WO2010037351A1 - Péptido antagonista de la actividad de la interleucina - 15 - Google Patents

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Osvaldo Reyes Acosta
Haydee Geronimo Perez
Hilda Elisa Garay Perez
Yunier Rodriguez Alvarez
Gerardo Enrique Guillen Nieto
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Centro De Ingenieria Genetica Y Biotecnologia
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Definitions

  • the present invention relates to the branch of molecular pharmacology and in particular refers to a peptide derived from lnlerlcuc ⁇ na-15 (IL 15), which prevents the binding of the atocin to the alpha subunit of the receptor (IL-15R ⁇ ) Therefore, it is useful for the treatment of diseases related to the abnormal expression of IL-15 and / or IL-15Ru in the course of the disease
  • the atocin known as IL-15 is a 14-15 kDa ghcoproteln, which was simultaneously identified by two groups as a factor that activates T cells (Grabstein, KH et al, Science 1994, 264 965-968, Burton, JD et al , Proc Nati Acad Sa USA 1994, 91, 4935-4939)
  • the messenger ribonucleic acid (mRNA) of i -) Ia IL-15 is present in a wide variety of cells and tissues, however the protein is rarely found in the supernatant of culture of these cells that express the transcript, since there is a strong post-transcriptional control of their expression at the level of translation and intracellular traffic (Bamford RN et al, J Immunol 1998, 160 4418-4426, Kurys G, et al, J Biol Chem 2000, 275 30653-
  • IL-15 can exist in active form as a membrane protein (Musso et al Blood 1999, 93 3531-3539) and more recently it was observed that it can function as a ligand or as a receptor for IL -15 expressed as an integral membrane protein acts as a receptor and by binding the alpha subunit of the soluble receptor induces the secretion of the atokines
  • the ⁇ subunit of the receptor is shared with IL-2, atocin with which IL-15 has a high structural homology, and the ⁇ subunit is shared with other atokines, such as IL-2, IL-4 , IL-7, IL-9, IL-21 IL-15R (x, is specific for IL-15, to which it binds with very high affinity (Kd 10 ⁇ 11 ) and can be found as a membrane receptor or in soluble form (Budagian V et al J Biol Chem 2004 24 40368-75, Mortier et al, J of
  • IL-15 expression associated with the pathogenesis of autoimmune and inflammatory diseases have been found, such as Crohn's disease (Kirman I, Am J Gastroenterol 1996, 91 1789-1794), sonasis (Ruckert R. J Immunol 2000, 165 2240-2250), leukemias (Yamada and Leukemia and Limphoma 1999, 35 37-45) and rheumatoid arthritis (RA) (Mclnnes IB, Immunology Today 1998, 19 75-79)
  • RA rheumatoid arthritis
  • IL-15 precedes the Tumor Necrosis Factor ⁇ (TNF ⁇ ) in the atokine cascade, proposing a mechanism dependent on cell contact in which IL-15 activated T cells induce the synthesis of TNFu by macrophages.
  • TNF ⁇ Tumor Necrosis Factor ⁇
  • IL-15 acts as an important factor in the migration of T cells to synovial fluid (Mclnnes et al, Nat Med 1997, 3 189-195) Ziolkowska and collaborators reported that IL-15 induces the expression of IL-17 in the articulation of patients with RA and it is known that this atocin stimulates the release by synovio ⁇ of mediators of inflammation such as IL-6, IL-8 Colony Stimulation Factor of Granulo ⁇ tos-Macrophages, and prostaglandin E2, suggesting an important role to IL-15 in the pathogenesis of RA (Ziolkowska et al, J Immunology 2000,164 2832-2838) Recently, it was shown that IL -15 exacerbates collagen-induced arthritis (collagen mduced arthritis, abbreviated CIA) in a transgenic mouse of this atocin (Yoshihara et al, Eur J Immunol 2007, 37 2744-2752) All these elements suggest that the action of an antagonist of
  • WO03017935 it describes four antibodies Two of them called 146B7 and 146H5 that bind to IL-15 in the region that interacts with the ⁇ subunit of the receptor, and inhibit proliferation cell induced by IL-15 of the CT cell line LL-2 and in peripheral blood mononuclear cells (pe ⁇ pheral blood mononuclear cells, abbreviated PBMC), and antibodies called 404A8 and 404E4 that do not inhibit the proliferation of these antibodies 146B7, is in Clinical Phase II for the treatment of The AR by the Amgen company, with the designation of AMG714 Bernard and collaborators in 2004 identified two binding sequences of the IL-15 to the ⁇ subunit of the receptor.
  • PBMC peripheral blood mononuclear cells
  • sequences are comprised between amino acid (aa) 44 to 52 and 64 at 68 of mature piotein, and describe muteins that can act as agonists or antagonists of IL-15 (Bernard J et al J Biol Chem 2004, 279 24313-24322) Santos et al. Described an IL-15 antagonist peptide (Patent application No. WO2006 / 029578)
  • a small-sized peptide (10 aa) as an IL-15 antagonist has the advantage of selectively blocking the binding of the IL -15 to the ⁇ subunit of the receptor and mediate or prevent the effects of IL-15 s due to the interaction with said receptor subunit
  • This invention contributes to solving the aforementioned problem by providing a more soluble and more active peptide than the peptide described in Patent Application No. WO2006 / 029578, obtaining a decrease in the inhibitory concentration 50, that is in the concentration of the substance that It produces 50% of 5 inhibition (IC 50 ), from 130 ⁇ M to 8 ⁇ M, due to the change of the second Lys by the amino acid Thr and the obtaining of the dimic form Said sequence (SEQ ID NO 12), synthesized as a linear peptide of 10 amino acids, it interacts with the u subunit of the receptor and shows antagonistic capacity of the IL-15.
  • the optimization consisted of making specific substitutions of the 0 amino acids of said peptide to identify the essential amino acids in its antagonistic activity of the IL-15.
