WO2021166210A1 - 電気泳動装置 - Google Patents

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WO2021166210A1
WO2021166210A1 PCT/JP2020/006990 JP2020006990W WO2021166210A1 WO 2021166210 A1 WO2021166210 A1 WO 2021166210A1 JP 2020006990 W JP2020006990 W JP 2020006990W WO 2021166210 A1 WO2021166210 A1 WO 2021166210A1
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electrophoresis
current value
abnormality
flow path
electrode
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和希 野田
克洋 有留
剛 大浦
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株式会社日立ハイテク
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    • G02F1/1685Operation of cells; Circuit arrangements affecting the entire cell

Definitions

  • the present invention relates to an electrophoresis apparatus, and particularly to anomaly detection in a flow path.
  • Capillary electrophoresis equipment is widely used as a technique for separating and analyzing many biological samples including deoxyribonucleic acid (DNA). Since the capillary electrophoresis apparatus can perform electrophoresis using a high voltage, high-speed and high-resolution sample separation is realized.
  • Patent Document 1 in the confirmation of the state of the energizing circuit performed prior to electrophoresis, only the detection of an abnormality at the time of voltage rise was made, and the change in the state of foreign matter such as air bubbles was not taken into consideration.
  • An object of the present invention is to improve the accuracy of abnormality detection in view of the above problems.
  • the electrophoresis apparatus of the present invention includes a flow path filled with an electrophoresis medium, a first electrode provided on the cathode side of the flow path, and a second electrode provided on the anode side of the flow path.
  • an electrophoresis apparatus having a power source for applying a voltage between the first electrode and the second electrode, a pump for sending the migration medium to the flow path, and a control unit, the control unit. Is to apply a voltage to the first electrode and the second electrode prior to the filling step of filling the flow path with the migration medium, the electrophoresis step of performing the electrophoresis of the sample, and the electrophoresis of the sample.
  • Controls the analysis workflow including the abnormality detection step of determining the state of the current-carrying path based on the current value flowing through the current-carrying path including the electrophoresis medium filled in the flow path, and the control unit controls the control unit.
  • the abnormality detection step is characterized in that a voltage is applied to the current-carrying path for 20 seconds or longer.
  • the electrophoresis apparatus of the present invention can improve the accuracy of abnormality detection.
  • the schematic diagram of the electrophoresis apparatus of Example 1 The high voltage power supply circuit diagram which shows the voltage control mechanism of an electrophoresis apparatus. The figure which shows the change of the current value by the application time. The figure which shows the change of the current value by the applied voltage.
  • the analysis workflow diagram of Example 1 The schematic diagram of the electrophoretic apparatus provided with the 3rd electrode of Example 3. The analysis workflow diagram of Example 2.
  • FIG. 1 is a schematic view of an electrophoresis apparatus according to this embodiment.
  • the electrophoresis apparatus 100 includes a capillary array 102, an irradiation detection unit 104 that optically detects a sample separated by electrophoresis, and a pump unit 106 that feeds an electrophoresis medium.
  • the capillary array 102 includes a single or a plurality of capillaries 108, a load header 110, and a capillary head 112.
  • the capillary 108 is composed of a glass tube having an inner diameter of several tens to several hundreds of microns and an outer diameter of several hundreds of microns, and the surface of the capillary 108 is coated with a polyimide resin in order to improve the strength.
  • the detection position 114 of the capillary 108 for reading the sample information by the irradiation detection unit 104 has the polyimide resin coating removed so that the internal light emission leaks to the outside.
  • the irradiation detection unit 104 has a light source 116 and an optical detector 118, and the excitation light from the light source 116 is applied to the sample at the detection position 114, and light having a wavelength depending on the sample is emitted. The emitted light is detected by the optical detector 118.
  • the load header 110 is provided on the cathode side of the capillary 108.
  • a hollow electrode 120 is attached to the load header 110, and the load header 110 and the hollow electrode 120 are integrated.
  • the cathode end of the capillary 108 passes through the hollow electrode 120 and is fixed in a state of protruding from the hollow electrode 120.
  • the hollow electrode 120 is conductive with the high-voltage power supply 122, and when a voltage is applied such as electrophoresis or sample introduction, the hollow electrode 120 functions as a cathode electrode.
  • the electrophoresis apparatus 100 is provided with a first ammeter 124 and a second ammeter 126 for detecting the current in the current-carrying path when a voltage is applied by the high-voltage power supply 122.
  • a cathode buffer container 129 containing a buffer 128, a cleaning container 131 containing pure water 130, a waste liquid container 132, and a sample container 135 containing a solution 134 containing a sample are provided at the cathode end of the capillary 108. It is conveyed by a transfer machine 136 that can move to three axes.
  • the capillary head 112 is a member that is attached to and detached from the pump unit 106 with pressure resistance confidentiality.
  • the capillary head 112 bundles the capillary anode ends into one when there are a plurality of capillary 108s.
  • the inside of the capillary 108 is filled with the electrophoresis medium 137 by the pump unit 106.
  • the electrophoresis medium 137 gives a difference in migration rate to the sample during electrophoresis.
  • the pump unit 106 is mainly composed of a block 138 in which a flow path is formed and a pump 140.
  • the block 138 is a connection portion for communicating the capillary array 102, the electrophoresis medium container 142 containing the electrophoresis medium 137, and the anode buffer container 144, and communicates the capillary array 102, the electrophoresis medium container 142, and the anode buffer container 144. A flow path for this is formed.
  • a connecting pipe 146 connecting the anode buffer container 144 and the block 138 is connected to the block 138.
  • the connecting pipe 146 is provided with a valve 148.
  • the migration medium 137 contained in the migration medium container 142 with the valve 148 open is pumped by the pump 140, the migration medium 137 passes through the flow path formed in the block 138 and the connecting tube 146, and the anode. The liquid is sent toward the buffer container 144. As a result, the flow path in the block 138 is filled with the electrophoresis medium 137.
  • the running medium 137 is sent in a state where the valve 148 is closed, the running medium 137 is sent to the capillary array 102, and the inside of the capillary 108 can be filled with the running medium 137.
  • a check valve 152 is provided between the block 138 and the migration medium container 142 so that the migration medium 137 sucked from the migration medium container 142 does not flow back.
  • the connecting tube 146 and the electrode (GND) 156 are inserted into the anode buffer container 144 so as to be immersed in the buffer 154 in the anode buffer container 144. If a voltage is applied while the connecting pipe 146 is not immersed in the buffer 154, a discharge may occur. Further, it is desirable that the positions of the liquid levels of the buffer 154 and the buffer 128 housed in the anode buffer container 144 and the cathode buffer container 129 are about the same. This is to prevent the buffer 154 (128) from flowing into the capillary 108 due to the difference in pressure due to the difference in the height of the liquid level. Further, in this embodiment, the pump 140 is used to send the running medium 137, but the user may manually send the running medium 137 into the flow path using a syringe or the like.
  • the electrophoresis apparatus 100 has a constant temperature bath 158 for keeping the temperature of the capillary array 102 constant during the electrophoresis of the sample, and the capillary array 102 is arranged in the constant temperature bath 158. Further, the electrophoresis apparatus 100 is used in a state of being connected to the computer 160 by a communication cable 162 or the like.
  • the computer 160 is connected to the microcomputer 164 of the electrophoresis apparatus 100.
