WO2022250072A1 - 心疾患治療薬 - Google Patents

心疾患治療薬 Download PDF

Info

Publication number
WO2022250072A1
WO2022250072A1 PCT/JP2022/021330 JP2022021330W WO2022250072A1 WO 2022250072 A1 WO2022250072 A1 WO 2022250072A1 JP 2022021330 W JP2022021330 W JP 2022021330W WO 2022250072 A1 WO2022250072 A1 WO 2022250072A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
group
carbon atoms
nucleic acid
hydrogen atom
linear
Prior art date
Application number
PCT/JP2022/021330
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
由依 宮阪
アジャヤラム セレスタ
幸介 千葉
峻哲 川野邊
Original Assignee
ルクサナバイオテク株式会社
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ルクサナバイオテク株式会社 filed Critical ルクサナバイオテク株式会社
Publication of WO2022250072A1 publication Critical patent/WO2022250072A1/ja

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/04Inotropic agents, i.e. stimulants of cardiac contraction; Drugs for heart failure
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Definitions

  • the present invention relates to a therapeutic drug for heart disease containing an oligonucleotide having a nucleoside with a specific modification, an antisense oligonucleotide containing the oligonucleotide to enhance the cardiac function, a method for producing the same, and the like.
  • Antisense oligonucleotides exert their effects by hybridizing to target nucleic acid sequences and suppressing gene expression itself.
  • Various artificial nucleic acids have been developed and introduced with the aim of improving the nuclease resistance of antisense oligonucleotides (ASO) and improving their binding affinity and specificity to target nucleic acids, and various formulations have been launched.
  • ASO antisense oligonucleotides
  • Patent Document 1 the ASOs that have been developed so far tend to accumulate in specific organs such as the liver and kidneys due to the characteristics of the ASO itself or the characteristics of the artificial nucleic acid. It is known that the desired effect cannot be exhibited, and the applications and target diseases are limited.
  • Non-Patent Document 1 For the purpose of treating heart diseases caused by specific gene mutations such as muscular dystrophy, attempts have been made to exert the effects of ASO on the heart by, for example, binding fatty acids as ligands to ASO ( Non-Patent Document 1).
  • an object of the present invention is to provide an ASO or the like that is excellent in terms of production and cost and that can exert an effect on the heart without binding specific substances such as fatty acids.
  • an antisense oligonucleotide (ASO) having a modified nucleoside in which guanidine is introduced into the bridge between the 2' and 4' sugar moieties of the nucleotide has been found to be effective against the heart, where conventional ASO is difficult to exert its effect.
  • ASO antisense oligonucleotide
  • the present inventors have found that the ASO having the modified nucleoside can exhibit an effect, and obtained the idea that the use of the ASO having the modified nucleoside as a therapeutic agent will lead to the treatment of heart disease. Based on this idea, the present inventors have made further intensive studies and completed the present invention.
  • Base represents a purin-9-yl group or a 2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl group optionally having one or more substituents selected from the ⁇ group, wherein
  • the ⁇ group is a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, a linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a mercapto group, or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • a therapeutic drug for heart disease comprising an oligonucleotide having one or more nucleosides represented by [2] The therapeutic agent of [1], wherein R 12 is any branched chain alkyl group of 3 to 7 carbon atoms having the same or different branched chains.
  • Base represents a purin-9-yl group or a 2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl group optionally having one or more substituents selected from the ⁇ group, wherein
  • the ⁇ group is a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, a linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a mercapto group, or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • R 1 , R 12 , and R 13 each independently represent a hydrogen atom, an optionally branched or ring-forming alkyl group having 1 to 7 carbon atoms, or an amino group-protecting group, and R 14 is , representing a hydrogen atom)
  • a drug for enhancing the function of an antisense oligonucleotide in the heart comprising an oligonucleotide having one or more nucleosides represented by: [7] The potentiator of [6], wherein R 12 is any branched chain alkyl group of 3 to 7 carbon atoms with the same or different branched chains.
  • a method for producing a therapeutic drug for heart disease comprising the step of synthesizing the oligonucleotide according to any one of [1] to [5].
  • a method for designing an antisense oligonucleotide with enhanced function, wherein at least one nucleoside constituting the oligonucleotide is represented by the following formula I or II:
  • Base represents a purin-9-yl group or a 2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl group optionally having one or more substituents selected from the ⁇ group, wherein
  • the ⁇ group is a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, a linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a mercapto group, or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • R 1 , R 12 , and R 13 each independently represent a hydrogen atom, an optionally branched or ring-forming alkyl group having 1 to 7 carbon atoms, or an amino group-protecting group, and R 14 is , representing a hydrogen atom)
  • Base represents a purin-9-yl group or a 2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl group optionally having one or more substituents selected from the ⁇ group, wherein
  • the ⁇ group is a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, a linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a mercapto group, or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • R 1 , R 12 , and R 13 each independently represent a hydrogen atom, an optionally branched or ring-forming alkyl group having 1 to 7 carbon atoms, or an amino group-protecting group, and R 14 is , representing a hydrogen atom)
  • Base represents a purin-9-yl group or a 2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl group optionally having one or more substituents selected from the ⁇ group, wherein
  • the ⁇ group is a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, a linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a mercapto group, or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • a method for enhancing the function of an antisense oligonucleotide in a mammalian heart comprising administering an oligonucleotide having one or more nucleosides represented by: [15] The enhancement method according to [14], wherein the antisense oligonucleotide function enhancement in the mammalian heart is dystrophin production promotion in the mammalian heart.
  • the present invention enables the production of ASO that can exert its effect even on the heart.
  • the ASO is suitable as a therapeutic drug for heart disease, particularly heart disease caused by gene mutation, and is excellent in terms of production and cost.
  • the ASO may also exert effects on the heart, thus enhancing the function of ASO in the heart.
  • the ASO can promote the production of (truncated) dystrophin by exon skipping, for example, in patients with Duchenne muscular dystrophy for the reasons described above.
  • FIG. 1 shows the amount of RNA (MALAT1) in each organ after single intravenous administration of antisense oligonucleotides to normal mice.
  • FIG. 2 shows the amount of RNA (MALAT1) in the liver after a single intravenous administration of antisense oligonucleotides with different modifications to normal mice.
  • FIG. 3 shows the amount of RNA (MALAT1) in the heart after a single intravenous administration of antisense oligonucleotides with different modifications to normal mice.
  • FIG. 4 shows the results of exon skipping assays using splicing control oligonucleotides (SSO) containing LNA or GuNA(t-Bu) modifications.
  • SSO splicing control oligonucleotides
  • the present invention provides an antisense oligonucleotide having a modified nucleoside in which guanidine is introduced into the bridge between the 2' and 4' sugar moieties of nucleotides (hereinafter also referred to as "guanidine-bridged nucleoside").
  • ASO is an invention that was completed based on the discovery that it can also exert an effect on the heart. In one aspect, the effects of the nucleotides in liver and muscle prior to the ASO of the present invention may be preserved.
  • Base represents a purin-9-yl group or a 2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl group optionally having one or more substituents selected from the ⁇ group, wherein
  • the ⁇ group is a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, a linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a mercapto group, or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • R 1 , R 12 , and R 13 each independently represent a hydrogen atom, an optionally branched or ring-forming alkyl group having 1 to 7 carbon atoms, or an amino group-protecting group, and R 14 is , representing a hydrogen atom
  • Oligonucleotides having one or more nucleosides i.e., guanidine-bridged nucleosides
  • this A therapeutic drug for heart disease hereinafter sometimes referred to as "therapeutic drug of the present invention
  • linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms refers to any linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, specifically methyl group, ethyl group, n-propyl group, n-butyl group, n-pentyl group, or n-hexyl group.
  • linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms includes an alkoxy group having any linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. Examples include methoxy group, ethoxy group, n-propoxy group and the like.
  • linear alkylthio group having 1 to 6 carbon atoms includes an alkylthio group having any linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. Examples thereof include a methylthio group, an ethylthio group and an n-propylthio group.
  • linear alkylamino group having 1 to 6 carbon atoms refers to any linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, or any linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, which may be the same or different.
  • Amino groups with two chain alkyl groups are included. Examples thereof include methylamino group, dimethylamino group, ethylamino group, methylethylamino group and diethylamino group.
  • any straight chain alkyl group having 1 to 7 carbon atoms includes methyl, ethyl, n-propyl, n-butyl, n-pentyl, n-hexyl, and n-heptyl groups.
  • Optional branched chain alkyl groups of 3 to 7 carbon atoms having the same or different branched chains include isopropyl, isobutyl, tert-butyl, isopentyl groups and the like, and
  • Optional cyclic alkyl groups include cyclobutyl, cyclopentyl, cyclohexyl, and the like.
  • halogen atom includes, for example, a fluorine atom, a chlorine atom, a bromine atom, or an iodine atom.
  • protecting group for amino group for nucleic acid synthesis "hydroxyl group protected by protecting group for nucleic acid synthesis”, “mercapto group protected by protecting group for nucleic acid synthesis”, “protecting group for nucleic acid synthesis”
  • protecting group for nucleic acid synthesis The term “protecting group” described in “protected amino group” is not particularly limited as long as it can stably protect an amino group, a hydroxyl group, or a mercapto group during nucleic acid synthesis. Specifically, it refers to protective groups that are stable under acidic or neutral conditions and cleavable by chemical methods such as hydrogenolysis, hydrolysis, electrolysis, and photolysis.
  • Examples of such protecting groups include alkyl groups having 1 to 6 carbon atoms; alkenyl groups having 1 to 6 carbon atoms; acyl groups; tetrahydropyranyl groups or tetrahydrothiopyranyl groups; a silyl group; a methyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms; a methyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms; a methyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms; a methyl group substituted with a substituted alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms; an ethyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms; an ethyl group substituted with a halogen atom; and an aryl group having 1 to 3 a substituted methyl group; an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a methyl group substitute
  • the tetrahydropyranyl group or tetrahydrothiopyranyl group includes a tetrahydropyran-2-yl group, a 3-bromotetrahydropyran-2-yl group, a 4-methoxytetrahydropyran-4-yl group and a tetrahydropyranyl group.
  • a tetrahydrofuranyl group or a tetrahydrothiofuranyl group includes a tetrahydrofuran-2-yl group and a tetrahydrothiofuran-2-yl group.
  • Examples of the methyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms include a methoxymethyl group, 1,1-dimethyl-1-methoxymethyl group, ethoxymethyl group, propoxymethyl group, isopropoxymethyl group, butoxymethyl group, A t-butoxymethyl group and the like can be mentioned.
  • 2-methoxyethoxymethyl group etc. are mentioned as a methyl group substituted with the C1-C6 alkoxy group substituted with the C1-C6 alkoxy group.
  • Examples of the methyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms substituted with a halogen atom include a 2,2,2-trichloroethoxymethyl group and a bis(2-chloroethoxy)methyl group.
  • Examples of the ethyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms include a 1-ethoxyethyl group and a 1-(isopropoxy)ethyl group.
  • Ethyl groups substituted with halogen atoms include 2,2,2-trichloroethyl groups and the like.
  • the methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups includes a benzyl group, ⁇ -naphthylmethyl group, ⁇ -naphthylmethyl group, diphenylmethyl group, triphenylmethyl group, ⁇ -naphthyldiphenylmethyl group, 9-an thrylmethyl group and the like.