  • the substitutions that contemplate changes of charge in the particular case of the second hsin of said peptide by threonine with a neutral charge or by Glutamic acid that provides a negative charge, an increase in the antagonistic activity of the peptide 10 times higher was obtained5
  • the dimic form of this peptide formed between two peptide molecules through the free cistern is 7 times more active than form monomé ⁇ ca
  • the resulting peptide which constitutes the essence of this invention, has the amino acid sequence that appears as SEQ ID NO 12 in the sequence listing East increase in the activity of the peptide as a result of the indicated change of the amino acid Lys by Thr is surprising On the basis of the available information, for people versed in this field of the technique it was not expected that said change in the primary structure of the peptide would generate a marked increase in the biological activity of the peptide, as demonstrated in the embodiments of the present invention
  • the peptide with the amino acid sequence listed as SEQ ID No. 12 when binding to the soluble alpha chain, as described in the present invention, can inhibit the effect of reverse signaling through the membrane IL-15 referred to by Budalgian et al. 2004 (Budalgian et al, J Biol Chem 2004, 40
  • the present invention contemplates the use of said peptide in the treatment of RA, alone or in combination with some other appropriate molecule, such as, for example, anti-inflammatory spheroidal drugs (such as corticosteroids) and drugs modifying the course of the disease (for example , methotrexate) 0
  • an appropriate molecule such as, for example, anti-inflammatory spheroidal drugs (such as corticosteroids) and drugs modifying the course of the disease (for example , methotrexate) 0
  • the subject of this invention is also the topical use of this peptide in the treatment of diseases manifested in the skin and in whose lesions the expression of IL-15 is detected in the course of the disease, as in the so ⁇ asis and the cutaneous T-cell lymphoma
  • the peptide is used to inhibit the binding of the 5 subunit of the soluble receptor to the IL-15 expressed in the tumor cell membrane and inhibit its migration
  • the peptide object of the present invention may have a linear structure or may be dimensioned, and is characterized essentially by its antagonistic capacity of IL-15
  • the m vitro effect produced by the peptide or object of the present invention is demonstrated.
  • alanine mapping of the peptide described in patent application No. WO2006 / 029578 was performed every mutant peptide was chemically synthesized by the solid phase synthesis method.
  • the peptide object of the present invention inhibits the expression of IL-8 induced by IL-15Rc / This same peptide inhibits the expression of IL-6 and the release of TNF alpha (TNFu) induced by IL-15Ru
  • the peptide is obtained by genetic manipulation or by chemical synthesis.
  • the peptide is obtained as a dimer formed between two peptide molecules comprising the amino acid sequence described in the sequence listing as SEQ ID No 12
  • the dimer is obtained from two peptide molecules
  • the object of the present invention is also the deoxyribonucleic acid (DNA) that codes for the peptide whose sequence is SEQ ID No. 12, its expression product is capable of binding to the alpha subunit of the cell receptor of lnterleuc ⁇ na-15 or its fraction soluble, and inhibits the biological activity of Ia
  • a vector containing said DNA sequence can be used as an alternative for the expression of the peptide sequence
  • IL-15 dependent on the alpha subunit of the lnterleuc ⁇ na-15 cell receptor characterized in that
  • the therapeutic pharmaceutical composition comprises the dimethyl peptide.
  • the pharmaceutical composition comprises the peptide. monome ⁇ co or dime ⁇ co conjugate, or mixed with pharmaceutically acceptable excipients
  • the therapeutic pharmaceutical composition capable of inhibiting the biological activity of the IL-15 dependent on the alpha subunit of the cell receptor of lnterleuc ⁇ na-15 contains the nucleic acid chain that 5 codes for the peptide (SEQ ID No. 12)
  • a peptide comprising the amino acid sequence described in the sequence listing as SEQ ID No. 12 for the manufacture of a medicament for the treatment of rheumatoid arthritis, Crohn's disease, the so ⁇ asis and for the treatment of prostate cancer
  • FIG. 1 Effect of different concentrations of peptide on the proliferation of the CTLL-2 line induced by IL-15 CTLL-2 cells were incubated with 300 pg / mL of IL-15 in combination with serial dilutions of the peptides. The proliferation was
  • FIG. 3 Effect of different concentrations of peptide on the proliferation of the K ⁇ T225 line induced by IL-15
  • the K ⁇ T225 cells were incubated with 300 pg / mL 5 of IL-15 in combination with signal dilutions of the peptides. Proliferation was measured using Ia MTT mitochondrial staining
  • Figure 4 Effect of the peptide on the proliferation of the CTLL-2 line induced by different concentrations of IL-15 and a fixed concentration of peptide
  • concentrations of IL-15 used were 75 pg of IL-15 / ml (1), 150 pg of IL-15 / ml O (2), 300 pg of lL-15 / ml (3)
  • FIG. 5 Graph showing the inhibitory effect of the peptide on the induction of the mRNA of the IL-8 ( Figure 5A) and the IL-6 ( Figure 5B) in the cells of the PC-3 cell line by incubation with the IL- 15R ⁇ Figure 6.
  • Synovial fluid cells of patients with RA were incubated with IL-15 (100 ng / mL) in combination with a concentration of 65 ⁇ M of the peptide per 48h
  • the amount of TNF alpha was measured by ELISA. Data from controls with synovial fluid effusion due to trauma are shown.
  • Example 1 Optimization of a peptide of IL-15 that binds to IL-15R ⁇ and inhibits the biological function of IL-15.
  • the peptides were synthesized by the Fmoc / tBu strategy in syringes.
  • the Fmoc-AM-MBHA ream was used at 0.54 mmol / g and the synthesis protocol was followed with 0 mechanical agitation.
  • the peptides were lyophilized and They were characterized by HPLC and mass spectrometry. All peptides were obtained with more than 95% purity and there was correspondence between the mass obtained and that expected for the corresponding amino acid sequence S
  • Example 2 Effect of the peptides described on the proliferation of the CTLL-2 and KIT225 cell lines.
  • CTLL-2 and K ⁇ T225 lines are dependent on IL-15 and proliferate in the presence of atocin. Molecules that bind to IL-15 and prevent signal transduction at 0 through the receptor inhibit the proliferation of these lines.
