WO2017047816A1 - 架橋型核酸ＧｕＮＡ、その製造方法および中間体化合物 - Google Patents

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聡 小比賀
英治 川西
浩昭 澤本
修平 山腰
勇樹 新井
新司 熊谷
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田辺三菱製薬株式会社
国立大学法人大阪大学
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Definitions

  • the present invention relates to a monomer and an oligomer of a crosslinked nucleic acid GuNA, a method for producing the same, and an intermediate compound for the production thereof.
  • an antisense method an anti-gene method, a method using an aptamer, a method using siRNA, etc. as a method for treating a disease with a nucleic acid drug.
  • the antisense method introduces an oligonucleotide (antisense strand) complementary to the mRNA involved in the disease from the outside to form a double strand, thereby inhibiting the translation process of the pathogenic RNA and treating the disease.
  • the method using siRNA is also similar to the antisense method, in which translation from mRNA to protein is inhibited by double-stranded RNA administered to a living body.
  • the antigene method suppresses transcription from DNA to RNA by introducing from the outside a triplex-forming oligonucleotide corresponding to a DNA site that transcribes pathogenic RNA.
  • aptamers exhibit functions by regulating the activity of the protein by specifically binding to biological components such as proteins that cause disease.
  • S-oligo phosphorothioate type oligonucleotide
  • BNA bridged nucleic acid
  • LNA 4′-locked nucleic acid
  • 2'-amino LNA has been reported as one of artificial nucleic acids (Non-patent Document 7). It has nuclease resistance, has high binding affinity with the target nucleic acid chain, and is the most expected molecule as a nucleic acid drug material like the LNA. However, only nucleotides having thyminyl or 5-methyl-cytosinyl are known as nucleosides having appropriate substituents that can be used as raw materials for synthesizing oligonucleotides (Non-patent Document 8). In addition, Aza-ENA has been reported as another artificial nucleic acid (Non-patent Document 9). It has a structure in which the carbon atom constituting the bridge is one more than that of 2′-amino LNA, and only thyminyl is known as the base moiety of the nucleic acid.
  • Still another artificial nucleic acid is guanidine cross-linked artificial nucleic acid (GuNA).
  • GuNA guanidine cross-linked artificial nucleic acid
  • Patent Document 5 GuNA containing thyminyl as a nucleobase moiety is known.
  • the production of GuNA requires multiple steps, and therefore it has not been easy to produce it efficiently.
  • GENA has been reported as an artificial nucleic acid similar to GuNA (Non-patent Document 10). The number of carbon atoms constituting the bridge is one more than that of GuNA, and only the base portion of the nucleic acid is known as thyminyl.
  • Non-Patent Document 11 A known method for producing GuNA is described in Non-Patent Document 11, but it requires a multi-step number of steps, and the yield of GuNA production is not sufficient.
  • the manufacturing route is shown below.
  • the present invention relates to a method for producing a guanidine cross-linked artificial nucleic acid (hereinafter abbreviated as GuNA), an intermediate compound for the production, and a GuNA monomer or oligomer.
  • GuNA guanidine cross-linked artificial nucleic acid
  • the present invention relates to the following items [1] to [89], but is not limited thereto.
  • Item [1] Formula I: [Wherein R 1 And R 2 Are each independently a hydroxyl protecting group, R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, m is an integer from 1 to 3, and ring A is C optionally substituted by one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A ′.
  • the manufacturing method including the process of making a reducing agent react with the compound represented by these, and cleaving the oxazolidine ring condensed to ring A '.
  • R 1 And R 2 Are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Are each a hydrogen atom, ring A is thyminyl or uracinyl, and ring A ′ is represented by the following structural formula II-1 or II-2: And the reducing agent is Ph 3 Item 2.
  • R 1 And R 2 Each independently represents a benzyl (Bn) group, a 2-naphthylmethyl group, a p-methoxybenzyl group, a 3,4-dimethoxybenzyl group, a 2,6-dimethoxybenzyl group, or a p-phenylbenzyl group; 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, m is an integer from 1 to 3, and ring A is C optionally substituted by one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • Or a salt thereof Or a salt thereof.
  • R 1 And R 2 are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Item 5.
  • R 1 And R 2 Is independently a hydroxyl protecting group
  • R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • m is an integer of 1 to 3
  • ring A ′ is C which may be substituted with one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A ′.
  • R 1 And R 2 are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Item 7.
  • R 1 And R 2 are each independently a hydroxyl protecting group
  • R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 5 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 6 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • m is an integer of 1 to 3
  • ring A ′ is C which may be substituted with one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A ′.
  • the manufacturing method including the process of making an azidating agent react with the compound represented by these.
  • Item [9] R 1 And R 2 Are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Item 9.
  • the production method according to Item 8 wherein each is a hydrogen atom, ring A ′ is the following structural formula II-1 or II-2, and the azidating agent is DPPA.
  • Formula VII wherein B is the base portion of the nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, R 7 Is a hydrogen atom or hydroxyl protecting group, R 8 Is a hydrogen atom, a phosphate group that may be substituted with one or more substituents, or a thiophosphate group that may be substituted with one or more substituents, and R 9 , R 10 And R 11 Each independently represents a hydrogen atom, C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group or an amino-protecting group, and m is an integer
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A ′.
  • R 1 And R 2 are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Item 12.
  • R 1 And R 2 are each independently a hydroxyl protecting group
  • R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 5 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 6 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • X is a leaving group
  • m is an integer from 1 to 3
  • ring A ′ may be substituted with one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A ′.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • a production method comprising a step of reacting a compound represented by the formula (I) with a hydroxyl group activator to activate an unprotected hydroxyl group substituted on the tetrahydrofuran ring in the general formula V.
  • R 1 And R 2 Are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Are each a hydrogen atom
  • X is a mesyloxy group (Ms—O—)
  • ring A is thyminyl or uracinyl
  • ring A ′ is the following structural formula II-1 or II-2
  • hydroxyl activity Item 14 The method according to Item 13, wherein the agent is trifluoromethanesulfonyl chloride.
  • Formula VII Wherein B is the base portion of the nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, R 7 Is a hydrogen atom or hydroxyl protecting group, R 8 Is a hydrogen atom, a phosphate group that may be substituted with one or more substituents, or a thiophosphate group that may be substituted with one or more substituents; 9 , R 10 And R 11 Each independently represents a hydrogen atom, C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group or an amino-protecting group, and m is an integer of 1
  • Item [16] Formula IV: [Wherein R 1 And R 2 Are each independently a hydroxyl protecting group, R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, X is a leaving group, m is an integer from 1 to 3, and ring A ′ may be substituted with one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A ′.
  • R 1 And R 2 are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Item 17.
  • R 1 And R 2 are each independently a hydroxyl protecting group
  • R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 5 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 6 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • X is a leaving group
  • m is an integer from 1 to 3
  • ring A may be substituted with one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • Or a salt thereof Or a salt thereof.
  • R 1 And R 2 are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Item 19.
  • R 1 And R 2 are each independently a hydroxyl protecting group
  • R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 5 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 6 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • m is an integer of 1 to 3
  • ring A ′ is C which may be substituted with one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A ′.
  • the manufacturing method including the process of making an azidating agent react with the compound represented by these.
  • R 1 And R 2 Are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Are each a hydrogen atom, X is a mesyloxy group (Ms—O—), ring A ′ is the following structural formula II-1 or II-2, and the azidating agent is nBu 4 NN 3 Or the manufacturing method of claim
  • Formula VII wherein B is the base portion of the nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, R 7 Is a hydrogen atom or hydroxyl protecting group, R 8 Is a hydrogen atom, a phosphate group that may be substituted with one or more substituents, or a thiophosphate group that may be substituted with one or more substituents, and R 9 , R 10 And R 11 Each independently represents a hydrogen atom, C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group or an amino-protecting group, and m is an integer
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A ′.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • a process comprising reacting a compound represented by the formula (I) with a hydroxyl group activator to activate an unprotected hydroxyl group substituted on the tetrahydrofuran ring in formula VI.
  • R 1 And R 2 Are each a Bn group and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 In item 23, wherein each represents a hydrogen atom, ring A is thyminyl or uracinyl, ring A ′ is the following structural formula II-1 or II-2, and the hydroxyl group activator is trifluoromethanesulfonyl chloride The manufacturing method as described.
  • Formula VII Wherein B is the base portion of the nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, R 7 Is a hydrogen atom or hydroxyl protecting group, R 8 Is a hydrogen atom, a phosphate group that may be substituted with one or more substituents, or a thiophosphate group that may be substituted with one or more substituents; 9 , R 10 And R 11 Each independently represents a hydrogen atom, C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group or an amino-protecting group, and m is an integer of 1
  • Formula VII wherein B is the base portion of the nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • An alkyl group each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 7 Is a hydrogen atom or hydroxyl protecting group
  • R 8 Is a hydrogen atom, a phosphate group that may be substituted with one or more substituents, or a thiophosphate group that may be substituted with one or more substituents
  • 9 , R 10 And R 11 Each independently represents a hydrogen atom, C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • B may have one or more protecting groups adenynyl, one or more protecting groups guaninyl, one or more protecting groups cytosinyl, one or more protections 5-methylcytosinyl which may have a group or uracinyl which may have one or more protecting groups,
  • R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Are each a hydrogen atom and R 7 Is a DMTr group and R 8 Is a hydrogen atom or -P (O (CH 2 ) 2 CN) (N (iPr) 2 ) Group, R 9 Is Teoc group or Boc group, R 10 Is a Teoc group or a Boc group and R 11 Item 27.
  • Item 26 wherein is a hydrogen atom.
  • Item [28] B is thyminyl optionally having one or more protecting groups, and R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Are each a hydrogen atom and R 7 Is a DMTr group and R 8 Is a hydrogen atom or -P (O (CH 2 ) 2 CN) (N (iPr) 2 ) Group, R 9 Is a Teoc group and R 10 Is a Teoc group and R 11 Item 27.
  • Formula VIII wherein B is the base portion of the nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, R 12 And R 13 Are each independently a hydrogen atom or a hydroxyl-protecting group, and m is an integer of 1 to 3.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • B may have one or more protecting groups adenynyl, one or more protecting groups guaninyl, one or more protecting groups cytosinyl, one or more protections 5-methylcytosinyl which may have a group, thyminyl which may have one or more protecting groups or uracinyl which may have one or more protecting groups, R 12 , R 13 , R 14 And R 15 Item 30.
  • Item [31] B may have one or more protecting groups adeninyl, one or more protecting groups guanine, one or more protecting groups cytosinyl, one or more protections 5-methylcytosinyl which may have a group, thyminyl which may have one or more protecting groups or uracinyl which may have one or more protecting groups, R 12 Is a DMTr group, R 13 Is TMS group, R 14 Is a DMTr group, R 15 Item 30.
  • Item [32] B may have one or more protecting groups adenynyl, one or more protecting groups guaninyl, one or more protecting groups cytosinyl, one or more protections 5-methylcytosinyl which may have a group, thyminyl which may have one or more protecting groups or uracinyl which may have one or more protecting groups, R 12 Is TMS group, R 13 Is TMS group, R 14 Is a hydrogen atom, R 15 Item 30.
  • Formula VII Wherein B is the base portion of the nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, R 7 Is a hydrogen atom or hydroxyl protecting group, R 8 Is a hydrogen atom, a phosphate group that may be substituted with one or more substituents, or a thiophosphate group that may be substituted with one or more substituents; 9 , R 10 And R 11 Each independently represents a hydrogen atom, C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group or an amino-protecting group, and m is an integer of 1
  • Item [34] Formula VIII: Wherein B is the base portion of the nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, R 12 Is a Bn group, DMTr group, or TMS group, and R 13 Is a Bn group, a hydrogen atom, or a TMS group, and m is an integer of 1 to 3.
  • Item [35] B may have one or more protecting groups adenynyl, one or more protecting groups guaninyl, one or more protecting groups cytosinyl, one or more protecting groups 5-methylcytosinyl, which may have one or more thyminyl which may have one or more protecting groups, or uracinyl which may have one or more protecting groups, R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Are each a hydrogen atom and R 12 And R 13 Item 35.
  • Item [36] B may have one or more protecting groups adenynyl, one or more protecting groups guaninyl, one or more protecting groups cytosinyl, one or more protecting groups 5-methylcytosinyl, which may have one or more thyminyl which may have one or more protecting groups, or uracinyl which may have one or more protecting groups,
  • R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Are each a hydrogen atom and R 12 Is a DMTr group and R 13 Item 35.
  • Item [38] B may have one or more protecting groups adenynyl, one or more protecting groups guaninyl, one or more protecting groups cytosinyl, one or more protecting groups 5-methylcytosinyl or uracinyl optionally having one or more protecting groups, and R 7 Is a hydroxyl protecting group, R 16 , R 17 And R 18 Is a hydrogen atom and R 20 Is -P (O (CH 2 ) 2 CN) (N (iPr) 2 ) And R 21 , R 22 And R 23 Item 38.
  • Item [40] B is adenyl, guaninyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl, thyminyl or uracinyl, R 16 , R 17 And R 18 40.
  • R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Each independently represents a hydrogen atom or C 1-6 Item 42.
  • R 1 And R 2 are each independently a Bn group, a 4,4′-dimethoxytrityl (DMTr) group, a t-butyldimethylsilyl group, a t-butyldiphenylsilyl group, a trifluoromethanesulfonyl group, a trimethylsilyl group, a methanesulfonyl group, or the like.
  • DMTr 4,4′-dimethoxytrityl
  • a t-butyldimethylsilyl group a t-butyldiphenylsilyl group
  • a trifluoromethanesulfonyl group a trimethylsilyl group
  • methanesulfonyl group or the like.
  • Item 44 The compound or a salt thereof according to any one of Items 41 to 43.
  • ring A ′ is a 6-membered unsaturated heterocycle optionally substituted with one or more substituents,
  • the leaving group is preferably a hydroxyl leaving group, and examples thereof include a methanesulfonyloxy (mesyloxy; Ms-O-) group, a trifluoromethanesulfonyloxy group, a p-toluenesulfonyloxy group, and the like. It is not limited.
  • a compound of the general formula I By reacting the compound of Item 46 with a reducing agent, a compound of the general formula I: [Wherein R 1 And R 2 Are each independently a hydroxyl protecting group, R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, m is an integer from 1 to 3, and ring A is C optionally substituted by one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form a ring A.
  • the reducing agent used in this production method is a phosphine, preferably Ph. 3 P. Ring A is preferably thyminyl or uracinyl.
  • the method for producing a compound or a salt thereof according to Item 46 comprising a method for producing the compound according to Item 46 by reacting the compound according to Item 47 with an azidating agent.
  • the azidating agent used in this production method is hydroazide, sodium azide, lithium azide, tetrabutylammonium azide, trimethylsilyl azide, diphenylphosphoryl azide (DPPA), nicotinyl azide, zinc azide (Zn (N 3 ) 2 ), Preferably DPPA.
  • the method for producing a compound or a salt thereof according to Item 46 comprising a method for producing the compound according to Item 46 by reacting the compound according to Item 48 with an azidating agent.
  • the azidating agent used in this production method is, for example, nBu 4 NN 3 Or sodium azide, but not limited thereto.
  • R 1 And R 2 are each independently a hydroxyl protecting group
  • R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 5 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • R 6 are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • m is an integer from 1 to 3
  • ring A is C optionally substituted by one or more substituents.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A. ] 47.
  • a method for producing a compound or a salt thereof according to item 46 comprising a method for producing the compound according to item 46 by reacting a compound represented by the formula:
  • the hydroxyl group activator used in this production method is, for example, trifluoromethanesulfonyl chloride, methanesulfonyl chloride, or trifluoromethanesulfonic anhydride, but is not limited thereto.
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • Item 49 Item 49.
  • a method for producing a compound or a salt thereof according to Item 48 comprising a method for producing the compound according to Item 48 by reacting a compound represented by the formula:
  • the hydroxyl group activator used in this production method is, for example, methanesulfonyl chloride, but is not limited thereto.
  • Guanidine cross-linked artificial nucleic acid is represented by the general formula X: [Wherein R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, B is the base portion of a nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 16 , R 17 And R 18 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, an amino-protecting group, and m is an integer of 1 to 3; An oligonucleotide
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • Item [62] R 1 And R 2 Item 62.
  • Item [63] A compound or a salt thereof, wherein the compound according to any one of Items 59 to 62 is selected from the following: 1- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -7- (Benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hept-3-yl ⁇ -5 -Methylpyrimidine-2,4 (1H, 3H) -dione and 1- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -7- (benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -2-oxa-5 -Azabicyclo [2.2.1] hept-3-yl ⁇ -pyrimidine-2,4 (1H, 3H) -dione Item [64] The compound or salt thereof according to Item 57 or 58, wherein D is B (B is a base moiety of a nucleic acid which may be substituted with one or more substituent
  • the item [65] B is adenyl which may be substituted with one or more substituents, guaninyl which may be substituted with one or more substituents, cytosynyl which may be substituted with one or more substituents, one Item 65.
  • the compound according to Item 64 which is 5-methylcytosinyl optionally substituted with one or more substituents, thyminyl optionally substituted with one or more substituents, or uracinyl optionally substituted with one or more substituents. Its salt.
  • R 1 68 The compound or a salt thereof according to Item 64 or 65, wherein is a hydroxyl-protecting group.
  • Item [72] A compound or a salt thereof, wherein the compound according to any one of Items 64 to 71 is selected from the following: 1-[(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hepta -3-yl] -5-methylpyrimidine-2,4 (1H, 3H) -dione Item [73]
  • General formula IX: [Wherein R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, R 14 And R 15 Each independently represents a protecting group for
  • Alkyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • An alkenyl group C optionally substituted by one or more substituents 2-6
  • a 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with the above-mentioned substituent, and the unsaturated heterocycle may be condensed with another ring to form ring A.
  • Item 65 Item 65.
  • B may have one or more protecting groups adeninyl, one or more protecting groups guaninyl, one or more protecting groups.
  • Ring A is preferably thyminyl or uracinyl.
  • R 14 , R 15 And R 16 are preferably all Bn groups or R 14 Is a DMTr group, R 15 TMS group, and R 16 Is a hydrogen atom, but is not limited thereto.
  • the method of substituting ring A includes a method using a Lewis acid, preferably a method using a Lewis acid and a silylating agent, but is not limited thereto.
  • a method for producing a guanidine-crosslinked artificial nucleic acid comprising the production method according to item 62 or 63, wherein the guanidine-crosslinked artificial nucleic acid is represented by the general formula X:
  • R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group
  • each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6
  • B is the base portion of a nucleic acid that may be substituted with one or more substituents
  • R 16 , R 17 And R 18 Each independently represents a hydrogen atom, C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group or an amino-protecting group, and m is an integer of 1 to 3;
  • Item [77] The compound according to Item 76 or a salt thereof, wherein B is thyminyl, adenylyl, guaninyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl or uracinyl which may have one or more protecting groups.
  • Item [78] R 3 , R 4 , R 5 And R 6 Item 78.
  • R 7 The hydroxyl-protecting group is preferably an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups substituted with a halogen atom and / or a cyano group. Group, more preferably DMTr group, but not limited thereto.
  • Term [80] R 8 Item 80. The compound or a salt thereof according to any one of Items 76 to 79, wherein is a hydrogen atom.
  • Term [81] R 8 Item 80 The compound or a salt thereof according to any one of Items 76 to 79, wherein is a phosphate group which may be substituted with one or more substituents.
  • the phosphate group is preferably —P (O (CH 2 ) 2 CN) (N (iPr) 2 ) Group, but not limited thereto.
  • R 9 And R 10 84 The compound or a salt thereof according to any one of Items 76 to 81, wherein each independently represents an amino acid protecting group.
  • the protecting group for the amino acid is preferably a Teoc group or a Boc group, but is not limited thereto.
  • R 11 83 The compound or a salt thereof according to any one of Items 76 to 82, wherein is a hydrogen atom.
  • Item [84] The compound according to Item 76 or a salt thereof, wherein B is thyminyl optionally having one or more protecting groups.
  • R 9 And R 10 Item 84.
  • Item [86] Formula X: [Wherein R 3 And R 4 Each independently represents a hydrogen atom, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 5 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, each R 6 Are independently hydrogen atoms, or C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group, B is the base portion of a nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 16 , R 17 And R 18 Each independently represents a hydrogen atom, C which may be substituted with one or more substituents 1-6 An alkyl group or an amino-protecting group, and m is an integer of 1 to 3; ] An oligonucleotide having at least one nucleoside represented by
  • Item [87] The oligonucleotide or salt thereof according to Item 86, wherein B is adeninyl, guaninyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl, thyminyl, or uracinyl.
  • R 16 , R 17 And R 18 90. The oligonucleotide or salt thereof according to item 86 or 87, wherein is a hydrogen atom.
  • the production method of the present invention can significantly reduce the number of steps as compared with the conventional production method, and can greatly improve the production yield of GuNA.
  • GuNA having various nucleobases other than thyminyl can be efficiently and selectively produced in a suitable ⁇ form.
  • a GuNA oligomer containing a GuNA monomer having various other nucleobases for example, a GuNA monomer having a base portion of adeninyl, guaninyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl or uracinyl, and a GuNA oligomer containing these GuNA monomers Can be manufactured.
  • the intermediate compounds of the present invention are useful for the production of various nucleobases of GuNA.
  • Intermediate compounds of the present invention include 2'-amino LNA monomers.
  • 2′-amino LNA having not only adenylyl and thyminyl but also various other nucleobases, for example, 2′-amino LNA having a guanylyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl or uracinyl base moiety.
  • 2′-amino LNA oligomers having various nucleobases prepared according to the present invention can be used to produce 2'-amino LNA oligomers.
  • oligomers of 2′-amino LNA are resistant to nucleases and bind tightly to nucleic acids having complementary sequences, the treatment, reduction, prevention, recurrence prevention and diagnosis of various diseases as pharmaceuticals using nucleic acids, and As a reagent using nucleic acid, it can be widely used in various tests and tests.
  • GuNA produced according to the present invention is remarkably resistant to nucleases, firmly binds to nucleic acids having complementary sequences, and efficiently migrates into cells. Therefore, treatment of various diseases as pharmaceuticals using nucleic acids, It can be widely used for various tests and tests as a reagent using reduction, prevention, recurrence prevention and diagnosis, and nucleic acid.
  • an arbitrary linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms include a methyl group, an ethyl group, an n-propyl group, an n-butyl group, an n-pentyl group, and an n-hexyl group.
  • an arbitrary branched alkyl group having 3 to 6 carbon atoms having the same or different branched chain include iso (abbreviated “i”) propyl group, isobutyl group, tert (abbreviated “t”)-butyl Group, sec (abbreviated as “s”)-butyl group, neopentyl group, isopentyl group and the like, and any cyclic alkyl group having 3 to 6 carbon atoms includes a 3- to 6-membered monocyclic cycloalkyl group
  • Specific examples include, but are not limited to, a cyclopropyl group, a cyclobutyl group, a cyclopentyl group, a cyclohexyl group, and the like.
  • substituents include a group consisting of a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • one or more good C 2-6 alkenyl optionally substituted with a substituent is 2 to 6 (C 2-6) carbon atoms, preferably from 2 carbons 4 (C 2- 4 ) any linear alkenyl group, any branched alkenyl group having 3 to 6 carbon atoms having the same or different branched chain, any cyclic alkenyl group having 3 to 6 carbon atoms, and 4 to 6 carbon atoms These combinations are included.
  • straight chain alkenyl group having 2 to 6 carbon atoms include ethenyl group, 1-propenyl group, 2-propenyl group, 1-butenyl group, 2-butenyl group, 1-pentenyl group, 2- Pentenyl group, 3-pentenyl group, 4-pentenyl group, 1-hexenyl group and the like
  • specific examples of any branched alkenyl group having 3 to 6 carbon atoms having the same or different branched chain include isopropenyl Groups, 1-methyl-1-propenyl group, 1-methyl-2-propenyl group, 2-methyl-1-propenyl group, 2-methyl-2-propenyl group, 1-methyl-2-butenyl group, etc.
  • the cyclic alkenyl group having 3 to 6 carbon atoms is preferably a 3- to 6-membered monocyclic cycloalkenyl group. Specific examples include a cyclopropenyl group, cyclobutenyl group, , Cyclopentenyl group, and cyclohexenyl group include, but are not limited to.
  • the substituent include a group consisting of a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • C 2-6 alkynyl which may be substituted with one or more substituents means 2 to 6 carbon atoms (C 2-6 ), preferably 2 to 4 carbon atoms (C 2 — 4 ) any linear alkynyl group, any branched alkynyl group having 3 to 6 carbon atoms having the same or different branched chain, any cyclic alkynyl group having 3 to 6 carbon atoms, and 4 to 6 carbon atoms These combinations are included.
  • an arbitrary linear alkynyl group having 2 to 6 carbon atoms include ethynyl group, 1-propynyl group, 2-propynyl group, 1-butynyl group, 2-butynyl group, 1-pentynyl group, 2-
  • the branched alkynyl group having 3 to 6 carbon atoms having the same or different branched chain include isopropylinyl group, 3-pentynyl group, 4-pentynyl group, 1-hexynyl group and the like.
  • cyclic alkynyl group having 3 to 6 carbon atoms a 3- to 6-membered monocyclic cycloalkynyl group is preferable, and specific examples thereof include a cyclobutynyl group, a cyclopentynyl group Although such cyclohexenyl group include, but are not limited to.
  • substituents include a group consisting of a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • C 1-6 alkoxy group refers to a monovalent group in which C 1-6 alkyl is bonded to an oxygen atom, and means a C 1-6 alkyl-O group. Specific examples include, but are not limited to, methoxy group, ethoxy group, n-propoxy group, i-propoxy group, n-butoxy group, t-butoxy group, s-butoxy group, and 3-methylbutoxy group. Not.
  • halogen examples include a fluorine atom (fluoro), a chlorine atom (chloro), a bromine atom (bromo), or an iodine atom (iodo).
  • aryl (group) is a functional group or substituent derived from an aromatic hydrocarbon, including those composed of a plurality of rings, specifically from an aromatic hydrocarbon group. This means a monovalent group having 6 to 14 carbon atoms excluding one hydrogen atom, and examples thereof include a phenyl group, an indenyl group, a naphthyl group, a phenanthrenyl group, and an anthracenyl group.
  • the aryl ring is a halogen atom, a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a hydroxyl group, a C 1-6 alkoxy group, an aryloxy group, an amino group, a nitro group, a tri
  • the aryl group which may be substituted with one or more groups such as a fluoromethyl group and a phenyl group includes, for example, a 2-methylphenyl group, a 3-methylphenyl group, 4 -Methylphenyl group, 2,6-dimethylphenyl group, 2,4-dimethylphenyl group, 2-chlorophenyl group, 4-chlorophenyl group, 2,4-dichlorophenyl group, 2,5-dichlorophenyl group, 2,6-dichlorophenyl Group, 2-bromophenyl group, 4-methoxyphenyl group, 4-chloro-2-
  • heteroaryl (group) refers to any heteroaromatic compound having 3 to 12 carbon atoms containing a hetero atom (eg, a nitrogen atom, an oxygen atom, and / or a sulfur atom) in the ring structure.
  • a hetero atom eg, a nitrogen atom, an oxygen atom, and / or a sulfur atom
  • a monovalent group excluding one hydrogen atom including pyridyl, pyrimidinyl, pyridazinyl, pyrrolyl, isoquinolyl, quinolyl, indolyl, imidazolyl, triazolyl, furyl, and thienyl groups It is done.
  • the heteroaryl ring is a halogen atom, a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a hydroxyl group, a C 1-6 alkoxy group, an aryloxy group, an amino group, a nitro group, It may be substituted with one or more groups such as a trifluoromethyl group and a phenyl group.
  • protecting group described in “protecting group for hydroxyl group”, “protecting group for amino group”, “protecting group for phosphate group”, and “protecting group for mercapto group” means nucleic acid There is no particular limitation as long as it can stably protect an amino group, a hydroxyl group, a phosphate group or a mercapto group during synthesis. Specifically, it refers to a protecting group that is stable under acidic or neutral conditions and can be cleaved by chemical methods such as hydrogenolysis, hydrolysis, electrolysis, and photolysis.
  • Examples of such a protecting group include an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms; an alkenyl group having 2 to 6 carbon atoms; an alkynyl group having 2 to 6 carbon atoms; an acyl group; a tetrahydropyranyl group or a tetrahydrothiopyranyl group.
  • “Hydroxyl protecting group” refers to a protecting group usually used in organic synthetic chemistry (particularly, nucleic acid synthesis), such as an aliphatic acyl group; an aromatic acyl group; an optionally substituted aminocarbonyl group; An aliphatic sulfonyl group; an aromatic sulfonyl group; a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups; an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms; an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms; a halogen atom And / or a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups substituted with a cyano group; or a silyl group.
  • benzyl (Bn) group 4,4′-dimethoxytrityl (DMTr) group, 4-methoxytrityl group, triphenylmethyl group, 2-naphthylmethyl group, diphenylaminocarbonyl (DPC) group, cyanoethoxy.
  • DMTr 4,4′-dimethoxytrityl
  • DPC diphenylaminocarbonyl
  • 4-methoxybenzyl (p-methoxybenzyl) group 3,4-dimethoxybenzyl group, 2,6-dimethoxybenzyl group, p-phenylbenzyl group, methanesulfonyl group, trifluoromethan
  • benzyl (Bn) group 4,4′-dimethoxytrityl (DMTr) group, t-butyldimethylsilyl group, t-butyldiphenylsilyl group, trimethylsilyl (TMS) group, diphenylaminocarbonyl (DPC) group, methanesulfonyl Group, trifluoromethanesulfonyl group is preferred.
  • DMTr 4,4′-dimethoxytrityl
  • t-butyldimethylsilyl group t-butyldiphenylsilyl group
  • TMS trimethylsilyl
  • DPC diphenylaminocarbonyl
  • methanesulfonyl Group trifluoromethanesulfonyl group is preferred.
  • the “hydroxyl group which may be substituted with one or more substituents” includes a hydroxyl group which may have a protecting group, and the substituent includes, for example, the above-mentioned hydroxyl-protecting group, A C 1-6 alkyl group, an optionally substituted aryl group, an optionally substituted heteroaryl group, and preferred hydroxyl protecting groups include a Bn group, a DPC group, a DMTr group, a 4-methoxytrityl group, Triphenylmethyl group, 2-naphthylmethyl group, cyanoethoxycarbonyl group, tetrahydropyranyl group, trimethylsilyl group, triethylsilyl group, triisopropylsilyl group, t-butyldimethylsilyl group, t-butyldiphenylsilyl group, trimethylsilyl group, 4-methoxybenzyl group, 3,4-dimethoxybenzyl group,
  • the aryl group which may be substituted and the substituent of the heteroaryl group which may be substituted include a halogen atom, a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a hydroxyl group A C 1-6 alkoxy group, an aryloxy group, an amino group, a nitro group, a trifluoromethyl group, a phenyl group, and the like, which may be substituted with one or more of these groups.
  • “Amino group protecting group” refers to a protecting group usually used in organic synthetic chemistry (particularly, nucleic acid synthesis), such as an aliphatic acyl group; an aromatic acyl group; an optionally substituted alkoxycarbonyl group; And a methyl group substituted with 3 aryl groups; a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups substituted with a halogen atom and / or a cyano group.
  • acetyl (Ac) group phenoxyacetyl (Pac) group, propionyl group, isobutyryl group, benzoyl (Bz) group, methoxycarbonyl group, ethoxycarbonyl group, t-butoxycarbonyl (Boc) group, trimethylsilylethoxycarbonyl.
  • Teoc cyanoethoxycarbonyl
  • Ceoc cyanoethoxycarbonyl
  • Cbz benzyloxycarbonyl
  • Fmoc 9-fluorenylmethoxycarbonyl
  • 2,2,2-trichloroethoxycarbonyl group 2,2,2-trichloroethoxycarbonyl group
  • t -Amyloxycarbonyl group 4-methoxybenzyl group, triphenylmethyl group, 2-nitrobenzenesulfonyl group, 2,4-dinitrobenzenesulfonyl group, 2- (trimethylsilyl) ethoxymethyl group, and the like. Not a constant.
  • an isobutyryl group a benzoyl (Bz) group, a t-butoxycarbonyl (Boc) group, and a trimethylsilylethoxycarbonyl (Teoc) group are preferable.
  • amino group which may be substituted with one or more substituents includes an amino group which may have a protecting group, and the substituent includes, for example, the above amino group.
  • Preferred amino protecting groups include a Bn group, a DPC group, a DMTr group, 4- Methoxytrityl group, triphenylmethyl group, 2-naphthylmethyl group, cyanoethoxycarbonyl group, tetrahydropyranyl group, trimethylsilyl group, triethylsilyl group, triisopropylsilyl group, t-butyldimethylsilyl group, t-butyldiphenylsilyl group , Trimethylsilyl group, 4-methoxybenzyl group, 3,4-dimethoxybenzyl group, benzoyl (Bz) group, acetyl group
  • preferred C 1-6 alkyl groups are methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, sec-butyl, t-butyl, pentyl, isopentyl, and preferred aryl groups.
  • Is a phenyl group, biphenyl group, naphthyl group, anthracenyl group, and preferred heteroaryl groups are pyridyl group, pyrimidinyl group, pyridazinyl group, pyrrolyl group, isoquinolyl group, quinolyl group, indolyl group, imidazolyl group, benzimidazolyl group , Triazolyl group, furyl group, thienyl group and the like.
  • a halogen atom a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group
  • substituent of the aryl group which may be substituted or the heteroaryl group which may be substituted a halogen atom, a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group
  • examples thereof include a hydroxyl group, a C 1-6 alkoxy group, an aryloxy group, an amino group, a nitro group, a trifluoromethyl group, and a phenyl group, which may be substituted with one or more of these groups.
  • the “protecting group for a phosphate group” refers to a protecting group usually used in organic synthetic chemistry (particularly, nucleic acid synthesis).
  • the “protecting group for mercapto group” refers to a protecting group usually used in organic synthetic chemistry (particularly, nucleic acid synthesis), and examples thereof include an aliphatic acyl group, an aromatic acyl group, and a benzoyl (Bz) group. It is not limited to these.
  • the term “leaving group” refers to a portion of a substrate molecule having an electron pair when cleaved by heterolytic cleavage during the reaction, such as a halogen atom (eg, fluorine Atom, chlorine atom, bromine atom, iodine atom) and “hydroxyl leaving group”.
  • a halogen atom eg, fluorine Atom, chlorine atom, bromine atom, iodine atom
  • hydroxyl leaving group include a sulfonyloxy group (eg, p-toluenesulfonyloxy group, mesyloxy group, trifluoromethanesulfonyloxy group), an acyloxy group (preferably a saturated or unsaturated acyloxy group having 1 to 8 carbon atoms).
  • R L is an aryl group which may be substituted with an alkyl group (preferably having a total carbon number of 6 to 8, A phenyl group, a p-tolyl group, etc.), an aryloxy group optionally substituted with an alkyl group (preferably having a total carbon number of 6-8, such as a phenoxy group, a p-tolyloxy group, etc.), an aralkyl group (preferably total A carbon number of 7 to 9, such as a benzyl group, an arylalkenyl group (preferably a total carbon number of 8 or 9, such as a cinnamyl group)
  • Aralkyloxy group (total carbon number 7-15, such as benzyloxy group, 9-fluorenylmethyloxy group, etc.), alkoxy group (straight chain or branched alkoxy group having 1-8 carbon atoms, For example, a methoxy group, an e
  • Specific examples include an iodo atom, a bromo atom, a chloro atom, a fluoro atom, a mesyloxy group, a methanesulfonyloxy group, and trifluoromethanesulfonyl.
  • Examples of a preferable leaving group include a methanesulfonyloxy group (mesyloxy group; Ms—O—), trifluoromethyl group, and the like. Examples thereof include a tansulfonyloxy group and a p-toluenesulfonyloxy group.
  • a hydroxyl group refers to phosphoric acid, phosphorous acid, or hypophosphorous acid which may have a substituent (which includes a protecting group).
  • a hydroxyl group includes a phosphate group of the formula -P (R P1) R P2, wherein, R P1 and R P2 are protected with independently, a hydroxyl group, the protecting group of the nucleic acid synthesis, Mercapto group, mercapto group protected with a protecting group for nucleic acid synthesis, amino group, alkoxy group having 1 to 5 carbon atoms, alkylthio group having 1 to 6 carbon atoms, cyanoalkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, or 1 carbon atom Represents an amino group substituted with an alkyl group of 1 to 6.
  • R P1a represents an alkyl group having 1 to 5 carbon atoms and a cyanoalkyl group having 1 to 6 carbon atoms
  • R P2a represents an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms
  • specific examples of the “phosphoramidite group” include: A group represented by the formula —P (O (CH 2 ) 2 CN) (N (iPr) 2 ) or a group represented by the formula —P (OCH 3 ) (N (iPr) 2 )
  • iPr represents an isopropyl group.
  • the term “optionally substituted thiophosphate group” includes a thiophosphate group which may have a substituent (which includes a protecting group).
  • a substituent which includes a protecting group
  • it includes a phosphate group represented by the formula —P ( ⁇ S) (R P3 ) R P4 , wherein R P3 and R P4 are each independently protected with a hydroxyl group or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • a hydroxyl group, a mercapto group, a mercapto group protected with a protecting group for nucleic acid synthesis an amino group, an alkoxy group having 1 to 5 carbon atoms, an alkylthio group having 1 to 6 carbon atoms, a cyanoalkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, Alternatively, it represents an amino group substituted with an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
  • examples of the term “acyl group” include aliphatic acyl groups and aromatic acyl groups.
  • examples of the aliphatic acyl group include formyl group, acetyl group, propionyl group, butyryl group, isobutyryl group, pentanoyl group, pivaloyl group, valeryl group, isovaleryl group, octanoyl group, nonanoyl group, decanoyl group, 3-methylnonanoyl group, 8-methylnonanoyl group, 3-ethyloctanoyl group, 3,7-dimethyloctanoyl group, undecanoyl group, dodecanoyl group, tridecanoyl group, tetradecanoyl group, pentadecanoyl group, hexadecanoyl group, 1-methylpentadecanoyl group, 14-methylpentadecanoyl group, 13,13-
  • aromatic acyl group examples include arylcarbonyl groups such as benzoyl group, ⁇ -naphthoyl group and ⁇ -naphthoyl group; halogenoarylcarbonyl groups such as 2-bromobenzoyl group and 4-chlorobenzoyl group; 2 , 4,6-trimethylbenzoyl group, arylcarbonyl group substituted with an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms such as 4-toluoyl group; substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms such as 4-anisoyl group A carboxylated arylcarbonyl group such as a 2-carboxybenzoyl group, a 3-carboxybenzoyl group and a 4-carboxybenzoyl group; a nitrated arylcarbonyl group such as a 4-nitrobenzoyl group and a 2-nitrobenzoyl group ; From 1 carbon atom such as 2- (methoxycarbonyl
  • aralkyl group is substituted with an aromatic hydrocarbon group (for example, a 6 to 14-membered monocyclic, bicyclic or tricyclic aromatic hydrocarbon group).
  • Specific examples include, but are not limited to, a benzyl group, a phenethyl group, a 1-naphthylmethyl group, and a 2-naphthylmethyl group.
  • the tetrahydropyranyl group or the tetrahydrothiopyranyl group includes a tetrahydropyran-2-yl group, a 3-bromotetrahydropyran-2-yl group, a 4-methoxytetrahydropyran-4-yl group, a tetrahydro Examples thereof include, but are not limited to, a thiopyran-4-yl group and a 4-methoxytetrahydrothiopyran-4-yl group.
  • tetrahydrofuranyl group or the tetrahydrothiofuranyl group include, but are not limited to, a tetrahydrofuran-2-yl group and a tetrahydrothiofuran-2-yl group.
  • sil group examples include trimethylsilyl group, triethylsilyl group, isopropyldimethylsilyl group, t-butyldimethylsilyl group, methyldiisopropylsilyl group, methyldi-t-butylsilyl group, and triisopropylsilyl group.
  • a silyl group substituted with an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms such as t-butyldiphenylsilyl group, diphenylmethylsilyl group, butyldiphenylbutylsilyl group, diphenylisopropylsilyl group, phenyldiisopropylsilyl group
  • Examples include, but are not limited to, a silyl group substituted with three alkyl groups having 1 to 6 carbon atoms substituted with two aryl groups, and a triphenylsilyl group.
  • methyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms includes a methoxymethyl group, 1,1-dimethyl-1-methoxymethyl group, ethoxymethyl group, propoxymethyl group, Examples thereof include, but are not limited to, propoxymethyl group, butoxymethyl group, t-butoxymethyl group and the like.
  • examples of the term “methyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms” include 2-methoxyethoxymethyl group. It is not limited to.
  • methyl group substituted with a C 1-6 alkoxy group substituted with a halogen atom includes 2,2,2-trichloroethoxymethyl group, bis (2-chloroethoxy) methyl Groups and the like, but are not limited thereto.
  • ethyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms include, but are not limited to, 1-ethoxyethyl group, 1- (isopropoxy) ethyl group, and the like.
  • ethyl group substituted by a halogen atom examples include, but are not limited to, 2,2,2-trichloroethyl group and the like.
  • methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups includes benzyl group, ⁇ -naphthylmethyl group, ⁇ -naphthylmethyl group, diphenylmethyl group, triphenylmethyl group, 4, Examples thereof include, but are not limited to, 4′-dimethoxytrityl group, 4-methoxytrityl group, trityl group, ⁇ -naphthyldiphenylmethyl group, 9-anthrylmethyl group and the like.
  • a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups substituted with a C 1-6 alkyl group, a C 1-6 alkoxy group, a halogen atom and / or a cyano group As 4-methylbenzyl, 2,4,6-trimethylbenzyl, 3,4,5-trimethylbenzyl, 4-methoxybenzyl, 4-methoxyphenyldiphenylmethyl, 4,4'-dimethoxytri Examples thereof include, but are not limited to, phenylmethyl group, 2-nitrobenzyl group, 4-nitrobenzyl group, 4-chlorobenzyl group, 4-bromobenzyl group, 4-cyanobenzyl group and the like.
  • carbonyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms includes a methoxycarbonyl group, an ethoxycarbonyl group, a t-butoxycarbonyl group, an isobutoxycarbonyl group, a Teoc group, a Ceoc group, Examples include, but are not limited to, Fmoc group.
  • halogen atom, aryl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms and / or a nitro group includes a 4-chlorophenyl group, a 2-fluorophenyl group, a 4-methoxyphenyl group, Examples thereof include, but are not limited to, a 4-nitrophenyl group and a 2,4-dinitrophenyl group.
  • carbonyl group substituted with a C 1-6 alkoxy group substituted with a halogen atom and / or a silyl group substituted with 3 C 1-6 alkyl groups 2,2,2-trichloroethoxycarbonyl group, 2-trimethylsilylethoxycarbonyl group and the like, but are not limited thereto.
  • alkenyloxycarbonyl group examples include, but are not limited to, a vinyloxycarbonyl group and an allyloxycarbonyl group.
  • aralkyloxycarbonyl group optionally substituted with an aryl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms and / or a nitro group includes a benzyloxycarbonyl group, 4-methoxybenzyloxy Examples include, but are not limited to, a carbonyl group, a 3,4-dimethoxybenzyloxycarbonyl group, a 2-nitrobenzyloxycarbonyl group, and a 4-nitrobenzyloxycarbonyl group.
  • unsaturated heterocycle includes an unsaturated aliphatic heterocyclic group or an aromatic heterocyclic group.
  • An unsaturated aliphatic heterocyclic group is the same or different 1 to 3 having at least one double bond in the ring and independently selected from the group consisting of an oxygen atom, a sulfur atom, and a nitrogen atom.
  • the unsaturated aliphatic heterocyclic group is, for example, a 4- to 8-membered ring, preferably a 5- to 7-membered ring, more preferably a 5- or 6-membered ring, and particularly preferably a 6-membered ring.
  • the aromatic heterocyclic group includes, as its heterocyclic moiety, an aromatic group containing the same or different 1 to 3 hetero atoms independently selected from the group consisting of an oxygen atom, a sulfur atom, and a nitrogen atom.
  • a heterocyclic group preferably containing at least one nitrogen atom, and at least one selected from the group consisting of an oxygen atom, a sulfur atom, or a nitrogen atom (preferably 1-2)
  • An aromatic heterocyclic group which may contain a hetero atom, which may be the same or different in the case of two or more, and one is particularly preferred.
  • the aromatic heterocyclic group is, for example, a 4- to 8-membered ring, preferably a 5- to 7-membered ring, more preferably a 5- or 6-membered ring, and particularly preferably a 6-membered ring.
  • a pyrrolyl group a furanyl group, a thienyl group, a pyridinyl group, a pyrimidinyl group, and a pyridazinyl group.
  • a pyrimidinyl group Particularly preferred is a pyrimidinyl group.
  • the unsaturated heterocycle may be optionally substituted with a substituent.
  • substituents include an optionally substituted C 1-6 alkyl group, an optionally substituted C 2-6 alkenyl group, Examples thereof include an optionally substituted C 2-6 alkynyl group, an optionally substituted amino group, an optionally substituted hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, or a halogen atom, and preferably an optionally substituted C 1-1 Examples include, but are not limited to, 6 alkyl groups, oxo groups, or thioxo groups.
  • the unsaturated heterocycle may be further condensed with another ring.
  • Other rings that can be fused include saturated or unsaturated non-aromatic carbocycles, aromatic carbocycles, saturated or unsaturated non-aromatic heterocycles, or aromatic heterocycles, but aromatic rings Or an aromatic heterocycle is preferable.
  • the saturated carbocycle refers to an alkane that forms a ring, such as the cycloalkane having 3 to 6 carbon atoms.
  • the unsaturated non-aromatic non-aromatic carbocyclic ring refers to an alkene forming a ring, for example, the above-mentioned cyclic alkene having 3 to 6 carbon atoms.
  • the aromatic carbocycle (also referred to as aryl) includes, for example, a 6 to 14-membered monocyclic, bicyclic or tricyclic aromatic hydrocarbon group. Specific examples include benzene, naphthalene, Examples include, but are not limited to, phenanthrene or anthrene.
  • the saturated or unsaturated non-aromatic heterocycle is independently selected from the group consisting of an oxygen atom, a sulfur atom, and a nitrogen atom, which may have at least one double bond in the ring. Saturated 5- to 14-membered monocyclic or bicyclic non-aromatic heterocycle containing 3 heteroatoms.
  • azetidine pyrrolidine, pyrazolidine, piperidine, piperazine, morpholine, thiomorpholine, homopiperidine, oxazolidine, isoxazolidine, thiazolidine, isothiazolidine, imidazolidine, imidazoline, tetrahydrofuran, dihydrofuran, tetrahydrothien, dihydrothien, dihydro Examples include, but are not limited to, pyran, tetrahydropyran, indoline, isoindoline, chroman, isochroman, dihydrobenzofuran, dihydrofuropyridine and dihydrobenzothien.
  • the 5- to 7-membered unsaturated heterocycle in the “optionally substituted 5- to 7-membered unsaturated heterocycle” as “ring A” contains two or more nitrogen atoms, and one As long as the above oxygen atom is substituted, it may be a base portion of a nucleic acid in the term “base portion of a nucleic acid that may have a substituent” described in the present specification.
  • Natural nucleobases as well as ring portions derived from non-natural nucleobases, such as adenine, guanine derived purine rings or derivatives thereof, or pyrimidine mono or dione rings derived from uracil, cytosine, thymine or derivatives thereof Preferred examples include, but are not limited to, thyminyl or uracinyl. As a substituent, it is synonymous with the case of the definition of the said unsaturated heterocycle.
  • Preferred substituents for ring A include a C 1-6 alkyl group which may be substituted with one or more substituents, a C 2-6 alkenyl group which may be substituted with one or more substituents, one or more A C 2-6 alkynyl group that may be substituted with one or more substituents, an amino group that may be substituted with one or more substituents, a hydroxyl group that may be substituted with one or more substituents, an oxo group, a thioxo group , And a halogen atom, but is not limited thereto.
  • Ring A ′ which is an unsaturated heterocycle, is condensed with a tetrahydrofuran ring and an oxazolidine ring to form a polycyclic structure.
  • Ring A ′ is not particularly limited as long as it is an unsaturated heterocycle containing two or more nitrogen atoms, but is preferably an “optionally substituted 5- to 7-membered unsaturated heterocycle”.
  • the unsaturated heterocycle may be further condensed with another ring.
  • Preferred substituents for ring A ′ include a C 1-6 alkyl group which may be substituted with one or more substituents, a C 2-6 alkenyl group which may be substituted with one or more substituents, one C 2-6 alkynyl group which may be substituted with the above substituents, amino group which may be substituted with one or more substituents, hydroxyl group which may be substituted with one or more substituents, oxo group, thioxo A group and a halogen atom, but not limited thereto.
  • Ring A is not particularly limited as long as it is an unsaturated heterocycle containing two or more nitrogen atoms, but is preferably an optionally substituted 5- to 7-membered unsaturated heterocycle, and an optionally substituted pyrimidine More preferred is a ring, and most preferred is thyminyl or uracinyl.
  • the unsaturated heterocycle may be further condensed with another ring.
  • base portion of a nucleic acid in the term “base portion of a nucleic acid that may have a substituent” includes a base portion of a natural nucleic acid and a base portion of a non-natural nucleic acid, and is aromatic. It includes heterocyclic groups, and includes, for example, monocyclic groups, bicyclic groups, tricyclic groups, and the like. It should be apparent to those skilled in the art that the base portions of various nucleic acids previously considered to be “non-natural” are subsequently found in nature. Accordingly, the “base portion of nucleic acid” includes not only known purine and pyrimidine heterocycles, but also heterocyclic analogs and tautomers thereof.
  • the base portion of the nucleic acid include adenyl, guanylyl, thyminyl, cytosynyl, uracinyl, purinyl, xanthinyl, diaminopurinyl, 8-oxo-N 6 -methyladenynyl, 7-deazaxanthinyl, 7-deazaguaninyl, N 4 , N 4 -ethanocytosinyl, N 6 , N 6 -ethano-2,6-diaminopurinyl, 5-methylcytosinyl, 5- (C 3 -C 6 ) -alkynylcytosinyl, 5-fluorocytosinyl, 5-bromouracinyl, pseudoephedrine iso cytosine sulfonyl, 2-hydroxy-5-methyl-4-triazolopyrimidine pyridinylcarbonyl, Isoshitoshiniru, Iso
  • Preferred base parts of nucleic acids include, for example, adeninyl, guaninyl, 2,6-diaminopurinyl, thyminyl, 2-thiothyminyl, cytosynyl, 5-methylcytosynyl, uracinyl, 5-fluorocytosynyl, xanthinyl, 6-aminopurinyl, 2-aminopurinyl , 6-chloro-2-amino-purinyl, and 6-chloropurinyl, and particularly preferred nucleobase moieties include, for example, adeninyl, guaninyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl, thyminyl, or uracinyl.
  • the base portion of these nucleic acids may further have one or more substituents.
  • substituents include a hydroxyl group, a C 1-6 alkoxy group, a mel group, a C 1-6 alkylthio group. group, an amino group, an amino group substituted with an alkyl group of C 1-6, alkyl group of C 1-6, alkynyl group of C 1-6 and, oxo group, thioxo group, and a halogen atom.
  • Functional oxygen, sulfur and nitrogen groups on the base moiety can be protected and / or deprotected if necessary or desired.
  • Suitable protecting groups are well known to those skilled in the art, and include, for example, the hydroxyl protecting groups and amino protecting groups described above, and include diphenylaminocarbonyl groups, silyl groups (eg, trimethylsilyl group, dimethylhexylsilyl group).
