RU2808493C1 - Штамм вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-2/VII - Google Patents
Штамм вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-2/VII Download PDFInfo
- Publication number
- RU2808493C1 RU2808493C1 RU2023110539A RU2023110539A RU2808493C1 RU 2808493 C1 RU2808493 C1 RU 2808493C1 RU 2023110539 A RU2023110539 A RU 2023110539A RU 2023110539 A RU2023110539 A RU 2023110539A RU 2808493 C1 RU2808493 C1 RU 2808493C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- sat
- foot
- mouth disease
- strain
- disease virus
- Prior art date
Links
- 241000710198 Foot-and-mouth disease virus Species 0.000 title claims abstract description 102
- 208000007212 Foot-and-Mouth Disease Diseases 0.000 title claims abstract description 26
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims abstract description 20
- 230000002265 prevention Effects 0.000 title claims abstract description 9
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 title claims abstract description 8
- 101100422538 Escherichia coli sat-2 gene Proteins 0.000 title description 3
- 101710173681 Sulfate adenylyltransferase subunit 2 2 Proteins 0.000 claims abstract description 138
- 241000710189 Aphthovirus Species 0.000 claims description 3
- 241000709664 Picornaviridae Species 0.000 claims description 3
- 244000037640 animal pathogen Species 0.000 claims description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 abstract description 18
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 abstract description 12
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 6
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 abstract description 3
- 244000005700 microbiome Species 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 26
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 25
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 21
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 15
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 13
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 12
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 12
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 12
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 11
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 11
- 244000309730 Foot-and-mouth disease virus serotype SAT2 Species 0.000 description 10
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 10
- 238000000034 method Methods 0.000 description 10
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 9
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 9
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 7
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 7
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 7
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 7
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 7
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 6
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 5
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 5
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 4
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 description 4
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 4
- 230000008569 process Effects 0.000 description 4
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 4
- 102100031974 CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4 Human genes 0.000 description 3
- 101000703754 Homo sapiens CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4 Proteins 0.000 description 3
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 3
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 3
- 208000002399 aphthous stomatitis Diseases 0.000 description 3
- 229960001701 chloroform Drugs 0.000 description 3
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 3
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 3
- BTWUORFYKAZQHW-UHFFFAOYSA-L disodium;2-hydroxy-3-[4-[4-[(2-hydroxy-3-sulfonatopropyl)amino]-3-methylphenyl]-2-methylanilino]propane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].[Na+].C1=C(NCC(O)CS([O-])(=O)=O)C(C)=CC(C=2C=C(C)C(NCC(O)CS([O-])(=O)=O)=CC=2)=C1 BTWUORFYKAZQHW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 238000004264 monolayer culture Methods 0.000 description 3
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 3
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001573881 Corolla Species 0.000 description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 241000699673 Mesocricetus auratus Species 0.000 description 2
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 2
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 2
- 101710140501 Sulfate adenylyltransferase subunit 2 1 Proteins 0.000 description 2
- 102100030100 Sulfate anion transporter 1 Human genes 0.000 description 2
- 101710144481 Sulfate anion transporter 1 Proteins 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 2
- 210000003414 extremity Anatomy 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 230000002949 hemolytic effect Effects 0.000 description 2
- 210000000003 hoof Anatomy 0.000 description 2
- 230000000521 hyperimmunizing effect Effects 0.000 description 2
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 2
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 2
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241001250090 Capra ibex Species 0.000 description 1
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 241001492218 Foot-and-mouth disease virus - type SAT 2 Species 0.000 description 1
- 206010018910 Haemolysis Diseases 0.000 description 1
- 108010006464 Hemolysin Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004407 Lactalbumin Human genes 0.000 description 1
- 108090000942 Lactalbumin Proteins 0.000 description 1
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241001144416 Picornavirales Species 0.000 description 1
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 1
- 241001493546 Suina Species 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000003044 adaptive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000027645 antigenic variation Effects 0.000 description 1
- 238000002306 biochemical method Methods 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000005101 cell tropism Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008029 eradication Effects 0.000 description 1
- -1 freon Chemical compound 0.000 description 1
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 230000003067 hemagglutinative effect Effects 0.000 description 1
- 239000003228 hemolysin Substances 0.000 description 1
- 230000008588 hemolysis Effects 0.000 description 1
- 230000008004 immune attack Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000012417 linear regression Methods 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- WSFSSNUMVMOOMR-NJFSPNSNSA-N methanone Chemical compound O=[14CH2] WSFSSNUMVMOOMR-NJFSPNSNSA-N 0.000 description 1
- 244000005706 microflora Species 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 244000309711 non-enveloped viruses Species 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000000149 penetrating effect Effects 0.000 description 1
- 238000013081 phylogenetic analysis Methods 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009800 post vaccination immunity Effects 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000000601 reactogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- 238000009281 ultraviolet germicidal irradiation Methods 0.000 description 1
- 210000001364 upper extremity Anatomy 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Abstract
Изобретение относится к области биотехнологии и ветеринарной вирусологии. Предложен новый штамм вируса ящура Aphtae epizooticae под регистрационным номером №459 - деп / 23-9 - ГКШМ ФГБУ «ВНИИЗЖ». Изобретение может быть использовано для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-2/VII и для контроля антигенной активности противоящурных вакцин. 1 ил., 3 табл., 5 пр.
Description
Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии, может быть использовано для разработки и изготовления средств диагностики, специфической профилактики ящура генотипа SAT-2/VII и контроля антигенной и иммуногенной активности противоящурных вакцин.
