PT1404873E - Compostos de imunomodulação quiméricos e métodos de utilização dos mesmos - Google Patents

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Description

ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
DESCRIÇÃO "Compostos de imunomodulação quiméricos e métodos de utilização dos mesmos"
CAMPO TÉCNICO 0 presente invento refere-se a compostos de imunomodulação quiméricos ("CIC") contendo ácido nucleico e partes que não são de ácido nucleico e à utilização de tais compostos para modular uma resposta imunitária. O invento é útil nos campos de biomedicina e imunologia.
ANTECEDENTES A referência a uma publicação nesta secção não deve ser interpretada como indicação de tal publicação ser especialidade anterior ao presente invento. 0 tipo de resposta imunitária gerada por infecção ou por outra provocação antigénica pode ser geralmente distinguida pelo subconjunto de células T auxiliadoras (Th) envolvidas na resposta. O subconjunto Thl é responsável por funções clássicas mediadas por células, tais como hipersensibilidade do tipo retardada e activação de linfócitos T citotóxicos (CTL), enquanto o conjunto Th2 funciona mais eficazmente como um auxilio para a activação de células B. 0 tipo de resposta imunitária a um antigénio é geralmente influenciada pelas citocinas, produzidas pelas células sensiveis ao antigénio. Pensa-se que as diferenças nas citocinas excretadas por células Thl e Th2 reflectem diferentes funções biológicas destes dois subconjuntos. Consultar, por exemplo, Romagnani (2000) Ann. Allergy Asthma Immunol. 85:9-18. O subconjunto Thl pode ser particularmente adequado para responder a infecções viricas, patogéneos intracelulares e células de tumor, dado que excreta IL-2 e IFN-γ, que activam CTL. O subconjunto Th2 pode ser mais adequado para responder a bactérias vivas livres e parasitas helminticos e pode mediar reacções alérgicas, dado que se sabe que IL-4 e IL-5 induzem produção de IgE e activação de eosinófilos, respectivamente. Em geral, as células Thl e Th2 excretam 2 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ padrões de citocinas distintos e portanto um tipo de resposta pode moderar a actividade de outro tipo de resposta. Um desvio do equilíbrio Thl/Th2 pode resultar numa resposta alérgica ou, alternativamente, numa resposta CTL aumentada. É reconhecido desde há algum tempo que se pode induzir uma resposta imunitária do tipo Thl em mamíferos por administração de determinados polinucleótidos de imunomodulação. Os polinucleótidos de imunomodulação incluem sequências denominadas sequências de imuno-estimulação ("ISS"), frequentemente incluindo um dinucleótido CG. Consultar, e.g., publicações PCT WO 98/55495, WO 97/28259, patentes U.S. N° 6 194 388 e 6 207 646; e Krieg et al. (1995) Nature 374:546-49 e Krieg, Antisense Oligonucleotide Technology, 1998, 431-448. Para muitas doenças infecciosas, tais como tuberculose e malária, as respostas do tipo Th2 têm pouco valor de protecção contra a infecção. As vacinas baseadas em proteínas induzem tipicamente respostas imunitárias do tipo Th2, caracterizadas por títulos elevados de anticorpos neutralizantes mas sem imunidade mediada por células significativa. Além disso, alguns tipos de respostas a anticorpo são desadequados em determinadas indicações, mais notoriamente em alergia, em que a resposta a anticorpo IgE pode resultar num choque anafiláctico. WO 01/83503, WO 02/26757 e WO 01/12804 descrevem métodos para aumentar o efeito de imuno-estimulação de oligonucleótidos contendo CpG por introdução de açúcares ou bases modificadas em 2' ou 3', por introdução de ligações internucleótido modificadas, por introdução de análogos de dinucleótido ou por introdução de um nucleósido substituído em 2' .
Dada a necessidade de métodos melhorados de imunoterapia, existe uma necessidade para identificar compostos úteis para modulação de uma resposta imunitária.
DESCRIÇÃO DO INVENTO
Num aspecto, o invento refere-se a um composto quimérico com actividade de imunomodulação. O composto de imunomodulação quimérico ("CIC") compreende em geral duas ou 3 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ mais partes de ácido nucleico e uma ou mais partes que não são de ácido nucleico. As partes de ácido nucleico num CIC podem ser iguais ou diferentes. As partes que não são de ácido nucleico num CIC com mais do que uma parte que não é de ácido nucleico podem ser iguais ou diferentes. Assim, numa concretização, o CIC compreende duas ou mais partes de ácido nucleico e uma ou mais partes espaçadoras que não são de ácido nucleico, em que pelo menos uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico está ligada covalentemente a duas partes de ácido nucleico. Pelo menos uma parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-TCG-3'.
Assim, o presente invento proporciona um composto de imunomodulação quimérico (CIC) compreendendo duas ou mais partes de ácido nucleico e uma ou mais partes espaçadoras que não são de ácido nucleico, em que pelo menos uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico está ligada covalentemente a duas partes de ácido nucleico, em que o referido espaçador não é um polipéptido, em que pelo menos uma parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-TCG-3', na posição 5 linha, em que todas as partes de ácido nucleico que compreendem a sequência 5'-CG-3' têm menos de 8 nucleótidos de comprimento, em que o referido CIC tem actividade de imunomodulação.
Num aspecto, o invento proporciona um composto de imunomodulação quimérico que tem uma estrutura nuclear com a fórmula "Ni-Si-N2", em que N2 e N2 são partes de ácido nucleico e Si é uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico e em que o CIC apresenta actividade de imunomodulação. Numa concretização, a estrutura nuclear é "N1-S1-N2-S2_N3", em que N3 é uma parte de ácido nucleico e S2 é uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico. Numa concretização, o CIC tem a estrutura nuclear "Ni-Si-N2-S2-[Nv-Sv] A", em que A é um número inteiro entre 1 e 100 e [NV-SV]A indica A iterações adicionais de partes de ácido nucleico 4 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ conjugadas a partes espaçadoras que não são de ácido nucleico, em que S e N são seleccionados independentemente em cada iteração de "[Nv-Sv]". Numa concretização, A é pelo menos 2 e pelo menos 4 partes de ácido nucleico no CIC têm sequências diferentes.
Num aspecto, o CIC compreende uma estrutura nuclear com a fórmula Ni-Si-N2 ou Ni-Si-N2-S2-N3 (em que Nif N2 e N3 são partes de ácido nucleico, S3 e S2 são partes espaçadoras que não são de ácido nucleico e S2 e S2 estão ligadas covalentemente a exactamente duas partes de ácido nucleico). Os exemplos de tais CIC são CIC com estruturas nucleares da fórmula (5' -1^-3' ) -Si-N2 . Numa concretização, N2 tem a sequência 5'-TCGAX-3', em que X é 0 a 20 bases de nucleótidos (SEQ ID NO: 1) . Numa concretização, X é 0 a 3 bases de nucleótidos. Numa concretização, X é CGT. Noutra concretização N2 tem a sequência 5' -TCGTCGA-3' . Numa concretização, o CIC tem a estrutura Ni-Si-N2-S2- [Nv-Sv] A (em que A é um número inteiro entre 1 e 100 e [NV-SV]A indica "A" iterações adicionais de partes de ácido nucleico conjugadas a partes espaçadoras que não são nucleótidos, em que S e N são seleccionados independentemente em cada iteração de [Nv-Sv] ) · Numa concretização A é 1 a 3.
Noutro aspecto, o invento proporciona um CIC que tem uma estrutura nuclear com a fórmula [NV]A---Sp, em que Sp é um espaçador multivalente ligado covalentemente à quantidade "A" de partes de ácido nucleico seleccionadas independentemente, Nv, em que A é pelo menos 3 e em que o CIC apresenta actividade de imunomodulação. Numa concretização, o CIC tem a sequência nuclear [SV-NV]A---Sp em que Sp é um espaçador multivalente ligado covalentemente à quantidade "A" de elementos [Sv-Nv] seleccionados independentemente e o elemento [Sv-Nv] seleccionado independentemente inclui uma parte espaçadora ligada covalentemente a uma parte de ácido nucleico e em que A é pelo menos 3. Numa concretização, A é de 3 a 50. Numa concretização diferente, A é superior a 50. Numa concretização, pelo menos 2, pelo menos 3 ou pelo menos 4 partes de ácido nucleico no CIC têm sequências diferentes.
Num aspecto, o CIC compreende uma estrutura nuclear com a fórmula [NV]A-SP ou [Sv-Nv]A-Sp (em que Sp é um espaçador 5 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ multivalente ligado covalentemente à quantidade "A" partes de ácido nucleico seleccionadas independentemente, Nv, ou elementos seleccionados independentemente [Sv-Nv], em que cada elemento seleccionado independentemente [Sv-Nv] compreendendo uma parte espaçadora ligada covalentemente a uma parte de ácido nucleico, em que A é pelo menos 3. Em concretizações, A é de 3 a cerca de 50 ou de cerca de 50 a cerca de 500. Numa concretização, Sp compreende um dendrimero. Numa concretização, uma parte de ácido nucleico do CIC tem uma sequência seleccionada de TCGXXXX, TCGAXXX, XTCGXXX, XTCGAXX, TCGTCGA, TCGACGT, TCGAACG, TCGAGAT, TCGACTC, TCGAGCG, TCGATTT, TCGCTTT, TCGGTTT, TCGTTTT, TCGTCGT, ATCGATT, TTCGTTT, TTCGATT, ACGTTCG, AACGTTC, TGACGTT, TGTCGTT, TCGXXX, TCGAXX, TCGTCG, AACGTT, ATCGAT, GTCGTT, GACGTT, TCGXX, TCGAX, TCGAT, TCGTT, TCGTC, TCGA, TCGT, TCGX ou TCG (em que "X" é qualquer nucleótido).
Noutro aspecto, o invento proporciona um CIC que tem uma estrutura nuclear com a fórmula "Ni-Si", em que Ni é uma parte de ácido nucleico e Si é uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico e o CIC apresenta actividade de imunomodulação. O CIC pode compreender partes de espaçador que não são nucleótido compreendendo, por exemplo, trietilenoglicol, hexa-etilenoglicol, um polímero compreendendo partes de oligoetilenoglicol ligadas por fosfodiéster e/ou fosforotiolato, alquilo C2-C10 (e.g., propilo, butilo, hexilo), glicerol ou um glicerol modificado (e.g., glicerol derivatizado na posição 1, 2 ou 3 hidroxilo; e.g., 3-levulinil-glicerol), penta-eritritol ou penta-eritritol modificado (penta-eritritol modificado em qualquer (is) posição (ões) hidroxilo, e.g., "triplo"), 2-(hidroximetil)etilo, 1,3-diamino-2-propanol, um nucleótido abásico, um polissacárido (e.g., um polissacárido reticulado), um dendrimero e/ou outros componentes de partes espaçadoras aqui divulgadas, em várias combinações.
Em várias concretizações, um CIC descrito anteriormente tem uma ou mais das seguintes características: (i) o CIC inclui pelo menos uma parte de ácido nucleico inferior a 8 nucleótidos (ou pares de bases) de comprimento ou, 6 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ alternativamente, inferior a 7 nucleótidos de comprimento (ii) todas as partes de ácido nucleico do CIC têm menos de 8 nucleótidos de comprimento ou, alternativamente, menos de 7 nucleótidos de comprimento, (iii) o CIC inclui pelo menos uma parte de ácido nucleico que inclui a sequência 5'-CG-3' (e.g., 5'-TCG-3'), (iv) o CIC inclui pelo menos duas partes de ácido nucleico com sequências diferentes, (v) todas as partes de ácido nucleico do CIC têm a mesma sequência, (vi) o CIC inclui pelo menos uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico que é ou compreende trietilenoglicol, hexa-etilenoglicol, propilo, butilo, hexilo, glicerol ou um glicerol modificado (e.g., glicerol derivatizado na posição 1, 2 ou 3 hidroxilo; e.g., 3-levulinil-glicerol) , penta-eritritol ou penta-eritritol modificado (penta-eritritol modificado em qualquer(is) posição(ões) hidroxilo, e.g., "triplo"), 2-(hidroximetil)etilo, 1,3-diamino-2-propanol, um nucleótido abásico, um polissacárido (e.g., um polissacárido reticulado) ou um dendrímero. Em algumas concretizações, a parte espaçadora não é um polipéptido.
Em várias concretizações, um CIC aqui descrito tem uma ou mais das seguintes caracteristicas: (vii) o CIC inclui pelo menos uma parte de ácido nucleico do CIC que não tem "actividade de imunomodulação isolada", (viii) o CIC não inclui qualquer parte de ácido nucleico com "actividade de imunomodulação isolada", (ix) o CIC inclui pelo menos uma parte de ácido nucleico do CIC que tem "actividade imunológica isolada inferior". "Actividade de imunomodulação isolada" e "actividade imunológica isolada inferior" são aqui descritas. Em várias concretizações um CIC aqui descrito inclui pelo menos uma parte de ácido nucleico que está em cadeia dupla ou parcialmente em cadeia dupla. Podem conceber-se CIC com partes de ácido nucleico auto-complementares de modo a formarem-se tais cadeias duplas. Consultar, e.g., C-84, C-85 e C-87.
Assim, em vários aspectos, o invento proporciona um CIC compreendendo duas ou mais partes de ácido nucleico e uma ou mais partes espaçadoras que não são de ácido nucleico, em que pelo menos uma parte espaçadora está ligada covalentemente a duas partes de ácido nucleico e pelo menos uma parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-CG-3' e em que o referido 7 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ CIC apresenta actividade de imunomodulação. O CIC pode compreender pelo menos três partes de ácido nucleico, em que cada parte de ácido nucleico está ligada covalentemente a pelo menos uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico. O CIC pode apresentar pelo menos uma actividade de imunomodulação, tal como (a) a capacidade de estimular a produção de IFN-γ por células mononucleares de sangue periférico humano; (b) a capacidade para estimular a produção de IFN-α por células mononucleares de sangue periférico humano; e/ou (c) a capacidade de estimular a proliferação de células B humanas.
Uma ou mais partes de ácido nucleico do CIC podem compreender uma sequência tal como 5'-TCGA-3', 5'-TCGACGT,-3', 5'-TCGTCGA-3' e 5'-ACGTTCG-3'. Numa concretização, uma ou mais partes de ácido nucleico do CIC pode ter a sequência 5'- X1X2CGX3X4-3' (em que Xi são zero a dez nucleótidos; X2 está ausente ou é A, T ou U; X3 está ausente ou é A; e X4 são zero a dez nucleótidos e em que a parte de ácido nucleico está conjugada a uma parte espaçadora, por exemplo na extremidade 3')· Numa concretização, a soma dos nucleótidos em Xi, X2, X3 e X4 pode ser inferior a 8, inferior a 7, inferior a 6, inferior a 5 ou inferior a 4. Em algumas concretizações, uma ou mais partes de ácido nucleico do CIC podem ter uma sequência de ácido XTCGXXX, XTCGAXX, TCGAGCG, ATCGATT, TCGAXXX, TCGAGAT, TCGTTTT, AACGTTC, ATCGAT, nucleico tal como TCGXXXX, TCGTCGA, TCGACGT, TCGAACG, TCGACTC, TCGTCGT, TGACGTT, GTCGTT, TCGATTT, TCGCTTT, TCGGTTT, TTCGTTT, TTCGATT, ACGTTCG, TGTCGTT, TCGXXX, TCGAXX, TCGTCG, AACGTT, GACGTT, TCGXX, TCGAX, TCGAT, TCGTT, TCGTC, TCGA, TCGT, TCGX ou TCG (em que "X" é qualquer nucleótido).
Numa concretização, uma ou mais partes de ácido nucleico compreendem 3 a 7 bases. Numa concretização, a parte de ácido nucleico compreende 3 a 7 bases e tem a sequência 5' — [(X) 0-2]TCG[(X)2_4]-3/ ou 5' -TCG [ (X) 2-4] -3' ou 5' -TCG (A/T) [ (X) χ_3] -3' , ou 5'-TCG(A/T)CG(A/T)-3' ou 5'-TCGACGT-3' ou 5'-TCGTCGA-3', em que cada X é um nucleótido seleccionado independentemente. Em algumas concretizações, o CIC contém pelo menos 3, pelo menos 10, pelo menos 30 ou pelo menos 100 partes de ácido nucleico com uma sequência descrita anteriormente. 8 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Ο CIC pode incluir pelo menos uma parte de ácido nucleico que é inferior a cerca de 8 nucleótidos de comprimento. Opcionalmente todas as partes de ácido nucleico no CIC são inferiores a 8 nucleótidos de comprimento. De acordo com o invento, todas as partes de ácido nucleico no CIC que compreendem a sequência 5'-CG-3' são inferiores a 8 nucleótidos de comprimento. O CIC pode incluir pelo menos 2 partes de ácido nucleico com diferentes sequências. 0 CIC pode conter pelo menos uma parte de ácido nucleico que não compreende a sequência 5'-CG-3'. O CIC pode incluir pelo menos uma parte de ácido nucleico que não tem actividade imunológica isolada ou que tem actividade imunológica isolada inferior. Opcionalmente, nenhuma parte de ácido nucleico do CIC tem actividade de imunomodulação isolada. As ligações entre os nucleótidos das partes de ácido nucleico podem incluir fosfodiéster, éster fosforotiolato, éster fosforoditiolato, outras ligações covalentes e suas misturas. De igual modo, as ligações entre partes de ácido nucleico e partes de espaçador ou entre componentes de partes de espaçador podem incluir fosfodiéster, éster fosforotiolato, éster fosforoditiolato, outras ligações e suas misturas.
Numa concretização, o CIC inclui um grupo de ligação reactivo (e.g., um grupo tio reactivo) . O CIC pode estar ligado ou associado de forma não covalente a um polipéptido, e.g., um polipéptido antigénico. 0 invento também proporciona composições compreendendo um CIC conjuntamente com um excipiente farmaceuticamente aceitável e/ou um antigénio e/ou um microtransportador catiónico (tal como um polímero de ácido láctico e ácido glicólico). A composição pode ser essencialmente isenta de endotoxina.
Num aspecto, o invento proporciona uma composição contendo um CIC aqui descrito e um excipiente farmaceuticamente aceitável, um antigénio (e.g., um antigénio para o qual se pretende uma resposta imunitária) ou ambos. Numa concretização, a composição é formulada sob padrões GMP. Numa concretização, a composição é preparada por um processo que inclui ensaio da composição para a presença de endotoxina. Numa concretização, a composição encontra-se 9 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ essencialmente isenta de endotoxina. Numa concretização, a composição não contém lipossomas.
Num aspecto, o invento proporciona a utilização de um CIC, tal como aqui descrito, para o fabrico de um medicamento.
Num aspecto, o invento proporciona um CIC para utilização num método de modular uma resposta imunitária num indivíduo, por administração de um composto de imunomodulação quimérico ou composição, tal como aqui descrita, numa quantidade suficiente para modular uma resposta imunitária no indivíduo. Numa concretização, o indivíduo sofre de uma doença associada com uma resposta imunitária de tipo Th2, por exemplo, uma alergia ou asma induzida por alergia. Numa concretização, o indivíduo tem uma doença infecciosa.
Num aspecto, o invento proporciona um CIC para utilização num método de aumentar interferão gama (IFN-γ) num indivíduo por administração de um CIC ou composição, tal como aqui descrita, numa quantidade suficiente para aumentar IFN-γ no indivíduo. Numa concretização, o indivíduo tem uma doença inflamatória. Numa concretização, o indivíduo tem fibrose pulmonar idiopática.
Num aspecto, o invento proporciona um CIC para utilização num método de aumentar interferão alfa (IFN-α) num indivíduo, por administração de um CIC ou composição, tal como aqui descrito, numa quantidade suficiente para aumentar IFN-α no indivíduo. Numa concretização, o indivíduo tem uma infecção virica.
Num aspecto, o invento proporciona um CIC para utilização num método de melhoria de um sintoma de uma doença infecciosa num indivíduo, por administração de uma quantidade eficaz de um CIC ou composição, tal como aqui descrito, ao indivíduo, em que a quantidade eficaz é uma quantidade suficiente para melhorar um sintoma da doença infecciosa.
Num aspecto, o invento proporciona um CIC para utilização num método de melhorar uma doença relacionada com IgE num indivíduo, por administração de uma quantidade eficaz de um 10 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ CIC ou composição aqui descrito a um indivíduo com uma doença relacionada com IgE, em que uma quantidade eficaz é uma quantidade suficiente para melhorar um sintoma da doença relacionada com IgE. Numa concretização, a doença relacionada com IgE é alergia ou uma doença relacionada com alergia. O invento proporciona adicionalmente um CIC para utilização num método de modular uma resposta imunitária num indivíduo, por administração a um indivíduo de um CIC numa quantidade suficiente para modular uma resposta imunitária no referido indivíduo. Em concretizações, o indivíduo tem cancro e/ou sofre de uma doença associada com uma resposta imunitária do tipo Th2 (e.g., uma alergia ou asma induzida por alergia) e/ou tem uma doença infecciosa.
DESCRIÇÃO SUCINTA DAS FIGURAS A figura 1 apresenta a estrutura de determinados reagentes úteis para a síntese de partes espaçadoras que não são de ácido nucleico de CIC. Apresenta-se precursores de parte espaçadora de fosforamidite protegida com dimetoxitritilo para partes espaçadoras HEG, propilo, TEG, HME, butilo e abásicas. A figura 2 apresenta a estrutura de determinados reagentes úteis para a síntese de partes espaçadoras simétricas ou assimétricas que não são de ácido nucleico de CIC. Apresentam-se precursores de parte espaçadora de fosforamidite protegida com dimetoxitritilo para partes espaçadoras de glicerol [2] "ramificado simétrico"), levulinil-glicerol [3] ("ramificado assimétrico"), "triplo" [9] e "duplo simétrico" [10].
As figuras 3A e 3B são diagramas da síntese de um CIC ramificado. A figura 4 apresenta o esquema sintético para C-105. A figura 5 apresenta a indução de genes imuno-associados no pulmão de ratinho após tratamento intranasal com CIC. 11 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
As figuras 6A-C apresentam o efeito de CIC nos niveis de IL-12 p40 (figura 6A) , IL-6 (figura 6B) e TNF-alfa (figura 6C) .
As figuras 7A-B apresentam as estruturas de C-8 (figura 7A) e C-101 (figura 7B).
MODOS DE LEVAR O INVENTO À PRÁTICA I. Métodos gerais A prática do presente invento empregará, salvo indicação em contrário, técnicas de biologia molecular convencionais (incluindo técnicas recombinantes), microbiologia, biologia celular, bioquímica, química de ácido nucleico e imunologia, que estão no âmbito do conhecimento na especialidade. Tais técnicas são explicadas completamente na literatura, tal como, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, segunda edição (Sambrook et al., 1989) e Molecular Cloning: A Laboratory Manual, terceira edição (Sambrook e Russel, 2001), (conjunta e individualmente aqui referido como "Sambrook"). Oligonucleotide Synthesis (M. J. Gait, ed., 1984); Animal Cell Culture (R.I. Freshney, ed., 1987); Handbook of Experimental Immunology (D.M. Weir e C.C. Blackwell, ed.); Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J.M. Miller e M.P. Calos, ed., 1987); Current Protocols in Molecular Biology (F.M. Ausubel et al., ed., 1987, incluindo suplementos até 2001); PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., ed., 1994); Current Protocols in Immunology (J.E. Coligan et al., ed., 1991); The Immunoassay Handbook (D. Wild, ed., Stockton Press NY, 1994); Bioconjugate Techniques (Greg T. Hermanson, ed., Academic Press, 1996); Methods of
Immunological Analysis (R. Masseyeff, W.H. Albert e N.A. Staines, ed., Weinheim: VCH Verlags gesellschaft mbH, 1993), Harlow e Lane (1988) Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Publications, New York e Harlow e Lane (1999) Using Antibodies: A Laboratory Manual Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY (conjunta e individualmente aqui referido como "Harlow e Lane"), Beaucage et al. ed., Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry John Wiley & Sons, Inc., New York, 2000); e Agrawal, ed., Protocols for Oligonucleotides and Analogs, Synthesis and Properties Humana Press Inc., New Jersey, 1993). 12 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ II. Definições
Tal como aqui utilizada, a forma singular "um", "uma", "o" e "a" inclui referências no plural salvo indicação em contrário ou claramente no contexto. Por exemplo, como será aparente pelo contexto, "um" composto de imuno-estimulação quimérico ("CIC") pode incluir um ou mais CIC. De igual modo, a referência na forma singular de um elemento componente de um CIC (i.e., parte de ácido nucleico ou parte espaçadora que não é de ácido nucleico) pode incluir múltiplos elementos. Por exemplo, uma descrição de "uma parte de ácido nucleico" num CIC pode também descrever duas ou mais "partes de ácido nucleico" no CIC.
Tal como aqui utilizado indiferentemente, as expressões "polinucleótido", "oligonucleótido" e "ácido nucleico" incluem ADN em cadeia simples (ADNss), ADN em cadeia dupla (ADNds), ARN em cadeia simples (ARNss) e ARN em cadeia dupla (ARNds), oligonucleótidos e oligonucleósidos modificados ou suas combinações. 0 ácido nucleico pode ser configurado linear ou circularmente ou o oligonucleótido pode conter tanto segmentos lineares, como circulares. Os ácidos nucleicos são polímeros de nucleósidos ligados, e.g., através de ligações fosfodiéster ou ligações alternativas, tais como ésteres fosforotiolato. Um nucleósido consiste de uma base purina (adenina (A) ou guanina (G) ou seu derivado) ou pirimidina (timina (T) , citosina (C) ou uracilo (U) ou seu derivado) ligada a um açúcar. As quatro unidades de nucleósido (ou bases) em ADN são denominadas desoxiadenosina, desoxiguanosina, desoxitimidina e desoxicitidina. Um nucleótido é um éster de fosfato de um nucleósido. A expressão "3'" refere-se na generalidade a uma região ou posição num polinucleótido ou oligonucleótido a 3' (jusante) de outra região ou posição no mesmo polinucleótido ou oligonucleótido. A expressão "5'" refere-se na generalidade a uma região ou posição num polinucleótido ou oligonucleótido a 5' (montante) de outra região ou posição no mesmo polinucleótido ou oligonucleótido. 13 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Um elemento, e.g., região, parte, parte espaçadora que não é de ácido nucleico, parte de ácido nucleico ou sequência está "adjacente" a outro elemento, e.g., região, parte, parte espaçadora que não é de ácido nucleico, parte de ácido nucleico ou sequência, se faz fronteira directa com essa região, parte, espaçador ou sequência. A expressão "conjugado CIC-antigénio" refere-se a um complexo no qual se encontram ligados um CIC e um antigénio. Tais ligações conjugadas incluem ligações covalentes e/ou não covalentes. A expressão "antigénio" significa uma substância que é reconhecida e se liga especificamente a um anticorpo ou um receptor de antigénio de célula T. Os antigénios podem incluir péptidos, proteínas, glicoproteínas, polissacáridos, hidratos de carbono complexos, açúcares, gangliósidos, lípidos e fosfolípidos; suas partes e suas combinações. Os antigénios podem ser os encontrados na natureza ou podem ser sintéticos. Os antigénios adequados para administração com um CIC incluem qualquer molécula capaz de desencadear uma resposta de célula B ou célula T específica de antigénio. Preferentemente, os antigénios desencadeiam uma resposta de anticorpo especifica para o antigénio. Os haptenos estão incluídos no âmbito de "antigénio". Um hapteno é um composto de baixo peso molecular que não é por si só imunogénico mas que se torna imunogénico quando conjugado com uma molécula imunogénica contendo determinantes antigénicos. As moléculas pequenas podem necessitar de ser haptenizadas de modo a tornarem-se antigénicas. Preferentemente, os antigénios do presente invento incluem péptidos, lípidos (e.g. esteróides, ácidos gordos e fosfolípidos), polissacáridos, tal como os utilizados em vacinas de Hemophilus influenza, gangliósidos e glicoproteínas. "Adjuvante" refere-se a uma substância que, quando adicionada a um agente imunogénico, tal como um antigénio, melhora ou potência não especificamente uma resposta imunitária ao agente, no hospedeiro recebedor, por exposição à mistura. 14 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ A expressão "péptido" são polipéptidos que têm um comprimento suficiente e uma composição para efectuar uma resposta biológica, e.g., produção de anticorpo ou actividade de citocina, quer o péptido seja ou não um hapteno. Tipicamente, os péptidos têm pelo menos seis resíduos de aminoácidos de comprimento. A expressão "péptido" inclui adicionalmente aminoácidos modificados (quer sejam ou não de ocorrência natural), incluindo tais modificações, entre outras, fosforilação, glicosilação, peguilação, lipidização e metilação. "Péptidos antigénicos" podem incluir péptidos nativos purificados, péptidos sintéticos, péptidos recombinantes, extractos impuros de péptido ou péptidos num estado parcialmente purificado ou estado activo não purificado (tal como péptidos que são parte de vírus, células, microrganismos atenuados ou inactivados ou fragmentos de tais péptidos. Assim, um "péptido antigénico" ou "polipéptido antigénico" significa todo ou uma parte de um polipéptido que apresenta uma ou mais propriedades antigénicas. Assim, por exemplo, um "polipéptido antigénico Amb a 1" ou "antigénio polipéptido Amb a 1" é uma sequência de aminoácidos de Amb a 1, seja a sequência completa, uma parte da sequência e/ou uma modificação da sequência, que apresenta uma propriedade antigénica (i.e., liga-se especificamente a um anticorpo ou um receptor de células T).
Uma "molécula de entrega" ou "veículo de entrega" é uma parte química que facilita, permite e/ou melhora a entrega de um CIC, mistura de CIC e antigénio ou conjugado CIC-antigénio a um local específico e/ou relativamente a um ponto temporal especifico. Um veiculo de entrega pode ou não estimular adicionalmente uma resposta imunitária.
Uma "resposta alérgica a antigénio" significa uma resposta imunitária geralmente caracterizada pela geração de eosinófilos (usualmente nos pulmões) e/ou IgE específico de antigénio e seus efeitos resultantes. Tal como é bem conhecido na especialidade, IgE liga-se a receptores IgE em mastócitos e basófilos. Por exposição posterior ao antigénio reconhecido pelo IgE, o antigénio reticula o IgE nos mastócitos e basófilos causando desgranulação destas células, 15 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ incluindo, entre outros, libertação de histamina. Sabe-se e pretende-se que as expressões "resposta alérgica a antigénio", "alergia" e "condição alérgica" sejam igualmente adequadas para aplicação de alguns dos métodos do invento. Adicionalmente sabe-se e pretende-se que os métodos do invento incluam os que são igualmente adequados para prevenir uma resposta alérgica, bem como para tratar uma condição alérgica pré-existente.
Tal como aqui utilizada, a expressão "alergénio" significa um antigénio ou parte antigénica de uma molécula, usualmente uma proteína, que desencadeia uma resposta alérgica por exposição a um indivíduo. Tipicamente, o indivíduo é alérgico ao alergénio tal como indicado, por exemplo pelo ensaio de pápula e erupção cutânea ou por qualquer método conhecido na especialidade. Diz-se que uma molécula é um alergénio mesmo que apenas um pequeno subconjunto de indivíduos apresentem uma resposta imunitária alérgica (e.g., IgE) por exposição à molécula. São conhecidos na especialidade vários alergénios isolados. Tais incluem, entre outros, os aqui apresentados na tabela 1. A expressão "dessensibilização" refere-se ao processo da administração de doses crescentes de um alergénio ao qual o indivíduo tenha demonstrado sensibilidade. Os exemplos de doses de alergénio utilizadas para dessensibilização são conhecidos na especialidade, consultar, por exemplo, Fomadley (1998) Otolaryngol. Clin. North Am. 31:111-127. "Imunoterapia específica de antigénio" refere-se a qualquer forma de imunoterapia que envolva antigénio e gere uma modulação especifica de antigénio da resposta imunitária. No contexto de alergia, a imunoterapia específica de antigénio inclui, entre outras, terapia de dessensibilização. A expressão "microtransportador" refere-se a uma composição particulada que é insolúvel em água e que tem um tamanho inferior a cerca de 150, 120 ou 100 pm, mais usualmente inferior a cerca de 50-60 μm e pode ser inferior a cerca de 10 pm ou mesmo inferior a cerca de 5 pm. Os microtransportadores incluem "nanotransportadores", que são microtransportadores que têm um tamanho inferior a cerca de 1 16 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ μιη, preferentemente inferior a cerca de 500 nm. Os microtransportadores incluem partículas de fase sólida, tais como partículas formadas por polímeros de ocorrência natural biocompatíveis, polímeros sintéticos ou copolímeros sintéticos, embora também se possam incluir ou excluir da presente definição microtransportadores formados por agarose ou agarose reticulada, bem como outros materiais biodegradáveis conhecidos na especialidade. Os microtransportadores de fase sólida são formados a partir de polímeros ou outros materiais que são não erodíveis e/ou não degradáveis em condições fisiológicas de mamíferos, tais como poliestireno, polipropileno, sílica, cerâmica, poliacrilamida, ouro, látex, hidroxiapatite, materiais ferromagnéticos e paramagnéticos. Os microtransportadores de fase sólida biodegradáveis podem ser formados por polímeros que são degradáveis (e.g., poli(ácido láctico), poli(ácido glicólico) e seus copolímeros, tais como poli(D, L-lactídeo-co-glicolídeo) ou erodíveis (e.g., poli(orto-ésteres, tal como 3,9-dietilideno-2,4,8,10-tetraoxaspiro[5.5]undecano (DETOSU) ou poli(anidridos), tal como poli(anidridos) de ácido sebácico) em condições fisiológicas de mamífero. Os microtransportadores podem também ser em fase líquida (e.g., baseados em óleo ou lípido), tais como lipossomas, "iscom" (complexos de estimulação imunitária que são complexos estáveis de colesterol, fosfolipido e saponina activa adjuvante) sem antigénio ou gotículas ou micelas encontradas em emulsões de óleo-em-água ou de água-em-óleo. Os microtransportadores de fase líquida biodegradáveis incorporam tipicamente um óleo biodegradável, dos quais se conhecem vários na especialidade, incluindo óleos de esqualeno e vegetais. Os microtransportadores têm forma tipicamente esférica, mas também são aceitáveis microtransportadores que se desviam da forma esférica (e.g., elipsoidal, em forma de bastonete, etc.). Devido à sua natureza insolúvel, os microtransportadores de fase sólida são filtráveis de água e de soluções à base de água (aquosas) (e.g., utilizando um filtro de 0,2 micra). A expressão "não biodegradável", tal como aqui utilizada, refere-se a um microtransportador que não é degradado ou erodido em condições fisiológicas de mamífero normais. Em geral, considera-se que um microtransportador não é 17 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ biodegradável caso não seja degradado (i.e., perca menos do que 5% da sua massa ou comprimento médio de polímero) após uma incubação de 72 horas a 37 °C em soro humano normal.
Considera-se que um microtransportador é "biodegradável" caso seja degradável ou erodível em condições fisiológicas de mamífero normais. Em geral, considera-se que um microtransportador é biodegradável caso seja degradado (i.e., perca pelo menos 5% da sua massa ou comprimento médio de polímero) após uma incubação de 72 horas a 37 °C em soro humano normal. A expressão "complexo CIC/microtransportador" ou "complexo CIC/MC" refere-se a um complexo de um CIC e um microtransportador. Os componentes do complexo podem estar ligados covalentemente ou não covalentemente. As ligações não covalentes podem ser mediadas por qualquer força de ligação não covalente, incluindo por interacção hidrofóbica, ligação iónica (electrostática), ligações de hidrogénio e/ou atracções de van der Waals. No caso de ligações hidrofóbicas, a ligação é geralmente através de uma parte hidrofóbica (e.g., colesterol) ligada covalentemente ao CIC.
Um "indivíduo" ou "sujeito" é um vertebrado, tal como uma ave, preferentemente um mamífero, tal como um humano. Os mamíferos incluem, entre outros, humanos, primatas não humanos, animais de quinta, animais de desporto, animais experimentais, roedores (e.g., ratinhos e ratos) e animais de estimação.
Uma "quantidade eficaz" ou uma "quantidade suficiente" de uma substância é a quantidade suficiente para efectuar um efeito biológico pretendido, tal como resultados benéficos, incluindo resultados clínicos, e como tal uma "quantidade eficaz" depende do contexto na qual está a ser aplicada. No contexto de administração de uma composição que modula uma resposta imunitária de um antigénio co-administrado, uma quantidade eficaz de um CIC e antigénio é uma quantidade suficiente para conseguir tal modulação comparativamente à resposta imunitária obtida quando o antigénio é administrado sozinho. Uma quantidade eficaz pode ser administrada numa ou mais administrações. 18 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ A expressão "co-administração", tal como aqui utilizada, refere-se à administração de pelo menos duas substâncias diferentes suficientemente próximas no tempo para modular uma resposta imunitária. Preferentemente, a co-administração refere-se a administração simultânea de pelo menos duas substâncias diferentes. "Estimulação" de uma resposta imunitária, tal como resposta Thl, significa um aumento da resposta, que pode ser devido a desencadear e/ou melhorar uma resposta. De igual modo, "estimulação" de uma citocina ou tipo de célula (tal como CTL) significa um aumento da quantidade ou nível de citocina ou tipo de célula.
Uma "doença associada a IgE" é uma condição fisiológica que é em parte caracterizada por níveis de IgE elevados, que podem ou não ser persistentes. As doenças associadas a IgE incluem, entre outras, alergias e reacções alérgicas, doenças relacionadas com alergia (descritas seguidamente), asma, rinite, conjuntivite, urticária, choque, alergias a picada de himenópteros e alergias a fármacos e infecções por parasitas. A expressão também inclui manifestações relacionadas de tais doenças. Em geral, IgE em tais doenças é específica de antigénio.
Uma "doença relacionada com alergia" significa uma doença resultante dos efeitos de uma resposta imunitária IgE específica de antigénio. Tais efeitos podem incluir, entre outros, hipotensão e choque. A anafilaxia é um exemplo de uma doença relacionada com alergia durante a qual a histamina libertada para a circulação causa vasodilatação, bem como aumento da permeabilidade dos capilares, com resultante perda acentuada de plasma da circulação. A anafilaxia pode ocorrer sistemicamente, com os efeitos associados estendendo-se a todo o corpo, e pode ocorrer localmente, com a reacção limitada a um tecido ou órgão alvo específico. A expressão "doença vírica", tal como aqui utilizada, refere-se a uma doença que tem um vírus como seu agente etiológico. Os exemplos de doença víricas incluem hepatite B, hepatite C, influenza, síndrome de imunodeficiência adquirida (SIDA) e herpes zoster. 19 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Tal como aqui utilizado e bem compreendido na especialidade, "tratamento" é uma abordagem para obter resultados benéficos ou pretendidos, incluindo resultados clínicos. Para os objectivos deste invento, os resultados clínicos benéficos ou pretendidos incluem, entre outros, alívio ou melhoria de um ou mais sintomas, diminuição da extensão da doença, estabilização (i.e., sem pioria) do estado da doença, prevenção do alastramento da doença, atraso ou retardamento da progressão da doença, melhoria ou paliação do estado da doença e remissão (quer parcial, quer total), detectável ou indetectável. "Tratamento" pode também significar prolongar a sobrevivência comparativamente à sobrevivência esperada sem receber tratamento. "Paliação" de uma doença significa que a extensão e/ou as manifestações clínicas indesejáveis de uma doença ou de um estado de doença são diminuídos e/ou o decurso temporal da progressão é abrandado ou aumentado, comparativamente a não tratar a doença. Especialmente no contexto de alergia, tal como é bem compreendido pelos peritos na especialidade, pode ocorrer paliação por modulação da resposta imunitária contra o(s) alergénio(s). Adicionalmente, não ocorre necessariamente paliação por administração de uma dose, mas frequentemente ocorre por administração de uma série de doses. Assim, uma quantidade suficiente para paliar uma resposta ou doença pode ser administrada numa ou mais administrações.
Um "título de anticorpo" ou "quantidade de anticorpo" que é "desencadeado" por um CIC e antigénio refere-se à quantidade de um determinado anticorpo medida num ponto temporal após administração do CIC e antigénio.
Um "anticorpo associado a Thl" é um anticorpo cuja produção e/ou aumento está associado a uma resposta imunitária Thl. Por exemplo, IgG2a é um anticorpo associado a Thl em ratinho. Para os objectivos deste invento, a medição de um anticorpo associado a Thl pode ser a medição de um ou mais de tais anticorpos. Por exemplo, em humanos, a medição de anticorpo associado a Thl pode envolver medição de IgGl e/ou IgG3. 20 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Um "anticorpo associado a Th2" é um anticorpo cuja produção e/ou aumento está associado a uma resposta imunitária Th2. Por exemplo, IgGl é um anticorpo associado a Th2 em ratinho. Para os objectivos deste invento, a medição de um anticorpo associado a Th2 pode ser a medição de um ou mais de tais anticorpos. Por exemplo, em humanos, a medição de um anticorpo associado a Th2 pode envolver medição de IgG2 e/ou IgG4. "Suprimir" ou "inibir" uma função ou actividade, tal como produção de citocina, produção de anticorpo ou libertação de histamina, é reduzir a função ou actividade quando comparada com as mesmas condições, excepto para uma condição ou parâmetro de interesse ou, alternativamente, comparativamente a outra condição. Por exemplo, uma composição compreendendo um CIC e antigénio que suprime a libertação de histamina reduz a libertação de histamina, por exemplo comparativamente à libertação de histamina induzida apenas pelo antigénio. Como outro exemplo, uma composição compreendendo um CIC e antigénio que suprime a produção de anticorpo, reduz a extensão e/ou niveis de anticorpo, por exemplo comparativamente à extensão e/ou niveis de anticorpo produzidos pelo antigénio sozinho.
Tal como aqui utilizado fabrico ou formulação "sob padrões GMP" quando em referência a uma composição farmacêutica significa que a composição é formulada estéril, substancialmente isotónica e em total observância de todas as regulações de Boas Práticas de Fabrico (GMP) da "U.S. Food e Drug Administration".
Tal como aqui utilizada, a expressão "imunogénico" tem o significado normal na especialidade e refere-se a um agente (e.g., polipéptido) que desencadeia uma resposta imunitária adaptativa, por injecção numa pessoa ou animal. A resposta imunitária pode ser de células B (humoral) e/ou células T (celular).
Pretende-se que todas as gamas incluam os valores terminais. Assim, um polímero de "desde 2 a 7 nucleótidos" ou "entre 2 e 7 nucleótidos" inclui polímeros de 2 nucleótidos e polímeros de 7 nucleótidos. Quando se descreve um limite 21 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ inferior e um limite superior seleccionado independentemente, considera-se que o limite superior é superior ao limite inferior. III. Compostos de imunomodulação quiméricos O invento proporciona compostos de imunomodulação quiméricos ("CIC") úteis, entre outros, para modular uma resposta imunitária em indivíduos, tal como mamíferos, incluindo humanos. O presente invento baseia-se, em parte, na constatação que algumas moléculas quiméricas contendo partes de ácido nucleico ligadas covalentemente a partes espaçadoras que não são de ácido nucleico têm actividade de imunomodulação, particularmente em células humanas.
Surpreendentemente, esta actividade manifesta-se mesmo em casos em que as partes de ácido nucleico têm uma sequência que, quando apresentada como um polinucleótido isolado, não apresenta actividade de imunomodulação significativa.
Assim, o invento proporciona novos reagentes e métodos para modular uma resposta imunitária, incluindo tratamento e profilaxia de doença em humanos e outros animais.
As seguintes secções descrevem a estrutura e propriedades dos CIC do invento, bem como a estrutura e propriedades das partes componentes de ácido nucleico e partes espaçadoras que não são de ácido nucleico.
1. Estrutura nuclear de CIC
Os CIC do presente invento contêm uma ou mais partes de ácido nucleico e uma ou mais partes espaçadoras que não são de ácido nucleico. Abrangem-se CIC com uma variedade de estruturas. Para fins ilustrativos, os exemplos de CIC têm as estruturas nucleares descritas nas fórmulas I-VII, seguidamente. As fórmulas I-III apresentam sequências nucleares para "CIC lineares". As fórmulas IV-VI apresentam sequências nucleares para "CIC ramificados". A fórmula VII apresenta um estrutura nuclear para "CIC com espaçador único".
Em cada uma das fórmulas apresentada seguidamente, "N" indica uma parte de ácido nucleico (orientada na orientação 22 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 5'->3' ou 3'->5') e "S" indica uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico. Um travessão indica uma ligação covalente entre a parte de ácido nucleico e a parte espaçadora que não é de ácido nucleico. Um travessão duplo (" —") indica ligações covalentes entre a parte espaçadora que não é de ácido nucleico e pelo menos 2 partes de ácido nucleico. Um travessão triplo ("---") indica ligações covalentes entre uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico e múltiplas (i.e., pelo menos 3) partes de ácido nucleico. Os indices são utilizados para indicar partes de ácido nucleico ou partes espaçadoras que não são de ácido nucleico posicionadas diferentemente. No entanto, não se pretende que a utilização de indices para distinguir diferentes partes de ácido nucleico indique que as partes têm necessariamente uma estrutura ou sequência diferente. De igual modo, não se pretende que a utilização de indices para distinguir diferentes partes espaçadoras indique necessariamente que as partes têm estruturas diferentes. Por exemplo, na fórmula II, seguidamente, as partes de ácido nucleico denominadas Ni e N2 podem ter a mesma sequência ou sequências diferentes e as partes espaçadoras denominadas Si e S2 podem ter a mesma estrutura ou estruturas diferentes. A. CIC lineares
Numa concretização, o CIC compreende a estrutura nuclear Ní-Si-N2 (I).
Numa concretização, o CIC compreende a estrutura nuclear NÍ-S1-N2-S2-N3 (II).
Numa concretização, o CIC compreende a estrutura nuclear N1-S1-N2-S2-[Nv-Sv]a (III) em que A é um número inteiro entre 1 e cerca de 100 e [Nv-Sv] indica A iterações adicionais de partes de ácido nucleico conjugadas a partes espaçadoras que não são de ácido nucleico. O indice "v" indica que N e S são seleccionados independentemente em cada iteração de "[Nv-Sv]." "A" é por 23 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ vezes entre 1 e cerca de 10, por vezes entre 1 e 3, por vezes exactamente 1, 2, 3, 4 ou 5. Em algumas concretizações, A é um número inteiro numa gama definida por um limite inferior de 1, 2, 3, 4 ou 5 e um limite superior seleccionado independentemente de 10, 20, 50 ou 100 (e.g., entre 3 e 10).
Em algumas concretizações do invento, o CIC tem a estrutura de fórmula I, II ou III. No entanto, de acordo com o invento, em algumas concretizações, os CIC lineares compreendem as estruturas apresentadas nas fórmulas I-III, não lhes estando necessariamente limitadas. Ou seja, as fórmulas I, II e III definem estruturas nucleares nas quais as partes espaçadoras que não são de ácido nucleico na estrutura nuclear estão ligadas covalentemente a não mais do que duas partes de ácido nucleico. No entanto, considera-se que, em muitas concretizações, partes químicas adicionais (e.g., fosfato, mononucleótido, partes adicionais de ácido nucleico, grupos alquilo, amino, tio ou dissulfureto ou grupos de ligação e/ou partes espaçadoras) estão ligadas covalentemente num terminal das estruturas nucleares. Por exemplo, se todas as partes de ácido nucleico num CIC forem 5'-TCGTCGA-3' e as partes espaçadoras forem seleccionadas de hexa-etilenoglicol ("HEG"), um multímero de HEG ligado por fosforotiolato e glicerol, os CIC com uma estrutura nuclear de fórmula I incluem cada uma das seguintes fórmulas: (Ia) (Ib) (Ic) (Id)
TCGTCGA-HEG-TCGTCGA-OH TCGTCGA-HEG-TCGTCGA-PO4
TCGTCGA-HEG-TCGTCGA-HEG
HEG-TCGTCGA-HEG-TCGTCGA-HEG (Ie) (If)
TCGTCGA-HEG-TCGTCGA-HEG-TCGTCGA
TCGTCGA-HEG-TCGTCGA- (HEG)4-TCGTCGA (TCGTCGA) 2-glicero1-TCGTCGA-HEG-TCGTCGA (Ig) (Ih)
PO4-TCGTCGA-HEG-TCGTCGA 24 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ TCGTCGA-(HEG) ΐ5-Τ (li) (TCGTCGA-HEG)2-glicerol-HEG-TCGTCGA (I j ) TCGTCGA-HEG-T-HEG-T (Ik)
Será imediatamente evidente que o género de CIC compreendendo uma estrutura nuclear de fórmula I abrange CIC compreendendo uma estrutura nuclear de fórmula II ou III.
Em algumas concretizações, um ou mais espaçadores compreendem unidades menores (e.g., HEG, TEG, glicerol, C3 alquilo e semelhantes) ligadas conjuntamente. Numa concretização, a ligação é uma ligação éster (e.g., fosfodiéster ou éster fosforotiolato) ou outra ligação, e.g., tal como descrito seguidamente.
Em determinadas concretizações, as estruturas terminais do CIC estão ligadas covalentemente (e.g., parte de ácido nucleico com parte de ácido nucleico; parte espaçadora com parte espaçadora ou parte de ácido nucleico com parte espaçadora), resultando numa conformação circular. B. CIC ramificados
Numa concretização, o CIC compreende a estrutura nuclear [Nv]a — Sp (IV) em que Sp é um espaçador multivalente ligado covalentemente à quantidade "A" de partes de ácido nucleico Nv seleccionadas independentemente e em que A é pelo menos 3, e.g., exactamente 3, 4, 5, 6 ou 7 ou mais do que 7. Em várias concretizações, A é um número inteiro entre 3 e 100 (inclusive). Em algumas concretizações, A é um número inteiro numa gama definida por um limite inferior de cerca de 3, 5, 10, 50 ou 100 e um limite superior seleccionado independentemente de cerca de 5, 7, 10, 50, 100, 150, 200, 250 ou 500. Também se considera que em algumas concretizações, A é superior a cerca de 500.
Numa concretização relacionada, o CIC compreende a estrutura nuclear 25 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ [Sv-Nv]a— Sp (V) em que Sp é um espaçador multivalente ligado covalentemente à quantidade "A" de elementos Sv-Nv seleccionados independentemente, compreendendo uma parte espaçadora ligada covalentemente a uma parte de ácido nucleico e em que A é pelo menos 3. Em várias concretizações, A é um número inteiro entre 3 e 100 (inclusive). Em algumas concretizações, A é um número inteiro numa gama definida por um limite inferior de 5, 10, 50 ou 100 e um limite superior seleccionado independentemente de 10, 50, 100, 250 ou 500.
Também se considera que em algumas concretizações A é superior a 500. Numa concretização relacionada, o CIC compreende a estrutura nuclear: (Si—NiJ-Sp— (Nv)a (VI) em que Sp é um espaçador multivalente ligado covalentemente à quantidade "A" de partes de ácido nucleico, Nv, seleccionadas independentemente, e pelo menos uma parte de ácido nucleico Ni ligada à parte espaçadora Si, em que A é pelo menos 2. Numa concretização, A é 2. Em várias concretizações, A é 3, é 4, é 5 ou é um número inteiro entre 3 e 100 (inclusive). Em algumas concretizações, A é um número inteiro numa gama definida por um limite inferior de 5, 10, 50 ou 100 e um limite superior seleccionado independentemente de 10, 50, 100, 150, 200, 250 ou 500. Também se considera que em algumas concretizações A é superior a 500. Em algumas concretizações do invento, o CIC tem a estrutura de fórmula I, II ou III. No entanto, de acordo com o invento, os CIC ramificados compreendem as estruturas apresentadas nas fórmulas IV, V e VI, não se lhes limitando. Ou seja, as fórmulas IV, V e VI definem estruturas nucleares nas quais uma parte espaçadora multivalente (Sp) está ligada covalentemente a pelo menos três (3) partes de ácido nucleico. Considera-se que, em algumas concretizações, partes químicas adicionais (e.g., fosfato, mononucleótido, partes de ácido nucleico e/ou partes espaçadoras adicionais) estão ligadas covalentemente aos terminais das estruturas nucleares. Por exemplo, caso todas as partes de ácido nucleico num CIC sejam 5'TCGTCGA 3' e todas as partes 26 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ espaçadoras sejam glicerol ou HEG, os CIC com a estrutura nuclear de fórmula IV incluem: (TCGTCGA) 2-glicerol-TCGTCGA (IVa) (TCGTCGA-HEG)2-glicerol-TCGTCGA (IVb) (TCGTCGA-HEG-TCGTCGA) 2-glicerol-TCGTCGA (IVc) [ (TCGTCGA) 2-glicerol-TCGTCGA] 2-glicerol-TCGTCGA (IVd)
Será imediatamente evidente, por exemplo, que o género dos CIC compreendendo uma estrutura nuclear de fórmula IV abrange CIC compreendendo uma estrutura nuclear de fórmula V ou VI. Numa concretização preferida do invento, o CIC compreende pelo menos duas partes de ácido nucleico diferentes (i.e., sequências diferentes).
Em algumas concretizações, um ou mais espaçadores compreendem unidades menores (e.g., HEG, TEG, glicerol, C3 alquilo e semelhantes) ligadas conjuntamente. Numa concretização, a ligação é uma ligação éster (e.g., fosfodiéster ou éster fosforotiolato). C. CIC com espaçador único
Num aspecto diferente do invento, o CIC compreende uma estrutura na qual existe uma única parte de ácido nucleico conjugada covalentemente a uma única parte espaçadora, i.e., Ní-Sí (VII)
Numa concretização, Si tem a estrutura de um multimero compreendendo unidades mais pequenas (e.g., HEG, TEG, glicerol, 1' 2'-didesoxirribose, subunidades C2 alquilo-C12 alquilo e semelhantes), tipicamente ligadas por uma ligação éster (e.g., fosfodiéster ou éster fosforotiolato) , e.g., tal como descrito seguidamente. Consultar, e.g., fórmula Vila, seguidamente. O multimero pode ser heteromérico ou homomérico. Numa concretização, o espaçador é um heterómero de unidades monoméricas (e.g., HEG, TEG, glicerol, 1'2'-didesoxirribose, ligantes C2 alquilo a C12 alquilo e 27 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ semelhantes) ligados por uma ligação éster (e.g., fosfodiéster ou éster fosforotiolato). Consultar, e.g., fórmula Vllb, seguidamente.
Por exemplo, caso a parte de ácido nucleico seja 5'TCGTCGA 3' e a parte espaçadora seja um multimero de hexa-etilenoglicol ["(HEG)i5"] ligado por fosforotiolato, um CIC com a estrutura nuclear de fórmula VII inclui: TCGTCGA-(HEG) 15 (Vila)
De igual modo, caso a parte de ácido nucleico seja 5'TCGTCGA 3' e a parte espaçadora seja um multimero de subunidades alternadas de hexa-etilenoglicol e propilo ligadas por fosforotiolato, um CIC com a estrutura nuclear de fórmula VI inclui: TCGTCGA-HEG-propil-HEG-propil-HEG (Vllb).
2. Actividade de imunomodulação de CIC
Os CIC do invento têm actividade de imunomodulação. As expressões "imunomodulador", "actividade de imunomodulação" ou "modulação de uma resposta imunitária", tal como aqui utilizadas, incluem efeitos de imuno-estimulação, bem como de imunossupressão. Uma resposta imunitária que é imunomodulada de acordo com o presente invento é geralmente aquela que é desviada para uma resposta imunitária de "tipo Thl", em oposição a uma resposta imunitária de "tipo Th2". As respostas de tipo Thl são consideradas tipicamente respostas do sistema imunitário celular (e.g., linfócitos citotóxicos), enquanto as respostas do tipo Th2 são geralmente "humorais" ou baseadas em anticorpo. As respostas imunitárias do tipo Thl são normalmente caracterizadas por reacções de "hipersensibilidade do tipo retardada" a um antigénio. As respostas de tipo Thl podem ser detectadas a nivel bioquímico por níveis aumentados de citocinas associadas a Thl, tal como IFN-γ, IFN-α, IL-2, IL-12 e TNF-β, bem como IL-6, embora IL-6 também possa estar associada a respostas do tipo Th2. As respostas imunitárias do tipo Th2 estão geralmente associadas a maiores níveis de produção de anticorpo, incluindo produção de IgE, uma ausência ou produção mínima de CTL, bem como 28 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ expressão de citocinas associadas a Th2, tais como IL-4 e IL-5. A imunomodulação de acordo com o invento pode ser reconhecida por medições (ensaios) in vitro, in vivo e/ou ex vivo. Os exemplos de respostas imunitárias mensuráveis indicativas de actividade de imunomodulação incluem produção de anticorpo especifico de antigénio, excreção de citocinas, activação ou expansão de populações de linfócitos, tal como células NK, linfócitos T CD4+, linfócitos T CD8+, linfócitos B e semelhantes, não se lhes limitando. Consultar, e.g., WO 97/28259; WO 98/16247; WO 99/11275; Krieg et al. (1995) Nature 374:546-549; Yamamoto et al. (1992) J. Immunol. 148:4072-4076; Bailas et al. (1996) J. Immunol. 157:1840-1845; Klinman et al. (1997) J. Immunol. 158:3635-3639; Sato et al. (1996) Science 273:352-354; Pisetsky (1996) J. Immunol. 156:421-423; Shimada et al. (1986) Jpn. J. Câncer Res. 77:808-816; Cowdery et al. (1996) J. Immunol. 156:4570-4575; Roman et al. (1997) Nat Med. 3:849-54; Lipford et al. (1997) Eur. J. Immunol. 27:2340-2344; WO 98/55495, WO 00/61151, Pichyangkul et al. (2001) J. Imm. Methods 247:83-94. Consultar também os exemplos, seguidamente. Descrevem-se aqui determinados ensaios úteis com objectivos ilustrativos e não limitativos.
