RU2005123815A - Искусственный промотор для экспрессии последовательностей днк в растительных клетках - Google Patents

Искусственный промотор для экспрессии последовательностей днк в растительных клетках Download PDF

Info

Publication number
RU2005123815A
RU2005123815A RU2005123815/13A RU2005123815A RU2005123815A RU 2005123815 A RU2005123815 A RU 2005123815A RU 2005123815/13 A RU2005123815/13 A RU 2005123815/13A RU 2005123815 A RU2005123815 A RU 2005123815A RU 2005123815 A RU2005123815 A RU 2005123815A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
fragment
artificial
artificial promoter
transcription
exon
Prior art date
Application number
RU2005123815/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2326167C2 (ru
Inventor
СОСА Гильермо СЕЛЬМАН-ОУСЕЙН (CU)
СОСА Гильермо СЕЛЬМАН-ОУСЕЙН
РОДРИГЕС Альберто САЛАСАР (CU)
РОДРИГЕС Альберто САЛАСАР
РЕМЕДИОС Дайми АБРЕУ (CU)
РЕМЕДИОС Дайми АБРЕУ
ГОНСАЛЕС Османи РАМОС (CU)
ГОНСАЛЕС Османи РАМОС
Original Assignee
Сентро Де Инженьериа Генетика И Биотекнологиа (Cu)
Сентро Де Инженьериа Генетика И Биотекнологиа
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=40293792&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RU2005123815(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Сентро Де Инженьериа Генетика И Биотекнологиа (Cu), Сентро Де Инженьериа Генетика И Биотекнологиа filed Critical Сентро Де Инженьериа Генетика И Биотекнологиа (Cu)
Publication of RU2005123815A publication Critical patent/RU2005123815A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2326167C2 publication Critical patent/RU2326167C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (71)

