TW201249863A - Processes for the manufacture of macrocyclic depsipeptides and new intermediates - Google Patents
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Description
201249863 六、發明說明： 【發明所屬之技術領域】 本發明係關於製備巨環縮肽之方法或製程，係關於新穎 中間物及其製備以及相關之發明實施例。 【先前技術】 環縮肽在藥理學方面具有多種用途。作為實例，wo 2009/024527中所揭示之縮肽係用於治療各種疾病。例 如，WO 2009/024527中所提及之式II化合物可用於治療及 預防發炎性及/或過度增生性且瘙癢性皮膚病（例如，異位 性皮膚炎、牛皮蘚、膿皰型牛皮蘚、酒渣鼻、瘢痕瘤、肥 大性瘢痕、痤瘡、内塞頓症候群（Netherton's syndrome)或 其他瘙痏·性皮膚病（例如，結節性癢療、老年人之未指明 瘙癢））以及具有上皮屏障功能障礙之其他疾病（例如，老化 皮膚）。 先前自藍綠細菌念珠藻（cyanobacterium Nostoc)分離之 Nostopeptin BN920 亦自微胞藻屬（Microcystis)分離出。 Nostopeptin BN920抑制IC50值為31 nM之膠凝乳蛋白酶（參 見 J. Nat. Prod. 68(9)，1324-7 (2005))。 該等化合物可藉由發酵（使用番紅粒黴菌（chondromyces crocatus)、黏液細菌）分別與包含所謂的ahp次結構（ahp : 3-胺基-6-經基-六氫°比。定-2-酮）及相應的脫氫ahp次結構（脫 風ahp . 3 -胺基-3,4 -二鼠-1H-0比咬-2-嗣）（本文中亦稱為 「脫水物」）之其他縮肽一起產生。因此，關於該等化合 物中之任何單一化合物之發酵產率相當低。 163698.doc 201249863 本發明係關於允許獲得具有增加之產率及/或呈良好純 度之該等環縮肽之製程或方法。 鑒於在a成具有許多可能異構物之複雜分子中的許多風 險（例如，差向異構、互變異構及諸如此類），已可找到製 備方法，較佳包含固相肽合成與溶解中之反應之混合，此 允許以良好產率及/或所需立體異構物純度（尤其兩者皆有） 產生式I環縮肽。藉由將該等副產物（尤其脫氫ahp次結構 及/或包含ahp之期望產物之類似物（具有五員環而非讣⑴） 轉化成期望最終產物可降低副產物之量且甚至提高產率。 此允許進-步增加產率。目前為止，#内吾人尚未關注利
用固相肽合成之合成。 【發明内容】 (i/a)在第一實施例中，本發明係關於製備式I
尤其式IA之環縮肽化合物之方法或製程， 163698.doc 201249863
° ΙΑ 其中 八,係具有末端羧基或胺甲醯基之胺基酸（尤其天冬醯胺或 麩醯胺酸）之二價部分，且在式〗中係在其右手側（對應於C 末端）處經由羰基（較佳其(X-羧基之羰基）鍵結至分子之其餘 部分；或係C!-8-烷醯基或磷酸化之羥基_(：18_烷醯基； X係經由Α丨之Ν鍵結且係醯基，或者若…係^^·烷醯基或 磷酸化之羥基-C^-烷醢基，則X不存在； R·2係Ci-S-院基，尤其係甲基； R3係胺基酸、尤其白胺酸、異白胺酸或纈胺酸之侧鏈；
Rs係胺基酸、較佳苯丙胺酸、白胺酸、異白胺酸或纈胺酸 之側鏈；
Re係羥基胺基酸、尤其酪胺酸之側鏈； I係胺基酸、較佳胺基酸白胺酸、異白胺酸或纈胺酸之側 鏈；且 Υ係氫或Ci-8-烷基； 或其鹽， 該方法包含 選擇性去保護式II， I63698.doc 201249863
尤其式IIA之化合物， II
Ο 針 R, HA 對式I之化合物所定義且 Y A D 、汉6*及尺7*分別對應於式；ί中之 、A,、R2、R3、R5、RjR7，但限制條件係若該等部分 上之反應性官能團（例如’胺基、亞胺基、經基、緩基、
其中Prot係保護基團，γ係如 X*、Α】*、r2*、r3*、R 疏基、曱脒基'〇底基、0-膦醯基（-0_P(=0)(0H)2)可能參盘 不期望副反應，則該等至少係以經保護形式存在；以產生 式 III， 163698.doc 201249863
OH Ο
(III) 尤其式ΠΙΑ之化合物，
ΙΙΙΑ 其中X*、Al*、R2*、R3*、R5*、R6*及R7*具有剛才所定義 之含義， 使游離羥基在氧化條件下反應以形成式IV，
163698.doc 201249863 尤其IVA之化合物，
並移除其餘保護基團以產生式I之化合物或其鹽， 及若需要，則將式I或尤其IA之游離化合物轉化成鹽，將 式I化合物之鹽轉化成式I或尤其IA之化合物之不同鹽或轉 化成式I或尤其IA之游離化合物，及/或將式I或尤其IA之化 合物之脫水物類似物及/或五員環類似物轉化成式I或尤其 IA之相應化合物。 用於式III或尤其IIIA之化合物之氧化的適宜氧化條件通 常係使用存於DMSO中之IBX (J. Org. Chem. 1995，仰， 7272-7276)；二鉻酸°比D定鏽或氯鉻酸°比咬鑌（Tetrahedron Lett. 1979, 5，399-402);草醯氣、二甲亞砜及三級胺（】. Peptide Sci. 2006，72，140-146)、氧代銨鹽（】.0^.(：116111· 1985，50, 1332-1334);由氧代銨鹽催化之鹼性次氯酸鹽（J Org. Chem. 1989， 5令 2970-2972);氧代胺鑌鹽 (Tetrahedron Lett. 1988, 29, 5671-5672) > RuCl2(PPh3)3 (Tetrahedron Lett. 1981, 22, 1605-1608) ； TEMPO (1 mol%)，在次氣酸納之存在下（Tetrahedron Lett. 1990，>57, 2177-2180) ; NaI04、TEMPO、NaBr (Tetrahedron 2006, 163698.doc 201249863 62，8928-8932) ; Si〇2 支撐之氧化釩（IV)及 t_ BuOOH(Advanced Synthesis & Catalysis 2007, 349, 846-848)。較佳地，利用存於dmSO中或較佳存於惰性溶劑（例 如’四氫吱喃）中之IBX，在DMSO之存在下，在介於〇°c至 50 C之間、較佳介於2〇°C至25〇C之間之溫度下實施該反 應。 (ιι/a)本發明之再一實施例係關於上文所述方法或製 程’其另外包含藉由固相肽合成（尤其用於合成下文所給 之前體XX或尤其XXA用於下文所給之式VIII或尤其VIIIA 之寡肽前體’或合成下文所給之式XXIV或尤其χΧΙνΑ之 寡肽前體用於下文所給之式XXV或尤其XXVA之寡肽前體） 與溶液相合成（尤其自剛才所提及之化合物合成最終產物） 之組合自相應起始胺基酸及側鏈前體製備式IV或尤其lVA 之化合物。 (ni/a)本發明之又一實施例係關於上文所述之方法或製 程’其對於合成上文式Π之化合物進一步包含使式VI， 163698.doc
201249863 尤其VIA之化合物
VIA 其中Prot係保護基團，γ俜如^ 係如針對式I之化合物所定義， R2*、R3*、R5*、R6*及r7*役, 此 7係如針對式II之化合物所定義. 與式VII之酸反應
VII 或與其反應性衍生物反應， 其中X"係胺基保護基團或係x*，且其中χ*及Αι*係 對上文式π之化合物所定義；及，若χ“係胺基保護基 團，則移除該胺基保護基團以產生(尤其ΠΑ)之衍 生物，其中存在Η(氫）而非X*，並使用相應酸χ*_〇Η或其 反應性衍生物使所得胺基與醯基χ*偶合，其中χ*係如針 對式II之化合物所定義。 (iv/a)本發明之另一實施例係關於上文（尤其在前述段 落中）所述方法或製程，其進一步包含在式VI化合物之直 鏈（即’尚未為環狀）前體肽（帶有N•末端胺基及c_末端叛 基）之内醯胺化下進行環化，此係在允許自該胺基及該缓 基形成酿胺鍵之反應條件下、較佳使用溶液相化學進行。 163698.doc 201249863 存於溶液中之内醯胺化通常係以極低濃度之受質進行， 以避免寡聚合及聚合。此需要大量溶劑及極大反應器來進 行反應。例如’在參考文獻Yokokawa等人，Tetrahedr〇n 2005, <57，1459-1480中，寡肽之巨内醯胺化係以2 mM〇1/公 升之濃度實施》此困難可藉由溶解三級鹼及偶合試劑及以 受控方式將募肽溶液添加至此溶液來回避。受控（尤其緩 慢）添加寡肽溶液永久性生成存於溶液中之低濃度經活化 寡肽且從而防止寡聚合及聚合。募肽溶液之添加速率可根 據巨環化之反應速率來調節：若巨環化係快速反應，則可 快速添加寡肽溶液。若巨環化緩慢，則必須緩慢添加溶 液，以確保永久性低濃度之經活化寡肽。因此，受控添加 寡肽使能夠以少得多的溶劑量起作用並仍維持經活化寡肽 之濃度低於1〇·3 mM，例如，在10-4 m]y^1〇-6 mM之範圍 内或甚至更低。將寡肽受控添加至偶合試劑溶液之此變化 形式係本發明之實施例。 (V/a)在又一實施例中，本發明係關於上文（尤其在前述 &落中）所述方法或製程，其巾直鍵（若使用，此術語意為 尚未為環狀）前體肽具有式VIII， 163698.doc -12· 201249863 尤其VIIIA，
VIII，
其中Prot*係可選擇性裂解 VIIIA 之仵蠖某困且’>a所存在的其他保護基擅 乙俅邊丞團且在直鏈前體肽人 土搜 ^ s ^ 〇成』間之去保護步驟期間韻 疋（例如’稀丙氧基幾基），且V、R3*、r5*、R6* 如針對上文所述之式VI化合物所定義；其進-步包含在, VIII、尤其VI„A之化合物 勿環化後，原位移除保護基團
Prot*以產生式¥1、尤其VIA之化合物。 (vi/a)在另一實施例中，本發明係關於上文（尤其在前 述段落中）所述方法或製程，其中式VIII、尤其νΙΠΑ之直 鍵前體肽係藉由固相肽合成及隨後自所採用固體載體裂解 163698.doc 13 201249863 自相應胺基酸合成β (vii/a)本發明之實施例進一步係關於上文所述（尤其在 前述段落（vi/a)中）方法或製程’其進一步包含 在變化形式a)中，使式IX，
IX 尤其式IXA之胺基酸，
其中R/係如針對上文式II之化合物所定義，且Pr〇t**係在 樹月曰上可移除而不裂解其他鍵之胺基保護基團；或該胺基 酸之反應性衍生物經由氧偶合至可裂解連接體L，該可裂 解連接體L鍵結至固體樹脂res(例如，藉由與式（x_L)z_ RES之樹脂反應，其中L及RES係如剛才所定義，χ係（例 如）函基，例如氣，且z係大於〇之數值，例如，自然數）； 並移除保護基團prot** ; 使由式X，
163698.doc 201249863 尤其XA表示的可獲得之樹脂鍵結胺基酸，
XA 其中RES及R3*係如針對式IX之化合物所定義，η係大於0 之（例如，自然數）數值，且L係可裂解連接體；與式XI，
XI 尤其ΧΙΑ之胺基酸偶合，
ΧΙΑ 其中Prot*自如針對上文式VIII之化合物所定義，且R2*係 如針對上文式II之化合物所定義；或與該胺基酸之反應性 衍生物偶合，使由式XII， 163698.doc 15 201249863
尤其XIIA表示的可獲得之樹脂鍵結二肽，
ΧΙΙΑ 其中Prot*係如針對上文式VIII之化合物所定義，R2*及R3* 係如針對上文式II之化合物所定義，且η、L及RES係如針 對式X之化合物所定義；經由游離羥基與式XIII， H0
NH-Prot**
XIII 尤其ΧΠΙΑ之胺基酸偶合， NH-Prot**
XIIIA 其中Prot* *係如針對式IX之化合物所定義，且R7*係如針 163698.doc •16- 201249863 對上文式II之化合物所定義；或與該胺基酸之反應性衍生 物偶合，並移除保護基團Prot** ; 或者，在變化形式b)中，使式XXVII，
XXVII 尤其式XXVIIA之二肽，
NHProt**
XXVIIA 其中R2*及Prot**係如針對式IX、尤其IXA之化合物所闡 述，且Prot*係如針對上文式VIII之化合物所定義；或該二 肽之反應性衍生物偶合至胺基醯基部分，該胺基醯基部分 係經由氧鍵結至可裂解連接體L，該可裂解連接體L鍵結至 固體樹脂RES，從而具有如在變化形式a)下所述可獲得之 式X，
尤其XA， 163698.doc -17-
X 201249863
其中咖及H 一式ιχ之化合物所 係如剛才所定義； Χλ 定義 並移除保護基團pr〇t** ; 及’在變化形式a)或變化形式b)之反應後， (viii/a)使可獲得之式XIV，
RES 〇 η
XIV 尤其XIVA之化合物， 163698.doc •18· 201249863
XIVA 其中R2*、R3*及R7*係如針對上文式II之化合物所定義， Prot*係如針對上文式VIII之化合物所定義，且η、L及RES 係如針對式X之化合物所定義；與式XV，
fV
XV 尤其式XVA之胺基酸偶合， Ο Prot** H〇V-
XVA 其中R6*及Y係如針對上文式II之化合物所定義，且Prot** 係如針對上文式IX之化合物所定義；或與該胺基酸之反應 性衍生物偶合，並移除保護基團Prot* * ; (ix/a)較佳使可獲得之式XVI， 163698.doc -19- 201249863
尤其式XVIA之化合物，
XVIA 其中Υ、R2*、R3*、R7*及R6*係如針對上文式II之化合物 所定義，Prot*係如針對上文式VIII之化合物所定義’且 η、L及RES係如針對式X之化合物所定義；與式XVII，
Prot**-NH
HO 尤其式XVIIA之胺基酸偶合， 163698.doc -20-
XVII 201249863
XVIIA 其中R5*係如針對上文式II之化合物所定義，且Prot**係如 針對式IX之化合物所定義；或與該胺基酸之反應性衍生物 偶合，並移除保護基團Prot**， 且較佳地， (x/a)最後使所得之式XVIII，
XVIII 尤其XVIIIA之化合物，
XVIIIA 其中Y、R2*、R3*、R7*、R6*及R5*係如針對上文式II之化 163698.doc -21 - 201249863 合物所定義，Prot*係如針對上文式VIII之化合物所定義， 且η、L及RES係如針對上文式X之化合物所定義；偶合至 式 XIX，
° XIX 尤其式XIXA之非天然胺基酸（=合成組元（synthon))，
XIXA 其中Prot係如針對上文式II之化合物所定義，且Prot**係如 針對式IX之化合物所定義；或偶合至該合成組元之經活化 衍生物，並移除保護基團Prot**以產生式XX，
XX 尤其XXA之化合物， 163698.doc -22 201249863
XXA 其中Prot、Y、R2*、R3*、R7*、係如針對上文式 II之化合物所定義，Prot*係如針對上文式VIII之化合物所 定義，且η、L及RES係如針對式X之化合物所定義， 及 (xi/a)使式XX中之固相鍵結肽自固相l_reS裂解，以產 生上文所顯示之式VIII、尤其VIIIAi相應化合物。 本發明之另一實施例係關於根據部分（i/a)合成上文所給 之式II化合物，較佳之前係根據部分（ii/a)或更佳根據部分 (iii/a)之反應；較佳之前係根據部分（iv/a)或較佳之反 應，較佳之前係根據部分（vi/a)之反應，較佳之前係根據 部分（x/a)之反應’較佳之前係根據部分（ix/a)之反應，較 佳之刖係根據部分（viii/a)之反應，較佳之前係根據部分 (vii/a)之反應。 (i/b)本發明之另一實施例係關於上文方法或製程，其 對於合成上文所給之式Π化合物包含在式II化合物之直鏈 (尚未為環狀）前體肽（帶有末端胺基及C-末端羧基）之内 酿胺化下進行環化’此係在允許自該胺基及該羧基形成醢 163698.doc •23· 201249863 胺鍵之反應條件下、較佳使用溶液相化學進行。 (ii/b)本發明之另一實施例係關於根據前述段落（i/b)之 方法或製程’其中直鏈前體肽具有式XXV，
XXV
XXVA 其中 X*、A】*、R2*、R3*、R5*、R6*、R7* 及 Prot係如斜對 上文式II之化合物所定義。 (iii/b)另一實施例係關於根據前述段落（ii/b)之方法或 製程，其對於合成式XXV之化合物進一步包含裂解式 XXIV， 163698.doc •24· 201249863 ο
RES
XXIV 尤其XXIVA之化合物，
XXIVA 其中 X*、A，、R2*、R3*、R5*、R6*、R7* 及 Prot係如針對 上文式II之化合物所定義，L係可裂解連接體，RES係固體 樹脂，η係自然數，且Prot**係可移除而不會並行移除保護 基團Prot且產物保留在樹脂上之胺基保護基團；並（在裂解 之前、與其並行或在其之後）移除保護基團Prot**以產生式 XXV之化合物。 (iv/b)本發明之另一實施例係關於根據前述段落（iii/b) 之方法或製程，其對於合成式XXIV之化合物進一步包含 163698.doc -25- XIX， 201249863 使式XIX，
Pr〇t'NH HO
OProt 尤其XIXA之胺基酸，
XIXA 其中Prot係如針對上文式II之化合物所定義，且Prot**係如 針對上文式XXIV之化合物所定義；或該胺基酸之經活化 衍生物與式XXIII， ,Α
RES (XXIII) 尤其XXIIIA之化合物偶合， 163698.doc -26- 201249863
XXIIIA 其中X*、A,、R2*、r3*、R5*、R6*及R7*係如針對上文式 11之化合物所定義，L係可裂解連接體，RES係固體樹脂， 且η係自然數。 (Wb)本發明之再一實施例係關於根據前述段落（iv/b)之 方法或製程’其對於合成式XXIII2化合物進一步包含使 式 XVII*、
XVII*， 尤其XVIIA*之胺基酸，
XVIIA* 其中R5*係如針對上文式II之化合物所定義，且Prot***係 可選擇性裂解而不影響所存在之其他保護基團且產物保留 在樹脂上之胺基保護基團；或該胺基酸之反應性衍生物與 式 XXII， 163698.doc •27· 201249863
XXII 尤其XXIIA之化合物偶合，
XXIIA 其中X*、A丨*、R2*、R3*、R6*&r7*係如針對上文式 化合物所定義，L係可裂解連接體，RES係固體樹脂，且η 係自然數；並移除保護基團prot***。 (v!/b)在又一實施例中，本發明係關於根據前述段落 (v/b)之方法或製程，其對於合成式χχπ之化合物進一步包 含使式XV*， I63698.doc ，28· XV* 201249863
〇 HO
Prot*** I 、Ί 尤其XVA*之胺基酸， O Prot*** H〇Vv R6* XVA* 其中R6*及Y係如針對上文式II之化合物所定義，且Prot*** 係可選擇性裂解而不影響所存在之其他保護基團且產物保 留在樹脂上之胺基保護基團；或該胺基酸之反應性衍生物 與式XXI，
RES η
XXI 尤其ΧΧΙΑ之化合物偶合， 163698.doc -29 201249863