Os ensaios são em geral efectuados por administração ou colocando em contacto uma célula, tecido, animal ou semelhantes com uma amostra de ensaio (e.g., contendo um CIC, polinucleótido e/ou outro agente) e medição de uma resposta. As amostras de ensaio contendo CIC ou polinucleótidos podem estar numa variedade de formas ou concentrações, que será compreendida pelo perito na prática da especialidade como sendo adequada para o tipo de ensaio. Por exemplo, para os objectivos de um ensaio baseado em células, utilizam-se frequentemente CIC ou polinucleótidos a uma concentração de 20 pg/ml ou 10 pg/ml ou 2 pg/ml. Tipicamente, para os objectivos do ensaio, a concentração é determinada pela medição de absorvância a 260 nm e utilizando a conversão 0,5 D026o/ml = 20 pg/ml. Tal normaliza a quantidade total de ácido nucleico na amostra de ensaio e pode ser utilizada, por exemplo, quando a parte espaçadora não tem uma absorvância significativa a 260 nm. Alternativamente, a concentração ou 29 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ peso podem ser medidos por outros métodos conhecidos na especialidade. Caso se pretenda, a quantidade da parte de ácido nucleico pode ser determinada por medição da absorvância a 260 nm e o peso do CIC calculado utilizando a fórmula molecular do CIC. Este método é por vezes utilizado quando a razão entre o peso contribuído pela(s) parte(s) espaçadora(s) e o peso contribuído pelas partes de ácido nucleico num CIC é elevada (i.e., superior a 1).
Será igualmente entendido que os controlos positivos e negativos são úteis em ensaios para actividade de imunomodulação. Um controlo positivo adequado para a actividade de imunomodulação é o ADN fosforotiolato imunomodulador com a sequência 5'-TGACTGTGAACGTTCGAGATGA-3' (SEQ ID NO:2), embora sejam evidentes para os peritos na prática da especialidade outros controlos positivos adequados com actividade de imunomodulação. Um controlo negativo adequado é sem agente de ensaio (i.e., apenas excipiente ou meio, também denominado como "células sozinhas" para determinados ensaios in vitro). Alternativamente utiliza-se um ADN fosf orotiolato com a sequência 5'-TGACTGTGAACCTTAGAGATGA-3' (SEQ ID NO:3) como um controlo negativo, em algumas concretizações. Podem conceber-se outros controlos negativos pelo perito orientado pela presente descrição e concepção de ensaio normal.
Uma classe de ensaios úteis são "ensaios de resposta de citocina". Um exemplo de ensaio para actividade de imunomodulação mede a resposta de citocina de células mononucleares de sangue periférico humanas ("PBMC") (e.g., tal como descrito em Bohle et al. [1999], Eur. J. Immunol. 29:2344-53; Verthelyi et al. [2001] J. Immunol. 166:2372-77). Numa concretização deste ensaio, recolhe-se o sangue periférico de um ou mais voluntários dadores saudáveis e isolam-se PBMC. Tipicamente recolhe-se o sangue por venopunção utilizando uma seringa heparinizada, com uma camada de almofada de FICOLL® (Amersham Pharmacia Biotech) e centrifuga-se. Recolhem-se então os PBMC da interface de FICOLL® e lava-se duas vezes com solução salina tamponada de fosfato (PBS) fria. Ressuspendem-se as células e cultivam-se (e.g., em placas de 48 ou 96 poços) a 2 x 106 células/mL em RPMI 1640 com soro AB humano inactivado por calor a 10%, 30 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ penicilina a 50 unidades/mL, estreptomicina a 50 pg/mL, glutamina a 30 0 pg/mL, piruvato de sódio 1 mM e 1 x MEM aminoácidos não essenciais (NEAA) na presença e ausência de amostras de ensaio ou controlos durante 24 horas.
Recolhe-se meio isento de células de cada poço e ensaia-se para a concentração de IFN-γ e/ou IFN-α. Detecta-se a actividade de imunomodulação quando a quantidade de IFN-γ excretada pelas PBMC em contacto com o composto de ensaio é significativamente maior (e.g., pelo menos cerca de 3 vezes maior, usualmente pelo menos cerca de 5 vezes maior) do que a quantidade excretada pelas PBMC na ausência do composto de ensaio ou, em algumas concretizações, na presença de um composto de controlo inactivo (e.g., 5'-TGACTGTGAACCTTAGAGATGA-3' (SEQ ID NO:3)). Reciprocamente, um composto de ensaio não tem actividade de imunomodulação caso a quantidade de IFN-γ excretada pelas PBMC em contacto com o composto de ensaio não seja significativamente maior (e.g., menos do que 2 vezes maior) do que na ausência do composto de ensaio ou, alternativamente, na presença de um composto de controlo inactivo (e.g., 5'-TGACTGTGAACCTTAGAGATGA-3' (SEQ IDNO:3)).
Quando se ensaia a concentração de IFN-α, a quantidade de IFN-α excretada pelas PBMC em contacto com o composto de ensaio é frequentemente significativamente maior (e.g., no caso de IFN-α por vezes pelo menos cerca de 2 vezes ou pelo menos cerca de 3 vezes maior) do que a quantidade excretada pelas PBMC na ausência do composto de ensaio ou, em algumas concretizações, na presença de um composto de controlo inactivo (e.g., 5'-TGACTGTGAACCTTAGAGATGA-3' (SEQ ID NO:3)). Em algumas concretizações, o nível de excreção de IFN-a significativamente aumentado é pelo menos cerca de 5 vezes, pelo menos cerca de 10 vezes ou mesmo pelo menos cerca de 20 vezes maior à dos controlos. Reciprocamente, um composto de ensaio não tem actividade de imunomodulação caso a quantidade de IFN-α excretada pelas PBMC em contacto com o composto de ensaio não seja significativamente maior (e.g., menos do que 2 vezes maior) do que na ausência do composto de ensaio ou, alternativamente, na presença de um composto de controlo inactivo (e.g., 5'-TGACTGTGAACCTTAGAGATGA-3' (SEQ ID NO:3)). 31 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Tal como ilustrado nos exemplos, seguidamente, a administração de alguns CIC resulta em excreção significativa tanto de IFN-γ, como de IFN-α, enquanto a administração de outros CIC tem um efeito menor na excreção de IFN-oí ou, reciprocamente, um menor efeito na excreção de IFN-γ. Consultar, e.g., exemplo 49.
Outra classe de ensaio útil são os ensaios de proliferação celular, e.g., ensaios de proliferação de células B. O efeito de um agente (e.g. um CIC) na proliferação de células B pode ser determinado utilizando qualquer de uma variedade de ensaios conhecidos na especialidade. Apresenta-se um exemplo de um ensaio de proliferação de células B no exemplo 41.
Para ter em consideração a variabilidade do dador, e.g., em ensaios baseados em células, tal como ensaios de citocina e de proliferação, preferentemente efectuam-se ensaios utilizando células (e.g., PBMC) de múltiplos dadores diferentes. 0 número de dadores é usualmente pelo menos 2 (e.g. 2), preferentemente pelo menos 4 (e.g. 4), por vezes pelo menos 10 (e.g. 10). Detecta-se actividade de imunomodulação quando a quantidade de IFN-γ excretada na presença do composto de ensaio (e.g. em pelo menos metade dos dadores saudáveis ensaiados, preferentemente em pelo menos 75%, com a maior preferência em pelo menos 85%) é pelo menos cerca de 3 vezes maior ou pelo menos cerca de 5 vezes maior do que a excretada na ausência do composto de ensaio ou, em algumas concretizações, na presença de um composto de controlo inactivo, tal como descrito anteriormente.
Podem também efectuar-se ensaios in vitro utilizando células de ratinho, tal como descrito, por exemplo, no exemplo 42, seguidamente, e noutras células de mamifero.
Descrevem-se exemplos de ensaio in vivo nos exemplos 43, 44 e 46 (ratinhos) e exemplo 45 (primatas não humanos).
Salvo indicação em contrário ou quando tal for evidente, os ensaios de citocina descritos nos exemplos, seguidamente, são efectuados utilizando PBMC humanas, utilizando essencialmente o protocolo descrito no exemplo 28. Podem 32 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ ensaiar-se elevados números de compostos de ensaio simultaneamente, e.g., utilizando placas multi-poço ou outros materiais de ensaio multi-câmara. Caso se pretenda, os ensaios podem ser efectuados por mecanismos robóticos controlados por computador, bem conhecidos na especialidade. 3. Partes de ácido nucleico
Os CIC do invento compreendem uma ou mais partes de ácido nucleico. A expressão "parte de ácido nucleico", tal como aqui utilizada, refere-se a um monómero de nucleótido (i.e., um mononucleótido) ou polimero (i.e., compreendendo pelo menos 2 nucleótidos contíguos) . Tal como aqui utilizado, um nucleótido compreende (1) uma base purina ou pirimidina ligada a um açúcar que se encontra numa ligação éster com um grupo fosfato ou (2) um análogo no qual a base e/ou açúcar e/ou éster de fosfato são substituídos por análogos, e.g., tal como descrito seguidamente. Num CIC compreendendo mais do que uma parte de ácido nucleico, as partes de ácido nucleico podem ser iguais ou diferentes.
As três secções seguintes descrevem características de partes de ácido nucleico, tal como comprimento, a presença e a posição de sequências ou motivos de sequência na parte, bem como descrevem (sem pretender limitar o invento) as propriedades e estrutura de partes de ácido nucleico e CIC contendo as partes. A. Comprimento
Usualmente uma parte de ácido nucleico tem de 1 a 100 nucleótidos de comprimento; embora sejam possíveis partes mais compridas em algumas concretizações. Em algumas concretizações, o comprimento de uma ou mais partes de ácido nucleico num CIC é inferior a 8 nucleótidos (i.e., 1, 2, 3, 4, 5, 6 ou 7 nucleótidos) . Em várias concretizações, uma parte de ácido nucleico (tal como uma parte de ácido nucleico com menos do que 8 nucleótidos de comprimento) tem pelo menos 2 nucleótidos de comprimento, frequentemente pelo menos 3, pelo menos 4, pelo menos 5, pelo menos 6 ou pelo menos 7 nucleótidos de comprimento. Em outras concretizações, a parte de ácido nucleico tem pelo menos 10, pelo menos 20 ou pelo 33 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ menos 30 nucleótidos de comprimento. De acordo com o invento, todas as partes de ácido nucleico que compreendem a sequência 5'-CG-3' têm menos de 8 nucleótidos de comprimento.
Tal como apresentado nos exemplos seguintes, os CIC contendo apenas partes de ácido nucleico heptaméricas, hexaméricas, pentaméricas, tetraméricas e triméricas foram activos em ensaios para actividade de imuno-estimulação (e.g., exemplos 36 e 37). Assim, considera-se que, em algumas concretizações, um CIC compreenderá pelo menos uma parte de ácido nucleico mais curta do que 8 nucleótidos. Em algumas concretizações, todas as partes de ácido nucleico num CIC serão mais curtas do que 8 nucleótidos (e.g., com um comprimento numa gama definida por um limite inferior de 2, 3, 4, 5 ou 6 e um limite superior seleccionado independentemente de 5, 6 ou 7 nucleótidos, em que o limite superior é maior do que o limite inferior). Por exemplo, numa concretização, partes especificas de ácido nucleico num CIC (incluindo todas as partes de ácido nucleico no CIC) podem ter 6 ou 7 nucleótidos de comprimento. Numa concretização, o CIC compreende duas partes espaçadoras e uma parte de ácido nucleico intermediária que tem menos de 8 bases de comprimento (e.g., 5, 6 ou 7 bases de comprimento).
Considera-se que num CIC compreendendo múltiplas partes de ácido nucleico, as partes de ácido nucleico podem ter comprimentos iguais ou diferentes. Numa concretização, o comprimento de um ou mais ou da maioria (e.g., pelo menos cerca de 2, pelo menos cerca de 4 ou pelo menos cerca de 25%, pelo menos cerca de 50%, pelo menos cerca de 75%) ou todas as partes de ácido nucleico num CIC são menores do que 8 nucleótidos, em algumas concretizações menores do que 7 nucleótidos, em algumas concretizações menores do que 6 nucleótidos, em algumas concretizações entre 2 e 6 nucleótidos, em algumas concretizações entre 2 e 7 nucleótidos, em algumas concretizações entre 3 e 7 nucleótidos, em algumas concretizações entre 4 e 7 nucleótidos, em algumas concretizações entre 5 e 7 nucleótidos e em algumas concretizações entre 6 e 7 nucleótidos. 34 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Tal como discutido em maior detalhe seguidamente, pelo menos uma parte de ácido nucleico de um CIC inclui a sequência TCG. Todas as partes de ácido nucleico que compreendem um motivo de ácido nucleico contendo CG têm menos de 8 nucleótidos de comprimento (e.g., tem um comprimento específico tal como descrito anteriormente menor do que 8 nucleótidos). Nenhuma das partes de ácido nucleico num CIC que é mais comprido do que 8 nucleótidos compreende a sequência "CG" ou opcionalmente a sequência "TCG" ou "ACG" (i.e., todas as partes de ácido nucleico no CIC que compreende a sequência CG têm menos de 8 nucleótidos de comprimento). Numa concretização, pelo menos uma parte de ácido nucleico no CIC não compreende uma sequência CG. B. Sequências e motivos
Tal como foi salientado anteriormente, uma parte de ácido nucleico específica pode ter uma variedade de comprimentos. Numa concretização, a parte de ácido nucleico tem um comprimento inferior a 8 nucleótidos. Numa concretização, a parte de ácido nucleico tem um comprimento de 8 nucleótidos ou maior. Em várias concretizações pelo menos uma parte de ácido nucleico de um CIC do invento compreende uma sequência tal como descrita seguidamente.
Nas fórmulas apresentadas seguidamente, todas as sequências estão no sentido 5'->3' e utilizam-se as seguintes abreviaturas: B = 5-bromocitosina; bU = 5-bromouracilo; a-A = 2-amino-adenina; g = 6-tioguanina; t = 4-tiotimina. H = uma citosina modificada compreendendo um grupo atractor de densidade electrónica, tal como halogénio, na posição 5. Em várias concretizações, substitui-se uma citosina (C) na sequência referida seguidamente por N4-etilcitosina ou N4-metilcitosina ou 5-hidroxicitosina. Em várias concretizações, substitui-se uma guanosina (G) na fórmula por 7-deazaguanosina.
Nos CIC ensaiados até à data, a presença de CG correlaciona-se com actividade de indução de citocina. Assim numa concretização, pelo menos uma parte de ácido nucleico de um CIC compreende pelo menos uma sequência 5'-citosina, guanina-3' (5'-CG-3')· A citosina não se encontra metilada na 35 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ posição C-5 e, preferentemente, não se encontra metilada em qualquer posição. 0 CIC contém pelo menos uma parte de ácido nucleico compreendendo a sequência 5'-TCG-3' na posição 5 linha.
Numa concretização, uma ou mais partes de ácido nucleico compreendem 3 a 7 bases. Numa concretização, a parte de ácido nucleico compreende 3 a 7 bases e tem a sequência 5'-[(X)0-2]TCG[ (X) 2_4] -3' ou 5' -TCG [ (X) 2-4] —3' ou 5' -TCG (A/T) [ (X) χ_3] -3' ou 5'-TCG(A/T)CG(A/T)-3' ou 5'-TCGACGT-3' ou 5'-TCGTCGA-3', em que cada X é um nucleótido seleccionado independentemente. Em algumas concretizações, o CIC contém pelo menos 3, pelo menos 10, pelo menos 30 ou pelo menos 100 partes de ácido nucleico com uma sequência supracitada.
Numa concretização, a parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-timidina, citosina, guanina-3' (5'-TCG-3'), por exemplo (sem limitações), o 3-mero TCG, o 4-mero TCGX (e.g., TCGA), os 5-meros TCGXX (e.g., TCGTC e TCGAT), os 6-meros TCGXXX, XTCGXX e TCGTCG e os 7-meros TCGXXXX, XTCGXXX, XXTCGXX e TCGTCGX, em que X é qualquer base. Frequentemente pelo menos uma parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-timidina, citosina, guanina, adenosina-3' (5'-TCGA-3'), e.g., compreende uma sequência 5'-TCGACGT-3'.
Em algumas concretizações , uma parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-ACGTTCG-3'; 5'-TCGTCG-3'; 5'-AACGTTC-3'; 5'-AACGTT-3'; 5'-TCGTT-3'; 5'-CGTTCG-3'; 5'-TCGTCGA-3'; 5'-TCGXXX-3'; 5'-XTCGXX-3'; 5'-XXTCGX-3; 5'-TCGAGA-3'; 5'-TCGTTT-3'; 5'-TTCGAG-3'; 5'-TTCGT-3'; 5'-TTCGC-3'; 5'-GTCGT-3'; 5'-ATCGT-3'; 5'-ATCGAT-3'; 5'-GTCGTT-3'; 5' -GTCGAC-3'; 5'-ACCGGT-3'; 5'-AABGTT-3'; 5'-AABGUT-3', 5 '-TCGTBG-3' em que X é qualquer nucleótido. Em algumas concretizações , uma parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-X1X2CGX3X4-3', em que Xi é zero a cinco nucleótidos; X2 está ausente ou é A, T ou U; X3 está ausente ou é A e X4 é zero a cinco nucleótidos. Numa concretização, a parte de ácido nucleico está conjugada com uma parte espaçadora na extremidade 3' . Em algumas concretizações, Xi é zero a dois nucleótidos e X4 é zero a dois nucleótidos. 36 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Em algumas concretizações, a parte de ácido nucleico compreende uma sequência que é 5'-purina, purina C, G, pirimidina, pirimidina-3'; por exemplo (todos 5'-3') , GACGCT; GACGTC; GACGTT; GACGCC; GACGCU; GACGUC; GACGUU; GACGUT; GACGTU; AGCGTT; AGCGCT; AGCGTC; AGCGCC; AGCGUU; AGCGCU; AGCGUC; AGCGUT; AGCGTU; AACGTC; AACGCC; AACGTT; AACGCT; AACGUC; AACGUU; AACGCU; AACGUT; AACGTU; GGCGTT; GGCGCT; GGCGTC; GGCGCC; GGCGUU; GGCGCU; GGCGUC; GGCGUT; GGCGTU, AACGTT, AGCGTC; GACGTT; GGCGTT; AACGTC; GACGTC; GGCGTC; AACGCC; GGCGTT AGCGCC; e AACGCC. GACGCC; GGCGCC; AGCGCT; GACGCT; GGCGCT;
Em algumas concretizações, relativamente a qualquer das sequências descritas anteriormente, a parte de ácido nucleico compreende adicionalmente um, dois, três ou mais sequências TCG e/ou TBG e/ou THG, preferentemente 5' relativamente à sequência apresentada anteriormente. Os TCG(s) e/ou TBG(s) podem ou não estar directamente adjacente à sequência apresentada. Em algumas concretizações, a(s) sequência(s) adicional (is) TCG e/ou TBG estão imediatamente a 5' e adjacentes à sequência de referência. Em outras concretizações, existem uma ou duas bases de separação.
Em algumas concretizações, uma parte de ácido nucleico compreende a sequência: (5'->3r) TCGTCGA; TCGTCG; TCGTTT; TTCGTT; TTTTCG; ATCGAT; GTCGAC; GTCGTT; TCGCGA; TCGTTTT; TCGTC; TCGTT; TCGT; TCG; ACGTTT; CCGTTT; GCGTTT; AACGTT; TCGAAAA; TCGCCCC; TCGGGGG.
Em algumas diferente de 5'-GAGCTT-3', 5'-TACGTT-3, 5'-ACCGTT-3', 5'-AACGTG-3', concretizações, um ou mais 5'-TCCGGA-3', '5'-CACGTT-3', 5'-AACGGT-3', 5'-AACGTA-3' e a parte de ácido nucleico é dos hexâmeros 5'-AACGTT-3', 5'-AGCGTT-3', 5'-AACGAT-3', 5'-AACGTC-3'. 5'-GACGTT-3', 5'-GACGTT-3', 5'-ATCGTT-3', 5'-AACGCT-3',
Em algumas concretizações, o CIC contém pelo menos 3, pelo menos 10, pelo menos 30 ou pelo menos 100 partes de ácido nucleico com uma sequência descrita anteriormente. 37 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ C. Sequências de partes de ácido nucleico: Efeitos de heterogeneidade e posição
Considera-se que num CIC compreendendo múltiplas partes de ácido nucleico, as partes de ácido nucleico podem ser as mesmas ou diferentes.
Numa concretização, todas as partes de ácido nucleico num CIC têm a mesma sequência. Numa concretização, um CIC compreende partes de ácido nucleico com pelo menos 2, pelo menos 3, pelo menos 4, pelo menos 5 ou pelo menos 6 ou mais sequências diferentes. Numa concretização, um CIC tem menos do que 10 partes de ácido nucleico diferentes. Numa concretização cada uma das partes de ácido nucleico num CIC tem uma sequência diferente.
Em algumas concretizações, uma única parte de ácido nucleico contém mais do que uma iteração de um motivo de sequência listado anteriormente em §3(B) ou dois ou mais motivos de sequência diferentes. Os motivos no interior de uma única parte de ácido nucleico podem ser adjacentes, sobrepostos ou separados por bases de nucleótidos adicionais no interior da parte de ácido nucleico. Numa concretização uma parte de ácido nucleico inclui uma ou mais regiões palindrómicas. No contexto de oligonucleótidos em cadeia simples, a expressão "palíndroma" refere-se a uma sequência que seria um palindrómica caso o oligonucleótido estivesse complexado com uma sequência complementar para formar uma molécula em cadeia dupla. Noutra concretização, uma parte de ácido nucleico tem uma sequência que é palindrómica ou um parcialmente palindrómica relativamente a uma segunda parte de ácido nucleico no CIC. Numa concretização do invento, a sequência de uma ou mais partes de ácido nucleico de um CIC não é palindrómica. Numa concretização do invento, a sequência de uma ou mais das partes de ácido nucleico de um CIC não inclui uma sequência palindrómica maior do que quatro bases, opcionalmente maior do que 6 bases.
Tal como descrito anteriormente, em várias concretizações, um ou mais (e.g., todas) as partes de ácido nucleico num CIC compreendem uma sequência 5'-CG-3', alternativamente uma sequência 5'-TCG-3'. Numa concretização, 38 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ a parte de ácido nucleico tem 5, 6 ou 7 bases de comprimento. Numa concretização, a parte de ácido nucleico tem a fórmula 5' -TCG [ (X) 2-4 ] - 3' ou 5'-TCG(A/T) [ (X) !_3] ou 5'-TCG(A/T)CG(A/T)-3' ou 5' -TCGACGT-3' (em que cada X é um nucleótido seleccionado independentemente). Numa concretização a parte de ácido nucleico supramencionada é uma parte 5 linha.
Numa concretização uma parte de ácido nucleico compreende uma sequência 5'-TCGTCGA-3' . Numa concretização, uma parte de ácido nucleico compreende uma sequência seleccionada de (todas 5'->3) : TCGXXXX, TCGAXXX, XTCGXXX, XTCGAXX, TCGACGT, TCGAACG, TCGAGAT, TCGACTC, TCGAGCG, TCGATTT, TCGCTTT, TCGGTTT, TCGTTTT, TCGTCGT, ATCGATT, TTCGTTT, TTCGATT, ACGTTCG, AACGTTC, TGACGTT, TGTCGTT, TCGXXX, TCGAXX, GTCGTT, GACGTT, ATCGAT, TCGTCG; TCGTTT; TCGAGA; TTCGAG; TTCGTT; AACGTT; ABGUTCG; TCGXX, TCGAX, TCGAT, TCGTT, TCGTC; TCGA, TCGT e TCGX (em que X é A, T, G ou C; U é 2' -desoxiuridina e B é 5-bromo-2'-desoxicitidina).
Numa concretização, a parte de ácido nucleico é um 7-mero com a sequência TCGXXXX, TCGAXXX, XTCGXXX, XTCGAXX, TCGTCGA, TCGACGT, TCGAACG, TCGAGAT, TCGACTC, TCGAGCG, TCGATTT, TCGCTTT, TCGGTTT, TCGTTTT, TCGTCGT, ATCGATT, TTCGTTT, TTCGATT, ACGTTCG, AACGTTC, TGACGTT ou TGTCGTT; ou é um 6-mero com a sequência TCGXXX, TCGAXX, TCGTCG, AACGTT; ATCGAT, GTCGTT, ou GACGTT; ou é um 5-mero com a sequência TCGXX, TCGAX, TCGAT, TCGTT ou TCGTC; ou é um 4-mero com a sequência TCGA, TCGT, ou TCGX ou é um 3-mero com a sequência TCG, em que X é A, T, G ou C.
Numa concretização, pelo menos cerca de 25%, preferentemente pelo menos cerca de 50% ou pelo menos cerca de 75% e por vezes todas as partes de ácido nucleico no CIC compreendem pelo menos uma das sequências supracitadas. Numa concretização, pelo menos uma parte de ácido nucleico não compreende um motivo CG. Noutras concretizações, pelo menos cerca de 25%, por vezes pelo menos cerca de 50% e por vezes pelo menos cerca de 75% das partes de ácido nucleico no CIC são partes de ácido nucleico que não têm um motivo CG ou alternativamente um motivo TCG. 39 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ A posição de uma sequência ou motivo de sequência num CIC pode influenciar a actividade de imunomodulação do CIC, tal como ilustrado nos exemplos seguintes. Quando se refere a posição de um motivo de sequência numa parte de ácido nucleico de um CIC, é útil a seguinte terminologia: (1) Num CIC contendo múltiplas partes de ácido nucleico, uma parte com uma extremidade 5' livre denomina-se "uma parte 5 linha". Considerar-se-á que um CIC único pode ter múltiplas partes 5 linha. (2) Dentro de uma parte de ácido nucleico especifica, uma sequência ou motivo está em "posição 5 linha" da parte quando não existem quaisquer bases de nucleótidos 5' relativamente à sequência de referência nessa parte. Assim, na parte com a sequência 5'-TCGACGT-3', as sequências T, TC, TCG e TCGA encontram-se na "posição 5 linha", enquanto a sequência GAC não se encontra. A titulo ilustrativo, um CIC contendo a sequência TCG na posição 5 linha de uma parte de ácido nucleico pode tornar o CIC mais activo do que um CIC semelhante em tudo o resto com um motivo TCG posicionado diferentemente. Um CIC com uma sequência TCG numa parte 5 linha, e.g., na posição 5 linha da parte 5 linha pode tornar um CIC particularmente activo. Consultar e.g. exemplo 38. Pode conceber-se uma parte de ácido nucleico com uma extremidade 5' livre utilizando o símbolo "5'F" à esquerda da fórmula para a sequência de bases da parte de ácido nucleico (e.g., 5' F-TACG-3') . Tal como aqui utilizada, a expressão "extremidade 5' livre" no contexto de uma parte de ácido nucleico tem o seu significado habitual e significa que o terminal 5' da parte de ácido nucleico não se encontra conjugado a um grupo bloqueador ou a uma parte espaçadora que não é um nucleótido. A actividade de imuno-estimulação pode também ser influenciada pela posição de um motivo CG numa parte de ácido nucleico (e.g., numa parte 5'). Por exemplo, numa concretização útil, o CIC contém pelo menos uma parte de ácido nucleico com a sequência 5'-X-CG-Y-3' em que X tem zero, um ou dois nucleótidos e Y tem 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 ou mais do que 15 nucleótidos de comprimento. Numa concretização, a sequência 5'-X-CG-Y-3' está numa parte 5' do CIC, e.g., a posição 5 linha do CIC. Numa concretização, o CIC contém 2, 3 ou mais partes de ácido nucleico com uma sequência com a fórmula de sequência 5'-X- 40 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ CG-Y-3'. Por exemplo, numa concretização, todas as partes de ácido nucleico do CIC têm sequências com a fórmula de sequência 5'-X-CG-Y-3'.
Similarmente um CIC incluindo a sequência TCGA (e.g., uma sequência incluindo TCGACGT) numa parte de ácido nucleico tem actividade de imunomodulação e é eficaz em indução de IFN-oí. Um TCGA (e.g., uma sequência incluindo TCGACGT) numa parte 5 linha, e.g., na posição 5 linha da parte 5 linha, torna o CIC particularmente activo. Consultar exemplos 38 e 49. Assim, numa concretização, um CIC compreende a estrutura nuclear com a fórmula (5' -Ni-3' )-Si-N2 (Ia) em que Ni tem a sequência 5'-TCGAX-3' e X tem 0 a 20 bases de nucleótidos, frequentemente 0 a 3 bases. Numa concretização, X é CGT. A sequência TCGTCGA é também particularmente eficaz na indução de IFN-a.
Adicionalmente, a presença de extremidades 5' de ácido nucleico livres (não conjugadas) pode afectar a actividade de imuno-estimulação. Consultar, e.g., exemplo 39. Em várias concretizações, um CIC do invento contém pelo menos 1, pelo menos 2, pelo menos 3, pelo menos 4 ou pelo menos 5 extremidades 5' livres. Em algumas concretizações, o número de extremidades 5' livres é de 1 a 10, de 2 a 6, de 3 a 5 ou de 4-5. Numa concretização, o número de extremidades 5' livres é pelo menos cerca de 50 ou pelo menos cerca de 100. D. "Actividade de imunomodulação isolada"
Uma propriedade de uma parte de ácido nucleico é a "actividade de imunomodulação isolada" associada à sequência de nucleótido da parte de ácido nucleico. Tal como salientado anteriormente, os presentes inventores verificaram surpreendentemente que os CIC apresentam actividade de imunomodulação mesmo quando nenhuma das partes de ácido nucleico do CIC tem uma sequência que, quando apresentada como um polinucleótido sozinho, apresente actividade de imunomodulação comparável.
Em algumas concretizações, uma parte de ácido nucleico de um CIC não tem "actividade de imunomodulação isolada" ou tem "actividade de imunomodulação isolada inferior" (i.e., quando comparada ao CIC), tal como descrito seguidamente. 41 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ A "actividade de imunomodulação isolada" de uma parte de ácido nucleico é determinada pela medição da actividade de imunomodulação de um polinucleótido isolado com a sequência primária da parte de ácido nucleico e com o mesmo esqueleto de ácido nucleico (e.g., fosforotiolato, fosfodiéster, quiméricas). Por exemplo, um CIC com a estrutura "5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'" contém três partes de ácido nucleico. Para determinar a actividade de imunomodulação independente, por exemplo, da primeira parte de ácido nucleico no CIC, sintetiza-se um polinucleótido de ensaio com a mesma sequência (i.e., 5'-TCGTCG-3') e a mesma estrutura de esqueleto (e.g., fosforotiolato) utilizando métodos de rotina e mede-se a sua actividade de imunomodulação (caso exista). A actividade de imunomodulação pode ser determinada utilizando ensaios padrão que indicam vários aspectos da resposta imunitária, tal como os descritos anteriormente em §2. Preferentemente utiliza-se o ensaio de PMBC humanas descrito anteriormente em §2. Tal como discutido anteriormente, para ter em consideração a variação dos dadores, tipicamente o ensaio é efectuado utilizando células obtidas de múltiplos dadores. Um polinucleótido não tem actividade de imunomodulação (e a parte de ácido nucleico correspondente não tem "actividade de imunomodulação isolada") quando a quantidade de IFN-γ excretada pelas PBMC em contacto com o polinucleótido não é significativamente maior (e.g., menos do que cerca de 2 vezes maior) na maioria dos dadores do que na ausência do composto de ensaio ou (em algumas concretizações) na presença de um composto de controlo inactivo (e.g., 5'-TGACTGTGAACCTTAGAGATGA-3' (SEQ ID NO:3).)
Para comparar a actividade de imunomodulação de um CIC e de um polinucleótido isolado, mede-se a actividade de imunomodulação, preferentemente utilizando o ensaio de PBMC humanas descrito anteriormente em §2. Usualmente compara-se a actividade de dois compostos, ensaiando-os em paralelo nas mesmas condições (e.g., utilizando as mesmas células), usualmente a uma concentração de cerca de 20 yg/ml. Tal como salientado anteriormente, tipicamente a concentração é determinada por medição da absorvância a 260 nm e utilizando a conversão 0,5 DC>26o/ml= 20 pg/ml. Tal normaliza a quantidade 42 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ de ácido nucleico total na amostra de ensaio. Alternativamente pode medir-se a concentração ou peso por outros métodos conhecidos na especialidade. Caso se pretenda, a quantidade de parte de ácido nucleico pode ser determinada por medição da absorvância a 260 e o peso do CIC calculado utilizando a fórmula molecular do CIC. Este método é utilizado por vezes quando a razão entre o peso contribuído pela(s) parte (s) espaçadora(s) e o peso contribuído pelas partes de ácido nucleico num CIC é elevada (i.e., superior a D ·
Alternativamente pode utilizar-se uma concentração de 3 μΜ, particularmente quando os pesos moleculares calculados das duas amostras em comparação diferem mais de 20%.
Uma parte de ácido nucleico de um CIC é caracterizada como tendo "actividade de imunomodulação inferior" quando o polinucleótido de ensaio tem menos actividade do que o CIC ao qual se compara. Preferentemente a actividade de imunomodulação isolada do polinucleótido de ensaio não é mais do que cerca de 50% da actividade do CIC, mais preferentemente não mais do que cerca de 20%, com a maior preferência não mais do que cerca de 10% da actividade do CIC ou, em algumas concretizações, ainda menos.
Para CIC com múltiplas partes de ácido nucleico (e.g., múltiplas diferentes), também é possível determinar a actividade de imunomodulação (caso exista) de uma mistura de polinucleótidos de ensaio correspondentes às múltiplas partes de ácido nucleico. O ensaio pode ser efectuado utilizando uma quantidade total de polinucleótido de ensaio (i.e., na mistura) que é igual à quantidade do CIC utilizado. Alternativamente, uma quantidade de cada polinucleótido de ensaio, ou de cada polinucleótido de ensaio diferente, na mistura pode ser igual à quantidade do CIC no ensaio. Tal como salientado em §2, para ter em consideração a variação de dadores, utilizam-se preferentemente PBMC de múltiplos dadores para ensaios e análise.
Numa concretização, uma ou mais (e.g., pelo menos cerca de 2, pelo menos cerca de 4 ou pelo menos cerca de 25%, pelo menos cerca de 50% ou todas, medidas individualmente ou 43 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ alternativamente em combinação) das partes de ácido nucleico num CIC não têm actividade de imunomodulação isolada. Numa concretização, uma ou mais (e.g., pelo menos cerca de 2, pelo menos cerca de 4 ou pelo menos cerca de 25%, pelo menos cerca de 50% ou todas, medidas individualmente ou alternativamente em combinação) têm actividade de imunomodulação isolada inferior comparativamente ao CIC.
Numa concretização relacionada, um CIC compreende uma ou mais partes de ácido nucleico com actividade de imunomodulação isolada. Por exemplo, em algumas concretizações, todas ou quase todas (e.g., pelo menos 90%, preferentemente pelo menos 95%) as partes de ácido nucleico têm actividade de imunomodulação isolada. Por exemplo, um CIC compreendendo espaçador(es) multivalente(s) pode compreender mais do que 4, frequentemente mais do que 10, frequentemente pelo menos cerca de 20, pelo menos cerca de 50, pelo menos cerca de 100, pelo menos cerca de 400 ou pelo menos cerca de 1000 partes de ácido nucleico (e.g., pelo menos cerca de 2500) com actividade de imuno-estimulação isolada.
Assim, num CIC especifico, o número de partes de ácido nucleico que têm actividade de imunomodulação isolada pode ser zero (0), um (1), 2 ou mais, 3 ou mais, menos do que 3, 4 ou mais, menos do que 4, 5 ou mais, menos do que 5, pelo menos 10, pelo menos cerca de 20, pelo menos cerca de 50, pelo menos cerca de 100, pelo menos cerca de 400 ou pelo menos cerca de 1000, todas ou menos do que todas as partes de ácido nucleico do CIC. E. Estrutura da parte de ácido nucleico
Uma parte de ácido nucleico de um CIC pode conter modificações estruturais relativamente a ácidos nucleicos de ocorrência natural. As modificações incluem qualquer conhecida na especialidade para polinucleótidos, modificações do grupo 3'OH ou 5'OH, modificações da base do nucleótido, modificações do componente de açúcar e modificações do grupo fosfato, não se lhes limitando. Descrevem-se seguidamente várias tais modificações. 44 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ A parte de ácido nucleico pode ser ADN, ARN ou ADN/ARN misto, em cadeia simples, em cadeia dupla ou parcialmente em cadeia dupla e pode conter outros polinucleótidos modificados. Abrangem-se partes de ácido nucleico em cadeia dupla e CIC e a menção de uma expressão "base" ou "nucleótido" pretende abranger pares de bases ou nucleótidos com bases emparelhadas, salvo indicação em contrário. Uma parte de ácido nucleico pode conter bases de ocorrência natural ou bases de ocorrência não natural modificadas e podem conter açúcar, fosfato e/ou terminais modificados. Por exemplo, as modificações de fosfato incluem metilfosfonato, fosforotiolato, fosforamidato (em ponte ou não em ponte), fosfotriéster e fosforoditiolato, não se lhes limitando, e podem ser utilizados em qualquer combinação. Podem também ser utilizadas outras ligações não fosfato. Preferentemente, os CIC e partes de ácido nucleico do presente invento compreendem esqueletos de fosforotiolato. Também se podem fazer modificações de açúcar conhecidas na especialidade, tal como análogos 2'-alcoxi-ARN, análogos 2'-amino-ARN e quimeras 2'-alcoxi-ARN/ADN ou amino-ARN/ADN e outras aqui descritas e combinadas com qualquer modificação de fosfato. Os exemplos de modificações de base (discutidas adicionalmente em seguida) incluem adição de uma parte atractora de densidade electrónica em C-5 e/ou C-β de uma citosina (e.g., 5-bromocitosina, 5-clorocitosina, 5-fluorocitosina, 5-iodocitosina) e C-5 e/ou C-β de um uracilo (e.g., 5-bromouracilo, 5-clorouracilo, 5-fluorouracilo, 5-iodouracilo), não se lhes limitando. Consultar, por exemplo, pedido PCT N° WO 99/62923. A parte de ácido nucleico pode também conter nucleótidos com fosfato modificado. É também conhecida na especialidade a síntese de ácidos nucleicos contendo ligações fosfato modificadas ou ligações não fosfato. Para uma revisão, consultar Matteucci (1997) "Oligonucleotide Analogs: an OverView" em Oligonucleotides as Therapeutic Agents, (D.J. Chadwick e G. Cardew, ed.) John Wiley and Sons, New York, NY. O derivado de fósforo (ou grupo fosfato modificado) que pode ser ligado à parte de açúcar ou de análogo de açúcar nos ácidos nucleicos do presente invento pode ser um monofosfato, difosfato, trifosfato, alquilofosfonato, fosforotiolato, fosforoditiolato, fosforamidato ou semelhantes. A preparação 45 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ dos análogos de fosfato supracitados e a sua incorporação em nucleótidos, nucleótidos modificados e oligonucleótidos, é só por si conhecida e não é necessário descrevê-la aqui detalhadamente. Peyrottes et al. (1996) Nucleic Acids Res. 24:1841-1848; Chaturvedi et al. (1996) Nucleic Acids Res. 24:2318-2323; e Schultz et al. (1996) Nucleic Acids Res. 24:2966-2973. Por exemplo, a síntese de oligonucleótidos fosforotiolato é semelhante à descrita anteriormente para oligonucleótidos de ocorrência natural, excepto que a etapa de oxidação é substituída por uma etapa de sulfurização (Zon (1993) "Oligonucleoside Phosphorothioates" em Protocols for Oligonucleótides and Analogs, Synthesis and Properties (Agrawal, ed.) Humana Press, p. 165-190). De igual modo, a síntese de outros análogos de fosfato, tal como fosfotriéster (Miller et al. (1971) JACS 93:6657-6665), fosforamidatos não em ponte (Jager et al. (1988) Biochem. 27:7247-7246), N3' a P5' fosforamidatos (Nelson et al. (1997) JOC 62:7278-7287) e f osf orodit iolatos (patente U.S. N° 5 453 496) também foi descrita. Também podem ser utilizados outros ácidos nucleicos modificados mas não no fósforo (Stirchak et al. (1989) Nucleic Acids Res. 17:6129-6141). Os ácidos nucleicos com esqueletos de fosforotiolato parecem ser mais resistentes a degradação após injecção no hospedeiro. Braun et al. (1988) J. Immunol. 141:2084-2089; e Latimer et al. (1995) Mol. Immunol. 32:1057-1064.
As partes de ácido nucleico utilizadas no invento podem compreender ribonucleótidos (contendo ribose como o único ou o principal componente de açúcar) e/ou desoxirribonucleótidos (contendo desoxirribose como o principal componente de açúcar). Os açúcares modificados ou análogos de açúcar podem ser incorporados na parte de ácido nucleico. Assim, além de ribose e desoxirribose, a parte de açúcar pode ser pentose, desoxipentose, hexose, desoxi-hexose, glucose, arabinose, xilose, lixose e um grupo ciclopentilo "análogo" de açúcar. O açúcar pode encontrar-se numa forma piranosilo ou furanosilo. A parte de açúcar é preferentemente o furanosídeo de ribose, desoxirribose, arabinose ou 2'-0-alquilorribose e o açúcar pode ser ligado às respectivas bases heterocíclicas na configuração anomérica α ou β. As modificações de açúcar incluem análogos 2'-alcoxi-ARN, análogos 2'-amino-ARN e quimeras 2'-alcoxi-ARN/ADN ou amino-ARN/AND, não se lhes 46 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ limitando. Por exemplo, uma modificação de açúcar no CIC inclui 2'-amino-2'-desoxiadenosina, não se lhe limitando. A preparação destes açúcares ou análogos de açúcar e os respectivos "nucleósidos" em que tais açúcares ou análogos se encontram ligados a uma base heterocíclica (base de ácido nucleico) é por si só conhecida e não é necessário descrevê-la aqui, excepto quando tal preparação possa estar relacionada com qualquer exemplo específico. Também podem ser feitas modificações de açúcar e combinadas com qualquer modificação de fosfato na preparação de um CIC.
As bases heterociclicas ou bases de ácido nucleico que são incorporadas na parte de ácido nucleico podem ser as bases principais purina e pirimidina de ocorrência natural, (nomeadamente uracilo, timina, citosina, adenina e guanina, tal como mencionado anteriormente) , bem como modificações de ocorrência natural e modificações sintéticas das referidas bases principais.
Os peritos na especialidade reconhecerão que se encontram disponíveis na especialidade um elevado número de nucleósidos "sintéticos" não naturais compreendendo várias bases heterociclicas e várias partes de açúcar (e análogos de açúcar) e, desde que os outros critérios do presente invento sejam cumpridos, a parte de ácido nucleico pode incluir uma ou várias bases heterociclicas diferentes das cinco bases principais componentes de ácido nucleicos de ocorrência natural. Preferentemente, no entanto, a base heterocíclica é, sem limitação, grupos uracil-5-ilo, citosin-5-ilo, adenin-7-ilo, adenin-8-ilo, guanin-7-ilo, guanin-8-ilo, 4-aminopirrolo [2.3 —d]pirimidin-5-ilo, 2-amino-4-oxopirolo[2,3 —d]pirimidin-5-ilo ou 2-amino-4-oxopirrolo[2.3-d]pirimidin-3-ilo, em que as purinas se encontram ligadas à parte de açúcar da parte de ácido nucleico através da posição 9, as pirimidinas através da posição 1, as pirrolopirimidinas através da posição 7 e as pirazolopirimidinas através da posição 1. A parte de ácido nucleico pode compreender pelo menos uma base modificada. Tal como aqui utilizada, a expressão "base modificada" é sinónimo de "análogo de base", por exemplo, "citosina modificada" é sinónimo de "análogo de citosina". De igual modo, os nucleósidos ou nucleótidos "modificados" são 47 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ aqui definidos como sinónimos de "análogos" de nucleósido ou nucleótido. Os exemplos de modificações de base incluem adição de uma parte atractora de densidade electrónica em C-5 e/ou C-6 de uma citosina da parte de ácido nucleico, não se lhes limitando. Preferentemente, a parte atractora de densidade electrónica é um halogénio. Tais citosinas modificadas podem incluir azacitosina, 5-bromocitosina, 5-clorocitosina, citosina clorada, ciclocitosina, citosina arabinosideo, 5-fluorocitosina, fluoropirimidina, 5,6-di-hidrocitosina, 5-iodocitosina, 5-nitrocitosina e qualquer outra análogo de pirimidina ou pirimidina modificada, não se lhes limitando. Outros exemplos de modificações de base incluem adição de uma parte atractora de densidade electrónica a C-5 e/ou C-6 de uracilo da parte de ácido nucleico, não se lhes limitando. Preferentemente, a parte atractora de densidade electrónica é um halogénio. Tais uracilos modificados podem incluir5-bromouracilo, 5-clorouracilo, 5-fluorouracilo, 5-iodouracilo, não se lhes limitando. Consultar também, Kandimalla et al., 2001, Bioorg. Med. Chem. 9:807-13.
Outros exemplos de modificações de base incluem a adição de um ou mais grupos tiol à base incluindo 6-tio-guanina, 4-tio-timina e 4-tio-uracilo, não se lhes limitando. A preparação de nucleósidos com bases modificadas e a síntese de oligonucleótidos modificados utilizando os referidos nucleósidos com bases modificadas como precursores foi descrita, por exemplo, em patentes U.S. 4 910 300, 4 948 882 e 5 093 232. Conceberam-se estes nucleósidos com bases modificadas de modo a poderem ser incorporados por síntese química quer em posições terminais, quer em posições internas de um oligonucleótido. Tais nucleósidos com bases modificadas, presentes quer em posições terminais, quer em posições internas de um oligonucleótido, podem servir como locais para ligação de um péptido ou de outro antigénio. Os nucleósidos modificados na sua parte de açúcar foram também descritos (incluindo e.g., patentes U.S. 4 849 513, 5 015 733, 5 118 800, 5 118 802, não se lhes limitando) e podem ser utilizados similarmente. 48 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 4. Partes espaçadoras que não sao ácido nucleico
Os compostos CIC do invento compreendem uma ou mais partes espaçadoras que não são de ácido nucleico ligadas covalentemente às partes de ácido nucleico. Por conveniência, as partes espaçadoras que não são de ácido nucleico são por vezes aqui denominadas simplesmente como "espaçadores" ou "partes espaçadoras".
Os espaçadores têm geralmente um peso molecular de cerca de 50 a cerca de 500 000 (e.g. cerca de 50 a cerca de 50 000), por vezes desde cerca de 75 a cerca de 5000, por vezes desde cerca de 75 a cerca de 500, e estão ligados covalentemente, em várias concretizações, a uma, duas, três ou mais do que três partes de ácido nucleico. Vários agentes são adequados para ligar partes de ácido nucleico. Por exemplo, uma variedade de compostos denominados na literatura cientifica como "ligantes que não são de ácido nucleico", "ligantes não nucleotídicos" ou "moléculas de plataforma de valência" podem ser utilizados como espaçadores num CIC. Diz-se que a parte espaçadora compreende um determinado componente espaçador (e.g., hexa-etilenoglicol) quando o espaçador inclui o componente (ou um derivado substituído) como uma subunidade ou parte do espaçador. Por exemplo, o espaçador apresentado no exemplo 49 pode ser descrito como compreendendo um componente de polissacárido, um componente de hexa-etilenoglicol e um componente de ligante tioéter derivatizado. Tal como descrito seguidamente, em determinadas concretizações, um espaçador compreende múltiplas subunidades ligadas covalentemente e pode ter uma estrutura homopolimérica ou heteropolimérica. Frequentemente, as subunidades estão ligadas por um ligante, ligação fosfodiéster e/ou ligação de éster fosforotiolato. Consultar os exemplos, seguintes. As partes espaçadoras que não são nucleótido de um CIC compreendendo ou derivadas de tais unidades múltiplas podem ser denominadas "compostos espaçadores". Numa concretização, para fins de ilustração e não se lhes limitando, o CIC contém um composto espaçador compreendendo quaisquer dois ou mais (e.g., 3 ou mais, 4 ou mais ou 5 ou mais) dos seguintes compostos com ligação fosfodiéster e/ou ligação de éster fosforotiolato: unidade de oligoetilenoglicol (e.g., espaçador trietilenoglicol; 49 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ espaçador hexa-etilenoglicol); unidade alquilo (e.g., espaçador propilo; espaçador butilo; espaçador hexilo) ; espaçador ramificado (e.g., espaçador 2-(hidroximetil)etilo; espaçador glicerol; espaçador triplo; espaçador duplo simétrico).
Considerar-se-á que os mononucleótidos e polinucleótidos não se incluem na definição de espaçadores que não são de ácido nucleico, dado que sem esta exclusão não haveria qualquer diferença entre a parte de ácido nucleico e uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico adjacente.
Descrevem-se aqui vários espaçadores, para fins ilustrativos e não se lhes limitando. 0 leitor considerará que, por conveniência, uma parte espaçadora (ou componente de uma parte espaçadora) é por vezes denominada pelo nome quimico do composto (e.g., hexaetilenoglicol) do qual é derivada a parte espaçadora ou componente, com o entendimento que o CIC na realidade contém o conjugado do(s) composto(s) com partes de ácido nucleico. Tal como será entendido pelo perito na especialidade (e tal como descrito em maior detalhe aqui seguidamente), o espaçador que não é ácido nucleico pode ser (e usualmente é) formado a partir de parte(s) espaçadora(s) precursora(s) que incluem grupos reactivos para permitir acoplamento de um ou mais ácidos nucleicos (e.g., oligonucleótidos) ao precursor de parte espaçadora para formar o CIC e podem incluir-se grupos protectores. Os grupos reactivos no precursor de espaçador podem ser iguais ou diferentes.
Os exemplos de espaçadores que não são de ácido nucleico compreendem oligo-etilenoglicol (e.g., espaçadores trietilenoglicol, tetraetilenoglicol, hexaetilenoglicol e outros polímeros compreendendo até cerca de 10, cerca de 20, cerca de 40, cerca de 50, cerca de 100 ou cerca de 200 unidades etilenoglicol), espaçadores alquilo (e.g., propilo, butilo, hexilo e outros espaçadores alquilo C2 - C12, e.g., usualmente alquilo C2 - CIO, mais frequentemente alquilo C2 -C6), espaçadores simétricos ou assimétricos derivados de glicerol, penta-eritritol, 1,3,5-tri-hidroxiciclo-hexano ou 1,3-diamino-2-propanol (e.g., partes espaçadoras duplas e triplas simétricas aqui descritas). Opcionalmente, estes 50 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ componentes espaçadores são substituídos. Por exemplo, tal como será entendido por um perito na especialidade, pode substituir-se glicerol e 1,3-diamino-2-propanol na posição 1, 2 e/ou 3 (e.g., substituição de um ou mais hidrogénios ligados a carbono por um dos grupos listados seguidamente). Similarmente pode substituir-se penta-eritritol em qualquer ou em todas as posições metileno com qualquer dos grupos descritos seguidamente. Os substituintes incluem álcool, alcoxi (tal como metoxi, etoxi e propoxi), alquilo de cadeia linear ou ramificada (tal como alquilo C1-C12), amina, aminoalquilo (tal como aminoalquilo C1-C12), fosforamidite, fosfato, fosforamidato, fosforoditiolato, tiofosfato, hidrazida, hidrazina, halogénio, (tal como F, Cl, Br ou I), amida, alquilamida (tal como alquilamida C1-C12), ácido carboxílico, éster carboxílico, anidrido carboxílico, halogeneto de ácido carboxílico, éter, halogeneto de sulfonilo, éster imidato, isocianato, isotiocianato, haloformato, aducto de carbodiimida, aldeídos, cetona, sulfidrilo, haloacetilo, halogeneto de alquilo, sulfonato de alquilo, NR1R2 em que R1R2 é -C(=0)CH=CHC(=0) (maleimida), tioéter, ciano, açúcar (tal como manose, galactose e glucose), carbonilo a,β-insaturado, alquilo de mercúrio, sulfona a,β-insaturada.
Numa concretização, um espaçador pode compreender um ou mais nucleótidos abásicos (i.e., sem uma base de nucleótido, mas com as partes açúcar e fosfato). Os exemplos de nucleótidos abásicos incluem 1'2'-didesoxirribose, 1'-desoxirribose, 1'-desoxarabinose e seus polímeros.
Os espaçadores podem compreender oligómeros e polímeros heteroméricos ou homoméricos das componentes que não são ácido nucleico aqui descritas (e.g., ligados por uma ligação fosfodiéster ou fosforotiolato ou alternativamente uma ligação amida, éster, éter, tioéter, dissulfureto, fosforamidato, fosfotriéster, fosforoditiolato, metilfosfonato ou outra). Por exemplo, numa concretização, a parte espaçadora contém um componente espaçador ramificado (e.g., glicerol) conjugado através de uma ligação fosfodiéster ou fosforotiolato a um oligoetilenoglicol, tal como HEG (consultar, e.g., C-94). Outro exemplo é um espaçador compreendendo uma componente de espaçador multivalente conjugada a um oligoetilenoglicol, tal como HEG. 51 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Outros espaçadores adequados compreendem alquilo substituído, poliglicol substituído, poliamina opcionalmente substituída, poliálcool opcionalmente substituído, poliamida opcionalmente substituída, poliéter opcionalmente substituído, poliimina opcionalmente substituída, polifosfodiéster (tal como poli(1-fosfo-3-propanol) opcionalmente substituído e semelhantes. Os substituintes opcionais incluem álcool, alcóxi (tal como metóxi, etóxi e propóxi), alquilo de cadeia linear ou ramificada (tal como alquilo C1-C12), amina, aminoalquilo (tal como aminoalquilo C1-C12), fosforamidite, fosfato, tiofosfato, hidrazida, hidrazina, halogénio (tal como F, Cl, Br ou I), amida, alquilamida (tal como alquilamida C1-C12), ácido carboxilico, éster carboxilico, anidrido carboxilico, halogeneto de ácido carboxilico, éter, halogeneto de sulfonilo, éster imidato, isocianato, isotiocianato, haloformato, aducto carbodiimida, aldeídos, cetona, sulfidrilo, haloacetilo, halogeneto de alquilo, sulfonato de alquilo, NR1R2 em que R1R2 é -C(=0)CH=CHC(=0) (maleimida), tioéter, ciano, açúcar (tal como manose, galactose e glucose), carbonilo a,β-insaturado, alquilo de mercúrio, sulfona α,β-insaturada.
Outros espaçadores adequados podem compreender moléculas policiclicas, tal como as que contêm anéis fenilo ou ciclo-hexilo. 0 espaçador pode ser um poliéter, tal como polifosfopropanodiol, polietilenoglicol, polipropilenoglicol, uma molécula policíclica bifuncional tal como um pentaleno, indeno, naftaleno, azuleno, heptaleno, bifenileno, asimindaceno, sim-indaceno, acenaftileno, fluoreno, fenaleno, fenantreno, antraceno, fluoranteno, acefenatrileno, aceantrileno, trifenileno, pireno, criseno, naftaceno, tiantreno, isobenzofurano, cromeno, xanteno, fenoxatiina bifuncionais, que podem ser substituídos ou modificados, ou uma combinação dos poliéteres e das moléculas policiclicas. A molécula policíclica pode ser substituída ou polissubstituída com grupo alquilo C1-C5, alquilo C6, alcenilo, hidroxialquilo, halogénio ou haloalquilo. As moléculas poli-heterociclicas contendo azoto (e.g., indolizina) não são tipicamente espaçadores adequados. Os espaçadores podem ser também um poliálcool, tal como glicerol ou penta-eritritol. Numa concretização, o espaçador compreende (1-fosfopropano)3- 52 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ fosfato ou (1-fosfopropano)4-fosfato (também denominado tetrafosfopropanodiol e pentafosfopropanodiol). Numa concretização, o espaçador contém 2,2'-etileno-dioxidietilamina (EDDA) derivatizada.