  • a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups substituted with an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a halogen atom and/or a cyano group 4-methyl benzyl group, 2,4,6-trimethylbenzyl group, 3,4,5-trimethylbenzyl group, 4-methoxybenzyl group, 4-methoxyphenyldiphenylmethyl group, 4,4'-dimethoxytriphenylmethyl group, 2- nitrobenzyl group, 4-nitrobenzyl group, 4-chlorobenzyl group, 4-bromobenzyl group, 4-cyanobenzyl group and the like.
  • a carbonyl group substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms includes a methoxycarbonyl group, an ethoxycarbonyl group, a t-butoxycarbonyl group, an isobutoxycarbonyl group and the like.
  • the "aryl group substituted with a halogen atom, an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms and/or a nitro group” includes a 4-chlorophenyl group, a 2-fluorophenyl group, a 4-methoxyphenyl group, a 4-nitrophenyl group, 2,4-dinitrophenyl group and the like.
  • a carbonyl group substituted with a halogen atom, a cyano group and/or a silyl group substituted with 3 alkyl groups having 1 to 6 carbon atoms and substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms 2, 2,2-trichloroethoxycarbonyl group, 2-cyanoethoxycarbonyl group, 2-trimethylsilylethoxycarbonyl group and the like.
  • alkenyloxycarbonyl groups include vinyloxycarbonyl groups and aryloxycarbonyl groups.
  • aralkyloxycarbonyl group optionally substituted with an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms and/or an aryl group substituted with a nitro group examples include a benzyloxycarbonyl group, a 9-fluorenylmethyloxycarbonyl group, 4-methoxybenzyloxycarbonyl group, 3,4-dimethoxybenzyloxycarbonyl group, 2-nitrobenzyloxycarbonyl group, 4-nitrobenzyloxycarbonyl group and the like.
  • Examples of protective groups for "a hydroxyl group protected by a protective group for nucleic acid synthesis” include an aliphatic acyl group; an aromatic acyl group; a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups; a halogen atom and 1 carbon atom. aryl groups substituted with 6 to 6 alkoxy groups and/or nitro groups; alkyl groups having 1 to 6 carbon atoms; or alkenyl groups having 1 to 6 carbon atoms; Examples of the “amino group-protecting group for nucleic acid synthesis” include an acyl group and a benzoyl group. Examples of the “protecting group” of the "mercapto group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis” include an aliphatic acyl group, an aromatic acyl group, and a benzoyl group.
  • oligonucleotides shall also include pharmacologically acceptable salts of oligonucleotides.
  • the salts include alkali metal salts such as sodium salts, potassium salts and lithium salts, alkaline earth metal salts such as calcium salts and magnesium salts, aluminum salts, iron salts, zinc salts, copper salts, nickel salts and cobalt salts.
  • metal salts such as salts; inorganic salts such as ammonium salts, t-octylamine salts, dibenzylamine salts, morpholine salts, glucosamine salts, phenylglycine alkyl ester salts, ethylenediamine salts, N-methylglucamine salts, guanidine salts, diethylamine salt, triethylamine salt, dicyclohexylamine salt, N,N'-dibenzylethylenediamine salt, chloroprocaine salt, procaine salt, diethanolamine salt, N-benzyl-phenethylamine salt, piperazine salt, tetramethylammonium salt, tris(hydroxymethyl) Amine salts such as organic salts such as aminomethane salts; Halohydrogenates such as hydrofluoride, hydrochloride, hydrobromide, hydroiodide, nitrates, perchlorates, Inorganic acid salts such as
  • guanidine-bridged nucleoside may be at any position of the oligonucleotide contained in the therapeutic agent of the present invention, for example, at the 5' end or the 3' end.
  • nucleosides other than guanidine-bridged nucleosides constituting oligonucleotides contained in the therapeutic agent of the present invention include nucleosides represented by the following formula IV.
  • Base represents a purin-9-yl group or a 2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl group optionally having one or more substituents selected from the ⁇ group, wherein
  • the ⁇ group is a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, a linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a mercapto group, or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • a mercapto group a linear alkylthio group having 1 to 6 carbon atoms, an amino group, a linear alkylamino group having 1 to 6 carbon atoms, an amino group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, and a halogen atom
  • R 8 is a hydrogen atom
  • R 9 is a hydrogen atom, a halogen atom, or a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms which may be substituted with a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms.
  • R 8 and R 9 together have the following formula:
  • R 21 is selected from a hydrogen atom, an optionally branched or ring-forming alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, an optionally branched or ring-forming alkenyl group having 2 to 6 carbon atoms, and the above ⁇ group an aryl group having 3 to 10 carbon atoms which may have one or more optional substituents and may contain a heteroatom, and one or more optional substituents selected from the ⁇ group an aralkyl group having an aryl moiety of 3 to 12 carbon atoms which may optionally contain a heteroatom, or an amino group-protecting group for nucleic acid synthesis;
  • R 22 and R 23 are each independently a hydrogen atom; optionally substituted with an aryl group having 3 to 12 carbon atoms which may contain a heteroatom, and optionally branched or forming a ring; an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms; or an aralkyl group having an aryl moiety having 3 to 12 carbon atoms
  • examples of the crosslinked nucleoside include nucleosides having the following structural formula.
  • R is a hydrogen atom, an optionally branched or ring-forming alkyl group having 1 to 7 carbon atoms, an optionally branched or ring-forming alkenyl group having 2 to 7 carbon atoms, a hetero atom an aryl group having 3 to 12 carbon atoms which may contain , an aralkyl group having an aryl moiety having 3 to 12 carbon atoms which may contain a hetero atom, or an amino group-protecting group for nucleic acid synthesis.
  • R is a hydrogen atom, a methyl group, an ethyl group, an n-propyl group, an isopropyl group, a phenyl group, or a benzyl group, more preferably R is a hydrogen atom or a methyl group.
  • Base The definition is the same as in Formula IV above.
  • Nucleosides constituting oligonucleotides contained in the therapeutic agent of the present invention may be natural nucleosides, and examples of such natural nucleosides include adenosine, N6-methyladenosine, guanosine, uridine, 5-methyluridine, Cytidine, deoxyadenosine, N6-methyl-2'-deoxyadenosine, deoxyguanosine, thymidine, deoxyuridine, deoxycytidine, 5-methyl-2'-deoxycytidine and the like.
  • the length of the oligonucleotide contained in the therapeutic agent of the present invention is not particularly limited as long as it has antisense activity, but it is typically 10 to 50 nucleotides long, preferably 10 to 30 nucleotides long, more preferably 10 to 30 nucleotides long. is 13-30 nucleotides long, more preferably 15-20 nucleotides long.
  • modifications other than bridging between the 2' and 4' positions may be further applied.
  • modifications include, for example, phosphorothioate modification, 2'-O-methoxyethyl modification of the sugar moiety, 2'-O-methyl modification of the sugar moiety, 2' fluoro modification of the sugar moiety, methylation of Base (base moiety) or Examples include, but are not limited to, acetylation, Base substitution, and the like.
  • Base it is preferable to substitute with one capable of forming a base pair with the base of the target of Base before substitution (ie, forming a base pair with the Base).
  • the base pair may be not only a Watson-Crick base pair but also a Hoogsteen base pair or a Wobble base pair.
  • the oligonucleotide contained in the therapeutic agent of the present invention is a target mRNA (in this specification, mRNA includes pre-mRNA.) function ( post-transcriptional modification, translation, etc.) (hereinafter sometimes referred to as “suppressive ASO"), or enhance the function (hereinafter referred to as “enhanced ASO”).
  • suppressive ASO post-transcriptional modification, translation, etc.
  • Inhibitory ASOs typically form a double-stranded region with a target mRNA, and the double-stranded region is cleaved by ribonuclease H (RNase H), thereby suppressing the function of the target mRNA.
  • RNase H ribonuclease H
  • enhanced ASO typically forms a double-stranded region with a splicing promoting sequence of pre-mRNA as a splicing control oligonucleotide (SSO) to mask the sequence and skip splicing.
  • SSO splicing control oligonucleotide
  • the function of the mRNA can be enhanced by forming a double-stranded region with the binding sequence of the enzyme that degrades the mRNA contained in the target mRNA to mask the sequence and suppress the degradation of the mRNA.
  • the function of inhibitory ASO and the function of enhancing ASO are also collectively referred to as "function of ASO" or "antisense activity”.
  • the ASO of the present invention can suppress or enhance the function of target mRNA, thereby controlling gene expression.
  • the term "gene expression” is used to include at least "production of a functional protein encoded by the target mRNA", but it also includes “production of target mRNA". Used in the sense of including. Therefore, the suppression of gene expression means not only the reduction in the amount of functional protein encoded by the gene in cells, but also the reduction of mRNA transcribed from the gene by administration of the ASO of the present invention. It may also include decreasing its abundance in a cell.
  • the enhancement of gene expression means not only that the administration of the ASO of the present invention increases the abundance in cells of the functional protein encoded by the gene, but also that the mRNA transcribed from the gene may also include increasing the abundance of in cells.
  • the inhibitory ASO is preferably a gapmer-type oligonucleotide.
  • the term "gapmer-type oligonucleotide” means a plurality of (eg, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 or more) nucleotides recognized by RNase H.
  • ap region is at least one modified to confer resistance to ribonucleases (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more) nucleotides (herein, the 3′ external region is referred to as the “3′ wing region” and the 5′ external region as the “5′ (sometimes referred to as "wing regions”).
  • ribonucleases e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more
  • the 3′ external region is referred to as the “3′ wing region” and the 5′ external region as the “5′ (sometimes referred to as "wing regions”).
  • At least one nucleoside constituting each of the 3' wing region and the 5' wing region is preferably a bridging nucleoside.
  • the enhanced ASO preferably has at least one nucleoside modified to impart resistance to RNase.
  • Such ASOs may be those in which all nucleoside residues are modified, or those in which some nucleoside residues are modified (ie, Mixmer-type oligonucleotides).
  • a bridged nucleoside is preferred as such a modified nucleoside.
  • can also exert an effect on the heart means that at least the function of target mRNA in the heart can be suppressed or enhanced compared to oligonucleotides that do not have guanidine-bridged nucleosides. Also, “the effect of a nucleotide can be maintained” means that the function of ASO is maintained or improved compared to an oligonucleotide having no guanidine-bridged nucleoside.
  • treatment includes alleviation or improvement of symptoms, progression of disease or symptoms, or prevention, delay, or cessation of manifestation of symptoms.
  • Target diseases of the therapeutic agent of the present invention include, for example, overexpression or overaccumulation of the protein encoded by the ASO target mRNA of the present invention, or deletion or reduction of the protein encoded by the ASO target mRNA of the present invention. underlying heart disease.
  • the target of the ASO of the present invention is a splicing-promoting sequence within an exon, and introduction of the ASO during the splicing reaction inhibits the function of the splicing-promoting sequence, induces exon skipping, and eliminates the exon sequence.
  • cardiomyopathy idiopathic cardiomyopathy, specific cardiomyopathy
  • Specific cardiomyopathies include, for example, ischemic myocardial disease, inflammatory myocardial disease, metabolic myocardial disease, and systemic myocardial disease.
  • Becker type (BMD) muscular dystrophy For example, in the case of Duchenne muscular dystrophy, the ASO of the present invention targets the splicing promoting sequence of the pre-mRNA transcribed from the dystrophin gene (DMD gene).
  • DMD gene dystrophin gene
  • an effective amount of the ASO of the present invention may be used alone, or may be formulated as a pharmaceutical composition together with any carrier, for example, a pharmaceutically acceptable carrier (formulated are also referred to as therapeutic agents).
  • a pharmaceutically acceptable carrier formulated are also referred to as therapeutic agents.
  • Pharmaceutically acceptable carriers include, for example, excipients such as sucrose and starch, binders such as cellulose and methylcellulose, disintegrants such as starch and carboxymethylcellulose, lubricants such as magnesium stearate and aerosil, citric acid, Fragrance agents such as menthol, preservatives such as sodium benzoate and sodium hydrogen sulfite, stabilizers such as citric acid and sodium citrate, suspending agents such as methyl cellulose and polyvinyl pyrrolid, dispersing agents such as surfactants, water, Examples include, but are not limited to, diluents such as physiological saline, base waxes, and the like.
  • the therapeutic agent of the present invention may further contain a reagent for nucleic acid introduction.
  • the nucleic acid introduction reagent includes calcium chloride, calcium enrichment reagent, atelocollagen; liposome; nanoparticle; Cationic lipids such as (ethyleneimine) (PEI) and the like can be used.
  • the therapeutic agent of the present invention may also be a pharmaceutical composition in which the ASO of the present invention is encapsulated in liposomes.
