RU2002119394A - Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторов - Google Patents

Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторов

Info

Publication number
RU2002119394A
RU2002119394A RU2002119394/13A RU2002119394A RU2002119394A RU 2002119394 A RU2002119394 A RU 2002119394A RU 2002119394/13 A RU2002119394/13 A RU 2002119394/13A RU 2002119394 A RU2002119394 A RU 2002119394A RU 2002119394 A RU2002119394 A RU 2002119394A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
probe
target
intercalating agent
nucleic acid
intensity
Prior art date
Application number
RU2002119394/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2273668C2 (ru
Inventor
Джэсмин Дж. ДЭКСИС (CA)
Джэсмин Дж. ДЭКСИС
Пьер ПИКАР (CA)
Пьер ПИКАР
Глен Х. ЭРИКСОН (GB)
Глен Х. ЭРИКСОН
Original Assignee
Инджиниес Корпорейшн (Bb)
Инджиниес Корпорейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Инджиниес Корпорейшн (Bb), Инджиниес Корпорейшн filed Critical Инджиниес Корпорейшн (Bb)
Publication of RU2002119394A publication Critical patent/RU2002119394A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2273668C2 publication Critical patent/RU2273668C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6839—Triple helix formation or other higher order conformations in hybridisation assays

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Claims (32)