Ящур является особо опасным высококонтагиозным вирусным заболеванием, которое причиняет серьезный экономический ущерб в связи с затратами на ликвидацию болезни и введением строгих ограничений, налагаемых на внутреннюю и международную торговлю продукцией животноводства. На сегодняшний день система мер для борьбы с ящуром и его профилактики предусматривает стемпинг-аут, а также массовую иммунизацию восприимчивых животных, и далее контроль уровня напряженности поствакцинального иммунитета [1].
Возбудителем является безоболочечный вирус рода Aphthovirus семейства Picornaviridae. Выделяют 7 различных серотипов вируса ящура: О, А, Азия-1, С и SAT-1, SAT-2, SAT-3. Геном вируса ящура представлен одноцепочечной молекулой РНК (ssRNA(+)) положительной полярности. Вирионная РНК различных штаммов вируса ящура имеют одинаковую длину около 8400-8500 и.о., кодирует 4 структурных белка: VP1, VP2, VP3, VP4 [2]. Вирус ящура серотипа SAT-2 имеет большую изменчивость последовательности в гене белка VP1 по сравнению с вирусами серотипов О, А и С [2, 3], для которых он рассматривается как широкий антигенный вариант, поэтому в случае SAT-2 требуется тщательный отбор иммунодоминантного вакцинного штамма [3].
Изменчивость вируса в пределах одного генотипа приводит к возникновению новых изолятов, которые отличаются по степени вирулентности и иммуногенности от ранее выделенных штаммов вируса ящура. Каждый серотип генетически разделен на различные топотипы, генетические линии и сублинии. Различия между ними определяют при анализе нуклеотидной последовательности 1D-гена (белок VP1), который характеризуется высокой геномной и антигенной вариабельностью [1, 2, 3].
Белок VP1 является наиболее вариабельным, поскольку на него приходится около 90% мутаций всех структурных генов. Самыми вариабельными областями являются участки 40-60, 130-160 и 190-213 а.о. [3, 4]. Участок поверхностного белка VP1 в регионе 130-160 а.о. отличается высокой вариабельностью, поскольку участвует в процессе связывания с рецепторами клетки-хозяина [4, 5]. Изменчивость данного региона дает возможность вирусу ящура взаимодействовать с рецепторами клеток разных типов и облегчает переход от одного вида хозяина к другому. Серотипы вируса ящура в среднем на 86% имеют идентичные последовательностей, хотя VP1 значительно более вариабелен. Нуклеотидные последовательности кодирующей области VP1 используются для генетической характеристики штаммов ящура из-за их значимости для прикрепления и проникновения вируса в клетку, защитного иммунитета и специфичности серотипа. Филогенетический анализ на основе последовательности VP1 широко используется для вывода эволюционной динамики, эпидемиологических отношений между генетическими линиями и для отслеживания происхождения и перемещения штаммов вируса ящура [5].
Наблюдаемая генетическая вариация в геноме вируса ящура является результатом двух процессов. Во-первых, это ошибки, которые возникают в результате репликации вирусной РНК и отсутствия репарации кодируемой РНК-зависимой РНК-полимеразы. Во-вторых, конкурентный отбор, который воздействует на геном. В природной среде в результате будут преобладать изоляты новых генетических линий, которые включают в свой геном требуемые для данной среды характеристики [4, 5].
В РНК-содержащих вирусах вариациям в геноме благоприятствуют высокие частоты мутаций во время репликации вируса, а возникающие линии и сублинии обусловлены мутациями и рекомбинацией. Рекомбинация - еще один важный процесс, определяющий биологию и эволюцию вирусов. Она представляет собой обмен генетическим материалом между двумя несегментированными РНК-геномами. Генетическая рекомбинация происходит между вирусами одного и того же серотипа [5]. Рекомбинации в нуклеиновой кислоте вируса ящура происходят легче в 3'-части генома, чем в участках, кодирующих структурные вирусные белки. Мутации в результате рекомбинации могут привести к обмену генетическим материалом и образованию новых антигенных вариантов, которые зачастую приводят к изменениям тропизма клеток. Одна или несколько аминокислотных замен на поверхности вирусных частиц могут привести к изменению распознавания и использования рецепторов. В результате один и тот же вирус может приобретать способность проникать в клетки с использованием альтернативных рецепторов [4, 5].
Антигенные вариации возникают из-за аминокислотных мутаций, которые изменяют распознавание вирусных белков иммунной системой организма. Поверхностно открытые структуры вируса особенно подвержены иммунной атаке. Процесс появления новых антигенных форм определяется сложным взаимодействием вирусных факторов и факторов клеток-хозяев. Изменения в генах, кодирующих капсидные белки, путем мутации могут привести к антигенным изменениям и появлению новых генетических линий [5, 6].
Для выявления генетических связей между различными изолятами и штаммами обычно применяют нуклеотидное секвенирование. Следовательно, в условиях вспышки можно проследить происхождение вируса. Антигенные характеристики вируса, связанные с появлением новых штаммов, важны для характеристики вспышек и поиска оптимальных вакцинных препаратов [4, 6].
Для вируса ящура серотипа SAT-2 характерна высокая генетическая изменчивость, а именно он включает в себя следующие 14 топотипов (I-XIV), внутри которых нет разделения на генетические группы. Такое высокое генетическое и антигенное разнообразие приводит к проблемам в специфической профилактике ящура при применении культуральных инактивированных противоящурных вакцин, а также затрудняет штаммоспецифическую диагностику выделенных изолятов вируса ящура. В результате возникает необходимость создания новых средств диагностики и специфической иммунопрофилактики в отношении вируса ящура серотипа SAT-2.
