RU96122565A - Актиномицетный промотор - Google Patents

Актиномицетный промотор

Info

Publication number
RU96122565A
RU96122565A RU96122565/13A RU96122565A RU96122565A RU 96122565 A RU96122565 A RU 96122565A RU 96122565/13 A RU96122565/13 A RU 96122565/13A RU 96122565 A RU96122565 A RU 96122565A RU 96122565 A RU96122565 A RU 96122565A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
dna
paragraphs
host
expression system
sequence
Prior art date
Application number
RU96122565/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2140984C1 (ru
Inventor
Серизава Нобуфуса
Ватанабе Итиро
Original Assignee
Санкио Компани Лимитед
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Санкио Компани Лимитед filed Critical Санкио Компани Лимитед
Publication of RU96122565A publication Critical patent/RU96122565A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2140984C1 publication Critical patent/RU2140984C1/ru

Links

Claims (1)

1. ДНК, обладающая активностью промотора транскрипции, причем упомянутая ДНК соответствует части, но не всей, 5'-некодирующей области в 1 кб, непосредственно примыкающей к открытой рамке считывания Streptomyces carbophilus, причем упомянутая рамка считывания кодирует цитохром Р-450.
2. ДНК, по п.1, отличающаяся тем, что имеет активность промотора транскрипции по крайней мере в одном штамме Streptomyces carbophilus.
3. ДНК по п.1 или 2, отличающаяся тем, что имеет активность промотора транскрипции по крайней мере в одном штамме Streptomyces lividans.
4. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что упомянутый цитохром Р-450 представляет собой цитохром P-450sca-2.
5. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что упомянутая промоторная активность является конститутивной.
6. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что упомянутая ДНК имеет длину по крайней мере 74 п.о.
7. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что упомянутая ДНК имеет длину по крайней мере 300 п.о.
8. ДНК по любому из пп.1-6, отличающаяся тем, что имеет длину менее 100 п.о.
9. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что непосредственно равноценна упомянутой 5' некодирующей области в 1 кб, к которой удалена по крайней мере одна пара оснований.
10. ДНК по п.9, отличающаяся тем, что упомянутая по крайней мере одна пара оснований удаляется с помощью средств, выбираемых из : рестрикционных эндонуклеаз, инженерии, отщепления от одного конца упомянутой 5'-некодирующей области, и их сочетания.
11. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что непосредственно равноценна упомянутой 5'-некодирующей области в 1 кб, которая частично расщеплена в направлении 5′ _→ 3′.
12. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что является двухцепочечной.
13. Цепь ДНК, которая является одной из цепей ДНК по любому из предшествующих пунктов.
14. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что содержит непрерывную последовательность из последовательности 1, начинающуюся с 428 и продолжающуюся на всем или части расстояния до основания под номером 1.
15. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что имеет длину, достаточную для способности проявлять промоторную активность по крайней мере существенно равноценную активности ДНК-вставки, выбираемой из группы, состоящей из ДНК-вставок в 320 и 428 п.о. плазмид pSCA1013-Δ(1013/428) и рSСА1013-Δ(1013/320), соответственно.
16. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что является достаточно короткой, чтобы не подвергаться субстратной индукции в значительной степени.
17. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что имеет полную последовательность, которая, по существу, идентична последовательности упомянутой 5'-некодирующей области в 1 кб, которой соответствует упомянутая ДНК.
18. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что имеет полную последовательность, которая, по существу, гомологична по крайней мере одной последовательности оснований упомянутой 5'-некодирующей области в 1 кб, которой соответствует упомянутая ДНК.
19. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что гибридизуется, при 60oC в 6 х SSC, с ДНК, содержащей нуклеотидную последовательность 1-320 последовательности 1.
20. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что гибридизуется, при 60oС в 6 х SSC, с ДНК, содержащей нуклеотидную последовательность 1-428 последовательности 1.
21. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что способна проявлять достаточную промоторную активность, чтобы обеспечить общий уровень экспрессии, по истечении одного часа превышающий, при сравнении, общий уровень экспрессии, полученный с упомянутой 5'-некодирующей областью в 1 кб, которая подверглась одночасовой субстратной индукции.
22. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что имеет одну или несколько дополнительных пар оснований, связанных с ней в тандем по крайней мере по одному из ее концов.
23. ДНК по любому из пп.1-7 и 9-22, отличающаяся тем, что имеет нуклеотидную последовательность 1-428 последовательности 1.
24. ДНК по любому из пп.1-7 и 9-22, отличающаяся тем, что имеет нуклеотидную последовательность 1-320 последовательности 1.
25. ДНК по любому из пп.1-6 и 9-22, отличающаяся тем, что имеет нуклеотидную последовательность 1-158 последовательности 1.
26. ДНК по любому из пп.1-6 и 9-22, отличающаяся тем, что имеет нуклеотидную последовательность 1-101 последовательности 1.
27. ДНК по любому из пп.1-6 и 8-22, отличающаяся тем, что имеет нуклеотидную последовательность 1-74 последовательности 1.
28. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что получена из SANK 62795 Streptomyces lividans, имеющего инвентарный номер FERM ВР-5299.
29. ДНК по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что имеет оперативную транскрипционную промоторную связь с открытой рамкой считывания.
30. ДНК-последовательность, содержащая ДНК по любому из предшествующих пунктов, при условии, что упомянутая ДНК не содержится в упомянутой ДНК-последовательности в таком варианте, который обеспечивает полную версию упомянутой 5'-некодирующей области в 1 кб.
31. Вектор, содержащий ДНК по любому из предшествующих пунктов.