  • Liposomes are closed microscopic vesicles having an internal phase surrounded by one or more lipid bilayers, and can typically hold water-soluble substances in the internal phase and fat-soluble substances within the lipid bilayers.
  • the ASOs of the present invention may be retained within the liposome internal phase or within the lipid bilayer.
  • the liposomes used in the present invention may be single-layered or multi-layered, and the particle size can be appropriately selected within the range of, for example, 10 to 1000 nm, preferably 50 to 300 nm. Considering deliverability to the target tissue, the particle size is, for example, 200 nm or less, preferably 100 nm or less.
  • Methods for encapsulating water-soluble compounds such as oligonucleotides in liposomes include lipid film method (vortex method), reverse phase evaporation method, surfactant removal method, freeze-thaw method, remote loading method and the like. is not limited to, and any known method can be selected as appropriate.
  • the medicament of the present invention can be administered orally or parenterally to mammals (e.g. humans, rats, mice, guinea pigs, rabbits, sheep, horses, pigs, cows, dogs, cats, monkeys). is possible, but parenteral administration is preferred. Accordingly, there is also provided a method of treating heart disease in a mammal, comprising administering to the mammal an effective amount of the ASO of the present invention.
  • mammals e.g. humans, rats, mice, guinea pigs, rabbits, sheep, horses, pigs, cows, dogs, cats, monkeys.
  • Formulations suitable for parenteral administration include aqueous and non-aqueous
  • aqueous and non-aqueous There are isotonic sterile injectable solutions, which may contain antioxidants, buffers, bacteriostats, tonicity agents and the like.
  • aqueous and non-aqueous sterile suspensions which may contain suspending agents, solubilizers, thickeners, stabilizers, preservatives, and the like.
  • the formulation can be enclosed in a container such as an ampoule or a vial in units of unit doses or multiple doses.
  • the active ingredient and a pharmaceutically acceptable carrier can be lyophilized and stored in such a manner that they can be dissolved or suspended in an appropriate sterile vehicle just prior to use.
  • Other formulations suitable for parenteral administration can include sprays and the like.
  • the content of the ASO of the present invention in the pharmaceutical composition is, for example, about 0.1 to 100% by weight of the entire pharmaceutical composition.
  • the dosage of the therapeutic agent of the present invention varies depending on the purpose of administration, administration method, type of target disease, severity, and conditions of administration target (sex, age, body weight, etc.).
  • a single dose of the ASO of the present invention is generally 0.01 mg/kg to 1000 mg/kg, and in the case of topical administration, it is preferably 0.001 mg/body to 100 mg/body. It is desirable to administer such doses 1 to 10 times, more preferably 5 to 10 times.
  • the therapeutic drug of the present invention can also be used in combination with, for example, a therapeutic drug for heart disease that is already on the market.
  • These concomitant drugs can be formulated together with the medicament of the present invention and administered as a single preparation, or can be formulated separately from the medicament of the present invention and administered as the same drug as the medicament of the present invention. Alternatively, they can be administered simultaneously or staggered by different routes.
  • the dose of these concomitant drugs may be the amount usually used when the drug is administered alone, or the dose can be reduced from the amount usually used.
  • one or more oligonucleotides having guanidine-bridged nucleosides of the present invention are provided.
  • enhancement of the function of ASO means that the function of the ASO of the present invention is a modified nucleoside (hereinafter referred to as (Also called "guanidine-bridged nucleoside").
  • oligonucleotides having a guanidine-bridged nucleoside of the present invention e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or dystrophin production-enhancing agents, including those above.
  • the dystrophin production-enhancing drug of the present invention contains an ASO that targets the splicing-enhancing sequence in the pre-mRNA of the dystrophin gene in patients with Duchenne muscular dystrophy.
  • the ASO inhibits the function of the splicing-promoting sequence, induces exon skipping, and produces new mRNA in which the exon sequence has disappeared, thereby promoting the production of truncated dystrophin in the heart. be.
  • the ASO function-enhancing drug (e.g., dystrophin production-enhancing drug) of the present invention may be ASO alone, or may be formulated as a pharmaceutical composition together with any carrier, e.g., a pharmaceutically acceptable carrier. good too.
  • the function-enhancing drug is orally or parenterally administered to mammals (e.g., humans, rats, mice, guinea pigs, rabbits, sheep, horses, pigs, cows, dogs, cats, monkeys). parenteral administration is preferred. Therefore, a method for enhancing the function of ASO in the heart of a mammal (eg, a method for promoting dystrophin production), which comprises administering the ASO of the present invention to a mammal, is also provided.
  • Therapeutic drug for heart disease is fully incorporated for the specific structure of ASO contained in the ASO function-enhancing drug (eg, dystrophin production promoter) of the present invention.
  • a method for producing a therapeutic agent of the present invention comprising a step of synthesizing an oligonucleotide having a guanidine-bridged nucleoside of the present invention (hereinafter referred to as “this (sometimes referred to as the “process of the invention”) is provided.
  • the method for synthesizing oligonucleotides in the production method of the present invention is not particularly limited, and known methods can be adopted. Examples of such known methods include chemical synthesis methods such as the phosphoramidite method and the H-phosphonate method. In the chemical synthesis method, a commercially available automatic nucleic acid synthesizer can be used. Moreover, the amidite method is generally used for the chemical synthesis method.
  • the amidite is not particularly limited, and may be prepared by a known method (eg, the method described in WO 2014/046212), or a commercially available amidite may be used.
  • the present invention provides the following: A method for designing an antisense oligonucleotide with enhanced function, wherein at least one nucleoside constituting the oligonucleotide is represented by the following formula I or II:
  • Base represents a purin-9-yl group or a 2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl group optionally having one or more substituents selected from the ⁇ group, wherein
  • the ⁇ group is a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protecting group for nucleic acid synthesis, a linear alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a linear alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a mercapto group, or a protecting group for nucleic acid synthesis.
  • R 1 , R 12 , and R 13 each independently represent a hydrogen atom, an optionally branched or ring-forming alkyl group having 1 to 7 carbon atoms, or an amino group-protecting group, and R 14 is , representing a hydrogen atom)
  • substitution means substituting an oligonucleoside that constitutes a nucleotide that is the target (design source) of the design method of the present invention with an oligonucleoside represented by formula I or II above. Moreover, as long as the oligonucleoside after substitution has the same structure as the oligonucleoside represented by the above formula I or II, the oligonucleoside represented by the above formula I or II may be partially substituted.
  • Example 1 Design and Synthesis of Antisense Oligonucleotides for Evaluation
  • antisense oligonucleotides shown in Table 1 below were designed. 5 is 5-methylcytosine, Ln is LNA, Am is AmNA, Sc is scpBNA, Gu is GuNA (t-Bu), ⁇ indicates a phosphorothioate bond.
  • Antisense oligonucleotides were synthesized using an automatic nucleic acid synthesizer (nS-8 type, manufactured by Gene Design Co., Ltd.). Chain length extension used the standard phosphoramidite method. Sulfurization for phosphorothioate conversion uses DDTT (((dimethylamino-methylidene)amino)-3H-1,2,4-dithiazaoline-3-thione), etc., and the activator is 0.25 M Activator 42 (registered trademark) (catalog No. L031100, Sigma-Aldrich) and extended coupling time to 30 min.
  • DDTT ((dimethylamino-methylidene)amino)-3H-1,2,4-dithiazaoline-3-thione)
  • Example 2 Changes in systemic kinetics after single intravenous administration of antisense oligonucleotide to normal mice Japan SLC Co., Ltd.) was used. Animals are kept in open racks under an environment of temperature: 22-26°C, humidity: 40-65%, lighting time: 7:00-19:00 (12 hours), and all animals are fed with food and water. were given ad libitum.
  • antisense oligonucleotides administered intravenous in order to evaluate systemic kinetics.
  • a single injection was administered through the tail vein using a G injection needle.
  • Four sequences shown in Table 1 were used as antisense oligonucleotides.
  • PBS was administered as a control group.
  • An autopsy was performed 72 hours after a single intravenous administration of each antisense and PBS.
  • the animals were anesthetized with isoflurane inhalation anesthesia (concentration of anesthesia: 1.5-3.0%).
  • concentration of anesthesia 1.5-3.0%.
  • the abdomen was opened, and 0.15 mL of blood was collected from the retro-abdominal vena cava using a syringe containing EDTA-2K and a 23G injection needle, and temporarily stored under ice temperature.
  • the chest was opened, and 0.4 mL of blood was collected from the heart using a syringe containing 10,000 units/10 mL heparin sodium injection and a 23G needle, and temporarily stored under ice temperature.
  • Each blood sample was subjected to hematology and blood biochemistry tests. Thereafter, the abdominal aorta was dissected and exsanguinated to death. Liver, heart, muscle, and femoral skeletal muscle were excised. After measuring the weight of the organ, the excised organ was frozen in liquid nitrogen and stored at -60°C or lower.
  • RNA was extracted from the excised organs using an RNA extraction reagent (Sigma-Aldrich Japan, Tripure Isolation Reagent).
  • a reverse transcription reaction was performed using a reverse transcription reaction reagent (TOYOBO, ReverTra Ace qPCR RT kit). The reaction conditions were 37°C, 15 minutes ⁇ 98°C, 5 minutes.
  • a PCR amplification reaction was performed using a nucleic acid amplification reaction reagent (TOYOBO, THUNDERBIRD (registered trademark) Probe qPCR Mix).
  • the nucleic acid amplification reaction was carried out by temperature cycling of 92°C for 60 seconds ⁇ [(95°C for 15 seconds ⁇ 60°C for 60 seconds) x 45 cycles].
  • GPDH mouse glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
  • MALAT1 RNA MALAT1 RNA relative to the amount of GAPDH mRNA was evaluated.
  • the amount of RNA by each antisense oligonucleotide was shown as a relative value when the amount of RNA in the PBS-administered group (shown as CT in the drawing) was set to 1.
  • the primer set used is as follows: (Primer set for MALAT1 detection) TaqMan Gene Expression Assay Mm01227912_s1_4351370 (ThermoFisher Scientific) (Primer set for GAPDH detection) TaqMan Gene Expression Assay Mm99999915_g1_4448490 (ThermoFisher Scientific)
  • Example 3 Examination of ASO functions due to differences in nucleoside modification using normal mice
  • antisense oligonucleotides shown in Table 2 below were obtained.
  • 5 is 5-methylcytosine
  • Ln LNA
  • Am is AmNA
  • Sc is scpBNA
  • Gu GuNA (t-Bu)
  • indicates a phosphorothioate bond.
  • Each obtained antisense oligonucleotide was administered to BALB/cCrSlc (female, 8 weeks old, Japan SLC Co., Ltd.) by the same method as in Example 2, and then the liver and heart were excised.
  • the same method as in Example 2 was used to evaluate the amount of MALAT1 RNA relative to the amount of GAPDH mRNA.
  • the amount of RNA by each antisense oligonucleotide was shown as a relative value when the amount of RNA in the PBS-administered group (indicated as Vehicle in the drawings) was set to 1.
  • Example 4 Exon Skipping Assay Using SSO Containing GuNA(t-Bu) Modifications
  • SSO splicing control oligonucleotides shown in Table 3 below were obtained.
  • Ln is LNA
  • Om is 2′-O-methyl (2′-OMe)
  • Am is AmNA
  • Sc is scpBNA
  • Gu is GuNA (t-Bu)
  • indicates a phosphorothioate bond.
  • Each obtained SSO was prepared with Lipofectamine (registered trademark) 3000 (ThermoFisher SCIENTIFIC) to a final concentration of 150 nM, and placed in a 96-well plate (Sumitomo Bakelite) at a density of 2.0 x 103 cells/well. and added to C2C12 cells (obtained from the European Collection of Authenticated Cell Cultures) that had been previously induced to differentiate using AdipoInducer Reagent (Takara Bio Inc.). The plates were incubated at 37°C for 96 hours. After that, the cells were collected and RNA extraction was performed in the same manner as in Example 2.
  • Lipofectamine registered trademark
  • 3000 ThermoFisher SCIENTIFIC
  • RNA was used as a template.
  • a primary reverse transcription reaction was performed using a reverse transcription reaction reagent (Promega, Access RT-PCR System). The reaction conditions were temperature cycling of 45° C. for 45 minutes ⁇ 95° C. for 2 minutes ⁇ [(94° C. 30 seconds ⁇ 58° C. 60 seconds ⁇ 72° C. 120 seconds) ⁇ 30 cycles].
  • secondary nucleic acid amplification was carried out in the same manner as in the primary reverse transcription reaction. Amplification products were electrophoresed on an agarose gel and quantitative analysis was performed for exon 23 skipping.
  • the primer sets used are as follows.
  • the present invention enables the production of ASO that can exert its effect even on the heart.
  • the ASO is suitable as a therapeutic drug for heart disease, particularly heart disease caused by gene mutation, and is excellent in terms of production and cost.
  • ASO can also exert its effect on the heart, it is also useful as an agent for enhancing the function of ASO in the heart.

