WO2007042494A2 - Mikrobiologische herstellung von 3-hydroxypropionsäure - Google Patents

Mikrobiologische herstellung von 3-hydroxypropionsäure Download PDF

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WO2007042494A2
WO2007042494A2 PCT/EP2006/067182 EP2006067182W WO2007042494A2 WO 2007042494 A2 WO2007042494 A2 WO 2007042494A2 EP 2006067182 W EP2006067182 W EP 2006067182W WO 2007042494 A2 WO2007042494 A2 WO 2007042494A2
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Achim Marx
Volker F. Wendisch
Doris Rittmann
Stefan Buchholz
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Evonik Degussa Gmbh
Forschungszentrum Jülich GmbH
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    • C12P7/40—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a carboxyl group including Peroxycarboxylic acids
    • C12P7/44—Polycarboxylic acids

Definitions

  • the present invention relates to a genetically modified cell as compared to its wild type, to a method for producing a genetically modified cell, to the genetically modified cells obtainable by these methods, to a method for producing 3-hydroxypropionic acid, to a method for the production of polyacrylates, to a method for the production of Acrylic acid esters and the use of cells for the production of 3-hydroxypropionic acid.
  • Acrylic acid is a technically very important starting compound. It is used, inter alia, for the preparation of polyacrylates, in particular of crosslinked, partially neutralized polyacrylates, which have a high ability to absorb water in the dry and substantially anhydrous state.
  • These "superabsorbent" cross-linked polyacrylates are capable of absorbing many times their own weight in water, and because of their high absorbency, the absorbent polymers are suitable for incorporation in water absorbent structures and articles such as baby diapers, incontinence products or sanitary napkins on Modern Superabsorbent Polymer Technology; FL Buchholz, AT Graham, Wiley-VCH, 1998.
  • Acrylic esters such as methyl acrylate and butyl acrylate, are also industrially important starting compounds which are used in particular for the preparation of copolymers. These copolymers are usually used in the form of polymer dispersions as adhesives, paints or textile, leather and paper auxiliaries.
  • acrylic acid is technically primarily by the two-stage, catalytic Gas phase oxidation of propylene, the propylene is in turn obtained by thermal decomposition of petroleum derived petroleum processing.
  • the acrylic acid obtained in this way is then optionally esterified by the addition of alcohols.
  • a disadvantage of the two-stage process for the preparation of acrylic acid is, first, that the temperatures used in both stages between 300 and 450 0 C lead to the formation of oligomers and other undesirable cracking products. This has the consequence that an undesirably high amount of higher boiling than the acrylic acid compounds or compounds which are difficult to separate from the acrylic acid, such as acetic acid incurred. As a rule, these compounds have to be separated off from the acrylic acid by distillation, which in turn leads to a further thermal loading of the acrylic acid and the associated formation of dimers and oligomers.
  • a high content of acrylic acid dimers or acrylic acid oligomers is disadvantageous since these dimers or oligomers are incorporated into the polymer in the preparation of superabsorbents by radical polymerization of acrylic acid in the presence of crosslinking agents.
  • the copolymerized dimers are split to form ⁇ -hydroxypropionic acid, which is dehydrated under the postcrosslinking conditions to form acrylic acid.
  • a high content of dimeric acrylic acid in the acrylic acid used for the preparation of the superabsorbent therefore leads to the content of acrylic acid monomers in a thermal treatment of the polymers, such as occurs in the post-crosslinking, increases.
  • a further disadvantage of this conventional process for the preparation of acrylic acid is that the starting material (propylene) used is produced from crude oil and thus from non-renewable raw materials, which is particularly advantageous in view of the increasingly heavy and, above all, more expensive oil production from an economic point of view especially in the long term is questionable.
  • WO-A-03/62173 describes the preparation of acrylic acid, in which alpha-alanine is first formed from pyruvate by fermentation, which is then converted into beta-alanine by means of the enzyme 2,3-aminomutase.
  • the beta-alanine is converted into 3-hydroxypropionic acid via ⁇ -alanyl-CoA, acrylyl-CoA, 3-hydroxypropionyl-CoA or else via malonic semialdehyde, from which acrylic acid is obtained after dehydration.
  • WO-A-02/42418 describes another way of producing, for example, 3-hydroxypropionic acid from renewable raw materials.
  • pyruvate is first converted to lactate, from which subsequently lactyl-CoA is formed.
  • the lactyl-CoA is then converted to 3-hydroxypropionic acid via acrylyl-CoA and 3-hydroxypropionyl-CoA.
  • Another route described in WO-A-02/42418 for the preparation of 3-hydroxypropionic acid is the reaction of glucose via propionate, propionyl-CoA, acrylyl-CoA and 3-hydroxypropionyl-CoA.
  • This document also describes the reaction of pyruvate to 3-hydroxypropionic acid via acetyl-CoA and malonyl-CoA.
  • the 3-hydroxypropionic acid obtained by the respective routes can be converted to the acrylic acid by dehydration.
  • WO-A-01/16346 describes the fermentative production of 3-hydroxypropionic acid from glycerol using microorganisms comprising the dhaB gene from Klebsiella pneumoniae (a gene coding for glycerol dehydratase) and a gene coding for a glycerol Aldehyde dehydrogenase encoded express.
  • 3-hydroxypropionic acid is formed from glycerol via 3-hydroxypropionaldehyde, which can then be converted by dehydration into acrylic acid.
  • the present invention has for its object to overcome the disadvantages resulting from the prior art.
  • the object of the present invention was to provide recombinant microorganisms or systems comprising at least two recombinant microorganisms which are even better, in particular more efficient than the microorganisms described in the prior art, made of renewable raw materials, in particular of carbohydrates and / or or off Glycerol to produce 3-hydroxypropionic acid, which can then be converted in a gentle dehydration reaction in pure acrylic acid.
  • a contribution towards achieving the abovementioned objects is made by a cell which has been genetically modified in comparison with its wild-type and which has at least one, preferably both, of the properties a) and b):
  • an increased compared to their wild-type preferably by at least 10%, more preferably by at least 25%, more preferably by at least 50%, moreover still more preferably by at least 75%, further preferably by at least 100% and am most preferably at least 500%, more preferably up to 5,000%, most preferably up to 2,500% increased activity of an enzyme E ia which catalyzes the reaction of pyruvate to oxaloacetate or an enzyme Eib that catalyzes the reaction of phosphoenolpyruvate to oxaloacetate, but preferably an enzyme E ia , which catalyzes the conversion of pyruvate to oxaloacetate,
  • an increased compared to their wild type preferably by at least 10%, more preferably by at least 25%, more preferably by at least 50%, more preferably still by at least 75%, further preferably by at least 100% and am most preferably at least 500%, more preferably up to 5,000%, most preferably up to 2,500% increased activity of an enzyme E 2 which catalyzes the conversion of aspartate to beta-alanine,
  • the cell in addition to the properties a) or b), preferably a) and b), by at least one of the properties c) or d) is characterized: c) the genetically modified cell is capable of releasing beta-alanine from the cell;
  • the genetically modified cell is able to convert beta-alanine to 3-hydroxypropionic acid.
  • Such a genetically engineered cell is capable, either itself or in combination with other cells which can convert beta-alanine to 3-hydroxypropionic acid, of carbohydrates or of glycerol 3-hydroxypropionic acid, since the formed beta-alanine to 3-hydroxypropionic acid can be implemented.
  • a wild-type cell is preferably referred to as a cell whose genome is in a state as naturally produced by evolution, and is used for both the entire cell and for individual genes. fall therefore in particular not such cells or genes whose gene sequences have been at least partially modified by humans by recombinant methods.
  • the term "increased activity of an enzyme” is preferably to be understood as an increased intracellular activity
  • an activity of an enzyme which is increased compared to its wild type also includes, in particular, a cell whose wild type has no or at least no detectable activity of this enzyme and which only after increasing the enzyme activity, for example by overexpression, a detectable activity of this enzyme shows.
  • the term “overexpression” or the expression “increase in expression” used in the following embodiments also encompasses the case in which a starting cell, for example a wild-type cell, has no or at least no detectable expression and only by recombinant methods a detectable Expression of the enzyme is induced.
  • an increase in enzymatic activity can be achieved by increasing the copy number of the gene sequence or of the gene sequences which code for the enzyme, use a strong promoter or use a gene or allele which codes for a corresponding enzyme with an increased activity and, where appropriate, combining these measures.
  • Genetically modified cells according to the invention are produced, for example, by transformation, transduction, conjugation or a combination of these methods with a vector which contains the desired gene, an allele of this gene or parts thereof and a vector which enables expression of the gene.
  • heterologous expression is achieved by integration of the gene or alleles into the chromosome of the cell or an extrachromosomally replicating vector.
  • the expression of the above and all of the enzymes or genes mentioned below can be detected in the gel with the aid of 1- and 2-dimensional protein gel separation and subsequent optical identification of the protein concentration with appropriate evaluation software. If the increase in enzyme activity is based solely on an increase in the expression of the corresponding gene, the quantification of the increase in enzyme activity can be determined in a simple manner by a comparison of the 1- or 2-dimensional protein separations between wild-type and genetically modified cell.
  • a common method for preparing protein gels coryneform bacteria and to identify the proteins is that of Hermann et al. ((2001) Electrophoresis 22: 1712-1723).
  • Protein concentration can also be assessed by Western blot hybridization with an antibody specific for the protein to be detected (Sambrook et al., Molecular Cloning: a laboratory manual, 2nd Ed. Co., Spring Harbor Laboratory Press, ColD Spring Harbor, NY USA, 1989) and subsequent optical evaluation with appropriate software for concentration determination (Lohaus and Meyer (1989) Biospektrum 5: 32-39; Lottspeich (1999) Angewandte Chemie 111: 2630-2647).
  • the activity of DNA binding proteins can be measured by DNA band shift assays (also called gel retardation) (Wilson et al., (2001) Journal of Bacteriology, 183: 2151-2155).
  • the determination of the increase in the enzyme activity and also the determination of the reduction of an enzyme activity are preferably carried out by means of the methods described in Hermann et al. (Electrophoresis 22: 1712-1723 (2001)), Lohaus et al. (Biospektrum 5: 32-39 (1998)), Lottspeich (Angewandte Chemie 111: 2630-2647 (1999)) and Wilson et al. (Journal of Bacteriology 183: 2151-2155 (2001)).
  • mutations can be generated either undirected by classical methods, such as by UV irradiation or mutation-releasing chemicals, or specifically by genetic engineering methods such as deletion (s), insertion (s) and / or nucleotide exchange (s). These mutations result in genetically engineered cells.
  • Particularly preferred mutants of enzymes are, in particular, also those enzymes which are no longer or at least -feedbaofc-inhibitable in comparison with the wild-type enzyme.
  • the increase in the enzyme activity is accomplished by increasing the expression of an enzyme, one increases, for example, the copy number of the corresponding genes or mutates the promoter and regulatory region or the ribosome binding site, which is located upstream of the structural gene.
  • expression cassettes act, which are installed upstream of the structural gene.
  • the enzyme gene can be assigned as regulatory sequences but also so-called “enhancers", which also cause increased gene expression via an improved interaction between RNA polymerase and DNA. Measures to extend the lifetime of m-RNA also improve expression. Furthermore, by preventing degradation of the enzyme protein, enzyme activity is also enhanced.
  • genes or gene constructs are either present in plasmids with different copy numbers or are integrated and amplified in the chromosome. Alternatively, overexpression of the genes in question can be achieved by altering the composition of the medium and culture. For instructions on this, the skilled person will find, inter alia, in Martin et al. (Bio / Technology 5, 137-146 (1987)), Guerrero et al. (Gene 138: 35-41 (1994)), Tsuchiya and Morinaga (Bio / Technology 6: 428-430 (1988)), in Eikmanns et al. (Gene 102: 93-98 (1991)), EP-A-0 472 869, U.S.
  • episomal plasmids are used, for example. Suitable plasmids are in particular those which are replicated in coryneform bacteria. Numerous known plasmid vectors, such as pZl (Menkel et al., Applied and Environmental Microbiology 64: 549-554 (1989)), pEKEx1 (Eikmanns et al., Gene 107: 69-74 (1991)) or pHS2-l ( Sonnen et al., Gene 107: 69-74 (1991)) are based on the cryptic plasmids pHM1519, pBLI or pGAl.
  • plasmid vectors such as those based on pCG4 (US 4,489,160) or pNG2 (Serwold-Davis et al., FEMS Microbiology Letters 66: 119-124 (1990)) or pAG1 (US 5,158,891) can be used in the same way become.
  • plasmid vectors by means of which one can apply the method of gene amplification by integration into the chromosome, as described for example by Reinscheid et al. (Applied and Environmental Microbiology 60: 126-132 (1994)) for duplication or amplification of the hom-thrB operon.
  • the complete gene is cloned into a plasmid vector that is present in a host (typically Escherichia coli) but not in the host Corynebacterium glutamicum can be replicated.
  • vectors examples include pSUP301 (Simon et al., Bio / Technology 1: 784-791 (1983)), pK18mob or pK19mob (Schäfer et al., Gene 145: 69-73 (1994)), pGEM-T (Promega Corporation , Madison, Wisconsin, USA), pCR2.1-TOPO (Shuman, Journal of Biological Chemistry 269: 32678-84 (1994)), pCR® Blunt (Invitrogen, Groningen, The Netherlands), pEMI (Schrumpf et al., Journal of Bacteriology 173: 4510-4516)) or pBGS8 (Spratt et al., Gene 41: 337-342 (1986)).
  • the plasmid vector containing the gene to be amplified is then converted by conjugation or transformation into the desired strain of Corynebacterium glutamicum.
  • the method of conjugation is described by Shufer et al. , Applied and Environmental Microbiology 60: 756-759 (1994). Methods for transformation are described by Thierbach et al. (Applied Microbiology and Biotechnology 29: 356-362 (1988)), Dunican and Shivnan (Bio / Technology 7: 1067-1070 (1989)) and Tauch et al. (FEMS Microbiology Letters 123: 343-347 (1994)). After homologous recombination by means of a cross-over event, the resulting strain contains at least two copies of the gene of interest.
  • the cells according to the invention are preferably genetically modified cells. These can be prokaryotes or eukaryotes. These may be mammalian cells (such as human cells), plant cells or microorganisms such as yeast cells, fungi or bacterial cells, with microorganisms being particularly preferred and bacterial cells and yeast cells being most preferred.
  • Bacterial, yeast and fungal cells which are suitable according to the invention are all those bacterial, yeast and fungal cells which have been used in the German Collection of Microorganisms and Cell Cultures GmbH (DSMZ), Braunschweig, Germany Wild-type bacterial strains are deposited. Suitable bacterial cells belong to the genera under
  • Yeast cells which are suitable according to the invention belong to those genera which are under
  • Cells particularly preferred according to the invention are those of the genera Corynebacterium, Brevibacterium, Bacillus, Lactobacillus, Lactococcus, Candida, Pichia, Kluveromyces, Saccharomyces, Bacillus, Escherichia and Clostridium, Bacillus flavum, Bacillus lactofermentum, Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, Kluveromyces lactis, Candida blankii Candida rugosa, Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens and Pichia postoris are particularly preferred, and Corynebacterium glutamicum is most preferred.
  • the enzyme E ia is preferably a carboxylase, more preferably a pyruvate carboxylase (EC number 6.4.1.1), which catalyzes the reaction of pyruvate to oxaloacetate.
  • Genes for pyruvate carboxylases are for example from Rhizobium etli (Dünn et al., J. Bacteriol 178: 5960-5970 (1996), see also WO-A-99/53035), Bacillus subtillis (Genbank Accession No. Z97025), Mycobacterium tuberculosis (Genbank Accession No.
  • Preferred pyruvate carboxylases according to the invention are those pyruvate carboxylases which are selected from genes selected from the group consisting of PC, Pcx, CG1516, CG1516, pyc-1, PYC2, AAR162Cp, pyrl, accC-2, pycA, pycA2, pca, CglO689, pyc , pycB, accC, oadA, acc and accCl, the pyc gene being particularly preferred.
  • Pyruvate carboxylases preferred according to the invention are also described in particular in US Pat. Nos.
  • a pyruvate carboxylase particularly preferred according to the invention is that mutant which is described in "A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum genome information to generate a new L-lysine-producing mutant" (Onishi et al., Applied Microbiology and Biotechnology 58 (2): 217- In this mutation, the amino acid proline has been replaced by serine at position 458.
  • the disclosure of this publication regarding the possibilities of producing pyruvate carboxylase mutants is hereby incorporated by reference and forms part of the disclosure of the present invention Accordingly, cells which are particularly preferred according to the invention are those which have the above-described enzyme mutant as exogenous protein or which have exogenous DNA sequences which code for such an enzyme and which express this enzyme in sufficient quantity.
  • the determination of the intracellular activity of the pyruvate carboxylase is preferably carried out according to the thesis of Petra Peters-Wendisch at Klasmaschinen GmbH "Anaplerotische Reactions in Corynebacterium glutamicum: Investigation of the importance of PEP carboxylase and pyruvate carboxylase in the central metabolism and in amino acid production (1996).
  • the enzyme EIb is preferably a carboxylase, more preferably a
  • Phosphoenolpyruvate carboxylase (EC 4.1.1.31), which catalyzes the conversion of Phosphoenolypyruvat to oxaloacetate.
  • Phosphoenolpyruvate carboxylases preferred according to the invention are those phosphoenolpyruvate carboxylases which are encoded by the genes selected from the group comprising F12M16.21, F14N22.13, K15M2.8, ppc, clpA, pepC, capP, Cgl1585 and pepC, the ppc gene is particularly preferred.
  • PPC genes for wild-type phosphoenolpyruvate carboxylases or mutants of these enzymes are known, for example, from US 6,599,732, US 5,573,945, US 4,757,009 and US 4,980,285.
  • the production of cells with increased phosphoenolpyruvate carboxylase activity is described inter alia in US 4,757,009.
  • the disclosure of this document Regarding the approach to overexpressing the phosphoenolpyruvate carboxylase in microorganisms is also incorporated herein by reference and forms a part of the disclosure of the present invention.
  • the other measures mentioned in connection with the enzyme E ia can be used to increase the enzyme activity of phosphoenolpyruvate carboxylase, including the expression of enzyme mutants.
  • Particularly preferred mutants in this context are those which do not require activation by acetyl-CoA and / or which are feedback-inhibited with respect to aspartic acid (see in particular US Pat. No. 6,919,190).
  • the corresponding genes of any conceivable origin, whether from bacteria, yeasts, plants, animals or fungi can also be used in connection with phosphoenolpyruvate carboxylase.
  • all the alleles of the ppc gene can be used, in particular also those which result from the degeneracy of the genetic code or by function-neutral sense mutations (sense mutations)
  • the enzyme E 2 is preferably a decarboxylase, more preferably a glutamate decarboxylase or an aspartate decarboxylase, with a 1-aspartate 1-decarboxylase (EC number 4.1.1.11) being the most abundant preferred is that which is encoded by the panD gene.
  • Aspartate decarboxylase catalyzes the conversion of aspartate to beta-alanine.
  • Genes for aspartate decarboxylase (panD genes), inter alia, from Escherichia coli (FEMS Microbiology Letters 143: 247-252 (1996)), Photorhabdus luminescens subsp. laumondii, Mycobacterium bovis subsp.
  • panD genes of every conceivable origin, whether from bacteria, yeasts, plants, animals or fungi, can be used.
  • all the alleles of the panD gene can be used, in particular also those which result from the degeneracy of the genetic code or by function-neutral sense mutations (sense mutations).
  • a particularly preferred aspartate decarboxylase according to the invention in addition to the aspartate decarboxylase from Corynebacterium glutamicum is the Escherichia coli mutant DV9 (Vallari and Rock, Journal of Bacteriology 164: 136-142 (1985)).
  • the disclosure of this publication with respect to the aforementioned mutant is hereby incorporated by reference and forms part of the disclosure of the present invention.
  • the aspartate decarboxylase activity is determined according to the method described by Dusch et al. (Applied and Environmental Microbiology 65 (4): 1530-1539 (1999)) in the section entitled "Aspartate Decarboxylase Activity Assay".
  • the cell according to the invention is a genetically modified Corynebacterium glutamicum cell, it may be sufficient if only the activity of the enzyme E 2 is increased, since even the wild type of these cells has a comparatively high pyruvate carboxylase activity. Nevertheless, it is also preferred when using Corynebacterium glutamicum if in the cell according to the invention both the activity of the enzyme E ia and the activity of the enzyme E 2 or both the activity of the enzyme E x b and the activity of the enzyme E 2 is increased.
  • the cells according to the invention are further characterized in that, besides the properties a) or b), preferably a) and b), they are characterized by at least one of the properties c) or d):
  • the genetically modified cell is able to release beta-alanine from the cell
  • the genetically modified cell is able to convert beta-alanine to 3-hydroxypropionic acid.
  • outgrowing encompasses both the active and passive transport of beta-alanine out of the cell into the medium surrounding the cell.
  • a 10% increase in efflux means that the genetically modified cell is able to remove 10% more beta-alanine from the cell in a defined time interval compared to its wild type under the same conditions, in particular with the same intracellular and extracellular beta-alanine concentration ,
  • the increased efflux is realized by an increase in the activity of the abovementioned transport enzymes, the increase being in turn due to the techniques already mentioned in connection with the enzymes E 1a , E 11 , and E 2 (mutation of the Transport enzyme or increase the gene expression of the transport enzyme) can be carried out.
  • Preferred transport enzymes in this connection are, for example, the so-called “multi-drug-resistance” proteins (MDR proteins), for example with the genes ebrA and ebrB as well as the so-called “multi-drug efflux transporters", where the “multi-drug resistance” efflux transporters "are particularly preferred, for example with the blt and bmr genes, Suitable transport systems for beta-alanine are also described in" Handbook of Corynebacterium glutamicum ", publisher L. Eggeling and M. Bott, CRC Press, Boca Raton, USA.
  • MDR proteins multi-drug-resistance proteins
  • Cells satisfying condition d) are capable of converting the formed beta-alanine to 3-hydroxypropionic acid. In principle, at least two variants are conceivable.