  • t-butyldimethylsilyl group, and t-butyldiphenylsilyl group trityl group, alkyl group, acyl group (for example, acetyl group, propionyl group, isobutyryl group, benzoyl (Bz) group, phenoxyacetyl (Pac) group) ), Alkoxycarbonyl groups (for example, t-butoxycarbonyl (Boc) group, benzyloxycarbonyl (Cbz) group, diphenylaminocarbonyl (DPC) group, cyanoethoxycarbonyl (Ceoc) group), sulfonyl groups (for example, methanesulfonyl group) And p-toluenesulfo Le group) and the like, but not limited thereto.
  • acyl group for example, acetyl group, propionyl group, isobutyryl group, benzoyl (Bz)
  • the "azido agent" in the present invention a reagent for adding an azide group, for example hydrogen azide, sodium azide, lithium azide, tetrabutylammonium azide (nBu 4 NN 3), trimethylsilyl azide, diphenylphosphoryl Azide (DPPA), nicotinyl azide, and zinc azide (Zn (N 3 ) 2 ) are preferable, and tetrabutylammonium azide, sodium azide, and diphenylphosphoryl azide (DPPA) are more preferable.
  • an azide group for example hydrogen azide, sodium azide, lithium azide, tetrabutylammonium azide (nBu 4 NN 3), trimethylsilyl azide, diphenylphosphoryl Azide (DPPA), nicotinyl azide, and zinc azide (Zn (N 3 ) 2 ) are preferable, and tetrabutylammonium azide, sodium azide, and dipheny
  • hydroxyl activator refers to a reagent that activates an unprotected hydroxyl group and enhances the elimination ability.
  • a methanesulfonylating agent a trifluoromethanesulfonylating agent, an ethanesulfonylating agent, 2, 2, 2-trifluoroethanesulfonylating agent, propanesulfonylating agent, iso-propanesulfonylating agent, butanesulfonylating agent, nonafluorobutanesulfonylating agent, heptafluoropropane-1-sulfonylating agent, pentanesulfonylating agent, Pentafluoroethanesulfonylating agent, cyclopentanesulfonylating agent, hexanesulfonylating agent, cyclohexanesulfonylating agent, o-to
  • the “reducing agent” is preferably a phosphine such as trialkylphosphine or triarylphosphine, a metal hydride, a transition metal catalyst in the presence of hydrogen gas, etc., and triphenylphosphine, tributylphosphine, lithium aluminum More preferred are hydride, sodium borohydride, nickel borohydride, palladium carbon in the presence of hydrogen gas or palladium hydroxide in the presence of hydrogen gas.
  • the “phosphoramidite method” is a solid phase synthesis method of a nucleic acid using a nucleotide monomer that is a phosphoramidite.
  • a nucleotide monomer that is a phosphoramidite.
  • the “phosphoramidite method” includes a step of coupling a phosphoramidite monomer with a hydroxyl group protected using a tetrazole compound, an imidazole compound, or the like, followed by oxidation or oxidative sulfuration to form a phosphorodiester bond.
  • the “phosphoramidite method” preferably uses a phosphoramidite monomer which is at least one kind of cross-linked nucleic acid, and more preferably the cross-linked nucleic acid is GuNA.
  • substitution of ring A with B means that ring A bonded to the sugar moiety of the nucleic acid is dissociated from the sugar moiety and replaced with B which is the base moiety of the nucleic acid which may be substituted with one or more substituents.
  • Ring A bonded to the sugar moiety of the nucleic acid is dissociated by treatment with a Lewis acid, and B is bonded to the sugar moiety of the nucleic acid from which ring A has been dissociated.
  • Lewis acids used for dissociation include, but are not limited to, TMSOTf and TBSOTf.
  • Silylating agents can be used to facilitate the transglycosylation reaction. Examples of the silylating agent include, but are not limited to, BSA and hexamethyldisilazane. This transglycosylation reaction is preferably carried out in one step.
  • B may be provided in any reactant that can be substituted, and the reactant is preferably a “nucleobase”.
  • “Nucleobase” includes not only known purine and pyrimidine heterocycles, but also heterocyclic analogs and tautomers thereof.
  • nucleobases include adenine, guanine, thymine, cytosine, uracil, purine, xanthine, diaminopurine, 8-oxo-N 6 -methyladenine, 7-deazaxanthine, 7-deazaguanine, N 4 , N 4 -Ethanocytosine, N 6 , N 6 -ethano-2,6-diaminopurine, 5-methylcytosine, 5- (C 3 -C 6 ) -alkynylcytosine, 5-fluorocytosine, 5-bromouracil, pseudoisocytosine, 2-hydroxy-5-methyl-4-triazolopyridine, isocytosine, isoguanine, inosine, N 6 - allyl purine, N 6 - Ashirupurin, N 6 - benzylpurine, N 6 - Haropurin, N 6 - vinyl purine, N 6 - acet
  • Preferred nucleobases include, for example, adenine, guanine, 2,6-diaminopurine, thymine, 2-thiothymine, cytosine, 5-methylcytosine, uracil, 5-fluorocytosine, xanthine, 6-aminopurine, 2-aminopurine, Examples include 6-chloro-2-amino-purine, and 6-chloropurine.
  • Particularly preferred nucleobases include, for example, adenine, guanine, cytosine, 5-methylcytosine, thymine, or uracil.
  • nucleobases may further have one or more substituents, and examples of the substituent include a hydroxyl group, a C 1-6 alkoxy group, a melt group, a C 1-6 alkylthio group, amino group, an alkyl group substituted with an amino group of C 1-6, alkyl group of C 1-6, and alkynyl groups of C 1-6, oxo group, thioxo group, and a halogen atom.
  • Functional oxygen, sulfur and nitrogen groups on the nucleobase can be protected and / or deprotected if necessary or desired.
  • Suitable protecting groups are well known to those skilled in the art, and include, for example, the hydroxyl protecting groups and amino protecting groups described above, and include diphenylaminocarbonyl groups, silyl groups (eg, trimethylsilyl group, dimethylhexylsilyl group).
  • nucleobases can be obtained commercially or can be produced by organic synthetic techniques using commercially available starting materials.
  • ⁇ -form refers to the direction in which the base portion of the nucleic acid substituted at the 1′-position of the (deoxy) ribose site of the nucleic acid is substituted and the 5 ′ substituted at the (deoxy) ribose 4′-position of the nucleic acid. 'It refers to those having stereochemistry in which the direction in which the position side chain is substituted is substituted in the same direction.
  • the direction of substitution of the base portion of the nucleic acid substituted at the 1 ′ position of the (deoxy) ribose site of the nucleic acid and the substitution at the 4 ′ position of the (deoxy) ribose of the nucleic acid refers to a compound having a configuration in which the 5 ′ side chain that is not used for crosslinking is substituted in the same direction.
  • ⁇ -form differs in the direction in which the base portion of the nucleic acid substituted at the 1 ′ position of the ribose site of the nucleic acid and the direction in which the 5 ′ side chain substituted at the ribose 4 ′ position of the nucleic acid is substituted. Those with stereochemistry substituted in the other direction.
  • ⁇ selective means that a ⁇ -isomer can be selectively obtained.
  • the content of ⁇ -form relative to the total content of ⁇ -form and ⁇ -form of the product obtained by transglycosylation is selectively obtained at 80% or more, more preferably 90% or more, and most preferably 99% or more. It means being done.
  • artificial nucleic acid includes an artificial nucleoside, an artificial nucleotide (in the present specification, one nucleoside or nucleotide may be described as a monomer), or an artificial oligonucleotide. These artificial nucleic acids are not natural nucleic acids and are nucleic acids that can be produced only artificially.
  • these artificial nucleic acids include those in which the nucleobase part has a non-natural base, those in which the sugar part has a modified sugar, and / or those in which the phosphate part has a non-natural phosphate group,
  • the saccharide moiety has a non-natural saccharide, particularly one having a (deoxy) ribose in which the 2 ′ and 4 ′ carbon atoms are cross-linked.
  • the term “artificial oligonucleotide” refers to two or more of the same or different “artificial nucleotides” linked by a phosphodiester bond or a thiophosphate diester bond, preferably 2 to 100. More preferably, 5 to 50, most preferably 10 to 30 artificial nucleotides bound to each other, or a complementary strand formed with these complementary strands.
  • an oligonucleotide in which two or more nucleotides are bonded may be described as an oligomer.
  • R 1 and R 2 each independently represent a hydroxyl-protecting group
  • R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, or C 1-1 which may be substituted with one or more substituents.
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group, each R 6 is independently a hydrogen atom or 1, one is substituted with or more substituents is also C 1-6 alkyl group, m is an integer of 1 to 3 and ring a may be substituted by one or more substituents C 1- 6 alkyl group, C 2-6 alkenyl group optionally substituted with one or more substituents, C 2-6 alkynyl group optionally substituted with one or more substituents, substituted with one or more substituents An amino group that may be substituted, a hydroxyl group that may be substituted with one or more substituents, an oxo group, a thioxo group, and A 5- to 7-membered unsaturated heterocycle optionally substituted with one or more substituents selected from the group consisting of halogen atoms, and the unsaturated heterocycle is condensed with another ring to form ring A
  • a production method comprising the step of reacting a compound represented by
  • the reducing agent is preferably a phosphine, more preferably triphenylphosphine (Ph 3 P).
  • R 1 and R 2 each independently represent a hydroxyl-protecting group
  • R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, or C 1-1 which may be substituted with one or more substituents.
  • 6 is an alkyl group
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group
  • each R 6 is independently a hydrogen atom or 1
  • one is substituted with or more substituents is also C 1-6 alkyl group
  • m is an integer of 1 to 3 and ring a may be substituted by one or more substituents C 1- 6 alkyl group
  • C 2-6 alkynyl group optionally substituted with one or more substituents
  • substituted with one or more substituents An amino group that may be substituted, a hydroxyl group that may be substituted with one or more substituents, an oxo group, a thio
  • ring A is preferably not thyminyl.
  • a salt thereof is mentioned as a novel intermediate compound.
  • R 1 and R 2 are each independently benzyl (Bn) group, 2-naphthylmethyl group, 4-methoxybenzyl group, 3,4-dimethoxybenzyl group, 2,6 - a dimethoxybenzyl group, or p- phenylbenzyl group
  • R 3, R 4, R 5 and R 6 are each independently a hydrogen atom or one or more C 1-6 alkyl which may be substituted with a substituent
  • ring A is a C 1-6 alkyl group which may be substituted with one or more substituents, a C 2-6 alkenyl group which may be substituted with one or more substituents, one or more A C 2-6 alkynyl group that may be substituted with one or more substituents, an amino group that may be substituted with one or more substituents, a hydroxyl group that may be substituted with one or more substituents, an oxo group, a thioxo group
  • Bn benzyl
  • the compound of general formula I or a salt thereof is of the general formula Ia: In the compound or is preferably (wherein a salt thereof represented, R 1, R 2, R 3, R 4, R 5, R 6, m and ring A have the same meanings as formula I.
  • M 1 or 2
  • R 1 and R 2 are each independently a hydroxyl protecting group
  • a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups may be mentioned.
  • benzyl (Bn) group, 2-naphthylmethyl group, p-methoxybenzyl group, 3,4-dimethoxybenzyl group, 2,6-dimethoxybenzyl group and p-phenylbenzyl group are preferable, and benzyl group is more preferable. .
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are preferably each independently a hydrogen atom.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are C 1-6 alkyl groups optionally substituted with one or more substituents
  • the C 1-6 alkyl group is preferably a methyl group, an ethyl group, a propyl group, an isopropyl group, a butyl group, an isobutyl group, a pentyl group, or a hexyl group, and more preferably a methyl group.
  • the substituent includes a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • One or more (or preferably 1 to 3) groups selected from the group may be the same or different.
  • ring A is preferably a 6-membered unsaturated heterocycle, and the substituent of ring A is substituted with one or more substituents.
  • the substituent is preferably a methyl group or a halogen atom (fluoro atom, chloro atom, bromo atom, etc.).
  • the wavy line in the structural formula II-1 or II-2 Represents the point of attachment of the condensed tetrahydrofuran ring or oxazolidine ring to the rest of the molecule.
  • a preferred compound represented by the general formula II or a salt thereof has the general formula II in which R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are represented by the general formula I (general formula I— two or more of the same meanings as in a), wherein ring A ′ is cleaved by the reduction reaction step of the production method to cleave the oxazolidine ring fused to ring A ′ to form ring A of general formula I
  • a compound or a salt thereof which represents an unsaturated heterocycle containing a nitrogen atom and substituted with one or more oxygen atoms.
  • the general formula II [Wherein R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 and m each have the same meaning as in general formula I, and ring A ′ is substituted with one or more substituents A C 1-6 alkyl group that may be substituted, a C 2-6 alkenyl group that may be substituted with one or more substituents, a C 2-6 alkynyl group that may be substituted with one or more substituents, An amino group that may be substituted with one or more substituents, a hydroxyl group that may be substituted with one or more substituents, an oxo group, a thioxo group, and one or more substituents selected from the group consisting of halogen atoms It is an optionally substituted 5- to 7-membered unsaturated heterocyclic ring, and the unsaturated heterocyclic ring may be condensed with another ring to form a
  • the manufacturing method including the process of making an azidating agent react with the compound represented by these is provided.
  • the azidating agent comprises hydrazoic acid, sodium azide, lithium azide, tetrabutylammonium azide (nBu 4 NN 3 ), trimethylsilyl azide, diphenylphosphoryl azide (DPPA), nicotinyl azide, zinc azide ( Zn (N 3 ) 2 ) is preferred, and diphenylphosphoryl azide (DPPA) is more preferred.
  • the general formula II [Wherein, R 1 and R 2 are independently a protecting group for a hydroxyl group, m is an integer of 1 to 3, and R 3 and R 4 are each independently a hydrogen atom, or one or more substituents.
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more may be substituted with a substituent C 1-6 alkyl group
  • each R 6 are independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group
  • ring a 'is may be substituted by one or more substituents C 1- 6 alkyl group, C 2-6 alkenyl group optionally substituted with one or more substituents, C 2-6 alkynyl group optionally substituted with one or more substituents, substituted with one or more substituents
  • the compound represented by the general formula II or a salt thereof is represented by the general formula II-a: (Wherein R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , m, and ring A ′ are each as defined in formula II). .)
  • R 1 and R 2 are each independently a hydroxyl protecting group
  • a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups may be mentioned.
  • a benzyl group, a 2-naphthylmethyl group, and a 4-methoxybenzyl group are preferable, and a benzyl group is more preferable.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each independently a hydrogen atom.
  • R 3, R 4, R 5 and R 6 is one or more of which may be substituted with a substituent C 1-6 alkyl group
  • the C 1-6 alkyl group is preferably a methyl group, an ethyl group, a propyl group, an isopropyl group, a butyl group, an isobutyl group, a pentyl group, or a hexyl group, and more preferably a methyl group.
  • the substituent includes a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • One or more (or preferably 1 to 3) groups selected from the group may be the same or different.
  • the ring A ′ is preferably a 6-membered unsaturated heterocyclic ring, and the ring A ′ is represented by the structural formula II-1 or II-2. More preferably, the structure is As the substituent for ring A ′, a C 1-6 alkyl group which may be substituted with one or more substituents, a C 2-6 alkenyl group which may be substituted with one or more substituents, one or more One or more (preferably 2 or 3) substituents selected from the group consisting of a C 2-6 alkynyl group, a halogen atom and an oxo group which may be substituted with the above substituents are preferred. A group and a halogen atom (fluoro atom, chloro atom, bromo atom, etc.) are more preferred.
  • the compound represented by the general formula II or a salt thereof is the compound represented by the above general formula II (preferably the compound represented by the general formula II-a or a salt thereof, more preferably ring A ′ is represented by the above general formula a II-1 or formula II or a compound or a salt thereof represented by the general formula II-a having the structure of formula II-2.),
  • R 1 and R 2 are each Bn radical
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each preferably a hydrogen atom
  • ring A ′ is particularly preferably a compound or a salt thereof, which is represented by the following general formula II-1 or II-2.
  • R 1 and R 2 each independently represent a hydroxyl-protecting group
  • R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, or C 1-1 which may be substituted with one or more substituents.
  • 6 is an alkyl group
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group
  • each R 6 is independently a hydrogen atom or 1
  • m is an integer of 1 to 3
  • ring A ′ is a C that is optionally substituted with one or more substituents 1-6 alkyl group, C 2-6 alkenyl group optionally substituted with one or more substituents, C 2-6 alkynyl group optionally substituted with one or more substituents, one or more substituents
  • the compound represented by the general formula III or a salt thereof is represented by the general formula III-a: (Wherein R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , m, and ring A ′ are each as defined in formula III). .)
  • a preferred compound represented by the general formula III (or general formula III-a) or a salt thereof is represented by R 1 , R 2 , R 3 in the general formula III (or general formula III-a).
  • R 4 , R 5 , R 6 and ring A ′ have the same meaning as in general formula II (or general formula II-a), for example, a compound of the above general formula II-1 or II-2 or a salt thereof It is.
  • R 1 and R 2 each independently represent a hydroxyl-protecting group
  • R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, or C 1-1 which may be substituted with one or more substituents.
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group, each R 6 is independently a hydrogen atom or 1, A C 1-6 alkyl group optionally substituted with one or more substituents, X is a leaving group, m is an integer from 1 to 3, and ring A ′ is one or more substituents A C 1-6 alkyl group which may be substituted with, a C 2-6 alkenyl group which may be substituted with one or more substituents, a C 2-6 alkynyl group which may be substituted with one or more substituents An amino group which may be substituted with one or more substituents, a hydroxyl group which may be substituted with one or more substituents, an oxo group A 5- to 7-membered unsaturated heterocycle optionally substituted with one or more substituents selected from the group consisting of a thioxo group, and a halogen atom, and the unsaturated
  • a production method comprising a step of reacting a compound represented by the formula (I) with a hydroxyl group activator to activate an unprotected hydroxyl group substituted on the tetrahydrofuran ring in the general formula V is provided.
  • the hydroxyl group activator is preferably a trifluoromethanesulfonylating agent or a methanesulfonylating agent, more preferably trifluoromethanesulfonyl chloride, methanesulfonyl chloride, or trifluoromethanesulfonic anhydride, and trifluoromethanesulfonyl chloride is Particularly preferred.
  • R 1 and R 2 each independently represent a hydroxyl-protecting group
  • R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, or C 1-1 which may be substituted with one or more substituents.
  • 6 is an alkyl group
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group
  • each R 6 is independently a hydrogen atom or 1
  • X is a leaving group
  • m is an integer from 1 to 3
  • ring A ′ is one or more substituents
  • the compound represented by the general formula IV or a salt thereof is represented by the general formula IV-a: Or a salt thereof (wherein R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , X, m, and ring A ′ are each as defined in formula IV). .)
  • the compound represented by the general formula IV or a salt thereof has the general formula IV (preferably the general formula IV-a), wherein R 1 and R 2 are each a Bn group, and R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each preferably a hydrogen atom, and the ring A ′ is more preferably the ring A ′ represented by the general formula II-1 or II-2.
  • the above substituents may be included, and as the substituent, a methyl group and a halogen atom (a fluoro atom, a chloro atom, a bromo atom, etc.) are preferable.
  • the leaving group as X is preferably a mesyloxy (Ms—O—) group.
  • R 1 and R 2 each independently represent a hydroxyl-protecting group
  • R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, or C 1-1 which may be substituted with one or more substituents.
  • 6 is an alkyl group
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group
  • each R 6 is independently a hydrogen atom or 1
  • X is a leaving group
  • m is an integer from 1 to 3
  • ring A is one or more substituents
  • the compound represented by the general formula V or a salt thereof is represented by the general formula Va: (Wherein, R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , X, m, and ring A are each as defined in General Formula V). is there.).
  • R 1 and R 2 are each independently a hydroxyl protecting group
  • a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups may be mentioned.
  • a benzyl group, a 2-naphthylmethyl group, and a 4-methoxybenzyl group are preferable, and a benzyl group is more preferable.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each independently a hydrogen atom.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are C 1-6 alkyl groups optionally substituted by one or more substituents
  • the C 1-6 alkyl group is preferably a methyl group, an ethyl group, a propyl group, an isopropyl group, a butyl group, an isobutyl group, a pentyl group, or a hexyl group, and more preferably a methyl group.
  • the substituent includes a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • One or more (or preferably 1 to 3) groups selected from the group may be the same or different.
  • the leaving group as X is preferably a mesyloxy (Ms—O—) group.
  • ring A is preferably a 6-membered unsaturated heterocycle, and the substituent of ring A includes a C 1-6 alkyl group, C 2 -2 Examples thereof include one or more (preferably 2 or 3) substituents selected from the group consisting of a 6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a halogen atom and an oxo group. More preferably, ring A is thyminyl or uracinyl. The substituent is preferably a methyl group or a halogen atom (fluoro atom, chloro atom, bromo atom, etc.).
  • the compound represented by formula V, said formula V (preferably, formula V-a), R 1 and R 2 are each Bn group, R 3, R 4 , R 5 and R 6 are each preferably a hydrogen atom, and ring A is particularly preferably a compound or a salt thereof, wherein thyminyl or uracinyl.
  • R 1 and R 2 each independently represent a hydroxyl-protecting group
  • R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, or C 1-1 which may be substituted with one or more substituents.
  • 6 is an alkyl group
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group
  • each R 6 is independently a hydrogen atom or 1
  • m is an integer of 1 to 3
  • ring A ′ is C 1 optionally substituted with one or more substituents.
  • the manufacturing method including the process of making an azidating agent react with the compound represented by these is provided.
  • the azidating agent is preferably nBu 4 NN 3 or sodium azide.
  • the preferred compound represented by general formula II or a salt thereof, and the compound represented by general formula IV or a salt thereof are each as described elsewhere herein.
  • R 1 and R 2 are each a Bn group, and R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each a hydrogen atom.
  • X is a mesyloxy (Ms—O—) group
  • ring A ′ is the general formula II-1 or II-2
  • the azidating agent is nBu 4 NN 3 or sodium azide .
  • R 1 and R 2 each independently represent a hydroxyl-protecting group
  • R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, or C 1-1 which may be substituted with one or more substituents.
  • 6 is an alkyl group
  • each R 5 is independently hydrogen atom or one or more substituents which may be substituted with C 1-6 alkyl group
  • each R 6 is independently a hydrogen atom or 1
  • m is an integer of 1 to 3
  • ring A ′ is C 1 optionally substituted with one or more substituents.
  • a production method comprising a step of reacting a compound represented by the formula (I) with a hydroxyl group activator to activate an unprotected hydroxyl group substituted on the tetrahydrofuran ring in the general formula VI is provided.
  • the hydroxyl group activator is preferably a trifluoromethanesulfonylating agent or a methanesulfonylating agent, more preferably trifluoromethanesulfonyl chloride, methanesulfonyl chloride, or trifluoromethanesulfonic anhydride, and trifluoromethanesulfonyl chloride is Particularly preferred.
  • preferred compounds of formula II or salts thereof are as described elsewhere herein.
  • R 1 and R 2 are each a Bn group, and R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each a hydrogen atom.
  • ring A is thyminyl or uracinyl
  • ring A ′ is the general formula II-1 or II-2
  • the hydroxyl activator is trifluoromethanesulfonyl chloride.
  • preferred compounds of the general formula VI or salts thereof are those of the general formula VI-a: It is preferable that
  • preferred compounds of the general formula VI are those wherein R 1 and R 2 are a Bn group, R 3 , R 4 , R 5 and R 6 is a hydrogen atom and ring A is thyminyl or uracinyl or a salt thereof.
  • preferred compounds of formula II or salts thereof are as described elsewhere herein.
  • the general formula VIII [Wherein, B is a base moiety of a nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 and R 4 may each independently be substituted with a hydrogen atom, or one or more substituents.
  • a C 1-6 alkyl group each R 5 is independently hydrogen atom or one or more may be substituted with a substituent C 1-6 alkyl group, each R 6 is independently hydrogen An atom, or a C 1-6 alkyl group that may be substituted with one or more substituents, R 12 and R 13 are each independently a hydrogen atom or a hydroxyl-protecting group, and m is 1 to 3 Is an integer.
  • An optionally substituted C 2-6 alkynyl group, an amino group optionally substituted with one or more substituents, a hydroxyl group optionally substituted with one or more substituents, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom A 5- to 7-membered unsaturated heterocycle which may be substituted with one or more substituents selected from the group consisting of, and the unsaturated heterocycle is condensed with another ring to form ring A Also good.
  • the manufacturing method including the process of substituting the ring A of the compound represented by B to B is provided.
  • the Lewis acid used in the ring A substitution reaction is preferably TMSOTf.
  • a silylating agent may be used to promote the substitution reaction, and the silylating agent is preferably BSA.
  • the general formula VIII [Wherein, B is a base moiety of a nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and R 3 and R 4 may each independently be substituted with a hydrogen atom, or one or more substituents.
  • a C 1-6 alkyl group each R 5 is independently hydrogen atom or one or more may be substituted with a substituent C 1-6 alkyl group, each R 6 is independently hydrogen An atom, or a C 1-6 alkyl group that may be substituted with one or more substituents, R 12 and R 13 are each independently a hydrogen atom or a hydroxyl-protecting group, and m is 1 to 3 Is an integer.
  • ring A is preferably not thyminyl.
  • a salt thereof is mentioned as a novel intermediate compound.
  • the compound represented by the general formula VIII or a salt thereof is represented by the general formula VIII-a: Or a salt thereof.
  • R 4 and R 6 are hydrogen atoms
  • ring A is preferably not thyminyl.
  • B is a base moiety of a nucleic acid that may be substituted with one or more substituents
  • R 3 , R 4 , R 5 , R 6 are Each independently a hydrogen atom, or a C 1-6 alkyl group optionally substituted with one or more substituents
  • R 12 is a Bn group, a DMTr group, or a TMS group
  • R 13 is a Bn group , A hydrogen atom, or a TMS group, or a salt thereof.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each independently a hydrogen atom.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are C 1-6 alkyl groups optionally substituted by one or more substituents
  • the C 1-6 alkyl group is preferably a methyl group, an ethyl group, a propyl group, an isopropyl group, a butyl group, an isobutyl group, a pentyl group, or a hexyl group, and more preferably a methyl group.
  • the substituent includes a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • One or more (or preferably 1 to 3) groups selected from the group may be the same or different.
  • B is a base portion of a nucleic acid, preferably a base portion of a natural nucleic acid and a base portion of a non-natural nucleic acid, and a purine derived from adenine or guanine.
  • a ring or a derivative thereof, or a mono- or dione ring of a pyrimidine derived from uracil, cytosine or thymine or a derivative thereof is more preferable, and adenylyl, guaninyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl, thyminyl or uracinyl is particularly preferable.
  • the base portion of the nucleic acid may have one or more substituents, and preferred substituents include a hydroxyl group, a C 1-6 alkoxy group, a mercapto group, a C 1-6 alkylthio group, an amino group, a C 1-1 An amino group substituted with a 6 alkyl group, a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom are preferred, a C 1-6 alkyl group, And more preferably one or more (preferably 2 or 3) substituents selected from the group consisting of oxo groups.
  • the hydroxyl group, amino group, and thiol group in the base portion of the nucleic acid may be protected, and the protecting group is preferably a hydroxyl protecting group or an amino protecting group usually used in nucleic acid synthesis, such as an acetyl group or a phenoxyacetyl group.
  • the protecting group is preferably a hydroxyl protecting group or an amino protecting group usually used in nucleic acid synthesis, such as an acetyl group or a phenoxyacetyl group.
  • Group, isobutyryl group, benzoyl group, cyanoethoxycarbonyl group and diphenylaminocarbonyl group are more preferred, and isobutyryl group, benzoyl group and diphenylaminocarbonyl group are particularly preferred.
  • the compound represented by the general formula VIII or a salt thereof is an adeninyl in which B is optionally substituted with one or more substituents in the general formula VIII (preferably, the general formula VIII-a), Guaninyl optionally substituted with one or more substituents, Cytosinyl optionally substituted with one or more substituents, 5-methylcytosinyl optionally substituted with one or more substituents, one or more substituents Or uracinyl optionally substituted with one or more substituents, R 3 , R 4 , R 5 , R 6 are each a hydrogen atom, and R 12 , R 13 are all It is particularly preferable that the compound is a Bn group or a salt thereof.
  • the compound represented by the general formula VIII or a salt thereof is an adeninyl in which B is optionally substituted with one or more substituents in the general formula VIII (preferably, the general formula VIII-a), Guaninyl optionally substituted with one or more substituents, Cytosinyl optionally substituted with one or more substituents, 5-methylcytosinyl optionally substituted with one or more substituents, one or more substituents Or uracinyl optionally substituted with one or more substituents, R 3 , R 4 , R 5 , R 6 are each a hydrogen atom, R 12 is a DMTr group, It is particularly preferable that R 13 is a hydrogen atom or a compound or a salt thereof.
  • the general formula IX [Wherein R 3 , R 4 , R 5 , R 6 each have the same meaning as in general formula VIII, R 14 and R 15 each independently represent a hydrogen atom or a hydroxyl-protecting group, An integer of 1 to 3, and ring A is a C 1-6 alkyl group which may be substituted with one or more substituents, a C 2-6 alkenyl group which may be substituted with one or more substituents, A C 2-6 alkynyl group that may be substituted with one or more substituents, an amino group that may be substituted with one or more substituents, a hydroxyl group that may be substituted with one or more substituents, an oxo group A 5- to 7-membered unsaturated heterocycle optionally substituted with one or more substituents selected from the group consisting of a thioxo group, and a halogen atom, and the unsaturated heterocycle is fused with another ring Ring A may be formed.
  • ring A is preferably not thyminyl.
  • a salt thereof is mentioned as a novel intermediate compound.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are as defined in general formula VIII (general formula VIII-a).
  • the hydroxyl-protecting group is preferably synonymous with the group defined by the general formula I.
  • ring A is one or more (preferably 2 or 3) substituents selected from the group consisting of a C 1-6 alkyl group and an oxo group. More preferred is a pyrimidine base moiety of a nucleic acid which may be substituted with.
  • the compound represented by the general formula IX or a salt thereof includes an adenylyl, one or more, in which B is substituted with one or more substituents in the general formula IX (general formula IX-a)
  • B is substituted with one or more substituents in the general formula IX (general formula IX-a)
  • thyminyl or uracinyl optionally substituted with one or more substituents, wherein R 14 and R 15 are all Bn groups, and ring A is thyminyl or uracinyl.
  • the compound represented by the general formula IX or a salt thereof includes an adenylyl, one or more, in which B is substituted with one or more substituents in the general formula IX (general formula IX-a)
  • B is substituted with one or more substituents in the general formula IX (general formula IX-a)
  • R 14 is a DMTr group
  • R 15 is a hydrogen atom
  • ring A is thyminyl or uracinyl.
  • the compound represented by the general formula IX or a salt thereof includes an adenylyl, one or more, in which B is substituted with one or more substituents in the general formula IX (general formula IX-a)
  • B is substituted with one or more substituents in the general formula IX (general formula IX-a)
  • thyminyl or uracinyl optionally substituted with one or more substituents
  • R 14 is a hydrogen atom
  • R 15 is a hydrogen atom
  • ring A is thyminyl or uracinyl.
  • a C 1-6 alkyl group which may be substituted with R 7 is a hydrogen atom or a protecting group for a hydroxyl group, and R 8 is a hydrogen atom, a phosphate group which may be substituted with one or more substituents , Or a thiophosphate group that may be substituted with one or more substituents, and R 9 , R 10, and R 11 are each independently a hydrogen atom, C 1 that may be substituted with one or more substituents.
  • a -6 alkyl group or an amino-protecting group, and m is an integer of 1 to 3;
  • the compound represented by the general formula VII or a salt thereof is represented by the general formula VII-a: Or a salt thereof.
  • B, R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 7 , R 8 , R 9 , R 10 , R 11, and m are each as defined in General Formula VII).
  • B is thyminyl
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each a hydrogen atom
  • R 7 is a DMTr group
  • R 8 is a hydrogen atom or —P (O (CH 2 ) 2 CN) (N (iPr) 2 ) group
  • R 9 is a Boc group
  • R 10 is a Boc group
  • R 11 is a hydrogen atom, a known compound described in International Publication No. 2014/046212 Is intended to be excluded.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each independently a hydrogen atom.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are C 1-6 alkyl groups which may be substituted with one or more substituents
  • the C 1-6 alkyl group is preferably a methyl group, an ethyl group, a propyl group, an isopropyl group, a butyl group, an isobutyl group, a pentyl group, or a hexyl group, and more preferably a methyl group.
  • the substituent includes a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • One or more (or preferably 1 to 3) groups selected from the group may be the same or different.
  • R 7 is preferably a hydroxyl-protecting group, more preferably a trityl-type protecting group, and particularly preferably a DMTr group.
  • R 8 is of the formula: —P (O (CH 2 ) 2 CN) (N (iPr) 2 )
  • the group is preferably.
  • R 9 and R 10 are amino-protecting groups and R 11 is a hydrogen atom, and the amino-protecting group is It is more preferably a Teoc group or a Boc group.
  • B is a base moiety of a nucleic acid that may be substituted with one or more substituents, and preferred substituents include a hydroxyl group, a C 1-6 alkoxy group, a mercapto group, a C 1-6 alkylthio group. , amino group, C 1-6 alkyl-substituted amino group with a group, C 1-6 alkyl groups, C 2-6 alkenyl groups, C 2-6 alkynyl group, an oxo group, a thioxo group, or a halogen atom, C One or more (preferably 2 or 3) substituents selected from the group consisting of a 1-6 alkyl group and an oxo group are more preferable.
  • the hydroxyl group, amino group, and thiol group in the base portion of the nucleic acid may be protected, and the protecting group is preferably a hydroxyl protecting group or an amino protecting group usually used in nucleic acid synthesis, such as an acetyl group or a phenoxyacetyl group.
  • the protecting group is preferably a hydroxyl protecting group or an amino protecting group usually used in nucleic acid synthesis, such as an acetyl group or a phenoxyacetyl group.
  • Group, isobutyryl group, benzoyl group, cyanoethoxycarbonyl group and diphenylaminocarbonyl group are more preferred, and isobutyryl group, benzoyl group and diphenylaminocarbonyl group are particularly preferred.
  • a more preferable embodiment of B is adenynyl, guaninyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl, thyminyl or uracinyl
  • the compound represented by the general formula VII or a salt thereof is a compound of the general formula VII (general formula VII-a) in which B may have one or more protecting groups, one or more Guanylyl, which may have one or more protecting groups, cytosynyl which may have one or more protecting groups, 5-methylcytosinyl which may have one or more protecting groups, or one or more protecting groups
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each a hydrogen atom
  • R 7 is a DMTr group
  • R 8 is a hydrogen atom or —P (O (CH 2 ) 2 CN ) (N (iPr) 2 ) group
  • R 9 is a Teoc group or Boc group
  • R 10 is a Teoc group or Boc group
  • R 11 is a hydrogen atom, or a salt thereof. It is preferable.
  • B is thymine which may have one or more protecting groups
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each hydrogen an atom
  • R 7 is a DMTr group
  • R 8 is a hydrogen atom or -P is (O (CH 2) 2 CN ) (N (iPr) 2) group
  • R 9 is a Teoc group
  • R 10 Is a Teoc group
  • R 11 is preferably a hydrogen atom, or a salt thereof.
  • the method for producing a compound represented by the general formula VII or a salt thereof may include at least one of the steps described herein.
  • the method for producing a compound represented by the general formula VII or a salt thereof comprises reacting a compound represented by the general formula II with a reducing agent to thereby react the compound represented by the general formula I or a salt thereof. The manufacturing process is included.
  • the method for producing the compound represented by the general formula VII or a salt thereof comprises reacting the compound represented by the general formula III with an azidating agent to thereby react the compound represented by the general formula II or a salt thereof.
  • the process of manufacturing is included.
  • the method for producing a compound represented by the general formula VII or a salt thereof is obtained by reacting the compound represented by the general formula V with a hydroxyl group activator and substituting the tetrahydrofuran ring in the general formula V.
  • the method for producing the compound represented by the general formula VII or a salt thereof comprises reacting the compound represented by the general formula IV with an azidating agent to thereby react the compound represented by the general formula II or a salt thereof.
  • the process of manufacturing is included.
  • the method for producing a compound represented by the general formula VII or a salt thereof is obtained by reacting a compound represented by the general formula VI with a hydroxyl group activator and substituting the tetrahydrofuran ring in the general formula VI.
  • the method for producing a compound represented by the general formula VII or a salt thereof comprises substituting the ring A of the compound represented by the general formula IX with B to thereby obtain a compound represented by the general formula VIII or a salt thereof.
  • a step of producing a salt comprises substituting the ring A of the compound represented by the general formula IX with B to thereby obtain a compound represented by the general formula VIII or a salt thereof.
  • the general formula X [Wherein R 3 , R 4 , R 5 , R 6 are each independently a hydrogen atom or a C 1-6 alkyl group which may be substituted with one or more substituents, and B is one or more Wherein R 16 , R 17 , and R 18 are each independently a hydrogen atom, a C 1-6 alkyl group that may be substituted with one or more substituents. Or an amino-protecting group, and m is an integer of 1 to 3.
  • An oligonucleotide having at least one nucleoside represented by the formula (provided that m 1 or 2, B is thyminyl, R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 16 , R 17 , R 18 Except for oligonucleotides having only nucleosides each having a hydrogen atom as a bridging nucleic acid),
  • General formula XI [Wherein B, R 3 , R 4 , R 5 , R 6 and m each have the same meaning as in general formula X, R 7 is a hydrogen atom or a hydroxyl protecting group, and R 20 is 1 A phosphate group which may be substituted with one or more substituents or a thiophosphate group which may be substituted with one or more substituents, and R 21 , R 22 and R 23 are each independently a hydrogen atom, 1 A C 1-6 alkyl group which may be substituted with one or more substituents or a protecting group for an amino group.
  • the phosphoramidite method preferably follows a method according to the method described in WO 2014 / 046212A1.
  • B in the method for producing the oligonucleotide represented by the general formula X, in the general formula X or the general formula XI, B may have one or more protecting groups, and one or more protections. May have a guanynyl group, may have one or more protecting groups, may have cytosynyl, may have one or more protecting groups, may have one or more protecting groups Good uracinyl, R 7 is a hydroxyl protecting group, R 16 , R 17 and R 18 are hydrogen atoms, and R 20 is —P (O (CH 2 ) 2 CN) (N (iPr) 2 ). It is preferable that R 21 , R 22 and R 23 are each independently an amino-protecting group.
  • a novel GuNA oligonucleotide or salt thereof is provided,
  • the general formula X [Wherein R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each independently a hydrogen atom or a C 1-6 alkyl group optionally substituted with one or more substituents, and B is one or more
  • the base portion of the nucleic acid which may be substituted with a substituent of R 16, R 16, R 17 and R 18 are each independently a hydrogen atom, C 1-6 alkyl optionally substituted with one or more substituents Or a protective group for an amino group, and m is an integer of 1 to 3.
  • An oligonucleotide having at least one nucleoside represented by the formula (provided that m 1 or 2 and B is thyminyl, R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 16 , R 17 and R 18 Is an oligonucleotide having only nucleosides each having a hydrogen atom as a bridged nucleic acid.) Or a salt thereof.
  • the compound represented by the general formula X or a salt thereof is represented by the general formula Xa: It is preferable that it is an oligonucleotide or its salt which has one or more nucleosides represented by these.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are each independently a hydrogen atom.
  • R 3 , R 4 , R 5 and R 6 are C 1-6 alkyl groups optionally substituted by one or more substituents
  • the C 1-6 alkyl group is preferably a methyl group, an ethyl group, a propyl group, an isopropyl group, a butyl group, an isobutyl group, a pentyl group, or a hexyl group, and more preferably a methyl group.
  • the substituent includes a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • One or more (or preferably 1 to 3) groups selected from the group may be the same or different.
  • R 16 , R 17 and R 18 are each independently a hydrogen atom.
  • the general formula X (formula X-a) in, R 16, R 17 and R 18 is may be formed a branched or ring may be substituted with one or more substituents C 1 If it is -6 alkyl group, the C 1-6 alkyl as the methyl group, an ethyl group, a propyl group, an isopropyl group, butyl group, isobutyl group, pentyl group or hexyl group are preferred, and more preferably a methyl group.
  • the substituent includes a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 2-6 alkynyl group, a C 1-6 alkoxy group, an amino group, a hydroxyl group, an oxo group, a thioxo group, and a halogen atom.
  • One or more (or preferably 1 to 3) groups selected from the group may be the same or different.
  • B is adeninyl, guaninyl, cytosynyl, 5-methylcytosinyl, thyminyl or uracinyl
  • R 16 , R 17 and R 18 are hydrogen atoms It is preferably a nucleotide or a salt thereof.
  • the oligonucleotide or salt thereof is a combination of two or more of the nucleotides in a continuous or discontinuous manner, and preferably contains 2 to 100 nucleotides. It is more preferable that it contains up to 10 nucleotides, and most preferable is a combination of 10 to 30 artificial nucleotides, or the formation of a duplex with these complementary strands.
  • the nucleotides located between the nucleotides are not particularly limited, but natural nucleotides having no cross-linked structure are preferred, for example.
  • salt in the term “salt of a compound” means an alkali metal salt such as sodium salt, potassium salt or lithium salt, an alkaline earth metal salt such as calcium salt or magnesium salt, an aluminum salt, Metal salts such as iron salt, zinc salt, copper salt, nickel salt, cobalt salt; inorganic salt such as ammonium salt, t-octylamine salt, dibenzylamine salt, morpholine salt, glucosamine salt, phenylglycine alkyl ester salt, Ethylenediamine salt, N-methylglucamine salt, guanidine salt, diethylamine salt, triethylamine salt, dicyclohexylamine salt, N, N'-dibenzylethylenediamine salt, chloroprocaine salt, procaine salt, diethanolamine salt, N-benzyl-phenethylamine salt, Piperazine salt, tetramethylan Amine salts such as organic salts such as sodium salt, potassium salt or lithium salt, an
  • each compound represented by the general formulas I-XI described herein includes enantiomeric or diastereomeric forms or mixtures thereof.
  • the steric configuration of the sugar moiety in the structure of each compound includes an ⁇ -form and a ⁇ -form, with the ⁇ -form being preferred.
  • the compounds represented by the general formulas I to XI are obtained in the form of diastereomers or enantiomers, they are obtained by conventional methods well known in the field of organic synthesis (for example, sugar synthesis), such as chromatography or fractional crystallization. Etc. can be separated.
  • Each compound represented by the general formulas I to XI described in this specification is an isotope (eg, 3 H, 13 C, 14 C, 15 N, 18 F, 32 P, 35 S, 125 I, etc.) And a deuterium converter.
  • oligonucleotides and their analogs described in the present specification are usually used in the pharmaceutical formulation technical field such as excipients, binders, preservatives, oxidation stabilizers, disintegrants, lubricants, and flavoring agents.
  • Adjuvants can be incorporated into parenteral preparations or liposome preparations.
  • a topical preparation such as a solution, cream, ointment and the like can be prepared by blending a pharmaceutical carrier usually used in the art.
  • optically active isomers having an absolute configuration in each compound represented by the general formulas I to XI can be obtained by using optically active isomers as starting materials or by separating isomers generated in the middle of the synthesis. Can be manufactured.
  • ⁇ -selective transglycosylation proceeds efficiently, and the resulting compound represented by the general formula VIII can selectively obtain the desired ⁇ -form. Can do.
  • the compound of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof can be produced by the following method, but is not limited thereto.
  • the raw material compounds when their specific production methods are not described, those commercially available can be used, or can be produced according to a known method or a method analogous thereto.
  • THF Tetrahydrofuran TBAF: Tetra-n-butylammonium fluoride
  • Ph 3 P Triphenylphosphine
  • DMF N, N-dimethylformamide
  • MsCl Methanesulfonyl chloride
  • DMAP N, N-dimethyl-4-aminopyridine iPr 2 NEt
  • DIPEA N, N-diisopropylethylamine
  • Tf 2 O trifluoromethanesulfonic anhydride
  • NaN 3 sodium azide
  • Bu 4 NN 3 tetrabutylammonium azide
  • TfCl trifluoromethanesulfonyl chloride
  • Ph 3 PO triphenylphosphine oxide
  • BSA N , O-bis (trimethylsilyl) acetamide
  • TMSOTf trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate
  • TBSOTf t-
  • compound 2 is prepared by using sugar compound 1 as a starting material and introducing a hydroxyl protecting group as R 1 group.
  • a precursor of the compound represented by general formula III for example, compound 7
  • a multi-step (six steps) reaction route according to a known reaction.
  • a compound represented by the general formula III for example, compound 8
  • a Mitsunobu reaction is carried out using an appropriate azidation reagent to obtain compounds represented by general formula II (for example, compound 9 (thymine derivative), compound 36 (uracil derivative)) as novel intermediates. .
  • the compound represented by the general formula I is deprotected, and then a new another protecting group is introduced to obtain a compound represented by the general formula IX (for example, compound 14 ). Subsequently, it is reacted with a guanidinating reagent to obtain a guanidine compound represented by the general formula VII (for example, compound 15 ) as a novel intermediate, and further reacted with a phosphoramidite reagent to give a general compound of formula VII (or , A GuNA phosphoramidite compound represented by the general formula XI) (for example, Compound 16 ) can be produced.
  • the compound can be used as a monomer starting material for producing an artificial oligonucleotide of the cross-linked nucleic acid GuNA.
  • Modification methods include mesylation reaction pathway ([Method B]), azidation reaction pathway ([Method C]), and nucleobase exchange reaction pathway ([Method D]).
  • Compound 1 is commercially available or can be produced according to methods generally known in general organic synthetic chemistry (particularly, nucleic acid synthesis) using commercially available raw material compounds. .
  • Each production process can be carried out under reaction conditions according to the method described in J. Org. Chem. 2011, 76, 9891-9899, but depending on the type of compound 1 as the starting material, the conditions of the individual reaction processes (For example, reagents, reaction time, etc.) may be appropriately modified. Further, according to the method described in J. Org. Chem.
  • thymine is reacted as a nucleobase with respect to intermediate compound 4 , as shown below, Analogs of various nucleobases other than thymine can also be produced by reacting with another nucleobase (for example, uracil (U)) instead of thymine (T).
  • another nucleobase for example, uracil (U)
  • hydroxyl protecting group R a is a silyl type protecting group (eg, TBDPS)
  • acidic conditions eg, acetic acid-THF-water
  • fluoride ion donating reagent eg, TBAF
  • Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction, and the reaction may be carried out in an appropriate solvent (for example, ethers such as THF, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, water, or a mixed solvent thereof). it can.
  • the reaction proceeds suitably at a reaction temperature of 0 ° C. to 100 ° C., particularly 0 ° C. to 50 ° C.
  • a novel intermediate compound represented by general formula II for example, compound 9 (thymine), compound 36 (uracil)
  • an azidation reaction is carried out by subjecting a compound represented by the general formula III under Mitsunobu reaction conditions (for example, an azidation reagent (for example, diphenylphosphoryl azide (DPPA), an azodicarboxylic acid diester (for example, diethyl azodicarboxylate (DEAD) , Diisopropyl azodicarboxylate (DIAD)), and triphenylphosphine (Ph 3 P)).
  • an azidation reagent for example, diphenylphosphoryl azide (DPPA), an azodicarboxylic acid diester (for example, diethyl azodicarboxylate (DEAD) , Diisopropyl azodicarboxylate (DIAD)
  • DEAD diethyl azodicarboxylate
  • DIAD Diisopropyl azodicarboxy
  • ethers such as THF, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, hydrocarbons such as toluene, water, or a mixed solvent thereof. Etc.).
  • the reaction proceeds suitably at a reaction temperature of ⁇ 78 ° C. to 100 ° C., particularly 0 ° C. to 50 ° C.
  • the progress of the reaction for obtaining the azide compound represented by the general formula II from the compound represented by the general formula III is easily influenced by the degree of purification of the reaction substrate and the like, and is not easy to handle in operation. Therefore, an intermediate compound represented by general formula IV (for example, compound 10 (thymine), compound 35 (uracil)) in which a hydroxyl group is once converted into a leaving group is not produced directly. Then, the leaving group is removed and a suitable azidating agent is introduced, whereby the compound represented by the general formula II can be easily derived.
  • the leaving group X is not particularly limited as long as it is a group generally known in organic synthesis.
  • a methanesulfonyloxy group (mesyloxy; Ms—O—), a trifluoromethanesulfonyloxy group, p- A toluenesulfonyloxy group is mentioned, and a mesyloxy group is preferable.
  • the reagent for introducing the leaving group include trifluoromethanesulfonyl chloride, methanesulfonyl chloride, p-toluenesulfonyl chloride or trifluoromethanesulfonic anhydride, and methanesulfonyl chloride is preferable.
  • azidating agents include nBu 4 NN 3 or sodium azide.
  • the leaving group can be introduced under reaction conditions well known in organic synthetic chemistry (eg, sugar synthesis) (eg, using a sulfonylating agent (eg, MsCl) under basic conditions (eg, dimethylaminopyridine (DMAP)). ))
  • reaction conditions well known in organic synthetic chemistry (eg, sugar synthesis) (eg, using a sulfonylating agent (eg, MsCl) under basic conditions (eg, dimethylaminopyridine (DMAP)).
  • Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction, and the reaction may be carried out in an appropriate solvent (for example, ethers such as THF, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, water, or a mixed solvent thereof). it can.
  • the reaction proceeds suitably at a reaction temperature of ⁇ 25 ° C. to room temperature, particularly 0 ° C. to room temperature.
  • reaction involving deprotection and azidation is carried out under the reaction conditions well known in organic synthetic chemistry (eg, sugar synthesis), depending on the type of leaving group (eg, tetrabutylammonium azide).
  • Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction, and the reaction may be carried out in an appropriate solvent (for example, ethers such as dioxane, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, water, or a mixed solvent thereof). it can.
  • the reaction temperature suitably proceeds from room temperature to a temperature under reflux of the solvent, for example, a temperature of 100 ° C. or higher.
  • the method for producing the compound represented by the general formula II includes the following steps: a) deprotecting the precursor of the compound of general formula III (deprotection of the hydroxyl protecting group at the 5 ′ position) to obtain a compound of general formula III; and b) The obtained compound represented by the general formula III is subjected to Mitsunobu reaction using an appropriate azidation reagent to obtain the compound represented by the general formula II.
  • the following steps b ′) and c ′) may be included instead of the step b): b ′)
  • the compound represented by the general formula IV obtained by reacting the obtained compound represented by the general formula III with an appropriate reagent to introduce a leaving group (X) (on the 5′-position hydroxyl group).
  • c ′ The obtained compound represented by the general formula IV is reacted with an appropriate azidation reagent to obtain a compound represented by the general formula II.
  • Another production method of the novel intermediate compound represented by the general formula II The following describes another production method of the compound represented by the general formula II.
  • using the compound 2 prepared from the compound 1 as a starting material first, mesylation of a hydroxyl group is carried out, followed by a method according to the method described in the above J. Org. Chem. 2011, 76, 9891-9899 ( According to the production of compound 6 from compound 3 ), a novel intermediate compound represented by general formula V (specifically, compound 25 ) is obtained through a multi-step (four steps) reaction pathway.
  • the mesylation reaction is carried out under reaction conditions generally known in organic synthetic chemistry (for example, nucleic acid synthesis) (for example, an appropriate hydroxyl group activator (for example, a mesylation agent such as methanesulfonyl chloride, methanesulfonic anhydride, etc.). ) Under basic conditions (eg in the presence of triethylamine). Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction, and the reaction may be carried out in an appropriate solvent (for example, ethers such as THF, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, water, or a mixed solvent thereof). it can.
