid 2.5 g, 11 mmol
  • thionyl chloride 37 mL
  • Dehydrated DMF (5 mL) was added to the solid to prepare a diluted solution. Further, under an argon atmosphere, dehydrated DMF (2 mL), sodium hydroxide (0.47 g, 12 mmol) and tert-butyl mercaptan (1.3 mL, 11 mmol) were added to a 100 mL flask and stirred under ice cooling to obtain After the diluent was added dropwise to the resulting mixture, the mixture was warmed to room temperature and stirred for 4 hours. After that, water (70 mL) was slowly added dropwise to the mixture under ice-cooling.
  • the precipitated solid was collected by filtration, ethanol (30 mL) was added, the mixture was stirred at 100° C., water (30 mL) was added dropwise, and the mixture was cooled to room temperature. The precipitated solid was collected by filtration, and the resulting solid was dried under reduced pressure. Ethanol (30 mL) was added to the resulting solid, the mixture was stirred at 100° C., water (30 mL) was added dropwise, and the mixture was cooled to room temperature. The precipitated solid was collected by filtration and the solid obtained was dried under reduced pressure (3.4 g).
  • Synthesis Example 11 Synthesis of 2-phenyl-2H-1,2-benzothiazin-3(4H)-one (Compound (Ic-13))
  • 2-chloropyridine-3-acetonitrile 5 .0 g, 33 mmol
  • 4 mol/L aqueous sodium hydroxide solution 75 mL
  • 6 mol/L hydrochloric acid 60 mL was slowly added dropwise under ice-cooling, and the mixture was stirred for 1 hour.
  • the precipitated solid was collected by filtration, washed with 2-propanol (40 mL) and dried under reduced pressure (5.6 g).
  • Dehydrated DMF (20 mL) was added to the concentrate to prepare a diluted solution. Also, under an argon atmosphere, dehydrated DMF (2 mL), sodium hydroxide (2.6 g, 64 mmol), and tert-butyl mercaptan (4.4 mL, 39 mmol) were added to a 300 mL flask and stirred for 10 minutes under ice-cooling. After the diluent was added dropwise to the obtained mixture, the mixture was stirred at 110° C. for 23 hours. After that, water (260 mL) was slowly added dropwise to the mixture under ice-cooling.
  • Synthesis Example 12 Synthesis of 2-(4-methyl-2-pyridinyl)isothiazolo[5,4-b]pyridin-3(2H)-one (Compound (Ic-15)) -Chloropyridine-3-carbonyl chloride (5.0 g, 28 mmol) and anhydrous THF (12 mL) were added and the mixture was stirred under ice cooling. To the resulting mixture, a solution of triethylamine (4.8 mL, 34 mmol), 2-amino-5-methylpyridine (3.7 g, 34 mmol) and anhydrous THF (28 mL) was added dropwise over 30 minutes and warmed to room temperature. and stirred for 23 hours.
  • Triethylamine 4.8 mL, 34 mmol
  • 2-amino-5-methylpyridine 3.7 g, 34 mmol
  • anhydrous THF 28 mL
  • Dehydrated DMF (20 mL) was added to the concentrate to prepare a diluted solution. Further, under an argon atmosphere, dehydrated DMF (4 mL), sodium hydroxide (1.3 g, 34 mmol), and tert-butyl mercaptan (3.6 mL, 32 mmol) were added to a 300 mL flask and stirred under ice cooling to obtain After the diluent was added dropwise to the resulting mixture, the mixture was warmed to room temperature and stirred for 5 hours. After that, water (240 mL) was slowly added dropwise to the mixture over 25 minutes under ice-cooling.
  • the precipitated solid was collected by filtration, ethanol (60 mL) was added, the mixture was stirred at 100° C., water (60 mL) was added dropwise, and the mixture was cooled under ice cooling. The precipitated solid was collected by filtration and the solid obtained was dried under reduced pressure (5.4 g).
  • Synthesis Example 13 Synthesis of Oligonucleotide Precursor Having Phosphite Ester Bond Under an argon atmosphere, HO- Me C-SUC-TOB (15.1 g, 11.2 mmol) and Piv-TOB (30.1 g) were placed in a 500 mL flask. , 30.2 mmol), dehydrated chloroform (562 mL) and dehydrated acetonitrile (169 mL) were added to prepare a solution. Molecular sieves 3A (11.2 g), dG-CE phosphoramidite (18.9 g, 22.5 mmol) and triphenylphosphine (1.5 g, 5.6 mmol) were then added and the solution was stirred for 30 minutes.
  • Examples 22-41 and Comparative Example 4 A mixture of DMTrO-G(III)A(S)G(S) Me C-SUC-TOB and Piv-TOB (100 mg: DMTrO- G(III)A(S)G(S) Me 2 C-SUC-TOB (52.8 mg, 0.018 mmol) and dry dichloromethane (0.9 mL) were added to prepare a solution. After adding pyridine (0.11 mmol) and water (8.8 ⁇ L) to the solution, various oxidizing agents (53 ⁇ mol) shown in Tables 7 to 9 below were added and stirred at room temperature for 3 hours for oxidation.
  • the oligonucleotide DMTrO-G(O)A(S)G(S) Me C-SUC-TOB was synthesized.
  • Triphenylphosphine (9.2 mg, 35 ⁇ mol) was then added and the solution was stirred at room temperature for 30 minutes. After that, acetonitrile (129 mL) was added, and the precipitated solid was collected by suction filtration using a Kiriyama funnel and then dried under reduced pressure. A mixture of S)G(S) MeC -SUC-TOB was obtained. m/z: Calcd. 3013.49, Found 3014.54 [M+H] +
  • Compounds (Ib-2) to (Ib-5) and compound (Ib-8) used were those obtained in Synthesis Examples 3 to 7 described above.
  • Compounds (Ic-11) to (Ic-13) and compound (Ic-15) used were those obtained in Synthesis Examples 9 to 12 described above.
  • Compound (Ic-1), Compound (Ic-2), Compound (Ic-5), Compound (Ic-10), Compound (Ic-14), Compound (Ic-16) and Compound (Ic-17) are The one synthesized by the method described in Supporting Information of Non-Patent Document 2 was used. Other oxidizing agents used were commercially available products.
  • sulfide Sulfurizing G(III) A(S) G(S) Me C-SUC-TOB to form DMTrO-G(S) A(S) G(S) Me C-SUC-TOB (hereinafter "sulfide" ) was synthesized to prepare a test solution containing an oxidant and a sulfide.
  • oligonucleotides by suppressing the production of the above-mentioned truncated forms or desulfurized forms compared to the case where iodine is used.
  • Oligonucleotides obtained by the production method of the present invention can be used for human or veterinary pharmaceuticals (RNA, DNA, oligonucleotide medicines, etc.), functional foods, foods for specified health uses, foods, chemical products, biological and industrial products. It can be used for various applications such as polymer materials.

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Abstract

本発明は、亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体を、酸化剤によって酸化して、リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドを製造する方法であって、前記酸化剤が、式(I)で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)である方法(式中の記号の定義は明細書に記載した通りである)を提供する。