1. Способ анализа связывания, включающий обеспечение мишени, включающей, по меньшей мере, одну последовательность нуклеиновой кислоты; обеспечение зонда, включающего последовательность нуклеиновой кислоты или аналога нуклеиновой кислоты, не полностью комплементарную, по меньшей мере, части мишени; обеспечение интеркалирующего агента, причем любой из указанных зонда или интеркалирующего агента включает флуорофор, добавление зонда, мишени и интеркалирующего агента к гибридизационной среде для получения испытуемого образца, облучение испытуемого образца возбуждающим излучением, чтобы заставить флуорофор испускать флуоресцентное излучение, определение интенсивности флуоресцентного излучения, причем эта интенсивность является прямым показателем аффинности связывания между зондом и мишенью, и определение на основании указанной интенсивности степени ошибочного спаривания между зондом и мишенью.
2. Способ по п.1, в котором определение осуществляют путем калибровки указанной интенсивности по сравнению с интенсивностью, демонстрируемой другими зондами в сочетании с указанными мишенью и интеркалирующим агентом, при этом каждый из этих других зондов отличается, по меньшей мере, одним основанием.
3. Способ по п.2, в котором каждый из указанного зонда и других зондов представляет собой отличный от мишени элемент, выбранный из группы, состоящей из правильного спаривания, ошибочного спаривания одной пары оснований, ошибочного спаривания двух пар оснований, ошибочного спаривания трех пар оснований, делеции одной пары оснований, делеции двух пар оснований и делеции трех пар оснований, при условии, что указанный зонд не может обеспечивать правильное спаривание.
4. Способ по п.1, включающий также количественное определение аффинности связывания.
5. Способ по п.1, представляющий собой гомогенный анализ, осуществляемый без использования сигнального гасящего агента на мишени и зонде.
6. Способ по п.1, представляющий собой гомогенный анализ, осуществляемый без предварительной денатурации мишени.
7. Способ по п.1, представляющий собой гомогенный анализ, осуществляемый без амплификации мишени методом ПЦР.
8. Способ по п.1, в котором мишень представляет собой dsDNA, а зонд гибридизируется конкретно с данной мишенью, образуя триплекс.
9. Способ по п.8, в котором зонд представляет собой ssDNA или РНК.
10. Способ по п.1, в котором зонд имеет частично заряженный остов.
11. Способ по п.11, в котором зонд имеет незаряженный остов.
12. Способ по п.1, в котором зонд включает последовательность PNA.
13. Способ по п.1, в котором зонд представляет собой ssPNA, полученную с помощью параллельного синтеза.
14. Способ по п.13, в котором зонд и мишень имеют одинаковую длину.
15. Способ по п.1, в котором зонд имеет длину от 6 до 30 нуклеотидов.
16. Способ по п.1, в котором зонд имеет длину в 15 нуклеотидов.
17. Способ по п.1, в котором интеркалирующий агент ковалентно связан с зондам.
18. Способ по п.1, в котором интеркалирующий агент добавляют к гибридизационной среде в форме, свободной от зонда и мишени.
19. Способ по п.1, в котором интеркалирующий агент выбирают из группы, состоящей из YOYO-1, TOTO-1, этидийбромида, гомодимера-1 этидия, гомодимера-2 этидия и акридина.
20. Способ по п.1, в котором зонд состоит по существу из последовательности нуклеиновой кислоты или последовательности аналога нуклеиновой кислоты.
21. Способ по п.1, в котором возбуждающее излучение испускается из аргонового ионного лазера с длиной волны от около 200 до около 1000 нм.
22. Способ по п.1, осуществляемый в диапазоне температур от 5 до 85°С.
23. Способ по п.1, осуществляемый при температурах ниже 25°С.
24. Способ по п.1, в котором надежность способа не зависит от последовательности оснований зонда и мишени и не зависит от содержания гуанина и цитозина в зонде или мишени.
25. Способ по п.1, в котором испытуемый образец имеет объем около 20 микролитров и содержит около 10 фемтомоль мишени и около 10 фемтомоль зонда.
26. Способ по п.1, в котором концентрация мишени и испытуемого образца составляет не более чем 5 × 10-10 М.
27. Способ по п.23, в котором концентрация зонда и испытуемого образца составляет не более чем 5 × 10-10 М.
28. Способ анализа связывания, включающий обеспечение мишени, включающей, по меньшей мере, одну последовательность нуклеиновой кислоты, обеспечение зонда, включающего первый флуорофор и последовательность нуклеиновой кислоты или аналога нуклеиновой кислоты, не полностью комплементарную, по меньшей мере, части мишени, обеспечение интеркалирующего агента, включающего второй флуорофор, причем первый флуорофор и второй флуорофор флуоресцируют при разных длинах волн, добавление зонда, мишени и интеркалирующего агента к гибридизационной среде для получения испытуемого образца, облучение испытуемого образца возбуждающим излучением, чтобы заставить, по меньшей мере, один из указанных первого и второго флуорофоров испускать флуоресцентное излучение, определение интенсивности флуоресцентного излучения, причем эта интенсивность является прямым показателем аффинности связывания между зондом и мишенью, и определение на основании указанной интенсивности степени ошибочного спаривания между зондом и мишенью.
29. Способ по п.1, в котором длина волны, при которой флуоресцирует интеркалирующий агент, меняется на вторую длину волны после встраивания, и разница между длиной волны и второй длиной волны указывает на то, является ли комплекс, образованный между данными зондом и мишенью, дуплексом или триплексом, а также на то, представляет ли собой мишень ДНК или РНК.
30. Способ по п.1, осуществляемый в лунке или на непроницаемой поверхности.
31. Способ по п.1, осуществляемый на биочипе.
32. Способ анализа связывания, включающий обеспечение мишени, включающей, по меньшей мере, одну последовательность нуклеиновой кислоты; обеспечение зонда, включающего последовательность нуклеиновой кислоты или аналога нуклеиновой кислоты, обеспечение интеркалирующего агента, причем любой из указанных зонда или интеркалирующего агента включает флуорофор, добавление зонда, мишени и интеркалирующего агента к гибридизационной среде для получения испытуемого образца, облучение испытуемого образца возбуждающим излучением, чтобы заставить флуорофор испускать флуоресцентное излучение, определение интенсивности флуоресцентного излучения, причем эта интенсивность является прямым показателем аффинности связывания между зондом и мишенью, калибровку указанной интенсивности по сравнению со значениями интенсивности, демонстрируемыми другими зондами в сочетании с указанными зондом и интеркалирующим агентом, причем каждый из указанного зонда и других зондов представляют собой отличный от мишени элемент, выбранный из группы, состоящей из правильного спаривания, ошибочного спаривания одной пары оснований, ошибочного спаривания двух пар оснований, ошибочного спаривания трех пар оснований, делеции одной пары оснований, делеции двух пар оснований и делеции трех пар оснований; и определение на основании калибровки степени ошибочного спаривания между зондом и мишенью.
RU2002119394/13A 1999-12-21 2000-12-21 Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторов RU2273668C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US09/468,679 US6403313B1 (en) 1999-12-21 1999-12-21 Fluorescent intensity assay for duplex and triplex nucleic acid hybridization solution utilizing fluorescent intercalators
US09/468,679 1999-12-21

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2002119394A true RU2002119394A (ru) 2004-01-27
RU2273668C2 RU2273668C2 (ru) 2006-04-10