Outros exemplos de espaçadores que não são ácido nucleico úteis nos CIC incluem "ligantes" descritos por Cload e Schepartz, J. Am. Chem. Soc. (1991), 113:6324; Richardson e Schepartz, J. An. Chem. Soc. (1991), 113:5109; Ma et al., Nucleic Acids Research (1993), 21:2585; Ma et al., Biochemistry (1993), 32:1751; McCurdy et al., Nucleosides & Nucleotides (1991), 10:287; Jaschke et al., Tetrahedron Lett. (1993), 34:301; Ono et al., Biochemistry (1991), 30:9914; e Arnold et al., publicação internacional N° WO 89/02439 e EP0313219B1 intitulada "Non-nucleic acid Linking Reagents for Nucleotide Probes", ligantes descritos por Salunkhe et al., J. An. Chem. Soc. (1992), 114:8768; Nelson et al., Biochemistry 35:5339-5344 (1996); Bartley et al., Biochemistry 36:14502-511 (1997); Dagneaux et al. Nucleic Acids Research 24:4506-12 (1996); Durand et al., Nucleic Acids Research 18:6353-59 (1990); Reynolds et al., Nucleic Acids Research, 24:760-65 (1996); Hendry et al. Biochemica et Biophysica Acta, 1219:405-12 (1994); Altmann et al., Nucleic Acids Research, 23:4827-35 (1995) e patente U.S. N° 6 117 657 (Usman et al.).
As partes espaçadoras adequadas podem conferir carga e/ou hidrofobicidade ao CIC, conferir propriedades farmacocinéticas favoráveis (e.g., estabilidade melhorada, maiores tempos de residência no sangue) ao CIC e/ou resultar em direcção do CIC a determinadas células ou órgãos alvo. As partes espaçadoras podem ser seleccionadas ou modificadas de modo a ajustar o CIC para propriedades farmacocinéticas pretendidas, indução de uma determinada resposta imunitária ou adequação a modos de administração pretendidos (e.g., administração oral).
Num CIC compreendendo mais do que uma parte espaçadora, os espaçadores podem ser iguais ou diferentes. Assim, numa concretização, todas as partes espaçadoras que não são de ácido nucleico num CIC têm a mesma estrutura. Numa concretização, um CIC contém partes espaçadoras que não são 53 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ de ácido nucleico com pelo menos 2, pelo menos 3, pelo menos 4, pelo menos 5 ou pelo menos 6 ou mais estruturas diferentes.
Em algumas concretizações do invento abrangidas, a parte espaçadora de um CIC é definida para excluir determinadas estruturas. Assim, em algumas concretizações do invento, um espaçador é diferente de um nucleótido abásico ou polímero de nucleótidos abásicos. Em algumas concretizações do invento, um espaçador é diferente de um oligo(etilenoglicol) (e.g., HEG, TEG e semelhantes) ou poli(etilenoglicol). Em algumas concretizações, um espaçador é diferente de um espaçador alquilo C3. Em algumas concretizações um espaçador é diferente de um alquilo ou de um espaçador substituído. Em algumas concretizações, um espaçador é diferente de um polipéptido. Assim, em algumas concretizações, uma molécula imunogénica, e.g., uma proteína ou polipéptido, não é adequada como um componente de partes espaçadoras. No entanto, tal como discutido seguidamente, abrange-se que em determinadas concretizações, um CIC é um "CIC proteáceo" i.e. compreendendo uma parte espaçadora compreendendo um polipéptido (i.e., oligómero ou polímero de aminoácidos). Por exemplo, tal como discutido seguidamente, em algumas concretizações, pode utilizar-se um antigénio polipeptídico como uma plataforma (espaçador multivalente) à qual estão conjugadas várias partes de ácido nucleico. No entanto, em algumas concretizações, a parte espaçadora não é proteácea e/ou não é um antigénio (i.e., a parte espaçadora, quando isolada do CIC, não é um antigénio).
As partes espaçadoras adequadas não tornam o CIC, do qual são um componente, insolúvel em solução aquosa (e.g., PBS, pH 7,0). Assim, a definição de espaçadores exclui microtransportadores ou nanotransportadores. Adicionalmente, não se prefere uma parte espaçadora que tenha baixa solubilidade, tal como um espaçador dodecilo (solubilidade <5 mg/ml quando medida como um precursor diálcool 1,12-di-hidroxidodecano) porque pode reduzir a hidrofilicidade e actividade do CIC. Preferentemente, as partes espaçadoras têm solubilidade muito superior a 5 mg/ml (e.g., solubilidade de pelo menos cerca de 20 mg/ml, pelo menos cerca de 50 mg/ml ou pelo menos cerca de 100 mg/ml), e.g., quando medida como 54 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ precursores diálcool. A forma da parte espaçadora utilizada para ensaiar a sua solubilidade em água é geralmente a molécula do seu precursor de espaçador mais semelhante inactivado e desprotegido. Por exemplo, C-19 contém uma parte espaçadora incluindo um grupo dodecilo com ligações diéster fosforotiolato nas posições C-l e C-12, ligando assim a parte espaçadora às partes de ácido nucleico. Neste caso, a solubilidade em água da versão diálcool do espaçador dodecilo, 1,12-di-hidroxidodecano, foi ensaiada e verificou-se que é inferior a 5 mg/ml. Os espaçadores com elevada solubilidade em água, quando ensaiados como os seus precursores diálcool, resultaram em CIC mais imuno-estimulantes. Estes espaçadores com maior solubilidade em água incluem, entre outros, propano-1,3-diol; glicerol; butano-1,4-diol; pentano-1,5-diol; hexano-1,6-diol; trietilenoglicol, tetraetilenoglicol e HEG. A. Partes espaçadoras carregadas e multi-unidade A carga de um CIC pode ser proveniente de fosfato, tiofosfato ou outros grupos nas partes de ácido nucleico, bem como grupos nas partes espaçadoras que não são de ácido nucleico. Em algumas concretizações do invento, uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico tem uma carga global não nula (e.g., uma carga global positiva ou uma carga global negativa, quando medida a pH 7) . Numa concretização útil, o CIC tem uma carga global negativa. Em algumas concretizações, aumenta-se a carga negativa de uma parte espaçadora num CIC por derivatização de uma subunidade de espaçador aqui descrita para aumentar a sua carga. Por exemplo, pode ligar-se covalentemente glicerol a duas partes de ácido nucleico e pode fazer-se reagir o álcool remanescente com uma fosforamidite activada, seguido por oxidação ou sulfurização para formar um fosfato ou tiofosfato, respectivamente. Em determinadas concretizações a carga negativa proveniente das partes espaçadoras que não são de ácido nucleico num CIC (i.e., a soma das cargas quando existe mais do que um espaçador) é superior à carga negativa proveniente das partes de ácido nucleico do CIC. A carga pode ser calculada com base na fórmula molecular ou determinada experimentalmente, e.g., por electroforese capilar (Li, ed., 1992, Capillary Electrophoresis, Principies, Practice and Application 55 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Elsevier Science Publishers, Amsterdam, The Netherlands, p. 202-206).
Tal como referido anteriormente, os espaçadores adequados podem ser polímeros de compostos que não são ácido nucleico (e.g., que não são nucleótidos) mais pequenos, tal como os aqui descritos, que são eles próprios úteis como espaçadores, incluindo compostos usualmente aqui denominados "ligantes" que não são nucleótidos. Tais polímeros (i.e., "espaçadores multi-unidade") podem ser heteroméricos ou homoméricos e compreendem frequentemente unidades monoméricas (e.g., HEG, TEG, glicerol, 1'2'-didesoxirribose e semelhantes) ligadas por uma ligação éster (e.g., fosfodiéster ou éster fosforotiolato). Assim, numa concretização, o espaçador contém uma estrutura polimérica (e.g., heteropolimérica) de unidades que não são nucleótido (e.g., de 2 a cerca de 100 unidades, alternativamente 2 a cerca de 50, e.g., 2 a cerca de 5, alternativamente e.g., cerca de 5 a cerca de 50, e.g., cerca de 5 a cerca de 20).
Para fins ilustrativos, os CIC contendo espaçadores multi-unidade incluem
5' -TCGTCG- (C3) 15-T
5' -TCGTCG- (glicerol) 15-T
5'-TCGTCG-(TEG)8-T
5'-TCGTCG-(HEG)4-T em que (C3)is significa 15 ligantes propilo ligados através de ésteres fosforotiolatos; (glicerol) i5 significa 15 ligantes glicerol ligados através de ésteres fosforotiolatos; (TEG)s significa 8 ligantes trietilenoglicol ligados através de ésteres fosforotiolatos; e (HEG)4 significa 4 ligantes hexa-etilenoglicol ligados através ésteres fosforotiolatos. Considerar-se-á que determinados espaçadores multi-unidade têm uma carga global negativa e que a carga negativa pode ser aumentada por aumento do número de e.g., unidades monoméricas ligadas por éster. 56 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Β. Parte espaçadora multivalente
Em determinadas concretizações, uma parte espaçadora é uma parte espaçadora multivalente que não é de ácido nucleico (i.e., um "espaçador multivalente"). Tal como utilizado neste contexto, um CIC contendo um espaçador multivalente contém um espaçador ligado covalentemente a três (3) ou mais partes de ácido nucleico. Os espaçadores multivalentes são por vezes denominados na especialidade como "moléculas de plataforma". Os espaçadores multivalentes podem ser poliméricos ou não poliméricos. Os exemplos de moléculas adequadas incluem glicerol ou glicerol substituído (e.g., 2-hidroxi-metilglicerol, levulinil-glicerol); tetra-aminobenzeno, hepta-aminobetaciclodextrina, 1,3,5-tri-hidroxiciclo-hexano, pentaeritritol e derivados de pentaeritritol, tetra-aminopentaeritritol, 1,4,8,11-tetra-azaciclotetradecano (Cyclam), 1,4,7,10-tetra-azaciclododecano (Cyclen), polietilenoimina, 1,3-diamino-2-propanol e derivados substituídos (e.g., "duplo simétrico"), compostos [propiloximetil]etilo (e.g., "triplo"), derivados de polietilenoglicol tal como os denominados "PEG em estrela" e "bPEG" (consultar, e.g., Gnanou et al., 1988, Makromol. Chem. 189:2885; Rein et al., 1993, Acta Polimer 44:225, Merrill et al., patente U.S. n° 5 171 264; Shearwater Polymers Inc., Huntsville AL), dendrímeros e polissacáridos.
Os dendrímeros são conhecidos na especialidade e são definidos quimicamente como moléculas globulares, geralmente preparadas por reacção em etapas ou repetitiva de monómeros multifuncionais para obter uma estrutura ramificada (consultar, e.g., Tomalia et al., 1990, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 29:138-75). São conhecidos vários dendrímeros, e.g., dendrímeros poliamidoamina, polietilenoimina e polipropilenoimina com terminação de amina. Os exemplos de dendrímeros úteis no presente invento incluem polímeros "em estrela densa" ou polímeros "Starburst". tal como os descritos em patente U.S. N° 4 587 329; 5 338 532; e 6 177 414, incluindo os denominados "dendrímeros poli(amidoamina) ("PAMAM")". Ainda outras moléculas de espaçadores multiméricos adequados para utilização no presente invento incluem moléculas de plataforma de valência quimicamente definidas, não poliméricas tal como as divulgadas em patente 57 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ U.S. 5 552 391; e pedidos PCT PCT/US00/15968 (publicado como WO 00/75105); PCT/US96/09976 (publicado como WO 96/40197), PCT/US 9 7/10075 (publicado como WO 97/46251); PCT/US94/10031 (publicado como WO 95/07073); e PCT/US99/29339 (publicado como WO 00/34231). Podem utilizar-se muitos outros espaçadores multivalentes adequados que são conhecidos dos peritos na especialidade. A conjugação de uma parte de ácido nucleico a uma molécula de plataforma pode ser efectuada de várias formas, tipicamente envolvendo um ou mais agentes de reticulação e grupos funcionais na parte de ácido nucleico e molécula de plataforma. Adicionam-se grupos de ligação às plataformas utilizando técnicas de sintese química de rotina. Podem adicionar-se os grupos de ligação às partes de ácido nucleico utilizando técnicas sintéticas padrão.
Os espaçadores multivalentes com uma variedade de valências são úteis na prática do invento e em várias concretizações o espaçador multivalente de um CIC está ligado a entre cerca de 3 e cerca de 400 partes de ácido nucleico, por vezes cerca de 100 a cerca de 500, por vezes cerca de 150 a cerca de 250, por vezes 3-200, por vezes de 3 a 100, por vezes de 3-50, frequentemente de 3-10 e por vezes mais do que 400 partes de ácido nucleico. Em várias concretizações, o espaçador multivalente está conjugado a mais do que 10, mais do que 25, mais do que 50, mais do que 100 ou mais do que 500 partes de ácido nucleico (que podem ser iguais ou diferentes). Considerar-se-á que, em determinadas concretizações nas quais um CIC contém um espaçador multivalente, o invento proporciona uma população de CIC com estruturas moleculares ligeiramente diferentes. Por exemplo, quando se prepara um CIC utilizando um dendrímero, polissacárido ou outro espaçador multivalente com uma valência elevada, produz-se uma mistura de moléculas com alguma heterogeneidade, i.e., compreendendo números diferentes (dentro ou predominantemente dentro de uma gama determinável) de partes de ácido nucleico ligadas à parte espaçadora multivalente. Quando se utiliza um dendrímero, polissacárido ou semelhantes como um elemento de um espaçador multivalente, as partes de ácido nucleico podem ser ligadas directa ou indirectamente ao elemento (e.g., dendrímero). Por 58 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ exemplo, um CIC pode compreender partes de ácido nucleico ligadas a um dendrímero através de um elemento oligoetilenoglicol (em que o dendrímero + oligoetilenoglicol constituem a parte espaçadora). Considerar-se-á que as partes de ácido nucleico podem ser conjugadas a mais do que uma parte espaçadora, tal como descrito anteriormente em § III(1)B.
Podem utilizar-se como espaçadores multivalentes em CIC polissacáridos derivatizados para permitir ligação a partes de ácido nucleico. Os polissacáridos adequados podem ser polissacáridos de ocorrência natural ou polissacáridos sintéticos. Os exemplos de polissacáridos incluem, e.g., dextrano, manina, quitosana, agarose e amido. A manina pode ser utilizada, por exemplo, porque existem receptores de manina (manose) em tipos de células revelantes imunologicamente, tal como monócitos e macrófagos alveolares e portanto a parte espaçadora de polissacárido pode ser utilizada para ter como alvo determinados tipos de células. Numa concretização, o polissacárido está reticulado. Um composto adequado é sacarose reticulada com epicloridrina (e.g., FICOLL®) . FICOLL® é sintetizado por reticulação de sacarose com epicloridrina que resulta numa estrutura altamente ramificada. Por exemplo, tal como apresentado no exemplo 49, pode preparar-se aminoetilcarboximetil-ficoll (AECM-Ficoll) pelo método de Inman, 1975, J. Imm. 114:704-709. 0 número de partes de ácido nucleico num CIC compreendendo um polissacárido pode estar na gama aqui descrita para um CIC (e.g., um CIC multivalente). Por exemplo, numa concretização, o polissacárido compreende entre cerca de 150 e cerca de 250 partes de ácido nucleico. Pode fazer-se então reagir AECM-Ficoll com um agente de reticulação heterobifuncional, tal como éster 6-maleimido-capróico acil-N-hidroxisuccinimida e seguidamente conjugado a uma parte de ácido nucleico derivatizada com tiol (consultar Lee, et al., 1980, Mol. Imm. 17:749-56). Podem modificar-se similarmente outros polissacáridos.
5. Síntese de CIC A preparaçao de CIC utilizando métodos de rotina está bem dentro das capacidades dos peritos na especialidade, 59 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ orientados por este fascículo e o conhecimento na especialidade. São conhecidas técnicas para preparar partes de ácido nucleico (e.g., oligonucleótidos e oligonucleótidos modificados). As partes de ácido nucleico podem ser sintetizadas utilizando técnicas incluindo métodos enzimáticos e métodos químicos e combinações de abordagens enzimáticas e químicas, não se lhes limitando. Por exemplo, pode sintetizar-se quimicamente ADN ou ARN contendo ligações fosfodiéster por acoplamento sequencial de nucleósido fosforamidites adequadas ao grupo 5'-hidroxilo do oligonucleótido em crescimento ligado a um suporte sólido pela extremidade 3' , seguido pela oxidação do triéster de fosfito intermediário a um triéster de fosfato. Os suportes sólidos úteis para síntese de ADN incluem vidro de porosidade controlada (Applied Biosystems, Foster City, CA) , matriz de pérolas de poliestireno (Primer Support, Amersham Pharmacia, Piscataway, NJ) e TentGel (Rapp Polymere GmbH, Tubingen, Germany). Uma vez sintetizada a sequência de oligonucleótidos pretendida, remove-se o oligonucleótido do suporte, desprotegem-se os grupos triéster de fosfato a diésteres de fosfato e desprotegem-se as bases de nucleósido utilizando amoníaco aquoso ou outras bases.
Por exemplo, os polinucleótidos de ADN ou ARN (partes de ácido nucleico) contendo ligações fosfodiéster são geralmente sintetizados por iterações repetidas das seguintes etapas: a) remoção do grupo protector do grupo 5'-hidroxilo do nucleósido ou ácido nucleico ligado ao suporte sólido por 3', b) acoplamento de nucleósido fosforamidite activado ao grupo 5'-hidroxilo, c) oxidação do triéster de fosfito ao triéster de fosfato e d) adição de capuz aos grupos 5'-hidroxilo que não reagiram. Prepara-se ADN ou ARN contendo ligações fosforotiolato, tal como descrito anteriormente, excepto a etapa de oxidação ser substituída por uma etapa de sulfurização. Uma vez sintetizada a sequência de oligonucleótidos pretendida, remove-se o oligonucleótido do suporte, desprotegem-se os grupos triéster de fosfato a diésteres de fosfato e desprotegem-se as bases de nucleósido utilizando amoníaco aquoso ou outras bases. Consultar, por exemplo, Beaucage (1993) "Oligodeoxyribonucleotide Synthesis" em PROTOCOLS FOR OLIGONUCLEOTIDES AND ANALOGS, SYNTHESIS AND PROPERTIES (Agrawal, ed.) Humana Press, Totowa, NJ; Warner et 60 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ al. (1984) DNA 3:401; Tang et al. (2000) Org. Process Res. Dev. 4: 194-198; Wyrzykiewica et al. (1994) Bioorg. & Med. Chem. Lett. 4:1519-1522; Radhakrishna et al. (1989) J. Org. Chem. 55:4693-4699 e Patente U.S. N° 4 458 066. Encontram-se largamente disponíveis máquinas programáveis que sintetizam automaticamente partes de ácido nucleico de sequências especificadas. Os exemplos incluem o sintetizador de ADN automatizado Expedite 8909 (Perseptive Biosystem, Framington MA); ABI 394 (Applied Biosystems, Inc., Foster City, CA); e OligoPilot II (Amersham Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ).
Podem montar-se polinucleótidos no sentido 3' para 5' , e.g., utilizando nucleósidos com bases protegidas (monómeros) contendo um grupo protector em 5' lábil a ácido e uma 3'-fosforamidite. Os exemplos de tais monómeros incluem nucleoside-3'-0-(N,N-diisopropilamino)-2- cianoetilfosforamidite protegido com 5'-0-4,4'-dimetoxitritilo, enquanto os exemplos dos nucleósidos protegidos incluem N6-benzoiladenosina, N4-benzoilcitidina, N2-isobutririlguanosina, timidina e uridina, não se lhes limitando. Neste caso, o suporte sólido utilizado contém um nucleósido protegido ligado por 3' . Alternativamente, os polinucleótidos podem ser montados no sentido 5' para 3' utilizando nucleósidos com bases protegidas contendo um grupo protector em 3' lábil a ácido e uma 5'-fosforamidite. Os exemplos de tais monómeros incluem nucleósido-5'-O-(N,N-diisopropilamino)-2-cianoetilfosforamidite protegida com 3'-O-(4, 4'-dimetoxitritilo), em que os exemplos dos nucleósidos protegidos incluem N6-benzoiladenosina, N4-benzoilcitidina, N2-isobutririlguanosina, timidina e uridina (Glen Research, Sterling, VA), não se lhes limitando. Neste caso, o suporte sólido utilizado contém um nucleósido protegido ligado por 5' . Os componentes de ácido nucleico circular podem ser isolados, sintetizados através de métodos recombinantes ou sintetizados quimicamente. A síntese química pode ser efectuada utilizando qualquer método descrito na literatura. Consultar, por exemplo, Gao et al. (1995) Nucleic Acids Res. 23:2025-2029 e Wang et al. (1994) Nucleic Acids Res. 22:2326-2333. A conjugação das partes de ácido nucleico e partes espaçadoras pode ser efectuada de várias formas, dependendo 61
ΕΡ 1 404 873/PT do CIC específico a ser preparado. São conhecidos na especialidade métodos para adição de partes espaçadoras específicas e são descritas, por exemplo, nas referências citadas anteriormente. Consultar, e.g., Durand et al., Nucleic Acids Research 18:6353-59 (1990). A ligação covalente entre uma parte espaçadora e uma parte de ácido nucleico pode ser qualquer uma de vários tipos, incluindo fosfodiéster, fosforotiolato, amida, éster, éter, tioéter, dissulfureto, fosforamidato, fosfotriéster, fosforoditiolato, metilfosfonato e outras ligações. Tal como salientado anteriormente, podem modificar-se opcionalmente os precursores de parte espaçadora com grupos de activação terminais para acoplamento a ácidos nucleicos. Podem ver-se exemplos de partes espaçadoras activadas na figura 1, em que foram adicionados grupos protectores adequados para síntese automatizada. Por exemplo, outros precursores de parte espaçadora incluem (1) HOCH2CH2O (CH2CH2O) nCH2CH2OH, em que n= 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44 ou 45 ou é superior a 45; (2) HOCH2CHOHCH2OH; (3) HO(CH2)nOH, em que n=l, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 ou 11, não se lhes limitando.
Numa concretização, inclui-se um precursor de parte espaçadora que inclui um primeiro e um segundo grupo reactivo que permitem conjugação com partes de ácido nucleico de um modo em etapas, no qual o primeiro grupo reactivo tem a propriedade de poder acoplar eficazmente ao terminal de uma cadeia de ácidos nucleicos em crescimento e o segundo grupo reactivo é capaz de extensão adicional, de uma forma em etapas, da cadeia mista de partes de nucleótido e de não nucleótido em crescimento no CIC. Será frequentemente conveniente combinar parte(s) espaçadora(s) e partes de ácido nucleico utilizando a mesmo química do tipo fosforamidite utilizada para a síntese da parte de ácido nucleico. Por exemplo, podem sintetizar-se convenientemente os CIC do invento utilizando um sintetizador de ADN automatizado (e.g., Expedite 8909; Perseptive Biosystems, Framington, MA) utilizando química de fosforamidite (consultar, e.g., Beaucage, 1993, anteriormente; Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, anteriormente). No entanto, os peritos na especialidade compreenderão que, caso se pretenda, se podem 62 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ efectuar manualmente as mesmas etapas de síntese (ou etapas equivalentes) de um sintetizador de ADN automatizado. A ligação resultante entre o ácido nucleico e os precursores de espaçador pode ser uma ligação fosforotiolato ou fosfodiéster. Em tal síntese, tipicamente, protege-se uma extremidade do espaçador (ou subunidade de espaçador para espaçadores multiméricos) com um grupo 4,4'-dimetil- oxitritilo, enquanto a outra extremidade contém um grupo fosforamidite.
Encontram-se disponíveis comercialmente vários espaçadores com grupos protectores e reactivos úteis, por exemplo:
Espaçador trietilenoglicol ou "espaçador TEG" 9-0-(4,4'-dimetoxitritil)trietilenoglicol-1-0-[(2-cianoetil)]N,N-di-isopropilfosforamidite (Glen Research, 22825 Davis Drive,
Sterling, VA);
Espaçador hexaetilenoglicol ou "espaçador HEG" 18-0-(4,4'-dimetoxitritil)hexa-etilenoglicol-1-0-[(2 — cianoetil)]N,N-di-isopropilfosforamidite (Glen Research,
Sterling, VA);
Espaçador propilo 3-(4,4'-dimetoxitritiloxi)propiloxi-ΙΟ- (2-cianoetil) ]N,N-di-isopropilfosforamidite (Glen Research, Sterling, VA);
Espaçador butilo 4-(4,4'-dimetoxitritiloxi)butiloxi-1-0-[(2-cianoetil)]N,N-di-isopropilfosforamidite (Chem Genes
Corporation, Ashland Technology Center, 200 Homer Ave, Ashland, MA);
Espaçador hexilo: 6- (4,4'-dimetoxitritiloxi)-hexiloxi-1-0-[(2-cianoetil)]N,N-di-isopropilfosforamidite (Biosearch
Technologies, Novoto, CA)
Espaçador 2-(hidroximetil)etilo ou "espaçador HME" 1-(4,4'-dimetoxitritiloxi)-3-(levuliniloxi)-propiloxi-2-0-[(2-cianoetil)]N,N-di-isopropilfosforamidite; também denominado espaçador "ramificado assimétrico" (consultar a figura 2) (Chem Genes Corp., Ashland Technoklgy Center, Ashland MA.); 63 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ "Espaçador nucleótido abásico" ou "espaçador abásico" 5-0-(4,4'-dimetoxitritil)-1,2-didesoxirribose-3-0-[(2-cianoetil)]N,N-di-isopropilfosforamidite (Glen Research,
Sterling, VA); "Espaçador ramificado simétrico" ou "espaçador qlicerol" 1,3-0,0-bis(4,4'-dimetoxitritil)glicerol-2-0-[(2-cianoetil)] N, N-di-isopropilfosforamidite (Chem Genes, Ashland, MA) (consultar a figura 2); "Espaçador triplo" (consultar a figura 2) 2,2,2-0,0,0- tris[3-0-(4,4'-dimetoxitritiloxi)propiloximetil]eti1-1-0-[(2 — cianoetil)]N,N-di-isopropilfosforamidite (Glen Research,
Sterling, VA); "Espaçador duplo simétrico" (consultar a figura 2) 1,3- O, 0-bis[5-0-(4,4'-dimetoxitritiloxi)pentilamido]propil-2-0-[(2-cianoetil)]N,N-di-isopropilfosforamidite (Glen Research, Sterling, VA); "Espaçador_dodecilo" 12-(4,4'- dimetoxitritiloxi)dodeciloxi-1-0-[(2-cianoetil)]N,N-di-isopropilf osf oramidite (Glen Research, Sterling, VA).
Podem comprar-se estes e uma vasta gama de outros precursores de partes espaçadoras protegidos (e.g., compreendendo grupos de protecção de DMT e fosforamidite) ou podem ser sintetizados utilizando métodos de rotina para utilização na preparação dos CIC aqui descritos. 0 instrumento é programado de acordo com as instruções do fabricante para adicionar monómeros de nucleótido e espaçadores na ordem pretendida.
Os CIC preparados "in situ" num sintetizador de ADN necessitam de nucleósidos protegidos e monómeros de espaçador protegidos, ambos contendo grupos funcionais reactivos ou activáveis. A forma reactiva e/ou protegida da parte espaçadora pode ser descrita como um "componente de precursor de espaçador". Os peritos na especialidade considerarão que os grupos reactivos nos precursores de espaçador formam ligações estáveis após acoplamento e removem-se os grupos 64 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ protectores no precursores de espaçador na parte espaçadora resultante no CIC. Os grupos protectores são geralmente removidos durante a síntese em etapas do CIC, de modo a permitir a reacção nesse local. Nos casos em que existem grupos protectores em grupos reactivos adicionais, removem-se grupos protectores após a síntese em etapas do CIC (tal como o grupo levulinilo no precursor de espaçador apresentado na figura 2, estrutura 3, utilizado para preparar C-25). É um exemplo de um precursor de espaçador sem funcionalidade reactiva adicional 18-0-(4,4'-dimetoxitritil)-hexa-etilenoglicol-1-0-[(2-cianoetil)-N,N-di-isopropil-fosforamidite], que contém um grupo protector, o grupo 4,4'-dimetoxitritilo, e um grupo reactivo, o grupo (2-cianoetil)-N,N—di—isopropilfosforamidite. Durante a preparação do CIC utilizando química de fosforamidite num sintetizador de ADN, activa-se o grupo (2-cianoetil)-N,N-di-isopropilfosforamidite no precursor de espaçador com um ácido fraco, tal como 1H-tetrazole, e faz-se reagir com o 5'-hidroxilo livre da parte de ácido nucleico protegida por nucleobase para formar um triéster fosfite. 0 grupo triéster fosfite é então oxidado ou sulfurizado para um grupo fosfotriéster ou triéster de fosforotiolato estável, respectivamente. 0 grupo triéster resultante é estável durante o resto da síntese do CIC e permanece nessa forma até à desprotecção final. De modo a acoplar outro precursor de espaçador ou um monómero de nucleósido activado, que se tornará parte da próxima parte de ácido nucleico, remove-se o grupo 4,4'-dimetoxitritilo no precursor de espaçador. Após acoplamento e oxidação ou sulfurização, este grupo também se torna um grupo fosfotriéster ou triéster de fosforotiolato estável, respectivamente. Uma vez que o CIC protegido esteja completamente montado, cliva-se o CIC do suporte sólido, removem-se os grupos cianoetilo nos grupos fosfotriéster ou triéster de fosforotiolato e remove-se a protecção da nucleobase. Neste exemplo, o CIC contém partes de espaçador incluindo ligações fosfodiéster ou diésteres de fosforotiolato estáveis com as partes de ácido nucleico. Convertem-se tanto o grupo fosforamidite reactivo, como o grupo hidroxilo protegido do precursor de espaçador em ligações fosfodiéster ou diéster de fosforotiolato estáveis na parte espaçadora. Dado que a reacção de cada extremidade 65 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ do espaçador pode ser independente, uma ligação pode ser um fosfodiéster e a outra ligação um diéster de fosforotiolato ou qualquer das suas combinações. Podem também preparar-se desta forma CIC com outras modificações fosfato, tal como fosforoditiolato, metilfosfonato e fosforamidato, utilizando um precursor de espaçador com o grupo reactivo adequado, os reagentes auxiliares correctos e protocolos concebidos para este tipo de ligação. Estes protocolos são análogos aos descritos para preparar partes de ácido nucleico com ligações fosfato modificadas.
Embora a utilização de química de fosforamidite seja conveniente para a preparação de determinados CIC, considerar-se-á que os CIC do invento não se limitam a compostos preparados por qualquer método de síntese ou preparação específicos. Por exemplo, podem preparar-se partes de ácido nucleico contendo grupos que não são compatíveis com as condições de síntese de ADN e desprotecção, tal como, hidrazina ou maleimida, não se lhes limitando, por reacção de uma parte de ácido nucleico contendo um ligante amino com o agente de reticulação heterobifuncional adequado, tal como SHNH (hidrazinionicotinato de succinimidilo) ou sulfo-SMCC (4-[N-maleimidometil]-ciclo-hexano-l-carboxilato de sulfosuccinimidilo).
Descrevem-se na literatura métodos para conjugar proteína, péptidos, oligonucleótidos e moléculas pequenas em várias combinações e podem ser adaptados para conseguir conjugação de uma parte de ácido nucleico contendo um grupo de ligação reactivo a um precursor de parte espaçadora. Consultar, por exemplo, Bioconjugate Techniques, Greg T. Hermanson, Academic Press, Inc., San Diego, CA, 1996. Em algumas concretizações, sintetiza-se uma ou mais partes de ácido nucleico e adiciona-se um grupo de ligação reactivo (e.g., amino, carboxilato, tio, dissulfureto e semelhantes) utilizando técnicas de química sintética padrão. 0 grupo de ligação reactivo (que se considera que forma uma parte da parte espaçadora resultante) conjuga-se a compostos não ácido nucleico adicionais (por exemplo, entre outros, um composto listado em §4, anteriormente) para formar uma parte da parte espaçadora. Adicionam-se grupos de ligação reactivos aos ácidos nucleicos utilizando métodos padrão para síntese de 66 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ ácido nucleico, utilizando uma variedade de reagentes conhecidos na especialidade. Os exemplos incluem reagentes que contêm um grupo amino, grupo carboxilato, grupo tiol, grupo dissulfureto, grupo aldeído, grupo diol, grupo dieno e um grupo fosforamidite protegidos. Uma vez incorporados estes compostos nos ácidos nucleicos, através do grupo fosforamidite activado, e após desprotecção, proporcionam ácidos nucleicos com reactividade amino, carboxilato, aldeído, diol, dieno ou tiol. Apresentam-se seguidamente exemplos de grupos reactivos para conjugar uma parte de ácido nucleico contendo um grupo ligante reactivo a um precursor de parte espaçadora que contém um grupo reactivo.
Grupo reactivo de Grupo reactivo de precursor Liqação estável ácido nucleico de parte espaçadora formada tiol maleimida, halo-acetilo tioéter maleimida tiol tioéter tiol dissulfureto de piridina dissulfureto dissulfureto de piridina tiol dissulfureto amina NHS ou outro éster activo amida amina carboxilato amida carboxilato amina amida aldeído, cetona hidrazina, hidrazida hidrazona, hidrazida hidrazina, hidrazida aldeído, cetona hidrazona, hidrazida dieno dienófilo anel alifático ou heterocíclico 0 grupo de ligação reactivo e o precursor de espaçador reagem para formar uma ligação estável e o grupo de átomos completo entre as duas (ou mais) partes de ácido nucleico é definido como a parte espaçadora. Por exemplo, uma parte de ácido nucleico sintetizada com um grupo mercapto-hexilo ligado à parte de ácido nucleico através de um grupo fosforotiolato pode reagir com um precursor de espaçador contendo um (ou mais) grupo(s) maleimida, formando ligação(ões) tioéter. A parte espaçadora deste CIC inclui o grupo fosforotiolato e o grupo hexilo do ligante na parte de ácido nucleico, a nova ligação tioéter e o resto do espaçador que era parte do precursor de espaçador. 67 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Embora se possam preparar CIC lineares utilizando estas estratégias de conjugação, estes métodos são aplicados mais frequentemente na preparação de CIC ramificados. Adicionalmente podem preparar-se moléculas de precursor de espaçador com vários grupos reactivos ortogonais para permitir a adição de mais do que um tipo de partes de ácido nucleico (e.g., motivos de sequência diferentes).
Numa concretização preparam-se CIC com espaçadores multivalentes conjugados a mais do que um tipo de partes de ácido nucleico. Por exemplo, foram descritas plataformas contendo dois grupos maleimida (que podem reagir com polinucleótidos contendo tiol) e dois grupos éster activados (que podem reagir com ácidos nucleicos contendo amino) (consultar, e.g., PCT/US94/10031, publicado como WO 95/07073). Estes dois grupos activados podem reagir independentemente um do outro. Tal resultaria num CIC contendo um total de 4 partes de ácido nucleico, duas de cada sequência.
Podem também preparar-se CIC com espaçadores multivalentes contendo duas sequências de ácido nucleico diferentes utilizando o espaçador ramificado simétrico, descrito anteriormente, e química de fosforamidite convencional (e.g., utilizando métodos manuais ou automatizados). O espaçador ramificado simétrico contém um grupo fosforamidite e dois grupos protectores que são iguais e que são removidos simultaneamente. Numa abordagem, por exemplo, sintetiza-se um primeiro ácido nucleico e acopla-se ao espaçador ramificado simétrico, removem-se os grupos protectores do espaçador. Seguidamente sintetizam-se dois ácidos nucleicos adicionais (com a mesma sequência) no espaçador (utilizando o dobro da quantidade de reagentes utilizada para a síntese de uma única parte de ácido nucleico em cada etapa). Este procedimento é descrito detalhadamente no exemplo 15, seguidamente.
Pode utilizar-se um método semelhante para ligar três partes de ácido nucleico diferentes (denominados seguidamente como ácidos nucleicos I, II e III) a uma plataforma multivalente (e.g., espaçador ramificado assimétrico). Tal é efectuado mais convenientemente utilizando um sintetizador de ADN automatizado. Numa concretização, o espaçador ramificado 68 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ assimétrico contém um grupo fosforamidite e dois grupos protectores ortogonais que podem ser removidos independentemente. Primeiramente sintetiza-se o ácido nucleico I, seguidamente acopla-se o espaçador ramificado assimétrico ao ácido nucleico I, seguidamente adiciona-se o ácido nucleico II após a remoção selectiva de um dos grupos protectores. Desprotege-se o ácido nucleico II e adiciona-se capuz e seguidamente remove-se o outro grupo protector no espaçador. Finalmente sintetiza-se o ácido nucleico III. Este procedimento descreve-se detalhadamente no exemplo 17, seguidamente.
Os ligantes hidrofilicos de comprimentos variáveis são úteis, por exemplo, para ligar partes de ácidos nucleicos e moléculas de plataforma. Conhecem-se vários ligantes adequados. Os ligantes adequados incluem oligómeros ou polímeros lineares de etilenoglicol, não se lhes limitando. Tais ligantes incluem ligantes com a fórmula R1S (CH2CH2O) nCH2CH20 (CH2) mC02R2 em que n = 0-200, m = 1 ou 2, R1 = H ou um grupo protector tal como tritilo, R = H ou alquilo ou arilo, e.g., éster de 4-nitrofenilo. Estes ligantes são úteis na ligação de uma molécula contendo um grupo reactivo tiol, tal como halo-acetilo, maleiamida, etc., através de um tioéter a uma segunda molécula que contém um grupo amino através de uma ligação amida. A ordem de ligação pode variar, i.e., a ligação tioéter pode ser formada antes ou depois da formação da ligação amida. Outros ligantes úteis incluem Sulfo-SMCC (4-[N-maleimidometil]-ciclo-hexano-l-carboxilato de sulfosuccinimidilo) Pierce Chemical Co. produto 22322;
Sulfo-EMCS (éster maleimidocaproiloxilo' Sulfo-GMBS (éster maleimidobutiriloxi 1 ) sulfossuccinimida de Ν-[ε-
Pierce Chemical Co. produto 22307; sulfossuccinimida de N-[γ-
Pierce Chemical Co. produto 22324 (Pierce Chemical Company, Rockford, IL) e compostos semelhantes de fórmula geral éster maleimido-R-C(O)NHS, em que R = alquilo, alquilo cíclico, polímeros de etilenoglicol e semelhantes.
Descrevem-se métodos particularmente úteis para ligar covalentemente partes de ácido nucleico a espaçadores multivalentes nas referências citadas anteriormente e nos exemplos. 69 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Assim, num aspecto, o invento proporciona um método para preparar um CIC útil para modular uma resposta imunitária num mamifero, por ligação covalente de polinucleótido(s) a um composto, resultando assim num composto quimérico compreendendo uma parte de ácido nucleico e uma região de parte espaçadora e com actividade de imunomodulação. Em várias concretizações, a região de ácido nucleico pode ter a estrutura e sequência de qualquer parte de ácido nucleico aqui descrita e a região de espaçador pode ter a estrutura de qualquer parte espaçadora aqui descrita. Frequentemente há mais do que uma etapa de junção, e.g., sendo a junção repetida pelo menos uma vez para proporcionar dois polinucleótidos ligados covalentemente a um ou dois espaçadores e é frequentemente repetida pelo menos duas ou três vezes. O método compreende adicionalmente a combinação do CIC com um excipiente farmaceuticamente aceitável para formar uma composição. Numa concretização, a composição é estéril, e.g., adequada para administração a um doente humano, e.g., fabricada ou formulada com padrões GMP. Numa concretização, combina-se o CIC com um microtransportador e/ou antigénio, tal como aqui descrito. Também se considera que, em algumas concretizações, uma formulação de CIC do invento estará isenta de um ou mais de (i) um sistema de dispersão coloidal, (ii) lipossomas, (iii) microtransportadores, (iv) polipéptidos, (v) antigénios e (vi) endotoxina. 6. CIC proteáceos
Em determinadas concretizações, utiliza-se um polipéptido, tal como uma proteina antigénio ou fragmento de antigénio, como uma parte espaçadora multivalente à qual se conjugam covalentemente várias partes de ácido nucleico, directamente ou através de ligantes, para formar um "CIC proteáceo". O polipéptido pode ser um antigénio ou imunogénio para o qual se pretende uma resposta imunitária adaptativa ou um transportador (e.g., albumina). Tipicamente, um CIC proteáceo compreende pelo menos uma, e usualmente várias ou muitas partes de ácido nucleico que (a) têm entre 2 e 7, mais frequentemente entre 4 e 7 nucleótidos de comprimento, alternativamente entre 2e6, 2e5, 4e6ou4e5 70 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ nucleótidos de comprimento e/ou (b) têm actividade de imunomodulação isolada inferior ou não têm actividade de imunomodulação isolada. Os métodos de preparar um CIC proteáceo serão evidentes para um perito na especialidade por revisão da presente descrição. Por exemplo, pode conjugar-se covalentemente um ácido nucleico a uma parte espaçadora de polipéptido por métodos conhecidos na especialidade, incluindo ligações entre uma extremidade 3' ou 5' de uma parte de ácido nucleico (ou numa posição interna de uma base adequadamente modificada na parte de ácido nucleico) e um polipéptido com um grupo reactivo adequado (e.g., um éster N-hidroxissuccinimida, que se pode fazer reagir directamente com o grupo amino N4 de resíduos de citosina) . Como um exemplo adicional, pode ligar-se um polipéptido a uma extremidade 5' livre de uma parte de ácido nucleico através de um grupo amina, tiol ou carboxilo que foi incorporado na parte de ácido nucleico. Alternativamente, o polipéptido pode ser conjugado a uma parte espaçadora, tal como aqui descrito. Adicionalmente, um grupo de ligação compreendendo uma amina, tiol ou carboxilo protegido numa extremidade e uma fosforamidite pode ser ligado covalentemente a um grupo hidroxilo de um polinucleótido e, subsequentemente à desprotecção, a funcionalidade pode ser utilizada para ligar covalentemente o CIC a um péptido. 7. Purificação
Os CIC do invento são purificados utilizando quaisquer meios convencionais, tal como cromatografia líquida de elevado desempenho, métodos electroforéticos, cromatografia de afinidade de ácido nucleico, cromatografia de exclusão de tamanho e cromatografia de permuta iónica. Em algumas concretizações, um CIC encontra-se substancialmente puro, e.g., pelo menos cerca de 80% puro em peso, frequentemente pelo menos cerca de 90% puro em peso, mais frequentemente pelo menos cerca de 95% puro, com a maior preferência pelo menos cerca de 85% puro. 8. Composições
Em várias concretizações, as composições do invento compreendem um ou mais CIC, (i.e. um único CIC ou uma 71 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ combinação de dois ou mais CIC) opcionalmente em conjunção com outro agente de imunomodulação, tal como um péptido, um antigénio (descrito seguidamente) e/ou um adjuvante adicional. As composições do invento podem compreender um CIC e um excipiente farmaceuticamente aceitável. "Farmaceuticamente aceitável" significa que o transportador, diluente ou excipiente deve ser compatível com os outros ingredientes da formulação e não nocivo para o seu recebedor. São bem conhecidos na especialidade excipientes farmaceuticamente aceitáveis e incluem água estéril, soluções isotónicas, como soro fisiológico e solução salina tamponada de fosfato e outros excipientes conhecidos na especialidade. Consultar, e.g., Remington: The Science and Practice of Pharmacy (19a edição, 1995, Gennavo, ed. ) . São conhecidos na especialidade adjuvantes (dos quais o alúmen é um exemplo). Podem preparar-se formulações de CIC com outros agentes imunoterapêuticos, tal como citocinas e anticorpos. Em algumas concretizações a composição é isotónica e/ou estéril, e.g., adequada para administração a um doente humano, e.g., fabricado ou formulado sob padrões GMP.
A. Complexos CIC/MC
Podem administrar-se os CIC sob a forma de complexos de CIC/microtransportador (CIC/MC). Assim, o invento proporciona composições compreendendo complexos CIC/MC.
Os complexos CIC/MC compreendem um CIC ligado à superfície de um microtransportador (i.e., o CIC não está encapsulado no MC) e preferentemente compreendem múltiplas moléculas de CIC ligadas a cada microtransportador. Em determinadas concretizações, pode complexar-se uma mistura de diferentes CIC a um microtransportador, de modo que o microtransportador esteja ligado a mais do que uma espécie de CIC. A ligação entre o CIC e MC pode ser covalente ou não covalente (e.g. mediada por interacções iónicas e/ou hidrofóbicas) . Tal como será entendido por um perito na especialidade, o CIC pode ser modificado ou derivatizado e a composição do microtransportador pode ser seleccionada e/ou modificada para acomodar o tipo pretendido de ligação desejada para a formação do complexo CIC/MC. 72 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Podem ligar-se complexos CIC/MC ligados covalentemente utilizando qualquer tecnologia de reticulação covalente conhecida na especialidade. Tipicamente, a parte do CIC será modificada, quer para incorporar uma parte adicional (e.g., um grupo amina, carboxilo ou sulfidrilo livre), quer para incorporar bases de nucleótidos modificadas (e.g., fosforotiolato) para proporcionar um local ao qual a parte do CIC pode ser ligada ao microtransportador. A ligação entre as partes de CIC e MC do complexo pode ser efectuada na extremidade 3' ou 5' do CIC ou numa base modificada adequadamente numa posição interna do CIC. O microtransportador é também geralmente modificado para incorporar partes através das quais se pode formar uma ligação covalente, embora possam também ser utilizados grupos funcionais normalmente presentes no microtransportador. O CIC/MC é formado por incubação do CIC com um microtransportador em condições que permitem a formação de um complexo covalente (e.g., na presença de um agente de reticulação ou por utilização de um microtransportador activado, compreendendo uma parte activada que formará uma ligação covalente com o CIC). É conhecida na especialidade uma larga variedade de tecnologias de reticulação e incluem agentes de reticulação reactivos com grupos amino, carboxilo e sulfidrilo. Tal como será evidente para o perito na especialidade, a selecção de um agente de reticulação e do protocolo de reticulação dependerá da configuração do CIC e do microtransportador, bem como da concentração final pretendida do complexo CIC/MC. 0 agente de reticulação pode ser homobifuncional ou heterobifuncional. Quando se utiliza um agente de reticulação homobifuncional, o agente de reticulação explora a mesma parte no CIC e MC (e.g., pode utilizar-se um agente de reticulação de aldeído para ligar covalentemente um CIC e MC, em que ambos o CIC e MC compreendem uma ou mais aminas livres). Os agentes de reticulação heterobifuncionais utilizam partes diferentes no CIC e no MC (e.g., pode utilizar-se um éster maleimido-N-hidroxissuccinimida para ligar covalentemente um sulfidrilo livre no CIC e uma amina livre no MC) e são preferidos para minimizar a formação de ligações inter- microtransportador. Na maioria dos casos, é preferível fazer a reticulação através de uma primeira parte 73 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ de reticulação no microtransportador e uma segunda parte de reticulação no CIC, em que a segunda parte de reticulação não está presente no microtransportador. Um método preferido de produzir o complexo CIC/MC é por 'activação' do microtransportador por incubação com um agente de reticulação heterobifuncional, seguidamente formando o complexo CIC/MC por incubação do CIC e do MC activado em condições adequadas para reacção. O agente de reticulação pode incorporar um braço "espaçador" entre as partes reactivas ou as duas partes reactivas no agente de reticulação podem ser ligadas directamente.
Numa concretização preferida, a parte de CIC contém pelo menos um sulfidrilo livre (e.g., proporcionado por uma base ou ligante modificado com 5'-tiol) para reticulação com o microtransportador, enquanto o microtransportador compreende grupos amina livres. Utiliza-se um agente de reticulação heterobifuncional reactivo com estes dois grupos (e.g., um agente de reticulação compreendendo um grupo maleimida e um NHS-éster) , tal como a utilização de 4-(N-maleimidometil)ciclo-hexano-l-carboxilato de succinimidilo para activar o MC, seguidamente reticular covalentemente o CIC para formar o complexo CIC/MC.
Os complexos CIC/MC não covalentes podem ser ligados por qualquer ligação ou interacção não covalente, incluindo ligações iónicas (electrostáticas), interacções hidrofóbicas, ligações de hidrogénio, atracções de van der Waals ou uma combinação de duas ou mais interacções diferentes, tal como é normalmente o caso quando se liga o CIC e o MC com um par de ligação.
Os complexos CIC/MC não covalentes são tipicamente complexados por interacções hidrofóbicas ou electrostáticas (iónicas) ou uma sua combinação, (e.g., através de emparelhamento de bases entre um CIC e um polinucleótido ligado a um MC) . Devido à natureza hidrofílica do esqueleto dos polinucleótidos, os complexos CIC/MC que se baseiam em interacções hidrofóbicas para formar o complexo requerem geralmente modificação da parte do CIC do complexo para incorporar uma parte altamente hidrofóbica. Preferentemente a parte hidrofóbica é biocompatível, não imunogénica e é de 74 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ ocorrência natural no indivíduo para o qual se pretende a composição (e.g., encontra-se em mamíferos, particularmente humanos). Os exemplos de partes hidrofóbicas preferidas incluem lipidos, esteróides, esteróis, tal como colesterol, e terpenos. O método de ligação da parte hidrofóbica do CIC dependerá obviamente da configuração do CIC e da identidade da parte hidrofóbica. A parte hidrofóbica pode ser adicionada em qualquer local conveniente no CIC, preferentemente na extremidade 5' ou 3' ; no caso de adição de uma parte de colesterol a um CIC, a parte colesterol é adicionada preferentemente à extremidade 5' do CIC, utilizando reacções químicas convencionais (consultar, por exemplo, Godard et al. (1995) Eur. J. Biochem. 232:404-410). Preferentemente preparam-se microtransportadores para utilização em complexos CIC/MC ligados por ligações hidrofóbicas a partir de materiais hidrofóbicos, tal como gotículas de óleo ou polímeros hidrofóbicos, embora se possam também utilizar materiais hidrofilicos modificados para incorporar partes hidrofóbicas. Quando o microtransportador é um lipossoma ou outro microtransportador de fase líquida compreendendo um lúmen, o complexo CIC/MC é formado por mistura do CIC e do MC após preparação do MC, de modo a evitar encapsulação do CIC durante o processo de preparação do MC.
Os complexos CIC/MC não covalentes ligados por ligação electrostática tipicamente exploram a elevada carga negativa do esqueleto de polinucleótido. Assim, os microtransportadores para utilização em complexos CIC/MC ligados não covalentemente são em geral carregados positivamente ao pH fisiológico (e.g., cerca de pH 6,8-7,4). O microtransportador pode possuir intrinsecamente uma carga positiva, mas podem derivatizar-se ou modificar-se de outra forma os microtransportadores preparados a partir de compostos que normalmente não possuem uma carga positiva para os tornar carregados positivamente. Por exemplo, o polímero utilizado para preparar o microtransportador poder ser derivatizado para adicionar grupos carregados positivamente, tal como aminas primárias. Alternativamente podem incorporar-se compostos carregados positivamente na formulação de um microtransportador durante o fabrico (e.g., podem utilizar-se tensioactivos carregados positivamente durante o fabrico de copolímeros de poli(ácido láctico)/poli(ácido glicólico) para 75 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ conferir uma carga positiva nas partículas de microtransportador resultantes). Consultar, e.g., exemplos 28 e 34, seguidamente.
Podem produzir-se complexos CIC/MC não covalentes ligados por emparelhamento de bases de nucleótidos utilizando metodologias convencionais. Em geral, produzem-se complexos CIC/MC com bases emparelhadas utilizando um microtransportador compreendendo um polinucleótido ligado, preferentemente ligado covalentemente, (o "polinucleótido de captura") que é pelo menos parcialmente complementar ao CIC. 0 segmento de complementaridade entre o CIC e o nucleótido de captura tem preferentemente pelo menos 6, 8, 10 ou 15 pares de bases contíguas, com maior preferência pelo menos 20 pares de bases contíguas. O nucleótido de captura pode estar ligado ao MC por qualquer método conhecido na especialidade e está preferentemente ligado covalentemente ao CIC na extremidade 5' ou 3' .
Noutras concretizações, pode utilizar-se um par de ligação para ligar o CIC e MC num complexo CIC/MC. O par de ligação pode ser um receptor e ligando, um anticorpo e antigénio (ou epítopo) ou qualquer outro par de ligação que se ligue com elevada afinidade (e.g., Kd inferior a cerca de 1CT8) . Um tipo de par de ligação preferido é biotina e estreptavidina ou biotina e avidina, que forma complexos muito estáveis. Quando se utiliza um par de ligação para mediar a ligação do complexo CIC/MC, derivatiza-se o CIC, tipicamente através de uma ligação covalente, com um membro do par de ligação e derivatiza-se o MC com o outro membro do par de ligação. A mistura dos dois compostos derivatizados resulta na formação do complexo CIC/MC.
Muitas concretizações do complexo CIC/MC não incluem um antigénio e determinadas concretizações excluem antigénio(s) associado(s) com a doença que é o objectivo da terapia com o complexo CIC/MC. Em concretizações adicionais, o CIC também está ligado a uma ou mais moléculas de antigénio. O antigénio pode ser acoplado com a parte do CIC de um complexo CIC/MC de várias formas, incluindo interacções covalentes e/ou não covalentes. Alternativamente o antigénio pode ser ligado ao microtransportador. A ligação entre o antigénio e o CIC nos 76 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ complexos CIC/MC compreendendo um antigénio ligado ao CIC pode ser efectuada por técnicas aqui descritas e conhecidas na especialidade. B. Antigénio co-administrado
Em algumas concretizações, o CIC é co-administrado com um antigénio. Pode co-administrar-se qualquer antigénio com um CIC e/ou utilizar-se para preparação de composições compreendendo um CIC e antigénio.
Em algumas concretizações, o antigénio é um alergénio. Apresentam-se na tabela 1 exemplos de alergénios recombinantes. A preparação de muitos alergénios é bem conhecida na especialidade, incluindo, preparação de alergénio de antigénio E de pólen de ambrósia (Amb ai) (Rafnar et al. (1991) J. Biol. Chem. 266:1229-1236), alergénio de relva Lol p 1 (Tamborini et al. (1997) Eur. J. Biochem. 249:886-894), principais alergénios do ácaro do pó Der pi e Der PII (Chua et al. (1988) J. Exp. Med. 167:175-182; Chua et al. (1990) Int. Arch. Allergy Appl. Immunol. 91:124-129), alergénio do gato doméstico Fel d I (Rogers et al. (1993) Mol. Imnunol. 30:559-568), pólen de vidoeiro de papel Bet vl (Breiteneder et al. (1989) EMBO J. 8:1935-1938), alergénios de cedro-japonês Cry j 1 e Cry j 2 (Kingetsu et al. (2000) Immunology 99:625-629) e antigénios de proteina de outros três pólen (Elsayed et al. (1991) Scand. J. Clin. Lab. Invest. Supl. 204:17-31), não se lhes limitando. Foi relatada a preparação de antigénios de proteina de pólen da relva para administração in vivo.