  • the reaction proceeds suitably at a reaction temperature of ⁇ 25 ° C. to 100 ° C., particularly 0 ° C. to room temperature.
  • the method for producing the compound represented by the general formula IV includes the following steps: A compound represented by the general formula V as a novel intermediate is reacted with a hydroxyl group activator (for example, a trifluoromethanesulfonylating agent) to substitute for the tetrahydrofuran ring in the general formula V. A compound represented by the general formula IV is obtained by activating the hydroxyl group.
  • a hydroxyl group activator for example, a trifluoromethanesulfonylating agent
  • the intermediate compound represented by the general formula VI is made basic with a hydroxyl group activator under the same reaction conditions as in the method for obtaining compound 7 from compound 6 (or compound 25 to compound 10 ) in the above production method.
  • a novel intermediate compound represented by the general formula II (specifically, compound 9 ) is produced.
  • the hydroxyl group activator in this reaction include trifluoromethanesulfonyl chloride, methanesulfonyl chloride, or trifluoromethanesulfonic anhydride, and trifluoromethanesulfonyl chloride is preferred.
  • Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction, and the reaction may be carried out in an appropriate solvent (for example, ethers such as THF, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, water, or a mixed solvent thereof). it can.
  • the reaction proceeds suitably at a reaction temperature of 0 ° C. to 100 ° C., particularly 0 ° C. to room temperature.
  • a method for producing a compound represented by the general formula II as a novel intermediate from a compound represented by the general formula VI includes the following steps: By reacting the compound represented by the general formula VI with a hydroxyl group activator to activate the unprotected hydroxyl group substituted on the tetrahydrofuran ring in the general formula VI, the compound represented by the general formula II is represented. A compound is obtained.
  • novel intermediate compounds of general formula I Further, by subjecting the obtained compound represented by the general formula II to a reduction reaction, a novel intermediate compound represented by the general formula I in which the azido group is reduced (for example, the compound 12 (thymine), Compound 37 (uracil)) (sometimes referred to herein as “2′-amino LNA”) can be obtained.
  • the main reduction reaction of the azide group can be performed, for example, under a reducing agent (for example, phosphines such as triphenylphosphine).
  • Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction, and the reaction may be carried out in an appropriate solvent (for example, ethers such as THF, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, water, or a mixed solvent thereof). it can.
  • the reaction proceeds suitably at a temperature of 0 ° C. to high temperature, particularly room temperature to 100 ° C. or less.
  • the method for producing a novel intermediate compound represented by the general formula I includes the following steps: The compound represented by the general formula I or a salt thereof is produced by reacting the novel intermediate compound represented by the general formula II obtained above with a reducing agent.
  • this reaction is a novel reaction characterized by introducing an amino group at the 2 ′ position by extending an azidomethyl group from the carbon atom at the 4 ′ position and bridging it with the carbon atom at the 2 ′ position. It is a process.
  • Intermediate compound 3 (for example, the compound of Example 13 ) is obtained by deprotecting the R 1 group and the R 2 group on the 5′-position and the 3′-position, respectively, of the compound represented by the general formula I obtained above. Get. Subsequently, an intermediate compound 4 (for example, compound 14 ) as a precursor is introduced by introducing a new hydroxyl protecting group having a different deprotection condition from the deprotected protecting group only on the hydroxyl group at the 5 ′ position (R 7 ). ) Or a salt thereof.
  • the deprotection reaction can be carried out under reaction conditions generally known in organic synthetic chemistry (for example, nucleic acid synthesis) depending on the type of protecting group.
  • the deprotection reaction can be carried out by hydrogenolysis reaction with hydrogen in the presence of an organometallic catalyst (for example, palladium-carbon).
  • organometallic catalyst for example, palladium-carbon
  • Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction.
  • ethers such as THF, acetates such as ethyl acetate, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, acids such as acetic acid, methanol, etc. Alcohol, water or a mixed solvent thereof) or a base itself can be used as a solvent.
  • the reaction proceeds suitably at room temperature to high temperature, particularly at room temperature to 50 ° C. or less.
  • examples of the newly introduced hydroxyl protecting group include a trityl-type protecting group (for example, DMTr group).
  • the introduction reaction of this protecting group can be carried out under reaction conditions well known in organic synthetic chemistry (for example, nucleic acid synthesis) depending on the type of protecting group.
  • the hydroxyl-protecting group is a trityl-type protecting group (for example, DMTr group)
  • the reaction can be performed under basic conditions (for example, in the presence of pyridine).
  • Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction.
  • An appropriate solvent for example, ethers such as THF, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, water or a mixed solvent thereof
  • a base itself is used as a solvent.
  • the reaction temperature suitably proceeds at 0 ° C. to 50 ° C., particularly at room temperature.
  • the method for producing intermediate compound 4 includes the following steps. a) subjecting the compound represented by the general formula I obtained above (R 1 group and R 2 group on the 5′-position and 3′-position) to a deprotection reaction (to obtain an intermediate compound 3); b) A hydroxyl protecting group is introduced into the reaction product (position 5 ′).
  • the obtained intermediate compound 4 can be guanidine-ized and subsequently phosphoramidated to produce a novel compound represented by the general formula VII.
  • Nucleobase exchange reaction Using the compound represented by the general formula I or the intermediate compound 4 (collectively referred to as the compound represented by the general formula IX (eg, compound 12 , compound 14 )) obtained as described above as a starting material, An nucleobase pyrimidine such as thymine (T) or uracil (U) is exchanged with another nucleobase (eg, adenine (A), guanine (G), uracil (U), thymine ( T), cytosine (C), or 5-methylcytosine ( MeC )), and as a novel intermediate, a compound represented by the general formula VIII or a salt thereof (eg, compound 26 , compound 28 , compound) 29 ) can be produced.
  • T thymine
  • U uracil
  • T thymine
  • C cytosine
  • MeC 5-methylcytosine
  • the base exchange reaction can be carried out, for example, on a compound represented by the general formula IX in the presence of a Lewis acid, and the reaction can be promoted by reacting with a silylating agent.
  • silylating agents include BSA and hexamethyldisilazane
  • Lewis acids include, but are not limited to, TMSOTf, TBSOTf, and tin chloride.
  • the silylating agent can be used in an amount of about 1 to about 20 molar equivalents relative to the reaction substrate, and the Lewis acid can be used in a catalytic amount (about 0.05 molar equivalents) to 2 molar equivalents. Any solvent may be used as long as it does not affect the reaction.
  • ethers such as THF, halogenated hydrocarbons such as dichloromethane, dichloroethane, and chloroform, hydrocarbons such as benzene and toluene, In acetonitrile, water or a mixed solvent thereof).
  • the reaction temperature suitably proceeds from 0 ° C. to high temperature, particularly from room temperature to about 60 ° C.
  • the compound represented by the general formula IX or the compound represented by the general formula VIII obtained above was reacted with a guanidinating reagent to be guanidized on the bridged amino group of the compound represented by the general formula VIII.
  • a guanidine compound (for example, Compound 15 ) represented by the general formula VII (wherein R 8a is a hydrogen atom) is obtained.
  • the guanidination reaction can be performed under reaction conditions (for example, reagents) generally known in organic synthesis (particularly, nucleic acid synthesis).
  • guanidine reagent examples include the following formula: [Wherein R pro is an amino-protecting group (for example, Teoc, Boc)] Can be carried out in the presence of a suitable activating reagent (eg, silver triflate (AgOTf)).
  • a suitable activating reagent eg, silver triflate (AgOTf)
  • the obtained compound represented by the general formula VII is reacted with a phosphoramidite reagent to give a compound represented by the general formula VII or a salt thereof (sometimes referred to herein as “GuNA phosphoramidite”) (for example, Compound 16 ) is obtained.
  • the phosphoramidination reaction can be performed under reaction conditions (for example, reagents) generally known in organic synthesis (particularly, nucleic acid synthesis).
  • reaction conditions for example, reagents
  • examples of the phosphoramidite reagent include the following formula: However, it is not limited to this.
  • the phosphoramidination reaction may be performed in the presence of a suitable base (for example, DIPEA) or an appropriate acid (for example, diisopropylammonium tetrazolide, 4,5-dicyanoimidazole).
  • the method for producing a compound represented by the general formula VII or a salt thereof includes the following steps: a) A compound represented by the general formula IX or a salt thereof, or a compound represented by the general formula VIII or a salt thereof is subjected to a guanidination reaction to represent a compound represented by the general formula VII (wherein R 8a is a hydrogen atom). To obtain a compound; b) The reaction product is subjected to phosphoramidination reaction to obtain a compound represented by the general formula VII (wherein R 8b is an optionally substituted phosphate group).
  • the manufacturing method of the compound represented by general formula VII, or its salt may include the following at least 1 process among the processes described in this specification.
  • GuNA oligonucleotide represented by general formula X The compound represented by the general formula VII or the general formula XI or a salt thereof can be used as a monomer starting material for producing a GuNA oligonucleotide.
  • a GuNA oligonucleotide can be synthesized by performing an oligomerization reaction using a compound represented by the general formula VII or the general formula XI or a salt thereof and then deprotecting the amino protecting group as necessary.
  • the oligomerization reaction is not limited as long as it is a method generally known in synthetic chemistry (particularly, nucleic acid synthesis), but can be performed by, for example, a phosphoramidite method.
  • a phosphoramidite method it can carry out in accordance with the method according to the method as described in WO2014 / 046212A1, for example.
  • an oligonucleotide having one or more nucleotides represented by the general formula X can be produced.
  • the method for producing an oligonucleotide represented by the general formula X includes the following steps: a) After the oligomerization reaction using the compound represented by the general formula VII or the general formula XI, or a salt thereof, the amino protecting group is deprotected as necessary.
  • the manufacturing method of the compound represented by general formula VII or general formula XI, or its salt may include the following at least 1 process among the processes described in this specification.
  • a compound represented by the general formula VII (wherein R 8a is a hydrogen atom) or a salt thereof is subjected to a phosphoramididation reaction, and is represented by the general formula VII (wherein R 8b is an optionally substituted phosphate group).
  • a step of producing a compound or a salt thereof A step of producing a compound represented by the general formula XI by deprotecting any one or more of the amino protecting groups of R 9 , R 10 and R 11 of the compound represented by the general formula VII.
  • s is a single line
  • d is a double line
  • dd is a double double line
  • t is a triple line
  • td is a triple double line
  • q is a quadruple line
  • quin is a five line
  • sept is a seven-fold line
  • m is a multiple line
  • br is wide
  • brs is a wide single line
  • brd is a wide double line
  • brt is a wide triple line
  • J is a coupling constant.
  • the manufacturing method of the compound 12 is not limited to these. Specifically, it was produced according to the method described in J. Org. Chem. 2011, 76, 9891-9899 using commercially available compound 1 as a starting material.
  • Example 3 Compound 9 can also be synthesized from compound 8 according to Examples 3 and 4 below. ⁇ (2S, 3S, 3aS, 9aR) -3- (benzyloxy) -2-[(benzyloxy) methyl] -7-methyl-6-oxa-2,3,3a, 9a-tetrahydro-6H-furo [ 2 ', 3': 4,5] [1,3] oxazolo [3,2-a] pyrimidin-2-yl ⁇ methyl methanesulfonate (compound 10 ) MsCl (2.05 mL, 26.42 mmol) and DMAP (5695 mg, 46.61 mmol) were added to a suspension of compound 8 (7.00 g, 15.54 mmol) in methylene chloride (155 mL) under ice cooling, and at room temperature.
  • compound 16a and 15b Although an example of the manufacturing method of compound 16a and 15b is shown, it is not limited to these. Specifically, compounds 16a and 15b were prepared using compound 12 obtained above as a starting material.
  • Example 6 1-[(1R, 3R, 4R, 7S) -7-hydroxy-1- (hydroxymethyl) -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hept-3-yl] -5-methylpyrimidine-2 , 4 (1H, 3H) -Dione acetate (Compound 13 )
  • Compound 12 (1.00 g, 2.225 mmol) and acetic acid (6 mL) were mixed and palladium hydroxide (200 mg, 1.425 mmol) was added. Under hydrogen atmosphere, the mixture was heated and stirred at an external temperature of 50 ° C. for 6 hours. The reaction solution was purged with nitrogen, filtered through a membrane filter using methanol, and the filtrate was concentrated.
  • Example 7 1-[(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hepta -3-yl] -5-methylpyrimidine-2,4 (1H, 3H) -dione (compound 14 ) Under ice-cooling, 4,4′-dimethoxytrityl chloride (12.4 g, 36.4 mmol) was added to a solution of compound 13 (4.00 g, 12.1 mmol) in pyridine (37 mL, 462 mmol), and the mixture was warmed to room temperature. Allow to warm and stir for 1.5 hours.
  • reaction mixture was added dropwise to an aqueous acetic acid solution (water 250 mL / acetic acid 69.5 mL), ethyl acetate (300 mL) was added, and the mixture was stirred for 30 min. After extraction with ethyl acetate, the organic layer was washed successively with saturated brine, saturated aqueous sodium hydrogen carbonate and saturated brine, dried over anhydrous sodium sulfate, and insolubles were removed by filtration. After the solvent was distilled off from the filtrate, the resulting residue was purified by silica gel column chromatography (chloroform / methanol, 100/0 to 90/10) to obtain compound 14 (5.98 g, yield 86%). Obtained.
  • Example 8 Bis [2- (trimethylsilyl) ethyl] ⁇ [(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-hydroxy-3- (5-methyl -2,4-Dioxa-3,4-dihydropyrimidin-1 (2H) -yl) -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hept-5-yl] methylidene ⁇ biscarbamate (Compound 15a ) Compound 14 (1266 mg, 2.215 mmol), THF (7.7 mL), and 2-trimethylsilylethyl N- [methylsulfanyl- (2-trimethylsilylethoxycarbonylamino) methylene] carbamate (1258 mg, 3.322 mmol) in THF (7 mL) ) And Et 3 N (1.23 mL, 8.859 mmol) and AgOTf (854 mg,
  • Example 9 Bis [2- (trimethylsilyl) ethyl] ⁇ [(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7- ⁇ [(2-cyanoethoxy) (Dipropan-2-ylamino) phosphanyl] oxy ⁇ -3- (5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1 (2H) -yl) -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.
  • Example 11 (Azido route) Synthesis of compound 20 from compound 2 (3,5-di-O-benzyl-4-C-hydroxymethyl-1,2-O-isopropylidene- ⁇ -D-ribofuranose) is known in the literature (Henrik M. Pfundheller , HM, Bryld, T., Olsen, CE, Wengel, J. Helvetica Chimica Acta 2000, 83, 128-151).
  • TMSOTf 46.96 g, 210 mmol
  • 8% aqueous sodium hydrogen carbonate solution was added under cooling in an ice bath, the precipitated solid was filtered off, and acetonitrile was distilled off under reduced pressure.
  • Ethyl acetate was added and the organic layer was separated and washed with saturated brine. Each aqueous layer was re-extracted with ethyl acetate, and the combined organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate and insolubles were removed by filtration.
  • mesyl root One production method of compound 10 (hereinafter also referred to as mesyl root) is shown.
  • Example 12 (Mesyl root) Synthesis of compound 24 from compound 2 was performed according to known literature (Henrik M. Pfundheller, H. M., Bryld, T., Olsen, C. E., Wengel, J. Helvetica Chimica Acta 2000, 83, 128-151).
  • Triethylamine method Under a nitrogen atmosphere, Compound 2 (7.50 g, 18.7 mmol), methylene chloride (150 mL), and Et 3 N (7.83 mL, 56.2 mmol) were mixed, and MsCl (1.74 mL, 22.5 mmol) was added dropwise at 0 ° C. . After dropping, the mixture was warmed to room temperature and stirred for 2 hours. Water was added to the reaction mixture, and the mixture was extracted with methylene chloride. The organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate, filtered and concentrated.
  • Example 16 N- (1- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -7- (Benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hept-3-yl ⁇ -2-Oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl) benzamide (Compound 26C ) In the same manner as in Example 13, from Compound 12 (20.0 mg, 0.0445 mmol) and N- (2-oxo-1H-pyrimidin-4-yl) benzamide (28.7 mg, 0.134 mmol) to Compound 26C (10 .4 mg, 43% yield).
  • Example 17 Synthesis of adenine (bz) (compound 28A ) from thymine compound (compound 14 ) N- (9- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-[(trimethylsilyl) oxy] -2-oxa-5- Azabicyclo [2.2.1] hept-3-yl ⁇ -9H-purin-6-yl) benzamide (Compound 28A ) In the same manner as in Example 13, Compound 28A (1.92 g, 97% yield) was obtained from Compound 14 (1.50 g, 2.60 mmol) and BSA (6.40 mL, 26.0 mmol).
  • Example 18 Desilylation of adenine (bz) (compound 29A ) N- (9- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1 ] Hept-3-yl ⁇ -9H-purin-6-yl) benzamide (Compound 29A ) Compound 28A (110 mg, 0.1453 mmol) and THF (2 mL) were mixed, and TBAF (0.19 mL, 0.1889 mmol) was added dropwise under ice cooling, followed by stirring at the same temperature for 50 minutes.
  • TMSOTf (20 ⁇ L, 0.1050 mmol) was added dropwise under ice cooling, and the mixture was stirred at an external temperature of 60 ° C. for 15 minutes. Under ice-cooling, saturated aqueous sodium hydrogen carbonate, saturated aqueous ammonium chloride, saturated aqueous sodium hydrogen carbonate, saturated brine, and chloroform were added, and the mixture was stirred for 10 minutes. Insoluble material was filtered off through Celite, and the filtrate was passed through a phase separator.
  • Example 22 Desilylation of methylcytosine (bz) (compound 29 Me C ) N- (1- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1 ] Hept-3-yl ⁇ -5-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl) benzamide (Compound 29 Me C ) In the same manner as in Example 18, compound 29 Me C (1001 mg, yield 99%) was obtained from compound 28 Me C (1124 mg, 1.5049 mmol).
  • Example 23 Synthesis of cytosine (bz) (compound 28C ) from thymine compound (compound 14 ) N- (1- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-[(trimethylsilyl) oxy] -2-oxa-5- Azabicyclo [2.2.1] hept-3-yl ⁇ -2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl) benzamide (Compound 28C ) In the same manner as in Example 21, from compound 14 (200 mg, 0.350 mmol) and N- (2-oxo-1H-pyrimidin-4-yl) benzamide (226 mg, 1.05 mmol), compound 28C (101 mg, yield) 39%).
  • Example 24 Desilylation of cytosine (bz) (compound 29C ) N- (1- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-hydroxy-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1 ] Hept-3-yl ⁇ -2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl) benzamide (Compound 29C ) In the same manner as in Example 18, compound 29C (86.0 mg, yield 98%) was obtained from compound 28C (101 mg, 0.133 mmol).
  • Example 25 Adenine (bz) guanidine (teoc) (compound 15Aa ) Bis [2- (trimethylsilyl) ethyl] ⁇ [(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-hydroxy-3- ⁇ 6- [ (Phenylcarbonyl) amino] -9H-purin-9-yl ⁇ -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hept-5-yl] methylidene ⁇ biscarbamate (Compound 15Aa ) In the same manner as in Example 8, compound 15Aa (111 mg, containing 1.1 wt% ethyl acetate, yield 82%) was obtained from compound 29A (91.5 mg, 0.134 mmol).
  • Example 28 Phosphorylation (teoc) of guanine (ib, dpc) (compound 16Ga ) Bis [2- (trimethylsilyl) ethyl] ⁇ [(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7- ⁇ [(2-cyanoethoxy) (Dipropan-2-ylamino) phosphanyl] oxy ⁇ -3- ⁇ 6-[(diphenylcarbamoyl) oxy] -2-[(2-methylpropanoyl) amino] -9H-purin-9-yl ⁇ -2-oxa -5-Azabicyclo [2.2.1] hept-5-yl] methylidene ⁇ biscarbamate (Compound 16Ga ) Compound 15Ga (50.5 mg, 0.0423 mmol) in acetonitrile (1 mL) at room temperature
  • diisopropylammonium tetrazolide (21.8 mg, 0.127 mmol) and 2-cyanoethyl N, N, N ′, N′-tetraisopropyl phosphorodiamidite (38.3 mg, 0.127 mmol) were added at room temperature. Stir for 3 hours.
  • 2-cyanoethyl N, N, N ′, N′-tetraisopropyl phosphorodiamidite (6.4 mg, 0.0212 mmol) was added and stirred at room temperature for 20 minutes. Under ice-cooling, chloroform (5 mL) and saturated brine (2 mL) were added and stirred, and passed through a phase separator.
  • Example 30 Phosphorylation (teoc) of methylcytosine (bz) (compound 16 Me Ca ) Bis [2- (trimethylsilyl) ethyl] ⁇ [(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7- ⁇ [(2-cyanoethoxy) (Dipropan-2-ylamino) phosphanyl] oxy ⁇ -3- ⁇ 5-methyl-2-oxo-4-[(phenylcarbonyl) amino] pyrimidin-1 (2H) -yl ⁇ -2-oxa-5-azabicyclo [ 2.2.1] Hepta-5-yl] methylidene ⁇ biscarbamate (compound 16 Me Ca ) In the same manner as in Example 9, Compound 16 Me Ca (31 mg, 52% yield) was obtained from Compound 15 Me Ca (50 mg, 0.0497 mmol mmol). MS (APCI
  • Example 31 Adenine (bz) guanidine (boc) (compound 15Ab ) Di-tert-butyl ⁇ [(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7-hydroxy-3- ⁇ 6-[(phenylcarbonyl) Amino] -9H-purin-9-yl ⁇ -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hept-5-yl] methylidene ⁇ biscarbamate (Compound 15Ab ) In the same manner as in Example 10, compound 15Ab (1.735 g, containing 2.0 wt% hexane, yield 74%) was obtained from compound 29A (1.74 g, 2.54 mmol).
  • Example 34 Phosphorylation (boc) of guanine (ib, dpc) (compound 16Gb ) Di-tert-butyl ⁇ [(1R, 3R, 4R, 7S) -1- ⁇ [Bis (4-methoxyphenyl) (phenyl) methoxy] methyl ⁇ -7- ⁇ [(2-cyanoethoxy) (dipropane-2 -Ylamino) phosphanyl] oxy ⁇ -3- ⁇ 6-[(diphenylcarbamoyl) oxy] -2-[(2-methylpropanoyl) amino] -9H-purin-9-yl ⁇ -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] Hepta-5-yl] methylidene ⁇ biscarbamate (Compound 16Gb ) In the same manner as in Example 28, Compound 16Gb (43.8 mg, 84% yield) was obtained from Compound 15Gb (41.8 mg, 0.0379 mmol). MS (
  • a method for producing a uracil form (compound 26A ) and a guanine form (compound 26G ) (hereinafter also referred to as uracil route) is shown.
  • Example 39 1- ⁇ 2-O-acetyl-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5-O- [tert-butyl (diphenyl) silyl] - ⁇ -L-lyxofuranosyl ⁇ pyrimidine-2,4 (1H, 3H) -Dione (Compound 30 ) 3,5-Di-O- benzyl--4-C-hydroxymethyl -l, analogously 2-O-isopropylidene-.alpha.-D-ribofuranose (Compound 2) (15.0 g, 37.45 mmol ) from the literature methods (J. Org. Chem.
  • Example 40 1- ⁇ 3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5-O- [tert-butyl (diphenyl) silyl] - ⁇ -L-lyxofuranosyl ⁇ pyrimidine-2,4 (1H, 3H)- Dione (Compound 31 ) ((2R, 3R, 4S, 5S) -4-Benzyloxy-5- (benzyloxymethyl) -5-((tert-butyl (diphenyl) silyl) oxymethyl) -2- (2,4-dioxopyrimidine -1-yl) tetrahydrofuran-3-yl) acetate (compound 30 , 11 g, 14.97 mmol) and tetrahydrofuran (55 mL) are mixed, and methylamine (34 mL, 306.5 mmol) is added dropwise with a dropping funnel at room temperature.
  • methylamine 34 mL, 306.5 mmol
  • Example 45 1- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -7- (Benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hept-3-yl ⁇ -pyrimidine -2,4 (1H, 3H) -dione (Compound 37 )
  • Compound 35 (2.2 g, 4.8 mmol), THF (32 mL), H 2 O (6.4 mL, 360 mmol) were mixed, Ph 3 P (1.90 g, 7.20 mmol) was added, and 70 ° C. for 21.5 hours. Stir with heating.
  • Example 46 N- (9- ⁇ (1R, 3R, 4R, 7S) -7- (Benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hept-3-yl ) ⁇ -9H-purin-6-yl) benzamide (Compound 26A ) BSA (0.5053 mL, 2.067 mmol) was added to a solution of Compound 37 (100 mg, 0.2296 mmol), N- (9H-purin-6-yl) benzamide (164.8 mg, 0.6889 mmol) in 1,2-dichloroethane (2.296 mL). In addition, the reaction was stirred at 60 ° C. for 15 minutes.
  • Example 48 (5xi) -3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -6-deoxy-1,2-O- (1-methylethylidene) - ⁇ -L-lyxo-hexofuranose (compound 41 )
  • Compound 40 (synthesized from compound 2 according to the method described in J. Med. Chem. 2000, 43, 4516-4525) (2.00 g, 5.02 mmol) and THF (25.1 mL) were mixed and cooled to ⁇ 78 ° C. did.
  • Methyl magnesium bromide (0.91M, 8.3 mL, 7.53 mmol) was added dropwise at the same temperature, and the mixture was stirred at ⁇ 78 ° C. for 1 hour.
  • TMSOTf (0.684 mL, 3.54 mmol) was added dropwise at the same temperature. After stirring at room temperature for 5 minutes, the mixture was heated and stirred at 50 ° C. for 2 hours. A saturated aqueous sodium hydrogen carbonate solution was added dropwise at 0 ° C., and then the reaction solution was concentrated. The residue was extracted with ethyl acetate, the organic layer was washed with saturated brine, dried over anhydrous sodium sulfate, and the solvent was evaporated.
  • Example 49 N- (9- ⁇ (1R, 3R, 4R, 6S, 7S) -7- (benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -6-methyl-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1 ] hept-3-yl) ⁇ - 9H-purin-6-yl) benzamide (compound 39aa)
  • compound 39Aa In the same manner as in Example 13, from compound 38a (50 mg, 0.108 mmol) and (N- (9H-purin-6-yl) benzamide (77.4 mg, 0.324 mmol), compound 39Aa (50.9 mg, yield)
  • the compound 39Aa is in the “ ⁇ form”, but the “ ⁇ form” as an isomer was not obtained.
  • Example 50 N- (9- ⁇ (1R, 3R, 4R, 6R, 7S) -7- (benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -6-methyl-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1 ] Hept -3-yl) ⁇ -9H-purin-6-yl) benzamide (Compound 39Ab )
  • compound 39Ab In the same manner as in Example 13, from compound 38b (50 mg, 0.108 mmol) and (N- (9H-purin-6-yl) benzamide (77.4 mg, 0.324 mmol), compound 39Ab (48.1 mg, yield)
  • the compound 39Ab is in the “ ⁇ form”, but the “ ⁇ form” as an isomer was not obtained.
  • Example 51 9- ⁇ (1R, 3R, 4R, 6S, 7S) -7- (Benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -6-methyl-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hepta- 3-yl ⁇ -2-[(2-methylpropanoyl) amino] -9H -purin-6-yl diphenylcarbamate (compound 39Ga ) Analogously to Example 13, compound 38a (33 mg, 0.0712 mmol) and (2- (2-methylpropanoylamino) -9-purin-1-yl) N, N-diphenylcarbamate (130 mg, 0.641 mmol) ) (Synthetic method is according to the method described in J.
  • Example 52 9- ⁇ (1R, 3R, 4R, 6R, 7S) -7- (Benzyloxy) -1-[(benzyloxy) methyl] -6-methyl-2-oxa-5-azabicyclo [2.2.1] hepta- 3-yl ⁇ -2-[(2-methylpropanoyl) amino] -9H -purin-6-yl diphenylcarbamate (compound 39Gb ) Analogously to Example 13, compound 38b (20 mg, 0.0432 mmol) and (2- (2-methylpropanoylamino) -9-purin-1-yl) N, N-diphenylcarbamate (79.0 mg, 0 388 mmol) (synthetic method is according to the method described in J.
  • Manufacture of GuNA nucleotide monomers with different ring sizes of cross-linked chains by transglycosylation reaction Manufacture of GuNA monomers with different ring sizes of cross-linked chains by modifying the number of carbon atoms in the cross-linked chains with ribose backbone be able to.
  • An example is shown below, but trans-glycosylation can be performed using compound 61 obtained by the following scheme to produce GuNA monomers having various nucleobases and different ring sizes.
  • Example 52 Ethyl (5E) -3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5,6-dideoxy-1,2-O- (1-methylethylidene) - ⁇ -L-lyxo-hepta-5- Enofurauronate (Compound 48 ) Sodium hydride (1.38 g, 34.43 mmol, containing 60%) was added to a solution of ethyl diethylphosphonoacetate (6.83 mL, 34.43 mmol) in THF (163 mL) under ice cooling, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes. did.
  • reaction solution was ice-cooled, and a solution of compound 40 (10.96 g, 26.48 mmol) in THF (54 mL) was added dropwise. The ice-water bath was removed and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. Ethyl acetate (300 mL) and cold water (500 mL) were added to the reaction solution, and after stirring for a while, the organic layer was separated. The aqueous layer was separated and extracted with ethyl acetate (100 mL), and the organic layers were combined, washed with water and saturated brine, and dried over anhydrous sodium sulfate.
  • Example 53 Ethyl 3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5,6-dideoxy-1,2-O- (1-methylethylidene) - ⁇ -L-lyxo-heptofurouronate (Compound 49 )
  • Nickel (II) chloride hexahydrate (1212 mg, 5.100 mmol) was added to a solution of compound 48 (12.06 g, 25.50 mmol) in methanol (241 mL).
  • the reaction mixture was ice-cooled, and sodium borohydride (1930 mg, 51.00 mmol) was added over 40 minutes. The ice-water bath was removed and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours.
  • the reaction solution was filtered through Celite and washed with ethyl acetate (300 mL) and water (300 mL), and then the organic layer of the filtrate was separated.
  • the aqueous layer was separated and extracted with ethyl acetate (executed twice with 150 mL), and the organic layers were combined, washed with water (300 mL) and saturated brine (300 mL), and dried over anhydrous sodium sulfate.
  • the solvent was distilled off under reduced pressure to obtain Compound 49 (11.90 g, yield 98%).
  • Example 54 3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5,6-dideoxy-1,2-O- (1-methylethylidene) - ⁇ -L-lyxo-heptofuranose (compound 50 )
  • a solution of compound 49 (11.90 g, 25.08 mmol) in THF (83 mL) was added dropwise to a suspension of lithium aluminum hydride (1904 mg, 50.17 mmol) in THF (155 mL) over 15 minutes under ice-cooling. Stir at room temperature for 1 hour.
  • reaction mixture was ice-cooled, saturated aqueous sodium sulfate solution (10 mL) was added dropwise, then water (3 mL) was added, and the mixture was stirred overnight at room temperature.
  • the reaction solution was filtered through Celite, washed with ethyl acetate (executed three times with 100 mL), and the filtrate was dried over anhydrous sodium sulfate.
  • the solvent was distilled off under reduced pressure to obtain Compound 50 (10.98 g, 25.04 mmol, yield 100%).
  • Example 56 7-azido-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5,6,7-trideoxy-1,2-O- (1-methylethylidene) - ⁇ -L-lyxo-heptofuranose (compound 52 )
  • Sodium azide (4365 mg, 67.15 mmol) was added to a solution of compound 51 (11.72 g, 22.38 mmol) and 15-crown-5 (4.43 mL, 22.38 mmol) in DMF (117 mL) at 50 ° C. Stir for 16 hours. Water was added to the reaction mixture, and the mixture was extracted with ethyl acetate.
  • Example 57 1,2-di-O-acetyl-7-azido-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5,6,7-trideoxy-L-lyxo-heptofuranose (compound 53 )
  • Acetic anhydride (9.94 mL, 105 mmol) and concentrated sulfuric acid (0.0497 mL, 0.932 mmol) were added to a solution of compound 52 (9.94 g, 21.9 mmol) in acetic acid (19.9 mL), and the mixture was stirred at room temperature for 4 hours.
  • Ethyl acetate (200 mL) was added to the reaction solution.
  • Example 58 1- ⁇ 2-O-acetyl-7-azido-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5,6,7-trideoxy- ⁇ -L-lyxo-heptofranosyl ⁇ -5-methylpyrimidine- 2,4 (1H, 3H) -dione (compound 54 )
  • compound 53 11.40 g, 21.78 mmol
  • acetonitrile 57 mL
  • BSA (16 mL, 47.93 mmol
  • TMSOTf (4.337 mL, 23.96 mmol) was slowly added dropwise at the same temperature, and the mixture was stirred at an external temperature of 80 ° C. for 3 hours.
  • the reaction solution was ice-cooled, and 5% aqueous sodium carbonate solution (50 mL) was added over 30 minutes to quench the reaction.
  • Ethyl acetate (100 mL) and water (100 mL) were added, and after stirring for a while, the organic layer was separated.
  • the aqueous layer was separated and extracted with ethyl acetate (50 mL), and the organic layers were combined, washed with 5% aqueous sodium hydrogen carbonate solution (100 mL) and saturated brine (100 mL), and dried over anhydrous sodium sulfate.
  • the solvent was distilled off under reduced pressure, and the obtained residue was purified by silica gel column chromatography (hexane / ethyl acetate, 95 / 5-50 / 50) to give compound 54 (10.62 g, yield 83%). It was.
  • Example 59 1- ⁇ 7-azido-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -5,6,7-trideoxy- ⁇ -L-lyxo-heptofuranosyl ⁇ -5-methylpyrimidine-2,4 (1H, 3H) -Dione (Compound 55 ) Methylamine (10.62 mL, 120 mmol, 40% aqueous solution) was added to a solution of compound 54 (10.62 g, 18.10 mmol) in THF (32 mL) and ethyl acetate (11 mL) under ice cooling, and the mixture was stirred for 2 hours.
  • the reaction mixture was ice-cooled, 1,8-diazabicyclo [5.4.0] -7-undecene (8.21 mL, 54.43 mmol) was added dropwise, and the mixture was stirred at room temperature for 4 hr.
  • the reaction mixture was diluted with ethyl acetate (400 mL), poured into 10% aqueous citric acid solution (500 mL), and stirred for a while.
  • the organic layer was separated, and the aqueous layer was separated and extracted with ethyl acetate (100 mL).
  • the organic layers were combined and washed with water (500 mL) and saturated brine (300 mL).
  • Activated carbon (1.00 g) was added to the organic layer (brown), stirred for 20 minutes, and filtered through Celite. The filtrate was concentrated under reduced pressure and azeotroped with toluene. Ethyl acetate (40 mL) was added and suspended in the resulting concentrated residue, hexane (300 mL) was added, and the precipitate was collected by filtration. The compound 56 (8.61 g, 94% yield) was obtained by air-drying under a nitrogen atmosphere and then drying under reduced pressure.
  • reaction mixture was concentrated under reduced pressure, and the resulting residue was purified by silica gel column chromatography (ethyl acetate / methanol, 100/0 to 97/3) to contain compound 58 (7.67 g, ethyl acetate 1.1 wt%). Yield 89%).
  • Example 63 1- ⁇ 3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -7-[(tert-butoxycarbonyl) amino] -5,6,7-trideoxy- ⁇ -L-xylo-heptofuranosyl ⁇ -5-methyl Pyrimidine-2,4 (1H, 3H) -dione (Compound 59 ) To a solution of compound 58 (7.67 g, 13.1 mmol) in THF (153 mL) was added dropwise 1M aqueous sodium hydroxide solution (32.8 mL, 32.8 mmol) under ice-cooling, the ice bath was removed and room temperature was 6 hours. Stir.
  • Example 64 1- ⁇ 3-O-benzyl-4-[(benzyloxy) methyl] -7-[(tert-butoxycarbonyl) amino] -5,6,7-trideoxy-2-O-[(trifluoromethyl) sulfonyl] - ⁇ -L-xylo-heptofuranosyl ⁇ -5-methylpyrimidine-2,4 (1H, 3H) -dione (compound 60 ) Pyridine (15.6 mL, 193 mmol) and DMAP (3130 mg, 25.6 mmol) are added to a solution of compound 59 (7.82 g, 12.8 mmol) in dichloromethane (63 mL), and trifluoromethanesulfonic anhydride is added under ice cooling.
  • Example 65 1- ⁇ (1R, 6R, 8R, 9S) -9- (Benzyloxy) -6-[(benzyloxy) methyl] -7-oxa-2-azabicyclo [4.2.1] non-8-yl ⁇ -5-methyl Pyrimidine-2,4 (1H, 3H) -dione (Compound 61 )
  • dichloromethane 124 mL
  • trifluoroacetic acid 41.2 mL, 535 mmol
  • Example 66 N- (9- ⁇ (1R, 5R, 7R, 8S) -8- (Benzyloxy) -5-[(Benzyloxy) methyl] -6-oxa-2-azabicyclo [3.2.1] oct-7-yl ⁇ - 9H-Purin-6-yl) benzamide (Compound 63 ) Compound 62 (1- ⁇ (1R, 5R, 7R, 8S) -8- (benzyloxy) -5-[(benzyloxy) methyl] -6-oxa-2-azabicyclo [3.2.1] oct-7-yl ⁇ - 3,5-di-O-benzyl-4-C according to the method described in 5-methylpyrimidine-2,4 (1H, 3H) -dione, J.
  • Example 67 9- ⁇ (1R, 5R, 7R, 8S) -8- (Benzyloxy) -5-[(benzyloxy) methyl] -6-oxa-2-azabicyclo [3.2.1] oct-7-yl ⁇ -2- [ (2-Methylpropanoyl) amino] -9H-purin-6-yl diphenylcarbamate (Compound 64 ) Analogously to Example 66, compound 62 (49.8 mg, 0.107 mmol) and [2- (2-methylpropanoylamino) -9H-purin-6-yl] N, N-diphenylcarbamate (133.
  • Example 68 N- (9- ⁇ (1R, 6R, 8R, 9S) -9- (benzyloxy) -6-[(benzyloxy) methyl] -7-oxa-2-azabicyclo [4.2.1] non-8-yl ⁇ - 9H-Purin-6-yl) benzamide (Compound 65 ) Compound 61 (49.7 mg, 0.104 mmol) and N- (9H-purin-6-yl) benzamide (74.7 mg, 0.312 mmol) were placed in 10 mL Nascor, and 1,2-dichloroethane (1 mL), BSA (0.230 mL, 0.941 mmol) was added. After stirring at 60 ° C.
  • TMSOTf (0.0050 mL, 0.026 mmol) was added, and the mixture was stirred at 60 ° C. for 3.5 hours.
  • the mixture was brought to room temperature, 3% aqueous sodium hydrogen carbonate solution (10 mL) and chloroform (15 mL) were added, and the mixture was stirred.
  • the organic layer was separated and extracted from the aqueous layer with CHCl3 (10 mL).
  • the organic layers were mixed and washed with tap water (10 mL).
  • the aqueous layer was extracted with CHCl3 (5 mL) and mixed with the organic layer.
  • the aqueous layer was extracted with chloroform (5 mL).
  • Example 69 9- ⁇ (1R, 6R, 8R, 9S) -9- (Benzyloxy) -6-[(benzyloxy) methyl] -7-oxa-2-azabicyclo [4.2.1] non-8-yl ⁇ -2- [ (2-Methylpropanoyl) amino] -9H-purin-6-yl diphenylcarbamate (Compound 66 ) Analogously to Example 68, compound 61 (50.1 mg, 0.105 mmol) and [2- (2-methylpropanoylamino) -9H-purin-6-yl] N, N-diphenylcarbamate (131.
  • Example 70 Compound obtained in synthesis and purification Example 32 oligonucleotide analogues 16Ab, compound 16 Me Ca obtained in Example 30, Compound 16Ga obtained in Example 28, and various commercially available phosphoramidites . Oligonucleotide analogues having various nucleobases were prepared using a 0.2 ⁇ mol scale CPG or polystyrene carrier with a DNA / RNA oligonucleotide automatic synthesizer nS-8 or nS-8II (both manufactured by Gene Design Co., Ltd.). 'Synthesized with terminal DMTr ON or OFF.
  • the coupling time of the acetonitrile solution (0.1M) of GuNA monomer is 8 minutes, and the other steps are performed under the normal oligonucleotide synthesis conditions of nS-8 or nS-8II. went.
  • the activator 5-ethylthio-1H-tetrazole (0.25 M) was used.
  • TTTT A TTTTT 5'-d (TTTT A TTTTT) -3 '( SEQ ID NO: 1) (A: guanidine crosslinked nucleic acid, compound 48) using a compound 16Ab obtained in Example 32, a polystyrene carrier 0.2 .mu.mol (LV -PS dT 0.2 ⁇ mol, manufactured by Glen Research) as a Boc-protected oligonucleotide.
  • the synthesized column was filled with a 20% trifluoroacetic acid methylene chloride solution and allowed to stand at room temperature for 1 hour. Methylene chloride and acetonitrile were sequentially passed to wash the carrier, and the carrier was preliminarily dried under a nitrogen stream, and dried under reduced pressure.
  • oligonucleotides that can form a double strand with the oligonucleotide oligonucleotides that are complementary sequences of compounds 51 to 58 and that do not contain guanidine cross-linked nucleic acids and have only natural nucleosides (from compound 67 , respectively) 74 ), and oligonucleotides (compounds 75 to 78 , respectively), which are complementary sequences of compounds 51 to 54 and do not contain guanidine-bridged nucleic acids and have only natural nucleosides, were synthesized according to normal oligonucleotide synthesis conditions. And purified.
  • Example 71 Measurement of Melting Temperature (Tm)
  • Tm Melting Temperature
  • a sample solution (130 ⁇ L) containing 100 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate buffer (pH 6.99), 4 ⁇ M oligonucleotide, and 4 ⁇ M complementary strand was obtained every minute from room temperature for the compounds listed in Table 2.
  • the temperature was lowered at a rate of 0.5 ° C. per minute and cooled to 5 ° C.
  • the compounds listed in Table 3 were heated in a boiling water bath, then allowed to stand and cooled to room temperature.
  • a nitrogen stream was passed through the cell chamber of the spectrophotometer (Shimadzu, UV-1650PC or UV-1800) to prevent condensation, and the sample solution was gradually cooled to 5 ° C and kept at 5 ° C for another 1 minute before measurement. Started. The temperature was gradually increased to 90 ° C. at a rate of 0.5 ° C. per minute, and the ultraviolet absorption at 260 nm was measured every 0.5 ° C. increase. In addition, in order to prevent the density
  • Table 2 Effect of 1-residue guanidine cross-linked nucleic acid introduction on Tm value *: Base sequence of complementary strand oligonucleotide: -Complementary strands of compounds 51 and 59: DNA / 5'-d (AGCAAAAAACGC) -3 '(compound 67 ) (SEQ ID NO: 12), RNA / 5′-r (AGCAAAAAACGC) -3 ′ (compound 75 ) (SEQ ID NO: 13), -Complementary strands of compounds 52 and 60: DNA / 5'-d (AGCAAATAACGC) -3 '(compound 68 ) (SEQ ID NO: 14), RNA / 5′-r (AGCAAATAACGC) -3 ′ (compound 76 ) (SEQ ID NO: 15), -Complementary strands of compounds 53 and 61: DNA / 5'-d (AGCAAAGAACGC) -3 '(compound 69 ) (
  • the oligonucleotide containing the guanidine-bridged artificial nucleic acid had excellent duplex formation ability not only for RNA but also for DNA at all bases. Further, for any base, the Tm value increased as the introduction ratio of the guanidine cross-linked artificial nucleic acid into the oligonucleotide increased. Therefore, the oligonucleotide into which the guanidine cross-linked artificial nucleic acid of the present invention is introduced is considered to be an oligonucleotide suitable for the antisense method.
  • the novel method for producing a crosslinked nucleic acid GuNA of the present invention can reduce the number of steps for producing the crosslinked nucleic acid GuNA, and can improve the yield of the crosslinked nucleic acid GuNA.
  • cross-linked artificial nucleic acids GuNA containing various kinds of nucleobases can be produced using the compounds as novel intermediates of the present invention.
  • the production method and intermediate compound of the present invention are useful for the efficient production of guanidine-crosslinked nucleic acid GuNA, and the guanidine-crosslinked artificial nucleic acid GuNA oligomer can be used for various medicines, diagnosis, and test research.
  • SEQ ID Nos: 1-12, 14, 16, 18, and 20-23 represent DNA oligonucleotides.
  • SEQ ID Nos: 13, 15, 17, and 19 represent RNA oligonucleotides.