Description

オリゴヌクレオチドの製造方法
 本発明は、オリゴヌクレオチドの製造方法に関するものである。
 オリゴヌクレオチドの製造方法として、ホスホロアミダイト法およびH-ホスホネート法が広く用いられている。酸化を行うホスホロアミダイト法では、例えば、下記式で表されるように、ホスホロアミダイト(化合物(1))とヌクレオシド(化合物(2))とを縮合して、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体(化合物(3))を合成し、次いで該オリゴヌクレオチド前駆体を酸化することによって、オリゴヌクレオチド(化合物(4))が得られる。なお、本明細書中、「式(1)で表される化合物」を「化合物(1)」と略称することがある。他の式で表される化合物、他の式で表される基等も、同様に略称することがある。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000012
[式中、DMTrは4,4’-ジメトキシトリチル基を示し、i-Prはイソプロピル基を示し、CEは2-シアノエチル基を示し、BaseおよびBase’は保護されていてもよい核酸塩基を示し、並びにRは保護基または固相担体を示す。]
 なお、ホスホロアミダイト法では、ヌクレオシドに換えてヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(例えば、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド)を縮合させてもよい。また、ホスホロアミダイト法では、オリゴヌクレオチド前駆体の酸化に換えて、オリゴヌクレオチド前駆体の硫化を行ってもよい。
 酸化を行うH-ホスホネート法では、例えば下記式で表されるように、H-ホスホネート(化合物(5))と塩化ピバロイル(PivCl)とを反応させて、活性化されたH-ホスホネート(化合物(6))を合成し、これとヌクレオシド(化合物(7))とを縮合して、ホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体(化合物(8))を合成し、次いで該オリゴヌクレオチド前駆体を酸化することによってオリゴヌクレオチド(化合物(9))が得られる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000013
[式中、DMTrは4,4’-ジメトキシトリチルを示し、N(Et)はトリエチルアミンを示し、BaseおよびBase’は保護されていてもよい核酸塩基を示し、Pivはピバロイル基を示し、並びにRは保護基または固相担体を示す。]
 なお、H-ホスホネート法では、ヌクレオシドに換えてヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(例えば、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド)を縮合させてもよい。また、H-ホスホネート法では、オリゴヌクレオチド前駆体の酸化に換えて、オリゴヌクレオチド前駆体の硫化を行ってもよい。
 前述のような代表的なホスホロアミダイト法およびH-ホスホネート法以外にも、様々なオリゴヌクレオチドの製造方法が提案されている。例えば、非特許文献1には、下記式で示されるように、多量のトリフェニルホスフィンおよび多量の2,2’-ジピリジルジスルフィドの存在下で、H-ホスホネート(化合物1)およびヌクレオシド(化合物2)を、縮合および酸化して、ジヌクレオチド(化合物4)を製造することが開示されている。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000014
[式中、DMTrは4,4’-ジメトキシトリチルを示し、Thはチミン塩基を示し、PPhはトリフェニルホスフィンを示し、およびAcはアセチル基を示す。]
 また、非特許文献2および特許文献1には、オリゴヌクレオチドの製造方法は開示されていないが、下記式で表されるように、亜リン酸トリエチル(P(OEt))によってベンゾイソチアゾロン(benzoisothiazolone)誘導体(化合物1)を還元すること(言い換えれば、ベンゾイソチアゾロン誘導体(化合物1)によって亜リン酸トリエチル(P(OEt))を酸化してリン酸トリエチル(O=P(OEt))を形成すること)が開示されている。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000015
国際公開第2017/070157号
ARKIVOC 2009 (iii) 264-273 J. Am. Chem. Soc. 2016, 138, 6715-6718
 ホスホロアミダイト法では、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体(例えば前記式(3)で表される化合物)の酸化に使用される酸化剤としてヨウ素が広く用いられている。また、H-ホスホネート法でも、ホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体(例えば前記式(8)で表される化合物)の酸化に使用される酸化剤としてヨウ素が広く用いられている。
 この点、本発明者らは、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体のための酸化剤としてヨウ素を用いると、前駆体の亜リン酸エステル結合部位が酸化剤と作用して分解することによって形成される副生成物(以下「欠損体」と記載することがある)が生成することを見出した。また、亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合に加えて、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体をヨウ素を用いて酸化すると、前記チオリン酸エステル結合がリン酸エステル結合に転化することによって形成される副生成物(以下「脱硫体」と記載することがある)が生成することを見出した。
 本発明は上記のような事情に着目してなされたものであって、その目的は、ヨウ素を使用する場合に比べて、前述の欠損体または脱硫体の生成を抑制することができるオリゴヌクレオチドの製造方法を提供することにある。
 本発明者らが鋭意検討を重ねた結果、式(I):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000016
[式中、
 Xは、単結合、硫黄原子、酸素原子、-S(=O)-または-N(-R)-を示し、
 Xが単結合である場合、Rは、ハロゲン原子を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 Xが硫黄原子または-S(=O)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 Xが酸素原子である場合、RおよびRは、それらが結合する硫黄原子および酸素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びに
 Xが-N(-R)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、並びにRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成するか、またはRおよびRは、それらが結合する窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びにRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示す。]
で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)を酸化剤として用いて亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体を酸化することによって、前述の副生成物の生成を抑制することができることを見出した。この知見に基づく本発明は、以下の通りである。
 [1] 亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体を、酸化剤によって酸化して、リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドを製造する方法であって、
 前記酸化剤が、式(I):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000017
[式中、
 Xは、単結合、硫黄原子、酸素原子、-S(=O)-または-N(-R)-を示し、
 Xが単結合である場合、Rは、ハロゲン原子を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 Xが硫黄原子または-S(=O)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 Xが酸素原子である場合、RおよびRは、それらが結合する硫黄原子および酸素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びに
 Xが-N(-R)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、並びにRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成するか、またはRおよびRは、それらが結合する窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びにRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示す。]
で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)である方法。
 [2] 前記式(I)で表される化合物が、式(Ia):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000018
[式中、
 R1aは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 環Aは、5または6員の不飽和複素環を示し、
 Y1aは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-を示し、
 mは、0~3の整数を示し、
 m個のR2aは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
 mが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2aは、環Aと共に、置換されていてもよい縮合環を形成していてもよい。]
で表される化合物、および/または式(Ib):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000019
[式中、
 R1bは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 環Bは、6員の芳香族炭化水素環、または5若しくは6員の芳香族複素環を示し、
 nは、0~5の整数を示し、
 n個のR2bは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
 nが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2bは、環Bと共に、置換されていてもよい2環式の縮合芳香族複素環を形成していてもよい。]
で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)
である、前記[1]に記載の方法。
 [3] 前記式(Ia)で表される化合物が、式(Ic):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000020
[式中、
 R1cは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 Y1cは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-を示し、
 pは、0または1を示し、
 R2cは、水素原子、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、
 環Cは、6員の芳香族炭化水素環、6員の含窒素芳香族複素環、または窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環を示し、
 qは、0~4の整数を示し、および
 q個のR3cは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示す。]
で表される化合物である、前記[2]に記載の方法。
 [4] 前記式(Ic)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オンからなる群から選ばれる少なくとも一つである、前記[3]に記載の方法。
 [5] 前記環Cが、6員の芳香族炭化水素環または6員の含窒素芳香族複素環である、前記[3]に記載の方法。
 [6] 前記式(Ic)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、および2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オンからなる群から選ばれる少なくとも一つである、前記[5]に記載の方法。
 [7] 前記式(Ib)で表される化合物における式(r1):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000021
で表される基が、
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
 (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (10)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~3個の置換基で置換されていてもよい2-イミダゾリル基
である、前記[2]~[6]のいずれか一つに記載の方法。
 [8] 前記式(Ib)で表される化合物が、2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)、4,4’-ジピリジルジスルフィド、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸、2,2’-ジチオビス(1H-イミダゾール)、および2,2’-ジチオビス(1-メチル-1H-イミダゾール)からなる群から選ばれる少なくとも一つである、前記[7]に記載の方法。
 [9] 前記酸化を水の存在下で行う、前記[1]~[8]のいずれか一つに記載の方法。
 [10] 亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体が、
(1)ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドとの縮合によって得られた亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体、または
(2)オリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイトとの縮合によって得られた亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体
である、前記[1]~[9]のいずれか一つに記載の方法。
 [11] 亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体が、亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合に加えて、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である、前記[1]~[10]のいずれか一つに記載の方法。
 [12] ワンポット合成によってオリゴヌクレオチドを製造する方法であって、
 前記ワンポット合成が、
 非極性溶媒を含む溶液中で、疎水性保護基を有するヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)と、水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されており、且つホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)とを縮合して、亜リン酸エステル結合および疎水性保護基を有し、且つ水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているオリゴヌクレオチド前駆体(c)を形成する工程(1)、
 工程(1)後の溶液に、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)のクエンチ剤(i)を添加して、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)をクエンチする工程(2)、
 工程(2)後の溶液に酸化剤を添加して、前記オリゴヌクレオチド前駆体(c)を酸化して、リン酸エステル結合および疎水性保護基を有し、且つ水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているオリゴヌクレオチド(d)を形成する工程(3)、
 工程(3)後の溶液に酸化剤のクエンチ剤(ii)を添加して、酸化剤をクエンチする工程(4)、
 工程(4)後の溶液に酸を添加して、前記オリゴヌクレオチド(d)の酸性条件下で除去可能な一時保護基を除去して、保護されていない水酸基および疎水性保護基を有するオリゴヌクレオチド(e)を形成する工程(5)、並びに
 前記オリゴヌクレオチド(e)を含む溶液に極性溶媒を添加して、前記オリゴヌクレオチド(e)を析出させる工程(7)
を含み、並びに
 前記酸化剤が、式(I):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000022
[式中、
 Xは、単結合、硫黄原子、酸素原子、-S(=O)-または-N(-R)-を示し、
 Xが単結合である場合、Rは、ハロゲン原子を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 Xが硫黄原子または-S(=O)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 Xが酸素原子である場合、RおよびRは、それらが結合する硫黄原子および酸素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びに
 Xが-N(-R)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、並びにRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成するか、またはRおよびRは、それらが結合する窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びにRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示す。]
で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)である方法。
 [13] 前記式(I)で表される化合物が、式(Ia):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000023
[式中、
 R1aは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 環Aは、5または6員の不飽和複素環を示し、
 Y1aは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-を示し、
 mは、0~3の整数を示し、
 m個のR2aは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
 mが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2aは、環Aと共に、置換されていてもよい縮合環を形成していてもよい。]
で表される化合物、および/または式(Ib):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000024
[式中、
 R1bは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 環Bは、6員の芳香族炭化水素環、または5若しくは6員の芳香族複素環を示し、
 nは、0~5の整数を示し、
 n個のR2bは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
 nが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2bは、環Bと共に、置換されていてもよい2環式の縮合芳香族複素環を形成していてもよい。]
で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)
である、前記[12]に記載の方法。
 [14] 前記式(Ia)で表される化合物が、式(Ic):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000025
[式中、
 R1cは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
 Y1cは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-を示し、
 pは、0または1を示し、
 R2cは、水素原子、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、
 環Cは、6員の芳香族炭化水素環、6員の含窒素芳香族複素環、または窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環を示し、
 qは、0~4の整数を示し、および
 q個のR3cは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示す。]
で表される化合物である、前記[13]に記載の方法。
 [15] 前記式(Ic)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オンからなる群から選ばれる少なくとも一つである、前記[14]に記載の方法。
 [16] 前記環Cが、6員の芳香族炭化水素環または6員の含窒素芳香族複素環である、前記[14]に記載の方法。
 [17] 前記式(Ic)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、および2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オンからなる群から選ばれる少なくとも一つである、前記[16]に記載の方法。
 [18] 前記式(Ib)で表される化合物における式(r1):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000026
で表される基が、
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
 (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (10)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~3個の置換基で置換されていてもよい2-イミダゾリル基
である、前記[13]~[17]のいずれか一つに記載の方法。
 [19] 前記式(Ib)で表される化合物が、2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)、4,4’-ジピリジルジスルフィド、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸、2,2’-ジチオビス(1H-イミダゾール)、および2,2’-ジチオビス(1-メチル-1H-イミダゾール)からなる群から選ばれる少なくとも一つである、前記[18]に記載の方法。
 [20] 前記クエンチ剤(i)が水である、前記[12]~[19]のいずれか一つに記載の方法。
 [21] 前記クエンチ剤(ii)が有機リン化合物である、前記[12]~[20]のいずれか一つに記載の方法。
 [22] 有機リン化合物が、ホスフィン類、亜リン酸トリエステル、亜ホスフィン酸エステル、亜ホスホン酸ジエステルおよびホスフィン酸エステルからなる群から選ばれる少なくとも一つである、前記[21]に記載の方法。
 [23] 有機リン化合物がホスフィン類である、前記[21]に記載の方法。
 [24] 前記ワンポット合成が、工程(3)後の溶液に、芳香族アミン類を添加することをさらに含む、前記[12]~[23]のいずれか一つに記載の方法。
 [25] 前記ワンポット合成が、工程(5)の後および工程(7)の前に、工程(5)後の溶液に塩基を添加する工程(6)をさらに含む、前記[12]~[24]のいずれか一つに記載の方法。
 [26] 前記オリゴヌクレオチド前駆体(c)が、亜リン酸エステル結合に加えて、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である、前記[12]~[25]のいずれか一つに記載の方法。
 [27] 式(In):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000027
[式中、
 (1)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は0を示し、環C”は窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環を示し、およびq’は0を示すか、
 (2)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は0を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、q’は1を示し、およびR3nはC1-6パーフルオロアルキル基を示すか、
 (3)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は1を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、およびq’は0を示すか、または
 (4)R1nは1個のC1-6アルキル基で置換されているピリジル基を示し、p’は0を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、およびq’は0を示す。]
で表される化合物。
 [28] 前記式(In)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン、または2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オンである前記[27]に記載の化合物。
 本発明によれば、ヨウ素を使用する場合に比べて、前述の欠損体または脱硫体の生成を抑制して、オリゴヌクレオチドを製造することができる。
1.用語
 まず、本明細書中で使用する用語について説明する。なお、特段の記載がない限り、本明細書に記載する用語は、本発明が属する技術分野の当業者に一般に理解されるのと同じ意味を有する。
1-1.基に関する用語
 本明細書中、「Ca-b」とは、炭素数がa以上b以下(a、bは整数を示す)を意味する。
 本明細書中、「ハロゲン原子」とは、フッ素原子、塩素原子、臭素原子またはヨウ素原子を意味する。
 本明細書中、「炭化水素基」としては、例えば、脂肪族炭化水素基、芳香脂肪族炭化水素基、単環式飽和炭化水素基および芳香族炭化水素基等が挙げられ、その具体例としては、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アルキレン基等の1価基および2価基が挙げられる。
 本明細書中、「アルキル(基)」は、直鎖状または分岐鎖状のいずれでもよい。「アルキル(基)」としては、炭素数1以上のアルキル基が挙げられ、特に炭素数範囲の限定がない場合には、好ましくはC1-10アルキル基であり、より好ましくはC1-6アルキル基である。その具体例としては、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、ペンチル、ヘキシル等が挙げられる。
 本明細書中、「アルケニル(基)」は、直鎖状または分岐鎖状のいずれでもよい。「アルケニル(基)」としては、例えば、C2-6アルケニル基等が挙げられる。具体的には、例えば、ビニル、1-プロペニル、アリル、イソプロペニル、ブテニル、イソブテニル等が挙げられる。
 本明細書中、「アルキニル(基)」は、直鎖状または分岐鎖状のいずれでもよい。「アルキニル(基)」としては、例えば、C2-6アルキニル基等が挙げられる。その具体例としては、エチニル、1-プロピニル、2-プロピニル、1-ブチニル、2-ブチニル、3-ブチニル、1-ペンチニル、2-ペンチニル、3-ペンチニル、4-ペンチニル、1-ヘキシニル、2-ヘキシニル、3-ヘキシニル、4-ヘキシニル、5-ヘキシニル等が挙げられる。
 本明細書中、「シクロアルキル(基)」は、環状アルキル基を意味し、例えばC3-8シクロアルキル基、好ましくはC3-6シクロアルキル基が挙げられる。その具体例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル等が挙げられる。
 本明細書中、「アリール(基)」は、単環式または多環式(縮合)の芳香族炭化水素基を意味し、例えば、フェニル、1-ナフチル、2-ナフチル、ビフェニリル、1-アントリル、2-アントリル等のC6-14アリール基が挙げられる。中でもC6-10アリール基がより好ましく、フェニルが特に好ましい。
 本明細書中、「ヘテロアリール(基)」は、炭素原子以外に窒素原子、硫黄原子および酸素原子から選ばれるヘテロ原子を環構成原子として含有する単環式または多環式(縮合)の芳香族複素環基を意味する。ヘテロアリール基としては、例えば、5または6員の単環式ヘテロアリール基および8~14員の縮合多環式ヘテロアリール基が挙げられる。
 本明細書中、「5または6員の単環式ヘテロアリール(基)」としては、例えば、チエニル、フリル、ピロリル、イミダゾリル、ピラゾリル、チアゾリル、イソチアゾリル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、ピリジル、(ピリジン-N-オキシド)-イル、ピラジニル、ピリミジニル、ピリダジニル、1,2,4-オキサジアゾリル、1,3,4-オキサジアゾリル、1,2,4-チアジアゾリル、1,3,4-チアジアゾリル、トリアゾリル、テトラゾリル、トリアジニル等が挙げられる。なお、本発明において「ヘテロアリール基」は、下記式で示される(ピリジン-N-オキシド)-イル基を包含する(下記式中、*は結合位置を示す)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000028
 本明細書中、「5または6員の単環式の含窒素ヘテロアリール(基)」としては、例えば、前述の「5または6員の単環式ヘテロアリール(基)」のうち、環構成原子として少なくとも1個以上の窒素原子を含有するものが挙げられる。
 本明細書中、「8~14員の縮合多環式ヘテロアリール(基)」としては、例えば、ベンゾチオフェニル、ベンゾフラニル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾイソオキサゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾイソチアゾリル、ベンゾトリアゾリル、イミダゾピリジニル、チエノピリジニル、フロピリジニル、ピロロピリジニル、ピラゾロピリジニル、オキサゾロピリジニル、チアゾロピリジニル、イミダゾピラジニル、イミダゾピリミジニル、チエノピリミジニル、フロピリミジニル、ピロロピリミジニル、ピラゾロピリミジニル、オキサゾロピリミジニル、チアゾロピリミジニル、ピラゾロトリアジニル、ナフト[2,3-b]チエニル、フェノキサチイニル、インドリル、イソインドリル、1H-インダゾリル、プリニル、イソキノリル、キノリル、フタラジニル、ナフチリジニル、キノキサリニル、キナゾリニル、シンノリニル、カルバゾリル、β-カルボリニル、フェナントリジニル、アクリジニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサジニル等が挙げられる。
 本明細書中、「8~14員の縮合多環式の含窒素ヘテロアリール(基)」としては、例えば、前述の「8~14員の縮合多環式ヘテロアリール(基)」のうち、環構成原子として少なくとも1個以上の窒素原子を含有するものが挙げられる。
 本明細書中、「アラルキル(基)」としては、C7-20アラルキル基が挙げられ、好ましくはC7-16アラルキル基(C6-10アリール-C1-6アルキル基)である。その具体例としては、ベンジル、1-フェニルエチル、2-フェニルエチル、1-フェニルプロピル、ナフチルメチル、1-ナフチルエチル、1-ナフチルプロピル等が挙げられる。
 本明細書中、「アルキレン(基)」は、直鎖状または分岐鎖状のいずれでもよい。「アルキレン(基)」としては、炭素数1以上のアルキレン基が挙げられ、特に炭素数範囲の限定がない場合には、好ましくはC1-10アルキレン基であり、より好ましくはC1-6アルキレン基である。その具体例としては、メチレン、エチレン、プロピレン、ブチレン、ペンチレン、ヘキシレンが挙げられる。
 本明細書中、「アルコキシ(基)」は、直鎖状または分岐鎖状のいずれでもよい。「アルコキシ(基)」としては、炭素数1以上のアルコキシ基が挙げられ、特に炭素数範囲の限定がない場合には、好ましくはC1-10アルコキシ基であり、より好ましくはC1-6アルコキシ基である。その具体例としては、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、イソプロポキシ、ブトキシ、イソブトキシ、sec-ブトキシ、tert-ブトキシ、ペンチルオキシ、ヘキシルオキシ等が挙げられる。
 本明細書中、「アシル(基)」は、直鎖状または分岐鎖状のいずれでもよい。「アシル(基)」としては、例えば、C1-6アルカノイル基、C7-13アロイル基等が挙げられる。「アシル(基)」の具体例としては、ホルミル、アセチル、n-プロピオニル、イソプロピオニル、n-ブチリル、イソブチリル、ピバロイル、バレリル、ヘキサノイル、ベンゾイル、ナフトイル、レブリニル等が挙げられる。「アシル(基)」は、置換されていてもよい。
 本明細書中、「6員の芳香族炭化水素環」とは、ベンゼン環を意味する。「6員の芳香族炭化水素環」が縮合環の一部を形成している場合、「6員の芳香族炭化水素環」とは、縮合環の一部を形成しているベンゼン環を意味する。
 本明細書中、「5または6員の芳香族複素環」としては、例えば、チオフェン環、フラン環、1H-ピロール環、イミダゾール環、ピラゾール環、チアゾール環、イソチアゾール環、オキサゾール環、イソオキサゾール環、1,2,4-オキサジアゾール環、1,3,4-オキサジアゾール環、1,2,4-チアジアゾール環、1,3,4-チアジアゾール環、トリアゾール環、テトラゾール環、ピリジン環、ピリジン-N-オキシド環、ピラジン環、ピリミジン環、ピリダジン環、トリアジン環等が挙げられる。なお、本発明において「芳香族複素環」は、ピリジン-N-オキシド環を包含する。
 本明細書中、「4~8員の含窒素複素環」としては、例えば、アゼチジン環、ピロリジン環、ピロリン環、2H-ピロール環、ピペリジン環、ピペラジン環、アザシクロヘプタン環、アザシクロオクタン環、1H-ピロール環、イミダゾール環、ピラゾール環、チアゾール環、イソチアゾール環、オキサゾール環、イソオキサゾール環、1,2,4-オキサジアゾール環、1,3,4-オキサジアゾール環、1,2,4-チアジアゾール環、1,3,4-チアジアゾール環、トリアゾール環、テトラゾール環、ピリジン環、ピリジン-N-オキシド環、ピラジン環、ピリミジン環、ピリダジン環、トリアジン環等が挙げられる。
 本明細書中、「5または6員の含窒素複素環」としては、例えば、前述の「4~8員の含窒素複素環」のうち、環構成原子が5または6個であるものが挙げられる。
 本明細書中、「6員の含窒素芳香族複素環」としては、例えば、ピリジン環、ピリジン-N-オキシド環、ピラジン環、ピリミジン環、ピリダジン環、トリアジン環等が挙げられる。
 本明細書中、「2環式の縮合含窒素複素環」としては、例えば、ピロリジン環、デカヒドロイソキノリン環、デカヒドロキノリン環、ベンゾチオフェン環、ベンゾフラン環、イソベンゾフラン環、ベンゾイミダゾール環、ベンゾオキサゾール環、ベンゾイソオキサゾール環、ベンゾチアゾール環、ベンゾイソチアゾール環、ベンゾトリアゾール環、インド-ル環、イソインドール環、1H-インダゾール環、プリン環、イソキノリン環、5,6,7,8-テトラヒドロイソキノリン環、キノリン環、5,6,7,8-テトラヒドロキノリン環、フタラジン環、プテリジン環、ナフチリジン環、キノキサリン環、キナゾリン環、シンノリン環等が挙げられる。
 本明細書中、「2環式の縮合芳香族複素環」としては、例えば、ベンゾチオフェン環、ベンゾフラン環、イソベンゾフラン環、ベンゾイミダゾール環、ベンゾオキサゾール環、ベンゾイソオキサゾール環、ベンゾチアゾール環、ベンゾイソチアゾール環、ベンゾトリアゾール環、インド-ル環、イソインドール環、1H-インダゾール環、プリン環、イソキノリン環、5,6,7,8-テトラヒドロイソキノリン環、キノリン環、5,6,7,8-テトラヒドロキノリン環、フタラジン環、プテリジン環、ナフチリジン環、キノキサリン環、キナゾリン環、シンノリン環等が挙げられる。なお、本明細書中の「2環式の縮合芳香族複素環」には、一つの環が芳香族複素環であり、もう一つの環が非芳香族複素環または非芳香族炭化水素環である2環式の縮合環(例えば、5,6,7,8-テトラヒドロイソキノリン環)も含まれる。
 本明細書中、「窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環」としては、例えば、5,6,7,8-テトラヒドロイソキノリン環、キノリン環等が挙げられる。
 本明細書中、「電子求引性基」としては、例えば、ハロゲン原子、パークロロアルキル基(例、トリクロロメチル基)、パーフルオロアルキル基(例、トリフルオロメチル基)、ニトロ基、シアノ基、ホルミル基、アルキルカルボニル基(-CO-R、R:アルキル基)、パークロロアルキルカルボニル基(-CO-R、R:パークロロアルキル基)、パーフルオロアルキルカルボニル基(-CO-R、R:パーフルオロアルキル基)、カルボキシ基、アルコキシカルボニル基(-CO-OR、R:アルキル基)、アルキルスルホニル基(-S(=O)-R、R:アルキル基)、スルホ基等が挙げられる。
 本明細書中、「パークロロアルキル基」とは、全ての水素原子が塩素原子で置換されたアルキル基を意味する。
 本明細書中、「パーフルオロアルキル基」とは、全ての水素原子がフッ素原子で置換されたアルキル基を意味する。
 本明細書中、「リンカー」としては、例えば、-O-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-OC(=O)-、-NR’-、-C(=O)NR’-、-NR’C(=O)-、-S-、-SO-、-SO-、-Si(R’)(R”)O-、-Si(R’)(R”)-(R’およびR”は、それぞれ独立に、水素原子またはC1-22炭化水素基を示す)等が挙げられる。リンカーは、好ましくは-O-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-OC(=O)-、-C(=O)NH-、-NHC(=O)-、-S-、-SO-、-SO-、-Si(R’)(R”)O-、または-Si(R’)(R”)-(R’およびR”は、それぞれ独立に、水素原子またはC1-22炭化水素基を示す)である。
 本明細書中、「置換基」としては、例えば、前述のハロゲン原子、アルキル基、アラルキル基、アルコキシ基、アシル基、アルケニル基、アルキニル基、シクロアルキル基、アリール基に加えて、水酸基、ニトロ基、シアノ基、グアニジル基、カルボキシ基、アルコキシカルボニル基(アルコキシ部は前記アルコキシ基と同様)、スルホ基、ホスホ基、アルキルスルファニル基 (アルキル部は前記アルキル基と同様)、アルキルスルフィニル基(アルキル部は前記アルキル基と同様)、アルキルスルホニル基(アルキル部は前記アルキル基と同様)、アミノ基、モノアルキルアミノ基(アルキル部は前記アルキル基と同様)、ジアルキルアミノ基(アルキル部は前記アルキル基と同様)、オキソ基等が挙げられる。
 本明細書中、「水酸基の保護基」に特に限定はなく、公知の保護基を使用することができる。該保護基としては、例えば、メチル基、ベンジル基、p-メトキシベンジル基、tert-ブチル基、メトキシメチル基、2-メトキシエチル基、2-テトラヒドロピラニル基、2-エトキシエチル基、2-シアノエチル基、(2-シアノエトキシ)メチル基、1-(2-シアノエトキシ)エチル基、ビス(2-アセトキシエトキシ)メチル(ACE)基、(2-ニトロベンジル)オキシメチル(NBOM)基、(2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル(SEM)基、1-(2-シアノエトキシ)エチル基、2-((4-メチルフェニル)スルホニル)エトキシメチル(TEM)基、tert-ブチルジチオメチル(DTM)基、((2-(メチルチオ)フェニル)チオ)メチル(MPTM)基、(N-ジクロロアセチル-N-メチル)アミノベンジルオキシメチル(DCMABOM)基、(2-アセチルエチル)カルボニルオキシメチル基(当該分野において「アセタールレブニリルエステル(ALE)基」とも呼ばれる)、フェニルカルバモイル基、1,1-ジオキソチオモルホリン-4-チオカルバモイル基、アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基、トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、tert-ブチルジメチルシリル基、[(トリイソプロピルシリル)オキシ]メチル(Tom)基、1-(4-クロロフェニル)-4-エトキシピペリジン-4-イル(Cpep)基等が挙げられる。
 本明細書中、「水酸基の酸性条件下で除去可能な一時保護基」としては、例えば、トリチル基、9-フェニル-9-キサンテニル基、9-フェニル-9-チオキサンテニル基、1,1-ビス(4-メトキシフェニル)-1-フェニルメチル基(本明細書中「4,4’-ジメトキシトリチル基」と記載することがある)等のビス(C1-6アルコキシ)トリチル基、1-(4-メトキシフェニル)-1,1-ジフェニルメチル基(本明細書中「4-モノメトキシトリチル基」と記載することがある)等のモノ(C1-18アルコキシ)トリチル基等が挙げられる。脱保護の容易さ等の観点から、前記一時保護基は、好ましくは4,4’-ジメトキシトリチル基または4-モノメトキシトリチル基であり、より好ましくは4,4’-ジメトキシトリチル基である。
 本明細書中、「アミノ基の保護基」に特に限定はなく、公知の保護基を使用することができる。該保護基としては、例えば、ピバロイル基、ピバロイロキシメチル基、アセチル基、トリフルオロアセチル基、フェノキシアセチル基、4-イソプロピルフェノキシアセチル基、4-tert-ブチルフェノキシアセチル基、ベンゾイル基、イソブチリル基、(2-ヘキシル)デカノイル基、ジメチルホルムアミジニル基、1-(ジメチルアミノ)エチリデン基、9-フルオレニルメチルオキシカルボニル基を挙げることができる。これらの中で、アセチル基、フェノキシアセチル基、4-イソプロピルフェノキシアセチル基、ベンゾイル基、イソブチリル基、(2-ヘキシル)デカノイル基、ジメチルホルムアミジニル基、および=NC(R11)-N(R12)(R13)で表される基(式中、R11は、メチル基を示し、R12およびR13は、それぞれ独立にC1-6アルキル基を示すか、またはR11およびR12が一緒になって、それらが結合する炭素原子および窒素原子と共に5または6員の含窒素複素環を形成していてもよい。)等が挙げられる。前記=NC(R11)-N(R12)(R13)で表される基としては、例えば、1-(ジメチルアミノ)エチリデン基が挙げられる。
 本明細書中、「リン酸基の保護基」に特に限定はなく、公知の保護基を使用することができる。リン酸基の保護基としては、例えば、以下のものが挙げられる:
下記式(Pg-1)で表される2-シアノエチル基、
下記式(Pg-2)で表される2-[2-(4,4’-ジメトキシトリチルオキシ)エチルスルホニル]エチル基、
下記式(Pg-3)で表される[3-(4,4’-ジメトキシトリチルオキシ)-2,2-ジ(エトキシカルボニル)]プロピル基、
下記式(Pg-4)で表される[3-(4,4’-ジメトキシトリチルオキシ)-2,2-ジ(N-メチルカルバモイル)]プロピル基。
 リン酸基の保護基は、好ましくは2-シアノエチル基である。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000029
[式中、Meは、メチル基を示し、Etは、エチル基を示し、DMTrは、4,4’-ジメトキシトリチル基を示し、および*は、リン酸基との結合位置を示す。]
 本明細書中、「疎水性保護基」としては、例えば、国際公開第2017/104836号に「アンカー」と記載されている保護基を使用することができる。
 疎水性保護基は、好ましくは、下記式(Pg-5)で表される保護基である:
**L-Y-Z   (Pg-5)
[式中、
 **は保護される基との結合位置を示し;
 Lは、単結合、または式(Pg-i-1)若しくは(Pg-i-2):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000030
(式中、
 *は、Yとの結合位置を示し;
 **は前記と同義であり;
 R1pおよびR2pは、それぞれ独立に、C1-22炭化水素基を示し;
 Lは、置換されていてもよい2価のC1-22炭化水素基を示し、前記2価のC1-22炭化水素基中の-CH-はリンカーで置き換わっていてもよく;
 Lは、単結合を示すか、または***C(=O)N(R3p)-R4p-N(R5p)****(式中、***は、Lとの結合位置を示し、****は、C=Oとの結合位置を示し、R4pは、C1-22アルキレン基を示し、R3pおよびR5pは、それぞれ独立に、水素原子若しくはC1-22アルキル基を示すか、またはR3pおよびR5pが一緒になって、環を形成していてもよい。)で表される基を示す。)で表される基を示し;
 Yは、単結合、酸素原子、またはNR(Rは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。)を示し;および
 Zは、式(Pg-ii-1)~式(Pg-ii-5)のいずれか:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000031
[式中、
 *は、結合位置を示し;
 環A’は、ベンゼン環を示し;
 環B’は、シクロヘキサン環を示し;
 環D’は、ナフタレン環または2環式の縮合芳香族複素環を示し;
 R6pは、水素原子であるか、或いはRが、下記式(Pg-iii)で表される基である場合には、環A’または環B’のR6pは、R8pと一緒になって単結合または-O-を示して、環A’または環B’および環C’と共に縮合環を形成していてもよく;
 kは、1~4の整数を示し;
 k個のQは、それぞれ独立に、-O-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-OC(=O)-、-NR’-、-C(=O)NR’-または-NR’C(=O)-(前記式中、R’は、それぞれ独立に、水素原子またはC1-6アルキル基を示す)を示し(k個のQは、好ましくは、それぞれ独立に、-O-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-OC(=O)-、-C(=O)NH-または-NHC(=O)-を示し);
 k個のQ’は、それぞれ独立に、単結合、-O-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-OC(=O)-、-NR’-、-C(=O)NR’-または-NR’C(=O)-(前記式中、R’は、それぞれ独立に、水素原子またはC1-6アルキル基を示す)を示し;
 k個のR7pは、それぞれ独立に、炭素数10以上の直鎖状の脂肪族炭化水素基が単結合またはリンカーを介して結合した炭化水素基を示し;
 環A’および環B’は、それぞれ独立に、k個のQR7pに加えて、さらにハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいC1-6アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいC1-6アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよく;
 Rは、水素原子を示し;および
 Rは、水素原子、または式(Pg-iii):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000032
(式中、
 *は、結合位置を示し;
 環C’は、ベンゼン環を示し:
 jは、0~4の整数を示し;
 j個のQは、それぞれ独立に、前記と同義であり;
 j個のR9pは、それぞれ独立に、炭素数10以上の直鎖状の脂肪族炭化水素基が単結合またはリンカーを介して結合した炭化水素基を示し;
 R8pは、水素原子を示すか、或いは環A’または環B’のR6pと一緒になって単結合または-O-を示して、環A’または環B’および環C’と共に縮合環を形成していてもよく;
 環C’は、j個のQR9pに加えて、さらにハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいC1-6アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいC1-6アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよい。)で表される基を示すか、或いは
 RおよびRが、一緒になってオキソ基を形成し;
 uは、1または2を示し;および
 R10pは、C2-21パーフルオロアルキル基を示す。]
で表される基を示す。]
 なお、環A’、環C’、R6pおよびR8pが縮合環を形成する場合、環A’および環C’は、それぞれ、前記縮合環中のベンゼン環部分を示す。環B’、環C’、R6pおよびR8pが縮合環を形成する場合、環C’は、前記縮合環中のベンゼン環部分を示し、環B’は、前記縮合環中のシクロヘキサン環部分を示す。
 前記炭素数10以上の直鎖状の脂肪族炭化水素基は、好ましくは直鎖状のC10-40アルキル基および直鎖状のC10-40アルケニル基から選ばれる基であり、より好ましくは直鎖状のC10-40アルキル基であり、さらに好ましくは直鎖状のC10-30アルキル基であり、特に好ましくは直鎖状のC12-28アルキル基であり、最も好ましくは直鎖状のC14-26アルキル基である。
 前記リンカーは、好ましくは-O-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-OC(=O)-、-NR’-、-C(=O)NR’-または-NR’C(=O)-(R’は、水素原子またはC1-22炭化水素基を示す)であり、より好ましくは-O-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-OC(=O)-、-C(=O)NH-または-NHC(=O)-であり、さらに好ましくは-O-である。
 前記「炭素数10以上の直鎖状の脂肪族炭化水素基が単結合またはリンカーを介して結合した炭化水素基」は、好ましくは、直鎖状のC10-40アルキル基、1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したベンジル基、または1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したシクロヘキシルメチル基である。
 Qは、好ましくは-O-、-C(=O)NH-または-NHC(=O)-であり、より好ましくは-O-である。
 Q’は、好ましくは単結合、-O-、-C(=O)NH-または-NHC(=O)-であり、より好ましくは単結合または-O-である。
 式(Pg-5)において、式(Pg-i-1)で表されるLの好ましい態様は、
 Lが、2価のC1-22炭化水素基、またはCH-O-1,4-フェニレン-O-CHであり;および
 Lが、単結合であるか、または***C(=O)N(R3p)-R4p-N(R5p)****(式中、***は、Lとの結合位置を示し、****は、C=Oとの結合位置を示し、R4pは、C1-6アルキレン基を示し、R3pおよびR5pは、それぞれ独立に水素原子、若しくは置換されていてもよいC1-6アルキル基を示すか、またはR3pおよびR5pが一緒になって、置換されていてもよいC1-6アルキレン基を形成していてもよい。)で表される基である
基である。
 式(Pg-i-1)で表されるLの別の好ましい態様は、
 Lが、2価のC1-22炭化水素基であり;および
 Lが単結合である
基である。
 式(Pg-i-1)で表されるLの別の好ましい態様は、
 Lが、エチレン基であり;および
 Lが、***C(=O)N(R3p)-R4p-N(R5p)****(式中、***は、Lとの結合位置を示し、****は、C=Oとの結合位置を示し、R4pは、C1-22アルキレン基を示し、R3pおよびR5pは、それぞれ独立に、水素原子若しくはC1-22アルキル基を示すか、またはR3pおよびR5pが一緒になって、環を形成していてもよい。)で表される基である
基である。
 式(Pg-i-1)で表されるLの別の好ましい態様は、
 Lが、エチレン基であり;および
 Lが、***C(=O)N(R3p)-R4p-N(R5p)****(式中、***は、Lとの結合位置を示し、****は、C=Oとの結合位置を示し、N(R3p)-R4p-N(R5p)部分が、1,4-ピペラジンジイル基を形成する。)で表される基である
基である。
 式(Pg-i-1)で表されるLの別の好ましい態様は、
 Lが、エチレン基であり;および
