RU2657422C2 - Способ диагностики и/или прогноза острого повреждения почек - Google Patents

Способ диагностики и/или прогноза острого повреждения почек Download PDF

Info

Publication number
RU2657422C2
RU2657422C2 RU2014123753A RU2014123753A RU2657422C2 RU 2657422 C2 RU2657422 C2 RU 2657422C2 RU 2014123753 A RU2014123753 A RU 2014123753A RU 2014123753 A RU2014123753 A RU 2014123753A RU 2657422 C2 RU2657422 C2 RU 2657422C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
mir
expression
diagnosis
predisposition
expression level
Prior art date
Application number
RU2014123753A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2014123753A (ru
Inventor
ФРАЙЛЕ Элия АГВАДО
МУНЬОС Мирен Эдурне РАМОС
ТОА Анхель Мануэль КАНДЕЛА
Гарсиа Фернандо ЛИАНЬО
БЕРМЕХО Мария Лаура ГАРСИА
Original Assignee
Фундасион Пара Ла Инвестигасион Биомедика Дель Оспиталь Университарио Рамон И Кахаль
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Фундасион Пара Ла Инвестигасион Биомедика Дель Оспиталь Университарио Рамон И Кахаль filed Critical Фундасион Пара Ла Инвестигасион Биомедика Дель Оспиталь Университарио Рамон И Кахаль
Publication of RU2014123753A publication Critical patent/RU2014123753A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2657422C2 publication Critical patent/RU2657422C2/ru

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686Polymerase chain reaction [PCR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118Prognosis of disease development
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/178Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

Предложенная группа изобретений относится к области медицины. Предложен способ диагностики и/или определения у субъекта предрасположенности к развитию острого повреждения почек, включающий определение уровня экспрессии по меньшей мере miR-26b и сравнение указанного уровня экспрессии с контрольным значением, где снижение экспрессии является показателем острого повреждения почек или предрасположенности к развитию острого повреждения почек. Предложено применение in vitro набора реагентов и по меньшей мере miR-26b для диагностики и/или определения предрасположенности к развитию острого повреждения почек ишемической или токсической этиологии. Предложенная группа изобретений обеспечивает эффективные средства и методы диагностики и/или определения предрасположенности к развитию острого повреждения почек. 3 н. и 6 з.п. ф-лы, 7 ил., 4 табл.

