TW201629086A - 免疫調節劑 - Google Patents
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Abstract
本發明提供新穎的大環肽,其抑制PD-1/PD-L1及PD-L1/CD80蛋白質/蛋白質相互作用,及因此適用於改善各種疾病,包括癌症及傳染性疾病。
Description
本申請案主張2014年12月18日申請之美國臨時申請案序號62/094,008之權益,該案係以其全文引用的方式併入本文中。
本發明提供新穎的大環肽,其抑制PD-1/PD-L1及CD80/PD-L1蛋白質/蛋白質相互作用,及因此適用於改善各種疾病,包括癌症及傳染性疾病。
蛋白質程式化死亡1(PD-1)為CD28受體家族中的一個抑制成員,該家族亦包括CD28、CTLA-4、ICOS及BTLA。PD-1表現於活化B細胞、T細胞及骨髓細胞上(Agata等人,同前述;Okazaki等人,Curr.Opin.Immunol.,14:779-782(2002);Bennett等人,J.Immunol.,170:711-718(2003))。
PD-1蛋白為作為Ig基因超家族一部分之55kDa I型跨膜蛋白(Agata等人,Int.Immunol.,8:765-772(1996))。PD-1包含膜近端免疫受體酪胺酸抑制基元(ITIM)及基於膜遠端酪胺酸之切換基元(ITSM)(Thomas,M.L.,J.Exp.Med.,181:1953-1956(1995);Vivier,E.等人,Immunol.Today,18:286-291(1997))。雖然在結構上類似於CTLA-4,但PD-1缺少對CD80 CD86(B7-2)結合至為關鍵之MYPPY基元。已識別得PD-1的兩個配體PD-L1(B7-H1)及PD-L2(b7-DC)。已顯示表現PD-1之T細胞的活化在與表現PD-L1或PD-L2之細胞相互作用後下調(Freeman等人,J.Exp.Med.,192:1027-1034(2000);Latchman
等人,Nat.Immunol.,2:261-268(2001);Carter等人,Eur.J.Immunol.,32:634-643(2002))。PD-L1及PD-L2均為結合至PD-1但不結合至其他CD28家族成員之B7蛋白質家族成員。PD-L1配體大量存於多種人類癌症中(Dong等人,Nat.Med.,8:787-789(2002))。PD-1與PD-L1間之相互作用導致腫瘤浸潤性淋巴細胞之減少、T-細胞受體介導之增殖之減少及由癌細胞引起之免疫逃避(Dong等人,J.Mol.Med.,81:281-287(2003);Blank等人,Cancer Immunol.Immunother.,54:307-314(2005);Konishi等人,Clin.Cancer Res.,10:5094-5100(2004))。免疫抑制可藉由抑制PD-1與PD-L1局部相互作用逆轉,及該效應當在PD-1與PD-L2相互作用亦遭受阻斷時係累加(Iwai等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,99:12293-12297(2002);Brown等人,J.Immunol.,170:1257-1266(2003))。
亦已顯示PD-L1與CD80相互作用(Butte MJ等人,Immunity;27:111-122(2007))。已顯示表現免疫細胞上PD-L1/CD80之相互作用係一種抑制相互作用。已顯示此相互作用之阻斷使得此抑制相互作用消除(Paterson AM等人,J Immunol.,187:1097-1105(2011);Yang J等人,J Immunol.8月1日;187(3):1113-9(2011))。
當表現PD-1之T細胞與表現其配體之細胞接觸時,回應於抗原刺激之功能性活性(包括增殖、細胞介素分泌及細胞毒性)減少。PD-1/PD-L1或PD-L2相互作用在解析感染或腫瘤期間或在發展自身耐受性期間下調免疫反應(Keir,M.E.等人,Annu.Rev.Immunol.,26:Epub(2008))。長期性抗原刺激(諸如,在腫瘤疾病或慢性感染中發生之抗原刺激)產生出表現提高水平之PD-1且相對對慢性抗原活性而言係功能障礙之T細胞(參見Kim等人,Curr.Opin.Imm.(2010))。此稱之為「T細胞耗盡」。B細胞亦展現PD-1/PD配體抑制作用及「耗盡」。
已證實使用針對PD-L1之抗體阻斷PD-1/PD-L1連接恢復並增強在
許多系統中之T細胞活化。罹患晚期癌症之病患從針對PD-L1之單株抗體之療法獲益(Brahmer等人,New Engl.J.Med.(2012))。腫瘤及慢性感染之臨床前動物模型已顯示藉由單株抗體阻斷PD-1/PD-L1路徑可增強免疫反應且導致腫瘤排斥作用或對感染之控制。經由PD-1/PD-L1阻斷之抗腫瘤免疫療法可增強對許多組織學不同腫瘤之治療免疫反應(Dong,H.等人,「B7-H1 pathway and its role in the evasion of tumor immunity」,J.Mol.Med.,81(5):281-287(2003);Dong,H.等人,「Tumor-associated B7-H1 promotes T-cell apoptosis:a potential mechanism of immune evasion」,Nat.Med.,8(8):793-800(2002))。
干擾PD-1/PD-L1相互作用引起具有慢性感染之系統中T細胞活性之增強。阻斷PD-L1引起具有慢性淋巴細胞脈絡叢腦膜炎病毒感染之小鼠中病毒清除率之提高及免疫之恢復(Barber,D.L.等人,「Restoring function in exhausted CD8 T cells during chronic viral infection」,Nature,439(7077):682-687(2006))。感染HIV-1之人類化小鼠顯示增強之抵抗病毒血症之保護作用及CD4+ T細胞之病毒耗盡(Palmer等人,J.Immunol.(2013))。經由針對PD-L1之單株抗體阻斷PD-1/PD-L1可恢復對來自以下病患之T細胞之活體外抗原特異性功能性:HIV病患(Day,Nature(2006);Petrovas,J.Exp.Med.(2006);Trautman,Nature Med.(2006);D'Souza,J.Immunol.(2007);Zhang,Blood(2007);Kaufmann,Nature Imm.(2007);Kasu,J.Immunol.(2010);Porichis,Blood(2011))、HCV病患(Golden-Mason,J.Virol.(2007);Jeung,J.Leuk.Biol.(2007);Urbani,J.Hepatol.(2008);Nakamoto,PLoS Path.(2009);Nakamoto,Gastroenterology(2008))及HBV病患(Boni,J.Virol.(2007);Fisicaro,Gastro.(2010);Fisicaro等人,Gastroenterology(2012);Boni等人,Gastro.(2012);Penna等人,J.Hep.(2012);Raziorrough,Hepatology(2009);Liang,World J.Gastro.(2010);
Zhang,Gastro.(2008))。
亦已顯示PD-L1/CD80相互作用之阻斷可刺激免疫性(Yang J.等人,J Immunol.8月1日;187(3):1113-9(2011))。已顯示自阻斷PD-L1/CD80相互作用產生之免疫刺激經由組合阻斷進一步的PD-1/PD-L1或PD-1/PD-L2相互作用得以增強。
假設免疫細胞表型之改變為敗血性休克之一個重要的因素(Hotchkiss等人,Nat Rev Immunol(2013))。此等包括PD-1及PD-L1之水平之提高(Guignant等人,Crit.Care(2011)),來自PD-1及PD-L1水平提高之敗血性休克病患的細胞展現提高之T細胞凋亡水平。針對於PD-L1之抗體可降低免疫細胞凋亡水平(Zhang等人,Crit.Care(2011))。另外,缺乏PD-1表現之小鼠比野生型小鼠對敗血性休克症狀更具抗性。Yang J.等人.J Immunol.8月1日;187(3):1113-9(2011))。研究已顯示使用抗體阻斷PD-L1之相互作用可抑制不適當的免疫反應並改善疾病症狀。
除了增強對慢性抗原之免疫反應外,亦已顯示阻斷PD-1/PD-L1路徑可增強對疫苗接種(包括慢性感染情境中之治療性疫苗接種)之反應(Ha,S.J.等人,「Enhancing therapeutic vaccination by blocking PD-1-mediated inhibitory signals during chronic infection」,J.Exp.Med.,205(3):543-555(2008);Finnefrock,A.C.等人,「PD-1 blockade in rhesus macaques:impact on chronic infection and prophylactic vaccination」,J.Immunol.,182(2):980-987(2009);Song,M.-Y.等人,「Enhancement of vaccine-induced primary and memory CD8+ t-cell responses by soluble PD-1」,J.Immunother.,34(3):297-306(2011))。
本文中所述的分子證實在基於生化及細胞之兩種實驗系統中阻斷PD-L1與PD-1相互作用之能力。此等結果與治療性投藥以增強在癌症或慢性感染中之免疫性(包括治療性疫苗)之潛力一致。
本文中所述的大環肽能夠抑制PD-L1與PD-1以及與CD80間的相互作用。此等化合物已證實高度有效地結合PD-L1,阻斷PD-L1與PD-1或CD80中任一者之相互作用,且能夠促進增強T細胞功能活性,因此使得該等化合物成為非經腸、口服、肺部、鼻、頰及持續釋放型調配物之候選者。
在一個態樣中,本發明提供式(I)之化合物,
或其醫藥上可接受之鹽,其中:A係選自鍵、
其中:
表示與羰基的連接點及表示與氮原子的連接點;z為0、1或2;w為1或2;n為0或1;m為1或2;m'為0或1;p為0、1或2;Rx係選自氫、胺基、羥基及甲基;R14及R15獨立地選自氫及甲基;及Rz係選自氫及-C(O)NHR16;其中R16係選自氫、-CHR17C(O)NH2、-CHR17C(O)NHCHR18C(O)NH2及-CHR17C(O)NHCHR18C(O)NHCH2C(O)NH2;其中R17係選自氫及-CH2OH及其中R18係選自氫及甲基;Rv為氫或天然胺基酸側鏈;Rc、Rf、Rh、Ri及Rm為氫;Rn為氫或甲基或Rv與Rn形成吡咯啶環;Ra為氫或甲基;Rj係選自氫、C1-C6烷氧基C1-C6烷基、C1-C6烷基、羧基C1-C6烷基、鹵代C1-C6烷基、羥基C1-C6烷基、(NRa'Rb')C1-C6烷基,其中Ra'及Rb'係獨立地選自氫及C1-C6烷基;及苯基C1-C6烷基,其中該苯基係視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、氰基、鹵基及硝基之基團取代;R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12及R13係獨立地選自天然胺基酸側鏈及非天然胺基酸側鏈;或R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12及R13可
各自獨立地與如下文所述之對應鄰位R基團形成環;Rb係選自C1-C6烷氧基C1-C6烷基、C1-C6烷基、羧基C1-C6烷基、鹵代C1-C6烷基、羥基C1-C6烷基、(NRa'Rb')C1-C6烷基,其中Ra'及Rb'係獨立地選自氫及C1-C6烷基;及苯基C1-C6烷基,其中該苯基係視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、氰基、鹵基及硝基之基團取代;或Rb及R2與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷、吡咯啶、嗎啉、哌啶、哌嗪及四氫噻唑之環;其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、氰基、甲基、鹵基及羥基之基團取代;Rd係選自氫、C1-C6烷氧基C1-C6烷基、C1-C6烷基、羧基C1-C6烷基、鹵代C1-C6烷基、羥基C1-C6烷基、(NRa'Rb')C1-C6烷基,其中Ra'及Rb'係獨立地選自氫及C1-C6烷基;及苯基C1-C6烷基,其中該苯基係視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、氰基、鹵基及硝基之基團取代;或Rd及R4可與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷、吡咯啶、嗎啉、哌啶、哌嗪及四氫噻唑之環;其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、氰基、甲基、鹵基、羥基及苯基之基團取代;Re係選自氫、C1-C6烷氧基C1-C6烷基、C1-C6烷基、羧基C1-C6烷基、鹵代C1-C6烷基、羥基C1-C6烷基、(NRa'Rb')C1-C6烷基,其中Ra'及Rb'係獨立地選自氫及C1-C6烷基;及苯基C1-C6烷基,其中該苯基係視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、氰基、鹵基及硝基之基團取代;或Re及R5可與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷、吡咯啶、嗎啉、哌啶、哌嗪及四氫噻唑之環;其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、氰基、甲基、鹵基及羥基之基團取代;Rg係選自氫、C1-C6烷氧基C1-C6烷基、C1-C6烷基、羧基C1-C6烷
基、鹵代C1-C6烷基、羥基C1-C6烷基、(NRa'Rb')C1-C6烷基,其中Ra'及Rb'係獨立地選自氫及C1-C6烷基;及苯基C1-C6烷基,其中該苯基係視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、氰基、鹵基及硝基之基團取代;或Rg及R7可與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷、吡咯啶、嗎啉、哌啶、哌嗪及四氫噻唑之環;其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、視需要經鹵基取代之苄基、苄氧基、氰基、環己基、甲基、鹵基、羥基、視需要經甲氧基取代之異喹啉基氧基、視需要經鹵基取代之喹啉基氧基及四唑基之基團取代;其中該吡咯啶及哌啶環係視需要與環己基、苯基或吲哚基稠合;其限制條件為,Ra、Rb、Rd、Re、Rg、Rj、Rk及Rl中之至少一者係選自C1-C6烷氧基C1-C6烷基、C2-C6烷基、羧基C1-C6烷基、鹵代C1-C6烷基、羥基C1-C6烷基、(NRa'Rb')C1-C6烷基,其中Ra'及Rb'係獨立地選自氫及C1-C6烷基;及苯基C1-C6烷基,其中該苯基係視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、氰基、鹵基及硝基之基團取代。
在本發明第一態樣之第一實施例中提供一種式(I)之化合物或其醫藥上可接受之鹽,其中Re係選自氫及甲基,或Re及R5可與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷、吡咯啶、嗎啉、哌啶、哌嗪及四氫噻唑之環;其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、氰基、甲基、鹵基及羥基之基團取代;及Rj為氫或甲基。在本發明第一態樣之第二實施例中,Rk係選自氫及甲基,或Rk及R11可與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷、吡咯啶、嗎啉、哌啶、哌嗪及四氫噻唑之環;其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、氰基、甲基、鹵基及羥基之基團取代;及Rl為甲基,或Rl及R12與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷及吡咯啶之環,其中各環係視需要經一至四個獨立
選自胺基、氰基、甲基、鹵基及羥基之基團取代。在第三態樣中,A為
,其中z及w各為1;R14及R15為氫;及Rz為-C(O)NHR16;其中R16為-CHR17C(O)NH2;R17為氫;R1為視需要經羥基取代之苄基;R2為氫或甲基;R8為-(CH2)吲哚基;R10係選自-(CH2)吲哚基及-(CH2)苯并噻吩基,其各者係視需要經-CH2CO2H取代;R11為丁基;及R12為丁基。
在另一實施例中,本發明提供一種增強、刺激且/或增加有此需要的個體之免疫反應之方法,該方法包括向該個體投與治療上有效量之式(I)之化合物或其治療上可接受之鹽。在另一實施例中,該方法進一步包括在式(I)之化合物或其治療上可接受之鹽之前、之後或同時投與另一藥劑。在另一實施例中,該另一藥劑為抗微生物劑、抗病毒劑、細胞毒性劑及/或免疫反應調節劑。在另一實施例中,該另一藥劑為HDAC抑制劑。在另一實施例中,該另一藥劑為TLR7及/或TLR8促效劑。
在另一實施例中,本發明提供一種抑制有此需要的個體之癌細胞生長、增殖或轉移之方法,該方法包括向該個體投與治療上有效量
之式(I)之化合物或其治療上可接受之鹽。應明瞭該抑制作用可係直接或間接的。在另一實施例中,該癌症係選自黑色素瘤、腎細胞癌、鱗狀非小細胞肺癌(NSCLC)、非鱗狀NSCLC、結腸直腸癌、去勢抗性前列腺癌、卵巢癌、胃癌、肝細胞癌、胰臟癌、頭部及頸部鱗狀細胞癌、食道癌、胃腸道癌及乳癌及血液惡性疾病。
在另一實施例中,本發明提供一種治療有此需要的個體之傳染性疾病之方法,該方法包括向該個體投與治療上有效量之式(I)之化合物或其治療上可接受之鹽。在另一實施例中,該傳染性疾病係由病毒引起。在另一實施例中,該病毒係選自HIV、A型肝炎、B型肝炎、C型肝炎、疱疹病毒及流感病毒。
在另一實施例中,本發明提供一種治療有此需要的個體之敗血性休克之方法,該方法包括向該個體投與治療上有效量之一或多種本文中所述之大環肽。
在另一實施例中,本發明提供一種阻斷個體之PD-L1與PD-1及/或CD80相互作用之方法,該方法包括向該個體投與治療上有效量之至少一種本文中所述之大環肽。
在R側鏈為經甲基取代之環的一部分之式(I)之化合物中,應明瞭該甲基可處在環中任何可取代碳原子(包括為大環母結構的一部分之碳)上。
在式(I)之化合物中,較佳的R1側鏈為:苯丙胺酸、酪胺酸、3-噻吩-2-基、4-甲基苯基丙胺酸、4-氯苯基丙胺酸、3-甲氧基苯基丙胺酸、異色胺酸、3-甲基苯基丙胺酸、1-萘基丙胺酸、3,4-二氟苯基丙胺酸、4-氟苯基丙胺酸、3,4-二甲氧基苯基丙胺酸、3,4-二氯苯基丙胺酸、4-二氟甲基苯基丙胺酸、2-甲基苯基丙胺酸、2-萘基丙胺酸、色胺酸、4-吡啶基、4-溴苯基丙胺酸、3-吡啶基、4-三氟甲基苯基丙胺酸、4-羧基苯基丙胺酸、4-甲氧基苯基丙胺酸、聯苯基丙胺酸及3-
氯苯基丙胺酸;及2,4-二胺基丁烷。
在R2不為環之一部分的式(I)之化合物中,較佳的R2側鏈為:丙胺酸、絲胺酸及甘胺酸。
在式(I)之化合物中,較佳的R3側鏈為:天冬醯胺、天冬胺酸、麩胺酸、麩胺醯胺、絲胺酸、鳥胺酸、離胺酸、組胺酸、蘇胺酸、白胺酸、丙胺酸、2,3-二胺基丙烷及2,4-二胺基丁烷。
在R4不為環之一部分的式(I)之化合物中,較佳的R4側鏈為:纈胺酸、丙胺酸、異白胺酸及甘胺酸。
在式(I)之化合物中,較佳的R5側鏈為:胺基甲烷、組胺酸、天冬醯胺、2,3-二胺基丙烷、絲胺酸、甘胺酸、2,4-二胺基丁烷、蘇胺酸、丙胺酸、離胺酸、天冬胺酸、丙胺酸及3-噻唑基丙胺酸。
在式(I)之化合物中,較佳的R6側鏈為:白胺酸、天冬胺酸、天冬醯胺、麩胺酸、麩胺醯胺、絲胺酸、離胺酸、3-環己烷、蘇胺酸、鳥胺酸、2,4-二胺基丁烷、丙胺酸、精胺酸及鳥胺酸(COCH3)。
在R7不為環之一部分的式(I)之化合物中,較佳的R7側鏈為:甘胺酸、2,4-二胺基丁烷、絲胺酸、離胺酸、精胺酸、鳥胺酸、組胺酸、天冬醯胺、麩胺醯胺、丙胺酸及2,4-二胺基丁烷(C(O)環丁烷)。
在式(I)之化合物中,較佳的R8側鏈為色胺酸及1,2-苯并異噻唑啉基丙胺酸。
在式(I)之化合物中,較佳的R9側鏈為:絲胺酸、組胺酸、離胺酸、鳥胺酸、2,4-二丁基胺、蘇胺酸、離胺酸、甘胺酸、麩胺酸、纈胺酸、2,3-二胺基丙烷、精胺酸、天冬胺酸及酪胺酸。
在式(I)之化合物中,較佳的R10側鏈為:視需要經取代之色胺酸、苯并異噻唑基苯丙胺酸、1-萘基丙胺酸及甲硫胺酸。
在式(I)之化合物中,較佳的R11側鏈為:正白胺酸、白胺酸、天冬醯胺、苯丙胺酸、甲硫胺酸、乙氧基甲烷、丙胺酸、色胺酸、異白
胺酸、苯基丙烷、麩胺酸、己烷及庚烷。
在R12不為環之一部分的式(I)之化合物中,較佳的R12側鏈為:正白胺酸、丙胺酸、乙氧基甲烷、甲硫胺酸、絲胺酸、苯丙胺酸、甲氧基乙烷、白胺酸、色胺酸、異白胺酸、麩胺酸、己烷、庚烷及甘胺酸。
在式(I)之化合物中,較佳的R13側鏈為:精胺酸、鳥胺酸、丙胺酸、2,4-二胺基丁烷、2,3-二胺基丙烷、白胺酸、天冬胺酸、麩胺酸、絲胺酸、離胺酸、蘇胺酸、環丙基甲烷、甘胺酸、纈胺酸、異白胺酸、組胺酸及2-胺基丁烷。
根據本發明,吾人已發現特異性結合至PD-L1且能夠抑制PD-L1與PD-1及CD80相互作用之肽。此等大環肽展現活體外免疫調節療效,因此使得該等大環肽成為用於治療各種疾病(包括癌症及傳染性疾病)之治療性候選者。
術語「特異性結合」或「特異地結合」係指蛋白質及結合性分子諸如化合物或配體間之相互作用。該相互作用取決於蛋白質之由結合性分子識別之特定結構(亦即,酶結合位點、抗原決定子或抗原決定基)之存在。例如,若化合物具有對蛋白質結合位點「A」之特異結合性,則該化合物存在於包含含有結合位點A之蛋白質之反應中,及特異結合至蛋白質結合位點A之經標記肽將減少結合至蛋白質之經標記肽的量。相反地,化合物與蛋白質之非特異性結合不導致經標記肽自蛋白質發生濃度依賴性置換。
本發明意欲包括本發明化合物中出現的原子之所有同位素。同位素包括彼等具有相同原子數但具有不同質量數之原子。作為一般實例且無限制地,氫之同位素包括氘及氚。碳之同位素包括13C及14C。通常,可藉由熟習此項技術者已知的習知技術或藉由與彼等本文所述者類似的方法使用適當同位素標記之試劑代替否則使用的非標記試劑
來製備同位素標記之本發明化合物。此等化合物可具有多種潛在用途,例如,用作測定生物活性中之標準品及試劑。就穩定同位素而言,此等化合物可具有有利地調節生物學、藥理學或藥物動力學性質之潛力。
本文中所述標的的另一態樣為一種所揭示肽用作放射性標記配體用於開發配體結合分析法或用於監測活體內吸收、代謝、分佈、受體結合或佔有或化合物定位之用途。例如,可使用放射性同位素125I製備本文中所述的大環肽及所得的放射性標記肽可用於開發結合分析法或用於代謝研究。或者且就相同目的而言,本文中所述的大環肽可藉由使用熟習此項技術者已知的方法催化氚化轉化為放射標記形式。
本發明之大環肽亦可藉由使用熟習此項技術者已知的方法添加放射性示蹤物用作PET造影劑。
較佳的肽包含至少一種本文中所提供的大環肽及此等肽可包含於醫藥組合物及組合中。
除非在特定情況中另作限制,否則本文中所提供的定義無限制性地適用於如本說明書全文所使用的術語。
熟習胺基酸及肽化學技術者知曉胺基酸包括由一般結構式表示之化合物:
其中R及R'係如本文中所論述。
除非另有指示,否則如本文中單獨地或作為另一基團的一部分使用,術語「胺基酸」包括(但不限於)連接至相同碳(稱之為「α」碳)之胺基及羧基,其中R及/或R'可為天然或非天然側鏈,包括氫。在
「α」碳之絕對「S」構形通常稱為「L」或「自然」構形。在「R」及「R'」(主要)取代基同時為氫之情況中,胺基酸為甘胺酸但不具對掌性。
如本文中所使用,術語「天然胺基酸側鏈」及「天然生成之胺基酸側鏈」係指任何的通常呈S-構形(亦即,L-胺基酸)之天然生成之胺基酸(亦即,丙胺酸、精胺酸、天冬醯胺、天冬胺酸、半胱胺酸、麩胺醯胺、麩胺酸、甘胺酸、組胺酸、異白胺酸、白胺酸、離胺酸、甲硫胺酸、苯丙胺酸、脯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、色胺酸、酪胺酸及纈胺酸)之側鏈。
如本文中所使用,術語「非天然胺基酸側鏈」及「非天然生成之胺基酸側鏈」係指任何的通常呈R-構形(亦即,D-胺基酸)之天然生成之胺基酸之側鏈或係指選自以下之除呈R-或S-構形(亦即,分別為D-或L-胺基酸)之天然生成之胺基酸側鏈外之基團:C2-C7烯基、C1-C3烷氧基C1-C3烷基、C1-C6烷氧基羰基C1-C3烷基、C1-C7烷基、C1-C3烷基硫基C1-C3烷基、醯胺基C1-C3烷基、胺基C1-C3烷基、氮雜吲哚基C1-C3烷基、苯并噻唑基C1-C3烷基、苯并噻吩基C1-C3烷基、苄氧基C1-C3烷基、羧基C1-C3烷基、C3-C14環烷基C1-C3烷基、聯苯基甲基、呋喃基C1-C3烷基、咪唑基C1-C3烷基、萘基C1-C3烷基、吡啶基C1-C3烷基、噻唑基C1-C3烷基、噻吩基C1-C3烷基;聯苯基C1-C3烷基,其中該聯苯基係視需要經甲基取代;視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C4烷氧基、C1-C4烷基、C1-C3烷基磺醯基胺基、醯胺基、胺基、胺基C1-C3烷基、胺基磺醯基、羧基、氰基、鹵基、鹵代C1-C3烷基、羥基、-NC(NH2)2、硝基及-OP(O)(OH)2之基團取代之雜環基;吲哚基C1-C3烷基,其中該吲哚基部分係視需要經一個選自C1-C3烷基、羧基C1-C3烷基、鹵基、羥基及苯基之基團取代,其中該苯基
係視需要進一步經一個、兩個或三個獨立選自C1-C3烷氧基、C1-C3烷基及鹵基之基團取代;NRyRy'(C1-C7烷基),其中Ry及Ry'獨立地選自氫、C2-C4烯氧基羰基、C1-C3烷基、C1-C3烷基羰基、C3-C14環烷基羰基、呋喃基羰基及苯基羰基。當烷基連接子含有多於一個碳時,另一NRyRy'基可在鏈上。
NRqRt羰基C1-C3烷基,其中Rq及Rt獨立地選自氫、C1-C3烷基及三苯基甲基;視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C4烷氧基、C1-C4烷基、C1-C3烷基磺醯基胺基、醯胺基、胺基、胺基C1-C3烷基、胺基磺醯基、羧基、氰基、鹵基、鹵代C1-C3烷基、羥基、-NC(NH2)2、硝基及-OP(O)(OH)2之基團取代之苯基;苯基C1-C3烷基,其中該苯基部分係視需要經一個、兩個、三個、四個或五個獨立選自C1-C4烷氧基、C1-C4烷基、C1-C3烷基磺醯基胺基、醯胺基、胺基、胺基C1-C3烷基、胺基磺醯基、羧基、氰基、鹵基、鹵代C1-C3烷基、羥基、-NC(NH2)2、硝基及-OP(O)(OH)2之基團取代;及苯氧基C1-C3烷基,其中該苯基係視需要經C1-C3烷基取代。
如本文中所使用,術語「C2-C4烯基」係指含有至少一個碳-碳雙鍵之兩個至四個碳原子之直鏈或分支鏈基團。
如本文中所使用,術語「C2-C7烯基」係指含有至少一個碳-碳雙鍵之兩個至七個碳原子之直鏈或分支鏈基團。
如本文中所使用,術語「C2-C4烯氧基」係指經氧原子連接至母分子部分之C2-C4烯基。
如本文中所使用,術語「C1-C3烷氧基」係指經氧原子連接至母分子部分之C1-C3烷基。
如本文中所使用,術語「C1-C4烷氧基」係指經氧原子連接至母分子部分之C1-C4烷基。
如本文中所使用,術語「C1-C6烷氧基」係指經氧原子連接至母分子部分之C1-C6烷基。
如本文中所使用,術語「C1-C3烷氧基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之C1-C3烷氧基。
如本文中所使用,術語「C1-C6烷氧基C1-C6烷基」係指經C1-C6烷基連接至母分子部分之C1-C6烷氧基。
如本文中所使用,術語「C1-C6烷氧基羰基」係指經羰基連接至母分子部分之C1-C6烷氧基。
如本文中所使用,術語「C1-C6烷氧基羰基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之C1-C6烷氧基羰基。
如本文中所使用,術語「C1-C3烷基」係指衍生自含有一至三個碳原子之直鏈或分支鏈飽和烴之基團。
如本文中所使用,術語「C1-C4烷基」係指衍生自含有一至四個碳原子之直鏈或分支鏈飽和烴之基團。
如本文中所使用,術語「C1-C6烷基」係指衍生自含有一至六個碳原子之直鏈或分支鏈飽和烴之基團。
