RU2014129015A - Композиции и способы для модификации заданной последовательности нуклеиновой кислоты-мишени - Google Patents

Композиции и способы для модификации заданной последовательности нуклеиновой кислоты-мишени Download PDF

Info

Publication number
RU2014129015A
RU2014129015A RU2014129015A RU2014129015A RU2014129015A RU 2014129015 A RU2014129015 A RU 2014129015A RU 2014129015 A RU2014129015 A RU 2014129015A RU 2014129015 A RU2014129015 A RU 2014129015A RU 2014129015 A RU2014129015 A RU 2014129015A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
site
protein
target
modification
Prior art date
Application number
RU2014129015A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2663354C2 (ru
Inventor
Йоел Моше ШИБОЛЕТ
Дан Майкл ВЕЙНТАЛ
Original Assignee
Таргитджин Байотекнолоджиз Лтд
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Таргитджин Байотекнолоджиз Лтд filed Critical Таргитджин Байотекнолоджиз Лтд
Publication of RU2014129015A publication Critical patent/RU2014129015A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2663354C2 publication Critical patent/RU2663354C2/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7105—Natural ribonucleic acids, i.e. containing only riboses attached to adenine, guanine, cytosine or uracil and having 3'-5' phosphodiester links
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/711—Natural deoxyribonucleic acids, i.e. containing only 2'-deoxyriboses attached to adenine, guanine, cytosine or thymine and having 3'-5' phosphodiester links
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7115—Nucleic acids or oligonucleotides having modified bases, i.e. other than adenine, guanine, cytosine, uracil or thymine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/712—Nucleic acids or oligonucleotides having modified sugars, i.e. other than ribose or 2'-deoxyribose
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7125—Nucleic acids or oligonucleotides having modified internucleoside linkage, i.e. other than 3'-5' phosphodiesters
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713—Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K19/00—Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8213—Targeted insertion of genes into the plant genome by homologous recombination
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/825—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving pigment biosynthesis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8251—Amino acid content, e.g. synthetic storage proteins, altering amino acid biosynthesis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/09—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a nuclear localisation signal

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Нуклеопротеиновая композиция для модификации заданного сайта-мишени в последовательности нуклеиновой кислоты-мишени в клетке-мишени, содержащая:(а) молекулу полинуклеотида, кодирующую химерный полипептид, при этом указанный полипептид содержит:(i) функциональный домен, способный к модифицированию указанного сайта-мишени, при этом функциональный домен лишен сайта специфического связывания нуклеиновой кислоты; и(ii) связующий домен, способный к взаимодействию с придающей специфичность нуклеиновой кислотой, при этом связующий домен лишен сайта специфического связывания нуклеиновой кислоты-мишени; и(b) придающую специфичность нуклеиновую кислоту (SCNA), содержащую:(i) нуклеотидную последовательность, комплементарную участку нуклеиновой кислоты-мишени, фланкирующему сайт-мишень; и(ii) участок распознавания, способный к специфическому присоединению к связующему домену полипептида;в соответствии с чем в результате сборки полипептида и SCNA внутри клетки-мишени образуется функциональный нуклеопротеиновый комплекс, способный к специфической модификации указанной нуклеиновой кислоты-мишени в сайте-мишени.2. Композиция по п. 1, в которой указанный функциональный домен содержит каталитический домен.3. Композиция по п. 1, в которой указанную модификацию нуклеиновой кислоты-мишени выбирают из мутации, делеции,вставки, замены, связывания, расщепления, создания двухцепочечного разрыва, одноцепочечного разрыва, метилирования, ацетилирования, лигирования, рекомбинации, раскручивания спирали, химической модификации, мечения, активации и инактивации.4. Композиция по п. 1, в которой указанный химерный полипептид, кроме того, содержит домен субклет

Claims (38)