Description

ОБЛАСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение относится к области общей биомедицины и, в частности, относится к способу диагностики и/или прогноза острого повреждения почек.
ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
МикроРНК представляют собой малые эндогенно закодированные РНК (рибонуклеиновая кислота) (22-25 нуклеотидов), способные распознавать информационные РНК и, таким образом, негативно регулировать экспрессию белка в РНК-индуцируемых комплексах выключения гена (RISCs, RNA-induced silencing complexes), благодаря частичной или полной комплементарности с целевыми мРНК. Большинство микроРНК транскрибируются РНК полимеразой II с отдельных генов или, как некоторые из них, с полицистронных транскриптов одновременно. Изначально они образуются в форме более длинных премикроРНК, которые процессируются в ядре рибонуклеазой III, транспортируются в цитоплазму посредством экспортина 5 и Ran (RAs-related Nuclear protein, RAs-связанные ядерные белки)-ГТФ (гуанозинтрифосфат)-зависимых механизмов и окончательно процессируются другой рибонуклеазой III до зрелой формы в цитоплазме.
Их функция имеет важное значение в большом количестве процессов, включая эмбриональное развитие, ответ на стресс или точную регуляцию физиологических процессов и, таким образом, сохранение гомеостаза тела.
Совсем недавно было показано, что микроРНК являются ключевыми регуляторами в быстром и точном клеточном ответе на любой тип стимулов, включая недостаток питания или гипоксию (Ivan M, Harris AL, Martelli F, Kulshreshtha R. Hypoxia response and microRNAs: no longer two separate worlds. J Cell Mol Med.; 12(5A): 1426-31, 2008).
Заявка на патент WO 2011012074 описывает ряд микроРНК, включая среди прочего miR-29a, в качестве плазматических маркеров рака печени, а также способ диагностики и оценки рака печени на основе детектирования по меньшей мере одной из указанных микроРНК.
Заявка на патент WO 2009036236 относится к ряду микроРНК, включая среди прочего miR-146a, в качестве плазматических маркеров рака печени, а также способ диагностики и/или оценки различных онкологических патологий на основе детектирования по меньшей мере одной из описанных микроРНК.
Akkina, S. et al., "MicroRNAs in renal function and disease", Translational Research, 2011 Apr, Vol. 157, No. 4, pg. 236-240 and Li, J.Y. et al., "Review: The role of microRNAs in renal disease", NEPHROLOGY (CARLTON), Sep 2010, Vol. 15, No. 6, p. 599-608, описывают участие микроРНК в физиологии и патологии почек.
JUAN, D. et al., "Identification of a microRNA panel for clear-cell renal cancer", UROLOGY, 2010 Apr, Vol. 75, No. 4, pages 835-41, описывает ряд микроРНК в качестве маркеров рака почки.
Острая почечная недостаточность (ΟΠΗ) представляет собой синдром, который характеризуется резким снижением гламерулярного фильтрата в течение нескольких дней или недель, и клинически выражается как неспособность выводить азотсодержащие продукты жизнедеятельности и регулировать гомеостаз жидкости и электролитов.
ΟΠΗ является одной из наиболее серьезных проблем среди заболеваний почек в развитом мире, так как является причиной высокой смертности около 50%. Около 30% случаев ΟΠΗ происходят у пациентов, поступивших в ОРИТ в результате полиорганной недостаточности. В последнем случае смертность возрастает до 80%.
Развитие ΟΠΗ также является одним из наиболее распространенных осложнений после оперативных вмешательств при сердечных заболеваниях, в количестве до 30000 в год в Испании, и более 1% указанных оперативных вмешательств проводят в данной больнице. Практически у всех пациентов, которые подвергаются оперативным вмешательствам, развивается определенная степень ΟΠΗ. Долгосрочное прогрессирование пациентов зависит от степени тяжести данной послеоперационной ΟΠΗ, в результате чего смертность близка к 60% в случаях, когда требуется диализ после оперативного вмешательства при сердечных заболеваниях (Candela-Toha А, Elias-Martin Ε, Abraira V et al. Predicting Acute Renal Failure after Cardiac Surgery: External Validation of Two New Clinical Scores. Clin J Am Soc Nephrol; 3:1260-1265, 2008). Кардиохирургия и трансплантация почек являются двумя «квази» экспериментальными ситуациями для изучения ΟΠΗ у человека с момента и во время регистрации ишемических стимулов и также может быть контролируемой. Вся данная статистика смертельных исходов заболевания значительно не изменилась за последние десятилетия, и до сих пор не существует эффективной терапии для предотвращения и/или лечения ΟΠΗ во всех данных ситуациях. В значительной степени это связано с отсутствием точных маркеров повреждения почек, помимо определения креатинина и мочевины в сыворотке крови, которые применяют до сих пор. Эти общепринятые маркеры не отражают напрямую повреждение клеток, а также участок ткани почки (канальцы или эндотелий), в котором произошло указанное повреждение, они являются лишь параметрами, указывающими на нарушенную функцию почек в результате повреждения (Vaidya VS, Waikar SS, Ferguson MA, et al., Urinary