Em algumas concretizações, o alergénio é um alergénio alimentar, incluindo alergénio do amendoim, por exemplo Ara h I (Stanley et al. (1996) Adv. Exp. Med. Biol. 409:213-216); alergénio de noz, por exemplo, Jug r I (Tueber et al. (1998) J. Allergy Clin. Immunol. 101:807-814); alergénio de castanhas do maranhão, por exemplo, albumina (Pastorello et al. (1998) J. Allergy Clin. Immunol. 102:1021-1027; alergénio do camarão, por exemplo Pen a I (Reese et al. (199 7) Int. Arch. Allergy Immunol. 113:240-242); alergénio do ovo, por exemplo, ovomucóide (Crooke et al. (1997) J. Immunol. 159:2026-2032); alergénio do leite, por exemplo, β- 77 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ lactoglobina bovina (Selot al. (1999) Clin. Exp. Allergy 29:1055-1063); alergénio do peixe, por exemplo, parvalbuminas (Van Do et al. (1999) Scand. J. Immunol. 50:619-625; Galland et al. (1998) J. Chromatogr. B. Biomed. Sei. Appl. 706:63-71), não se lhes limitando. Em algumas concretizações, o alergénio é um alergénio do látex, incluindo Hev b 7 (Sowka et al. (1998) Eur. J. Biochem. 255:213-219), não se lhe limitando. A tabela 1 apresenta uma lista de alergénios que pode ser utilizada. TABELA 1
ALERGÉNIOS RECOMBINANTES
Grupo Alergénio Referência ANIMAIS: CRUSTÁCEOS Camarão/lagosta Tropomiosina Leung et al. (1996) J. Allergy Clin. Immunol. 98:954-961 Pan s I Leung et al. (1998) Mol. Mar. Biol. Biotechnol. 7:12-20 INSECTOS Formiga Sol i 2 (veneno) Schmidt et al. J Allergy Clin Immunol., 1996, 98:82-8 Abelha Fosfolipase A2 (PLA) Muller et al. J Allergy Clin Immunol, 1995, 96:395-402 Forster et al. J Allergy Clin Immunol, 1995, 95:1229-35 Muller et al. Clin Exp Allergy, 1997, 27:915-20 Hialuronidase (Hya) Soldatova et al. J Allergy Clin Immunol, 1998, 101:691-8 Barata Bla g Bd90K Helm et al. J Allergy Clin Immunol, 1996, 98:172-180 Bla g 4 (uma calicina) Vailes et al. J Allergy Clin Immunol, 1998, 101:274-280 Glutationa S-transferase Arruda et al. J Biol Chem, 1997, 272:20907-12 Per a 3 Wu et al. Mol Immunol, 1997, 34:1-8 78 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Grupo Alergénio Referência Ácaro do pó Der p 2 (alergénio principal) Variante de Der p2 Der f2 Der plO Tyr p2 Lynch et ai. J Allergy Clin Immunol, 1998, 101:562-4 Hakkaart et ai. Clin Exp Allergy, 1998, 28:169-74 Hakkaart et al. Clin Exp Allergy, 1998, 28:45-52 Hakkaart et al. Int Arch Allergy Immunol, 1998, 115 (2):1 150-6 Mueller et al. J Biol Chem, 1997, 272:26893-8 Smith et al. J Allergy Clin Immunol, 1998, 101:423-5 Yasue et al. Clin Exp Immunol, 1998, 113:1-9 Yasue et al. Cell Immunol, 1997, 181:30-7 Asturias et al. Biochim Biophys Acta, 1998, 1397:27-30 Eriksson et al. Eur J Biochem, 1998 Vespão Antigénio 5 também denominado Dol m V (veneno) Tomalski et al. Arch Insect Biochem Physiol, 1993, 22:303-13 Mosquito Aed a I (apirase salivar) Xu et al. Int Arch Allergy Immunol, 1998, 115:245-51 Vespa antigénio 5, hialuronidase e fosfolipase (veneno) King et al. J Allergy Clin Immunol, 1996, 98:588-600 MAMÍFEROS Gato Fel d I Slunt et al. J Allergy Clin Immunol, 1995, 95:1221-8 Hoffmann et al. (1997) J Allergy Clin Immunol 99:227-32 Hedlin Curr Opin Pediatr, 1995, 7:676-82 Vaca Bos d 2 (pelo; uma lipocalina) Zeiler et al. J Allergy Clin Immunol, 1997, 100:721-7 Rautiainen et al. Biochem Bioph. Res Comm., 1998, 247:746-50 79 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Grupo Alergénio Referência β-lactoglobulina (BLG, principal alergénio do leite de vaca) Chatel et al. Mol Immunol, 1996, 33:1113-8 Lehrer et al. Crit Rev Food Sei Nutr, 1996, 36:553-64 Cão Can fie Can f2, lipocalinas salivares Konieczny et al. Immunology, 1997, 92:577-86 Spitzauer et al. J Allergy Clin Immunol, 1994, 93:614-27 Vrtala et al. J Immunol, 1998, 160:6137-44 Cavalo Equ cl (alergénio principal, uma lipocalina) Gregoire et al. J Biol Chem, 1996, 271:32951-9 Ratinho proteína urinária de ratinho (MUP) Konieczny et al. Immunology, 1997, 92 : 577-86 OUTROS ALERGÉNIOS DE MAMÍFERO Insulina Ganz et al. J Allergy Clin Immunol, 1990, 86:45-51 Grammer et al. J Lab Clin Med, 1987,109:141-6 Gonzalo et al. Allergy, 1998, 53:106-7 Interferões interferão alfa 2c Detmar et al. Contact Dermatis, 1989, 20:149-50 MOLUSCOS Topomiosina Leung et al. J Allergy Clin Immunol, 1996, 98:954-61 ALERGÉNIOS DE PLANTA: Cevada Hor v 9 Astwood et al. Adv Exp Med Biol, 1996, 409:269-77 Vidoeiro alergénio de pólen, Bet v 4 Twardosz et al. Biochem Bioph. Res Comm., 1997, 23 9:197 Pauli et al. J Allergy Clin Immunol, 1996, 97:1100-9 van Neerven et al. Clin Exp Allergy, 1998, 28:423-33 rBet v I Bet v 2: (profilina) Jahn-Schmid et al. Immunotechnology, 1996, 2:103-13 80 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Grupo Alergénio Referência Breitwieser et al. Biotechniques, 1996, 21:918-25 Fuchs et al. J Allergy Clin Immunol, 1997, 100:3 56-64 Castanha do Globulina Bartolome et al. Allergol maranhão Immunopathol, 1997,25:135-44 Cereja Pru a I (alergénio Scheurer et al. Mol Immunol, 1997, principal) 34:619-29 Milho Zml3 (pólen) Heiss et al. FEBS Lett, 1996, 381:217-21 Lehrer et al. Int Arch Allergy Immunol, 1997, 113:122-4 Relva Phl pl, Phl p2, Bufe et al. Am J Respir Crit Care Phl p5 (pólen de Med, 1998,157:1269-76 rabo de gato) Hol 1 5 pólen de erva-lanar Vrtala et al. J Immunol Jun 15, 1998, 160:6137-44 Niederberger et al. J Allergy Clin Immun., 1998, 101:258-64 Schramm et al. Eur J Biochem, 1998, 252:200-6 Alergénio de erva- Zhang et al. J Immunol, 1993, f ebra 151:791-9 Cyn d 7 de grama Smith et al. Int Arch Allergy bermuda Immunol, 1997, 114:265-71 Cyn d 12 (uma Asturias et al. Clin Exp Allergy, profilina) 1997, 27:1307-13 Fuchs et al. J Allergy Clin Immunol, 1997, 100:356-64 Cedro japonês Jun a 2 (Juniperus Yokoyama et al. Biochem. Biophys. ashei) Cry j 1, Cry j 2 (Cryptomeria japonica) Res. Commun., 2000, 275:195-202 Kingetsu et al. Immunology, 2000, 99:625-629 Junipero Jun o 2 (pólen) Tinghino et al. J Allergy Clin Immunol, 1998, 101:772-7 81 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Grupo Alergénio Referência Látex Hev b 7 Sowka et ai. Eur J Biochem, 1998, 255:213-9 Fuchs et ai. J Allergy Clin Immunol, 1997, 100:3 56-64 Mercurialis Mer a I (profilina) Vallverdu et al. J Allergy Clin Immunol, 1998, 101:3 63-70 Mostarda (Amarela) Sin a I (semente) Gonzalez de la Pena et al. Biochem Bioph. Res Comm., 1993, 190:648-53 Sementes de Bra r I alergénio Smith et al. Int Arch Allergy colza do pólen Immunol, 1997, 114:265-71 Amendoim Ara h I Stanley et al. Adv Exp Med Biol, 1996, 409:213-6 Burks et al. J Clin Invest, 1995, 96 :1715-21 Burks et al. Int Arch Allergy Immunol, 1995, 107:248-50 Poa-dos-prados Poa p9 Parronchi et al. Eur J Immunol, 1996, 26:697-703 Astwood et al. Adv Exp Med Biol, 1996, 409:269-77 Ambrósia Amb a I Sun et al. Biotechnology Ag, 1995, 13 : 779-86 Hirschwehr et al. J Allergy Clin Immunol, 1998, 101:196-206 Casale et al. J Allergy Clin Immunol, 1997, 100:110-21 Centeio Lol p I Tamborini et al. Eur J Biochem, 1997, 249:886-94 Noz Jug r I Teuber et al. J Allergy Clin Immun. , 1998, 101:807-14 Trigo alergénio Fuchs et al. J Allergy Clin Immunol, 1997, 100:356-64 Donovan et al. Electrophoresis, 1993, 14:917-22 FUNGOS: Aspergillus Asp f 1, Asp f 2, Asp f3, Asp f 4, rAsp f 6 Crameri et al. Mycoses, 1998, 41 Supl 1:56-60 Hemmann et al. Eur J Immunol, 1998, 28:1155-60 Banerjee et al. J Allergy Clin Immunol, 1997, 99:821-7 82 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Grupo Alergénio Referência Superóxido dismutase de manganês (MNSOD) Crameri Int Arch Allergy Immunol, 1998, 115:99-114 Crameri et al. Adv Exp Med Biol, 1996, 409:111-6 Moser et al. J Allergy Clin Immunol, 1994, 93: 1-11 Mayer et al. Int Arch Allergy Immunol, 1997,113:213-5 Blomia alergénio Caraballo et al. Adv Exp Med Biol, 1996, 409:81-3 Penicillinium alergénio Shen et al. Clin Exp Allergy, 1997, 27:682-90 Psilocybe Psi c 2 Homer et al. Int Arch Allergy Immunol, 1995, 107:298-300
Em algumas concretizações, o antigénio é de um agente infeccioso, incluindo protozoários, bactérias, fungos (incluindo unicelulares e multicelulares) e agentes viricos infecciosos. Descrevem-se aqui exemplos de antigénios viricos adequados e são conhecidos na especialidade. As bactérias incluem Hemophilus influenza, Mycobacterium tuberculosis e Bordetella pertussis. Os agentes infecciosos protozoários incluem plasmódio da malária, espécies Leishmania, espécies Trypanosoma e espécies Schistosoma. Os fungos incluem Candida albicans.
Em algumas concretizações, o antigénio é um antigénio virico. Os antigénios polipeptídicos viricos incluem proteínas de VIH, tal como proteínas gag de VIH (incluindo proteína de ancoramento à membrana (MA), proteína de cápside nuclear (CA) e proteína de nucleocápside (NC) , não se lhes limitando), polimerase de VIH, proteína de matriz (M) de vírus influenza e proteína e nucleocápside (NP) de vírus influenza, antigénio de superfície de hepatite B (HBsAg), proteína nuclear de hepatite B (HBcAg), proteína e de hepatite (HBeAg), ADN polimerase de hepatite B, antigénios de hepatite C e semelhantes, não se lhes limitando. As referências que discutem a vacinação para influenza incluem Scherle e Gerhard (1988) Proc. Natl. Acad. Sei. USA 85:4446-4450; Scherle e Gerhard (1986) J. Exp. Med. 164:1114-1128; 83 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Granoff et al. (1993) Vaccine 11:S46-51; Kodihalli et al. (1997) J. Virol. 71:3391-3396; Ahmeida et al. (1993) Vaccine 11:1302-1309; Chen et al. (1999) Vaccine 17:653-659; Govorkova e Smirnov (1997) Acta Virol. (1997) 41:251-257; Koide et al. (1995) Vaccine 13:3-5; Mbawuike et al. (1994) Vaccine 12:1340-1348; Tamura et al. (1994) Vaccine 12:310-316; Tamura et al. (1992) Eur. J. Immunol. 22:477-481; Hirabayashi et al. (1990) Vaccine 8:595-599. Outros exemplos de polipéptidos de antigénio são antigénios específicos de grupo e específicos de subgrupo, que são conhecidos para vários agentes infecciosos, incluindo adenovirus, vírus de herpes simplex, vírus de papiloma, vírus sincicial respiratório e vírus pox, não se lhes limitando. São conhecidos muitos péptidos e proteínas antigénicas e estão disponíveis na especialidade; podem identificar-se outras utilizando técnicas convencionais. Para imunização contra formação de tumor ou tratamento de tumores existentes, os péptidos de imunomodulação podem incluir células de tumor (vivas ou irradiadas), extractos de células de tumor ou subunidades de proteínas de antigénio de tumor, tal como Her-2/neu, Marti, antigénios carcinoembrionários (CEA), gangliósidos, glóbulo de gordura do leite humano (HMFG), mucina (MUC1), antigénios MAGE, antigénios BAGE, antigénios GAGE, gplOO, antigénio especifico de próstata (PSA) e tirosinase. Podem formar-se vacinas para contracepção imuno-baseada incluindo proteínas de esperma administradas com os CIC. Lea et al. (1996) Biochim. Biophys. Acta 1307:263.
Os vírus atenuados e inactivados são adequados para utilização aqui como antigénio. A preparação destes vírus é bem conhecida na especialidade e muitos estão disponíveis comercialmente (consultar, e.g., Physicians' Desk Reference (1998) 52a edição, Medicai Economics Company, Inc.). Por exemplo, o vírus polio encontra-se disponível como IPOL® (Pasteur Merieux Connaught) e ORIMUNE® (Lederle Laboratories), o vírus de hepatite A como VAQTA® (Merck), o vírus do sarampo como ATTENUVAX® (Merck), o vírus da papeira como MUMPSVAX® (Merck) e o vírus da rubéola como MERUVAX®II (Merck). Adicionalmente, os vírus atenuados e inactivados, tal como VIH-1, VIH-2, vírus de herpes simplex, vírus da hepatite B, rotavírus, papilomavírus humano e não humano e 84 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ vírus cerebral de acção lenta podem proporcionar antigénios peptídicos.
Em algumas concretizações, o antigénio contém um vector vírico, tal como vaccinia, adenovírus e vírus da varíola do canário.
Os antigénios podem ser isolados da sua fonte utilizando técnicas de purificação conhecidas na especialidade ou, mais convenientemente, podem ser produzidos utilizando métodos recombinantes.
Os péptidos antigénicos podem incluir péptidos nativos purificados, péptidos sintéticos, proteínas recombinantes, extractos de proteína impuros, vírus atenuados ou inactivados, células, microrganismos ou fragmentos de tais péptidos. Os péptidos de imunomodulação podem ser nativos ou podem ser sintetizados química ou enzimaticamente. Qualquer método de síntese química conhecido na especialidade é adequado. Pode utilizar-se síntese peptídica em fase de solução para construir péptidos de tamanho moderado ou pode utilizar-se síntese em fase sólida para a construção química de péptidos. Atherton et al. (1981) Hoppe Seylers Z. Physiol. Chem. 362:833-839. Também se podem utilizar enzimas proteoliticas para acoplar aminoácidos para produzir péptidos. Kullmann (1987) Enzymatic Peptide Synthesis, CRC Press, Inc. Alternativamente o péptido pode ser obtido por utilização da maquinaria bioquímica de uma célula ou por isolamento de uma fonte biológica. Podem utilizar-se técnicas de ADN recombinante para a produção de péptidos. Hames et al. (1987) Transcription and Translation: A Practical Approach, IRL Press. Os péptidos podem também ser isolados utilizando técnicas padrão, tal como cromatografia de afinidade.
Preferentemente os antigénios são péptidos, lípidos (e.g., esteróis excluindo colesterol, ácidos gordos e fosfolípidos), polissacáridos, tal como os utilizados em vacinas de H. influenza, gangliósidos e glicoproteínas. Estes podem ser obtidos através de vários métodos conhecidos na especialidade, incluindo isolamento e síntese utilizando métodos químicos e enzimáticos. Em determinados casos, tal como para muitos esteróis, ácidos gordos e fosfolípidos, as 85 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ partes antigénicas das moléculas encontram-se disponíveis comercialmente.
Os exemplos de antigénios viricos úteis nas presentes composições e métodos utilizando as composições incluem antigénios de VIH, não se lhes limitando: Tais antigénios incluem os antigénios derivados de glicoproteínas de invólucro de VIH, não se lhes limitando, incluindo gp 160, gp 120 e gp41, não se lhes limitando. São conhecidas numerosas sequências para genes e antigénios de VIH. Por exemplo, a base de dados de sequências de VIH de Los Alamos National
Laboratory recolhe, mantém e anota as sequências de nucleótidos e de aminoácidos de VIH. Tal base de dados encontra-se acessível através da internet em http://hiv- web.lanl.gov/ e numa publicação anual, consultar Human Retroviruses and AIDS Compendium (por exemplo, edição de 2000) .
Podem obter-se antigénios derivados de agentes infecciosos utilizando métodos conhecidos na especialidade, por exemplo, de extractos viricos ou bacterianos nativos, de células infectadas com o agente infeccioso, de polipéptidos purificados, de polipéptidos produzidos recombinantemente e/ou como péptidos sintéticos.
Os CIC podem ser administrados em combinação com antigénio de várias formas. Em algumas concretizações, administra-se um CIC e antigénio numa localização espacial próxima uma da outra. Tal como descrito seguidamente, a proximidade espacial pode ser conseguida de várias formas, incluindo conjugação, encapsidação, através de afixação a uma plataforma ou adsorção numa superfície. Numa concretização, um CIC e antigénio são administrados como uma mistura (e.g., em solução). Considera-se especificamente que, em determinadas concretizações, o CIC não está conjugado a um imunogénio ou antigénio.
Em algumas concretizações, o CIC está ligado a um polipéptido, e.g., um antigénio. A parte de CIC pode ser ligada à parte de antigénio de um conjugado de várias formas, incluindo interacções covalentes e/ou não covalentes, através da parte de ácido nucleico ou da parte espaçadora que não é 86 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ de ácido nucleico. Em algumas concretizações, a ligação é através de um grupo reactivo tal como tio, amina, carboxilato, aldeído, hidrizina, hidrizona, dissulfureto e semelhantes, não se lhes limitando. A ligação entre as partes pode ser feita na extremidade 3' ou 5' de uma parte de ácido nucleico ou numa base modificada adequadamente numa posição interna na parte de ácido nucleico. Por exemplo, se o antigénio é um péptido e contém um grupo reactivo adequado (e.g., um éster de N-hidroxissuccinimida) este pode reagir directamente com o grupo amina N4 de resíduos de citosina. Dependendo do número e localização dos resíduos de citosina no CIC, pode conseguir-se acoplamento específico num ou mais resíduos.
Alternativamente podem incorporar-se oligonucleósidos modificados, tal como são conhecidos na especialidade, em qualquer dos terminais ou em posições internas no CIC. Estes podem conter grupos funcionais bloqueados que, quando desbloqueados, são reactivos com uma variedade de grupos funcionais que podem estar presentes ou ligados ao antigénio de interesse.
Quando o antigénio é um péptido, esta parte do conjugado pode ser ligada à parte de ácido nucleico ou parte espaçadora através de química em suporte sólido. Por exemplo, pode adicionar-se uma parte de ácido nucleico de um CIC a uma parte de polipéptido que foi pré-sintetizada num suporte. Haralambidis et al. (1990) Nucleic Acids Res. 18:493-499; e Haralambidis et al. (1990) Nucleic Acids Res. 18:501-505.
Alternativamente, o CIC pode ser sintetizado de modo a ser ligado a um suporte sólido através de um ligante clivável que se estende a partir da extremidade 3' de uma parte de ácido nucleico. Por clivagem química do CIC do suporte, deixa-se um grupo terminal tiol ou um grupo terminal amina na extremidade 3' da parte de ácido nucleico (Zuckermann et al., 1987, Nucleic Acids Res. 15:5305-5321; Corey et al., 1987, Science 238:1401-1403; Nelson et al., 1989, Nucleic Acids Res. 17:1781-1794). A conjugação do CIC modificado com amino a grupos amina do péptido pode ser efectuada como descrito em Benoit et al. (1987) Neuromethods 6:43-72. A conjugação do 87 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ CIC modificado com tiol a grupos carboxilo do péptido pode ser efectuada tal como descrito em Sinah et al. (1991) Oligonucleotide Analogues: A Practical Approach, IRL Press. Também foi descrito o acoplamento de uma parte de ácido nucleico ou espaçador com uma maleimida ligada ao tiol da cadeia lateral de um residuo de cisterna de um péptido. Tung et al. (1991) Bioconjug. Chem. 2:464-465. A parte de péptido do conjugado pode ser ligada a uma extremidade 5' livre de uma parte de ácido nucleico, através de um grupo amina, tiol ou carboxilo que foi incorporado na parte de ácido nucleico ou espaçador (e.g., através de uma extremidade 5' ou extremidade 3' livres, através de uma base modificada e semelhantes).
Convenientemente pode ligar-se covalentemente um grupo de ligação compreendendo uma amina, tiol ou carboxilo protegidos numa extremidade e uma fosforamidite a um grupo hidroxilo de um CIC. Agrawal et al. (1986) Nucleic Acids Res. 14:6227-6245; Connolly (1985) Nucleic Acids Res. 13:4485-4502; Kremsky et al. (1987) Nucleic Acids Res. 15:2891-2909; Connolly (1987) Nucleic Acids Res. 15:3131-3139; Bischoff et al. (1987) Anal. Biochem. 164:336-344; Blanks et al. (1988) Nucleic Acids Res. 16:10283-10299; e patentes U.S. N° 4 849 513, 5 015 733, 5 118 800 e 5 118 802. Após desprotecção, podem utilizar-se as funcionalidades amina, tiol e carboxilo para ligar covalentemente o CIC a um péptido. Benoit et al. (1987); e Sinah et al. (1991).
Pode também formar-se um conjugado CIC-antigénio através de interacções não covalentes, tais como ligações iónicas, interacções hidrofóbicas, ligações de hidrogénio e/ou atracções de van der Waals.
Os conjugados ligados não covalentemente podem incluir uma interacção não covalente, tal como um complexo biotina-estreptavidina. Pode ligar-se um grupo biotinilo, por exemplo, a uma base modificada de um CIC. Roget et al. (1989) Nucleic Acids Res. 17:7643-7651. A incorporação de uma parte de estreptavidina na parte de péptido permite a formação de um complexo ligado não covalentemente do péptido conjugado com estreptavidina e do oligonucleótido biotinilado. 88 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Também podem ocorrer associações não covalentes através de interacções iónicas envolvendo um CIC e resíduos no interior do antigénio, tal como aminoácidos carregados, ou através da utilização de uma parte de ligante compreendendo resíduos carregados que podem interactuar tanto com o oligonucleótido, como com o antigénio. Por exemplo, pode ocorrer conjugação não covalente entre um CIC geralmente carregado negativamente e resíduos de aminoácidos carregados positivamente de um péptido, e.g., resíduos polilisina, poliarginina e poli-histidina.
Pode ocorrer conjugação não covalente entre CIC e antigénios através de motivos de ligação de ADN de moléculas que interactuam com AND, como os seus ligandos naturais. Por exemplo, podem encontrar-se tais motivos de ligação de ADN em factores de transcrição e anticorpos anti-ADN. A ligação do CIC a um lípido pode ser formada utilizando métodos padrão. Estes métodos incluem a síntese de conjugados oligonucleótido-fosfolípido (Yanagawa et al. (1988) Nucleic Acids Symp. Ser. 19:189-192), conjugados oligonucleótido-ácido gordo (Grabarek et al. (1990) Anal. Biochem. 185:131-135; e Staros et al. (1986) Anal. Biochem. 156:220-222) e conjugados oligonucleótido-esterol, Boujrad et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sei. USA 90:5728-5731, não se lhes limitando. A ligação do oligonucleótido a um oligossacárido pode ser formada utilizando métodos conhecidos padrão. Estes métodos incluem a síntese de conjugados oligonucleótido-oligossacárido, em que o oligossacárido é uma parte de uma imunoglobulina, 0'Shannessy et al. (1985) J. Applied Biochem. 7:347-355, não se lhes limitando.
Podem encontrar-se métodos adicionais para a ligação de péptidos e outras moléculas a oligonucleótidos em patente U.S. N° 5 391 723; Kessler (1992) "Nonradioactive labeling methods for nucleic acids" em Kricka (ed.) Nonisotopic DNA Probe Techniques, Academic Press; e Geoghegan et al. (1992) Bioconjug. Chem. 3:138-146. 89 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Pode associar-se em proximidade um CIC com um ou mais antigénios de outras formas. Em algumas concretizações, um CIC e antigénio estão associados proximamente por encapsulação. Noutras concretizações, um CIC e antigénio estão associados em proximidade por ligação a uma molécula de plataforma. Uma "molécula de plataforma" (também denominada "plataforma") é uma molécula contendo locais que permitem a ligação de um CIC e antigénio(s). Noutras concretizações, um CIC e antigénio estão associados em proximidade por adsorção a uma superfície, preferentemente uma partícula transportadora.
Em algumas concretizações, os métodos do invento utilizam um agente de encapsulação que podem manter a associação em proximidade de um CIC e de um primeiro antigénio até que o complexo fique disponível para o alvo (ou composições compreendendo tais agentes de encapsulação). Preferentemente, a composição compreendendo um CIC, antigénio e agente de encapsulação está sob a forma de emulsões adjuvantes de óleo-em-água, micropartículas e/ou lipossomas. Mais preferentemente, as emulsões adjuvantes de óleo-em-água, micropartículas e/ou lipossomas que encapsulam um CIC estão sob a forma de partículas de cerca de 0,04 pm a cerca de 100 pm de tamanho, preferentemente qualquer das seguintes gamas: de cerca de 0,1 pm a cerca de 20 pm; de cerca de 0,15 pm a cerca de 10 pm; de cerca de 0,05 pm a cerca de 1,00 pm; de cerca de 0,05 pm a cerca de 0,5 pm.
Os sistemas de dispersão coloidais, tais como microesferas, pérolas, complexos macromoleculares, nanocápsulas e sistemas baseados em lípidos, tais como emulsões óleo-em-água, micelas, micelas mistas e lipossomas podem proporcionar encapsulação eficaz de composições contendo CIC. A composição de encapsulação contém adicionalmente qualquer de uma grande variedade de componentes. Estes incluem alúmen, lípidos, fosfolípidos, estruturas de membrana lipídica (LMS), polietilenoglicol (PEG) e outros polímeros, tal como polipéptidos, glicopéptidos e polissacáridos, não se lhes limitando. 90 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Os polipéptidos adequados para componentes de encapsulação incluem qualquer um conhecido na especialidade e incluem proteínas de liqação de ácido qordo, não se lhes limitando. Os polipéptidos modificados contêm qualquer de várias modificações, incluindo glicosilação, fosforilação, miristilação, sulfação e hidroxilação, não se lhes limitando. Tal como aqui utilizado, um polipéptido adequado é aquele que protegerá uma composição contendo CIC para preservar a sua actividade de imunomodulação. Os exemplos de proteínas de ligação incluem albuminas, tal como albumina de soro bovina (BSA) e albumina da ervilha, não se lhes limitando.
Outros polímeros adequados podem ser quaisquer conhecidos na especialidade de produtos farmacêuticos e incluem polímeros de ocorrência natural, tal como dextranos, hidroxietilamido e polissacáridos e polímeros sintéticos, não se lhes limitando. Os exemplos de polímeros de ocorrência natural incluem proteínas, glicopéptidos, polissacáridos, dextrano e lípidos. 0 polímero adicional pode ser um polímero sintético. Os exemplos de polímeros sintéticos que são adequados para utilização no presente invento incluem polialquilglicóis (PAG) tal como PEG, polióis polioxietilados (POP), tal como glicerol polioxietilado (POG), politrimetilenoglicol (PTG) polipropilenoglicol (PPG), poli-hidroxietilmetacrilato, polivinilálcool (PVA), ácido poliacrílico, polietiloxazolina, poliacrilamida, polivinilpirrolidona (PVP), poliaminoácidos, poliuretano e polifosfazeno, não se lhes limitando. Os polímeros sintéticos podem também ser lineares ou ramificados, substituídos ou não substituídos, homopoliméricos, co-polímeros ou co-polímeros em bloco de dois ou mais monómeros sintéticos diferentes.
Os PEG para utilização em composições de encapsulação do presente invento são comprados a fornecedores de produtos químicos ou sintetizados utilizando técnicas conhecidas dos peritos na especialidade. A expressão "LMS", tal como aqui utilizada, significa partículas de lípido lamelares em que os grupos de cabeça polar de um lípido polar estão arranjados de modo a estarem em contacto com a fase aquosa de uma interface para formar estruturas membranares. Os exemplos de LMS incluem 91 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ lipossomas, micelas, cocleatos (i.e., lipossomas geralmente cilíndricos), micro-emulsões, vesículas unilamelares, vesículas multilamelares e semelhantes.
Um sistema de dispersão coloidal útil na administração de CIC é um lipossoma. Em ratinhos imunizados com um antigénio encapsulado em lipossoma, pareceu que os lipossomas melhoram a resposta imunitária do tipo Thl ao antigénio. Aramaki et al. (1995) Vaccine 13:1809-1814. Tal como aqui utilizado, um "lipossoma" ou "vesícula lipídica" é uma pequena vesícula circundada por pelo menos uma e possivelmente mais do que uma bicamada de membrana lipídica. Os lipossomas são preparados artificialmente a partir de fosfolípidos, glicolípidos, lípidos, esteróides, tal como colesterol, moléculas relacionadas ou uma sua combinação, por qualquer técnica conhecida na especialidade, incluindo sonicação, extrusão ou remoção de detergente de complexos lípido-detergente mas não se lhes limitando. Um lipossoma pode também compreender opcionalmente componentes adicionais, tal como um componente de direcção a alvo de tecido. Entende-se que uma "membrana lipídica" ou "bicamada lipídica" não tem necessariamente que consistir exclusivamente de lípidos, mas pode conter adicionalmente quaisquer outros componentes adequados, incluindo colesterol e outros esteróides, compostos químicos solúveis em lípidos, proteínas de qualquer comprimento e outras moléculas anfipáticas, não se lhes limitando, desde que a estrutura geral da membrana seja uma folha de duas superfícies hidrofílicas que revestem um núcleo hidrofóbico. Para uma discussão geral da estrutura de membranas, consultar The Encyclopedia of Molecular Biology por J. Kendrew (1994). Para lípidos adequados consultar e.g., Lasic (1993) "Lipossomes: from Physics to Applications" Elsevier, Amsterdam. São conhecidos na especialidade processos para preparar lipossomas contendo composições que contêm CIC. Podem preparar-se as vesículas lipídicas por qualquer técnica adequada conhecida na especialidade. Os métodos incluem microencapsulação, microfluidização, método LLC, injecção de etanol, injecção de freon, o método das "bolhas", diálise de detergente, hidratação, sonicação e evaporação de fase reversa. Revisto em Watwe et al. (1995) Curr. Sei. 68:715- 92 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 724. As técnicas podem ser combinadas de forma a obter vesículas com as características mais desejáveis. O invento abrange também a utilização de LMS contendo componentes de direcção a alvos de tecido ou celulares. Tais componentes de direcção a alvo são componentes de um LMS que melhoram a sua acumulação em determinados locais de tecido ou celulares, de preferência a outros locais de tecido ou celulares, quando a administrados a um animal intacto, órgão ou cultura celular. Um componente de direcção ao alvo está geralmente acessível ao exterior do lipossoma e assim liga-se preferentemente à superfície exterior ou insere-se preferencialmente na bicamada lipídica exterior. Um componente de direcção ao alvo pode ser, entre outros, um péptido, uma região de um péptido maior, um anticorpo específico para uma molécula ou marcador de superfície celular ou seu fragmento de ligação de antigénio, um ácido nucleico, um hidrato de carbono, uma região de um hidrato de carbono complexo, um lípido especial ou uma molécula pequena, tal como um fármaco, hormona ou hapteno, ligada a qualquer uma das moléculas citadas anteriormente. São conhecidos na especialidade anticorpos com especificidade para marcadores de superfície celular específicos de tipo de célula e são facilmente preparados por métodos conhecidos na especialidade.
Os LMS podem ser dirigidos a alvos de qualquer tipo de célula para a qual se deve dirigir um tratamento terapêutico, e.g., um tipo de célula que pode modular e/ou participar numa resposta imunitária. Tais células e órgãos alvo incluem APC, tal como macrófagos, células dendríticas e linfócitos, estruturas linfáticas, tal como nódulos linfáticos e o baço e estruturas não linfáticas, particularmente aquelas em que se encontram células dendríticas, não se lhes limitando.
As composições LMS do presente invento podem adicionalmente compreender tensioactivos. Os tensioactivos podem ser catiónicos, aniónicos, anfifílicos ou não iónicos. Os tensioactivos não iónicos são uma classe de tensioactivos preferidos; são particularmente preferidos aqueles que são solúveis em água. 93 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Em algumas concretizações o CIC e o antigénio estão associados em proximidade por ligação a uma molécula plataforma tal como uma plataforma de valência proteácea ou não proteácea (e.g., sintética). Descrevem-se anteriormente exemplos de plataformas adequadas, na discussão sobre plataformas de valência utilizadas como uma parte espaçadora num CIC. A ligação de antigénios a plataformas de valência pode efectuar-se utilizando métodos de rotina. Como exemplo, os polipéptidos contêm partes de cadeias laterais de aminoácidos com grupos funcionais tais como grupos amino, carboxilo ou sulfidrilo que servem como locais para acoplamento do polipéptido à plataforma. Podem adicionar-se ao polipéptido resíduos que têm tais grupos funcionais se o polipéptido não apresentar já esses grupos. Tais resíduos podem ser incorporados por técnicas de síntese em fase sólida ou técnicas recombinantes, sendo ambas bem conhecidas na especialidade de síntese de péptidos. Quando o polipéptido tem uma ou mais cadeias de hidratos de carbono (ou se o antigénio for um hidrato de carbono), podem aí incorporar-se grupos funcionais amino, sulfidrilo e/ou aldeído por química convencional. Por exemplo, podem incorporar-se grupos amino primários por reacção do açúcar oxidado com etilenodiamina na presença de cianoboro-hidreto de sódio, podem introduzir-se sulfidrilos por reacção de dicloridrato de cisteamina seguido de redução com um agente de redução de dissulfureto padrão e podem gerar-se grupos aldeído seguindo oxidação de periodato. De modo semelhante, pode também derivatizar-se a molécula plataforma para conter grupos funcionais caso não apresente já grupos funcionais adequados.
Noutra concretização co-administram-se um CIC e um antigénio adsorvendo ambos a uma superfície tal como uma nanopartícuia ou microtransportador. A adsorção de um CIC e/ou antigénio a uma superfície pode ocorrer através de interacções não-covalentes incluindo interacções iónicas e/ou hidrofóbicas. A adsorção de polinucleótidos e polipéptidos a uma superfície com o objectivo de entregar as moléculas adsorvidas a células é bem conhecida na especialidade. Consultar, por exemplo, Douglas et al. (1987) Crit. Rev. Ther. Drug. Carrier Syst. 3:233-261; Hagiwara et al. (1987) In Vivo 1:241-252; Bousquet et al. (1999) Pharm. Res. 16:141-147; e Kossovsky et al., patente U.S. 5 460 831. 94 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Preferentemente ο material compreendendo a superfície adsorvente é biodegradável.
De um modo geral as caracteristicas das nanoparticulas tal como carga superficial, tamanho de partícula e peso molecular, dependem das condições de polimerização, da concentração de monómero e da presença de estabilizantes durante o processo de polimerização (Douglas et al., 1987, anteriormente). Pode modificar-se a superfície das partículas transportadoras, por exemplo, com um revestimento de superfície de modo a permitir ou melhorar a adsorção do CIC e/ou antigénio. As partículas transportadoras com CIC e/ou antigénio adsorvidos podem ser adicionalmente revestidas com outras substâncias. A adição de tais outras substâncias pode, por exemplo, prolongar a semivida das partículas após administração ao indivíduo e/ou pode dirigir as partículas a um tipo específico de células ou tecido, tal como aqui descrito.
Descreveram-se superfícies nanocristalinas às quais se podem adsorver um CIC e antigénio (consultar, por exemplo, patente U.S. 5 460 831). As partículas de núcleo nanocristalino (com diâmetros de 1 pm ou menos) estão revestidas com uma camada de modificação de energia superficial que promove a adsorção de polipéptidos, polinucleótidos e/ou outros agentes farmacêuticos. Tal como descrito na patente U.S. 5 460 831, por exemplo, reveste-se uma partícula de núcleo com uma superfície que promove adsorção de um oligonucleótido e que é subsequentemente revestida com uma preparação de antigénio, por exemplo, sob a forma de uma mistura lípido-antigénio. Tais nanoparticulas são complexos auto-montados de partículas de tamanho nanométrico, tipicamente na ordem de 0,1 pm, que apresentam uma camada interior de CIC e uma camada exterior de antigénio.
Outra superfície adsorvente são nanoparticulas produzidas pela polimerização de alquilcianoacrilatos. Os alquilcianoacrilatos podem ser polimerizados em meio aquoso acidificado por um processo de polimerização aniónica. Dependendo das condições de polimerização, as partículas pequenas tendem a apresentar tamanhos na gama de 20 a 3000 nm 95 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ e é possível produzir nanopartícuias com características de superfície específicas e com cargas superficiais específicas (Douglas et ai., 1987, anteriormente). Por exemplo, podem adsorver-se oligonucleótidos a nanoparticulas de poli-isobutilo e poli-iso-hexilcianoacrilato na presença de catiões hidrofóbicos tais como cloreto de tetrafenilfosfónio ou sais de amónio quaternários tal como brometo de cetiltrimetilamónio. A adsorção de oligonucleótidos a estas nanoparticulas parece ser mediada pela formação de pares iónicos entre grupos fosfato carregados negativamente da cadeia de ácido nucleico e os catiões hidrofóbicos. Consultar, por exemplo, Lambert et al. (1998) Biochimie 80 : 969-976, Chavany et al. (1994) Pharm. Res. 11:1370-1378; Chavany et al. (1992) Pharm. Res. 9:441-449. Podem também adsorver-se polipéptidos a nanoparticulas de polialquilcianoacrilato. Consultar, por exemplo, Douglas et al.,1987; Schroeder et al. (1998) Peptides 19:777-780.
Outra superfície adsorvente são nanoparticulas produzidas por polimerização de malonato de metilideno. Por exemplo, tal como descrito em Bousquet et al., 1999, os polipéptidos adsorvidos a nanoparticulas de poli(malonato de metilideno 2.1.2) parecem fazê-lo inicialmente através de forças electrostáticas seguido de estabilização através de forças hidrofóbicas. C. Adjuvantes adicionais
Pode também administrar-se um CIC em conjunção com um adjuvante. A administração de um antigénio com um CIC e um adjuvante potência uma resposta imunitária ao antigénio e pode assim resultar numa resposta imunitária aumentada relativamente à resultante de uma composição compreendendo apenas CIC e antigénio. Os adjuvantes são conhecidos na especialidade e incluem, não se lhes limitando, emulsões de óleo em água, emulsões de água em óleo, alúmen (sais de alumínio), lipossomas e micropartículas, incluindo poliestireno, amido, polifoafazeno e polilactídeo/poliglicosídeos, não se lhes limitando. Outros adjuvantes adequados também incluem MF59, DETOX™ (Ribi), misturas de esqualeno (SAF-1), péptido de muramilo, derivados de saponina, preparações de parede celular de micobactérias, 96 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ monofosforil lípido A, derivados de ácido micólico, tensioactivos de copolimeros em bloco não iónicos, Quil A, subunidade de toxina B de cólera, polifosfazeno e derivados e complexos de imunoestimulação (ISCOM) tal como os descritos por Takahashi et al. (1990) Nature 344:873-875, assim como adjuvantes baseados em lipidos e outros aqui descritos, não se lhes limitando. Para uso veterinário e para a produção de anticorpos em animais podem usar-se componentes mitogénicos de adjuvante de Freund (tanto completo como incompleto). IV. Métodos do invento 0 invento proporciona métodos de modular uma resposta imunitária num indivíduo preferentemente um mamífero, com maior preferência um humano, compreendendo administrar ao indivíduo um CIC tal como aqui descrito. A imunomodulação pode incluir estimular uma resposta imunitária do tipo Thl e/ou inibir ou reduzir uma resposta imunitária do tipo Th2. Administra-se o CIC numa quantidade suficiente para modular uma resposta imunitária. Tal como aqui descrito, a modulação de uma resposta imunitária pode ser humoral e/ou celular e mede-se utilizando técnicas padrão na especialidade e tal como aqui descrito. Vários indivíduos são adequados para receber o(s) CIC(s) aqui descrito(s). Preferentemente, mas não necessariamente, o indivíduo é humano.
Em determinadas concretizações o indivíduo sofre de uma doença associada a resposta imunitária do tipo Th2, tal como (entre outras) alergias, asma induzida por alergias, dermatite atópica, inflamação gastrointestinal eosinofílica, esofagite eosinofílica e aspergilose broncopulmonar alérgica. A administração de um CIC resulta em imunomodulação, níveis aumentados de uma ou mais citocinas associadas a resposta imunitária do tipo Thl, que pode resultar numa redução das características de uma resposta do tipo Th2 associadas com a resposta do indivíduo a um alergénio. A imunomodulação de indivíduos com doenças associadas a resposta do tipo Th2 resulta numa redução ou melhoria de um ou mais dos sintomas da doença. Quando a doença é alergia ou asma induzida por alergia, a melhoria em um ou mais dos sintomas inclui uma 97
ΕΡ 1 404 873/PT redução em um ou mais dos seguintes: rinite, conjuntivite alérgica, níveis de IgE na circulação, níveis de histamina na circulação e/ou necessidade de terapia de inalador de 'salvação' (e.g., albuterol inalado administrado por inalador ou nebulizador de dose controlada).
Em concretizações adicionais o indivíduo sujeito à terapia de imunomodulação do invento é um indivíduo que recebe uma vacina. A vacina pode ser uma vacina profiláctica ou uma vacina terapêutica. Uma vacina profiláctica compreende um ou mais epítopos associados com uma doença para a qual o indivíduo pode estar em risco (e.g., antigénios de M tuberculosis como uma vacina para prevenção de tuberculose). As vacinas terapêuticas compreendem um ou mais epítopos associados com uma doença específica que afecte o indivíduo, tal como antigénios de superfície de M. tuberculosis ou M. bovis em doentes de tuberculose, antigénios aos quais o indivíduo é alérgico (i.e., terapia de dessensibilização de alergia) em indivíduos sujeitos a alergias, células tumorais de um indivíduo com cancro (e.g., tal como descrito em patente U.S. n° 5 484 596) ou antigénios associados a tumor em doentes de cancro. Pode administrar-se CIC em conjunção com a vacina (e.g., na mesma injecção ou numa injecção simultânea mas independente) ou pode administrar-se o CIC separadamente (e.g., pelo menos 12 horas antes ou após administração da vacina). Em determinadas concretizações, o(s) antigénio(s) da vacina é(são) parte do CIC por ligação covalente ou não covalente ao CIC. A administração de terapia CIC a um indivíduo que recebe uma vacina resulta numa resposta imunitária à vacina que está desviada para uma resposta do tipo Thl comparativamente com indivíduos que recebem vacina não contendo um CIC. O desvio para uma resposta do tipo Thl pode reconhecer-se através de uma resposta de hipersensibilidade do tipo atrasado (DTH) ao(s) antigénio(s) na vacina, aumento de IFN-γ e outras citocinas associadas a resposta do tipo Thl, produção de CTL específicos para o(s) antigénio(s) da vacina, níveis baixos ou reduzidos de IgE específico para o(s) antigénio(s) da vacina, uma redução de anticorpos associados a Th2 específicos para o(s) antigénio(s) da vacina e/ou um aumento de anticorpos associados a Thl específicos para o(s) antigénio(s) da vacina. No caso de vacinas terapêuticas, a 98 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ administração de CIC e vacina também resulta em melhoria de um ou mais sintomas da doença que a vacina pretende tratar. Tal como será evidente para o perito na especialidade, os sintomas exactos e a forma da sua melhoria dependerão da doença que se pretende tratar. Por exemplo, quando a vacina terapêutica é para tuberculose o tratamento de CIC em vacina resultará em redução da tosse, dores na pleura ou precordiais, febre e/ou outros sintomas conhecidos na especialidade. Quando a vacina é um alergénio utilizado em terapia de dessensibilização de alergia, o tratamento resulta numa redução do sintomas de alergia (e.g., redução da rinite, conjuntivite alérgica, níveis de IgE na circulação e/ou níveis de histamina na circulação).
Outras concretizações do invento referem-se a terapia de imunomodulação de indivíduos com uma doença preexistente tal como cancro ou uma doença infecciosa. O cancro é um alvo atraente para imunomodulação porque a maioria dos cancros expressam antigénios associados a tumor e/ou específicos de tumor que não se encontram noutras células do corpo. A estimulação de uma resposta do tipo Thl contra células de tumor resulta na morte directa e/ou por vizinhança de células de tumor pelo sistema imunitário, levando a uma redução de células cancerosas e uma redução dos sintomas. A administração de um CIC a um indivíduo com cancro resulta em estimulação de uma resposta imunitária do tipo Thl contra as células de tumor. Tal resposta imunitária pode matar células de tumor, quer por acção directa de células do sistema imunitário (e.g., CTL) ou componentes do sistema imunitário humoral, quer por efeitos de vizinhança em células próximas das células que são alvo do sistema imunitário incluindo macrófagos e células assassinas naturais (NK). Consultar, por exemplo, Cho et al. (2000) Nat. Biotechnol. 18:509-514. No tratamento de uma doença preexistente, podem administrar-se CIC conjuntamente com outros agentes imunoterapêuticos tal como citocinas, adjuvantes e anticorpos. Por exemplo, pode administrar-se um CIC como parte de um regime terapêutico que inclui administração de um agente de ligação que liga um antigénio apresentado por células tumorais. Os exemplos de agentes de ligação incluem anticorpos policlonais e monoclonais. Os exemplos de antigénios alvo incluem CD20, CD22, HER2 e outros conhecidos na especialidade ou a serem 99 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ futuramente revelados. Sem limitações teóricas, pensa-se que o CIC aumenta a morte de células tumorais às quais o agente de ligação está associado (e.g., por aumento da citotoxicidade celular dependente de anticorpo e/ou função de efector). O agente de ligação pode estar opcionalmente marcado, e.g., com um radioisótopo ou toxina que danifica uma célula à qual o agente de ligação está ligado. O CIC pode ser administrado conjuntamente com o agente (e.g., simultaneamente) ou antes ou depois (e.g., menos de 24 horas antes ou após administração do agente). Por exemplo, no caso de cancro, pode administrar-se o CIC conjuntamente com um agente quimioterapêutico que é útil ou que se suspeita que é útil para o tratamento de cancro. Noutro exemplo, pode administrar-se o CIC conjuntamente com terapia de radiação, terapia génica ou semelhantes. O CIC pode ser qualquer um dos aqui descritos. A terapia de imunomodulação de acordo com o invento é também útil para indivíduos com doenças infecciosas, especialmente doenças infecciosas que são resistentes a respostas imunitárias humorais (e.g., doenças causadas por infecções por micobactérias e patogéneos intracelulares). A terapia imunomodulatória pode ser utilizada para o tratamento de doenças infecciosas causadas por patogéneos celulares (e.g., bactérias ou protozoários) ou por patogéneos subcelulares (e.g., vírus). A terapia CIC pode administrar-se a indivíduos que sofram de doenças por micobactérias tal como tuberculose (e.g., infecções por M. tuberculosis e/ou M. bovis) , lepra (i.e., infecções por M. leprae) ou infecções por M. marinum ou M. ulcerans. A terapia CIC é também útil para o tratamento de infecções víricas, incluindo infecções por virus influenza, vírus sincicial respiratório (RSV), vírus de hepatite B, vírus de hepatite C, vírus de herpes, nomeadamente vírus de herpes simplex e vírus de papiloma. As doenças causadas por parasitas intracelulares tais como malária (e.g., infecção por Plasmodium vivax, P. ovale, P. falciparum e/ou P. malariae), leishmânia (e.g., infecção por Leishmania donovani, L. tropica, L. mexicana, L. braziliensis, L. peruviana, L. infantum, L. chagasi e/ou L. aethiopica) e toxoplasmose (i.e., infecção por Toxoplasmosis gondii) também beneficiam de terapia CIC. A terapia CIC também é útil para o tratamento de doenças parasitárias tais 100 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ como esquistossomíase (i.e., infecção por fascíolas sanguíneas do género Schistosoma tal como S. haematobium, S. mansoni, S. japonicum e S. mekongi) e clonorquíases (i.e., infecção por Clonorchis sinensis). A administração de um CIC a um indivíduo que padeça de uma doença infecciosa resulta numa melhoria de sintomas da doença infecciosa. Em algumas concretizações a doença infecciosa não é uma doença vírica. O invento proporciona adicionalmente métodos de aumentar ou estimular pelo menos uma citocina associada a Thl num indivíduo incluindo IL-2, IL-12, TNF-β, IFN-γ e IFN-α. Em determinadas concretizações, o invento proporciona métodos de aumentar ou estimular IFN-γ num indivíduo, particularmente num indivíduo com necessidade de aumentar os níveis de IFN-γ, por administração de uma quantidade eficaz de um CIC ao indivíduo tal como IFN-γ. Os indivíduos com necessidade de aumento de IFN-γ são aqueles com doenças que respondem à administração de IFN-γ. Tais doenças incluem várias doenças inflamatórias incluindo, colite ulcerativa e não se lhe limitando. Tais doenças também incluem várias doenças fibróticas, incluindo fibrose pulmonar idiopática (IPF), escleroderma, fibrose cutânea induzida por radiação, fibrose hepática incluindo fibrose hepática induzida por esquistossomíase, fibrose renal, não se lhes limitando, assim como outras doenças que podem ser melhoradas por administração de IFN-γ. A administração de um CIC de acordo com o invento resulta num aumento dos níveis de IFN-γ e resulta na melhoria de um ou mais sintomas, estabilização de um ou mais sintomas ou prevenção de progressão (e.g., redução ou eliminação de lesões ou sintomas adicionais) da doença que é sensível a IFN-γ. Os métodos do invento podem ser levados à prática em combinação com outras terapias que constituem o padrão de tratamento da doença, tal como administração de agentes anti-inflamatórios tal como terapia sistémica por corticosteróides (e.g., cortisona) em IPF.
Em determinadas concretizações o invento proporciona métodos de aumentar IFN-α num indivíduo, nomeadamente num indivíduo com necessidade de niveis aumentados de IFN-α; por administração de uma quantidade eficaz de um CIC a um indivíduo de modo a que os níveis de IFN-α sejam aumentados. Os indivíduos com necessidade de aumento de IFN-α são aqueles 101 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ com doenças que são sensíveis à administração de IFN-a, incluindo IFN-a recombinante, incluindo infecções viricas e cancro, não se lhes limitando. A administração de um CIC de acordo com o invento resulta num aumento dos níveis de IFN-α e resulta em melhoria de um ou mais sintomas, estabilização de um ou mais sintomas ou prevenção da progressão (e.g., redução ou eliminação de lesões ou sintomas adicionais) da doença que é sensível a IFN-α. Os métodos do invento podem ser levados à prática em combinação com outras terapias que constituam os cuidados padrão para a doença tal como administração de agentes anti-víricos para infecções viricas.
Tal como se tornará evidente por análise da presente divulgação, a composição do espaçador de um CIC pode afectar a resposta imunitária desencadeada por administração do CIC. Virtualmente todos os espaçadores ensaiados (com a excepção do dodecilo) podem ser usados em CIC para induzir eficazmente IFN-γ em PBMC humanas. Contudo, tem-se observado que a composição do espaçador de CIC lineares tem efeitos diferenciais na indução de IFN-α. Por exemplo, os CIC contendo espaçadores, por exemplo, HEG, TEG ou C6 tendem a causar maior indução de IFN-α (e proliferação de células B reduzida) em PBMC relativamente a CIC contendo espaçadores C3, C4 ou abásicos (consultar, e.g., exemplo 34, seguidamente).
Também se proporcionam métodos de reduzir os níveis, nomeadamente os níveis séricos de IgE num indivíduo com uma doença relacionada com IgE por administração de uma quantidade eficaz de um CIC ao indivíduo. Em tais métodos, o CIC pode ser administrado sozinho (e.g., sem antigénio) ou administrada com antigénio, tal como um alergénio. Uma doença relacionada com IgE é uma condição, doença ou conjunto de sintomas que melhoram por redução dos níveis de IgE. A redução de IgE resulta numa melhoria de sintomas da doença relacionada com IgE. Tais sintomas incluem sintomas de alergia tais como rinite, conjuntivite e sensibilidade diminuída a alergénios, uma redução dos sintomas de alergia num indivíduo com alergias ou uma redução da gravidade de uma resposta alérgica. 102 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Os métodos do invento incluem concretizações nas quais os CIC são administrados sob a forma de um ou mais complexos CIC/microtransportador.
Em algumas concretizações, o invento proporciona métodos de estimular produção de CTL num indivíduo, compreendendo administrar uma quantidade eficaz de um CIC ao indivíduo de modo a que a produção de CTL seja aumentada.
Tal como será evidente para o perito na especialidade, os métodos do invento podem ser levados à prática em combinação com outras terapias para a indicação específica para a qual se administra o CIC. Por exemplo, pode administrar-se terapia de CIC conjuntamente com fármacos anti-malária tal como cloroquina para doentes de malária, conjuntamente com fármacos contra leishmânia tal como pentamidina e/ou alopurinol para doentes de leishmânia, conjuntamente com fármacos anti-micobactérias tal como isoniazidas, rifampina e/ou etambutol em doentes de tuberculose ou conjuntamente com terapia de dessensibilização de alergénio para doentes atópicos (alergia). A. Administração e avaliação da resposta imunitária
Pode administrar-se o CIC em combinação com agentes farmacêuticos e/ou imunogénicos e/ou outros imunoestimulantes, tal como aqui descrito e pode ser combinada com um seu transportador fisiologicamente aceitável.
Por exemplo, pode administrar-se um CIC ou composição do invento conjuntamente com outros agentes imunoterapêuticos tal como citocinas, adjuvantes e anticorpos. Pode administrar-se o CIC conjuntamente com o agente (e.g., simultaneamente ou antes ou depois (e.g., menos de 24 horas antes ou após administração do agente) . O CIC pode ser qualquer dos aqui descritos.
Tal como todas as composições de imunoestimulação, as quantidades imunologicamente eficazes e o método de administração de uma formulação CIC específica podem variar de indivíduo para indivíduo, para a doença a tratar e outros 103 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ factores que são evidentes para o perito na especialidade. Os factores a ter em consideração incluem a presença de um antigénio em co-administração, administração do CIC com uma molécula adjuvante ou de entrega ou ligada covalentemente a esta, via de administração e número de doses de imunização a administrar. Tais factores são conhecidos na especialidade e insere-se no âmbito dos peritos na especialidade fazer tais determinações sem experiências desnecessárias. Uma dosagem adequada é aquela que proporciona a modulação de resposta imunitária pretendida ao antigénio. De um modo geral, determina-se a dosagem pela quantidade de CIC administrada ao doente e não pela quantidade total de CIC. As gamas de dosagem úteis do CIC, em quantidades de CIC entregue, podem ser, por exemplo, desde qualquer dos seguintes: 1 a 500 pg/kg, 100 a 400 pg/kg, 200 a 300 pg/kg, 1 a 100 pg/kg, 100 a 200 pg/kg, 300 a 400 pg/kg, 400 a 500 pg/kg. A quantidade absoluta administrada a cada doente depende das propriedades farmacológicas tais como biodisponibilidade, taxa de depuração e via de administração. A quantidade e método de administração eficazes da formulação CIC especifica podem variar com base no doente individual e no estágio da doença e outros factores evidentes para o perito na especialidade. A(s) via(s) de administração úteis numa aplicação especifica são evidentes para o perito na especialidade. As vias de administração incluem as vias tópica, dérmica, transdérmica, transmucosa, epidérmica, parentérica, gastrointestinal e nasofaringea e pulmonar, incluindo transbrônquica e transalveolar, não se lhes limitando. Uma gama de dosagem adequada é aquela que proporciona composição contendo CIC em quantidade suficiente para atingir uma concentração nos tecidos de cerca de 1-10 pM tal como medido por níveis sanguíneos. A quantidade absoluta administrada a cada doente depende de propriedades farmacológicas tais como biodisponibilidade, taxa de depuração e via de administração.
Tal como aqui descrito, são alvos preferidos par o CIC os APC e tecidos com concentração elevada de APC. Assim, prefere-se a administração de CIC a pele e/ou mucosa de mamífero nas quais as APC estão presentes em concentração relativamente elevada. 104 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Ο presente invento proporciona formulações CIC adequadas para aplicação tópica incluindo implantes fisiologicamente aceitáveis, pomadas, cremes, elixires e géis, não se lhes limitando. A administração tópica é, por exemplo, através de uma faixa ou ligadura com um sistema de entrega nela disperso, por administração directa de um sistema de entrega em incisões ou feridas abertas ou por dispositivo de administração transdérmico num local de interesse. Os cremes, elixires, géis ou pomadas com um CIC neles dispersos são adequados para uso como pomadas tópicas ou agentes de enchimento de feridas.