如本文中所使用,術語「C1-C3烷基羰基」係指經羰基連接至母分子部分之C1-C3烷基。
如本文中所使用,術語「C1-C3烷基硫基」係指經硫原子連接至母分子部分之C1-C3烷基。
如本文中所使用,術語「C1-C3烷基硫基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之C1-C3烷基硫基。
如本文中所使用,術語「C1-C3烷基磺醯基」係指經磺醯基連接至母分子部分之C1-C3烷基。
如本文中所使用,術語「C1-C3烷基磺醯基胺基」係指經胺基連接至母分子部分之C1-C3烷基磺醯基。
如本文中所使用,術語「醯胺基」係指-C(O)NH2。
如本文中所使用,術語「醯胺基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之醯胺基。
如本文中所使用,術語「胺基」係指-NH2。
如本文中所使用,術語「胺基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之胺基。
如本文中所使用,術語「胺基磺醯基」係指經磺醯基連接至母分子部分之胺基。
如本文中所使用,術語「氮雜吲哚基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子之氮雜吲哚基。氮雜吲哚基可經該基團中之任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「苯并噻唑基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子之苯并噻唑基。苯并噻唑基可經該基團中任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「苯并噻吩基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子之苯并噻吩基。苯并噻吩基可經該基團中之任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「苄氧基」係指經氧原子連接至母分子部分之苄基。
如本文中所使用,術語「苄氧基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之苄氧基。
如本文中所使用,術語「聯苯基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之聯苯基。聯苯基可經該基團中之任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「羰基」係指-C(O)-。
如本文中所使用,術語「羧基」係指-CO2H。
如本文中所使用,術語「羧基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之羧基。
如本文中所使用,術語「羧基C1-C6烷基」係指經C1-C6烷基連接至母分子部分之羧基。
如本文中所使用,術語「氰基」係指-CN。
如本文中所使用,術語「C3-C14環烷基」係指具有三個至十四個碳原子及零個雜原子之飽和單環狀、雙環狀或三環狀烴環體系。雙環狀及三環狀環可係稠合、螺環狀或橋聯。環烷基之代表性實例包括(但不限於)環丙基、環戊基、雙環[3.1.1]庚基及金剛烷基。
如本文中所使用,術語「C3-C14環烷基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之C3-C14環烷基。
如本文中所使用,術語「C3-C14環烷基羰基」係指經羰基連接至母分子部分之C3-C14環烷基。
如本文中所使用,術語「呋喃基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之呋喃基。呋喃基可經該基團中任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「呋喃基羰基」係指經羰基連接至母分子部分之呋喃基。
如本文中所使用,術語「鹵基」及「鹵素」係指F、Cl、Br或I。
如本文中所使用,術語「鹵代C1-C3烷基」係指經一個、兩個或三個鹵原子取代之C1-C3烷基。
如本文中所使用,術語「鹵代C1-C6烷基」係指經一個、兩個或三個鹵原子取代之C1-C6烷基。
如本文中所使用,術語「鹵代甲基」係指經一個、兩個或三個
鹵原子取代之甲基。
如本文中所使用,術語「雜環基」係指含有一個、兩個或三個獨立選自氮、氧及硫之雜原子之五-、六-或七員環。五員環具有零個至兩個雙鍵及六-及七員環具有零個至三個雙鍵。術語「雜環基」亦包括其中雜環基環稠合至四-至六員芳族或非芳族碳環狀環或另一單環狀雜環基的雙環狀基團。本發明之雜環基係經該基團中之碳原子連接至母分子部分。雜環基之實例包括(但不限於)苯并噻吩基、呋喃基、咪唑基、吲哚啉基、吲哚基、異噻唑基、異噁唑基、嗎啉基、噁唑基、哌嗪基、哌啶基、吡唑基、吡啶基、吡咯啶基、吡咯并吡啶基、吡咯基、噻唑基、噻吩基及硫代嗎啉基。
如本文中所使用,術語「羥基」係指-OH。
如本文中所使用,術語「羥基C1-C6烷基」係指經一個、兩個或三個羥基取代之C1-C6烷基。
如本文中所使用,術語「咪唑基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之咪唑基。咪唑基可經該基團中任何可取代基團連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「吲哚基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之吲哚基。吲哚基可經該基團中之任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「萘基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之萘基。萘基可經該基團中之任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「硝基」係指-NO2。
如本文中所使用,術語「NRyRy'」係指兩個經氮原子連接至母分子部分之基團Ry及Ry'。Ry及Ry'獨立地選自氫、C2-C4烯氧基羰基、C1-C3烷基羰基、C3-C14環烷基羰基、呋喃基羰基及苯基羰基。
如本文中所使用,術語「NRyRy'(C1-C3)烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之NRyRy'基。
如本文中所使用,術語「NRqRt」係指兩個經氮原子連接至母分子部分之基團Rq及Rt。Rq及Rt獨立地選自氫、C1-C3烷基及三苯基甲基。
如本文中所使用,術語「NRqRt羰基」係指經羰基連接至母分子部分之NRqRt基。
如本文中所使用,術語「NRqRt羰基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之NRqRt羰基。
如本文中所使用,術語「苯氧基」係指經氧原子連接至母分子部分之苯基。
如本文中所使用,術語「苯氧基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之苯氧基。
如本文中所使用,術語「苯基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之苯基。
如本文中所使用,術語「苯基C1-C6烷基」係指經C1-C6烷基連接至母分子部分之苯基。
如本文中所使用,術語「苯基羰基」係指經羰基連接至母分子部分之苯基。
如本文中所使用,術語「吡啶基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之吡啶基。吡啶基可經該基團中之任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「硫基」係指-S-。
如本文中所使用,術語「磺醯基」係指-SO2-。
如本文中所使用,術語「噻唑基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之噻唑基。噻唑基可經該基團中之任何可取代原子連
接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「噻吩基C1-C3烷基」係指經C1-C3烷基連接至母分子部分之噻吩基。噻吩基可經該基團中之任何可取代原子連接至烷基部分。
如本文中所使用,術語「治療」係指:(i)預防可能易患疾病、病症及/或病狀但尚未診斷為患有該疾病、病症及/或病狀之病患中出現之該疾病、病症或病狀;(ii)抑制疾病、病症或病症,亦即,阻止其發展;及(iii)緩解疾病、病症或病症,亦即,引起疾病、病症及/或病狀及/或與該疾病、病症及/或病狀相關聯之症狀消退。
可例如藉由諸如均相時間解析熒光(HTRF)、表面電漿共振(SPR)、等位滴定量熱法(ITC)、核磁共振光譜法(NMR)及類似之方法測量大環肽與PD-L1之結合性。另外,可如本文在細胞結合分析中所述測量大環肽與表現於細胞表面上之PD-L1之結合性。
投與本文中所述之治療劑包括(但不限於)投與治療上有效量之治療劑。如本文中所使用,術語「治療上有效量」係指(但不限於)治療或預防可藉由投與本文中所述之PD-1/PD-L1結合抑制劑之組合物治療的病狀之治療劑的量。該量為足以顯示可檢測治療或預防或改善效果的量。該效果可包括(例如但不限於)治療或預防本文中所列的病狀。針對個體之精確有效量將隨著個體大小及健康狀態、所治療病狀之性質及程度、主治醫生之建議及針對投藥所選擇之治療劑或治療劑之組合而改變。因此,提前指定精確有效量是沒有用的。
在另一態樣中,本發明係關於使用本發明之大環肽抑制個體中腫瘤細胞生長之方法。如本文中所證實,本發明之大環肽能夠結合至PD-L1,中斷PD-L1與PD-1間之相互作用,與已知阻斷與PD-1相互作用之抗-PD-1單株抗體競爭結合PD-L1,增強CMV特異性T細胞IFNγ分泌,及增強HIV特異性T細胞IFNg分泌。結果,本發明之大環肽可用
於改良免疫反應,治療疾病(諸如癌症或傳染性疾病),刺激保護性自體免疫反應或刺激抗原特異性免疫反應(例如,藉由共同投與PD-L1阻斷肽與受關注抗原)。
為可更輕易地明瞭本發明,首先定義特定術語。其他定義述於詳細說明中。
術語「程式化死亡配體1」、「程式化細胞死亡配體1」、「蛋白質PD-L1」、「PD-L1」、「PDL1」、「PDCDL1」、「hPD-L1」、「hPD-LI」、「CD274」及「B7-H1」可互換使用,且包括人類PD-L1之變體、同功異型物、物種同源物及具有至少一個與PD-L1共同的抗原決定基之類似物。完整PD-L1序列可以GENBANK®寄存編號NP_054862找到。
術語「程式化死亡1」、「程式化細胞死亡1」、「蛋白質PD-1」、「PD-1」、「PD1」、「PDCD1」、「hPD-1」及「hPD-I」可互換使用,且包括人類PD-1之變體、同功異型物、物種同源物、及具有至少一個與PD-1共同的抗原決定基之類似物。完整PD-1序列可以GENBANK®寄存編號U64863找到。
術語「與細胞毒性T淋巴細胞相關聯之抗原-4」、「CTLA-4」、「CTLA4」、「CTLA-4抗原」及「CD152」(參見,例如,Murata,Am.J.Pathol.,155:453-460(1999))可互換使用,且包括人類CTLA-4之變體、同功異型物、物種同源物、及具有至少一個與CTLA-4共同的抗原決定基之類似物(參見,例如,Balzano,Int.J.Cancer Suppl.,7:28-32(1992))。完整CTLA-4核酸序列可以GENBANK®寄存編號L15006找到。
術語「免疫反應」係指例如淋巴細胞、抗原呈現細胞、吞噬細胞、粒細胞及由上述細胞或肝臟產生之可溶性大分子(包括大環肽、細胞介素及補體)會導致選擇性損傷、破壞或自人體消除侵入病原體、經病原體感染之細胞或組織、癌細胞或在自體免疫性或病理性發
炎情況下之正常人類細胞或組織之作用。
如本文中所使用,「不良事件」(AE)為與採用醫學治療相關聯之任何不利且一般非期望、甚至不想要出現之徵兆(包括異常性實驗室發現)、症狀或疾病。例如,不良事件可與回應於治療之免疫系統之活化或免疫系統細胞(例如,T細胞)增殖相關聯。醫學治療可具有一或多種相關聯之AE且各AE可具有相同或不同的嚴重度。提及能夠「改變不良事件」之方法意指降低一或多種與採用不同治療療程相關聯之AE之發病率及/或嚴重度之治療療程。
如本文中所使用,「過度增生性疾病」係指細胞生長增加超過正常水平之病狀。例如,過度增生性疾病或病症包括惡性疾病(例如,食道癌、結腸癌、膽囊癌)及非惡性疾病(例如,動脈粥樣硬化、良性增生及良性前列腺過度生長)。
如本文中所使用,「約」或「基本上由......組成」意指在如由熟習此項技術者所測定之特定值之可接受誤差範圍內,該誤差範圍將部分地取決於該值係如何測得或確定,亦即,測量系統之限制。例如,「約」或「基本上由......組成」可意指在按照相關技術實務之一個或多於一個標準偏差內。或者,「約」或「基本上由......組成」可意指至多20%之範圍。另外,尤其相對於生物系統或過程而言,該等術語可意指值之至多一個數量級或至多5倍。當申請案及申請專利範圍中提供特定值時,除非有相反規定,否則「約」或「基本上由......組成」之含義應假設為在該特定值之可接受誤差範圍內。
如本文中所述,除非另外說明,否則任何濃度範圍、百分率範圍、比率範圍或整數範圍應理解為包括所述範圍中任何整數及若適宜其分數(諸如整數之十分之一及百分之一)之值。
競爭分析法
本發明亦關於能夠競爭參照抗-PD-L1抗體(MDX-1105)之結合至
少約20%、至少約30%、至少約40%、至少約50%、至少約60%、至少約70%、至少約80%、至少約90%及至少約100%的大環肽。此等大環肽可與一或多種本文中所揭示之大環肽共有結構同源性,本文中所揭示之巨環大環肽包括突變體、保守取代、功能性取代及缺失形式,條件係其特異性結合PD-L1。例如,若大環肽實質上結合至PD-L1之與參照抗-PD-L1抗體相同之區域,則該大環肽應結合至PD-L1之至少與抗-PD-L1單株抗體所結合的PD-L1抗原決定基重疊之抗原決定基。重疊區域可在一個胺基酸殘基至數百個胺基酸殘基範圍內。在競爭分析法中,大環肽則應競爭且/或阻斷抗-PD-L1單株抗體結合至PD-L1及由此減少抗-PD-L1單株抗體與PD-L1之結合,較佳減少至少約50%。
相關技術中已知出於競爭分析目的可用作參照抗體之抗-PD-L1抗體。例如,可使用以下代表性抗-PD-L1抗體:MDX-1105(BMS);L01X-C(Serono)、L1X3(Serono)、MSB-0010718C(Serono)及PD-L1 Probody(CytomX)、及揭示於共同擁有之WO 2007/005874中之PD-L1抗體。
相關技術中已知出於競爭分析目的可用作參照抗體之抗-PD-1抗體。例如,可使用以下代表性抗-PD-1抗體:納武單抗(nivolumab)(BMS);各揭示於共同擁有之美國專利第8,008,449號(BMS)中之17D8、2D3、4H1、4A11、7D3及5F4、MK-3475(Merck,揭示於美國專利第8,168,757號中)及揭示於美國專利第7,488,802號中之抗體。
醫藥組合物
在另一態樣中,本發明提供一種含有與醫藥上可揭示之載劑共同調配之一種或組合之本發明大環肽的組合物,例如,醫藥組合物。此等組合物可包括一種或組合(例如,兩種或更多種不同)之本發明大環肽、或免疫偶聯物或雙特異性分子。例如,本發明醫藥組合物可包
括結合至靶抗原上之不同抗原決定基或具有互補活性之大環肽(或免疫偶聯物或雙特異性分子)之組合。
本發明醫藥組合物亦可以組合療法(亦即,與其他藥劑組合)投與。例如,組合療法可包括大環肽與至少一種其他抗發炎藥或免疫抑制劑之組合。下文在關於本發明大環肽之用途的段落中更詳細地描述可用於組合療法中之治療劑之實例。
如本文中所使用,「醫藥上可接受之載劑」包括任何及所有的生理上相容之溶劑、分散介質、包衣、抗細菌劑及抗真菌劑、等滲劑及吸收延緩劑及類似。較佳地,載劑適用於靜脈內、肌肉內、皮下、非經腸、脊柱或表皮投與(例如,藉由注射或輸注)。根據投藥途徑,活性化合物(亦即,大環肽、免疫偶聯物或雙特異性分子)可以材料塗覆以保護化合物免遭酸及其他的可能使化合物失活之自然條件作用。
本發明醫藥化合物可包含一或多種醫藥上可接受之鹽。「醫藥上可接受之鹽」或「治療上可接受之鹽」係指保留母體化合物之所期望的生物活性但不賦予任何非所欲毒物學效應之鹽(參見,例如,Berge,S.M.等人,J.Pharm.Sci.,66:1-19(1977))。此等鹽之實例包括酸加成鹽及鹼加成鹽。酸加成鹽包括彼等衍生自無毒無機酸諸如鹽酸、硝酸、磷酸、硫酸、氫溴酸、氫碘酸、亞磷酸等以及衍生自無毒無機酸諸如脂族單-及二羧酸、經苯基取代之鏈烷酸、羥基鏈烷酸、芳族酸、脂族及芳族磺酸等之鹽。鹼加成鹽包括彼等衍生自鹼土金屬諸如鈉、鉀、鎂、鈣等以及衍生自無毒有機胺諸如N,N'-二苄基乙二胺、N-甲基葡糖胺、氯普魯卡因、膽鹼、二乙醇胺、乙二胺、普魯卡因等之鹽。
本發明醫藥組合物亦可包含醫藥上可接受之抗氧化劑。醫藥上可接受之抗氧化劑之實例包括:(1)水溶性抗氧化劑,諸如抗壞血酸、半胱胺酸鹽酸鹽、硫酸氫鈉、偏亞硫酸氫鈉、亞硫酸鈉等;(2)
油溶性抗氧化劑,諸如抗壞血酸棕櫚酸酯、丁基化羥基苯甲醚(BHA)、丁基化羥基甲苯(BHT)、卵磷脂、沒食子酸丙酯、α-生育酚等;及(3)金屬螯合劑,諸如檸檬酸、乙二胺四乙酸(EDTA)、山梨糖醇、酒石酸、磷酸等。
可用於本發明醫藥組合物中之適宜水性及非水性載劑之實例包括水、乙醇、多元醇(諸如甘油、丙二醇、聚乙二醇等)及其適宜混合物、植物油(諸如橄欖油)及可注射之有機酯(諸如油酸乙酯)。可例如藉由使用諸如卵磷脂之包衣材料、若為分散液則藉由維持所需粒度、及藉由使用表面活性劑來維持適度流動性。
此等組合物亦可含有佐劑,諸如防腐劑、濕潤劑、乳化劑及分散劑。可同時藉由滅菌程序(同前述)及藉由包含多種抗細菌劑及抗真菌劑(例如,對羥基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、山梨酸等)來防止微生物存在。亦可能期望該等組合物中包含等滲劑,諸如蔗糖、氯化鈉等。此外,可藉由包含延緩吸收之試劑諸如單硬脂酸鋁及明膠使得可注射醫藥形式之吸收時間延長。
醫藥上可接受之載劑包括無菌水溶液或分散液及用於無菌可注射溶液或分散液之臨時製備的無菌粉末。相關技術中已知此等介質及試劑於醫藥活性物質之用途。除了在任何習知介質或試劑與活性化合物不相容之範圍外,包括其在本發明醫藥組合物中之用途。組合物中亦可併入補充活性化合物。
治療性組合物通常必須無菌且在製造及儲藏條件下穩定。該組合物可調配為溶液、微乳液、脂質體或其他的適於高藥物濃度之有序結構。載劑可為包含(例如)水、乙醇、多元醇(例如,甘油、丙二醇及液體聚乙二醇等)及其適宜混合物之溶劑或分散液介質。可例如藉由使用諸如卵磷脂之包衣、若為分散液則藉由維持所需粒度、及藉由使用表面活性劑維持適度流動性。在許多情況中,組合物中將較佳包含
等滲劑,例如糖、多元醇(諸如甘露醇、山梨醇)或氯化鈉。可藉由在組合物中包含延緩吸收之試劑例如單硬脂酸鹽及明膠使得可注射組合物之吸收時間延長。
可藉由將所需量的活性化合物與按需要一種或組合之以上所例舉成分併入適宜溶劑中接著無菌微過濾來製備無菌可注射溶液。一般而言,藉由將活性化合物併入含有鹼性分散液介質及自上文所列舉之其等之所需要的其他成分之無菌媒劑中製備分散液。就用於製備無菌可注射溶液之無菌粉末而言,較佳的製備方法為真空乾燥及冷凍乾燥(凍乾),其自經其先前無菌過濾溶液產生出活性成分加上任何其他所需成分之粉末。
可與載劑材料組合以產生出單一劑型之活性成分的量將取決於所治療的個體及特定投藥模式而變化。可與載劑材料組合以產生出單一劑型之活性成分的量將一般為產生出治療效應之組合物的量。一般而言,以與醫藥上可接受之載劑組合為100%計,該量將在約0.01%至約99%活性成分,較佳約0.1%至約70%,最佳約1%至約30%活性成分範圍內。
調整給藥方案以提供最佳所需反應(例如,治療反應)。例如,可投與單一團注劑,可隨時間投與若干分次劑量或可如治療情況之緊急狀態所指示按比例減少或增加劑量。尤其宜將非經腸式組合物調配呈單元劑型來方便投藥及劑量均勻性。如本文中所使用之單元劑型係指適用作針對待治療個體之單位劑型的物理上離散單元;各單元包含經計算以產生出所需治療效應的預定量的活性化合物以及所需醫藥載劑。依照及直接根據(a)活性化合物之獨特特徵及意欲達成之特定治療效應、及(b)複合此活性化合物用於治療個體敏感性之技術中固有的限制,來決定本發明之單元劑型之規格。
對於大環肽之投與,劑量在約0.0001至100mg/kg,及更通常0.01
至5mg/kg宿主體重範圍內。例如,劑量可為0.3mg/kg體重、1mg/kg體重、3mg/kg體重、5mg/kg體重或10mg/kg體重或在1至10mg/kg範圍內。一例示性治療療程需要每天一次、每天兩次、每週兩次、每週三次、每週一次、每兩週一次、每三週一次、每四週一次、每月一次、每3個月一次或每3至6個月一次投與。本發明大環肽之較佳給藥方案包括經靜脈內投與1mg/kg體重或3mg/kg體重,且採用一種以下給藥時間表提供該大環化合物:(i)每四週6次劑量,接著每三個月;(ii)每三週;(iii)每三週3mg/kg體重一次,接著1mg/kg體重。
在一些方法中,同時投與兩種或更多種具有不同結合特異性之大環肽,於該情況中,所投與的各化合物的劑量落在指定的範圍內。通常在多種情況下投與該等化合物。單次劑量間的時間間隔可係例如每週、每月、每三個月或每年一次。如藉由測量病患中針對靶抗原之大環肽之血液水平所指示,時間間隔亦可係不規則的。在一些方法中,調整劑量以達成約1至1000mu.g/ml及在一些方法中約25至300mu.g/ml之血漿濃度。
或者,大環肽可呈持續釋放型調配物投與,於該情況中,需較不頻繁地投藥。投藥之劑量及頻率可取決於治療是預防性還是治療性而改變。在預防性應用中,於一段長的時間期內以相對不頻繁的時間間隔投與相對低的劑量。一些病患在其後半生繼續接受治療。在治療性應用中,有時需要相對短的時間間隔下相對高的劑量直到減慢或終止疾病之進展,且較佳直到病患顯示疾病症狀部分或完全地改善。此後,病患可投與預防性方案。
可改變本發明醫藥組合物中活性成分之實際劑量水平以便達成活性成分之可有效實現針對特定病患、組合物及投藥模式之所需治療反應而對病患無毒的量。所選劑量水平將取決於多種藥物動力學因素而改變,該等因素包括所使用的本發明特定組合物或其酯、鹽或醯胺
之活性、投藥途徑、投藥時間、所使用的特定化合物之排泄率、治療的持續時間、其他的組合所使用的特定組合物使用之藥物、化合物及/或材料、所治療的病患之年齡、性別、體重、病狀、一般健康及以往的病史、及醫學技術中熟知的類似因素。
本發明大環肽之「治療上有效劑量」較佳導致疾病症狀嚴重度之降低、無疾病症狀期之頻率及持續時間之增加、或因疾病折磨所致之受損或殘疾之防止。例如,就治療腫瘤而言,「治療上有效劑量」較佳使得細胞生長或腫瘤生長相對於未治療個體抑制至少約20%,更佳至少約40%,甚至更佳至少約60%,及又更佳至少約80%。可在預測人類腫瘤效力或病毒效力之動物模型系統中評估化合物抑制腫瘤生長及/或HIV之能力。或者,可藉由熟練專業者已知的分析法檢驗化合物之抑制(該種活體外抑制作用)之能力來評估組合物之該種性質。治療上有效量之治療性化合物可減小腫瘤尺寸,減小病毒負載量,或是改善個體症狀。熟習此項技術者將可基於此等因素諸如個體尺寸、個體症狀嚴重度及所選的特定組合物或投藥途徑來確定該等量。
在另一態樣中,本發明提供一種含有如本文中所述之大環肽及另一免疫調節劑之醫藥成分套組。該套組亦可進一步包括用於治療過度增生性疾病(諸如,如本文中所述之癌症)及/或抗病毒疾病之使用說明。
可使用相關技術中已知的多種方法中之一或多種方法經一或多種投藥途徑投與本發明組合物。如熟習此項技術者所瞭解,投藥途徑及/或模式將取決於所需結果而改變。本發明大環肽之較佳投藥途徑包括靜脈內、肌肉內、皮內、腹膜內、皮下、脊柱或其他非經腸投藥途徑(例如,藉由注射或輸注)。如本文中所使用,詞語「非經腸投與」意指除經腸及局部投與之外之投藥模式(通常藉由注射),且包括(但不限於)靜脈內、肌肉內、動脈內、鞘內、囊內、眶內、心臟內、
皮內、腹膜內、經氣管、皮下、表皮下、關節內、囊下、蛛網膜下、脊柱內、硬膜外及胸骨內注射及輸注。
或者,可經由非注射途徑,諸如局部、表皮或黏膜投藥途徑,例如,經鼻內、經口、經陰道、經直腸、經舌下或經局部,來投與本發明大環肽。
可用將保護化合物以防快速釋放之載劑製備活性化合物,諸如控制釋放型調配物,包括植入物、經皮貼劑及微囊化遞送系統。可使用生物可降解、生物相容性聚合物,諸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酐、聚乙醇酸、膠原蛋白、聚原酸酯及聚乳酸。用於製備此等調配物之許多方法獲得專利或通常為熟習此項技術者已知。參見,例如,Robinson,J.R.編,Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems,Marcel Dekker,Inc.,New York(1978)。
可用相關技術中已知的醫學裝置投與治療性組合物。例如,在一較佳實施例中,可用皮下無針注射裝置,諸如,揭示於美國專利第5,399,163號、第5,383,851號、第5,312,335號、第5,064,413號、第4,941,880號、第4,790,824號或第4,596,556號中之裝置投與本發明之治療性組合物。適用於本發明之熟知的植入物及模組之實例包括:美國專利第4,487,603號,其揭示一種用於以受控速率施配藥物之植入式微量注射泵;美國專利第4,486,194號,其揭示一種用於經由皮膚投與藥物之治療裝置;美國專利第4,447,233號,其揭示一種用於以精確輸注速率遞送藥物之藥物輸注泵;美國專利第4,447,224號,其揭示一種用於連續藥物遞送之可變流量植入式輸注設備;美國專利第4,439,196號,其揭示一種具有多腔區室之滲透藥物遞送系統;及美國專利第4,475,196號,其揭示一種滲透藥物遞送系統。此等專利係以引用的方式併入本文中。熟習此項技術者已知許多其他此等植入物、遞送系統及模組。
在某些實施例中,本發明大環肽可經調配以確保適當的活體內分佈。例如,血液-腦障壁(BBB)排斥許多高度親水性化合物。為確保本發明之治療性化合物跨越BBB(若需要),其可調配呈(例如)脂質體。對於製造脂質體之方法,參見,例如,美國專利第4,522,811號、第5,374,548號及第5,399,331號。該等脂質體可包含一或多個選擇性地被運輸至特定細胞或器官中由此增強靶向藥物遞送之部分(參見,例如,Ranade,V.V.,J.Clin.Pharmacol.,29:685(1989))。例示性靶向部分包括葉酸鹽或生物素(參見,例如,Low等人之美國專利第5,416,016號);甘露糖苷(Umezawa等人,Biochem.Biophys.Res.Commun.,153:1038(1988));大環肽(Bloeman,P.G.等人,FEBS Lett.,357:140(1995);Owais,M.等人,Antimicrob.Agents Chemother.,39:180(1995));表面活性劑蛋白A受體(Briscoe等人,Am.J.Physiol.,1233:134(1995));p120(Schreier等人,J.Biol.Chem.,269:9090(1994));亦參見Keinanen,K.等人,FEBS Lett.,346:123(1994);Killion,J.J.等人,Immunomethods 4:273(1994)。
本發明之用途及方法
本發明大環肽、組合物及方法具有許多活體外及活體內效用,其包括(例如)檢測PD-L1或藉由阻斷PD-L1增強免疫反應。例如,可將此等分子投與培養中之細胞(活體外或間接活體內)或投與人類個體(例如,活體內)以增強多種情況中之免疫。因此,在一個態樣中,本發明提供一種改良個體之免疫反應之方法,其包括向該個體投與本發明大環肽使得該個體中之免疫反應得以改良。較佳地,增強、刺激或上調該反應。在其他態樣,大環肽可具有抗食蟹獼猴、抗小鼠及/或抗土撥鼠結合及治療活性。
如本文中所使用,術語「個體」意欲包括人類及非人類動物。
非人類動物包括所有脊椎動物,例如,哺乳動物及非哺乳動物,諸如非人類的靈長類動物、羊、狗、貓、牛、馬、雞、土撥鼠、兩棲類動物及爬行類動物,然而,較佳為哺乳動物,諸如非人類的靈長類動物、羊、狗、貓、牛及馬。較佳之個體包括需要增強免疫反應之人類病患。該等方法尤其適於治療具有可藉由強化T細胞介導之免疫反應治療之病症之人類病患。在一特定實施例中,該等方法尤其適於治療活體內癌細胞。為達成抗原特異性增強免疫,大環肽可連同受關注抗原一起投與。當針對PD-L1之大環肽連同另一藥劑一起投與時,此兩者可以任一順序或同時投與。
