MXPA05001933A - Composiciones y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores. - Google Patents

Composiciones y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores.

Info

Publication number
MXPA05001933A
MXPA05001933A MXPA05001933A MXPA05001933A MXPA05001933A MX PA05001933 A MXPA05001933 A MX PA05001933A MX PA05001933 A MXPA05001933 A MX PA05001933A MX PA05001933 A MXPA05001933 A MX PA05001933A MX PA05001933 A MXPA05001933 A MX PA05001933A
Authority
MX
Mexico
Prior art keywords
seq
antibody
polypeptide
tat
amino acid
Prior art date
Application number
MXPA05001933A
Other languages
English (en)
Inventor
Zemin Zhang
Original Assignee
Genentech Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Genentech Inc filed Critical Genentech Inc
Publication of MXPA05001933A publication Critical patent/MXPA05001933A/es

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6801—Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
    • A61K47/6803—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6801—Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
    • A61K47/6803—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates
    • A61K47/6807—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates the drug or compound being a sugar, nucleoside, nucleotide, nucleic acid, e.g. RNA antisense
    • A61K47/6809—Antibiotics, e.g. antitumor antibiotics anthracyclins, adriamycin, doxorubicin or daunomycin
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
    • A61K47/6843—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a material from animals or humans
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
    • A61K47/6851—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/32—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against translation products of oncogenes
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies

Abstract

La presente invencion se dirige a composiciones de material utiles para el diagnostico y tratamiento de tumores de mamiferos y metodos para utilizar esas composiciones de material para los mismos.

Description

COMPOSICIONES Y MÉTODOS PARA EL DIAGNOSTICO Y TRATAMIENTO DE TUMORES CAMPO DE LA INVENCIÓN La presente invención se dirige a composiciones de material útiles para el diagnóstico y tratamiento de tumores en mamíferos y a métodos para utilizar esas composiciones de material para los mismos. ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN Los tumores malignos (cánceres) son la segunda causa principal de inactivación en los Estados Unidos, después de las enfermedades cardiacas (Boring et al., CA Cancel J. Clin. 43:7 (1993)). El cáncer se caracteriza por el incremento en el número de células anormales o neoplásicas derivadas de un tejido normal que prolifera para formar una masa tumoral, la invasión de tejidos adyacentes por estas células neoplásicas tumorales y la generación de células malignas que eventualmente se propagan a través de la sangre o el sistema linfático hacia los nodos linfáticos regionales y hacia sitios distantes a través de un proceso llamado metástasis. En un estado canceroso, una célula prolifera bajo condiciones en las cuales las células normales no crecerían. El cáncer se manifiesta por sí mismo en una extensa variedad de formas, caracterizadas por diferentes grados de invasividad y agresividad. En intentos por descubrir objetivos celulares - - efectivos para la terapia del cáncer, los investigadores han buscado identificar polipéptidos asociados a la transraembrana o de otra manera asociados a la membrana que se expresan específicamente en la superficie de uno o más tipos particulares de célula cancerosa en comparación a una o más células normales no cancerosas. Con frecuencia tales polipéptidos asociados a la membrana se expresan más abundantemente sobre la superficie de las células cancerosas en comparación a sobre la superficie de las células no cancerosas . La identificación de tales polipéptidos de antígeno de superficie celular asociados al tumor ha dado origen a la capacidad para enfocar específicamente las células cancerosas para su destrucción a través de terapias a base de anticuerpos. A este respecto, se hace notar que la terapia a base de anticuerpos ha probado ser muy efectiva en el tratamiento de ciertos cánceres. Por ejemplo, HERCEPTIN® y RITUXAN® (ambos de Genentech Inc., South San Francisco, California) son anticuerpos que se han utilizado con éxito para tratar el cáncer de mama y el linfoma no-de Hodgkin, respectivamente. Más específicamente, el HERCEPTIN® es un anticuerpo monoclonal humanizado derivado de ADN recombinante que se enlaza selectivamente al dominio extracelular del proto-oncogén del receptor 2 del factor humano de crecimiento epidérmico (HER2) . La sobreexpresión de la proteína HER2 se observa en el 25-30% de los cánceres de mama primarios. El - - RITUXAN® es un anticuerpo quimérico monoclonal murino/humano genéticamente diseñado dirigido contra el antígeno CD20 encontrado en la superficie de los linfocitos B normales y malignos. Ambos anticuerpos se producen recombinantemente en las células CHO. En otros intentos por descubrir objetivos celulares efectivos para la terapia del cáncer, los investigadores han buscado identificar (1) polipéptidos no asociados a la membrana que se producen específicamente por uno o más tipo(s) particulares de célula (s) cancerosa (s) en comparación con uno o más tipos particulares de célula (s) normal (es) no cancerosa (s) , (2) polipéptidos que se producen por células cancerosas en un nivel de expresión que es significativamente más elevado que el de una o más células normales no cancerosas, o (3) polipéptidos cuya expresión se limita específicamente solo a un solo (o un número muy limitado de diferentes) tipo(s) de tejido tanto en el estado canceroso como no canceroso (e.gr., tejido prostático normal y de tumoral prostático) . Tales polipéptidos pueden permanecer intracelulármente localizados o pueden secretarse por la célula cancerosa. Además, tales polipéptidos pueden expresarse no por la célula cancerosa en sí, sino por células que producen y/o secretan polipéptidos que tienen un efecto de potenciación o aumento del crecimiento sobre las células cancerosas. Tales polipéptidos secretados frecuentemente son - - proteínas que proveen a las células cancerosas con una ventaja en crecimiento sobre las células normales e incluyen cosas como, por ejemplo, factores angiogénicos , factores de adhesión celular, factores -de crecimiento y lo similar. Se esperaría que la identificación de los antagonistas de tales polipéptidos no asociados con la membrana sirviera como agentes terapéuticos efectivos para el tratamiento de tales cánceres. Además, la identificación del patrón de expresión de tales polipéptidos sería útil para el diagnóstico de cánceres particulares en mamíferos. A pesar de los avances anteriormente identificados en la terapia del cáncer en mamíferos, existe una gran necesidad de agentes diagnósticos y terapéuticos adicionales capaces de detectar la presencia de tumor en un mamífero e inhibir efectivamente el crecimiento de células neoplásicas, respectivamente. De acuerdo a esto, es un objetivo de la presente invención identificar (1) polipéptidos asociados a la membrana celular que se expresan más abundantemente en uno o más tipos de célula (s) cancerosa (s) en comparación con células normales o en otras células cancerosas diferentes, (2) polipéptidos no asociados a la membrana que se producen específicamente por uno o más tipos particulares de célula (s) cancerosa (s) (o por otras células que producen polipéptidos que tienen un efecto de potenciación sobre el crecimiento de las células cancerisas) en comparación con uno o más tipos - - particulares de célula (s) normal (es) no cancerosa (s) , (3) polipeptidos no asociados a la membrana que se producen por las células cancerosas a un nivel de expresión significativamente más elevado que el de una o más células normales no cancerosas, o (4) polipéptidos cuya expresión se limita específicamente solo a un (o un número muy limitado de diferentes) tipo(s) de tejido tanto en estado canceroso como no canceroso {e.g., tejido normal prostático y tumoral prostático) y utilizar los polipéptidos, y sus ácidos nucleicos de codificación, para producir composiciones de material útiles en el tratamiento terapéutico y la detección diagnóstica del cáncer en mamíferos. También es un objetivo de la presente invención identificar polipéptidos asociados a la membrana celular, secretados o intracelulares cuya expresión se limita solo a uno, o un número muy limitado de tejidos, y utilizar esos polipéptidos y sus ácidos nucleicos de codificación, para producir composiciones de material útiles en el tratamiento terapéutico y en la detección diagnóstica del cáncer en mamíferos . SUMARIO DE LA INVENCIÓN -11 Modalidades En la presente especificación, los Solicitantes describen por primera vez la identificación de varios polipéptidos celulares (y sus ácidos nucleicos de codificación o sus fragmentos) que se expresan a un mayor - - grado sobre la superficie o por uno o más tipos de células cancerosas en comparación a sobre la superficie o por uno o más tipos de células normales no cancerosas. Alternativamente, tales polipéptidos se expresan por células que producen y/o secretan polipéptidos que tienen un efecto de potenciación o de aumento de crecimiento sobre las células cancerosas. De nuevo alternativamente, tales polipéptidos pueden no encontrarse sobreexpresados por las células tumorales en comparación con las células normales del mismo tipo de tejido, sino que pueden encontrarse específicamente expresados tanto por células tumorales como en células normales de un solo, o un número muy limitado de tipos de tejido (preferentemente tejidos que no son esenciales para la vida, e.g., de próstata, etc.). Todos los polipéptidos anteriores se refieren en la presente como polipéptidos de Objetivo Antigénico Asociado al Tumor (polipéptidos "TAT" ) y se espera que sirvan como objetivos efectivos para la terapia y el diagnóstico del cáncer en mamíferos. De acuerdo a esto, en una modalidad de la presente invención, la invención proporciona una molécula de ácido nucleico aislada que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica para un polipéptido de objetivo antigénico asociado al tumor o un fragmento del mismo (un polipéptido "TAT" ) . En ciertos aspectos, la molécula de ácido nucleico aislada comprende una secuencia de nucleótidos que tiene al - - menos aproximadamente un 80% de identidad de secuencia del ácido nucleico, alternativamente al menos aproximadamente 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% de identidad de secuencia del ácido nucleico, para (a) una molécula de ADN que codifica para un polipéptido TAT de longitud total que tiene una secuencia de aminoácidos como se describe en la presente, una secuencia de aminoácidos de polipéptido TAT que carece del péptido de señal como se describe en la presente, un dominio extracelular de un polipéptido TAT de transmembrana, con o sin el péptido de señal, como se describe en la presente o cualquier otro fragmento específicamente definido de una secuencia de aminoácidos del polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente o (b) el complemento de la molécula de ADN de (a) . En otros aspectos, la molécula de ácido nucleico aislada comprende una secuencia de nucleótidos que tiene al menos aproximadamente el 80% de identidad de secuencia del ácido nucleico, alternativamente al menos aproximadamente 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% de identidad de secuencia del ácido nucleico, para (a) una molécula de ADN que comprende la secuencia de codificación de un ADNc del polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente, la secuencia de codificación de un polipéptido TAT - - que carece del péptido de señal como se describe en la presente, la secuencia de codificación de un dominio extracelular de un polipéptido TAT de transmembrana, con o sin el péptido de señal, como se describe en la presente o la secuencia de codificación de cualquier otro fragmento específicamente definido de la secuencia de aminoácidos del polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente o (b) el complemento de la molécula de ADN de (a) . En aspectos adicionales, la invención se refiere a una molécula de ácido nucleico aislada que comprende una secuencia de nucleotidos que tiene al menos aproximadamente el 80% de identidad de secuencia del ácido nucleico, alternativamente al menos aproximadamente 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% de identidad de secuencia del ácido nucleico, para (a) una molécula de ADN que codifica el mismo polipéptido maduro codificado por la región de codificación de longitud total de cualquiera de los ADNcs de la proteína humana depositados con la ATCC como se describe en la presente o (b) el complemento de la molécula de ADN de (a) . Otro aspecto de la invención proporciona una molécula de ácido nucleico aislada que comprende una secuencia de nucleotidos que codifica para un polipéptido TAT que es ya sea de dominio de transmembrana suprimido o de dominio de transmembrana inactivado, o es complementario a - - tal secuencia de nucleótidos de codificación, en donde el (los) dominio (s) de transmembrana de tal (es) polipéptido (s) se describe (n) en la presente. Por lo tanto, se contemplan los dominios extracelulares solubles de los polipéptidos TAT descritos en la presente. En otros aspectos, la presente invención se dirige a moléculas aisladas de ácido nucleico que se hibridizan a (a) una secuencia de nucleótidos que codifica para un polipéptido TAT que tiene una secuencia de aminoácidos de longitud total como se describe en la presente, una secuencia de aminoácidos de polipéptido TAT que carece del péptido de señal como se describe en la presente, un dominio extracelular de un polipéptido TAT de transmembrana, con o sin el péptido de señal, como se describe en la presente o cualquier otro fragmento específicamente definido de una secuencia de aminoácidos de polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente o (b) el complemento de la secuencia de nucleótidos de (a) . A este respecto, una modalidad de la presente invención se dirige a fragmentos de una secuencia de codificación del polipéptido TAT de longitud total o su complemento, como se describe en la presente, que puede encontrar su uso como, por ejemplo, sondas de hibridación útiles como, por ejemplo, sondas de diagnóstico, sondas de oligonucleótidos de antisentido o para fragmentos de codificación de un polipéptido TAT de longitud total que - - opcionalmente pueden codificar un polipéptido que comprende un sitio de enlace para un anticuerpo de polipéptido anti-TAT, un oligopéptido de enlace TAT u otra molécula orgánica pequeña que se enlaza a un polipéptido TAT. Tales fragmentos de ácido nucleico son comúnmente de al menos aproximadamente 5 nucleótidos de longitud, alternativamente de al menos aproximadamente 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 3 0, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, í 80, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320, 330, 340, 350, 360, 370, 380, 390, 400, 410, 420, 430, 440, 450, 460, 470, 480, 490, 500, 510, 520, 530, 540, 550, 560, 570, 580, 590, 600, 610, 620, 630, 640, 650, 660, 670, 680, 690, 700, 710, 720, 730, 740, 750, 760, 770, 780, 790, 800, 810, 820, 830, 840, 850, 860, 870, 880, 890, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990 o 1000 nucleótidos de longitud, en donde en este contexto el término "aproximadamente" significa la longitud de referencia de la secuencia de nucleótidos más o menos 10% de esa longitud de referencia. Se hace notar que pueden determinarse nuevos fragmentos de una secuencia de nucleótidos que codifican al polipéptido TAT de manera rutinaria alineando la secuencia de nucleótidos de codificación del polipéptido TAT con otras secuencias de - - nucleótidos conocidas utilizando cualquiera de una variedad de programas de alineación de secuencia bien conocidos y determinando cual (es) fragmento (s) de secuencia de nucleótidos de codificación del polipeptido TAT son nuevos. Todos tales nuevos fragmentos de las secuencias de • nucleótidos que codifican el polipéptido TAT se contemplan en la presente. También se encuentran contemplados los fragmentos de polipéptido TAT codificados por estos fragmentos de molécula de nucleótido, preferentemente aquellos fragmentos de polipéptido TAT que comprenden un sitio de unión para un anticuerpo anti-TAT, un oligopéptido de enlace TAT u otra molécula orgánica pequeña que se enlaza a un polipéptido TAT. En otra modalidad, la invención proporciona polipéptidos TAT aislados codificados por cualquiera de las secuencias aisladas de ácido nucleico identificadas anteriormente en la presente. En un cierto aspecto, la invención se refiere a un polipéptido TAT aislado, que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos aproximadamente el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos, alternativamente al menos aproximadamente 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% de identidad de la secuencia de aminoácidos, para un polipéptido TAT que tiene una secuencia de aminoácidos de - - longitud total como se describe en la presente, una secuencia de aminoácidos de polipéptido TAT que carece del péptido de señal como se describe en la presente, un dominio extracelular de una proteína del polipéptido TAT de transmembrana, con o sin el péptido de señal, como se describe en la presente, una secuencia de aminoácidos codificada por cualquiera de las secuencias de ácido nucleico descritas en la presente o cualquier otro fragmento específicamente definido de una secuencia de aminoácidos del polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente . En un aspecto adicional, la invención se refiere a un polipéptido TAT aislado que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos aproximadamente el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos, alternativamente al menos aproximadamente 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% o 99% de identidad de la secuencia de aminoácidos, para una secuencia de aminoácidos codificada por cualquiera de los ADNcs de proteína humana depositados con la ATCC como se describe en la presente. En un aspecto específico, la invención proporciona un polipéptido TAT aislado sin la secuencia de señal N-terminal y/o sin la metionina de inicio y se codifica por una secuencia de nucleótidos que codifica tal secuencia de - - aminoácidos como se describió anteriormente en la presente. También se describen en la presente procesos para producir los mismos, en donde aquellos procesos comprenden cultivar una célula huésped que comprende un vector que comprende la molécula de ácido nucleico de codificación apropiada bajo condiciones adecuadas para la expresión del polipéptido ??? y la recuperación del polipéptido TAT a partir del cultivo celular . Otro aspecto de la invención proporciona un polipéptido TAT aislado que es ya sea suprimido del dominio de transmembrana o inactivado del dominio de transmembrana. También se encuentran descritos en la presente procesos para producir el mismo en donde estos procesos comprenden cultivar una célula huésped que comprende un vector que comprende la molécula de ácido nucleico de codificación apropiada bajo condiciones adecuadas para la expresión del polipéptido TAT y la recuperación del polipéptido TAT a partir del cultivo celular. En otras modalidades de la presente invención, la invención proporciona vectores que comprenden el ADN que codifica para cualquiera de los polipéptidos descritos en la presente. También se proporcionan las células huésped que comprenden cualquiera de tales vectores. A modo de ejemplo, las células huésped pueden ser células CHO, células de E. coli o células de levadura. Se proporciona además un proceso - - para producir cualquiera de los polipéptidos descritos en la presente y comprende cultivar las células huésped bajo condiciones adecuadas para la expresión del polipéptido deseado y recuperar el polipéptido deseado a partir del cultivo celular . En otras modalidades, la invención proporciona polipéptidos quiméricos aislados que comprenden cualquiera de los polipéptidos TAT descritos en la presente fusionados a un polipéptido heterólogo (no-TAT) . Ejemplos de tales moléculas quiméricas comprenden cualquiera de los polipéptidos TAT descritos en la presente fusionados a un polipéptido heterólogo tal como, por ejemplo, una secuencia marcadora de ep tope o una región Fe de una inmunoglobulina. En otra modalidad, la invención proporciona un anticuerpo que se enlaza, preferentemente de manera especifica, a cualquiera de los polipéptidos descritos anterior o posteriormente. Opcionalmente, el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal, fragmento de anticuerpo, anticuerpo quimérico, anticuerpo humanizado, anticuerpo de cadena única o un anticuerpo que inhibe competitivamente el enlace de un anticuerpo de polipéptido anti-TAT a su epítope antigénico respectivo. Los anticuerpos de la presente invención opcionalmente pueden conjugarse a un agente inhibidor del crecimiento o a un agente citotóxico tal como una toxina, incluyendo, por ejemplo un maytansinoide o calicheamicina, un - - antibiótico, un isótopo radioactivo, una enzima nucleolítica o lo similar. Los anticuerpos de la presente invención pueden producirse opcionalmente en células CHO o en células bacteriales y preferentemente inducir la inactivación de la célula a la cual se enlazan. Para propósitos de diagnóstico, los anticuerpos de la presente invención pueden marcarse de manera detectable, unidos a un soporte sólido o lo similar. En otras modalidades de la presente invención, la invención proporciona vectores que comprenden el ADN que codifica para cualquiera de los anticuerpos descritos en la presente. También se proporciona la célula huésped que comprende cualquiera de tales vectores. A modo de ejemplo, las células huésped pueden ser células CHO, células de E. coli o células de levadura. Se proporciona además un proceso para producir cualquiera de los anticuerpos descritos en la presente y comprende cultivar células huésped bajo condiciones adecuadas para la , expresión del anticuerpo deseado y recuperar el anticuerpo deseado a partir del cultivo celular. En otra modalidad, la invención proporciona oligopeptidos ("oligopeptidos de enlace TAT") que se enlazan, preferentemente de manera específica, a cualquiera de los polipéptidos TAT descritos anterior o posteriormente. Opcionalmente, los oligopéptidos de enlace TAT de la presente invención pueden conjugarse a un agente inhibidor del - - crecimiento o a un agente citotóxico tal como una toxina, incluyendo, por ejemplo un maytansinoide o calicheamicina, un antibiótico, un isótopo radioactivo, una enzima nucleolítica o lo similar. Los oligopéptidos de enlace TAT de la presente invención pueden producirse opcionalmente en células CHO o en células bacteriales y preferentemente inducir la inactivación de la célula a la cual se enlazan. Para propósitos de diagnóstico, los oligopéptidos de enlace TAT de la presente invención pueden marcarse de manera detectable, unidos a un soporte sólido o lo similar. En otras modalidades de la presente invención, la invención proporciona vectores que comprenden el ADN que codifica para cualquiera de los oligopéptidos de enlace TAT descritos en la presente. También se proporciona la célula huésped que comprende cualquiera de tales vectores . A modo de ejemplo, las células huésped pueden ser células CHO, células de E. coli o células de levadura. Se proporciona además un proceso para producir cualquiera de los oligopéptidos de enlace TAT descritos en la presente y comprende cultivar las células huésped bajo condiciones adecuadas para la expresión del oligopéptido deseado y recuperar el oligopéptido deseado a partir del cultivo celular. En otra modalidad, la invención proporciona moléculas orgánicas pequeñas ("moléculas orgánicas de enlace - - TAT") que se enlazan, preferentemente de manera específica, a cualquiera de los polipéptidos TAT descritos anterior o posteriormente. Opcionalmente, las moléculas orgánicas de enlace TAT de la presente invención pueden conjugarse a un agente inhibidor del crecimiento o a un agente citotóxico tal como una toxina, incluyendo, por ejemplo un maytansinoide o calicheamicina, un antibiótico, un isótopo radioactivo, una enzima nucleolítica o lo similar. Las moléculas orgánicas de enlace TAT de la presente invención preferentemente inducen la inactivación de la célula a la cual se enlazan. Para propósitos de diagnóstico, las moléculas orgánicas de enlace TAT de la presente invención pueden marcarse de manera detectable, unidas a un soporte sólido o lo similar. Aún en una modalidad adicional, la invención se refiere a una composición de materia que comprende un polipéptido TAT como se describe en la presente, un polipéptido quimérico TAT como se describe en la presente, un anticuerpo anti-TAT como se describe en la presente, un oligopéptido de enlace TAT como se describe en la presente o una molécula orgánica de enlace TAT como se describe en la presente, en combinación con un vehículo. Opcionalmente, el vehículo es un vehículo farmacéuticamente aceptable. Aún en otra modalidad, la invención se refiere a un artículo de manufactura que comprende un contenedor y una composición de materia contenida dentro del contenedor, en - - donde la composición de materia puede comprender un polipeptido TAT como se describe en la presente, un polipéptido quimérico TAT como se describe en la presente, un anticuerpo anti-TAT como se describe en la presente, un oligopéptido de enlace TAT como se describe en la presente o una molécula orgánica de enlace TAT como se describe en la presente. El artículo opcionalmente puede comprender además una etiqueta fija al contenedor o un inserto de empaque incluido con el contenedor, que se refiera al uso de la composición de materia para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un tumor. Otra modalidad de la presente invención se dirige al uso de un polipéptido TAT como se describe en la presente, un polipéptido quimérico TAT como se describe en la presente, un anticuerpo de polipéptido anti-TAT como se describe en la presente, un oligopéptido de enlace TAT como se describe en la presente o una molécula orgánica de enlace TAT como se describe en la presente, para la preparación de un medicamento útil en el tratamiento de una condición que responde al polipéptido TAT, al polipéptido- quimérico TAT, al anticuerpo de polipéptido anti-TAT, al oligopéptido de enlace TAT o a la molécula orgánica de enlace TAT. -12 Modalidades Adicionales Otra modalidad de la presente invención se dirige a un método para inhibir el crecimiento de una célula que - - expresa un polipéptido TAT, en donde el método comprende poner en contacto la célula con un anticuerpo, un oligopéptido o una mplécula orgánica pequeña que se enlaza al polipéptido TAT, y en donde el enlace del anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica al polipéptido TAT ocasiona la inhibición del crecimiento de la célula que expresa el polipéptido TAT. En modalidades preferidas, la célula es una célula cancerosa y el enlace del anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica al polipéptido TAT ocasiona la inactivación de la célula que expresa el polipéptido TAT. Opcionalmente, el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal, un fragmento de anticuerpo, un anticuerpo quimérico, un anticuerpo humanizado o un anticuerpo de cadena única. Los anticuerpos, oligopéptidos de enlace TAT y las moléculas orgánicas de enlace TAT empleados en los métodos de la presnte invención pueden conjugarse opcionalmente a un agente inhibidor del crecimiento o agente citotóxico tal como una toxina, incluyendo, por ejemplo un maytansinoide o calicheamicina, un antibiótico, un isótopo radiactivo, una enzima nucleolítica o lo similar. Los anticuerpos y los oligopéptidos de enlace TAT empleados en los métodos de la presente invención pueden producirse opcionalmente en células CHO o en células bacteriales . Aún otra modalidad de la presente invención se dirige a un método para tratar terapéuticamente a un mamífero - - que tiene un tumor canceroso que comprende células que expresan un polipeptido TAT, en donde el método comprende administrar al mamífero una cantidad terapéuticamente efectiva de un anticuerpo un oligopéptido o una molécula orgánica pequeña que se enlaza al polipeptido TAT dando como resultado en consecuencia el tratamiento terapéutico efectivo del tumor. Opcionalmente el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal, fragmento de anticuerpo, anticuerpo quimérico, anticuerpo humanizado o un anticuerpo de cadena única. Los anticuerpos, oligopéptidos de enlace TAT y las moléculas orgánicas de enlace TAT empleados en los métodos de la presente invención opcionalmente pueden conjugarse a un agente inhibidor del crecimiento o a un agente citotóxico tal como una toxina, incluyendo, por ejemplo, un maytansinoide o calicheamicina, un antibiótico, un isótopo radioactivo, una enzima nucleolitica o lo similar. Los anticuerpos y los oligopéptidos empleados en los métodos de la presente invención pueden producirse opcionalmente en células CHO o células bacteriales . Aún otra modalidad de la presente invención se dirige a un método para determinar la presencia de un polipeptido TAT en una muestra sospechosa de contener el polipéptido TAT, en donde el método comprende exponer la muestra a un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica pequeña que se enlaza al polipéptido TAT y determinar el - - enlace del anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica al polipeptido TAT en la muestra, en donde la presencia de tal enlace es indicativa de la presencia del polipeptido TAT en la muestra. Opcionalmente, la muestra puede contener células (las cuales pueden ser células cancerosas) sospechosas de expresar el polipéptido TAT. El anticuerpo, el oligopéptido de enlace TAT o la molécula orgánica de enlace TAT empleados en el método, opcionalmente pueden estar marcados detectablemente, unidos a un soporte sólido o lo similar. Una modalidad adicional de la presente invención se dirige a un método para diagnosticar la presencia de un tumor en un mamífero, en donde el método comprende detectar el nivel de expresión de un gen que codifica para un polipéptido TAT (a) en una muestra de prueba de células de tejido obtenidas de dicho mamífero y (b) en una muestra de control de células normales no cancerosas conocidas del mismo origen o tipo de tejido, en donde un mayor nivel de expresión del polipéptido TAT en la muestra de prueba, en comparación con la muestra de control, es indicativo de la presencia de tumor en el mamífero a partir del cual se obtuvo la muestra de prueba . Otra modalidad de la presente invención se dirige a un método para diagnosticar la presencia de un tumor en un mamífero, en donde el método comprende (a) poner en contacto una muestra de prueba que comprende células de tejido - - obtenidas del mamífero con un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica pequeña que se enlaza a un polipéptido TAT y (b) detectar la formación de un complejo entre el anticuerpo, el oligopéptido o la molécula orgánica pequeña y el polipéptido TAT en la muestra de prueba, en donde la formación de un complejo es indicativa de la presencia de un tumor en el mamífero. Opcionalmente , el anticuerpo, el oligopéptido de enlace TAT o la molécula orgánica de enlace TAT empleado se marca de manera detectable, unido a un soporte sólido o lo similar y/o la muestra de prueba de las células de tejido se obtiene de un individuo sospechoso de tener un tumor canceroso . Aún otra modalidad de la presente invención se dirige a un método para tratar o prevenir un trastorno celular proliferativo asociado con la expresión o actividad alterada, preferentemente incrementada de un polipéptido TAT, comprendiendo el método administrar a un sujeto que necesita tal tratamiento una cantidad efectiva de un antagonista de un polipéptido TAT. Preferentemente, el trastorno celular proliferativo es cáncer y el antagonista del polipéptido TAT es un anticuerpo de polipéptido anti-TAT, un oligopéptido de enlace TAT, una molécula orgánica de enlace TAT o un oligonucleótido de antisentido. El tratamiento efectivo o la prevención del trastorno celular proliferativo puede ser el resultado de la inactivación directa o la inhibición del - - crecimiento de las células que expresan el polipéptido TAT o al antagonizar la actividad de potenciación del crecimiento celular de un polipéptido TAT. Aún otra modalidad de la presente invención se dirige a un método para enlazar un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica pequeña a una célula que expresa un polipéptido TAT, en donde el método comprende poner en contacto una célula que expresa un polipéptido TAT con dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica pequeña bajo condiciones que son adecuadas para el enlace del anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica pequeña a dicho polipéptido TAT y que permiten en enlace entre ellos . Otras modalidades de la presente invención se dirigen al uso de (a) un polipéptido TAT, (b) un ácido nucleico que codifica para un polipéptido TAT o un vector o célula huésped que comprende ese ácido nucleico, (c) un anticuerpo de polipéptido anti-TAT, (d) un oligopéptido de enlace TAT, o (e) una molécula orgánica pequeña de enlace TAT en la preparación de un medicamento útil para (i) el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer o tumor, o (ii) el tratamiento terapéutico o la prevención de un trastorno celular proliferativo . Otra modalidad de la presente invención se dirige a un método para inhibir el crecimiento de una célula cancerosa, en donde el crecimiento de dicha célula cancerosa - - depende al menos en parte de el (los) efecto (s) de potenciación del crecimiento de un polipéptido TAT (en donde el polipéptido TAT puede expresarse ya sea por la célula cancerosa en si o una célula que produce el (los) polipéptido (s) que tiene (n) un efecto de potenciación del crecimiento sobre las células cancerosas) , en donde el método comprende poner en contacto el polipéptido TAT con un anticuerpo, un oligopéptido o una molécula orgánica pequeña que se enlaza al polipéptido TAT, antagonizando en consecuencia la actividad de potenciación del crecimiento del polipéptido TAT y, a su vez, inhibir el crecimiento de la célula cancerosa. Preferentemente se inhibe completamente el crecimiento de la célula cancerosa. Aún más preferentemente, el enlace del anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica pequeña al polipéptido TAT, induce la inactivación de la célula cancerosa. Opcionalmente, el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal, fragmento de anticuerpo, anticuerpo quimérico, anticuerpo humanizado o anticuerpo de cadena única. Los anticuerpos, oligopéptidos de enlace TAT y las moléculas orgánicas de enlace TAT empleadas en los métodos de la presente invención pueden conjugarse opcionalmente a un agente inhibidor del crecimiento o a un agente citotoxico tal como una toxina, incluyendo, por ejemplo, un maytansinoide o calicheamicina, un antibiótico, un isótopo radiactivo, una enzima nucleolitica o lo similar. Los anticuerpos y los - - oligopéptidos de enlace TAT empleados en los métodos de la presente invención pueden producirse opcionalmente en células CHO o en células bacteriales. Aún otra modalidad de la presente invención se dirige a un método para tratar terapéuticamente un tumor en un mamífero, en donde el crecimiento de dicho tumor depende al menos en parte de el (los) efecto (s) de potenciación del crecimiento de un polipéptido TAT, en donde el método comprende administrar al mamífero una cantidad terapéuticamente efectiva de un anticuerpo, un oligopéptido o una molécula orgánica pequeña que se enlaza al polipéptido TAT, antagonizando en consecuencia la actividad de potenciación del crecimiento de dicho polipéptido TAT y dando como resultado el tratamiento terapéutico efectivo del tumor. Opcionalmente, el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal, fragmento de anticuerpo, anticuerpo quimérico, anticuerpo humanizado o anticuerpo de cadena única. Los anticuerpos, oligopéptidos de enlace TAT y las moléculas orgánicas de enlace TAT empleadas en los métodos de la presente invención pueden conjugarse opcionalmente a un agente inhibidor del crecimiento o a un agente citotóxico tal como una toxina, incluyendo, por ejemplo, un maytansinoide o calicheamiciña, un antibiótico, un isótopo radiactivo, una enzima nucleolítica o lo similar. Los anticuerpos y los oligopéptidos empleados en los métodos de la presente - - invención, pueden producirse opcionalmente en células CHO o en células bacteriales. -13 Modalidades Adicionales Aún en modalidades adicionales, la invención se dirige al siguiente conjunto de reivindicaciones potenciales para esta solicitud: 1. El ácido nucleico aislado que tiene una secuencia de nucleótidos que tiene al menos 80% de identidad de secuencia del ácido nucleico para: (a) una molécula de ADN que codifica para la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82 -158) ; (b) una molécula de ADN que codifica para la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158), que carece de su péptido de señal asociado,- (c) una molécula de ADN que codifica para un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su péptido de señal asociado; (d) una molécula de ADN que codifica para un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (e) la secuencia de nucleótidos, mostrada en - - cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ IS NOS : 1-81); (f) la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleotidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS.1-81); o (g) el complemento de (a) , (b) , (c) , (d) , (e) o (f) . 2. El ácido nucleico aislado que tiene : (a) una secuencia de nucleotidos que codifica para la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) una secuencia de nucleotidos que codifica para la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID N0S:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) una secuencia de nucleotidos que codifica para un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su péptido de señal asociado; (d) una secuencia de nucleotidos que codifica para un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (e) la secuencia de nucleotidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ IS NOS: 1-81); (f) la región de codificación de longitud total de - - la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); o (g) el complemento de (a) , (b) , (c) , (d) , (e) o (f) - 3. El ácido nucleico aislado que se híbrida a: (a) un ácido nucleico que codifica para la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) un ácido nucleico que codifica para la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un ácido nucleico que codifica para un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su péptido de señal asociado; (d) un ácido nucleico que codifica para un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (e) la secuencia de nucleótidos ,mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ IS NOS: 1-81); (f) la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); o - - (g) el complemento de (a) , (b) , (c) , (d) , (e) o (f) - 4. El ácido nucleico de la Reivindicación 3 , en donde la hibridación se presenta bajo condiciones de rigurosidad . 5. El ácido nucleico de la Reivindicación 3 que es de al menos aproximadamente 5 nucleótidos de longitud. 6. Un vector de expresión que comprende el ácido nucleico de la Reivindicación 1, 2, o 3. 7. El vector de expresión de la Reivindicación 6, en donde dicho ácido nucleico se encuentra operablemente enlazado a las secuencias de control reconocidas por una célula huésped transformada con el vector. 8. Una célula huésped que comprende el vector de expresión de la Reivindicación 7. 9. La célula huésped de la Reivindicación 8 que es una célula CHO, una célula de E. coli o una célula de levadura . 10. Un proceso para producir un polipéptido, que comprende cultivar la célula huésped de la Reivindicación 8 bajo condiciones adecuadas para la expresión de dicho polipéptido y recuperar dicho polipéptido a partir del cultivo celular. 11. Un polipéptido aislado que tiene al menos 80% de identidad de secuencia del ácido nucleico para: - - (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82- 158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS : 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 12. Un polipéptido aislado que tiene: (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las - - Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , con su secuencia de péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 13. Un polipéptido quimérico que comprende el polipéptido de la Reivindicación 11 o 12 fusionado a un polipéptido heterologo . 14. El polipéptido quimérico de la Reivindicación 13, en donde dicho polipéptido heterologo es una secuencia de marca de epítope o una región Fe de una inmunoglobulina. 15. Un anticuerpo aislado que se enlaza a un polipéptido que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las - - Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) ; O (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 16. Un anticuerpo aislado que se enlaza a un polipéptido que tiene : (a) la secuencia. de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada,- (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , con su secuencia de péptidos de señal asociada; - - (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de peptidos de señal asociada,- (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS.1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 17. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que es un anticuerpo monoclonal . 18. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que es un fragmento de anticuerpo. 19. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que es un anticuerpo quimérico o humanizado. 20. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento. 21. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que se conjuga a un agente citotóxico. 22. El anticuerpo de la Reivindicación 21, en donde el agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas nucleoliticas . - - 23. El anticuerpo de la Reivindicación 21, en donde el agente citotóxico es una toxina. 24. El anticuerpo de la Reivindicación 23, en donde la toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina . 25. El anticuerpo de la Reivindicación 23, en donde la toxina es un maytansinoide. 26. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que se produce en bacterias . 27. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que se produce en células CHO . 28. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que induce la inactivación de la célula a la cual se enlaza. 29. El anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16 que se encuentra marcado de manera detectable. 30. Un ácido nucleico aislado que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica para el anticuerpo de la Reivindicación 15 o 16. 31. Un vector de expresión que comprende el ácido nucleico de la Reivindicación 30 operablemente enlazado a las secuencias de control reconocidas por una célula huésped transformada con el vector. 32. Una célula huésped que comprende el vector de expresión de la Reivindicación 31. 33. La célula huésped de la Reivindicación 32 que - - es una célula CHO, una célula de E. coli o una célula de levadura. 34. Un proceso para producir un anticuerpo que comprende cultivar la célula huésped de la Reivindicación 32 bajo condiciones adecuadas para la expresión de dicho anticuerpo y recuperar dicho anticuerpo a partir del cultivo celular. 35. Un oligopéptido aislado que se enlaza a un polipéptido que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158). , que carece de su péptido de señal asociado,- (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS : 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de - - codificación de longitud total de la secuencia de nucleotidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 36. Un oligopéptido aislado que se enlaza a un polipéptido que tiene : (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su secuencia de péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleotidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); O (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleotidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 37. El oligopéptido de la Reivindicación 35 o 36 - - que se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento. 38. El oligopéptido de la Reivindicación 35 o 36 que se conjuga a un agente citotóxico. 39. El oligopéptido de la Reivindicación 38, en donde el agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas nucleolíticas . 40. El oligopéptido de la Reivindicación 38, en donde el agente citotóxico es una toxina. 41. El oligopéptido de la Reivindicación 40, en donde la toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina. 42. El oligopéptido de la Reivindicación 40, en donde la toxina es un maytansinoide. 43. El oligopéptido de la Reivindicación 35 o 36 que induce la inactivación de la célula a la cual se enlaza. 44. El oligopéptido de la Reivindicación 35 o 36 que se encuentra marcado de manera detectable. 45. Una molécula orgánica de enlace TAT que se enlaza a un polipéptido que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido - - de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS : 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS:l-81) . 46. La molécula orgánica de la Reivindicación 45 que se enlaza a un polipéptido que tiene: (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su secuencia de péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio - - extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 47. La molécula orgánica de la Reivindicación 45 o 46 que se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento. 48. La molécula orgánica de la Reivindicación 45 o 46 que se conjuga a un agente citotóxico. 49. La molécula orgánica de la Reivindicación 48, en donde el agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas nucleolxticas . 50. La molécula orgánica de la Reivindicación 48, en donde el agente citotóxico es una toxina. 51. La molécula orgánica de la Reivindicación 50, en donde la toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina. 52. La molécula orgánica de la Reivindicación 50, en donde la toxina es un maytansinoide. - - 53. La molécula orgánica de la Reivindicación 45 o 46 que induce la inactivación de la célula a la cual se enlaza . 54. La molécula orgánica de la Reivindicación 45 o 46 que se encuentra marcada de manera detectable. 55. Una composición de material que comprende: (a) el polipéptido de la Reivindicación 11; (b) el polipéptido de la Reivindicación 12 ; (c) el polipéptido quimérico de la Reivindicación 13 ; (d) el anticuerpo de la Reivindicación 15; (e) el anticuerpo de la Reivindicación 16; (f) el oligopéptido de la Reivindicación 35; (g) el oligopéptido de la Reivindicación 36; (h) la molécula orgánica de enlace TAT de la Reivindicación 45; o (i) la molécula orgánica de enlace TAT de la Reivindicación 46; en combinación con un vehículo. 56. La composición de material de la Reivindicación 55, en donde dicho vehículo es un vehículo farmacéuticamente aceptable . 57. Un artículo de fabricación que comprende: (a) un contenedor; y (b) la composición de material de la Reivindicación 55 contenida dentro de dicho contenedor. - - 58. El artículo de fabricación de la Reivindicación 57 que comprende además una etiqueta fija a dicho contenedor, o un inserto de empaque incluido dentro de dicho contenedor, refiriéndose al uso de dicha composición de material para el tratamiento terapéutico, o la detección diagnóstica de un cáncer. 59. Un método para inhibir el crecimiento de una célula que expresa una proteina que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82- 158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) ; O (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos - - mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID N0S:1-81), comprendiendo dicho método poner en contacto dicha célula con un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica que se enlaza a dicha proteina, ocasionando en consecuencia el enlace de dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica a dicha proteína, la inhibición del crecimiento de dicha célula. 60. El método de la Reivindicación 59, en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo monoclonal . 61. El método de la Reivindicación 59, en donde dicho anticuerpo es un fragmento de anticuerpo. 62. El método de la Reivindicación 59, en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo quimérico o humanizado. 63. El método de la Reivindicación 59, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento. 64. El método de la Reivindicación 59, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente citotóxico. 65. El método de la Reivindicación 64, en donde dicho agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas nucleolíticas . 66. El método de la Reivindicación 64, en donde el agente citotóxico es una toxina. 67. El método de la Reivindicación 66, en donde la - - toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina. 68. El método de la Reivindicación 66, en donde la toxina es un maytansinoide. 69. El método de la Reivindicación 59 en donde dicho anticuerpo se produce en bacterias . 70. El método de la Reivindicación 59, en donde dicho anticuerpo se produce en células CHO. 71. El método de la Reivindicación 59, en donde dicha célula es una célula cancerosa. 72. El método de la reivindicación 71, en donde dicha célula cancerosa se expone además a tratamiento de radiación o a un agente quimioterapéutico . 73. El método de la Reivindicación 71, en donde dicha célula cancerosa se selecciona del grupo que consiste de una célula de cáncer de seno, una célula de cáncer colorrectal, una célula de cáncer pulmonar, una célula de cáncer ovárico, una célula de cáncer del sistema nervioso central, una célula de cáncer hepático, una célula de cáncer de vejiga, una célula de cáncer pancreático, una célula de cáncer cervical, una célula de melanoma y una célula de leucemia. 74. El método de la Reivindicación 71, en donde dicha proteína se expresa más abundantemente por dicha célula cancerosa comparada con una célula normal del mismo origen de - - tej ido . 75. El método de la Reivindicación 59 que ocasiona la inactivación de dicha célula. 76. El método de la Reivindicación 59, en donde dicha proteína tiene : (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82~158), con su secuencia de péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . - - 77. Un método para tratar terapéuticamente a un mamífero que tiene un tumor canceroso que comprende células que expresan una proteína que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID N0S:1-81), comprendiendo dicho método administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente efectiva de un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica que se enlaza a dicha proteína, tratando en consecuencia efectivamente a dicho - - mamífero . 78. El método de la Reivindicación 77 en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo monoclonal . 79. El método de la Reivindicación 77, en donde dicho anticuerpo es un fragmento de anticuerpo. 80. El método de la Reivindicación 77, en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo quimérico o humanizado. 81. El método de la Reivindicación 77, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento. 82. El método de la Reivindicación 77, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente citotóxico. 83. El método de la Reivindicación 82, en donde dicho agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas nucleolxticas . 84. El método de la Reivindicación 82, en donde el agente citotóxico es una toxina. 85. El método de la Reivindicación 84, en donde la toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina. 86. El método de la Reivindicación 84, en donde la toxina es un maytansinoide. 87. El método de la Reivindicación 77, en donde - - dicho anticuerpo se produce en bacterias . 88. El método de la Reivindicación 77, en donde dicho anticuerpo se produce en células CHO. 89. El método de la reivindicación 77, en donde dicho tumor se expone además a tratamiento de radiación o a un agente quimioterapeutico. 90. El método de la Reivindicación 77, en donde dicho tumor es un tumor de mama, un tumor colorrectal, un tumor pulmonar, un tumor ovárico, un tumor del sistema nervioso central, un tumor hepático, un tumor de vejiga, un tumor pancreático, o un tumor cervical. 91. El método de la Reivindicación 77, en donde dicha proteina se expresa más abundantemente por las células cancerosas de dicho tumor comparada con una célula normal del mismo origen de tejido. 92. El método de la Reivindicación 77, en donde dicha proteína tiene : (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82~158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158), con su secuencia de - - péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS.1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS:l-81) . 93. Un método para determinar la presencia de una proteina en una muestra que se sospecha que contiene dicha proteina, en donde dicha proteína tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID MOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82- 158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido - - mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS : 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS : 1-81) , comprendiendo dicho método exponer dicha muestra a un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica que se enlaza a dicha proteína y determinar el enlace de dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica a dicha proteína en dicha muestra, en donde el enlace del anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica a dicha proteína es indicativo de la presencia de dicha proteína en dicha muestra. 94. El método de la Reivindicación 93 , en donde dicha muestra comprende una célula que se sospecha que expresa dicha proteína . 95. El método de la Reivindicación 94 , en donde dicha célula es una célula cancerosa. 96. El método de la Reivindicación 93, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se marca de manera detectable. 97. El método de la Reivindicación 93 en donde dicha proteína tiene: - - (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82~158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , con su secuencia de péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 98. Un método para diagnosticar la presencia de un tumor en un mamífero, comprendiendo dicho método determinar el nivel de expresión de un gen que codifica para una proteína que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: - - (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extraceluíar del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82- 158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS : 1-81) ; O (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS:l-81), en una muestra de prueba de células de tejido obtenidas de dicho mamífero y en una muestra de control de células normales conocidas del mismo origen de tejido, en donde un mayor nivel de expresión de dicha proteína en la muestra de prueba, comparada con la muestra de control, es indicativo de la presencia de tumor en el mamífero del cual se obtuvo la muestra de prueba. 99. El método de la Reivindicación 98, en donde la - - etapa de determinación del nivel de expresión de un gen que codifica para dicha proteína comprende emplear un oligonucleótido en una hibridación in situ o en un análisis RT-PCR. 100. El método de la Reivindicación 98, en donde la etapa de determinación del nivel de expresión de un gen que codifica para dicha proteína comprende emplear un anticuerpo en un análisis de inmunohistoquímica o un inmunoanálisis Western. 101. El método de la Reivindicación 98, en donde dicha proteína tiene : (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de peptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su secuencia de peptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su secuencia de peptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la - - secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS.1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS.1-81) . 102. Un método para diagnosticar la presencia de un tumor en un mamífero, comprendiendo dicho método poner en contacto una muestra de prueba de células de tejido obtenidas de dicho mamífero con un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica que se enlaza a una proteína que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82 -158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID N0S:82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ - - ID NOS.1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleotidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS : 1-81) , y detectar la formación de un complejo entre dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica y dicha proteina en la muestra de prueba, en donde la formación de un comple o es indicativa de la presencia de un tumor en dicho mamífero. 103. El método de la Reivindicación 102, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se marca de manera detectable. 104. El método de la Reivindicación 102, en donde dicha muestra de prueba de células de tejido se obtiene de un individuo que se sospecha que tiene un tumor canceroso. 105. El método de la Reivindicación 102, en donde dicha proteína tiene: (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su secuencia de · péptidos de señal asociada; - - (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) ; o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 106. Un método para tratar o prevenir un trastorno celular proliferativo asociado con la expresión o la actividad incrementada de una proteína que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82- - - 158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID N0S:1-81), comprendiendo dicho método administrar a un sujeto que necesita tal tratamiento una cantidad efectiva de un antagonista de dicha proteina, tratando o previniendo en consecuencia efectivamente dicho trastorno celular proliferativo . 107. El método de la Reivindicación 106, en donde dicho trastorno celular proliferativo es cáncer. 108. El método de la Reivindicación 106, en donde dicho antagonista es un anticuerpo de polipéptido anti-TAT, un oligopéptido de enlace TAT, una molécula orgánica de enlace TAT o un oligonucleótido de anti-sentido. 109. Un método para enlazar un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica a una célula que expresa una proteina que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las - - Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleotidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleotidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID N0S:1-81), comprendiendo dicho método poner en contacto dicha célula con un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica que se enlaza a dicha proteína y permitir que ocurra el enlace del anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica a dicha proteína, enlazando en consecuencia dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica a dicha célula. 110. El método de la Reivindicación 109, en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo monoclonal . 111. El método de la Reivindicación 109, en donde dicho anticuerpo es un fragmento de anticuerpo. 112. El método de la Reivindicación 109, en donde - - dicho anticuerpo es un anticuerpo quimérico o humanizado. 113. El método de la Reivindicación 109, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento. 114. El método de la Reivindicación 109, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente citotóxico. 115. El método de la Reivindicación 114, en donde dicho agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas nucleolíticas . 116. El método de la Reivindicación 114, en donde el agente citotóxico es una toxina. 117. El método de la Reivindicación 116, en donde la toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina. 118. El método de la Reivindicación 116, en donde la toxina es un maytansinoide . 119. El método de la Reivindicación 109 en donde dicho anticuerpo se produce en bacterias . 120. El método de la Reivindicación 109, en donde dicho anticuerpo se produce en células CHO. 121. El método de la Reivindicación 109, en donde dicha célula es una célula cancerosa. 122. El método de la reivindicación 121, en donde - - dicha célula cancerosa se expone además a tratamiento de radiación o a un agente quimioterapéutico . 123. El método de la Reivindicación 121, en donde dicha célula cancerosa se selecciona del grupo que consiste de una célula de cáncer de seno, una célula de cáncer colorrectal, una célula de cáncer pulmonar, una célula de cáncer ovárico, una célula de cáncer del sistema nervioso central, una célula de cáncer hepático, una célula de cáncer de vejiga, una célula de cáncer pancreático, una célula de cáncer cervical, una célula de melanoma y una célula de leucemia. 124. El método de la Reivindicación 123, en donde dicha protelna se expresa más abundantemente por dicha célula cancerosa comparada con una célula normal del mismo origen de tejido. 125. El método de la Reivindicación 109 que ocasiona la inactivación de dicha célula. 126. El uso de un ácido nucleico como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 5 o 30 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer. 127. El uso de un ácido nucleico como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 5 o 30 en la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 128. El uso de un ácido nucleico como se reivindica - - en cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 5 o 30 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo . 129. El uso de un vector de expresión como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 6, 7 o 31 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer. 130. El uso de un vector de expresión como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 6, 7 o 31 en la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 131. El uso de un vector de expresión como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 6, 7 o 31 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo. 132. El uso de una célula huésped como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 8, 9, 32 o 33 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer. 133. El uso de una célula huésped como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 8, 9, 32 o 33 en la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 134. El uso de una célula huésped como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 8, 9, 32 o 33 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo . - - 135. El uso de un polipéptido como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 11 a 14 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer. 136. El uso de un polipéptido como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 11 a 14 en la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 137. El uso de un polipéptido como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 11 a 14 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo . 138. El uso de un anticuerpo como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 15 a 29 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer. 139. El uso de un anticuerpo como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 15 a 29 en la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 140. El uso de un anticuerpo como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 15 a 29 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo . 141. El uso de un oligopéptido como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 35 a 44 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico - - o la detección diagnóstica de un cáncer. 142. El uso de un oligopéptido como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 35 a 44 en la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 143. El uso de un oligopéptido como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 35 a 44 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo. 14 . El uso de una molécula orgánica de enlace TAT como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 45 a 54 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer. 145. El uso de una molécula orgánica de enlace TAT como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 45 a 54 en la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 146. El uso de una molécula orgánica de enlace TAT como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 45 a 54 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo. 147. El uso de una composición de material como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 55 o 56 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer. 148. El uso de una composición de material como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 55 o 56 en - - la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 149. El uso de una composición de material como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 55 o 56 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo . 150. El uso de un artículo de fabricación como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 57 o 58 en la preparación de un medicamento para el tratamiento terapéutico o la detección diagnóstica de un cáncer. 151. El uso de un artículo de fabricación como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 57 o 58 en la preparación de un medicamento para tratar un tumor. 152. El uso de un artículo de fabricación como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 57 o 58 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno celular proliferativo . 153. Un método para inhibir el crecimiento de una célula, en donde el crecimiento de dicha célula depende al menos en parte de un efecto de potenciación del crecimiento de una proteína que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido - - de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleotidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) ; O (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleotidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS.1-81), comprendiendo dicho método poner en contacto dicha proteína con un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica que se enlaza a dicha proteína, inhibiendo en consecuencia el crecimiento de dicha célula . 154. El método de la Reivindicación 153, en donde dicha célula es una célula cancerosa. 155. El método de la Reivindicación 153, en donde dicha proteína se expresa por dicha célula. 156. El método de la Reivindicación 153, en donde el enlace de dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica a dicha proteína antagoniza la actividad de potenciación del crecimiento de dicha proteína. - - 157. El método de la Reivindicación 153, en donde el enlace de dicho anticuerpo, oligopeptido o molécula orgánica a dicha proteína induce la inactivación de dicha célula . 158. El método de la Reivindicación 153, en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo monoclonal . 159. El método de la Reivindicación 153, en donde dicho anticuerpo es un fragmento de anticuerpo. 160. El método de la Reivindicación 153, en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo quimérico o humanizado. 161. El método de la Reivindicación 153, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento. 162. El método de la Reivindicación 153, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente citotóxico. 163. El método de la Reivindicación 162, en donde dicho agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas nucleolíticas . 164. El método de la Reivindicación 162, en donde el agente citotóxico es una toxina. 165. El método de la Reivindicación 164, en donde la toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina. - - 166. El método de la Reivindicación 164, en donde la toxina es un maytansinoide . 167. El método de la Reivindicación 153 en donde dicho anticuerpo se produce en bacterias. 168. El método de la Reivindicación 153, en donde dicho anticuerpo se produce en células CHO. 169. El método de la Reivindicación 153, en donde dicha protexna tiene: (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su secuencia de péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada,- (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la - - región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleotidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS :1-81) . 170. Un método para tratar terapéuticamente un tumor en un mamífero, en donde el crecimiento de dicho tumor depende al menos en parte de un efecto de potenciación del crecimiento de una proteína que tiene al menos el 80% de identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) .el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82- 158) , con su péptido de señal asociado; (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , que carece de su péptido de señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleotidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleotidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81), - - comprendiendo dicho método poner en contacto dicha proteina con un anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica que se enlaza a dicha proteína, tratando en consecuencia efectivamente dicho tumor. 171. El método de la Reivindicación 170, en donde dicha proteína se expresa por las células de dicho tumor. 172. El método de la Reivindicación 170, en donde el enlace de dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica a dicha proteína antagoniza la actividad de potenciación del crecimiento celular de dicha proteína. 173. El método de la Reivindicación 170, en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo monoclonal . 174. El método de la Reivindicación 170, en donde dicho anticuerpo es un fragmento de anticuerpo. 175. El método de la Reivindicación 170, en donde dicho anticuerpo es un anticuerpo quimérico o humanizado. 176. El método de la Reivindicación 170, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento. 177. El método de la Reivindicación 170, en donde dicho anticuerpo, oligopéptido o molécula orgánica se conjuga a un agente citotóxico. 178. El método de la Reivindicación 177, en donde dicho agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas - - nucleollticas . 179. El método de la Reivindicación 177, en donde el agente citotóxico es una toxina. 180. El método de la Reivindicación 179, en donde la toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina . 181. El método de la Reivindicación 179, en donde la toxina es un maytansinoide. 182. El método de la Reivindicación 170 en' donde dicho anticuerpo se produce en bacterias . 183. El método de la Reivindicación 170, en donde dicho anticuerpo se produce en células CHO. 184. El método de la Reivindicación 170, en donde dicha proteína tiene: (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), con su secuencia de péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las - - Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS:l-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS:l-81) . Serán evidentes aún modalidades adicionales de la presente invención para el técnico experto al leer la presente especificación. BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS DIBUJOS La Figura 1 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:l) de un ADNc de TAT306, en donde la SEQ ID NO:l es un clon designado en la presente como "DNA103367" . La Figura 2 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 2) de un ADNc de TAT307, en donde la SEQ ID NO: 2 es un clon designado en la presente como "DNA108628" . La Figura 3 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 3) de un ADNc de TAT308, en donde la SEQ ID NO: 3 es un clon designado en la presente como "DNA108720". La Figura 4 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:4) de un ADNc de TAT309, en donde la SEQ ID NO: 4 es un clon designado en la presente como "DNA111260" .