As vias preferidas de administração dérmica são aquelas que forem menos invasivas. Os meios preferidos de entre estes são transmissão transdérmica, administração epidérmica e injecção subcutânea. Destes meios, a administração epidérmica é preferida para maiores concentrações esperadas de APC no tecido intradérmico. A administração transdérmica é conseguida por aplicação de um creme, elixir, gel, etc. capaz de permitir que o CIC penetre na pele e entre no fluxo sanguíneo. As composições adequadas para administração transdérmica incluem suspensões, óleos, cremes e pomadas farmaceuticamente aceitáveis aplicados directamente na pele ou incorporados num transportador protector tal como um dispositivo transdérmico (também denominado "adesivo"), não se lhes limitando. Podem encontrar-se exemplos de cremes, pomadas, etc., adequados em, por exemplo, Physician's Desk Reference.
Para transmissão transdérmica, a iontoforese é um método adequado. Pode conseguir-se transmissão por iontoforese utilizando adesivos disponíveis comercialmente que entregam o seu produto continuamente através de pele sem feridas durante períodos de vários dias ou mais. 0 uso deste método permite transmissão controlada de composições farmacêuticas em concentrações relativamente elevadas, permite infusão de fármacos de combinação e permite o uso simultâneo de um promotor de absorção.
Um exemplo de produto de adesivo para utilização neste método é o produto de marca registada LECTRO PATCH de General 105 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Medicai Company of Los Angeles, CA. Este produto mantém electronicamente eléctrodos de reservatório a pH neutro e pode ser adaptado para proporcionar dosagens com diferentes concentrações para dosear continua e/ou periodicamente. A preparação e utilização do adesivo deve ser efectuada de acordo com as instruções impressas do fabricante que acompanham o produto LECTRO PATCH. São também adequados outros sistemas de adesivo oclusivo.
Para transmissão transdérmica é também um método adequado a entrega ultrassónica de baixa frequência. Mitragotri et al. (1995) Science 269:850-853. A aplicação de frequências ultrassónicas de baixa frequência (cerca de 1 MHz) permite a entrega de composições terapêuticas com controlo geral, incluindo as de elevado peso molecular. A administração epidérmica envolve essencialmente irritar mecânica ou quimicamente a camada mais externa da epiderme de forma suficiente para provocar uma resposta imunitária contra o agente irritante. Especificamente a irritação deve ser suficiente para atrair APC ao local da irritação.
Um exemplo de meio irritante mecânico utiliza uma multiplicidade de dentes curtos de diâmetro muito estreito que podem ser usados para irritar a pele e atrair APC ao local da irritação, para absorver CIC transferidas da extremidade dos dentes. Por exemplo, o teste de tuberculina antiga MONO-VACC fabricado por Pasteur Merieux de Lyon, França contém um dispositivo adequado para introdução de composições contendo CIC. O dispositivo (que é distribuído nos EUA por Connaught Laboratories, Inc. de Swiftwater, PA) consiste num recipiente de plástico com um êmbolo de seringa numa extremidade e um disco com dentes na outra. O disco com dentes é suporte de vários dentes de diâmetro estreito com um comprimento suficiente para apenas raspar a camada superficial de células epidérmicas. Cada um dos dentes do kit MONO-VACC está revestido com tuberculina antiga; no presente invento, cada agulha está revestida com uma composição farmacêutica de uma formulação CIC. O uso do dispositivo é preferentemente de acordo com as instruções escritas do fabricante incluídas com 106 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ ο produto de dispositivo. Os dispositivos semelhantes que podem também ser usados nesta concretização são aqueles que são habitualmente usados para efectuar testes de alergia.
Outra abordagem adequada à administração epidérmica de CIC é por utilização de um produto quimico que irrita as células exteriores da epiderme, provocando assim uma resposta imunitária suficiente para atrair APC para a área. Um exemplo é um agente queratolitico, tal como ácido salicilico usado no creme depilatório tópico disponível comercialmente por Noxema Corporation sob a marca registada NAIR. Esta abordagem pode também ser usada para conseguir administração epitelial na mucosa. 0 produto químico irritante pode também ser aplicado conjuntamente com o irritante mecânico (como ocorreria, por exemplo, se o dente do tipo MONO-VACC fosse também revestido com o produto químico irritante). Pode suspender-se o CIC num transportador que também contém o produto químico irritante ou pode ser co-administrado com este.
As vias de administração parentérica incluem as vias eléctrica (iontoforese) ou injecção directa tal como injecção directa numa linha venosa central, injecção intravenosa, intramuscular, intraperitoneal, intradérmica ou subcutânea queratolitico. As formulações de CIC adequadas para administração parentérica são geralmente formuladas em água USP ou água para injecção e podem compreender adicionalmente tampões de pH, agentes de enchimento salinos, conservantes e outros excipientes farmaceuticamente aceitáveis. Podem formular-se CIC para injecção parentérica em soluções isotónicas estéreis farmaceuticamente aceitáveis tal como soro fisiológico e solução salina tamponada com fosfato para injecção.
As vias de administração gastrointestinais incluem, entre outras, ingestão e rectal. 0 invento inclui formulações de CIC adequadas para administração gastrointestinal incluindo pós, comprimidos ou líquido farmaceuticamente aceitáveis para ingestão e supositórios para administração rectal, não se lhes limitando. Tal como será evidente para os peritos na especialidade, os comprimidos ou supositórios compreenderão adicionalmente sólidos farmaceuticamente aceitáveis, tais como amido, para proporcionar volume à composição. 107 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ A administração nasofaríngea e pulmonar inclui inalação e inclui vias de administração tais como as vias intranasal, transbrônquica e transalveolar. 0 invento inclui formulações de CIC adequadas para administração por inalação incluindo suspensões liquidas para formar aerossóis assim como formas em pó para sistemas de entrega por inalação de pó seco, não se lhes limitando. Os dispositivos adequados para administração por inalação de formulações CIC incluem atomizadores, vaporizadores, nebulizadores e dispositivos de entrega por inalação de pó seco, não se lhes limitando.
Pode utilizar-se a escolha das vias de administração para modular a resposta imunitária desencadeada. Por exemplo, os títulos de IgG e as actividades CTL foram idênticos quando se administrou um vector de vírus influenza pelas vias intramuscular ou epidérmica (pistola génica); contudo, a inoculação muscular proporcionou principalmente IgG2a, enquanto a via epidérmica proporcionou maioritariamente IgGl. Pertmer et al. (1996) J. Virol. 70:6119-6125. Assim, o perito na especialidade pode tirar vantagem de pequenas diferenças na imunogenicidade desencadeada por diferentes vias de administração dos oligonucleótidos de imunomodulação do presente invento.
Pretende-se que as composições e métodos de administração anteriormente mencionados descrevam de forma não limitativa os métodos de administrar as formulações de CIC do invento. Os métodos de produzir as diferentes composições e dispositivos encontram-se abrangidos pelas capacidades do perito na especialidade e não se descrevem aqui detalhadamente. A análise (qualitativa e quantitativa) da resposta imunitária ao CIC pode ser por qualquer método conhecido na especialidade, incluindo medir produção de anticorpo específica de antigénio (incluindo medir subclasses específicas de anticorpo), activação de populações específicas de linfócitos tais como células T CD4+, células NK ou CTL, produção de citocinas tais como IFN-γ, IFN-α, IL-2, IL-4, IL-5, IL-10 ou IL-12 e/ou libertação de histamina, não se lhes limitando. Os métodos para medir resposta 108 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ específica de anticorpo incluem ensaio de imunoabsorção enzimática (ELISA) e são bem conhecidos na especialidade. A medição de números de tipos de linfócitos específicos tais como células T CD4+ pode conseguir-se, por exemplo, com separação celular activada por fluorescência (FACS). Podem efectuar-se ensaios de citotoxicidade e CTL por exemplo tal como descrito em Raz et al. (1994) Proc. Natl. Acad. Sei. USA 91:9519-9523 e Cho et al. (2000). Podem medir-se concentrações de citocinas, por exemplo, por ELISA. Estes e outros ensaios para avaliar a resposta imunitária a um imunogénio são bem conhecidos na especialidade. Consultar, por exemplo, SELECTED METHODS IN CELLULAR IMMUNOLOGY (1980) Mishell e Shiigi, ed., W.H. Freeman e Co.
Preferentemente estimula-se uma resposta do tipo Thl, i.e., desencadeada e/ou aumentada. Com referência ao invento, pode determinar-se a estimulação de uma resposta imunitária do tipo Thl in vitro ou ex-vivo por medição de produção de citocinas a partir de células tratadas com um CIC comparativamente com células de controlo não tratadas com CIC. Os métodos para determinar a produção de citocinas pelas células incluem os métodos aqui descritos e quaisquer conhecidos na especialidade. O tipo de citocinas produzidas em resposta a tratamento com CIC indica uma resposta imunitária desviada para tipo Thl ou tipo Th2 pelas células. Tal como aqui utilizada, a expressão produção de citocina com "desvio para tipo Thl" refere-se ao aumento de produção de citocinas mensurável com uma resposta imunitária do tipo Thl na presença de um estimulante comparativamente com a produção de tais citocinas na ausência de estimulação. Os exemplos de tais citocinas com desvio para tipo Thl incluem IL-2, IL-12, IFN-γ e IFN-α, não se lhes limitando. Contrariamente, "citocinas com desvio para tipo Th2" refere-se às associadas com uma resposta imunitária de tipo Th2 e incluem IL-4, IL-5 e IL-13, não se lhes limitando. As células úteis para a determinação de actividade CIC incluem células do sistema imunitário, principalmente células isoladas de um hospedeiro e/ou linhas celulares, preferentemente APC e linfócitos, ainda mais preferentemente macrófagos e células T. A estimulação de uma resposta imunitária do tipo Thl pode também ser medida num hospedeiro tratado com um CIC e pode 109 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ ser determinada por qualquer método conhecido na especialidade incluindo, não se lhes limitando: (1) uma redução dos niveis de IL-4 ou IL-5 medidos antes e após provocação com antigénio; ou a detecção de niveis inferiores (ou mesmo nulos) de IL-4 ou IL-5 num hospedeiro tratado com CIC comparativamente com um controlo tratado sem CIC desencadeado com antigénio ou desencadeado e provocado; (2) um aumento dos niveis de IL-12, IL-18 e/ou IFN (a, β ou γ) antes e após provocação com antigénio; ou detecção de niveis superiores de IL-12, IL-18 e/ou IFN (α, β ou γ) num hospedeiro tratado com CIC comparativamente com um controlo tratado sem CIC desencadeado com antigénio ou desencadeado e provocado; (3) produção de anticorpo com "desvio para tipo Thl" num hospedeiro tratado com CIC comparativamente com um controlo tratado sem CIC; e/ou (4) uma redução dos niveis de IgE especifico de antigénio tal como medido antes e depois de provocação com antigénio; ou detecção de niveis inferiores (ou mesmo nulos) de IgE especifico de antigénio num hospedeiro tratado com CIC comparativamente com um controlo tratado sem CIC desencadeado com antigénio ou desencadeado e provocado. Várias destas determinações podem ser efectuadas por medição de citocinas produzidas por APC e/ou linfócitos, preferentemente macrófagos e/ou células T, in vitro ou ex vivo usando métodos descritos aqui ou quaisquer conhecidos na especialidade. Algumas destas determinações podem efectuar-se por medição da classe ou da subclasse de anticorpos específicos de antigénio usando métodos aqui descritos ou quaisquer conhecidos na especialidade. A classe e/ou subclasse de anticorpos específicos de antigénio produzidos em resposta a tratamento com CIC indica uma resposta imunitária desviada para tipo Thl ou para tipo Th2 pelas células. Tal como aqui utilizada, a expressão produção de anticorpo "desviada para tipo Thl" refere-se a uma produção aumentada mensurável de anticorpos associada com resposta imunitária do tipo Thl (i.e., anticorpos associados a Thl) . Podem medir-se um ou mais anticorpos associados a Thl. Exemplos de tais anticorpos desviados para tipo Thl incluem IgGl e/ou IgG3 humanos (consultar, e.g., Widhe et al. (1998) Scand. J. Immunol. 47:575-581 e de Martino et al. (1999) Ann. Allergy Asthma Immunol. 83:160-164) e IgG2a murina, não se lhes limitando. Contrariamente, "anticorpos 110 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ desviados para tipo Th2" refere-se aos associados com uma resposta imunitária do tipo Th2 e incluem IgG2, IgG4 e/ou IgE humanos (consultar, e.g., Widhe et al. (1998) e de Martino et al. (1999)) e IgGl e/ou IgE murinos, não se lhes limitando. A indução de citocinas desviadas para tipo Thl que ocorre em resultado da administração de CIC produz respostas imunitárias celulares aumentadas, tal como as produzidas por células NK, células assassinas citotóxicas, células auxiliadoras Thl e células de memória. Estas respostas são especialmente benéficas para uso em vacinação protectora ou terapêutica contra virus, fungos, parasitas protozoários, bactérias, doenças alérgicas e asma, assim como tumores.
Em algumas concretizações é suprimida uma resposta Th2. A supressão de uma resposta Th2 pode ser determinada, por exemplo, por redução dos níveis de citocinas associadas a Th2, tal como IL-4 e IL-5, assim como redução de IgE e redução da libertação de histamina em resposta a alergénio. V. Kits do invento 0 invento proporciona kits. Em certas concretizações, os kits do invento compreendem um ou mais recipientes compreendendo um CIC. Os kits podem compreender adicionalmente um conjunto adequado de instruções, geralmente instruções escritas, relacionadas com o uso do CIC para o tratamento pretendido (e.g., imunomodulação, melhoria de sintomas de uma doença infecciosa, níveis aumentados de IFN-γ, níveis aumentados de IFN-α ou melhoria de uma doença relacionada com IgE).
Os kits podem compreender CIC empacotado em qualquer pacote conveniente e apropriado. Por exemplo, se o CIC é uma formulação seca (e.g., liofilizada ou como pó seco), utiliza-se normalmente um frasquinho com uma tampa resistente, de modo a que o CIC possa ser facilmente ressuspenso por injecção de fluido através da tampa resistente. São mais convenientemente utilizadas ampolas com sistemas de fecho não resistentes e removíveis (e.g., vidro selado) ou tampas resistentes para formulações líquidas de CIC. Também se consideram pacotes para uso em combinação com um dispositivo 111 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ específico, tal como um inalador, dispositivo de administração nasal (e.g., um atomizador) ou um dispositivo de infusão tal como uma minibomba.
As instruções relativas ao uso de CIC incluem geralmente informação relativamente a dosagem, horário de dosagem e via de administração para o tratamento pretendido. Os recipientes de CIC podem ser doses unitárias, pacotes de quantidade (e.g., pacotes multi-dose) ou doses subunitárias. As instruções fornecidas nos kits do invento são tipicamente instruções escritas numa etiqueta ou folheto inserido (e.g., uma folha de papel incluída no kit), mas são também aceitáveis instruções legíveis por uma máquina (e.g., instruções transportadas num disco de armazenamento magnético ou óptico).
Em algumas concretizações, os kits compreendem adicionalmente um antigénio (ou um ou mais antigénios), que podem ou não estar empacotados no mesmo recipiente (formulação) que o(s) CIC. Os antigénios foram aqui descritos.
Em determinadas concretizações, os kits do invento compreendem um CIC sob a forma de um complexo CIC/microtransportador (CIC/MC) e podem compreender adicionalmente um conjunto de instruções, geralmente instruções escritas, referentes ao uso do complexo CIC/MC para o tratamento pretendido (e.g., imunomodulação, melhoria de sintomas de uma doença infecciosa, níveis aumentados de IFN-γ, níveis aumentados de IFN-α ou melhoria de uma doença relacionada com IgE).
Em algumas concretizações, os kits do invento compreendem materiais para a produção do complexo CIC/MC, incluem geralmente recipientes separados para CIC e MC apesar de em determinadas concretizações se fornecerem materiais para produzir o MC em vez de MC preformado. 0 CIC e MC são preferentemente fornecidos numa forma que permite formação do complexo CIC/MC por mistura dos CIC e MC fornecidos. Esta configuração é preferida quando o complexo CIC/MC está ligado por ligações não covalentes. Esta configuração é também preferida quando o CIC e MC são reticulados através de um 112 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ agente de reticulação heterobifuncional; tanto CIC como MC são fornecidos numa forma "activada" (e.g., ligada ao agente de reticulação heterobifuncional de modo a que uma parte reactiva com o CIC fique disponível).
Os kits para os complexos CIC/MC compreendendo um MC em fase liquida compreendem preferentemente um ou mais recipientes incluindo materiais para produzir MC em fase liquida. Por exemplo, um kit CIC/MC para MC em emulsão óleo-em-água pode compreender um ou mais recipientes contendo uma fase de óleo e uma fase aquosa. Os conteúdos do recipiente são emulsionados para produzir o MC, que pode então ser misturado com o CIC, preferentemente um CIC que foi modificada para incorporar uma parte hidrofóbica. Tais materiais incluem óleo e água para produção de emulsões óleo-em-água ou recipientes de componentes de lipossomas liofilizados (e.g., uma mistura de fosfolipidos, colesterol e um tensioact ivo) mais um ou mais recipientes de uma fase aquosa (e.g., um tampão aquoso farmaceuticamente aceitável). VI. Exemplos
Proporcionam-se os seguintes exemplos para ilustrar o invento não o limitando.
Exemplo 1: Estrutura de polinucleótidos e compostos quiméricos A tabela 2 apresenta as estruturas de polinucleótidos e moléculas quiméricas referidas nos exemplos. "HEG" é uma parte espaçadora hexa(etilenoglicol); "TEG" é trietilenoglicol; "C3" é uma parte espaçadora propilo; "C4" é um espaçador butilo; "C6" é um espaçador hexilo; "C12" é um espaçador dodecilo; "HME" é 2-hidroximetiletilo; "abásico" ou "ab" é 1'2'-didesoxirribose. Descrevem-se outros espaçadores neste fascículo e nas figuras.
Excepto nos casos anotados na tabela 2 ou em exemplos específicos, todas as ligações de nucleótidos e ligações entre partes de ácido nucleico e partes espaçadoras são éster fosforotiolato. Por exemplo, em CIC compreendendo partes espaçadoras compostas (subunidades múltiplas) com unidades 113 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ múltiplas HEG ou C3 (e.g., C-13, C-14, C-15, C-15, C-91, C-
92, C-36, C-37 e C-38), as unidades C3 ou HEG estão ligadas com um ligante fosforotiolato. De igual modo, as CIC ramificadas apresentadas (e.g., C-93, C-94, C-95, C-96, C-97, C-9 8, C-100, C-101, C-103, C-104, C-121, C-122, C-123, C-124, C-125, C-126, C-127, C-129, C-130) compreendem ligantes fosforotiolato entre a subunidade ramificada e a subunidade linear do espaçador. Preparam-se outras CIC ramificadas (e.g., C-26, C-99, C-102, C-105 e C-137) por estratégias de conjugação e têm grupos ligantes tal como descrito nos exemplos. A tabela 2 também inclui CIC (e.g., C-128, C-106- C-113) com um grupo ligante terminal (e.g., HS(CH2)6 - e HO (CH2) õSS (CH2) e) útil para ligar essas moléculas com partes espaçadoras ramificadas para criar CIC ramificadas. Consultar, e.g., exemplo 18. Estes grupos ligantes estão ligados ao CIC com uma ligação fosforotiolato. TABELA 2
COMPOSTOS E POLINUCLEÓTIDOS DE ENSAIO Número de designação dos compostos Estrutura P-l 5'-TCGTCGA-3' P-2 5'-TCGTCG-3' P-3 5'-ACGTTCG-3' P-4 5'-AGATGAT-3' P-5 5'-ATCTCGA-3' P-6 5' -TGA CTG TGA ACG TTC GAG ATG A-3' (SEQ ID NO:134) P-7 5' -TGA CTG TGA ACC TTA GAG ATG A-3' (SEQ ID NO:135) P-8 5'-TGACTGTGAAGGTTAGAGATGA-3' (SEQ ID NO:136) P-9 5' -CTGTGAACGTTCGAGATG-3' (SEQ ID NO:83) P-10 5'-TCGTCGAACGTTCGAGATG-3' (SEQ ID NO:41) P-ll 5'-AACGTT-3' P-12 5'-TCGTCGT-3' P-13 5'-TCGAGAT-3' 114 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Número de designação dos compostos Estrutura P—14 5'-TCGACGT-3' P-15 HO (CH2)èSS(CH2) 6-5'-TGACTGTGAACCTTAGAGATGA-3' (SEQ ID NO:137) P-16 HS(CH2) 6-5'-TGACTGTGAACCTTAGAGATGA-3' (SEQ ID NO:138) M-l 5' -TGCTGC-3'-HEG-5'-AGCTTGC-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-8 5' -TCGTCGA-3' -HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-9 5'-TCGTCGA-3'- C3-5'-ACGTTCG-3'-C3-5'-AGATGAT-3' C-10 5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-ll 5'-TCGTCG-3'- C3-5'-ACGTTCG-3'-C3-5'-AGATGAT-3' C-12 (5' -TCGTCGA-3')2-glicerol-3'-AGCTGCT-5' C-13 5' -TCGTCG-3' -(C3) 15-5'-T-3' C-14 5'-TCGTCG-3'-(HME) ls-5'-T-3' C-15 5'-TCGTCG-3'-(TEG)8-5' -T-3' C-16 5'-TCGTCG-3'-(HEG)4-5' -T-3' C-17 5' -TCGTCG-3'-C4-5' -ACGTTCG-3'-C4-5'-AGATGAT-3' C-18 5'-TCGTCG-3'-TEG-5'-ACGTTCG-3'-TEG-5'-AGATGAT-3' C-19 5' -TCGTCG-3'-C12-5'-ACGTTCG-3'-C12-5'-AGATGAT-3' C-2 0 5'-TCGTCG-3'-abásico-5'-ACGTTCG-3'-abásico-5'-AGATGAT-3' C-21 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' C-22 5' -TCGTCG-3'-HEG-5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-TCGTCG-3' C-23 5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-AACGTT-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-2 4 5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-25 5'-TCGTCG-3'-HME-5'-ACGTTCG-3'-HME-5'-AGATGAT-3' C-26 (5'-TCGTCGA-3') 4-R em que R = dendrímero Starburst ® (consultar ex. 18) C-2 7 (5' -TCGTCGA-3')2-glicerol-5'-AACGTTC-3' C-2 8 (5'-TCGTCGA-3')2-glicerol-5'-TCGTCGA-3' C-29 5' -TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-TEG C-30 HEG-5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-TEG C-31 HEG-5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-TEG (ligações fosfodiéster) C-32 õ^TCG-S-HEG-õ-TCG-S-HEG-S-TCG-S-HEG-S-TCG-S-HEG-õ-TCG- 3’-HEG-5’-TCG-3’ 115 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Número de designação dos compostos Estrutura C-33 5'-TCGTCGA-3'-C3-5'-TCGTCGA-3'-C3-5'-TCGTCGA-3' todas ligações fosforotiolato C-3 4 HS(CH2) 6-5'-TCGTCGA-3'-C3-5'-ACGTTCG-3'-C3-5'-AGATGAT-3' C-35 5’-TCGTCGA-3’ \ glicerol -5’-AGATGAT -3’ / 5’-AACGTTC-3’ C-36 5'-TCGTCGA-3'-(HEG)6-5'-TCGTCGA-3' (ligações fosfodiéster) C-3 7 5' -TCGTCGA-3'-(HEG)4-3 ' -AGCTGCT-5' C-3 8 5' -TCGTCGA-3'-(HEG)4-5' -TCGTCGA-3' C-39 5' -TCGTCGA-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' C-40 5' -TCGTCG-3'-HEG-5'-TCGA-3' C-41 5'-TCGTTTT-3'-HEG-5'-TCGTTTT-3'-HEG-5'-TCGTTTT-3' C-42 5'-TCGTCGT-3'-HEG-5'-TCGTCGT-3'-HEG-5'-TCGTCGT-3 ' C-43 5' -TCGTC-3'-HEG-5'-TCGTC-3'-HEG-5'-TCGTC-3'-HEG-5'-TCGTC-3' C-44 ^-TCGT-S^HEG-õ-TCGT-S^HEG-õ^TCGT-S^HEG-S-TCGT-S^HEG-S’- TCGT-3’ C-45 5'-TCGAGAT-3'-HEG-5'-TCGAGAT-3'-HEG-5'-TCGAGAT-3' C-46 5'-TTCGTTT-3'-HEG-5'-TTCGTTT-3'-HEG-5'-TTCGTTT-3 ' C-47 5'-TCGTCGT-3'-HEG-5'-TGTCGTT-3'-HEG-5'-TGTCGTT-3 ' C-48 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' C-49 5' -TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-GGGGGG-3' C-50 5'-TCGAACG-3'-HEG-5'-TCGAACG-3'-HEG-5'-TCGAACG-3' C-51 5'-TCGACGT-3'-HEG-5'-TCGACGT-3'-HEG-5'-TCGACGT-3' C-52 5'-CGTTCGA-3'-HEG-5'-CGTTCGA-3'-HEG-5'-CGTTCGA-3' C-53 5'-TGACTGTGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-5 4 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-55 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' C-56 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3' C-5 7 5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-58 5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' C-59 5'-AGATGAT-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3' 116 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Número de designação dos compostos Estrutura C-6 0 5'-AGATGAT-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' C-61 5'-TCCATTT-3'-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-TGACGTT-3' C-62 5'-TGACGTT-3'-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-TCCATTT-3' C-63 5'-TCGACTC-3'-HEG-5'-TCGAGCG-3'-HEG-5' -TTCTCTT-3 ' C-6 4 5’-CT GT G AAC GTT CG AG AT G-3’ (SEQ ID NO:83)-HEG-5’-CTGTGAACGTTCGAGATG-3’ (SEQ ID NO:83) C-65 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3'-HEG-3'-AGCTGCT-5' C-6 6 5’-TCGTCGMCGTTCGAGATG-3’ (SEQ ID NO:41)-HEG-5’-TCGTCGAACGTTCGAGATG-3’ (SEQ ID NO:41) C-6 7 5’-TCGTCGAACGTTCGAGATG-3’ (SEQ ID NO:41 )-HEG-3’-GTAGAGCTTGCAAGCTGCT-5’ (SEQ ID NO:41) C-6 8 5'-TCG-3'-HEG-5'-T-3' C-69 5'-TCGAT-3'-HEG-5'-TCGAT-3'-HEG-5'-TCGAT-3'-HEG-5'-TCGAT-3' C-7 0 5’-TCGTCGA-3’-HEG-5’-TCGTCGA-3’-HEG-5’-AACGTTC-3’-HEG-5’- AGAT-3’ C-71 SCTCGACGT-S^HEG-õ^TCGACGT-S^HEG-õ-TCGACGT-S^HEG-S’- TCGACGT-3’ C-72 5'-TCCTCCA-3'-HEG-5'-ACCTTAG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' (sem CG) C-73 5'-ACGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTCGA-3' C-7 4 5'-TCGATTT-3'-HEG-5'-TCGATTT-3'-HEG-5'-TCGATTT-3' C-75 5'-TTCGATT-3'-HEG-5'-TTCGATT-3'-HEG-5'-TTCGATT-3' C-76 5'-TTTCGAT-3'-HEG-5'-TTTCGAT-3'-HEG-5'-TTTCGAT-3' C-77 5'-TTTTCGA-3'-HEG-5'-TTTTCGA-3'-HEG-5'-TTTTCGA-3' C-78 5'-TCGCTTT-3'-HEG-5'-TCGCTTT-3'-HEG-5'-TCGCTTT-3 ' C-79 5'-TCGGTTT-3'-HEG-5'-TCGGTTT-3'-HEG-5'-TCGGTTT-3 ' C-8 0 5'-ACGATTT-3'-HEG-5'-ACGATTT-3'-HEG-5'-ACGATTT-3' C-81 5'-ATCGAT-3'-HEG-5'-ATCGAT-3'-HEG-5'-ATCGAT-3' C-82 5'-ATCGATT-3'-HEG-5'-ATCGATT-3'-HEG-5'-ATCGATT-3' 117 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Número de designação dos compostos Estrutura C-83 5'-AACGTT-3'-HEG-5'-AACGTT-3'-HEG-5'-AACGTT-3' C-8 4 C397: 5'-GsGs-3'-C3-5'-TGC-3'-C3-5'-ATCGAT-3'-C3-5'-GCA-3'-C3-5'-GGsGsGsGsG-3' (s=ligações fosforotiolato, outras ligações são fosfodiéster) C-85 5'-GsGs-3'-C3-5'-TCGTGC-3'-C3-5'-ATCGAT-3'-C3-5'-GCACGA-3'-C3-5'-GGsGsGsGsG-3' (s=ligações fosforotiolato, outras ligações são fosfodiéster) C-86 5' -TGCTGCA-3'-C3-5'-AGCTTGC-3'-C3-5'-AGATGAT-3' (sem CG) C-8 7 5'-GsGsGsGs-3'-C3-5'-ATCGAT-3'-C3-5'-TGATGCATCA-3'-C3-5'-ATCGAT-3'-C3-5'-GsGsGsGsGsG-3' (s=ligações fosforotiolato, outras ligações são fosfodiéster) C-8 8 5' -TCCA-3'-C3-5'-TGACGTT-3'-C3-5'-CCTGATGCT-3' C-89 5'-TGACTGTGA-3'-C3-5'-ACGTTCG-3'-C3-AGATGAT-3' C-90 5'-TCGTCGA-3'-C3-5'-TCGTCGA-3'-C3-5'-TCGTCGA-3' C-91 5'-TCG-3'-(ab)3-5' -T-3' C-92 (ab)-5'-TCG-3'-(ab)2-5' -T-3' C-93 (5' -TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5' -TCGTCGA-3' (fosfodiéster) C-94 (5' -TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-TCGTCGA-3' C-95 (5' -TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-3'-AGCTGCT-5' C-96 (5' -TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-AACGTTC-3' C-97 (5' -TCGTCGA-3' -HEG) 2-glicerol-HEG-5' -AACGTTC-3' -HEG-5' -TCGA-3' C-98 (5' -TCGTCGA-3' -HEG) 3-tr iplo-HEG-5' -AACGTTC-3' -HEG-5' -TCGA-3' C-99 TMEA-(5'-TGACTGTGAACGTTCGAGATGA-3')3 (SEQ ID NO:139) (Consultar ex. 23) C-100 (5' -TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5' -AACGTTC-3'-HEG-5'-TCGACGT-3' C-101 (5' -TCGACGT-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-TCGACGT-3' C-102 Dendrímero Starburst®-(5'-TGACTGTGAACGTTCGAGATGA-3')x (gama de X = 3-16) (SEQ ID NO:2) (Consultar ex. 24) C-103 (5'-TCGTCGA-3'-TEG)2-glicerol-TEG-5'-TCGTCGA-3' C-104 (5'-TCGTCGA-3'-C3)2-glicer01-C3-5'-TCGTCGA-3' C-105 TMEA-(S-(CH2) 3-3'-TAGTAGA-5'-HEG-3'-GCTTGCA-5' -HEG-3' -AGCTGCT-5')3 (consultar ex. 23) C-106 HO (CH2) 6SS (CH2) 6-5' -TGACTGTGAACGTTCGAGATGA-3' (SEQ ID NO:140) 118 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Número de designação dos compostos Estrutura C-107 HS(CH2) 6-5'-TGACTGTGAACGTTCGAGATGA-3' (SEQ ID NO:141) C-110 HO(CH2)sSS(CH2)6-5’-TCGTCG-3,-C3-5,-ACGTTCG-3,-C3-5,-AGATGAT- 3’ C-lll HS (CH2) 6-5'-TCGTCG-3'-C3-5'-ACGTTCG-3'-C3-5'-AGATGAT-3' C-112 HO(CH2)6SS(CH2)6-5’-TCGTCGA-3’-HEG-5'-ACGTTCG-3’-HEG-5’- AGATGAT-3’ C-113 HS (CH2) 6-5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5' -AGATGAT-3' C-114 5'-T CGTCG A-3’'C3-5’'ACGTTCG-3’-C3-5'-AGAT GAT-3’-C3-(CH?)aSS(CH?)aOH C-115 5' -TCGTCGA-3'-C3-5'-ACGTTCG-3'-C3-5'-AGATGAT-3'-C3-(CH2) 3SH C-116 δ'-ΤΟΟΤΟΘΑ^'-ΗΕΘ^'-ΑΟΘΤΤΟΘ-β'-ΗΕΟ-^-ΑΘΑΤβΑΤ-δ’- (CH2)aSS(CH7)s0H C-117 5' -TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-(CH2) 3SH C-118 5' -TCGTCGA-3'-HEG-C3-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' C-119 õ^TCGA-S-HEG-õ-TCGA^-HEG-^-TCGA-StHEG-StTCGA-^-HEG-S’- TCGA-3’ C-120 5'-TCGTCG-3'-C6-5'-ACGTTCG-3'-C6-5'-AGATGAT-3' C-121 (5'-AACGTT-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-AACGTT-3' C-122 (5' -TCAACGTT-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-TCAACGTT-3' C-123 (5'-TCGTCGA-3'-HEG-HEG)2-glicerol-HEG-HEG-5'-TCGTCGA-3' C-124 (5'-TCGACGT-3'-HEG)2 duplo simétrico-HEG-5'-TCGACGT-3' C-125 (5'-TCGACGT-3'-HEG)3-triplo-HEG-5'-TCGACGT-3' C-126 ((5' -TCGACGT-3'-HEG)2-glicerol-HEG)2-glicerol-HEG-5'-TCGACGT-3' C-127 (5' -TCGACGT-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-AACGTTC-3' C-128 HO(CH2)6SS(CH2)6-5’-TCGTCGA-3,-C3-5,-ACGTTCG-3’-C3-5’- AGATGAT-3’ C-129 ((5'-TCGACGT-3'-HEG)2-glicerol-HEG)2-glicerol-HEG-5' -T-3' C-130 (5'-TCGACGT-3'-HEG)3-triplo-HEG-5' -T-3' C-131 5'-TCGTCGA-3'-C4-5'-ACGTTCG-3'-C4-5'-AGATGAT-3' C-132 5' -TCGTCGA-3'-C6 -5'-ACGTTCG-3'-C6-5'-AGATGAT-3' C-133 5'-TCGTCGA-3'-TEG-5'-ACGTTCG-3'-TEG-5'-AGATGAT-3' C-134 5'-TCGTCGA-3'-PEG-5'-ACGTTCG-3'-PEG-5'-AGATGAT-3' [PEG= (CH2CH20 ) 45] C-135 5' -TCGACGT-3' -HEG- (CH2) 3SS (CH2) 3OH 119 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Número de designação dos compostos Estrutura C-136 5'-TCGACGT-3'-HEG-(CH2) 3SH C-137 (5'-TCGACGT-3'-HEG)X-Ficoll40o (X na gama = 150-250, média 185) Consultar exemplo 49
Exemplo 2: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores hexa-etilenoglicol
Sintetizou-se C-10 com a estrutura apresentada seguidamente. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são hexa-etilenoglicol (HEG), ligadas às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-10: 5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' A molécula C-10 foi sintetizada por TriLink BioTechnologies (SanDiego, CA) num sintetizador automático de ADN Perseptive Biosystems Expedite 8909 usando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-O-dimetoxitritil-hexa-etilenoglicol-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. (tal como será evidente para o leitor especialista, as expressões "monómero de nucleósido" ou "parte espaçadora" são algumas vezes aqui utilizadas, e.g., no contexto da síntese de CIC, em referência aos reagentes precursores quando são desprotegidos e ligados a outras componentes utilizando métodos sintéticos tal como os aqui descritos, dão origem a partes das CIC que são de ácido nucleico e a partes que não são de ácido nucleico). Colocou-se o precursor do espaçador HEG num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores HEG na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 120 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3'
3. Adição do espaçador HEG 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3'
5. Adição do espaçador HEG 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3' O ciclo de síntese consistiu de uma etapa de detritilação, uma etapa de acoplamento (monómero de fosforamidite mais ΙΗ-tetrazole), uma etapa de adição de capuz, uma etapa de sulfurização utilizando 3H-1,2- benzoditiol-3-ona 1,1-dióxido (reagente de Beaucage) 0,05 M e uma etapa final de adição de capuz. No final da montagem, clivou-se o composto 'tritil-off' do vidro de porosidade controlada e desprotegeram-se as bases com amoníaco aquoso concentrado a 58 °C durante 16 horas. Purificou-se o composto por electroforese de poliacrilamida preparativa, dessalinizou-se num cartucho Sep-pak Plus (Waters, Milford, MA) e precipitou-se a partir de cloreto de sódio aquoso 1 M com 2,5 volumes de etanol a 95%. Dissolveu-se a molécula em água Milli Q e determinou-se o rendimento a partir da absorvância a 260 nm. Finalmente, liofilizou-se o composto para a forma de pó. Caracterizou-se o composto por electroforese em gel capilar, espectrometria de massa com ionização por electrospray e RP-HPLC para confirmar composição e pureza. Efectuou-se também um ensaio de teor em endotoxina (ensaio LAL, Bio Whittaker), que revelou níveis de endotoxina <5 EU/mg composto (i.e., essencialmente isento de endotoxina).
Sintetizaram-se de igual modo C-8, C-21, C-22, C-23, C-24, C-32 e M-l e outros HEG-CIC lineares.
Exemplo 3: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores propilo
Sintetizou-se C-ll com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são propilo (C3) ligado às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. 121 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ C-11: 5'-TCGTCG-3'-C3-5'-ACGTTCG-3'-C3-5'-AGATGAT-3' A molécula C-11 foi sintetizada por TriLink BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-O-dimetoxitritil-propil-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor do espaçador C3 num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores C3 na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3' 3. Adição do espaçador C3 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3' 5. Adição do espaçador C3 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3' A síntese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2. 0 C-9 e outros CIC contendo C3 foram sintetizados de forma análoga.
Exemplo 4: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores butilo
Sintetizou-se C-17 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são butilo (C4) ligado às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-17: 5'-TCGTCG-3'-C4-5'-ACGTTCG-3'-C4-5'-AGATGAT-3 122 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ A molécula C-17 foi sintetizada por TriLink BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-O-dimetoxitritil-butil-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtida de ChemGenes,
Ashland, MA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor do espaçador C4 num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores C4 na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3' 3. Adição do espaçador C4 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3' 5. Adição do espaçador C4 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3' A síntese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 5: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores trietilenoglicol
Sintetizou-se C-18 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são trietilenoglicol (TEG) ligado às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-18: 5'-TCGTCG-3'-TEG-5'-ACGTTCG-3'-TEG-5'-AGATGAT-3' A molécula C-18 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-O-dimetoxitritil-trietilenoglicol-O- 123 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ (Ν,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor do espaçador TEG num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores TEG na ordem pretendida, com a sintese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Sintese de parte 5'-AGATGA-3'
3. Adição do espaçador TEG 4. Sintese de parte 5'-ACGTTCG-3'
5. Adição do espaçador TEG 6. Sintese de parte 5'-TCGTCG-3' A sintese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 6: Sintese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores dodecilo
Sintetizou-se C-19 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são dodecilo (C12) ligado às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-19: 5'-TCGTCG-3'-C12-5'-ACGTTCG-3'-C12-5'-AGATGAT-3' A molécula C-19 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-O-dimetoxitritildodecil-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor do espaçador C12 num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e 124 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ espaçadores C12 na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3' 3. Adição do espaçador C12 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3' 5. Adição do espaçador C12 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3' A síntese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 7: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores abásicos
Sintetizou-se C-20 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são l',2'-didesoxirribose (abásico) ligadas às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-20: 5'-TCGTCG-3'-abásico-5'-ACGTTCG-3'-abásico-5'- AGATGAT-3' A molécula C-20 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato.
Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 5'-0-(4,4'-dimetoxitritil)-l',2'- didesoxirribose-3'-0-(N,N-di-isopropil)2- cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor do espaçador abásico num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores abásicos na ordem pretendida, com a sintese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5' . 125 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3' 3. Adição do espaçador abásico 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3' 5. Adição do espaçador abásico 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3' A síntese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 8: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores hexa-etilenoglicol e trietilenoglicol
Sintetizou-se C-29 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são hexa-etilenoglicol (HEG) ligadas às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato e o grupo terminal a 3' é trietilenoglicol (TEG) ligado à parte de ácido nucleico através de uma ligação fosforotiolato. C-29: 5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-
TEG A molécula C-29 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. O vidro de porosidade controlada com trietilenoglicol, utilizado como suporte sólido para a síntese, foi de Glen Research (Sterling, VA). Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-0-dimetoxitritil-hexa-etilenoglicol-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtida de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor do espaçador HEG num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores HEG na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 126 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 1. Utilizar um suporte sólido de trietilenoglicol 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3'
3. Adição do espaçador HEG 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3'
5. Adição do espaçador HEG 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3' A síntese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 9: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores hexa-etilenoglicol e trietilenoglicol
Sintetizou-se C-30 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras e o grupo terminal a 5' são hexa-etilenoglicol (HEG) ligadas às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato e o grupo terminal a 3' é trietilenoglicol (TEG) ligado à parte de ácido nucleico através de uma ligação fosforotiolato.
C-30: HEG-5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-TEG A molécula C-30 foi sintetizada por TriLink BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. O vidro de porosidade controlada com trietilenoglicol, utilizado como suporte sólido para a síntese, foi de Glen Research (Sterling, VA). Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-0-dimetoxitritil-hexa-etilenoglicol-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtida de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor do espaçador HEG num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores HEG na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 127 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 1. Utilizar um suporte sólido de trietilenoglicol 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3'
3. Adição do espaçador HEG 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3'
5. Adição do espaçador HEG 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3'
7. Adição do espaçador HEG A síntese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 10: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores hexa-etilenoglicol e trietilenoglicol e com ligações fosfodiéster
Sintetizou-se C-31 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosfodiéster e as partes espaçadoras e o grupo terminal a 5' são hexa-etilenoglicol (HEG) ligadas às partes de ácido nucleico através de ligações fosfodiéster e o grupo terminal a 3' é trietilenoglicol (TEG) ligado à parte de ácido nucleico através de uma ligação fosfodiéster. C-31: HEG-5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5' -AGATGAT-
3'-TEG A molécula C-31 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosfodiéster. O vidro de porosidade controlada com trietilenoglicol, utilizado como suporte sólido para a síntese, foi de Glen Research (Sterling, VA). Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-0-dimetoxitritil-hexa-etilenoglicol-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor do espaçador HEG num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores HEG na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 128 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 1. Utilizar um suporte sólido de trietilenoglicol 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3'
3. Adição do espaçador HEG 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3'
5. Adição do espaçador HEG 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3'
7. Adição do espaçador HEG 0 ciclo de síntese consistiu de uma etapa de detritilação, uma etapa de acoplamento (monómero de fosforamidite mais ΙΗ-tetrazole), uma etapa de adição de capuz, uma etapa de oxidação e uma etapa final de adição de capuz. No final da montagem, clivou-se o composto 'tritil-off' do vidro de porosidade controlada e desprotegeram-se as bases com amoníaco aquoso concentrado a 58 °C durante 16 horas. Purificou-se o composto por electroforese de poliacrilamida preparativa, dessalinizou-se num cartucho Sep-pak Plus (Waters, Milford, MA) e precipitou-se a partir de cloreto de sódio aquoso 1 M com 2,5 volumes de etanol a 95%. Dissolveu-se o composto em água Milli Q e determinou-se o rendimento a partir da absorvância a 260 nm. Finalmente, liofilizou-se o composto para a forma de pó. Caracterizou-se o composto por electroforese em gel capilar, espectrometria de massa com ionização por electrospray e RP-HPLC para confirmar composição e pureza. Efectuou-se também um ensaio de teor em endotoxina (ensaio LAL, Bio Whittaker), que revelou níveis de endotoxina <5 EU/mg composto.
Exemplo 11: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e espaçadores 2-hidroximetiletilo
Sintetizou-se C-25 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são 2-hidroximetiletilo (HME) ligadas à parte de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-25: 5'-TCGTCG-3'-HME-5'-ACGTTCG-3'-HME-5'-AGATGAT-3' A molécula C-25 foi sintetizada por TriLink BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o 129 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 1-0-(4,4'-dimetoxitritil)-3-O-levulinil-glicerol-2-0-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtida de ChemGenes, Ashland, MA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o espaçador HME num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores HME na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3'
3. Adição do espaçador HME 4. Síntese de parte 5'-ACGTTCG-3'
5. Adição do espaçador HME 6. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3' A síntese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2. 0 grupo levulinilo é removido durante o tratamento com amoníaco.
Exemplo 12: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e uma parte espaçadora carregada negativamente
Sintetizou-se C-13 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e a parte espaçadora é um polímero de propilo (C3) ligado através de ligações fosforotiolato. C-13 : 5' -TCGTCG-3' - (C3 ) i5-5' -T-3' A molécula C-13 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 4,4'-O-dimetoxitritilpropil-0-(N,N-di-isopropil )2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração 130
ΕΡ 1 404 873/PT final de 0,1 M. Colocou-se o espaçador C3 num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores C3 na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Adição de 15 espaçadores C3 3. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3' 0 ciclo de síntese consistiu de uma etapa de detritilação, uma etapa de acoplamento (monómero de fosforamidite mais ΙΗ-tetrazole), uma etapa de adição de capuz, uma etapa de sulfurização utilizando 3-amino-l,2,4-ditiazole-5-tiona (ADTT) 0,02 M em acetonitrilorpiridina 9:1 e uma etapa final de adição de capuz. No final da montagem clivou-se o composto 'tritil-on' do vidro de porosidade controlada e desprotegeram-se as bases com amoníaco aquoso concentrado a 58 °C durante 16 horas. Purificou-se o composto por HPLC numa coluna Hamilton PRP-1 utilizando um gradiente crescente de acetonitrilo em acetato de trietilamónio 0,1 M. Concentrou-se o composto purificado à secura, removeu-se o grupo 4,4'-dimetoxitritilo com ácido acético aquoso a 80% e seguidamente precipitou-se o composto duas vezes a partir de cloreto de sódio aquoso 1 M com 2,5 volumes de etanol a 95%. Dissolveu-se o composto em água Milli Q e determinou-se o rendimento a partir da absorvância a 260 nm. Finalmente, liofilizou-se o composto para a forma de pó.
Caracterizou-se o composto por electroforese em gel capilar, espectrometria de massa com ionização por electrospray e RP-HPLC para confirmar composição e pureza. Efectuou-se também um ensaio de teor em endotoxina (ensaio LAL, Bio Whittaker), que revelou níveis de endotoxina <5 EU/mg composto.
Sintetizaram-se C-14, C-15 e C-16 de forma semelhante.
Exemplo 13: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e uma parte espaçadora carregada negativamente 131 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Sintetizou-se C-38 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são hexa-etilenoglicol (HEG) ligado através de ligações fosforotiolato. C-38: 5'-TCGTCGA-3'-(HEG)4-5' -TCGTCGA-3' A molécula C-38 foi sintetizada tal como descrito no exemplo 2. O precursor de parte espaçadora é 4,4'-0-dimetoxitritil-hexa-etilenoglicol-O-(N,N-di-isopropil) 2- cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA). A síntese foi efectuada nas seguintes etapas: 1. Utilizar um suporte sólido "A" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-TCGTCG-3'
3. Adição de 4 espaçadores HEG 4. Síntese de parte 5'-TCGTCGA-3'
Purificou-se o composto utilizando HPLC tal como descrito no exemplo 12. Caracterizou-se o composto e determinou-se o teor em endotoxina tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 14: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura linear e uma parte espaçadora carregada negativamente com ambas as partes de ácido nucleico ligadas através da extremidade 3'
Sintetizou-se C-37 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são hexa-etilenoglicol (HEG) ligado através de ligações fosforotiolato. C-37: 5'-TCGTCGA-3'-(HEG)-3'-AGCTGCT-5' A molécula C-37 foi sintetizada tal como descrito no exemplo 2, excepto pelo utilização de um nucleósido ligado ao suporte por 5' e de nucleósido-5'-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidites protegido com 3'-0-(4,4'- dimetoxitritilo) (Glen Research, Sterling, VA) para sintetizar a primeira parte de ácido nucleico. 0 precursor de parte espaçadora é 4,4' -O-dimetoxitritil-hexa-etilenoglicol- 132 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Ο-(Ν,N-di-isopropil) 2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) . A síntese foi efectuada nas seguintes etapas: 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 5' 2. Síntese de parte 3'-AGCTGC-5' com nucleósido-5'-0-(N,N-di-isopropil) 2-cianoetilfosforamidites protegido com 3'-0-(4,4'-dimetoxitritilo) (síntese de 5' para 3')
3. Adição de 4 espaçadores HEG 4. Síntese de parte 5'-TCGTCGA-3' com nucleósido-3'-0-(N,N-di-isopropil) 2-cianoetilfosforamidites protegido com 5'-0-(4,4'-dimetoxitritilo) (síntese de 3' para 5') 0 composto foi purificado por HPLC tal como descrito no exemplo 12. 0 composto foi caracterizado e determinou-se o teor em endotoxina tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 15: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura ramificada
Sintetizou-se C-27 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e a parte espaçadora é glicerol ligada às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-27: (5'-TCGTCGA-3')2~glicerol-5' -AACGTTC-3' A molécula C-27 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 1,3-di-(4,4'-O-dimetoxitritil)-glicerol-2-0-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (fosforamidite ramificada simétrica obtida de ChemGenes, Ashland, MA, figura 2) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o espaçador glicerol num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e o espaçador glicerol na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 133 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 1. Utilizar um suporte sólido "C" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-AACGTT-3' 3. Adição de fosforamidite ramificada simétrica baseada em glicerol 4. Síntese simultânea de duas partes 5'-TCGTCGA-3' A preparação deste composto ramificado seguiu o mesmo protocolo descrito no exemplo 2, excepto que na etapa 4 se duplicou a entrega de cada reagente no ciclo de síntese devido à construção simultânea de duas cadeias de ácido nucleico. A fosforamidite ramificada simétrica apresentada na figura 2 necessita que as sequências de ácido nucleico sintetizadas após a adição da fosforamidite ramificada simétrica, sejam as mesmas, apesar da sequência de ácido nucleico sintetizada antes da sua adição poder ser a mesma ou diferente destas últimas sequências.
Purificou-se e caracterizou-se o composto ramificado tal como descrito no exemplo 2.
Sintetizou-se C-28 de forma semelhante.
Exemplo 16: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura ramificada e todas as partes de ácido nucleico ligadas através da extremidade 3'
Sintetizou-se C-95 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e as partes espaçadoras são glicerol e HEG ligadas às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-95: (5' -TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-3'-AGCTGCT-5' A molécula C-95 foi sintetizada tal como descrito no exemplo 2, excepto pelo utilização de um nucleósido ligado ao suporte por 5' e de nucleósido-5'-O-(N,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidites protegido com 3'-0-(4,4'- dimetoxitritilo) (Glen Research, Sterling, VA) para sintetizar a primeira parte de ácido nucleico. 0 precursor de parte espaçadora ramificada é 1,3-di-(4,4'-O-dimetoxitritil)- 134 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ glicerol-2-Ο-(Ν,N-di-isopropil) 2-cianoetilfosforamidite (fosforamidite ramificada simétrica obtida de ChemGenes, Ashland, MA, figura 2). A sintese foi efectuada nas seguintes etapas: 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 5' 2. Sintese de parte 3'-AGCTGC-5' com nucleósido-5'-0-(N,N-di-isopropil) 2-cianoetilfosforamidites protegido com 3'-0-(4,4'-dimetoxitritilo) (sintese de 5' para 3')
3. Adição de um espaçador HEG 4. Adição da fosforamidite ramificada simétrica baseada em glicerol
5. Adição simultânea de dois espaçadores HEG 6. Sintese simultânea de duas partes 5'-TCGTCGA-3' com nucleósido-3'-0-(N,N-di-isopropil) 2- cianoetilfosforamidites protegido com 5'-0-(4,4'- dimetoxitritilo) (sintese de 3' para 5') A preparação deste composto ramificado seguiu o mesmo protocolo descrito no exemplo 2, excepto que nas etapas 5 e 6 se duplicou a entrega de cada reagente no ciclo de sintese devido à construção simultânea de duas cadeias de ácido nucleico. A fosforamidite ramificada simétrica apresentada na figura 2 necessita que as sequências de ácido nucleico sintetizadas após a adição da fosforamidite ramificada simétrica, sejam as mesmas, apesar da sequência de ácido nucleico sintetizada antes da sua adição poder ser a mesma ou diferente destas últimas sequências. 0 composto foi purificado por HPLC tal como descrito no exemplo 12. 0 composto foi caracterizado e determinou-se o teor em endotoxina tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 17: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura ramificada contendo três partes de ácido nucleico diferentes
Sintetizou-se C-35 com a fórmula seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e a parte espaçadora é glicerol ligada às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. 135 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 5’-TCGTCGA-3’ \ C-35: glicerol-5’-AGATGAT-3’ / 5’-AACGTTC-3’ A molécula C-35 foi sintetizada tal como descrito no exemplo 2. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de parte espaçadora, 1-(4,4'-O-dimetoxitritil)-3-0-levulinil-glicerol-2-Ο-(N,N-di-isopropil)2- cianoetilfosforamidite (fosforamidite ramificada simétrica obtida de ChemGenes, Ashland, MA, figura 2) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o precursor de glicerol num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e o espaçador glicerol na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "T" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-AGATGA-3' 3. Adição de uma fosforamidite ramificada assimétrica baseada em glicerol
4. Síntese de parte 5'-AACGTTC-3' na extremidade dimetoxitritilO
5. Detritilação e adição de capuz à parte AACGTTC 6. Remoção do grupo protector levulinilo 7. Síntese de parte 5'-TCGTCGA-3' A síntese ocorre essencialmente tal como descrito no exemplo 2, com a excepção que após a etapa 4 ocorre detritilação da parte 5'-AACGTTC-3' e adição de capuz com anidrido acético/N-metilimidazole de modo a terminar essa parte de ácido nucleico. Seguidamente remove-se o grupo protector levulinilo com hidrato de hidrazina 0,5 M em piridina:ácido acético 3:2/pH 5,1 durante 5 min. O suporte sólido contendo o composto é bem lavado com acetonitrilO anidro e adiciona-se a parte 5'-TCGTCGA-3' usando o protocolo descrito no exemplo 2. 136 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ Ο composto ramificado é purificado e caracterizado tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 18: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura ramificada através de uma estratégia de conjugação
Sintetizou-se C-36 tal como apresentado na figura 3. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e a parte espaçadora baseia-se no dendrimero STARBURST®. A parte de ácido nucleico é sintetizada com um espaçador 5'-C6-dissulfureto (modificador tiol C6 S-S, Glen Research, Sterling, VA, produto n° 10-1926-xx), que por redução proporciona um grupo tiol que pode reagir com os grupos maleimida No dendrimero. Síntese de 5'-C6-dissulfureto-TCGTCGA (4):
Sintetiza-se 5'-C6-dissulfureto-TCGTCGA utilizando um sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolvem-se os monómeros de nucleósido e o modificador tiol C6 S-S (Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,1 M. Coloca-se o modificador tiol num local de monómero auxiliar no instrumento. Programa-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e o modificador tiol na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "A" ligado ao suporte em 3' 2. Síntese de parte 5'-TCGTGC-3' 3. Adição do precursor de modificador tiol (S-tritil-6-mercapto-hexil)-(2-cianoetil)-(N,N-di-isopropil)- fosforamidite) O ciclo de síntese consistiu de uma etapa de detritilação, uma etapa de acoplamento (monómero de fosforamidite mais ΙΗ-tetrazole), uma etapa de adição de capuz, uma etapa de sulfurização utilizando 3-amino-l,2,4-ditiazole-5-tiona (ADTT) 0,02 M em acetonitrilo:piridina 9:1 e uma etapa final de adição de capuz. No final da montagem, 137 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ clivou-se ο composto 'tritil-on' do vidro de porosidade controlada e desprotegeram-se as bases com amoníaco aquoso concentrado a 58 °C durante 16 horas. Purificou-se o composto por HPLC numa coluna Hamilton PRP-1 utilizando um gradiente crescente de acetonitrilo em acetato de trietilamónio 0,1 M. Concentrou-se o composto purificado à secura, removeu-se o grupo 4,4'-dimetoxitritilo com ácido acético aquoso a 80% e seguidamente precipitou-se o composto duas vezes a partir de cloreto de sódio aquoso 1 M com 2,5 volumes de etanol a 95%. Dissolveu-se o composto em água Milli Q e determinou-se o rendimento a partir da absorvância a 260 nm. Finalmente, liofilizou-se o composto para a forma de pó.