XXIA 其中X*、Αι*、R2*、尺3*及尺7*係如針對上文式II之化合物 所定義，L係可裂解連接體，RES係固體樹脂，且η係自然 數，並移除保護基團Prot***。 (vii/b)本發明之另一實施例係關於根據前述段落（vi/b) 之方法或製程’其對於合成式XXI之化合物進一步包含使 式 XIII*， NH-Prot*** XIII* 尤其XIIIA*之胺基酸， ?7* H〇
NH-Prot*** XIIIA* 其中Prot***係可選擇性裂解而不影響所存在之其他保護基 團且產物保留在樹脂上之胺基保護基團’且r/係如針斜 上文式II之化合物所定義；或該胺基酸之反應性衍生物， 與式XXVI， 163698.doc -30- 201249863
I- -In
XXVI 尤其XXVIA之化合物之羥基反應，
XXVIA 其中X*、A，、R2*及R3*係如針對上文式II之化合物所定 義，L係可裂解連接體，RES係固體樹脂，且η係自然數； 並移除保護基團Prot* * *。 (viii/b)在再一實施例中，本發明係關於根據前述段落 (vii/b)之方法或製程，其對於合成式XXVI、尤其XXVIA之 化合物進一步包含使由式XII*， 163698.doc •31 - 201249863
XII* 尤其XIIA*表示的樹脂鍵結二肽，
XIIA* 其中Prot****係可選擇性裂解而不影響如上文所定義式II 化a物中所存在之其他保護基團且產物保留在樹脂上之保 4基團，R_2*及R,係如針對上文之化合物所定義，L 係可裂解連接體，RES係固體樹脂，且n係自然數；在移 除保護基團Prot****之後經由由此可獲得之游離胺基與式 VII之酸偶合， χ**ζΑ’、οη νπ 其中X * *係胺基保遠基團或係X *，且其中χ *及A! *係如針 對上文式II之化合物所定義；或與該酸之反應性衍生物偶 合； 及，若X* *係胺基保護基團，則移除該胺基保護基團X* * 163698.doc • 32- 201249863 以產生式II之衍生物，其中存在Η而非χ*，並使用相應酸 Χ*-ΟΗ或該酸之反應性衍生物使所得胺基與醯基X*偶合， 其中X*係如針對上文式Π之化合物所定義。 (ix/b)本發明之又一實施例係關於根據前述段落（viii/b) 之方法或製程，其對於合成式XII之化合物進一步包含使 由式X，
尤其ΧΑ表示之樹脂鍵結胺基酸，
其中R，係如針對上文式II之化合物所定義，L係可裂解連 接體，RES係固體樹脂，且n係自然數； 與式XI*，
尤其ΧΙΑ*之胺基酸偶合， 163698.doc •33· 201249863
其中Prot****係可選擇性裂解而不影響所存在之其他保護 基團且產物保留在樹脂上之保護基團，且r2*係如針對上 文式II之化合物所定義；或與該胺基酸之反應性衍生物偶 合0 (x/b)本發明之另一實施例係關於根據前述段落（ix/b)之 方法或製程’其對於獲得式X之樹脂鍵結胺基酸進一步包 含使式IX*，
IX* 尤其IXA*之胺基酸，
IXA* 其中R·3*係如上述中針對式II之化合物所定義，且prot*** 係可選擇性裂解而不影響所存在之其他保護基團且產物保 留在樹脂上之胺基保護基團；或式IX*之該胺基酸之反應 性衍生物偶合至鍵結至固體樹脂RES之可裂解連接體L， 並移除保護基團Pr〇t* * *。 (i/c)本發明之另一實施例係關於根據前述段落（i/a)至 (x/b)中任一段落之方法或製程，其中符號A,、R2、R3、 R5、R6、R7、X及γ或相應的未經保護或經保護部分 163698.doc -34· 201249863 R2 、R3%、R5*、R6*、汉7*、X*及Y3經選擇，以使得在式I 之所得化合物或其鹽中，
Ai#L-越酿胺酸之二價基團，其經由其α_羧基之羰基鍵結 至式1中Al右側之胺基且經由其α-胺基鍵結至X，或係2S-(2-羥基-3-膦醯氧基丙醯基； R2係甲基； R·3係異丙基、異丁基（任何地方使用時，2_曱基-正·丙基） 或苄基’尤其係異丁基；
Rs係第二丁基或苄基，尤其係第二·丁基； R·6係4-羥基苄基； I係異丙基或第二-丁基（任何地方使用時，卜甲基正丙 基），尤其係第二-丁基； X係乙醯基或異丁醢基，或者若、係23_(2_羥基_3_膦醯氧 基）-丙醯基，則X不存在， 且 Y係曱基。此段落在下文中亦稱為段落a)。 (ι/d)在另一特定實施例中，本發明係關於將上文所給 或特定而言具有前述段落（i/c)中所定義取代基之式j化合物 之脫水物轉化成式I之相應化合物的方法或製程，其中兮 脫水物具有式V， 163698.doc -35- 201249863 Ο
尤其VA，
其中Υ、X、A,、R2、R3、r5、r6及尺7係如針對上文式I之 化合物所定義； 或尤其使式I化合物及其相應脫水物及/或其具有五員環而 非式I中ahp結構之相應半胺縮醛類似物之混合物之平衡移 位的方法或製程，該相應半胺縮醛類似物亦作為副產物形 成且具有式V*，
HO
尤其式VA*， 163698.doc -36- 201249863
其中Υ、X、Al、R2 ' R3、R5、以且R7係分別如針對上文 式I之化合物所定義； 以有利於式I之化合物， 該方法或製程包含使用水性酸作為反應性溶劑來驅動反 應。該方法可獨立使用（例如，亦針對發酵或生物合成之 產物），或除上下文所述之其他製程或方法以外另外使 用’以增加產率或以將式V '尤其VA之化合物及/或具有 五員環而非式I中ahp結構之類似物再轉化成式][之相應化合 物。 所闡述用於將脫水物及/或五員環類似物（總與期望ahp環 有關）轉化成式I或尤其IA之期望化合物（例如，將來自實例 3B之化合物a脫水物轉化成化合物A)之方法使能夠直接合 成此類化合物《至目前為止，必須避開作為最後步驟之酸 處理’以避免產物脫水。 (i/e)本發明之另一實施例係關於根據前述段落（i/d)之 方法’其中該酸係羧酸’尤其係鹵基取代之Cw烷酸，更 尤其係三氟乙酸或三氯乙酸。 (i/f)在又一實施例中，本發明係關於式Π之化合物， 163698.doc -37· 201249863 .OProt
其中Prot係保蠖基團，Y係如上文第一實例中針對式I之化 合物或特定而言如或上文所給段落（i/c)所定義，且X*、 A/、R2*、R3*、r5*、r6*及r7*分別對應於上述中所定義 或上文所給段落（i/a)中式I中之X、A丨、R2、R3、R5、R6及 R7，然而限制條件係該等部分上之反應性官能團係以經保 護形式存在。 (i/g)在再一實施例中，本發明係關於選自由式II、 III、IV、V、VI、VIII、X、XII、XIV、XVI、XVIII、 XIX、XX、XXI、XXII、XXIII、XXIV、XXV、XXVI 及 XXVIII、且尤其式 IIA、IIIA、IVA、VA、VIA、VIIIA、 XA、XIIA、XIVA、XVIA、XVIIIA、XIXA、XXA、 XXIA、XXIIA、XXIIIA、XXIVA、XXVA、XXVIA 及 XXVIIIA之化合物組成之群之新穎化合物，更尤其關於由 各實例中所給之以下化合物組成之群：來自方案1 :化合 物2、化合物3、化合物4、合成組元1 ;來自方案2 :化合 物5 ;根據實例1B(2)之Fmoc-Leu-連接體-樹脂；根據實例 1B(3)之Fmoc-Thr-Leu-連接體-樹脂；根據實例1B(4)之 163698.doc • 38 · 201249863
Fmoc-Gln(Trt)-Thr-Leu-連接體-樹脂；根據實例16(5)之異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr-Leu-連接體-樹脂；根據實例16(6)之 異 丁醯基-GIn(Trt)-Thr(Ile-Fmoc)-Leu-連接體_樹脂；實例 1B(7)之產物=異 丁醢基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Fmoc)_ Leu-連接體-樹脂（先前稱為：異丁醯基_Gln(Trt)-Thr(Ile-N-me-Tyr(tBu)-Fmoc)-Leu-連接體-樹脂）；根據實例iB(8)之 異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-Fmoc)-Leu-連接 體-樹脂（先前稱為：異丁醢基-Gln(Trt)-Thr(Ile-N-me-Tyr(tBu)-Ile-Fmoc)-Leu-連接體-樹脂）；根據實例 ιΒ(9)之 異 丁醢基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-合成組元 1-H)-Leu-連接體-樹脂（先前稱為：異丁醯基·〇1η(ΤΓ〇-Τ1ΐΓ(Ι1ε-Ν-Me-Tyr(tBu)-Ile-合成組元1-H)-Leu-連接體-樹脂）；根據實 例 1B(10)及方案 3之異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-合成組元l-H)-Leu-OH(先前稱為：異丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-N-Me-Tyr(tBu)-Ile-合成組元 l-H)-Leu-OH);根據 實例1B(12)之Η-Thr-Leu-樹脂；根據實例1B(13)之H-Gln(Trt)-Thr_Leu·樹脂；根據實例1B(14)之異丁醯基-Gln(Trt)-Thr-Leu-樹月旨；根據實例1B(15)之異丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-H)-Leu-樹脂；根據實例 1B(16)之異丁醯 基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-H)-Leu_樹脂；根據實例 1B(17)之異 丁醯基 _Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-H)-Leu-樹脂；根據實例ib(18)之異丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-合成組元1-H)-Leu-樹脂；來自方案3、化 合物6及/或7 (後者較佳）；來自方案4 :化合物8及5員環半 I63698.doc •39· 201249863 胺縮醛異構物；來自方案5:前體肽2、化合物9、化合物 10 (此者在關於方案5之當前列舉中為較佳）及/或化合物 11 ;來自實例2A(1)之 Fmoc-Thr-Leu-Trt-Tentagel-S ;根據 實例 2A(2)之 Fmoc-Gln(Trt)-Thr-Leu-Trt-Tentagel-S ;根據 實例 2A(3)之 Ac-Gln(Trt)-Thr-Leu-Trt-Tentagel-S ;根據實 例 2A(4)之 Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S ; 根據實例 2A(5)之 Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu)Me-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S (先前稱為：Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-N_Me-Tyr(tBu)-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S);根據實例 2A(6)之 Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu)Me-Phe-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S(先前稱為：Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-N-Me-Tyr(tBu)-Phe-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S);及根據實例 2A(7)之 Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu)Me-Phe-合成乡且元 l-H)-Leu-OH(先前稱 為：Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-N-Me-Tyr(tBu)-Phe-合成組元 1-H)-Leu-OH)(前體肽2)。 【實施方式】 以下定義（或亦上文已包括之定義）可代替上下文本發明 實施例中所用之更一般術語，以定義本發明之其他實施 例，其中一個、兩個或更多個或所有一般術語可由更具體 術語來代替，以定義以下該等本發明實施例： 具有末端羧基或胺甲醯基之胺基酸之二價部分較佳係α-胺甲醯基或羧基-Cw取代之胺基酸，尤其係天冬醯胺或麩 醯胺酸之二價部分，且在式I中係在其右手側處經由羰基 (較佳其α·羧基之羰基）鍵結至分子之其餘部分。 163698.doc • 40· 201249863
Ci-8_烧酿基或構酸化之經基-Ci_g-烧酿基（c〗_8_院醯基帶 有經基以及膦酿基（-0-P(=0)(0H)2)) ’ A丨係例如2,3-二經 基-丙醯基（較佳呈S型）或2-羥基-3-膦醯基-丙醯基（較佳呈8 型）。 R·2及R2*係Ci·8·烧基、尤其曱基，在任何地方提及時。 R3係胺基酸、尤其天然胺基酸之側鏈。較佳地，其係可 為具支鏈或直鏈之C,·8烷基。最尤其地，C!_8烷基係正_(2· 曱基）丙基（異丁基）、正-(1-曱基）丙基（第二-丁基）或甲基， 即，帶有該部分之胺基酸係白胺酸、異白胺酸或纈胺酸。 若存在必須阻止其參與反應之官能團，則R3*係呈經保 護形式之相應側鏈。較佳地，其係可為具支鏈或直鏈之 C!·8烷基’尤其如前述段落中所定義。 月女基酸之側鍵」可選自任何部分，例如，單環咬多 環、直鏈、飽和、不飽和（例如，具有共軛雙鍵）或部分飽 和的有機部分，例如’在基礎結構中具有最多2〇個碳原子 及0個至5個獨立選自N、〇及S且代替相應數量之碳原子之 雜原子’且可經最多三個選自胺基、亞胺基、羥基、緩 基、胺曱醯基、酼基、甲脒基、哌基、〇_膦醯基（_〇_ P(=0)(0H)2)之部分取代。較佳地，側鏈係選自2〇種標準& 胺基酸：精胺酸、组胺酸、離胺酸、天冬胺酸、麩胺酸、 絲胺酸、蘇胺酸、天冬醯胺、麵醯胺酸、半胱胺酸、甘胺 酸、丙胺酸、白胺酸、異白胺酸、甲硫胺酸、笨丙胺酸、 色胺酸、酪胺酸、纈胺酸，及另外脯胺酸（具有包括心胺 基之内部環化）者。 163698.doc •41 - 201249863 對於胺基酸，在本發明中依照下表使用其名稱或常規的 三個字母代碼： 胺基酸 三個字母代碼 丙胺酸 Ala 精胺酸 Arg 天冬醯胺 Asn 天冬胺酸 Asp 天冬醯胺或天冬胺酸 Asx 半胱胺酸 Cys 麩胺酸 Glu 麩醯胺酸 Gin 麩酿胺酸或麩胺酸 Glx 甘胺酸 Gly 組胺酸 His 異白胺酸 lie 白胺酸 Leu 離胺酸 Lys 曱硫胺酸 Met 苯丙胺酸 Phe 脯胺酸 Pro 絲胺酸 Ser 蘇胺酸 Thr 色胺酸 Try 酪胺酸 Tyr 纈胺酸 Val r5係胺基酸、較佳標準胺基酸之側鏈。較佳地，其係可 為具支鏈或直鏈且未經取代或經苯基取代之cN8烷基。最 尤其地，其係苄基、正-(2-甲基）丙基、異丁基或曱基， 即，帶有該部分之胺基酸係苯丙胺酸、白胺酸、異白胺酸 或纈胺酸。 Κ·6係羥基胺基酸、尤其酪胺酸之側鏈。 -42- 163698.doc 201249863 R7係胺基酸、尤其天然胺基酸之側鏈。較佳地，其係可 為具支鏈或直鏈之成基。最尤其地，其係正_(2_甲基） 丙基（異丁基）、正_(1砰基）丙基（第二_丁基）或甲基，即， 帶有該部分之胺基酸係白胺酸、異白胺酸或顯胺酸。 C〗-8_烷基可係直鏈或經一或多次支化；例如，其可係 正-(2-曱基）丙基、正_(1_甲基）丙基或甲基。 若存在諸如驗性基團（例如，胺基或亞胺幻或酸性基團 (例如，羧基或酚羥基)等鹽形成基團，則以游離形式或以 ^或以鹽與游離形式之混合物來使用所有化合物。因此， 若提及化合物，則此包括所有該等變化形式。例如，鹼性 基團可與諸如氫㈣（例如，Ηα、硫酸）或有機酸（例如乙 酸）等酸形成鹽，而酸性基團可與陽離子（例如，銨、烷基 銨、鹼金屬或鹼土金屬鹽陽離子（例如，ca、Mg、Na、κ 或Li陽離子）或諸如此類）形成鹽。 在本發明中任何地方使用時，「或諸如此類」或「及諸 如此類」係指以下事實：彼等在該表達之前所提及者之其 他替代選擇為熟習此項技術者所已知且可添加至彼等所具 體提及之表達；在其他實施例中，「或諸如此類」及」及 諸如此類」可在一或多個或所有本發明實施例中刪除。 若在本說明書及申請專利範圍通篇中提及，則在部分 A 、R/、、r5*、R6*、R?*、χ*上所存在之保護基團 Prot、Prot*、Pr〇t**、Pr〇t***、pr〇t****及任何其他保護 基團經選擇，以使得其允許正交保護。 正交保護係一種如下策略：允許使多個保護基團中之一 163698.doc •43- 201249863 者（或多者但非全部）在期望時且各自利用—組專用反應條 牛去保4而不會影響其他保護基團或經由(例如)固體合 成樹月曰上之連接體至樹脂之鍵1言之··該策略使用藉由 不同化學機制移除之不同類型保護基團，而且在固相肽合 成之情形中使㈣當連接體（其中連接體·樹脂鍵可一起視 為羧基保護基團）。 較佳地，保護基團係如下來選擇： 保護基團Prot較佳經選擇以抵抗在本發明之縮肽合成期 間所用或存在之任何其他保護基團之移除，例如，能夠抵 抗弱鹼（參見Prot*)，但可利用氟離子移除（尤其在無水條 件下），例如，BwN+F-(而且若原位產生，則例如使用
Bu4N+Cr與 KF.H20)、KF與 18-冠-6、LiBr與 18_冠 _6、BF3· 一乙基謎、。比咬-HF、存於尿素中之hf、Et3N(HF)3 (其中 Et係乙基）或諸如此類，其中溶劑係（例如）選自由N，N•二甲 基甲酿胺、乙腈、氯仿及四氫β夫B南組成之群。 較佳地，Prot係醚保護基團，尤其選自由曱矽烷基保護 基團組成之群，其中甲矽烷基部分帶有最多三個經由碳 (視情況經由另一 Si原子）鍵結之有機部分，例如第三丁基 二苯基矽烷基 '三苯基矽烷基、三異丙基矽烷基、第三丁 基二甲基矽烧基、三苯基石夕烧基、二苯基甲基石夕院基、二 第三丁基二甲基矽烷基、第三丁基甲氧基苯基矽烷基、畚 (三苯基矽烷基）矽烷基或諸如此類。
Prot*係可選擇性裂解而不影響所存在之其他保護基團 且亦不影響縮肽形成酯鍵或至樹脂RES之連接體之保護基 163698.doc -44 - 201249863 團且在直鏈前體肽之合成期間之去保護步驟期間（例 士移除烯丙氧基羰基）穩定；其較佳係可藉由具體三苯 基膦錯合物在金屬氫化物或其他還原劑之存在下（例如， (PH3P)4Pd較佳二_正·丁基氫化錫或三-正·丁基氣化錫、苯 基石夕烧、硼氫化納或雙甲酮與組合）在適當溶劑（例如，四 氫夫喃）中移除之保護基團’且較佳在允許移除保護基團 Pr〇t“之條件下不可裂解；例如，且Prot*係選自*c3_c8 烷-2_烯基氧基羰基部分組成之群，例如，烯丙氧基羰基 (Alloc)、1-異丙基烯丙氧基羰基、4_硝基桂皮基氧基羰基 及3-(3’-吡啶基）丙_2_烯基氧基羰基。