- - La Figura 5 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID N0:5) de un ADNc de TAT310, en donde la SEQ ID N0:5 s un clon designado en la presente como ,lDNA150051" . La Figura 6 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 6) de un ADNc de TAT311, en donde la SEQ ID NO: 6 s un clon designado en la presente como "DNA150576" . La Figura 7 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 7) de un ADNc de TAT312, en donde la SEQ ID NO: 7 s un clon designado en la presente como "DNA150S55" . La Figura 8 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 8) de un ADNc de TAT313, en donde la SEQ ID NO: 8 s un clon designado en la presente como "DNA151242" . La Figura 9 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 9) de un ADNc de TAT314, en donde la SEQ ID NO: 9 es un clon designado en la presente como "DNA151475" . La Figura 10 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 10) de un ADNc de TAT315, en donde la SEQ ID NO: 10 es un clon designado en la presente como "DNA170028" . La Figura 11 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 11) de un ADNc de TAT316, en donde la SEQ ID NO: 11 es un clon designado en la presente como "DNA170036". La Figura 12 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 12) de un ADNc de TAT317, en donde la SEQ ID NO:12 es un clon designado en la presente como "DNA226549" . La Figura 13 muestra una secuencia de nucleótidos - - (SEQ ID NO: 13) de un ADNc de TAT318, en donde la SEQ ID N0:13 es un clon designado en la presente como "DNA193850". La Figura 14 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 14) de un ADNc de TAT319, en donde la SEQ ID NO: 14 es un clon designado en la presente como "DNA194607" . La Figura 15 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 15) de un ADNc de TAT320, en donde la SEQ ID N0:15 es un clon designado en la presente como "DNA196615" . La Figura 16 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 16) de un ADNc de TAT321, en donde la SEQ ID NO: 16 es un clon designado en la presente como "DNA199062" . Las Figuras 17A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 17) de un ADNc de TAT322, en donde la SEQ ID NO: 17 es un clon designado en la presente como "DNA220776". La Figura 18 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 18) de un ADNc de TAT323, en donde la SEQ ID NO: 18 es un clon designado en la presente como "DNA254783" . La Figura 19 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 19) de un ADNc de TAT324, en donde la SEQ ID NO : 19 es un clon designado en la presente como nDNA220980" . La Figura 20 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 20) de un ADNc de TAT325, en donde la SEQ ID NO:20 es un clon designado en la presente como DNA254898" . La Figura 21 muestra una secuencia de nucleótidos - - (SEQ ID NO: 21) de un ADNc de TAT326, en donde la SEQ ID NO: 21 s un clon designado en la presente como ¾DNA256257" . La Figura 22 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:22) de un ADNc de TAT327, en donde la SEQ ID NO:22 s un clon designado en la presente como ,¾DNA222801" . La Figura 23 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO : 23) de un ADNc de TAT328, en donde la SEQ ID NO -.23 s un clon designado en la presente como "DNA225388" . La Figura 24 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 24) de un ADNc de TAT329, en donde la SEQ ID NO: 24 s un clon designado en la presente como "DNA226421" . La Figura 25 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:25) de un ADNc de TAT330, en donde la SEQ ID NO:25 s un clon designado en la presente como "DNA228521" . La Figura 26 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:26) de un ADNc de TAT331, en donde la SEQ ID NO:26 s un clon designado en la presente como "DNA233286" . La Figura 27 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 27) de un ADNc de TAT332, en donde la SEQ ID NO: 27 es un clon designado en la presente como "DNA45493". La Figura 28 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 28) de un ADNc de TAT333, en donde la SEQ ID NO: 28 es un clon designado en la presente como "DNA59608" . La Figura 29 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 29) de un ADNc de TAT334, en donde la SEQ ID NO: 29 - - s un clon designado en la presente, como "DNA62872" . La Figura 30 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:30) de un ADNc de TAT335, en donde la SEQ ID NO:30 s un clon designado en la presente como "DNA76533" . La Figura 31 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID ?G0.31) de un ADNc de TAT336, en donde la SEQ ID NO: 31 s un clon designado en la presente como "DNA84932" . La Figura 32 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:32) de un ADNc de TAT337, en donde la SEQ ID NO:32 s un clon designado en la presente como "DNA88045" . La Figura 33 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 33) de un ADNc de TAT338, en donde la SEQ ID NO: 33 s un clon designado en la presente como "DNA88232" . La Figura 34 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 34) de un ADNc de TAT339, en donde la SEQ ID NO: 34 s un clon designado en la presente como "DNA88237" . La Figura 35 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 35) de un ADNc de TAT340, en donde la SEQ ID NO: 35 s un clon designado en la presente como "DNA88334" . La Figura 36 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:36) de un ADNc de TAT341, en donde la SEQ ID NO:36 s un clon designado en la presente como ?,???88411" . La Figura 37 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:37) de un ADNc de TAT342, en donde la SEQ ID NO:37 s un clon designado en la presente como "DNA88431" .
- - La Figura 38 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:38) de un ADNc de TAT343, en donde la SEQ ID NO-.38 es un clon designado en la presente como "DNA261046" . La Figura 39 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO-.39) de un ADNc de TAT344, en donde la SEQ ID NO:39 es un clon designado en la presente como "DNA182432" . La Figura 40 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 0) de un ADNc de TAT3 5, en donde la SEQ ID NO: 40 es un clon designado en la presente como nDNA194036" . La Figura 41 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:41) de un ADNc de TAT346, en donde la SEQ ID NO:41 es un clon designado en la presente como "DNA225731" . La Figura 42 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 42) de un ADNc de TAT348, en donde la SEQ ID NO: 42 es un clon designado en la presente como "DNA227996" . La Figura 43 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 43) de un ADNc de TAT353, en donde la SEQ ID NO: 43 es un clon designado en la presente como "DNA304652". Las Figuras 44A-C muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 44) de un ADNc de TAT354, en donde la SEQ ID NO: 44 es un clon designado en la presente como "DNA304766" . La Figura 45 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 5) de un ADNc de TAT355, en donde la SEQ ID NO: 5 es un clon designado en la presente como "DNA304767".
- - La Figura 46 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:46) de un ADNc de TAT356, en donde la SEQ ID NO: 6 es un clon designado en la presente como "DNA136821" . La Figura 47 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 47) de un ADNc de TAT357, en donde la SEQ ID NO: 47 es un clon designado en la presente como "DNA254851" . La Figura 48 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 48) de un ADNc de TAT358, en donde la SEQ ID NO: 48 es un clon designado en la presente como ¾DNA47361" . Las Figuras 49A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 49) de un ADNc de TAT359, en donde la SEQ ID NO: 49 es un clon designado en la presente como "DNA304987" . La Figura 50 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 50) de un ADNc de TAT360, en donde la SEQ ID NO: 50 es un clon designado en la presente como "DNA39975" . La Figura 51 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 51) de un ADNc de TAT361, en donde la SEQ ID NO: 51 es un clon designado en la presente como "DNA39979" . La Figura 52 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 52) de un ADNc de TAT362, en donde la SEQ ID NO: 52 es un clon designado en la presente como "DNA40594" . La Figura 53 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:53) de un ADNc de TAT363, en donde la SEQ ID NO:53 es un clon designado en la presente como "DNA336539" .
- - La Figura 54 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 54) de un ADNc de TAT364, en donde la SEQ ID NO: 54 es un clon designado en la presente como "DNA225930" . Las Figuras 55A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 55) de un ADNc de TAT365, en donde la SEQ ID NO: 55 es un clon designado en la presente como "DNA194909" . La Figura 56 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 56) de un ADNc de TAT366, en donde la SEQ ID NO: 56 es un clon designado en la presente como "DNA271250" . La Figura 57 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 57) de un ADNc de TAT362, en donde la SEQ ID NO: 57 es un clon designado en la presente como "DNA210128" . La Figura 58 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 58) de un ADNc de TAT368, en donde la SEQ ID NO: 58 es un clon designado en la presente como "DNA257955" . La Figura 59 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 59) de un ADNc de TAT369, en donde la SEQ ID NO: 59 es un clon designado en la presente como "DNA266520". La Figura 60 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:60) de un ADNc de TAT370, en donde la SEQ ID NO:60 es un clon designado en la presente como "DNA327261" . La Figura 61 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 61) de un ADNc de TAT371, en donde la SEQ ID NO: 61 es un clon designado en la presente como "DNA327295" .
- - La Figura 62 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 62) de un ADNc de TAT372, en donde la SEQ ID NO: 62 s un clon designado en la presente como "DNA225786" . La Figura 63 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 63) de un ADNc de TAT380, en donde la SEQ ID NO: 63 s un clon designado en la presente como "DNA226374" . La Figura 64 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 64) de un ADNc de TAT381, en donde la SEQ ID NO: 64 s un clon designado én la presente como "DNA255788" . La Figura 65 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:65) de un ADNc de TAT382, en donde la SEQ ID NO:65 s un clon designado en la presente como ,¾DNA327296" . La Figura 66 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 66) de un ADNc de TAT383, en donde la SEQ ID NO:66 s un clon designado en la presente como "DNA96970" . La Figura 67 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 67) de un ADNc de TAT384, en donde la SEQ ID NO: 67 es un clon designado en la presente como "DNA225790" . La Figura 68 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO:68) de un ADNc de TAT385, en donde la SEQ ID NO:68 es un clon designado en la presente como "DNA92958" . La Figura 69 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 69) de un ADNc de TAT386, en donde la SEQ ID NO: 69 s un clon designado en la presente como "DNA257716" . La Figura 70 muestra una secuencia de nucleótidos - - (SEQ ID NO:70) de un ADNc de ???387, en donde la SEQ ID NO: 70 es un clon designado en la presente como "DNA226862" . Las Figuras 71A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 71) de un ADNc de TAT388, en donde la SEQ ID NO: 71 es un clon designado en la presente como "DNA331165" . Las Figuras 72A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 72) de un ADNc de TAT389, en donde la SEQ ID NO: 72 es un clon designado en la presente como "DNA331167" . La Figura 73 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 73) de un ADNc de TAT390, en donde la SEQ ID NO: 73 es un clon designado en la presente como ""DNA331173" . Las Figuras 74A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 74) de un ADNc de TAT391, en donde la SEQ ID NO: 74 es un clon designado en la presente como "DNA331171" . Las Figuras 75A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 75) de un ADNc de TAT392, en donde la SEQ ID NO: 75 es un clon designado en la presente como XVDNA226266" . La Figura 76 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 76) de un ADNc de TAT396, en donde la SEQ ID NO: 76 es un clon designado en la presente como "DNA125753" . La Figura 77 muestra una secuencia de nucleótidos - - (SEQ ID NO: 77) de un ADNc de TAT397, en donde la SEQ ID NO: 77 es un clon designado en la presente como "DNA199793" . Las Figuras 78A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 78) de un ADNc de TAT398, en donde la SEQ ID NO: 78 es un clon designado en la presente como "DNA210647" . Las Figuras 79A-B muestran una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 79) de un ADNc de TAT427, en donde la SEQ ID NO: 79 es un clon designado en la presente como "DNA332801" . La Figura 80 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 80) de un ADNc de TAT399, en donde la SEQ ID NO:80 es un clon designado en la presente como "DNA226884" . La Figura 81 muestra una secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO: 81) de un ADNc de TAT423, en donde la SEQ ID NO: 81 es un clon designado en la presente como ,VDNA335916" . La Figura 82 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO:82) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO : 1 mostrada en la Figura 1. La Figura 83 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 83) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 3 mostrada en la Figura 3. La Figura 84 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 84) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO:4 mostrada en la Figura 4.
- - La Figura 85 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 85) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 5 mostrada en la Figura 5. La Figura 86 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 86) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 6 mostrada en la Figura 6. La Figura 87 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 87) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 7 mostrada en la Figura 7. La Figura 88 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 88) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 8 mostrada en la Figura 8. La Figura 89 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 89) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 9 mostrada en la Figura 9. La Figura 90 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 90) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 10 mostrada en la Figura 10. La Figura 91 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 91) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 11 mostrada en la Figura 11. La Figura 92 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 92) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 12 mostrada en la Figura 12. La Figura 93 muestra la secuencia de aminoácidos - - (SEQ ID NO: 93) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 13 mostrada en la Figura 13. La Figura 94 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 94) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 14 mostrada en la Figura 14. La Figura 95 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 95) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 15 mostrada en la Figura 15. La Figura 96 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 96) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 16 mostrada en la Figura 16. La Figura 97 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 97) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 17 mostrada en las Figuras 17A-B. La Figura 98 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 98) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 18 mostrada en la Figura 18. La Figura 99 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 99) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 19 mostrada en la Figura 19. La Figura 100 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 100) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 20 mostrada en la Figura 20. La Figura 101 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 101) derivada de la secuencia de codificación de - - la SEQ ID NO: 21 mostrada en la Figura 21. La Figura 102 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 102) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 22 mostrada en la Figura 22. La Figura 103 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 103) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 23 mostrada en la Figura 23. La Figura 104 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 104) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 24 mostrada en la Figura 24. La Figura 105 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 105) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 25 mostrada en la Figura 25. La Figura 106 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 106) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 26 mostrada en la Figura 26. La Figura 107 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 107) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 27 mostrada en la Figura 27. La Figura 108 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 108) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 28 mostrada en la Figura 28. La Figura 109 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 109) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 29 mostrada en la Figura 29.
- - La Figura 110 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 110) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 30 mostrada en la Figura 30. La Figura 111 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 111) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO:31 mostrada en la Figura 31. La Figura 112 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 112) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 32 mostrada en la Figura 32. La Figura 113 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 113)- derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 33 mostrada en la Figura 33. La Figura 114 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 114) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO:34 mostrada en la Figura 34. La Figura 115 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 115) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 35 mostrada en la Figura 35. La Figura 116 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 116) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO:36 mostrada en la Figura 36. La Figura 117 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 117) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 37 mostrada en la Figura 37. La Figura 118 muestra la secuencia de aminoácidos - - (SEQ ID NO: 118) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 38 mostrada en la Figura 38. La Figura 119 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 119) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO:39 mostrada en la Figura 39. La Figura 120 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 120) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 0 mostrada en la Figura 40. La Figura 121 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 121) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 41 mostrada en la Figura 41. La Figura 122 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 122) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 2 mostrada en la Figura 42. La Figura 123 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 123) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO:43 mostrada en la Figura 43. La Figura 124 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 124) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 44 mostrada en la Figura 44. La Figura 125 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 125) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 45 mostrada en la Figura 45. La Figura 126 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 126) derivada de la secuencia de codificación de - - la SEQ ID NO: 6 mostrada en la Figura 46. La Figura 127 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 127) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 47 mostrada en la Figura 47. La Figura 128 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 128) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 49 mostrada en las Figuras 49A-B. La Figura 129 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 129) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 50 mostrada en la Figura 50. La Figura 130 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 130) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 51 mostrada en la Figura 51. La Figura 131 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 131) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 52 mostrada en la Figura 52. La Figura 132 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 132) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 53 mostrada en la Figura 53. La Figura 133 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO -.133) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 54 mostrada en la Figura 54. Las Figuras 134A-B muestran la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 134) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 55 mostrada en las Figuras 55A- - - B. La Figura 135 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 135) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 56 mostrada en la Figura 56. La Figura 136 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 136) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 57 mostrada en la Figura 57. La Figura 137 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 137) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 58 mostrada en la Figura 58. La Figura 138 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 138) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 59 mostrada en la Figura 59. La Figura 139 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 139) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 60 mostrada en la Figura 60. La Figura 140 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 140) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 62 mostrada en la Figura 62. La Figura 141 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 141) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 63 mostrada en la Figura 63. La Figura 142 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 142) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 64 mostrada en la Figura 64.
- - La Figura 143 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 143) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 65 mostrada en la Figura 65. La Figura 144 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO -.144) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 66 mostrada en la Figura 66. La Figura 145 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 145) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 67 mostrada en la Figura 67. La Figura 146 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 146) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO -.69 mostrada en la Figura 69. La Figura 147 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 147) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 70 mostrada en la Figura 70. La Figura 148 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 148) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 71 mostrada en la Figura 71A-B. La Figura 149 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 149) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 72 mostrada en la Figura 72A-B. La Figura 150 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 150) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 73 mostrada en la Figura 73. La Figura 151 muestra la secuencia de aminoácidos - - (SEQ ID NO: 151) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 74 mostrada en la Figura 74A-B. La Figura 152 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 152) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 75 mostrada en la Figura 75?-?. La Figura 153 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 153) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 76 mostrada en la Figura 76. La Figura 154 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 154) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 77 mostrada en la Figura 77. La Figura 155 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 155) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 78 mostrada en la Figura 78A-B. La Figura 156 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 156) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 79 mostrada en la Figura 79A-B. La Figura 157 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO: 157) derivada de la secuencia de codificación de la SEQ ID NO: 80 mostrada en la Figura 80. La Figura 158 muestra la secuencia de aminoácidos (SEQ ID NO:158) derivada de la secuencia de codificaciób de la SEQ ID NO: 81 mostrada en la Figura 81. DESCRIPCIÓN DETALLADA DE LAS MODALIDADES PREFERIDAS I. Definiciones - - Los términos "polipéptido TAT" y "TAT" como se utilizan en la presente y cuando se siguen inmediatamente por una designación numérica, se referieren a varios polipéptidos , en donde la designación completa (i.e., TAT/número) se refiere a las secuencias de polipéptido especificas como se describe en la presente. Los términos "polipéptido TAT/número" y "TAT/número" en donde el término "número" se proporciona como una designación numérica actual como se utiliza en la presente incluye polipéptidos de secuencia nativa, variantes de polipéptido y fragmentos de polipéptidos de secuencia nativa y variantes de polipéptido (que se definen adicionalmente en la presente) . Los polipéptidos TAT descritos en la presente pueden aislarse a partir de una variedad de fuentes, tales como a partir de tipos de tejido humano o a partir de otras fuentes o preparados mediante métodos recombinantes o sintéticos. El término "polipéptido TAT" se refiere a cada polipéptido individual TAT/número descrito en la presente. Todas las exposiciones en esta especificación que se refieren al "polipéptido TAT" se refieren a cada uno de los polipéptidos individualmente asi como en conjunto. Por ejemplo, las descripciones de preparación, purificación, derivación, formación de anticuerpos para o contra, formación de oligopéptidos de enlace TAT para o contra, formación de moléculas orgánicas de enlace TAT para o contra, - - administración, composiciones que contienen, el tratamiento de una enfermedad con, etc., pertenecen individualmente a cada polipéptido de la invención. El término "polipéptido TAT" también incluye las variantes de los polipéptidos TAT/número descritos en la presente. Un "polipéptido TAT de secuencia nativa" comprende un polipéptido que tiene la misma secuencia de aminoácidos que el polipéptido TAT corresponidente derivado de la naturaleza. Tales polipéptidos TAT de secuencia nativa pueden aislarse de la naturaleza o pueden producirse por medios recombinantes o sintéticos. El término "polipéptido TAT de secuencia nativa" incluye específicamente formas truncadas o secretadas que ocurren de manera natural del polipéptido TAT específico (e.g., una secuencia de domino extracelular) , formas de variante que ocurren de manera natural (e.g., formas alternativamente empalmadas) y variantes alélicas que ocurren de manera natural del polipéptido. En ciertas modalidades de la invención, los polipéptidos TAT de secuencia nativa descritos en la presente son polipéptidos de secuencia nativa maduros o de longitud total que comprenden las secuencias de aminoácidos de longitud total mostradas en las figuras acompañantes . Los codones de inicio y de terminación (si se indican) se muestran en negritas y subrayadas en las figuras. Los residuos de ácido nucleico indicados como UN" "X" en las - - figuras acompañantes son cualquier residuo de ácido nucleico. Sin embargo, aunque los polipéptidos TAT descritos en las figuras acompañantes se muestran que inician con residuos de metionina designados en la presente como posición 1 de aminoácido en las figuras, es concebible y posible que puedan emplearse otros residuos de metionina ubicados ya sea corriente arriba o corriente abajo a partir de la posición 1 de aminoácidos en las figuras como el residuo de aminoácido de inicio para los polipéptidos TAT. El "dominio extracelular" o "ECD" del polipéptido TAT se refiere a una forma del polipéptido TAT que se encuentra esencialmente libre de los dominios de transmembrana y citoplásmico . Comúnmente, un ECD de polipéptido TAT tendrá menos de 1% de tales dominios de transmembrana y/o citoplásmico y preferentemente, tendrá menos del 0.5% de tales dominios. Deberá entenderse que cualquier dominio de transmembrana identificado para los polipéptidos TAT de la presente invención se identifican acuerdo a los criterios rutinariamente empleados en la técnica para identificar ese tipo de dominio hidrofóbico. Los límites exactos de un dominio de transmembrana pueden variar pero más probablemente por no mas de aproximadamente 5 aminoácidos en ya sea el extremo del dominio como se identificó inicialmente en la presente. Por lo tanto opcionalmente un dominio extracelular de un polipéptido TAT - - puede contener desde aproximadamente 5 o menos aminoácidos en cualquier lado del límite del dominio de transmembrana/ dominio extracelular como se identifica en los Ejemplos o la especificación y tales polipéptidos se contemplan por la presente invención con o sin el polipéptido de señal asociado y el ácido nucleico que los codifican. La ubicación aproximada de los "péptidos de señal" de los diversos polipéptidos TAT descritos en la presente puede mostrarse en la presente especificación y/o las figuras acompañantes. Sin embargo, se observa, que el límite C-terminal de un péptido de señal puede variar, pero más probablemente por no más de aproximadamente 5 aminoácidos en cualquier lado del límite C-terminal del péptido de señal como se identificó inicialmente en la presente, en donde el límite C-terminal del péptido de señal puede identificarse de acuerdo a los criterios rutinarios empleados en la técnica para identificar ese tipo de elemento de secuencia de aminoácidos {e.g., Nielsen et al., Prot . Eng. 10:1-6 (1997) y von Heinje et al., Nucí. Acid. Res. 14:4683-4690 (1986)). Además, también debe reconocerse que, en algunos casos, el desdoblamiento de una secuencia de señal a partir de un polipéptido secretado no es totalmente uniforme, dando como resultado más de una especie secretada. Estos polipéptidos maduros, se contemplan por la presente invención en donde el péptido de señal se desdobla dentro de no mas de - - aproximadamente 5 aminoácidos en cualquier lado del límite C-terminal del péptido de señal como se identificó en la presente y los polinucleótidos que lo codifican. La "variante del polipéptido TAT" significa un polipéptido TAT, preferentemente un polipéptido TAT activo, como se define en la presente que tiene al menos aproximadamente 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con una secuencia de polipéptido TAT de secuencia nativa de longitud total como se describe en la presente, una secuencia de polipéptido TAT que carece del péptido de señal como se describe en la presente, un dominio extracelular de un polipéptido TAT, con o sin el péptido de señal, como se describe en la presente o cualquier otro fragmento de una secuencia de polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente (tal como la codificada por un ácido nucleico que representa solamente una porción de la secuencia de codificación completa para un polipéptido TAT de longitud total) . Tales variantes del polipéptido TAT incluyen, por ejemplo, los polipéptidos TAT en donde se agregan o suprimen uno o más residuos de aminoácidos, en la N- o C- terminal de la secuencia de aminoácidos natural de longitud total . Comúnmente, una variante del polipéptido TAT tendrá al menos 80% de identidad de secuencia de aminoácidos, alternativamente al menos aproximadamente 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, - - 97%, 98% o 99% de identidad de secuencia de aminoácidos para una secuencia de polipeptido TAT de secuencia nativa de longitud total como se describe en la presente, una secuencia de polipeptido TAT que carece del péptido de señal como se describe en la presente, un dominio extracelular de un polipéptido TAT, con o sin el péptido de señal, como se describe en la presente o cualquier otro fragmento específicamente definido de una secuencia de polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente. Comúnmente, los polipeptidos de variante TAT son de al menos aproximadamente 10 aminoácidos de longitud, alternativamente de al menos aproximadamente 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320, 330, 340, 350, 360, 370, 380, 390, 400, 410, 420, 430, 440, 450, 460, 470, 480, 490, 500, 510, 520, 530, 540, 550, 560, 570, 580, 590, 600 aminoácidos de longitud o más. Opcionalmente, los polipéptidos de variante TAT no tendrán más de una sustitución de aminoácidos conservadora en comparación a la secuencia de polipéptido TAT nativo, alternativamente no más de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 o l0 sustituciones de aminoácido conservadoras en comparación a la secuencia de polipéptido TAT nativo. El "porcentaje (%) de identidad de la secuencia de aminoácidos" con respecto a las secuencias de polipéptido TAT - - identificadas en la presente se define como el porcentaje de residuos de aminoácido en una secuencia candidato que son idénticos con los residuos de aminoácidos en la secuencia de polipéptido TAT específica, después de alinear las secuencias e introducir los espacios, si es necesario, para lograr el porcentaje máximo de identidad de secuencia y sin considerar cualquiera de las sustituciones conservadoras como parte de la identidad de secuencia. El alineamiento para los propósitos de determinar el porcentaje de la identidad de secuencia de aminoácidos puede lograrse en varias formas que se encuentran dentro de la experiencia en la técnica, por ejemplo, utilizando software de computadora públicamente disponible tal como software BLAST, BLAST-2, ALIGN o Megalign (DNASTAR) . Los expertos en la técnica pueden determinar los parámetros apropiados para medir el alineamiento, incluyendo cualquier algoritmo necesario para lograr el máximo alineamiento sobre la longitud completa de las secuencias que se comparan. Sin embargo, para propósitos de la presente, los valores del % de identidad de secuencia de aminoácidos se generan utilizando el programa de computadora de comparación de secuencia ALIGN-2, en donde el código de la fuente completa para el programa ALIGN-2 se proporciona en la Tabla 1 de abajo. El programa de computadora de comparación de secuencia ALIGN-2 se autorizó por de Genentech, Inc. y el código fuente mostrado en la Tabla 1 de abajo se registró con - - la documentación del usuario en la Oficina de Derechos de Autor de los E.U., Washington D.C., 20559, en donde se registró bajo el Registro de Derechos de Autor de E.U. No. TXU510087. El programa ALIGN-2 se encuentra públicamente disponible a través de Genentech, Inc., South San Francisco, California o puede recopilarse a partir del código fuente proporcionado en la Tabla 1 de abajo. El programa ALIGN-2 debe recopilarse para · utilizarse en un sistema de operación UNIX, preferentemente UNIX V4.0D digital. Todos los parámetros de comparación de secuencia se establecen por el programa ALIGN-2 y no varían. En situaciones en donde se emplea ALIGN-2 para las comparaciones de secuencia de aminoácidos, el % de identidad de secuencia de aminoácidos de una secuencia A de aminoácidos dada para, con o contra una secuencia B de aminoácidos dada (que puede expresarse alternativamente como una secuencia A de aminoácidos dada que tiene o comprende un cierto % de identidad de secuencia de aminoácidos para, con o contra una secuencia B de aminoácidos dada) se calcula como sigue: 100 veces la fracción X/Y en donde X es el número de residuos de aminoácido marcados como equivalencias idénticas mediante el programa ALIGN-2 de alineamiento de secuencia en ese alineamiento del programa de A y B y en donde Y es el número total de residuos de aminoácido en B. Se apreciará que en donde la longitud de la - - secuencia de aminoácidos A no es igual a la longitud de la secuencia de aminoácidos B, el % de identidad de secuencia de aminoácidos de A a B no será igual al % de identidad de secuencia de aminoácidos de B a A. Como ejemplos de los cálculos de % de identidad de secuencia de aminoácidos utilizando este método, las Tablas 2 y 3 demuestran cómo calcular el % de identidad de secuencia de aminoácidos de la secuencia de aminoácidos designada "Proteína de Comparación" para la secuencia de aminoácidos designada "TAT" , en donde "TAT" representa la secuencia de aminoácidos de un polipéptido TAT hipotético de interés, la "Proteina de Comparación" representa la secuencia de aminoácidos de un polipéptido contra el cual el polipéptido TAT de interés se compara y "X, "Y y "Z cada uno representa diferentes residuos de aminoácido hipotéticos. A menos que se establezca específicamente de otro modo, todos los % de los valores de identidad de secuencia de aminoácidos utilizados en la presente se obtienen como se describe en el párrafo inmediatamente precedente utilizando el programa de computadora ALIGN-2. El "polinucleótido de variante TAT" o la "secuencia de ácido nucleico de variante TAT" se refiere a una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido TAT, preferentemente un polipéptido TAT activo, como se define en la presente y que tiene al menos aproximadamente 80% de identidad de secuencia de ácido nucleico con una secuencia nucleótida que codifica una secuencia de polipéptido TAT de secuencia nativa de longitud total como se describe en la presente, una secuencia de polipéptido TAT de secuencia nativa de longitud total que carece del péptido de señal como se describe en la presente, un dominio extracelular de un polipéptido TAT, con o sin el péptido de señal, como se describe en la presente o cualquier otro fragmento de una secuencia de polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente (tal como la codificada por un ácido nucleico que representa solamente una porción de la secuencia de codificación completa para un polipéptido TAT de longitud total) . Comúnmente, un polinucleótido de variante TAT tendrá al menos aproximadamente 80% de identidad de secuencia de ácido nucleico, alternativamente al menos aproximadamente 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% o 99% de identidad de secuencia de ácido nucleico con una secuencia de ácido nucleico que codifica una secuencia de polipéptido TAT de secuencia nativa de longitud total como se describe en la presente, una secuencia de polipéptido TAT de secuencia nativa de longitud total que carece del péptido de señal como se describe en la presente, un dominio extracelular de un polipéptido TAT, con o sin la secuencia de señal, como se describe en la presente o cualquier otro fragmento de una secuencia de polipéptido - - TAT de longitud total como se describe en la presente. Las variantes no abarcan la secuencia nativas de nucleótidos. Comúnmente, los polipéptidos de variante TAT son de al menos aproximadamente 5 nucleótidos de longitud, alternativamente de al menos aproximadamente 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 , 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70 , 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320, 330, 340, 350, 360, 370, 380, 390, 400, 410, 420, 430, 440, 450, 460, 470, 480, 490, 500, 510, 520, 530, 540, 550, 560, 570, 580, 590, 600, 610, 620, 630, 640, 650, 660, 670, 680, 690, 700, 710, 720, 730, 740, 750, 760, 770, 780, 790, 800, 810, 820, 830, 840, 850, 860, 870, 880, 890, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990 o 1000 nucleótidos de longitud, en donde en este contexto el término waproximadamente" se refiere a la longitud de la secuencia de nucleótidos referida más o menos el 10% de esa longitud referida. El "porcentaje (%) de identidad de secuencia de ácido nucleico" con respecto a las secuencias de ácido nucleico de codificación TAT identificadas en la presente se define como el porcentaje de nucleótidos en una secuencia candidato que son idénticos con los nucleótidos en la secuencia de ácido nucleico TAT de interés, después de - - alinear las secuencias e introducir los espacios, si es necesario, para lograr el porcentaje máximo de identidad de secuencia. El alineamiento para los propósitos de determinar el porcentaje de la identidad de secuencia de ácido nucleico puede lograrse en varias formas que se encuentran dentro de la experiencia en la técnica, por ejemplo, utilizando software de computadora públicamente disponible tal como software BLAST, BLAST-2, ALIGN o Megalign (DNASTAR) . Sin embargo, para propósitos de la presente, el % de los valores de identidad de secuencia de ácido nucleico se genera utilizando el programa ALIGN-2 de computadora de comparación de secuencia, en donde el código fuente completo para el programa ALIGN-2 se proporciona en la Tabla 1 de abajo. El programa de computadora de comparación de secuencia ALIGN-2 se autorizó por Genentech, Inc. y el código fuente mostrado en la Tabla 1 de abajo se registró con la documentación del usuario en la Oficina de Derechos de Autor de los E.U., Washington D.C., 20559, en donde se registró bajo el Registro de Derechos de Autor de E.U. No. TXU510087. El programa ALIGN-2 se encuentra públicamente disponible a través de Genentech, Inc., South San Francisco, California o puede recopilarse a partir del código fuente proporcionado en la Tabla 1 de abajo. El programa ALIGN-2 debe recopilarse para el uso en un sistema de operación UNIX, preferentemente UNIX V4.0D digital. Todos los parámetros de comparación de secuencia se establecen por el programa ALIGN-2 y no varían. En situaciones en donde se emplea ALIGN-2 para las comparaciones de secuencia de ácido nucleico, el % de identidad de secuencia de ácido nucleico de una secuencia C de ácido nucleico dada para, con o contra una secuencia D de ácido nucleico dada (que puede expresarse alternativamente como una secuencia C de ácido nucleico dada que tiene o comprende un cierto % de identidad de secuencia de ácido nucleico para, con o contra una secuencia D de ácido nucleico dada) se calcula como sigue: 100 veces la fracción W/Z en donde W es el número de nucleótidos marcados como equivalencias idénticas por el programa ALIGN-2 de alineamiento de secuencia en ese alineamiento del programa de C y D y en donde Z es el número total de nucleótidos en D. Se apreciará que en donde la longitud de la secuencia de ácido nucleico C no es igual a la longitud de la secuencia de ácido nucleico D, el % de identidad de secuencia de ácido nucleico de C a D no será igual al % de identidad de secuencia de ácido nucleico de D a C. Como ejemplos de los cálculos de % de identidad de secuencia de ácido nucleico, las Tablas 4 y 5 demuestran cómo calcular el % de identidad de secuencia de ácido nucleico de la secuencia de ácido nucleico designada "ADN de Comparación" para la secuencia de ácido nucleico designada "TAT-ADN" , en donde "TAT-ADN" - - representa una secuencia de interés' hipotética del ácido nucleico que codifica TAT, el "ADN de Comparación" representa la secuencia de nucleótidos de una molécula de ácido nucleico contra el cual la molécula de ácido nucleico "TAT-ADN" de interés se compara y "N" , "L" y "V" cada uno representa diferentes nucleótidos hipotéticos. A menos que se establezca específicamente de otro modo, todos los % de los valores de identidad de secuencia de ácido nucleico utilizados en la presente se obtienen como se describe en el párrafo inmediatamente precedente utilizando el programa de computadora ALIGN-2. En otras modalidades, los polinucleótidos de la variante TAT son moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido TAT y que son capaces de hibridizar, preferentemente bajo hibridación y condiciones de lavado rigurosas, a las secuencias nucleótidas que codifican un polipéptido TAT de longitud total como se describe en la presente. Los polipéptidos de variante TAT pueden ser aquellos que se codifican por un polinucleótido de variante TA . El término "región de codificación de longitud total" cuando se utiliza en referencia a un ácido nucleico que codifica un polipéptido TAT se refiere a las secuencia de nucleótidos que codifica el polipéptido TAT de longitud total de la invención (que frecuentemente se muestra entre los codones de inicio y detención, inclusive del mismo, en las figuras acompañantes) . El término "región de codificación de longitud total" cuando se utiliza en referencia a un ácido nucleico depositado en la ATCC se refiere a la porción de codificación del polipéptido ??? del ADNc insertado dentro del vector depositado con la ATCC (que frecuentemente se muestra entre los codones de inicio y detención, inclusive del mismo, en las figuras acompañantes) . "Aislado" cuando se utiliza para describir los diversos polipéptidos TAT descritos en la presente, se refiere al polipéptido que se ha identificado y separado y/o recuperado de un componente de su ambiente natural . Los componentes contaminantes de su ambiente natural son materiales que pueden interferir típicamente con el diagnóstico o usos terapéuticos para el polipéptido y puede incluir enzimas, hormonas y otros solutos proteináceos o no proteináceos . En las modalidades preferidas, el polipéptido se purificará (1) a un grado suficiente para obtener al menos 15 residuos de la secuencia de aminoácidos N-terminal o interna mediante el uso de un secuencxador de copa giratorio o (2) hasta la homogeneidad mediante SDS-PAGE bajo condiciones sin reducción o de reducción utilizando azul de Coomassie o preferentemente, tintura de plata. El polipéptido aislado incluye el polipéptido in situ dentro de las células recombinantes ya que al menos un componente del - - ambiente natural del polipéptido TAT no estará presente. Sin embargo, comúnmente, el polipéptido aislado se preparará mediante al menos una etapa de purificación. Un ácido nucleico que codifica al polipéptido TAT "aislado" u otro ácido nucleico que codifica al polipéptido es una molécula de ácido 'nucleico que se identifica y separa a partir de al menos una molécula de ácido nucleico contaminante con al cual se asocia comúnmente en la fuente natural del ácido nucleico que codifica al polipéptido. Una molécula aislada de ácido nucleico que codifica al polipéptido es diferente en la forma o colocación en la cual se encuentra en la naturaleza. Por lo tanto, las moléculas aisladas de ácido nucleico que codifican al polipéptido se distinguen de la molécula de ácido nucleico que codifica al polipéptido especifico ya que existe en las células naturales. Sin embargo, una molécula de ácido nucleico que codifica al polipéptido aislado incluye moléculas de ácido nucleico que codifican al polipéptido contenidas en las células que comúnmente expresan el polipéptido en donde, por ejemplo, la molécula de ácido nucleico se encuentra en una ubicación cromosomal diferente al de las células naturales. El término "secuencias de control" se refiere a las secuencias de ADN necesarias para la expresión de una secuencia de codificación operablemente enlazada en un organismo huésped particular. Por ejemplo, las secuencias de - - control que son adecuadas para los procariotos, incluyen un promotor opcionalmente una secuencia operadora y un sitio de unión a ribosoma. Las células eucarióticas se conocen para utilizar promotores, señales de poliadenilación y mejoradores. El ácido nucleico se "enlaza operablemente" cuando se coloca en una relación funcional con otra secuencia de ácido nucleico. Por ejemplo, el ADN para una presecuencia o guía secretora se enlaza operablemente al ADN para un polipeptido si se expresa como una preproteína que participa en la secreción del polipeptido; un promotor o mej orador se enlaza operablemente a una secuencia de codificación si este afecta la transcripción de la secuencia; o un sitio de unión a ribosoma se enlaza operablemente a una secuencia de codificación si este se coloca a fin de facilitar la traducción. Generalmente, "enlazado operablemente" significa que las secuencias de ADN que se enlazan son contiguas y en el caso de una guia secretora, contiguas y en la fase de lectura. Sin embargo, los mejoradores no tienen que ser contiguos. El enlace se lleva a cabo mediante ligación en sitios de restricción convenientes . Si tales sitios no existen, se utilizan los adaptadores o enlazadores de oligonucleótidos sintéticos de acuerdo con la práctica convencional . La "rigurosidad" de las reacciones de hibridación - - se determina fácilmente por alguien de experiencia ordinaria en la técnica y generalmente es un cálculo empírico que depende de la longitud de la sonda, temperatura de lavado y concentración de sal . En general , las sondas más largas requieren temperaturas mayores para hibridarse adecuadamente, mientras que se necesitan sondas mas cortas a temperaturas inferiores . La hibridación generalmente depende de la capacidad del ADN desnaturalizado para re-hibridarse cuando los filamentos complementarios se encuentran presentes en un ambiente por debajo de su temperatura de fusión. Tanto más alto sea el grado de la homología deseada entre la sonda y la secuencia hibridable, más alta será la temperatura relativa que pueda utilizarse. Como resultado, las temperaturas relativas mayores tenderían a hacer mas rigurosas las condiciones de reacción, mientras que las temperaturas inferiores las hacen menores. Para detalles adicionales y explicación de la rigurosidad de las reacciones de hibridación, ver Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, (Protocolos Actuales en Biología Molecular) , Wiley Interscience Publishers, (1995) . Las "condiciones de rigurosidad" o "condiciones de alta rigurosidad" como se define en la presente pueden identificarse por aquellos que: (1) emplean baja rigurosidad iónica y alta temperatura para el lavado, por ejemplo de coluro de sodio 0.015 M/ citrato de sodio 0.0015 M/ dodecil - - sulfato de sodio 0.1% a 50°C; (2) emplean durante la hibridación un agente de desnaturalización, tal como formamida, por ejemplo, 50% (v/v) de formamida con 0.1% de albúmina de suero bovino/Ficoll al 0.1%/polivinilpirrolidona al 0.1%/amortiguador de fosfato de sodio 50 mM a pH 6.5 con cloruro de sodio 750 mM, citrato de sodio 75 mM a 42 °C; o (3) la hibridación durante la noche en una solución que emplea 50% de formamida, 5 x SSC (NaCl 0.75 M, citrato de sodio 0.075 M) , fosfato de sodio 50 mM (pH 6.8), pirofosfato de sodio al 1%, 5 x solución de Denhardt, ADN de esperma de salmón sonicado (50 µg/ml) , SDS al 0.1% y sulfato de dextran al 10% a 42 °C, con un lavado de 10 minutos a 42 °C en 0.2 x SSC (cloruro de sodio/citrato de sodio) y formamida al 50% a 55°C seguido por un lavado de alta rigurosidad de 10 minutos consistiendo de 0.1 x SSC que contiene EDTA a 55°C. Las "condiciones moderadamente rigurosas" pueden identificarse como se describe por Sambrook et al . , Molecular Cloning : A Laboratory Manual , (Clonación Molecular: un Manual de Laboratorio) , New York: Cold Spring Harbor Press, 1989 e incluye el uso de solución de lavado y condiciones de hibridación (e.=r. , temperatura, resistencia iónica y % de SDS) menos rigurosas que las descritas anteriormente. Un ejemplo de condiciones moderadamente rigurosas es la incubación durante la noche a 37°C en una solución que comprende: formamida al 20%, 5 x SSC (NaCl 150 mM, citrato de - - trisodio 15 m ) , fosfato de sodio 50 mM (pH 7.6), 5 x solución de Denhardt, sulfato de dextran al 10% y 20 mg/ml de ADN de esperma de salmón cortado desnaturalizado, seguido por el lavado de los filtros en 1 x SSC a aproximadamente 37-50 °C. El técnico experto reconocerá cómo ajustar la temperatura, la resistencia iónica, etc., a medida que sea necesario para ajustar los factores tal como la longitud de la sonda y lo similar. El término "epítope marcado" cuando se utiliza en la presente se refiere a un polipéptido quimérico que comprende un polipéptido TAT o anticuerpo anti-TAT fusionado a un "polipéptido marcador" . El polipéptido marcador tiene suficientes residuos para proporcionar un epitope contra el cual puede elaborarse un anticuerpo, encontrándose aún suficientemente corto de tal forma que no interfiere con la actividad del polipéptido al cual se fusiona. El polipéptido marcador preferentemente también es claramente único de manera que el anticuerpo no reacciona sustancialmente de manera cruzada con otros epítopes. Los polipéptidos marcadores adecuados generalmente tienen al menos seis residuos de aminoácido y usualmente entre aproximadamente 8 y 50 residuos de aminoácido (preferentemente, entre aproximadamente 10 y 20 residuos de aminoácido) . "Activo" o "actividad" para los propósitos de la presente se refiere a la(s) forma (s) de un polipéptido TAT el - - cual retiene una actividad biológica y/o inmunológica de un TAT nativo o que ocurre de manera natural, en donde la actividad "biológica" se refiere a una función biológica . (ya sea inhibidora o estimulatoria) causada por un TAT natural o que ocurre de manera natural diferente a la capacidad para inducir la producción de un anticuerpo contra un epítope antigénico poseído por un TAT natural o que ocurre de manera natural y una actividad "inmunológica" se refiere a la capacidad de inducir la producción de un anticuerpo contra un epítope antigénico poseído por un TAT natural o que ocurre de manera natural . El término "antagonista" se utiliza en el amplio sentido e incluye cualquier molécula que bloquea, inhibe o neutraliza parcial o completamente una actividad biológica de un polipéptido TAT nativo descrito en la presente. En una forma similar, el término "agonista" se utiliza en el más amplio sentido e incluye cualquier molécula que imita una actividad biológica de un polipéptido TAT nativo descrito en la presente. Las moléculas agonistas o antagonistas adecuadas específicamente incluyen anticuerpos o fragmentos de anticuerpos agonistas o antagonistas, fragmentos o variantes de secuencia de aminoácidos de polipéptidos TAT naturales, péptidos oligonucleótidos de antisentido, moléculas orgánicas pequeñas, etc. Los métodos para identificar agonistas o antagonistas de un polipéptido TAT - - pueden comprender poner en contacto un polipéptido TAT con una molécula agonista o antagonista candidato y medir un cambio detectable en una o más actividades biológicas normalmente asociadas con el polipéptido TAT. "Tratar" o "tratamiento" o "alivio" se refiere tanto al tratamiento terapéutico como a las medidas profilácticas o preventivas, en donde el objeto es evitar o retrasar (disminuir) la condición o trastorno patológico enfocado. Los que necesitan del tratamiento incluyen aquellos que aún se encuentran con el trastorno así como aquellos propensos de tener el trastorno o aquellos en quienes el trastorno se puede evitar. Un sujeto o mamífero se "trata" exitosamente para un cáncer que expresa el polipéptido TAT si, después de recibir una cantidad terapéutica de un anticuerpo anti-TAT oligopéptido de enlace TAT o molécula orgánica de enlace TAT de acuerdo con los métodos de la presente invención, el paciente muestra la reducción observable y/o medible en o la ausencia de uno o más de los siguientes : la reducción en el número de células cancerosas o la ausencia de las células cancerosas; la reducción en el tamaño del tumor; la inhibición (i.e., disminución hasta cierto grado y preferentemente la detención) de la infiltración de células cancerosas hacia los órganos periféricos incluyendo la difusión del cáncer en el tejido blando y hueso; la inhibición (i.e., disminución hasta - - cierto grado y preferentemente la detención) de la metástasis de tumor; la inhibición, hasta cierto grado, del crecimiento del tumor; y/o el alivio, hasta cierto grado de uno o más de los síntomas asociados con el cáncer específico; morbilidad y mortalidad reducida y mejoramiento en la calidad de vida. Hasta el grado en que el anticuerpo anti-TAT o el oligopéptido de enlace TAT puede evitar el crecimiento y/o la eliminación de las células cancerosas existentes, pueden ser citostáticos y/o citotóxicos. La reducción de estos signos o síntomas puede también sentirse por el paciente. Los ' parámetros anteriores para valorar el tratamiento exitoso y mejoramiento en la enfermedad son fácilmente medibles mediante procedimientos de rutina familiares para un médico. Para la terapia del cáncer, puede medirse la eficacia, por ejemplo, al valorar el tiempo de la progresión de la enfermedad (TTP) y/o determinar la tasa de respuesta (R ) . La metástasis puede determinarse mediante pruebas de estadificación y mediante escaneo del hueso y pruebas para el nivel de calcio y otras enzimas para determinar la difusión hacia el hueso. Los escaneos CT también pueden hacerse para buscar la difusión hacia la pelvis y nodos linfáticos en el área. Los rayos X de tórax y mediciones de los niveles de enzima del hígado por métodos conocidos se utilizan para buscar la metástasis hacia los pulmones e hígado respectivamente. Otros métodos de rutina - - para monitorear la enfermedad incluyen ultrasonografía transrectal (TRUS) y biopsia por inyección transrectal (TKMB) . Para el cáncer de vejiga, que es un cáncer más localizado, los métodos para determinar el progreso de la enfermedad incluyen la evaluación citológica urinaria mediante cistoscopia, el monitoreo de la presencia de sangre en la orina, visualización del tracto urotelial mediante sonografia o un pielograma intravenoso, tomografía computarizada (CT) e imagen de resonancia magnética (MRI) . La presencia de metástasis distante puede valorarse por el CT del abdomen, los rayos X de tórax o imagen de radionúclido del esqueleto. La administración "crónica" se refiere a la administración del (de los) agente (s) en un modo continuo como opuesto a un modo agudo, a fin de mantener el efecto terapéutico inicial (actividad) por un periodo extendido. La administración "intermitente" es el tratamiento que no se hace consecutivamente sin interrupción, sino más bien es de naturaleza cíclica. "Mamífero" para propósitos del tratamiento de, aliviar los síntomas de o el diagnóstico de un cáncer se refiere a cualquier animal clasificado como mamífero, incluyendo humanos, animales domésticos y de granja y animales de zoológico, de entretenimiento o mascotas, tales - - como perros, gatos, ganado, caballos ovejas, cerdos, cabras, conejos, etc. Preferentemente, el mamífero es humano. La administración "en combinación con" uno o más agentes terapéuticos adicionales incluye la administración simultánea (concurrente) y consecutiva en cualquier orden. Los "vehículos" como se utiliza en la presente incluyen vehículos, excipientes o estabilizadores farmacéuticamente aceptables que no son tóxicos para la célula o el mamífero que se está exponiendo a estos en las dosis y concentraciones empleadas. Con frecuencia el vehículo fisiológicamente aceptable es una solución acuosa amortiguada del pH. Ejemplos de vehículos fisiológicamente aceptables incluyen amortiguadores tales como fosfato, citrato y otros ácidos orgánicos; los antioxidantes incluyen ácido ascórbico; el polipéptido de bajo peso molecular (menos de aproximadamente 10 residuos) ; las proteínas, tales como albúmina de suero, gelatina o inmunoglobulinas; los polímeros hidrofilicos tales como polivinilpirrolidona; los aminoácidos tales como glicina, glutamina, asparagina, arginina o lisina; los monosacáridos, disacáridos y otros carbohidratos que incluyen glucosa, mañosa o dextrinas; agentes quelantes tales como EDTA; alcoholes de azúcar tales como manitol o sorbitol; contraiones que forman sales tales como sodio; y/o surfactantes no iónicos tales como TWEEN®, polietilen glicol (PEG) y PLU ONICS®.