Family

ID=23860789

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2002119394/13A RU2273668C2 (ru) 1999-12-21 2000-12-21 Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторов

Country Status (17)

Country Link
US (1) US6403313B1 (ru)
EP (1) EP1242620B1 (ru)
JP (1) JP4041867B2 (ru)
KR (1) KR100537979B1 (ru)
CN (1) CN1413264A (ru)
AT (1) ATE372390T1 (ru)
AU (1) AU778892B2 (ru)
BR (1) BR0016614A8 (ru)
CA (1) CA2394752C (ru)
DE (1) DE60036307T2 (ru)
ES (1) ES2296661T3 (ru)
HK (1) HK1047454B (ru)
IL (2) IL150284A0 (ru)
MX (1) MXPA02006262A (ru)
PT (1) PT1242620E (ru)
RU (1) RU2273668C2 (ru)
WO (1) WO2001046467A2 (ru)

Families Citing this family (40)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6656692B2 (en) * 1999-12-21 2003-12-02 Ingeneus Corporation Parallel or antiparallel, homologous or complementary binding of nucleic acids or analogues thereof to form duplex, triplex or quadruplex complexes
US6858390B2 (en) * 1998-12-31 2005-02-22 Ingeneus Corporation Aptamers containing sequences of nucleic acid or nucleic acid analogues bound homologously, or in novel complexes
US7309569B2 (en) 1999-12-21 2007-12-18 Ingeneus, Inc. Parallel or antiparallel, homologous or complementary binding of nucleic acids or analogues thereof to form duplex, triplex or quadruplex complexes
US7052844B2 (en) * 1999-12-21 2006-05-30 Ingeneus, Inc. Purification of DS-DNA using heteropolymeric capture probes and a triplex, quadruplex or homologous duplex binding mechanism
US20030181412A1 (en) * 1999-12-21 2003-09-25 Ingeneus Corporation Method for modifying transcription and/or translation in an organism for therapeutic, prophylactic and/or analytic uses
US20030170659A1 (en) * 2000-01-24 2003-09-11 Ingeneus Corporation Electrical treatment of binding media to encourage, discourage and/or study biopolymer binding
US7220541B2 (en) 2000-01-24 2007-05-22 Ingeneus, Inc. Homogeneous assay of biopolymer binding by means of multiple measurements under varied conditions
KR100386606B1 (ko) * 2001-02-03 2003-06-02 엘지전자 주식회사 Ｄｎａ 검출 방법 및 그 장치
KR100434067B1 (ko) * 2002-03-14 2004-06-04 엘지전자 주식회사 핵산 혼성화 검출을 위한 핵산검출장치 및 핵산 혼성화검출방법
JP2005289810A (ja) * 2002-03-18 2005-10-20 Sangaku Renkei Kiko Kyushu:Kk 蛍光色素基およびインターカレート基を含有する二本鎖核酸を選択的に検出するための蛍光試薬
US20040019791A1 (en) * 2002-07-24 2004-01-29 Congruence, Llc Code for object identification
US7268878B2 (en) * 2002-08-01 2007-09-11 Sensor Technologies Llc Fluorescence correlation spectroscopy instrument and method of using the same
US20040142329A1 (en) * 2003-01-17 2004-07-22 Ingeneus Corporation Probe conjugation to increase multiplex binding motif preference
US20040180345A1 (en) * 2003-03-14 2004-09-16 Ingeneus Corporation Pre-incubation method to improve signal/noise ratio of nucleic acid assays
GB0310270D0 (en) * 2003-05-03 2003-06-11 Univ Edinburgh Biomolecular devices
US8911942B2 (en) 2004-05-20 2014-12-16 Quest Diagnostics Investments Incorporated Single label comparative hybridization
