TWI805577B - 靶向組合物 - Google Patents

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愛蜜莉 P 西
馬克 烏德
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Abstract

本發明提供某些核酸(例如,雙鏈siRNA分子)以及包含靶向部分、雙鏈siRNA及視情況存在之連接基團之偶聯物。某些實施例亦提供用於製備該等偶聯物之合成方法。該等偶聯物可用於將治療性雙鏈siRNA靶向至肝臟並治療包括肝炎(例如,B型肝炎及D型肝炎)在內之肝病。

Description

靶向組合物
多種疾病係肝臟特異性的,例如B型肝炎及非酒精性脂肪性肝炎(NASH)。因此,將有益的係具有可主要靶向至活個體之肝臟、腎臟、心臟、胰臟或其他器官之治療性組合物。
包括siRNA在內之核酸可用作治療劑。
當前業內需要可用於在活個體中遞送(例如,靶向)治療性核酸(例如雙鏈siRNA)之組合物及方法。
本發明提供核酸分子(例如,治療性雙鏈siRNA分子)以及可用於靶向該等核酸(例如至肝臟)之化合物、組合物及方法。
因此,在一個態樣中,本發明提供選自由以下組成之群之雙鏈siRNA分子:siRNA 1(SEQ ID NO:1及2)、2(SEQ ID NO:3及4)、3(SEQ ID NO:5及6)、4(SEQ ID NO:7及8)、5(SEQ ID NO:9及10)、6(SEQ ID NO:11及12)、7(SEQ ID NO:13及14)、8(SEQ ID NO:15及16)、9(SEQ ID NO:17及18)、10(SEQ ID NO:19及20)、11(SEQ ID NO:21及22)、12(SEQ ID NO:23及24)、13(SEQ ID NO:25及26)、14(SEQ ID NO:27及28)、15(SEQ ID NO:29及30)、16(SEQ ID NO:31及32)、17(SEQ ID NO:33及34)、18(SEQ ID NO:35及36)、19(SEQ ID NO:37及38)、20(SEQ ID NO:39及40)、21(SEQ ID NO:41及42)、22(SEQ ID NO:43及44)、23(SEQ ID NO:45及46)、24(SEQ ID NO:47及48)、25(SEQ ID NO:49及50)、26(SEQ ID NO:51及52)、27(SEQ ID NO:53及54)、28(SEQ ID NO:55及56)、29(SEQ ID NO:57及58)、30(SEQ ID NO:59及60)、31(SEQ ID NO:61及62)、32(SEQ ID NO:63及64)、33(SEQ ID NO:65及66)、34(SEQ ID NO:67及68)、35(SEQ ID NO:69及70)、36(SEQ ID NO:71及72)及37(SEQ ID NO:73及74)。
在另一態樣中,本發明提供式I化合物
Figure 107112376-A0202-12-0002-583
其中:R1係靶向配體;L1係不存在的或係連接基團;L2係不存在的或係連接基團;R2係選自表1之雙鏈siRNA之雙鏈siRNA分子;環A係不存在的、3至20員環烷基、5至20員芳基、5至20員雜芳基或3至20員雜環烷基;各RA獨立地選自由以下組成之群:氫、羥基、CN、F、Cl、Br、I、-C1-2烷基-ORB、C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基;其中C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基視情況經一或多個獨立地選自以下之基團取代:鹵基、羥基及C1-3烷氧基;RB係氫、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵;並且n係0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;或其鹽。
本發明之另一態樣提供包含本文所述之一種siRNA之GalNAc偶聯物,該等偶聯物不限於包含本文揭示之配體-連接體之偶聯物。例如,本發明之一個態樣提供式X之GalNAc偶聯物: A-B-C(X)其中A係靶向配體;B係可選連接體;且C係本文所述之siRNA分子。
本文所述之治療性雙鏈siRNA以及包含該siRNA之化合物及組合物可用於治療B型肝炎病毒及B型肝炎病毒/D型肝炎病毒。
本發明亦提供可用於製備式I化合物之本文所揭示之合成中間體及方法。
熟悉此項技術者自以下詳述及附圖將明瞭本發明之其他目的、特徵及優點。
圖1:圖解說明式Ie之中間體化合物,其中靶向配體/連接體結合至固相載體,且其中Pg1係保護基團DMTr。
圖2:圖解說明式Id之代表性化合物,其中靶向配體結合至固相載體,其共價結合有核酸。
圖3:圖解說明式Id之代表性化合物,其中靶向配體-核酸偶聯物已自固相載體裂解並去保護以提供式I化合物。
在包括附圖、實例及方案在內之本申請案中,應該理解,寡核苷酸可為如表1所述之雙鏈siRNA分子。
相關申請案之交叉參考
本專利申請案主張2017年6月26日提出申請之美國申請案第62/525,071號及2017年4月11日提出申請之美國申請案第62/484,247號之優先 權權益,該等申請案係以引用方式併入本文中。
序列表
本申請案含有以ASCII格式電子提交且以全文引用方式併入本文之序列表。在2018年4月30日創建之該ASCII拷貝稱為08155_067WO1_SL.txt且大小為161,545字節。
除非另有說明,否則如本文所用之以下術語具有歸於其之含義。
如本文所用之術語“偶聯物”包括包含連接至靶向配體之寡核苷酸(例如,siRNA分子)之式(I)化合物。因此,術語化合物及偶聯物在本文中可互換使用。
如本文所用之術語“小干擾RNA”或“siRNA”係指雙鏈RNA(亦即雙鏈體RNA),其當siRNA與靶基因或序列在相同的細胞中時能夠減少或抑制靶基因或序列之表現(例如,藉由介導與siRNA序列互補之mRNA之翻譯之降解或抑制達成)。siRNA與靶基因或序列可具有基本或完全的一致性,或者可包含錯配區(亦即錯配基序)。在某些實施例中,siRNA可為約19-25(雙鏈體)個核苷酸長,並且較佳為約20-24、21-22或21-23(雙鏈體)個核苷酸長。siRNA雙鏈體可包含約1至約4個核苷酸或約2至約3個核苷酸的3'突出端及5'磷酸酯末端。siRNA之實例包括(但不限於)由兩個分開的鏈分子組裝之雙鏈多核苷酸分子,其中一條鏈係有義鏈且另一條鏈係互補反義鏈。
在某些實施例中,siRNA之一條鏈或兩條鏈上之5'及/或3'突出端包含具有與靶序列(例如,反義鏈中之3'突出端)或其互補鏈(例如,有義鏈中之3'突出端)之互補性之1-4個(例如,1、2、3或4個)經修飾及/或未修飾的脫氧胸苷(t或dT)核苷酸、1-4個(例如,1、2、3或4個)經修飾(例如,2'OMe)及/或未修飾的尿苷(U)核糖核苷酸及/或1-4個(例如,1、2、3或4個)經修飾(例如,2'OMe)及/或未修飾的核糖核苷酸或脫氧核糖核苷酸。
較佳地,siRNA係化學合成的。siRNA亦可藉由用大腸桿菌(E.coli)RNase III或Dicer裂解較長的dsRNA(例如,長度大於約25個核苷酸之dsRNA)來產生。該等酶將dsRNA加工成生物活性siRNA(例如參見,Yang等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,99:9942-9947(2002);Calegari等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,99:14236(2002);Byrom等人,Ambion TechNotes,10(1):4-6(2003);Kawasaki等人,Nucleic Acids Res.,31:981-987(2003);Knight等人,Science,293:2269-2271(2001);及Robertson等人,J.Biol.Chem.,243:82(1968))。較佳地,dsRNA為至少50個核苷酸至約100、200、300、400或500個核苷酸長。dsRNA之長度可長至1000、1500、2000、5000個核苷酸或更長。dsRNA可以編碼完整的基因轉錄本或部分基因轉錄本。在某些情況下,siRNA可以由質體編碼(例如,轉錄為自動摺疊成具有髮夾環圈之雙鏈體之序列)。
片語“抑制靶基因之表現”係指本發明之siRNA沉默、減少或抑制靶基因表現之能力。為檢查基因沉默之程度,使測試試樣(例如,來自表現靶基因之目標生物體之生物試樣或表現靶基因之培養細胞試樣)與沉默、減少或抑制靶基因表現之siRNA接觸。將靶基因在測試試樣中之表現與靶基因在不與siRNA接觸之對照試樣(例如,如來自表現靶基因之目標生物體之生物試樣或表現靶基因之培養細胞試樣)中之表現進行比較。對照試樣(例如,表現靶基因之試樣)可賦予100%之值。在特定實施例中,當相對於對照試樣(例如,僅緩衝液,靶向不同基因的siRNA序列、亂序siRNA序列等)測試試樣的值為約100%、99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、90%、89%、88%、87%、86%、85%、84%、83%、82%、81%、80%、79%、78%、77%、76%、75%、70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%、25%、20%、15%、10%、5%或0%時,可達成靶基因表現的沉默、抑制或減少。適宜分析包括(但不限於)使用熟悉此項技術者已知之技術來檢查蛋白質或mRNA含量,該等技術例如如 熟悉此項技術者已知之斑點墨點、北方墨點、原位雜交、ELISA、免疫沈澱、酶功能以及表型分析。
術語“合成活化基團”係指可以附接至原子以活化該原子從而允許其與另一反應性基團形成共價鍵之基團。應該理解,合成活化基團之性質可能取決於其所活化之原子。例如,當使合成活化基團附接至氧原子時,合成活化基團係將活化此氧原子以與另一反應基團形成鍵(例如,酯鍵、胺基甲酸酯鍵或醚鍵)之基團。該等合成活化基團係已知的。可以附接至氧原子之合成活化基團之實例包括(但不限於)乙酸酯、琥珀酸酯、三氟甲磺酸酯及甲磺酸酯。當合成活化基團附接至羧酸之氧原子時,合成活化基團可為可自已知之偶合劑(例如,已知之醯胺偶合劑)衍生之基團。該等偶合劑係已知的。該等偶合劑之實例包括(但不限於)N,N'-二環己基碳二亞胺(DCC)、羥基苯并三唑(HOBt)、碳酸N-(3-二甲基胺基丙基)-N'-乙酯(EDC)、(苯并三唑-1-基氧基)參(二甲基胺基)鏻六氟磷酸鹽(BOP)、苯并三唑-1-基-氧基三吡咯啶基鏻六氟磷酸鹽(PyBOP)或O-苯并三唑-1-基-N,N,N',N'-四甲基脲鎓六氟磷酸鹽(HBTU)。
治療性核酸(例如siRNA)之“有效量”或“治療有效量”係足以產生期望效應(例如與在不存在siRNA時檢測到之正常表現程度相比,靶序列之表現受抑制)之量。在特定實施例中,當相對於對照(例如,僅緩衝液,靶向不同基因之siRNA序列、亂序siRNA序列等)用siRNA獲得之值為約100%、99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、90%、89%、88%、87%、86%、85%、84%、83%、82%、81%、80%、79%、78%、77%、76%、75%、70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%、25%、20%、15%、10%、5%或0%時,達成靶基因或靶序列表現之抑制。適用於量測靶基因或靶序列表現之分析包括(但不限於)使用熟悉此項技術者已知之技術來檢查蛋白質或mRNA 含量,該等技術例如如熟悉此項技術者已知之斑點墨點、北方墨點、原位雜交、ELISA、免疫沈澱、酶功能以及表型分析。
如本文所用之術語“核酸”係指呈單鏈或雙鏈形式之含有至少兩種核苷酸(亦即脫氧核糖核苷酸或核糖核苷酸)之聚合物,且包括DNA及RNA。“核苷酸”含有糖脫氧核糖(DNA)或核糖(RNA)、鹼基及磷酸酯基團。核苷酸係經由磷酸酯基團連接在一起。“鹼基”包括嘌呤及嘧啶,其進一步包括天然化合物腺嘌呤、胸腺嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶、肌苷及天然類似物,以及包括(但不限於)放置新的反應性基團(例如(但不限於)胺、醇、硫醇、羧酸酯及烷基鹵)之修飾之嘌呤及嘧啶之合成衍生物。核酸包括含有已知核苷酸類似物或經修飾主鏈殘基或鍵聯之核酸,其係合成的、天然存在的及非天然存在的,且其具有與參考核酸類似之結合性質。該等類似物及/或經修飾殘基之實例包括(但不限於)硫代磷酸酯、胺基磷酸酯、膦酸甲酯、手性-膦酸甲酯、2'-O-甲基核糖核苷酸及肽-核酸(PNA)。另外,核酸可以包括一或多個UNA部分。
術語“核酸”包括任何寡核苷酸或多核苷酸,其中含有至多60個核苷酸之片段通常稱為寡核苷酸,且更長的片段稱為多核苷酸。脫氧核糖寡核苷酸由稱為脫氧核糖之5-碳糖組成,該5-碳糖在此糖之5'及3'碳處與磷酸酯共價連結以形成交替的無支鏈聚合物。DNA可以呈如反義分子、質體DNA、預凝聚DNA、PCR產物、載體、表現盒、嵌合序列、染色體DNA或該等基團之衍生物及組合的形式。核糖寡核苷酸由類似的重複結構組成,其中5-碳糖係核糖。RNA可以呈(例如)小干擾RNA(siRNA)、Dicer受質dsRNA、小髮夾RNA(shRNA)、不對稱干擾RNA(aiRNA)、微RNA(miRNA)、mRNA、tRNA、rRNA、tRNA、病毒RNA(vRNA)及其組合的形式。因此,在本發明之上下文中,術語“多核苷酸”及“寡核苷酸”係指由天然存在的鹼基、糖及糖間(主鏈)鍵聯組成之核苷酸或核苷單體之聚合物或寡聚物。術語“多核苷酸”及“寡核苷酸”亦包括包含非天然存在的單 體或其部分之聚合物或寡聚物,其功能類似。該等經修飾或取代之寡核苷酸由於以下性質而通常優於天然形式,例如增強之細胞攝取、降低之免疫原性及在核酸酶存在下增加之穩定性。
除非另外指示,否則特定核酸序列亦隱含地涵蓋其保守修飾之變體(例如,簡併密碼子取代)、等位基因、直系同源物、SNP及互補序列以及明確指示之序列。具體而言,簡併密碼子取代可藉由產生其中一或多個所選(或所有)密碼子之第三位置經混合鹼基及/或脫氧肌苷殘基取代之序列來達成(Batzer等人,Nucleic Acid Res.,19:5081(1991);Ohtsuka等人,J.Biol.Chem.,260:2605-2608(1985);Rossolini等人,Mol.Cell.Probes,8:91-98(1994))。
術語“基因”係指包含產生多肽或前體多肽所必需之部分長度或全長編碼序列之核酸(例如,DNA或RNA)序列。
如本文所用之“基因產物”係指諸如RNA轉錄本或多肽等的基因產物。
除非另有說明,否則如本文所用之術語“烷基”本身或作為另一取代基之一部分意指具有指定碳原子數之直鏈或具支鏈烴基團(亦即C1-8意指1至8個碳)。烷基之實例包括甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、第三丁基、異丁基、第二丁基、正戊基、正己基、正庚基、正辛基及諸如此類。術語“烯基”係指具有一或多個雙鍵之不飽和烷基。類似地,術語“炔基”係指具有一或多個三鍵之不飽和烷基。該等不飽和烷基之實例包括乙烯基、2-丙烯基、巴豆基、2-異戊烯基、2-(丁二烯基)、2,4-戊二烯基、3-(1,4-戊二烯基)、乙炔基、1-及3-丙炔基、3-丁炔基以及更高級的同系物及異構物。
術語“伸烷基”本身或作為另一取代基之一部分意指衍生自烷烴(包括直鏈及支鏈烷烴)之二價基團,如藉由-CH2CH2CH2CH2-及-CH(CH3)CH2CH2-所示。
術語“環烷基”、“碳環的”或“碳環”係指烴環系統,其具有3至20個環原子總數(例如,3至20員環烷基係具有3至20個環原子之環烷基,或C3-20環烷基為具有3至20個碳環原子之環烷基),並且對於3-5員環烷基係完全飽和的或在環頂點之間具有不超過一個雙鍵及對於6員環烷基或更大的係完全飽和的或在環頂點之間具有不超過兩個雙鍵。如本文所用,“環烷基”、“碳環的”或“碳環”亦意欲指雙環、多環及螺環烴環系統,例如雙環[2.2.1]庚烷、蒎烷、雙環[2.2.2]辛烷、金剛烷、降莰烯、螺環C5-12烷烴等。如本文所用,術語“烯基”、“炔基”、“環烷基”、“碳環”及“碳環的”意欲包括其單重及多重鹵化變體。
術語“雜環烷基”、“雜環的”或“雜環”係指含有1至10個選自N、O及S之雜原子作為環原子且總共具有3-20個環原子之飽和或部分不飽和的環系統基團(例如,3至20員雜環烷基係具有3-20個環原子之雜環烷基,C2-19雜環烷基係具有3-10個環原子且2-19個環原子為碳之雜環烷基),其中氮及硫原子視情況經氧化,氮原子視情況經四級銨化。除非另有說明,否則“雜環烷基”、“雜環的”或“雜環”環可為單環、雙環、螺環或多環系統。“雜環烷基”、“雜環的”或“雜環”環之非限制性實例包括吡咯啶、六氫吡啶、N-甲基六氫吡啶、咪唑啶、吡唑啶、丁內醯胺、戊內醯胺、咪唑啶酮、乙內醯脲、二氧戊環、鄰苯二甲醯亞胺、六氫吡啶、嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮、1,4-二噁烷、嗎啉、硫嗎啉、硫嗎啉-S-氧化物,硫嗎啉-S,S-氧化物、六氫吡嗪、哌喃、吡啶酮、3-吡咯啉、噻喃、哌喃酮、四氫呋喃、四氫噻吩、奎寧環、莨菪烷、2-氮雜螺[3.3]庚烷、(1R,5S)-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷、(1s,4s)-2-氮雜雙環[2.2.2]辛烷、(1R,4R)-2-氧雜-5-氮雜雙環[2.2.2]辛烷及諸如此類。“雜環烷基”、“雜環的”或“雜環”基團可經由一或多個環碳或雜原子附接至分子之其餘部分。“雜環烷基”、“雜環的”或“雜環”可包括其單重及多重鹵化變體。
術語“烷氧基”及“烷硫基”以其習用意義使用且係指經由氧原子(“氧 基”)或硫基附接至分子其餘部分之彼等烷基,並且進一步包括其單重及多重鹵化變體。
除非另有說明,否則術語“鹵基”或“鹵素”本身或作為另一取代基之一部分意指氟、氯、溴或碘原子。術語“(鹵基)烷基”意欲包括“烷基”及“鹵烷基”取代基。另外,術語“鹵烷基”意欲包括單鹵烷基及多鹵烷基。例如,術語“C1-4鹵烷基”意欲包括三氟甲基、2,2,2-三氟乙基、4-氯丁基、3-溴丙基、二氟甲基及諸如此類。
術語“芳基”意指具有6-14個碳原子之碳環芳族基團,無論是否與一或多個基團稠合。除非另有說明,否則芳基之實例包括苯基、萘基、聯苯基及諸如此類。
術語“雜芳基”係指一或多個含有1至5個選自N、O及S之雜原子之芳基環,其中氮及硫原子視情況經氧化,並且一或多個氮原子視情況經四級銨化。雜芳基可經由雜原子附接至分子之其餘部分。雜芳基之實例包括吡啶基、噠嗪基、吡嗪基、嘧啶基、三嗪基、喹啉基、喹喔啉基、喹唑啉基、
Figure 107112376-A0202-12-0010-504
啉基、酞嗪基、苯并三嗪基、嘌呤基、苯并咪唑基、苯并吡唑基、苯并三唑基、苯并異噁唑基、異苯并呋喃基、異吲哚基、吲哚嗪基、苯并三嗪基、噻吩并吡啶基、噻吩并嘧啶基、吡唑并嘧啶基、咪唑并吡啶、苯并噻唑基(benzothiaxolyl)、苯并呋喃基、苯并噻吩基、吲哚基、喹啉基、異喹啉基、異噻唑基、吡唑基、吲唑基、蝶啶基、咪唑基、三唑基、四唑基、噁唑基、異噁唑基、噻二唑基、吡咯基、噻唑基、呋喃基、噻吩基及諸如此類。
術語醣包括單醣、二醣及三醣。該術語包括葡萄糖、蔗糖果糖、半乳糖及核糖,以及脫氧糖(例如脫氧核糖)及胺基糖(諸如半乳糖胺)。醣衍生物可以方便地按照國際專利申請公開案第WO 96/34005號及第97/03995號中所述來製備。醣可以經由醚鍵、硫醚鍵(例如,S-糖苷)、胺氮(例如,N-糖苷)或碳-碳鍵(例 如,C-糖苷)方便地連接至式I化合物之剩餘部分。在一個實施例中,醣可經由醚鍵方便地連接至式I化合物之其餘部分。在一個實施例中,術語醣包括下式之組:
Figure 107112376-A0202-12-0011-584
其中:X係NR3且Y係選自-(C=O)R4、-SO2R5及-(C=O)NR6R7;或X係-(C=O)-且Y係NR8R9;R3係氫或(C1-C4)烷基;R4、R5、R6、R7、R8及R9各自獨立地選自由以下組成之群:氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)鹵烷基、(C1-C8)烷氧基及(C3-C6)環烷基,該(C3-C6)環烷基視情況經一或多個獨立地選自由以下組成之群之基團取代:鹵基、(C1-C4)烷基、(C1-C4)鹵烷基、(C1-C4)烷氧基及(C1-C4)鹵烷氧基;R10係-OH、-NR8R9或-F;且R11係-OH、-NR8R9、-F或視情況經一或多個獨立地選自由以下組成之群之基團取代之5員雜環:鹵基、羥基、羧基、胺基、(C1-C4)烷基、(C1-C4)鹵烷基、(C1-C4)烷氧基及(C1-C4)鹵烷氧基。在另一實施例中,醣可選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0011-585
在另一實施例中,醣可為:
Figure 107112376-A0202-12-0012-586
術語“動物”包括哺乳動物物種,例如人類、小鼠、大鼠、狗、貓、倉鼠、天竺鼠、兔、牲畜及諸如此類。
術語“脂質”係指一組有機化合物,其包括(但不限於)脂肪酸之酯且特徵在於不溶於水但可溶於許多有機溶劑中。其通常分成至少三類:(1)“簡單脂質”,其包括脂肪及油以及蠟;(2)“化合物脂質”,其包括磷脂及醣脂;及(3)“衍生之脂質”,例如類固醇。
術語“脂質粒子”包括可用於遞送治療性核酸(例如,siRNA)至目標靶位點(例如,細胞、組織、器官及諸如此類)之脂質調配物。在較佳實施例中,本發明之脂質粒子係核酸-脂質粒子,其通常由防止粒子聚集之陽離子脂質、非陽離子脂質(例如,磷脂)、偶聯之脂質(例如,PEG-脂質)及視情況膽固醇形成。通常,治療性核酸(例如,siRNA)可囊封在粒子之脂質部分中,從而保護其免受酶降解。
術語“電子緻密核心”當用於闡述本發明之脂質粒子時係指當使用低溫透射電子顯微術(“cryoTEM”)可視化時脂質粒子內部部分之黑色外觀。本發明之一些脂質粒子具有電子緻密核心並且缺乏脂質雙層結構。本發明之一些脂質粒子具有電子緻密核心,缺乏脂質雙層結構,並且具有倒六角形或立方相結構。雖然不希望受理論束縛,但認為非雙層脂質填充提供在內部具有水及核之脂質圓柱體之三維網絡,亦即基本上與含有核酸之水性通道互相滲透之脂質液滴。
如本文所用,術語“SNALP”係指穩定的核酸-脂質粒子。SNALP係由脂質(例如,防止粒子聚集之陽離子脂質、非陽離子脂質及偶聯之脂質)製成之粒 子,其中核酸(例如,siRNA)完全囊封在脂質內。在某些情況下,SNALP對於全身施加係極其有用的,乃因其可在靜脈內(i.v.)注射後展現延長之循環壽命,其可以在遠端位點(例如,與投與位點物理分離之位點)積累並且其可以介導在該等遠端位點處之siRNA表現。核酸可以與縮合劑複合並且囊封在如PCT公開案第WO 00/03683號中所述之SNALP內,該公開案之揭示內容出於所有目的以全文引用方式併入本文中。
本發明之脂質粒子(例如,SNALP)通常具有如下之平均直徑:約30nm至約150nm、約40nm至約150nm、約50nm至約150nm、約60nm至約130nm、約70nm至約110nm、約70nm至約100nm、約80nm至約100nm、約90nm至約100nm、約70至約90nm、約80nm至約90nm、約70nm至約80nm,或約30nm、35nm、40nm、45nm、50nm、55nm、60nm、65nm、70nm、75nm、80nm、85nm、90nm、95nm、100nm、105nm、110nm、115nm、120nm、125nm、130nm、135nm、140nm、145nm或150nm,並且基本上係無毒的。另外,核酸當存在於本發明之脂質粒子中時,在水溶液中對核酸酶之降解具有抗性。核酸-脂質粒子及其製備方法揭示於(例如)美國專利公開案第20040142025號及第20070042031號中,該等公開案之揭示內容出於所有目的以全文引用併入本文中。
如本文所用,“囊封之脂質”可指以完全囊封、部分囊封或二者提供治療性核酸(例如siRNA)之脂質粒子。在較佳實施例中,核酸(例如,siRNA)係完全囊封於脂質粒子中(例如,以形成SNALP或其他核酸-脂質粒子)。
術語“脂質偶聯物”係指抑制脂質粒子聚集之偶聯脂質。該等脂質偶聯物包括(但不限於)PEG-脂質偶聯物,例如,如偶聯至二烷基氧基丙基之PEG(例如,PEG-DAA偶聯物)、偶聯至二醯基甘油之PEG(例如,PEG-DAG偶聯物)、偶聯至膽固醇之PEG、偶聯至磷脂醯乙醇胺之PEG及偶聯至神經醯胺之PEG(例 如參見美國專利第5,885,613號)、陽離子PEG脂質、聚噁唑啉(POZ)-脂質偶聯物、聚醯胺寡聚物(例如,ATTA-脂質偶聯物)及其混合物。在PCT公開案第WO 2010/006282號中闡述了POZ-脂質偶聯物之其他實例。PEG或POZ可以直接偶聯至脂質,或可以經由連接體部分連接至脂質。可以使用適於將PEG或POZ偶聯至脂質之任何連接體部分,包括(例如)含非酯之連接體部分及含酯之連接體部分。在某些較佳實施例中,使用含非酯之連接體部分,例如醯胺或胺基甲酸酯。上述專利文件中之每一者之揭示內容出於所有目的以全文引用方式併入本文中。
術語“兩親性脂質”部分地指其中脂質材料之疏水性部分向疏水相定向而親水性部分朝水相定向之任何適宜材料。親水性特徵源自極性或帶電基團(例如碳水化合物、磷酸根、羧酸根、硫酸根合、胺基、巰基、硝基、羥基及其他類似基團)之存在。疏水性可藉由納入非極性基團來賦予,該等非極性基團包括(但不限於)長鏈飽和及不飽和脂族烴基團及該等由一或多個芳族、環脂族或雜環基團取代之基團。兩親性化合物之實例包括(但不限於)磷脂質、胺脂質及神經鞘脂質。
磷脂質之代表性實例包括(但不限於)磷脂醯膽鹼、磷脂醯乙醇胺、磷脂醯絲胺酸、磷脂醯肌醇、磷脂酸、棕櫚醯油醯磷脂醯膽鹼、溶血磷脂醯膽鹼、溶血磷脂醯乙醇胺、二棕櫚醯磷脂醯膽鹼、二油醯磷脂醯膽鹼、二硬脂醯磷脂醯膽鹼及二亞油醯磷脂醯膽鹼。其他缺乏磷之化合物(例如神經鞘脂質、醣神經鞘脂質家族、二醯甘油及β-醯氧基酸)也在稱為兩親性脂質之組內。另外,上述兩親性脂質可以與其他脂質(包括甘油三酯及固醇)混合。
術語“中性脂質”係指在所選pH下以不帶電荷或中性兩性離子形式存在之多種脂質物質中之任一者。在生理pH下,該等脂質包括(例如)二醯基磷脂醯膽鹼、二醯基磷脂醯乙醇胺、神經醯胺、神經鞘磷脂、腦磷脂、膽固醇、腦 苷脂及二醯基甘油。
術語“非陽離子脂質”係指任何兩親性脂質以及任何其他中性脂質或陰離子脂質。
術語“陰離子脂質”係指在生理pH下帶負電荷之任何脂質。該等脂質包括(但不限於)磷脂醯甘油、心磷脂、二醯基磷脂醯絲胺酸、二醯基磷脂酸、N-十二烷醯磷脂醯乙醇胺、N-琥珀醯磷脂醯乙醇胺、N-戊二醯磷脂醯乙醇胺、賴胺醯磷脂醯甘油、棕櫚醯油醯磷脂醯甘油(POPG)及連結至中性脂質之其他陰離子修飾基團。
術語“疏水性脂質”係指具有非極性基團之化合物,該等非極性基團包括(但不限於)長鏈飽和及不飽和脂族烴基團及該等視情況由一或多個芳族、環脂族或雜環基團取代之基團。適宜實例包括(但不限於)二醯基甘油、二烷基甘油、N-N-二烷基胺基、1,2-二醯基氧基-3-胺基丙烷及1,2-二烷基-3-胺基丙烷。
術語“陽離子脂質”及“胺基脂質”在本文中可互換使用,以包括具有一個、兩個、三個或更多個脂肪酸或脂肪烷基鏈及pH可滴定胺基頭部基團(例如,烷基胺基或二烷基胺基頭部基團)之彼等脂質及其鹽。陽離子脂質在低於陽離子脂質之pKa之pH下通常被質子化(亦即帶正電荷),並且在高於pKa之pH下基本上係中性的。本發明之陽離子脂質亦可稱為可滴定的陽離子脂質。在一些實施例中,陽離子脂質包含:可質子化之三級胺(例如,pH可滴定的)頭部基團;C18烷基鏈,其中每條烷基鏈獨立地具有0至3個(例如,0、1、2或3個)雙鍵;以及頭部基團與烷基鏈之間之醚、酯或縮酮鍵聯。該等陽離子脂質包括(但不限於)DSDMA、DODMA、DLinDMA、DLenDMA、γ-DLenDMA、DLin-K-DMA、DLin-K-C2-DMA(亦稱為DLin-C2K-DMA、XTC2及C2K)、DLin-K-C3-DMA、DLin-K-C4-DMA、DLen-C2K-DMA、γ-DLen-C2K-DMA、DLin-M-C2-DMA(亦稱為MC2)、DLin-M-C3-DMA(亦稱為MC3)及(DLin-MP-DMA)(亦稱為1-B11)。
術語“烷基胺基”包括式-N(H)R之基團,其中R係如本文所定義之烷基。
術語“二烷基胺基”包括式-NR2之基團,其中各R獨立地係如本文所定義之烷基。
術語“鹽”包括任何陰離子及陽離子複合物,例如在陽離子脂質與一或多個陰離子之間形成之複合物。陰離子之非限制性實例包括無機及有機陰離子,如氫負離子、氟離子、氯離子、溴離子、碘離子、草酸根(例如,半草酸根)、磷酸根、膦酸根、磷酸氫根、磷酸二氫根、氧負離子、碳酸根、碳酸氫根、硝酸根、亞硝酸根、氮負離子、亞硫酸氫根、硫負離子、亞硫酸根、硫酸氫根、硫酸根、硫代硫酸根、硫酸氫根、硼酸根、甲酸根、乙酸根、苯甲酸根、檸檬酸根、酒石酸根、乳酸根、丙烯酸根、聚丙烯酸根、富馬酸根、馬來酸根、衣康酸根、乙醇酸根、葡萄糖酸根、蘋果酸根、扁桃酸根、惕各酸根、抗壞血酸根、水楊酸根、聚甲基丙烯酸根、過氯酸根、氯酸根、亞氯酸根、次氯酸根、溴酸根、次溴酸根、碘酸根、烷基磺酸根、芳基磺酸根、砷酸根、亞砷酸根、鉻酸根、重鉻酸根、氰離子、氰酸根、硫代氰酸根、氫氧根、過氧根離子、高錳酸根及其混合物。在特定實施例中,本文揭示之陽離子脂質之鹽係結晶鹽。
術語“醯基”包括任何烷基、烯基或炔基,其中附接點處之碳經側氧基取代,如下所定義。以下係醯基之非限制性實例:-C(=O)烷基、-C(=O)烯基及-C(=O)炔基。
術語“促融的”係指脂質粒子(例如SNALP)與細胞膜融合之能力。膜可為質膜或圍繞細胞器(例如胞內體、細胞核等)之膜。
如本文所用,術語“水溶液”係指全部或部分地包含水之組合物。
如本文所用,術語“有機脂質溶液”係指全部或部分地包含具有脂質之有機溶劑之組合物。
如本文所用之“遠端位點”係指物理上分離之位點,其不限於毗鄰的微血管床,但包括廣泛分佈於整個生物體內之位點。
“血清穩定的”關於核酸-脂質粒子(例如SNALP)意指在暴露於可顯著降解游離DNA或RNA之血清或核酸酶分析之後,粒子不顯著降解。適宜分析包括(例如)標準血清分析、DNAse分析或RNAse分析。
如本文所用之“全身遞送”係指遞送脂質粒子從而使得諸如siRNA等活性劑廣泛分佈在生物體內。一些投與技術可引起某些藥劑而非其他藥劑之全身遞送。全身遞送意指有用量、較佳治療量之藥劑暴露於身體之大部分。為獲得廣泛生物分佈,通常需要一定的血液壽命,使得藥劑在到達投與位點遠端之疾病位點之前不會迅速降解或清除(例如藉由第一代謝器官(first pass organ)(肝臟、肺等)或藉由快速、非特異性細胞結合)。脂質粒子之全身遞送可藉由業內已知之任何方式進行,該等方式包括(例如)靜脈內、皮下及腹膜內。在較佳實施例中,脂質粒子之全身遞送係藉由靜脈內遞送進行。
如本文所用之“局部遞送”係指將活性劑(例如siRNA)直接遞送至生物體內之靶位點。例如,藥劑可藉由直接注射至疾病位點、其他靶位點或靶器官(例如肝臟、心臟、胰臟、腎臟及諸如此類)來局部遞送。
當本文用於闡述脂質:siRNA之比率時,術語“脂質”係指粒子中之總脂質。
熟悉此項技術者將會瞭解,具有手性中心之本發明化合物可以光學活性及外消旋形式存在及分離。一些化合物可能展現多態性。應該理解,本發明涵蓋本發明化合物之任何外消旋、光學活性、多晶型或立體異構形式或其混合物,其具有本文所述之有用性質,業內中眾所周知如何製備光學活性形式(例如,藉由重結晶技術拆分外消旋形式、藉由自光學活性起始材料合成、藉由手性合成或藉由使用手性固定相之層析分離)。
當本文之化合物式中之鍵以非立體化學方式(例如,平面)繪製時,該鍵所附接之原子包括所有立體化學可能性。除非另外特別指出,否則當本文之化合物式中之鍵以限定的立體化學方式(例如,粗體、粗體-楔形、虛線或虛線-楔形)繪製時,應理解,立體化學鍵所附接之原子在所繪示之絕對立體異構物中得以富集。在一個實施例中,化合物可為至少51%所繪示之絕對立體異構物。在另一實施例中,化合物可為至少60%所繪示之絕對立體異構物。在另一實施例中,化合物可為至少80%所繪示之絕對立體異構物。在另一實施例中,化合物可為至少90%所繪示之絕對立體異構物。在另一實施例中,化合物可為至少95%所繪示之絕對立體異構物。在另一實施例中,化合物可為至少99%所繪示之絕對立體異構物。
除非本文另有說明,否則術語“約”在與數值或數值範圍一起使用時意指所述數值或值範圍之正或負5%。
產生siRNA分子
siRNA可以若干種形式提供,包括(例如)以一或多個經分離之小干擾RNA(siRNA)雙鏈體之形式、以較長雙鏈RNA(dsRNA)之形式或以自DNA質體中之轉錄盒轉錄之siRNA或dsRNA形式。在一些實施例中,siRNA可以酶促方式產生或藉由部分/全部有機合成產生,並且經修飾之核糖核苷酸可藉由活體外酶促或有機合成引入。在某些情況下,每條鏈係以化學方式製備的。合成RNA分子之方法在業內係已知的,例如如Verma及Eckstein(1998)中所述或如本文所述之化學合成方法。