  • the computer 160 can control the operation of the electrophoresis apparatus 100 and the functions possessed by the computer 160, and can exchange data detected by the electrophoresis apparatus 100.
  • the computer 160 and the microcomputer 164 will be described in detail as control units, but one control unit may play the roles of the computer 160 and the microcomputer 164.
  • FIG. 2 is a high-voltage power supply circuit diagram showing the voltage control mechanism of this device. The voltage control mechanism will be described below with reference to FIG.
  • the voltage control mechanism includes a microcomputer 164, a controller 166, a high voltage power supply 122, a first ammeter 124, and a second ammeter 126. Based on the control of the controller 166, the output of the high-voltage power supply 122 and the voltage applied to the energization path are performed.
  • the energization path is a hollow electrode 120, a buffer 128 filled in the cathode buffer container 129, an electrophoresis path, a buffer 154 filled in the anode buffer container 144, and an electrode (GND) 156.
  • the electrophoresis path is an electrophoresis medium 137 filled in a capillary 108, a flow path formed in a block 138, and a connecting tube 146 (see FIG. 1).
  • the high-voltage power supply 122 is conducting with the hollow electrode 120 via the first ammeter 124 and with the electrode (GND) 156 via the second ammeter 126.
  • the second ammeter 126 is connected to the microcomputer 164.
  • a voltage is applied by the high voltage power supply 122, an electric field is generated between the hollow electrode 120 and the electrode (GND) 156. Due to this electric field, the negatively charged sample moves from the cathode side of the capillary 108 to the anode side of the capillary 108.
  • the first ammeter 124 detects the current flowing from the high-voltage power supply 122 to the hollow electrode 120, and transmits the current value to the microcomputer 164.
  • the second ammeter 126 detects the current flowing from the electrode (GND) 156 to GND, and transmits the current value to the microcomputer 164. In the abnormality detection described later, the value of the second ammeter 126 is used as the current value flowing through the energizing path.
  • a medium having a relatively large resistance as compared with metal such as a buffer 154 (168) and an electrophoresis medium 137, is interposed between the first ammeter 124 and the second ammeter 126. Further, there are many connections such as a block 138 and a capillary array 102 between the first ammeter 124 and the second ammeter 126.
  • the area between the first ammeter 124 and the second ammeter 126 is a portion where noise is likely to occur in the measured current value.
  • the numerical value indicated by the second ammeter 126 is unlikely to include noise.
  • the second ammeter 126 detects the net current value flowing through the electrophoresis path.
  • the microcomputer 164 reads the current values from the first ammeter 124 and the second ammeter 126 and performs the calculation. Then, a command is sent to the controller 166 to control the high voltage power supply 122 to each state such as high voltage application, low voltage application, and voltage cutoff.
  • a voltage is applied between the hollow electrode 120 and the electrode (GND) 156 and the current flowing through the current path is compared with the threshold value prior to the electrophoresis of the sample.
  • abnormality detection is performed to determine the state of the current-carrying path.
  • the resistance of the foreign matter makes it difficult for the current to flow, and the current value becomes smaller than when there is no foreign matter. Therefore, the state of the energizing path can be determined by comparing the current value and the threshold value.
  • Patent Document 1 only the rising time of the current is conscious, and only the detection of foreign matter that can be detected at the rising of the current is considered.
  • foreign matter such as minute bubbles that cannot be detected as foreign matter at the time of starting the current may expand due to Joule heat applied by the voltage after the abnormality detection step, blocking the electrophoresis path and causing discharge.
  • a voltage larger than that in the abnormality detection step is applied. Therefore, the voltage application after the abnormality detection step is more likely to cause a failure of the pump unit 106 or damage to the capillary 108 than the voltage application in the abnormality detection step, and it is preferable to detect foreign matter in the abnormality detection step.
  • the analysis operation is stopped. If the detection of foreign matter is delayed, the return work will increase accordingly, and the time required for analysis will increase.
  • FIG. 3 is a graph showing the change in the current value with respect to the voltage application time when a voltage of 2 kilovolts is applied between the hollow electrode 120 and the electrode (GND) 156 in a state where air bubbles are mixed.
  • the current value is measured by intentionally mixing bubbles in the electrophoresis path. If it is lower than the predetermined threshold value as described above, it is determined that there is an abnormality.
  • the solid line data shows that bubbles can be detected when the current rises (for example, 3 seconds after the voltage is applied), and the dotted line data shows that bubbles are not detected when the current rises.
  • the application time is set to 60 seconds or less so that there is no danger of electric discharge or the like even in an abnormal state. Further, increasing the application time enhances the foreign matter detection performance, but if the application time is too long, the time required for the analysis workflow will be extended, so the above-mentioned 20 seconds or more and 60 seconds or less is preferable. be.
  • the horizontal axis is the applied voltage applied to the hollow electrode 120 and the electrode (GND) 156
  • the vertical axis is the current value flowing through the energizing path acquired by the second ammeter 126.
  • the applied voltage and the detected current value have a roughly linear relationship.
  • the applied voltage was small, the current value was low even in the absence of foreign matter, and the difference in current value depending on the presence or absence of foreign matter was small.
  • the applied voltage is 3 kilovolts or less, it can be confirmed that the detected current values overlap depending on the presence or absence of bubbles.
  • the applied voltage when the applied voltage is small, it is difficult to set the optimum threshold value, and it is difficult to identify the presence or absence of an abnormality.
  • the applied voltage when the applied voltage is large, there is a large difference in the detected current value between the state without foreign matter and the state with foreign matter, so that it becomes easy to determine whether or not there is an abnormality.
  • the applied voltage when there are bubbles decreases from 4 kilovolts to 5 kilovolts
  • the bubbles and the like are likely to expand and the detected current is further reduced. Therefore, the larger the applied voltage, the more accurately the foreign matter can be detected.
  • a voltage of 4 kilovolts or more it is preferable to apply a voltage of 4 kilovolts or more to detect an abnormality.
  • the applied voltage is made too large, there is a risk of discharge or the like. Therefore, in abnormality detection, it is preferable to apply a voltage of about 4 kilovolts to 6 kilovolts at the time of abnormality detection, in which discharge or the like is unlikely to occur even in an abnormal state such as air bubbles or foreign matter being mixed in the flow path.
  • the operator installs the cathode buffer container 129, the washing container 131, the anode buffer container 144, the electrophoresis medium container 142, the capillary array 102, and the sample container 135 in the apparatus. Since the cathode buffer container 129, the washing container 131, the anode buffer container 144, the electrophoresis medium container 142, the capillary array 102, and the sample container 135 are all replacement members, they are replaced at predetermined timings.
  • the capillary array 102 and the migration medium container 142 are replaced by using the pump unit 106 before performing the analysis workflow.
  • the flow path formed in 108 and block 138 is filled with the migration medium 137.
  • the analysis workflow will be described with reference to FIG.
  • the analysis workflow is executed upon receiving a start instruction from computer 160 (300).
  • the pump 140 first fills the flow path and connecting tube 146 formed in the block 138 with the migration medium 137 (301).
  • the capillary array 102 is filled with the migration medium 137 (302).
  • abnormality detection is performed to confirm whether or not there is an abnormality in the energizing path (303).