Prot**係在樹脂上可移除而不會裂解其他鍵之保護基團 (不會裂解經由其（尤其）α_羧基之羰基鍵結至經由下文所提 及連接體L之鍵結之胺基酸或肽）；在存在保護基團以“時 亦不會使其裂解，尤其係可在不同於彼等用於保護基團 Prot*及Prot者之條件下移除，而不裂解縮肽或縮肽前體中 酉曰（而非醯胺）鍵，同時保留經由連接體至樹脂RES(若存在） 之鍵結的保護基團；其較佳可藉由弱鹼（例如，六氫吡 啶、嗎啉、二環己基胺、對-二甲基胺基_吡啶、二異丙基 胺、六氫《比嗪、叁_(2·胺基乙基）胺）在適當溶劑（例如， N’N_ 一曱基甲醯胺、二氣甲烷）中移除；Prot**係（例如）選 自由苐-9-基曱氧基羰基（Fm〇c)、2_(2ι或吡啶基）乙氧基 幾基及2,2·雙（4,硝基苯基）乙氧基羰基組成之群。
Prot***(可選擇性裂解而不影響所存在之其他保護基團 且產物保留在樹脂上之胺基保護基團）及pr〇t****(可選擇 163698.doc • 45· 201249863 性裂解而不影響上下文所定義式π化合物中所存在之其他 保護基團且產物保留在樹脂上之保護基團）較佳係可如 Prot**移除之保護基團，且係例如選自Pr〇t***所提及者， 例如薙-9-基曱氧基羰基（Fmoc)。 在此情形中’較佳正交合成方法利用Fmoc方法，該 Fmoc方法已知通常用於使用固相肽合成與溶液相巨内醯胺 化及此外化學轉化之組合進行肽合成。 或者’例如’可使用Boc保護基團代替Fmoc Pr〇t**、 Prot***及 Prot****。 然而，此將需要不同側鏈保護基團，且然後^甲基_Tyr 之羥基將亦必須以不同方式進行保護以維持保護基團之正 交性。 所存在之其他保護基團以及至樹脂RES(若存在）之鍵結 連接體在可移除Prot*及pr0t"之條件下較佳不可移除，例 如，在A*中，可利用（例如）三苯甲基（trM、 對醯胺進行N-保護（利用（例如）三氟乙酸（TFA)裂解）；在 中，酪胺酸羥基可以第三-丁基醚形式來保護，或藉由 第二-丁基二甲基甲矽烷基、甲氧基甲基、B〇c(第三·丁氧 基羰基）或乙酸芳酯（利用TFA裂解）來保護。 適當保護基團以及其引入及移除之方法為業内所已知。 例如’保護基團、其引人及移除方法可係選自彼等在諸如 「Protective Groups in 〇rganic Synthesis」，第三版，T w
Green及RG_M. Wuts (編輯）e j. Wiley & s〇ns有限公司， New York ’ 1999等標準教科書令所闞述者。 163698.doc -46 - 201249863 因此保護基團 Prot、prot*、pr〇t**、pr()t***、p^t**** 及其他保護基團並不限於彼等上文所提及者_而是其應滿 足使其適於正交保護之條件，例如，如上文或下文所述。 建4避免過於鹼性而不能避免縮肽（酯）鍵裂解之條件（儘 管針對Fmoc裂解所闡述之鹼（例如，六氫吡啶）通常係允許 的）。 在用於固相肽合成（SPPS)之可能固體載體中，尤其可提 及以下載體： -不具或具有間隔物之凝膠型載體：該等係高度溶劑化且 具有均衡分佈之官能團之聚合物。此類型之載體最為普 遍，且包括： 聚苯乙烯：與（例如）1%至2%二乙稀基苯交聯之苯乙稀； 聚丙烯醯胺或聚曱基丙烯醯胺：作為聚苯乙烯之親水替代 物’聚乙一醇(PEG) : PEG-聚苯乙烯(PEG_PS)較聚苯乙烯 更穩定且將合成位點與聚合物主鏈間隔開；基於pEG之載 體：由PEG-聚丙二醇網絡或pEG與聚醯胺或聚苯乙稀（該 等已包括間隔物（PEG))組成； -表面型載體：針對表面官能化所研發之物質，包括受控 孔徑玻璃、纖維素纖維及高度交聯之聚苯乙烯。 _複合物：由剛性基質支撐之凝膠型聚合物。 通常°玄等凝膠載有可鍵結針對上下文各種前體所提及之 連接體L之反應性基團。例如，豸等基團包括胺基甲基、 具有末端經基之聚乙二醇基團及諸如此類。 在本發明之實施例中可使用任何該載體。 163698.doc -47- 201249863 在本發明之另一具體實施例中使用凝膠型載體，在該等 載體中，聚苯乙烯（經二乙烯基苯交聯）、聚丙烯醯胺及聚 甲基丙烯醯胺樹脂尤佳。 在可能連接體中，尤其可使用所有普遍已知且適當者。 本發明之可能實施例中之實例係2·甲氧基_4_节基氧基苄 基醇連接體（Sasrin·連接體，Sasrin代表超強酸敏感樹脂， 經由醇式OH鍵結胺基酸或肽三苯甲基連接體家族（例 如，三苯曱基、2C1-三苯甲基，其經由〇H鍵結胺基酸或 狀）；4-(2,4-二甲氧基苯基羥甲基）苯氧基甲基-連接體 (Rink-Acid-連接體，經由0H鍵結胺基酸或肽）；或叁（烧氧 基）节基酯連接體（HAL-連接體，經由〇H鍵結胺基酸或 狀）。 若k及酸、尤其胺基酸或肽（例如二肽）之反應性衍生 物’則其可原位形成或可原樣使用。 原樣使用之反應性（或活性）衍生物包括醯基鹵化物，例 如，醯基-氣化物、-氟化物或-硝基苯基酯（例如2,4_二硝基 苯基酯）’·或欲反應之酸之羧基之酸酐（對稱或（例如）與乙 酸形成）。 對於原位胺基酸活化’可施加常規偶合劑。該等試劑為 熟習此項技術者所已知且可方便地自許多來源獲得，例
如 ’ Aldrich ChemFiles-Peptide Synthesis (Aldrich Chemical 有限公司 ’ Sigma-Aldrich Corporation, Milwaukee, WI， USA)第 7 卷第 2 期，2007(參見 http://www.sigmaaldrich.com/ etc/medialib/docs/Aldrich/Brochure/al_chemfile_v7_n2.Par.O 163698.doc -48- 201249863 001.File.tmp/al_chemfile_v7_n2.pdf)。在用於醯胺及酯鍵合 成之可能偶合劑中’尤其可提及以下偶合劑： 三。坐、脲鏽或六氟鱗鹽衍生物，例如，丨·羥基-笨并三 。坐（HOBt)、1-羥基_7_氮雜-苯并三唑（HOAt)、2-氰基_2-(經 基亞胺基）乙酸乙酯、六氟磷酸2_(1H_7-氮雜苯并三唑 基）-1，1，3,3-四甲基脲鑌曱銨鹽（11八丁11)、六氟磷酸笨并三 "坐-1-基-氧基三吡咯啶基鱗（PyB〇p)、六氟磷酸苯并三唑· 1-基-氧基-叁-(二甲基胺基）_鱗（8〇1>)、1_(三曱苯_2·磺醯 基）-3-硝基-1，2,4-三唑（MSNT)、六氟磷酸2_(1H-苯并三唑· 1-基）-1，1，3,3-四曱基脲鏽(；1^1'1；)、六氟硼酸2-(111-苯并三 »坐-1-基）-1，1，3,3-四曱基脲鏽（TBTU)、四氟硼酸2-琥珀醯 亞胺基-1，1，3,3-四曱基脲鑌（TSTU)、四氟硼酸2-(5-降冰片 烯-2,3-二曱醯亞胺基）_1，1,3,3_四甲基脲鏽（7^1'11)、四氟 蝴酸〇-[(氰基（乙氧基羰基）-次曱基）胺基]-1，1,3,3-四甲基脲 鏽（TOTU)、六氟磷酸〇-(苯并三吐基）13-二甲基 二亞曱基脲鑌（HBMDU)、六氟磷酸〇-(苯并三唑-1-基）-1，1，3,3-雙（四亞曱基）脲鏽（HBPyU)、六氟磷酸0-(苯并三 峻-1-基）-1，1，3,3-雙（五亞甲基）脲鑌（HBPipU)、3-羥基-4-側 氧基-3,4-二氫-l，2,3-苯并三嗪（HODhbt)、1-羥基-7-氮雜苯 并三唑及其相應脲鏽或鱗鹽（所指定之HAPyU及A0P)、六 氟磷酸1-氰基-2-乙氧基-2-側氧基亞乙基胺基氧基-二曱基 胺基·嗎啉基-碳鏽（C0MU)、六氟磷酸氯三吡咯啶基鐫 (PyCloP)或諸如此類； 碳二亞胺’例如，二環己基碳二亞胺、N-(3-二曱基胺 163698.doc •49- 201249863 基丙基）-N’-乙基碳二亞胺、ι_第三-丁基_3-乙基碳二亞 胺、N·環己基-N’-2-嗎啉基乙基）碳二亞胺或二異丙基碳二 亞胺（尤其用於經由形成羧基之〇-醯基脲來形成酯）；或 活性酯形成劑’例如，2-巯基笨并噻唑（2-MBT)， 疊氮化物形成劑，例如，疊氮化二苯基磷醯， 酸針，例如丙烧膦酸酐， 酸性鹵化劑’例如，1_氣·Ν，Ν，2-三苯基-1-丙烯基胺、 四氟硼酸或六氟磷酸氣-Ν,Ν,Ν',Ν'-雙（四亞曱基）曱脒鏽、 六氟磷酸氯-Ν，Ν，Ν，，Ν，-四甲基甲脒鏽、六氟磷酸氟· Ν，Ν，Ν·，Ν'-四曱基甲脒鏽、六氟磷酸氟_队队;^，，：^_雙（四亞 甲基）曱脒鏽， 或諸如此類或兩種或更多種該等試劑之混合物。 而且’對於式XII或ΧΙΙΑ之化合物分別與彼等式ΧΙΙΙ或 ΧΙΙΙΑ之化合物或式ΧΙΠ*或χΙΙΙΑ*之化合物分別與彼等式 XXVI或XX VIΑ之化合物之酯偶合，可原位使用或形成相 應反應性羧基化合物。本文中，MSNT尤佳作為偶合劑， 此乃因此允許維持高立體特異性。 若適當，可在弱鹼（例如，N-曱基嗎啉、三烷基胺（例如 乙基一異丙基胺）、二-(烧基）胺基°比°定（例如N，N -二曱基胺 基。比啶）或諸如此類）之存在下實施反應（注意：條件的驗性 不會強至使得式I化合物之前體中所存在之酯基（例如縮狀 酯基團）水解）’若適當或需要在適當溶劑或溶劑混合物（例 如’ N，N二烷基曱醯胺（例如二曱基曱醯胺）、鹵化烴（例如 二氣甲烷）、N-烷基吡咯啶酮（例如N-甲基吡咯啶酮）、猜類 I63698.doc -50- 201249863 (例如乙腈）或此外芳香烴（例如曱苯）或兩者或更多者之混 合物）之存在下，在存在所提供之過量偶合劑之情況下， 亦可存在水。溫度可係室溫或更低或更高，例如在-20°C 至50°C之範圍内。 式 IX、IXA、XI、ΧΙΑ、XIII、XIIIA、XV、XVA、 XVII、XVIIA、XXVII (可藉由（例如）溶液相合成獲得）、 XVII*、XVIIA*、XV*、XVA*、XIII*、XIIIA*、XI*、 ΧΙΑ*、IX*及IXA*之胺基酸為已知或其可根據業内已知方 法合成，其可在市面上購得及/或其可以類似於業内已知 方法之方式合成。 其餘起始物質（例如，式XIX或VII之酸或式XXVII或 XXVIIA之二肽）亦為已知或其可根據業内已知方法合成， 其可在市面上購得及/或其可以類似於業内已知方法之方 式合成。 例如，式XIX之合成組元可如實例1A(4)(其係本發明之 具體實施例）中所述或以類似於其之方式來製備。中間物 化合物1之合成（方案1)係闡述於Tetrahedron 61, 1459-1480 (2005)中。 二肽之偶合反應利用呈游離形式或呈經活化形式之胺基 酸之相應羧基。 實例：以下實例闡釋本發明，而不限制其範圍。 縮寫 aq. 水性
Boc/BOC 第三-丁氧基羰基 163698.doc •51 - 201249863 鹽水 存於水中之氣化鈉溶液（在RT下飽和） Bzl 苄基 COMU 六氣碟酸1-氰基_2·乙氧基_2_側氧基亞乙基 胺基氧基-二甲基胺基-嗎啉基-碳鏽 DCM 二氣甲烷 DIPEA N，N-二異丙基乙胺 DMAP 4_ 一甲基胺基〇比咬 DMF Ν，Ν_二甲基甲醯胺 Fmoc/FMOC 9-薙基甲氧基羰基 Et 乙基 HATU 六氟磷酸2-(1Η-苯并三唑-1·基）-1，1，3,3-四 曱基脲鏽甲基銨 HFIP 六氟異丙醇 HPLC 高效液相層析法 HR-MS 高解析質谱法 I PA 乙酸異丙酯 IPC 製程中控制（In-Process Control) IR 紅外光譜法 IT 内部溫度 Kaiser測試 基於節三酮（ninhydrin)之測試以監測SPPS 中之去保護（參見 E. Kaiser，R. L. Colescott， C. D. Bossinger, P. I. Cook, Analytical Bio chemistry 1970, 34 595);若描述為 OK，此 意味著去保護成功。 163698.doc -52- 201249863 me 甲基 MS 質譜法 MSNT 1-(三甲苯-2-磺醯基）-3-硝基-1,2,4-三唑 NMR 核磁共振光譜法
PyBOP 六氟磷酸苯并三唑-1-基-氧基三。比咯啶基鱗 BOP 六氟磷酸苯并三唑-1-基-氧基-叁-(二曱基胺 基）-鱗 RP 逆相 RT/rt 室溫 SPPS 固相肽合成 TBME 第三-丁基-曱基醚 TFA 三氟乙酸TEMPO 2,2,6,6-四甲基-1-六 氫吡啶基氧基，游離基團。 RBF 圓底燒瓶 對於胺基酸，縮寫參見上表。 化合物名稱...... 根據於Pure & Appl. Chem. 1984，5(5, 595-624 中出版之 Joint Commission在 Biochemical Nomenclature方面之建議 (「International Union of Pure and Applied Chemistry」及 「International Union of Biochemistry」）導出開鏈寡肽之 名稱。先前，使用簡單肽命名慣例用於該等化合物。先前 名稱於括號中給出。 實例1 :化合物A之合成 1A合成組元1之合成 163698.doc -53- 201249863 ⑴替代物1: 反應方案1 :
1A(1>化合物1之製備 (5)-2-((第三-丁氧基羰基）胺基）-5-羥基戊酸苄基酯 藉由類似於R. K. Olson，K. Ramasamy，T. Emery, C/iem. 1984，49，3527中所報導程序之程序來製備化合物 1。將BOC-Glu-OBzl (50 g，148.2 mmol)溶解於四氫》夫畴 (800 mL)中，並添加三乙基胺（47.3 g，467.4 mmol)。將溶 163698.doc -54- 201249863 液冷卻至IT=-10°C。緩慢添加氣甲酸乙酯（5 1.8 g，98%純 度’ 467.8 mmol)，將溫度維持於IT=_1〇〇c至· 15。〇下。將 由此獲得之懸浮液再攪拌1小時。IPC (HPLC)指示起始物 質之消失。使反應混合物升溫至〇。〇，並在〇。〇至5°c下於25 分鐘至30分鐘内添加水（8〇〇 mL)。混合物至2個相之分離 變得可見。在劇烈攪拌下，在〇°c至5〇c下以10份添加硼氫 化納（11.8 g，299.4 mmol)。由於在添加硼氩化鈉期間釋放 氫氣，故要當心。在〇°C至5°C下將反應混合物再攪拌5分 鐘’並於30分鐘内將溫度升高至2〇°c至25。(：。由於在溫度 升高期間繼續釋放氫氣，故要當心。在2〇。〇至25°C下將反 應混合物攪拌15分鐘，然後處理。 對於處理’將水（1250 mL)添加至反應混合物中，隨後 添加乙酸乙酯（1250 mL)。分離各相，並用乙酸乙酯（600 mL)萃取水相。將有機層合併並用鹽水（2x600 mL)洗滌。 將有機層經硫酸鎂乾燥，在減壓及40°C至45。(：下使溶劑蒸 發，從而獲得50.8 g粗產物。HPLC純度：94 a%。藉由急 驟層析法在矽膠上利用己烷流分/乙酸乙酯（7:3至1:1)作為 流動相來純化粗產物。
產量：40.85 g (85.2%)。純度：98% (HPLC)。MS及NMR 證實所提出結構。 1A(2)化合物2:(5>2-((第三·丁氧基羰基）胺基）5-((第三-丁 基二苯基甲矽烷基）氧基）戊酸苄基酯之製備 將來自先前步驟之醇（化合物1，40_3 g，124.6 mmol)溶 解於二曱基甲醯胺（200 mL)中，並添加咪唑（12.8 g， 163698.doc -55- 201249863 99.5%純度，186.9 mmol)。在室溫下搜拌混合物，直至形 成溶液為止（5 min至10 min)。於10分鐘内逐滴添加第三-丁基-二苯基-甲矽烷基-氯41.9 g，98%純度，149.5 mmol)，並在室溫下再繼續攪拌15分鐘。ipc (HPLC)指示 起始物質（醇）之消失。 對於處理，將乙酸異丙酯（400 mL)添加至反應混合物 中，隨後緩慢添加半飽和碳酸氫鈉水溶液（400 mL)。由於 添加放熱，發生氣體釋放，故要當心。分離各相，並用乙 酸異丙酯（400 mL)萃取水相。將有機層合併並用水（400 mL)萃取。在硫酸鎂上乾燥有機層，並在減壓下在40°C至 45°C下使溶劑蒸發。在真空中在25°C下將殘留物乾燥過 夜，從而獲得83.25 g呈無色油狀物之粗產物。HPLC分析 指示存在81 a%期望產物及1 8.6 a%相應矽醇。粗產物未經 進一步純化即用於下一步驟。經純化樣品之NMR及HR-MS 證實所提出結構。HR-MS :針對C33H43N05Si來計算： [M+H]+ : 562.29833 ； [M+NH4]+ : 579.32488 ； [M+Na]+ : 584.28027。測定值：[M+H]+ ： 562.29848 ； [M+NH4]+ : 579.32489 ; [M+Na]+ : 584.27995 » 1A(3)化合物4之製備： (5>2-((((9丹-第-9-基）甲氧基）幾基）胺基）-5-((第三-丁基二 苯基曱矽烷基）氧基）戊酸节基酯 將來自先前步驟之83.25 g粗產物（對應於化合物2之70 g 理論產量，124.6 mmol)溶解於二氣甲院（650 mL)中，並將 三氟乙酸（3 58.8 g，99%純度，3115 mmol)逐滴添加至劇烈 163698.doc -56 - 201249863 攪拌溶液中。30分鐘後IPC(HPLC)指示B〇C保護基團完全 裂解。將反應混合物（澄清溶液）轉移至帶有機械攪拌器之6 L 4頸圓底燒瓶’並用1000 mL之二氯曱烷稀釋。將半飽和 碳酸鈉水溶液（1800 mL)緩慢添加至劇烈攪拌溶液中。由 於在添加碳酸鈉期間觀察到強烈的氣體釋放，故要當心。 完成添加後水相之pH: 9至10。將反應混合物再授拌15分 鐘並分離各相《用二氯甲烷（1000 mL)萃取水相併合併有 機層’從而獲得存於二氣甲烷中之產物溶液。在4〇<>c至 45°C下在減壓下將溶液濃縮至大約65〇 m]L之最終體積用於 下一步驟。HPLC指示溶液中存在80.5%之化合物3及19.5 a°/〇矽醇。 對於FMOC化’將飽和碳酸氫納水溶液（65〇 mL)緩慢添 加至化合物3之劇烈攪拌溶液中’隨後添加fm〇C-氣化物 (36.55 g’ 97%純度，137 mmol)。由於在添加FMOC-C1期 間觀察到氣體釋放’故要當心。在室溫下繼續攪拌丨5分 鐘°有機層之IPC (HPLC)指示中間物化合物3之消失及至 化合物4之完全轉化。對於處理，分離各層並用二氣曱烷 (650 mL)萃取水相。將有機層合併並用水（65〇 mL)萃取。 將有機層經硫酸鎂乾燥，並在4〇°c至45〇c下在減壓下移除 溶劑，從而獲得112.6 g粗產物。 將粗產物懸浮於乙醇/異丙醇/水（89:5:6 ; 2400 mL)中， 並將懸浮液加熱至IT 50°C，從而獲得溶液。將溶液冷卻至 45°C ’添加種晶並在1小時内繼續將溫度冷卻至2〇。〇：至 25°C °在大約40°C下開始結晶。在20。(：至25°C下將懸浮液 163698.doc •57· 201249863 攪拌過夜，然後在30分鐘内冷卻至IT 0°C至5°C，並在〇°c 至5°C下再繼續攪拌2小時。藉由分離過濾產物，將滤餅用 乙醇/異丙醇/水（89:5:6 ; 240 mL)洗滌並在減壓下乾燥，從 而獲得純化合物4(根據HPLC為100 a%純度）。產量：66 g (77.4%)。藉由MS及NMR HR-MS來充分表徵該產物：針對 C43H45N05Si來計算：[M+H]+ : 684.31398 ; [M+NaH4]+ : 701.34053 ; [M+Na]+ : 706.29592。測定值：[M+H]+ : 684.31392 ; [M+NH4]+ : 701.34021 ; [M+Na]+ : 706.29539。 母液提供30.6 g之發泡體，根據HPLC其包含30 a%產物及 29 a°/〇矽醇。 1A(4)合成組元1自化合物4之製備·· (S)-2-((((9/f-苐-9-基）甲氧基）羰基）胺基）-5-((第三-丁基二 苯基曱矽烷基）氧基）戊酸 將化合物4 (66 g，96.6 mmol)懸浮於乙醇/異丙基醇/水 (89:5:6 ; 3000 mL)中，並將懸浮液加熱至IT 45°C，從而獲 得溶液。將溶液冷卻至IT 30°C。用氬氣惰化之後，在氬氣 流下將鈀·觸媒（10%，在硫酸鋇上；6.6 g)添加至溶液中。 然後在稍大於大氣壓之氫壓下在3〇°C至35。(：下使產物氫 化。根據HPLC在1.5 h後完成氫化》將反應混合物經基於 纖維素之助濾劑（Cellflock 40 ;基於纖維素之助遽劑）過 濾’並用乙醇/異丙醇/水（89:5:6 ; 600 mL)洗滌助濾劑。在 減壓下在45°C至50°C下蒸發溶劑，從而得到59.58 g發泡體 作為粗產物。藉由層析法在矽膠上以2份（2X1 kg矽膠60)使 用二氣甲烷/甲醇95:5至80:20作為流動相來純化粗產物。 163698.doc -58 - 201249863 產量：52 g (90.6%)。藉由MS及NMR來充分表徵該產物。 HR-MS :針對C36H39N05Si 來計算：[M+H]+ : 594.26703 ; [M+NH4]+ : 611.29358 ; [M+Na]+ : 616.24897 ;測定值： [M+H]+ ： 594.26743 ； [M+NH4]+ : 611.29385 ; [M+Na]+ ： 616.24900 ° (ii)替代物2 : 反應方案2 :
