JP6562517B2 - 架橋型ヌクレオシドおよびヌクレオチド - Google Patents
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Description
Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン−9−イル基または2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
R2およびR3は、それぞれ独立して、水素原子、核酸合成の水酸基の保護基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数2から7のアルケニル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよくそしてヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよくそしてヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール部分を有するアラルキル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいアシル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいシリル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいリン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、−P(R4)R5[式中、R4およびR5は、それぞれ独立して、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
R6およびR7は、それぞれ独立して、水素原子;水酸基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基;アミノ基;および核酸合成の保護基で保護されたアミノ基;からなる群から選択される基であるか、あるいは、R6およびR7は一緒になって、=C(R10)R11[式中、R10およびR11は、それぞれ独立して、水素原子、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
R8およびR9は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基を表し;そして
Xは酸素原子または硫黄原子である)である。
Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン−9−イル基または2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
R6およびR7は、それぞれ独立して、水素原子;水酸基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基;アミノ基;および核酸合成の保護基で保護されたアミノ基;からなる群から選択される基であるか、あるいは、R6およびR7は一緒になって、=C(R10)R11[式中、R10およびR11は、それぞれ独立して、水素原子、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
R8およびR9は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基を表し;そして
Xは酸素原子または硫黄原子である)である。
「Base」は、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン−9−イル基または2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
R2およびR3は、それぞれ独立して、水素原子、核酸合成の水酸基の保護基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数2から7のアルケニル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよくそしてヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよくそしてヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール部分を有するアラルキル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいアシル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいシリル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいリン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、−P(R4)R5[式中、R4およびR5は、それぞれ独立して、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
R6およびR7は、それぞれ独立して、水素原子;水酸基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基;アミノ基;および核酸合成の保護基で保護されたアミノ基;からなる群から選択される基であるか、あるいは、R6およびR7は一緒になって、=C(R10)R11[式中、R10およびR11は、それぞれ独立して、水素原子、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
R8およびR9は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基を表し;そして
Xは酸素原子または硫黄原子である)で表される構造を有する。
実施例1.7、実施例2.3および実施例3.5、ならびに比較例1で得られた化合物8(エキソメチレン体)、化合物11((R)−メチル体)、化合物16((S)−メチル体)ならびにEoNAを、それぞれアミダイトブロックとして用い、これらとdmC(Ac)およびTのホスホロアミダイト(いずれもシグマ−アルドリッチ社製)との0.1Mの無水アセトニトリル溶液を調製し、nS−8 Oligonucleotides Synthesizer(株式会社ジーンデザイン製オリゴヌクレオチド合成装置)を用いて、当該分野において公知のホスホロアミダイト法に従って、表17に示す各オリゴヌクレオチドの合成を行った(ここで、Xは実施例1.7で得られた化合物8(エキソメチレン体)に由来する構造に相当し、Yは実施例2.3で得られた化合物11((R)−メチル体)に由来する構造に相当し、Zは実施例3.5で得られた化合物16((S)−メチル体)に由来する構造に相当し、Wは比較例1で得られたEoNAに由来する構造に相当する)。