  • a voltage smaller than the voltage used for electrophoresis is applied as described above, and the current value flowing in the energization path at that time is measured. The presence or absence of abnormality is confirmed by comparing the measured current value with a predetermined threshold value.
  • a voltage of 4 kilovolts or more for 20 seconds or more it is preferable to apply a voltage of 4 kilovolts or more for 20 seconds or more.
  • preliminary electrophoresis is executed (304).
  • the preliminary electrophoresis is for making the state of the electrophoresis medium 137 in the capillary 108 suitable for electrophoresis.
  • a voltage of several to several tens of kilovolts is applied for several tens of minutes.
  • the current is measured during the preliminary run to detect abnormalities.
  • a sample is introduced into the capillary 108 (305).
  • the sample container 135 is transferred by the transfer machine 136, and the capillary 108 cathode end and the hollow electrode 120 are immersed in the solution 134 containing the sample.
  • the sample is introduced into the capillary 108 by applying a voltage between the hollow electrode 120 and the electrode (GND) 156 by the high voltage power supply 122. Then, the transfer machine 136 transfers the cathode buffer container 129 so that the capillary 108 cathode end and the hollow electrode 120 penetrate the buffer 128, and starts electrophoresis (306). By applying a voltage between the hollow electrode 120 and the electrode (GND) 156 by the high voltage power supply 109, the sample to be detected is separated while moving in the capillary 108. The sample is detected by the irradiation detection unit 104 as it passes through the detection position 114 of the capillary 108.
  • an abnormality is detected in the abnormality detection in step 303 or the preliminary electrophoresis in step 304, it is necessary to eliminate the abnormal state. If an abnormality is detected, it is considered that the cause of the abnormality is insufficient liquid volume in the buffer 128 (154), residual air bubbles or foreign matter in the electrophoresis path, damage to the capillary 108, etc., because there is an abnormality in the energizing path. Be done. In the past, when an abnormality was confirmed, the error was immediately notified and the operator was requested to take action. The operator visually confirmed the abnormal state and took predetermined measures according to the cause of the confirmed abnormality. Foreign matter is removed when foreign matter is found in the flow path.
  • the foreign matter is automatically removed, so that the frequency of requesting the operator to respond can be reduced and the operability can be improved. Further, since a predetermined flow is automatically performed when an abnormality is detected, it is possible to reduce individual differences in abnormality detection.
  • step 303 or step 304 when an abnormality is detected, the number of times the abnormality is detected in step 303 or step 304 is recorded in a control unit such as a computer 160 or a microcomputer 164 (307).
  • a control unit such as a computer 160 or a microcomputer 164.
  • the process returns to step 301, the flow path of the block 138 and the capillary 108 are refilled with the migration medium 137, and the abnormality is detected in step 303.
  • the current values measured in step 303 before and after the refilling of the electrophoresis medium 137 are compared (308). When the bubbles expand or the foreign matter moves, the measured current value fluctuates.
  • the change in the state of the foreign matter is confirmed by comparing the current values in step 303 before and after the refilling of the migration medium 137.
  • the change in the current value measured in step 303 before and after the refilling of the migration medium 137 is larger than a predetermined threshold value, it is determined that the abnormal state has changed.
  • the abnormal state is changed by refilling the migration medium 137, there is a high possibility that the abnormal state will be released by filling the migration medium 137. Therefore, returning to step 301, the foreign matter is attempted to be removed by refilling the migration medium 137. If the change in the current value before and after refilling the migration medium 137 in step 308 is less than the threshold value, it is considered that the abnormal state has not changed.
  • the electrophoresis medium 137 is strongly fed by increasing the liquid feeding pressure or increasing the liquid feeding speed (309). .. Specifically, by increasing the drive current of the pump 140, the force for pushing out the electrophoresis medium 137 of the pump 140 is increased. Alternatively, when the pump 140 is driven by a motor, the rotation speed of the motor is increased to feed the migration medium 137 faster. After that, the abnormality is detected by measuring the current value in the same manner as the abnormality detection in step 303 (310). If no abnormality is detected, the foreign matter has been removed, and the preliminary electrophoresis in step 304 is performed.
  • the current value measured in the previous step 303 is compared with the current value measured in step 310 (311).
  • the change in the current value is less than the threshold value, it is considered that the abnormal state has not changed, so that it is highly possible that the cause of the error is other than the foreign matter in the electrophoresis path.
  • the error is notified and the operator is requested to take action (313).
  • the process returns to step 301 to refill the migration medium 137.
  • the number of times an abnormality is detected is recorded in step 307, and a threshold value is set for the number of times an abnormality is detected in step 303 or step 304. If the number of times the abnormality recorded in step 307 is detected exceeds the threshold value, an error is displayed and the device is stopped (313).
  • a threshold value it is possible to suppress the consumption of the migration medium 137 more than necessary, and by removing the foreign matter a predetermined number of times, it is possible to show that there is a high possibility of an abnormality other than the foreign matter when an error is displayed. It is possible.
  • a threshold value is set for the number of times an abnormality is detected in step 303 or step 304, but the same analysis can be performed by recording the number of filling steps of steps 301 to 302 and setting a threshold value for the number of times. It is possible to carry out the workflow.
  • the electrophoresis apparatus 600 of this embodiment has a third electrode 602 for confirming the position where the abnormality occurs.
  • the apparatus configuration is the same as that of the first embodiment except that the third electrode 602 is provided.
  • the electrophoresis apparatus 600 provided with the third electrode 602 of this embodiment will be described with reference to FIG.
  • the flow path that communicates the migration medium container 142 and the capillary 108 is the first flow path 604, and the anode buffer container 144 in which the electrode (GND) 156 is housed.
  • the position where the second flow path 606 communicates with the capillary 108, the first flow path 604 and the second flow path 606 intersect, and the capillary head 112 is connected is referred to as the capillary connection portion 608.
  • the electrophoresis apparatus 600 of this embodiment newly includes a third electrode 602 in the first flow path 604.
  • a third electrode 602 in the first flow path 604.
  • the current value between the hollow electrode 120 and the electrode (GND) 156 and the current value between the hollow electrode 120 and the third electrode 602 are measured, and the state of the energization path is determined. to decide.
  • the abnormality detection of this embodiment is performed by using the current value between the hollow electrode 120 and the electrode (GND) 156 as the first current value and the current value between the hollow electrode 120 and the third electrode 600 as the second current value. explain.
  • the abnormality detection pattern there is no error in the first current value and the second current value (case 1), the abnormality is detected only in the first current value (case 2), and the abnormality is detected only in the second current value (case 2).
  • case 3 abnormality detection
  • case 4 abnormality detection
  • a foreign substance in the capillary 108, the capillary connecting portion 608, the second flow path 606, or the connecting pipe 116, or an error in the case of an abnormal state other than the foreign substance is detected.
  • a foreign matter in the capillary 108, the capillary connection portion 608 or the first flow path 604, or an abnormal state other than the foreign matter is detected. Therefore, when an abnormality is determined based on either the first current value or the second current value, it can be determined that the cause of the abnormality can be detected by only one of them.
  • the cause of the error is a foreign substance in the second flow path 606 or the connecting pipe 146, and the abnormality is determined only from the second current value (case 2).
  • the cause of the error is a foreign substance in the first flow path 604.
  • the block 138 and the capillary 108 were refilled with the electrophoresis medium 137.