На территории Африканского континента регистрируются вспышки ящура серотипа SAT-2. Неблагополучная эпизоотическая ситуация связана с генотипом SAT-2/VII, который распространен в странах Северной Африки, в частности, в Египте, где вспышки отмечают в период с 2012 по 2022 гг. и Либии (2012 г.). На территории Западной Африки, в частности в Камеруне (2014 г.), Нигерии (2019-2021 гг.), также распространены изоляты вируса ящура данного генотипа. Соответственно, в указанных странах проводились мероприятия по ликвидации и борьбе с ящуром указанного генотипа. При этом появляются новые представители данного генотипа, которые имеют геномные и аминокислотные замены, что приводит к появлению новых свойств. В связи с этим имеются риски заноса изолятов данного серотипа на территорию Российской Федерации и других стран. Степень изменчивости внутри одного топотипа VII высокая, поэтому возникает острая необходимость в изучении свойств появляющихся штаммов вируса ящура и изготовления на его основе вакцинных препаратов и диагностических тест-систем.
Анализируя вспышки, которые регистрировались на территории Африки, обнаружено, были выявлены изоляты разных топотипов серотипа SAT-2, с I по XIV.
Известны производственные штаммы вируса ящура серотипа SAT-2, которые применяются или использовались ранее в мире для производства средств специфической профилактики ящура:
- штамм («SAT-2/ZIM/14/2002») (генотип SAT-2/I),
- штамм («SAT-2/ZIM/5/81») (генотип SAT-2/II),
- штамм («SAT-2/ВОТ/Р3/98») (генотип SAT-2/III),
- штамм («SAT-2/ETH/1/90») (генотип SAT-2/IV),
- штамм («SAT-2/GHA/2/90») (генотип SAT-2/V),
- штамм («SAT-2/GAM/8/79») (генотип SAT-2/VI),
- штамм («SAT-2/SAU/6/2000») (генотип SAT-2/VII),
- штамм («SAT-2/RWO/1/00») (генотип SAT-2/VIII),
- штамм («SAT-2/KEN/2/84») (генотип SAT-2/IX),
- штамм («SAT-2/ША/19/98») (генотип SAT-2/X),
- штамм («SAT-2/ANG/4/74») (генотип SAT-2/XI),
- штамм («SAT-2/UGA/51/75») (генотип SAT-2/XII),
- штамм («SAT-2/ETH/2/2007») (генотип SAT-2/XIII),
- штамм («SAT-2/ETH/2/9»1) (генотип SAT-2/XIV).
Изолят «SAT-2/Eritrea» вируса ящура был выделен от крупного рогатого скота на территории государства Эритрея в 1998 г. и поступил в ФГБУ «ВНИИЗЖ» из Всемирной справочной лаборатории института Пирбрайта для проведения научных исследований в 2020 г. По результатам исследований данной лаборатории современные циркулирующие изоляты в странах Африки и странах Закавказья, куда в настоящее время агрессивно проникает вирус ящура данного генотипа, близки по данным серологических и молекулярно-биологических исследований именно с изолятом «SAT-2/Eritrea» и, соответственно, штаммом «SAT-2/Eritrea/1998».
По результатам сравнительного анализа нуклеотидных последовательностей выделенный изолят принадлежит к топотипу VII серотипа SAT-2 вируса ящура, который значительно отличается от производственных штаммов вируса ящура типа SAT-2, в том числе и от штамма «SAT-2/SAU/6/2000» (генотип SAT-2/VII), который широко применяется в настоящее время [1].
Настоящее изобретение позволяет расширить арсенал производственных штаммов вируса ящура серотипа SAT-2, обладающих высокой инфекционной, антигенной и иммуногенной активностью в нативном виде, пригодный для контроля антигенной и иммуногенной активности вакцин, изготовления чувствительных и высокоспецифичных диагностических тест-систем и высоко иммуногенных вакцинных препаратов путем получения штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура типа SAT-2.
Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура депонирован во Всероссийской государственной коллекции экзотических типов вирусов ящура и других патогенов животных (ГКШМ) ФГБУ «ВНИИЗЖ» под регистрационным номером: №459 - деп / 23-9 - ГКШМ ФГБУ «ВНИИЗЖ».
Экспериментально подтверждена возможность использования штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура для изготовления средств диагностики и профилактики ящура генотипа SAT-2/VII.
Сущность изобретения отражена на графическом изображении:
Фиг. 1. - Дендрограмма, отражающая филогенетическое взаимоотношение штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура с эпизоотическими штаммами серологического типа SAT-2 Дендрограмма основана на сравнении полных нуклеотидных последовательностей гена VP1.
Сущность изобретения пояснена следующими перечнями последовательностей:
SEQ ID NO:1 представляет последовательность нуклеотидов гена белка VP1 штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура серотипа SAT-2;
SEQ ID NO:2 представляет последовательность аминокислот гена белка VP1 штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура серотипа SAT-2.
Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура характеризуется следующими признаками и свойствами.
Морфологические признаки
Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура серотипа SAT-2 относится к отряду Picornavirales, семейству Picornaviridae, роду Aphthovirus, виду Foot-and-Mouth Disease virus и обладает морфологическими признаками, характерными для возбудителя ящура: форма вириона иксаэдрическая, размер 21-22 нм. Вирион состоит из молекулы одноцепочечной молекулы РНК с позитивным смыслом, заключенной в белковую оболочку.