Fmoc-Glu-OBzl(市售）
1A(5)化合物4自Fmoc-Glu-OBz丨經由化合物5之一鋼式製 備： 163698.doc -59- 201249863 將 Fmoc_Glu-OBzl (5 g，10.88 mmol)溶於四氫呋喃（80 mL)中’並添加三乙基胺（3.3 g，32.6 mmol)。將溶液冷卻 至-15 C ’並在-12°C將氣曱酸乙醋（7.3 g，67.27 mmol)經30 分鐘添加至溶液◦在-1(TC至-15°C將由此獲得之懸浮液再 攪拌卜】、時，並將溫度提高至〇。〇。將水（80 mL)逐滴添加至 反應混合物中，將溫度維持於〇°c。在〇〇c以3份（每1〇分鐘！ 份）添加硼氫化鈉（總計0.805 g，21.27 mmol)，並在〇°C將 反應混合物再攪拌1 h。由於釋放氫氣，故小心操作。反應 混合物用水（100 mL)稀釋並用乙酸異丙酯（15〇 mL)萃取， 並分離各層。用乙酸異丙酯（1〇0 mL)再萃取水相，合併有 機層。用半飽和氣化鈉溶液（2x50 mL)洗合併之有機相， 並在減壓下將溶液濃縮至約5 〇 mL之最終體積。經濃縮溶 液經澄清過濾’並用乙酸異丙酯（2〇 mL)洗濾器殘留物。 將由此獲得之化合物5溶液移至圓底燒瓶中，並添加咪唑 (1_49 g，21.89 mmol)。混合物在室溫攪拌15 min，並添加 第二丁基-二笨基·矽烷基_氣（4 45 g，i6 19 mmol)。反應混 合物在室溫攪拌15 h。對於處理，懸浮液用乙酸異丙酯（2〇 mL)稀釋並用水（3x50 mL)萃取。分離有機層，並在減壓下 蒸發溶劑，獲得9.95 g粗產物。藉由管柱層析在矽膠上用 乙酸異丙酯/己烷（2:8)作為移動相純化粗產物，獲得6 5 g 之固體，將其懸浮於己烷中，並在室溫攪拌3 h。沈澱物 藉由過濾分離及在50。(：在減壓下乾燥，獲得56 §之化合物 4。產率：經兩個步驟為75%。HR_MS : C43H45N〇5Si之計 算值：[M+H]+ : 684.31398 ; [M+NH4]+ : 701.34053 ; [M+Na] : 706.29592。測定值：[M+H]+ : 684 3143〇 ; I63698.doc •60· 201249863 [M+NH4]+ : 701.34073 ; [M+Na]+ : 706.29577。 1A(6)化合物4自Fmoc-Glu-OBz丨經由化合物5使用氣甲酸 異丙酯代替氣甲睃乙酯之替代性一鍋式製備： 將 Fmoc-Glu-OBzl (60 g，130,579 mmol)溶解於四氫呋喃 (550 mL)中’並添加三乙基胺（40.8 g，4〇3·2〇2 mm〇1)。獲 得含有一些沈澱物之渾濁溶液。將此渾濁溶液/懸浮液轉 移至滴液漏斗，並在_351：至-301：下添加至4.5 L·反應器中 存於四氫呋喃（300 mL)中之氣甲酸異丁酯（54 96 g，402.41 mmol)之預冷卻溶液中，在添力0期間維持此溫度。用額外 四氫吱喃（50 mL)洗務滴液漏斗中之殘餘物，並在_35至 -3 0 C下將反應混合物再檀拌2小時。在45分鐘内將水（960 mL)添加至反應混合物巾’使溫度升高直至〇。〇為止。形成 懸浮液。在0°C下在1 h内以20份添加硼氫化鈉（14·4 g， 380.625 mmol) ’並在〇°C下將反應混合物再攪拌〗小時。由 於釋放氫氣故要當心。 將懸浮液傾倒至第三-丁基-甲基醚（6〇〇 mL)上，並用水 (600 mL)洗滌反應燒瓶，將其添加至產物混合物（2個相） 中。分離各相，用第三丁基_曱基醚（6〇〇 mL)萃取水相， 併合併有機相。將有機相用水（2x600 mL)洗滌，經無水硫 酉文鎮（200 g)乾燥’並在減壓下移除溶劑，直至達成a之最 終體積為止。用二甲基-曱醯胺（600 g)稀釋溶液，並在減 壓下蒸發溶劑，直至達成400 mL之最終體積。將由此獲得 之化合物5溶液轉移之至圓底燒瓶。將咪唑（14 4 g， 211.524 mmol)添加至化合物5之DMF溶液中，並在室溫下 將混合物攪拌5分鐘。最後，在20°C至25。(：下在20分鐘期 163698.doc •61 · 201249863 間逐滴添加TBDPS-Cl (39.6 g，144.07 mmol)，並在此溫度 下將反應混合物再攪拌1小時。 然後將反應混合物傾倒至乙酸乙酯（〗2〇〇 mL)中，並用 水（700 mL)萃取混合物。分離各層，並用水（3x3〇〇 mL)洗 滌有機層。在減壓下蒸發溶劑，從而得到丨〇6 g粗產物。 在40°C至50°C下將粗產物（1〇6 g)溶解於乙醇/異丙醇/水 (89.5.6，1200 mL)中，並添加種晶（〇 5 g化合物4)。使混 合物冷卻至室溫’並在室溫下攪拌17小時。將懸浮液冷卻 至-20°C並在-20°C下攪拌2小時。藉由過濾分離產物，將濾 餅用溶劑混合物乙醇/異丙醇/水（89:5:6 ; 3 x200 mL)洗滌並 在40°C下在減壓下乾燥，從而獲得66 5 g之化合物4 (經2個 步驟後為74.6%產率）。HPLC指示產物為99 a%純度。 可自母液（在蒸發溶劑之後為34 g)分離額外產物，根據 HPLC其含有大約30 a°/〇化合物4。 1B前體肽1藉由SPPS之合成
前體肽1 :異 丁醯基-G丨n(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-合 成組元 l-H)-Leu-〇H
163698.doc • 62· 201249863 已使用2種不同固體載體製得前體肽1 設備： 在底部具有濾布或燒結玻璃濾板之固相合成反應器。氮 氣歧管允許經由濾布或燒結玻璃濾板及底閥排出反應器内 容物。 1B(1)三苯甲基-連接體至固體載體之偶合： 與若干份之二曱基甲醯胺（1600 mL)及異丙醇（1600 mL) 一起交替攪拌200 g之胺基甲基-聚苯乙烯樹脂（與二乙 烯基苯交聯，胺基甲基之裝載量為1 mmol/g)(供應者：
Senn Chemicals AG，Dielsdorf/Switzerland)。在用二曱基甲 醯胺最後兩次洗之後，用先前製得之存於二甲基曱醯胺 (1600 mL)中之4-羥基-二苯基甲基-苯甲酸（91 3 g，3〇〇 mmol)、1-羥基-苯并三唑單水合物（45 9 g，3〇〇 mm〇i)及二 異丙基碳二亞胺（75·7 g，600 mmol)溶液處理該樹脂。將反 應混合物攪拌1.5 h，並實施茚三酮測試。測試仍顯示游離 胺基，且因此添加二異丙基碳二亞胺（7.6 g，6〇 mm〇1)並將 反應攪拌過夜。早上之另一茚三酮測試為陰性，並將反應 混合物過濾掉。利用二甲基甲醯胺及異丙醇交替洗滌該樹 脂。在真空中乾燥樹脂並產生257 g之乾連接體-樹脂。該 物質未經進一步分析即用於下一合成步驟。 1B(2) Fmoc-Leu-OH之偶合 Fmoc-Leu-連接體-樹脂之製備 猎由擾拌使連接體-樹脂〇9〇 g，147 8麵〇1)在甲苯 (1400 mL)t /合脹。將溶劑過漶掉並經甲苯〇彻爪[)及乙 163698.doc •63 · 201249863 酿基氣（53 mL，1478 mmol)之溶液置換。將此混合物撥拌2 h，過濾掉，經相同混合物置換，將該相同混合物再搜拌2 h，然後過濾掉。將氯化之樹脂用甲苯洗滌兩次並用二氣 甲烧洗滌三次。 在圆底燒瓶中，製備[111〇(^1^11-〇11(104.8§，296 111111。1；) 及N-曱基-嗎啉（49 mL，444 mmol)存於二氣甲烷（6〇〇 mL) 中之溶液。將此溶液添加至樹脂並攪拌過夜。在早上，將 溶液過濾掉，並利用二氣甲烷及異丙醇交替洗滌樹脂。將 樹月曰在真空中乾燥並產生234.7 g之乾Fmoc-Leu-連接體-樹 脂。Fmoc基團之裝載量經測定為〇 787 mmol/g，此導致 185 mmol (為理論值之125%)之產量。外部承包商處之胺 基酸分析證實<〇· 1 % D-Leu對映異構物。 1B(3) Fmoc-Thr-OH之偶合 Fmoc-Thr-Leu-連接體·樹脂之製備 藉由攪拌使Fmoc-Leu-連接體-樹脂（140 g，1〇9 mmol)相 繼在兩份二曱基曱醯胺（1100 mL)中各自溶脹30 min 〇 藉由存於二甲基甲醯胺中之2〇〇/0六氫吡啶連續洗滌兩次 (分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉由用二曱基 曱醯胺及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌該樹脂。將酚酞及 水添加至最終洗滌溶液之樣品中。不出現粉色證實成功移 除六氫。比。定。 將樹脂用四氫呋喃（12〇〇 mL)洗滌三次，以為隨後偶合 步驟做準備。 在圓底燒瓶中’製備存於四氫呋喃（6〇〇 mL)中之Fmoc- 163698.doc •64· 201249863
Thr-OH(ll2.l g，3M mmol)、羥基苯并三唑單水合物 (51·25 g，334 mmol)及二異丙基碳二亞胺（51 mL，… mmol)溶液。 將溶液添加至樹脂中’並立即檢驗ρΗ (ρΙ1=6·5) ^將反 應混α物攪拌1.5 h，直至茚三_測試顯示反應完全。將溶 液過濾掉，並利用二曱基甲醯胺及異丙醇交替洗滌樹脂。 將樹脂之小樣品乾燥並運送用於胺基酸分析（〇丨3% D Leu, <0.1/。D-Thr, <0.1% L-all〇-Thr，<0.1% D-allo-Thr)，使大 部分物質未經進一步乾燥即經受下一步驟。 1B(4) Fmoc-Gln(Trt)-OH之偶合 Fmoc-Gln(Trt)-Thr-Leu_連接體_樹脂之製備 藉由授拌使來自先前步驟之Fmoc-Thr-Leu-連接體-樹脂 連續在兩份二甲基甲醯胺（i i 〇〇 mL)中各自溶脹3〇 min。 藉由用存於二曱基曱醯胺中之20〇/〇六氫吡啶連續洗滌兩 次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉由用二甲 基曱酿胺及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌該樹脂。將酚酞 及水添加至最終洗滌溶液之樣品中。不出現粉色證明成功 移除六氫°比。定。 將樹脂用二曱基甲醯胺（1100 mL)洗滌三次，以為隨後 偶合步驟做準備。 在圓底燒瓶中，製備存於二曱基曱醯胺（4〇〇 mL)中之 Fmoc-Gln(Trt)-〇H(138.6 g, 226 mmol) ' HATU(86.2 g, 226 mmol)及乙基二異丙基胺（58·4 g，452 mm〇i)溶液。 將溶液添加至樹脂中’並立即檢驗pH(pH= 1 〇)。將反應 163698.doc -65- 201249863 混合物攪拌3 h ’直至茚三酮測試顯示反應完全。將溶液 過濾掉，並將利用二甲基甲醯胺及異丙醇交替洗務樹脂。 將樹脂在真空中乾燥並產生17〇 g之乾Fmoc_Gln(Trt)_ Thr-Leu-連接體-樹脂^ Fmoc基團之裝載量經測定為〇 6〇 mmol/g ’此指示1〇2 mmol(經最後兩個步驟後為理論之 94%)之產量。外部承包商處之胺基酸分析產生以下值： (0.13% D-Leu, <0.1〇/〇 D-Thr, <0.1% L-allo-Thr, <0.l〇/〇 D-allo-Thr，<0.8% D-Gln)。 1B(5)異丁酸之偶合 異丁酿基-6111(1>1)-1'11卜1^11_連接體-樹脂之製備 藉由搜拌使Fmoc-Gln(Trt)-Thr-Leu-連接體-樹脂（169 g， 101 mmol)連續在兩份二甲基曱醢胺（13〇〇 mL)中各自溶脹 30 min。 藉由用存於二甲基甲醯胺（1300 mL)中之20〇/〇六氫吡啶連 續洗滌兩次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉 由用二甲基甲醯胺及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌該樹 脂。將酚酞及水添加至最終洗滌溶液之樣品中。不出現粉 色證明成功移除六氫吡啶β 將樹脂用二甲基甲醯胺（1100 mL)洗滌三次，以為隨後 偶合步驟做準備。 在圓底燒瓶中’製備存於二甲基甲醯胺（550 mL)中之異 丁酸（17.9 g，203 mmol)、PyBOP (105.5 g, 203 mmol)及乙 基一異丙基胺（52.4 g，406 mmol)溶液。 將溶液添加至樹脂中，並立即檢驗ρΗ(ρΗ=9·5)。將反應 163698.doc •66- 201249863 混合物攪拌2.5 h，直至茚三酮測試顯示反應完全。將溶液 過濾掉，並將利用二甲基曱醯胺及異丙醇交替洗滌樹脂。 使該批次未經乾燥及進一步分析即直接經受下一步驟。 1B(6) Fmoc-Ile-ΟΗ之偶合（醋化） 異 丁贐基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Fmoc)-Leu-連接艘-樹脂之 製備 藉由攪拌使異丁醯基-Gln(Trt)-Thr-Leu-連接體-樹脂（濕 的’來自上一步驟’ 1〇1 mm〇l)連續在三份二氯曱烧（12〇〇 mL)中各自溶脹20 min。 將溶劑過濾掉，並以固體形式添加MSNT(88 g, 297 mmol)及 Fmoc-Ile-OH(105 g，297 mmol)。添加二氣曱烷 (500 mL)以及N-曱基咪唑（18.2 g，223mmol)及乙基二異丙 基胺（51.2 g，396 mmol)於二氣甲烷（100 mL)中之溶液。將 反應混合物攪拌2 h，直至HPLC製程中控制顯示反應完全 為止。將溶液過濾掉，並隨後用三份二氯曱烷、三份二曱 基曱醯胺及三份異丙醇洗滌樹脂。將樹脂在真空中乾燥並 產生 172 g之乾異 丁酿基 _Gln(Trt)-Thr(Ile-Fmoc)-Leu-連接 體-樹脂。Fmoc裝載量經測定為0.418 mmol/g，從而指示 72 mmol (經最後兩個步驟後為71%)之產量。 1B⑺ Fmoc_N-甲基-Tyr(tBu)-OH之偶合 異 丁酿基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Fmoc)-Leu-連接 體-樹脂之製備 (先前稱為：異 丁醯基_Gln(Trt)-Thr(I丨e-N-me-Tyr(tBu)-Fmoc)-Leu-連接體-樹脂） 163698.doc •67- 201249863 藉由攢:拌使異丁醯基_Gin(Trt)_Thr(iie_Fmoc)-Leu-連接 體-树月曰（172 g，72 mmol)連續在兩份二甲基甲醯胺（1300 mL)中各自溶脹3〇 min。 藉由用存於二曱基甲醯胺（1400 mL)中之20%六氫吡啶連 續洗滌兩次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉 由用一甲基甲醯胺及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌樹脂。 將齡醜及水添加至最終洗滌溶液之樣品中。不出現粉色證 明成功移除六氫n比咬。 將樹脂用二甲基曱醯胺（11〇〇 mL)洗滌三次以為隨後偶 合步驟做準備。 製備存於一曱基曱酿胺（700 mL)中之Fmoc-N-曱基· Tyr(tBu)-〇H(68.7 g，144 mmol)及HATU(55.1 g，144 mmol) 溶液’並將其添加至肽-樹脂中，隨後在攪拌下添加存於 二曱基甲醯胺（100 mL)中之乙基-二異丙基胺（37.5 g，289 mmol)溶液。在添加偶合溶液之後立即檢驗pH，且在反應 1 h之後得到相同結果（pH 1 〇)。將溶液攪拌2 h，直至茚三 酮測試顯示反應完全。將溶液過濾掉，並利用二甲基曱醯 胺及異丙醇交替洗滌樹脂。 使該批次未經乾燥及進一步分析即直接經受下一步驟。 1B(8) Fmoc-Ile-OH之偶合 異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-IleFmoc)-Leu·連 接體-樹脂之製備。 (先前稱為：異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-N-me-Tyr(tBu)-Ile-Fmoc)-Leu-連接趙-樹脂。） 163698.doc • 68 · 201249863 藉由攪拌使濕的異丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Fmoc)-Leu-連接體-樹脂（72 mmol)連續在兩份二甲基甲醯 胺（1200 mL及1300 mL)中各自溶服30 min。