1. Нуклеопротеиновая композиция для модификации заданного сайта-мишени в последовательности нуклеиновой кислоты-мишени в клетке-мишени, содержащая:
(а) молекулу полинуклеотида, кодирующую химерный полипептид, при этом указанный полипептид содержит:
(i) функциональный домен, способный к модифицированию указанного сайта-мишени, при этом функциональный домен лишен сайта специфического связывания нуклеиновой кислоты; и
(ii) связующий домен, способный к взаимодействию с придающей специфичность нуклеиновой кислотой, при этом связующий домен лишен сайта специфического связывания нуклеиновой кислоты-мишени; и
(b) придающую специфичность нуклеиновую кислоту (SCNA), содержащую:
(i) нуклеотидную последовательность, комплементарную участку нуклеиновой кислоты-мишени, фланкирующему сайт-мишень; и
(ii) участок распознавания, способный к специфическому присоединению к связующему домену полипептида;
в соответствии с чем в результате сборки полипептида и SCNA внутри клетки-мишени образуется функциональный нуклеопротеиновый комплекс, способный к специфической модификации указанной нуклеиновой кислоты-мишени в сайте-мишени.
2. Композиция по п. 1, в которой указанный функциональный домен содержит каталитический домен.
3. Композиция по п. 1, в которой указанную модификацию нуклеиновой кислоты-мишени выбирают из мутации, делеции,
вставки, замены, связывания, расщепления, создания двухцепочечного разрыва, одноцепочечного разрыва, метилирования, ацетилирования, лигирования, рекомбинации, раскручивания спирали, химической модификации, мечения, активации и инактивации.
4. Композиция по п. 1, в которой указанный химерный полипептид, кроме того, содержит домен субклеточной локализации.
5. Композиция по п. 1, в которой SCNA включает нуклеиновую кислоту, выбираемую из группы, состоящей из одноцепочечной ДНК, одноцепочечной РНК, двухцепочечной РНК, модифицированной ДНК, модифицированной РНК, закрытой нуклеиновой кислоты (LNA) и пептидо-нуклеиновой кислоты (PNA), или их комбинации.
6. Композиция по п. 1, в которой указанной нуклеиновой кислотой-мишенью является ДНК.
7. Композиция по п. 1, в которой участок распознавания в SCNA содержит химическую модификацию, выбираемую из группы, состоящей из 5'-концевой модификации, 3'-концевой модификации и внутренней модификации.
8. Композиция по п. 7, в которой указанную химическую модификацию выбирают из группы, состоящей из модификации нуклеотида и добавления ненуклеотидного компонента.
9. Композиция по п. 8, в которой ненуклеотидный компонент выбирают из биотина, флуоресцеина, аминолинкеров, олигопептидов, аминоаллила, молекулы красителя, флуорофоров, дигоксигенина, акридита, аденилирования, азида, NHS-эфира, холестерил-TEG, алкинов, фоторазрушаемого биотина, тиола, дитиола.
10. Композиция по п. 8, в которой модификацию нуклеотида
выбирают из группы, состоящей из фосфата, 2-аминопурина, Тримера-20, 2,6-диаминопурина, 5-бромдезоксиуридина, дезоксиуридина, инвертированного dT, дидезоксинуклеотидов, 5-метилдезоксицитидина, дезоксиинозина, 5-нитроиндола, 2-О-метил-РНК-оснований, изо-dC, изо-dG, фтор-модифицированных оснований и фосфоротиоатных связей.
11. Композиция по п. 1, в которой присоединение указанной модификации к указанному связующему домену является таковым пары партнеров по связыванию, выбираемой из белок-белок, VirD2 Agrobacterium - связывающийся с VirD2 белок; антитело-антиген; одноцепочечное антитело-антиген; одноцепочечный Fv-фрагмент антитела против флуоресцеина (анти-FAM ScFv) - флуоресцеин; одноцепочечный Fv-фрагмент иммуноглобулина (scFv) против DIG (анти-DIG-ScFv) - дигоксигенин (DIG) и IgG-белок A.
12. Композиция по п. 1, в которой указанный участок распознавания в SCNA содержит нуклеотидный мотив, способный к специфического присоединению связующего домена химерного белка.
13. Композиция по п. 12, в которой присоединение нуклеотидного мотива к связующему домену выбирают из взаимодействия спираль-петля-спираль с доменом E-боксом; взаимодействия одноцепочечной ДНК с VirE2; StickyC с дцДНК; белка оболочки вируса с нуклеиновой кислотой; взаимодействия основного связывающего домен Tat бычьего вируса иммунодефицита (BIV) с петлевым участком 1 последовательности трансдействующего отвечающего элемента (TAR) BIV; взаимодействия N-белка фага λ, ϕ21 со "шпильками" петли бокса-B в сайте N-использования (nut); и взаимодействия белка rev ВИЧ с "Ножкой" IIB отвечающего на rev элемента (RRE) ВИЧ.
14. Композиция по п. 12, в которой связующий домен содержит полипептид, выбираемый из группы, состоящей из белка VirD2 Agrobacterium, VPg пикорнавирусов, топоизомеразы, белка А фага ϕX174, белка A* ϕX и любых их вариантов.