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Abstract

本発明は、グアニジン架橋型人工核酸（以下、ＧｕＮＡと略す）の製造方法、およびその製造のための中間体化合物を提供する。具体的には、本発明は、一般式Ｉ：（式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及び環Ａは明細書に記載する通りである）で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、一般式II：（式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及び環Ａ'は明細書に記載する通りである）で表される化合物に還元剤を反応させることにより製造する方法を提供する。

Description

架橋型核酸ＧｕＮＡ、その製造方法および中間体化合物
　本発明は、架橋型核酸ＧｕＮＡのモノマー及びオリゴマー、その製造方法、並びにその製造ための中間体化合物に関する。
　核酸医薬による疾病の治療法として、アンチセンス法、アンチジーン法、アプタマーを用いる方法、ｓｉＲＮＡを用いる方法などがある。このうち、アンチセンス法は、疾病に関わるｍＲＮＡと相補的なオリゴヌクレオチド（アンチセンス鎖）を外部から導入し、二重鎖を形成させることにより、病原ＲＮＡの翻訳過程を阻害し、疾病の治療や予防を行う手法である。ｓｉＲＮＡを用いる方法もアンチセンス法に類似しており、生体に投与した二重鎖ＲＮＡによりｍＲＮＡからタンパク質への翻訳を阻害する。一方、アンチジーン法は、病原ＲＮＡを転写するＤＮＡ部位に対応する三重鎖形成オリゴヌクレオチドを外部から導入することによりＤＮＡからＲＮＡへの転写を抑制する。また、アプタマーは疾病の原因となるタンパク質などの生体成分と特異的に結合することにより該タンパク質の活性を調節して機能を発揮する。
　こうした核酸医薬の素材として、種々の人工核酸が開発されているが、未だ切札となるべき分子が存在しない。例えば、これまでに開発されてきた核酸医薬の素材として、ホスホロチオエート（Phosphorothioate：Ｓ－ＰＯ３）型オリゴヌクレオチド（Ｓ－オリゴ）、２’，４’－ブリッジド（架橋）核酸（bridged nucleic acid）（ＢＮＡ）／２’，４’－ロックト核酸（locked nucleic acid）（ＬＮＡ）（特許文献１から４および非特許文献１から６）などがある。Ｓ－オリゴは、サイトメガロウイルスに対するアンチセンス医薬品として、既に米国で上市されている。これは、高いヌクレアーゼ耐性を有するものの、標的核酸鎖との結合親和性が低いという難点を有しており、改善が必要である。これまでに開発されている２’，４’－ＢＮＡ／ＬＮＡは、いずれも標的核酸鎖との結合親和性が高く、これからの核酸医薬の素材として最も期待される分子である。しかしながら、ヌクレアーゼに対する耐性が十分ではなく、生体内での安定性という点で改良の余地がある。
　人工核酸の１つとして２’－アミノＬＮＡが報告されている（非特許文献７）。ヌクレアーゼ耐性を有し、標的核酸鎖との結合親和性が高く、前記ＬＮＡと同様に核酸医薬の素材として最も期待される分子である。しかしながら、オリゴヌクレオチドを合成するための原料となりうる適切な置換基を備えたヌクレオシドとしては、チミニルまたは５－メチル－シトシニルを有するヌクレオチドしか知られていない（非特許文献８）。
　また、別の人工核酸として、Aza-ENAが報告されている（非特許文献９）。架橋を構成する炭素原子が２’－アミノＬＮＡより、１つ増えた構造を有しており、その核酸の塩基部分はチミニルのみしか知られていない。
　さらに別の人工核酸としてグアニジン架橋型人工核酸（ＧｕＮＡ）が挙げられる。これまで、グアニジン架橋型人工核酸（ＧｕＮＡ）については、核酸塩基部分としてチミニルを含むＧｕＮＡが知られている（特許文献５）。しかしながら、チミニル以外の核酸塩基部分を含むＧｕＮＡは知られていない。また、ＧｕＮＡの製造は多段階を要し、そのため効率よく製造することは容易ではなかった。また、ＧｕＮＡに類似する人工核酸として、ＧＥＮＡが報告されている（非特許文献１０）。架橋を構成する炭素原子がＧｕＮＡより、１つ増えた構造を有しており、その核酸の塩基部分はチミニルのみしか知られていない。
　これまで知られるＧｕＮＡの製造方法は、非特許文献１１に記載されているが、多段階の工程数を必要とし、ＧｕＮＡの生成収率も十分な収率ではなかった。その製造経路を下記に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000037
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000038
国際公開第９８／３９３５２号 国際公開第２００５／０２１５７０号 国際公開第２００３／０６８７９５号 国際公開第２０１１／０５２４３６号 国際公開第２０１４／０４６２１２号
C. Wahlestedtら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA，2000年，97巻，10号，5633-5638頁 Y. Hariら、Bioorg. Med. Chem.，2006年，14巻，1029-1038頁 K. Miyashitaら、Chem. Commun.，2007年，3765-3767頁 S.M.A. Rahmanら、J. Am. Chem. Soc.，2008年，130巻，14号，4886-4896頁 M. Kuwaharaら、Nucleic Acids Res.，2008年，36巻，13号，4257-4265頁 S. Obikaら、Bioorg. Med. Chem.，2001年，9巻，1001-1011頁 S.K. Singhら、J. Org. Chem. 1998， 63， 6078-6079頁 Christoph Rosenbohmら、Org. Biomol. Chem.，2003年，１巻，655-663頁 Oommen P. Vargheseら、J. AM. CHEM. SOC. 2006年, 128巻, 15173-15187頁 Jharna Barmanら、RSC Advances, 2015年, 16巻, 12257-12260頁 Ajaya R. Shresthaら、Chem. Commun. 2014年， 50巻， 575-577頁
　本発明は、グアニジン架橋型人工核酸（以下、ＧｕＮＡと略す）の製造方法、およびその製造のための中間体化合物、およびＧｕＮＡのモノマーやオリゴマーに関する。
　前記課題を解決するために本発明者等は鋭意研究の結果、下記に示す通り、従来の製造方法と比較して工程数が少なく、ＧｕＮＡの収率が改善されたＧｕＮＡの新規な製造方法、およびその製造方法に有用な新規な中間体化合物を見出し、本発明を完成した。
　すなわち、本発明は、以下の項〔１〕～〔８９〕に関するものであるが、これらに限定されるものではない。
項〔１〕
　一般式Ｉ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000039
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000040
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Ｉのものと同じ意味を示し、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物に還元剤を反応させ、環Ａ’に縮合するオキサゾリジン環を開裂させる工程を含む、製造方法。
項〔２〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａがチミニルもしくはウラシニルであり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000041
 であり、そして還元剤がＰｈ３Ｐである項１に記載の製造方法。
項〔３〕
　一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000042
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩の製造方法であって、項１または２に記載の工程を含む製造方法。
項〔４〕
　一般式Ｉ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000043
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立してベンジル（Ｂｎ）基、２－ナフチルメチル基、p－メトキシベンジル基、３，４－ジメトキシベンジル基、２，６－ジメトキシベンジル基またはｐ－フェニルベンジル基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩。
項〔５〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである項４に記載の化合物またはその塩。
項〔６〕
　一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000044
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩。
項〔７〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、そして環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２である項６に記載の化合物またはその塩。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000045
 項〔８〕
　一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000046
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式III：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000047
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及び環Ａ’は各々一般式IIのものと同じ意味を示す。］
で表される化合物にアジド化剤を反応させる工程を含む、製造方法。
項〔９〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２であり、そしてアジド化剤がＤＰＰＡである項８に記載の製造方法。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000048
 項〔１０〕
　一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000049
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、そしてＲ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩の製造方法であって、項８または９に記載の工程を含む製造方法。
項〔１１〕
　一般式III：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000050
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして、環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩。
項〔１２〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２である項１１に記載の化合物またはその塩。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000051
 項〔１３〕
　一般式IV：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000052
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式Ｖ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000053
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｘ及びｍは各々一般式IVのものと同じ意味を示し、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させて、一般式Ｖ中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化する工程を含む製造方法。
項〔１４〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ基（Ｍｓ－Ｏ－）であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルであり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２であり、そして水酸基の活性化剤がトリフルオロメタンスルホニルクロリドである項１３に記載の製造方法。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000054
 項〔１５〕
　一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000055
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩の製造方法であって、項１３または１４に記載の工程を含む製造方法。
項〔１６〕
　一般式IV：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000056
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩。
項〔１７〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ基（Ｍｓ－Ｏ－）であり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２である項１６に記載の化合物またはその塩。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000057
 〔１８〕
　一般式Ｖ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000058
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩。
項〔１９〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ基（Ｍｓ－Ｏ－）であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルである項１８に記載の化合物またはその塩。
項〔２０〕
　一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000059
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式IV：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000060
 ［式中、Ｘは脱離基であり、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及び環Ａ’は各々一般式IIのものと同じ意味を示す。］
で表される化合物にアジド化剤を反応させる工程を含む、製造方法。
項〔２１〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ基（Ｍｓ－Ｏ－）であり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２であり、そしてアジド化剤がｎＢｕ４ＮＮ３またはアジ化ナトリウムである項２０に記載の製造方法。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000061
 項〔２２〕
　一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000062
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、そしてＲ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩の製造方法であって、項２０または２１に記載の工程を含む製造方法。
項〔２３〕
　一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000063
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式VI:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000064
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式IIのものと同じ意味を示し、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させて、一般式VI中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化する工程を含む、製造方法。
項〔２４〕
　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルであり、環Ａ’が、下記構造式II－１またはII－２であり、そして水酸基の活性化剤がトリフルオロメタンスルホニルクロリドである項２３に記載の製造方法。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000065
 項〔２５〕
　一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000066
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩の製造方法であって、項２３または２４記載の工程を含む製造方法。
項〔２６〕
　一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000067
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。（但し、ｍ＝１であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＢｏｃ基、Ｒ１０がＢｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるもの、およびｍ＝２であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＣｅｏｃ基、Ｒ１０がＣｅｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるものを除く。）］
で表される化合物またはその塩。
項〔２７〕
　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｒ７がＤＭＴｒ基であり、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基であり、Ｒ９がＴｅｏｃ基またはＢｏｃ基であり、Ｒ１０がＴｅｏｃ基またはＢｏｃ基であり、そしてＲ１１が水素原子である項２６に記載の化合物またはその塩。
項〔２８〕
　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｒ７がＤＭＴｒ基であり、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基であり、Ｒ９がＴｅｏｃ基であり、Ｒ１０がＴｅｏｃ基であり、そしてＲ１１が水素原子である項２６に記載の化合物またはその塩。
項〔２９〕
　一般式VIII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000068
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ１２及びＲ１３は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式IX：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000069
 ［式中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式VIIIのものと同じ意味であり、Ｒ１４及びＲ１５は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物の環ＡをＢに置換する工程を含む、製造方法。
項〔３０〕
　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４及びＲ１５がすべてＢｎ基であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである項２９に記載の製造方法。
項〔３１〕
　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニン、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ１２がＤＭＴｒ基、Ｒ１３がＴＭＳ基、Ｒ１４がＤＭＴｒ基、Ｒ１５が水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである項２９に記載の製造方法。
項〔３２〕
　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ１２がＴＭＳ基、Ｒ１３がＴＭＳ基、Ｒ１４が水素原子、Ｒ１５が水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである項２９に記載の製造方法。
項〔３３〕
　一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000070
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩の製造方法であって、項２９から３２のいずれか１つ以上に記載の工程を含む製造方法。
項〔３４〕
　一般式VIII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000071
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ１２はＢｎ基、ＤＭＴｒ基、またはＴＭＳ基であり、Ｒ１３はＢｎ基、水素原子、またはＴＭＳ基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩。
項〔３５〕
　Ｂが１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、そしてＲ１２及びＲ１３が各々Ｂｎ基である、項３４に記載の化合物またはその塩。
項〔３６〕
　Ｂが１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｒ１２がＤＭＴｒ基であり、そしてＲ１３が水素原子である、項３４に記載の化合物またはその塩。
項〔３７〕
　一般式Ｘ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000072
 ［式中、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチド（但し、ｍ＝１または２の場合、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が各々水素原子であるヌクレオシドのみを架橋型核酸として有するオリゴヌクレオチドを除く。）の製造方法であって、
一般式XI：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000073
 ［式中、Ｂ、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Ｘのものと同じ意味であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ２０は１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物からホスホラミダイト法により製造する方法。
項〔３８〕
　Ｂが１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ７が水酸基の保護基であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が水素原子であり、Ｒ２０が－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基であり、そしてＲ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立してアミノ基の保護基である、項３７に記載の製造方法。
項〔３９〕
　一般式Ｘ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000074
 ［式中、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチド（但し、ｍ＝１または２の場合、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が各々水素原子であるヌクレオシドのみを架橋型核酸として有するオリゴヌクレオチドを除く。）またはその塩。
項〔４０〕
　Ｂがアデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニル、チミニルまたはウラシニルであり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が水素原子である、項３９に記載のオリゴヌクレオチドまたはその塩。
項〔４１〕一般式XII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000075
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｄ１は、Ｎ３、水酸基又は-Ｘ（-Ｘは脱離基であり、好ましくは水酸基の脱離基であり、メタンスルホニルオキシ（メシルオキシ；Ｍｓ－Ｏ－）基、トリフルオロメタンスルホニルオキシ基、p－トルエンスルホニルオキシ基等が例示されるが、これに限定されない。）であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい（「５から７員環の不飽和ヘテロ環」の置換基は、好ましくは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、又はハロゲン原子である。）。］
で表される化合物またはその塩。
項〔４２〕Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子、またはＣ１－６アルキル基である項４１に記載の化合物またはその塩。
項〔４３〕Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子である項４１又は４２に記載の化合物またはその塩。
項〔４４〕Ｒ１及びＲ２は各々独立して、Ｂｎ基、４，４'－ジメトキシトリチル（ＤＭＴｒ）基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、ｔ－ブチルジフェニルシリル基、トリフルオロメタンスルホニル基、トリメチルシリル基、又はメタンスルホニル基等である項４１から４３のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。
項〔４５〕環Ａ’が、１つ以上の置換基で置換されてもよい６員環の不飽和ヘテロ環であり、好ましくは以下の構造II－１またはII－２を有するヘテロ環である項４１から４４のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000076
 項〔４６〕Ｄ１がＮ３である項４１から４５のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。
項〔４７〕Ｄ１が水酸基である項４１から４５のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。
項〔４８〕Ｄ１が-Ｘ（脱離基）である項４１から４５のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。当該脱離基は、好ましくは水酸基の脱離基であり、メタンスルホニルオキシ（メシルオキシ；Ｍｓ－Ｏ－）基、トリフルオロメタンスルホニルオキシ基、p－トルエンスルホニルオキシ基等が例示されるが、これに限定されない。
項〔４９〕項４６に記載の化合物に還元剤を反応させることにより、一般式Ｉ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000077
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成していてもよい。]
で表される化合物を製造する方法。本製造方法に用いられる還元剤は、ホスフィン類であり、好ましくはＰｈ３Ｐである。また、環Ａは好ましくはチミニル若しくはウラシニルである。
項〔５１〕項４７に記載の化合物に、アジド化剤を反応させることにより項４６に記載の化合物を製造する方法を含む、項４６に記載の化合物又はその塩の製造方法。本製造方法に用いられるアジド化剤は、アジ化水素酸、アジ化ナトリウム、アジ化リチウム、テトラブチルアンモニウムアジド、トリメチルシリルアジド、ジフェニルホスホリルアジド（ＤＰＰＡ）、ニコチニルアジド、アジ化亜鉛（Ｚｎ（Ｎ３）２）であり、好ましくはＤＰＰＡである。
項〔５２〕項４８に記載の化合物に、アジド化剤を反応させることにより項４６に記載の化合物を製造する方法を含む、項４６に記載の化合物又はその塩の製造方法。本製造方法に用いられるアジド化剤は、例えば、ｎＢｕ４ＮＮ３又はアジ化ナトリウムであるがこれに限定されない。
項〔５３〕一般式VI：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000078
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。]
で表される化合物に、水酸基の活性化剤を反応させることにより項４６に記載の化合物を製造する方法を含む、項４６に記載の化合物またはその塩の製造方法。本製造方法に用いられる水酸基の活性化剤は、例えば、トリフルオロメタンスルホニルクロリド、メタンスルホニルクロリドまたはトリフルオロメタンスルホン酸無水物であるがこれに限定されない。
項〔５４〕一般式Ｖ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000079
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして、環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。]
で表される化合物に、水酸基の活性化剤を反応させることにより項４８に記載の化合物を製造する方法を含む、項４８に記載の化合物又はその塩の製造方法。本製造方法に用いられる水酸基の活性化剤は、例えば、メタンスルホニルクロリドであるがこれに限定されない。
項〔５５〕項４９から５４のいずれか１つに記載の製造方法を含む一般式VII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000080
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、又は１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］で表される化合物またはその塩の製造方法。
項〔５６〕項４９から５５のいずれか１つに記載の製造方法を含むグアニジン架橋型人工核酸の製造方法。グアニジン架橋型人工核酸とは、一般式Ｘ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000081
 ［式中、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８は各々独立して水素原子、又は１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、アミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチドであり、
一般式XI：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000082
 ［式中、Ｂ、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Ｘのものと同じ意味であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ２０は１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、そしてＲ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基である。］に記載の化合物からホスホラミダイト法により製造されうる核酸である。
項〔５７〕
　一般式XIII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000083
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水素原子又は水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そしてＤは、環Ａ（式中、環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。）又はＢ（１つ以上の置換基で置換されていてよい核酸の塩基部分）である。〕
で表される化合物またはその塩。
項〔５８〕Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６が各々水素原子である項５７に記載の化合物またはその塩。
項〔５９〕Ｄが環Ａである項５７又は５８に記載の化合物またはその塩。
項〔６０〕環Ａがチミニルまたはウラシニルである項５９に記載の化合物またはその塩。
項〔６１〕Ｒ１及びＲ２が各々独立した水酸基の保護基である項５９または６０に記載の化合物またはその塩。
項〔６２〕Ｒ１及びＲ２は各々独立してＢｎ基、２－ナフチルメチル基、p－メトキシベンジル基、３，４－ジメトキシベンジル基、２，６－ジメトキシベンジル基またはｐ－フェニルベンジル基である、項６１に記載の化合物またはその塩。
項〔６３〕項５９から６２のいずれか１つに記載の化合物が以下から選択される化合物またはその塩；
1-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン及び1-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン
項〔６４〕ＤがＢ（Ｂは、1つ以上の置換基で置換されていてよい核酸の塩基部分。）である、項５７又は５８に記載の化合物またはその塩。
項〔６５〕Ｂが１つ以上の置換基で置換されていてよいアデニニル、１つ以上の置換基で置換されていてよいグアニニル、１つ以上の置換基で置換されていてよいシトシニル、１つ以上の置換基で置換されていてよい５－メチルシトシニル、１つ以上の置換基で置換されていてよいチミニルまたは１つ以上の置換基で置換されていてよいウラシニルである項６４に記載の化合物またはその塩。
項〔６６〕Ｒ１が水酸基の保護基である項６４または６５に記載の化合物またはその塩。
項〔６７〕Ｒ１がＢｎ基、ＤＭＴｒ基又はＴＭＳ基のいずれかである項６６に記載の化合物またはその塩。
項〔６８〕Ｒ２が水酸基の保護基である項６４から６７のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。
項〔６９〕Ｒ２がＢｎ基である項６８に記載の化合物またはその塩。
項〔７０〕Ｒ２がＴＭＳ基である項６８に記載の化合物またはその塩。
項〔７１〕Ｒ２が水素原子である項６４から６７のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。
項〔７２〕項６４から７１のいずれか１つに記載の化合物が以下から選択される化合物またはその塩：
1-[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒドロキシ-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル]-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン
項〔７３〕
　一般式IX：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000084
 ［式中、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ１４及びＲ１５は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物の環Ａを置換することにより項６４に記載の化合物を製造する方法を含む、項６４に記載の化合物またはその塩の製造方法。
　本製造方法において、好ましくは、Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルである。また、環Ａは、好ましくは、チミニルまたはウラシニルである。Ｒ１４、Ｒ１５及びＲ１６は好ましくはすべてＢｎ基であるか、又はＲ１４がＤＭＴｒ基、Ｒ１５がＴＭＳ基、およびＲ１６が水素原子であるが、これに限定されない。本製造において環Ａを置換する方法とはルイス酸を用いる方法、好ましくはルイス酸およびシリル化剤を用いる方法があるがこれらに限定されない。
項〔７４〕項７３に記載の製造方法を含む一般式VII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000085
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、又は１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩の製造方法。
項〔７５〕項６２又は６３に記載の製造方法を含むグアニジン架橋型人工核酸の製造方法であって、該グアニジン架橋型人工核酸とは、一般式Ｘ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000086
 ［式中、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、又はアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチドであり、
一般式XI：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000087
 ［式中、Ｂ、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Ｘのものと同じ意味であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、そしてＲ２０は１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基である。］
に記載の化合物からホスホラミダイト法により製造されうる核酸である、該製造方法。
項〔７６〕
　一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000088
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。（但し、ｍ＝１であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＢｏｃ基、Ｒ１０がＢｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるもの、およびｍ＝２であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＣｅｏｃ基、Ｒ１０がＣｅｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるものを除く。）］
で表される化合物またはその塩。
項〔７７〕Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいチミニル、アデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニルまたはウラシニルである項７６に記載の化合物またはその塩。
項〔７８〕Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子である項７６又は７７に記載の化合物またはその塩。
項〔７９〕Ｒ７が水酸基の保護基である項７６から７８のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。Ｒ７の水酸基の保護基は、好ましくは炭素数１から６のアルキル基、炭素数１から６のアルコキシ基、ハロゲン原子および／またはシアノ基で置換された１から３個のアリール基で置換されたメチル基であり、更に好ましくはＤＭＴｒ基であるがこれに限定されない。
項〔８０〕Ｒ８が水素原子である項７６から７９のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。
項〔８１〕Ｒ８が１つ以上の置換基で置換されていてよいリン酸基である項７６から７９のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。当該リン酸基は好ましくは－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基であるがこれに限定されない。
項〔８２〕Ｒ９及びＲ１０が各々独立してアミノ酸の保護基である項７６から８１のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。当該アミノ酸の保護基は、好ましくはＴｅｏｃ基またはＢｏｃ基であるがこれに限定されない。
項〔８３〕Ｒ１１が水素原子である項７６から８２のいずれか１つに記載の化合物またはその塩。
項〔８４〕Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルである項７６に記載の化合物またはその塩。
項〔８５〕Ｒ９及びＲ１０がＴｅｏｃ基である、項８４に記載の化合物またはその塩。
項〔８６〕
　一般式Ｘ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000089
 ［式中、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチド（但し、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が各々水素原子であるヌクレオシドのみを架橋型核酸として有するオリゴヌクレオチドを除く。）またはその塩。
項〔８７〕Ｂがアデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニル、チミニルまたはウラシニルである項８６に記載のオリゴヌクレオチドまたはその塩。
項〔８８〕Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が水素原子である項８６または８７に記載のオリゴヌクレオチドまたはその塩。
項〔８９〕一般式XI：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000090
 ［式中、Ｂ、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Ｘのものと同じ意味であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、そしてＲ２０は１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、そしてＲ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基である。］
で表される化合物からホスホラミダイト法により製造する方法を含む、項８６から８９のいずれか１つに記載のオリゴヌクレオチドまたはその塩の製造方法。
　本発明の製造方法は、従来の製造方法と比較して工程数を大幅に短縮することができ、またＧｕＮＡの生成収率を大きく改善できる。本発明の核酸塩基置換方法により、チミニル以外の各種核酸塩基を有するＧｕＮＡを効率よく、かつ好適なβ体選択的に製造することができる。本発明の製造方法により、他の各種核酸塩基を有するＧｕＮＡモノマーを含むＧｕＮＡオリゴマー、例えばアデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニルまたはウラシニルの塩基部分を有するＧｕＮＡモノマー及びこれらのＧｕＮＡモノマーを含むＧｕＮＡオリゴマーを製造することができる。本発明の中間体化合物は各種核酸塩基のＧｕＮＡの製造に有用である。
　本発明の中間体化合物には２’－アミノＬＮＡのモノマーが含まれる。本発明の核酸塩基置換方法により、アデニニル、チミニルのみではなく、他の各種核酸塩基を有する２’－アミノＬＮＡ、例えば、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニルまたはウラシニルの塩基部分を有する２’－アミノＬＮＡを製造することができる。
　本発明により製造された各種核酸塩基を有する２’－アミノＬＮＡのモノマーを使用して２’－アミノＬＮＡのオリゴマーを製造することができる。２’－アミノＬＮＡのオリゴマーはヌクレアーゼに耐性であり、相補的な配列を有する核酸に強固に結合することから、核酸を用いた医薬品として各種疾患の治療、軽減、予防、再発予防及び診断、並びに核酸を用いた試薬として各種検査や試験に広く利用することができる。
　本発明により製造されたＧｕＮＡはヌクレアーゼに著しく耐性であり、相補的な配列を有する核酸に強固に結合し、さらに細胞内へ効率よく移行することから、核酸を用いた医薬品として各種疾患の治療、軽減、予防、再発予防及び診断、並びに核酸を用いた試薬として各種検査や試験に広く利用することができる。
　以下に、本発明をさらに詳細に説明する。なお、本明細書において引用された全ての刊行物は、参照として本明細書に組み込まれる。
（定義）
　まず、本明細書中で用いられる用語を定義する。
　本明細書において、用語「１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル」は、炭素数１から６（Ｃ１－６）、好ましくは炭素数１から４（Ｃ１－４）の任意の直鎖アルキル基、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数３から６の任意の分岐鎖アルキル基、炭素数３から６の任意の環状アルキル基、および炭素数４から６のこれらの組み合わせを包含する。例えば、炭素数１から６の任意の直鎖アルキル基の具体例としては、メチル基、エチル基、ｎ－プロピル基、ｎ－ブチル基、ｎ－ペンチル基、ｎ－ヘキシル基などが挙げられ、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数３から６の任意の分岐鎖アルキル基の具体例としては、イソ（「ｉ」と略す）プロピル基、イソブチル基、ｔｅｒｔ（「ｔ」と略す）－ブチル基、ｓｅｃ（「ｓ」と略す）－ブチル基、ネオペンチル基、イソペンチル基などが挙げられ、そして炭素数３から６の任意の環状アルキル基としては、３～６員単環式シクロアルキル基が好ましく、具体例としては、シクロプロピル基、シクロブチル基、シクロペンチル基、シクロヘキシル基などが挙げられるが、これらに限定されない。置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　本明細書において、用語「１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル」は、炭素数２から６（Ｃ２－６）、好ましくは炭素数２から４（Ｃ２－４）の任意の直鎖アルケニル基、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数３から６の任意の分岐鎖アルケニル基、炭素数３から６の任意の環状アルケニル基、および炭素数４から６のこれらの組み合わせを包含する。例えば、炭素数２から６の任意の直鎖アルケニル基の具体例としては、エテニル基、１－プロペニル基、２－プロペニル基、１－ブテニル基、２－ブテニル基、１－ペンテニル基、２－ペンテニル基、３－ペンテニル基、４－ペンテニル基、１－ヘキセニル基などが挙げられ、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数３から６の任意の分岐鎖アルケニル基の具体例としては、イソプロペニル基、１－メチル－１－プロペニル基、１－メチル－２－プロペニル基、２－メチル－１－プロペニル基、２－メチル－２－プロペニル基、１－メチル－２－ブテニル基などが挙げられ、そして炭素数３から６の任意の環状アルケニル基としては、３～６員単環式シクロアルケニル基が好ましく、具体例としては、シクロプロペニル基、シクロブテニル基、シクロペンテニル基、シクロヘキセニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　本明細書において、用語「１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル」は、炭素数２から６（Ｃ２－６）、好ましくは炭素数２から４（Ｃ２－４）の任意の直鎖アルキニル基、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数３から６の任意の分岐鎖アルキニル基、炭素数３から６の任意の環状アルキニル基、および炭素数４から６のこれらの組み合わせを包含する。例えば、炭素数２から６の任意の直鎖アルキニル基の具体例としては、エチニル基、１－プロピニル基、２－プロピニル基、１－ブチニル基、２－ブチニル基、１－ペンチニル基、２－ペンチニル基、３－ペンチニル基、４－ペンチニル基、１－ヘキシニル基などが挙げられ、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数３から６の任意の分岐鎖アルキニル基の具体例としては、イソプロピニル基、１－メチル－１－プロピニル基、１－メチル－２－プロピニル基、２－メチル－１－プロピニル基、２－メチル－２－プロピニル基、１－メチル－２－ブチニル基などが挙げられ、そして炭素数３から６の任意の環状アルキニル基としては、３～６員単環式シクロアルキニル基が好ましく、具体例としては、シクロブチニル基、シクロペンチニル基、シクロヘキシニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　本明細書において、用語「Ｃ１－６アルコキシ基」とは、Ｃ１－６アルキルが酸素原子と結合した１価基をいい、Ｃ１－６アルキル－Ｏ基を意味する。具体例としては、メトキシ基、エトキシ基、ｎ－プロポキシ基、ｉ－プロポキシ基、ｎ－ブトキシ基、ｔ－ブトキシ基、ｓ－ブトキシ基、３－メチルブトキシ基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「ハロゲン（原子）」としては、例えば、フッ素原子（フルオロ）、塩素原子（クロロ）、臭素原子（ブロモ）、またはヨウ素原子（ヨード）が挙げられる。
　本明細書において、用語「アリール（基）」とは、芳香族炭化水素から誘導された官能基または置換基であり、複数の環からなるものも含み、具体的には芳香族炭化水素基から水素原子１個を除いた炭素数６～１４の１価の基を意味し、例えば、フェニル基、インデニル基、ナフチル基、フェナンスレニル基、アントラセニル基などが挙げられる。また、アリール環が、ハロゲン原子、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、水酸基、Ｃ１－６アルコキシ基、アリールオキシ基、アミノ基、ニトロ基、トリフルオロメチル基、フェニル基等の１種以上の基によって置換されていてもよく、そのような置換されていてもよいアリール基としては、例えば、２－メチルフェニル基、３－メチルフェニル基、４－メチルフェニル基、２，６－ジメチルフェニル基、２，４－ジメチルフェニル基、２－クロロフェニル基、４－クロロフェニル基、２，４－ジクロロフェニル基、２，５－ジクロロフェニル基、２，６－ジクロロフェニル基、２－ブロモフェニル基、４－メトキシフェニル基、４－クロロ－２－ニトロフェニル基、４－ニトロフェニル基、２－ニトロフェニル基、２，４－ジニトロフェニル基、ビフェニル基などが挙げられる。好適なアリール基としては、ハロゲン原子、Ｃ１－６アルコキシ基、もしくはニトロ基で置換されたフェニル基、または無置換フェニル基などが挙げられる。
　本明細書において、用語「ヘテロアリール（基）」とは環構造にヘテロ原子（例えば、窒素原子、酸素原子、および／または硫黄原子）を含む炭素数３～１２の任意の複素芳香族化合物から水素原子１個を除いた１価の基を意味し、ピリジル基、ピリミジニル基、ピリダジニル基、ピロリル基、イソキノリル基、キノリル基、インドリル基、イミダゾリル基、トリアゾリル基、フリル基、チエニル基などが挙げられる。また、ヘテロアリール環が、ハロゲン原子、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、水酸基、Ｃ１－６アルコキシ基、アリールオキシ基、アミノ基、ニトロ基、トリフルオロメチル基、フェニル基等の１種以上の基によって置換されていてもよい。
　本明細書において、本発明化合物、中間体化合物、原料化合物等に官能基（例えば、水酸基、アミノ基、カルボキシル基等）を有する場合は、Theodora W. Greene， Peter G. M. Wuts， "Protective Groups in Organic Synthesis" 4th. ed.， John Wiley & Sons， Inc.， 1999に記載の方法に準じて、有機合成化学において通常用いる保護基で保護し、反応後、当該保護基を除去することにより、目的とする化合物を得ることができる。保護基としては、同書に記載された有機合成化学において通常用いる保護基が挙げられ、官能基毎の保護基については、下記に記載する。
　本明細書において、「水酸基の保護基」、「アミノ基の保護基」、「リン酸基の保護基」、「メルカプト基の保護基」内に記載される用語「保護基」とは、核酸合成の際に安定してアミノ基、水酸基、リン酸基またはメルカプト基を保護し得るものであれば、特に制限されない。具体的には、酸性または中性条件で安定であり、加水素分解、加水分解、電気分解、および光分解のような化学的方法により開裂し得る保護基のことをいう。このような保護基としては、例えば、炭素数１から６のアルキル基；炭素数２から６のアルケニル基；炭素数２から６のアルキニル基；アシル基；テトラヒドロピラニル基またはテトラヒドロチオピラニル基；テトラヒドロフラニル基またはテトラヒドロチオフラニル基；シリル基；炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたメチル基；炭素数１から６のアルコキシ基で置換された炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたメチル基；ハロゲン原子で置換された炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたメチル基；炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたエチル基；ハロゲン原子で置換されたエチル基；１から３個のアリール基で置換されたメチル基；炭素数１から６のアルキル基、炭素数２から６のアルケニル基、炭素数２から６のアルキニル基、炭素数１から６のアルコキシ基、ハロゲン原子および／またはシアノ基で置換された１から３個のアリール基で置換されたメチル基；炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたカルボニル基；ハロゲン原子、炭素数１から６のアルコキシ基および／またはニトロ基で置換されたアリール基；ハロゲン原子および／または炭素数１から６の３個のアルキル基で置換されたシリル基で置換された炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたカルボニル基；アルケニルオキシカルボニル基；炭素数１から６のアルコキシ基および／またはニトロ基で置換されたアリール基で置換されてもよいアラルキルオキシカルボニル基などが挙げられる。
　「水酸基の保護基」としては、有機合成化学（特に、核酸合成）において通常用いる保護基をいい、例えば、脂肪族アシル基；芳香族アシル基；置換されていてよいアミノカルボニル基；置換されていてよいアルコキシカルボニル基；脂肪族スルホニル基；芳香族スルホニル基；１から３個のアリール基で置換されたメチル基；炭素数１から６のアルキル基、炭素数１から６のアルコキシ基、ハロゲン原子および／またはシアノ基で置換された１から３個のアリール基で置換されたメチル基；またはシリル基が挙げられる。具体例としては、ベンジル（Ｂｎ）基、４，４'－ジメトキシトリチル（ＤＭＴｒ）基、４－メトキシトリチル基、トリフェニルメチル基、２－ナフチルメチル基、ジフェニルアミノカルボニル（ＤＰＣ）基、シアノエトキシカルボニル基、テトラヒドロピラニル基、トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、ｔ－ブチルジフェニルシリル基、トリフェニルシリル基、４－メトキシベンジル（p-メトキシベンジル）基、３，４－ジメトキシベンジル基、２，６－ジメトキシベンジル基、ｐ－フェニルベンジル基、メタンスルホニル基、トリフルオロメタンスルホニル基、メトキシメチル基、ベンゾイル（Ｂｚ）基、またはアセチル基等が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、ベンジル（Ｂｎ）基、４，４'－ジメトキシトリチル（ＤＭＴｒ）基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、ｔ－ブチルジフェニルシリル基、トリメチルシリル（ＴＭＳ）基、ジフェニルアミノカルボニル（ＤＰＣ）基、メタンスルホニル基、トリフルオロメタンスルホニル基が好ましい。
　本明細書において「１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基」とは、保護基を有していてもよい水酸基を包含し、当該置換基は、例えば、前記の水酸基の保護基、Ｃ１－６アルキル基、置換されていてもよいアリール基、置換されていてもよいヘテロアリール基であり、好ましい水酸基の保護基としてはＢｎ基、ＤＰＣ基、ＤＭＴｒ基、４－メトキシトリチル基、トリフェニルメチル基、２－ナフチルメチル基、シアノエトキシカルボニル基、テトラヒドロピラニル基、トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、ｔ－ブチルジフェニルシリル基、トリメチルシリル基、４－メトキシベンジル基、３，４－ジメトキシベンジル基、ベンゾイル（Ｂｚ）基、アセチル基であり、好ましいＣ１－６アルキルとしてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ｓｅｃ－ブチル基、ｔ－ブチル基、ペンチル基、イソペンチル基であり、好ましいアリールとしては、フェニル基、ビフェニル基、ナフチル基、アントラセニル基であり、好ましいヘテロアリール基としてはピリジル基、ピリミジニル基、ピリダジニル基、ピロリル基、イソキノリル基、キノリル基、インドリル基、イミダゾリル基、ベンズイミダゾリル基、トリアゾリル基、フリル基、チエニル基などが挙げられる。また、置換されてもよいアリール基、置換されていてもよいヘテロアリール基の置換基としては、ハロゲン原子、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、水酸基、Ｃ１－６アルコキシ基、アリールオキシ基、アミノ基、ニトロ基、トリフルオロメチル基、フェニル基等が挙げられ、これらの１種以上の基によって置換されていてもよい。
　「アミノ基の保護基」としては、有機合成化学（特に、核酸合成）において通常用いる保護基をいい、例えば、脂肪族アシル基；芳香族アシル基；置換されていてよいアルコキシカルボニル基；１から３個のアリール基で置換されたメチル基；ハロゲン原子および／またはシアノ基で置換された１から３個のアリール基で置換されたメチル基が挙げられる。具体例としては、アセチル（Ａｃ）基、フェノキシアセチル（Ｐａｃ）基、プロピオニル基、イソブチリル基、ベンゾイル（Ｂｚ）基、メトキシカルボニル基、エトキシカルボニル基、ｔ－ブトキシカルボニル（Ｂｏｃ）基、トリメチルシリルエトキシカルボニル（Ｔｅｏｃ）基、シアノエトキシカルボニル（Ｃｅｏｃ）基、ベンジルオキシカルボニル（Ｃｂｚ）基、アリルオキシカルボニル基、９－フルオレニルメトキシカルボニル（Ｆｍｏｃ）基、２，２，２－トリクロロエトキシカルボニル基、ｔ－アミルオキシカルボニル基、４－メトキシベンジル基、トリフェニルメチル基、２－ニトロベンゼンスルホニル基、２，４－ジニトロベンゼンスルホニル基または２－（トリメチルシリル）エトキシメチル基等が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、イソブチリル基、ベンゾイル（Ｂｚ）基、ｔ－ブトキシカルボニル（Ｂｏｃ）基、トリメチルシリルエトキシカルボニル（Ｔｅｏｃ）基が好ましい。
　本明細書において「１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基」とは、保護基を有していてもよいアミノ基を包含し、当該置換基は、例えば、前記のアミノ基の保護基、Ｃ１－６アルキル基、置換されていてもよいアリール基、置換されていてもよいヘテロアリール基であり、好ましいアミノ基の保護基としてはＢｎ基、ＤＰＣ基、ＤＭＴｒ基、４－メトキシトリチル基、トリフェニルメチル基、２－ナフチルメチル基、シアノエトキシカルボニル基、テトラヒドロピラニル基、トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、ｔ－ブチルジフェニルシリル基、トリメチルシリル基、４－メトキシベンジル基、３，４－ジメトキシベンジル基、ベンゾイル（Ｂｚ）基、アセチル基であり、好ましいＣ１－６アルキル基としてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ｓｅｃ－ブチル基、ｔ－ブチル基、ペンチル基、イソペンチル基であり、好ましいアリール基としては、フェニル基、ビフェニル基、ナフチル基、アントラセニル基であり、好ましいヘテロアリール基としてはピリジル基、ピリミジニル基、ピリダジニル基、ピロリル基、イソキノリル基、キノリル基、インドリル基、イミダゾリル基、ベンズイミダゾリル基、トリアゾリル基、フリル基、チエニル基などが挙げられる。また、置換されてもよいアリール基、又は置換されていてもよいヘテロアリール基の置換基としては、ハロゲン原子、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、水酸基、Ｃ１－６アルコキシ基、アリールオキシ基、アミノ基、ニトロ基、トリフルオロメチル基、フェニル基等が挙げられ、これらの１種以上の基によって置換されていてもよい。
　「リン酸基の保護基」としては、有機合成化学（特に、核酸合成）において通常用いる保護基をいい、例えば、炭素数１から６のアルキル基および／またはシアノ基で置換された炭素数１から６のアルキル基；アラルキル基；ニトロ基および／またはハロゲン原子で置換されたアリール基で置換されたアラルキル基；炭素数１から６のアルキル基、ハロゲン原子、またはニトロ基で置換されたアリール基；２－シアノエチル基；２，２，２－トリクロロエチル基；ベンジル基；２－クロロフェニル基；または４－クロロフェニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　「メルカプト基の保護基」としては、有機合成化学（特に、核酸合成）において通常用いる保護基をいい、例えば、脂肪族アシル基または芳香族アシル基、ベンゾイル（Ｂｚ）基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「脱離基」とは、反応の間にヘテロリシスでの開裂により切断される場合の、電子対を持つ方の基質分子の一部をいい、例えばハロゲン原子（例えば、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子）、「水酸基の脱離基」を包含する。水酸基の脱離基の例としては、スルホニルオキシ基（例えば、パラトルエンスルホニルオキシ基、メシルオキシ基、トリフルオロメタンスルホニルオキシ基など）、アシロキシ基（好ましくは炭素数１～８の、飽和もしくは不飽和アシロキシ基であり、例えばＲＬ－Ｃ（＝Ｏ）－Ｏ－で表され、式中のＲＬはアルキル基で置換されていてもよいアリール基（好ましい総炭素数が６～８であり、例えばフェニル基、ｐ－トリル基など）、アルキル基で置換されていてもよいアリールオキシ基（好ましい総炭素数が６～８であり、例えばフェノキシ基、ｐ－トリルオキシ基など）、アラルキル基（好ましい総炭素数が７～９であり、例えばベンジル基など）、アリールアルケニル基（好ましい総炭素数が８または９であり、例えばシンナミル基など）、アラルキルオキシ基（総炭素数７～１５、例えばベンジルオキシ基、９－フルオレニルメチルオキシ基など）、アルコキシ基（炭素数１～８の直鎖状または分岐鎖状のアルコキシ基、たとえばメトキシ基、エトキシ基、ｔ－ブトキシ基など）で表される基が挙げられ、具体例としては、ヨード原子、ブロモ原子、クロロ原子、フルオロ原子、メシルオキシ基、メタンスルホニルオキシ基、トリフルオロメタンスルホニルオキシ基、エタンスルホニルオキシ基、２，２，２－トリフルオロ－エタンスルホニルオキシ基、プロパンスルホニルオキシ基、イソ－プロパンスルオニルオキシ基、ブタンスルホニルオキシ基、ノナフルオロブタンスルホニルオキシ基、ヘプタフルオロプロパン－１－スルホニルオキシ基、ペンタンスルホニルオキシ基、ペンタフルオロエタンスルホニルオキシ基、ペンタンスルホニルオキシ基、シクロペンタンスルホニルオキシ基、ヘキサンスルホニルオキシ基、シクロヘキサンスルホニルオキシ基、ｏ－トルエンスルホニルオキシ基、ｍ－トルエンスルホニルオキシ基、ｐ－トルエンスルホニルオキシ基、ベンゼンスルホニルオキシ基、ｏ－ブロモベンゼンスルホニルオキシ基、ｍ－ブロモベンゼンスルホニルオキシ基、ｐ－ブロモ－ベンゼンスルホニルオキシ基、ｏ－ニトロベンゼンスルホニルオキシ基、ｍ－ニトロベンゼンスルホニルオキシ基、およびｐ－ニトロベンゼンスルホニルオキシ基などが挙げられるが、これらに限定されない。好ましい脱離基の例として、メタンスルホニルオキシ基（メシルオキシ基；Ｍｓ－Ｏ－）、トリフルオロメタンスルホニルオキシ基、ｐ－トルエンスルホニルオキシ基が挙げられる。
　本明細書において、用語「置換されてもよいリン酸基」とは、置換基（これは、保護基を含む）を有していてもよいリン酸、亜リン酸、または次亜リン酸を包含する。例えば、式－Ｐ（ＲＰ１）ＲＰ２で表されるリン酸基を包含し、式中、ＲＰ１およびＲＰ２は、それぞれ独立して、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数１から５のアルコキシ基、炭素数１から６のアルキルチオ基、炭素数１から６のシアノアルコキシ基、または炭素数１から６のアルキル基で置換されたアミノ基を表す。ここで、上記式中、ＲＰ１がＯＲＰ１ａそしてＲＰ２がＮＲＰ２ａとして表すことができる基は「ホスホラミダイト基」と呼称され、好ましい例である。ＲＰ１ａとは炭素数１から５のアルキル基、炭素数１から６のシアノアルキル基であり、ＲＰ２ａとは炭素数１から６のアルキル基を表し、「ホスホラミダイト基」の具体例としては、式－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）で表される基、または式－Ｐ（ＯＣＨ３）（Ｎ（ｉＰｒ）２）で表される基などが挙げられるが、これらに限定されない。ここで、ｉＰｒはイソプロピル基を表す。
　本明細書において、用語「置換されてもよいチオリン酸基」とは、置換基（これは、保護基を含む）を有していてもよいチオリン酸基を包含する。例えば、式－Ｐ（＝Ｓ）（ＲＰ３）ＲＰ４で表されるリン酸基を包含し、式中、ＲＰ３およびＲＰ４は、それぞれ独立して、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数１から５のアルコキシ基、炭素数１から６のアルキルチオ基、炭素数１から６のシアノアルコキシ基、または炭素数１から６のアルキル基で置換されたアミノ基を表す。