  • the cause of the abnormality can be identified as a foreign substance in the block 138 or the connecting tube 146, the foreign substance is removed by sending the electrophoresis medium 137 to the flow path of the block 138.
  • the third electrode 602 is preferably provided at the connection portion of the migration medium container 142 of the block 138. Further, although the third electrode 602 is provided in the block 138 in FIG. 6, it may be inserted into the electrophoresis medium container 142.
  • FIG. 7 will be used to explain a part of this embodiment that is different from the analysis workflow of the first embodiment.
  • the flow when refilling the migration medium 137 is different from that in Example 1. Since the other flows are the same as those in the first embodiment, the description thereof will be omitted.
  • the abnormality detection in steps 303 and 310 the abnormality is determined based on the first current value and the second current value, and the abnormality is detected based on at least one of the first current value and the second current value. If so, it is determined that there is an abnormality. When it is determined that there is no abnormality based on the first current value and the second current value (case 1), it is determined that there is no abnormality.
  • FIG. 7 although the illustration of steps 307 to 311 is omitted for the sake of legibility, the same applies to steps 307 to 311 in FIG. 5 of the first embodiment.
  • the migration medium 137 is to be refilled in steps 307 to 311 (700)
  • the result of abnormality detection is confirmed in this embodiment (701).
  • the flow differs depending on the result of abnormality detection.
  • the cause of the abnormality is in the second flow path 606 or in the connecting pipe 146, respectively, as described above. Since it can be determined that the foreign matter is the foreign matter in the first flow path 604 or the foreign matter in the first flow path 604, the flow path formed in the block 138 is filled with the migration medium 137 (702). When the flow path of the block 138 is filled with the migration medium 137, the migration medium 137 in the migration medium container 142 passes through the first flow path 604, the capillary connection portion 608, the second flow path 606, and the connecting tube 146, and is an anode buffer.
  • the liquid is sent to the container 144, and the foreign matter is discharged to the anode buffer container 144. If an abnormality is detected in the first current value of Case 2, the cause is foreign matter in the second flow path 606 or the connecting pipe 146, and the foreign matter is located near the anode buffer container 144 to which the foreign matter is discharged. ing. Since it is sufficient to send the migration medium 137 filled with the second flow path 606 and the connecting tube 146, a smaller amount of the running medium 137 than the running medium filling in steps 301 and 702 is sent to the flow path of the block 138 ( 703). By adjusting the liquid feed amount of the migration medium 137 in Case 2 and Case 3, it is possible to further reduce the amount of the migration medium 137 used.
  • Case 4 When an abnormality is detected in the first current value and the second current value of the case 4, foreign matter in the capillary 108, foreign matter in the first flow path 604, foreign matter in the second flow path 606 or the connecting pipe 146, etc. Various cases are possible. Therefore, in Case 4, the process returns to step 302, and the flow path of the block 138 and the capillary 108 are refilled with the migration medium 137 in the same manner as in the first embodiment.
  • the state of the energizing path is confirmed before electrophoresis, and if there is an abnormality, the system for removing the mixed foreign matter and the number of times of removing the foreign matter are limited.