Biomarkers for Sensitive and Specific Detection of Acute Renal Injury in Humans. Clin Transl Sci.; 1(3): 200-208, 2008). Фактически, возможно, чтобы пациенты с субклиническим повреждением почек не определены как таковые, по причине отсутствия существенного изменения уровней креатинина и мочевины в сыворотке крови. Таким образом, за последние годы осуществлялись различные исследования для определения и подтверждения эффективности новых маркеров ΟΠΗ, таких как NGAL (Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, нейтрофильный желатиназо-ассоциированный липокалин), IL18, KIM (Kidney Injury Molecule 1, молекула повреждения почек), Цистатин С, VEGF (Vascular endothelial growth factor, фактор роста эндотелия сосудов) или CXCL10 (chemokine (С-Х-С motif), хемокин подсемейства С-Х-С), которые, по-видимому, работают как хорошие маркеры для популяции детей без значимых дополнительных патологий, но не для популяции взрослых пациентов (Vaidya VS, Waikar SS, Ferguson MA, et al., Urinary Biomarkers for Sensitive and Specific Detection of Acute Renal Injury in Humans. Clin Transl Sci. 1(3): 200-208, 2008).
Все описанное выше обосновывает необходимость выявления и определения эффективности новых биомаркеров прогрессирования повреждения почек, которые указывают на участок ткани, в котором происходит повреждение, а также на степень повреждения и/или восстановления, определение которых также является быстрым, простым и не требует проведения биопсии у пациента, которому они необходимы.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Таким образом, в первом аспекте настоящее изобретение относится к способу для получения данных, которые возможно применять для диагностики и/или прогноза острого повреждения почек, который включает определение уровня экспрессии по меньшей мере одной микроРНК, выбранной из miR-26b, miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, mi-R93, miR-10a, в образце, полученном от субъекта.
В настоящем изобретении острое повреждение почек понимается как любое повреждение, вызванное острым снижением функции почек в течение часов или дней, как, например, уменьшение гломерулярного фильтрата, или накопление в сыворотке крови азотсодержащих продуктов, или неспособность регулировать гомеостаз.
Во втором аспекте настоящее изобретение относится к способу диагностики и/или прогноза острого повреждения почек (здесь и далее способ согласно настоящему изобретению), который включает определение по меньшей мере одной микроРНК, выбранной из miR-26b, miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, miR-93, miR-10a, в образце, полученном от субъекта, и сравнение указанного уровня экспрессии с контрольным значением, где изменение указанного уровня экспрессии является показателем острого повреждения почек.
В более конкретном варианте осуществления настоящего изобретения образец для анализа выбирают из крови, сыворотки крови или мочи.
В более конкретном варианте осуществления настоящего изобретения снижение экспрессионного уровня miR-26b, miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, mi-R93 и/или miR-10a в сыворотке крови по отношению к контрольному уровню является показателем острого повреждения почек.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения экспрессию одной или нескольких микроРНК определяют с помощью количественной ПЦР (полимеразная цепная реакция).
В еще одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения экспрессию микроРНК определяют с помощью микрочипов.
В еще одном предпочтительном варианте осуществления, способ согласно настоящему изобретению включает определение уровней экспрессии miR-26b, miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, mi-R93 и miR-10a одновременно. В другом более предпочтительном варианте осуществления изобретения, снижение уровня экспрессии по меньшей мере одной из микроРНК является показателем острого повреждения почек.
В третьем аспекте настоящее изобретение относится к применению по меньшей мере одной микроРНК, выбранной из miR-26b, miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, mi-R93 и miR-10a для диагностики и прогнозирования острого повреждения почек.
В четвертом аспекте настоящее изобретение относится к применению miR-26b, miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, mi-R93 и miR-10a одновременно для диагностики и прогнозирования острого повреждения почек.
В пятом аспекте настоящее изобретение относится к набору реагентов для диагностики и/или прогнозирования острого повреждения почек (здесь и далее набор реагентов согласно настоящему изобретению) согласно способу согласно настоящему изобретению, включающему зонды и праймеры, необходимые для определения уровня экспрессии по меньшей мере одной микроРНК, выбранной из miR-26b, miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, mi-R93 и miR-10a.
В шестом аспекте настоящее изобретение относится к применению набора реагентов согласно настоящему изобретению для диагностики и/или прогнозирования острого повреждения почек.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ
Фиг. 1 показывает экспрессию miR-26b в сыворотке крови у пациентов с ΟΠΗ с ишемической этиологией (ПИ) и токсической этиологией (ПТ) со времени постановки диагноза (Д0) до 7 дней после постановки диагноза по сравнению с экспрессией микроРНК у двух групп здоровых индивидуумов (здоровые), а) значение цикла амплификации, на котором экспрессию микроРНК детектировали во всех образцах (пересечение пороговой линии, СТ) по сравнению с синтетической микроРНК, применяемой в качестве внутреннего контроля методики, б) относительное значение экспрессии микроРНК у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровыми индивидуумами, которые приравнивают к 1 посредством экспоненциальной математической формулы.
Фиг. 2 показывает экспрессию miR-29a в сыворотке крови у пациентов с ΟΠΗ с ишемической этиологией (ПИ) и токсической этиологией (ПТ) со времени постановки диагноза (Д0) до 7 дней после постановки диагноза по сравнению с экспрессией микроРНК у двух групп здоровых индивидуумов (здоровые), а) значение цикла амплификации, на котором экспрессию микроРНК детектировали во всех образцах (пересечение пороговой линии, СТ) по сравнению с синтетической микроРНК, применяемой в качестве внутреннего контроля методики, б) относительное значение экспрессии микроРНК у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровыми индивидуумами, которые приравнивают к 1 посредством экспоненциальной математической формулы.
Фиг. 3 показывает экспрессию miR-454 в сыворотке крови у пациентов с ΟΠΗ с ишемической этиологией (ПИ) и токсической этиологией (ПТ) со времени постановки диагноза (Д0) до 7 дней после постановки диагноза по сравнению с экспрессией микроРНК у двух групп здоровых индивидуумов (здоровые), а) значение цикла амплификации, на котором экспрессию микроРНК детектировали во всех образцах (пересечение пороговой линии, СТ) по сравнению с синтетической микроРНК, применяемой в качестве внутреннего контроля методики, б) относительное значение экспрессии микроРНК у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровыми индивидуумами, которые приравнивают к 1 посредством экспоненциальной математической формулы.
Фиг. 4 показывает экспрессию miR-146 в сыворотке крови у пациентов с ΟΠΗ с ишемической этиологией (ПИ) и токсической этиологией (ПТ) со времени постановки диагноза (Д0) до 7 дней после постановки диагноза по сравнению с экспрессией микроРНК у двух групп здоровых индивидуумов (здоровые), а) значение цикла амплификации, на котором экспрессию микроРНК детектировали во всех образцах (пересечение пороговой линии, СТ) по сравнению с синтетической микроРНК, применяемой в качестве внутреннего контроля методики, б) относительное значение экспрессии микроРНК у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровыми индивидуумами, которые приравнивают к 1 посредством экспоненциальной математической формулы.
Фиг. 5 показывает экспрессию miR-27a в сыворотке крови у пациентов с ΟΠΗ с ишемической этиологией (ПИ) и токсической этиологией (ПТ) со времени постановки диагноза (Д0) до 7 дней после постановки диагноза по сравнению с экспрессией микроРНК у двух групп здоровых индивидуумов (здоровые), а) значение цикла амплификации, на котором экспрессию микроРНК детектировали во всех образцах (пересечение пороговой линии, СТ) по сравнению с синтетической микроРНК, применяемой в качестве внутреннего контроля методики, б) относительное значение экспрессии микроРНК у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровыми индивидуумами, которые приравнивают к 1 посредством экспоненциальной математической формулы.
Фиг. 6 показывает экспрессию miR-93 в сыворотке крови у пациентов с ΟΠΗ с ишемической этиологией (ПИ) и токсической этиологией (ПТ) со времени постановки диагноза (Д0) до 7 дней после постановки диагноза по сравнению с экспрессией микроРНК у двух групп здоровых индивидуумов (здоровые), а) значение цикла амплификации, на котором экспрессию микроРНК детектировали во всех образцах (пересечение пороговой линии, СТ) по сравнению с синтетической микроРНК, применяемой в качестве внутреннего контроля методики, б) относительное значение экспрессии микроРНК у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровыми индивидуумами, которые приравнивают к 1 посредством экспоненциальной математической формулы.
Фиг. 7 показывает экспрессию miR-10а в сыворотке крови у пациентов с ΟΠΗ с ишемической этиологией (ПИ) и токсической этиологией (ПТ) со времени постановки диагноза (Д0) до 7 дней после постановки диагноза по сравнению с экспрессией микроРНК у двух групп здоровых индивидуумов (здоровые), а) значение цикла амплификации, на котором экспрессию микроРНК детектировали во всех образцах (пересечение пороговой линии, СТ) по сравнению с синтетической микроРНК, применяемой в качестве внутреннего контроля методики, б) относительное значение экспрессии микроРНК у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровыми индивидуумами, которые приравнивают к 1 посредством экспоненциальной математической формулы.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Эксперимент для крупномасштабного исследования микроРНК изначально проводили с использованием РНК, полученной от пациентов с острым повреждением почек с различной этиологией. Образцы, применяемые для данного способа, включали:
- Два образца от пациентов с острым повреждением почек с ишемической этиологией во время максимального повреждения почек, определенного с помощью обычных клинических диагностических параметров, таких как креатинин в сыворотке крови.
- Два образца от данных пациентов через 7 или 10 дней после почечной недостаточности, когда функция органа восстановлена, также оценивали с помощью креатинина в сыворотке крови.
- Два образца от пациента с почечной недостаточностью, вызванной нефротоксическими веществами, один во время максимального повреждения, а другой - когда функция почек восстановлена.
- Образец от пациента с почечной недостаточностью, вызванной сепсисом, собранный во время максимального повреждения органа.
- Две группы, состоящие из 5 здоровых человек, которые применяли в качестве контроля.
Эксперимент для крупномасштабного исследования микроРНК в сыворотке крови осуществляли с помощью количественной ПЦР, применяя прибор Taqman Low Density Array (TLDAs) фирмы Applied Biosystems. При анализе полученных данных, отбирали интересующие микроРНК для исследования.
Данные по экспрессии отобранных микроРНК, полученные в предыдущем эксперименте, впоследствии были подтверждены. В этой связи применяли образцы от пациентов, отличных от тех, которые были перечислены выше, и они состоят из:
- Четыре пациента с острой почечной недостаточностью с ишемической этиологией, обозначенные как ПИ1, ПИ2, ПИ3, ПИ4. От каждого пациента применяли образцы, полученные от каждого пациента в день 0, время постановки диагноза, в 1, 3, 5 и 7 дни после постановки диагноза почечная недостаточность.
- Три пациента с острой почечной недостаточностью, вызванной нефротоксическими веществами, обозначенные как ПТ1, ПТ2, ПТ3. От каждого пациента применяли образцы, полученные в день 0, время постановки диагноза, в 1, 3, 5 и 7 дни после постановки диагноза почечная недостаточность.
- Две контрольные группы, каждая из которых состоит из 10 здоровых людей.
Для подтверждения данных осуществляли количественную ПЦР с применением индивидуальных зондов технологии LNA (Exiqon) для каждой микроРНК.
Как показано на Фиг. 1-4, экспрессия микроРНК в сыворотке крови снижается у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровыми контролями.
Фиг. 5 показывает, что экспрессия микроРНК miR-27a снижается у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровым контролем. Важно отметить, что экспрессия miR-27a в течение 7 дней была наиболее вариабельной среди пациентов, и некоторые из них имели тенденцию к восстановлению значений экспрессии до уровня здоровых индивидуумов.
Экспрессия miR-93 (Фиг. 6) снижается у пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровым контролем, и также следует отметить, что у некоторых пациентов в день 7 данная микроРНК демонстрирует тенденцию к восстановлению значений, близких к контролю.
Экспрессия miR-10а (Фиг. 7) снижается у некоторых пациентов с ΟΠΗ по сравнению со здоровым контролем, данная тенденция не наблюдалась у пациента с ишемией, и очень важно отметить, что на 7 день уровни экспрессии микроРНК восстановились у некоторых пациентов.
Помимо этого, для экспрессии микроРНК у различных пациентов были посчитаны значения площади под кривой с помощью анализа характеристической кривой (ROC-характеристики).
Таблица 1 показывает, что данные микроРНК имеют диагностическую ценность для ΟΠΗ, независимо от этиологии ΟΠΗ, их чувствительность и специфичность намного превышает данные показатели определения креатинина в сыворотке крови (маркер, который применяют в настоящее время).
Figure 00000001
Figure 00000002
Таблица 1: Анализ характеристической кривой для микроРНК у пациентов в ОРИТ (Отделение реанимации и интенсивной терапии) в день 0.
Данные таблицы 2 показывают, что данные микроРНК являлись более чувствительными и специфичными, чем креатинин, свидетельствуя, что несмотря на нормальные значения креатинина, почечная недостаточность сохраняется, таким образом, данные микроРНК имеют высокую прогностическую ценность в отношении прогрессирования данных пациентов в течение долгого времени в долгосрочную хроническую почечную недостаточность.
Figure 00000003
Таблица 2: Анализ характеристической кривой для микроРНК у пациентов в ОРИТ в день 7.
Данные таблицы 3 показывают, что изменение данных микроРНК указывает на предрасположенность к развитию ишемической ΟΠΗ после кардиохирургического вмешательства.
Figure 00000004
Таблица 3: Анализ характеристической кривой для микроРНК у пациентов после кардиохирургического вмешательства.
Данные таблицы 4 показывают, что изменение данных микроРНК являются ранними индикаторами развития ΟΠΗ после кардиохирургического вмешательства.
Figure 00000005
Figure 00000006
Таблица 4: Анализ характеристической кривой для микроРНК у пациентов сразу после кардиохирургического вмешательства.

