RU2012129362A - Обнаружение мишени tsg праймером - Google Patents

Обнаружение мишени tsg праймером Download PDF

Info

Publication number
RU2012129362A
RU2012129362A RU2012129362/10A RU2012129362A RU2012129362A RU 2012129362 A RU2012129362 A RU 2012129362A RU 2012129362/10 A RU2012129362/10 A RU 2012129362/10A RU 2012129362 A RU2012129362 A RU 2012129362A RU 2012129362 A RU2012129362 A RU 2012129362A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
acid sequence
target nucleic
primer
molecule
Prior art date
Application number
RU2012129362/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2551321C2 (ru
Inventor
Джон Йоон ЧУН
Ин Таэк ХВАН
Original Assignee
Сиджен, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Сиджен, Инк. filed Critical Сиджен, Инк.
Publication of RU2012129362A publication Critical patent/RU2012129362A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2551321C2 publication Critical patent/RU2551321C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6816Hybridisation assays characterised by the detection means
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/34Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Способ детекции нуклеиновокислотной последовательности-мишени из ДНК или смеси нуклеиновых кислот с использованием праймера, генерирующего сигнал от мишени (TSG-праймера), включающий стадии:(a) гибридизации нуклеиновокислотной последовательности-мишени с TSG-праймером; при этом TSG-праймер содержит (1) гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеиновокислотной последовательности-мишени, и (2) репортерную молекулу и молекулу-гаситель; при этом если TSG-праймер не гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно располагаются близко друг к другу, что позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы; при этом если TSG-праймер гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно разделяются, что не позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы, в результате чего генерируется и выявляется сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени;(b) приведения в контакт продукта со стадии (а) с матричной полимеразой нуклеиновых кислот в условиях удлинения праймера, так что реакция 3'-удлинения индуцируется по 3'-концу TSG-праймера; и(c) детекции сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, тем самым данный сигнал указывает на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени в ДНК или смеси нуклеиновых кислот.2. Способ по п.1, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот

Claims (21)