Caracterizou-se o composto por electroforese em gel capilar, espectrometria de massa com ionização por electrospray e RP-HPLC para confirmar composição e pureza. Efectuou-se também um ensaio de teor em endotoxina (ensaio LAL, Bio Whittaker), que revelou níveis de endotoxina <5 EU/mg composto. Síntese de 5'-tiol-C6-TCGTCGA (5):
Reduz-se o ácido nucleico modificado com dissulfureto (4) a um tiol utilizando cloridrato de tris(2-carboxietilfosfina) (TCEP; Pierce, Rockford, IL). Dissolve-se o ácido nucleico a uma concentração de 20 mg/ml em tampão contendo fosfato de sódio 0,1 M /cloreto de sódio 0,15 M /pH 7,5. Dissolve-se TCEP num frasquinho separado a uma concentração de 0,17 M em fosfato de sódio 0,1 M /cloreto de sódio 0,15 M /pH 7,5. Adicionar 5 equivalentes de TCEP ao ácido nucleico e misturar suavemente. Incubar a solução durante 120 min a 40 °C e seguidamente purificar por cromatografia de exclusão de tamanho (coluna Pharmacia P2) para proporcionar o 5'-tiol-C6-TCGTCGA (5). Síntese do dendrímero STARBURST® modificado com maleimida (7) :
Os dendrímeros STARBURST® com diferentes números de aminas (4, 8, 16, 32, 64, etc.) estão disponíveis de Aldrich (Milwaukee, WI) . Dissolve-se um dendrímero Starburst® (6) contendo quatro grupos amino em dimetilformamida (DMF) a uma 138
ΕΡ 1 404 873/PT concentração de 0,2 M. Adicionam-se então trietilamina (10 equivalentes) e sulfosuccinimidil-4-(N-maleimidometil)-ciclo-hexano-l-carboxilato (sulfo-SMCC; Pierce, Rockford, IL, 8 equivalentes) e agita-se a solução durante 2 horas ou até a reacção estar completa, tal como determinado por cromatografia em camada fina (TLC; 10% metanol/diclorometano). Pára-se a reacção com água durante 30 min e seguidamente remove-se o DMF em vácuo. Dissolve-se o residuo em diclorometano e lava-se duas vezes com solução saturada de bicarbonato de sódio seguido de água. Seca-se a fase orgânica sobre MgSCh, filtra-se e concentra-se à secura em vácuo. Purifica-se o produto por cromatografia em sílica gel para proporcionar T_. Síntese do dendrímero STARBURST®-(5'-TCGTCGA-3')4 (8):
Dissolve-se o dendrímero STARBURST® modificado com maleimida (6) em DMSO (5 mg/ml) e adiciona-se gota-a-gota o 5'-C6-tiol-TCGTCGA (5) purificado (10 equivalentes), dissolvido a uma concentração de 10 mg/ml em fosfato de sódio 0,1 M /cloreto de sódio 0,15 M /pH 7,5. Agita-se a mistura resultante durante a noite a 40 °C. Purifica-se o conjugado por cromatografia de exclusão de tamanho (Sephadex G-25) para proporcionar o composto 8.
Exemplo 19: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura ramificada
Sintetizou-se C-94 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e a parte espaçadora é glicerol ligada às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-94: (5'-TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-TCGTCGA-3' A molécula C-94 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e os precursores de parte espaçadora [1,3-di-(4,4'-O-dimetoxitritil)-glicerol-2-0-(N, N-di-isopropil) 2-cianoetilfosforamidite (fosforamidite 139 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ ramificada simétrica obtida de ChemGenes, Ashland, MA, figura 2) e 4,4'-O-dimetoxitritil-hexa-etilenoglicol-O-(N,N-di-isopropil) 2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocaram-se os espaçadores glicerol e HEG num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido, espaçadores HME e o espaçador glicerol na ordem pretendida, com a síntese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "A" ligado ao suporte em 5' 2. Síntese de parte 5'-TCGTCGA-3'
3. Adição de um espaçador HEG 4. Adição de uma fosforamidite ramificada simétrica baseada em glicerol
5. Adição simultânea de dois espaçadores HEG 6. Síntese simultânea de duas partes 5'-TCGTCGA-3' A preparação deste composto ramificado seguiu o mesmo protocolo descrito no exemplo 2, excepto que nas etapas 5 e 6 se duplicou a entrega de cada reagente no ciclo de síntese devido à construção simultânea de duas cadeias de ácido nucleico. A fosforamidite ramificada simétrica apresentada na figura 2 necessita que as sequências de ácido nucleico sintetizadas após a adição da fosforamidite ramificada simétrica, sejam as mesmas, apesar da sequência de ácido nucleico sintetizada antes da sua adição poder ser a mesma ou diferente destas últimas sequências. O composto ramificado foi purificado por HPLC tal como descrito no exemplo 12 e caracterizado tal como descrito no exemplo 2.
Sintetizaram-se C-96 e C-101 de forma análoga.
Sintetizaram-se também C-103 e C-104 pelo mesmo método, excepto pela utilização de espaçadores trietilenoglicol ou propilo, respectivamente em vez dos espaçadores hexa-etilenoglicol. 140 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Exemplo 20: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura ramificada
Sintetizou-se C-98 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato e a parte espaçadora é glicerol ligada às partes de ácido nucleico através de ligações fosforotiolato. C-98 : (5'-TCGTCGA-3'-HEG) 3-triplo-HEG-5' -AACGTTC-3' -HEG- 5'-TCGA-3' A molécula C-98 foi sintetizada por TriLink BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e as partes espaçadoras [fosforamidite tripla (obtida de Glen Research, Sterling, VA) e 4,4'-O-dimetoxitritil-hexa-etilenoglicol-O-(N,N-di-isopropil) 2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocaram-se os espaçadores triplo e HEG num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido, espaçador HEG e espaçador triplo na ordem pretendida, com a sintese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "A" ligado ao suporte em 3' 2. Sintese de parte 5'-TCGA-3'
3. Adição de um espaçador HEG 4. Sintese de parte 5'-AACGTTC-3'
5. Adição de um espaçador HEG 6. Adição da fosforamidite tripla (consultar fig. 2)
7. Adição simultânea de três espaçadores HEG 8. Sintese simultânea de três partes 5'-TCGTCGA-3' A preparação deste composto ramificado seguiu o mesmo protocolo descrito no exemplo 2, excepto que nas etapas 7 e 8 se triplicou a entrega de cada reagente no ciclo de sintese devido à construção simultânea de 3 cadeias de ácido 141 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ nucleico. A fosforamidite tripla simétrica apresentada na figura 2 necessita que as sequências de ácido nucleico sintetizadas após a adição da fosforamidite tripla simétrica sejam as mesmas, apesar da sequência de ácido nucleico sintetizada antes da sua adição, poder ser a mesma ou diferente destas últimas sequências. O composto ramificado foi purificado por HPLC tal como descrito no exemplo 12 e caracterizado tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 21: Síntese de um composto quimérico linear com espaçadores hexa-etilenoglicol e um ligante 3'-tiol
Sintetizam-se primeiramente CIC contendo ligantes 3'-tiol e purificam-se sob a forma dos seus derivados dissulfureto. Reduz-se então o grupo dissulfureto para proporcionar o grupo tiol reactivo. Por exemplo, para sintetizar C-116 sintetizou-se C-8 como no exemplo 2 com excepção da utilização do modificador 3'-tiol C3 S-S CPG (Glen Research, Sterling, VA) como suporte sólido em vez de suporte sólido "T".
C-116:5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-(CH2)3SS(CH2)3OH
Considerar-se-á que C-116 pode ser descrito como [C—8] — 3'-dissulfureto. Purificou-se o CIC por HPLC tal como descrito no exemplo 12. Caracterizou-se o composto tal como descrito no exemplo 2.
Reduziu-se C-116 ao tiol usando cloridrato de tris(2-carboxietilfosfina) (TCEP; Pierce, Rockford, IL) . Dissolveu-se C-116 a uma concentração de 30,5 mg/ml (0,8 ml, 24,4 mg; 3,14 umol) em tampão fosfato de sódio 100 mM /cloreto de sódio 150 mM /EDTA 1 mM / pH 7,4. Dissolve-se TCEP num frasquinho separado a uma concentração de 0,167 M em tampão fosfato de sódio 100 mM /cloreto de sódio 150 mM /EDTA 1 mM / pH 7,4. Adicionam-se 5 equivalentes (100 ul, 4,8 mg, 17 umol) da solução-mãe de TCEP à solução de CIC. A solução foi misturada suavemente, incubada durante 120 min a 40 °C e purificada numa coluna Sephadex G-25 (5 ml, Amersham Pharmacia, Piscataway, NJ) para proporcionar C-117 (13,2 mg). 142 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Considerar-se-á que C-117 pode ser descrito como [C-8J-3'-tio. Purificou-se o CIC por HPLC tal como descrito no exemplo 12 .
Sintetizou-se C-115 de forma análoga a partir de C-114.
Exemplo 22: Síntese de um composto quimérico linear com espaçadores propilo e um ligante 5'-tiol
Sintetizam-se primeiramente CIC contendo ligantes 5'-tiol e purificam-se sob a forma dos seus derivados dissulfureto. Reduz-se então o grupo dissulfureto para proporcionar o grupo tiol reactivo. 0 composto C-110 (seguidamente) pode ser descrito como 5'-dissulfureto-C-11. O composto C-lll pode ser descrito como 5'-tiol-C-ll C-110 : HO(CH2) 6SS (CH2)6-5'-TCGTCG-3'-C3-5'-ACGTTCG-3'-C3- 5'-AGATGAT-3'
Sintetizou-se C-110 tal como descrito no exemplo 3, com excepção do acoplamento final ter sido com o modificador tiol C6 S-S (Glen Research, Sterling, VA). Purificou-se o CIC por HPLC tal como descrito no exemplo 12. Caracterizou-se o composto tal como descrito no exemplo 2. Reduziu-se C-110 ao tiol usando cloridrato de tris(2-carboxietilfosfina) (TCEP; Pierce, Rockford, IL) tal como descrito no exemplo 22.
Sintetizaram-se C-107, C-113 e P-16 de forma análoga.
Exemplo 23: Sintese de um composto quimérico com uma estrutura ramificada através de uma estratégia de conjugação
Sintetizou-se C-105 tal como apresentado na figura 4.
Dissolveu-se tris(2-maleimidoetil)amina (TMEA, Pierce,
Rockford, IL) a concentração de 4,3 mg/ml em dimetilformamida (DMF) . Adicionou-se a solução de TMEA (12 ul, 52 ug, 1,0 eq) a uma solução de C-117 (237 ul, 4,0 mg, 4,0 eq) em tampão fosfato de sódio 100 mM /cloreto de sódio 150 mM /EDTA 1 mM / pH 7,4 e misturou-se bem. Deixou-se a solução à temperatura ambiente durante a noite e purificou-se numa coluna Superdex 200 (24 ml, Amersham Pharmacia, Piscataway, NJ) em tampão fosfato de sódio 10 mM /cloreto de sódio 141 mM / pH 7,0. 143 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Secou-se ο produto em vácuo, dissolveu-se em 0,4 ml de água Milli Q e precipitou-se com 1,0 ml de etanol a 95%. Após congelar a -20 °C durante 1 hora, centrifugou-se a mistura (2 min a 14 K RPM) e removeu-se cuidadosamente o sobrenadante. Dissolveu-se o sedimento em 0,35 ml de água Milli Q e mediu-se a concentração de C-105 (0,4 mg isoladas). Analisou-se o composto tal como descrito no exemplo 2.
Sintetizou-se C-99 de forma análoga.
Exemplo 24: Síntese de um composto quimérico com uma estrutura ramificada através de uma estratégia de conjugação A. Síntese de maleimido-DENDRÍMERO STARBURST® de geração 2
Adquiriu-se o dendrímero STARBURST® de geração 2 contendo 16 grupos hidroxilo como uma solução a 20% em metanol de Aldrich (Milwaukee, WI). Secou-se o dendrímero em vácuo (191 ul, 38,2 mg, 11,7 umol), redissolveu-se em 200 ul de DMF e tornou-se a secar em vácuo para remover os últimos vestígios de metanol. Para preparar o maleimido-dendrímero, dissolveu-se N-(p-maleimidofenil)isocianato (PMPI, 50 mg, 233,5 umol) em 200 ul de DMF num frasquinho de vidro separado e seguidamente adicionou-se rapidamente ao dendrímero. Submeteu-se a mistura a vórtex até dissolução do dendrímero. Colocou-se a solução num misturador com rotação durante a noite à temperatura ambiente. Concentrou-se a solução no vácuo, dissolveu-se em metanol a 20%/diclorometano (1 ml) e purificou-se numa coluna de sílica gel de 7,5 g (70-230 mesh, 60 A) em metanol a 20%/diclorometano. O produto maleimido-dendrímero eluiu da coluna na primeira fracção (devido à presença de DMF residual) e estava isento dos subprodutos PMPI. Concentrou-se o produto até um sólido creme (10 mg, 13% de rendimento).
B. Síntese de DENDRÍMERO STARBURST®-(5'-TGACTGTGAACGT TCGAGATGA)x=3_i6 (SEQ ID NO: 2) (C-102)
Dissolveu-se o maleimido-dendrímero (5, 7 mg) em dimetilssulfóxido (DMSO) para produzir uma solução-mãe a uma concentração de 2,5 mg/ml. Adicionou-se a solução-mãe 144 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ maleimido-dendrímero (100 ul, 0,25 mg, 0,0375 umol) a uma solução de C-107 (9,1 mg, 1,2 umol) em tampão fosfato de sódio 100 mM /cloreto de sódio 150 mM /EDTA 1 mM / pH 7,4 (0,7 ml). Deixou-se a solução num agitador rotativo durante a noite à temperatura ambiente e purificou-se o produto numa coluna Superdex 200 (24 ml, Amersham Pharmacia, Piscataway, NJ) em tampão fosfato de sódio 10 mM /cloreto de sódio 141 mM / pH 7,0. O produto eluiu com o volume vazio da coluna aos 10,4 min (1,3 mg). Verificou-se que o produto era uma mistura de espécies de elevado peso molecular, representando diferentes cargas de polinucleótido no dendrimero, por análise num E-gel de agarose a 1,2% (Invitrogen, Carlsbad, CA) . C-102 correu como uma mistura de produtos entre 1 kb e maiores que 15 kb (tamanho efectivo comparativamente com marcadores de ADN em cadeia dupla).
Exemplo 25: Síntese de um composto quimérico linear com espaçadores propilo e ligações mistas fosfodiéster/fosforotiolato
Sintetizou-se C-84 com a estrutura seguidamente apresentada. As partes de ácido nucleico são ADN com ligações fosforotiolato, indicadas por um "s" minúsculo ou ligações fosfodiéster (todas as outras ligações) e as partes espaçadoras são propilo (C3) ligado às partes de ácido nucleico através de ligações fosfodiéster. C-84: 5'-GsGs-3'-C3-5'-TGC-3'-C3-5'-ATCGAT-3'-C3-5'-GCA- 3'-C3-5'-GGsGsGsGsG-3' (em que o "s" minúsculo indica uma ligação fosforotiolato e as outras ligações são fosfodiéster) A molécula C-84 foi sintetizada por TriLink
BioTechnologies (San Diego, CA) num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909 utilizando o protocolo do fabricante para 1 umol de ADN fosforotiolato. Programaram-se as ligações fosforotiolato utilizando letras maiúsculas para as bases e programaram-se as ligações fosfodiéster utilizando letras minúsculas para as bases e posições auxiliares contendo espaçador propilo fosforamidite. Dissolveram-se os monómeros de nucleósido e o precursor de 145 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ parte espaçadora, 4,4'-O-dimetoxitritil-propil-O-(Ν,N-di-isopropil)2-cianoetilfosforamidite (obtido de Glen Research, Sterling, VA) em acetonitrilo anidro para uma concentração final de 0,05 M. Colocou-se o espaçador C3 num local de monómero auxiliar no instrumento. Programou-se o instrumento para adicionar os monómeros de nucleótido e espaçadores C3 na ordem pretendida, com a sintese das partes de ácido nucleico a decorrer no sentido de 3' para 5'. 1. Utilizar um suporte sólido "G" ligado ao suporte em 3' 2. Sintese de 5'-GGsGsGsGsG-3' 3. Adição do espaçador C3 4. Sintese de 5'-GCA-3' 5. Adição do espaçador C3 6. Sintese de 5'-ATCGAT-3' 7. Adição do espaçador C3 8. Sintese de 5'-TGC-3' 9. Adição do espaçador C3 10. Sintese de 5'-GsGs-3' A sintese, desprotecção, manuseamento e análise foram efectuadas tal como descrito no exemplo 2.
Sintetizaram-se C-85 e C-87 de forma análoga.
Exemplo 26: Síntese de oligonucleótidos contendo menos de oito (8) nucleótidos
Sintetizaram-se polinucleótidos contendo menos de oito bases e contendo ligações fosforotiolato num sintetizador de ADN automático Perseptive Biosystems Expedite 8909. Purificaram-se polinucleótidos por RP-HPLC numa coluna Polymer Labs PLRP-S utilizando um gradiente crescente de acetonitrilo em acetato de trietilamónio 0,1 M. Concentraram-se os polinucleótidos purificados até à secura, removeu-se o grupo 4,4'-dimetoxitritilo com ácido acético aquoso a 80% e seguidamente precipitaram-se os compostos duas vezes de acetato de sódio aquoso 0,6 M/pH 5,0 com 3 volumes de isopropanol. Dissolveram-se os polinucleótidos em água Milli Q e determinou-se o rendimento a partir da absorvância a 260 nm. Finalmente, liofilizaram-se os polinucleótidos para a 146 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ forma de pó. Caracterizaram-se os polinucleótidos e determinou-se o teor em endotoxina, tal como descrito no exemplo 2.
Exemplo 27: Preparação de microtransportadores biodegradáveis catiónicos
Prepararam-se microtransportadores catiónicos de poli(ácido láctico, ácido glicólico) (cPLGA) como seguidamente descrito. Dissolveu-se 0,875 g de polímero 50:50 de poli(D,L-lactídeo-co-glicolídeo) (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN) com uma viscosidade intrínseca de 0,41 dl/g (0,1%, clorofórmio, 25°C) em 7,875 g de diclorometano a uma concentração de 10% p/p, conjuntamente com 0,3 g de DOTAP. Emulsionou-se então a fase orgânica transparente em 500 ml de solução aquosa de PVA (0,35% p/v) por homogeneização a 4000 rpm durante 30 minutos à temperatura ambiente utilizando um misturador de laboratório (Silverson L4R, Silverson Instruments). Aumentou-se então a temperatura do sistema para 40 °C por circulação de água quente através da camisa do vaso misturador. Simultaneamente reduziu-se a velocidade de agitação para 1500 rpm e mantiveram-se estas condições durante 2 horas para extrair e evaporar o diclorometano. Deixou-se arrefecer a suspensão de microesferas até à temperatura ambiente e com o auxílio de água fria circulante.
Separaram-se os microtransportadores por centrifugação a 8000 rpm durante 10 minutos à temperatura ambiente (Beckman Instruments) e ressuspenderam-se em água desionizada por sonicação suave em banho. Repetiu-se a lavagem por centrifugação mais duas vezes para remover o excesso de PVA da superfície das partículas. Suspenderam-se os sedimentos de partículas resultantes da centrifugação final em aproximadamente 10 ml de água e liofilizaram-se durante a noite. Caracterizou-se o pó de microtransportadores catiónicos seco relativamente a tamanho e carga superficial: tamanho médio (número pesado, μ) = 1,4; potencial zeta (mV) = 32,4. 147 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Exemplo 28: Imunomodulação de células humanas pelas CIC
Efectuaram-se ensaios para avaliar a actividade de imunomodulação de (1) moléculas quiméricas contendo partes espaçadoras e (2) polinucleótidos.
Sintetizaram-se os compostos quiméricos e os polinucleótidos tal como anteriormente descrito ou por química convencional de fosforotiolato. Os polinucleótidos P-6 e P-7 foram sintetizados por Hybridon Specialty Products (Milford MA) . Determinou-se a actividade de imunomodulação por ensaios de rotina tal como aqui revelados.
Recolheu-se sangue periférico de voluntários por venopunção utilizando seringas heparinizadas. Depositou-se o sangue numa almofada de FICOLL® (Amersham Pharmacia Biotech) e centrifugou-se. Recolheram-se as PBMC, localizadas na interface do FICOLL® e seguidamente lavaram-se duas vezes com solução salina tamponada de fosfato (PBS) fria. Ressuspenderam-se as células e cultivaram-se em placas de 48 poços (exemplos 29-32) ou placas de 96 poços (exemplos 33-40) a 2 x 106 células/mL a 37 °C em RPMI 1640 com soro AB humano inactivado pelo calor a 10% mais 50 unidades/mL de penicilina, estreptomicina 50 yg/mL, glutamina a 300 yg/mL, piruvato de sódio 1 mM e 1 x aminoácidos não essenciais MEM (NEAA).
Cultivaram-se as células na ausência de amostras de ensaio, na presença de amostras de ensaio a 20 yg/ml (0,5 OD/ml) ou na presença de amostras de ensaio a 20 yg/ml pré-misturadas com cPLGA (quando utilizado) a 100 yg/ml durante 24 horas. Recolheu-se então meio isento de células de cada poço e ensaiou-se para as concentrações de IFN-γ e IFN-a. Utilizou-se SAC (Pansorbin CalBiochem, diluição 1/5000) como controlo positivo. A SAC contém material celular de Staph. aureus (cowan).
Ensaiaram-se IFN-γ e IFN-α utilizando kits CYTOSCREEN™ ELISA de BioSource International, Inc., de acordo com as instruções do fabricante. 148 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
No ensaio de PBMC humanas os níveis basais de IFN-γ podem variar, mesmo de forma significativa, conforme o dador. Os níveis de IFN-α apresentam geralmente reduzidos níveis basais sob condições de não estimulação.
Apresentam-se exemplos dos resultados de tais ensaios nos exemplos 29-40 seguidamente.
Em cada uma das experiências apresentadas, "meio sozinho" e "P-7" são controlos negativos. Demonstrou-se anteriormente que "P-7" não tem actividade de imunoestimulação. SAC e "P-6" são controlos positivos. Demonstrou-se anteriormente que P-6 tem uma actividade de imunoestimulação significativa.
Exemplo 29 Actividade de imunoestimulação das CIC
Este exemplo mostra que quatro CIC diferentes tiveram actividade de imunomodulação significativa tal como evidenciado pela estimulação da excreção de IFN-γ e IFN-a (tabela 3) . Tal como esperado, P-7 não apresentou qualquer actividade. Além disso, P-l, um 7-mero contendo TCG, não apresentou qualquer actividade. Curiosamente, os CIC com partes espaçadoras HEG e propilo apresentaram diferentes graus de estimulação da excreção de IFN-α. Apesar de ambos os tipos de CIC estimularem a excreção de IFN-α, o efeito foi mais marcado para os CIC contendo HEG.
Tabela 3 IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) Composto de ensaio Dador 1 Dador 2 média Dador 1 Dador 2 média meio sozinho 8 0 4 0 0 0 P-7 410 51 231 0 0 0 SAC 2040 1136 1588 393 43 218 P-6 2180 669 1425 401 39 220 P-l 8 0 4 0 0 0 C-8 1916 696 1306 1609 44 827 C-9 2157 171 1164 142 0 71 C-10 1595 952 1273 1662 50 856 C-ll 2308 270 1289 119 0 59 149 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Exemplo 30 Actividade de polinucleótidos
Este exemplo mostra que os polinucleótidos P-l, P-2, P-3, P-4 e P-5 não tiveram actividade de imunomodulação (tabela 4). Estes polinucleótidos têm as sequências das partes de ácido nucleico de C-10 e C-ll, apresentadas no exemplo 29 como tendo actividade de imunomodulação.
Tabela 4 IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) Composto de ensaio Dador 3 Dador 4 média Dador 3 Dador 4 média meio sozinho 0 3 2 0 18 9 P—7 3 8 5 0 31 15 SAC 1179 2000 1589 50 969 510 P-6 99 223 161 28 106 67 P-l 1 4 2 0 32 16 P-3 1 3 2 0 32 16 P-4 0 3 1 0 58 29 P-5 0 3 2 0 57 29 P-2 0 4 2 0 40 20
Exemplo 31 Actividade de misturas de polinucleótidos
Este exemplo mostra que uma mistura de polinucleótidos P-1 e P-3 ou P-l, P-3, P-4 e P-5 não teve actividade de imunomodulação (tabela 5). Estes polinucleótidos têm as sequências das partes de ácido nucleico de C-10 e C-ll que tinham actividade de imunomodulação. As misturas continham quantidades iguais de cada polinucleótido para uma concentração total de 20 pg/ml de polinucleótido total. 150 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Tabela 5 IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) Composto de ensaio Dador 5 Dador 6 média Dador 5 Dador 6 média meio sozinho 3 52 28 20 20 20 P-7 7 66 37 20 94 57 SAC 903 284 593 458 8215 4337 P-6 73 1170 621 54 482 268 (P-l) + (P-3) 3 36 19 20 40 30 (P-l)+(P-3)+(P-4)+(P-5) 1 99 50 70 65 68 C-10 102 806 454 91 1700 896 C-ll 25 792 409 76 175 126
Exemplo 32 Actividade de imunomodulação dos CIC
Este exemplo mostra a actividade de imunomodulação de (ΓΙΟ e C-ll num ensaio com dadores diferentes dos exemplos 29 e 31 (tabela 6).
Tabela 6 IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) Composto de ensaio Dador 7 Dador 8 média Dador 7 Dador 8 média meio sozinho 1 0 1 0 0 0 P-7 2 2 2 0 0 0 SAC 594 1100 847 22 303 163 P-6 15 367 191 4 59 32 C-10 23 198 111 46 539 293 C-ll 5 419 212 6 56 31
Exemplo 33 Actividade de imunomodulação dos CIC
Este exemplo mostra a actividade de imunomodulação de C-8 e C-9 num ensaio com dadores diferentes do exemplo 29 (tabela 7). P-2, um β-mero contendo TCG, não apresentou qualquer actividade. 151 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Tabela 7 IFN-y IFN-oí Dador 9 Dador 10 Dador 11 Dador 12 média Dador 9 Dador 10 Dador 11 Dador 12 média meio sozinho 17 1 1 10 7 4 2 2 15 6 P-7 5 2 3 2 3 0 3 1 5 2 SAC 380 688 159 73 325 2246 364 1129 1029 1192 P-6 66 20 72 23 45 12 28 12 12 16 P-2 2 3 1 2 2 0 2 1 4 2 0 1 co 312 35 31 28 102 58 30 18 49 39 0 1 to 134 7 56 30 56 8 10 1 15 8
Exemplo 34 Actividade de imunomodulação dos CIC
Os ensaios apresentados na tabela 8 demonstram actividade de imunoestimulação de vários CIC do invento, i.e., CIC caracterizados por várias partes de ácido nucleico curtas diferentes e várias partes espaçadoras diferentes. A tabela 8 também mostra que o composto M-l, que tem uma estrutura mista HEG/ácido nucleico mas não apresenta qualquer sequência 5'-C,G-3' (consultar tabela 2), assim como determinados outros compostos (C-19), não apresentaram qualquer actividade. A formulação dos CIC com cPLGA aumentou significativamente a indução de IFN-α. Os níveis de IFN-γ também aumentaram em alguns casos. Os números "28---" representam dadores individuais. TABELA 8
Cone IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) Estímulo ug/ml 2 8065 28066 28067 28068 média 28065 28066 28067 28068 média Células 0 96 2 1 2 25 0 4 0 6 3 sozinhas P-6 20 439 12 28 906 346 14 17 45 126 50 P-7 20 397 1 8 15 105 0 8 0 3 3 P-2 20 79 1 1 0 20 0 3 0 0 1 P-3 20 94 27 1 0 31 0 0 5 0 1 P—4 20 93 1 1 1 24 0 0 9 0 2 152 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Cone IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml)
Estímulo ug/ml 28065 28066 28067 28068 média 28065 28066 28067 28068 média P-2 + P-3 + P-4 20 tot; cada 6,7 99 0 1 C-8 20 1000 19 56 C-9 20 1000 8 57 C-10 20 1000 9 51 C-l 7 20 1000 6 32 C-18 20 1000 102 27 C-19 20 84 8 1 C-2 0 20 354 13 16 C-21 20 653 16 24 C-23 20 438 5 6 C-2 4 20 337 2 4 C-25 20 541 6 19 Μ—1 20 157 1 40 C-2 7 20 475 3 24 C-2 8 20 1082 5 42 PLGA 0 55 1 1 P-6 + 20 975 191 287 PLGA P-7 + 20 19 27 6 PLGA P-2 + 20 357 138 104 PLGA P-3 + 20 134 1 1 PLGA P-4 + 20 19 1 0 PLGA P-2 + P-3 + P-4 + PLGA 20 tot; cada 6,7 122 4 14 C-8 + 20 527 280 245 PLGA C-9 + 20 334 139 343 PLGA C-10 + 20 619 152 557
PLGA 0 25 0 0 8 0 2 419 373 123 6 96 358 146 510 394 13 0 22 64 25 559 405 116 6 107 340 142 459 374 21 0 22 95 34 695 456 51 9 16 162 59 2 24 0 1 0 13 4 505 222 21 5 13 64 26 960 413 227 24 183 769 300 238 172 52 3 19 137 53 116 115 28 0 8 67 26 337 226 11 0 22 79 28 2 50 0 0 3 0 1 226 182 3 0 24 16 11 410 385 3 0 29 52 21 5 16 0 2 12 10 6 573 506 388 194 565 2000 787 11 15 0 5 0 0 1 443 261 982 708 2100 2336 1532 4 35 307 0 0 0 77 3 6 34 5 0 0 10 70 53 1820 0 435 106 590 357 352 2395 538 4380 4625 2985 456 318 1093 130 1686 2045 1239 420 437 2049 369 3515 3586 2380 153 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Cone IFN-γ (pg/rnl) IFN-α (pg/ml)
Estímulo ug/ml 28065 28066 28067 28068 média 28065 28066 28067 28068 média C-17 + PLGA 20 508 184 587 355 408 1914 240 2729 2774 1914 C-18 + PLGA 20 732 108 355 448 411 2188 375 3513 7141 3304 C-19 + PLGA 20 1000 780 730 466 744 5997 3753 14359 7079 7797 C-2 0 + PLGA 20 1055 256 270 488 517 1044 191 1265 2000 1125 C-21 + PLGA 20 682 874 390 481 607 2468 784 3372 4962 2897 C-23 + PLGA 20 216 161 120 377 219 789 189 1573 2000 1138 C-2 4 + PLGA 20 236 47 188 707 295 31 20 772 340 291 C-25 + PLGA 20 427 179 289 499 348 414 87 1082 1335 730 M-l + PLGA 20 7 1 3 5 4 0 0 8 5 3 C-2 7 + PLGA 20 888 205 235 466 448 136 44 388 259 207 C-28 + PLGA 20 860 88 489 415 463 216 73 401 520 303 SAC 0 1000 339 511 355 551 284 156 1544 350 583
Por análise da tabela 8 será evidente que o dador 28065 apresentou valores basais elevados no ensaio de IFN-gama. Os valores apresentados como "1000" indicam uma medida fora dos limites de sensibilidade do ensaio.
Exemplo 42: Imunomodulação de células de ratinho por CIC
Ensaiaram-se polinucleótidos e compostos quiméricos para actividade de imunoestimulação em esplenócitos de ratinho. Avaliou-se a imunoestimulação por medição de excreção de citocinas para o meio de cultura. Determinaram-se os níveis de citocinas no sobrenadante de cultura por testes de ensaio de imunoabsorção enzimática (ELISA).
Isolaram-se e preparam-se células usando técnicas padrão. Recolheram-se baços de ratinhos BALB/c com 8 a 20 semanas de 154 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ idade e isolaram-se os esplenócitos usando raspagem padrão e tratamento com tampão de lise ACK de BioWhittaker, Inc. Recolheram-se conjuntamente quatro baços nesta experiência. Lavaram-se as células isoladas em meio RPMI 1640 suplementado com soro fetal de vitelo (FCS) inactivado pelo calor a 2%, 2-mercaptoetanol 50 μΜ, penicilina-estreptomicina a 1% e L-glutamina 2 mM e ressuspenderam-se a aproximadamente 7 x 105 células/ml em FCS/RPMI (meio RPMI 1640 com FCS inactivado pelo calor a 2%, 2-mercaptoetanol 50 μΜ, penicilina-estreptomicina a 1% e L-glutamina 2 mM) a 10%.
Estabeleceram-se culturas de células em triplicado com aproximadamente 7 x 105 células/poço numa placa de microtitulação de 96 poços e fundo plano em 100 μΐ de FCS/RPMI a 10% e deixaram-se as células repousar durante pelo menos 1 hora após plaqueamento. Incubaram-se os compostos de ensaio indicados (às concentrações indicadas) durante 24 horas a 37 °C. Recolheram-se os sobrenadantes celulares e congelaram-se a -80 °C. Determinou-se a produção de citocinas pelas células por ELISA, tal como apresentado na tabela 9. TABELA 9
Composto de ensaio Dose IL-6 IL-12 IFNy P-6 5,0 pg/ml 9311 5374 2505 1,0 pg/ml 5760 4565 2175 0,1 pg/ml 121 1665 187 C-10 5,0 pg/ml 3342 2329 199 1,0 pg/ml 1761 1738 104 0,1 pg/ml 9 122 9 C-ll 5,0 pg/ml 10098 4279 3342 1,0 pg/ml 11814 4914 3220 0,1 pg/ml 458 3359 960 P—7 5,0 pg/ml 9 177 23 1,0 pg/ml 7 143 30 SAC 734 1343 18843 Meio sozinho 9 124 9 155 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Exemplo 35 Actividade de CIC contendo partes de ácido nucleico 3-nucleótido e aumento de actividade por cPLGA
Este exemplo apresenta actividade de imunoestimulação de vários CIC na presença e ausência de cPLGA tal como avaliado usando PBMC humanas. Curiosamente, a versão fosfodiéster de C-30 (C-31) foi inactiva como um CIC sozinho mas teve boa actividade quando formulado com cPLGA. De facto, a tendência geral foi a de que enquanto os CIC contendo todas as ligações fosfodiéster (C-31, C-36 e C-93) foram inactivos como CIC sozinhos, tornaram-se significativamente mais activos quando formulados com cPLGA. C-32, um CIC contendo apenas partes de ácido nucleico triméricas, apresentou actividade quando usado sozinho e demonstrou mais actividade quando formulado com cPLGA. Consultar tabela 10. TABELA 10 IFN- -Y (pg/ml) IFN- -a (pg/ml) estímulo 28089 28090 28098 28099 média 28089 28090 20988 28099 média células sozinhas 0 0 0 4 1 25 79 33 28 41 P-6 84 255 745 125 302 0 62 105 105 68 P-7 0 4 0 2 1 0 27 19 37 21 C-10 35 44 174 140 98 17 61 187 304 142 C-21 61 68 218 124 118 56 157 286 466 241 C-22 31 15 110 91 62 0 46 97 247 97 C-8 62 52 205 116 109 21 124 314 362 205 C-9 12 7 10 10 67 39 C-29 63 50 150 177 110 75 92 359 332 214 C-30 0 6 12 20 9 134 29 52 47 65 C-31 0 0 0 2 0 158 26 62 29 69 C-32 0 5 11 35 13 285 31 46 59 106 C-33 0 0 0 3 1 56 22 34 30 36 C-93 0 0 0 3 1 0 30 25 29 21 C-2 8 14 15 183 45 64 0 64 42 67 43 PLGA 15 2 16 10 11 8 38 39 49 33 P-6 + PLGA 606 144 3277 160 1047 197 103 340 91 183 P-7 + PLGA 121 3 91 5 55 7 85 36 47 44 156 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 156 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ IFN- -Y (pg/ml) IFN- -ct (pg/ml) estímulo 28089 28090 28098 28099 média 28089 28090 20988 28099 média C-10 + PLGA 804 373 1501 301 745 523 256 509 1317 651 C-21 + PLGA 1138 454 1612 630 958 1347 1020 1001 2302 1418 C-22 + PLGA 772 244 1271 357 661 619 386 604 1339 737 C-8 + PLGA 668 332 1863 506 842 1005 683 934 1680 1075 C-9 + PLGA 1036 330 683 308 363 335 C-29 + PLGA 825 477 1536 341 795 909 711 855 1419 973 C-3 0 + PLGA 97 233 447 41 205 44 116 49 33 60 C-31 + PLGA 256 327 1597 406 647 696 912 1028 1361 999 C-32 + PLGA 454 192 259 57 240 281 289 218 131 230 C-33 + PLGA 171 186 249 96 176 658 1220 1764 1304 1237 C-93 + PLGA 427 628 1707 323 771 990 1738 2681 4000 2352 C-2 8 + PLGA 683 306 2252 224 866 136 155 141 70 126 SAC 195 489 101 306 273 67 239 92 70 117
Exemplo 36 Actividade de imunoestimulaçao de CIC contendo 5' TCG.
Este exemplo mostra imunomodulação por CIC contendo diferentes partes de ácido nucleico (consultar tabela 11). De um modo geral, as sequências contendo um 5'-TCG-3' (C-8, C-
21, C-50, C-51, etc.) ou 5'-NTCG (C-46), em que N é qualquer nucleósido, foram mais activas do que outros CIC contendo CG (C-24, C-52). Adicionalmente, enquanto a maioria dos CIC induziram uma quantidade significativa de IFN-γ, os resultados foram mais variáveis para a indução de IFN-a, sugerindo que os requisitos de motivo para indução de IFN-a podem ser mais restritivos do que os requisitos para indução de IFN—γ. Nomeadamente, os CIC contendo um 5'-TCGA-3' (C-50, C-51, C-45) geraram mais IFN-α do que os CIC contendo um 5'-TCGT-3'(C-41, C-42, C-52).
Com excepção de C-8 e C-21 (incluindo o motivo 5'-TCGTCGA-3')r a melhor indução de IFN-α foi gerada por CIC com o TCGA na posição 5'. e
Verificou-se que os CIC contendo apenas partes de ácido nucleico hexaméricas (C-22), pentaméricas (C-43) 157 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ tetraméricas (C-44) induziam IFN-γ quando utilizados sozinhos. Além disso, cada um destes CIC, assim como C-32 contendo apenas partes de ácido nucleico triméricas, induziram consideravelmente IFN-γ e IFN-α quando formulados com cPLGA. 0 C-39, um CIC com duas partes de ácido nucleico heptaméricas, foi activo quando utilizado sozinho, enquanto C-40, um CIC com uma parte de ácido nucleico hexamérica e uma parte de ácido nucleico tetramérica, foi inactivo nesta experiência. Ambos estes CIC apresentaram actividade significativa quando formulados com cPLGA. TABELA 11 IFN-γ (pg/ml) IFN-a (pg/ml) estímulo 28042 28043 28044 28045 média 28042 28043 28044 28045 média células 15 4 3 5 7 0 44 9 0 13 sozinhas P-6 495 1189 925 212 705 27 85 36 21 42 P-7 66 76 26 13 45 0 11 22 20 13 C-8 468 939 1000 234 660 20 51 32 5 27 C-2 4 148 156 312 26 161 0 0 8 0 2 C-21 790 1519 1198 177 921 57 72 79 15 56 C-42 198 1067 4000 37 1326 0 29 24 0 13 C-41 174 1075 841 45 534 0 3 23 0 7 C-45 590 1466 984 253 823 62 123 152 14 88 C-46 399 814 480 63 439 24 73 26 3 31 C-47 112 537 142 17 202 20 0 0 0 5 C-50 1324 1292 509 192 829 36 137 193 35 100 C-51 795 1349 1114 411 917 112 245 240 36 158 C-52 238 214 212 28 173 0 3 35 48 22 M-l 45 29 7 3 21 0 0 13 2 4 C-22 206 343 736 40 331 12 18 67 30 32 C-43 128 536 566 16 312 0 14 20 0 8 C-44 238 359 484 51 283 0 12 60 1 18 C-32 91 19 78 17 51 0 0 8 0 2 C-39 343 488 281 137 312 31 187 46 36 75 C-40 26 55 20 23 31 0 26 31 2 15 PLGA 192 82 55 3 83 0 0 0 8 2 P-6 + PLGA 1382 1538 2581 178 1420 106 387 371 38 226 P-7 + PLGA 152 324 174 12 166 0 2 0 2 1 158 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) estímulo 28042 28043 28044 28045 média 28042 28043 28044 28045 média C-8 + PLGA 1367 2547 1490 286 1423 2182 2193 716 211 1325 C-2 4 + PLGA 1017 1380 1362 52 953 0 31 65 0 24 C-21 + PLGA 4000 1204 1870 325 1850 2959 2024 886 191 1515 C-42 + PLGA 1515 1417 2190 372 1374 425 1081 295 69 468 C-41 + PLGA 710 1940 1910 496 1264 535 1987 534 119 794 C-45 + PLGA 1380 2292 1920 634 1557 2408 4000 1693 642 2186 C-46 + PLGA 2201 2352 1432 472 1614 502 1309 257 100 542 C-47 + PLGA 3579 4000 1137 161 2219 46 271 30 0 87 C-50 + PLGA 2969 1209 1465 402 1511 1548 2818 1242 327 1484 C-51 + PLGA 2018 4000 1000 463 1870 1837 3241 1154 536 1692 C-52 + PLGA 1172 1726 1551 117 1142 12 34 34 0 20 M- -1+PLGA 215 159 23 3 100 0 1 0 0 0 C-22 + PLGA 4000 2975 1085 136 2049 325 1186 226 42 445 C-43 + PLGA 2210 2594 1354 194 1588 358 1293 402 49 526 C-44 + PLGA 1452 4000 2006 276 1934 986 4000 1768 192 1736 C-32 + PLGA 2211 4000 2759 133 2276 204 1142 771 12 532 C-39 + PLGA 1800 4000 2275 274 2087 2167 4000 2613 736 2379 C-40 + PLGA 1438 498 1813 160 977 2758 4000 1556 370 2171 SAC 1618 1271 1053 123 1016 285 110 57 0 113
Exemplo 37 Actividade de imunoestimulação de CIC
Este exemplo apresenta ensaios de imunomodulação para CIC lineares adicionais (alguns contendo ligações fosforotiolato (PS) e fosfodiéster (PO)) e CIC ramificados (tabelas 12 e 13) . A comparação de C-94, um CIC ramificado, com C-21, um CIC linear contendo as mesmas partes de ácido nucleico, revelou que o CIC ramificado induziu 4 vezes mais IFN-α do que o CIC linear. As quantidades de IFN-γ e IFN-α induzidas aumentaram significativamente para cada CIC por formulação com cPLGA. As versões fosfodiéster de C-94 e C-93 foram activas apenas quando formuladas. C-87 apresentou uma indução notável de IFN-a. 159 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ TABELA 12 IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) estímulo 28042 28043 28044 28045 média 28042 28043 28044 28045 média células 11 4 0 13 7 8 2 3 64 19 sozinhas P-6 324 1036 529 653 636 9 34 22 108 43 P-7 34 19 48 35 34 0 0 4 54 15 C-8 623 753 646 604 656 78 25 52 256 103 C-53 39 27 38 26 32 0 0 0 5 1 C-49 367 433 767 353 480 30 8 100 88 57 C-84 29 23 69 232 88 0 0 5 222 57 C-85 17 13 315 134 120 0 0 28 24 13 C-94 443 198 1417 888 736 302 252 664 1855 768 C-93 8 1 41 17 17 7 3 81 61 38 C-21 572 460 4000 1644 1669 146 94 191 349 195 C-9 691 268 590 1306 714 39 0 11 64 29 PLGA 9 5 59 72 36 7 0 98 112 54 P-6 + PLGA 601 358 1474 1941 1093 115 116 515 1298 511 P-7 + PLGA 13 13 46 65 34 5 0 0 43 12 C-8 + PLGA 284 551 1781 3113 1432 595 396 1013 2259 1066 C-53 + PLGA 21 12 217 210 115 19 0 0 42 15 C-49 + PLGA 1471 1219 4000 2061 2188 904 460 4000 1040 1601 C-8 4 + PLGA 235 232 291 956 428 1777 914 4000 3641 2583 C-85 + PLGA 313 294 554 1167 582 2116 921 4000 2413 2362 C-9 4 + PLGA 2412 755 4000 3379 2637 1883 1640 4000 4000 2881 C-93 + PLGA 880 316 869 1251 829 778 471 2045 988 1071 C-21 + PLGA 4000 690 4000 2533 2806 712 577 2572 1571 1358 C-9 + PLGA 1451 763 4000 1804 2005 389 199 397 477 366 160 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ TABELA 13 IFN-g IFN-a (pg/ml) (pg/ml)
Estímulo 28218 28219 28220 28221 média 28218 28219 28220 28221 média células 5 5 5 5 5 32 32 32 32 32 sozinhas P—6 13 7 25 141 47 32 32 32 32 32 P —7 5 5 5 5 5 32 32 32 32 32 C-8 7 83 24 38 977 281 3075 32 4269 265 1910 C-94 15 39 44 269 92 32 167 633 412 311 SAC 2552 621 1383 647 1301 483 105 32 452 268 Exemplo 38 Efeito da posição do motivo de sequência no
CIC
Este exemplo descreve ensaios de imunomodulação para vários CIC (alguns dos quais foram ensaiados em diferentes dadores nos exemplos anteriores) e ilustra o efeito da posição da sequência de ácido nucleico no CIC.
Os CIC ensaiados incluíram CIC contendo duas sequências de ácido nucleico contendo CG diferentes em partes de ácido nucleico (TCGTCGA e ACGTTCG) conjuntamente com uma parte de ácido nucleico que não contém uma sequência CG (AGATGAT). Das sequências de ácido nucleico contendo CG, os CIC contendo uma sequência de TCGTCGA têm maior actividade do que CIC contendo apenas ACGTTCG. Destes dois, os CIC com TCGTCGA foram mais activos. Pode utilizar-se a estrutura geral dos CIC utilizados neste exemplo, N1-S1-N2-S2-N3, para descrever a colocação dos motivos no interior do CIC. A colocação do motivo mais activo, TCGTCGA, na posição Ni deu origem aos CIC mais activos (C— 8, C-56) . A colocação na posição N2 também conferiu actividade. Por exemplo, C-57 com o TCGTCGA na posição N2 foi algo mais activo do que C-58, com o TCGTCGA na posição N3. Um CIC com uma sequência ACGTTCG na posição Ni, apesar de ser menos activo do que um CIC semelhante com uma sequência TCGTCGA, foi mais activo do que um CIC com a sequência AGATGAT na posição N2 (comparar C-57 e C-58 com C-59 e C-60) . Nesta experiência, C-61, que continha partes de ácido nucleico que compreendem motivos CG mas não motivos TCG, induziu IFN-γ quando formulado com cPLGA. Consultar a tabela 14. 161 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ TABELA 14 IFN-Y (pg/ml) IFN-a (pg/ml) estímulo 28156 28157 28158 28159 média 28156 28157 28158 28159 média células 125 3 4 5 34 3 3 1 8 4 sozinhas P-6 1132 872 207 231 611 52 484 7 32 144 P-8 255 20 31 31 84 16 9 24 8 14 C-8 1612 742 340 197 723 102 755 61 160 270 C-9 1162 729 192 329 603 26 142 78 20 67 C-23 733 576 202 295 452 26 235 59 169 122 C-54 297 378 88 218 245 8 96 8 13 31 C-55 511 566 55 186 329 9 5 63 3 20 C-56 1223 543 203 563 633 98 415 57 131 175 C-57 419 323 67 262 268 5 52 61 42 40 C-58 404 288 59 84 209 13. 30 29 23 24 C-60 304 209 26 38 144 5 22 3 1 8 C-61 92 179 35 63 92 3 0 47 0 13 PLGA 43 63 5 11 30 85 246 0 3 83 P-6 + PLGA 1070 2643 251 496 1115 582 2948 418 359 1077 P-8 + PLGA 95 115 26 34 67 43 8 2 23 19 C-8 + PLGA 1083 1862 269 1129 1086 4000 4877 857 1573 2827 C-9 + PLGA 814 1412 307 992 881 1398 1778 418 483 1019 C-23 + PLGA 825 865 182 1423 824 1020 1621 240 597 869 C-54 + PLGA 838 1150 157 1751. 974 752 1265 147 278 611 C-55 + PLGA 1048 960 247 2356 1153 505 801 78 211 399 C-56 + PLGA 792 604 321 4000 1429 4000 4000 852 2433 2821 C-57 + PLGA 1027 814 101 3056 1250 555 1476 10 252 573 C-58 + PLGA 804 1065 135 1021 756 179 932 3 139 313 C-6 0 + PLGA 650 858 56 1014 645 71 118 32 50 68 C-61 + PLGA 1265 1508 238 864 969 4 80 1 63 37 SAC 780 1184 83 659 677 208 55 6 34 76
Esta experiência também comparou a actividade de imunomodulação de dois tipos de CIC ramificados: C-94 tem partes HEG entre a componente de glicerol ramificado e as partes de ácido nucleico, enquanto C-28 tem as partes de ácido nucleico ligadas directamente ao espaçador de glicerol. 162 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Consultar tabela 15. Curiosamente, enquanto a indução de IFN-γ foi semelhante para ambos os CIC ramificados, a indução de IFN-α foi drasticamente superior para o CIC contendo os espaçadores HEG. Um CIC ramificado contendo três sequências P-6 ligadas através das suas extremidades 5 a um espaçador trietilamina com activação de maleimido (C-99), induziu IFN-γ apenas quando formulado com cPLGA e não induziu IFN-α. De um modo geral, a maior produção de IFN-α foi obtida usando CIC com partes de ácido nucleico ligadas através de uma estrutura ramificada e apresentando múltiplas extremidades 5' de partes de ácido nucleico não ligadas ou "livres" e incluindo espaçadores que proporcionam flexibilidade conformacional e distância entre as partes de ácido nucleico. TABELA 15 IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) estímulo 110 112 119 120 média 110 112 119 120 média células sozinhas 44 24 20 28 29 20 200 2 2 56 P-6 1508 344 144 104 525 50 172 234 72 132 P-7 124 24 16 40 51 2 32 474 2 128 C-8 1152 540 136 48 469 196 30 264 42 133 C-59 256 52 28 40 94 2 6 2 2 3 C-63 1536 376 80 60 513 294 38 464 228 256 C-50 1096 264 52 48 365 716 84 838 636 569 C-51 1528 240 52 40 465 1408 72 2200 622 1076 C-45 880 192 52 36 290 446 130 1074 428 520 C-41 512 100 32 32 169 58 2 182 6 62 C-42 1508 204 56 56 456 250 26 156 36 117 C-46 1224 400 68 36 432 58 2 208 48 79 C-52 472 48 40 28 147 2 2 292 2 75 C-39 604 116 108 32 215 674 26 444 250 349 C-40 180 12 4 20 54 6 198 152 2 90 C-94 5168 284 104 120 1419 1608 144 2610 878 1310 C-28 5564 52 44 60 1430 38 4 56 26 31 C-99 276 12 16 40 86 22 4 86 2 29 PLGA 32 8 72 120 58 10 2 60 92 41 P-6 + PLGA 1640 968 960 2300 1467 948 260 1298 1470 994 P-7 + PLGA 72 16 32 316 109 14 14 22 2 13 C-8 + PLGA 1948 1220 1188 2384 1685 6674 1138 2130 2650 3148 C-59 + PLGA 680 824 620 1828 988 234 2 76 278 148 C-63 + PLGA 1208 1580 2340 2092 1805 4148 738 2796 2298 2495 C-50 + PLGA 812 3684 1432 992 1730 3768 1414 4161 3402 3186 163 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) estímulo 110 112 119 120 média 110 112 119 120 média C-51 + PLGA 1240 11216 2896 924 4069 5244 1260 5104 6148 4439 C-45 + PLGA 2736 3024 3056 2472 2822 5532 1544 5474 4206 4189 C-41 + PLGA 3168 1808 16000 3656 6158 3542 746 2074 2094 2114 C-42 + PLGA 1612 2032 10212 1908 3941 3462 1030 2118 2054 2166 C-46 + PLGA 3048 2012 3720 3608 3097 2372 638 2372 2682 2016 C-52 + PLGA 1032 1236 2344 1724 1584 64 20 252 206 136 C-39 + PLGA 2024 1332 8228 1244 3207 3764 846 3078 2658 2587 C-40 + PLGA 1360 1244 5364 1864 2458 2362 684 3794 2616 2364 C-94 + PLGA 2668 3188 8840 3396 4523 5658 1838 8000 6346 5461 C-28 + PLGA 2104 2568 3572 1320 2391 302 2 284 198 197 C-99 + PLGA 768 672 5316 472 1807 114 80 344 260 200
Exemplo 39 Actividade de CIC ramificados
Este exemplo demonstra que CIC ramificados com múltiplas extremidades 5' livres e flexibilidade conformacional proporcionada por espaçadores HEG induzem mais IFN-a relativamente a CIC lineares com espaçadores HEG (comparar C-94 com C-21 e C-96 com C-23) ou CIC ramificados sem espaçadores (HEG) adicionais (comparar C-94 com C-28 e C-96 com C-27). A adição de outro espaçador HEG e de uma parte de ácido nucleico de 4 bases a C-96 provocou uma redução da indução de IFN-α (comparar C-96 com C-97). Consultar tabela 16 .
Ensaiou-se a actividade de imunoestimulação de dois CIC contendo motivos triméricos 5'-TCG-3' (C-91 e C-68). Apesar de nenhum ser por si só activo, C-91 teve uma actividade significativa quando formulado com cPLGA.
Um dendrimero STARBURST® contendo uma poliamina hidrofílica com sequências P-6 múltiplas a ele conjugadas (C-102), teve significativamente mais actividade IFN-α do que a sequência P-6 sozinha comparativamente com uma quantidade igual de P-6 (numa base comparativa de cadeia de P-6 por cadeia de P-6) . Este resultado confirma, usando uma composição e um protocolo sintético diferentes do anteriormente demonstrado, a utilidade de uma entrega multimérica de partes de ácido nucleico contendo 5'-CG-3' num núcleo flexivel e hidrofilico para indução de IFN-a significativamente aumentada. 164 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Tabela 16 IFN-g IFN-a (pg/ml) (pg/ml)
Estímulo 28185 28186 28187 28188 média x4 28185 28186 28187 28188 média x 2 células sozinhas 5 1 13 1 5 20 36 4 32 4 19 38 P-6 205 17 148 8 94 378 120 41 4 4 42 84 P-7 0 4 19 2 6 25 4 25 5 31 16 32 C-8 154 25 123 9 78 311 196 31 202 4 108 217 C-9 4 181 61 384 17 161 644 1895 239 136 13 571 1142 C-2 8 162 24 75 5 66 266 14 4 0 4 6 11 C-21 244 37 125 7 103 413 443 64 1 4 128 256 C-23 42 14 29 3 22 88 83 27 59 55 56 112 C-2 7 49 3 21 3 19 75 4 4 39 4 13 25 C-96 163 22 195 12 98 392 2550 446 118 40 788 1577 C-9 7 259 16 125 5 101 405 307 71 4 2 96 192 C-9 189 24 95 11 80 319 25 16 4 146 48 95 C-86 1 4 30 5 10 40 7 4 4 31 11 22 C-91 3 4 6 7 5 20 9 46 37 4 24 48 C-6 8 0 4 2 1 2 7 4 13 25 4 11 23 ( C-102 158 43 101 6 77 307 1880 187 109 4 545 1090 PLGA 10 4 13 4 8 30 4 4 0 4 3 6 P—6 + PLGA 315 64 128 39 137 546 710 116 78 4 227 454 P-7 + PLGA 7 3 15 2 7 27 4 4 4 9 5 10 C—8 + PLGA 319 127 242 24 178 712 1599 646 601 35 720 1441 C-9 4 + PLGA 391 118 280 34 206 823 6761 19553 3949 207 7618 15235 C-2 8 + PLGA 395 65 175 13 162 649 84 145 15 13 64 128 C-21 + PLGA 333 49 177 20 145 579 3581 3169 1340 64 2038 4077 C-23 + PLGA 199 67 102 15 96 382 599 250 110 21 245 490 C-2 7 + PLGA 292 170 95 14 142 570 54 58 4 39 39 78 C-96 + PLGA 400 186 244 41 218 872 27504 5572 2464 173 8928 17857 C-9 7 + PLGA 356 177 124 39 174 696 2264 668 285 48 816 1632 C-9 + PLGA 384 82 93 19 145 579 479 451 193 35 290 579 C-86 + PLGA 11 3 84 4 25 101 33 4 4 4 11 22 C-91 + PLGA 161 101 114 1 94 377 880 494 316 4 423 847 C-6 8 + PLGA 31 8 24 4 17 67 14 51 4 4 18 37 C-102 + PLGA 774 132 380 7 323 1293 2094 397 221 26 684 1369 SAC 195 22 274 15 127 506 73 4 151 102 82 165 165 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Exemplο 40
Esta experiência analisou a actividade de uma série de CIC contendo um motivo de ácido nucleico hexamérico, 5'-TCGTCG-3' e múltiplos espaçadores ligados à extremidade 3' da parte de ácido nucleico (C-13, C-14, C-15 e C-16) . Consultar a tabela 17. Nenhum dos CIC foi activo quando utilizado sozinho, contudo todos apresentaram actividade significativa quando formulados com cPLGA.
