TW213951B - - Google Patents
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Description
A (i H () 經濟部屮央標平局0工消作杜印11 明説明(,) 本發明為有闢一種新顥霣讎,詳言之為一可於大觴桿 _及豔嫌齠複製之往返載讎.含有由豔球豳類之侧囊胞 SI P B A 1 之 〇 Γ i A 匾 D N A 片段 β β鐮齠Μ囊胞结具類似离等植物特如红藻之光合作用 檐製.可由水,二《化磺及微量無機*生物合成有機物, 故為自營繁殖β且.《1«!跑SS為單细瞄,於洋菜基上形 成〇丨豳落,且其R2菌株易将DNA帶入细_内,故可依撖 生物及遣傳方法加以轉形· 故近來由使用侧囊胞齠R2齠株(如PUH24及PUS25)内生 質體發展許多S殖載鼸(參見C.A.H.J.J. von der Hondel 等人,P i* o c . N a t 1 . A c a d . S c i . U S A 7 7 ( 3 ) ; 1 5 7 0 - 1 5 7 4 ( 1 9 8 0 ) ;C.J.Kuhle^eier等人,Mol.Gen.Genet.184:249-254( 1981);L, ASheran及 P.van do Putte.J.Bacteriol.180 (1):410-413(1982);S.Gendel等人,J.Bacteriol 156 (1):148-154(1983 ) ;S.S.GoldenftL.A.Sherian.J. Bacteriol.155(3):966-972(1983);C.J.Kuhle^eier等人 ,Plasmid 10:156-163(1983);C.J.Kuhleieier等人, G e n e 3 1 : 1 0 9 - 11 6 ( 1 9 8 4 } ; D . E . L a u d e n b .等人,Μ o 1 · G e n , Genet, 199:00-302(1985) ;K.Y.Cruber1f Λ , Curr. Hicrobiol. 1 5 :265-268 ( 1 987 ),等〕,且用於如引入外 來基因及基因遘殖》 使用R2B株表現異生蛋白霣之例有,人讎磺酸脱水_ 及大腸桿篇lac IQ抑制蛋白〔G.D.Price及K.R.Badger, (ί*/1先閲 Α'·ι<竹而之;/).ifJfj^-'ii巧本灯) 裝. 本紙張尺度边用中as家炫準(CNS)1? 4規怙(210X297公«) 81. 2. 20,000 ‘U.:、發’説叫(>) Plant Physiol 91:505-513(1989)〕,解澱粉芽抱桿 《 A 50之 α -激粉酶[I.V.Elansk&ya及 I.B.Morzunoba.Mol •Genet Microbiol Virasol.0(9}:7-l(1989)〕,球形芽 孢桿醣1 5 9 3 H之殺ft蛋白質[D.J.Scanlan等人· Gene. 9 0 : 4 3 - 4 9 ( 1 9 9 0 ) . M.R.Seh&eter* S.S.Golden,J. Bacteriol 171Π>:3973-398Η1989Π ,大腸榫 β 之 Hn -遇氣技化 _ [M.Y.Gruber等人,Proc.Natl.Acad.Sci. USA 8 7:2 6 0 8 - 2 6 1 2 ,入噬皤钃之(clts之抑制蛋白霣[ D.Friedbergft J.Seiifers,Mol.6en.Genet.203:505-510 ( 1 9 8 6 )] , cya ηobacteriu Synechosystis PCC.6 80 3 株之 disaturase[H.Wada等人.Nature 347:200-203( 1 9 9 0 )]等 0 此外,例囊胞«6301株被使用以网生質體(PBA1)載鼸 (與大腸桿阐之兩棲_鑛> 如PBAS 18〔 12fcb,IL.Shinozaki e t al. , Gene. 1 9 : 2 2 1 - 2 2 5 ( 1 982 )]及 pBAS 5 C 1 4kb . kazuo Shinozaki,"Shofcubutsu Idenshi Sosa GijutBH"(植物 基因搡作技術),由Hikoyuki Ya"guchi指導,98至llfl 頁,CMC發行〕上發展。但,毎一載《於基因操作上皆有 困雞,如可被嵌入任一載鼸之基因大小皆受限制,因其 本身即已有lOlib以上長度且任一 _體僅有少數可供SRI 之限制内切核酸期I作用部位《且· 6301齠株和R2_株相 比有不易將基因D Η Α»入纗胞内之缺點·故其轉形頻率 低於R2篇株·為增加6 3 0 1 68株轉形頻率,B.Daniell,
本紙張尺度边用中明囤家4i^(CNS)»F4規格(210X297AW 81. 2. 20,000 經濟部屮央桴準而卩工消frN-作杜印5Ϊ 1、發明説明u ) et al.〔PNAS(USA), 83 : 254β-255Μΐ986)〕,提出将 6301«株之细胞以EDTA-溶»素處理形成通透雎靨( Perieaplasts),而使其易於帶人DNAe事實上此法的確 成功地增進了 63ϋ1®株的轉形頻率,但有如操作簧畤複 雜且更會因EDTA-溶β衆處理而損傷细胞之缺點· 故,為提离側囊胞齠6301皤株轉形頻率,構築一易於 基因操作處理之質β,本發明首先専研纽I小質麟•«由 將6301®株内生質讎pBAl複製起始S外之部份盡置縮小 做為-基部.U旧丨時將1比1體與含大梢閉C 〇 1 . E 1霣黼複»起始B (OriES )且其中由rop® (也稱γο·Ε但本發明中稱為1*0口 區定義之基因己除去之卯Α丨;段結合.、!!两使1m. I) (: 1 «所用之多申選范运·S' 而成功地製得4顯笤增強6 3 0 1 Μ株轉衫_苹之f j體,! !因ίίπ完,木特叫 故本發明明提供一能於大腸桿醣及籃嫌篇中複製生畏 之往返載體霣鼸,具有 U)由供囊胞睹所衍生之pBAl質鼸的OriAS · (b) 多重選殖匾,及 (c) 含OriEB且其由rop區定義之基因己去除之大鼸桿® 素E1質饑匾域β 以下詳述本發明之《黼· ”由侧囊胞齠所衍生之ΡΒΑ1»讎的OriAE "<籣稱"OriA" )於本發明之質讎中為含由豔*藻中cloococcus屬鲕囊 胞豳 6 3 0 1 ( S y n e c h 〇 c 〇 c c u s P P C β 3 0 1 , A T C C 2 7 1 4 4 , ϋ T EI 625¾株)之兩内生霣讎中分子量<5.04 土 0.2β>Χ 10» ( (-先閱-作而之沁^贺川^^巧木·^) 本紙張尺度边用中Sffl家標毕(CHS)T^ii岱(210x297公及) 81. 2. 20,000 A (; η ()_______ 發叫説明(斗) 霣子顯微分析所得)或5.2Χ 1〇β (洋菜醪《泳分析所得 )〔K.Shinozaki et ai.,Gene. ,1 9:2 2 1 - 2 2 4 ( 1 9 8 2 )〕之 PBAI質體所衍生之複製起始S之基因H段,大小遍常為 2.8至8.0111),以2.8至4.41[13之範園為佳。特以由^1»〇1及 Ββ·ΗΙ兩限製醐切拥pBAl所得4.4kb之含OriA區DNA片段, 或是以PvuII及Ββ·ΗΙ切割PBAI所得之3.3kb含OriAB之 DNA片段等。 "多重 選殖B"(簡稱"HCB")為具種種限制内切核_ _辨織部位的序列(又稱多達结子(Polylinker ί ) *包括 作為大颺捍«應殖載讎之〇〇181質_?旧,如具EcoRI,
SacI,Kpnl,Seal,X«aI,BaBHI,XbaI.SalI,AccI,Hindi,
PstI,SphI及Hindlll限制内切核酸W辨織部位之55bP DNA片段,及,由pus12, PUC13. PUC19等衍生之MCB及 大腸桿齄噬《讎載讎H13之HCB亦可❶更甚者•亦可用 化學合成之HCB β
於本發明中用於與OriA及HC结合”含OriE堪且其中由 γορΒ定義之基因己除去之由Col E1霣讎衍生之B域"( 簡稱"OriE")意指大腸桿0中所用之co1 E1質讎禊製起 始B且其複製數(Copy number)為毎細胞20至30。此OriA