15. Способ модифицирования заданного сайта-мишени в последовательности нуклеиновой кислоты-мишени с помощью программируемого нуклеопротеинового молекулярного комплекса, который включает стадии:
a. доставки последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей программируемый химерный полипептид, в клетку-хозяина, при этом указанный химерный полипептид содержит:
(i) функциональный домен, способный к модифицированию указанного сайта-мишени, при этом функциональный домен лишен сайта специфического связывания нуклеиновой кислоты; и
(ii) связующий домен, способный к взаимодействию с придающей специфичность нуклеиновой кислотой, при этом связующий домен лишен сайта специфического связывания нуклеиновой кислоты-мишени;
b. доставки молекулы придающей специфичность нуклеиновой кислоты (SCNA) или нуклеиновой кислоты, кодирующей SCNA, в указанную клетку-хозяина, при этом указанная молекула SCNA содержит:
(i) нуклеотидную последовательность, комплементарную участку нуклеиновой кислоты-мишени, фланкирующему сайт-мишень; и
(ii) участок распознавания, способный к специфическому присоединению к связующему домену полипептида с высоким
сродством связывания;
причем экспрессия полипептида в клетке, содержащей SCNA, создает возможность для присоединения указанного химерного полипептида к SCNA, образуя активный запрограммированный нуклеопротеиновый комплекс, в силу чего химерный белок нацеливается на заданную последовательность нуклеиновой кислоты-мишень в клетке-хозяине, допускается модификация заданного сайта-мишени последовательности нуклеиновой кислоты-мишени с помощью указанного активного запрограммированного нуклеопротеинового молекулярного комплекса.
16. Способ по п. 15, в котором указанной нуклеиновой кислотой-мишенью является ДНК.
17. Способ по п. 16, в котором указанной ДНК-мишенью является геномная ДНК.
18. Способ по п. 17, в котором указанная геномная ДНК-мишень эукариотического происхождения.
19. Способ по п. 15, в котором указанной последовательностью нуклеиновой кислоты-мишенью является последовательность экстрахромосомной нуклеиновой кислоты, выбираемая из группы, состоящей из таковых митохондрии, хлоропласта, амилопласта и хромопласта.
20. Способ по п. 15, в котором указанную последовательность нуклеиновой кислоты-мишень выбирают из последовательности вирусной нуклеиновой кислоты, последовательности прокариотической нуклеиновой кислоты и синтетической последовательности нуклеиновой кислоты.
21. Способ по п. 15, в котором указанную модификацию выбирают
из группы, состоящей из мутации, делеции, вставки, замены, связывания, расщепления, создания двухцепочечного разрыва, одноцепочечного разрыва, метилирования, ацетилирования, лигирования, рекомбинации, раскручивания спирали, химической модификации, мечения, активации и инактивации.
22. Способ по п. 15, в котором химерный белок содержит белковый компонент с функциональным модификатором нуклеиновой кислоты, причем функциональную модификацию выбирают из группы, состоящей из активации транскрипции, инактивации транскрипции, сайленсинга РНК-транскрипта, альтернативного сплайсинга РНК, реконфигурации структуры хроматина, инактивации внутриклеточного паразита и вируса и изменения клеточной локализации или компартментализации указанной последовательности нуклеиновой кислоты-мишени.
23. Способ по п. 15, в котором указанная SCNA включает молекулу нуклеиновой кислоты, выбираемую из группы, состоящей из одноцепочечной ДНК, одноцепочечной РНК, двухцепочечной РНК, модифицированной ДНК, модифицированной РНК, закрытой нуклеиновой кислоты (LNA) и пептидо-нуклеиновой кислоты (PNA), или их комбинаций.
24. Способ по п. 15, в котором взаимодействие между SCNA и нуклеиновой кислотой-мишенью осуществляется через спаривание оснований, выбираемое из группы, состоящей из спаривания оснований с образованием полной двойной спирали, спаривания оснований с образованием частичной двойной спирали, спаривания оснований с образованием полной тройной спирали, спаривания оснований с образованием частичной тройной спирали и D-петель
или разветвленных форм, образуемых в результате указанного спаривания.
25. Способ по п. 15, в котором участок распознавания в SCNA включает модификацию, выбираемую из группы, состоящей из 5'-концевой модификации, 3'-концевой модификации и внутренней модификации.
26. Способ по п. 25, в котором указанную модификацию выбирают из группы, состоящей из модификации нуклеотида, биотина, флуоресцеина, аминолинкеров, олигопептидов, аминоаллила, молекулы красителя, флуорофоров, дигоксигенина, акридита, аденилирования, азида, NHS-эфира, холестерил-TEG, алкинов, фоторазрушаемого биотина, тиола, дитиола, модифицированных оснований, фосфата, 2-аминопурина, Тримера-20, 2,6-диаминопурина, 5-бромдезоксиуридина, дезоксиуридина, инвертированного dT, дидезоксинуклеотидов, 5-метилдезоксицитидина, дезоксиинозина, 5-нитроиндола, 2-О-метил-РНК-оснований, изо-dC, изо-dG, фтор-модифицированных оснований и фосфоротиоатных связей.