本發明進一步提供檢測樣品中人類、土撥鼠、食蟹獼猴及/或小鼠PD-L1抗原之存在或測量人類、土撥鼠、食蟹獼猴及/或小鼠PD-L1抗原的量之方法,其包括使該樣品及對照樣品與特異性地結合至人類、土撥鼠、食蟹獼猴及/或小鼠PD-L1之參照大環肽在容許大環分子與人類、土撥鼠、食蟹獼猴及/或小鼠PD-L1間形成複合物之條件下接觸。接著檢測複合物之形成,其中樣品與對照樣品間之複合物形成差異指示樣品中存在人類、土撥鼠、食蟹獼猴及/或小鼠PD-L1抗原。
考慮到相較於CD28、ICOS及CTLA-4,本發明大環肽對PD-L1之特異結合性,本發明大環肽可用於特異性檢測細胞表面上之PD-L1表現及此外可用於藉由免疫親和純化法純化PD-L1。
癌症
藉由大環肽阻斷PD-1可增強病患之對癌細胞之免疫反應。PD-1之配體PD-L1並不表現於正常人類細胞中,但大量存於多種人類癌症中(Dong等人,Nat.Med.,8:787-789(2002))。PD-1與PD-L1間之相互作用導致腫瘤浸潤性淋巴細胞之減少、T-細胞受體介導之增殖之減少及由癌細胞引起之免疫逃避(Dong等人,J.Mol.Med.,81:281-287(2003);Blank等人,Cancer Immunol.Immunother.,54:307-314
(2005);Konishi等人,Clin.Cancer Res.,10:5094-5100(2004))。免疫抑制可藉由抑制PD-1與PD-L1之局部相互作用逆轉及當PD-1與PD-L2相互作用亦被阻斷時效應係累加的(Iwai等人,Proc.Natl.Acad.Sci.,99:12293-12297(2002);Brown等人,J.Immunol.,170:1257-1266(2003))。雖然以往的研究已顯示可藉由抑制PD-1與PD-L1相互作用恢復T細胞增殖,但尚未報導藉由阻斷PD-1/PD-L1相互作用對活體內癌症腫瘤生長之直接效應。在一個態樣中,本發明係關於使用大環肽活體內治療個體使得癌性腫瘤之生長得以抑制。大環肽可單獨使用以抑制癌性腫瘤之生長。或者,大環肽可結合其他免疫原性劑、標準癌症治療法或其他的如下文所述之大環肽使用。
因此,在一個實施例中,本發明提供一種抑制個體之腫瘤細胞生長之方法,其包括向該個體投與治療上有效量之大環肽。
可使用本發明大環肽抑制生長的較佳癌症包括通常對免疫療法反應之癌症。用於治療之較佳癌症之非限制性實例包括黑色素瘤(例如,轉移性惡性黑色素瘤)、腎細胞癌(例如,透明細胞癌)、前列腺癌(例如,激素難治性前列腺腺癌及去勢抗性前列腺癌)、乳癌、結腸直腸癌及肺癌(例如,鱗狀及非鱗狀非小細胞肺癌)。另外,本發明包括可使用本發明大環肽抑制生長的難治性或復發性惡性病。
可採用本發明方法治療的其他癌症之實例包括骨癌、胰臟癌、皮膚癌、頭部或頸部癌症、皮膚或眼內惡性黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、結腸癌、直腸癌、肛門部位之癌症、胃癌、睪丸癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病(Hodgkin's Disease)、非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin's lymphoma)、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、慢性或急性白血病(包括急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病、急性淋巴母細胞性白血病、慢性淋
巴細胞性白血病)、兒童實體腫瘤、淋巴細胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎臟或輸尿管癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)贅瘤、原發性CNS淋巴瘤、腫瘤血管生成、脊椎軸腫瘤、腦幹膠質瘤、垂體腺瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、表皮樣癌、鱗狀細胞癌、T細胞淋巴瘤、環境引起之癌症(包括由石棉引起之癌症)及該等癌症之組合。本發明亦適用於治療轉移性癌症,特別是表現PD-L1之轉移性癌症(Iwai等人,Int.Immunol.,17:133-144(2005))。
視情況,針對PD-L1之大環肽可組合免疫原性劑,諸如癌細胞、經純化之腫瘤抗原(包括重組蛋白、肽及碳水化合物分子)、細胞及經編碼免疫刺激細胞介素之基因轉染之細胞(He等人,J.Immunol.,173:4919-4928(2004))。可使用的腫瘤疫苗之非限制性實例包括黑色素瘤抗原之肽,諸如gp100之肽、MAGE抗原、Trp-2、MART1及/或酪胺酸酶、或經轉染以表現細胞介素GM-CSF之腫瘤細胞(於下文中進一步論述)。
人類中,已顯示一些腫瘤為免疫原性,諸如黑色素瘤。預期藉由經PD-L1阻斷升高T細胞活化之臨限,吾人可期望活化宿主中之腫瘤反應。
PD-L1阻斷有可能係在組合免疫接種方案時最有效。已設計出用於抗腫瘤之疫苗接種之許多實驗策略(參見Rosenberg,S.,Development of Cancer Vaccines,ASCO Educational Book Spring:60-62(2000);Logothetis,C.,ASCO Educational Book Spring:300-302(2000);Khayat,D.,ASCO Educational Book Spring:414-428(2000);Foon,K.,ASCO Educational Book Spring:730-738(2000);亦參見Restifo,N.等人,Cancer Vaccines,第61章,第3023-3043頁,在DeVita,V.等人編,Cancer:Principles and Practice of Oncology,第五版(1997)中)。在一種此等策略中,使用自體性或同種異體腫瘤細胞製備疫苗。已顯示此
等細胞疫苗在腫瘤細胞經轉導以表現GM-CSF時最有效。已顯示GM-CSF為腫瘤疫苗接種之抗原呈現之強效活化劑(Dranoff等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:3539-3543(1993))。
各種腫瘤中基因表現及大規模基因表現模式之研究已產生出所謂的腫瘤特異性抗原之定義(Rosenberg,S.A.,Immunity,10:281-287(1999))。在許多情況中,此等腫瘤特異性抗原為表現於腫瘤及產生腫瘤的細胞中之分化抗原,例如黑色素細胞抗原gp100、MAGE抗原及Trp-2。更重要的是,許多此等抗原可顯示為存於宿主中之腫瘤特異性T細胞之標靶。PD-L1阻斷可與表現於腫瘤中之重組蛋白及/或肽集合聯合使用,以產生對此等蛋白質之免疫反應。此等蛋白質通常由免疫系統視為自體抗原且因此對其具耐受性。腫瘤抗原亦可包含蛋白質端粒酶,其為合成染色體之端粒酶所需要且表現於多於85%之人類癌症及僅有限數目之體細胞組織中(Kim,N等人,Science,266:2011-2013(1994))。(可藉由各種方法保護此等體細胞組織免遭免疫攻擊)。由於會改變蛋白質序列或在兩種非相關序列間產生融合蛋白(亦即,費城染色體(Philadelphia chromosome)中之bcr-abl)之體細胞突變、或來自B細胞腫瘤之獨特型,腫瘤抗原亦可為表現於癌細胞中之「新抗原」。
其他腫瘤疫苗可包括來自與人類癌症牽連之病毒(諸如人乳頭瘤病毒(HPV)、肝炎病毒(HBV及HCV)及卡波西氏疱疹肉類病毒(KHSV))之蛋白質。可結合PD-L1阻斷使用的腫瘤特異性抗原之另一形式為單離自腫瘤組織本身之經純化熱休克蛋白(HSP)。此等熱休克蛋白包含來自腫瘤細胞之蛋白質之片段及此等HSP遞送至抗原呈現細胞時可高度有效地引起腫瘤免疫(Suot,R.等人,Science,269:1585-1588(1995);Tamura,Y.等人,Science,278:117-120(1997))。
樹突細胞(DC)為可用於準備抗原特異性反應之強效抗原呈現細
胞。DC可在間接活體內產生且載有各種蛋白質及肽抗原以及腫瘤細胞提取物(Nestle,F.等人,Nat.Med.,4:328-332(1998))。DC亦可藉由遺傳手段轉導以亦表現此等腫瘤抗原。DC亦已出於免疫接種之目的而直接融合至腫瘤細胞(Kugler,A.等人,Nat.Med.,6:332-336(2000))。作為一種免疫接種之方法,DC免疫接種可有效地組合PD-L1阻斷以活化更強效之抗腫瘤反應。
PD-L1阻斷亦可組合標準癌症治療。PD-L1阻斷可有效地組合化學治療方案。在此等實例中,可降低所投與的化療劑的劑量(Mokyr,M.等人,Cancer Res.,58:5301-5304(1998))。此種組合之一個實例為大環肽與用於治療黑色素瘤之達卡巴嗪(decarbazine)之組合。此種組合之另一實例為大環肽與用於治療黑色素瘤之介白素-2(IL-2)之組合。PD-L1阻斷與化學療法之組合使用背後的科學原理是,細胞死亡(為大多數化學治療性化合物之細胞毒性作用的後果)將導致抗原呈現路徑中腫瘤抗原之水平增加。經由細胞死亡可導致與PD-L1阻斷協同作用之其他組合療法為放射、手術及激素剝奪(hormone deprivation)。此等方案之各者產生出宿主中之腫瘤抗原源。血管生成抑制劑亦可組合PD-L1阻斷。血管生成之抑制導致腫瘤細胞死亡,其可饋送腫瘤抗原至宿主抗原呈現路徑中。
阻斷PD-L1之大環肽亦可組合靶向表現Fc α或Fc γ受體之效應子細胞至腫瘤細胞之雙特異性大環肽使用(參見,例如,美國專利第5,922,845號及第5,837,243號)。雙特異性大環肽可用於靶向兩個不同的抗原。例如,抗-Fc受體/抗腫瘤抗原(例如,Her-2/neu)雙特異性大環肽已用於靶向巨噬細胞至腫瘤的位點。此種靶向可更有效地活化腫瘤特異性反應。此等反應之T細胞組將藉由使用PD-L1阻斷強化。或者,抗原可藉由使用結合至腫瘤抗原及樹突細胞特異性細胞表面標記物之雙特異性大環肽直接遞送至DC。
腫瘤藉由多種機制避開宿主免疫監視。許多此等機制藉由使藉由腫瘤表現且為免疫抑制性之蛋白質失活而被克服。此等尤其包括TGF-β(Kehrl,J.等人,J.Exp.Med.,163:1037-1050(1986))、IL-10(Howard,M.等人,Immunology Today,13:198-200(1992))及Fas配體(Hahne,M.等人,Science,274:1363-1365(1996))。針對此等實體各者之大環肽可組合抗-PD-L1使用以反作用於免疫抑制劑之效應及有利於宿主之腫瘤免疫反應。
可用於活化宿主免疫響應性的其他大環肽可組合抗-PD-L1使用。此等肽包括活化DC功能及抗原呈現之樹突細胞表面上之分子。抗-CD40大環肽能夠有效地取代T細胞輔助活性(Ridge,J.等人,Nature,393:474-478(1998))且可結合PD-1抗體使用(Ito,N.等人,Immunobiology,201(5):527-540(2000))。活化針對T細胞共刺激分子諸如CTLA-4(例如,美國專利第5,811,097號)、OX-40(Weinberg,A.等人,Immunol.,164:2160-2169(2000))、4-1BB(Melero,I.等人,Nat.Med.,3:682-685(1997)及ICOS(Hutloff,A.等人,Nature,397:262-266(1999))之大環肽亦可提供提高之T細胞活化水平。
目前,骨髓移植用於治療多種造血源性腫瘤。雖然移植物抗宿主疾病係此種治療之結果,但可自移植物抗腫瘤反應獲得治療效益。PD-L1阻斷可用於增加供者移植之腫瘤特異性T細胞之有效性。
亦存在數種實驗治療方案,其涉及為了抗原特異性T細胞抗腫瘤,間接活體內活化及增殖抗原特異性T細胞及將此等細胞過繼性轉移至接受者中(Greenberg,R.等人,Science,285:546-551(1999))。此等方法亦可用於活化對感染劑諸如CMV之T細胞反應。可預期存在大環肽下之間接活體內活化會增加過繼性轉移之T細胞之頻率及活性。
傳染性疾病
使用本發明之其他方法以治療已暴露於特定毒素或病原體之病
患。因此,本發明之另一態樣提供一種治療個體之傳染性疾病之方法,其包括向該個體投與本發明大環肽使得該個體之傳染性疾病得以治療。
類似於其針對如上所述腫瘤之應用,PD-L1阻斷可單獨地或作為佐劑組合疫苗使用以刺激對病原體、毒素及自體抗原之免疫反應。此治療方法可尤其可用的病原體之實例包括目前無有效疫苗之病原體或習知疫苗不完全有效之病原體。此等病原體包括(但不限於)HIV、肝炎(A型、B型及C型)、流感病毒、疱疹、梨形鞭毛蟲病(Giardia)、瘧疾(Butler,N.S.等人,Nature Immunology 13,188-195(2012);Hafalla,J.C.R.等人,PLOS Pathogens;2012年2月2日))、利什曼體病(Leishmania)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、銅綠假單胞菌(Pseudomonas Aeruginosa)。PD-L1阻斷尤其可用於抗藉由試劑已確認的感染,諸如在感染過程中呈現改變之抗原之HIV。此等新穎的抗原決定基在抗人類PD-L1投與的時間被識別係外來物,因此經由PD-L1激發不會被負信號減弱之強T細胞反應。
引起可由本發明方法治療之感染之致病病毒之一些實例包括HIV、肝炎(A型、B型或C型)、疱疹病毒(例如,VZV、HSV-1、HAV-6、HSV-II及CMV、愛潑斯坦-巴爾病毒(Epstein Barr virus))、腺病毒、流感病毒、黃病毒屬(flaviviruses)、伊科病毒(echovirus)、鼻病毒(rhinovirus)、科沙奇病毒(coxsackie virus)、豇豆花葉病毒屬(cornovirus)、呼吸道融合病毒、腮腺炎病毒、輪狀病毒(rotavirus)、麻疹病毒、風疹病毒、小病毒、疫苗病毒、HTLV病毒、登革熱病毒、乳頭瘤病毒、軟疣病毒、脊髓灰質炎病毒、狂犬病病毒、JC病毒及蟲媒病毒腦炎病毒。
引起可由本發明方法治療之感染之致病細菌之一些實例包括衣原體、立克次體細菌、分支桿菌、葡萄球菌、鏈球菌、肺炎球菌、腦
膜炎雙球菌及淋球菌(conococci)、克雷伯氏菌(klebsiella)、變形桿菌、沙雷氏菌(serratia)、假單胞菌、軍團菌(legionella)、白喉菌、沙門氏菌(salmonella)、桿菌、霍亂(cholera)、破傷風菌、肉毒桿菌、炭疽菌、鼠疫菌、鉤端螺旋體病(leptospirosis)細菌及萊姆病(Lyme disease)細菌。
引起可由本發明方法治療之感染之致病真菌之一些實例包括念珠菌屬(白色念珠菌、克柔念珠菌(krusei)、光滑念珠菌(glabrata)、熱帶念珠菌(tropicalis)等)、新型隱球菌(Cryptococcus neoformans)、曲黴菌屬(煙麯黴(fumigatus)、黑麯黴(niger)等)、麯藻菌目(Genus Mucorales)(毛黴(mucor)、犁頭黴(absidia)、根黴(rhizophus))、申克氏胞絲菌(Sporothrix schenkii)、皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis)、巴西副球孢子菌(Paracoccidioides brasiliensis)、粗球孢子菌(Coccidioides immitis)及莢膜組織漿菌(Histoplasma capsulatum)。
引起可由本發明方法治療之感染之致病寄生蟲之一些實例包括溶組織內阿米巴原蟲(Entamoeba histolytica)、結腸小袋纖毛蟲(Balantidium coli)、福氏耐格里阿米巴原蟲(Naegleriafowleri)、棘阿米巴科(Acanthamoeba sp.)、蘭氏賈第鞭毛蟲(Giardia lambia)、隱孢子蟲科(Cryptosporidium sp.)、卡式肺囊蟲(Pneumocystis carinii)、間日瘧原蟲(Plasmodium vivax)、巴貝斯原蟲(Babesia microti)、布氏錐蟲(Trypanosoma brucei)、克氏錐蟲(Trypanosoma cruzi)、杜氏利什曼原蟲(Leishmania donovani)、岡地弓漿蟲(Toxoplasma gondi)及巴西日圓線蟲(Nippostrongylus brasiliensis)。
在所有上述方法中,PD-L1阻斷可組合免疫療法之其他形式,諸如細胞介素治療(例如,干擾素、靶向VEGF活性或VEGF受體之藥劑、GM-CSF、G-CSF、IL-2)或雙特異性抗體療法,此提供腫瘤抗原之增強呈現(參見,例如,Holliger,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,
90:6444-6448(1993);Poljak,Structure,2:1121-1123(1994))。
自體免疫反應
大環肽可激發並增強自體免疫反應。實際上,使用腫瘤細胞及肽疫苗引起抗腫瘤反應顯示,許多抗腫瘤反應涉及抗自身反應性(抗-CTLA-4+GM-CSF改質B 16黑色素瘤中所觀察到的色素脫落,van Elsas等人,同前述;經Trp-2疫苗接種之小鼠中之色素脫落(Overwijk,W.等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,96:2982-2987(1999));藉由TRAMP腫瘤細胞疫苗引起之自體免疫前列腺炎(Hurwitz,A.,同前述(2000))、黑色素瘤肽抗原疫苗接種及在人類臨床試驗中所觀察到的白斑病(Rosenberg,S.A.等人,J.Immunother.Emphasis Tumor Immunol.,19(1):81-84(1996))。
因此,可考慮結合各種自體蛋白使用抗-PD-L1阻斷以設計出可有效產生抵抗此等自體蛋白之免疫反應以用於疾病治療之疫苗接種方案。例如,阿茲海默氏症(Alzheimer's disease)涉及A.β肽呈澱粉樣沉積物不適當的積聚在腦中;抵抗澱粉樣之抗體反應能夠清除此等澱粉樣沉積物(Schenk等人,Nature,400:173-177(1999))。
其他自體蛋白亦可用作標靶,諸如,用於治療過敏及哮喘之IgE及用於類風濕性關節炎之TNF.α。最終,可藉由使用本文中所揭示之大環分子引起對各種激素之抗體反應。中和抗體對生殖激素之反應可用於避孕。中和抗體對激素及其他的為特定腫瘤之生長所需要的可溶性因子之反應亦可視為可能的疫苗接種標靶。
如上所述的針對使用抗-PD-L1大環分子之類似方法可用於引起治療性自體免疫反應以治療具有其他自體抗原之不適當積聚,諸如澱粉樣沉積物,包括阿茲海默氏症中之A.β、細胞介素(諸如TNF α)及IgE之病患。
疫苗
大環肽可用於藉由共同投與抗-PD-1大環分子與受關注抗原(例如,疫苗)刺激抗原特異性免疫反應。因此,在另一態樣中,本發明提供一種增強個體之對抗原之免疫反應之方法,其包括向該個體投與:(i)抗原;及(ii)抗-PD-1大環分子,使得個體中對抗原之免疫反應增強。抗原可為(例如)腫瘤抗原、病毒抗原、細菌抗原或來自病原體之抗原。此等抗原之非限制性實例包括彼等述於上節中者,諸如上文所述之腫瘤抗原(或腫瘤疫苗)或來自病毒、細菌或其他的上文所述之病原體之抗原。
活體內及活體外投與本發明組合物(例如,大環肽、多特異性及雙特異性分子及免疫偶聯物)之適宜途徑為相關技術所熟知且可由熟習此項技術者選擇。例如,該等組合物可藉由注射(例如,靜脈內或皮下)投與。所使用的分子之適宜劑量將取決於個體之年齡及體重及組合物之濃度及/或調配而改變。
如前面所述,本發明大環肽可與一種或多種其他治療劑,例如,細胞毒性劑、放射毒性劑或免疫抑制劑共同投與。肽可聯結至該藥劑(作為免疫複合物)或可與該藥劑分開投與。在後一情況(分開投與)中,肽可在藥劑之前、之後或與其同時投與或可與其他已知的療法(例如,抗癌療法,例如,放射)共同投與。此等治療劑尤其包括抗癌藥物,諸如多柔比星(doxorubicin)(阿黴素(adriamycin))、順鉑、硫酸博來黴素(bleomycin sulfate)、卡莫司汀(carmustine)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、達卡巴嗪及環磷醯胺羥基脲,其等單獨地僅在對病患毒性或亞毒性之水平下有效。順鉑係每四週一次以100mg/劑量經靜脈內投與及阿黴素係每21天一次以60至75mg/ml劑量經靜脈內投與。本發明大環肽與化療劑之共同投與可提供兩種經由不同的對人類腫瘤細胞產生細胞毒性效應之機制起作用之抗癌藥物。此種共同投與可解決由於藥物抗性發展或將致使其與肽無反應之腫瘤細胞之抗原性改變
所致之問題。
包括本發明組合物(例如,大環肽、雙特異性或多特異性分子或免疫偶聯物)及使用說明之套組亦屬於本發明之範圍內。該套組可進一步包含至少一種額外的試劑或一或多種額外的本發明大環肽(例如,具有互補活性之人類抗體,其結合至PD-L1抗原中與大環分子不同之抗原決定基)。套組通常包括指明套組內容物之所欲用途之標籤。術語標籤包括任何的套組上或與套組一起提供或以其他方式隨附套組之書面或記錄材料。
組合療法
本發明大環肽與另一PD-L1拮抗劑及/或其他免疫調節劑之組合適用於增強抵抗過度增生性疾病之免疫反應。例如,可將此等分子投與培養中之細胞(活體外或間接活體內)或投與人類個體(例如,活體內)以增強多種情況中之免疫。因此,在一個態樣中,本發明提供一種改良個體之免疫反應之方法,其包括向該個體投與本發明之大環肽使得該個體之免疫反應得以改良。較佳地,增強、刺激或上調反應。在另一實施例中,本發明提供一種改變與以免疫刺激性治療劑治療過度增生性疾病相關聯之不良事件之方法,其包括向該個體投與本發明大環肽及亞治療劑量之另一免疫調節劑。
藉由大環肽阻斷PD-L1可增強病患中對癌細胞之免疫反應。可使用本發明大環肽抑制生長的癌症包括通常對免疫療法回應之癌症。適合用本發明組合療法治療之癌症之代表性實例包括黑色素瘤(例如,轉移性惡性黑色素瘤)、腎癌、前列腺癌、乳癌、結腸癌及肺癌。其他的可使用本發明方法治療之癌症之實例包括骨癌、胰臟癌、皮膚癌、頭部或頸部癌症、皮膚或眼內惡性黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛門部位之癌症、胃癌、睪丸癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病、非霍奇金氏淋巴
瘤、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、慢性或急性白血病(包括急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病、急性淋巴母細胞性白血病、慢性淋巴細胞性白血病)、兒童實體腫瘤、淋巴細胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎臟或輸尿管癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)贅瘤、原發性CNS淋巴瘤、腫瘤血管生成、脊椎軸腫瘤、腦幹膠質瘤、垂體腺瘤、卡波西氏肉瘤、表皮樣癌、鱗狀細胞癌、T細胞淋巴瘤、環境引起之癌症(包括由石棉引起之癌症)及該等癌症之組合。本發明亦適用於治療轉移性癌症。
在某些實施例中,含有至少一種本文中所述之大環肽之治療劑之組合可呈含在醫藥上可接受之載劑中之單一組合物並行投與、或呈各藥劑可按順序投與之分開組合物並行投與。例如,第二免疫調節劑及本發明大環肽可按順序投與,諸如,先投與第二免疫調節劑接著投與大環肽,或先投與大環肽接著投與第二免疫調節劑。另外,若按順序投與多於一個劑量之組合療法,則按順序投與之順序在各投與時間點可相反或保持相同順序,按順序投與可組合並行投與或其任何組合。例如,第一次投與第二免疫調節劑及大環肽可係並行,第二次投與可係按順序先投與第二免疫調節劑接著投與大環肽,及第三次投與可係按順序先投與大環肽接著投與第二免疫調節劑等。另一代表性給藥方案可涉及第一次投與為按順序先大環肽接著投與第二免疫調節劑,及隨後的投與可係並行。
視情況,大環肽與第二免疫調節劑之組合可進一步組合免疫原性劑,諸如癌細胞、經純化之腫瘤抗原(包括重組蛋白、肽及碳水化合物分子)、細胞及經編碼免疫刺激細胞介素之基因轉染之細胞(He等人,J.Immunol.,173:4919-4928(2004))。可使用的腫瘤疫苗之非限制性實例包括黑色素瘤抗原之肽,諸如gp100之肽、MAGE抗原、Trp-
2、MART1及/或酪胺酸酶、或經轉染以表現細胞介素GM-CSF之腫瘤細胞(於下文中進一步論述)。
PD-L1大環肽與第二免疫調節劑之組合可進一步組合疫苗接種方案。已設計出針對腫瘤之疫苗接種之許多實驗策略(參見Rosenberg,S.,Development of Cancer Vaccines,ASCO Educational Book Spring:60-62(2000);Logothetis,C.,ASCO Educational Book Spring:300-302(2000);Khayat,D.,ASCO Educational Book Spring:414-428(2000);Foon,K.,ASCO Educational Book Spring:730-738(2000);亦參見Restifo等人,Cancer Vaccines,第61章,第3023-3043頁,在DeVita等人編,Cancer:Principles and Practice of Oncology,第五版(1997)中)。其中一種此等策略中,使用自體性或同種異體腫瘤細胞製備疫苗。已顯示此等細胞疫苗在腫瘤細胞經轉導以表現GM-CSF時最有效。已顯示GM-CSF為腫瘤疫苗接種之抗原呈現之強效活化劑(Dranoff等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:3539-3543(1993))。
在各種腫瘤中探討基因表現及大規模基因表現模式之研究已產生出所謂的腫瘤特異性抗原之定義(Rosenberg,Immunity,10:281-287(1999))。在許多情況中,此等腫瘤特異性抗原為表現於腫瘤及產生腫瘤的細胞中之分化抗原,例如黑色素細胞抗原gp100、MAGE抗原及Trp-2。更重要的是,許多此等抗原可顯示為存於宿主中之腫瘤特異性T細胞之標靶。在某些實施例中,PD-L1大環肽與第二免疫調節劑之組合可與表現於腫瘤中之重組蛋白及/或肽集合聯合使用,以產生對此等蛋白質之免疫反應。此等蛋白質通常由免疫系統視為自體抗原且因此對其具耐受性。腫瘤抗原亦可包含蛋白質端粒酶,其為合成染色體之端粒酶所需要且表現於多於85%之人類癌症及僅有限數目之體細胞組織中(Kim等人,Science,266:2011-2013(1994))。(可藉由各種方法保護此等體細胞組織免遭免疫攻擊)。由於會改變蛋白質序列或
在兩種非相關序列間產生融合蛋白(亦即,費城染色體(Philadelphia chromosome)中之bcr-abl)之體細胞突變、或來自B細胞腫瘤之獨特型,腫瘤抗原亦可為表現於癌細胞中之「新抗原」。
其他腫瘤疫苗可包括來自與人類癌症牽連之病毒(諸如人乳頭瘤病毒(HPV)、肝炎病毒(HBV及HCV)及卡波西氏疱疹肉類病毒(KHSV))之蛋白質。可結合PD-L1大環肽阻斷使用的腫瘤特異性抗原之另一形式為單離自腫瘤組織本身之經純化熱休克蛋白(HSP)。此等熱休克蛋白包含來自腫瘤細胞之蛋白質之片段及此等HSP遞送至抗原呈現細胞時可高度有效地引起腫瘤免疫(Suot等人,Science,269:1585-1588(1995);Tamura等人,Science,278:117-120(1997))。
樹突細胞(DC)為可用於準備抗原特異性反應之強效抗原呈現細胞。DC可在間接活體內產生且載有各種蛋白質及肽抗原以及腫瘤細胞提取物(Nestle等人,Nat.Med.,4:328-332(1998))。DC亦可藉由遺傳手段轉導以亦表現此等腫瘤抗原。DC亦已出於免疫接種之目的而直接融合至腫瘤細胞(Kugler等人,Nat.Med.,6:332-336(2000))。作為一種免疫接種之方法,DC免疫接種可有效地進一步組合抗-PD-L1大環肽及第二免疫調節劑之組合以活化更強效之抗腫瘤反應。
抗-PD-L1大環肽及另一免疫調節劑之組合亦可進一步組合標準癌症治療。例如,大環肽及第二免疫調節劑之組合可有效地組合化學治療方案。在此等實例中,如利用大環肽及第二免疫調節劑之組合所觀察到,可降低與本發明組合投與之其他化療劑的劑量(Mokyr等人,Cancer Res.,58:5301-5304(1998))。此種組合之一個實例為大環肽及第二免疫調節劑之組合進一步與用於治療黑色素瘤之達卡巴嗪的組合。另一實例為大環肽及第二免疫調節劑之組合進一步與用於治療黑色素瘤之介白素-2(IL-2)的組合。PD-L1大環肽及另一免疫調節劑與化學療法之組合使用背後的科學原理是,細胞死亡(為大多數化學治療