 Lが、***C(=O)N(R3p)-R4p-N(R5p)****(式中、***は、Lとの結合位置を示し、****は、C=Oとの結合位置を示し、R4pは、ペンチレン基、またはヘキシレン基を示し、R3pおよびR5pは、それぞれ独立に、水素原子またはメチル基を示す。)で表される基である
基である。
 式(Pg-i-1)で表されるLの別の好ましい態様は、
 Lが、置換基を有していてもよいフェニレン基であり;および
 Lが、***C(=O)N(R3p)-R4p-N(R5p)****(式中、***は、Lとの結合位置を示し、****は、C=Oとの結合位置を示し、N(R3p)-R4p-N(R5p)部分が、1,4-ピペラジンジイル基を形成する。)で表される基である
基である。
 式(Pg-i-1)で表されるLは、特に好ましくはスクシニル基である。
 次に、式(Pg-5)において式(Pg-i-2)で表されるLについて説明する。
 式(Pg-i-2)中のLは、好ましくは2価のC6-10芳香族炭化水素基であり、より好ましくはフェニレン基である。
 式(Pg-i-2)中のLは、好ましくは単結合である。
 式(Pg-i-2)中のLおよびLの好ましい組合せとしては、Lが2価のC6-10芳香族炭化水素基であり、Lが単結合である、組合せである。式(Pg-i-2)中のLおよびLのより好ましい組合せとしては、Lがフェニレン基であり、Lが単結合である、組合せである。
 式(Pg-i-2)中のR1pおよびR2pは、それぞれ独立に、好ましくはC1-22アルキル基であり、より好ましくはC1-10アルキル基である。
 式(Pg-i-2)で表されるLの好ましい態様は、
 R1pおよびR2pが、それぞれ独立に、C1-22アルキル基であり;
 Lが、2価のC6-10芳香族炭化水素基であり;および
 Lが、単結合である
基である。
 式(Pg-i-2)で表されるLの別の好ましい態様は、
 R1pおよびR2pが、それぞれ独立に、C1-10アルキル基であり;
 Lが、フェニレン基であり;および
 Lが、単結合である
基である。
 式(Pg-5)におけるYがNRである場合、前記Rは、好ましくは、水素原子、C1-6アルキル基またはC7-16アラルキル基であり、より好ましくは水素原子、メチル、エチルまたはベンジルであり、さらに好ましくは水素原子である。Yは、好ましくは単結合、酸素原子またはNRであり、より好ましくは単結合または酸素原子である。
 式(Pg-ii-1)において、R6pは水素原子であることが好ましい。また、式(Pg-ii-1)において、RおよびRが、水素原子であるか、または一緒になってオキソ基を形成することが好ましい。
 式(Pg-ii-1)で表されるZの好ましい態様は、
 RおよびRが、水素原子であり;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基である、
基である。
 式(Pg-ii-1)で表されるZの好ましい別の態様は、
 RおよびRが、水素原子であり;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したベンジル基、または1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したシクロヘキシルメチル基である、
基である。
 式(Pg-ii-1)で表されるZの好ましい別の態様は、
 Rが、水素原子であり;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基であり;および
 Rが、式(Pg-iii)(式中、*は結合位置であり、jが、0~3の整数であり、j個のQが、-O-であり、j個のR9pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基であり、およびR8pが、水素原子である。)で表される基である、
基である。
 式(Pg-ii-1)で表されるZの好ましい別の態様は、
 Rが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基であり;および
 Rが、式(Pg-iii)(式中、*は結合位置であり、jが、0~3の整数であり、j個のQが、-O-であり、j個のR9pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基であり、およびR8pは、R6pと一緒になって単結合または-O-を示して、環A’および環C’と共に縮合環を形成する。)で表される基である、
基である。
 式(Pg-ii-1)で表されるZの好ましい別の態様は、
 RおよびRが、一緒になってオキソ基を形成し;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基である、
基である。
 式(Pg-ii-1)で表されるZの好ましい別の態様は、
 RおよびRが、一緒になってオキソ基を形成し;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;
 k個のR7pが、それぞれ独立に、1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したベンジル基、または1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したシクロヘキシルメチル基である、
基である。
 式(Pg-ii-2)で表されるZの好ましい態様は、
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基、1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したベンジル基、または1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したシクロヘキシルメチル基である、
基である。
 式(Pg-ii-3)において、R6pは水素原子であることが好ましい。また、式(Pg-ii-3)において、RおよびRが、水素原子であるか、または一緒になってオキソ基を形成することが好ましい。
 式(Pg-ii-3)で表されるZの好ましい態様は、
 RおよびRが、水素原子であり;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基である、
基である。
 式(Pg-ii-3)で表されるZの好ましい別の態様は、
 RおよびRが、水素原子であり;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したベンジル基、または1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したシクロヘキシルメチル基である、
基である。
 式(Pg-ii-3)で表されるZの好ましい別の態様は、
 Rが、水素原子であり;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基であり;および
 Rが、式(Pg-iii)(式中、*は結合位置であり、jが、0~3の整数であり、j個のQが、-O-であり、j個のR9pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基であり、およびR8pが、水素原子である。)で表される基である、
基である。
 式(Pg-ii-3)で表されるZの好ましい別の態様は、
 Rが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基であり;および
 Rが、式(Pg-iii)(式中、*は結合位置であり、jが、0~3の整数であり、j個のQが、-O-であり、j個のR9pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基であり、およびR8pは、R6pと一緒になって単結合または-O-を示して、環B’および環C’と共に縮合環を形成する。)で表される基である、
基である。
 式(Pg-ii-3)で表されるZの好ましい別の態様は、
 RおよびRが、一緒になってオキソ基を形成し;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基である、
基である。
 式(Pg-ii-3)で表されるZの好ましい別の態様は、
 RおよびRが、一緒になってオキソ基を形成し;
 R6pが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQが、-O-であり;
 k個のR7pが、それぞれ独立に、1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したベンジル基、または1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したシクロヘキシルメチル基である、
基である。
 式(Pg-ii-4)で表されるZの好ましい態様は、
 環D’が、ナフタレン環であり;
 RおよびRが、水素原子であり;
 kが、1~3の整数であり;
 k個のQ’が、-O-であり;および
 k個のR7pが、それぞれ独立に、直鎖状のC10-40アルキル基、1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したベンジル基、または1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したシクロヘキシルメチル基である、
基である。
 式(Pg-ii-4)で表されるZの好ましい別の態様は、
 環D’が、インドール環であり;
 RおよびRが、水素原子であり;
 kが、1であり;
 Q’が、単結合であり;および
 R7pが、直鎖状のC10-40アルキル基、1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したベンジル基、または1~3個の直鎖状のC10-40アルキル基が-O-を介して結合したシクロヘキシルメチル基であり;および
 R7pが、インドール環の窒素原子に結合している
基である。
 式(Pg-ii-5)で表されるZの好ましい態様は、
 uが、1または2であり;および
 R10pが、C4-10パーフルオロアルキル基である
基である。
 Zは、好ましくは式(Pg-ii-1)、式(Pg-ii-2)または式(Pg-ii-3)で表される基である。
 保護基(Pg-5)は、好ましくは、
 Lが、スクシニル基であるか、または式(Pg-i-2)で表される基(式(Pg-i-2)中、R1pおよびR2pが、それぞれ独立に、C1-10アルキル基であり、Lが、2価のフェニレン基であり、Lが、単結合である。)であり、および
 Y-Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)ベンジルオキシ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルオキシ基、3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルオキシ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルアミノ基、2,4-ビス(ドコシルオキシ)ベンジルアミノ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)ベンジルアミノ基、ビス(4-ドコシルオキシフェニル)メチルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]ベンジルアミノ基、2,4-ビス(ドデシルオキシ)ベンジルアミノ基、フェニル(2,3,4-トリス(オクタデシルオキシ)フェニル)メチルアミノ基、ビス[4-(12-ドコシルオキシドデシルオキシ)フェニル]メチルアミノ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルアミノ基、3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルアミノ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルオキシ基、3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルオキシ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、2,4-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、ビス(4-ドコシルオキシシクロへキシル)メチルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、2,4-ビス(ドデシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、フェニル(2,3,4-トリス(オクタデシルオキシ)シクロへキシル)メチルアミノ基、ビス[4-(12-ドコシルオキシドデシルオキシ)シクロへキシル]メチルアミノ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、または3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基である
基であるか、または
 L-Yが、単結合またはスクシニル-1,4-ピペラジンジイル基であり、および
 Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)ベンゾイル基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンゾイル基、または3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンゾイル基である
基である。
 保護基(Pg-5)は、より好ましくは、
 Lが、スクシニル基であり、および
 Y-Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)ベンジルオキシ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルオキシ基、3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルオキシ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルアミノ基、2,4-ビス(ドコシルオキシ)ベンジルアミノ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)ベンジルアミノ基、ビス(4-ドコシルオキシフェニル)メチルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]ベンジルアミノ基、2,4-ビス(ドデシルオキシ)ベンジルアミノ基、フェニル(2,3,4-トリス(オクタデシルオキシ)フェニル)メチルアミノ基、ビス[4-(12-ドコシルオキシドデシルオキシ)フェニル]メチルアミノ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルアミノ基、3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルアミノ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルオキシ基、3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルオキシ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、2,4-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、ビス(4-ドコシルオキシシクロへキシル)メチルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、2,4-ビス(ドデシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、フェニル(2,3,4-トリス(オクタデシルオキシ)シクロへキシル)メチルアミノ基、ビス[4-(12-ドコシルオキシドデシルオキシ)シクロへキシル]メチルアミノ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、または3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基である
基であるか、または
 L-Yが、単結合またはスクシニル-1,4-ピペラジンジイル基であり、および
 Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)ベンゾイル基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンゾイル基、または3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンゾイル基である
基である。
 保護基(Pg-5)は、さらに好ましくは、
 Lが、スクシニル基であり、および
 Y-Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルオキシ基、3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルオキシ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、2,4-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、3,5-ビス(ドコシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、4-メトキシ-2-[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、2,4-ビス(ドデシルオキシ)シクロヘキシルメチルアミノ基、3,5-ビス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基、または3,4,5-トリス[3’,4’,5’-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]シクロヘキシルメチルアミノ基である
基であるか、または
 L-Yが、単結合またはスクシニル-1,4-ピペラジンジイル基であり、および
 Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル基である
基である。
 保護基(Pg-5)は、特に好ましくは、
 Lが、スクシニル基であり、および
 Y-Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ基、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ基またはフェニル(2,3,4-トリス(オクタデシルオキシ)フェニル)メチルアミノ基である
基であるか、または
 L-Yが、スクシニル-1,4-ピペラジンジイル基であり、および
 Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル基である
基である。
 保護基(Pg-5)は、最も好ましくは、
 Lが、スクシニル基であり、および
 Y-Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ基、または3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ基である
基であるか、または
 L-Yが、スクシニル-1,4-ピペラジンジイル基であり、および
 Zが、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル基である
基である。
 保護基(Pg-5)、およびそれを形成するために用いられる化合物は、公知の方法(例えば国際公開第2017/104836号、国際公開第2019/131719号、国際公開第2020/235658号、国際公開第2021/039935号または国際公開第2021/198883号に記載の方法)またはそれに準じた方法によって、形成または製造することができる。
1-2.オリゴヌクレオチド合成に関する用語
 本明細書中、「固相担体」とは、当該分野においてオリゴヌクレオチド合成の固相合成に使用されるものであれば特に制限されず、例えば、ガラスビーズ、樹脂ビーズ等が挙げられる。固相担体として用いられる支持体または樹脂は、当技術分野において公知であり、固相合成での使用に適した、あらゆる支持体または樹脂であり得る。前記支持体または樹脂としては、例えば、ポリスチレン支持体(ポリスチレン支持体は、例えばp-メチルベンジル-ヒドリルアミンによってさらに機能化されていてもよい)、珪藻土封入ポリジメチルアクリルアミド(ペプシンK)、シリカ、微細孔性ガラス、両親媒性のポリスチレン-ポリエチレングリコール(PEG)樹脂、PEG-ポリアミド、PEG-ポリエステル樹脂、Wang-PEGレジン、Rink-アミドPEGレジン等が挙げられる。前記支持体または樹脂は、修飾されていてもよい。修飾された支持体または樹脂としては、例えば、長鎖アルキルアミノ制御細孔ガラス(long chain alkylamino Controlled Pore Glass, lcaa CPG)等が挙げられる。
 本明細書中、オリゴヌクレオチドの構成単位となる「ヌクレオシド」とは、核酸塩基が糖(例えば、2-デオキシリボース、リボース、2位炭素原子および4位炭素原子が2価の有機基により結合された2-デオキシリボースまたはリボース、3位炭素原子および5位炭素原子が2価の有機基により結合された2-デオキシリボースまたはリボース、3位炭素原子および4位炭素原子が2価の有機基により結合された2-デオキシリボースまたはリボースなど)の1位にN-グリコシド化により結合された化合物を意味する。
 本明細書中、「核酸塩基」とは、核酸の合成に使用されるものであれば特に制限されず、例えば、シトシル基(シトシン塩基)、ウラシル基(ウラシル塩基)、チミニル基(チミン塩基)等のピリミジン塩基、アデニル基(アデニン塩基)、グアニル基(グアニン塩基)等のプリン塩基を挙げることができる。また、「保護されていてもよい核酸塩基」とは、例えば、核酸塩基中のアミノ基、カルボニル基等が保護されていてもよいことを意味する。保護されていてもよい核酸塩基は、好ましくは前述のアミノ基の保護基でアミノ基が保護されていてもよい核酸塩基であり、より好ましくはアミノ基を有さない核酸塩基、または前述のアミノ基の保護基で保護されたアミノ基を有する核酸塩基である。
 カルボニル基に、例えば、フェノール、2,5-ジクロロフェノール、3-クロロフェノール、3,5-ジクロロフェノール、2-ホルミルフェノール、2-ナフトール、4-メトキシフェノール、4-クロロフェノール、2-ニトロフェノール、4-ニトロフェノール、4-アセチルアミノフェノール、ペンタフルオロフェノール、4-ピバロイロキシベンジルアルコール、4-ニトロフェネチルアルコール、2-(メチルスルホニル)エタノール、2-(フェニルスルホニル)エタノール、2-シアノエタノール、2-(トリメチルシリル)エタノール、ジメチルカルバミン酸クロライド、ジエチルカルバミン酸クロライド、エチルフェニルカルバミン酸クロライド、1-ピロリジンカルボン酸クロライド、4-モルホリンカルボン酸クロライド、ジフェニルカルバミン酸クロライド等を反応せることによって、カルボニル基を保護することができる。
 本明細書中の「核酸塩基」には、核酸塩基が置換基(例えば、ハロゲン原子、アルキル基、アラルキル基、アルコキシ基、アシル基、アルコキシアルキル基、水酸基、アミノ基、モノアルキルアミノ、ジアルキルアミノ、カルボキシ、シアノ、ニトロ等)で置換されている修飾核酸塩基(例えば、8-ブロモアデニル基、8-ブロモグアニル基、5-ブロモシトシル基、5-ヨードシトシル基、5-ブロモウラシル基、5-ヨードウラシル基、5-フルオロウラシル基、5-メチルシトシル基、8-オキソグアニル基、ヒポキサンチニル基等)も包含される。
 本明細書中の「糖」は、水酸基がアミノ基に置き換わったアミノ糖、および2位水酸基がハロゲン原子に置き換わったリボースも包含する。
 アミノ糖としては、例えば、以下に示すような3位水酸基がアミノ基に置き換わった2-デオキシリボース、3位水酸基がアミノ基に置き換わったリボース、および3位水酸基がアミノ基に、2位水酸基がハロゲンに置き換わったリボースが挙げられる(下記式中、Xはハロゲン原子を示す。)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000033
 2位炭素原子および4位炭素原子が2価の有機基により結合された2-デオキシリボースまたはリボース、3位炭素原子および5位炭素原子が2価の有機基により結合された2-デオキシリボースまたはリボース、または3位炭素原子および4位炭素原子が2価の有機基により結合された2-デオキシリボースまたはリボースとしては、例えば、以下の化合物が挙げられる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000034
[式中、Rは、水素原子、置換されていてもよい炭化水素基、置換されていてもよい水酸基、または置換されていてもよいアミノ基を示し、およびR’は、水素原子または水酸基を示す。]
 本明細書中の「リン酸基」は、-O-P(=O)(OH)だけでなく、酸素原子が硫黄原子またはNHに置き換わった基(例えば、-O-P(=S)(OH)、-NH-P(=O)(OH)、-NH-P(=S)(OH))も包含する。また、リン酸基中の水酸基(-OH)が-OR(式中、Rは、有機基(例えば、リン酸基の保護基)を示す)に置き換わった基(例えば、保護されたリン酸基)も、「リン酸基」に包含される。
 本明細書中、「亜リン酸エステル結合」とは、下記式(P1-1)で表される結合、または前記結合中の酸素原子がNHに置き換わった下記式(P1-2)で表される結合を表す(下記式中、*は結合位置を示す)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000035
 本明細書中、「ホスホン酸エステル結合」とは、下記式(P2-1)で表される結合、または前記結合中の酸素原子がNHに置き換わった下記式(P2-2)で表される結合を表す(下記式中、*は結合位置を示す)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000036
 本明細書中、「リン酸エステル結合」とは、下記式(P3-1)で表される結合、または前記結合中の酸素原子がNHに置き換わった下記式(P3-2)で表される結合を表す(下記式中、*は結合位置を示す)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000037
 本明細書中、「チオリン酸エステル結合」とは、下記式(P4-1)で表される結合、または前記結合中の酸素原子がNHに置き換わった下記式(P4-2)で表される結合を表す(下記式中、*は結合位置を示す)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000038
 本明細書中、「ヌクレオチド」とは、ヌクレオシドにリン酸基が結合した化合物を意味する。なお、リン酸基の説明は、前述の通りである。
 本明細書中、「オリゴヌクレオチド」とは、ヌクレオシドにヌクレオチドが1個以上連結した化合物を意味する。なお、「オリゴヌクレオチド」には、前記式(P3-1)で表されるリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドだけでなく、前記式(P3-2)で表されるリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド、前記式(P4-1)で表されるチオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオシド、および前記式(P4-2)で表されるチオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオシドも包含される。本発明におけるオリゴヌクレオチド中のヌクレオシドの数は特に限定されないが、好ましくは2~50、より好ましくは2~30である。
 本明細書中、「ホスホロアミダイト」とは、亜リン酸ジエステルのモノアミド(P(OR)(NR)、4個のRは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基を示し、前記NRは、二つのRが互いに結合して、環状アミノ基を形成してもよい)を意味する。
 本明細書中、「ホスホロアミダイト化されたヌクレオシド」とは、ヌクレオシドに-X-P(OR)(NR)で表される基(式中、Xは、酸素原子またはNHを示し、3個のRは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基を示し、前記NRは、二つのRが互いに結合して、環状アミノ基を形成してもよい)を導入することによって得られる化合物を意味する。
 本明細書中、「ホスホロアミダイト化されたヌクレオチド」とは、ヌクレオチドに-X-P(OR)(NR)で表される基(式中、Xは、酸素原子またはNHを示し、3個のRは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基を示し、前記NRは、二つのRが互いに結合して、環状アミノ基を形成してもよい)を導入することによって得られる、-X-P(OR)(NR)で表される基およびリン酸基を有する化合物を意味する。なお、前記リン酸基は、置換されていてもよい。
 本明細書中、「ホスホロアミダイト化されたオリゴヌクレオチド」とは、オリゴヌクレオチドに-X-P(OR)(NR)で表される基(式中、Xは、酸素原子またはNHを示し、3個のRは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基を示し、前記NRは、二つのRが互いに結合して、環状アミノ基を形成してもよい)を導入することによって得られる化合物を意味する。
 本明細書中、「亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体」とは、オリゴヌクレオチド中のリン酸エステル結合が亜リン酸エステル結合に置き換わった前駆体を意味する。この前駆体を酸化することによって、リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドを製造することができる。
 亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、好ましくは
(1)ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドとの縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体、または
(2)オリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイトとの縮合によって得られた亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体
である。
 亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、より好ましくはヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドとの縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である。
 亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、さらに好ましくは疎水性保護基を有する、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)と、水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されており、且つホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)との縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である。
 前記縮合は、3’末端から5’末端への方向にオリゴヌクレオチド鎖の伸長を行う縮合(以下「3’-5’縮合」と記載する)および5’末端から3’末端への方向にオリゴヌクレオチド鎖の伸長を行う縮合(以下「5’-3’縮合」と記載する)のいずれでもよい。以下、3’-5’縮合および5’-3’縮合のそれぞれにおいて好ましい前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)および前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)を順に説明する。
 3’-5’縮合において、前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)としては、例えば式(a-I):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000039
[式中、
 rは、0以上の整数を示し;
 r+1個のBaseは、それぞれ独立に、保護されていてもよい核酸塩基を示し;
 r+1個のXn1は、それぞれ独立に、酸素原子またはNHを示し;
 r+1個のXn2は、それぞれ独立に、水素原子、ハロゲン原子、保護されていてもよい水酸基、または2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基を示し;
 r個のR10は、それぞれ独立に、酸素原子または硫黄原子を示し;
 r個のRp1は、それぞれ独立に、リン酸基の保護基を示し;
 Pgは、**L-Y-Z(式中、**はXn1との結合位置を示す)、**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体を示し;並びに
 L、YおよびZの定義および説明は、前述の保護基(Pg-5)でのL、YおよびZの定義および説明と同じである。]
で表される化合物(即ち、ヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチド)が挙げられる。
 rが0である場合、化合物(a-I)はヌクレオシドであり、rが1以上である場合、化合物(a-I)はオリゴヌクレオチドである。rは、49以下が好ましく、29以下がより好ましく、19以下がさらに好ましく、4以下が特に好ましく、2以下が最も好ましい。
 核酸塩基であるBaseのアミノ基は、保護基で保護されていることが好ましい。アミノ基の保護基としては、例えば前述のアミノ基の保護基が挙げられるが、Baseのアミノ基の保護基は、好ましくはアセチル基、フェノキシアセチル基、4-イソプロピルフェノキシアセチル基、ベンゾイル基、イソブチリル基、(2-ヘキシル)デカノイル基、ジメチルホルムアミジニル基、および=NC(R11)-N(R12)(R13)で表される(式中、R11は、メチル基を示し、R12およびR13は、それぞれ独立にC1-6アルキル基を示すか、またはR11およびR12が一緒になって、それらが結合する炭素原子および窒素原子と共に5または6員の含窒素複素環を形成していてもよい。)である。化合物(a-I)が複数のアミノ基を有する場合、アミノ基の保護基は1種のみでもよく、2種以上でもよい。
 Xn2のハロゲン原子としては、フッ素原子、塩素原子が好ましく、フッ素原子がより好ましい。
 Xn2の保護されていてもよい水酸基の保護基としては、例えば前述の水酸基の保護基が挙げられるが、好ましくはメチル基、2-メトキシエチル基、トリエチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、またはtert-ブチルジメチルシリル基、(2-シアノエトキシ)メチル基、1-(2-シアノエトキシ)エチル基である。
 Xn2の「2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基」としては、ヌクレオシドの2位炭素原子および4位炭素原子と結合する限り特に限定はない。この2価の有機基としては、例えば、置換されていてもよいC2-7アルキレン基、並びに-O-、-NR33-(R33は水素原子またはC1-6アルキル基を示す)、-S-、-CO-、-COO-、-OCONR34-(R34は水素原子またはC1-6アルキル基を示す)および-CONR35-(R35は水素原子またはC1-6アルキル基を示す)から選ばれる2価のリンカーと、置換されていてもよいC1-7アルキレン基とから構成される2価の有機基等が挙げられる。C1-7アルキレン基およびC2-7アルキレン基が有していてもよい置換基としては、例えば、メチリデン基(CH=)が挙げられる。
 「2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基」としては、置換されていてもよいC2-7アルキレン基、-OR-(Rは4位炭素原子と結合するC1-6アルキレン基を示す)、-O-NR33-R-(Rは4位炭素原子と結合するC1-6アルキレン基を示し、R33は前記と同義を示す)、-O-R-O-R-(RはC1-6アルキレン基を示し、Rは4位炭素原子と結合架橋するC1-6アルキレン基を示す)が好ましく、-OR-(Rは前記と同義を示す)、-O-NR33-R-(RおよびR33は前記と同義を示す)、-O-R-O-R-(RおよびRは前記と同義を示す)がより好ましい。R、R、RおよびRで示されるC1-6アルキレン基としては、それぞれ独立に、メチレン基またはエチレン基が好ましい。
 「2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基」としては、-O-CH-、-O-CH-CH-、-O-NR33-CH-(R33は前記と同義を示す)、-O-CH-O-CH-がより好ましく、-O-CH-、-O-CH-CH-、-O-NH-CH-、-O-N(CH)-CH-、-O-CH-O-CH-(それぞれ、左側が2位炭素原子に結合し、右側が4位炭素原子に結合する。)がさらに好ましい。
 r+1個のXn2は、それぞれ独立に、好ましくは水素原子、ハロゲン原子、または保護されていてもよい水酸基であり、より好ましくは水素原子、フッ素原子または保護されていてもよい水酸基である。
 r個のRp1としては、例えば前述のリン酸基の保護基が挙げられるが、好ましくは2-シアノエチル基である。
 前記式(a-I)中のPgが**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体である場合、化合物(a-I)は、固相担体に担持されたヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドである。Pgは、好ましくは**L-Y-Z(式中、**はXn1との結合位置を示す)または固相担体であり、より好ましくは**L-Y-Zである。L、YおよびZの定義および説明は、前述の保護基(Pg-5)でのL、YおよびZの定義および説明と同じである。
 3’-5’縮合において、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)としては、例えば
式(b-I):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000040
[式中、
 sは、0以上の整数を示し;
 s+1個のBaseは、それぞれ独立に、保護されていてもよい核酸塩基を示し;
 s+1個のXn3は、それぞれ独立に、酸素原子またはNHを示し;
 s+1個のXn4は、それぞれ独立に、水素原子、ハロゲン原子、保護されていてもよい水酸基、または2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基を示し;
 Q”は、水酸基の酸性条件下で除去可能な一時保護基を示し;
 s個のR14は、それぞれ独立に、酸素原子または硫黄原子を示し;
 s+1個のRp2は、それぞれ独立に、リン酸基の保護基を示し;並びに
 R15およびR16は、それぞれ独立に、アルキル基を示すか、または隣接する窒素原子と一緒になって形成する5または6員の飽和環状アミノ基を示し、かかる飽和環状アミノ基は、窒素原子の他に環構成原子として酸素原子または硫黄原子を1個有していてもよい。]
で表される化合物(即ち、ヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチド)が挙げられる。
 sが0である場合、化合物(b-I)は、ホスホロアミダイト化されたヌクレオシドであり、sが1以上である場合、化合物(b-I)は、ホスホロアミダイト化されたオリゴヌクレオチドである。化合物(b-I)において、sは、49以下が好ましく、29以下がより好ましく、19以下がさらに好ましく、4以下が特に好ましく、2以下が最も好ましい。
 核酸塩基であるBaseのアミノ基は、保護基で保護されていることが好ましい。該保護基としては、前述のアミノ基の保護基に加えて、前述の-L-Y-Z基を使用することができる。該保護基は、好ましくは前述のアミノ基の保護基であり、より好ましくは、アセチル基、フェノキシアセチル基、4-イソプロピルフェノキシアセチル基、ベンゾイル基、イソブチリル基、(2-ヘキシル)デカノイル基、ジメチルホルムアミジニル基、および=NC(R11)-N(R12)(R13)で表される基(式中、R11は、メチル基を示し、R12およびR13は、それぞれ独立にC1-6アルキル基を示すか、またはR11およびR12が一緒になって、それらが結合する炭素原子および窒素原子と共に5または6員の含窒素複素環を形成していてもよい。)である。化合物(b-I)が複数のアミノ基を有する場合、アミノ基の保護基は1種のみでもよく、2種以上でもよい。
 前記式(b-I)中のXn4の説明は、前記式(a-I)中のXn2の説明と同じである。s+1個のXn4は、それぞれ独立に、好ましくは水素原子、ハロゲン原子、または保護されていてもよい水酸基であり、より好ましくは水素原子または保護されていてもよい水酸基である。
 前記式(b-I)中のRp2の説明は、前記式(a-I)中のRp1の説明と同じである。
 s+1個のRp2としては、例えば前述のリン酸基の保護基が挙げられるが、好ましくは2-シアノエチル基である。
 前記式(b-I)中のR15およびR16は、それぞれ独立に、好ましくはC1-10アルキル基であるか、または隣接する窒素原子と一緒になって形成する5または6員の飽和環状アミノ基であり、より好ましくはC1-10アルキル基であり、さらに好ましくはC1-6アルキル基である。
 化合物(a-I)および化合物(b-I)は、公知の方法(例えば国際公開第2017/104836号に記載の方法)またはそれに準じた方法によって製造することができる。
 化合物(a-I)および化合物(b-I)の縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、下記式(c-I)で表される化合物である(下記式(c-I)の記号の定義および説明は前述の通りである)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000041
 前記式(c-I)中のPgが**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体である場合、化合物(c-I)は、固相担体に担持されたオリゴヌクレオチド前駆体である。Pgは、好ましくは**L-Y-Z(式中、**はXn1との結合位置を示す)または固相担体であり、より好ましくは**L-Y-Zである。
 前記式(c-I)中、s個のR14およびr個のR10の少なくとも一つが硫黄原子であることが好ましい。
 5’-3’縮合において、前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)としては、例えば式(a-I’):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000042
[式中、
 rは、0以上の整数を示し;
 r+1個のBaseは、それぞれ独立に、保護されていてもよい核酸塩基を示し;
 r個のXn1は、それぞれ独立に、酸素原子またはNHを示し;
 r+1個のXn2は、それぞれ独立に、水素原子、ハロゲン原子、保護されていてもよい水酸基、または2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基を示し;
 Xn5は、水酸基またはアミノ基を示し;
 r個のR10は、それぞれ独立に、酸素原子または硫黄原子を示し;
 r個のRp1は、それぞれ独立に、リン酸基の保護基を示し;
 Pgは、**L-Y-Z(式中、**は、酸素原子との結合位置を示す)、**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体を示し;並びに
 L、YおよびZの定義および説明は、前述の保護基(Pg-5)でのL、YおよびZの定義および説明と同じである。]
で表される化合物(即ち、ヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチド)が挙げられる。
 式(a-I’)中のXn5は、好ましくは水酸基である。Xn5以外の記号の説明は、前記式(a-I)中の記号の説明と同じである。
 前記式(a-I’)中のPgが**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体である場合、化合物(a-I’)は、固相担体に担持されたヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドである。Pgは、好ましくは**L-Y-Z(式中、**は、酸素原子との結合位置を示す)または固相担体であり、より好ましくは**L-Y-Zである。
 5’-3’縮合において、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)としては、例えば式(b-I’):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000043
[式中、
 sは、0以上の整数を示し;
 s+1個のBaseは、それぞれ独立に、保護されていてもよい核酸塩基を示し;
 s個のXn3は、それぞれ独立に、酸素原子またはNHを示し;
 s+1個のXn4は、それぞれ独立に、水素原子、ハロゲン原子、保護されていてもよい水酸基、または2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基を示し;
 Xn6は、酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されている水酸基、または酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているアミノ基を示し;
 s個のR14は、それぞれ独立に、酸素原子または硫黄原子を示し;
 s+1個のRp2は、それぞれ独立に、リン酸基の保護基を示し;並びに
 R15およびR16は、それぞれ独立に、アルキル基を示すか、または隣接する窒素原子と一緒になって形成する5または6員の飽和環状アミノ基を示し、かかる飽和環状アミノ基は、窒素原子の他に環構成原子として酸素原子または硫黄原子を1個有していてもよい。]
で表される化合物が挙げられる。
 Xn6は、好ましくは酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されている水酸基である。Xn6以外の記号の説明は、前記式(b-I)中の記号の説明と同じである。
 化合物(a-I’)および化合物(b-I’)は、公知の方法(例えば国際公開第2017/104836号に記載の方法)またはそれに準じた方法によって製造することができる。
 化合物(a-I’)および化合物(b-I’)の縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、下記式(c-I’):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000044
[式中、
 rは、0以上の整数を示し;
 r+1個のBaseは、それぞれ独立に、保護されていてもよい核酸塩基を示し;
 r+1個のXn1は、それぞれ独立に、酸素原子またはNHを示し;
 r+1個のXn2は、それぞれ独立に、水素原子、ハロゲン原子、保護されていてもよい水酸基、または2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基を示し;
 r個のR10は、それぞれ独立に、酸素原子または硫黄原子を示し;
 r個のRp1は、それぞれ独立に、リン酸基の保護基を示し;
 sは、0以上の整数を示し;
 s+1個のBaseは、それぞれ独立に、保護されていてもよい核酸塩基を示し;
 s個のXn3は、それぞれ独立に、酸素原子またはNHを示し;
 s+1個のXn4は、それぞれ独立に、水素原子、ハロゲン原子、保護されていてもよい水酸基、または2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基を示し;
 Xn6は、酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されている水酸基、または酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているアミノ基を示し;
 s個のR14は、それぞれ独立に、酸素原子または硫黄原子を示し;
 s+1個のRp2は、それぞれ独立に、リン酸基の保護基を示し;
 Pgは、**L-Y-Z(式中、**は、酸素原子との結合位置を示す)、**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体を示し;並びに
 L、YおよびZの定義および説明は、前述の保護基(Pg-5)でのL、YおよびZの定義および説明と同じである。]
で表される化合物である(式中の記号の説明は前述の通りである)。
 前記式(c-I’)中のPgが**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体である場合、化合物(c-I’)は、固相担体に担持されたオリゴヌクレオチド前駆体である。Pgは、好ましくは**L-Y-Z(式中、**は、酸素原子との結合位置を示す)または固相担体であり、より好ましくは**L-Y-Zである。
 前記式(c-I’)中、r個のR10およびs個のR14の少なくとも一つが硫黄原子であることが好ましい。
 次に「オリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイトとの縮合によって得られた亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体」を説明する。前記前駆体としては、例えば、式(γ-I)または式(γ-I’):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000045
[式中、
 tは、1以上の整数を示し、
 t+1個のBaseは、それぞれ独立に、保護されていてもよい核酸塩基を示し;
 t+1個のXn1は、それぞれ独立に、酸素原子またはNHを示し;
 t+1個のXn2は、それぞれ独立に、水素原子、ハロゲン原子、保護されていてもよい水酸基、または2位炭素原子および4位炭素原子と結合する2価の有機基を示し;
 t個のR10は、それぞれ独立に、酸素原子または硫黄原子を示し;
 t個のRp1およびRp3は、それぞれ独立に、リン酸基の保護基を示し;
 Rp4は、保護されたアミノ基を有するアルキル基、またはリン酸基の保護基を示し;
 Pgは、**L-Y-Z(式中、**は、Xn1との結合位置または酸素原子との結合位置を示す)、**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体を示し;並びに
 L、YおよびZの定義および説明は、前述の保護基(Pg-5)でのL、YおよびZの定義および説明と同じである。]
で表される化合物が挙げられる。
 前記式(γ-I)または式(γ-I’)中のPgが**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体である場合、化合物(γ-I)または化合物(γ-I’)は、固相担体に担持されたオリゴヌクレオチド前駆体である。Pgは、好ましくは**L-Y-Z(式中、**は、酸素原子との結合位置を示す)または固相担体であり、より好ましくは**L-Y-Zである。
 前記式(γ-I)および式(γ-I’)中の記号について説明する。tは、49以下が好ましく、29以下がより好ましく、19以下がさらに好ましく、4以下が特に好ましく、2以下が最も好ましい。Rp3およびRp4の「リン酸基の保護基」としては、例えば、前述のリン酸基の保護基が挙げられる。Rp3は、好ましくは2-シアノエチル基である。Rp4の「保護されたアミノ基を有するアルキル基」中の「保護されたアミノ基」としては、例えば、前述のアミノ基の保護基で保護されたアミノ基が挙げられる。Rp4の「保護されたアミノ基を有するアルキル基」は、好ましくは保護されたアミノ基を有するC1-6アルキル基であり、より好ましくは6-(トリフルオロアセチルアミノ)ヘキシル基である。Rp4は、好ましく2-シアノエチル基または6-(トリフルオロアセチルアミノ)ヘキシル基である。その他の記号の説明は、前述の通りである。
 本明細書中、「ホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体」とは、オリゴヌクレオチド中のリン酸エステル結合がホスホン酸エステル結合に置き換わった前駆体を意味する。この前駆体を酸化することによって、リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドを製造することができる。
 ホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、好ましくは、疎水性保護基を有する、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)と、水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されたH-ホスホネート(B)との縮合によって得られた、ホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である。前記H-ホスホネート(B)は、トリエチルアミン塩等の塩の形態で使用してもよい。
 前記縮合は、3’-5’縮合および5’-3’縮合のいずれでもよい。3’-5’縮合および5’-3’縮合のそれぞれにおいて好ましい前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)および前記H-ホスホネート(B)を順に説明する。
