WO2019128454A1 - 一种新型木霉及其应用 - Google Patents

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刘艳萍
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  • the amount of enzyme required to degrade and release 1 ⁇ mol of reducing sugar per minute from a sodium hydroxymethylcellulose solution at a concentration of 5 mg/ml at 50 ° C and a pH of 4.8 (neutral pH 6.0) is one enzyme.
  • the vitality unit U, the reducing sugar is equivalent to glucose.

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Abstract

提供了一种木霉,其保藏编号为CCTCC NO:M2017796。该木霉可用于表达一种或多种内源或外源蛋白。

Description

一种新型木霉及其应用
本申请要求于2017年12月29日提交中国专利局、申请号为201711477699.0、发明名称为“一种新型木霉及其应用”的中国专利申请的优先权,其全部内容通过引用结合在本申请中。
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,具体涉及一种新型的木霉表达宿主及其在表达外源蛋白中的应用。
背景技术
随着基因工程技术的发展,到20世纪中后期人们利用基因工程的方法对微生物进行了改造,我们称这类微生物为基因工程菌也叫做转基因工程菌。由于微生物具有转化效率高、繁殖快、容易培养、易于控制的特点因此基因工程菌得到了广泛的应用,其研究前景亦十分广阔。基因工程菌的构建包括最佳表达载体的构建,适宜宿主细胞的选择、转化、筛选鉴定和遗传稳定性获得质粒能稳定遗传的、髙效表达的转基因工程菌等过程。
酶作为生物催化剂可应用于多个领域,酶的产率、产量、品质和功能是酶应用于工业中的重要决定因素。酶的高效表达与多个因素相关:宿主的细胞生长特性、表达水平、胞内/胞外表达模式、翻译后修饰、活性蛋白等。为了实现酶的高效表达,酶表达系统的选择至关重要。重组酶已在多个宿主中成功表达,如大肠杆菌、芽孢杆菌、酵母、丝状真菌等。
在表达重组蛋白的系统中,大肠杆菌由于其遗传特性及生理学行为了解得最清楚,被广泛用作表达宿主。当前已商业化的基因工程产品大多是通过大肠杆菌表达的,其最突出的优点是工艺简单、产量高、周期短、生产成本低,表达外源基因产物的水平远高于其它基因工程表达系统。但该系统也存在明显的缺陷,例如表达出的蛋白质缺少糖 基化、磷酸化等翻译后修饰,导致某些真核来源的蛋白质无法正常发挥功能;高表达引起蛋白质聚集,形成包涵体,导致表达产物没有活性;此外,表达产物中掺杂有大肠杆菌本身含有的内毒素或有毒蛋白,使其在医药应用上受到限制。
芽孢杆菌因生长迅速、培养条件简单、遗传背景了解较清晰而被作为表达宿主广泛应用。芽孢杆菌具有良好的发酵基础和生产技术,其在相对简单的培养基中就能生长到很高的密度。芽孢杆菌的细胞壁组成简单,当分泌蛋白跨过细胞膜后,就被加工和直接释放到培养基中。此外,芽孢杆菌分泌的蛋白质产品中不会混杂有类似革兰氏阴性菌细胞壁成分中的热源性脂多糖等物质,从而使得目的蛋白的纯化相对比较简单。此外,多数芽孢杆菌无致病性,其拥有一套高效的分泌信号肤及分子伴侣系统,赋予了芽孢杆菌高效分泌目的蛋白的能力,而且在多数情况下,芽孢杆菌分泌的真核来源的重组蛋白质可以具有其天然构象和生物活性。
酵母是一种单细胞低等真核微生物,作为表达工具有独特的优点,酵母可以在较宽的范围内生长;表达产物可以进行翻译后修饰;可进行分泌型表达,利于蛋白的分离纯化;可进行高密度发酵,能适应工业化生产的需要;菌种已长期广泛应用于酿酒和食品工业,安全可靠。酵母表达系统优点为蛋白翻译后修饰(如糖基化)、高热耐受性、高盐耐受性等。因此,酵母作为基因表达系统特别是在大分子真核生物基因研究方面得到日益广泛的应用。