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Abstract

本発明は、下記式IまたはII: (式IまたはII中、 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり; R1、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す) で表されるヌクレオシドを1以上有するオリゴヌクレオチドを含む、心疾患の治療薬を提供する。

Description

心疾患治療薬
 本発明は、特定の修飾が付されたヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを含む心疾患の治療薬、該オリゴヌクレオチドを含むアンチセンスオリゴヌクレオチドの心臓における機能増強薬、およびそれらの製造方法等に関する。
 アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的となる核酸配列にハイブリダイズして遺伝子発現自体を抑制することで作用を発現する。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)のヌクレアーゼ耐性の向上や、標的核酸への結合親和性、特異性などの改善を目的として様々な人工核酸が開発・導入され、様々な製剤が上市されるようになった(例えば、特許文献1)。しかしながらこれまで開発されてきたASOは、ASO自体の特性あるいは人工核酸の特性から、肝臓や腎臓などの特定の臓器に集積する傾向がありこれらの臓器においては効果を示すものの、例えば、心臓においては所望する効果を発揮することができないことが知られており、使用用途や対象疾患が限られていた。
 最近、筋ジストロフィー等の特定の遺伝子変異に起因する心疾患の治療目的で、例えば、ASOにリガンドとしての脂肪酸を結合させる等の方法により、心臓においてASOの効果を発揮させる試みが為されている(非特許文献1)。
国際公開第2014/046212
Nucleic Acids Res. 2019 Jul 9; 47(12): 6029-6044.
 しかしながら、リガンドを結合させる該方法は、製造面において手間がかかり、またコスト面でも課題が残るものであった。したがって、本発明の課題は、脂肪酸等の特定の物質を結合させることなく心臓において効果を発揮することのできる、製造およびコスト面において優れたASOなどを提供することである。
 本発明者らは上記課題を解決するため鋭意検討を重ねた。その結果、驚くべきことにヌクレオチドの糖部の2’位と4’位との架橋にグアニジンを導入した修飾ヌクレオシドを有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)が、従来のASOでは効果が発揮し難い心臓でも効果を発揮し得ることを見出し、該修飾ヌクレオシドを有するASOを治療薬として用いることで心疾患の治療につながるとの着想を得た。かかる着想に基づき本発明者らはさらに鋭意検討し、本発明を完成するに至った。
 すなわち本発明は以下の通りである。
[1]
 下記式IまたはII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000004
(式IまたはII中、
 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
 R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
で表されるヌクレオシドを1以上有するオリゴヌクレオチドを含む、心疾患の治療薬。
[2]
 R12が、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数3から7の任意の分岐鎖アルキル基である、[1]に記載の治療薬。
[3]
 Rが、水素原子、または分岐もしくは環を形成していてもよい炭素数1から3のアルキル基であり、R13が、水素原子である、[1]または[2]に記載の治療薬。
[4]
 R12が、tert-ブチル基である、[1]~[3]のいずれか一つに記載の治療薬。
[5]
 前記心疾患が、心筋症である、[1]~[4]のいずれか一つに記載の治療薬。
[6]
 下記式IまたはII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000005
(式IまたはII中、
 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
 R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
で表されるヌクレオシドを1以上有するオリゴヌクレオチドを含む、心臓におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの機能増強薬。
[7]
 R12が同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数3から7の任意の分岐鎖アルキル基である、[6]に記載の増強薬。
[8]
 Rが、水素原子、または分岐もしくは環を形成していてもよい炭素数1から3のアルキル基であり、R13が、水素原子である、[6]または[7]に記載の増強薬。
[9]
 R12が、tert-ブチル基である、[6]~[8]のいずれか一つに記載の増強薬。
[10]
 心臓におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの機能増強薬が、心臓におけるジストロフィン産生促進薬である、[6]~[9]のいずれか一つに記載の増強薬。
[11]
 [1]~[5]のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチドを合成する工程を含む、心疾患の治療薬の製造方法。
[12]
 機能の増強したアンチセンスオリゴヌクレオチドの設計方法であって、オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオシドを、下記式IまたはII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000006
(式IまたはII中、
 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
 R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
で表されるオリゴヌクレオシドに置換することを含む、設計方法。
[13]
 哺乳動物に対し、下記式IまたはII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000007
(式IまたはII中、
 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
 R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
で表されるヌクレオシドを1以上有するオリゴヌクレオチドの有効量を投与することを特徴とする、哺乳動物の心疾患の治療方法。
[14]
 哺乳動物に対し、下記式IまたはII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000008
(式IまたはII中、
 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
 R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
で表されるヌクレオシドを1以上有するオリゴヌクレオチドを投与することを含む、哺乳動物の心臓におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの機能増強方法。
[15]
 哺乳動物の心臓におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの機能増強が、哺乳動物の心臓におけるジストロフィン産生促進である、[14]に記載の増強方法。
 本発明により、心臓でも効果を発揮し得るASOの製造が可能となる。また、該ASOは、心疾患、特に遺伝子の変異に起因する心疾患の治療薬として適しており、製造およびコスト面からも優れている。さらに、該ASOは、心臓でも効果を発揮し得るため、心臓においてASOの機能を増強し得うる。また、該ASOは、上記のような理由から、例えば、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの患者において、エクソンスキッピングにより、(短縮型)ジストロフィンの産生を促進し得る。
図1は、正常マウスにアンチセンスオリゴヌクレオチドを単回静脈内投与した時の各臓器におけるRNA(MALAT1)の量を示す。 図2は、正常マウスに修飾の異なるアンチセンスオリゴヌクレオチドを単回静脈内投与した時の肝臓におけるRNA(MALAT1)の量を示す。 図3は、正常マウスに修飾の異なるアンチセンスオリゴヌクレオチドを単回静脈内投与した時の心臓におけるRNA(MALAT1)の量を示す。 図4は、LNA修飾またはGuNA(t-Bu)修飾を含むスプライシング制御オリゴヌクレオチド(SSO)を用いたエクソンスキッピングアッセイの結果を示す。
1.心疾患の治療薬
 本発明は、ヌクレオチドの糖部の2’位と4’位との架橋にグアニジンを導入した修飾ヌクレオシド(以下、「グアニジン架橋型ヌクレオシド」ともいう。)を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)が、心臓でも効果を発揮し得ることを見出したことに基づいて完成した発明である。一態様において、本発明のASO従来の肝臓や筋肉における該ヌクレオチドの効果は維持され得る。
 具体的には、本発明により、下記式IまたはII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000009
(式IまたはII中、
 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
 R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
で表されるヌクレオシド(すなわち、グアニジン架橋型ヌクレオシド)を1以上(例:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上)有するオリゴヌクレオチド(以下、「本発明のASO」と称することがある。)を含む、心疾患の治療薬(以下、「本発明の治療薬」と称することがある。)が提供される。
 本明細書において、用語「炭素数1から6の直鎖アルキル基」は、炭素数1から6の任意の直鎖アルキル基をいい、具体的にはメチル基、エチル基、n-プロピル基、n-ブチル基、n-ペンチル基、またはn-ヘキシル基をいう。
 本明細書において、用語「炭素数1から6の直鎖アルコキシ基」は、炭素数1から6の任意の直鎖アルキル基を有するアルコキシ基を包含する。例えば、メトキシ基、エトキシ基、n-プロポキシ基などが挙げられる。
 本明細書において、用語「炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基」は、炭素数1から6の任意の直鎖アルキル基を有するアルキルチオ基を包含する。例えば、メチルチオ基、エチルチオ基、n-プロピルチオ基などが挙げられる。
 本明細書において、用語「炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基」は、炭素数1から6の任意の直鎖アルキル基を1つあるいは炭素数1から6の同一のまたは異なる任意の直鎖アルキル基を2つ有するアミノ基を包含する。例えば、メチルアミノ基、ジメチルアミノ基、エチルアミノ基、メチルエチルアミノ基、ジエチルアミノ基などが挙げられる。
 本明細書において、用語「分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基」は、炭素数1から7の任意の直鎖アルキル基、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数3から7の任意の分岐鎖アルキル基、炭素数3から7の任意の環状アルキル基および炭素数4から7のこれらの組み合わせを包含する。例えば、炭素数1から7の任意の直鎖アルキル基としては、メチル基、エチル基、n-プロピル基、n-ブチル基、n-ペンチル基、n-ヘキシル基、およびn-ヘプチル基が挙げられ、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数3から7の任意の分岐鎖アルキル基としては、イソプロピル基、イソブチル基、tert-ブチル基、イソペンチル基などが挙げられ、そして炭素数3から7の任意の環状アルキル基としては、シクロブチル基、シクロペンチル基、シクロヘキシル基などが挙げられる。
 本明細書において、用語「ハロゲン原子」としては、例えば、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、またはヨウ素原子が挙げられる。