之代表性例為可用限制内切核酸_PvuII; AvaI,Ba*HI ,Eco47III,EcoRV, PstI 等由 PBR 3 2 2 切出,大小為 1.5 至 4.1kb,以1.5至2.5kb為佳且可使用質讎PUC18衍生之含 OriE DNAH 段。 81. 2. 20,000 (^先«!../;开而之./1':-卞川卟诏.?;;木.0;) 線- 本紙张尺度遑用中國困家《^(CNS)IM規怙(2丨0X297公放) Π (ί /;、發明説明(Γ ) 且,此含OriE之DNAH段可含抗蕖基因如安比西林抗 藥基因U p f ),作為避殖指樣。 只要是本發明所提供之質讎則分具前述三種必要基因 E , EP 0 r i A , M C E及0 r i E之D N A Η段,可含*箝其他蠢 傅訊息之DNAH段,如安比西林抗蕖基因做為抗抗生索 指禳且/或氰徽素基因做抗抗生素指標。此質體之典型 例為由本發明者命名之"質體ΡΒΑΧ18”,及”質讎ΡΒΑΧ20” 其含OriA,MC及OriE匾3基因區域之DNA片段,分子置分 別為 4.48MDa(约 6.9kb)及 3.76MDa(約 5.8kb)· 本發明中,霣釅分子量由洋菜謬《泳法澜得β 以下詳述質體ΡΒΑΧ18及ΡΒΑΧ20。 画1為質體ΡΒΑΧ18限制内切核酸Μ興·。 函2為質《|ρΒΑΧ20限制内切核酸_興_, 圖3為質髓ΡΒΑΧ18及ΡΒΑΧ20之構築β 質讎ΡΒΑΧ18及ΡΒΑΧ20對各種限制期辨織部位數目及限制 内切核酸酶切割Η段畏度(kb}示於表1。且,ρΒΑΧ 18及 ΡΒΑΧ20之限_内切核酸_興_示於圏1至2。 7 本紙張尺度边用中國Η家標準(CNS)T4規格(2丨Οχ297公兑) 81. 2. 20,000 -η iVJ Λη_ 而 木 (i Λ (ί ΙΠ;
S a m ΗI xr,al :/1彳 5 Τ Bg:II Hpal Ξ〇ο. Η V Seal FvuII Hindi: Kpnl PstI
pgMa· S -π 先 間 Ά 竹 3.8, 1.M5 0.OO5, 0.55 P25 2·8 , 1 ;V5 5 , C. 3 7 8.f- σ · 5.9 IT.9 Γ 0 s s H®珈» (kb)
stKPBAX IS Λ. 'fi I1} 木 α 裝 .線 0 0 經濟部屮央楛準劝八:作杜*f5i
本紙張尺度边用中a ffl家榀毕(CNS) Ή册Μ 2 ] 0 X :!D7公及) 81. 2. 20,000 A (i Η (i 經濟部屮央標平沿Ht-/νί你合作杜卬¾ 五、#叫説叫(7) 本發明中具上述特性之質讎PBAX18及pBAX2〇,可由如 下方法製得· 首先,由含《囊鼸鐘所衍生之霣βρΒΑΙ OriA DNAH 段可依習知方法(T.Haniatis et al.. Molecular Cloning-a Laboratory Manuo^l-,published by Cold S p r i n g B a b o r L a b o r a t o r y).於大腰桿鏞中 fi 播侧 β «及大《桿齠之往返«讎PBAS18(參考K.Shinozaki et al.,Gene 19:22 1- 22 4 (1982)〕,再依習知方法(1·· Kaniatis et al.,Holecular Cloning),由所選殖之質 臞PBAS18以一组BaiHI及Xhol限制内切核酸M或BaiHI及 p v 限制内切核St to之糾合加..丨.U1]别·由丨丨L. . Ilf分别丨π到约L Mi 約3 . 3ltb之含Ori A之DN A片段。必要時,可用T 4 DNA聚 合酶將5’-突出嫌加以變鈍。 另一方面,«黼PUC MCB可由如以限制内切核酸_ EcoRI及Hindlll切拥霣髅PUC18製得。 且,可簡便地利用質鼸PBR322,(其為一典型Col E1 質臞 >,做為含Col El霣鼸OriEB且其由roplg決定之基 因己去除之DNA片斷· 故所得MCB輿以限制内切核酸_EcoRI和HindIII®_ 之霣體PBR 3 2 2結合•以T 4 DNA结合酶處理得到上述HC 匾殖入霣 P B R 3 2 2之質讎P B K 3 2 2 Μ ·將由限制内切核_ _ Eco47III 及 PvuII切拥之霣籲 PBR322M.與含 OriB 及 NC B之2 · 5 k b D Η A片斷及上述含〇 r i A D Η A片斷结合•以Ϊ 4 DNA接合_作用可得所欲之霣讎PBAX18及PBAX20· -9 - 81. 2. 20,000 ___ϋϋ_ 五、發明説明u ) 钃3為質fl|pBAX18及PBAX20構築,其特殊製法於例 中教述 而本發明中所製備之質讎為具可於大腰捍朗中自行複 製之OriEB及可於侧囊胞«中自行複製之OriAH之往返 載鼸質體。故,本發明質讎可使用大腸挥齠快邃大量生 産,所得之大量霣醒可使藍錄_如僳囊胞菌有效轉形。 且,由於本發明中MCE己殖入霣體,故除霣*pBAS18 唯一所用之EcoRI辨識位置外可利用如S*aI,Ba*HI,XbaI ,ScaI及EcoRV做為嵌入(外來 > 基因辨雄位置。 且,本發明«髏可縮小質讎pBAX18(12kb)約一半大小 (6.9kb至5.8kb),因質體pBAl中除OriAE之外的DHA部 份已於本發明質鱺中去除。故,可於本發明質鼸中殖入 一較可殖入PBAS18質體外來基因大之外來基因β 將具上述特性之本發明質體以基因操作法引入寄主細 胞之方法可依已知,如 D.A.Liahtfoot et al.,J.Geieral Microbial 134:1509 - l 514(1988)所敘述之方法 β 經濟部屮央標準杓ML消作杜印5Ϊ 此轉形的對侧囊胞睡6301,其轉形頻率可提离約1000 倍(對以質體PBAS18_形相同®株而言}·故,使用本發 明質B,甚至於有外來基因嵌入時,可易於邐取嵌入 目的基因質臞之细胞。 可嵌入本發明質黼之结構基因可由供囊胞»,其他藍 嫌菌細胞,其他細豳及高等動植物所衍生之结構基因等 ,故不受其來源限制.且亦可使用化學合成之结構基因 -1 0 - 本紙張尺度边用中國國家標準(匸吣)〒4規格(21〇父^/公龙) 81. 2. 20,000 經濟部屮央標準劝:消t合作杜印¾ _IUi_、發明説明(9 ) 匾用為本發明質體之殖入結構基因〇此基因之例子為如 化學合成之人類《氣枝化SS [h-SOD,h-SDD-Alae (參考 日本待公開専利申讅第158884/ 1990»等]β 本發明質·以下例詳述之„ 例 1 ( 1 )將多重《殖Ε (衍自P U C 1 8 )引入 A)pBR322之EcoKI-Hindlll切拥及鹹性磷酸期處理 於20>u l(10>u g)之pBR322 DNA溶掖中加入40# 1之5倍 HindI I I ί* 街液(50·Μ rris-HCl(pH7.5),35iM MgC1 2 , 3〇〇·Μ Nacl) ,80單位(i〇/U i>HindIII (由簀酒造公司出品 ),及130>u 1無齠水後將混掖於37T:中培餐2小時。反 慝後,於産物溶掖中加入40,“1 5倍EcoRI緩衝掖(500·Μ Tris-HCl (pH7 . 5) , 35·Μ Η gC t 2 , 2 5 0 ·Μ Nacl, 35·Μ l~Vt 氫乙酵,0·05%小牛血清白蛋白),120單位(10#1) EcoRI (由寶酒造公司製造)及50>ul無®水.再於37*C中 反應2小時。反慝後,以酚-氨仿處理及酒精沈澱,收
-Π 間 Λ;V 之 Λ A 集所得 D N A ,溶於 1 0 0 >u 1 , 0 . 1 Μ T r i s - H C 1 ( p Η 8 . 0 )後, Ρί加入10 U1鹼性磷持胸. Ί5: Ϊ!'1! ;v (1 單位 /10 1)1 鹼竹礤酷 _· 10 rnM 丨丨(:丨(ρΗ7.γη. Γ’0 γπΜ Nacl,l ·Μ ZnS04 ),再於37°C中反瞳1小時.反蠹後, 再追加10//I鹹性磷酸_溶液,再於65-C反應30分鐘β 所得産物溶掖以酚-氱仿《理再經酒精沈毈,收得DNA» Β)從 PUC18 分離多重菝殖 E (EcoRI-Hindlll) 於_小管30//l(2〇Ag)pUC18 DNA溶液中,各加入20# 1 〇 倍 K 播衡掖(2 0 0 Η T r i 8 - H C 1 ( p Η 8 . 5 ) , 1 0 0 _ Η M g C 1 2 , 11 本紙尺度边用中國國家標準(CNS) 1M规格(2】(1X2(JV公楚) 81. 2. 20,000 Λ (; IU; 丘、發明説明(λ 〇) 10·Μ DTT , 100·Μ Κ C 1 ) , 8 0 單位(1 0 # 1 ) H i η d I I I 及 1 4 0 >u 1 0 反DN P 得 37收 於澱 各沈 ,精 水酒 £ 並 無理 tA 於 溶 而 後 應 反 無 處得 仿所 氰於 斷KO 艟 入 各 中 液 溶 後