Антигенные свойства
По антигенным свойствам штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура относится к серотипу SAT-2. Вирус стабильно нейтрализуется гомологичной антисывороткой и не проявляет гемагглютинирующей активности. У переболевших животных в сыворотке крови образуются типоспецифические антитела, выявляемые в иммуноферментном анализе (ИФА) и реакции микронейтрализации (РМН).
Методом нуклеотидного секвенирования была определена первичная структура 1D-гена, кодирующего белок VP1, штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей показал, что штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура принадлежит к генотипу SAT-2/VII (Фиг. 1).
Антигенное родство (r1) штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура изучено в РМН в перекрестном исследовании штамма со специфическими сыворотками, полученными на следующие производственные штаммы вируса ящура:
- штамм («SAT-2/ZIM/14/2002») (генотип SAT-2/I),
- штамм («SAT-2/ZIM/5/81») (генотип SAT-2/II),
- штамм («SAT-2/BOT/P3/98») (генотип SAT-2/III),
- штамм («SAT-2/ETH/1/90») (генотип SAT-2/IV),
- штамм («SAT-2/GHA/2/90») (генотип SAT-2/V),
- штамм («SAT-2/GAM/8/79») (генотип SAT-2/VI),
- штамм («SAT-2/SAU/6/2000») (генотип SAT-2/VII),
- штамм («SAT-2/RWO/1/00») (генотип SAT-2/VIII),
- штамм («SAT-2/KEN/2/84») (генотип SAT-2/IX),
- штамм («SAT-2/ША/19/98») (генотип SAT-2/X),
- штамм («SAT-2/ANG/4/74») (генотип SAT-2/XI),
- штамм («SAT-2/UGA/51/75») (генотип SAT-2/XII),
- штамм («SAT-2/ETH/2/2007») (генотип SAT-2/XIII),
- штамм («SAT-2/ETH/2/9»1) (генотип SAT-2/XIV).
Титр референтных сывороток крови КРС, полученных путем иммунизации животных моновалентными вакцинами из производственных штаммов вируса ящура серотипа SAT-2, против 102 ТЦД50 гомологичного и гетерологичного вируса определяли в РМН при перекрестном титровании, рассчитывая значения с использованием уравнения линейной регрессии, и выражали в lg. Значение i1 определяли, как антилогарифм разности lg титров сыворотки против гетерологичного и гомологичного вируса [7, 8, 9].
Значение r1 в РМН интерпретировали следующим образом:
при ≥ 0,3 - исследуемый и производственный штаммы вируса ящура являются близкородственными;
при < 0,3 - исследуемый образец штамма вируса ящура отличается от производственного штамма.
Показатели антигенного родства при изучении штамма «SAT-2/Eritrea/1998» составили r1 от 0,01 до 0,20 а именно для штамма «SAT-2/ZIM/14/2002» - 0,05, для «SAT-2/ZIM/5/81» - 0,07, для «SAT-2/BOT/P3/98» - 0,06, для «SAT-2/ETH/1/90» - 0,01, для «SAT-2/GHA/2/90» - 0,09, для «SAT-2/GAM/8/79» - 0,08, для «SAT-2/SAU/6/2000» - 0,20, для «SAT-2/RWO/1/00» -0,17, для «SAT-2/KEN/2/84» - 0,11, для «SAT-2/UGA/19/98» - 0,13, для «SAT-2/ANG/4/74» - 0,11, для «SAT-2/UGA/51/75» - 0,12, для «SAT-2/ETH/2/2007» -0,19, для «SAT-2/ETH/2/9»1 - 0,18.
Полученные данные свидетельствуют об отсутствии антигенного родства с производственными штаммами вируса ящура серотипа SAT-2.
Гено- и хемотаксономическая характеристики
Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура является РНК(+) -содержащим вирусом с молекулярной массой 8,08×106 Д. Нуклеиновая кислота представлена одноцепочной линейной молекулой молекулярной массой 2,8×106 Д. Вирион имеет белковую оболочку, состоящую из четырех основных белков VP1, VP2, VP3 и VP4. Липопротеидная оболочка отсутствует.
Основным антигенным белком является VP1. В вирионе содержится приблизительно 31,5% РНК и 68,5% белка. Вирусная РНК является инфекционной и участвует в образовании белков-предшественников в инфицированных клетках. Предшественники, в свою очередь, расщепляются с образованием более стабильных структурных и неструктурных полипептидов вируса. Из 8 неструктурных полипептидов, накапливающихся в инфицированных клетках, выделяют РНК-зависимую РНК-полимеразу (3D-ген), участвующую в репликации РНК для сборки вирионов.
Физические свойства
Масса вириона составляет 8,4×10-18 г. Плавучая плотность 1,42 г/см3.
Устойчивость к внешним факторам
Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура устойчив к детергентам и органическим растворителям, таким как эфир, хлороформ, фреон, ацетон. Наиболее стабилен при рН 7,5-7,7. Сдвиги рН как в кислую, так и в щелочную сторону ведут к инактивации вируса. Чувствителен к формальдегиду, УФ-облучению, γ-облучению, высоким температурам (выше 38,0°С).
Дополнительные признаки и свойства
Реактогенность - реактогенными свойствами не обладает.
Патогенность - патогенен для парнокопытных животных.
Вирулентность - вирулентен для естественно-восприимчивых животных при контактном, аэрозольном и парентеральном заражении.
Стабильность - сохраняет исходные биологические свойства при пассировании в чувствительных биологических системах в течение 5 пассажей (срок наблюдения) на перевиваемых культурах.