1. Способ детекции нуклеиновокислотной последовательности-мишени из ДНК или смеси нуклеиновых кислот с использованием праймера, генерирующего сигнал от мишени (TSG-праймера), включающий стадии:
(a) гибридизации нуклеиновокислотной последовательности-мишени с TSG-праймером; при этом TSG-праймер содержит (1) гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеиновокислотной последовательности-мишени, и (2) репортерную молекулу и молекулу-гаситель; при этом если TSG-праймер не гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно располагаются близко друг к другу, что позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы; при этом если TSG-праймер гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно разделяются, что не позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы, в результате чего генерируется и выявляется сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени;
(b) приведения в контакт продукта со стадии (а) с матричной полимеразой нуклеиновых кислот в условиях удлинения праймера, так что реакция 3'-удлинения индуцируется по 3'-концу TSG-праймера; и
(c) детекции сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, тем самым данный сигнал указывает на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени в ДНК или смеси нуклеиновых кислот.
2. Способ по п.1, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 5'→3'-нуклеазной активностью, и TSG-праймер удлиняется по своему 3'-концу под действием полимеразной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот и расщепляется на своем 5'-конце под действием 5'→3'-нуклеазной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот, в результате чего из TSG-праймера высвобождается либо репортерная молекула, либо молекула-гаситель, генерируя сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
3. Способ по п.2, дополнительно включающий повторение по меньшей мере дважды стадий (а)-(b) или (а)-(с) вместе со стадией денатурации между повторяющимися циклами с целью усиления сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
4. Способ по п.1 или 2, где репортерная молекула или молекула-гаситель на TSG-праймере расположена на его 5'-конце или на расстоянии 1-5 нуклеотидов от его 5'-конца.
5. Способ по п.1, где молекула-гаситель представляет собой флуоресцентную молекулу и где сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, детектируемый на стадии (с), представляет собой сигнал от флуоресцентной молекулы-гасителя.
6. Способ по п.1, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 3'→5'-экзонуклеазной активностью.
7. Способ по п.6, где TSG-праймер содержит по меньшей мере один ошибочно спаренный нуклеотид, имеющий остов, устойчивый в отношении 3'→5'-экзонуклеазной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот на своем 3'-концевом участке.
8. Способ по п.1, который осуществляют на твердой фазе и где TSG-праймер иммобилизован через свой 5'-конец на поверхности твердой подложки.
9. Способ по п.1 или 8, где нуклеиновокислотная последовательность-мишень включает по меньшей мере два типа нуклеиновокислотных последовательностей, и TSG-праймеры включают по меньшей мере два типа праймеров.
10. Способ по п.1 или 8, где нуклеиновокислотная последовательность-мишень имеет вариабельность нуклеотидов.
11. Способ детекции нуклеиновокислотной последовательности-мишени из ДНК или смеси нуклеиновых кислот с использованием праймера, генерирующего сигнал от мишени, (TSG-праймера) в реакции амплификации, включающий стадии:
(а) гибридизации нуклеиновокислотной последовательности-мишени с использованием пары праймеров, состоящей из двух праймеров в качестве прямого праймера и обратного праймера, способных амплифицировать нуклеиновокислотную последовательность-мишень; при этом по меньшей мере один из этих двух праймеров представляет собой TSG-праймер; при этом TSG-праймер содержит (1) гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеиновокислотной последовательности-мишени, и (2) репортерную молекулу и молекулу-гаситель; при этом если TSG-праймер не гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно располагаются близко друг к другу, что позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы; при этом если TSG-праймер гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно разделяются, что не позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы, в результате чего генерируется и выявляется сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени;