AU2005286084C1 (en) * 2004-09-24 2011-11-24 Ingeneus Inc. Genomic assay
EP1846760B1 (en) 2005-01-27 2010-12-15 Quest Diagnostics Investments Incorporated Rapid comparative genome hybridization
US8076074B2 (en) 2005-11-29 2011-12-13 Quest Diagnostics Investments Incorporated Balanced translocation in comparative hybridization
RU2394915C2 (ru) * 2006-03-24 2010-07-20 Александр Борисович Четверин Бесконтактные способы обнаружения молекулярных колоний, наборы реагентов и устройство для их осуществления
US7807359B2 (en) 2006-12-01 2010-10-05 Quest Diagnostics Investments Incorporated Methods of detecting TPMT mutations
US7507539B2 (en) 2007-07-30 2009-03-24 Quest Diagnostics Investments Incorporated Substractive single label comparative hybridization
EP2201136B1 (en) * 2007-10-01 2017-12-06 Nabsys 2.0 LLC Nanopore sequencing by hybridization of probes to form ternary complexes and variable range alignment
US8093063B2 (en) 2007-11-29 2012-01-10 Quest Diagnostics Investments Incorporated Assay for detecting genetic abnormalities in genomic nucleic acids
US8262879B2 (en) 2008-09-03 2012-09-11 Nabsys, Inc. Devices and methods for determining the length of biopolymers and distances between probes bound thereto
US9650668B2 (en) 2008-09-03 2017-05-16 Nabsys 2.0 Llc Use of longitudinally displaced nanoscale electrodes for voltage sensing of biomolecules and other analytes in fluidic channels
JP5717634B2 (ja) 2008-09-03 2015-05-13 ナブシス， インコーポレイテッド 流体チャネル内の生体分子および他の分析物の電圧感知のための、長手方向に変位されるナノスケールの電極の使用
DK2337860T3 (en) * 2008-10-15 2016-08-29 Axolabs Gmbh A method for the detection of oligonucleotides
US8039794B2 (en) 2008-12-16 2011-10-18 Quest Diagnostics Investments Incorporated Mass spectrometry assay for thiopurine-S-methyl transferase activity and products generated thereby
US20110086772A1 (en) 2009-09-25 2011-04-14 Signature Genomics Laboratories Llc Multiplex (+/-) stranded arrays and assays for detecting chromosomal abnormalities associated with cancer and other diseases
US8715933B2 (en) 2010-09-27 2014-05-06 Nabsys, Inc. Assay methods using nicking endonucleases
US8859201B2 (en) 2010-11-16 2014-10-14 Nabsys, Inc. Methods for sequencing a biomolecule by detecting relative positions of hybridized probes
WO2012109574A2 (en) 2011-02-11 2012-08-16 Nabsys, Inc. Assay methods using dna binding proteins
KR102012690B1 (ko) * 2011-07-12 2019-08-21 주식회사 파나진 평행 결합 구조의 이중 혼성화 ｐｎａ 프로브 시스템
EP2802411B1 (en) * 2012-01-13 2017-04-05 Koninklijke Philips N.V. Dna sequencing with reagent recycling on wiregrid
US8956815B2 (en) 2012-04-18 2015-02-17 Toxic Report Llc Intercalation methods and devices
US9914966B1 (en) 2012-12-20 2018-03-13 Nabsys 2.0 Llc Apparatus and methods for analysis of biomolecules using high frequency alternating current excitation
US10294516B2 (en) 2013-01-18 2019-05-21 Nabsys 2.0 Llc Enhanced probe binding
RU2675502C1 (ru) * 2013-11-29 2018-12-19 Конинклейке Филипс Н.В. Оптический контроль химической реакции
CN113720837B (zh) * 2021-09-23 2024-01-19 西北大学 一种快速检测水体中汞离子的比色传感器