 3’-5’縮合において、前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)は、好ましくは、前述の化合物(a-I)である。
 3’-5’縮合において、前記H-ホスホネート(B)としては、例えば下記式(B-I)で表される化合物が挙げられる(下記式(B-I)中の記号の定義および説明は、前記式(b-I)中の記号の定義および説明と同じである。)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000046
 化合物(B-I)は、公知の方法(例えば Acta Biochimica Polonica.1998, 45, 907-915. に記載の方法)またはそれに準じた方法によって製造することができる。
 化合物(a-I)および化合物(B-I)の縮合によって得られたホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、下記式(C-I)で表される化合物である(下記式(C-I)中の記号の定義および説明は、前記式(c-I)中の記号の定義および説明と同じである。)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000047
 前記式(C-I)中のPgが**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体である場合、化合物(C-I)は、固相担体に担持されたオリゴヌクレオチド前駆体である。Pgは、好ましくは**L-Y-Z(式中、**は、Xn1との結合位置を示す)または固相担体であり、より好ましくは**L-Y-Zである。
 前記式(C-I)中、s個のR14およびr個のR10の少なくとも一つが硫黄原子であることが好ましい。
 5’-3’縮合において、前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)は、好ましくは、前述の化合物(a-I’)である。
 5’-3’縮合において、H-ホスホネート(B)としては、例えば下記式(B-I’)で表される化合物が挙げられる(下記式(B-I’)の記号の定義および説明は、前記式(b-I’)中の記号の定義および説明と同じである)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000048
 化合物(B-I’)は、公知の方法(例えば Phosphorus Chemistry II. Topics in Current Chemistry, vol 361. Springer, Cham. Recent Advances in H-Phosphonate Chemistry に記載の方法)またはそれに準じた方法によって製造することができる。
 化合物(a-I’)および化合物(B-I’)の縮合によって得られたホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、下記式(C-I’)で表される化合物である(下記式(C-I’)中の記号の定義および説明は、前記式(c-I’)中の記号の定義および説明と同じである。)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000049
 前記式(C-I’)中のPgが**L-Y-Sp(式中、**はXn1との結合位置を示し、およびSpは固相担体を示す)または固相担体である場合、化合物(C-I)は、固相担体に担持されたオリゴヌクレオチド前駆体である。Pgは、好ましくは**L-Y-Z(式中、**は、酸素原子との結合位置を示す)または固相担体であり、より好ましくは**L-Y-Zである。
 前記式(C-I’)中、r個のR10およびs個のR14の少なくとも一つが硫黄原子であることが好ましい。
 本明細書中、「ワンポット合成」とは、中間体を合成する工程および目的の最終生成物を合成する工程を含む多段階の工程からなる合成であって、前記中間体を単離しない合成を意味する。なお、前記「中間体を合成する工程」は、一つのみでもよく、二つ以上でもよい。
2.本発明の製造方法
 以下、本発明の製造方法について説明する。本発明の製造方法は、酸化剤として下記式(I):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000050
で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)を使用して、亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体を酸化して、リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドを製造することを特徴とする。化合物(I)は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
2-1.酸化剤
 以下、本発明の製造方法で使用する酸化剤である、化合物(I)(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)について説明する。
 前記式(I)中のXは、単結合、硫黄原子、酸素原子、-S(=O)-または-N(-R)-である。
 Xが単結合である場合、前記式(I)中のRは、ハロゲン原子であり、および前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基である。
 Xが硫黄原子または-S(=O)-である場合、前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、および前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基である。
 Xが酸素原子である場合、前記式(I)中のRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および酸素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成する。
 Xが-N(-R)-である場合、
 (1)前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、並びに前記式(I)中のRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成するか、または
 (2)前記式(I)中のRおよびRは、それらが結合する窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びに前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基である。
2-1-1.化合物(IA)および化合物(IB)
 化合物(I)の中でも、
 前記式(I)中の、Xが-N(-R)-であり、Rが、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、並びにRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成する化合物(本明細書中「化合物(IA)」と記載する)、並びに
 前記式(I)中の、Xが、硫黄原子であり、Rが、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、およびRが、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基である化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)(以下、化合物(IB)」と記載する)
が好ましい。
 即ち、化合物(I)の中でも、
 Xが、硫黄原子または-N(-R)-であり、
 Rが、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、
 Xが硫黄原子である場合、Rは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、並びに
 Xが-N(-R)-である場合、RおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成する
化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)が好ましい。
 以下、まず、化合物(IA)および化合物(IB)について説明する。
2-1-1A.化合物(IA)
 まず、化合物(IA)について説明する。化合物(IA)において、前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、好ましくは置換されていてもよいC1-10アルキル基、置換されていてもよいフェニル基、置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基、または置換されていてもよい8~14員の縮合多環式ヘテロアリール基である。
 化合物(IA)において、前記式(I)中のRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成する。
2-1-1A-1.化合物(Ia)
 化合物(IA)は、好ましくは下記式(Ia)で表される化合物である。化合物(Ia)は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000051
 以下、化合物(Ia)の各基について説明する。
 前記式(Ia)中のR1aは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、好ましくは置換されていてもよいC1-10アルキル基、置換されていてもよいフェニル基、または置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基である。
 前記式(Ia)中の環Aは、5または6員の不飽和複素環である。前記式(Ia)中のY1aは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-であり、好ましくは-C(=O)-である。
 前記式(Ia)中のmは、0~3の整数であり、およびm個のR2aは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、好ましくは置換されていてもC1-6よいアルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基である。ここで「mが0である」とは、R2aが存在しないことを意味する。
 前記式(Ia)中のmが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2aは、環Aと共に、置換されていてもよい縮合環を形成していてもよい。
 環Aである5または6員の不飽和複素環は、下記式(r2)~(r4)のいずれかで表される環である[式中の記号の定義は前記の通りである。]。なお、下記式(r2)~(r4)ではR2aを省略している。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000052
 隣接する2個のR2aおよび環Aが形成する縮合環は、好ましくは2環式または3環式の縮合環であり、より好ましくは2環式の縮合環である。該縮合環としては、例えば、下記式(r5)~(r25)のいずれかで表される環が挙げられる。該縮合環は置換されていてもよい。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000053
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000054
2-1-1A-2.化合物(Ic)
 化合物(Ia)は、好ましくは下記式(Ic)で表される化合物である。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000055
 以下、化合物(Ic)の各基について説明する。
 前記式(Ic)中のR1cは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、好ましくは置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいフェニル基、または置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基である。
 本発明の製造方法の一態様において、R1cは、好ましくは
 (1)置換されていてもよいフェニル基および置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基
である。
 本発明の製造方法の別の一態様において、R1cは、好ましくは
 (1)置換されていてもよいフェニル基および置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基からなる群から選ばれる選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいピリジル基
である。
 本発明の製造方法の別の一態様において、R1cは、好ましくは
 (1)1または2個のピリジル基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいピリジル基
である。
 本発明の製造方法の別の一態様において、R1cは、好ましくは
 (1)1または2個のピリジル基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)1または2個のC1-6アルキル基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)ピリジル基(特に、2-ピリジル基または4-ピリジル基)
である。
 本発明の製造方法の別の一態様において、R1cは、好ましくは
 (1)C1-6アルキル基、
 (2)C1-6アルキル基、C1-6アルコキシ基およびハロゲン原子からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)1個のC1-6アルキル基で置換されているピリジル基(例、4-メチル-2-ピリジル基)
である。
 前記式(Ic)中のY1cは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-であり、好ましくは-C(=O)-である。
 前記式(Ic)中のpは、0または1であり、好ましくは0である。ここで「pが0である」とは、式(Ic)中の-CH(R2c)-が存在しないことを意味する。
 前記式(Ic)中のR2cは、水素原子、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、好ましくは水素原子、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基である。
 前記式(Ic)中の環Cは、6員の芳香族炭化水素環、6員の含窒素芳香族複素環、または窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環である。
 本発明の製造方法の一態様において、前記環Cは、好ましくは6員の芳香族炭化水素環(即ち、ベンゼン環)または6員の含窒素芳香族複素環であり、より好ましくはベンゼン環またはピリジン環であり、さらに好ましくはピリジン環である。
 本発明の製造方法の別の一態様において、前記環Cは、好ましくはベンゼン環、ピリジン環またはキノリン環である。
 前記式(Ic)中のqは、0~4の整数であり、好ましくは0~2の整数であり、より好ましくは0または1である。ここで「qが0である」とは、R3cが存在しないことを意味する。
 前記式(Ic)中のq個のR3cは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基である。
 本発明の製造方法の一態様において、q個のR3cは、それぞれ独立に、好ましくは置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基であり、より好ましくはハロゲン原子またはニトロ基であり、さらに好ましくはニトロ基である。
 本発明の製造方法の別の一態様において、q個のR3cは、それぞれ独立に、好ましくは電子求引性基であり、より好ましくはハロゲン原子、C1-6パーフルオロアルキル基またはニトロ基であり、さらに好ましくはC1-6パーフルオロアルキル基またはニトロ基であり、特に好ましくはトリフルオロメチル基である。
 好適な化合物(Ic)としては、以下の化合物が挙げられる。以下の化合物は、いずれも1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
(化合物(Ic-i))
 前記式(Ic)中の、
 R1cが、
 (1)置換されていてもよいフェニル基および置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基
であり、
 Y1cが、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-であり、
 pが、0または1であり、
 R2cが、水素原子、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、
 環Cが、6員の芳香族炭化水素環または6員の含窒素芳香族複素環であり、
 qが、0~4の整数であり、並びに
 q個のR3cが、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基である
化合物(本明細書中「化合物(Ic-i)」と記載する)。
(化合物(Ic-ii))
 前記式(Ic)中の、
 R1cが、
 (1)置換されていてもよいフェニル基および置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基からなる群から選ばれる選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいピリジル基
であり、
 Y1cが、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-であり
 pが、0または1であり、
 R2cが、水素原子、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基であり、
 環Cが、6員の芳香族炭化水素環または6員の含窒素芳香族複素環であり、
 qが、0~2の整数であり、並びに
 q個のR3cが、それぞれ独立に、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基である
化合物(本明細書中「化合物(Ic-ii)」と記載する)。
(化合物(Ic-iii))
 前記式(Ic)中の、
 R1cが、
 (1)1または2個のピリジル基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいピリジル基
であり、
 Y1cが、-C(=O)-であり
 pが、0であり、
 環Cが、ベンゼン環またはピリジン環であり、
 qが、0~2の整数であり、
 q個のR3cが、それぞれ独立に、ハロゲン原子またはニトロ基である
化合物(本明細書中「化合物(Ic-iii)」と記載する)。
(化合物(Ic-iv))
 前記式(Ic)中の、
 R1cが、
 (1)1または2個のピリジル基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)1または2個のC1-6アルキル基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)ピリジル基(特に、2-ピリジル基または4-ピリジル基)
であり、
 Y1cが、-C(=O)-であり
 pが、0であり、
 環Cが、ベンゼン環またはピリジン環であり、
 qが、0~2の整数であり、並びに
 q個のR3cが、ニトロ基である
化合物(本明細書中「化合物(Ic-iv)」と記載する)。
(化合物(Ic-i’))
 前記式(Ic)中の、
 R1cが、
 (1)置換されていてもよいフェニル基および置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基
であり、
 Y1cが、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-であり、
 pが、0または1であり、
 R2cが、水素原子、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、
 環Cが、6員の芳香族炭化水素環、6員の含窒素芳香族複素環、または窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環であり、
 qが、0~4の整数であり、並びに
 q個のR3cが、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基である
化合物(本明細書中「化合物(Ic-i’)」と記載する)。
(化合物(Ic-ii’))
 前記式(Ic)中の、
 R1cが、
 (1)置換されていてもよいフェニル基および置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基からなる群から選ばれる選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよいC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいピリジル基
であり、
 Y1cが、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-であり
 pが、0または1であり、
 R2cが、水素原子、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基であり、
 環Cが、6員の芳香族炭化水素環、6員の含窒素芳香族複素環、または窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環であり、
 qが、0~2の整数であり、並びに
 q個のR3cが、それぞれ独立に、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基である
化合物(本明細書中「化合物(Ic-ii’)」と記載する)。
(化合物(Ic-iii’))
 前記式(Ic)中の、
 R1cが、
 (1)C1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいピリジル基
であり、
 Y1cが、-C(=O)-であり
 pが、0または1であり、
 環Cが、ベンゼン環、ピリジン環またはキノリン環であり、
 qが、0~2の整数であり、
 q個のR3cが、それぞれ独立に、ハロゲン原子、C1-6パーフルオロアルキル基またはニトロ基である
化合物(本明細書中「化合物(Ic-iii’)」と記載する)。
(化合物(Ic-iv’))
 前記式(Ic)中の、
 R1cが、
 (1)C1-6アルキル基、
 (2)C1-6アルキル基、C1-6アルコキシ基およびハロゲン原子からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (3)1または2個のC1-6アルキル基で置換されているピリジル基(例、4-メチル-2-ピリジル基)
であり、
 Y1cが、-C(=O)-であり
 pが、0または1であり、
 環Cが、ベンゼン環、ピリジン環またはキノリン環であり、
 qが、0~2の整数であり、並びに
 q個のR3cが、C1-6パーフルオロアルキル基である
化合物(本明細書中「化合物(Ic-iv’)」と記載する)。
(化合物(Ic)の好ましい具体例)
 化合物(Ic)の好ましい具体例としては、下記式(Ic-1)~(Ic-17)のいずれかで表される化合物が挙げられる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000056
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000057
 本発明の製造方法の一態様において、化合物(Ic)は、好ましくは2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-3))、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-4))、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-5))、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-6))、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-7))、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-8))、2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-9))、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-10))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン(化合物(Ic-11))、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-14))、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-16))、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-17))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(Ic)は、好ましくは2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-3))、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-4))、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-5))、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-6))、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-7))、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-8))、および2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-9))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(Ic)は、好ましくは2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-5))、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-10))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン(化合物(Ic-11))、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))、2-(2,6ージメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-14))、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))、2-(4ーメトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-16))、および2-(4ーフルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-17))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(Ic)は、好ましくは2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-10))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン(化合物(Ic-11))、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))、2-(2,6ージメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-14))、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))、2-(4ーメトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-16))、および2-(4ーフルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-17))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法において、化合物(Ic)は、最も好ましくは2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))である。
2-1-1B.化合物(IB)
 次に、化合物(IB)について説明する。化合物(IB)において、前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、好ましくは置換されていてもよいC1-10アルキル基、置換されていてもよいフェニル基、置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基、または置換されていてもよい8~14員の縮合多環式ヘテロアリール基である。
 化合物(IB)において、前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、好ましくは置換されていてもよいフェニル基、置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基、または置換されていてもよい8~14員の縮合多環式ヘテロアリール基である。
2-1-1B-1.化合物(Ib)
 化合物(IB)は、好ましくは下記式(Ib)で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)である。化合物(Ib)は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000058
 以下、化合物(Ib)の各基について説明する。
 前記式(Ib)中のR1bは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、好ましくは置換されていてもよいC1-10アルキル基、置換されていてもよいフェニル基、置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基、または置換されていてもよい8~14員の縮合多環式ヘテロアリール基である。
 本発明の製造方法の一態様(以下「態様(A)」と記載する)において、R1bは、より好ましくは
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたアルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、
 (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
 (10)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (11)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~3個の置換基で置換されていてもよい2-イミダゾリル基
である。
 態様(A)において、R1bは、さらに好ましくは
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたアルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である。
 態様(A)において、R1bは、特に好ましくは
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (6)置換されていてもよいC1-6アルキル基および置換されていてもよいフェニル基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (7)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (8)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (9)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である。
 態様(A)において、R1bは、最も好ましくは、1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、5-(1,2,3-トリアゾリル)基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基である。
 本発明の製造方法の別の一態様(以下「態様(B)」と記載する)において、R1bは、より好ましくは
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたアルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である。
 態様(B)において、R1bは、さらに好ましくは
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいC1-6アルキル基および置換されていてもよいフェニル基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (8)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である。
 態様(B)において、R1bは、特に好ましくは、1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基である。
 前記式(Ib)中の環Bは、6員の芳香族炭化水素環(即ち、ベンゼン環)、または5若しくは6員の芳香族複素環であり、好ましくは5または6員の芳香族複素環であり、より好ましくはトリアゾール環、テトラゾール環、ピリジン環またはピリジン-N-オキシド環であり、さらに好ましくはテトラゾール環、ピリジン環またはピリジン-N-オキシド環である。
 前記式(Ib)中のnは、0~5の整数であり、n個のR2bは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、より好ましくは置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基である。ここで、「nが0である」とは、R2bが存在しないことを意味する。
 前記式(Ib)中のnが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2bは、環Bと共に、置換されていてもよい2環式の縮合芳香族複素環(好ましくは置換されていてもよいベンゾイミダゾール環、置換されていてもよいベンゾオキサゾール環、または置換されていてもよいベンゾチアゾール環)を形成していてもよい。
 本発明の製造方法の一態様(以下「態様(C)」と記載する)において、化合物(Ib)における式(r1):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000059
で表される基は、好ましくは
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
 (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (10)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~3個の置換基で置換されていてもよい2-イミダゾリル基
である。
 態様(C)において、基(r1)は、より好ましくは
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である。
 態様(C)において、基(r1)は、さらに好ましくは
 (1)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (5)置換されていてもよいC1-6アルキル基および置換されていてもよいフェニル基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (8)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である。
 態様(C)において、基(r1)は、特に好ましくは2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、5-(1,2,3-トリアゾリル)基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基であり、最も好ましくは2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、5-(1,2,3-トリアゾリル)基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、または(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基である。
 本発明の製造方法の別の一態様(以下「態様(D)」と記載する)において、基(r1)は、好ましくは
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である。
 態様(D)において、基(r1)は、さらに好ましくは
 (1)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいC1-6アルキル基および置換されていてもよいフェニル基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (5)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (6)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (7)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である。
 態様(D)において、基(r1)は、特に好ましくは2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基であり、最も好ましくは2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、または(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基である。
 好適な化合物(Ib)としては、以下の化合物が挙げられる。以下の化合物は、いずれも1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
(化合物(Ib-i))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたアルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、
 (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
 (10)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (11)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~3個の置換基で置換されていてもよい2-イミダゾリル基
であり、並びに
 基(r1)が、
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
 (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
 (10)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~3個の置換基で置換されていてもよい2-イミダゾリル基
である化合物(本明細書中「化合物(Ib-i)」と記載する)。
(化合物(Ib-ii))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたアルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
であり、並びに
 基(r1)が、
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である化合物(本明細書中「化合物(Ib-ii)」と記載する)。
(化合物(Ib-iii))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (6)置換されていてもよいC1-6アルキル基および置換されていてもよいフェニル基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (7)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (8)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (9)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
であり、並びに
 基(r1)が、
 (1)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
 (5)置換されていてもよいC1-6アルキル基および置換されていてもよいフェニル基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (8)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である化合物(本明細書中「化合物(Ib-iii)」と記載する)。
(化合物(Ib-iv))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、5-(1,2,3-トリアゾリル)基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基であり、および
 基(r1)が、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、5-(1,2,3-トリアゾリル)基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基である化合物(本明細書中「化合物(Ib-iv)」と記載する)。
(化合物(Ib-v))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、5-(1,2,3-トリアゾリル)基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基であり、および
 基(r1)が、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、5-(1,2,3-トリアゾリル)基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、または(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基である化合物(本明細書中「化合物(Ib-v)」と記載することがある)である。
(化合物(Ib-i’))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたアルキル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
であり、並びに
 基(r1)が、
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (5)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
である化合物(本明細書中「化合物(Ib-i’)」と記載する)。
(化合物(Ib-ii’))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、
 (1)1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (4)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (5)置換されていてもよいC1-6アルキル基および置換されていてもよいフェニル基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (6)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (7)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (8)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
であり、並びに
 基(r1)が、
 (1)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
 (3)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
 (4)置換されていてもよいC1-6アルキル基および置換されていてもよいフェニル基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
 (5)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
 (6)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、または
 (7)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基
である化合物(本明細書中「化合物(Ib-ii’)」と記載する)。
(化合物(Ib-iii’))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基であり、および
 基(r1)が、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基である化合物(本明細書中「化合物(Ib-iii’)」と記載する)。
(化合物(Ib-iv’))
 前記式(Ib)中の、
 R1bが、1個のカルボキシ基で置換されたC1-6アルキル基、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、4-ピリジル基、または2-ピリジル基であり、および
 基(r1)が、2-ベンゾチアゾリル基、2-ベンゾイミダゾリル基、2-ベンゾオキサゾリル基、1-フェニル-1H-テトラゾール-5-イル基、または(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基である化合物(本明細書中「化合物(Ib-iv’)」と記載することがある)である。
(化合物(Ib)の好ましい具体例)
 化合物(Ib)の好ましい具体例としては、下記式(Ib-1)~(Ib-12)のいずれかで表される化合物が挙げられる(下記式(Ib-7)中のPhはフェニル基を示す)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000060
 本発明の製造方法の一態様において、化合物(Ib)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド(化合物(Ib-6))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))、4,4’-ジピリジルジスルフィド(化合物(Ib-9))、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-10))、2,2’-ジチオビス(1H-イミダゾール)(化合物(Ib-11))、および2,2’-ジチオビス(1-メチル-1H-イミダゾール)(化合物(Ib-12))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(Ib)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド(化合物(Ib-6))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))、4,4’-ジピリジルジスルフィド(化合物(Ib-9))、および3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-10))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(Ib)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))、4,4’-ジピリジルジスルフィド(化合物(Ib-9))、および3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-10))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(Ib)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド(化合物(Ib-6))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、および2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(Ib)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、および2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法のにおいて、化合物(Ib)は、最も好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))である。
2-1-2.化合物(ID)~化合物(IG)
 前述の化合物(IA)および化合物(IB)以外の化合物(I)は、以下の化合物に分類することができる:
 前記式(I)中の、Xが、単結合であり、Rが、ハロゲン原子であり、および前記式(I)中のRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(ID)」と記載する)、
 前記式(I)中の、Xが、-S(=O)-であり、Rが、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基であり、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(IE)」と記載する)、
 前記式(I)中の、Xが、酸素原子であり、並びにRおよびRが、それらが結合する硫黄原子および酸素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成する化合物(本明細書中「化合物(IF)」と記載する)、並びに
 前記式(I)中の、Xが-N(-R)-であり、RおよびRが、それらが結合する窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びにRが、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(IG)」と記載する)。
 化合物(ID)、化合物(IE)、化合物(IF)および化合物(IG)は、いずれも1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。以下、化合物(ID)、化合物(IE)、化合物(IF)および化合物(IG)について順に説明する。
2-1-2D.化合物(ID)
 前記式(I)中のXが単結合である化合物(ID)について説明する。化合物(ID)は、下記式(Id):
2d-S-R1d   (Id)
[式中、R1dは、ハロゲン原子を示し、およびR2dは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示す。]。
で表すことができる。化合物(Id)(=化合物(ID))は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 前記式(Id)中のR1dは、好ましくは塩素原子である。前記式(Id)中のR2dは、好ましくは置換されていてもよいヘテロアリール基であり、より好ましくは電子求引性基で置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基であり、さらに好ましくはニトロ基で置換されていてもよいピリジル基である。
 好適な化合物(Id)としては、以下の化合物が挙げられる。以下の化合物は、いずれも1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
(化合物(Id-i))
 前記式(Id)中、R1dが、ハロゲン原子であり、およびR2dが、置換されていてもよいヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(Id-i)」と記載する)。
(化合物(Id-ii))
 前記式(Id)中、R1dが、塩素原子であり、およびR2dが、電子求引性基で置換されていてもよい5または6員の単環式ヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(Id-ii)」と記載する)。
(化合物(Id-iii))
 前記式(Id)中、R1dが、塩素原子であり、およびR2dが、ニトロ基で置換されていてもよいピリジル基である化合物(本明細書中「化合物(Id-iii)」と記載する)。
(化合物(Id)の好ましい具体例)