  • the cells can convert the beta-alanine via beta-alanyl-CoA, acrylyl-CoA and hydroxypropionyl-CoA to 3-hydroxypropionic acid.
  • the cell has an increased, preferably by at least 10%, more preferably by at least 25%, compared to its wild type preferably by at least 50%, more preferably still by at least 75%, more preferably by at least 100% and most preferably by at least 500%, more preferably to 5,000%, most preferably to 2,500% increased activity of at least one, preferably all the following enzymes E 3 to E 6 :
  • an enzyme E 3 which catalyzes the conversion of beta-alanine to beta-alanyl-coenzyme A
  • an enzyme E 4 which catalyzes the conversion of beta-alanyl-coenzyme A into acrylyl-coenzyme A
  • an enzyme E 6 which catalyzes the conversion of 3-hydroxypropionyl-coenzyme A to 3-hydroxypropionic acid.
  • Genetically modified cells which are particularly preferred according to the invention are those in which, where appropriate in addition to increasing at least one of the enzyme activities E ia or E ib and E 2, the activity of the following enzymes or enzyme combinations is increased: E 3 , E 4 , E 5 , E 6 , E 3 E 4 , E 3 E 5 , E 3 E 6 , E 4 E 5 , E 4 E 6 , E 5 E 6 , E 3 E 4 E 5 , E 3 E 4 E 6 , E 3 E 5 E 5 , E 4 E 5 E 6 or E 3 E 4 E 5 E 6.
  • the increase in the enzymatic activity of the enzymes E 3 to E 6 can also be effected by the techniques mentioned in connection with the enzymes E ia , E ia and E 2 , such as mutation or increase of the enzyme expression.
  • E 3 is a coenzyme A transferase (EC 2.8.3.1) or coenzyme A synthetase, preferably a coenzyme A transferase, E 4 is a beta alanyl coenzyme A ammonium lysase
  • Preferred enzymes with a CoA transferase activity are those from Megasphaera elsdenii, Clostridium propionicum, Clostridium kluyveri and also from Escherichia coli.
  • a DNA sequence coding for a CoA transferase mention should be made here of the sequence of Megasphaera elsdenii designated in WO-A-03/062173 with SEQ ID NO: 24.
  • Further preferred enzymes are those variants of the CoA transferase which are described in WO-A-03/062173.
  • Suitable enzymes having a beta-alanyl-coenzyme A ammonium lyase activity are, for example, those from Clostridium propionicum.
  • DNA sequences encoding such an enzyme can be obtained, for example, from Clostridium propionicum as described in Example 10 of WO-A-03/062173.
  • the DNA sequence which codes for the Clostridium propionicum beta-alanyl-coenzyme A ammonium lyase is given in WO-A-03/062173 as SEQ ID NO: 22.
  • Suitable enzymes having a 3-hydroxypropionyl-coenzyme A dehydratase activity are, in particular, those enzymes which are selected from genes selected from the group comprising ECHS1, EHHADH, HADHA, CG4389, CG6543, CG6984, CG8778, ech-1, ech-2, ech -3, ech-5, ech-6, ech-7, FCAALL.314, FCAALL.21, FOX2, ECI12, ECIl, paaF, paaG, yfcX, fadB, faoA, fadBlx, phaB, echA9, echA17, fad-1 , fad-2, fad-3, paaB, echA7, dcaE, hcaA, RSpO671, RSpOO35, RSpO648, RSpO647, RS03234, RS03271, RS04421, RS044
  • 3-hydroxypropionyl-coenzyme A dehydratases which are suitable according to the invention are in particular those from Chloroflexus aurantiacus, Candida rugosa, Rhodosprillium rubrum and Rhodobacter capsulates.
  • a particular example of a DNA sequence coding for a 3-hydroxypropionyl-coenzyme A dehydratase is given, for example, in WO-A-02/42418 as SEQ ID NO: 40.
  • the cells can convert the beta-alanine via malonic semialdehyde to 3-hydroxypropionic acid.
  • the cell has an increased, compared to its wild-type, preferably by at least 10%, more preferably by at least 25%, more preferably by at least 50%, even more preferably by at least n5%, more preferably at least 100% and most preferably at least 500%, more preferably up to 5,000%, most preferably up to 2,500% increased activity of at least one, preferably both enzymes E7 and E8:
  • an enzyme E 7 which catalyzes the conversion of beta-alanine to malonic acid semialdehyde
  • an enzyme E 8 which catalyzes the reaction of malonic semialdehyde to 3-hydroxypropionic acid.
  • Genetically modified cells which are particularly preferred according to the invention are those in which, where appropriate in addition to increasing at least one of the enzyme activities E ia or E ib and E 2, the activity of the following enzymes or enzyme combinations is increased: E 7 , E 8 and E 7 E 8 .
  • the increase in the enzymatic activity of the enzymes E 7 and E 8 can also be effected by the techniques mentioned in connection with the enzyme E ia , E ib and E 2 , such as mutation or increase of the enzyme expression.
  • E 7 a beta-alanine 2-oxoglutarate aminotransferase (EC 2.6.1.19) or a taurine 2-oxoglutarate transaminase (2.6.1.55), preferably a beta-alanine 2-oxoglutarate aminotransferase, and
  • E 8 is a 3-hydroxypropionate dehydrogenase (EC 1.1.1.59) or 3-hydroxybutyrate dehydrogenase (EC 1.1.1.30), but preferably a 3-hydroxypropionate dehydrogenase (EC 1.1.1.59)
  • genes of beta-alanine 2-oxoglutarate aminotransferase are known, for example, from Neurospora crassa ("About the beta-alanine-alpha-ketoglutarate transaminase", Aurich and Hoppe-Seyler's, Z. Physiol. Chem. 326: 25-33 (1961)) Further information on genes of this enzyme from other microorganisms can be found in particular the genes of 3-hydroxypropionate dehydrogenase or 3-hydroxybutyrate dehydrogenase Various microorganisms can be found in the KEGG GENE Database.
  • the cells according to the invention fulfill the condition d), it is further preferred for the cell to reduce by at least 10%, more preferably by at least 25%, more preferably by at least 50%, in addition to its wild-type even more preferably by at least 75%, more preferably by at least 100%, and most preferably by at least 500%, more preferably to 5,000%, most preferably to 2,500% reduced efflux of beta-alanine.
  • An efflux reduced by 10% means that the genetically modified cell is able to remove 10% less beta-alanine from the cell in a defined time interval under the same conditions, in particular with the same intracellular and extracellular beta-alanine concentration ,
  • the reduced efflux is realized by a reduction in the activity of the above-mentioned transport enzymes, whereby the reduction can be effected by mutation of the transport enzyme or reduction of the gene expression of the transport enzyme. It may also be advantageous that the cells which fulfill the condition d) use those cells whose wild-type is unable to remove beta-alanine from the cell.
  • the cells of the invention are capable of being produced alone (when condition d) is satisfied) or in combination with other microorganisms capable of producing 3-hydroxypropionic acid from beta-alanine (when condition (c) is satisfied) from pyruvate 3-hydroxypropionic acid to build.
  • these are capable of producing the pyruvate required for the production of the beta-alanine, in particular also from glycerol as carbon source.
  • the cell according to the invention has an increased, compared to its wild-type, preferably by at least 10%, more preferably by at least 25%, more preferably by at least 50%, moreover still more preferably by at least 75%. , more preferably by at least 100%, and most preferably by at least 500%, more preferably to 5,000%, most preferably to 2,500% increased activity of at least one, preferably all of the following enzymes Eg to E22:
  • an enzyme En which catalyzes the conversion of glycerol 3-phosphate to dihydroxyacetone phosphate
  • an enzyme E 12 that catalyzes the transfer of sulfur to the sulfur acceptor thioredoxin 1 an enzyme E13, which catalyzes the hydrolysis of phospholipids to form alcohols and glycerol,
  • an enzyme Ei 4 which catalyzes the transport of glycerol-3-phosphate into the cell in exchange for phosphate;
  • an enzyme Ei 5 which catalyzes the conversion of dihydroxyacetone phosphate to glyceraldehyde-3-phosphate
  • an enzyme E i6 which catalyzes the conversion of glyceraldehyde-3-phosphate to 1,3-bisphosphoglycerate ,
  • an enzyme E20 which catalyzes the conversion of phosphoenolpyruvate to pyruvate
  • an enzyme E22 which catalyzes the conversion of dihydroxyacetone to dihydroxyacetone phosphate.
  • Genetically modified cells which are particularly preferred according to the invention are those in which, in addition to the increase of one or more of the enzyme activities E ia or Eib and E 2 and optionally one or more of the enzyme activities E 3 until E 6 or E 7 and E 8 the activity of the following enzymes or enzyme combinations is increased: E 9 , Ei 0 , En, E 12 , E 13 , E 14 , E 15 , E 16 , E 11 , Ei 8 , E 19 , e 20, e 21, e 22, e I0 e H, wherein an increase preferably one or more of the enzyme activities selected from the group consisting of e 9, egg 0, En, e 13, egg 4, e 2 i and e 22 particularly and an increase in enzyme activities Eio and En is most preferred.
  • E 9 is an aquaglyceroporine (glycerol facilitator) which is preferably encoded by the glpF gene
  • Eio is a glycerol kinase (EC 2.7.1.30) which is preferably encoded by the glpK gene
  • En is a glycerol-3-phosphate dehydrogenase ( EC 1.1.99.5), preferably a FAD-dependent glycerol-3-phosphate
  • Dehydrogenase preferably from the glpA gene, the glpB
  • E 12 is a sulfur transferase, which is encoded by the gene glpE, E13 a glycerol phosphodiesterase (EC 3.1.4.46), which is preferably from glpQ- Egg 4 is a glycerol-3-phosphate permease, which is preferably encoded by the glpT gene
  • E 2 i is a glycerol dehydrogenase (EC 1.1.1.6), which is preferably encoded by the gldA gene, and E 22 is a dihydroxyacetone kinase (EC 2.7.1.29), which is preferably encoded by the dhaK gene.
  • the gene sequences of the above-mentioned enzymes are known in the literature and may be, for example, the KEGG GENE Database, the National Library of Biotechnology Information (NCBI) databases of the National Library of Medicine (Bethesda, MD, USA) or the nucleotide sequence database of the European Molecular Biologies Laboratories (EMBL, Heidelberg, Germany and Cambridge, UK).
  • NCBI National Library of Biotechnology Information
  • EMBL European Molecular Biologies Laboratories
  • gap-gene encoding glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (Eikmanns (1992), Journal of Bacteriology 174: 6076-6086)
  • the tpi gene encoding triosephosphate isomerase (Eikmanns (1992), Journal of Bacteriology 174: 6076-6086)
  • the pgk gene encoding the 3-phosphoglycerate kinase (Eikmanns (1992), Journal of Bacteriology 174: 6076-6086) are known from other sources.
  • genes of the enzymes Eg to E 22 can be genetically engineered cells in which at least one, more preferably at least two, more preferably at least three and most preferably all activities of the enzymes Eg to E 22 by the above in connection with the Enzyme E ia , E ib and E 2 described techniques (mutation of the enzyme or increase of the enzyme expression) has been increased produce. These cells are able to be cultured in the presence of glycerol as the sole carbon source (or together with carbohydrates as another carbon source).
  • the following genes preferably express heterologously in the cells according to the invention: the glpG gene or the b3424 gene, the glpX gene or the 3925 gene , the dhaR gene, the ycgU gene or the bl201 gene, the fsa gene, the mipB gene, the ybiZ gene or the B0825 gene.
  • the nucleotide sequences of these genes may in turn be the KEGG GENE Database, National Library of Medicine (NCBI) databases of the National Library of Medicine (Bethesda, MD, USA) or the nucleotide sequence database of the European Molecular Biology Laboratories (EMBL, Heidelberg, Germany or Cambridge, UK).
  • NCBI National Library of Medicine
  • EMBL European Molecular Biology Laboratories
  • the cells are in a position not to obtain the pyruvate required for the production of the beta-alanine or at least only to a small extent from glycerol.
  • the provision of the pyruvate in the cells takes place mainly by glycolysis.
  • Such cells are culturable in a nutrient medium, which contains carbohydrates such as glucose as a carbon source.
  • the cells according to the invention optionally in addition to an increased activity of at least one, preferably all of the aforementioned enzymes E 9 to E22, one compared to their wild-type increased, preferably by at least 10%, more preferably at least 25%, more preferably at least 50%, still more preferably at least 75%, even more preferably at least 100% and most preferably at least 500%, most preferably up to 5,000%, most preferably up to 2,500% increased activity of at least one, preferably all of the following enzymes Ei6 to E20 and E23 to E27: an enzyme E23, which facilitates the diffusion of glycerol into the cell, an enzyme E 2 4, which the conversion of glucose to ⁇ -D Glucose-6-phosphate catalyzed, an enzyme E25, which is the reaction of ⁇ -D-
  • Glucose-6-phosphate catalyzed to ß-D-fructose-6-phosphate, an enzyme E26, which the conversion of ß-D-
  • Fructose-6-phosphate catalyses ⁇ -D-fructose-1,6-biphosphate, an enzyme E27 which inhibits the conversion of ⁇ -D-
  • Biphosphoglycerate catalyzes to 3-phosphoglycerate, an enzyme Ei 8 , which is the reaction of
  • Phosphoglycerate catalyzed to Phosphoenolpyruvat and an enzyme E 2 o, which catalyze the conversion of phosphoenolpyruvate to pyruvate.
  • Erf indungsgelant particularly preferred genetically modified cells are those in which, optionally in addition to increase one or more of the enzyme activities E ia or E ib and E 2 and optionally one or more of the enzyme activities E 3 to E 6 or E 7 and E 8 the Activity of the following enzymes or enzyme combinations: E 16 , E 11 , E 13 , E 19 , E 20 , E 23 , E 24 , E 25 , D 26 , E 27 and Ei 6 Ei 7 EisEi 9 E 2 oE 23 E 24 E 25 E 26 E 27 .
  • E 23 is a glucose transporter, preferably a glucose transporter encoded by a gene selected from the group comprising glutl, gluP or fucP, or a glucose permease (2.7.1.69),
  • E 24 is a glucokinase (2.7.1.2),
  • E 25 is a glucose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.9),
  • E 26 is a 6-phosphofructo-kinase (EC 2.7.1.11),
  • Egg 6 is a glyceraldehyde-3-phosphate Deydrogenase (EC 1.2.1.12)
  • nucleotide sequences of these genes can again be found in the KEGG GENE Database, National Library of Medicine (NCBI) databases of the National Library of Medicine (Bethesda, MD), the nucleotide sequence database of the European Molecular Biology Laboratories (EMBL, Heidelberg, Germany or Cambridge, UK).
  • the activity of the aspartate aminotransferase (EC 2.6.1.1.A) may be increased.
  • the sequence of the corresponding gene (aspB) can be found, inter alia, the KEGG GENE Database. Furthermore, in the cells according to the invention it is preferred to monitor the activity of enzymes,
  • phosphoenolpyruvate such as the phosphoenylpyruvate carboxy-kinase (EC 4.1.1.49) (see also DE-A-199 50 409),
  • E 31 which catalyze the conversion of beta-alanine into carnosine, such as carnosine synthase (EC 6.3.2.11),
  • pantothenate such as pantothenate-beta-alanine ligase (EC 6.3.2.1),
  • E 34 which catalyze the conversion of beta-alanine to N-carbomyl-beta-alanine, such as beta-ureidopropionase (EC 3.5.1.6),
  • E 36 which catalyze the conversion of pyruvate to acetyl-coenzyme A, such as pyruvate dehydrogenase (EC 1.2.1.51),
  • E 37 which catalyzes the conversion of pyruvate to acetyl phosphate, such as pyruvate oxidase (EC 1.2.3.3),
  • E 3 S catalyzes which the conversion of pyruvate to acetate, such as the pyruvate dehydrogenase (EC 1.2.2.2),
  • E 39 which catalyze the conversion of pyruvate to phosphoenolpyruvate, such as phosphoenolpyruvate synthase (EC 2.7.9.2) or pyruvate-phosphate dikinase (EC 2.7.9.1), and / or
  • E 40 which catalyze the conversion of pyruvate into alanine, such as alanine transaminase (2.6.1.2) or alanine-oxo acid transaminase (EC 2.6.1.12)
  • the term "attenuate” in this context describes the reduction or elimination of the intracellular activity of one or more enzymes in a cell which are encoded by the corresponding DNA, for example by using or inserting a weak promoter Gene or allele used, which codes for a corresponding enzyme with a low activity or inactivates the corresponding gene or enzyme and optionally combines these measures.
  • the pentose phosphate route for example by increasing the activity of glucose-6-phosphate dehydrogenase (EC 1.1.1.49) and 6-phosphogluconate dehydrogenase (EC 1.1 .1.44), and at the same time to inhibit glycolysis, for example by attenuating the activity of glucose-6-phosphate isomerase, as described in WO-A-01/07626.
  • the activity of the glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.4) is increased by one of the techniques mentioned in connection with the enzyme E ia , Eib and E 2 .
  • the genes of this enzyme from numerous microorganisms can also be taken from the KEGG GENE Database.
  • US Pat. No. 6,355,454 and WO-A-00/53726 describe genes for glutamate dehydrogenase and possibilities for overexpression of this enzyme. The disclosure of these references for carrying out the overexpression of glutamate dehydrogenase in cells is hereby incorporated by reference and forms part of the disclosure of the present invention.
  • beta-alanine and alpha-alanine in a weight ratio of at least 2: 1, particularly preferably at least 3: 1 and furthermore preferably at least 4: 1.
  • a formation of beta-alanine and alpha-alanine in a weight ratio of at least 2: 1 means that the cells within a time interval of 29 hours at 37 ° C at least form twice as much beta-alanine as alpha-alanine, preferably form and release into the nutrient medium surrounding the cells.
  • glucose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.9) is attenuated.
  • the present invention relates to a genetically engineered cell which
  • an increased aspartate decarboxylase activity EC 4.1.1.11
  • an aspartate decarboxylase from Corynebacterium glutamicum preferably by an aspartate decarboxylase from Corynebacterium glutamicum
  • beta-alanyl-coenzyme A ammonium lysase activity EC 4.3.1.6
  • 3-hydroxypropionyl-coenzyme A dehydratase activity EC 4.2.1.- in particular EC 4.2.1.17.
  • the present invention relates in particular to a genetically modified cell, which
  • an increased aspartate decarboxylase activity EC 4.1.1.11
  • an aspartate decarboxylase from Corynebacterium glutamicum preferably by an aspartate decarboxylase from Corynebacterium glutamicum
  • the present invention also relates to a genetically engineered cell which
  • an increased pyruvate carboxylase activity (EC 6.4.1.1), preferably by expression of the genome-inducing mutant described in "A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum” (Ohnishi et al., Applied Microbiology and Biotechnology 58 : 217-223 (2002)), and
  • an increased aspartate decarboxylase activity (EC 4.1.1.11), preferably by an aspartate decarboxylase from Corynebacterium glutamicum and at least one of, preferably all of the following properties:
  • the present invention relates in particular to a genetically modified cell, which
  • the present invention also relates to a genetically engineered cell which
  • glycerol-3-phosphate dehydrogenase activity EC 1.1.99.5
  • a glycerol-3-phosphate dehydrogenase which is encoded by the glpD gene
  • glycerol kinase activity EC 2.7.1.30
  • a glycerol kinase encoded by the glpK gene preferably by a glycerol kinase encoded by the glpK gene
  • the cell is preferably a microorganism of the strain Corynebacterium glutamicum.
  • the genetically engineered cell is able to remove beta-alanine from the cell
  • the genetically engineered cell is capable of converting beta-alanine to 3-hydroxypropionic acid
  • the enzymes E ia , E ib and E2 are preferably those enzymes which have already been described in connection with the cells according to the invention.
  • the increase in the abovementioned enzyme activities is preferably carried out in accordance with the genetic engineering methods described in connection with the cells according to the invention and also in the scope described in connection with the cells according to the invention.
  • As cells in which the activity of the enzymes E ia or E ib and / or E2 is increased preferably those genera and strains are used which have already been mentioned above in connection with the genetically modified cells according to the invention.
  • Cells particularly preferably used in the method according to the invention are those of the genera Corynebacterium, Brevibacterium, Bacillus, Lactobacillus, Lactococcus, Candida, Pichia, Kluveromyces, Saccharomyces, Bacillus, Escherichia and Clostridium, Bacillus flavum, Bacillus lactofermentum, Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, Kluveromyces lactis, Candida blankii, Candida rugosa, Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens and Pichia postoris are moreover preferred and Corynebacterium glutamicum is most preferred.
  • cells can be used in the inventive method selected from the group consisting of the wild-type strains Corynebacterium glutamicum ATCC13032, Corynebacterium acetoglutamicum ATCC15806, Corynebacterium acetoacidophilum ATCC13870, Corynebacterium thermoaminogenes FERM BP-1539, Corynebacterium molassecola ATCC17965, Brevibacterium flavum ATCC14067, Brevibacterium lactofermentum ATCC13869 and Brevibacterium divaricatum ATCC14020.
  • Cells capable of releasing beta-alanine from the cell are preferably those cells which have an increased, preferably at least 10%, more preferably at least 25%, compared to their wild-type %, moreover preferably by at least 50%, still more preferably by at least 75%, further preferably by at least 100%, and most preferably by at least 500%, more preferably by 5,000%, most preferably by 2,500% increased efflux of Preferably, this increased efflux is facilitated by increased activity of an enzyme that catalyzes the efflux of beta-alanine out of the cell.
  • Cells capable of converting beta-alanine to 3-hydroxypropionic acid are in particular those cells in which the activity of at least one, preferably all, enzymes E 3 described in connection with the cells according to the invention to E 6 or cells in which the activity of at least one, preferably both in connection with the Cells of the invention described enzymes E 7 and Es increased.
  • the method for producing genetically modified cells also includes further method steps, such as increasing the activity of one or more of the enzymes Eg to E 27 described in connection with the cells according to the invention or weakening the activity associated with the Cells according to the invention described enzymes E28 to E 40 comprises.