1. Искусственный промотор, характеризующийся тем, что он является молекулярной рекомбинантной ДНК, осуществляющей промоцию экспрессии в клетках растений любой последовательности ДНК, слитой с 3'-концом, включающий в себя
а) следующий за ним регуляторный элемент 5'-транскрипции,
b) ядро искусственного промотора, содержащее ТАТА-бокс, нуклеотидную последовательность с GC-содержанием ниже, чем 64% и сайт инициации транскрипции, слитой с его 3'-концом;
с) синтетическую нуклеотидную последовательность, транскрибируемую, но транслируемую, соответствующую первому химерному экзону, искусственный интрон, способный усиливать экспрессию генов, слитых с ним в клетках растений, и второй химерный экзон со свойствами усиления трансляции любого гена, встроенного в прямом направлении.
2. Искусственный промотор по п.1, характеризующийся тем, что он представляет собой рекомбинантную молекулу ДНК, где регуляторный элемент 5'-транскрипции является искусственным.
3. Искусственный промотор по п.1, характеризующийся тем, что он представляет собой рекомбинантную молекулу ДНК, где регуляторный элемент 5'-транскрипции гомологичен последовательности ДНК, которая природно усиливает и/или регулирует экспрессию гена в клетках растения.
4. Искусственный промотор по п.3, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого происходит из гена актина-1 риса.
5. Искусственный промотор по п.4, где его регуляторный элемент 5'-транскрипции содержит область от -43 до -310 из сайта инициации транскрипции гена актина-1 риса.
6. Искусственный промотор по п.5, где нуклеотидная последовательность регуляторного элемента 5'-транскрипции соответствует SEQ ID NO: 10 или ее фрагменту.
7. Искусственный промотор по п.5, где нуклеотидная последовательность регуляторного элемента 5'-транскрипции нуклеотидной последовательности соответствует SEQ ID NO: 11 или ее фрагменту.
8. Искусственный промотор по п.3, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого происходит из гена убиквитина-1 кукурузы.
9. Искусственный промотор по п.8, где нуклеотидная последовательность содержит область от -299 до -855 из сайта инициации транскрипции гена убиквитина-1 кукурузы.
10. Искусственный промотор по п.9, где регуляторный элемент 5'-транскрипции соответствует SEQ ID NO: 19 или ее фрагменту.
11. Искусственный промотор по пп.2 и 3, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого является as-1-подобным энахансером транскрипции.
12. Искусственный промотор по п.11, где нуклеотидная последовательность as-1-подобного энхансера транскрипции по существу идентична фрагменту последовательности, соответствующей нуклеотидам 7-26 SEQ ID NO:13 или комплементарной ей последовательности.
13. Искусственный промотор по п.3, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого происходит из вирусного промотора.
14. Искусственный промотор по п.13, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого происходит из 35S-промотора CaMV.
15. Искусственный промотор по пп.2 и 3, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого контролирует органоспецифическую, тканеспецифическую или специфическую в отношении стадии развития экспрессию гена в клетках растения.
16. Искусственный промотор по п.15, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого контролирует экспрессию в семенах.
17. Искусственный промотор по п.16, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого происходит из гена B-1-глутелина риса.
18. Искусственный промотор по п.17, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого включает в себя фрагмент области от -31 до -245 из сайта инициации транскрипции гена B-1-глутелина риса.
19. Искусственный промотор по п.18, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого соответствует последовательности SEQ ID NO: 21 или ее фрагменту.
20. Искусственный промотор по п.15, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого контролирует экспрессию гена в клетках растений в условиях биотического или абиотического стресса.
21. Искусственный промотор по п.15, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого контролирует экспрессию в раненых тканях растения.
22. Искусственный промотор по п.1, регуляторный элемент 5'-транскрипции которого содержит 2 или более оперативно сшитых регуляторных элемента из другого источника, каждый из которых соответствует любой из характеристик, указанных в пп.2-21.
23. Искусственный промотор по п.1, где первый экзон из искусственной области экзон/интрон/экзон содержит С- и А-богатые последовательности.
24. Искусственный промотор по п.1, где первый экзон из искусственной области экзон/интрон/экзон содержит последовательности с часто повторяющимся мотивом СТСС и/или его гомологичными последовательностями СТС, ТСС и ТС.
25. Искусственный промотор по п.1, интрон которого искусственной области экзон/интрон/экзон содержит последовательности, в которых СТСС-мотив и/или его гомологичные последовательности СТС, ТСС и ТС часто повторяются.
26. Искусственный промотор по пп.23-25, где нуклеотидная последовательность искусственной области экзон/интрон/экзон соответствует SEQ ID NO: 6 или ее фрагменту.
27. Искусственный промотор по п.1, где второй экзон из искусственной области экзон/интрон/экзон содержит последовательность мотивов с высоким содержанием С и А.
28. Искусственный промотор по п.1, где второй экзон из искусственной области экзон/интрон/экзон содержит последовательность, гомологичную по меньшей мере на 83% мотиву HCAYYY (H=C или T или A; Y=C или T).
29. Искусственный промотор по пп.27 и 28, где нуклеотидная последовательность второго экзона из искусственной области экзон/интрон/экзон соответствует последовательности SEQ ID NO: 1.
30. Искусственный промотор по п.24, где нуклеотидная последовательность искусственной области экзон/интрон/экзон соответствует SEQ ID NO: 8 или ее фрагменту.