Биотехнологические характеристики
Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура репродуцируется в перевиваемых культурах клеток: почки сибирского горного козерога (ПСГК-30), почки свиньи (IB-RS-2), почки сирийского хомячка (ВНК-21).
При испытании было проведено 5 последовательных пассажей штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура в перевиваемых культурах клеток ПСГК-30, ВНК-21, IB-RS-2. Биологические свойства характеризовали путем определения инфекционной активности вируса каждого пассажа в перевиваемой клеточной линии IB-RS-2 и на естественно восприимчивых животных - крупном рогатом скоте (КРС) и свиньях.
Сущность предлагаемого изобретения пояснена примерами его исследования, которые не ограничивают объем изобретения.
Пример 1. Исследование биологических свойств штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура при репродукции в монослойных перевиваемых клеточных линиях.
При выделении изолята «SAT-2/Eritrea» вируса ящура с целью получения его однородной популяции, обладающей оптимальными биотехнологическими свойствами, использовали комплекс биологических, вирусологических и биохимических методов, предусмотренных методическими указаниями по выявлению и идентификации штаммов вируса ящура [7].
Биологические и вирусологические методы включали в себя метод выделения в культуре клеток и адаптацию вируса ящура к перевиваемым клеточным линиям.
Выделение вируса ящура проводили в монослойных перевиваемых клеточных линиях ПСГК-30, IB-RS-2, ВНК-21 с последующей адаптацией в течение 5 последовательных пассажей. Культуры клеток выращивали на соответствующих питательных средах, в стационарных условиях во флаконах с площадью рабочей поверхности 25 см2, освобождали от ростовой среды и заражали 10%-ной суспензией афтозного материала (множественность заражения составляла 1-10 ТЦД50 на клетку), приготовленной в растворе Хэнкса с 0,5% гидролизата лактальбумина по стандартной рецептуре.
Для удаления микрофлоры и балластных клеточных компонентов вирусную суспензию предварительно обрабатывали 10%-ным раствором трихлорметана. После 30-минутного контакта вируса с клеточной культурой при температуре 37±0,5°С во флаконы вносили по 5,0 см3 поддерживающей среды и инкубировали при температуре 37±0,5°С до появления цитопатического действия (ЦПД) в культуре клеток, которое представлено в виде округления клеток, повышения их оптической плотности, дегенерации и отделении клеток от поверхности субстрата. При ЦПД не менее 95% клеток, флаконы подвергали замораживанию-оттаиванию, очистке клеточной взвеси хлороформом и центрифугированию при 3000 g в течение 15 мин. Полученный вируссодержащий материал использовали для последующих пассажей. Вирус считался адаптированным к культурам клеток, если в течение не менее 24 часов проявлялось 95-100%) ЦПД в монослое клеточных культур. Адаптация эпизоотического изолята «SAT-2/Eritrea» к различным клеточным линиям наступала на уровне пятого пассажа. Титр инфекционной активности определяли с помощью разработанной ранее методики [10].
Результаты адаптации вируса к различным клеточным культурам представлены в таблице 1, данные которой свидетельствуют о высокой адаптационной способности изолята «SAT-2/Eritrea» вируса ящура к использованным клеточным культурам. В монослойной культуре клеток ПСГК-30 за 24 ч получали вирусную суспензию с активностью в РСК 1:16 и титром инфекционной активности 7,25±0,10 lg ТЦД50/СМ3. В монослойной культуре клеток IB-RS-2 за 22 ч получали вирусную суспензию с активностью в РСК 1:16 и титром инфекционной активности 7,25±0,10 lg ТЦД50/см3. В монослойной культуре клеток ВНК-21 за 18 ч получали вирусную суспензию с активностью в РСК 1:32 и титром инфекционной активности 7,50±0,10 lg ТЦД50/СМ3. В итоге получен штамм «SAT-2/Eritrea/1998» с охарактеризованными биологическими культуральными свойствами, который далее использовали для исследования его свойств.
Пример 2. Оценка биологических свойств штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура на крупном рогатом скоте.
Заражение КРС исходным штаммом вируса ящура проводили интрадермолингвально (I пассаж). Адаптацию и наработку штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура на КРС проводили в течение 2 последовательных пассажей. С целью определения титра инфекционной активности адаптированного штамма из афт на этапе 2 пассажа на КРС получали 10%-ную вирусную суспензию, из которой готовили последовательные 10-кратные разведения на 1/15 М фосфатно-солевом буферном растворе (ФБР). Подготовленные разведения с 10-2 по 10-6 вводили интрадермолингвально в 4 точки по 0,1 см3 двум головам КРС. Учет результатов титрования на животных проводили спустя 24 ч по наличию афт на месте введения разведений вируса ящура штамма «SAT-2/Eritrea/1998». Титр инфекционной активности на КРС штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура на стадии первого пассажа на КРС составил 4,25 lg ИД50/0,1 см3, второго пассажа - 5,00 lg ИД50/0,1 см3. Таким образом, была получена 10%-ная афтозная суспензия вируса ящура штамма «SAT-2/Eritrea/1998» (2 пассаж на КРС) с титром инфекционной активности 5,00 lg ИД50 0,1 см3.
Пример 3. Оценка биологических свойств штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура на свиньях.