27. Способ по п. 25, в котором ассоциацией между модификацией и указанным связующим доменом является взаимодействие пары партнеров по связыванию, выбираемой из белок-белок, VirD2 Agrobacterium - связывающийся с VirD2 белок; антитело-антиген; одноцепочечное антитело-антиген; одноцепочечный Fv-фрагмент антитела против флуоресцеина (анти-FAM ScFv) - флуоресцеин; одноцепочечный Fv-фрагмент иммуноглобулина (scFv) против DIG (анти-DIG-ScFv) - дигоксигенин (DIG) и IgG-белок A.
28. Способ по п. 15, в котором участок распознавания в SCNA
содержит нуклеотидный мотив, способный к взаимодействию со связующим доменом химерного белка.
29. Способ по п. 28, в котором взаимодействие между нуклеотидным мотивом и связующим доменом выбирают из взаимодействия спираль-петля-спираль с доменом E-боксом; взаимодействия одноцепочечной ДНК с VirE2; StickyC с дцДНК; белка оболочки вируса с нуклеиновой кислотой; взаимодействия основного связывающего домена Tat бычьего вируса иммунодефицита (BIV) с петлевым участком 1 последовательности трансдействующего отвечающего элемента (TAR) BIV; взаимодействия N-белка фага λ, ϕ21 со "шпильками" петли бокса-B в сайте N-использования (nut); взаимодействия белка rev ВИЧ с "Ножкой" IIB отвечающего на rev элемента (RRE) ВИЧ и взаимодействия VirD2 Agrobacterium с последовательностью правого края.
30. Способ по п. 28, в котором связующий домен содержит полипептид, выбираемый из группы, состоящей из белка VirD2 Agrobacterium, VPg пикорнавирусов, топоизомеразы, белка А фага ϕX174, белка A* ϕX и их вариантов.
31. Нуклеопротеиновый комплекс, созданный с помощью способа по п. 15, где в результате физической связи между связующим доменом белкового компонента и участком распознавания в относящемся к придающей специфичность нуклеиновой кислоте компоненте образуется запрограммированный функциональный комплекс в клетке-мишени.
32. Нуклеопротеиновый комплекс по п. 31, где физической связью между связующим доменом белкового компонента и
относящимся к придающей специфичность нуклеиновой кислоте компонентом является аффинное взаимодействие, выбираемое из группы, состоящей из взаимодействия лиганд-рецептор, лиганд-субстрат, водородных связей, сил Ван-дер-Ваальса, ионных связей и гидрофобного взаимодействия.
33. Клетка-хозяин с заданной генетической модификацией в заданном сайте-мишени, созданной с помощью способа по п. 15.
34. Клетка-хозяин по п. 33, которую выбирают из группы, состоящей из клетки позвоночного животного, клетки млекопитающего, клетки человека, клетки животного, клетки растения, клетки беспозвоночного, клетки круглого червя, клетки насекомого и стволовой клетки.
35. Трансгенный организм или нокаутный организм, с заданной генетической модификацией, созданной с помощью способа по п. 15.
36. Способ лечения генетического заболевания организма, включающий экспрессию в клетке организма нуклеопротеинового программируемого молекулярного комплекса по п. 1.
37. Клетка-хозяин, содержащая:
a) полипептид, содержащий:
(i) функциональный домен, способный к модифицированию сайта-мишени в последовательности нуклеиновой кислоты-мишени в клетке, при этом функциональный домен лишен сайта специфического связывания нуклеиновой кислоты; и
(ii) связующий домен, который способен к взаимодействию с придающей специфичность нуклеиновой кислотой и лишен сайта специфического связывания нуклеиновой кислоты-мишени; и
b) придающую специфичность нуклеиновую кислоту (SCNA),
содержащую:
(i) нуклеотидную последовательность, комплементарную участку нуклеиновой кислоты-мишени, фланкирующему сайт-мишень; и
(ii) участок распознавания, способный к специфическому присоединению к связующему домену полипептида;
в соответствии с чем в результате сборки полипептида и SCNA в клетке-хозяине образуется функциональный нуклеопротеиновый комплекс, способный к специфическому модифицированию нуклеиновой кислоты-мишени в сайте-мишени.
38. Клетка-хозяин по п. 37, которую выбирают из группы, состоящей из клетки позвоночного животного, клетки млекопитающего, клетки человека, клетки животного, клетки растения, клетки беспозвоночного, клетки круглого червя, клетки насекомого и стволовой клетки.
RU2014129015A 2011-12-16 2012-12-16 Композиции и способы для модификации заданной последовательности нуклеиновой кислоты-мишени RU2663354C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161576423P 2011-12-16 2011-12-16
US61/576,423 2011-12-16
PCT/IL2012/050528 WO2013088446A1 (en) 2011-12-16 2012-12-16 Compositions and methods for modifying a predetermined target nucleic acid sequence

