RU2014135391A - Способ амплификации нуклеиновых кислот - Google Patents
Способ амплификации нуклеиновых кислот Download PDFInfo
- Publication number
- RU2014135391A RU2014135391A RU2014135391A RU2014135391A RU2014135391A RU 2014135391 A RU2014135391 A RU 2014135391A RU 2014135391 A RU2014135391 A RU 2014135391A RU 2014135391 A RU2014135391 A RU 2014135391A RU 2014135391 A RU2014135391 A RU 2014135391A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nanoparticles
- oligonucleotides
- excitation
- conjugated
- excited
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
- B01L7/525—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples with physical movement of samples between temperature zones
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
- B01L7/525—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples with physical movement of samples between temperature zones
- B01L7/5255—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples with physical movement of samples between temperature zones by moving sample containers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B82—NANOTECHNOLOGY
- B82Y—SPECIFIC USES OR APPLICATIONS OF NANOSTRUCTURES; MEASUREMENT OR ANALYSIS OF NANOSTRUCTURES; MANUFACTURE OR TREATMENT OF NANOSTRUCTURES
- B82Y20/00—Nanooptics, e.g. quantum optics or photonic crystals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/18—Means for temperature control
- B01L2300/1861—Means for temperature control using radiation
- B01L2300/1872—Infrared light
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Clinical Laboratory Science (AREA)
- Nanotechnology (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
1. Способ амплификации нуклеиновых кислот (1), в котором наночастицы (8) в объеме реакционной смеси (2) переносят тепло в окружающую их среду посредством возбуждения, характеризующийся тем, что при возбуждении наночастиц (8) среда, окружающая наночастицы (8), нагревается локально, где интервал возбуждения выбран более коротким или равным критическому времени возбуждения t1=(s1*|x|)/D, где s1=100, a D является термодиффузией среды между наночастицами (8).2. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что нуклеиновые кислоты (1) амплифицируют путем полимеразной цепной реакции.3. Способ по п.1, характеризующийся тем, что наночастицы (8) возбуждают лазером (16).4. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что один тип конъюгатов наночастиц (8) и олигонуклеотидов (4) конъюгирован с прямыми праймерами (14), а также с обратными праймерами (15).5. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что наночастицы (8) конъюгированы с олигонуклеотидами (4).6. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что один тип конъюгатов наночастиц (8) и олигонуклеотидов (4) конъюгирован с прямыми праймерами (14), а также с обратными праймерами (15).7. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что в способе применяют обратные последовательности (34), которые могут связываться с такими олигонуклеотидами (4), которые отсоединились от наночастиц (8), к которым они были ранее прикреплены.8. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что заполняющие молекулы (9) прикреплены к наночастицам (8).9. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что олигонуклеотиды (4) на наночастицах (8) содержат спейсерную последовательность (6) в качестве составляющей последовательности.10. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что тепло, переносимое к среде, окружающей наночастицы (8), посредством возбуждения наночастиц (8), достаточно для дегибриди
Claims (16)
1. Способ амплификации нуклеиновых кислот (1), в котором наночастицы (8) в объеме реакционной смеси (2) переносят тепло в окружающую их среду посредством возбуждения, характеризующийся тем, что при возбуждении наночастиц (8) среда, окружающая наночастицы (8), нагревается локально, где интервал возбуждения выбран более коротким или равным критическому времени возбуждения t1=(s1*|x|)2/D, где s1=100, a D является термодиффузией среды между наночастицами (8).
2. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что нуклеиновые кислоты (1) амплифицируют путем полимеразной цепной реакции.
3. Способ по п.1, характеризующийся тем, что наночастицы (8) возбуждают лазером (16).
4. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что один тип конъюгатов наночастиц (8) и олигонуклеотидов (4) конъюгирован с прямыми праймерами (14), а также с обратными праймерами (15).
5. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что наночастицы (8) конъюгированы с олигонуклеотидами (4).
6. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что один тип конъюгатов наночастиц (8) и олигонуклеотидов (4) конъюгирован с прямыми праймерами (14), а также с обратными праймерами (15).
7. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что в способе применяют обратные последовательности (34), которые могут связываться с такими олигонуклеотидами (4), которые отсоединились от наночастиц (8), к которым они были ранее прикреплены.
8. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что заполняющие молекулы (9) прикреплены к наночастицам (8).
9. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что олигонуклеотиды (4) на наночастицах (8) содержат спейсерную последовательность (6) в качестве составляющей последовательности.