  • dilutions were made of them in 96-well culture plates (Costar, United States) in a volume of 25 ⁇ L of RPMI medium (Gibco) supplemented with 10% bovine fetal serum (Gibco) CTLL-2 or K ⁇ T225 cells (previously washed) were added at a concentration of 5 x 10 3 cells per well and then allowed incubation for 30 min, then a saturating amount of IL -15 of 300 pg / mL was added to each well
  • Ia antagonist ability of peptides varying the concentration of IL-15 at a fixed concentration of peptide of 260 uM was incubated for 72 h at 37 0 C and 5% CO 2
  • Ia mitocond ⁇ al MTT was also evaluated ( Cosman et al, Nature 1984, 312 768-771) The MTT is reduced by the mitochondrial dehydrogenase of the living cell to form purple
  • the antagonistic capacity of the peptides was also evaluated by varying the concentration of IL-15 to a fixed concentration of peptide.
  • H it is observed that the antagonistic effect of the mutant peptide Lys-Thr is dependent on the concentration of IL-15
  • Example 3 Competent ELISA to study the ability of the peptides to displace the binding to IL-15Ra.
  • the peptides were characterized by the binding to IL-15R to ELISA Briefly, 96-well plates were coated with purified IL-15 in PBS and blocked with 1% bovine albumin in phosphate buffered saline ⁇ from the English Phosphate Buffered Saline, abbreviated PBS) Dilutions of each peptide were added to the wells and the incubation was performed for 1 hour at 37 0 C The plate was washed 0 with PBS-Tween 20 and incubated with IL-15Ra-Fc for 1 hour at 37 0 C washes were repeated and incubated with an anti Fc-human IgG-peroxidase for 1 hour at 37 0 C conjugate washes were repeated and revealed Ia antigen-antibody reaction in the presence of substrate and 3, 3 ', 5, 5Tetramet ⁇ lbenc ⁇ d ⁇ na ( TMB) obtaining the OD reading at 450 nm
  • TMB 5Tetramet ⁇ lb
  • Example 4 Evaluation of the effect of the peptide (SEQ ID No. 12) on the expression of IL-8 and IL-6 in the prostate cancer line PC-3.
  • RNA was isolated by the method of T ⁇ Reagent (Sigma) and analyzed by measurement of 5 OD at 260/280 nm and by agarose gel electrophoresis. Reverse transcription and chain reaction of the pohmerase were performed in real time using Quantitect Reverse Transc ⁇ ption Kit and QuantiTect SYBR Green PCR (QUIAGEN) on a Rotor Gene 6000
  • Example 5 Inhibition of the production of TNF alpha induced by IL-15 by dimerized SEQ ID No. 12 peptide in synovial fluid cells! of patients with rheumatoid arthritis (RA).
  • synovial fluid of patients with RA after obtaining informed consent, was extracted and incubated with hyaluronidase at 10 ⁇ g per mL of fluid for 45 min at 37 0 C After centrifugation at 1200 revolutions per minute for 10 min. synovial fluid cells In 96-well plate 2X1 O * 5 cells per well were incubated with 50 ⁇ g / mL of
  • Example 6 Xenotransplantation model in SCID mice of human psoriasis.
  • mice (2-3 months old) were transplanted with a 1.5 cm x 1.5 cm piece of skin from a patient with so ⁇ asis
  • mice were randomized into three placebo groups, "0 mice” treated with the peptide SEQ ID No. 12 at a dose of 10 mg / kg of weight and treated with cyclopopna A at a dose of 10 mg / kg, on alternate days for 2 weeks
  • mice were sacrificed and a 4mm biopsy was taken from each xenotransplant.
  • the biopsies were set at formalin for the paraffin embedding, and they were stained with hematocillin and eosin (H)
  • the skin from patients with psoriasis treated with the peptide SEQ ID No. 12 or its dimeric form shows a reduction in the severity of the disease, an important reduction in the thickness of the epidermis, in the number of inflammatory cells and the cyiratinocyte cycle, as well as the degree of parakeratosis of psoriatic lesions.

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Abstract

La presente invención se relaciona con la rama de la farmacología molecular, en particular con un péptido derivado de la secuencia de la lnterleucιna-15 (IL-15), que fue optimizado para inhibir la actividad biológica de esta molécula. En la presente invención se muestra que el péptido, al unirse a la subunidad alfa del receptor (IL-15Rα), inhibe la proliferación de células T inducida por la IL-15, la inducción de Factor de Necrosis Tumoral α (TNFα) por IL-15, y la expresión de la IL-8 e IL-6 por la IL-15Rα. La invención se relaciona, además, con el uso del péptido en el tratamiento de patologías donde la expresión anormal de la IL-15 o IL-15Rα está relacionada con el curso de la enfermedad, como la artritis reumatoide (AR) y el cáncer de próstata.