 本明細書において、「核酸合成のアミノ基の保護基」、「核酸合成の保護基で保護された水酸基」、「核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基」、「核酸合成の保護基で保護されたアミノ基」内に記載される用語「保護基」とは、核酸合成の際に安定してアミノ基、水酸基、またはメルカプト基を保護し得るものであれば、特に制限されない。具体的には、酸性または中性条件で安定であり、加水素分解、加水分解、電気分解、および光分解のような化学的方法により開裂し得る保護基のことをいう。このような保護基としては、例えば、炭素数1から6のアルキル基;炭素数1から6のアルケニル基;アシル基;テトラヒドロピラニル基またはテトラヒドロチオピラニル基;テトラヒドロフラニル基またはテトラヒドロチオフラニル基;シリル基;炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたメチル基;炭素数1から6のアルコキシ基で置換された炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたメチル基;ハロゲン原子で置換された炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたメチル基;炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたエチル基;ハロゲン原子で置換されたエチル基;1から3個のアリール基で置換されたメチル基;炭素数1から6のアルキル基、炭素数1から6のアルコキシ基、ハロゲン原子および/またはシアノ基で置換された1から3個のアリール基で置換されたメチル基;炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたカルボニル基;ハロゲン原子、炭素数1から6のアルコキシ基および/またはニトロ基で置換されたアリール基;ハロゲン原子、シアノ基および/または炭素数1から6の3個のアルキル基で置換されたシリル基で置換された炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたカルボニル基;アルケニルオキシカルボニル基;炭素数1から6のアルコキシ基および/またはニトロ基で置換されたアリール基で置換されていてもよいアラルキルオキシカルボニル基;などが挙げられる。
 より具体的には、テトラヒドロピラニル基またはテトラヒドロチオピラニル基としては、テトラヒドロピラン-2-イル基、3-ブロモテトラヒドロピラン-2-イル基、4-メトキシテトラヒドロピラン-4-イル基、テトラヒドロチオピラン-4-イル基、4-メトキシテトラヒドロチオピラン-4-イル基などが挙げられる。テトラヒドロフラニル基またはテトラヒドロチオフラニル基としては、テトラヒドロフラン-2-イル基、テトラヒドロチオフラン-2-イル基が挙げられる。炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたメチル基としては、メトキシメチル基、1,1-ジメチル-1-メトキシメチル基、エトキシメチル基、プロポキシメチル基、イソプロポキシメチル基、ブトキシメチル基、t-ブトキシメチル基などが挙げられる。炭素数1から6のアルコキシ基で置換された炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたメチル基としては、2-メトキシエトキシメチル基などが挙げられる。ハロゲン原子で置換された炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたメチル基としては、2,2,2-トリクロロエトキシメチル基、ビス(2-クロロエトキシ)メチル基などが挙げられる。炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたエチル基としては、1-エトキシエチル基、1-(イソプロポキシ)エチル基などが挙げられる。ハロゲン原子で置換されたエチル基としては、2,2,2-トリクロロエチル基などが挙げられる。1から3個のアリール基で置換されたメチル基としては、ベンジル基、α-ナフチルメチル基、β-ナフチルメチル基、ジフェニルメチル基、トリフェニルメチル基、α-ナフチルジフェニルメチル基、9-アンスリルメチル基などが挙げられる。「炭素数1から6のアルキル基、炭素数1から6のアルコキシ基、ハロゲン原子および/またはシアノ基で置換された1から3個のアリール基で置換されたメチル基」としては、4-メチルベンジル基、2,4,6-トリメチルベンジル基、3,4,5-トリメチルベンジル基、4-メトキシベンジル基、4-メトキシフェニルジフェニルメチル基、4,4’-ジメトキシトリフェニルメチル基、2-ニトロベンジル基、4-ニトロベンジル基、4-クロロベンジル基、4-ブロモベンジル基、4-シアノベンジル基などが挙げられる。炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたカルボニル基としては、メトキシカルボニル基、エトキシカルボニル基、t-ブトキシカルボニル基、イソブトキシカルボニル基などが挙げられる。「ハロゲン原子、炭素数1から6のアルコキシ基および/またはニトロ基で置換されたアリール基」としては、4-クロロフェニル基、2-フロロフェニル基、4-メトキシフェニル基、4-ニトロフェニル基、2,4-ジニトロフェニル基などが挙げられる。「ハロゲン原子、シアノ基および/または3個の炭素数1から6のアルキル基で置換されたシリル基で置換された炭素数1から6のアルコキシ基で置換されたカルボニル基」としては、2,2,2-トリクロロエトキシカルボニル基、2-シアノエトキシカルボニル基、2-トリメチルシリルエトキシカルボニル基などが挙げられる。アルケニルオキシカルボニル基としては、ビニルオキシカルボニル基、アリールオキシカルボニル基などが挙げられる。「炭素数1から6のアルコキシ基および/またはニトロ基で置換されたアリール基で置換されていてもよいアラルキルオキシカルボニル基」としては、ベンジルオキシカルボニル基、9-フルオレニルメチルオキシカルボニル基、4-メトキシベンジルオキシカルボニル基、3,4-ジメトキシベンジルオキシカルボニル基、2-ニトロベンジルオキシカルボニル基、4-ニトロベンジルオキシカルボニル基などが挙げられる。
「核酸合成の保護基で保護された水酸基」の保護基としては、例えば、脂肪族アシル基;芳香族アシル基;1から3個のアリール基で置換されたメチル基;ハロゲン原子、炭素数1から6のアルコキシ基および/またはニトロ基で置換されたアリール基;炭素数1から6のアルキル基;または炭素数1から6のアルケニル基;が挙げられる。「核酸合成のアミノ基の保護基」としては、例えば、アシル基、ベンゾイル基が挙げられる。「核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基」の「保護基」としては、例えば、脂肪族アシル基または芳香族アシル基、ベンゾイル基が挙げられる。
 本明細書において、オリゴヌクレオチドには、薬理学上許容されるオリゴヌクレオチドの塩も含まれるものとする。該塩としては、ナトリウム塩、カリウム塩、リチウム塩のようなアルカリ金属塩、カルシウム塩、マグネシウム塩のようなアルカリ土類金属塩、アルミニウム塩、鉄塩、亜鉛塩、銅塩、ニッケル塩、コバルト塩などの金属塩;アンモニウム塩のような無機塩、t-オクチルアミン塩、ジベンジルアミン塩、モルホリン塩、グルコサミン塩、フェニルグリシンアルキルエステル塩、エチレンジアミン塩、N-メチルグルカミン塩、グアニジン塩、ジエチルアミン塩、トリエチルアミン塩、ジシクロヘキシルアミン塩、N,N’-ジベンジルエチレンジアミン塩、クロロプロカイン塩、プロカイン塩、ジエタノールアミン塩、N-ベンジル-フェネチルアミン塩、ピペラジン塩、テトラメチルアンモニウム塩、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン塩のような有機塩等のアミン塩;フッ化水素酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩のようなハロゲン原子化水素酸塩、硝酸塩、過塩素酸塩、硫酸塩、リン酸塩等の無機酸塩;メタンスルホン酸塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩のような炭素数1から6のアルカンで置換されたスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩のようなアリールスルホン酸塩、酢酸塩、リンゴ酸塩、フマル酸塩、コハク酸塩、クエン酸塩、酒石酸塩、シュウ酸塩、マレイン酸塩等の有機酸塩;グリシン塩、リジン塩、アルギニン塩、オルニチン塩、グルタミン酸塩、アスパラギン酸塩のようなアミノ酸塩を挙げられる。
 上述のグアニジン架橋型ヌクレオシドは、本発明の治療薬に含まれるオリゴヌクレオチドのいずれの位置にあってもよく、例えば、5’末端、あるいは3’末端でもよい。
 本発明の治療薬に含まれるオリゴヌクレオチドを構成するグアニジン架橋型ヌクレオシド以外のヌクレオシドとしては、例えば、下記式IVで表されるヌクレオシドなどが挙げられる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000010
 (式中、
 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり、そして
 Rは水素原子でありかつRは水素原子、ハロゲン原子、または炭素数1から6の直鎖アルコキシ基で置換されていてもよい炭素数1から6の直鎖アルコキシ基である。)
 また、RおよびRは一緒になって以下の式:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000011
 (式中、
 R21は、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数2から6のアルケニル基、前記α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよくそしてヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から10のアリール基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよくそしてヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール部分を有するアラルキル基、または核酸合成のアミノ基の保護基であり;
 R22およびR23は、それぞれ独立して、水素原子;ヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール基で置換されていてもよく、かつ分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルキル基;またはヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール部分を有するアラルキル基;であるか、あるいは
 R22およびR23は一緒になって、-(CH-[式中、qは2から5の整数である]を表し;
 R24およびR25は、それぞれ独立して、水素原子;水酸基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルキル基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルコキシ基;アミノ基;および核酸合成の保護基で保護されたアミノ基;からなる群から選択される基であるか、あるいは、
 R24およびR25は一緒になって、=C(R36)R37[式中、R36およびR37は、それぞれ独立して、水素原子、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
 R26およびR27は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基であり;
 R28は、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基であり;
 R29は、水素原子、水酸基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルコキシ基、アミノ基、あるいは核酸合成の保護基で保護されたアミノ基であり;
 R31、R32、およびR33は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルキル基、あるいは核酸合成のアミノ基の保護基であり;
 R34およびR35は、それぞれ独立して、水素原子、水酸基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から6のアルコキシ基、アミノ基、または核酸合成の保護基で保護されたアミノ基であり;
 mは0から2の整数であり;
 nは0から1の整数であり;
 pは0から1の整数であり;
 Xは、酸素原子、硫黄原子、またはアミノ基であり;そして
 Xは酸素原子または硫黄原子である]
で表される二価の基を表す。)を構成してもよく、かかる構成を有するヌクレオシドを架橋型ヌクレオシドと称することがある。
 より具体的には、上記架橋型ヌクレオシドとして、例えば、下記構造式を有するヌクレオシドなどが挙げられる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000012
 (式中、Rは、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数2から7のアルケニル基、ヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール基、ヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール部分を有するアラルキル基、または核酸合成のアミノ基の保護基を表す。好ましくは、Rは、水素原子、メチル基、エチル基、n-プロピル基、イソプロピル基、フェニル基、またはベンジル基であり、より好ましくは、Rは、水素原子またはメチル基である。Baseの定義は、上記式IVにおける定義と同一である。)