  • the current value and the threshold value are compared to determine the state of the current-carrying path, but the abnormal state may be determined from the slope of the current value or the like.
  • Electrophoretic apparatus 102: Capillary array, 104: Irradiation detection unit, 106: Pump unit, 108: Capillary, 110: Load header, 112: Capillary head, 114: Detection position, 116: Light source, 118: Optical detector , 120: Hollow electrode, 122: High-voltage power supply, 124: First electrophoresis meter, 126: Second electrophoretic meter, 128: Buffer, 129: Cathode buffer container, 130: Pure water, 131: Cleaning container, 132: Waste liquid container, 134: Solution containing sample 135: Sample container, 136: Conveyor, 137: Electrophoretic medium, 138: Block, 140: Pump, 142: Electrophoretic medium container, 144: Anode buffer container, 146: Connecting tube, 148: Valve , 152: Check valve, 154: Buffer, 156: Electrode (GND), 158: Constant temperature bath, 160: Computer, 162: Communication

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Abstract

本発明は、異常検知の精度を向上した電気泳動装置を提供する。 上記課題を解決するため、本発明の電気泳動装置は、内部に泳動媒体が充填される流路と、前記流路の陰極側に設けられた第1電極と、前記流路の陽極側に設けられた第2電極と、前記第1電極と前記第2電極との間に電圧を印加するための電源と、前記流路に前記泳動媒体を送液するポンプと、制御部と、を有する電気泳動装置において、前記制御部は、前記流路に前記泳動媒体を充填する充填工程と、試料の電気泳動を行う電気泳動工程と、前記試料の電気泳動に先立って、前記第1電極及び前記第2電極に電圧を印加し、前記流路に充填された前記泳動媒体を含む通電路に流れる電流値に基づいて、前記通電路の状態を判断する異常検知工程と、を有する分析ワークフローに関する制御を行い、前記制御部は、前記異常検知工程で、前記通電路に20秒以上電圧を印加することを特徴とする。

Description

電気泳動装置
 本発明は、電気泳動装置に関わり、特に流路中の異常検知に関する。
 キャピラリ電気泳動装置は、デオキシリボ核酸(DNA)をはじめ、多くの生体試料を分離分析する技術として広く普及している。キャピラリ電気泳動装置は、高電圧を用いて電気泳動を行うことが可能なため、高速かつ高分解能な試料の分離を実現している。
 特開2003-344356は、試料の電気泳動に先立って、泳動媒体を含む通電路に試料を電気泳動する際の電圧より小さい電圧を印加し、通電路に流れる電流を検出し、検出された電流に基づいて、通電路の状態を判断する方法を開示している。これにより、通電路の異常による弊害を回避及び減少させることが可能である。
特開2003-344356
 特許文献1は、電気泳動に先立って行われる通電路の状態の確認では、電圧立ち上がり時の異常の検知のみで、気泡等の異物の状態の変化が考慮されていなかった。
 本発明は、上記課題を鑑み、異常検知の精度を向上することを目的とする。
 本発明の電気泳動装置は、内部に泳動媒体が充填される流路と、前記流路の陰極側に設けられた第1電極と、前記流路の陽極側に設けられた第2電極と、前記第1電極と前記第2電極との間に電圧を印加するための電源と、前記流路に前記泳動媒体を送液するポンプと、制御部と、を有する電気泳動装置において、前記制御部は、前記流路に前記泳動媒体を充填する充填工程と、試料の電気泳動を行う電気泳動工程と、前記試料の電気泳動に先立って、前記第1電極及び前記第2電極に電圧を印加し、前記流路に充填された前記泳動媒体を含む通電路に流れる電流値に基づいて、前記通電路の状態を判断する異常検知工程と、を有する分析ワークフローに関する制御を行い、前記制御部は、前記異常検知工程で、前記通電路に20秒以上電圧を印加することを特徴とする。
 本発明の電気泳動装置は、異常検知の精度を向上することが可能である。
実施例1の電気泳動装置の概略図。 電気泳動装置の電圧制御機構を示す高圧電源回路図。 印加時間による電流値の変化を示す図。 印加電圧による電流値変化を示す図。 実施例1の分析ワークフロー図。 実施例3の第3電極を備えた電気泳動装置の概略図。 実施例2の分析ワークフロー図。
 図1は本実施例による電気泳動装置の概略図である。電気泳動装置100は、キャピラリアレイ102、電気泳動によって分離された試料を光学的に検出する照射検出ユニット104、泳動媒体を送液するポンプユニット106を有する。
 キャピラリアレイ102は、単数もしくは複数本のキャピラリ108、ロードヘッダ110及びキャピラリヘッド112を備えている。
 キャピラリ108は、内径数十~数百ミクロンメートル、外形数百ミクロンメートルのガラス管で構成されており、強度を向上させるためキャピラリ108の表面はポリイミド樹脂でコーティングされている。ただし、照射検出ユニット104により試料の情報を読み取るためのキャピラリ108の検出位置114は、内部の発光が外部に漏れるようにポリイミド樹脂のコーティングを除去されている。照射検出ユニット104は、光源116と光学検出器118を有し、光源116からの励起光が検出位置114にある試料に照射され、試料に依存した波長の光が放出される。放出された光を光学検出器118によって検出する。
 ロードヘッダ110は、キャピラリ108の陰極側に設けられている。ロードヘッダ110に中空電極120が装着されており、ロードヘッダ110と中空電極120は一体となっている。キャピラリ108の陰極端は中空電極120内を通り、中空電極120から突出した状態で固定される。中空電極120は、高圧電源122と導通しており、電気泳動や試料導入など電圧を印加する際に、中空電極120は陰極電極として機能する。高圧電源122による電圧印加時に、通電路の電流を検出するための第1電流計124と第2電流計126が電気泳動装置100に設けられている。必要に応じて、キャピラリ108の陰極端に、バッファ128を収容した陰極バッファ容器129、純水130を収容した洗浄容器131、廃液容器132及び試料を含んだ溶液134を収容した試料容器135が、3軸に移動可能な搬送機136により搬送される。
 キャピラリヘッド112は、ポンプユニット106と耐圧機密で着脱する部材である。キャピラリヘッド112は、キャピラリ108が複数の場合に、キャピラリ陽極端を一つに束ねる。キャピラリ108の内部は、泳動媒体137がポンプユニット106により充填される。泳動媒体137は、電気泳動時の試料に泳動速度差を与える。
 ポンプユニット106は、流路が形成されたブロック138と、ポンプ140とから主に構成される。ブロック138は、キャピラリアレイ102、泳動媒体137が収容された泳動媒体容器142及び陽極バッファ容器144を連通させるための接続部であり、キャピラリアレイ102、泳動媒体容器142及び陽極バッファ容器144を連通させるための流路が形成されている。また、ブロック138に、陽極バッファ容器144とブロック138をつなぐ連結管146が接続されている。連結管146は、バルブ148が設けられている。バルブ148が開いた状態で泳動媒体容器142に収容された泳動媒体137がポンプ140により送液されると、泳動媒体137は、ブロック138に形成された流路と連結管146を経由し、陽極バッファ容器144に向かって送液される。これにより、ブロック138内の流路に泳動媒体137が充填される。バルブ148が閉まった状態で泳動媒体137が送液される場合は、キャピラリアレイ102に泳動媒体137が送液され、キャピラリ108内を泳動媒体137で充填することが可能となる。ブロック138と泳動媒体容器142の間には、泳動媒体容器142から吸引された泳動媒体137が逆流しないよう逆止弁152が設けられている。また、連結管146と電極(GND)156は、陽極バッファ容器144内のバッファ154に浸るように、陽極バッファ容器144に挿入される。連結管146がバッファ154に浸っていない状態で電圧を印加すると、放電が生じる恐れがある。また、陽極バッファ容器144と陰極バッファ容器129に収容されるバッファ154とバッファ128の液面の位置は同程度であることが望ましい。これは、液面の高低差による圧力の差により、キャピラリ108内にバッファ154(128)が流れるのを防ぐためである。また、本実施例ではポンプ140を用いて泳動媒体137の送液を行っているが、ユーザがシリンジ等を用いて手動で流路内に泳動媒体137を送液してもよい。