Заражение свиней исходным штаммом «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура проводили внутрикожно на стадии первого пассажа в область венчика передних конечностей. Адаптацию и наработку штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура на свиньях вели в течение 2 последовательных пассажей. С целью определения титра инфекционной активности адаптированного штамма из афт 2 пассажа на свиньях получали 10%-ную вирусную суспензию, из которой готовили последовательные 10-кратные разведения с использованием в качестве растворителя 1/15 М ФБР. Подготовленные разведения с 10-2 по 10-6 вводили внутрикожно в венчики копытец по 0,1 см3 в 4 точки на каждый палец конечности одного разведения, из расчета 1 разведение на 2 копытца 1 конечности каждому из 2 подопытных подсвинков.
Учет результатов титрования проводили через 24 ч по наличию афт на месте введения разведений. Титр инфекционной активности на свиньях для штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура на свиньях на стадии первого пассажа составил 4,50 lg ИД50/0,1 см3, второго - 5,25 lg ИД50/0,1 см3.
Пример 4. Исследование биологических свойств штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура при репродукции в перевиваемой суспензионной клеточной линии ВНК-21/SUSP/ARRIAH.
Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура репродуцировали в суспензионной перевиваемой культуре клеток из почки новорожденного сирийского хомячка ВНК-21/SUSP/ARPJAH. В качестве поддерживающей среды использовали среду Игла, с добавлением ферментативного гидролизата мышц сухого (ФГМС), гидролизата белков крови сухого (ГБКС) при рН среды 7,5-7,7. Клеточную линию заражали вирусом из расчета 0,001-0,100 ТЦД50/клетка.
Культивирование штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура осуществляли при температуре 37,0±0,1°С до достижения цитопатического действия вируса, соответствующего 95-100%. Полученную вируссодержащую суспензию контролировали на стерильность, а также определяли концентрацию 146S компонента (иммуногенный компонент) и общего вирусного белка (ОВБ). Концентрация ОВБ в суспензии составляла 1,91±0,31 мкг/см3. Значения титра инфекционной активности вируса, а также процентное содержание 146S компонента штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура отражены в таблице 2, из данных которой видно, что при средней концентрации клеток ВНК-21/SUSP/ARRIAH, равной 4,11±0,14 млн клеток/см3, дозе заражения 0,005 ТЦД50/кл. и продолжительности репродукции вируса 14,83±0,56 ч средний титр инфекционной активности возбудителя ящура был равен 8,41±0,21 lg ТЦД50/см3. Концентрацию 146S компонента вируса ящура определяли с помощью ранее разработанной методики [11]. Содержание данного компонента составило 1,34±0,22 мкг/см3 (69,54±0,40%).
Пример 5. Оценка типовой специфичности и активности штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура
Оценку типовой специфичности и активности штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура проводили в реакции связывания комплемента (РСК).
К полученному антигену штамма «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура, взятому в объеме 0,4 см3 в разведениях 1:2, 1:4, 1:8, 1:16, 1:32, 1:64 добавляли по 0,1 см3 гомологичной и гетерологичных гипериммунных сывороток, полученных на вирус ящура в рабочем (удвоенном) титре и 0,1 см3 комплемента в рабочем разведении. Смесь выдерживали в водяной бане в течение 20 мин при температуре 37±0,1°С. Затем вносили по 0,2 см3 гемолитической системы и выдерживали 30 мин при температуре 37±0,1°С. Положительный результат реакции соответствовал 100%-ной задержке гемолиза эритроцитов барана («4 креста»). Параллельно проводили контрольные реакции без сыворотки, без комплемента и компонентов реакции.
В качестве реагентов в РСК использовали сыворотки ящурные типоспецифические гипериммунные морских свинок, полученные на штаммы вируса ящура «SAT-2/Eritrea/1998», «SAT-2/SAU/6/2000», «А/Турция/06», «Азия-1/Таджикистан/2011», «SAT-1 №96», «SAT-3/Bech/65» комплемент сухой для РСК, гемолизин (сыворотка гемолитическая), эритроциты барана 2% (взвесь на физиологическом растворе, рН=7,05-7,15). В качестве контроля использовали антигены вируса ящура штаммов «SAT-2/Eritrea/1998», «SAT-2/SAU/6/2000», «А/Турция/06», «Азия-1/Таджикистан/2011», «SAT-1 №96», «SAT-3/Bech/65».
Результаты исследования отражены в таблице 3, из которой следует, что штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура обладает выраженной типовой специфичностью, относится к вирусу ящура серотипа SAT-2 и активен в РСК в разведении 1:32.
Источники информации, принятые во внимание при составлении описания изобретения к заявке на выдачу патента Российской Федерации на изобретение «Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-2/VII».
1. OIE. Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals. 7th ed. Paris, 2022. - Ch. 3.1.8
2. Пономарев А.П., Узюмов В.Л. Вирус ящура: структура, биологические и физико-химические свойства. Владимир: Фолиант, 2006. - 250 с.
3. Alexandersen, S. The pathogenesis and diagnosis of foot and mouth disease / S. Alexsandersen, Z. Zhang, A.L. Donaldson // J. Compr. Pathol. - 2003. - V. 129. - P. 268-282.
4. Жильцова M.B. Биологические свойства эпизоотических изолятов вируса ящура типов А, О и Азия-1: Автореф... дис. кан. наук. - Владимир: 2008. - 23 с.
5. Бурдов А.Н., Дудников А.И., Малярец П.В. и др. Ящур. / Под ред. А.Н. Бурдова. - М., Агропромиздат, 1990, 320 с.
6. Анализ эпизоотической ситуации по ящуру в России с 2010 г. по март 2019 г. / В.П. Семакина, Т.П. Акимова, В.А. Мищенко, А.К. Караулов // Ветеринария. - 2019. - №11. - С. 16-20.