31. Искусственный промотор по любому из п.24, где нуклеотидная последовательность искусственной области экзон/интрон/экзон соответствует, по крайней мере частично, последовательности SEQ ID NO: 20.
32. Фрагмент ДНК из искусственного промотора по п.24, такой, что когда он слит с любым функциональным в растениях промотором, он способствует усилению экспрессии ДНК-последовательностей, находящихся под контролем указанного промотора.
33. Фрагмент искусственного промотора по п.32, способный усиливать трансляцию слитых с ним генов.
34. Фрагмент искусственного промотора по п.33, содержащий последовательность, гомологичную по меньшей мере на 83% мотиву HCAYYY (H=C или T или A; Y=C или T).
35. Фрагмент искусственного промотора по п.33, с последовательностью С- и А-богатых мотивов.
36. Фрагмент искусственного промотора по п.33, где нуклеотидная последовательность соответствует последовательности SEQ ID NO: 1.
37. Фрагмент искусственного промотора по пп.33-36, который способствует усилению трансляции мРНК, продуцируемых в растительных клетках под контролем 35S-промотора CaMV.
38. Фрагмент искусственного промотора по п.32, соответствующий области экзон/интрон/экзон.
39. Фрагмент искусственного промотора по п.38, где первый экзон содержит последовательность С- и А-богатых мотивов.
40. Фрагмент искусственного промотора по п.38, где его первый экзон содержит часто повторяющийся мотив СТСС и/или гомологичные ему последовательности СТС, ТСС и ТС.
41. Фрагмент искусственного промотора по п.38, где его интрон содержит последовательности с часто повторяющимся мотивом СТСС и/или гомологичными ему последовательностями СТС, ТСС и ТС.
42. Фрагмент искусственного промотора по п.38, где нуклеотидная последовательность соответствует последовательности SEQ ID NO: 6.
43. Фрагмент искусственного промотора по п.38, где нуклеотидная последовательность соответствует последовательности SEQ ID NO:8.
44. Фрагмент искусственного промотора по пп.38-43, который способствует усилению экспрессии любого гена под контролем 35S-промотора CaMV в растительных клетках.
45. Фрагмент искусственного промотора по п.32, соответствующий as-1-подобному энхансеру транскрипции.
46. Фрагмент искусственного промотора, нуклеотидная последовательность которого по существу идентична последовательности фрагмента, соответствующего нуклеотидам 7-26 SEQ ID NO:13, или комплементарной ей последовательности.
47. Фрагмент искусственного промотора по п.32, соответствующий регуляторному элементу 5'-транскрипции.
48. Фрагмент искусственного промотора по п.47, где регуляторный элемент 5'-транскрипции происходит из гена актина-1 риса.
49. Фрагмент искусственного промотора по п.48, где нуклеотидная последовательность содержит фрагмент от -43 до -310 из сайта инициации транскрипции гена актина-1 риса.
50. Фрагмент искусственного промотора по п.49, где нуклеотидная последовательность соответствует последовательности SEQ ID NO:10 или ее фрагменту.
51. Фрагмент искусственного промотора по п.49, где нуклеотидная последовательность соответствует последовательности SEQ ID NO:11 или ее фрагменту.
52. Фрагмент искусственного промотора по п.47, где его регуляторный элемент 5'-транскрипции происходит из гена убиквитина-1 кукурузы.
53. Фрагмент искусственного промотора по п.52, где нуклеотидная последовательность содержит область от -299 до -855 сайта инициации транскрипции гена убиквитина-1 кукурузы.
54. Фрагмент искусственного промотора по п.53, где регуляторный элемент 5'-транскрипции соответствует последовательности SEQ ID NO:19 или ее фрагменту.
55. Кассета экспрессии последовательностей ДНК в растительных клетках, содержащая искусственный промотор по любому из пп.1-31.
56. Кассета экспрессии последовательностей ДНК в растительных клетках, содержащая элемент энхансера транскрипции, функционально слитый с фрагментом ДНК по любому из пп.32-54.
57. ДНК-вектор для трансформации растительной клетки, содержащий одну из кассет экспрессии, охарактеризованную в п.55 или 56.
58. Бактериальная клетка, несущая вектор по п.57, и ее потомки.
59. Растительная клетка, трансформированная вектором по п.57, и ее потомки.
60. Растительная клетка по п.59, экспрессирующая фрагмент ДНК под контролем искусственного промотора в кассете экспрессии, введенной с помощью вектора, описанного в п.57.
61. Растительная клетка по п.59 с кассетой экспрессии, характеризующейся по п.55 или 56, стабильно интегрированной в ее геном.
62. Трансгенное растение, регенерировавшее из растительной клетки, охарактеризованной в п.61.
63. Трансгенное растение по п.62, экспрессирующее фрагмент ДНК под контролем искусственного промотора, содержащего кассету экспрессии, введенную с помощью вектора, описанного в п.57.
64. Потомки трансгенного растения, охарактеризованного в п.63.
65. Растения по п.64, являющиеся двудольными растениями.
66. Растения из семейства пасленовых.
67. Растения по п.66, принадлежащие к одному из следующих видов: табаку, томатам или картофелю.
68. Растения по п.64, являющиеся однодольными растениями.
69. Травянистые растения по п.68.
70. Растения по п.69, принадлежащие к одному из следующих видов: рису, сахарному тростнику, кукурузе, пшенице или ячменю.
71. Очистка или применение рекомбинантных белков, продуцируемых клетками или растениями по п.60 или 63 в результате экспрессии указанных фрагментов ДНК под контролем искусственного промотора, включенного кассету экспрессии, введенную с помощью вектора, описанного в пункте 57.
RU2005123815/13A 2002-12-27 2003-12-19 Искусственный промотор для экспрессии последовательностей днк в растительных клетках RU2326167C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CU20020337 2002-12-27
CU2002-0337 2002-12-27