Claims (9)

1. Способ диагностики и/или определения у субъекта предрасположенности к развитию острого повреждения почек, который включает определение уровня экспрессии по меньшей мере miR-26b в образце сыворотки крови или крови, собранной у пациента, и сравнение указанного уровня экспрессии с контрольным значением, где снижение указанного уровня экспрессии является показателем острого повреждения почек или предрасположенности к развитию острого повреждения почек.
2. Способ по п. 1, диагностики и/или определения у субъекта предрасположенности к развитию острого повреждения почек ишемической или токсической этиологии.
3. Способ по любому из пп. 1 или 2, где экспрессию микроРНК определяют с помощью количественной ПЦР.
4. Способ по любому из пп. 1 или 2, где уровень экспрессии микроРНК определяют с помощью РНК-микрочипов.
5. Способ по любому из пп. 1 или 2, отличающийся тем, что дополнительно включает определение уровней экспрессии miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, miR-93 и miR-10a одновременно.
6. Способ по п. 5, где снижение уровня экспрессии по меньшей мере одной микроРНК является показателем острого повреждения почек.
7. Применение in vitro по меньшей мере miR-26b для диагностики и/или определения у субъекта предрасположенности к развитию острого повреждения почек ишемической или токсической этиологии в образце сыворотки крови или крови, собранной у пациента.
8. Применение in vitro по п. 7, дополнительно включающее определение уровня экспрессии miR-29a, miR-454, miR-146a, miR-27a, miR-93 и miR-10a одновременно.
9. Применение in vitro набора реагентов для диагностики и/или определения у субъекта предрасположенности к развитию острого повреждения почек ишемической или токсической этиологии согласно способу по любому из пп. 1-6, включающего зонды и праймеры, необходимые для определения уровня экспрессии по меньшей мере miR-26b.
RU2014123753A 2011-12-15 2012-12-11 Способ диагностики и/или прогноза острого повреждения почек RU2657422C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
ESP201132023 2011-12-15
ES201132023A ES2414290B1 (es) 2011-12-15 2011-12-15 Metodo para el diagnóstico y/o pronóstico de daño renal agudo
PCT/ES2012/070858 WO2013087961A1 (es) 2011-12-15 2012-12-11 Metodo para el diagnostico y/o pronostico de daño renal agudo