中 •C 倍應 5 -, 反 及 掖 酒 以 0 時 小 ( A 位DN 單澱 90沈 丨精 \y IX Λί 之 牧 回 再於1.5%洋菜膠霣泳分離目的DNA片斷(約50bp),由膠 鼸中溶離DNA,以酚-氰仿處理,酒精沈澱純化。 C)pBR322(以EcoRI-Hindlll切拥)與多重選殖B黏合 於 0.2// g{ \ μ 1 ) PBR 3 2 2 ( EcoRI -H indl I I , AP* 理)DNA 及 0 . 2 >u g ( 1 /z 1 )多重選殖 B D N A 加入 1 m 1 T E (1 0 Μ T r i s-HCl(pH8.0),l_M EDTA)及 24//1 Takara 黏合組套 A 溶液 ,混勻混掖後加入3>ui Takara酚-氰仿合合組B溶掖, 於1 6汜反鼷4小時。 D )質《3 P B R 3 2 2 Μ之趲殖 於3>u l(40ng>所得》S合溶液加入以50·Μ CaCl2處理 之2 0 0 # 1大腸桿《 Η B 1 0 1 , ffi和ffl合之。於冰水中培餐 半小時後於42Ό培餐2分鐘使细胞圾取DNA。於懸浮掖内 加入1.8·1 2ΥΤ液體培餐基(16g/l胰化蛋白鼸,10g/l 酵母萃取液,5g/l NaClh混掖並於37-C搖晃培餐1小 之 '/(Af 項办墒1'>;7^.=0 經濟部屮央標準XJn L消作合作杜.rp5i 於 \ 鋪5g 平· 後C1 時Na 基 餐 培 菜 洋 嫌 白 蛋 化 胰 \ g ο 5 含 /V 掖 取 萃 母 酵 «32 質ΒΓ 到(P 得 β 落質 @ 的 成目 形含 所得 由 0 ) 林 西 比 安 灌 篩 興 N 酸 核 切 内 刺 限 析 分 以 蓍 培00 的 拜0 嫌 所 0 落 篇 之 本紙張尺度边用中困國家楳準(CNS)T4規仂(210x297公犮) 81. 2. 20,000 A (i Π (i 五、發明説明(㈠) 於2 0 0 1 2 Υ T液讎培餐基(含1 0 0 >u g / 1安比西林)並依 SDS-alkali法大量製備霣AIDNA。 <2)軍離 PVUI1-EC047III片段(2550bp> 同(1)中裂法之g/ 1〇私UPBR322M質《IDRA中加入 2〇u 1 0 倍 M S 衢液(100 臟 Μ ΤΓί8-Β(:1(ρΗ7·5),100·Μ
HgC 1 2 , 10臟M DTT , 500·Μ Ν aC 1 ) , 12〇Stt (ΐ〇^ l)Pvu ΙΙΙ(寶酒堆公司出品)及無®水使混掖總龌建200/ζ 1β 於37*0反應3小時後以酚-氱仿處理,以酒精沈澱牧集DNA .分溶於174·1無醎水中•溶液内分別加入20/il 1〇倍 Η緩衡掖及24單位Eco47III(由寶酒造公司出品),並分 別於37*C反應3小時。反*後以酒精沈》得DH A後以1.5 %洋菜顧霣泳分離目的DNAH段<2550bp>e &Geneclean 純化分離之 D Ν A 片段形成 5 0// 1 0 1 H T r i 8 - H C 1 ( ρ Η 8 . , 溶掖·於溶液中加入5>ul鐮性《酸_溶掖後於37*〇反窿 1小時。反應後再加入5#1_性供酸_溶液再於β5<Ό反 醮30分鐘,以酚-氰仿處理後.酒精沈».收集所得DNa ,溶於 20 1 ΤΕβ (3)分離ft囊豳β之PBAS18複裂起始黏 將往返質讎?8冉318(1(.8111(1〇281^61:(^1.,66118 19: 經濟部+央標準劝A'L-vifr合作杜印1i 22卜224(1982)]〔可於大颺捍_及供囊胞鹧中複製生 長,其中將供囊16鏞6 30 169株之一内生質體(pBAl,以 Ββ·ΗΙ切割)殖人PBR322之BaMI位〕引入大腸桿_ 〇1〇1 株》所得齠株於含5fl>ug/il安比西林之LB液體培餐基 -1 3- 81. 2. 20,〇〇〇 本紙》尺度边用中Η國家標準(CNS)>fM規W(210X297公垃) W (i__ 五、發明説明(p) 中培餐,以SDS -齡性法大《製備__質鼸。於14#g(2〇 A 1)製得PBAS18 DNA中加入20>u 1 10倍k纽衡液,100 軍位(10# l)BaiBI(由寶酒迪公3出& )及麵0水使毎一 小管總«稹為200//1.該小管於30*0反鼴3小畤後以酒 精沈»枚集DNA·以1%洋菜膠霣泳分離目的DNAH段( PBA1,約 8.0kbp)並以 Geneclean 純化。於 2#g(5#l)分 離鲔化之PBA1 (以Ba«HI切剌)之DNA中加入10倍K緩衝液 ,24擊位(2>u l)XhoI (由簀酒进公司出品)及38# 1無® 水,將混液於37*C反應:3小時後,以氛仿處理及酒 精沈醸收集DNA。所得以BaiHI-XhoI切割之pBAl DNA兩 衊以Takara補齊组套加以變鈍(blunted)。 (4) 構築縮小之大腸桿«及《囊睢齠往返載讎PBAX18( 6 . 9 k b ρ ) 於 40ng(2iu 1>變鈍之 DNA及 200ng(4iu 1)PuvIIEco47III DNA片段加人48//1 Takarafc合组套A溶液,充分混合 後再加入6# 1 B溶液後於16*C下反應4小畤·以此溶 掖將大颺桿篇BB101篇株_形後平鍤於LB洋菜培餐基(含 5 0// g/*l安比西林及1.5%洋菜)可得«落•由明落中 »備霣驩,並以分析限制内切核酸鼸興籂S含目的霣 釀PBAX18之《落。《選所得之B株以毎瓶45·1之2 YT掖 讎培餐基(含100# g/ ·1安比西林)培餐以SDS-_性法製 備霣fll DNA· (5) 製備 PBAX20(約 5.8kb) -14* 81. 2. 20,000 (••-'•先閒^介而之.'1-"#^,々^"^“) 本紙張尺度逍用中SH家楳準(CNS)T4垛IM210X29V公祛) Λ (i l\ (; 五、發明说明(G) 於 1// g(4# 1)(3}所製得之 Ba_BI-XhoI(鈍)BNAH 斷加 入2>ul 10倍Η缓衡掖,ι#ι(ΐ2摩位)Pvull及13/ul麹 Μ水後於37°C反應3小時。於2// I(l〇〇ng)本反鼴掖中 加入 100ng(2;u 1)由(2丨中所製捋之 PvuII-Eco47 DHAH 段及1β#1 TakaralS合组套a溶掖.充分混合後加入B 溶掖再於16*C反應2小時後,以本溶液將大颺榫《Η丨101 齠株轉形並平鋪於LB洋菜培養基上(含50# g/nl安比西 林及1.596洋菜)得到《落·由所得《落中鐮邇載有目的 質觴(PBAX20)之豳瑶並培餐於2〇〇·1 2YT掖鼸培餐基(含 100# g/il安比西林}並以SDS-鍊性法製備霣讎DNA· 例 2 倒囊胞豳6301之株轉形 將細胞於100»1BG-11掖齷培餐基中培餐1至5天後以 8000rp·速度5分鐮離心牧集細酶,懸浮於10111新鮮液 «培餐基(108至108細胞/ ·1)*將毎一毫升細胞戀浮 掖倒入聚乙二烯管(Falcon 2059}中·将由例1 ®得之 質體DNA加毎一管中(以1# g*度加入(PBAS18為10# g) 。分別以鋁》紙包裹管子,於30*0»夜培餐.除去«β 紙後於30*C以光照(10 0 0- 2000勒克斯)培餐之· 5倍裼 釋該懸浮掖(加入P B A S 1 8者不稀釋} •以1 〇 〇〜5 0 0// 1之 量平鋪於BG-11洋菜培餐基中(含1// g/«l安比西林及1·Η 硫代硫醆納及1.5%洋菜)·培餐平板於2000-3000勒克 斯光照下4至10日。 使用本發明質_畤所得_«_形鳞率為1〇~3至ΙΟ—4 -1 5- 本紙張尺度边用中SS家楳>Μ〇ί5)Ή^^(210χ:!97公及) 装- Τ» ---^ 線- M濟部屮央標準L消作合作杜卬¾ 81. 2. 20,000 -.^ ' s 4 Α6 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 五、發明説明( ) f 補充 細 胞 / U g質髖DHA , 約為使用 PBAS質體 時(1 0' 7細胞 / U g質體DNA)之1 000倍。 例 3 PBAS10 (約 10 .1 k b )之做成 例 1 - (3) 所 分離 精 製之pBA 1 ( Ba mH I 切割 ) DNA兩終 端 > 以 Ta k a r a B 1 a n t i n g kit 平 滑 終 端 化° 於 所得之平 滑 终 端 化 DNA 4 0 n g ( 2 u \)與 P v u I I- Ec 〇47 I I I Η段之 DNA 200η g (4 u 1 ) 中 ,加入4 8 w 1之T a k a r a L ί g a t i ο η k i t A 液 t 並 充分 攪 拌後,加 入 6 u 1 B液, 於 161C下培 餐 4 小 時 O 使 用此 溶 液,轉形 大 腸 桿 菌 HB101 ,並塗覆 於LB洋菜培養基( 含 5 0 w g / m 1安 比 西 林 ,1 . 5 %洋菜) , 取 得 選 殖 株 0由 所 得之遘51 株 > 製 備 質體 > 並由分析 其 限 制 酶 輿 圖 ,筛 選 保持有目 的 質 體 PBAS10之選殖株。 將 篩 m 之 m 殖 株, 於 45ml 之 2YT 液 體 培 養基 ( 含 100 M g/ m 1安 比 西 林 ) 中培 養 ,並以SDS- 鹸 性 法 調製 質 體 DNA ° 例 4 A . η id υ 1 a η S R2株的轉形 於 100 m 1之 BG - I I 液體培養基 中 培 養 1-5 天 之細胞, 以 80 00 Γ P nt離心5分鐘收集, 並懸浮於1 0 m 1之新鮮液髖 培 養 基 中 ( 10 β -1 09 細胞/ 毫升) C >將此細胞懸浮液 各 1 m 1分 注 於 聚丙 烯 管(Fa 1 con 2059) 中 並於管中 加 入 例 1 製 得 之質髏DNA 0 . 