分離RNA、合成RNA、使核酸雜交、製備及篩選cDNA文庫以及實施PCR之方法在業內係眾所周知的(例如參見Gubler及Hoffman,Gene,25:263-269(1983);Sambrook等人,同上;Ausubel等人,同上),PCR方法亦係眾所周知的(參見,美國專利第4,683,195號及第4,683,202號;PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications(Innis等人,編輯,1990))。表現文庫亦係熟悉此項技術者眾所周知的。揭示用於本發明之一般方法之其他基本文本包括Sambrook等人,Molecular Cloning,A Laboratory Manual(第2版1989);Kriegler,Gene Transfer and Expression:A Laboratory Manual(1990);及Current Protocols in Molecular Biology(Ausubel等人,編輯,1994)。出於所有目的,該等參考文獻之揭示內容係以全文引用方式併入本文中。
通常,siRNA係以化學方式合成。包含本發明之siRNA分子之寡核苷酸可以使用業內已知之多種技術中之任一種來合成,例如在Usman等人,J.Am.Chem.Soc.,109:7845(1987);Scaringe等人,Nucl.Acids Res.,18:5433(1990);Wincott等人,Nucl.Acids Res.,23:2677-2684(1995)及Wincott等人,Methods Mol.Bio.,74:59(1997)中所闡述之彼等。寡核苷酸之合成利用常見的核酸保護及偶聯基團,例如5’-末端處之二甲氧基三苯甲基及3’-末端處之亞磷醯胺。作為非限制性實例,可以使用0.2μmol規模之方案在Applied Biosystems合成儀上實施小規模合成。或者,可以在來自Protogene(Palo Alto,CA)之96孔板合成儀上實施0.2μmol規模之合成。然而,更大或更小規模之合成亦在本發明之範圍內。用於寡核苷酸合成之適宜試劑、用於RNA去保護之方法及用於RNA純化之方法為熟悉此項技術者已知。
siRNA分子可自兩種不同的寡核苷酸組裝而成,其中一種寡核苷酸包含有義鏈且另一種包含siRNA之反義鏈。例如,每條鏈可分開合成並在合成及/或去保護之後藉由雜交或連接連結在一起。
本發明之實施例
實例25中之表1闡述靶向B型肝炎病毒(縮寫為“HBV”)之一系列化學修飾之siRNA雙鏈體(所顯示之有義鏈及反義鏈)。如本文所闡述,本發明之化合物可包含此一siRNA(亦即siRNA 1-37)。
因此,本發明之一個態樣係選自由以下組成之群之核酸分子:SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71及SEQ ID NO:73。
本發明之另一態樣係選自由以下組成之群之核酸分子:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72及SEQ ID NO:74。
本發明之一個態樣係包含本文所述之核酸分子或其組合之組合物。
本發明之一個態樣提供選自由以下組成之群之雙鏈siRNA分子:siRNA 1(SEQ ID NO:1及2)、2(SEQ ID NO:3及4)、3(SEQ ID NO:5及6)、4(SEQ ID NO:7及8)、5(SEQ ID NO:9及10)、6(SEQ ID NO:11及12)、7(SEQ ID NO:13及14)、8(SEQ ID NO:15及16)、9(SEQ ID NO:17及18)、10(SEQ ID NO:19及20)、11(SEQ ID NO:21及22)、12(SEQ ID NO:23及24)、13(SEQ ID NO:25及 26)、14(SEQ ID NO:27及28)、15(SEQ ID NO:29及30)、16(SEQ ID NO:31及32)、17(SEQ ID NO:33及34)、18(SEQ ID NO:35及36)、19(SEQ ID NO:37及38)、20(SEQ ID NO:39及40)、21(SEQ ID NO:41及42)、22(SEQ ID NO:43及44)、23(SEQ ID NO:45及46)、24(SEQ ID NO:47及48)、25(SEQ ID NO:49及50)、26(SEQ ID NO:51及52)、27(SEQ ID NO:53及54)、28(SEQ ID NO:55及56)、29(SEQ ID NO:57及58)、30(SEQ ID NO:59及60)、31(SEQ ID NO:61及62)、32(SEQ ID NO:63及64)、33(SEQ ID NO:65及66)、34(SEQ ID NO:67及68)、35(SEQ ID NO:69及70)、36(SEQ ID NO:71及72)及37(SEQ ID NO:73及74)。
本發明之另一態樣提供包含本文所述之雙鏈siRNA分子之組合物。
在一個實施例中,該組合物係包含醫藥學上可接受之載劑之醫藥組合物。
本發明之一個態樣係如發明內容中所闡述之式I化合物,或其鹽。
在式I化合物之一個實施例中,R1係靶向配體;L1係不存在的或係連接基團;L2係不存在的或係連接基團;R2係選自表1之雙鏈siRNA之雙鏈siRNA分子;環A係不存在的、3至20員環烷基、5至20員芳基、5至20員雜芳基或3至20員雜環烷基;各RA獨立地選自由以下組成之群:氫、羥基、CN、F、Cl、Br、I、-C1-2烷基-ORB及C1-8烷基,該C1-8烷基視情況經一或多個獨立地選自以下之基團取代:鹵基、羥基及C1-3烷氧基;RB係氫、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵;且 n係0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在一個實施例中,R1係-C(H)(3-p)(L3-醣)p,其中各L3獨立地係連接基團;p係1、2或3;且醣係單醣或二醣。
在一個實施例中,醣係:
Figure 107112376-A0202-12-0022-587
其中:X係NR3,且Y係選自-(C=O)R4、-SO2R5及-(C=O)NR6R7;或X係-(C=O)-且Y係NR8R9;R3係氫或(C1-C4)烷基;R4、R5、R6、R7、R8及R9各自獨立地選自由以下組成之群:氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)鹵烷基、(C1-C8)烷氧基及(C3-C6)環烷基,該(C3-C6)環烷基視情況經一或多個獨立地選自由以下組成之群之基團取代:鹵基、(C1-C4)烷基、(C1-C4)鹵烷基、(C1-C4)烷氧基及(C1-C4)鹵烷氧基;R10係-OH、-NR8R9或-F;且R11係-OH、-NR8R9、-F或5員雜環,該5員雜環視情況經一或多個獨立地選自由以下組成之群之基團取代:鹵基、羥基、羧基、胺基、(C1-C4)烷基、(C1-C4)鹵烷基、(C1-C4)烷氧基及(C1-C4)鹵烷氧基;或其鹽。
在一個實施例中,醣係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0023-588
及其鹽。
在一個實施例中,醣係:
Figure 107112376-A0202-12-0023-589
在一個實施例中,各L3獨立地係具有0至50個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,各L3獨立地係具有1至20個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6) 烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,L3係:
Figure 107112376-A0202-12-0024-590
或其鹽。
在一個實施例中,R1係:
Figure 107112376-A0202-12-0024-591
或其鹽。
在一個實施例中,R1係:
Figure 107112376-A0202-12-0024-592
其中G係-NH-或-O-;RC係氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)鹵烷基、(C1-C8)烷氧基、(C1-C6)烷醯基、(C3-C20)環烷基、(C3-C20)雜環、芳基、雜芳基、單醣、二醣或三醣;並且其中環烷基、雜環、芳基(ary)、雜芳基及醣視情況經一或多個獨立地選自由以下組成之群之基團取代:鹵基、羧基、羥基、胺基、(C1-C4)烷基、(C1-C4)鹵烷基、(C1-C4)烷 氧基及(C1-C4)鹵烷氧基;或其鹽。
在一個實施例中,RC係:
Figure 107112376-A0202-12-0025-593
在一個實施例中,R1係:
Figure 107112376-A0202-12-0025-594
在一個實施例中,RC係:
Figure 107112376-A0202-12-0025-596
在一個實施例中,G係-NH-。
在一個實施例中,R1係:
Figure 107112376-A0202-12-0025-595
在一個實施例中,R1係:
Figure 107112376-A0202-12-0026-597
其中各RD獨立地選自由以下組成之群:氫、(C1-C6)烷基、(C9-C20)烷基矽基、(RW)3Si-、(C2-C6)烯基、四氫哌喃基、(C1-C6)烷醯基、苯甲醯基、芳基(C1-C3)烷基、TMTr(三甲氧基三苯甲基)、DMTr(二甲氧基三苯甲基)、MMTr(單甲氧基三苯甲基)及Tr(三苯甲基);並且各RW獨立地選自由以下組成之群:(C1-C4)烷基及芳基。
在一個實施例中,連接基團L1及L2獨立地係具有1至50個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,L1及L2獨立地係具有1至20個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4 個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,L1及L2獨立地係具有1至14個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,L1係經由-NH-、-O-、-S-、-(C=O)-、-(C=O)-NH-、-NH-(C=O)-、-(C=O)-O-、-NH-(C=O)-NH-或-NH-(SO2)-連接至R1
在一個實施例中,L2係經由-O-連接至R2
在一個實施例中,L1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0027-598
在一個實施例中,L1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0028-599
及其鹽。
在一個實施例中,L2係-CH2-O-或-CH2-CH2-O-。
在一個實施例中,式I化合物具有以下式Ia:
Figure 107112376-A0202-12-0028-600
其中: 各D獨立地選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0028-806
及-N=; 或其鹽。
在一個實施例中,式Ia之化合物係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0029-602
其中:Q1係氫且Q2係R2;或Q1係R2且Q2係氫;Z係-L1-R1;及其鹽。
在一個實施例中,式I化合物具有以下式Ib:
Figure 107112376-A0202-12-0029-603
其中: 各D獨立地選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0029-604
及-N=; 各m獨立地係1或2;或其鹽。
在一個實施例中,式Ib之化合物係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0030-606
其中:Q1係氫且Q2係R2;或Q1係R2且Q2係氫;Z係-L1-R1;及其鹽。
在一個實施例中,式I化合物具有以下式(Ic):
Figure 107112376-A0202-12-0030-605
其中E係-O-或-CH2-;n係選自由以下組成之群:0、1、2、3及4;且n1及n2各自獨立地選自由以下組成之群:0、1、2及3;或其鹽。
在某些實施例中,式(Ic)之化合物係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0031-607
其中Z係-L1-R1;及其鹽。
在一個實施例中,-A-L2-R2部分係:
Figure 107112376-A0202-12-0031-608
其中:Q1係氫且Q2係R2;或Q1係R2且Q2係氫;且各q獨立地係0、1、2、3、4或5;或其鹽。
在一個實施例中,式(I)化合物係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0031-609
Figure 107112376-A0202-12-0032-610
及其鹽。
在一個實施例中,R1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0033-611
其中RS
Figure 107112376-A0202-12-0033-613
; n係2、3或4;x係1或2。
在一個實施例中,L1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0033-612
在一個實施例中,L1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0034-614
在一個實施例中,A係不存在的、苯基、吡咯啶基或環戊基。
在一個實施例中,L2係視情況經羥基取代之C1-4伸烷基-O-。
在一個實施例中,L2係-CH2O-、-CH2CH2O-或-CH(OH)CH2O-。
在一個實施例中,各RA獨立地係羥基或視情況經羥基取代之C1-8烷基。
在一個實施例中,各RA獨立地選自由以下組成之群:羥基、甲基及-CH2OH。
在一個實施例中,式I化合物具有以下式(Ig):
Figure 107112376-A0202-12-0034-615
其中B係-N-或-CH-;L1係不存在的或-NH-;L2係視情況經羥基或鹵基取代之C1-4伸烷基-O-;n係0、1或2;或其鹽。
在一個實施例中,式I化合物具有以下式(Ig):
Figure 107112376-A0202-12-0035-616
其中B係-N-或-CH-;L1係不存在的或-NH-;L2係視情況經羥基或鹵基取代之C1-4伸烷基-O-;n係0、1、2、3、4、5、6或7;或其鹽。
在一個實施例中,式I化合物具有以下式(Ig):
Figure 107112376-A0202-12-0035-617
其中B係-N-或-CH-;L1係不存在的或-NH-;L2係視情況經羥基或鹵基取代之C1-4伸烷基-O-;n係0、1、2、3或4;或其鹽。
在一個實施例中,式Ig之化合物係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0036-618
其中R’係C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基;其中C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基視情況經鹵基或羥基取代;及其鹽。
在一個實施例中,式I化合物係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0036-619
在一個實施例中,式I化合物或其鹽係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0036-620
Figure 107112376-A0202-12-0037-621
Figure 107112376-A0202-12-0038-622
Figure 107112376-A0202-12-0039-623
Figure 107112376-A0202-12-0040-624
在一個實施例中,式I化合物或其鹽係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0041-625
Figure 107112376-A0202-12-0042-626
Figure 107112376-A0202-12-0043-627
Figure 107112376-A0202-12-0044-628
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0044-629
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0045-631
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0045-630
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0046-632
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0046-633
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0047-634
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0047-635
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0048-636
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0048-637
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0049-638
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0049-639
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0050-640
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0050-641
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子(例如,選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子)。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0051-642
或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0051-643
或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0052-644
或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0053-645
或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0054-646
或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0055-647
或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0056-648
或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,式I化合物係:
Figure 107112376-A0202-12-0057-649
或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,本發明提供式(I)化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0057-650
其中: L1係不存在的或係連接基團;L2係不存在的或係連接基團;R2係核酸;環A係不存在的、3至20員環烷基、5至20員芳基、5至20員雜芳基或3至20員雜環烷基;各RA獨立地選自由以下組成之群:氫、羥基、CN、F、Cl、Br、I、-C1-2烷基-ORB、C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基;其中C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基視情況經一或多個獨立地選自以下之基團取代:鹵基、羥基及C1-3烷氧基;RB係氫、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵;且n係0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;或其鹽。
在一個實施例中,本發明提供下式之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0058-651
其中:L2係不存在的或係連接基團;R2係核酸;環A係不存在的、3至20員環烷基、5至20員芳基、5至20員雜芳基或3至 20員雜環烷基;各RA獨立地選自由以下組成之群:氫、羥基、CN、F、Cl、Br、I、-C1-2烷基-ORB、C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基;其中C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基視情況經一或多個獨立地選自以下之基團取代:鹵基、羥基及C1-3烷氧基;RB係氫、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵;且n係0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;或其鹽。
在一個實施例中,本發明提供下式之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0059-652
其中:L1係不存在的或係連接基團;L2係不存在的或係連接基團;R2係核酸;B係二價的且係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0060-653
其中:各R’獨立地係C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基;其中C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基視情況經鹵基或羥基取代;以*標記之化合價附接至L1或若不存在L1則附接至R1;且以**標記之化合價附接至L2或若不存在L2則附接至R2;或其鹽。
在一個實施例中,L1及L2獨立地係具有1至50個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,L1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0061-656
或其鹽。
在一個實施例中,L1係經由選自由以下組成之群之鍵聯連接至B1:-O-、-S-、-(C=O)-、-(C=O)-NH-、-NH-(C=O)、-(C=O)-O-、-NH-(C=O)-NH-或-NH-(SO2)-。
在一個實施例中,L1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0061-655
在一個實施例中,L2係經由-O-連接至R2
在一個實施例中,L2係視情況經羥基取代之C1-4伸烷基-O-。
在一個實施例中,L2不存在。
Figure 107112376-A0202-12-0061-654
在一個實施例中,本發明提供以下化合物, 或其鹽,其中R2係核酸。
本發明之一個態樣係包含式I化合物及醫藥學上可接受之載劑之醫藥 組合物。
本發明之另一態樣係遞送雙鏈siRNA至動物肝臟之方法,其包含向動物投與式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之另一態樣係治療動物之疾病或病症(例如,肝病或病毒感染,例如B型肝炎病毒感染)之方法,其包含向動物投與式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之某些實施例提供式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其用於醫學療法中。
本發明之某些實施例提供式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其用於預防性或治療性治療動物之疾病或病症(例如,肝病或病毒感染,例如B型肝炎病毒感染)。
本發明之某些實施例提供式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其用於製備用以治療動物之疾病或病症(例如,肝病或病毒感染,例如B型肝炎病毒感染)之醫藥。
在某些實施例中,動物係哺乳動物,例如人類(例如,HBV感染之患者)。
在一個實施例中,式I化合物具有以下式(Id):
Figure 107112376-A0202-12-0062-657
其中:R1d係選自:
Figure 107112376-A0202-12-0063-658
Figure 107112376-A0202-12-0063-659
Xd係C2-10伸烷基;nd係0或1;R2d係選自表1之雙鏈siRNA之雙鏈siRNA分子;並且R3d係H、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵。
在一個實施例中,R3d包括將式Id化合物之剩餘部分連結至固體載體之連接基團。連接基團之性質不關鍵,前提係該化合物係適於製備式Id化合物之中間體,其中R2d係選自表1之雙鏈siRNA之雙鏈siRNA分子。
在一個實施例中,R3d中之連接體之分子量為約20道爾頓(dalton)至約1,000道爾頓。
在一個實施例中,R3d中之連接體之分子量為約20道爾頓至約500道爾頓。
在一個實施例中,R3d中之連接體將固體載體與式I化合物之剩餘部分分開約5埃(angstrom)至約40埃(包括端值)長。
在一個實施例中,R3d中之連接體係具有2至15個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由(-O-)或(-N(H)-)置換,且其中該鏈在碳上視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,R3d中之連接體係具有2至10個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由(-O-)或(-N(H)-)置換,且其中該鏈在碳上視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,R3d中之連接體係-C(=O)CH2CH2C(=O)N(H)-。
在一個實施例中,R1d係:
Figure 107112376-A0202-12-0065-660
在一個實施例中,R1d係:
Figure 107112376-A0202-12-0065-661
在一個實施例中,Xd係C8伸烷基。
在一個實施例中,nd係0。
在一個實施例中,R2d係siRNA。
在一個實施例中,R3d係H。
在另一實施例中,(Id)之化合物或其鹽係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0066-662
及其鹽。
本發明之一個態樣係包含式(Id)化合物及醫藥學上可接受之載劑之醫藥組合物。
本發明之一個態樣係遞送雙鏈siRNA至動物肝臟之方法,其包含向動物投與式(Id)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之另一態樣係治療動物之疾病或病症(例如,病毒感染,例如B型肝炎病毒感染)之方法,其包含向動物投與式(Id)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之某些實施例提供式(Id)化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其 用於醫學療法中。
本發明之某些實施例提供式(Id)化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其用於預防性或治療性治療動物之疾病或病症(例如,病毒感染,例如B型肝炎病毒感染)。
本發明之某些實施例提供式(Id)化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其用於製備用以治療動物之疾病或病症(例如,病毒感染,例如B型肝炎病毒感染)之醫藥。
在某些實施例中,動物係哺乳動物,例如人類(例如,HBV感染之患者)。
本發明亦提供可用於製備式(Id)化合物之本文揭示之合成中間體及方法。例如,本發明包括式Ie之中間體化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0067-664
或其鹽,其中:R1d係選自:
Figure 107112376-A0202-12-0067-663
Figure 107112376-A0202-12-0068-665
Xd係C2-8伸烷基;nd係0或1;Pg1係H或適宜保護基團;且R3d係H、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵。圖1圖解說明式(Ie)之代表性中間體化合物,其中靶向配體/連接體結合至固相載體,且其中Pg1係保護基團DMTr。
在一個實施例中,Pg1係TMTr(三甲氧基三苯甲基)、DMTr(二甲氧基三苯甲基)、MMTr(單甲氧基三苯甲基)或Tr(三苯甲基)。
本發明亦提供製備如本文所述之式(Id)化合物之方法,其包含使相應的式(Ie)化合物經受固相核酸合成條件以提供相應的式(Id)化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0068-666
其中,在式(Ie)中:Xd係C2-8伸烷基;nd係0或1; Pg1係H;且R3d係至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵;其中在式(Id)中,R2d係選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子。
在一個實施例中,該方法進一步包含自固體載體去除該化合物以提供相應的式Id化合物,其中R3d係H。
在一個實施例中,該化合物不為式Id化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0069-667
或其鹽,其中:R1d係選自:
Figure 107112376-A0202-12-0069-668
Figure 107112376-A0202-12-0070-669
Xd係C2-10伸烷基;Nd係0或1;R2d係選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子;且R3d係H、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵。
在一個實施例中,化合物不為式Ie化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0070-670
或其鹽,其中:R1d係選自:
Figure 107112376-A0202-12-0070-671
Figure 107112376-A0202-12-0071-672
Xd係C2-8伸烷基;nd係0或1;Pg1係H或適宜保護基團;且R3d係H、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵。
在一個實施例中,R3d係H。
在一個實施例中,R3d係至固體載體之共價鍵。
在一個實施例中,R3d係至結合至固體載體之連接基團之鍵,其中連接基團係具有2至15個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由(-O-)或(-N(H)-)置換,且其中該鏈在碳上視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,R3d係至結合至固體載體之連接基團之鍵,其中連接基團係具有2至10個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由(-O-)或(-N(H)-)置換,且其 中該鏈在碳上視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,R3d係至結合至固體載體之連接基團之鍵,其中連接基團係-C(=O)CH2CH2C(=O)N(H)-。