丝状真菌表达系统优点为可高效表达大分子真核蛋白、超强分泌蛋白能力、食品安全型宿主等。木霉和曲霉等是公认的安全生产菌株,有十分成熟的批量发酵技术和较强的蛋白质胞外分泌能力,它们的转化系统和对外源基因的表达已引起广泛关注。木霉表达系统是近年来新兴的用于外源基因表达的体系,它可以克服在原核表达系统中无法进行特定翻译后修饰的缺陷,而且比酿酒酵母具有更高的分泌外源蛋白的能力,所以成为生产具有生物活性的真核生物蛋白的重要途径。
然而,木霉大多自身可以合成一定的纤维素酶,所以表达出的为混合酶系,分离纯化目的蛋白比较困难,因此直接限制了木霉作为纤维素酶表达宿主的应用。另外,大量研究表明,木霉对外源蛋白的表达量并没有预计的高。因此,开发新型的表达系统,寻找更多、更高效的表达外源蛋白的方法,是需要进一步研究热点和难点。
发明内容
本发明的目的是提供一种新型里氏木霉宿主,并将其用于重组表达外源或内源基因,蛋白表达量得到显著提高,应用前景广阔。
本发明首先提供一种里氏木霉,为里氏木霉O11-8U(Trichoderma reesei O11-8U),已于2017年12月15日保藏于中国武汉武汉大学的中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCC NO:M2017796。
本发明的里氏木霉宿主可用于有效表达一种或多种内源或外源蛋白。
所述的蛋白选自半纤维素酶、过氧化物酶、蛋白酶、纤维素酶、木聚糖酶、脂肪酶、磷脂酶、酯酶、角质酶、果胶酶、角蛋白酶、还原酶、氧化酶、酚氧化酶、脂加氧酶、木质素酶、支链淀粉酶、鞣酸酶、戊聚糖酶、malanase、β-葡聚糖酶、阿拉伯糖苷酶、透明质酸酶、软骨素酶、漆酶、淀粉酶、葡糖淀粉酶中的任一种或几种。
所述的蛋白选自乙酰酯酶、氨肽酶、淀粉酶、阿拉伯糖酶、阿拉伯呋喃糖苷酶、羧肽酶、过氧化氢酶、纤维素酶、几丁质酶、凝乳酶、角质酶、脱氧核糖核酸酶、差向异构酶、酯酶、α-半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、α-葡聚糖酶、葡聚糖裂解酶、内切-β-葡聚糖酶、葡糖淀粉酶、葡糖氧化酶、α-葡糖苷酶、β-葡糖苷酶、葡糖醛酸糖苷酶、半纤维素酶、己糖氧化酶、水解酶、转化酶、异构酶、漆酶、脂肪酶、裂解酶、甘露糖苷酶、氧化酶、氧化还原酶、果胶酸裂解酶、果胶乙酰酯酶、果胶解聚酶、果胶甲基酯酶、果胶裂解酶、过氧化物酶、酚氧 化酶、植酸酶、多聚半乳糖醛酸酶、蛋白酶、鼠李糖半乳糖醛酸酶、核糖核酸酶、奇异果甜蛋白、转移酶、转运蛋白、转谷氨酰胺酶、木聚糖酶、己糖氧化酶中的任一种或几种。
本发明再一个方面提供一种里氏木霉重组菌株,是将携带有目的基因的表达载体转化入上述里氏木霉宿主细胞获得的。
作为实施例的优选,所述的目的基因为纤维素酶基因;
所述的纤维素酶基因,其一种核苷酸序列为SEQ ID NO:5,编码的氨基酸序列为SEQ ID NO:6。
所述的纤维素酶基因,其一种核苷酸序列为SEQ ID NO:7,编码的氨基酸序列为SEQ ID NO:8。
所述表达载体,作为实施例的一种具体选择,为PC2G载体。
上述里氏木霉重组菌株用于生产纤维素酶。
本发明以里氏木霉U11-4为出发菌株,通过诱变获得的突变菌里氏木霉O11-8U可以作为一种新型宿主细胞,普遍应用于内源或异源基因的重组表达。以突变菌里氏木霉O11-8U为宿主细胞构建得到的重组菌株能高效表达纤维素酶NCE5,其发酵酶活达到86U/mL,蛋白量达到0.62mg/ml,比以出发菌株里氏木霉U11-4为宿主细胞构建得到的对照菌株分别提高了56.4%和51.2%;所述里氏木霉O11-8U还可高效表达纤维素酶TT45,以该菌为宿主构建得到的重组菌株的发酵酶活达到60.89U/ml,蛋白含量达到0.59mg/ml,比以出发菌株为宿主细胞构建得到的对照菌株分别提高了83.1%和78.8%,效果显著。
生物保藏说明
分类命名:里氏木霉O11-8U,Trichoderma reesei O11-8U于2017年12月15日保藏于中国典型培养物保藏中心,地址为中国,武汉,武汉大学,保藏编号为CCTCC NO:M2017796。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。