5 u g ( PBAS18為 1 . 0 /Li g )濃 度 〇 分 別 以 鋁 鉑紙 包 裹管子* 於 30它 下 培餐 1 晚後•除 去 鋁 鉑 紙 於 光照 射 下 (1 0 0 0〜 2 00 0勒克斯 ) ,於 30t: 下 再 培 餐 6 小 時〇 5 倍稀釋該細 胞 懸 浮 液( 加 入 PBAS1 8 -1 6 - (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 甲4(2丨(以297公釐)80.5.20,00〇張(出 •裝. 訂· _線· A 6 B 6 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 -/,,,’〜 ηΛ五、發明説明() 修庀 衣年月日補充 者不稀釋)> 各1 0〜5 0 /1塗覆於B G - I I洋菜培養基 上(含1 wg/ml安比西林,1 mM硫代硫酸納,1.5 %洋 菜)。此些平板於光照射下(2000〜3000勒克斯)培餐 4 * 1 0 天。 如此所得之選殖株的轉形率,於使用本發明質髏時為 104〜10s細胞/ wg質體DNA ,成功地逹成於使用質 體PBAS18時(102細胞/Wg質體DHA)之約1000倍的效 率° 例 5 Anabaena variabilis IAM M205株之轉形 於Anabaena variabilis IAM M205細胞中之質體導入 ,為使用基因導入裝置GTE-10 (島津製作所社裝)進行 電穿孔作用。將於100ml BG-1培養基中培養至對數增殖 期之細胞,以10000rpm離心10分鐘收集,以1 mM Hepes-NaOH(pH7.2)清洗 2 次後,於 1 mM Hepes-HaOH(pH7.2) 中以10s細胞/ ml (O.D.730 = 3)懸浮。於腔室(chamber) 中加人50〜100W 1之細胞懸浮液及質體DNA溶液(25〜 30^/8),於濃縮器容量1“尸及3^卩中,各以2.3〜2.71115 與8.1〜8.3ms時定數之電氣條件,分別設定6〜8KV/cin之 電場強度,進行脈衝(pulse)。將印加有脈衝之細胞, 立即移至新培養基中,並於1〜2日光照射下培養。將 此細胞懸浮液塗覆於0.5〜1 /ig/ml安比西林BG-11洋菜 培餐基中。此些平板於光照射下培養4~10天。_ -17- 甲 4 (210X297公釐)80. 5. 20,000張(H) ................................................i...........................^...........................¥(請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) ο Α6 Β 6 五、發明説明() 結果,於具有本發明質體PBAX18時,可轉形10細胞/ w s質體DNA。 工業上之利用性 本發明質髏可以大腸桿菌大置製備,且可於大腸桿菌 及藍緣菌中複製,並可作為於Μ綠菌中表現許多各種結 播基因之往返載體。 ................................................i...........................玎...........................緣 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部中央標準局員工消費合作社印敗 18 Ψ 4 (210X297公釐)80. 5. 20,000張(H)
Claims (1)
- A7 B7 C7 D7 鳗濟部中央標準局8工消費合作钍印发 lTfl01714號「新穎質醱之製法」專利案 (82年8月31日修正) A申請專利範圍: 1. 一種製備可於大腸桿菌、Anacystis nidulans或 Anabena variabilis中後製之往返載S3質鼸之方法 ,其待激為将侧囊胞菌6301衍生之内生質體pBAI 複製起始區(OriA區)外之部分儘量縮小做為一基 部,其中OriA區為含OriA區之DHA Η段,且當其由 質體pBAI切出時大小為2.8至8.0kb,且同時與含大 腸捍菌Col.Ei質醱複製起始區(OriE區)且其中 由γορ匾定義之基因已去除之DHAH段結合,並再結 合多重遘殖區,其次將所得之質醱轉形至大腸桿菌 ,Anacystis nidulans或 Anabena variabilis宿主 細胞中,將所得之轉形株培養於選擇培養基中並由 所得之菌落中筛選出帶有所欲質體之菌落。 之如申請專利範圍第1項之製法,其中OriE區(c)為 含OriE區且其中由rop區定義之基因已去除之DHAJH 段,且當其由質體PBR322切出時大小為1.5-4.lkb。 3.如申誚專利範圍第1項至第2項任一項之製法,其 中該含OriE之DNA Η段再含一安比西林抗藥基因 (A m pr ) 〇 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -丨裝· 訂 竦- 本紙张尺度適用中®國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公釐) 修正 82· 7. 2 I 本年月曰 I補充__ 第81101714號專利案本案載體於外源基因之表現實例 中文本 I表現調節區之製備(1-1) PANE 18之選殖 40ng(lw ΠρΑΝΕ 18(K.Shinozaki et.al.,Proc.Nath. Acad.Sw.USA 80:4050-4054(1983))〔其中於 pBR 322之 EcoRI址,已插人5,600bp段,其中含有Anacystis nidulans 6301之核薛糖-1,5 -二礎酸錢基酶/氧化酶之 起動子區者〕加入100//1之501!^經〇6丨15處理的大腸桿 菌HB101種条之細胞懸浮液,將混合物溫和混合。混合 物於冰水中培育30分鐘,又於42亡培育3分鐘,而將DNA 攝取入細胞内。於此懸浮液内加入lml LB培養基(10g/l 巴克多胰蛋白臃,5g/l酵回抽取物,10g/l NaCl), 於37t進行振搖培育1小時。取100/i 1及200w 1此細胞 懸浮液,接種至LB瓊脂培餐基(含50w g/ml安比西林及 1.5%瓊脂)上。此平板於37它培育24小時,然後,分離 所生成之菌落。 分離得之菌落以白金環接種入2ml 2YT液態培餐基(含 16g/l巴克多胰蛋白臃,10g/l酵母抽取物,5g/l NaCl ,及50wg/ml安比西林)内,及於37T:培育隔夜。取lml 培餐物,加至200ral 2YT液態培餐基(含100Ug/ml安比 西林)内,及於371C培餐隔夜。培餐細胞經由於8,000rpra 離心10分鐘收集,依SD-鹼方法(B.Perbal,A.分子選殖 之實用指南,273至276頁,約翰威利父子公司出販), 由培餐細胞大量製備質醱DNA。 (1-2) Sac I-Sph I段之分離 (參照第1圖) 於依本朵夫管(容積1.5ml)内,將無菌水加至大量製 備的 10wl(10wg)pANE 18DHA, 10«1 之 10XL〇w 缓衝液 (100nM Tris-HC1(PH 7.5),100nM MgCU , 10ΠΜ 二硫 赤絲醇(DTT))及50單位SacI(寶酒造公司生産)内,令總 體積為100//1,混合物於37C反應3小時。反應後,加 入 15w 1 之 10XHigh缓衝液(500πιΜ Tris-HCl(pH 7.5), 100mM MgC12 , 10mM DTT, 1 08mM NaC 1) , 50單位 SphI (寶酒造公司生産)及30W 1無菌水;又於37υ反應3小. 時。反應後,加入1/10容積之3Μ乙酸鈉(pH 4.8)及2.5 容積乙醇,混合物就此於-2 01:放置2小時或2小時以 上。於15,000rPni及4¾藉離心10分鐘收集所生成的沈 澱,以70%乙醇洗滌,及減壓乾燥。殘渣溶于50W1 TE (10mM Tris-HC1(PH 8.0), lmM EDTA)内,加入 1/10倍 體積之電泳標記(0.25%溴酚藍,0.2 5%二甲苯氰醇, 30%甘油),混合物置1 , 5%瓊脂糖上,於50V使用TAE 缓衝液(40niM Tris -乙酸鹽,2mM EDTA)霄泳1.5小時。 電泳後,凝謬浸於0 . 5 u g / m 1 e t h i d ί u in溴溶液(於T A E ) 15分鑪,俾進行DNA之染色。染色後的凝膠置於轉發光 醴上,照射紫外光,切下含期望的DHA之帶。期望的DNA 段(約 l,200bp)使用 DNA純化套件 Geneclean(BIO 101 公 司製造)純化。 (1-3)於 pUC 18選殖 SacI-SphI 段 (1) SacI-SphI 切開 pUC 18 於依本朵夫管(容積1.5ml)内,無菌水加至1(10 A/g)pUC 18 DHA, 5W1 10XLow 緩衝液及 50 單位 SacI, 將總體積調至50m 1;混合物於37C反應3小時。