 本発明の治療薬に含まれるオリゴヌクレオチドを構成するヌクレオシドは、天然型のヌクレオシドであってもよく、かかる天然型のヌクレオシドとしては、アデノシン、N6-メチルアデノシン、グアノシン、ウリジン、5-メチルウリジン、シチジン、デオキシアデノシン、N6-メチル-2’-デオキシアデノシン、デオキシグアノシン、チミジン、デオキシウリジン、デオキシシチジン、5-メチル-2’-デオキシシチジンなどが挙げられる。
 本発明の治療薬に含まれるオリゴヌクレオチドの長さは、アンチセンス活性を有する限り特に限定されないが、典型的には10~50ヌクレオチド長であり、好ましくは10~30ヌクレオチド長であり、より好ましくは13~30ヌクレオチド長であり、さらに好ましくは15~20ヌクレオチド長である。
 本発明の治療薬に含まれるオリゴヌクレオチドを構成するヌクレオシドにおいて、2’位と4’位との架橋以外の修飾を、さらに施してもよい。かかる修飾としては、例えば、ホスホロチオエート修飾、糖部の2’-O-メトキシエチル修飾、糖部の2’-O-メチル修飾、糖部の2’フルオロ修飾、Base(塩基部)のメチル化またはアセチル化、Baseの置換などが挙げられるが、これらに限定されない。Baseを置換する場合には、置換する前のBaseの標的の(すなわち、該Baseと塩基対を形成する)塩基と、塩基対を形成できるものに置換することが好ましい。前記塩基対は、ワトソンクリック型塩基対だけでなく、フーグスティーン型塩基対やゆらぎ塩基対(Wobble base pair)であってもよい。
 本発明の治療薬に含まれるオリゴヌクレオチドは、該オリゴヌクレオチドの配列と相補的な配列を含む標的mRNA(本明細書において、mRNAには、pre-mRNAも含まれるものとする。)の機能(転写後修飾、翻訳など)を抑制するもの(以下、「抑制型ASO」と称することがある。)であってもよく、該機能を亢進するもの(以下、「亢進型ASO」と称することがある。)であってもよい。抑制型ASOは、典型的には、標的mRNAと二本鎖領域を形成し、該二本鎖領域がリボヌクレアーゼH(RNase H)により切断されることで、標的mRNAの機能を抑制することができる(このようなASOの機能を抑制型ASOの機能とも称する)。一方で亢進型ASOは、典型的には、スプライシング制御オリゴヌクレオチド(SSO)として、pre-mRNAのスプライシング促進配列と二本鎖領域を形成して該配列をマスクし、スプライシングをスキップさせることで、mRNAの機能を亢進(回復)することができる(これにより、機能的なタンパク質の細胞中での存在量が上昇することとなる)(このようなASOの機能を亢進型ASOの機能とも称する)。あるいは、標的mRNAに含まれる、該mRNAを分解する酵素の結合配列と二本鎖領域を形成して該配列をマスクし、該mRNAの分解を抑制することで、mRNAの機能を亢進することができる(このようなASOの機能も亢進型ASOの機能とも称する)。本明細書において、抑制型ASOの機能と、亢進型ASOの機能を総称して、「ASOの機能」または「アンチセンス活性」とも称する。
 本発明のASOは、標的mRNAの機能を抑制または亢進することができ、それにより遺伝子の発現を制御することができる。本明細書において「遺伝子の発現」とは、特にことわらない限り、少なくとも「標的mRNAにコードされた機能的なタンパク質の産生」を含む意味で用いられるが、さらに「標的mRNAの産生」をも含む意味で用いられる。したがって、遺伝子の発現抑制とは、本発明のASOの投与により、該遺伝子にコードされる機能的なタンパク質の細胞中での存在量が減少することだけでなく、該遺伝子から転写されるmRNAの細胞中での存在量が減少することも含んでいてもよい。同様に、遺伝子の発現亢進とは、本発明のASOの投与により、該遺伝子にコードされる機能的なタンパク質の細胞中での存在量が増加することだけでなく、該遺伝子から転写されるmRNAの細胞中での存在量が増加することも含んでいてもよい。
 抑制型ASOは、生体内での安定性および効率的なmRNAの切断の観点から、ギャップマー(Gapmer)型オリゴヌクレオチドであることが好ましい。本発明において「ギャップマー型オリゴヌクレオチド」とは、RNase Hにより認識される複数(例:5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15またはそれ以上)のヌクレオチドを有する内部領域(本明細書において、「ギャップ領域」と称することがある。)が、リボヌクレアーゼに対する耐性を付与するように修飾された少なくとも一つ(例:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上)のヌクレオチドを有する外部領域(本明細書において、3’側の外部領域を「3’ウイング領域」と、5’側の外部領域を「5’ウイング領域」と称することがある。)間に配置されるキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドを意味する。3’ウイング領域と5’ウイング領域の各領域を構成する少なくとも一つのヌクレオシドは、架橋型ヌクレオシドであることが好ましい。
 亢進型ASOは、生体内での安定性の観点から、RNaseに対する耐性を付与するように修飾されたヌクレオシドを少なくとも一つ有するものがよい。かかるASOは、すべてのヌクレオシド残基が修飾されたものであってもよく、一部のヌクレオシド残基が修飾されたもの(すなわち、ミックスマー(Mixmer)型オリゴヌクレオチド)であってもよい。かかる修飾されたヌクレオシドとしては、架橋型ヌクレオシドが好ましい。
 本明細書において、「心臓でも効果を発揮し得る」とは、グアニジン架橋型ヌクレオシドを有さないオリゴヌクレオチドと比較して、少なくとも心臓における標的mRNAの機能を抑制または亢進できることを意味する。また、「ヌクレオチドの効果が維持され得る」とは、グアニジン架橋型ヌクレオシドを有さないオリゴヌクレオチドと比較して、ASOの機能が維持されるか、向上されることを意味する。
 本発明において、「治療」には、症状の軽減や改善、病気や症状の進行、あるいは症状の顕在化の予防、遅延や停止も包含される。本発明の治療薬の対象疾患として、例えば、本発明のASOの標的mRNAにコードされるタンパク質の過剰発現または過剰蓄積、あるいは本発明のASOの標的mRNAにコードされるタンパク質の欠失または減少に起因する心疾患が挙げられる。また、本発明のASOの標的がエクソン内のスプライシング促進配列であり、スプライシング反応時に該ASOを導入することでスプライシング促進配列の機能が阻害されエクソンのスキッピングが誘導され、エクソンの配列が消失した新たなmRNAが産生されることで病態が改善するような心疾患も挙げられる。具体的には、例えば、心筋症(特発性心筋症、特定心筋症)等が挙げられる。特定心筋症としては、例えば、虚血性心筋疾患、炎症性心筋疾患、代謝性心筋疾患、全身性心筋疾患が挙げられ、全身性心筋疾患としては、例えば、ジストロフィン異常症(デュシェンヌ型(DMD)/ベッカー型(BMD)筋ジストロフィー)が挙げられる。例えば、デュシェンヌ型筋ジストロフィーであれば、ジストロフィン遺伝子(DMD遺伝子)から転写されたmRNA前駆体のスプライシング促進配列が本発明のASOの標的となる。
 本発明の治療薬として、有効量の本発明のASOを単独で用いてもよいし、任意の担体、例えば医薬上許容される担体とともに、医薬組成物として製剤化してもよい(製剤化したものを治療剤とも称する)。
 医薬上許容される担体としては、例えば、ショ糖、デンプン等の賦形剤、セルロース、メチルセルロース等の結合剤、デンプン、カルボキシメチルセルロース等の崩壊剤、ステアリン酸マグネシウム、エアロジル等の滑剤、クエン酸、メントール等の芳香剤、安息香酸ナトリウム、亜硫酸水素ナトリウム等の保存剤、クエン酸、クエン酸ナトリウム等の安定剤、メチルセルロース、ポリビニルピロリド等の懸濁剤、界面活性剤等の分散剤、水、生理食塩水等の希釈剤、ベースワックス等が挙げられるが、それらに限定されるものではない。
 本発明のASOの標的細胞内への導入を促進するために、本発明の治療薬は更に核酸導入用試薬を含んでいてもよい。該核酸導入用試薬としては、塩化カルシウム、Calcium enrichment試薬、アテロコラーゲン;リポソーム;ナノパーティクル;リポフェクチン、リプフェクタミン(lipofectamine)、DOGS(トランスフェクタム)、DOPE、DOTAP、DDAB、DHDEAB、HDEAB、ポリブレン、あるいはポリ(エチレンイミン)(PEI)等の陽イオン性脂質等を用いることができる。
 また、本発明の治療薬は、本発明のASOがリポソームに封入されてなる医薬組成物であってもよい。リポソームは、1以上の脂質二重層により包囲された内相を有する微細閉鎖小胞であり、通常は水溶性物質を内相に、脂溶性物質を脂質二重層内に保持することができる。本明細書において「封入」という場合には、本発明のASOはリポソーム内相に保持されてもよいし、脂質二重層内に保持されてもよい。本発明に用いられるリポソームは単層膜であっても多層膜であってもよく、また、粒子径は、例えば10~1000nm、好ましくは50~300nmの範囲で適宜選択できる。標的組織への送達性を考慮すると、粒子径は、例えば200nm以下、好ましくは100nm以下である。
 オリゴヌクレオチドのような水溶性化合物のリポソームへの封入法としては、リピドフィルム法(ボルテックス法)、逆相蒸発法、界面活性剤除去法、凍結融解法、リモートローディング法等が挙げられるが、これらに限定されず、任意の公知の方法を適宜選択することができる。
 本発明の医薬は、経口的に又は非経口的に、哺乳動物(例:ヒト、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ウマ、ブタ、ウシ、イヌ、ネコ、サル)に対して投与することが可能であるが、非経口的に投与するのが望ましい。よって、哺乳動物に対し、本発明のASOの有効量を投与することを特徴とする、該哺乳動物における心疾患の治療方法も提供される。
 非経口的な投与(例えば、皮下注射、筋肉注射、静脈内注入、局所注入(局所外用、局所塗布)、髄腔内投与、腹腔内投与など)に好適な製剤としては、水性及び非水性の等張な無菌の注射液剤があり、これには抗酸化剤、緩衝液、制菌剤、等張化剤等が含まれていてもよい。また、水性及び非水性の無菌の懸濁液剤が挙げられ、これには懸濁剤、可溶化剤、増粘剤、安定化剤、防腐剤等が含まれていてもよい。当該製剤は、アンプルやバイアルのように単位投与量あるいは複数回投与量ずつ容器に封入することができる。また、有効成分及び医薬上許容される担体を凍結乾燥し、使用直前に適当な無菌のビヒクルに溶解又は懸濁すればよい状態で保存することもできる。非経口的な投与に好適な別の製剤としては、噴霧剤等を挙げることができる。
 医薬組成物中の本発明のASOの含有量は、例えば、医薬組成物全体の約0.1ないし100重量%である。
 本発明の治療薬の投与量は、投与の目的、投与方法、対象疾患の種類、重篤度、投与対象の状況(性別、年齢、体重など)によって異なるが、例えば、成人に全身投与する場合、通常、本発明のASOの一回投与量として0.01mg/kg以上1000mg/kg以下、局所投与する場合、0.001mg/body以上100mg/body以下が望ましい。かかる投与量を1~10回、より好ましくは5~10回投与することが望ましい。
 本発明の治療薬は、例えば既に上市されている心疾患に対する治療薬と組み合わせて用いることもできる。これらの併用薬剤(組み合わせ医薬)は、本発明の医薬とともに製剤化して単一の製剤として投与することもできるし、あるいは、本発明の医薬とは別個に製剤化して、本発明の医薬と同一もしくは別ルートで、同時もしくは時間差をおいて投与することもできる。また、これらの併用薬剤の投与量は、該薬剤を単独投与する場合に通常用いられる量であってよく、あるいは通常用いられる量より減量することもできる。
2.ASOの機能増強薬
 別の態様において、本発明により、本発明のグアニジン架橋型ヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを1以上(例:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上)含む、ASOの機能増強薬またはASOの機能が増強した薬剤が提供される。
 本明細書において、ASOの機能の増強とは、本発明のASOの機能が、本発明で用いるヌクレオチドの糖部の2’位と4’位との架橋にグアニジンを導入した修飾ヌクレオシド(以下、「グアニジン架橋型ヌクレオシド」ともいう。)を有さないASOのものと比して、向上していることを意味する。
 本発明のASOの機能増強薬としては、例えば、本発明のグアニジン架橋型ヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを1以上(例:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上)含む、ジストロフィンの産生促進薬が挙げられる。
 本発明のジストロフィンの産生促進薬は、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの患者において、ジストロフィン遺伝子のmRNA前駆体におけるスプライシング促進配列を標的とするASOを含む。該ASOにより、スプライシング反応時に、スプライシング促進配列の機能が阻害されエクソンのスキッピングが誘導され、エクソンの配列が消失した新たなmRNAが産生され、その結果として、心臓において短縮型ジストロフィンの産生が促進される。