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014129015A true RU2014129015A (ru) 2016-02-10
RU2663354C2 RU2663354C2 (ru) 2018-08-03

Family

ID=48611953

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014129015A RU2663354C2 (ru) 2011-12-16 2012-12-16 Композиции и способы для модификации заданной последовательности нуклеиновой кислоты-мишени

Country Status (15)

Country Link
US (5) US11458157B2 (ru)
EP (1) EP2790708A4 (ru)
JP (1) JP2015500648A (ru)
CN (1) CN104080462B (ru)
AU (2) AU2012354062B2 (ru)
BR (1) BR112014014105B1 (ru)
CA (2) CA3226329A1 (ru)
HK (1) HK1203362A1 (ru)
IL (2) IL253373A0 (ru)
IN (1) IN2014MN00974A (ru)
PH (1) PH12014501360A1 (ru)
RU (1) RU2663354C2 (ru)
UA (1) UA115772C2 (ru)
WO (1) WO2013088446A1 (ru)
ZA (1) ZA201403785B (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113614247A (zh) * 2018-11-26 2021-11-05 拜奥卡德联合股份公司 Dna切割剂

Families Citing this family (75)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2569425B1 (en) 2010-05-10 2016-07-06 The Regents of The University of California Endoribonuclease compositions and methods of use thereof
US9528124B2 (en) 2013-08-27 2016-12-27 Recombinetics, Inc. Efficient non-meiotic allele introgression
US10920242B2 (en) 2011-02-25 2021-02-16 Recombinetics, Inc. Non-meiotic allele introgression
EP3613852A3 (en) 2011-07-22 2020-04-22 President and Fellows of Harvard College Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity
UA116097C2 (uk) 2011-12-11 2018-02-12 Зе Стейт Оф Ізраел, Міністрі Оф Агрікалче Енд Руерал Девелопмент, Агрікалчерал Рісьоч Організейшн, (А.Р.О.), Волкані Сентре Спосіб модуляції провідності устячка рослини
GB201122458D0 (en) 2011-12-30 2012-02-08 Univ Wageningen Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof
US10058078B2 (en) 2012-07-31 2018-08-28 Recombinetics, Inc. Production of FMDV-resistant livestock by allele substitution
EP2920319B1 (en) 2012-11-16 2020-02-19 Poseida Therapeutics, Inc. Site-specific enzymes and methods of use
EP2971167B1 (en) 2013-03-14 2019-07-31 Caribou Biosciences, Inc. Compositions and methods of nucleic acid-targeting nucleic acids
US9902973B2 (en) 2013-04-11 2018-02-27 Caribou Biosciences, Inc. Methods of modifying a target nucleic acid with an argonaute
GB201311057D0 (en) 2013-06-21 2013-08-07 Univ Greenwich Antisense oligonucleotide compositions
US20150044192A1 (en) 2013-08-09 2015-02-12 President And Fellows Of Harvard College Methods for identifying a target site of a cas9 nuclease
US9228207B2 (en) 2013-09-06 2016-01-05 President And Fellows Of Harvard College Switchable gRNAs comprising aptamers
US10538570B2 (en) * 2013-09-30 2020-01-21 Northwestern University Targeted and modular exosome loading system
AP2016009207A0 (en) 2013-10-25 2016-05-31 Livestock Improvement Corp Ltd Genetic markers and uses therefor
US9068179B1 (en) 2013-12-12 2015-06-30 President And Fellows Of Harvard College Methods for correcting presenilin point mutations
MX2016010285A (es) 2014-02-11 2017-01-11 Univ Colorado Regents Ingenieria genetica multiplexada habilitada por crispr.
CN106459884A (zh) * 2014-05-16 2017-02-22 株式会社钟化 土壤杆菌及使用土壤杆菌的转化植物的制造方法
AU2015277180A1 (en) * 2014-06-17 2017-01-12 Poseida Therapeutics, Inc. A method for directing proteins to specific loci in the genome and uses thereof
AU2015298571B2 (en) 2014-07-30 2020-09-03 President And Fellows Of Harvard College Cas9 proteins including ligand-dependent inteins
CN106715768B (zh) 2014-07-30 2020-06-16 哈佛学院院长及董事 用于测定核酸的系统和方法
KR102656470B1 (ko) 2014-12-10 2024-04-09 리전츠 오브 더 유니버스티 오브 미네소타 질환을 치료하기 위한 유전적으로 변형된 세포, 조직 및 장기
US10738290B2 (en) * 2015-04-21 2020-08-11 Novartis Ag RNA-guided gene editing system and uses thereof
EP3929286A1 (en) 2015-06-17 2021-12-29 Poseida Therapeutics, Inc. Compositions and methods for directing proteins to specific loci in the genome
EP4339287A3 (en) 2015-07-31 2024-05-22 Regents Of The University Of Minnesota Modified cells and methods of therapy
MX2018004808A (es) 2015-10-20 2018-08-01 Pioneer Hi Bred Int Funcion restauradora para un producto genico no funcional mediante sistemas cas guiados y metodos de uso.
CN108513575A (zh) 2015-10-23 2018-09-07 哈佛大学的校长及成员们 核碱基编辑器及其用途
JP7064439B2 (ja) * 2015-11-04 2022-05-10 アトレカ インコーポレイテッド 単一細胞に関連する核酸の解析のための、核酸バーコードの組み合わせセット
US9856497B2 (en) 2016-01-11 2018-01-02 The Board Of Trustee Of The Leland Stanford Junior University Chimeric proteins and methods of regulating gene expression
KR20180095719A (ko) 2016-01-11 2018-08-27 더 보드 어브 트러스티스 어브 더 리랜드 스탠포드 주니어 유니버시티 키메라 단백질 및 면역요법 방법
US9896696B2 (en) * 2016-02-15 2018-02-20 Benson Hill Biosystems, Inc. Compositions and methods for modifying genomes
EP3417065A4 (en) * 2016-02-18 2019-07-17 President and Fellows of Harvard College METHOD AND SYSTEMS FOR MOLECULAR RECORDING BY CRISPR-CAS SYSTEM
WO2017155714A1 (en) 2016-03-11 2017-09-14 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Novel cas9 systems and methods of use
CN105779609A (zh) * 2016-04-15 2016-07-20 上海伊丽萨生物科技有限公司 一种超敏免疫检测方法
AU2017280353B2 (en) 2016-06-24 2021-11-11 Inscripta, Inc. Methods for generating barcoded combinatorial libraries