 化合物(Id)の好ましい具体例は、下記式(Id-1)で表される3-ニトロ-2-ピリジンスルフェニルクロリドである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000061
2-1-2E.化合物(IE)
 前記式(I)中のXが-S(=O)-である化合物(IE)について説明する。化合物(IE)は、下記式(Ie):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000062
[式中、R1eおよびR2eは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示す。]
で表すことができる。化合物(Ie)(=化合物(IE))は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 前記式(Ie)中のR1eおよびR2eは、それぞれ独立に、好ましくは置換されていてもよいアリール基であり、より好ましくは置換されていてもよいフェニル基である。
(化合物(Ie)の好ましい具体例)
 化合物(Ie)の好ましい具体例は、下記式(Ie-1)で表される(S)-フェニル
 ベンゼンチオスルホナートである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000063
2-1-2F.化合物(IF)
 前記式(I)中の、Xが、酸素原子であり、並びにRおよびRが、それらが結合する硫黄原子および酸素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成する化合物(IF)について説明する。化合物(IF)は、好ましくは、下記式(If):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000064
[式中、
 環Dは、6員の芳香族炭化水素環または5若しくは6員の芳香族複素環を示し、
 wは、0~4の整数を示し、
 w個のR1fは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、
 X1fは、-C(=O)-、-C(=S)-、-S(=O)-または-CHR2f-を示し、
 R2fは、水素原子、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
 vは、0~3の整数を示す。]
で表される化合物である。化合物(If)は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 前記式(If)中の環Dは、好ましくは6員の芳香族炭化水素環(即ち、ベンゼン環)である。
 前記式(If)中のwは、好ましくは0~2の整数であり、より好ましくは0または1である。ここで「wが0である」とは、R1fが存在しないことを意味する。
 前記式(If)中のw個のR1fは、それぞれ独立に、好ましくは置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子またはニトロ基である。
 前記式(If)中のR2fは、好ましくは水素原子、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、または電子求引性基であり、より好ましくは水素原子、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子またはニトロ基である。
 前記式(If)中のX1fは、好ましくは-C(=O)-である。
 前記式(If)中のvは、好ましくは0である。ここで「vが0である」とは、前記式(If)中の括弧内の-CH-が存在しないことを意味する。
 好適な化合物(If)としては、以下の化合物が挙げられる。以下の化合物は、いずれも1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
(化合物(If-i)
 前記式(If)中の、
 環Dが、ベンゼン環であり、
 wが、好ましくは0~2の整数であり、および
 w個のR1fが、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、
 X1fが、-C(=O)-であり、および
 vが、0~3の整数である化合物(本明細書中「化合物(If-i)」と記載する)。
(化合物(If-ii)
 前記式(If)中の、
 環Dが、ベンゼン環であり、
 wが、好ましくは0~2の整数であり、および
 w個のR1fが、それぞれ独立に、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子またはニトロ基であり、
 X1fが、-C(=O)-であり、および
 vが、0~3の整数である化合物(本明細書中「化合物(If-ii)」と記載する)。
(化合物(If-iii)
 前記式(If)中の、
 環Dが、ベンゼン環であり、
 wが、好ましくは0または1の整数であり、
 R1fが、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子またはニトロ基であり、および
 X1fが、-C(=O)-であり、
 vが、0である化合物(本明細書中「化合物(If-iii)」と記載する)。
(化合物(If)の好ましい具体例)
 化合物(If)の好ましい具体例は、下記式(If-1)で表される3H-2,1-ベンゾオキサチオール-3-オンである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000065
2-1-2G.化合物(IG)
 前記式(I)中の、Xが-N(-R)-であり、RおよびRが、それらが結合する窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びにRが、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基である化合物(IG)について説明する。化合物(IG)は、好ましくは、下記式(Ig):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000066
[式中、
 環Eは、4~8員の含窒素複素環を示し、
 xは、0~6の整数を示し、
 x個のR1gは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、オキソ基、または電子求引性基を示し、
 xが2以上の整数である場合、隣接する2個のR1gは、環Eと共に、置換されていてもよい2環式の縮合含窒素複素環を形成していてもよく、および
 R2gは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示す。]
で表される化合物である。化合物(Ig)は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 前記式(Ig)中のR2gは、好ましくは置換されていてもよいヘテロアリール基であり、より好ましくは置換されていてもよい5若しくは6員の単環式の含窒素ヘテロアリール基、または置換されていてもよい8~14員の縮合多環式の含窒素ヘテロアリール基である。
 R2gは、さらに好ましくは
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、または
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基
である。
 R2gは、特に好ましくは
 (1)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、または
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基
である。
 R2gは、最も好ましくは2-ピリジル基または2-ベンゾチアゾリル基である。
 前記式(Ig)中のxは、0~6の整数であり、好ましくは2~6の整数である。ここで「xが0である」とは、R1gが存在しないことを意味する。
 前記式(Ig)中のx個のR1gは、それぞれ独立に、好ましくは置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、オキソ基、ハロゲン原子、またはニトロ基である。
 化合物(Ig)における式(r17):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000067
で表される基は、好ましくは式(r17’):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000068
[式中、
 環Fは、4~8員の含窒素複素環を示し、
 yは、0~4の整数を示し、および
 y個のR3gは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、
 yが2以上の整数である場合、隣接する2個のR3gは、環Fと共に、置換されていてもよい2環式の縮合含窒素複素環を形成していてもよい。]
で表される基である。
 前記式(r17’)中のyは、0~4である。ここで「yが0である」とは、R3gが存在しないことを意味する。
 前記式(r17’)中のy個のR3gは、それぞれ独立に、好ましくは置換されていてもC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、またはニトロ基であるか、または隣接する2個のR3gは、好ましくは、環Fと共に、置換されていてもよい2環式の縮合含窒素複素環を形成する。前記2環式の縮合含窒素複素環は、好ましくは置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいイソインドール環であり、より好ましくは置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいイソインドール環である。
 環Fは、好ましくはピロリジン環であるか、または隣接する2個のR3gと共に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいイソインドール環を形成する。
 環Fは、より好ましくはピロリジン環であるか、または隣接する2個のR3gと共に、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいイソインドール環を形成する。
 化合物(Ig)は、好ましくは下記式(Ig’)で表される、イミド結合(-C(=O)-N(-S-R2g)-C(=O)-)を有する化合物である(下記式中の記号の定義は、前述の通りである)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000069
 好適な化合物(Ig’)としては、以下の化合物が挙げられる。以下の化合物は、いずれも1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
(化合物(Ig-i-a))
 前記式(Ig’)中の、
 環Fが、ピロリジン環であり、
 yが、0~4の整数であり、
 y個のR3gが、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、
 R2gが、置換されていてもよいヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(Ig-i-a)」と記載する)。
(化合物(Ig-i-b))
 前記式(Ig’)中の、
 環Fが、隣接する2個のR3gと共に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいイソインドール環を形成し、および
 R2gが、置換されていてもよいヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(Ig-i-b)」と記載する)。
(化合物(Ig-ii-a))
 前記式(Ig’)中の、
 環Fが、ピロリジン環であり、
 yが、0~4の整数であり、
 y個のR3gが、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、および
 R2gが、置換されていてもよい5若しくは6員の単環式の含窒素ヘテロアリール基、または置換されていてもよい8~14員の縮合多環式の含窒素ヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(Ig-ii-a)」と記載する)。
(化合物(Ig-ii-b))
 前記式(Ig’)中の、
 環Fが、隣接する2個のR3gと共に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいイソインドール環を形成し、および
 R2gが、置換されていてもよい5若しくは6員の単環式の含窒素ヘテロアリール基、または置換されていてもよい8~14員の縮合多環式の含窒素ヘテロアリール基である化合物(本明細書中「化合物(Ig-ii-b)」と記載する)。
(化合物(Ig-iii-a))
 前記式(Ig’)中の、
 環Fが、ピロリジン環であり、
 yが、0~4の整数であり、
 y個のR3gが、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基であり、および
 R2gが、
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、または
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基
である化合物(本明細書中「化合物(Ig-iii-a)」と記載する)。
(化合物(Ig-iii-b))
 前記式(Ig’)中の、
 環Fが、隣接する2個のR3gと共に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいイソインドール環を形成し、および
 R2gが、
 (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、または
 (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基
である化合物(本明細書中「化合物(Ig-iii-b)」と記載する)。
(化合物(Ig-iv-a))
 前記式(Ig’)中の、
 環Fが、ピロリジン環であり、
 yが、0~4の整数であり、
 y個のR3gが、それぞれ独立に、置換されていてもC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、またはニトロ基であり、
 R2gが、
 (1)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、または
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基
である化合物(本明細書中「化合物(Ig-iv-a)」と記載する)。
(化合物(Ig-iv-b))
 前記式(Ig’)中の、
 環Fが、隣接する2個のR3gと共に、置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよいイソインドール環を形成し、および
 R2gが、
 (1)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、または
 (2)置換されていてもよいC1-6アルキル基、置換されていてもよいC1-6アルコキシ基、ハロゲン原子、およびニトロ基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基
である化合物(本明細書中「化合物(Ig-iv-b)」と記載する)。
(化合物(Ig)の好ましい具体例)
 化合物(Ig)の好ましい具体例としては、下記式(Ig-1)で表される1-(2-ピリジニルチオ)-2,5-ピロリジンジオン、下記式(Ig-2)で表される1-(2-ベンゾチアゾリルチオ)-2,5-ピロリジンジオン、下記式(Ig-3)で表される2-(2-ピリジニルチオ)-1H-イソインドール-1,3(2H)-ジオン、および下記式(Ig-4)で表される2-(2-ベンゾチアゾリルチオ)-1H-イソインドール-1,3(2H)-ジオンが挙げられる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000070
2-1-3.好ましい化合物(I)
 本発明の製造方法において、化合物(I)は、好ましくは化合物(Ia)および/または化合物(Ib)である。化合物(Ia)の中でも、化合物(Ic)が好ましい。
 本発明の製造方法の一態様において、化合物(I)は、好ましくは化合物(Ib)および/または化合物(Ic)であり、より好ましくは化合物(Ib-i)および/または化合物(Ic-i)であり、より一層好ましくは化合物(Ib-ii)および/または化合物(Ic-ii)であり、さらに好ましくは化合物(Ib-iii)および/または化合物(Ic-iii)であり、さらに一層好ましくは化合物(Ib-iv)および/または化合物(Ic-iv)であり、特に好ましくは化合物(Ib-v)および/または化合物(Ic-iv)である。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(I)は、好ましくは化合物(Ib-i’)および/または化合物(Ic-i’)であり、より好ましくは化合物(Ib-ii’)および/または化合物(Ic-ii’)であり、より一層好ましくは化合物(Ib-iii’)および/または化合物(Ic-iii’)であり、さらに好ましくは化合物(Ib-iv’)および/または化合物(Ic-iv’)である。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(I)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド(化合物(Ib-6))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))、4,4’-ジピリジルジスルフィド(化合物(Ib-9))、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-10))、2,2’-ジチオビス(1H-イミダゾール)(化合物(Ib-11))、2,2’-ジチオビス(1-メチル-1H-イミダゾール)(化合物(Ib-12))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-3))、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-4))、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-5))、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-6))、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-7))、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-8))、および2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-9))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(I)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド(化合物(Ib-6))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))、4,4’-ジピリジルジスルフィド(化合物(Ib-9))、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-10))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-3))、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-4))、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-5))、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-6))、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-7))、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-8))、および2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-9))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(I)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド(化合物(Ib-6))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-3))、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-4))、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-5))、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-6))、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-7))、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-8))、および2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-9))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(I)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド(化合物(Ib-6))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))、4,4’-ジピリジルジスルフィド(化合物(Ib-9))、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-10))、2,2’-ジチオビス(1H-イミダゾール)(化合物(Ib-11))、2,2’-ジチオビス(1-メチル-1H-イミダゾール)(化合物(Ib-12))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-3))、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-4))、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-5))、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-6))、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-7))、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-8))、2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-9))、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-10))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン(化合物(Ic-11))、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-14))、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-16))、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-17))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(I)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)(化合物(Ib-7))、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))、4,4’-ジピリジルジスルフィド(化合物(Ib-9))、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-10))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン(化合物(Ic-5))、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-10))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン(化合物(Ic-11))、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-14))、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-16))、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-17))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(I)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-2))、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-10))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン(化合物(Ic-11))、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-14))、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-16))、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-17))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法の別の一態様において、化合物(I)は、好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-14))、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-16))、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-17))からなる群から選ばれる少なくとも一つである。
 本発明の製造方法において、化合物(I)は、特に好ましくは2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド(化合物(Ib-1))および/または2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))であり、最も好ましくは2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-1))である。
2-1-4.化合物(I)の製造方法
 化合物(I)は、市販品を使用してもよく、公知の方法によって製造してもよい。例えば、化合物(Ib-1)(即ち、2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド、MBTS)等は市販されている。
 化合物(I)の製造方法の例として、代表的な製造方法を以下に示すが、製造方法はこれらに限定されない。
 化合物(I)は、以下に示す代表的な製造方法、後述する合成例、公知の方法(例えば、非特許文献2の Supporting Information に記載の方法)またはそれらに準じた方法によって製造することができる。
 以下、代表的な製造方法における各工程の反応の略図を示すが、略図中の各記号は、前記と同義である。
(化合物(Ib)の製造方法)
 化合物(Ib)は、例えば、下記式に示すように、チオールの酸化およびカップリングによって製造することができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000071
 化合物(Ib-1s)および化合物(Ib-2s)を酸化するための酸化剤としては、例えば、過酸化水素、ヨウ素、酸素、N-ブロモスクシンイミド、N-クロロスクシンイミド等が挙げられる。酸化剤は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 酸化剤の使用量は、化合物(Ib-1s)および化合物(Ib-2s)の合計1molに対して、好ましくは1~10mol、より好ましくは1~5molである。化合物(Ib-2s)は、化合物(Ib-1s)に対してほぼ等量で使用することが好ましい。
 この反応は、反応を阻害しない適切な溶媒中で行われる。前記溶媒としては、例えば、酢酸エチル、酢酸イソプロピル等のエステル系溶媒;1,4-ジオキサン、テトラヒドロフラン等の極性エーテル系溶媒;ジクロロメタン、クロロホルム等のハロゲン系溶媒;ベンゼン、トルエン、キシレン、メシチレン等の芳香族系溶媒等が挙げられる。前記溶媒の使用量は、化合物(Ib-1s)および化合物(Ib-2s)の合計1mmolに対して、好ましくは1~20mL、より好ましくは3~10mLである。
 この反応温度は、好ましくは-10℃~50℃、より好ましくは0℃~40℃であり、その反応時間は、好ましくは1~24時間、より好ましくは1~10時間である。
 前記反応後、公知の方法(例えば抽出等)によって化合物(Ib)を回収することができる。回収した化合物(Ib)は、公知の手段(例えば再結晶、クロマトグラフィー等)によって精製することができる。
(Y1cがカルボニルである化合物(Ic)の製造方法)
 Y1cがカルボニルである化合物(Ic)は、例えば、以下に示す工程によって製造することができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000072
工程A1
 本工程は、化合物(Ic-1s)の酸塩化物を合成する工程である。詳しくは、反応器に、化合物(Ic-1s)と、過剰量の塩化チオニル(例えば、化合物(Ic-1s)1molに対して10mol)とを添加し、1時間~1晩還流することによって、化合物(Ic-1s)の酸塩化物が得られる。
 本工程は、不活性雰囲気下(例えば、アルゴン雰囲気下)で行うことが好ましい。反応完了後、塩化チオニルを留去することによって、化合物(Ic-1s)の酸塩化物を含む固体を回収することができる。
工程A2
 本工程は、化合物(Ic-1s)の酸塩化物と、適切なアミン(R4c-NH)とを反応させることによって、化合物(Ic-2s)を合成する工程である。詳しくは、工程A1で得られた化合物(Ic-1s)の酸塩化物を含む固体、適切なアミン(R4c-NH)および塩基を適切な溶媒に添加し、反応させることによって化合物(Ic-2s)が得られる。
 塩基は、有機塩基および無機塩基のいずれでもよく、好ましくはトリエチルアミンである。R4c-NHおよび塩基の使用量は、それぞれ、化合物(Ic-1s)の酸塩化物1molに対して、好ましくは1~1.5mol程度である。
 本工程は、反応を阻害しない適切な溶媒中で行われる。前記溶媒としては、例えば、1,4-ジオキサン、テトラヒドロフラン(THF)等の極性エーテル系溶媒が挙げられ、THFが好ましい。前記溶媒の使用量は、前記固体を溶解できれば特に限定はないが、化合物(Ic-1s)の酸塩化物1mmolに対して、好ましくは5~10mL程度である。
 本工程は、低温(例えば0℃程度)で行うことが好ましい。反応の完了はTLC等によって確認することができる。反応完了後、公知の手段(例えば濃縮および抽出)によって、化合物(Ic-2s)を回収することができる。
工程A3
 本工程は、化合物(Ic-2s)とtert-ブチルチオールとを反応させることによって、化合物(Ic-3s)を合成する工程である。詳しくは、化合物(Ic-2s)とtert-ブチルチオールとを、塩基の存在下、適切な溶媒中で反応させることによって、化合物(Ic-3s)が得られる。
 tert-ブチルチオールの使用量は、化合物(Ic-2s)1molに対して、好ましくは1~1.5mol程度である。
 本工程で使用する塩基としては、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム等のアルカリ金属水酸化物が挙げられ、水酸化ナトリウムが好ましい。塩基の使用量は、化合物(Ic-3s)1molに対して、好ましくは1~2mol程度である。
 本工程は、反応を阻害しない適切な溶媒中で行われる。前記溶媒としては、例えば、ジメチルホルムアミド(DMF)、ジメチルアセトアミド、N-メチルピペリドン等のアミド系溶媒が挙げられ、DMFが好ましい。前記溶媒の使用量は、化合物(Ic-2s)を溶解できれば特に限定はないが、化合物(Ic-2s)1mmolに対して、好ましくは5~10mL程度である。
 本工程の反応温度は、室温程度(例えば25℃)であり、その時間は、例えば1時間~1晩、好ましくは3~20時間程度である。反応完了後、公知の手段(例えば固液分離)によって、化合物(Ic-3s)を回収することができる。
工程A4
 本工程は、化合物(Ic-3s)の閉環反応によって、Y1cがカルボニルである化合物(Ic)を合成する工程である。以下の工程A4-1および工程A4-2の二通りのやり方によって、本工程を行うことができる。
工程A4-1
 本工程では、化合物(Ic-3s)、ジメチルスルホキシド(DMSO)、およびクロロトリメチルシラン(TMSCl)を適切な溶媒に添加し、得られた反応混合物を室温程度(例えば25℃)で反応させることによって、Y1cがカルボニルである化合物(Ic)を合成する。
 DMSOの使用量は、化合物(Ic-3s)1molに対して、好ましくは1~2mol程度である。TMSClの使用量は、化合物(Ic-3s)1molに対して、好ましくは1~1.5mol程度である。
 本工程は、反応を阻害しない適切な溶媒中で行われる。前記溶媒としては、例えば、クロロホルム、ジクロロメタン、1,2-ジクロロエタン等のハロゲン系溶媒が挙げられ、ジクロロメタンが好ましい。前記溶媒の使用量は、化合物(Ic-3s)が溶解できれば特に限定はないが、化合物(Ic-3s)1mmolに対して、好ましくは2~5mL程度である。
 本工程の反応時間は、例えば1時間~1晩、好ましくは5~10時間程度である。反応完了後、公知の手段(例えば固液分離)によって、Y1cがカルボニルである化合物(Ic)を回収することができる。回収した化合物(Ic)は、公知の手段(例えば再結晶、クロマトグラフィー等)によって精製することができる。
工程A4-2
 本工程では、化合物(Ic-3s)およびメタクロロ過安息香酸(mCPBA)を、適切な溶媒中で反応させ、スルホキシド中間体を得た後、これを加熱することによって、Y1cがカルボニルである化合物(Ic)を合成する。
 mCPBAの使用量は、化合物(Ic-3s)1molに対して、好ましくは1~1.5mol程度である。
 化合物(Ic-3s)およびメタクロロ過安息香酸(mCPBA)との反応は、反応を阻害しない適切な溶媒中で行われる。前記溶媒としては、例えば、クロロホルム、ジクロロメタン、1,2-ジクロロエタン等のハロゲン系溶媒が挙げられ、ジクロロメタンが好ましい。前記溶媒の使用量は、化合物(Ic-3s)が溶解できれば特に限定はないが、化合物(Ic-3s)1mmolに対して、好ましくは8~15mL程度である。
 化合物(Ic-3s)およびメタクロロ過安息香酸(mCPBA)との反応は、低温(例えば0℃程度)で行うことが好ましい。その反応時間は、例えば30分~1時間程度である。反応完了後、公知の手段(例えば抽出の後に濃縮および再結晶等)によって、スルホキシド中間体を回収することができる。
 回収したスルホキシド中間体を、その環化反応を阻害しない適切な溶媒中で加熱することで、Y1cがカルボニルである化合物(Ic)を合成することができる。前記溶媒としては、例えばトルエン、キシレン、ピリジンおよびこれらの組合せが挙げられ、トルエンとピリジンの組合せが好ましい。前記反応温度は70℃~120℃が好ましい。合成した化合物(Ic)は、公知の手段(例えば再結晶、クロマトグラフィー等)によって精製することができる。
 前記化合物(Ic-2s)(即ち、Y1cがカルボニルである化合物(Ic)を合成するための中間体)は、例えば、以下に示す工程によって製造することもできる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000073
工程A2’
 本工程は、縮合剤を使用して、化合物(Ic-1s)と、適切なアミン(R4c-NH)とを反応させることによって化合物(Ic-2s)を合成する工程である。
 本工程で使用する縮合剤としては、例えば、ジシクロヘキシルカルボジイミド(DCC)、ジイソプロピルカルボジイミド(DIC)、1-エチル-3-[3-(ジメチルアミノ)プロピル]カルボジイミド(EDC)およびその塩酸塩(EDC・HCl)、ヘキサフルオロリン酸(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリピロリジノホスホニウム(PyBop)、O-(ベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウム テトラフルオロボレート(TBTU)、1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-5-クロロ-1H-ベンゾトリアゾリウム-3-オキシド ヘキサフルオロホスフェート(HCTU)、O-ベンゾトリアゾール-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HBTU)等が挙げられる。これらの中で、EDC・HClが好ましい。
 R4c-NHおよび縮合剤の使用量は、それぞれ、化合物(Ic-1s)1molに対して、好ましくは1~5mol程度である。
 本工程では塩基を使用してもよい。塩基は、有機塩基および無機塩基のいずれでもよく、好ましくはトリエチルアミンである。塩基を使用する場合、その量は、化合物(Ic-1s)1molに対して、好ましくは1~5mol程度である。
 本工程は、反応を阻害しない適切な溶媒中で行われる。前記溶媒としては、例えば、1,4-ジオキサン、テトラヒドロフラン(THF)等の極性エーテル系溶媒が挙げられ、THFが好ましい。前記溶媒の使用量は、特に限定はないが、化合物(Ic-1s)1mmolに対して、好ましくは1~10mL程度である。
 本工程の反応温度は、室温程度(例えば25℃)であり、その時間は、例えば1時間~1晩、好ましくは3~20時間程度である。本工程は、不活性雰囲気下(例えば、アルゴン雰囲気下)で行うことが好ましい。反応の完了はTLC等によって確認することができる。反応完了後、公知の手段(例えば濃縮および抽出)によって、化合物(Ic-2s)を回収することができる。
2-2.酸化
 本発明の製造方法は、化合物(I)(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)を使用して、亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体(以下「オリゴヌクレオチド前駆体」と略称することがある)を酸化することを特徴とする。
 酸化剤として化合物(I)を使用することによって、副生成物(欠損体および脱硫体)の生成を抑制することができる。副生成物の生成を抑制するために、本発明の製造方法で使用する酸化剤全体に対する化合物(I)の量は、好ましくは80mol%以上、より好ましくは90mol%以上である。本発明の製造方法において酸化剤は、さらに好ましくは化合物(I)からなる。
 酸化反応の完結性の観点から、化合物(I)の使用量は、オリゴヌクレオチド前駆体1molに対して、好ましくは1~15mol、より好ましくは1~10mol、さらに好ましくは1~5molである。
 オリゴヌクレオチド前駆体は、好ましくは、
(1)ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドとの縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体、または
(2)オリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイトとの縮合によって得られた亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体
である。前記(1)のオリゴヌクレオチド前駆体としては、例えば、前記化合物(c-I)(即ち、前記化合物(a-I)と前記化合物(b-I)との縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体)、および前記化合物(c-I’)(即ち、前記化合物(a-I’)と前記化合物(b-I’)との縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体)が挙げられる。前記(2)のオリゴヌクレオチド前駆体としては、例えば、前記化合物(γ-I)および前記化合物(γ-I’)が挙げられる。
 亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体は、より好ましくはヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドとの縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である。
 オリゴヌクレオチド前駆体は、さらに好ましくは、疎水性保護基を有する、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)と、水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されており、且つホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)との縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である。
 オリゴヌクレオチド前駆体は、特に好ましくは、Pgが**L-Y-Zである前記化合物(c-I)(即ち、Pgが**L-Y-Zである前記化合物(a-I)と前記化合物(b-I)との縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体)、またはPgが**L-Y-Zである前記化合物(c-I’)(即ち、Pgが**L-Y-Zである前記化合物(a-I’)と前記化合物(b-I’)との縮合によって得られた、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体)である。
 オリゴヌクレオチド前駆体は、好ましくは亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合に加えて、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である。チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体をヨウ素で酸化すると、チオリン酸エステル結合がリン酸エステル結合に転化して得られる副生成物(脱硫体)が生成するが、酸化剤として化合物(I)を使用する本発明によれば、この脱硫体の生成を抑制することができる。
 オリゴヌクレオチド前駆体の酸化を水の存在下で行うことが好ましい。系中に存在する水は、酸素原子の供給源として作用するため、オリゴヌクレオチド前駆体の酸化を促進することができる。水の量は、オリゴヌクレオチド前駆体1molに対して、好ましくは0.5~200mol、より好ましくは1~100mol、さらに好ましくは1~50molである。
 オリゴヌクレオチド前駆体の酸化の反応温度は、好ましくは10~50℃、より好ましくは15~40℃であり、その反応時間は、好ましくは5分~5時間、より好ましくは30分~3時間である。
 オリゴヌクレオチド前駆体の酸化は、非極性溶媒を含む溶液中で行うことが好ましい。溶液中のオリゴヌクレオチド前駆体の濃度は、それらが溶媒に溶解していれば特に限定されないが、好ましくは1~30重量%である。
 非極性溶媒としては、例えば、クロロホルム、ジクロロメタン、1,2-ジクロロエタン等のハロゲン系溶媒;ベンゼン、トルエン、キシレン、メシチレン等の芳香族系溶媒;酢酸エチル、酢酸イソプロピル等のエステル系溶媒;ヘキサン、ペンタン、ヘプタン、オクタン、ノナン、シクロヘキサン等の脂肪族系溶媒;ジエチルエーテル、シクロペンチルメチルエーテル、tert-ブチルメチルエーテル等の非極性エーテル系溶媒が挙げられる。非極性溶媒は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。非極性溶媒は、好ましくはハロゲン系溶媒、芳香族系溶媒、エステル系溶媒および脂肪族系溶媒からなる群から選ばれる少なくとも一つであり、より好ましくはハロゲン系溶媒およびトルエンであり、さらに好ましくはクロロホルム、ジクロロメタンおよびトルエンからなる群から選ばれる少なくとも一つであり、特に好ましくはジクロロメタンである。
 非極性溶媒を含む溶液は、さらに非プロトン性極性溶媒を含んでいてもよい。非プロトン性極性溶媒としては、アセトニトリル、プロピオニトリル等のニトリル系溶媒;テトラヒドロフラン等の極性エーテル系溶媒;ピリジン等が挙げられ、これらの中でニトリル系溶媒が好ましく、アセトニトリルまたはピリジンがより好ましい。非プロトン性極性溶媒の使用量は、非極性溶媒100mLに対して、好ましくは10~100mL、より好ましくは10~50mLである。
2-3.ワンポット合成
 本発明の製造方法は、ワンポット合成で行うこともできる。
 該ワンポット合成は、
 非極性溶媒を含む溶液中で、疎水性保護基を有する、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)と、水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されており、且つホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)とを縮合して、亜リン酸エステル結合および疎水性保護基を有し、且つ水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているオリゴヌクレオチド前駆体(c)を形成する工程(1)、
 工程(1)後の溶液に、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)のクエンチ剤(i)を添加して、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)をクエンチする工程(2)
 工程(2)後の溶液に酸化剤を添加して、前記オリゴヌクレオチド前駆体(c)を酸化して、リン酸エステル結合および疎水性保護基を有し、且つ水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているオリゴヌクレオチド(d)を形成する工程(3)、
 工程(3)後の溶液に酸化剤のクエンチ剤(ii)を添加して、酸化剤をクエンチする工程(4)、
 工程(4)後の溶液に酸を添加して、前記オリゴヌクレオチド(d)の酸性条件下で除去可能な一時保護基を除去して、保護されていない水酸基および疎水性保護基を有するオリゴヌクレオチド(e)を形成する工程(5)、
 必要に応じて、工程(5)後の溶液に塩基を添加する工程(6)、並びに
 前記オリゴヌクレオチド(e)を含む溶液に極性溶媒を添加して、前記オリゴヌクレオチド(e)を析出させる工程(7)
を含み、並びに
 前記酸化剤が、化合物(I)(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)であることを特徴とする。ここで、ワンポット合成による本発明の製造方法は、中間体(即ち、工程(1)で得られたオリゴヌクレオチド前駆体(c)、および工程(3)で得られたオリゴヌクレオチド(d))を単離しないことを特徴とする。以下、該ワンポット合成の各工程を順に説明する。
(工程(1)(縮合))
 工程(1)では、非極性溶媒を含む溶液中で、疎水性保護基を有する、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)と、水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されており、且つホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)とを縮合して、亜リン酸エステル結合および疎水性保護基を有し、且つ水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているオリゴヌクレオチド前駆体(c)を形成する。
 前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)が有する疎水性保護基は、前記保護基(Pg-5)である。保護基(Pg-5)の説明は、前述の通りである。
 前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)が有する水酸基の一時保護基は、脱保護の容易さ等の観点から、好ましくは4,4’-ジメトキシトリチル基または4-モノメトキシトリチル基であり、より好ましくは4,4’-ジメトキシトリチル基である。
 工程(1)で使用する前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)と前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)との組合せは、好ましくは前記化合物(a-I)と前記化合物(b-I)との組合せ、または前記化合物(a-I’)と前記化合物(b-I’)との組合せであり、より好ましくはPgが**L-Y-Zである前記化合物(a-I)と、前記化合物(b-I)との組合せ、またはPgが**L-Y-Zである前記化合物(a-I’)と、前記化合物(b-I’)との組合せである。
 工程(1)は、非極性溶媒を含む溶液中で行われる。非極性溶媒としては、例えば、クロロホルム、ジクロロメタン、1,2-ジクロロエタン等のハロゲン系溶媒;ベンゼン、トルエン、キシレン、メシチレン等の芳香族系溶媒;酢酸エチル、酢酸イソプロピル等のエステル系溶媒;ヘキサン、ペンタン、ヘプタン、オクタン、ノナン、シクロヘキサン等の脂肪族系溶媒;ジエチルエーテル、シクロペンチルメチルエーテル、tert-ブチルメチルエーテル等の非極性エーテル系溶媒が挙げられる。非極性溶媒は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。非極性溶媒は、好ましくはハロゲン系溶媒、芳香族系溶媒、エステル系溶媒および脂肪族系溶媒からなる群から選ばれる少なくとも一つであり、より好ましくはハロゲン系溶媒およびトルエンからなる群から選ばれる少なくとも一つであり、さらに好ましくはクロロホルム、ジクロロメタンおよびトルエンからなる群から選ばれる少なくとも一つであり、特に好ましくはジクロロメタンおよび/またはトルエンである。工程(1)以降の工程も、同様に非極性溶媒を含む溶液中で行われる。
 非極性溶媒を含む溶液は、さらに非プロトン性極性溶媒を含んでいてもよい。非プロトン性極性溶媒としては、アセトニトリル、プロピオニトリル等のニトリル系溶媒;テトラヒドロフラン等の極性エーテル系溶媒等が挙げられ、これらの中でニトリル系溶媒が好ましく、アセトニトリルがより好ましい。非プロトン性極性溶媒の使用量は、非極性溶媒100mLに対して、好ましくは10~100mL、より好ましくは10~50mLである。
 前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)の使用量は、前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)の使用量1molに対して、例えば1~10mol、好ましくは1~5molである。溶液中の前記ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)の濃度は、好ましくは1~30重量%である。
 工程(1)の反応温度は、縮合が進行しさえすれば特に限定されないが、例えば0~100℃、好ましくは20~50℃である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、例えば5分~24時間である。
 縮合を促進するため、公知の活性化剤を使用してもよい。活性化剤としては、例えば、ピリジン・トリフルオロ酢酸塩、テトラゾール、5-エチルチオ-1H-テトラゾール、5-ベンジルチオ-1H-テトラゾール、4,5-ジシアノイミダゾール等が挙げられる。活性化剤は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。活性化剤を使用する場合、その使用量は、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)1molに対して、好ましくは0.5~10mol、より好ましくは1~5molである。
(工程(2)(ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)のクエンチ))
 工程(2)では、工程(1)後の溶液に、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)のクエンチ剤(i)を添加して、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)をクエンチする。
 クエンチ剤(i)は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。クエンチ剤(i)としては、例えば、水、アルコール類、フェノール類およびアミン類が挙げられる。
 クエンチ剤(i)として使用し得るアルコール類としては、例えば、メタノール、2-プロパノール、t-ブタノール、2,2,2,-トリフルオロエタノール、テトラヒドロフルフリルアルコール、フルフリルアルコール、2,3-O-イソプロピリデン-D-リボフラノース、3’-O-トリイソプロピルシリル-チミジン等のハロゲン化されていてもよい1価アルコール、エチレングリコール、ジエチレングリコール等のハロゲン化されていてもよい多価アルコールが挙げられる。