(b) приведения в контакт продукта со стадии (а) с матричной полимеразой нуклеиновых кислот в условиях удлинения праймера, так что реакция 3'-удлинения индуцируется по 3'-концам этих двух праймеров;
(c) денатурации продукта со стадии (b);
(d) повторение стадий (а)-(с) по меньшей мере дважды с целью как амплификации нуклеиновокислотной последовательности-мишени, так и усиления сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени; и
(e) детекции сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, при этом детекцию осуществляют для каждого цикла повторного проведения стадии (d), в конце повторного проведения стадии (d) или в каждый из предварительно заданных интервалов времени в процессе повторного проведения, тем самым данный сигнал указывает на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
12. Способ по п.11, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 5'→3'-нуклеазной активностью, и TSG-праймер удлиняется по своему 3'-концу под действием полимеразной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот и расщепляется на своем 5'-конце под действием 5'→3'-нуклеазной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот, в результате чего из TSG-праймера высвобождается либо репортерная молекула, либо молекула-гаситель, генерируя сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
13. Способ по п.11 или 12, где репортерная молекула или молекула-гаситель на TSG-праймере расположена на его 5'-конце или на расстоянии 1-5 нуклеотидов от его 5'-конца.
14. Способ по п.11, где молекула-гаситель представляет собой флуоресцентную молекулу и где сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, детектируемый на стадии (е), представляет собой сигнал от флуоресцентной молекулы-гасителя.
15. Способ по п.11, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 3'→5'-экзонуклеазной активностью.
16. Способ по п.11, который осуществляют на твердой фазе, где по меньшей мере один из этих двух праймеров иммобилизован через свой 5'-конец на поверхности твердой подложки и где иммобилизованный праймер представляет собой TSG-праймер.
17. Набор для детекции нуклеиновокислотной последовательности-мишени из ДНК или смеси нуклеиновых кислот с использованием праймера, генерирующего сигнал от мишени, (TSG-праймера), содержащий:
(a) TSG-праймер, содержащий (1) гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеиновокислотной последовательности-мишени, и (2) репортерную молекулу и молекулу-гаситель; при этом если TSG-праймер не гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно располагаются близко друг к другу, что позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы; при этом если TSG-праймер гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно разделяются, что не позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы, в результате чего генерируется и выявляется сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени;
(b) матричную полимеразу нуклеиновых кислот, способную индуцировать реакцию 3'-удлинения по 3'-концу TSG-праймера в результате действия на продукт гибридизации TSG-праймера и нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
18. Набор по п.17, содержащий пару праймеров, состоящую из двух праймеров в качестве прямого праймера и обратного праймера, способных амплифицировать нуклеиновокислотную последовательность-мишень; при этом по меньшей мере один из этих двух праймеров представляет собой TSG-праймер.
19. Набор по п.17 или 18, где матричная полимераза нуклеиновых кислот обладает 5'→3'-нуклеазной активностью для индукции как реакции 3'-удлинения по 3'-концу TSG-праймера в результате проявления ее полимеразной активности, так и реакции 5'-расщепления на 5'-конце TSG-праймера в результате проявления ее 5'→3'-нуклеазной активности.
20. Набор по любому из пп.17 и 18, где репортерная молекула или молекула-гаситель на TSG-праймере расположена на его 5'-конце или на расстоянии 1-5 нуклеотидов от его 5'-конца.
21. Набор по п.17 или 18, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 3'→5'-экзонуклеазной активностью.
RU2012129362/10A 2009-12-21 2010-03-26 Обнаружение мишени tsg-праймером RU2551321C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR20090127880 2009-12-21
KR10-2009-0127880 2009-12-21
PCT/KR2010/001873 WO2011078441A1 (en) 2009-12-21 2010-03-26 Tsg primer target detection