藉由用存於二 甲基甲醯胺（1400 mL)中之2〇%六氫吡啶連續洗滌兩次（分 別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉由用二曱基甲 醯胺及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌樹脂^將酞酚及水添 加至最終洗滌溶液之樣品中。不出現粉色證明成功移除六 氫π比咬。 將樹脂用二甲基曱醯胺（1100 mL)洗滌三次，以為隨後 偶合步驟做準備。 在圓底燒瓶中，製備存於二氣曱烷（440 mL)及二曱基曱 醯胺（440 mL)中之 Fmoc-Ile-OH(1〇3.9 g, 294 mmol)、 COMU(125.9 g，294 mmol)及乙基二異丙基胺（76 g, 588 mmol)溶液。 將溶液添加至樹脂中，並將反應混合物攪拌20 其 後’進行茚三酮測試，顯示反應完全《將溶液過濾掉並利 用二曱基甲醯胺及異丙醇交替洗滌樹脂。 將樹脂在真空中乾燥並產生185.5 g之乾異丁醯基· Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-Fmoc)-Leu-連接體-樹脂。 Fmoc基團之裝載量經測定為〇.4〇 mmol/g。從而獲得74 mmol之定量產量。 1B(9)合成組元1之偶合及最終Fmoc保護基團之裂解： 異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile_Tyr(tBu)Me-Ile-合成組元 1· H)-Leu-連接體-樹脂之製備 163698.doc -69· 201249863 (先前稱為：異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-N-me-Tyr-Ile-合 成組元1-H)-Leu-連接體·樹脂） 藉由攪拌使異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-Fmoc)-Leu-連接體-樹脂（30 g，12 mmol)連續在兩份二曱基 曱醢胺（240 mL及250 mL)中各自溶脹30 min。 藉由用存於二曱基甲醯胺（250 mL)中之20%六氫吡啶連 續洗務兩次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉 由二曱基曱醯胺及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌樹脂。將 酚酞及水添加至最終洗滌溶液之樣品中。不出現粉色證明 成功移除六氫η比咬。 將樹脂用二曱基曱醯胺（250 mL)洗滌三次，以為隨後偶 合步驟做準備。 在圓底燒瓶中，製備存於二甲基曱醯胺（120 mL)中之合 成組元 1(14.6 g，24.6 mmol)、PyBOP (12.85 g，24.6 mmol) 及乙基二異丙基胺（6.4 g，49.2 mmol)溶液。 將溶液添加至樹脂中，並將反應混合物攪拌3 h。其 後’茚三酮測試證實反應完全。將溶液過濾掉，並利用二 曱基甲醯胺及異丙醇交替洗滌樹脂。 藉由攪拌使所得肽-樹脂連續在兩份二甲基曱醯胺（250 mL)中各自溶脹30 min。 藉由用存於二甲基曱醯胺（250 mL)中之20%六氫吡啶連 續洗滌兩次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉 由用二曱基甲醯胺及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌肽-樹 脂。 163698.doc •70· 201249863 最後用二氯甲烷（250 mL)將肽-樹脂洗滌三次，以為裂解 肽做準備。 1B(10)前體肽1自固體載體之裂解 異 丁醯基-G丨n(Trt)-Thr(I丨e-Tyr(tBu)Me-Ile-合成組元 1-H)-Leu-OH(=前體肽1)之製備 (先則稱為.異 丁酿基-Gln(Trt)-Thr(Ile_N-me-Tyr(tBu)-lie-合成組元 l-H)-Leu-OH) 向濕的異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-合成 組元1 -H)-Leu-連接體-樹脂中添加乙酸（125 mL)及二氯甲 烷（125 mL)之混合物並將懸浮液攪拌2 h。過濾懸浮液並將 濾液收集於圓底燒瓶中（濾液1)»用二氣甲烷（25〇 mL)將樹 脂洗滌兩次’並將洗滌液與濾液1合併。 將樹脂用新鮮份之乙酸（125 mL)及二氯曱烷（125 mL)再 處理2 h »過濾懸浮液，並將濾液收集於圓底燒瓶中（濾液 2) °將樹脂用二氯甲烧（250 mL)洗務兩次，並將洗務液與 渡液2合併。 將乙酸（200 mL)及二氣甲烷（50 mL)添加至樹脂中，並將 懸浮液攪拌過夜。過濾懸浮液並收集濾液作為濾液3。 各別處理三份濾液以評估裂解方法之效率。在旋轉蒸發 器中濃縮濾液，並利用三份甲苯（100 mL)藉由共沸蒸餾移 除殘餘乙酸。然後在高真空中在冷凍乾燥機處乾燥油狀殘 留物。產量m:12.5g，遽液m g，遽液3:0 3 g〇 藉由RP層析法純化粗物質（前體肽1}，在旋轉蒸發器中 163698.doc -71 · 201249863 濃縮流分，並冷凍乾燥濃縮物。純度：98.8% »產量：8.5 g (對於最後兩個步驟為48%)。藉由1H-NMR、13C-NMR及 HR-MS表徵該產物。光譜證實所提出結構^ NMR光譜指示 存在若干構象。 HR-MS :針對C85H116N8013Si來計算：[M+H]+ : 1485.85039。 測定值：[M+H]+ : 1485.84929。 前體肽1使用氣化之樹脂的第二SPPS合成 1B(11)第一胺基蔽（Fmoc-Leu-OH)之固定化 利用240 ml之經乾燥DCM使2-氣三苯甲基氣樹脂（3〇 g， L=l.2 mmol/g ; Merck Novabiochem 855017)溶脹 10 min， 且然後排出溶劑’將固相反應器於緩慢氮氣流下保持密 閉。同時，在圆底燒瓶中混合Fmoc_Leu_〇H(42.6 g，120.8 mmol)及100 ml之乾1，4-二嗔烧。在真空下在45。〇下蒸發溶 劑，然後添加第二份1，4二"惡烧。在真空下在45。〇下再次蒸 發溶劑，直至獲得無色油狀殘留物為止，然後向此油狀殘 留物中依序添加乾DCM (155 mL)及DIPEA (40.4 mL)，將 然後5 min後添加 溶液以單一份添加至預溶脹之樹脂中 第二份DIPEA (16.5 mL)。將懸浮液攪拌2 h，並排出反應
授掉1 0 min。 min。量測到裝載量為〇95111111〇1々。
Fmoc裂解之一般方案·· ml存於DMF中之25%六氫吡 ’且然後藉由過濾移除反應 向預溶脹之樹脂中添加24〇 r 咬溶液，將懸浮液攪拌5分鐘， 163698.doc •72· 201249863 混合物，然後添加第二份相同之六氫吡啶溶液，將懸浮液 授拌15分鐘，且然後藉由過遽移除溶劑。 樹脂洗滌與乾燥： 如下洗滌樹脂： 250 ml之 DMF (6x2 min) 250 ml之IPA (3x2 min) 250 ml之TBME (6x2 min) 在真空下在40°C下將樹脂乾燥過夜，從而獲得35.7 g之 H-Leu-樹脂。 1B(12) : H-Thr-Leu-樹脂之 SPPS 合成 利用270 ml之DMF使來自先前步驟之H-Leu-樹脂（30 g) 溶脹30 min，然後排出溶劑。 在圓底燒瓶（RBF)中混合 Fmoc-Thr-OH(25.0 g，73.2 mmol)、BOP (40.4 g，91.5 mmol)及 DMF (250 mL)，將混合 物攪拌2 min，且然後添加DIPEA (18.9 g，146.4 mmol)。 以一份將由此獲得之混合物添加至預溶脹之肽-樹脂中， 並將反應混合物攪拌2.5 h。Kaiser測試為陽性，且因此根 據先前所述條件進行第二次偶合。1.0 h之後，Kaiser測試 為陰性，且認為反應完全，且經由過濾移除反應介質。 如下洗滌樹脂： 250 ml DMF (4x2 min) 250 ml IPA (3x2min) 250 ml TBME (5x2 min)。 在真空下在40°C下將樹脂乾燥過夜，從而產生52.2 g之 163698.doc -73- 201249863
Fmoc-Thr-Leu-樹脂，準備用於Fm〇c裂解步驟。
Fmoc裂解： 將樹脂（52.2 g)懸浮於272 ml之DMF中，並攪拌1.0 h， 然後藉由過濾移除溶劑。 以與針對1B(11)所述方式相同之方式裂解Fmoc保锼基 團’並如下洗蘇肽-樹脂： 250 ml DMF (6x2 min) 250 ml IPA (3x2min) 250 ml TBME (6x2 min) 在真空下在40°C下將樹脂乾燥過夜，從而產生39.9 g之 H-Thr-Leu-樹脂。 1B(13) : H-Gln(Trt)-Thr-Leu-樹脂之SPPS合成 利用270 ml之DMF使來自先前步驟之H-Thr-Leu-樹脂 (39.9g)溶脹30 min，然後排出溶劑。 在1^?中混合？111〇〇-0111(1^)-〇取44.7§，73.2 111111〇1)、 BOP (40_4 g，91.5 mmol)及 250 ml 之 DMF。將混合物攪拌2 min’ 且然後添加DIPEA (18.9 g，146.4 mmol)。以一份將 所得混合物添加至預溶脹之H-Thr-Leu-樹脂中，並將反應 混合物攪拌2.5 h，Kaiser測試為陰性，然後認為反應完 全，且經由過濾移除反應介質。 如下洗滌樹脂： 250 ml DMF (4x2 min) 250 ml IPA (3x2 min) 250 ml DMF (4x2 min) 163698.doc • 74· 201249863 濕的肽-樹脂未經任何處置即用於Fm〇c裂解步驟。
Fmoc裂解： 根據步驟1B(11)中所述程序裂解加⑽保護基團。然後如 下洗務樹脂： 250 ml DMF (4x2 min) 250 ml ΙΡΑ (3χ2 min) 250 ml TBME (5x2 min) 在真空下在4〇C下將樹脂乾燥過夜，從而產生54.4呂之 Gln(Trt)-Thr-Leu-樹脂。 1B(14).異 丁醯基-G 丨 n(Trt)-Thr-Leu-樹脂之 SPPS 合成 利用270 ml之DMF使來自先前步驟之肽_樹脂（54 4 g)溶 膜30 min，然後排出溶劑。 在 RBF 中混合異丁酸（6.4 g，73.2 mmol)、PyBop (38·1 g， 73.2 mmol)及230 ml之DMF，將混合物攪拌2 min，且然後 添加DIPEA (28.3 g，219.6 mmol)。以一份將溶液添加至預 溶脹之肽-樹脂中，並將反應混合物攪拌15 h。Kaiser測試 為陰性’然後認為反應完全’且經由過渡移除反應介質。 如下洗滌樹脂： 250 ml DMF (4x2 min) 250 ml ΙΡΑ (3x2 min) 250 ml TBME (5x2 min)。 在真空下在40°C下將樹脂乾燥過夜，從而產生55·8 §之 異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr-Leu-樹脂。 163698.doc •75· 201249863
1B(15):異 丁醢基-Gln(Trt)-Thr(I丨e-H)-Leu-樹脂之 SPPS 合成 將來自先前步驟之肽-樹脂（55·8 g)懸浮於250 ml之乾 DCM中1.0 h。然後藉由過濾移除溶劑，並將濕的肽_樹脂 保持於緩慢氮氣流下，並將溫度調節至〇〇c至51 ^ 在1^?中混合？111〇(：-116-011(51.7§，146.4 111111〇1)及15〇1111 之乾二噁烷。在真空下在45°C下蒸發溶劑，直至觀察到油 狀殘留物為止《重複蒸餾製程，且然後向殘留物中添加 150 ml之經乾燥DCM，將溶液冷卻至_1(TC，並添加MSNT (43.3 g，146.4 mmol)，將懸浮液攪拌3 min，且然後添加N_ 甲基-咪唑（14.2 g，173 mmol) ’將混合物攪拌2 min，並在 10 min中將溶液逐滴添加至上文所製得之肽-樹脂中。在完 成添加之後’在氮氣氣氛下將懸浮液攪拌2.〇 h。 如下洗滌樹脂： 250 ml DMC (4x2 min) 250 ml DMF (3x2 min) 濕的肽-樹脂未經進一步處置即用於Fmoc裂解步驟。
Fmoc裂解： 根據1B(11)中所述之一般方案裂解Fmoc保護基團。 在進行Fmoc裂解之後，如下洗滌樹脂： 250 ml DMF (5><2 min) 250 ml IPA (3x2 min) 250 ml TBME (5x2 min) 在真空下在40°C下將樹脂乾燥過夜，從而產生57_2 g之異 163698.doc -76- 201249863 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(0-Ile-H)-Leu-樹脂。 1B(16):異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(0-Ile-Tyr(tBu)MeN)-Leu-樹脂之SPPS合成 將來自先前步驟之肽-樹脂（57.2 g)懸浮於250 ml DMF中 3 0 min用於溶脹，然後藉由過濾移除溶劑。 在 RBF 中混合 Fmoc-NMeTyr(tBu)-OH(52.0 g, 109.8 mmol)、HATU(41.7 g，1〇9·8 mmol)及 230 ml 之 DMF，並將 混合物攪拌2 min。然後添加DIPEA (28.3 g，219.6 mmol)，並將溶液攪拌2·〇 min。然後將所得溶液添加至預 溶脹之肽-樹脂中。 將反應混合物搜拌1 .〇 h ’並實施Kaiser測試。Kaiser測 試為陰性。認為反應完全，並經由過濾移除反應介質。 如下洗滌肽-樹脂： 250 ml DMF (4x2 min) 250 ml IPA (1x2 min) 濕的肽-樹脂未經進一步處置即用於Fm〇c裂解步驟。
Fmoc裂解： 根據1B(11)中所用之一般方案裂解Fm〇c保護基團。 在進行Fmoc裂解之後，如下洗滌樹脂： 250 ml DMF (5x2 min) 250 ml IPA (1x2 min) 250 ml DMF (5x2 min) 所獲得之異 τ it 基·Gln(科Thr(Ile_Tyr(tBu)Me H)_Leu 樹 月曰未經乾燥即用於下一步驟。 163698.doc -77- 201249863 1B(17):異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile_Tyr(tBu)Me-Ile-H)-Leu-樹脂之SPPS合成 利用270 ml之DMF使來自先前步驟之異丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-H)_Leu-樹脂溶脹 30 min，然後排出溶 劑。 在圓底燒瓶中混合Fmoc-Ile-OH(38.8 g，109.8 mmol)、 HATU(41.7 g，109.8 mmol)及 DMF(250 mL)，將混合物攪拌 2 min ’ 且然後添加DIPEA(28.3 g，219.6 mmol)。以一份將 溶液添加至預溶脹之肽-樹脂中，並將反應混合物攪拌2.0 h，氣醌測試為陽性，且然後實施與Fmoc-Ile-OH之第二次 偶合。第二次偶合3 h後’藉由過濾分離肽_樹脂。 如下洗滌肽-樹脂： 250 ml DMF (4><2 min) 250 ml IPA (3x2 min) 250 ml DMF (4x2 min) 濕的肽-樹脂未經進一步處置即用於Fmoc裂解步驟》
Fmoc裂解： 以與1B(11)中所述方式相同之方式移除Fmoc保護基團， 且如下洗滌肽-樹脂。 250 ml DMF (5x2 min) 250 ml IPA (3x2 min) 250 ml TBME (4><2 min) 0 在真空下在40°C下將肽-樹脂乾燥過夜，從而產生67.0 g 之異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-H)-Leu-樹 163698.doc •78· 201249863 脂。 1B(18):異 丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me_Ile-合成 組元1-H)-Leu-樹脂之SPPS合成 將來自先前步驟之異丁醯基-Gln(Trt)-Thr(Ile-
Tyr(tBu)Me-Ile-H)-Leu-樹脂（33.5 g)懸浮於 150 ml 之 DMF 中30 min，然後排出溶劑。在RBF中混合Fmoc_合成組元^ OH(34.3 g，57.8 mmol)、PyBop (30.0 g，57.7 mmol)及 113 ml之DMF ’將混合物攪拌2 min，且然後添加DIPEA (14.9 g，115.2 mmol) ^以一份將溶液添加至預溶脹之肽-樹脂 中，將反應混合物搜拌2 · 0 h。藉由過渡移除反應介質。 如下洗滌肽-樹脂： 150 ml DMF (4x2 min) 150 ml IPA (3x2 min) 150 ml DMF (4x2 min) 濕的肽-樹脂未經進一步處置即用於Fm〇c裂解步驟。
Fmoc裂解： 以與1B(11)中的方式相同之方式、只是使用15〇 m丨之六 氫吡啶溶液移除Fmoc保護基團，且如下洗滌肽_樹脂。 150 ml DMF (5x2 min) 150 ml IPA (3x2 min) 150 ml TBME (4x2 min) 在真空下在4G°C下將肽-樹脂乾燥過夜，從而產生^ 〇 §之 異 丁酿基-Gln(Trt)-Thr(Ile_Tyr(tBu)Me-Ilej 成乡且元 1H)_ Leu-樹脂。 163698.doc 79- 201249863 1B(19):替代性SPPS合成：肽自固體載體之裂解 用350 ml之經乾燥DCM處理來自先前步驟之異丁醯基_ Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-合成組元 1-H)-Leu-樹脂 (29.75g) 1.0 h，藉由過濾移除溶劑，且然後添加350 ml存 於DCM中之3〇% v/v HFIP溶液。將混合物搜拌1〇 min，且 然後藉由過渡移除溶劑並將其保存在一旁^向濕的樹脂中 添加第二份相同的HFIP溶液，並將溶液攪拌丨〇 min，然後 藉由過濾移除溶劑並將其與先前溶液彙集在一起。用DCM (3 50 ml)將樹脂洗蘇3次，並將洗滌液與裂解溶液合併。 在真空下濃縮經合併溶液’直至觀察到油狀殘留物為 止，且然後添加200 ml之曱本’在減壓下在45 下蒸發溶 劑，直至獲得油狀殘留物為止。添加35〇 ml之己烷，並將 懸浮液搜拌2 藉由過濾移除溶劑，並用己烷（5〇爪丨）洗 滌濾餅，在真空下在35。(：下將濕餅乾燥過夜，從而產生 19.24 g之粗前體肽 1(=異丁 醯基 _Gln(Trt)_Thr(ne Ty…Bu) Me-ne-合成組元 l-H)-Leu-OH)。 藉由RP層析法純化一部分粗前體肽丨（6 〇 g)，在旋轉蒸 發器中濃縮產物流分，並冷凍乾燥濃縮物，從而獲得22 g 純度為99·3 %a之純前|^。以類似方式處理含有側流分 之產物’從而獲得L25 g純度為71·4 %a之額外較不純前體 肽。針對全部量之粗前體肽！24 、·Ζ4 g)進仃外推，此將對 應於來自主要流分之7.05 g純前體脱】B A上 』體狀1及來自側流分之4.01 g額外前體肽1 (純度為71.4 %a) » 1C化合物8之溶液相合成 163698.doc • 80 · 201249863 反應方案3 :