 さらに電気泳動装置100は、試料の電気泳動中にキャピラリアレイ102の温度を一定に保つための恒温槽158を有し、キャピラリアレイ102は、恒温槽158内に配置される。また、電気泳動装置100は、コンピュータ160と、通信ケーブル162等で接続された状態で使用される。図1では詳細に記載していないが、より具体的には、コンピュータ160は電気泳動装置100のマイコン164と接続されている。コンピュータ160は、電気泳動装置100の動作や保有する機能を制御し、電気泳動装置100で検出されたデータを授受できる。本実施例では、コンピュータ160とマイコン164を制御部として詳細を説明するが、1つの制御部でコンピュータ160とマイコン164の役割を行っても良い。
 図2は、本装置の電圧制御機構を示す高圧電源回路図である。以下図2を参照して、電圧制御機構を説明する。
 電圧制御機構は、マイコン164、コントローラ166、高圧電源122、第1電流計124、第2電流計126を含む。コントローラ166の制御に基づいて、高圧電源122の出力、通電路への電圧の印加を行う。ここで、通電路とは、中空電極120、陰極バッファ容器129に満たされたバッファ128、電気泳動路、陽極バッファ容器144に満たされたバッファ154,電極(GND)156である。電気泳動路は、キャピラリ108、ブロック138に形成された流路及び連結管146に充填された泳動媒体137である(図1参照)。
 高圧電源122は、第1電流計124を介して中空電極120と、第2電流計126を介して電極(GND)156と導通している。第2電流計126はマイコン164と接続されている。高圧電源122により電圧を印加すると、中空電極120と電極(GND)156の間に電界が生じる。この電界によって、負に帯電した試料は、キャピラリ108の陰極側からキャピラリ108の陽極側へ移動する。第1電流計124は、高圧電源122から中空電極120に流れる電流を検出し、その電流値をマイコン164に送信する。第2電流計126は、電極(GND)156からGNDに流れる電流を検出し、その電流値をマイコン164に送信する。後述する異常検知では、通電路を流れる電流値として、第2電流計126の値を使用する。第1電流計124と第2電流計126の間はバッファ154(168)や泳動媒体137など金属に比べて比較的抵抗の大きい媒体が介在している。さらに、第1電流計124と第2電流計126の間は、ブロック138やキャピラリアレイ102などの接続部が多く存在する。従って、第1電流計124と第2電流計126の間は、測定される電流値にノイズが発生しやすい部分である。一方で、第2電流計126が示す数値はノイズが含まれにくい。第2電流計126では、電気泳動路を流れる正味の電流値が検出される。
 マイコン164は第1電流計124及び第2電流計126からの電流値を読み込み、演算を行う。そして、コントローラ166に命令を送り、高圧電源122を高電圧印加、低電圧印加、電圧遮断等の各状態に制御する。
 分析ワークフローの詳細は後述するが、本発明の分析ワークフローでは、試料の電気泳動に先立って、中空電極120と電極(GND)156間に電圧を印加し、通電路を流れる電流と閾値とを比較することで通電路の状態を判断するための異常検知を行う。電気泳動路内に異物がある状態で通電路に電圧を印加すると、異物の抵抗により電流が流れにくくなり、異物がない状態に比べ電流値は小さくなる。そのため、電流値と閾値とを比較することで通電路の状態を判断可能である。特許文献1では、電流の立ち上がり時間しか意識されておらず、電流立ち上がり時に検出可能な異物の検出しか考慮されていなかった。しかし、電流立ち上げ時には異物として検出できない微小な気泡等の異物が、異常検知工程後の電圧印加のジュール熱により膨張し、電気泳動路を閉塞して放電を起こす可能性がある。異常検知工程後は、異常検知工程よりも大きい電圧が印加される。そのため、異常検知工程後の電圧印加は異常検知工程での電圧印加よりも、ポンプユニット106の故障やキャピラリ108の破損等の原因となりやすく、異常検知工程で異物を検知することが好ましい。また、異常検知工程の際に検知されなかった異物が電気泳動等の異常検知工程の後に検出されると、分析動作を停止させてしまう。異物の検出が遅れるとその分戻り作業が増えてしまい、分析に要する時間が長くなってしまう。
 図3は気泡が混入した状態で中空電極120と電極(GND)156間に2キロボルトの電圧を印加した際の、電圧の印加時間に対する電流値の変化を示すグラフである。本データ測定時は、電気泳動路内にあえて気泡を混入させて電流値を測定している。上述したように所定の閾値よりも低い場合は、異常があると判断される。図3のグラフの、実線のデータは電流立ち上がり時(例えば電圧印加から3秒後)に気泡が検知できているもの、点線のデータは電流立ち上がり時に気泡が検知されていないものである。いずれの場合も気泡が混入した状態だが、点線のデータは、電流立ち上がり時に気泡を検知することができていない。しかし、引き続き電圧を印加していくと、気泡の膨張等、異物の状態変化に伴い電流値が大きく減少していき、電流値が閾値を超え異物が検出される状態となった。特許文献1の気泡検知の方法では、実線のデータの場合しか異常検知で検出することができない。図3から電圧印加から17秒で検出電流値が大きく減少しはじめることが確認できる。そのため、異常検知工程での電圧印加は、電流値の変化が大きく表れる(例えば検出電流値の変化が1μA)、少なくとも20秒以上行うことが好適である。印加時間を長くし過ぎても、放電等の危険があるため、異常状態である場合でも放電等の危険がない程度、印加時間を60秒以下に設定するのが好適である。また、印加時間を長くすることは異物の検知性能を高めることになるが、長時間印加しすぎると、分析ワークフローに係る時間を延ばすことになるため、上述の20秒以上60秒以下が好適である。
 次に図4のグラフを用いて、印加電圧と検出電流との関係を示す。横軸は中空電極120と電極(GND)156に加える印加電圧、縦軸は第2電流計126で取得される通電路を流れる電流値である。異物がない場合は、印加電圧と検出される電流値はおおよそ線形関係になる。印加電圧が小さい場合は、異物がない状態でも電流値が低く、異物の有無による電流値の差が小さかった。図4のグラフでも印加電圧3キロボルト以下の場合は、気泡の有無で検出電流値が重なってしまっていることが確認できる。そのため、印加電圧が小さい場合、最適な閾値の設定が困難であり、異常の発生の有無を特定することは難しかった。一方で、印加電圧が大きい場合は、異物がない状態と異物がある状態とで、検出される電流値に大きく差が生じるため、異常かどうかを判別することが容易となる。さらに気泡有の場合の印加電圧が4キロボルトから5キロボルトで減少していることからも分かるように、印加電圧が大きい場合は、気泡等が膨張しやすく検出電流はより減少する。そのため、印加電圧が大きい方がより高精度に異物の検知を行うことが可能となる。そのため、4キロボルト以上の電圧を印加し異常検知を行うのが良い。しかし、印加電圧を大きくしすぎた場合、放電等の危険がある。したがって、異常検知では、気泡や異物が流路に混入している等の異常状態でも放電等が起きにくい、4キロボルト~6キロボルト程の電圧を異常検知の際に印加することが好適である。
 上述したように、4キロボルト以上の電圧を20秒以上印加し、異常を検知することでより高精度に異物を検知することが可能となる。異常検知工程後の分析動作の停止頻度を減少させることが可能となる。さらに、ポンプユニット106の故障やキャピラリ108の破損、放電等のリスクを低減することも可能となる。
 次に、分析ワークフローを開始する前の準備を説明する。オペレータは陰極バッファ容器129、洗浄容器131、陽極バッファ容器144、泳動媒体容器142、キャピラリアレイ102、試料容器135を装置に設置する。陰極バッファ容器129、洗浄容器131、陽極バッファ容器144、泳動媒体容器142、キャピラリアレイ102及び試料容器135は、いずれも交換部材であるため、所定のタイミングで交換を行う。分析ワークフロー開始前に、電気泳動路は泳動媒体137で充填されている必要があるため、キャピラリアレイ102や、泳動媒体容器142の交換の際は分析ワークフローを行う前にポンプユニット106を用いてキャピラリ108及びブロック138に形成された流路に泳動媒体137を充填する。