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2005123815A true RU2005123815A (ru) 2006-01-27
RU2326167C2 RU2326167C2 (ru) 2008-06-10

Family

ID=40293792

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2005123815/13A RU2326167C2 (ru) 2002-12-27 2003-12-19 Искусственный промотор для экспрессии последовательностей днк в растительных клетках

Country Status (13)

Country Link
US (1) US20060277628A1 (ru)
EP (1) EP1577395A1 (ru)
JP (1) JP2006512067A (ru)
KR (1) KR20050090411A (ru)
CN (1) CN1738902A (ru)
AR (1) AR042552A1 (ru)
AU (1) AU2003291914A1 (ru)
BR (1) BR0317765A (ru)
CA (1) CA2518966A1 (ru)
MX (1) MXPA05006983A (ru)
RU (1) RU2326167C2 (ru)
WO (1) WO2004058979A1 (ru)
ZA (1) ZA200505067B (ru)

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2118287B1 (en) * 2007-01-05 2014-11-05 Metahelix Life Sciences Private Limited A chimeric promoter and a method thereof
JP5158639B2 (ja) 2008-04-11 2013-03-06 独立行政法人農業生物資源研究所 植物の内胚乳に特異的に発現する遺伝子および該遺伝子のプロモーター、並びにそれらの利用
JP5594683B2 (ja) * 2010-03-19 2014-09-24 国立大学法人静岡大学 プロモーター
AU2012237662B2 (en) 2011-03-25 2017-06-15 Monsanto Technology Llc Plant regulatory elements and uses thereof
KR102273360B1 (ko) 2012-12-19 2021-07-06 몬산토 테크놀로지 엘엘씨 식물 조절 요소 및 그의 용도
RU2714724C2 (ru) * 2013-03-15 2020-02-19 БАЙЕР КРОПСАЙЕНС ЭлПи Конститутивные промоторы сои
RU2699982C2 (ru) * 2014-01-10 2019-09-11 Медикаго Инк. Энхансерные элементы cpmv
JP2023015421A (ja) * 2020-01-10 2023-02-01 日本たばこ産業株式会社 エンハンサー

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ZA88319B (en) * 1987-02-06 1988-08-12 Lubrizol Enterprises, Inc. Ocs enhancer
US5641876A (en) * 1990-01-05 1997-06-24 Cornell Research Foundation, Inc. Rice actin gene and promoter
WO1991009948A1 (en) * 1990-01-05 1991-07-11 Cornell Research Foundation, Inc. Rice actin gene and promoter
DE4222407C1 (de) * 1992-07-08 1993-10-07 Max Planck Gesellschaft Modulartiges Promotor-Konstrukt
WO1997047756A1 (en) * 1996-06-11 1997-12-18 Pioneer Hi-Bred International, Inc. A synthetic plant core promoter and upstream regulatory element
US6072050A (en) * 1996-06-11 2000-06-06 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Synthetic promoters
CN1157478C (zh) * 1996-09-03 2004-07-14 拜尔生物科学股份有限公司 改进的芽孢杆菌rna酶抑制剂基因
US6437223B1 (en) * 1998-03-13 2002-08-20 Syngenta Participations Ag Inbred maize line 2070BT
US6346655B1 (en) * 1999-03-31 2002-02-12 Syngenta Participations Ag Trichothecne-Resistant transgenic plants