Description

PÉPTIDO ANTAGONISTA DE LA ACTIVIDAD DE LA INTERLEUCINA-15
Campo de Ia técnica
La presente invención se relaciona con Ia rama de Ia farmacología molecular y en i particular se refiere a un peptido derivado de Ia lnlerlcucιna-15 (IL 15), que impide Ia unión de Ia atocina a Ia subunidad alfa del receptor (IL-15Rα) por Io que es útil para el tratamiento de enfermedades relacionadas con Ia expresión anormal de Ia IL-15 y/o de Ia IL-15Ru en el curso de Ia enfermedad
lo Estado de Ia técnica anterior
La atocina conocida como IL-15 es una ghcoprotelna de 14-15 kDa, que fue identificada simultáneamente por dos grupos como un factor que activa células T (Grabstein, K H et al , Science 1994, 264 965 -968, Burton, J D et al , Proc Nati Acad Sa USA 1994, 91 , 4935-4939) El acido ribonucleico mensajero (ARNm) de i -) Ia IL-15 esta presente en una amplia variedad de células y tejidos, sin embargo Ia proteina es raramente encontrada en el sobrenadante de cultivo de estas células que expresan el transcripto, ya que existe un fuerte control post-trancπpαonal de su expresión al nivel de Ia traducción y el trafico intracelular (Bamford RN et al , J Immunol 1998, 160 4418-4426, Kurys G, et al , J Biol Chem 2000, 275 30653-
20 30659) Ademas, se ha descrito que Ia IL-15 puede existir en forma activa como una proteina de membrana (Musso et al Blood 1999, 93 3531 -3539) y mas recientemente se observo que puede funcionar como ligando o como receptor La IL-15 expresada como proteina integral de membrana actúa como receptor y al unirse Ia subunidad alfa del receptor soluble induce Ia secreción de las atocinas
>-> proinflamatoπas IL-6 e IL-8, Ia activación de las quinasas llamadas MAPK y FAK, y promueve Ia migración en células de carcinoma de próstata (PC-3) que expresan Ia IL-15 en Ia membrana celular (Budalgian et al , J Biol Chem 2004, 40 42192- 42201 ) Los efectos biológicos de Ia IL-15 como ligando, son mediados a través de Ia unión
K) de Ia IL-15 a un receptor en Ia membrana celular compuesto por tres subunidades llamadas a β y γ La tres subunidades pueden co-expresarse en una misma célula o puede ocurrir que Ia IL-15 unida a Ia subunidad alfa sea presentada a células que expresan solo las subunidades [) y y e inducir Ia señalización en esta célula, un fenómeno conocido como señalización en Irans (Burkett et al J Exp Med 2004, 200 825-834) La subunidad β del receptor es compartida con Ia IL-2, atocina con Ia cual Ia IL-15 presenta una alta homología estructural, y Ia subunidad γ es compartida con otras atocinas, como IL-2, IL-4, IL-7, IL-9, IL-21 La IL-15R(x, es especifica para Ia IL-15, a Ia cual se une con muy alta afinidad (Kd 10~11) y puede encontrarse como receptor de membrana o en forma soluble (Budagian V et al J Biol Chem 2004 24 40368-75, Mortier et al , J of Immunology 2004, 173 1681 — 1688)
Se han encontrado altos niveles de expresión de Ia IL-15 asociados a Ia patogénesis de enfermedades autoinmunes e inflamatorias, como Ia enfermedad de Crohn (Kirman I , Am J Gastroenterol 1996, 91 1789-1794), Ia sonasis (Ruckert R. J Immunol 2000, 165 2240-2250), leucemias (Yamada Y Leukemia and Limphoma 1999, 35 37-45) y artritis reumatoide (AR) (Mclnnes I B , Immunology Today 1998, 19 75-79) En Ia AR, Mclnnes y colaboradores encontraron anormalidades en Ia expresión de Ia IL-15, altas concentraciones en el fluido sinovial y Ia expresión de Ia atocina en células de Ia membrana sinovial Ellos sugirieron que Ia IL-15 precede al Factor de Necrosis Tumoral α (TNFα) en Ia cascada de atocinas, proponiendo un mecanismo dependiente del contacto celular en el cual células T activadas por IL-15 inducen Ia síntesis de TNFu por macrófagos Proponen, además, que Ia IL-15 actúa como un importante factor en Ia migración de células T hacia el fluido sinovial (Mclnnes et al , Nat Med 1997, 3 189-195) Ziolkowska y colaboradores informaron que la IL-15 induce Ia expresión de Ia IL-17 en Ia articulación de pacientes con AR y es conocido que esta atocina estimula Ia liberación por sinovioαtos de mediadores de Ia inflamación como IL-6, IL-8. Factor de Estimulación de Colonias de Granuloαtos- Macrófagos, y prostaglandina E2, sugiriendo un papel importante a Ia IL-15 en Ia patogénesis de Ia AR (Ziolkowska et al , J Immunology 2000,164 2832-2838) Recientemente, se demostró que Ia IL-15 exacerba Ia artritis inducida por colágeno (del inglés collagen mduced artritis, abreviado CIA) en un ratón transgénico de esta atocina (Yoshihara et al , Eur J Immunol 2007, 37 2744-2752) Todos estos elementos sugieren que Ia acción de un antagonista de Ia IL-15 tiene un potencial terapéutico en el tratamiento de Ia AR y otras enfermedades autoinmunes e inflamatorias Se ha descrito previamente que el residuo Acido Aspártico en Ia posición 56 de Ia molécula de IL-15 es importante en Ia unión a Ia subunidad β del receptor y que el residuo Glutamina en Ia posición 156 es importante en Ia unión a Ia subunidad γ del receptor Muteinas (proteínas mutadas) de estos aminoácidos se comportan como moléculas antagonistas de Ia IL-15 que se unen a Ia subunidad a del receptor e impiden Ia traducción de señal a través de las subunidades β y γ Anticuerpos que reconocen estos aminoácidos también actúan como antagonistas de Ia IL-15 (patente No US6177079, patente No US6168783, patente No US6013480, patente No US6001973, patente No US9706931 , Solicitud de patente internacional No WO9741232)