32. Вектор по п. 31, отличающийся тем, что упомянутый вектор способен экспрессировать белок в соответствующей клетке-хозяине, причем упомянутый белок кодируется открытой рамкой считывания в опретивной связи с упомянутой ДНК.
33. Вектор по п.32, отличающийся тем, что упомянутый белок представляет собой p-450sca-2.
34. Вектор по любому из пп.31-33, отличающийся тем, что предоставляет хозяину селектируемый фенотип.
35. Хозяин, трансформированный вектором по любому из пп.31-34, при этом ДНК, обладающая активностью промотора транскрипции, находится в оперативной транскрипционной промоторной связи с добавочной открытой рамкой считывания.
36. Экспрессионная система, содержащая хозяина по п. 35, причем упомянутая система экспрессирует белок, кодируемый упомянутой добавочной открытой рамкой считывания, когда упомянутый хозяин культивируется при условиях, подходящих для экспрессии упомянутого белка.
37. Экспрессионная система по п.36, отличающаяся тем, что упомянутый хозяин является хозяином-прокариотом.
38. Экспрессионная система по п.37, отличающаяся тем, что упомянутый хозяин выбирается из группы, состоящей из Escherichia coli, Bacillus subtilis и Streptomyces.
39. Экспрессионная система по п.37, отличающаяся тем, что упомянутый хозяин представляет собой актиномицетного хозяина.
40. Экспрессионная система по п.37, отличающаяся тем, что упомянутый хозяин представляет собой стрептомицетного хозяина.
41. Экспрессионная система по п.37, отличающаяся тем, что упомянутый хозяин представляет собой Streptomyces lividans.
42. Экспрессионная система по п.41, отличающаяся тем, что упомянутый хозяин представляет собой штамм ТК21 Streptomyces lividans.
43. Экспрессионная система по любому из пп.36-42, отличающаяся тем, что упомянутый хозяин представляет собой трансформированный штамм S. Lividans, и открытая рамка считывания представляет собой гетерологичную ДНК.
44. Экспрессионная система по любому из пп.36-43, отличающаяся тем, что предназначена для экспрессии прокариотических белков.
45. Экспрессионная система по любому из пп.36-44, отличающаяся тем, что упомянутый вектор представляет собой многокопийный экспрессирующий вектор.
46. Экспрессионная система по п.45, отличающаяся тем, что упомянутый многокопийный вектор представляет собой pIJ702.
47. Экспрессионная система по любому из пп.36-46 для экспрессии продуктов, которые по природе экспрессируются только после субстратной индукции.
48. Экспрессионная система по любому из пп.36-47, отличающаяся тем, что упомянутый белок представляет собой антибиотик.
49. Экспрессионная система по любому из пп.36-48, отличающаяся тем, что культивируется совместно с системой, продуцирующей субстрат для упомянутого продукта экспрессии.
50. Экспрессионная система по любому из пп.36-49, отличающаяся тем, что упомянутым продуктом экспрессии является цитохром Р-450.
51. Экспрессионная система по п.50, отличающаяся тем, что упомянутым продуктом экспрессии является цитохром Р-450sca-2.
52. Экспрессионная система по п.51, отличающаяся тем, что упомянутым продуктом экспрессии является цитохром Р-450sca-2.
53. Экспрессионная система по любому из пп.36-52, отличающаяся тем, что белок, который экспрессируется, представляет собой цитохром Р-450sca-2, а хозяином является штамм S. lividans, который также экспрессирует систему переноса электронов, придающую упомянутому цитохрому способность принимать участие в гидроксилировании любого ML-236B, присутствующего в системе.
54. Способ получения натрийправастатина, который включает культивирование экспрессионной системы по п.53, при этом хозяином является, предпочтительно, штамм ТК21 S. lividans, причем упомянутое культивирование происходит в присутствии натрий-МL-236В и при условиях, допускающих продуцирование цитохрома, позволяющих упомянутому натрий-МL-236В превращаться в натрийправастатин с помощью каталитического действия упомянутого цитохрома Р-450sca-2, и последующее извлечение натрийправастатина из культуры.
55. Способ по п.54, отличающийся тем, что упомянутый хозяин представляет собой SANK 62795 Streptomyces lividans, имеющий инвентарный номер FERM ВР-5299.
56. Способ по п. 54 или 55, отличающийся тем, что упомянутый ML-236B продуцируется Penicillium citrinum, который сокультивируется с упомянутым хозяином.
57. Способ продуцирования нужного белка, причем упомянутый способ включает культивирование трансформированного хозяина по п.35 при условиях, допускающих продуцирование упомянутого белка, чтобы получить упомянутый белок, и извлечение белка.
58. Экспрессионная система по любому из пп.36-53, отличающаяся тем, что упомянутая открытая рамка считывания кодирует любую подходящую аминокислотную последовательность.
59. Экспрессионная система по п.58, отличающаяся тем, что упомянутую аминокислотную последовательность выбирают среди природной, вариантной или полимерной формы белка; слитой формы двух или большего числа различных белков; и их сочетаний.
60. SANK 62795 Streptomyces lividans, имеющий инвентарный номер FERM ВР-5299.
61. Плазмида рSСА1013-Δ(1013/428).
62. Плазмида pSCA1013-Δ(l013/320).
63. Плазмида pSCA1013-Δ(1013/158).
64. Плазмида pSCA1013-Δ(1013/101).
65. Плазмида pSCA1013-Δ(1013/74).
66. Streptomyces lividans TK21/pSCAl013-Δ(10l3/428).
67. Streptomyces lividans TK21/pSCAl013-Δ(1013/320).
68. Streptomyces lividans TK21/pSCAl013-Δ(10l3/158).
69. Streptomyces lividans TK21/pSCAl013-Δ(1013/101).
70. Streptomyces lividans TK21/pSCA1013-Δ(1013/74).
71. Промотор транскрипции, имеющий нуклеотидную последовательность 1-428 последовательности 1, полученный культивированием SANK 62795 Streptomyces lividans, имеющего инвентарный номер FERM ВР-5299, извлечением из клеток pSCA1013-Δ(1013/428) и перевариванием плазмиды ферментами рестрикции.
72. ДНК, обладающая активностью промотора транскрипции, по любому из предшествующих пунктов, которая соответствует упомянутой 5'-некодирующей области в 1 кб, из которой удалена по крайней мере одна пара оснований.
RU96122565A 1995-11-29 1996-11-28 Фрагмент днк, способ получения натрийправастатина, плазмида экспрессии (варианты), рекомбинантный штамм (варианты) RU2140984C1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP7-310247 1995-11-29
JP31024795 1995-11-29