  • a contribution to the solution of the abovementioned objects is also provided by the genetically modified cells obtainable by the process described above. These are able to form alone or in combination with other cells from carbohydrates or from glycerol 3-hydroxypropionic acid.
  • cells which are able to take up beta-alanine and convert it to 3-hydroxypropionic acid particular preference is given to those cells in which the activity of at least one, preferably of all enzymes E 3 to E 6 or cells in which the activity is at least one, preferably both enzymes E 7 and E 8 has been increased compared to the wild-type is preferred.
  • Such cells are described, for example, in WO-A-02/42418 and WO-A-03/62173.
  • cells in which, in addition to these enzymatic activities, the activity of enzymes which increase the transport or efflux of beta-alanine into the cells have also been particularly preferred.
  • the genetically modified cells according to the invention can be used in process step i) continuously or discontinuously in the batch process (batch culturing) or in the fed-batch process (feed process) or repeated-fed-batch process (repetitive feed process) for the production of beta Alanine with the nutrient medium in contact and thus cultivated. Also conceivable is a semi-continuous process, as described in GB-A-1009370. A summary of known cultivation methods can be found in the textbook by Chmiel ("Bioprocessing Technology 1. Introduction to the
  • sugars and carbohydrates such as glucose, sucrose, lactose, fructose, maltose, molasses, starch and cellulose, oils and fats such.
  • oils and fats such as soybean oil, sunflower oil, peanut oil and coconut oil, fatty acids such.
  • palmitic acid, stearic acid and linoleic acid alcohols such.
  • glycerol and ethanol and organic acids such as acetic acid can be used.
  • acetic acid can be used.
  • These substances can be used individually or as a mixture.
  • Particularly preferred is the use of carbohydrates, in particular monosaccharides, oligosaccharides or polysaccharides, as described in US 6,01,494 and US 6,136,576, of C 5 sugars or of glycerol.
  • organic nitrogen-containing compounds such as peptones, yeast extract, meat extract, malt extract, corn steep liquor, soybean meal and urea or inorganic compounds such as ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium phosphate, ammonium carbonate and ammonium nitrate may be used.
  • the nitrogen sources can be used singly or as a mixture.
  • phosphorus source can phosphoric acid
  • the culture medium must continue to contain salts of metals such. As magnesium sulfate or iron sulfate, which are necessary for growth. Finally, essential growth substances such as amino acids and vitamins can be used in addition to the above-mentioned substances.
  • suitable precursors can be added to the culture medium.
  • the stated feedstocks can be used for Culture may be added in the form of a one-time batch or fed in a suitable manner during the cultivation.
  • the culture For pH control of the culture basic compounds such as sodium (hydrogen) carbonate, sodium hydroxide, potassium hydroxide, ammonia or ammonia water or acidic compounds such as phosphoric acid or sulfuric acid are used in a suitable manner.
  • basic compounds such as sodium (hydrogen) carbonate, sodium hydroxide, potassium hydroxide, ammonia or ammonia water or acidic compounds such as phosphoric acid or sulfuric acid are used in a suitable manner.
  • B. fatty acid polyglycol esters are used.
  • the medium suitable selective substances such as B. antibiotics are added.
  • oxygen or oxygen-containing gas mixtures such. For example, air is introduced into the culture.
  • the temperature of the culture is normally from 20 0 C to 45 ° C and preferably 25 ° C to 40 0 C.
  • cells which can convert glycerol as a substrate, it may be preferred to employ as the cells, those cells which are described in US Pat. No. 6,803,218 and in these cells increase the activity of the enzymes E ia or Ei b and / or E 2 (and optionally the other enzymes E3 to E20).
  • the cells can be heated at temperatures in the region of 40.degree be cultured to 100 ° C.
  • the beta-alanine-containing nutrient medium is contacted with the other cells capable of taking up the beta-alanine and converting it to 3-hydroxypropionic acid.
  • the cells according to the invention and the other cells can be cultured together in a nutrient medium, so that the beta-alanine released by the cells according to the invention is taken up, as it were, in statu nascendii of the other cells and converted to 3-hydroxypropionic acid.
  • the process according to the invention for the preparation of 3-hydroxypropionic acid may also comprise, as a further process step iii), the purification of the finally obtained 3-hydroxypropionic acid from the nutrient medium.
  • This purification can be carried out by any cleaning method known to those skilled in the art. For example, sedimentation, filtration or centrifugation techniques can be used to separate the cells. From the liberated from cells, 3-hydroxypropionic acid-containing nutrient medium, the 3-hydroxypropionic acid can be isolated by extraction, distillation, ion exchange, electrodialysis or crystallization.
  • the purification of the 3-hydroxypropionic acid from the nutrient solution is carried out continuously according to a particular embodiment of the method according to the invention, wherein it is further preferred in this context to carry out the fermentation continuously, so that the entire process of the enzymatic reaction of the starting materials to form 3- Hydroxypropionic acid can be carried out continuously until the purification of the 3-hydroxypropionic acid from the nutrient medium.
  • a device for separating the cells used in the fermentation preferably via a filter having an exclusion size in a range of 20 to 200 kDa, in which a solid / liquid Separation takes place.
  • centrifuge a suitable sedimentation device or a combination of these devices, wherein it is particularly preferred to first separate at least a portion of the cells by sedimentation and then to supply the cells partially freed from the nutrient medium of an ultrafiltration or centrifugation device.
  • the enriched in its 3-hydroxypropionic acid portion fermentation product is fed after separation of the cells of a preferably multi-stage separation plant.
  • a separation plant a plurality of series-connected separation stages are provided, each of which lead out return lines, which are returned to the second fermentation tank. Furthermore lead out of the respective separation stages derivatives.
  • the individual separation stages can work according to the principle of electrodialysis, reverse osmosis, ultrafiltration or nanofiltration. As a rule, these are membrane separation devices in the individual separation stages. The selection of the individual separation stages results from the nature and extent of the fermentation by-products and substrate residues.
  • the 3-hydroxypropionic acid can also be separated by extraction from the cell-free culture medium, wherein in In this case, ultimately, the pure 3-hydroxypropionic acid can be obtained.
  • high-boiling organic amines can be added to the nutrient medium in which the 3-hydroxypropionic acid is present as the ammonium salt. Subsequently, the mixture thus obtained is heated, with ammonia and water escape and the 3-hydroxypropionic acid is extracted into the organic phase.
  • a contribution to achieving the object stated at the outset is also made by a process for preparing 3-hydroxypropionic acid, comprising the process step of bringing into contact a cell according to the invention which has the property d) or D), with a nutrient medium comprising carbohydrates or glycerol under conditions under which 3-hydroxypropionic acid is formed from the carbohydrates or the glycerol.
  • Cultivation is essentially the same as in the method for the preparation of 3-hydroxypropionic acid described above, but in this case according to the invention, genetically modified cells are used, which can implement beta-alanine to 3-hydroxypropionic acid. Cells according to the invention which are capable of doing so have already been described in detail at the beginning.
  • Hydroxypropionic acid may comprise, as a further process step, the purification of the 3-hydroxypropionic acid from the nutrient medium.
  • the dehydration of the 3-hydroxypropionic acid can basically be carried out in the liquid phase or in the gas phase, liquid-phase dehydration being preferred. Furthermore, it is preferred according to the invention that the dehydration is carried out in the presence of a catalyst, wherein the type of catalyst used depends on whether a gas-phase or a liquid-phase reaction is carried out. Suitable dehydration catalysts are both acidic and alkaline catalysts. Acid catalysts are particularly preferred because of the low tendency to oligomer formation. Of the
  • Dehydration catalyst can be used both as a homogeneous and as a heterogeneous catalyst. Subsequent to the dehydration, an acrylic acid-containing phase is obtained, which can optionally be purified by further purification steps, in particular by distillation, extraction or crystallization or by a combination of these methods.
  • the free-radical polymerization of acrylic acid is carried out by polymerization processes known to those skilled in the art and can be carried out both in an emulsion or suspension and in aqueous solution. Furthermore, further co-monomers, in particular crosslinkers, may be present during the polymerization. Particular preference is given to free-radical polymerization of the acrylic acid obtained in process step II) in at least partially neutralized form in the presence of crosslinking agents. In this polymerization, hydrogels are obtained which can then be comminuted, ground and optionally surface-modified, in particular surface-postcrosslinked. The polymers thus obtained are particularly suitable for use as superabsorbents in hygiene articles such as diapers or sanitary napkins.
  • esterification of acrylic acid is carried out by the skilled person known esterification, particularly preferably characterized in that the obtained in step II) acrylic acid with alcohols, preferably with methanol, ethanol, 1-propanol, 2-propanol, n-butanol, tert. Butanol or iso-butanol is brought into contact and to a temperature of at least 50 0 C, more preferably at least 100 0 C heated.
  • the water formed in the esterification can be removed by the addition of suitable separation aids by azeotropic distillation from the reaction mixture.
  • a further contribution to the solution of the abovementioned objects is the use of a genetically modified cell which has at least one, preferably both, of the properties a) and b) in comparison with its wild type:
  • an increased compared to their wild-type preferably by at least 10%, more preferably by at least 25%, more preferably by at least 50%, moreover still more preferably by at least 75%, further preferably by at least 100% and am most preferably at least 500%, more preferably up to 5,000%, most preferably up to 2,500% increased activity of an enzyme E ia which catalyzes the reaction of pyruvate to oxaloacetate or an enzyme Eib that catalyzes the reaction of phosphoenolpyruvate to oxaloacetate, but preferably an enzyme E ia , which catalyzes the conversion of pyruvate to oxaloacetate,
  • FIG. 1 shows the reaction scheme for the formation of beta-alanine from glucose or glycerol via pyruvate, oxaloacetate and aspartate.
  • FIG. 2 shows the reaction scheme for the formation of 3-hydroxypropionic acid from beta-alanine via beta-alanyl-coenzyme A, acrylyl-coenzyme A and 3-hydroxypropionyl-coenzyme A or via malonic semialdehyde.
  • FIG. 3 shows the plasmid vectors pVWexl-panD.
  • FIG. 4 shows the plasmid vectors pVWExl-glpKD Ec .
  • FIG. 5 shows the plasmid vectors pVWExl-panD-glpKD Ec .
  • a genetically modified cell of the strain Corynebacterium glutamicum was produced in which the heterologous genes glpK, glpD, and the homologous genes pyc and panD were expressed.
  • the procedure was as follows:
  • strain DM1727 was described by Georgi et al. (Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) and represents a genetically modified Corynebacterium glutamicum strain which has an increased activity of the pyruvate carboxylase compared to the wild-type strain. This increased activity of the enzyme is due to a mutation of the amino acid at position 458 (replacement of proline by serine). See also "A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum genome. Information to generate a novel L-lysine-producing mutant" (Ohnishi et al., Applied Microbiology and Biotechnology 58: 217-223 (2002)).
  • glpK rev 5'TCTAGAT_TATTCGTCGTGTTCTTCCCACGCC (SEQ ID NO: 2) (the underlined nucleotide corresponds to the base pair 4113737 in the MG1655 genome, the interface corresponds to an XbaI interface) gip ⁇ for : 5 'GGGACGTCGAC ⁇ GG ⁇ G ⁇ GATGACTGAAAAAATATATC
  • the primers corresponded to the bases 4113737 to 4113762 and 4115225 to 4115245 of the glpK gene of E. coli.
  • PCR could be carried out according to the standard method of Innis et al. (PCR protocols, A Guide to Methods and Applications, 1990, Academic Press) for non-degenerate, homologous primers a fragment of 1533 base pairs of E. coli chromosomal DNA which, as described in Eikmanns et al. (Microbiology, 140: 1817-1828 (1994)) was amplified.
  • This PCR fragment was inserted into the plasmid vector pGEM-T (Promega Corporation, Madison, Wisconsin, USA) to obtain the plasmid vector pGEM-T-glpK E. c . cloned.
  • glpD rev 5 'GTTAATTCTAGATTACGACGCCAGCGATAA (SEQ ID NO: 5)
  • the primers corresponded to bases 3560036 to 3560053 and 3561524 to 3561541 of the E. coli plpD gene.
  • PCR could be carried out according to the standard method of Innis et al. (PCR protocols, A Guide to Methods and Applications, 1990, Academic Press) for non-degenerate, homologous primers a fragment of 1524 base pairs of E. coli chromosomal DNA which, as described in Eikmanns et al. (Microbiology 140: 1817-1828 (1994)), was amplified.
  • This PCR fragment was inserted into the plasmid vector pGEM-T (Promega Corporation, Madison, Wisconsin, USA) to obtain the plasmid vector pGEM-T-glpD E. c . cloned.
  • the 1524 base pair fragment was excised with Xball from the plasmid vector pGEM-T glpD Ec and into the spel-SAP (shrimp alkaline phosphatase) cut plasmid vector pGEM-T-glpK Ec to obtain the plasmid vector pGEM-T-glpKD E. c cloned.
  • the glpKD E. c Fragment excised by SalI and cut with SalI plasmid pVWExl (this expression plasmid was et by Peters-Wendisch al, Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. 3: described 295- 300 (2001)) was cloned to obtain the plasmid pVWExl-glpKD Ec.
  • NC003450 Corynebacterium glutamicum genome
  • NCglO133 rev 5 'CTAAAACGGGTACCCTAAATGCTTCTCGACGTC
  • the primers corresponded to bases 147570 to 147588 and 147964 to 147980 of the panD gene of C. glutamicum.
  • PCR could be carried out according to the standard method of Innis et al. (PCR protocols, A Guide to Methods and Applications, 1990, Academic Press) for non-degenerate, homologous primers, a fragment of about 430 base pairs of C. glutamicum chromosomal DNA which, as described in Eikmanns et al. (Microbiology 140: 1817-1828 (1994)), was amplified.
  • This PCR fragment was cloned into the plasmid vector pGEM-T (Promega Corporation, Madison, Wisconsin, USA) to obtain the plasmid vector pGEM-T-panD.
  • panD fragment was excised from pGEM-T-panD using Spei and KpnI and cloned into the plasmid vector pVWEx1 cut with XbaI and KpnI to obtain the plasmid vector pVWEx1-panD. Furthermore, the panD fragment cut from pGEM-T-Pand by means of SpeI and KpnI was transformed into XbaI and KpnI-cut plasmid vector pVWExl-glpKÜEc to obtain the plasmid vector pVWExl-panD-glpKD Ec (SEQ ID NO: 1).
  • the plasmid vectors pVWExl-panD, pVWExl-glpKD Ec and pVWExl-panD-glpKD Ec (SEQ ID NO: 1) are shown in FIGS.
  • the alpha or beta alanine concentration was detected by HPLC.
  • the method was described by Georgi et al. (Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) and by Marx et al. (US 6,355,454).
  • To identify the alpha-alanine or beta-alanine signal a corresponding standard was used.
  • the alpha or beta alanine concentration was detected by HPLC.
  • the method was described by Georgi et al. (Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) and by Marx et al. (US 6,355,454).
  • To identify the alpha-alanine or beta-alanine signal a standard was used.

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Abstract

Die vorliegende Erfindung betrifft eine gegenüber ihrem Wildtyp gentechnisch veränderte Zelle, welche mindestens eine der Eigenschaften a) oder b) aufweist: a) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität eines Enzyms E1, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert, oder eines Enzyms E1b, welches die Umsetzung von Phosphoenolpyruvat zu Oxalacetat katalysiert, b) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität eines Enzyms E2, welches die Umsetzung von Aspartat zu Beta-Alanin katalysiert, wobei die Zelle neben den Eigenschaften a) oder b) durch mindestens eine der Eigenschaften c) oder d) gekennzeichnet ist: c) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen; d) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin zu 3-Hydroxypropionsäure umzusetzen. Die Erfindung betrifft auch Verfahren zur Herstellung einer gentechnisch veränderten Zelle, die durch diese Verfahren erhältlichen gentechnisch veränderten Zellen, Verfahren zur Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure, ein Verfahren zur Herstellung von Acrylsäure, ein Verfahren zur Herstellung von Polyacrylaten, ein Verfahren zur Herstellung von Acrylsäureestern sowie die Verwendung von Zellen zur Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure.

Description

Mikrobiologische Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure
Die vorliegende Erfindung betrifft eine gegenüber ihrem Wildtyp gentechnisch veränderte Zelle, Verfahren zur Herstellung einer gentechnisch veränderten Zelle, die durch diese Verfahren erhältlichen, gentechnisch veränderten Zellen, Verfahren zur Herstellung von 3- Hydroxypropionsäure, ein Verfahren zur Herstellung von Polyacrylaten, ein Verfahren zur Herstellung von Acrylsäureestern sowie die Verwendung von Zellen zur Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure .
Acrylsäure ist eine technisch sehr bedeutende Ausgangsverbindung. Sie dient unter anderem zur Herstellung von Polyacrylaten, insbesondere von vernetzten, teilneutralisierten Polyacrylaten, die im trockenen und im wesentlichen wasserfreien Zustand eine große Fähigkeit zur Wasserabsorption aufweisen. Diese als „Superabsorber" bezeichneten, vernetzten Polyacrylate können ein Mehrfaches ihres Eigengewichts an Wasser absorbieren. Aufgrund der hohen Absorptionsfähigkeit eignen sich die absorbierenden Polymere zur Einarbeitung in wasserabsorbierenden Strukturen und Gegenständen, wie z. B. Babywindeln, Inkontinenzprodukten oder Damenbinden. In diesem Zusammenhang wird auf Modern Superabsorbent Polymer Technology; F. L. Buchholz, A. T. Graham, Wiley-VCH, 1998 verwiesen .
Acrylsäureester, wie beispielsweise Methylacrylat und Butylacrylat, sind ebenfalls industriell bedeutende Ausgangsverbindungen, die insbesondere zur Herstellung von Copolymeren eingesetzt werden. Diese Copolymere werden meist in Form von Polymerdispersionen als Klebstoffe, Anstrichmittel oder Textil-, Leder-und Papierhilfsmittel eingesetzt .
Die Herstellung der Acrylsäure erfolgt technisch in erster Linie durch die zweistufige, katalytische Gasphasenoxidation von Propylen, wobei das Propylen wiederum durch thermische Spaltung von bei der Erdölverarbeitung anfallenden Benzinen erhalten wird. Die auf diese Weise erhaltene Acrylsäure wird anschließend durch den Zusatz von Alkoholen gegebenenfalls verestert.
Nachteilig bei dem zweistufigen Verfahren zur Herstellung von Acrylsäure ist zum einen, dass die in beiden Stufen angewandten Temperaturen zwischen 300 und 4500C zur Bildung von Oligomeren und weiteren unerwünschten Crackprodukten führen. Dieses hat zur Folge, dass eine unerwünscht hohe Menge an höher als die Acrylsäure siedenden Verbindungen oder an Verbindungen, die nur schwer von der Acrylsäure zu trennen sind, wie etwa Essigsäure, anfallen. Diese Verbindungen müssen in der Regel destillativ von der Acrylsäure abgetrennt werden, was wiederum zu einer weiteren thermischen Belastung der Acrylsäure und der damit verbundenen Bildung von Dimeren und Oligomeren führt. Ein hoher Gehalt an Acrylsäuredimeren oder Acrylsäureoligomeren ist jedoch nachteilig, da diese Dimeren oder Oligomeren bei der Herstellung von Superabsorbern durch radikalische Polymerisation von Acrylsäure in Gegenwart von Vernetzern in das Polymer eingebaut werden. Bei der im Anschluss an die Polymerisation erfolgenden Nachbehandlung der Oberfläche der Polymerpartikel, beispielsweise im Rahmen einer Oberflächennachvernetzung, werden die einpolymerisierten Dimere jedoch unter Bildung von ß- Hydroxypropionsäure gespalten, die unter den Nachvernetzungsbedingungen unter Bildung von Acrylsäure dehydratisiert wird. Ein hoher Gehalt an dimerer Acrylsäure in der zur Herstellung der Superabsorber eingesetzten Acrylsäure führt daher dazu, dass der Gehalt an Acrylsäuremonomeren bei einer thermischen Behandlung der Polymere, wie sie bei der Nachvernetzung erfolgt, ansteigt.
Auch andere, oftmals toxische Verbindungen sind in der durch die katalytische Gasphasenoxidation erhältlichen Acrylsäure noch nachweisbar. Zu diesen Verunreinigungen gehören insbesondere Aldehyde, die sich störend auf den Polymerisationsverlauf auswirken, mit der Folge, dass die Polymere noch beachtliche Mengen an löslichen Bestandteilen beinhalten .
Zur Lösung dieser Probleme sind im Stand der Technik bereits einige Ansätze beschrieben worden (siehe zum Beispiel EP-A-O 574 260 oder DE-A-101 38 150) .
Ein weiterer Nachteil dieses herkömmlichen Verfahrens zur Herstellung von Acrylsäure besteht darin, dass das eingesetzte Edukt (Propylen) aus Erdöl und somit aus nicht- nachwachsenden Rohstoffen hergestellt wird, was vor allem im Hinblick auf die zunehmend schwerer und vor allem teurer werdende Erdölgewinnung aus ökonomischen Aspekten vor allem langfristig bedenklich ist.
Auch hier sind im Stand der Technik bereits einige Ansätze beschrieben, um diesem Problem zu begegnen.
So beschreibt WO-A-03/62173 die Herstellung von Acrylsäure, bei dem fermentativ aus Pyruvat zunächst Alpha-Alanin gebildet wird, welches dann mittels des Enzyms 2,3- Aminomutase zu Beta-Alanin umgesetzt wird. Das Beta-Alanin wiederum wird über ß-Alanyl-CoA, Acrylyl-CoA, 3- Hydroxypropionyl-CoA oder aber über Malonäuresemialdehyd zu 3-Hydroxypropionsäure umgesetzt, aus der nach einer Dehydratisierung Acrylsäure enthalten wird.