图1:SDS-PAGE电泳检测分析图;其中泳道1为对照菌株里氏木霉U11-4-NCE5的发酵上清液,泳道2为里氏木霉O11-8U-NCE5的发酵上清液,箭头所指处的蛋白条带即为纤维素酶NCE5。
具体实施方式
申请人通过基因敲除的方法,将野生型里氏木霉(Trichoderma reesei)中的纤维素酶基因CBH1、CBH2、EG1和EG2四个基因敲除后,获得一株自身不分泌纤维素酶的里氏木霉菌株,命名为里氏木霉U(Trichoderma reesei U)。
申请人进一步通过对里氏木霉U进行紫外诱变,筛选获得一株突变菌里氏木霉U11,其菌丝形态粗短,菌丝体致密且分枝更多,能使发酵菌液的粘度显著降低,达到降低搅拌速度又提高溶氧的目的,更有利于菌株的高密度发酵。里氏木霉U11可以作为一种新型宿主细胞,普遍应用于内源或异源基因的重组表达。以突变菌里氏木霉U11为宿主细胞构建得到的重组菌株里氏木霉能高效表达NCE5和葡萄糖转苷酶基因,其发酵酶活分别高达412U/mL和3550U/mL,比对照菌株分别提高了43.1%和50.4%。此外,申请人还将糖化酶、葡萄糖氧化酶、果胶酶、淀粉酶等分别在突变菌宿主U11中进行重组表达。与对照宿主里氏木霉U相比,突变菌宿主U11对上述基因的表达量均提高了40-60%,取得了意料不到的效果。
申请人已于2016年12月7日将上述突变菌里氏木霉U11(Trichoderma reesei U11)保藏于中国武汉武汉大学的中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCC NO:M2016726。
实施例1纤维二糖水解酶(CEL74a)基因的敲除
1.1CEL74a基因敲除表达盒的构建
首先,提取里氏木霉的总基因组DNA:将里氏木霉接种于PDA培养基培养7天,取1cm×1cm菌块于1.5mL离心管中,加入400μl裂解缓冲液(60mM Tris-HCl,pH7.8,20mM Na-Ac,1mM EDTA,1.5%SDS),用珠式研磨机剧烈震荡2.5min;65℃水浴20min,加入200μl 10M乙酸铵溶液混匀,冰浴10min,12000rpm离心10分钟,取上清;加入等体积苯酚抽提一次,12000rpm离心2分钟,取上清;加入等体积异丙醇沉淀5分钟,12000rpm离心5分钟;70%乙醇洗涤两次;最后将干燥的DNA溶于ddH 2O。
以里氏木霉基因组DNA为模板扩增里氏木霉Cel74a基因(核苷酸序列为SEQ ID NO:1)的上下游序列,其中上游片段所用到的引物序列为:
Cel74aEcoR1-5F:GTACGAATTCGTAATGGAGATGAGCTCACTTC
Cel74aXba1-5R:GTAC TCTAGA TGCTAGAGTC TGTCTCGGAG
下游片段所用到的引物序列为:
Cel74aMlu1-3F:GTACACGCGTCTCCAACTCCCTATTGCAAATC、
Cel74aSph1-3R:GTACGCATGCGAACACCCGCGACGGGTTGAACT;
将该基因上下游用Phusion DNA聚合酶(Thermo scientific)从里氏木霉基因组DNA中扩增出来。PCR扩增条件为95℃4min;94℃30S;55℃40S,72℃1min 30个循环;72℃7min。利用凝胶回收试剂盒回收PCR扩增产物。
敲除盒构建时采用黑曲霉pyrG标签,采用上述方法提取黑曲霉基因组为模板,用如下引物扩增pyrG片段,扩增后的片段经胶回收后连接pMD18T载体。
pyrG F:CGCCGTCGTG TCTCGTCTCC
pyrG R:GCCGCTGGTCAATGTTATCTGGTAT
载体连接后转化大肠杆菌,并挑取阳性转化子进行测序,测序后的质粒命名为pyrG4-pMD18T。
将pyrG4-pMD18T质粒及Cel74a基因上游片段用限制性内切酶EcoRⅠ、XbaⅠ进行双酶切,酶切后的片段用PCR纯化试剂盒进行纯化。纯化后的片段与目的基因片段用T4连接酶进行连接。将连接产物转化进Trans5α大肠杆菌(Transgen),用氨苄青霉素进行选择。为确保准确,对若干克隆进行测序(Invitrogen)。测序后提取阳性转化子质粒,命名pMD18T-pyrG4-5F。