　本明細書において、用語「アシル基」の例としては、脂肪族アシル基および芳香族アシル基が挙げられる。具体的には、脂肪族アシル基の例としては、ホルミル基、アセチル基、プロピオニル基、ブチリル基、イソブチリル基、ペンタノイル基、ピバロイル基、バレリル基、イソバレリル基、オクタノイル基、ノナノイル基、デカノイル基、３－メチルノナノイル基、８－メチルノナノイル基、３－エチルオクタノイル基、３，７－ジメチルオクタノイル基、ウンデカノイル基、ドデカノイル基、トリデカノイル基、テトラデカノイル基、ペンタデカノイル基、ヘキサデカノイル基、１－メチルペンタデカノイル基、１４－メチルペンタデカノイル基、１３，１３－ジメチルテトラデカノイル基、ヘプタデカノイル基、１５－メチルヘキサデカノイル基、オクタデカノイル基、１－メチルヘプタデカノイル基、ノナデカノイル基、アイコサノイル基およびヘナイコサノイル基のようなアルキルカルボニル基；フェノキシアセチル（Ｐａｃ）基のようなアリールオキシアルキルカルボニル基；スクシノイル基、グルタロイル基、アジポイル基のようなカルボキシ化アルキルカルボニル基；クロロアセチル基、ジクロロアセチル基、トリクロロアセチル基、トリフルオロアセチル基のようなハロゲン原子で置換された炭素数１から６のアルキル基で置換されたカルボニル基；メトキシアセチル基のような炭素数１から６のアルコキシアルキルカルボニル基；（Ｅ）－２－メチル－２－ブテノイル基のような不飽和アルキルカルボニル基が挙げられる。また、芳香族アシル基の例としては、ベンゾイル基、α－ナフトイル基、β－ナフトイル基のようなアリールカルボニル基；２－ブロモベンゾイル基、４－クロロベンゾイル基のようなハロゲノアリールカルボニル基；２，４，６－トリメチルベンゾイル基、４－トルオイル基のような炭素数１から６のアルキル基で置換されたアリールカルボニル基；４－アニソイル基のような炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたアリールカルボニル基；２－カルボキシベンゾイル基、３－カルボキシベンゾイル基、４－カルボキシベンゾイル基のようなカルボキシ化アリールカルボニル基；４－ニトロベンゾイル基、２－ニトロベンゾイル基のようなニトロ化アリールカルボニル基；２－（メトキシカルボニル）ベンゾイル基のような炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたカルボニル化アリールカルボニル基；４－フェニルベンゾイル基のようなアリール化アリールカルボニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「アラルキル基」とは、芳香族炭化水素基（例えば、６～１４員の単環式、二環式または三環式の芳香族炭化水素基を挙げられる）で置換された、炭素数１～６、好ましくは炭素数１～４、より好ましくは炭素数１～３のアルキル基をいう。具体例としては、ベンジル基、フェネチル基、１－ナフチルメチル基、および２－ナフチルメチル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　テトラヒドロピラニル基またはテトラヒドロチオピラニル基としては、より具体的には、テトラヒドロピラン－２－イル基、３－ブロモテトラヒドロピラン－２－イル基、４－メトキシテトラヒドロピラン－４－イル基、テトラヒドロチオピラン－４－イル基、４－メトキシテトラヒドロチオピラン－４－イル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　テトラヒドロフラニル基またはテトラヒドロチオフラニル基としては、より具体的には、テトラヒドロフラン－２－イル基、テトラヒドロチオフラン－２－イル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「シリル基」の例としては、トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、イソプロピルジメチルシリル基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、メチルジイソプロピルシリル基、メチルジ－ｔ－ブチルシリル基、トリイソプロピルシリル基のような炭素数１から６のアルキル基で置換されたシリル基；ｔ－ブチルジフェニルシリル基、ジフェニルメチルシリル基、ブチルジフェニルブチルシリル基、ジフェニルイソプロピルシリル基、フェニルジイソプロピルシリル基のような１から２個のアリール基で置換された炭素数１から６の３つのアルキル基で置換されたシリル基、トリフェニルシリル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたメチル基」としては、メトキシメチル基、１，１－ジメチル－１－メトキシメチル基、エトキシメチル基、プロポキシメチル基、イソプロポキシメチル基、ブトキシメチル基、ｔ－ブトキシメチル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「炭素数１から６のアルコキシ基で置換された炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたメチル基」としては、２－メトキシエトキシメチル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「ハロゲン原子で置換された炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたメチル基」としては、２，２，２－トリクロロエトキシメチル基、ビス（２－クロロエトキシ）メチル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたエチル基」としては、１－エトキシエチル基、１－（イソプロポキシ）エチル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「ハロゲン原子で置換されたエチル基」としては、２，２，２－トリクロロエチル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「１から３個のアリール基で置換されたメチル基」としては、ベンジル基、α－ナフチルメチル基、β－ナフチルメチル基、ジフェニルメチル基、トリフェニルメチル基、４，４’－ジメトキシトリチル基、４－メトキシトリチル基、トリチル基、α－ナフチルジフェニルメチル基、９－アンスリルメチル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「炭素数１から６のアルキル基、炭素数１から６のアルコキシ基、ハロゲン原子および／またはシアノ基で置換された１から３個のアリール基で置換されたメチル基」としては、４－メチルベンジル基、２，４，６－トリメチルベンジル基、３，４，５－トリメチルベンジル基、４－メトキシベンジル基、４－メトキシフェニルジフェニルメチル基、４，４’－ジメトキシトリフェニルメチル基、２－ニトロベンジル基、４－ニトロベンジル基、４－クロロベンジル基、４－ブロモベンジル基、４－シアノベンジル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたカルボニル基」としては、メトキシカルボニル基、エトキシカルボニル基、ｔ－ブトキシカルボニル基、イソブトキシカルボニル基、Ｔｅｏｃ基、Ｃｅｏｃ基、Ｆｍｏｃ基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「ハロゲン原子、炭素数１から６のアルコキシ基および／またはニトロ基で置換されたアリール基」としては、４－クロロフェニル基、２－フロロフェニル基、４－メトキシフェニル基、４－ニトロフェニル基、２，４－ジニトロフェニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「ハロゲン原子および／または３個の炭素数１から６のアルキル基で置換されたシリル基で置換された炭素数１から６のアルコキシ基で置換されたカルボニル基」としては、２，２，２－トリクロロエトキシカルボニル基、２－トリメチルシリルエトキシカルボニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「アルケニルオキシカルボニル基」としては、ビニルオキシカルボニル基、アリルオキシカルボニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「炭素数１から６のアルコキシ基および／またはニトロ基で置換されたアリール基で置換されてもよいアラルキルオキシカルボニル基」としては、ベンジルオキシカルボニル基、４－メトキシベンジルオキシカルボニル基、３，４－ジメトキシベンジルオキシカルボニル基、２－ニトロベンジルオキシカルボニル基、４－ニトロベンジルオキシカルボニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本明細書において、用語「不飽和ヘテロ環」とは、不飽和の脂肪族ヘテロ環式基または芳香族ヘテロ環式基を包含する。不飽和の脂肪族ヘテロ環式基とは、環内に少なくとも１個の二重結合を有し、酸素原子、硫黄原子、及び窒素原子からなる群より独立して選ばれる同一もしくは異なる１～３の異項原子を含む、不飽和の脂肪族ヘテロ環式基をいい、好ましくは、環内に少なくとも１個の二重結合を有し、少なくとも１個の窒素原子を含み、さらに酸素原子、硫黄原子、又は窒素原子からなる群より独立して選ばれる少なくとも１個（１～２個が好ましく（２個以上の場合は同一もしくは異なってもよい）、１個が特に好ましい）の異項原子を含んでいてもよい不飽和の脂肪族ヘテロ環式基をいう。該不飽和の脂肪族ヘテロ環式基は、例えば４から８員環であり、５から７員環が好ましく、５もしくは６員環がより好ましく、６員環が特に好ましい。具体例としては、ジヒドロピリミジニル基、ピロリジニル基、イミダゾリニル基、ピラゾリジニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。また、芳香族ヘテロ環式基は、そのヘテロ環式部分としては、酸素原子、硫黄原子、及び窒素原子からなる群より独立して選ばれる同一もしくは異なる１～３の異項原子を含む、芳香族ヘテロ環式基をいい、好ましくは少なくとも１個の窒素原子を含み、さらに酸素原子、硫黄原子、又は窒素原子からなる群より独立して選ばれる少なくとも１個（１～２個が好ましく（２個以上の場合は同一もしくは異なってもよい）、１個が特に好ましい）の異項原子を含んでいてもよい芳香族ヘテロ環式基をいう。該芳香族ヘテロ環式基は、例えば４から８員環であり、５から７員環が好ましく、５もしくは６員環がより好ましく、６員環が特に好ましい。具体例としては、ピロリル基、フラニル基、チエニル基、ピリジニル基、ピリミジニル基、ピリダジニル基などが挙げられるが、これらに限定されない。特に好ましくはピリミジニル基である。該不飽和ヘテロ環は、適宜、置換基で置換されていてもよく、該置換基としては例えば、置換されてもよいＣ１－６アルキル基、置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、置換されてもよいアミノ基、置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、またはハロゲン原子を挙げられ、好ましくは置換されてもよいＣ１－６アルキル基、オキソ基、またはチオキソ基などが挙げられるが、これらに限定されない
　該不飽和ヘテロ環は、さらに別の環と縮合してもよい。当該縮合し得る別の環としては、飽和もしくは不飽和非芳香族の炭素環、芳香族炭素環、飽和もしくは不飽和非芳香族のヘテロ環、または芳香族ヘテロ環を挙げられるが、芳香族環または芳香族ヘテロ環が好ましい。飽和炭素環とは、環を形成するアルカンをいい、例えば前記炭素数３から６のシクロアルカンを意味する。不飽和非芳香族の非芳香族炭素環とは、環を形成するアルケンをいい、例えば前記炭素数３から６の環状アルケンを意味する。芳香族炭素環（アリールとも呼称する）とは、例えば６～１４員環の単環式、二環式または三環式の芳香族炭化水素基を包含し、具体例としては、ベンゼン、ナフタレン、フェナントレンまたはアンスレンなどが挙げられるが、これらに限定されない。飽和もしくは不飽和非芳香族のヘテロ環とは、環内に少なくとも１個の二重結合を有してもよい、酸素原子、硫黄原子、及び窒素原子からなる群より独立して選ばれる１～３の異項原子を含む、飽和の５～１４員環の単環式または二環式の非芳香族ヘテロ環をいう。具体例としては、アゼチジン、ピロリジン、ピラゾリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、チオモルホリン、ホモピペリジン、オキサゾリジン、イソオキサゾリジン、チアゾリジン、イソチアゾリジン、イミダゾリジン、イミダゾリン、テトラヒドロフラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロチエン、ジヒドロチエン、ジヒドロピラン、テトラヒドロピラン、インドリン、イソインドリン、クロマン、イソクロマン、ジヒドロベンゾフラン、ジヒドロフロピリジン及びジヒドロベンゾチエンなどが挙げられるが、これらに限定されない。
　また、「環Ａ」としての「置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環」における５から７員環の不飽和ヘテロ環は、二つ以上の窒素原子を含み、かつ一つ以上の酸素原子が置換されていれば、本明細書で記載する用語「置換基を有してもよい核酸の塩基部分」における核酸の塩基部分であってもよい。天然の核酸塩基、並びに非天然の核酸塩基由来の環部分であってもよく、例えばアデニン、グアニン由来のプリン環もしくはその誘導体、またはウラシル、シトシン、チミン由来のピリミジンのモノ若しくはジオン環またはその誘導体が挙げられ、好ましくはチミニルまたはウラシニルなどが挙げられるが、これらに限定されない。置換基としては、前記不飽和ヘテロ環の定義の場合と同義である。環Ａの好ましい置換基としては、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子であるが、これに限定されない。
　本明細書における不飽和ヘテロ環である「環Ａ’」は、テトラヒドロフラン環、オキサゾリジン環と縮合し、多環構造を形成する。環Ａ’は二つ以上の窒素原子を含む不飽和ヘテロ環であれば特に限定されないが、「置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環」であることが好ましい。該不飽和ヘテロ環は、さらに別の環と縮合してもよい。環Ａ’の好ましい置換基としては、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子であるが、これに限定されない。
　本明細書の製造方法において環Ａが水酸基の活性化剤を用いた反応により環Ａ’に変化する場合、または環Ａ’が還元剤を用いた反応により、縮合するオキサゾリジン環が開裂して環Ａに変化する場合、２つの窒素原子を結合する構造非限定の部分は環Ａと環Ａ’とで一致する。環Ａは二つ以上の窒素原子を含む不飽和ヘテロ環であれば特に限定されないが、置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であることが好ましく、置換されてもよいピリミジン環であることがより好ましく、チミニルまたはウラシニルであることが最も好ましい。該不飽和ヘテロ環は、さらに別の環と縮合してもよい。
　本明細書において、用語「置換基を有してもよい核酸の塩基部分」における「核酸の塩基部分」とは、天然の核酸の塩基部分、及び非天然の核酸の塩基部分を含み、芳香族ヘテロ環式基を含み、例えば、単環基、二環基、三環基などを包含する。当該分野の当業者にとって、これまで「非天然」であると考えられてきた様々な核酸の塩基部分がその後に天然において見出されることは、明らかであるべきである。従って、「核酸の塩基部分」とは、公知のプリンおよびピリミジンのヘテロ環だけでなく、そのヘテロ環アナログおよび互変異性体を含む。核酸の塩基部分の具体例としては、アデニニル、グアニニル、チミニル、シトシニル、ウラシニル、プリニル、キサンチニル、ジアミノプリニル、８－オキソ－Ｎ６－メチルアデニニル、７－デアザキサンチニル、７－デアザグアニニル、Ｎ４，Ｎ４－エタノシトシニル、Ｎ６，Ｎ６－エタノ－２，６－ジアミノプリニル、５－メチルシトシニル、５－（Ｃ３～Ｃ６）－アルキニルシトシニル、５－フルオロシトシニル、５－ブロモウラシニル、シュードイソシトシニル、２－ヒドロキシ－５－メチル－４－トリアゾロピリジニル、イソシトシニル、イソグアニニル、イノシニル、Ｎ６－アリルプリニル、Ｎ６－アシルプリニル、Ｎ６－ベンジルプリニル、Ｎ６－ハロプリニル、Ｎ６－ビニルプリニル、Ｎ６－アセチレン性プリニル、Ｎ６－アシルプリニル、Ｎ６－ヒドロキシアルキルプリニル、Ｎ６－チオアルキルプリニル、Ｎ２－アルキルプリニル、Ｎ４－アルキルピリミジニル、Ｎ４－アシルピリミジニル、Ｎ４－ベンジルプリニル、Ｎ４－ハロピリミジニル、Ｎ４－ビニルピリミジニル、Ｎ４－アセレン性ピリミジニル、Ｎ４－アセチルピリミジニル、Ｎ４－ヒドロキシアルキルピリミジニル、Ｎ６－チオアルキルピリミジニル、６－アザピリミジニル、６－アザシトシニル、２－および／または４－メルカプトピリミジニル、ウラシニル、Ｃ５－アルキルピリミジニル、Ｃ５－ベンジルピリミジニル、Ｃ５－ハロピリミジニル、Ｃ５－ビニルピリミジニル、Ｃ５－アセチレン性ピリミジニル、Ｃ５－アシルピリミジニル、Ｃ５－ヒドロキシアルキルプリニル、Ｃ５－アミドピリミジニル、Ｃ５－シアノピリミジニル、Ｃ５－ニトロピリミジニル、Ｃ５－アミノピリミジニル、Ｎ２－アルキルプリニル、Ｎ２－アルキル－６－チオプリニル、５－シチジニル、５－アザウラシニル、トラゾロピリジニル、イミダゾロピリジニル、ピロロピリミジニル、およびピラゾロピリミジニルなどを挙げられるが、これらに限定されない。好ましい核酸の塩基部分としては例えば、アデニニル、グアニニル、２，６－ジアミノプリニル、チミニル、２－チオチミニル、シトシニル、５－メチルシトシニル、ウラシニル、５－フルオロシトシニル、キサンチニル、６－アミノプリニル、２－アミノプリニル、６－クロロ－２－アミノ－プリニル、および６－クロロプリニルが挙げられ、特に好ましい核酸塩基部分としては例えば、アデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニル、チミニルまたはウラシニルが挙げられる。これらの核酸の塩基部分は、さらに１つ以上の置換基を有していてもよく、置換基としては、水酸基、Ｃ１－６のアルコキシ基、メル力プ卜基、Ｃ１－６のアルキルチオ基、アミノ基、Ｃ１－６のアルキル基で置換されたアミノ基、Ｃ１－６のアルキル基、Ｃ１－６のアルキニル基および、オキソ基、チオキソ基、ハロゲン原子が挙げられる。該塩基部分上の官能性の酸素、硫黄および窒素基は、必要ならばまたは所望するならば、保護しおよび／または脱保護することができる。適当な保護基は当該分野の当業者にとってよく知られており、例えば、前記した水酸基の保護基、アミノ基の保護基を含み、ジフェニルアミノカルボニル基、シリル基（例えば、トリメチルシリル基、ジメチルへキシルシリル基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、およびｔ－ブチルジフェニルシリル基）、トリチル基、アルキル基、アシル基（例えば、アセチル基、プロピオニル基、イソブチリル基、ベンゾイル（Ｂｚ）基、フェノキシアセチル（Ｐａｃ）基）、アルコキシカルボニル基（例えば、ｔ－ブトキシカルボニル（Ｂｏｃ）基、ベンジロキシカルボニル（Ｃｂｚ）基、ジフェニルアミノカルボニル（ＤＰＣ）基、シアノエトキシカルボニル（Ｃｅｏｃ）基）、スルホニル基（例えば、メタンスルホニル基、およびｐ－トルエンスルホニル基）などが挙げられるが、これらに限定されない。
　本発明において「アジド化剤」とは、アジド基を付加する試薬であり、例えばアジ化水素酸、アジ化ナトリウム、アジ化リチウム、テトラブチルアンモニウムアジド（ｎＢｕ４ＮＮ３）、トリメチルシリルアジド、ジフェニルホスホリルアジド（ＤＰＰＡ）、ニコチニルアジド、アジ化亜鉛（Ｚｎ（Ｎ３）２）が好ましく、テトラブチルアンモニウムアジド、アジ化ナトリウム、ジフェニルホスホリルアジド（ＤＰＰＡ）がより好ましい。
　本発明において「水酸基の活性化剤」とは、無保護の水酸基を活性化し脱離能を高める試薬であり、例えばメタンスルホニル化剤、トリフルオロメタンスルホニル化剤、エタンスルホニル化剤、２，２，２－トリフルオロエタンスルホニル化剤、プロパンスルホニル化剤、イソ－プロパンスルオニル化剤、ブタンスルホニル化剤、ノナフルオロブタンスルホニル化剤、ヘプタフルオロプロパン－１－スルホニル化剤、ペンタンスルホニル化剤、ペンタフルオロエタンスルホニル化剤、シクロペンタンスルホニル化剤、ヘキサンスルホニル化剤、シクロヘキサンスルホニル化剤、ｏ－トルエンスルホニル化剤、ｍ－トルエンスルホニル化剤、ｐ－トルエンスルホニル化剤、ベンゼンスルホニル化剤、ｏ－ブロモベンゼンスルホニル化剤、ｍ－ブロモベンゼンスルホニル化剤、ｐ－ブロモベンゼンスルホニル化剤、ｏ－ニトロベンゼンスルホニル化剤、ｍ－ニトロベンゼンスルホニル化剤、およびｐ－ニトロベンゼンスルホニル化剤が挙げられ、具体的にはメタンスルホニルクロリド、メタンスルホン酸無水物、トリフルオロメタンスルホニルクロリド、トリフルオロメタンスルホン酸無水物、エタンスルホニルクロリド、２，２，２－トリフルオロエタンスルホニルクロリド、２，２，２－トリフルオロエタンスルホニルフルオリド、プロパンスルホニルクロリド、プロパンスルホニルフルオリド、イソプロピルスルオニルクロリド、イソプロピルスルホニルフルオリド、ブタンスルホニルクロリド、ブタンスルホニルフルオリド、ノナフルオロブタンスルホニルクロリド、ノナフルオロブタンスルホニルフルオリド、ノナフルオロブタンスルホン酸無水物、ヘプタフルオロプロパン－１－スルホニルクロリド、ヘプタフルオロプロパン－１－スルホニルフルオリド、ペンタンスルホニルクロリド、ペンタンスルホニルフルオリド、ペンタフルオロエタンスルホニルクロリド、ペンタフルオロエタンスルホニルフルオリド、シクロペンタンスルホニルクロリド、シクロペンタンスルホニルフルオリド、ヘキサンスルホニルクロリド、ヘキサンスルホニルフルオリド、シクロヘキサンスルホニルクロリド、シクロヘキサンスルホニルフルオリド、ｏ－トルエンスルホニルクロリド、ｏ－トルエンスルホニルフルオリド、ｍ－トルエンスルホニルクロリド、ｍ－トルエンスルホニルフルオリド、ｐ－トルエンスルホニルクロリド、ｐ－トルエンスルホニルフルオリド、ベンゼンスルホニルクロリド、ベンゼンスルホニルフルオリド、ｏ－ブロモベンゼンスルホニルクロリド、ｏ－ブロモベンゼンスルホニルフルオリド、ｍ－ブロモベンゼンスルホニルクロリド、ｍ－ブロモベンゼンスルホニルフルオリド、ｐ－ブロモベンゼンスルホニルクロリド、ｐ－ブロモベンゼンスルホニルフルオリド、ｏ－ニトロベンゼンスルホニルクロリド、ｏ－ニトロベンゼンスルホニルフルオリド、ｍ－ニトロベンゼンスルホニルクロリド、ｍ－ニトロベンゼンスルホニルフルオリド、ｐ－ニトロベンゼンスルホニルクロリド、およびｐ－ニトロベンゼンスルホニルフルオリドなどが挙げられるが、これらに限定されない。例えば、トリフルオロメタンスルホニルクロリド、トリフルオロメタンスルホン酸無水物、メタンスルホニルクロリド、メタンスルホン酸無水物、ｐ－トルエンスルホン酸クロリド、ノナフルオロ－１－ブタンスルホニルフルオリド、ヘプタフルオロプロパン－１－スルホニルフルオリド、２，２，２－トリフルオロエタンスルホニルクロリド、ペンタフルオロエタンスルホニルクロリドが好ましく、トリフルオロメタンスルホニルクロリド、トリフルオロメタンスルホン酸無水物、メタンスルホニルクロリド、メタンスルホン酸無水物、ｐ－トルエンスルホニルクロリドがより好ましい。
　本発明において「還元剤」とは、例えばトリアルキルホスフィンやトリアリールホスフィンなどのホスフィン類、金属ヒドリド類、水素ガス等の存在下での遷移金属触媒が好ましく、トリフェニルホスフィン、トリブチルホスフィン、リチウムアルミニウムヒドリド、水素化ホウ素ナトリウム、水素化ホウ素ニッケル、水素ガス存在下でのパラジウムカーボンまたは水素ガス存在下での水酸化パラジウムがより好ましい。
　「ホスホラミダイト法」とはホスホラミダイトであるヌクレオチドモノマーを用いた核酸の固相合成法であり、例えば、ヌクレオチドの５’水酸基または３’水酸基、核酸の塩基部分のアミノ基、さらにＲＮＡの場合は２’水酸基が保護されたホスホラミダイトモノマーを、テトラゾール系化合物、イミダゾール系化合物などを用いてカップリングさせ、後に酸化または酸化的硫化することでホスホロジエステル結合を形成する工程を含むものである。本発明において「ホスホラミダイト法」は少なくとも１種類の架橋型核酸であるホスホラミダイトモノマーを使用することが好ましく、架橋型核酸がＧｕＮＡであることがより好ましい。
　本発明において「環ＡをＢに置換」とは核酸の糖部分に結合する環Ａを糖部分から解離させ、１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であるＢに置き換えること（トランスグリコシル化）を意味する。核酸の糖部分に結合した環Aをルイス酸で処理することにより解離させ、環Ａが解離した核酸の糖部分にＢを結合する。解離に用いるルイス酸としては例えばＴＭＳＯＴｆ、ＴＢＳＯＴｆなどが挙げられるが、これらに限定されない。トランスグリコシル化の反応を促進するためにシリル化剤を使用することができる。シリル化剤としては、例えばＢＳＡ、ヘキサメチルジシラザンなどが挙げられるが、これらに限定されない。このトランスグリコシル化の反応は一工程で行われることが好ましい。
　トランスグリコシル化反応において、Ｂは置換できる態様であればいかなる反応物で提供されてもよく、該反応物は「核酸塩基」であることが好ましい。「核酸塩基」とは、公知のプリンおよびピリミジンのヘテロ環だけでなく、そのヘテロ環アナログおよび互変異性体を含む。核酸塩基の具体例としては、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、プリン、キサンチン、ジアミノプリン、８－オキソ－Ｎ６－メチルアデニン、７－デアザキサンチン、７－デアザグアニン、Ｎ４，Ｎ４－エタノシトシン、Ｎ６，Ｎ６－エタノ－２，６－ジアミノプリン、５－メチルシトシン、５－（Ｃ３～Ｃ６）－アルキニルシトシン、５－フルオロシトシン、５－ブロモウラシル、シュードイソシトシン、２－ヒドロキシ－５－メチル－４－トリアゾロピリジン、イソシトシン、イソグアニン、イノシン、Ｎ６－アリルプリン、Ｎ６－アシルプリン、Ｎ６－ベンジルプリン、Ｎ６－ハロプリン、Ｎ６－ビニルプリン、Ｎ６－アセチレン性プリン、Ｎ６－アシルプリン、Ｎ６－ヒドロキシアルキルプリン、Ｎ６－チオアルキルプリン、Ｎ２－アルキルプリン、Ｎ４－アルキルピリミジン、Ｎ４－アシルピリミジン、Ｎ４－ベンジルプリン、Ｎ４－ハロピリミジン、Ｎ４－ビニルピリミジン、Ｎ４－アセレン性ピリミジン、Ｎ４－アセチルピリミジン、Ｎ４－ヒドロキシアルキルピリミジン、Ｎ６－チオアルキルピリミジン、６－アザピリミジン、６－アザシトシン、２－および／または４－メルカプトピリミジン、ウラシル、Ｃ５－アルキルピリミジン、Ｃ５－ベンジルピリミジン、Ｃ５－ハロピリミジン、Ｃ５－ビニルピリミジン、Ｃ５－アセチレン性ピリミジン、Ｃ５－アシルピリミジン、Ｃ５－ヒドロキシアルキルプリン、Ｃ５－アミドピリミジン、Ｃ５－シアノピリミジン、Ｃ５－ニトロピリミジン、Ｃ５－アミノピリミジン、Ｎ２－アルキルプリン、Ｎ２－アルキル－６－チオプリン、５－アザウラシル、トラゾロピリジン、イミダゾロピリジン、ピロロピリミジン、およびピラゾロピリミジンなどを挙げられるが、これらに限定されない。好ましい核酸塩基としては例えば、アデニン、グアニン、２，６－ジアミノプリン、チミン、２－チオチミン、シトシン、５－メチルシトシン、ウラシル、５－フルオロシトシン、キサンチン、６－アミノプリン、２－アミノプリン、６－クロロ－２－アミノ－プリン、および６－クロロプリンが挙げられ、特に好ましい核酸塩基としては例えば、アデニン、グアニン、シトシン、５－メチルシトシン、チミンまたはウラシルが挙げられる。これらの核酸塩基は、さらに１つ以上の置換基を有していてもよく、置換基としては、水酸基、Ｃ１－６のアルコキシ基、メル力プ卜基、Ｃ１－６のアルキルチオ基、アミノ基、Ｃ１－６のアルキル基で置換されたアミノ基、Ｃ１－６のアルキル基、Ｃ１－６のアルキニル基および、オキソ基、チオキソ基、ハロゲン原子が挙げられる。該核酸塩基上の官能性の酸素、硫黄および窒素基は、必要ならばまたは所望するならば、保護しおよび／または脱保護することができる。適当な保護基は当該分野の当業者にとってよく知られており、例えば、前記した水酸基の保護基、アミノ基の保護基を含み、ジフェニルアミノカルボニル基、シリル基（例えば、トリメチルシリル基、ジメチルへキシルシリル基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、およびｔ－ブチルジフェニルシリル基）、トリチル基、アルキル基、アシル基（例えば、アセチル基、プロピオニル基、イソブチリル基、ベンゾイル基（Ｂｚ）、フェノキシアセチル基（Ｐａｃ））、アルコキシカルボニル基（例えば、ｔ－ブトキシカルボニル基（Ｂｏｃ）、ベンジロキシカルボニル基（Ｃｂｚ）、ジフェニルアミノカルボニル基（ＤＰＣ）、シアノエトキシカルボニル基（Ｃｅｏｃ））、スルホニル基（例えば、メタンスルホニル基、およびｐ－トルエンスルホニル基）などが挙げられるが、これらに限定されない。これら核酸塩基は、商業的に入手することができ、あるいは商業的に入手可能な出発原料を用いて有機合成的な手法により製造することができる。
　本明細書において、用語「β体」とは、核酸の（デオキシ）リボース部位の１’位に置換した核酸の塩基部分が置換する方向と、核酸の（デオキシ）リボース４’位に置換した５’位側鎖が置換する方向が同一の方向に置換された立体化学を持つものをいう。架橋型人工核酸２’，４’－ＬＮＡの場合、核酸の（デオキシ）リボース部位の１’位に置換した核酸の塩基部分が置換する方向と、核酸の（デオキシ）リボース４’位に置換した架橋には用いられていない５’位側鎖が置換する方向が同一の方向に置換された立体配置を持つ化合物をいう。なお、用語「α体」とは核酸のリボース部位の１’位に置換した核酸の塩基部分が置換する方向と、核酸のリボース４’位に置換した５’位側鎖が置換する方向が異なった方向に置換された立体化学を持つものをいう。
　本明細書において用語「β選択的」とはβ体を選択的に得ることができることをいう。好ましくは、トランスグリコシル化により得られる生成物のα体とβ体の合計含有量に対するβ体の含有量が８０％以上、より好ましくは９０％以上、最も好ましくは９９％以上に選択的に得られることをいう。
　本明細書において、用語「人工核酸」とは、人工ヌクレオシド、人工ヌクレオチド（本明細書では１個のヌクレオシドまたはヌクレオチドをモノマーと記載する場合もある。）、または人工オリゴヌクレオチドを包含する。これらの人工核酸は天然の核酸ではなく、かつ人為的にのみ製造することができる核酸である。これらの人工核酸には核酸塩基部分が非天然の塩基を有するもの、糖部分が修飾された糖を有するもの、及び／またはリン酸部分が非天然のリン酸基を有するものがあげられるが、本発明では糖部分が非天然の糖を有するもの、特に２’位と４’位の炭素原子が架橋されている（デオキシ）リボースを有するものをいう。
　本明細書において、用語「人工オリゴヌクレオチド」とは、同一または異なる「人工ヌクレオチド」がリン酸ジエステル結合やチオリン酸ジエステル結合等で２個以上結合したものをいい、好ましくは２から１００個までの、より好ましくは５から５０個までの、最も好ましくは１０から３０個までの人工ヌクレオチドが結合したもの、またはこれらの相補鎖と２重鎖を形成したものをいう。本明細書では２個以上のヌクレオチドが結合したオリゴヌクレオチドをオリゴマーと記載する場合もある。
　本発明の製造方法および化合物（中間体を含む）の態様について記載する。
一般式Ｉで表される化合物の製造方法
　一態様において、一般式Ｉ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000091
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000092
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Ｉのものと同じ意味を示し、環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物に還元剤を反応させ、環Ａ’に縮合するオキサゾリジン環を開裂させる工程を含む、製造方法を提供する。
　一実施態様において、当該還元剤はホスフィン類が好ましく、トリフェニルホスフィン（Ｐｈ３Ｐ）がより好ましい。
　一態様において、一般式Ｉ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000093
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。ここで、ｍ＝１もしくは２であり、かつＲ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が水素原子である場合、またはｍ＝１であり、かつＲ３もしくＲ５がメチル基で、Ｒ４及びＲ６が水素原子である場合、環Ａはチミニルでないことが好ましい。］
で表される化合物またはその塩が、新規な中間体化合物として挙げられる。
　一実施態様において、上記一般式Ｉ中、Ｒ１及びＲ２が各々独立してベンジル（Ｂｎ）基、２－ナフチルメチル基、４－メトキシベンジル基、３，４－ジメトキシベンジル基、２，６－ジメトキシベンジル基またはｐ－フェニルベンジル基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、そして環Ａが、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環が別の環と縮合して環Ａを形成してもよい、で表される化合物またはその塩が、挙げられる。
　一実施態様において、一般式Ｉで表される化合物またはその塩は、一般式Ｉ－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000094
 で表される化合物またはその塩であることが好ましい（式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及び環Ａは、一般式Ｉと同義である。ここで、ｍ＝１もしくは２であり、かつＲ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が水素原子である場合、またはｍ＝１であり、かつＲ３もしくＲ５がメチル基で、Ｒ４及びＲ６が水素原子である場合、環Ａはチミニルでないことが好ましい。）。
　一実施態様において、一般式Ｉ（一般式Ｉ－ａ）中、Ｒ１及びＲ２が各々独立して水酸基の保護基である場合、１から３個のアリール基で置換されたメチル基が挙げられ、例えばベンジル（Ｂｎ）基、２－ナフチルメチル基、ｐ－メトキシベンジル基、３，４－ジメトキシベンジル基、２，６－ジメトキシベンジル基およびｐ－フェニルベンジル基が好ましく、ベンジル基がより好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｉ（一般式Ｉ－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子であることが好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｉ（一般式Ｉ－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基である場合、当該Ｃ１－６アルキル基としてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ペンチル基、またはヘキシル基が好ましく、メチル基がより好ましい。当該置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　一実施態様において、一般式Ｉ（一般式Ｉ－ａ）中、環Ａは、６員環の不飽和ヘテロ環が好ましく、環Ａの置換基としては、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、ハロゲン原子およびオキソ基からなる群から選ばれる１つ以上（好ましくは２もしくは３個）の置換基が挙げられる。環Ａは、チミニルまたはウラシニルであることがより好ましい。当該置換基としてはメチル基、ハロゲン原子（フルオロ原子、クロロ原子、ブロモ原子など）が好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｉで表される化合物またはその塩は、前記一般式Ｉ（好ましくは、一般式Ｉ－ａ）中、Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルであり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000095
 である、化合物またはその塩であることが特に好ましい。
　ここで、以下本明細書において、構造式II－１またはII－２中の波線：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000096
 は、縮合しているテトラヒドロフラン環またはオキサゾリジン環の分子の残部との結合点を示す。
　一実施態様において、好ましい一般式IIで表される化合物またはその塩は、一般式II中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が一般式Ｉ（一般式Ｉ－ａ）のものと同じ意味を示し、環Ａ’が該製造方法の還元反応の工程により、環Ａ’に縮合するオキサゾリジン環が開裂して一般式Ｉの環Ａを形成する、二つ以上の窒素原子を含み、かつ一つ以上の酸素原子が置換されている不飽和ヘテロ環を意味する化合物またはその塩である。
一般式IIで表される化合物の製造方法
　一態様において、一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000097
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Ｉのものと同じ意味を示し、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式III：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000098
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ、そして環Ａ’は各々一般式IIのものと同じ意味を示す。］
で表される化合物にアジド化剤を反応させる工程を含む、製造方法を提供する。
　一実施態様において、当該アジド化剤はアジ化水素酸、アジ化ナトリウム、アジ化リチウム、テトラブチルアンモニウムアジド（ｎＢｕ４ＮＮ３）、トリメチルシリルアジド、ジフェニルホスホリルアジド（ＤＰＰＡ）、ニコチニルアジド、アジ化亜鉛（Ｚｎ（Ｎ３）２）が好ましく、ジフェニルホスホリルアジド（ＤＰＰＡ）がより好ましい。
　一態様において、一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000099
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は独立して水酸基の保護基であり、ｍは１～３の整数であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩が、新規な中間体化合物として挙げられる。
　一実施態様において、一般式IIで表される化合物またはその塩は、一般式II－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000100
 で表される化合物またはその塩であることが好ましい（式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ、そして環Ａ’は各々一般式IIと同義である。）。
　一実施態様において、一般式II（一般式II－ａ）中、Ｒ１及びＲ２が各々独立して水酸基の保護基である場合、１から３個のアリール基で置換されたメチル基が挙げられ、例えばベンジル基、２－ナフチルメチル基、４－メトキシベンジル基が好ましく、ベンジル基がより好ましい。
　一実施態様において、一般式II（一般式II－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子であることが好ましい。
　一実施態様において、一般式II（一般式II－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基である場合、当該Ｃ１－６アルキル基としてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ペンチル基、またはヘキシル基が好ましく、メチル基がより好ましい。当該置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　一実施態様において、一般式II（一般式II－ａ）中、環Ａ’は、６員環の不飽和ヘテロ環が好ましく、さらに環Ａ’は前記構造式II－１またはII－２で表される構造であることがより好ましい。環Ａ’の置換基としては、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、ハロゲン原子およびオキソ基からなる群から選ばれる１つ以上（好ましくは２もしくは３個）の置換基が好ましく、当該置換基としてはメチル基、ハロゲン原子（フルオロ原子、クロロ原子、ブロモ原子など）がより好ましい。
　一実施態様において、一般式IIで表される化合物またはその塩は、前記一般式II（好ましくは、一般式II－ａで表される化合物またはその塩、より好ましくは環Ａ’が前記一般式II－１または一般式II－２の構造を有する前記一般式II又は一般式II－ａで表される化合物またはその塩である。）中、Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａ’が下記一般式II－１またはII－２である、化合物またはその塩であることが特に好ましい。
　一態様において、一般式III：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000101
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして、環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩が、中間体化合物として挙げられる。
　一実施態様において、一般式IIIで表される化合物またはその塩は、一般式III－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000102
 で表される化合物またはその塩であることが好ましい（式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ、そして環Ａ’は各々一般式IIIと同義である。）。
　一実施態様において、好ましい一般式III（または一般式III－a）で表される化合物またはその塩は、前記一般式III（または前記一般式III－a）中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及び環Ａ’が一般式II（または一般式II－ａ）のものと同じ意味を示し、例えば前記一般式II－１またはII－２である化合物またはその塩である。
一般式IVで表される化合物の製造方法
　一態様において、一般式IV：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000103
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式Ｖ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000104
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及びＸは各々一般式IVのものと同じ意味を示し、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させて、一般式Ｖ中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化する工程を含む製造方法を提供する。
　一実施態様において、当該水酸基の活性化剤はトリフルオロメタンスルホニル化剤またはメタンスルホニル化剤が好ましく、トリフルオロメタンスルホニルクロリド、メタンスルホニルクロリド、またはトリフルオロメタンスルホン酸無水物がより好ましく、トリフルオロメタンスルホニルクロリドが特に好ましい。
　一態様において、一般式IV：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000105
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩が、中間体化合物として挙げられる。
　一実施態様において、一般式IVで表される化合物またはその塩は、一般式IV－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000106
 で表される化合物またはその塩であることが好ましい（式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｘ、ｍ、及び環Ａ’は各々一般式IVと同義である。）。
　一実施態様において、一般式IVで表される化合物またはその塩は、前記一般式IV（好ましくは、一般式IV－ａ）中、Ｒ１、Ｒ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、そして環Ａ’が前記一般式II－１またはII－２で表される環Ａ’であることがより好ましく、さらに環Ａ’は１つ以上の置換基を有してもよく、当該置換基としてはメチル基、ハロゲン原子（フルオロ原子、クロロ原子、ブロモ原子など）が好ましい。
　一実施態様において、一般式IV（一般式IV－ａ）中、Ｘとしての脱離基は、メシルオキシ（Ｍｓ－Ｏ－）基が好ましい。
　一態様において、一般式Ｖ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000107
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩が新規な中間体化合物として挙げられる。
　一実施態様において、一般式Ｖで表される化合物またはその塩は、一般式Ｖ－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000108
 で表される化合物またはその塩であることが好ましい（式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｘ、ｍ、及び環Ａは各々一般式Ｖと同義である。）。
　一実施態様において、一般式Ｖ（一般式Ｖ－ａ）中、Ｒ１及びＲ２が各々独立して水酸基の保護基である場合、１から３個のアリール基で置換されたメチル基が挙げられ、例えばベンジル基、２－ナフチルメチル基、４－メトキシベンジル基が好ましく、ベンジル基がより好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｖ（一般式Ｖ－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子であることがより好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｖ（一般式Ｖ－a）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基である場合、当該Ｃ１－６アルキル基としてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ペンチル基、またはヘキシル基が好ましく、メチル基がより好ましい。当該置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　一実施態様において、一般式Ｖ（一般式Ｖ－ａ）中、Ｘとしての脱離基は、メシルオキシ（Ｍｓ－Ｏ－）基が好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｖ（一般式Ｖ－ａ）中、環Ａは、６員環の不飽和ヘテロ環が好ましく、環Ａの置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、ハロゲン原子およびオキソ基からなる群から選ばれる１つ以上（好ましくは２もしくは３個）の置換基が挙げられる。環Ａは、チミニルまたはウラシニルであることがより好ましい。当該置換基としてはメチル基、ハロゲン原子（フルオロ原子、クロロ原子、ブロモ原子など）が好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｖで表される化合物またはその塩は、前記一般式Ｖ（好ましくは、一般式Ｖ－ａ）中、Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである、化合物またはその塩であることが特に好ましい。
一般式IIで表される化合物の別製造方法
　一実施態様において、一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000109
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式IV：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000110
 ［式中、Ｘは脱離基であり、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及び環Ａ’は各々一般式IIのものと同じ意味を示す］
で表される化合物にアジド化剤を反応させる工程を含む、製造方法を提供する。
　一実施態様において、当該アジド化剤はｎＢｕ４ＮＮ３またはアジ化ナトリウムが好ましい。
　一実施態様において、好ましい一般式IIで表される化合物またはその塩、および一般式IVで表される化合物またはその塩はそれぞれ、本明細書中他所で記載する通りである。
　一実施態様において、前記一般式IIで示される化合物またはその塩の製造法において、Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ（Ｍｓ－Ｏ－）基であり、環Ａ’が前記一般式II－１またはII－２であり、そしてアジド化剤がｎＢｕ４ＮＮ３またはアジ化ナトリウムである、ことが好ましい。
一般式IIで表される化合物のさらに別製造方法
　一態様において、一般式II：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000111
 ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式VI：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000112
 ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式IIのものと同じ意味を示し、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させて、一般式VI中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化する工程を含む、製造方法、を提供する。
　一実施態様において、当該水酸基の活性化剤はトリフルオロメタンスルホニル化剤またはメタンスルホニル化剤が好ましく、トリフルオロメタンスルホニルクロリド、メタンスルホニルクロリド、またはトリフルオロメタンスルホン酸無水物がより好ましく、トリフルオロメタンスルホニルクロリドが特に好ましい。
　一実施態様において、好ましい一般式IIで表される化合物またはその塩は、本明細書中他所で記載する通りである。
　一実施態様において、前記一般式IIで示される化合物またはその塩の製造法において、Ｒ１、Ｒ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルであり、環Ａ’が、前記一般式II－１またはII－２であり、そして水酸基の活性化剤がトリフルオロメタンスルホニルクロリドである、ことが好ましい。
　一実施態様において、好ましい一般式VIで表される化合物またはその塩は、一般式VI-a：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000113
 であることが好ましい。
　一実施態様において、好ましい一般式VI（一般式VI－ａ）で表される化合物またはその塩は、一般式VI中、Ｒ１及びＲ２がＢｎ基、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が水素原子であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルである化合物またはその塩である。
　一実施態様において、好ましい一般式IIで表される化合物またはその塩は、本明細書中他所で記載する通りである。
一般式VIIIで表される化合物の製造方法
　一態様において、一般式VIII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000114
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ１２及びＲ１３は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
一般式IX：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000115
 ［式中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式VIIIのものと同じ意味であり、Ｒ１４及びＲ１５は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
で表される化合物の環ＡをＢに置換する工程を含む、製造方法、を提供する。
　一実施態様において、環Ａの置換反応（トランスグリコシル化）に使用するルイス酸はＴＭＳＯＴｆが好ましい。また置換反応を促進するためにシリル化剤を使用してもよく、当該シリル化剤はＢＳＡが好ましい。
　一態様において、一般式VIII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000116
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ１２及びＲ１３は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。ここで、ｍ＝１もしくは２であり、かつＲ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が水素原子である場合、またはｍ＝１であり、かつＲ３もしくＲ５がメチル基で、Ｒ４及びＲ６が水素原子である場合、環Ａはチミニルでないことが好ましい。］
で表される化合物またはその塩が、新規な中間体化合物として挙げられる。
　一実施態様において、一般式VIIIで表される化合物またはその塩は、一般式VIII－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000117
 で表される化合物またはその塩であることが好ましい。ここで、ｍ＝１もしくは２であり、かつＲ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が水素原子である場合、またはｍ＝１であり、かつＲ３もしくＲ５がメチル基で、Ｒ４及びＲ６が水素原子である場合、環Ａはチミニルでないことが好ましい。
　一実施態様において、一般式VIII（一般式VIII－ａ）中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、そしてＲ１２はＢｎ基、ＤＭＴｒ基、またはＴＭＳ基であり、Ｒ１３はＢｎ基、水素原子、またはＴＭＳ基である、で表される化合物またはその塩が挙げられる。
　一実施態様において、一般式VIII（一般式VIII－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子であることがより好ましい。
　一実施態様において、一般式VIII（一般式VIII－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基である場合、当該Ｃ１－６アルキル基としてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ペンチル基、またはヘキシル基が好ましく、メチル基がより好ましい。当該置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　一実施態様において、一般式VIII（一般式VIII－ａ）中、Ｂは核酸の塩基部分であり、天然の核酸の塩基部分、並びに非天然の核酸の塩基部分が好ましく、アデニン、グアニン由来のプリン環もしくはその誘導体、またはウラシル、シトシン、チミン由来のピリミジンのモノ若しくはジオン環またはその誘導体がより好ましく、アデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニル、チミニルまたはウラシニルが特に好ましい。当該核酸の塩基部分は１つ以上の置換基を有してもよく、好ましい当該置換基としては水酸基、Ｃ１－６アルコキシ基、メルカプト基、Ｃ１－６アルキルチオ基、アミノ基、Ｃ１－６アルキル基で置換されたアミノ基、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基および、オキソ基、チオキソ基、ハロゲン原子が好ましく、Ｃ１－６アルキル基、およびオキソ基からなる群から選ばれる１つ以上（好ましくは２もしくは３個）の置換基がより好ましい。当該核酸の塩基部分の水酸基やアミノ基、チオール基は保護されていてもよく、当該保護基としては、核酸合成において通常用いる水酸基の保護基およびアミノ基の保護基が好ましく、アセチル基、フェノキシアセチル基、イソブチリル基、ベンゾイル基、シアノエトキシカルボニル基、ジフェニルアミノカルボニル基がより好ましく、イソブチリル基、ベンゾイル基、ジフェニルアミノカルボニル基が特に好ましい。
　一実施態様において、一般式VIIIで表される化合物またはその塩は、前記一般式VIII（好ましくは、一般式VIII－ａ）中、Ｂが１つ以上の置換基で置換されてもよいアデニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいグアニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいチミニルまたは１つ以上の置換基で置換されてもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６が各々水素原子であり、そしてＲ１２、Ｒ１３がすべてＢｎ基である、化合物またはその塩であることが特に好ましい。
　一実施態様において、一般式VIIIで表される化合物またはその塩は、前記一般式VIII（好ましくは、一般式VIII－ａ）中、Ｂが１つ以上の置換基で置換されてもよいアデニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいグアニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいチミニルまたは１つ以上の置換基で置換されてもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６が各々水素原子であり、Ｒ１２がＤＭＴｒ基であり、そしてＲ１３が水素原子である、化合物またはその塩であることが特に好ましい。
　一態様において、一般式IX：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000118
 ［式中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６は各々一般式VIIIのものと同じ意味であり、Ｒ１４、Ｒ１５は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。ここで、ｍ＝１もしくは２であり、かつＲ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が水素原子である場合、またはｍ＝１であり、かつＲ３もしくＲ５がメチル基で、Ｒ４及びＲ６が水素原子である場合、環Ａはチミニルでないことが好ましい。］
で表される化合物またはその塩が、新規な中間体化合物として挙げられる。
　一実施態様において、一般式IXで表される化合物またはその塩は、一般式IX－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000119
 で表される化合物またはその塩であることが好ましい（式中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ１４、Ｒ１５、ｍ及び環Ａは各々一般式IXと同義である。ここで、ｍ＝１もしくは２であり、かつＲ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が水素原子である場合、またはｍ＝１であり、かつＲ３もしくＲ５がメチル基で、Ｒ４及びＲ６が水素原子である場合、環Ａはチミニルでないことが好ましい）。
　一実施態様において、一般式IX（一般式IX－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は一般式VIII（一般式VIII－ａ）中の定義と同義である。
　一実施態様において、一般式IX（一般式IX－ａ）中、Ｒ１５が水酸基の保護基であるとき、該水酸基の保護基は、一般式Ｉで定義する基と同義であることが好ましい。
　一実施態様において、一般式IX（一般式IX－ａ）中、環Ａが、Ｃ１－６アルキル基およびオキソ基からなる群から選ばれる１つ以上（好ましくは２もしくは３個）の置換基で置換されていてもよい核酸のピリミジン塩基部分であることがより好ましい。
　一実施態様において、一般式IXで表される化合物またはその塩は、一般式IX（一般式IX－ａ）中、Ｂが、１つ以上の置換基で置換されてもよいアデニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいグアニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいチミニルまたは１つ以上の置換基で置換されてもよいウラシニルであり、Ｒ１４及びＲ１５がすべてＢｎ基であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルである、ことが特に好ましい。
　一実施態様において、一般式IXで表される化合物またはその塩は、一般式IX（一般式IX－ａ）中、Ｂが、１つ以上の置換基で置換されてもよいアデニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいグアニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいチミニルまたは１つ以上の置換基で置換されてもよいウラシニルであり、Ｒ１４がＤＭＴｒ基、Ｒ１５が水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである、ことが特に好ましい。
　一実施態様において、一般式IXで表される化合物またはその塩は、一般式IX（一般式IX－ａ）中、Ｂが、１つ以上の置換基で置換されてもよいアデニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいグアニニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の置換基で置換されてもよいチミニルまたは１つ以上の置換基で置換されてもよいウラシニルであり、Ｒ１４が水素原子、Ｒ１５が水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである、ことが特に好ましい。
一般式VIIで表される化合物の製造方法
　一態様において、一般式VII：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000120
 ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子または１つ以上の置換基で置換されていてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。（但し、ｍ＝１であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＢｏｃ基、Ｒ１０がＢｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるもの、およびｍ＝２であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＣｅｏｃ基、Ｒ１０がＣｅｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるものを除く。）］
で表される化合物またはその塩が、新規な化合物として挙げられる。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩は、一般式VII－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000121
 で表される化合物またはその塩であることが好ましい。（式中、Ｂ、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ７、Ｒ８、Ｒ９、Ｒ１０、Ｒ１１及びｍは各々一般式VIIと同義である。）。
　一般式VII中の但し書における、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＢｏｃ基、Ｒ１０がＢｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるものを除く場合は、国際公開第２０１４／０４６２１２号に記載の公知の化合物を除くことを意図する。
　一実施態様において、一般式VII（一般式VII－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子であることがより好ましい。
　一実施態様において、一般式VII（一般式VII－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基である場合、当該Ｃ１－６アルキル基としてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ペンチル基、またはヘキシル基が好ましく、メチル基がより好ましい。当該置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　一実施態様において、一般式VII（一般式VII－ａ）中、Ｒ７が水酸基の保護基であることが好ましく、トリチル型保護基がより好ましく、ＤＭＴｒ基が特に好ましい。
　一実施態様において、一般式VII（一般式VII－ａ）中、化合物又はその塩がホスホラミダイトである場合、Ｒ８は式：－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）の基であることが好ましい。
　一実施態様において、一般式VII（一般式VII－ａ）中、Ｒ９及びＲ１０がアミノ基の保護基であって、Ｒ１１が水素原子であることが好ましく、該アミノ基の保護基がＴｅｏｃ基またはＢｏｃ基であることがより好ましい。
　一実施態様において、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、好ましい当該置換基としては水酸基、Ｃ１－６アルコキシ基、メルカプト基、Ｃ１－６アルキルチオ基、アミノ基、Ｃ１－６アルキル基で置換されたアミノ基、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、オキソ基、チオキソ基、ハロゲン原子が好ましく、Ｃ１－６アルキル基、およびオキソ基からなる群から選ばれる１つ以上（好ましくは２もしくは３個）の置換基がより好ましい。当該核酸の塩基部分の水酸基やアミノ基、チオール基は保護されていてもよく、当該保護基としては、核酸合成において通常用いる水酸基の保護基およびアミノ基の保護基が好ましく、アセチル基、フェノキシアセチル基、イソブチリル基、ベンゾイル基、シアノエトキシカルボニル基、ジフェニルアミノカルボニル基がより好ましく、イソブチリル基、ベンゾイル基、ジフェニルアミノカルボニル基が特に好ましい。Ｂのより好ましい態様としては、保護基を有してもよいアデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニル、チミニルまたはウラシニルである。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩は、一般式VII（一般式VII－ａ）中、Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、または１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｒ７がＤＭＴｒ基であり、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基であり、Ｒ９がＴｅｏｃ基またはＢｏｃ基であり、Ｒ１０がＴｅｏｃ基またはＢｏｃ基であり、そしてＲ１１が水素原子である、化合物またはその塩、であることが好ましい。
　一実施態様において、一般式VII（一般式VII－ａ）中、Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｒ７がＤＭＴｒ基であり、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基であり、Ｒ９がＴｅｏｃ基であり、Ｒ１０がＴｅｏｃ基であり、そしてＲ１１が水素原子である、化合物またはその塩、であることが好ましい。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、本明細書に記載する工程のうち、以下の少なくとも１つの工程を含んでいてもよい。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、一般式IIで表される化合物に還元剤を反応させることにより、一般式Ｉで表される化合物またはその塩を製造する工程を含む。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、一般式IIIで表される化合物にアジド化剤を反応させることにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程を含む。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、一般式Vで表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させて、一般式Ｖ中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化することにより、一般式IVで表される化合物またはその塩を製造する工程を含む。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、一般式IVで表される化合物にアジド化剤を反応させることにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程を含む。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、一般式VIで表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させて、一般式VI中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化することにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程を含む。
　一実施態様において、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、一般式IXで表される化合物の環ＡをＢに置換することにより、一般式VIIIで表される化合物またはその塩を製造する工程を含む。
一般式Ｘで表される人工オリゴヌクレオチドの製造方法
　一態様において、一般式Ｘ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000122
 ［式中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６は各々独立して水素原子または、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ１６、Ｒ１７、Ｒ１８は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチド（但し、ｍ＝１または２であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ１６、Ｒ１７、Ｒ１８が各々水素原子であるヌクレオシドのみを架橋型核酸として有するオリゴヌクレオチドを除く。）の製造方法であって、
一般式XI：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000123
 ［式中、Ｂ、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Xのものと同じ意味であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、そしてＲ２０は１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基である。］
で表される化合物からホスホラミダイト法により製造する方法、を提供する。
　一実施態様において、ホスホラミダイト法がＷＯ　２０１４／０４６２１２Ａ１に記載の方法に準じる方法に従うことが好ましい。
　一実施態様において、上記一般式Ｘで表されるオリゴヌクレオチドの製造法において、一般式Ｘまたは一般式ＸＩ中、Ｂが１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ７が水酸基の保護基であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が水素原子であり、Ｒ２０が－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基であり、そしてＲ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立してアミノ基の保護基である、ことが好ましい。
　一態様において、新規なＧｕＮＡオリゴヌクレオチドまたはその塩を提供し、
一実施態様において、一般式Ｘ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000124
 ［式中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、そしてＲ１６、Ｒ１７及びＲ１８は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチド（但し、ｍ＝1または２であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が各々水素原子であるヌクレオシドのみを架橋型核酸として有するオリゴヌクレオチドを除く。）またはその塩である。
　一実施態様において、一般式Ｘで表される化合物またはその塩が、一般式Ｘ－ａ：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000125
 で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチドまたはその塩であることが好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｘ（一般式Ｘ－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々独立して水素原子であることがより好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｘ（一般式Ｘ－ａ）中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基である場合、当該Ｃ１－６アルキル基としてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ペンチル基、またはヘキシル基が好ましく、メチル基がより好ましい。当該置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　一実施態様において、一般式Ｘ（一般式Ｘ－ａ）中、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が各々独立して水素原子であることがより好ましい。
　一実施態様において、一般式Ｘ（一般式Ｘ－ａ）中、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が１つ以上の置換基で置換されてもよい分枝もしくは環を形成してもよいＣ１－６アルキル基である場合、当該Ｃ１－６アルキル基としてはメチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、ブチル基、イソブチル基、ペンチル基、またはヘキシル基が好ましく、メチル基がより好ましい。当該置換基としては、Ｃ１－６アルキル基、Ｃ２－６アルケニル基、Ｃ２－６アルキニル基、Ｃ１－６アルコキシ基、アミノ基、水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる同一または異なる１つ以上（または１～３個が好ましい）の基が挙げられる。
　一実施態様において、一般式Ｘ（一般式Ｘ－ａ）中、Ｂがアデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニル、チミニルまたはウラシニルであり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が水素原子である、オリゴヌクレオチドまたはその塩である、ことが好ましい。
　一実施態様において、当該オリゴヌクレオチドまたはその塩は当該ヌクレオチドを２個以上連続して、あるいは不連続で結合したものであり、２から１００個までのヌクレオチドを含むものであることが好ましく、５から５０個までのヌクレオチドを含むものであることがより好ましく、最も好ましくは１０から３０個までの人工ヌクレオチドが結合したもの、またはこれらの相補鎖と２重鎖を形成したものである。当該ヌクレオチドが不連続で結合した場合、当該ヌクレオチド間に位置するヌクレオチドは特に限定されないが、例えば架橋構造を有さない天然のヌクレオチドが好ましい。
　本明細書において、用語「化合物の塩」における「塩」とは、ナトリウム塩、カリウム塩、リチウム塩のようなアルカリ金属塩、カルシウム塩、マグネシウム塩のようなアルカリ土類金属塩、アルミニウム塩、鉄塩、亜鉛塩、銅塩、ニッケル塩、コバルト塩などの金属塩；アンモニウム塩のような無機塩、ｔ－オクチルアミン塩、ジベンジルアミン塩、モルホリン塩、グルコサミン塩、フェニルグリシンアルキルエステル塩、エチレンジアミン塩、Ｎ－メチルグルカミン塩、グアニジン塩、ジエチルアミン塩、トリエチルアミン塩、ジシクロヘキシルアミン塩、Ｎ，Ｎ’－ジベンジルエチレンジアミン塩、クロロプロカイン塩、プロカイン塩、ジエタノールアミン塩、Ｎ－ベンジル－フェネチルアミン塩、ピペラジン塩、テトラメチルアンモニウム塩、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン塩のような有機塩等のアミン塩；フッ化水素酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩のようなハロゲン原子化水素酸塩、硝酸塩、過塩素酸塩、硫酸塩、リン酸塩等の無機酸塩；メタンスルホン酸塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩のような炭素数１から６のアルカンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、ｐ－トルエンスルホン酸塩のようなアリールスルホン酸塩、酢酸塩、リンゴ酸塩、フマル酸塩、コハク酸塩、クエン酸塩、酒石酸塩、シュウ酸塩、マレイン酸塩等の有機酸塩；および、グリシン塩、リジン塩、アルギニン塩、オルニチン塩、グルタミン酸塩、アスパラギン酸塩のようなアミノ酸塩などを挙げられるが、これらに限定されない。薬理的に許容し得る塩を包含する。