10. Способ по п. 5, характеризующийся тем, что тепло, переносимое к среде, окружающей наночастицы (8), посредством возбуждения наночастиц (8), достаточно для дегибридизации олигонуклеотидов (4) на поверхности наночастиц (8) от нуклеиновых кислот (1), гибридизованных с олигонуклеотидами (4).
11. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что способ включает этап общего нагревания.
12. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что температура отжига равна температуре элонгации.
13. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что в любое время способа только часть наночастиц (8) нагревается посредством возбуждения.
14. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что направленное перемещение образца (11) относительно возбуждающего поля происходит так, что наночастицы (8) в различных парциальных объемах образца (11) возбуждаются в различное время.
15. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что в способе применяют термолабильную ДНК-полимеразу (11).
16. Способ по любому из предыдущих пунктов, характеризующийся тем, что концентрацию продукта реакции амплификации определяют с применением тестовых зондов (21).
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE102012201475.6 | 2012-02-01 | ||
DE102012201475.6A DE102012201475B4 (de) | 2012-02-01 | 2012-02-01 | Verfahren zum Vervielfältigen von Nukleinsäuren |
PCT/EP2013/052100 WO2013113910A1 (en) | 2012-02-01 | 2013-02-01 | Method for the amplification of nucleic acids |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2014135391A true RU2014135391A (ru) | 2016-03-27 |
RU2603253C2 RU2603253C2 (ru) | 2016-11-27 |
Family
ID=47716001
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2014135391/10A RU2603253C2 (ru) | 2012-02-01 | 2013-02-01 | Способ амплификации нуклеиновых кислот |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US9382583B2 (ru) |
EP (2) | EP2809806B1 (ru) |
JP (2) | JP2015511124A (ru) |
CN (2) | CN107604052A (ru) |
AU (1) | AU2013214098B2 (ru) |
BR (1) | BR112014018737A2 (ru) |
CA (1) | CA2862912C (ru) |
DE (1) | DE102012201475B4 (ru) |
DK (1) | DK2809806T3 (ru) |
ES (1) | ES2596452T3 (ru) |
HU (1) | HUE030691T2 (ru) |
PL (1) | PL2809806T3 (ru) |
RU (1) | RU2603253C2 (ru) |
WO (1) | WO2013113910A1 (ru) |
Families Citing this family (22)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9816132B2 (en) | 2012-12-14 | 2017-11-14 | The Royal Institution For The Advancement Of Learning/Mcgill University | Heating mechanism for DNA amplification, extraction or sterilization using photo-thermal nanoparticles |
WO2015006864A1 (en) * | 2013-07-16 | 2015-01-22 | The Royal Institution For The Advancement Of Learning/Mcgill University | Heating mechanism for dna amplification, extraction or sterilization using photo-thermal nanoparticles |
DE102013022382B9 (de) * | 2013-08-01 | 2017-11-16 | Gna Biosolutions Gmbh | Verfahren zum Vervielfältigen von Nukleinsäuren |
DE102013215168B4 (de) | 2013-08-01 | 2016-01-07 | Gna Biosolutions Gmbh | Verwendung von einem oder mehreren Nanopartikeln zum Vervielfältigen von Nukleinsäuren |
DE102013215166B3 (de) * | 2013-08-01 | 2014-10-30 | Gna Biosolutions Gmbh | PCR-Verfahren zur Superamplifikation |
WO2015195357A1 (en) * | 2014-06-18 | 2015-12-23 | Luminex Corporation | Apparatus and methods for magnetic mixing |
US10544450B2 (en) | 2014-11-07 | 2020-01-28 | Gna Biosolutions Gmbh | Method for duplicating nucleic acids by means of a polymerase chain reaction |
US20180237824A1 (en) * | 2014-11-10 | 2018-08-23 | Gna Biosolutions Gmbh | Method for multiplying nucleic acids |
WO2016115542A1 (en) * | 2015-01-16 | 2016-07-21 | The Regents Of The University Of California | Led driven plasmonic heating apparatus for nucleic acids amplification |
WO2016200525A1 (en) * | 2015-06-08 | 2016-12-15 | The University Of Chicago | Bipyramid-templated synthesis of monodisperse noble metal nanocrystals |