在一個實施例中,本發明提供式(I)化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0072-673
其中:R1係H或合成活化基團;L1係不存在的或係連接基團;L2係不存在的或係連接基團;R2係選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子;環A係不存在的、3至20員環烷基、5至20員芳基、5至20員雜芳基或3至20員雜環烷基;各RA獨立地選自由以下組成之群:氫、羥基、CN、F、Cl、Br、I、-C1-2烷基-ORB、C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基;其中C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基視情況經一或多個獨立地選自以下之基團取代:鹵基、羥基及C1-3烷氧基;RB係氫、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵;且n係0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;或其鹽。
在一個實施例中,本發明提供式(I)化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0073-674
其中:R1係靶向配體;L1係不存在的或係連接基團;L2係不存在的或係連接基團;R2係H或合成活化基團;環A係不存在的、3至20員環烷基、5至20員芳基、5至20員雜芳基或3至20員雜環烷基;各RA獨立地選自由以下組成之群:氫、羥基、CN、F、Cl、Br、I、-C1-2烷基-ORB、C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基;其中C1-10烷基C2-10烯基及C2-10炔基視情況經一或多個獨立地選自以下之基團取代:鹵基、羥基及C1-3烷氧基;RB係氫、保護基團、至固體載體之共價鍵或至結合至固體載體之連接基團之鍵;且n係0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;或其鹽。
在一個實施例中,本發明提供式(Ig)化合物;
Figure 107112376-A0202-12-0073-675
其中:B係-N-或-CH-;L2係視情況經羥基或鹵基取代之C1-4伸烷基-O-;且n係0、1、2、3、4、5、6或7;或其鹽。
在一個實施例中,本發明提供選自由以下組成之群之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0074-676
其中:Q係-L1-R1;且R’係C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基;其中C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基視情況經鹵基或羥基取代;及其鹽。
在一個實施例中,本發明提供選自由以下組成之群之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0075-677
其中:Q係-L1-R1;及其鹽。
在一個實施例中,本發明提供式(Ig)化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0075-678
其中:B係-N-或-CH-;L1係不存在的或係連接基團;L2係視情況經羥基或鹵基取代之C1-4伸烷基-O-;n係0、1、2、3、4、5、6或7;R1係H或合成活化基團;且R2係H或合成活化基團;或其鹽。
在一個實施例中,本發明提供選自由以下組成之群之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0076-679
其中Q係-L1-R1;L1係不存在的或係連接基團;R’係C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基;其中C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基視情況經鹵基或羥基取代;R1係H或合成活化基團;且R2係H或合成活化基團;或其鹽。
在一個實施例中,本發明提供選自由以下組成之群之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0076-680
其中:Q係-L1-R1; L1係不存在的或係連接基團;R1係H或合成活化基團;且R2係H或合成活化基團;或其鹽。
在一個實施例中,R1係H或可衍生自DCC、HOBt、EDC、BOP、PyBOP或HBTU之合成活化基團。
在一個實施例中,R2係H、乙酸酯、三氟甲磺酸酯、甲磺酸酯或琥珀酸酯。
在一個實施例中,R1係可衍生自DCC、HOBt、EDC、BOP、PyBOP或HBTU之合成活化基團。
在一個實施例中,R2係乙酸酯、三氟甲磺酸酯、甲磺酸酯或琥珀酸酯。
在一個實施例中,L1係具有5至20個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NH-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或-S-置換。
在一個實施例中,本發明提供式(XX)之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0077-681
其中:R1係靶向配體;L1係不存在的或係連接基團;L2係不存在的或係連接基團;R2係選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子;B係二價的且係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0078-682
其中:各R’獨立地係C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基;其中C1-9烷基、C2-9烯基或C2-9炔基視情況經鹵基或羥基取代;以*標記之化合價附接至L1或若不存在L1則附接至R1;並且以**標記之化合價附接至L2或若不存在L2則附接至R2;或其鹽。
在一個實施例中,R1包含2至8個醣。
在一個實施例中,R1包含2至6個醣。
在一個實施例中,R1包含2至4個醣。
在一個實施例中,R1包含3至8個醣。
在一個實施例中,R1包含3至6個醣。
在一個實施例中,R1包含3至4個醣。
在一個實施例中,R1包含3個醣。
在一個實施例中,R1包含4個醣。
在一個實施例中,R1具有下式:
Figure 107112376-A0202-12-0079-683
其中:B1係包含約1至約20個碳原子之三價基團且共價鍵結至L1、T1及T2。B2係包含約1至約20個碳原子之三價基團且共價鍵結至T1、T3及T4;B3係包含約1至約20個碳原子之三價基團且共價鍵結至T2、T5及T6;T1係不存在的或係連接基團;T2係不存在的或係連接基團;T3係不存在的或係連接基團;T4係不存在的或係連接基團;T5係不存在的或係連接基團;且T6係不存在的或係連接基團。
在一個實施例中,每一醣獨立地選自:
Figure 107112376-A0202-12-0079-684
其中: X係NR3且Y係選自-(C=O)R4、-SO2R5及-(C=O)NR6R7;或X係-(C=O)-且Y係NR8R9;R3係氫或(C1-C4)烷基;R4、R5、R6、R7、R8及R9各自獨立地選自由以下組成之群:氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)鹵烷基、(C1-C8)烷氧基及(C3-C6)環烷基,該(C3-C6)環烷基視情況經一或多個獨立地選自由以下組成之群之基團取代:鹵基、(C1-C4)烷基、(C1-C4)鹵烷基、(C1-C4)烷氧基及(C1-C4)鹵烷氧基;R10係-OH、-NR8R9或-F;且R11係-OH、-NR8R9、-F或5員雜環,該5員雜環視情況經一或多個獨立地選自由以下組成之群之基團取代:鹵基、羥基、羧基、胺基、(C1-C4)烷基、(C1-C4)鹵烷基、(C1-C4)烷氧基及(C1-C4)鹵烷氧基。
在一個實施例中,每一醣獨立地選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0080-686
在一個實施例中,每一醣獨立地係:
Figure 107112376-A0202-12-0080-685
在一個實施例中,T1及T2中之一者不存在。
在一個實施例中,T1及T2二者不存在。
在一個實施例中,T1、T2、T3、T4、T5及T6中之每一者獨立地係不存在的或係具有1至50個碳原子之具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,T1、T2、T3、T4、T5及T6中之每一者獨立地係不存在的或係具有1至20個碳原子之具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,T1、T2、T3、T4、T5及T6中之每一者獨立地係不存在的或係具有1至50個碳原子之具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,或其鹽,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-或-NRX-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:鹵基、羥基及側氧基(=O)。
在一個實施例中,T1、T2、T3、T4、T5及T6中之每一者獨立地係不存在的或係具有1至20個碳原子之具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-置換,且其中烴鏈 視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:鹵基、羥基及側氧基(=O)。
在一個實施例中,T1、T2、T3、T4、T5及T6中之每一者獨立地係不存在的或係具有1至20個碳原子之具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-置換,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4個)選自以下之取代基取代:鹵基、羥基及側氧基(=O)。
在一個實施例中,T3、T4、T5及T6中之至少一者係:
Figure 107112376-A0202-12-0082-688
其中:n=1、2、3。
在一個實施例中,T3、T4、T5及T6中之每一者獨立地選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0082-687
其中:n=1、2、3。
在一個實施例中,T1及T2中之至少一者係甘胺酸
在一個實施例中,T1及T2中之每一者係甘胺酸。
在一個實施例中,B1係包含1至15個原子之三價基團且共價鍵結至L1、T1及T2
在一個實施例中,B1係包含1至10個原子之三價基團且共價鍵結至L1、T1及T2
在一個實施例中,B1包含(C1-C6)烷基。
在一個實施例中,B1包含C3-8環烷基。
在一個實施例中,B1包含矽基。
在一個實施例中,B1包含D-胺基酸或L-胺基酸。
在一個實施例中,B1包含醣。
在一個實施例中,B1包含磷酸酯基團。
在一個實施例中,B1包含膦酸酯基團。
在一個實施例中,B1包含芳基。
在一個實施例中,B1包含苯基環。
在一個實施例中,B1係苯基環。
在一個實施例中,B1係CH。
在一個實施例中,B1包含雜芳基。
在一個實施例中,B1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0083-689
在一個實施例中,B1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0083-690
在一個實施例中,B2係包含1至15個原子之三價基團且共價鍵結至L1、T1及T2
在一個實施例中,B2係包含1至10個原子之三價基團且共價鍵結至L1、T1及T2
在一個實施例中,B2包含(C1-C6)烷基
在一個實施例中,B2包含C3-8環烷基。
在一個實施例中,B2包含矽基。
在一個實施例中,B2包含D-胺基酸或L-胺基酸。
在一個實施例中,B2包含醣。
在一個實施例中,B2包含磷酸酯基團。
在一個實施例中,B2包含膦酸酯基團。
在一個實施例中,B2包含芳基。
在一個實施例中,B2包含苯基環。
在一個實施例中,B2係苯基環。
在一個實施例中,B2係CH。
在一個實施例中,B2包含雜芳基。
在一個實施例中,B2係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0084-692
在一個實施例中,B2係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0084-691
或其鹽。
在一個實施例中,B3係包含1至15個原子之三價基團且共價鍵結至L1、T1及T2
在一個實施例中,B3係包含1至10個原子之三價基團且共價鍵結至L1、T1及T2
在一個實施例中,B3包含(C1-C6)烷基。
在一個實施例中,B3包含C3-8環烷基。
在一個實施例中,B3包含矽基。
在一個實施例中,B3包含D-胺基酸或L-胺基酸。
在一個實施例中,B3包含醣。
在一個實施例中,B3包含磷酸酯基團。
在一個實施例中,B3包含膦酸酯基團。
在一個實施例中,B3包含芳基。
在一個實施例中,B3包含苯基環。
在一個實施例中,B3係苯基環。
在一個實施例中,B3係CH。
在一個實施例中,B3包含雜芳基。
在一個實施例中,B3係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0085-693
在一個實施例中,B3係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0085-694
或其鹽。
在一個實施例中,L1及L2獨立地係具有1至50個碳原子之二價、具支鏈或無支鏈、飽和或不飽和的烴鏈,其中烴鏈中之一或多個(例如,1、2、3或4個)碳原子視情況由-O-、-NRX-、-NRX-C(=O)-、-C(=O)-NRX-或-S-置換,且其中RX係氫或(C1-C6)烷基,且其中烴鏈視情況經一或多個(例如,1、2、3或4 個)選自以下之取代基取代:(C1-C6)烷氧基、(C3-C6)環烷基、(C1-C6)烷醯基、(C1-C6)烷醯基氧基、(C1-C6)烷氧基羰基、(C1-C6)烷基硫基、疊氮基、氰基、硝基、鹵基、羥基、側氧基(=O)、羧基、芳基、芳基氧基、雜芳基及雜芳基氧基。
在一個實施例中,L1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0086-695
或其鹽。
在一個實施例中,L1係經由選自由以下組成之群之鍵聯連接至B1:-O-、-S-、-(C=O)-、-(C=O)-NH-、-NH-(C=O)、-(C=O)-O-、-NH-(C=O)-NH-或-NH-(SO2)-。
在一個實施例中,L1係選自由以下組成之群:
Figure 107112376-A0202-12-0086-696
在一個實施例中,L2係經由-O-連接至R2
在一個實施例中,L2係視情況經羥基取代之C1-4伸烷基-O-。
在一個實施例中,L2係經由-O-連接至R2
在一個實施例中,L2不存在。
在一個實施例中,本發明提供選自由以下組成之群之化合物或鹽:
Figure 107112376-A0202-12-0087-697
Figure 107112376-A0202-12-0088-698
Figure 107112376-A0202-12-0089-699
Figure 107112376-A0202-12-0089-700
及其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子。
在一個實施例中,本發明提供下式之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0090-703
或其鹽,其中R2係核酸。
在一個實施例中,本發明提供下式之化合物:
Figure 107112376-A0202-12-0090-702
或其鹽,其中R2係核酸。
在一個實施例中,核酸分子(例如,siRNA)係經由有義鏈3’-末端處之磷酸酯之氧附接至化合物之剩餘部分。
在一個實施例中,皮下投與該化合物或鹽。
當化合物包含下式之基團時:
Figure 107112376-A0202-12-0090-701
環上存在四種可能的立體異構物(兩種順式及兩種反式)。除非另有說明,否則本 發明之化合物包括關於此一環之所有四種立體異構物。在一個實施例中,兩個R'基團呈順式構象。在一個實施例中,兩個R'基團呈反式構象。
本發明之一個態樣係核酸-脂質粒子,其包含:(a)一或多個選自表1之雙鏈siRNA分子之雙鏈siRNA分子;(b)陽離子脂質;及(c)非陽離子脂質。
實例
將藉助具體實例更詳細地闡述本發明。以下實例係出於了闡釋目的而提供的,且並非意欲以任何方式限制本發明。熟悉此項技術者將容易地認識到可以改變或修改各個非關鍵參數以產生基本上相同的結果。應該理解在一個實施例中,寡核苷酸係如表1所述之雙鏈siRNA分子。
實例1. 合成偶聯物1
Figure 107112376-A0202-12-0091-704
Figure 107112376-A0202-12-0091-705
方案3.
Figure 107112376-A0202-12-0092-706
Figure 107112376-A0202-12-0092-707
方案5.
Figure 107112376-A0202-12-0093-708
步驟1. 製備4-甲基苯磺酸2-(2-(2-(2-羥基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酯3
Figure 107112376-A0202-12-0093-709
將四甘醇(934g,4.8mol)於THF(175mL)及NaOH水溶液(5M,145mL)中之溶液冷卻(0℃)並用溶解於THF(605mL)中之對甲苯磺醯氯(91.4g,480mmol)處理,且然後攪拌2小時(0℃)。將反應混合物用水(3L)稀釋並用CH2Cl2(3x 500mL)萃取。將合併之萃取物用水及鹽水洗滌,然後乾燥(MgSO4),過濾並濃縮以得到淺黃色油狀4-甲基苯磺酸2-(2-(2-(2-羥基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酯3(140g,84%)。Rf(0.57,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟2. 製備2-(2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇4
Figure 107112376-A0202-12-0094-712
3(140g,403mmol)於DMF(880mL)中之溶液用疊氮化鈉(131g,2.02mol)處理並加熱(45℃)過夜。在減壓下去除大部分DMF,並且將殘餘物溶解於CH2Cl2(500mL)中並用鹽水(3x 500mL)洗滌,然後乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使殘餘物穿過短二氧化矽床(5% MeOH-CH2Cl2)並濃縮以產生黃色油狀2-(2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇4(65g,74%)。Rf(0.56,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟3. 製備全乙醯化半乳糖胺6
Figure 107112376-A0202-12-0094-710
用乙酸酐(1.25L,13.2mol)將於吡啶(1.5L)中之D-半乳糖胺鹽酸鹽5(250g,1.16mol)處理45分鐘。在攪拌過夜後,將反應混合物分為三個1L部分。將每一1L部分傾倒至3L冰水中,並混合1小時。在混合後,將固體濾掉,合併,經液氮冷凍,且然後凍乾5天以產生白色固體狀全乙醯化半乳糖胺6(369.4g,82%)。Rf(0.58,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟4. 製備(3aR,5R,6R,7R,7aR)-二乙酸5-(乙醯氧基甲基)-2-甲基-3a,6,7,7a-四氫-5H-哌喃并[3,2-d]噁唑-6,7-二基酯7
Figure 107112376-A0202-12-0094-711
將全乙醯化半乳糖胺6(8.45g,21.7mmol)於CHCl3(320mL)中之溶液 用TMSOTf(4.32mL,23.9mmol)逐滴處理。在攪拌(1.5h,40℃)後,將反應物藉由添加三乙胺(5mL)淬滅並濃縮至乾燥以得到淺黃色玻璃狀化合物7(7.2g,定量)。該產物不經過進一步純化即使用。Rf(0.59,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟5. 製備(2R,3R,4R,5R,6R)-二乙酸5-乙醯胺基-2-(乙醯氧基甲基)-6-(2-(2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)四氫-2H-哌喃-3,4-二基酯8
Figure 107112376-A0202-12-0095-713
將化合物7(7.2g,21.7mmol)及2-(2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇4(2.65g,15.2mmol)自甲苯(150mL)共沸(3x)以去除痕量的水。將經乾燥材料溶解於1,2-二氯乙烷(150mL)中,冷卻(約5℃)並用TMSOTf(784μL,4.34mmol)處理。在攪拌過夜後,將反應物藉由添加三乙胺(5mL)淬滅並濃縮。將殘餘物藉由層析(1%→5% MeOH-CH2Cl2)純化以得到褐色油狀8(7.12g,85%)。Rf(0.3,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟6. 製備2-(2-(2-(2-(((2R,3R,4R,5R,6R)-2,2,2-三氟乙酸3-乙醯胺基-4,5-二乙醯氧基-6-(乙醯氧基甲基)四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-銨9
Figure 107112376-A0202-12-0095-714
將疊氮化物8(7.12g,13mmol)於EtOAc(150mL)及三氟乙酸(2mL)中之溶液用炭載鈀(1.5g,10% w/w濕基)處理。然後將反應混合物用氫吹掃並劇烈攪拌過夜。在用氮吹掃後,藉助Celite過濾混合物,用MeOH沖洗。將濾液濃縮並經由層析(5%→10%→20% MeOH-CH2Cl2)純化以得到褐色油狀9(5.8g,72%)。Rf(0.34,15% MeOH-CH2Cl2)。
步驟7. 製備4-(((苄氧基)羰基)胺基)-4-(3-(第三丁氧基)-3-側氧基丙基)庚烷二油酸二第三丁基酯11
Figure 107112376-A0202-12-0096-715
向4-胺基-4-(3-(第三丁氧基)-3-側氧基丙基)庚烷二油酸二第三丁基酯10(13.5g,33mmol)、25% Na2CO3(水溶液)(150mL)及二氯甲烷(300mL)之溶液中緩慢添加氯甲酸苄酯(14mL,98mmol)。將溶液在室溫下劇烈攪拌過夜(16h)。完成後,添加其他二氯甲烷(100mL)並分離二氯甲烷層。將水層用二氯甲烷(2 x 100mL)萃取。將合併之二氯甲烷萃取物在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥。分離出無色油狀產物11,其不需進一步純化(15.8g,88%)。Rf(0.7,1:1 EtOAc-己烷)。
步驟8. 製備4-(((苄氧基)羰基)胺基)-4-(2-羧基乙基)庚二酸12
Figure 107112376-A0202-12-0096-716
11(15.6g,28.8mmol)於甲酸(50mL)中之溶液在室溫下攪拌2小時。將溶液濃縮至乾燥並溶解於乙酸乙酯(約25mL)中。靜置後,產物結晶為無色固體。將固體過濾,用乙酸乙酯洗滌並風乾以得到無色固體形式之12(10.2g,93%)。Rf(0.1,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟9. 製備化合物13
Figure 107112376-A0202-12-0096-717
12(793mg,2.08mmol)及9(5.8g,9.36mmol)於DMF(50mL)中之溶 液用BOP(3.67g,8.32mmol)、然後用N,N-二異丙基乙胺(4.31mL,25mmol)處理。在攪拌過夜後,將混合物濃縮至乾燥並經受層析(1%→2%→5%→10%→15%MeOH-CH2Cl2)以得到13(5.71g[粗製],>100%-含有不影響下一步驟之偶合副產物)。Rf(0.45,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟10. 製備化合物14
Figure 107112376-A0202-12-0097-807
將化合物13(5.7g)溶解於MeOH(150mL)及TFA(1.5mL)中,並用炭載鈀(1g,10% w/w濕基)處理。然後將反應混合物用氫吹掃並劇烈攪拌過夜。在用氮吹掃後,藉助Celite過濾混合物,用MeOH沖洗。將濾液濃縮並經由層析(5%→10%→20% MeOH-CH2Cl2)純化以得到褐色油狀14(2.15g,56%經兩個步驟)。Rf(0.32,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟11. 製備(5-胺基-1,3-伸苯基)二甲醇15
Figure 107112376-A0202-12-0097-719
經1小時將5-胺基間苯二甲酸二甲酯(20.0g,96mmol)於THF(350mL)中之溶液逐滴添加至3.75當量LiAlH4(13.6g,358mmol)於THF(440mL)中之回流混合物中。將混合物在回流下再攪拌2小時,然後冷卻至室溫並藉由小心地添加MeOH(27mL)、然後水(40mL)來淬滅。在將經淬滅混合物攪拌2小時後,將其過濾並濃縮至乾燥。將殘餘物自EtOAc重結晶(2X)以得到褐黃色晶體形式之15(10.2g,70%)。
步驟12. 製備10-((3,5-雙(羥甲基)苯基)胺基)-10-側氧基癸酸甲酯16
Figure 107112376-A0202-12-0097-720
將癸二酸甲酯(3.8g,17mmol)、15(2.5g,17mmol)及EEDQ(8.1g,33mmol)於2:1二氯甲烷/甲醇(200mL)中之溶液在室溫下攪拌2小時。完成後,將溶液濃縮至乾燥。將所獲得之固體用二氯甲烷(50mL)研磨並過濾。將固體用冷二氯甲烷沖洗並風乾以得到無色固體狀16(4.3g,72%)。Rf(0.33,EtOAc)。
步驟13. 製備10-((3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(羥甲基)苯基)胺基)-10-側氧基癸酸甲酯17
Figure 107112376-A0202-12-0098-722
16(4.3g,12mmol)於吡啶(50mL)中之溶液中添加4,4'-(氯(苯基)亞甲基)雙(甲氧基苯)(4.1g,12mmol)。將該溶液在氮下在室溫下攪拌過夜。完成後,將溶液濃縮至乾燥並將殘餘物藉由管柱層析(0.5%→0.75%→1%→1.5% MeOH-CH2Cl2)純化以得到黃色固體狀17(2.9g,35%)。Rf(0.6,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟14. 製備10-((3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(羥甲基)苯基)胺基)-10-側氧基癸酸鋰18
Figure 107112376-A0202-12-0098-721
17(2.9g,4.3mmol)於THF(60mL)中之溶液中添加水(15mL)及氫氧化鋰(112mg,4.7mmol)。將該溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將溶液濃縮以去除THF。將剩餘的水溶液在液氮上急速冷凍並凍乾過夜以得到無色固體(2.9g,定量)。Rf(0.3,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟15. 製備化合物19
Figure 107112376-A0202-12-0099-723
向14(454mg,0.67mmol)、18(1.25g,0.67mmol)及HBTU(381mg,1.0mmol)於無水DMF(25mL)中之溶液中添加N,N-二異丙基乙胺(0.35mL,2.0mmol)。將該溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將溶液傾倒至乙酸乙酯(250mL)中並用鹽水(3 x 200mL)洗滌。將乙酸乙酯層在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥。藉由管柱層析(5%→7.5%→10%→15%於CH2Cl2中之MeOH)純化,得到淺橙色泡沫狀19(1.5g,94%)。Rf(0.25,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟16. 製備化合物20
Figure 107112376-A0202-12-0099-724
將化合物19(1.5g,0.6mmol)、琥珀酸酐(120mg,1.2mmol)、DMAP(220mg,1.8mmol)及三甲胺(250μL,1.8mmol)於無水CH2Cl2(50mL)中之溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將溶液濃縮至乾燥並藉助短二氧化矽塞(100% CH2Cl2→15%於CH2Cl2中之MeOH)過濾以得到淡米色泡沫狀產物20(1.1g,70%)。質量m/z(ES-TOF MS)727.7[M+3H-DMTr]+,1091.1[M+2H-DMTr]。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.92(br s,1H),7.78(s,1H),7.49-7.47(m,3H),7.41(br s,1H),7.38-7.34(m,5H),7.32-7.26(m,4H),7.24-7.08(br s,3H),7.08(s,1H),6.90-6.80(m,7H),5.31(d,3H,J=2.7Hz),5.12(s,2H),5.06(dd,3H,J=11.2,3.2Hz),4.78(d,3H,J=8.5Hz),4.24-4.08(m,12H),3.95-3.88(m,7H),3.85-3.76(m,4H),3.78(s,6H),3.68-3.56(m,34H),3.54-3.44(m,8H),3.41-3.33(m,6H),2.70-2.60(m,4H),2.52-2.30(m,30H),2.24-2.16(m,8H),2.14(s,9H),2.04(s,9H),2.02-1.96(m,6H),1.98(s,9H),1.96(s,9H),1.74-1.52(m,4H),1.36-1.24(m,12H)。
步驟17. 製備偶聯物1
Figure 107112376-A0202-12-0100-725
使用標準醯胺偶合化學,將琥珀酸酯20負載至1000Å LCAA(長鏈胺基烷基)CPG(可控微孔玻璃珠)上。將二異丙基碳二亞胺(52.6μmol)、N-羥基琥珀醯亞胺(0.3mg,2.6μmol)及吡啶(10μL)於無水乙腈(0.3mL)中之溶液中添加至於無水二氯甲烷(0.2mL)中之20(20.6mg,8μmol)中。將此混合物添加至LCAA CPG(183mg)中。將懸浮液在室溫下輕輕混合物過夜。在20消失(HPLC)後,將反應混合物過濾並將CPG用各1mL之二氯甲烷、乙腈、5%乙酸酐/5% N-甲基咪唑/5%吡啶於THF中之溶液、然後用THF、乙腈及二氯甲烷洗滌。然後將CPG在高真空下乾燥過夜。藉由標準DMTr分析藉由UV/Vis(504nm)測得負載為25μmol/g。將所得GalNAc負載之CPG固體載體用於使用標準程序之自動寡核苷酸合成中。進行核苷酸去保護,隨後自固體載體去除(同時進行乙酸半乳糖胺去保護)得到GalNAc-寡核苷酸偶聯物1作為代表性實例。
實例2:合成偶聯物34
方案6.