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU96122565A true RU96122565A (ru) 1999-01-27
RU2140984C1 RU2140984C1 (ru) 1999-11-10

Family

ID=18002954

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU96122565A RU2140984C1 (ru) 1995-11-29 1996-11-28 Фрагмент днк, способ получения натрийправастатина, плазмида экспрессии (варианты), рекомбинантный штамм (варианты)

Country Status (20)

Country Link
US (1) US5830695A (ru)
EP (1) EP0776974B9 (ru)
KR (1) KR970027314A (ru)
CN (1) CN1158897A (ru)
AT (1) ATE239086T1 (ru)
AU (1) AU715626C (ru)
CA (1) CA2191503A1 (ru)
CZ (1) CZ291991B6 (ru)
DE (1) DE69627787T2 (ru)
DK (1) DK0776974T3 (ru)
ES (1) ES2197938T3 (ru)
HK (1) HK1004490A1 (ru)
HU (1) HU223206B1 (ru)
IL (1) IL119720A0 (ru)
NO (1) NO965072L (ru)
NZ (1) NZ299835A (ru)
PT (1) PT776974E (ru)
RU (1) RU2140984C1 (ru)
TW (1) TW562858B (ru)
ZA (1) ZA969974B (ru)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1020530B1 (en) * 1997-08-07 2008-03-12 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. PROCESS FOR THE PREPARATION OF HMG-CoA REDUCTASE INHIBITORS
KR100450562B1 (ko) * 2001-09-29 2004-09-30 코바이오텍 (주) 프라바스타틴의 전구체 및 그 유도체의 생산 방법
KR100414334B1 (ko) * 2001-09-29 2004-01-07 코바이오텍 (주) 프라바스타틴 나트륨의 생산 방법
NZ541815A (en) * 2003-01-21 2008-07-31 Ecopia Biosciences Inc Farnesyl dibenzodiazepinones, processes for their production and their use as pharmaceuticals
US7655646B2 (en) * 2003-01-21 2010-02-02 Thallion Pharmaceuticals, Inc. Dibenzodiazepinone analogues, processes for their production and their use as pharmaceuticals
US7297524B2 (en) * 2003-01-21 2007-11-20 Thallion Pharmceuticals Inc. Polynucleotides for production of farnesyl dibenzodiazepinones
CN1244688C (zh) * 2003-07-09 2006-03-08 上海天伟生物制药有限公司 生产普伐他汀钠的微生物和方法
US8163797B2 (en) * 2003-12-31 2012-04-24 Actavis Elizabeth Llc Method of treating with stable pravastatin formulation
TWI307360B (en) * 2004-12-03 2009-03-11 Teva Gyogyszergyar Zartkoruen Mukodo Reszvenytarsasag Process for constructing strain having compactin hydroxylation ability
EP1953233A1 (en) 2007-02-02 2008-08-06 LEK Pharmaceuticals d.d. Fermentation process for preparing pravastatin