WO-A-02/42418 beschreibt einen weiteren Weg zur Herstellung von beispielsweise 3-Hydroxypropionsäure aus nachwachsenden Rohstoffen. Dabei wird Pyruvat zunächst zu Lactat umgesetzt, aus dem anschließend Lactyl-CoA gebildet wird. Das Lactyl-CoA wird dann über Acrylyl-CoA und 3- Hydroxypropionyl-CoA zu 3-Hydroxypropionsäure umgesetzt. Eine weitere, in der WO-A-02/42418 beschriebene Route zur Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure sieht die Umsetzung von Glucose über Propionat, Propionyl-CoA, Acrylyl-CoA und 3-Hydroxypropionyl-CoA vor. Auch beschreibt diese Druckschrift die Umsetzung von Pyruvat zu 3- Hydroxypropionsäure über Acetyl-CoA und Malonyl-CoA. Die durch die jeweiligen Routen erhaltene 3-Hydroxypropionsäure kann durch Dehydratisierung zur Acrylsäure umgesetzt werden .
WO-A-01/16346 beschreibt die fermentative Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure aus Glycerol, bei dem Mikroorganismen eingesetzt werden, welche das dhaB-Gen aus Klebsiella pneumoniae (ein Gen, welches für Glycerin-Dehydratase codiert) und ein Gen, welches für eine Aldehyd- Dehydrogenase codiert, exprimieren. Auf diese Weise wird aus Glycerin über 3-Hydroxypropionaldehyd 3- Hydroxypropionsäure gebildet, die dann durch Dehydratisierung in Acrylsäure überführt werden kann.
Der Nachteil der vorstehend beschriebenen fermentativen Verfahren zur Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure als Ausgangsverbindungen für die Acrylsäuresynthese besteht unter anderem darin, dass die Menge an gebildeter 3- Hydroxypropionsäure in der Fermentationslösung zu gering ist, um diese Fermentationslösung als Ausgangsmaterial für eine großtechnische Herstellung von Acrylsäure in wirtschaftlich vorteilhafter Weise zu verwenden.
Der vorliegenden Erfindung lag die Aufgabe zugrunde, die sich aus dem Stand der Technik ergebenden Nachteile zu überwinden .
Insbesondere lag der vorliegenden Erfindung die Aufgabe zugrunde, rekombinante Mikroorganismen bzw. Systeme aus mindestens zwei rekombinanten Mikroorganismen bereitzustellen, die noch besser, insbesondere noch effizienter als die im Stand der Technik beschriebenen Mikroorganismen in der Lage sind, aus nachwachsenden Rohstoffen, insbesondere aus Kohlehydraten und/oder aus Glycerin 3-Hydroxypropionsäure herzustellen, welches anschließend in einer schonenden Dehydratisierungsreaktion in reine Acrylsäure überführt werden kann.
Einen Beitrag zur Lösung der vorstehend genannten Aufgaben leistet eine gegenüber ihrem Wildtyp gentechnisch veränderte Zelle, welche mindestens eine, vorzugsweise beide der Eigenschaften a) und b) aufweist:
a) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % gesteigerte Aktivität eines Enzyms Eia, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert oder eines Enzyms Eib, welches die Umsetzung von Phosphoenolpyruvat zu Oxalacetat katalysiert, vorzugsweise jedoch eines Enzyms Eia, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert,
b) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % gesteigerte Aktivität eines Enzyms E2, welches die Umsetzung von Aspartat zu Beta-Alanin katalysiert,
wobei die Zelle neben den Eigenschaften a) oder b) , vorzugsweise a) und b) , durch mindestens eine der Eigenschaften c) oder d) gekennzeichnet ist: c) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen;
d) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin zu 3-Hydroxypropionsaure umzusetzen.
Eine derart gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, selbst oder in Kombination mit anderen Zellen, welche Beta- Alanin zu 3-Hydroxypropionsaure umsetzen können, aus Kohlehydraten oder aus Glycerin 3-Hydroxypropionsaure zu bilden, da das gebildete Beta-Alanin zu 3- Hydroxypropsionsaure umgesetzt werden kann.
Unter einem „Wildtyp" einer Zelle wird vorzugsweise eine Zelle bezeichnet, deren Genom in einem Zustand vorliegt, wie er natürlicherweise durch die Evolution entstanden ist. Der Begriff wird sowohl für die gesamte Zelle als auch für einzelne Gene verwendet. Unter den Begriff „Wildtyp" fallen daher insbesondere nicht solche Zellen bzw. solche Gene, deren Gensequenzen zumindest teilweise durch den Menschen mittels rekombinanter Verfahren verändert worden sind.
Der Begriff „gesteigerte Aktivität eines Enzyms" ist vorzugsweise als gesteigerte intrazellulare Aktivität zu verstehen. Von der Formulierung „eine gegenüber ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität eines Enzyms" ist insbesondere auch eine Zelle umfasst, deren Wildtyp keine oder zumindest keine nachweisbare Aktivität dieses Enzyms aufweist und die erst nach Erhöhung der Enzymaktivitat, beispielsweise durch Uberexpression, eine nachweisbare Aktivität dieses Enzyms zeigt. In diesem Zusammenhang umfasst der Begriff „Uberexpression" oder die in den nachfolgenden Ausfuhrungen verwendete Formulierung „Erhöhung der Expression" auch den Fall, dass eine Ausgangszelle, beispielsweise eine Wildtyp-Zelle, keine oder zumindest keine nachweisbare Expression aufweist und erst durch rekombinante Verfahren eine nachweisbare Expression des Enzyms induziert wird. Grundsatzlich lasst sich eine Steigerung der enzymatischen Aktivität dadurch erzielen, dass man die Kopienzahl der Gensequenz bzw. der Gensequenzen erhöht, welche für das Enzym kodieren, einen starken Promotor verwendet oder ein Gen oder Allel nutzt, das für ein entsprechendes Enzym mit einer gesteigerten Aktivität kodiert und gegebenenfalls diese Maßnahmen kombiniert. Erfindungsgemaß gentechnisch veränderte Zellen werden beispielsweise durch Transformation, Transduktion, Konjugation oder einer Kombination dieser Methoden mit einem Vektor erzeugt, der das gewünschte Gen, ein Allel dieses Gens oder Teile davon und einen die Expression des Gens ermöglichenden Vektor enthalt. Die heterologe Expression wird insbesondere durch Integration des Gens oder der Allele in das Chromosom der Zelle oder einem extrachromosomal replizierenden Vektor erzielt .
Einen Überblick über die Möglichkeiten zur Erhöhung der Enzym-Aktivitat in Zellen am Beispiel der Pyruvat- Carboxylase gibt DE-A-100 31 999, die hiermit als Referenz eingeführt wird und deren Offenbarungsgehalt hinsichtlich der Möglichkeiten zur Erhöhung der Enzym-Aktivitat in Zellen einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung bildet.
Die Expression der vorstehend und aller nachfolgend genannten Enzyme bzw. Gene ist mit Hilfe von 1- und 2- dimensionaler Proteingelauftrennung und anschließender optischer Identifizierung der Proteinkonzentration mit entsprechender Auswertesoftware im Gel nachweisbar. Wenn die Erhöhung einer Enzymaktivitat ausschließlich auf einer Erhöhung der Expression des entsprechenden Gens basiert, so kann die Quantifizierung der Erhöhung der Enzymaktivitat in einfacher Weise durch einen Vergleich der 1- oder 2- dimensionalen Proteinauftrennungen zwischen Wildtyp und gentechnisch veränderter Zelle bestimmt werden. Eine gebrauchliche Methode zur Praparation der Proteingele bei coryneformen Bakterien und zur Identifizierung der Proteine ist die von Hermann et al . ((2001) Electrophoresis 22: 1712-1723) beschriebene Vorgehensweise. Die Proteinkonzentration kann ebenfalls durch Western-Blot- Hybridisierung mit einem für das nachzuweisende Protein spezifischen Antikörper (Sambrook et al . , Molecular Cloning: a laboratory manual, 2nd Ed. CoId Spring Harbor Laboratory Press, CoId Spring Harbor, N. Y. USA, 1989) und anschließender optischer Auswertung mit entsprechender Software zur Konzentrationsbestimmung (Lohaus und Meyer (1989) Biospektrum 5: 32-39; Lottspeich (1999) Angewandte Chemie 111: 2630-2647) analysiert werden. Die Aktivität von DNA-bindenden Proteinen kann mittels DNA-Band-Shift-Assays (auch als Gelretardation bezeichnet) gemessen werden (Wilson et al . (2001) Journal of Bacteriology, 183: 2151- 2155) . Die Wirkung von DNA-bindenden Proteinen auf die Expression anderer Gene kann durch verschiedene gut beschriebene Methoden des Reportergen-Assays nachgewiesen werden (Sambrook et al . , Molecular Cloning: a laboratory manual, 2nd Ed. CoId Spring Harbor Laboratory Press, CoId Spring Harbor, N. Y. USA, 1989) . Die intrazellulären enzymatischen Aktivitäten können nach verschiedenen beschriebenen Methoden (Donahue et al . (2000) Journal of Bacteriology 182 (19): 5624-5627; Ray et al . (2000) Journal of Bacteriology 182 (8): 2277-2284; Freedberg et al . (1973) Journal of Bacteriology 115 (3): 816-823) bestimmt werden. Sofern in den nachfolgenden Ausführungen keine konkreten Methoden zur Bestimmung der Aktivität eines bestimmten Enzyms angegeben werden, erfolgt die Bestimmung der Steigerung der Enzymaktivität und auch die Bestimmung der Verminderung einer Enzymaktivität vorzugsweise mittels der in Hermann et al . (Electophoresis 22: 1712-1723 (2001)), Lohaus et al . (Biospektrum 5: 32-39 (1998)), Lottspeich (Angewandte Chemie 111: 2630-2647 (1999)) und Wilson et al . (Journal of Bacteriology 183: 2151-2155 (2001)) beschriebenen Methoden. Wird die Erhöhung der Enzymaktivitat durch Mutation des endogenen Gens bewerkstelligt, so können derartige Mutationen entweder nach klassischen Methoden ungerichtet erzeugt werden, wie etwa durch UV-Bestrahlung oder durch mutationsauslosende Chemikalien, oder gezielt mittels gentechnologischer Methoden wie Deletion (en) , Insertion (en) und/oder Nukleotidaustausch (e) . Durch diese Mutationen werden gentechnisch veränderte Zellen erhalten. Besonders bevorzugte Mutanten von Enzymen sind insbesondere auch solche Enzyme, die nicht mehr oder zumindest im Vergleich zum Wildtyp-Enzym vermindert -feedbaofc-inhibierbar sind.
Wird die Erhöhung der Enzymaktivitat durch Erhöhung der Expression eines Enzyms bewerkstelligt, so erhöht man beispielsweise die Kopienzahl der entsprechenden Gene oder mutiert die Promotor- und Regulationsregion oder die Ribosomenbindungsstelle, die sich stromaufwärts des Strukturgens befindet. In gleicher Weise wirken Expressionskassetten, die stromaufwärts des Strukturgens eingebaut werden. Durch induzierbare Promotoren ist es zusatzlich möglich, die Expression zu jedem beliebigen Zeitpunkt zu steigern. Desweiteren können dem Enzym-Gen als regulatorische Sequenzen aber auch sogenannte "Enhancer" zugeordnet sein, die über eine verbesserte Wechselwirkung zwischen RNA-Polymerase und DNA ebenfalls eine erhöhte Genexpression bewirken. Durch Maßnahmen zur Verlängerung der Lebensdauer der m-RNA wird ebenfalls die Expression verbessert. Weiterhin wird durch Verhinderung des Abbaus des Enzymproteins ebenfalls die Enzymaktivitat verstärkt. Die Gene oder Genkonstrukte liegen dabei entweder in Plasmiden mit unterschiedlicher Kopienzahl vor oder sind im Chromosom integriert und amplifiziert . Alternativ kann weiterhin eine Uberexpression der betreffenden Gene durch Veränderung der Medienzusammensetzung und Kulturfuhrung erreicht werden. Anleitungen hierzu findet der Fachmann unter anderem bei Martin et al . (Bio/Technology 5, 137-146 (1987)), bei Guerrero et al . (Gene 138: 35-41 (1994)), Tsuchiya und Morinaga (Bio/Technology 6: 428-430 (1988)), bei Eikmanns et al . (Gene 102: 93-98 (1991)), in EP-A- 0 472 869, im US 4,601,893, bei Schwarzer und Pühler (Bio/Technology 9: 84-87 (1991)), bei Reinscheid et al . (Applied and Environmental Microbiology 60: 126-132 (1994)), bei LaBarre et al . (Journal of Bacteriology 175: 1001-1007 (1993)), in WO-A-96/15246, bei Malumbres et al . (Gene 134: 15-24 (1993)), in JP-A-10-229891, bei Jensen und Hammer (Biotechnology and Bioengineering 58: 191-195 (1998)) und in bekannten Lehrbüchern der Genetik und Molekularbiologie. Die vorstehend beschriebenen Maßnahmen führen ebenso wie die Mutationen zu gentechnisch veränderten Zellen.
Zur Erhöhung der Expression der jeweiligen Gene werden zum Beispiel episomale Plasmide eingesetzt. Als Plasmide eignen sich insbesondere solche, die in coryneformen Bakterien repliziert werden. Zahlreiche bekannte Plasmidvektoren, wie zum Beispiel pZl (Menkel et al . , Applied and Environmental Microbiology 64: 549-554 (1989)), pEKExl (Eikmanns et al . , Gene 107: 69-74 (1991)) oder pHS2-l (Sonnen et al . , Gene 107: 69-74 (1991)) beruhen auf den kryptischen Plasmiden pHM1519, pBLl oder pGAl . Andere Plasmidvektoren, wie zum Beispiel solche, die auf pCG4 (US 4,489,160) oder pNG2 (Serwold-Davis et al . , FEMS Microbiology Letters 66: 119-124 (1990)) oder pAGl (US 5,158,891) beruhen, können in gleicher Weise eingesetzt werden.
Weiterhin eignen sich auch solche Plasmidevektoren, mit Hilfe derer man das Verfahren der Genamplifikation durch Integration in das Chromosom anwenden kann, so wie es beispielsweise von Reinscheid et al . (Applied and Environmental Microbiology 60: 126-132 (1994)) zur Duplikation bzw. Amplifikation des hom-thrB-Operons beschrieben wurde. Bei dieser Methode wird das vollständige Gen in einen Plasmidvektor kloniert, der in einem Wirt (typischerweise Escherichia coli) , nicht aber in Corynebacterium glutamicum repliziert werden kann. Als Vektoren kommen beispielsweise pSUP301 (Simon et al . , Bio/Technology 1: 784-791 (1983)), pK18mob oder pK19mob (Schäfer et al . , Gene 145: 69-73 (1994)), pGEM-T (Promega Corporation, Madison, Wisconsin, USA), pCR2.1-TOPO (Shuman, Journal of Biological Chemistry 269: 32678-84 (1994)), pCR®Blunt (Invitrogen, Groningen, Niederlande), pEMl (Schrumpf et al . , Journal of Bacteriology 173: 4510-4516)) oder pBGS8 (Spratt et al . , Gene 41: 337-342 (1986)) in Frage. Der Plasmidvektor, der das zu amplifizierende Gen enthält, wird anschließend durch Konjugation oder Transformation in den gewünschten Stamm von Corynebacterium glutamicum überführt. Die Methode der Konjugation ist beispielsweise bei Schäfer et al . , Applied and Environmental Microbiology 60: 756-759 (1994) beschrieben. Methoden zur Transformation sind beispielsweise bei Thierbach et al . (Applied Microbiology and Biotechnology 29: 356-362 (1988)), Dunican und Shivnan (Bio/Technology 7: 1067-1070 (1989)) und Tauch et al . (FEMS Microbiology Letters 123: 343-347 (1994)) beschrieben. Nach homologer Rekombination mittels eines „cross-over"-Ereignisses enthält der resultierende Stamm mindestens zwei Kopien des betreffenden Gens.
Bei den erfindungsgemäßen Zellen handelt es sich bevorzugt um gentechnisch veränderte Zellen. Diese können Prokaryonten oder Eukaryonten sein. Dabei kann es sich um Säugetierzellen (wie etwa Zellen aus dem Menschen) , um pflanzliche Zellen oder um Mikroorganismen wie Hefezellen, Pilze oder Bakterienzellen handeln, wobei Mikroorganismen besonders bevorzugt und Bakterienzellen und Hefezellen am meisten bevorzugt sind.
Erfindungsgemäß geeignete Bakterien-, Hefe- und Pilzzellen sind alle diejenigen Bakterien-, Hefe- und Pilzzellen, die bei der Deutschen Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ) , Braunschweig, Deutschland, als Wildtyp-Bakterien-Stämme hinterlegt sind. Geeignete Bakterienzellen gehören zu den Gattungen, die unter
http : //www. dsmz . de/species/bacteria .htm
aufgeführt sind. Erfindungsgemäß geeignete Hefezellen gehören zu denjenigen Gattungen, die unter
http : //www. dsmz . de/species/yeasts .htm
aufgeführt sind und erfindungsgemäß geeignete Pilze sind diejenigen, die unter
http : //www. dsmz . de/species/fungi . htm
aufgeführt sind. Erfindungsgemäß besonders bevorzugte Zellen sind diejenigen der Gattungen Corynebacterium, Brevibacterium, Bacillus, Lactobacillus, Lactococcus, Candida, Pichia, Kluveromyces, Saccharomyces, Bacillus, Escherichia und Clostridium, wobei Bacillus flavum, Bacillus lactofermentum, Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, Kluveromyces lactis, Candida blankii, Candida rugosa, Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens und Pichia postoris besonders bevorzugt und Corynebacterium glutamicum am meisten bevorzugt ist bzw. sind.
Bei dem Enzym Eia handelt es sich vorzugsweise um eine Carboxylase, besonders bevorzugt um eine Pyruvat- Carboxylase (EC-Nummer 6.4.1.1), welche die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert. Gene für Pyruvat- Carboxylasen (pyc-Gene) sind beispielsweise aus Rhizobium etli (Dünn et al . , J. Bacteriol. 178: 5960-5970 (1996), siehe auch WO-A-99/53035) , Bacillus subtillis (Genbank Accession Nr. Z97025) , Mycobacterium tuberculosis (Genbank Accession Nr. Z83018), Pseudomonas fluorescens (WO-A- 99/53035) und aus Methanobacterium thermoautotrophicum (Mukhopadhyay, J. Biol. Chem. 273: 5155-5166 (1998)) kloniert und sequenziert. Des Weiteren wurde Pyruvat- Carboxylase-Aktivität in Brevibacterium lactofermentum (Tosaka et al . , Agric. Biol. Chem. 43: 1513-1519 (1979)) und in Corynebacterium glutamicum (Peters-Wendisch et al . , Microbiology 143: 1095-1103 (1997)) nachgewiesen. Die Nukleotidsequenz des pyc-Gens ist auch in DE-A-100 31 999, DE-A-198 31 609, US 6,171,833, US 6,403,351 und US 6,455,284 beschrieben. Erfindungsgemäß bevorzugte Pyruvat-Carboxylasen sind diejenigen Pyruvat-Carboxylasen, die von Genen ausgewählt aus der Gruppe umfassend PC, Pcx, CG1516, CG1516, pyc-1, PYC2, AAR162Cp, pyrl, accC-2, pycA, pycA2, pca, CglO689, pyc, pycB, accC, oadA, acc und accCl kodiert werden, wobei das pyc-Gen besonders bevorzugt ist. Erfindungsgemäß bevorzugte Pyruvat-Carboxylasen sind insbesondere auch in US 6,455,284, US 6,171,833, US 6,884,606, US 6,403,351, US 6,852,516 und US 6,861,246 beschrieben. Grundsätzlich jedoch können pyc-Gene jeder nur denkbaren Herkunft, gleichgültig ob aus Bakterien, Hefen, Tieren, Pilzen oder Pflanzen verwendet werden. Weiterhin können alle Allele des pyc-Gens verwendet werden, insbesondere auch diejenigen, die sich aus der Degeneriertheit des genetischen Codes oder durch funktionsneutrale Sinnmutationen (sense mutations) ergeben.
Eine erfindungsgemäß besonders bevorzugte Pyruvat- Carboxylase ist diejenige Mutante, die in „A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum genome information to generate a new L-lysine-producing mutant" (Onishi et al . , Applied Microbiology and Biotechnology 58(2): 217-223 (2002)) beschrieben ist. Bei dieser Mutation wurde die Aminosäure Prolin an Position 458 durch Serin ersetzt. Der Offenbarungsgehalt dieser Veröffentlichung hinsichtlich der Möglichkeiten zur Herstellung von Pyruvat- Carboxylase-Mutanten wird hiermit als Referenz eingeführt und bildet einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung. Erfindungsgemäß besonders bevorzugte Zellen sind demnach solche, die die vorstehend beschriebene Enzymmutante als exogenes Protein aufweisen bzw. solche, welche exogene DNA-Sequenzen aufweisen, die für eines solches Enzym kodieren und die dieses Enzym in ausreichender Menge exprimieren.
Die Herstellung von Zellen mit erhöhter Pyruvat- Carboxylase-Aktivität ist unter anderem in DE-A-100 31 999 und auch in DE-A-198 31 609 eingehend beschrieben. Der Offenbarungsgehalt dieser Druckschriften hinsichtlich der unterschiedlichen Möglichkeiten zur Erhöhung der Aktivität der Pyruvat-Carboxylase in Zellen, insbesondere in Bakterien der Gattung Corynebacterium wird hiermit ebenfalls als Referenz eingeführt und bildet einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung.
Die Bestimmung der intrazellulären Aktivität der Pyruvat- Carboxylase erfolgt vorzugsweise gemäß dem in der Dissertation von Petra Peters-Wendisch am Forschungszentrum Jülich GmbH „Anaplerotische Reaktionen in Corynebacterium glutamicum: Untersuchung zur Bedeutung der PEP-Carboxylase und der Pyruvat-Carboxylase im Zentralstoffwechsel und bei der Aminosäureproduktion" (1996) beschriebenen Verfahren.