Also Published As

Publication number Publication date
AU2003291914A1 (en) 2004-07-22
EP1577395A1 (en) 2005-09-21
CA2518966A1 (en) 2004-07-15
AR042552A1 (es) 2005-06-22
ZA200505067B (en) 2006-05-31
RU2326167C2 (ru) 2008-06-10
KR20050090411A (ko) 2005-09-13
US20060277628A1 (en) 2006-12-07
JP2006512067A (ja) 2006-04-13
MXPA05006983A (es) 2006-02-22
WO2004058979A1 (es) 2004-07-15
CN1738902A (zh) 2006-02-22
BR0317765A (pt) 2005-11-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2224795C2 (ru) Модифицированный ген bacillus thuringiensis для борьбы с чешуекрылыми насекомыми в растениях
Heidecker et al. Structural analysis of plant genes
Ravel et al. Conserved cis-regulatory modules in promoters of genes encoding wheat high-molecular-weight glutenin subunits
RU98111460A (ru) Модифицированный ген bacillus thuringiensis для борьбы с чешуекрылыми насекомыми в растениях
Zhao et al. A positive feedback loop of BBX11–BBX21–HY5 promotes photomorphogenic development in Arabidopsis
Saisho et al. The gene for alternative oxidase-2 (AOX2) from Arabidopsis thaliana consists of five exons unlike other AOX genes and is transcribed at an early stage during germination
CN105859860A (zh) 抗病相关蛋白在调控植物抗病性中的应用
Keeler et al. Expression of de novo high-lysine α-helical coiled-coil proteins may significantly increase the accumulated levels of lysine in mature seeds of transgenic tobacco plants
EP1527091B1 (en) Corn root preferential promoters and uses thereof
RU2005123815A (ru) Искусственный промотор для экспрессии последовательностей днк в растительных клетках
CN107629121B (zh) 一个来源于玉米的转录因子ZmNLP9及其用途
US20060236424A1 (en) Methods and compositions for designing nucleic acid molecules for polypeptide expression in plants using plant virus codon-bias
CN113025616B (zh) 一种橡胶树泛素基因启动子proHbUBI2及其克隆与应用
CN107602683B (zh) 一个来源于玉米的转录因子ZmNLP4及其用途
de Almeida Barros et al. In silico characterization and expression analysis of the multigene family encoding the Bowman–Birk protease inhibitor in soybean
Dennis et al. Molecular approaches to crop improvement
Basso et al. Insights obtained using different modules of the cotton uceA1. 7 promoter
CN106047833A (zh) OsCIPK31及其编码基因在调控植物除草剂抗性中的应用
JP2000004884A (ja) 植物を矮性化させる方法
Hollung et al. Another Lea B19 gene (Group1 Lea) from barley containing a single 20 amino acid hydrophilic motif
Kim et al. A complete sequence of the pGA1611 binary vector
Duan et al. Analyzing the action of evolutionarily conserved modules on HMW-GS 1Ax1 promoter activity
Fang et al. Cloning, characterization and genetic engineering of FLC homolog in Thellungiella halophila
KR101112703B1 (ko) 식물의 뿌리털 발달 조절 유전자 ｒｈｓ1 및 이를 이용한 식물의 뿌리털 발달 조절 방법
JP2000050873A (ja) ペチュニアの転写因子ＰｅｔＳＰＬ２の遺伝子の導入によって花序の節間を短縮させる方法