163698.doc -81 - 201249863 01^-((3 S，6S，9S，12S，15S，18S，19R)-6-(4-(第三-丁氧基） 苄基）-3,9-二（(S)-第二-丁基）-12-(3-((第三-丁基二苯基甲矽 烧基）氧基）丙基）-15-異丁基-7,19-二曱基-2,5,8,11，14,17-六 側氧基-1-氧雜-4,7，I0，I3，I6-五氮雜環十九烷_18_基）_2_異 丁醯胺基-N5-三苯曱基戊烧二醯胺 在35°C下將存於乙腈（120 mL)中之前體肽1 (1.9 g，1.28 mmol)渾濁溶液/懸浮液在90 min期間添加至存於乙腈（100 mL)中之 HATU(972 mg, 2.56 mmol)及 DMAP (468.6 mg， 3_84 mmol)之經攪拌混合物中。用乙腈（3〇 mL)洗滌滴液漏 斗。添加懸浮液後之IPC (HPLC)指示不存在前體肽及完成 環化。對於處理，在減壓下蒸發溶劑直至大約5〇 mL之最 終體積為止，並用乙酸異丙酯（250 mL)稀釋殘留物。用水 (2x100 mL)萃取有機相並在減壓下蒸發溶劑，從而獲得2.3 g之粗產物。藉由急驟層析法在矽膠上利用乙酸乙酯作為 流動相來純化粗產物’從而獲得1.79 g (1.22 mmol)呈發泡 體之化合物6。產率：95%。藉由iH-NMR、〗3C-NMR及 HR_MS來表徵該產物。光譜證實所提出結構。NMR光譜指 示存在若干構象。 HR-MS :針對 C85H114N.8012Si 來計算：[M+H]+ : 1467.83983 ; [M+NH4]+ : 1484.86637 ; [M+Na]+ : 1489.82177。 測定值：[M+H]+ : 1467.83984 ; [M+NH4]+ : 1484.86555 ; [M+Na]+ : 1489.82073。 合成化合物6之第二實例（15 g規模） 在〇°C下將存於第三-丁基-甲基-醚（75〇 mL)中之前體肽1 163698.doc -82 · 201249863 (15.0 g)溶液在1.5 h期間緩慢添加至存於乙腈（375 中 之DMAP (2.80 g)及HATU(5.87 g)之預冷卻溶液中。在室溫 下將反應混合物再攪拌30 min。然後用第三_丁基·甲基_醚 (750 mL)稀釋反應混合物，並將其傾倒至半飽和NaCi水溶 液（1500 〇1〇上。分離各相，並用半飽和Naa水溶液（15〇〇 mL)再次萃取有機相。分離有機層，並在減壓下將溶劑部 分蒸發至大約175 mL之最終體積。將此溶液經矽膠（具有 225 g矽膠之管柱）且使用第三·丁基_甲基_醚作為流動相過 濾。在真空中在40 C至45°C下蒸發並乾燥溶劑，從而得到 根據HPLC純度為97.53%之化合物6。產量：14 19 g (95 7 %)。 1C(2)化合物7之合成 (8)->11-((38,68’98，128，15 8，188，191〇-6-(4-(第三_丁氧基） 苄基）-3,9-二（(S)-第二-丁基）_i2-(3-羥基丙基）_15_異丁基_ 7’19-二甲基-2,5,8，11，14，17-六側氧基_1_氧雜_4,71〇13，16_ 五氮雜環十九烷-18-基）-2-異丁醯胺基_N5·三苯f基戊烷二 醯胺 將化合物6(1.79 g, 1.22 mmol)溶解於四氫呋喃（6〇 mL) 中，並在室溫下添加Et3N(HFM6.62 g，41.1 mmol)。在室 溫下將反應混合物攪拌8·5小時，然後用乙酸異丙酯（2〇〇 mL)稀釋，並將所得溶液/懸浮液緩慢添加至劇烈攪拌之飽 和NaHC〇3水溶液中。分離有機相並用水（1〇〇爪丨）萃取。在 減壓下蒸發溶劑，從而得到1.86 g粗產物，藉由急驟層析 法在矽膠上利用乙酸乙酯/異丙醇（95:5)作為流動相將其純 163698.doc • 83 · 201249863 化，從而獲得1.24 g (1.00 mmol)之化合物7。產率： 82%。 藉由IR、NMR及MS來充分表徵該產物。光譜證實所提 出結構。 HR-MS :針對C69H96N8012來計算：[Μ+Η] + :1229·72205 ; [M+NH4]+ : 1246.74860 ; [M+Na]+ : 1251.70399。測定 值：[M+H]+ : 1229.72128 ; [M+NH4]+ : 1246.74780 ; [M+Na]+ : 1251.70310 。 製備化合物7之第二實例（14 g規模） 將化合物6 (14.0 g, 9.537 mmol)溶解於四氫呋喃（220 mL)中，並添加第三-丁基-曱基-醚（116 mL)。藉由在10分 鐘内緩慢添加來用Et3N(HF)3 (23.05 g)處理溶液。在室溫 下將反應混合物攪拌24 h。對於處理，用第三-丁基-曱基-醚（570 mL)稀釋反應混合物，並將混合物傾倒至半飽和 NaHC03水溶液（632 mL)上。將雙相混合物攪拌30 min，並 分離各相。用水（280 mL)萃取有機相。用第三-丁基-甲基-醚（380 mL)萃取兩個水相，併合併有機相。將有機相經無 水MgS04 (8.0 g)乾燥，並在減壓下將溶劑部分蒸發至大約 100 mL之最終體積。添加曱苯（140 mL)，並將溶劑再次蒸 發至80 mL之最終體積。用第三-丁基-曱基-醚（70 mL)稀 釋此溶液，並在30 min期間藉由緩慢添加庚烷（140 mL)使 產物沈澱。將所形成懸浮液加熱至50°C至55°C，並在此溫 度下攪拌30 min。然後在30 min内將懸浮液冷卻至0°C，在 〇°C下攪拌2 h，並藉由過濾分離產物。在真空中乾燥產物 163698.doc -84- 201249863 (白色沈澱物），從而獲得11 ·〇8 g之化合物7。（94·5%產 率）。產物之HPLC指示純度為97 a°/〇。 1C(3)化合物8之合成（參見結構之反應方案4) (8)-：^1-((38,68,98，128，158，188，1911)-6-(4-(第三-丁氧基） 苄基）-3,9-二（(S)-第二-丁基）-15-異丁基-7,19-二曱基_ 2,5,8，11，14，17-六側氧基-12-(3-側氧基丙基）-1-氧雜_ 4,7，10，13，16-五氮雜環十九烧-18-基）-2-異丁酿胺基_1^5-三 笨甲基戊烧二酿胺 將化合物7 (1.2 g，0.98 mmol)溶解於四氫呋喃（19〇 mL) 及二甲亞颯（62 mL)之混合物中。添加1 _經基_ 1,2 _苯礙酿_ 3(1//)-酮 1-氧化物（IBX) (2.42 g, 45% g/g, 3.9 mmol)，並 將溶液攪拌大約4.5小時，其後HPLC指示起始物質（化合物 7)消失。然後將反應混合物傾倒至飽和NaHC03水溶液（3〇〇 mL)上’並用二氣曱烷（2x3 00 mL)萃取。將有機層合併並 用水（2x3 00 mL)洗滌。在減壓下蒸發溶劑，從而得到2 31 g呈發泡體之粗產物。藉由急驟層析法在矽膠上利用乙酸 乙酯/異丙醇（95:5)純化粗產物，從而獲得1 · 1 6 g之產物混 合物，其包含至少2種在LC-MS中具有期望質量之產物。 產物混合物原樣用於下一步驟。 HR-MS(主要異構物）：針對C69H94N8012來計算：[M+H]+: 1227.70640 ； [M+NH4]+ ： 1244.73295 ； [M+Na]+ ： 1249.68834 〇 測定值：[M+H]+ : 1227.70599 ; [M+NH4]+ : 1244.73200 ; [M+Na]+ : 1249.68733。 HR-MS(次要異構物）：針對c69H94N8012來計算：[M+H]+: 163698.doc -85 - 201249863 1227.70640 ; [M+NH4]+ : 1244.73295 ; [M+Na]+ : 1249.68834。 測定值：[M+H]+ : 1227.70598 ; [M+NH4]+ : 1244.73198 ; [M+Na]+ : 1249.68751。 合成化合物8之第二實例（i〇 g規模） 將化合物7 (10.0 g，8.13 mmol)溶解於四氫呋喃（127 mL) 及二曱亞颯（42 mL)中。在室溫下在劇烈攪拌下向此溶液 中添加1-羥基-1,2-苯峨醯-3(17/)-_ 1-氧化物（IBX) (15.18 g，45 °/〇m/m，24.4 mmol)。在室溫下將反應混合物攪拌16 h。然後將反應混合物傾倒至NaHC03水溶液（500 mL)上， 並添加乙酸乙S旨（250 mL)。將雙相混合物攪拌30 min，並 分離各相。用半飽和NaCl水溶液（250 mL)洗滌有機相，並 分各層。用乙酸乙酯（250 mL)萃取水層，併合併有機相。 在無水硫酸鎂上乾燥經合併有機相，並部分蒸發溶劑，從 而獲得大約50 g溶液。在矽膠管柱（1〇〇 g矽膠）上使用乙酸 乙酯/甲醇（98··2 v/v)作為流動相使此溶液急驟層析。用甲 苯（135 mL)處理由此獲得之產物溶液（537 4 ，並在“π 下在減壓下藉由部分蒸發溶劑將所得溶液濃縮至112 g最 終重量。將所得溶液冷卻至〇。〇,並在3〇min期間添加庚烷 (135 mL)。在〇°C下將由此獲得之懸浮液攪拌】h，藉由過 濾分離產物並用庚烷（2x3〇 mL)洗滌。最後，在真空中在 45C下將產物乾燥過夜，從而獲得8 824 g化合物8及其半 胺縮备異構物之混合物。產率：88.々％。 1D化合物A之合成 (S)-N -((2S’5S，8S，UR，i2S，15S，18S，21R)-2,8-di-(S)-第二· 丁基-21-經基-5_(4·經基节基）15·異丁基_41卜二曱基_ 163698.doc •86· 201249863 3,6,9，13，16,22-六側氧基-10-氧雜-1，4,7，14，17-五氮雜二環 [16.3.1]二十二烧-12 -基）-2 -異丁酿胺基戊烧二酿胺 反應方案4 : 化合物7
HO
163698.doc -87- 201249863 將化合物8 (2.0 g)溶解於二氣曱烷（400 mL)中，並將溶 液冷卻至0C。在0C下將三氟乙酸（115.9 g)添加至所授拌 溶液中，並在〇°C下將反應混合物攪拌4 h。在此溫度下添 加二氣曱烧（400 mL)，隨後添加水（2〇 g)。使反應混合物 升溫至室溫，並在室溫下再繼續攪拌5小時。對於處理， 將反應混合物傾倒至所攪拌之存於水（8〇〇 mL)中之乙酸鈉 (165.1 g)>谷液中，並添加乙酸乙醋（4〇〇 mL )，從而獲得溶 液。移除上層（水相）’並用水（2x200 mL)洗滌下層有機相 (二氣甲烷相）。用乙酸乙酯（2〇〇 mL)萃取水層，併合併有 機層。在減壓下移除溶劑，從而獲得呈5_及6員環異構物 之混合物之粗化合物A (參見反應方案5)，伴隨著三苯甲基 醇及反應之其他副產物。 藉由RP層析法在Silica Kromasil 100-10-C8上以作為流 動相之乙腈/水之梯度來純化粗產物。蒸發含有流分之產 物以移除乙腈’將沈澱物溶解於乙酸乙酯中，並在減壓下 移除溶劑’從而獲得0.895 g之化合物A ;產率：59.1%。 藉由NMR及MS來充分表徵該產物，且該產物之光谱係與 來自發酵之化合物A相同。 HR-MS :針對 〇46^172〇121^8來言十算：[m+H]+ : 929.53425 ; [M+NH4]+ : 946.56080 ; [M+Na]+ : 951.51619。測定值： [M+H]+ ： 929.53445 ； [M+NH4]+ ： 946.56129 ； [M+Na]+ : 951.51624 。 *H-NMR (600 MHz, d6-DMSO) δΗ: -0.11 (3H, d, J=6.2 Hz), 0.64 (4H, m), 0.77 (3H, d, J=6.2 Hz), 0.81 (3H, t, J=7.3 163698.doc -88 - 201249863
Hz), 0.84 (3H, d, J=7.0 Hz), 0.88 (3H, d, J=6.6 Hz), 1.02 (3H, d, J=6.7 Hz), 1.02 (1H, m), 1.03 (3H, d, J=6.7 Hz), 1.09 (1H, m), 1.20 (3H, d, J=6.2 Hz), 1.24 (1H, m), 1.39 (1H, m), 1.51 (1H, m), 1.75 (6H, m), 1.83 (1H. m), 1.92 (1H, m), 2.12 (2H, m), 2.47 (1H, m), 2.58 (1H, m), 2.67 (1H, m), 2.71 (3H, s), 3.16 (1H, d, J=14.2 Hz), 4.30 (1H, m), 4.34 (1H, m), 4.42 (1H, d, J=10.6 Hz), 4.45 (1H, m), 4.61 (1H, d, J=9.2 Hz), 4.71 (1H, dd, J=9.5, 5.5 Hz), 4.93 (1H, s), 5.05 (1H, dd, J=11.4, 2.6 Hz), 5.48 (1H, m), 6.07 (1H, d, J=2.6 Hz), 6.64 (2H, d, J = 8.4 Hz), 6.73 (1H, s), 6.99 (2H, d, J=8.4 Hz), 7.25 (1H, s), 7.35 (1H, d, J=9.2
Hz), 7·64 (1H，d, J=9.5 Hz), 7.73 (1H，d, J=9.2 Hz), 8.01 (1H，d，J=7.7 Hz)，8.42 (1H，d，J=8.8 Hz)，9.17 (1H，s)。 13C-NMR (150 MHz, d6-DMSO) 5C： 10.35, CH3； 11.21 CH3; 13.85, CH3; 16.00, CH3; 17.68, CH3; 19.52, 2xCH3; 20.89, CH3; 21.75, CH2； 23.30, CH3; 23.74, CH2； 24.21, CH; 24.48, CH2; 27.35, CH2； 29.78, CH2； 30.08, CH3; 31.49, CH2; 33.18, CH; 33.24, CH2; 33.76, CH, 37.41, CH; 39.23, CH2; 48.84, CH; 50.69, CH; 52.11, CH; 54.17 CH; 54.70, CH; 55.31, CH; 60.66, CH; 71.89, CH; 73.97, CH; 115.32, 2xCH; 127.34, Cq; 130.37, 2xCH; 156.27, Cq; 169.12, Cq; 169.29, Cq; 169.37, Cq; 169.79 Cq; 170.65, Cq; 172.40, Cq; 172.53, Cq; 173.87 Cq; 176.38, Cq。 合成化合物A之第二實例（8.5 g規模） 163698.doc -89- 201249863 將化合物8 (8.5 g，6.924 mmol)溶解於二氣甲烷（595 mL) 中，並將溶液冷卻至〇<t。將存於二氯甲烷（127 5 mL)中之 三氟乙酸（127.5 mL)溶液添加至經冷卻溶液中，將溫度維 持在〇°C至5°C下。在0°C下將反應混合物攪拌5 5 h並用二 氣曱烷（850 mL)稀釋，隨後添加水（42.5 mL)。使反應混合 物升溫至室溫，並在室溫下攪拌175 he對於處理，將反 應混合物傾倒至所攪拌之乙酸鈉水溶液（存於722 g水中之 169 g乙酸鈉）及乙酸乙酯（7〇〇 mL)之雙相混合物上。分離 各相，並用乙酸鈉水溶液（存於722 g水中之169 g乙酸鈉） 再次洗滌有機相。分離各層並用水（2x85〇 mL)洗滌有機 相。用乙酸乙酯（700 mL)萃取個別水相，併合併有機 層。將有機層經無水硫酸鎂乾燥，並在的它至“它下在減 壓下部分蒸發溶劑，從而獲得187 g之稀懸浮液。在15分 鐘内添加庚烷（187 g)，並將所形成懸浮液冷卻至〇它。在 〇°C下將懸浮液攪拌〗h，並藉由過濾分離產物。在真空中 在40°C下乾燥粗產物，從而獲得5 65 £粗化合物A。粗產 率：87.8% 〇 藉由RP層析法在Silica Kromasil l〇〇-i〇_c8上以作為流 動相之乙腈/水之梯度來純化〇96 g之粗產物。蒸發含有流 分之產物以移除乙腈，將沈澱物溶解於乙酸乙酯中，並在 減壓下部分移除溶劑，從而獲得4〇 g之溶液。在室溫下在 30 min期間將庚烷（4〇心添加至所攪拌溶液中並在室溫 下將所得懸浮液再搜拌2 h。藉由過濾分離產物，並用乙 酸乙酯/庚烷（1:1，2xl〇 mL)洗滌。在真空中在叫它至化艺 163698.doc *90· 201249863 下將產物乾燥16 h’從而獲得0.702 g之化合物A。RP層析 法及沈殿後之產率：64%。 實例2 :化合物b (N〇stopeptin BN920)之合成 (8)-2-乙醯胺基-：^-((18,23,58,88，1111，128，158，188,211〇-2-卡基- 21-經基- 5- (4 -經基 > 基）-15-異丁基-8-異丙基-4,11_ 二甲基_3,6,9，13，16,22-六側氧基-10-氧雜-1，4,7，14，17-五氮 雜二環[16.3.1]二十二烷-12-基）戊烷二醢胺 反應方案5 :
化合物10 163698.doc •91 · 201249863
化合物 B (Nostopeptin BN920) 2A前體肽2藉由SPPS之合成：
Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu)Me-Phe-合成組元 1-H)-Leu-