DE102015010065B3 (de) * | 2015-08-03 | 2016-07-21 | Gna Biosolutions Gmbh | Verwendung von Nanopartikeln und von kationisch modifizierter Nukleinsäure zum Nachweis einer nachzuweisenden Nukleinsäure in einer Lösung |
EP3184647A1 (en) * | 2015-12-23 | 2017-06-28 | Koninklijke Philips N.V. | Laser pcr and bead detection in one reaction chamber |
DE102016120124B8 (de) | 2016-10-21 | 2018-08-23 | Gna Biosolutions Gmbh | Verfahren zum Durchführen einer Polymerase-Kettenreaktion und Vorrichtung zum Ausführen des Verfahrens |
DE102016124692B4 (de) | 2016-12-16 | 2019-05-16 | Gna Biosolutions Gmbh | Verfahren und System zum Vervielfältigen einer Nukleinsäure |
US11753485B2 (en) | 2017-09-26 | 2023-09-12 | National Research Council Of Canada | Microfluidic assisted fabrication of polymer microparticle-metal nanoparticle composites |
DE102017123919A1 (de) | 2017-10-13 | 2019-04-18 | Gna Biosolutions Gmbh | Verfahren und Vorrichtung zur Lyse von Mikroorganismen |
WO2019090306A1 (en) * | 2017-11-06 | 2019-05-09 | The Regents Of The University Of Michigan | Compositions and methods for detection of microorganisms |
DE102018103215B3 (de) | 2018-02-13 | 2019-08-14 | Gna Biosolutions Gmbh | Verfahren und Vorrichtung zur Extraktion einer Nukleinsäure aus einer Probenflüssigkeit |
EP3569717A3 (en) * | 2019-08-28 | 2020-04-08 | Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH | Diagnostic method for the detection of dna and rna viruses by carrying out a polymerase chain reaction in a heated reaction volume |
CN112301106A (zh) * | 2020-10-30 | 2021-02-02 | 南京师范大学 | 具有光热响应的DNA修饰的金纳米颗粒的DNA-AuNP探针及其制备方法和应用 |
CN113355455B (zh) * | 2021-05-21 | 2024-05-03 | 广东粤港澳大湾区国家纳米科技创新研究院 | 一种检测新型冠状病毒的荧光定量纳米粒子pcr的引物、引物探针组合及其应用 |
CN113278733B (zh) * | 2021-05-21 | 2024-03-01 | 广东粤港澳大湾区国家纳米科技创新研究院 | 一种检测新冠病毒的突变毒株的引物和探针的组合 |
Family Cites Families (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US6953659B2 (en) * | 2000-07-14 | 2005-10-11 | Massachusetts Institute Of Technology | Direct, externally imposed control of nucleic acids |
EP1356086A2 (de) | 2000-12-13 | 2003-10-29 | Institut Für Physikalische Hochtechnologie E.V. | Verfahren zum simultanen positionsspezifischen schneiden von fadenförmigen organischen molekülketten, insbesonere dna |
WO2003048769A1 (en) | 2001-11-30 | 2003-06-12 | Nanosphere, Inc. | Real-time monitoring of pcr amplification using nanoparticle probes |
WO2005042783A1 (en) * | 2003-10-30 | 2005-05-12 | North Carolina State University | Temperature-jump enhanced electrochemical detection of nucleic acid hybridization |
EP1840222B1 (en) * | 2004-12-29 | 2011-02-23 | Suzhou Yangtze Delta Academy of Bio-x Science Ltd. | The optimum method of amplification on polymerase chain reaction |
EP2029721A4 (en) | 2006-05-30 | 2011-01-26 | Univ Utah Res Found | SIMULTANEOUS AMPLIFICATION AND DETECTION OF RIBONUCLEIC ACID BY AN OPTICAL METHOD USING RESONANCE OF SURFACE PLASMONS |
DE102007027654B8 (de) * | 2007-06-15 | 2012-03-15 | Gna Biosolutions Gmbh | Verfahren zum Nachweis von Nukleinsäuren |
EP2110175A1 (de) * | 2008-03-20 | 2009-10-21 | Fraunhofer-Gesellschaft zur Förderung der angewandten Forschung e.V. | Verfahren und Vorrichtung zur thermischen Steuerung biologischer und chemischer Reaktionen unter Einsatz von magnetischen Partikeln oder magnetischen Beads und Wechselmagnetfeldern |
-
2012
- 2012-02-01 DE DE102012201475.6A patent/DE102012201475B4/de active Active
-
2013
- 2013-02-01 JP JP2014555234A patent/JP2015511124A/ja not_active Withdrawn
- 2013-02-01 CN CN201710868078.9A patent/CN107604052A/zh active Pending
- 2013-02-01 PL PL13704388T patent/PL2809806T3/pl unknown
- 2013-02-01 CN CN201380007616.5A patent/CN104093860A/zh active Pending
- 2013-02-01 AU AU2013214098A patent/AU2013214098B2/en not_active Ceased
- 2013-02-01 EP EP13704388.1A patent/EP2809806B1/en active Active