Family Cites Families (43)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4220450A (en) 1978-04-05 1980-09-02 Syva Company Chemically induced fluorescence immunoassay
FR2558172B1 (fr) 1984-01-16 1986-06-13 Inst Nat Sante Rech Med Sonde contenant un acide nucleique modifie et reconnaissance par des anticorps specifiques et utilisation de cette sonde et de ces anticorps specifiques pour detecter et caracteriser une sequence d'adn homologue
US4876187A (en) 1985-12-05 1989-10-24 Meiogenics, Inc. Nucleic acid compositions with scissile linkage useful for detecting nucleic acid sequences
US5011769A (en) 1985-12-05 1991-04-30 Meiogenics U.S. Limited Partnership Methods for detecting nucleic acid sequences
US5874555A (en) 1987-10-30 1999-02-23 California Institute Of Technology Triple helices and processes for making same
US5403711A (en) 1987-11-30 1995-04-04 University Of Iowa Research Foundation Nucleic acid hybridization and amplification method for detection of specific sequences in which a complementary labeled nucleic acid probe is cleaved
WO1990002204A1 (en) 1988-08-31 1990-03-08 Research Development Foundation Manual in situ hybridization assay
US5800992A (en) * 1989-06-07 1998-09-01 Fodor; Stephen P.A. Method of detecting nucleic acids
US5824477A (en) 1990-09-12 1998-10-20 Scientific Generics Limited Electrochemical denaturation of double-stranded nucleic acid
DE69128520T2 (de) 1990-10-31 1998-07-09 Tosoh Corp Verfahren zum Nachweis oder Quantifizierung von Zielnukleinsäuren
WO1992011390A1 (en) * 1990-12-17 1992-07-09 Idexx Laboratories, Inc. Nucleic acid sequence detection by triple helix formation
US5539082A (en) 1993-04-26 1996-07-23 Nielsen; Peter E. Peptide nucleic acids
US5641625A (en) * 1992-05-22 1997-06-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Cleaving double-stranded DNA with peptide nucleic acids
US6048690A (en) 1991-11-07 2000-04-11 Nanogen, Inc. Methods for electronic fluorescent perturbation for analysis and electronic perturbation catalysis for synthesis
US5558998A (en) * 1992-02-25 1996-09-24 The Regents Of The Univ. Of California DNA fragment sizing and sorting by laser-induced fluorescence
US5332659A (en) 1992-04-09 1994-07-26 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Light emission-or absorbance-based binding assays for polynucleic acids
JPH06153997A (ja) * 1992-11-27 1994-06-03 Canon Inc 検出信号増幅による標的核酸の検出方法
US6027880A (en) 1995-08-02 2000-02-22 Affymetrix, Inc. Arrays of nucleic acid probes and methods of using the same for detecting cystic fibrosis
US5861124A (en) 1993-07-15 1999-01-19 Hamamatsu Photonics Kk Method and apparatus for detecting denaturation of nucleic acid
EP0716713A1 (en) 1993-08-18 1996-06-19 Id Biomedical Corporation Compositions and methods for detecting target nucleic acid sequences utilizing adjacent sequence-enzyme molecules
ATE227342T1 (de) 1993-09-02 2002-11-15 Ribozyme Pharm Inc Enzymatische nukleiksaüre die nicht-nukleotide enthaltet
US5538848A (en) 1994-11-16 1996-07-23 Applied Biosystems Division, Perkin-Elmer Corp. Method for detecting nucleic acid amplification using self-quenching fluorescence probe
AU8102694A (en) 1993-11-17 1995-06-06 Id Biomedical Corporation Cycling probe cleavage detection of nucleic acid sequences
US5998193A (en) 1994-06-24 1999-12-07 Gene Shears Pty., Ltd. Ribozymes with optimized hybridizing arms, stems, and loops, tRNA embedded ribozymes and compositions thereof
JP3189000B2 (ja) * 1994-12-01 2001-07-16 東ソー株式会社 特定核酸配列の検出方法
US5814516A (en) 1995-10-13 1998-09-29 Lockheed Martin Energy Systems, Inc. Surface enhanced Raman gene probe and methods thereof
US5824557A (en) 1996-04-02 1998-10-20 Panvera Corporation Method for detecting and quantitating nucleic acid impurities in biochemical preparations
SE506700C2 (sv) * 1996-05-31 1998-02-02 Mikael Kubista Sond och förfaranden för analys av nukleinsyra
US5948897A (en) 1996-06-14 1999-09-07 Simon Fraser University Method of binding two or more DNA double helices and products formed
US5912332A (en) 1996-07-26 1999-06-15 Hybridon, Inc. Affinity-based purification of oligonucleotides using soluble multimeric oligonucleotides
US5691145A (en) 1996-08-27 1997-11-25 Becton, Dickinson And Company Detection of nucleic acids using G-quartets
US6251591B1 (en) 1997-02-27 2001-06-26 Lorne Park Research, Inc. Quantitative method for detecting nucleotide concentration
US5846729A (en) * 1997-02-27 1998-12-08 Lorne Park Research, Inc. Assaying nucleotides in solution using a fluorescent intensity quenching effect
US6060242A (en) 1997-02-27 2000-05-09 Lorne Park Research, Inc. PNA diagnostic methods
US6046004A (en) * 1997-02-27 2000-04-04 Lorne Park Research, Inc. Solution hybridization of nucleic acids with antisense probes having modified backbones
US6312925B1 (en) * 1997-05-08 2001-11-06 Epoch Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions to facilitate D-loop formation by oligonucleotides
US6013442A (en) * 1997-08-05 2000-01-11 Wisconsin Alumni Res Found Direct quantitation of low copy number RNA
GB9725197D0 (en) * 1997-11-29 1998-01-28 Secr Defence Detection system
US6017709A (en) 1998-04-29 2000-01-25 University Of Houston DNA replication templates stabilized by guanine quartets
US6255050B1 (en) 1998-05-22 2001-07-03 Lorne Park Research, Inc. Dynamic hybridization system
GB9812768D0 (en) * 1998-06-13 1998-08-12 Zeneca Ltd Methods
GB9821989D0 (en) * 1998-10-08 1998-12-02 Hybaid Ltd Detection of nucleic acid polymorphism
US6265170B1 (en) 2000-01-24 2001-07-24 Ingeneus Corporation Homogenous assay of duplex of triplex hybridization by means of multiple measurements under varied conditions