- - Por "fase sólida" o "soporte sólido" se refiere a una matriz no acuosa a la cual un anticuerpo oligopéptido de enlace TAT o molécula orgánica de enlace TAT de la presente invención puede adherirse o unirse. Ejemplos de fases sólidas abarcados en la presente incluyen aquellas parcial o totalmente formadas de cristales (e.g., cristal poroso controlado), polisacáridos (e.g., agarosa) , poliacrilamidas, poliestireno, polivinil alcohol y siliconas. En ciertas modalidades, dependiendo del contexto, la fase sólida puede comprender la cavidad de una placa de ensayo; en otras es una columna de purificación [e.g. , una columna de cromatografía de afinidad) . Este término también incluye una fase sólida discontinua de partículas separadas, tal como aquella descrita en la Patente de E.U. No. 4,275,149. Un "liposoma" es una vesícula pequeña compuesta de varios tipos de llpidos, fosfolípidos y/o surfactantes que es útil para el suministro de una droga (tal como un polipéptido TAT, un anticuerpo del mismo o un oligopéptido de enlace TAT) a un mamífero. Los componentes del liposoma se ordenan comúnmente en una formación de bicapa similar al ordenamiento de lípidos de las membranas biológicas. Una molécula "pequeña" o molécula orgánica "pequeña" se define en la presente para tener un peso molecular por debajo de aproximadamente 500 Daltones. Una "cantidad efectiva" de un polipéptido, - - anticuerpo oligopéptido de enlace TAT, molécula orgánica de enlace TAT o un agonista o antagonista del mismo como se describe en la presente es una cantidad suficiente para llevar a cabo un propósito específicamente establecido. Una "cantidad efectiva" puede determinarse empíricamente y en una forma rutinaria, en relación con el propósito establecido. El término "cantidad terapéuticamente efectiva" se refiere a una cantidad de un anticuerpo, polipéptido oligopéptido de enlace TAT, molécula orgánica de enlace TAT u ' otra droga efectiva para "tratar" una enfermedad o trastorno en un sujeto o mamífero. En el caso del cáncer, la cantidad terapéuticamente efectiva de la droga puede reducir el número de células cancerosas; reducir el tamaño del tumor; inhibir (i.e., disminución hasta cierto grado y preferentemente la detención) de la infiltración de células cancerosas en los órganos periféricos; inhibir (i.e., disminución hasta cierto grado y preferentemente la detención) de la metástasis de tumor; inhibir, hasta cierto grado, el crecimiento del tumor; y/o el alivio hasta cierto grado, de uno o más de los síntomas asociados con el cáncer. Ver, la definición en la presente de "tratamiento" . Hasta el grado en que la droga pueda evitar el crecimiento y/o eliminar las células cancerosas existentes, puede ser citostática y/o citotóxica. Una "cantidad inhibidora del crecimiento" de un anticuerpo anti-TAT, polipéptido TAT oligopéptido de enlace - - TAT o molécula orgánica de enlace TAT es una cantidad capaz de inhibir el crecimiento de una célula, especialmente tumor, e.g.f célula cancerosa ya sea in vitro o in vivo. Una "cantidad inhibidora del crecimiento" de un anticuerpo anti-TAT, polipéptido TAT oligopéptido de enlace TAT o molécula orgánica de enlace TAT para propósitos de inhibir el crecimiento de la célula neoplásica puede determinarse empíricamente y en una forma rutinaria. Una "cantidad citotóxica" de un anticuerpo anti-TAT, polipéptido TAT oligopéptido de enlace TAT o molécula orgánica de enlace TAT es una cantidad capaz de provocar la destrucción de una célula, especialmente tumor, e.g., célula cancerosa ya sea in vitro o in vivo. Una "cantidad citotóxica" de un anticuerpo anti-TAT, polipéptido TAT oligopéptido de enlace TAT o molécula orgánica de enlace TAT para propósitos de inhibir el crecimiento de la célula neoplásica puede determinarse empíricamente y en una forma rutinaria. El término "anticuerpo" se utiliza en el más amplio sentido y específicamente cubre, por ejemplo, anticuerpos monoclonales anti-TAT únicos (incluyendo anticuerpos agonistas, antagonistas y neutralizantes) , composiciones de anticuerpo anti-TAT con especificidad poliepitópica, anticuerpos policlonales, anticuerpos anti-TAT de cadena única y fragmentos de anticuerpos anti-TAT (ver abajo) - - mientras que exhiban la actividad biológica o inmunológica deseada. El término "inmunoglobuli a" (Ig) se usa intercambiablemente con anticuerpo en la presente. Un "anticuerpo aislado" es uno que se ha identificado y separado y/o recuperado a partir de un componente de su ambiente natural . Los componentes contaminantes de su ambiente natural son materiales que pueden interferir con el diagnóstico o usos terapéuticos para el anticuerpo y puede incluir enzimas, hormonas y otros solutos proteináceos o no porteináceos . En modalidades preferidas, el anticuerpo se purificará (1) a más de 95% por peso de anticuerpo como se determinó por el método Lowry y más preferentemente más de 99% por peso (2) a un grado suficiente para obtener al menos 15 residuos de la secuencia de aminoácidos N-terminal o interna mediante el uso de un secuenciador de copa giratorio o (3) hasta la homogeidad mediante SDS-PAGE bajo condiciones de reducción o de no reducción utilizando azul de Coomassie o preferentemente, tintura de plata. El anticuerpo aislado incluye el anticuerpo in si tu dentro de las células recombinantes ya que al menos un componente del ambiente natural del anticuerpo no estará presente. Sin embargo, comúnmente, el anticuerpo aislado se preparará mediante al menos una etapa de purificación. La unidad básica de anticuerpo de 4 cadenas es una - - glicoproteína heterotetramétrica compuesta de dos cadenas ligeras (L) idénticas y dos cadenas pesadas (H) idénticas (un anticuerpo IgM consiste de 5 de las unidades básicas de heterotetrámero junto con un polipéptido adicional llamado cadena J y por lo tanto contiene 10 sitios de unión a antígeno, mientras que los anticuerpos IgA secretados pueden polimerizarse para formar ensamblajes polivalentes que comprenden 2-5 de las unidades básicas de 4 cadenas junto con la cadena J) . En el caso de IgGs, la unidad de 4 cadenas es generalmente de aproximadamente 150,000 daltones . Cada cadena L se enlaza a una cadena H mediante una unión covalente de disulfuro, mientras que las dos cadenas H se enlazan entre sí mediante una o más uniones de disulfuro dependiendo del isotipo de cadena H. Cada cadena H y L también tienen puentes de disulfuro de intracadena espaciados de forma regular. Cada cadena H tiene en la N-terminal, un dominio variable (VH) seguido por tres dominios constantes (CH) para cada una de las cadenas a y ? y cuatro dominios CH para los isotipos µ y e. Cada cadena L tiene en la N-terminal, un dominio variable (VL) seguido por un dominio constante (¾) en su otro extremo. La VL se alinea con la VH y la CL se alinea con el primer dominio constante' de la cadena pesada (CH1) . Los residuos de aminoácidos particulares se cree que forman una interferencia entre los dominios variables de cadena ligera y cadena pesada. El par - - de una VH y una VL juntas forman un sitio de unión a antígeno único. Para la estructura y propiedades de las diferentes clases de anticuerpos, ver e.g., Basic and Clinical Immunology (Inmunología Básica y Clínica) , 8a edición, Daniel P. Stites, Abba I. Terr y Tristram G. Parslow (eds.), Appleton & Lange, Norwalk, CT, 1994, página 71 y Capitulo 6. La cadena L de cualquier especie de vertebrado puede asignarse a uno o dos tipos claramente distintos, llamados kappa y lambda, en base a las secuencias de aminoácidos de sus dominios constantes . Dependiendo de la secuencia de aminoácidos del dominio constante de sus cadenas pesadas (CH) , las inmunoglobulinas pueden asignarse a diferentes clases de isotipos. Existen cinco clases de inmunoglobulinas: IgA, IgD, IgE, IgG e IgM, que tienen cadenas pesadas designadas , d, e, ? y µ respectivamente. Las clases ? y se dividen además en subclases en la base de diferencias relativamente pequeñas en la secuencia y función ¾/ e.g., los humanos expresan las siguientes subclases: IgGl, IgG2, IgG3, IgG4, IgAl e IgA2. El término "variable" se refiere al hecho de que ciertos segmentos de los dominios variables difieren extensamente en la secuencia entre los anticuerpos. El dominio V media el enlace a antígeno y define la especificidad de un anticuerpo particular para su antígeno particular. Sin embargo, la variabilidad no se distribuye - - uniformemente a través de la extensión de 110 aminoácidos de los dominios variables. En su lugar, las regiones V consisten de extensiones relativamente invariantes llamadas regiones de estructura (FRs) de 15-30 aminoácidos separados por regiones más cortas de extrema variabilidad llamadas "regiones hipervariables" que son cada una de 9-12 aminoácidos de largo. Los dominios variables de las cadenas naturales pesada y ligera cada uno comprende cuatro FRs, adoptando grandemente una configuración de lámina ß, conectada por tres regiones hipervariables, que forman circuitos de conexión y en algunos casos forman parte de la estructura de lámina ß. Las regiones hipervariables en cada cadena se sostienen juntas en proximidad cercana mediante las FRs y con las regiones hipervariables de la otra cadena contribuyen a la formación de los sitios de unión a antígeno de los anticuerpos (ver Kabat et al . , Sequences of Proteins of Immunological Interest , (Secuencias de Proteínas de Interés Inmunológico) , 5a Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD . (1991)). Los dominios constantes no se involucran directamente en el enlace a anticuerpo hacia un antígeno, pero exhiben varias funciones efectoras, tales como la participación del anticuerpo en el anticuerpo dependiente de la citotoxicidad celular (ADCC) . El término "región hipervariable" cuando se utiliza en la presente se refiere a los residuos de aminoácido de un - - anticuerpo que es responsable del enlace antígeno. La región hipervariable generalmente comprende residuos de aminoácido provenientes de una "región determinante de complementaridad" o "CDR" (e.g., alrededor de aproximadamente los residuos 24-34 (Ll) , 50-56 (L2) y 89-97 (L3) en la VL y alrededor de aproximadamente de 1-35 (Hl) , 50-65 (H2) y 95-102 (H3) en la VH; Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest (Secuencias de Proteínas de Interés Inmunológico) , 5a Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)) y/o aquellos residuos a partir de un circuito hipervariable" (e.g., residuos 26-32 (Ll) , 50-52 (L2) y 91-96 (L3) en la VL y 26-32 (Hl) , 53-55 (H2) y 96-101 (H3) en la VH; Chothia y Lesk J. Mol. Biol., 196:901-917 (1987) ) . El término "anticuerpo monoclonal" como se utiliza en la presente se refiere a un anticuerpo obtenido a partir de una población de anticuerpos sustancialmente homogéneos, i.e., los anticuerpos individuales que comprenden la población son idénticos excepto para mutaciones que ocurren posiblemente de manera natural que pueden presentarse en cantidades menores . Los anticuerpos monoclonales son altamente específicos, estando dirigidos contra un sitio antigénico único. Además, en contraste a las preparaciones del anticuerpo policlonal que incluye diferentes anticuerpos dirigidos contra diferentes determinantes (epítopes) , cada - - anticuerpo monoclonal se dirige contra un determinante único en el antígeno. En adición a su especificidad, los anticuerpos monoclonales son ventajosos en que pueden sintetizarse sin contaminarse por otros anticuerpos. No debe considerarse que el modificador "monoclonal" requiere la producción del anticuerpo por cualquier método particular. Por ejemplo, los anticuerpos monoclonales útiles en la presente invención pueden prepararse mediante la metodología de hibridoma descrita primero por Kohler et al . , Nature, 256:495 (1975) o puede hacerse utilizando métodos de ADN recombinantes en células bacteriales, animal eucariótico o planta (ver, e.g., la Patente de E.U. No. 4,816,567). Los "anticuerpos monoclonales" pueden aislarse también a partir de bibliotecas de anticuerpos de fago utilizando las técnicas descritas por ejemplo en Clackson et al., Nature, 352:624-628 (1991) y Marks et al., J. Mol. Biol . , 222:581-597 (1991). Los anticuerpos monoclonales en la presente incluyen anticuerpos "quiméricos" en los cuales una porción de la cadena pesada y/o ligera es idéntica u homologa a las secuencias correspondientes en anticuerpos derivados a partir de especies particulares o que pertenecen a una clase o subclase de anticuerpo particular, mientras que el resto de la(s) cadena (s) es idéntica u homologa a las secuencias correspondientes en anticuerpos derivados a partir de otras especies o que pertenece a otra clase o subclase de - - anticuerpo, asi como los fragmentos de tales anticuerpos, siempre que exhiban la actividad biológica deseada (ver la Patente de E.U. No. 4,816,567; y orrison et al., Proc . Nati . Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984)). Los anticuerpos quiméricos de interés en la presente incluyen anticuerpos "primatizados" que comprenden secuencias de unión a antígeno de dominio variable derivadas de un primate no humano (e.g.. Mono del Viejo Mundo, Simio, etc.) y secuencias de región constante humana. Un anticuerpo "intacto" es uno que comprende un sitio de unión a antígeno así como una CL y al menos dominios constante de cadena pesada, CH1, CH2 y CH3. Los dominios constantes pueden ser dominios constante de secuencia nativa (e.g., dominios constantes de secuencia nativa humana) o variantes de secuencia de aminoácidos de los mismos. Preferentemente, el anticuerpo intacto tiene una o más funciones efectoras . Los "fragmentos de anticuerpo" comprenden una porción de un anticuerpo intacto, preferentemente el enlace a antígeno o la región variable del anticuerpo intacto. Ejemplos de fragmentos de anticuerpo incluyen fragmentos Fab, Fab', F(ab' )2 y Fv; diabodies; anticuerpos lineales (ver la Patente de E.U. No. 5,641,870, Ejemplo 2; Zapata et al., Protein Eng. 8(10): 1057-1062 [1995]); moléculas de anticuerpo de cadena única; y anticuerpos multiespecíficos formados a partir de fragmentos de anticuerpo. La digestión de la papaina de los anticuerpos produce dos fragmentos idénticos de unión a antígeno, llamados fragmentos "Fab" y un fragmento residual "Fe" , una designación que refleja la capacidad para cristalizar fácilmente. El fragmento Fab consiste de una cadena L completa junto con el dominio de región variable de la cadena H (VH) y el primer dominio constante de una cadena pesada (CH1) . Cada fragmento Fab es monovalente con respecto al enlace a antígeno, i.e., tiene un solo sitio de unión a antigeno. El tratamiento de la pepsina de un anticuerpo produce un solo fragmento grande F(ab')2 que corresponde aproximadamente a dos fragmentos Fab de enlace de disulfuro que tienen actividad divalente de unión a antígeno y todavía es capáz del enlace cruzado al antígeno. Los fragmentos Fab' difieren de los fragmentos Fab en que tienen unos cuantos residuos adicionales en la terminación carboxi del dominio CH1 incluyendo una o más cisternas provenientes de la región de articulación del anticuerpo. Fab' -SH es la designación en la presente para Fab' en la cual el (los) residuo (s) de cisteína de los dominios constantes portan un grupo de tiol libre. Los fragmentos de anticuerpo F(ab')2 originalmente se producían como pares de los fragmentos Fab' que tienen cisternas de articulación entre ellos. También se conocen otros acoplamientos químicos de fragmentos de anticuerpo .
- - El fragmento Fe comprende las porciones de la terminal carboxi de ambas cadenas H sostenidas juntas por disulfuros. Las funciones efectoras de los anticuerpos se determinan por las secuencias en la región Fe, cuya región es también la parte reconocida por los receptores Fe (FcR) encontrada en ciertos tipos de células. "Fv" es el fragmento mínimo de anticuerpo que contiene un sitio de reconocimiento y de unión a antígeno completo. Este fragmento consiste de un dxmero de un dominio de región variable de una cadena pesada y/o una ligera en asociación estrecha no covalente. A partir de la dualidad funcional de estos dos dominios emanan seis circuitos hipervariables (3 circuitos cada uno a partir de la cadena H y L) que contribuyen a los residuos de aminoácidos para el enlace a antígeno y confieren el enlace a antígeno específicamente al anticuerpo. Sin embargo, aún un solo dominio variable (o la mitad de un Fv que comprende solamente tres CDRs específicos para un antígeno) tiene la capacidad de reconocer y unirse al antígeno, aunque a una afinidad inferior que el sitio de unión completo. El "Fv de cadena sencilla" también abreviado como "sFv" o "scFv" son fragmentos de anticuerpo que comprenden los dominios de anticuerpo VH y VL conectados en una cadena de polipéptido sencilla. Preferentemente, el polipéptido sFv además comprende un enlazador de polipéptido entre los - - dominios VH y VL que permite al sFv formar la estructura deseada para el enlace a antígeno. Para una revisión del sFv ver Pluckthun en The Pharmacology of Monoclonal Antibodies (La Farmacología de Anticuerpos onoclonales) vol . 113, Rosenburg and Moore eds . , Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994) ; Borrebaeck 1995, infra. El término "diabodies" se refiere a los fragmentos pequeños de anticuerpo preparados mediante la construcción de fragmentos sFv (ver párrafo anterior) con enlazadores cortos (aproximadamente de 5-10 residuos) entre los dominios VH y VL de tal manera que se logran los pares de la inter-cadena pero no de la intra-cadena de los dominios V, dando como resultado un fragmento bivalente, i.e.r un fragmento que tiene dos sitios de unión a antígeno. Los diabodies biespecíficos son heterodímeros de dos fragmentos sFv de "cruzamiento" en los cuales los dominios VH y VL de los dos anticuerpos se encuentran presentes en diferentes cadenas de polipéptido. Los diabodies se describen más completamente en, por ejemplo, la EP 404,097; WO 93/11161; y Hollinger et al., Proc . Nati. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993). Las formas "humanizadas" de anticuerpos no humanos (e.g. , roedores) son anticuerpos quiméricos que contienen secuencia mínima derivada a partir del anticuerpo no humano. Para la mayor parte, los anticuerpos humanizados son inmunoglobulinas humanas (anticuerpo receptor) cuyos residuos - - provenientes de una región hipervariable del receptor se reemplazan por residuos provenientes de una región hipervariable de una especie no humana (anticuerpo donador) tal como ratón, rata, conejo o primate no humano que tiene la especificidad, afinidad y capacidad del anticuerpo deseado. En algunos casos, los residuos de región de estructura (FR) de la inmunoglobulina humana se reemplazan por los residuos no humanos correspondientes. Además, los anticuerpos humanizados pueden comprender residuos que no se encuentran en el anticuerpo receptor o en el anticuerpo donador. Estas modificaciones se hacen para refinar adicionalmente el desempeño del anticuerpo. En general, el anticuerpo humanizado comprenderá sustancialmente todo de al menos uno y típicamente dos dominios variables, en los cuales todos o sustancialmente todos los circuitos hipervariables corresponden a aquellos de una inmunoglobulina no humana y todos o sustancialmente todos de los FRs son aquellos de una secuencia de inmunoglobulina humana. El anticuerpo humanizado opcionalmente también comprenderá al menos una porción de una región constante de inmunoglobulina (Fe) , típicamente la de una inmunoglobulina humana. Para detalles adicionales, ver Jones et al., Nature 321:522-525 (1986); Riechman et al., Nature 332:323-329 (1988); y Presta, Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992). Un "anticuerpo dependiente de la especie" e.g., un - - anticuerpo IgE anti-humano de mamífero es un anticuerpo que tiene una afinidad de unión mas fuerte para un antigeno proveniente de una primera especie de mamífero que la que tiene para un homólogo de ese antígeno proveniente de una segunda especie de mamífero. Normalmente, el anticuerpo dependiente de la especie "enlazado específicamente" a un antígeno humano (i.e., tiene un valor de afinidad de unión (Kd) de no más de aproximadamente 1 x 10"7 M, preferentemente no más de aproximadamente 1 x 10"8 y más preferentemente no más de aproximadamente 1 x 1CT9 M) pero tiene una afinidad de unión para un homólogo del antígeno proveniente de una segunda especie de mamífero no humano que es de al menos aproximadamente 50 veces o al menos aproximadamente 500 veces o al menos aproximadamente 1000 veces, más débil que su afinidad de unión para el antígeno humano. El anticuerpo dependiente de la especie puede ser de cualquiera de los diversos tipos de anticuerpos como se definió anteriormente, pero preferentemente es un anticuerpo humanizado o humano. Un "oligopéptido de enlace TAT" es un oligopéptido que se enlaza, preferentemente de manera específica, a un polipéptido TAT como se describe en la presente. Los oligopéptidos de enlace TAT pueden sintetizarse químicamente utilizando metodología de síntesis de oligopéptido conocida o ' pueden prepararse y purificarse utilizando tecnología recombinante . Los oligopéptidos de enlace TAT son usualmente - - de al menos aproximadamen e 5 aminoácidos de longitud, alternativamente de al menos aproximadamente de 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 aminoácidos de longitud o más, en donde tales oligopéptidos como se describe en la presente son capaces de unirse, preferentemente de manera especifica, a un polipéptido TAT. Los oligopéptidos de enlace TAT pueden identificarse sin experimentación excesiva utilizando técnicas bien conocidas. A este respecto, debe notarse que las técnicas para clasificar bibliotecas de oligopéptido para oligopéptidos que son capaces de unirse específicamente a un objetivo de polipéptido se conocen bien en la técnica (ver e.g., las Patentes de E.U. Nos. 5,556,762, 5,750,373, 4,708,871, 4,833,092, 5,223,409, 5,403,484, 5,571,689, 5 , 663,143; Las Publicaciones del PCT Nos. WO 84/03506 y la WO84/03564; Geysen et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 81:3998-4002 (1984); Geysen et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 82:178-182 (1985); Geysen et al., en Synt etic Peptides as Antigens (Péptidos Sintéticos como Antígenos) , 130-149 (1986); Geysen et al., J. Immunol. Meth., 102:259-274 (1987); Schoofs et al., J. Immunol, 140:611-616 (1988), Cwirla, S. E. et al., (1990) Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 87:6378; Lowman, H.B., et al., (1991) Biochemistry 30:10832; Clackson, T. et al., (1991) Nature, 352:624; Marks, J. D. et al., (1991), J. Mol. Biol., 222:581; Kang, A.S. et al . , (1991) Proc. Natl . Acad. Sci. USA 88:8363 y Smith G. P. (1991) Current . Opln. Biotechnol . , 2:668). Una "molécula orgánica de enlace TAT" es una molécula orgánica diferente a un oligopéptido o anticuerpo como se define en la presente que se enlaza, preferentemente de manera especifica, a un polipéptido TAT como se describe en la presente. Las moléculas orgánicas de enlace TAT pueden identificarse y sintetizarse químicamente utilizando metodología conocida (ver e.g., las Publicaciones del PCT Nos. WOOO/00823 y la WOOO/39585) . Las moléculas orgánicas de enlace TAT usualmente son menores a aproximadamente 2000 daltones de tamaño, alternativamente menores a aproximadamente 1500, 750, 500, 250 o 200 daltones de tamaño, en donde tales moléculas orgánicas que son capaces de enlazarse, preferentemente de manera específica, a un polipéptido TAT como se describe en la presente pueden identificarse sin experimentación excesiva utilizando técnicas bien conocidas. A este respecto, debe notarse que las técnicas para clasificar bibliotecas de moléculas orgánicas para moléculas que son capaces de enlazarse a un - - objetivo de polipéptido se conocen bien en la técnica (ver e.g., las Publicaciones del PCT Nos. WO00/00823 y la WOOO/39585) . Un anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica "que enlaza" un antígeno de interés, e.g., un objetivo de antígeno de polipéptido asociado a un tumor, es uno que se enlaza al antígeno con afinidad suficiente de tal forma que el anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica es útil como un agente de diagnóstico y/o terapéutico para enfocar una célula o tejido que expresa el antígeno y no reacciona significativamente de manera cruzada con otras proteínas . En tales modalidades, el grado de enlace del anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica a una proteína "no enfocada" será menor de aproximadamente 10% del enlace del anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica a su proteína objetivo particular como se determina por el análisis de selección de la célula activada por fluorescencia (FACS) o mediante radioinmunoprecipitación (RIA) . Con respecto al enlace de un anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica a una molécula objetivo, el término "enlace específico" o "específicamente enlazado a" o es "específico para" un polipéptido particular o un epítope en un objetivo de polipéptido particular se refiere al enlace que es mediblemente diferente de una interacción no específica. El enlace específico puede medirse, por ejemplo, al determinar - - el enlace de una molécula comparada con el enlace de una molécula control, que generalmente es una molécula de estructura similar que no tiene actividad de unión. Por ejemplo, el enlace especifico puede determinarse mediante la competencia con una molécula control que es similar al objetivo, por ejemplo, un exceso de objetivo no etiquetado. En este caso, el enlace específico se indica si el enlace del objetivo etiquetado a una sonda se inhibe competitivamente mediante el exceso del objetivo no etiquetado. El término "unión específica" o "se enlaza específicamente a" o es "específico para" un polipeptido particular o un epítope en un objetivo de polipéptido particular como se utiliza en la presente puede exhibirse, por ejemplo, mediante una molécula que tiene un Kd para el objetivo de al menos aproximadamente 104 M, alternativamente al menos aproximadamente 10'5 , alternati amente al menos aproximadamente 10"e M, alternativamente al menos aproximadamente lo"7 M, alternativamente al menos aproximadamente 10"8 M, alternativamente al menos aproximadamente io-9 M, alternativamente al menos aproximadamente 10-io , alternativamente al menos aproximadamente lo'11 , alternativamente al menosi aproximadamente 1012 M o mayor . En una modalidad, el término "enlace específico" se refiere al enlace en donde una molécula se enlaza a un polipéptido o epítope particular en un polipéptido particular sin enlazarse - - sustancialmente a cualquier otro polipéptido o epltope de polipéptido . Un anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica que "inhibe el crecimiento de las células de tumor que expresan un polipéptido TAT" o un anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica "inhibidora del crecimiento" es uno que da como resultado la inhibición del crecimiento medible de las células cancerosas que expresan o sobreexpresan al polipéptido TAT apropiado. El polipéptido TAT puede ser un polipéptido de transmembrana expresado en la superficie de una célula cancerosa o puede ser un polipéptido que se produce y secreta por una célula cancerosa. Los anticuerpos oligopéptidos u otras moléculas orgánicas anti-TAT inhibidores del crecimiento preferidos inhiben el crecimiento de las células de tumor que expresan TAT por más de 20%, preferentemente desde aproximadamente 20% hasta aproximadamente 50% y aún más preferentemente, por más de 50% {e.g., desde aproximadamente 50% hasta aproximadamente 100%) en comparación con el control apropiado, siendo el control típicamente células de tumor no tratadas con el anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica que se prueba. En una modalidad, la inhibición del crecimiento puede medirse a una concentración de anticuerpo de aproximadamente 0.1 hasta 30 µg/ml o aproximadamente 0.5 nM hasta 200 nM en un cultivo celular, en donde la inhibición del crecimiento se determina - - de 1-10 días después de la exposición de las células de tumor al anticuerpo . La inhibición del crecimiento de las células de tumor in vivo puede determinarse en varias formas tal como se describe en los Ejemplos Experimentales de la sección de abajo. El anticuerpo es inhibidor del crecimiento in vivo si la administración del anticuerpo anti-TAT a aproximadamente 1 µg/kg hasta aproximadamente 100 mg/kg de peso corporal da como resultado la reducción en el tamaño del tumor o la proliferación celular del tumor dentro de aproximadamente 5 días a 3 meses a partir de la primer administración del anticuerpo, preferentemente dentro de aproximadamente 5 hasta 30 días. Un anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica que "induce la apoptosis" es el que induce la inactivación celular programada como se determinó por el enlace de la anexina V, la fragmentación de ADN, disminución celular, dilatación del retículo endoplásmico, fragmentación celular y/o formación de vesículos de membrana (llamados cuerpos apoptoticos) . La célula usualmente es la que sobreexpresa un polipéptido TAT. Preferentemente la célula es una célula tumoral, e.g. , una célula de próstata, de mama ovario, estómago, endometrial, pulmón, riñon, colon, vejiga. Diversos métodos se encuentran disponibles para evaluar los eventos celulares asociados con la apoptosis. Por ejemplo, la transubicación de la fosfatidil serina (PS) puede medirse - - por el enlace de la anexina; la fragmentación del ADN puede evaluarse a través del escalonamiento de ADN; y la condensación nuclear/cromatina junto con la fragmentación de ADN puede evaluarse mediante cualquier incremento en las células hipodiploides . Preferentemente, el anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica que incluye apoptosis es la que da como resultado aproximadamente 2 hasta 50 veces, preferentemente de aproximadamente 5 hasta 50 veces y más preferentemente de aproximadamente 10 hasta 50 veces, la inducción del enlace de la anexina relacionada con la célula no tratada en un ensayo de enlace de anexina. Las "funciones efectoras" del anticuerpo se refieren a las actividades biológicas atribuibles a la región Fe (una región Fe de secuencia nativa o una región Fe variante de secuencia de aminoácidos) de un anticuerpo y varía con el isotipo del anticuerpo. Ejemplos de funciones efectoras del anticuerpo incluyen: el enlace Clq y citotoxicidad dependiente del complemento; enlace del receptor Fe; citotoxicidad mediada por la célula dependiente del anticuerpo (ADCC) ; fagocitosis; subregulación de los receptores de la superficie celular [e.g., receptor de la célula B) ; y la activación de las células B. La "citotoxicidad mediada por la célula dependiente del anticuerpo" o "ADCC" se refiere a una forma de citotoxicidad en la cual la Ig secretada enlazada en los - - receptores Fe (FcRs) presentes en ciertas células citotóxicas (e.g., células Eliminadoras Naturales (NK) , neutrófilos y macrófagos) permiten a estas células efectoras citotóxicas enlazarse específicamente a una célula objetivo que porta el antígeno y subsecuentemente eliminar la célula objetivo con las citotoxinas . Los anticuerpos "arman" las células citotóxicas y se requieren absolutamente para tal eliminación. Las células primarias para mediar las células ADCC, NK expresan solamente FcyRIII, mientras que los monocitos expresen FcyRI, FcyRII y FcyRIII. La expresión FcR en las células hematopoyéticas se resume en la Tabla 3 en la página 464 de Ravetech y Kinet, Annu. Rev. Immunol . 9:457-92 (1991) . Para valorar la actividad ADCC de una molécula de interés, puede llevarse a cabo un ensayo ADCC in vitro, tal como aquel descrito en la Patente de E.U. No. 5,500,362 o la 5,821,337. Las células efectoras útiles para tales ensayos incluyen células mononucleares de sangre periférica (PBMC) y células Eliminadoras Naturales (NK) . Alternativa o adicionalmente, la actividad ADCC de la molécula de interés puede valorarse in vivo, e.g., en un modelo animal tal como el descrito por Clynes et al., (EUA) 95:652-656 (1998). El "receptor Fe" o "FcR" describe un receptor que se enlaza a la región Fe de un anticuerpo. El FcR preferido es una secuencia nativa FcR humana. Además, un FcR preferido es uno que se enlaza a un anticuerpo de IgG (un receptor - - gamma) e incluye receptores de las subclases FcyRI, FcyRII y FcyRIII, incluyendo variantes alélicas y alternativamente formas empalmadas de estos receptores. Los receptores FcyRII incluyen FcyRIIA (un "receptor de activación") y FcyRIIB (un "receptor de inhibición" ) , que tiene secuencias de aminoácidos similares que difieren principalmente en los dominios citoplásmicos del mismo. El receptor de activación FcyRIIA contiene un motivo inmunoreceptor de activación en base a la tirosina (ITAM) en su dominio citoplásmico . El receptor de inhibición FcyRIIB contiene un motivo inmunoreceptor de inhibición en base a la tirosina (ITIM) en su dominio citoplásmico. (Ver revisión de M. in Daéron, Annu. Rev. Immunol . 15:203-234 (1997)). Los FcRs se resumieron en Ravetch y Kinet, Annu. Re . Immunol . 9:457-492 (1991); Capel et al., Immunomethods 4:25-34 (1994); y de Haas et al., J. Lab. Clin. Med. 126:330-41 (1995). Otros FcRs incluyendo aquellos a identificarse en el futuro, se encuentran incluidos por el término "FcR" en la presente. El término también incluye al receptor neonatal, FcRn, que es responsable de la transferencia de IgGs maternas a los fetos (Guyer et al., J. Immunol . 117:587 (1976) y Kim et al., J. Immunol. 24:249 (1994)). Las "células efectoras humanas" son leucocitos que expresan uno o más FcRs y llevan a cabo funciones efectoras. Preferentemente, las células expresan al menos FcyRIII y - - llevan a cabo la función efectora de ADCC. Los ejemplos de leucocitos humanos que median ADCC incluyen células mononucleares de sangre periférica (PBMC) , células eliminadoras naturales (NK) , monocitos, células T citotóxicas y neutrófilos; siendo preferidas las células PBMCs y NK. Las células efectoras pueden aislarse a partir de una fuente natural, e.g., a partir de la sangre. La "citotoxicidad dependiente del complemento" o "CDC" se refiere a la lísis de una célula objetivo en la presencia del complemento. La activación de la trayectoria clásica del complemento se inicia por el enlace del pirmer componente del sistema del complemento (Clq) hacia los anticuerpos (de la subclase apropiada) que se enlazan a su antigeno cognado. Para valorar la activación del complemento, puede llevarse a cabo un ensayo CDC, e.g., como se describe en Gazzano-Santoro et al., J. Immunol . Methods 202:163 (1996) . Los. términos "cáncer" y "canceroso" se refieren a o describen la condición fisiológica en los mamíferos que se caracteriza típicamente por el crecimiento celular no regulado. Ejemplos de cáncer incluyen pero no se limitan a, carcinoma, linfoma, blastoma, sarcoma y leucemia o malignidades linfoides . Ejemplos más particulares de tales cánceres incluyen cáncer de células escamosas {e.g., cáncer de células escamosas epiteliales) , cáncer de pulmón - - incluyendo cáncer de pulmón de células pequeñas, cáncer de pulmón de células no pequeñas, adenocarcinoma del pulmón y carcinoma escamoso de pulmón, cáncer del peritoneo, cáncer hepatocelular, cáncer gástrico o estomacal incluyendo cáncer gastrointestinal, cáncer pancreático, glioblastoma, cáncer cervical, cáncer de ovario, cáncer de hígado, cáncer de vejiga, cáncer del tracto urinario, hepatoma, cáncer de mama, cáncer de colon, cáncer rectal, cáncer colorrectal, carcinoma endometrial o uterino, carcinoma de la glándula salival, cáncer de riñon o renal, cáncer de próstata, cáncer vulvar, cáncer de la tiroides, carcinoma hepático, carcinoma anal, carcinoma penial, melanoma, mieloma múltiple y cáncer de linfoma de la célula B, cerebro, asi como cabeza y cuello y metástasis asociadas. Los términos "trastorno proliferativo celular" y "trastorno proliferativo" se refiere a los trastornos que se asocian con algunos grados de proliferación celular anormal . En una modalidad, el trastorno proliferativo celular es cáncer. El "tumor" como se utiliza en la presente, se refiere a todos los crecimientos y proliferaciones celulares neoplásicos ya sea malignos o benignos y todas las células y tejidos pre-cancerosos y cancerosos. Un anticuerpo oligopeptido u otra molécula orgánica que "induce la inactivación celular" es uno que ocasiona que - - una célula viable se vuelva no viable. La célula es la que expresa un polipéptido TAT, preferentemente una célula que sobreexpresa un polipéptido TAT en comparación con una célula normal del mismo tipo de tejido. El polipéptido TAT puede ser un polipéptido de transmembrana expresado en la superficie de una célula cancerosa o puede ser un polipéptido que se produce y secreta por una célula cancerosa. Preferentemente, la célula es una célula cancerosa, e.g., una célula de mama ovario, estómago, endometrial, glándula salival, pulmón, riñon, colon, tiroide, pancreática o vejiga. La inactivación celular in vitro puede determinarse en la ausencia del complemento y las células efectoras inmunes para distinguir la inactivación celular inducida por la citotoxicidad mediada por la célula dependiente del anticuerpo (ADCC) o citotoxicidad dependiente del complemento (CDC) . Así, el ensayo para la inactivación celular puede llevarse a cabo utilizando suero inactivado por calor (i.e., en la ausencia del complemento) y en la ausencia de las células efectoras inmunes. Para determinar si el anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica es capaz de inducir la inactivación celular, la pérdida de la integridad de la membrana como se evaluó por la absorción del yoduro de propidio (PI) , azul de tripano (ver Moore et al., Cytotechnology 17:1-11 (1995)) o 7AAD puede valorarse en relación a las células no tratadas. Los anticuerpos - - oligopéptidos u otras moléculas orgánicas preferidos que inducen la inactivación celular son aquellos que inducen la absorción de PI en el ensayo de absorción PI en células BT47 . Una "célula que expresa TAT" es una célula que expresa un polipéptido TAT endógeno o transfectado ya sea en la superficie celular o en una forma secretada. Un "cáncer que expresa TAT" es un cáncer que comprende células que tienen un polipéptido TAT presente en la superficie celular o que produce y secreta un polipéptido TAT. Un "cáncer que expresa TAT" opcionalmente produce suficientes niveles de polip ptidos TAT en la superficie de las células del mismo, de tal manera que el anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica anti-TAT puede enlazarse al mismo y tener un efecto terapéutico con respecto al cáncer. En otra modalidad, un "cáncer que expresa TAT" opcionalmente produce y secreta suficientes niveles de polipéptido TAT, de tal manera que un anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica antagonista anti-TAT puede enlzarse al mismo y tener un efecto terapéutico con respecto al cáncer. Con respecto a lo anterior, el antagonista puede ser un oligonucleótido de antisentido que reduce, inhibe o evita la producción y secreción del polipéptido TAT secretado por las células de tumor. Un cáncer que "sobreexprésa" un polipéptido TAT es el que tiene niveles significativamente mayores del polipéptido - - TAT en la superficie celular del mismo o produce y secreta en comparación a una célula no cancerosa del mismo tipo de tejido. Tal sobreexpresión puede causarse mediante la amplificación del gen o mediante la transcripción o traducción incrementada. La sobreexpresión del polipeptido TAT puede determinarse en un ensayo de diagnóstico o pronóstico al evaluar niveles incrementados de la proteína TAT presente en la superficie de una célula o secretarse por la célula (e.g., a través de un ensayo inmunohistoquimico utilizando anticuerpos anti-TAT preparados contra un polipeptido TAT aislado que puede prepararse utilizando tecnología de ADN recombinante a partir de un ácido nucleico aislado que codifica al polipéptido TAT; análisis FACS, etc.). Alternativa o adicionalmente, se pueden medir los niveles de ácido nucleico que codifican al polipéptido TAT o ARNm en la célula, e.g., a través de la hibridación fluorescente in situ utilizando un ácido nucleico en base a la sonda correspondiente para un ácido nucleico que codifica TAT o el complemento del mismo; (FISH; ver W098/45479 publicada en Octubre, 1998) , las técnicas de inmunotransferencia Southern, Northern o la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) , tales como PCR cuantitativo de tiempo real (RT-PCR) . También se puede estudiar la sobreexpresión del polipéptido TAT al medir el antlgeno vertido en un fluido biológico tal como suero, e.g., - - utilizando ensayos en base al anticuerpo (ver también e.g., la Patente de E.U. No. 4,933,294 expedida en Junio 12, 1990; WO91/05264 publicada en Abril 18, 1991; la Patente de E.U. 5,401,638 expedida en Marzo 28, 1995; y Sias et al., J_ Immunol . Methods 132:73-80 (1990)). Aparte de los ensayos anteriores, varios ensayos in vivo se encuentran disponibles para el practicante experto. Por ejemplo, se pueden exponer células dentro del cuerpo del paciente a un anticuerpo que se marca opcionalmente con un marcador detectable, e.g., un isótopo radioactivo y puede evaluarse el enlace del anticuerpo a las células en el paciente, e.g., mediante exploración externa para la radioactividad o mediante analizar una biopsia tomada del paciente previamente expuesto al anticuerpo. Como se utiliza en la presente, el término "inmunoadhesina" designa a las moléculas similares al anticuerpo que combinan la especificidad de enlace de una proteina heteróloga (una "adhesina" ) con las funciones efectoras de los dominios constantes de inmunoglobulina. Estructuralmente, las inmunoadhesinas comprenden una fusión de una secuencia de aminoácidos con la especificidad de enlace deseada que es diferente al reconocimiento del antígeno y al sitio de enlace de un anticuerpo (i.e., es "heterólogo" ) y una secuencia de dominio de constante de inmunoglobulina. La parte de adhesina de una molécula de - - inmunoadhesina típicamente es una secuencia de aminoácidos contigua que comprende al menos el sitio de enlace de un receptor o un ligando. La secuencia de dominio constante de inmunoglobulina en la inmunoadhesina puede obtenerse a partir de cualquier inmunoglobulina, tales como los subtipos IgGl, IgG2, IgG3 o IgG4, IgA (incluyendo IgAl e IgA2) , IgE, IgD o IgM. La palabra "marcador" cuando se utiliza en la presente se refiere a un compuesto o composición detectable que se conjuga directa o indirectamente al anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica a fin de generar un anticuerpo oligopéptido u otra molécula orgánica "marcado" . El marcador puede ser detectable por sí mismo (e.g., marcadores de radioisótopo o marcadores fluorescentes) o en el caso de un marcador enzimáticao puede catalizar la alteración química de un compuesto o composición de sustrato que sea detectable. El término "agente citotóxico" como se utiliza en la presente se refiere a una sustancia que inhibe o evita la función de las células y/o causa la destrucción de las células . El término se propone para incluir isótopos radiactivos {e.g., At , 1 , I Y , Re , Re , Sm , Bi , P32 e isótopos radiactivos de Lu) , agentes quimioterapéuticos, e.g., raetotrexato, adriamicina, alcaloides vinca (vincristina, vinblastina, etopósido) doxorubicina, melfalan, - - mitomicina C, clorambucil, daunorubicina u otros agentes de intercalación, enzimas y fragmentos de los mismos tales como enzimas nucleolíticas, antibióticos y toxinas tales como toxinas de molécula pequeña o toxinas enzimáticamente activas de origen bacterial, fungal, vegetal o animal, incluyendo fragmentos y/o variantes de los mismos y los diversos agentes anti-tumor o anti-cancerígenos descritos abajo. Se describen abajo otros agentes citotóxicos. Un agente tumoricida causa la destrucción de las células de tumor. Un "agente inhibidor del crecimiento" cuando se utiliza en la presente se refiere a un compuesto o composición que inhibe el crecimiento de una célula, especialmente una célula de cáncer que expresa TAT ya sea in vi tro o in vivo. Así, el agente inhibidor del crecimiento puede ser uno que reduce significativamente el porcentaje de las células que expresan TAT en la fase S. Ejemplos de agentes inhibidores del crecimiento incluyen agentes que bloquean la progresión del ciclo celular (en un lugar diferente a la fase S) , tales como agentes que inducen la retención Gl y la retención de la fase M. Los bloqueadores clásicos de la fase M incluyen las vincapervincas (vincristina y vinblastina) , taxanos e inhibidores de la topoisomerasa II tales como doxorubicina, epirubicina, daunorubicina, etopósido y bleomicina. Estos agentes que retienen Gl también se vierten en la retención de la fase S, - - por ejemplo, los agentes de alquilación de ADN tales como tamoxifen, prednisona, dacarbazina, mecloretamina, cisplatina, metotrexato, 5-fluorouracilo y ara-C. Información adicional puede encontrarse en The Molecular Basis of Cáncer (Las Bases Moleculares del Cáncer) Mendelsohn e Israel, eds., Capitulo 1, titulado "Cell cycle regulation oncogenes, and antineoplastic drugs" (Regulación del ciclo celular oncógenos y drogas antineoplasicas) por Murakami et al., (WB Saunders : Philadelphia, 1995), especialmente la pág. 13. Los taxanos (paclitaxel y docetaxel) son drogas anticáncer ambas derivadas del árbol de tejo. Docetaxel (TAXOTERE®, Rhone-Poulenc Rorer) , derivado del tejo Europeo, es un análogo semisintético de paclitaxel (TAXOL®, Bristol-Myers Squibb) . Paclitaxel y docetaxel promueven el ensamblaje de microtúbulos a partir de dimeros de tubulina y estabilizan los microtúbulos al evitar la despolimerización, que da como resultado la inhibición de la mitósis en células . La "doxorubicina" es un antibiótico de antraciclina . El nombre químico completo de la doxorubicina es (8S-cis) -10- [ (3-amino-2 , 3 , 6-trideoxi-a-L-lixo-hexapiranosil) oxi] -7,8,9, 10-tetrahidro-6, 8 , ll-trihidroxi-8- (hidroxiacetil) -l-metoxi-5, 12-naftacenediona. El término "citocina" es un término genérico para proteínas liberadas por una población celular que actúan sobre otra célula como mediadores intercelulares. Ejemplos - - de tales citocinas son linfocinas, monocinas y hormonas tradicionales de polipéptido. Incluidas entre las citocinas se encuentran la hormona del crecimiento tal como la hormona del crecimiento humano, la hormona del crecimiento humano de N-metionil y la hormona del crecimiento bovino; hormona paratiroidea; tiroxina; insulina; proinsulina; relaxina; prorelaxina; hormonas de la glicoproteína tales como hormona de estimulación folicular (FSH) , hormona de estimulación tiroidea (TSH) y hormona luteinizante (LH) ; factor del crecimiento hepático; factor del crecimiento de fibroblastos; prolactina, lactógeno placental; factor-a y -ß de necrosis de tumor; sustancia que inhibe el mullerian; péptido asociado con la gonadotropina de ratón; inhibina; activina; factor del crecimiento endotelial vascular; integrina; trombopoyetina (TPO) ; factores del crecimiento del nervio tales como NGF-ß; factor del crecimiento de plaquetas; factores del crecimiento de transformación (TGFs) tales como TGF-ct y TGF-ß; factor I y II del crecimiento similar a la insulina; eritropoyetina (EPO) ; factores osteoinductivos; interferones tales como interferón-cc, -ß y -?; factores de estimulación de colonias (CSFs) tales como macrófagos-CSF ( -CSF) ; granulocito-macrófago-CSF (GM-CSF) ; y granulocito-CSF (G-CSF) ; interleucinas (ILs) tales como IL-1, IL-la, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-11, IL-12; un factor de necrosis de tumor tal como TNF-a o TNF-ß; y otros factores - - polipéptidos que incluyen LIF y ligando de equipo ( L) . Como se utiliza en la presente, el término citocina incluye proteínas provenientes de fuentes naturales o provenientes de cultivos de células recombinantes y equivalentes biológicamente activos de las citocinas de secuencia nativa. El término "inserto de paquete" se utiliza para referirse a las instrucciones que se acostumbran incluir en paquetes comerciales de productos terapéuticos, que contienen la información acerca de las indicaciones, usos, dosis, administración, contraindicaciones y/o precauciones concernientes al uso de tales productos terapéuticos . "Tumor linfoide" , "enfermedad linfoide" o lo similar, incluye, por e emplo, cánceres asociados con la células B incluyendo, por e emplo, linfornas de grado alto, intermedio y bajo (incluyendo el linforna de células B tal como, por ejemplo, el linforna de células B de tejido linfoide asociado a la mucosa y al linfoma no de Hodgkin, linfoma de célula de corteza, linfoma de Burkitt, linfoma de zona marginal, linfoma difuso de célula grande, linfoma folicular, y linfoma de Hodgkin) y leucemias (incluyendo leucemia linfocítica crónica) , mieloma múltiple, y otros cánceres ematológicos y/o asociados a las células B.