- 2013-02-01 DK DK13704388.1T patent/DK2809806T3/en active
- 2013-02-01 RU RU2014135391/10A patent/RU2603253C2/ru active
- 2013-02-01 ES ES13704388.1T patent/ES2596452T3/es active Active
- 2013-02-01 EP EP16179482.1A patent/EP3101143B1/en active Active
- 2013-02-01 HU HUE13704388A patent/HUE030691T2/en unknown
- 2013-02-01 BR BR112014018737A patent/BR112014018737A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2013-02-01 US US14/375,946 patent/US9382583B2/en active Active
- 2013-02-01 CA CA2862912A patent/CA2862912C/en active Active
- 2013-02-01 WO PCT/EP2013/052100 patent/WO2013113910A1/en active Application Filing
-
2016
- 2016-01-25 JP JP2016011619A patent/JP6475645B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2016-06-07 US US15/175,237 patent/US9926594B2/en active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
HUE030691T2 (en) | 2017-05-29 |
EP3101143B1 (en) | 2018-08-01 |
EP2809806A1 (en) | 2014-12-10 |
US20140377764A1 (en) | 2014-12-25 |
ES2596452T3 (es) | 2017-01-09 |
JP2016127842A (ja) | 2016-07-14 |
DE102012201475A1 (de) | 2013-08-01 |
AU2013214098A1 (en) | 2014-07-24 |
JP6475645B2 (ja) | 2019-02-27 |
US20160281139A1 (en) | 2016-09-29 |
DK2809806T3 (en) | 2016-10-10 |
EP2809806B1 (en) | 2016-08-10 |
WO2013113910A1 (en) | 2013-08-08 |
CN107604052A (zh) | 2018-01-19 |
DE102012201475B4 (de) | 2014-12-18 |
AU2013214098B2 (en) | 2016-05-12 |
CA2862912C (en) | 2017-02-28 |
US9382583B2 (en) | 2016-07-05 |
EP3101143A1 (en) | 2016-12-07 |
BR112014018737A2 (pt) | 2017-07-04 |
CA2862912A1 (en) | 2013-08-08 |
US9926594B2 (en) | 2018-03-27 |
RU2603253C2 (ru) | 2016-11-27 |
CN104093860A (zh) | 2014-10-08 |
JP2015511124A (ja) | 2015-04-16 |
PL2809806T3 (pl) | 2017-02-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2014135391A (ru) | Способ амплификации нуклеиновых кислот | |
JP6669699B2 (ja) | 連続的な増幅反応のための方法および装置 | |
Zhao et al. | Isothermal amplification of nucleic acids | |
JP6234980B2 (ja) | 法医学的dnaの定量化のための改善された方法 | |
ES2647237T3 (es) | Cebadores quiméricos para reacciones de amplificación de ácidos nucleicos mejoradas | |
Tröger et al. | Isothermal amplification and quantification of nucleic acids and its use in microsystems | |
JP2008539759A5 (ru) | ||
JP2014513557A5 (ru) | ||
WO2009126678A3 (en) | Detection of target nucleic acid sequences using fluorescence resonance energy transfer | |
WO2009094638A3 (en) | Methods and apparatuses for convective polymerase chain reaction (pcr) | |
JP2012529266A (ja) | 反応カートリッジにおける多重核酸配列の検出 | |
JP2014507950A5 (ru) | ||
Kim et al. | Loop-mediated isothermal amplification-based nucleic acid lateral flow assay for the specific and multiplex detection of genetic markers | |
Fan et al. | A graphene-based biosensor for detecting microRNA with augmented sensitivity through helicase-assisted signal amplification of hybridization chain reaction | |
RU2011107993A (ru) | Алгоритм обнаружения для пцр-анализа | |
Furutani et al. | Development of an on-site rapid real-time polymerase chain reaction system and the characterization of suitable DNA polymerases for TaqMan probe technology | |
DK2162549T3 (da) | Fremgangsmåde til at detektere nukleinsyrer | |
Lee et al. | Poly-adenine-coupled LAMP barcoding to detect apple scar skin viroid | |
ATE482270T1 (de) | Dna-kettenverlängerungsverfahren, dna- kettenamplifikationsverfahren und mikroarray zur dna-kettenverlängerung | |
RU2016117929A (ru) | Мультиплексные зонды | |
JP2009034052A (ja) | ハイブリダイゼーション方法および装置 | |
CA3026646A1 (en) | Thermostable polymerase inhibitor compositions and methods | |
Zhao et al. | Universal Exponential Amplification Confers Multilocus Detection of Mutation-Prone Virus | |
TWI480377B (zh) | Methods for detecting Bacillus anthracis | |
Du et al. | A simple rapid detection method of DNA based on ligation-mediated real-time fluorescence PCR |