Bei dem Enzym EIb handelt es sich vorzugsweise um eine Carboxylase, besonders bevorzugt um eine
Phosphoenolpyruvat-Carboxylase (EC 4.1.1.31), welche die Umsetzung von Phosphoenolypyruvat zu Oxalacetat katalysiert. Erfindungsgemäß bevorzugte Phosphoenolpyruvat- Carboxylasen sind diejenigen Phosphoenol-pyruvat- Carboxylasen, die von den Genen ausgewählt aus der Gruppe umfassend F12M16.21, F14N22.13, K15M2.8, ppc, clpA, pepC, capP, Cgll585 und pepC kodiert werden, wobei das ppc-Gen besonders bevorzugt ist. ppc-Gene für Wildtyp- Phosphoenolpyruvat-Caboxylasen oder Mutanten dieser Enzyme sind beispielsweise aus US 6,599,732, US 5,573,945, US 4,757,009 sowie aus US 4,980,285 bekannt. Die Herstellung von Zellen mit erhöhter Phosphoenolpyruvat- Carboxylase-Aktivität ist unter anderem in US 4,757,009 beschrieben. Der Offenbarungsgehalt dieser Druckschrift hinsichtlich der Vorgehensweise bei der Uberexpression der Phosphoenolpyruvat-Carboxylase in Mikroorganismen wird hiermit ebenfalls als Referenz eingeführt und bildet einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung. Neben der Uberexpression des Enzyms können auch die anderen, im Zusammenhang mit dem Enzym Eia genannten Maßnahmen zur Erhöhung der Enzymaktivitat der Phosphoenolpyruvat- Carboxylase angewendet werden, unter anderem auch die Expression von Enzymmutanten. In diesem Zusammenhang besonders bevorzugte Mutanten sind diejenigen, die keiner Aktivierung durch Acetyl-CoA bedürfen und/oder die feedback-inhibiert sind im Hinblick auf Asparaginsaure (siehe hierzu insbesondere US 6,919,190). Grundsatzlich können auch im Zusammenhang mit der Phosphoenolpyruvat- Carboxylase die entsprechenden Gene jeder nur denkbaren Herkunft, gleichgültig ob aus Bakterien, Hefen, Pflanzen, Tieren oder Pilzen, verwendet werden. Weiterhin können auch hier alle Allele des ppc-Gens verwendet werden, insbesondere auch diejenigen, die sich aus der Degeneriertheit des genetischen Codes oder durch funktionsneutrale Sinnmutationen (sense mutations) ergeben
Die Bestimmung der Aktivität der Phosphoenolpyruvat- Carboxylase erfolgt vorzugsweise gemäß dem in der Dissertation von Petra Peters-Wendisch am Forschungszentrum Julich GmbH „Anaplerotische Reaktionen in Corynebacterium glutamicum: Untersuchung zur Bedeutung der PEP-Carboxylase und der Pyruvat-Carboxylase im Zentralstoffwechsel und bei der Aminosaureproduktion" (1996) beschriebenen Verfahren.
Einen Überblick über Phosphoenolpyruvat-Carboxylasen und Pyruvat-Carboxylasen geben insbesondere auch Sauer und Eikmanns (FEMS Microbiology Reviews 29: 765-794 (2005)).
Bei dem Enzym E2 handelt es sich vorzugsweise um eine Decarboxylase, besonders bevorzugt um eine Glutamat- Decarboxylase oder eine Aspartat-Decarboxylase, wobei eine 1-Aspartat-l-Decarboxylase (EC-Nummer 4.1.1.11) am meisten bevorzugt ist, welche von dem panD-Gen kodiert wird. Die Aspartat-Decarboxylase katalysiert die Umsetzung von Aspartat zu Beta-Alanin. Gene für die Aspartat- Decarboxylase (panD-Gene) unter anderem aus Escherichia coli (FEMS Microbiology Letters 143: 247-252 (1996)), Photorhabdus luminescens subsp. laumondii, Mycobacterium bovis subsp. bovis sowie aus zahlreichen anderen Mikroorganismen wurden bereits kloniert und sequenziert. Insbesondere die Nukleotidsequenz des panD-Gens aus Corynebacterium glutamicum ist in der DE-A-198 55 313 beschrieben. Grundsätzlich können panD-Gene jeder nur denkbaren Herkunft, gleichgültig ob aus Bakterien, Hefen, Pflanzen, Tieren oder Pilzen, verwendet werden. Weiterhin können alle Allele des panD-Gens verwendet werden, insbesondere auch diejenigen, die sich aus der Degeneriertheit des genetischen Codes oder durch funktionsneutrale Sinnmutationen (sense mutations) ergeben.
Eine neben der Aspartat-Decarboxylase aus Corynebacterium glutamicum erfindungsgemäß besonders bevorzugte Aspartat- Decarboxylase ist die Escherichia coli-Mutante DV9 (Vallari und Rock, Journal of Bacteriology 164: 136-142 (1985)). Der Offenbarungsgehalt dieser Veröffentlichung hinsichtlich der vorstehend genannten Mutante wird hiermit als Referenz eingeführt und bildet einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung.
Die Herstellung von Zellen mit erhöhter Aspartat- Decarboxylase-Aktivität ist unter anderem in DE-A- 198 55 314 eingehend beschrieben. Der Offenbarungsgehalt dieser Druckschriften hinsichtlich der unterschiedlichen Möglichkeiten zur Erhöhung der Aktivität der Aspartat- Decarboxylase in Zellen, insbesondere in Bakterien der Gattung Corynebacterium wird hiermit ebenfalls als Referenz eingeführt und bildet einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung. Erfindungsgemäß besonders bevorzugte Zellen sind solche, die vorstehend beschriebene Enzymmutante DV9 aus Escherichia coli oder aber panD aus Corynebacterium glutamicum aufweisen bzw. solche, welche DNA-Sequenzen aufweisen, die für eines dieser Enzym kodieren und die dieses Enzym in ausreichender Menge exprimieren .
Die Bestimmung der Aspartat-Decarboxylase-Aktivitat erfolgt gemäß dem von Dusch et al . (Applied and Environmental Microbiology 65(4): 1530-1539 (1999)) in dem Kapitel mit der Überschrift „Aspartate decarboxylase activity assay" beschriebenen Testverfahren.
Sofern es sich bei der erfindungsgemaßen Zelle um eine gentechnisch veränderte Corynebacterium glutamicum-Zelle handelt, kann es ausreichend sein, wenn nur die Aktivität des Enzyms E2 erhöht wird, da bereits der Wildtyp dieser Zellen eine vergleichsweise hohe Pyruvat-Carboxylase- Aktivitat aufweist. Dennoch ist es auch bei der Verwendung von Corynebacterium glutamicum bevorzugt, wenn in der erfindungsgemaßen Zelle sowohl die Aktivität des Enzyms Eia als auch die Aktivität des Enzyms E2 bzw. sowohl die Aktivität des Enzyms Exb als auch die Aktivität des Enzyms E2 erhöht ist.
Die erfindungsgemaßen Zellen sind des weiteren dadurch gekennzeichnet, dass sie neben den Eigenschaften a) oder b) , vorzugsweise a) und b) , durch mindestens eine der Eigenschaften c) oder d) gekennzeichnet ist:
a) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen;
b) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin zu 3-Hydroxypropionsaure umzusetzen.
Der Begriff ,,3-Hydroxypropionsaure", wie er hierin verwendet wird, umfasst die protonierte Form der 3- Hydroxypropionsäure ebenso wie die deprotonierte Form der 3-Hydroxypropionsäure (= 3-Hydroxypropionat) und Mischungen aus protonierter und deprotonierter Form. Der Begriff „herausschleusen" umfasst sowohl den aktiven als auch den passiven Transport von Beta-Alanin aus der Zelle hinaus in das die Zelle umgebende Medium.
Erfindungsgemäßen Zellen, welche die Bedingung c) erfüllen, sind vorzugsweise dadurch gekennzeichnet, dass sie endogene und/oder exogene, vorzugsweise exogene Transportenzyme in der Zellmembran aufweisen, welche selektiv oder nicht selektiv, vorzugsweise selektiv, aktiv oder passiv, gegebenenfalls im Austausch gegen oder zusammen mit Ionen wie Natrium, Kalium oder Chlor Beta-Alanin durch die Zellmembran hindurch nach außen, also in den Bereich außerhalb der Zelle, schleusen können (=Efflux des Beta- Alanins aus der Zelle) . Dabei ist es erfindungsgemäß besonders bevorzugt, dass die gentechnisch veränderte Zelle einen im Vergleich zu ihrem Wildtyp erhöhten, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % erhöhten Efflux von Beta- Alanin aus der Zelle heraus aufweist. Ein um 10 % erhöhter Efflux bedeutet dabei, dass die gentechnisch veränderte Zelle im Vergleich zu ihrem Wildtyp unter gleichen Bedingungen, insbesondere bei gleicher intrazellulärer und extrazellulärer Beta-Alanin-Konzentration in einem definierten Zeitintervall um 10 % mehr Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen vermag. Vorzugsweise wird der erhöhte Efflux durch eine Steigerung der Aktivität der vorstehend genannten Transportenzyme realisiert, wobei die Erhöhung wiederum durch die bereits im Zusammenhang mit den Enzymen Ela, E11, und E2 genannten Techniken (Mutation des Transportenzyms oder Steigerung der Genexpression des Transportenzyms) erfolgen kann.
In diesem Zusammenhang bevorzugte Transportenzyme sind beispielsweise die sogenannten „multi-drug-resistance"- Proteine (MDR-Proteine) , beispielsweise mit den Genen ebrA und ebrB sowie die sogenannten „multi-drug-efflux transporter" , wobei die „multi-drug-efflux transporter" , beispielsweise mit den blt- und bmr-Genen besonders bevorzugt sind. Geeignete Transportsysteme für Beta-Alanin sind auch in „Handbook of Corynebacterium glutamicum" , Herausgeber L. Eggeling und M. Bott, CRC Press, Boca Raton, USA, 2005, Kapitel IV, „Genomic Analyses of Transporter Proteins in Corynebacterium glutamicum and Corynebacterium efficiens", B. Winnen, J. Felce, und M. H. Saier, Jr., Seiten 149-186 beschrieben. Weitere geeignete Transportsysteme für Beta-Alanin, insbesondere solche, die vom cycA-Gen kodiert werden, sind in Schneider et al (Appl . Microbiol. Biotechnol. 65(5): 576-582 (2004)) beschrieben. Geeignete Transportsysteme für Beta-Alanin sind weiterhin in Anderson und Thwaites (J. Cell. Physiol. 204(2): 604-613 (2005)), Brechtel und King (Biochem. J. 333: 565-571 (1998)), Guimbal et al . (Eur. J. Biochem. 234(3): 794-800 (1995)), Munck und Munck (Biochim. Biophys. Acta 1235(1): 93-99 (1995)) und Shuttleworth und Goldstein (J. Exp. Zool. 231(1): 39-44 (1984)) beschrieben.
Erfindungsgemäße Zellen, welche die Bedingung d) erfüllen, sind in der Lage, das gebildete Beta-Alanin in 3- Hydroxypropionsäure umzusetzen. Dabei sind grundsätzlich mindestens zwei Varianten denkbar.
Gemäß der Variante A können die Zellen das Beta-Alanin über Beta-Alanyl-CoA, Acrylyl-CoA und Hydroxypropionyl-CoA zu 3- Hydroxypropionsäure umsetzen. In diesem Zusammenhang ist es besonders bevorzugt, dass die Zelle eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % gesteigerte Aktivität mindestens eines, vorzugsweise aller folgenden Enzyme E3 bis E6 aufweist :
eines Enzyms E3, welches die Umsetzung von Beta-Alanin zu Beta-Alanyl-Coenzym A katalysiert,
eines Enzyms E4, welches die Umsetzung von Beta- Alanyl-Coenzym A zu Acrylyl-Coenzym A katalysiert,
eines Enzyms E5, welches die Umsetzung von Acrylyl- Coenzym A zu 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A katalysiert,
eines Enzyms E6, welches die Umsetzung von 3- Hydroxypropionyl-Coenzym A zu 3-Hydroxypropionsäure katalysiert .
Erfindungsgemäß besonders bevorzugte gentechnisch veränderte Zellen sind dabei diejenigen, bei denen, gegebenenfalls zusätzlich zur Steigerung mindestens einer der Enzymaktivitäten Eia oder Eib sowie E2 die Aktivität folgender Enzyme oder Enzymkombinationen gesteigert ist: E3, E4, E5, E6, E3E4, E3E5, E3E6, E4E5, E4E6, E5E6, E3E4E5, E3E4E6, E3E5E5, E4E5E6 oder E3E4E5E6.
Die Steigerung der enzymatischen Aktivität der Enzyme E3 bis E6 kann auch hier durch die im Zusammenhang mit den Enzymen Eia, Eia und E2 genannten Techniken, wie Mutation oder Erhöhung der Enzymexpression, erfolgen.
Es ist in diesem Zusammenhang weiterhin bevorzugt, dass das Enzym
E3 eine Coenzym A-Transferase (EC 2.8.3.1) oder Coenzym A- Synthetase, vorzugsweise eine Coenzym A-Transferase, E4 eine Beta-Alanyl-Coenzym A-Ammonium-Lysase
(EC 4.3.1.6), E5 eine 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A-Dehydratase
(EC 4.2.1.-, insbeson-dere EC 4.2.1.17) und
E6 eine Coenzym A-Transferase (EC 2.8.3.1), 3-
Hydroxypropionyl-Coen-zym A-Hydrolase (EC 3.1. 2. -) oder 3-Hydroxybutyryl-Coenzym A-Hydro-lase
(EC 3.1.2.4), vorzugsweise eine Coenzym A-Transferase
ist .
Bevorzugte Enzyme mit einer CoA-Transferaseaktivität sind diejenigen aus Megasphaera elsdenii, Clostridium propionicum, Clostridium kluyveri und auch aus Escherichia coli. Als Beispiele für eine CoA-Transferase codierende DNA-Sequenz seien an dieser Stelle die in der WO-A- 03/062173 mit der SEQ ID NO: 24 bezeichnete Sequenz aus Megasphaera elsdenii genannt. Des weiteren bevorzugte Enzyme sind diejenigen Varianten der CoA-Transferase, die in der WO-A-03/062173 beschrieben werden.
Geeignete Enzyme mit einer Beta-Alanyl-Coenzym A-Ammonium- Lyase-Aktivität sind beispielsweise diejenigen aus Clostridium propionicum. DNA-Sequenzen, welche für ein solches Enzym kodieren, können beispielsweise aus Clostridium propionicum, wie im Beispiel 10 der WO-A- 03/062173 beschrieben, erhalten werden. Die DNA-Sequenz, welche für die Beta-Alanyl-Coenzym A-Ammonium-Lyase aus Clostridium propionicum kodiert, ist in der WO-A-03/062173 als SEQ ID NO: 22 angegeben.
Geeignete Enzyme mit einer 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A- Dehydratase-Aktivität sind insbesondere diejenigen Enzyme, die von Genen ausgewählt aus der Gruppe umfassend ECHSl, EHHADH, HADHA, CG4389, CG6543, CG6984, CG8778, ech-1, ech- 2, ech-3, ech-5, ech-6, ech-7, FCAALL.314, FCAALL.21, FOX2, ECI12, ECIl, paaF, paaG, yfcX, fadB, faoA, fadBlx, phaB, echA9, echA17, fad-1, fad-2, fad-3, paaB, echA7, dcaE, hcaA, RSpO671, RSpOO35, RSpO648, RSpO647, RS03234, RS03271, RS04421, RS04419, RS02820, RS02946, paaG2, paaGl, ech, badK, crt, ydbS, eccH2, pimF, paaG3, fabJ-1, caiD-2, fabJ- 2, ysiB, yngF, yusL, phaA, phaB, fucA, caiD, ysiB, echA3, echA5, echA6, echA7, echA8, echA14, echA15, echAlβ, echA17, echAlδ.l, echA19, echA20, echA21, echA2, echA4, echA9, echAll, echAlO, echA12, echA13, echA18, echAl, fadB-1, echA8-l, echA12-2, fadB-2, echA16-2, CglO919, fadBl, SCF41.23, SCDlO.16, SCK13.22, SCP8.07c, StBACl 6H6.14 , SC5F2A.15, SC6A5.38, faoA, hbdl, crt, hbd-1, hbd-2, hbd-5, fad-4, hbd-10, fad-5, hbdl, paaF-1, paaF-2, paaF-3, paaF-4, paaF-5, paaF-6 und paaF-7 kodiert werden. Als Beispiele für erfindungsgemäß geeignete 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A- Dehydratasen seien insbesondere diejenigen aus Chloroflexus aurantiacus, Candida rugosa, Rhodosprillium rubrum und Rhodobacter capsulates genannt. Ein besonderes Beispiel einer für eine 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A-Dehydratase kodierenden DNA-Sequenz ist beispielsweise in der WO-A- 02/42418 als SEQ ID NO: 40 angegeben.
Die Herstellung gentechnisch veränderter Zellen, in denen mindestens eine, vorzugsweise alle der vorstehend genannten enzymatischen Aktivitäten E3 bis E6 erhöht worden ist bzw. sind, ist beispielsweise in den Beispielen der WO-A- 02/42418 und der WO-A-03/062173 beschrieben. Der Offenbarungsgehalt dieser beiden Druckschriften hinsichtlich der Erhöhung der Aktivitäten dieser Enzyme in Zellen wird hiermit als Referenz eingeführt und bildet einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung.
Gemäß der Variante B können die Zellen das Beta-Alanin über Malonsäuresemialdehyd zu 3-Hydroxypropionsäure umsetzen. In diesem Zusammenhang ist es besonders bevorzugt, dass die Zelle eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens n5 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % gesteigerte Aktivität mindestens eines der, vorzugsweise beider Enzyme E7 und E8 aufweist:
eines Enzyms E7, welches die Umsetzung von Beta-Alanin zu Malon-säuresemialdehyd katalysiert,
eines Enzyms E8, welches die Umsetzung von Malonsäuresemialdehyd zu 3-Hydroxypropionsäure katalysiert .
Erfindungsgemäß besonders bevorzugte gentechnisch veränderte Zellen sind dabei diejenigen, bei denen, gegebenenfalls zusätzlich zur Steigerung mindestens einer der Enzymaktivitäten Eia oder Eib sowie E2 die Aktivität folgender Enzyme oder Enzymkombinationen gesteigert ist: E7, E8 und E7E8.
Die Steigerung der enzymatischen Aktivität der Enzyme E7 und E8 kann auch hier durch die im Zusammenhang mit dem Enzym Eia, Eib und E2 genannten Techniken wie Mutation oder Erhöhung der Enzymexpression erfolgen.
Es ist in diesem Zusammenhang weiterhin bevorzugt, dass das Enzym
E7 eine Beta-Alanin-2-Oxoglutarat-Aminotransferase (EC 2.6.1.19) oder eine Taurin-2-Oxoglutarat- Transaminase (2.6.1.55), vorzugsweise eine Beta- Alanin-2-Oxoglutarat-Aminotransferase, und
E8 eine 3-Hydroxypropionat-Dehydrogenase (EC 1.1.1.59) oder 3-Hydroxy-butyrat-Dehydrogenase (EC 1.1.1.30), vorzugsweise jedoch eine 3-Hydroxypropionat- Dehydrogenase (EC 1.1.1.59)
ist . Die Gene der Beta-Alanin-2-Oxoglutarat-Aminotransferase sind beispielsweise aus Neurospora crassa bekannt („Über die beta-Alanin-alpha-Ketoglutarat-Transaminase", Aurich und Hoppe-Seyler's, Z. Physiol. Chem. 326: 25-33 (1961)). Weitere Informationen zu Genen dieses Enzyms aus anderen Mikroorganismen können insbesondere der KEGG GENE Database (KEGG = Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) entnommen werden. Auch die Gene der 3-Hydroxypropionat-Dehydrogenase oder der 3-Hydroxybutyrat-Dehydrogenase aus unterschiedlichsten Mikroorganismen können der KEGG GENE Database entnommen werden.
Wenn die erfindungsgemaßen Zellen die Bedingung d) erfüllen, so ist es weiterhin bevorzugt, dass die Zelle einen im Vergleich zu ihrem Wildtyp verminderten, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des Weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % verminderten Efflux von Beta-Alanin aufweist. Ein um 10 % verminderter Efflux bedeutet dabei, dass die gentechnisch veränderte Zelle im Vergleich zu ihrem Wildtyp unter gleichen Bedingungen, insbesondere bei gleicher intrazellularer und extrazellularer Beta-Alanin-Konzentration in einem definierten Zeitintervall um 10 % weniger Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen vermag. Vorzugsweise wird der verminderte Efflux durch eine Verminderung der Aktivität der vorstehend genannten Transportenzyme realisiert, wobei die Verminderung durch Mutation des Transportenzyms oder Verminderung der Genexpression des Transportenzyms erfolgen kann. Von Vorteil kann es auch sein, dass als Zellen, welche die Bedingung d) erfüllen, solche Zellen eingesetzt werden, deren Wildtyp nicht in der Lage ist, Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen. Die erfindungsgemaßen Zellen sind in der Lage, alleine (wenn die Bedingung d) erfüllt ist) oder aber in Kombination mit anderen Mikroorganismen, welche 3- Hydroxypropionsaure aus Beta-Alanin herstellen können (wenn die Bedingung c) erfüllt ist) aus Pyruvat 3- Hydroxypropionsaure zu bilden.
Ausgehend vom Pyruvat als Startpunkt für die Herstellung des Beta-Alanins sind nun wiederum zwei unterschiedliche Ausfuhrungsformen der erfindungsgemaßen Zellen denkbar.
Gemäß der ersten Ausfuhrungsform der erfindungsgemaßen Zellen sind diese in der Lage, das für die Herstellung des Beta-Alanins benotigte Pyruvat insbesondere auch aus Glycerin als Kohlenstoffquelle herzustellen.