溶離液
・A液:0.1M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液(pH7.0)
・B液:0.1M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液/アセトニトリル=1:1
グラジエント
・B液濃度: 16〜32%(30分間)
カラム
・Waters社製XBridgeTM OST C18 2.5μm(10×50mm)(精製)
・Waters社製XBridgeTM OST C18 2.5μm(4.6×50mm)(純度確認)
流速
・3.0mL/分(精製)
・1.0mL/分(純度確認)
カラム温度
・50℃
検出
・UV(260nm)
終濃度をカコジル酸ナトリウム緩衝液(pH 7.2)10mM、塩化カリウム140mM、実施例4で得られたオリゴヌクレオチド4μM、および表17に示される一本鎖RNAまたは一本鎖DNA4μMを含むサンプル溶液(130μL)を沸騰水中に浴し、室温までゆっくりと冷ました後、各サンプル溶液を15℃まで冷却して融解温度(Tm)の測定を開始した。毎分0.5℃の割合で95℃まで昇温し、0.5℃間隔で260nmにおける吸光度をSHIMADZU UV−1650PC、SHIMADZU UV−1800 spectrometers(株式会社島津製作所製)を用いて測定し、プロットした。Tm値は全て中線法で算出し、3回の独立した測定結果の平均値とした。
終濃度をカコジル酸ナトリウム緩衝液(pH 7.2)10mM、塩化カリウム140mM、塩化マグネシウム5mM、実施例4で得られたオリゴヌクレオチド1.5μM、および表18に示される二本鎖DNA1.5μMを含むサンプル溶液(130μL)を沸騰水中に浴し、室温までゆっくりと冷ました後、各サンプル溶液を15℃まで冷却して融解温度(Tm)の測定を開始した。毎分0.5℃の割合で90℃まで昇温し、0.5℃間隔で260nmにおける吸光度をSHIMADZU UV−1650PC、SHIMADZU UV−1800 spectrometers(株式会社島津製作所製)を用いて測定し、プロットした。Tm値は全て中線法で算出し、3回の独立した測定結果の平均値とした。
実施例1.7で得られた化合物8(エキソメチレン体)、実施例2.3で得られた化合物11((R)−メチル体)、実施例3.5で得られた化合物16((S)−メチル体)、チミジン(天然体)、LNAおよびENAを、それぞれアミダイトブロックとして用いたこと以外は、実施例4と同様にして当該分野において公知のホスホロアミダイト法に従って、以下に示すオリゴヌクレオチドの合成を行った。
終濃度をそれぞれTris−HCl緩衝液(pH8.0)50mM、塩化マグネシウム10mM、実施例7で得られた各オリゴヌクレオチド7.5μM、3’−エキソヌクレアーゼ(Crotalus Admanteus Venom Phosphodiesterase:CAVP,Pharmacia Biotech社製)1.5μg/mLとしたサンプル溶液(100μL)を、37℃に保ち反応を行った。経時的に反応液の一部(20μL)を採取し、90℃で2分間加熱して酵素を失活させ、オリゴヌクレオチドの残量を、HPLC(SHIMADZU社製LC−20AT、SPD−20A、CTO−20A、CBM−20A)により定量した。
溶離液
・A液:0.1M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液(pH7.0)
・B液:0.1M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液/アセトニトリル=1:1
グラジエント
・B液濃度: 12〜24%(15分間) (天然体、LNA)
12〜24%(30分間) (ENA)
14〜26%(15分間) (エキソメチレン体、(R)−メチル体、(S)−メチル体)
カラム
・Waters社製XBridgeTM Shield RP18(4.6×50mm)(天然体、LNA、エキソメチレン体、(R)−メチル体、(S)−メチル体)
・Waters社製XBridgeTM Shield RP18(4.6×50mm)を2本連結(ENAのみ)
流速
・1.0mL/分
カラム温度
・50℃
検出
・UV(260nm)
実施例9.4、実施例10.6および実施例11.6で得られた化合物20(無置換体)、化合物26((R)−メチル−エキソメチレン体)、および化合物32((S)−メチル−エキソメチレン体)を、それぞれアミダイトブロックとして用い、これらとdmC(Ac)およびTのホスホロアミダイト(いずれもシグマ−アルドリッチ社製)との0.1Mの無水アセトニトリル溶液を調製し、nS−8 Oligonucleotides Synthesizer(株式会社ジーンデザイン製オリゴヌクレオチド合成装置)を用いて、当該分野において公知のホスホロアミダイト法に従って、表35に示す各オリゴヌクレオチドの合成を行った(ここで、Qは実施例9.4で得られた化合物20(無置換体)に由来する構造に相当し、Rは実施例10.6で得られた化合物26((R)−メチル−エキソメチレン体)に由来する構造に相当し、Sは実施例11.6で得られた化合物32((S)−メチル−エキソメチレン体)に由来する構造に相当する)。
溶離液
・A液:0.1M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液(pH7.0)
・B液:0.1M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液/アセトニトリル=1:1
グラジエント
・B液濃度: 16〜32%(30分間)
カラム
・Waters社製XBridgeTM OST C18 2.5μm(10×50mm)(精製)
・Waters社製XBridgeTM OST C18 2.5μm(4.6×50mm)(純度確認)
流速
・3.0mL/分(精製)
・1.0mL/分(純度確認)
カラム温度
・50℃
検出
・UV(260nm)
終濃度をカコジル酸ナトリウム緩衝液(pH 7.2)10mM、塩化カリウム140mM、実施例12で得られたオリゴヌクレオチド4μM、および表35に示される一本鎖RNAまたは一本鎖DNA4μMを含むサンプル溶液(130μL)を沸騰水中に浴し、室温までゆっくりと冷ました後、各サンプル溶液を15℃まで冷却して融解温度(Tm)の測定を開始した。毎分0.5℃の割合で95℃まで昇温し、0.5℃間隔で260nmにおける吸光度をSHIMADZU UV−1650PC、SHIMADZU UV−1800 spectrometers(株式会社島津製作所製)を用いて測定し、プロットした。Tm値は全て中線法で算出し、3回の独立した測定結果の平均値とした。