 図5を参照して分析ワークフローを説明する。分析ワークフローは、コンピュータ160から開始の命令を受け取ると実行される(300)。分析ワークフローが実行されると、はじめに、ポンプ140により、ブロック138に形成された流路及び連結管146に泳動媒体137が充填される(301)。次に、キャピラリアレイ102に泳動媒体137を充填する(302)。続いて、通電路に異常がないか確認するため異常検知を行う(303)。
 異常検知は、上述したように電気泳動に用いる電圧よりも小さい電圧を印加し、その際に通電路に流れる電流値を測定する。測定した電流値と所定の閾値とを比較することで異常の有無を確認する。これにより、異常を事前に検出し、異常事態での電気泳動によるポンプユニット106やキャピラリ108の故障、また異常検知後の異常の検出を低減することができる。異常検知は、4キロボルト以上の電圧を20秒以上印加することが好ましい。
 異常検知において、異常なしと判断された場合、予備泳動を実行する(304)。予備泳動は、キャピラリ108内の泳動媒体137の状態を電気泳動に適した状態にするためのものである。予備泳動で、数~十数キロボルトの電圧を数十分間加える。予備泳動の間も電流を測定し、異常の検出を行う。予備泳動中に、異常が検出されなかった場合、キャピラリ108に試料を導入する(305)。搬送機136によって試料容器135を移送し、キャピラリ108陰極端及び中空電極120を、試料を含んだ溶液134に浸す。次に、中空電極120と電極(GND)156間に高圧電源122により電圧を印加することで、試料をキャピラリ108内に導入する。その後、搬送機136によって、キャピラリ108陰極端及び中空電極120をバッファ128に浸透するように、陰極バッファ容器129を移送し、電気泳動を開始する(306)。中空電極120と電極(GND)156間に高圧電源109により電圧を印加することで、検出対象である試料はキャピラリ108内を移動する間に分離される。試料は、キャピラリ108の検出位置114を通過する際に、照射検出ユニット104により検出される。
 ステップ303の異常検知、または、ステップ304の予備泳動で異常が検出された場合、異常状態を解消する必要がある。異常が検知された場合は、通電路に異常があるため、バッファ128(154)の液量不足、電気泳動路内の気泡の残留や異物の混入、キャピラリ108の破損等が異常の原因として考えられる。従来は異常が確認された場合は、直ちにエラーを報知し、オペレータに対応を要求していた。オペレータは、目視で異常状態の確認を行い、確認された異常の原因に応じて所定の対応行っていた。異物の除去は、流路内に異物が確認された場合に行われる。しかし、流路内の異物は見えにくく、異物の有無の特定は困難であり、非常に手間であった。特に、微小な異物は目視では捕えにくい。また、目視による確認では前記問題に加えて、ひとが目視により異物の有無を判断するため、異物の検知に個人差が生じるという問題がある。電気泳動路内に異物が混入したまま電気泳動を続けると、異物が大きな抵抗として働く場合があり、導通不良による分析精度の低下や、部分放電による構成部品の破損等を招く恐れがある。本実施例の分析ワークフローでは、異常が検知された場合に、自動で異物の除去を行うため、オペレータへの対応要求の頻度を低減することができ、操作性を向上することが可能となる。また、異常が検知された場合に所定のフローを自動で行うため、異常検知の個人差を低減することが可能である。
 本実施例の分析ワークフローでは、異常が検出された場合、ステップ303またはステップ304で異常が検出された回数をコンピュータ160またはマイコン164等の制御部に記録する(307)。ステップ303またはステップ304で異常が検知されたのが1回目の場合、ステップ301に戻りブロック138の流路及びキャピラリ108に泳動媒体137を再充填し、ステップ303の異常検知を行う。異常が検知されたのが2回目以降かつ閾値回数未満の場合、泳動媒体137の再充填前後のステップ303で計測した電流値の比較を行う(308)。気泡の拡大や異物が移動した場合、測定される電流値が変動するため、泳動媒体137の再充填前後のステップ303の電流値を比較することで異物の状態の変化を確認する。泳動媒体137の再充填前後のステップ303で測定した電流値の変化が所定の閾値よりも大きい場合、異常の状態が変化したと判断する。この場合、泳動媒体137の再充填により異常の状態が変化しているため、泳動媒体137の充填を行うことで異常状態が解除される可能性が高い。そのため、ステップ301に戻り、泳動媒体137を再充填することで異物の除去を試みる。ステップ308で泳動媒体137の再充填前後の電流値の変化が閾値未満の場合、異常状態に変化が生じなかったと考えられる。異物が電気泳動路で詰まってしまっている等異物が動きにくい状態である可能性があるため、送液圧力の増加や送液速度を早くすることにより強く泳動媒体137を送液する(309)。具体的には、ポンプ140の駆動電流を大きくすることでポンプ140の泳動媒体137を押し出す力を増加させる。またはポンプ140をモータで駆動している場合は、モータの回転速度を上げて、泳動媒体137を速く送液する。その後ステップ303の異常検知と同様に、電流値の測定による異常検知を行う(310)。異常が検出されなかった場合、異物を除去できているので、ステップ304の予備泳動を行う。ステップ310の異常検知で異常が検出された場合、前回のステップ303で測定した電流値と、ステップ310で測定した電流値との比較を行う(311)。電流値の変化が閾値未満の場合、異常状態に変化が生じなかったと考えられるため、電気泳動路内の異物以外のエラー原因の可能性が高いと考えられる。異物以外のエラーは、バッファ128(154)の液量不足やキャピラリ108の破損等、原因は多岐に渡るため、エラーを報知し、オペレータに対応を要求する(313)。電流値の変化が閾値を超えた場合、異物が移動したことが想定される。そのため、ステップ301に戻り泳動媒体137の再充填を行う。
 異常が検出された回数をステップ307で記録し、ステップ303またはステップ304で異常が検出された回数に閾値を設ける。ステップ307で記録した異常が検出された回数が閾値を超えた場合、エラーを表示し、装置を停止させる(313)。閾値を設けることで、必要以上の泳動媒体137の消費を抑えることができ、また所定の回数異物の除去を行うことで、エラー表示時に異物以外の異常の可能性が高いことを提示することが可能である。また、本実施例ではステップ303またはステップ304で異常が検出された回数に閾値を設けたが、ステップ301~ステップ302の充填工程の回数を記録し、回数に閾値を設けることでも、同様の分析ワークフローを実施することが可能である。
 本実施例の電気泳動装置600は、異常の発生位置を確認するための第3の電極602を有する。第3の電極602を有する以外の装置構成は実施例1と同様である。
 図6を参照して、本実施例の第3の電極602を備えた電気泳動装置600について説明する。本実施例では、ブロック138に形成された流路のうち、泳動媒体容器142とキャピラリ108とを連通する流路を第1流路604、電極(GND)156が収容された陽極バッファ容器144とキャピラリ108とを連通する流路を第2流路606、第1流路604と第2流路606が交差しかつキャピラリヘッド112が接続される箇所をキャピラリ接続部608とする。
 本実施例の電気泳動装置600は、第1流路604に新たに第3の電極602を備える。実施例1の異常検知では、中空電極120と電極(GND)156との間の電流値から、異常の有無しか判断できなかった。本実施例の異常検知では、中空電極120と電極(GND)156との間の電流値と、中空電極120と第3の電極602との間の電流値とを測定し、通電路の状態を判断する。
 中空電極120と電極(GND)156との間の電流値を第1電流値、中空電極120と第3の電極600との間の電流値を第2電流値として、本実施例の異常検知を説明する。
 本実施例では、異常検知のパターンとして、第1電流値及び第2電流値でエラーなし(ケース1)、第1電流値でのみ異常検知(ケース2)、第2電流値でのみ異常検知(ケース3)、第1電流値及び第2電流で異常検知(ケース4)の4つのパターンが考えられる。ケース1のみ異常なしと判断される。
 第1電流値からは、キャピラリ108、キャピラリ接続部608、第2流路606または連結管116にある異物または、異物以外の異常状態の場合のエラーが検出される。第2電流値からは、キャピラリ108、キャピラリ接続部608または第1流路内604の異物または、異物以外の異常状態が検出される。そのため、第1電流値または第2電流値の一方に基づき異常と判断される場合は、いずれか一方でのみで検出可能な異常原因と判断できる。つまり、第1電流値からのみ異常が判断される場合(ケース2)は、エラー原因が第2流路606内または連結管146内の異物、第2電流値からのみ異常が判断される場合(ケース3)は、エラー原因が第1流路604内の異物と判断することが可能となる。実施例1では、異常が検知された場合は、ブロック138及びキャピラリ108に泳動媒体137の再充填を行っていた。本実施例のケース2またはケース3の場合は、異常原因がブロック138内または連結管146内の異物と特定できるため、ブロック138の流路に泳動媒体137を送液することで異物を除去することができる。これにより、異物の除去に用いる泳動媒体137の使用量を削減することが可能である。第3の電極602は、第1流路604全体の異常を検知したいため、ブロック138の泳動媒体容器142の接続部に設けるのが好ましい。また、図6では第3の電極602はブロック138に設けているが、泳動媒体容器142に挿入しても良い。