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014123753A RU2014123753A (ru) 2016-02-10
RU2657422C2 true RU2657422C2 (ru) 2018-06-13

Family

ID=48611890

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014123753A RU2657422C2 (ru) 2011-12-15 2012-12-11 Способ диагностики и/или прогноза острого повреждения почек

Country Status (10)

Country Link
US (2) US20140378335A1 (ru)
EP (1) EP2792752B1 (ru)
JP (1) JP6356071B2 (ru)
CN (2) CN107385025A (ru)
BR (1) BR112014014279A2 (ru)
CA (1) CA2859081A1 (ru)
ES (3) ES2432853B1 (ru)
MX (1) MX359369B (ru)
RU (1) RU2657422C2 (ru)
WO (1) WO2013087961A1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2768578C1 (ru) * 2020-12-25 2022-03-24 федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Ульяновский государственный университет" Способ прогнозирования острого повреждения почек у пациентов с декомпенсацией хронической сердечной недостаточности на основе системы оценки риска

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105303261A (zh) * 2015-11-10 2016-02-03 北京大学第一医院 医院内急性肾损伤预警系统
JP7166659B2 (ja) * 2018-10-04 2022-11-08 学校法人自治医科大学 急性腎障害の検査方法、急性腎障害の検査用キット、動物治療方法、及び急性腎障害用医薬
RU2749245C1 (ru) * 2020-11-13 2021-06-07 федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (Сеченовский университет) (ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Се Способ диагностики гипоксии паренхимы почек при экспериментальной интраабдоминальной гипертензии
ES2950308B2 (es) * 2022-03-02 2024-06-19 Univ Oviedo Métodos y usos para cuantificar la sobredistensión pulmonar mediante la determinación de un conjunto de miARNs

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2198400C2 (ru) * 2001-04-12 2003-02-10 Российский НИИ геронтологии Способ диагностики гипоксически-ишемического поражения почек

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2699646A1 (en) 2007-09-14 2009-03-19 The Ohio State University Research Foundation Mirna expression in human peripheral blood microvesicles and uses thereof
CN101988120A (zh) 2009-07-30 2011-03-23 江苏命码生物科技有限公司 一种利用血清中的微小核糖核酸诊断肝癌的新技术
ES2363661B2 (es) * 2009-09-04 2012-05-30 Fundación Para La Investigación Biomédica Del Hospital Universitario Ramón Y Cajal. Método para el diagnóstico y/o pronóstico de daño renal agudo.
CN102218144B (zh) * 2010-04-13 2016-03-02 江苏命码生物科技有限公司 一种调节生物体内微小核糖核酸含量的方法及其用途
SG184821A1 (en) * 2010-04-21 2012-11-29 Amc Amsterdam Means and methods for determining risk of cardiovascular disease

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2198400C2 (ru) * 2001-04-12 2003-02-10 Российский НИИ геронтологии Способ диагностики гипоксически-ишемического поражения почек

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
CHOW T.F. et al. The miR-17-92 cluster is over expressed in and has an oncogenic effect on renal cell carcinoma. J Urol. 2010 Feb; 183(2): 743-51. *
DU B. et al. High glucose down-regulates miR-29a to increase collagen IV production in HK-2 cells. FEBS Lett. 2010 Feb 19; 584(4): 811-6. Epub 2010 Jan 12. *
GODWIN J.G. et al. Identification of a microRNA signature of renal ischemia reperfusion injury. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Aug 10; 107(32): 14339-44. Epub 2010 Jul 22. *
GODWIN J.G. et al. Identification of a microRNA signature of renal ischemia reperfusion injury. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Aug 10; 107(32): 14339-44. Epub 2010 Jul 22. LONG J. et al. Identification of microRNA-93 as a novel regulator of vascular endothelial growth factor in hyperglycemic conditions. J Biol Chem. 2010 Jul 23; 285(30): 23457-65. Epub 2010 May 25. DU B. et al. High glucose down-regulates miR-29a to increase collagen IV production in HK-2 cells. FEBS Lett. 2010 Feb 19; 584(4): 811-6. Epub 2010 Jan 12. CHOW T.F. et al. The miR-17-92 cluster is over expressed in and has an oncogenic effect on renal cell carcinoma. J Urol. 2010 Feb; 183(2): 743-51. *
LONG J. et al. Identification of microRNA-93 as a novel regulator of vascular endothelial growth factor in hyperglycemic conditions. J Biol Chem. 2010 Jul 23; 285(30): 23457-65. Epub 2010 May 25. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2768578C1 (ru) * 2020-12-25 2022-03-24 федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Ульяновский государственный университет" Способ прогнозирования острого повреждения почек у пациентов с декомпенсацией хронической сердечной недостаточности на основе системы оценки риска