 本発明のASOの機能増強薬(例:ジストロフィンの産生促進薬)は、ASOを単独で用いてもよいし、任意の担体、例えば、医薬上許容される担体とともに、医薬組成物として製剤化してもよい。また、該機能増強薬は、経口的に又は非経口的に、哺乳動物(例:ヒト、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ウマ、ブタ、ウシ、イヌ、ネコ、サル)に対して投与することが可能であるが、非経口的に投与するのが望ましい。よって、哺乳動物に対し、本発明のASOを投与することを含む、該哺乳動物の心臓におけるASOの機能増強方法(例:ジストロフィンの産生促進方法)も提供される。
 本発明のASOの機能増強薬(例:ジストロフィンの産生促進薬)に含まれるASOの具体的な構造等の内容は、「1.心疾患の治療薬」の内容が全て援用される。
3.グアニジン架橋型ヌクレオシドを有するASOの製造方法
 別の態様において、本発明により、本発明のグアニジン架橋型ヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを合成する工程を含む、本発明の治療薬の製造方法(以下、「本発明の製法」と称することがある。)が提供される。
 本発明の製法におけるオリゴヌクレオチドの合成方法は、特に制限されず、公知の方法を採用することができる。かかる公知の方法として、例えば、ホスホロアミダイト法、H-ホスホネート法などの化学合成法が挙げられる。前記化学合成法において、市販の自動核酸合成機を使用することができる。また、前記化学合成法は、一般に、アミダイト法が使用される。前記アミダイトは、特に制限されず、公知の方法(例えば、国際公開第2014/046212号に記載の方法)により作製してもよく、市販のアミダイトを用いてもよい。
4.機能の増強したアンチセンスオリゴヌクレオチドの設計方法
 別の態様において、本発明により、以下:
 機能の増強したアンチセンスオリゴヌクレオチドの設計方法であって、オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオシドを、下記式IまたはII:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000013
(式IまたはII中、
 Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
 R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
で表されるオリゴヌクレオシドに置換することを含む、設計方法
が提供される。
 本発明において「置換」とは、本発明の設計方法の対象(設計元)となるヌクレオチドを構成するオリゴヌクレオシドを、上記式IまたはIIで表されるオリゴヌクレオシドへと置換することを意味する。また、置換後のオリゴヌクレオシドが上記式IまたはIIで表されるオリゴヌクレオシドと同じ構造になる限り、上記式IまたはIIで表されるオリゴヌクレオシドの一部の置換であってもよい。
 以下、実施例等により、本発明を詳しく説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
実施例1:評価用のアンチセンスオリゴヌクレオチドの設計と合成
 GuNA(t-Bu)修飾の効果を検討するために、下記の表1に示すアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計した。5は5-メチルシトシン、LnはLNA、AmはAmNA、ScはscpBNA、GuはGuNA(t-Bu)、^はホスホロチオエート結合を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000014
 アンチセンスオリゴヌクレオチドは、核酸自動合成機(nS-8型、株式会社ジーンデザイン製)を用いて合成した。鎖長の伸長は標準的なホスホロアミダイト法を用いた。ホスホロチオエート化のための硫化はDDTT(((dimethylamino-methylidene)amino)-3H-1,2,4-dithiazaoline-3- thione)等を使用し、アクチベーターは0.25 M Activator 42(登録商標)(カタログ番号L031100、シグマ-アルドリッチ)を用いて、カップリング時間を30分に延長して行った。塩基処理により固相担体からの切り出し及び脱保護を行ない、逆相HPLCおよび陰イオン交換クロマトグラフィーによる精製を行った。得られたアンチセンスオリゴヌクレオチドの純度及び構造をLC-MSによって確認した。
実施例2:正常マウスにアンチセンスオリゴヌクレオチドを単回静脈内投与した時の全身動態の変化
 アンチセンスオリゴヌクレオチドによる正常マウスへの単回静脈内投与試験には、BALB/cCrSlc(メス、8週齢、日本エスエルシー株式会社)を用いた。動物は、温度:22~26℃、湿度:40~65%、照明時間:7:00~19:00(12時間)の環境下のオープンラックにて飼育し、すべての動物は飼料及び水分を自由摂取させた。
 アンチセンスオリゴヌクレオチドのマウスへの投与は、全身動態の評価をすべく、静脈内投与とした。G注射針を用いて、尾静脈より単回投与した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは表1に示してある4配列を用いた。コントロール群としてPBSを投与した。
 各アンチセンス及び、PBSを単回静脈内投与後、72時間後に剖検を実施した。イソフルランの吸入麻酔 (麻酔の濃度:1.5-3.0%)にて麻酔した。全身麻酔下のマウスを開腹し、腹部後大静脈よりEDTA-2Kを加えたシリンジ及び23G注射針を用いて0.15 mLを目安に採血し、氷温下にて一時保管した。その後、開胸し、心臓より1万単位/10 mLヘパリンナトリウム注を加えたシリンジ及び23G注射針を用いて0.4 mLを目安に採血し、氷温下にて一時保管した。各採血液は、血液学検査及び血液生化学検査を実施した。その後、腹部大動脈を切開し、放血死させた。肝臓、心臓、筋肉、大腿部骨格筋を摘出した。摘出した臓器は、臓器重量を測定後、液体窒素にて凍結し、-60℃以下で保管した。
 摘出した臓器は、RNA抽出試薬(シグマアルドリッチジャパン、Tripure Isolation Reagent)を用いて、total RNAを抽出した。当該RNAを鋳型として、逆転写反応試薬(TOYOBO、ReverTra Ace qPCR RT kit)を用いて、逆転写反応を行った。反応条件は、37℃ 15分→98℃ 5分で行った。さらに当該cDNAを鋳型として、核酸増幅反応試薬(TOYOBO、THUNDERBIRD(登録商標) Probe qPCR Mix)を用いて、PCR増幅反応を行った。核酸増幅反応は、92℃ 60秒→[(95℃ 15秒→60℃ 60秒)×45サイクル]の温度サイクリングで行った。リアルタイムPCRでは、ハウスキーピング遺伝子のマウスグリセルアルデヒド-3-リン酸脱水素酵素(GAPDH)のmRNA量も同時に測定し、GAPDHのmRNA量に対するMALAT1のRNA量を評価した。各アンチセンスオリゴヌクレオチドによるRNA量は、PBS投与群(図面中、CTと示す)のRNA量を1とした場合の相対値にて示した。
 用いるプライマーセットは下記の通りである:
(MALAT1検出用プライマーセット)
TaqMan Gene Expression Assay Mm01227912_s1_4351370(ThermoFisher Scientific社)
(GAPDH検出用プライマーセット)
TaqMan Gene Expression Assay Mm99999915_g1_4448490(ThermoFisher Scientific社)
 その結果を図1に示す。LNA修飾を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを投与した場合、肝臓におけるRNA発現量はPBS投与群の約15%、筋肉におけるRNA発現量はPBS投与群の約40%まで抑制されているのに対し、心臓におけるRNA発現量は約60%までしか抑制されていなかった。それに対し、GuNA(t-Bu)修飾を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを投与した場合、肝臓や筋肉におけるRNA発現量は同程度であったのに対し、心臓におけるRNA発現量は約40%以下にまで抑制されていた。
 実施例3:正常マウスを用いたヌクレオシド修飾の違いによるASOの機能の検討
 実施例1と同様の方法により、下記の表2に示すアンチセンスオリゴヌクレオチドを取得した。5は5-メチルシトシン、LnはLNA、AmはAmNA、ScはscpBNA、GuはGuNA(t-Bu)、^はホスホロチオエート結合を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000015
 取得した各アンチセンスオリゴヌクレオチドを、実施例2と同様の方法により、BALB/cCrSlc(メス、8週齢、日本エスエルシー株式会社)に投与した後、肝臓及び心臓を摘出した。摘出した臓器について、実施例2と同様の方法により、GAPDHのmRNA量に対するMALAT1のRNA量を評価した。なお、各アンチセンスオリゴヌクレオチドによるRNA量は、PBS投与群(図面中、Vehicleと示す)のRNA量を1とした場合の相対値にて示した。
 その結果を図2及び3に示す。AmNA及びscpBNA修飾を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを投与した場合、肝臓におけるRNA発現量はPBS投与群の約40%まで抑制されていたのに対し、心臓におけるRNA発現量は約10%までしか抑制されていなかった。それに対し、AmNA、scpBNA、及びGuNA(t-Bu)修飾を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを投与した場合、肝臓におけるRNA発現量は、AmNA及びscpBNA修飾を含むASOと比して同程度あるいは多少低いもの(約30%)であったが、心臓におけるRNA発現量は約35%以下にまで抑制されていた。
 該結果から、各臓器、特に、心臓におけるASOの機能の増強を企図する場合、GuNA(t-Bu)修飾を用いることが有効であることが分かった。
 実施例4:GuNA(t-Bu)修飾を含むSSOを用いたエクソンスキッピングアッセイ
 実施例1と同様の方法により、下記の表3に示すスプライシング制御オリゴヌクレオチド(SSO)を取得した。LnはLNA、Omは2’-O-メチル(2’-OMe)、AmはAmNA、ScはscpBNA、GuはGuNA(t-Bu)、^はホスホロチオエート結合を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000016
 取得した各SSOを、Lipofectamine(登録商標)3000(ThermoFisher SCIENTIFIC社)で終濃度150 nMになるように調製し、96ウェルのプレート(住友ベークライト社)に2.0×10細胞/ウェルの密度で播種し、予め AdipoInducer Reagent (タカラバイオ社)を用いて分化誘導を行ったC2C12細胞(European Collection of Authenticated Cell Culturesより入手)中に添加した。該プレートを、37℃で96時間インキュベートした。その後、細胞を回収し、実施例2と同様の方法によりRNA抽出を行った。当該RNAを鋳型として、逆転写反応試薬(プロメガ社、 Access RT-PCR System )を用いて、1次逆転写反応を行った。反応条件は、45℃ 45分→95℃ 2分→[(94℃ 30秒→58℃ 60秒→72℃ 120秒)×30サイクル]の温度サイクリングで行った。さらに当該cDNAを鋳型として、1次逆転写反応と同様に2次核酸増幅を行った。増幅産物を、アガロースゲル上で電気泳動し、エクソン23スキッピングに関して定量解析を行った。なお、用いたプライマーセットは下記の通りである。
(1次 PCR プライマー)
Forward: CAGAATTCTGCCAATTGCTGAG (配列番号10)
Reverse: TTCTTCAGCTTGTGTCATCC (配列番号11)
(2次 PCRプライマー)
Forward: CCCAGTCTACCACCCTATCAGAGC (配列番号12)
Reverse: CCTGCCTTTAAGGCTTCCTT (配列番号13)
 その結果を図4に示す。LNA修飾を含むSSO(LX-A5669)は、エクソン23のスキッピングを約5%(平均値)の割合で誘導した。それに対し、GuNA(t-Bu)修飾を含むSSO(LX-A6783、及びLX-A6784)は、エクソン23のスキッピングを、それぞれ約34%(平均値)、及び約45%(平均値)の割合で誘導した。該結果から、GuNA(t-Bu)修飾を用いることで、エクソンスキッピングの誘導効率をより高めることができることが分かった。
 本発明により、心臓でも効果を発揮し得るASOの製造が可能となる。また、該ASOは、心疾患、特に遺伝子の変異に起因する心疾患の治療薬として適しており、製造およびコスト面からも優れている。さらに、該ASOは、心臓でも効果を発揮し得るため、心臓におけるASOの機能増強薬としても有用である。
 本出願は、日本で出願された特願2021-088132(出願日:2021年5月26日)を基礎としており、その内容は本明細書に全て包含されるものである。