同时用限制性内切酶Mlu1I和SphI(Fermentas)对纯化后的下游PCR产物进行酶切与质粒pMD18T-pyrG4-5F质粒进行酶切。使用凝胶纯化试剂盒将酶切产物纯化,并用T4DNA连接酶(Fermentas)将上述两个酶切产物连接。将连接产物转化进Trans5α大肠杆菌(Transgen),用氨苄青霉素进行选择。为确保准确,对若干克隆进行测序(Invitrogen)。
使用质粒中量制备试剂盒(Axygen)从测序结果正确的大肠杆菌克隆中纯化质粒。所得1个基因敲除质粒为ΔCel74a-pMD18T。
1.2转化与筛选
1.2.1原生质体制备
接种里氏木霉U11(CCTCC NO:M2016726)菌丝于PDA平板上生长7天;切取直径约2cm的菌落置于约100ml YEG+U(0.5%酵母粉、1%葡萄糖、1%尿苷)的液体培养基中,30℃、200rpm振荡培养过夜;多层纱布过滤收集菌丝;将菌丝置于盛有20ml裂解酶液(Sigma L1412)酶解2小时;取出酶解液,加入0.7M NaCl溶液,轻轻摇晃,倒于三层灭菌擦镜纸过滤,收集滤液,3000rpm,离心10min;弃上清,加10-20ml STC液(20%蔗糖,50mM Tris-Cl,50mM CaCl 2)悬浮,3000rpm,离心10min;加适量STC悬浮分装(150μl/管,10 8个/ml)。
1.2.2转化与验证
取10μgΔCel74a-pMD18T质粒DNA加入到200μl原生质体中,接着加入50μl 25%PEG轻轻混匀,室温静置20min;然后再次加2ml  25%PEG,轻轻混匀,室温静置5min,加入4m 1.2M山梨醇,室温放置。把原生质体加到50ml左右熔化后冷却至45-55℃的上层半固体培养基(0.1%MgSO 4,1%KH 2PO4,0.6%(NH 4) 2SO 4,1%葡萄糖,18.3%山梨醇,0.35%琼脂糖),轻轻混匀后倒入下层基础培养基平板(2%葡萄糖,0.5%(NH4) 2SO 4,1.5%KH 2PO 4,0.06%MgSO 4,0.06%CaCl 2,1.5%琼脂),30℃黑暗培养数天至转化子长出。
按照实施例1.1所述方法提取转化子基因组DNA为模板,利用基因组内部引物(Cel74a-Fs:TATTCCGCTCCACAGACTCGGGCA;和Cel74a-Ra:ATTCTGCTTC TGGCAGACAT ACGG)扩增Cel74a基因验证转化子。PCR扩增条件为95℃4min;94℃30S;59℃40S,72℃1min 30个循环;72℃7min。
未扩增到Cel74a基因的转化子分别利用基因组CEL74A-F和pyrGR及pyrGF和CEL74A-R两对引物进行交叉验证。PCR扩增条件为95℃4min;94℃30S;59℃40S,72℃3min 30个循环;72℃7min。
两对引物序列为:
CEL74A-F:AAGTAGTGAGCGCAGCCAACATAC
CEL74A-R:GATTGTGAGA AGCAGGTTGT TGCTG
两对交叉引物均能扩增到4k左右的目的片段,证明CEL74A基因在里氏木霉U11中敲除成功。申请人将敲除后的菌株命名为里氏木霉U11-1(Trichoderma reesei U11-1)。
采用上述同样方法,申请人将里氏木霉U11中的EGⅢ(核苷酸序列为SEQ ID NO:2),XYNⅢ(核苷酸序列为SEQ ID NO:3),BGL(核苷酸序列为SEQ ID NO:4)3个基因也依次进行了敲除。
申请人将敲除了CEL74A,EGⅢ,XYNⅢ和BGL4个基因的里氏木霉U11菌株命名为里氏木霉U11-4(Trichoderma reesei U11-4)。
实施例2紫外诱变与筛选
申请人以里氏木霉U11-4为出发菌,通过紫外诱变进一步筛选菌落变小、菌丝分枝增多的突变菌。