- - Tabla 1 /* * C-C incrementado de 12 a 15 * Z es promedio de EQ * B es promedio de ND * comparación con detención es _M; detención-detención = 0 ; J (sujeto) comparación = 0 */ define# _M -8 /* valor de una comparación con una detención*/ día [26] [26] /* A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z*/ /* A*/ 2, 0, -2, 0, 0, -4, 1, -1, -1, 0, -1, -2, -1, 0, _M, i, o, -2, 1, 1, 0, 0, -6, 0, -3, 0}, /* B*/ 0, 3, -4, 3, 2, -5, 0, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 2 M, -i, 1, 0, 0, 0, 0, -2, -5, 0, -3, 1}, /* C*/ -2,-4, 15, -5, -5, -4, -3,-3, -2, 0,-5, -6, - -4, _M, -3,-E 5, -4, 0,-2, 0,-2,-8, 0, 0, -5}, /* D*/ 0, 3, -5, 4, 3, -6, 1, 1, -2, 0, 0, -4, -3, 2 M, -i, 2, -] L, 0, 0, 0, -2, -7, 0, -4, 2}, /* E*/ 0, 2, -5, 3, 4, -5, 0, 1, -2, 0, 0, -3, -2, 1 M, -i, 2, -: L, 0, 0, 0, -2, -7, 0, -4, 3}, /* F*/ -4,-5,-4, -6, -5, 9, -5, -2, 1, 0, -5, 2, 0, 4, _M,-5,-5, -4, -3, -3, 0, -1, 0, 0, 7,-5}, /* G*/ 1, 0, -3, 1, 0, -5, 5, -2,-3, 0, -2, -4, -3, M, -i, -i,-:i, 1, 0, 0, -1,-7, 0, -5, 0}r /* H*/ -1, 1, -3, 1, 1, -2, -2, 6,-2, 0, 0, -2, -2 2, _M, 0, 3 2,-1,-1, 0, -2,-3, 0, 0, 2}, /* I*/ ' 1 2 ^ 2 ^ *2 ~~2 j JL ^ — 3 "~ 2 ^ ^5 ^ 0 ^ 2 ^ 2 ^ 2 2, _M, -2,-2 -2,-1, 0, 0, 4,-5, 0, -1,-2}, /* J*/ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, M, 0, 0, ' ), 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, o}, /* K*/ -1, 0, -5, 0, 0, -5, -2, 0, -2, 0, 5, -3, 0, 1, _M, -i, 1 , 3, 0, 0, 0, -2, -3, 0, -4, 0}, - - /* w { -2, -3, -6, -4, -3, 2, -4, -2, 2, 0, -3, 6, 4, -3, _M, -3,-2 ,-3,-3,-1, 0, 2,-2, 0, -1,-2}, /* M*/ { -1,-2, -5, -3, -2, 0, -3,-2, 2, 0, 0 , 4, 6, - 2, _M, -2, -1 , 0, -2, -1, 0, 2,-4, 0, -2,-1}, /* N*/ { 0, 2, -4, 2, 1, -4, 0, 2, -2, 0, 1, -3, -2, 2, _M, -1, 1 , 0, 1, 0, 0, -2, -4, 0, -2, l}, /* 0*/ { , M, M, M, M, M, M, M, M, M, M, M, M, , 0, M, M, M, M, , M, M, M, M, M, M }, /* P*/ { 1,-1,-3, -1, -1, -5,-1, 0, -2, 0, -1 -3 -2 - 1, M, 6, 0, 0, 1, 0, 0, -1,-6, 0, -5, 0,}, /* Q*/ { 0, 1, -5, 2, 2, -5, -1, 3, -2, 0, 1, -2, -1, 1, M, 0, 4, 1, -1, -1, 0, -2, -5, 0, -4, 3}, /* R*/ { -2, 0, -4, -1,-1, -4, -3, 2,-2, 0, 3, -3, 0, o. _M, 0, 1, 6, 0, -1, 0, -2, 2, 0, -4, 0}, /* S*/ { 1, 0, 0, 0, 0, -3, 1, -1,-1, 0, 0, -3, -2, 1, M, 1, -i, o , 2, 1, 0, -1, -2, 0, -3, 0}, /* T*/ { 1, 0, -2, 0, 0, -3, 0, -1, 0, 0, 0, -1, -1, 0, _M, 0, -1 ,-1, 1, 3, 0, 0, -5, 0, -3, 0}, /* U*/ { 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 , 0, 0, 0, M, o, o, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, o}, /* V*/ { 0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, 4, 0, —2 , 27 2 ~~ 2, M,-l, -2, -2, -1, 0, 0, 4,-6, 0, -2,-2}, /* */ { -6, -5, -8, -7, -7, 0, -7, -3,-5, 0, -3,-2,-4,- 4, _M,-6,-5, 2,-2,-5, 0, -6,17, 0, 0, -6}, /* X*/ { 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, M, o, o, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, o}, /* y*/ { -3,-3, 0, -4,-4, 7,-5, 0, -1, 0, -4, -1,-2,- 2, _ ,-5, -4, -4,-3, -3, 0, -2, 0, 0, 10, -4}, /* Z*/ { 0, 1, -5, 2, 3, -5, 0, 2, -2, 0, 0, -2, -1, 1,_ _M, 0, 3, 0, 0, 0, 0, -2, -6, 0, -4, 4} /* */ incluye# < stdio.h > incluyes < ctype. h. > define# MAXJMP 16 /* salto max en un diag*/ - - defi:n.e# MAXGAP 24 /* no continuar para penalizar espacios mayores que este*/ define# JMPS 1024 / * salto max en una ruta*/ define# MX 4 /* salvar si existe al menos bases MX-1 desde el último salto*/ define# D AT 3 /* ¦valor de bases de comparación */ d fine# DMIS 0 /* pena para bases desacopladas*/ define# DINSO 8 /* pena para un espacio*/ define# DINS1 1 /* pena por base*/ define# PINSO 8 /* pena para un espacio*/ define# PINS1 4 /* pena por residuo*/ salto de estruct { corto n [MAXJMP] ; /* tamaño de salto (neg para dely) */ corto sin señal x [MAXJMP] ; /* sin base, del salto en la sec x*/ /* limita la sec a 2?16 1 */ }; diag de estruct { - - int score; /* puntuación en el último salto*/ largo offset; /* fuera del bloque prev*/ corto ijmp; /* índice de salto actual*/ salto de estruct jp; /* lista de saltos*/ }; ruta de estruc { int spc /* número de espacios guía*/ corto n [J PS] ; /* sizeofl salto (espacio) */ int x[JMPS] ; /* loe del salto (último elemento antes del espacio) */ }; carácter *ofile; /* nombre de archivo de salida */ carácter *namex[2]; /* nombres de sec: conseguir secs ()*/ carácter *prog; /* prog nombre para mensajes de error*/ carácter *segx[2]; /* secs: conseguir secs ()*/ int dmax; /* diag mejor: nw ()*/ int dmaxO; /* diag final */ int dna; /* fijar si adn: principal () */ - - int endgaps; /* fijar si espacios finalesde penalización*/ int gapx, gapy; /* total de espacios en secs */ int lenO, lenl; /* sec lens */ int ngapx, ngapy; /* tamaño total de espacios*/ int sraax; /* puntuación raax: n ()*/ int *xbm; /* mapa de bits para comparación*/ largo offset; /* salida actual en archivo de salto*/ estruct diag *dx; /* conserva diagonales */ estruct path pp[2]; /* conserva ruta para secs*/ carácter *calloc(), *malloc(), *index() , *strcpy() ; carácter *getseq(), *g-calloc () ; /* programa de alineamiento Needleman-Wunsch * * uso : progs archivol archivo2 * en donde archivol y archivo2 son dos adn o dos secuencias de proteínas . * Las secuencias pueden ser en caso superior o inferior pueden contener ambigüedad - - * Cualquier línea que inicia con 1 ; ' , '>' o '<' se ignora * La longitud max del archivo es 65535 (limitado por x corto sin señal en la estruct de salto) * Una secuencia con 1/3 o más de sus elementos ACGTU se suponen ser ADN * La salida esta en el archivo "align.out" * * El programa puede crear un archivo tmp en /tmp para mantener info a cerca de la cola de traza. * Versión original desarrollada bajo BSD 4.3 en un vax 8650 */ incluye# "nw.h" incluyeS "day.h" estático _dbval [26] = { 1, 14, 2, 13, 0, 0, 4, 11, 0, 0, 12, 0, 3, 15, 0, 0, 0, 5, 6, 8, 8, 7, 9, 0, 10, 0 }; estático _jpbval [26] = { 1, 2 I (1 < < ('D'-'A' )) I (1 < < ('?'-?' )), 4, 8, 16, 32, 64, 128, 256, OxFFFFFFF, 1 < < 10 , 1 < < 1 1 , 1 < < 12 , 1 < < 13, 1 < < 14, 1 < < 15, 1 < < 16, 1 < < 17, 1 < < 18, 1 < < 19, 1 < < 20, 1 < < 21, 1 < < 22, - - 1 < <23, 1 < < 24, 1 < < 25 I (1 < < (?'-'?1 ) ) ¡ (1 < < CQ'-'A' )) } principal (ac, av) principal int ac ; carácter *av[] ; { prog = av [0] ; si (ac I = 3) { fprintf (stderr, "uso : %s archivol archivo2\n" , prog) ; fprintf (stderr, "en donde archivol y archivo2 son dos adn o dos secuencias de proteínas . \n" ) ; fprintf (stderr, "Las secuencias pueden estar en el caso superior o inferior\n" ) ; fprintf (stderr, "Cualquier línea que incia con 1 ; 1 o ' < 1 se ignora\n") ,- fprintf (stderr, "La salida esta en el archivo\ " align . out\ " \n" ) ; salida (1) ; } namex[0] = av[l]; namexfl] = av[2] ,- seqx[0] - getseq (name [0] , &len0) ; - - seqx[l] = getseq (name [1] , &lenl) ; xbm = (dna) ? __dbval : _pbval; endgaps = 0; /* 1 para penalizar espacios finales */ ofile= "align. out " ; /* archivo de salida */ nw() ; /* llenar en la matriz, conseguir los saltos posibles*/ readjmps ( ) ; /* consigue los saltos actuales */ printO; /* imprime estados, alineamiento*/ cleanup(O); /* desenlaza cualquier archivo tmp } /* hace el alineamiento, regresa a la mejor puntuación: principal ( ) * adn: valores en Fitch y Smith, PNAS, 80, 1382-1386, 1983 * pro: valores PA 250 * Cuando las puntuaciones son iguales, preferimos desacoplar cualquier espacio, prefer - - * un nuevo espacio para extender un espacio en curso prefer un espacio en seqx * para un espacio en seq y. */ n ( ) nw *px, *py; /* secs y ptrs*/ *ndely, *dely; /* mantiene pista dely*/ int delx, delx; /* mantiene pista delx*/ int *tmp; /* para transferencia hileraO, hileral*/ int mis; /* puntuación para cada tipo*/ insO, insl; /* penas de inserción*/ id; /* índice de diagonal */ ij ; /* índice de salto*/ *colO, *coll; /* puntuación para hilera actual, última*/ registro xx yy; /* índice en secs */ dx = (struct diag * ) g_calloc ( "to get diags", lenO+Ienl + 1, sizeof (struct diag)); ndely (int *) g_calloc ( "to get ndely" , lenl + 1, sizeof (int) ) ; dely = (int *) g_calloc ( "to get dely", lenl + 1, sizeof (int) ) ; colO = (int *)g_calloc ("to get colO", lenl + 1, sizeof (int) ) ; coll = (int *)g_calloc ("to get coll", lenl + 1, sizeof (int) ) ; insO = (dna) ? DINSO : PINSO; insl = (dna)? DINS1 : PINS1; smax = -10000; si (espaciosfinales) { para (colO [0] = dely[0] = -insO yy = 1; yy < = lenl; yy+ +) { colO [yy] = del [yy] = colO [yy-1] - insl; ndely[yy] = yy; } colO [0] = 0; /* Waterman Bull Math Biol 84*/ } además para (yy = 1; yy < = lenl; yy+ +) dely[yy] = -insO; /* llenar la matriz de comparación */ para (px seqx[0] , xx = 1; xx < = lenO ; px+ +, xx+ +) { - - /* inicia primera entrada en col */ si (espaciosfinales) { si (xx = = 1) coll[0] = delx = - (insO+insl) ; además eolito] = delx = colO [0] - insl; ndelx = xx; } además { COll [0] = 0; delx = -insO; ndelx = 0 ; } ...nw para (py = seqx[l] yy = 1; yy < = lenl; py+ + yy+ +) { mis = colO [yy-1] ; si (dna) mis + = (xbm[*px- '?' ] &xbm[*py- ?' ] ) ? DMAT S; además mis + = _day [*px- '?' ] [*py-'A']; /* actualiza pena para del en sec x; * favor de nuevo del sobre del en curso * ignore MAXGAP si se ponderan endgaps - - */ si (endgaps ] | ndelytyy] < MAXGAP) { si (colO [yy] - insO > = dely[yy]) { delytyy] = colO [yy] - (insO+insl) ; ndelyfyy] = 1; } además { dely[yy] -= insl; ndely[yy] + + } } además { si (colO [yy] - (insO+insl) > = dely [yy] ) { dely [yy] = colO [yy] - (insO+insl); ndely[yy] = 1; } además ndely [yy] + + ; > /* actualiza pena para del en sec y; * favor de nuevo del sobre del en curso*/ */ si (endgaps | | ndelx < MAXGAP) { si (coll [yy-1] - insO > = delx) { delx = coll [yy-1] - (insO+insl) ; ndelx = 1 ; } además { delx - ins 1; - - ndelx + +; } } además { si (coll[yy-l] - (insO+insl) > = delx) { delx = coll [yy-1] - (insO+insl) ; ndelx = 1 ; } además ndelx+ +; } /* recoge la puntuación máxima; fuimos favorecidos *mis sobre cualquier del y delx sobre dely */ ... nw id = X - yy + lenl - 1; si (mis > = delx && mis > = dely [yy] ) coll [yy] = mis ; además si (delx > = delytyy]) { coll [yy] = delx; ij = dx[id] .ijmp; si (dx[id] .jp.n[0] && (Idna | | (ndelx > = MAXJMP && XX > dx[id] .jp. x[ij] + MX) I I mis > dx[id] . score + DINSO) ) { dx[id] . ijmp + +; si (+ + ij > = MAXJMP) { writejmps (id) ; ij = dx[id].ijmp = 0; d [id] . offset = offset; offset + = sizeof (struct jmp) + sizeof (offset) ; } dx [id] . jp .n [ij ] = ndelx; dx [id] . jp .x [ij ] = xx; dx[id] . score = delx,- } adem s { coll [yy] = dely[yy]; ij = dx[id] .ijmp; si (dx[id] .jp.n[0] && (ídna | | (ndely [yy] > = MAXJMP SS xx > dx[id] - jp. x[ij] + MX) I I mis > d fid]. score + DINSO) ) { dx[id] . ijmp + +; si (+ + ij > = MAXJMP) { writejmps (id) ; ij = dx [id] .ijmp = 0; dx[id] .offset = offset; offset + = sizeof (struct jmp) + sizeof (offset) ; - - } } dx[id] . jp.n[ij] = -ndelytyy]; dx [id] . jp .x [ij ] = xx; dx[id] .score = delytyy] ; } si (xx = = lenO && yy < lenl) { /* last col */ si (endgaps) coll [yy] - = insO+insl* (Ienl-yy) ; si (coll[yy] > smax) { smax = coll [yy] ; dmax = id; } } } si (endgaps && xx < lenO) coll [yy-1] - = insO+insl* (IenO-xx) ; si (coll [yy-1] > smax) { smax = coll [yy-1] ; dmax = id; } tmp = colO; colO = coll; coll = tmp; - - (vacío) libre ( (carácter *)ndely); (vacío) libre ( (carácter *)dely); (vacío) libre ( (carácter *)colO); (vacío) libre ( (carácter *)coll); } /* * * print() -- solo rutina visible fuera de este módulo * * estático: * getmatO -- mejor ruta de cola de traza, compara cuenta: print () * pr_align() -- imprime alineamiento de lo descrito en ordenamiento p [] : print () * dumpblockO -- descarga un bloque de líneas con números, asteriscos: pr_align() * numsO -- pone una línea de números: dumpblockO * putlineO -- pone una línea (nombre, [núm] , sec, [núm] ) : dumpblock ( ) * starsO --pone una línea de asteriscos: dumpblockO * stripname 0 -- quitar cualquier ruta y prefijo de un nombre de secuencia */ include # "nw.h" - - define# SPC 3 define# P_LINE 256 /* línea de salida máxima*/ define# P_SPC 3 /* espacio entre nombre o núm sec*/ externo _day[26] [26] ; int olen /* establece longitud de linea de salida */ ARCHIVO *fx; /* archivo de salida*/ print() print { int Ix, ly, primer espacio, último espacio; /* sobreposición*/ si ( (fx = fopen(ofile, "w")) = = 0) { fprintf (stderr, " %s: no puede escribir % s\n" , prog ofile) ,- eliminar (1) ; } fprintf (fx, " < primera secuencia: % s (longitud = % d)\n", namex[0], lenO) ; fprintf (fx, " < segunda secuencia: % s (longitud = % d) \n" , namex[l], lenl) ; olen = 60; - - Ix = lenO; ly = lenl; primer espacio = último espacio = 0; si (dmax < lenl - 1) { /* guiando espacio en x */ pp[0] . spc = primer espacio = lenl - dmax - 1; ly -= PP [o] -SpC; } además si (dmax > lenl - 1) { /* guiando espacio en y*/ p [1] .spc = primer espacio = dmax - (lenl - 1) ; lx -= pp [1] .spc; } si (dmaxO < lenO - 1) { /* arrastrando espacio en x */ último espacio = lenO - dmaxO -1; lx-= último espacio; } además si (dmaxO > lenO - 1) { /* arrastrando espacio en y*/ último espacio = dmaxO - (lenO - 1) ; ly -= último espacio; } getmat (lx, ly, primer espacio, último espacio) ; pr_align() ; } /* - - * cola de traza la mejor ruta, cuenta comparaciones */ estático getmatdx, ly, primer espacio, último espacio) getmat int lx, ly; /* "núcleo" (menos espacios finales) */ int primer espacio, último espacio; /*guiando arrastrando sobreponer*/ { int nm, iO, il, sizO, sizl; caract outx[32]; doble pct; registro nO, ni; caract registro *p0, *pl; /* consigue comparaciones totales, puntuación */ iO = il sizO = sizl = 0; p0 = seqx[0] + pp [1] . spc; pl = seqxfl] + pp[0]. spc; nO = pp[l] .spc + 1; ni = pp[0] .spc + 1; nm = 0 ; mientras (*p0 && *pl) { - - si (sizO) { pl + +; ni + + ; sizO-- ; } además si (sizl) { pO + + ; nO + + ; sizl-- ; } además { si (xbm [*p0 - 1A 1 ] Scxbm [*pl- 1A' ] ) nm+ + ; si (n0+ + = = p [0].x[iO]) sizO = pp[0].n[iO+ +] ; si (nl+ + = = pp[l].x[il]) sizl = pp[l] .n[il + + ] ; pO + +; pl + +; } } /* homología pct : * si se penalizan espacios finales, la base es la sec más corta - - * además, elimina inclinaciones y toma el núcleo más corto */ si (espacios finales) Ix = (lenO < lenl) ? lenO : lenl; además lx = (Ix < ly) ? lx : ly; pct = 100.* (doble)nm/ (doble) lx; fprintf(fx, "\n"); fprintf (fx, " < %d compara %s en una sobreposicion de %d: %.2f similitud de porcentaje \n", nm, (nm = = 1)? " " : "es", lx, pct); fprintf (fx, " < espacios en primera secuencia: % d " , gapx) ; ...getmat si (gapx) { (vacío) sprintf (outx, " (%d %s%s)", ngapx, (dna) ? "base" : "residuo" , (ngapx = = 1) ? " " : "S") ; fprintf (fx, "%s" outx) ,- fprintf (fx, ", espacios en segunda secuencia: %d", gapy) ; si (gapy) { (vacío) sprintf (outx, " (%d %s %s)", - - ngapy, (dna) ? "base" : "residuo" , (ngapy = = 1) ? " " : "s") ; fprintf (fx, "% s" outx) ; } si (dna) fprintf (fx, "\n < puntuación: %d (comparación = %d, desacoplo = %d, pena de espacio = %d + %d por base) \n" , smax, DMAT, DMIS, DINSO, DINS1) ; además fprintf (fx, "\n < puntuación: %d (matriz Dayhoff PAM 250, pena de espacio = %d + %d por residuo) \n", smax, PINSO, PINS1) ; si (espacios finales) fprintf (fx, "< espacios finales penalizados, espacio final izquierdo: %d %s %s, espacio final derecho: %d %s %s\n" , primer espacio, (dna)? "base" : "residuo", (primer espacio = = 1)? " " : "s" , último espacio, (dna)? "base" : "residuo", (último espacio = = 1) ? " " : "s"); además fprintf (fx, w < espacios finales no penalizados\n" ) ; } estático nm; compara en el núcleo - para verificación*/ estático lmax; gitudes de nombres de archivo quitados*/ estático ij [2] ; índice jmp para una ruta */ estático nc [2] ; /* número en asterisco de línea actual*/ estático ni [2] ; /* número de elemento actual -- para espaciar*/ estático siz [2] ; caract estático *ps [2] ; /* ptr para elemento actual*/ caract estático *po [2] ; /* ptr para siguiente ranura de caract de salida*/ caract estático out [2] [P_LINE] ; /* línea de salida */ caract estático star [P_LINE] ; /* establece por asteriscos ( ) */ /* * alineamiento impreso de lo descrito en ruta de estruct pp [] */ - - estático pr_align() pr_align { int nn; /* cuenta de caract */ int más ; registro i; para (i = 0, Imax = 0 ; i < 2 ; i + +) { nn = stripname (name [i] ) ; si (nn > lmax) lmax = nn; nc [i] = 1; ni [i] = 1; SÍZ [i] = ij [i] = 0 ; ps [i] = seqx[i] ; po [i] = out [i] ; } para (nn = nm = 0, más = 1; más; ) { ...pr align para (i = más = 0; i < 2; i + +) { /* * ¿tenemos más de esta secuencia? */ si (!*ps[i]) continua; - - más + + ; si (pp [i] . spc) { /* guiando espacio*/ *po [i] + + = ? pp[i] .spc--; } además si (siz[i]) { /* en un espacio*/ *po[i] + + =' - siz [i] --; } además { /* ponemos un elemento de */ *po [i] = *ps [i] ; si (islower (*ps [i] ) ) *ps [i] = toupper (*ps [i] ) ; po[i] + +; ps[i] + +; /* * ¿estamos en el siguiente espacio para esta sec? */ si (ni [i] = = pp[i] .x[ij [i]]) { /* - - *necesitamos fundir todos los espacios *en esta ubicación */ sizti] = pp[i] .n[ij [i] + + ] ; mientras (ni [i] = = p [i] .x[ij [i] ] ) siz [i] + = pp[i] .n[ij [i] + +] ; ni [i] + +; } si (+ + nn = = olen | | Imás && nn) { descarga bloque (); para (i = 0 ; i < 2 ; i + +) po [i] = out [i] ; nn = 0; } } } /* * descarga' un bloque de líneas, incluyendo números, asteriscos: pr_align() */ - - estático descarga bloque 0 dumpblock { registro i; para (i = 0; i < 2; i + +) *po[i] -- = \0' ; .. dumpblock (vacío) putc ( ' \n1 , fx) ; para (i = 0 ; i < 2 ; i + +) { si (*out[i] && (*out[i] ! I I *(po[i]) ! = )) { si(i = = 0) nums (i) ; si (i = = 0 && *out [i] ) asteriscos () ; poner línea (i) ; si (i = = 0 && *out [i] ) fprintf (fx, asterisco) ; si (i = = 1) nums (i) ; /* * elimina línea de números: descarga bloque () - - */ estático nums(ix) nmns int ix; /* índice en out [] conservar línea de sec */ { caract nline [P_LINE] ; registro i , j ; caract registro *pn, *px, *py; para (pn = nline, i = 0 ; i < Imax + P_SPC; i + +, pn + +) *pn = ¾ »; para (i = nc [ix] , py = out [ix] ; *py; py + +, pn + +) { si (*py = = 1 ¾ I |*py = = *pn = * además { si (i% 10 = = 0 I I (i = = 1 SS nc [ix] ! = 1) ) { j = (i < 0)? -i : i; para (px = pn; j ; j / = 10, px--) *px = j % 10 + ' 01 ; si (i < 0) *px = - 1 ; - - } además *pn = * \· i+ +; } } *pn = \0' ; nc [ix] = i ; para (pn = nline; *pn; pn+ +) (vacío) putc(*pn, fx) ; (vacío) putc('\n', fx) ; } /* * elimina una linea (nombre, [núm] , sec, [núm] ) : dumpblock() */ estático poner línea (ix) putline int ix; { ...putline int i ; caract registro *px; para (px = namex [ix] , + +) (vacío) putc(*px, - - para ( ; i < Imax + P_SPC; i + +) (vacío) putc ( 1 ' , fx) ; /* este cuenta desde 1: * ni [] es elemento actual (desde 1) * nc [] es númeo en asterisco de línea actual */ para (px = out [ix] ; *px; px + +) (vacío) putc (*px&0x7F, fx) ; (vacío) putc('\n', fx) ; } /* * pone una línea de asteriscos (secs siempre en out [0] out[l]): dumpblock() ' */ estático asteriscos () stars { int i ; caract registro *p0, *pl, ex, *px; si (!*out[0] I I (*out[0] = = && *(po[0] = = ¾ 1 ) I I - - !*out[l] I I (*out[l] = = * 1 && * (po[l] = = ? * ) ) regreso ; x = asterisco; para (i = lmax+P_SPC; i; i--) tpx++ = para (pO = out [0] , pl = out [1] ; *p0 && *pl; p0 ++, pl+ +) { si (isalpha (*p0) && isalpha (*pl) ) { si (xbm[*p0- '?' ] &xbm[*pl- 'A' ] ) { ex = " * ' ; nm+ + ; } además si (!dna && _day [*p0- '?' ] [*pl- 'A' ] > 0) ex además ex = } además ex = ' 1 ; *px + + = ex; } *px+ + = ' \n' ; - - *px = 1 \0 ' ; } /* * quitar ruta o prefijo de pn, regresar a len: pr_align () */ estático quitar nombre (pn) stripname caract *pn; /* nombre de archivo (puede ser ruta) */ { caract registro *p / *py py = 0; para (px = pn; *px; px+ +) si (*px = = '/' ) py = px + 1; si (py) (vacío) strcpy(pn, py) regreso (strien (pn) ) ; } - - /* * clanup O -- elimina cualquier archivo tmp * getseq () -- lee en sec, establece adn, len, maxlen * g_calloc () callocO con verificación de error * readjmps () consigue buenos saltos, desde archivo tmp si es necesario * writejmps () escribe un ordenamiento lleno de saltos a un archivo tmp : n ( ) */ incluye# "nw.h" incluye# <sys/archivo . h> caract *jname = "/tmp/homgXXXXXX" ; /* archivo tmp para saltos*/ ARCHIVO *fj; int cleanup () ; /* elimina archivo tmp */ largo lseek O ; /* * retira cualquier archivo tmp si soplamos */ eliminar (i) cleanup int i ; { si (fj) - - (vacío) sin enlace (jname) ; salida (i) ; } /* * lee, regresa ptr a sec, establece dna, len, maxlen * salta lineas que inician con ' ; ', ' <' o ' >' * sec en caso superior o inferior caract * getseq (archivo, len) getseq caract *archivo; /* nombre de archivo */ int *len; /* sec len*/ { caract línea [1024], *pseq; caract registro *px, *PY; int natgc, tlen; ARCHIVO * fp; si ( (fp = fopen (archivo, " r ")) = = 0) { fprintf (stderr, " %s : no puede leer % s\n", prog, archivo) ,- salida (1) ,- } tlen = natgc = 0 ,- mientras (fgets (línea, 1024, fp) ) { - - si (*línea = = 1 ; ' | | *línea = = < | | *línea = = x>' ) continua; para (px = línea; *px ! = px + + ) si (isupper (*px) | | islower (*px) ) tlen+ +; } si ( (pseq = malloc ((sin señal) (tlen + 6))) = = 0) { fprintf (stderr, " %s: malloc () archivado para conseguir %d bytes para %s\n" , prog, tlen+6, archivo) ; salida (1) ; } pseq[0] = pseq[l] = pseq [2] = pseq [3] = ' \01 ; ...getseq py = pseq + 4; *len = tlen; rebobinar (fp) ; mientras (fgets (linea, 1024, fp) ) { si (*linea = = 1 ; ' | | *línea = = | I *línea = = ¾ l) continua; para (px = linea; *px ! =' \n '; px + +) { si (isupper (*px) ) - - *py + + = *px; además si (islowe (*px) ) *Py + + = toupper(*px) ; si (índice ( "ATGCU" , * (py-1) ) ) natgc + + ; *py + + = ' \0 ' ; *py = *0' ; (vacío) fcióse (fp); dna = natgc > (tlen/3) ; regreso (pseq + 4); } caract * g_calloc (msg, nx, sz) g_calloc caract *msg; /* programa, rutina de 11amada*/ int nx, sz; número y tamaño de elementos */ { caract *px, *calloc () ; si ( (px = calloc((sin señal) nx, (sin señal) sz) ) = 0) { si (*msg) { - - fprintf (stderr, " s : g-calloc() falló %s (n= %d, sz = %d) \n" , prog, msg, nx, sz) ; salida (1) ; } } regreso (px) ; } /* * consigue saltos finales desde dx[] o archivo tmp, establece pp [] , restablece dmax: mainO */ readjmpsO readjmps { int fd = -1; int siz, iO, il; registro i, j, xx; si (fj) { (vacio) fcióse (fj); si ( (fd = open (jname o_RDONLY, 0) ) < 0 ) { fprintf (stderr, w % s: no puede abrir () % s\n" , prog, jname) ; eliminar (1) ; } - - } para (i = iO = il = O, dmaxO = dmax, xx - lenO ; ; i + +) { mientras (1) { para (j = dx[dmax] .ijmp; j > = O && dx [dmax] . jp .X [j ] > = xx; j--) ... readjmps si (j < O && dx[dmax] .fuera && fj ) { (vacío) lseek(fdf dx [dmax] . fue a, O j(vacío) leer(fd, (caract*) &dx [dmax] . jp, sizeof (estruct jmp)); (vacío) leer(fd, (caract*) &dx [dmax] . fuera, sizeof (dx [dmax] . fuera) ) ; dx[dmax] .ijmp = MAXJMP-l; } además interrupción; } Si (i > = JMPS { fprintf (stderr, " % s: demasiados espacios en alíneamiento\n" , prog) ; eliminar (1) ; } si (j > = 0) { - - siz = dx [dmax] . jp . n [j ] ; xx = dx [dmax] . jp .x [j ] ; dmax + = siz; si (siz < 0) { /* espacio en segunda sec */ pp[l].n[il] = -siz; xx + - siz; /* id = xx - yy + lenl - 1 */ pp [1] .x [il] = xx - dmax + lenl - 1; gapy + + ; ngapy -= siz; /* ignore MAXGAP cuando hacen espacios finales */ siz = (-siz < MAXGAP | | espaciosf finales)? siz : MAXGAP; il + +; } además si (siz > 0) { /* espacio en primera sec */ pp[0] .n[i0] = siz; pp [0] .x [iO] = xx; gapx + +; ngapx + = siz; /* ignore MAXGAP cuando hacen espacios finales */ siz = (siz < MAXGAP | | espacios finales)? siz : MAXGAP; i 0+ +; } } además interrupción; } /* invierte el orden de los saltos */ para (j = 0, i0--; j < i0; j + +, i0--) { i = pp[0].n[j]; pp[0].n[j] = pp [0] .n [i0] ; pp[0].n[i0] = i; i = pp[0].x[j]; pp[0].x[j] = pp [0] .x[Í0] ; pp [0] .x[i0] = i; } para (j = 0, il--; j < il; j + +, il--) { i = pp[l].n[j]; pp[l].n[j] = pp [1] .n [il] ; pp[l] .n[il] = i; i = pp[l].x[j]; pp[l].x[j] = pp [1] .x[il] ; pp [1] .x[il] = i; } si (fd > = 0) (vacío) cierra (fd); si (fj) { - - (vacío) sin enlace (jname) ,- fj = 0; fuera = 0 ; } } /* * escribe una estruct jmp llena fuera del prev (si hay) : nw() */ writejmps (ix) writejmps int ix; { caract *mktem ( ) ,- si (!fj) { si (mktemp (jname) < 0) { fprintf (stderr, "% s: no puede mktem () % s\n" , prog, jname); eliminar (1) ; } si ( (fj = fopen(jname, "w" )) = 0) { fprintf (stderr, " % s: no puede escribir % s\n" , prog, jname); salida (1) ,- > } (vacío) fwrite ( (caract *) &dx [ix] . jp, sizeof (estruct jmp) , 1, fj) ; - - (vacío) fwrite ( (caract *)&dx[ix] .fuera, zeof (d [ix] . fuera) , 1, fj ); - - Tabla 2 AT (Longitud 15 aminoácidos) Proteina de Comparación XXXXXYYYYYYY (Longitud = 12 aminoácidos) % de identidad de secuencia de aminoácidos = (el número de residuos de aminoácidos idénticamente acoplados entre las dos secuencias de polipéptidos como se determina por ALIGN-2) dividido entre (el número total de residuos de aminoácido del polipéptido TAT) = dividido entre 15 = 33.3 % Tabla 3 TAT xxxxxxxxx (Longitud 10 aminoácidos) Proteína de Comparación XXXXXYYYYYYZZYZ (Longitud = 15 aminoácidos) % de identidad de secuencia de aminoácidos = - - (el número de residuos de aminoácidos idénticamente acoplados entre las dos secuencias de polipéptidos como se determina por ALIGN-2) dividido entre (el número total de residuos de aminoácido del polipéptido TAT) = dividido entre 10 = 50% Tabla 4 TAT-ADN NMINNIM (Longitud = 14 nucleótidos) ADN de Comparison NMNIÑTNNLLLLLLLLLL (Longitud = 16 nucleótidos) % de identidad de secuencia de ácidos nucleicos = (el número de nucleótidos idénticamente acoplados entre las dos secuencias de ácidos nucleicos como se determina por ALIGN-2) dividido entre (el número total de nucleótidos de la secuencia de ácidos nucleicos TAT-ADN) = 6 dividido entre 14 = 42.9% Tabla 5 TAT-ADN NNNNNNNNNNNN (Longitud=12 - - nucleótidos) ADN de comparación MN1MLLLVV (Longitud=9 nucleótidos) % de identidad de secuencia de ácido nucleico = (el número de nucleótidos que corresponden idénticamente entre las dos secuencias de ácido nucleico como se determina por ALIGN-2) dividido entre (el número total de nucleótidos de la secuencia TAT-ADN de ácido nucleico) = 4 dividido entre 12 = 33.3%* II . Composiciones y Métodos de la Invención A. Anticuerpos Anti-TAT En una modalidad, la presente invención proporciona anticuerpos anti-TAT que pueden encontrar su uso en la presente como agentes terapéuticos y/o de diagnóstico. Los anticuerpos ejemplificativos incluyen anticuerpos policlonales , monoclonales, humanizados, biespecificos y heterocon ugados . 1. Anticuerpos Policlonales Los anticuerpos policlonales se cultivan preferentemente en animales mediante múltiples inyecciones subcutáneas (se) o intraperitoneales (ip) del antxgeno relevante y un adyuvante. Puede ser útil conjugar el antígeno relevante (especialmente cuando se utilizan péptidos sintéticos) a una proteína que es inmunogénica en las - - especies a inmunizar. Por ejemplo, el antxgeno puede conjugarse a hemocianina de lapa californiana (KLH) , albúmina de suero, tiroglobulina bovina o inhibidor de tripsina de semilla de soya, utilizando un agente bifuncional o de derivación, e.g. , éster de maleimidobenzoil sulfosuccinimida (conjugación a través de residuos de cisterna) , N-hidroxisuccinimida (a través de residuos de lisina) , glutaraldehído, anhídrido succínico, SOCl2 o R"LKT=C=NR, en donde R y R1 son diferentes grupos alquilo. Se inmuniza a los animales contra el antígeno, conjugados inmunogénicos o derivados, combinando, e.g. , 100 -g o 5 \XQ de la proteína o conjugado (para conejos o ratones, respectivamente) con 3 volúmenes de adyuvante completo de Freund e inyectando la solución intradérmicamente en sitios múltiples. Un mes después, los animales se refuerzan con 1/5 a 1/10 de la cantidad original del péptido o conjugado en adyuvante completo de Freund mediante inyección subcutánea en sitios múltiples. De siete a 14 días después, los animales se sangran y el suero se analiza para la titulación del anticuerpo. Los animales se refuerzan hasta que el título se establece. Los conjugados también pueden elaborarse en un cultivo celular recombinante como fusiones de proteína. También, se utilizan adecuadamente agentes de agregación tales como alumbre para mejorar la respuesta inmune. 2. Anticuerpos Monoclonales - - Los anticuerpos monoclonales pueden elaborarse utilizando el método de hibridoma descrito primeramente por Kohler et al., Nature , 256:495 (1975) o pueden elaborarse mediante métodos de ADN recombinante (Patente de E.U. No. 4, 816, 567) . En el método de hibridoma, un ratón u otro animal huésped apropiado, tal como un hámster, se inmuniza como se describió anteriormente para producir linfocitos que producen o son capaces de producir anticuerpos que se enlazarán específicamente a la proteína utilizada para la inmunización. Alternativamente, los linfocitos pueden inmunizarse in vi tro. Después de la inmunización, los linfocitos se aislan y después se fusionan con una línea celular de mieloma utilizando un agente de fusión adecuado, tal como polietilen glicol, para formar una célula de hibridoma (Goding, Monoclonal Antibodies: Principies and Practice, (Goding, Anticuerpos Monoclonales: Principios y Práctica) pag. 59-103 (Academic Press, 1986) ) . Las células de hibridoma así preparadas se siembran y se cultivan en un medio de cultivo adecuado cuyo medio contiene preferentemente una o más sustancias que inhiben el crecimiento o la supervivencia de las células de mieloma originales no fusionadas (también referidas como socio de fusión). Por ejemplo, si las células de mieloma originales carecen de la enzima hipoxantina guanina fosforibosil - - transferasa (HGPRT o HPRT) , el medio de cultivo selectivo para los hibridomas incluirá típicamente hipoxantina, aminopterina y timidina (medio HAT) , cuyas sustancias evitan el crecimiento de células deficientes en HGPRT. Las células de mieloma de socio de fusión preferidas son aquellas que se fusionan eficientemente, soportan la producción estable a alto nivel del anticuerpo por medio de las células que producen un anticuerpo seleccionado y son de sentido a un medio selectivo que se selecciona contra las células originales no fusionadas . Las lineas celulares de mieloma preferidas son las líneas de mieloma murinas, tales como las derivadas de tumores de ratón MOPC-21 y MPC-11 disponibles del Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, California, EUA y SP-2 y derivados e.g., células X63-Ag8-653 disponibles del American Type Culture Collection, Manassas, Virginia, EUA. También se han descrito las líneas celulares de mieloma humano y de heteromieloma de ratón-humano para la producción de anticuerpos monoclonales humanos (Kozbor, J. Immunol . , 133:3001 (1984); y Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, (Técnicas de Producción y Aplicaciones de Anticuerpos Monoclonales) pag. 51-63 ( arcel Dekker, Inc., New York, 1987)). El medio de cultivo en el cual se cultivan las células de hibridoma se analiza para la producción de - - anticuerpos monoclonales dirigidos contra el antígeno. Preferentemente, la especificidad de enlace de los anticuerpos monoclonales producidos por células de hibridoma se determina mediante inmunoprecipitación o mediante un análisis de enlace in vitro, tal como un radioinmunoanálisis (RIA) o un análisis inmunoabsorbente enlazado a la enzima (ELISA) . La afinidad de enlace del anticuerpo monoclonal puede determinarse, por ejemplo, mediante el análisis Scatchard descrito en Munson et al., Anal . Biochem. , 107:220 (1980) . Una vez identificadas las células de hibridoma que producen anticuerpos de la especificidad, afinidad y/o actividad deseada, los clones pueden subclonarse limitando los procedimientos de dilución y cultivarse mediante métodos estándar (Goding, Monoclonal Antibodies : Principies and Practice, (Goding, Anticuerpos Monoclonales: Principios y Práctica) pag. 59-103 (Academic Press, 1986)). Los medios de cultivo adecuados para este propósito incluyen, por ejemplo, medio D-MEM o RPMI-1640. Además, las células de hibridoma pueden cultivarse in vivo como tumores de ascitis en un animal e.g., mediante inyección i.p. de las células en ratones . Los anticuerpos monoclonales secretados por los subclones se separan adecuadamente del medio de cultivo, del - - fluido de la ascitis o del suero mediante procedimientos convencionales de purificación de anticuerpos tales como, por ejemplo, cromatografía de afinidad (e.gr. , utilizando proteína A o proteína G-Sepharose) o cromatografía de intercambio iónico, cromatografía en hidroxilapatita, electroforesis en gel, diálisis, etc. El ADN que codifica los anticuerpos monoclonales se aisla y se secuencia fácilmente utilizando procedimientos convencionales {e.g., utilizando sondas de oligonucleótido que son capaces de enlazarse específicamente a genes que codifican las cadenas pesada y ligera de los anticuerpos murinos) . Las células de hibridoma sirven como una fuente preferida de tal ADN. Una vez aislado, el ADN puede colocarse dentro de vectores de expresión, que se transfectan entonces dentro de células huésped tales como las células de E. coli, células COS de simio, células Ováricas de Hámster Chino (CHO) o células de mieloma que de otra manera no producen proteína de anticuerpo, para obtener la síntesis de los anticuerpos monoclonales en las células huésped recombinantes . Los artículos de revisión acerca de la expresión recombinante en bacterias de ADN que codifican el anticuerpo incluyen Skerra et al., Curr. Opinión in Immunol . , 5:256-262 (1993) y Plückthun, Immunol . evs . 130:151-188 (1992) . En una modalidad adicional, los anticuerpos - - monoclonales o los fragmentos de anticuerpo pueden aislarse a partir de bibliotecas de bacteriófagos de anticuerpos generadas utilizando las técnicas descritas en McCafferty et al., Nature, 348:552-554 (1990). Clackson et al., Nature, 352:624-628 (1991) y Marks et al., J. Mol. Biol . , 222:581-597 (1991) que describen el aislamiento de anticuerpos murinos y humanos, respectivamente, utilizando bibliotecas de bacteriófagos . Publicaciones subsecuentes describen la producción de anticuerpos humanos de alta afinidad (rango nM) mediante redistribución de cadena (Marks et al., Bio/Technology, 10:779-783 (1992)), así como la infección combinatoria y la recombinación in vivo como estrategia para construir bibliotecas muy grandes de bacteriófagos (Waterhouse et al., Nuc. Acids Res., 21:2265-2266 (1993)). De este modo, estas técnicas son alternativas viables para las técnicas tradicionales del hibridoma de anticuerpo monoclonal para el aislamiento de anticuerpos monoclonales. El ADN que codifica el anticuerpo puede modificarse para producir polipéptidos de anticuerpos quiméricos o de fusión, por ejemplo, sustituyendo las secuencias humanas de dominio constante de cadena pesada y de cadena ligera (<¾ y CL) para las secuencias murinas homologas (Patente de E.U. No. 4,816,567; y Morrison, et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 81:6851 (1984)) o fusionando la secuencia de codificación de inmunoglobulina con toda o parte de la secuencia de - - codificación para un polipéptido no de inmunoglobulina (polipéptido heterólogo) . Las secuencias de polipéptidos no de inmunoglobulina pueden sustituirse para los dominios constantes de un anticuerpo o se sustituyen para los dominios variables de un sitio de combinación de antígeno de un anticuerpo para crear un anticuerpo quimérico bivalente que comprende un sitio de combinación de antigeno que tiene especificidad para un antígeno y otro sitio de combinación de antígeno que tiene especificidad para un antígeno diferente. 3. Anticuerpos Humanos y Humanizados Los anticuerpos anti-TAT de la invención pueden comprender además anticuerpos humanizados o anticuerpos humanos . Las formas humanizadas de los anticuerpos no-humanos {e.g., murinos) son inmunoglobulinas quiméricas, cadenas de inmunoglobulina o fragmentos de las mismas (tales como Fv, Fab, Fab' , F(ab' )2 u otras subsecuencias de anticuerpos de enlace de antígeno) que contienen la secuencia mínima derivada de la inmunoglobulina no-humana. Los anticuerpos humanizados incluyen inmunoglobulinas humanas (anticuerpo receptor) en cuyos residuos desde una región de determinación de complementariedad (CDR) del receptor se reemplazan por residuos provenientes de una CDR de una especie no-humana (anticuerpo donador) tal como ratón, rata o conejo que tienen la especificidad, la afinidad y la capacidad deseada. En algunos casos, los residuos de la - - estructura Fv de la inmunoglobulina humana se reemplazan por los residuos no-humanos correspondientes. Los anticuerpos humanizados también pueden comprender residuos que no se encuentran en el anticuerpo receptor ni en la CDR importada o las secuencias de estructura. En general, el anticuerpo humanizado comprenderá sustancialmente todos de al menos uno y típicamente dos, dominios variables, en los cuales todas o sustancialmente todas las regiones CDR corresponden a aquellas de una inmunoglobulina no-humana y todas o sustancialmente todas las regiones FR son aquellas de una secuencia humana de consenso de inmunoglobulina. El anticuerpo humanizado de manera óptima comprenderá al menos una porción de una región constante de inmunoglobulina (Fe) , típicamente la de una inmunoglobulina humana [Jones et al., Nature, 321:522-525 (1986); Riechmann et al., Nature, 332:323-329 (1988); y Presta, Curr. Op. Struct . Biol . , 2:593-59S (1992) ] . Los métodos para humanizar anticuerpos no-humanos son bien conocidos en la técnica. Generalmente, un anticuerpo humanizado tiene uno o más residuos de aminoácido introducidos en él provenientes de una fuente que es no-humana. Estos residuos de aminoácido no-humanos se refieren frecuentemente como residuos de "importación" , que se toman típicamente de un dominio variable de "importación" . La humanización puede llevarse a cabo esencialmente siguiendo el método de Winter y colaboradores [Jones et al., Nature , 321:522-525 (1985); Riechman et al., Nature , 332:323-327 (1988); Verhoeyen et al., Science, 239:1534-1536 (1988)], sustituyendo las secuencias de roedor CDRs o CDR para las secuencias correspondientes de un anticuerpo humano. De acuerdo con esto, tales anticuerpos "humanizados" son anticuerpos quiméricos (Patente de E.U. No. 4,816,567), en donde sustancialmente menos de un dominio variable humano intacto se ha sustituido por la secuencia correspondiente de una especie no-humana. En la práctica, los anticuerpos humanizados son típicamente anticuerpos humanos en los cuales algunos residuos CDR y posiblemente algunos residuos FR se sustituyen por residuos de sitios análogos en anticuerpos de roedor . La elección de los dominios variables humanos, tanto ligeros como pesados, a utilizar para preparar los anticuerpos humanizados es muy importante para reducir la antigenicidad y la respuesta ???? (anticuerpo humano anti-ratón) cuando se propone el anticuerpo para uso terapéutico humano . De acuerdo al así llamado método de "adaptación óptima" , la secuencia del dominio variable de un anticuerpo de roedor se clasifica contra la biblioteca completa de las secuencias de dominio variable humano conocidas . Se identifica la secuencia del dominio V humano que es la más cercana a la del roedor y la región de estructura humana (FR) - - dentro de ésta aceptada para el anticuerpo humanizado (Sims et al., J . Immunol , 151:2296 (1993); Chothia et al., J. Mol . Biol . 196:901 (1987)). Otro método utiliza una región particular de estructura derivada de la secuencia de consenso de todos los anticuerpos humanos de un subgrupo particular de las cadenas ligera o pesada. La misma estructura puede utilizarse para varios diferentes anticuerpos humanizados (Cárter et al., Proc . Nati. Acad. Sci . USA, 89:4285 (1992); Presta et al., J. Immunol . 151:2623 (1993)). Además es importante que los anticuerpos se humanicen con retención de la alta afinidad de enlace para el antígeno y otras propiedades biológicas favorables . Para lograr esta meta, de acuerdo con un método preferido, los anticuerpos humanizados se preparan mediante un proceso de análisis de las secuencias nativas y varios productos humanizados conceptuales utilizando modelos tridimensionales de las secuencias humanizadas y nativas . Los modelos tridimensionales de inmunoglobulina se encuentran comúnmente disponibles y son familiares para los expertos en la técnica. Se encuentran disponibles programas de computadora que ilustran y despliegan probables estructuras conformacionales tridimensionales de secuencias candidato de inmunoglobulina seleccionadas . La inspección de estas imágenes permite el análisis del probable rol de los residuos en el funcionamiento de la secuencia de inmunoglobulina candidato, - - i.e.r el análisis de los residuos que influencian la capacidad de la inmunoglobulina candidato para enlazar su antígeno. De esta manera, los residuos FR pueden seleccionarse y combinarse a partir de las secuencias de receptor e importación de modo que se logra la característica del anticuerpo deseada, tal como la afinidad aumentada para el (los) antígeno (s) objetivo. En general, los residuos de región hipervariable se encuentran directamente y más sustancialmente implicados en influenciar el enlace del antígeno . Se contemplan varias formas de un anticuerpo humanizado anti-TAT. Por ejemplo, el anticuerpo humanizado puede ser un fragmento de anticuerpo, tal como un Fab, que se encuentra opcionalmente conjugado con uno o más agentes citotóxicos a fin de generar un inmunoconjugado . Alternativamente, el anticuerpo humanizado puede ser un anticuerpo intacto, tal como un anticuerpo intacto de IgGl. Pueden generarse anticuerpos humanos como una alternativa para la humanización. Por ejemplo, es posible ahora producir animales transgénicos (e.g., ratones) que son capaces, al inmunizarse, de producir un repertorio completo de anticuerpos humanos en ausencia de la producción endógena de inmunoglobulina. Por ejemplo, se ha descrito que la eliminación homocigótica del gen de la región de unión de la cadena pesada del anticuerpo (JH) en ratones quiméricos y - - mutantes de linea germinal da como resultado la completa inhibición de la producción endógena de anticuerpos. La transferencia del ordenamiento del gen de inmunoglobulina humano de línea germinal a tales ratones mutantes de línea germinal dará como resultado la producción de anticuerpos humanos al probar al antígeno. Ver, e.g. , Jakobovits et al., Proc. Nati. Acad. Sei. USA, 90:2551 (1993); Jacobovits et al., Nature, 362:255-258 (1993); Bruggemann et al. Year in Immuno, 7:33 (1993); Patentes de los E.U. Nos. 5,545,806, 5,569,825, 5,591,669 (todas de GenPharm) ; 5,545,807; y O 97/17852. Alternativamente, la tecnología de imagen de fago (McCafferty et al., Nature, 348:552-553 [1990]) puede utilizarse para producir anticuerpos humanos y fragmentos de anticuerpo in vitro, a partir de los repertorios del gen de inmunoglobulina de dominio variable (V) de donadores no inmunizados. De acuerdo con esta técnica, los genes de anticuerpo de dominio V se clonan en bloque dentro de un gen de protelna ya sea de cubierta mayor o menor de un bacteriófago filamentoso, tal como M13 o fd y se muestran como fragmentos de anticuerpo funcional en la superficie de la partícula de bacteriófagos . Debido a que la partícula filamentosa contiene una copia de ADN monocatenario del genoma de bacteriófagos, las selecciones en base a las propiedades funcionales del anticuerpo también dan como - - resultado la selección del gen que codifica para el anticuerpo que exhibe aquellas propiedades. De este modo, el bacteriófago imita algunas de las propiedades de la célula B. La imagen de bacteriófago puede llevarse a cabo en una variedad de formatos, revisados en, e.g., Johnson, Kevin S. y Chiswell, David J. , Current Opinión in Structural Biology, 3:564-571 (1993). Pueden utilizarse varias fuentes de segmentos del gen V para la imagen de bacteriófago . Clackson et al., Nature , 352:624-628 (1991) aisló un ordenamiento diverso de anticuerpos anti-oxazolona de una pequeña biblioteca aleatoria combinatoria de genes V derivados de los bazos de ratones inmunizados. Puede construirse un repertorio de genes V de donantes humanos no inmunizados y pueden aislarse anticuerpos para un diverso ordenamiento de antígenos (incluyendo auto-antxgenos) esencialmente siguiendo las técnicas descritas por Marks et al., J. Mol . Biol .. 222:581-597 (1991) o Griffith et al., EMBO__J. ' 12 : 725-734 (1993). Ver, también, Patentes de los E.U. Nos 5,565,332 y 5,573,905. Como se trató anteriormente, los anticuerpos humanos también pueden generarse mediante células B activadas in vitro (ver Patentes de los E.U. 5,567,610 y 5,229,275). 4. Fragmentos de anticuerpo En ciertas circunstancias existen ventajas en el uso de fragmentos de anticuerpo, en lugar de anticuerpos - - completos . El menor tamaño de los fragmentos permite una rápida limpieza y puede conducir al acceso mejorado hacia tumores sólidos. Se han desarrollado varias técnicas para la producción de fragmentos de anticuerpo. Tradicionalmente, estos fragmentos se derivaron a través de la digestión proteolítica de anticuerpos intactos (ver, e.g., Morimoto et al., Journal of Biochemical and Biophysical Methods, 24:107-117 (1992); y Brennan et al., Science, 229:81 (1985)). Sin embargo, ahora estos fragmentos pueden producirse directamente por medio de células huésped recombinantes . Todos los fragmentos de anticuerpo Fab, Fv y ScFv pueden expresarse en y secretarse de E coli, permitiendo así la fácil producción de grandes cantidades de estos fragmentos . Pueden aislarse los fragmentos de anticuerpo de las bibliotecas de bacteriófagos de anticuerpo anteriormente tratadas. Alternativamente, los fragmentos Fab'-SH pueden recuperarse directamente de E. coli y acoplarse químicamente para formar fragmentos F(ab')2 (Cárter et al., Bio/Technology 10:163-167 (1992)). De acuerdo con otro procedimiento, los fragmentos F(ab')2 pueden aislarse directamente del cultivo de la célula huésped recombinante . Los fragmentos Fab y F(ab')2 con una vida media in vivo incrementada que comprenden residuos de recuperación de epítope de enlace al receptor se describen en la Patente de E.U. No. 5,869,046.
- - Otras técnicas para la producción de fragmentos de anticuerpo serán aparentes para el practicante experto. En otras modalidades, el anticuerpo de elección es un fragmento Fv de cadena única (scFv) . Ver, W093/16185; Patente de E.U. No. 5,571,894; y la Patente de E.U. No. 5,587,458. Fv y sFv son las únicas especies con sitios de combinación intactos- que se encuentran libres de las regiones constantes; por lo tanto, son adecuadas para el enlace reducido no-específico durante su uso in vivo. Las proteínas de fusión sFv pueden construirse para producir la fusión de una proteína efectora ya sea en la terminal amino o la carboxi de un sFv. Ver, Antibody Engineering, edic. Borrebaeck, supra. El fragmento de anticuerpo también puede ser un "anticuerpo lineal", e.g. , como se describe por ejemplo en la Patente de E.U. 5,641,870. Tales fragmentos de anticuerpo lineales pueden ser monoespecíficos o biespecíficos . 5. Anticuerpos Biespecíficos Los anticuerpos biespecíficos son anticuerpos que tienen especificidades de enlace para al menos dos epítopes diferentes. Los anticuerpos biespecíficos ejemplificativos pueden enlazarse a dos diferentes epítopes de una proteína TAT como se describe en la presente. Otros de tales anticuerpos pueden combinar un sitio de enlace TAT con un sitio de enlace para otra proteína. Alternativamente, una rama de anti-TAT puede combinarse con una rama que se enlaza - - a una molécula activadora en un leucocito tal como una molécula receptora de célula T, (e.g., CD3) o receptores Fe para IgG(FcyR), tales como FcyRI (CD64) , FcyRII (CD32) y FcyRIII (CD16) , a fin de enfocar y localizar los mecanismos celulares de defensa para la célula que expresa TAT. Los anticuerpos biespecíficos pueden utilizarse también para localizar agentes citotóxicos para células que expresan TAT. Estos anticuerpos poseen una rama de enlace TAT y una rama que enlaza el agente citotóxico {e.g., saporina, anti-interferon-cü, alcaloide de vinca, cadena A de ricina, metotrexato o hapteno de isótopo radioactivo) . Los anticuerpos biespecíficos pueden prepararse como anticuerpos de longitud total o fragmentos de anticuerpo {e.g., anticuerpos F(ab')2 biespecíficos) . La WO 96/16673 describe un anticuerpo anti- ErbB2/anti-FcyRIII biespecífico y la Patente de E.U. No. 5,837,234 describe un anticuerpo anti-ErbB2/anti-FcyRI biespecífico. Un anticuerpo anti-ErbB2/Fca biespecífico se muestra en la WO98/02463. La Patente de E.U. No. 5,821,337 muestra un anticuerpo anti-ErbB2/anti-CD3 biespecífico. Se conocen en la técnica los métodos para preparar anticuerpos biespecíficos . La producción tradicional de anticuerpos biespecíficos de longitud total se basa en la coexpresión de dos pares de inmunoglobulinas de cadena pesada-cadena ligera, en donde las dos cadenas tienen diferentes - - especificidades (Millstein et al., Mature, 305:537-539 (1983)) . Debido a la selección aleatoria de las cadenas pesada y ligera de inmunoglobulina, estos hibridomas (cuadromas) producen una mezcla potencial de 10 diferentes moléculas de anticuerpo, de las cuales solo una tiene la estructura biespecífica correcta. La purificación de la molécula correcta, que comúnmente se hace mediante etapas de cromatografía de afinidad, es más bien complicada y el rendimiento del producto es bajo. Procedimientos similares se describen en la WO 93/08829 y en Traunecker et al., EMBO J. 10 :3655-3659 (1991) . De acuerdo con un procedimiento diferente, los dominios variables de anticuerpo con las especificidades de enlace deseadas (sitios que combinan anticuerpo-antígeno) se encuentran fusionados a secuencias de inmunoglobulina de dominio constante. Preferentemente, la fusión es con un dominio constante de Ig de cadena pesada, que comprende al menos parte de las regiones articuladas CH2 y CH3. Se prefiere tener presente la primera región constante de cadena pesada (CH1) que contiene el sitio necesario para el enlace de cadena ligera, en al menos una de las fusiones. Los ADNs que codifican las fusiones de inmunoglobulina de cadena pesada y, si se desea, las de inmunoglobulina de cadena ligera, se insertan en vectores de expresión separados y se co-transíectan dentro de una célula huésped adecuada. Esto - - proporciona mayor flexibilidad al ajustar las proporciones mutuas de los tres fragmentos de polipéptido en modalidades en donde las proporciones desiguales de las tres cadenas de polipéptido utilizadas en la construcción proporcionan el rendimiento óptimo del anticuerpo biespecífico deseado. Sin embargo, es posible insertar las secuencias de codificación para dos o todas las tres cadenas de polipéptido dentro de un solo vector de expresión cuando la expresión de al menos dos cadenas de polipéptido en proporciones iguales da como resultado altos rendimientos o cuando las proporciones no afectan significativamente el rendimiento de la combinación de cadena deseada. En una modalidad preferida de este procedimiento, los anticuerpos biespecíficos se componen de una cadena pesada híbrida de inmunoglobulina con una primera especificidad de enlace en una rama y un par híbrido de inmunoglobulina de cadena pesada-cadena ligera (que proporciona una segunda especificidad de enlace) en la otra rama. Se encontró que esta estructura asimétrica facilita la separación del compuesto biespecífico deseado de las combinaciones de cadena de inmunoglobulina no deseadas, ya que la presencia de una cadena ligera de inmunoglobulina en solo una mitad de la molécula biespecífica proporciona un fácil modo de separación. Este procedimiento se describe en la O 94/04690. Para detalles adicionales para generar - - anticuerpos biespecíficos ver, por ejemplo, Suresh et al., Methods in Enzymology 121:210 (1986) . De acuerdo con otro procedimiento descrito en la Patente de E.U. No. 5,731,168, puede diseñarse la interfase entre un par de moléculas de anticuerpo para maximizar el porcentaje de heterodímeros que se recuperan del cultivo celular recombinante . La interfase preferida comprende al menos una parte del dominio CH3. En este método, una o más cadenas laterales pequeñas de aminoácido de la interfase de la primera molécula de anticuerpo se reemplazan con cadenas laterales más grandes (e.gr. , tirosina o triptofano) . Las "cavidades" compensatorias de tamaño idéntico o similar a la(s) cadena (s) lateral (es) grande (s) se crean en la interfase de la segunda molécula de anticuerpo reemplazando las cadenas laterales grandes de aminoácido con más pequeñas (e.g., alanina o treonina) . Esto proporciona un mecanismo para incrementar el rendimiento del heterodímero sobre otros productos finales no deseados tales como los homodimeros . Los anticuerpos biespecíficos incluyen anticuerpos reticulados o "heteroconjugados" . Por ejemplo, uno de los anticuerpos en el heteroconjugado puede acoplarse a avidina, el otro a biotina. Tales anticuerpos, por ejemplo, se han propuesto para dirigir las células del sistema inmune hacia las células no deseadas (Patente de E.U. No. 4,676,980) y para el tratamiento de la infección VIH (WO 91/00360, WO - - 92/200373 y EP 03089) . Los anticuerpos heteroconjugados pueden elaborarse utilizando cualquier método conveniente de entrecrúzameento . Los agentes de entrecruzamiento adecuados son bien conocidos en la técnica y se describen en la Patente de E.U. No. 4,676,980, junto con una variedad de técnicas de reticulación. Las técnicas para generar anticuerpos biespecíficos a partir de fragmentos de anticuerpo también se han descrito en la literatura. Por ejemplo, los anticuerpos biespecíficos pueden prepararse utilizando enlace químico. Brennan et al., Science 229:81 (1985) describe un procedimiento en donde los anticuerpos intactos se desdoblan proteolíticamente para generar fragmentos F(ab')2. Estos fragmentos se reducen en la presencia del agente de acomplej amiento de ditiol, arsenita de sodio, para estabilizar los ditioles vecinos y prevenir la formación intermolecular de disulfuro. Los fragmentos Fab' generados se convierten entonces en derivados de tionitrobenzoato (TNB) . Uno de los derivados Fab'-TNB se reconvierte entonces a Fab'-tiol mediante la reducción con mercaptoetilamina y se mezcla con una cantidad equimolar del otro derivado Fab'-TNB para formar el anticuerpo biespecífico . Los anticuerpos biespecíficos producidos pueden utilizarse como agentes para la inmunización selectiva de enzimas. El progreso reciente ha facilitado la recuperación - - directa de los fragmentos Fab'-SH a partir de E. coli que pueden acoplarse químicamente para formar anticuerpos biespecíficos . Shalaby et al., J. Exp . Med. 175:217-225 (1992) describe la producción de una molécula F(ab' )2 de anticuerpo biespecífico totalmente humanizado. Cada fragmento Fab' se secretó por separado a partir de E. coli y se sometió a acoplamiento químico directo in vitro para formar el anticuerpo biespecífico . El anticuerpo biespecífico así formado fue capaz de enlazarse a células que sobreexpresan el receptor ErbB2 y las células T humanas normales, así como activar la actividad lítica de los linfocitos citotóxicos humanos contra objetivos de tumor de mama humano. También se han descrito varias técnicas para elaborar y aislar fragmentos biespecíficos de anticuerpo directamente a partir del cultivo celular recombinante . Por ejemplo, se produjern anticuerpos biespecíficos utilizando zippers de leucina. Kostelny et al., J . Immunol . 148 (5) : 1547-1553 (1992). Los péptidos de zipper de leucina de las proteínas Fos y Jun se enlazaron a las porciones Fab' de dos anticuerpos diferentes mediante la fusión del gen. Los homodímeros del anticuerpo se redujeron en la región articulada para formar monómeros y después se re-oxidaron para formar los heterodímeros del anticuerpo. Este método también puede utilizarse para la producción de homodímeros de anticuerpo. La tecnología iabody" descrita por Hollinger - - et al., Proc. Nati. Acad. Sci . USA 90:6444-6448 (1993) ha proporcionado un mecanismo alternativo para elaborar fragmentos de anticuerpo biespecíficos . Los fragmentos comprenden un VH conectado a un VL mediante un enlazador que es demasiado corto para permitir el acoplamiento entre los dos dominios en la misma cadena. De acuerdo con esto, los dominios VH y VL de un fragmento se fuerzan para hacer par con los dominios VL y VH complementarios de otro fragmento, por lo cual forman dos sitios de enlace de antígeno. También se ha reportado otra estrategia para elaborar fragmentos de anticuerpo biespecíficos mediante el uso de los dímeros Fv (sFv) de cadena única. Ver, Gruber et al., J. Immunol . , 152:5368 (1994) . Se contemplan los anticuerpos con más de dos valencias. Por ejemplo, pueden prepararse anticuerpos triespeclficos . Tutt et al., J. Immunol. 147:60 (1991). 6. Anticuerpos Heteroconjugados Los anticuerpos heteroconjugados también se encuentran dentro del alcance de la presente invención. Los anticuerpos heteroconjugados se componen de dos anticuerpos covalentemente unidos. Tales anticuerpos, por ejemplo, se han propuesto para dirigir las células del sistema inmune a células no deseadas [Patente de E.U. No. 4,676,980] y para el tratamiento de la infección VIH [WO 91/00360; WO 92/200373; EP 03089] . Se contempla que los anticuerpos pueden - - prepararse in vitro utilizando métodos conocidos en la química de la proteina sintética, incluyendo aquellos que implican agentes de reticulación. Por ejemplo, las inmunotoxinas pueden construirse utilizando una reacción de intercambio de disulfuro o formando un enlace de tioéter. Ejemplos de reactivos adecuados para este propósito incluyen iminotiolato y metil-4-mercaptobutirimidato y aquellos descritos, por ejemplo, en la Patente de E.U. No. 4,676,980. 7. Anticuerpos Multivalentes Un anticuerpo multivalente puede internalizarse (y/o catabolizarse) más rápido que un anticuerpo bivalente mediante una célula que expresa un antlgeno al cual se enlazan los anticuerpos. Los anticuerpos de la presente invención pueden ser anticuerpos multivalentes (que son diferentes de los de clase IgM) con tres o más sitios de enlace de antígeno {e.g., anticuerpos tetravalentes), que pueden producirse fácilmente mediante la expresión recombinante del ácido nucleico que codifica las cadenas de polipéptido del anticuerpo. El anticuerpo multivalente puede comprender un dominio de dimerizacion y tres o más sitios de enlace de antígeno. El dominio de dimerizacion preferido comprende (o consiste de) una región Fe o una región articulada. En este escenario, el anticuerpo comprenderá una región Fe y tres o más sitios de enlace de antígeno amino-terminal a la región Fe. El anticuerpo multivalente - - preferido en la presente comprende (o consiste de) tres hasta aproximadamente ocho, pero de preferencia cuatro, sitios de enlace de antígeno. El anticuerpo multivalente comprende al menos una cadena de polipéptido (y de preferencia dos cadenas de polipéptido) en donde la (las) cadena (s) de polipéptido comprenden dos o más dominios variables. Por ejemplo, la (las) cadena (s) de polipéptido puede (n) comprender VD1- (XI) n-VD2- (X2) n-Fc, en donde VD1 es un primer dominio variable, VD2 es un segundo dominio variable, Fe es una cadena de polipéptido ¦ de una región Fe, XI y X2 representan un aminoácido o polipéptido y n es 0 o 1. Por ejemplo, la(s) cadena (s) de polipéptido puede (n) comprender: VH-CH1-enlazador flexible-VH-CHl-cadena de región Fe; o VH-CH1-VH-CHl-cadena de región Fe. El anticuerpo multivalente en la presente comprende además preferentemente al menos dos (y preferentemente cuatro) polipéptidos de dominio variable de cadena ligera. El anticuerpo multivalente en la presente puede comprender., por ejemplo, desde aproximadamente dos hasta aproximadamente ocho polipéptidos de dominio variable de cadena ligera. Los polipéptidos de dominio variable de cadena ligera contemplados en la presente comprenden un dominio variable de cadena ligera y opcionalmente, comprenden además un dominio CL. 8. Diseño de la Función Efectora Puede ser deseable modificar el anticuerpo de la - - invención con respecto a la función efectora, e.g., a fin de mejorar la citotoxicidad mediada por la célula dependiente del antígeno (ADCC) y/o la citotoxicidad dependiente del complemento (CDC) del anticuerpo. Esto puede lograrse introduciendo una o más sustituciones de aminoácido en una región Fe del anticuerpo. Alternativa o adicionalmente, el (los) residuo (s) de cisteína puede (n) introducirse en la región Fe, por lo cual se permite la formación del enlace de intercadenas de disulfuro en esta región. El anticuerpo homodimérico así generado puede tener una capacidad de internalización incrementada y/o incrementada inactivación celular mediada por el complemento y citotoxicidad celular dependiente del anticuerpo (ADCC) . Ver, Carón et al., J. Exp. Med. 176:1191-1195 (1992) y Shopes, B . J. Immunol . 148:2918-2922 (1992). Los anticuerpos homodiméricos con actividad anti-tumor mejorada también pueden prepararse utilizando reticuladores heterobifuncionales como se describió en Wolf et al., Cáncer Research 53:2560-2565 (1993) . Alternativamente, puede diseñarse un anticuerpo que tenga regiones Fe duales y por lo cual puede tener lisis de complemento mejorada y capacidades ADCC. Ver, Stevenson et al., Anti-Cáncer Drug Design 3:219-230 (1989). Para aumentar la vida media del suero del anticuerpo, se debe incorporar un epitope de enlace del receptor de recuperación dentro del anticuerpo (especialmente un fragmento de anticuerpo) por - - ejemplo como se describió en la Patente de E.U. 5,739,277,. Como se utiliza en la presente, el término "epítope de enlace de receptor de recuperación" se refiere a un epítope de la región Fe de una molécula IgG (e.gr. , IgG2, IgG2, IgG3 o IgG ) que es responsable del incremento en la vida media del suero in vivo de la molécula IgG. 9. Inmunoconjugados La invención se refiere también a los inmunoconjugados que comprenden un anticuerpo conjugado a un agente citotóxico tal como un agente quimioterapéutico, un agente inhibidor del crecimiento, una toxina (e.g., una toxina enzimáticamente activa de origen bacterial, fungal, vegetal o animal o sus fragmentos) o un isótopo radioactivo (i.e., un radioconj ugado) . Se han descrito arriba los agentes quimioterapéuticos útiles en la generación de tales inmunoconjugados . Las toxinas enzimáticamente activas y fragmentos de las mismas que pueden utilizarse incluyen la cadena A de difteria, fragmentos activos sin enlace de la toxina de difteria, la cadena A de exotoxina (de Pseudomonas aeruginosa) , cadena A de ricina, cadena A de abrina, cadena A de modecina, alfa-sarcina, proteínas de Aleurites fordii, proteínas de diantina, proteínas de Phytolaca americana (PAPI, PAPII, PAP-S) , inhibidor de momordica charantia, curcina, crotina, inhibidor de sapaonaria officinalis, - - gelonina, mitogelina, restrictocina, fenomicina, enomicina y los tricotecenos . Se encuentra disponible una variedad de radionúclidos para la producción de anticuerpos radioconjugados . Los ejemplos incluyen 212Bi, 131I, 131In, 90Y, y 18SRe. Los conjugados del anticuerpo y el agente citotoxico se elaboran utilizando una variedad de agentes bifuncionales de acoplamiento de proteína tales como propionato de N-succinimidil-3- (2-piridilditiol) (SPDP) , iminotiolano (IT), derivados bifuncionales de imidoésteres (tales como adipimidato de dimetilo HCL) , esteres activos (tales como suberato de disuccinimidilo) , aldehidos (tales como glutaraldehído) , compuestos bis-azido (tales como bis (p-azidobenzoil) hexanodiamina) , derivados de bis-diazonio (tales como bis- (p-diazoniobenzoil) -etilendiamina) , diisocianatos (tales como tolieno 2 , 6-diisocianato) y compuestos de flúor bis-activos (tales como 1 , 5-difluoro-2 , 4-dinitrobenceno) . Por ejemplo, puede prepararse una inmunotoxina de ricina como se describe en Vitetta et al., Science, 238 : 1098 (1987). El ácido l-isotiocianatobencil-3-metildietilen triaminopentaacético (MX-DTPA) marcado con carbono 14 es un agente de quelación ej emplificativo para la conjugación del radionucleótido al anticuerpo. Ver, WO94/11026. También se contemplan en la presente los conjugados de un anticuerpo y una o más toxinas de molécula pequeña, tales como una calicheamicina, maytansinoides, un tricoteno y - - CC1065 y los derivados de estas toxinas que tienen actividad de toxina . Maytansina y maytansinoides En una modalidad preferida, un anticuerpo anti-TAT (de longitud total o fragmentos) de la invención se conjuga a una o más moléculas maytansinoides. Los maytansinoides son inhibidores mitotóticos que actúan innbiendo la polimerización de tubulina. La maytansina se aisló primeramente del arbusto Africano del este Maytenus serrata (Patente de E.U. No. 3,896,111).