Also Published As

Publication number Publication date
BR112014014279A8 (pt) 2017-06-13
CN104080925A (zh) 2014-10-01
ES2414290A2 (es) 2013-07-18
RU2014123753A (ru) 2016-02-10
EP2792752B1 (en) 2018-04-04
ES2414290B1 (es) 2014-04-16
US20140378335A1 (en) 2014-12-25
BR112014014279A2 (pt) 2017-06-13
JP6356071B2 (ja) 2018-07-11
CN104080925B (zh) 2017-08-01
CA2859081A1 (en) 2013-06-20
EP2792752A1 (en) 2014-10-22
ES2676449T3 (es) 2018-07-19
MX2014006811A (es) 2015-11-06
JP2015501650A (ja) 2015-01-19
US20170175191A1 (en) 2017-06-22
ES2432853B1 (es) 2015-03-09
WO2013087961A1 (es) 2013-06-20
EP2792752A4 (en) 2015-12-02
ES2432853A2 (es) 2013-12-05
CN107385025A (zh) 2017-11-24
ES2432853R1 (es) 2014-03-11
ES2414290R1 (es) 2013-10-11
MX359369B (es) 2018-09-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Silva et al. Forensic miRNA: potential biomarker for body fluids?
JP6203209B2 (ja) 早期結腸直腸癌の検出のための血漿マイクロrna
TWI580788B (zh) 用於檢測川崎病的方法及套組
RU2657422C2 (ru) Способ диагностики и/или прогноза острого повреждения почек
JP2011510623A (ja) 妊娠の合併症を診断するための方法及び組成物
CN102575294A (zh) 用于急性肾损伤的诊断和/或预后的方法
WO2016186987A1 (en) Biomarker micrornas and method for determining tumor burden
US20170240969A1 (en) A circulating non-coding rna as predictor of mortality in patients with acute kidney injury
US20190390275A1 (en) Chronic kidney disease diagnostic
CN106676185A (zh) 一种预测个体动脉瘤发生的血液中外泌体miRNA谱及检测试剂盒
KR101381894B1 (ko) 위암의 림프절 전이 진단 마커로서의 혈청 miRNA
CN112522391B (zh) hsa_circ_0008961作为痛风诊断标志物的应用
CN111808966B (zh) miRNA在诊断乳腺癌患病风险的应用
CN113718028A (zh) 基于微小rna的子痫前期诊断用途及组合物
CN113832232A (zh) 用于预测肺腺癌对含铂双药化疗反应性的生物标志物其及相关产品
CN108728528A (zh) 基于Taqman探针的肾小管上皮细胞特异性基因检测荧光定量PCR一步法试剂盒
AU2021105761A4 (en) Use of microRNA markers microRNA-130a and microRNA-130b in diagnosis of Hepatic fibrosis
CN114941025B (zh) 用于诊断子痫前期的miRNA及其应用
Athira et al. Circulatory miR-126 expression as an epigenetic marker in diabetes mellitus; a systematic review & meta-analysis
ES2432849B1 (es) Metodo para el diagnóstico y/o pronóstico de daño renal agudo
ES2432854B1 (es) Metodo para el diagnóstico y/o pronóstico de daño renal agudo
CN113817818B (zh) 用于诊断过敏性气道炎症的工具
CN118272516A (zh) 尿液迁移体miRNA标志物及其应用、诊断原发性肾小球疾病的试剂盒
ES2432533A1 (es) Metodo para el diagnóstico y/o pronóstico de daño renal agudo
CN113862369A (zh) 与肺腺癌对含铂双药化疗敏感性相关的标志物及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20191212