終濃度をカコジル酸ナトリウム緩衝液(pH 7.2)10mM、塩化カリウム140mM、塩化マグネシウム5mM、実施例12で得られたオリゴヌクレオチド1.5μM、および表36に示されるヘアピン二本鎖DNA1.5μMを含むサンプル溶液(130μL)を沸騰水中に浴し、室温までゆっくりと冷ました後、各サンプル溶液を15℃まで冷却して融解温度(Tm)の測定を開始した。毎分0.5℃の割合で90℃まで昇温し、0.5℃間隔で260nmにおける吸光度をSHIMADZU UV−1650PC、SHIMADZU UV−1800 spectrometers(株式会社島津製作所製)を用いて測定し、プロットした。Tm値は全て中線法で算出し、3回の独立した測定結果の平均値とした。
実施例1.7で得られた化合物8(エキソメチレン体)、実施例2.3で得られた化合物11((R)−メチル体)、実施例3.5で得られた化合物16((S)−メチル体)、実施例9.4で得られた化合物20(無置換体)、実施例10.6で得られた化合物26((R)−メチル−エキソメチレン体)、実施例11.6で得られた化合物32((S)−メチル−エキソメチレン体)、チミジン(天然体)、およびENAを、それぞれアミダイトブロックとして用いたこと以外は、実施例4と同様にして当該分野において公知のホスホロアミダイト法に従って、以下に示すオリゴヌクレオチドの合成を行った。
終濃度をそれぞれTris−HCl緩衝液(pH8.0)50mM、塩化マグネシウム10mM、実施例15で得られた各オリゴヌクレオチド7.5μM、3’−エキソヌクレアーゼ(Crotalus Admanteus Venom Phosphodiesterase:CAVP,Pharmacia Biotech社製)2.5μg/mLとしたサンプル溶液(100μL)を、37℃に保ち反応を行った。経時的に反応液の一部(20μL)を採取し、90℃で2分間加熱して酵素を失活させ、オリゴヌクレオチドの残量を、HPLC(SHIMADZU社製LC−20AT、SPD−20A、CTO−20A、CBM−20A)により定量した。
溶離液
・A液:0.1M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液(pH7.0)
・B液:0.1M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液/アセトニトリル=1:1
グラジエント
・B液濃度: 12〜24%(15分間) (天然体、無置換体)
12〜24%(30分間) (ENA)
14〜26%(15分間) (エキソメチレン体、(R)−メチル体、(S)−メチル体、(R)−メチル−エキソメチレン体、(S)−メチル−エキソメチレン体)
カラム
・Waters社製XBridgeTM Shield RP18(4.6×50mm)(天然体、エキソメチレン体、(R)−メチル体、(S)−メチル体、(R)−メチル−エキソメチレン体、(S)−メチル−エキソメチレン体)
・Waters社製XBridgeTM Shield RP18(4.6×50mm)を2本連結(ENAのみ)
流速
・1.0mL/分
カラム温度
・50℃
検出
・UV(260nm)
本実施例では、4種の塩基(A、T、GおよびC)で構成されるオリゴヌクレオチドにおいて、以下の人工核酸のいずれかを取り込ませた。実施例1.7で得られた化合物8(エキソメチレン体)、実施例2.3で得られた化合物11((R)−メチル体)、実施例3.5で得られた化合物16((S)−メチル体)、実施例9.4で得られた化合物20(無置換体)、実施例10.6で得られた化合物26((R)−メチル−エキソメチレン体)、実施例11.6で得られた化合物32((S)−メチル−エキソメチレン体)、チミジン(天然体)、LNAおよびENAを、それぞれアミダイトブロックとして用いたこと以外は、実施例4と同様にして当該分野において公知のホスホロアミダイト法に従って、以下に示すオリゴヌクレオチドの合成を行った。天然体の場合、オリゴヌクレオチドの配列は、5’−d(TTCAGCATTGGTATTC)−3’(配列番号5)である。
本実施例では、実施例17で得られた各オリゴヌクレオチドについて、標的鎖として5’−r(GAAUACCAAUGCUGAA)−3’(配列番号6)の一本鎖オリゴRNAと二重鎖形成させ、当該RNAとの融解温度を測定した。
4.51×105細胞/mLに調製したHuh−7(ヒト肝癌細胞株:PS20)を96ウェル平底マイクロプレート(IWAKI)に播種し、37℃にて5%CO2下で24時間培養した。各アンチセンス核酸分子が最終濃度100nMもしくは400nMとなるように、Lipofectamine 3000(Life Technologies社製)およびOpti−MEM(Life Technologies社製)をさらに添加して混合し、室温にて15分間静置した後、各ウェルに添加した。実施例17で得られた各オリゴヌクレオチドを添加し、24時間後に細胞を回収した。なお、コントロールとして、オリゴヌクレオチド無添加で同じ処理を行った。細胞の回収は、SuperPrep(登録商標) Cell Lysis & RT Kit for qPCR(東洋紡績株式会社製)を用いて行った。また、このキットを用いてトータルRNAの回収を行った。
Hs_ApoB_Fw :GGCTCACCCTGAGAGAAGTG(配列番号8)
Hs_ApoB_Rv :GCTGCTTTCTGGAACCTCAC(配列番号8)
Hs_GAPDH_Fw:GGCCTCCAAGGAGTAAGACC(配列番号9)
Hs_GAPDH_Rv:AGGGGTCTACATGGCAACTG(配列番号10)
Claims (6)
- 以下の式(I)または(I’)で表される化合物またはその塩:
Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン−9−イル基または2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