 図7を用いて、本実施例の、実施例1の分析ワークフローと異なる部分を説明する。本実施例では、実施例1と泳動媒体137の再充填を行うときのフローが異なる。その他のフローは実施例1と同様であるため、説明は省略する。また、ステップ303及びステップ310の異常検知では、第1電流値及び第2電流値に基づき異常の判断を行い、第1電流値または第2電流値の少なくともいずれか一方に基づき異常が検知された場合は、異常ありと判断される。第1電流値及び第2電流値に基づき異常なしと判断された場合(ケース1)を異常なしと判断する。また、図7は、見やすさのためステップ307からステップ311の図示を省略したが、実施例1の図5におけるステップ307からステップ311と同様である。
 ステップ307からステップ311で泳動媒体137を再充填することになった場合(700)、本実施例では異常検知の結果の確認を行う(701)。本実施例では、異常検知の結果によりフローが異なる。
 ケース2またはケース3の、第1電流値または第2電流値のいずれか一方から異常が検知された場合は、上述したように、それぞれ異常の原因が第2流路606内または連結管146内の異物、または第1流路604内の異物と判断できるため、ブロック138に形成された流路に泳動媒体137を充填する(702)。ブロック138の流路に泳動媒体137を充填する場合、泳動媒体容器142内の泳動媒体137が第1流路604、キャピラリ接続部608、第2流路606及び連結管146を経由し、陽極バッファ容器144へと送液され、異物が陽極バッファ容器144へと排出される。ケース2の第1電流値で異常が検知された場合は、第2流路606または連結管146内の異物が原因であり、異物が、異物の排出先の陽極バッファ容器144に近くに位置している。第2流路606及び連結管146充填分の泳動媒体137を送液すれば良いため、ステップ301やステップ702の泳動媒体充填よりも少量の泳動媒体137をブロック138の流路に送液する(703)。ケース2とケース3で泳動媒体137の送液量を調整することでさらに泳動媒体137の使用量を削減することが可能となる。
 ケース4の第1電流値及び第2電流値で異常が検知された場合は、キャピラリ108内の異物や、第1流路604内の異物及び第2流路606または連結管146内の異物等様々なケースが考えられる。そのため、ケース4では、ステップ302に戻り実施例1と同様にブロック138の流路及びキャピラリ108へ泳動媒体137の再充填を行う。
 以上のように、本例は、電気泳動装置において、電気泳動前に通電路の状態を確認し、異常があった場合、混入した異物を除去するシステム、また、異物の除去回数に制限を持たせること、異物の混入位置によって除去方法を変えることで、泳動媒体泳動媒体の消費量を抑えるシステムを確立した。
 実施例1及び実施例2では、分析ワークフローの送液後の異常検知について説明したが、分析ワークフローを行う前の泳動媒体137の充填後に、上述した異常検知工程を行うことも可能である。
 また、実施例1及び実施例2の異常検知工程では、電流値と閾値を比較し通電路の状態を判断したが、電流値の傾き等から異常状態を判断しても良い。
100:電気泳動装置、102:キャピラリアレイ、104:照射検出ユニット、106:ポンプユニット、108:キャピラリ、110:ロードヘッダ、112:キャピラリヘッド、114:検出位置、116:光源、118:光学検出器、120:中空電極、122:高圧電源、124:第1電流計、126:第2電流計、128:バッファ、129:陰極バッファ容器、130:純水、131:洗浄容器、132:廃液容器、134:試料を含んだ溶液
135:試料容器、136:搬送機、137:泳動媒体、138:ブロック、140:ポンプ、142:泳動媒体容器、144:陽極バッファ容器、146:連結管、148:バルブ、152:逆止弁、154:バッファ、156:電極(GND)、158:恒温槽、160:コンピュータ、162:通信ケーブル、164:マイコン、166:コントローラ、168:バッファ、600:電気泳動装置、602:第3の電極、604:第1流路、606:第2流路、608:キャピラリ接続部

Claims (11)

  1.  内部に泳動媒体が充填される流路と、
     前記流路の陰極側に設けられた第1電極と、
     前記流路の陽極側に設けられた第2電極と、
     前記第1電極と前記第2電極との間に電圧を印加するための電源と、
     前記流路に前記泳動媒体を送液するポンプと、
     制御部と、
    を有する電気泳動装置において、
     前記制御部は、前記流路に前記泳動媒体を充填する充填工程と、
     試料の電気泳動を行う電気泳動工程と、
     前記試料の電気泳動に先立って、前記第1電極及び前記第2電極に電圧を印加し、前記流路に充填された前記泳動媒体を含む通電路に流れる電流値に基づいて、前記通電路の状態を判断する異常検知工程と、
    を有する分析ワークフローに関する制御を行い、
     前記制御部は、前記異常検知工程で、前記通電路に20秒以上電圧を印加することを特徴とする電気泳動装置。
  2.  請求項1の電気泳動装置において、
     前記流路は、キャピラリと、ブロックとを備え、
     前記ブロックは、前記キャピラリと泳動媒体容器を連通する第1流路と、前記第2電極が収容された緩衝液容器と前記キャピラリとを連通する第2流路と、を有し、
     前記第1流路または前記泳動媒体容器は、異常を確認するための第3電極を備え、
     前記異常検知工程では、前記第1電極と前記第2電極との間の第1電流値と、前記第1電極と前記第3電極との間の第2電流値とに基づいて、前記通電路の状態を判断することを特徴とする電気泳動装置。
  3.  請求項2の電気泳動装置において、
     前記第1電流値及び前記第2電流値から異常が判断された場合は、前記キャピラリ及び前記ブロックに前記泳動媒体の充填を行い、
     前記第1電流値または前記第2電流値のいずれか一方から異常が判断された場合は、前記ブロックに前記泳動媒体の充填を行うことを特徴とする電気泳動装置。
  4.  請求項3の電気泳動装置において、
     前記第1電流値から異常が検知されかつ前記第2電流値から異常が検知されない場合は、
     前記第2電流値から異常が検知され、かつ前記第1電流値から異常が検知されない場合よりも、少量の前記泳動媒体が送液されることを特徴とする電気泳動装置。
  5.  請求項1乃至4の電気泳動装置において、
     前記制御部は、前記異常検知工程で、4キロボルト以上の電圧を印加することを特徴とする電気泳動装置。
  6.  請求項1乃至5の電気泳動装置において、
     前記制御部は、前記異常検知工程で異常が検知された場合は、再度充填工程を行うことを特徴とする電気泳動装置。
  7.  請求項6の電気泳動装置において、
     前記制御部は、前記異常検知工程で異常が検出された回数または前記充填工程を行った回数を記録し、
     前記分析ワークフローにおいて、異常が検知されたのが2回目の場合は、1回目の異常検知時の電流値と、2回目の異常検知時の電流値とに基づいて、再度前記充填工程を行うか判断することを特徴とする電気泳動装置。
  8.  請求項7の電気泳動装置において、
     1回目の異常検知時の電流値と2回目の異常検知時の電流値との差が閾値を基準に電流値の変化が小さいと判断された場合は、前記充填工程での前記泳動媒体の送液よりも、速い送液速度または大きな送液圧力で前記泳動媒体を送液することを特徴とする電気泳動装置。
  9.  請求項8の電気泳動装置において、
     速い送液速度または大きな送液圧力で前記泳動媒体を送液した後に電流値を測定し、2回目の異常検知の電流値と比較することで、再度前記充填工程を行うか判断を行い、
     前記充填工程を行わない場合は、エラーを報知することを特徴とする電気泳動装置。
  10.  請求項6乃至9の電気泳動装置において、
     記録された前記回数が所定の回数に達した場合は、エラーを報知することを特徴とする電気泳動装置。
  11.  請求項1の電気泳動装置において、
     前記異常検知工程は、前記通電路を流れる電流値と、所定の閾値とを比較することで前記通電路の状態を判断することを特徴とする電気泳動装置。
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