Subsecuentemente se descubrió que ciertos microbios también producen maytansinoides tales como maytansinol y ésteres de maytansinol C-3 (Patente de E.U. No. 4,151,042). Se describen el maytansinol sintético y sus derivados y análogos, por ejemplo, en las Patentes de E.U. Nos. 4,137,230; 4,248,870; 4,256,745; 4,260,608; 4,265,814; 4,294,757; 4,307,016; 4,308,268; 4,308,269; 4,309,428; 4,313,946; 4,315,929, 4,317,821; 4,322,348; 4,331,598; 4,361,650; 4,364,866; 4,424,219; 4,450,254; 4,362,663; y 4,371,533, cuyas descripciones se incorporan en la presente expresamente mediante la referencia. Conjugados de maytansinoide-anticuerpo En un intento para mejorar su índice terapéutico, la maytansina y maytansinoides se han conjugado a anticuerpos que se enlazan específicamente a antígenos de célula tumoral .
- - Los inmunoconjugados que contienen maytansinoides y su uso terapéutico se describen, por ejemplo, en las Patentes de E.U. Nos. 5,208,020, 5,416,064 y en la Patente Europea EP 0 425 235 Bl, cuyas descripciones se incorporan en la presente expresamente mediante la referencia. Liu et al., Proc. Nati. Acad. Sci . USA 93:8618-8623 (1996) describió inmunoconjugados que comprenden un maytansinoide designado DM1 ligado al anticuerpo monoclonal C242 dirigido contra el cáncer colorrectal humano. Se encontró que el conjugado es altamente citotóxico hacia células cultivadas de cáncer de colon y mostró actividad antitumoral en un análisis de crecimiento tumoral in vivo. Chari et al., Cáncer Research 52:127-131 (1992) describe inmunoconjugados en los cuales un maytansinoide se conjugó a través de un enlazador de disulfuro al anticuerpo murino A7 que enlaza un antígeno en lineas celulares humanas de cáncer de colon o a otro anticuerpo murino monoclonal TA.l que enlaza el oncógeno HER-2/neu. La citotoxicidad del conjugado TA.1-maytansinoide se probó in vitro en la línea celular humana de cáncer de mama S -BR-3, que expresa 3 x 105 antígenos de superficie HER-2 por célula. El conjugado de droga logró un grado de citotoxicidad similar a la droga de maytansinoide libre, el cual pudo aumentarse incrementando el número de moléculas maytansinoides por molécula de anticuerpo. El conjugado A7-maytansinoide mostró baja citotoxicidad sistémica en ratones.
- - Conjugados de anticuerpo del polipéptido anti-TAT-maytansinoide (inmunoconjugados) Los conjugados de anticuerpo anti- AT-maytansinoide se preparan enlazando químicamente un anticuerpo anti-TAT a una molécula maytansinoide sin disminuir significativamente la actividad biológica ya sea de la molécula de anticuerpo o del maytansinoide. Un promedio de 3-4 moléculas de maytansinoide conjugadas por molécula de anticuerpo ha mostrado eficacia para mejorar la citotoxicidad de las células objetivo sin afectar negativamente la función o solubilidad del anticuerpo, aunque incluso se esperaría que una molécula de toxina/anticuerpo mejorara la citotoxicidad sobre el uso del anticuerpo desnudo. Los maytansinoides se conocen bien en la técnica y pueden sintetizarse mediante técnicas conocidas o aislarse de fuentes naturales. Los maytansinoides adecuados se describen, por ejemplo, en la Patente de E.U. No. 5,208,020 y en otras publicaciones de patentes y no de patentes referidas anteriormente en la presente. Los maytansinoides preferidos son maytansinol y análogos de maytansinol modificados en el anillo aromático o en otras posiciones de la molécula de maytansinol, tal como varios ésteres de maytansinol. Existen muchos grupos de enlace conocidos en la técnica para elaborar conjugados de anticuerpo-maytansinoide, incluyendo, por ejemplo, aquellos descritos en la Patente de - - E.U. No. 5,208,020 o Patente EP 0 425 235 Bl y Chari et al., Cáncer Research 52:127-131 (1992). Los grupos de enlace incluyen grupos disulfuro, grupos tioéter, grupos lábiles al ácido, grupos fotolábiles, grupos lábiles a peptidasa o grupos lábiles a estearasa, como se describe en las patentes anteriormente identificadas, siendo preferidos los grupos disulfuro y tioéter. Los conjugados de anticuerpo y maytansinoide pueden elaborarse utilizando una variedad de agentes de acoplamiento de proteína bifuncional tales como propionato de N-succinimidil-3- (2-pir-idilditio) (SPDP) , succinimidil-4- (N-maleimidometil) ciclohexano-1-carboxilato, iminotiolano (IT), derivados bifuncionales de imidoésteres (tales como adipimidato de dimetilo HCL) , esteres activos (tales como suberato de disuccinimidilo) , aldehidos (tales como glutaraldehído) , compuestos de bis-azido (tales como bis (p-azidobenzoil) hexanodiamina) , derivados de bis-diazonio (tales como bis- (p-diazoniobenzoil) -etilendiamina, diisocianatos (tales como tolueno 2 , 6-diisocianato) y compuestos de flúor bis-activos (tales como 1 , 5-difluoro-2 , 4-dinitrobenceno) . Los agentes de acoplamiento particularmente preferidos incluyen propionato de N-succinimidil-3- (2-piridilditio) (SPDP) (Carlsson et al., Biochem. J. 173:723-737 [1978]) y N-succinimidil-4- (2-piridiltio) pentanoato (SPP) para proporcionar un enlace de disulfuro.
- - El enlazador puede encontrarse unido a la molécula de maytansinoide en varias posiciones, dependiendo del tipo de enlace. Por ejemplo, un enlace de éster puede formarse mediante la reacción con un grupo hidroxilo utilizando técnicas de acoplamiento convencionales. La reacción puede ocurrir en la posición C-3 teniendo un grupo hidroxilo, la posición C-14 modificada con hidroximetilo, la posición C-15 modificada con un grupo hidroxilo y la posición C-20 que tiene un grupo hidroxilo. En una modalidad preferida, el enlace se forma en la posición C-3 del maytansinol o un análogo de maytansinol . Calicheamicina Otro inmunoconjugado de interés comprende un anticuerpo anti-TAT conjugado a una o más moléculas de calicheamicina. La familia de calicheamicina de antibióticos es capaz de producir rompimientos de ADN bicatenarios a concentraciones sub-picomolares . Para la preparación de los conjugados de la familia calicheamicina, ver Patentes de ?.?. 5,712,374, 5,714,586, 5,739,116, 5,767,285, 5,770,701, 5,770,710, 5,773,001, 5,877,296 (todas de American Cyanamid Company) . Los análogos estructurales de calicheamicina que pueden utilizarse incluyen, pero no se limitan a, ??1, 2t . 0C31, N-acetil-??1, PSAG y 01! (Hinman et al., C ncer Research 53:3336-3342 (1993), Lode et al., Cáncer Research 58:2925-2928 (1998) y las patentes de E.U. anteriormente mencionadas - - de American Cyanamid) . Otra droga anti-tumoral a la cual puede conjugarse el anticuerpo es QFA que es un antifolato. Tanto la calicheamicina como la QFA tienen sitios intracelulares de acción y no cruzan fácilmente la membrana del plasma. En consecuencia, la absorción celular de estos agentes a través de la internalización mediada por el anticuerpo mejora grandemente sus efectos citotóxicos. Otros agentes citotóxicos Otros agentes antitumorales que pueden conjugarse a los anticuerpos anti-TAT de la invención incluyen BCNU, estreptozoicina, vincristina y 5-fluorouracilo, la familia de agentes conocidos colectivamente como complejo LL-E33288 descrito en las patentes de E.U. 5,053,394, 5,770,710, así como las esperamicinas (patente de E.U. 5,877,296). Las toxinas enzimáticamente activas y sus fragmentos que pueden utilizarse incluyen la cadena A de difteria, fragmentos activos sin enlace de la toxina de difteria, cadena A de exotoxina (de Pseudomonas aeruginosa) , cadena A de ricina, cadena A de abrina, cadena A de modeccina, alf -sarcina, proteínas de Aleurites fordii, proteínas de diantina, proteínas de Phytolaca americana (PAPI, PAPII y PAP-S) , inhibidor de momordica charantia, curcina, crotina, inhibidor de sapaonaria officinalis, gelonina, mitogelina, restrictocina, fenomicina, enomicina y los tricotecenos . Ver, por ejemplo, WO 93/21232 publicada en - - Octubre 28, 1993. La presente invención contempla además un inmunoconjugado formado entre un anticuerpo y un compuesto con actividad nucleolítica {e.g., una ribonucleasa o una endonucleasa de ADN tal como desoxirribonucleasa; DNasa) . Para la destrucción selectiva del tumor, el anticuerpo puede comprender un átomo altamente radioactivo. Se encuentra disponible una variedad de isótopos radiactivos para la producción de anticuerpos anti-TAT radioconjugados . Los ejemplos incluyen At211, I131, I125 Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 e isótopos radiactivos de Lu. Cuando el conjugado se utiliza para el diagnóstico, puede comprender un átomo radioactivo para estudios centellograficos, por ejemplo tc9Sm o I123 o una marca de rotación para la representación de imágenes por resonancia magnética nuclear (NMR) (también conocida como representación de imágenes por resonancia magnética, mri) , tal como de nuevo yodo-123 yodo-131, indio-111, flúor-19, carbono-13, nitrógeno-15 oxigeno-17, gadolinio, manganeso o hierro. El radio u otras marcas pueden incorporarse en el conjugado de maneras conocidas. Por ejemplo, el péptido puede biosintetizarse o puede sintetizarse mediante la síntesis química de aminoácido utilizando precursores adecuados de aminoácido que involucran, por ejemplo, flúor-19 en lugar de hidrógeno. Las marcas tales como tc99m o I123, Re18S, Re188 e In111 pueden unirse a través de un residuo de cisteína en el péptido. El itrio-90 puede unirse a través de un residuo de lisina. El método IODOGEN (Fraker et al., (1978) Biochem. Biophys. Res. Commun. 80:49-57 puede utilizarse para incorporar el yodo-123. "Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy" ( "Anticuerpos Monoclonales en la Inmunocentellografía" ) (Chatal, CRC Press 1989) describe otros métodos en detalle. Los conjugados del anticuerpo y el agente citotóxico pueden elaborarse utilizando una variedad de agentes de acoplamiento de proteína bifuncxonales tales como propionato de N-succinimidil-3 - (2-piridilditio) (SPDP) , succinimidil-4- (N-maleimidometil) ciclohexano-1-carboxilato, iminotiolano (IT) , derivados bifuncxonales de imidoésteres (tales como adipimidato de dimetilo HCL) , ésteres activos (tales como suberato de disuccinimidilo) , aldehidos (tales como glutaraldehído) , compuestos bis-azido (tales como bis (p-azidobenzoil) -hexanodiamina) , derivados de bis-diazonio (tales como bis- (p-diazoniobenzoil) -etilendiamina, diisocianatos (tales como tolueno 2 , 6-diisocianato) y compuestos de flúor bis-activos (tales como 1, 5-difluoro-2 , 4-dinitrobenceno) . Por ejemplo, una inmunotoxina de ricina puede prepararse como se describió en Vitetta et al., Science 238:1098 (1987). El ácido l-isotiocianatobencil-3-metildietileno triaminopentaacético (MX-DTPA) marcado con - - carbono-14 es un agente de quelación ej emplificativo para la conjugación del radionucleótido al anticuerpo. Ver, WO94/11026. El enlazador puede ser un "enlazador desdoblable" que facilita la liberación de la droga citotóxica en la célula. Por ejemplo, puede utilizarse un enlazador lábil al ácido, enlazador sensible a la peptidasa, enlazador fotolábil, enlazador de dimetilo o enlazador que contiene disulfuro . (Chari et al.. Cáncer Research 52:127-131 (1992); Patente de E.U. No. 5,208,020). Alternativamente, puede elaborarse una proteína de fusión que comprende el anticuerpo anti-TAT y el agente citotóxico, e.g., mediante técnicas recombinantes o síntesis del péptido. La longitud del ADN puede comprender las regiones respectivas que codifican para las dos porciones del conjugado ya sea adyacentes entre sí o separadas por una región que codifica para un péptido de enlace que no destruye las propiedades deseadas del conjugado. Aún en otra modalidad, el anticuerpo puede conjugarse a un "receptor" (tal como estreptavidina) para su utilización en el pre-objetivo tumoral en donde el conjugado del receptor de anticuerpo se administra al paciente, seguido por el retiro en la circulación del conjugado no enlazado utilizando un agente de limpieza y después la administración de un "ligando" (e.g., avidina) que se conjuga a un agente citotóxico {e.g., un radionucleótido).
- - . Inmunoliposomas Los anticuerpos anti-??? descritos en la presente también pueden formularse como inmunoliposomas . Un "liposoma" es una pequeña vesícula compuesta de varios tipos de lípidos, fosfolípidos y/o surfactante que es útil para el suministro de una droga a un mamífero. Los componentes del liposoma comúnmente se encuentran dispuestos en una formación bicapa, similar a la disposición del lípido de las membranas biológicas. Los liposomas que contienen el anticuerpo se preparan mediante métodos conocidos en la técnica, tal como se describe en Epstein et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 82:3688 (1985); H ang et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 77:4030 (1980); las Pats. de E.U. Nos. 4,485,045 y 4,544,545; y W097/38731 publicada en Octubre 23, 1997. Los liposomas con tiempo de circulación mejorado se describen en la Patente de E.U. NO. 5, 013,556. Pueden generarse liposomas particularmente útiles mediante el método de evaporación en fase inversa con una composición de lípido que comprende fosfatidilcolina, colesterol y fosfatidiletanolamina derivada de PEG (PEG-PE) . Los liposomas se extruyen a través de filtros de un tamaño de poro definido para producir liposomas con el diámetro deseado. Los fragmentos Fab' del anticuerpo de la presente invención pueden conjugarse a los liposomas como se describe en Martin et al., J. Biol.Chem. 257:286-288 (1982) a través - - de una reacción de intercambio de disulfuro. Opcionalmente se encuentra contenido un agente quimioterapéutico dentro del liposoma. Ver, Gabizon et al., J. National Cáncer Inst . 81 (19) :1484 (1989) . B. Oligopéptidos de Enlace ??? Los oligopéptidos de enlace TAT de la presente invención son oligopéptidos que se enlazan, preferentemente de manera específica a un polipeptido TAT como se describe en la presente. Los oligopéptidos de enlace TAT pueden sintetizarse químicamente utilizando metodología conocida para la síntesis de oligopéptidos o pueden prepararse y purificarse utilizando tecnología recombinante . Los oligopéptidos de enlace TAT son comúnmente de al menos aproximdamente 5 aminoácidos de longitud, alternativamente de al menos aproximadamente 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76 , 77 , 78 , 79 , 80 , 81, 82. 83 , 84 , 85, 86, 87, 88 , 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 aminoácidos de longitud o más, en donde tales oligopéptidos son capaces de enlazarse, preferentemente de manera específica, a un polipeptido TAT como se describe en la presente. Los oligopéptidos de enlace TAT pueden identificarse sin - - experimentación indebida utilizando técnicas bien conocidas. A este respecto, se anota que las técnicas para la selección de bibliotecas de oligopéptidos para oligopéptidos que son capaces de enlazarse específicamente a un objetivo polipeptido son muy conocidas en la técnica (ver, e.gr., Patentes de E.U. Nos. 5,556,762, 5,750,373, 4,708,871, 4,833,092, 5,223,409, 5,403,484, 5,571,689, 5,663,143; Publicaciones PCT Nos. WO 84/03506 y WO 84/03564; Geysen et al., Proc. Nati. Acad. Sci . USA., 81:3998-4002 (1984); Geysen et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA., 82:178-182 (1985); Geysen et al., en Synthetic Peptides as Antigens, (Péptidos Sintéticos como Antígenos) 130-149 (1986); Geysen et al., J. Immunol. Meth. , 102:259-274 (1987); Schoofs et al., J. Immunol., 140:611-616 (1988); Cwirla S.E. et al., (1990) Proc. Nati. Acad. Sci. USA ., 87:6378; Lowman H.B. et al., (1991) Biochemistry, 30:10832; Clackson T. et al., (1991) Nature, 352:624; Marks J.D., et al., (1991), J. Mol. Biol . 222:581; Kang A.S. et al., (1991) Proc. Nati. Acad. Sci. USA., 88:8363 y Smith G.P. (1991) Current Opin. Biotechnol . , 2 : 668) . A este respecto, la imagen de bacteriófago (fago) es una técnica muy conocida que permite seleccionar grandes bibliotecas de oligopéptido para identificar al (a los) miembro (s) de aquellas bibliotecas que son capaces de enlazarse específicamente a un objetivo de polipéptido. La - - imagen fago es una técnica mediante la cual se despliegan polipéptidos variantes como proteínas de fusión para la proteína de recubrimiento en la superficie de las partículas del bacteriófago (Scott, J.K. y Smith, G.P. (1990) Science 249:386). La utilidad de la imagen fago reside en el hecho de que las grandes bibliotecas de variantes de proteína selectivamente aleatorizadas (o ADNcs clonados aleatoriamente) pueden clasificarse rápida y eficientemente para aquellas secuencias que se enlazan a una molécula objetivo con alta afinidad. La imagen de las bibliotecas de péptido (Cwirla S.E. et al. (1990), Proc. Nati. Acad. Sci . USA, 87:6378) o de proteína (Lowman, H.B. et al., (1991) Biochemistry, 30:10832; Clackson T. et al., (1991) Nature 352:624; Marks J.D. et al., (1991), J. Mol . ¦ Biol . , 222 : 581 ; Kanf A.S. et al . , (1991) Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 88:8363) en fago se han utilizado para seleccionar millones de polipéptidos u oligopéptidos para unos con propiedades de enlace específicas (Smith G.P. (1991) Current Opin. Biotechnol., 2:668). La clasificación de las bibliotecas fago de mutantes aleatorios requiere una estrategia para construir y propagar un gran número de variantes, un procedimiento para la purificación de afinidad utilizando el receptor objetivo y un medio para evaluar los resultados de enriquecimientos del enlace. Patentes de E.U. Nos. 5,223,409, 5,403,484, 5 , 571, 689 y 5 , 663 , 143.
- - Aunque la mayoría de los métodos de imagen fago han utilizado un fago filamentoso, también se conocen sistemas lambdoides de imagen fago (WO 95/34683; U.S. 5,627,024), sistemas T4 de imagen fago (Ren, Z-J. et al., (1998) Gene 215:439; Zhu Z. (1997) CAN 33:534; Jiang J. et al., (1997) can 128:44380; Ren Z-J. et al., (1997) CAN 127:215644; Ren Z-J. (1996) Protein Sci . 5:1833; Efimov, V.P. et al., (1995) Virus Genes 10:173) y sistemas T7 de imagen fago (Smith G.P. y Scott, J.K. (1993) Methods in Enzymology, 217, 228_257; E.U. 5,766,905) . Se han desarrollado ahora muchas otras mejoras y variantes del concepto básico de imagen fago. Estas mejoras aumentan la capacidad de los sistemas de imagen para seleccionar bibliotecas de péptidos para enlazarse a moléculas objetivo seleccionadas y para desplegar proteínas funcionales con el potencial de seleccionar estas proteínas para las propiedades deseadas. Se han desarrollado dispositivos de reacción combinatoria para las reacciones de imagen fago (WO 98/14277) y se han utilizado bibliotecas de imagen fago para analizar y controlar las interacciones bimoleculares (WO 98/20169; WO 98/20159) y las propiedades de péptidos helicoidales forzados (WO 98/20036) . La WO 97/35196 describe un método para aislar un ligando de afinidad en el cual una biblioteca de imagen fago se encuentra en contacto con una solución en la cual el ligando se enlazará a una - - molécula objetivo y una segunda solución en la cual el ligando de afinidad no se enlazará a la molécula objetivo, para aislar selectivamente los ligandos de enlace. La WO 97/46251 describe un método para la bio-panoramización de una biblioteca aleatoria de imagen fago con un anticuerpo de afinidad purificado y después el aislamiento del fago de enlace, seguido por un proceso de micro-panoramización utilizando pozos de micro-placas para aislar el fago de alta afinidad de enlace. También se ha reportado el uso de la proteína A de Staphylococcus aureus como una etiqueta de afinidad (Li et al., (1998) Mol. Biotech. , 9:187). La WO 97/47314 describe el uso de bibliotecas de sustracción de sustrato para distinguir las especificidades de la enzima utilizando una biblioteca combinatoria que puede ser una biblioteca de imagen fago. Un método para seleccionar las enzimas adecuadas para su uso en detergentes utilizando imagen fago se describe en la WO 97/09446. Los métodos adicionales para seleccionar proteínas de enlace específicas se describen en las Patentes de E.U. Nos. 5,498,538, 5,432,018 y WO 98/15833. Los métodos para generar bibliotecas de péptidos y seleccionar estas bibliotecas también se encuentran descritos en las Patentes de E.U. Nos. 5,723,286, 5,432,018, 5,580,717, 5,427,908, 5,498,530, 5,770,434, 5,734,018, 5,698,426, 5,763,192 y 5,723,323.
- - C. Moléculas Orgánicas de Enlace TAT Las moléculas orgánicas de enlace TAT son moléculas orgánicas diferentes de los oligopéptidos o anticuerpos como se definen en la presente que se enlazan, preferentemente de manera específica, a un polipéptido TAT como se describe en la presente. Las moléculas orgánicas de enlace TAT pueden identificarse y sintetizarse químicamente utilizando metodología conocida (ver, e.g., Publicaciones PCT Nos. WOOO/00823 y WOOO/39585) . Las moléculas orgánicas de enlace TAT son comúnmente menores a aproximadamente 2000 daltones en tamaño, alternativamente menores a aproximadamente 1500, 750, 500, 250 o 200 daltones de tamaño, en donde tales moléculas orgánicas que son capaces de enlazarse, preferentemente de manera específica, a un polipéptido TAT como se describió en la presente pueden identificarse sin experimentación indebida utilizando técnicas muy conocidas. A este respecto, se anota que las técnicas para seleccionar biblioecas de moléculas orgánicas para moléculas capaces de enlazarse a un objetivo polipéptido son muy conocidas en la técnica (ver e.g., Publicaciones PCT Nos. WO00/00823 y WOOO/39585. Las moléculas orgánicas de enlace TAT pueden ser por ejemplo, aldehidos, cetonas oximas, hidrazonas, semicarbazonas, carbazidas, aminas primarias, aminas secundarias, aminas terciarias, hidrazinas N-sustituídas, hidrazidas, alcoholes, éteres, tioles, tioéteres, disulfuros, ácidos carboxílicos, - - esteres, amidas, ureas, carbamatos, carbonatos, cetales, tiocetales, acétales, tioacetales, haluros de arilo, sulfonatos de arilo, haluros de alquilo, sulfonatos de alquilo, compuestos aromáticos, compuestos heterocíclicos, anilinas, alquenos, alquinos, dioles, aminoalcoholes oxazolidinas oxazolinas, tiazolidinas , tiazolinas, enaminas, sulfonamidas , epóxidos, aziridinas, isocianatos, cloruros de sulfonilo, compuestos diazo, cloruros de ácido o lo similar. D. Selección de Anticuerpos Anti-TAT oligopeptidos de enlace TAT y Moléculas Orgánicas de Enlace TAT con las Propiedades Deseadas Las técnicas para generar anticuerpos oligopeptidos y moléculas orgánicas que se enlazan a polipéptidos TAT se an descrito anteriormente. Además se pueden seleccionar anticuerpos oligopéptidos u otras moléculas orgánicas con ciertas características biológicas, según se desee. Los efectos inhibidores del crecimiento de un anticuerpo anti-TAT oligopeptido u otra molécula orgánica de la invención pueden valorarse mediante métodos conocidos en la técnica, e.g., utilizando células que expresan un polipéptido TAT ya sea endógenamente o seguido de la transfección con el gen TAT. Por ejemplo, pueden tratarse líneas celulares tumorales apropiadas y células TAT-transfectadas con un anticuerpo monoclonal anti-TAT oligopéptido, u otra molécula orgánica de la invención en - - varias concetraciones durante unos cuantos días (e.g., 2-7 días) y colorearse con violeta de cristal o MTT o analizarse mediante algún otro análisis colorimétrico. Otro método para medir la proliferación sería comparar la absorción de timidina 3H por las células tratadas en presencia o ausencia de un anticuerpo anti-TAT, un oligopéptido de enlace TAT o la molécula orgánica de enlace TAT de la invención. Después del tratamiento las células se cosechan y la cantidad de radiactividad incorporada dentro del ADN se cuantifica en un contador de escintilación. Los controles positivos apropiados incluyen el tratamiento de una línea celular seleccionada con un anticuerpo inhbidor de crecimiento conocido por inhibir el crecimiento de esa línea celular. La inhibición del crecimiento de las células tumorales in vivo puede determinarse en varias formas conocidas en la técnica. Preferentemente, la célula tumoral es la que sobreexpresa un polipéptido TAT. Preferentemente, el anticuerpo anti-TAT, el oligopéptido de enlace TAT o la molécula orgánica de enlace TAT inhibirán la proliferación celular de una célula tumoral que expresa TAT in vit.ro o in vivo por aproximadamente 25-100% en comparación con la célula tumoral no tratada, más preferentemente, por aproximadamente 30-100% y aún más preferentemente por aproximadamente 50-100% o 70-100%, en una modalidad, a una concentración de anticuerpo de aproximadamente 0.5 a 30 µg/ml. La inhibición del - - crecimiento puede medirse a una concentración de anticuerpo de aproximadamente 0.5 a 30 µg/ml o aproximadamente 0.5 nM a 200 nM en el cultivo celular, en donde la inhibición del crecimiento se determina de 1-10 días después de la exposición de las células tumorales al anticuerpo. El anticuerpo es inhibidor del crecimiento in vivo si la administración del anticuerpo anti-TAT en aproximadamente 1 µ9/]¾ hasta aproximadamente 100 mg/kg de peso corporal da como resultado la reducción en el tamaño del tumor o la reducción de la proliferación de la célula tumoral dentro de aproximadamente 5 días hasta 3 meses desde la primera administración del anticuerpo, preferentemente dentro de aproximadamente 5 a 30 días. Para seleccionar un anticuerpo anti-TAT, un oligopéptido de enlace TAT o una molécula orgánica de enlace TAT que induce la inactivación celular, puede valorarse la pérdida de la integridad de la membrana como se indica e.g., por la absorción de yoduro de propidio (PI) azul de tripano o absorción de 7AAD en relación al control. Un análisis de absorción de PI puede llevarse a cabo en ausencia de células del complemento y efectoras inmunes . Las células tumorales que expresan el polipéptido TAT se incuban con un medio solo o con un medio que contiene el anticuerpo anti-TAT apropiado (e.g., en aproximadamente 10 µg/ml) , el oligopéptido de enlace TAT o la molécula orgánica de enlace TAT. Las células - - se incuban durante un periodo de 3 días . Después de cada tratamiento, las células se lavan y se hacen alícuotas en tubos de 12 x 75 cubiertos con un filtro de 35 mm (1 mi por tubo, 3 tubos por grupo de tratamiento) para el retiro de aglutinaciones de células. Los tubos reciben entonces PI (10 µg/ml) . Las muestras pueden analizarse utilizando un citómetro de flujo FACSCA ® y el software CellQuest FACSCONVERT® (Becton Dickinson) . Aquellos anticuerpos anti-TAT oligopéptidos de enlace TAT o moléculas orgánicas de enlace TAT que inducen niveles estadísticamente significativos de inactivación celular determinado por la absorción de PI pueden seleccionarse como anticuerpos anti-TAT oligopéptidos de enlace TAT o moléculas orgánicas de enlace TAT que inducen la inactivación celular. Para seleccionar anticuerpos oligopéptidos u otras moléculas orgánicas que se enlazan a un epítope en un polipéptido TAT enlazado por un anticuerpo de interés, puede llevarse a cabo un análisis de rutina de bloqueo cruzado tal como el descrito en Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Ed Harlow y David Lañe (1988) . Este análisis puede utilizarse para determinar si un anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica de prueba se enlaza al mismo sitio o epítope como un anticuerpo anti-TAT conocido. Alternativamente o de manera adicional, puede llevarse a cabo una representación del epítope mediante - - métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, la secuencia del anticuerpo puede mutagenizarse tal como mediante exploración de alanina para identificar residuos de contacto. El anticuerpo mutante se prueba inicialmente para enlazarse con el anticuerpo policlonal para asegurar el plegamiento apropiado. En un método diferente, los péptidos que corresponden a diferentes regiones de un polipéptido TAT pueden utilizarse en análisis de competencia con los anticuerpos de prueba o con un anticuerpo de prueba y un anticuerpo con un epítope caracterizado o conocido. E. Terapia de Prodroga Mediada por la Enzima Dependiente del Anticuerpo (ADEPT) Los anticuerpos de la presente invención también pueden utilizarse en ADEPT conjugando el anticuerpo a una enzima de activación de prodrogas que convierte una prodroga (e.g., un agente quimioterapéutico de peptidilo, ver WO81/01145) en una droga activa anti-cáncer. Ver por ejemplo, WO 88/07378 y la Patente de E.U. No. 4,975,278. El componente de enzima del inmunoconjugado útil para ADEPT incluye cualquier enzima capaz de actuar en una prodroga de tal modo que la convierte a su forma citotóxica más activa. Las enzimas que son útiles en el método de esta inveción incluyen, pero no se limitan a, fosfatasa alcalina útil para convertir prodrogas que contienen fosfato en drogas - - libres; arilsulfatasa útil para convertir prodrogas que contienen sulfatos en drogas libres; citosina deaminasa útil para convertir 5-fluorocitosina no-tóxica en la droga anticáncer, 5-fluoruracilo; proteasas, tales como la proteasa serratia, termolisina subtilisina, carboxipeptidasas y catepsinas (tales como las catepsinas B y L) , que son útiles para convertir prodrogas que contienen péptido en drogas libres; D-alanilcarboxipeptidasas , útiles para convertir prodrogas que contienen sustituyentes D-aminoácido; enzimas de desdoblamiento de carboxidrato tales como ß-galactosidasa y neuraminidasa útiles para convertir prodrogas glicosiladas en drogas libres; ß-lactamasa útil para convertir drogas derivadas con ß-lactanos en drogas libres; y amidasas de penicilina, tales como penicilina V amidasa o penicilina G amidasa, útiles para convertir drogas derivadas en sus nitrógenos de amina con grupos fenoxiacetilo o fenilacetilo, respectivamente, en drogas libres. Alternativamente, los anticuerpos con actividad enzimática, también conocidos en la técnica como "abzimas" , pueden utilizarse para convertir las prodrogas de la invención en drogas activas libres (ver, e.g., Massey, Nature 328:457-458 (1987)). Los conjugados de anticuerpo-abzima pueden prepararse como se describe en la presente para suminisrar la abzima a una población de células tumorales . Las enzimas de esta invención pueden enlazarse - - covalentemente a los anticuerpos anti-TAT mediante técnicas muy conocidas en la técnica tales como el uso de los reactivos heterobifuncionales de reticulación tratados anteriormente. Alternativamente, las proteínas de fusión que comprenden al menos la región de enlace de antígeno de un anticuerpo de la invención enlazadas a al menos una porción funcionalmente activa de una enzima de la invención pueden construirse utilizando técnicas recombinantes de ADN muy conocidas en la técnica (ver, e.g., Neuberger et al., Nature 312:604-508 (1984). F . Polipéptidos TAT de Longitud Total La presente invención proporciona también secuencias de nucleotido recientemente identificadas y aisladas que codifican los polipéptidos referidos en la presente solicitud como polipéptidos TAT. En particular, los ADNcs (de longitud parcial y total) que codifican varios polipéptidos TAT se han identificado y aislado, como se describe en mayor detalle abajo en los Ejemplos. Como se describe en los Ejemplos abajo, se han depositado varios clones de ADNc en la ATCC. Las secuencias de nucleotido actuales de aquellos clones pueden determinarse fácilmente por el técnico experto mediante el secuenciado del clon depositado utilizando métodos de rutina en la técnica. La secuencia de aminoácidos predicada puede determinarse a partir de la secuencia de nucleótidos utilizando experiencia - - de rutina. Para los polipéptidos TAT y los ácidos nucleicos de codificación descritos en la presente, en algunos casos, los Solicitantes han identificado lo que se considera ser el marco de lectura mejor identificable con la información de secuencia disponible por el momento. G. Variantes de Anticuerpo Anti-TAT y Polipéptido TAT Adicionalmente a los anticuerpos anti-TAT y los polipéptidos TAT de longitud total de la secuencia nativa descritos en la presente, se contempla que pueden prepararse variantes del anticuerpo anti-TAT y del polipéptido TAT. Las variantes del anticuerpo anti-TAT y del polipéptido TAT pueden prepararse introduciendo los cambios apropiados del nucleótido en el ADN de codificación y/o mediante la síntesis del anticuerpo o polipéptido deseado. Los expertos en la técnica apreciarán que los cambios del aminoácido pueden alterar los procesos port-translacionales del anticuerpo anti-TAT o del polipéptido TAT, tales como el cambio del número o posición de los sitios de glicosilación o alterar las características de anclaje de la membrana. Las variaciones en los anticuerpos anti-TAT y los polipéptidos TAT descritos en la presente, pueden elaborarse, por ejemplo, utilizando cualquiera de las técnicas y lineamientos para mutaciones conservadoras y no conservadoras publicadas, por ejemplo, en la Patente de E.U. No. 5,364,934.
- - Las variaciones pueden ser una sustitución, eliminación o inserción de uno o más codones que codifican el anticuerpo o polipéptido que dan como resultado un cambio en la secuencia de aminoácidos en comparación con el anticuerpo o polipéptido de la secuencia nativa. Opcionalmente, la variación es por sustitución de al menos un aminoácido con cualquier otro aminoácido en uno o más de los dominios del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT. La guía para determinar cuál residuo de aminoácido puede insertarse, sustituirse o suprimirse sin afectar de manera adversa la actividad deseada puede encontrarse comparando la secuencia del anticuerpo anti-TAT o polipéptido ??? con la de moléculas de proteína homologas conocidas y minimizando el número de cambios en la secuencia de aminoácido hechos en regiones de alta homología. Las sustituciones de aminoácido pueden ser el resultado del reemplazo de un aminoácido con otro aminoácido que tiene propiedades estructurales y/o químicas similares, tal como el reemplazo de una leucina con una serina, i.e., reemplazos conservadores de aminoácido. Las inserciones o eliminaciones pueden encontrarse opcionalmente en el rango de aproximadamente 1 a 5 aminoácidos. La variación permitida puede determinarse haciendo sistemáticamente inserciones, eliminaciones o sustituciones de aminoácidos en la secuencia y analizando las variaciones resultantes para la actividad exhibida por la secuencia nativa de longitud total o madura.
- - Se proporcionan en la presente los fragmentos del anticuerpo anti-TAT y del polipéptido TAT. Tales fragmentos pueden encontrarse truncados en las N-terminal o C-terminal o pueden carecer de residuos internos, por ejemplo, al compararse con un anticuerpo o proteína nativa de longitud total . Ciertos fragmentos carecen de residuos de aminoácido que no son esenciales para una actividad biológica deseada del anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT. Los fragmentos del anticuerpo anti-TAT y del polipéptido TAT pueden prepararse mediante cualquiera de una variedad de técnicas convencionales . Los fragmentos de péptido deseados pueden sintetizarse químicamente. Un procedimiento alternativo implica generar fragmentos de anticuerpo o polipéptido mediante digestión enzimática, e.g., tratando la proteína con una enzima conocida para desdoblar las proteínas en sitios definidos por medio de residuos de aminoácido particulares o por digerir el ADN con enzimas de restricción adecuadas y aislar el fragmento deseado. Aún otra técnica adecuada implica aislar y amplificar un fragmento de ADN que codifica un fragmento de anticuerpo o polipéptido deseado mediante reacción en cadena de polimerasa (PCR) . Los oligonucleótidos que definen los términos deseados del fragmento de ADN se emplean en los iniciadores 5' y 3' en la PCR. Preferentemente, los fragmentos de anticuerpo anti-TAT y de polipéptido TAT comparten al menos - - una actividad biológica y/o inmunológica con el anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT nativo descritos en la presente . En modalidades particulares, las sustituciones conservadoras de interés se muestran en la Tabla 6 bajo el encabezado de las sustituciones preferidas . Si tales sustituciones dan como resultado un cambio en la actividad biológica, entonces se introducen más cambios sustanciales, denominados sustituciones ej emplificativas en la Tabla 6 o como se describe adicionalmente más adelante con referencia a las clases de aminoácidos se introducen y se seleccionan los productos . Tabla 6 Residuo Sustituciones Sustituciones Original Ej emplificativas Preferidas Ala (A) val ; leu; ile val Arg (R) lys;gln;asn lys Asn(N) gln;his ; lys ; arg gln Asp(D) glu glu Cys (C) ser ser Gln(Q) asn asn Glu(E) asp asp Gly(G) pro; ala ala His (H) asn; gln; lys ; arg arg Ile(I) 1e ;val ;met ; ala;phe; - - norleucina Leu(L) norleucina; ile; val; met ; ala; phe ile Lys (K) arg; gln; asn arg Met (M) leu; phe; ile leu Phe (F) leu; val; ile; ala; tyr leu Pro (P) ala ala Ser (S) thr thr Thr (T) ser ser Tr (W) tyr; phe tyr Tyr (?) trp; phe; thr; ser phe Val (V) ile ; leu; met; phe; ala; norleucina leu Se logran modificaciones sustanciales en función o la identidad inmunológica del anticuerpo anti-??? o del polipeptido TAT seleccionando las sustituciones que difieren significativamente en su efecto para mantener (a) la estructura de la estructura del polipeptido en el área de la sustitución, por ejemplo, como una conformación de hoja o helicoidal, (b) la carga o hidrofobicidad de la molécula en el sitio objetivo o (c) el volumen de la cadena lateral. Los residuos que se presentan naturalmente se dividen en grupos en base a las propiedades de la cadena lateral común: (1) hidrofóbicos : norleucina, met, ala, val, leu, ile; - - (2) hidrofllicos neutrales: cys, ser, thr; (3) acídicos: asp, glu; (4) básicos: asn, gln, his, lys, arg; (5) residuos que influencian la orientación de la cadena: gly,pro; y (6) aromáticos: trp, tyr, phe. Las sustituciones no conservadoras ocasionarán el intercambio de un miembro de una de estas clases por otra clase . Tales residuos sustituidos pueden introducirse en los sitios de sustitución conservadora o, más preferentemente, en los sitios restantes (no-conservados) . Las variaciones pueden efectuarse utilizando métodos conocidos en la técnica tales como mutagénesis mediada por oligonucleótido (dirigida al sitio) , exploración de alanina y mutagénesis de PCR. La mutagénesis dirigida al sitio [Cárter et al., ucí. Acids Res. 13:4331 (1986), Zoller et al., Nucí . Acids Res . _10:6487 (1987)], la mutagénesis de cásete [Wells et al., Gene, 34^:315 (1985)], la mutagénesis de selección de restricción [Wells et al . , Philos . Trans . R. Soc. London Ser. 317 : 415 (1986)] u otras técnicas conocidas pueden llevarse a cabo en el ADN clonado para producir el ADN variante del anticuerpo anti-TAT o del polipéptido TAT. También puede emplearse el análisis de exploración de aminoácido para identificar uno o más aminoácidos a lo largo de una secuencia continua. Entre los aminoácidos de - - exploración preferidos se encuentran los aminoácidos relativamente pequeños, neutros. Tales aminoácidos incluyen alanina, glicina, serina y cisteína. Alanina es típicamente un aminoácido de exploración preferido entre este grupo debido a que elimina la cadena lateral más allá del beta-carbono y es menos probable que altere la conformación de la cadena principal de la variante [Cunningham and Wells, Science, 244 : 1081-1085 (1989)]. También se prefiere típicamente la alanina debido a que es el aminoácido más común. Además, se encuentra frecuentemente en ambas posiciones oculta y expuesta [Creig ton, The Proteins , (W.H. Freeman & Co., N.Y.); Chothia, J. Mol.Biol., 150:1 (1976)]. Si la sustitución de alanina no produce las cantidades adecuadas de variantes, puede utilizarse un aminoácido isotérico. Cualquier residuo de cisteína no involucrado en mantener la apropiada conformación del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT también puede sustituirse, generalmente con serina, para mejorar la estabilidad oxidativa de la molécula y prevenir la reticulación aberrante. De manera inversa, puede (n) agregarse enlace (s) de cisteína al anticuerpo anti-TAT o al polipéptido TAT para mejorar su estabilidad (particularmente cuando el anticuerpo es un fragmento de anticuerpo tal como un fragmento Fv) . Un tipo particularmente preferido de variante - - sustitucional implica la sustitución de uno o más residuos de región hipervariable de un anticuerpo nativo (e.g., un anticuerpo humanizado o humano). Generalmente, la(s) variante (s) resultante (s) seleccionada (s) para el desarrollo posterior tendrá (n) propiedades biológicas mejoradas en relación al anticuerpo nativo a partir del cual se genera (n) . Un modo conveniente para generar tales variantes sustitucionales implica maduraciones de afinidad utilizando imagen fago. Brevemente, varios sitios de región hipervariable (e.g., sitios 6-7) se encuentran mutados para generar todas las sustituciones de aminoácido posibles en cada sitio. Las variantes del anticuerpo así generadas se despliegan de una manera monovalente a partir de partículas fago filamentosas como fusiones para el producto del gen III de M13 encapsulado dentro de cada partícula. Las variantes fago-desplegadas se seleccionan entonces por su actividad biológica (e.g., afinidad de enlace) como se describe en la presente. A fin de identificar sitios candidato de región hipervariable para la modificación, puede llevarse a cabo la mutagénesis de exploración de alanina para identificar los residuos de región hipervariable que contribuyen significativamente al enlace del antígeno. Alternativamente o adicionalmente, puede ser benéfico analizar una estructura de cristal del complejo de antígeno-anticuerpo para identificar puntos de contacto entre el anticuerpo y el - - polipéptido TAT humano. Tales residuos de contacto y los residuos vecinos son candidatos para la sustitución de acuerdo a las técnicas elaboradas en la presente . Una vez generadas tales variantes, el panel de variantes se somete a selección como se describe en la presente y pueden seleccionarse los anticuerpos con propiedades superiores en uno o más análisis relevantes para desarrollo posterior. Las moléculas de ácido nucleico que codifican las variantes de secuencia de aminoácido del anticuerpo anti-TAT se preparan mediante una variedad de métodos conocidos en la técnica. Estos métodos incluyen, pero no se limitan a, aislamiento a partir de una fuente natural (en el caso de las variantes de secuencia de aminoácido que se presentan de manera natural) o preparación mediante mutagénesis mediada por oligonucleótido (o dirigida al sitio) , mutagénesis PCR y mutagénesis de cásete de una variante preparada con mayor anterioridad o una versión no-variante del anticuerpo anti-TAT. H. Modificaciones de Anticuerpos Anti-TAT y Polipéptidos TAT Las modificaciones covalentes de los anticuerpos anti-TAT y los polipéptidos TAT se incluyen dentro del alcance de esta invención. Un tipo de modificación covalente incluye hacer reaccionar residuos de aminoácido objetivo de un anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT con un agente - - orgánico de derivación que es capaz de reaccionar con cadenas laterales seleccionadas o los residuos N- o C-terminal del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT. La derivación con agentes bifuncionales es útil, por ejemplo, para la reticulación del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT a una matriz o superficie de soporte insoluble en agua para su uso en el método para purificar anticuerpos anti-TAT y viceversa. Los agentes de reticulación comúnmente utilizados incluyen, e.g. , 1, 1-bis (diazoacetil) -2-feniletano, glutaraldehído, esteres de N-hidroxisuccinimida, por ejemplo, ásteres con ácido 4-azidosalicílico, imidoésteres homobifuncionales, incluyendo ésteres de disuccinimidilo tales como 3,3'-ditiobis (succinimidilpropionato) , maleimidas bifuncionales tales como bis-N-maleimido-1, 8-octano y agentes tales como metil-3- [ (p-azidofenil) ditio] propioimidato . Otras modificaciones incluyen la deamidación de los residuos de glutamxnilo y asparaginilo a los correspondientes residuos de glutamilo y aspartilo, respectivamente, la hidroxilación de prolina y lisina, la fosforilación de grupos hidroxilo de los residuos de serilo o treonilo, la metilación de los grupos oc-amino de las cadenas laterales de lisina, arginina, e histidina [T.E. Creighton, Proteins : Structure and Molecular Properties, W.H. Freeman & Co., San Francisco, pp. 79-86 (1983)], la acetilación de la amina N-terminal y la amidación de cualquier grupo carboxilo C-terminal.