Figure 107112376-A0202-12-0101-726
Figure 107112376-A0202-12-0101-727
方案8.
Figure 107112376-A0202-12-0102-728
步驟1. 製備4-(2-(((苄氧基)羰基)胺基)乙醯胺基)-4-(3-(第三丁氧基)-3-側氧基丙基)庚二酸二第三丁基酯21
Figure 107112376-A0202-12-0102-729
將4-胺基-4-(3-(第三丁氧基)-3-側氧基丙基)庚二酸二第三丁基酯(25g,60mmol)及Z-甘胺酸(18.9g,90.2mmol)於CH2Cl2(300mL)中之溶液用EDC(23g,120mmol)、二異丙基乙胺(32mL,180mmol)及DMAP(Cat.17mg)連續處理。攪拌(16h)後,將反應混合物傾倒至NaHCO3(飽和水溶液)中,用CH2Cl2萃取,用鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮以得到非晶形固體狀4-(2-(((苄氧基)羰基)胺基)乙醯胺基)-4-(3-(第三丁氧基)-3-側氧基丙基)庚二酸二第三丁基酯21並且不經進一步處理即使用(36g,定量)。Rf(0.85,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟2. 製備4-(2-(((苄氧基)羰基)胺基)乙醯胺基)-4-(2-羧基乙基)庚二酸22
Figure 107112376-A0202-12-0103-730
將4-(2-(((苄氧基)羰基)胺基)乙醯胺基)-4-(3-(第三丁氧基)-3-側氧基丙基)庚二酸二第三丁基酯21(59.3mmol,36g)之溶液在純淨甲酸(150mL)中攪拌72小時。完成後,在減壓下去除甲酸並將粗製固體在高真空下乾燥過夜以產生無色固體狀22(15.9g,61%)。Rf(0.15,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟3. 製備化合物23
Figure 107112376-A0202-12-0103-731
22(6.2g,14.1mmol)及2-(2-(2-(2-(((2R,3R,4R,5R,6R)-2,2,2-三氟乙酸3-乙醯胺基-4,5-二乙醯氧基-6-(乙醯氧基甲基)四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-銨(35g,56.5mmol)於DMF(250mL)中之溶液用BOP(25g,56.5mmol)、然後N,N-二異丙基乙胺(29mL,170mmol)處理。在攪拌過夜後,將混合物濃縮至乾燥並經受層析(100% CH2Cl2至15% MeOH-CH2Cl2)以得到化合物23(24.6g,89%)。Rf(0.55,15% MeOH-CH2Cl2)。
步驟4. 製備化合物24
Figure 107112376-A0202-12-0103-732
將化合物23(24.6g)溶解於MeOH(200mL)及TFA(1.5mL)中,並用氮吹掃。添加炭載鈀(1g,10% w/w濕基),然後將反應混合物用氫吹掃並劇烈攪拌過夜。完成後,將反應物用氮吹掃,藉助Celite過濾並用MeOH沖洗。將濾液濃縮並藉由矽膠60上之管柱層析(梯度:5%→10%→20% MeOH-CH2Cl2)純 化以得到淺褐色黏性油狀24(23g)。Rf(0.32,10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟5. 製備(5-胺基-1,3-伸苯基)二甲醇26
Figure 107112376-A0202-12-0104-733
使氫化鋁鋰(13.6g,358mmol)於無水四氫呋喃(450mL)中之懸浮液在氮氣氛下回流並用5-胺基間苯二酸二甲酯25(20g,96mmol)於無水四氫呋喃(350mL)中之溶液逐滴處理。在完成添加後,將混合物加熱至回流並再保持2小時。完成後,使溶液冷卻至室溫並藉由緩慢添加MeOH(27mL)然後水(40mL)來淬滅。在攪拌2小時後,將混合物過濾、濃縮並自EtOAc再結晶以產生灰白色晶體狀(5-胺基-1,3-伸苯基)二甲醇26(10.2g,70%)。Rf0.5(15% MeOH-CH2Cl2)。
步驟6. 製備3,5-雙(羥甲基)苄腈27
Figure 107112376-A0202-12-0104-734
使26(5g,33mmol)於2N鹽酸(100mL)中之溶液冷卻至0℃並用硝酸鈉(3.53g,36mmol)於水(50mL)中之冷溶液處理。將反應混合物在
Figure 107112376-A0202-12-0104-507
5℃之溫度下維持30min,然後用氰化銅(I)(3.19g,35.6mmol)及氰化鈉(3.53g,72mmol)於水(50mL)中之溶液一次性處理。在室溫下攪拌過夜後,將混合物過濾,用二氯甲烷(3 x 100mL)萃取,濃縮且不經進一步純化即使用。獲得黃色固體狀二醇3,5-雙(羥甲基)苄腈27(2.19g,41%)。Rf0.75(15% MeOH-CH2Cl2)。
步驟7. 製備3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(羥甲基)苄腈28
Figure 107112376-A0202-12-0104-735
將3,5-雙(羥甲基)苄腈27(538mg,3.3mmol)於吡啶(14mL)中之溶液用4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(1.17g,3.46mmol)處理,並在室溫下攪拌過夜。一旦完成,將混合物濃縮且分散於乙醚(25mL)中,過濾並濃縮。將粗製產物藉由 矽膠60之管柱層析(梯度:10%至50% EtOAc-己烷)純化以產生黃色固體狀28(725mg,47%)。Rf0.5(1:1 EtOAc-己烷)。
步驟8. 製備(3-(胺基甲基)-5-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)苯基)甲醇29
Figure 107112376-A0202-12-0105-736
使28(100mg,0.22mmol)於甲基四氫呋喃(5mL)中之溶液冷卻至0℃並用氫化鋁鋰(0.64mmol=0.28mL之2.3M於MeTHF中之溶液)緩慢處理。在攪拌1小時後,將反應物藉由添加甲醇(1mL)、然後水(0.3mL)淬滅,並攪拌30min。將混合物過濾並濃縮以產生(3-(胺基甲基)-5-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)苯基)甲醇29(78mg,77%)。Rf0.15(10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟9. 製備10-((3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(羥甲基)苄基)胺基)-10-側氧基癸酸甲酯30
Figure 107112376-A0202-12-0105-808
將(3-(胺基甲基)-5-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-甲基)苯基)甲醇29(78mg,0.17mmol)及癸二酸單甲酯(38mg,0.17mmol)於二氯甲烷(5mL)中之溶液用EDC(48mg,0.25mmol)、DMAP(cat.,5mg)及二異丙基乙胺(57μL,0.33mmol)連續處理。在攪拌(3.5h)後,將反應混合物傾倒至飽和碳酸氫鈉溶液(50mL)中。將碳酸氫鈉溶液用二氯甲烷(3 x 50mL)萃取,用鹽水(50mL)洗滌,在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥。將粗製物質藉由矽膠60上之管柱層析(梯度:2%至5% MeOH-CH2Cl2)純化以得到黃色油狀10-((3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(羥甲基)苄基)胺基)-10-側氧基癸酸甲酯30(57mg,53%)。Rf0.45(10% MeOH-CH2Cl2)。
步驟10. 製備10-((3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(羥甲基)苄基)胺基)-10-側氧基癸酸鋰31
Figure 107112376-A0202-12-0106-809
將化合物30(188mg,0.28mmol)溶解於四氫呋喃(5mL)中,並用LiOH(7mg,0.30mmol)於水(1mL)中之溶液處理。完成後,在真空下去除四氫呋喃并將剩餘的水性混合物冷凍並凍乾以得到無色固體狀10-((3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(羥甲基)苄基)胺基)-10-側氧基癸酸鋰31(180mg,99%)。Rf0.45(10%MeOH-CH2Cl2)。
步驟11. 製備化合物32、33及34
嚴格根據用於合成化合物19、201之相同程序來製備化合物32、33及34。
實例3. 合成偶聯物36
Figure 107112376-A0202-12-0106-739
步驟1. 製備偶聯物36
使用與用於合成化合物34及所有相應中間體之一致程序來製備偶聯物36。唯一的例外係其中使用丙酸酐代替乙酸酐之化合物6合成。
實例4. 合成偶聯物42
方案9.
Figure 107112376-A0202-12-0107-740
Figure 107112376-A0202-12-0107-741
步驟1. 製備化合物37
Figure 107112376-A0202-12-0107-742
向18β-甘草亭酸(2.5g,5.3mmol)、(3-胺基丙基)胺基甲酸第三丁基酯 (1.1g,6.4mmol)及HBTU(3.0g,8.0mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(20mL)中之溶液中添加二異丙基乙胺(2.75mL,15.9mmol)。將該溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將溶液在真空中濃縮至乾燥。將殘餘物藉由矽膠60上之管柱層析(梯度:2%至5% MeOH/CH2Cl2)純化以得到無色固體狀產物(2.1g,63%)。
步驟2. 製備化合物38
Figure 107112376-A0202-12-0108-744
37(2.1g,3.3mmol)及三乙胺(3.5mL,10mmol)於二氯甲烷(25mL)中之溶液中添加乙酸酐(850μL,5.3mmol)及DMAP(5mg)。將溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將溶液濃縮至乾燥並溶解於乙酸乙酯(100mL)中,用水(100mL)洗滌,在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥以得到淺褐色泡沫狀物(1.9g,85%)。
步驟3. 製備化合物39
Figure 107112376-A0202-12-0108-810
向38(1.5g,2.3mmol)於無水二噁烷(25mL)中之溶液中添加2M於二噁烷中之氯化氫(25mL)。將該溶液在室溫下攪拌過夜,然後在真空中濃縮至乾燥以得到淺褐色固體(1.3g,96%)。
步驟4. 製備化合物40、41及42
嚴格根據用於合成化合物19、201之相同程序來製備化合物40、4142。
實例5. 合成偶聯物43
方案11.
Figure 107112376-A0202-12-0109-745
Figure 107112376-A0202-12-0109-746
步驟1. 製備11-(2,6-雙(羥甲基)-4-甲基苯氧基)十一烷酸甲酯44
Figure 107112376-A0202-12-0109-747
將2,6-雙(羥甲基)-對甲酚(2.7g,16.3mmol)、11-溴十一烷酸甲酯(5.0g,17.9mmol)及碳酸鉀(4.5g,32.6mmol)於丙酮(100mL)中之溶液回流16小時。完 成後,將該溶液在真空中濃縮至乾燥,懸浮於乙酸乙酯(150mL)中並用水(2 x 100mL)及鹽水(100mL)洗滌。將乙酸乙酯層在硫酸鎂上乾燥,過濾並在真空中濃縮至乾燥。將殘餘物藉由矽膠60上之管柱層析(梯度100% Hex→50% EtOAc/Hex)純化以得到無色油狀11-(2,6-雙(羥甲基)-4-甲基苯氧基)十一烷酸甲酯44(1.6g,27%)。
步驟2. 製備11-(2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-6-(羥甲基)-4-甲基苯氧基)十一烷酸甲酯45
Figure 107112376-A0202-12-0110-749
向11-(2,6-雙(羥甲基)-4-甲基苯氧基)十一烷酸甲酯44(1.5g,4.1mmol)於無水吡啶(20mL)中之溶液中添加4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(1.4g,4.1mmol)。將該溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將該溶液在真空中濃縮至乾燥並藉由矽膠60上之管柱層析(0.5至1%於CH2Cl2中之MeOH)純化以得到淺黃色固體狀11-(2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-6-(羥甲基)-4-甲基苯氧基)十一烷酸甲酯45(1.1g,40%)。
步驟3. 製備11-(2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-6-(羥甲基)-4-甲基苯氧基)十一烷酸鋰46
Figure 107112376-A0202-12-0110-748
向11-(2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-6-(羥甲基)-4-甲基苯氧基)十一烷酸甲酯45(1.1g,1.7mmol)於無水四氫呋喃(40mL)及水(10mL)中之溶液中添加氫氧化鋰(44mg,1.8mmol)。將該溶液在真空下濃縮以去除所有四氫呋喃。將剩餘的水溶液在液氮上急速冷凍,然後凍乾過夜以得到淺粉色固體狀11-(2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-6-(羥甲基)-4-甲基苯氧基)十一烷酸 鋰46(1.1g,94%)。
步驟4. 製備化合物47
10(1.33g,0.66mmol)、46(0.5g,0.73mmol)、HBTU(400mg,1mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(25mL)中之溶液中添加二異丙基乙胺(0.35mL,2mmol)。將該溶液在室溫下攪拌過夜(18小時)。完成後,在真空下去除溶劑並將殘餘物藉由矽膠上之管柱層析(梯度:100% CH2Cl2-5%-10%-15%於CH2Cl2中之MeOH)純化以得到無色固體狀47(710mg,41%)。
步驟5. 製備化合物48
47(0.71g,0.3mmol)、三乙胺(0.4mL,3.0mmol)及聚苯乙烯-DMAP(3mmol/g負載,200mg,0.6mmol)於二氯甲烷(15mL)中之溶液中添加琥珀酸酐(60mg,0.6mmol)。將溶液在室溫下攪拌過夜並在完成後過濾並在真空中濃縮至乾燥。將殘餘物藉由矽膠60上之管柱層析(梯度5%至20%於CH2Cl2中之MeOH)純化以得到淺黃色固體狀48(570mg,70%)。1H NMR(DMSO-d6,400MHz)δ 7.91(m,1H),7.86-7.76(m,6H),7.45-7.40(m,2H),7.36-7.14(m,10H),7.10(s,1H),6.91(d,J=8.9Hz,4H),5.21(d,J=3.3Hz,3H),5.01(s,2H),4.97(dd,J=11.2,3.4Hz,3H),4.56(d,J=8.5Hz,3H),4.06-3.98(m,11H),3.93-3.84(m,3H),3.81-3.72(m,3H),3.74(s,6H),3.65-3.46(m,38H),3.40-3.35(m,6H),3.20-3.16(m,6H),2.56-2.44(m,4H),2.33(s,3H),2.15-2.08(m,2H),2.10(s,9H),2.04-1.96(m,6H),1.89(s,9H),1.82-1.76(m,4H),1.77(s,9H),1.54-1.34(m,4H),1.28-1.10(m,12H),
步驟6. 製備化合物49
48(100mg,40μmol)、N-羥基琥珀醯亞胺(30mg/mL於乙腈中之溶液,50μL,13μmol)、N,N'-二異丙基碳二亞胺(40μL,264μmol)及吡啶(50μL)於二氯甲烷(2mL)及乙腈(3mL)中之溶液中添加1000Å lcaa CPG(prime synthesis,920mg)。將該溶液在室溫下在軌道式震盪器上攪拌過夜。反應溶液之TLC分析 顯示僅部分消耗活化之N-羥基琥珀酸酯,因此添加其他CPG(500mg)。將溶液再次攪拌過夜。完成後,將CPG過濾並用二氯甲烷(25mL)、乙腈(25mL)及四氫呋喃(25mL)洗滌。將CPG上未反應之胺殘餘物藉由添加乙酸酐於乙腈(3mL)中及10% N-甲基咪唑/10%吡啶於四氫呋喃(3mL)中之1:1溶液乙醯化(封端)。將懸浮液靜置2小時,然後過濾並用等份的四氫呋喃(25mL)、乙腈(25mL)及二氯甲烷(25mL)沖洗。將負載之CPG 49在高真空下乾燥過夜。使用標準DMT負載分析(3%於CH2Cl2中之三氯乙酸,UV-VIS,A504),測定配體負載效率為22μmol/g。
步驟7. 製備偶聯物43
將所得GalNAc負載之CPG固體載體49用於使用標準程序之自動寡核苷酸合成中。進行核苷酸去保護,隨後自固體載體去除(同時進行乙酸半乳糖胺去保護)得到GalNAc-寡核苷酸偶聯物43。
實例6. 合成偶聯物50
Figure 107112376-A0202-12-0112-750
方案14.
Figure 107112376-A0202-12-0113-752
步驟1. 製備2-((2-((第三丁基二甲基矽基)氧基)乙基)胺基)乙-1-醇51
Figure 107112376-A0202-12-0113-753
將乙醇胺(77mL,1.25mol)及(2-溴乙氧基)-第三丁基二甲基矽烷(15g,62.7mmol)於無水乙腈(200mL)中之溶液回流3小時。完成後,使反應物冷卻至室溫,用水(400mL)稀釋並用乙酸乙酯(3 x 150mL)萃取。將合併之乙酸乙酯萃取物在硫酸鎂上乾燥,過濾並在真空中濃縮至乾燥。藉由二氧化矽墊首先用50%乙酸乙酯/己烷、然後用50% MeOH/EtOAc過濾來純化殘餘物以得到淺黃色油狀51(14g,100%)。
步驟2. 製備2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-N-(2-((第三丁基二甲基矽基)氧基)乙基)乙-1-胺52
Figure 107112376-A0202-12-0113-751
向2-((2-((第三丁基二甲基矽基)氧基)乙基)胺基)乙-1-醇51(14g,64mmol)及三乙胺(17.5mL,128mmol)於無水二氯甲烷(250mL)中之溶液中添加4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(24g,70mmol)。將該溶液在室溫下攪拌過夜,然後在真空中濃縮至乾燥。將殘餘物溶解於乙酸乙酯(300mL)中並用水(250mL)及鹽水(250mL)洗滌。將乙酸乙酯在硫酸鎂上乾燥,過濾並在真空中濃縮至乾燥。藉由矽膠60上之管柱層析(1%至5%於CH2Cl2中之MeOH)純化得到淺黃色黏性油狀52(13g,39%)。
步驟3. 製備10-((2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙基)(2-((第三丁基二甲基矽基)氧基)乙基)胺基)-10-側氧基癸酸甲酯53
Figure 107112376-A0202-12-0114-754
將2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-N-(2-((第三丁基二甲基矽基)氧基)乙基)乙-1-胺52(5.4g,10.3mmol)、癸二酸單甲酯(2.2g,10.3g)、HBTU(4.9g,12.9mmol)、DIPEA(5.3mL,30.9mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(100mL)中之溶液在室溫下攪拌3小時。完成後,將溶液傾倒至水(400mL)中並用乙酸乙酯(1 x 500mL)萃取。將乙酸乙酯萃取物用鹽水(2 x 250mL)洗滌,在硫酸鎂上乾燥,過濾並在真空中濃縮至乾燥。藉由矽膠60上之管柱層析(10%至25%於己烷中之乙酸乙酯)純化得到黏性黃色油狀53(6.5g,87%)。
步驟4. 製備10-((2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙基)(2-羥基乙基)胺基)-10-側氧基癸酸甲酯54
Figure 107112376-A0202-12-0114-755
向10-((2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙基)(2-((第三丁基二甲基矽基)氧基)乙基)胺基)-10-側氧基癸酸甲酯53(2.0g,2.8mmol)及三乙胺(1mL)於無水四氫呋喃(20mL)中之溶液中添加TBAF(1M於THF中,3.4mL,3.3mmol)。 將溶液攪拌6h,但藉由TLC(5%於CH2Cl2中之MeOH)觀察到只有一部分轉化。添加另外1.7mL TBAF並將溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將溶液在真空中濃縮並藉由矽膠60上之管柱層析(10%至50%於己烷中之EtOAc,然後100% EtOAc)純化以得到黏性無色油狀54(0.5g,29%)。
步驟5. 製備10-((2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙基)(2-羥基乙基)胺基)-10-側氧基癸酸鋰55
Figure 107112376-A0202-12-0115-756
向10-((2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙基)(2-羥基乙基)胺基)-10-側氧基癸酸甲酯54(0.5g,0.83mmol)於THF(40mL)中之溶液中添加水(10mL)及氫氧化鋰(24mg,1.0mmol)。將該溶液在室溫下攪拌過夜,然後在真空中濃縮以去除THF。將剩餘的水溶液在液氮上快速冷凍並凍乾以得到無色固體狀55(485mg,95%)。
步驟6. 製備化合物56、57、58及50
嚴格使用與用於合成化合物47484943之彼等程序一致之程序來製備化合物56575850。
實例7. 合成偶聯物59
Figure 107112376-A0202-12-0115-757
方案16.