OH 設備： 肽合成器，其配備有具有用於自動溶劑遞送、搖動並吸 出試劑之玻料及歧管之250 ml玻璃反應器。 2Α(1) Ρηι〇(：-ΤΙιι·-Ι^ιι-Τι·ί-Τβη*α8Η.8之合成 藉由搖動使Fmoc-Leu-Trt-Tentagel-S-樹脂（18.7 g，裝載 量為 0.37 mmol/g(由 Rapp Polymere GmBH, Tubingen/ Germany供應））在DMF中溶脹30 min。 藉由用存於DMF中之20%六氫〇比咬連續處理兩次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。在藉由用DMF及異丙 醇交替洗滌若干次來洗滌樹脂之後，藉助在將酚酞及水添 加至最後一次洗滌步驟後是否存在粉色來檢驗鹼是否完全 移除。 將 4.7 g之Fmoc-Thr-OH、5.26 g之HATU及 1.8 g之DIPEA 溶解於50 ml之DMF中。再攪拌5 min後，添加u g之 I63698.doc •92- 201249863 DIPEA。檢驗ρΗ(>11)之後，將混合物添加至經去保護樹 脂中並搖動2 h。所實施Kaiser測試為OK，並藉由用DMF 及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌樹脂。乾燥之後，樹脂重 量係19.01 g。將小樣品裂解並藉由HPLC檢驗。單一主峰 顯示轉化成功。 2A(2) Fmoc-Gln(Trt)-Thr-Leu-Trt-Tentagel-S之合成 使 19.01 g Fmoc-Thr-Leu-Trt-Tentagel-S-樹脂（6.6 mmol) 在DMF中預溶脹，並藉由存於DMF中之20%六氫吡啶連續 處理兩次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。在藉 由用DMF及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌樹脂之後，藉助 在將酚酞及水添加至最後一次洗滌步驟後是否存在粉色來 檢驗驗是否完全移除。 W8.07giFmoc-Gln(Trt)-OH、5_01giHATU&3.4g2 DIPEA溶解於50 ml之DMF中。檢驗ρΗ(>11)之後，將混合 物添加至經去保護樹脂中並搖動1.5 h。所實施Kaiser測試 為OK，並藉由用DMF及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌樹 脂。所得樹脂直接用於下文以下步驟中，僅將小樣品裂解 並藉由HPLC檢驗。單一主峰顯示轉化成功。 2A(3) Ac-Gln(Trt)-Thr-Leu-Trt-Tentagel-S之合成 藉由在 DMF 中搖動使上文 Fmoc-Gln(Trt)-Thr-Leu-Trt-Tentagel-S樹脂在DMF中重新溶脹10 min。藉由用存於 DMF中之20%六氫°比°定連續處理兩次（分別5 min及15 min) 來裂解Fmoc保護基團。藉由用DMF及異丙醇交替洗滌若 干次來洗滌樹脂。將酚酞及水添加至最終洗滌溶液之樣品 163698.doc -93- 201249863 中。不出現粉色證明成功移除六氫。比。定。 將 0.774 g之乙酸、6.707 g 之 PyBOP 及 3.33 gtDIPEA 溶 解於50 ml之DMF中。檢驗ρΗ(>11)之後，將混合物添加至 經去保護樹脂中並搖動2.5 h。所實施Kaiser測試為〇κ，並 藉由用DMF及異丙醇交替洗;;條若干次來洗條樹脂。所得樹 脂直接用於下文以下步驟中，僅將小樣品裂解並藉由 HPLC檢驗。單一主峰顯示轉化成功。 2A(4) Ac-Gln(Trt)-Thr(Val，Fmoc)-Leu-Trt-Tentage卜S 之 合成（先前稱為：Ac-Gln(Trt)-Thr(VahFm〇c)-Leu-Trt-
Tentagel-S)(側鏈醋化） 藉由在DMF中搖動使上文Ac-Gln(Trt)-Thr-Leu-Trt-
Tentagel-S樹脂在DMF中重新溶脹1 0 min。 將 8.7 g之 Fmoc-Val-OH 及 8.3 g 之 D+IPEA溶解於 25 ml 之 DCM中。並行地，將2.76 g之MSNT溶解於另一 25 ml DCM 中。將兩種溶液合併’並在3 min預活化之後置於肽樹脂 中並搖動2 h。藉由用DMF及異丙醇交替洗滌若干次來洗 滌樹脂。所得樹脂直接用於下文以下步驟中’僅將小樣品 裂解並藉由HPLC檢驗。單一主峰顯示轉化成功。 2A(5) Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu)Me-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S之合成（先前稱為· Ac-GIn(Tl^)-Thr(Val_N-me-Tyr(tBu)-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S) 藉由在 DMF 中搖動使上文 Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S樹脂在 DMF 中重新溶服 10 min。 藉由用存於DMF中之20°/。六氫。比啶連續處理兩次（分別5 163698.doc -94· 201249863 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉由用DMF及異丙醇 交替洗蘇若干次來洗蘇樹脂。將酴醜及水添加至最終洗條 溶液之樣品中。不出現粉色證明成功移除六氫吡啶。 將6.1g之Fmoc-N-Me-Tyr(tBu)-OH、4·8g之HATU及3.3 g之DIPEA溶解於50 ml之DMF中。檢驗ρΗ(>11)之後，將混 合物添加至經去保護樹脂中並搖動2.5 h。所實施Kaiser測 試為OK，並藉由用DMF及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌 樹脂。所得樹脂直接用於下文以下步驟中，僅將小樣品裂 解並藉由HPLC檢驗。單一主峰顯示轉化成功。 2A(6) Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu)Me-Phe-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S 之合成（先前稱為：Ac_Gln(Trt)-Thr(Val-N-me-Tyr(tBu)-Phe-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S) 藉由在 DMF 中搖動使上文 Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu) Me-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S 樹脂在 DMF 中重新溶脹 1〇 min。 藉由用存於DMF中之20%六氫°比啶連續處理兩次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉由用DMF及異丙醇 父替洗蘇:¾•干次來洗j：條樹脂。將盼醜及水添加至最終洗務 溶液之樣品中。不出現粉色證明成功移除六氫吡啶。 將 9.66 g 之 Fmoc-Phe-OH、9.48 g 之 HATU 及 6.4 g 之 DIPEA溶解於1〇〇 mi之DMFf。檢驗pH(>11)之後，將混合 物添加至經去保護樹脂中並搖動2 h。所實施Kaiser測試為 OK，並藉由用DMF及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌樹 月曰。所得樹脂直接用於下文以下步驟中，僅將小樣品裂解 I63698.doc •95· 201249863 並藉由HPLC檢驗。單一主峰顯示轉化成功。 2A(7) Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu)Me-Phe-合成組元 1_ H)-Leu-OH 之合成（先前稱為：Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-N-me-Tyr(tBu)-Phe-合成組元 l-H)-Leu-OH)(=前體肽 2) 藉由在 DMF 中搖動使上文 Ac-Gln(Trt)-Thr(Val-Tyr(tBu) Me-Phe-Fmoc)-Leu-Trt-Tentagel-S 樹脂在 DMF 中重新溶脹 1 0 min。 藉由用存於DMF中之20%六氫吡啶連續處理兩次（分別5 min及15 min)來裂解Fmoc保護基團。藉由用DMF及異丙醇 交替洗滌若干次來洗滌樹脂。將酚酞及水添加至最終洗滌 溶液之樣品中》不出現粉色證明成功移除六氫吡啶。 將6·77 g之合成組元1、5.9 g之PyBOP及2.95 g之DIPEA 溶解於100 ml之DMF中。檢驗ρΗ(>11)之後，將混合物添 加至經去保護樹脂中並搖動2 h。所實施Kaiser測試為 OK，並藉由用DMF及異丙醇交替洗滌若干次來洗滌樹 脂。取小樣品用於HPLC檢驗之後，藉由用存於DMF中之 20%六風。比咬連續處理兩次（分別5 min及15 min)來裂解 Fmoc保護基團。藉由用DMF及異丙醇交替洗滌若干次來 洗條樹脂。最後用DCM將樹脂洗滌兩次。藉由在存於 DCM中之80〇/〇乙酸之混合物中搖動過夜來自樹脂裂解所合 成狀。將所得肽溶液過濾掉，並用DCM將樹脂洗滌兩次。 蒸發經合併濾液並最後藉由rP層析法使用梯度系統將其純 化。藉由HPLC分析所收集流分，並將純流分彙集在一 起’蒸發並最後冷凍乾燥。 163698.doc -96- 201249863 產量：3.54 g (42%)前體肽2。 HR-MS .針對 c85H108N8〇i3Si來言十算：[Μ+Η]+=1477·78779 ; 測定值：[Μ+Η]+=1477.78691。 2Β化合物β之合成 (S)-2-乙酿胺基N1_((IS，2S，5S，8S，11R，12S，15S，18S，21R)_ 2-苄基-21-羥基-5_(4_羥 基节基）·15_異丁基 _8_異丙基 _4，u_ 二甲基-3,6,9，13，16,22-六側氡基-1〇-氧雜_1，4,7，14，17-五氤 雜二環[16.3.1]二十二烷·12-基）戊烷二醯胺 2B(0)化合物9之合成 (S)-2-乙醯胺基 _N〗_((3S，6S，9S，12S，15S，18S，19R)9^*_ 6-(4-(第三-丁氧基）苄基）_12_(3·((第三-丁基二苯基甲矽烷 基）氧基）丙基）-15-異丁基-3-異丙基-7，19-二甲基-2,5,8，1 1，14，17-六側氧基-1_氧雜-4,7,1〇，13，16-五氮雜環十九烷- 18-基）-Ν5-三苯曱基戊烷二醯胺 在針對化合物6製備所述之類似條件下使前體肽2内醯胺 化’從而獲得化合物Β。藉由IR、NMR及MS來充分表徵該 產物（化合物9)。光譜證實所提出結構。 HR-MS :針對C85H106N8O12Si來計算：[M+H]+ : 1459.77723 ; [M+NH4]+ : 1476.80377。測定值：[M+H]+ : 1459.77719 ; [M+NH4]+ : 1476.80291。 2B(1)化合物1〇之合成 (8)-2-乙醯胺基->^-((38,68,95，128，15 8，188，1911)-9-节基_ 6-(4-(第三·丁氧基）苄基）-12-(3-經基丙基）-15-異丁基-3-異 丙基-7，19-二甲基-2,5,8，11，14，17-六側氧基-1-氧雜- 163698.doc •97- 201249863 4,7，10，13，16-五氮雜環十九烷·18_基）_n5_=苯甲基戊烷二 醯胺 在針對化合物7製備所述之類似條件下實施去甲石夕烧化 反應，從而獲得化合物10。藉由IR、；^]^11及]^8來充分表 徵該產物。光譜證實所提出結構。 HR-MS :針對 C69H88N8〇12 來計算：[m+H]+ : 1221.65945 ; [M+NH4]+: 1238.6860; [M+Na]+: 1243.64139。測定值： [M+H]+ ： 1221.65894 ； [M+NH4]+ ： 1238.68518 ； [M+Na]+ : 1243.64001 ° 2B(2)化合物11 (醛）之合成 (S)-2-乙醯胺基-Ni-((3S，6S，9S，12S，15S，18S，19R)-94*_ 6-(4-(第三-丁氧基）苄基）_15·異丁基_3_異丙基_7，19_二甲 基-2,5,8，11，14，17-六側氧基-12-(3-侧氧基丙基）-1_氧雜_ 4,7，10,13,16-五氣雜環十九院-18-基）-N5-三苯曱基戊烧二 醯胺 在針對化合物8製備所述之類似條件下使化合物1 〇氧 化’從而獲得化合物11。LC-MS分析顯示若干個具有期望 質量之峰，此指示存在醛、5員環半胺縮醛及6員環半胺縮 醛之混合物。混合物原樣用於下一步驟。HR-MS(主峰）： 針對 C69H86N80 丨2來計算：[M+H]+ : 1219.64380 ; [M+NH4]+ : 1236.67035 ; [M+Na]+ : 1241.62574 » 測定值：[m+H]+ : 1219.64404 ； [M+NH4]+ ： 1236.67053 ； [M+Na]+ ： 1241.62524 ° 2B(3)化合物B (Nostopeptin BN920)自化合物11之合成 (S)-2-乙醯胺基-：^-((18,28,58,88，1111，128，158，188,2111)- 163698.doc • 98- 201249863 2-苄基-21-羥基-5-(4-羥基苄基）-15-異丁基-8-異丙基-4，11-二甲基-3,6,9，13，16,22-六側氧基-10-氧雜-1，4,7，14，17-五氮 雜二環[16.3.1]二十二烷-12-基）戊烷二醯胺 將化合物11 (1 ·〇 g，0.82 mmol)溶解於二氯甲烧（200 mL) 中。在15°C至25°C下在10分鐘期間添加三氟乙酸（57.8 g)， 並在室溫下將反應混合物攪拌45小時。然後用二氣甲烷 (200 mL)稀釋反應混合物，並添加水（10 mL)。在室溫下再 繼續攪拌24小時。在20分鐘内將反應混合物傾倒至飽和 NaHC03水溶液（700 mL)上，並依序添力口二氣曱院（5〇〇 mL)、異丙醇（50 mL)及水（500 mL)。分離各層，並用存於 二氣甲烷（500 mL)中之異丙醇（50 mL)溶液萃取水層。再次 分離各層，並用二氣曱烷（5 x300 mL)將水層萃取若干次。 將有機層合併並在減壓下蒸發溶劑，從而獲得粗產物混合 物（1.0 g)，其包含期望Nostopeptin BN920以及三苯甲基醇 及反應之其他副產物。藉由矽膠層析法利用二氣甲烷/異 丙醇作為流動相來純化粗產物，從而獲得純Nostopeptin BN920 (212 mg ’純度為97%(A))。收集較不純流分，從而 得到純度為90% (A)之402 mg額外產物《得自所有流分之 產率：614 mg (81%)。藉由IR、NMR及MS來充分表徵該 產物。光譜證實所提出結構。 HR-MS :針對C46H64N8012來計算：[m+H]+ : 921.47165 ; [M+NH4]+ : 938.49820 ; [M+Na]+ : 943.45359。測定值： [M+H]+ ： 921.47167 ； [M+NH4]+ ： 938.49861 ； [M+Na]+ : 943.45337。 163698.doc -99- 201249863 實例3:平衡之移位 反應方案4顯示存在脫水物形式之化合物A。現已發現， 此可使用在以下反應方案中所繪示之脫水物形式之簡單水 合程序來容易地轉化（轉化回）成化合物A : 反應方案6 :
此允許提高化合物A在任何類型合成（本發明中之化學合 成或藉由使用W02009/024527中之發酵）中之產率。 例如，在包含ahp次單元之化合物（例如實例1中之化合 163698.doc -100- 201249863 物A)中之酸敏感保護基團裂解期間，觀測到大量相應脫水 副產物形成。此副產物通常藉由例如層析法分離並處置。 此導致有價值產物損失並導致此步驟之產率低。例如，若 使化合物8之氧化產物經酸性條件以裂解三苯甲基及第三 丁基保護基團（方案4) ’則形成大量化合物a脫水物副產 物。視酸濃度及反應條件而定，化合物A脫水物可能甚至 作為此產物混合物中之主要產物形成。 例如，在氧化步驟（實例1)之後使用三氟乙酸/二氯曱烷 (5:95 v/v)裂解保護基團時，觀測到化合物A/化合物a脫水 物之比率（1:2)。 因此’尋找將脫水物副產物轉化成所欲產物之方式。現 已發現，此可在充分界定之條件下在水存在下藉由產物混 合物之酸催化平衡而達成。將水添加至實例丨之反應混合 物中，且隨後在室溫攪拌19 h，得到化合物A/化合物A脫 水物之比率約96:4之產物混合物。因此，在酸催化之去保 護步驟（方案4)之後將水添至反應混合物中，使化合物A/化 合物A脫水物之比率自水游離條件下之（1:2)改變至水添加 及平衡後之（96:4)。
化合物A在酸性去保護條件下形成化合物A脫水物係藉 由使用二氟乙酸於DCM中將純化合物A轉化成化合物A脫 水物證實。化合物八用33% (v/v) TFA於DCM中在室溫處理 2 h，得到化合物A脫水物/化合物八之比率為78 22 (根據 HPLC)之產物混合物。當吸水劑（例如分子篩）添加至反應 混合物中時，可使脫水達到>95%轉化因此，純化合物A 163698.doc • 101 · 201249863 於TFA/DCM之1:2混合物中在分子篩存在下攪拌，得到定 量粗產率及約96面積％ HPLC純度之脫水產物（實例3B)。 粗產物中仍存在約4面積％之化合物A。 將七自實例3B之化合物A脫水物轉化成化合物A係藉由 在三氟乙酸及水之存在下攪拌存於二氯曱烷中之化合物A 脫水物（實例3C)來證實。根據HPLC，由此獲得之產物包 含95.6面積％化合物A及僅4.4面積％化合物A脫水物。 反應方案7 : 化合物8 ch2ci/tfa 去保護