El uso de antagonistas de Ia atocina ha sido efectivo en modelos animales de soπasis (Villadsen L S et al J Clin Invest 2003, 1 12 1571 -1580) y en AR (Ferraπ- Lacraz S et al, J Immunol 2004, 173 5818-5826) Ruchatz y colaboradores generaron un fragmento soluble de Ia IL-15Rα muπna y demostraron que Ia administración de este fragmento inhibe Ia artritis inducida por colágeno en ratones DBA/1 (Ruchatz H, J Immunology 1998, 160 5654-5660) Posteriormente, se encontró que Ia IL-15Rα puede actuar como un potente agonista de Ia función biológica de Ia IL-15 (Mortier E J Biol Chem 2006, 281 1612-1619, Rubinstein MP, PNAS 2006, 103 9166-9171 ) Genmab posee Ia patente de anticuerpos humanos específicos para IL-15 (Solicitud de patente No WO03017935), en ella se describen cuatro anticuerpos Dos de ellos llamados 146B7 y 146H5 que se unen a Ia IL-15 en Ia región que interactúa con Ia subunidad γ del receptor, e inhiben Ia proliferación celular inducida por IL-15 de Ia linea celular CTLL-2 y en células mononucleares de sangre periférica (del ingles peπpheral blood mononuclear cells, abreviado PBMC), y los anticuerpos llamados 404A8 y 404E4 que no inhiben Ia proliferación De estos anticuerpos el 146B7, se encuentra en Fase clínica Il para el tratamiento de Ia AR por Ia compañía Amgen, con Ia denominación de AMG714 Bernard y colaboradores en el 2004 identificaron dos secuencias de unión de Ia IL- 15 a Ia subunidad σ del receptor Estas secuencias están comprendidas entre el aminoácido (aa) 44 al 52 y 64 al 68 de ia pioteina madura, y describen muteinas que pueden actuar como agonistas o antagonistas de Ia IL-15 (Bernard J et al J Biol Chem 2004, 279 24313-24322) Santos y colaboradores describieron un péptido antagonista de Ia IL-15 (Solicitud de patente No WO2006/029578) La aplicación de un péptido de pequeña talla (10 aa) como antagonista de IL-15 tiene Ia ventaja de bloquear selectivamente Ia unión de Ia IL-15 a Ia subunidad α del receptor y mediar o impedir los efectos de Ia IL-15 s debidos a Ia interacción con dicha subunidad receptora
Sin embargo, Ia identificación de secuencias peptídicas antagonistas de Ia IL-15 que posean una mayor solubilidad y actividad biológica que el mencionado péptido posee singular importancia o Explicación de Ia invención
Esta invención contribuye a resolver el problema antes mencionado al proporcionar un peptido más soluble y más activo que el péptido descrito en Ia Solicitud de patente No WO2006/029578, obteniéndose una disminución en Ia concentración inhibitoria 50, o sea en Ia concentración de Ia sustancia que produce un 50% de5 inhibición (IC50), de 130 μM a 8 μM, producto del cambio de Ia segunda Lys por el aminoácido Thr y Ia obtención de Ia forma diméπca Dicha secuencia (SEQ ID NO 12), sintetizada como un péptido lineal de 10 aminoácidos, interactúa con Ia subunidad u del receptor y muestra capacidad antagonista de Ia IL-15 La optimización consistió en Ia realización de sustituciones puntuales de los0 aminoácidos de dicho péptido para identificar los aminoácidos esenciales en su actividad antagonista de Ia IL-15 En las sustituciones que contemplan cambios de carga, en el caso particular de Ia segunda hsina del mencionado péptido por treonina con una carga neutra o por ácido glutámico que aporta una carga negativa, se obtuvo un incremento en Ia actividad antagonista del péptido 10 veces superior5 Además se encontró que Ia forma diméπca de este péptido formada entre dos moléculas de peptido a través de Ia cisterna libre es 7 veces más activa que forma monoméπca
Como resultado se encontró que, en especifico, Ia sustitución antes mencionada da como resultado un péptido 10 veces más activo en el ensayo de proliferación de Ia0 linea celular CTLL-2 dependiente de IL-15 Este péptido mantiene Ia capacidad de unión a Ia subunidad o del receptor para Ia IL-15
El péptido resultante, que constituye Ia esencia de esta invención, tiene Ia secuencia aminoacidica que aparece como SEQ ID NO 12 en el listado de secuencias Este aumento en Ia actividad del peptido como resultado dol cambio indicado del aminoácido Lys por Thr resulta sorprendente Sobre Ia base de Ia información disponible, para las personas versadas en este campo de Ia técnica no se esperaba que dicho cambio en Ia estructura primaria del péptido generara un aumento tan s marcado en Ia actividad biológica del péptido, como el que se demuestra en los ejemplos de realización de Ia presente invención
Al obtener por síntesis química un dímero del péptido que aparece en Ia Lista de Secuencias como SEQ ID No 12 a través de Ia Cys libre, este resulta 7 veces mas activo que Ia forma monoméπca y 15 veces mas activo que el péptido original ιo descrito en Ia solicitud de patente No WO2006/029578.
El péptido con Ia secuencia aminoacídica listada como SEQ ID No 12 al unirse a Ia cadena alfa soluble, como se describe en Ia presente invención, puede inhibir el efecto de señalización inversa a través de Ia IL-15 de membrana referido por Budalgian y colaboradores en el 2004 (Budalgian et al , J Biol Chem 2004, 40
! 5 42192-42201 )
La presente invención contempla el uso del mencionado péptido en el tratamiento de Ia AR, solo o en combinación con alguna otra molécula apropiada, como por ejemplo drogas esferoidales anti-inflamatoπas (como los corticosteroides) y drogas modificadoras del curso de Ia enfermedad (por ejemplo, el methotrexato) 0 Es también objeto de Ia presente invención el uso tópico de este peptido en el tratamiento de enfermedades que se manifiestan en Ia piel y en cuyas lesiones se detecta Ia expresión de Ia IL-15 en el curso de Ia enfermedad, como en Ia soπasis y el Linfoma de células T cutáneo En una realización de Ia invención, el péptido se utiliza para inhibir Ia unión de Ia 5 subunidad α del receptor soluble a Ia IL-15 expresada en Ia membrana de Ia célula tumoral e inhibir su migración
El péptido objeto de Ia presente invención puede tener una estructura lineal o puede estar dimeπzado, y se caracteriza fundamentalmente por su capacidad antagonista de Ia IL-15 Por otro lado, se demuestra el efecto m vitro que produce el péptido 0 objeto de Ia presente invención en un ensayo celular de proliferación en Ia línea muπna CTLL-2, y en Ia línea humana de Leucemia linfocítica Kιt225 Para Ia identificación del péptido descrito en esta invención se realizó el mapeo de alanina del peptido descrito en Ia solicitud de patente No WO2006/029578 Cada péptido mutante se sintetizo químicamente por el método de síntesis en fase solida Después se purificaron por Cromatografía Líquida de Alta Eficiencia (del ingles High Performance Liquicl Chromatography, abreviado HPLC) y se analizaron por espectrometría de masa, obteniéndose en todos los casos mas de 95% de pureza s Cada péptido se evaluó en cuanto a su efectividad para inhibir Ia actividad biológica de Ia IL-15