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2012129362A true RU2012129362A (ru) 2014-01-27
RU2551321C2 RU2551321C2 (ru) 2015-05-20

Family

ID=44195946

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012129362/10A RU2551321C2 (ru) 2009-12-21 2010-03-26 Обнаружение мишени tsg-праймером

Country Status (11)

Country Link
US (1) US9845492B2 (ru)
EP (1) EP2516679B1 (ru)
JP (1) JP5822843B2 (ru)
KR (1) KR101569476B1 (ru)
CN (1) CN102762744B (ru)
AU (1) AU2010336137B2 (ru)
BR (1) BR112012018394B8 (ru)
CA (1) CA2784344C (ru)
IL (1) IL220478A (ru)
RU (1) RU2551321C2 (ru)
WO (1) WO2011078441A1 (ru)

Families Citing this family (34)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2606150B1 (en) * 2010-08-20 2016-03-16 Life Technologies Corporation Quantitative real-time pcr assay using fret dual-labeled primers
MX340258B (es) 2011-01-11 2016-07-01 Seegene Inc Detección de secuencias de ácido nucleico objetivo mediante ensayo de escisión y extensión del pto.
KR101569479B1 (ko) 2011-03-29 2015-11-16 주식회사 씨젠 Pto 절단 및 연장-의존적 절단에 의한 타겟 핵산서열의 검출
US9850524B2 (en) 2011-05-04 2017-12-26 Seegene, Inc. Detection of target nucleic acid sequences by PO cleavage and hybridization
KR20130101952A (ko) * 2012-02-02 2013-09-16 주식회사 씨젠 Pto 절단과 연장-의존적 혼성화를 이용한 타겟 핵산서열의 검출
US9963738B2 (en) * 2012-02-20 2018-05-08 Speedx Pty Ltd Detection of nucleic acids
US20150011416A1 (en) * 2012-02-23 2015-01-08 Qiagen Mansfield, Inc Multimodal pcr target detection
RU2620955C2 (ru) 2012-03-05 2017-05-30 Сиджен, Инк. Детекция нуклеотидной вариации в нуклеиновокислотной последовательности-мишени в анализе с расщеплением и удлинением зондирующего и метящего олигонуклеотида (рто)
KR101756975B1 (ko) 2012-04-19 2017-07-12 주식회사 씨젠 Pto 절단 및 연장-의존적 시그널링 올리고뉴클레오타이드 절단을 이용한 타겟 핵산서열의 검출
US9074249B2 (en) 2012-06-04 2015-07-07 New England Biolabs, Inc. Detection of amplification products
US9074243B2 (en) 2012-07-27 2015-07-07 New England Biolabs, Inc. Detection of amplification products
EP4570924A3 (en) * 2013-01-24 2025-09-03 California Institute of Technology Chromophore-based characterization and detection methods
US10077475B2 (en) 2013-01-24 2018-09-18 California Institute Of Technology FRET-based analytes detection and related methods and systems
KR102222546B1 (ko) * 2013-02-07 2021-03-08 러트거즈,더스테이트유니버시티오브뉴저지 고도로 선택적인 핵산 증폭 프라이머
EP2971147A4 (en) * 2013-03-15 2016-08-31 Abbott Molecular Inc MULTIPLEX ALLELNACHWEIS
WO2015147370A1 (en) 2014-03-28 2015-10-01 Seegene, Inc. Detection of target nucleic acid sequences using different detection temperatures
WO2015164602A2 (en) * 2014-04-23 2015-10-29 Children's Medical Center Corporation High-throughput structure determination using nucleic acid calipers
KR101742681B1 (ko) * 2015-01-30 2017-06-01 에스디 바이오센서 주식회사 상보적 염기서열 내지는 미스-매치된 염기를 포함하는 상보적인 염기서열과 연결된 pcr 프라이머 및 이를 이용한 핵산 증폭 방법
KR101756875B1 (ko) * 2015-05-28 2017-07-11 에스디 바이오센서 주식회사 상보적 염기서열과 미스-매치된 염기서열 그리고 reporter와 quencher를 포함하는 이중 기능성 올리고뉴클레오타이드 및 이를 이용한 핵산 증폭 및 측정 방법
CN105256055B (zh) * 2015-11-13 2019-02-05 中华人民共和国汕头出入境检验检疫局 基于dpo引物的实时荧光pcr检测植物乳杆菌的方法、引物及试剂盒
CN108368547B (zh) 2015-12-15 2022-04-05 Seegene株式会社 与靶核酸序列有关的信号提取
US11473127B2 (en) 2017-03-28 2022-10-18 Seegene, Inc. Analytical signal for determination of the presence of a target nucleic acid sequence
CN107091834B (zh) * 2017-05-24 2019-07-02 青岛科技大学 一种基于发卡错配循环放大技术检测dna的方法
US11591645B2 (en) 2017-08-31 2023-02-28 Seegene, Inc. Evaluation of performance of components using a pair of dimer-forming primers
US12018318B2 (en) 2017-09-28 2024-06-25 Seegene, Inc. Method and device for analyzing target analyte in sample
WO2019066461A2 (en) 2017-09-29 2019-04-04 Seegene, Inc. DETECTION OF TARGET NUCLEIC ACID SEQUENCES BY CLEAVAGE ANALYSIS AND EXTENSION OF PTO
CN107760764B (zh) * 2017-10-23 2023-04-07 上海阅尔基因技术有限公司 一种基于引物荧光和淬灭标记的靶核酸检测方法和试剂盒
US12391997B2 (en) 2018-01-05 2025-08-19 Seegene, Inc. Method for determining the presence or absence of M. tuberculosis, M. bovis and M. bovis BCG in a sample
JP7077992B2 (ja) * 2019-02-22 2022-05-31 横河電機株式会社 核酸配列計測用デバイス、核酸配列計測方法、および核酸配列計測装置
CN118186090A (zh) 2020-09-23 2024-06-14 迈克生物股份有限公司 检测核酸的组合、方法及试剂盒
CN112111566A (zh) 2020-09-23 2020-12-22 迈克生物股份有限公司 多重核酸检测方法、组合及试剂盒
EP4403645A4 (en) 2021-09-17 2025-10-08 Seegene Inc DETECTION OF A TARGET NUCLEIC ACID SEQUENCE USING A MARKER OLIGONUCLEOTIDE CARRYING A SYNTHETIC NON-NATURAL BASE
EP4603593A1 (en) 2022-10-14 2025-08-20 Seegene, Inc. Method for detecting target nucleic acid in sample using two probes with different tm values
EP4621068A1 (en) 2022-11-16 2025-09-24 Seegene, Inc. Detection of target nucleic acid by quenching-pto cleavage and extension (q-ptoce) assay