性化合物之細胞毒性作用的後果)將導致抗原呈現路徑中腫瘤抗原之水平增加。經由細胞死亡可導致與抗-PD-L1大環肽及另一免疫調節劑之組合協同作用之其他組合療法包括放射、手術或激素剝奪。此等方案之各者產生出宿主中之腫瘤抗原源。血管生成抑制劑亦可組合PD-L1及第二免疫調節劑之組合。血管生成之抑制導致腫瘤細胞死亡,此亦可係意欲饋送腫瘤抗原至宿主抗原呈現路徑中之腫瘤抗原之來源。
PD-L1及另一免疫調節劑之組合亦可組合靶向表現Fc α或Fc γ受體之效應子細胞至腫瘤細胞之雙特異性大環肽使用(參見,例如,美國專利第5,922,845號及第5,837,243號)。雙特異性大環肽可用於靶向兩個不同的抗原。例如,抗-Fc受體/抗腫瘤抗原(例如,Her-2/neu)雙特異性大環肽已用於靶向巨噬細胞至腫瘤的位點。此種靶向可更有效地活化腫瘤特異性反應。此等反應之T細胞組將藉由使用PD-L1與第二免疫調節劑之組合強化。或者,抗原可藉由使用結合至腫瘤抗原及樹突細胞特異性細胞表面標記物之雙特異性大環肽直接遞送至DC。
在另一實例中,大環肽及第二免疫調節劑之組合可結合抗癌大環藥劑,諸如RITUXAN®(利妥昔單抗(rituximab))、HERCEPTIN®(曲妥珠單抗(trastuzumab))、BEXXAR®(托西莫單抗(tositumomab))、ZEVALIN®(替伊莫單抗(ibritumomab))、CAMPATH®(阿來珠單抗(alemtuzumab))、Lymphocide(依帕珠單抗(eprtuzumab))、AVASTIN®(貝伐單抗(bevacizumab))及TARCEVA®(厄洛替尼(erlotinib))等使用。舉例而言但不希望受理論限制,用抗癌抗體或與毒素偶聯之抗癌抗體治療可導致癌細胞死亡(例如,腫瘤細胞),此將強化藉由第二免疫調節劑標靶或PD-L1介導之免疫反應。在一例示性實施例中,過度增生性疾病(例如,癌症腫瘤)之治療可包括並行或按順序或其任何組合組合大環肽及第二免疫調節劑之抗癌抗體,此可強宿主之抗腫瘤免疫反應。
腫瘤藉由多種機制避開宿主免疫監視。許多此等機制藉由使藉由腫瘤表現且為免疫抑制性之蛋白質失活而被克服。此等尤其包括TGF-β(Kehrl,J.等人,J.Exp.Med.,163:1037-1050(1986))、IL-10(Howard,M.等人,Immunology Today,13:198-200(1992))及Fas配體(Hahne,M.等人,Science,274:1363-1365(1996))。在另一實例中,針對此等實體各者之抗體可進一步組合大環肽及另一免疫調節劑以反作用於免疫抑制劑之效應及有利於宿主之抗腫瘤免疫反應。
可用於活化宿主免疫響應性的其他藥劑可進一步組合本發明大環肽使用。此等包括活化DC功能及抗原呈現之樹突細胞表面上之分子。抗-CD40大環肽能夠有效地取代T細胞輔助活性(Ridge,J.等人,Nature,393:474-478(1998))且可結合本發明大環肽(單獨或呈與抗-CTLA-4組合之組合形式)使用(Ito,N.等人,Immunobiology,201(5):527-540(2000))。活化針對T細胞共刺激分子諸如OX-40(Weinberg,A.等人,Immunol.,164:2160-2169(2000))、4-1BB(Melero,I.等人,Nat.Med.,3:682-685(1997)及ICOS(Hutloff,A.等人,Nature,397:262-266(1999))之大環肽亦可提供提高之T細胞活化水平。
目前,骨髓移植用於治療多種造血源性腫瘤。雖然移植物抗宿主疾病係此種治療之結果,但可自移植物抗腫瘤反應獲得治療效益。單獨或組合另一免疫調節劑之本發明大環肽可用於增加供者移植之腫瘤特異性T細胞之有效性。
亦存在數種實驗治療方案,其涉及為了抗原特異性T細胞抗腫瘤,間接活體內活化及增殖抗原特異性T細胞及將此等細胞過繼性轉移至接受者中(Greenberg,R.等人,Science,285:546-551(1999))。此等方法亦可用於活化對感染劑諸如CMV之T細胞反應。可預期存在本發明大環肽(單獨或與另一免疫調節劑之組合)下之間接活體內活化會
增加過繼性轉移之T細胞之頻率及活性。
在某些實施例中,本發明提供一種改變與用免疫刺激劑治療過度增生性疾病相關聯之不良事件之方法,其包括向該個體投與本發明大環肽與亞治療劑量之另一免疫調節劑之組合。例如,本發明方法提供一種藉由向病患投與非吸收性類固醇來降低免疫刺激治療性抗體引起之結腸炎或腹瀉之發病率之方法。因為任何將接受免疫刺激治療性抗體的病患處在發展出因該治療引起之結腸炎或腹瀉之風險,故該整個病患群體適合根據本發明方法之療法。雖然已投與類固醇以治療發炎性腸病(IBD)及防止IBD之惡化,但其尚未用於預防診斷未罹患IBD之患者中的IBD(降低IBD之發病率)。與類固醇、甚至非吸收性類固醇相關聯之顯著副作用使預防性用途受到限制。
在其他實施例中,本發明大環肽(單獨或與另一免疫調節劑組合)可進一步組合使用任何非吸收性類固醇使用。如本文中所使用,「非吸收性類固醇」為展現廣泛首過代謝使得肝臟中代謝後類固醇之生物可利用率低(亦即,低於約20%)之糖皮質激素。在本發明之一個實施例中,該非吸收性類固醇為布地奈德(budesonide)。布地奈德為在口服投與後主要藉由肝臟廣泛代謝之局部作用的糖皮質激素。ENTOCORT® EC(Astra-Zeneca)為經開發使藥物遞送至迴腸且遍及結腸最佳化之布地奈德之pH-及時間-依賴性口服調配物。在美國已核准ENTOCORT® EC用於治療輕度至中度的涉及迴腸及/或上升結腸之克羅恩氏病。ENTOCORT® EC用於治療克羅恩氏病之常用的口服劑量為6至9mg/天。ENTOCORT® EC在被吸收前釋放於腸中並留在腸黏膜中。一旦其通過腸黏膜靶組織,ENTOCORT® EC經肝臟中的細胞色素P450系統廣泛代謝成具有可忽視的糖皮質激素活性之代謝產物。因此,生物可利用率低(約10%)。布地奈德之低生物可利用率導致與具有較不廣泛首過代謝之其他糖皮質類固醇相比其治療比提高。布地
奈德與全身作用的腎上腺皮質類固醇相比其不良作用更小,包括更小的下視丘-垂體抑制。然而,長期性投與ENTOCORT® EC可導致全身糖皮質激素效應,諸如腎上腺皮質功能亢進及腎上腺抑制。參見Physicians' Desk Reference Supplement,第58版,608-610(2004)。
在還有其他實施例中,結合非吸收性類固醇之PD-L1與另一免疫調節劑之組合可進一步組合水楊酸酯。水楊酸酯包括5-ASA藥劑,諸如(例如):柳氮磺吡啶(sulfasalazine)(AZULFIDINE®,Pharmacia & Upjohn);奧沙拉嗪(olsalazine)(DIPENTUM®,Pharmacia & UpJohn);巴柳氮(balsalazide)(COLAZAL®,Salix Pharmaceuticals,Inc.);及美沙拉嗪(mesalamine)(ASACOL®,Procter & Gamble Pharmaceuticals;PENTASA®,Shire US;CANASA®,Axcan Scandipharm,Inc.;ROWASA®,Solvay)。
劑量及調配物
適宜之式I之肽、或更特定言之本文中所述之大環肽可呈單獨的化合物或與可接受之載劑混合呈醫藥調配物之形式投與病患以治療糖尿病及其他相關疾病。熟習治療糖尿病技術者可輕易地確定針對需要此種治療的哺乳動物(包括人類)之化合物之劑量及投藥途徑。投藥途徑可包括(但不限於)經口、口腔內、直腸、經皮、頰、鼻內、肺、皮下、肌肉內、皮內、舌下、結腸內、眼內、靜脈內或腸投與。該化合物係根據投藥途徑基於可接受之醫藥實務基礎上進行調配(Fingl等人,在The Pharmacological Basis of Therapeutics,第1章,第1頁(1975)中;Remington's Pharmaceutical Sciences,第18版,Mack Publishing Co.,Easton,PA(1990))。
本文中所述之醫藥上可接受之肽組合物可呈多種劑型諸如錠劑、膠囊(其各者包含持續釋放型或定時釋放型調配物)、丸劑、粉末、顆粒、酏劑、原位凝膠、微球體、晶型錯合物、脂質體、微乳
液、酊劑、懸浮液、糖漿、氣溶膠噴霧及乳液投與。本文中所述之組合物亦可呈口服、靜脈內(團注或點滴輸注)、腹膜內、皮下、經皮或肌肉內形式投與,其等均採用熟習醫藥技術之一般技術者熟知的劑型。該等組合物可單獨地投與,但一般將併與根據所選投藥途徑及標準醫藥實務而選擇的醫藥載劑一起投與。
本文中所述之組合物之給藥方案當然將取決於已知的因素,諸如特定藥劑之藥效動力學特徵及其投藥模式及途徑;接受者之物種、年齡、性別、健康狀況、醫學病狀及體重;症狀之性質及程度;合併治療類型;治療之頻率;投藥途徑、病患之腎功能及肝功能、及所期望的效應而改變。醫師或獸醫可決定並規定藥物預防、反轉或抑制疾病狀態進展所需要的有效量。
經由一般指南,活性成分當在用於指定效應時之日口服劑量將在約0.001與1000mg/kg體重間,較佳在約0.01與100mg/kg體重/天間,且最佳在約0.6與20mg/kg/天間之範圍內。活性成分當在用於指定效應時之靜脈內日劑量於恆速輸注期間將在0.001ng與100.0ng/min/Kg體重間之範圍內。此恆速靜脈內輸注可較佳以0.01ng至50ng/min/Kg體重且最佳以0.01ng至10.0mg/min/Kg體重之速率投與。本文中所述之組合物可以單次日劑量投與,或總日劑量可以每天兩次、三次或四次之分次劑量投與。本文中所述之組合物亦可藉由儲積調配物之投與,其若需要將允許在數天/數週/數月時間內持續釋放藥物。
本文中所述之組合物可呈鼻內形式藉由局部使用適當的鼻內媒劑、或藉由經皮途徑使用經皮皮膚貼劑投與。當呈經皮遞送系統形式投與時,整個給藥方案中劑量之投與當然將係連續的而非斷續的。
該等組合物通常呈與針對所欲投藥形式適宜選擇(亦即,口服錠劑、膠囊、酏劑、需要或無需推進劑產生之氣溶膠噴霧及糖漿)並符合習知醫藥實務之合適醫藥稀釋劑、賦形劑或載劑(本文中統稱為醫
藥載劑)之混合物投與。
例如,對於呈錠劑或膠囊形式之口服投與,可將活性藥物組分與口服非毒性醫藥上可接受之惰性載劑諸如(但不限於)乳糖、澱粉、蔗糖、葡萄糖、甲基纖維素、硬脂酸鎂、磷酸二鈣、硫酸鈣、甘露醇及山梨糖醇組合;對於呈液體形式之口服投與,可將口服藥物組分與任何口服非毒性醫藥上可接受之惰性載劑諸如(但不限於)乙醇、甘油及水組合。除此之外,當需要或必需時,適宜的黏合劑、潤滑劑、崩解劑及著色劑亦可併入混合物中。適宜的黏合劑包括(但不限於)澱粉、明膠、天然糖類(諸如(但不限於)葡萄糖或β-乳糖)、玉米甜味劑、天然及合成膠(諸如阿拉伯膠、黃蓍膠或海藻酸鈉)、羧甲基纖維素、聚乙二醇及蠟。用於此等劑型中之潤滑劑包括油酸鈉、硬脂酸鈉、硬脂酸鎂、苯甲酸鈉、乙酸鈉及氯化鈉。崩解劑包括(但不限於)澱粉、甲基纖維素、瓊脂、膨潤土及黃原膠。
本文中所述之組合物亦可呈混合膠束或脂質體遞送系統(諸如小型單層微脂粒、大型單層微脂粒及多薄片層微脂粒)之形式投與。脂質體可由多種磷脂諸如膽固醇、硬脂胺或磷脂醯膽鹼形成。可添加滲透增強劑以增強藥物吸收。
由於已知前藥可增強藥品之許多期望之品質(亦即,溶解度、生物可利用率、製造等),故本文中所述之化合物可呈前藥形式遞送。因此,本文中所述之標的意欲涵蓋目前所主張化合物之前藥、遞送其之方法、及含有其之組合物。
本文中所述之組合物亦可與作為可標靶之藥物載劑之可溶性聚合物偶聯。此等聚合物可包括聚乙烯吡咯啶酮、吡喃共聚物、聚羥基丙基-甲基丙烯醯胺-苯酚、聚羥基乙基天冬醯胺苯酚或經棕櫚醯基殘基取代之聚環氧乙烷-聚離胺酸。另外,本文中所述之組合物可與一類可用於達成藥物之控制釋放之生物可降解聚合物組合,例如,聚乳
酸、聚乙醇酸、聚乳酸與聚乙醇酸之共聚物、聚ε己酸內酯、聚羥基丁酸、聚原酸酯、聚縮醛類、聚二氫吡喃、聚氰基丙烯酸酯、及水凝膠之交聯或兩性嵌段共聚物。
適於投與之劑型(醫藥組合物)每劑量單位可含有約0.01毫克至約500毫克之活性成分。在此等醫藥組合物中,活性成分將通常以佔組合物總重量約0.5至95重量%的量存在。
明膠膠囊可含有活性成分及粉狀載劑,諸如乳糖、澱粉、纖維素衍生物、硬脂酸鎂及硬脂酸。類似的稀釋劑可用於製備壓縮錠劑。錠劑及膠囊均可呈持續釋放型產品製得以在數小時的時間內持續釋放藥物。壓縮錠劑可經糖包衣或經膜包衣以掩蔽任何令人不悅的氣味並保護錠劑免遭氣氛影響、或經腸衣包衣以選擇性地崩解於胃腸道中。
適於口服投與之液態劑型可含有著色劑及矯味劑以增加病患可接受度。
一般而言,水、適宜的油、鹽水、右旋糖(葡萄糖)水溶液、及相關之糖溶液及二醇(諸如丙二醇或聚乙二醇)為非經腸溶液之適宜載劑。用於非經腸投與之溶液較佳含有活性成分之水溶性鹽、適宜的穩定劑、及視需要之緩衝物質。單獨或組合之諸如亞硫酸氫鈉、亞硫酸鈉或抗壞血酸之抗氧化劑為適宜的穩定劑。亦使用檸檬酸及其鹽及EDTA鈉。此外,非經腸溶液可含有防腐劑,諸如氯化苄二甲烴銨、對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯及氯丁醇。
適宜的醫藥載劑述於Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第十九版,Mack Publishing Company(1995)(為此項領域中之標準參考文本)中。
可如下說明適用於本文中所述化合物之投與之代表性醫藥劑型:
膠囊
大數目之單位膠囊可藉由將標準兩片式硬明膠膠囊填充100毫克粉狀活性成分、150毫克乳糖、50毫克纖維素及6毫克硬脂酸鎂製得。
軟明膠膠囊
可製得活性成分含在可消化油諸如大豆油、棉籽油或橄欖油中之混合物及借助於正排量泵注入明膠中以形成含有100毫克活性成分之軟明膠膠囊。應洗滌並乾燥該等膠囊。
錠劑
可藉由習知程序製得錠劑,使得其劑量單位為(例如)100毫克活性成分、0.2毫克膠態二氧化矽、5毫克硬脂酸鎂、275毫克微晶纖維素、11毫克澱粉及98.8毫克乳糖。可施用適宜之包衣以增加可口性或延遲吸收。
可注射液
本文中所述之肽組合物之可注射調配物可能需要或可能不需要使用賦形劑,諸如,彼等已經過監管機構核准之賦形劑。此等賦形劑包括(但不限於)溶劑及共溶劑、增溶劑、乳化劑或增稠劑、螯合劑、抗氧化劑及還原劑、抗微生物防腐劑、緩衝劑及pH調整劑、增積劑、保護劑及張度調整劑及特殊添加劑。可注射調配物必須是無菌、無熱原且就溶液而言無顆粒物質。
可藉由在可含有或可不含共溶劑或其他賦形劑的醫藥上可接受之緩衝液中攪拌例如1.5重量%活性成分製得適於注射投與之非經腸組合物。應利用氯化鈉使溶液等滲並滅菌。
懸浮液
可製得用於口服及/或非經腸投與之水性懸浮液,使得(例如)每5mL中含有100mg細分散之活性成分、20mg羧甲基纖維素鈉、5mg苯甲酸鈉、1.0g山梨糖醇溶液(U.S.P.)及0.025mL香草醛或其他可口的矯味劑。
生物可降解微顆粒
可例如藉由將適宜的生物可降解聚合物溶於溶劑中,將待併入的活性劑添加至聚合物溶液,及自基質移除溶劑由此形成聚合物之基質(其中活性劑分佈遍及基質)製得適於注射投與之持續釋放型非經腸組合物。
肽合成
本發明之描述在本文中應根據化學結合之定律及原理來理解。應明瞭本發明包含的化合物為適當地穩定以用作藥劑之其等化合物。熟習此項技術者將知曉哪些化合物基於化學結合及穩定性之一般原理基礎上將係穩定的及將係不穩定的。
可採用多種相關技術認可的方法,包括經由肽片段之構形輔助再連接、選殖或合成肽片段之酶連接、及化學連接之逐步固相合成、半合成,進行本發明大環肽之化學合成。合成本文中所述之大環肽及其類似物之一種較佳方法為使用各種固相技術,諸如,彼等述於Chan,W.C.等人編,Fmoc Solid Phase Synthesis,Oxford University Press,Oxford(2000);Barany,G.等人,The Peptides:Analysis,Synthesis,Biology,第2卷:「Special Methods in Peptide Synthesis,Part A」,第3-284頁,Gross,E.等人編,Academic Press,New York(1980);及在Stewart,J.M.等人,Solid-Phase Peptide Synthesis,第2版,Pierce Chemical Co.,Rockford,IL(1984)中之技術之化學合成。較佳的策略係基於Fmoc(9-茀基甲基甲氧基羰基)基來暫時保護α-胺基結合第三丁基來暫時保護胺基酸側鏈(參見(例如)Atherton,E.等人,「The Fluorenylmethoxycarbonyl Amino Protecting Group」,在The Peptides:Analysis,Synthesis,Biology,第9卷:「Special Methods in Peptide Synthesis,Part C」,第1-38頁,Undenfriend,S.等人編,Academic Press,San Diego(1987)中。
可以逐步方式在不溶性聚合物擔體(亦稱為「樹脂」)上自肽的C端開始合成該等肽。合成係藉由通過形成醯胺或酯鍵將肽的C端胺基酸附接至樹脂開始。此允許所得肽最終分別以C端醯胺或羧酸釋放。
C端胺基酸及所有其他的用於合成中之胺基酸需要差別性地保護其α-胺基及側鏈官能度(若存在)使得α-胺基保護基可在合成期間選擇性地脫去。胺基酸之偶聯係藉由活化其羧基為活性酯及其與附接至樹脂之N-端胺基酸之未封端α-胺基反應進行。重複α-胺基脫除保護基及偶聯之順序直到組裝成整個肽序列。接著通常在適宜的清除劑之存在下自樹脂釋放肽同時使側鏈官能度脫除保護基以限制副反應。最終藉由逆相HPLC純化所得肽。
如前驅物至最終肽所需要的肽基-樹脂之合成係使用市售交聯聚苯乙烯聚合物樹脂(Novabiochem,San Diego,CA;Applied Biosystems,Foster City,CA)。較佳的固體擔體為:4-(2',4'-二甲氧基苯基-Fmoc-胺基甲基)-苯氧乙醯基-對甲基二苯甲基胺樹脂(Rink醯胺MBHA樹脂);9-Fmoc-胺基-呫噸-3-基氧基-Merrifield樹脂(Sieber醯胺樹脂);4-(9-Fmoc)胺基甲基-3,5-二甲氧基苯氧基)戊醯基-胺基甲基-Merrifield樹脂(PAL樹脂)(對於C端羧醯胺)。第一個及隨後的胺基酸之偶聯可分別使用HOBt、6-Cl-HOBt或自DIC/HOBt、HBTU/HOBt、BOP、PyBOP或自DIC/6-Cl-HOBt、HCTU、DIC/HOAt或HATU製得之HOAt活性酯達成。較佳的固體擔體為:氯化2-氯三苯甲基樹脂及9-Fmoc-胺基-呫噸-3-基氧基-Merrifield樹脂(Sieber醯胺樹脂)(對於經保護肽片段)。第一個胺基酸負載至氯化2-氯三苯甲基樹脂上最佳藉由使經Fmoc保護之胺基酸與該樹脂在二氯甲烷及DIEA中反應來達成。若需要,則可添加少量的DMF以促使胺基酸溶解。
本文中所述之肽類似物之合成可藉由使用單或多通道肽合成儀,諸如CEM Liberty微波合成儀或Protein Technologies,Inc.
Prelude(6個通道)或Symphony(12個通道)合成儀進行。
可使用任何標準程序裂解其各自肽之肽基樹脂前驅物並脫除保護基(參見,例如,King,D.S.等人,Int.J.Peptide Protein Res.,36:255-266(1990))。一種期望的方法係存在水及TIS作為清除劑下使用TFA。通常,室溫下使肽基樹脂在TFA/水/TIS(94:3:3,v:v:v;1mL/100mg肽基樹脂)中攪拌2至6h。接著濾出廢樹脂且在減壓下濃縮或乾燥TFA溶液。沉澱所得肽粗產物並用Et2O洗滌、或直接再溶解於DMSO或50%乙酸水溶液中以藉由製備型HPLC純化。
可藉由使用製備型HPLC,例如,在Waters型號4000或Shimadzu型號LC-8A液相層析儀上純化獲得具有所需純度之肽。將肽粗產物之溶液注射至YMC S5 ODS(20X 100mm)柱中及以MeCN含在水(二者均經0.1% TFA緩衝)中之線性梯度洗脫,利用14至20mL/min之流速且藉由在220nm下之UV吸光度監測流出物。可藉由電子噴霧MS分析證實經純化肽之結構。
實驗程序
熟習此項技術者熟知本申請案中所使用的縮寫,包括尤其在隨後的說明性方案及實例中所使用的縮寫。一些所用縮寫係如下:DMF為N,N-二甲基甲醯胺;HATU為六氟磷酸O-(7-氮雜苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓;HCTU為六氟磷酸O-(6-Cl-1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓;TFA為三氟乙酸;DBU為1,8-重氮雙環[5.4.0]十一-7-烯;DIAD為偶氮二羧酸二異丙酯;TIS為三異丙基矽烷;DMSO為二甲亞碸;MeCN或ACN為乙腈;DCM為1,1-二氯甲烷;DIEA或DIPEA為二異丙基乙胺;Fmoc為9-茀甲氧羰基;NMM為N-甲基嗎啉;DMAP為4-N,N-二甲基胺基吡啶;NMP為N-甲基吡咯啶酮;Ac為乙醯基;及Et為乙基。
分析數據:
質譜法:「ESI-MS(+)」表示以正離子模式進行的電噴霧電離質譜法;「ESI-MS(-)」表示以負離子模式進行的電噴霧電離質譜法;「ESI-HRMS(+)」表示以正離子模式進行的高解析電噴霧電離質譜法;「ESI-HRMS(-)」表示以負離子模式進行的高解析電噴霧電離質譜法。檢出的質量在「m/z」單位命名後面報告。準確質量大於1000之化合物經常呈二價或三價離子檢測到。
分析型LCMS條件A:
管柱:Waters BEH C18,2.1×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:具有0.05% TFA之水;流動相B:具有0.05% TFA之乙腈;溫度:50℃;梯度:在2min內從2% B變為98% B,接著,0.5min維持在98% B;流速:0.8mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析型LCMS條件C:
管柱:Waters BEH C18,2.1×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:具有0.2%甲酸及0.01% TFA之水;流動相B:具有0.2%甲酸及0.01% TFA之乙腈;溫度:50℃;梯度:在2min內從2% B變為80% B,在0.1分鐘內從80% B變為98% B,接著,0.5min維持在98% B;流速:0.8mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析型LCMS條件D:
管柱:Waters BEH C18,2.1×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10mM乙酸銨);溫度:70℃;梯度:在3min內從0% B變為100% B,接著,2.0分鐘維持在100% B;流速:0.75mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析型LCMS條件E:
管柱:Waters BEH C18,2.1×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有0.1%三氟乙酸);流動相B:95:5乙腈:水(具有0.1%三
氟乙酸);溫度:50℃或70℃;梯度:在3min內從0% B變為100% B,接著,0.75或2.0分鐘維持在100% B;流速:0.75或1.11mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析型LCMS條件F:
管柱:Waters XBridge C18,2.1×50mm;流動相A:5:95乙腈:水(具有10mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10mM乙酸銨);溫度:35℃;梯度:在4min內從0% B變為100% B,接著,1分鐘維持在100% B;流速:4mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析型LCMS條件G:
管柱:Waters BEH C18,2.0×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10mM乙酸銨);溫度:50℃;梯度:在3min內從0% B變為100% B,接著,0.5分鐘維持在100% B;流速:0.5mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析型LCMS條件H:
管柱:Waters BEH C18,2.0×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10mM乙酸銨);溫度:50℃;梯度:在3分鐘內從0% B變為100% B,接著,0.5分鐘維持在100% B;流速:1.0mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析型LCMS條件I:
管柱:Waters BEH C18,2.0×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10mM乙酸銨);溫度:50℃;梯度:在3分鐘內從0% B變為100% B,接著,0.5分鐘維持在100% B;流速:0.5mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析型LCMS條件J:
Waters CSH C18,2.1×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有三氟乙酸);流動相B:95:5乙腈:水(具有三氟乙酸);溫度:70℃;梯度:0%B,在3分鐘內從0% B變為100% B,接著,2.0分鐘維持在100% B;流速:0.75mL/min;檢測:在220nm下之UV。
一般程序:
Symphony法A:
在Symphony肽合成儀(Protein Technologies)上於自動化下進行所有操作。除非註明,否則在裝有底部玻璃濾片的Symphony聚丙烯容器中進行所有程序。該容器通過該管的底部及頂部兩者連接至Symphony肽合成儀。通過容器的底部添加所有溶劑、DMF、DCM、胺基酸及試劑且向上通過玻璃濾片而與樹脂接觸。通過容器的底部移去所有溶液。「週期性地攪拌」描述短暫脈衝N2氣通過底部玻璃濾片;該脈衝持續約5秒且以每15秒進行。胺基酸溶液自製備超過三週後一般不使用。HATU溶液在製備5天內使用。DMF=二甲基甲醯胺;DCM=二氯甲烷;THF=四氫呋喃;HCTU=2-(6-氯-1-H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓;HATU=3-氧化六氟磷酸1-[雙(二甲基胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓;NMM=n-甲基嗎啉;DIPEA=二異丙基乙胺;DMAP=N,N-二甲基吡啶-4-胺;Rink樹脂=4-(2',4'-二甲氧基苯基-Fmoc-胺基甲基)-苯氧基乙醯胺基-胺基甲基樹脂;Sieber樹脂=Fmoc-胺基-呫噸-3-基氧基,其中「3-基氧基」描述對聚苯乙烯樹脂連接的位置及種類。所使用的樹脂為具有Rink或Sieber連接子(在氮處經Fmoc保護)中任一者之Merrifield聚合物(聚苯乙烯);100-200網目,1% DVB,分別為0.35mmol/g或0.71mmol/g負載。亦可在合成中使用其他常見的酸敏感樹脂,諸如官能化氯三苯甲基樹脂。下文列出所使用的常見胺基酸,圓括號內指示側鏈保護基。Fmoc-Ala-OH;
Fmoc-Arg(Pbf)-OH;Fmoc-Asn(Trt)-OH;Fmoc-Asp(OtBu)-OH;Fmoc-Cys(Trt)-OH;Fmoc-Dab(Boc)-OH(Dab=2,4-二胺基丁酸);Fmoc-Dap(Boc)-OH(Dap=2,3-二胺基丙酸);Fmoc-Gln(Trt)-OH;Fmoc-Gly-OH;Fmoc-His(Trt)-OH;Fmoc-t-Hyp(tBu)-OH(t-Hyp=反-4-羥脯胺酸);Fmoc-Ile-OH;Fmoc-Leu-OH;Fmoc-Lys(Boc)-OH;Fmoc-Nle-OH;Fmoc-Met-OH;Fmoc-[N-Me]Ala-OH;Fmoc-[N-Me]Nle-OH;Fmoc-Phe-OH;Fmoc-Pro-OH;Fmoc-Sar-OH(Sar=肌胺酸或[N-Me]Gly);Fmoc-Ser(tBu)-OH;Fmoc-Thr(tBu)-OH;Fmoc-Trp(Boc)-OH;Fmoc-Tyr(tBu)-OH;Fmoc-Val-OH。
「Symphony法A」之程序描述依0.050至0.100mmol規格進行的實驗,其中該規格係藉由樹脂取代決定。此規格相當於約143至286mg或70至140mg的Rink或Sieber-Merrifield樹脂,分別如上所述。所有程序可藉由依規格倍數調整所述體積擴大規格超過0.050至0.100mmol規格。在胺基酸偶聯之前,以樹脂膨脹程序(下文描述作「膨脹程序」)開始所有肽合成順序。胺基酸與一級胺N端之偶聯採用下文所述之「標準偶聯程序」。胺基酸與二級胺N端之偶聯採用下文所述之「二級胺偶聯」程序。