R2およびR3は、それぞれ独立して、水素原子、核酸合成の水酸基の保護基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数2から7のアルケニル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよくそしてヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよくそしてヘテロ原子を含んでいてもよい炭素数3から12のアリール部分を有するアラルキル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいアシル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいシリル基、該α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいリン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、−P(R4)R5[式中、R4およびR5は、それぞれ独立して、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
R6およびR7は、それぞれ独立して、水素原子;水酸基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基;アミノ基;および核酸合成の保護基で保護されたアミノ基;からなる群から選択される基であるか、あるいは、R6およびR7は一緒になって、=C(R10)R11[式中、R10およびR11は、それぞれ独立して、水素原子、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
R8およびR9は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基を表し;そして
Xは酸素原子または硫黄原子であり、ただし、R6、R7、R8およびR9がともに水素原子である場合を除く)。 - 前記式(I)または(I’)において、Xが酸素原子である、請求項1に記載の化合物またはその塩。
- 前記式(I)または(I’)において、前記Baseが、6−アミノプリン−9−イル基、2,6−ジアミノプリン−9−イル基、2−アミノ−6−クロロプリン−9−イル基、2−アミノ−6−フルオロプリン−9−イル基、2−アミノ−6−ブロモプリン−9−イル基、2−アミノ−6−ヒドロキシプリン−9−イル基、6−アミノ−2−メトキシプリン−9−イル基、6−アミノ−2−クロロプリン−9−イル基、6−アミノ−2−フルオロプリン−9−イル基、2,6−ジメトキシプリン−9−イル基、2,6−ジクロロプリン−9−イル基、6−メルカプトプリン−9−イル基、2−オキソ−4−アミノ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、4−アミノ−2−オキソ−5−フルオロ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、4−アミノ−2−オキソ−5−クロロ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、2−オキソ−4−メトキシ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、2−オキソ−4−メルカプト−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、2−オキソ−4−ヒドロキシ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、2−オキソ−4−ヒドロキシ−5−メチル−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、または4−アミノ−5−メチル−2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基である、請求項1または2に記載の化合物またはその塩。
- 前記式(I)または(I’)において、前記Baseが、2−オキソ−4−ヒドロキシ−5−メチル−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基である、請求項3に記載の化合物またはその塩。
- 以下の式(II)または(II’)で表されるヌクレオシド構造を少なくとも1つ含有するオリゴヌクレオチドまたはその薬理学上許容される塩:
Baseは、α群から選択される任意の置換基を1以上有していてもよいプリン−9−イル基または2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基を表し、ここで、該α群は、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1から6の直鎖アルキル基、炭素数1から6の直鎖アルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1から6の直鎖アルキルチオ基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖アルキルアミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、およびハロゲン原子からなり;
R6およびR7は、それぞれ独立して、水素原子;水酸基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基;分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基;アミノ基;および核酸合成の保護基で保護されたアミノ基;からなる群から選択される基であるか、あるいは、R6およびR7は一緒になって、=C(R10)R11[式中、R10およびR11は、それぞれ独立して、水素原子、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルコキシ基、炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基、炭素数1から6のシアノアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルアミノ基を表す]を表し;
R8およびR9は、それぞれ独立して、水素原子、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルキル基、分岐または環を形成していてもよい炭素数1から7のアルコキシ基、または炭素数1から6の直鎖または分岐鎖アルキルチオ基を表し;そして
Xは酸素原子または硫黄原子であり、ただし、R6、R7、R8およびR9がともに水素原子である場合を除く)。 - 前記式(II)または(II’)において、Xが酸素原子である、請求項5に記載のオリゴヌクレオチドまたはその薬理学上許容される塩。
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