WO2018027078A1 (en) 2016-08-03 2018-02-08 President And Fellows Of Harard College Adenosine nucleobase editors and uses thereof
CA3033327A1 (en) 2016-08-09 2018-02-15 President And Fellows Of Harvard College Programmable cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
WO2018039438A1 (en) 2016-08-24 2018-03-01 President And Fellows Of Harvard College Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing
US20190225974A1 (en) 2016-09-23 2019-07-25 BASF Agricultural Solutions Seed US LLC Targeted genome optimization in plants
CN107880132B (zh) * 2016-09-30 2022-06-17 北京大学 一种融合蛋白及使用其进行同源重组的方法
KR20240007715A (ko) 2016-10-14 2024-01-16 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 핵염기 에디터의 aav 전달
EP3529359B1 (en) 2016-10-18 2023-12-13 Regents of the University of Minnesota Tumor infiltrating lymphocytes for use in therapy
ES2969671T3 (es) * 2016-11-08 2024-05-21 Harvard College Obtención de imágenes con multiplexación usando MERFISH, microscopía de expansión y tecnologías relacionadas
US10745677B2 (en) 2016-12-23 2020-08-18 President And Fellows Of Harvard College Editing of CCR5 receptor gene to protect against HIV infection
JP7178355B2 (ja) 2017-02-28 2022-11-25 エンドサイト・インコーポレイテッド Ｃａｒ ｔ細胞療法のための組成物および方法
EP3592853A1 (en) 2017-03-09 2020-01-15 President and Fellows of Harvard College Suppression of pain by gene editing
JP2020510439A (ja) 2017-03-10 2020-04-09 プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ シトシンからグアニンへの塩基編集因子
SG11201908658TA (en) 2017-03-23 2019-10-30 Harvard College Nucleobase editors comprising nucleic acid programmable dna binding proteins
EP3601610A1 (en) 2017-03-30 2020-02-05 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Methods of identifying and characterizing gene editing variations in nucleic acids
US11560566B2 (en) 2017-05-12 2023-01-24 President And Fellows Of Harvard College Aptazyme-embedded guide RNAs for use with CRISPR-Cas9 in genome editing and transcriptional activation
US11591620B2 (en) 2017-05-18 2023-02-28 Cargill, Incorporated Genome editing system
WO2018218150A1 (en) 2017-05-26 2018-11-29 President And Fellows Of Harvard College Systems and methods for high-throughput image-based screening
US10011849B1 (en) 2017-06-23 2018-07-03 Inscripta, Inc. Nucleic acid-guided nucleases
US9982279B1 (en) 2017-06-23 2018-05-29 Inscripta, Inc. Nucleic acid-guided nucleases
JP2020530307A (ja) 2017-06-30 2020-10-22 インティマ・バイオサイエンス，インコーポレーテッド 遺伝子治療のためのアデノ随伴ウイルスベクター
US11732274B2 (en) 2017-07-28 2023-08-22 President And Fellows Of Harvard College Methods and compositions for evolving base editors using phage-assisted continuous evolution (PACE)
CN111263810A (zh) * 2017-08-22 2020-06-09 纳匹基因公司 使用多核苷酸指导的核酸内切酶的细胞器基因组修饰
US11319532B2 (en) 2017-08-30 2022-05-03 President And Fellows Of Harvard College High efficiency base editors comprising Gam
CN107759673B (zh) * 2017-09-27 2021-06-04 复旦大学 可对hbv的dna进行表观甲基化修饰的蛋白分子及其应用
CN111757937A (zh) 2017-10-16 2020-10-09 布罗德研究所股份有限公司 腺苷碱基编辑器的用途
AU2019207409B2 (en) 2018-01-12 2023-02-23 Basf Se Gene underlying the number of spikelets per spike qtl in wheat on chromosome 7a
JP2021512147A (ja) 2018-01-22 2021-05-13 エンドサイト・インコーポレイテッドＥｎｄｏｃｙｔｅ， Ｉｎｃ． Ｃａｒ ｔ細胞の使用方法
BR112020023853A2 (pt) 2018-05-25 2021-04-13 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Sistemas e métodos para melhoramento aprimorado por modulação das taxas de recombinação
CN109355246B (zh) * 2018-11-21 2022-02-11 河南农业大学 一种拟南芥叶肉细胞原生质体及其制备方法和应用
RU2712497C1 (ru) * 2018-11-26 2020-01-29 Автономная некоммерческая образовательная организация высшего образования Сколковский институт науки и технологий Средство разрезания ДНК на основе Cas9 белка из биотехнологически значимой бактерии Clostridium cellulolyticum
US20220098621A1 (en) 2019-02-05 2022-03-31 Emendobio Inc. Crispr compositions and methods for promoting gene editing of ribosomal protein s19 (rps19) gene
DE112020001342T5 (de) 2019-03-19 2022-01-13 President and Fellows of Harvard College Verfahren und Zusammensetzungen zum Editing von Nukleotidsequenzen
US20230312737A1 (en) * 2020-03-04 2023-10-05 Regents Of The University Of Minnesota Anti-dr5 polypeptides and methods of use thereof
CN111514949B (zh) * 2020-04-27 2020-12-01 四川大学 一种微流控芯片及其制备方法
EP4146804A1 (en) 2020-05-08 2023-03-15 The Broad Institute Inc. Methods and compositions for simultaneous editing of both strands of a target double-stranded nucleotide sequence
US20230374476A1 (en) * 2021-02-05 2023-11-23 University Of Massachusetts Prime editor system for in vivo genome editing
EP4095243A1 (en) * 2021-05-25 2022-11-30 European Molecular Biology Laboratory System for hybridization-based precision genome cleavage and editing, and uses thereof
CA3234338A1 (en) 2021-10-08 2023-04-13 Pencil Biosciences Limited Synthetic genome editing system
CA3235955A1 (en) * 2021-11-12 2023-05-19 Targetgene Biotechnologies Ltd. Systems and methods for trans-modulation of immune cells by genetic manipulation of immune regulatory genes
CN114717259B (zh) * 2022-05-26 2023-06-20 山西大学 一种温控诱导型基因编辑系统及其应用