反應 後,加入7.5//110父11丨8}1缓衝液,50單位5?^及37.5 w 1無菌水,反應又於37亡持纊3小時。酚:氣仿:異 戊醇(25: 24:1 )以等體積加至反應溶液,混合物經強力 攪拌,及於1 5 , 0 0 0 r p m及4 t離心4小時,取出水層。於 此水層内加入1/ 10倍體積之3M乙酸鈉(pH4.8)及2.5倍 體積乙醇,俾藉乙醇沈澱DNA。於15,000rpni及及4T離 心10分鐘,收集沈澱,以70%乙醇洗滌,及減壓乾燥。 殘渣溶於20/zl TE,用於如下實驗。 (2) 插人 Sacl-S^phl 段(1.200bp)至 pUC 18(SacI-SphI) 25wl Takara DNA接合套件A液(寶酒造公司生産)加 至 0.1« g(2/i l)SacI-SphI 段 DNA 及 0.5μ g(lu 1)pUC 18 (SacI-SphI),谢以充分攪拌。此溶液内加入3wl Takara DNA接合套件B液,混合物經充分攢拌,及於16C培育1 小時。反應後,此溶液用以轉形大腸桿_ J Μ 1 0 9。 (3) 大置製備pARup 18 -3- 於5 w I U 0 0 w s )接合i容液内,加入1 0 0 W 1經以C a C 1 2 處理的大腸捍菌J M 1 0 9之細胞懸浮液,繼以溫和混合。 混合物於冰水中培育3 0分鐘,然後於4 2 TC培育2分鐘, 而使細胞將DNA攝入其中。lml 2YT液態培養基加至此懸 浮液内,於37¾振搖培育1小時。取100以1及200w 1此 細胞懸浮液,接種於2YT瓊脂培養基(含50wg/inl安比 西林,40wg/l 5 -溴-4 -氛-3 -吲哚基- /3-D -硫基半乳 糖苷(X-gal), 23.83rag/ 1異丙基-/3 -D -硫基乳糖顋喃 糖蒈(IPTG)及1.5%琪脂)上。此平板於371C培育24小時 ,所得白色薗落打點於新製2YT瓊脂培養基(含50wg/ ml安比西林,X-gal, IPTG及1.5%瓊脂)上,於371C培 育隔夜,分離白色菌落。 分離得之白色菌落使用白金璟接種入2ral 2ΥΤ液態培 養基(含50Wg/ral安比西林),於3710培育隔夜。取lml 培養液.移人1.5ml依本朵夫管内,於15,000rpni離心30 秒,俾收集細胞。收集得之細朐懸浮於150/i 1SET缓衝 液(20% 蔗糖,50mM TiMs-HC1(pH 7.6), 50mM EDTA)内 ,加人5w 1 RNase溶液(10mg/ral核糖核酸酶A, 0.1M乙 酸納(P Η 4 . 8 ) , 0 . 3 m Μ E D T A ),混合物藉渦旋混合機充 分搜拌。於其中加入350// 1之溶解液(USDS, 0.2N NaOH ),藉將営倒置,溫和攪拌混合物,使其完金溶解。所 得溶解液於冰水中培育10分鐘,加入250w 1 3M乙酸納 (pH 4.8),混合物經充分混合,然後躭此置於冰水中歴 30分鐘。此混合液於15,000rpra及離心10分鐘,俾沈 澱SD和染色體DNA。上清液移至另一根依本朵夫管,加 入等量異丙醇,混合物經充分混合,繼以於15,000rpra ,4 t離心7分鐘,呈沈澱收集質體D N A。沈澱溶於無菌 水,部分溶液使用限剪内核酸酶EcoRI及Hind III(二者 皆由寶酒造公司生産)進行切開。切開産物接受1 . 5%瓊 脂糖膠電泳,俾證實l,200bP SacI-SphI段插入pUC 18。 已證實S a c I - S p h I段已插人p U C 1 8之薗落,移至4 0 0 m 1 2YT液態培養基(含100以g/πι丨安比西林),培育隔夜。 培育後細胞於8,000rpm及41C離心10分鐘回收,經由SDS-_方法大量製備質體DNA。 (1-4) EcoRI-Pst I段之分離(參考第1圖) (1) E c 〇 RI - H i n d I 11 段之分離 於依本朵夫管(容積1.5ml)内,將無菌水加至10« 1(10 wg)大量製備之pARup 18 DNA溶液,20W1 10Xk缓衝 液(200mM Tris-HCl(pH 8.5), 100mM MgCl2 , 100ibM DTT, l,000mM KC1)及 40 單位 Hindlll,將總體積調至 200 1。總計準備20根内含前述内容物之依本朵夫管,於 37TC持鑲反應3小時。反應後,以酚-氣仿處理混合物 ,藉乙醇沈澱收集D N A , i容于1 5 5 w 1無菌水。於此溶液 内,加入 40u I 5X EcoRI缓衝液(500mM Tris-HCl(pH7.5) ,35mM MgCl2 , 250mM NaCl, 35mM 2-氫硫基乙醇, 0.05%牛血淸白蛋白(BSA))及40單位EcoRI,而將總體 積調至2 0 0 W 1。於3 7 t:,於所得2 0根依本朵夫管(容積 1 . 5 m 1 )内分別反應3小時。反應後,反應混合物同樣接 受酚-氯仿處理及乙醇沈澱而回收DHA。期望的DNA段(約 l,200bp)藉1.5%瓊脂糖膠電泳分離,及使用DNA純化套 化套件Geneclean純化。 (2) EcoRI-Pst I段(約 350 bp)之分離 於依本朵夫管(容積1.5ml)内之40w g(86(w 1)純DNA 段内加入10w 1之10x High缓衝液及48單位Pstl(寶酒造 公司生産)而將總體積調至100w 1,於37C反應3小時。 反應後,進行1.5%瓊脂糖膠電泳,分離所需DNA段(約 350bp)。DNA自凝膠上電溶離,使用核酸純化卡匣Hensorb 20(杜邦公司生産)純化。 (1-5)Pst I-H ind I I I段之合成 (1)寡核苷酸之合成與純化 欲合成含Shine Dalgarn〇(S/D)序列之表現調節區, 使用DNA合成儀380A (日本應用生物糸統公司生産)藉磷 酸亞二酸法合成十寡核苷酸(參照第2圖)。合成完成後 ,以每15分鐘添加0.5ral之方式,總計加入2ml銨水(27% 或27%以上)至矽膠柱,由氣化矽載體上切下各寡核苷 酸,收集入小瓶。又將1 οι 1氛水加入此小瓶,小瓶利用 Μ及P a r a f ί 1 in等密封,於5 5 加熱8小時或8小時以上 ,俾於基部去除保護基(醯基)。小瓶由恆溫浴中取出, 調整回室溫,移開蓋後,内容物減ffi濃縮至乾。乾燥後 ,殘渣于200wl 0.01M三乙胺-乙酸溶液(TEAA, pH 7.5) 然後,使用A Μ - 3 1 3 - 0 D S (山村化學研究室公司生産)進行 HPLC,以乙贈及0.1M TEAA濃度梯度溶離,由溶離分中 分段取出主峰。所得峰經減壓濃縮至乾,加入100 w 1 8 0 %乙酸(乙W溶液),將混合物混合,然後,就此於室 溫放置30分鐘俾去除5’端之二甲基三苯甲基(DMTr),及 將其轉成OH基。30分鐘後,將混合物快速濃縮至乾,殘 渣溶解於200/i 1之0.01M TEAAUH7.5),加入等體積二 乙醚,藉抽取去除D Μ T r基。所得溶液經減壓濃縮至乾, 殘渣溶於110w 1之0.01M TEAA(pH7.5),再度藉製備性 HPLC純化。含寡核苜酸之溶離分經減壓濃縮,殘渣溶於 T E ,用於下述實驗。 (2) 以動素酶將合成的寡核驻酸磷酸化 各4wg純寡核苷酸分別與120W 1整分之動素酶缓衝液 (50mM Tr i s-HC 1 (pH7 . 6) , 10mM MgCU , 0.1mM EDTA, 5mM DTT, 0·1πιΜ 精眯,1.7«M ATP)混合,加入 9 單位 T+聚核苷酸動素酶(寶酒造公司産製),及於37t培育 15分鐘。然後,加入ATP至終濃度為lmM,再度加入9單 位聚核苷酸動素酶,及於371C培育25分鐘。反應後 ,混合物接受90t:之熱處理5分鐘,使SS失活。磷酸化 寡核苷酸使用核酸純化卡匣N e n s 〇「b 2 0純化。 (3) Pst Ι-Η ί nd I I 段之製備 經由使用T4 DNA接合W(參照第3 _),直接接合寡 st I -H Ud I I 1段 0 H C 1 ( p H 7 . 6 ) , ( 0 m M 苷酸(屬於組成各 較佳tie「股之5’端 I調為80jU 1。所生 時時間逐漸冷卻至 M A T P ,加入2 . 5單 於4 C培育1 5小時。 乙醇沈澱回收DNA而 考第4圖) Pstl-Hindlll段之 I-Pst I段,及各 0 . 5 I I段,分別與5 /i I 套件B液加至所得各 反應後,溶液經以 醇沈澱俾回收DNA。 應混合物 w 1之無閨水中。4 -H C 1 ( p Η 7 . 5 ) , 3 5 m Μ w I ) Η ί n d I I I 加至 核苷酸而製備具不同m鹼基數之4 p 20W 1 5X 接合缓衝液(250ΙΠΜ Tris-MgCla )及無菌水,加至1.5jug寡核 Pstl-Hind III段之寡核轻酸中位在 )及各lM g其充寡核苷酸,而將總體I 成之溶液於9 0 加熱5分鐘,以2小 4^C ;加入各 10w 1 100idM DTT 及 10Π1 位接合酶(寶酒造公司産製),及 反應溶液以等體積酚-氛仿處理,藉 用於後述實驗。 (1-6) EcoRI-Hind III 段之製備(參 (1) EcoRI-PstI段(起動子區)與各 直接接合 各份1.0W g如上(1-4)分離之EcoR w g具不同氮鹼基數的四Pstl-Hindl 之0.3M Nall混合。1簀酒造接合 溶液,於2 6 υ培育1或1以上小時。 酚-氯仿處理,及以習知方式進行乙 (2 )以Η ί n d I I I — E c 〇 R I切開接合反 回收的D N A殘渣個別溶於每分1 4 . 5 w 1 5xHindIII 缓衝液(50mM Tris MgCl2 , 300raM NaCl)及 12單位(1.5 各溶液内,反應於37C進行1.5小時。反醮後,又加入 4 μ 1 5 x E c o R I 缓衝液,1 2 單位(1 . 0 w 1 ) E c o R I 和 5 以 1 無 菌水,又於37t反應1.5小時。以等量酚-氛仿處理反應 溶液,然後,藉乙醇沈澱回收D N A。 (1-7)四具不同氦鹼基數之表現調節區EcoRI-Hindlll 段之選殖 (1)以 EcoRI-Hind III 切開 pUC 18 於依本朵夫管(容積1.5ml)内,將無菌水加至25/ug P U C 1 8 , 1 0 w 1 1 0 X k 缓衝液(2 0 0 m Μ T r i s - H C 1 ( p Η 8 . 5 ), 100inM MgC 1 a , 10mM DTT , 100mM KC1)和 64 單位 18/z 1 )Hind III,而將總體積調為100w 1,反應於37七進行 3小時。此反應溶液以等體積酚-氯仿處理,藉乙醇沈 澱回收DNA。DNA殘渣溶解於75m 1無菌水,加入20W 1 5XEcoRI缓衝液和60單位(5/u l)Ec〇RI,反應於37T進 行3小時。反應後,反應混合物同樣接受酚-氣仿處理 與乙醇沈澱。回收的DNA溶於TE至0.25/ig/w丨,用於 下述實驗。 (2)四表現調節區EcoRI-Hind III之插入pUC 18 (EcoRI-Hind III) 各 60以(1/^ 1)四 EcoRI-Hind III 段及各份 500ns(2w 1) P U C 1 8 ( E c o R I - H i n d I I I)分別置於依本朵夫管内,加入 每份24m 1寶酒造接合套件A液,紐以充分混合。又將每 份3« 1寶酒造接合套件B液加至混合後之溶液内;混合 後,於16C反應2小時或以上。此等溶液用於下述實驗。(3)大量製備口41^9 1,2,3及4 於各3 w 1 ( 5 6 n g )接合溶液内加人各份1 0 0 w 1之經以 C a C丨2處理之大腸捍薗 J Μ 1 0 9細胞懸浮液,繼以溫和 攪拌。混合後之溶液於冰水中培育30分鐘,又於421C培 育2分鐘,而使細胞將DNA攝入其中。於此懸浮液内加 入每份lml之2ΥΤ液態培養基,於37¾振搖培養 1小時後 ,混合物接種於整分2YT瓊脂培養基(含有50/ig/ml安 比西林,40rag/l X-gal, 23.83g/l IPTG 和 1.5% 瓊脂 )上。經由自所得白色菌落製備質體,及分析限剪内核酸 酶圖譜,分別篩檢擄帶有所需質體pARup 1,2,3及4之菌 落。 攜有質體pARup 1,2,3及4之個別菌落,於毎份200ml 之2YT液態培養基(含100 W g/ ml安比西林)内培育·,藉 SDS-驗方法大量製得個別質體DNA。 (I - 8 ) E c 〇 R I - H i n d I I I 段之分離 各20“8(20"〖)大量製備之質體〇“卜&1?1^1,2,3及 4)分別置依本朵夫管内,將每份20/i 1之10X k缓衝液, 每份120單位(15w UHindlll及無菌水加入其中,而將 總醱積調為200/z 1。對各質體準備6根此依本朵夫管。 於37¾培育3小時。反應後,反應混合物經酚-氮仿處理 ,葙乙醇沈澱收集DNA,及溶於每份150m 1無豳水。此 等DNA溶液内加入每份40wl之SxEcoRI级衝液,及每 份120單位(10« l)EcoRI,於37C培育3小時。反應後 -10- .5 %瓊脂 用核酸純 菌 JM 109 55 (K . 80:4050-約 1 500 bp 醛糖-1 , 5-]攢拌。混 卜鐘,而使 LB液態培 !於LB瓊脂 脂)上,分 w s/四環 至 2 0 w g ( X H i gh缓 ,_乙醇沈澱回收DNA。期望的各段DNA段藉1 糖醪電泳分離。分別由凝膠上電溶離D H A ,使 化卡@^115〇1^20純化(4!?1^1,2,3和4)。 II轉錄終結(终結子)區之製備(參照第5圖) (11-1)?冉以115 5之選殖 於100w 1之經以50mM CaCU處理的大腸桿 之細胞懸浮液内加入5 0 0 w g ( 0 . 5 w 1 ) p A N P 1 1 Shinozaki et.al. ,Proc.Hath.Acad.Sci.USA 4054(1983)),其中於 pBR 322之 Pst I址插入 之一段,内含 Anacystis nidulans 6301 之核 二磷酸羧基酶/氣化酶之終結子區,繼以溫和 合液於冰水中培育30分鐘,又於421C培育2女 細胞將DNA攝入其中。於此懸浮液内加入linl 養基,於37υ振搖培養1小時後,混合物接巷 培養基(内含:12.5wg/ml四環素及1.5%瓊 離所得菌落。 分離所得菌落於2.81 2YT液態培養基(含25 素)内培餐,藉SDS-鹸方法大置製備質體DNA。 (I 1-2) Eco52 I-Pst I段之製備 (1) Pst I段之分離 於依本朵夫管(容積1.5π1)内,將無閨水加 2 0 w 1 )大量製備之 P A Ν Ρ 1 1 5 5 D N A , 2 0 w 1 1 0 衝液,及120單位U0wl>Pst I而將绝髖積調為200μ1 總計準備6根含前述内容物之依本朵夫管(容積1.5nl ),於各管内於3 71培育3小時。反應後,藉乙醇沈澱 回收DNA,然後,藉1.5%瓊脂糖膠電泳分離期望的DNA 段(約l,500bp)。分離得之DNA藉Geneclean純化,用於 下述實驗。 (2)以 Eco52I 切開 Pst I 段 於 6 4 , 5 w 1 (約 1 0 u g ) P s t I 段 D N A 溶液内,加入 7 . 5 w 1 1 0 X E c 〇 5 2 I 缓衝液(1 0 0 m Μ T r i s - H C 1 ( p Η 9 . 0 ) , 3 0 πι Μ M g C 1 2 ,1,000πιΜ HaCl, 0.1%BSA),及 18單位(3wl)Eco52I (Toyob 〇公司産製),於37 C培育3小時。培育後,混合 物接受酚-氱仿處理,及乙醇沈澱,及回收沈澱的DNA。 回收得之DNA溶于8w 1無菌水。 (I 1-3) pARut 13之生成 (1) Eco52I-Pst I 段之鈍化 lwl DHA鈍化套件(賫酒造公司産製)X10缓衝液加 至II-2製備之8W1 Ec〇52I-PstI段DNA溶液内,於70t 培育5分鐘後,混合物移至37C恆溫浴。於DNA鈍化套 件内,於此溶液内加入1 w 1 T + D Ν Α聚合SS ,混合物皆 滴液溫和混合,及於3 7 TC反應混合物5分鐘。反應後, 於DNA鈍化套件内,於此溶液内加入40jul DNA稀缓衝液 ,混合物皆渦旋強力«拌而使酶失活。 (2 )以S in a I切W p U C 1 3及去8S酸化作用 於 20m g(20/i 1 ) pUC 13 DHA 内力 Π 入 40/i 1 5 x S m a I ifg -12- 衝液(50mM Tris-HC1(PH8.0), 35mM MgCU , 100mM KCl ,35mM 2 -氫硫基乙醇,0.05%BSA), 80 單位(lewDSmal (寶酒造公司産製),及130α 1無菌水,繼以於30TC反應 4小時。反應後,反應混合物以酚-氣仿處理及接受乙 醇沈澱,回收DNA。回收得之DNA溶于100/il 0.1roM Tris -H C 1 ( p Η 8 . 0 ),加入1 0 W 1鹼性磷酸酶溶液(1 . 0單位鹼性 磷酸酶(AP,賫酒造公司産製),10niM Tris-HCl(pH 7.5) ,50mM NaCl, ΙπιΜ ZnS〇4 ),於 371C 反應 2 小時。反應 後又加入10 Μ 1_性磷酸酶溶液,繼以於65ΊΟ培育30分 鐘。反應溶液經以酚-氱仿處理,DHA經以乙醇沈澱, 收集,及溶解於ΤΕ至0.5Wg//il。 、 (3 )鈍端段之插入p U C 1 3 ( S m a I , A P ) 32w 1賫酒造接合套件A液加至2w 1 (約100 ng)鈍端 段DHA溶液及2α l(1.0/ig)經鹼性磷酸酿處理的pUC 13 DNA溶液,繼以充分搜拌。於此溶液内加入1寶酒造 接合套件B液,經充分攢拌後,於1 6 1C培育1小時或以 上。