Also Published As

Publication number Publication date
CA2394752C (en) 2012-09-25
AU778892B2 (en) 2004-12-23
CN1413264A (zh) 2003-04-23
JP4041867B2 (ja) 2008-02-06
DE60036307T2 (de) 2008-05-29
ES2296661T3 (es) 2008-05-01
IL150284A0 (en) 2002-12-01
IL150284A (en) 2008-03-20
CA2394752A1 (en) 2001-06-28
AU1726301A (en) 2001-07-03
RU2273668C2 (ru) 2006-04-10
PT1242620E (pt) 2007-12-13
WO2001046467A3 (en) 2002-05-30
HK1047454A1 (en) 2003-02-21
EP1242620A2 (en) 2002-09-25
WO2001046467A2 (en) 2001-06-28
ATE372390T1 (de) 2007-09-15
KR20020079757A (ko) 2002-10-19
BR0016614A (pt) 2003-01-07
DE60036307D1 (de) 2007-10-18
EP1242620B1 (en) 2007-09-05
BR0016614A8 (pt) 2019-01-22
MXPA02006262A (es) 2004-09-06
US6403313B1 (en) 2002-06-11
JP2003517841A (ja) 2003-06-03
KR100537979B1 (en) 2005-12-21
HK1047454B (zh) 2008-07-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2002119394A (ru) Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторов
US20050196790A1 (en) Methods for detection and quantitation of minimum length polymers
JP2005537030A5 (ru)
US20060008823A1 (en) DNA profiling and SNP detection utilizing microarrays
CN108431235A (zh) 靶核酸的等温环介导扩增(lamp)的荧光检测的方法，寡核苷酸及其试剂盒
RU2002122770A (ru) Гомогенный анализ дуплексной или триплексной гибридизации с использованием множественных измерений при варьируемых условиях
JP2002516667A (ja) 修飾バックボーンを有するアンチセンスプローブと核酸の液中ハイブリッド形成
JP2004000185A (ja) Ｐｃｒ増幅とハイブリダイゼーションプロービングアッセイを組み合わせた方法およびそのための試薬
JP2008535478A (ja) シグナル増幅による核酸の検出および分析のための方法および組成物
RU2273643C2 (ru) Способ анализа опосредованной катионами гибридизации тройных комплексов
RU2003103772A (ru) Способ анализа опосредованной катионами гибридизации тройных комплексов
PT1171633E (pt) Métodos para marcar materiais
JPWO2012077819A1 (ja) 標的核酸の検出方法及びキット
CA2549849A1 (en) Improved selective ligation and amplification assay
JP3855492B2 (ja) 混合核酸断片分析法
EP2798086B1 (en) Reagents and methods for autoligation chain reaction
CN110546273A (zh) 通过衔接子序列定量ngs dna
JP2022516250A (ja) 固相モログラフィーによる標的核酸の検出
US6861515B2 (en) Analysis of biological targets using a biochip comprising a fluorescent marker
McCarthy et al. Detection and identification of IHN and ISA viruses by isothermal DNA amplification in microcapillary tubes
EP1606389B1 (en) Methods for polynucleotide sequence detection
US6911536B1 (en) Triplex and quadruplex catalytic hybridization
WO2021215989A1 (en) Rapid detection of specific genetic sequences using a multi-labelled dna hybrid comprising a reporter strand and an anchor strand
JP2020150862A (ja) Ｉｄｈ−１遺伝子多型の検出方法

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20161222