　本明細書で記載する一般式Ｉ～XIで表される各化合物は、エナンチオマーもしくはジアステレオマーの形態またはこれらの混合物を包含する。例えば、各化合物の構造における、糖部分の立体配置がα体およびβ体を包含するが、β体が好ましい。前記一般式Ｉ～XIで表される化合物がジアステレオマーまたはエナンチオマーの形態で得られる場合、これらを有機合成（例えば、糖合成）の分野で周知の慣用の方法、例えばクロマトグラフィーまたは分別結晶法等で分離することができる。例えば、下記式：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000126
 で表される１６ａの化合物は、糖部分の立体配置がβ体である。
　本明細書で記載する一般式Ｉ～XIで表される各化合物は、同位元素（例えば、３Ｈ、１３Ｃ、１４Ｃ、１５Ｎ、１８Ｆ、３２Ｐ、３５Ｓ、１２５Ｉ等）等で標識された化合物および重水素変換体を包含する。
　本明細書で記載するオリゴヌクレオチドおよびその類縁体は、例えば、賦形剤、結合剤、防腐剤、酸化安定剤、崩壊剤、滑沢剤、矯味剤などの医薬の製剤技術分野において通常用いられる補助剤を配合して、非経口投与製剤またはリポソーム製剤とすることができる。また、例えば、当該技術分野で通常用いられる医薬用担体を配合して、液剤、クリーム剤、軟膏剤などの局所用の製剤を調製できる。
（製造方法）
　以下に、本明細書で記載する架橋型核酸ＧｕＮＡの製造方法を記載する。なお、一般式Ｉ～XIで表される各化合物において絶対立体配置を有する光学活性体は、出発原料に光学活性体のものを用いるかまたは合成の途中段階で生じる異性体を分離することによっても製造することができる。また、以下で記載する核酸塩基を置換する核酸塩基交換反応は、β選択的トランスグリコシル化が効率よく進行し、得られる一般式VIIIで表される化合物は所望するβ体を選択的に得ることができる。
　本発明化合物またはその薬理的に許容しうる塩は、以下の方法で製造することができるが、これらに限定されるものではない。
　原料化合物については、それらの具体的な製法が述べられていない場合には、市販されているものを用いることができるか、または公知の方法もしくはこれに準ずる方法に従って製造することができる。
　なお、本明細書において使用される略号は、それぞれ以下の意味を表す。
　ＴＨＦ：テトラヒドロフラン
　ＴＢＡＦ：フッ化テトラ－ｎ－ブチルアンモニウム
　Ｐｈ３Ｐ：トリフェニルホスフィン
　ＤＭＦ：Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド
　ＭｓＣｌ：メタンスルホニルクロリド
　ＤＭＡＰ：Ｎ，Ｎ－ジメチル－４－アミノピリジン
　ｉＰｒ２ＮＥｔ、及びＤＩＰＥＡ：Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン
　Ｔｆ２Ｏ：トリフルオロメタンスルホン酸無水物
　ＮａＮ３：アジ化ナトリウム
　Ｂｕ４ＮＮ３：テトラブチルアンモニウムアジド
　ＴｆＣｌ：トリフルオロメタンスルホニルクロリド
　Ｐｈ３ＰＯ：トリフェニルホスフィンオキシド
　ＢＳＡ：Ｎ，Ｏ－ビス（トリメチルシリル）アセトアミド
　ＴＭＳＯＴｆ：トリフルオロメタンスルホン酸トリメチルシリル
　ＴＢＳＯＴｆ： t-ブチルジメチルシリルトリフルオロメタンスルホン酸
　Ｂｎ：ベンジル
　ＴＭＳ：トリメチルシリル
　ＴＢＤＰＳ：ｔｅｒｔ－ブチルジフェニルシリル
　Ａｃ：アセチル
　Ｔｅｏｃ：トリメチルシリルエトキシカルボニル
　Ｂｏｃ：ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル
　ＣＨ２Ｃｌ２：ジクロロエタン
　ＭｅＣＮ：アセトニトリル
　ＤＰＰＡ：ジフェニルホスホリルアジド
　ＤＩＡＤ：アゾジカルボン酸 ジイソプロピル
　ＤＭＴｒ：４，４’－ジメトキシトリチル
　ＢＨＴ：ジブチルヒドロキシトルエン
　まず、本願発明の架橋型核酸ＧｕＮＡの製造方法の概略を記載する。
　主要製造経路（［Ａ法］）において、出発物質として糖化合物１を用い、Ｒ１基として水酸基保護基を導入して化合物２を調製する。次いで、化合物２を出発として用いて、公知の反応に従って多段階（６工程）の反応経路を経て、一般式IIIで表される化合物の前駆体（例えば、化合物７）を調製する。当該化合物を脱保護することにより、一般式IIIで表される化合物（例えば、化合物８）を新規な中間体として得る。続いて、適当なアジド化試薬を用いて光延反応を行うことにより、一般式IIで表される化合物（例えば、化合物９（チミン誘導体）、化合物３６（ウラシル誘導体））を新規な中間体として得る。
　更に、適当な還元剤を反応させることにより、一般式Ｉで表される化合物（例えば、化合物１２）を新規な中間体として得る。
　次いで、一般式Ｉで表される化合物を、脱保護し、次いで新たな別の保護基を導入することにより、一般式IXで表される化合物（例えば、化合物１４）を得る。続いて、グアニジン化試薬と反応させ、一般式VIIで表されるグアニジン化合物（例えば、化合物１５）を新規な中間体として得て、更にホスホラミダイト試薬と反応させ、新規な化合物として一般式VII（または、一般式XI）で表されるＧｕＮＡホスホラミダイト化合物（例えば、化合物１６）を製造することができる。該化合物は、架橋型核酸ＧｕＮＡの人工オリゴヌクレオチドを製造するための、モノマー出発原料として使用することができる。
　また、上述した主要製造経路（［Ａ法］）において、別の製造経路を採用することにより改変を行うことができる。改変法としては、メシル化反応経路（［Ｂ法］）、アジド化反応経路（［Ｃ法］）、及び核酸塩基交換反応経路（［Ｄ法］）を含む。
　本願発明の製造法についての製造経路の概要を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000127
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000128
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000129
［Ａ法］
一般式IIIで表される新規な中間体化合物の前駆体の製造
　まず、出発原料の化合物１から、一般式IIIの化合物の前駆体（例えば、化合物７）は文献公知の方法（例えば、J. Org. Chem. 2011， 76， 9891-9899に記載）に従って７工程を経て行う。
　代表的な製造例を下記に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000130
　化合物１は、商業的に入手可能であるか、あるいは商業的に入手可能な原料化合物を用いて一般的な有機合成化学（特に、核酸合成）において一般的に知られる方法に従って製造することができる。例えば、上記文献中に記載されている化合物１を適当な試薬を用いた有機合成法に従って一般式で表される他の１の化合物を得ることもできる。
　各製造工程は、J. Org. Chem. 2011， 76， 9891-9899に記載の方法に従う反応条件下で行うことができるが、出発原料である化合物１の種類に応じて個々の反応工程の条件（例えば、試薬、反応時間等）を適宜改変してもよい。また、J. Org. Chem. 2011， 76， 9891-9899に記載の方法によれば、中間体化合物４に対して核酸塩基としてチミン（Ｔ）を反応させるのに対して、下記に示す通り、チミン（Ｔ）に代わって別の核酸塩基（例えば、ウラシル（Ｕ））と反応させることによって、チミン以外の各種核酸塩基の類縁体を製造することもできる。
一般式IIで表される新規中間体化合物の製造
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000131
 （一般式III化合物の前駆体の一般式中、Ｒａは水酸基の保護基を示す。）
　次いで、前記の調製した一般式III化合物の前駆体を適当な溶媒中、脱保護反応により、新規な一般式IIIで表される中間体化合物（例えば、化合物８（チミン）、化合物３４（ウラシル））を得る。かかる脱保護反応は、保護基の種類に応じて適当な反応条件（例えば、試薬等）下で行うことができる。例えば、水酸基の保護基Ｒａがシリル型保護基（例えば、ＴＢＤＰＳ）であるときは、酸性条件下での加水分解（例えば、酢酸－ＴＨＦ－水）またはフッ化物イオン供与試薬（例えば、ＴＢＡＦ）を用いて処理することにより、実施することができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、水またはそれらの混合溶媒等）中、実施することができる。反応温度は、０℃～１００℃、とりわけ０℃～５０℃で好適に進行する。
　続いて、光延反応条件下、適当なアジド化試薬と反応させることにより、新規な一般式IIで表される中間体化合物（例えば、化合物９（チミン）、化合物３６（ウラシル））を得る。
　かかるアジド化反応は、一般式IIIで表される化合物を光延反応条件下（例えば、アジド化試薬（例えば、ジフェニルホスホリルアジド（ＤＰＰＡ）を、アゾジカルボン酸ジエステル（例えば、アゾジカルボン酸ジエチル（ＤＥＡＤ）、アゾジカルボン酸ジイソプロピル（ＤＩＡＤ））、およびトリフェニルホスフィン（Ｐｈ３Ｐ）の存在下で行う）で実施することができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、トルエンなどの炭化系水素類、水またはそれらの混合溶媒等）中、実施することができる。反応温度は、－７８℃～１００℃、とりわけ０℃～５０℃で好適に進行する。
　ここで、当該一般式IIIで表される化合物から一般式IIで表されるアジド化合物を得る反応の進行は、反応基質の精製の度合い等によって影響を受けやすく、操作上扱いが容易でない。そこで、直接に一般式IIの化合物を製造するのではなく、一旦水酸基を脱離基に変換した一般式IVで表される中間体化合物（例えば、化合物１０（チミン）、化合物３５（ウラシル））に変換し、その後当該脱離基を除去して適当なアジド化剤を導入することによって、一般式IIで表される化合物を容易に導くことができる。
　脱離基Ｘとしては、有機合成上一般的に知られる基であれば特に限定されるものではないが、例えばメタンスルホニルオキシ基（メシルオキシ；Ｍｓ－Ｏ－）、トリフルオロメタンスルホニルオキシ基、ｐ－トルエンスルホニルオキシ基を挙げられ、メシルオキシ基が好ましい。脱離基を導入するための試薬の例としては、トリフルオロメタンスルホニルクロリド、メタンスルホニルクロリド、ｐ－トルエンスルホニルクロリドまたはトリフルオロメタンスルホン酸無水物が挙げられ、メタンスルホニルクロリドが好ましい。
　アジド化剤の例としては、ｎＢｕ４ＮＮ３またはアジ化ナトリウムが挙げられる。
　脱離基の導入は、有機合成化学（例えば、糖合成）でよく知られる反応条件下（例えば、スルホニル化剤（例えば、ＭｓＣｌ）を用いて、塩基性条件下（例えば、ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ））実施することができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、水またはそれらの混合溶媒等）中、実施することができる。反応温度は、－２５℃～室温、とりわけ０℃～室温で好適に進行する。
　一方、脱保護およびアジド化を伴う反応は、有機合成化学（例えば、糖合成）でよく知られる反応条件下、脱離基の種類に応じて適当なアジド化試薬（例えば、テトラブチルアンモニウムアジド）を実施することができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ジオキサン等のエーテル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、水またはそれらの混合溶媒等）中、実施することができる。反応温度は、室温から溶媒還流下の温度、例えば１００℃以上の温度で好適に進行する。
　すなわち、一般式IIで表される化合物の製造方法は、以下の工程を含む：
a）一般式IIIの化合物の前駆体を脱保護して（５’位の水酸基保護基の脱保護）、一般式IIIで表される化合物を得る；および、
b）得られた一般式IIIで表される化合物を適当なアジド化試薬を用いる光延反応に付して、一般式IIで表される化合物を得る。
　別製法として、前記b）工程に代えて、以下のb'）およびc'）工程を含んでもよい：
b'）得られた一般式IIIで表される化合物を適当な試薬と反応させて、脱離基（Ｘ）を導入して（５’位の水酸基上）、一般式IVで表される化合物を得る；
c'）得られた一般式IVで表される化合物を適当なアジド化試薬と反応させて、一般式IIで表される化合物を得る。
一般式IIで表される新規な中間体化合物の別製造方法
　一般式IIで表される化合物の別製造方法を記載する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000132
 　前記の通り、化合物１から調製した化合物２を出発として用いて、まず水酸基のメシル化を行い、続いて前記J. Org. Chem. 2011， 76， 9891-9899に記載の方法に準じた方法（化合物３から化合物６の製造）に従って多段階（４工程）の反応経路を経て、一般式Ｖで表される新規な中間体化合物（具体例として、化合物２５）を得る。
　メシル化反応は、有機合成化学（例えば、核酸合成）で一般的に知られる反応条件下（例えば、適当な水酸基の活性化剤（例えば、メタンスルホニルクロリド、メタンスルホン酸無水物などのメシル化剤）を塩基条件下（例えば、トリエチルアミンの存在下）、実施することができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、水またはそれらの混合溶媒等）中、実施することができる。反応温度は、－２５℃～１００℃、とりわけ０℃～室温で好適に進行する。
　すなわち、一般式IVで表される化合物の製造方法は、以下の工程を含む：
　新規な中間体としての一般式Ｖで表される化合物に、水酸基の活性化剤（例えば、トリフルオロメタンスルホニル化剤）を反応させて、一般式Ｖ中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化することによって、一般式IVで表される化合物を得る。
　前記したように、一般式IVで表される化合物（例えば、化合物１０（チミン）、化合物３５（ウラシル））に、アジド化剤（例えば、ｎＢｕ４ＮＮ３またはアジ化ナトリウム）を反応させることによって、一般式IIで表される化合物を取得する。
一般式IIで表される新規な中間体化合物の別製造方法
　一般式IIで表される化合物の更に別の製造方法を記載する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000133
 　前記の通り、化合物１から調製した化合物２を出発として用いて、文献（Henrik M. Pfundheller， H. M.， Bryld， T.， Olsen， C. E.， Wengel， J. Helvetica Chimica Acta 2000， 83， 128-151）に記載の方法に準じた方法に従って多段階（５工程）の反応経路を経て、中間体としての一般式VIで表されるアジド体化合物（具体例として、化合物２１）を得る。
　次いで、一般式VIで表される中間体化合物を、前記の製法における化合物６から化合物７（または、化合物２５から化合物１０）を得る方法と同様の反応条件下、水酸基の活性化剤を塩基性条件下（例えば、ＤＭＡＰ存在下）反応させることにより、一般式IIで表される新規な中間体化合物（具体例としては、化合物９）を製造する。
　本反応における水酸基の活性化剤の例としては、トリフルオロメタンスルホニルクロリド、メタンスルホニルクロリド、またはトリフルオロメタンスルホン酸無水物を挙げられるが、トリフルオロメタンスルホニルクロリドが好ましい。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、水またはそれらの混合溶媒等）中、実施することができる。反応温度は、０℃～１００℃、とりわけ０℃～室温で好適に進行する。
　すなわち、一般式VIで表される化合物から、新規な中間体としての一般式IIで表される化合物を製造する方法は、以下の工程を含む：
　一般式VIで表される化合物を、水酸基の活性化剤と反応させて、一般式VI中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化することにより、一般式IIで表される化合物を得る。
一般式Ｉで表される新規な中間体化合物の製造
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000134
 　更に、得られた一般式IIで表される化合物を、還元反応に付することによって、アジド基が還元された一般式Ｉで表される新規な中間体化合物（例えば、化合物１２（チミン）、化合物３７（ウラシル））（本明細書中、「２’－アミノＬＮＡ」と呼称することがある）を得ることができる。
　アジド基の本還元反応は、例えば、還元剤（例えば、トリフェニルホスフィンなどのホスフィン類）下で行うことができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、水またはそれらの混合溶媒等）中、実施することができる。反応温度は、０℃～高温、とりわけ室温～１００℃以下の温度で好適に進行する。
　すなわち、一般式Ｉで表される新規中間体化合物の製造方法は、以下の工程を含む：
　前記で得られた一般式IIで表される新規中間体化合物を、還元剤と反応させることにより、一般式Ｉで表される化合物またはその塩を製造する。
　ここで、本反応は、４’位の炭素原子からアジドメチル基を伸長して２’位の炭素原子と架橋することで、２’位のアミノ基を導入することを特徴とする、新規な反応工程である。
一般式VIIで表される新規なモノマー化合物の前駆体の製造
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000135
　前記で得られた一般式Ｉで表される化合物を５’位および３’位上でそれぞれＲ１基およびＲ２基を脱保護して、中間体化合物３（例えば、実施例１３の化合物）を得る。続いて、脱保護した保護基と脱保護条件が異なる新たな水酸基保護基を５’位の水酸基上のみ（Ｒ７）に導入することで、前駆体としての中間体化合物４（例えば、化合物１４）またはその塩を得る。
　ここで、脱保護反応としては、保護基の種類に応じて有機合成化学（例えば、核酸合成）で一般的に知られる反応条件下で行うことができる。例えば、ベンジル型保護基（例えば、Ｂｎ基）の場合には、有機金属触媒（例えば、パラジウム－炭素）存在下、水素との水素化分解反応により脱保護反応を実施することができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、酢酸エチルなど酢酸エステル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、酢酸等の酸類、メタノールなどアルコール類、水またはそれらの混合溶媒等）あるいは塩基自体を溶媒として用いて、実施することができる。反応温度は、室温～高温、とりわけ室温～５０℃以下の温度で好適に進行する。
　また、新たに導入される水酸基保護基としては、例えばトリチル型保護基（例えば、ＤＭＴｒ基）が挙げられる。本保護基の導入反応は、保護基の種類に応じて有機合成化学（例えば、核酸合成）でよく知られる反応条件下、実施することができる。例えば、水酸基の保護基がトリチル型保護基（例えば、ＤＭＴｒ基）であるときは、塩基性条件下（例えば、ピリジンの存在下）で実施することができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、ジクロロメタン等のハロゲン化炭化水素類、水またはそれらの混合溶媒等）あるいは塩基自体を溶媒として用いて、実施することができる。反応温度は、０℃～５０℃、とりわけ室温で好適に進行する。
　すなわち、中間体化合物４の製造方法は、以下の工程を含む。
a）前記で得られた一般式Ｉで表される化合物（５’位および３’位上のＲ１基およびＲ２基）を、脱保護反応に付す（中間体化合物３を得る）；
b）反応生成物に、水酸基の保護基を導入する（５’位）。
　本明細書中で後述の通り、得られた中間体化合物４をグアニジン化、続いてホスホラミダイト化を行って、一般式VIIで表される新規化合物を製造することができる。
核酸塩基交換反応
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000136
 　前述の通り得られた一般式Ｉで表される化合物又は中間体化合物４（一般式IXで表される化合物と総称する（例、化合物１２、化合物１４））を出発物質として用いて、核酸塩基交換反応（トランスグリコシル化反応）によりチミン（T）、ウラシル（U）等の核酸塩基のピリミジンを、別の核酸塩基（例えば、アデニン（A）、グアニン（G）、ウラシル（U）、チミン（T）、シトシン（C）、または５－メチルシトシン（MeC））に置換することによって、新規な中間体として一般式VIIIで表される化合物またはその塩（例、化合物２６、化合物２８、化合物２９）を製造することができる。
　該塩基交換反応は、例えば一般式IXで表される化合物を、ルイス酸の存在下で実施することができ、シリル化剤を反応させることによって反応を促進することができる。
　シリル化剤としては、例えばＢＳＡ、ヘキサメチルジシラザンなどが挙げられ、ルイス酸としては例えばＴＭＳＯＴｆ、ＴＢＳＯＴｆ、塩化スズなどが挙げられるが、これらに限定されない。
　反応基質に対して、シリル化剤は約１～約２０モル当量数で、ルイス酸は触媒量（約０．０５モル当量数）～２モル当量数で使用することができる。
　溶媒としては反応に影響を与えないものであればよく、適当な溶媒（例えば、ＴＨＦ等のエーテル類、ジクロロメタン、ジクロロエタン、クロロホルム等のハロゲン化炭化水素類、ベンゼン、トルエンなどの炭化系水素類、アセトニトリル、水またはそれらの混合溶媒等）中、実施することができる。反応温度は、０℃～高温、とりわけ室温～約６０℃で好適に進行する。
一般式VIIで表されるモノマー化合物の製造
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000137
　前記で得られた一般式IXで表される化合物または一般式VIIIで表される化合物をグアニジン化試薬と反応させて、一般式VIIIで表される化合物の架橋アミノ基上でグアニジン化された、一般式VII（一般式中、Ｒ８aは水素原子）で表されるグアニジン化合物（例えば、化合物１５）を得る。ここで、グアニジン化反応は、有機合成（特に、核酸合成）上一般的に知られる反応条件（例えば、試薬）下で行うことができる。該グアニジン化試薬としては、例えば下記式：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000138
 ［式中、Ｒｐｒｏはアミノ基の保護基（例えば、Ｔｅｏｃ、Ｂｏｃ）である］
が挙げられ、適当な活性化試薬（例えば、銀トリフラート（ＡｇＯＴｆ））の存在下で行うことができる。
　更に、得られた一般式VIIで表される化合物を、ホスホラミダイト試薬と反応させ、一般式VIIで示される化合物またはその塩（本願明細書中、「ＧｕＮＡホスホラミダイト」と呼称することがある）（例えば、化合物１６）を得る。ここで、ホスホラミダイト化反応は、有機合成（特に、核酸合成）上一般的に知られる反応条件（例えば、試薬）下で行うことができる。該ホスホラミダイト化試薬としては、例えば下記式：
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000139
 が挙げられるが、これに限定されない。当該ホスホラミダイト化反応は、適宜塩基（例えば、ＤＩＰＥＡ）または適宜酸（例えば、ジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド、４，５－ジシアノイミダゾール）の存在下で行ってもよい。
　すなわち、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、以下の工程を含む：
a）一般式IXで表される化合物若しくはその塩、または一般式VIIIで表される化合物若しくはその塩を、グアニジン化反応させて、一般式VII（式中、Ｒ８aは水素原子）で表される化合物を得る；
b）反応生成物をホスホラミダイト化反応させて、一般式VII（式中、Ｒ８bは置換されてもよいリン酸基）で表される化合物を得る。
　また、一般式VIIで表される化合物またはその塩の製造方法は、本明細書に記載する工程のうち、以下の少なくとも１つの工程を含んでいてもよい。
　一般式IIで表される化合物に還元剤を反応させることにより、一般式Ｉで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式IIIで表される化合物にアジド化剤を反応させることにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式Vで表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させることにより、一般式IVで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式IVで表される化合物にアジド化剤を反応させることにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式VIで表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させることにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式IXで表される化合物の環Ａを置換することにより、一般式VIIIで表される化合物またはその塩を製造する工程。
一般式Xで表されるＧｕＮＡオリゴヌクレオチドの製造
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000140
 　一般式VII、もしくは一般式XIで表される化合物またはその塩は、ＧｕＮＡオリゴヌクレオチドを製造するための、モノマー出発原料として使用することができる。ＧｕＮＡオリゴヌクレオチドは、一般式VII、もしくは一般式XIで表される化合物またはその塩を用いてオリゴマー化反応をした後、必要に応じてアミノ保護基を脱保護することで合成することができる。
　オリゴマー化反応は例えば、合成化学（特に、核酸合成）上一般的に知られる方法であれば限定されるものではないが、例えばホスホラミダイト法により行うことができる。ホスホラミダイト法としては、例えばＷＯ　２０１４／０４６２１２Ａ１に記載の方法に準じる方法に従って行うことができる。
　本オリゴマー化反応により、一般式Ｘで表されるヌクレオチドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチドを製造することができる。
　すなわち、一般式Xで表されるオリゴヌクレオチドの製造方法は、以下の工程を含む：
a）一般式VIIもしくは一般式XIで表される化合物、またはその塩を用いてオリゴマー化反応をした後、必要に応じてアミノ保護基を脱保護する。
　また、一般式VIIもしくは一般式XIで表される化合物またはその塩の製造方法は、本明細書に記載する工程のうち、以下の少なくとも１つの工程を含んでいてもよい。
　一般式IIで表される化合物に還元剤を反応させることにより、一般式Ｉで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式IIIで表される化合物にアジド化剤を反応させることにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式Vで表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させることにより、一般式IVで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式IVで表される化合物にアジド化剤を反応させることにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式VIで表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させることにより、一般式IIで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式IXで表される化合物の環Ａを置換することにより、一般式VIIIで表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式IXで表される化合物若しくはその塩、または一般式VIIIで表される化合物若しくはその塩をグアニジン化反応させることにより、一般式VII（式中、Ｒ８aは水素原子）で表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式VII（式中、Ｒ８aは水素原子）で表される化合物またはその塩をホスホラミダイト化反応させて、一般式VII（式中、Ｒ８bは置換されてもよいリン酸基）で表される化合物またはその塩を製造する工程。
　一般式VIIで表される化合物のＲ９、Ｒ１０、Ｒ１１のアミノ保護基のいずれか１つ以上を脱保護することにより、一般式XIで表される化合物を製造する工程。
　以下に実施例を挙げて本発明を更に具体的に説明するが、本発明はこれら実施例に限定されるものではない。なお、化合物の同定は元素分析値、マス・スペクトル、高速液体クロマト質量分析計；ＬＣＭＳ、ＩＲスペクトル、ＮＭＲスペクトル、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）等により行った。ＮＭＲにおいて水素核磁気共鳴（１Ｈ－ＮＭＲ）では共鳴周波数が４００ＭＨｚのものを、リン核磁気共鳴（３１Ｐ－ＮＭＲ）では共鳴周波数が１６１．８ＭＨｚのものを用いた。ＮＭＲに用いられる記号としては、ｓは一重線、ｄは二重線、ｄｄは二重の二重線、ｔは三重線、ｔｄは三重の二重線、ｑは四重線、quinは五重線、septは七重線、ｍは多重線、ｂｒは幅広い、ｂｒｓは幅広い一重線、ｂｒｄは幅広い二重線、ｂｒｔは幅広い三重線及びＪは結合定数を意味する。
　化合物１２の製造法の一例を示すが、これらに限定されるものではない。具体的には、市販の化合物１を出発物質として用いて、J. Org. Chem. 2011， 76， 9891-9899に記載の方法に準じて製造した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000141
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000142
実施例１
（(2R,3S,3aS,9aR)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジロキシ)メチル]-2-(ヒドロキシメチル)-7-メチル-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン （化合物８）
　化合物７（J. Org. Chem. 2011， 76， 9891に記載の方法に準じ、3，5-ジ-O-ベンジル-4-C-ヒドロキシメチル-l，2-O-イソプロピリデン-α-D-リボフラノース ２から合成した）（２．００ｇ， ２．９０３ｍｍｏｌ）およびＴＨＦ（１４．５ｍＬ）を混合し、０℃冷却下、ＴＢＡＦ（３．７７ｍＬ， ３．７７４ｍｍｏｌ）を滴下した。室温にて１３０分撹拌した後、溶媒留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール、１００／０～８５／１５）にて精製することで化合物８（１２６０ｍｇ、収率９６％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 451 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 7.41-7.24 （8H， m）， 7.21-7.11 （3H， m）， 6.25 （1H， d， J = 6.2 Hz）， 5.32 （1H， dd， J = 6.2， 2.6 Hz）， 4.79 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.61 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.39 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.34 （1H， d， J = 2.6 Hz）， 4.34 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 3.86 （1H， dd， J = 12.2， 5.7 Hz）， 3.69 （1H， dd， J = 12.2， 7.7 Hz）， 3.33 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 3.30 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 2.20 （1H， dd， J =  7.7， 5.7 Hz）， 1.99-1.95 （3H， m）
実施例２
(2R,3S,3aS,9aR)-2-(アジドメチル)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジルオキシ)メチル]-7-メチル-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン （化合物９）
　化合物８（３００ｍｇ， ０．６６５９ｍｍｏｌ）とＴＨＦ（４．４ｍＬ）を混合した。０℃冷却下、Ｐｈ３Ｐ（５２４ｍｇ， １．９９８ｍｍｏｌ）、およびアゾジカルボン酸 ジイソプロピル（０．４１３ｍＬ， ２．０９８ｍｍｏｌ）を加え、続いてジフェニルホスホリルアジド（０．４３１ｍＬ， １．９９８ｍｍｏｌ）を滴下した。室温下、１０分撹拌した後、外温５０℃にて３０分加熱撹拌した。ＤＭＦ（１．２ｍＬ）を加え、外温５０℃にて１７時間加熱撹拌した。０℃として飽和食塩水を加え、酢酸エチルで抽出した。得られた有機層に無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥し、ろ過した後、溶媒留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール、１００／０～９５／５）にて精製することで化合物９（２８５ｍｇ， 収率９０％、不純物としてＰｈ３ＰＯを含む）を得た。
MS（APCI）: m/z = 476 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 7.41-7.26 （8H， m）， 7.21-7.11 （3H， m）， 6.19 （1H， d， J = 6.2 Hz）， 5.29 （1H， dd， J = 6.2， 2.3 Hz）， 4.77 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.61 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.40 （1H， d， J = 12.0 Hz）， 4.35 （1H， d， J = 12.0 Hz）， 4.29 （1H， d， J = 2.3 Hz）， 3.63 （1H， d， J = 12.8 Hz）， 3.49 （1H， d， J = 12.8 Hz）， 3.33 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 3.25 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 2.01-1.95 （3H， m）
実施例３
　また、化合物９は以下の実施例３及び４に従って化合物８から合成することもできる。
{(2S,3S,3aS,9aR)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジルオキシ)メチル]-7-メチル-6-オキサ-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-2-イル}メチル　メタンスルホネート （化合物10）
　化合物８（７．００ｇ， １５．５４ｍｍｏｌ）の塩化メチレン（１５５ｍＬ）懸濁液に氷冷下、ＭｓＣｌ（２．０５ｍＬ， ２６．４２ｍｍｏｌ）とＤＭＡＰ（５６９５ｍｇ， ４６．６１ｍｍｏｌ）を加え、室温にて１．５時間撹拌した。ジイソプロピルエーテル（５００ｍＬ）を加えて生じた白色固体をろ取し、ジイソプロピルエーテルにて洗浄した。得られた固体をジイソプロピルエーテル（５００ｍＬ）、クロロホルム（１００ｍＬ）にて再結晶し、得られた結晶を水（１Ｌ）にて洗浄した後、乾燥することで化合物１０（８．１２ｇ， １５．４ｍｍｏｌ， 収率９８．９％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 529 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 7.39-7.27 （8H， m）， 7.21-7.14 （3H， m）， 6.22 （1H， d， J = 6.1 Hz）， 5.28 （1H， dd， J = 6.1， 2.6 Hz）， 4.76 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.60 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.44-4.31 （5H， m）， 3.40 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 3.29 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 2.92 （3H， s）， 2.00-1.95 （3H， m）
実施例４
(2R,3S,3aS,9aR)-2-(アジドメチル)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジルオキシ)メチル]-7-メチル-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン（化合物９）
　化合物１０（７．００ｇ，１３．２４ｍｍｏｌ）の１、４－ジオキサン（１３２ｍＬ）溶液にテトラブチルアンモニウムアジド（１１．３ｇ，３９．７３ｍｍｏｌ）を加え、外温１２０℃にて７時間撹拌した。氷冷下とし、飽和重曹水を加えた。酢酸エチルにて２回抽出した後、有機層を飽和食塩水にて洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した後、不溶物をろ去した。ろ液を溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール、９０／１０～８５／１５）にて精製することで化合物９（５．８０ｇ， １２ｍｍｏｌ， 収率９２％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 476 （M＋H）+
　１Ｈ－ＮＭＲは実施例２で得た化合物９と一致した。
実施例５
1-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物12）
　化合物９（１４４６ｍｇ， ３．０４１ｍｍｏｌ）、ＴＨＦ（２０ｍＬ）および水（４ｍＬ）を混合し、Ｐｈ３Ｐ（１１９６ｍｇ，４．５６２ｍｍｏｌ）を加えて外温７０℃で１７時間加熱撹拌した。溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール、９５／５～８５／１５）にて精製することで化合物１２（１２６７ｍｇ， 収率９２％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 450 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.08 （1H， brs）， 7.61-7.57 （1H， m）， 7.39-7.23 （10H， m）， 5.52 （1H， s）， 4.65-4.51 （4H， m）， 3.91 （1H， s）， 3.87 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.80 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.64 （1H， s）， 3.15 （1H， d， J = 9.7 Hz）， 2.90 （1H， d， J = 9.7 Hz）， 1.68-1.53 （3H， m） 
　化合物１６ａ及び１５ｂの製造法の１例を示すが、これらに限定されるものではない。具体的には、上記で得られた化合物１２を出発物質として用いて化合物１６ａ及び１５ｂを製造した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000143
実施例６
1-[(1R,3R,4R,7S)-7-ヒドロキシ-1-(ヒドロキシメチル)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル]-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン　酢酸塩 （化合物13）
　化合物１２（１．００ｇ， ２．２２５ｍｍｏｌ）および酢酸（６ｍＬ）を混合し、水酸化パラジウム（２００ｍｇ、１．４２５ｍｍｏｌ）を加えた。水素雰囲気下、外温５０℃にて６時間加熱撹拌した。反応液を窒素置換した後、メタノールを用いてメンブランフィルターでろ過し、ろ液を濃縮した。トルエンにて共沸を行い、真空乾燥することで化合物１３（７７４ｍｇ， トルエン９．８ｗｔ％含有， 収率１００％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 270 （M＋H）+
1H-NMR （DMSO-d6） δ: 11.31 （1H， brs）， 7.75-7.70 （1H， m）， 5.33 （1H， s）， 3.83 （1H， s）， 3.78-3.56 （2H， m）， 3.26 （1H， s）， 2.90 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 2.58 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 1.91 （3H， s）， 1.79-1.75 （3H， m）
実施例７
1-[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒドロキシ-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル]-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物14）
　氷冷下、化合物１３（４．００ｇ， １２．１ｍｍｏｌ）のピリジン（３７ｍＬ，４６２ｍｍｏｌ）溶液に、４，４’－ジメトキシトリチルクロリド（１２．４ｇ，３６．４ｍｍｏｌ）を加えた後、室温まで昇温させて、１．５時間撹拌した。反応液を酢酸水溶液（水２５０ｍＬ／酢酸６９．５ｍＬ）に滴下し、酢酸エチル（３００ｍＬ）を加えて３０分間撹拌した。酢酸エチルにて抽出した後、有機層を飽和食塩水、飽和重曹水、飽和食塩水にて順次洗浄し、無水硫酸ナトリウムにて乾燥して不溶物をろ去した。ろ液を溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール、１００／０～９０／１０）にて精製することで化合物１４（５．９８ｇ，収率８６％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 572 （M＋H）+
1H-NMR （DMSO-d6） δ: 11.33 （1H， brs）， 7.63-7.59 （1H， m）， 7.47-7.21 （9H， m）， 6.94-6.86 （4H， m）， 5.37 （1H， d， J = 5.1 Hz）， 5.34 （1H， s）， 4.05 （1H， d， J = 5.1 Hz）， 3.74 （6H， s）， 3.39-3.22 （3H， m）， 2.84 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 2.63 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 1.53-1.46 （3H， m）
実施例８
ビス[2-(トリメチルシリル)エチル] {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒロドキシ-3-(5-メチル-2,4-ジオキサ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物15a）
　化合物１４（１２６６ｍｇ， ２．２１５ｍｍｏｌ）、ＴＨＦ（７．７ｍＬ）、および２－トリメチルシリルエチル　Ｎ－［メチルスルファニル－（２－トリメチルシリルエトキシカルボニルアミノ）メチレン］カルバメート（１２５８ｍｇ，３．３２２ｍｍｏｌ）のＴＨＦ（７ｍＬ）の溶液を混合し、氷冷下にてＥｔ３Ｎ（１．２３ｍＬ，８．８５９ｍｍｏｌ）、およびＡｇＯＴｆ（８５４ｍｇ，３．３２２ｍｍｏｌ）を順次加えた。室温まで昇温後、室温で４時間撹拌した。氷冷下、飽和食塩水を加え、酢酸エチルで抽出した。有機層を無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、不溶物をろ去した。ろ液を溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル、５５／４５～４５／５５）にて精製することで化合物１５ａ（１５６３ｍｇ， 酢酸エチル１．９ｗｔ％含有， 収率７８％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 902 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 10.36 （1H， brs）， 8.26 （1H， s）， 7.59 （1H， s）， 7.49-7.42 （2H， m）， 7.39-7.20 （7H， m）， 6.89-6.80 （4H， m）， 5.62 （1H， s）， 4.71 （1H， s）， 4.36-4.07 （5H， m）， 3.84-3.70 （7H， m）， 3.62 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 3.57-3.46 （2H， m）， 1.67 （3H， s）， 1.11-0.97 （4H， m）， 0.04 （18H， s）
実施例９
ビス[2-(トリメチルシリル)エチル] {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-{[(2-シアノエトキシ)(ジプロパン-2-イルアミノ)ホスファニル]オキシ}-3-(5-メチル-2,4-ジオキソ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物16a）
　化合物１５ａ（６０．５ｍｇ，０．０６７１ｍｍｏｌ）、及びジクロロメタン（１．５ｍＬ）を混合し、氷冷下、ｉＰｒ２ＮＥｔ（０．０２３２ｍＬ，０．１３４ｍｍｏｌ）、および２－シアノエチル　Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルクロロホスホラアミド（０．０２２４ｍＬ，０．１０１ｍｍｏｌ）を順次滴下し、室温として４時間撹拌した。再び氷冷下とし、ｉＰｒ２ＮＥｔ（０．０２３２ｍＬ，０．１３４ｍｍｏｌ）、２－シアノエチル　Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルクロロホスホラアミド（０．０２２４ｍＬ，０．１０１ｍｍｏｌ）を追加し、室温として２時間撹拌した。氷冷下、飽和重曹水を加え、クロロホルムで抽出した。有機層を水、飽和食塩水にて順次洗浄した後、無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、不溶物をろ去した。ろ液を溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル、６５／３５～５０／５０）にて精製することで化合物１６ａ（４０．１ｍｇ， 収率５４％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 1102 （M＋H）+
31P-NMR （CDCl3） δ: 149.44， 149.31， 148.87， 148.69
実施例１０
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒドロキシ-3-(5-メチル-2,4-ジオキソ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物15b）
　化合物１４（１．２０ｇ， ２．１０ｍｍｏｌ）のＴＨＦ（２１ｍＬ）懸濁液に、室温にてＥｔ３Ｎ（１．２ｍＬ，８．４ｍｍｏｌ）、ｔｅｒｔ－ブチル　Ｎ－［（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニルアミノ）－メチルスルファニル－メチレン］カルバメート（９１０ｍｇ，３．１ｍｍｏｌ）、およびＡｇＯＴｆ（８１０ｍｇ，３．１ｍｍｏｌ）を順次加え、室温にて２時間撹拌した。反応液に飽和食塩水を加え、酢酸エチルにて抽出した。酢酸エチル有機層を飽和食塩水にて洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、不溶物をろ去した。ろ液を溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル、５０／５０～３０／７０）にて精製することで化合物１５ｂ（１．４４ｇ， １．７７ｍｍｏｌ， 収率８４％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 814 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 10.11 （1H， brs）， 8.09 （1H， brs）， 7.65-7.57 （1H， m）， 7.52-7.41 （2H， m）， 7.40-7.19 （7H， m）， 6.89-6.78 （4H， m）， 5.57 （1H， s）， 4.67 （1H， s）， 4.32 （1H， s）， 4.15 （1H， brs）， 3.85-3.72 （7H， m）， 3.64-3.40 （3H， m）， 1.72-1.65 （3H， m）， 1.48 （18H， s）
　化合物１２の別製造法（以下、アジドルートとも呼称する）を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000144
実施例１１（アジドルート）
　化合物２（3，5-ジ-O-ベンジル-4-C-ヒドロキシメチル-l，2-O-イソプロピリデン-α-D-リボフラノース）から化合物２０の合成は、既知文献（Henrik M. Pfundheller， H. M.， Bryld， T.， Olsen， C. E.， Wengel， J. Helvetica Chimica Acta 2000， 83， 128-151）に従い実施した。
3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-5-O-(トリフルオロメチルスルホニル)-β-L-リキソフラノース （化合物17）
　化合物２（70.10 g， 174 mmol）を塩化メチレン（700 mL）に溶解し、そこにピリジン（41.51 g， 524 mmol）を加え、内温－５５℃まで冷却した。内温－５５℃～－４８℃でTf2O（78.93 g， 280 mmol）を３０分間かけて滴下し、同温で１時間撹拌した。氷浴に切り替え更に１時間撹拌した後、８％炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、有機層を分離し、８％炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で順次洗浄した。各水層を酢酸エチルで再抽出し、合一した有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥して不溶物をろ去た。溶媒を減圧留去して、化合物１７（92.96 g）を得た。
　1H-NMR （CDCl3）：文献の値と一致した。
5-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-デオキシ-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-β-L-リキソフラノース （化合物18）
　窒素気流下、化合物１７（92.96 g， 174 mmol）をＤＭＦ（465 mL）に溶解した。室温でＮａＮ３（45.42 g， 698 mmol）を加え、外温６０℃で４時間３０分撹拌した。放冷後に、酢酸エチルと水に分配した。有機層を分離して８％炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で順次洗浄した。各水層を酢酸エチルで再抽出し、合一した有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥して不溶物をろ去した。溶媒を減圧留去して、粗体（75.70 g）を得た。カラムクロマトグラフィー（n-ヘキサン／酢酸エチル＝９０／１０～８０／２０）で精製し、化合物18（45.70 g， 収率60%）を得た。
　1H-NMR （CDCl3）：文献の値と一致した。
1,2-ジ-O-アセチル-5-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-デオキシ-L-リキソフラノース （化合物19）
　窒素気流下、化合物１８（45.70 g）を無水酢酸（46 mL）と酢酸（92 mL）に溶解した。氷浴冷却下で濃硫酸（280 μL）を加え、室温で２時間撹拌した。酢酸エチル（420 mL）で希釈後、氷浴冷却下で飽和炭酸ナトリウム水溶液を滴下した後、有機層を分離して８％炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で順次洗浄した。各水層を酢酸エチルで再抽出し、合一した有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥して不溶物をろ去した。溶媒を減圧留去後、トルエンで共沸して化合物１９（50.72 g）を得た。精製は行わず、定量的収率として次工程に用いた。
　1H-NMR （CDCl3）：文献の値と一致した。
1-{2-O-アセチル-5-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-デオキシ-α-L-リキソフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物20）
　窒素気流下、化合物１９（50.72 g）をアセトニトリル（445 mL）に溶解して、チミン（26.56 g， 210 mmol）を加えた。室温でＢＳＡ（171.86 g， 841 mmol）を２０分間かけて滴下し、外温９０℃で1時間撹拌した。放冷後に、氷浴冷却下でＴＭＳＯＴｆ（46.96 g， 210 mmol）を１５分間かけて滴下し、外温９０℃で１時間撹拌した。放冷後に、氷浴冷却下で８％炭酸水素ナトリウム水溶液を加えた後、析出した固体を濾別し、アセトニトリルを減圧留去した。酢酸エチルを加えて有機層を分離して飽和食塩水で洗浄した。各水層を酢酸エチルで再抽出して、合一した有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥して不溶物をろ去した。溶媒を減圧留去して化合物２０（66.18 g）を得た。精製は行わず、定量的収率として次工程に用いた。
MS （ESI）: m/z 536 （M+H）+
　1H-NMR （CDCl3）：文献の値と一致した。
1-{5-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-デオキシ-α-L-リキソフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物21）
　化合物２０（66.18 g）をＴＨＦ（70 mL）に溶解して共沸した後、ＴＨＦ（200 mL）に溶解して、窒素気流下、室温で４０％メチルアミン水溶液（132 mL）を加えた。室温で１時間３０分撹拌後、溶媒を減圧留去した。濃縮残渣を酢酸エチル、水、および飽和食塩水に分配し、有機層を分離して、飽和食塩水で洗浄した。各水層を酢酸エチルで再抽出し、合一した有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥して不溶物をろ去した。溶媒を減圧留去して化合物２１（56.26 g）を得た。精製は行わず、定量的収率として次工程に用いた。
MS （ESI）: m/z 494 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 7.40-7.26 （12H， m）， 5.88 （1H， d， J = 5.1 Hz）， 4.74 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 4.64 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 4.55 （2H， s）， 4.40 （1H， t， J = 5.4 Hz）， 4.26 （1H， d， J = 5.7 Hz）， 3.72 （1H， s）， 3.69 （1H， d， J = 4.1 Hz）， 3.56 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 3.43 （1H， d， J = 12.8 Hz）， 2.81 （1H， d， J = 5.1 Hz）， 1.63 （3H， brd）
(2R,3S,3aS,9aR)-2-(アジドメチル)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジルオキシ)メチル]-7-メチル-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン （化合物9）
　窒素気流下、化合物２１（56.26 g）を塩化メチレン（935 mL）に溶解し、ＤＭＡＰ（51.38 g， 420 mmol）を加えた。氷浴冷却下で３０分間撹拌後、ＴｆＣｌ（51.44 g， 210 mmol）を２５分間かけて滴下した。室温で１時間撹拌後、氷浴冷却下で水を加えた。有機層を分離して水、０．１Ｍ　塩酸水溶液、４％炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で順次洗浄した。各水層を酢酸エチルで再抽出して、合一した有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥して不溶物をろ去した。溶媒を減圧留去して化合物９（52.10 g）を得た。精製は行わず、定量的収率として次工程に用いた。
MS （ESI）: m/z 476 （M+H）+
　1H-NMR （CDCl3）: 実施例２の化合物９と一致した。（DMAP残留）
1-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物12）
　窒素気流下、化合物９（46.9 g）をＴＨＦ（810 mL）に溶解して、水（160 mL）を加えた。室温でＰｈ３Ｐ（29.79 g， 113.5 mmol）を加えて、外温７０℃で１７時間撹拌した。放冷後に、溶媒を減圧留去し、トルエン（200 mL × 2）で共沸して粗体（167.79 g）を得た。カラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール＝１００／０～９０／１０～６／１～４／１）で精製して、Ｐｈ３ＰＯと酢酸エチルを含む粗化合物１２（42.78 g）を得た。窒素気流下、１Ｌのナスフラスコ中で粗化合物１２（42.78 g）を酢酸エチル（200 mL）に懸濁した。外温５０℃で１時間撹拌した後、ジイソプロピルエーテル（200 mL）を加えて、更に外温５０℃で３０分間撹拌した。終夜かけて放冷後に固体を濾取、酢酸エチル／ジイソプロピルエーテル＝１／１（100 mL × 2）で洗浄、減圧乾燥して、化合物１２（30.11 g， 収率70% ：化合物１８基準）を得た。
MS （ESI）: m/z 450 （M+H）+
　1H-NMR は実施例５で得た化合物１２と一致した。（CDCl3） 
　化合物１０の１製造法（以下、メシルルートとも呼称する）を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000145
実施例１２（メシルルート）
　化合物２から化合物２４の合成は、既知文献（Henrik M. Pfundheller， H. M.， Bryld， T.， Olsen， C. E.， Wengel， J. Helvetica Chimica Acta 2000， 83， 128-151）に従い実施した。
3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-5-O-(メチルスルホニル)-β-L-リキソフラノース （化合物22）
ピリジン法：窒素雰囲気下、化合物２（1.00 g， 2.50 mmol）およびピリジン（10 mL）を混合し、０℃でＭｓＣｌ（0.23 mL， 2.97 mmol）を滴下した。滴下後同温で１時間撹拌後に、室温まで昇温し、さらに４時間撹拌した。反応液に、１０％塩酸水溶液を加え、酢酸エチルで抽出した。有機層を、無水硫酸ナトリウムで乾燥し濾過後濃縮した。粗体をカラムクロマトグラフィー（n-ヘキサン／酢酸エチル＝１００／０～２／１）に付すことで、化合物２２（743 mg， 収率62%）を得た。
　1H-NMR （CDCl3）：文献の値と一致した。
トリエチルアミン法：
　窒素雰囲気下、化合物２（7.50 g， 18.7 mmol）、塩化メチレン（150 mL）、およびＥｔ３Ｎ（7.83 mL， 56.2 mmol）を混合し、０℃でＭｓＣｌ（1.74 mL， 22.5 mmol）を滴下した。滴下後室温まで昇温し、２時間撹拌した。反応液に、水を加え、塩化メチレンで抽出した。有機層を、無水硫酸ナトリウムで乾燥し濾過後濃縮した。粗体をカラムクロマトグラフィー（n-ヘキサン／酢酸エチル＝１００／０～５０／５０）に付すことで、化合物２２（8.20 g， 収率92%）を得た。
　1H-NMR （CDCl3）：文献の値と一致した。
1,2-ジ-O-アセチル-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-O-メチルスルホニル)-L-リキソフラノース （化合物23）
　窒素雰囲気下、化合物２２（8.20 g， 17.1 mmol）、酢酸（140 mL）、無水酢酸（14 mL）、および濃硫酸（0.14 mL）を混合し、終夜撹拌した。反応液に、氷水を加え、酢酸エチルで抽出した。有機層を、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し濾過後濃縮した。粗体をカラムクロマトグラフィー（n-ヘキサン／酢酸エチル＝１００／０～２／１）に付すことで、化合物２３（5.45 g， 収率61%）を得た。
　1H-NMR （CDCl3）：文献の値と一致した。
1-{2-O-アセチル-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-O-(メチルスルホニル)-α-L-リキソフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物24）
　窒素雰囲気下、化合物２３（5.15 g， 9.86 mmol）、およびアセトニトリル（25 mL）を混合し、０℃でチミン（1.67 g， 13.2 mmol）を加え、ＢＳＡ（5.20 mL， 21.3 mmol）をゆっくり滴下した。滴下後、５０℃で３時間撹拌した。完溶を確認後、０℃に冷却し、ＴＭＳＯＴｆ（1.90 mL， 10.5 mmol）をゆっくり加えた。反応液を５０℃で終夜撹拌した。原料が消失していなかったため、０℃に冷却し、ＴＭＳＯＴｆ（1.90 mL， 10.5 mmol）をゆっくり加えた。滴下後、５０℃で４時間撹拌した。反応液に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え酢酸エチルで抽出した。有機層を、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し濾過後濃縮した。粗体をカラムクロマトグラフィー（n-ヘキサン／酢酸エチル＝１００／０～５０／５０）に付すことで、化合物２４（5.00 g， 収率86%）を得た。
　1H-NMR （CDCl3）：文献の値と一致した。
1-{3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-O-(メチルスルホニル)-α-L-リキソフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物25）
　窒素雰囲気下、化合物２４（5.00 g， 8.49 mmol）、７Ｎ アンモニアメタノール溶液（60 mL）を混合し、４～７時間撹拌した。反応液を濃縮し、粗体をカラムクロマトグラフィー（n-ヘキサン／酢酸エチル１００／０～３０／７０）に付すことで、化合物２５（4.12 g， 収率89%）を得た。
MS （ESI）: m/z 547 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 9.08 （1H， brs）， 7.39-7.26 （11H， m）， 5.94 （1H， d， J = 5.0 Hz）， 4.80 （1H， d， J = 11.4 Hz）， 4.62 （1H， d， J = 11.4 Hz）， 4.56-4.43 （4H， m）， 4.35 （1H， d， J = 5.8 Hz）， 4.29 （1H， d， J = 11.0 Hz）， 3.78 （1H， d， J = 10.1 Hz）， 3.66-3.61 （2H， m）， 2.94 （3H， s）， 1.59 （3H， d， J = 0.8 Hz）
{(2S,3S,3aS,9aR)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジルオキシ)メチル]-7-メチル-6-オキサ-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-2-イル}メチル　メタンスルホネート （化合物10）
　窒素雰囲気下、化合物２５（4.10 g， 7.50 mmol）、塩化メチレン（80 mL）、およびＤＭＡＰ（3.67 g， 30.0 mmol）を混合し、０℃でＴｆＣｌ（2.4 mL， 22.5 mmol）を滴下した。滴下後、室温まで昇温し、２～４時間撹拌した。反応液に、水を加え、塩化メチレンで抽出した。有機層を、無水硫酸ナトリウムで乾燥し濾過後濃縮した。粗体をカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール＝９０／１０）を二回繰り返すことで、化合物１０（3.20g， 収率81%）を得た。
MS （ESI）: m/z 529 （M+H）+
　1H-NMR （CDCl3） は実施例３で得た化合物１０と一致した。
　核酸塩基置換法を用いた、チミン化合物（化合物１２）からの種々の核酸塩基化合物の製造法を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000146
実施例１３
チミン化合物（化合物12）からアデニン（bz）（化合物26A）の合成
N-(9-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル)}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド （化合物26A）
　化合物１２（１００ ｍｇ，０．２２２５ ｍｍｏｌ）とＮ－（９Ｈ－プリン－６－イル）ベンズアミド（１５９ｍｇ，０．６６７４ｍｍｏｌ）の１，２－ジクロロエタン（２ｍＬ）懸濁液にＢＳＡ（０．４９ｍＬ，２．００２ｍｍｏｌ）を加えて、外温６０℃にて１５分撹拌した。１５分室温にて放冷した後、ＴＭＳＯＴｆ（１３μＬ，０．０６７ｍｍｏｌ）を加え、再度外温６０℃として１５分撹拌した。氷冷下にて反応液にクロロホルム（１０ｍＬ）と飽和食塩水（２ｍＬ）、飽和重曹水（２ｍＬ）を加えて室温として１０分撹拌した。有機層をフェーズセパレーターに通した。溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール、９６／４～９０／１０）にて精製することで化合物２６Ａ（１１９ｍｇ， 酢酸エチル１．０ｗｔ％含有， 収率９５％）を得た。なお、化合物２６Aは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z = 563 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.91 （1H， s）， 8.77 （1H， s）， 8.34 （1H， s）， 8.06-8.01 （2H， m）， 7.65-7.59 （1H， m）， 7.57-7.51 （2H， m）， 7.40-7.23 （8H， m）， 7.22-7.17 （2H， m） ， 6.02 （1H， s）， 4.67 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.62 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.53 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.50 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.16 （1H， s）， 3.89 （1H， s）， 3.84 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.79 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.22 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 3.02 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 2.21 （1H， brs）
実施例１４
チミン化合物（化合物12）からグアニン（ib，dpc）（化合物26G）の合成
9-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-6-イル ジフェニルカルバメート（化合物26G）
　実施例１３と同様にして、化合物１２（１０００ｍｇ，２．２２５ｍｍｏｌ）と［２－（２－メチルプロパノイルアミノ）－９Ｈ－プリン－６－イル］Ｎ，Ｎ－ジフェニルカルバメート（２７７９ｍｇ，６．６７４ｍｍｏｌ）（合成法はJ. Org. Chem. 1996， 61， 9207に記載の方法に準じる）から、化合物２６Ｇ（１３５３ｍｇ， 収率８２％）を得た。なお、化合物２６Gは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z = 740 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.26 （1H， s）， 7.90 （1H， s）， 7.52-7.13 （20H， m）， 5.92 （1H， s）， 4.65 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.61 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.50 （2H， s）， 4.10 （1H， s）， 3.89 （1H， s）， 3.81 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.76 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.19 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 3.04 （1H， brd）， 2.98 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 1.26 （6H， d， J = 6.7 Hz）
実施例１５
チミン化合物（化合物12）からメチルシトシン（bz）（化合物26 Me C）の合成
N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-5-メチル-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル)ベンズアミド（化合物26ｍC）