将里氏木霉U11-4接种于新鲜的PDA平板,30℃培养5-7天。待菌落表面变白,产生大量孢子时,吸取5ml无菌水洗脱,获得孢子液,离心后用无菌水重悬,用血球计数板计数,使孢子浓度约为5×10 7个/ml。取一个转子放入90mm的无菌培养皿,加入10ml稀释好的孢子悬液,在磁力搅拌器上搅拌使孢子液处于均匀状态。在无菌超净工作台中,用功率为9w的紫外灯于垂直距离20cm的上方照射,分别照射60s、90s、120s、150s、180s。将照射后的孢子液稀释10000倍,取其中100ul均匀涂布PDA平板,30℃培养2-3d后计数,以未被紫外照射的孢子液为对照,计算致死率。结果显示,紫外照射120s时,里氏木霉孢子的致死率为90%,因此选取该照射时间进行后续诱变实验。
诱变筛选:取一个转子放入90mm的无菌培养皿中,加入10ml稀释好的孢子悬液(浓度为5×10 7个/ml)。在磁力搅拌器上搅拌使孢子液处于均匀状态。在无菌超净工作台中,用功率为9w的紫外灯于垂直距离20cm的上方照射,照射120s,然后在黑暗条件下放置30min。将孢子悬液稀释10000倍,取其中100ul均匀涂布于PDA平板,30℃培养2-3d,同时以出发菌里氏木霉U11-4为对照组,采用同样方法涂布PDA平板,30℃培养2-3d。
申请人共涂布了130个PDA平板,每个平板长出约50个菌落。通过观察菌落形态,并与出发菌里氏木霉U11-4进行比较,挑选出菌落形态发生明显变异的突变体177个,分别接种到PDA复筛平板(每个平板均匀接种12个突变体),30℃培养2-3d。
最终,申请人筛选得到29株菌落形态明显变小,菌丝体致密且分枝更多的里氏木霉突变菌。这些突变菌在放大发酵过程中具有菌丝体粗短,溶氧水平高,发酵液黏度低等优点。
实施例3里氏木霉表达宿主的尿嘧啶营养缺陷型筛选
5-氟乳清酸可以诱导菌体缺失尿嘧啶核苷酸合成途径中的乳清核苷酸转移酶或乳清苷单磷酸脱羧酶,从而使5-氟乳清酸无法形成有 毒的物质5-氟尿嘧啶核苷酸,从而产生了对5-氟乳清酸的抗性,其嘧啶核苷酸营养可以通过向培养基中添加尿嘧啶进行补充,因此利用5-氟乳清酸诱导形成的尿嘧啶营养缺陷型菌株可以在含有5-氟乳清酸和尿嘧啶的培养基中生长;而野生型菌株因不具备对5-氟乳清酸的抗性,无法在含有5-氟乳清酸的培养条件下生长。因此常用5-氟乳清酸来筛选尿嘧啶缺陷型的突变株。
分别将实施例2筛选到的29株里氏木霉突变菌的孢子用浓度为0.1%的吐温-20溶液稀释至约1×10 7个/mL;然后将孢子悬液均匀涂布于含有1.5g/mL 5-氟乳清酸和1.87g/mL尿嘧啶核苷(Uridine)的基本固体培养基(2%葡萄糖,0.5%(NH 4) 2SO 4,1.5%KH 2PO 4,0.06%MgSO 4,0.06%CaCl 2,1.5%琼脂)平板上,每一平板涂布约1×10 6个孢子,避光30℃培养7d以上。结果显示,每种突变菌的平板上都有不同数量的菌落长出,说明这些菌落有可能是对应突变菌的尿嘧啶缺陷型菌株。
分别挑取上述每种突变菌对应平板上长出的菌落,将每个菌落分别涂布于基本培养基平板和含有1.87g/mL Uridine的基本培养基平板进行验证。真正的尿嘧啶缺陷型菌株只能在含有Uridine的基本培养基平板上生长,而在缺少Uridine的基本培养基平板上无法生长。最终,申请人在实施例2中通过紫外诱变获得的29株里氏木霉突变菌中,每株突变菌都对应筛选到1株生长状态相对最好的尿嘧啶缺陷型菌株,共29株,分别命名为里氏木霉O11-1U,O11-2U,O11-3U,O11-4U,……,O11-29U。
为了进一步确定上述29株尿嘧啶缺陷型突变菌株的稳定性,分别将其用液体基本培养基(2%葡萄糖,0.5%(NH 4) 2SO 4,1.5%KH 2PO 4,0.06%MgSO 4,0.06%CaCl 2)振荡培养7天,观察其能否生长,重复3次试验。实验结果显示,29株尿嘧啶缺陷型突变菌株在缺少Uridine的液体基本培养基中均无法生长。
实施例4中性纤维素酶基因NCE5在里氏木霉突变菌中的表达
为了验证突变菌里氏木霉O11-1U,O11-2U,O11-3U,O11-4U,……,O11-29U对目标基因的表达效率,申请人选择将来源于里氏木霉的中性纤维素酶基因NCE5(其核苷酸序列为SEQ ID NO:5,编码氨基酸序列为SEQ ID NO:6)分别在出发菌里氏木霉U11-4和上述突变菌株中进行表达。
4.1提取里氏木霉总基因组DNA