- - Otro tipo de modificación covalente del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT incluido dentro del alcance de esta invención comprende alterar el patrón de glicosilación nativo del anticuerpo o polipéptido. La "alteración del patrón de glicosilación nativo" pretende significar para los propósitos en la presente, suprimir uno o más residuos de carbohidrato encontrados en el anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT de secuencia nativa (ya sea retirando el sitio de glicosilación subyacente o suprimiendo la glicosilación mediante medios químicos y/o enzimáticos) y/o agregando uno o más sitios de glicosilación que no se encuentran presentes en el anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT de secuencia nativa. Además, la frase incluye cambios cualitativos en la glicosilación de las proteínas nativas, implicando un cambio en la naturaleza y proporciones de los diversos residuos de carbohidrato presentes . La glicosilación de anticuerpos y otros polipéptidos es típicamente ya sea Enlazada a N o enlazada a 0. Enlazada a N se refiere a la unión del residuo de carbohidrato a la cadena lateral de un residuo de asparagina. Las secuencias de tripéptido asparagina-X-serina y asparagina-X-treonina, donde X es cualquier aminoácido excepto prolina, son las secuencias de reconocimiento para la unión enzimática del residuo de carbohidrato a la cadena lateral de asparagina. De este modo, la presencia de - - cualquiera de estas secuencias de tripéptido en un polipéptido crea un sitio de glicosilación potencial. Glicosilación Enlazada a 0 se refiere a la unión de uno de los azúcares de N-acetilgalactosamina, galactosa o xilosa a un hidroxiaminoácido, más comúnmente serina o treonina, aunque puede utilizarse también 5-hidroxiprolina o 5-hidroxilisina . La adición de sitios de glicosilación al anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT se logra convenientemente alterando la secuencia de aminoácido de modo tal que contenga una o más de las secuencias de tripéptido arriba descritas (para sitios de glicosilación Enlazados a N) . La alteración también puede efectuarse mediante la adición o la sustitución de uno o más residuos de serina o treonina a la secuencia del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT original (para sitios de glicosilación Enlazados a O) . La secuencia de aminoácido del anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT puede alterarse opcionalmente a través de cambios en el nivel de ADN, particularmente mutando el ADN que codifica el anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT en bases preseleccionadas de modo tal que se generan codones que se traducirán en los aminoácidos deseados. Otro medio para incrementar el número de residuos de carbohidrato en el anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT es mediante acoplamiento químico o enzimático de glicosidos - - al polipéptido. Tales métodos se describen en la técnica, e.g., en la WO 87/05330 publicada el 11 de Septiembre de 1987 y en Aplin y Wriston, CRC Crit . Rev. Biochem. , pp. 259-305 (1981) . El retiro de los residuos de carbohidrato presentes en el anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT puede lograrse química o enzimáticamente o mediante sustitución mutacional de los codones que codifican para residuos de aminoácido que sirven como objetivo para la glicosilación. Las técnicas químicas de desglicosilación se conocen en la técnica y se describen, por ejemplo, por Hakimuddin et al., Aren. Biochem. Biophys . , 259 :52 (1987) y por Edge et al., Anal . Biochem. , 118 : 131 (1981) . El desdoblamiento enzimático de los residuos de carbohidrato en los polipéptidos puede lograrse mediante el uso de una variedad de endo-y exo-glicosidasas como se describe por Thotakura et al., Meth. Enzymol , 138 :350 (1987) . Otro tipo de modificación covalente del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT comprende enlazar el anticuerpo o polipéptido a uno de una variedad de polímeros no-proteináceos, e.g., polietilen glicol (PEG) , polipropilen glicol o polioxialquilenos , en la manera indicada en las Patentes de E.U. Nos. 4,640,835; 4,496,689; 4,301,144; 4,670,417; 4,791,192; o 4,179,337. El anticuerpo o polipéptido también puede atraparse en microcápsulas preparadas, por ejemplo, mediante técnicas de coacervación o - - mediante polimerización interfacial (por ejemplo, cápsulas de hidroximetilcelulosa o de gelatina y microcápsulas de poli- (metilmetacrilato) , respectivamente) , en sistemas coloidales de suministro de drogas (por ejemplo, liposomas, microesferas de albúmina, microemulsiones , nanoparticulas y nanocápsulas) o en macroemulsiones . Tales técnicas se describen en Remington's Pharmaceutical Sciences, 16a edición oslo, A. , Ed., (1980). El anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT de la presente invención también pueden modificarse en una manera para formar moléculas quiméricas que comprenden un anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT fusionado a otro polipéptido eterólogo o secuencia de aminoácido. En una modalidad, tal molécula quimérica comprende una fusión del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT con un polipéptido marcador que proporciona un epitope al cual puede enlazarse selectivamente un anticuerpo anti-marcador. El marcador de epitope se coloca generalmente en el terminus de amino- o carboxilo- del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT. La presencia del tales formas epitope-marcadas del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT pueden detectarse utilizando un anticuerpo contra el polipéptido marcador. También, la provisión del marcador de epitope permite que el anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT se purifique fácilmente por purificación de afinidad utilizando un anticuerpo anti- - - marcador u otro tipo de matriz de afinidad que se enlace al marcador de epítope . Varios polipéptidos marcador y otros anticuerpos respectivos son bien conocidos en la técnica. Los ejemplos incluyen marcadores de poli-histidina (poli- is) o poli-histidina-glicina (poli-his-gly) ; el polipéptido marcador flu HA y su anticuerpo 12CA5 [Field et al., Mol . Cell. Biol., 8^:2159-2165 (1988)]; el marcador c-myc y los anticuerpos 8F9, 3C7, 6E10, G4 y 9E10 para el mismo [Evan et al., Molecular and Cellular Biology, 5:3610-3616 (1985); y el marcador de glicoproteina D (gD) del virus de Herpes Simples y su anticuerpo [Paborsky et al., Protein Engineering, _3(6) :547-553 (1990)]. Otros polipéptidos de marcador incluyen el péptido Marcados [Hoop et al., BioTec nology, 6^:1204-1210 (1988)]; el péptido KT3 de epítope [Martin et al., Science, 255^192-194 (1992)]; un péptido de epitope de a-tubulina [Skinner et al., J. Biol. Chem. , 266: 15163-15166 (1991) ] ,- y el marcador de péptido del gen T7 de la proteína 10 [Lutz-Freyermuth et al., Proc. Nati. Acad. Sci . USA, 82:6393-6397 (1990)]. En una modalidad alternativa, la molécula quimérica puede comprender una fusión del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT con una inmunoglobulina o una región particular de una inmunoglobulina. Para una forma bivalente de la molécula quimérica (también referida como una "inmunoadhesina" ) , tal fusión podría ser para la región Fe de una molécula IgG. Las fusiones Ig incluyen de preferencia la sustitución de una forma soluble (dominio transmembrana suprimido o inactivado) de un anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT en lugar de al menos una región variable dentro de una molécula Ig. En una modalidad particularmente preferida, la fusión de inmunoglobulina incluye la articulación, C¾ y C¾ o la articulación C¾, CH2 y las regiones C¾ de una molécula IgGl. Para la producción de fusiones de inmunoglobulina ver también la Patente de E.U. No. 5,428,130 expedida en Junio 27, 1995. I . Preparación de Anticuerpos Anti-TAT y Polipéptidos TAT La siguiente descripción se refiere principalmente a la producción de anticuerpos anti-TAT y polipéptidos TAT cultivando células transformadas o transfectadas con un vector que contiene un anticuerpo anti-TAT y un polipéptido TAT que codifica ácido nucleico. Por supuesto, se contempla que pueden emplearse métodos alternativos, que son bien conocidos en la técnica, para preparar anticuerpos anti-TAT y polipéptidos TAT. Por ejemplo, la secuencia de aminoácido apropiada o sus porciones, puede producirse mediante síntesis directa del péptido utilizando técnicas de fase sólida [ver, e.g., Stewart et al., Solid-Phase Peptide Synthesis, W.H. Freeman Co., San Francisco, CA (1969); Merrifield, J. Am. Chem. Soc, 85:2149-2154 (1963)]. La síntesis de proteína in - - vi tro puede llevarse a cabo utilizando técnicas manuales o por automatización. La síntesis automatizada puede lograrse, por ejemplo, utilizando un Applied Biosystems Peptide Synthesizer (Foster City, CA) utilizando las instrucciones del fabricante. Varias porciones del anticuerpo anti-TAT o del polipéptido TAT pueden sintetizarse químicamente por separado y combinarse utilizando métodos químicos o enzimáticos para producir el anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT deseado. 1. Aislamiento del Anticuerpo Anti-TAT o Polipéptido TAT que codifica ADN El anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT que codifica ADN puede obtenerse a partir de una biblioteca de ADNc preparada a partir de tejido que se cree que posee el ARNm del anticuerpo anti-TAT o del polipéptido TAT y que lo expresa en un nivel detectable. De acuerdo con esto, el anticuerpo anti-TAT humano o el ADN del polipéptido TAT pueden obtenerse convenientemente de una biblioteca de ADNc preparada a partir de tejido humano. El gen que codifica el anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT también puede obtenerse de una biblioteca genómica o mediante procedimientos sintéticos conocidos (e.g., síntesis automatizada de ácido nucleico) . Las bibliotecas pueden seleccionarse con sondas (tales como oligonucleótidos de al menos aproximadamente 20- - - 80 bases) diseñadas para identificar el gen de interés de la proteína codificada por el . La selección del ADNc o biblioteca genómica con la sonda seleccionada pueden llevarse a cabo utilizando procedimientos estándar, tales como los descritos en Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989) . Un medio alternativo para aislar el gen que codifica el anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT es utilizar metodología PCR [Sambrook et al., supra : Dieffenbach et al., PCR Primer: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1995)] . Las técnicas para seleccionar una biblioteca de ADNc son bien conocidas en la técnica. Las secuencias de oligonucleótido seleccionadas como sondas deben ser de longitud suficiente y suficientemente inambiguas que los falsos positivos se minimicen. El oligonucleótido se marca de preferencia de tal modo que puede detectarse a la hibridación al ADN en la biblioteca que se selecciona. Los métodos de marcado son bien conocidas en la técnica, e incluyen el uso de radiomarcas como ATP 32P-marcado, biotinilación o marcado con enzimas . Las condiciones de hibridización, incluyendo rigidez moderada y alta rigidez, se proporcionan en Sambrook et al. , supra. Las secuencias identificadas en tales métodos de selección de biblioteca pueden compararse y alinearse a otras - - secuencias conocidas depositadas y disponibles en bases públicas de datos tales como GenBank u otras bases privadas de datos . La identidad de secuencia (ya sea en el nivel aminoácido o nucleótido) dentro de regiones definidas de la molécula o a través de la secuencia de longitud total pueden determinarse utilizando métodos conocidos en la técnica y como aquí se describe . El ácido nucleico que tiene secuencia que codifica proteina puede obtenerse seleccionando el ADNc o las bibliotecas genómicas utilizando la secuencia de aminoácido deducida descrita en la presente por primera vez y, si es necesario, utilizando procedimientos de primera extensión convencionales como se describe en Sambrook et al . , supra, para detectar precursores y procesar intermediarios de ARNm que pueden no haber sido reversa-transcritos dentro del ADNc. 2. Selección y Transformación de Células Huésped Las células huésped se transfectan o se transforman con vectores de expresión o de clonación descritos en la presente para la producción del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT y se cultivan en un medio nutritivo convencional modificado según sea apropiado para inducir promotores, seleccionar transformadores o amplificar los genes que codifican las secuencias deseadas. Las condiciones del cultivo, tales como el medio, temperatura, pH y lo similar, pueden seleccionarse por el técnico experto sin - - experimentación indebida. En general, los principios, protocolos y técnicas prácticas para maximizar la productividad de los cultivos celulares pueden encontrarse en Mammalian Cell Biotechnology: A Practical Approach, M.Butler, ed. (IRL Press, 1991) y Sambrook et al., supra . Los métodos de transfección de célula eucariótica y transformación de célula procariótica son conocidos para el técnico de experiencia ordinaria, por ejemplo, CaCl2, CaP0 , liposoma-mediada y electroporación. Dependiendo de la célula huésped utilizada, la transformación se lleva a cabo utilizando técnicas estándar apropiadas para tales células . El tratamiento de calcio empleando cloruro de calcio, como se describe en Sambrook et al . , supra o la electroporación se utilizan generalmente para procariotos . La infección con Agrobacterium tumefaciens se utiliza para la transformación de ciertas células vegetales como se describe por Shaw et al., Gene, 23_:315 (1983) y O 89/95859 publicada el 29 de Junio de 1989. Para células de mamífero sin tales paredes celulares, puede emplearse el método de precipitación de fosfato de calcio de Graham y van der Eb, Virology, 52 :456-457 (1978) . Los aspectos generales de las transfecciones de sistema huésped de célula de mamífero se han descrito en la Patente de E.U. No. 4,399,216. Las transformaciones en levadura se llevan a cabo típicamente de acuerdo al método de Van Solingen et al., J. Bact . , 130 :946 (1977) y Hsiao et al., - - Proc. Nati. Acad. Sci . (USA), 76:3829 (1979) . Sin embargo, también pueden utilizarse otros métodos para introducir el ADN en las células tales como microinyección nuclear, electroporación, fusión bacterial de protoplasto con células intactas o policationes , e.g., polibreno, poliornitina . Para varias técnicas para transformar células de mamífero, ver Keo n et al., Methods in Enzimology, 185:527-537 (1990) y Mansour et al., Nature, 336:348-352 (1988). Las células huésped adecuadas para clonar o expresar el ADN en los vectores en la presente incluyen procarioto, levadura o mayores células eucarioto. Los procariotos incluyen pero no se limitan a eubacteria, tal como organismos Gramo-negativo o Gramo-positivo, por ejemplo, Enterobacteriáceas tal como E. coli. Varias especies de E. coli se encuentran disponibles públicamente, tales como la especie E. coli K12 294 (ATCC 31,446); E. coli X1776 (ATCC 31,537); la especie E. coli 3110 (ATCC 27,325) y 5 772 (ATCC 53,635). Otras células procarioticas huésped adecuadas incluyen Enterobacteriáceas tales como Escherichia, e.g., E. coli, Enterobacter, Erwinia, Klehsiella, Proteus, Sal onella, e.g., Salmonella typhimuriu , Serratia, e.g., Serratia marcescans y Shigella, así como Bacilli tales como B. subtilis y B. licheniformis (e.g., B. licheniformis 41P descrita en DD 266,710 publicada el 12 de Abril de 1989), Pseudomonas tales como P. aeruginosa y Streptoyces. Estos - ejemplos son ilustrativos en lugar de limitantes. La especie W3110 es un huésped o huésped nativo par icularmente preferido debido a que es una especie huésped común para las fermentaciones de producto del ADN recombinante . Preferentemente, la célula huésped secreta cantidades mínimas de enzimas proteolíticas . Por ejemplo, la especie 3110 puede modificarse para efectuar una mutación genética en los genes que codifican las proteínas endógenas al huésped, con ejemplos de tales huéspedes incluyendo la especie E. coli W3110 1A2, que tiene el genotipo tonA completo; especie E. coli W3110 9E4, que tiene el genotipo tonA ptr3 completo; especie E. coli W3110 27C7 (ATCC 55,244), que tiene el genotipo tonA ptr3 phoA E15 completo [argF-lac) 169 degP ompT kaif; especie E. coli W3110 37D6, que tiene el genotipo tonA ptr3 phoA E15 completo [argF-lac) 169 degP ompT rbs7 ilvG kaif; especie E. coli W3110 40B4, que es una especie 37D6 con mutación de supresión degP no resistente a la kanamicina; y la especie E. coli que tiene la proteasa periplásmica mutante descrita en la Patente de E.U. No. 4,946,783 expedida el 7 de Agosto de 1990. Alternativamente, son adecuados los métodos de clonación in vitro, e.g. , PCR u otras reacciones polimerasa de ácido nucleico. El anticuerpo de longitud total, los fragmentos de anticuerpo y las proteínas de fusión de anticuerpo pueden producirse en bacterias, en particular cuando no se necesita - - glicosilación y efector Fe, tal como cuando el anticuerpo terapéutico se conjuga a un agente citotóxico [e.g., una toxina) y el inmunoconjugado por sí mismo muestra efectividad en la eliminación de la célula tumoral . Los anticuerpos de longitud total tienen mayor vida media en circulación. La producción de E. coli es más rápida y más eficiente en costo. Para la expresión de fragmentos de anticuerpo y polipéptidos en bacterias, ver, e.g., la U.S. 5,648,237 (Cárter et al.), U.S. 5,789,199 (Joly et al.) y U.S. 5, 840,523 (Simmons et al.) que describen la región de inicio de translación (TIR) y las secuencias de señal para optimizar la expresión y la secreción, estas patentes se incorporan en la presente mediante la referencia. Después de la expresión, el anticuerpo se aisla a partir de pasta celular de E. coli en una fracción soluble y puede purificarse mediante, e.g., una columna A o G de proteína dependiendo del isotipo. La purificación final puede llevarse a cabo similar al proceso para purificar el anticuerpo expresado e.g., en células CHO. Además de los procariotos, los microbios eucarióticos tales como hongos filamentosos o levadura son huéspedes de clonación o de expresión adecuados para los vectores que codifican el anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT. Saccharomyces cerevisiae es un microorganismo huésped eucariótico menor comúnmente utilizado. Otros incluyen, Schizosaccharomyces pombe (Beach - - and Nurse, Nature, 290:140 [1981]; EP 139, 383 publicada el 2 de Mayo de 1985); huéspedes Kluyvero yces (Patente de E.U. No. 4,943,529; Fleer et al., Bio/Technology, 9:968-975 (1991) tales como e.g. , K. lactis (MW98-8C, CBS683, CBS4574; Louvencourt et al.,.J. Bacteriol . , 154 (2 ): 737-742 [1983]); K.fragilis (ATCC 12,424), K. bulgaricus (ATCC 16,045); K. wickeramii (ATCC 24,178); K. waltii (ATCC 56,500), K. drosophilarum (ATCC 36,906; Van der Berg et al., Bio/Technology, 8:135 (1990)), K. thermotolerans y K. marxianus; yarrowia (EP 402,226); Pichia pastoris (EP 183,070; Sreekrishna et al., J. Basic Microbiol ., 28 : 265-278 [1988]; Candida; Trichoderma recia (EP 244,234); Neurospora crassa (Case et al., Proc. Nati. Acad. Sci . USA 76:5259-5263 [1979] ) ; Schwanniomyces tales como Schwanniomyces occidentalis (EP 394,538 publicada en Octubre 31 de 1990); y hongos filamentosos tales como e.g., Neurospora, Penicillium, Tolypocladium (WO 91/00357 publicada el 10 de Enero de 1991) y huéspedes Aspergilius tales como A. nidulans (Ballance et al., Biochem. Biophys. Res. Commmon, 112:284-289 [1983]; Tilburn et al., Gene, 26:205-221 [1983]; Yelton et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 81:1470-1474 [1984]; y A Níger (Kelly and Hynes, EMBO J. , 4:475-479 [1985]. Las levaduras metilotrópicas son adecuadas en la presente e incluyen, pero no se limitan a, levadura capaz de crecimiento en metanol seleccionada del género que consiste de Hansenula, Candida, - - Kloeckera, Pichia, Saccharomyces, Torulopsis y Rhodotorula. Una lista de las especies específicas que son e emplificativos de esta clase de levaduras puede encontrarse en C. Anthony, The Biochemistry of Methylotrophs, 269 (1982) . Las células huésped adecuadas para la expresión de anticuerpo anti-TAT o del polipéptido TAT se derivan de organismos multicelulares. Ejemplos de células invertebradas incluyen las células de insectos tales como Drosophila S2 y Spodoptera Sf9, así como células vegetales, tales como los cultivos celulares de algodón, maíz, semilla de soya, petunia, tomate y tabaco. Se han identificado numerosas especies y variantes bacilovirales y las células huésped de insecto permisivas correspondientes de huéspedes tales como Spodoptera frugiperda (oruga) , Aedes aegypti (mosquito) , Aedes albopictus (mosquito) , Drosophila melanogaster (mosca de la fruta) y Bombix mori . Una variedad de especies virales para transfeccion se encuentran disponibles públicamente, e.g. , la variante L-l de Autographa californica NPV y la especie Bm-5 de Bombix mori NPV y tales virus pueden utilizarse como el virus presente de acuerdo con la presente invención, particularmente para la transfeccion de células de Spodoptera frugiperda. Sin embargo, el interés ha sido mayor en las células vertebradas y la propagación de las células vertebradas en cultivo (cultivo de tejido) se ha convertido - - en un procedimiento de rutina. Los ejemplos de líneas celulares huésped de mamífero útiles son la línea CV1 de riñon de mono transformada por SV40 (COS-7, ATCC CRL 1651) ; línea de riñon embriónico humano (293 o células 293 subclonadas para crecimiento en cultivo en suspensión, Graham et al., J. Gen Virol . 36:59 (1977)); células renales de bebe hámster (BHK, ATCC CCL 10) ; células ováricas de hámster Chino/-DHFR (CHO, Urlaub et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980); células sertoli de ratón (TM4, Mather, Biol . Reprod. , 23:243-251 (1980)); células renales de mono (CV1 ATCC CCL 70) ; células renales de mono verde africano (VERO-76, ATCC CRL-1587) ; células de carcinoma cervical humano (HELA, ATCC CCL 2) ; células renales caninas (MDCK, ATCC CCL 34) ; células hepáticas de rata búfalo (BRL 3A, ATCC CRL 1442); células pulmonares humanas (W138, ATCC CCL 75); células hepáticas humanas (Hep G2, HB 8065) ; tumor mamario de ratón (MMT 060562, ATCC CCL 51); células TRI (Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982)); células MRC 5; células FS4; y una línea de hepatoma humano (Hep G2) . Las células huésped se transforman con los vectores de expresión o de clonación anteriormente descritos para la producción del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT y se cultivan en un medio nutritivo convencional modificado según sea apropiado para inducir promotores, seleccionar transformantes o amplificar los genes que codifican las secuencias deseadas . 3. Selección y uso de un Vector Replicable El ácido nucleico (e.gr., ADNc o ADN genómico) que codifica el anticuerpo anti-TAT o polipéptido ??? pueden insertarse en un vector replicable para clonación (amplificación del ADN) o para expresión. Varios vectores se encuentran públicamente disponibles. El vector, por ejemplo, puede encontrarse en forma de un plásmido, cósmido, partícula viral o fago. La secuencia de ácido nucleico apropiada puede insertarse en el vector mediante una variedad de procedimientos . En general , el ADN se inserta dentro de el (los) sitio (s) de restricción de endonucleasa apropiado (s) utilizando técnicas conocidas en la técnica. Los componentes del vector incluyen generalmente, pero no se limitan a, uno o más de una secuencia de señal, un origen de replicación, uno o más genes marcadores, un elemento de aumento, un promotor y una secuencia de terminación de transcripción. La construcción de vectores adecuados que contienen uno o más de estos componentes emplea técnicas de enlace estándar que son conocidas para el técnico experto. El TAT puede producirse de manera recombinante no solo directamente, sino también como un polipéptido de fusión con un polipéptido heterólogo, que puede ser una secuencia de señal u otro polipéptido que tiene un sitio de segmentación específico en el N-terminus de la proteína madura o polipéptido. En general, la secuencia de señal puede ser un componente del vector o puede ser parte del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT que codifica el ADN que se encuentra insertado en el vector. La secuencia de señal puede ser una secuencia procariótica de señal seleccionada, por ejemplo, del grupo de la fosfatasa alcalina, penicillinasa, lpp o derivaciones termo-estables de enterotoxina II. Para la secreción de la levadura la señal de secuencia puede ser e.g. , la derivación de levadura invertasa, la derivación del factor alfa (incluyendo Saccharomyces y derivaciones de Kluyveromyces factor a, las últimas descritas en la Patente de E.U. No. 5,010,182); o derivación de fosfatasa de ácido, la derivación glucoamilasa de C. albicans (EP 362,179 publicada el 4 de Abril de 1990) o la señal descrita en O 90/1364S publicada el 15 de Noviembre de 1990. En la expresión de la célula de mamífero, las secuencias de señal de mamífero pueden utilizarse para la secreción directa de la proteína, tal como las secuencias de señal de polipéptidos secretados de la misma especie o relacionada, así como líderes secretores virales. Tanto los vectores de expresión como de clonación contienen una secuencia de ácido nucleico que permite que el vector se repita en una o más células huésped seleccionadas . Tales secuencias son bien conocidas para una variedad de bacterias, levadura y virus. El origen de la replicación a - - partir del plásmido pBR322 es adecuado para la mayor parte de las bacterias Gramo-negativas , el origen de plásmido 2m es adecuado para la levadura y varios orígenes virales (SV40, polioma, adenovirus, VSV o BPV) son útiles para la clonación de vectores en células de mamífero. Los vectores de expresión y clonación contendrán típicamente un gen de selección, también llamado un marcador seleccionable . Los genes de selección típicos codifican proteínas que (a) confieren resistencia a los antibióticos u otras toxinas, e.g. , ampicilina, neomicina, metotrexato o tetraciclina, (b) complementan las deficiencias auxotrópicas o (c) suministran nutrientes críticos no disponibles del medio compuesto, e.g., la racemasa D-alanina que codifica el gen para Bacilli . Un ejemplo de marcadores seleccionables adecuados para células de mamífero son aquellos que permiten la identificación de células competentes para recibir el ácido nucleico que codifica el anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT, tales como DHFR o quinasa timidina. Una célula huésped apropiada cuando se emplea DHFR del tipo silvestre es la línea celular CHO deficiente en actividad DHFR, preparada y propagada como se describe por Urlaub et al. , Proc. Nati. Acad. Sci . USA 77:4216 (1980). Un gen de selección adecuado para su uso en la levadura es el gen trpl presente en el plásmido de levadura YRp7 [Stinchcomb et al., Mature, 282:39 (1979); ingsman et al . , Gene 7:141 (1979); Tschemper et al., Gene 10:57 (1980)] . El gen trpl proporciona un marcador de selección para una especie mutante de levadura que carece de la habilidad para crecer en triptofano, por ejemplo, ATCC No. 44076 o PEP4-1 [Jones, Genetics, 85:12 (1977)]. Los vectores de expresión y de clonación comúnmente contienen un promotor operablemente enlazado a la secuencia de ácido nucleico que codifica el anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT para dirigir la síntesis directa de ARNm. Los promotores reconocidos por una variedad de células huésped potenciales son bien conocidos. Los promotores adecuados para su uso con huéspedes procarióticos incluyen los sistemas promotores de jS-lactamasa y lactosa [Chang et al., Nature, 275:615 (1978); Goeddel et al., Nature , 281:544 (1979)], fosfatasa alcalina, un sistema de promotor de triptofano (trp) [Goeddel, Nucleic Acids Res . , 8:4057 (1980); EP 36,776] y promotores híbridos tales como el promotor tac [deBoer et al., Proc. Nati. Acad. Sei. USA, 80:21-25 (1983)]. Los promotores para uso en sistemas bacteriales contendrán también una secuencia Shine-Dalgrano (S.D.) operablemente enlazada al anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT que codifica el ADN. Los ej emplos de secuencias promotoras adecuadas para su uso con huéspedes de levadura incluyen los promotores para la 3-fosfoglicerato quinasa [Hitzeman et al., J. Biol ..
- - Chem. , 255:2073 (1980)] u otras enzimas glicolíticas [Hess et al., J. Adv. Enzyme Reg., 7:149 (1968); Holanda, Biochemistry, 17:4900 (1978)], tal como enolasa, gliceraldehído-3-fosfato dehidrogenasa, hexoquinasa, piruvato descarboxilasa, fosfo fructoquinasa, glucosa-6-fosfato isomerasa, 3 -fosfoglicerato mutasa, piruvato quinasa, tiosefosfato isomerasa, fosfoglucosa isomerasa y glucoquinasa . Otros promotores de levadura, que son promotores inducibles que tienen la ventaja adicional de la transcripción controlada por las condiciones de crecimiento, son las regiones promotoras para alcohol dehidrogenasa 2, isocitocromo C, ácido fosfatasa, enzimas degradativas asociadas con el metabolismo del nitrógeno, metalotioneina, gliceraldehído-3-fosfato dehidrogenasa y enzimas responsables de la utilización de maltosa y galactosa. Los vectores y promotores adecuados para su uso en la expresión de levadura se describen adicionalmente en la EP 73,657. Una transcripción del anticuerpo anti-TAT o del polipéptido TAT a partir de los vectores en células huésped de mamífero se controla, por ejemplo, mediante los promotores obtenidos de los genomas o virus tales como virus de polioma, virus de viruela (UK 2,211,504 publicada el 5 de Julio de 1989) , adenovirus (tal como un Adenovirus 2) , virus de papiloma bovino, virus de sarcoma avícola, citomegalovirus, - - un retrovirus, virus de hepatitis B y Virus de Simio 40 (SV40) , de promotores heterólogos de mamífero, e.g., el promotor de actina o un promotor de inmunoglobulina y de los promotores de choque térmico, a condición de que tales promotores sean compatibles con los sistemas de célula huésped. La transcripción de un ADN que codifica el anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT mediante eucariotos mayores puede incrementarse insertando una secuencia de aumento en el vector. Los aumentadores son elementos cis-activos del ADN, comúnmente de aproximadamente 10 a 300 bp, que actúan en un promotor para incrementar su transcripción. Muchas secuencias de aumento se conocen ahora para los genes de mamífero (globina, elastasa, albúmina, D-fetoproteína, e insulina) . Típicamente, sin embargo, se utilizará un aumentador de un virus de célula eucariótica. Los ejemplos incluyen el aumentador SV40 en el lado posterior del origen de replicación (bp 100-270) , el aumentador promotor citomegalovirus , el aumentador polioma en el lado posterior del origen de replicación y los aumentadores de adenovirus. El aumentador puede unirse dentro del vector en la posición 5' o 3' a la secuencia de codificación del anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT, pero se localiza preferentemente en un sitio 5' desde el promotor. Los vectores de expresión utilizados en células - - huésped eucarióticas (células de levadura, de hongo, de insecto, vegetales, animales, humanas o nucleadas de otros organismos multicelulares) también contendrán las secuencias necesarias para la terminación de la transcripción y para estabilizar el ARNm. Tales secuencias se encuentran comúnmente disponibles de las regiones no traducidas 5' y ocasionalmente 3' de los ADNs o ADNcs eucarióticos o virales. Estas regiones contienen segmentos de nucleótido transcritos como fragmentos poliadenilados en la porción no traducida del ARNm que codifica el anticuerpo anti-TAT o el polipéptido TAT. Aún otros métodos, vectores y células huésped adecuados para su adaptación a la síntesis de un anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT en un cultivo celular recombinante vertebrado se describen en Gething et al., Nature, 293:620-625 (1981); Mantei et al., ature, 281:40-46 (1979); EP 117, 060; y EP 117,058. 4. Cultivo de las Células Huésped Las células huésped utilizadas para producir el anticuerpo anti-TAT y el polipéptido TAT de esta invención pueden cultivarse en una variedad de medios . Los medios comercialmente disponibles tales como el de Ham FIO (Sigma) , Minimal Essential Médium (MEM) , (Sigma), RPM1.-1640 (Sigma) y el Modified Eagle's Médium de Dulbecco (DMEM) , (Sigma) son adecuados para el cultivo de las células huésped. En - - adición, cualquiera de los medios descritos en Ham et al., Meth. Enz. 58:44 (1979), Barnes et al., Anal. Biochem. 102:255 (1980), Pats. de E.U. Nos. 4,767,704; 4,657,866; 4,927,762; 4,560,655; o 5,122,469; WO 90/03430; WO 87/00195; o Pat de E.U. Re. 30,985 pueden utilizarse como medio de cultivo para las células huésped. Cualquiera de estos medios puede suplementarse según sea necesario con hormonas y/o otros factores de crecimiento (tales como insulina, transferrina o factor de crecimiento epidérmico) , sales (tales como cloruro de sodio, calcio, magnesio y fosfato) , amortiguadores (tales como HEPES) , nucleótidos (tales como adenosina y timidina) , antibióticos (tales como la droga GENTAMYCIN®) , elementos de rastreo (definidos como compuestos inorgánicos comúnmente presentes en las concentraciones finales en el rango micromolar) y glucosa o una fuente de energía equivalente . Cualquier otro suplemento necesario puede incluirse también a las concentraciones adecuadas que serán conocidas por los expertos en la técnica. Las condiciones del cultivo, tales como temperatura, pH y lo similar, son aquellas previamente utilizadas con la célula huésped seleccionada para la expresión y serán aparentes para el técnico de experiencia ordinaria. 5. Detección de Amplificación/Expresión del Gen La amplificación y/o expresión del gen puede medirse en una muestra directamente, por ejemplo, mediante - - inmunotransferencia convencional, inmunotransferencia para cuantificar la transcripción de ARNm [Thomas, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77:5201-5205 (1980)], coloración por puntos (análisis de 7ADN) o hibridación in situ, utilizando una sonda apropiadamente marcada, en base a las secuencias proporcionadas en la presente. Alternativamente, pueden emplearse anticuerpos que puedan reconocer duplos específicos, incluyendo duplos de ADN, duplos de AR y duplos híbridos de ADN-AR o duplos de ADN-proteína . Los anticuerpos a su vez pueden marcarse y puede llevarse a cabo el análisis cuando los duplos se encuentran unidos a una superficie, de modo que al formarse los duplos en la superficie, puede detectarse la presencia de anticuerpo unido al duplo . La expresión del gen, alternativamente, puede medirse mediante métodos inmunológicos, tales como la coloración inmunohistoquímica de las células o secciones de tejido y análisis del cultivo celular o los fluidos corporales, para cuantificar directamente la expresión del producto del gen. Los anticuerpos útiles para la coloración inmunohistoquímica y/o el análisis de los fluidos muestra pueden ser ya sea monoclonales o policlonales y pueden prepararse en cualquier mamífero. Convenientemente, pueden prepararse anticuerpos contra un polipéptido TAT de secuencia nativa o contra un péptido sintético en base a las secuencias - - de ADN provistas en la presente o contra una secuencia exógena fusionada a ADN TAT y que codifica un epitope de anticuerpo específico. 6. Purificación del Anticuerpo Anti-TAT y el Polipéptido TAT Las formas del anticuerpo anti-TAT y el polipéptido TAT pueden recuperarse del medio de cultivo o de lisatos de células huésped. Si se encuentra unido a la membrana, puede liberarse de la membrana utilizando una solución detergente adecuada (e.g., Triton-X 100) o mediante segmentación enzimática. Las células empleadas en la expresión del anticuerpo anti-TAT y el polipéptido TAT pueden romperse mediante varios medios físicos o químicos, tales como ciclaje de congelación-deshielo, sonicación, rompimiento mecánico o agentes de lisado celular. Puede desearse purificar el anticuerpo anti-TAT y el polipéptido TAT a partir de proteínas o polipéptidos celulares recombinantes . Los siguientes procedimientos son ej emplificativos de procedimientos de purificación adecuados: mediante el fraccionamiento en una columna de intercambio de ión; precipitación de etanol; HPLC en fase de reversa; cromatografía en sílice o en una resina de intercambio de catión tal como DEAE; cromatoenfoque; SDS-PAGE; precipitación de sulfato de amonio; filtración de gel utilizando, por ejemplo, Sephadex G-75; columnas de proteína A Sepharosa para - - retirar contaminantes tales como IgG; y columnas de quelación de metal para enlazar formas marcadas con epítope del anticuerpo anti-TAT y el polipéptido TAT. Varios métodos de purificación de proteína pueden emplearse y tales métodos se conocen en la técnica y se describen por ejemplo en Deutscher, Methods in Enzymology, 182 (1990) ; Scopes Protein Purification: Principies and Practice, Springer-Verlag, New York (1982). La(s) etapa (s) de purificación seleccionada (s) dependerá (n) , por ejemplo, de la naturaleza del proceso de producción utilizado y del anticuerpo anti-TAT o polipéptido TAT producido. Al utilizar técnicas recombinantes , el anticuerpo puede producirse intracelulármente, en el espacio periplásmico o secretarse directamente dentro del medio. Si el anticuerpo se produce intracelularmente, como primera etapa, el desecho particulado ya sean células huésped o fragmentos lisados, se retira, por ejemplo, mediante centrifugación o ultrafiltración. Cárter et al., Bio-Technology, 10:163-167 (1992) describe un procedimiento para aislar anticuerpos que se secretan hacia el espacio periplásmico de E. coli. Brevemente, la pasta celular se derrite en presencia de acetato de sodio (pH 3.5), EDTA y fenilmetilsulfonilfluoruro (P SF) durante aproximadamente 30 min. El desecho celular puede retirarse mediante centrifugación. Cuando el anticuerpo se secreta dentro del - - medio, los sobrenadantes de tales sistemas de expresión en general se concentran primero utilizando un filtro de proteína comercialmente disponible, por ejemplo, una unidad de ultrafiltración Amicon o Millipore. Puede incluirse un inhibidor de proteasa tal como P SF en cualquiera de las etapas anterio'res para inhibir la proteolisis y pueden incluirse antibióticos para prevenir el crecimiento de contaminantes accidentales. La composición de anticuerpo preparada a partir de las células puede purificarse utilizando, por ejemplo, cromatografía de hidroxilapatita, electroforesis en gel, diálisis y cromatografía de afinidad, con la cromatografía de afinidad siendo la técnica de purificación preferida. La adecuabilidad de la proteína A como enlazando de afinidad depende de las especies y el isotipo de cualquier dominio Fe de inmunoglobulina que se encuentre presente en el anticuerpo. La proteína A puede utilizarse para purificar anticuerpos que se basan en las cadenas pesadas de DI, ?2 o ?4 humano (Lindmark et al., J.Immunol. Meth. 62:1-13 (1983)). La proteína G se recomienda para todos los isotipos de ratón y para el D3 humano (Guss et al., EMBO J. 5:15671575 (1986)). La matriz a la cual se encuentra unido el ligando de afinidad es más frecuentemente agarosa, pero se encuentran disponibles otras matrices. Las matrices mecánicamente estables tales como de vidrio de poro controlado o de - - poli (estirenodivinil) benceno permiten proporciones de flujo más rápidas u pequeñas tiempos de procesamiento de los que pueden lograrse con agarosa. Cuando el anticuerpo comprende un dominio CH3 , la resina Bakerbond ABX™ (J.T. Baker, P illipsburg, NJ) es útil para la purificación. Otras técnicas para la purificación de proteína tales como fraccionamiento en una columna de intercambio de ion, precipitación de etanol, HPLC en Fase de Reversa, cromatografía en sílice, cromatografía en heparina SEPHAROSE™, cromatografía en una resina de intercambio de anión o catión (tal como una columna de ácido poliaspártico) , cromatoenfoque , SDS-PAGE y precipitación de sulfato de amonio se encuentran disponibles dependiendo del anticuerpo a recupera . Siguiendo cualquier etapa preliminar de purificación, la mezcla que comprende el anticuerpo de interés y los contaminantes pueden someterse a cromatografía hidrofóbica de interacción de bajo pH utilizando un amortiguador de elusión a un pH entre aproximadamente 2.5-4.5, de preferencia efectuada a bajas concentraciones de sal (e.g., desde aproximadamente 0-0.25M de sal) . J. Formulaciones Farmacéuticas Las formulaciones terapéuticas de los anticuerpos anti-TAT, los oligopéptidos de enlace TAT, las moléculas orgánicas de enlace TAT y/o los polipéptidos TAT utilizados - - de acuerdo con la presente invención se preparan para almacenamiento mezclando el anticuerpo, polipéptido oligopéptido o molécula orgánica que tiene el grado deseado de pureza con vehículos farmacéuticamente aceptables opcionales, excipientes o estabilizadores (Remington' s Pharmaceutical Sciences, 16a. edición Osol, A. Ed. (1980)), en forma de formulaciones liofilizadas o soluciones acuosas. Los vehículos, excipientes o estabilizadores aceptables son no-tóxicos para los receptors en las dosis y concentraciones empleadas, e incluyen amortiguadores tales como acetato, Tris, fosfato, citrato y otros ácidos orgánicos; antioxidantes incluyendo ácido ascórbico y metionina; preservativos (tales como cloruro de octadecildimetilbenzil amonio; cloruro de hexametonio; cloruro de benzalkonio, cloruro de benzetonio; alcohol de fenol, butilo o bencilo; parabenos de alquilo tales como parabeno de metilo o propilo; catecol; resorcitol; ciclohexanol ,- 3-pentanol; y m-cresol) ; polipéptidos de bajo peso molecular (menor que aproximadamente 10 residuos) ; proteínas, tales como albúmina de suero, gelatina o inmunoglobulinas ; polímeros hidrofílicos tales como polivinilpirrolidona,- aminoácidos tales como glicina, glutamina, asaparagina, histidina, arginina o lisina; monosacáridos , disacáridos y otros carbohidratos incluyendo glucosa, mannosa o dextrinas; agentes de quelacion tales como EDTA; tonicificadores tales como trehalosa y - - cloruro de sodio; azúcares tales como sucrosa, mannitol, trehalosa o sorbitol; surfactantes tales como polisorbato; contra iones de formación de sal tales como sodio; compuestos de metal {e.g. , compuestos de Zn-proteína) ; y/o surfactantes no-iónicos tales como TWEEN®, PLURONICS® o polietilen glicol (PEG) . El anticuerpo comprende de preferencia el anticuerpo en una concentración de entre 5-200 mg/ml, de preferencia entre 10-100 mg/ml. Las formulaciones en la presente también pueden contener más de un compuesto activo según sea necesario para la indicación particular a tratar, preferentemente aquellos con actividades complementarias que no se afectan de manera adversa entre sí. Por ejemplo, en adición a un anticuerpo anti-TAT oligopéptido de enlace TAT o molécula orgánica de enlace TAT, puede ser deseable incluir en la formulación, un anticuerpo adicional, e.g., un segundo anticuerpo anti-TAT que enlaza a un epítope diferente en el polipéptido TAT o un anticuerpo para algún otro objetivo tal como un factor de crecimiento que afecta el crecimiento del cáncer particular. Alternativamente o adicionalmente, la composición puede comprender además un agente quimioterapéutico, agente citotóxico, citosina, agente inhibidor del crecimiento, agente anti-hormonal y/o cardioprotector. Tales moléculas se encuentran adecuadamente presentes en combinación en cantidades que son efectivas para el propósito pretendido.
- - Los ingredientes activos también pueden encerrarse en microcápsulas preparadas, mediante técnicas de coacervación o mediante polimerización interfacial, por ejemplo, microcápsulas de hidroximetilcelulosa o gelatina y microcápsulas de poli- (metilmetacrilato) , respectivamente, en sistemas coloidales de suministro de drogas (por ejemplo, liposomas, microesferas de albúmina, microemulsiones, nano-partículas y nanocápsulas) o en macroemulsiones . Tales técnicas se describen en Remington's Pharmaceutical Sciences, 16a. edición Osol, A. Ed. (1980) . Pueden prepararse preparaciones de liberación sostenida. Los ejemplos adecuados de preparaciones de liberación sostenida incluyen matrices semi-permeables de polímeros ' hidrofóbicos sólidos que contienen el anticuerpo, cuyas matrices se encuentran en forma de artículos conformados, e.g., películas o microcápsulas. Los ejemplos de matrices de liberación sostenida incluyen poliésteres, hidrogeles (por ejemplo, poli (2 -hidroxietil-metacrilato) o poli (vinilalcohol) ) , poliláctidos (Pat. de E.U: No. 3,773,919), copolímeros de ácido L-glutámico y ? etil-L-glutamato, acetato de etilen-vinilo no degradable, copolímeros degradables de ácido l ctico-ácido glicólico tales como LUPRON DEPOT® (microesferas inyectables compuestas de copolímero de ácido láctico-ácido glicólico y acetato de leuprolida) y ácido poli-D- (-) -3-hidroxibutírico.
- - Las formulaciones a utilizar para la administración in vivo deben ser estériles. Esto se logra fácilmente mediante filtración a través de membranas de filtración estériles . K. Diagnóstico y Tratamiento con Anticuerpos Anti-TAT oligopéptidos de Enlace TAT y Moléculas Orgánicas de Enlace TAT Para determinar la expresión TAT en el cáncer, se encuentran disponibles varios análisis. En una modalidad, la sobreexpresion del polipéptido TAT puede analizarse mediante inmunohistoquímica (IHC) . Secciones de tejido inmersos en parafina de una biopsia del tumor pueden someterse al análisis IHC y adecuarse a un criterio de intensidad de coloración de la proteína TAT como sigue : Puntuación 0 - no se observa coloración o se observa coloración en membrana en menos del 10% de las células tumorales . Puntuación 1 + - se detecta una coloración tenue/apenas perceptible en membrana en más del 10% de las células tumorales. Las células solo están coloreadas en parte de su membrana. Puntuación 2 + - se observa una coloración débil a moderada en la membrana completa en más del 10% de las células tumorales . Puntuación 3 + - se observa una coloración moderada - - a fuerte en la membrana completa en más del 10% de las células tumorales. Aquellos tumores con puntuación de 0 o 1+ para la expresión del polipéptido TAT pueden caracterizarse como que no sobreexpresan TAT, mientras que aquellos tumores con puntuaciones de 2+ o 3+ pueden caracterizarse como que sobreexpresan TAT. Alternativamente o adicionalmente, los análisis FISH tales como el INFORM® (vendido por Ventana, Arizona) o PATHVISION® (Vysis, Illinois) pueden llevarse a cabo en tejido tumoral fijo en formalina, inmerso en parafina para determinar el grado (si existe) de sobreexpresión TAT en el tumor. La sobreexpresión o amplificación TAT puede evaluarse utilizando un análisis de diagnóstico in vivo, e.g., administrando una molécula (tal como un anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica) que enlaza la molécula a detectar y se marca con una marca detectable {e.g., un isótopo radioactivo o una marca fluorescente) y explorando externamente al paciente para la localización de la marca. Como se describió anteriormente, los anticuerpos anti-TAt oligopéptidos y moléculas orgánicas de la invención tienen varias aplicaciones no-terapéuticas. Los anticuerpos anti-TAT oligopéptidos y moléculas orgánicas de la presente invención pueden ser útiles para el diagnóstico y - - estadificación de cánceres que expresan el polipéptido TAT {e.g., en radiovisualización) . Los anticuerpos oligopéptidos y moléculas orgánicas son también útiles para la purificación o inmunoprecipitación del polipéptido TAT de las células, para la detección y cuantificación del polipéptido TAT in vit.ro, e.g., en un ELISA o una inmunotransferenciá, para destruir y eliminar las células que expresan TAT de una población de células mezcladas como una etapa en la purificación de otras células. Actualmente, dependiendo de la etapa del cáncer, el tratamiento del cáncer implica una o una combinación de las siguientes terapias: cirugía para retirar el tejido canceroso, terapia de radiación y quimioterapia. La terapia con anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica puede ser especialmente deseable en pacientes ancianos que no toleran bien la toxicidad y los efectos laterales de la quimioterapia y en enfermedad metastática donde la terapia de radiación tiene una utilidad limitada. Los anticuerpos anti-TAT oligopéptidos y moléculas orgánicas que se dirigen al tumor de la invención son útiles para aliviar cánceres que expresan TAT al diagnóstico inicial de la enfermedad o durante la recaída. Para aplicaciones terapéuticas, el anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica puede utilizarse solo o en terapia de combinación con, e.g., hormonas, antiangiogenes o compuestos radiomarcados o con - - cirugía, crioterapia y/o radioterapia. El tratamiento con anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica puede administrarse en conjunción con otras formas de terapia convencionales, consecuentemente con ya sea la terapia pre- o post-convencional . Las drogas quimioterapéuticas tales como TAXOTERE® (docetaxel) , TAXOL® (palictaxel) , estramustina y mitoxantrona se utilizan en el tratamiento del cáncer, en particular, en pacientes de alto riesgo. En el presente método de la invención para el tratamiento o alivio del cáncer, puede administrarse al paciente con cáncer el anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica en conjunción con el tratamiento con uno o más de los agentes quimioterapéuticos precedentes. En particular, se contempla la terapia de combinación con palictaxel y derivados modificados (ver, e.g., EP0600517) . El anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica se administrará con una dosis terapéuticamente efectiva del agente quimioterapéutico . En otra modalidad, el anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica se administra en conjunción con quimioterapia para mejorar la actividad y eficacia del agente quimioterapéutico, e.g., paclitaxel . El Physicians' Desk Reference (PDR) describe dosificaciones de estos agentes que se han utilizado en el tratamiento de varios cánceres. El régimen de dosificación y las dosificaciones de estas drogas quimioterapéuticas antes mencionadas que son terapéuticamente - - efectivos dependerán del cáncer particular a tratar, la extensión de la enfermedad y otros factores familiares para el médico experto en la técnica y pueden determinarse por el médico . En una modalidad particular, se administra al paciente un conjugado que comprende un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica conjugado con un agente citotóxico. Preferentemente, el inmunoconjugado unido a la proteina TAT se internaliza por medio de la célula, dando como resultado una eficacia terapéutica incrementada del inmunoconjugado en la eliminación de la célula cancerosa a la cual se enlaza. En una modalidad preferida, el agente citotóxico se dirige o interfiere con el ácido nucleico en la célula cancerosa. Los ejemplos de tales agentes citotóxicos se describen en lo anterior e incluyen maytansinoides, calicheamicinas , ribonucleasas y endonucleasas de ADN. Los anticuerpos anti-TAT oligopéptidos, moléculas orgánicas o conjugados de toxina de los mismos se administran a un paciente humano, de acuerdo con métodos conocidos, tales como la administración intravenosa, e.g., como un bolo o mediante infusión continua durante un período de tiempo, mediante vias intramuscular, intraperitoneal, intracerebroespinal, subcutánea, intra-articular, intrasinovial , intratecal oral, tópica o inhalación. Se prefiere la administración intravenosa o subcutánea del anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica. Otros regímenes terapéuticos pueden combinarse con la administración del anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica. La administración combinada incluye la co-administración utilizando formulaciones separadas o una sola formulación farmacéutica y la administración consecutiva en cualquier orden, en donde preferentemente existe un período de tiempo mientras que ambos (o todos los) agentes activos ejercen simultáneamente sus actividades biológicas. Preferentemente, tal terapia combinada da como resultado un efecto terapéutico sinergístico . También puede ser deseable combinar la administración del anticuerpo o anticuerpos anti-TAT oligopéptidos o moléculas orgánicas con la administración de un anticuerpo dirigido contra otro antígeno tumoral asociado con el cáncer particular. En otra modalidad, los métodos de tratamiento terapéutico de la presente invención implican la administración combinada de un anticuerpo (o anticuerpos) anti-TAT oligopéptidos o moléculas orgánicas y uno o más agentes quimioterapéuticos o agentes inhibidores del crecimiento, incluyendo la co- dministración de cócteles de diferentes agentes quimioterapéuticos. Los agentes quimioterapéuticos incluyen fosfato de estramustina, prednimustina, cisplatina, 5-fluorouracilo, melfalan, - - ciclofosfamida, hidroxiurea e hidroxiureataxanos (tales como paclitaxel y doxetaxel) y/o antibióticos de antraciclina. Los programas de preparación y dosificación para tales agentes guimioterapéuticos pueden utilizarse de acuerdo con las instrucciones del fabricante o como se determine empíricamente por el practicante experto. Los programas de preparación y dosificación para tal quimioterapia también se describen en Chemotherapy Service Ed. , M.C. Perry, Williams & Williams, Baltimore, MD (1992) . El anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica pueden combinarse con un compuesto anti-hormonal; e.gr. , un compuesto anti-estrógeno tal como tamoxifen; un anti-progesterona tal como onapristona (ver, EP 616 812) ; o un anti-andrógeno tal como flutamide, en dosificaciones conocidas para tales . moléculas . Cuando el cáncer a tratar es un cáncer andrógeno independiente, el paciente puede haberse sometido previamente a la terapia anti-andrógeno y, después de que el cáncer se convierte en andrógeno independiente, puede administrarse al paciente el anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica (y opcionalmente otros agentes como se describe en la presente) . Algunas veces, puede ser benéfico co-administrar también un cardioprotector (para prevenir o reducir la disfunción miocardial asociada con la terapia) o una o más citosinas al paciente. En adición a los regímenes terapéuticos anteriores, el paciente puede someterse al retiro quirúrgico de las células cancerosas y/o a terapia de radiación, antes de, simultáneamente con o posterior a la terapia de anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica. Las dosis adecuadas para cualquiera de los agentes coadministrados anteriores son aquellas actualmente utilizadas y pueden disminuirse debido a la acción combinada (sinergia) del agente y el anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica. Para la prevención o tratamiento de la enfermedad, la dosis y el modo de administración se seleccionarán por el médico de acuerdo con criterios conocidos. La dosis apropiada del anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica dependerá del tipo de enfermedad a tratar, como se definió anteriormente, la severidad y el curso de la enfermedad ya sea que el anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica se administre para propósitos preventivos o terapéuticos, la terapia previa, la historia clínica del paciente y la respuesta al anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica y la discreción del médico que lo atiende. El anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica se administra adecuadamente al paciente en una vez o sobre una serie de tratamientos. Preferentemente, el anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica se administra mediante infusión intravenosa o mediante inyecciones subcutáneas . Dependiendo del tipo y la - - severidad de la enfermedad, de aproximadamente 1 Dg/kg hasta aproximadamente 50 mg/kg de peso corporal (e.gr. , aproximadamente 0.1-15 mg/kg/dosis) del anticuerpo puede ser una dosis inicial candidato para la administración al paciente ya sea, por ejemplo, mediante una o más administraciones separadas o mediante infusión continua. Un régimen de dosificación puede comprender la administración de una dosis inicial de carga de aproximadamente 4 mg/kg, seguida por una dosis semanal de mantenimiento de aproximadamente 2 mg/kg del anticuerpo anti-TAT. Sin embargo, pueden ser útiles otros regímenes de dosificación. Una dosis diaria típica puede fluctuar desde aproximadamente 1 Dg/kg hasta 100 mg/kg o más, dependiendo de los factores antes mencionados . Para administraciones repetidas durante varios días o más largas, dependiendo de la condición, el tratamiento se sostiene hasta que se presenta una supresión deseada de los síntomas de la enfermedad. El progreso de esta terapia puede verificarse fácilmente mediante métodos y análisis convencionales en base al criterio conocido por el médico u otras personas expertas en la técnica. Además de la administración de la proteína de anticuerpo al paciente, la presente solicitud contempla la administración del anticuerpo mediante terapia genética. Tal administración de ácido nucleico que codifica el anticuerpo se abarca en la expresión "administrar una cantidad - - terapéutica efectiva de un anticuerpo". Ver,, por ejemplo, WO96/07321 publicada el 14 de Marzo de 1996 referente al uso de la terapia genética para generar anticuerpos intracelulares . Existen dos importantes procedimientos para introducir el ácido nucleico (opcionalmente contenido en un vector) en las células del paciente; in vivo y ex vivo. Para el suministro in vivo el ácido nucleico se inyecta directamente dentro del paciente, comúnmente en el sitio en donde se requiere el anticuerpo. Para el tratamiento ex vivo, las células del paciente se retiran, el ácido nucleico se introduce en estas células aisladas y las células modificadas se administran al paciente ya sea directamente o, por ejemplo, encapsuladas dentro de membranas porosas que se implantan dentro del paciente (ver, e.g., Patentes de E.U. Nos. 4,892,538 y 5,283,187). Existe una variedad de técnicas disponibles para introducir ácidos nucleicos en células viables . Las técnicas varían dependiendo de si el ácido nucleico se transfiere dentro de células cultivadas in vit.ro o in vivo en las células del huésped pretendido. Las técnicas adecuadas para la transferencia del ácido nucleico dentro de células de mamífero in vitro incluyen el uso de liposomas, electroporación, microinyección, fusión celular, DEAE-dextran, el método de precipitación de fosfato de calcio, etc. Un vector comúnmente utilizado para el - - suministro ex vivo del gen es un vector retroviral . Las técnicas de transferencia de ácido nucleico in vivo actualmente preferidas incluyen la transfección con vectores virales (tales como adenovirus, virus de Herpes simplex I o virus adeno-asociado) y sistemas a base de lípidos (los lípidos útiles para la transferencia lipido-mediada del gen son DOTMA, DOPE y DC-Chol, por ejemplo) . Para una revisión de los protocolos de marcación de gen y terapia genética actualmente conocidos ver Anderson et al . , Science 256:808-813 (1992) . Ver, también WO 93/25673 y las referencias citadas en la misma. Los anticuerpos anti-TAT de la invención pueden encontrarse en diferentes formas abarcadas por la definición de "anticuerpo" en la presente. De este modo, los anticuerpos incluyen anticuerpo de longitud total o intacto, fragmentos de anticuerpo, anticuerpo de secuencia nativa o variantes de aminoácido, anticuerpos humanizados, quiméricos o de fusión, inmunoconjugados y sus fragmentos funcionales. En los anticuerpos de fusión una secuencia de anticuerpo se fusiona a una secuencia heteróloga de polipéptido. Los anticuerpos pueden modificarse en la región Fe para proporcionar las funciones de efector deseadas. Como se trató en mayor detalle en las secciones de la presente, con las regiones Fe apropiadas, el anticuerpo desnudo unido sobre la superficie celular puede inducir citotoxicidad, e.g. , a - - través de la citotoxicidad celular anticuerpo-dependiente (ADCC) o mediante el complemento de suministro en la citotoxicidad complemento-dependiente o algún otro mecanismo. Alternativamente, cuando es deseable eliminar o reducir la función efectora, a fin de minimizar los efectos laterales o las complicaciones terapéuticas, pueden utilizarse ciertas otras regiones Fe. En una modalidad, el anticuerpo compite para enlazarse o enlazarse sustancialmente a, el mismo epítope que los anticuerpos de la invención. Se contemplan también los anticuerpos que tienen las características biológicas de los presentes anticuerpos anti-TAT de la invención, incluyendo específicamente la dirección al tumor in vivo y cualquier inhibición de la proliferación celular o características citotóxicas. Los métodos para producir los anticuerpos anteriores se describen en detalle en la presente . Los presentes anticuerpos anti-TAT oligopéptidos y moléculas orgánicas son útiles en el tratamiento de un cáncer que expresa TAT o para aliviar uno o más síntomas del cáncer en un mamífero. Tal cáncer incluye cáncer de próstata, cáncer del tracto urinario, cáncer pulmonar, cáncer de mama, cáncer de colon y cáncer ovárico, más específicamente, adenocarcinoma prostático, carcinomas de célula renal, adenocarcinomas colorrectales, adenocarcinomas pulmonares, - - carcinomas de célula escamosa pulmonar y mesotelioma pleural . Los cánceres abarcan cánceres metastáticos de cualquiera de los precedentes. El anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica es capaz de enlazarse a al menos una porción de las células cancerosas que expresan el polipéptido TAT en el mamífero. En una modalidad preferida, el anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica es efectivo para destruir o matar las células tumorales que expresan TAT o para inhibir el crecimiento de tales células tumorales, i vitro o in vivo, al enlazarse al polipéptido TAT en la célula. Tal anticuerpo incluye un anticuerpo anti-TAT desnudo (no conjugado a ningún agente) . Los anticuerpos desnudos que tienen propiedades citotóxicas o de inhibición del crecimiento celular pueden reforzarse adicionalmente con un agente citotóxico para hacerlos incluso más potentes en la eliminación de la célula tumoral . Pueden conferirse propiedades citotóxicas a cualquier anticuerpo anti-TAT, e.g. , conjugando el anticuerpo con un agente citotóxico, para formar un inmunoconjugado como se describe en la presente. El agente citotóxico o un agente de inhibición del crecimiento es de preferencia una molécula menor. Se prefieren las toxinas tales como calicheamicina o un maytansinoide y análogos o derivados de los mismos . La invención proporciona una composición que comprende un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula - - orgánica de la invención y un vehículo. Para el propósito del tratamiento del cáncer, pueden administrarse las composiciones al paciente que necesita tal tratamiento, en donde las composiciones pueden comprender uno o más anticuerpos anti-TAT presentes como inmunoconjugados o como el anticuerpo desnudo. En una modalidad adicional, las composiciones pueden comprender estos anticuerpos oligopéptidos o moléculas orgánicas en combinación con otros agentes terapéuticos tales como agentes citotóxicos o inhbidores de crecimiento, incluyendo agentes quimioterapéuticos . La invención proporciona también formulaciones que comprenden un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica de la invención y un vehículo. En una modalidad, la formulación es una formulación terapéutica que comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable. Otro aspecto de la invención es ácidos nucleicos aislados que codifican anticuerpos anti-TAT. Se abarcan los ácidos nucleicos que codifican ambas cadenas H y L y especialmente los residuos de región hipervariable, las cadenas que codifican el anticuerpo de secuencia nativa así como las variantes, modificaciones y versiones humanizadas del anticuerpo . La invención proporciona también métodos útiles para el tratamiento de un cáncer que expresa el polipéptido - - TAT o para aliviar uno o más síntomas del cáncer en un mamífero, que comprenden administrar una cantidad terapéuticamente efectiva de un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica al mamífero. Las composiciones terapéuticas de anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica pueden administrarse a corto plazo (agudo) o crónico o intermitente como lo dirija el médico. También se proporcionan métodos para inhibir el crecimiento y destruir una célula que expresa el polipeptido TAT. La invención proporciona también equipos y artículos de manufactura que comprenden al menos un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica. Los equipos que contienen anticuerpos anti-TAT oligopéptidos o moléculas orgánicas encuentran su uso, e.g., para análisis de eliminación de célula TAT, para la purificación o inmunoprecipitación del polipéptido TAT de las células. Por ejemplo, para el aislamiento y la purificación de TAT, el equipo puede contener un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica acoplado a perlas (e.g., perlas de sefarosa) . Pueden proporcionarse equipos que contienen los anticuerpos oligopéptidos o moléculas orgánicas para la detección y cuantificación de TAT in vítro, e.g., en un ELISA o una inmunotransferencia . Tal anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica útil para la detección puede proveerse con una etiqueta tal como una radioetiqueta fluorescente.