Family Cites Families (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
US5235033A (en) 1985-03-15 1993-08-10 Anti-Gene Development Group Alpha-morpholino ribonucleoside derivatives and polymers thereof
US4935357A (en) * 1986-02-05 1990-06-19 New England Biolabs, Inc. Universal restriction endonuclease
DE779362T1 (de) * 1989-12-22 2001-04-05 Applied Research Systems DNS-Konstrukten zur Aktivierung und Veränderung der Expression von endogenen Genen
US6544780B1 (en) 2000-06-02 2003-04-08 Genphar, Inc. Adenovirus vector with multiple expression cassettes
EP1356061A2 (en) * 2000-10-13 2003-10-29 Crosslink Genetics Corporation Artificial transcriptional factors and methods of use
EP1501943A4 (en) * 2002-04-16 2005-06-22 Promega Corp METHOD FOR IMPROVING APPROVED RECOMBINATION
WO2004037977A2 (en) 2002-09-05 2004-05-06 California Institute Of Thechnology Use of chimeric nucleases to stimulate gene targeting
DK2927318T3 (da) 2003-08-08 2020-08-03 Sangamo Therapeutics Inc Fremgangsmåde og sammensætninger til målrettet spaltning og rekombination
DE102004043155A1 (de) 2004-09-03 2006-03-23 TransMIT Gesellschaft für Technologietransfer mbH Hochspezifisch mit DNA interagierende Enzym-Konjugate mit programmierbarer Spezifität
US20070042404A1 (en) * 2005-08-19 2007-02-22 Huimin Zhao Compositions and method for detecting endonuclease activity
EP2325332B1 (en) 2005-08-26 2012-10-31 DuPont Nutrition Biosciences ApS Use of CRISPR associated genes (CAS)
EP2155868A2 (en) * 2007-04-19 2010-02-24 Codon Devices, Inc Engineered nucleases and their uses for nucleic acid assembly
JP2011505809A (ja) 2007-12-07 2011-03-03 プレシジョン バイオサイエンシズ，インク． ヒトゲノムのＤＮａｓｅ高感受性領域に見出される認識配列を有する合理的に設計されたメガヌクレアーゼ
US20100076057A1 (en) * 2008-09-23 2010-03-25 Northwestern University TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA
WO2010054108A2 (en) 2008-11-06 2010-05-14 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Cas6 polypeptides and methods of use
NZ598457A (en) * 2009-08-03 2014-06-27 Recombinetics Inc Methods and compositions for targeted gene modification
US8586526B2 (en) 2010-05-17 2013-11-19 Sangamo Biosciences, Inc. DNA-binding proteins and uses thereof
EP2504430A4 (en) * 2009-11-27 2013-06-05 Basf Plant Science Co Gmbh CHIMERIC ENDONUCLEASES AND USES THEREOF
CN102770539B (zh) * 2009-12-10 2016-08-03 明尼苏达大学董事会 Tal效应子介导的dna修饰
EP2392208B1 (en) * 2010-06-07 2016-05-04 Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Fusion proteins comprising a DNA-binding domain of a Tal effector protein and a non-specific cleavage domain of a restriction nuclease and their use
KR101736503B1 (ko) 2010-08-06 2017-05-16 가부시키가이샤 시세이도 엘라스타제 저해제
US10030245B2 (en) 2011-03-23 2018-07-24 E I Du Pont De Nemours And Company Methods for producing a complex transgenic trait locus
GB201122458D0 (en) 2011-12-30 2012-02-08 Univ Wageningen Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof
DK3401400T3 (da) * 2012-05-25 2019-06-03 Univ California Fremgangsmåder og sammensætninger til rna-styret mål-dna-modifikation og til rna-styret transskriptionsmodulering
US8697359B1 (en) 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
US9228207B2 (en) * 2013-09-06 2016-01-05 President And Fellows Of Harvard College Switchable gRNAs comprising aptamers