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5179013A (en) * 1987-02-02 1993-01-12 Sankyo Company, Limited Cytochrome P-450 enzymes
ATE108483T1 (de) * 1987-02-02 1994-07-15 Sankyo Co Cytochrom-p-450-enzyme.
JPH03155790A (ja) * 1989-11-13 1991-07-03 Yamanouchi Pharmaceut Co Ltd 放線菌発現系転写促進配列
US5164305A (en) * 1990-01-18 1992-11-17 Cetus Oncology Corporation Streptomyces promoter and method of use thereof
WO1993012236A1 (en) * 1991-12-16 1993-06-24 E.I. Du Pont De Nemours And Company Constitutive expression of p450soy and ferredoxin-soy in streptomyces, and biotransformation of chemicals by recombinant organisms
JPH0670780A (ja) * 1992-08-28 1994-03-15 Sankyo Co Ltd 放線菌のシトクロムP−450sca遺伝子

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107400677B (zh) 一种基于CRISPR-Cas9系统的地衣芽孢杆菌基因组编辑载体及其制备方法
An High efficiency transformation of cultured tobacco cells
CN110331146A (zh) 一种调控sgRNA转录的启动子、表达载体,及其基因组编辑系统和应用
RU96122565A (ru) Актиномицетный промотор
Vargas et al. Isolation of cryptic plasmids from moderately halophilic eubacteria of the genus Halomonas. Characterization of a small plasmid from H. elongata and its use for shuttle vector construction
Kuhlemeier et al. Cloning of nitrate reductase genes from the cyanobacterium Anacystis nidulans
Jeong et al. Genetic engineering system for syngas-utilizing acetogen, Eubacterium limosum KIST612
ES8301503A1 (es) Procedimiento para la produccion de un microorganismo gene- ticamente modificado
WO1989006688A2 (en) Novel enzyme
Chauvat et al. Mutagenesis by random cloning of an Escherichia coli kanamycin resistance gene into the genome of the cyanobacterium Synechocystis PCC 6803: selection of mutants defective in photosynthesis
JPH1084978A (ja) 改良されたリボフラビン生産
AU3170197A (en) Isolation of the biosynthesis genes for pseudo- oligosaccharides from Streptomyces glaucescens GLA.O and their use
KR970027314A (ko) 악티노마이세트 프로모터
US4590162A (en) Transposable cloning vector
EP0213898B1 (en) A host-vector system
EP0196375B1 (en) Gene coding for signal peptides and utilization thereof
Temple et al. Analysis of cloned structural and regulatory genes for carbohydrate utilization in Pseudomonas aeruginosa PAO
Srinivas et al. Escherichia coli vectors having stringently repressible replication origins allow a streamlining of Crispr/Cas9 gene editing
KR100427587B1 (ko) 신규 d-글루탐산 합성효소 유전자 dna 및 이를 이용한 항생제 비의존성 벡터
EP0240105B1 (en) A gene coding for biotin synthetase and utilization thereof
Ladygin et al. Transformation of Chlamydomonas reinhardtii CW-15 with the hygromycin phosphotransferase gene as a selectable marker
JP2002508669A (ja) 所望の遺伝子の複数コピー、及び選択マーカーではなく、スクリーニング可能マーカーを含むタンパク質産生細胞
WO1986000929A1 (en) Recombinant dna molecule, transformed microorganisms and process for producing penicillin v amidase
JP2008526246A (ja) ジソラゾールの産生のための合成経路をコードする遺伝子
JP4329129B2 (ja) ビオチン生合成遺伝子を含むdna断片およびその利用