- - L. Artículos de Manufactura y Equipos Otra modalidad de la invención es un articulo de manufactura que contiene materiales útiles para el tratamiento del cáncer que expresa anti-???. El artículo de manufactura comprende un contenedor y una etiqueta o inserto de empaque en o asociado con el contenedor. Los contenedores adecuados incluyen, por ejemplo, botellas, viales, jeringas, etc. Los contenedores pueden formarse de una variedad de materiales tales como vidrio o plástico. El contenedor contiene una composición que es efectiva para tratar una condición cancerosa y puede tener una puerta estéril de acceso (por ejemplo el contenedor puede ser una bolsa de solución intravenosa o un vial que tiene un obturador perforable mediante una aguja de inyección hipodérmica) . Al menos un agente activo en la composición es un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica de la invención. La etiqueta o inserto de empaque indica que la composición se utiliza para tratar el cáncer. La etiqueta o inserto de empaque comprenderá además instrucciones para adiministrar la composición de anticuerpo oligopéptido o molécula orgánica para el paciente con cáncer. Adicionalrnente, el artículo de manufactura puede comprender además un segundo contenedor que comprende un amortiguador farmacéuticamente aceptable, tal como agua bacteriostática para inyección (BWFI) , salina fosfato-amortiguada, solución de Ringer y solución de - - dextrosa. Puede incluir además otros materiales deseables desde un punto de vista comercial y de usuario, incluyendo otros amortiguadores, diluyentes, filtros, agujas y jeringas. También se proporcionan equipos que son útiles para varios propósitos, e.g., para análisis de eliminación de célula que expresa TAT, para la purificación o inmunoprecipitacion del polipéptido TAT de las células . Para el aislamiento y purificación del polipéptido TAT, el equipo puede contener un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica acoplada a perlas {e.g., perlas de sefarosa) . Pueden proporcionarse equipos que contienen los anticuerpos oligopéptidos o moléculas orgánicas para la detección y cuantificación del polipéptido TAT in vitro, e.g., en un ELISA o una inmunotransferencia. Como con el artículo de manufactura, el equipo comprende un contenedor y una etiqueta o inserto de empaque en o asociado con el contenedor. El contenedor contiene una composición que comprende al menos un anticuerpo anti-TAT oligopéptido o molécula orgánica de la invención. Pueden incluirse contenedores adicionales que contienen, e.g., diluyentes y amortiguadores, anticuerpos de control . La etiqueta del inserto de empaque puede proporcionar una descripción de la composición así como instrucciones para el uso pretendido in vivo o diagnóstico. M. Usos para Ácidos Nucleicos que Codifican Polipéptidos TAT y Polipéptido TAT - - Las secuencias de nucleótidos (o su complemento) que codifican polipéptidos TAT tienen varias aplicaciones en la técnica de la biología molecular, incluyendo usos como sondas de hibridización, en mapeo de cromosoma y gen y en la generación de sondas anti-sentido de ARN y ADM. El ácido nucleico que codifica TAT también será útil para la preparación de polipéptidos TAT mediante las técnicas recombinantes descritas en la presente, en donde aquellos polipéptidos TAT pueden encontrar su uso, por ejemplo, en la preparación de anticuerpos anti-TAT como se describe en la presente . El gen TAT de longitud total de la secuencia nativa o sus porciones, puede utilizarse como sondas de hibridación para una biblioteca de ADWc para aislar el ADNc de TAT de longitud total o para aislar aún otros ADNcs (por ejemplo, aquellos que codifican las variantes de TAT que se presentan naturalmente o TAT de otras especies) que tienen una identidad de secuencia deseada para la secuencia TAT nativa descrita en la presente. Opcionalmente, la longitud de las sondas será de aproximadamente 20 hasta aproximadamente 50 bases . Las sondas de hibridación pueden derivarse de regiones al menos parcialmente nuevas de la secuencia de nucleótido de longitud total nativa en donde aquellas regiones pueden determinarse sin experimentación indebida o a partir de secuencias genómicas incluyendo promotores, - - elementos aumentadores e intrones de TAT de secuencia nativa. A modo de ejemplo, un método de selección comprenderá aislar la región de codificación del gen TAT utilizando la secuencia de ADN conocida para sintetizar una sonda seleccionada de aproximadamente 40 bases. Las sondas de hibridación pueden marcarse mediante una variedad de ¦ marcas, incluyendo radionucleótidos tales como 32P o 35S o marcas enzimáticas tales como fosfatasa alcalina acoplada a la sonda a través de sistemas de acoplamiento de avidina/biotina . Las sondas marcadas que tienen una secuencia complementaria para la del gen TAT de la presente invención pueden utilizarse para seleccionar bibliotecas de ADNc humano, ADN genómico o ARNm para determinar a cuáles miembros de tales bibliotecas se hibridiza la sonda. Las técnicas de hibridación se describen en mayor detalle en los ejemplos a continuación. Cualquiera de las secuencias EST descritas en la presente solicitud pueden emplearse de manera similar como sondas, utilizando los métodos descritos en la presente. Otros fragmentos útiles de los ácidos nucleicos que codifican TAT incluyen oligonucleótidos anti-sentido o de sentido que comprenden una secuencia de ácido nucleico monocatenario (ya sea de ARN o ADN) capaz de enlazarse para dirigirse a las secuencias de ARNm TAT (sensible) o ADN TAT (anti-sensible) . Los oligonucleótidos anti-sentido o de sentido, de acuerdo con la presente invención, comprenden un - 06 - fragmento de la región de codificación del ADN TAT. Tal fragmento generalmente comprende al menos aproximadamente 14 nucleótidos, preferentemente desde aproximadamente 14 hasta 30 nucleótidos. La habilidad para derivar un oligonucleótido anti-sensible o sensible, en base a la secuencia de ADNc que codifica una proteina dada se describe, por ejemplo, en Stein and Cohén (Cáncer Res . , 48:2659, 1988) y van der Krol et al., (BioTechniques 6:958, 1988). El enlace de los oligonucleótidos de anti-sentido o de sentido a las secuencias de ácido nucleico objetivo da como resultado la formación de duplos que bloquean la transcripción o translación de la secuencia objetivo mediante uno de varios medios, incluyendo la reticulación aumentada de los duplos, la terminación prematura de la transcripción o translación o por otros mdios . Tales métodos se encuentran abarcados por la presente invención. De este modo, los oligonucleótidos anti-sentido pueden utilizarse para bloquear la expresión de las proteínas TAT, en donde aquellas proteínas TAT pueden jugar un papel en la inducción del cáncer en mamíferos. Los oligonucleótidos anti-sentido o de sentido comprenden además oligonucleótidos que tienen estructuras modificadas de azúcar-fosfodiéster (u otros enlaces de azúcar, tales como los descritos en la WO 91/06629 y en donde tales enlaces de azúcar son resistentes a las nucleasas endógenas. Tales oligonucleótidos con enlaces de - - azúcar resistentes son estables in vivo (i.e., capaces de resistir la degradación enzimática) pero retienen la especificidad de secuencia para ser capaces de enlazarse a las secuencias de nucleótidos objetivo. Los sitios intragénicos preferidos para el enlace de antisentido incluyen la región que incorpora el codón de iniciación/inicio de la traslación (5 ' -AUG/5 ' -ATG) o el codón de terminación/detención (5'-UAA, 5'-UAG y 5-UGA/5 ' -TAA, 5'-TAG y 5'-TGA) día estructura de lectura abierta (ORF) del gen. Estas regiones se refieren a una porción del ARNm o gen que abarca desde aproximadamente 25 hasta aproximadamente 50 nucleótidos contiguos en cualquier dirección (i.e., 5' o 3') desde un codón de traslación de iniciación o de terminación. Otras regiones preferidas para el enlace de antisentido incluyen: intrones, exones, uniones de intrón-exón; la estructura de lectura abierta (ORF) o "región de codificación" , que es la región entre el codón de translación de iniciación y el codón de traslación de terminación; la tapa 5' de un ARNm que comprende un residuo N7-metilado de guanosina unido al residuo más 5' del ARNm a través del enlace 5' -5' de trifosfato e incluye la estructura de la tapa 5' en si así como los primeros 50 nucleótidos adyacentes a la tapa superior; la región 5' no traducida (5'UTR) , la porción de un ARNm en la dirección 5' desde el codón de traslación de iniciación, e incluye así los nucleótidos entre el sitio de - - la tapa 5' y el codón de traslación de iniciación de un AR m o los nucleotidos correspondientes en el gen; y la región no traducida 3' (3'UTR), la porción de un ARNm en la dirección 3 ' desde el codón de traslación de terminación, e incluyendo así los nucleotidos entre el codón de traslación de terminación y el extremo 3' de un ARNm o los nucleotidos correspondientes en el gen. Ejemplos específicos de los compuestos de antisentido preferidos para inhibir la expresión de las proteínas TAT incluyen oligonucleótidos que contienen estructuras modificadas , o enlaces internucleósidos no naturales. Los oligonucleótidos que han modificado estructuras incluyen aquellos que retienen un átomo de fosfato en la estructura y los que no tienen un átomo de fósforo en la estructura. Para los propósitos de esta especificación, y como algunas veces se refiere en la técnica, los oligonucleótidos modificados que no tienen un átomo de fósforo en su estructura de internucleósidos también pueden considerarse como oligonucleósidos . Las estructuras de oligonucleótidos modificados preferidas incluyen, por ejemplo, fosforotioatos , fosforotioatos quirales, fosforoditioatos, fosforotriésteres, aminoalquilfosforotri-ésteres, fosfonatos de metilo y otros de alquilo incluyendo fosfonatos de 3 ' -alquileno, fosfonatos de 5 ' -alquileno, y fosfonatos quirales, fosfinatos, fosforamidatos incluyendo - - fosforamidatos de 3'-araino, y aminoalguilfosforoamidatos , tionofosforamidatos , tionoalquilfosfonatos , tionoalquilfosfotriésteres, selenofosf tos y borano-fosfatos que tienen enlaces normales 3'-5', análogos enlazados 2' -5' de éstos, y los que tienen polaridad invertida en donde uno o más enlaces de internucleótidos son un enlace de 3 ' a 3', de 5' a 5', o de 2' a 2'. Los oligonucleotidos preferidos que tienen invertida la polaridad comprenden un enlace único de 3' a 3' en el enlace más 3'- del internucleótido, i.e., un residuo único de nucleósido invertido que puede ser abásico (la nucleobase se pierde o tiene un grupo hidroxilo en su lugar) . Varias sales, sales mezcladas y formas ácidas libres también se incluyen. Las patentes de los Estados Unidos representativas que muestran la preparación de enlaces que contienen fósforo incluyen, pero no se limitan a las Pat . de E. U. Nos . 3, 687, 808; 4,469, 863 ; 4,476,301; 5, 023243 , 177, 196; 5, 188, 897; 5,264,423; 5,276, 019; 5, 278,302 , 286, 717; 5,321, 131; 5, 399, 676 ; 5,405, 939; 5,453,496 , 455, 233; 5,466, 677; 5,476,925; 5,519,126; 5,536,821 , 541, 306; 5,550, 111; 5,563,253; 5,571, 799; 5,587,361 , 194, 599; 5, 565,555; 5, 527, 899; 5,721,218; 5, 672, 697 ,625,050, cada una de las cuales se incorpora en la presente mediante la referencia. Las estructuras de oligonucleotidos modificados preferidas que no incluyen un átomo de fósforo en las mismas tienen estructuras que se forman mediante enlaces alquilo o cicloalquilo de cadena corta, enlaces de internucleósidos de heteroátomo mezclado y alquilo o cicloalquilo, o uno o más enlaces de internucleósidos heteroatómicos o heterocíclicos de cadena corta. Estas incluyen las que tienen enlaces morfolino (formados en parte a partir de la porción azúcar de un nucleósido) ; estructuras siloxano; estructuras de sulfuro, sulfóxido y sulfona estructuras de formacetilo y tioformacetilo; estructuras de metilen formacetilo y tioformacetilo : estructuras de riboacetilo estructuras que contienen alqueno estructuras de sulfamato estructuras de metilenimino y metilenhidrazino; estructuras de sulfonato y sulfonamida; estructuras de amida; y otras que tienen partes componentes mezcladas de N, O, S y CH.sub.2. Las patentes de los Estados Unidos representativas que muestran la preparación de tales oligonucleósidos incluyen, pero no se limitan a, las Pat . de E.U. Nos . : 5, 034, 506; 5, 166,315 , 185, 444; 5,214, 134; 5,216,141; 5,235, 033; 5,264,562 , 264, 564; 5,405, 938; 5,434,257; 5,466, 677; 5,470, 967 ,489,677; 5,541,307; 5,561,225; 5,596, 086; 5, 602,240 , 610, 289; 5, 602, 240; 5, 608, 046; 5,610,289; 5,618,704 ,623,070; 5,663,312; 5, 633, 360; 5,677,437; 5,792,608 ,646,269 y 5,677,439, cada una de las cuales se incorpora en la presente mediante la referencia. En otros oligonucleótidos de antisentido - - preferidos, los enlaces tanto de azúcar como de internucleósidos, i.e., la estructura de las unidades de nucleótido, se reemplazan con grupos nuevos. Las unidades de base se mantienen para hibridación con un compuesto objetivo de ácido nucleico apropiado . Uno de tales compuestos oligoméricos , un mimétido de oligonucleótido que ha mostrado tener excelentes propiedades de hibridación, se refiere como un ácido nucleico péptido (PNA) . En los compuestos PNA, la estructura de azúcar de un oligonucleótido se reemplaza con una estructura que contiene amida, en particular una estructura de aminoetilglicina . Las nucleobases se retienen y se unen directa o indirectamente a átomos de aza nitrógeno de la porción amida de la estructura. Las patentes de los Estados Unidos representativas que muestran la preparación de compuestos PNA incluyen, pero no se limitan a, las Pat. de E.U. Nos. 5,539,082; 5,714,331; y 5,719,262, cada una de las cuales se incorpora en la presente mediante la referencia. Puede encontrarse una enseñanza adicional de los compuestos PNA en Nielsen et al., Science, 1991, 254, 1497-1500. Los oligonucleótidos de antisentido preferidos incorporan estructuras fosforotioato y/o estructuras heteroátomo, y en particular -CH2-NH-0-CH2- , -CH2- (CH3) -0-CH2- [conocida como estructura metileno (metilimino) o MMI] , -C¾-0-N(CH3) -C¾-, -CH2-N(CH3) -N(C¾) -CH2- y -0-N (CH3) -CH2-C¾- [en donde la estructura fosfodiester natural se representa como -0-P-0-CH2-] descritas en la Pat . de E.U. No. 5,489,677 antes referida, y las estructuras amida de la Pat. de E.U. No. 5,602,240 antes referida. También se prefieren los oligonucleótidos antisentido que tienen estructuras morfolino de la Pat. de E.U. No., 5,034,506 antes referida. Los oligonucleótidos modificados también pueden contener uno o más residuos de azúcar sustituido. Los oligonucleótidos preferidos comprenden uno de los siguientes en la posición 2': OH; F; O-alquilo, S-alquilo, o N-alquilo; O-alquenilo, S-alquenilo, o N-alquenilo; O-alquinilo, S-alquinilo, o N-alquinilo; o O-alquilo-O-alquilo, en donde el alquilo, alquenilo y alquinilo puede ser alquilo Ci a C10 sustituido o no sustituido o alquenilo y alquinilo C2 a Cío-Se prefieren particularmente 0 [ (CH2)n0] mCH3, 0 (CH2) n0CH3, 0(CH2)nNH2, 0(CH2)nCH3, 0(CH2)nONH2 y O (CH2) n0N [ (CH2) nC¾) ] 2 , en donde n y m son desde 1 hasta aproximadamente 10. Otros oligonucleótidos antisentido preferidos comprenden uno de los siguientes en la posición 2' : alquilo inferior Ci a C10, alquilo, alquenilo, alquinilo, alcarilo, aralquilo, 0-alcarilo o O-aralquilo inferior sustituido, SH, SCH, OCN, Cl, Br, CN, CF3, 0CF3, S0CH3, S02, CH3, ON02, N02, N3, NH2, heterocicloalquilo, heterocicloalcarilo, aminoalquilamino, polialquilamino, sililo sustituido, y un grupo ARN de división, un grupo indicador, un intercalador, un grupo para mejorar las propiedades farmacéuticas de un oligonucleótido o - - un grupo para mejorar las propiedades farmacéuticas de un oligonucleótido, y otros sustituyentes que tengan propiedades similares. Una modificación preferida incluye 2 ' -metoxietoxi (2 ' -O-CH2-CH2-OCH3, conocido también como 2 ' -O- (2-metoxietilo) o 2'-M0E) (Martin et al., Helv. Chim. Acta, 1995, 78, 486-504), i.e., un grupo alcoxialcoxi . Una modificación preferida adicional incluye 2 ' -dimetilaminoxietoxi , i.e., un grupo O (CH2) 2ON (CH3) 2, también conocido como 2'-DMAOE como se describe en los ejemplos siguientes, y 2'-dimetilaminoetoxietoxi (también conocido en la técnica como 2 ' -O-dimetilaminoetoxietilo o 2 ' -DMAEOE) , i.e., 2'-0-CH2-0-CH2-N(CH2) . Una modificación preferida adicional incluye Ácidos Nucleicos Cerrados (LNAs) en los cuales el grupo 2'hidroxilo se enlaza al átomo de carbono 3' o 4' del anillo de azúcar formando así un residuo de azúcar bicíclico. El enlace es preferentemente un grupo metileno (~CH2-)n que hace un puente con el átomo de oxígeno y el átomo de carbono 4 ' en donde n es 1 o 2. Los LNAs y su preparación se describen n la WO 98/39352 y WO 99/14226. Otras modificaciones preferidas incluyen (2'-0-CH3) , 2' -aminopropoxi (2 ' -OCH2CH2CH2N¾) , 2'-alilo (2'-C¾-CH=CH2) , 2'-0-alilo (2 ' -0-CH2-CH=CH2) y 2'-fluoro (2'-F). La modificación 2' puede encontrarse en la posición arabino (arriba) o en la posición ribo (abajo) . Una modificación 2'-arabino preferida es 2'-F. También pueden realizarse modificaciones similares en otras posiciones en el oligonucleótido, particularmente la posición 3' del azúcar en el nucleótido 3' terminal o en los oligonucleótidos 2' -5' enlazados y la posición 5' del nucleótido 5' terminal. Los oligonucleótidos también pueden tener miméticos de azúcar tales como los residuos ciclobutilo en lugar del azúcar pentofuranosilo . Las patentes de los Estados Unidos representativas que muestran la preparación de tales estructuras de azúcar modificadas incluyen, pero no se limitan a las Pat . de E.U. Nos.: 4,981,957; 5,118,800; 5,319,080; 5,359,044; 5,393,878; 5,446,137; 5,466,786; 5,514,785; 5,519,134; 5,567,811; 5,576,427; 5,591,722; 5,597,909; 5,610,300; 5,627,053; 5,639,873; 5,646,265; 5,658,873; 5,670,633; 5,792,747; y 5,700,920, cada una de las cuales se incorpora en la presente mediante la referencia en su totalidad. Los oligonucleótidos también pueden incluir modificaciones o sustituciones de nucleobase (referida frecuentemente en la técnica simplemente como "base" ) . Como se utiliza en la presente, las nucleobases "no modificadas" o "naturales" incluyen las bases de purina adenina (A) y guanina (G) , y las bases de pirimidina timina (T) , citosina (C) y uracilo (U) . Las nucleobases modificadas incluyen otras nucleobases sintéticas y naturales tales como 5- - - metilcitosina (5-me-C) , 5- idroxiraetil citosina, xantina, hipoxantina, 2-arainoadenina, 6-metilo y otros derivados alquilo de adenina y guanina, 2-propil y otros derivados alquilo de adenina y guanina, 2-tiouracilo, 2-tiotimina y 2-tiocitosina, 5-halouracilo y citosina, 5-propinilo (-C=C-CH, o -CH2-C=CH) uracilo y citosina y otros derivados alquinilo de bases de pirimidina, 6-azo uracilo, citosina y timina, 5-uracil (pseudouracilo) , 4-tiouracilo, 8-halo, 8-amino, 8-tiol, 8-tioalquilo, 8-hidroxilo y otras adeninas y guaninas 8-sustituidas, 5-halo particularmente 5-bromo, 5-trifluorometilo y otros uracilos y citosinas 5-sustituidas, 7-metilguanina y 7-metiladenina, 2-F-adenina, 2-amino-adenina, 8-azaguanina y 8-azaadenina, 7-deazagunanina, y 7-deazaadenina y 3-deazaguanina y 3-deazaadenina. Las nucleobases modificadas adicionales incluyen pirimidinas triciclicas tales como fenoxazina citidina (IH-pirimido [5 , 4-b] [1 , 4] benzoxazin-2- (3H) -ona) , fenotiazina citidina (1H-pirimido [5, 4-b] [1 , 4] benztiazin-2 - (3H) -ona) , mordazas G tales como una fenoxazina citidina sustiuida (e.g., 9- (2-aminoetoxi) -H-pirimido [5,4-b] [1, 4] benzoxazin-2 (3H) -ona) , carbazol citidina (2H-pirimido [4 , 5-b] indol-2-ona) , piridoindol citidina (H-pirido [3 ', 2 ' : 4 , 5] pirrólo [2 , 3-d] pirimidin-2 -ona) . Las nucleobases modificadas también pueden incluir aquellas en las cualers la base de purina o pirimidina se reemplaza con otros heterociclos, por ejemplo, 7-deaza-adenina, 7- - - deazagúanosina, 2-aminopiridinaa y 2-piridona. Nucleobases adicionales incluyen las descritas en la Pat . de E.U. No. 3,687,808, las descritas en The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engxneering, páginas 858-859, Kroschwitz J. I., ed. John Wiley & Sons, 1990, y las descritas por Englisch et al . , Angewandre Chemic . International Edition, 1991, 30, 613. Ciertas de estas nucleobases son particularmente útiles para incrementar la afinidad de enlace de los compuestos oligoméricos de la invención. Éstas incluyen pirimidinas 5-sustituidas, 6-azapirimidinas y purinas N-2, N-6 y 0-6 sustituidas, incluyendo sustituciones 2-aminopropiladenina, 5-propiniluracilo y 5-propinilcitosina, 5-metilcitosina que han mostrado incrementar la estabilidad dúplex ácida por 0.6-1.2 grados C. (Sanghvi et al., Antisense Research and Applications, CRC Press, Boca Ratón, 1993, pp. 276-278) y son sustituciones de base preferidas, incluso más preferentemente al combinarse con modificaciones de azúcar 2 ' -O-metoxietilo . Las patentes de los Estados Unidos representativas que muestran la preparación ded nucleobases modificadas incluyen, pero no se limitan a: la Pat. de E.U. No. 3,687,808, así como las Pat. de E.U. Nos. 4, 845, 205 5,130,302 5, 134, 066 5,175,273 5,367, 066 5,432,272 5,457, 187 5,459,255 5,484, 908 5,502,177 5,525,711 5,552, 540 5,587,469 5,594, 121 5, 596, 091 5, 614, 617 5, 645, 985 5, 830, 653 5,763,588 6, 005, 096 - - ,681,941 6 5,750,692 cada una de las cales se incorpora en la presente mediante la referencia. Otra modificación de oligonucleótidos de antisentido se enlaza químicamente al oligonucleótido, uno o más residuos o conjugados que aumentan la actividad, la distribución celular o la compensación celular del oligonucleótido. Los compuestos de la invención pueden incluir grupos conjugados covalentemente enlazados a grupos funcionales tales como los grupos hidroxilo primarios o secundarios. Los grupos conjugados de la invención incluyen inte caladores , moléculas indicadoras, poliaminas, poliamidas, glivoles de polietileno, poliéteres, grupos que aumentan las propiedades farmacodinámicas de oligómeros, y grupos que aumentan las propiedades farmacocinéticas de los oligómeros. Los grupos conjugados típicos incluyen, colesteroles, lípidos, lípidos catiónicos, fosfolípidos, fosfolípidos catiónicos, biotina, fenazina, folato, fenantridina, antraquinona, acridina, fluorescentes, rodaminas, cumarinas, y tintes. Los grupos que aumentan las propiedades farmacodinámicas en el contexto de esta invención, incluyen grupos que mejoran la compensación del oligómero, aumentan la resistencia del oligómero a la degradación, y/ofortalecen la hibridación secuencia-específica con el A N. Los grupos que aumentan las propiedades farmacocinéticas en el contexto de esta - - invención, incluyen grupos que mejoran la compensación, distribución, metabolismo o excreción del oligómero. Los residuos conjugados incluyen, pero no se limitan a residuos lípidos tales como un residuo ded colesterol (Letsinger et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 1986, 86, 6553-6556, ácido cólico (Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Let . 1994, 4, 1053-1060), un tioéter, e . g. , hexil-S-tritiltiol (Maoharan et al., Ann. N.Y. Acad. Sci. 1992, 660, 306-309; Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Let. 1993, 3, 2765-2770; un tiocolesterol (Oberhauser et al., Nucí. Acids . Res. 1992, 20, 533-538), una cadena alif tica e . g . , dodecandiol o residuos undecilo (Saison-Behmoaras et al., EMBO J. , 1991, 10, 1111-1118; Kabanov et al., FEBS Lett. 1990, 259, 327-330; Svinarchuk et al., Biochimic, 1993, 75, 49-54), un fosfolípido, e.g., di-hexadecil-rac-glicerol o trietil amonio 1, 2-di-0-hexadecil-rac-glicero-3-H-fosfonato (Manoharan et al., Tetrahedron Lett. 1995, 36, 3651-3654; Shen et al., Nucí. Acids Res. 1990, 18, 3777-3783); una poliamina o una cadena de glicol de polietileno (Manoharan et al., Nucleosides & Nucleotides, 1995, 14, 969-973), o ácido adamantina acético (Manoharan et al., Tetrahedron Lett. 1995, 36, 3651-3654), un residuo palmitilo (Mishra et al., Biochim. Biophys. Acta 1995, 1264, 220-237), o un residuo octadecilamina o hexilamino-carbonil-oxicolesterol . Los oligonucleótidos de la invención también pueden conjugarse a - - sustancias de droga activa, por ejemplo, aspirina, warfarina, fenilbuazona, ibuprofeno, suprofeno, fenbufeno, cetoprofeno, (S) - (+) -pranoprofeno, caprofeno, dansilsarcosina, ácido 2 , 3 , 5-triyodobenzoico, ácido flufenámico , ácido folínico, una benzotiadiazina, clorotiazida, una diazepina, un barbiturato, una cefalosporina, una droga sulfa, un antidiabético, un antibacterial o un antibiótico. Los conjugados de oligonucleótido-droga y su preparación se describen en la solicitud de patente de E.U. Ser. No. 09/334,130 (presentada en Junio 15 de 1999) y las Patentes de los Estados Unidos Nos.: 4,828,979; 4,948,882; 5,218,105; , 525, 465,· 5,541,313, 5,545,730; 5,552, 538,¦ 5, 578, 717, ,580,731; 5,591,584 5,109,124; 5,118, 802; 5, 138, 045,¦ ,414, 077; 5,486, 603 5,512,439; 5,578, 718 ; 5, 608, 046; 4,587,044; 4,605,735 4,667,015; 4,762,779; 4,789,737; 4, 824, 941; 4,835,263 4,876,335; 4,904,582; 4, 958, 013 ; , 082, 830; 5,112,963 5,214,136; 5,082,830; 5,112,963; , 214, 136; 5,254,469 ; 5,258,506; 5,262,536; 5,272,250; ,292,873; 5,317, 098 ; 5,371,241; 5,391, 723; 5,416,203; ,451,463; 5,510,475 ; 5,512,667; 5,514, 785 ; 5,565,552; , 567, 810; 5, 574, 142; 5,585, 481; 5,587,371; 5,595,726; ,597,696; 5,599,923; 5,599,928 y 5,688,941, cada una de las cuales se incorpora en la presente mediante la referencia. No es necesario que todas las posiciones en un compuesto dado se modifiquen uniformemente, y de hecho más de una de las modificaciones antes mencionadas pueden incorporarse en un solo compuesto o incluso en un solo nucleósido dentro de un oligonucleótido. La presente invención incluye también compuestos ansentido que son compuestos quiméricos. Compuestos antisentido "quiméricos" o "quimeras" en el contexto de esta invención, son compuestos antisentido, particularmente oligonucleótidos , que contienen dos o más regiones químicamente distintas, cada una compuesta de al menos una unidad de monómero, i.e., un nucleótido en el caso de un compuesto oligonucleótido. Estos oligonucleótidos típicamente contienen al menos una región en donde el oligonucleótido se modifica a fin de conferir al oligonucleótido una resistencia incrementada a la degradación de nucleasa, compensación celular aumentada, y/o afinidad de enlace aumentada para el ácido nucleico objetivo. Una región adicional del oligonucleótido puede servir como un sustrato para enzimas capaces de dividir los híbridos ARMrADN o ARN.ARN. A modo de ejemplo, NRasa H es una endonucleasa celular que divide la cuerda de ARN de una dupla ARN-ADN. La activación de NRasa H, en consecuencia, da como resultado una división del objetivo de ARN, con lo cual aumenta grandemente la eficiencia de la inhibición del oligonucleótido de la expresión del gen. Consecuentemente, frecuentemente pueden obtenerse resultados comparables con oligonucleótidos más cortos cuando se utilizan oligonucleótidos quiméricos, - - comparados con los desoxioligonucleótidos de fosforotioato que se hibridan a la misma región objetivo. Los compuestos antisentido de la invención pueden formarse como estructuras compuestas de dos o más oligonucleótidos, oligonucleótidos modificados, oligonucleótidos y/o miméticos de oligonucleótidos como se describió anteriormente. Los oligonucleótidos antisentido quiméricos preferidos incorporan al menos un azúcar 2 ' modificado (preferentemente 2'-0-(CH2)2-0-C¾) en la terminal 3' para conferir una resistencia de nucleasa y una región con al menos 4 azúcares 2'-H contiguos para conferir una actividad de NRasa H. Tales compuestos también se han referido en la técnica como híbridos o gápmeros. Los gápmeros preferidos tienen una región de azúcares 2' modificados (preferentemente 2 ' -O- (CH2) 2-0-C¾) en la terminal 3' en la terminal 5' separados por al menos una región que tiene al menos 4 azúcares 2'-H contiguos y preferentemente incorpora enlaces de estructura de fosforotioato . Las patentes de los Estados Unidos representativas que muestran la preparación de tales estructuras híbridas incluyen, pero no se limitan a las Pat . de E.U. Nos.: 5,013,830; 5,149,797; 5,220,007; 5,256,775; 5,366,878; 5,403,711; 5,491,133; 5,565,350; 5,623,065; 5,652,355; 5,652,356 y 5,700,922, cada una de las cuales se incorpora en la presente mediante la referencia en su totalidad.
- - Los compuestos antisentido utilizados de acuerdo con esta invención, pueden prepararse conveniente y rutinariamente a través de la muy conocida técnica de síntesis de fase sólida. El equipo para tal síntesis se comercializa por varios vendedores incluyendo, por ejemplo, Applied Biosystems (Foster City, Calif.). Cualquier otro medio para tal síntesis conocido en la técnica puede emplearse adicional o alternativamente . Es muy conocido el uso de técnicas similares para preparar oligonucleótidos tales como los fosforotioatos y derivados alquilados . Los compuestos de la invención también pueden mezclarse, encapsularse, conjugarse o de otra manera asociarse con otras moléculas, estructuras moleculares o mezclas de compuestos, como por ejemplo, liposomas, moléculas dirigidas por el receptor, formulaciones orales, rectales, tópicas u oras, para auxiliar en la compensación, distribución, y/o absorción. Las patentes de los Estados Unidos representativas que muestran la preparación de tales formulaciones auxiliares de compensación, distribución y/o absorción incluyen, pero no se limitan a, las Pat . de E.U. Nos.: 5,108,921; 5,354,844; 5,416,016; 5,459,127; 5,521,291 ,543,158 5,547, 932 5,583,020 5,591, 721 4m426,330 4, 534, 899 5, 013, 556 5, 108,921 5,213, 804 5, 227, 170 5,264,221 5,336, 633 5,395,619 5,416, 016 5,417, 978 5,462,854 5,469, 854 5, 512,295 5,527, 528 5, 534,259 - - ,543,152; 5,556,948; 5,580,575 y 5,595,756, cada una de las cuales se incorpora en la presente mediante la referencia. Otros ejemplos de oligonucleótidos de sentido o anti-sentido incluyen aquellos oligonucleótidos que se encuentran covalentemente enlazados a mitades orgánicas, tales como aquellas descritas en la WO 90/10048 y a otras mitades que incrementan la afinidad de los oligonucleótidos para una secuencia objetivo de ácido nucleico, tal como poli (L-lisina) . Aún adicionalmente, los agentes de intercalación, tales como elipticina y los agentes de alquilación o complejos de metal pueden unirse a oligonucleótidos de sentido o anti-sentido para modificar las especificidades de enlace del oligonucleótido sensible o anti-sensible para la secuencia de nucleotido objetivo. Los oligonucleótidos de anti-sentido o de sentido pueden introducirse en una célula que contiene la secuencia objetivo de ácido nucleico mediante cualquier método de transferencia de gen, incluyendo, por ejemplo, transfección de ADN CaP04-mediada, electoporación o utilizando vectores de transferencia de gen tales como el virus Epstein-Barr . En un procedimiento preferido, un oligonucleótido anti-sensible o sensible se inserta en un vector retroviral adecuado. Una célula que contiene la secuencia objetivo de ácido nucleico se pone en contacto con el vector recombinante retroviral ya sea ín vivo o ex vivo. Los vectores retrovirales adecuados incluyen, pero no se limitan a, aquellos derivados del retrovirus murino M- uLV, N2 (un retrovirus derivado de M-MuLV) o los vectores de copia doble designados DCT5A, DCT5B y DCT5C (ver WO 90/13641) . Los oligonucleótidos de sentido o antisentido también pueden introducirse en una célula que contenga la secuencia de nucleótidos objetivo mediante la formación de un conjugado con una molécula de enlace a ligando, como se describe en la WO91/04753. Las moléculas de enlace a ligando adecuadas incluyen, pero no se limitan a, receptores de superficie celular, factores del crecimiento otras citocinas u otros ligando que se unan a los receptores de superficie celular. Preferentemente, la conjugación de las moléculas de enlace a ligando no interfieren sustancraímente con la capacidad de la molécula de enlace a ligando para unirse a su molécula o receptor o entrada de bloque correspondiente del oligonucléotido de sentido o antisentido o su versión conjugada en la célula. Alternativamente, puede introducirse un oligopéptido de sentido o antisentido en una célula que contiene la secuencia de ácido nucleico objetivo mediante la formación de un complejo de oligonucleótido-lípido, como se describe en la WO 90/10448. El complejo oligonucleótido-lípido de sentido o antisentido preferentemente se disocia dentro de la célula mediante una lipasa endógena.
Las moléculas de ARN o ADN de antisentido o sentido generalmente son de al menos aproximadamente 5 nucleotidos de longitud, alternativamente de al menos aproximadamente 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60 , 65, 70, 75, 8 ¡0, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320, 330, 340, 350, 360, 370, 380, 390, 400, 410, 420, 430, 440, 450, 460, 470, 480, 490, 500, 510, 520, 530, 540, 550, 560, 570, 580, 590, 600, 610, 620, 630, 640, 650, 660, 670, 680, 690, 700, 710, 720, 730, 740, 750, 760, 770, 780, 790, 800, 810, 820, 830, 840, 850, 860, 870, 880, 890, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990 o 1000 nucleotidos de longitud, en donde en este contexto el término "aproximadamente" significa la longitud de la secuencia de nucleotidos referida más o menos 10% de esa longitud referida. Las sondas pueden también emplearse en técnicas de PCR para generar una agrupación de secuencias para la identificación de secuencias de codificación TAT cercanamente relacionadas . Las secuencias de nucleotidos que codifican para un TAT también pueden utilizarse para construir sondas de hibridación para representar el gen que codifica para ese TAT - - y para el análisis genético de individuales con trastornos genéticos. Las secuencias de nucleótidos proporcionadas en la presente pueden representarse para un cromosoma y regiones especificas de un cromosoma utilizando técnicas conocidas, tales como hibridación in situ, análisis de enlace contra marcadores cromosomales conocidos y selección por hibridación con las bibliotecas. Cuando las secuencias de codificación para TAT codifican una proteina que se enlaza a otra proteína (ejemplo, en donde el TAT es un receptor) , el TAT puede utilizarse en ensayos para identificar las otras proteínas o moléculas involucradas en la interacción del enlace. Mediante tales métodos, pueden identificarse los inhibidores de la interacción del enlace receptor/ligando. Las proteínas involucradas en tales interacciones del enlace puede también utilizarse para clasificar el péptido o inhibidores de molécula pequeña o agonistas de la interacción del enlace. También, el receptor TAT puede utilizarse para aislar el (los) ligando (s) correlativos (s) . Los ensayos de selección pueden diseñarse para encontrar compuestos guía que imitan la actividad biológica de un TAT natural o un receptor para TAT. Tales ensayos de selección incluirán ensayos dóciles para selección de alto rendimiento de bibliotecas químicas, haciéndolos particularmente adecuados para identificar candidatos de droga de molécula pequeña. Las moléculas - - pequeñas contempladas incluyen compuestos sintéticos orgánicos o inorgánicos. Los ensayos pueden llevarse a cabo en una variedad de formatos, incluyendo ensayos de unión proteína-proteína, ensayos de selección bioquímica, inmunoensayos y ensayos en base a células, que se encuentran bien caracterizados en la técnica. Los ácidos nucleicos que codifican TAT o sus formas modificadas pueden también utilizarse para generar ya sea animales transgénicos o animales "knock out" que a su vez, son útiles en el desarrollo y selección de reactivos terapéuticamente útiles. Un animal transgénico (e.g. , un ratón o rata) es un animal que tiene células que contienen un transgen cuyo transgen se introdujo en el animal o un ascendiente del animal en un prenatal, e.g. una etapa embriónica. Un transgen es un ADN el cual se integra en el genoma de una célula a partir de la cual se desarrolla un animal transgénico. En una modalidad, el ADNc que codifica TAT puede utilizarse para clonar ADN genómico que codifica TAT de acuerdo con técnicas establecidas y las secuencias genómicas utilizadas para generar animales transgénicos que contienen células que expresan el ADN que codifica TAT. Los métodos para generar animales transgénicos, particularmente animales tales como ratones o ratas se han vuelto convencionales en la técnica y se describen, por ejemplo, en las Patentes de E.U. Nos. 4,736,866 y 4,870,009.
- - Típicamente, las células particulares pueden objetivarse para la incorporación del transgen TAT con mej oradores específicos del tejido. Los animales transgénicos que incluyen una copia de un transgen que codifica TAT introducido en la línea germinal del animal en una etapa embriónica pueden utilizarse para examinar el efecto de la expresión incrementada del ADN que codifica TAT. Tales animales pueden utilizarse como animales de prueba para los reactivos considerados para conferir protección a partir de por ejemplo, condiciones patológicas asociadas con su sobreexpresión. De acuerdo con esta faceta de la invención, un animal se trata con el reactivo y una incidencia reducida de la condición patológica, comparada a animales no tratados que portan el transgen, puede indicar una intervención terapéutica potencial para la condición patológica. Alternativamente, los homólogos no humanos de TAT pueden utilizarse para construir un animal "knock out" TAT que tiene un gen defectuoso o alterado que codifica TAT como un resultado de la recombinación homologa entre el gen endógeno que codifica TAT y el ADN genómico alterado que codifica TAT introducido en una célula germinal embriónica del animal. Por ejemplo, el ADNc que codifica TAT puede utilizarse para clonar el ADN genómico que codifica TAT de acuerdo con técnicas establecidas . Una porción del ADN genómico que codifica TAT puede suprimirse o reemplazarse con - - otro gen, tal como un gen que codifica un marcador seleccionable que puede utilizarse para monitorear la integración. Típicamente, se incluyen varias kilobases de ADN flanqueador no alterado (tanto en los extremos 5' como 3') en el vector [ver e.g., Thomas y Capecchi, Cell , 51:503 (1987) para una descripción de vectores de recombinación homologa] . El vector se introduce en una línea celular germinal embriónica (e.g. , mediante electroporación) y se seleccionan las células en las cuales el ADN introducido se ha recombinado homólogamente con el ADN endógeno [ver e.g., Li et al., Cell, 69:915 (1992)]. Las células seleccionadas se inyectan entonces en una blastocisto de un animal (e.g., un ratón o rata) para formar quimeras de agregación [ver e.g., Bradley, en Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells: A Practical Approach, (Teratocarclnomas y Células Germinales Embriónicas: Una Procedimiento Práctico) E. J. Robertson, ed. (IRL oxford, 1987) , pp. 113-152] . Un embrión quimérico puede entonces implantarse en un animal criado, hembra seudopreñada adecuada y el embrión llevado a término para crear un animal "knock out" . La descendencia que alberga el ADN homólogamente recombinado en sus células germinales puede identificarse mediante técnicas estándar y utilizarse para animales creados en los cuales todas las células de los animales contienen el ADN homólogamente recombinado. Los animales knock out pueden caracterizarse por ejemplo, por su capacidad para defenderse contra ciertas condiciones patológicas y por su desarrollo de condiciones patológicas debido a la ausencia del polipéptido TAT. El ácido nucleico que codifica los polipéptidos TAT también puede utilizarse en la terapia genética. En las aplicaciones de terapia genética, los genes se introducen en las células a fin de lograr la síntesis in vivo de un producto genético terapéuticamente efectivo, por ejemplo, para el reemplazo de un gen defectuoso. La "terapia genética" incluye tanto la terapia genética convencional en donde se logra un efecto duradero mediante un solo tratamiento como en la administración de agentes terapéuticos del gen, que involucra la administración de una sola vez o repetida de un ADN o ARNm terapéuticamente efectivo. Los ADNs y ARNs de antisentido pueden utilizarse como agentes terapéuticos para bloquear la expresión in vivo de ciertos genes . Ya se ha demostrado que los oligonucleótidos de antisentido cortos pueden importarse en las células en donde ellos actúan como inhibidores, a pesar de sus bajas concentraciones intracelulares causadas por su absorción limitada por la membrana celular. (Zamecnik et al., Proc . Nati. Acad. Sci . USA 83:4143-4145 [1986]). Los oligonucleótidos pueden modificarse para mejorar su absorción, e.g., al sustituir sus grupos de fosfodiéster negativamente cargados por grupos no cargados.