将里氏木霉接种摇瓶培养基过夜培养,取适量菌体置于离心管中,13000rpm离心5min,弃上清;加入400μl抽提缓冲液(100mM TrisHCl,100mM EDTA,250mM NaCl,1%SDS);然后加100mg石英砂或玻璃珠、在珠打仪剧烈振荡2min左右;水浴锅65℃水浴20min后加入200μl 10M NH4AC冰浴10min;13000rpm离心10min取上清,然后加入2倍体积的无水乙醇,-20℃放置30min;13000rpm离心10min弃上清,用70%乙醇洗涤2次;晾干,加入适量水溶解于-20℃保存。
4.2基因克隆
以4.1中提取的基因组总DNA为模板,利用引物anl-F和anl-R(TCTAGAGGAGCGGCAGTCCGGCAGCGGCC和AGTTAGTTAGCACTCAAGGG A)进行PCR扩增。PCR扩增条件为95℃4min;94℃30S,59℃40S,72℃1min 30个循环;72℃7min。利用凝胶回收试剂盒回收PCR扩增产物。
4.3测序分析
将4.2中回收的扩增产物连接到PC2G载体,获得克隆载体NCE5-PC2G质粒并送至北京华大基因研究中心进行测序分析。测序结果,扩增产物的核苷酸序列为SEQ ID NO:5,其编码氨基酸序列为SEQ ID NO:6。多个克隆的结果证明没有发生扩增错误。
4.4转化与筛选
4.4.1原生质体制备
接种实施例3获得的里氏木霉突变体O11-1U菌丝于PDA平板 上生长7天;切取直径约3cm的菌落置于约60mlYEG(0.5%酵母粉、1%葡萄糖、0.1%Uridine)的液体培养基中,30℃、200rpm振荡培养过夜;多层纱布过滤收集菌丝;将菌丝置于盛有20ml裂解酶液(Sigma L1412)酶解2小时;取出酶解液,加入0.7M NaCl溶液,轻轻摇晃,倒于三层灭菌擦镜纸过滤,收集滤液,3000rpm,离心10min;弃上清,加10-20ml STC液(20%蔗糖,50mM Tris-Cl,50mM CaCl 2)悬浮,3000rpm,离心10min;加适量STC悬浮分装(200μl/管,10 8个/ml)。
4.4.2转化与验证
取10μg NCE5-PC2G DNA加入到200μl原生质体中,接着加入50μl 25%PEG轻轻混匀,室温静置25min;然后分2-3次再加2ml 25%PEG,轻轻混匀,室温静置25min,把原生质体加到50ml左右熔化后冷却至45-55℃的上层半固体培养基(0.1%MgSO 4,1%KH 2PO4,0.6%(NH 4) 2SO 4,1%葡萄糖,18.3%山梨醇,0.35%琼脂糖),轻轻混匀后倒入下层基础培养基平板(2%葡萄糖,0.5%(NH4) 2SO 4,1.5%KH 2PO 4,0.06%MgSO 4,0.06%CaCl 2,1.5%琼脂),30℃黑暗培养数天至转化子长出。通过摇瓶发酵,选出纤维素酶表达量最高的阳性转化子,命名为里氏木霉O11-1U-NCE5。
采用上述同样方法,分别以里氏木霉突变菌株O11-2U,O11-3U,O11-4U,……,O11-29U为宿主细胞,构建得到重组表达中性纤维素酶NCE5的里氏木霉重组菌株,对应选出表达量最高的阳性转化子,分别命名为里氏木霉O11-2U-NCE5,O11-3U-NCE5,O11-4U-NCE5……,O11-29U-NCE5。
同时,以出发菌株里氏木霉U11-4作为对照宿主,采用上述同样方法,构建得到重组表达中性纤维素酶NCE5的里氏木霉重组菌株,对应选出表达量最高的阳性转化子,命名为里氏木霉U11-4-NCE5,作为对照菌株。
4.5发酵验证
将上述构建的对照菌株里氏木霉U11-4-NCE5,与以突变菌株O11-1U,O11-2U,O11-3U,……,O11-29U为宿主细胞构建得到的重组菌株里氏木霉O11-1U-NCE5,O11-2U-NCE5,O11-3U-NCE5……,O11-29U-NCE5分别接种于摇瓶培养基(葡萄糖10g/L,液糖10g/L,玉米浆15g/L,硫酸铵9g/L,硫酸镁5-10g/L,磷酸二氢钾20g/L磷酸氢二铵4g/L)30℃,200rpm摇床培养48h之后,温度控为25℃,发酵3天。分别取发酵上清液测定其中的纤维素酶酶活。
(1)酶活测定方法
在50℃、pH值为4.8(中性为pH6.0)的条件下,每分钟从浓度为5mg/ml的羟甲基纤维素钠溶液中降解释放1μmol还原糖所需要的酶量为一个酶活力单位U,还原糖以葡萄糖等量。