膨脹程序:
將Merrifield Rink或Sieber樹脂(70mg,0.050mmol或140mg,0.100mmol)添加至Symphony聚丙烯反應容器。如下洗滌(膨脹)樹脂三次:將DMF(2.5至5.0mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡來週期性地攪拌該混合物10分鐘,然後通過玻璃濾片除去溶劑。
標準偶聯程序:
如下洗滌樹脂三次:將DMF(2.5至5.0mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物30秒,然後通
過玻璃濾片除去溶劑。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.5至5.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。再次重複該程序。如下洗滌樹脂6次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5至5.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將胺基酸(0.2M含於DMF中,1.25至2.5mL,5eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,1.25至2.5mL,5eq),且最後添加NMM(0.8M含於DMF中,1.25至2.5mL,10eq)。週期性地攪拌該混合物一小時,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。用DMF(2.5至5.0mL)洗滌樹脂五次,每次攪拌樹脂30秒。將乙酸酐:DIEA:DMF(10:5:85 v/v/v,2.5至5.0mL)之溶液添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物20min,接著通過玻璃濾片除去溶液。可如下連續地洗滌樹脂五次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.5至5.0mL)且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂直接用於下一步驟。
二級胺偶聯程序:
如下洗滌樹脂三次:將DMF(2.5至5.0mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶劑。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.5至5.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。再次重複該程序。如下洗滌樹脂6次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5至5.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將胺基酸(0.2M含於DMF中,2.5至5.0mL,10eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,2.5至5.0mL,10eq),且最後添加NMM(0.8M含於DMF中,2.5至5.0mL,20eq)。週期性地攪拌該混合物兩小時,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。用DMF(2.5至5.0mL)洗滌樹脂五次,每次攪拌樹脂30秒。將乙酸
酐:DIEA:DMF(10:5:85 v/v/v,2.5至5.0mL)之溶液添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物20min,接著通過玻璃濾片除去溶液。可如下連續地洗滌樹脂五次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.5至5.0mL)且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂直接用於下一步驟。
無脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯程序:
如下洗滌樹脂三次:將DMF(2.5至5.0mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶劑。將胺基酸(0.2M含於DMF中,2.5至5.0mL,10eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,2.5至5.0mL,10eq),且最後添加NMM(0.8M含於DMF中,2.5至5.0mL,20eq)。週期性地攪拌該混合物六小時,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。用DMF(2.5至5.0mL)洗滌樹脂五次,每次攪拌樹脂30秒。將乙酸酐:DIEA:DMF(10:5:85 v/v/v,2.5至5.0mL)之溶液添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物20min,接著通過玻璃濾片除去溶液。可如下連續地洗滌樹脂五次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.5至5.0mL)且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂直接用於下一步驟。
氯乙酸酐封端程序:
如下洗滌樹脂三次:將DMF(2.5至5.0mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶劑。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.5至5.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。用DMF(2.5至5.0mL)洗滌樹脂一次。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.5至5.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。如下洗滌樹脂6次:每次洗滌,通過容器底部添
加DMF(2.5至5.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將NMM(0.8M含於DMF中,3.0mL,48eq)添加至反應容器,接著添加氯乙酸酐(0.4M含於DMF中,3.0mL,24eq)。週期性地攪拌該混合物30分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。用DMF(4.0mL)洗滌樹脂一次。將NMM(0.8M含於DMF中,3.0mL,48eq)添加至反應容器,接著添加氯乙酸酐(0.4M含於DMF中,3.0mL,24eq)。週期性地攪拌該混合物30分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。用DMF(3.0mL)洗滌樹脂六次且週期性地攪拌該混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。接著用DCM(3.0mL)洗滌樹脂五次且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。接著用氮氣流乾燥所得樹脂10min。
Symphony法B:
在Symphony肽合成儀(Protein Technologies)上於自動化下進行所有操作。除非註明,否則在裝有底部玻璃濾片的20mL Symphony聚丙烯管中進行所有程序。該管通過該管的底部及頂部兩者連接至Symphony肽合成儀。通過管的底部添加所有溶劑、DMF、DCM、胺基酸及試劑且向上通過玻璃濾片而與樹脂接觸。通過管的底部移去所有溶液。「週期性地攪拌」描述短暫脈衝N2氣通過底部玻璃濾片;該脈衝持續約5秒且以每15秒進行。胺基酸溶液自製備超過三週後一般不使用。HATU溶液在製備5天內使用。DMF=二甲基甲醯胺;HCTU=2-(6-氯-1-H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓;HATU=3-氧化六氟磷酸1-[雙(二甲基胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓;NMM=N-甲基嗎啉;DIPEA=二異丙基乙胺;Sieber=Fmoc-胺基-呫噸-3-基氧基,其中「3-基氧基」描述對聚苯乙烯樹脂連接的位置及種類。所使用的樹脂為具有Sieber連接子(在氮處經Fmoc保護)之Merrifield聚合物(聚苯乙烯);100至200網目,1% DVB,0.71mmol/g
負載。亦可在合成中使用其他常見的酸敏感樹脂,諸如Rink或官能化氯三苯甲基樹脂。下文列出所使用的常見胺基酸,圓括號內指示側鏈保護基。
Fmoc-Ala-OH;Fmoc-Arg(Pbf)-OH;Fmoc-Asn(Trt)-OH;Fmoc-Asp(OtBu)-OH;Fmoc-Bzt-OH;Fmoc-Cys(Trt)-OH;Fmoc-Dab(Boc)-OH;Fmoc-Dap(Boc)-OH;Fmoc-Gln(Trt)-OH;Fmoc-Gly-OH;Fmoc-His(Trt)-OH;Fmoc-t-Hyp(tBu)-OH(t-Hyp=反-4-羥脯胺酸;Fmoc-Ile-OH;Fmoc-Leu-OH;Fmoc-Lys(Boc)-OH;Fmoc-Nle-OH;Fmoc-Met-OH;Fmoc-[N-Me]Ala-OH;Fmoc-[N-Me]Nle-OH;Fmoc-Phe-OH;Fmoc-Pro-OH;Fmoc-Sar-OH;Fmoc-Ser(tBu)-OH;Fmoc-Thr(tBu)-OH;Fmoc-Trp(Boc)-OH;Fmoc-Tyr(tBu)-OH;Fmoc-Val-OH。
「Symphony法B」之程序描述依0.10mmol規格進行的實驗,其中該規格係由結合至樹脂之Sieber連接子的量決定。此規格相當於約140mg的上述Sieber-Merrifield樹脂。所有程序可藉由依規格倍數調整所述體積擴大規格超過0.10mmol規格。在胺基酸偶聯之前,以樹脂膨脹程序(下文描述作「膨脹程序」)開始所有肽合成順序。胺基酸與一級胺N端之偶聯採用下文所述之「標準偶聯程序」。胺基酸與二級胺N端之偶聯使用「二級胺基酸偶聯程序B」,定製的胺基酸(custom amino acid)通過下文所述之「定製的胺基酸偶聯程序」之手動空白添加胺基酸偶聯,及使用下文所述之「最終封端程序」添加氯乙醯基酸酐至序列的最後位置。
膨脹程序:
將Merrifield Sieber樹脂(140mg,0.100mmol)添加至Symphony聚丙烯反應容器。如下洗滌(膨脹)樹脂三次:將DMF(2.5至5.0mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物10分鐘,然後通過玻璃濾片除去溶劑。
標準偶聯程序:
如下洗滌樹脂三次:將DMF(2.5mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶劑。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。如下洗滌樹脂6次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將胺基酸(0.2M含於DMF中,2.5mL,10eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,2.5mL,10eq),且最後添加NMM(0.8M含於DMF中,2.5mL,20eq)。週期性地攪拌該混合物30分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下洗滌樹脂6次:通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將Ac2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3 2.5mL)添加至反應容器,週期性地攪拌該混合物10分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂直接用於下一步驟。
二級胺偶聯程序:
如下洗滌樹脂三次:將DMF(2.5mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶劑。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。如下洗滌樹脂6次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然
後通過玻璃濾片除去溶液。將胺基酸(0.2M含於DMF中,2.5mL,10eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,2.5mL,10eq),且最後添加NMM(0.8M含於DMF中,2.5mL,20eq)。週期性地攪拌該混合物60分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。以通過容器底部添加的DMF(6.25mL)洗滌樹脂且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將胺基酸(0.2M含於DMF中,2.5mL,10eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,2.5mL,10eq),且最後添加NMM(0.8M含於DMF中,2.5mL,20eq)。週期性地攪拌該混合物60分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將Ac2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3 2.5mL)添加至反應容器,週期性地攪拌該混合物10分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂直接用於下一步驟。
定製的胺基酸偶聯程序:
如下洗滌樹脂三次:將DMF(2.5mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶劑。將胺基酸(0.2M含於DMF中,2.5mL,10eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,2.5mL,10eq),且最後添加NMM(0.8M含於DMF中,2.5mL,20eq)。週期性地攪拌該混合物六小時,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下洗滌樹脂6次:通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將Ac2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3 2.5mL)添加至反應容器,週期性地攪拌該混合物10分鐘,接著通過玻璃濾片
除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂直接用於下一步驟。
最終封端程序:
如下洗滌樹脂三次:將DMF(2.5mL)添加至反應容器,此後,藉由從反應容器底部N2鼓泡週期性地攪拌該混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶劑。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.5至5.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。用DMF(2.5至5.0mL)洗滌樹脂一次。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.5至5.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。如下洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將NMM(0.8M含於DMF中,2.5mL,20eq)添加至反應容器,接著添加氯乙酸酐(0.4M含於DMF中,2.5mL,10eq)。週期性地攪拌該混合物15分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。以通過容器底部添加的DMF(6.25mL)洗滌樹脂且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將NMM(0.8M含於DMF中,2.5mL,10eq)添加至反應容器,接著添加氯乙酸酐(0.4M含於DMF中,2.5mL,10eq)。週期性地攪拌該混合物15分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下洗滌樹脂6次:通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將Ae2O/DIPEA/DMF(v/v/v 1:1:3 2.5mL)添加至反應容器,週期性地攪拌該混合物10分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器底部添加DMF(2.5mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂四次:每次洗滌,通過容器底部添加DCM(2.5mL)且週期性地攪
拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。接著用氮氣流乾燥所得樹脂10min。
手動程序
溴乙酸偶聯:
除非另外註明,否則在室溫下手動進行所有操作。如下洗滌樹脂三次:在配備三通活塞之50mL燒結玻璃反應器中組合來自四次0.100mmol規格Symphony合成之用於製備樹脂中間物A及B之樹脂並用DMF(10mL)洗滌三次,藉由從反應容器底部N2鼓泡攪拌。將哌啶:DMF(20:80 v/v,10mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。再次重複該程序。用DMF(10mL)洗滌樹脂六次。將溴乙酸(10.0eq)含在DMF(5.0mL)及DIC(10.3eq)中之溶液添加至反應容器。藉由N2鼓泡攪拌該混合物一小時,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。用DMF(5mL)洗滌樹脂五次。將所得樹脂懸浮於DCM/DMF(3:2)中及依體積分成七個相等的份(0.057mmol),將該等份轉移至25mL燒結針筒中。將各樹脂等分試樣直接用於接下來的樹脂上N-烷基化步驟。
樹脂上N-Gly-烷基化法A:
除非另外註明,否則在室溫下手動進行所有操作。將所需胺(10eq)及DIEA(11eq)含在DMF( mL)中之溶液添加至來自溴乙醯基化步驟之樹脂(0.057mmol)且攪拌所得混合物一小時。用DMF(10mL)洗滌樹脂五次。再次重複該程序。在使用胺之鹽酸鹽之情況下,使用另一份10eq的DIEA。藉由小樹脂樣品之TFA微裂解監測反應進程。反應完成後,用DMF(10mL)洗滌N-烷基化樹脂五次且放回至Symphony反應容器中以在Symphony肽合成儀上完成序列組裝。
樹脂上N-Gly-烷基化法B:
除非另外註明,否則在室溫下手動進行所有操作。將所需胺(10
eq)及DIEA(11eq)含在DMF(mL)中之溶液添加至來自溴乙醯化步驟之樹脂(0.057mmol)且攪拌所得混合物一小時。用DMF(10mL)洗滌樹脂五次。再次重複該程序。在使用胺之鹽酸鹽之情況下,使用另一份10eq的DIEA。接著用胺(10至20eq)及DMAP(21eq)之溶液處理樹脂一至十六小時。藉由小樹脂樣品之TFA微裂解監測反應進程。反應完成後,用DMF(10mL)洗滌N-烷基化樹脂五次且放回至Symphony反應容器中以在Symphony肽合成儀上完成序列組裝。
樹脂上N-Gly-烷基化法C:
除非另外註明,否則在室溫下手動進行所有操作。在所需胺為乙胺之情況下,使用此程序。將乙胺鹽酸鹽(10eq)及DIEA(21eq)含在DMF(mL)中之溶液添加至來自溴乙醯基化步驟之樹脂(0.057mmol)且攪拌所得混合物一小時。用DMF(10mL)洗滌樹脂五次。再次重複該程序。接著用2M乙胺之THF(10mL)溶液處理樹脂十六小時。藉由小樹脂樣品之TFA微裂解監測反應進程。反應完成後,用DMF(10mL)洗滌N-烷基化樹脂五次且放回至Symphony反應容器中,以在Symphony肽合成儀上完成序列組裝。
樹脂上N-Gly-烷基化法D
除非另外註明,否則在室溫下手動進行所有操作。將所需胺(10eq,1.0mmol)及DBU(5eq,0.5mmol)含在DMF(3mL)中之溶液添加至溴乙醯基化樹脂(0.100mmol)且攪拌所得混合物三小時。用DMF(5mL)洗滌樹脂一次。再次重複該程序,但允許反應繼續進行16h。用DMF(4mL)及DCM(4mL)洗滌樹脂四次,且接著放回至Symphony反應容器中以在Symphony肽合成儀上完成序列組裝。
烷基化法A:
將對應於烷基化基團之醇(0.046g,1.000mmol)、三苯基膦(0.131g,0.500mmol)及DIAD(0.097mL,0.500mmol)含在3mL THF
中之溶液添加至硝基苯磺酸化樹脂(0.186g,0.100mmol),且在室溫下攪拌反應混合物16小時。用THF(5mL)四氫呋喃洗滌樹脂三次,及重複上述程序1至3次。藉由經50μL TIS含在1mL TFA中之溶液處理1.5小時之小樹脂樣品之TFA微裂解監測反應進程。
烷基化法B:
用N-甲基吡咯啶酮(NMP)(3mL)洗滌硝基苯磺酸化樹脂(0.100mmol)三次。將NMP(3mL)、烷基溴(20eq,2.000mmol)及DBU(20eq,0.301mL,2.000mmol)之溶液添加至樹脂,且在室溫下攪拌反應混合物16小時。用NMP(3mL)洗滌樹脂且再次重複上述程序。藉由經50μL TIS含在1mL TFA中之溶液處理1.5小時之小樹脂樣品之TFA微裂解監測反應進程。
硝基苯磺酸酯形成:
將三甲吡啶(10eq)含在DCM(2mL)中之溶液添加至樹脂,接著添加Nos-Cl(8eq)含在DCM(1mL)中之溶液。在室溫下攪拌反應混合物16小時。用DCM(4mL)洗滌樹脂三次及用DMF(4mL)洗滌三次。重複交替的DCM及DMF洗滌三次,接著進行最後一組四次的DCM洗滌(4mL)。
硝基苯磺酸酯移去:
利用DMF(3mL)之三次洗滌及NMP(3mL)之三次洗滌膨脹樹脂(0.100mmol)。將NMP(3mL)、DBU(0.075mL,0.500mmol)及2-巰基乙醇(0.071mL,1.000mmol)之溶液添加至樹脂且在室溫下攪拌反應混合物5分鐘。於過濾及用NMP(3mL)洗滌後,在室溫下用NMP(3mL)、DBU(0.075mL,0.500mmol)及2-巰基乙醇(0.071mL,1.000mmol)之溶液再處理樹脂5分鐘。用NMP(3mL)洗滌樹脂三次,用DMF(4mL)洗滌四次及用DCM(4mL)洗滌四次,且放回至Symphony反應容器中以在Symphony肽合成儀上完成序列組裝。
氯乙醯氯偶聯程序:
將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)添加至含有來自前一步驟之樹脂之反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物5分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。可如下連續地洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(5.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將3.5mL之DIPEA(40eq)及氯乙醯氯(20eq)含在DMF中之溶液添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物三小時,接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂五次:每次洗滌,添加DMF(5.0mL)於容器頂部且週期性地攪拌所得混合物60秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:每次洗滌,添加CH2Cl2(5.0mL)於容器頂部且週期性地攪拌所得混合物60秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。接著在高真空下乾燥樹脂。
CEM法A:
在CEM Liberty微波肽合成儀(CEM Corporation)上於自動化下進行所有操作。除非註明否則在裝有通向CEM Discovery微波單元的底部玻璃濾片的30或125mL聚丙烯管中進行所有程序。該管通過該管的底部及頂部兩者連接至CEM Liberty合成儀。可通過管的頂部及底部添加DMF及DCM,此可均勻地向下沖洗管的側部。除了從頂部轉移樹脂時,通過管的底部移去所有溶液。「週期性鼓泡」描述短暫地鼓泡N2氣通過底部玻璃濾片。胺基酸溶液自製備超過三週後一般不使用。HATU溶液在製備5天內使用。DMF=二甲基甲醯胺;HCTU=2-(6-氯-1-H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓;HATU=3-氧化六氟磷酸1-[雙(二甲基胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓;DIPEA=二異丙基乙胺;Sieber=Fmoc-胺基-呫噸-3-基氧基,其中「3-基氧基」
描述對聚苯乙烯樹脂連接的位置及種類。所使用的樹脂為具有Sieber連接子(在氮處經Fmoc保護)之Merrifield聚合物(聚苯乙烯);100至200網目,1% DVB,0.71mmol/g負載。下文列出所使用的常見胺基酸,圓括號內指示側鏈保護基。Fmoc-Ala-OH;Fmoc-Arg(Pbf)-OH;Fmoc-Asn(Trt)-OH;Fmoc-Asp(OtBu)-OH;Fmoc-Bzt-OH;Fmoc-Cys(Trt)-OH;Fmoc-Dab(Boc)-OH;Fmoc-Dap(Boc)-OH;Fmoc-Gln(Trt)-OH;Fmoc-Gly-OH;Fmoc-His(Trt)-OH;Fmoc-Hyp(tBu)-OH;Fmoc-Ile-OH;Fmoc-Leu-OH;Fmoc-Lys(Boc)-OH;Fmoc-Nle-OH;Fmoc-Met-OH;Fmoc-[N-Me]Ala-OH;Fmoc-[N-Me]Nle-OH;Fmoc-Phe-OH;Fmoc-Pro-OH;Fmoc-Sar-OH;Fmoc-Ser(tBu)-OH;Fmoc-Thr(tBu)-OH;Fmoc-Trp(Boc)-OH;Fmoc-Tyr(tBu)-OH;Fmoc-Val-OH
「CEM法A」之程序描述依0.100mmol規格進行的實驗,其中該規格係由結合至樹脂之Sieber連接子的量決定。此規格相當於約140mg的上述Sieber-Merrifield樹脂。所有程序可藉由依規格倍數調整所述體積擴大規格超過0.100mmol規格。在胺基酸偶聯之前,以樹脂膨脹程序(下文描述作「樹脂膨脹程序」)開始所有肽合成序列。胺基酸與一級胺N端之偶聯採用下文所述之「單偶聯程序」。胺基酸與二級胺N端之偶聯採用下文所述之「二級胺偶聯程序」。氯乙醯基與肽的N端之偶聯由上文詳述之「氯乙醯氯偶聯程序」或「氯乙酸偶聯程序」描述。
樹脂膨脹程序:
將Merrifield:Sieber樹脂(140mg,0.100mmol)添加至50mL聚丙烯圓錐形管。然後,將DMF(7mL)添加至該管,接著添加DCM(7mL)。接著將樹脂從容器頂部轉移至反應容器。另重複該程序兩次。添加DMF(7mL),接著添加DCM(7mL)。藉由從反應容器底部N2鼓泡
15分鐘使樹脂膨脹,然後通過玻璃濾片除去溶劑。
標準偶聯程序:
將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)之溶液添加至含有來自前一步驟之樹脂之反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)之溶液添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將胺基酸(0.2M含於DMF中,2.5mL,5eq)、HATU(0.5M含於DMF中,1.0mL,5eq)及DIPEA(2M含於NMP中,0.5mL,10eq)添加至反應容器。除了在50℃偶聯之Fmoc-Cys(Trt)-OH及Fmoc-His(Trt)-OH之外,針對所有胺基酸藉由在75℃下N2鼓泡5分鐘混合該混合物,通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將乙酸酐:DIEA:DMF(10:1:89 v/v/v,5.0mL)之溶液添加至反應容器。在65℃週期性地鼓泡該混合物2分鐘,接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將所得樹脂直接用於下一步驟。
雙偶聯偶聯程序:
將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)之溶液添加至含有來自前一步驟之樹脂之反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)之溶液添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將胺基酸(0.2M含
於DMF中,2.5mL,5eq)、HATU(0.5M含於DMF中,1.0mL,5eq)及DIPEA(2M含於NMP中,0.5mL,10eq)添加至反應容器。除了在50℃偶聯之Fmoc-Cys(Trt)-OH及Fmoc-His(Trt)-OH之外,針對所有胺基酸藉由在75℃下N2鼓泡5分鐘混合該混合物,通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將胺基酸(0.2M含於DMF中,2.5mL,5eq)、HATU(0.5M含於DMF中,1.0mL,5eq)及DIPEA(2M含於NMP中,0.5mL,10eq)添加至反應容器。除了在50℃偶聯之Fmoc-Cys(Trt)-OH及Fmoc-His(Trt)-OH之外,針對所有胺基酸藉由在75℃下N2鼓泡5分鐘混合該混合物,通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將乙酸酐:DIEA:DMF(10:1:89 v/v/v,5.0mL)之溶液添加至反應容器。在65℃週期性地鼓泡該混合物2分鐘,接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將所得樹脂直接用於下一步驟。
定製的胺基酸偶聯程序:
將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)之溶液添加至含有來自前一步驟之樹脂之反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)之溶液添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將含有HATU(2.5eq至10eq)之胺基酸溶液(1.25mL至5mL,2.5eq至10eq)添加至反應容器,及最後添加DIPEA(2M含於NMP中,0.5mL至1mL,20eq)。藉
由在25℃至75℃ N2鼓泡5分鐘至2小時混合該混合物,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將乙酸酐:DIEA:DMF(10:1:89 v/v/v,5.0mL)之溶液添加至反應容器。在65℃週期性地鼓泡該混合物2分鐘,接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:用DMF(7mL)從頂部洗滌,接著用DMF(7mL)從底部洗滌及最後用DMF(7mL)從頂部洗滌。將所得樹脂直接用於下一步驟。
氯乙醯氯偶聯程序:
將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)添加至含有來自前一步驟之樹脂之反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,5.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。可如下連續地洗滌樹脂五次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(4.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將3.0mL之DIPEA(4.0mmol,0.699mL,40eq)及氯乙醯氯(2.0mmol,0.160mL,20eq)含在DMF中之溶液添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物12至18小時,接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:每次洗滌添加DMF(4.0mL)於容器頂部且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂四次:每次洗滌添加CH2Cl2(2.0mL)於容器頂部且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。
整體脫除保護基法A:
除非另外註明,否則在室溫下手動進行所有操作。「整體脫除保護基法A」之程序描述依0.057至0.100mmol規格進行的實驗,其中該規格係由結合至樹脂之Rink或Sieber連接子的量決定。該程序可藉由
依規格倍數調整所述體積擴大規格超過0.057至0.100mmol規格。使用三氟乙酸:三異丙基矽烷:二硫蘇糖醇(95:2.5:2.5 v:v:w)或三氟乙酸:三異丙基矽烷:二硫蘇糖醇(96.5:2.5:1.0 v:v:w)製備「脫除保護基溶液」。該溶液於將其添加至樹脂前經冰中預冷卻。將「脫除保護基溶液」(2.5至4.0mL)添加至25mL燒結針筒中的樹脂。在振盪器中混合該混合物60min。通過玻璃濾片過濾該溶液至冷的乙醚(30mL)中。使沉澱固體離心3min。倒出上清液並將固體再懸浮於乙醚(15mL)中。再重複此程序兩次。倒出上清液且在高真空下乾燥殘餘固體。獲得呈白色至灰白色固體之肽粗產物。
環化法A:
除非另外註明,否則手動進行所有操作。「環化法A」之程序描述以0.057至0.100mmol規格進行的實驗。將肽粗產物固體溶於乙腈:0.1M碳酸氫銨緩衝液水溶液(1:3或1:2,v:v;30至40mL)之溶液中,且使用NaOH水溶液(1.0M)小心地將該溶液之pH調整至8.5至9.0。接著使用振盪器混合該溶液12至18小時。濃縮反應溶液且接著將殘餘物溶解於乙腈:水中。使該溶液進行逆相HPLC純化以提供所需環狀肽。
製備用於實例3003至3050之樹脂中間物
製備樹脂中間物A:
將Sieber樹脂(0.100mmol)添加至Symphony 20mL反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著,連續地進行以下程序:遵循Fmoc-Gly-OH「Symphony法B:樹脂膨脹程序」;遵循Fmoc-Cys(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;
遵循Fmoc-Leu-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Ala-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」。
使用20%哌啶/DMF(5mL)利用週期性氮攪拌脫除Fmoc基5分鐘。用DMF(2.5mL)洗滌樹脂且接著將20%哌啶/DMF(5mL)添加至樹脂,並繼續週期性氮攪拌5min。用DMF(2.5mL)洗滌所得樹脂六次,接著用DCM(2.5mL)洗滌五次,可用作用於N-烷基化程序之中間物。
製備樹脂中間物B:
將Sieber樹脂(0.100mmol)添加至Symphony 20mL反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著,連續地進行以下程序:遵循Fmoc-Gly-OH「Symphony法B:樹脂膨脹程序」;遵循Fmoc-Cys(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Leu-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Nle-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」。
使用20%哌啶/DMF(5mL)利用週期性氮攪拌脫除Fmoc基5min。用DMF(2.5mL)洗滌樹脂且接著將20%哌啶/DMF(5mL)添加至樹脂,並繼續週期性氮攪拌5min。用DMF(2.5mL)洗滌所得樹脂六次,接著用DCM(2.5mL)洗滌五次,可用作用於N-烷基化程序之中間物。
製備樹脂中間物C:
將Sieber樹脂(0.100mmol)添加至Symphony 20mL反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著,連續地進行以下程序:
遵循Fmoc-Gly-OH「Symphony法B:樹脂膨脹程序」;遵循Fmoc-Cys(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Leu-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-n甲基-Nle-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;Fmoc-Nle-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」。
使用20%哌啶/DMF(5mL)利用週期性氮攪拌脫除Fmoc基5min。用DMF(2.5mL)洗滌樹脂且接著將20%哌啶/DMF(5mL)添加至樹脂,並繼續週期性氮攪拌5min。用DMF(2.5mL)洗滌所得樹脂六次,接著用DCM(2.5mL)洗滌五次,可用作用於N-烷基化程序之中間物。
製備樹脂中間物D:
將Sieber樹脂(0.100mmol)添加至Symphony 20mL反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著,連續地進行以下程序:遵循Fmoc-Gly-OH「Symphony法B:樹脂膨脹程序」;遵循Fmoc-Cys(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Leu-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-n甲基-Nle-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Ala-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」。
使用20%哌啶/DMF(5mL)利用週期性氮攪拌脫除Fmoc基5min。用DMF(2.5mL)洗滌樹脂且接著將20%哌啶/DMF(5mL)添加至樹脂,並繼續週期性氮攪拌5min。用DMF(2.5mL)洗滌所得樹脂六次,接著用DCM(2.5mL)洗滌五次,可用作用於N-烷基化程序之中間物。
製備樹脂中間物E:
將Sieber樹脂(0.100mmol)添加至Symphony 20mL反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著,連續地進行以下程序:遵循Fmoc-Gly-OH「Symphony法B:樹脂膨脹程序」;遵循Fmoc-Cys(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Leu-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-n甲基-Nle-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-n甲基-Nle-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」;遵循Fmoc-Trp(Boc)-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」;遵循Fmoc-Dab(Boc)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Trp(Boc)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Hyp(tBu)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Glu(tBu)-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」;遵循Fmoc-His(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Pro-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Asn(Trt)-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」;遵循Fmoc-Ala-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」。
使用20%哌啶/DMF(5mL)利用週期性氮攪拌脫除Fmoc基5min。用DMF(2.5mL)洗滌樹脂且接著將20%哌啶/DMF(5mL)添加至樹脂,並繼續週期性氮攪拌5min。用DMF(2.5mL)洗滌所得樹脂六次,接著
用DCM(2.5mL)洗滌五次,可用作用於N-烷基化程序之中間物。
製備樹脂中間物F:
將Sieber樹脂(0.100mmol)添加至Symphony 20mL反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著,連續地進行以下程序:遵循Fmoc-Gly-OH「Symphony法B:樹脂膨脹程序」;遵循Fmoc-Cys(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Leu-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-n甲基-Nle-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」。
使用20%哌啶/DMF(5mL)利用週期性氮攪拌脫除Fmoc基5min。用DMF(2.5mL)洗滌樹脂且接著將20%哌啶/DMF(5mL)添加至樹脂,並繼續週期性氮攪拌5min。用DMF(2.5mL)洗滌所得樹脂六次,且接著轉移至BioRad管,並用以下溶液處理:含在DMF(3mL)中之溴乙酸(10eq,1mmol)及DIC(11eq,1.1mmol)。攪拌該反應混合物3小時。於過濾及DMF洗滌(3mL)後,用以下溶液再處理樹脂:含在DMF(3mL)中之溴乙酸(10eq,1mmol)及DIC(11eq,1.1mmol)。攪拌該反應混合物16小時。過濾後,用DMF(3.0mL)洗滌樹脂五次,接著用DCM(2.5mL)洗滌五次,可用作用於N-烷基化程序之中間物。
製備樹脂中間物G:
將Sieber樹脂(0.100mmol)添加至Symphony 20mL反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著連續地進行以下程序:遵循Fmoc-Gly-OH「Symphony法B:樹脂膨脹程序」;遵循Fmoc-Cys(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Leu-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-n甲基-Nle-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-n甲基-Nle-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」;遵循Fmoc-Trp(Boc)-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」;遵循Fmoc-Dab(Boc)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Trp(Boc)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Hyp(tBu)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Glu(tBu)-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」;遵循Fmoc-His(Trt)-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Pro-OH「Symphony法B:標準偶聯程序」;遵循Fmoc-Asn(Trt)-OH「Symphony法B:二級胺偶聯程序」。
使用20%哌啶/DMF(5mL)利用週期性氮攪拌脫除Fmoc基5min。用DMF(2.5mL)洗滌樹脂且接著將20%哌啶/DMF(5mL)添加至樹脂,及繼續週期性氮攪拌5分鐘。用DMF(2.5mL)洗滌所得樹脂六
次,且接著轉移至BioRad管,並用以下溶液處理:含在DMF(3mL)中之溴乙酸(10eq,1mmol)及DIC(11eq,1.1mmol)。攪拌該反應混合物3小時。於過濾及DMF洗滌(3mL)後,用以下溶液再處理樹脂:含在DMF(3mL)中之溴乙酸(10eq,1mmol)及DIC(11eq,1.1mmol)。攪拌該反應混合物16小時。過濾後,用DMF(3.0mL)洗滌樹脂五次,接著用DCM(2.5mL)洗滌五次,可用作用於N-烷基化程序之中間物。
製備樹脂中間物H。
將Rink樹脂(mg,0.100mmol)添加至四個Symphony反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著,連續地進行以下程序:遵循「Symphony法A:樹脂膨脹程序」;利用Fmoc-Gly-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Cys(Trt)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Leu-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-[N-Me]Nle-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;利用Fmoc-[N-Me]Nle-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;利用Fmoc-Trp(Boc)-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;利用Fmoc-Dab(Boc)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Trp(Boc)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」。
於50mL燒結玻璃反應器中組合所得樹脂且如上文溴乙酸偶聯程序中所述用DMF洗滌。
製備樹脂中間物I。
將Rink樹脂(mg,0.100mmol)添加至四個Symphony反應容器且將該等容器置於Symphony肽合成儀上。接著,連續地進行以下程序:遵循「Symphony法A:樹脂膨脹程序」;利用Fmoc-Gly-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Cys(Trt)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Leu-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-[N-Me]Nle-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;利用Fmoc-[N-Me]Nle-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;利用Fmoc-Trp(Boc)-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;利用Fmoc-Dab(Boc)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Trp(Boc)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-t-Hyp(tBu)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;
利用Fmoc-Glu(OtBu)-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;利用Fmoc-His(Trt)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」。
於50mL燒結玻璃反應器中組合所得樹脂且如上文溴乙酸偶聯程序中所述用DMF洗滌。
製備實例3003
遵循下文所述之一般合成順序由樹脂中間物H開始來製備實例3003。將樹脂中間物A(0.400mmol)置於50mL燒結玻璃反應器中。接著,連續地進行以下程序:遵循「溴乙酸偶聯」程序;遵循「樹脂上N-Gly-烷基化法C」程序;遵循「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序利用Fmoc-Glu(OtBu)-OH;利用Fmoc-His(Trt)-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Pro-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Asn(Trt)-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;利用Fmoc-[N-Me]Ala-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程
序」;利用Fmoc-Tyr(tBu)-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;遵循「氯乙酸酐封端程序」;遵循「整體脫除保護基法A」;遵循「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為6.3mg,及其利用「分析型LCMS條件D」藉由LCMS分析估算得的純度為99%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.88min;ESI-MS(+)m/z 935.1(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:934.4692(M+2H)
實測值:934.4674(M+2H)
製備實例3004
遵循針對製備實例3003所述之一般合成順序由樹脂中間物H開始利用以下一般程序來製備實例3004:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法A」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯程序」;「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從50% B變為90% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為6.6mg,及其利用「分析型LCMS條件D」藉由LCMS分析估算得的純度為95%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.87min;ESI-MS(+)m/z 961.9(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:965.4771(M+2H)
實測值:965.4754(M+2H)
製備實例3005
遵循針對製備實例3003所述之一般合成順序由樹脂中間物H開始利用以下一般程序來製備實例3005:「溴乙酸偶聯B」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法B」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯程序」;「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為3.9mg,及其利用「分析型LCMS條件D」藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.72min;ESI-MS(+)m/z 950.4(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:949.4563(M+2H)
實測值:949.4547(M+2H)
製備實例3006
遵循針對製備實例3003所述之一般合成順序由樹脂中間物H開始利用以下一般程序來製備實例3006:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法A」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯程序」;「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;「氯乙酸酐封端A」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從50% B變為90% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為13.8mg,及其利用「分析型LCMS條件D及E」藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.90min;ESI-MS(+)m/z 950.5(M+2H)。
分析型LCMS條件E:滯留時間=1.58min;ESI-MS(+)m/z 950.1
(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:949.4745(M+2H)
實測值:949.4725(M+2H)
製備實例3007
遵循針對製備實例3003所述之一般合成順序由樹脂中間物H開始利用以下一般程序來製備實例3007:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法B」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯程序」;「Symphony法A:二級胺偶聯」程序;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從50% B變為90% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為3.9mg,及其利用「分析型LCMS條件D」藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.96min;ESI-MS(+)m/z 969.3(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:968.4629(M+2H)
實測值:968.4617(M+2H)。
製備實例3008