Family Cites Families (40)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3996345A (en) 1974-08-12 1976-12-07 Syva Company Fluorescence quenching with immunological pairs in immunoassays
US4351760A (en) 1979-09-07 1982-09-28 Syva Company Novel alkyl substituted fluorescent compounds and polyamino acid conjugates
US4683195A (en) 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
US4800159A (en) 1986-02-07 1989-01-24 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences
IL86724A (en) 1987-06-19 1995-01-24 Siska Diagnostics Inc Methods and kits for amplification and testing of nucleic acid sequences
EP0359789B1 (en) 1988-01-21 1993-08-04 Genentech, Inc. Amplification and detection of nucleic acid sequences
US5210015A (en) * 1990-08-06 1993-05-11 Hoffman-La Roche Inc. Homogeneous assay system using the nuclease activity of a nucleic acid polymerase
US5538848A (en) * 1994-11-16 1996-07-23 Applied Biosystems Division, Perkin-Elmer Corp. Method for detecting nucleic acid amplification using self-quenching fluorescence probe
US6117635A (en) 1996-07-16 2000-09-12 Intergen Company Nucleic acid amplification oligonucleotides with molecular energy transfer labels and methods based thereon
US6485901B1 (en) * 1997-10-27 2002-11-26 Boston Probes, Inc. Methods, kits and compositions pertaining to linear beacons
EP0930370B1 (en) * 1997-12-15 2007-08-08 CSL Behring GmbH Labeled primer for use in detection of target nucleic acids
GB9812768D0 (en) 1998-06-13 1998-08-12 Zeneca Ltd Methods
US6383752B1 (en) * 1999-03-31 2002-05-07 Hybridon, Inc. Pseudo-cyclic oligonucleobases
US6322980B1 (en) 1999-04-30 2001-11-27 Aclara Biosciences, Inc. Single nucleotide detection using degradation of a fluorescent sequence
US6277607B1 (en) * 1999-05-24 2001-08-21 Sanjay Tyagi High specificity primers, amplification methods and kits
WO2000079009A2 (en) * 1999-06-22 2000-12-28 Invitrogen Corporation Improved primers and methods for the detection and discrimination of nucleic acids
US7205105B2 (en) * 1999-12-08 2007-04-17 Epoch Biosciences, Inc. Real-time linear detection probes: sensitive 5′-minor groove binder-containing probes for PCR analysis
US7344830B2 (en) 2000-09-26 2008-03-18 Health Research Inc. Heteroduplex tracking assay
AU2002305941A1 (en) * 2001-03-01 2002-09-19 The Johns Hopkins University Quantitative assay for the simultaneous detection and speciation of bacterial infections
US20060057561A1 (en) 2001-06-14 2006-03-16 Hart Keith W Virus detection method, primers therefor and screening kit
US7205112B2 (en) * 2001-06-27 2007-04-17 University Of South Florida Materials and methods for detection of enterovirus and norovirus
EP1439222A1 (en) 2001-10-26 2004-07-21 Matsushita Electric Industrial Co., Ltd. Method of detecting target nucleic acid and nucleic acid probe
US6818420B2 (en) * 2002-02-27 2004-11-16 Biosource International, Inc. Methods of using FET labeled oligonucleotides that include a 3′-5′ exonuclease resistant quencher domain and compositions for practicing the same
JP4457001B2 (ja) * 2002-05-31 2010-04-28 セクレタリー・デパートメント・オブ・アトミック・エナジー ドナー/アクセプター部分が相補鎖上となる標的核酸検出のmet/fretに基づく方法
JP3923917B2 (ja) 2003-03-26 2007-06-06 株式会社東芝 ターゲットの製造方法、標的配列検出方法、ターゲットおよび標的配列検出用アッセイキット
US20070141572A1 (en) * 2003-04-18 2007-06-21 Eliane Ubalijoro Polynucleotides for the detection of listeria moncytogenes
CA2542768A1 (en) * 2003-10-28 2005-05-12 Epoch Biosciences, Inc. Fluorescent probes for dna detection by hybridization with improved sensitivity and low background
JP2007534308A (ja) * 2003-11-19 2007-11-29 アレロジック・バイオサイエンシズ・コーポレーション 複数のフルオロフォアで標識したオリゴヌクレオチド
GB0423552D0 (en) * 2004-10-22 2004-11-24 Hepcgen Ltd Methods
KR101032750B1 (ko) 2005-03-05 2011-05-06 주식회사 씨젠 이중 특이성 올리고뉴클레오타이드를 사용한 방법 및 이중 특이성 올리고뉴클레오타이드
US20070048758A1 (en) * 2005-06-09 2007-03-01 Epoch Biosciences, Inc. Improved primer-based amplification methods
US7919244B2 (en) * 2005-06-16 2011-04-05 Biotools Biotechnological & Medical Laboratories, S.A. Nucleic acid detection method involving the direct generation of a measurable signal
WO2007011946A2 (en) 2005-07-15 2007-01-25 Applera Corporation Detection of nucleic acid amplification
JP5027126B2 (ja) 2005-07-25 2012-09-19 アリーア サン ディエゴ, インコーポレイテッド リコンビナーゼポリメラーゼ増幅を多重化するための方法
US20090068643A1 (en) * 2005-11-23 2009-03-12 Integrated Dna Technologies, Inc. Dual Function Primers for Amplifying DNA and Methods of Use
US20070254284A1 (en) * 2006-05-01 2007-11-01 Biwei Zhao A nucleic acid detection method
GB0609498D0 (en) * 2006-05-12 2006-06-21 Oncomethylome Sciences S A Novel methylation marker
GB0703997D0 (en) * 2007-03-01 2007-04-11 Oxitec Ltd Methods for detecting nucleic sequences
KR20110050327A (ko) * 2009-11-07 2011-05-13 주식회사 씨젠 Thd 프라이머 타겟 검출