Figure 107112376-A0202-12-0116-758
步驟1. 製備(2R,5R)-5-羥基六氫吡啶-2-甲酸甲酯61
Figure 107112376-A0202-12-0116-759
將(2R,5R)-5-羥基六氫吡啶-2-甲酸60(3.5g,24.1mmol)溶解於MeOH(50mL)中。使HCl(g)鼓泡穿過溶液2min,並將反應物在回流下攪拌1.5h。將反應物在真空中濃縮以定量產率得到(2R,5R)-5-羥基六氫吡啶-2-甲酸甲酯61,其不經進一步純化即使用。
步驟2. 製備(2R,5R)-5-羥基六氫吡啶-1,2-二甲酸1-(第三丁基)酯2-甲酯62
Figure 107112376-A0202-12-0116-760
將(2R,5R)-5-羥基六氫吡啶-2-甲酸甲酯61(24.1mmol)及TEA(7.2mL,53.02mmol)在室溫下在DCM(100mL)中攪拌。逐份添加二碳酸二第三丁基酯(5.7g,26.5mmol)並將反應物攪拌2h。將反應物用DCM(100mL)稀釋並用1M HCl(2 x 75mL)、飽和NaHCO3(2 x 75mL)、H2O(2 x 75mL)及飽和NaCl溶液(2 x75mL)依序洗滌。將有機物分離,乾燥(Na2SO4)並在真空中濃縮以得到(2R,5R)-5-羥基六氫吡啶-1,2-二甲酸1-(第三丁基)酯2-甲酯62(5.53g,88%),其不經進一步純化即使用。
步驟3. 製備(2R,5R)-5-羥基-2-(羥甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯63
Figure 107112376-A0202-12-0117-761
將(2R,5R)-1-(第三丁氧基羰基)-5-羥基六氫吡啶-2-甲酸62(5.53g,21.4mmol)在0℃下在THF中攪拌。經1h逐滴添加LiBH4(3.0M於THF中之溶液)(8.9mL,27.7mmol)。使反應物升溫至室溫並繼續攪拌16h。將反應物用1M NaOH淬滅,在真空中去除THF並用EtOAc(10 x 100mL)將水溶液澈底萃取。將合併之有機物用H2O(50mL)、飽和NaCl溶液(2 x 50mL)洗滌,乾燥(Na2SO4)並在真空中濃縮以得到(2R,5R)-5-羥基-2-(羥甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯63(2.4g,49.0%),其不經進一步純化即使用。
步驟4. 製備(3R,6R)-6-(羥甲基)六氫吡啶-3-醇64
Figure 107112376-A0202-12-0117-811
將(2R,5R)-5-羥基-2-(羥甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯63(2.4g,10.4mmol)在室溫下在Et2O中攪拌。使HCl(g)鼓泡穿過達45s,並將反應物在室溫下攪拌45min。將反應物在真空中濃縮並在高真空下乾燥以得到(3R,6R)-6-(羥甲基)六氫吡啶-3-醇64。該產物不經進一步純化即使用。
步驟5. 製備2,2,2-三氟-1-((2R,5R)-5-羥基-2-(羥甲基)六氫吡啶-1-基)乙-1-酮65
Figure 107112376-A0202-12-0117-763
將來自先前反應之粗製(3R,6R)-6-(羥甲基)六氫吡啶-3-醇64在室溫下 在含有TEA(3.5mL,25.2mmol)之MeCN(50mL)中攪拌。添加三氟乙酸乙酯(3mL,25.2mmol)並將反應物在室溫下攪拌16hr,然後在真空中濃縮以得到2,2,2-三氟-1-((2R,5R)-5-羥基-2-(羥甲基)六氫吡啶-1-基)乙-1-酮65。該產物不經進一步純化即使用。
步驟6. 製備1-((2R,5R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-羥基六氫吡啶-1-基)-2,2,2-三氟乙-1-酮66
Figure 107112376-A0202-12-0118-812
將來自先前反應之粗製2,2,2-三氟-1-((2R,5R)-5-羥基-2-(羥甲基)六氫吡啶-1-基)乙-1-酮65在室溫下在含有TEA(50mL)之DCM中攪拌。一次性添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(DMTrCl)(3.87g,11.44mmol),並將反應物在室溫下攪拌3小時。將反應物用DCM(50mL)稀釋,並用飽和NaHCO3(2 x 75mL)、H2O(2 x 75mL)及飽和NaCl溶液(2 x75mL)依序洗滌。將有機物分離,乾燥(Na2SO4),在真空中濃縮並藉由管柱層析(100%己烷-60% EtOAc/己烷)(0.1% TEA)純化以得到1-((2R,5R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-羥基六氫吡啶-1-基)-2,2,2-三氟乙-1-酮66(3.14g,57%)
步驟7. 製備(3R,6R)-6-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-六氫吡啶-3-醇67
Figure 107112376-A0202-12-0118-765
將1-((2R,5R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-羥基六氫吡啶-1-基)-2,2,2-三氟乙-1-酮66(3.14g,6.0mmol)在室溫下在MeOH(50mL)中攪拌。添加KOH(672mg,12mmol),並將反應物在室溫下攪拌16小時。添加另外的KOH(300mg,6mmol),並繼續再攪拌24h。將反應物在真空中濃縮,吸收於DCM(150mL)中,用H2O(4 x 50mL)洗滌,乾燥(Na2SO4)並在真空中濃縮以得到(3R,6R)-6-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)六氫吡啶-3-醇67(2.34g, 90%),其不經進一步純化即使用。
步驟8. 製備12-((2R,5R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)-甲氧基)甲基)-5-羥基六氫吡啶-1基)-12-側氧基十二烷酸甲酯68
Figure 107112376-A0202-12-0119-766
將(3R,6R)-6-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)六氫吡啶-3-醇67(2.34g,5.34mmol)在室溫下在DCM(75mL)中攪拌。添加三乙胺(2.2mL,16.2mmol)、HATU(3.5g,9.2mmol)及12-甲氧基-12-側氧基十二烷酸(1.32g,5.4mmol),並將反應物在室溫下攪拌3h。將所得固體沈澱物藉由過濾去除,將濾液在真空中濃縮並將殘餘物藉由管柱層析(2.5%MeOH/DCM,0.1% TEA)純化,從而以定量產率得到12-((2R,5R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-羥基六氫吡啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸甲酯68。
步驟9. 製備12-((2R,5R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-甲基)-5-羥基六氫吡啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸鋰69
Figure 107112376-A0202-12-0119-767
將12-((2R,5R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-羥基六氫吡啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸甲酯68(5.4mmol)及LiOH(140mg,5.94mmol)在室溫下在THF:H2O(1:1,100mL)中攪拌48h。在真空中去除THF,將水溶液冷凍並凍乾以得到12-((2R,5R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-羥基六氫吡啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸鋰69(3.2g,91%)。其不經另外的純化即用於後續反應中。
步驟10. 製備化合物70、71、72及59
嚴格使用與用於合成化合物47484943之彼等程序一致之程序來製備化合物70、71、7259。
實例8. 合成偶聯物142
Figure 107112376-A0202-12-0120-768
方案18.
Figure 107112376-A0202-12-0121-769
步驟1. 製備3,4,5-三乙醯氧基苯甲酸73
向沒食子酸(20g)於吡啶(50mL)及乙酸酐(50mL)中之溶液。將該溶液在室溫下攪拌過夜,然後傾倒至冰水(1L)中。用濃鹽酸使溶液呈酸性,因此沈澱出無色固體。經由過濾收集固體並用水(5 x 100mL)洗滌。將濕固體在液氮上冷凍並冷凍乾燥以得到3,4,5-三乙醯氧基苯甲酸(26g,75%)。
步驟2. 製備三乙酸5-((2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙基)胺甲醯基)苯-1,2,3-三基酯74
向3,4,5-三乙醯氧基苯甲酸(10g,33.8mmol)、N-苄氧羰基-1,2-二胺基乙烷鹽酸鹽(5.3g,33.8mmol)及HBTU(13.5g,35.5mmol)於DMF(200mL)中之溶液中添加DIPEA(17.5mL,101mmol)。將該溶液攪拌16小時,然後用乙酸乙酯(250mL)稀釋,用鹽水(3 x 200mL)洗滌,在硫酸鎂上乾燥,過濾並在真空中濃縮至乾燥。將粗製產物藉由矽膠上之管柱層析(梯度1%至5%於DCM中之MeOH)純化以得到灰白色固體狀三乙酸5-((2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙基)胺甲醯基)苯-1,2,3-三基酯(5.5g)。
步驟3. 製備3,4,5-三羥基-N-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙基)苯甲醯胺75
將三乙酸5-((2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙基)胺甲醯基)苯-1,2,3-三基酯(5g,1.1mmol)於1:1 MeOH/CH2Cl2(100mL)中之溶液在室溫下攪拌3天。完成後,去除溶劑以得到無色固體狀3,4,5-三羥基-N-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙基)苯甲醯胺(4g,定量)。
步驟4. 製備2,2',2"-((5-((2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙基)胺甲醯基)苯-1,2,3-三基)三(氧基))三乙酸三甲酯76
將3,4,5-三羥基-N-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙基)苯甲醯胺(4g,11.6mmol)、溴乙酸甲酯(7.7g,46.4mmol)及碳酸鉀(9.6g,69.4mmol)於DMF(100mL)中之溶液在60℃下攪拌過夜。完成後,使該溶液冷卻至室溫,用乙酸乙酯(200mL)稀釋,用水(200mL)、鹽水(3 x 100mL)洗滌,在硫酸鎂上乾燥,過濾並在真空中濃縮至乾燥。將粗製產物藉由矽膠上之管柱層析(梯度2%至10%於DCM中之MeOH)純化以得到米色固體狀2,2',2"-((5-((2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙基)胺甲醯基)苯-1,2,3-三基)三(氧基))-三乙酸三甲酯(5g,79%)
步驟5. 製備2,2',2"-((5-((2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙基)-胺甲醯基)苯-1,2,3-三基)三(氧基))三乙酸77
將2,2',2"-((5-((2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙基)-胺甲醯基)苯-1,2,3-三基)三(氧基))三乙酸三甲酯(5g,9.2mmol)及1M NaOH(30mL)於甲醇(100mL)中之溶液在室溫下攪拌2小時。完成後,將反應物濃縮以去除甲醇,並用水(75mL)稀釋。使混合物冷卻至0℃,用2M HCl酸化並用乙酸乙酯(5 x 150mL)萃取。將合併之乙酸乙酯萃取物在硫酸鎂上乾燥,過濾並在真空中濃縮至乾燥以得到無色固體狀2,2',2"-((5-((2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙基)胺甲醯基)苯-1,2,3-三基)三(氧基))三乙酸(2.3g,50%)。
步驟6. 製備化合物78
使用與用於化合物13之程序一致之程序,自化合物9(2.75g,4.3mmol)及77(0.5g,0.96mmol)製備化合物78。產量:600mg。
步驟7. 製備化合物79
使用與用於化合物14之程序一致之程序,自化合物78(0.6g)製備化合物79。產量:500mg。
步驟8. 製備化合物140
使用與用於化合物19之程序一致之程序,自化合物79(500mg,0.25mmol)及化合物18(175mg,0.25mmol)製備化合物140。產率:250mg,44%。
步驟9. 製備化合物141
使用與用於化合物20之程序一致之程序,自化合物140(250mg,0.11mmol)製備化合物141。產量:200mg。
步驟10. 製備偶聯物142
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物141(200mg)及1000A lcaa CPG(1.8g)製備偶聯物142。產量:1.9g,22μmol/g CPG負載。將所得GalNAc負載之CPG固體載體用於使用標準程序之自動寡核苷酸合成中。進行核苷酸去保護,隨後自固體載體去除(同時進行乙酸半乳糖胺去保護)得到GalNAc-寡核苷酸偶聯物142。
實例9. 合成偶聯物145
方案19.
Figure 107112376-A0202-12-0124-770
Figure 107112376-A0202-12-0124-771
步驟1. 製備外消旋(順式)5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)-二酮123
向3,4-二甲基呋喃-2,5-二酮(3g,24mmol)及N-苄基-1-甲氧基-N-((三甲基矽基)甲基)甲胺(7g,29.8mmol)於二氯甲烷(75mL)中之冷卻溶液(0℃)中緩慢添加三氟乙酸(75μL)。攪拌過夜,隨著冰浴融化使溶液緩慢升溫至室溫。將反應混合物濃縮至乾燥,溶解於乙酸乙酯(100mL)中,用飽和碳酸氫鈉(2 x 100mL)洗滌,在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥。藉由矽膠上之管柱層析(梯度:20%於己烷中之乙酸乙酯至100%乙酸乙酯)純化得到黃色油狀外消旋(順式)5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)-二酮(3.5g,56%)。
步驟2. 製備外消旋(順式)1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇124
向(3aR,6aS)-5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)- 二酮(3.5g,13.4mmol)於無水乙醚(50mL)中之冷卻(0℃)溶液中分三部分緩慢添加氫化鋁鋰糰粒(1.5g,40mmol)。將溶液攪拌過夜,隨著冰水浴融化而升溫至室溫。完成後,使反應物冷卻至0℃並用1.5mL 5M NaOH、然後1.5mL水極其緩慢地淬滅。攪拌30分鐘,然後添加硫酸鎂並過濾。將濾液濃縮以得到無色油狀外消旋(順式)1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(2.7g)。
步驟3. 製備外消旋(順式)3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇125
向((3R,4S)-1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(10g,40mmol)於甲醇(10mL)中之溶液中添加濕的活性炭載10%鈀(1g)。將溶液在氫氣氛下劇烈攪拌16小時。完成後,將溶液藉助Celite過濾,並濃縮至乾燥以得到無色固體狀外消旋(順式)3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(5.5g,86%)。
步驟4. 製備外消旋(順式)10-(3,4-雙(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸甲酯126
使用與用於化合物17之程序一致之程序自化合物125(1.3g,8.2mmol)及癸二酸單甲酯(1.8g,8.2mmol)製備化合物126。產率:1.8g,61%。
步驟5. 製備外消旋(順式)10-(3-((雙(4-甲氧基苯基-)(苯基)甲氧基)-甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸甲酯127
使用與用於化合物18之程序一致之程序自126(1.8g,5.0mmol)及4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(1.7g,5.0mmol)製備化合物127。產率:1.4g,42%。
步驟6. 製備外消旋(順式)10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)-(苯基)甲氧基)-甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸鋰128
向化合物127(3.0g,4.6mmol)於THF(50mL)及水(50mL)中之溶液中添加氫氧化鋰(121mg,5.0mmol)。將該溶液在室溫下攪拌4小時,然後濃縮以去除THF。將剩餘的水溶液冷凍乾燥過夜以得到淺粉色固體(2.9g,定量)。
步驟7. 製備化合物143
使用與用於化合物19之程序一致之程序自128(270mg,0.42mmol)及化合物14(800mg,0.42mmol)製備化合物143。產率:900mg,87%。
步驟8. 製備化合物144
使用與用於化合物20之程序一致之程序自化合物143(500mg,0.2mmol)製備化合物144。產量:200mg。
步驟9. 製備偶聯物145
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物144(200mg)及1000A lcaa CPG(1.8g)製備化合物145。產率:1.9g,20μmol/g CPG負載。使用標準程序,將所得GalNAc負載之CPG固體載體用於自動寡核苷酸合成中。進行核苷酸去保護,隨後自固體載體去除(同時進行乙酸半乳糖胺去保護)得到GalNAc-寡核苷酸偶聯物145。
實例10. 合成偶聯物150
方案21.
Figure 107112376-A0202-12-0127-772
步驟1. 製備146-1
向十二烷二酸單甲酯(12.2g,50.0mmol)於二氯甲烷(300mL)中之溶液中添加N-羥基琥珀醯亞胺(6.10g,53.0mmol)及1-乙基-3-(3-二甲基胺基丙基)碳二亞胺鹽酸鹽(EDC)(10.52g,55.0mmol)。將混濁混合物在室溫下攪拌過夜,並且反應物變成澄清溶液。TLC指示反應完成。將有機物用飽和NH4Cl(300mL)及鹽水(100mL)洗滌。將有機層分離、經MgSO4乾燥並濃縮至乾燥以得到白色固體狀純淨十二烷二酸1-(2,5-二側氧基吡咯啶-1-基)酯12-甲酯146-1(16.7g,97.8%)。
步驟2. 製備環戊-3-烯-1-基甲醇146-2
經5hr在0℃下在氮氣下向氫化鋁鋰(15.2g,0.40mol)於無水乙醚(1L)中之懸浮液中逐滴添加環戊-3-烯甲酸甲酯(50g,0.40mol)於乙醚(300mL)中之 溶液。將懸浮液在室溫下攪拌過夜。TLC指示反應完成。使反應物再冷卻至0℃。逐滴添加Na2SO4(32mL)之飽和溶液以淬滅反應物。在完成添加後,將混合物再攪拌3h,並藉助celite墊過濾。蒸發溶劑得到無色液體狀環戊-3-烯基甲醇146-2(37.3g,95%)。
步驟3. 製備(6-氧雜雙環[3.1.0]己烷-3-基)甲醇146-3
在0℃下向環戊-3-烯基甲醇146-2(4.0g,41mmol)於二氯甲烷(150mL)中之溶液中逐份添加3-氯過苯甲酸(10g,45mmol,77%純度)。將反應物攪拌過夜。添加二氯甲烷(150mL)。將有機物用硫代硫酸鈉(12g於10mL水中)、隨後飽和NaHCO3(40mL)洗滌。重複此過程,直至洗掉所有剩餘的3-氯過苯甲酸為止。將有機物經MgSO4乾燥。蒸發溶劑得到黃色油狀順式-及反式-6-氧雜雙環[3.1.0]己烷-3-基甲醇之混合物146-3(2.6g,57%)。GC-MS:m/z 114(5)(M+),95(15),88(100),81(15)。
步驟4. 製備2-胺基-4-(羥甲基)環戊-1-醇146-4
在0℃下向6-氧雜雙環[3.1.0]己烷-3-基甲醇146-3(2.0g,17.6mmol)於甲醇(20mL)中之溶液中吹掃氨氣持續10min。將反應物在室溫下攪拌過夜。TLC指示反應未完成。去除甲醇並添加NH3.H2O(50mL),並將此在室溫下攪拌一週。TLC證實反應完成。藉由與乙醇共沸來去除水以得到黃色油狀2-胺基-4-(羥甲基)環戊醇146-4(2.1g,91%)。
步驟5. 製備12-(2-羥基-4-(羥甲基)環戊基基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯146-5
使用與12-(2-(第三丁氧基羰基胺基)乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸酯(3-2)之合成中所闡述相同之程序自2-胺基-4-(羥甲基)環戊醇146-4及十二烷二酸1-(2,5-二側氧基吡咯啶-1-基)酯12-甲酯146-1製備化合物146-5。以87.4%產率獲得灰白色固體狀12-(2-羥基-4-(羥甲基)環戊基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯146-5。
步驟6. 製備化合物147
使用與用於化合物18之程序一致之程序自化合物146(1.4g,2.33mmol)定量製備化合物147。
步驟7. 製備化合物148
使用與用於化合物19之程序一致之程序自化合物147(150mg,0.23mmol)及化合物14(431mg,0.23mmol)製備化合物148。產率:460mg,84%。
步驟8. 製備化合物149
使用與用於化合物20之程序一致之程序自化合物148(460mg,0.19mmol)製備化合物149。產率:436mg,91%。
步驟9. 製備偶聯物150
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物149(436mg)及1000A lcaa CPG(2.62g)製備化合物150。產量:2.7g,21.3μmol/gCPG負載。將所得GalNAc負載之CPG固體載體用於使用標準程序之自動寡核苷酸合成中。進行核苷酸去保護,隨後自固體載體去除(同時進行乙酸半乳糖胺去保護)得到GalNAc-寡核苷酸偶聯物150
實例11. 合成偶聯物153、158、163、168及173
方案22.
Figure 107112376-A0202-12-0130-773
步驟1. 製備(2S,4R)-4-羥基吡咯啶-1,2-二甲酸1-(第三丁基)酯2-甲酯(133)
將(2S,4R)-4-羥基吡咯啶-2-甲酸甲酯(25.9g,46mmol)、BOC酸酐(65.9g,302.5mmol)及TEA(42ml,302.5mmol)在室溫下在DCM中攪拌16h。將有機物用1M HCl(x2)、飽和NaHCO3(x2)、H2O及鹽水依序洗滌乾燥並在真空中濃縮以得到(2S,4R)-4-羥基吡咯啶-1,2-二甲酸1-(第三丁基)酯2-甲酯(133)(58.1g,85%)。
步驟2. 製備(4R)-4-羥基-2-甲基吡咯啶-1,2-二甲酸1-(第三丁基)酯2-甲酯(134)
將(2S,4R)-4-羥基吡咯啶-1,2-二甲酸1-(第三丁基)酯2-甲酯(133)(5g,20.4mmol)及MeI(12g,84.5mmol)在-40℃下在無水THF中攪拌。逐滴添加LDA(2.0M於THF中之溶液)(37.5mL,75mmol)。使反應物升溫至室溫並攪拌4h,然後用飽和NH4Cl淬滅。將反應物用EtOAc萃取,用H2O及鹽水洗滌,乾燥(Na2SO4)並在真空中濃縮。將殘餘物藉由管柱層析50:50 EtOAc//己烷純化以得到 呈外消旋混合物之(4R)-4-羥基-2-甲基吡咯啶-1,2-二甲酸1-(第三丁基)酯2-甲酯(134)(3.6g,68%)
步驟3. 製備(2S,4R)-4-羥基-2-(羥甲基)-2-甲基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(135a)
將(4R)-4-羥基-2-甲基吡咯啶-1,2-二甲酸1-(第三丁基)酯2-甲酯(134)(19g,73.5mmol)在無水THF中在N2下攪拌。逐滴添加LiBH4溶液(48ml,96mmol)並將反應物在室溫下攪拌48h。將反應物用1M NaOH淬滅,在真空中去除THF並將殘餘物用EtOAc(4 x 100ml)萃取。將有機物用H2O及鹽水洗滌,乾燥(Na2SO4)並在真空中濃縮。將殘餘物藉由管柱層析(5% MeOH/DCM)純化以得到作為主要產物之(2S,4R)-4-羥基-2-(羥甲基)-2-甲基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(135a)(8g,47%)。根據文獻參考指定結構。
步驟4. 製備(3R,5S)-5-(羥甲基)-5-甲基吡咯啶-3-醇鹽酸鹽(136)
將(2S,4R)-4-羥基-2-(羥甲基)-2-甲基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(135a)(8g,34.6mmol)在室溫下在EtOAc中攪拌並施加氣態HCl持續約2分鐘。將反應物攪拌1小時,然後在真空中濃縮並在高真空下乾燥,從而以定量方式得到(3R,5S)-5-(羥甲基)-5-甲基吡咯啶-3-醇鹽酸鹽(136)
步驟5. 製備12-((2S,4R)-4-羥基-2-(羥甲基)-2-甲基吡咯啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸甲酯(137)
將(3R,5S)-5-(羥甲基)-5-甲基吡咯啶-3-醇鹽酸鹽(136)(7.9g,47.4mmol)、12-甲氧基-12-側氧基十二烷酸(11.5g,47.4mmol)、HBTU(36g,76mmol)及TEA 20mL,142.2mmol)在室溫下在DCM中攪拌16h。將沈澱物藉由過濾去除,並將有機物用1M HCl(x2)、飽和NaHCO3(x2)、H2O及鹽水洗滌。在乾燥後,將有機物在真空中濃縮並藉由管柱層析(5% MeOH/DCM)純化以得到12-((2S,4R)-4-羥基-2-(羥甲基)-2-甲基吡咯啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸甲酯(137)(3.1g,18.3%)。
步驟6. 製備12-((2S,4R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-甲基)-4-羥基-2-甲基吡咯啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸甲酯(138)
將12-((2S,4R)-4-羥基-2-(羥甲基)-2-甲基吡咯啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸甲酯(137)(3.1g,9.0mmol)、DMTr-Cl(2.8g,8.2mmol)及TEA(1.1ml,8.2mmol)在室溫下在DC<中攪拌16h。將反應物在真空中濃縮並將殘餘物藉由管柱層析(5% MeOH/DCM,0.1%TEA)純化以得到12-((2S,4R)-2-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羥基-2-甲基吡咯啶-1-基)-l2-側氧基十二烷酸甲酯(138)(2.7g,45.5mmol)。
Figure 107112376-A0202-12-0132-774
步驟7. 製備化合物154-1
在0℃下在氮氣下向N-(2-羥基乙基)鄰苯二甲醯亞胺(4.80g,25.0mmol)及4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(8.8g,26.0mmol)於二氯甲烷(200mL)中之溶液中逐滴添加三乙胺(10.4mL,74.6mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌3h。TLC指示反應完成。將有機層用鹽水(100mL)洗滌,經MgSO4乾燥並濃縮至乾燥。其不經純化即直接用於下一反應。
步驟8. 製備化合物154-2
將於乙醇(100mL)中之上文所獲得之2-(2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲 氧基)乙基)異吲哚啉-1,3-二酮(154-1)及肼一水合物(3.6mL,74mmol)在室溫下攪拌過夜。TLC指示反應完成。濾出沈澱物。蒸發濾液。藉由乙酸乙酯(100mL)吸收殘餘物。將有機溶液用10% NaOH、水及鹽水洗滌,並經MgSO4乾燥。蒸發溶劑得到黃色液體狀2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙胺(154-2)(8.11g,89.3%產率,經兩個步驟)。此不經進一步純化即用於下一反應。
步驟9. 製備化合物154-3
向L-蘇胺酸(1.19g,10.0mmol)及NaHCO3(2.3g,27mmol)於水(20mL)及二噁烷(10mL)中之溶液中逐滴添加於二噁烷(10mL)中之十二烷二酸1-(2,5-二側氧基吡咯啶-1-基)酯12-甲酯146-1(3.1g,9.1mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌過夜。添加4N HCl(10mL)。將沈澱物藉由過濾收集並用水(3 x 10mL)洗滌。將固體於乾燥器中經P2O5乾燥以得到灰白色固體狀(2S,3R)-3-羥基-2-(12-甲氧基-12-側氧基十二烷醯胺基)丁酸154-3(2.84g,82.2%)。LC-MS(ESI):m/z:346(100),(M+H+)。
步驟10. 製備化合物154
將(2S,3R)-3-羥基-2-(12-甲氧基-12-側氧基十二烷醯胺基)丁酸154-3(2.47g,7.15mmol)、2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙胺154-2(2.60g,7.15mmol)、EDC(1.64g,8.58mmol)、1-羥基苯并三唑(HOBt)(1.16g,8.58mmol)及TEA(2.4mL,17.2mmol)在室溫下在二氯甲烷(72mL)中攪拌2h。添加水(30mL)。將有機層分離並用鹽水(2 x30mL)洗滌。蒸發溶劑,隨後進行管柱層析(30%乙酸乙酯/己烷-50%乙酸乙酯/己烷)得到蠟狀黃色半固體狀12-((2S,3R)-1-(2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙基胺基)-3-羥基-1-側氧基丁烷-2-基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯154(2.60g,52.6%)。1HNMR(400MHz,丙酮-d6,ppm):δ 7.51(t,J=5.5Hz,1H),7.45-7.49(m,2H),7.28-7.36(m,6H),7.21(tt,J=7.2,1.2Hz,1H),7.08(d,J=8.1Hz,1H),6.88(dt,J=8.9,2.5Hz,4H),4.39(dd,J=8.2,3.0Hz,1H), 4.20-4.27(m,1H),3.78(s,6H),3.60(s,1H),3.35-3.52(m,2H),3.07-3.16(m,2H),2.23-2.37(m,4H),1.53-1.65(m,4H),1.23-1.36(m,12H),1.10(d,J=6.4Hz,3H)。
Figure 107112376-A0202-12-0134-775
步驟11. 製備化合物164-1
向第三丁醇鉀(14.6g,130mol)於THF(120mL)/乙醚(360mL)中之懸浮液中添加甲基三苯基溴化鏻(46.6g,130mmol)。將混合物回流2hr,且然後冷卻至0℃。逐滴添加於乙醚(50mL)中之2-甲醯基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(13.0g,65.2mmol)。將反應混合物在0℃下攪拌,且然後藉由添加水(250mL)淬滅。將有機層分離並將水溶液用乙醚(250mL)萃取。將合併之萃取物經MgSO4乾燥。蒸發溶劑,隨後藉由管柱層析純化(5%乙酸乙酯/己烷)得到無色液體狀3-乙烯基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯164-1(11.5g,89.4%)。GC-MS:m/z:197(2)(M+),141(40),124(30),57(100)。
步驟12. 製備化合物164-2
t-BuOH(140mL)及水(70mL)之混合物中裝填AD-mix-β(47.4g)及甲磺醯胺(2.89g,30.4mmol)。將混合物在室溫下攪拌30min,且然後冷卻至0℃。添加3-乙烯基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯164-1(6.00g,30.4mmol)。將反應物在室溫下攪拌過夜。使反應混合物冷卻至0℃。添加硫代硫酸鈉五水合物(96g,387mmol)並使溫度升溫至室溫。添加水(700mL)並將混合物用乙酸乙酯(500mL)萃 取。將萃取物用水(2 x 50mL)及鹽水(50mL)洗滌,並經MgSO4乾燥。蒸發溶劑,隨後進行管柱層析(2%甲醇/二氯甲烷-7%甲醇/二氯甲烷),得到淺褐色油狀3-(1,2-二羥基乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯164-2(5.4g,77%)。
步驟13. 製備化合物164-3
向3-(1,2-二羥基乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯164-2(3.1g,13.4mmol)於乙醇(10mL)中之溶液中添加3N HCl(30mL,90mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌過夜。TLC指示反應完成。蒸發乙醇。添加甲苯并蒸發。將此過程重複三次以得到褐色油狀1-(吡咯啶-3-基)乙烷-1,2-二醇鹽酸鹽164-3(2.0g,89%)。LC-MS(ESI):m/z:132(100),(M+H+,游離胺)。
步驟14:製備化合物164-4