反應後。此溶液用以轉形大賜桿菌JM 109。 (I I - 4 ) B a m Η I - E c 〇 R I 段之製備 (1)大蛋製備pARnt 13 於ly 1 (約40ng)接合溶液内加入100w丨經以50πιΜ CaCl2 處理之大賜桿KIJM109細胞懸浮液,谢以溫和混合。混合 後之溶液於冰水中培育30分鐘,曲以於42C培育2分鏞 ,而使細胞將DNA攝入其中。lml 2YT液態培餐基加至此 -13- 懸浮液内,於3 7 1C振搖培育1小時,懸浮液接種至2 Y T 瓊脂培餐基(含5 0 u s / m 1安比西林,4 0 ra g / 1 X - g a 1 , 23.83ng/l IPTG及1.5%瓊脂)上。由所得白色菌落製 得質體,分析其限剪内核酸酶圖譜,藉此篩檢擄有期望 的質體pARut 13之薗落。篩檢得之菌落於400ral 2YT液 態培養基(含100W g/m丨安比西林)内培養,藉SDS -鹼方 法製得大量質體DNA。 (2 ) B a m Η I - E c 〇 RI 段之分離 準備8依本朵夫管(容積1.5ml),於其中,於15Wg( 15w 1)大量製備之質體DHA(pARut 13)内加人20μ I 10X k缓衝液,120單位(10W l)BaraHI (寶酒造公司産製 )及無菌水而調成總體積200w 1。各管於301C培育3小 時。反應後,反應混合物以酚氛仿處理,藉乙醇沈澱收 集DNA,溶於各份110/z 1無菌水中。於此等DNA溶液内, 加入每份30/i 1 5x EcoRI缓衝液,及毎份120單位(10// 1) EcoRI,龃於371培育3小時。反應後,藉乙醇沈澱回 收DMA,藉1.5%瓊脂糖膠電泳分離期望的DHA段(約300 bp)。由凝膠上分別溶離出DNA。使用核酸純化卡匣 Nensorb 20純化。 I I Ih 操縱子之生成 (III-1)轉錄終結區與h基因之接合 (1)以 BaraHI-EcoRI 切開 pUC 13-h-SOD 於依本朵夫管内,於 10iUg(20wl), pUC 13-h-S0D( -14- 參照日本第210129/1989號特許申請案說明書例1)〔其 中於PUC 13之Hindlll-Bam HI址已插入编碼著人超氣化 物變異SS之股全長(475bP)DNA段〕,加人40wl 5X EcoRI缓衝液,120單位(10iil)EcoRI,及無菌水而調成 _ 2 9 _ 總體積200^1,於37t:培育3小時。反應後,反應混合 物以酚-氯仿處理,藉乙醇沈澱收集DHA鄉力及溶於215 Μ 1無菌水。此溶液内加入25u 1 10Xk缓衝液及100單 位(1 0 μ 1 ) B a ra Η I ,於3 0 υ反應3小時。反應後,使用 Geneclean純化 DNA〇 (2 )將轉錄終結區(B a m Η I - E c 〇 R I)插人 p U C 1 3 - h - S 0 D (BaniH I-EcoR I) 至 加 液 A 件 套 合 接 造 酒 寶 3 11 Η N D 及 1.後 將拌 0 攪 合分 混充 分經 充 , 以 内 0 液 , 溶 區此 結至 終加 錄液 轉 B 0 之件鐘 備套分 製合‘ PO II接育 1)造培 W酒 υ 4 寶16 (01 於 sw 反應後,此溶液用以轉形大腸桿菌 J Μ 1 0 9。 (I I I - 2 ) H i n d I I I - E c 〇 R I ( h S 0 D -終結子)段之製備-U 1 ; (1)大悬製備 P U C 1 3 - h S 0 D t 於2 /i 1 (約7 0 n g )接合溶液内,加入1 0 0 w 1經以5 0 m Μ CaCU處理的大賜桿菌JM 109細胞懸浮液,缈以溫和混 合。混合溶液於冰水中培育3 0分鐘,然後於4 2亡培育2 分鑪,而使細胞攝入DNA。添加1 ml 2YT液態培餐基後 ,所得混合物於3 7 t:振搖培養1小時,然後接種至2 Υ Τ 瓊脂培養基(含有50Wg/ml安比西林,40mg/l X-sal ,23.83mg/l IPTG及1.5%瓊脂)上。由所得白色菌落 製備質體,攜有所需的DNA段之菌落,經由分析其限剪 内核酸SS圖譜進行篩檢。篩檢得之菌落於60ral 2YT液態 培養基(含100ϋ g/ml安比西林)内培養,藉SDS -鹼方法 製得質體D N A。 (2) Hindlll-EcoRI 段之分離 準備二依本朵夫管(容積1.5ml),其中於50W l(25Wg) 製妥的pUC 13-hSOD DNA溶液内加入20/il 10xk缓衝 液,120單位(15wl)HUd III及無菌水而調成總體積 200m 1。於各管内,於37¾培育3小時。反應後,反應 混合物以酚-氛仿處理,藉乙醇沈澱,收集DNA,及溶於 150^1整分之無菌水中。於此等DNA溶液内,加入每份 40w l 5xEcoRI緩衝液及毎份 120單位(10W l)EcoRI, 於37P培育3小時。反應後,葙乙醇沈澱回收DNA,藉 1.5%瓊脂糖膠電泳分離所需DNA段(約790bp)。使用 Geneclean純化 DNA。 (III-3) Hind III-EcoRI(hSOD-終結子)段與表現調 節區ARup 1,2,3及4之接合(參照第6圖) 準備依本朵夫管,其中,於各1.12/ig(2.1iul表現調 節區(冉1?1^1,2,3及4)及2.11«8(2.2//1)整分之}1丨以111 -EcoRI段内,分別加人每份4α 1之5X接合缓衝液(250raM -16- Tris-HCl(pH 7.6), 50mM MgCl2 ),每份 2w 1 100mM DTT ,每份2w 1 ATP,每份2.5單位(lw 1)T4 DNA接合酶( 簀酒造公司産製)及無菌水,而調成總體積20u 1。於此 等管内於15勺培育隔夜。藉60T:熱處理10分鐘中止反應 。於此等溶液内加入每份10w 1之5xEcoRI缓衝液,及 分別加入每份12單位(lw 1)之EcoRI及無菌水而將總體 積調成50w 1。此等溶液於37¾培育3小時。反應後, 藉2%瓊脂糖膠電泳分離所需各段DNA(參照第7圖,各 約1200bp)及使用Geneclean純化。 (III-4)四 sHOD基因表現性DNA段之選殖 (1) EcoRI切開pUC 18及隨後之鹼性磷酸酶處理 於依本朵夫管内,於20wg(30wl)質體pUC 18 DNA内 加人40u 1之5X EcoRI缓衝液,添加120單位(10/z l)EcoRI 及無菌水而將總體積調為200w 1,及於37¾培育3小時。 反應後,反應混合物以酚氣仿處理,藉乙醇沈澱收集DHA ,溶於 108/z 1 之 0.1M Tris-HCIUH 8.0)内。10u 1 驗性 磷酸酶溶液加入此溶液内,及於3 7七培育1小時。反應 後,又加入1 0 w 1鹼性礎酸酶溶液,於6 5 1C培育3 0分鐘 。反應溶液以酚-氯仿處理,藉乙醇沈澱收集DNA,及溶 於 ΤΕ至 0.16w g/ ml0 (2) hSOD操縱子段插人pUC 18(經EcoRI及Ap處理) 每份24wl之寶酒造接合套件A液分別加至各100ng(l w l)hS0D操縱子(起動子-SOD-終結子1,2,3及4)〇^及320 -17- ng(2u 1)整分之經EcoRI及1¾性磷酸SS處理之pUC 18DNA ,繼以充分攪拌。每份1之簀酒造接合套件B液加至 此等溶液内,經充分攪拌後,於1 t:培育隔夜。 (3) 大量製備?1)(:18-1?1^1-1^00 1,2,3及4 於各4 w 1 (約5 0 n g )接合溶液内加入毎份2 0 0 w 1之經以 50mMCaCl2處理之大腸桿菌 JM 109種糸細胞懸浮液, 繼以溫和攪拌。此等混合液於冰水中培育30分鐘,又於 42 =培育2分鐘,使細胞將DNA攝入其中。每份1Π1之2YT 液態培養基加至此等懸浮液,經於37C振搖培養1小時 後,混合物接種於部分於部分2YT瓊脂培養基(含50y g/ ml 安比西林,40ng/ral X-gal, 23.83ml/l IPTG 及 1.5 瓊脂)上。由所得白色菌落製備質體,藉分析其限剪内 核酸酶圖譜而分別篩檢攜帶有期望的個別質體(PUC 18-Rupt-hSOD 1,2,3及4)之0落。篩檢得之各菌落於每份 200ral之2YT液態培養基(含100W g/ml安比西林)内培養 ,藉S D S -鹼方法大量製備各質體D N A。 (4) EcoR I段(約 1 200bp)之分離 對毎種質體準備三根依本朵夫管,於各管内將毎份40 w 1之5X EcoRI缓衝液,每份120單位(10w l)EcoRI及毎 份130w 1無菌水,加至各約20/zg(20/i 1)大董製備之質 體(?1](:18-1?1^1:^500 1,2,3及4)〇於此等管内,於37 = 培育3小時。反應後,箱乙酵沈澱收集DNA,及對各K 體溶於每份100w 1 TE。藉1.5%瓚脂糖膠爾泳分離期望 的値別D N A段(約1 , 2 0 0 b P )及使用G e n e c 1 e a n純化。 (IV)hSOD基因表現媒介之選殖 ' (1 )以E c o R I切開p B A X 1 8及隨後之鹼性磷酸SS ( A P )處理 準備兩根依本朵夫管,其中於10wg(20w 1>pBAX18 DHA 内加入40w 1之5XEcoRI缓衝液,120單位(10W l)EcoRI 及130/i 1無菌水而調成總體積200w 1。各管内於37^0培 育小時,藉Geneclean純化DNA及溶于100wl之0.1M T r i s - H C 1 ( p Η 8 . 0 )。將1 0 w 1鹼性磷酸酶溶液加至此溶液 ,於3 7 t培育1小時,又加入10 w 1鹼性磷酸酶溶液後, 於65¾培育30分鐘。反應後,反應混合物以酚-氣仿處 理,及藉乙醇沈澱回收DNA。 (2) hSOD操縱子與PBAX18 (EcoRI, AP處理)之接合,大 置製備 每份0.5« g(0.1w 1)之經以EcoRI及AP處理之PBAX18 分別加至各0.25/i g(lw 1)之如上U -4)所製之四hSOD操 縱子(約1.2kbp),使用寶酒造接合套件進行接合。大腸 桿菌Η B 1 0 1種糸分別使用此等接合溶液轉形,個別含轉形 體之液體接種於LB瓊脂培餐基(含50/i g/ml安比西林) 上而得菌落。由所得菌落製備質體,藉分析其限剪内核 酸酶圖譜,篩檢攜有期望的個別質體(PBAXS0D6, PBAXS0D7 PBAXS0D8, PBAXS0D9, PBAXS0D6-4, PBAXS0D7-4.及 PBAXS0D8-4)2®^。篩檢得之個別菌落於每份50ml之 LB液態培養基(含100W 8/ra丨安比西林)内培餐,藉SDS- 鹺方法製備質體DNA。 V 使用藍綠溪 Anacystis nidulans 6301 及 R2 表現 hSOD 基因 (V-l) A.nidulans 6301(Synechcoccus PCC 6301)及 R2 (Synechococcus PCC 7942)之轉形 已於每份100ml之BG-11液態培養基内培養1至5目的 値別細胞,經由以8 , 0 0 0 r p m離心5分鐘收集,及愍浮於 毎份10ml之新製液態培養基(10a -103細胞/ ml)内。 各lral細胞懸浮液倒入聚乙烯管(Falcon 2059)内,製得 之質體DNA分別以0.1至10Wg濃度置於管内。製妥之管 分別覆以鋁箔,於30t:培育隔夜後,移開鋁箔,然後, 於30¾於光照下又培育6小時(光源:冷白營光燈; 1,000-2,000勒克司)。取各100至500/i 1之細胞懸浮液 ,接種於BG-11瓊脂培養基(含有liaM硫代硫酸納,1至 5/ug/ml安比西林,及1.5%瓊脂)。平板於光照下培養 4至10日(光源:冷白螢光燈;2,000-3 ,000勒克司)。 (V-2)培養 所得菌落移至每份2ml之BG-11液態培養基(含10// g/ m 1安比西林)及於光照下培餐1 0日(光源:冷白營光燈; 2,000台3,000勒克司)。然後,培餐醪移至每份100ml之 BG-11液態培餐基(含10m s/ml安比西林),於光照下培 養20日(2,000-3,000勒克司)。取各10ml培餐醪,分別 移至毎份100m丨之BG-11液態培餐基(含50α s/ral安比西 -20 - 林),及於光照下培育20日。經由於8,000rpn及離心 10分鐘而收集各細胞,再度懸浮於ImM Hepes缓衝液(pH 7 . 0 )内,藉離心洗滌。洗滌後,個別細胞儲存於-2 0 1C 至用於實驗為止。 (V - 3 ) h S 0 D之檢測 (1 ) h S 0 D活度染漬 使用經由以核糖黃素進行光聚合法,所製得之丙烯醯 胺膠進行電泳(蛋白質,核酸與酵素11:744(1966))。電 泳後,凝膠以50mM璘酸鉀(pH 7.8)-0.5mM EDTA洗二至 三次(5分鐘),然後浸於硝藍四唑錄(NBT)溶液(2.5mM NBT, 50mM磷酸鉀,0.5mM EDTA,pH7.8)内 7 分鐘。随後 ,凝膠浸於核糖黃素溶液(100X/M核糖黃素,30mM四甲 基乙饍二胺,50mM磷酸鉀,0.5raM EDTA, pH 7.8),於 白光中染漬至膠中出現對比為止。結果示於第9圖。此 圖中,具SOD活性之部分未經染漬,而其它部分染成紫 色。由此可知,除Anacystis nidulans本身具有的Fe-S 0 D活度外,於轉形體檢得h S 0 D活度。 (2 )以抗-人-S 0 D抗體進行檢測 (2 - 1 )西方吸漬 於還原態及Laemmli等人(自然237,680(1970))之條 件下,使用20% SDS-聚丙烯醛胺膠進行®泳。電泳後, 凝膠内之蛋白質_電鞞移至硝基纖維素膜(Amashai«公司 産製.Hybond(C))上。膜浸沒於含0.3%H2 02之50% 甲醇内20分鐘,使内生性過氧化酶失活,然後,於371 浸於 TBS〔(20niM T「is-HCl, 0.9%NaCl, PH7.4)含 5% 脱 脂乳及0 . 1 % T w e e η 2 0 (封阻)〕内2小時。膜接受封阻 處理,以洗滌液(含0.05%Tween 20之TBS)洗5分鐘, 繼以於371C於含1/ 1000抗-人-SOD抗體(caprine IgG, Binding Site公司産製)及0.1% Tween 20之TBS内培育 2小時。膜以洗滌液洗20分鐘(5分鐘X5);然後,以含 10mg 二胺聯苯胺(DAB)及 15W 1 32%H2 02 0.1M Tris -H C 1 ( ρ Η 7 . 4 ) 4 0 in 1 染漬。 結果,於線上檢知染成褐色的一帶,此處係由轉形體 所得抽取物被電泳之處,也是標準樣品hSOD(Sigi»a公司 生産的同一位置(第10圖)。 (2-2) Ouchterlony方法(免疫學實驗指南,74-77頁, Gakkai Shuppan 中心出販) 1 . 2 %瓊脂糖膠溶液(含有1 0 m Μ磷酸鹽缓衝液(ρ Η 7 . 2 ),0.15Μ NaCl,及 0.1%HaN3 )於培養皿(Falcon 1029 )内固化至厚2至3 mm,於適當位置打孔。10 w 1抗-人-S 0 D抗體置於中心孔,而轉形體油取物(各1 0 w 1 ), A . nidulans R2 (非轉形體)抽取物(40/nl)作對照,及標 準樣品hSOD分別置周圍各孔内,於4¾培育隔夜。培育 後,由培養皿中取出瓊脂平板,浸於PBS(10mM磷酸鹽缓 衝液,pH 7.2, 0.15M NaCl),箱此充分去除蛋白質(PBS 置換數次,2至3日)。此板浸於0.5%醯胺黑溶液(90ml -22 - Γ*· 甲醇,1 0 m丨冰醋酸)内染潰。結構顯示抗-人-$00抗體與 標準樣品hSOD間,及抗-人-SOD抗體與轉形體抽取物(6-4 ,8 - 4 )間生成沈澱線。又復,出現沈澱線組合成單一線 (3形),因而證實於轉形體内生成與標準樣品hSOD相同 的抗原(人-SOD)(第11圖)。 (3) h-SOD活度之檢測 雖然 Anacystis nidulans有生産 SOD(Fe-SOD),但可 利用其被lmM KCN抑制之差異,測量hS0D(Cu Zn-SOD)與 内生性SOD(Fe-SOD)之活度區別。光學試管(lnil)内放置 52raM磷酸鉀(pH7.8), 0.1mM EDTA, 0.1mM黃嘌昤,10WM 細胞色素C(馬心III型,SUraa公司産製)及樣品(SOD), 將總體積調為980/z 1。將20// 1之黃嘌昤氧化SS (Boehringer -Mannheim公司出品)加至其中,起始反應,隨著於550 mm之吸全蒺_始速率(30至60秒)之加快,測定細胞色素 C之還原,此值以u表示。未添加SOD樣品時,細胞色 素C之還原速率表示為v 。於此等條件下,SOD抑制50% 細胞色素C之還原定為1/3單位,由(ν/υ-1)測定樣 品内的總單位數(植物酵素-蛋白研究方法,3 7 3頁, Koji Asada, Kyoritsu出版公司)。愎次,.將 100mM KC1 (1 0 w丨)加至已測定y之反應溶液,測定細胞色素C通 原速率 ι/'及單位數(v/v'-l)〇 測定 Anacystis nidulans 細胞内生成的h S 0 D ( ( v· 1 ) - v / υ - 1 ))之活度。 結果,得自轉形體之粗製油取物之比活度(毎1 A280 -23- 213^)«^·· 單位之活度)顯示數值高0.7至12單位/ A280(表1)。 表 1 r — — — 丁 — — — — 丁 — — — — — — — — — I原始媒丨表現媒介丨hSOD表現量(比活度,| I介質體丨 丨單位/ A280) | ·_ι ιι I j·» — I .-bpv apJ 1 PBAX0D6 1 7.18 PBAX18 1 PBAX0D7 I 9.98 1 PBAX0D8 1 11.79 1 PBAX0D9 1 6.78 L__ 一丄一 一一一丄一________ J -24-
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