　化合物１２のアセトニトリル（６．７ｍＬ）溶液に、Ｎ－（５－メチル－２－オキソ－１Ｈ－ピリミジン－４－イル）ベンズアミド（合成法はＥｕｒｏｐｅａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００６，３１５２に記載の方法に準じる、４３１ｍｇ，２．００２ｍｍｏｌ）、及びＢＳＡ（１．４７ｍＬ，６．００ｍｍｏｌ）を加えて、外温６０℃とし、１５分撹拌した。室温に放冷した後、ＴＭＳＯＴｆ（３９μＬ，０．２００ｍｍｏｌ）を滴下して、再度外温６０℃とし、１５０分間撹拌した。氷冷下とし、飽和重曹水、クロロホルムを順次加えて分液した。水層をクロロホルムにて２回抽出した後、有機層を飽和食塩水にて洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。不溶物をろ去した後、溶媒留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール、１００／０～９５／５）にて精製することで、化合物２６ Ｍｅ Ｃ（７１ ｍｇ， 収率１９％）を得た。なお、化合物２６ Ｍｅ Ｃは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z = 553 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 13.38 （1H， brs）， 8.36-8.27 （2H， m）， 7.81-7.75 （1H， m）， 7.58-7.21 （13H， m）， 5.57 （1H， s）， 4.68-4.50 （4H， m）， 3.92 （1H， s）， 3.89 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 3.81（1H， d， J = 11.3 Hz）， 3.71 （1H， s）， 3.16 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 2.91 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 1.80-1.75 （3H， m）
実施例１６
N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル)ベンズアミド（化合物26C）
　実施例１３と同様にして化合物１２（２０．０ mg， ０．０４４５ｍｍｏｌ）とＮ－（２－オキソ－１Ｈ－ピリミジン－４－イル）ベンズアミド （２８．７ｍｇ， ０．１３４ｍｍｏｌ）から化合物２６Ｃ（１０．４ ｍｇ， 収率４３％）を得た。なお、化合物２６Ｃは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z = 539 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.64 （1H， brs）， 8.28 （1H， d， J = 7.2 Hz）， 7.90 （2H， d， J = 7.7 Hz）， 7.62 （1H， m）， 7.53 （2H， m）， 7.45-7.20 （11H， m）， 5.66 （1H， s）， 4.66 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.62 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.55 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.47 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 3.87 （2H， s）， 3.84 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.79 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.16 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 2.95 （1H， d， J = 9.8 Hz）
　核酸塩基置換法を用いた、チミン化合物（化合物１４）からの種々の核酸塩基化合物製造法を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000147
実施例１７
チミン化合物（化合物14）からアデニン（bz）（化合物28A）の合成
N-(9-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-[(トリメチルシリル)オキシ]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド （化合物28A）
　実施例１３と同様にして化合物１４（１．５０ｇ， ２．６０ｍｍｏｌ）、およびＢＳＡ（６．４０ｍＬ，２６．０ｍｍｏｌ）から化合物２８Ａ（１．９２ｇ， 収率９７％）を得た。なお、化合物２８Ａは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z = 757 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 9.07（1H， s）， 8.82 （1H， s）， 8.42 （1H， s）， 8.09-8.01 （2H， m）， 7.66-7.19 （12H， m）， 6.90-6.80 （4H， m）， 6.05 （1H， s）， 4.40 （1H， s）， 3.89 （1H， s）， 3.80 （6H， s）， 3.46 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.32 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.11 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 2.99 （1H， d， J = 10.3 Hz）， -0.02 （9H， s）
実施例１８
アデニン（bz）の脱シリル化（化合物29A）
N-(9-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒドロキシ-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド （化合物29A）
　化合物２８Ａ（１１０ｍｇ， ０．１４５３ｍｍｏｌ）、およびＴＨＦ（２ｍＬ）を混合し、氷冷下、ＴＢＡＦ（０．１９ｍＬ，０．１８８９ｍｍｏｌ）を滴下し、同温にて５０分撹拌した。反応液にクロロホルム（１０ｍＬ）と飽和食塩水（２ｍＬ）を加えて撹拌し、抽出した。有機層を飽和食塩水（２ｍＬ）にて洗浄後、硫酸ナトリウムにて乾燥した。不溶物をろ去し、溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール、１００／０～９１／９）にて精製することで、化合物２９Ａ（９６．５ｍｇ、酢酸エチル１．４ｗｔ％含有、収率９７％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 685 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 9.16 （1H， s）， 8.78 （1H， s）， 8.33 （1H， s）， 8.08-7.99 （2H， m）， 7.65-7.21 （12H， m）， 6.89-6.81 （4H， m）， 6.05 （1H， s）， 4.31 （1H， s）， 3.90 （1H， s）， 3.80 （6H， s）， 3.59 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.52 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.16 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.09 （1H， d， J = 10.8 Hz）
実施例１９
チミン化合物（化合物14）からグアニン（ib，dpc）（化合物28G）の合成
9-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-[(トリメチルシリル)オキシ]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-6-イル ジフェニルカルバメート（化合物28G）
　化合物１４（２００ｍｇ，０．３４９９ｍｍｏｌ）、［２－（２－メチルプロパノイルアミノ）－９Ｈ－プリン－６－イル］Ｎ，Ｎ－ジフェニルカルバメート（４３７ｍｇ， １．０５０ ｍｍｏｌ）の１，２－ジクロロエタン（４ ｍＬ）懸濁液に室温にてＢＳＡ（０．８５６ｍＬ， ３．４９９ ｍｍｏｌ）を加えて外温６０℃にて１５分撹拌した。氷冷下としてＴＭＳＯＴｆ（２０μＬ，０．１０５０ ｍｍｏｌ）を滴下し、外温６０℃にて１５分撹拌した。氷冷下にて飽和重曹水、飽和塩化アンモニウム水、飽和重曹水、飽和食塩水，、クロロホルムを加えて１０分撹拌した。不溶物をセライトろ去した後、ろ液をフェーズセパレーターに通した。溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール、９９／１～９６／４）にて精製することで化合物２８Ｇ（２９５ｍｇ， 酢酸エチル４．１ｗｔ％，ＢＳＡに由来するアセトアミド１．９ｗｔ％含有， 収率９０％）を得た。なお、化合物２８Gは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z = 934 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.37 （1H， s）， 7.95 （1H， s）， 7.52-7.20 （19H， m）， 6.88-6.82 （m， 4H）， 5.99 （1H， s）， 4.29 （1H， s）， 3.84 （1H， s）， 3.79 （6H， s）， 3.46 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.29 （1H， d， J = 10.8 Hz），  3.14-3.00 （1H， m）， 3.08 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 2.97 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 1.28 （3H， d， J = 6.7 Hz）， 1.27 （3H， d， J = 6.7 Hz）
実施例２０
グアニン（ib，dpc）の脱シリル化（化合物29G）
9-[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒドロキシ-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル]-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-6-イル ジフェニルカルバメート（化合物29G）
　実施例１８と同様にして化合物２８Ｇ（２１０ｍｇ， ０．２１８２ｍｍｏｌ）から化合物２９Ｇ（１６３ｍｇ， 収率８７％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 862 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.20 （1H， s）， 8.08 （1H， s）， 7.49-7.18 （19H， m）， 6.85-6.80 （m， 4H）， 5.93 （1H， s）， 4.48 （1H， s）， 4.01 （1H， s）， 3.77 （6H， s）， 3.49 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.45 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.19 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.13 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 2.80 （1H， brs）， 1.24 （3H， d， J = 6.7 Hz）， 1.23 （3H， d， J = 6.7 Hz）
実施例２１
チミン化合物（化合物１４）からメチルシトシン（bz）（化合物28 Me C）の合成
N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-[(トリメチルシリル)オキシ]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-5-メチル-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル)ベンズアミド （化合物28 Me C）
　化合物１４（２００ｍｇ， ０．３４９９ｍｍｏｌ）とＮ－（５－メチル－２－オキソ－１Ｈ－ピリミジン－４－イル）ベンズアミド（２４１ｍｇ，１．０５０ｍｍｏｌ）の１，２－ジクロロエタン（３．５ｍＬ）懸濁液にＢＳＡ（０．７７ｍＬ，３．１４９ｍｍｏｌ）を加えて外温４０℃にて１５分撹拌した。氷冷下にてＴＭＳＯＴｆ（１０μＬ，０．０５２４８ｍｍｏｌ）を加え、再度、外温４０℃として１５分撹拌した。氷冷下にて反応液に酢酸エチル（１０ｍＬ）と飽和重曹水（２ｍＬ）を加えて撹拌し、抽出した。有機層を飽和食塩水（２ｍＬ）にて洗浄した後、硫酸ナトリウムにて乾燥した。不溶物をろ去し、ろ液を溶媒留去した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール、１００／０～９５／５）にて精製することで化合物２８ Ｍｅ Ｃ（１７６ｍｇ， 収率６７％）を得た。なお、化合物２８ Ｍｅ Ｃは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z = 747 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 13.44 （1H， brs）， 8.36-8.29 （2H， m）， 8.05 （1H， s）， 7.58-7.21 （12H， m）， 6.90-6.80 （4H， m）， 5.58 （1H， s）， 4.27 （1H， s）， 3.81 （6H， s）， 3.59 （1H， s）， 3.53 （1H， d， J =  10.8 Hz）， 3.23 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 2.97 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 2.78 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 1.87 （3H， s）， 0.06 （9H， s）
実施例２２
メチルシトシン（bz）の脱シリル化（化合物29 Me C）
N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒドロキシ-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-5-メチル-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル)ベンズアミド （化合物29 Me C） 
　実施例１８と同様にして化合物２８ Ｍｅ Ｃ（１１２４ｍｇ， １．５０４９ ｍｍｏｌ）から化合物２９ Ｍｅ Ｃ（１００１ｍｇ， 収率９９％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 675 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 13.40 （1H， brs）， 8.36-8.24 （2H， m）， 7.91-7.86 （1H， m）， 7.56-7.20 （12H， m）， 6.92-6.79 （4H， m）， 5.56 （1H， s）， 4.22 （1H， s）， 3.85-3.77 （6H，m）， 3.68 （1H， s）， 3.56 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.46 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 2.97 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 2.93 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 1.87-1.84 （3H， m）
実施例２３
チミン化合物（化合物１４）からシトシン（bz）（化合物28C）の合成
N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-[(トリメチルシリル)オキシ]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル)ベンズアミド（化合物28C）
　実施例２１と同様にして、化合物１４（２００ｍｇ，０．３５０ｍｍｏｌ）とＮ－（２－オキソ－１Ｈ－ピリミジン－４－イル）ベンズアミド（２２６ｍｇ，１．０５ｍｍｏｌ）から、化合物２８Ｃ（１０１ｍｇ， 収率３９％）を得た。なお、化合物２８Cは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z= 733 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.61 （1H， d， J = 7.7 Hz）， 7.94-7.89 （2H， m）， 7.66-7.25 （13H， m）， 6.92-6.86 （4H， m）， 5.70 （1H， s）， 4.22 （1H， s）， 3.85 （6H， s）， 3.70 （1H， s）， 3.53 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.32 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.00 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 2.82 （1H， d， J = 9.8 Hz）， 0.02 （9H， s）
実施例２４
シトシン（bz）の脱シリル化（化合物29C）
N-(1-{(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒドロキシ-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル)ベンズアミド（化合物29C）
　実施例１８と同様にして化合物２８Ｃ（１０１ｍｇ， ０．１３３ ｍｍｏｌ）から化合物２９Ｃ（８６．０ｍｇ， 収率９８％）を得た。
MS（APCI）: m/z= 661 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.48 （1H， d， J = 7.7 Hz）， 7.82-7.76 （2H， m）， 7.60-7.19 （13H， m）， 6.93-6.82 （4H， m）， 5.63 （1H， s）， 4.24 （1H， s）， 3.87 （1H， s）， 3.81 （6H， s）， 3.53 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.44 （1H， d， J =10.8 Hz）， 3.01 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 2.88 （1H， d， J = 10.3 Hz）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000148
実施例２５
アデニン（bz）のグアニジン化（teoc）（化合物15Aa）
ビス[2-(トリメチルシリル)エチル] {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒロドキシ-3-{6-[(フェニルカルボニル)アミノ]-9H-プリン-9-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物15Aa）
　実施例８と同様にして化合物２９Ａ（９１．５ｍｇ， ０．１３４ｍｍｏｌ）から化合物１５Ａａ（１１１ｍｇ， 酢酸エチル１．１ｗｔ％含有， 収率８２％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 1015 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 10.66 （1H， brs）， 9.01 （1H， s）， 8.77 （1H， s）， 8.25 （1H， s）， 8.08-7.98 （2H， m）， 7.67-7.40 （5H， m）， 7.39-7.17 （7H， m）， 6.90-6.78 （4H， m）， 6.28 （1H， s）， 5.13 （1H， brs）， 4.63-4.54 （1H， m）， 4.32-4.15 （4H， m）， 3.96 （1H， d， J= 11.3 Hz）， 3.87-3.74 （7H， m）， 3.62-3.50 （2H， m）， 3.31-3.09 （1H， m）， 1.16-0.98 （4H， m）， 0.04 （18H， s）
実施例２６
アデニン（bz）のリン酸化（teoc）（化合物16Aa）
ビス[2-(トリメチルシリル)エチル] {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-{[(2-シアノエトキシ)(ジプロパン-2-イルアミノ)ホスファニル]オキシ}-3-{6-[(フェニルカルボニル)アミノ]-9H-プリン-9-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物16Aa）
　実施例９と同様にして化合物１５Ａａ（１０４．８ mg，０．１０３２ mmol）から化合物１６Ａａ（６６．８ｍｇ， 収率５３％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 1215 （M＋H）+
31P-NMR （CDCl3） δ: 149.67， 149.39， 149.34， 148.01
実施例２７
グアニン（ib，dpc）のグアニジン化（teoc）（化合物15Ga）
ビス[2-(トリメチルシリル)エチル] {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-3-{6-[(ジフェニルカルバモイル)オキシ]-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-9-イル}-7-ヒドロキシ-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物15Ga）
　実施例８と同様にして化合物２９Ｇ（９４．４ｍｇ， ０．１１０ｍｍｏｌ）から化合物１５Ｇａ（１１４ｍｇ， 収率８４％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 1192 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 10.87 （1H， brs）， 8.12 （1H， s）， 8.03 （1H， s）， 7.52-7.33 （11H， m）， 7.32-7.13 （8H， m）， 6.81-6.75 （4H， m）， 6.24 （1H， brs）， 5.18 （1H， s）， 4.99 （1H， brs）， 4.26-4.03 （6H， m）， 3.93-3.81 （1H， m）， 3.76 （3H， s）， 3.76 （3H， s）， 3.45 （1H， d， J = 10.8Hz）， 3.38 （1H， d， J = 10.8Hz）， 2.65-2.52 （1H， m）， 1.22 （3H， d， J = 7.2Hz）， 1.17 （3H， d， J = 6.7Hz）， 1.13-0.87 （4H， m）， 0.03 （9H， brs）， -0.01 （9H， brs）
実施例２８
グアニン（ib，dpc）のリン酸化（teoc）（化合物16Ga）
ビス[2-(トリメチルシリル)エチル] {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-{[(2-シアノエトキシ)(ジプロパン-2-イルアミノ)ホスファニル]オキシ}-3-{6-[(ジフェニルカルバモイル)オキシ]-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-9-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート（化合物16Ga）
　化合物１５Ｇａ（５０．５ｍｇ， ０．０４２３ｍｍｏｌ）のアセトニトリル（１ｍＬ）溶液に室温にてジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド（１０．９ｍｇ， ０．０６３５ｍｍｏｌ）、２－シアノエチル　Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト（１９．１ｍｇ， ０．０６３５ｍｍｏｌ）を加えて室温にて１時間撹拌した。さらにジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド（２１．８ｍｇ，　０．１２７ｍｍｏｌ）、２－シアノエチル　Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト（３８．３ｍｇ，　０．１２７ｍｍｏｌ）を追加して室温にて３時間撹拌した。さらに２－シアノエチル　Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト（６．４ｍｇ， ０．０２１２ｍｍｏｌ）を加えて室温にて２０分撹拌した。氷冷下にてクロロホルム（５ｍＬ）、飽和食塩水（２ｍＬ）を加えて撹拌し、フェーズセパレーターに通した。溶媒留去した後、シリカゲルカラムクロマトグラフィー精製（ヘキサン／酢酸エチル、８０／２０～６０／４０）を行うことで化合物１６Ｇａ（６１．４ｍｇ， 収率８３％）を得た。
MS（APCI）: m/z= 1392 （M＋H）+
31P-NMR （CDCl3） δ: 149.16， 148.68
実施例２９
メチルシトシン（bz）のグアニジン化（teoc）（化合物15 Me Ca）
ビス[2-(トリメチルシリル)エチル] {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒロドキシ-3-{5-メチル-2-オキソ-4-[(フェニルカルボニル)アミノ]ピリミジン-1(2H)-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート（化合物15 Me Ca）
2-トリメチルシリルエチル N-（（（1R，4R，6R，7S）-6-（4-ベンズアミド-5-メチル-2-オキソ-ピリミジン-1-イル）-4-（（ビス（4-メトキシフェニル）-フェニル-メトキシ）メチル）-7-ヒドロキシ-5-オキサ-2-アザビシクロ（2.2.1）ヘプタン-2-イル）-（2-トリメチルシリルエトキシカルボニルアミノ）メチレン）カルバメート （化合物15 Me Ca） 
　実施例８と同様にして化合物２９ Ｍｅ Ｃ（８９０ｍｇ，１．３１９ mmol）から化合物１５ Ｍｅ Ｃａ（８７０ｍｇ， 収率６６％）を得た。
MS（APCI）: m/z= 1005 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 13.41 （1H， brs）， 10.37 （1H， brs）， 8.37-8.25 （2H， m）， 7.75 （1H， s）， 7.58-7.21 （12H， m）， 6.93-6.81 （4H， m）， 5.67 （1H， s）， 4.76 （1H， s）， 4.36-4.12 （5H， m）， 3.86-3.73 （7H， m）， 3.63 （1H， d， J = 11.7 Hz）， 3.56 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 3.52 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 1.87 （3H， s）， 1.11-1.00 （4H， m）， 0.04 （18H， s）
実施例３０
メチルシトシン（bz）のリン酸化（teoc）（化合物16 Me Ca）
ビス[2-(トリメチルシリル)エチル] {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-{[(2-シアノエトキシ)(ジプロパン-2-イルアミノ)ホスファニル]オキシ}-3-{5-メチル-2-オキソ-4-[(フェニルカルボニル)アミノ]ピリミジン-1(2H)-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物16 Me Ca）
　実施例９と同様にして化合物１５ Ｍｅ Ｃａ（５０ｍｇ， ０．０４９７ｍｍｏｌｍｍｏｌ）から化合物１６ Ｍｅ Ｃａ（３１ｍｇ， 収率５２％）を得た。
MS（APCI）: m/z= 1205 （M＋H）+
31P-NMR （CDCl3） δ: 149.66， 149.44， 149.03. 148.87
実施例３１
アデニン（bz）のグアニジン化（boc）（化合物15Ab）
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒドロキシ-3-{6-[(フェニルカルボニル)アミノ]-9H-プリン-9-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物15Ab）
　実施例１０と同様にして化合物２９Ａ（１．７４ｇ， ２．５４ｍｍｏｌ）から化合物１５Ａｂ（１．７３５ｇ， ヘキサン２．０ｗｔ％含有， 収率７４％）を得た。
MS（APCI）: m/z= 927 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 10.46 （1H， brs）， 9.08 （1H， s）， 8.76 （1H， s）， 8.26 （1H， s）， 8.06-7.99 （2H， m）， 7.66-7.18 （12H， m）， 6.88-6.80 （4H， m）， 6.22 （1H， s）， 5.21 （1H， s）， 4.50 （1H， s）， 3.95-3.81 （2H， m）， 3.79 （6H， s）， 3.58-3.49 （2H， m）， 3.47-3.37 （1H， m）， 1.65 （9H， s）， 1.59-1.40 （9H， m）
実施例３２
アデニン（bz）のリン酸化（boc）（化合物16Ab）
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-{[(2-シアノエトキシ)(ジプロパン-2-イルアミノ)ホスファニル]オキシ}-3-{6-[(フェニルカルボニル)アミノ]-9H-プリン-9-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物16Ab）
　実施例９と同様にして化合物１５Ａｂ （１００ｍｇ， ０．１０７９ｍｍｏｌ）から化合物１６Ａｂ（１０５ｍｇ， 収率８６％）を得た。
MS（APCI）: m/z=1127 （M＋H）+
31P-NMR （CDCl3） δ: 149.39， 149.23
実施例３３
グアニン（ib，dpc）のグアニジン化（boc）（化合物15Gb）
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-3-{6-[(ジフェニルカルバモイル)オキシ]-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-9-イル}-7-ヒドロキシ-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物15Gb）
　実施例１０と同様にして化合物２９Ｇ（７７．８ｍｇ， ０．０９０３ｍｍｏｌ）から化合物１５Ｇｂ（８３．２ｍｇ， 収率８２％）を得た。
MS（APCI）: m/z=1104 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 10.56 （1H， s）， 8.13 （1H， s）， 8.01 （1H， s）， 7.49-7.33 （11H， m）， 7.32-7.14 （8H， m）， 6.77-6.80 （4H， m）， 6.17 （1H， brs）， 5.10 （1H， brs）， 4.14-4.00 （2H， m）， 3.89-3.81 （1H， m）， 3.76 （3H， s）， 3.76 （3H， s）， 3.50-3.36 （2H， m）， 2.73-2.58 （1H， m）， 1.55-1.32 （18H， m）， 1.22 （3H， d， J =7.2Hz）， 1.17 （3H， d， J =7.2Hz） 
実施例３４
グアニン（ib，dpc）のリン酸化（boc）（化合物16Gb）
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-{[(2-シアノエトキシ)(ジプロパン-2-イルアミノ)ホスファニル]オキシ}-3-{6-[(ジフェニルカルバモイル)オキシ]-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-9-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート　（化合物16Gb）
　実施例２８と同様にして化合物１５Ｇｂ（４１．８ｍｇ， ０．０３７９ｍｍｏｌ）から化合物１６Ｇｂ（４３．８ｍｇ， 収率８４％）を得た。
MS（APCI）: m/z=1304 （M＋H）+
31P-NMR （CDCl3） δ: 148.92， 148.80， 148.36
実施例３５
メチルシトシン（bz）のグアニジン化（boc）（化合物15 Me Cb）
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒロドキシ-3-{5-メチル-2-オキソ-4-[(フェニルカルボニル)アミノ]ピリミジン-1(2H)-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物15 Me Cb）
　実施例１０と同様にして、化合物２９ Ｍｅ Ｃ（１７６２ｍｇ， ２．６１２ｍｍｏｌ）から化合物１５ Ｍｅ Ｃｂ（１４６７ｍｇ， 収率６１％）を得た。
MS（APCI）: m/z = 917 （M＋H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 13.39 （1H， brs）， 10.11 （1H， brs）， 8.38-8.26 （2H， m）， 7.77 （1H， s）， 7.57-7.21 （12H， m）， 6.91-6.80 （4H， m）， 5.62 （1H， s）， 4.71 （1H， s）， 4.34 （1H， s）， 3.85-3.75 （7H， m）， 3.58 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 3.54 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 3.49 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 1.88 （3H， s）， 1.53-1.45 （18H， m）
実施例３６
メチルシトシン（bz）のリン酸化（boc）（化合物16 Me Cb）
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-{[(2-シアノエトキシ)(ジプロパン-2-イルアミノ)ホスファニル]オキシ}-3-{5-メチル-2-オキソ-4-[(フェニルカルボニル)アミノ]ピリミジン-1(2H)-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート （化合物16 Me Cb）
　実施例９と同様にして１５ Ｍｅ Ｃｂ（１４２ｍｇ， ０．１５４９ｍｍｏｌ）から１６ Ｍｅ Ｃｂ（８５．０ｍｇ， 収率４９％）を得た。
MS（APCI）: m/z= 1117 （M＋H）+
31P-NMR （CDCl3） δ: 149.48， 149.08， 148.56
実施例３７
シトシン（bz）のグアニジン化（boc）（化合物15Cb）
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-ヒロドキシ-3-{2-オキソ-4-[(フェニルカルボニル)アミノ]ピリミジン-1(2H)-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート　（化合物15Cb）
　実施例１０と同様にして、化合物２９Ｃ（８６ｍｇ，０．１３０ｍｍｏｌ）から、化合物１５Ｃｂ（９１ｍｇ， 収率７７％）を得た。
MS（APCI）: m/z= 903 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 10.06 （1H， brs）， 8.66 （1H， brs）， 8.33 （1H， d， J = 7.7 Hz）， 7.92-7.85 （2H， m）， 7.65-7.23 （13H， m）， 6.92-6.85 （4H， m）， 5.71 （1H， s）， 4.86 （1H， s）， 4.30 （1H， s）， 4.26-4.07 （1H， m）， 3.87-3.74 （7H， m）， 3.62-3.53 （2H， m）， 3.45 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 1.49 （18H， s）
実施例３８
シトシン（bz）のリン酸化（boc）（化合物16Cb）
ジ-tert-ブチル {[(1R,3R,4R,7S)-1-{[ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ]メチル}-7-{[(2-シアノエトキシ)(ジプロパン-2-イルアミノ)ホスファニル]オキシ}-3-{2-オキソ-4-[(フェニルカルボニル)アミノ]ピリミジン-1(2H)-イル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-5-イル]メチリリデン}ビスカルバメート　（化合物16Cb）
　実施例９と同様にして、化合物１５Ｃｂ（９１ｍｇ，０．１００ｍｍｏｌ）から、化合物１６Ｃｂ（６１ｍｇ， 収率５５％）を得た。
MS（APCI）: m/z= 1103 （M+H）+
31P-NMR （CDCl3） δ: 149.58， 149.25， 148.86
　ウラシル体（化合物26A）およびグアニン体（化合物26G）の製造法（以下、ウラシルルートとも呼称する）を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000149
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000150
実施例３９
1-{2-O-アセチル-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-O-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]-α-L-リキソフラノシル}ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物30）
　3，5-Di-O-ベンジル-4-C-ヒドロキシメチル-l，2-O-イソプロピリデン-α-D-リボフラノース（化合物２）（15.0 g， 37.45 mmol）から文献記載の方法に準じ（J. Org. Chem. 2011， 76， 9891-9899）、２工程で得られた化合物４ （25.58 g， 37.46 mmol） に、アセトニトリル （100 mL）、及びウラシル （5.668 g， 50.57 mmol）を混合した後、BSA （21.02 mL， 85.97 mmol）を10分かけて滴下した。反応系が均一になるまで５０℃で１３分加熱した後、０℃に冷却した。０℃下、ＴＭＳＯＴｆ（7.7mL， 40.08 mmol）を滴下した。室温下、５分撹拌した後、５０℃で２時間加熱撹拌した。０℃下、飽和重層水（200mL）を加えた後、反応液を濃縮した。残渣を酢酸エチルで抽出後、飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、不溶物をろ去し、溶媒留去した。粗体をカラムクロマトグラフィー（n-ヘキサン／酢酸エチル＝６５／３５～５０／５０）に付すことで、化合物３０（23.84 g， 収率87%， 2より3工程で）を得た。
MS（APCI）: m/z= 735 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.00-7.95 （1H， m）， 7.72 （1H， d，J = 8.2 Hz）， 7.64-7.56 （4H， m） 7.46-7.27 （14H， m）， 7.22-7.16 （2H， m）， 6.07 （1H， d， J = 5.7 Hz）， 5.35-5.27 （2H， m）， 4.58-4.47 （4H， m）， 4.35 （1H， d， J = 5.7 Hz）， 3.92 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.82-3.63 （3H， m）， 1.94 （3H， s）， 1.04 （9H， s）
実施例４０
1-{3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5-O-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]-α-L-リキソフラノシル}ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物31）
　（（2R，3R，4S，5S）-4-ベンジルオキシ-5-（ベンジルオキシメチル）-5-（（tert-ブチル（ジフェニル）シリル）オキシメチル）-2-（2，4-ジオキソピリミジン-1-イル）テトラヒドロフラン-3-イル）アセテート （化合物30， 11 g， 14.97 mmol）、テトラヒドロフラン （55 mL）を混合し、室温下、メチルアミン （34 mL， 306.5 mmol） を滴下ロートで滴下し、室温下、１時間撹拌した。酢酸エチルを加えた後、酢酸エチルで抽出。飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後不溶物をろ去し、溶媒留去した。粗体をカラムクロマトグラフィー（n-ヘキサン／酢酸エチル＝５０／５０～４０／６０）に付すことで、化合物３１（9.23 g， 収率89%）を得た。
MS（APCI）: m/z= 693 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.08 （1H， brs）， 7.68-7.59 （5H， m） 7.48-7.26 （14H， m）， 7.24-7.19 （2H， m）， 5.95 （1H， d， J = 4.1 Hz）， 5.40-5.33 （1H， m）， 4.73 （1H， d， J =11.1 Hz）， 4.63 （1H， d， J = 11.1 Hz）， 4.49-4.40 （2H， m）， 4.37-4.26 （2H， m）， 3.82-3.69 （3H， m）， 3.59 （1H， d， J = 10.1 Hz）， 3.54 （1H， d，  J = 10.1 Hz）， 1.06 （9H， s）
実施例４１
(2S,3S,3aS,9aR)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジロキシ)メチル]-2-({[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ}メチル)-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン （化合物32）
　化合物３１ （9.23 g， 13.3 mmol）、塩化メチレン （66.6 mL）、及びＤＭＡＰ （5.70 g， 46.6 mmol）を混合し、０℃に冷却した。０℃下、ＴｆＣｌ （5.61 g， 33.3 mmol） を滴下した。室温下、１時間撹拌した。０℃下、水を加えた後、クロロホルムで抽出した。飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、不溶物をろ去し、溶媒留去した。粗体をカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール＝１００／０＝９０／１０）に付すことで、化合物３２（8.58 g、収率95%）を得た。
MS（APCI）: m/z= 675 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 7.67-7.58 （4H， m）， 7.48-7.19 （15H， m）， 7.13-7.07 （2H， m）， 6.21 （1H， d， J = 6.1 Hz）， 6.09 （1H， d， J = 7.2 Hz）， 5.51 （1H， dd， J = 6.1， 4.1 Hz）， 4.80 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 4.60 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 4.41-4.28 （3H， m）， 3.82 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.68 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.36-3.27 （2H， m）， 1.03 （9H， s）
実施例４２
(2R,3S,3aS,9aR)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジロキシ)メチル]-2-(ヒドロキシメチル)-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン （化合物33）
　化合物３２ （8.58 g， 12.7 mmol）、ＴＨＦ （63.6 mL）を混合し、０℃冷却下、１Ｍ ＴＢＡＦ（16.5 mL， 16.5 mmol） を滴下ロートで滴下した。室温下、２．５時間撹拌した。溶媒留去後、粗体をカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール＝１００／０～８５／１５）に付すことで、化合物３３（5.54 g、収率quant.）を得た。MS（APCI）: m/z= 437 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 7.41-7.26 （9H， m）， 7.20-7.13 （2H， m）， 6.27 （1H， d， J = 6.2 Hz）， 6.06 （1H， d， J = 7.7 Hz）， 5.35 （1H， dd， J = 6.2， 2.6 Hz）， 4.78 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.60 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.43-4.31 （3H， m）， 3.88-3.80 （1H， m）， 3.72-3.63 （1H， m）， 3.40-3.26 （2H， m）， 2.35-2.21 （1H， m）
実施例４３
{(2S,3S,3aS,9aR)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジロキシ)メチル]-6-オキソ-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-2-イル}メチル　メタンスルホネート （化合物34）
　化合物３３ （5.54 g， 12.7 mmol）、塩化メチレン （127 mL） を混合し、０℃下、ＭｓＣｌ （1.68 mL， 21.6 mmol）、ＤＭＡＰ （4.65 g， 38.1 mmol） を加えた。室温で１時間撹拌した。０℃下、水を加えた後、クロロホルムで抽出した。飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、不溶物をろ去し、溶媒留去した。粗体をカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール＝１００：０～９０／１０）に付すことで、化合物３４（5.47 g、収率84%）を得た。
MS（APCI）: m/z= 515 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 7.41-7.25 （9H， m）， 7.21-7.15 （2H， m）， 6.23 （1H， d， J = 6.2 Hz）， 6.08 （1H， d， J = 7.7 Hz）， 5.30 （1H， dd， J = 6.2， 2.6 Hz）， 4.76 （1H， d， J = 11.6 Hz）， 4.60 （1H， d， J = 11.6 Hz）， 4.46-4.29 （5H， m）， 3.39 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 3.31 （1H， d， J = 10.3 Hz）， 2.92 （3H， s）
実施例４４
(2R,3S,3aS,9aR)-2-(アジドメチル)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジルオキシ)メチル]-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン （化合物35）
　化合物３４ （3.00 g， 5.830 mmol）、１，４－ジオキサン （58.3 mL）を混合し、テトラブチルアンモニウムアジド （4.976 g， 17.49 mmol）を加えた。１２０℃で４．５時間加熱撹拌した。室温にした後、０℃下、飽和重層水を加え、酢酸エチルで抽出した。飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、不溶物をろ去し、溶媒留去した。粗体をカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール＝１００：０～９０／１０）に付すことで、化合物３５（2.264 g、収率84%）を得た。
MS（APCI）: m/z= 462 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 7.41-7.24 （9H， m）， 7.20-7.13 （2H， m）， 6.21 （1H， d， J = 6.1 Hz）， 6.07 （1H， d， J = 7.7 Hz）， 5.32 （1H， dd， J = 6.1， 2.1 Hz）， 4.76 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.60 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.40 （1H， d， J = 12.1 Hz）， 4.34 （1H， d， J = 12.1 Hz）， 4.29 （1H， d， J = 2.1 Hz）， 3.62 （1H， d， J = 12.8 Hz）， 3.47 （1H， d， J = 12.8 Hz）， 3.32 （1H， d， J = 10.2 Hz）， 3.27 （1H， d， J = 10.2 Hz）
実施例４５
1-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン （化合物37）
　化合物３５ （2.2 g， 4.8 mmol）、ＴＨＦ （32 mL）、Ｈ２Ｏ （6.4 mL， 360 mmol）を混合し、Ｐｈ３Ｐ （1.90 g， 7.20 mmol）を加え、７０℃で２１．５時間加熱撹拌した。溶媒留去後、粗体をカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール＝１００：０～１７／２）に付すことで、化合物３７（2.067 g、収率quant.）を得た。
MS（APCI）: m/z= 436 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.30 （1H， brs）， 7.80 （1H， d， J = 8.2 Hz）， 7.40-7.21 （10H， m）， 5.53 （1H， s）， 5.46 （1H， d， J = 8.2 Hz）， 4.65-4.49 （4H， m）， 3.87 （1H， s）， 3.83 （1H， d， J = 10.9 Hz）， 3.78 （1H， d， J = 10.9 Hz）， 3.64 （1H， s）， 3.14 （1H， d， J = 10.0 Hz）， 2.89 （1H， d， J = 10.0 Hz）
実施例４６
N-(9-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル)}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド （化合物26A）
　化合物３７ （100 mg， 0.2296 mmol）、Ｎ－（９Ｈ－プリン－６－イル）ベンズアミド（164.8 mg， 0.6889 mmol）の１，２－ジクロロエタン （2.296 mL） 溶液にＢＳＡ（0.5053 mL， 2.067 mmol） を加え，反応液を６０℃で１５分撹拌した．室温にて放冷、撹拌し、ＴＭＳＯＴｆ （0.01331 mL， 0.06889 mmol）を加え、５０℃で１５ 分加熱撹拌した。クロロホルムで希釈した後、０℃下、飽和重層水を加え、クロロホルムで抽出した。飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、不溶物をろ去し、溶媒留去した。粗体をカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール＝１００／０～９５／５）および逆相分取（１０ｍＭ炭酸アンモニウム水溶液／アセトニトリル＝９０／１０～６０／４０）に付すことで、化合物２６Ａ（129.2 mg、収率84%）を得た。なお、化合物２６Ａは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z= 563 （M+H）+
　1H-NMRは実施例１３での化合物２６Ａと一致した。
実施例４７
ウラシル体からグアニン体の製造 （化合物26G）
9-{(1R,3R,4R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-6-イル ジフェニルカルバメート（化合物26G）
　実施例１３と同様にして、化合物３７（３００ｍｇ，０．６８９ｍｍｏｌ）と（２－（２－メチルプロパノイルアミノ）－９－プリン－１－イル）Ｎ，Ｎ－ジフェニルカルバメート（８６１ｍｇ，２．０７ｍｍｏｌ）（合成法はJ. Org. Chem. 1996， 61， 9207に記載の方法に準じる）から、化合物２６Ｇ（４１２ｍｇ， 収率８１％）を得た。なお、化合物２６Gは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z= 740 （M+H）+
　1H-NMRは実施例１４での化合物２６Ｇと一致した。
　次に、ピリミジン誘導体（化合物38aおよび化合物38b）の製造法を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000151
実施例４８
(5xi)-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-6-デオキシ-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-β-L-リキソ-ヘキソフラノース（化合物４１）
　化合物４０（J. Med. Chem. 2000， 43， 4516-4525に記載の方法に準じ，化合物２から合成）（2.00g， 5.02mmol）、ＴＨＦ（25.1mL）を混合し、－７８℃に冷却した。同温下、メチルマグネシウムブロミド（0.91M， 8.3 mL， 7.53mmol）を滴下し、－７８℃で１時間撹拌した。飽和塩化アンモニウム水溶液を加えた後、酢酸エチルで抽出した。飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、溶媒留去した。粗体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（n－ヘキサン／酢酸エチル、８０／２０～７５／２５）にて精製することで化合物４１（１．６２ｇ）を混合物として得た。
(5xi)－5－アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5,6-ジデオキシ-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-β-L-リキソ-ヘキソフラノース（化合物４２）
　化合物４１（１．４４ｇ）、トルエン（１７．４ｍＬ）を混合し、０℃冷却下、Ｐｈ３Ｐ（２．７３ｇ，１０．４ｍｍｏｌ）、ＤＩＡＤ（２．１５ｍＬ，１０．９ｍｍｏｌ）を入れた後、ＤＰＰＡ（２．２４ｍＬ，１０．４ｍｍｏｌ）を滴下した。室温下、１時間撹拌後、５０℃で２時間加熱撹拌し、溶媒留去した。粗体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（n－ヘキサン／酢酸エチル、８５／１５～８０／２０）にて精製することで化合物４２（１．５３ｇ）を混合物として得た。
(5xi)-1,2-ジ-O-アセチル-5-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5,6-ジデオキシ-L-リキソ-ヘキソフラノース（化合物４３）
　化合物４２（１．４７ｇ）、無水酢酸（４ｍＬ）、酢酸（２．３１ｍＬ）を混合し、０℃で濃硫酸（１７．９μＬ）を滴下後、室温で２時間撹拌した。０℃下、飽和炭酸ナトリウム水溶液（８．８ｍＬ）を滴下し、ｐＨ＝６とした後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、水、飽和食塩水で順次洗浄後、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒留去後、トルエンで３回共沸して化合物４３（１．６０ｇ）を得た。精製は行わず、次工程に用いた。
1-{(5xi)-2-O-アセチル-5-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5,6-ジデオキシ-α-L-リキソ-ヘキソフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物４４）
　化合物４３（１．６０ｇ）、アセトニトリル（１１．０ｍＬ）、チミン（５６３ｍｇ，４．４６７ｍｍｏｌ）を混合した後、ＢＳＡ（１．８６ｍＬ，７．６０ｍｍｏｌ）を滴下した。反応系が均一になるように５０℃で１０分加熱した後、０℃に冷却した。同温下、ＴＭＳＯＴｆ（０．６８４ｍＬ，３．５４ｍｍｏｌ）を滴下した。室温下、５分撹拌した後、５０℃で２時間加熱撹拌した。０℃下、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を滴下した後、反応液を濃縮した。残渣を酢酸エチルで抽出、有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、溶媒留去。粗体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（n－ヘキサン／酢酸エチル、６７／３３～５０／５０）にて精製することで化合物４４（６２８ｍｇ，収率３５％：化合物４１基準）を混合物として得た。
1-{(5xi)-5-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジルオキシ)メチル]-5,6-ジデオキシ－α-L-リキソ-ヘキソフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物４５）
　化合物４４（６２０ｍｇ，１．１３ｍｍｏｌ）、ＴＨＦ（４．５ｍＬ）を混合し、室温下、４０％メチルアミン水溶液（２．５６ｍＬ）を滴下し、室温下、４０分撹拌した。反応液を酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、溶媒留去した。粗体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（n－ヘキサン／酢酸エチル、６０／４０～４０／６０）にて精製することで化合物４５（５５６ｍｇ，収率９７％）を混合物として得た。
(2R,3S,3aS,9aR)-2-(1-アジドエチル)-3-(ベンジルオキシ)-2-[(ベンジルオキシ)メチル]-7-メチル-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン（化合物４６）
　化合物４５（５４１ｍｇ，１．０７ｍｍｏｌ）、塩化メチレン（５．３ｍＬ）、ＤＭＡＰ（４５６ｍｇ，３．７３ｍｍｏｌ）を混合し、０℃に冷却した。同温下、ＴｆＣｌ（０．２８２ｍＬ，２．６７ｍｍｏｌ）を滴下した後，室温下、９０分撹拌した。０℃下、反応液に水を加えた後、クロロホルムで抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、溶媒留去した。粗体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール、１００／０～８９／１１）にて精製することで化合物４６（４５８ｍｇ，収率８８％）を混合物として得た。
1-{(1R,3R,4R,6S,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-6-メチル-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物３８a）
1-{(1R,3R,4R,6R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-6-メチル-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物３８b）
　化合物４６（４５０ｍｇ，０．９１９ｍｍｏｌ）、ＴＨＦ（６．１ｍＬ）、および水（１．２２ｍＬ）を混合し、Ｐｈ３Ｐ（３６２ｍｇ，１．３８ｍｍｏｌ）を加え、７０℃で１６時間加熱撹拌した。溶媒を留去した後、粗体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール、１００／０～８５／１５）にて精製することで化合物３８（４０６ｍｇ，収率９５％）を混合物として得た。化合物３８（２８７ｍｇ）をキラルＨＰＬＣ（ＤＡＩＣＥＬ，ＣＨＩＲＡＬＰＡＫ　ＩＣ、φ３０ｘ２５０ｍｍ、メタノール／ＴＨＦ／ジエチルアミン、６５／３５／０．１、流速２０ｍＬ／分）にて精製することで、ＴＨＦの安定化剤であるＢＨＴを含む粗３８ａ（１３８ｍｇ）および粗３８ｂ（１３９ｍｇ）を得た。各々をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル／メタノール、１００／０～８５／１５）にて精製することで、化合物３８ａ（１３２ｍｇ）および化合物３８ｂ（１２３ｍｇ）を得た。
化合物３８ａ：
MS（APCI）: m/z= 464 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.21 （1H， brs）， 7.55-7.50 （1H， m）， 7.39-7.22 （10H， m）， 5.48 （1H， s）， 4.66-4.56 （3H， m）， 4.49 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 3.91-3.83 （3H， m）， 3.70 （1H， s）， 3.25 （1H， q， J = 6.7 Hz）， 1.62-1.57 （3H， m）， 1.20 （3H， d， J = 6.7 Hz）
化合物３８ｂ：
MS（APCI）: m/z= 464 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.18 （1H， brs）， 7.67-7.62 （1H， m）， 7.39-7.22 （10H， m）， 5.47 （1H， s）， 4.66-4.50 （4H， m）， 4.02 （1H， s）， 3.77 （1H， d， J = 11.0 Hz）， 3.72 （1H， d， J = 11.0 Hz）， 3.55 （1H， s）， 3.49 （1H， q， J = 6.7 Hz）， 1.58-1.54 （3H， m）， 1.14 （3H， d， J = 6.7 Hz）
　チミン体からのアデニン体の製造（化合物39Aa）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000152
実施例４９
N-(9-{(1R,3R,4R,6S,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-6-メチル-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル)}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド（化合物３９Ａａ）
　実施例１３と同様にして、化合物３８ａ（５０ｍｇ，０．１０８ｍｍｏｌ）と（Ｎ－（９Ｈ－プリン－６－イル）ベンズアミド（７７．４ｍｇ，０．３２４ｍｍｏｌ）から、化合物３９Ａａ（５０．９ｍｇ， 収率８２％）を得た。なお、化合物３９Aaは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z= 577 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 9.03 （1H， s）， 8.78 （1H， s）， 8.28 （1H， s）， 8.08-8.00 （2H， m）， 7.65-7.50 （3H， m）， 7.40-7.16 （10H， m）， 5.99 （1H， s）， 4.70-4.62 （2H， m）， 4.53-4.44 （2H， m）， 4.14 （1H， s）， 3.96 （1H， s）， 3.91-3.82 （2H， m）， 3.37 （1H， q， J = 6.7 Hz）， 1.25 （3H， d， J = 6.7 Hz）
チミン体からのアデニン体の製造（化合物39Ab）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000153
実施例５０
N-(9-{(1R,3R,4R,6R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-6-メチル-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル)}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド　（化合物３９Ａｂ）
　実施例１３と同様にして、化合物３８ｂ（５０ｍｇ，０．１０８ｍｍｏｌ）と（Ｎ－（９Ｈ－プリン－６－イル）ベンズアミド（７７．４ｍｇ，０．３２４ｍｍｏｌ）から、化合物３９Ａｂ（４８．１ｍｇ， 収率７７％）を得た。なお、化合物３９Abは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z= 577 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 9.03 （1H， s）， 8.77 （1H， s）， 8.41 （1H， s）， 8.08-8.00 （2H， m）， 7.66-7.49 （3H， m）， 7.41-7.14 （10H， m）， 5.99 （1H， s）， 4.70 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.60 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.56-4.46 （2H， m）， 4.29 （1H， s）， 3.78-3.68 （3H， m）， 3.54 （1H， q， J = 6.7 Hz）， 1.20 （3H， d， J = 6.7 Hz）
チミン体からのグアニン体の製造（化合物39Ga）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000154
実施例５１
9-{(1R,3R,4R,6S,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-6-メチル-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-6-イル ジフェニルカルバメート（化合物39Ga）
実施例１３と同様にして、化合物３８a（３３ｍｇ，０．０７１２ｍｍｏｌ）と（２－（２－メチルプロパノイルアミノ）－９－プリン－１－イル）Ｎ，Ｎ－ジフェニルカルバメート（１３０ｍｇ，０．６４１ｍｍｏｌ）（合成法はJ. Org. Chem. 1996， 61， 9207に記載の方法に準じる）から、化合物３９Ｇa（３７．６ｍｇ， 収率７０％）を得た。なお、化合物３９Gaは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z= 754 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.21 （1H， s）， 7.88 （1H， s）， 7.49-7.41 （2H， m）， 7.40-7.15 （19H， m）， 5.87 （1H， s）， 4.64 （2H， s）， 4.49 （1H， d， J = 11.8 Hz），4.45 （1H， d， J = 11.8 Hz），4.07 （1H， s），3.95 （1H， s）， 3.87-3.80 （2H， m），3.33 （1H, q, J = 6.7 Hz）,　3.07 （1H, brs）, 1.26 （6H， d， J = 6.7 Hz）， 1.22 （3H， d， J = 6.7 Hz）
チミン体からのグアニン体の製造（化合物39Gb）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000155
実施例５２
9-{(1R,3R,4R,6R,7S)-7-(ベンジルオキシ)-1-[(ベンジルオキシ)メチル]-6-メチル-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタ-3-イル}-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-6-イル ジフェニルカルバメート　（化合物39Gb）
　実施例１３と同様にして、化合物３８ｂ（２０ｍｇ，０．０４３２ｍｍｏｌ）と（２－（２－メチルプロパノイルアミノ）－９－プリン－１－イル）Ｎ，Ｎ－ジフェニルカルバメート（７９．０ｍｇ，０．３８８ｍｍｏｌ）（合成法はJ. Org. Chem. 1996， 61， 9207に記載の方法に準じる）から、化合物３９Ｇｂ（２７．９ｍｇ， 収率８６％）を得た。なお、化合物３９Gbは「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS（APCI）: m/z= 754 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.33 （1H， s）， 7.88 （1H， s）， 7.48-7.41 （2H， m）， 7.41-7.14 （19H， m）， 5.88 （1H， s）， 4.69 （1H， d， J = 12.3 Hz），4.58 （1H， d， J = 12.3 Hz），4.52-4.45 （2H， m），4.24 （1H， s），3.74-3.65 （3H， m），3.50 （1H, q, J = 6.7 Hz）, 3.04 （1H, brs）, 1.26 （3H， d， J = 7.2 Hz），1.25 （3H， d， J = 7.2 Hz）， 1.16 （3H， d， J = 6.7 Hz）
3’，5’－水酸基のチミン体からアデニン体の製造（化合物47）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000156
実施例５１
N-(9-{(1R,3R,4R,7S)-7-[(トリメチルシリル)オキシ]-1-{[(トリメチルシリル)オキシ]メチル}-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]へプタ-3-イル)}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド（化合物47）
　実施例１３と同様にして化合物１３（５０ｍｇ， ０．１３２ｍｍｏｌ）、およびＢＳＡ（０．３６ｍＬ，　１．４５ｍｍｏｌ）から化合物４７（５６．６ｍｇ， 酢酸エチル２．９ｗｔ％含有， 収率７９％）を得た。なお、化合物４７は「β体」であるが、異性体である「α体」は得られなかった。
MS （APCI）: m/z 527 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3） δ: 9.07 （1H， s）， 8.80 （1H， s）， 8.36 （1H， s）， 8.08-8.02 （2H， m）， 7.65-7.59 （1H， m）， 7.57-7.51 （2H，m）， 6.04 （1H， s）， 4.29 （1H， s）， 3.90 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 3.84 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 3.76 （1H， s）， 3.16 （1H， d， J = 9.7 Hz）， 3.90 （1H， d， J = 9.7 Hz）， 0.19 （9H， s）， 0.09 （9H， s）
トランスグリコシル化反応による、架橋鎖のリングサイズが異なるＧｕＮＡヌクレオチドモノマーの製造
　リボース骨格との架橋鎖を構成する炭素鎖の炭素数を改変することによる、架橋鎖のリングサイズが異なるＧｕＮＡモノマーを製造することができる。１例を以下に示すが、下記スキームにより得られる化合物６１を用いてトランスグリコシル化を行い、各種核酸塩基を有するリングサイズの異なるＧｕＮＡモノマーを製造することができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000157
　以下、上記製法の各工程を記載する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000158
実施例５２
エチル (5E)-3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-5,6-ジデオキシ-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-β-L-リキソ-へプタ-5-エノフラヌロネート（化合物４８）