向1-(吡咯啶-3-基)乙烷-1,2-二醇鹽酸鹽164-2(2.0g,12mmol)於水(30mL)中之溶液逐份添加NaHCO3(3.7g,44mmol)。然後添加二噁烷(20mL)。向上文溶液中添加於二噁烷(30mL)中之十二烷二酸1-(2,5-二側氧基吡咯啶-1-基)酯12-甲酯146-1(3.7g,11mmol)。將反應混合物攪拌過夜。將此混合物用乙酸乙酯(3 x100mL)萃取。將合併之萃取物用0.5N HCl(50mL)及鹽水(50mL)洗滌,並經MgSO4乾燥。
步驟15. 製備化合物164
使用與合成2-(2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)乙基)異吲哚啉-1,3-二酮138中所闡述相同之程序,自12-(3-(1,2-二羥基乙基)吡咯啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸甲酯164-4及4,4-二甲氧基三苯甲基氯(1當量)製備此物質。將產物藉由管柱層析(1.5%甲醇/二氯甲烷)純化。以51%產率獲得黃色油狀12-(3-(2-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-羥基乙基)吡咯啶-1-基)-12-側氧基十二烷酸甲酯164。 1HNMR(400MHz,丙酮-d6,ppm):δ 7.49-7.54(m,2H),7.35-7.40(m,4H),7.28-7.34(m,2H),7.19-7.25(m,1H),6.86-6.91(m,4H),4.11-4.20(m,1H),3.79(s, 6H),3.68-3.77(m,1H),3.60(s,3H),3.29-3.59(m,3H),3.06-3.20(m,3H),2.33-2.55(m,1H),2.29(t,J=7.4Hz,2H),2.19(t,J=7.6Hz,2H),1.65-2.0(m,2H),1.51-1.62(m,4H),1.26-1.35(m,12H)。
Figure 107112376-A0202-12-0136-776
步驟16. 製備化合物170-1
在室溫下,向2-胺基乙基胺基甲酸第三丁基酯(2.88g,18.0mmol)及三乙胺(2.98g,29.4mmol)於二氯甲烷(100mL)中之溶液中逐滴添加於二氯甲烷(50mL)中之十二烷二酸1-(2,5-二側氧基吡咯啶-1-基)酯12-甲酯(146-1)(5.09g,14.9mmol)。將反應混合物攪拌過夜並且TLC指示反應完成。添加100mL鹽水,並分離有機層。將有機層用0.5N HCl(150mL)、鹽水(2 x 100mL)洗滌,並經MgSO4乾燥。蒸發溶劑得到白色固體狀純淨12-(2-(第三丁氧基羰基胺基)乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯170-1(5.85g100%)。
步驟17. 製備化合物170-2
在0℃下向12-(2-(第三丁氧基羰基胺基)乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸酯170-1(5.55g,14.4mmol)於甲醇(100mL)中之溶液逐滴添加亞硫醯氯(3.3mL,45.5mmol)。然後將反應物在室溫下攪拌過夜。TLC指示反應完成。蒸發溶劑及揮發性有機物。然後將殘餘物與庚烷共蒸發兩次,從而定量得到白色固體狀12-(2-胺基乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯鹽酸鹽170-2。LC-MS(ESI):m/z:287(100),(M+H+,游離胺)。
步驟18. 製備化合物170-3
將於THF(50mL)及水(50mL)中之(-)-(S)-2,2-二甲基-1,3-二氧戊環-4-甲酸甲酯(5.01g,31.2mmol)及LiOH.H2O(2.55g,60.8mmol)攪拌過夜。TLC指示反應完成。蒸發THF並將水溶液用1N HCl酸化至pH=1。將此溶液用乙酸乙酯(5 x 50mL)萃取。將合併之萃取物經MgSO4乾燥。蒸發溶劑得到淡黃色液體狀(S)-2,2-二甲基-1,3-二氧戊環-4-甲酸170-3(2.93g,64.3%)。
步驟19. 製備化合物170-4
使用與合成十二烷二酸1-(2,5-二側氧基吡咯啶-1-基)酯12-甲酯146-1中所闡述相同之程序自(S)-2,2-二甲基-1,3-二氧戊環-4-甲酸170-3及N-羥基琥珀醯亞胺以86%產率合成化合物170-4。以86%產率獲得白色固體狀(S)-2,2-二甲基-1,3-二氧戊環-4-甲酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯170-4
步驟20. 製備化合物170-5
在0℃下經4h向12-(2-胺基乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯鹽酸鹽170-2(14.4mmol)及(S)-2,2-二甲基-1,3-二氧戊環-4-甲酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯170-4(3.80g,15.6mmol)於二氯甲烷(100mL)中之懸浮液中添加於二氯甲烷(25mL)中之三乙胺(6mL,43.0mmol)。然後將反應混合物在室溫下攪拌過夜。LC-MS指示起始材料170-2經完全轉化。將有機層用鹽水(50mL)、1N HCl(50mL)、鹽水(50mL)洗滌,經MgSO4乾燥並濃縮至乾燥以得到白色固體狀(S)-12-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧戊環-4-甲醯胺基)乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯170-5(5.93g,99.3%)。
步驟21. 製備化合物170-6
向(S)-12-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧戊環-4-甲醯胺基)乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯170-5(5.93g,14.3mmol)之溶液中添加一滴濃硫酸。將此混合物回流6hr,且然後冷卻至室溫。將固體藉由過濾收集並用冷甲醇洗滌兩次。將固 體在空氣中乾燥(3.32g)。自母液獲得第二批(0.42g)以得到白色晶體狀(S)-12-(2-(2,3-二羥基丙醯胺基)乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯170-6(總計3.74g,69.4%)。LC-MS(ESI):m/z:375(100),(M+H+)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6,ppm):δ 7.79(br,2H),5.49(d,J=5.3Hz,1H),4.66(t,J=5.8Hz,1H),3.83-3.88(m,1H),3.55-3.61(m,4H),3.41-3.47(m,1H),3.05-3.15(m,4H),2.29(t,J=7.4Hz,2H),2.03(t,J=7.6Hz,2H),1.42-1.52(m,4H),1.18-1.29(m,12H)。
步驟22. 製備化合物170
在氮氣下向(S)-12-(2-(2,3-二羥基丙醯胺基)乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯170-6(2.99g,7.99mmol)於無水吡啶(57.5mL)中之溶液一次性添加4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(2.84g,8.38mmol)。將反應物在室溫下攪拌2天。添加甲醇(5mL)以淬滅反應物。蒸發吡啶。添加甲苯,且然後蒸發。將此過程重複三次。添加水(100mL)並將此混合物用乙酸乙酯(5 x 250mL)萃取。將萃取物合併並經MgSO4乾燥。蒸發溶劑,隨後進行管柱層析(1%甲醇/二氯甲烷-3%甲醇/二氯甲烷),得到黏性油狀(S)-12-(2-(3-(雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-2-羥基丙醯胺基)-乙基胺基)-12-側氧基十二烷酸甲酯170(1.70g,31.4%)。1HNMR(400MHz,丙酮-d6,ppm):δ 7.64-7.70(br,1H),7.47-7.51(m,2H),7.33-7.37(m,4H),7.26-7.32(m,2H),7.20(dt,J=7.3,2.1Hz,1H),7.11(br,1H),6.86(d,J=8.7Hz,4H),4.84(br,1H),4.21(dd,J=5.1,3.8Hz,1H),3.78(s,6H),3.60(s,1H),3.25-3.42(m,6H),2.28(t,J=7.4Hz,2H),1.48-1.62(m,4H),1.21-1.34(m,12H)。
方案26.
Figure 107112376-A0202-12-0139-777
步驟23. 製備化合物139、155、160、165及170
使用與用於化合物18之程序一致之程序,自化合物138、154、159、164169製備化合物139、155、160、165170。
步驟24. 製備偶聯物153、158、163、168及173
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物139、154、159、164169製備偶聯物153、158、163、168173。
實例12. 合成偶聯物176
方案27.
Figure 107112376-A0202-12-0140-778
Figure 107112376-A0202-12-0140-779
步驟1. 製備12-胺基十二烷酸甲酯132
在室溫下將12-胺基十一烷酸(131)(10g,4.64mmol)在MeOH中攪拌。逐滴添加乙醯氯(856μL,12mmol),並將反應物攪拌1.5hr。在真空中去除溶劑,將殘餘物吸收於MTBE中並在冰箱中冷凍過夜。將所得沈澱物藉由過濾收集,用冰冷MTBE洗滌並在高真空下乾燥以得到12-胺基十二烷酸甲酯132
步驟2. 製備外消旋(順式)12-(12-(10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)-(苯基)甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸醯胺基)十二烷醯胺基)十二烷酸甲酯129
在室溫下將外消旋(順式)10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸鋰(128)(2g,3.1mmol)、12-胺基十二烷酸甲酯(132)(778mg,3.1mmol)、HBTU(1.2g,3.1mmol)及TEA(1.4mL,10mmol)在DCM中攪拌過夜。藉由過濾去除沈澱物,將濾液在真空中濃縮並將殘餘物藉由管柱層析(5% MeOH,DCM)純化。TLC顯示具有一致質量之兩個閉合的運行點,將該等點指定為幾何異構物並彙集在一起,從而以定量方式得到12-(12-(10-((3R,4S)-3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸醯胺基)十二烷醯胺基)十二烷酸甲酯(129)。
步驟3. 製備外消旋(順式)12-(12-(10-(-3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)-甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸醯胺基)-十二烷醯胺基)十二烷酸鋰130
在室溫下將外消旋(順式)12-(12-(10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸醯胺基)十二烷醯胺基)十二烷酸甲酯(129)(3.1mmol)在THF:H2O(50:50)中與LiOH(88mg,3.7mmol)一起攪拌過夜。藉由TLC證實反應,並在真空中去除THF。將水溶液在液體N2中冷凍並凍乾48小時,從而定量得到外消旋(順式)12-(12-(10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)-甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸醯胺基)-十二烷醯胺基)十二烷酸鋰130。
步驟4. 製備偶聯物176
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物24及130製備偶 聯物176。
實例13. 合成偶聯物179
Figure 107112376-A0202-12-0142-780
Figure 107112376-A0202-12-0142-781
步驟1. 製備化合物80
在室溫下將化合物24(2g,0.86mmol)、N-苄氧羰基-L-麩胺酸(120mg, 0.43mmol)、HBTU(326mg,0.86mmol)及TEA(353μL,2.6mmol)在DCM中攪拌過夜。將混合物在真空中濃縮並藉由管柱層析純化以得到化合物80(2.88g,83%)。
步驟2. 製備化合物81
使用與用於化合物14之程序一致之程序,自化合物80(670mg,0.17mmol)製備偶聯物81。化合物以粗製形式用於後續反應中,並將產率視為定量的。
步驟3. 製備偶聯物179
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物18及81製備偶聯物179。
實例14. 合成偶聯物182
Figure 107112376-A0202-12-0143-782
Figure 107112376-A0202-12-0143-783
步驟1. 製備化合物93
使用與用於化合物89之程序一致之程序,自(2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)-D-麩胺酸(2.25g,8.1mmol)及9(13g,21mmol)製備化合物93。產量:11.2g。
步驟2. 製備化合物94
使用與用於化合物90之程序一致之程序,自化合物93(11.1g)製備化合物94。產量:10.2g。
步驟3. 製備偶聯物182
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物18及94製備偶聯物182
實例15. 合成偶聯物185及188
Figure 107112376-A0202-12-0144-784
方案34.
Figure 107112376-A0202-12-0145-785
Figure 107112376-A0202-12-0145-786
步驟1. 製備4-甲基苯磺酸14-羥基-3,6,9,12-四氧雜十四烷基酯82
將戊乙二醇(35g,147mmol)、TEA(41mL,294mmol)及三甲胺-HCl(1.4g,14.7mmol)於CH2Cl2(600mL)中之溶液用甲苯磺醯氯(29.4g,154mmol)處理。在攪拌(18h)後,將反應混合物用H2O-鹽水(1:1)洗滌,乾燥(MgSO4),過濾,濃縮並 經受層析以產生淺黃色油狀82(24.6g,43%)。Rf0.8(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟2. 14-疊氮基-3,6,9,12-四氧雜十四-1-醇83
使用與用於化合物4之程序一致之程序,自82(24.6g,62.7mmol)及疊氮化鈉(7.13g,110mmol)製備14-疊氮基-3,6,9,12-四氧雜十四-1-醇(83)。產率:14.8g,90%。
步驟3. 製備化合物84
將GalNAc 6(12.2g,31.4mmol)及HO-PEG-N3 83(9.2g,35mmol)於1,2-二氯乙烷(150mL)中之溶液用Sc(OTf)3(771mg,1.6mmol)處理。在攪拌(85℃,2hr)後,使反應物冷卻(室溫),藉由添加TEA(40mL)淬滅並濃縮。使粗製物質經受層析以產生淺黃色泡沫狀84(11.16g,60%)。Rf0.7(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟4. 製備化合物85
84(11.16g,18.8mmol)及Pd/C(1.1g,10%-濕載體)於EtOAc(120mL)中之溶液用TFA(4.32mL,56.5mmol)處理並用H2吹掃。在劇烈攪拌(4.5h)後,將反應物用N2吹掃,藉助Celite過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生無色泡沫狀85(5.77g,45%)。Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟5. 製備化合物95
使用與用於化合物91之程序一致之程序,自(2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)-D-麩胺酸(1.04g,3.7mmol)及化合物94(10.2g)製備化合物95。產量:7.2g。
步驟6. 製備化合物96
使用與用於化合物92之程序一致之程序,自化合物95(11.1g)製備化合物96。產量:6.5g。
步驟7. 製備化合物97
使用與用於化合物89之程序一致之程序,自(2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)-D-麩胺酸(2g,7.1mmol)及85(12.1g,17.8mmol)製備化合物97。產量:10g,定 量。
步驟8. 製備化合物98
使用與用於化合物90之程序一致之程序,自化合物97(10g,7.2mmol)製備化合物98。產率:3.5g,36%。
步驟9. 製備化合物99
使用與用於化合物91之程序一致之程序,自(2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)-D-麩胺酸(350mg,1.25mmol)及化合物98(2.86mg,2.5mmol)製備化合物99
步驟10. 製備化合物100
使用與用於化合物92之程序一致之程序,自化合物99(3.2g,1.25mmol)定量製備化合物100。
步驟11. 製備偶聯物185及188
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物1896或18100製備偶聯物185188。
實例16. 合成偶聯物191、194、197及200
Figure 107112376-A0202-12-0147-787
方案37.
Figure 107112376-A0202-12-0148-788
Figure 107112376-A0202-12-0148-789
步驟1. 製備2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇86
向2-(2-(2-氯乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(13g,77mmol)於水(200mL)中之 溶液中添加疊氮化鈉(10g,154mmol)。將反應物加熱至100℃並保持18小時。使反應物冷卻至室溫,並傾倒至1L分液漏斗中,並用二氯甲烷(3 x 200mL)萃取。將合併之二氯甲烷萃取物在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥,以得到無色油狀2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(11.7g)。
步驟2. 製備化合物87
使用與用於化合物84之程序一致之程序,自86(4.95g,28.3mmol)及6(10g,25.7mmol)製備化合物87。產率:10g,77%。
步驟3. 製備化合物88
使用與用於化合物85之程序一致之程序,自87(10g,19.8mmol)製備化合物88。產率:7.63g,65%。
步驟4. 製備化合物89
88(2g,3.38mmol)及Z-麩胺酸(427mg,1.52mmol)於CH2Cl2(50mL)中之溶液用HBTU(1.41g,3.7mmol)及休尼格鹼(Hünig’s base)(1.77mL,10.1mmol)處理。在攪拌(18h)後,將混合物濃縮並經受層析以產生無色泡沫狀89(871mg,48%)。Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟5. 製備化合物90
89(870mg,0.72mmol)及Pd/C(90mg,10%-濕載體)於EtOAc(10mL)中之溶液用TFA(84μL,1.1mmol)處理並用H2吹掃。在劇烈攪拌(2h)後,將反應物用N2吹掃,藉助Celite過濾並濃縮。粗製物質不經進一步處理即使用,並且產生無色泡沫狀90(850mg,定量)。Rf0.25(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟6. 製備化合物91
90(850mg,0.72mmol)及Z-麩胺酸(91mg,0.32mmol)於CH2Cl2(10mL)中之溶液用HBTU(300mg,0.79mmol)及休尼格鹼(502μL,2.9mmol)處理。攪拌(1.5h)後,將混合物用CH2Cl2稀釋,並用NaHCO3(飽和水溶液)洗滌,乾燥 (MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生無色泡沫狀91(590mg,76%)。Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟7. 製備化合物92
91(590mg,0.25mmol)及Pd/C(100mg,10%-濕載體)於CH3OH(30mL)中之溶液用TFA(29μL,0.37mmol)處理並用H2吹掃。在攪拌(3h)後,將混合物用N2吹掃,然後藉助Celite過濾並濃縮。粗製物質不經進一步純化即使用,並產生無色泡沫狀92(600mg,定量)。Rf0.1(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟8. 製備化合物101
使用與用於化合物89之程序一致之程序,自(R)-2-((2-側氧基-2-苯基-112-乙基)胺基)己二酸(2.51g,8.6mmol)及9(11g,17.2mmol)製備化合物101。產率:4.2g,37%。
步驟9. 製備化合物102
使用與用於化合物90之程序一致之程序,自化合物101(4.2g,3.2mmol)製備化合物102。產率:2.1g,47%。
步驟10. 製備化合物103
使用與用於化合物91之程序一致之程序,自(R)-2-((2-側氧基-2-苯基-112-乙基)胺基)己二酸(265mg,0.9mmol)及化合物102(2.1g,1.8mmol)製備化合物103。產率:(560mg,24%)。
步驟11. 製備化合物104
使用與用於化合物92之程序一致之程序,自化合物103(560mg)定量製備化合物104。該化合物不經進一步純化即使用。
步驟12. 製備偶聯物191、194及197
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物128及92、96及100製備偶聯物191、194及197
實例16a. 合成偶聯物191a
Figure 107112376-A0202-12-0151-790
Figure 107112376-A0202-12-0151-791
方案38a.
Figure 107112376-A0202-12-0152-792
步驟1. 製備2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇86a
向2-(2-(2-氯乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(13g,77mmol)於水(200mL)中之溶液中添加疊氮化鈉(10g,154mmol)。將反應物加熱至100℃並保持18小時。使反應物冷卻至室溫,並傾倒至1L分液漏斗中,並用二氯甲烷(3 x 200mL)萃取。將合併之二氯甲烷萃取物在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥,以得到無色油狀2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(11.7g)。
步驟2. 製備化合物87a
使用與用於化合物84之程序一致之程序,自86a(4.95g,28.3mmol)及6a(10g,25.7mmol)製備化合物87a。產率:10g,77%。
步驟3. 製備化合物88a
使用與用於化合物85之程序一致之程序,自87a(10g,19.8mmol)製備化合物88a。產率:7.63g,65%。
步驟4. 製備化合物89a
88a(2g,3.38mmol)及Z-L-麩胺酸(427mg,1.52mmol)於CH2Cl2(50mL)中之溶液用HBTU(1.41g,3.7mmol)及休尼格鹼(1.77mL,10.1mmol)處理。攪拌(18h)後,將混合物濃縮並經受層析以產生無色泡沫狀89a(871mg,48%)。 Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟5. 製備化合物90a
89a(870mg,0.72mmol)及Pd/C(90mg,10%-濕載體)於EtOAc(10mL)中之溶液用TFA(84μL,1.1mmol)處理並用H2吹掃。劇烈攪拌(2h)後,將反應物用N2吹掃,藉助Celite過濾並濃縮。粗製物質不經進一步處理即使用並產生無色泡沫狀90a(850mg,定量)。Rf0.25(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟6. 製備化合物91a
90a(850mg,0.72mmol)及Z-麩胺酸(91mg,0.32mmol)於CH2Cl2(10mL)中之溶液用HBTU(300mg,0.79mmol)及休尼格鹼(502μL,2.9mmol)處理。攪拌(1.5h)後,將混合物用CH2Cl2稀釋,並用NaHCO3(飽和水溶液)洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生無色泡沫狀91a(590mg,76%)。Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟7. 製備化合物92a
91a(590mg,0.25mmol)及Pd/C(100mg,10%-濕載體)於CH3OH(30mL)中之溶液用TFA(29μL,0.37mmol)處理並用H2吹掃。攪拌(3h)後,將混合物用N2吹掃,然後藉助Celite過濾並濃縮。粗製物質不經進一步處理即使用並產生無色泡沫狀92a(600mg,定量)。Rf0.1(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟8. 製備偶聯物191a,
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物128及化合物92a製備偶聯物191a。
實例16b. 合成偶聯物191b
方案36b
Figure 107112376-A0202-12-0154-793
Figure 107112376-A0202-12-0154-794
Figure 107112376-A0202-12-0154-795
步驟1. 製備2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇86b
向2-(2-(2-氯乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(13g,77mmol)於水(200mL)中之溶液中添加疊氮化鈉(10g,154mmol)。將反應物加熱至100℃並保持18小時。使反應物冷卻至室溫並傾倒至1L分液漏斗中,並用二氯甲烷(3 x 200mL)萃取。將合併之二氯甲烷萃取物在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥,以得到無色油狀2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(11.7g)。
步驟2. 製備化合物87b
使用與用於化合物84之程序一致之程序,自86b(4.95g,28.3mmol)及6b(10g,25.7mmol)製備化合物87a。產率:10g,77%。
步驟3. 製備化合物88b
使用與用於化合物85之程序一致之程序,自87b(10g,19.8mmol)製備化合物88a。產率:7.63g,65%。
步驟4. 製備化合物89b
88b(2g,3.38mmol)及外消旋Z-麩胺酸(427mg,1.52mmol)於CH2Cl2(50mL)中之溶液用HBTU(1.41g,3.7mmol)及休尼格鹼(1.77mL,10.1mmol)處理。在攪拌(18h)後,將混合物濃縮並經受層析以產生無色泡沫狀89b(871mg,48%)。Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟5. 製備化合物90b
89b(870mg,0.72mmol)及Pd/C(90mg,10%-濕載體)於EtOAc(10mL)中之溶液用TFA(84μL,1.1mmol)處理並用H2吹掃。劇烈攪拌(2h)後,將反應物用N2吹掃,藉助Celite過濾並濃縮。粗製物質不經進一步處理即使用並產生無色泡沫狀90b(850mg,定量)。Rf0.25(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟6. 製備化合物91b
90b(850mg,0.72mmol)及Z-麩胺酸(91mg,0.32mmol)於CH2Cl2 (10mL)中之溶液用HBTU(300mg,0.79mmol)及休尼格鹼(502μL,2.9mmol)處理。在攪拌(1.5h)後,將混合物用CH2Cl2稀釋,並用NaHCO3(飽和水溶液)洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生無色泡沫狀91b(590mg,76%)。Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟7. 製備化合物92b
91b(590mg,0.25mmol)及Pd/C(100mg,10%-濕載體)於CH3OH(30mL)中之溶液用TFA(29μL,0.37mmol)處理,並用H2吹掃。攪拌(3h)後,將混合物用N2吹掃,然後藉助Celite過濾並濃縮。粗製物質不經進一步處理即使用並產生無色泡沫狀92b(600mg,定量)。Rf0.1(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟8. 製備偶聯物191b
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物128及化合物92b製備偶聯物191b。
實例16c. 合成偶聯物191c
Figure 107112376-A0202-12-0156-796
方案37c.
Figure 107112376-A0202-12-0157-797
Figure 107112376-A0202-12-0157-798
步驟1. 製備2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇86c
向2-(2-(2-氯乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(13g,77mmol)於水(200mL)中之溶液中添加疊氮化鈉(10g,154mmol)。將反應物加熱至100℃並保持18小時。 使反應物冷卻至室溫並傾倒至1L分液漏斗中,並用二氯甲烷(3 x 200mL)萃取。將合併之二氯甲烷萃取物在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥,以得到無色油狀2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(11.7g)。
步驟2. 製備化合物87c
使用與用於化合物84之程序一致之程序自86c(4.95g,28.3mmol)及6c(10g,25.7mmol)製備化合物87c。產率:10g,77%。
步驟3. 製備化合物88c
使用與用於化合物85之程序一致之程序自87c(10g,19.8mmol)製備化合物88c。產率:7.63g,65%。
步驟4. 製備化合物89c
88c(2g,3.38mmol)及外消旋Z-麩胺酸(427mg,1.52mmol)於CH2Cl2(50mL)中之溶液用HBTU(1.41g,3.7mmol)及休尼格鹼(1.77mL,10.1mmol)處理。在攪拌(18h)後,將混合物濃縮並經受層析以產生無色泡沫狀89c(871mg,48%)。Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟5. 製備化合物90c
89c(870mg,0.72mmol)及Pd/C(90mg,10%-濕載體)於EtOAc(10mL)中之溶液用TFA(84μL,1.1mmol)處理並用H2吹掃。劇烈攪拌(2h)後,將反應物用N2吹掃,藉助Celite過濾並濃縮。粗製物質不經進一步處理即使用並產生無色泡沫狀90c(850mg,定量)。Rf0.25(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟6. 製備化合物91c
90c(850mg,0.72mmol)及Z-麩胺酸(91mg,0.32mmol)於CH2Cl2(10mL)中之溶液用HBTU(300mg,0.79mmol)及休尼格鹼(502μL,2.9mmol)處理。攪拌(1.5h)後,將混合物用CH2Cl2稀釋,並用NaHCO3(飽和水溶液)洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生無色泡沫狀91c(590mg,76%)。 Rf0.5(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟7. 製備化合物92c
91c(590mg,0.25mmol)及Pd/C(100mg,10%-濕載體)於CH3OH(30mL)中之溶液用TFA(29μL,0.37mmol)處理並用H2吹掃。攪拌(3h)後,將混合物用N2吹掃,然後藉助Celite過濾並濃縮。粗製物質不經進一步處理即使用並產生無色泡沫狀92c(600mg,定量)。Rf0.1(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟8. 製備偶聯物191c
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物128及化合物92c製備偶聯物191c。
實例17. 合成偶聯物203及206
Figure 107112376-A0202-12-0159-799
步驟1. 製備化合物69b
使用與用於化合物69之程序一致之程序自(2S,4R)-4-羥基吡咯啶-2-甲酸製備化合物69b
步驟2. 製備偶聯物203及206
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物96100製備偶聯物203206
實例18. 合成偶聯物209
Figure 107112376-A0202-12-0160-800
步驟1. 製備偶聯物209
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物96160製備偶聯物209
實例18a. 合成偶聯物209a
方案40a.