Tabela 17 IFN-γ (pg/ml) IFN-α (pg/ml) estímulo 28057 28058 28059 28060 média 28057 28058 28059 28060 média células sozinhas 1 2 1 39 11 0 0 0 0 0 P-6 83 103 1230 85 375 621 396 145 123 321 P-7 1 2 3 4 2 0 0 0 0 0 C-13 2 3 12 5 6 31 0 249 0 70 C-14 3 1 1 3 2 0 0 0 0 0 C-15 5 3 0 1 2 0 0 0 0 0 C-16 1 2 0 6 2 0 0 0 0 0 PLGA 40 32 49 254 94 35 222 41 0 74 P-6 + PLGA 2000 2000 2000 452 1613 2000 2000 1747 403 1537 P-7 + PLGA 40 271 16 40 92 0 527 161 108 199 C-13 + PLGA 2000 262 221 168 663 5865 7994 5912 1437 5302 C-14 + PLGA 2000 359 732 2000 1273 3937 6871 6371 2953 5033 C-15 + PLGA 2000 585 2000 258 1211 2991 6282 4138 1731 3786 C-16 + PLGA 172 207 277 71 182 1842 2529 2333 1362 2017 SAC 673 2000 2000 2000 1668 920 2000 387 146 863
Exemplo 41: Efeitos de CIC no ensaio de proliferação de células B
Isolaram-se PBMC humanas de sangue heparinizado de dois indivíduos normais. Mantiveram-se algumas PBMC de reserva enquanto se incubaram as remanescentes com pérolas MACS CD19+ (Miltenyi Biotec). Passaram-se então estas células através de um magneto separando as células B CD19+ através de selecção positiva. Esta população foi >98% CD19+ tal como determinado por análise FACS. Cultivaram-se então células B a 1 x 105/200 166 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ μΐ/poço em placas de fundo redondo de 96 poços. Em alguns casos, cultivaram-se também PBMC mas a 2 x 105/200 μΐ/poço. Estimularam-se células em triplicado com polinucleótido ou CIC a 2 pg/ml. O período de cultura foi de 48 horas a 37 °C. No final do período de cultura submeteram-se as placas a um impulso de 3H-timidina, 1 pCi/poço e incubaram-se durante 8 horas adicionais. Seguidamente recolheram-se os conteúdos das placas utilizando técnicas de cintilação líquida padrão e recolheram-se dados em contagens por minuto (cpm).
Experiência A: Os resultados da experiência A (tabela 18) demonstram que polinucleótidos (P-6) e CIC (C-8, C-9, C-21, C-28) contendo motivos 5'-C,G-3' causam proliferação de células B. Os compostos de controlo P-7 e M-l e um polinucleótido heptamérico, P-l, geraram proliferação de células B reduzida ou nula. O CIC ramificado C-28 e o CIC contendo os espaçadores propilo C-9, induziram mais proliferação de células B do que os CIC contendo espaçadores de hexa-etilenoglicol, C-8 e C-21. A proliferação de PBMC foi equivalente à de células B.
Tabela 18
Dador 146 Dador 147 média Tipo de célula estimulo cpml cpm2 cpm3 média cpml cpm2 cpm3 média de ambos células B células sozinhas 538 481 795 605 482 360 296 379 492 células B P-6 29280 33430 30056 30922 35729 18032 21166 24976 27949 células B P-7 4858 5810 7079 5916 4364 4066 2774 3735 4825 células B P-l 761 608 721 697 569 460 687 572 634 células B C-8 23815 30066 22969 25617 20914 22370 23659 22314 23966 células B C-9 35365 42705 45231 41100 55543 49035 44985 49854 45477 células B C-21 28467 16074 19258 21266 17604 18851 19887 18781 20024 células B M-l 1514 2815 1173 1834 1679 1667 1436 1594 1714 células B C-28 50999 54630 46418 50682 65593 51040 50357 55663 53173 PBMC células sozinhas 2744 2303 2284 2444 1301 2402 2143 1949 2196 PBMC P-6 22067 23740 28099 24635 26436 23830 17531 22599 23617 PBMC P-7 7620 8362 9686 8556 9783 9841 10476 10033 9295 PBMC P-l 9724 3041 2425 5063 1706 1960 324 1330 3197 167 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Dador 146 Dador 147 média Tipo de célula estímulo cpml cpm2 cpm3 média cpml cpm2 cpm3 média de ambos PBMC 0 1 co 47202 40790 44811 44268 38845 39733 27981 35520 39894 PBMC C—9 55348 24857 39953 40053 88106 65413 90665 81395 60724 PBMC C-21 30338 22685 22383 25135 28819 530 370888 22146 23641 PBMC Μ—1 8753 5203 4496 6151 1034 3298 1674 2002 4076 PBMC C-28 94977 121595 84977 100516 103916 91439 100905 98753 99635
Experiência Β : A experiência Β (tabela 19) avaliou os efeitos da composição do espaçador, assim como a estrutura dos CIC (linear relativamente a ramificada) sobre a proliferação de células B. Os CIC lineares contendo espaçadores propilo, butilo, abásico e hidroximetiletilo tenderam a induzir mais proliferação de células B do que os CIC correspondentes contendo espaçadores hexa-etilenoglicol ou trietilenoglicol (comparar C-10, C-ll, C-17, C-18, C-20, C-25). O espaçador dodecilo tornou os CIC inactivos (C-19). Notavelmente, os dados de proliferação de células B não reflectem necessariamente os dados de citocinas anteriormente apresentados, observando-se diferenças especificas entre proliferação de células B e indução de IFN-a. TABELA 19
ENSAIO DE PROLIFERAÇÃO 121 194 média amostra célula Estímulo cpml cpm2 cpm3 média cpml cpm2 cpm3 média de ambos 1 células B células sozinhas 451 757 297 502 203 228 151 194 348 2 células B P—6 19 9 96 15031 19804 18277 13678 12732 9003 11804 15041 3 células B P-7 1623 1821 2901 2115 1992 1593 1686 1757 1936 4 células B C-8 2604 12078 17696 10793 9333 9391 7602 8 775 9784 5 células B C-9 21938 35400 23877 27072 13660 16717 17866 16081 21576 6 células B C-10 15142 14136 16158 15145 7480 5458 5943 6294 10720 7 células B C-ll 30367 30412 18528 26436 16967 20898 11253 16373 21404 8 células B C-22 17147 14014 6844 12668 6472 5540 3894 5302 8985 9 células B C-9 4 11418 14406 11110 12311 7361 8505 5349 7072 9692 10 células B C-28 35393 26954 26780 29709 21588 13691 15691 16990 23350 11 células B C-17 27975 30426 9895 22765 17467 14890 10518 14292 18529 12 células B C-l 8 17085 14653 15869 10028 12217 10538 10928 13398 13 células B C-19 858 1099 926 961 371 403 312 362 662 168 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 121 194 média amostra célula Estímulo cpml cpm2 cpm3 média cpml cpm2 cpm3 média de ambos 14 células B C-2 0 31276 30851 28532 30220 18082 18705 17481 18089 24155 15 células B C-23 10628 16221 20087 15645 8730 6532 9596 8286 11966 16 células B C-2 4 8206 6789 2799 5931 3979 3407 3468 3618 4775 17 células B C-25 34360 35016 26480 31952 16060 19509 17384 17651 24802
Exemplo 43: Indução de genes imuno-associados no pulmão de ratinho após tratamento intranasal com CIC.
Investigou-se a capacidade de C-9, C-23 e P-6 (controlo positivo) para induzir expressão de ARNm de 75 genes diferentes no pulmão de ratinho. Os genes avaliados incluíram genes que codificam citocinas, quimiocinas, moléculas de superfície celular, factores de transcrição, metaloproteases e outras moléculas. 0 estudo foi efectuado em Northview Pacific Laboratories (Hercules, CA) com ratinhos fêmea BALB/c de 6-8 semanas de idade de Jackson Labs (Bar Harbor, ME) . Trataram-se intranasalmente cinco ratinhos por grupo sob anestesia suave com isoflurano com 20 ug of C-9, C-23, P-6 (controlo positivo) ou P-7 (controlo negativo) em 50 uL de soro fisiológico. Experiências anteriores demonstraram que a indução óptima da maioria dos genes foi às 6 h após tratamento. Seguidamente, às 6 h recolheram-se os pulmões e congelaram-se instantaneamente em azoto líquido e armazenaram-se a -80 °C para utilização posterior. Isolou-se o ARN total utilizando kits RNeasy mini (Qiagen Inc., Valência, CA) . Trataram-se as amostras de ARN com ADNase (Roche Diagnostics, Mannheim, Alemanha) e converteu-se em ADNc usando ARNase H-transcriptase reversa Superscript II (Invitrogen, Rockville MD) tal como descrito em Scheerens et al., 2001, Eur. J. of Immunology 31:1465-74. Recolheram-se conjuntamente as amostras de ADNc por grupo e mediu-se em cada amostra de conjunto a expressão de ARNm dos de 75 genes utilizando PCR quantitativo em tempo real (ABI Prism 5700, Perkin Elmer Applied Biosystems) e verde syber (Qiagen Inc.). Além dos genes de interesse, mediu-se em cada amostra a expressão de ARNm de um gene de expressão basal (HPRT ou ubiquitina) . De modo a corrigir para a quantidade de ARN em cada amostra, calcularam-se todos os dados relativamente à expressão do gene de expressão basal. Apresenta-se na figura 5 uma selecção dos genes com maior regulação positiva, sendo 169 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ os dados expressos como número de vezes de aumento de indução relativamente à resposta em ratinhos tratados com controlo (P-7) . Os dados demonstram que C-9, C-23 e P-6 induzem de forma potente a expressão de vários genes incluindo IL-6, IL-12p40, IFN-alfa, IP-10 e IL-10. Contudo, o tratamento de ratinhos com C-9 induziu expressão de ARNm de IFN-alfa consideravelmente mais elevada comparativamente com o grupo tratado com C-23 ou com P-6.
Exemplo 44: Actividade in vivo dos CIC
Executou-se um estudo in vivo por injecção de ratinhos (10 ratinhos/grupo) por via subcutânea no cachaço com 20 ug (volume 200 ul) de P-6 (controlo positivo), P-7 (controlo negativo), C-9, C-23, P-l ou P-ll. Recolheu-se sangue 2 horas mais tarde. Para o grupo de controlo positivo LPS, injectaram-se ratinhos por via intraperitoneal com um volume de 200 ul e recolheu-se sangue 1,5 horas mais tarde (i.e., no máximo da actividade TNF-α induzida por LPS) . Coagulou-se o sangue e preparou-se e armazenou-se o soro a -80 °C até ser ensaiado. Ensaiaram-se citocinas do soro usando kits Biosource cytoscreen para TNF-α e pares de anticorpo Pharmingen para mIL-6 e mIL-12. Ensaiaram-se todas as amostras em duplicado. O P-6 e os dois CIC, C-9 e C-23, induziram IL-12 p40, IL-6 e TNF-α, enquanto o oligonucleótido de controlo P-7 foi inactivo (figura 6A-C). O CIC C-23 foi mais potente do que C-9 e P-6 neste ensaio. Tal como esperado o hexâmero (P-ll: 5'-AACGTT) e o heptâmero (P-l: 5'-TCGTCGA) foram inactivos.
Exemplo 45: Resposta imunitária de primatas a antigénio e
CIC
Analisaram-se em babuínos as respostas imunitárias à administração de antigénio de superfície de hepatite B (HBsAg) na presença de CIC. O HBsAg foi HBsAg recombinante produzido em levedura. Os grupos de babuínos (oito animais por grupo) incluíram babuínos macho e fêmea com pesos na gama 8-31 kg (média de pesos do grupo a 13-16 kg) no início do estudo. 170 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Imunizaram-se os babuínos por duas vezes com um intervalo de dois meses (0 e 2 meses) por injecção intramuscular (IM) com 2 0 yg de HBsAg num volume de 1 ml. Tal como geralmente descrito seguidamente, alguns dos grupos também receberam CIC (C-8 ou C-9) ou um controlo positivo (P-6) com o HBsAg.
Recolheram-se sangramentos de todos os animais antes da imunização e às 2 semanas após imunização. Mediram-se os títulos de anti-HBsAg IgG da seguinte forma. Analisaram-se amostras de soro de babuíno com o kit comercial AUSAB EIA (Abbott Labs n° de catálogo 9006-24 e 1459-05) usando pérolas revestidas com HBsAg derivado de plasma humano. Ensaiaram-se as amostras conjuntamente com um painel de padrões positivos e negativos de HBsAg derivados de plasma humano na gama de 0-150 mIU/ml. Utilizaram-se HBsAg conjugado com biotina e anticorpo conjugado com anti-biotina-HRP de coelho como o complexo de anticorpo secundário usado para detecção. Desenvolveu-se o ensaio com ortofenilenodiamina (OPD) e determinaram-se os valores de absorvância a 492 nm com subtracção de linha de base a 600 nm (espectrofotómetro Quantum II, Abbott Labs). Utilizando o valor de absorvância do espécimen expressa-se a concentração de anti-HBsAg correspondente em mili-unidades internacionais por ml (mIU/ml) tal como determinado a partir de uma curva de calibração de acordo com parâmetros estabelecidos pelo fabricante. Para espécimes diluídos, a quantificação baseou-se na absorvância do espécimen que resultou num valor entre 0-150 mIU/ml, a multiplicar pelo factor de diluição para chegar à concentração final.
Efectuou-se a análise estatística com dados transformados em logaritmos por análise de variância (programa NCSS97 Statistical Software, Kaysville, UT) usando comparação planeada ANOVA a um factor (a = 0,05). Considerou-se que p d 0,05 era significativo.
Os grupos de animais ensaiados foram imunizados como se segue:
Grupo 1-20 yg de HBsAg;
Grupo 2 20 yg de HBsAg + 1000 yg de P-6; 171 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Grupo 3 - 20 pg de HBsAg + 1000 pg de C-8;
Grupo 4 - 20 pg de HBsAg + 1000 pg de C-9
Apresentam-se os resultados do estudo na tabela 20 seguidamente. A administração de CIC ou do controlo positivo P-6 conjuntamente com HBsAg resultou no aumento dos títulos de anticorpos anti-HBsAg comparativamente com a administração de HBsAg sozinho. Numa comparação de pares, as respostas imunitárias detectadas nos grupos 2, 3 e 4 foram significativamente diferentes das detectadas no grupo 1 (p<0,05 para o grupo 2 e p<0,005 para os grupos 3 e 4, após a segunda imunização). Não se detectou diferença estatística entre os grupos 2, 3 e 4. TABELA 20
Resposta de anticorpo dos babuínos (AUSAB EIA)
HBsAg + CIC N° N° do grupo Vacina Anti-HBsAg (mIU/ml) após primeira após segunda B339 1 0 7 B340 0 63 B341 0 15 B342 0 80 B343 HBV (20 ug) 0 55 B344 0 50 B345 0 28 B346 0 24 Média 0 40 Desvio padrão 0 26 B347 2 0 329 B348 6 121 B349 HBV (20 ug) 0 108 B350 17 13,569 B351 0 315 B352 P-6 (1000 ug) 0 38 B353 15 1,446 B354 21 1,675 Média 7 2200* Desvio padrão 9 4,637 B379 B380 3 HBV (20 ug) 2 0 184 3,038 172 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ N° N° do grupo Vacina Anti-HBsAg (mIU/ml) após primeira após segunda B381 0 41,706 B382 125 3,718 B383 0 250 B3 8 4 C-8 (1000 ug) 52 13,750 B385 0 11,626 B386 0 79 Média 22 9294** Desvio padrão 45 14,121 B3 8 7 4 0 5,605 B3 8 8 42 8,978 B389 HBV (20 ug) 0 312 B390 0 2,992 B391 405 12,663 B392 C-9 (1000 ug) 26 112 B393 75 2,364 B394 0 52 Média 68 4135** Desvio padrão 139 4,633 * ρ<0,05, ** ρ<0,005 comparativamente com HBV sozinho (grupo 1)
Exemplo 46: Respostas in vivo geradas por um conjugado CIC-antigénio
Este exemplo mostra a indução de uma resposta imunitária mediada por anticorpo em ratinhos por administração de um conjugado CIC-antigénio.
Tal como seguidamente descrito, imunizaram-se 10 ratinhos/grupo duas vezes por via intradérmica (na cauda) a intervalos de duas semanas com conjugado C-ll/Amb a 1 sintetizado tal como seguidamente descrito (1 ug ou 10 ug) , Ρ-6/Amb a 1 (1 ug) ou Amb a 1 (1 ug) . Determinaram-se os títulos de IgGl e de IgG2a específicos de anti-Amb 1 a partir de soros retirados 2 semanas após cada injecção. As restimulações in vitro foram efectuadas em células de baço às 6 semanas após a segunda imunização para determinar as respostas IFNy e IL-5 específicas de Amb a 1.
Os ratinhos imunizados com o conjugado C-11-Amb a 1 apresentaram o padrão característico de resposta imunitária observado com o material de referência Ρ-6-Amb a 1, 173 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ especificamente, uma alteração da resposta imunitária específica a Amb a 1, do tipo Th2 para o tipo Thl. Os ratinhos imunizados com os conjugados C-ll ou P-6 desenvolveram respostas IgG2a fortes e respostas IgGl reduzidas. Os grupos tratados com conjugados também demonstraram um apagamento da resposta IL-5 e elevação da resposta IFN-γ. Adicionalmente, as respostas imunitárias ao conjugado C-ll-Amb a 1 parecem aumentar de uma forma dependente da dose, tal como demonstrado por comparação dos grupos de dose de 1 ug e 10 ug. 0 conjugado C-ll-Amb a 1 desencadeia uma resposta imunitária de qualidade semelhante à observada com Ρ-6-Amb a 1.
Apresentam-se os resultados nas tabelas 21-23.
Procedimento geral 0 estudo com animais foi efectuado em Northview Pacific Laboratories (Hercules, CA) usando ratinhos BALB/c fêmea com 8-12 semanas de idade de Charles River Laboratories (Hollister, CA) . Injectaram-se 10 ratinhos/grupo duas vezes por via intradérmica na cauda (ID) a intervalos de duas semanas com um dos seguintes materiais: conjugado C-ll/Amb a 1 (1 ug), conjugado C-ll/Amb a 1 (10 ug), conjugado Ρ-6/Amb a 1 (1 ug) ou antigénio Amb a 1 (1 ug). Recolheram-se sangramentos pela via retro-orbital duas semanas após cada uma das injecçóes e preparou-se o soro para determinação de anticorpo. Seis semanas após a 2a injecção, recolheram-se os baços para ensaios de restimulação in vitro para determinar resposta de citocinas de IFNy e IL-5. Ensaiaram-se os baços individualmente. Utilizou-se Amb a 1 a 25 e 5 ug/ml para restimulação com 5xl05 células/poço e recolheram-se os sobrenadantes ao dia 4 e armazenaram-se a -80 °C até ensaio. Os controlos para o ensaio in vitro incluíram SAC a 0,01% e PMA/IO a 10 ng/ml e 1 uM, respectivamente.
Ensaios de IgGl e IgG2a anti-Amb a 1 de ratinho
Analisaram-se amostras de soro de ratinho por ELISA em placas de 96 poços de fundo redondo revestidas com 50 μΐ/poço de antigénio Amb alai pg/ml. Utilizou-se anticorpo IgGl (ou IgG2a) de cabra anti-ratinho conjugado com biotina como o 174 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ anticorpo secundário. Utilizou-se para detecção um conjugado estreptavidina-peroxidase de rábano. Desenvolveu-se o ensaio com TMB e determinaram-se os valores de absorvância a 450 nm com subtracção de linha de base a 650 nm (leitor de microplacas Emax precision, Molecular Devices, Sunnyvale, CA). Definiu-se o titulo como o reciproco da diluição do soro que deu origem a uma absorvância em ELISA de 0,5 OD usando uma análise a 4 parâmetros (Softmax Pro97, Molecular Devices, Sunnyvale, CA) . Ensaiaram-se todas as amostras em poços em duplicado em placas independentes e relataram-se os títulos como a média dos dois valores.
Ensaios de IL-5 e IFN-gama de ratinho
Ensaiaram-se os sobrenadantes para os níveis de IL-5 e IFNy por ELISA de captura em placas revestidas com anticorpo monoclonal anti-citocina. Utilizaram-se MAb anti-citocina biotinilados como os anticorpos secundários. Utilizou-se para detecção conjugado estreptavidina-peroxidase de rábano e desenvolveu-se o ensaio com TMB. Calculou-se a concentração a partir de uma recta de calibração produzida em cada placa. Determinaram-se os valores de absorvância a 450 nm com subtracção de linha de base a 650 nm (leitor de microplacas Emax precision, Molecular Devices, Sunnyvale, CA). Ensaiaram-se todas as amostras em poços em duplicado em placas independentes e relataram-se os títulos como a média dos dois valores.
Efectuou-se a análise estatística com dados transformados em logaritmos com o programa NCSS97 (NCSS Statistical Software, Kaysville, UT) usando comparação planeada ANOVA a um factor, α = 0,05. Considerou-se que p ^ 0,05 era estatisticamente significativo. Síntese do conjugado C-ll/Amb a 1 Síntese de C-ll activado (C-lll):
Dissolveu-se 5'-dissulfureto-C-11 (C-110) em tampão de activação (fosfato de sódio 100 mM /cloreto de sódio 150 mM /pH 7,5) e activou-se por redução com TCEP. Purificou-se o CIC activado (C-lll) usando uma coluna Sephadex G25 175 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ (Pharmacia) de 5 ml usando o mesmo tampão de activação do que a fase móvel. Recolheram-se fracções manualmente a intervalos de 0,5 minutos com início na elevação da linha de base. Após purificação, determinou-se a concentração das diferentes fracções usando A260 e um coeficiente de extinção de 25,6 OD/mg. Síntese de Amb a 1 activado:
Activou-se Amb a 1 por bloqueio prévio dos seus sulfidrilos livres e seguidamente adicionando uma agente de reticulação heterofuncional. Removeu-se o excesso de reagentes por dessalinização usando uma coluna de dessalinização HiTrap G-25 (N° de catálogo Pharmacia 17-1408-01) . O Amb a 1 activado resultante tem uma média de 9,3 locais por proteína activada. Síntese de conjugado C-ll/Amb a 1:
Combinaram-se o C-ll activado (C-lll) e Amb a 1 activado e o conjugado resultante C-ll/Amb a 1 foi fraccionado usando uma coluna de cromatografia de exclusão de tamanho Superdex 200 (N° de catálogo Pharmacia 17-1088-01; 1 cm x 30 cm). Utilizou-se tampão de formulação (fosfato 10 mM, NaCl 150 mM, pH 7,2) como fase móvel. Recolheram-se fracções a intervalos de 1 minuto com início no início da elevação da linha de base.
Analisaram-se as amostras de conjugado por SDS-PAGE usando um gel NuPAGE a 4-12% (N° de catálogo Invitrogen NP0322) usando tampão MOPS (N° de catálogo Invitrogen NP0001) e por cromatografia de exclusão de tamanho (SEC-HPLC) usando uma coluna BioSep SEC-S3000 (N° de catálogo Phenomenex 00H-2146-EO). Após SDS-PAGE visualizou-se a proteína por utilização de coloração com azul de Coomassie (GelCode, N° de catálogo Pierce 24596). Confirmou-se a presença do CIC por utilização de coloração com ADN-prata (Pharmacia, N° de catálogo 17-6000-30). Utilizaram-se tanto SDS-PAGE como SEC-HPLC para definir critérios de junção e para a caracterização do conjunto obtido. Mediu-se a concentração de proteína pelo método do ácido bicinconínico (BCA, N° de catálogo Sigma BCA-1) . 176 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ TABELA 21
Actividade de conjugados C-ll/Amb a 1 em ratinhos Títulos de IgGl e IgG2a anti-Amb a 1
Grupo N° do animal Imunização 2 semanas após a Ia imunização IgGl IgG2a 2 semanas após a 2a imunização IgGl IgG2a 1 1 Conjugado 30 148 7,900 19,886 2 C-ll/Amb a 1 30 221 13,037 19,735 3 30 943 946 23,918 4 30 64 5, 485 10,487 5 d ug) 38 1,894 3,805 9,945 6 30 943 600 5, 249 7 30 570 10,337 20,156 8 ID 30 259 600 8,350 9 56 30 2,575 5, 747 10 30 30 8,381 28,971 média 33** 510 5,367** 15,244* desvio padrão 8 599 4, 400 8,285 2 11 51 345 8,982 27,877 12 Conjugado 30 667 201,008 612,739 13 C-ll/Amb a 1 77 445 6, 739 86,672 14 30 1,662 22,578 121,770 15 (10 ug) 30 67 190,835 88,745 16 30 450 5, 971 17,600 17 55 1, 137 29,646 105,398 18 ID 99 1, 119 70,159 183,152 19 99 8,227 80,052 250,206 20 30 1,613 6,235 63,616 média 53* 1,573 62,221 155,778* desvio padrão 29 2,399 75,298 174,925 3 21 30 37 3, 437 65,306 22 Conjugado de 1, 422 303 15,652 6, 198 23 referência P-6/Amb a 1 485 265 84,927 177,281 24 170 1,182 37,379 56,074 25 (1 ug) 903 2,027 38,121 76,572 26 88 2,298 32,499 240,098 177 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Grupo N° do animal Imunização 2 semanas após a Ia imunização 2 semanas após a 2a imunização IgGl IgG2a IgGl IgG2a 27 33 321 3,011 24,404 28 ID 30 55 24,307 20,796 29 113 89 43,060 19,586 30 30 39 37,116 7,317 média 330 662 31,951 69,363 desvio padrão 475 862 23,568 78,697 4 31 3,405 349 172,827 6,244 32 Amb a 1 7,331 30 164,673 1,003 33 2,847 35 112,766 7,174 34 4, 021 30 100,281 1,399 35 (1 ug) 8,333 212 156,037 4,969 36 1,214 286 118,407 2, 125 37 1,279 30 396,404 600 38 ID 4,332 80 187,335 4,599 39 569 30 63,536 600 40 2,696 30 161,039 902 média 3,603** 111* 163,331** 2,962** desvio padrão 2,554 123 90,406 2,530
Utilizou-se um valor de 30 para amostras <30 após a Ia imunização Utilizou-se um valor de 600 para amostras <600 após a 2a imunização *p<0,05, **p<0,005 comparativamente com Ρ-6/Amb a 1 178 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ TABELA 22
Actividade de conjugados C-ll/Amb a 1 em ratinhos Resposta de IFNy in vitro (pg/ml)
Animal Imunização A 25 ug/ml mba 1 5 ug/ml PMA Meio sozinho 1 22501 16320 12505 45 2 Conjugado 16291 10054 8433 45 3 C-ll/Amb a 1 8534 5084 5835 45 4 Π tto\ 16925 8322 3796 45 5 l1 USJ 23136 11298 9225 45 6 ID 24900 25489 21525 185 7 4383 2716 8855 45 8 MORTO MORTO MORTO MORTO 9 16088 6285 27722 45 10 25067 12431 28201 45 __ Media 17536 10889 14011 61 Desvio padrão 7289 6839 9353 47 — 11 19994 13466 33702 45 12 Conjugado 50732 25103 36467 45 13 C-ll/Amb a 1 54752 28422 21770 123 14 /1 Π Iinfc 96417 78017 24601 1305 15 83356 43505 20021 151 16 1D 88018 51299 40604 829 17 87839 59079 31562 83 18 49763 28468 58062 211 ϊ 19 %£^26694Í#ÍfS 20 61939 29505 53393 756 Média 65868** 39652 35576 394 Desvio padrão 24860 20160 13331 455 21 4275 3083 36550 45 22 Conjugado de referência 4307 996 23742 45 23 Ρ-6/Amb a 1 40761 16956 15407 45 24 (1 “g) 40764 23643 8961 118 25 35645 30164 15915 209 26 ID 40895 31027 13355 308 27 25538 14349 15515 73 28 15884 12432 11623 45 29 4215 4608 71066 45 30 63276 46897 43680 734 Média 27556 18416 25581 167 Desvio padrão 20099 14603 19548 218 31 3016 2585 108000 452 32 Amb a 1 1193 277 94345 104 33 0«g) 5112 6239 97567 461 34 1301 251 89623 49 35 6879 2972 77808 56 36 ID 1187 673 77299 89 37 4492 2840 89253 282 38 6170 3765 70169 187 39 2099 1152 108000 132 40 2209 3895 103131 309 Média 3366** 2465 91520 212 Desvio padrãu 2143 1915 13239 156
Utilizou-se um valor de 18 para valores <18
Os valores não foram incluídos nos cálculos dado que o valor para o mei° sozinho foi >3 desvio padrão + média de todos valores para meio sozinh° (i.e. 2014 pg/ml) **p<0, 005 comparativamente com Ρ-6/Amb a 1 para restimulação com 25 179 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ TABELA 23 a 1 em ratinhos (pg/ml)
Actividade de conjugados C-ll/Amb Resposta de IL-5 in vitro
Animal Imunização Aml 25 ug/ml > a 1 5 ug/ml PMA Meio sozinho 1 67 106 2202 41 2 Conjugado 49 53 2406 24 3 C-ll/Amb a 1 264 24 968 24 4 (1 ug) 24 24 2979 24 5 68 45 2851 46 V 6 ΆίΑ, ED ; t '·/< ιΐοΐΐεϊ':’ . t. 121:.. .;· t.;/T2547A'iíjt dtvM29ÍAi. t 7 24 24 3935 24 8 MORTO MORTO MORTO MORTO 9 24 24 1383 24 10 24 203 1837 53 Média 68 63 2320 33 Desvia padrãn 86 63 948 12 11 24 33 1655 24 12 Conjugado 41 73 2258 84 13 C-ll/Amb a 1 169 137 892 24 14 (10 ug) 261 221 918 33 15 134 221 658 24 16 ID 253 187 778 29 17 72 109 966 24 18 24 35 3656 24 19 334 231 1238 145 20 213 55 751 24 Média 153 130 1377 44 Desvio padran 111 80 940 40 21 Conjugado de referência 24 24 1514 24 22 24 60 3725 24 23 Ρ-6/Amb a 1 157 277 1702 24 24 (1 ug) 96 152 4473 24 25 88 36 1414 24 26 ID 39 372 1235 24 27 218 176 1037 24 28 103 54 1382 24 29 24 459 2194 24 30 110 102 2990 24 Média 88 171 2167 24 Desvio padrao 64 151 1174 0 31 724 331 1332 24 32 Amb a 1 91 57 3186 24 33 (lug) 930 1259 1574 56 34 375 674 2506 24 35 1093 763 2197 24 36 ID 1206 490 3715 27 37 2808 2115 1727 67 38 1441 909 1655 58 39 1240 1228 1367 24 40 1373 481 1683 68 Média 1128** 831 2094 40 Desvio padrao 734 588 808 20
Utilizou-se um valor de 24 para valores <24
Os valores não foram incluídos nos cálculos dado que o valor para o meio sozinho foi >3 desvio padrão + média de todos valores para meio sozinho (i.e. 124 pg/ml) *p<0,05, **p<0,005 comparativamente com Ρ-6/Amb a restimulação com 25 ug/ml 1 para 180 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Exemplo 47: Efeito da parte espaçadora na actividade de
CIC
Este exemplo mostra o efeito de diferentes partes espaçadoras na indução de IFN-α. A comparação de C-90 (C3 CIC) e C-51 (HEG CIC) mostrou que C-51 induziu 8 vezes mais IFN-α do que C-90, apesar da quantidade de IFN-γ induzida por cada CIC ser semelhante. De igual modo, a comparação de CIC ramificados contendo diferentes ligantes mostrou que para indução de IFN-α, HEG (C-94) > TEG (C-103) > C3 (C-104) = sem ligante (C-28).
Tabela 24 IFN-g IFN-g (pg/ml) (pg/ml)
Estímulo 28234 28235 28236 28237 média 28234 28235 28236 28237 média células sozinhas 4 4 4 4 4 16 16 16 16 16 P-6 15 52 51 1167 321 58 16 16 74 41 P-7 13 4 7 4 7 62 16 16 16 28 C-90 7 118 497 1586 552 16 46 117 345 131 C-51 17 123 193 1580 478 16 77 352 3798 1061 C—71 30 168 448 1663 577 17 30 538 1665 563 C-101 14 205 627 2612 865 16 249 1354 8566 2546 C-96 21 239 354 1396 503 16 120 608 993 434 C-97 10 119 269 980 345 16 16 140 16 47 C-100 27 183 490 1907 652 16 16 398 193 156 C-88 5 21 17 477 130 95 16 212 111 109 C-33 23 86 247 2076 608 16 16 16 91 35 C-21 4 107 308 1645 516 16 16 73 678 196 C-28 10 14 88 1229 335 16 16 16 16 16 C-94 7 161 239 1116 381 16 118 548 3631 1078 C-103 21 44 250 1854 542 16 21 126 213 94 C-104 14 4 87 125 58 16 29 16 16 19 PLGA 4 31 18 10 16 16 122 157 35 83 P-6 + PLGA 57 514 1052 3775 1350 16 694 1163 3444 1329 P-7 + PLGA 4 4 11 13 8 16 16 16 16 16 C-90 + PLGA 139 673 831 4618 1565 1175 696 4544 5103 2880 181 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ IFN-g IFN-g (pg/ml) (pg/ml)
Estímulo 28234 28235 28236 28237 média 28234 28235 28236 28237 média C-51 + PLGA 88 644 1064 3748 1386 3257 2168 8000 8000 5356 C-71 + PLGA 101 797 1254 3899 1513 3085 2244 8000 8000 5332 C-101 + 110 659 879 6944 2148 4679 4488 8000 8000 6292 PLGA C-96 + PLGA 143 1070 1167 5471 1963 4107 3237 6660 8000 5501 C-9 7 + PLGA 68 737 988 5327 1780 4742 4216 8000 8000 6240 C-100 + 176 1299 1742 7804 2755 1520 1092 4074 3777 2616 PLGA C-8 8 + PLGA 102 512 1148 5055 1704 803 613 2409 6412 2559 C-33 + PLGA 118 444 968 3947 1369 551 566 3514 6727 2840 C-21 + PLGA 159 411 1089 4056 1429 1369 1561 5366 8000 4074 C-2 8 + PLGA 28 131 1005 3868 1258 16 16 184 134 88 C-94 + PLGA 174 623 1352 4034 1546 4145 4653 7197 8000 5999 C-103 + 192 643 1388 5063 1822 895 1486 4456 5405 3061 PLGA C-104 + 40 73 641 4930 1421 16 16 128 92 63 PLGA SAC 1845 1250 924 5350 2342 2374 327 1149 3744 1899 Exemplo 48: Avaliação de actividade de imunomodulação
isolada de polinucleótidos com sequência correspondente a partes de ácido nucleico CIC
Este exemplo ilustra adicionalmente a actividade de imunoestimulação de CIC que contêm partes de ácido nucleico que não têm actividade de imunomodulação isoladamente. Avaliou-se a actividade de polinucleótidos com sequência correspondente às partes de ácido nucleico CIC sozinhas ou em combinação com espaçadores livres e comparou-se com a actividade de um CIC contendo a mesma quantidade de ácido nucleico e espaçador. Por exemplo, comparou-se CIC C-101 3 uM com P-14 9 uM ou uma mistura de P-14 9 uM e hexa-etilenoglicol 9 uM e qlicerol 3 uM (devido a C-101 conter três equivalentes de P-14, três equivalentes de hexa-etilenoglicol e um equivalente de glicerol). Em todos os casos, os CIC foram activos enquanto os polinucleótidos curtos foram inactivos, tanto sozinhos como misturados com espaçadores. Consultar a tabela 25. A actividade dos 182 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ espaçadores sozinhos foi ensaiada a uma concentração de 9 uM e todos foram completamente inactivos. TABELA 25 IFN-g IFN-a (pg/ml) (pg/ml) estímulo 28250 28251 28252 28253 média 28250 28251 28252 28253 média células sozinhas 18 5 9 1 8 16 16 30 19 20 P-6 121 18 34 37 52 16 16 16 16 16 P-7 104 1 39 1 36 16 16 16 16 16
Espaçador propilo 13 1 1 1 4 16 16 16 16 16 Espaçador butilo 8 5 1 1 4 16 16 16 16 16 Trietilenoglicol 15 1 7 1 6 16 16 16 16 16 Hexa- etilenoglicol 12 1 1 15 7 16 16 16 35 21 Glicerol 16 12 2 1 8 16 16 16 16 16 C-51 135 45 164 167 128 181 246 95 1226 437 C-101 224 63 180 146 153 540 1472 509 2645 1291 P-l 4 10 34 11 10 16 16 16 16 16 16 P- 14/HEG/glicerol 14 19 10 10 13 16 16 16 16 16 C-21 122 51 155 203 133 31 69 41 264 101 C-9 4 340 60 287 128 204 245 645 323 1198 603 P-l 54 21 56 1 33 16 16 16 16 16 P-l/HEG/glicerol 15 9 19 1 11 16 16 16 16 16 C-45 107 26 95 8 59 16 109 55 382 140 P-13 18 13 22 1 14 16 16 16 16 16 P-13/HEG 40 28 45 1 28 16 16 16 16 16 C-10 337 163 776 898 544 16 23 25 124 47 P—2 7 25 53 1 22 16 16 25 16 18 P-3 32 21 72 1 31 16 29 38 31 29 P—4 72 1 43 1 29 16 16 16 16 16 P-2/P-3/P-4/HEG 68 1 38 1 27 16 16 16 16 16 183 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
Exemplo 49: Preparação de (5'-TCGACGT-3'—HEG) ave=185
Ficollioo (C-137) Ά. Preparação de maleimido-Ficoll^o
Preparou-se aminoetilcarboximetil (AECM) 180-FÍC0II400 pelo método de Inman (J. Immunology, 1975, 114: 704-709). Em média verificaram-se 180 grupos aminoetilo por mole de Ficoll (PM = 400 000 Da). Adicionaram-se gota-a-gota 27,6 mg (62,6 umol) de sulfosuccinimidil-4-[N-maleimidometil]-ciclo-hexano-1- carboxilato dissolvidos em 300 ul de DMSO, sob vórtex constante, a 23,2 mg (0,058 umol) de AECM180-FÍC0II400 dissolvido em 1,0 ml de tampão de fosfato de sódio 0,1 M (pH 6,66). Colocou-se a mistura reaccional num agitador durante 2 h e seguidamente dessalinizou-se numa coluna Sephadex G-25 para proporcionar 20 mg de maleimido-Ficoll4oo · Em média verificaram-se aproximadamente 165 grupos maleimida por mole de Ficoll. B. Preparação de 5'-TCGACGT-3'-HEG-(CH2) 3-SH (C-136)
Sintetizou-se 5' -TCGACGT-3' -HEG- (CH2) 3-SS-(CH2) 3-OH (C-135) de forma análoga a C-116. A 10 mg (3,57 umol) de C-135 dissolvido em 0,4 mL de tampão fosfato de sódio 0,1 M / cloreto de sódio 150 mM /pH 7,5 adicionaram-se 5,7 mg (20 umol) de TCEP dissolvido em 0,7 ml do mesmo tampão. Submeteu-se a mistura a vórtex vigoroso e colocou-se num banho de água a 40 °C durante 2 h. Purificou-se o tiol (C-136) por RP-HPLC (coluna Polymer Labs PLRP-S) usando um gradiente crescente de acetonitrilo em tampão de acetato de trietilamónio (TEAA)/pH 7,0 e usou-se imediatamente na reacção seguinte. C. Preparação de (5'-TCGACGT-3'-HEG)x-Ficoll 400 (C—137) A 5,5 mg (0,014 umol) de maleimido-Ficoll40o dissolvido em 0,7 ml de fosfato de sódio 0,1 M /pH 6,66 adicionaram-se 6,8 mg (2,5 umol) de C-136 dissolvido em 3,45 mL de tampão de acetonitrilo a aproximadamente 30%/TEAA/pH 7,0. Colocou-se a mistura num agitador à temperatura ambiente durante a noite e purificou-se o produto numa coluna Superdex 200 (Pharmacia). Os cálculos utilizando o peso total do produto isolado e os valores de absorvância a 260 nm mostraram que o produto 184 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ continha, em média, aproximadamente 185 oligonucleótidos por mole de Ficoll. Obteve-se igualmente uma segunda fracção contendo uma menor carga de oligonucleótidos por mole de Ficoll. D. Actividade de C-137
Tal como apresentado na tabela 26, o CIC baseado em polissacárido apresentou actividade notável em ensaios de resposta de citocinas, apresentando estimulação particularmente significativa de IFN-a. TABELA 26 IFN-g (pg/ml) IFN-a (pg/ml)
Composto estimulador 28313 28314 28315 28316 Média x4 28313 28314 28315 28316 Médi.a Células sozinhas 1 9 11 11 8 32 31 122 100 98 88 P6 1 38 47 309 99 395 31 130 122 134 104 P7 1 11 12 20 11 43 31 176 107 121 109 C-137 1 22 13 54 22 90 3612 5468 624 4000 3426 SAC 87 77 56 4000 1055 4220 346 192 114 1172 456 ***
LISTAGEM DE SEQUÊNCIAS <110> Fearon, Karen Dina, Dino Tuck, Stephen
<120> COMPOSTOS DE IMUNOMODULAÇÃO QUIMÉRICOS E MÉTODOS DE UTILIZAÇÃO DOS MESMOS-I <130> 377882002040 <140> A determinar <141> Em anexo <150> 60/299 883 <151> 2001-06-21 <150> 60/375 253 <151> 2002-04-23 185 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <160> 141 <17 0> FastSEQ para Windows versão 4.0 <210> 1 <211> 24
<212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> (5)...(24) <223> n = qualquer nucleótido <2 21> variação <222> (5)...(24) <223> podem estar ou não presentes n <400> 1 tcgannnnnn ηηηηηηηηηη ηηηη 24 <210> 2 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 2 tgactgtgaa cgttcgagat ga 22 <210> 3 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 186 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 3 tgactgtgaa ccttagagat ga 22
<210> 4 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 1 <223> η = t, g, c ou 5-bromocitosina <221> variação <222> 2 <223> n = t, g, a ou u <221> variação <222> 4 <223> n = t, a ou c <221> variação <222> 7 <223> n = t, g ou u <400> 4 nnancgntcg 10
<210> 5 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 5 tgaacgttcg 10 <210> 6 187 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 6 ggaacgttcg 10
<210> 7 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 7 tgaacgutcg 10 <210> 8 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 8 tgaccgttcg 10 <210> 9 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 9 tgatcggtcg 10 188 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<210> 10 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <2 2 0> <223> Construção sintética <400> 10 tgatcgttcg 10 <210> 11 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 11 tgaacggtcg 10 <210> 12 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 12 gtaacgttcg 10 <210> 13 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 189 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 13 gtatcggtcg 10 <210> 14 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 14 gtaccgttcg 10 <210> 15 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 15 gaaccgttcg 10 <210> 16 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 1 <223> n = 5-bromocitosina <400> 16 ngaccgttcg 10 <210> 17 <211> 10 190 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<212> ADN <213> Sequência artificial <2 2 0> <223> Construção sintética <4 0 0> 17 cgaacgttcg 10
<210> 18 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 18 cgaccgttcg 10 <210> 19 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 1 <223> n = 5-bromocitosina <400> 19 ngaacgttcg 10
<210> 20 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 191 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 20 ttaacgutcg 10 <210> 21 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 21 tuaacgutcg 10 <210> 22 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 22 ttaacgttcg 10 <210> 23 <211> 24 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 23 tcgtcgaacg ttcgttaacg ttcg 24 <210> 24 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial 192 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <220> <223> Construção sintética <400> 24 tgactgtgaa cgutcgagat ga 22 <210> 25 <211> 24 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 25 tcgtcgaucg utcgttaacg utcg 24 <210> 26 <211> 24 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 26 tcgtcgaucg ttcgtuaacg utcg 24 <210> 27 <211> 24 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 27 tcgtcguacg utcgttaacg utcg 24
<210> 28 <211> 24 <212> ADN 193 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 7 <223> n = 2-amino-adenina <400> 28 tcgtcgnacg utcgttaacg utcg 24 <210> 29 <211> 24 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 29 tgatcgaacg ttcgttaacg ttcg 24 <210> 30 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 30 tgactgtgaa cgutcggtat ga 22 <210> 31 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 194 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 31 tgactgtgac cgttcggtat ga 22 <210> 32 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 32 tgactgtgat cggtcggtat ga 22 <210> 33 <211> 16 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 33 tcgtcgaacg ttcgtt 16 <210> 34 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 34 tcgtcgtgaa cgttcgagat ga 22 <210> 35 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> 195 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <223> Construção sintética <400> 35 tcgtcggtat cggtcggtat ga 22 <210> 36 <211> 18 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 36 cttcgaacgt tcgagatg 18 <210> 37 <211> 18 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 37 ctgtgatcgt tcgagatg 18 <210> 38 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 38 tgactgtgaa cggtcggtat ga 22 <210> 39 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial 196 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <220> <223> Construção sintética <400> 39 tcgtcggtac cgttcggtat ga 22 <210> 40 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 40 tcgtcggaac cgttcggaat ga 22 <210> 41 <211> 19 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 41 tcgtcgaacg ttcgagatg 19 <210> 42 <211> 20 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 42 tcgtcgtaac gttcgagatg 20 <210> 43 <211> 22 197 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 43 tgactgtgac cgttcggaat ga 22 <210> 44 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 44 tcgtcgaacg ttcgaacgtt cg 22 <210> 45 <211> 19 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 2, 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 45 tngtngaacg ttcgagatg 19 <210> 46 <211> 19 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 198 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> variaçao <222> 5 <223> n = 5-bromocitosina <40 0> 46 tcgtngaacg ttcgagatg 19 <210> 47 <211> 20 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 47 tcgtcgaccg ttcggaatga 20 <210> 48 <211> 20 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> <223> 2,5 n = 5-bromocitosina <400> 48 tngtngaccg ttcggaatga 20
<210> 49 <211> 20 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 199 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> <222> variaçao 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 49 tcgtngaccg ttcggaatga 20 <210> 50 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 50 ttcgaacgtt cgttaacgtt cg 22 <210> 51 <211> 18 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 4 <223> n = 5-bromocitosina <400> 51 cttngaacgt tcgagatg 18 <210> 52 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 200 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 52 tgatcgtcga acgttcgaga tg 22
<210> 53 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 1 <223> η = t, g, c ou 5-bromocitosina <221> variação <222> 2 <223> n = t, g, a ou u <221> variação <2 2 2> 4 <223> n = t, a ou c <221> <222> variação 5 <223> n = 5-bromocitosina <221> variação <222> 7 <223> n = t, g ou u <40 0> 53 nnanngntcg 10 <210> 54 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 201 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> variação <222> 5 <223> η = 5-bromocitosina <400> 54 tgaangttcg 10
<210> 55 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> n = 5-bromocitosina <40 0> 55 tgaangutcg 10 <210> 56 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 56 tgacngttcg 10
<210> 57 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial 202 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 57 tgatnggtcg 10 <210> 58 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 58 gtatnggtcg 10 <210> 59 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 5 <223> n = 5-bromocitosina <40 0> 59 gtacngttcg 10 <210> 60 <211> 10 203 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> n = 5-bromocitosina <4 0 0> 60 gaacngttcg 10 <210> 61 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 61 gaaangutcg 10 <210> 62 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 1, 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 62 ngacngttcg 10 204 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<210> 63 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 63 cgaangttcg 10 <210> 64 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 1, 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 64 ngaangttcg 10 <210> 65 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variaçao <222> 1, 5 <223> n = 5-bromocitosina 205 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 65 ngaangutcg 10
<210> 66 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> η = 5-bromocitosina <400> 6 6 ttaangutcg 10
<210> 67 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> η = 5-bromocitosina <400> 67 tuaangutcg 10
<210> 68 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 206 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> variaçao <222> 5 <223> η = 5-bromocitosina <400> 68 ttaangttcg 10
<210> 69 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 11 <223> η = 5-bromocitosina <400> 69 tgactgtgaa ngutcgagat ga 22
<210> 70 <211> 24 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 9, 19 <223> η = 5-bromocitosina <400> 70 tcgtcgaang ttcgttaang ttcg 24
<210> 71 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial 207 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 11 <223> n = 5-bromocitosina <400> 71 tgactgtgaa ngutcggtat ga 22 <210> 72 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 11 <223> n = 5-bromocitosina <400> 72 tgactgtgaa ngutcggaat ga 22 <210> 73 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 11 <223> n = 5-bromocitosina <400> 73 tcgtcggaaa ngutcggaat ga 22 <210> 74 <211> 20 208 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> <223> variação 5, 9 n = 5-bromocitosina <400> 74 tcgtngaang utcggaatga 20 <210> 75 <211> 10 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 1 <223> n = t, c ou 5-bromocitosina <221> <222> variação 2 <223> n = t, g, a ou u <221> variação <222> 4 <223> n = t, a ou c <221> variação <222> 7 <223> n = t, g ou u <400> 75 nnancgntcg 10 <210> 76 <211> 22 209 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 11 <223> n = 5-bromocitosina <400> 76 tgactgtgaa ngttcgagat ga 22 <210> 77 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 11, 15 <223> n = 5-bromocitosina <400> 77 tgactgtgaa ngttngagat ga 22 <210> 78 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 11 <223> n = 5-bromocitosina <400> 78 tgactgtgaa ngttccagat ga 22 210 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <210> 79 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 79 tgactgtgaa cgtucgagat ga 22 <210> 80 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 13 <223> n = 5-bromouracilo <400> 80 tgactgtgaa cgntcgagat ga 22 <210> 81 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 11 <223> n = 5-bromocitosina <400> 81 tgactgtgaa ngttcgtuat ga 22 211 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <210> 82 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 11 <223> n = 5-bromocitosina <400> 82 tgactgtgaa ngttcggtat ga 22 <210> 83 <211> 18 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 83 ctgtgaacgt tcgagatg 18 <210> 84 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 2, 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 84 tngtngtgaa cgttcgagat ga 22 <210> 85 212 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 85 tcgtngtgaa cgttcgagat ga 22 <210> 86 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 13 <223> n = 4-tiotimina <400> 86 tgactgtgaa cgntcgagat ga 22 <210> 87 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> <223> variação 12, 16 n = 6-tioguanina 213 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 87 tgactgtgaa cnttcnagat ga 22 <210> 88 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 88 tgactgtgaa cgttcgtuat ga 22 <210> 89 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 89 tgactgtgaa cgttcgttat ga 22 <210> 90 <211> 24 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 90 tcgttcaacg ttcgttaacg ttcg 24 <210> 91 <211> 24 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> 214 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <223> Construção sintética <400> 91 tgattcaacg ttcgttaacg ttcg 24
<210> 92 <211> 18 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 92 ctgtcaacgt tcgagatg 18 <210> 93 <211> 20 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 93 tcgtcggaac gttcgagatg 20 <210> 94 <211> 19 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 94 tcgtcggacg ttcgagatg 19 <210> 95 <211> 19 <212> ADN <213> Sequência artificial 215 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <220> <223> Construção sintética <400> 95 tcgtcgtacg ttcgagatg 19 <210> 96 <211> 19 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 96 tcgtcgttcg ttcgagatg 19 <210> 97 <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 97 tcgtgaacgt tcg 13 <210> 98 <211> 14 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 98 tcgtcgaacg ttcg 14 <210> 99 <211> 13 216 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 2 <223> n = 5-bromocitosina <400> 99 tngtgaacgt tcg 13 <210> 100 <211> 14 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 2, 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 100 tngtngaacg ttcg 14 <210> 101 <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 101
tcgttaacgt tcg 13 <210> 102 <211> 16 <212> ADN 217 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> caracteristicas mistas <2 2 2> (4) ...(6) <223> podem estar ou não presentes tcg <221> variação <222> 7, 8 <223> n = qualquer nucleótido <2 21> variação <222> 7, 8 <223> podem estar ou não presentes n <221> variação <222> 10 <223> n = t, a ou c <221> variação <222> 13 <223> n = t, g ou u <400> 102 tcgtcgnnan cgntcg 16 <210> 103 <211> 11 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 103 tcgaacgttc g 11
<210> 104 <211> 14 <212> ADN 218 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 104 tcgtcgaacg ttcg 14 <210> 105 <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 105 tcgtgaacgt tcg 13 <210> 106 <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 106 tcggtatcgg tcg 13 <210> 107 <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 107 tcggtaccgt tcg 13 <210> 108 219 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 108 tcggaaccgt tcg 13 <210> 109 <211> 12 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 109 tcggaacgtt cg 12 <210> 110 <211> 15 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 110 tcgtcggaac gttcg 15 <210> 111 <211> 12 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 111 tcgtaacgtt cg 12 220 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<210> 112 <211> 11 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 112 tcgaccgttc g 11 <210> 113 <211> 14 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 113 tcgtcgaccg ttcg 14 <210> 114 <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 114 tcgttaacgt tcg 13 <210> 115 <211> 16 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 221 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> variaçao <222> 2 <223> η = 5-bromocitosina <221> variação <222> 5 <223> η = 5-bromocitosina <2 21> variação <222> 4-6 <223> podem ou não estar presentes tng <221> variação <222> <1 co <223> n = qualquer nucleótido <221> variação <222> CO <223> podem estar ou nao presentes n <2 21> variação <222> (10)...(10) <223> n = t, a ou c <221> variação <222> (13)...(13) <223> n = t, g ou u <400> 115 tngtngnnan cgntcg 16 <210> 116 <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variaçao <222> 2 <223> η = 5-bromocitosina 222 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 116 tngtgaacgt tcg 13
<210> 117 <211> 16 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 2, 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 117 tngtngtgaa cgttcg 16 <210> 118 <211> 11 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 2 <223> n = 5-bromocitosina <400> 118 tngaacgttc g 11 <210> 119 <211> 11 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética 223
ΕΡ 1 404 8 7 3/PT <221> variação <222> 2 <223> n = 5-bromocitosina <40 0> 119 tngaccgttc g 11
<210> 120 <211> 14 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 2, 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 120 tngtngaccg ttcg 14 <210> 121 <211> 16 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 5 <223> n = 5-bromocitosina <221> <222> <223> variação 7, 8 n = qualquer nucleótido <221> variaçao <222> 7, 8 <223> podem estar ou não presentes n 224 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> variaçao <222> 10 <223> n = t, a ou c <221> <222> variação 13 <223> n = t, u ou g <400> 121 tcgtngnnan cgntcg 16 <210> 122 <211> 16 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 122 tcgtngtgaa cgttcg 16 <210> 123 <211> 14 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 123 tcgtngaacg ttcg 14 <210> 124 225 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ
<211> 14 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> n = 5-bromocitosina <400> 124 tcgtngaccg ttcg 14 <210> 125 <211> 16 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> caracteristicas_mistas <222> (4) ... (6) <223> podem ou não estar presentes tcg <221> variação <222> 7, 8 <223> n = qualquer nucleótido <221> variação <222> 7, 8 <223> podem estar ou não presentes n <221> variação <2 2 2> 10 <223> n = t, a ou c <221> variação <222> 11 <223> n = 5-bromocitosina 226 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> variaçao <222> (13) ... (13 <223> n = t, g ou u <400> 125 tcgtcgnnan ngntcg 16
<210> 126 <211> 13 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 8 <223> n = 5-bromocitosina <400> 126 tcggaaangt tcg 13 <210> 127 <211> 11 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> <222> variação 6 <223> n = 5-bromocitosina <400> 127 tcgaangttc g 11 <210> 128 <211> 16 <212> ADN <213> Sequência artificial 227 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 2 <223> η = 5-bromocitosina <221> variação <222> (4) ... (6) <223> podem ou não estar presentes tng <221> variação <222> 5 <223> n = 5-bromocitosina <221> variação <222> 7, 8 <223> n = qualquer nucleótido <221> variação <222> 7,8 <223> podem estar ou não presentes n <221> variação <222> (10)...(10) <223> n = t, a ou c <221> variação <2 2 2> (13)...(13) <223> n = t, g ou u <4 0 0> 128 tngtngnnan ngntcg 16 <210> 129 <211> 11 <212> ADN <213> Sequência artificial <2 2 0> <223> Construção sintética 228 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> variaçao <222> 2, 6 <223> η = 5-bromocitosina <400> 129 tngaangutc g 11
<210> 130 <211> 11 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 2, 6 <223> η = 5-bromocitosina <4 0 0> 130 tngaangttc g 11
<210> 131 <211> 16 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5 <223> η = 5-bromocitosina <221> variação <222> 7, 8 <223> η = qualquer nucleótido <221> variação <222> 7, 8 <223> podem estar ou não presentes n 229 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <221> variaçao <222> 10 <223> η = t, a, c <221> variação <222> 11 <223> n = 5-bromo citosina <221> variação <222> (13)...(13) <223> n = t, g ou u <4 0 0> 131 tcgtngnnan ngntcg 16 <210> 132 <211> 14 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5, 9 <223> n = 5-bromo citosina <400> 132 tcgtngaang utcg 14 <210> 133 <211> 14 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> variação <222> 5, 9 <223> n = 5-bromo citosina 230 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <400> 133 tcgtngaang ttcg 14 <210> 134 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 134 tgactgtgaa cgttcgagat ga 22 <210> 135 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 135 tgactgtgaa ccttagagat ga 22 <210> 136 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 136 tgactgtgaa ggttagagat ga 22 <210> 137 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> 231 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <223> Construção sintética <221> base_modificada <222> 1 <223> n = timina ligada a um grupo ligante reactivo <400> 137 ngactgtgaa ccttagagat ga 22 <210> 138 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> base_modifiçada <222> 1 <223> n = timina ligada a um grupo ligante reactivo <400> 138 ngactgtgaa ccttagagat ga 22 <210> 139 <211> 66 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <400> 139 tgactgtgaa cgttcgagat gatgactgtg aacgttcgag atgatgactg tgaacgttcg 60 agatga 66 <210> 140 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial 232 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ <220> <223> Construção sintética <221> base_modificada <222> 1 <223> n = timina ligada a um grupo ligante reactivo <400> 140 ngactgtgaa cgttcgagat ga 22 <210> 141 <211> 22 <212> ADN <213> Sequência artificial <220> <223> Construção sintética <221> base_modificada <222> 1 <223> n = timina ligada a um grupo ligante reactivo <400> 141 ngactgtgaa cgttcgagat ga 22
Lisboa, 2013-07-23

Claims (30)

  1. ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 1/7 REIVINDICAÇÕES 1. Composto de imunomodulação quimérico (CIC) compreendendo duas ou mais partes de ácido nucleico e uma ou mais partes espaçadoras que não são de ácido nucleico, em que pelo menos uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico está ligada covalentemente a duas partes de ácido nucleico, em que o referido espaçador não é um polipéptido, em que pelo menos uma parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-TCG-3' na posição 5 linha, em que todas as partes de ácido nucleico que compreendem a sequência 5'-CG-3' têm menos de 8 nucleótidos de comprimento, em que o referido CIC tem actividade de imunomodulação.