7. Методические рекомендации по выделению и идентификации штаммов вируса ящура /А.А. Гусев, В.М. Захаров, Ж.А. Шажко и др.; ФГУ «ВНИИЗЖ». - Владимир. 2002. - 31 с.
8. Методические рекомендации по определению антигенного соответствия между эпизоотическими изолятами и производственными штаммами вируса ящура в перекрестной реакции микронейтрализации /С.Р. Кременчугская; ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2012. - 36 с.
9. Эпизоотологические особенности ящура типа А, вызванного гетерологичными штаммами вируса / А.В. Мищенко, В.А. Мищенко, В.В. Дрыгин [и др.] // Ветеринария. - 2014. - №11. - С. 20-24.
10. Патент №2674076 С1 Российская Федерация, МПК А61К 39/135 C12Q 1/68. Способ определения титра инфекционной активности вируса ящура в неинактивированном сырье для вакцины с применением метода обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции в режиме реального времени: №2017145889: заявл. 25.12.2017: опубл. 04.12.2018 / Д.А. Лозовой, Д.В. Михалишин [и др.]; заявитель Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ").
11. Патент №2712769 С1 Российская Федерация, МПК G01M 33/58, C12Q 1/68. Способ спектрометрического определения концентрации 146S частиц вируса ящура в неинактивированном сырье для вакцины по оценке количества молекул вирусной РНК, выделенной после иммунного захвата вирионов: №2019116272: заявл. 27.05.2019: опубл. 31.01.2020 / Д.А. Лозовой, Д.В. Михалишин [и др.]; заявитель ФГБУ "ВНИИЗЖ".
--->
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE ST26SequenceListing PUBLIC "-//WIPO//DTD Sequence Listing
1.3//EN" "ST26SequenceListing_V1_3.dtd">
<ST26SequenceListing dtdVersion="V1_3" fileName="FMDV SAT-2 Eritrea
1998_1678255673402.xml" softwareName="WIPO Sequence"
softwareVersion="2.1.2" productionDate="2023-03-08">
<ApplicationIdentification>
<IPOfficeCode>RU</IPOfficeCode>
<ApplicationNumberText>0</ApplicationNumberText>
<FilingDate>2023-03-08</FilingDate>
</ApplicationIdentification>
<ApplicantFileReference>491</ApplicantFileReference>
<EarliestPriorityApplicationIdentification>
<IPOfficeCode>RU</IPOfficeCode>
<ApplicationNumberText>0</ApplicationNumberText>
<FilingDate>2023-03-08</FilingDate>
</EarliestPriorityApplicationIdentification>
<ApplicantName languageCode="ru">ФГБУ "Федеральный центр охраны
здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ")</ApplicantName>
<ApplicantNameLatin>FGBI "ARRIAH"</ApplicantNameLatin>
<InventorName languageCode="ru">Доронин Максим
Игоревич</InventorName>
<InventorNameLatin>Doronin Maksim Igorevich </InventorNameLatin>
<InventionTitle languageCode="ru">Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса
ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для
диагностики и специфической профилактики ящура генотипа
SAT-2/VII</InventionTitle>
<SequenceTotalQuantity>2</SequenceTotalQuantity>
<SequenceData sequenceIDNumber="1">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>648</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..648</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q1">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>FMDV</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>accacctcggcgggagaaggcgcggatgtcgtcaccacggacccgtcta
cacacggcgggaacgtgcaagagggccgacgcaagcacactgaagtcgccttccttcttgaccgcagtac
acatgtccacacaaacaaaacatcattcgttgtggacctcatggacacaaagggaaaagcactcgtaggt
gcgatcctgcgggcttccacttactacttttgtgaccttgagattgcatgtgtgggtgaccacactaggg
tcttttggcagcctaacggggcgccgcggactacccaacttggtgacaaccccatggtttacgccaaggg
cggtgtgacccgctttgctatcccgttcacggccccacacaggctgctgtccactgtctacaatggcgag
tgcacctacgcaaaaaccgccaccgccattcgtggagaccgcgcagcactcgcggcgaagtacgctgcca
gcgtgcacactctaccgcaaaccttcaacttcgggttcgtgaccgtcgacaaaccagtcgatgtttacta
ccggatgaagagggctgagttgtactgtccacgcccactgctgccagcctacgaccacgcaagcagagac
agattcgacgcgcccattggcgtcgaaaggcagaccctg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="2">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>216</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>AA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..216</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>protein</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q2">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>FMDV</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>TTSAGEGADVVTTDPSTHGGNVQEGRRKHTEVAFLLDRSTHVHTNKTSF
VVDLMDTKGKALVGAILRASTYYFCDLEIACVGDHTRVFWQPNGAPRTTQLGDNPMVYAKGGVTRFAIPF
TAPHRLLSTVYNGECTYAKTATAIRGDRAALAAKYAASVHTLPQTFNFGFVTVDKPVDVYYRMKRAELYC
PRPLLPAYDHASRDRFDAPIGVERQTL</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
</ST26SequenceListing>
<---
Claims (1)
- Штамм «SAT-2/Eritrea/1998» вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа SAT-2/VII семейства Picornaviridae рода Aphthovirus, депонированный во Всероссийской государственной коллекции экзотических типов вируса ящура и других патогенов животных (ГКШМ) ФГБУ «ВНИИЗЖ» под регистрационным номером №459 - деп / 23-9 - ГКШМ ФГБУ «ВНИИЗЖ» и предназначенный для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-2/VII.