遵循下文所述之一般合成順序由樹脂中間物I開始來製備實例3008。將樹脂中間物B(0.400mmol)置於50mL燒結玻璃反應器中。接著,連續地進行以下程序:遵循「溴乙酸封端」程序;遵循「樹脂上N-Gly-烷基化法A」程序;利用Fmoc-Asn(Trt)-OH遵循「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;利用Fmoc-[N-Me]Ala-OH遵循「Symphony法A:標準偶聯程序」;利用Fmoc-Tyr(tBu)-OH遵循「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;遵循「氯乙酸酐封端程序」;
遵循「整體脫除保護基法A」;遵循「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從50% B變為90% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。
產物的產量為10.6mg,及其利用「分析型LCMS條件D」藉由LCMS分析估算得的純度為99%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.87min;ESI-MS(+)m/z 974.3(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:973.4745(M+2H)
實測值:973.4729(M+2H)。
製備實例3009
遵循針對製備實例3008所述之一般合成順序由樹脂中間物I開始利用以下一般程序來製備實例3009:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法A」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級
胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯」程序;「Symphony法A:二級胺偶聯」程序;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在35分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為9.1mg,及其利用「分析型LCMS條件E」藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件E:滯留時間=1.56min;ESI-MS(+)m/z 958.0(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:957.4720(M+2H)
實測值:957.4693(M+2H)。
製備實例3010
遵循針對製備實例3008所述之一般合成順序由樹脂中間物I開始利用以下一般程序來製備實例3010:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-
Gly-烷基化法B」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯」程序;「Symphony法A:二級胺偶聯」程序;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從50% B變為90% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為4.7mg,及其利用「分析型LCMS條件D」藉由LCMS分析估算得的純度為97%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.83min;ESI-MS(+)m/z 977.7(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:976.4604(M+2H)
實測值:976.4592(M+2H)。
製備實例3011
遵循針對製備實例3003所述之一般合成順序由樹脂中間物H開始
利用以下一般程序來製備實例3011:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法A」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯程序」;「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從50% B變為90% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為10.6mg,及其利用「分析型LCMS條件D及E」藉由LCMS分析估算得的純度為89%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.85min;ESI-MS(+)m/z 942.9(M+2H)。
分析型LCMS條件E:滯留時間=1.47min;ESI-MS(+)m/z 942.6(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:941.9723(M+2H)
實測值:941.9747(M+2H)。
製備實例3012
遵循針對製備實例3003所述之一般合成順序由樹脂中間物H開始利用以下一般程序來製備實例3012:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法A」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯程序」;「Symphony法A:二級胺偶聯程序」;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為3.4mg,及其利用「分析型LCMS條件D及E」藉由LCMS分析估算得的純度為95%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.95min;未檢測到ESI-MS(+)m/z (M+2H)。
分析型LCMS條件E:滯留時間=1.60min;未檢測到ESI-MS(+)m/z (M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:942.4667(M+2H)
實測值:942.4659(M+2H)。
製備實例3013
遵循針對製備實例3008所述之一般合成順序由樹脂中間物I開始利用以下一般程序來製備實例3013:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法C」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;Symphony法A:標準偶聯」程序;「Symphony法A:二級胺偶聯」程序;「氯乙酸酐偶聯」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在40分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為5.8mg,及其利用「分析型LCMS條件D及E」藉由LCMS分析估算得的純度為97%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.80min;ESI-MS(+)m/z 942.9(M+2H);
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.56min;ESI-MS(+)m/z 943.0(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:942.4667(M+2H)
實測值:942.4656(M+2H)。
製備實例3014
遵循針對製備實例3008所述之一般合成順序由樹脂中間物I開始利用以下一般程序來製備實例3014:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法A」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;「Symphony法A:標準偶聯」程序;「Symphony法A:二級胺偶聯」程序;「氯乙酸酐偶聯」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在40分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為10.2mg,及其利用「分析型LCMS條件D」藉由LCMS分析估
算得的純度為90%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.75min;ESI-MS(+)m/z 950.5(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:949.9722(M+2H)
實測值:949.9704(M+2H)。
製備實例3015
遵循針對製備實例3008所述之一般合成順序由樹脂中間物I開始利用以下一般程序來製備實例3015:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法B」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;Symphony法A:標準偶聯」程序;「Symphony法A:二級胺偶聯」程序;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除去保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在40分鐘內從40% B變為80% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的
產量為3.4mg,及其利用「分析型LCMS條件D」藉由LCMS分析估算得的純度為90%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.72min;ESI-MS(+)m/z 958.2(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:957.4538(M+2H)
實測值:957.4521(M+2H)。
製備實例3016
遵循針對製備實例3008所述之一般合成順序由樹脂中間物I開始利用以下一般程序來製備實例3016:「溴乙酸偶聯」程序;「樹脂上N-Gly-烷基化法A」程序;「Symphony法A:不脫除Fmoc保護基之二級胺偶聯」程序;Symphony法A:標準偶聯」程序;「Symphony法A:二級胺偶聯」程序;「氯乙酸酐封端」程序;「整體脫除保護基法A」;「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在35分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20
mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為4.0mg,及其利用「分析型LCMS條件D及E」藉由LCMS分析估算得的純度為98%。
分析型LCMS條件D:滯留時間=1.85min;未檢測到ESI-MS(+)m/z,(M+2H);
分析型LCMS條件E:滯留時間=1.56min;未檢測到ESI-MS(+)m/z,(M+2H)。
ESI-HRMS(+)m/z:
計算值:950.4642(M+2H)
實測值:950.4629(M+2H)。
製備實例3017
遵循下文所述之一般合成順序由樹脂中間物E開始來製備實例3017。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法B」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge
C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為5.1mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.71min;ESI-MS(+)m/z 956.2(M+2H);
分析型LCMS條件I:滯留時間=2.73min;ESI-MS(+)m/z 956.3(M+2H)。
製備實例3019
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物E開始來製備實例3019。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」
及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從45% B變為85% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為10.7mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為97%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.73min;ESI-MS(+)m/z 987.2(M+2H)。
分析型LCMS條件I:滯留時間=2.81min;ESI-MS(+)m/z 987.2(M+2H)。
製備實例3020
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物A開始來製備實例3020。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法B」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙
酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為14.1mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為97%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.5min;ESI-MS(+)m/z 935.9(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.26min;ESI-MS(+)m/z 935.0(M+2H)。
製備實例3021
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物B開始來製備實例3021。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法B」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有0.1%三氟乙酸);流動相B:95:5乙腈:水(具有0.1%三氟乙酸);梯度:在30分鐘
內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為6.0mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.77min;ESI-MS(+)m/z 956.4(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.47min;ESI-MS(+)m/z 956.3(M+2H)。
製備實例3022
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物D開始來製備實例3022。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從35% B變為75% B,接著,35分鐘維持在100% B;流速:20
mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為10.7mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.26min;ESI-MS(+)m/z 942.8(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.0min;ESI-MS(+)m/z 942.5(M+2H)。
製備實例3023
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物C開始來製備實例3023。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法B」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的
產量為6.9mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為98%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.67min;ESI-MS(+)m/z 955.9(M+2H)。
分析型LCMS條件I:滯留時間=2.73min;ESI-MS(+)m/z 956.2(M+2H)。
製備實例3024
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物D開始來製備實例3024。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法B」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為9.2mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.59min;ESI-MS(+)m/z 935.0
(M+2H)。
分析型LCMS條件E:滯留時間=1.38min;ESI-MS(+)m/z 935.3(M+2H)。
製備實例3025
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物D開始來製備實例3025。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為8.0mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為95%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.5min;ESI-MS(+)m/z 950.0(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.37min;ESI-MS(+)m/z 949.6
(M+2H)。
製備實例3026
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物E開始來製備實例3026。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯除去」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:Waters CSH C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從5% B變為45% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為10.8mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為78%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.74min;ESI-MS(+)m/z 971.1
(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.37min;ESI-MS(+)m/z 971.1(M+2H)。
製備實例3028
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物D開始來製備實例3028。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法B」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從5% B變為45% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為4.1mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為82%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.31min;ESI-MS(+)m/z 950.0(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.16min;ESI-MS(+)m/z 950.0
(M+2H)。
製備實例3029
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物D開始來製備實例3029。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從50% B變為90% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為2.7mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為78%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.97min;ESI-MS(+)m/z 967.7(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.53min;ESI-MS(-)m/z 965.5(M+2H)。
製備實例3030
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物C開始來合成實例3030。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯除去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在40分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為3.0mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為86%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.59min;ESI-MS(+)m/z 964.3(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.27min;ESI-MS(+)m/z 964.3(M+2H)。
製備實例3032
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物E開始來製備實例3032。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:Waters CSH C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從0% B變為40% B,接著,0分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為4.6mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為98%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.69min;ESI-MS(+)m/z 963.4(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.14min;ESI-MS(+)m/z 964.2
(M+2H)。
製備實例3033
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物D開始來製備實例3033。連續地進行以下程序:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從5% B變為45% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從25% B變為70% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為0.6mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為85%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.42min;ESI-MS(+)m/z 943.0(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.13min;ESI-MS(+)m/z 1883.9(M+H)。
製備實例3037
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序以樹脂中間物F開始來製備實例3037。連續地進行以下程序:「樹脂上N-Gly-烷基化法D」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從0% B變為40% B,接著,0分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為32.0mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為94%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.25min;ESI-MS(+)m/z 943.2(M+2H);
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.14min;ESI-MS(+)m/z 943.2(M+2H)。
製備實例3038
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序以樹脂中間物F開始來製備實例3038,該一般合成順序係由以下一般程序組成:「樹脂上N-Gly烷基化法D」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為11.9mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為95%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.64min;ESI-MS(+)m/z 962.1(M+2H);
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.33min;ESI-MS(+)m/z 962.0(M+2H)。
製備實例3041
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序由樹脂中間物D開始來製備實例3041,該一般合成順序係由以下一般程序組成:「硝基苯磺酸酯形成」、「烷基化法A」、「硝基苯磺酸酯移去」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為3.8mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為81%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.68min;ESI-MS(+)m/z 970.0(M+2H);
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.51min;ESI-MS(+)m/z 969.3(M+2H)。
製備實例3044