取三支试管各加入0.5mL CMC底物,与待测酶液一起50℃水浴预热5min。在第一、二试管中各加入0.5mL待测液,并计时,50℃水浴中反应15min。反应完后在三支试管中各加入1.5mLDNS试剂,并在第三支试管总补加0.5mL的待测酶液。取出并摇匀三支试管后,在沸水浴中反应5min。迅速冷却至室温,用水定到5.0mL。以第三支试管试液为对照在540nm波长条件下测第一、二试管试液的吸光度,吸光度在0.25-0.35之间为宜。待测酶液反应液的吸光度与水平控制酶液反应液吸光度之差的绝对值不超过0.015。
酶活X=(葡萄糖等量值/180/15/0.5)×n
其中:X——酶活力单位,IU/g(mL);
180——葡萄糖从微克换算成微摩尔;
15——待测液与底物的反应时间;
0.5——加入反应的待测酶液量;
n——稀释倍数;
(2)酶活测定结果
以出发菌里氏木霉U11-4作为对照宿主构建得到的对照菌株里 氏木霉U11-4-NCE5,其发酵上清液酶活为55U/mL,蛋白含量为0.41mg/ml,而以突变菌株O11-1U,O11-2U,O11-3U,……,O11-29U为宿主细胞构建得到的重组菌株里氏木霉O11-1U-NCE5,O11-2U-NCE5,O11-3U-NCE5……,O11-29U-NCE5,其发酵酶活约为71~86U/mL,蛋白量约为0.55-0.62mg/ml,说明纤维素酶基因NCE5在出发菌里氏木霉U11-4以及突变菌株O11-1U,O11-2U,O11-3U,……,O11-29U中均得到有效表达,且在突变菌中的表达量明显高于出发菌。其中,以突变菌O11-8U为宿主细胞构建得到的重组菌株里氏木霉O11-8U-NCE5发酵酶活最高,为86U/mL,蛋白量最高达0.62mg/ml,比对照菌株提高了56.4%和51.2%,取得了意料不到的技术效果。
将对照菌株里氏木霉U11-4-NCE5和以突变菌株O11-8U为宿主细胞构建得到的重组菌株里氏木霉O11-8U-NCE5发酵上清液进行SDS-PAGE电泳检测,结果如图1所示,与对照菌株相比,里氏木霉O11-8U-NCE5中目的蛋白NCE5(箭头所指处)的表达量有明显提高。
申请人已于2017年12月15日将上述突变菌里氏木霉O11-8U(Trichoderma reesei O11-8U)保藏于中国武汉武汉大学的中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCC NO:M2017796。
实施例5纤维素酶TT45在里氏木霉O11-8U中的表达
参考实施例4所述方法,提取里氏木霉基因组,按以下引物进行PCR扩增,得到纤维素酶TT45基因片段(其核苷酸序列为SEQ ID NO:7,氨基酸序列为SEQ ID NO:8)。
TT45-KpnI-F:CGGGGTACCATGCGATCTACCCCGGTCC
TT45-MluI-R:CGACGCGTTCAGAGGCACTGAGAGTAGTAG
将纤维素酶TT45基因片段连接到PC2G载体,获得重组载体;然后将重组载体转化入宿主细胞里氏木霉O11-8U,构建得到重组表达纤维素酶TT45的里氏木霉重组菌株,选出表达量最高的阳性转化子,命名为里氏木霉O11-8U-TT45(Trichoderma reesei  O11-8U-TT45)。
同时,以出发菌株里氏木霉U11-4作为对照宿主,采用上述同样方法,构建得到重组表达纤维素酶TT45的里氏木霉重组菌株,对应选出表达量最高的阳性转化子,命名为里氏木霉U11-4-TT45,作为对照菌株。
将上述构建的里氏木霉O11-8U-TT45和对照菌里氏木霉U11-4-TT45分别接种于摇瓶培养基(葡萄糖10g/L,液糖10g/L,玉米浆15g/L,硫酸铵9g/L,硫酸镁5-10g/L,磷酸二氢钾20g/L磷酸氢二铵4g/L)30℃,200rpm摇床培养48h之后,温度控为25℃,发酵3天。分别取发酵上清液测定其中的纤维素酶酶活(酶活测定方法参考实施例4.5)。