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2808493C1 true RU2808493C1 (ru) | 2023-11-28 |
Family
ID=
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2560268C1 (ru) * | 2014-02-19 | 2015-08-20 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | ШТАММ ВИРУСА ЯЩУРА Aphtae epizooticae ТИПА А ДЛЯ ИЗГОТОВЛЕНИЯ БИОПРЕПАРАТОВ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ И СПЕЦИФИЧЕСКОЙ ПРОФИЛАКТИКИ ЯЩУРА ТИПА А И ИХ КОНТРОЛЯ |
US10865389B2 (en) * | 2016-09-08 | 2020-12-15 | The Government of the United States of America, as represented by the Secretary of Homeland Security | DNA vaccines against foot-and-mouth disease virus |
RU2744791C1 (ru) * | 2020-05-26 | 2021-03-15 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровью животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | Штамм Азия-1 N 2356/14/2018 вируса ящура Aphtae epizooticae типа Азия-1 для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура типа Азия-1 |
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2560268C1 (ru) * | 2014-02-19 | 2015-08-20 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | ШТАММ ВИРУСА ЯЩУРА Aphtae epizooticae ТИПА А ДЛЯ ИЗГОТОВЛЕНИЯ БИОПРЕПАРАТОВ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ И СПЕЦИФИЧЕСКОЙ ПРОФИЛАКТИКИ ЯЩУРА ТИПА А И ИХ КОНТРОЛЯ |
US10865389B2 (en) * | 2016-09-08 | 2020-12-15 | The Government of the United States of America, as represented by the Secretary of Homeland Security | DNA vaccines against foot-and-mouth disease virus |
RU2744791C1 (ru) * | 2020-05-26 | 2021-03-15 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровью животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | Штамм Азия-1 N 2356/14/2018 вируса ящура Aphtae epizooticae типа Азия-1 для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура типа Азия-1 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
BASTOS, A.D.C. et al. The implications of virus diversity within the SAT 2 serotype for control of foot-and-mouth disease in sub-Saharan Africa. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY. 2003, v.84, pp.1595-1606. * |
SANGARE, O. et al. A first molecular epidemiological study of SAT-2 type foot-and-mouth disease viruses in West Africa. EPIDEMIOL INFECT. 2004, v.132, n.3, pp.525-532. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Gebauer et al. | Rapid selection of genetic and antigenic variants of foot-and-mouth disease virus during persistence in cattle | |
CN113564130B (zh) | 柯萨奇病毒a10型毒株及其应用 | |
RU2808493C1 (ru) | Штамм вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-2/VII | |
RU2806602C1 (ru) | Штамм "SAT-2/Кения/19/2017" вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления средств диагностики и профилактики ящура генотипа SAT-2/IV | |
RU2807038C1 (ru) | Штамм вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-1/X | |
RU2804634C1 (ru) | Штамм "SAT-1/Кения/2017" вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-1/NWZ | |
RU2806606C1 (ru) | Штамм "О N 2620/Оренбургский/2021" вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа O/ME-SA/Ind-2001e для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура | |
RU2809223C1 (ru) | Штамм "O N 2241/Эфиопия/2011" вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа О/ЕА-3 для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура | |
Brown | Stepping stones in foot-and-mouth research: a personal view | |
RU2799606C1 (ru) | Штамм "SAT-1/Танзания/2012" вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа SAT-1/I для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа SAT-1/I | |
RU2793828C1 (ru) | Штамм "О/Кения/2017" вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа O/EA-2 для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа O/EA-2 | |
RU2799602C1 (ru) | Штамм А/Иран/2018 вируса ящура Aphtae epizooticae типа А для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура типа А | |
RU2799601C1 (ru) | Штамм А/Афганистан/2017 вируса ящура Aphtae epizooticae типа А для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура типа А | |
RU2817257C1 (ru) | Штамм "SAT-2/XIV/2023" вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа SAT-2/XIV для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура | |
Barros et al. | Genetic variation of foot-and-mouth disease virus isolates recovered from persistently infected water buffalo (Bubalus bubalis) | |
RU2810133C1 (ru) | Штамм "А/Танзания/2013" вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа A/AFRICA/G-I для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа A/AFRICA/G-I | |
RU2773659C1 (ru) | Штамм А 2205/G IV вируса ящура Aphtae epizooticae типа А для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура типа А | |
RU2817256C1 (ru) | Штамм А/Египет/EURO-SA/2022 вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура генотипа A/EURO-SA | |
CN114921422A (zh) | 一种犬源猫细小病毒分离株及其应用 | |
RU2801950C1 (ru) | Штамм O N 2356/Пакистан/2018 вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа O/ME-SA/PanAsia2ANT-10 для изготовления биопрепаратов для диагностики ящура | |
RU2811585C1 (ru) | Штамм "O/ARRIAH/Mya-98" вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура | |
RU2817031C1 (ru) | Штамм "О N 2222/Тайвань/1/2012" вируса ящура Aphtae epizooticae для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура | |
RU2816943C1 (ru) | Штамм "Азия-1/G-V/2006" вируса ящура Aphtae epizooticae генотипа Азия-1/G-V для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура | |
Gao et al. | The rescue and selection of thermally stable type O vaccine candidate strains of foot-and-mouth disease virus | |
RU2804875C1 (ru) | Вакцина против ящура генотипа SAT-2/VII из штамма "SAT-2/Eritrea/1998" культуральная инактивированная сорбированная |