 クエンチ剤(i)として使用し得るフェノール類としては、例えば、4-ニトロフェノールやペンタフルオロフェノールが挙げられる。クエンチ剤(i)として使用し得るアミン類としては、例えば、モルホリンが挙げられる。
 クエンチ剤(i)の使用量は、工程(1)でのホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)の使用量1molに対して、好ましくは1~20mol、より好ましくは1~10mol、さらに好ましくは1~5molである。
 クエンチ剤(i)は、好ましくは水である。クエンチ剤(i)として水を使用することによって、その後の工程(3)の酸化を促進することができる。クエンチ剤(i)として水を使用する場合、その使用量は、ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)の工程(1)における使用量1molに対して、好ましくは1~20mol、より好ましくは2~15mol、さらに好ましくは2~10molである。
 クエンチ剤(i)の添加後の溶液の温度は、ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)がクエンチできさえすれば特に限定されないが、好ましくは5~40℃、より好ましくは15~30℃である。クエンチ剤(i)の添加後の溶液の撹拌時間は、使用するクエンチ剤(i)の種類、温度等によって異なるが、例えば10分~3時間である。
(工程(3)(酸化))
 工程(3)は、酸化剤として化合物(I)(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)を用いて、前記オリゴヌクレオチド前駆体(c)の亜リン酸エステル結合を酸化して、リン酸エステル結合に転化することを特徴とする。詳しくは、工程(3)では、工程(2)後の溶液に酸化剤(即ち、化合物(I))を添加して、前記オリゴヌクレオチド前駆体(c)を酸化して、リン酸エステル結合および疎水性保護基を有し、且つ水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているオリゴヌクレオチド(d)を形成する。酸化剤および酸化の説明は、前述の通りである。
 本発明の製造方法では脱硫体の生成を抑制できるため、前記オリゴヌクレオチド前駆体(c)は、亜リン酸エステル結合に加えて、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体であることが好ましい。
(芳香族アミンの添加)
 工程(3)後の溶液に、芳香族アミンを添加することが好ましい。芳香族アミンは、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。芳香族アミンを添加することによって、欠損体の生成をさらに抑制することができる。芳香族アミンの添加は、工程(3)の後、工程(4)のクエンチ剤の添加前に行ってもよく、工程(4)でクエンチ剤(ii)および芳香族アミンを同時に添加してもよく、工程(4)でクエンチ剤(ii)および芳香族アミンを順次添加してもよい。
 芳香族アミンとしては、例えば、アニリン、2-クロロアニリン、3-クロロアニリン、2,4-ジクロロアニリン、2-フルオロアニリン、4-メトキシアニリン、4-ニトロアニリン、2,6-ジクロロアニリン、2,6-キシリジン等が挙げられる。
 芳香族アミンは、好ましくはアニリン、2-クロロアニリン、3-クロロアニリン、2,4-ジクロロアニリン、2-フルオロアニリン、4-メトキシアニリン、4-ニトロアニリン、2,6-ジクロロアニリン、2,6-キシリジンからなる郡から選ばれる少なくとも一つであり、より好ましくは2-クロロアニリンおよび/または2,6-キシリジンであり、さらに好ましくは2,6-キシリジン(即ち、2,6-ジメチルアニリン)である。
 欠損体の抑制の観点から、芳香族アミンの使用量は、工程(3)で使用した酸化剤1molに対して、好ましくは1~20mol、より好ましくは1~10mol、さらに好ましくは1~5molである。
(工程(4)(酸化剤のクエンチ))
 工程(4)では、工程(3)後の溶液に酸化剤のクエンチ剤(ii)を添加して、酸化剤をクエンチする。クエンチ剤(ii)は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 クエンチ剤(ii)は、好ましくは有機リン化合物である。有機リン化合物は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 有機リン化合物は、好ましくはホスフィン類、亜リン酸トリエステル、亜ホスフィン酸エステル、亜ホスホン酸ジエステルおよびホスフィン酸エステルからなる群から選ばれる少なくとも一つであり、より好ましくはホスフィン類である。前記ホスフィン類等は、いずれも、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 ホスフィン類は、式:P(R)(式中、三つのRは、それぞれ独立に、水素原子、アルキル基またはアリール基を示す)で表される化合物である。ホスフィン類としては、例えば、トリフェニルホスフィン、メチルジフェニルホスフィン等が挙げられる。
 亜リン酸トリエステルは、式:P(OR’)(式中、三つのR’は、それぞれ独立に、アルキル基またはアリール基を示す)で表される化合物である。亜リン酸トリエステルとしては、例えば、亜リン酸トリエチル等が挙げられる。
 亜ホスフィン酸エステルは、式:P(OR’)(R)(式中、二つのRは、それぞれ独立に、水素原子、アルキル基またはアリール基を示し、およびR’は、アルキル基またはアリール基を示す)で表される化合物である。亜ホスフィン酸エステルとしては、例えば、エトキシジフェニルホスフィン等が挙げられる。
 亜ホスホン酸ジエステルは、式:P(R)(OR’)2、(式中、Rは、水素原子、アルキル基またはアリール基を示し、および二つのR’は、それぞれ独立に、アルキル基またはアリール基を示す)で表される化合物である。亜ホスホン酸ジエステルとしては、例えば、ジエトキシフェニルホスフィン等が挙げられる。
 ホスフィン酸エステルは、式:P(=O)(R)(OR’)(式中、二つのRは、それぞれ独立に、水素原子、アルキル基またはアリール基を示し、R’は、アルキル基またはアリール基を示し、並びに一つのRおよびR’は、それらが結合するリン原子および酸素原子と共に複素環を形成していてもよい)で表される化合物である。ホスフィン酸エステルとしては、例えば、下記式で表される9,10-ジヒドロ-9-オキサ-10-ホスファフェナントレン 10-オキシド等が挙げられる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000074
 本発明の製造方法の一態様において、クエンチ剤(ii)は、好ましくはトリフェニルホスフィン、メチルジフェニルホスフィン、亜リン酸トリエチル、エトキシジフェニルホスフィン、ジエトキシフェニルホスフィン、および9,10-ジヒドロ-9-オキサ-10-ホスファフェナントレン 10-オキシドからなる群から選ばれる少なくとも一つであり、より好ましくはトリフェニルホスフィンおよび/またはメチルジフェニルホスフィンであり、さらに好ましくはトリフェニルホスフィンである。
 クエンチ剤(ii)の使用量は、工程(3)での酸化剤の余剰分をクエンチできればよく、酸化剤の余剰量(即ち、「酸化剤の工程(3)での使用量」-「前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)の工程(1)での使用量」)の1molあたり、好ましくは1~10mol、より好ましくは1~5molである。
 クエンチ剤(ii)の添加後の溶液の温度は、酸化剤がクエンチできさえすれば特に限定されないが、好ましくは0℃~50℃、より好ましくは10℃~40℃である。クエンチ剤(ii)の添加後の溶液の撹拌時間は、使用するクエンチ剤(ii)の種類、温度等によって異なるが、好ましくは5分~5時間、より好ましくは5分~2時間である。
(工程(5)(一時保護基の除去))
 工程(5)では、工程(4)後の溶液に酸を添加して、前記オリゴヌクレオチド(d)の酸性条件下で除去可能な一時保護基を除去して、保護されていない水酸基および疎水性保護基を有するオリゴヌクレオチド(e)を形成する。酸は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 酸は、一時保護基を良好に除去できれば特に限定されないが、例えば、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリクロロ酢酸、メタンスルホン酸、塩酸、酢酸、p-トルエンスルホン酸等が挙げられる。良好な一時保護基の除去の観点から、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリクロロ酢酸がより好ましく、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸がさらに好ましく、トリフルオロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸がさらに一層好ましく、トリフルオロ酢酸が特に好ましい。
 酸の使用量は、オリゴヌクレオチド(d)1molに対し、例えば1~100mol、好ましくは1~40molである。
 工程(5)の反応温度は、反応が進行しさえすれば特に限定されないが、例えば-10℃~50℃、より好ましくは0℃~40℃である。反応時間は、使用するオリゴヌクレオチド(d)、酸の種類および非極性溶媒の種類、反応温度等により異なるが、例えば5分~5時間である。
 オリゴヌクレオチド(d)の一時保護基の除去前、その間または除去後に、カチオン捕捉剤を溶液に添加することが好ましい。即ち、一時保護基の除去をカチオン捕捉剤の存在下で行うか、または一時保護基の除去後に反応液にカチオン捕捉剤を添加することが好ましい。カチオン捕捉剤は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 カチオン捕捉剤としては、除去された一時保護基による再保護または脱保護された官能基への副反応が進行しなければ、特に限定されないが、ピロール、2-メチルピロール、3-メチルピロール、2,3-ジメチルピロール、2,4-ジメチルピロール等のピロール誘導体;インドール、3-メチルインドール、4-メチルインドール、5-メチルインドール、6-メチルインドール、7-メチルインドール、5,6-ジメチルインドール、6,7-ジメチルインドール、5-メトキシインドール等のインドール誘導体;2-メチルフラン、2,3-ジメチルフラン、2-メチル-3-(メチルチオ)フラン、メントフラン等のフラン誘導体を使用することができる。カチオン捕捉剤の使用量は、前記オリゴヌクレオチド(d)1molに対して、好ましくは1~50mol、より好ましくは5~20molである。
(工程(6)(中和))
 工程(5)で使用した酸を中和するために、前記ワンポット合成は、工程(5)の後および工程(7)の前に、工程(5)後の溶液に塩基を添加する工程(6)をさらに含んでいてもよい。但し、工程(7)(固液分離)および洗浄を行うことによって、工程(5)で使用した酸をオリゴヌクレオチド(e)から除去することができるため、工程(6)(中和)は必須ではない。
 塩基は1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。塩基としては、有機塩基が好ましい。有機塩基としては、例えば、ピリジン、2,4,6-トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、1,2,4-トリアゾール、N-フェニルイミダゾール、2-アミノ-4,6-ジメチルピリミジン、1,10-フェナントロリン、イミダゾール、N-メチルイミダゾール、2-クロロベンズイミダゾール、2-ブロモベンズイミダゾール、2-メチルイミダゾール、2-フェニルベンズイミダゾール、N-フェニルベンズイミダゾール、5-ニトロベンズイミダゾールなどが挙げられる。これらの中で、ピリジン、2,4,6-トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、1,2,4-トリアゾール、N-フェニルイミダゾール、N-メチルイミダゾール、2-アミノ-4,6-ジメチルピリミジン、1,10-フェナントロリンが好ましく、ピリジン、2,4,6-トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、1,2,4-トリアゾール、N-フェニルイミダゾールがより好ましく、ピリジン、2,4,6-トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、1,2,4-トリアゾールがさらに好ましく、ピリジン、2,4,6-トリメチルピリジン、ベンズイミダゾールが特に好ましい。
 工程(6)における塩基の使用量は、工程(5)における酸の使用量1molに対して、好ましくは1~10molであり、より好ましくは1~3molである。
(工程(7)(固液分離))
 工程(7)では、前記オリゴヌクレオチド(e)を含む溶液(即ち、工程(5)後の溶液、または必要に応じて工程(6)後の溶液)に極性溶媒を添加して、前記オリゴヌクレオチド(e)を析出させる。
 工程(7)で使用する極性溶媒としては、例えば、メタノール、エタノール、イソプロパノール等のアルコール系溶媒;アセトニトリル、プロピオニトリル等のニトリル系溶媒;アセトン、2-ブタノン等のケトン系溶媒;1,4-ジオキサン、テトラヒドロフラン等の極性エーテル系溶媒;ジメチルホルムアミド、ジメチルアセトアミド、N-メチルピペリドン等のアミド系溶媒、ジメチルスルホキシド等のスルホキシド系溶媒;水等が挙げられる。極性溶媒は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。これらの中でも、ニトリル系溶媒が好ましく、アセトニトリルがより好ましい。
 前記オリゴヌクレオチド(e)の回収率を高めるために、固液分離における極性溶媒の添加量は、溶液中に含まれる非極性溶媒1mLに対して、好ましくは1~20mL、より好ましくは5~20mL、さらに好ましくは5~10mLである。
 前記オリゴヌクレオチド(e)の回収率を高めるために、国際公開第2016/117663号に記載されているような沈殿促進剤(例えば、3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルピバレート)を使用してもよい。
 析出した前記オリゴヌクレオチド(e)は、濾過等の公知の手段によって回収することができる。
 工程(1)~(5)および(7)(好ましくは工程(1)~(7))を含むワンポット合成を繰り返すことによって、オリゴヌクレオチド鎖を伸長させることができる。このようなワンポット合成を繰り返すオリゴヌクレオチドの製造方法も、本発明の製造方法に包含される。
(脱保護)
 本発明の製造方法では、工程(7)(固液分離)の後に、得られたオリゴヌクレオチド(e)の保護基(例えば、リン酸基の保護基、疎水性保護基)を、公知の方法によって除去する工程を含んでいてもよい。例えば、リン酸基の保護基である2-シアノエチル基および前述の保護基(Pg-5)等は、アンモニア水、アンモニア水/エタノール溶液、またはアンモニア水およびメチルアミン水溶液の混合液で処理することによって除去することができる。
3.新規化合物
 本発明は、オリゴヌクレオチドの製造方法において有用な、式(In):
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000075
[式中、
 (1)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は0を示し、環C”は窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環を示し、およびq’は0を示すか、
 (2)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は0を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、q’は1を示し、およびR3nはC1-6パーフルオロアルキル基を示すか、
 (3)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は1を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、およびq’は0を示すか、または
 (4)R1nは1個のC1-6アルキル基で置換されているピリジル基を示し、p’は0を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、およびq’は0を示す。]
で表される化合物も提供する。
 化合物(In)は、オリゴヌクレオチドの製造方法において、亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体(特に、亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体)を酸化するための酸化剤として有用である。化合物(In)は、1種のみを使用してもよく、2種以上を併用してもよい。
 前記式(In)中、「p’は0を示す」とは、式(In)中の括弧で括られた-CH-が存在しないことを意味する。
 前記式(In)中、「q’は0を示す」とは、式(In)中のR3nが存在しないことを意味する。
 R1nの「置換されていてもよいフェニル基」は、好ましくはフェニル基である。
 R1nの「1個のC1-6アルキル基で置換されているピリジル基」は、好ましくは1個のメチル基で置換されているピリジル基であり、より好ましくは4-メチル-2-ピリジル基である。
 環C”の「窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環」は、好ましくはキノリン環である。
 環C”の「6員の含窒素芳香族複素環」は、好ましくはピリジン環である。
 R3nの「C1-6パーフルオロアルキル基」は、好ましくはトリフルオロメチル基である。
 化合物(In)は、好ましくは2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン(化合物(Ic-11))、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))、または2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))である。
 化合物(In)は、前述の「Y1cがカルボニルである化合物(Ic)の製造方法」、後述する合成例、公知の方法(例えば、非特許文献2の Supporting Information に記載の方法)またはそれらに準じた方法によって製造することができる。
 以下、実施例等を挙げて本発明をより具体的に説明するが、本発明は以下の実施例等によって制限を受けるものではなく、上記・下記の趣旨に適合し得る範囲で適当に変更を加えて実施することも可能であり、それらはいずれも本発明の技術的範囲に包含される。
 以下の実施例等に記載の「室温」とは、「20℃~30℃」を意味する。
 また、以下の実施例等で使用する略号の意味は、以下の通りである。
 DMF:ジメチルホルムアミド
 THF:テトラヒドロフラン
 SUC:スクシニル
 TOB:3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ
 Piv-TOB:3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルピバレート
 DDTT:[(N,N-ジメチルアミノメチリデン)アミノ]-3H-1,2,4-ジチアゾリン-3-チオン
 POS:5-フェニル-3H-1,2,4-ジチアゾール-3-オン
 DMTr:4,4’-ジメトキシトリチル
(ホスホロアミダイトまたはH-ホスホネート)
 2’-OMe-C-CE ホスホロアミダイト:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン-3’-[O-(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]-ホスホロアミダイト
 dT-CE ホスホロアミダイト:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]-ホスホロアミダイト
 dC-CE ホスホロアミダイト:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイル-デオキシシチジン-3’-[O-(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]-ホスホロアミダイト
 5-Me-dC(Bz)-CE ホスホロアミダイト:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイル-2’-デオキシ-5-メチルシチジン-3’-[O-(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]-ホスホロアミダイト
 dA-CE ホスホロアミダイト:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]-ホスホロアミダイト
 dG-CE ホスホロアミダイト:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリル-2’-O-メチルグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]-ホスホロアミダイト
 2’-F-A-CE ホスホロアミダイト:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイル-2’-フルオロ-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]-ホスホロアミダイト
 dT-H-ホスホネートTEA塩:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-デオキシチミジン-3’-H-ホスホネートのトリエチルアミン塩
(オリゴヌクレオチド)
 HO-T-SUC-TOB:デオキシチミジン-3’-イル3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルスクシネート
 HO-T(S)T-SUC-TOB:デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-Am(S)Cm-SUC-TOB:N-ベンゾイル-2’-O-メチルアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-Cm(O)Am(S)Cm-SUC-TOB:N-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル N-ベンゾイル-2’-O-メチルアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-T(O)T-SUC-TOB:デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-Cm(O)T(O)T-SUC-TOB:N-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン 3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOB:N-ベンゾイル-2’-フルオロ-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル N-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン 3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイル-2’-フルオロ-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル N-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン 3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-フルオロ-デオキシアデノシン-3’-ホスホリル-2’-O-メチルシチジン-3’-ホスホリル-デオキシチミジン-3’-ホスホリル-デオキシチミジン
 DMTrO-Af(O)Cm(O)T-OH:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-フルオロ-デオキシアデノシン-3’-ホスホリル-2’-O-メチルシチジン-3’-ホスホリル-デオキシチミジン
 DMTrO-Af(O)T(O)T-OH:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-フルオロ-デオキシアデノシン-3’-ホスホリル-デオキシチミジン-3’-ホスホリル-デオキシチミジン
 HO-A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOB:N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-デオキシシチジン 3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-G(III)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスフィチル N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-デオキシシチジン 3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネートDMTrO-G(O)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-デオキシシチジン 3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-G(O)A(S)C(S)T(S)T-OH:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-デオキシグアノシン-3’-ホスホリル-デオキシアデノシン-3’-ホスホロチオニル-デオキシシチジン-3’-ホスホロチオニル-デオキシチミジン-3’-ホスホロチオニル-デオキシチミジン
 DMTrO-T(OH)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-デオキシチミジン-3’-ホスホリル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-G(O)T(S)T-SUC-TOB:N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOB:N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-MeC(O)A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOB:N-ベンゾイル-2’-デオキシ-5-メチルシチジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-T(S)T(S)T-SUC-TOB:デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-T(S)T(S)T-OH:デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル-デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル-デオキシチミジン
 DMTrO-C(O)T(S)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイル-デオキシシチジン 3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-C(S)T(S)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイル-デオキシシチジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-MeC-SUC-TOB:N-ベンゾイル-5-メチル-2’-デオキシシチジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-G(S)MeC-SUC-TOB:N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-5-メチル-2’-デオキシシチジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 HO-A(S)G(S)MeC-SUC-TOB:N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-5-メチル-2’-デオキシシチジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-G(O)A(S)G(S)MeC-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホリル N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-5-メチル-2’-デオキシシチジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-G(S)A(S)G(S)MeC-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-5-メチル-2’-デオキシシチジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-G(O)A(S)G(S)MeC-OH:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-デオキシグアノシン-3’-ホスホリル-デオキシアデノシン-3’-ホスホロチオニル-デオキシグアノシン-3’-ホスホロチオニル-5-メチル-2’-デオキシシチジン
(オリゴヌクレオチド前駆体)
 DMTrO-G(III)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスフィチル N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-デオキシシチジン 3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
DMTrO-C(III)T(S)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイル-デオキシシチジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスフィチル デオキシチミジン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-T(H)T-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-デオキシチミジン-3’-ホスホニル デオキシチミジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
 DMTrO-G(III)A(S)G(S)MeC-SUC-TOB:5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスフィチル N-[1-(ジメチルアミノ)エチリデン]-デオキシアデノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-イソブチリル-デオキシグアノシン-3’-[O-(2-シアノエチル)]ホスホロチオニル N-ベンゾイル-5-メチル-2’-デオキシシチジン-3’-イル-[3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル]スクシネート
合成例1:亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体の合成
 アルゴン雰囲気下、1000mLのフラスコにHO-T-SUC-TOB(2.5g,2.0mmol)、Piv-TOB(5.0g,5.0mmol)、脱水ジクロロメタン(100mL)および脱水アセトニトリル(30mL)を加え、溶液を調製した。その後dT-CE ホスホロアミダイト(3.0g,4.0mmol)およびトリフェニルホスフィン(270mg,1.0mmol)を加え、溶液を30分撹拌した。続いて、5-エチルチオ-1H-テトラゾール(530mg,4.0mmol)を加え、溶液を室温で45分撹拌した。その後、溶液に2,2,2-トリフルオロエタノール(1.5mL、20mmol)を加え、室温で30分撹拌した後、2,6-ジメチルアニリン(1.8mL、15mmol)およびPOS(1.0g、5.1mmol)を順次加え、室温で溶液を1.0時間撹拌した。その後、2,3-ジメチルフラン(2.1mL,20mmol)、トリフルオロ酢酸(5.2mL,68mmol)、および2,6-ジメチルアニリン(83.5μL、0.7μmol)を順次加え、溶液を室温で55分撹拌した。さらにトリフルオロ酢酸(620μL,8.1mmol)および2,6-ジメチルアニリン(10μL、0.10μmol)を加え、溶液を室温で15分撹拌した。続いて溶液にピリジン(19mL,230mmol)およびメタノール(870μL)を順次加え、溶液を室温にて115分撹拌した。その後、アセトニトリル(1L)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、Piv-TOBおよび2量体であるオリゴヌクレオチドHO-T(S)T-SUC-TOBの混合物を得た(8.1g、収率98%)。
m/z:Calcd. 1610.03,Found 1611.06[M+H]
 上記で得られた固体(8.1g)と、dT-CE ホスホロアミダイトの代わりにdC-CE ホスホロアミダイトとを用いたこと以外は上記と同様にして、Piv-TOBおよび3量体であるオリゴヌクレオチドHO-C(S)T(S)T-SUC-TOBの混合物を得た(8.7g、収率97%)。
m/z:Calcd. 2072.11,Found 2073.14[M+H]
 上記で得られた固体(2.8g)と、dT-CE ホスホロアミダイトの代わりにdA-CE ホスホロアミダイトとを用いたこと以外は上記と同様にして、Piv-TOBおよび4量体であるオリゴヌクレオチドHO-A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOBの混合物を得た(3.0g、収率98%)。
m/z:Calcd. 2523.23,Found 1262.63[M+2H]2+
 アルゴン雰囲気下、100mLの二口フラスコに上記で得られた固体(400mg)、脱水ジクロロメタン(4.0mL)および脱水アセトニトリル(1.2mL)を加え、溶液を調製した。その後、dG-CE ホスホロアミダイト(136mg,161μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(21.1mg,162μmol)を順次加え、溶液を室温で60分撹拌した。その後、アセトニトリル(30mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、Piv-TOBと、5量体であるオリゴヌクレオチド前駆体DMTrO-G(III)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOBの混合物を得た(453mg、収率99%)。
m/z:Calcd. 3261.49,Found 1631.67[M+2H]2+
実施例1:化合物(Ib-1)を用いた酸化
 アルゴン雰囲気下、20mLの二口フラスコに、合成例1で得られた固体(100.0mg:DMTrO-G(III)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOBとして56.9mg、17.4μmol)、脱水ジクロロメタン(0.9mL)および脱水アセトニトリル(0.3mL)を加え、溶液を調製した。その後、水(9μL,0.5mmol)および化合物(Ib-1)(12.1mg,36.4μmol)を順次加え、溶液を室温で60分撹拌した。その後、トリフェニルホスフィン(4.6mg,18μmol)を加え、溶液を30分撹拌した。続いて、アセトニトリル(10mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、Piv-TOBと、5量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-G(O)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOBの混合物を得た(82mg、収率82%)。
 なお、化合物(Ibー1)は市販品を使用した。
m/z:Calcd. 3277.48,Found 1639.75[M+2H]2+
実施例2:化合物(Ic-1)を用いた酸化
 アルゴン雰囲気下、20mLの二口フラスコに合成例1で得られた固体(100mg:DMTrO-G(III)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOBとして57mg、17μmol)、脱水ジクロロメタン(0.9mL)、および脱水アセトニトリル(0.3mL)を加え、溶液を調製した。その後、水(9μL,0.5mmol)および化合物(Ic-1)(8.0mg,35μmol)を順次加え、溶液を室温で60分撹拌した。その後、トリフェニルホスフィン(4.7mg,18μmol)を加え、溶液を30分撹拌した。続いて、アセトニトリル(10mL)を添加し、析出した固体をキリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、Piv-TOBおよび5量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-G(O)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOBの混合物を得た(83mg、収率83%)。
 なお、化合物(Ic-1)は、非特許文献2のSupporting Information に記載の方法によって合成したものを使用した。
m/z:Calcd.3277.48,Found 1639.75[M+2H]2+
比較例1:ヨウ素を用いた酸化
 アルゴン雰囲気下、20mLの二口フラスコに合成例1で得られた固体(100mg:DMTrO-G(III)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOBとして57mg、17μmol)、脱水ジクロロメタン(0.9mL)、および脱水アセトニトリル(0.3mL)を加え、溶液を調製した。その後、水(9μL,0.5mmol)、ピリジン(5.7μL,71μmol)およびヨウ素(8.8mg,35μmol)を順次加え、溶液を室温で60分撹拌した。その後、トリフェニルホスフィン(4.8mg,18μmol)を加え、溶液を30分撹拌した。続いて、アセトニトリル(10mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、Piv-TOBおよび5量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-G(O)A(S)C(S)T(S)T-SUC-TOBの混合物を得た(83mg、収率83%)。
m/z:Calcd. 3277.48,Found 1639.75[M+2H]2+
実施例1、実施例2および比較例1の対比
 以下のようにして、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド、およびチオリン酸エステル結合がリン酸エステル結合に転化して得られた副生成物(以下「脱硫体」と記載する)を分析し、脱硫体の割合を算出した。
 実施例1、実施例2または比較例1で得られた固体(10mg)および28重量%アンモニア水(5mL)をオートクレーブに入れて、65℃で4時間加熱した後、室温まで冷却した。シリンジフィルターにより反応液中の不溶物を除去した後、遠心エバポレーターで減圧濃縮し、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドDMTrO-G(O)A(S)C(S)T(S)T-OH(以下「目的のオリゴヌクレオチド」と記載する)を得た。
m/z:Calcd. 1827.36,Found 1826.34[M-H]
 得られた目的のオリゴヌクレオチドおよび脱硫体を含む混合物を、液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)により分析した。観測された各化合物(目的のオリゴヌクレオチドおよび脱硫体)の抽出イオンクロマトグラム(EIC)を用いて、各化合物のピーク面積を算出し、下記式:
 脱硫体の割合(%)=(脱硫体のピーク面積/目的のオリゴヌクレオチドのピーク面積)×100
により、脱硫体の割合(%)を算出した。結果を表1に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000076
 表1の結果から明らかなように、酸化剤として、ヨウ素の代わりに化合物(Ib-1)または化合物(Ic-1)を使用することによって、脱硫体の生成を抑制することができる。
合成例2:ホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体の合成
 アルゴン雰囲気下、200mLの三口フラスコにHO-T-SUC-TOB(500mg,400μmol)、dT-H-ホスホネートTEA塩(568mg,800μmol)、脱水ジクロロメタン(10mL)、および脱水ピリジン(10mL)を加え、溶液を調製した。続いて、塩化ピバロイル(0.2mL,1.6mmol)を加え、溶液を1時間撹拌した。その後アセトニトリル(140mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いる吸引濾過で回収した後、乾燥し、2量体であるオリゴヌクレオチド前駆体DMTrO-T(H)T-SUC-TOBを得た(727mg、収率98%)。
実施例3:化合物(Ic-1)を用いた酸化
 アルゴン雰囲気下、50mLの二口フラスコに合成例2で得られたオリゴヌクレオチド前駆体(171mg,93μmol)、ジクロロメタン(4.7mL)、およびアセトニトリル(1.4mL)を加え、溶液を調製した。続いて、水(60μL)、化合物(Ic-1)(43mg,189μmol)およびジアザビシクロウンデセン(DBU)(55μL,372μmol)を加えて、溶液を室温で2時間撹拌した。その後、アセトニトリル(42mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、2量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-T(OH)T-SUC-TOBを定量的に得た。
m/z:Calcd. 1843.16,Found 1842.15[M-H]
実施例4:化合物(Ib-1)を用いた酸化
 アルゴン雰囲気下、50mLの二口フラスコに合成例2で得られたオリゴヌクレオチド前駆体(170mg,93μmol)、ジクロロメタン(4.7mL)、およびアセトニトリル(1.4mL)を加え、溶液を調製した。続いて、化合物(Ib-1)(62mg,186μmol)およびDBU(55μL,372μmol)を加えて、溶液を室温で2時間撹拌した。その後、アセトニトリル(42mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、2量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-T(OH)T-SUC-TOBを定量的に得た。
m/z:Calcd. 1843.16,Found 1842.15[M-H]
実験例1
 非特許文献1(ARKIVOC 2009 (iii) 264-273)には、下記式で示されるように、多量のトリフェニルホスフィンおよび多量の2,2’-ジピリジルジスルフィドの存在下で、H-ホスホネート(化合物1)およびヌクレオシド(化合物2)を、縮合および酸化して、ジヌクレオチド(化合物4)を製造することが開示されている。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000077
 また、オリゴヌクレオチド合成で伸長を繰り返していくと、意図せずに、オリゴヌクレチドのチオリン酸エステル部分の保護基(例えば、2-シアノエチル基)が除去されることがある。そこで、チオリン酸エステル部分の保護基が除去されたオリゴヌクレオチドと、非特許文献1で使用される2,2’-ジピリジルジスルフィドまたは本発明で使用される化合物(Ib-1)とを反応させて、2,2’-ジピリジルジスルフィドおよび化合物(Ib-1)を評価した。なお、以下の実験では、非特許文献1に記載の反応条件に合わせて、基質(即ち、チオリン酸エステル部分の保護基が除去されたオリゴヌクレオチド)に対して、多量の2,2’-ジピリジルジスルフィドまたは多量の化合物(Ib-1)を使用した。
(1)2,2’-ジピリジルジスルフィドおよびトリフェニルホスフィンを用いた実験
 2-シアノエチル基が除去されたHO-T(S)T(S)T-SUC-TOBおよびPiv-TOBの混合物(40mg:HO-T(S)T(S)T-SUC-TOBとして20mg、0.012mmol)を、脱水ジクロロメタン(0.3mL)および脱水ピリジン(0.3mL)に溶解させて溶液を調製し、トリフェニルホスフィン(15mg、0.059mmol)および2,2’-ジピリジルジスルフィド(25mg、0.12mmol)を加え、溶液を室温にて4.5時間撹拌した。その後、溶液にアセトニトリル(7mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、減圧乾燥し、固体を得た(31.2mg)。
 得られた固体(10mg)および28重量%アンモニア水(5mL)をオートクレーブに入れて、65℃で4時間加熱した後、室温まで冷却した。シリンジフィルターにより反応液中の不溶物を除去した後、遠心エバポレーターで減圧濃縮し、得られた濃縮物のLC-MS分析を行った。
(2)化合物(Ib-1)および水を用いた実験
 シアノエチル基が除去されたHO-T(S)T(S)T-SUC-TOBおよびPiv-TOBの混合物(40mg:HO-T(S)T(S)T-SUC-TOBとして20mg、0.012mmol)を、脱水ジクロロメタン(0.3mL)および脱水ピリジン(0.3mL)に溶解させて溶液を調製し、水(6μL、0.3mmol)および化合物(Ib-1)(39mg、0.12mmol)を加え、溶液を室温にて4.5時間撹拌した。その後、溶液にアセトニトリル(7mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、減圧乾燥し、定量的に固体を得た。
 得られた固体(10mg)および28重量%アンモニア水(5mL)をオートクレーブに入れて、65℃で4時間加熱した後、室温まで冷却した。シリンジフィルターにより反応液中の不溶物を除去した後、遠心エバポレーターで減圧濃縮し、得られた濃縮物のLC-MS分析を行った。
(3)評価
 チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドHO-T(S)T(S)T-OH(以下「目的のオリゴヌクレオチド」と記載する)の量、および目的のオリゴヌクレオチドと酸化剤(2,2’-ジピリジルジスルフィドまたは化合物(Ib-1))とが反応して形成された副生成物(以下「副生成物」と記載する)の量を以下のようにして測定し、副生成物の割合を算出した。詳しくは、上記実験で得られた濃縮物をLC-MSにより分析し、観測された各化合物(目的のオリゴヌクレオチドおよび副生成物)の抽出イオンクロマトグラム(EIC)を用いて、各化合物のピーク面積を算出し、下記式:
 副生成物の割合(%)=(副生成物のピーク面積/(目的のオリゴヌクレオチドのピーク面積+副生成物のピーク面積)×100
により副生成物の割合を算出した。結果を表2に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000078
 表2に示すように、2,2’-ジピリジルジスルフィドおよびトリフェニルホスフィンを用いると、多量の副生成物が生じた。一方、多量の化合物(Ib-1)および水を用いても、副生成物は検出されなかった。なお、2,2’-ジピリジルジスルフィドおよびトリフェニルホスフィンを使用する非特許文献1に記載の方法では、この実験例1で示す結果と同様に、多量の副生成物が生じる。
合成例3:2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))の合成
 200mLのナスフラスコに、テトラヒドロフラン(100mL)、2-メルカプトプロピオン酸(10mmol)、および化合物(Ib-1)(20mmol)を加え、溶液を24時間撹拌した。その後、溶液を濾過し、濾液の溶媒を減圧留去した後、得られた濃縮物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的物(1.6g)を得た。
H-NMR(400MHz,メタノール-d)δ 7.91(d,J=8.0,1H),7.81(d,J=8.0,1H),7.47(dd,J=8.0,1H),7.38(dd,J=8.0,1H),3.89(q,J=7.1,1H),1.58(d,J=7.1,3H)
合成例4:3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))の合成
 200mLのナスフラスコに、テトラヒドロフラン(100mL)、3-メルカプトプロピオン酸(10mmol)、および化合物(Ib-1)(20mmol)を加えて溶液を調製し、溶液を24時間撹拌した。その後、溶液を濾過し、濾液の溶媒を減圧留去した後、得られた濃縮物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的物(1.3g)を得た。
H-NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 7.93(d,J=8.0,1H),7.81(d,J=8.0,1H),7.48(dd,J=8.0,1H),7.39(dd,J=8.0,1H),3.24(t,J=6.8,2H),2.81(t,J=6.8,2H).
合成例5:2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド(化合物(Ib-4))の合成
 300mLのナスフラスコにジクロロメタン(150mL)、2-メルカプトベンゾイミダゾール(20mmol)、およびトリエチルアミン(22mmol)を加え、その後ヨウ素(11mmol)を加え、溶液を3時間撹拌した。その後、溶液を濾過し、濾液の溶媒を減圧留去した後、得られた濃縮物を、ジエチルエーテルおよびエタノールを用いて再結晶し、目的物(2.5g)を得た。
H-NMR(400MHz,DMSO-d)δ=7.58-7.56(m,4H),7.26-7.22(m,4H).
合成例6:2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド(化合物(Ib-5))の合成
 30mLのナスフラスコに2-メルカプトベンゾオキサゾール(1.5g,10mmol)および酢酸エチル(18mL)を加えて、溶液を調製した。溶液に、過酸化水素(33重量%,489μL)を0℃で60分かけて滴下した後、溶液を室温に昇温し、2.5時間撹拌した。溶液に水(1.4mL)を加え、混合物を10分撹拌した後、有機層を分取し、水層を酢酸エチル(5mL)で2回抽出した。抽出で得られた溶液を、硫酸ナトリウムで乾燥し、その溶媒を減圧除去した。得られた固体を氷冷したジエチルエーテルで洗浄した後、ジエチルエーテルにて再結晶した。析出した固体を濾過によって回収した後、減圧乾燥し、目的物(210mg)を得た。
H-NMR(400MHz,Chloroform-d)δ=7.76-7.69(m,2H),7.58-7.50(m,2H),7.42-7.32(m,4H).
合成例7:2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)(化合物(Ib-8))の合成
 100mLのナスフラスコに2-メルカプトピリジン-N-オキシド(3.8g,30mmol)および水(27mL)を加えて、溶液を調製した。溶液に、過酸化水素(33重量%,3.2mL)を0℃で60分かけて滴下した後、溶液を40℃に昇温し、1時間撹拌した。溶液を濾過して、固体を回収し、回収した固体をメタノールで洗浄し、減圧乾燥して、目的物(1.2g)を得た。
H-NMR(400MHz,Chloroform-d)δ=8.31(d,J=5.2,2H),7.62(d,J=6.4,2H),7.34-7.24(m,2H),7.20(dd,J=6.4,2H).
合成例8:亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体の合成
 アルゴン雰囲気下、200mLの二口フラスコにHO-T-SUC-TOB(2.1g,1.7mmol)、脱水ジクロロメタン(87mL)および脱水アセトニトリル(26mL)を加え、溶液を調製した。その後、モレキュラーシーブ3A(1.7g)、トリフェニルホスフィン(227mg,867μmol)、dT-CE ホスホロアミダイト(2.6g,3.5mmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(452mg,3.47mmol)を順次加え、室温で60分撹拌した。反応溶液にトリフルオロエタノール(1.3mL,17mmol)を加え室温で30分撹拌した。その後、2,6-キシリジン(2.6mL,21mmol)およびDDTT(892,4.34mmol)を加え、溶液を室温で60分撹拌した。モレキュラーシーブ3Aを濾過によって除去した後、インドール(2.0g,17mmol)およびトリフルオロ酢酸(4.8mL,63mmol)を順次加え、溶液を室温で30分撹拌した。さらにトリフルオロ酢酸(265μL,3.46mmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した。その後、溶液にピリジン(16mL,200mmol)および水(742μL)を順次加え、溶液を室温にて60分撹拌した。その後、アセトニトリル(858mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、2量体であるオリゴヌクレオチドHO-T(S)T-SUC-TOBを得た(2.6g、収率94%)。