  2. 2. CIC da reivindicação 1, em que a parte de ácido nucleico compreendendo um 5' TCG tem uma extremidade 5' livre.
  3. 3. CIC da reivindicação 1 ou 2, em que o CIC tem pelo menos uma actividade de imunomodulação seleccionada do grupo que consiste de: (a) capacidade de estimular produção de IFN-gama por células mononucleares de sangue periférico humano; (b) capacidade de estimular produção de IFN-alfa por células mononucleares de sangue periférico humano; (c) capacidade de estimular proliferação de células B.
  4. 4. CIC da reivindicação 1-3 que compreende: (i) uma estrutura nuclear com a fórmula: Ni-S!-N2 ou Ni-Si-N2-S2-N3 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 2/7 em que Ni, N2 e N3 são partes de ácido nucleico, Si e S2 são partes espaçadoras que não são de ácido nucleico e Si e S2 estão ligadas covalentemente a exactamente duas partes de ácido nucleico; ou (ii) uma estrutura nuclear com a fórmula: [Nv] *---Sp em que Sp é um espaçador multivalente ligado covalentemente a X partes de ácido nucleico seleccionadas independentemente, Nv e em que X é pelo menos 3; ou (iii) pelo menos 3 partes de ácido nucleico, em que cada parte de ácido nucleico está ligada covalentemente a pelo menos uma parte espaçadora que não é de ácido nucleico.
  5. 5. CIC da reivindicação 4(ii) em que X é desde 3 a cerca de 50 ou em que X é desde cerca de 50 a cerca de 500.
  6. 6. CIC da reivindicação 4(ii) em que Sp compreende um dendrimero, um polissacárido ou um polissacárido reticulado.
  7. 7. CIC de qualquer reivindicação anterior compreendendo uma parte espaçadora não nucleótido compreendendo oligoetilenoglicol, glicerol, um alquilo C2-Cio, um nucleótido abásico, pentaeritritol, 1,3-diamino-2-propanol, 2- (hidroximetil)etilo, um polissacárido ou um dendrimero.
  8. 8. CIC de qualquer reivindicação anterior compreendendo uma parte espaçadora de composto não nucleótido.
  9. 9. CIC de qualquer reivindicação anterior em que o espaçador não nucleótido compreende uma subunidade HEG.
  10. 10. CIC de qualquer reivindicação anterior em que o espaçador não nucleótido compreende partes de oligoetilenoglicol ligadas por fosfodiéster e/ou fosforotiolato.
  11. 11. CIC da reivindicação 4 (ii), compreendendo uma primeira subunidade espaçadora compreendendo um dendrimero, ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 3/7 um polissacárido, glicerol, pentaeritritol ou 2-(hidroximetil) etilo e compreendendo adicionalmente pelo menos uma subunidade HEG, em que a referida subunidade HEG está ligada covalentemente à primeira subunidade espaçadora e a uma parte de ácido nucleico.
  12. 12. CIC da reivindicação 11, em que a ligação entre a subunidade HEG e o primeiro elemento espaçador é uma ligação fosfodiéster ou uma ligação de éster de fosforotiolato e a ligação entre a subunidade HEG e a parte de ácido nucleico é uma ligação fosfodiéster ou uma ligação de éster de fosforotiolato.
  13. 13. CIC de qualquer reivindicação anterior em que: pelo menos uma parte de ácido nucleico compreende a sequência 5'-TCGA-3'; ou pelo menos uma parte de ácido nucleico tem a sequência 5' -TCG [ (X) 2-4] -3 ' ; 5' -TCG (A/T) [ (X) !_3] -3' ; ou 5' -TCG (A/T) [ (X) 1- 3]-3' em que cada X é um nucleótido seleccionado independentemente; ou pelo menos uma parte de ácido nucleico tem a sequência 5'-TCGACGT-3' ou 5'-TCGTCGA-3'; ou todas as partes de ácido nucleico no CIC têm uma sequência de fórmula 5'-TCG [ (X) 2-4]-3'; 5'-TCG (A/T) [ (X) 1-3]-3'; ou TCG (AT) [(X)i-3]-3' em que cada X é um nucleótido seleccionado independentemente.
  14. 14. CIC de qualquer reivindicação anterior em que todas as partes de ácido nucleico são as mesmas.
  15. 15. CIC de qualquer reivindicação anterior em que pelo menos uma parte de ácido nucleico do CIC (i) não tem actividade imunológica isolada ou (ii) tem actividade imunológica isolada inferior, ou (iii) em que nenhuma parte de ácido nucleico do CIC tem actividade de imunomodulação isolada. ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 4/7
  16. 16. CIC da reivindicação 10 com uma fórmula seleccionada do grupo que consiste de: 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' 5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' 5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-TCGTCG-3' 5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-AACGTT-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' 5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-TEG HEG-5'-TCGTCG-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-TEG 5'-TCGTTTT-3'-HEG-5'-TCGTTTT-3'-HEG-5'-TCGTTTT-3' 5'-TCGTCGT-3'-HEG-5'-TCGTCGT-3'-HEG-5'-TCGTCGT-3' 5'-TCGAGAT-3'-HEG-5'-TCGAGAT-3'-HEG-5'-TCGAGAT-3' 5'-TCGTCGT-3'-HEG-5'-TGTCGTT-3'-HEG-5'-TGTCGTT-3' 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3'-HEG-5'-GGGGGG-3' 5'-TCGAACG-3'-HEG-5'-TCGAACG-3'-HEG-5'-TCGAACG-3' 5'-TCGACGT-3'-HEG-5'-TCGACGT-3'-HEG-5'-TCGACGT-3' 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-AGATGAT-3' 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3' 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-AGATGAT-3'-HEG-5'-ACGTTCG-3' 5'-TCGACTC-3'-HEG-5'-TCGAGCG-3'-HEG-5'-TTCTCTT-3' 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3'-HEG-3'-AGCTGCT-5 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 5/7 5'-TCGAT-3'-HEG-5'-TCGAT-3'-HEG-5'-TCGAT-3'-HEG-5'-TCGAT 3' 5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-TCGTCGA-3'-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5' AGAT-3' 5'-TCGACGT-3'-HEG-5'-TCGACGT-3'-HEG-5'-TCGACGT-3'-HEG-5' TCGACGT-3' 5'-TCGATTT-3'-HEG-5'-TCGATTT-3'-HEG-5'-TCGATTT-3' 5'-TCGCTTT-3'-HEG-5'-TCGCTTT-3'-HEG-5'-TCGCTTT-3' 5'-TCGGTTT-3'-HEG-5'-TCGGTTT-3'-HEG-5'-TCGGTTT-3' (5'-TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-TCGTCGA-3' (5'-TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-3'-AGCTGCT-5' (5'-TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-AACGTTC-3' (5'-TCGTCGA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-TCGA-3' (5'-TCGTCGA-3'-HEG)3-triplo-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-TCGA-3' (5'-TCGTGCA-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-AACGTTC-3'-HEG-5'-TCGACGT-3' (5'-TCGACGT-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-TCGACGT-3' (5'-TCGTCGA-3'-TEG)2-glicerol-TEG-5'-TCGTCGA-3' (5'-TCGTCGA-3'-HEG-HEG)2-glicerol-HEG-HEG-5'-TCGTCGA-3' (5'-TCGACGT-3'-HEG)2-duplo simétrico-HEG-5'-TCGACGT-3' (5'-TCGACGT-3'-HEG)3-triplo-HEG-5'-TCGACGT-3' ((5'-TCGACGT-3'-HEG)2-glicerol-HEG)2-glicerol-HEG-5'-TCGACGT-3' (5'-TCGACGT-3'-HEG)2-glicerol-HEG-5'-AACGTTC-3 ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 6/7 ((5'-TCGACGT-3'-HEG)2-glicerol-HEG)2-glicerol-HEG-5'-Τ-3' (5'-TCGACGT-3'-HEG)3-triplo-HEG-5'-T-3' (5' -TCGACGT-3' -HEG) x-Ficoll40o
  17. 17. CIC de qualquer reivindicação anterior, em que as ligações entre nucleótidos das partes de ácido nucleico são seleccionadas de ligações fosfodiéster e ligações de éster de fosforotiolato e/ou as ligações entre os nucleótidos das partes de ácido nucleico, as partes de ácido nucleico e as partes de espaçador e entre subunidades de partes de espaçador são fosfodiéster e/ou éster de fosforotiolato.
  18. 18. CIC da reivindicação 1 em que a parte espaçadora compreende um dendrimero ou um polissacárido.
  19. 19. Composição compreendendo um CIC descrito em qualquer reivindicação anterior e um excipiente farmaceuticamente aceitável.
  20. 20. Composição da reivindicação 19 em que a composição é essencialmente isenta de endotoxina.
  21. 21. Composição da reivindicação 19 ou 20 compreendendo adicionalmente um antigénio.
  22. 22. Composição da reivindicação 19 ou 20 compreendendo adicionalmente uma microesfera catiónica.
  23. 23. Composição da reivindicação 22 em que a microesfera compreende um polimero de ácido láctico e ácido glicólico.
  24. 24. CIC das reivindicações 1 a 18 ou uma composição das reivindicações 19 a 23 para uso na modulação de uma resposta imunitária num indivíduo.
  25. 25. Composição para uso de acordo com a reivindicação 24, em que o referido indivíduo sofre de uma doença associada com uma resposta imunitária do tipo Th2 ou tem uma doença infecciosa. ΕΡ 1 404 873/ΡΤ 7/7
  26. 26. Composição para uso de acordo com a reivindicação 25, em que a referida doença associada com uma resposta imunitária do tipo Th2 é uma alergia ou asma induzida por alergia.
  27. 27. CIC das reivindicações 1-18 ou uma composição das reivindicações 19-23 para uso em aumento de interferão-gama (IFN-γ) num indivíduo; aumento de interferão-alfa (IFN-α) num indivíduo; melhoria de um sintoma de uma doença infecciosa num indivíduo; melhoria de uma doença relacionada com IgE num indivíduo; ou tratamento de cancro.
  28. 28. Composição da reivindicação 27 para uso no aumento de IFN-γ, em que o referido indivíduo tem fibrose pulmonar idiopática.
  29. 29. Composição da reivindicação 27 para uso no aumento de IFN-α, em que o referido indivíduo tem uma infecção vírica.
  30. 30. Composição da reivindicação 27, em que a referida doença relacionada com IgE é alergia ou uma doença relacionada com alergia. Lisboa, 2013-07-23
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Families Citing this family (86)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030109469A1 (en) * 1993-08-26 2003-06-12 Carson Dennis A. Recombinant gene expression vectors and methods for use of same to enhance the immune response of a host to an antigen
US7935675B1 (en) 1994-07-15 2011-05-03 University Of Iowa Research Foundation Immunostimulatory nucleic acid molecules
US6239116B1 (en) 1994-07-15 2001-05-29 University Of Iowa Research Foundation Immunostimulatory nucleic acid molecules
US20030026782A1 (en) * 1995-02-07 2003-02-06 Arthur M. Krieg Immunomodulatory oligonucleotides
US6207646B1 (en) * 1994-07-15 2001-03-27 University Of Iowa Research Foundation Immunostimulatory nucleic acid molecules
US6406705B1 (en) 1997-03-10 2002-06-18 University Of Iowa Research Foundation Use of nucleic acids containing unmethylated CpG dinucleotide as an adjuvant
US20040006034A1 (en) * 1998-06-05 2004-01-08 Eyal Raz Immunostimulatory oligonucleotides, compositions thereof and methods of use thereof
US6977245B2 (en) 1999-04-12 2005-12-20 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Oligodeoxynucleotide and its use to induce an immune response
EP1176966B1 (en) * 1999-04-12 2013-04-03 THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA, as represented by THE SECRETARY, DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES Oligodeoxynucleotide and its use to induce an immune response
US6949520B1 (en) * 1999-09-27 2005-09-27 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Methods related to immunostimulatory nucleic acid-induced interferon
US20030129251A1 (en) * 2000-03-10 2003-07-10 Gary Van Nest Biodegradable immunomodulatory formulations and methods for use thereof
US7129222B2 (en) * 2000-03-10 2006-10-31 Dynavax Technologies Corporation Immunomodulatory formulations and methods for use thereof
KR100917101B1 (ko) * 2000-08-04 2009-09-15 도요 보세키 가부시키가이샤 플렉시블 금속적층체 및 그 제조방법
CA2430691A1 (en) 2000-12-27 2002-07-04 Dynavax Technologies Corporation Immunomodulatory polynucleotides and methods of using the same
US20040132677A1 (en) * 2001-06-21 2004-07-08 Fearon Karen L. Chimeric immunomodulatory compounds and methods of using the same-IV
US7785610B2 (en) * 2001-06-21 2010-08-31 Dynavax Technologies Corporation Chimeric immunomodulatory compounds and methods of using the same—III
CN100334228C (zh) * 2001-06-21 2007-08-29 戴纳瓦克斯技术公司 嵌合免疫调制化合物及其使用方法
US7666674B2 (en) 2001-07-27 2010-02-23 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Use of sterically stabilized cationic liposomes to efficiently deliver CPG oligonucleotides in vivo
WO2003012061A2 (en) * 2001-08-01 2003-02-13 Coley Pharmaceutical Gmbh Methods and compositions relating to plasmacytoid dendritic cells
US20030133988A1 (en) * 2001-08-07 2003-07-17 Fearon Karen L. Immunomodulatory compositions, formulations, and methods for use thereof
US7354909B2 (en) * 2001-08-14 2008-04-08 The United States Of America As Represented By Secretary Of The Department Of Health And Human Services Method for rapid generation of mature dendritic cells
IL160157A0 (en) 2001-08-17 2004-07-25 Coley Pharm Group Inc Combination motif immune stimulation oligonucleotides with improved activity
WO2003035836A2 (en) * 2001-10-24 2003-05-01 Hybridon Inc. Modulation of immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds by optimal presentation of 5' ends
US7276489B2 (en) * 2002-10-24 2007-10-02 Idera Pharmaceuticals, Inc. Modulation of immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds by optimal presentation of 5′ ends
WO2003054161A2 (en) 2001-12-20 2003-07-03 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services USE OF CpG OLIGODEOXYNUCLEOTIDES TO INDUCE ANGIOGENESIS
US8466116B2 (en) 2001-12-20 2013-06-18 The Unites States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Use of CpG oligodeoxynucleotides to induce epithelial cell growth
US7807803B2 (en) 2002-07-03 2010-10-05 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Nucleic acid compositions for stimulating immune responses
US20040053880A1 (en) 2002-07-03 2004-03-18 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Nucleic acid compositions for stimulating immune responses
US7569553B2 (en) * 2002-07-03 2009-08-04 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Nucleic acid compositions for stimulating immune responses
EP1393745A1 (en) * 2002-07-29 2004-03-03 Hybridon, Inc. Modulation of immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds by optimal presentation of 5'ends
CN100471486C (zh) 2002-08-12 2009-03-25 戴纳伐克斯技术股份有限公司 免疫调节组合物,其制备方法和使用方法
AR040996A1 (es) 2002-08-19 2005-04-27 Coley Pharm Group Inc Acidos nucleicos inmunoestimuladores
US8263091B2 (en) 2002-09-18 2012-09-11 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Method of treating and preventing infections in immunocompromised subjects with immunostimulatory CpG oligonucleotides
ATE544466T1 (de) 2002-10-29 2012-02-15 Coley Pharm Group Inc Verwendung von cpg oligonukleotide zur behandlung von hepatitis c virus infektion
WO2004053104A2 (en) 2002-12-11 2004-06-24 Coley Pharmaceutical Group, Inc. 5’ cpg nucleic acids and methods of use
US8158768B2 (en) * 2002-12-23 2012-04-17 Dynavax Technologies Corporation Immunostimulatory sequence oligonucleotides and methods of using the same
EP1625140A4 (en) * 2002-12-23 2008-06-18 Dynavax Tech Corp BRANCHED IMMUNOMODULAR COMPOUNDS AND METHOD OF USE THEREOF
DK1575977T3 (da) * 2002-12-23 2009-11-09 Dynavax Tech Corp Oligonukleotider med Immunstimulatorisk sekvens og fremgangsmåder til anvendelse af disse
WO2004064782A2 (en) * 2003-01-16 2004-08-05 Hybridon, Inc. Modulation of immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds by utilizing modified immunostimulatory dinucleotides
US7354907B2 (en) * 2003-02-07 2008-04-08 Idera Pharmaceuticals, Inc. Short immunomodulatory oligonucleotides
MXPA05012421A (es) * 2003-05-16 2006-02-22 Hybridon Inc Tratamiento sinergistico de cancer usando inmunomeros junto con agentes quimioterapeuticos.
JP4989225B2 (ja) * 2003-09-25 2012-08-01 コーリー ファーマシューティカル グループ，インコーポレイテッド 核酸親油性接合体
KR101107818B1 (ko) 2003-10-30 2012-01-31 콜레이 파마시티컬 그룹, 인코포레이티드 향상된 면역자극 효능을 가진 ｃ-부류 올리고뉴클레오티드유사체
CA2549173A1 (en) * 2003-12-08 2005-07-07 Hybridon, Inc. Modulation of immunostimulatory properties by small oligonucleotide-based compounds
US20050175630A1 (en) * 2003-12-23 2005-08-11 Eyal Raz Immunogenic compositions and methods of use thereof
EP1753453A2 (en) * 2004-06-08 2007-02-21 Coley Pharmaceutical GmbH Abasic oligonucleotide as carrier platform for antigen and immunostimulatory agonist and antagonist
HUE036894T2 (hu) * 2004-06-15 2018-08-28 Idera Pharmaceuticals Inc Immunstimuláló oligonukleotid multimerek
US7427405B2 (en) * 2004-06-15 2008-09-23 Idera Pharmaceuticals, Inc. Immunostimulatory oligonucleotide multimers
MY159370A (en) 2004-10-20 2016-12-30 Coley Pharm Group Inc Semi-soft-class immunostimulatory oligonucleotides
NZ561144A (en) * 2005-03-04 2009-09-25 Dynavax Tech Corp Vaccines comprising oligonucleotides having immunostimulatory sequences (ISS) wherein the ISS are conjugated to antigens and stabilized by buffer conditions and further excipients
KR20080003388A (ko) * 2005-04-01 2008-01-07 메드벳 싸이언스 피티와이. 리미티드 진단 및 치료 방법, 및 이에 유용한 제제
AU2006331879A1 (en) * 2005-12-20 2007-07-05 Idera Pharmaceuticals, Inc. Immunostimulatory activity of palindromic immune modulatory oligonucleotides (IMO TM) contiaining different lengths of palindromic segments
ES2553284T5 (es) * 2006-02-15 2021-08-31 Rechtsanwalt Thomas Beck Composiciones y procedimientos para formulaciones de oligonucleótidos
JP5761911B2 (ja) 2006-04-07 2015-08-12 イデラ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッドＩｄｅｒａ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ， Ｉｎｃ． Ｔｌｒ７およびｔｌｒ８に対する安定化免疫調節ｒｎａ（ｓｉｍｒａ）化合物
KR100784164B1 (ko) 2006-05-08 2007-12-10 고려대학교 산학협력단 이중 마커를 이용한 ｓｉＲＮＡ의 정량용 조성물
DE102006035618A1 (de) * 2006-07-31 2008-02-07 Curevac Gmbh Nukleinsäure der Formel (I): GlXmGn, insbesondere als immunstimulierendes Adjuvanz
NZ575437A (en) 2006-09-27 2012-02-24 Coley Pharm Gmbh Cpg oligonucleotide analogs containing hydrophobic t analogs with enhanced immunostimulatory activity
WO2008050833A1 (fr) * 2006-10-25 2008-05-02 Panasonic Corporation Procédé d'émission et dispositif d'émission
BRPI0813981A2 (pt) * 2007-08-01 2017-05-09 Idera Pharmaceuticals Inc agonistas sintéticos da tlr9.
WO2009026465A2 (en) * 2007-08-21 2009-02-26 Dynavax Technologies Corporation Composition and methods of making and using influenza proteins
GB0807306D0 (en) 2008-04-22 2008-05-28 Univ Ghent Adjuvants for use in vaccination
WO2010002940A2 (en) * 2008-06-30 2010-01-07 Dynavax Technologies Corporation Heterogeneous synthesis of multivalent chimeric immunomodulatory compounds using platform based molecules
EP2328613A1 (en) * 2008-08-28 2011-06-08 GlaxoSmithKline Biologicals S.A. Vaccine
PE20110998A1 (es) 2008-12-09 2012-02-10 Coley Pharm Group Inc Oligonucleotidos inmunoestimuladores
US8552165B2 (en) * 2008-12-09 2013-10-08 Heather Davis Immunostimulatory oligonucleotides
JP5775004B2 (ja) * 2009-03-03 2015-09-09 アクセス メディカル システムズ，リミティド 高感度蛍光分析のための検出システム及び方法
EP2411521B1 (en) 2009-03-25 2015-01-14 The Board of Regents of The University of Texas System Compositions for stimulation of mammalian innate immune resistance to pathogens
FR2975600B1 (fr) 2011-05-24 2013-07-05 Assist Publ Hopitaux De Paris Agents pour le traitement de tumeurs
ES2750608T3 (es) 2013-07-25 2020-03-26 Exicure Inc Construcciones esféricas a base de ácido nucleico como agentes inmunoestimulantes para uso profiláctico y terapéutico
RU2684615C2 (ru) 2013-08-24 2019-04-10 Бхарат Байотек Интернэшнл Лимитед Бактериальная вакцина и способы ее получения
AU2014346658A1 (en) * 2013-11-06 2016-06-02 Solstice Biologics, Ltd. Polynucleotide constructs having disulfide groups
EP3508198A1 (en) 2014-06-04 2019-07-10 Exicure, Inc. Multivalent delivery of immune modulators by liposomal spherical nucleic acids for prophylactic or therapeutic applications
US9336861B1 (en) * 2014-08-12 2016-05-10 Skan Technologies Corporation Static random access memory (SRAM) bitcell and memory architecture without a write bitline
WO2016044839A2 (en) 2014-09-19 2016-03-24 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Compositions and methods for treating viral infections through stimulated innate immunity in combination with antiviral compounds
AU2015349680A1 (en) 2014-11-21 2017-06-08 Northwestern University The sequence-specific cellular uptake of spherical nucleic acid nanoparticle conjugates
MX2017009542A (es) 2015-01-23 2018-01-25 Dynavax Tech Corp Compuestos quimericos ramificados y lineales, polinucleotidos, usos y metodos para preparacion de los mismos.
IL260983B (en) * 2016-02-19 2022-07-01 Genisphere Llc Nucleic acid carriers and methods of medical use
WO2017143171A1 (en) 2016-02-19 2017-08-24 Genisphere Llc Nucleic acid carriers and therapeutic methods of use
US11981703B2 (en) 2016-08-17 2024-05-14 Sirius Therapeutics, Inc. Polynucleotide constructs
US11364304B2 (en) 2016-08-25 2022-06-21 Northwestern University Crosslinked micellar spherical nucleic acids
US20190321481A1 (en) * 2016-11-11 2019-10-24 Nantbio, Inc. Immunomodulatory compositions, processes for making the same, and methods for inhibiting cytokine storms
US11696954B2 (en) 2017-04-28 2023-07-11 Exicure Operating Company Synthesis of spherical nucleic acids using lipophilic moieties
WO2019006455A1 (en) 2017-06-30 2019-01-03 Solstice Biologics, Ltd. AUXILIARIES OF CHIRAL PHOSPHORAMIDITIS AND METHODS OF USE THEREOF
US20210122778A1 (en) * 2019-10-21 2021-04-29 Northwestern University Spherical nucleic acids with dendritic ligands
WO2021132528A1 (ja) * 2019-12-25 2021-07-01 ナパジェン ファーマ，インコーポレテッド ポリデオキシアデニル酸が連結した短鎖ＣｐＧ含有オリゴデオキシヌクレオチド、該オリゴデオキシヌクレオチドを含有する複合体、及びその用途
WO2021249116A1 (en) 2020-06-10 2021-12-16 Sichuan Clover Biopharmaceuticals, Inc. Coronavirus vaccine compositions, methods, and uses thereof

Family Cites Families (189)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3324301A (en) 1963-02-28 1967-06-06 Lan Jen Chu Photoelectric vehicle identification system
US4458066A (en) * 1980-02-29 1984-07-03 University Patents, Inc. Process for preparing polynucleotides
US4458065A (en) * 1983-02-17 1984-07-03 Eli Lilly And Company 7-N-(Substituted-apramycin antibiotic derivatives and intermediates therefor
US4948882A (en) 1983-02-22 1990-08-14 Syngene, Inc. Single-stranded labelled oligonucleotides, reactive monomers and methods of synthesis
US4650675A (en) 1983-08-18 1987-03-17 The Children's Medical Center Corporation Oligonucleotide conjugates
US4849513A (en) 1983-12-20 1989-07-18 California Institute Of Technology Deoxyribonucleoside phosphoramidites in which an aliphatic amino group is attached to the sugar ring and their use for the preparation of oligonucleotides containing aliphatic amino groups
US5118800A (en) 1983-12-20 1992-06-02 California Institute Of Technology Oligonucleotides possessing a primary amino group in the terminal nucleotide
US5118802A (en) 1983-12-20 1992-06-02 California Institute Of Technology DNA-reporter conjugates linked via the 2' or 5'-primary amino group of the 5'-terminal nucleoside
US5015733A (en) * 1983-12-20 1991-05-14 California Institute Of Technology Nucleosides possessing blocked aliphatic amino groups
US4828991A (en) 1984-01-31 1989-05-09 Akzo N.V. Tumor specific monoclonal antibodies
US4587329A (en) * 1984-08-17 1986-05-06 The Dow Chemical Company Dense star polymers having two dimensional molecular diameter
US4650575A (en) * 1985-07-03 1987-03-17 Pall Corporation Sorbing apparatus
US4910300A (en) 1985-12-11 1990-03-20 Chiron Corporation Method for making nucleic acid probes
US5093232A (en) 1985-12-11 1992-03-03 Chiron Corporation Nucleic acid probes
US5338532A (en) * 1986-08-18 1994-08-16 The Dow Chemical Company Starburst conjugates
US6312679B1 (en) 1986-08-18 2001-11-06 The Dow Chemical Company Dense star polymer conjugates as dyes
PT88550A (pt) 1987-09-21 1989-07-31 Ml Tecnology Ventures Lp Processo para a preparacao de reagentes de ligacao nao nucleotidicos para sondas nucleotidicas
US6031091A (en) 1987-09-21 2000-02-29 Gen-Probe Incorporated Non-nucleotide linking reagents for nucleotide probes
US5124246A (en) 1987-10-15 1992-06-23 Chiron Corporation Nucleic acid multimers and amplified nucleic acid hybridization assays using same
US5278302A (en) 1988-05-26 1994-01-11 University Patents, Inc. Polynucleotide phosphorodithioates
EP0352010B1 (en) * 1988-07-12 1993-10-27 Humber Growers Limited Combating of undesired organisms
US5391723A (en) 1989-05-31 1995-02-21 Neorx Corporation Oligonucleotide conjugates
US5552391A (en) 1990-01-16 1996-09-03 La Jolla Pharmaceutical Company Chemically-defined non-polymeric valency platform molecules and conjugates thereof
US5162515A (en) * 1990-01-16 1992-11-10 La Jolla Pharmaceutical Company Conjugates of biologically stable polymers and polynucleotides for treating systemic lupus erythematosus
US5171264A (en) 1990-02-28 1992-12-15 Massachusetts Institute Of Technology Immobilized polyethylene oxide star molecules for bioapplications
US5244807A (en) * 1990-05-23 1993-09-14 Automedix Sciences, Inc. Production of pseudomonas xa cells containing indolyl-3-alkane alpha-hydroxylase
US5460831A (en) 1990-06-22 1995-10-24 The Regents Of The University Of California Targeted transfection nanoparticles
EP0468520A3 (en) 1990-07-27 1992-07-01 Mitsui Toatsu Chemicals, Inc. Immunostimulatory remedies containing palindromic dna sequences
PT98562B (pt) 1990-08-03 1999-01-29 Sanofi Sa Processo para a preparacao de composicoes que compreendem sequencias de nucleo-sidos com cerca de 6 a cerca de 200 bases resistentes a nucleases
WO1993002093A1 (en) 1991-07-15 1993-02-04 La Jolla Pharmaceutical Company Modified phosphorous intermediates for providing functional groups on the 5' end of oligonucleotides
US5495006A (en) * 1991-09-27 1996-02-27 Allelix Biopharmaceuticals, Inc. Antiviral polynucleotide conjugates
US6113946A (en) 1992-04-03 2000-09-05 The Regents Of The University Of California Self-assembling polynucleotide delivery system comprising dendrimer polycations
EP0570973B1 (en) * 1992-05-22 1998-11-18 Eastman Kodak Company Color photographic materials and methods containing DIR or DIAR couplers and phenolic coupler solvents
US6172208B1 (en) 1992-07-06 2001-01-09 Genzyme Corporation Oligonucleotides modified with conjugate groups
US6346614B1 (en) * 1992-07-23 2002-02-12 Hybridon, Inc. Hybrid oligonucleotide phosphorothioates
EP0606811A3 (en) * 1992-12-28 1995-06-21 Ibm Use a preferred object handler.
US5849719A (en) 1993-08-26 1998-12-15 The Regents Of The University Of California Method for treating allergic lung disease
JPH09502092A (ja) 1993-09-02 1997-03-04 リボザイム・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド 非ヌクレオチドを含有する酵素性核酸
US6156501A (en) * 1993-10-26 2000-12-05 Affymetrix, Inc. Arrays of modified nucleic acid probes and methods of use
WO1995026204A1 (en) 1994-03-25 1995-10-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Immune stimulation by phosphorothioate oligonucleotide analogs
US5658738A (en) 1994-05-31 1997-08-19 Becton Dickinson And Company Bi-directional oligonucleotides that bind thrombin
JP3045928B2 (ja) * 1994-06-28 2000-05-29 松下電子工業株式会社 半導体装置およびその製造方法
US6207646B1 (en) 1994-07-15 2001-03-27 University Of Iowa Research Foundation Immunostimulatory nucleic acid molecules
EP1167377B2 (en) 1994-07-15 2012-08-08 University of Iowa Research Foundation Immunomodulatory oligonucleotides
US20030026782A1 (en) * 1995-02-07 2003-02-06 Arthur M. Krieg Immunomodulatory oligonucleotides
US6239116B1 (en) * 1994-07-15 2001-05-29 University Of Iowa Research Foundation Immunostimulatory nucleic acid molecules
US7935675B1 (en) * 1994-07-15 2011-05-03 University Of Iowa Research Foundation Immunostimulatory nucleic acid molecules
US6429199B1 (en) 1994-07-15 2002-08-06 University Of Iowa Research Foundation Immunostimulatory nucleic acid molecules for activating dendritic cells
US5627025A (en) * 1994-08-12 1997-05-06 The Rockefeller University Method for the identification of compounds capable of abrogating human immunodeficiency virus (HIV) infection of dendritic cells and T-lymphocytes
US5650502A (en) 1994-11-09 1997-07-22 Hybridon, Inc. Ribozyme analogs having rigid non-nucleotidic linkers
US5674683A (en) 1995-03-21 1997-10-07 Research Corporation Technologies, Inc. Stem-loop and circular oligonucleotides and method of using
WO1996040273A2 (en) 1995-06-07 1996-12-19 Schering Aktiengesellschaft Conjugates of ferrites and oligonucleotides, which bond specifically to certain target structures
US5874409A (en) 1995-06-07 1999-02-23 La Jolla Pharmaceutical Company APL immunoreactive peptides, conjugates thereof and methods of treatment for APL antibody-mediated pathologies
US7074768B2 (en) * 1995-08-17 2006-07-11 Idera Pharmaceuticals, Inc. Modified protein kinase A-specific oligonucleotides and methods of their use
DE69739515D1 (de) 1996-01-30 2009-09-10 Univ California Expressionsvektoren, die eine antigen-spezifische immunantwort induzieren, und methoden für ihre verwendung.
US5795582A (en) 1996-02-07 1998-08-18 Novavax, Inc. Adjuvant properties of poly (amidoamine) dendrimers
US5998602A (en) 1996-02-15 1999-12-07 The Cleveland Clinic Fouindation And Government RNase L activators and antisense oligonucleotides effective to treat RSV infections
JP2000512981A (ja) 1996-06-06 2000-10-03 ラ ホヤ ファーマシューティカル カンパニー ａＰＬ免疫応答性ペプチド、その結合体およびａＰＬ抗体媒介病理のための処置方法
FR2750136B1 (fr) 1996-06-25 1998-08-14 Cis Bio Int Conjugues d'un oligonucleotide/polymere conducteur electronique avec une molecule d'interet, et leurs utilisations
US5912332A (en) * 1996-07-26 1999-06-15 Hybridon, Inc. Affinity-based purification of oligonucleotides using soluble multimeric oligonucleotides
US5856462A (en) * 1996-09-10 1999-01-05 Hybridon Incorporated Oligonucleotides having modified CpG dinucleosides
ES2241042T3 (es) 1996-10-11 2005-10-16 The Regents Of The University Of California Conjugados de polinucleotido inmunoestimulador/ molecula inmunomoduladora.
US6258351B1 (en) 1996-11-06 2001-07-10 Shearwater Corporation Delivery of poly(ethylene glycol)-modified molecules from degradable hydrogels
CA2281838A1 (en) 1997-02-28 1998-09-03 University Of Iowa Research Foundation Use of nucleic acids containing unmethylated cpg dinucleotide in the treatment of lps-associated disorders
US6406705B1 (en) * 1997-03-10 2002-06-18 University Of Iowa Research Foundation Use of nucleic acids containing unmethylated CpG dinucleotide as an adjuvant
AU753688B2 (en) 1997-03-10 2002-10-24 Ottawa Civic Loeb Research Institute Use of nucleic acids containing unmethylated CpG dinucleotide as an adjuvant
US6426334B1 (en) 1997-04-30 2002-07-30 Hybridon, Inc. Oligonucleotide mediated specific cytokine induction and reduction of tumor growth in a mammal
US6524613B1 (en) 1997-04-30 2003-02-25 Regents Of The University Of Minnesota Hepatocellular chimeraplasty
AU7589398A (en) 1997-05-19 1998-12-11 Merck & Co., Inc. Oligonucleotide adjuvant
DE69838294T2 (de) 1997-05-20 2009-08-13 Ottawa Health Research Institute, Ottawa Verfahren zur Herstellung von Nukleinsäurekonstrukten
US6589940B1 (en) 1997-06-06 2003-07-08 Dynavax Technologies Corporation Immunostimulatory oligonucleotides, compositions thereof and methods of use thereof
US20040006034A1 (en) 1998-06-05 2004-01-08 Eyal Raz Immunostimulatory oligonucleotides, compositions thereof and methods of use thereof
PT1003850E (pt) 1997-06-06 2009-08-13 Dynavax Tech Corp Inibidores da actividade de sequências de adn imunoestimulantes
US6183959B1 (en) 1997-07-03 2001-02-06 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Method for target site selection and discovery
DK1009413T3 (da) 1997-09-05 2007-06-11 Univ California Anvendelse af immunstimulerende oligonukleotider til forebyggelse eller behandling af astma
CA2304813A1 (en) 1997-09-22 1999-04-08 Fritz Eckstein Nucleic acid catalysts with endonuclease activity
US7393630B2 (en) * 1997-12-16 2008-07-01 Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. Use of microparticles combined with submicron oil-in-water emulsions
GB9727262D0 (en) 1997-12-24 1998-02-25 Smithkline Beecham Biolog Vaccine
JPH11209289A (ja) 1998-01-22 1999-08-03 Taisho Pharmaceut Co Ltd 粘膜免疫誘起剤
DK1061954T3 (da) 1998-03-12 2004-10-18 Nektar Therapeutics Al Corp Polyethylenglycolderivater med proximale reaktive grupper
CA2323929C (en) 1998-04-03 2004-03-09 University Of Iowa Research Foundation Methods and products for stimulating the immune system using immunotherapeutic oligonucleotides and cytokines
JP2002513763A (ja) 1998-05-06 2002-05-14 ユニバーシティ オブ アイオワ リサーチ ファウンデーション Ｃｐｇオリゴヌクレオチドを使用して寄生生物感染および関連する疾患を予防および処置するための方法
WO1999058118A2 (en) 1998-05-14 1999-11-18 Cpg Immunopharmaceuticals Gmbh METHODS FOR REGULATING HEMATOPOIESIS USING CpG-OLIGONUCLEOTIDES
IL139813A0 (en) 1998-05-22 2002-02-10 Loeb Health Res Inst At The Ot Methods and products for inducing mucosal immunity
US5948648A (en) 1998-05-29 1999-09-07 Khan; Shaheer H. Nucleotide compounds including a rigid linker
US6562798B1 (en) 1998-06-05 2003-05-13 Dynavax Technologies Corp. Immunostimulatory oligonucleotides with modified bases and methods of use thereof
JP2002521489A (ja) 1998-07-27 2002-07-16 ユニバーシティ オブ アイオワ リサーチ ファウンデーション ＣｐＧオリゴヌクレオチドの立体異性体および関連する方法
JP2003524602A (ja) 1998-09-18 2003-08-19 ダイナバックス テクノロジーズ コーポレイション ＩｇＥ関連疾患の治療方法と、その治療において使用する組成物
EP1117433A1 (en) * 1998-10-09 2001-07-25 Dynavax Technologies Corporation Anti hiv compositions comprising immunostimulatory polynucleotides and hiv antigens
US6458953B1 (en) 1998-12-09 2002-10-01 La Jolla Pharmaceutical Company Valency platform molecules comprising carbamate linkages
US6399578B1 (en) 1998-12-09 2002-06-04 La Jolla Pharmaceutical Company Conjugates comprising galactose α1,3 galactosyl epitopes and methods of using same
WO2000054803A2 (en) 1999-03-16 2000-09-21 Panacea Pharmaceuticals, Llc Immunostimulatory nucleic acids and antigens
US6977245B2 (en) * 1999-04-12 2005-12-20 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Oligodeoxynucleotide and its use to induce an immune response
EP1176966B1 (en) 1999-04-12 2013-04-03 THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA, as represented by THE SECRETARY, DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES Oligodeoxynucleotide and its use to induce an immune response
AU4978100A (en) 1999-04-29 2000-11-17 Coley Pharmaceutical Gmbh Screening for immunostimulatory dna functional modifyers
FR2793249B1 (fr) 1999-05-03 2001-07-27 Roquette Freres Procede de transformation de matieres amylacees en phase seche
WO2000067787A2 (en) 1999-05-06 2000-11-16 The Immune Response Corporation Hiv immunogenic compositions and methods
CA2376057A1 (en) 1999-06-08 2000-12-14 La Jolla Pharmaceutical Company Valency platform molecules comprising aminooxy groups
ATE254624T1 (de) * 1999-07-07 2003-12-15 Exiqon As Synthese von stabilem chinon- und photoreaktivem keton-phosphoramidit-reagenz für festphasensynthese von photoreaktiven oligomer- konjugaten
US6531591B1 (en) * 1999-07-07 2003-03-11 Exiqon A/S Synthesis of stable quinone and photoreactive ketone phosphoramidite reagents for solid phase synthesis of photoreactive-oligomer conjugates
AU783745B2 (en) * 1999-08-13 2005-12-01 Hybridon, Inc. Modulation of oligonucleotide CpG-mediated immune stimulation by positional modification of nucleosides
CA2380947C (en) * 1999-08-19 2011-11-01 Dynavax Technologies Corporation Methods of modulating an immune response using immunostimulatory sequences and compositions for use therein
EP1212085B1 (en) 1999-08-27 2007-10-31 INEX Pharmaceuticals Corp. Compositions for stimulating cytokine secretion and inducing an immune response
AP1775A (en) * 1999-09-25 2007-08-28 Univ Iowa Res Found Immunostimulatory nucleic acids.
EP1220684B2 (en) 1999-09-27 2010-07-14 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Methods related to immunostimulatory nucleic acid-induced interferon
US7223398B1 (en) * 1999-11-15 2007-05-29 Dynavax Technologies Corporation Immunomodulatory compositions containing an immunostimulatory sequence linked to antigen and methods of use thereof
AU2593701A (en) 1999-12-21 2001-07-03 Regents Of The University Of California, The Method for preventing an anaphylactic reaction
ATE378348T1 (de) 2000-01-14 2007-11-15 Us Health Oligodeoxynukleotide und ihre verwendung zur induktion einer immunreaktion
US6815429B2 (en) * 2000-01-26 2004-11-09 Hybridon, Inc. Modulation of oligonucleotide CpG-mediated immune stimulation by positional modification of nucleosides
AT409085B (de) 2000-01-28 2002-05-27 Cistem Biotechnologies Gmbh Pharmazeutische zusammensetzung zur immunmodulation und herstellung von vakzinen
US6552006B2 (en) 2000-01-31 2003-04-22 The Regents Of The University Of California Immunomodulatory polynucleotides in treatment of an infection by an intracellular pathogen
US6613751B2 (en) 2000-02-23 2003-09-02 The Regents Of The University Of California Method for treating inflammatory bowel disease and other forms of gastrointestinal inflammation
US7157437B2 (en) 2000-03-10 2007-01-02 Dynavax Technologies Corporation Methods of ameliorating symptoms of herpes infection using immunomodulatory polynucleotide sequences
US20020098199A1 (en) 2000-03-10 2002-07-25 Gary Van Nest Methods of suppressing hepatitis virus infection using immunomodulatory polynucleotide sequences
US20020107212A1 (en) 2000-03-10 2002-08-08 Nest Gary Van Methods of reducing papillomavirus infection using immunomodulatory polynucleotide sequences
US20010046967A1 (en) 2000-03-10 2001-11-29 Gary Van Nest Methods of preventing and treating respiratory viral infection using immunomodulatory polynucleotide
US7129222B2 (en) 2000-03-10 2006-10-31 Dynavax Technologies Corporation Immunomodulatory formulations and methods for use thereof
US20020028784A1 (en) 2000-03-10 2002-03-07 Nest Gary Van Methods of preventing and treating viral infections using immunomodulatory polynucleotide sequences
US20030129251A1 (en) 2000-03-10 2003-07-10 Gary Van Nest Biodegradable immunomodulatory formulations and methods for use thereof
AU2001249609A1 (en) 2000-03-28 2001-10-08 Department Of Veterans Affairs Methods for increasing a cytotoxic T lymphocyte response in vivo
EP1278550A4 (en) 2000-04-07 2004-05-12 Univ California SYNERGISTIC IMPROVEMENTS OF POLYNUCLEOTIDE VACCINE
AU5736601A (en) 2000-05-01 2001-11-12 Hybridon Inc Modulation of oligonucleotide cpg-mediated immune stimulation by positional modification of nucleosides
EP1292331A2 (en) 2000-06-07 2003-03-19 Biosynexus Incorporated Immunostimulatory rna/dna hybrid molecules
KR100396983B1 (ko) 2000-07-29 2003-09-02 이강춘 고반응성의 가지 달린 고분자 유도체 및 고분자와 단백질또는 펩타이드의 접합체
ES2298269T3 (es) 2000-09-26 2008-05-16 Idera Pharmaceuticals, Inc. Modulacion de la actividad inmunoestimulante de analogos oligonucleotidicos inmunoestimulantes mediante cambios quimicos posicionales.
DE10048417A1 (de) 2000-09-29 2002-04-11 Roche Diagnostics Gmbh Verbindungen mit verzweigtem Linker
DE60134421D1 (de) 2000-12-08 2008-07-24 Coley Pharmaceuticals Gmbh Cpg-artige nukleinsäuren und verfahren zu ihrer verwendung
CA2430691A1 (en) 2000-12-27 2002-07-04 Dynavax Technologies Corporation Immunomodulatory polynucleotides and methods of using the same
WO2002074922A2 (en) 2001-03-16 2002-09-26 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for modulating an immune response
CN100334228C (zh) * 2001-06-21 2007-08-29 戴纳瓦克斯技术公司 嵌合免疫调制化合物及其使用方法
US20040132677A1 (en) 2001-06-21 2004-07-08 Fearon Karen L. Chimeric immunomodulatory compounds and methods of using the same-IV
US7785610B2 (en) 2001-06-21 2010-08-31 Dynavax Technologies Corporation Chimeric immunomodulatory compounds and methods of using the same—III
US20030006034A1 (en) * 2001-07-05 2003-01-09 Heartland Rig International, Llc Coiled tubing level wind system
US20030133988A1 (en) 2001-08-07 2003-07-17 Fearon Karen L. Immunomodulatory compositions, formulations, and methods for use thereof
US7354909B2 (en) * 2001-08-14 2008-04-08 The United States Of America As Represented By Secretary Of The Department Of Health And Human Services Method for rapid generation of mature dendritic cells
IL160157A0 (en) * 2001-08-17 2004-07-25 Coley Pharm Group Inc Combination motif immune stimulation oligonucleotides with improved activity
US7255866B2 (en) * 2001-09-17 2007-08-14 Allergan, Inc. Botulinum toxin therapy for fibromyalgia
WO2003035836A2 (en) 2001-10-24 2003-05-01 Hybridon Inc. Modulation of immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds by optimal presentation of 5' ends
US7276489B2 (en) * 2002-10-24 2007-10-02 Idera Pharmaceuticals, Inc. Modulation of immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds by optimal presentation of 5′ ends
US7576066B2 (en) * 2002-07-03 2009-08-18 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Nucleic acid compositions for stimulating immune responses
US7569553B2 (en) * 2002-07-03 2009-08-04 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Nucleic acid compositions for stimulating immune responses
US20040053880A1 (en) * 2002-07-03 2004-03-18 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Nucleic acid compositions for stimulating immune responses
US7605138B2 (en) * 2002-07-03 2009-10-20 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Nucleic acid compositions for stimulating immune responses
EP1393745A1 (en) 2002-07-29 2004-03-03 Hybridon, Inc. Modulation of immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds by optimal presentation of 5'ends
EP1575504A4 (en) * 2002-08-01 2009-11-04 Us Gov Health & Human Serv METHOD FOR THE TREATMENT OF INFLAMMATORY ARTHROPATHIES WITH SUPPRESSORS OF THE CPG OLIGONUCLEOTIDES
CN100471486C (zh) * 2002-08-12 2009-03-25 戴纳伐克斯技术股份有限公司 免疫调节组合物,其制备方法和使用方法
AR040996A1 (es) * 2002-08-19 2005-04-27 Coley Pharm Group Inc Acidos nucleicos inmunoestimuladores
US8043622B2 (en) * 2002-10-08 2011-10-25 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Method of treating inflammatory lung disease with suppressors of CpG oligonucleotides
WO2004034581A1 (ja) * 2002-10-11 2004-04-22 Fujitsu Limited Ｐｎ符号発生器、ｇｏｌｄ符号発生器、ｐｎ符号逆拡散器、ｐｎ符号発生方法、ｇｏｌｄ符号発生方法、ｐｎ符号逆拡散方法、及びコンピュータプログラム
US7325872B2 (en) * 2002-10-15 2008-02-05 Mattel, Inc. Rocker and method of using the same
ATE544466T1 (de) * 2002-10-29 2012-02-15 Coley Pharm Group Inc Verwendung von cpg oligonukleotide zur behandlung von hepatitis c virus infektion
WO2004047742A2 (en) 2002-11-21 2004-06-10 Archemix Corporation Multivalent aptamer therapeutics with improved pharmacodynamic properties and methods of making and using the same
WO2004053104A2 (en) * 2002-12-11 2004-06-24 Coley Pharmaceutical Group, Inc. 5’ cpg nucleic acids and methods of use
EP1625140A4 (en) 2002-12-23 2008-06-18 Dynavax Tech Corp BRANCHED IMMUNOMODULAR COMPOUNDS AND METHOD OF USE THEREOF
DK1575977T3 (da) * 2002-12-23 2009-11-09 Dynavax Tech Corp Oligonukleotider med Immunstimulatorisk sekvens og fremgangsmåder til anvendelse af disse
US8158768B2 (en) * 2002-12-23 2012-04-17 Dynavax Technologies Corporation Immunostimulatory sequence oligonucleotides and methods of using the same
WO2004064782A2 (en) 2003-01-16 2004-08-05 Hybridon, Inc. Modulation of immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds by utilizing modified immunostimulatory dinucleotides
US7354907B2 (en) * 2003-02-07 2008-04-08 Idera Pharmaceuticals, Inc. Short immunomodulatory oligonucleotides
US7176208B2 (en) * 2003-04-18 2007-02-13 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Quinoxalinyl macrocyclic hepatitis C serine protease inhibitors
MXPA05012421A (es) 2003-05-16 2006-02-22 Hybridon Inc Tratamiento sinergistico de cancer usando inmunomeros junto con agentes quimioterapeuticos.
WO2005001055A2 (en) * 2003-06-11 2005-01-06 Hybridon, Inc. Stabilized immunomodulatory oligonucleotides
WO2005009355A2 (en) 2003-07-15 2005-02-03 Hybridon, Inc. Synergistic stimulation of the immune system using immunostimulatory oligonucleotides and/or immunomer compounds in conjunction with cytokines and/or chemotherapeutic agents or radiation therapy
OA13310A (en) * 2003-09-05 2007-04-13 Anadys Pharmaceuticals Inc TLR7 ligands for the treatment of hepatitis C.
US7250398B2 (en) * 2003-09-12 2007-07-31 Novozymes A/S Synthetic antimicrobial polypeptides
JP4989225B2 (ja) * 2003-09-25 2012-08-01 コーリー ファーマシューティカル グループ，インコーポレイテッド 核酸親油性接合体
KR101107818B1 (ko) * 2003-10-30 2012-01-31 콜레이 파마시티컬 그룹, 인코포레이티드 향상된 면역자극 효능을 가진 ｃ-부류 올리고뉴클레오티드유사체
CA2549173A1 (en) * 2003-12-08 2005-07-07 Hybridon, Inc. Modulation of immunostimulatory properties by small oligonucleotide-based compounds
WO2005097993A2 (en) * 2004-02-19 2005-10-20 Coley Pharmaceutical Group, Inc. Immunostimulatory viral rna oligonucleotides
JP2007523173A (ja) 2004-02-20 2007-08-16 イデラ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド 修飾免疫調節オリゴヌクレオチドにより誘導された強力な粘膜免疫応答
HUE036894T2 (hu) 2004-06-15 2018-08-28 Idera Pharmaceuticals Inc Immunstimuláló oligonukleotid multimerek
US7427405B2 (en) * 2004-06-15 2008-09-23 Idera Pharmaceuticals, Inc. Immunostimulatory oligonucleotide multimers
US8289972B2 (en) * 2004-11-10 2012-10-16 Alcatel Lucent Gigabit passive optical network strict priority weighted round robin scheduling mechanism
WO2006091591A1 (en) * 2005-02-22 2006-08-31 The Regents Of The University Of California Methods of treating gastrointestinal inflammation
NZ561144A (en) * 2005-03-04 2009-09-25 Dynavax Tech Corp Vaccines comprising oligonucleotides having immunostimulatory sequences (ISS) wherein the ISS are conjugated to antigens and stabilized by buffer conditions and further excipients
AU2006241149A1 (en) 2005-04-26 2006-11-02 Coley Pharmaceutical Gmbh Modified oligoribonucleotide analogs with enhanced immunostimulatory activity
US7357184B2 (en) * 2005-10-21 2008-04-15 Schlumberger Technology Corporation Jacking frame having a wellhead centralizer and method of use
AU2006336242A1 (en) 2005-12-20 2007-07-26 Idera Pharmaceuticals, Inc. Novel synthetic agonists of toll-like receptors containing CG dinucleotide modifications
AU2006331879A1 (en) * 2005-12-20 2007-07-05 Idera Pharmaceuticals, Inc. Immunostimulatory activity of palindromic immune modulatory oligonucleotides (IMO TM) contiaining different lengths of palindromic segments
JP4864766B2 (ja) * 2006-03-31 2012-02-01 富士フイルム株式会社 半導体層の成膜方法
EP1887446A1 (de) * 2006-08-02 2008-02-13 Siemens Aktiengesellschaft Verfahren zur seriellen asynchronen Übertragung von Daten in einer Anordnung zur Überwachung, Steuerung und Regelung einer betriebstechnischen Anlage eines Gebäudes
NZ575437A (en) * 2006-09-27 2012-02-24 Coley Pharm Gmbh Cpg oligonucleotide analogs containing hydrophobic t analogs with enhanced immunostimulatory activity
DK2094849T3 (en) * 2006-11-09 2014-03-24 Dynavax Tech Corp LONG-TERM DISEASE MODIFICATION USING IMMUNSTIMULATORY OLIGONUCLEOTIDES
RU2009125599A (ru) * 2006-12-04 2011-01-20 Дзе Борд Оф Трастиз Оф Дзе Юниверсити Оф Иллинойс (Us) Композиции и способы лечения рака cpg-богатой днк и купредоксинами
EP2591787A1 (en) * 2007-08-13 2013-05-15 Pfizer Inc Combination motif immune stimulatory oligonucleotides with improved activity
WO2009026465A2 (en) * 2007-08-21 2009-02-26 Dynavax Technologies Corporation Composition and methods of making and using influenza proteins
EP2300102B1 (en) * 2008-05-15 2014-01-08 Dynavax Technologies Corporation Immunostimulatory sequences containing CpG for use in the treatment of allergic rhinitis
EP2278979A4 (en) * 2008-05-21 2012-09-26 Us Gov Health & Human Serv PROCESS FOR TREATING PNEUMOCONIOSIS WITH OLIGODESOXYNUCLEOTIDES
WO2010002940A2 (en) 2008-06-30 2010-01-07 Dynavax Technologies Corporation Heterogeneous synthesis of multivalent chimeric immunomodulatory compounds using platform based molecules
US8053422B2 (en) * 2008-12-04 2011-11-08 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Anti-cancer oligodeoxynucleotides

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