In diesem Zusammenhang ist es besonders bevorzugt, dass die erfindungsgemaße Zelle eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % gesteigerte Aktivität mindestens eines, vorzugsweise aller folgenden Enzyme Eg bis E22 aufweist:
eines Enzyms E9, welches die Diffusion von Glycerin in die Zelle hinein erleichtert,
eines Enzyms Ei0, welches die Umsetzung von Glycerin zu Glycerin-3-Phosphat katalysiert,
eines Enzyms En, welches die Umsetzung von Glycerin- 3-Phosphat zu Dihydroxyacetonphosphat katalysiert,
eines Enzyms E12, welches die Übertragung von Schwefel auf den Schwefelsakzeptor Thioredoxin 1 katalysiert, eines Enzyms E13, welches die Hydrolyse von Phospholipiden unter Bildung von Alkoholen und Glycerin katalysiert,
eines Enzyms Ei4, welches den Transport von Glycerin- 3-Phosphat in die Zelle hinein im Austausch gegen Phosphat katalysiert;
eines Enzyms Ei5, welches die Umsetzung von Dihydroxyacetonphosphat zu Glycerinaldehyd-3-Phosphat katalysiert,
eines Enzyms Ei6, welches die Umsetzung von Glycerinaldehyd-3-Phosphat zu 1, 3-Biphosphoglycerat katalysiert,
eines Enzyms Ei7, welches die Umsetzung von 1,3- Biphosphoglycerat zu 3-Phosphoglycerat katalysiert,
eines Enzyms Eis, welches die Umsetzung von 3- Phosphoglycerat zu 2-Phosphoglycerat katalysiert,
eines Enzyms E19, welches die Umsetzung von 2- Phosphoglycerat zu Phosphoenolpyruvat katalysiert,
eines Enzyms E20, welches die Umsetzung von Phosphoenolpyruvat zu Pyruvat katalysiert,
eines Enzyms E21, welches die Umsetzung von Glycerin zu Dihydroxyaceton katalysiert,
eines Enzyms E22, welches die Umsetzung von Dihydroxyaceton zu Dihydroxyacetonphosphat katalysiert .
Erfindungsgemäß besonders bevorzugte gentechnisch veränderte Zellen sind dabei diejenigen, bei denen, gegebenenfalls zusätzlich zur Steigerung einer oder mehrerer der Enzymaktivitäten Eia oder Eib sowie E2 und gegebenenfalls einer oder mehrere der Enzymaktivitäten E3 bis E6 oder E7 und E8 die Aktivität folgender Enzyme oder Enzymkombinationen gesteigert ist: E9, Ei0, En, E12, E13, E14, E15, E16, E11, Ei8, E19, E20, E21, E22, EI0EH, wobei eine Erhöhung einer oder mehrere der Enzymaktivitäten ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus E9, Ei0, En, E13, Ei4, E2i und E22 besonders bevorzugt ist und eine Erhöhung der Enzymaktivitäten Eio und En am meisten bevorzugt ist.
In diesem Zusammenhang ist es insbesondere bevorzugt, dass das Enzym
E9 ein Aquaglyceroporin (Glycerol-Facilitator) , der vorzugsweise vom glpF-Gen kodiert wird, Eio eine Glycerin-Kinase (EC 2.7.1.30), die vorzugsweise vom glpK-Gen kodiert wird, En eine Glycerin-3-Phosphat-Dehydrogenase (EC 1.1.99.5), vorzugsweise eine FAD-abhängige Glycerin-3-Phosphat-
Dehydrogenase, wobei die Glycerin-3-Phosphat-
Dehydrogenase vorzugsweise von dem glpA-Gen, dem glpB-
Gen, dem glpC-Gen oder dem glpD-Gen, besonders bevorzugt dem glpD-Gen kodiert wird, E12 eine Schwefeltransferase, welche von dem glpE-Gen kodiert wird, E13 eine Glycerinphosphodiesterase (EC 3.1.4.46), welche vorzugsweise vom glpQ-Gen kodiert wird, Ei4 eine Glycerin-3-Phosphat-Permease, welche vorzugsweise vom glpT-Gen kodiert wird
Ei5 eine Triosephosphat-Isomerase (EC 5.3.1.1), Ei6 eine Glyceraldehyd-3-Phosphat-Deydrogenase
(EC 1.2.1.12) ,
Ei7 eine Phosphoglycerat-Kinase (EC 2.7.2.3), E18 eine Phosphoglycerat-Mutase (EC 5.4.2.1), E19 eine Enolase (EC 4.2.1.11), E20 eine Pyruvat-Kinase (EC 2.7.1.40)
E2i eine Glycerin-Dehydrogenase (EC 1.1.1.6), die vorzugsweise vom gldA-Gen kodiert wird, und E22 eine Dihydroxyaceton-Kinase (EC 2.7.1.29), die vorzugsweise vom dhaK-Gen kodiert wird, ist .
Die Gensequenzen der vorstehend genannten Enzyme sind in der Literatur bekannt und können zum Beispiel der KEGG GENE Database, den Datenbanken des National Center for Biotechnology Information (NCBI) der National Library of Medicine (Bethesda, MD, USA) oder der Nukleotidsequenz- Datenbank der European Molecular Biologies Laboratories (EMBL, Heidelberg, Deutschland bzw. Cambridge, UK) entnommen werden. Des Weiteren sind das Glyceraldehyd-3- Phosphat-Dehydrogenase codierende gap-Gen (Eikmanns (1992), Journal of Bacteriology 174: 6076-6086), das für die Triosephosphat-Isomerase codierende tpi-Gen (Eikmanns (1992), Journal of Bacteriology 174: 6076-6086) und das für die 3-Phosphoglycerat-Kinase codierende pgk-Gen (Eikmanns (1992), Journal of Bacteriology 174: 6076-6086) aus anderen Quellen bekannt.
Mit den bekannten Genen der Enzyme Eg bis E22 lassen sich gentechnisch veränderte Zellen, in denen mindestens eine, besonders bevorzugt mindestens zwei, darüber hinaus bevorzugt mindestens drei und am meisten bevorzugt alle Aktivitäten der Enzyme Eg bis E22 durch die vorstehend im Zusammenhang mit dem Enzym Eia, Eib und E2 beschriebenen Techniken (Mutation des Enzyms oder Steigerung der Enzymexpression) erhöht worden ist, herstellen. Diese Zellen sind in der Lage, in Gegenwart von Glycerin als einziger Kohlenstoffquelle (oder aber zusammen mit Kohlehydraten als weitere Kohlenstoffquelle) kultiviert werden zu können. Neben der Erhöhung einer oder mehrerer der Enzymaktivitäten Eg bis E22 kann es in diesem Zusammenhang auch vorteilhaft sein, wenn in den erfindungsgemäßen Zellen folgende Gene vorzugsweise heterolog exprimieren: das glpG-Gen oder das b3424-Gen, das glpX-Gen oder das 3925-Gen, , das dhaR-Gen, das ycgU-Gen oder das bl201-Gen das fsa-Gen, das mipB-Gen, das ybiZ-Gen oder das B0825-
Gen das talC-Gen, das fsaB-Gen, das yijG-Gen oder das b3946-Gen.
Die Nukleotidsequenzen dieser Gene können wiederum der KEGG GENE Database, den Datenbanken des National Center for Biotechnology Information (NCBI) der National Library of Medicine (Bethesda, MD, USA) oder der Nukleotidsequenz- Datenbank der European Molecular Biologies Laboratories (EMBL, Heidelberg, Deutschland bzw. Cambridge, UK) entnommen werden.
Gemäß der zweiten Ausführungsform der erfindungsgemäßen Zellen sind diese in der Lage, das für die Herstellung des Beta-Alanins benötigte Pyruvat nicht oder zumindest nur in geringem Umfang aus Glycerin zu erhalten. In diesem Falle erfolgt die Bereitstellung des Pyruvates in den Zellen vornehmlich durch die Glykolyse. Derartige Zellen sind in einem Nährmedium kultivierbar, welches Kohlenhydrate wie beispielsweise Glukose als Kohlenstoffquelle beinhaltet.
In diesem Falle ist es bevorzugt, dass die erfindungsgemäßen Zellen, gegebenenfalls neben einer erhöhten Aktivität mindestens eines, vorzugsweise aller vorstehend genannten Enzyme E9 bis E22, eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 %gesteigerte Aktivität mindestens eines, vorzugsweise aller folgenden Enzyme Ei6 bis E20 und E23 bis E27 aufweisen: eines Enzyms E23, welches die Diffusion von Glycerin in die Zelle hinein erleichtert, eines Enzyms E24, welches die Umsetzung von Glukose zu α-D-Glukose-6-Phosphat katalysiert, eines Enzyms E25, welches die Umsetzung von α-D-
Glukose-6-Phosphat zu ß-D-Fruktose-6-Phosphat katalysiert, eines Enzyms E26, welches die Umsetzung von ß-D-
Fruktose-6-Phosphat zu ß-D-Fruktose-1, 6-Biphosphat katalysiert, eines Enzyms E27, welches die Umsetzung von ß-D-
Fruktose-1 , 6-Biphosphat zu Glycerinaldehyd-3-Phosphat und Dihydroxyacetonphosphat katalysiert, eines Enzyms E16, welches die Umsetzung von
Glycerinaldehyd-3-Phosphat zu 1, 3-Biphosphoglycerat katalysiert, eines Enzyms Ei7, welches die Umsetzung von 1,3-
Biphosphoglycerat zu 3-Phosphoglycerat katalysiert, eines Enzyms Ei8, welches die Umsetzung von 3-
Phosphoglycerat zu 2-Phosphoglycerat katalysiert, eines Enzyms E19, welches die Umsetzung von 2-
Phosphoglycerat zu Phosphoenolpyruvat katalysiert, und eines Enzyms E2o, welches die Umsetzung von Phosphoenolpyruvat zu Pyruvat katalysier. Erf indungsgemaß besonders bevorzugte gentechnisch veränderte Zellen sind dabei diejenigen, bei denen, gegebenenfalls zusatzlich zur Steigerung einer oder mehrerer der Enzymaktivitaten Eia oder Eib sowie E2 und gegebenenfalls einer oder mehrere der Enzymaktivitaten E3 bis E6 oder E7 und E8 die Aktivität folgender Enzyme oder Enzymkombinationen gesteigert ist: E16, E11, E13, E19, E20, E23, E24, E25, D26, E27 und Ei6Ei7EisEi9E2oE23E24E25E26E27.
In diesem Zusammenhang ist es insbesondere bevorzugt, dass das Enzym
E23 ein Glukosetransporter, vorzugsweise ein durch ein Gen ausgewählt aus der Gruppe umfassend glutl, gluP oder fucP kodierter Glukose-Transporter, oder eine Glukose- Permease (2.7.1.69),
E24 eine Glukokinase (2.7.1.2) ,
E25 eine Glukose-6-Phosphat-Isomerase (EC 5.3.1.9) ,
E26 eine 6-Phosphofrukto-Kinase (EC 2.7.1.11) ,
E27 eine Fruktose-Bisphosphat-Aldolase (EC 4.1.2.13) ,
Ei6 eine Glyceraldehyd-3-Phosphat-Deydrogenase (EC 1.2.1.12) ,
Ei7 eine Phosphoglycerat-Kinase (EC 2.7.2.3) ,
Eis eine Phosphoglycerat-Mutase (EC 5.4.2.1) ,
E19 eine Enolase (EC 4.2.1.11), und
E20 eine Pyruvat-Kinase (EC 2.7.1.40)
ist . Die Nukleotidsequenzen dieser Gene können wiederum der KEGG GENE Database, den Datenbanken des National Center for Biotechnology Information (NCBI) der National Library of Medicine (Bethesda, MD, USA) , der Nukleotidsequenz- Datenbank der European Molecular Biologies Laboratories (EMBL, Heidelberg, Deutschland bzw. Cambridge, UK) entnommen werden.
Weiterhin ist es in Zusammenhang mit dieser zweiten Ausfuhrungsform der erfindungsgemaßen Zelle bevorzugt, dass neben den vorstehend genannten Enzymen Eia oder Eib und/oder E2 sowie gegebenenfalls mindestens eines der Enzyme E3 bis E6, E7 oder E8 sowie E12 bis E27 auch die Aktivität von Enzymen des Phosphotransferase-Systems erhöht worden ist. In diesem Zusammenhang ist es insbesondere bevorzugt, das in den erfindungsgemaßen Zellen die ptsl- und ptsM-Gene verstärkt, vorzugsweise uberexprimiert sind. In diesem Zusammenhang wird insbesondere auf US 6,680,187 und 6,818,432 verwiesen, deren Offenbarungsgehalt hinsichtlich der Möglichkeiten zur Uberexprimierung der ptsl- bzw. ptsM- Gene hiermit als Referenz eingeführt wird und einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung bildet.
In den erfindungsgemaßen Zellen kann weiterhin, unabhängig davon, ob sie Glycerin oder Glukose als primäre Nährstoffquelle verwenden und auch unabhängig davon, ob sie alleine oder in Kombination mit anderen Zellen über Malonsauresemialdehyd oder über Beta-Alanyl-Coenzym A, Acrylyl-Coenzym A und 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A 3- Hydroxypropionsaure bilden, die Aktivität der Aspartat- Aminotransferase (EC 2.6.1.1. A) erhöht sein. Die Sequenz des entsprechenden Gens (aspB) kann unter anderem der KEGG GENE Database entnommen werden. Weiterhin ist es in den erfindungsgemäßen Zellen bevorzugt, die Aktivität von Enzymen,
E28 welche die Umsetzung von Oxaloacetat zu
Phosphoenolpyruvat katalysieren, wie etwa die Phosphoenylpyruvat-Carboxy-Kinase (EC 4.1.1.49) (siehe auch DE-A-199 50 409),
E29 welche die Umsetzung von Pyruvat zu Acetat katalysieren, wie etwa die Pyruvat-Oxidase (EC 1.2.2.2) (siehe auch DE-A-199 51 975),
E30 welche die Umsetzung von α-D-Glukose-6-Phosphat zu ß- D-Fruktose-6-Phosphat katalysieren (siehe auch US 09/396,478) ,
E31 welche die Umsetzung von Beta-Alanin zu Carnosin katalysieren, wie etwa die Carnosin-Synthase (EC 6.3.2.11) ,
E32 welche die Umsetzung von Beta-Alanin zu Alpha-Alanin katalysieren, wie etwa die Alanin-Aminomutase,
E33 welche die Umsetzung von Beta-Alanin zu (R) -
Pantothenat katalysieren, wie etwa die Pantothenat- Beta-Alanin-Ligase (EC 6.3.2.1),
E34 welche die Umsetzung von Beta-Alanin zu N-Carbomyl- Beta-Alanin katalysieren, wie etwa die Beta- Ureidopropionase (EC 3.5.1.6),
E35 welche die Umsetzung von Pyruvat zu Lactat katalysieren, wie etwa die 1-Lactat-Dehydrogenase
(EC 1.1.1.27) oder die Lactat-Malat-Transhydro-genase
(EC 1.1.99.7) , E36 welche die Umsetzung von Pyruvat zu Acetyl-Coenzym A katalysieren, wie etwa die Pyruvat-Dehydrogenase (EC 1.2.1.51) ,
E37 welche die Umsetzung von Pyruvat zu Acetylphosphat katalysiert, wie etwa die Pyruvat-Oxidase (EC 1.2.3.3) ,
E3S welche die Umsetzung von Pyruvat zu Acetat katalysiert, wie etwa die Pyruvat-Dehydrogenase (EC 1.2.2.2) ,
E39 welche die Umsetzung von Pyruvat zu Phosphoenolpyruvat katalysieren, wie etwa die Phosphoenolpyruvat-Synthase (EC 2.7.9.2) oder die Pyruvat-Phosphat- Dikinase (EC 2.7.9.1), und/oder
E40 welche die Umsetzung von Pyruvat zu Alanin katalysieren, wie etwa die Alanin-Transaminase (2.6.1.2) oder die Alanin-Oxosäure-Transaminase (EC 2.6.1.12)
abzuschwächen, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis maximal 5.000 %, besonders bis maximal 2.500 % abzuschwächen, wobei die Abschwächung der Enzyme E2S, E30, E33, E35, E36 und E40 besonders bevorzugt ist.
Der Begriff "abschwächen" beschreibt in diesem Zusammenhang die Verringerung oder Ausschaltung der intrazellulären Aktivität eines oder mehrerer Enzyme in einer Zelle, die durch die entsprechende DNA kodiert werden, indem man beispielsweise einen schwachen Promotor verwendet oder ein Gen bzw. Allel verwendet, das für ein entsprechendes Enzym mit einer niedrigen Aktivität kodiert bzw. das entsprechende Gen oder Enzym inaktiviert und gegebenenfalls diese Maßnahmen kombiniert.
Insbesondere kann es gemäß einer besonderen Ausfuhrungsform der erfindungsgemaßen Zellen sinnvoll sein, gezielt den Pentosephosphat-Weg zu fordern, beispielsweise durch Erhohen der Aktivität der Glucose-6-Phosphat-Dehydrogenase (EC 1.1.1.49) und der 6-Phosphogluconat-Dehydrogenase (EC 1.1.1.44), und gleichzeitig die Glykolyse zu hemmen, beispielsweise durch Abschwachung der Aktivität der Glucose-6-Phosphat-Isomerase, wie dieses in WO-A-01/07626 beschrieben ist.
Gemäß einer besonderen Ausfuhrungsform der erfindungsgemaßen Zelle ist bei dieser die Aktivität der Glutamat-Dehydrogenase (EC 1.4.1.4) durch eine der im Zusammenhang mit dem Enzym Eia, Eib und E2 genannten Techniken erhöht. Die Gene dieses Enzyms aus zahlreichen Mikroorganismen können ebenfalls der KEGG GENE Database entnommen werden. Weiterhin werden in US 6,355,454 und in WO-A-00/53726 Gene der Glutamat-Dehydrogenase und Möglichkeiten zur Uberexpression dieses Enzyms beschrieben. Der Offenbarungsgehalt dieser Druckschriften hinsichtlich der Durchfuhrung der Uberexpression der Glutamat- Dehydrogenase in Zellen wird hiermit als Referenz eingeführt und bildet einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Erfindung.
Weiterhin ist es bei den erfindungsgemaßen, gentechnisch veränderten Zellen bevorzugt, dass diese Beta-Alanin und Alpha-Alanin im Gewichtsverhaltnis von mindestens 2 : 1, besonders bevorzugt mindestens 3 : 1 und darüber hinaus bevorzugt mindestens 4 : 1 bilden. Eine Bildung von Beta- Alanin und Alpha-Alanin im Gewichtsverhaltnis von mindestens 2 : 1 bedeutet dabei, dass die Zellen innerhalb eines Zeitintervalls von 29 Stunden bei 37°C mindestens doppelt soviel Beta-Alanin wie Alpha-Alanin bilden, vorzugsweise bilden und in das die Zellen umgebende Nährmedium freisetzen.
In diesem Zusammenhang ist es besonders bevorzug, dass bei diesen erfindungsgemäßen Zellen
die Aktivität der Glutamat-Dehydrogenase (EC 1.4.1.4) erhöht ist, und
die Aktivität der Pyruvat-Carboxylase (EC 6.4.1.1) erhöht ist, und
die Aktivität der Aspartat-Decarboxylase (EC 4.1.1.11) erhöht ist, und
die Aktivität der Glucose-6-Phosphat-Isomerase (EC 5.3.1.9) abgeschwächt ist.
Die vorliegende Erfindung betrifft insbesondere eine gentechnisch veränderte Zelle, welche
eine erhöhte Pyruvat-Carboxylase-Aktivität (EC 6.4.1.1), vorzugsweise durch Expression der in in „A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum genome Information to generate a new L-lysine-producing mutant" (Ohnishi et al . , Applied Microbiology and Biotechnology 58: 217-223 (2002)) beschriebenen Mutante, und
eine erhöhte Aspartat-Decarboxylase-Aktivität (EC 4.1.1.11), vorzugsweise durch eine Asparat- Decarboxylase aus Corynebacterium glutamicum
und mindestens eines der, vorzugsweise alle nachfolgenden Eigenschaften aufweist:
erhöhte Coenzym A-Transferase-Aktivität (EC 2.8. 3.1),
erhöhte Beta-Alanyl-Coenzym A-Ammonium-Lysase- Aktivität (EC 4.3.1.6), und erhöhte 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A-Dehydratase- Aktivität (EC 4.2.1.- insbesondere EC 4.2.1.17).
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung insbesondere eine gentechnisch veränderte Zelle, welche
eine erhöhte Phosphoenolpyruvat-Carboxylase-Aktivität (EC 4.1.1.31) und
eine erhöhte Aspartat-Decarboxylase-Aktivität (EC 4.1.1.11), vorzugsweise durch eine Asparat- Decarboxylase aus Corynebacterium glutamicum
und mindestens eines der, vorzugsweise alle nachfolgenden Eigenschaften aufweist:
eine erhöhte Coenzym A-Transferase-Aktivität (EC 2.8. 3.1),
eine erhöhte Beta-Alanyl-Coenzym A-Ammonium-Lysase- Aktivität (EC 4.3.1.6), und
eine erhöhte 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A-Dehydratase- Aktivität (EC 4.2.1.-, insbesondere EC 4.2.1.17).
Die vorliegende Erfindung betrifft auch eine gentechnisch veränderte Zelle, welche
eine erhöhte Pyruvat-Carboxylase-Aktivität (EC 6.4.1.1), vorzugsweise durch Expression der in „A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum genome information to generate a new L-lysine- producing mutant" (Ohnishi et al . , Applied Microbiology and Biotechnology 58: 217-223 (2002)) beschriebenen Mutante, und
eine erhöhte Aspartat-Decarboxylase-Aktivität (EC 4.1.1.11), vorzugsweise durch eine Asparat- Decarboxylase aus Corynebacterium glutamicum und mindestens eines der, vorzugsweise alle nachfolgenden Eigenschaften aufweist:
erhöhte Beta-Alanin-2-Oxoglutarat-Aminotransferase- Aktivität (EC 2.6.1.19), und
erhöhte 3-Hydroxypropionat-Dehydrogenase-Aktivität (EC 1.1.1.59) .
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung insbesondere eine gentechnisch veränderte Zelle, welche
erhöhte Phosphoenolpyruvat-Carboxylase-Aktivität (EC 4.1.1.31) und
erhöhte Aspartat-Decarboxylase-Aktivität (EC 4.1.1.11), vorzugsweise durch eine Asparat- Decarboxylase aus Corynebacterium glutamicum
und mindestens eines der, vorzugsweise alle nachfolgenden Eigenschaften aufweist:
erhöhte Beta-Alanin-2-Oxoglutarat-Aminotransferase- Aktivität (EC 2.6.1.19), und
erhöhte 3-Hydroxypropionat-Dehydrogenase-Aktivität (EC 1.1.1.59) .