El peptido objeto de Ia presente invención inhibe Ia expresión de IL-8 inducida por IL-15Rc/ Este mismo péptido inhibe Ia expresión de IL-6 y Ia liberación de TNF alfa (TNFu) inducida por IL-15Ru
K) En una realización de Ia invención el peptido es obtenido por manipulación genica o por síntesis química En una materialización de Ia invención el peptido es obtenido como dímero formado entre dos moléculas de péptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12 En una realización particular, el dímero es obtenido a partir de dos moléculas de peptido
15 que se dimeπzan a través de Ia cisterna libre
Es también objeto de Ia presente invención el acido desoxirπbonucleico (ADN) que codifica para el peptido cuya secuencia es Ia SEQ ID No 12, su producto de expresión es capaz de unirse a Ia subunidad alfa del receptor celular de Ia lnterleucιna-15 o a su fracción soluble, e inhibe Ia actividad biológica de Ia
20 lnterleucιna-15 En una materialización de Ia invención, un vector que contenga dicha secuencia de ADN puede ser usado como alternativa para Ia expresión de Ia secuencia peptidica
Los resultados obtenidos sugieren el empleo del peptido reivindicado en Ia presente invención como herramienta terapéutica en el tratamiento de enfermedades
25 relacionadas con una sobreexpresión de Ia IL-15, como las mencionadas anteriormente, en las cuales se justifica Ia utilización de antagonistas de Ia IL-15 Por tanto, es también objeto de Ia presente invención una composición farmacéutica terapéutica capaz de inhibir Ia actividad biológica de Ia IL-15 dependiente de Ia subunidad alfa del receptor celular de Ia lnterleucιna-15 caracterizada porque
"0 contiene un péptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12 En una materialización de Ia invención, Ia composición farmacéutica terapéutica comprende el péptido dimeπzado En una realización de Ia invención, Ia composición farmacéutica comprende el péptido monomeπco o dimeπco conjugado, o mezclado con excipientes farmacéuticamente aceptables En otra materialización, Ia composición farmacéutica terapéutica capaz de inhibir Ia actividad biológica de Ia IL-15 dependiente de Ia subunidad alfa del receptor celular de Ia lnterleucιna-15 contiene Ia cadena de ácido nucleico que 5 codifica para el péptido (SEQ ID No 12)
Es también objeto de Ia presente invención ei uso de un péptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12 para Ia fabricación de un medicamento para el tratamiento de Ia artritis reumatoide, Ia enfermedad de Crohn, Ia soπasis y para el tratamiento del cáncer de próstata
K)
Breve descripción de las figuras
Figura 1. Efecto de diferentes concentraciones de péptido sobre Ia proliferación de Ia línea CTLL-2 inducida por IL-15 Las células CTLL-2 se incubaron con 300 pg/mL de IL-15 en combinación con diluciones seriadas de los péptidos La proliferación se
15 midió utilizando Ia tinción mitocondπal con 3-(4,5dιmetιltιazol-2-ιl) 2,5 bromurodifeniltetrazolio (MTT) Figura 1A Evaluación de los péptidos con SEQ ID No 4 y SEQ ID No 5, Figura 1 B Evaluación de los péptidos SEQ ID No 2 y SEQ ID No 3, Figura 1 C Evaluación de los péptidos SEQ ID No 7, SEQ ID No 8 y SEQ ID No 9 0 Figura 2. Gráfico que muestra Ia unión de Ia IL-15Rα humana a los peptidos. Se evaluó el desplazamiento de Ia unión de Ia IL-15 a Ia IL-15Rα por los péptidos mediante ELISA
Figura 3. Efecto de diferentes concentraciones de peptido sobre Ia proliferación de Ia línea KιT225 inducida por IL-15 Las células KιT225 se incubaron con 300 pg/mL 5 de IL-15 en combinación con diluciones senadas de los péptidos La proliferación se midió usando Ia tinción mitocondπal MTT
Figura 4. Efecto del peptido sobre Ia proliferación de Ia línea CTLL-2 inducida por diferentes concentraciones de IL-15 y una concentración fija de péptido Las concentraciones de IL-15 utilizadas fueron 75 pg de IL-15/ml (1 ), 150 pg de IL-15/ml O (2), 300 pg de lL-15/ml (3)
Figura 5. Gráfico que muestra el efecto inhibitorio del peptido sobre Ia inducción del ARNm de Ia IL-8 (Figura 5A) y Ia IL-6 (Figura 5B) en las células de Ia línea celular PC-3 por incubación con Ia IL-15R α Figura 6. Inhibición de Ia liberación de TNF alfa inducida por IL-15 al incubar células de fluido sinovial con el peptido Células de fluido sinovial de pacientes con AR se incubaron con IL-15 (100 ng/mL) en combinación con una concentración de 65 μM del peptido por 48h La cantidad de TNF alfa se midió por ELISA Se muestran datos s de controles con derrame de líquido sinovial por trauma
Exposición detallada de modos de realización / Ejemplos de realización
La presente invención se explica a través de ios siguientes ejemplos de realización
lυ Ejemplo 1. Optimización de un péptido de Ia IL-15 que se une a Ia IL-15Rα e inhibe Ia función biológica de Ia IL-15.
Diseño
A partir del péptido reivindicado en Ia solicitud de patente No WO2006/029578, se diseño un panel de péptidos en los que se realizó Ia sustitución de cada aminoácido
15 por el aminoácido alanina (Ala) En otro grupo de péptidos se realizo Ia sustitución de Ia cisterna (Cys) por Ser, y Lys por Thr o GIu Síntesis de péptidos
Los péptidos se sintetizaron por Ia estrategia Fmoc/tBu en jeringuillas Se utilizó Ia resma Fmoc-AM-MBHA a 0,54 mmol/g y se siguió el protocolo de síntesis con 0 agitación mecánica Después del tratamiento con acido tπfluoracético, los péptidos se liofilizaron y se caracterizaron por HPLC y espectrometría de masa Todos los péptidos fueron obtenidos con mas del 95% de pureza y hubo correspondencia entre Ia masa obtenida y Ia esperada para Ia secuencia de aminoácidos correspondiente S
Ejemplo 2. Efecto de los péptidos descritos sobre Ia proliferación de las líneas celulares CTLL-2 y KÍT225.