遵循針對製備實例0001所述之一般合成順序以樹脂中間物G來製備實例3044,該一般合成順序係由以下一般程序組成:「樹脂上N-Gly烷基化法D」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:waters CSH c-18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有0.1%三氟乙酸);流動相B:95:5乙腈:水(具有0.1%三氟乙酸);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為19.4mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為96%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.55min;ESI-MS(+)m/z 964.1(M+2H);
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.32min;ESI-MS(+)m/z 963.8(M+2H)。
製備實例3045
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序以樹脂中間物G來製備實例3045,該一般合成順序係由以下一般程序組成:「樹脂上N-Gly-烷基化法D」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從15% B變為55% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從5% B變為45% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為1.5mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為94%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.60min;ESI-MS(+)m/z 957.1(M+2H);
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.30min;ESI-MS(+)m/z 957.5
(M+2H)。
製備實例3046
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序以樹脂中間物G來製備實例3046,該一般合成順序係由以下一般程序組成:「樹脂上N-Gly-烷基化法D」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從10% B變為50% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為7.2mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.71min;ESI-MS(+)m/z 982.9(M+2H)。
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.40min;ESI-MS(+)m/z 982.9(M+2H)。
製備實例3047
遵循針對製備實例3017所述之一般合成順序以樹脂中間物F開始來製備實例3047,該一般合成順序係由以下一般程序組成:「樹脂上N-Gly-烷基化法D」、「Symphony法B:樹脂膨脹程序」、「Symphony法B:標準偶聯程序」、「Symphony法B:二級胺偶聯程序」、「Symphony法B:定製的胺基酸偶聯程序」、「Symphony法B:最終封端程序」、「整體脫除保護基法A」及「環化法A」。
通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從40% B變為80% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:Waters CSH C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從5% B變為45% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的
產量為1.0mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為97%。
分析型LCMS條件H:滯留時間=1.44min;ESI-MS(+)m/z 936.1(M+2H);
分析型LCMS條件J:滯留時間=1.21min;ESI-MS(+)m/z 936.4(M+2H)。
化合物5001、5002、5003之實驗程序
分析數據:
質譜法:「ESI-MS(+)」表示以正離子模式進行的電噴霧電離質譜法;「ESI-MS(-)」表示以負離子模式進行的電噴霧電離質譜法;「ESI-HRMS(+)」表示以正離子模式進行的高解析電噴霧電離質譜法;「ESI-HRMS(-)」表示以負離子模式進行的高解析電噴霧電離質譜法。檢出的質量在「m/z」單位命名後面報告。準確質量大於1000之化合物經常呈二價或三價離子檢測到。
分析條件A:
管柱:Waters BEH C18,2.0×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10mM乙酸銨);溫度:50℃;梯度:0%B,在3分鐘內從0% B變為100% B,接著,0.5分鐘維持在100% B;流速:1mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析條件B:
管柱:Waters BEH C18,2.0×50mm,1.7-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10mM乙酸銨);溫度:50℃;梯度:0%B,在3分鐘內從0% B變為100% B,接著,0.5分鐘維持在100% B;流速:0.5mL/min;檢測:在220nm下之UV。
分析條件C:
管柱:Waters Aquity BEH C18 2.1×50mm 1.7μm粒子;流動相A:具有0.05% TFA之水;流動相B:具有0.05% TFA之乙腈;溫度:40℃;梯度:0%B,在1.5分鐘內從0% B變為100% B,接著,0.5分鐘維持在100% B;流速:0.8mL/min;檢測:在220nm下之UV。
一般程序:
Prelude法A:
在Prelude肽合成儀(Protein Technologies)上於自動化下進行所有操作。除非註明否則在10mL裝有底部玻璃濾片之聚丙烯管中進行所有程序;在反應之規格超過0.100mmol之情況下,使用裝有底部玻璃濾片之40mL聚丙烯管。該管通過該管的底部及頂部兩者連接至Prelude肽合成儀。可通過管的頂部添加DMF及DCM,此可均勻地向下沖洗管的側部。通過管的底部添加剩餘的試劑且向上通過玻璃濾片而與樹脂接觸。通過管的底部移去所有溶液。「週期性地攪拌」描述短暫脈衝N2氣通過底部玻璃濾片;該脈衝持續約5秒且以每30秒進行。含在DMF中之氯乙醯氯溶液在製備24h內使用。胺基酸溶液自製備超過三週後一般不使用。HATU溶液在製備5天內使用。DMF=二甲基甲醯胺;HATU=3-氧化六氟磷酸1-[雙(二甲基胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓;DIPEA=二異丙基乙胺;Rink=(2,4-二甲氧基苯基)(4-烷氧基苯基)甲胺,其中「4-烷氧基」描述對聚苯乙烯樹脂連接的位置及種類。所使用的樹脂為具有Rink連接子(在氮處經Fmoc保護)之Merrifield聚合物(聚苯乙烯);100至200網目,1% DVB,0.56mmol/g負載。下文列出所使用的常見胺基酸,圓括號內指示側鏈保護基。
Fmoc-Ala-OH;Fmoc-Arg(Pbf)-OH;Fmoc-Asn(Trt)-OH;Fmoc-Asp(OtBu)-OH;Fmoc-Bzt-OH;Fmoc-Cys(Trt)-OH;Fmoc-Dab(Boc)-OH;Fmoc-Dap(Boc)-OH;Fmoc-Gln(Trt)-OH;Fmoc-G1y-OH;Fmoc-
His(Trt)-OH;Fmoc-Hyp(tBu)-OH;Fmoc-Ile-OH;Fmoc-Leu-OH;Fmoc-Lys(Boc)-OH;Fmoc-Nle-OH;Fmoc-Met-OH;Fmoc-[N-Me]Ala-OH;Fmoc-[N-Me]Nle-OH;Fmoc-Phe-OH;Fmoc-Pro-OH;Fmoc-Sar-OH;Fmoc-Ser(tBu)-OH;Fmoc-Thr(tBu)-OH;Fmoc-Trp(Boc)-OH;Fmoc-Tyr(tBu)-OH;Fmoc-Val-OH。
「Prelude法A」之程序描述依0.100mmol規格進行的實驗,其中該規格係由結合至樹脂之Rink連接子的量決定。此規格相當於約178mg的上述Rink-Merrifield樹脂。所有程序可藉由依規格倍數調整所述體積擴大規格超過0.100mmol規格。在胺基酸偶聯之前,以樹脂膨脹程序(下文描述作「樹脂膨脹程序」)開始所有肽合成序列。胺基酸與一級胺N端之偶聯採用下文所述之「單偶聯程序」。胺基酸與二級胺N端之偶聯採用下文所述之「雙偶聯程序」。氯乙醯氯與肽的N端之偶聯由下文所述之「氯乙醯氯偶聯程序」描述。
樹脂膨脹程序:
將Merrifield:Rink樹脂(178mg,0.100mmol)添加至10mL聚丙烯固相反應容器。如下洗滌(膨脹)樹脂三次:將DMF(2.0mL)添加至反應容器,此後,週期性地攪拌該混合物10分鐘,然後通過玻璃濾片除去溶劑。
單偶聯程序:
將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.0mL)添加至含有來自前一步驟之樹脂之反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。可如下連續地洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將胺基酸(0.2M含於DMF中,1.0mL,2eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含
於DMF中,1.0mL,2eq),且最後添加DIPEA(0.8M含於DMF中,0.5mL,4eq)。週期性地攪拌該混合物15分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下連續地洗滌樹脂四次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將乙酸酐(2.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物10分鐘,接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂四次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.0mL)且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂直接用於下一步驟。
雙偶聯程序:
將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.0mL)添加至含有來自前一步驟之樹脂之反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。可如下連續地洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將胺基酸(0.2M含於DMF中,1.0mL,2eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,1.0mL,2eq),且最後添加DIPEA(0.8M含於DMF中,0.5mL,4eq)。週期性地攪拌該混合物15分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下洗滌樹脂兩次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將胺基酸(0.2M含於DMF中,1.0mL,2eq)添加至反應容器,接著添加HATU(0.2M含於DMF中,1.0mL,2eq),且最後添加DIPEA(0.8M含於DMF中,0.5mL,4eq)。週期性地攪拌該混合物15分鐘,接著通過玻璃濾片除去反應溶液。如下洗滌樹脂兩次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將乙酸酐(2.0mL)添加至反應容
器。週期性地攪拌該混合物10分鐘,接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂四次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.0mL)且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂直接用於下一步驟。
氯乙醯氯偶聯程序:
將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.0mL)添加至含有來自前一步驟之樹脂之反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。將哌啶:DMF(20:80 v/v,2.0mL)添加至反應容器。週期性地攪拌該混合物3分鐘且接著通過玻璃濾片除去溶液。可如下連續地洗滌樹脂六次:每次洗滌,通過容器頂部添加DMF(2.0mL)且週期性地攪拌所得混合物30秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將DIPEA(0.8M含於DMF中,3.0mL,24eq)添加至反應容器,接著添加氯乙醯氯(0.8M含於DMF中,1.65mL,13.2eq)。週期性地攪拌該混合物30分鐘,接著通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂三次:每次洗滌添加DMF(2.0mL)於容器頂部且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。如下連續地洗滌樹脂四次:每次洗滌添加CH2Cl2(2.0mL)於容器頂部且週期性地攪拌所得混合物90秒,然後通過玻璃濾片除去溶液。將所得樹脂置於N2流下15分鐘。
Symphony法A:
除所提及之外,該程序集與「Prelude法A」者相同。對於所有程序,改用SymphonyX肽合成儀(Protein Technologies)替代Prelude肽合成儀及通過反應容器頂部添加所有試劑。
樹·脂膨脹程序:
該程序與「Prelude法A:樹脂膨脹程序」相同。
單偶聯程序:
該程序與「Prelude法A:單偶聯程序」相同,但DIPEA溶液之濃
度為0.4M及將1.0mL該溶液遞送至反應。
雙偶聯程序:
該程序與「Prelude法A:雙偶聯程序」相同,但DIPEA溶液之濃度為0.4M及將1.0mL該溶液遞送至反應。
氯乙醯氯偶聯程序:
該程序與「Prelude法A:氯乙醯氯偶聯程序」相同。
整體脫除保護基法A:
除非另外註明,否則手動進行所有操作。「整體脫除保護基法A」之程序描述依0.100mmol規格進行的實驗,其中該規格係由結合至樹脂之Rink連接子的量決定。該程序可藉由依規格倍數調整所述體積規格為超過0.100mmol規格。藉由在40mL玻璃小瓶中將三氟乙酸(22mL)、苯酚(1.325g)、水(1.25mL)及三異丙基矽烷(0.5mL)組合以製備「脫除保護基溶液」。自反應容器移去樹脂且轉移至4mL玻璃小瓶。將「脫除保護基溶液」(2.0mL)添加至該小瓶。在振盪器中強力混合該混合物(在1000RPM下混合1分鐘,接著在500RPM下混合1至2h)。通過0.2微米針筒過濾器過濾該混合物及用「脫除保護基溶液」(1.0mL)或TFA(1.0mL)萃取固體。將Et2O(15mL)添加至24mL加有將已合併的濾液之試管。強力混合該混合物,此後,沉澱出大量白色固體。離心該混合物5分鐘,接著,自固體倒去溶液並丟棄。將固體懸浮於Et2O(20mL)中;接著,離心該混合物5分鐘;及自固體倒去溶液並丟棄。對於最後一次,將固體懸浮於Et2O(20mL)中;離心該混合物5分鐘;及自固體倒去溶液並丟棄以提供呈白色至灰白色固體之肽粗產物。
環化法A:
除非另外註明,否則手動進行所有操作。「環化法B」之程序描述依0.100mmol規格進行的實驗,其中該規格係由用於產生肽之結合
至樹脂之Rink連接子的量決定。此規格並非基於直接測定程序中所使用肽的量基礎之上。該程序可藉由依規格倍數調整所述體積規格為超過0.100mmol規格。將肽粗產物固體溶於MeCN:0.1M NH4OAc水溶液(1:1)中達到18至22mL之總體積,且接著使用NaOH水溶液(1.0M)小心地將溶液調整至pH=8.5至9.0。接著允許該溶液在無攪拌下靜置6天。濃縮反應溶液且接著將殘餘物溶解於DMSO:MeOH中。使該溶液進行逆相HPLC純化以提供所需環狀肽。
一般合成順序A:
「一般合成順序A」描述用於提供本文中所述之環狀態之程序之一般順序。出於該一般程序之目的,「Symphony法A」之程序可與「Prelude法A」之程序互換。將Rink-Merrifield樹脂(178mg,0.100mmol)添加至10mL聚丙烯固相反應容器,且將該反應容器置於Prelude肽合成儀上。遵循「Prelude法A:樹脂膨脹程序」。接著,在Prelude上若經樹脂結合之肽的N端為一級胺則遵循「Prelude法A:單偶聯程序」或若經樹脂結合之肽的N端為二級胺則遵循「Prelude法A:雙偶聯程序」連續地進行一系列胺基酸偶聯。遵循「Prelude法A:氯乙醯氯偶聯程序」;接著,遵循「整體脫除保護基法A」;然後,遵循「環化法A」。
製備實例5001
遵循「一般合成順序A」製備實例5001。合成中,依該順序如所指示使用2-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)(2-(第三丁氧基)-2-側氧基乙基)胺基)乙酸。通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從50% B變為90% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為7.8mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析條件A:滯留時間=1.48min;ESI-MS(+)m/z 956.8.1(M-2H)
分析條件B:滯留時間=2.82min;ESI-MS(+)m/z 958.2(M+2H)。
製備實例5002
遵循「一般合成順序A」製備實例5002。合成中,依該順序如所指示使用2-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)(2-(第三丁氧基)-2-側氧基乙基)胺基)乙酸。通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從55% B變為95% B,接著,55分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為2.2mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為81%。
分析條件A:滯留時間=1.51min;ESI-MS(+)m/z 964.1(M-2H)
分析條件B:滯留時間=2.88min;ESI-MS(+)m/z 966.5(M+2H)。
製備實例5003
遵循「一般合成順序A」製備實例5003。合成中,依該順序如所指示使用2-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)(2-(第三丁氧基)-2-側氧基乙基)胺基)乙酸。通過製備型LC/MS利用以下條件純化粗物質:管柱:XBridge C18,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5甲醇:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從60% B變為100% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之部分並通過離心蒸發乾燥。通過製備型LC/MS利用以下條件進一步純化該物質:管柱:XBridge Phenyl,19×200mm,5-μm粒子;流動相A:5:95乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);流動相B:95:5乙腈:水(具有10-mM乙酸銨);梯度:在30分鐘內從5% B變為40% B,接著,5分鐘維持在100% B;流速:20mL/min。合併含有所需產物之溶離份並通過離心蒸發乾燥。產物的產量為4.0mg,及其藉由LCMS分析估算得的純度為100%。
分析條件A:滯留時間=1.777min;ESI-MS(+)m/z 972.40(M+2H)
分析條件B:滯留時間=2.393min;ESI-MS(+)m/z 968.25(M-
2H)
ESI-HRMS(+)m/z:計算值:971.9344(M+2H)實測值:971.9311(M+2H)。
採用均相時間解析熒光(HTRF)結合分析法測試大環肽競爭PD-1與PD-L1結合之能力之方法
採用PD-1/PD-L1均相時間解析熒光(HTRF)結合分析法研究本發明之大環肽結合至PD-L1之能力。
方法
可溶性PD-1與可溶性PD-L1之結合的均相時間解析熒光(HTRF)分析法。可溶性PD-1及可溶性PD-L1係指經羧基端截短移去跨膜區且融合至異種序列,特定言之人類免疫球蛋白G序列(Ig)之Fc部分或六聚組胺酸抗原決定基標籤(His)之蛋白質。所有結合研究係在由補充0.1%(w/v)牛血清白蛋白及0.05%(v/v)Tween-20之dPBS組成之HTRF分析緩衝液中進行。對於PD-1-Ig/PD-L1-His結合分析,在4μl分析緩衝液中預培養抑制劑與PD-L1-His(最終濃度10nM)15m,接著添加含在1μl分析緩衝液中之PD-1-Ig(最終濃度20nM)且進一步培養15m。使用來自人類、食蟹獼猴、小鼠或其他物種中任一者之PD-L1融合蛋白。使用經銪穴狀物標記之抗-Ig單株抗體(最終濃度1nM)及經別藻藍蛋白(APC)標記之抗-His單株抗體(最終濃度20nM)來達成HTRF檢測。在HTRF檢測緩衝液中稀釋抗體且取5μl分配於結合反應之頂部。允許反應平衡30分鐘及使用EnVision熒光計獲得信號(665nm/620nm比)。在PD-1-Ig/PD-L2-His(分別為20nM及5nM)、CD80-His/PD-L1-Ig(分別為100nM及10nM)及CD80-His/CTLA4-Ig(分別為10nM及5nM)之間確立額外的結合分析。如下進行生物素化化合物第71號與人類PD-L1-His之間之結合/競爭研究。在4μl分析緩衝液中將大環肽抑制劑與PD-L1-His(最終濃度10nM)預培養60分鐘,接著,添加含在1
μl分析緩衝液中之生物素化化合物第71號(最終濃度0.5nM)。允許結合平衡30分鐘,接著,添加含在5μl HTRF緩衝液中之經铕穴狀物標記之鏈黴親和素(最終濃度2.5pM)及經APC標記之抗His(最終濃度20nM)。允許反應平衡30m及使用EnVision熒光計獲得信號(665nm/620nm比)。
重組蛋白。在HEK293T細胞中表現具有C端人類Ig抗原決定基標籤之羧基截短之人類PD-1(胺基酸25-167)[hPD-1(25-167)-3S-IG]及具有C端His抗原決定基標籤之人類PD-L1(胺基酸18-239)[hPD-L1(19-239)-菸草脈斑駁病毒蛋白酶裂解位點(TVMV)-His]且連續地藉由重組蛋白A親和層析及尺寸排除層析純化。人類PD-L2-His(Sino Biologicals)、CD80-His(Sino Biologicals)、CTLA4-Ig(RnD Systems)均通過商業來源獲得。
重組人類PD-1-Ig之序列
hPD1(25-167)-3S-IG
(SEQ ID NO:1)
重組人類PD-L1-TVMV-His(PD-L1-His)之序列
hPDL1(19-239)-TVMV-His
(SEQ ID NO:2)
結果顯示於表1中。如所顯示,本發明大環肽證實強效抑制PD-1-Ig與PD-L1-TVMV-His(PD-L1-His)之結合活性。範圍如下:A=0.10至10μM;B=0.01至0.099μM;C=0.005至0.0099μM。
熟習此項技術者將明白本發明不限於前述說明性實例,及其可在不脫離本發明之本質屬性下以其他特定形式體現。因此期望該等實例之所有態樣應視為說明性而非限制性,參考隨附申請專利範圍而非前述實例,及因此本文意欲涵蓋屬於申請專利範圍之等效物之含義及範內的所有改變。
<110> 美商必治妥美雅史谷比公司
<120> 免疫調節劑
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<211> 237
<212> PRT
<213> 現代人
<400> 2
Claims (20)
- 一種式(I)之化合物,
- 如請求項1之化合物或其醫藥上可接受之鹽,其中Re係選自氫及甲基,或Re及R5可與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷、吡咯啶、嗎啉、哌啶、哌嗪及四氫噻唑之環;其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、氰基、甲基、鹵基及羥基之基團取代;及Rj為氫或甲基。
- 如請求項2之化合物或其醫藥上可接受之鹽,其中Rk係選自氫及甲基,或Rk及R11可與其所連接的原子共同形成選自氮雜環丁烷、吡咯啶、嗎啉、哌啶、哌嗪及四氫噻唑之環;其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、氰基、甲基、鹵基及羥基之基團取代;及Rl為甲基,或Rl及R12與其所連接的原子共同形成選自氮雜環 丁烷及吡咯啶之環,其中各環係視需要經一至四個獨立選自胺基、氰基、甲基、鹵基及羥基之基團取代。
- 如請求項3之化合物或其醫藥上可接受之鹽,其中A為,其中z及w各為1;R14及R15為氫;及Rz為-C(O)NHR16;其中R16為-CHR17C(O)NH2;R17為氫;R1為視需要經羥基取代之苄基;R2為氫或甲基;R8為-(CH2)吲哚基;R10係選自-(CH2)吲哚基及-(CH2)苯并噻吩基,其各者係視需要經-CH2CO2H取代;R11為丁基;及R12為丁基。
- 一種選自以下之化合物:
- 一種如請求項1之化合物或其治療上可接受之鹽之用途,其用於製造用於增強、刺激且/或增加有此需要的個體之免疫反應的藥物。
- 如請求項6之用途,其中該藥物進一步包含另一藥劑,或在該藥物之前、之後或與該藥物同時投與該另一藥劑。
- 如請求項7之用途,其中該另一藥劑為抗微生物劑、抗病毒劑、細胞毒性劑及/或免疫反應調節劑。
- 如請求項7之用途,其中該另一藥劑為HDAC抑制劑。
- 如請求項7之用途,其中該另一藥劑為TLR7及/或TLR8促效劑。
- 一種如請求項1之化合物或其治療上可接受之鹽之用途,其用於製造用於抑制有此需要的個體之癌細胞之生長、增殖或轉移的藥物。
- 如請求項11之用途,其中該癌症係選自黑色素瘤、腎細胞癌、鱗狀非小細胞肺癌(NSCLC)、非鱗狀NSCLC、結腸直腸癌、去勢抗性前列腺癌、卵巢癌、胃癌、肝細胞癌、胰臟癌、頭部及頸部鱗狀細胞癌、食道癌、胃腸道癌與乳癌、及血液惡性疾病。
- 一種如請求項1之化合物或其治療上可接受之鹽之用途,其用於製造用於治療有此需要的個體之傳染性疾病的藥物。
- 如請求項13之用途,其中該傳染性疾病係由病毒引起。
- 如請求項14之用途,其中該病毒係選自HIV、A型肝炎、B型肝炎、C型肝炎、疱疹病毒及流感病毒。
- 一種如請求項1之化合物或其治療上可接受之鹽之用途,其用於製造用於治療有此需要的個體之敗血性休克的藥物。
- 一種如請求項1之化合物或其治療上可接受之鹽之用途,其用於製造用於阻斷個體之PD-L1與PD-1及/或CD80相互作用的藥物。
- 一種增強、刺激及/或增加培養物中細胞之免疫反應之活體外方法,該方法包括對該細胞施用如請求項1之化合物或其醫藥上可接受之鹽。
- 一種阻斷培養物中細胞之PD-L1與PD-1及/或CD80相互作用之活 體外方法,該方法包括對該細胞施用如請求項1之化合物或其醫藥上可接受之鹽。
- 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至5中任一項之化合物或其治療上可接受之鹽及醫藥上可接受之載劑。
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