Die vorliegende Erfindung betrifft auch eine gentechnisch veränderte Zelle, welche
erhöhte Pyruvat-Carboxylase-Aktivität (EC 6.4.1.1), vorzugsweise durch Expression der in „A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum genome information to generate a new L-lysine- producing mutant" (Ohnishi et al . , Applied Microbiology and Biotechnology 58: 217-223 (2002)) beschriebenen Mutante, und erhöhte Aspartat-Decarboxylase-Aktivität (EC 4.1.1.11), vorzugsweise durch eine Asparat- Decarboxylase aus Corynebacterium glutamicum
und mindestens eines der, vorzugsweise alle nachfolgenden Eigenschaften aufweist:
erhöhte Glycerin-3-Phosphat-Dehydrogenase-Aktivität (EC 1.1.99.5), vorzugsweise durch eine Glycerin-3- Phosphat-Dehydrogenase, welche vom glpD-Gen kodiert wird, und
erhöhte Glycerin-Kinase-Aktivität (EC 2.7.1.30), vorzugsweise durch eine Glycerin-Kinase, die vom glpK- Gen kodiert wird,
wobei es sich bei der Zelle in diesem Fall vorzugsweise um Mikroorganismus des Stammes Corynebacterium glutamicum handelt .
Einen weiteren Beitrag zur Lösung der eingangs genannten Aufgaben leistet Verfahren zur Herstellung einer gentechnisch veränderten Zelle, welche durch mindestens eine der Eigenschaften C) oder D) gekennzeichnet ist:
A) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen,
B) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin zu 3-Hydroxypropionsäure umzusetzen,
umfassend mindestens einen, vorzugsweise beide der Verfahrensschritte A) und B) :
C) Erhöhung der Aktivität eines Enzyms Eia in einer Zelle, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert, oder eines Enzyms Eib, welches die Umsetzung von Phosphoenolypyruvat zu Oxalacetat katalysiert, D) Erhöhung der Aktivität eines Enzyms E2 in einer Zelle, welches die Umsetzung von Aspartat zu Beta-Alanin katalysiert .
Bei den Enzymen Eia, Eib und E2 handelt es sich vorzugsweise um diejenigen Enzyme, die bereits im Zusammenhang mit den erfindungsgemäßen Zellen beschrieben worden sind. Die Erhöhung der vorstehend genannten Enzymaktivitäten erfolgt vorzugsweise gemäß den im Zusammenhang mit den erfindungsgemäßen Zellen beschriebenen gentechnischen Verfahren und auch in dem im Zusammenhang mit den erfindungsgemäßen Zellen beschriebenen Umfang. Als Zellen, in denen die Aktivität der Enzyme Eia oder Eib und/oder E2 erhöht wird, werden vorzugsweise diejenigen Gattungen und Stämme eingesetzt, welche bereits vorstehend im Zusammenhang mit den erfindungsgemäßen gentechnisch veränderten Zellen genannt wurden.
Bei dem erfindungsgemäßen Verfahren besonders bevorzugt eingesetzte Zellen sind diejenigen der Gattungen Corynebacterium, Brevibacterium, Bacillus, Lactobacillus, Lactococcus, Candida, Pichia, Kluveromyces, Saccharomyces, Bacillus, Escherichia und Clostridium, wobei Bacillus flavum, Bacillus lactofermentum, Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, Kluveromyces lactis, Candida blankii, Candida rugosa, Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens und Pichia postoris darüber hinaus bevorzugt und Corynebacterium glutamicum am meisten bevorzugt ist bzw. sind. Insbesondere können bei dem erfindungsgemäßen Verfahren Zellen eingesetzt werden ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus den Wildtypstämmen Corynebacterium glutamicum ATCC13032, Corynebacterium acetoglutamicum ATCC15806, Corynebacterium acetoacidophilum ATCC13870, Corynebacterium thermoaminogenes FERM BP-1539, Corynebacterium melassecola ATCC17965, Brevibacterium flavum ATCC14067, Brevibacterium lactofermentum ATCC13869 und Brevibacterium divaricatum ATCC14020. Weiterhin bevorzugt sind bereits gentechnisch veränderte Bakterien, in denen die Aktivität mindestens eines der Enzyme E3 bis E25 oder aber eine der Enzymaktivitäten Eia, Eib oder E2 erhöht sind und gegebenenfalls eine oder mehrere der Enzymaktivitäten E26 bis E38 abgeschwächt sind. Unter diesen gentechnisch veränderten Zellen ist insbesondere der Stamm Corynebacterium glutamicum ATCC13032 DM1727 (Georgi et al . , Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) bevorzugt, welcher eine exogene Pyruvat-Carboxylase mit einer Aminosäuremutation an Position 458 (Prolin durch Serin ersetzt, siehe „A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum genome information to generate a new L-lysine-producing mutant" (Ohnishi et al . , Applied Microbiology and Biotechnology 58: 217-223 (2002)) aufweist .
Zellen, die in der Lage sind, Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen (und die somit die Bedingung C) erfüllen) sind vorzugsweise diejenigen Zellen, welche im Vergleich zu ihrem Wildtyp einen erhöhten, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise um 5.000%, besonders bevorzugt um 2.500% erhöhten Efflux von Beta-Alanin aus der Zelle heraus aufweisen, wobei dieser erhöhte Efflux vorzugsweise durch eine gesteigerte Aktivität eines Enzyms ermöglicht wird, welches den Efflux von Beta-Alanin aus der Zelle heraus katalysiert. Zellen, die in der Lage sind, Beta- Alanin zu 3-Hydroxypropionsäure umzusetzen (und die somit die Bedingung D) erfüllen) sind insbesondere diejenigen Zellen, in denen die Aktivität mindestens eines, vorzugsweise aller im Zusammenhang mit den erfindungsgemäßen Zellen beschriebenen Enzyme E3 bis E6 oder Zellen, in denen die Aktivität mindestens eines, vorzugsweise beider im Zusammenhang mit den erfindungsgemäßen Zellen beschriebenen Enzyme E7 und Es erhöht ist.
Es ist erfindungsgemäß weiterhin bevorzugt, dass das Verfahren zur Herstellung gentechnisch veränderter Zellen auch weitere Verfahrensschritte, wie etwa die Erhöhung der Aktivität eines oder mehrer der im Zusammenhang mit den erfindungsgemäßen Zellen beschriebenen Enzyme Eg bis E27 oder die Abschwächung der Aktivität der im Zusammenhang mit den erfindungsgemäßen Zellen beschriebenen Enzyme E28 bis E40 umfasst.
Einen Beitrag zur Lösung der eingangs genannten Aufgaben leisten auch die durch das vorstehend beschriebene Verfahren erhältlichen gentechnisch veränderten Zellen. Diese sind in der Lage, alleine oder aber in Kombination mit anderen Zellen aus Kohlenhydraten oder aus Glycerin 3- Hydroxypropionsäure zu bilden.
Einen weiteren Beitrag zur Lösung der eingangs genannten Aufgaben leistet ein Verfahren zur Herstellung von 3- Hydroxypropionsäure, umfassend die Verfahrensschritte
i) das in Kontakt bringen der erfindungsgemäßen, gentechnisch veränderten Zellen, welche die Eigenschaft c) bzw. C) aufweist, mit einem Nährmedium beinhaltend Kohlenhydrate oder Glycerin unter Bedingungen, unter denen aus den Kohlenhydraten oder dem Glycerin Beta-Alanin gebildet wird, welches zumindest teilweise aus der Zelle in das Nährmedium gelangt, so dass ein Beta-Alanin beinhaltendes Nährmedium erhalten wird,
ii) in Kontakt bringen des Beta-Alanin beinhaltenden
Nährmediums mit einer weiteren Zelle, welche in der Lage ist, das Beta-Alanin aufzunehmen und zu 3- Hydroxypropionsäure umzusetzen.
Als Zellen, die in der Lage sind, Beta-Alanin aufzunehmen und zur 3-Hydroxypropionsäure umzusetzen, sind insbesondere diejenigen Zellen bevorzugt, in denen die Aktivität mindestens eines, vorzugsweise aller Enzyme E3 bis E6 oder aber Zellen, in denen die Aktivität mindestens eines, vorzugsweise beider Enzyme E7 und E8 gegenüber dem Wildtyp erhöht worden ist bevorzugt. Solche Zellen sind beispielsweise in der WO-A-02/42418 und der WO-A-03/62173 beschrieben. Besonders bevorzugt sind darüber hinaus Zellen, bei denen zusätzlich zu diesen enzymatischen Aktivitäten auch die Aktivität von Enzymen erhöht worden ist, welche den Transport bzw. Efflux von Beta-Alanin in die Zellen hinein erhöhen. In diesem Zusammenhang ist insbesondere der GABA-Transporter GAT-2 sowie das durch das cycA-Gen kodierte Transportsystem, das in Schneider et al . , (Appl. Microbiol. Biotechnol. 65: 576-582 (2004)) beschrieben wird, bevorzugt.
Die erfindungsgemäßen, gentechnisch veränderten Zellen können im Verfahrensschritt i) kontinuierlich oder diskontinuierlich im batch-Verfahren (Satzkultivierung) oder im fed-batch-Verfahren (Zulaufverfahren) oder repeated-fed-batch-Verfahren (repetitives Zulaufverfahren) zum Zwecke der Produktion von Beta-Alanin mit dem Nährmedium in Kontakt und somit kultiviert werden. Denkbar ist auch ein semi-kontinuierliches Verfahren, wie es in der GB-A-1009370 beschrieben wird. Eine Zusammenfassung über bekannte Kultivierungsmethoden sind im Lehrbuch von Chmiel („Bioprozesstechnik 1. Einführung in die
Bioverfahrenstechnik" (Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, 1991)) oder im Lehrbuch von Storhas („Bioreaktoren und periphere Einrichtungen" , Vieweg Verlag, Braunschweig/Wiesbaden, 1994) beschrieben. Das zu verwendende Kulturmedium muss in geeigneter Weise den Ansprüchen der jeweiligen Stamme genügen. Beschreibungen von Kulturmedien verschiedener Mikroorganismen sind im Handbuch "Manual of Methods for General Bacterlology" der American Society for Bacteriology (Washington D. C, USA, 1981) enthalten.
Als Kohlenstoffquelle können Zucker und Kohlehydrate wie z. B. Glucose, Saccharose, Lactose, Fructose, Maltose, Melasse, Starke und Cellulose, Ole und Fette wie z. B. Sojaol, Sonnenblumenöl, Erdnussol und Kokosfett, Fettsauren wie z. B. Palmitinsaure, Stearinsaure und Linolsaure, Alkohole wie z. B. Glycerin und Ethanol und organische Sauren wie z. B. Essigsaure verwendet werden. Diese Stoffe können einzeln oder als Mischung verwendet werden. Besonders bevorzugt ist der Einsatz von Kohlehydraten, insbesondere Monosaccharide, Oligosaccharide oder Polysaccharide, wie dies in US 6,01,494 und US 6,136,576 beschrieben ist, von C5-Zuckern oder von Glycerin.
Als Stickstoffquelle können organische Stickstoff-haltige Verbindungen wie Peptone, Hefeextrakt, Fleischextrakt, Malzextrakt, Maisquellwasser, Sojabohnenmehl und Harnstoff oder anorganische Verbindungen wie Ammoniumsulfat, Ammoniumchlorid, Ammoniumphosphat, Ammoniumcarbonat und Ammoniumnitrat verwendet werden. Die Stickstoffquellen können einzeln oder als Mischung verwendet werden.
Als Phosphorquelle können Phosphorsaure,
Kaliumdihydrogenphosphat oder Dikaliumhydrogenphosphat oder die entsprechenden Natrium-haltigen Salze verwendet werden. Das Kulturmedium muss weiterhin Salze von Metallen enthalten wie z. B. Magnesiumsulfat oder Eisensulfat, die für das Wachstum notwendig sind. Schließlich können essentielle Wuchsstoffe wie Aminosäuren und Vitamine zusatzlich zu den oben genannten Stoffen eingesetzt werden. Dem Kulturmedium können überdies geeignete Vorstufen zugesetzt werden. Die genannten Einsatzstoffe können zur Kultur in Form eines einmaligen Ansatzes hinzugegeben oder in geeigneter Weise während der Kultivierung zugefüttert werden .
Zur pH-Kontrolle der Kultur werden basische Verbindungen wie Natrium (hydrogen) carbonat, Natriumhydroxid, Kaliumhydroxid, Ammoniak bzw. Ammoniakwasser oder saure Verbindungen wie Phosphorsäure oder Schwefelsäure in geeigneter Weise eingesetzt. Zur Kontrolle der Schaumentwicklung können Antischaummittel wie z. B. Fettsäurepolyglykolester eingesetzt werden. Zur Aufrechterhaltung der Stabilität von Plasmiden können dem Medium geeignete selektiv wirkende Stoffe wie z. B. Antibiotika hinzugefügt werden. Um aerobe Bedingungen aufrechtzuerhalten, werden Sauerstoff oder Sauerstoffhaltige Gasmischungen wie z. B. Luft in die Kultur eingetragen. Die Temperatur der Kultur liegt normalerweise bei 200C bis 45°C und vorzugsweise bei 25°C bis 400C. Insbesondere bei der Verwendung von Zellen, welche Glycerin als Substrat umwandeln können, kann es bevorzugt sein, als Zellen solche Zellen einzusetzen, die in der US 6,803,218 beschrieben werden und in diesen Zellen die Aktivität der Enzyme Eia oder Eib und/oder E2 zu erhöhen (sowie gegebenenfalls der weiteren Enzyme E3 bis E20) • In diesem Fall können die Zellen bei Temperaturen im Bereich von 40 bis 100°C kultiviert werden.
Zeitgleich mit der Bildung von Beta-Alanin oder von diesem Verfahrenschritt getrennt wird das Beta-Alanin beinhaltenden Nährmedium mit den weiteren Zellen, welche in der Lage sind, das Beta-Alanin aufzunehmen und zu 3- Hydroxypropionsäure umzusetzen, in Kontakt gebracht. Dabei können die erfindungsgemäßen Zellen und die weiteren Zellen gemeinsam in einem Nährmedium kultiviert werden, so dass das von den erfindungsgemäßen Zellen abgegebene Beta-Alanin quasi in statu nascendii von den weiteren Zellen aufgenommen und zu 3-Hydroxypropionsäure umgesetzt wird. Denkbar ist aber auch, zunächst ein Beta-Alanin-haltiges Nährmedium zu bilden, aus diesem die erfindungsgemäßen Zellen abzutrennen und erst dann dieses Beta-Alanin enthaltende Nährmedium mit den weiteren Zellen in Kontakt zu bringen. Besonders bevorzugt ist jedoch die gleichzeitige Kultivierung der erfindungsgemäßen und der weiteren Zellen.
Das erfindungsgemäße Verfahren zur Herstellung von 3- Hydroxypropionsäure kann als weiteren Verfahrensschritt iii) auch die Aufreinigung der letztendlich erhaltenen 3- Hydroxypropionsäure aus dem Nährmedium umfassen. Diese Aufreinigung kann durch jedes dem Fachmann bekannte Reinigungsverfahren erfolgen. So können beispielsweise Sedimentations-, Filtrations- oder Zentrifugationsverfahren eingesetzt werden, um die Zellen abzutrennen. Aus dem von Zellen befreiten, 3-Hydroxypropionsäure-haltigen Nährmedium kann die 3-Hydroxypropionsäure durch Extraktion, Destillation, Ionen-Austausch, Elektrodialyse oder Kristalisation isoliert werden.
Die Aufreinigung der 3-Hydroxypropionsäure aus der Nährlösung erfolgt gemäß einer besonderen Ausgestaltung des erfindungsgemäßen Verfahrens kontinuierlich, wobei es in diesem Zusammenhang weiterhin bevorzugt ist, auch die Fermentation kontinuierlich durchzuführen, so dass der gesamte Prozess von der enzymatischen Umsetzung der Edukte unter Bildung von 3-Hydroxypropionsäure bis zur Aufreinigung der 3-Hydroxypropionsäure aus dem Nährmedium kontinuierlich durchgeführt werden kann. Zur kontinuierlichen Aufreinigung der 3-Hydroxypropionsäure aus dem Nährmedium wird diese kontinuierlich über eine Vorrichtung zur Abtrennung der bei der Fermentation eingesetzten Zellen, vorzugsweise über einen Filter mit einer Ausschlussgröße in einem Bereich von 20 bis 200 kDa geführt, in dem eine Fest-/Flüssig-Trennung stattfindet. Denkbar ist auch der Einsatz einer Zentrifuge, einer geeigneten Sedimentationsvorrichtung oder eine Kombination dieser Vorrichtungen, wobei es besonders bevorzugt ist, zumindest einen Teil der Zellen zunächst durch Sedimentation abzutrennen und anschließend das von den Zellen teilweise befreite Nährmedium einer Ultrafiltrations- oder Zentrifugationsvorrichtung zuzuführen .
Das hinsichtlich seines 3-Hydroxypropionsäure-Anteils angereicherte Fermentationserzeugnis wird nach der Abtrennung der Zellen einer vorzugsweise mehrstufigen Trennanlage zugeführt. In dieser Trennanlage sind mehrere hintereinander geschaltete Trennstufen vorgesehen, aus denen jeweils Rückführ-Leitungen ausmünden, die zum zweiten Fermentationstank zurückgeführt sind. Weiterhin führen aus den jeweiligen Trennstufen Ableitungen heraus. Die einzelnen Trennstufen können nach dem Prinzip der Elektrodialyse, der Umkehrosmose, der Ultrafiltration oder der Nanofiltration arbeiten. In der Regel handelt es sich um Membran-Trenneinrichtungen in den einzelnen Trennstufen. Die Auswahl der einzelnen Trennstufen ergibt sich aus Art und Umfang der Fermentations-Nebenprodukte und Substratreste .
Neben der Abtrennung der 3-Hydroxypropionsäure mittels Elektrodialyse, Umkehrosmose, Ultrafiltration oder Nanofiltration, in deren Verlauf als Endprodukt eine wässrige 3-Hydroxypropionsäure-Lösung erhalten wird, kann die 3-Hydroxypropionsäure auch durch Extraktionsverfahren aus dem von Zellen befreiten Nährmedium abgetrennt werden, wobei in diesem Fall letztendlich die reine 3- Hydroxypropionsäure erhalten werden kann. Zur Abtrennung der 3-Hydroxypropionsäure durch Extraktion können dem Nährmedium, in dem die 3-Hydroxypropionsäure als Ammoniumsalz vorliegt, beispielsweise hochsiedende organische Amine zugesetzt werden. Anschließend wird die so erhaltene Mischung erhitzt, wobei Ammoniak und Wasser entweichen und die 3-Hydroxypropionsäure in die organische Phase extrahiert wird. Dieses als „Salt-Splitting" bezeichnete Verfahren ist der WO-A-02/090312 zu entnehmen, deren Offenbarungsgehalt hinsichtlich der Abtrennung von 3- Hydroxypropionsäure aus Nährmedien hiermit als Referenz eingeführt wird und einen Teil der Offenbarung der vorliegenden Anmeldung bildet.
Einen Beitrag zur Lösung der eingangs genannten Aufgabe leistet auch ein Verfahren zur Herstellung von 3- Hydroxypropionsäure, umfassend den Verfahrensschritt des in Kontakt bringens einer erfindungsgemäßen Zelle, welche die Eigenschaft d) bzw. D) aufweist, mit einem Nährmedium beinhaltend Kohlenhydrate oder Glycerin unter Bedingungen, unter denen aus den Kohlenhydraten oder dem Glycerin 3- Hydroxypropionsäure gebildet wird. Die Kultivierung erfolgt im Wesentlichen genauso wie bei dem vorstehend beschriebenen Verfahren zur Herstellung von 3- Hydroxypropionsäure, wobei jedoch in diesem Falle erfindungsgemäße, gentechnisch veränderte Zellen eingesetzt werden, die Beta-Alanin zu 3-Hydroxypropionsäure umsetzen können. Erfindungsgemäße Zellen, die hierzu in der Lage sind, wurden bereits eingangs eingehend beschrieben.
Auch dieses Verfahren zur Herstellung von 3-
Hydroxypropionsäure kann als weiteren Verfahrensschritt die Aufreinigung der 3-Hydroxypropionsäure aus dem Nährmedium umfassen .
Weiterhin leistet ein Verfahren zur Herstellung von Acrylsäure einen Beitrag zur Lösung der eingangs genannten Aufgaben, umfassend die Verfahrensschritte
I) Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure durch die vorstehend beschriebenen Verfahren, gegebenenfalls gefolgt von einem oder mehreren Aufreinigungsschritten, II) Dehydratisierung der 3-Hydroxypropionsäure unter Bildung von Acrylsäure.
Die Dehydratisierung der 3-Hydroxypropionsäure kann grundsätzlich in flüssiger Phase oder in der Gasphase durchgeführt werden, wobei eine Flüssigphasen- Dehydratisierung bevorzugt ist. Weiterhin ist es erfindungsgemäß bevorzugt, dass die Dehydratisierung in Gegenwart eines Katalysators erfolgt, wobei die Art des eingesetzten Katalysators davon abhängig ist, ob eine Gasphasen- oder eine Flüssigphasenreaktion durchgeführt wird. Als Dehydratisierungskatalysatoren kommen sowohl saure als auch alkalische Katalysatoren in Betracht. Saure Katalysatoren sind insbesondere wegen der geringen Neigung zur Oligomerenbildung bevorzugt. Der
Dehydratisierungskatalysator kann sowohl als homogener als auch als heterogener Katalysator eingesetzt werden. Im Anschluss an die Dehydratisierung wird eine Acrylsäure beinhaltende Phase erhalten, die gegebenenfalls durch weitere Aufreinigungsschritte, insbesondere durch Destillationsverfahren, Extraktionsverfahren oder Kristallisationsverfahren oder aber durch eine Kombination dieser Verfahren aufgereinigt werden kann.