Las líneas CTLL-2 y KιT225 son dependientes de IL-15 y proliferan en presencia de Ia atocina Moléculas que se unen a Ia IL-15 e impiden Ia transducción de señal a 0 través del receptor inhiben Ia proliferación de estas líneas
Para evaluar Ia capacidad neutralizante de los péptidos de Ia presente invención se realizaron diluciones senadas de los mismos en placas de cultivo de 96 pocilios (Costar, Estados Unidos) en un volumen de 25 μL de medio RPMI (Gibco) suplementado con 10 % do suero fetal bovino (Gibco) Se añadieron las células CTLL-2 o KιT225 (previamente lavadas) a una concentración de 5 x 103 células por pocilio y so permitió Ia incubación por 30 min, luego una cantidad saturante de IL-15 de 300 pg/mL se añadió a cada pocilio
Se evaluó también Ia capacidad antagonista de los péptidos variando Ia concentración de IL-15 a una concentración fija de péptido de 260 uM Se incubó por 72 h a 37 0C y 5% de CO2 Para medir Ia proliferación se uso Ia tinción mitocondπal MTT (Cosman et al , Nature 1984, 312 768-771 ) El MTT es reducido por Ia deshidrogenasa mitocondπal de Ia célula viva a formazan púrpura Se
10 determinó Ia IC50 de cada peptido para una concentración de IL-15 de 300 pg/mL
Tabla 1. Listado de péptidos evaluados y valor de Ia IC<,o obtenido en el ensayo de proliferación en Ia línea CTLL-2
i s
0
Figure imgf000010_0001
>s n d No determinado
Este ensayo se empleo en Ia evaluación de todos los peptidos permitiendo obtener Ia IC50 mostrada en Ia Tabla I Los valores de ICM muestran Ia pérdida del efecto 10 inhibitorio del péptido en los mutantes Cys-Ala, Cys-Ser, Phe-Ala y GIy-GIu, y Ia afectación de este efecto en casi un 50% en los mutantes Leu-Ala Se obtiene una actividad inhibitoria 5 veces superior en el mutante Lys-Thr y 15 veces superior en Ia forma diméπca del mutante Lys-Thr En las Figuras 1 A, 1 B y 1 C aparece representado el comportamiento de Ia Densidad Óptica (DO) a 576 nm obtenida para las diferentes concentraciones de péptido para los mutantes Phe-Ala, Cys-Ala, Leu1 -Ala, Leu2-Ala, Met-Ala, Thr-Ala, Val-Ala En Ia Figura 3 se muestra el comportamiento para el mutante Lys-Thr en su forma s monomeπca y diméπca, donde se observa que el efecto inhibitorio es dependiente de Ia concentración del péptido y un mayor efecto inhibitorio para Ia forma diménca del mutante Lys-Thr
Se evaluó también Ia capacidad antagonista de los péptidos variando Ia concentración de IL-15 a una concentración fija de péptido En Ia Figura 4 se H) observa que el efecto antagonista del peptido mutante Lys-Thr es dependiente de Ia concentración de IL-15
Ejemplo 3. ELISA de competencia para estudiar Ia capacidad de los péptidos de desplazar Ia unión a Ia IL-15Ra.
15 Los péptidos fueron caracterizados por Ia unión a Ia IL-15R a por ELISA Brevemente, placas de 96 pocilios fueron recubiertas con IL-15 purificada en PBS y bloqueadas con albúmina bovina al 1 % en tampón fosfato salino {del inglés Phosphate Buffered Saline, abreviado PBS) Diluciones de cada peptido fueron añadidas a los pocilios y Ia incubación se realizó por 1 hora a 370C La placa se lavó 0 con PBS-Tween 20 y se incubó con IL-15Ra-Fc por 1 hora a 370C Se repitieron los lavados y se incubó con un conjugado anti Fc-IgG humana-peroxidasa por 1 hora a 370C Se repitieron los lavados y se revelo Ia reacción antigeno-anticuerpo en presencia del sustrato y 3, 3', 5, 5Tetrametιlbencιdιna (TMB) obteniéndose Ia lectura de DO a 450nm Los resultados se muestran en Ia Figura 2, donde se s observa que el mutante Cys-Ala (SEQ ID No 5) no desplaza Ia unión de Ia IL-15Rα a Ia IL-15 y el mutante Phe-Ala (SEQ ID No 4) desplaza solo un 10% de Ia unión
Ejemplo 4. Evaluación del efecto del péptido (SEQ ID No. 12) sobre Ia expresión de IL-8 y de Ia IL-6 en Ia línea de cáncer de próstata PC-3.
*o Se evaluó el efecto del péptido (SEQ ID No 12) sobre Ia expresión de Ia IL-8 e IL-6 que es mediada por Ia unión de Ia IL-15Rσ a Ia IL-15 presente en Ia membrana de las células PC-3 (Budagian V , et al J Biol Chem 2004 279 42192-42201 ) El experimento se realizo en placas de 24 pocilios incubando 1 , 5 x106 células con una concentración de 100 μg /ml_ de los péptidos SEQ ID No 1 y SEQ ID No 12 y de Ia IL1 SRalfa (1 ng/mL) y combinaciones de iL-15Ru con los péptidos SEQ ID No 1 y SEQ ID No 12
El ARN se aisló por el método de TπReagent (Sigma) y se analizó por medida de Ia 5 DO a 260/280 nm y por electroforesis en gel de agarosa Se realizó Ia Transcripción reversa y reacción en cadena de Ia pohmerasa en tiempo real empleando Quantitect Reverse Transcπption Kit y QuantiTect SYBR Green PCR (QUIAGEN) en un equipo Rotor Gene 6000
En las Figuras 5A y 5B se observa que el péptido SEQ ID No 12 inhibe Ia io transcripción de las atocinas pro-inflamatorias IL-8 e IL-6 inducida por IL-15Rα
Ejemplo 5. Inhibición de Ia producción de TNF alfa inducida por IL-15 por el péptido SEQ ID No. 12 dimerizado, en células de fluido sinovia! de pacientes con Artritis reumatoide (AR).