Figure 107112376-A0202-12-0161-801
步驟1. 製備偶聯物209a
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物96a160製備偶聯物209a
實例19. 合成偶聯物212及215
方案41.
Figure 107112376-A0202-12-0162-802
Figure 107112376-A0202-12-0162-803
步驟1. 製備5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙醯胺基)-間苯二甲酸二甲酯105
將5-胺基間苯二甲酸二甲酯(5g,24mmol)、Z-Gly-OH(5g,24mmol)、EDC(5g,26.3mmol)、HOBt(3.6g,26.3mmol)、NMM(2.9mL,26.3mmol)於DMF(50mL)中之溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將反應混合物用乙酸乙酯 (250mL)稀釋並用各1M HCl(2 x 100mL)、飽和碳酸氫鈉(1 x 100mL)及鹽水(2 x 100mL)洗滌。在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥以得到無色固體狀5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸二甲酯(7.2g,79%)。
步驟2. 製備5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸106
向5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸甲酯(7.2g)於甲醇(25mL)及THF(25mL)中之溶液中添加1M NaOH(25mL)。將溶液在室溫下攪拌2小時,然後濃縮以去除THF及MeOH。將剩餘的水溶液用水(75mL)稀釋,在冰水浴上冷卻並用6M HCl酸化至pH=1。將固體過濾並用水(3 x 100mL)洗滌。將固體冷凍乾燥以得到5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)-間苯二甲酸(6.9g,定量)。
步驟3. 製備化合物107
使用與用於化合物95之程序一致之程序自5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸106(200mg,0.54mmol)及94(1.7g,1.3mmol)製備化合物107。產量:600mg。
步驟4. 製備化合物108
使用與用於化合物96之程序一致之程序自化合物107(600mg)製備化合物108。產量:650mg,定量。
步驟5. 製備化合物109
使用與用於化合物99之程序一致之程序,自5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸106(180mg,0.48mmol)及98(1.5g,1.1mmol)製備化合物109。產量:900mg。
步驟6. 製備化合物110
使用與用於化合物100之程序一致之程序,自化合物109(900mg)製備化合物110。產量:920mg,定量。
步驟7. 製備偶聯物212及215
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物128108110製備偶聯物212215
實例19a. 合成偶聯物212a及215a
Figure 107112376-A0202-12-0164-804
方案42a.
Figure 107112376-A0202-12-0165-805
步驟1. 製備5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基 )乙醯胺基)-間苯二甲酸二甲酯105a
將5-胺基間苯二甲酸二甲酯(5g,24mmol)、Z-Gly-OH(5g,24mmol)、EDC(5g,26.3mmol)、HOBt(3.6g,26.3mmol)、NMM(2.9mL,26.3mmol)於DMF(50mL)中之溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將反應混合物用乙酸乙酯(250mL)稀釋,並用各1M HCl(2 x 100mL)、飽和碳酸氫鈉(1 x 100mL)及鹽水(2 x 100mL)洗滌。在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥以得到無色固體狀5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸二甲酯(7.2g,79%)。
步驟2. 製備5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸106a
向5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸甲酯(7.2g)於甲醇(25mL)及THF(25mL)中之溶液中添加1M NaOH(25mL)。將溶液在室溫下攪拌2小時,然後濃縮以去除THF及MeOH。將剩餘的水溶液用水(75mL)稀釋,在冰水浴上冷卻並用6M HCl酸化至pH=1。將固體過濾並用水(3 x 100mL)洗滌。將固體冷凍乾燥以得到5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙 醯胺基)-間苯二甲酸(6.9g,定量)。
步驟3. 製備化合物107a
使用與用於化合物95之程序一致之程序,自5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸106a(200mg,0.54mmol)及94a(1.7g,1.3mmol)製備化合物107a。產量:600mg。
步驟4. 製備化合物108a
使用與用於化合物96a之程序一致之程序,自化合物107a(600mg)製備化合物108a。產量:650mg,定量。
步驟5. 製備化合物109a
使用與用於化合物99之程序一致之程序,自5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸106a(180mg,0.48mmol)及9a8(1.5g,1.1mmol)製備化合物109a。產量:900mg。
步驟6. 製備化合物110a
使用與用於化合物100之程序一致之程序,自化合物109(900mg)製備化合物110a。產量:920mg,定量。
步驟7. 製備偶聯物212a及215a
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物128108a110a製備偶聯物212a21a5。
實例20. 合成偶聯物218及221
方案43.
Figure 107112376-A0202-12-0167-503
Figure 107112376-A0202-12-0167-504
步驟1. 製備化合物111
使用與用於化合物89之程序一致之程序,自4-(((第三丁氧基羰基)胺基)甲基)鄰苯二甲酸(1.13g,3.84mmol)及88(5g,8.44mmol)製備化合物111。產率:2.21g,49%。
步驟2. 製備化合物112
111(2.21g,1.87mmol)於CH2Cl2(40mL)中之溶液用TFA(5mL)緩慢處理。在攪拌(2h)後,將混合物濃縮並經受層析以產生無色泡沫狀112(1.08g,47%)。Rf0.1(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟3. 製備化合物113
使用與用於化合物91之程序一致之程序,自化合物112(1.08g,0.88mmol)及(2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)-D-麩胺酸(112mg,0.39mmol)製備化合物113。產率:600mg,62%。
步驟4. 製備化合物114
使用與用於化合物92之程序一致之程序,自化合物113製備化合物114。
步驟5. 製備化合物115
使用與用於化合物93之程序一致之程序,自4-(((第三丁氧基羰基)胺基)甲基)鄰苯二甲酸(3.94g,13.3mmol)及9(18.2g,29.4mmol)製備化合物115。產率:9.02g,53%。
步驟6. 製備化合物116
使用與用於化合物112之程序一致之程序,自化合物115(8g,6.3mmol)製備化合物116。產率:3.23g,39%。
步驟7. 製備化合物117
使用與用於化合物95之程序一致之程序,自化合物116(3.23g,2.45mmol)及(2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)-D-麩胺酸(192mg,1.1mmol)製備化合物117。產率:2.22g,34%。
步驟8. 製備化合物118
使用與用於化合物96之程序一致之程序,自化合物117(2.22g, 0.84mmol)製備化合物118。產率:2.02g,91%。
步驟9. 製備偶聯物218及221
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物128114118製備偶聯物218221。
實例20a. 合成偶聯物218a及221a
Figure 107112376-A0202-12-0169-505
方案44a.
Figure 107112376-A0202-12-0170-506
步驟1. 製備化合物111a
使用與用於化合物89之程序一致之程序,自4-(((第三丁氧基羰基)胺基)甲基)鄰苯二甲酸(1.13g,3.84mmol)及88(5g,8.44mmol)製備化合物111a。產率:2.21g,49%。
步驟2. 製備化合物112a
111a(2.21g,1.87mmol)於CH2Cl2(40mL)中之溶液用TFA(5mL)緩慢處理。攪拌(2h)後,將混合物濃縮並經受層析以產生無色泡沫狀112a(1.08g,47%)。Rf0.1(10% CH3OH-CH2Cl2)。
步驟3. 製備化合物113a
使用與用於化合物91之程序一致之程序,自化合物112a(1.08g,0.88mmol)及(2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)-D-麩胺酸(112mg,0.39mmol)製備化合 物113a。產率:600mg,62%。
步驟4. 製備化合物114a
使用與用於化合物92之程序一致之程序,自化合物113a製備化合物114a。
步驟5. 製備化合物115a
使用與用於化合物93之程序一致之程序,自4-(((第三丁氧基羰基)胺基)甲基)鄰苯二甲酸(3.94g,13.3mmol)及9(18.2g,29.4mmol)製備化合物115a。產率:9.02g,53%。
步驟6. 製備化合物116a
使用與用於化合物11a之程序一致之程序,自化合物115a(8g,6.3mmol)製備化合物116a。產率:3.23g,39%。
步驟7. 製備化合物117a
使用與用於化合物95之程序一致之程序,自化合物116a(3.23g,2.45mmol)及(2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)麩胺酸(192mg,1.1mmol)製備化合物117a。產率:2.22g,34%。
步驟8. 製備化合物118a
使用與用於化合物96之程序一致之程序,自化合物117a(2.22g,0.84mmol)製備化合物118a。產率:2.02g,91%。
步驟9. 製備偶聯物21a8及221a
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物128114a或118a製備偶聯物218a22a1。
實例21. 合成偶聯物224
方案45.
Figure 107112376-A0202-12-0172-508
步驟1. 製備化合物224
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物96130製備偶聯物224。
實例21a. 合成偶聯物224b
Figure 107112376-A0202-12-0172-507
Figure 107112376-A0202-12-0173-509
步驟1. 製備化合物224b
使用與用於化合物1之程序一致之程序,自化合物96b130製備偶聯物224b。
實例22 合成偶聯物231
Figure 107112376-A0202-12-0173-510
Figure 107112376-A0202-12-0174-511
步驟1 製備化合物225
使用與用於化合物89之程序一致之程序,自5-(2-胺基乙醯胺基)間苯二甲酸106(560mg,1.5mmol)及9(2.24g,3.6mmol)製備化合物225。產率1.6g,80%。
步驟2 製備化合物226
以與14相同之方式製備化合物226。產率1.22g,78%。
步驟3 製備化合物227
以與89相同之方式自Z-麩胺酸(108mg,0.38mmol)及226(1.22g,0.92mmol)製備化合物227。產率471mg,45%。
步驟4 製備化合物228
以與14相同之方式製備化合物228。產率460mg,定量
步驟5 製備化合物229
以與89相同之方式自228(460mg,0.17mmol)及128(125mg,0.19mmol)製備化合物229。產率365mg,66%。
步驟6 製備化合物231
使用與用於化合物1之程序一致之程序製備偶聯物231。
實例22a 合成偶聯物231a
Figure 107112376-A0202-12-0175-512
Figure 107112376-A0202-12-0175-513
Figure 107112376-A0202-12-0176-514
步驟1 製備化合物225a
使用與用於89之程序一致之程序,自5-(2-胺基乙醯胺基)間苯二甲酸106(560mg,1.5mmol)及9(2.24g,3.6mmol)製備化合物225a。產率1.6g,80%。
步驟2 製備化合物226a
以與14相同之方式製備化合物226a。產率1.22g,78%。
步驟3 製備化合物227a
以與89相同之方式自Z-麩胺酸(108mg,0.38mmol)及226a(1.22g,0.92mmol)製備化合物227a。產率471mg,45%。
步驟4 製備化合物228a
以與14相同之方式製備化合物228a。產率460mg,定量
步驟5 製備化合物229a
以與89相同之方式自228a(460mg,0.17mmol)及128(125mg,0.19mmol)製備化合物229a。產率365mg,66%。
步驟6 製備化合物231a
使用與用於化合物1之程序一致之程序製備偶聯物231a。
實例22b 合成偶聯物231b
Figure 107112376-A0202-12-0177-515
Figure 107112376-A0202-12-0177-516
步驟1 製備化合物225b
使用與用於化合物89之程序一致之程序自5-(2-胺基乙醯胺基)間苯二甲酸106(560mg,1.5mmol)及9(2.24g,3.6mmol)製備化合物225b。產率1.6g,80%。
步驟2 製備化合物226b
以與14相同之方式製備化合物226b。產率1.22g,78%。
步驟3 製備化合物227b
以與89相同之方式自Z-麩胺酸(108mg,0.38mmol)及226b(1.22g,0.92mmol)製備化合物227b。產率471mg,45%。
步驟4 製備化合物228b
以與14相同之方式製備化合物228b。產率460mg,定量
步驟5 製備化合物229b
以與89相同之方式自228b(460mg,0.17mmol)及128(125mg,0.19mmol)製備化合物229b。產率365mg,66%。
步驟6 製備化合物231b
使用與用於化合物1之程序一致之程序製備偶聯物231b。
實例23. 合成偶聯物233
方案48
Figure 107112376-A0202-12-0179-517
步驟1. 製備化合物232
使用與用於化合物19之程序一致之程序自化合物24(650mg,0.33mmol)及化合物69b(175mg,0.33mmol)製備化合物232。產率:380mg,47%。
步驟2. 製備化合物233
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物232製備化合物233。
實例24. 合成偶聯物235
Figure 107112376-A0202-12-0180-518
步驟1. 製備化合物234
使用與用於化合物19之程序一致之程序自化合物24(1.1g,0.55mmol)及化合物18(175mg,0.33mmol)製備化合物234。產率:685mg,51%。
步驟2. 製備化合物235
使用與用於化合物1之程序一致之程序自化合物234製備化合物235。
實例25. HBV siRNA偶聯物之活體內測試
慢性HBV感染係對肝臟有進行性損害之全球性疾病。目前可用的治療可減少病毒DNA,但對極大促進疾病進展之病毒抗原幾乎沒有效應。因此,設計了靶向HBV以減少病毒抗原之siRNA。
在所確立之小鼠HBV感染模型中測試偶聯至GalNAc配體之闡述於表1中之經化學修飾HBV siRNA的活體內活性。在AAV-HBV1.2 C57BL/6小鼠模型中,在注射編碼HBV之超基因體長度序列之腺相關病毒(AAV)載體後達成穩定且持久的HBV表現,導致肝臟表現HBV RNA及蛋白質及將病毒及亞病毒粒子分泌至血液中。
用於該等研究中之AAV-HBV1.2構築體係基於Dion,S.等人,Journal of Virology,2013,87(10):5554-5563中所提供之細節。所有動物相關之程序皆係根據書面操作程序、根據加拿大動物保護委員會(CCAC)之良好動物實踐指南(Canadian Council on Animal Care(CCAC)Guidelines on Good Animal Practices)實施且由地方機構動物照護及使用委員會(Institutional Animal Care and Use Committee,IACUC)批准。
用AAV-HBV1.2載體之1E11載體基因體(VG)對每隻動物進行接種。在治療之前,對所有動物進行放血測試並測定個別動物之血清HBsAg含量,以證實所確立之HBV表現。
siRNA治療:在第0天經由在肩胛區中進行皮下注射,向小鼠(通常n=5隻)之組一次投與單次3mg/kg劑量之HBV siRNA偶聯物(每隻動物1個劑量)。一組僅投與媒劑(鹽水)之動物用作對照。
收集:在第0天、治療前及測試物品投與後之確定時間點(例如在研究第7、14、21、28、35、42、49、56、63及70天)對所有小鼠進行放血測試,以測定血清HBsAg含量之最大降低及藥理學活性之持續時間。
分析:使用Biorad EIA GS HBsAg 3.0套組(BioRad,目錄號32591)根據製造商之說明書測定血清試樣中之HBsAg含量。使用來自每一治療組之彙集血清來測定個別時間點之組平均HBsAg含量。分析數據並將其表示為相對於治療前基線之HBsAg含量(相對於第0天之%)。
結果:測試表1中所述之每一經化學修飾之HBV siRNA之結果呈現於表2中。數值代表治療後第7、14、21、28、42、49、56及70天之HBsAg含量%(相對於第0天基線)。
Figure 107112376-A0202-12-0182-519
Figure 107112376-A0202-12-0183-520
Figure 107112376-A0202-12-0184-521
2'-O-甲基核苷酸=小寫字母;2'-氟核苷酸=大寫字母;硫代磷酸酯連接體=s;未修飾=大寫字母
Figure 107112376-A0202-12-0184-522
Figure 107112376-A0202-12-0185-523
表2鑑定了所測試之HBV siRNA偶聯物之化合物編號(第2行)及相應的寡核苷酸(第1行)。
實例26 合成偶聯物320
Figure 107112376-A0202-12-0186-524
步驟1. 製備外消旋(順式)5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)-二酮301
向3,4-二甲基呋喃-2,5-二酮(3g,24mmol)及N-苄基-1-甲氧基-N-((三甲基矽基)甲基)甲胺(7g,29.8mmol)於二氯甲烷(75mL)中之冷卻溶液(0℃)中緩慢添加三氟乙酸(75μL)。攪拌過夜,從而隨著冰浴融化,使溶液緩慢升溫至室溫。將反應混合物濃縮至乾燥,溶解於乙酸乙酯(100mL)中,用飽和碳酸氫鈉(2 x 100mL)洗滌,在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥。藉由在矽膠上管柱層析(梯度:20%於己烷中之乙酸乙酯至100%乙酸乙酯)純化,得到黃色油狀(3aR,6aS)-5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)-二酮(3.5g,56%)。
步驟2. 製備外消旋(順式)(1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇302
向(3aR,6aS)-5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)-二酮(3.5g,13.4mmol)於無水乙醚(50mL)中之冷卻(0℃)溶液中分三部分緩慢添加氫化鋁鋰糰粒(1.5g,40mmol)。將溶液攪拌過夜,從而隨著冰浴融化而升溫至室溫。完成後,使反應物冷卻至0℃並用1.5mL 5M NaOH、隨後1.5mL水極其緩慢地淬滅。攪拌30分鐘,然後添加硫酸鎂並過濾。將濾液濃縮以得到無色油狀((3R,4S)-1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(2.7g)。
步驟3. 製備外消旋(順式)(3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇303
向((3R,4S)-1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(10g,40mmol)於甲醇(10mL)中之溶液中添加濕的活性炭載10%鈀(1g)。將溶液在氫氣氛下劇烈攪拌16小時。在完成後,將溶液藉助Celite過濾並濃縮至乾燥以得到無色固體狀((3R,4S)-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(5.5g,86%)。
步驟4. 製備外消旋(順式)10-(3,4-雙(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸甲酯304
3(1.3g,8.2mmol)及癸二酸單甲酯(1.8g,8.2mmol)於CH2Cl2(100mL)中之溶液用HBTU(3.41g,9.02mmol)及休尼格鹼(5.71mL,32.8mmol)處理。在攪拌過夜後,將混合物用NaHCO3(飽和水溶液)、水及鹽水洗滌,然後乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析(梯度:0% CH3OH-CH2Cl2至20%)以產生4(1.8g,61%)。
步驟5. 製備外消旋(順式)10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)-甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸甲酯305
304(1.8g,5.0mmol)及4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(1.7g,5.0mmol)於吡啶(180mL)中之溶液攪拌過夜。然後在減壓下去除吡啶并使粗製物質經受層析(梯度:0% CH3OH-CH2Cl2至10%)以得到黃色油狀5(1.4g,42%)。
步驟6. 製備外消旋(順式)10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)-(苯基)甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸鋰306
向化合物305(3.0g,4.6mmol)於THF(50mL)及水(50mL)中之溶液中添加氫氧化鋰(121mg,5.0mmol)。將溶液在室溫下攪拌4小時,然後濃縮以去除THF。將剩餘的水溶液冷凍乾燥過夜以得到淺粉色固體(2.9g,定量)。將化合物306製備為兩種順式-非鏡像異構物之混合物。
方案51 合成全乙醯化半乳糖胺307
Figure 107112376-A0202-12-0188-525
用乙酸酐(1.25L,13.2mol)將於吡啶(1.5L)中之D-半乳糖胺鹽酸鹽(250g,1.16mol)處理45分鐘。攪拌過夜後,將反應混合物分成三個1L部分。將每個1L部分傾倒至3L冰水中並混合1小時。在混合後,將固體濾掉,合併,經液氮冷凍,且然後凍乾5天以產生白色固體狀全乙醯化半乳糖胺7(369.4g,82%)。Rf(0.58,10% MeOH-CH2Cl2)。
Figure 107112376-A0202-12-0188-526
步驟1 製備化合物309
將2-[2-(2-氯乙氧基)]乙醇308(100g,593mmol)於水(1L)中之溶液用NaN3(77g,1.19mol)處理並加熱(90℃)。攪拌(72小時)後,使溶液冷卻(室溫)並用CH2Cl2萃取(4x)。將合併之有機物用鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾,濃縮且不經進一步處理即使用。獲得淺黃色油狀化合物9(88.9g,86%)。
步驟2 製備化合物310
7(2.76g,7.1mmol)及309(1.37g,7.8mmol)於1,2-二氯乙烷(40mL)中之溶液用Sc(OTf)3(174mg,0.36mmol)處理並加熱(85℃)。攪拌(2小時)後,使混合物冷卻(室溫)並藉由添加TEA(4mL)淬滅並濃縮。使粗製物質經受層析以產生淺黃色泡沫狀310(3.03g,85%)。
步驟3 製備化合物311
310(3.02g,5.99mmol)及Pd/C(300mg,10% Pd負載-濕載體)於EtOAc(30mL)中之溶液用TFA(576μL,7.5mmol)處理。將反應混合物用氫氣吹掃 (45min),然後用氮氣吹掃(10min),然後藉助celite過濾。將濾液濃縮,且然後使其經受層析以產生褐色泡沫狀311(2.67g,75%)。
Figure 107112376-A0202-12-0189-527
步驟1. 製備5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙醯胺基)-間苯二甲酸二甲酯312
將5-胺基間苯二甲酸二甲酯(5g,24mmol)、Z-Gly-OH(5g,24mmol)、EDC(5g,26.3mmol)、HOBt(3.6g,26.3mmol)、NMM(2.9mL,26.3mmol)於DMF(50mL)中之溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將反應混合物用乙酸乙酯(250mL)稀釋並用各1M HCl(2 x 100mL)、飽和碳酸氫鈉(1 x 100mL)及鹽水(2 x 100mL)洗滌。在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥以得到無色固體狀5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)-乙醯胺基)間苯二甲酸二甲酯(7.2g,79%)。
步驟2. 製備5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸313
向5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸甲酯(7.2g)於甲醇(25mL)及THF(25mL)中之溶液中添加1M NaOH(25mL)。將溶液在室溫下攪拌2小時,然後濃縮以去除THF及MeOH。將剩餘的水溶液用水(75mL)稀釋,在冰水浴上冷卻,並用6M HCl酸化至pH=1。將固體過濾並用水(3 x 100mL)洗滌。將固體冷凍乾燥以得到5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)-間苯二甲酸(6.9g,定量)。
方案54:製備四聚體
Figure 107112376-A0202-12-0190-528
步驟1 製備化合物314
313(2.09g,5.6mmol)及311(8.34g,14.07mmol)於CH2Cl2(150mL)中之溶液用HBTU(6.4g,16.9mmol)及休尼格鹼(7.35mL,42.2mmol)處理。攪拌(過夜)後,將反應混合物傾倒至NaHCO3(飽和水溶液)中,然後用水及鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析(梯度1-12% CH3OH-CH2Cl2)以產生淺黃色泡沫狀6(3.97g,55%)。
步驟2 製備化合物315
將化合物314(3.92g,3.07mmol)、Pd/C(400mg,10%負載-濕載體)及三氟乙酸(308μL,4mmol)用H2吹掃。在H2下攪拌(過夜)後將混合物用N2(15-20min)吹掃,然後藉助celite過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生白色至奶油色泡沫狀7(3.36g,86%)。
步驟3 製備化合物316
以與314相同之方式自Z-麩胺酸(306mg,1.09mmol)及315(3.3g,2.6mmol)製備化合物316。產率1.66g,60%。
步驟4 製備化合物317
以與315相同之方式製備化合物317。產率1.65g,定量。
方案55 製備完全偶聯物
Figure 107112376-A0202-12-0191-529
步驟1 製備化合物318
317(1.91g,0.75mmol)於CH2Cl2(100mL)中之溶液首先用休尼格鹼(392μL,2.25mmol)、然後用6(兩種順式-非鏡像異構物之混合物,509mg,0.79mmol)、隨後用HBTU(356mg,0.94mmol)處理。攪拌(過夜)後,將溶液傾倒至NaHCO3(飽和水溶液)中,然後用水及鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生白色泡沫狀318(1.19g,52%)。
步驟2 製備化合物319
318(1.19g,0.39mmol)於1,2二氯乙烷(100mL)中之溶液用TEA (542μL,3.9mmol)、DMAP(238mg,1.95mmol)及琥珀酸酐(195mg,1.95mmol)處理並加熱(85℃)。攪拌(2.5小時)後,將溶液自熱移除,並且用CH3OH(10mL)處理並使其攪拌(1小時)。攪拌後,將混合物傾倒至NaHCO3(飽和水溶液)中,然後用鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。所獲得之殘餘物不經進一步處理即使用。產量=1.4g,定量
步驟3 製備偶聯物320
使用標準醯胺偶合化學,將琥珀酸酯319負載至1000Å LCAA(長鏈胺基烷基)CPG(可控微孔玻璃珠)上。將二異丙基碳二亞胺(52.6μmol)、N-羥基琥珀醯亞胺(0.3mg,2.6μmol)及吡啶(10μL)於無水乙腈(0.3mL)中之溶液添加至於無水二氯甲烷(0.2mL)中之319(20.6mg,8μmol)中。將此混合物添加至LCAA CPG(183mg)中。將懸浮液在室溫下輕輕混合過夜。在319消失(HPLC)後,過濾反應混合物並將CPG用各1mL二氯甲烷、乙腈、5%乙酸酐/5% N-甲基咪唑/5%吡啶於THF中之溶液、然後THF、乙腈及二氯甲烷洗滌。然後將CPG在高真空下乾燥過夜。藉由標準DMTr分析藉由UV/Vis(504nm),測得負載為19μmol/g。將所得GalNAc負載之CPG固體載體用於使用標準程序之自動寡核苷酸合成中。進行核苷酸去保護,隨後自固體載體去除(同時進行乙酸半乳糖胺去保護)得到GalNAc-寡核苷酸偶聯物320。
實例27 合成偶聯物520
方案56 製備經活化連接體
Figure 107112376-A0202-12-0193-530
步驟1. 製備外消旋(順式)5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)-二酮301
向3,4-二甲基呋喃-2,5-二酮(3g,24mmol)及N-苄基-1-甲氧基-N-((三甲基矽基)甲基)甲胺(7g,29.8mmol)於二氯甲烷(75mL)中之冷卻溶液(0℃)中緩慢添加三氟乙酸(75μL)。攪拌過夜,從而隨著冰浴融化,使溶液緩慢升溫至室溫。將反應混合物濃縮至乾燥,溶解於乙酸乙酯(100mL)中,用飽和碳酸氫鈉(2 x 100mL)洗滌,在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥。藉由矽膠上之管柱層析純化(梯度:20%於己烷中之乙酸乙酯至100%乙酸乙酯)得到黃色油狀(3aR,6aS)-5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)-二酮(3.5g,56%)。
步驟2. 製備外消旋(順式)(1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇302
向(3aR,6aS)-5-苄基-3a,6a-二甲基四氫-1H-呋喃并[3,4-c]吡咯-1,3(3aH)-二酮(3.5g,13.4mmol)於無水乙醚(50mL)中之冷卻(0℃)溶液中分三部分緩慢添加氫化鋁鋰糰粒(1.5g,40mmol)。將溶液攪拌過夜,隨著冰浴融化而升溫至室溫。完成後,使反應物冷卻至0℃並用1.5mL 5M NaOH、隨後1.5mL水極其緩慢地淬滅。攪拌30分鐘,然後添加硫酸鎂並過濾。將濾液濃縮以得到無色油狀((3R,4S)-1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(2.7g)。
步驟3. 製備外消旋(順式)(3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇303
向((3R,4S)-1-苄基-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(10g,40mmol)於甲醇(10mL)中之溶液中添加濕的活性炭載10%鈀(1g)。將溶液在氫氣氛下劇烈攪拌16小時。完成後,將溶液藉助Celite過濾並濃縮至乾燥以得到無色固體狀((3R,4S)-3,4-二甲基吡咯啶-3,4-二基)二甲醇(5.5g,86%)。
步驟4. 製備外消旋(順式)10-(3,4-雙(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸甲酯304
3(1.3g,8.2mmol)及癸二酸單甲酯(1.8g,8.2mmol)於CH2Cl2(100mL)中之溶液用HBTU(3.41g,9.02mmol)及休尼格鹼(5.71mL,32.8mmol)處理。攪拌過夜後,將混合物用NaHCO3(飽和水溶液)、水及鹽水洗滌,然後乾燥(MgSO4)、過濾並濃縮。使粗製物質經受層析(梯度:0% CH3OH-CH2Cl2至20%)以產生4(1.8g,61%)。
步驟5. 製備外消旋(順式)10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)-甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸甲酯305
304(1.8g,5.0mmol)及4,4'-二甲氧基三苯甲基氯(1.7g,5.0mmol)於吡啶(180mL)中之溶液攪拌過夜。然後在減壓下去除吡啶并使粗製物質經受層析(梯度:0% CH3OH-CH2Cl2至10%)以產生黃色油狀5(1.4g,42%)。
步驟6. 製備外消旋(順式)10-(3-((雙(4-甲氧基苯基)-(苯基)甲氧基)甲基)-4-(羥甲基)-3,4-二甲基吡咯啶-1-基)-10-側氧基癸酸鋰306
向化合物305(3.0g,4.6mmol)於THF(50mL)及水(50mL)中之溶液中添加氫氧化鋰(121mg,5.0mmol)。將溶液在室溫下攪拌4小時,然後濃縮以去除THF。將剩餘的水溶液冷凍乾燥過夜以得到淺粉色固體(2.9g,定量)。將化合物306製備為兩種順式-非鏡像異構物之混合物。
方案57 合成全乙醯化半乳糖胺507
Figure 107112376-A0202-12-0195-531
用乙酸酐(1.25L,13.2mol)將於吡啶(1.5L)中之半乳糖胺鹽酸鹽(250g,1.16mol)處理45分鐘。攪拌過夜後,將反應混合物分成三個1L部分。將每個1L部分傾倒至3L冰水中並混合1小時。混合後,將固體濾掉,合併,經液氮冷凍,且然後凍乾5天以產生白色固體狀全乙醯化半乳糖胺507(369.4g,82%)。Rf(0.58,10% MeOH-CH2Cl2)。
Figure 107112376-A0202-12-0195-532
步驟1 製備化合物509
將2-[2-(2-氯乙氧基)]乙醇508(100g,593mmol)於水(1L)中之溶液用NaN3(77g,1.19mol)處理並加熱(90℃)。攪拌(72小時)後,使溶液冷卻(室溫)並用CH2Cl2萃取(4x)。將合併之有機物用鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾,濃縮且不經進一步處理即使用。獲得淺黃色油狀化合物509(88.9g,86%)。
步驟2 製備化合物510
507(2.76g,7.1mmol)及509(1.37g,7.8mmol)於1,2-二氯乙烷(40mL)中之溶液用Sc(OTf)3(174mg,0.36mmol)處理並加熱(85℃)。攪拌(2小時)後,使混合物冷卻(室溫)並藉由添加TEA(4mL)淬滅並濃縮。使粗製物質經受層析以產生淺黃色泡沫狀510(3.03g,85%)。
步驟3 製備化合物511
510(3.02g,5.99mmol)及Pd/C(300mg,10% Pd負載-濕載體)於EtOAc(30mL)中之溶液用TFA(576μL,7.5mmol)處理。將反應混合物用氫氣吹掃 (45min),然後用氮氣吹掃(10min),然後藉助celite過濾。將濾液濃縮,且然後使其經受層析以產生褐色泡沫狀511(2.67g,75%)。
Figure 107112376-A0202-12-0196-533
步驟1. 製備5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基 )乙醯胺基)-間苯二甲酸二甲酯312
將5-胺基間苯二甲酸二甲酯(5g,24mmol)、Z-Gly-OH(5g,24mmol)、EDC(5g,26.3mmol)、HOBt(3.6g,26.3mmol)、NMM(2.9mL,26.3mmol)於DMF(50mL)中之溶液在室溫下攪拌過夜。完成後,將反應混合物用乙酸乙酯(250mL)稀釋並用各1M HCl(2 x 100mL)、飽和碳酸氫鈉(1 x 100mL)及鹽水(2 x 100mL)洗滌。在硫酸鎂上乾燥,過濾並濃縮至乾燥以得到無色固體狀5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)-乙醯胺基)間苯二甲酸二甲酯(7.2g,79%)。
步驟2. 製備5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ 2 -乙基)胺基 )乙醯胺基)間苯二甲酸313
向5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)間苯二甲酸甲酯(7.2g)於甲醇(25mL)及THF(25mL)中之溶液中添加1M NaOH(25mL)。將溶液在室溫下攪拌2小時,然後濃縮以去除THF及MeOH。將剩餘的水溶液用水(75mL)稀釋,在冰水浴上冷卻,並用6M HCl酸化至pH=1。將固體過濾並用水(3 x 100mL)洗滌。將固體冷凍乾燥以得到5-(2-((2-側氧基-2-苯基-1λ2-乙基)胺基)乙醯胺基)-間苯二甲酸(6.9g,定量)。
Figure 107112376-A0202-12-0196-534
Figure 107112376-A0202-12-0197-535
步驟1 製備化合物514
313(2.09g,5.6mmol)及511(8.34g,14.07mmol)於CH2Cl2(150mL)中之溶液用HBTU(6.4g,16.9mmol)及休尼格鹼(7.35mL,42.2mmol)處理。攪拌(過夜)後,將反應混合物傾倒至NaHCO3(飽和水溶液)中,然後用水及鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析(梯度1-12% CH3OH-CH2Cl2)以產生淺黃色泡沫狀6(3.97g,55%)。
步驟2 製備化合物515
將化合物514(3.92g,3.07mmol)、Pd/C(400mg,10%負載-濕載體)及三氟乙酸(308μL,4mmol)用H2吹掃。在H2下攪拌(過夜)後,將混合物用N2吹掃(15-20min),然後藉助celite過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生呈白色至奶油色泡沫狀7(3.36g,86%)。
步驟3 製備化合物516
以與514相同之方式自Z-麩胺酸(306mg,1.09mmol)及515(3.3g,2.6mmol)製備化合物516。產率1.66g,60%。
步驟4 製備化合物517
以與515相同之方式製備化合物517。產量1.65g,定量。
方案61 製備完全偶聯物
Figure 107112376-A0202-12-0198-536
步驟1 製備化合物518
517(1.91g,0.75mmol)於CH2Cl2(100mL)中之溶液首先用休尼格鹼(392μL,2.25mmol)、然後306(兩種順式-非鏡像異構物之混合物,509mg,0.79mmol)、隨後HBTU(356mg,0.94mmol)處理。攪拌(過夜)後,將溶液傾倒至NaHCO3(飽和水溶液)中,然後用水及鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。使粗製物質經受層析以產生白色泡沫狀518(1.19g,52%)。
步驟2 製備化合物519
518(1.19g,0.39mmol)於1,2二氯乙烷(100mL)中之溶液用TEA(542μL,3.9mmol)、DMAP(238mg,1.95mmol)及琥珀酸酐(195mg,1.95mmol)處理 並加熱(85℃)。攪拌(2.5小時)後,將溶液自熱移除,且用CH3OH(10mL)處理且使其攪拌(1小時)。攪拌後,將混合物傾倒至NaHCO3(飽和水溶液)中,然後用鹽水洗滌,乾燥(MgSO4),過濾並濃縮。所獲得之殘餘物不經進一步處理即使用。產量=1.4g,定量
步驟3 製備偶聯物520
使用標準醯胺偶合化學,將琥珀酸酯519負載至1000Å LCAA(長鏈胺基烷基)CPG(可控微孔玻璃珠)上。將二異丙基碳二亞胺(52.6μmol)、N-羥基琥珀醯亞胺(0.3mg,2.6μmol)及吡啶(10μL)於無水乙腈(0.3mL)中之溶液添加至於無水二氯甲烷(0.2mL)中之519(20.6mg,8μmol)中。將此混合物添加至LCAA CPG(183mg)中。將懸浮液在室溫下輕輕混合過夜。519消失(HPLC)後,將反應混合物過濾並將CPG用各1mL二氯甲烷、乙腈、5%乙酸酐/5% N-甲基咪唑/5%吡啶於THF中之溶液、然後THF、乙腈及二氯甲烷洗滌。然後將CPG在高真空下乾燥過夜。藉由標準DMTr分析藉由UV/Vis(504nm)測得負載為19μmol/g。將所得GalNAc負載之CPG固體載體用於使用標準程序之自動寡核苷酸合成中。進行核苷酸去保護,隨後自固體載體去除(同時進行乙酸半乳糖胺去保護)得到GalNAc-寡核苷酸偶聯物520。
實例28. TTR siRNA偶聯物之活體內測試
在TTR敲低之野生型小鼠模型中測試化合物320(其中R2包含表3中闡述之經修飾TTR siRNA)之活體內活性。在本實例中,證明化合物320(其中R2包含經修飾之TTR siRNA)係用於TTR(轉甲狀腺素蛋白)類澱粉變性之罕見疾病之可能治療劑。在罹患此疾病之彼等患者中,轉甲狀腺素蛋白之錯誤摺疊及聚集與疾病進展相關。藉由使用此siRNA-GalNAc偶聯物,可以減少患者中錯誤摺疊/聚集之蛋白質之量,其中可能的結果係疾病進展停止。因此,某些實施例提供化合物320(其中R2包含經修飾之TTR siRNA)及其用於治療轉甲狀腺素 蛋白類澱粉變性之用途。
Figure 107112376-A0202-12-0200-537
2'-O-甲基核苷酸=小寫字母;2'-氟核苷酸=大寫字母;硫代磷酸酯連接體=s;未修飾=大寫字母
TTR siRNA序列及動物模型二者係如Nair等人,J.Am.Chem.Soc.,36(49),16958-16961(2014)所闡述。所有動物相關之程序皆係根據書面操作程序、根據加拿大動物保護委員會(CCAC)之良好動物實踐指南實施且由地方機構動物照護及使用委員會(IACUC)批准。
siRNA處理:在第0天經由在肩胛區中進行皮下注射,向雌性C57BL/6小鼠(n=4隻)一次投與單次2mg/kg劑量之化合物320(R2包含經修飾之TTR siRNA)(每隻動物1個劑量)。一組僅投與媒劑(PBS)之動物用作對照。
收集:在測試物品投與後之確定時間點(在第2、4、7、9、14及21天)對所有動物進行放血測試以測定血漿TTR含量之最大降低及藥理學活性之持續時間。
分析:使用Abnova Prealbumin(Mouse)ELISA套組(Cedar Lane,目錄號KA2070)根據製造商之說明書,測定血漿試樣中之TTR蛋白質含量。計算個別血漿試樣之TTR血漿蛋白值並測定每一組之平均值。根據該等平均值,確定相對於對照之TTR蛋白質含量(相對於PBS治療之動物之%)。
結果:測試結果呈現於表4中。值代表治療後第2、4、7、9、14及21天之TTR蛋白質含量%(相對於PBS對照)。
表4. 單次皮下投與(2mg/kg)來自表3之GalNAc偶聯之siRNA之後小鼠中的血
Figure 107112376-A0202-12-0201-538
結論:用化合物320(其中R2包含表3中所闡述之經修飾TTR siRNA)治療之動物展現靶mRNA及蛋白質之顯著敲低,其中在皮下注射後第4天與第9天之間出現TTR蛋白質之最大敲低。
實例.29. HBV siRNA偶聯物之活體內測試
在所確立之小鼠HBV感染模型中測試偶聯至GalNAc配體之闡述於實例25中表1中之經化學修飾HBV siRNA的活體內活性。在AAV-HBV1.2 C57BL/6小鼠模型中,在注射編碼HBV之超基因體長度序列之腺相關病毒(AAV)載體後達成穩定且持久的HBV表現,導致肝臟表現HBV RNA及蛋白質及將病毒及亞病毒粒子分泌至血液中。
用於該等研究中之AAV-HBV1.2構築體係基於Dion等人,Journal of Virology,87(10),5554-5563(2013)中提供之細節。所有動物相關之程序皆係根據書面操作程序、根據加拿大動物保護委員會(CCAC)之良好動物實踐指南實施且由地方機構動物照護及使用委員會(IACUC)批准。
利用AAV-HBV1.2載體之1E11載體基因體(VG)對每隻動物進行接種。在治療之前,對所有動物進行放血測試並測定個別動物之血清HBsAg含量,以證實所確立之HBV表現。
siRNA處理:在第0天經由在肩胛區中進行皮下注射,向小鼠(通常n=5隻)之組一次投與單次3mg/kg劑量之HBV siRNA偶聯物(每隻動物1個劑量)。一組僅投與媒劑(鹽水)之動物用作對照。
收集:在第0天、治療前及測試品投與後之確定時間點(例如在研究第7、14、21、28、42、56及70天)對所有小鼠進行放血測試以測定血清HBsAg 含量之最大降低及藥理學活性之持續時間。
分析:使用Biorad EIA GS HBsAg 3.0套組(BioRad,目錄號32591)根據製造商之說明書,測定血清試樣中之HBsAg含量。使用來自每一治療組之彙集血清來測定個別時間點之組平均HBsAg含量。分析數據並將其表示為相對於治療前基線之HBsAg含量(相對於第0天之%)。
結果:測試表1中所闡述之每一經化學修飾之HBV siRNA的結果呈現於表5中。值代表治療後第7、14、21、28、42、56及70天之HBsAg含量%(相對於第0天基線)。
Figure 107112376-A0202-12-0202-539
所測試之13種化合物中之每一者在單次劑量之皮下投與之治療後引起血清HBV表面抗原減少,其中在第14天或第21天獲得最大效應。顯示最大減少之四種化合物係化合物191a(其中寡核苷酸包含siRNA 3或25)及化合物320(其中R2包含siRNA 3或25)。該四種化合物由於在第一時間點(第7天)更快 速地減少(
Figure 107112376-A0202-12-0203-356
97%)、更大的最大減少(
Figure 107112376-A0202-12-0203-357
99%)及更持久的減少效應(在治療後8週第56天,仍然
Figure 107112376-A0202-12-0203-358
97%)而顯著。
<110> 加拿大商艾爾布圖斯生技公司(ARBUTUS BIOPHARMA CORPORATION)
<120> 靶向組合物
<130> 08155.067TW1
<140> TW 107112376
<141> 2018-04-11
<150> US 62/525,071
<151> 2017-06-26
<150> US 62/484,247
<151> 2017-04-11
<160> 76
<170> PatentIn 3.5版
<210> 1
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (18)..(18)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (19)..(19)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (20)..(20)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 1
Figure 107112376-A0305-02-0207-5
<210> 2