　ジエチルホスホノ酢酸エチル（６．８３ｍＬ, ３４．４３ｍｍｏｌ）のＴＨＦ(１６３ｍL)溶液に氷冷下にて水素化ナトリウム（１．３８ｇ, ３４．４３ｍｍｏｌ、６０％含有)を加え、室温で３０分撹拌した。反応溶液を氷冷し、化合物４０（１０．９６ｇ, ２６．４８ｍｍｏｌ）のＴＨＦ（５４ｍＬ）溶液を滴下した。氷水浴を外し室温で１時間撹拌した。反応液に酢酸エチル（３００ｍＬ）および冷水（５００ｍＬ）を加え、しばらく撹拌後、有機層を分液した。水層を酢酸エチル（１００ｍＬ）で分液抽出し、有機層を併せ水および飽和食塩水で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル、９５／５～６０／４０）にて精製することで化合物４８（１２．１８ｇ，収率 ９７％）を得た。
MS （APCI）: m/z 486 （M+NH4）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.38-7.19（11H， m），6.24 (1H, d, J = 15.9 Hz), 5.76 (1H, d, J = 4.1 Hz), 4.77 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.60 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.57 (1H, dd, J = 4.6, 4.1 Hz), 4.50 (1H, d, J = 11.8 Hz), 4.41 (1H, d, J = 11.8 Hz), 4.27 (1H, t, J = 4.6 Hz), 4.23-4.13 (2H, m), 3.38-3.30 (2H, m), 1.47 (3H, s), 1.30-1.24 (6H, m) 
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000159
 実施例５３
エチル 3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-5,6-ジデオキシ-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-β-L-リキソ-ヘプトフラヌロネート（化合物４９）
　化合物４８（１２．０６ｇ，２５．５０ｍｍｏｌ）のメタノール（２４１ｍＬ）溶液に塩化ニッケル（ＩＩ）６水和物（１２１２ｍｇ、５．１００ｍｍｏｌ）を加えた。反応液を氷冷し、水素化ホウ素ナトリウム（１９３０ｍｇ、５１．００ｍｍｏｌ）を４０分かけて加えた。氷水浴を外し、室温で２時間撹拌した。反応液をセライト濾過し、酢酸エチル（３００ｍＬ）および水（３００ｍＬ）で洗浄した後、濾液の有機層を分液した。水層を酢酸エチル（１５０ｍＬで２回実施）で分液抽出し、有機層を併せ水（３００ｍＬ）および飽和食塩水（３００ｍＬ）で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去することにより、化合物４９（１１．９０ｇ，収率 ９８％）を得た。
MS （APCI）: m/z 488 （M+NH4）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.38-7.21（10H m），5.75 (1H, d, J = 4.1 Hz), 4.76 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.61 (1H, dd, J = 5.1, 4.1 Hz), 4.55 (1H, d, J = 12.3 Hz),  4.49 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.40 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.14-4.06 (3H, m), 3.40 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.26 (1H, d, J = 10.3 Hz), 2.66-2.50 (2H, m), 2.37-2.26 (1H, m), 1.92-1.81 (1H, m), 1.62 (3H, s), 1.32 (3H, s), 1.23 (3H, t, J = 7.2 Hz)
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000160
実施例５４
3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-5,6-ジデオキシ-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-β-L-リキソ-ヘプトフラノース（化合物５０）
　水素化リチウムアルミニウム（１９０４ｍｇ、５０．１７ｍｍｏｌ）のＴＨＦ（１５５ｍＬ）懸濁液に氷冷下にて化合物４９（１１．９０ｇ,２５．０８ｍｍｏｌ）のＴＨＦ（８３ｍＬ）溶液を１５分かけて滴下し、室温で１時間撹拌した。反応液を氷冷し飽和硫酸ナトリウム水溶液（１０ｍＬ）を滴下し、続いて水（３ｍＬ）を加え室温で一昼夜撹拌した。反応液をセライト濾過し、酢酸エチル（１００ｍＬにて３回実施）で洗浄し、濾液を無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去することにより、化合物５０（１０．９８ｇ, ２５．０４ｍｍｏｌ, 収率　１００％）を得た。
MS （APCI）: m/z 446 （M+NH4）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.37-7.21（10H, m），5.76 (1H, d, J = 4.1 Hz), 4.76 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.62 (1H, dd, J = 5.7, 4.1 Hz), 4.56 (1H, d, J = 12.3 Hz),  4.51 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.41 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.16 (1H, d, J = 5.7 Hz), 3.76-3.58 (2H, m), 3.50 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.32 (1H, d, J = 10.3 Hz), 2.28-2.15 (1H, m), 2.06-2.01 (1H, m), 1.79-1.67 (2H, m), 1.65-1.55 (4H, m), 1.33 (3H, s)
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000161
実施例５５
　3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-5,6-ジデオキシ-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-7-O-(メチルスルホニル)-β-L-リキソ-ヘプトフラノース（化合物５１）
化合物５０（１０．４５ｇ, ２３．８３ｍｍｏｌ）の酢酸エチル（２０９ｍＬ）溶液に氷冷下にてトリエチルアミン（４．６４ｍＬ, ３３．３６ｍｍｏｌ）を加え、続いてメタンスルホニルクロリド（２．２２ｍＬ、２８．６０ｍｍｏｌ）を滴下し、同温度にて1時間撹拌した。反応液にメタノール（０．５ｍＬ）を加え３０分撹拌した。反応液を水（２００ｍＬ）にあけ有機層を分液した。有機層を飽和食塩水（１００ｍＬ）で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル、９０／１０～３０／７０）にて精製することにより化合物５１（１１．７２ｇ, 酢酸エチル３．３ｗｔ％含有、収率 ９７％）を得た。
MS （APCI）: m/z 524 （M+NH4）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.37-7.22（10H， m），5.74 (1H, d, J = 4.1 Hz), 4.76 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.61 (1H, dd, J = 5.7, 4.1 Hz), 4.55 (1H, d, J = 12.3 Hz),  4.51 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.41 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.30-4.12 (2H, m), 4.11 (1H, d, J = 5.7 Hz), 3.41 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.28 (1H, d, J = 10.3 Hz), 2.95 (3H, s), 2.25-2.15 (1H, m), 2.07-1.94 (1H, m), 1.83-1.65 (2H, m), 1.59 (3H, s), 1.33 (3H, s)
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000162
実施例５６
7-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-5,6,7-トリデオキシ-1,2-O-(1-メチルエチリデン)-β-L-リキソ-ヘプトフラノース（化合物５２）
　化合物５１（１１．７２ｇ, ２２．３８ｍｍｏｌ）および１５－クラウン－５（４．４３ｍＬ, ２２．３８ｍｍｏｌ）のＤＭＦ （１１７ｍＬ）溶液にアジ化ナトリウム（４３６５ｍｇ, ６７．１５ｍｍｏｌ）を投入し、５０℃で１６時間撹拌した。反応液に水を加え酢酸エチルで分液抽出した。有機層を併せ水および飽和食塩水で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル、９５／５～７０／３０）にて精製することにより、化合物５２（９．９４ ｇ, 収率　９８％）を得た。
MS （APCI）: m/z 471 （M+NH4）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.36-7.22（10H， m），5.74 (1H, d, J = 4.1 Hz), 4.76 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.60 (1H, dd, J = 5.1, 4.1 Hz), 4.55 (1H, d, J = 12.3 Hz),  4.51 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.41 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.11 (1H, d, J = 5.1 Hz), 3.42 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.34-3.19 (3H, m), 2.22-2.11 (1H, m), 1.92-1.80 (1H, m), 1.69-1.51 (2H, m), 1.60 (3H, s), 1.33 (3H, s)
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000163
実施例５７
1,2-ジ-O-アセチル-7-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-5,6,7-トリデオキシ-L-リキソ-ヘプトフラノース（化合物５３）
　化合物５２（９．９４ｇ，　２１．９ｍｍｏｌ）の酢酸（１９．９ｍＬ）溶液に無水酢酸（９．９４ｍＬ, １０５ｍｍｏｌ）および濃硫酸（０．０４９７ｍＬ，　０．９３２ｍｍｏｌ）を加え室温で４時間撹拌した。反応液に酢酸エチル（２００ｍＬ）を加えた。激しく撹拌下、10%炭酸ナトリウム水溶液（２００ｍＬ）を４０分かけて滴下し、そのまま１時間激しく撹拌した。有機層を分液し、水層を酢酸エチル（５０ｍＬ）で分液抽出した。有機層を併せ５％-重曹水（２００ｍＬ）および飽和食塩水（１００ｍＬ）で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、残渣をトルエンで共沸（１５０ｍＬにて２度実施）後に減圧乾燥することにより化合物５３ （１１．４０ｇ, トルエン４．９ｗｔ％含有、収率　１００％）を得た。
MS （APCI）: m/z 515 （M+NH4）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.38-7.13（10H， m），6.10 (1H, s), 5.33 (1H, d, J = 5.1 Hz), 4.60 (1H, d, J = 11.8 Hz), 4.55-4.42 (3H, m), 4.29 (1H, d, J = 5.1 Hz), 3.40 (1H, d, J = 9.8 Hz), 3.35 (1H, d, J = 9.8 Hz), 3.31-3.18 (2H, m), 2.11 (3H, s), 1.89 (3H, s), 1.89-1.56 (4H, m)
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000164
実施例５８
1-{2-O-アセチル-7-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-5,6,7-トリデオキシ-α-L-リキソ-ヘプトフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物５４）
　化合物５３（１１．４０ｇ, ２１．７８ｍｍｏｌ）のアセトニトリル（５７ｍＬ）溶液に室温でチミン（３０２２ｍｇ, ２３．９６ｍｍｏｌ）を投入し、続いてＢＳＡ（１６ｍＬ, ４７．９３ｍｍｏｌ）をゆっくり滴下した。外温６０℃で１時間撹拌した。ＴＭＳＯＴｆ（４．３３７ｍＬ, ２３．９６ｍｍｏｌ）を同温度でゆっくり滴下し、外温８０℃にて３時間撹拌した。反応液を氷冷し、５％炭酸ナトリウム水溶液（５０ｍＬ）を３０分かけて加え反応をクエンチした。酢酸エチル（１００ｍＬ）および水（１００ｍＬ）を加えしばらく撹拌後に有機層を分液した。水層を酢酸エチル（５０ｍＬ）で分液抽出し、有機層を併せ５％炭酸水素ナトリウム水溶液（１００ｍＬ）および飽和食塩水（１００ｍＬ）で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン／酢酸エチル、９５／５～５０／５０)にて精製することにより化合物５４ （１０．６２ｇ, 収率　８３％）を得た。
MS （ESI）: m/z 564 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 8.14（1H，s），7.44-7.42 (1H, m), 7.39-7.27 (10H, m), 6.19 (1H, d, J = 5.7 Hz), 5.39 (1H, t, J = 5.7 Hz), 4.64 (1H, d, J = 11.3 Hz), 4.55-4.42 (3H, m), 4.37 (1H, d, J = 5.7 Hz), 3.66 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.37 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.34-3.17 (2H, m), 2.10 (3H, s), 1.95-1.70 (2H, m), 1.63-1.51 (5H, m)
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000165
実施例５９
1-{7-アジド-3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-5,6,7-トリデオキシ-α-L-リキソ-ヘプトフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物５５）
　化合物５４（１０．６２ｇ, １８．１０ｍｍｏｌ）のＴＨＦ （３２ｍＬ）および酢酸エチル（１１ｍＬ）溶液に氷冷下にてメチルアミン（１０．６２ｍＬ, １２０ｍｍｏｌ, ４０％水溶液）を加え２時間撹拌した。反応液に１Ｎ-塩酸（１０５ｍＬ）を加えｐＨ＝８とした。酢酸エチル（２００ｍＬ、および５０ｍＬ）で分液抽出した。有機層を併せ飽和食塩水（１００ｍＬ）で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をトルエンで２回共沸後に減圧乾燥することにより化合物５５（１０．７４ｇ，　収率　１００％）を得た。
MS （ESI）: m/z 522 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 8.23（1H，brs），7.41-7.23 (9H, m), 7.19-7.12 (2H, m), 5.89 (1H, d, J = 6.2 Hz), 4.71 (1H, d, J = 11.3 Hz), 4.65 (1H, d, J = 11.3 Hz), 4.56 (1H, d, J = 11.3 Hz), 4.52 (1H, d, J = 11.3 Hz), 4.38-4.30 (1H, m), 4.17 (1H, d, J = 6.2 Hz), 3.63 (1H, d, J = 9.8 Hz), 3.41 (1H, d, J = 9.8 Hz), 3.37-3.28 (1H, m), 3.27-3.18 (1H, m), 2.94 (1H, d, J = 8.2 Hz), 1.98-1.71 (2H, m), 1.64-1.50 (5H, m)
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000166
実施例６０
(2R,3S,3aS,9aR)-2-(3-アジドプロピル)-3-(ベンジロキシ)-2-[(ベンジロキシ)メチル]-7-メチル-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン（化合物５６）
　化合物５５（１０．７４ｇ, １８．１４ｍｍｏｌ）のピリジン（３２ｍＬ）溶液に氷冷下にてメタンスルホニルクロリド（１．８３ｍＬ, ２３．５９ｍｍｏｌ）を滴下し、室温で３．５時間撹拌した。反応液を氷冷し１，８－ジアザビシクロ［５．４．０］－７－ウンデセン（８．２１ｍＬ, ５４．４３ｍｍｏｌ）を滴下後に室温で４時間撹拌した。反応液を酢酸エチル（４００ｍＬ）で希釈し、１０％クエン酸水溶液（５００ｍＬ）に注ぎしばらく撹拌した。有機層を分液し、水層を酢酸エチル（１００ｍＬ）で分液抽出した。有機層を併せ水（５００ｍＬ）および飽和食塩水（３００ｍＬ）で洗浄した。有機層(褐色)に活性炭（１．００ｇ）を加え２０分撹拌後にセライト濾過した。濾液を減圧濃縮後にトルエンで共沸した。得られた濃縮残渣に酢酸エチル（４０ｍＬ）を加え懸濁しヘキサン（３００ｍＬ）を加え析出物を濾取した。窒素雰囲気下で風乾後に減圧乾燥することにより化合物５６（８．６１ｇ, 収率　９４％）を得た。
MS （ESI）: m/z 504 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.41 - 7.27 (8H, m), 7.18 (1H , d, J = 1.5 Hz), 7.16 - 7.12 (2H , m), 6.09 (1H , d, J = 6.2 Hz,), 5.21 (1H, dd, J = 6.2, 1.0 Hz), 4.72 (1H , d, J = 11.8 Hz), 4.57 (1H , d, J = 11.8 Hz), 4.37 (1H , d, J = 11.8 Hz), 4.29 (1H , s), 4.26 (1H , d, J = 11.8 Hz), 3.24 (2H , t, J = 6.2 Hz), 3.18 (1H , d, J = 9.8 Hz), 3.13 (1H , d, J = 9.8 Hz), 1.97 (3H , d, J = 1.0 Hz), 1.88 - 1.45 (4H , m) 
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000167
実施例６１
(2R,3S,3aS,9aR)-2-(3-アミノプロピル)-3-(ベンジロキシ)-2-[(ベンジロキシ)メチル]-7-メチル-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-6-オン（化合物５７）
　化合物５６（８．６１ｇ, １７．１ｍｍｏｌ）の１，２－ジメトキシエタン（１９８ｍＬ）溶液に水（１７．２ｍＬ）を加え、６０℃(外温)にてトリフェニルホスフィン（４９３０ｍｇ, １８．８ｍｍｏｌ）を発泡見合いで小分けして加えた。同温度で２０分撹拌後に外温８０℃で２時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー　(クロロホルム／メタノール、１００／０～７０／３０)にて精製することにより化合物５７（８．２５ｇ, 酢酸エチル６．１ｗｔ％含有、収率 １００％）を得た。
MS （ESI）: m/z 478 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.39 - 7.23 (8H , m), 7.18 (1H , d, J = 1.0 Hz), 7.15 - 7.10 (2H , m), 6.11 (1H , d, J = 6.2 Hz,), 5.23 (1H , dd, J=6.2, 1.5 Hz), 4.72 (1H, d, J = 11.8 Hz,), 4.56 (1H , d, J=11.8 Hz), 4.35 (1H, d, J=11.8 Hz), 4.29 (1H, d, J = 1.5 Hz), 4.26 (1H , d, J = 11.8 Hz), 3.20 (1H , d, J = 10.3 Hz), 3.18 (1H, d, J = 10.3 Hz,), 2.65 (2H, t, J = 7.2 Hz), 1.95 (3 H , d, J = 1.0 Hz,), 1.80 - 1.29 (6H , m)   
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000168
実施例６２
tert-ブチル (3-{(2R,3S,3aS,9aR)-3-(ベンジロキシ)-2-[(ベンジロキシ)メチル]-7-メチル-6-オキソ-2,3,3a,9a-テトラヒドロ-6H-フロ[2',3':4,5][1,3]オキサゾロ[3,2-a]ピリミジン-2-イル}プロピル)カルバメート（化合物５８）
　化合物５７（７．５４ｇ, １４．８ｍｍｏｌ）のジクロロメタン（９８ｍＬ）溶液に二炭酸ジ-tert-ブチル  （３５６０ｍｇ、１６．３ｍｍｏｌ）を加え、室温で３時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー　(酢酸エチル／メタノール、１００／０～９７／３)にて精製することにより化合物５８（７．６７ｇ, 酢酸エチル１．１ｗｔ％含有、収率　８９％）を得た。
MS （ESI）: m/z 578 （M+H）+
1H-NMR （CDCl3）δ: 7.40 - 7.27 (8H, m), 7.17 (1H, d, J = 1.5 Hz), 7.15 - 7.09 (2H , m), 6.09 (1H, d, J = 6.2 Hz), 5.20 (1H, dd, J = 6.4, 1.5 Hz), 4.71 (1H, d, J = 11.8 Hz), 4.56 (1H, d, J = 11.8 Hz), 4.48 (1H, brs), 4.35 (1H, d, J = 12.3 Hz), 4.28 (1H, d, J = 1.5 Hz), 4.24 (1H, d, J = 12.3 Hz), 3.17 (1H, d, J = 9.8 Hz), 3.14 (1H, d, J = 9.8 Hz), 3.11 - 3.03 (2H, m), 1.97 (3H, d, J = 1.0 Hz), 1.78 - 1.62 (2H, m), 1.55 - 1.48 (1H, m), 1.43 (9H, s), 1.42 - 1.33 (1H, m) 
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000169
実施例６３
1-{3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-7-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-5,6,7-トリデオキシ-α-L-キシロ-ヘプトフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物５９）
化合物５８ （７．６７ｇ, １３．１ｍｍｏｌ）のＴＨＦ（１５３ｍＬ）溶液に氷冷下にて１Ｍ水酸化ナトリウム水溶液（３２．８ｍＬ, ３２．８ｍｍｏｌ）を滴下し、氷浴を外し室温にて６時間撹拌した。反応液に酢酸エチル（２００ｍＬ）および５％クエン酸水溶液（１２０ｍＬ）を加え、しばらく撹拌後に有機層を分液した。水層を酢酸エチル（１００ｍＬ）で分液抽出し、有機層を併せ水（２００ｍＬ）および飽和食塩水（１００ｍＬ）で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン／酢酸エチル、９０／１０～０／１００)にて精製することにより化合物５９（７．８２ｇ, 酢酸エチル２．４ｗｔ％含有、収率　１００％）を得た。
MS （ESI）: 496[M-Boc+H]+
1H-NMR （CDCl3）δ: 8.46 (1H, brs), 7.52 (1H, d, J = 1.0 Hz), 7.40 - 7.25 (10H, m), 6.07 (1H, d, J = 4.6 Hz), 4.77 (1H, d, J = 11.8 Hz), 4.61 - 4.46 (4H, m), 4.42 (1H, brs), 4.17-3.86 (2H, m), 3.73 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.47 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.17-2.98 (2H, m), 1.77-1.45 (7H, m), 1.43 (9H, s) 
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000170
実施例６４
1-{3-O-ベンジル-4-[(ベンジロキシ)メチル]-7-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-5,6,7-トリデオキシ-2-O-[(トリフルオロメチル)スルホニル]-α-L-キシロ-ヘプトフラノシル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物６０）
　化合物５９（７．８２ｇ，　１２．８ｍｍｏｌ）のジクロロメタン（６３ｍＬ）溶液にピリジン（１５．６ｍＬ, １９３ｍｍｏｌ）およびＤＭＡＰ（３１３０ｍｇ、２５．６ ｍｍｏｌ）を加え、氷冷下にてトリフルオロメタンスルホン酸無水物（５．３９ｍＬ、３２．０ｍｍｏｌ）を３０分かけて滴下し、同温度で１時間撹拌した。トリフルオロメタンスルホン酸無水物 （２．１６ｍＬ、１２．８ｍｍｏｌ）を追加して同温度にて３時間撹拌した。氷冷下にて反応液に飽和重層水（２００ｍＬ）を加えしばらく撹拌した。有機層を分液し、水層をジクロロメタン（１００ｍＬ）で分液抽出した。有機層を併せ飽和食塩水で洗浄後に無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、トルエンで３回共沸した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル、９０／１０～５０／５０）にて精製することにより化合物６０（８．２４ ｇ，酢酸エチル４．２ｗｔ％含有，収率　８８％)を得た。
MS （ESI）: 628[M-Boc+H]+
1H-NMR （CDCl3）δ: 8.36 (1H, brs), 7.41 - 7.27 (9 H, m), 7.25 - 7.21 (2H, m), 6.31 (1H, d, J = 5.1 Hz), 5.44 - 5.38 (1H, m,), 4.75 (1H, d, J = 11.8 Hz,), 4.59 - 4.40 (5H, m), 3.52 (1H, d, J = 9.8 Hz), 3.40 (1H, d, J = 9.8 Hz) , 3.22 - 3.01 (2H, m), 1.79 - 1.51 (7H, m,), 1.44 (9H, s) 
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000171
実施例６５
1-{(1R,6R,8R,9S)-9-(ベンジロキシ)-6-[(ベンジロキシ)メチル]-7-オキサ-2-アザビシクロ[4.2.1]ノン-8-イル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン（化合物６１）
　化合物６０（８．２４ｇ, １０．９ｍｍｏｌ）のジクロロメタン（１２４ｍＬ）溶液に氷冷下にてトリフルオロ酢酸 （４１．２ｍＬ，５３５ｍｍｏｌ）を加え、氷浴を外し室温で２時間撹拌した。反応液を減圧濃縮後にトルエン共沸した。得られた残渣をジクロロメタン（２００ｍＬ）に溶解し、氷冷下にて激しく撹拌しながら飽和重曹水（１００ｍＬ）を加え、室温で１３時間撹拌した。反応液の有機層を分液し、水層をクロロホルム(５０ｍＬで２度実施)で分液抽出した。有機層を併せ無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム／メタノール、１００／０～９５／５)にて精製することにより化合物６１（４．９６ ｇ, 収率　９６％）を得た。
MS （ESI）: 478[M+H]+
1H-NMR （CDCl3）δ: 8.24 (1H, brs), 7.97 (1H, d, J = 1.5 Hz), 7.40 - 7.26 (8H, m), 7.25 - 7.20 (2H, m), 5.86 (1H, s), 4.76 (1H, d, J = 11.8 Hz), 4.56 (1H d , J= 11.8 Hz), 4.53 - 4.46 (2H, m), 4.40 (1H, d, J = 7.2 Hz), 3.72 (1H, d, J=10.8 Hz), 3.58 (1H, d, J=7.2 Hz), 3.54 (1H, d, J=10.8 Hz), 3.34 - 3.21 (1H, m), 3.14 - 3.03 (1H, m), 1.90 - 1.55 (4H, m), 1.41 (3H, d, J=1.5 Hz) 
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000172
実施例６６
N-(9-{(1R,5R,7R,8S)-8-(ベンジロキシ)-5-[(ベンジロキシ)メチル]-6-オキサ-2-アザビシクロ[3.2.1]オクタ-7-イル}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド（化合物６３）
化合物６２　（1-{(1R,5R,7R,8S)-8-(ベンジロキシ)-5-[(ベンジロキシ)メチル]-6-オキサ-2-アザビシクロ[3.2.1]オクタ-7-イル}-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン，　J. Ａｍ. Ｃｈｅｍ. Ｓｏｃ．2006， 128， 15173． に記載の方法に準じ、3，5-ジ-O-ベンジル-4-C-ヒドロキシメチル-l，2-O-イソプロピリデン-α-D-リボフラノース ２から合成した）（４９．８ｍｇ, ０．１０７ｍｍｏｌ）とＮ－（９Ｈ－プリン－６－イル）ベンズアミド（７７．１ｍｇ，０．３２２ｍｍｏｌ） を１０ｍＬナスコルに入れ、トルエン (１ｍＬ)、および、ＢＳＡ（０．２３５ｍＬ、０．９６１ｍｍｏｌ）を加えた。外温６０℃にて１５分間した後、外温１００℃に昇温し、ＴＭＳＯＴｆ（０．００５ｍＬ、０．０２６ｍｍｏｌ）を加えた。同温度にて３０分撹拌した後、室温とし、３％ 重曹水溶液（１０ｍＬ）、クロロホルム（１０ｍＬ）を加え，撹拌した。 有機層を分離し，水層からクロロホルム（１０ｍＬ）で抽出した。有機層を混合し，水（１０ｍＬ）で洗浄した．水層をクロロホルム （５ｍＬ）で抽出し，有機層と混合した。混合した有機層は綿栓ろ過し，固体を除いた．ろ液を溶媒留去した後、逆相ＨＰＬＣ分取（１０ｍＭ炭酸アンモニウム水溶液／アセトニトリル＝６０／４０～３０／７０）に付し、さらに薄層クロマトグラフィー（クロロホルム／メタノール＝１２／１で２度上げを実施）で精製することで化合物６３（４．９ｍｇ、収率　8％）を得た。
MS （ESI）: 577[M+H]+
1H-NMR （CDCl3）δ: 9.08 （1H， brs）， 8.77 （1H， s）， 8.72 （1H， s）， 8.05 （2H， d， J = 7.7 Hz）， 7.65-7.59 （1H， m）， 7.57-7.51 （2H， m），7.39-7.21 （10H， m）， 6.45 （1H， s）， 4.64 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.58 （1H， d， J = 12.3 Hz），4.55 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.47 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.23 （1H， d， J = 3.6 Hz）， 3.71 （1H， d， J = 3.6 Hz）， 3.66 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.52 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.26-3.16 （1H， m）， 3.07（1H， dd， J = 13.9, 6.7 Hz），  2.07-1.97 （1H， m）， 1.86（1H， brs），1.37（1H， dd， J = 12.8, 4.6 Hz）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000173
実施例６７
9-{(1R,5R,7R,8S)-8-(ベンジロキシ)-5-[(ベンジロキシ)メチル]-6-オキサ-2-アザビシクロ[3.2.1]オクタ-7-イル}-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-6-イル ジフェニルカルバメート（化合物６４）
　実施例６６と同様にして、化合物６２（４９．８ｍｇ、０．１０７mmol）と、［２－（２－メチルプロパノイルアミノ）－９Ｈ－プリン－６－イル］Ｎ，Ｎ－ジフェニルカルバメート（１３３．９ｍｇ，０．３２１６ｍｍｏｌ）（合成法はJ. Org. Chem. 1996， 61， 9207に記載の方法に準じる）から、化合物６４（２４．４ｍｇ， 収率　３０％）を得た。
MS （ESI）: 754[M+H]+
1H-NMR （CDCl3）δ: 8.65 （1H， s）， 8.04 （1H， s）， 7.49-7.42 （2H， m）， 7.40-7.21 （18H， m）， 6.37 （1H， s）， 4.64 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.56 （1H， d， J = 12.3 Hz），4.53 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.44 （1H， d， J = 11.8 Hz）， 4.24 （1H， d， J = 3.6 Hz）， 3.66 （1H， d， J = 3.6 Hz）， 3.63 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.50 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.21-3.12 （1H， m）， 3.04（1H， dd， J = 13.9, 6.7 Hz），  2.90 （1H， brs）， 2.07 （1H， brs），2.06-1.93（1H， m）， 1.35（1H， dd， J = 12.8, 4.6 Hz）， 1.27（3H， d， J = 1.5 Hz）， 1.25（3H， d， J = 1.5 Hz）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000174
実施例６８
N-(9-{(1R,6R,8R,9S)-9-(ベンジロキシ)-6-[(ベンジロキシ)メチル]-7-オキサ-2-アザビシクロ[4.2.1]ノン-8-イル}-9H-プリン-6-イル)ベンズアミド（化合物６５）
　化合物６１ （４９．７ｍｇ, ０．１０４ｍｍｏｌ）, および、Ｎ－（９Ｈ－プリン－６－イル）ベンズアミド（７４．７ｍｇ, ０．３１２ｍｍｏｌ）を１０ｍＬナスコルに入れ、１，２－ジクロロエタン（１ｍＬ），ＢＳＡ （０．２３０ｍＬ, ０．９４１ｍｍｏｌ）を加えた。外浴６０℃にて１５分撹拌した後に、ＴＭＳＯＴｆ （０．００５０ｍＬ, ０．０２６ ｍｍｏｌ）を加え，外浴６０℃にて３．５時間撹拌した。室温とし、３％ 重曹水溶液（１０ｍＬ）、クロロホルム（１５ｍＬ）を加え，撹拌した。 有機層を分離し，水層からCHCl3（１０ｍＬ）で抽出した。有機層を混合し，水道水(10mL)で洗浄した．水層をCHCl3 (5mL)で抽出し，有機層と混合した。水層からクロロホルム （５ｍＬ）で抽出した．再度，有機層を混合し，５０℃で減圧濃縮した後、逆相ＨＰＬＣ分取（１０ｍＭ炭酸アンモニウム水溶液／アセトニトリル＝５０／５０～２０／８０）に付すことで化合物６５（１９．２ｍｇ、収率　３１％）を得た。
MS （ESI）: 591[M+H]+
1H-NMR （CDCl3）δ: 9.00 （1H， brs）， 8.80 （1H， s）， 8.70 （1H， s）， 8.04 （2H， d， J = 7.2 Hz）， 7.64-7.59 （1H， m）， 7.56-7.51 （2H， m），7.37-7.24 （10H， m）， 6.28 （1H， s）， 4.65 （1H， d， J = 6.7 Hz）， 4.60 （1H， d， J = 11.3 Hz），4.59 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.52 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.47 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 3.86 （1H， d， J = 6.7 Hz）， 3.65 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.51-3.47 （2H， m）， 3.36-3.28（1H， m），  3.17-3.08（1H， m）， 1.98-1.89 （2H， m）， 1.83-1.67 （2H， m）
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000175
実施例６９
9-{(1R,6R,8R,9S)-9-(ベンジロキシ)-6-[(ベンジロキシ)メチル]-7-オキサ-2-アザビシクロ[4.2.1]ノン-8-イル}-2-[(2-メチルプロパノイル)アミノ]-9H-プリン-6-イル ジフェニルカルバメート（化合物６６）
　実施例６８と同様にして、化合物６１（５０．１ｍｇ、０．１０５ｍｍｏｌ）と、［２－（２－メチルプロパノイルアミノ）－９Ｈ－プリン－６－イル］Ｎ，Ｎ－ジフェニルカルバメート（１３１．１ｍｇ，０．３１４８ｍｍｏｌ）（合成法はJ. Org. Chem. 1996， 61， 9207に記載の方法に準じる）から、化合物６６（４２．４ｍｇ， 収率　５３％）を得た。
MS （ESI）: 768[M+H]+
1H-NMR （CDCl3） δ: 8.60 （1H， s）， 8.01 （1H， s），7.47-7.42 （2H， m）， 7.40-7.21 （18H， m）， 6.18 （1H， s）， 4.68 （1H， d， J = 6.7 Hz）， 4.62 （1H， d， J = 11.3 Hz），4.60 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.51 （1H， d， J = 12.3 Hz）， 4.47 （1H， d， J = 11.3 Hz）， 3.84 （1H， d， J = 6.7 Hz）， 3.63 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.49 （1H， d， J = 10.8 Hz）， 3.36-3.25 （1H， m）， 3.13-3.04（1H， m），  2.92（1H， brs）， 1.97 （1H， s），1.94-1.84 （1H， m）， 1.80-1.65 （3H， m）， 1.26 （6H， d， J = 7.2 Hz）
実施例７０　オリゴヌクレオチド類縁体の合成および精製
　実施例３２で得られた化合物１６Ａｂ、実施例３０で得られた化合物１６ Ｍｅ Ｃａ、実施例２８で得られた化合物１６Ｇａ、および市販の各種ホスホラミダイトを用い、各種核酸塩基を有するオリゴヌクレオチド類縁体を、DNA／RNAオリゴヌクレオチド自動合成機nS-8またはnS-8II（いずれも株式会社ジーンデザイン製）により0.2μmolスケールのCPGまたはポリスチレン担体を用いて、5’末端DMTr ONまたはOFFにて合成した。ＧｕＮＡモノマーをカップリングする際の、ＧｕＮＡモノマーのアセトニトリル溶液（0．1M）のカップリング時間は8分で行い、それ以外の工程はnS-8またはnS-8IIの通常のオリゴヌクレオチド合成条件にて行った。活性化剤は5-エチルチオ-1H-テトラゾール（0．25M）を用いた。
　合成したオリゴヌクレオチド類縁体の精製および純度確認は逆相HPLCにより以下の条件で行った。
移動相
A液： 0.1M 酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液，pH7.0
B液： 0.1M 酢酸トリエチルアンモニウム （水：アセトニトリル=1:1）溶液
グラジエント： A:B =95:5→70:30(23分)もしくはA:B =95:5→50:50(22.5分)
使用カラム：
 分析 Waters XBridgeTM OST C18 2.5μm（4.6×50mm）
 分取 Waters XBridgeTM OST C18 2.5μm（10×50mm）
流速：
 分析　1 mL/分
 分取　4 mL/分
カラム温度： 50℃
検出： UV(254 nm)
　合成したオリゴヌクレオチド類縁体の分子量は、飛行時間型質量分析（MALDI－TOF－MS）により決定した。
5’-d(TTTTATTTTT)-3’（配列番号1）(A: グアニジン架橋型核酸，化合物48)の合成
　実施例３２で得られた化合物１６Ａｂを用いて、0.2μmolのポリスチレン担体（LV-PS dT 0.2μmol，Glen Research社製）上でBoc保護オリゴヌクレオチドとして合成し、合成後のカラムに20%トリフルオロ酢酸の塩化メチレン溶液を充して室温で1時間放置した。塩化メチレンとアセトニトリルを順次通して担体を洗浄し、窒素気流下で担体を予備的に乾燥し、これを減圧乾燥した。
　続いてアンモニアのメタノール溶液（7N）をカラムに通し、室温で1時間放置して切り出し、担体を28%アンモニア水で洗浄し、切り出し液と洗浄液をスナップバイアル内で合一した後、外温65℃で6時間加熱した。これを80%程度まで減圧濃縮し、逆相HPLC精製（グラジエント： A:B =95:5→70:30(23分) ）を行った。収率27%。
MALDI－TOF－MS：　m/z　理論値（M-H-）3057.06　実測値（M-H-）3053.00。
5’-d(TTTTATTTTT)-3’（配列番号1）(A: グアニジン架橋型核酸，化合物48)の合成2
　実施例３２で得られた化合物１６Ａｂを用いて、CPG担体（CPG 500Å dT 0.2μmol, Proligo社製）上でBoc保護オリゴヌクレオチドとして合成し、合成後のカラムに脱Boc液（トリメチルシリルトリフレート 940μL, 2,6-ジメチルピリジン 1,260 μL, 塩化メチレン10 mLの混合物）を充して室温で3時間放置した。脱Boc液を抜き、カラムに10v/v% 2,6-ジメチルピリジン/塩化メチレン溶液と塩化メチレンを順次通して担体を洗浄した。
　続いて28%アンモニア水を加え、12時間放置した後、切り出し液をスナップバイアルへ移し、外温65℃で5時間加熱した。これを半分量まで減圧濃縮し、逆相簡易カラム（Sep-Pak（登録商標） Plus C18 Cartridges, Waters社製）により精製し、逆相HPLC精製（グラジエント： A:B =95:5→70:30(23分) ）を行った。収率12%。
MALDI－TOF－MS m/z 理論値（M-H-）3057.06　実測値（M-H-）3058.82。
5’-d(TTTT m CTTTTT)-3’（配列番号2）( m C: グアニジン架橋型核酸，化合物49)の合成
　実施例３０で得られた化合物１６ Ｍｅ Ｃａを用いて、0.2μmolのポリスチレン担体（LV-PS dT 0.2μmol，Glen Research社製）上でTeoc保護オリゴヌクレオチドとして合成し、カラムより担体を取り出しスナップバイアルへ移した。テトラブチルアンモニウムフルオライドのテトラヒドロフラン溶液（0.2M）を添加し、外温65℃で8時間加熱、続いて28%アンモニア水を加え、外温65℃で8時間加熱した。これを約半分量まで減圧濃縮し、残渣をゲルろ過カラム（illustraTM　NAPTM-10 Column SephadexTM G-25 DNA Grade, GEへルスケア社製）、続いて逆相簡易カラム（Sep-Pak（登録商標） Plus C18 Cartridges, Waters社製）により精製し、さらに逆相HPLC精製（グラジエント： A:B =95:5→50:50(22.5分) ）を行った。収率19%。
MALDI－TOF－MS m/z 理論値（M-H-）3047.06　実測値（M-H-）3046.06。
5’-d(TTTTGTTTTT)-3’（配列番号3）(G: グアニジン架橋型核酸，化合物50)の合成
　上記化合物48の合成2の製法に準じて、実施例２８で得られた化合物１６Ｇａを用いて、CPG担体（CPG 500Å dT 0.2μmol, Proligo社製）でTeoc保護オリゴヌクレオチドとして合成し、脱保護から精製までの処理は化合物48と同様にして行った。収率23%。
MALDI－TOF－MS m/z 理論値（M-H-）3073.06　実測値（M-H-）3071.24。
　飛行時間型質量分析（MALDI－TOF－MS）による分子量測定の結果が理論値とよい一致を示したことから、それぞれ目的とするオリゴヌクレオチドが得られたことを確認した。
　化合物51～58も同様にして合成した。結果を表１に表す。
表１：グアニジン架橋型核酸を有するオリゴヌクレオチド
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000176
 　比較対照として、化合物５１から５８と同一の塩基配列であり、グアニジン架橋型核酸を含まず天然型ヌクレオシドのみを有するオリゴヌクレオチド（それぞれ、化合物５９から６６）を通常のオリゴヌクレオチド合成条件に従って合成し、精製した。また、前記オリゴヌクレオチドと二重鎖を形成し得る相補鎖オリゴヌクレオチドとして、化合物５１から５８の相補配列であり、グアニジン架橋型核酸を含まず天然型ヌクレオシドのみを有するオリゴヌクレオチド（それぞれ、化合物６７から７４）、および化合物５１から５４の相補配列であり、グアニジン架橋型核酸を含まず天然型ヌクレオシドのみを有するRNAであるオリゴヌクレオチド（それぞれ、化合物７５から７８）を通常のオリゴヌクレオチド合成条件に従って合成し、精製した。
実施例７１　融解温度（Tm）の測定
　実施例７０で得られた各種オリゴヌクレオチド（化合物48から66）と相補鎖オリゴヌクレオチド（化合物６７から７４、または化合物７５から７８）とアニーリング処理して二重鎖を形成させた後、二重鎖の50%が乖離する温度であるTm値を測定することにより、オリゴヌクレオチドの二重鎖形成能を調べた。
　具体的には，塩化ナトリウム　100mM、リン酸ナトリウム緩衝液（pH6.99）　10mM、オリゴヌクレオチド　4μM、相補鎖　4μMを含むサンプル溶液（130μL）を、表２に記載の化合物については、室温から毎分5℃で95℃まで昇温した後、毎分0.5℃の速度で降温し5℃まで冷却し、表３に記載の化合物については沸騰水浴で加熱した後、静置し室温まで冷却した。分光光度計（Shimadzu，UV-1650PCまたはUV-1800）のセル室内に結露防止のため窒素気流を通し、サンプル溶液を5℃まで徐々に冷却し、さらに1分間5℃に保った後、測定を開始した。90℃まで毎分0．5℃の割合で温度を緩やかに上昇させ、0.5℃上昇する毎に260 nmにおける紫外部吸収を測定した。なお、温度上昇による濃度変化を防止するため、セルは蓋付きのものを用いた。結果をTm値および修飾単位あたりのTm値差にて表２に示す。Tm値が高いほど、二重鎖形成能が高いことを示す。
表２：１残基のグアニジン架橋型核酸導入のTm値への影響
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000177
 *: 相補鎖オリゴヌクレオチドの塩基配列：
・化合物５１，５９の相補鎖： DNA／5’-d(AGCAAAAAACGC)-3’（化合物６７）（配列番号12），
　　　　　　　　　　　　　　 RNA／5’-r(AGCAAAAAACGC)-3’（化合物７５）（配列番号13），
・化合物５２，６０の相補鎖： DNA／5’-d(AGCAAATAACGC)-3’（化合物６８）（配列番号14），
　　　　　　　　　　　　　　 RNA／5’-r(AGCAAATAACGC)-3’（化合物７６）（配列番号15），
・化合物５３，６１の相補鎖： DNA／5’-d(AGCAAAGAACGC)-3’（化合物６９）（配列番号16），
　　　　　　　　　　　　　　 RNA／5’-r(AGCAAAGAACGC)-3’（化合物７７）（配列番号17），
・化合物５４，６２の相補鎖： DNA／5’-d(AGCAAACAACGC)-3’（化合物７０）（配列番号18），
　　　　　　　　　　　　　　 RNA／5’-r(AGCAAACAACGC)-3’（化合物７８）（配列番号19）。
表３：３残基のグアニジン架橋型核酸導入のTm値への影響
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000178
　表２および３から明らかなように、グアニジン架橋型人工核酸を含有するオリゴヌクレオチドは、全ての塩基において、RNAのみならずDNAに対しても優れた二重鎖形成能を有していた。また、いずれの塩基についてもオリゴヌクレオチドへのグアニジン架橋型人工核酸の導入割合が多いほど、Tm値の上昇が見られた。したがって、本発明のグアニジン架橋型人工核酸を導入したオリゴヌクレオチドは、アンチセンス法に適するオリゴヌクレオチドであると考えられる。
　本発明の架橋型核酸ＧｕＮＡの新規な製造方法は、架橋型核酸ＧｕＮＡの製造のための工程数を短縮することができ、架橋型核酸ＧｕＮＡの収率を改善できる。また、本発明の新規な中間体としての化合物を用いて、様々な種類の核酸塩基を含有する架橋型人工核酸ＧｕＮＡを製造することができる。本発明の製造方法、及び中間体化合物はグアニジン架橋型核酸ＧｕＮＡの効率的な製造に有用であり、グアニジン架橋型人工核酸ＧｕＮＡオリゴマーは、各種医薬、診断、試験研究に使用することができる。
　配列番号１～１２、１４、１６、１８および２０～２３は、ＤＮＡオリゴヌクレオチドを示す。
　配列番号１３、１５、１７、および１９は、ＲＮＡオリゴヌクレオチドを示す。

Claims (40)

  1. 　一般式Ｉ：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
    一般式II：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000002
     ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式Ｉのものと同じ意味を示し、環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
    で表される化合物に還元剤を反応させ、環Ａ’に縮合するオキサゾリジン環を開裂させる工程を含む、製造方法。
  2. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａがチミニルもしくはウラシニルであり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000003
     であり、そして還元剤がＰｈ３Ｐである請求項１に記載の製造方法。
  3. 　一般式VII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000004
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物またはその塩の製造方法であって、請求項１または２に記載の工程を含む製造方法。
  4. 　一般式Ｉ：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000005
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立してＢｎ基、２－ナフチルメチル、p－メトキシベンジル基、３,４－ジメトキシベンジル基、２,６－ジメトキシベンジル基またはｐ－フェニルベンジル基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩。
  5. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである請求項４に記載の化合物またはその塩。
  6. 　一般式II：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000006
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩。
  7. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６が各々水素原子であり、そして環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２である請求項６に記載の化合物またはその塩。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000007
  8. 　一般式II：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000008
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
    一般式III：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000009
     ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及び環Ａ’は各々一般式IIのものと同じ意味を示す。］
    で表される化合物にアジド化剤を反応させる工程を含む、製造方法。
  9. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２であり、そしてアジド化剤がＤＰＰＡである請求項８に記載の製造方法。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000010
  10. 　一般式VII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000011
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物またはその塩の製造方法であって、請求項８または９に記載の工程を含む製造方法。
  11. 　一般式III：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000012
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして、環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩。
  12. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２である請求項１１に記載の化合物またはその塩。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000013
  13. 　一般式IV：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000014
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
    一般式Ｖ：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000015
     ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｘ及びｍは各々一般式IVのものと同じ意味を示し、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
    で表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させて、一般式Ｖ中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化する工程を含む製造方法。
  14. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ基（Ｍｓ－Ｏ－）であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルであり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２であり、そして水酸基の活性化剤がトリフルオロメタンスルホニルクロリドである請求項１３に記載の製造方法。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000016
  15. 　一般式VII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000017
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物またはその塩の製造方法であって、請求項１３または１４に記載の工程を含む製造方法。
  16. 　一般式IV：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000018
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩。
  17. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ基（Ｍｓ－Ｏ－）であり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２である請求項１６に記載の化合物またはその塩。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000019
  18. 　一般式Ｖ：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000020
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｘは脱離基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａは、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩。
  19. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ基（Ｍｓ－Ｏ－）であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルである請求項１８に記載の化合物またはその塩。
  20. 　一般式II：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000021
     ［式中、Ｒ１、Ｒ２は各々独立して水酸基の保護基であり、、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
    一般式IV：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000022
     ［式中、Ｘは脱離基であり、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、ｍ及び環Ａ’は各々一般式IIのものと同じ意味を示す。］
    で表される化合物にアジド化剤を反応させる工程を含む、製造方法。
  21. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｘがメシルオキシ基（Ｍｓ－Ｏ－）であり、環Ａ’が下記構造式II－１またはII－２であり、そしてアジド化剤がｎＢｕ４ＮＮ３またはアジ化ナトリウムである請求項２０に記載の製造方法。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000023
  22. 　一般式VII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000024
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物またはその塩の製造方法であって、請求項２０または２１に記載の工程を含む製造方法。
  23. 　一般式II：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000025
     ［式中、Ｒ１及びＲ２は各々独立して水酸基の保護基であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、ｍは１～３の整数であり、そして環Ａ’は、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａ’を形成してもよい。］
    で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
    一般式VI:
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000026
     ［式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式IIのものと同じ意味を示し、そして環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
    で表される化合物に水酸基の活性化剤を反応させて、一般式VI中のテトラヒドロフラン環に置換している無保護の水酸基を活性化する工程を含む、製造方法。
  24. 　Ｒ１及びＲ２が各々Ｂｎ基であり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、環Ａがチミニルまたはウラシニルであり、環Ａ’が、下記構造式II－１またはII－２であり、そして水酸基の活性化剤がトリフルオロメタンスルホニルクロリドである請求項２３に記載の製造方法。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000027
  25. 　一般式VII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000028
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物またはその塩の製造方法であって、請求項２３または２４記載の工程を含む製造方法。
  26. 　一般式VII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000029
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。（但し、ｍ＝１であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＢｏｃ基、Ｒ１０がＢｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるもの、およびｍ＝２であり、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子、Ｒ７がＤＭＴｒ基、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮ）（Ｎ（ｉＰｒ）２）基、Ｒ９がＣｅｏｃ基、Ｒ１０がＣｅｏｃ基、そしてＲ１１が水素原子であるものを除く。）］
    で表される化合物またはその塩。
  27. 　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｒ７がＤＭＴｒ基であり、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ(ＣＨ２)２ＣＮ）（Ｎ(ｉＰｒ)２）基であり、Ｒ９がＴｅｏｃ基またはＢｏｃ基であり、Ｒ１０がＴｅｏｃ基またはＢｏｃ基であり、そしてＲ１１が水素原子である請求項２６に記載の化合物またはその塩。
  28. 　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｒ７がＤＭＴｒ基であり、Ｒ８が水素原子または－Ｐ（Ｏ(ＣＨ２)２ＣＮ）（Ｎ(ｉＰｒ)２）基であり、Ｒ９がＴｅｏｃ基であり、Ｒ１０がＴｅｏｃ基であり、そしてＲ１１が水素原子である請求項２６に記載の化合物またはその塩。
  29. 　一般式VIII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000030
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ１２及びＲ１３は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物またはその塩を製造する方法であって、
    一般式IX：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000031
     ［式中、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６及びｍは各々一般式VIIIのものと同じ意味であり、Ｒ１４及びＲ１５は各々独立して水素原子または水酸基の保護基であり、環Ａは１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルケニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ２－６アルキニル基、１つ以上の置換基で置換されてもよいアミノ基、１つ以上の置換基で置換されてもよい水酸基、オキソ基、チオキソ基、およびハロゲン原子からなる群から選ばれる１つ以上の置換基で置換されてもよい５から７員環の不飽和ヘテロ環であり、さらに該不飽和ヘテロ環は別の環と縮合して環Ａを形成してもよい。］
    で表される化合物の環ＡをＢに置換する工程を含む、製造方法。
  30. 　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５がすべてＢｎ基であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである請求項２９に記載の製造方法。
  31. 　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ１２がＤＭＴｒ基、Ｒ１３がＴＭＳ基、Ｒ１４がＤＭＴｒ基、Ｒ１５が水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである請求項２９に記載の製造方法。
  32. 　Ｂが、１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ１２がＴＭＳ基、Ｒ１３がＴＭＳ基、Ｒ１４が水素原子、Ｒ１５が水素原子であり、そして環Ａがチミニルまたはウラシニルである請求項２９に記載の製造方法。
  33. 　一般式VII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000032
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ８は水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基、または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、Ｒ９、Ｒ１０及びＲ１１は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基、またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物またはその塩の製造方法であって、請求項２９から３２のいずれか１つに記載の工程を含む製造方法。
  34. 　一般式VIII：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000033
     ［式中、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｒ１２はＢｎ基、ＤＭＴｒ基、またはＴＭＳ基であり、Ｒ１３はＢｎ基、水素原子、またはＴＭＳ基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物またはその塩。
  35. 　Ｂが１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、そしてＲ１２及びＲ１３が各々Ｂｎ基である、請求項３４に記載の化合物またはその塩。
  36. 　Ｂが１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよいチミニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６が各々水素原子であり、Ｒ１２がＤＭＴｒ基であり、そしてＲ１３が水素原子である、請求項３４に記載の化合物またはその塩。
  37. 　一般式Ｘ：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000034
     ［式中、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチド（但し、ｍ＝１または２の場合、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が各々水素原子であるヌクレオシドのみを架橋型核酸として有するオリゴヌクレオチドを除く。）の製造方法であって、
    一般式XI：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000035
     ［式中、Ｂ、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５及びＲ６は各々一般式Ｘのものと同じ意味であり、Ｒ７は水素原子または水酸基の保護基であり、Ｒ２０は１つ以上の置換基で置換されてもよいリン酸基または１つ以上の置換基で置換されてもよいチオリン酸基であり、そしてＲ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表される化合物からホスホラミダイト法により製造する方法。
  38. 　Ｂが１つ以上の保護基を有してもよいアデニニル、１つ以上の保護基を有してもよいグアニニル、１つ以上の保護基を有してもよいシトシニル、１つ以上の保護基を有してもよい５－メチルシトシニルまたは１つ以上の保護基を有してもよいウラシニルであり、Ｒ７が水酸基の保護基であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が水素原子であり、Ｒ２０が－Ｐ（Ｏ(ＣＨ２)２ＣＮ）（Ｎ(ｉＰｒ)２）であり、そしてＲ２１、Ｒ２２及びＲ２３は各々独立してアミノ基の保護基である、請求項３７に記載の製造方法。
  39. 　一般式Ｘ：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000036
     ［式中、Ｒ３及びＲ４は各々独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ５は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、各Ｒ６は独立して水素原子、または１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基であり、Ｂは１つ以上の置換基で置換されてもよい核酸の塩基部分であり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８は各々独立して水素原子、１つ以上の置換基で置換されてもよいＣ１－６アルキル基またはアミノ基の保護基であり、そしてｍは１～３の整数である。］
    で表されるヌクレオシドを１つ以上有しているオリゴヌクレオチド（但し、ｍ＝１または２の場合、Ｂがチミニル、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が各々水素原子であるヌクレオシドのみを架橋型核酸として有するオリゴヌクレオチドを除く。）またはその塩。
  40. 　Ｂがアデニニル、グアニニル、シトシニル、５－メチルシトシニル、チミニルまたはウラシニルであり、Ｒ１６、Ｒ１７及びＲ１８が水素原子である、請求項３９に記載のオリゴヌクレオチドまたはその塩。
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