Also Published As

Publication number Publication date
BR112012018394B8 (pt) 2021-07-27
KR101569476B1 (ko) 2015-11-16
CN102762744B (zh) 2017-07-25
JP5822843B2 (ja) 2015-11-24
IL220478A (en) 2016-09-29
US9845492B2 (en) 2017-12-19
WO2011078441A1 (en) 2011-06-30
IL220478A0 (en) 2012-08-30
KR20120107488A (ko) 2012-10-02
BR112012018394B1 (pt) 2021-02-23
EP2516679A4 (en) 2013-05-22
AU2010336137B2 (en) 2015-08-06
AU2010336137A1 (en) 2012-07-12
US20120264643A1 (en) 2012-10-18
EP2516679A1 (en) 2012-10-31
CA2784344C (en) 2018-01-02
CN102762744A (zh) 2012-10-31
JP2013514803A (ja) 2013-05-02
RU2551321C2 (ru) 2015-05-20
CA2784344A1 (en) 2011-06-30
EP2516679B1 (en) 2017-08-23
BR112012018394A2 (pt) 2017-01-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2012129362A (ru) Обнаружение мишени tsg праймером
US8329394B2 (en) Methods and substances for isolation and detection of small polynucleotides
JP2019528726A5 (ru)
RU2012109893A (ru) Зонд td и его применения
JP2009521223A5 (ru)
JP2015156872A5 (ru)
JP2013509871A5 (ru)
GB2595076A (en) Methods for targeted nucleic acid library formation
RU2012142160A (ru) Детекция нуклеиновокислотных последовательностей-мишеней в анализе с расщеплением и удлинением рто
US20110117559A1 (en) Small rna detection assays
EP1456416A4 (en) MULTIPLEX OLIGONUCLEOTIDE ADDITION AND TARGET AMPLIFICATION
WO2005089508A3 (en) Dna sequence detection by limited primer extension
RU2010116772A (ru) Полинуклеотидные праймеры
NZ594155A (en) Methods for amplifying hepatitis c virus nucleic acids
CA2532160A1 (en) Methods of genotyping using differences in melting temperature
RU2014138951A (ru) Детекция нуклеотидной вариации в нуклеиновокислотной последовательности-мишени в анализе с расщеплением и удлинением зондирующего и метящего олигонуклеотида (рто)
WO2008013462A2 (en) Isothermal detection methods and uses thereof
KR20100124705A (ko) 핵산 하이브리드화 방법
RU2016104218A (ru) Определение целевых нуклеиновокислотных последовательностей путем расщепления зондирующего олигонуклеотида и гибридизации
RU2015103777A (ru) Кооперативные праймеры, зонды и их применения
CN108368557A (zh) 包含用于核酸等温扩增的报告染料、猝灭剂的基于等温的双功能性寡聚核苷酸及利用其的核酸扩增和测定方法
RU2018113750A (ru) Улучшенное выявление коротких гомополимерных повторов
CN115948604A (zh) 一种基于DNAzyme与PER扩增的病毒检测试剂盒
KR20140123858A (ko) 폴리뉴클레오티드 및 그의 용도
JP2014003946A5 (ru)

Legal Events

Date Code Title Description
HE9A Changing address for correspondence with an applicant