Einen weiteren Beitrag zur Lösung der eingangs genannten Aufgaben leistet auch ein Verfahren zur Herstellung von Polyacrylaten, umfassend die Verfahrensschritte
I) Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure durch eines der vorstehend beschriebenen Verfahren, gegebenenfalls gefolgt von einem oder mehreren Aufreinigungsschritten,
II) Dehydratisierung der 3-Hydroxypropionsäure unter Bildung von Acrylsäure gemäß dem vorstehend beschrieben Verfahren, gegebenenfalls gefolgt von einem oder mehreren Aufreinigungsschritten, III) Radikalische Polymerisation der Acrylsäure.
Die radikalische Polymerisation der Acrylsäure erfolgt durch dem Fachmann bekannte Polymerisationsverfahren und kann sowohl in einer Emulsion oder Suspension als auch in wässriger Lösung durchgeführt werden. Weiterhin können bei der Polymerisation weitere Co-Monomere, insbesondere Vernetzer zugegen sein. Besonders bevorzugt ist die radikalische Polymerisation der im Verfahrensschritt II) erhaltenen Acrylsäure in zumindest teilneutralisierter Form in Gegenwart von Vernetzern. Bei dieser Polymerisation werden Hydrogele erhalten, die dann zerkleinert, gemahlen und gegebenenfalls Oberflächenmodifiziert, insbesondere Oberflächennachvernetzt werden können. Die so erhaltenen Polymere eignen sich insbesondere zum Einsatz als Superabsorber in Hygieneartikeln wie etwa Windeln oder Damenbinden .
Einen Beitrag zur Lösung der eingangs genannten Aufgaben leistet auch ein Verfahren zur Herstellung von Acrylsäureestern, umfassend die Verfahrensschritte
I) Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure durch eines der vorstehend beschriebenen Verfahren, gegebenenfalls gefolgt von einem oder mehreren Aufreinigungsschritten,
II) Dehydratisierung der 3-Hydroxypropionsäure unter Bildung von Acrylsäure gemäß dem vorstehend beschrieben Verfahren, gegebenenfalls gefolgt von einem oder mehreren Aufreinigungsschritten,
III) Veresterung der Acrylsäure. Die Veresterung der Acrylsäure erfolgt durch dem Fachmann bekannte Veresterungsverfahren, besonders bevorzugt dadurch, dass die im Verfahrensschritt II) erhaltene Acrylsäure mit Alkoholen, vorzugsweise mit Methanol, Ethanol, 1-Propanol, 2-Propanol, n-Butanol, tert . -Butanol oder iso-Butanol in Kontakt gebracht und auf eine Temperatur von mindestens 500C, besonders bevorzugt mindestens 1000C erhitzt wird. Gegebenenfalls kann das bei der Veresterung gebildete Wasser durch den Zusatz geeigneter Trennhilfen mittels azeotroper Destillation aus dem Reaktionsgemisch entfernt werden.
Einen weiteren Beitrag zur Lösung der eingangs genannten Aufgaben leistet die Verwendung einer gegenüber ihrem Wildtyp gentechnisch veränderten Zelle, welche mindestens eine, vorzugsweise beide der Eigenschaften a) und b) aufweist :
a) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % gesteigerte Aktivität eines Enzyms Eia, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert oder eines Enzyms Eib, welches die Umsetzung von Phosphoenolpyruvat zu Oxalacetat katalysiert, vorzugsweise jedoch eines Enzyms Eia, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert,
b) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte, vorzugsweise um mindestens 10 %, besonders bevorzugt um mindestens 25 %, darüber hinaus bevorzugt um mindestens 50 %, darüber hinaus noch mehr bevorzugt um mindestens 75 %, des weiteren bevorzugt um mindesten 100 % und am meisten bevorzugt um mindestens 500 %, maximal vorzugsweise bis 5.000 %, besonders bevorzugt bis 2.500 % gesteigerte Aktivität eines Enzyms E2, welches die Umsetzung von Aspartat zu Beta-Alanin katalysiert,
zur Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure .
Die vorliegende Erfindung wird nun anhand nichtlimitierender Figuren und Beispiele näher erläutert.
Es zeigt die Figur 1 das Reaktionsschema zur Bildung von Beta-Alanin aus Glukose oder Glycerin über Pyruvat, Oxaloacetat und Aspartat.
Es zeigt die Figur 2 das Reaktionsschema zur Bildung von 3- Hydroxypropionsäure aus Beta-Alanin über Beta-Alanyl- Coenzym A, Acrylyl-Coenzym A und 3-Hydroxypropionyl- Coenzym A oder über Malonsäuresemialdehyd.
Es zeigt die Figur 3 den Plasmidvektoren pVWexl-panD.
Es zeigt die Figur 4 den Plasmidvektoren pVWExl-glpKDE.c..
Es zeigt die Figur 5 den Plasmidvektoren pVWExl-panD- glpKDE.c..
Bei spiel
Es wurde eine gentechnisch veränderte Zelle des Stammes Corynebacterium glutamicum hergestellt, in der die heterologen Gene glpK, glpD, und die homologen Gene pyc und panD exprimiert wurden. Dabei wurde wie folgt vorgegangen:
Als Ausgangsstämme wurden der Wildtypstamm ATCC13032 (hinterlegt bei der Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH, Braunschweig mit der DSM-Nummer 20300) und der Stamm DM1727 verwendet. Der Stamm DM1727 wurde von Georgi et al . (Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) beschrieben und stellt einen gentechnisch veränderten Corynebacterium glutamicum-Stamm dar, der eine gegenüber dem Wildtyp-Stamm erhöhte Aktivität der Pyruvat- Carboxylase aufweist. Diese erhöhte Aktivität des Enzyms ist auf eine Mutation der Aminosäure an Position 458 (Austausch von Prolin durch Serin) zurückzuführen. Siehe hierzu auch ,,A novel methodology employing Corynebacterium glutamicum genome Information to generate a new L-lysine- producing mutant" (Ohnishi et al . , Applied Microbiology and Biotechnology 58: 217-223 (2002)).
1. Herstellen der Plasmidvektoren
Zunächst wurden die nachfolgenden zwei PCR-Primer synthetisiert (Unterstrichenes Nukleotid entspricht dem Basenpaar im E. coli-Genom MG1655 (GenBank Reference Sequence NC 000913 (U00096), Schnittstellen sind fett gedruckt) :
glpKrev: 5'TCTAGAT_TATTCGTCGTGTTCTTCCCACGCC (SEQ. ID NO. 2) (das unterstrichene Nukleotid entspricht dem Basenpaar 4113737 im MG1655-Genom, die Schnittstelle entspricht einer Xbal- Schnittstelle) gipκfor: 5' GGGACGTCGACΛΛGGΛGΛΓΛΓΛGATGACTGAAAAAAAATATATC
(SEQ. ID NO. 3)
(das unterstrichene Nukleotid entspricht dem Basenpaar 4115245 im MG1655-Genom, die Schnittstelle entspricht einer SaII- Schnittstelle)
Die Primer entsprachen den Basen 4113737 bis 4113762 und 4115225 bis 4115245 des glpK- Gens von E. coli. Mit diesen Primern konnte mittels PCR nach der Standardmethode von Innis et al . (PCR protocols. A guide to methods and applications, 1990, Academic Press) für nicht-degenerierte, homologe Primer ein Fragment von 1533 Basenpaaren chromosomaler DNA von E. coli, die, wie bei Eikmanns et al . (Microbiology, 140: 1817-1828 (1994)) beschrieben, isoliert wurde, amplifiziert werden.
Dieses PCR-Fragment wurde in den Plasmidvektor pGEM-T (Promega Corporation, Madison, Wisconsin, USA) unter Erhalt des Plasmidvektors pGEM-T-glpKE.c. kloniert.
Im Anschluss daran wurden die nachfolgenden zwei PCR-Primer synthetisiert (unterstrichenes Nukleotid entspricht dem Basenpaar im E. coli-Genom MG1655, Schnittstellen sind fett gedruckt und kursive Bereich markierten eine Ribosomenbindungstelle) :
gipDfor: 5' TCTAGAΛΛGGΛGΛΓΛΓΛGATGGAAACCAAAGATCTG
(SEQ. ID NO. 4)
(das unterstrichene Nukleotid entspricht dem Basenpaar 3560036 im MG1655-Genom, die Schnittstelle entspricht einer Xbal- Schnittstelle) glpDrev : 5 ' GTTAATTCTAGATTACGACGCCAGCGATAA (SEQ. ID NO. 5)
(das unterstrichene Nukleotid entspricht dem Basenpaar 3561541 im MG1655-Genom, die Schnittstelle entspricht einer Xbal- Schnittstelle)
Die Primer entsprachen den Basen 3560036 bis 3560053 und 3561524 bis 3561541 des plpD- Gens von E. coli. Mit diesen Primern konnte mittels PCR nach der Standardmethode von Innis et al . (PCR protocols. A guide to methods and applications, 1990, Academic Press) für nicht-degenerierte, homologe Primer ein Fragment von 1524 Basenpaaren chromosomaler DNA von E. coli, die, wie bei Eikmanns et al . (Microbiology 140: 1817-1828 (1994)) beschrieben, isoliert wurde, amplifiziert werden.
Dieses PCR-Fragment wurde in den Plasmidvektor pGEM-T (Promega Corporation, Madison, Wisconsin, USA) unter Erhalt des Plasmidvektors pGEM-T-glpDE.c. kloniert.
Anschließend wurde das 1524-Basenpaar-Fragment mit Xball aus dem Plasmidvektor pGEM-T glpDE.c. herausgeschnitten und in den mit Spel-SAP (SAP = Shrimp Alkaline Phosphatase) geschnittenen Plasmidvektor pGEM-T-glpKE.c. unter Erhalt des Plasmidvektors pGEM-T-glpKDE.c kloniert. Anschließend wurde das glpKDE.c. -Fragment mittels Sali herausgeschnitten und in mit Sali geschnittenem Plasmidvektor pVWExl (dieses Expressionsplasmid wurde durch Peters-Wendisch et al . , Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology 3: 295- 300 (2001) beschrieben) unter Erhalt des Plasmidvektors pVWExl-glpKDE.c. kloniert.
Im Anschluss daran wurden die nachfolgenden zwei PCR-Primer synthetisiert (unterstrichenes Nukleotid entspricht dem Basenpaar im Corynebacterium glutamicum -Genom (NC003450), Schnittstellen sind fett gedruckt und kursive Bereiche markieren eine Ribosomenbindungstelle) : NCgI0133for : 5 ' GGACACTAGTAAGGAGATATAGATGCTGCGCACCATCCTC
(SEQ. ID NO. 6)
(das unterstrichene Nukleotid entspricht dem Basenpaar 145570 im Genom von Corynebacterium glutamicum, die Schnittstelle entspricht einer Spel- Schnittstelle)
NCglO133rev: 5' CTAAAACGGGTACCCTAAATGCTTCTCGACGTC
(SEQ. ID NO. 7)
(das unterstrichene Nukleotid entspricht dem Basenpaar 147980 im Genom von Corynebacterium glutamicum, die Schnittstelle entspricht einer Kpnl-Schnittstelle)
Die Primer entsprachen den Basen 147570 bis 147588 und 147964 bis 147980 des panD-Gens von C. glutamicum. Mit diesen Primern konnte mittels PCR nach der Standardmethode von Innis et al . (PCR protocols. A guide to methods and applications, 1990, Academic Press) für nicht-degenerierte, homologe Primer ein Fragment von etwa 430 Basenpaaren chromosomaler DNA von C. glutamicum, die, wie bei Eikmanns et al. (Microbiology 140: 1817-1828 (1994)) beschrieben, isoliert wurde, amplifiziert werden.
Dieses PCR-Fragment wurde in den Plasmidvektor pGEM-T (Promega Corporation, Madison, Wisconsin, USA) unter Erhalt des Plasmidvektors pGEM-T-panD kloniert.
Anschließend wurde das panD-Fragment mittels Spei und Kpnl aus pGEM-T-panD herausgeschnitten und in den mit Xbal und Kpnl geschnittenen Plasmidvektor pVWExl unter Erhalt des Plasmidvektors pVWExl-panD kloniert. Des Weiteren wurde das mittels Spei und Kpnl aus pGEM-T-pand geschnittene panD- Fragment in mit Xbal und Kpnl geschnittenen Plasmidvektor pVWExl-glpKÜEc unter Erhalt des Plasmidvektors pVWExl-panD- glpKDEc (SEQ. ID NO. 1) kloniert.
Die Plasmidvektoren pVWExl-panD, pVWExl-glpKDEc und pVWExl- panD-glpKDEc (SEQ. ID NO. 1) sind in den Figuren 3 bis 5 gezeigt .
2. Tranformation der Zellen
In die eingangs genannten Ausgangsstämme wurden die Expressionsplasmide pVWExl, pVWExl-panDc.g. , pVWExl-glpKÜEc und pVWExl-glpKÜEc.panDcg mittels Elektroporation eingebracht (nach van der Rest et al . , Appl . Microbiol. Biotechnol. 52: 541-545 (1999)).
3. Kultivierung der Zellen
Mit Glukose als Kohlenstoffquelle
Die mit diesen Plasmiden transformierten Stämme wurden in CGXII-Medium kultiviert, welches von Georgi et al . (Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) und von Marx et al . (US 6,355,454) beschrieben wurde. Das Medium enthielt 40 g/kg Glukose.
Die Alpha- bzw. Beta-Alanin-Konzentration wurde mittels HPLC nachgewiesen. Die Methode wurde von Georgi et al . (Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) und von Marx et al . (US 6,355,454) beschrieben. Zur Identifizierung des Alpha-Alanin bzw. Beta-Alanin-Signals wurde ein entsprechender Standart eingesetzt.
Nach 29-stündiger Kultivierung der Zellen wurden folgenden Konzentrationen an Alpha-Alanin und Beta-Alanin im Nährmedium gemessen:
Figure imgf000060_0001
3.2. Mit Glycerin als Kohlenstoffquelle
Die mit diesen Plasmiden transformierten Stämme wurden in CGXII-Medium kultiviert, welches von Georgi et al . (Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) und von Marx et al . (US 6,355,454) beschrieben wurde. Das Medium enthielt 9 g/kg Glycerin.
Die Alpha- bzw. Beta-Alanin-Konzentration wurde mittels HPLC nachgewiesen. Die Methode wurde von Georgi et al . (Metabolie Engineering 7: 291-301 (2005)) und von Marx et al . (US 6,355,454) beschrieben. Zur Identifizierung des Alpha-Alanin- bzw. Beta-Alanin-Signals wurde ein entsprechender Standard eingesetzt.
Nach 24-stündiger Kultivierung der Zellen wurden folgende Konzentrationen an Alpha-Alanin und Beta-Alanin im Nährmedium gemessen:
Figure imgf000060_0002

Claims

Patentansprüche
1. Eine gegenüber ihrem Wildtyp gentechnisch veränderte Zelle, welche mindestens eine der Eigenschaften a) oder b) aufweist:
a) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität eines Enzyms Eia, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert, oder eines Enzyms Eib, welches die Umsetzung von Phosphoenolpyruvat zu Oxalacetat katalysiert,
b) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität eines Enzyms E2, welches die Umsetzung von Aspartat zu Beta-Alanin katalysiert,
wobei die Zelle neben den Eigenschaften a) oder b) durch mindestens eine der Eigenschaften c) oder d) gekennzeichnet ist:
c) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen,
d) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin zu 3-Hydroxypropionsäure umzusetzen.
2. Zelle nach Anspruch 1, wobei das Enzym Ei eine Pyruvat- Carboxylase ist.
3. Zelle nach Anspruch 1 oder 2, wobei die gesteigerte Aktivität des Enzyms Ei durch eine Mutation des Pyruvat-Carboxylase-Gens des Wildtyps der Zelle ist.
4. Zelle nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei das Enzym E2 eine Aspartat-Decarboxylase ist.
5. Zelle nach einem der vorhergehenden Ansprüche, welche die Eigenschaft d) aufweist, wobei die Zelle eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität mindestens eines der folgenden Enzyme E3 bis E6 aufweist :
eines Enzyms E3, welches die Umsetzung von Beta- Alanin zu Beta-Alanyl-Coenzym A katalysiert,
eines Enzyms E4, welches die Umsetzung von Beta- Alanyl-Coenzym A zu Acrylyl-Coenzym A katalysiert,
eines Enzyms E5, welches die Umsetzung von Acrylyl- Coenzym A zu 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A katalysiert,
eines Enzyms E6, welches die Umsetzung von 3- Hydroxypropionyl-Coenzym A zu 3-Hydroxypropionsäure katalysiert,
6. Zelle nach Anspruch 5, wobei das Enzym
E3 eine Coenzym A-Transferase oder Coenzym A- Synthetase,
E4 eine Beta-Alanly-Coenzym A-Ammonium-Lysase,
E5 eine 3-Hydroxypropionyl-Coenzym A-Dehydratase, und
E6 eine Coenzym A-Transferase, 3-Hydroxypropionyl- Coenzym A-Hydrolase oder 3-Hydroxybutyryl- Coenzym A-Hydrolase
ist .
7. Zelle nach einem der Ansprüche 1 bis 4, welche die Eigenschaft d) aufweist, wobei die Zelle eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität mindestens eines der folgenden Enzyme E7 und Es aufweist :
eines Enzyms E7, welches die Umsetzung von Beta- Alanin zu Malon-säuresemialdehyd katalysiert,
eines Enzyms E8, welches die Umsetzung von Malonsäuresemialdehyd zu 3-Hydroxypropionsäure katalysiert .
8. Zelle nach Anspruch 7, wobei das Enzym
E7 eine Beta-Alanin-2-Oxoglutarat-Aminotransferase und
Es eine 3-Hydroxypropionyl-Dehydrogenase oder 3- Hydroxybutyrat-Dehydrogenase
ist .
9. Zelle nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Zelle eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp verminderte Phosphoglucoisomerase-Aktivität aufweist.
10. Ein Verfahren zur Herstellung einer gentechnisch veränderten Zelle, welche durch mindestens eine der Eigenschaften C) oder D) gekennzeichnet ist:
A) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin aus der Zelle herauszuschleusen,
B) die gentechnisch veränderte Zelle ist in der Lage, Beta-Alanin zu 3-Hydroxypropionsäure umzusetzen,
umfassend mindestens einen, vorzugsweise beide der Verfahrensschritte A) und B) : A) Erhöhung der Aktivität eines Enzyms Eia in einer Zelle, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert, oder eines Enzyms Eib, welches die Umsetzung von Phosphoenolpyruvat zu Oxalacetat katalysiert oder
B) Erhöhung der Aktivität eines Enzyms E2 in einer Zelle, welches die Umsetzung von Aspartat zu Beta- Alanin katalysiert.
11. Verfahren nach Anspruch 10, wobei das Enzym Eia eine Pyruvat-Carboxylase und das Enzym Eib eine Phosphoenolpyruvat-Carboxylase ist .
12. Verfahren nach Anspruch 10 oder 11, wobei das Enzym E2 eine Aspartat-Decarboxylase ist.
13. Eine Zelle, erhältlich durch ein Verfahren nach einem der Ansprüche 10 bis 12.
14. Ein Verfahren zur Herstellung von 3- Hydroxypropionsäure, umfassend die Verfahrensschritte
i) das in Kontakt bringen einer Zelle nach einem der Ansprüche 1 bis 9 oder 13, welche die Eigenschaft c) aufweist, mit einem Nährmedium beinhaltend Kohlenhydrate oder Glycerin unter Bedingungen, unter denen aus den Kohlenhydraten oder dem Glycerin Beta-Alanin gebildet wird, welches zumindest teilweise aus der Zelle in das Nährmedium gelangt, so dass ein Beta-Alanin beinhaltendes Nährmedium erhalten wird; ii) in Kontakt bringen des Beta-Alanin beinhaltenden Nährmediums mit einer weiteren Zelle, welche in der Lage ist, das Beta-Alanin aufzunehmen und zu 3-Hydroxypropionsäure umzusetzen .
15. Ein Verfahren zur Herstellung von 3- Hydroxypropionsäure, umfassend den Verfahrensschritt des in Kontakt bringens einer Zelle nach einem der Ansprüche 1 bis 9 oder 13, welche die Eigenschaft d) aufweist, mit einem Nährmedium beinhaltend Kohlenhydrate oder Glycerin unter Bedingungen, unter denen aus den Kohlenhydraten oder dem Glycerin 3- Hydroxypropionsäure gebildet wird.
16. Ein Verfahren zur Herstellung von Acrylsäure, umfassend die Verfahrensschritte
I) Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure durch ein Verfahren nach Anspruch 14 oder 15;
II) Dehydratisierung der 3-Hydroxypropionsäure unter Bildung von Acrylsäure.
17. Ein Verfahren zur Herstellung von Polyacrylaten, umfassend die Verfahrensschritte
I) Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure durch ein Verfahren nach Anspruch 14 oder 15,
II) Dehydratisierung der 3-Hydroxypropionsäure unter Bildung von Acrylsäure,
III) Radikalische Polymerisation der Acrylsäure.
18. Ein Verfahren zur Herstellung von Acrylsäureestern, umfassend die Verfahrensschritte I) Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure durch ein Verfahren nach Anspruch 15 oder 16,
II) Dehydratisierung der 3-Hydroxypropionsäure unter Bildung von Acrylsäure,
III) Veresterung der Acrylsäure.
19. Verwendung einer gegenüber ihrem Wildtyp gentechnisch veränderten Zelle, welche mindestens eine der Eigenschaften a) oder b) aufweist:
a) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität eines Enzyms Eia, welches die Umsetzung von Pyruvat zu Oxalacetat katalysiert, oder eines Enzyms Eib, welches die Umsetzung von Phosphoenolpyruvat zu Oxalacetat katalysiert,
b) eine im Vergleich zu ihrem Wildtyp gesteigerte Aktivität eines Enzyms E2, welches die Umsetzung von Aspartat zu Beta-Alanin katalysiert,
zur Herstellung von 3-Hydroxypropionsäure.
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