m/z:Calcd.1610.03,Found 1611.05[M+H]
 アルゴン雰囲気下、100mLの二口フラスコにHO-T(S)T-SUC-TOB(1.3g,811μmol)、脱水ジクロロメタン(40mL)および脱水アセトニトリル(12mL)を加え、溶液を調製した。その後、モレキュラーシーブ3A(816mg)、トリフェニルホスフィン(109mg,417μmol)、dC(Bz)-CE ホスホロアミダイト(1.4g,1.6mmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(212mg,1.63μmol)を順次加え、溶液を室温で60分撹拌した。モレキュラーシーブ3Aを濾過によって除去した後、アセトニトリル(30mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、3量体であるオリゴヌクレオチド前駆体DMTrO-C(III)T(S)T-SUC-TOBを得た(1.8g、収率96%)。
m/z:Calcd. 2342.26,Found 2343.28[M+H]
実施例5~15および比較例2:各種酸化剤を用いた酸化
 フラスコにDMTrO-C(III)T(S)T-SUC-TOB(60mg,25μmol)、脱水ジクロロメタン(1.3mL)および脱水アセトニトリル(0.4mL)を加え、溶液を調製した。溶液に水(17μL)を加えた後、下記表3に示す各種酸化剤(38μmol)を添加し、室温で3時間撹拌して酸化を行い、3量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-C(O)T(S)T-SUC-TOB(以下「酸化体」と記載する)を合成した。なお、下記表3に示すように、酸化剤として2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-2))または3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸(化合物(Ib-3))を使用した実施例6および7では、上記のように水の存在下での酸化に加えて、前記操作で溶液に水を添加せず、無水条件下での酸化も行った。
 なお、化合物(Ib-2)~化合物(Ib-5)および化合物(Ib-8)は、前述の合成例3~7で得られたものを使用した。
 化合物(Ic-1)は、非特許文献2の Supporting Information に記載の方法によって合成したものを使用した。
 その他の酸化剤は、市販品を使用した。
実施例5~15および比較例2の対比
 実施例5~15および比較例2の酸化後の溶液(10μL)およびDDTT(1mg)を1mLバイアル瓶の中に入れ、テトラヒドロフラン(450μL)で希釈した後、DBU(20μL)を入れて、溶液を室温で30秒間撹拌して、未反応のDMTrO-C(III)T(S)T-SUC-TOBを硫化して、DMTrO-C(S)T(S)T-SUC-TOB(以下「硫化体」)を合成して、酸化体および硫化体を含む試験液を調製した。得られた試験液のMS分析を行い、観測された各化合物(酸化体(即ち、目的のオリゴヌクレオチドDMTrO-C(O)T(S)T-SUC-TOB)および硫化体)のアバンダンスを用いて、下記式:
 酸化体の割合(%)=(酸化体のアバンダンス/(酸化体のアバンダンス+硫化体のアバンダンス))×100
により、酸化体の割合を算出した。結果を表3に示す。なお、表3の実施例6および7の括弧内の数値は、無水条件下で酸化を行った際の酸化体の割合を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000079
 表3に示されるように、酸化剤として化合物(Ib-1)~化合物(Ib-10)または化合物(Ic-1)を使用することによって、非特許文献1(ARKIVOC 2009 (iii) 264-273)で使用されている2,2’-ジピリジルジスルフィドに比べて、オリゴヌクレオチド前駆体を効率的に酸化することができる。
実施例16:酸化剤として化合物(Ib-1)を用いたDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OHの合成
 アルゴン雰囲気下、300mLの二口フラスコにHO-T-SUC-TOB(351mg,284μmol)、Piv-TOB(350mg,350μmol)、脱水ジクロロメタン(14mL)および脱水アセトニトリル(4mL)を加え、溶液を調製した。その後、dT-CE ホスホロアミダイト(402mg,540μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(69.9mg,537μmol)を順次加え、溶液を室温で45分撹拌した。さらに、dT-CE ホスホロアミダイト(21mg,29μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(3.7mg,28μmol)を加え、溶液を室温で35分撹拌した。その後、水(184μL,10.2mmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した。溶液に化合物(Ib-1)(282mg,848μmol)を加え、溶液を室温で60分撹拌した。その後、トリフェニルホスフィン(74.2mg,283μmol)を加え、溶液を30分撹拌した後、2,3-ジメチルフラン(298μL,2.83mmol)およびトリフルオロ酢酸(563μL,7.35mmol)を順次加え、溶液を室温で30分撹拌した。さらに、トリフルオロ酢酸(86.6μL,1.13mmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した。続いて溶液にピリジン(2.0mL,25mmol)および水(120μL)を順次加え、溶液を室温にて60分撹拌した。その後、アセトニトリル(170mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、減圧乾燥し、Piv-TOBおよび2量体であるオリゴヌクレオチドHO-T(O)T-SUC-TOBの混合物を得た(766mg、収率96%)。
m/z:Calcd. 1594.06,Found 1595.07[M+H]
 上記で得られた固体(766mg)と、dT-CE ホスホロアミダイトの代わりに2’-OMe-C-CE ホスホロアミダイトとを用いたこと以外は上記と同様にしてPiv-TOBおよび3量体であるオリゴヌクレオチドHO-Cm(O)T(O)T-SUC-TOBの混合物を得た(875mg、収率98%)。
m/z:Calcd.2070.17,Found 2071.19[M+H]
 アルゴン雰囲気下、200mLの二口フラスコに上記で得られた固体(875mg)、脱水ジクロロメタン(13mL)および脱水アセトニトリル(4mL)を加え、溶液を調製した。その後、2’-F-A-CE ホスホロアミダイト(441mg,503μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(65.7mg,505μmol)を順次加え、溶液を室温で45分撹拌した。さらに、2’-F-A-CE ホスホロアミダイト(25mg,28μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(3.4mg,26μmol)を加え、溶液を室温で60分撹拌した。続いて、水(172μL,9.54mmol)を加え、溶液を室温で60分撹拌した後、溶液に化合物(Ib-1)(266mg,800μmol)を加え、溶液を室温で60分撹拌し、その後トリフェニルホスフィン(71.1mg,271μmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した。その後、アセトニトリル(129mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、減圧乾燥し、Piv-TOBおよび4量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOBの混合物を得た(1007mg、収率93%)。
m/z:Calcd.2860.41,Found 2861.42[M+H]
 上記で得られた固体(9.3mg)および28重量%アンモニア水(5mL)をオートクレーブに入れて、65℃で4時間加熱した後、室温まで冷却した。シリンジフィルターにより反応液中の不溶物を除去した後、遠心エバポレーターで減圧濃縮し、DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OHの水溶液を得た。
m/z:Calcd. 1498.39,Found 1497.37[M-H]
実施例17:酸化剤として化合物(Ic-1)を用いたDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OHの合成
 化合物(Ib-1)を化合物(Ic-1)に変えたこと以外は実施例16と同様にしてDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OHの水溶液を得た。
m/z:Calcd. 1498.39,Found 1497.37[M-H]
比較例3:酸化剤としてヨウ素を用いたDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OHの合成
 アルゴン雰囲気下、200mLの二口フラスコにHO-T-SUC-TOB(354mg,286μmol)およびPiv-TOB(351mg,352μmol)を加え、次いで脱水ジクロロメタン(14mL)および脱水アセトニトリル(4.2mL)を加え、溶液を調製した。その後、dT-CE ホスホロアミダイト(406mg,545μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(70.1mg,539μmol)を順次加え、溶液を室温で45分撹拌した。さらに、dT-CE ホスホロアミダイト(23mg,31μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(4.0mg,31μmol)を加え、溶液を室温で35分撹拌した。続いて、水(180μL,10.2mmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した後、溶液にピリジン(91μL,1.1mmol)およびヨウ素(145mg,569μmol)を順次加え、溶液を室温で90分撹拌した。その後、2,3-ジメチルフラン(298μL,2.83mmol)およびトリフルオロ酢酸(650μL,8.48mmol)を順次加え、溶液を室温で30分撹拌した。さらにトリフルオロ酢酸(86.6μL,1.13mmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した後、溶液にピリジン(2.3mL,29mmol)および水(120μL)を順次加え、溶液を室温にて60分撹拌した。その後、アセトニトリル(140mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、減圧乾燥し、Piv-TOBおよび2量体であるオリゴヌクレオチドHO-T(O)T-SUC-TOBの混合物を定量的に得た(827mg)。
m/z:Calcd.1594.06,Found 1595.07[M+H]
 上記で得られた固体(812mg)と、dT-CE ホスホロアミダイトの代わりに2’-OMe-C-CE ホスホロアミダイトを用いたこと以外は上記と同様にして、Piv-TOBおよび3量体であるオリゴヌクレオチドHO-Cm(O)T(O)T-SUC-TOBの混合物を得た(893mg、収率94%)。
m/z:Calcd.2070.17,Found 2071.19[M+H]
 アルゴン雰囲気下、200mLの二口フラスコに上記で得られた固体(889mg)、脱水ジクロロメタン(13mL)および脱水アセトニトリル(4.0mL)を加え、溶液を調製した。その後、2’-F-A-CE ホスホロアミダイト(729mg,833μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(107mg,819μmol)を順次加え、溶液を室温で105分撹拌した。続いて、水(174μL,9.63mmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した後、溶液にピリジン(200μL,2.48mmol)およびヨウ素(317mg,1.25mmol)を順次加え、溶液を室温で60分撹拌した。さらにトリフェニルホスフィン(109mg,414μmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した。その後、アセトニトリル(137mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、減圧乾燥し、Piv-TOBおよび4量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOBの混合物を得た(1052mg、収率95%)。
m/z:Calcd. 2860.41,Found 2861.42[M+H]
 上記で得られた固体(9.8mg)および28重量%アンモニア水(5mL)をオートクレーブに入れて、65℃で4時間加熱した後、室温まで冷却した。シリンジフィルターにより反応液中の不溶物を除去した後、遠心エバポレーターで減圧濃縮し、DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OHの水溶液を得た。
m/z:Calcd. 1498.39,Found 1497.37[M-H]
実施例16、実施例17および比較例3の対比
 実施例16、実施例17および比較例3で得られた水溶液中のDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH(以下「目的のオリゴヌクレオチド」と記載する)、および目的のオリゴヌクレオチドから2残基目または3残基目がそれぞれ欠損した3量体であるDMTrO-Af(O)Cm(O)T-OHまたはDMTrO-Af(O)T(O)T-OH(以下「欠損体」と記載する)をMS分析で測定した。MS分析は、観測された各化合物(目的のオリゴヌクレオチドおよび欠損体)の抽出イオンクロマトグラム(EIC)を用いて、各化合物のピーク面積を算出し、下記式:
 欠損体量の割合(%)=(各欠損体のピーク面積の合計/目的のオリゴヌクレオチドのピーク面積)×100
により欠損体の割合を算出した。結果を表4に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000080
 表4の結果から明らかなように、酸化剤として、ヨウ素の代わりに化合物(Ib-1)または化合物(Ic-1)を使用することによって、欠損体の生成を抑制することができる。
実施例18:酸化剤として化合物(Ic-1)を用いたHO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOBの合成(芳香族アミンの添加有り)
 アルゴン雰囲気下、3Lの三つ口フラスコにHO-T-SUC-TOB(6.4g,5.2mmol)、Piv-TOB(13g,13mmol)、脱水ジクロロメタン(349mL)および脱水アセトニトリル(98mL)を加え、溶液を調製した。その後dT-CE ホスホロアミダイト(7.3g,9.8mmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(1.3g,9.8mmol)を順次加え、溶液を室温で65分撹拌した。さらに、dT-CE ホスホロアミダイト(385mg,517μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(67.3mg,517μmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した後、水(932μL,51.7mmol)を加え、溶液を室温で40分撹拌した。続いて、化合物(Ic-1)(3.5g,15mmol)を加え、溶液を60分撹拌した。溶液に、トリフェニルホスフィン(1.4g,5.2mmol)および芳香族アミンとして2,6-キシリジン(5.5mL,45mmol)を順次加え、溶液を室温で30分撹拌した。その後、2,3-ジメチルフラン(5.4mL,52mmol)およびトリフルオロ酢酸(13.8mL,180mmol)を順次加え、室温で80分撹拌した。続いて溶液にピリジン(43.7mL,541mmol)および水(2.5mL)を順次加え、溶液を室温にて90分撹拌した。その後、アセトニトリルを添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、Piv-TOBおよび2量体であるオリゴヌクレオチドHO-T(O)T-SUC-TOBの混合物を得た(21g,収率98%)。
m/z:Calcd. 1594.06,Found 1595.07[M+H]
 上記で得られた固体(21g)と、dT-CE ホスホロアミダイトの代わりに2’-OMe-C-CE ホスホロアミダイトとを用いたこと以外は上記と同様にして、Piv-TOBおよび3量体であるオリゴヌクレオチドHO-Cm(O)T(O)T-SUC-TOBの混合物を定量的に得た(23g)。
m/z:Calcd. 2070.17,Found 2071.19[M+H]
 上記で得られた固体(21g)と、2’-OMe-C-CE ホスホロアミダイトの代わりに2’-F-A-CE ホスホロアミダイトとを用いたこと以外は上記と同様にして、Piv-TOBおよび4量体であるオリゴヌクレオチドHO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOBの混合物を得た(23g、収率99%)。
m/z:Calcd. 2558.28,Found 2559.29[M+H]
 また、芳香族アミンの添加の効果を確認するために、2,3-ジメチルフランを加える前の反応溶液から1.3mLを引き抜いた溶液にアセトニトリル(9mL)を添加し、析出した固体をキリヤマ漏斗で吸引濾過した後、乾燥することでPiv-TOBおよび4量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOBの混合物を得た(69mg)。
m/z:Calcd. 2860.41,Found 2861.42[M+H]
 上記で得られたDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-SUC-TOB(3.4mg)および28重量%アンモニア水(5mL)をオートクレーブに入れて、65℃で4時間加熱した後、室温まで冷却した。シリンジフィルターにより反応液中の不溶物を除去した後、遠心エバポレーターで減圧濃縮し、DMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OHの水溶液を得た。
m/z:Calcd.1498.39,Found 1497.37[M-H]
実施例17および実施例18の対比
 実施例17および実施例18で得られた水溶液中のDMTrO-Af(O)Cm(O)T(O)T-OH(以下「目的のオリゴヌクレオチド」と記載する)、および目的のオリゴヌクレオチドから2残基目または3残基目がそれぞれ欠損した3量体であるDMTrO-Af(O)Cm(O)T-OHまたはDMTrO-Af(O)T(O)T-OH(以下「欠損体」と記載する)をMS分析で測定した。MS分析は、観測された各化合物(目的のオリゴヌクレオチドおよび欠損体)の抽出イオンクロマトグラム(EIC)を用いて、各化合物のピーク面積を算出し、下記式:
 欠損体量の割合(%)=(各欠損体のピーク面積の合計/目的のオリゴヌクレオチドのピーク面積)×100
により欠損体の割合を算出した。結果を表5に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000081
 表5の結果から明らかなように、化合物(Ic-1)を用いる酸化工程後に、芳香族アミン(2,6-キシリジン)を添加することによって、欠損体の生成をさらに抑制することができる。
実施例19:酸化剤として化合物(Ib-1)を用いたHO- Me C(O)A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOBの合成
 アルゴン雰囲気下、30mLの2口フラスコにHO-T(S)T-SUC-TOB(250mg,88μmol)、脱水ジクロロメタン(4.4mL)および脱水アセトニトリル(1.3mL)を加え、溶液を調製した。その後dG-CE ホスホロアミダイト(149mg,176μmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(23mg,0.18mmol)を順次加え、溶液を室温で45分撹拌した。その後、溶液に2,2,2-トリフルオロエタノール(38μL,0.53mmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した。続いて、水(70μL)および化合物(Ib-1)(59mg,18mmol)を加え、溶液を室温で60分撹拌した。溶液の一部をサンプリングした後、溶液に2,3-ジメチルフラン(46μL,0.88mmol)およびトリフルオロ酢酸(102μL,1.32mmol)を順次加え、溶液を室温で80分撹拌した。続いて溶液にピリジン(319μL,3.95mmol)および水(19μL)を順次加え、溶液を室温にて90分撹拌した。その後、アセトニトリルを添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、3量体であるオリゴヌクレオチドHO-G(O)T(O)T-SUC-TOBを得た(111mg)。
m/z:Calcd. 2062.15,Found 2063.16[M+H]
 上記で得られた固体(111mg,34μmol)と、dG-CE ホスホロアミダイトの代わりにdA-CE ホスホロアミダイトとを用いたこと以外は上記と同様にして、4量体であるオリゴヌクレオチドHO-A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOBを得た(113mg,収率90%)。
m/z:Calcd.2497.30,Found 2498.32[M+H]
 上記で得られた固体(99mg,27μmol)と、dA-CE ホスホロアミダイトの代わりに5-Me-dC(Bz)-CE ホスホロアミダイトとを用いたこと以外は上記と同様にして、5量体であるオリゴヌクレオチドHO-MeC(O)A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOBを得た(93mg,収率84%)。
m/z:Calcd.2957.41,Found 1479.71[M+2H]2+
実施例20:酸化剤として化合物(Ib-1)を用いたHO- Me C(O)A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOBの合成(芳香族アミンの添加有り)
 酸化工程(即ち、溶液に化合物(Ib-1)を加え、溶液を室温で30分間撹拌した工程)の後に、芳香族アミンとして2,6-キシリジン(化合物(Ib-1)1molに対して3mol)を溶液に加え、溶液を室温で30分間撹拌する工程を追加したこと以外は実施例19と同様にして、HO-MeC(O)A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOBを得た(121mg)。
実施例19および実施例20の対比
 実施例19および実施例20で得られたHO-MeC(O)A(O)G(O)T(S)T-SUC-TOBをテトラヒドロフランに溶解させた後、DBUでリン酸エステル部分およびチオリン酸エステル部分に結合した保護基(2-シアノエチル基)を除去し、保護基を除去したオリゴヌクレオチド(以下「目的のオリゴヌクレオチド」と記載する)、および目的のオリゴヌクレオチドからMeC、AおよびGのいずれかが欠損した、4量体であるオリゴヌクレオチド(以下「欠損体」と記載する)をMS分析で測定した。MS分析は、観測された各化合物(目的のオリゴヌクレオチドおよび欠損体)の抽出イオンクロマトグラム(EIC)を用いて、各化合物のピーク面積を算出し、下記式:
 欠損体の割合(%)=(各欠損体のピーク面積の合計/目的のオリゴヌクレオチドのピーク面積)×100
により欠損体の割合を算出した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000082
 表6の結果から明らかなように、化合物(Ib-1)を用いる酸化工程後に、芳香族アミン(2,6-キシリジン)を添加することによって、欠損体の生成をさらに抑制することができる。
実施例21:20量体であるオリゴヌクレオチド(DMTrO-Um(O)Cm(O)Am(O)Am(O)Gm(S)Gm(S)Am(S)Am(S)Gm(S)Am(S)Um(S)Gm(S)Gm(S)Cm(S)Am(S)Um(S)Um(S)Um(S)Cm(S)Um-OH)(配列番号1)の固相合成
 前記配列の20mer量体であるオリゴヌクレオチドをホスホロアミダイト法による固相合成で合成した(前記配列中、Amは、2’-O-メチルアデノシン残基を示し、Cmは、2’-O-メチルシチジン残基を示し、Gmは、2’-O-メチルグアノシン残基を示し、Umは、2’-O-メチルウリジン残基を示し、(O)は、前記式(P3-1)で表されリン酸エステル結合を示し、および(S)は、前記式(P4-1)で表されるチオリン酸エステル結合を示す)。
 具体的には5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチルウリジンが41μmol/gで担持された多孔質ガラス(CPG)固相担体(ChemGenes 社製)(固相担体の量:24mg、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチルウリジン量:1μmol)をグラスフィルター付きのカラムに入れ、オリゴヌクレオチド合成機(商品名「nS-8」、ジーンデザイン社製)を使用し、3’側から5’側に向かって合成を行なった。ホスホロアミダイトとして、N-ベンゾイル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチルアデノシンホスホロアミダイトとN-アセチル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチルシチジンホスホロアミダイト、N-イソブチリル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチルグアノシンホスホロアミダイト、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチルウリジンホスホロアミダイトのそれぞれのアセトニトリル溶液を、活性化剤として5-エチルチオ-1H-テトラゾールのアセトニトリル溶液を、硫化剤としてDDTTのピリジン溶液を、キャッピング試薬として10重量%無水酢酸のTHF溶液および1-メチルイミダゾールおよびピリジンのTHF溶液の混合溶液を、脱トリチル試薬としてトリクロロ酢酸(TCA)のジクロロメタン溶液を用いた。酸化剤として、(1)0.01Mの化合物(Ib-1)のピリジン溶液、(2)0.1Mの化合物(Ic-1)のピリジン溶液、または(3)0.02Mの化合物(Ic-1)のアセトニトリル溶液を用いた。
 合成したオリゴヌクレオチドの固相担体からの切り出しおよびその塩基部の脱保護のために、28重量%アンモニア水およびエタノールの混合溶液(アンモニア水:エタノールの体積比=3:1)を用いて、55℃および15時間、合成したオリゴヌクレオチドを処理した後、固相担体を濾別し、濾液を遠心濃縮機で減圧濃縮した。合成したオリゴヌクレオチドをLC-MSで分析を行い、分子量を測定した。その結果、酸化剤として化合物(Ib-1)または化合物(Ic-1)を用いる固相合成によって、目的のオリゴヌクレオチドを合成できたことが確認された。
m/z:Calcd.7215.88,Found 2404.43[M-3H]3-
合成例9:2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン(化合物(Ic-11))の合成
 アルゴン雰囲気下、100mLのフラスコに2-クロロキノリン-3-カルボン酸(2.5g、12mmol)、および塩化チオニル(40mL)を加え、混合物を80℃で17時間撹拌した。塩化チオニルを減圧下で留去し、さらにトルエン(30mL)を加え、得られた溶液を減圧濃縮し、再度トルエン(60mL)を加え、得られた溶液を減圧下で乾燥し、固体を得た。得られた固体にTHF(15mL)を加え、氷浴下でトリエチルアミン(2.5mL、18mmol)とアニリン(1.3mL、14mmol)をゆっくり滴下した。得られた混合物を室温に昇温し、THF(2mL)およびトリエチルアミン(0.5mL、3.6mmol)を加え、2.5時間撹拌した後、減圧下で溶媒を留去し、ジクロロメタン(50mL)を加えた。得られた有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で2回、飽和食塩水で1回洗浄した後、硫酸ナトリウムで乾燥した。硫酸ナトリウムを濾過で除去した後、濾液を減圧下で乾燥して、固体を得た。
 前記固体に脱水DMF(10mL)を加えて、希釈液を調製した。また、アルゴン雰囲気下、100mLフラスコに脱水DMF(2mL)、水酸化ナトリウム(0.48g、12mmol)、およびtert-ブチルメルカプタン(1.4mL,12mmol)を加え、氷冷下で撹拌し、得られた混合物に、前記希釈液を滴下した後、混合物を室温に昇温し、4時間撹拌した。その後、混合物に、氷浴下で水(120mL)をゆっくり滴下した。析出した固体を濾過により回収し、エタノール(400mL)を加え、混合物を100℃で撹拌した後、混合物を室温まで冷却した。混合物から析出した固体を濾過によって回収し、得られた固体を減圧下で乾燥した(1.7g)。また、濾液を減圧下で濃縮し、エタノール(400mL)を加え、混合物を100℃で撹拌した後、水(200mL)を滴下し、混合物を室温まで冷却した。混合物から析出した固体を濾過によって回収し、得られた固体を減圧下で乾燥した(0.85g)。得られた1.7gの固体と、0.85gの固体とを混合し、このうちの2.0gの固体を次の工程に使用した。
 アルゴン雰囲気下、100mLフラスコに前記固体(2.0g)およびジクロロメタン(19mL)を加え、混合物を氷冷下で15分間撹拌した。得られた混合物に、メタクロロ過安息香酸(1.5g、6.4mmol)を加え、1時間撹拌して、有機層を調製した。得られた有機層に、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(20mL)を加えて室温で30分間撹拌した。析出固体を濾過で除去し、濾液の水層を除去した後、飽和チオ硫酸ナトリウム水溶液(20mL)および飽和食塩水(20mL)で有機層を順次洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥後、濾過し、減圧濃縮した(1.3g)。得られた濃縮液に、トルエン(72mL)およびピリジン(7.2mL)を加え、混合物を100℃に昇温し、2時間撹拌した。その後、混合物を室温に冷却し、析出した固体を濾過によって回収した後、得られた固体にエタノール(200mL)を加え、混合物を100℃で撹拌した後、水(67mL)を滴下し、混合物を室温まで冷却した。析出した固体を濾過によって回収した後、得られた固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチルの体積比=2/1)にて精製した後、減圧濃縮した。得られた濃縮液にエタノールを加え、混合物を100℃で撹拌した後、水を滴下し、混合物を室温まで冷却した。析出した固体を濾過によって回収した後し、減圧下で乾燥し、目的物を得た(121mg)。
1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 8.85 (s, 1H), 8.06 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 7.99 (dd, J = 8.3, 1.4 Hz, 1H), 7.83 (ddd, J = 8.5, 6.8, 1.5 Hz, 1H), 7.73 - 7.65 (m, 2H), 7.57 (ddd, J = 8.1, 7.0, 1.0 Hz, 1H), 7.48 - 7.39 (m, 2H), 7.32 - 7.24 (m, 1H).
m/z: Calcd. 278.05, Found 279.06[M+H]+
合成例10:2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-12))の合成
 200mLのフラスコに2-クロロ-5-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-カルボン酸(2.5g、11mmol)および塩化チオニル(37mL)を加え、混合物を80℃で4時間撹拌した。塩化チオニルを減圧下で留去した後、トルエン(30mL)を加え、得られた溶液を減圧下濃縮して、濃縮液を得た。
 前記濃縮液に脱水THF(5mL)を加えて、氷冷下で撹拌して、希釈液を調製した。前記希釈液に、トリエチルアミン(1.9mL,13mmol)、アニリン(1.2mL,13mmol)および脱水THF(10mL)の溶液を加え、得られた混合物を室温に昇温し、2.5時間撹拌した。減圧下で溶媒を留去した後、得られた残渣にジクロロメタン(30mL)および飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(50mL)を加え、撹拌した。水層を除去した後、有機層を、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(50mL)および飽和食塩水(50mL)で順次洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧下で乾燥して、固体を得た(3.1g)。
 前記固体に脱水DMF(5mL)を加えて、希釈液を調製した。また、アルゴン雰囲気下、100mLフラスコに、脱水DMF(2mL)、水酸化ナトリウム(0.47g、12mmol)およびtert-ブチルメルカプタン(1.3mL,11mmol)を加え、氷冷下で撹拌し、得られた混合物に、前記希釈液を滴下した後、混合物を室温に昇温し、4時間撹拌した。その後、混合物に、氷冷下で水(70mL)をゆっくり滴下した。析出した固体を濾過により回収し、エタノール(30mL)を加え、混合物を100℃で撹拌した後、水(30mL)を滴下し、混合物を室温まで冷却した。析出した固体を濾過によって回収し、得られた固体を減圧下で乾燥した。得られた固体にエタノール(30mL)を加え、混合物を100℃で撹拌した後、水(30mL)を滴下し、混合物を室温まで冷却した。析出した固体を濾過によって回収し、得られた固体を減圧下で乾燥した(3.4g)。
 アルゴン雰囲気下、100mLフラスコに前記固体(3.4g)およびジクロロメタン(32mL)を加え、混合物を氷冷下で15分間撹拌した。得られた混合物に、メタクロロ過安息香酸(2.5g、10mmol)を加え、2時間撹拌して、有機層を調製した。得られた有機層に、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(20mL)を加えて室温で1時間撹拌し、水層を除去した後、飽和チオ硫酸ナトリウム水溶液(50mL)および飽和食塩水(50mL)で有機層を順次洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥後、濾過し、減圧濃縮した(3.4g)。得られた濃縮液に、トルエン(186mL)およびピリジン(19mL)を加え、混合物を100℃に昇温し、1.5時間撹拌した。その後、混合物を室温に冷却し、減圧下で溶媒を除去した。得られた残渣に、エタノール(160mL)を加え、混合物を100℃に昇温し、水(80mL)をゆっくり滴下した。さらに混合物を、室温で1時間、氷冷下で15分間撹拌し、析出した固体を濾過によって回収し減圧下で乾燥した。得られた固体に、エタノール(120mL)を加え、混合物を100℃に昇温し、水(50mL)をゆっくり滴下した。さらに混合物を、室温で1時間、氷冷下で15分間撹拌し、析出した固体を濾過によって回収し、減圧下で乾燥し、目的物を得た(2.1g)。
1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 9.08 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.62 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 7.75 - 7.67 (m, 2H), 7.59 - 7.49 (m, 2H), 7.46 - 7.37 (m, 1H).
m/z: Calcd. 296.02, Found 297.03[M+H]+
合成例11:2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン(化合物(Ic-13))の合成
 アルゴン雰囲気下、300mLのフラスコに2-クロロピリジン-3-アセトニトリル(5.0g、33mmol)、および4mol/L水酸化ナトリウム水溶液(75mL)を加え、混合物を110℃で1時間撹拌した。混合物を、室温まで冷却した後、1時間撹拌し、氷冷下で6mol/L塩酸(60mL)をゆっくり滴下し、1時間撹拌した。析出した固体を濾過によって回収し、2-プロパノール(40mL)で洗浄し、減圧下で乾燥した(5.6g)。
 アルゴン雰囲気下、200mLのフラスコに前記固体および脱水THF(109mL)を加え、氷冷下で15分間撹拌した。得られた混合物に、トリエチルアミン(9.2mL、66mmol)、アニリン(3.6mL、39mmol)、および1-エチル-3-[3-(ジメチルアミノ)プロピル]カルボジイミド塩酸塩(9.4g、49mmol)を順次加え、室温に昇温し、2時間撹拌した。混合物に酢酸エチル(100mL)を加え、得られた有機層を、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(100mL)で3回、飽和食塩水(100mL)で1回洗浄した後、硫酸ナトリウムで乾燥した。硫酸ナトリウムを濾過で除去した後、濾液を減圧濃縮して、濃縮液を得た(8.1g)。
 前記濃縮液に脱水DMF(20mL)を加えて、希釈液を調製した。また、アルゴン雰囲気下、300mLフラスコに脱水DMF(2mL)、水酸化ナトリウム(2.6g、64mmol)、およびtert-ブチルメルカプタン(4.4mL,39mmol)を加え、氷冷下で10分間撹拌し、得られた混合物に、前記希釈液を滴下した後、混合物を110℃にて23時間撹拌した。その後、混合物に、氷冷下で水(260mL)をゆっくり滴下した。混合物に、ジクロロメタンを加え、得られた有機層を、水で2回、飽和食塩水で1回洗浄した後、硫酸ナトリウムで乾燥した。硫酸ナトリウムを濾過で除去した後、濾液を減圧濃縮して、濃縮液を得た。得られた濃縮液を、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチルの体積比=1/1)で精製し、減圧下で濃縮して、濃縮液を得た。(1.4g)。
 アルゴン雰囲気下、前記濃縮液にジクロロメタン(16mL)を加え、混合物を氷冷下で15分間撹拌した。得られた混合物に、メタクロロ過安息香酸(1.2g、5.2mmol)を加え、1時間撹拌して、有機層を調製した。得られた有機層に、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(16mL)を加えて室温で30分間撹拌し、水層を除去した後、飽和チオ硫酸ナトリウム水溶液(20mL)、飽和食塩水(20mL)で有機層を洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥後濾過し、減圧濃縮した(1.3g)。得られた濃縮液に、トルエン(85mL)およびピリジン(8.5mL)を加え、混合物を100℃に昇温し、1時間撹拌した後、120℃に昇温し、4時間撹拌した。その後、混合物を室温に冷却し、減圧下で溶媒を留去した後、得られた残渣を、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチルの体積比=1/3)にて精製した後、減圧下で濃縮して、濃縮液を得た。得られた濃縮液に、エタノールを加え、100℃に昇温し、水をゆっくり滴下した。混合物を室温に冷却した後、析出した固体を濾過によって回収し、目的物を得た(146mg)。
1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 8.82 - 8.71 (m, 1H), 8.28 (d, J = 4.1 Hz, 1H), 7.71 (d, J = 7.4 Hz, 1H), 7.55 (d, J = 7.9 Hz, 2H), 7.32 - 7.28 (m, 1H), 7.17 - 7.07 (m, 2H), 4.00 (s, 2H).
m/z: Calcd. 242.05, Found 243.05[M+H]+
合成例12:2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン(化合物(Ic-15))の合成
 アルゴン雰囲気下、100mLのフラスコに2-クロロピリジン-3-カルボニルクロリド(5.0g、28mmol)および脱水THF(12mL)を加え、混合物を氷冷下で撹拌した。得られた混合物に、トリエチルアミン(4.8mL、34mmol)、2-アミノ-5-メチルピリジン(3.7g、34mmol)および脱水THF(28mL)の溶液を30分間かけて滴下し、室温に昇温し23時間撹拌した。減圧下で溶媒を留去した後、得られた残渣にジクロロメタン(50mL)および飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(50mL)を加え、撹拌した。水層を除去した後、有機層を、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(50mL)および飽和食塩水(50mL)で順次洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧濃縮して、濃縮液を得た(7.1g)。
 前記濃縮液に脱水DMF(20mL)を加えて、希釈液を調製した。また、アルゴン雰囲気下、300mLフラスコに、脱水DMF(4mL)、水酸化ナトリウム(1.3g、34mmol)、およびtert-ブチルメルカプタン(3.6mL,32mmol)を加え、氷冷下で撹拌し、得られた混合物に、前記希釈液を滴下した後、混合物を室温に昇温し、5時間撹拌した。その後、混合物に、氷冷下で水(240mL)を25分間かけてゆっくり滴下した。析出した固体を濾過により回収し、エタノール(60mL)を加え、混合物を100℃で撹拌した後、水(60mL)を滴下し、混合物を氷冷下で冷却した。析出した固体を濾過によって回収し、得られた固体を減圧下で乾燥した(5.4g)。
 アルゴン雰囲気下、100mLフラスコに前記固体、およびジクロロメタン(60mL)を加え、混合物を氷冷下で15分間撹拌した。得られた混合物に、メタクロロ過安息香酸(4.7g、20mmol)を加え、2時間撹拌して、有機層を調製した。得られた有機層に、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(60mL)を加えて室温で1時間撹拌した後、析出した固体を濾過によって除去した。濾液の水層を除去した後、飽和チオ硫酸ナトリウム水溶液(50mL)および飽和食塩水(50mL)で有機層を順次洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥後濾過し、減圧濃縮した(5.7g)。得られた濃縮液に、トルエン(356mL)およびピリジン(36mL)を加え、混合物を100℃に昇温し、1時間撹拌した。その後、混合物を室温に冷却し、析出した固体を濾過によって除去した後、濾液の溶媒を減圧下を除去した。得られた残渣を、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチルの体積比=1/1)にて精製した後、減圧下で濃縮して、目的物を得た(1.3g)。
1H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 8.82 (dd, J = 4.8, 1.7 Hz, 1H), 8.60 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 8.33 (dd, J = 7.9, 1.7 Hz, 1H), 8.26 (s, 1H), 7.66 (dd, J = 8.5, 2.3 Hz, 1H), 7.39 (dd, J = 7.9, 4.7 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H).
m/z: Calcd. 243.05, Found 244.05[M+H]+
合成例13:亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体の合成
 アルゴン雰囲気下、500mLのフラスコにHO-MeC-SUC-TOB(15.1g,11.2mmol)、Piv-TOB(30.1g,30.2mmol)、脱水クロロホルム(562mL)および脱水アセトニトリル(169mL)を加え、溶液を調製した。その後、モレキュラーシーブ3A(11.2g)、dG-CE ホスホロアミダイト(18.9g,22.5mmol)およびトリフェニルホスフィン(1.5g,5.6mmol)を加え、溶液を30分撹拌した。続いて、5-エチルチオ-1H-テトラゾール(2.9g,22.5mmol)を加え、溶液を室温で60分撹拌した。その後、溶液に2,2,2-トリフルオロエタノール(8.2mL、112mmol)を加え、室温で30分撹拌した後、2,6-ジメチルアニリン(10mL、81mmol)およびPOS(5.5g、28mmol)を順次加え、室温で溶液を1.0時間撹拌した。その後、2,3-ジメチルフラン(11.8mL,0.11mol)、トリフルオロ酢酸(27.1mL,0.35mol)、および2,6-ジメチルアニリン(436μL、3.5mmol)を順次加え、溶液を室温で60分撹拌した。さらにトリフルオロ酢酸(1.7mL,22mmol)および2,6-ジメチルアニリン(28μL、0.22mmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した。続いて溶液にピリジン(91mL,1.1mmol)および脱水メタノール(7.3mL)を順次加え、溶液を室温にて120分撹拌した。モレキュラーシーブ3Aを濾過によって除去した後、アセトニトリル(4.7L)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、Piv-TOBおよび2量体であるオリゴヌクレオチドHO-G(S)MeC-SUC-TOBの混合物を得た(50g、収率99%)。
m/z:Calcd. 1808.12,Found 1809.13[M+H]
 上記で得られた固体(50g)と、脱水クロロホルムの代わりに脱水ジクロロメタンを、dG-CE ホスホロアミダイトの代わりにdA-CE ホスホロアミダイトとを用いたこと以外は上記と同様にして、Piv-TOBおよび3量体であるオリゴヌクレオチドHO-A(S)G(S)MeC-SUC-TOBの混合物を得た(54.4g、収率99%)。
m/z:Calcd. 2259.24,Found 2260.25[M+H]
 アルゴン雰囲気下、20mLの二口フラスコに上記で得られた固体(3.0g)、脱水ジクロロメタン(30mL)および脱水アセトニトリル(9.1mL)を加え、溶液を調製した。その後、モレキュラーシーブ3A(0.6g)、dG-CE ホスホロアミダイト(1.0g,1.2mmol)および5-エチルチオ-1H-テトラゾール(161mg,1.2mmol)を順次加え、溶液を室温で60分撹拌した。その後、溶液に2,2,2-トリフルオロエタノール(197μL、6.1mmol)を加え、室温で30分撹拌した。モレキュラーシーブ3Aを濾過によって除去した後、アセトニトリル(152mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、乾燥し、Piv-TOBと、4量体であるオリゴヌクレオチド前駆体DMTrO-G(III)A(S)G(S)MeC-SUC-TOBの混合物を得た(3.3g、収率98%)。
m/z:Calcd. 2997.50,Found 1499.75[M+2H]2+
実施例22~41および比較例4:各種酸化剤を用いた酸化
 フラスコにDMTrO-G(III)A(S)G(S)MeC-SUC-TOBおよびPiv-TOBの混合物(100mg:DMTrO-G(III)A(S)G(S)MeC-SUC-TOBとして52.8mg、0.018mmol)、並びに脱水ジクロロメタン(0.9mL)を加え、溶液を調製した。溶液にピリジン(0.11mmol)および水(8.8μL)を加えた後、下記表7~9に示す各種酸化剤(53μmol)を添加し、室温で3時間撹拌して酸化を行い、4量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-G(O)A(S)G(S)MeC-SUC-TOBを合成した。その後、トリフェニルホスフィン(9.2mg,35μmol)を加え、溶液を室温で30分撹拌した。その後、アセトニトリル(129mL)を添加し、析出した固体を、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過で回収した後、減圧乾燥し、Piv-TOBおよび4量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-G(O)A(S)G(S)MeC-SUC-TOBの混合物を得た。
m/z:Calcd.3013.49,Found 3014.54[M+H]
 なお、化合物(Ib-2)~化合物(Ib-5)および化合物(Ib-8)は、前述の合成例3~7で得られたものを使用した。
 化合物(Ic-11)~化合物(Ic-13)および化合物(Ic-15)は、前述の合成例9~12で得られたものを使用した。
 化合物(Ic-1)、化合物(Ic-2)、化合物(Ic-5)、化合物(Ic-10)、化合物(Ic-14)、化合物(Ic-16)および化合物(Ic-17)は、非特許文献2の Supporting Information に記載の方法によって合成したものを使用した。
 その他の酸化剤は、市販品を使用した。
実施例22~41および比較例4の対比(脱硫体の割合)
 以下のようにして、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド、およびチオリン酸エステル結合がリン酸エステル結合に転化して得られた副生成物(以下「脱硫体」と記載する)を分析し、脱硫体の割合を算出した。
 実施例22~41または比較例4で得られた固体(5mg)および28重量%アンモニア水(5mL)をオートクレーブに入れて、65℃で4時間加熱した後、室温まで冷却した。シリンジフィルターにより反応液中の不溶物を除去した後、遠心エバポレーターで減圧濃縮し、チオリン酸エステル結合を有するDMTrO-G(O)A(S)G(S)MeC-OH(以下「目的のオリゴヌクレオチド」と記載する)の水溶液を得た。
m/z:Calcd. 1547.37,Found 1546.34[M-H]
 得られた目的のオリゴヌクレオチドおよび脱硫体を含む混合物を、液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)により分析した。観測された各化合物(目的のオリゴヌクレオチドおよび脱硫体)の抽出イオンクロマトグラム(EIC)を用いて、各化合物のピーク面積を算出し、下記式:
 脱硫体の割合(%)=(脱硫体のピーク面積/目的のオリゴヌクレオチドのピーク面積)×100
により脱硫体の割合を算出した。結果を表7および8に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000083
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000084
 表7および8の結果から明らかなように、酸化剤として、ヨウ素の代わりに表7および8に示す化合物(Ic-1)等を使用することによって、脱硫体の生成を抑制することができる。
実施例22~32および比較例4の対比(欠損体の割合)
 前述の実施例22~32および比較例4の酸化までの操作を行い、4量体であるオリゴヌクレオチドDMTrO-G(O)A(S)G(S)MeC-SUC-TOB(以下「酸化体」と記載する)を含む溶液を調製した。この溶液(10μL)およびDDTT(1mg)を1mLバイアル瓶の中に入れ、テトラヒドロフラン(450μL)で希釈した後、DBU(20μL)を入れて、溶液を室温で30秒間撹拌して、未反応のDMTrO-G(III)A(S)G(S)MeC-SUC-TOBを硫化して、DMTrO-G(S)A(S)G(S)MeC-SUC-TOB(以下「硫化体」と記載する)を合成して、酸化体および硫化体を含む試験液を調製した。得られた試験液のMS分析を行い、観測された各化合物(目的のオリゴヌクレオチドである酸化体)および欠損体(HO-A(S)G(S)MeC-SUC-TOB))のアバンダンスを用いて、下記式:
 欠損体の割合(%)=(欠損体のアバンダンス/酸化体のアバンダンス)×100
により、欠損体の割合を算出した。結果を表9に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000085
 表9の結果から明らかなように、酸化剤として、ヨウ素の代わりに表9に示す化合物(Ic-1)等(但し、化合物(Ic-5)を除く)を使用することによって、欠損体の生成を抑制することができる。
 本発明製造方法によれば、ヨウ素を使用する場合に比べて、前述の欠損体または脱硫体の生成を抑制して、オリゴヌクレオチドを製造することができる。本発明の製造方法によって得られるオリゴヌクレオチドは、人体用または動物用の医薬品(RNA、DNA、オリゴ核酸医薬等)、機能性食品、特定保健用食品、食品、化成品、生体用や工業用の高分子材料等の各種用途に使用することができる。
 本願は、日本で出願された特願2021-21175号を基礎としており、その内容は本願明細書に全て包含される。