15 El líquido sinovial de pacientes con AR, después de obtener el consentimiento informado, fue extraído e incubado con hialuronidasa a 10 μg por mL de fluido por 45 min a 370C Después de centrifugación a 1200 revoluciones por minuto por 10 min se obtuvieron las células del fluido sinovial En placa de 96 pocilios se incubaron 2X1 O*5 células por pocilio con 50μg/mL de
"1O peptido, 60 ng/mL de IL-15 y combinación de péptido mas IL-15 Después de 48 horas de incubación se colectó el sobrenadante y se guardó a -70 0C para su evaluación La cantidad de TNFα se cuantificó por ELISA (R&D DTA50) En Ia Figura 6 se muestra que el péptido con Ia SEQ ID No 12 inhibe Ia secreción de TNFα en células del fluido sinovial de paciente con AR
Ejemplo 6: Modelo xenotransplante en ratones SCID de psoriasis humana.
Ratones SCID (2-3 meses de edad) fueron transplantados con una pieza de piel de 1 ,5 cm x 1 ,5 cm proveniente de paciente con soπasis Tres semanas después del trasplante, los ratones fueron aleatoπzados en tres grupos placebo, ratones "0 tratados con el péptido SEQ ID No 12 a una dosis de 10 mg/kg de peso y tratados con ciclospoπna A a una dosis de 10mg/Kg, en días alternos durante 2 semanas Una semana después de Ia última inyección, los ratones fueron sacrificados y una biopsia de 4mm se tomo de cada xenotransplante Las biopsias se fijaron en formalina para Ia incrustación de paraíina, y se tiñeron con hematocilina y eosina (H
& E).
Como resultado del experimento se observó que Ia piel proveniente de pacientes con soriasis tratada con el péptido SEQ ID No. 12 o su forma dimérica, muestran una reducción en Ia severidad de Ia enfermedad, una reducción importante en el espesor de Ia epidermis, en el número de células inflamatorias y el ciclo de los ciueratinocitos, así como en el grado de parakeratosis de las lesiones soriáticas.
I O

Claims

REIVINDICACIONES
Un peptido antagonista de Ia actividad de Ia lnterleucιna-15 caracterizado porque comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12 Un péptido de acuerdo con Ia reivindicación 1 , caracterizado porque se une a Ia subunidad alfa del receptor celular de Ia lnterleucιna-15 (IL-15Rα) o a su fracción soluble Un péptido de acuerdo con Ia reivindicación 1 , caracterizado porque inhibe Ia actividad biológica de Ia lnterleucιna-15 dependiente de Ia subunidad alfa del receptor (IL-15Ru) Un péptido de acuerdo con Ia reivindicación 1 , caracterizado porque inhibe ia expresión de IL-8 inducida por IL-15Rα Un péptido de acuerdo con Ia reivindicación 1 , caracterizado porque inhibe Ia expresión de IL-6 inducida por IL-15Rα Un péptido de acuerdo con Ia reivindicación 1 , caracterizado porque inhibe Ia liberación de TNF alfa (TNFα) inducida por IL-15 Un péptido de acuerdo con las reivindicaciones 1 a Ia 6, donde el peptido es obtenido por manipulación génica o pot síntesis química Un péptido de acuerdo con Ia reivindicación 7, donde el peptido es obtenido como dímero formado entre dos moléculas de péptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12 Un péptido de acuerdo con Ia reivindicación 8, donde el dímero es obtenido a partir de dos moléculas de péptido que se dimeπzan a través de Ia cisterna libre Secuencia de ácido nucleico caracterizada porque codifica para un péptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12, su producto de expresión es capaz de unirse a Ia subunidad alfa del receptor celular de Ia lnterleucιna-15 o a su fracción soluble, e inhibe Ia actividad biológica de Ia lnterleucιna-15 11 Cadena do acido nucleico de acuerdo con Ia reivindicación 10, caracterizada porque es capaz de inhibir Ia actividad biológica de Ia IL-15 dependiente de Ia subunidad alfa del receptor formando parte de un vector de expresión
12 Composición farmacéutica terapéutica capaz de inhibir Ia actividad biológica 5 de Ia IL-15 dependiente de Ia subunidad alfa del receptor celular de Ia lnterleucιna-15 caracterizada porque contiene un peptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12
13 Composición farmacéutica terapéutica de acuerdo con Ia reivindicación 12 ιo que comprende el peptido (SEQ ID No 12) dimenzado
14 Composición farmacéutica terapéutica de acuerdo con Ia reivindicación 12 que comprende el peptido monomeπco o dimeπco conjugado, o mezclado con excipientes farmacéuticamente aceptables
15 Composición farmacéutica terapéutica capaz de inhibir Ia actividad biológica ι -> de Ia IL-15 dependiente de Ia subunidad alfa del receptor celular de Ia lnterleucιna-15 caracterizada porque comprende Ia cadena de acido nucleico de Ia reivindicación 10
16 Uso de un peptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12 para Ia fabricación de un 0 medicamento para el tratamiento de Ia artritis reumatoide
17 Uso de un peptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12 para Ia fabricación de un medicamento para el tratamiento de Ia enfermedad de Crohn
18 Uso de un peptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en s el listado de secuencia como SEQ ID No 12 para Ia fabricación de un medicamento para el tratamiento de Ia soπasis
19 Uso de un peptido que comprende Ia secuencia de aminoácidos descrita en el listado de secuencia como SEQ ID No 12 para Ia fabricación de un medicamento para el tratamiento del cáncer de próstata
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