Claims (12)

  1.  下記式IまたはII:
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001
    (式IまたはII中、
     Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
     R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
    で表されるヌクレオシドを1以上有するオリゴヌクレオチドを含む、心疾患の治療薬。
  2.  R12が、同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数3から7の任意の分岐鎖アルキル基である、請求項1に記載の治療薬。
  3.  Rが、水素原子、または分岐もしくは環を形成していてもよい炭素数1から3のアルキル基であり、R13が、水素原子である、請求項1または2に記載の治療薬。
  4.  R12が、tert-ブチル基である、請求項1~3のいずれか一項に記載の治療薬。
  5.  前記心疾患が、心筋症である、請求項1~4のいずれか一項に記載の治療薬。
  6.  下記式IまたはII:
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000002
    (式IまたはII中、
     Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
     R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
    で表されるヌクレオシドを1以上有するオリゴヌクレオチドを含む、心臓におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの機能増強薬。
  7.  R12が同一のまたは異なる分岐鎖を有する炭素数3から7の任意の分岐鎖アルキル基である、請求項6に記載の増強薬。
  8.  Rが、水素原子、または分岐もしくは環を形成していてもよい炭素数1から3のアルキル基であり、R13が、水素原子である、請求項6または7に記載の増強薬。
  9.  R12が、tert-ブチル基である、請求項6~8のいずれか一項に記載の増強薬。
  10.  心臓におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの機能増強薬が、心臓におけるジストロフィン産生促進薬である、請求項6~9のいずれか一項に記載の増強薬。
  11.  請求項1~5のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドを合成する工程を含む、心疾患の治療薬の製造方法。
  12.  機能の増強したアンチセンスオリゴヌクレオチドの設計方法であって、オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオシドを、下記式IまたはII:
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000003
    (式IまたはII中、
     Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン-9-イル基または2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
     R、R12、およびR13は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、アミノ基の保護基を表し、そしてR14は、水素原子を表す)
    で表されるオリゴヌクレオシドに置換することを含む、設計方法。
     

     
PCT/JP2022/021330 2021-05-26 2022-05-25 心疾患治療薬 WO2022250072A1 (ja)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2021-088132 2021-05-26
JP2021088132 2021-05-26

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2022250072A1 true WO2022250072A1 (ja) 2022-12-01

Family

ID=84229876

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2022/021330 WO2022250072A1 (ja) 2021-05-26 2022-05-25 心疾患治療薬

Country Status (1)

Country Link
WO (1) WO2022250072A1 (ja)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014046212A1 (ja) * 2012-09-21 2014-03-27 国立大学法人大阪大学 グアニジン架橋を有する人工ヌクレオシドおよびオリゴヌクレオチド
WO2017047816A1 (ja) * 2015-09-18 2017-03-23 田辺三菱製薬株式会社 架橋型核酸GuNA、その製造方法および中間体化合物

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014046212A1 (ja) * 2012-09-21 2014-03-27 国立大学法人大阪大学 グアニジン架橋を有する人工ヌクレオシドおよびオリゴヌクレオチド
WO2017047816A1 (ja) * 2015-09-18 2017-03-23 田辺三菱製薬株式会社 架橋型核酸GuNA、その製造方法および中間体化合物

Non-Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
AJAYA R. SHRESTHA, YUTARO KOTOBUKI, YOSHIYUKI HARI, SATOSHI OBIKA: "Guanidine bridged nucleic acid (GuNA): an effect of a cationic bridged nucleic acid on DNA binding affinity", CHEMICAL COMMUNICATIONS, ROYAL SOCIETY OF CHEMISTRY, UK, vol. 50, no. 5, 1 January 2014 (2014-01-01), UK , pages 575 - 577, XP055246151, ISSN: 1359-7345, DOI: 10.1039/C3CC46017G *
KUMAGAI SHINJI, SAWAMOTO HIROAKI, TAKEGAWA-ARAKI TOMO, ARAI YUUKI, YAMAKOSHI SHUHEI, YAMADA KATSUYA, OHTA TETSUYA, KAWANISHI EIJI,: "Synthesis and properties of GuNA purine/pyrimidine nucleosides and oligonucleotides", ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY, ROYAL SOCIETY OF CHEMISTRY, vol. 18, no. 46, 7 December 2020 (2020-12-07), pages 9461 - 9472, XP093008825, ISSN: 1477-0520, DOI: 10.1039/D0OB01970D *
MASAKI YAMAGAMI, TAKURO KOBORI, TAKAO SUZUKI, KAZUO SEKIGUCHI, HIDEAKI SATO, NAOHIRO HORIE, RYUSUKE HATANAKA, TAKAO YAMAGUCHI, SAT: "Synthesis and Properties of Antisense Oligonucleotides Containing AmNA and GuNA", THE 46TH INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON NUCLEIC ACIDS CHEMISTRY 2019. THE 3RD ANNUAL MEETING OF JAPAN SOCIETY OF NUCLEIC ACIDS CHEMISTRY. ISNAC 2019; OCTOBER 29-31, 2019, JAPAN SOCIETY OF NUCLEIC ACIDS CHEMISTRY, JP, vol. 46, 1 January 2019 (2019-01-01) - 31 October 2019 (2019-10-31), JP, pages 184 - 185, XP009541587 *
MIYASAKA, YUI ET AL.: "2P-23 The knockdown activity of GuNA[t-Bu]-gapmer antisense oligonucleotides in heart", ABSTRACTS OF THE 6TH ANNUAL MEETING OF THE JAPANESE SOCIETY OF NUCLEIC ACID MEDICINE; JUNE 27 - JUNE 29, 2020, JAPANESE SOCIETY OF NUCLEIC ACID MEDICINE, JP, 18 June 2021 (2021-06-18) - 29 June 2020 (2020-06-29), JP, pages 155, XP009541528 *
NAOHIRO HORIE, SHINJI KUMAGAI, YUTARO KOTOBUKI, TAKAO YAMAGUCHI, SATOSHI OBIKA: "Facile synthesis and fundamental properties of an N -methylguanidine-bridged nucleic acid (GuNA[NMe])", ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY, ROYAL SOCIETY OF CHEMISTRY, vol. 16, no. 35, 1 January 2018 (2018-01-01), pages 6531 - 6536, XP055754022, ISSN: 1477-0520, DOI: 10.1039/C8OB01307A *
YOKO HIRAKAWA, FUMIKO YAMAIRI, TAKASHI KURITA, KARIN MURAHASHI, TAKASHI TATEOKA, TETSUYA OTA, TAKASHI SASAKI, JUN KODERA, SATOSHI : "P-069 Evaluation of biological activity and safety of guanidine-bridged artificial nucleic acid (GuNA)-loaded Malat1 antisense oligonucleotides", ABSTRACTS OF THE 5TH ANNUAL MEETING OF THE NUCLEIC ACID MEDICINE SOCIETY OF JAPAN; JULY 10-12, 2019, NUCLEIC ACID MEDICINE SOCIETY OF JAPAN, JP, 1 January 2019 (2019-01-01) - 12 July 2019 (2019-07-12), JP, pages 149, XP009541527 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TWI783434B (zh) 治療性化合物之標靶性配體
JP6233903B2 (ja) 架橋型ヌクレオシドおよびヌクレオチド
JP2024009262A (ja) Lpaの遺伝子発現の阻害のための組成物及び方法
JP2022519019A (ja) オリゴヌクレオチド組成物及びその方法
EP4153604A1 (en) Oligonucleotide compositions and methods thereof
KR20180008591A (ko) 펩티드 올리고뉴클레오티드 콘주게이트
JP2002510319A (ja) オリゴヌクレオチドの消化管を介したデリバリーのための組成物及び方法
BR112016020618B1 (pt) Oligômero antissentido, composição farmacêutica, e, uso de um oligômero antissentido
JPH072889A (ja) 2’−エーテル基を有するヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド
JP4787409B2 (ja) 治療用ホスホジエステラーゼ阻害剤
NZ501696A (en) Method for large-scale production of sodium and ammonium salts of di(uridine 5')-tetraphosphate
US11466274B2 (en) Modified gapmer oligonucleotides and methods of use
JP7190794B2 (ja) 核酸医薬及び多分岐脂質の複合体
BR112020022620A2 (pt) conjugados de oligonucleotídeos que compreendem nucleosídeos de açúcar 7'-5'-alfa-anomérico-bicíclicos
JP7138349B2 (ja) 核酸化合物およびオリゴヌクレオチド
BR112020018902A2 (pt) oligonucleotídeo antissenso com toxicidade reduzida
TW202019442A (zh) 用於反義遞送之三聚合肽
BR122020018622A2 (pt) Molécula de ácido nucleico para redução de papd5 e papd7 de mrna para o tratamento de infecção hepatite b
US20220145304A1 (en) Modified micrornas and their use in the treatment of cancer
TW202227135A (zh) 用於遞送治療劑之脂質結合物
EP1813623A1 (en) Purinenucleoside derivative modified in 8-position and medicinal use thereof
TW201728341A (zh) 肽寡核苷酸結合物
WO2022250072A1 (ja) 心疾患治療薬
WO2022234855A1 (ja) 中枢毒性が低減したオリゴヌクレオチドの設計方法
WO2015125845A1 (ja) 含窒素非芳香族複素環を含む核酸のリン酸部位修飾

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 22811342

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 22811342

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1