Claims (28)

  1.  亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体を、酸化剤によって酸化して、リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチドを製造する方法であって、
     前記酸化剤が、式(I):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001

    [式中、
     Xは、単結合、硫黄原子、酸素原子、-S(=O)-または-N(-R)-を示し、
     Xが単結合である場合、Rは、ハロゲン原子を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     Xが硫黄原子または-S(=O)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     Xが酸素原子である場合、RおよびRは、それらが結合する硫黄原子および酸素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びに
     Xが-N(-R)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、並びにRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成するか、またはRおよびRは、それらが結合する窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びにRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示す。]
    で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)である方法。
  2.  前記式(I)で表される化合物が、式(Ia):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000002

    [式中、
     R1aは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     環Aは、5または6員の不飽和複素環を示し、
     Y1aは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-を示し、
     mは、0~3の整数を示し、
     m個のR2aは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
     mが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2aは、環Aと共に、置換されていてもよい縮合環を形成していてもよい。]
    で表される化合物、および/または式(Ib):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000003

    [式中、
     R1bは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     環Bは、6員の芳香族炭化水素環、または5若しくは6員の芳香族複素環を示し、
     nは、0~5の整数を示し、
     n個のR2bは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
     nが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2bは、環Bと共に、置換されていてもよい2環式の縮合芳香族複素環を形成していてもよい。]
    で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)
    である、請求項1に記載の方法。
  3.  前記式(Ia)で表される化合物が、式(Ic):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000004

    [式中、
     R1cは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     Y1cは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-を示し、
     pは、0または1を示し、
     R2cは、水素原子、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、
     環Cは、6員の芳香族炭化水素環、6員の含窒素芳香族複素環、または窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環を示し、
     qは、0~4の整数を示し、および
     q個のR3cは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示す。]
    で表される化合物である、請求項2に記載の方法。
  4.  前記式(Ic)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オンからなる群から選ばれる少なくとも一つである、請求項3に記載の方法。
  5.  前記環Cが、6員の芳香族炭化水素環または6員の含窒素芳香族複素環である、請求項3に記載の方法。
  6.  前記式(Ic)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、および2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オンからなる群から選ばれる少なくとも一つである、請求項5に記載の方法。
  7.  前記式(Ib)で表される化合物における式(r1):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000005

    で表される基が、
     (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
     (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
     (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
     (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
     (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
     (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
     (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、
     (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
     (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
     (10)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~3個の置換基で置換されていてもよい2-イミダゾリル基
    である、請求項2~6のいずれか一項に記載の方法。
  8.  前記式(Ib)で表される化合物が、2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)、4,4’-ジピリジルジスルフィド、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸、2,2’-ジチオビス(1H-イミダゾール)、および2,2’-ジチオビス(1-メチル-1H-イミダゾール)からなる群から選ばれる少なくとも一つである、請求項7に記載の方法。
  9.  前記酸化を水の存在下で行う、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
  10.  亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体が、
    (1)ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドとの縮合によって得られた亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体、または
    (2)オリゴヌクレオチドと、ホスホロアミダイトとの縮合によって得られた亜リン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体
    である、請求項1~9のいずれか一項に記載の方法。
  11.  亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体が、亜リン酸エステル結合またはホスホン酸エステル結合に加えて、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である、請求項1~10のいずれか一項に記載の方法。
  12.  ワンポット合成によってオリゴヌクレオチドを製造する方法であって、
     前記ワンポット合成が、
     非極性溶媒を含む溶液中で、疎水性保護基を有するヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(a)と、水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されており、且つホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)とを縮合して、亜リン酸エステル結合および疎水性保護基を有し、且つ水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているオリゴヌクレオチド前駆体(c)を形成する工程(1)、
     工程(1)後の溶液に、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)のクエンチ剤(i)を添加して、前記ホスホロアミダイト化された、ヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド(b)をクエンチする工程(2)、
     工程(2)後の溶液に酸化剤を添加して、前記オリゴヌクレオチド前駆体(c)を酸化して、リン酸エステル結合および疎水性保護基を有し、且つ水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されているオリゴヌクレオチド(d)を形成する工程(3)、
     工程(3)後の溶液に酸化剤のクエンチ剤(ii)を添加して、酸化剤をクエンチする工程(4)、
     工程(4)後の溶液に酸を添加して、前記オリゴヌクレオチド(d)の酸性条件下で除去可能な一時保護基を除去して、保護されていない水酸基および疎水性保護基を有するオリゴヌクレオチド(e)を形成する工程(5)、並びに
     前記オリゴヌクレオチド(e)を含む溶液に極性溶媒を添加して、前記オリゴヌクレオチド(e)を析出させる工程(7)
    を含み、並びに
     前記酸化剤が、式(I):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000006

    [式中、
     Xは、単結合、硫黄原子、酸素原子、-S(=O)-または-N(-R)-を示し、
     Xが単結合である場合、Rは、ハロゲン原子を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     Xが硫黄原子または-S(=O)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、およびRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     Xが酸素原子である場合、RおよびRは、それらが結合する硫黄原子および酸素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びに
     Xが-N(-R)-である場合、Rは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、並びにRおよびRは、それらが結合する硫黄原子および窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成するか、またはRおよびRは、それらが結合する窒素原子と共に、置換されていてもよい複素環を形成し、並びにRは、置換されていてもよいアリール基または置換されていてもよいヘテロアリール基を示す。]
    で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)である方法。
  13.  前記式(I)で表される化合物が、式(Ia):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000007

    [式中、
     R1aは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     環Aは、5または6員の不飽和複素環を示し、
     Y1aは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-を示し、
     mは、0~3の整数を示し、
     m個のR2aは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
     mが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2aは、環Aと共に、置換されていてもよい縮合環を形成していてもよい。]
    で表される化合物、および/または式(Ib):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000008

    [式中、
     R1bは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     環Bは、6員の芳香族炭化水素環、または5若しくは6員の芳香族複素環を示し、
     nは、0~5の整数を示し、
     n個のR2bは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、および
     nが2以上の整数である場合、隣接する2個のR2bは、環Bと共に、置換されていてもよい2環式の縮合芳香族複素環を形成していてもよい。]
    で表される化合物(但し、2,2-ジピリジルジスルフィドを除く)
    である、請求項12に記載の方法。
  14.  前記式(Ia)で表される化合物が、式(Ic):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000009

    [式中、
     R1cは、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアリール基、または置換されていてもよいヘテロアリール基を示し、
     Y1cは、-S(=O)-、-S(=O)-、-C(=O)-または-C(=S)-を示し、
     pは、0または1を示し、
     R2cは、水素原子、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示し、
     環Cは、6員の芳香族炭化水素環、6員の含窒素芳香族複素環、または窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環を示し、
     qは、0~4の整数を示し、および
     q個のR3cは、それぞれ独立に、置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基、または電子求引性基を示す。]
    で表される化合物である、請求項13に記載の方法。
  15.  前記式(Ic)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-フェニルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-(4-メトキシフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、および2-(4-フルオロフェニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オンからなる群から選ばれる少なくとも一つである、請求項14に記載の方法。
  16.  前記環Cが、6員の芳香族炭化水素環または6員の含窒素芳香族複素環である、請求項14に記載の方法。
  17.  前記式(Ic)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-イソプロピルイソチアゾロ[4,5-c]ピリジン-3(2H)-オン、2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-フェニル-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、2-(2,6-ジメチルフェニル)-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(2-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、5-ニトロ-2-(4-ピリジル)-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オン、および2-[1-メチル-1-(2-ピリジル)エチル]-5-ニトロ-1,2-ベンゾチアゾール-3(2H)-オンからなる群から選ばれる少なくとも一つである、請求項16に記載の方法。
  18.  前記式(Ib)で表される化合物における式(r1):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000010

    で表される基が、
     (1)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾチアゾリル基、
     (2)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾイミダゾリル基、
     (3)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ベンゾオキサゾリル基、
     (4)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1または2個の置換基で置換されていてもよい5-(1,2,3-トリアゾリル)基、
     (5)置換されていてもよいアルキル基および置換されていてもよいアリール基からなる群から選ばれる1個の置換基で置換されていてもよい1H-テトラゾール-5-イル基、
     (6)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい(ピリジン-N-オキシド)-2-イル基、
     (7)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい4-ピリジル基、
     (8)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~4個の置換基で置換されていてもよい2-ピリジル基、
     (9)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~5個の置換基で置換されていてもよいフェニル基、または
     (10)置換されていてもよいアルキル基、置換されていてもよいアルコキシ基および電子求引性基からなる群から選ばれる1~3個の置換基で置換されていてもよい2-イミダゾリル基
    である、請求項13~17のいずれか一項に記載の方法。
  19.  前記式(Ib)で表される化合物が、2,2’-ジベンゾチアゾリルジスルフィド、2-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸、3-(2-ベンゾチアゾリルジチオ)プロパン酸、2,2’-ジベンゾイミダゾリルジスルフィド、2,2’-ジベンゾオキサゾリルジスルフィド、5,5’-ジ(1,2,3-トリアゾリル)ジスルフィド、5,5’-ジチオビス(1-フェニル-1H-テトラゾール)、2,2’-ジチオビス(ピリジン-N-オキシド)、4,4’-ジピリジルジスルフィド、3-(2-ピリジルジチオ)プロパン酸、2,2’-ジチオビス(1H-イミダゾール)、および2,2’-ジチオビス(1-メチル-1H-イミダゾール)からなる群から選ばれる少なくとも一つである、請求項18に記載の方法。
  20.  前記クエンチ剤(i)が水である、請求項12~19のいずれか一項に記載の方法。
  21.  前記クエンチ剤(ii)が有機リン化合物である、請求項12~20のいずれか一項に記載の方法。
  22.  有機リン化合物が、ホスフィン類、亜リン酸トリエステル、亜ホスフィン酸エステル、亜ホスホン酸ジエステルおよびホスフィン酸エステルからなる群から選ばれる少なくとも一つである、請求項21に記載の方法。
  23.  有機リン化合物がホスフィン類である、請求項21に記載の方法。
  24.  前記ワンポット合成が、工程(3)後の溶液に、芳香族アミン類を添加することをさらに含む、請求項12~23のいずれか一項に記載の方法。
  25.  前記ワンポット合成が、工程(5)の後および工程(7)の前に、工程(5)後の溶液に塩基を添加する工程(6)をさらに含む、請求項12~24のいずれか一項に記載の方法。
  26.  前記オリゴヌクレオチド前駆体(c)が、亜リン酸エステル結合に加えて、チオリン酸エステル結合を有するオリゴヌクレオチド前駆体である、請求項12~25のいずれか一項に記載の方法。
  27.  式(In):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000011

    [式中、
     (1)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は0を示し、環C”は窒素原子を含有する10員の2環式の縮合芳香族複素環を示し、およびq’は0を示すか、
     (2)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は0を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、q’は1を示し、およびR3nはC1-6パーフルオロアルキル基を示すか、
     (3)R1nは置換されていてもよいフェニル基を示し、p’は1を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、およびq’は0を示すか、または
     (4)R1nは1個のC1-6アルキル基で置換されているピリジル基を示し、p’は0を示し、環C”は6員の含窒素芳香族複素環を示し、およびq’は0を示す。]
    で表される化合物。
  28.  前記式(In)で表される化合物が、2-フェニルイソチアゾロ[5,4-b]キノリン-3(2H)-オン、2-フェニル-5-トリフルオロメチルイソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オン、2-フェニル-2H-1,2-ベンゾチアジン-3(4H)-オン、または2-(4-メチル-2-ピリジニル)イソチアゾロ[5,4-b]ピリジン-3(2H)-オンである請求項27に記載の化合物。
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