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (18)..(18)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (19)..(19)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (20)..(20)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (21)..(22)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (23)..(23)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 2
Figure 107112376-A0305-02-0210-6
<210> 3
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 3
Figure 107112376-A0305-02-0213-7
<210> 4
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (18)..(18)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (19)..(19)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (19)..(20)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (20)..(20)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (20)..(21)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 4
Figure 107112376-A0305-02-0215-8
<210> 5
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 5
Figure 107112376-A0305-02-0218-9
<210> 6
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (18)..(18)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (19)..(19)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (19)..(20)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (20)..(20)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (20)..(21)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 6
Figure 107112376-A0305-02-0220-10
<210> 7
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 7
Figure 107112376-A0305-02-0223-11
<210> 8
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
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<400> 8
Figure 107112376-A0305-02-0225-12
<210> 9
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
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<220>
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<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
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<400> 9
Figure 107112376-A0305-02-0228-13
<210> 10
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<222> (3)..(3)
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-氟核苷酸
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<220>
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<220>
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<400> 10
Figure 107112376-A0305-02-0231-14
<210> 11
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<222> (2)..(2)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<222> (3)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
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<220>
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<220>
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<220>
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<400> 11
Figure 107112376-A0305-02-0233-15
<210> 12
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0236-16
<210> 13
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
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<220>
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<222> (2)..(2)
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 13
Figure 107112376-A0305-02-0239-17
<210> 14
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<222> (13)..(13)
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<221> 尚未歸類之特徵
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<221> 尚未歸類之特徵
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Figure 107112376-A0305-02-0242-19
<210> 15
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<400> 15
Figure 107112376-A0305-02-0245-20
<210> 16
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
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<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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Figure 107112376-A0305-02-0248-22
<210> 17
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
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<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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Figure 107112376-A0305-02-0250-23
<210> 18
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0253-24
<210> 19
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<220>
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<222> (2)..(2)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
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<220>
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<220>
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<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 19
Figure 107112376-A0305-02-0256-27
<210> 20
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
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<220>
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<222> (6)..(6)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
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<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<400> 20
Figure 107112376-A0305-02-0259-28
<210> 21
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0261-29
<210> 22
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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Figure 107112376-A0305-02-0264-30
<210> 23
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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Figure 107112376-A0305-02-0267-31
<210> 24
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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<210> 25
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<220>
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<220>
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<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 25
Figure 107112376-A0305-02-0272-33
<210> 26
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (18)..(18)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (19)..(19)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (21)..(22)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (22)..(22)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (23)..(23)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 26
Figure 107112376-A0305-02-0275-34
<210> 27
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<400> 27
Figure 107112376-A0305-02-0278-35
<210> 28
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
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<220>
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<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
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<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<400> 28
Figure 107112376-A0305-02-0281-36
<210> 29
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
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<400> 29
Figure 107112376-A0305-02-0283-38
<210> 30
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
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<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<222> (9)..(9)
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<220>
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<223> 2'-氟核苷酸
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<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<400> 30
Figure 107112376-A0305-02-0286-39
<210> 31
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
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<220>
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<222> (5)..(5)
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<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
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<222> (13)..(13)
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 31
Figure 107112376-A0305-02-0288-40
<210> 32
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
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<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (18)..(18)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (19)..(19)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (19)..(20)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (20)..(20)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (20)..(21)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 32
Figure 107112376-A0305-02-0291-41
<210> 33
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 33
Figure 107112376-A0305-02-0293-42
<210> 34
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<222> (5)..(5)
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<400> 34
Figure 107112376-A0305-02-0296-43
<210> 35
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0299-44
<210> 36
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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<400> 36
Figure 107112376-A0305-02-0302-45
<210> 37
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
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<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0304-46
<210> 38
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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<220>
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<220>
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<222> (3)..(3)
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<220>
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<220>
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<222> (6)..(6)
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<220>
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<220>
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<222> (21)..(21)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (21)..(22)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (22)..(22)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (23)..(23)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 38
Figure 107112376-A0305-02-0307-47
<210> 39
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<400> 39
Figure 107112376-A0305-02-0310-48
<210> 40
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<221> 尚未歸類之特徵
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Figure 107112376-A0305-02-0313-49
<210> 41
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0315-50
<210> 42
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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<400> 42
Figure 107112376-A0305-02-0318-51
<210> 43
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0321-52
<210> 44
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (23)..(23)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 44
Figure 107112376-A0305-02-0324-53
<210> 45
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (18)..(18)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<400> 45
Figure 107112376-A0305-02-0326-54
<210> 46
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
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<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (22)..(22)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (23)..(23)
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<400> 46
Figure 107112376-A0305-02-0329-55
<210> 47
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
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<220>
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
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<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 47
Figure 107112376-A0305-02-0332-57
<210> 48
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
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<220>
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<220>
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<220>
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<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<400> 48
Figure 107112376-A0305-02-0334-58
<210> 49
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<220>
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<222> (1)..(2)
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<220>
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<222> (2)..(2)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
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<220>
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<220>
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<400> 49
Figure 107112376-A0305-02-0337-59
<210> 50
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<220>
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<222> (1)..(2)
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<220>
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<222> (3)..(3)
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<220>
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 50
Figure 107112376-A0305-02-0339-60
<210> 51
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
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<220>
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<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
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<222> (8)..(8)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
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<400> 51
Figure 107112376-A0305-02-0341-61
<210> 52
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
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<220>
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<220>
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<221> 經修飾鹼基
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<400> 52
Figure 107112376-A0305-02-0344-62
<210> 53
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0346-63
<210> 54
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<212> RNA
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Figure 107112376-A0305-02-0349-64
<210> 55
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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<210> 56
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<212> RNA
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<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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<210> 57
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<212> RNA
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<400> 57
Figure 107112376-A0305-02-0357-67
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<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
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<220>
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<220>
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<221> 尚未歸類之特徵
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Figure 107112376-A0305-02-0360-68
<210> 59
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0363-69
<210> 60
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0366-70
<210> 61
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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Figure 107112376-A0305-02-0368-71
<210> 62
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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<400> 62
Figure 107112376-A0305-02-0371-72
<210> 63
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<222> (1)..(1)
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<220>
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<220>
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<222> (2)..(3)
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<400> 63
Figure 107112376-A0305-02-0373-73
<210> 64
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<222> (2)..(2)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
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<222> (4)..(4)
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<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (11)..(11)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (12)..(12)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (14)..(14)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (15)..(15)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (16)..(16)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (18)..(18)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (19)..(19)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (19)..(20)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (20)..(20)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (20)..(21)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 64
Figure 107112376-A0305-02-0376-74
<210> 65
<211> 17
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (17)..(17)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 65
Figure 107112376-A0305-02-0378-75
<210> 66
<211> 22
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<222> (5)..(5)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (9)..(9)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (10)..(10)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<220>
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<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
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<400> 66
Figure 107112376-A0305-02-0381-76
<210> 67
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
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<222> (7)..(7)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
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<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (13)..(13)
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<220>
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<400> 67
Figure 107112376-A0305-02-0383-77
<210> 68
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<220>
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<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-氟核苷酸
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<221> 經修飾鹼基
<222> (19)..(19)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
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<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<400> 68
Figure 107112376-A0305-02-0386-79
<210> 69
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
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<221> 經修飾鹼基
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<221> 經修飾鹼基
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<220>
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 69
Figure 107112376-A0305-02-0389-80
<210> 70
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
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<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (3)..(3)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (4)..(4)
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<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (5)..(5)
<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (6)..(6)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (7)..(7)
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<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
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<220>
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<223> 2'-氟核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (21)..(21)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (21)..(22)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (22)..(22)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (23)..(23)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 70
Figure 107112376-A0305-02-0392-81
<210> 71
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (1)..(2)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (2)..(2)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
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<221> 經修飾鹼基
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<220>
<221> 經修飾鹼基
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<220>
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<222> (7)..(7)
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<221> 經修飾鹼基
<222> (8)..(8)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
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<400> 71
Figure 107112376-A0305-02-0394-83
<210> 72
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
<221> 經修飾鹼基
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<221> 尚未歸類之特徵
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<221> 尚未歸類之特徵
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<400> 72
Figure 107112376-A0305-02-0397-85
<210> 73
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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Figure 107112376-A0305-02-0400-86
<210> 74
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
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<220>
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<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
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<222> (23)..(23)
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Figure 107112376-A0305-02-0403-87
<210> 75
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<221> 尚未歸類之特徵
<222> (2)..(3)
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Figure 107112376-A0305-02-0406-88
<210> 76
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列之說明:合成 寡核苷酸
<220>
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<222> (3)..(3)
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<222> (21)..(21)
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<221> 尚未歸類之特徵
<222> (21)..(22)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (22)..(22)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<220>
<221> 尚未歸類之特徵
<222> (22)..(23)
<223> 硫代磷酸酯連接體
<220>
<221> 經修飾鹼基
<222> (23)..(23)
<223> 2'-O-甲基核苷酸
<400> 76
Figure 107112376-A0305-02-0409-4
Figure 107112376-A0202-11-0001-582

Claims (9)

  1. 一種化合物或其醫藥學上可接受之鹽,
    Figure 107112376-A0305-02-0410-1
    其中R2係核酸。
  2. 如請求項1之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其由下式代表,
    Figure 107112376-A0305-02-0410-3
    其中R2係核酸。
  3. 如請求項1或2之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2係雙鏈siRNA分子。
  4. 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之載劑。
  5. 如請求項4之醫藥組合物,其中該組合物係用於皮下投與。
  6. 一種如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽的用途,其係用於製備遞送siRNA至動物肝臟之醫藥品。
  7. 如請求項6之用途,其中該醫藥品係用於皮下投與。
  8. 一種如請求項1至3中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽的用途,其係用於製備用以預防性或治療性治療動物之B型肝炎病毒感染之醫藥品。
  9. 如請求項6至8中任一項之用途,其中該動物係人類。
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