化合物A 實例3之實驗細節 3A ： 將得自氧化之23 mg產物混合物（化合物8及衍生自其之 環胺縮醛）溶解於DCM (5.7 mL)中，並在劇烈攪拌下將TFA (0.3 mL)添加至溶液中。在室溫下將反應混合物攪拌5 h， 直至IPC(HPLC)指示保護基團完全裂解。反應混合物中存 163698.doc •102· 201249863 在比率為1:2之化合物A及化合物A脫水物以及額外副產 物°用DCM (5.7 mL)稀釋反應混合物，並用水（0.23 mL)處 理劇烈攪拌溶液。室溫下19 h攪拌時間後之HPLC指示化合 物A/化合物A脫水物之比率為96:4。 對於處理’將反應混合物傾倒至存於水（23 mL)中之乙 酸鈉（1.62 g)溶液上，並添加乙酸乙酯（35 mL)。分離各 相’並用水（2U5 mL)萃取有機層。用乙酸乙酯（35 mL)萃 取水層’併合併有機層。在減壓下蒸發溶劑，從而獲得22 mg呈發泡體之粗產物。藉由急驟層析法在矽膠上利用乙酸 乙酯/甲醇95:5至90:10來純化粗產物，從而獲得96.8面積％ 純度之化合物A以及1.8面積％之5員環異構物》 3B ： 將化合物A(250 mg)溶解於二氣甲烷（1〇 mL)中，並添加 三氟乙酸（5 mL) ’隨後添加分子篩（1 g) β 1 h後之IPC (HPLC)指示化合物A/化合物A脫水物之比率為17:83。在室 溫下將反應混合物總共攪拌7 2 h。對於處理，藉由過滤移 除分子師’並將溶液傾倒至飽和NaHC03水溶液上。用乙 酸乙酯（50 mL)萃取水層。用水（20 mL)洗滌有機相，並在 減壓下蒸發溶劑，並在真空中乾燥殘留物，從而獲得呈發 泡體之定量產量（245 mg)粗產物。粗產物之hplc分析指示 存在比率為大約4:96面積％之化合物A/化合物A脫水物。 HR-MS :針對 C46H7〇N8〇ii 來計算：[M+H]+=91 1.52368 [M+NH4]+=928.55023，[M+Na]+=933_50563 ;測定值： [M+H]+=911.52372，[M+NH4]+=928.55029，[M+Na]+=933.50538。 163698.doc • 103 - 201249863 化合物A脫水物之結構係藉由h-NMR來證實。 】H-NMR (600 MHz，d6-DMSO) δΗ: 0.06 (3Η，d，j = 6.6 Hz), 0.07 (3H，t，J=7.3 Hz)，0.70 (3H，d，J = 7.0 Hz)，0.77 (3H，d, J = 6.6 Hz)，0.81 (1H，m)，0.87 (6H，m)，1.00 (3H，d，J=7 〇 Hz)，1.02 (3H，d，J=7.0 Hz)，1.06 (1H，m)，ι·16 (3H，d， J = 6.5 Hz)，1.17 (1H，m)，1_30 (1H，m)，1.41 (1H，m)，i 53 (1H，m)，1.74 (2H，m)，1.91 (2H，m)，2.01 (lti，m)，2.11 (2 H, m), 2.4 5 (3 H，m)，2.7 3 (3 H，s)，2.7 4 (1H，m)，3 1 8 (1H， m), 4.32 (2H, m), 4.50 (1H, m), 4.54 (1H, m)5 4.64 (1H, d, J=9.5 Hz), 4.77 (1H, d, J=11.0 Hz), 5.18 (1H, m), 5.26 (1H, m)，5.42 (1H，q, J=6.6 Hz)，6.25 (1H, d, J=7.3 Hz)，6 32 (1H, d, J —7.7 Hz), 6.67 (2H, d, J = 8.4 Hz), 6.75 (1H s), 7.04 (2H，d，J=8.4 Hz), 7.25 (1H, s)，7.30 (ih，d, J=8.8 Hz)，7.89 (1H，d，J=9.2 Hz)，7.98 (1H，d，J=8.l Hz), 8.50 (1H，d，J=8.4 Hz)，9.24 (1H，s) » 3C ： 將來自貫例2化合物A脫水物（110 mg)溶解於dcm (20 mL)中。添加TFA (1 g)及水（0.2 m L)，並在室溫下將反應 混合物攪拌20 h。對於處理，將反應混合物傾倒至乙酸乙 酯（50 mL)上，並用飽和NaHC〇3水溶液（50 mL)萃取乙酸乙 酯溶液。用水（20 mL)萃取有機層，並蒸發溶劑。將殘留 物溶解於乙酸乙醋/異丙醇9:1 (20 mL)中，並將溶液經0.45 微米過濾器澄清過濾。在減壓下蒸發溶劑，並在真空中在 45°C下乾燥殘留物’從而獲得1〇〇 mg粗產物。HPLC分析 163698.doc •104· 201249863 指示存在大約95.6面積％化合物A及大約4.4面積％化合物A 脫水物。 163698.doc -105-
Claims (1)
- 201249863 七、申請專利範圍： 1. -種用於製備式！之環縮肽化合物之方法或製程其中 八！係具有末端羧基或胺甲醯基之胺基酸、尤其天冬醢胺 酸或麩醯胺酸之二價部分，且在中在其右手側經由羰 基鍵結至分子之其餘部分；或係Ci8_烷醯基或磷酸化羥 基-Ci_8_烧酿基； X係經由八〗之>1鍵結且係醯基，或者若Αι係。^烷醯基或 磷酸化羥基-C〗 — 8·烷醯基，則X不存在； R2係CN8-烷基，尤其係曱基； R3係胺基酸、尤其白胺酸、異白胺酸或纈胺酸之側鏈； Rs係胺基酸、較佳苯丙胺酸、白胺酸、異白胺酸或纈胺 酸之側鏈； R6係羥基胺基酸、尤其酪胺酸之側鏈； R·7係胺基酸、較佳白胺酸、異白胺酸或纈胺酸之側鍵； 及 Y係氫或Ci.8-烷基； 或其鹽， 163698.doc 201249863 該方法包含 選擇性去保護式II之化合物其中Prot係保護基團，Y係如式I之化合物所定義，且 X*、A，、R2*、r3*、Rs*、R6* 及 r7* 分別對應於式4 之X、A,、R2、R3、R5、尺6及R7，但限制條件係若該等 部分之反應性官能團可參與不欲之副反應，則該等部八 至少係以經保護形式存在；以產生式m之化合物。为義之含義， 文所定 163698.doc •2- 201249863 使游離羥基在氧化條件下反應以形成式以之化合物並移除其餘保護基團以產生式I之化合物或其鹽， 及視情況，將式I之游離化合物轉化成鹽，將該式I之化 合物之鹽轉化成該式I之化合物之不同鹽，或轉化成該式 I之游離化合物’及/或將該式I之化合物之脫水類似物轉 化成該式I之相應化合物。 2 ·如請求項1之方法或製程，其中該式IV之化合物係藉由 固相肽合成與溶液相合成之組合自相應起始胺基酸及側 鏈前體合成。 3.如請求項1或2之方法或製程，對於合成如請求項丨中所 示之式II之化合物，進一步包含使式VI之化合物163698.doc 201249863 其中Prot係保護基團’ Y係如式化合物所定義，且 R2*、R3*、R5*、116*及117*係如請求項i中式1](之化合物 所定義；與式VII之酸 X** 、0H VII 或其反應性衍生物反應， 其中X**係胺基保護基團或係X*，且其中X*及A! *係如 請求項1中式II之化合物所定義；若χ"係胺基保護基 團，則移除該胺基保護基團X**以產生Η而非，並使 用相應酸Χ*·0Η或其反應性衍生物使該所得胺基與酿基 X*偶合，其中X*係如請求項i中式„之化合物所定義。 4.如請求項3之方法或製程’其進一步包含在帶朴端胺基 及C端羧基之該式VI之化合物之直鏈前體肽之内醯胺化 下，在允許自該胺基及該敌基形成酿胺鍵之反應條件 下，較佳使用溶液相化學環化。 、 5. 如請求項4之方法或製程，其中該直键 前體狀具有式VIII其中Prot*係保護基團，其可選擇性裂解 VIII 而不影響所存在 163698.doc 201249863 之其他保護基團且在該直鍵前體肽合成期間之去保 驟期間穩定（例如烯丙氧基羰基），且汉2*、R3*、Rs*、 R’及R’係如請求項4之式VI之化合物所定義；其：― 步包含在該式vm、尤其VIIIA之化合物環化後原位移 除該保護基團Prot*以產生式VI之化合物。 6. 如請求項5之方法或製程，其中該式VI„、尤其¥111八之 直鏈前體肽係由相應胺基酸藉由固相肽合成及隨後自所 用之固相裂解而合成。 如請求項6之方法或製程，其包含 在變化a)中，使式IX<胺基酸其中R，係如請求項1中式Π之化合物所定義，且pr〇t** 係胺基保護基團，其可在樹脂上移除而不裂解其他鍵； 或該胺基酸之反應性衍生物’經由氧偶合至可裂解連接 體L，該連接體L鍵結至固體樹脂res， 及移除該保護基團Prot** ; 使所獲得之式X表示的樹脂鍵結胺基酸163698.doc X 201249863 其中RES及R3*係如式IX之化合物所定義，η係自然數， 且L係可裂解連接體；與式XI之胺基酸偶合XI 其中Prot*係如請求項5中式VIII之化合物所定義，且R2* 係如請求項1中式Π之化合物所定義；或與該胺基酸之反 應性衍生物偶合，使所獲得之式XII表示的樹脂鍵結二肽其中Prot*係如請求項5中式VIII之化合物所定義，R2*及 R3*係如請求項1中式Π之化合物所定義，且η、L及RES 係如該式X之化合物所定義；經由游離羥基與式ΧΙΠ之 胺基酸偶合 H0NH-Prot** XIII 其中Prot"係如該式IX之化合物所定義，且R7*係如請求 項1中式II之化合物所定義；或與該胺基酸之反應性衍生 物偶合，及移除該保護基團Prot** ; 或者，在變化b)中，使式XXVII之二肽 163698.doc XXVII 201249863 ο. OH其中R2*及Prot**係如該式IX、尤其ΙΧΑ之化合物所述， 且Prot*係如請求項5中式VIII之化合物所定義；或該二 肽之反應性衍生物偶合至胺基醯基部分，該胺基醯基部 分經由氧鍵結至可裂解連接體L，該連接體L鍵結至固體 樹脂RES，可獲得式X，如在變化a)下所述其中RES及R3*係如該式IX之化合物所定義，且L及RES 係如上定義； 及移除該保護基團Prot** ; 及，在變化a)或變化b)之反應後，使所獲得之式XIV之化 合物 163698.doc 201249863其中I I及R’係如請求項1中式Π之化合物 義，Pr〇t*係如請求項5中式vm之化合物所定義，且斤 及腿係如該式X之化合物所定義；與式χν之胺基酸= 定 、L 合 ΗΟR XV 其中RJ及Υ係如請求項1中式II之化合物所定義且 Prot**係如該式IX之化合物所定義；或與該胺基酸之反 應性衍生物偶合，及移除該保護基團Prot** ; 使所獲得之式XVI之化合物J6369S.doc XVI 201249863 其中Υ、R2*、R3*、R7*及R6*係如請求項1中式II之化合 物所定義，Prot*係如請求項5中式VIII之化合物所定 義，且η、L及RES係如該式X之化合物所定義；與式 XVII之胺基酸偶合 Prot**-NH HO XVII 其中R5*係如請求項1中式II之化合物所定義，且Prot** 係如該式IX之化合物所定義；或與該胺基酸之反應性衍 生物偶合，及移除該保護基團Prot**， 及最後使所得之式XVIII之化合物RES XVIII 其中Y、R2*、R3*、R7*、R6*及R5*係如請求項1中式II之 化合物所定義，Prot*係如請求項5中式VIII之化合物所 定義，且η、L及RES係如該式X之化合物所定義；偶合 至式XIX之合成組元（synthon)163698.doc XIX 201249863 其中Prot係如請求項1中式η之化合物所定義，且Prot" 係如該式IX之化合物所定義；或偶合至該合成組元之活 化衍生物，及移除該保護基團Prot**以產生式χχ之化 合物XX 其中 Prot、γ、R2*、r3*、r7*、R6^R5*係如請求項 ^ 式η之化合物所定義，Prot*係如請求項5中式νπι之化合 物所定義，且η、L及RES係如該式X之化合物所定義， 及使式XX中之固相鍵結肽自固相L-RES裂解，以產生如 請求項5中所示之該式νπι、尤其viiia之相應化合物。 8·如請求項1或2之方法或製程，對於合成如請求項1中該 式Π之化合物’包含在帶有N端胺基及C端羧基之該式π 之化合物之直鏈前體肽的内醯胺化下，在允許自該胺基 及該绩基形成醯胺鍵之反應條件下，較佳使用溶液相化 學環化。 9.如請求項8之方法或製程，其中該直鏈前體肽具有式 XXV 163698.doc -10- 201249863 OProtXXV 其中 X*、Αι*、R2*、R3*、r5*、r6*、R7*及 Prot係如請 求項1中式II之化合物所定義。 10. 如請求項9之方法或製程，對於合成該式XXV之化合 物’進一步包含裂解式χχιν之化合物0-L RES XXIV 其中 X*、A,、R2*、R3*、R5*、R6*、R7*及 prot係如請 求項1中式II之化合物所定義，L係可裂解連接體，RES 係固體樹脂，n係自然數，且Pr〇t**係胺基保護基團，其 可移除而不會並行移除保護基團Pr〇t且產物保留在該樹 脂上；及（在裂解之前，與其並行或在其之後）移除保護 163698.doc 201249863 基團Prot**以產生該式XXV之化合物。 11.如請求項10之方法或製程，對於合成該式XXIV之化合 物，進一步包含使式XIX之胺基酸其中Prot係如請求項1中式II之化合物所定義，且Prot** 係如請求項1 〇中式XXIV之化合物所定義；或該胺基酸之 經活化衍生物，與式XXIII之化合物偶合(XXIII) 其中 X*、A，、R2*、R3*、R5*、R6* 及 R7* 係如請求項 1 中式II之化合物所定義，L係可裂解連接體，RES係固體 樹脂，且η係自然數。 12.如請求項11之方法或製程，對於合成該式XXIII之化合 物，進一步包含使式XVII*之胺基酸163698.doc -12- XVII* 201249863 其中R，係如請求項i中式π之化合物所定義，且Ργ〇ρ** 係胺基保護基團，其可選擇性裂解而不影響所存在之其 他保護基團且產物保留在該樹脂上；或該胺基酸之反應 性衍生物，與式ΧΧΗ之化合物偶合XXII 其中X*、Ai*、R2*、R3*、及R7*係如請求項1中式II 之化合物所定義’ L係可裂解連接體，res係固體樹脂， 且η係自然數；及移除該保護基團Pr〇t***。 13.如請求項12之方法或製程’對於合成該式χχπ之化合 物’進一步包含使式XV*之胺基酸6 XV* 其中IU*及Υ係如請求項1中式II之化合物所定義，且 Prot***係胺基保護基團，其可選擇性裂解而不影響所存 在之其他保護基團且產物保留在該樹脂上；或該胺基酸 之反應性衍生物，與式XXI之化合物偶合 163698.doc -13- 201249863XXI 其中X*、A丨*、R2*、尺3*及117*係如請求項i中式„之化合 物所定義，L係可裂解連接體’ RES係固體樹脂，且n係 自然數；及移除該保護基圑Prot***。 14. 如清求項13之方法或製程’對於合成該式XX〗之化合 物，進一步包含使式XIII*之胺基酸 NH-Prot* ΧΙΙΓ ο 其中Ρπη***係胺基保護基團，其可選擇性裂解而不影丨 所存在之其他保護基團且產物保留在該樹脂上，且r 係如請求項i中式Π之化合物所定義；或該胺基酸之反」 性衍生物， 與式XXVI之化合物之羥基反應， 163698.doc 201249863XXVI 其中X*、A〗*、R2*及R，係如請求項丨中式π之化合物所 定義，L係可裂解連接體，RES係固體樹脂，且η係自然 數； 及移除該保護基團Prot***。 15.如請求項14之方法或製程，對於合成該式XXVI之化合 物’進一步包含使式ΧΠ*表示的樹脂鍵結二肽XII* 其中Prot****係保護基團，其可選擇性裂解而不影響如 請求項1中所定義該式Π之化合物中存在之其他保護基團 且產物保留在該樹脂上，尺^及尺，係如請求項1中式 化合物所定義，L係可裂解連接體，RES係固體樹脂，且 163698.doc •15- 201249863 η係自然數；在移除該保護基團pro”***之後，經由此所 獲得之游離胺基與式VII之酸偶合 χ**/Αι、〇Η νπ 其中X**係胺基保護基團或係χ*，且其中X*及A〗*係如 請求項1中式Π之化合物所定義；或與該酸之反應性衍生 物偶合； 及，若X**係胺基保護基團，則移除該胺基保護基團χΗί* 以產生Η而非X*，並使用相應酸χ*_〇Η或該酸之反應性 衍生物使該所得胺基與醯基X*偶合，其中χ*係如請求項 1中式II之化合物所定義。 16·如凊求項15之方法或製程，對於合成該κχπ之化合物， 進一步包含使該式X表示的樹脂鍵結胺基酸其中R3*係如請求項1中式；[I之化合物所定義，L係可裂解 連接體，RES係固體樹脂，且η係自然數； 與式XI*之胺基酸偶合163698.doc 201249863 其中Prot****係保護基團，其可選擇性裂解而不影響所 存在之其他保護基團且產物保留在該樹脂上，且r/係 如請求項1中式II之化合物所定義；或與該胺基酸之反應 性衍生物偶合。 17.如請求項16之方法或製程，對於獲得該式X之樹脂鍵結 胺基酸，進一步包含使式Ιχ*之胺基酸其中R3 *係如請求項1中式Η之化合物所定義，且Pr〇t* * * 係胺基保護基團，其可選擇性裂解而不影響所存在之其 他保護基團且產物保留在該樹脂上；或該式ιχ*之胺基 酸之反應性衍生物，偶合至經由可裂解連接體L所鍵結 之羥基上，該連接體L鍵結至固體樹脂RES，及移除該保 護基團Prot***。 18.如請求項1或2之方法或製程，其中符號…、&、&、 Rs、R6、R7、X及Y或相應未經保護或經保護部分、 、R5*、R6*、R7*、X*及Y3經選擇，以使得在該所得 之式I化合物或其鹽中， Ai係L-麵醯胺酸之二價基團，經由其心羧基之羰基鍵結 至式1中A1右側之胺基且經由其α_胺基鍵結至χ，或係2S_ (2-羥基-3-膦醯氧基丙醯基； 係曱基； &係異丙基、異丁基或苄基，尤其係異丁基； 163698.doc •17- 201249863 Rs係第二丁基或苄基，尤其係第二丁基； R6係4-羥基苄基；X係乙醢基或異丁醯基，或者若〜係28_(2_經基_3_鱗酿 氧基）-丙醯基，則X不存在， 及 Y係甲基。 19. 一種用於將如請求項丨中所示或具有如請求項18中所定 義之取代基之式I之化合物的脫水物轉化成式相應化 合物之方法或製程，其中該脫水物具有式V其中Y、X、Ai、R2、R3、r5、心及r7係如請求項j及j 8 中任一項中式I之化合物所定義； 及/或其相應半胺縮酸類似物，其具有五員環而非式I中 之ahp結構，其亦可作為副產物形成且具有式V* 163698.doc •18· 201249863尤其式VA* HO其中Υ、X、A!、R2、R3、r5、心及R?係分別如請求項丄 及18中任一項中式i之化合物所定義. 或一種用於使該式I之化合物及其相應脫水物及/或半胺 縮醛之混合物之平衡移位以有利於該式化合物的方法 或製程， 該方法或製程包含使用水性酸作為反應性溶劑來驅動該 反應。 20. 如請求項19之方法或製程，其中該酸係羧酸，尤其係經 函基取代之C,·8烷酸’更尤其係三氟乙酸或三氣乙酸。 21. —種式II之化合物， 163698.doc -19- 201249863 OProt其中⑽係保護基團，丫係如請求項18 11 定義，且X*、A * ώ α 飞i之化。物所 22. 於如’求項1或17中所定義之式kx、Al、R2'， 然而限制條件係該等部分上之反： 團係以未經保埯+ , κ B晚 保°隻或經保護形式存在。Rc 〇 一種式III之化合物， (ΠΙ) …係如請求項18中式I之化合物所定m、 A’、R’、R’、r5*、R，及R7*分別對應於 或17中所定義式1<χ、 尺項1 〜R2、R3、r5、Rjr7 限制條件係除式III中頂部所矣 、、、 τ項。P所表不之羥基以外，該等部分 上之反應性官能未經㈣或_護形式存在。77 163698.doc 201249863 四、指定代表圖： (一) 本案指定代表圖為：（無） (二) 本代表圖之元件符號簡單說明： 五、本案若有化學式時，請揭示最能顯示發明特徵的化學式：163698.doc
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