酶活测定结果显示:对照菌里氏木霉U11-4-TT45的发酵酶活为33.26U/ml,蛋白含量为0.33mg/ml,而里氏木霉O11-8U-TT45的发酵酶活高达60.89U/ml,蛋白含量高达0.59mg/ml,比对照菌提高了83.1%和78.8%,效果显著。所述结果也表明以突变菌株里氏木霉O11-8U为宿主细胞构建得到的重组菌株中纤维素酶TT45的表达量远远高于以出发菌里氏木霉U11-4为宿主细胞构建得到的重组菌株。
此外,申请人还将葡萄糖苷酶、葡聚糖酶、果胶酶、过氧化氢酶等分别在突变菌宿主O11-8U中进行重组表达。与出发菌株宿主里氏木霉U11-4相比,突变菌宿主O11-8U对上述基因的表达量均提高了30%以上,效果显著。
综上,本发明以里氏木霉U11-4为出发菌株,通过诱变获得的突变菌里氏木霉O11-8U(Trichoderma reesei O11-8U)可以作为一种新型宿主细胞,普遍应用于内源或异源基因的重组表达,有利于提高蛋白的产量,降低生产成本。
以上实施例的说明只是用于帮助理解本发明的方法及其核心思想。应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以对本发明进行若干改进和修饰,这些改进和 修饰也落入本发明权利要求的保护范围内。
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Claims (13)

  1. 一种里氏木霉,其特征在于,所述的里氏木霉的保藏编号为CCTCC NO:M2017796。
  2. 权利要求1所述的里氏木霉在表达一种或多种内源或外源蛋白中的应用。
  3. 如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述的蛋白为半纤维素酶、过氧化物酶、蛋白酶、纤维素酶、木聚糖酶、脂肪酶、磷脂酶、酯酶、角质酶、果胶酶、角蛋白酶、还原酶、氧化酶、酚氧化酶、脂加氧酶、木质素酶、支链淀粉酶、鞣酸酶、戊聚糖酶、malanase、β-葡聚糖酶、阿拉伯糖苷酶、透明质酸酶、软骨素酶、漆酶、淀粉酶、葡糖淀粉酶中的任一种或几种。
  4. 如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述的蛋白为乙酰酯酶、氨肽酶、淀粉酶、阿拉伯糖酶、阿拉伯呋喃糖苷酶、羧肽酶、过氧化氢酶、纤维素酶、几丁质酶、凝乳酶、角质酶、脱氧核糖核酸酶、差向异构酶、酯酶、α-半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、α-葡聚糖酶、葡聚糖裂解酶、内切-β-葡聚糖酶、葡糖淀粉酶、葡糖氧化酶、α-葡糖苷酶、β-葡糖苷酶、葡糖醛酸糖苷酶、半纤维素酶、己糖氧化酶、水解酶、转化酶、异构酶、漆酶、脂肪酶、裂解酶、甘露糖苷酶、氧化酶、氧化还原酶、果胶酸裂解酶、果胶乙酰酯酶、果胶解聚酶、果胶甲基酯酶、果胶裂解酶、过氧化物酶、酚氧化酶、植酸酶、多聚半乳糖醛酸酶、蛋白酶、鼠李糖半乳糖醛酸酶、核糖核酸酶、奇异果甜蛋白、转移酶、转运蛋白、转谷氨酰胺酶、木聚糖酶、己糖氧化酶中的任一种或几种。
  5. 一种里氏木霉重组菌株,其特征在于,所述的重组菌株是将携带有目的基因的表达载体转化到权利要求1所述的里氏木霉中构建获得的。
  6. 如权利要求5所述的里氏木霉重组菌株,其特征在于,所述的目的基因为纤维素酶基因。
  7. 如权利要求6所述的里氏木霉重组菌株,其特征在于,所述的纤维素酶基因的核苷酸序列为SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:7。
  8. 如权利要求5所述的里氏木霉重组菌株,其特征在于,所述的目的基因为葡萄糖苷酶基因、葡聚糖酶基因、果胶酶基因、过氧化氢酶基因。
  9. 如权利要求5所述的里氏木霉重组菌株,其特征在于,所述的表达载体为真核表达载体。
  10. 如权利要求5所述的里氏木霉重组菌株,其特征在于,所述的表达载体为PC2G载体。
  11. 权利要求5所述的里氏木霉重组菌株在生产目的基因表达的蛋白中的应用。
  12. 权利要求6所述的里氏木霉重组菌株在生产纤维素酶中的应用。
  13. 权利要求8所述的里氏木霉重组菌株在葡萄糖苷酶、葡聚糖酶、果胶酶、过氧化氢酶中的应用。
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