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113614247A (zh) * 2018-11-26 2021-11-05 拜奥卡德联合股份公司 Dna切割剂

Also Published As

Publication number Publication date
US20150211023A1 (en) 2015-07-30
ZA201403785B (en) 2023-12-20
HK1203362A1 (en) 2015-10-30
WO2013088446A1 (en) 2013-06-20
JP2015500648A (ja) 2015-01-08
IL253372B (en) 2019-02-28
US10220052B2 (en) 2019-03-05
EP2790708A1 (en) 2014-10-22
IL253372A0 (en) 2017-09-28
EP2790708A4 (en) 2015-11-04
IN2014MN00974A (ru) 2015-04-24
CN104080462B (zh) 2019-08-09
US11278560B2 (en) 2022-03-22
AU2012354062B2 (en) 2017-09-07
CA2858801A1 (en) 2013-06-20
BR112014014105A2 (pt) 2020-10-27
IL253373A0 (en) 2017-09-28
CA3226329A1 (en) 2013-06-20
AU2017268502B2 (en) 2019-04-04
BR112014014105B1 (pt) 2023-10-10
US20240148771A1 (en) 2024-05-09
US20170319613A1 (en) 2017-11-09
RU2663354C2 (ru) 2018-08-03
US11690866B2 (en) 2023-07-04
CN104080462A (zh) 2014-10-01
PH12014501360A1 (en) 2014-09-22
AU2017268502A1 (en) 2017-12-14
UA115772C2 (uk) 2017-12-26
US11458157B2 (en) 2022-10-04
AU2012354062A1 (en) 2014-07-03
NZ626105A (en) 2016-11-25
CA2858801C (en) 2024-02-27
US20170183687A1 (en) 2017-06-29
US20170233752A1 (en) 2017-08-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2014129015A (ru) Композиции и способы для модификации заданной последовательности нуклеиновой кислоты-мишени
CA3081441C (en) Kits for analysis using nucleic acid encoding and/or label
ES2950676T3 (es) Reparación de enlace de plantillas a endonucleasas para modificación de genes
AU2022246414A1 (en) Methods for breaking immunological tolerance using multiple guide rnas
ES2689256T3 (es) Ribonucleoproteínas Cascada modificadas y usos de las mismas
JP4931825B2 (ja) 構造核酸指向化学合成
AU2010279572B2 (en) Methods and compositions for targeted gene modification
US6849428B1 (en) Intein-mediated protein ligation of expressed proteins
JP5628664B2 (ja) 相同組換え方法およびクローニング方法並びにキット
JP2020510410A5 (ru)
AU2021203275A1 (en) Chimeric genome engineering molecules and methods
EP3786293A1 (en) Methods and compositions for producing a chimeric polypeptide
KR20100080068A (ko) 신규한 징크 핑거 뉴클레아제 및 이의 용도
ES2310240T3 (es) Uso de un enzima de restriccion de tipo iii para aislar etiquetas de secuencia que comprenden mas de 25 nucleotidos.
US20210187102A1 (en) Method of obtaining a polyepitopic protein and polyepitopic dna vector
US8053632B2 (en) Method of controlling cellular processes in plants
Perler Inteins—a historical perspective
Savic et al. Covalent linkage of the DNA repair template to the CRISPR/Cas9 complex enhances homology-directed repair
Bouda Characterizing the Role of MTERF3 in Mitochondrial Ribosome Assembly
Matthijs et al. CRISPR-ChAP-MS in plants: a challenge.
US20210380967A1 (en) Methods of Identifying Adenosine-to-Inosine Edited RNA
OSTAD et al. Sorting analysis of mouse peroxisomal protein by in vitro studies
Lumba Splice Site Recognition During Early Spliceosome Assembly
Ou et al. Efficient reprogramming of the heavy-chain CDR3 regions of a human antibody repertoire
CN107312788A (zh) 一种tale重复序列载体的构建方法