Existe una variedad de técnicas disponibles para introducir ácidos nucleicos en células viables . Las técnicas varían dependiendo ya sea si el ácido nucleico se transfiere en las células cultivadas in vitro o in vivo en las células del huésped propuesto. Las técnicas adecuadas para la transferencia de ácidos nucleicos en las células de mamíferos in vivo incluye el uso de liposomas, electroporación, microinyección, fusión celular, DEAE-dext ano, método de precipitación de fosfato de calcio, etc. Las técnicas de transferencia de gen in vivo actualmente preferidas incluyen la transfección con vectores virales (típicamente retrovirales) y la transfección mediada por el recubrimiento viral de proteína-liposoma (Dzau et al., Trends in Biotechnology 11, 205-210 [1993]).' En algunas situaciones es deseable proporcionar la fuente de ácido nucleico con un agente que dirija las células objetivo, tal como un anticuerpo específico para una proteína de membrana de superficie celular o la célula objetivo, un ligando para un receptor en la célula objetivo, etc. En donde se emplean los liposomas, puen utilizarse proteínas que se enlazan a una proteína de membrana de superficie celular asociada con la endocitosis para dirigir y/o facilitar la absorción, e.g., proteínas de cápside o fragmentos de los mismos, trópicos para un tipo de célula particular, anticuerpos para las proteínas que experimentan la infernalización en el ciclo de - - las proteínas que dirigen la localización intracelular y mejoran la media vida intracelular. La técnica de la endocitosis mediada por el receptor se describe, por ejemplo, por Wu et al., J. Biol . Chem. 262, 4429-4432 (1987); y Wagner et al., Proc. Nati. Acad. Sci . USA 87, 3410-3414 (1990). Para la revisión de los protocolos de marcación de gen y terapia genética ver Anderson et al., Science 256, 808-813 (1992) . Las moléculas de ácido nucleico que codifican los polipéptidos TAT o fragmentos de los mismos descritos en la presente son útiles para la identificación del cromosoma. A este respecto, existe una necesidad en curso para identificar nuevos marcadores de cromosomas ya que actualmente se encuentran disponibles relativamente pocos reactivos de marcación de cromosoma, en base a los datos de secuencia actual. Cada molécula de ácido nucleico TAT de la presente invención puede utilizarse como un marcador de cromosoma. Los polipéptidos TAT y las moléculas de ácido nucleico de la presente invención pueden también utilizarse diagnósticamente para el histotipado, en donde los polipéptidos TAT de la presente invención pueden expresarse diferencialmente en un tejido en comparación a otro, preferentemente en un tejido enfermo en comparación a un tejido normal del mismo tipo de tejido. Las moléculas de ácido nucleico TAT encontrarán uso para generar sondas para - - PC , análisis Northern, análisis Southern y análisis Western. Esta invención abarca métodos para seleccionar compuestos para identificar aquellos que imitan al polipeptido TAT (agonistas) o evitan el efecto del polipéptido TAT (antagonistas) . Los ensayos de selección para candidatos de drogas antagonistas se diseñan para identificar compuestos que se enlazan o acomplejan con los polipéptidos TAT codificados por los genes identificados en la presente o de otro modo interfieren con la interacción de los polipéptidos codificados con otras proteínas celulares, incluyendo e.g., inhibir la expresión del polipéptido TAT a partir de las células. Tales ensayos de selección incluirán ensayos disponibles para selección de alto rendimiento de bibliotecas químicas, marcando los particularmente adecuados para identificar candidatos de droga de molécula pequeña. Los ensayos pueden llevarse a cabo en una variedad de formatos, incluyendo ensayos de unión proteína-proteína, ensayos de selección bioquímica, inmunoensayos y ensayos en base a las células, los cuales se encuentran bien caracterizados en la técnica. Todos los ensayos para los antagonistas, son comunes en que llaman para ser contacto con el candidato de droga con un polipéptido TAT codificado por un ácido nucleico identificado en la presente bajo condiciones y durante un tiempo suficiente para permitir que estos dos componentes - - interactuen. En los ensayos de unión, la interacción es la unión y el complejo formado puede aislarse o detectarse en la mezcla de reacción. En una modalidad particular, el polipéptido TAT codificado por el gen identificado en la presente o el candidato de droga se inmoviliza sobre una fase sólida, e.g., sobra una placa de microtitulación, mediante uniones covalentes o no covalentes. La unión no covalente generalmente se lleva a cabo al cubrir la superficie sólida con una solución del polipéptido TAT y secando. Alternativamente, un anticuerpo inmovilizado, e.g., un anticuerpo monoclonal, específico para el polipéptido TAT a ser inmovilizado puede utilizarse para anclarlo a una superficie sólida. El ensayo se lleva a cabo al agregar el componente no inmovilizado, el cual puede marcarse por una marca detectable, para el componente inmovilizado, e.g., la superficie cubierta que contiene el componente anclado. Cuando se completa la reacción, los componentes sin reaccionar se retiran, e.g., mediante lavado y se detectan los complejos anclados sobre la superficie sólida. Cuando los componentes originalmente no inmovilizados portan una marca detectable, la detección de la marca inmovilizada sobre la superficie indica que ocurrió el acomplej miento. En donde los componentes originalmente no inmovilizados no portan una marca, puede detectarse el acomplejamiento, por - - ejemplo, al utilizar un anticuerpo marcado uniendo específicamente el complejo inmovilizado. Si el compuesto candidato interactúa pero no se enlaza a un polipéptido ??? particular codificado por un gen identificado en la presente, puede ensayarse su interacción con ese polipéptido mediante métodos bien conocidos para detectar las interacciones proteína-proteína. Tales ensayos incluyen procedimientos tradicionales, tales como, e.g., enlace cruzado, co-inmunoprecipitación y co-purificación a través de gradientes o columnas cromatográficas . Además, las interacciones proteína-proteína pueden monitorearse al utilizar un sistema genético en base a levadura descrito por Fields y colaboradores (Fields y Song, Nature (London) , 340:245-246 (1989); Chien et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 88:9578-9582 (1991)) como se describió por Chevray y Nathans, Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 89: 5789-5793 (1991). Muchos activadores transcripcionales , tales como GAL4 de levadura, consisten de dos dominios modulares físicamente separados, uno actúa como el dominio de unión a ADN, el otro funciona como el dominio de activación de la transcripción. El sistema de expresión de levadura descrito en las publicaciones anteriores (generalmente referido como el "sistema de dos híbridos") toma ventaja de esta propiedad y emplea dos proteínas híbridas, una en la cual la proteína objetivo se fusiona al dominio de unión a ADN de GAL4 y la - - otra en la cual las proteínas de activación del candidato se fusionan al dominio de activación. La expresión de un gen que reporta GALl-lacZ ba o en control de un promotor activado por GAL4 depende de la reconstitución de la actividad de GAL4 a través de una interacción proteina-proteína . Las colonias que contienen polipéptidos interactuantes se detectan con un sustrato cromogénico para ß-galactosidasa . Un equipo completo (MATCH A.KER™) para identificar las interacciones proteína-proteina entre dos proteínas específicas utilizando la técnica de dos híbridos se encuentra comercialmente disponible por Clontech. Este sistema puede también extenderse para representar los dominios de proteína involucrados en las interacciones específicas de la proteína así como para localizar exactamente los residuos de aminoácido que son cruciales en estas interacciones . Los compuestos que interfieren con la interacción de un gen que codifica un polipéptido TAT identificado en la presente y otros componentes intra- o extracelulares pueden probarse como sigue : usualmente se prepara una mezcla de reacción que contiene el producto del gen y el componente intra- o extracelular bajo las condiciones y por un tiempo que permita la interacción y unión de los dos productos . Para probar la capacidad de un compuesto candidato para inhibir la unión, la reacción se corre en la ausencia y en la presencia del compuesto de prueba. Además, puede agregarse - - un placebo para un tercera mezcla de reacción, para servir como un control positivo. La unión (formación del complejo) entre el compuesto de prueba y el componente intra- o extracelular presente en la mezcla, se monitorea como se describió aquí antes. La formación de un complejo en la(s) reacción (es) de control pero no en la mezcla de reacción contiene el compuesto de prueba que indica que el compuesto de prueba interfiere con la interacción del compuesto de prueba y su socio de reacción. Para el ensayo de los antagonistas, el polipeptido TAT puede agregarse a una célula junto con el compuesto a seleccionarse para una actividad particular y la capacidad del compuesto para inhibir la actividad de interés en la presencia del polipéptido TAT indica que el compuesto es un antagonista para el polipéptido TAT. Alternativamente, los antagonistas pueden detectarse al combinar el polipéptido TAT y un antagonista potencial con los receptores del polipéptido TAT que se enlazan a la membrana o receptores recombinantes bajo condiciones apropiadas para un ensayo de inhibición competitivo. El polipéptido TAT puede marcarse, tal como mediante radioactividad, de tal forma que el número de moléculas del polipéptido TAT enalazadas al receptor pueden utilizarse para determinar la efectividad del antagonista potencial . El gen que codifica al receptor puede identificarse por varios métodos conocidos por aquellos de - - experiencia en la técnica, por ejemplo, toma panorámica de ligando y clasificación de FACS. Coligan et al., Current Protocols in Immun. 1(2): Capítulo 5 (1991). Preferentemente, la expresión clonación se emplea en donde se prepara ARN poliadenilado a partir de una célula que responde al polipéptido TAT y una biblioteca de ADNc creada a partir de este ARN, que se divide en agrupamientos y se utilizan para transfectar células COS u otras células que no responden al polipéptido TAT. Las células transfectadas que se desarrollan en los portaobjetos de vidrio se exponen al polipéptido TAT marcado. El polipéptido TAT puede marcarse mediante una variedad de medios incluyendo la impregnación con yodo o la inclusión de un sitio de reconocimiento para una proteína cinasa de sitio específico. Después de la fijación e incubación, los portaobjetos se someten a un análisis autoradiográfico. Los agrupamientos positivos se identifican y los sub- grupamientos se preparan y se re-transfectan utilizando un sub-agrupamiento interactivo y un proceso de re-clasificación, produciendo eventualmente un solo clon que codifica al receptor putativo. Como un procedimiento alternativo para la identificación del receptor, el polipéptido TAT marcado puede enlazarse por fotoafinidad con la membrana celular o las preparaciones de extracto que expresan la molécula receptora. El material reticulado se reduce mediante PAGE y se expone a - - la película de rayos X. El complejo marcado que contiene el receptor puede cortarse, reduciéndose en fragmentos de péptido y someterse a la micro-secuenciación de la proteína. La secuencia de aminoácidos obtenida a partir de la micro-secuenciación puede utilizarse para diseñar un conjunto de sondas oligonucleótidas degeneradas para clasificar una biblioteca de ADNc para identificar el gen que codifica al receptor putativo. En otro ensayo para los antagonistas, las células de mamífero o una preparación de membrana que expresa al receptor puede incubarse con un polipéptido TAT marcado en la presencia del compuesto candidato. Puede medirse entonces la capacidad del compuesto para mejorar o bloquear esta interacción. Más ejemplos específicos de antagonistas potenciales incluyen un oligonucleótido que se enlaza a las fusiones de inmunoglobulina con un polipéptido TAT y en particular, anticuerpos que incluyen, sin limitación, anticuerpos y fragmentos de anticuerpos poli- y monoclonales, anticuerpos de cadena sencilla, anticuerpos anti-idiotípicos y versiones quiméricas o humanizadas de tales anticuerpos o fragmentos, así como anticuerpos y fragmentos de anticuerpos humanos. Alternativamente, un antagonista potencial puede ser una proteína relacionada cercanamente, por ejemplo, una forma mutada de un polipéptido TAT que reconoce al receptor - - pero no imparte efecto, inhibiendo por lo tanto competitivamente la acción del polipéptido TAT. Otro antagonista del polipéptido TAT potencial es una construcción de AR o ADN de antisentido preparada utilizando tecnología de antisentido, en donde, e.g. , una molécula de ARN o ADN de antisentido actúa para bloquear directamente la traducción del ARNm mediante hibridación para el ARNm objetivado y evitar la traducción de la protelna. La tecnología de antisentido puede utilizarse para controlar la expresión del gen a través de la formación de triple hélice o ADN o ARN de antisentido, basándose ambos de tales métodos en la unión de un polinucleótido a ADN o ARN. Por ejemplo, la porción de codificación 5' de la secuencia de polinucleótidos , que codifica a los polipéptidos TAT maduros de la presente, se utiliza para diseñar un oligonucleótido de ARN de antisentido de desde aproximadamente 10 hasta 40 pares base de longitud. Un oligonucleótido de ADN se diseña para ser complementario para una región del gen involucrado en la transcripción (de triple hélice ver Lee et al., Nucí. Acid. Res . 6:3073 (1979); Cooney et al., Science, 241:456 (1988); Dervan et al., Science, 251:1360 (1991)), evitando por lo tanto la transcripción y la producción del polipéptido TAT. El oligonucleótido de ARN de antisentido hibridiza al ARNm in vivo y bloquea la traducción de la molécula de ARNm en el polipéptido TAT (antisentido - Okano, Neurochem. , 56:560 - - (1991) ; Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of . Gene Expression (Oligodesoxinucleótidos como Inhibidores de Antisentido de la Expresión del Gen) (CRC Press :Boca Ratón, FL, 1988) . Los oliginucleótidos descritos arriba pueden también suministrarse a las células de tal manera que el ARN o ADN de antisentido pueda expresarse in vivo para inhibir la producción del polipéptido TAT. Cuando se utiliza ADN de antisentido, se prefieren los oligodesoxiribonucleótidos derivador a partir del sitio de traducción-iniciación, e.g., entre aproximadamente -10 y +10 posiciones de la secuencia de nucleotidos del gen obj etivo . Los antagonistas potenciales incluyen moléculas pequeñas que se enlazan al sitio activo, el sitio de unión a receptor o el factor de crecimiento u otro sitio de unión relevante del polipéptido TAT, bloqueando por lo tanto la actividad biológica normal del polipéptido TAT. Ejemplos de moléculas pequeñas incluyen, pero no se limitan a péptidos pequeños o moléculas similares a péptidos, preferentemente péptidos solubles y compuestos orgánicos o inorgánicos sin peptidilo sintético. Los ribozimas son moléculas de ARN enzimáticas capaces de catalizar el desdoblamiento específico de ARN. Los ribozomas actúan mediante hibridación específica de la secuencia hacia el ARN objetivo complementario, seguido por el desdoblamiento endonucleolítico . Los sitios específicos - - de desdoblamiento de ribosoma dentro de un objetivo de ARN potencial pueden identificarse mediante técnicas conocidas. Para detalles adicionales ver, e.g.r Rossi, Current Biology, 4:469-471 (1994) y la publicación de PCT No. WO 97/33551 (publicada en Septiembre 18, 1997) . Las moléculas de ácido nucleico en formación de triple hélice utilizadas para inhibir la transcripción deben ser monoca enarias y compuestas de desoxinucleótidos . La composición base de estos oligonucleótidos se diseña de tal forma que promueve la formación de triple hélice a través de reglas Hoogsteen de pares base, que generalmente requieren alargamientos considerables de purinas o pirimidinas en un filamento de un dúplex. Para detalles adicionales ver e.g., la publicación de PCT No. WO 97/33551, supra. Estas moléculas pequeñas pueden identificarse mediante cualquiera de uno o más ensayos de selección descritos aquí antes y/o mediante cualquier otra técnica de selección bien conocida por aquellos expertos en la materia. El ácido nucleico que codifica al polipéptido TAT aislado puede utilizarse en la presente para producir recombinantemente al polipéptido TAT utilizando técnicas bien conocidas en la materia como se describe en la presente. A su vez, los polipéptidos TAT producidos pueden emplearse para generar anticuerpos anti-TAT utilizando técnicas bien conocidas en la materia y como se describe en la presente.
- - Los anticuerpos que específicamente se enlazan al polipéptido ??? identificado en la presente, así como otras moléculas identificadas mediante los ensayos de selección hasta ahora descritos, pueden administrarse para el tratamiento de varios trastornos, incluyendo el cáncer, en la forma de composiciones farmacéuticas. Si el polipéptido TAT es intracelular y los anticuerpos completos se utilizan como inhibidores, se prefiere la internalizacion de los anticuerpos. Sin embargo, las lipofecciones o liposomas también pueden utilizarse para suministrar el anticuerpo o un fragmento de anticuerpo en las células. Cuando se utilizan los fragmentos de anticuerpo, se prefiere el fragmento inhibidor más pequeño que se enlaza específicamente al dominio de unión de la proteína objetivo. Por ejemplo, en base a las secuencias de región variable de un anticuerpo, las moléculas de péptido pueden diseñarse para retener la capacidad para unirse a la secuencia de la proteína objetivo. Tales péptidos pueden sintetizarse químicamente y/o producirse mediante tecnología de ADN recombinante . Ver, e.g., Marasco et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 90: 7889-7893 (1993) . La formulación de la presente también puede contener más de un compuesto activo según sea necesario para la indicación particular de que se trate, preferentemente aquellas con actividades complementarias que no se afectan - - adversamente entre sí. Alternativamente o además, la composición puede comprender un agente que mejora su función, tal como por ejemplo, un agente citotóxico, citocina, agente quimioterapéutico o agente inhibidor del crecimiento. Tales moléculas se encuentran presentes adecuadamente en combinación en cantidades que son efectivas para el propósito propuesto . Los siguientes ejemplos se ofrecen solamente para propósitos de ilustración y no intentan limitar de ninguna manera el alcance de la presente invención. Todas las patentes y referencias de literatura citadas en la presente especificación se incorporan en la presente mediante la referencia en su totalidad. EJEMPLOS Los reactivos comercialmente disponibles referidos en los ejemplos se utilizaron de acuerdo con las instrucciones de los fabricantes a menos que se indique de otro modo. La fuente de estas células identificadas en los siguientes ejemplos y a través de la especificación, mediante los números de acceso ATCC es la American Type Culture Collection, Manassas, VA. EJEMPLO 1 : Perfil de la Expresión del Tejido Utilizando GeneExpress® La base de datos patentada que contiene la información de la expresión de gen (GeneExpress®, Gene Logic - - Inc., Gaithersburg, MD) se analizó en un intento para identificar polipéptidos (y sus ácidos nucleicos de codificación) cuya expresión se sobre-regula significativamente en un (os) tejido (s) de tumor particular (es) de interés en comparación a otro(s) tumor (es) y/o tejidos normales. Específicamente, el análisis de la base de datos GeneExpress® se condujo utilizando ya sea software disponible a través de Gene Logic Inc., Gaithersburg, MD, para utilizarse con la base de datos GeneExpress® o con el software patentado escrito y desarrollado en Genentech, Inc., para utilizarse con la base de datos GeneExpress®. La clasificación de los alcances positivos en el análisis se basan en varios criterios incluyendo, por ejemplo, especificidad del tejido, especificidad del tumor y nivel de expresión en tejidos esenciales normales y/o de proliferación normal. La siguiente es una lista de moléculas cuyo perfil de expresión del tejido como se determinó a partir de un análisis de la base de datos GeneExpress® evidencia alta expresión del tejido y sobre-regulación significativa de la expresión en un tumor o tumores específicos en comparación a otro (s) tumor (es) y/o tejidos normales y opcionalmente la expresión relativamente baja en tejidos esenciales normales y/o de proliferación normal. Como tales, las moléculas listadas abajo son objetivos de polipéptido excelentes para el - - diagnóstico y terapia del cáncer en mamíferos Molécula Sobrerregulacion de la expresión en: según se compara a: DNA194607 (TAT319) tumor prostático tejido normal prostático DNA225388 (TAT328) tumor prostático tejido normal prostático DNA225388 (TAT328) tumor de mama tejido normal de mama DNA2S1046 (TAT343) tumor de mama tejido normal de mama DNA2S104S (TAT343) tumor de colon tej ido normal de colon DNA26104S (TAT343) tumor pulmonar te ido normal pulmonar DUA26104S (TAT343) tumor pancreático tejido normal pancreático DCTA2S1046 (TAT343) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA261046 (TAT343) tumor rectal tejido normal rectal DNA261046 (TAT343) tumor de piel tejido normal de piel DNA261046 (TAT3 3) tumor estomacal tejido normal estomacal DNA261046 (TAT343) tumor prostático tejido normal prostático DNA261046 (TAT343) tumor cerebral tejido normal cerebral DNA261046 (TAT343) tumor esofágico tejido normal esofágico Molécula Sobrerregulacion de la expresión en: según se compara a: DNA194036 (TAT345) tumor prostático tejido normal prostático DNA225731 (TAT346) tumor prostático tejido normal prostático DNA227996 (TAT348) tumor de mama tejido normal de mama DNA227996 (TAT348) tumor de colon tejido normal de colon DNA22799S (TAT348) tumor rectal tejido normal rectal DNA227996 (TAT348) tumor uterino tejido normal uterino DNA227996(TAT348) tumor pulmonar tejido normal pulmonar - - DKA227996 (TAT348) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA22799S (???348) tumor prostático tejido normal prostático DNA227996 (TAT348) tumor pancreático tej ido normal pancreático DNA227996 (TAT348) tumor estomacal tejido normal estomacal DNA227996 (TAT348) tumor de vej iga tej ido normal de vejiga DNA304652 (TAT353) tumor prostático tejido normal prostático DNA254851 (TAT357) tumor de piel tejido normal de piel DNA 54851 (TAT357) tumor de melanoma te ido normal asociado DNA39975 (TAT360) tumor de vej ga tejido normal de vejiga DNA39975 (TAT360) tumor de colon tejido normal de colon DWA39975 (TAT360) tumor rectal tej ido normal rectal DUA39975 (TAT360) tumor endometrial tejido normal endometrial DNA39975 (TAT360) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA39975 (TAT360) tumor ovárico tej ido normal ovárico DNA39975 (TAT360) tumor estomacal tejido normal estomacal DNA39975 (TAT360) tumor prostático tejido normal prostático DNA39979 (TAT361) tumor de colon te ido normal de colon DNA39979 (TAT361) tumor rectal tejido normal de vejiga DNA39979 (TAT361) tumor endometrial tejido normal endometrial DNA39979 (TAT361) tumor de mama tejido normal de mama DHA39979 (TAT361) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA39979 (TAT361) tumor de vejiga tejido normal de vejiga DNA39979 (TAT361) tumor prostático tejido normal prostático DNA336539 (TAT363) tumor de mama tejido normal de mama DNA336539 (TAT363) tumor de colon tejido normal de colon - - DNA336539 (TAT363) tumor rectal tejido normal rectal DNA336539 (TAT3S3) tumor endometrial tejido normal endometrial DNA336539 (TAT363) tumor renal te ido normal renal DNA336539 (TAT363) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA336539 (TAT363) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA336539 (TAT363) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA194909 (TAT365) tumor renal tejido normal renal DNA271250 (TAT366) tumor pulmonar te ido normal pulmonar DNA271250 (TAT366) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA271250 (TAT366) tumor de vejiga tejido normal de vejiga DNA266520 (TAT369) tumor de mama tejido normal de mama DNA327261 (TAT370) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA327261 (TAT370) tumor rectal tejido normal rectal DNA226374 (TAT380) tumor pulmonar tej ido normal pulmonar DNA226374 (???380) tumor tiroideo tejido normal tiroideo DNA226374 (TAT380) tumor prostático tejido normal prostático DNA22637 (TAT380) tumor uterino tejido normal uterino DNA226374 (TAT380) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA226374 (TAT380) tumor óseo tejido normal óseo DNA22637 (TAT380) tumor esofágico tejido normal esofágico DNA255788 (TAT381) tumor prostático tejido normal prostático DNA255788 (TAT381) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA255788 (TAT381) tumor de vej iga tejido normal de vejiga DNA327296 (TAT382) tumor uterino tejido normal uterino Molécula S egulación de la expresi >n en: según se compara a - - DNA327296 (TAT382) tumor mieloide tejido normal mieloide DNA327296 (TAT382) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA327296 (TAT382) tumor renal tejido normal renal DNA327296 (TAT382) tumor próstata tejido normal próstata DHA327296 (TAT382) tumor pancreático te ido normal pancreático DNA327296 (TAT382) tumor tiroideo tejido normal tiroideo DNA96970 (TAT383) tumor hepático tejido normal hepático DWA96970 (TAT383) tumor de tejido liso tejido liso normal DWA96970 (TAT383) tumor renal tejido normal renal DNA225790 (TAT384) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DWA225790 (TAT384) tumor de mama tejido normal de mama DNA225790 (TAT384) tumor uterino tejido normal uterino DNA225790 (TAT384) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA225790 (TAT384) tumor de vejiga tejido normal de vejiga DNA225790 (TAT384) tumor esofágico tejido normal esofágico DNA225790 (TAT384) tumor testicular tejido normal testicular DNA225790 (TAT384) tumor de colon tejido normal de colon DNA225790 (TAT384) tumor de piel tejido normal de piel DNA225790 (TAT384) tumor ovárico tejido normal ovárico DWA92958 (TAT385) glioma te ido normal glial DNA92958 (TAT385) tumor cerebral tejido normal cerebral DETA92958 (TAT385) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA257716 (TAT386) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA25771S (TAT386) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA226862 (TAT387) tumor cerebral tejido normal cerebral - - DNA226862 (TAT387) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA226862 (TAT387) tumor de mama tej ido normal de mama DNA226862 (TAT387) tumor uterino tejido normal uterino DNA226862 (TAT387) tumor de tejido liso tejido liso normal DNA226862 (TAT387) tumor de colon tejido normal de colon DNA226862 (TAT387) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA226862 (TAT387) tumor ovárico tejido normal ovárico DWA226862 (TAT387) tumor prostático tejido normal prostático DNA226862 (TAT387) tumor testicular tejido normal testicular DNA226862 (TAT387) tumor óseo tejido normal óseo DNA226862 (TAT387) tumor renal tej ido normal renal DNA331165 (TAT388) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA331165 (TAT388) tumor pulmonar de te ido normal pulmonar células pequeñas de células pequeñas D1TA331167 (TAT389) tumor de mama tejido normal de mama DNA331167 (TAT389) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA331167 (TAT389) tumor pulmonar de tejido normal pulmonar células pequeñas de células pequeñas DNA331167 (TAT389) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DUA331173 (TAT390) tumor pulmonar de tej ido normal pulmonar células pequeñas de células pequeñas DNA331173 (TAT390) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA331171 (TAT391) tumor cerebral tejido normal cerebral DNA331171 (TAT391) tumor pulmonar de tejido normal pulmonar células pequeñas de células pequeñas - - DNA331171 (TAT391) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA226266 (TAT392) glioma tejido normal glial/pulmonar DNA226266 (TAT392) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DMA226266 (TAT392) tumor uterino tejido normal uterino DMA22626S (TAT 92) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA22S26S (TAT392) tumor pulmonar de tej ido normal pulmonar células pequeñas de células pequeñas DNA22626S (TAT392) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA22626S (TAT392) tumor de tejido liso tejido liso normal DNA125753 (TAT396) tumor oseo tejido normal óseo DNA125753 (TAT396) tumor de mama te ido normal de mama Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a DNA125753 (TAT396) tumor endometrial tejido normal endometrial DNA125753 (TAT396) tumor renal tejido normal renal DNA125753 (TAT396) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA125753 (TAT396) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA125753 (TAT396) tumor testicular tejido normal testicular DNA125753 (TAT396) tumor de piel tejido normal de piel DNA125753 (TAT396) tumor de tejido liso tejido liso normal DNA199793 (TAT397) tumor de mama tejido normal de mama DHA199793 (TAT397) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA199793 (TAT397) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA199793 (TAT397) tumor prostático tejido normal prostático DNA210S47 (TAT398) tumor neuroendócrino tejido normal neuroendócrino - - DMA210647 (TAT398) tumor adrenal te ido normal adrenal DNA210647 (TAT398) sarcomas tejido normal asociado DNA210647 (TAT398) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA210647 (TAT398) tumor linfoide tejido normal linfoide DNA210647 (TAT398) tumor de tejido liso tejido liso normal DNA332801 (TAT427) tumor neuroendócrino tejido normal neuroendócrino DNA332801 (TAT427) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA332801 (TAT427) sarcomas tejido normal asociado DNA332801 (TAT427) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA332801 (TAT427) tumor linfoide tejido normal linfoide DNA332801 (TAT427) tumor de tejido liso tejido liso normal DNA226884 (TAT399) tumor de mama tejido normal de mama DNA226884 (TAT399) tumor endometrial te ido normal endometrial DNA226884 (TAT399) tumor renal tejido normal renal DNA226884 (TAT399) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA226884 (TAT399) tumor pulmonar de tejido normal pulmonar células pequeñas de células pequeñas DNA226884 (TAT399) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA226884 (TAT399) tumor de tejido liso tejido liso normal DNA335916 (TAT423) tumor de mama tejido normal de mama DNA335916 (TAT423) tumor endometrial tejido normal endometrial DNA33591S (TAT423) tumor renal tejido normal renal DNA33591S(TAT423) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA335916 (TAT423) tumor pulmonar de tejido normal pulmonar - - células pequeñas de células pequeñas DNA335916 (TAT423) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA335916 (TAT423) tumor de tejido liso tejido liso normal EJEMPLO 2 : Análisis de Microensayo para Detectar la Sobreregulación de los Polipéptidos TAT en Tumores Cancerosos Utilizando Microdisección de Captura por Láser Los microensayos de ácido nucleico, con frecuencia contienen miles de secuencias de gen, que son útiles para identificar genes diferencialmente expresado en tejidos enfermos en comparación a sus contrapartes normales . Utilizando los microensayos de ácido nucleico, las pruebas y las muestras de AKNm control de las pruebas y muestras de tejido de control se transcriben inversamente y se marcan para generar sondas de ADWc . Las pruebas de ADNc se hibridizan entonces para una disposición de ácidos nucleicos inmovilizados sobre un soporte sólido. La disposición se configura de tal manera que se conoce la secuencia y posición de cada miembro de la disposición. Por ejemplo, puede disponerse sobre un soporte sólido una selección de genes conocidos para expresarse en ciertos estados de enfermedad. La hibridación de una sonda marcada con un miembro dispuesto particular indica que la muestra a partir de la cual se deriva expresa ese gen. Si la señal de hibridación de una sonda a partir de una muestra de prueba (tejido enfermo) es - - mayor que la señal de hibridación de una sonda a partir de una muestra control (tejido normal) , se identifica el gen o genes sobre-expresados en el tejido enfermo. La implicación de este resultado es que una proteina sobre-expresada en un tejido enfermo es útil no solamente como un marcador de diagnóstico por la presencia de la condición de enfermedad, sino también como un objetivo terapéutico para el tratamiento de la condición de la enfermedad. La metodología de hibridación de los ácidos nucleicos y la tecnología de microensayo es bien conocida en la técnica. En un ejemplo, la preparación específica de ácidos nucleicos para la hibridación y las sondas, los portaobjetos y las condiciones de hibridación se detallan todas en la Solicitud de Patente del PCT Serie No. PCT/US01/10482 , presentada en Marzo 30 de 2001 y la cual se incorpora en la presenta mediante la referencia. En el presente ejemplo, se estudiaron los tumores cancerosos derivados de varios tejidos humanos para la expresión sobrerregulada del gen en relación a los tumores cancerosos de diferentes tipos de tejido y/o de tejidos humanos no cancerosos en un intento por identificar aquellos polipéptidos que se encuentran sobreexpresados en tumo (es) cancerosos (s) particular (es) . En ciertos experimentos, se obtuvo y se analizó el tejido tejido humano de tumor canceroso y el tej ido humano de tumor no canceroso del mismo - - tipo de tejido (frecuentemente del mismo paciente) para la expresión de los polipéptidos TAT. Adicionalmente, se obtuvo el tej ido humano canceroso de cualquiera de una variedad de diferentes tumores humanos y se comparó con una muestra "universal" epitelial de control que se preparó conjuntando tejidos humanos no cancerosos de origen epitelial, incluyendo hepáticos, renales y pulmonares. El ARNm aislado de los tejidos almacenados representa una mezcla de los productos del gen expresados a partir de estos diferentes tejidos. Los experimentos de hibridación de micro ensayo utilizando las muestras de control almacenadas generó un esquema lineal en un análisis de 2 colores. La curva de la línea generada en un análisis a 2 colores se utilizó entonces para normalizar las proporciones (detección de prueba : control) dentro de cada experimento. Las proporciones normalizadas de varios experimentos se compararon entonces y se utilizaron para identificar las agrupaciones de expresión del gen. De este modo, la muestra de "control universal" almacenada no solo permitió efectivas determinaciones relativas de la expresión del gen en una comparación simple de 2 muestras, sino también comparaciones de muestras múltiples a través de varios experimentos . En los presentes experimentos, se utilizaron las sondas de ácido nucleico derivadas de las secuencias de ácido nucleico que codifican el polipéptido TAT descritas en la - - presente en la creación del micro ensayo y el ARN de varios tejidos tumorales se utilizó para su hibridación al mismo. Abajo se muestran los resultados de estos experimentos, demostrando que varios de los polipéptidos TAT de la presente invención se sobreexpresan significativamente en varios tejidos tumorales humanos en comparación con otros tejidos tumorales humanos y/o tejido(s) humano (s) no canceroso (s) . Como se describió anteriormente, estos datos demuestran que los polipéptidos TAT de la presente invención son útiles no solo como marcadores diagnósticos de la presencia de uno o más tumores cancerosos, sino también que sirven como objetivos terapéuticos para el tratamiento de esos tumores. Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a: DNA336539 (TAT363) tumor de mama tejido normal de mama DNA336539 (TAT363) tumor prostático tejido normal prostático DNA336539 (TAT363) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA336539 (TAT363) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA336539 (TAT363) tumor de colon tejido normal de colon EJEMPLO 3 : Análisis Cuantitativo de la Expresión de ARNm de TAT En este ensayo, se utilizó un ensayo de 5' nucleasa (por ejemplo, TaqMan®) y una PCR cuantitativa en tiempo real (por ejemplo, AB1 Prizm 7700 Sequence Detection System® (Perkin Elmer, Applied Biosystems División, Foster City, CA) ) , para encontrar genes que se sobre-expresan - - significativamente en un tumor o tumores cancerosos en comparación con otros tumores cancerosos o tejido normal no canceroso. La reacción del ensayo de 5' nucleasa es una técnica fluorescente en base a PCR que hace uso de la actividad de 5' exonucleasa de la enzima Taq ADN polimerasa para monitorear la expresión del gen en tiempo real. Se utilizan dos iniciadores de oligonucleótido (cuyas secuencias se basan en el gen o la secuencia EST de interés) para generar un amplicón típico de una reacción PCR. Se diseña un tercer oligonucleótido o sonda para detectar la secuencia de nucleótidos localizada entre los dos iniciadores de PCR. La sonda es no-extensible mediante la enzima Taq ADN polimerasa, y se marca con un tinte indicador fluorescente y un tinte atenuador fluorescente . Cualquier emisión inducida por láser del tinte indicador se atenúa por medio del tinte atenuador cuando los dos tintes se localizan cercanos entre sí como se encuentran en la sonda. Durante la reacción de amplificación PCR, la enzima Taq ADN polimerasa divide la sonda de una manera dependiente del molde. Los fragmentos de sonda resultantes se desasocian en solución, y la señal del tinte indicador liberado se encuentra libre del efecto de atenuación del segundo fluoróforo. Una molécula del tinte indicador se libera por cada nueva molécula sintetizada, y la detección del tinte reportero no atenuado proporciona la base para la interpretación cuantitativa de los datos .
- - El procedimiento de 5' nucleasa se realiza en un dispositivo de PCR cuantitativa en tiempo real tal como el AB1 Prism 7700TM Seguence Detection. El sistema consiste de una cámara y computadora de dispositivo termociclador, láser acoplado a la carga (CCD) . El sistema amplifica las muestras en un formato de 96 pozos en un termociclador. Durante la amplificación, se colecta una señal fluorescente inducida por láser en tiempo real a través de cables de fibra óptica para todos los 96 pozos, y se detecta en el CCD. El sistema incluye software para accionar el instrumento y para analizar los datos . El material de inicio para la exploración fue AR m aislado de una variedad de diferentes tejidos cancerosos. El ARNm se cuantifica precisamente, e.g., fluorométricamente . Como control negativo, se aisló ARN de varios tejidos normales del mismo tipo de tejido que los tejidos cancerosos que se probaron. Los datos del ensayo de 5' nucleasa se expresan inicialmente como Ct o el ciclo de umbral . Esto se define como el ciclo en el cual se acumula la señal indicadora sobre el nivel de respaldo de fluorescencia. Los valores ACt se utilizan como medición cuantitativa del número relativo de copias de inicio de una secuencia objetivo particular en una muestra de ácido nucleico al comparar los resultados del ARNm canceroso con los resultados del ARNm normal humano. Dado - - que una unidad Ct corresponde a 1 ciclo de PCR o aproximadamente a un incremento relativo de 2 veces en relación al normal, dos unidades corresponden a un incremento relativo de 4 veces, 3 unidades corresponden a un incremento relativo de 8 veces y así sucesivamente, se puede medir cuantitativamente las veces de incremento relativo en la expresión del ARNm entre dos o más tejidos diferentes. Utilizando esta técnica, las moléculas abajo listadas se han identificado como significativamente sobreexpresadas (i.e., al menos 2 veces) en un tumor (es) particular (es) en comparación con su(s) contraparte (s) de tejido(s) no canceroso (s) (tanto del mismo como de diferentes donantes de tejido) y de este modo, representan excelentes objetivos de polipéptido para el diagnóstico y terapia del cáncer en mamíferos . Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a DNA194607 (TAT319) tumor prostático tejido normal prostático DNA225388 (TAT328) tumor prostático tejido normal prostático DHA2ei04S (TAT343 ) tumor de mama tejido normal de mama DNA19403S (TAT345) tumor prostático tej ido normal prostático DNA225731 (TAT346) tumor prostático tejido normal prostático Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a DNA227996 (TAT3 8) tumor prostático tejido normal prostático DNA304652 (TAT353) tumor prostático tejido normal prostático DHA304766 (TAT354) tumor de mama tejido normal de mama - - DNA304767 (TAT355) tumor prostático tejido normal prostático DNA304987 (TAT359) tumor de mama tejido normal de mama DNA39975 (TAT360) tumor de colon tejido normal de colon DNA39979 (TAT361) tumor de mama tejido normal de mama DNA336539 (TAT363) tumor de mama tejido normal de mama DNA336539 (TAT363) tumor pulmonar de tejido normal de células escamosas células escamosas DNA194909 (TAT365) tumor renal te ido normal renal DNA271250 (TAT366) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA266520 (TAT369) tumor de mama tejido normal de mama DNA327261 (TAT370) tumor de colon te ido normal de colon DNA225790 (TAT384) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA2268S2 (TAT387) tumor ovárico tejido normal ovárico EJEMPLO 4: Hibridación In si tu La hibridación in situ es una poderosa y versátil técnica para la detección y localización de secuencias de ácido nucleico dentro de preparaciones celulares o de tejido. Puede ser útil, por ejemplo, identificar sitios de expresión de gen, analizar la distribución del tejido de transcripción, identificar y localizar infección viral, seguir los cambios en la síntesis del ARMm específico y auxiliar en la representación de cromosomas. La hibridación in situ se llevó a cabo siguiendo una versión optimizada del protocolo por Lu y Gillett, Cell Vision 1:169-176 (1994), utilizando ribosondas marcadas 33P - - generadas por PCR. Brevemente, se seccionaron tejidos humanos embebidos en parafina, fijos en formalina, desparafinizados, desproteinados en proteinasa K (20 g/ml) durante 15 minutos a 37°C y procesados adicionalmente para hibridación in situ como se describe por Lu y Gillett supra. Una ribosonda marcada [33-P]UTP se generó a partir de un producto de PCR y se hibridó a 55°C durante la noche. Los portaobjetos se sumergieron en emulsión de rastreo nuclear Kodak NTB2 y se expusieron durante 4 semanas . Síntesis de la Ribosonda 33P Se secaron al vacío por velocidad 6.0 µ? (125 mCi) de 33P-UTP (Amersham BF 1002, SA<2000 Ci/mmol) . A cada tubo conteniendo 33P-UTP se agregaron los siguientes ingredientes : 2.0 µ? 5x de amortiguador de transcripción 1.0 µ? DTT (100 mM) 2.0 µ? mezcla de NTP (2.5 mM: 10µ; cada 10 mM GTP, CTP & ATP + 10 µ? ¾0 1.0 µ? UTP (50 µ?) 1.0 µ? Rnasin 1.0 µ? ADN molde (1 g) 1.0 µ? H20 1.0 µ? ARN polimerasa (para productos de PCR T3=A5, T7=S, comúnmente) Los tubos se incubaron a 37 °C durante una hora. 1.0 µ? de RQ1 DMasa se agregaron, seguido por incubación a - - 37 °C durante 15 minutos. 90 µ? de TE (10 mM de Tris pH 7.6/1 inM EDTA pH 8.0) se agregaron y la mezcla se pipeteó sobre papel DE81. La solución restante se cargó en una unidad de ultrafiltración Microcon-50 , y se giró utilizando el programa 10 (6 minutos) . La unidad de filtración se invirtió sobre un segundo tubo y se giró utilizando el programa 2 (3 minutos) . Después del girado final de recuperación, se agregaron 100 µ? de TE. 1 µ.1 del producto final se pipeteó en papel DE81 y se contó en 6 mi de Biofluor II . La sonda se corrió en un gel TBE/urea. 1-3 µ? de la sonda o 5 µ? de A N Mrk III se agregaron a 3 µ? de amortiguador de carga. Después de calentar en un bloque térmico de 95 °C durante tres minutos, la sonda se colocó inmediatamente en hielo. Los pozos de gel se lavaron, la muestra se cargó, y se corrió a 180-250 volts durante 45 minutos . El gel se envolvió en papel sarán y se expuso a película XAR con una pantalla de intensificación en un congelador a -70 °C de una hora hasta durante la noche. Hibridación de 33P A. Pre-tratamiento de las secciones congeladas Los portaobjetos se retiraron del congelador, se colocaron en charolas de aluminio y se deshielaron a temperatura ambiente durante 5 minutos . Las charolas se colocaron en un incubador a 55 DC durante cinco minutos para reducir la condensación. Los portaobjetos se fijaron durante - - minutos en paraformaldehldo al 4% en hielo en la cámara de humo, y se lavaron en 0.5 x SSC durante 5 minutos a temperatura ambiente (25 mi 20 x SSC + 975 mi SQ ¾0) . Después de la desproteinación en 0.5 Mg/ml de proteinasa K durante 10 minutos a 37°C (12.5 µ? de una reserva de 10 mg/ml en 250 mi precalentado en amortiguador de ARNasa libre de NRasa), las secciones se lavaron en 0.5 x SSC durante 10 minutos a temperatura ambiente . Las secciones se deshidrataron en etanol al 70%, 95%, 100%, dos minutos cada una . B . Pre-tratamiento de las secciones embebidas en parafina Los portaobjetos se desparainizaron, se colocaron en SQ H20, y se enjuagaron dos veces en 2 x SSC a temperatura ambiente, durante 5 minutos cada vez. Las secciones se desproteinaron en 20 g/ml de proteinasa K (500 µ? de 10 mg/ml en 250 mi de amortiguador libre de NRasa; 37°C, 15 minutos) - embrión humano, o 8 x proteinasa K (100 µ? en 250 mi de amortiguador de NRasa, 37 °C, 30 minutos) - tejidos de formalina. Se llevó a cabo el enjuague subsecuente en 0.5 x SSC y la deshidratación como se describió anteriormente. C . Pre-hibridación Los portaobjetos se dejaron en una caja plástica recubierta con amortiguador Box (4 x SSC, formamida al 50%) -papel filtro saturado .
- - D. Hibridación Una sonda 1.0 x 106 cpm y 1.0 µ? de tAR (reserva 50 mg/ml) por portaobjetos se calentaron a 95 °C durante 3 minutos. Los portaobjetos se enfriaron y se agregaron 48 µ? de amortiguador de hibridación por portaobjetos. Después de agitar, se agregaron 50 µ? de mezcla de 33P a 50 µ? de pre-hibridación en el portaobjetos. Los portaobjetos se incubaron durante la noche a 55 °C. E . Lavados Se efectuó el lavado 2 x 10 minutos con 2xSSC, EDTA a temperatura ambiente (400 mi 20 x SSC + 1S mi 0.25 EDTA, V!=4L) , seguido por un tratamiento de NRasaA a 37 °C durante 30 minutos (500 µ? de mg/ml en 250 mi de amortiguador de Rasa = 20 µg/tal) . Los portaobjetos se lavaron 2 x 10 minutos con 2 x SSC, EDTA a temperatura ambiente. Las condiciones rígidas de lavado fueron como sigue: 2 horas a 55 °C, 0.1 x SSC, EDTA (20 mi 20 x SSC + 16 mi EDTA, VX=4L) . F . Oligonucleótidos El análisis in situ se llevó a cabo en una variedad de las secuencias de ADM descritas en la presente . Los oligonucleotidos empleados para estos análisis se obtuvieron a fin de ser complementarios para los ácidos nucleicos (o sus complementos) como se muestra en las Figuras acompañantes. G. Resultados El análisis in situ se llevó a cabo en una variedad - - de las secuencias de ADN descritas en la presente . Los resultados de estos análisis son como sigue: (1) ???194607 (???319) La expresión de este gen aparece epitelial-específica- Se observa una fuerte expresión en el epitelio prostático benigno y maligno (3 de 3 casos) así como en el xenoinjerto LnCaP. (2) DNA225388 (TAT328) En un análisis de tejidos normales, el epitelio prostático es el único tejido con una señal positiva. En un análisis separado, 12/17 cánceres de próstata metastá icos y 20/25 primarios son positivos. En un tercer análisis, l/l adenocarcínoma prostático da una señal moderadamente fuerte, todos los otros neoplasmas son negativos. Finalmente, en un análisis del xenoinjerto ??? de cáncer de próstata 11 de 17 modelos de xenoinjerto son positivos. (3) DNA194036 (TAT345) Se observa una fuerte expresión en 2/3 muestras de cáncer colorrectal, 1/1 muestra de cáncer prostático, 3/3 muestras de cáncer endimetrial, 2/3 muestras transicionales de carcinoma celular, 3/3 muestras de carcinoma pulmonar de célula no pequeña, 1/1 muestra de cáncer pancreático, y en 2/3 muestras de melanoma maligno. En un análisis independiente, se observa también una fuerte expresión en 12/15 muestras de cáncer de próstata - - metastático y 25/26 de primario. La expresión se limita a las células epiteliales y los niveles de expresión son extremadamente fuertes en la mayoría de las muestras . Aun en otro análisis independiente, se observa una fuerte expresión en las células LnCaP en 17 de 17 modelos de xenografo de cáncer de próstata, en donde la expresión en estas células es muy fuerte. Aún en otro análisis independiente, se observa una fuerte expresión wn 10 de 11 muestras de cáncer de colon, 5 de 6 muestras de cáncer estomacal, 7 de 9 muestras de adenocarcinoma metastático, 2 de 2 muestras de colangiocarcinoma, y 4 de 4 muestras de carcinoma esofagal. Con respecto a la expresión en tejidos normales, se observa una expresión limitada en las células epiteliales de la próstata, intestino delgado y grueso, estómago, seno, túbulos renales distales, epidermis y en células germinales testiculares . La expresión es más fuerte en tejido normal de próstata en comparación con todos los otros tejidos normales probados . Todos los otros tej idos normales probados son negativos para la expresión. (4) DNA304652 (TAT353) Se observa una fuerte expresión en 2/3 muestras de cáncer colorrectal, 1/1 muestra de cáncer prostático, 3/3 muestras de cáncer endimetrial, 2/3 muestras transicionales de carcinoma celular, 3/3 muestras de carcinoma pulmonar de - - célula no pequeña, l/l muestra de cáncer pancreático, y en 2/3 muestras de melanoma maligno. En un análisis independiente, se observa también una fuerte expresión en 12/15 muestras de cáncer de próstata metastático y 25/26 de primario. La expresión se limita a las células epiteliales y los niveles de expresión son extremadamente fuertes en la mayoría de las muestras. Aun en otro análisis independiente, se observa una fuerte expresión en las células LnCaP en 17 de 17 modelos de xenografo de cáncer de próstata, en donde la expresión en estas células es muy fuerte. Aún en otro análisis independiente, se observa una fuerte expresión wn 10 de 11 muestras de cáncer de colon, 5 de 6 muestras de cáncer estomacal, 7 de 9 muestras de adenocarcinoma metastático, 2 de 2 muestras de colangiocarcinoma, y 4 de 4 muestras de carcinoma esofagal. Con respecto a la expresión en tejidos normales, se observa una expresión limitada en las células epiteliales de la próstata, intestino delgado y grueso, estómago, seno, túbulos renales distales, epidermis y en células germinales testiculares . La expresión es más fuerte en tejido normal de próstata en comparación con todos los otros tejidos normales probados . Todos los otros tej idos normales probados son negativos para la expresión. (5) DNA225731 (TAT346) - - En un análisis, se observa una fuerte expresión en 18 de 18 muestras de cáncer de próstata metastático primario.
Adicionalmente, 12 de 15 muestras de cáncer de próstata metastático son positivas para la expresión. En un análisis independiente, 17 de 18muestras de cáncer de próstata primario son positivas para la expresión.
Adicionalmente, 4 de 7 cánceres de próstata metastáticos son positivos para la expresión. Para la expresión en tejidos normales, se observa la expresión en epitelio de próstata, neuronas corticales y epitelio de seno, también se observa una señal positiva en mucosa de colon e intestino delgado (epitelio y lamina propria) , estroma ovárico, células germinales tesaticulares, nervio periférico, páncreas y epidermis. (6) DNA227996 (TAT348) En un análisis, 17 de las 18 muestras probadas muestran un muy fuerte nivel de expresión. Adicionalmente, de 16 muestras de cáncer prost tico metastático son positivas para expresión. En un análisis independiente, 17 de 24 muestras de cáncer de próstata primario son positivas para la expresión.
También 9 de 12 muestras de cáncer de próstata metastático son positivas para la expresión. Aún en otro análisis independiente, 11 de 35 muestras de adenocarcinoma pulmonar muestran una señal - - positiva, y 10 de 27 muestras de carcinoma de célula escamosa son positivas para la expresión. Con respecto a la expresión en tejidos normales, se observa una señal positiva de intensidad moderada en epitelio de próstata, epitelio de seno y mucosa de colon. Todos los otros tejidos normales probados son negativos para la expresión. (7) DNA254851 (TAT357) Todas las muestras de melanoma maligno probadas son fuertemente positivas para la expresión. Todos los tejidos normales probados, incluyendo tres muestras de piel normal, son negativos para la expresión. (8) DNA194909 (TAT365) Diecisiete de 33 muestras de carcinoma de célula renal son positivas para la expresión, mientras que todos los tejidos normales probados incluyendo tejido de riñon benigno, son negativos . (9) DNA271250 (TAT366) Todos los tejidos normales probados, incluyendo tejidos endometriales y ováricos normales, son negativos para la expresión. Contrariamente, 2 de 3 muestras de carcinoma celular j transicional muestran una señal de moderada a fuerte, 2 de 2 muestras de carcinoa ovárico muestran expresión positiva, y 1 de 2 muestras de adenocrcinoma endometrial son positivas para la expresión. - - (10) DNA266520 (TAT369) Se observa una fuerte señal en 1 sw 1 muestra de carcinoma pulmonar de célula no pequeña y 1 de 1 feocromocitoma . Todos los tejidos normales probados fueron negativos para la expresión. EJEMPLO 5 : Verificación y Análisis de la Expresión Diferencial de Polipéptidos TAT mediante GEPIS Los polipéptidos TAT que pueden haberse identificado como antígeno tumoral como se describe en uno o más de los Ejemplos anteriores se analizaron y se verificaron como sigue. Se investigó una base de datos de ADN de marca de secuencia expresada (EST) (LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals , Palo Alto, CA) y se identificaron interesantes secuencias EST mediante GEPIS . El perfilado de la expresión del gen en silico (GEPIS) es una herramienta de bioinformática desarrollada en Genentech, Inc. que caracteriza los genes de interés para nuevos objetivos terapéuticos del cáncer. GEPIS toma ventaja de grandes cantidades de información de la secuencia EST y de la biblioteca para determinar los perfiles de expresión del gen. GEPIS es capaz de determinar el perfil de expresión de un gen en base a su correlación proporcional con el número de sus ocurrencias en las bases de datos EST, y funciona integrando la base de datos relacional LIFESEQ® EST y la información propia de Genentech de una manera rigurosa y estadísticamente - - significativa. En este ejemplo, GEPIS se utiliza para identificar y validar de manera cruzada los nuevos antígenos tumorales, aunque GEPIS puede configurarse para desempeñar tanto análisis muy específicos como tareas de amplia selección. Para la selección inicial, GEPIS se utiliza para identificar las secuencias EST de la base de datos LIFESE Q® que se correlacionan con la expresión en un tejido o tejidos particulares de interés (frecuentemente un tejido tumoral de interés) . Las secuencias EST identificadas en esta selección inicial (o las secuencias de consenso obtenidas de la alineación de secuencias EST múltiples relacionadas y sobrepuestas obtenidas de la selección inicial) se sometieron entonces a una selección propuesta para identificar la presencia de al menos un dominio transmembrana en la proteína codificada. Finalmente GEPIS se empleó para generar un perfil completo de expresión de tejido para las varias secuencias de interés. Utilizando este tipo de bioinformática de selección, se identificaron varios polipéptidos TAT (y sus moléculas de codificación de ácido nucleico) como significativamente sobreexpresadas en un tipo particular de cáncer o ciertos cánceres en comparación con otros cánceres y/o tejidos normales no cancerosos. La clasificación de los aciertos de GEPIS se basa en varios criterios que incluyen, por ejemplo, especificidad del tejido, especificidad del tumor y el nivel de expresión en - - tejidos normales esenciales y/o normales de proliferación. Lo siguiente es una lista de moléculas cuyo perfil de expresión del tejido determinado por GEPIS evidencia una alta expresión en tejido y significativa sobrerregulación de la expresión en un tumor o tumores específicos comparado con otro(s) tumor (es) y/o tejidos normales y opcionalmente relativamente baja expresión en tejidos normales esenciales y/o normales de proliferación. Como tales, las moléculas abajo enlistadas son excelentes objetivos de polipéptido para el diagnóstico y terapia del cáncer en mamíferos.
Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a DNA103367 (TAT306) tumor hepático tejido normal hepático DNA108628 (TAT307) tumor de colón tejido normal de colon DNA108720 (TAT308) tumor renal tejido normal renal DNA111260 (TAT309) tumor prostático tejido normal prostático DNA111260 (TAT309) tumor de vejiga te ido normal de vejiga DNA150051 (TAT310) tumor de colon tejido normal de colon DNA150051 (TAT310) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA15057S (TAT311) tumor hepático tejido normal hepático DNA150655 (TAT312) tumor prostático tejido normal prostático DNA151242 (TAT313) tumor de mama tejido normal de mama DNA151475 (TAT314) tumor renal tejido normal renal Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a DNA170028 (TAT315) tumor de mama tejido normal de mama - - DNA170028 TAT315) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA170028 TAT315) tumor cerebral tejido normal cerebral DNA170028 TAT315) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA170028 TAT315) tumor de glándula tejido normal de glándula adrenal adrenal DNA170036 TAT316) tumor de colon tejido normal de colon • DNA170036 TAT31S) tumor uterino tejido normal uterino DNA170036 TAT316) tumor estomacal tejido normal estomacal DNA170036 TAT31S) tumor de mama tejido normal de mama DNA226549 TAT317) tumor mieloide tejido normal mieloide DNA226549 TAT317) tumor uterino tejido normal uterino DNA226549 TAT317) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA226549 TAT317) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA193850 TAT318) tumor de mama tejido normal de mama DMA193850 TAT318) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA193850 TAT318) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA194607 TAT319) tumor prostático tejido normal prostático DNA196615 TAT320) tumor uterino tejido normal uterino DNA196615 TAT320) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA199062 TAT321) tumor prostático tejido normal prostático DNA220776 TAT322) tumor de mama tejido normal de mama DNA254783 TAT323) tumor de colon tejido normal de colon DNA254783 TAT323) tumor mieloide tejido normal mieloide DNA220980 TAT324) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA220980 TAT324) tumor pulmonar tejido normal pulmonar - - DNA254898 tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA254898 tumor uterino tejido normal uterino DNA256257 tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA222801 tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA225388 tumor prostático tejido normal prostático DNA226421 tumor de uterino tejido normal de uterino DNA226421 tumor estomacal tejido normal estomacal DNA228521 tumor de mama tejido normal de mama DNA228521 tumor prostático tejido normal prostático DNA233286 tumor de mama tejido normal de mama 'DNA45493 tumor de colon tejido normal de colon DNA59608 tumor cerebral tejido normal cerebral DNA62872 tumor de mama tejido normal de mama DNA76533 tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA84932 tumor de glándula tejido normal de glándula adrenal adrenal DNA84932 tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA84932 tumor de mama tejido normal de mama DNA880 5 tumor prostático tejido normal prostático DÍÍA88232 tumor hepático tejido normal hepático DNA88232 tumor pancreático tejido normal pancreático DNA88237 tumor uterino tejido normal uterino DNA88237 tumor de mama tejido normal de mama DNA88334 tumor uterino tejido normal uterino DNA88334 tumor ovárico tejido normal ovárico - - DNA88411 (TAT341) tumor de mama tejido normal de mama DNA88411 (TAT341) tumor óseo tejido normal óseo DNA88431 (TAT342) tumor de mama tejido normal de mama DNA88431 (TAT342) tumor ovárico tejido normal ovárico ÜNA88431 (TAT342) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA88431 (TAT342) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA88431 (TAT342) tumor de vejiga tejido normal de vejiga Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a DNA261046 (TAT343) tumor de mama tejido normal de mama DNA261046 (TAT343) tumor de colon tejido normal de colon DNA261046 (TAT343) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA261046 (TAT343) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA261046 (TAT343) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA261046 (TAT343) tumor de recto tejido normal de recto DNA26104S (TAT343) tumor de piel tejido normal de piel DNA261046 (TAT343) tumor estomacal tejido normal estomacal DNA2S1046 (TAT343) tumor prostático tejido normal prostático DNA2ei04e (TAT343) tumor cerebral tejido normal cerebral DNA261046 (TAT343) tumor esofágico tejido normal esofágico DNA182432 (TAT344) tumor uterino tejido normal uterino DNA182432 (TAT344) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA182432 (TAT344) tumor de mama tejido normal de mama DNA182432 (TAT344) tumor cerebral tejido normal cerebral DNA182432 (TAT344) tumor linfoide · tejido normal linfoide DNA19 036 (TAT345) tumor prostático tejido normal prostático - - DWA19 036 (???345) tumor de vejiga tejido normal de vejiga DNA194036 (TAT345) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA225731 (TAT346) tumor prostático tejido normal prostático DNA22799S (TAT348) tumor óseo tejido normal óseo DNA22799S (TAT348) tumor de colon tejido normal de colon DNA22799S (TAT348) tumor prostático tejido normal prostático DNA227996 (TAT348) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA304652 (TAT353) tumor prostático tejido normal prostático DNA304652 (TAT353) tumor de vejiga tejido normal de vejiga DNA304652 (TAT353) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA304766 (TAT354) tumor de mama tejido normal de mama DNA30476S (TAT354) tumor de colon tejido normal de colon DNA30476S (TAT354) tumor de recto tejido normal de recto DNA304766 (TAT354) tumor prostático tejido normal prostático DNA304767 (TAT355) tumor de colon tejido normal de colon DNA304767 (TAT355) tumor renal tejido normal renal DMA304767 (TAT355) tumor prostático tejido normal prostático D A136821 (TAT356) tumor prostático tejido normal prostático DNA254851 (TAT357) tumor de piel tejido normal de piel DNA254851 (TAT357) tumor linfoide tejido normal linfoide DNA254851 (???357) tumor prostático tejido normal prostático DNA47361 (TAT358) tumor linfoide tejido normal linfoide DNA47361 (TAT358) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA47361 (TAT358) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA304987 (TAT359) tumor de mama tejido normal de mama - - DNA399975 (TAT360) tumor pulmonar tejido normal pulmonar ???399975 (TAT360) tumor de mama tejido normal de mama DNA399975 (TAT360) tumor de colon tejido normal de colon DNA399975 (TAT360) tumor uterino tejido normal uterino DNA399975 (TAT360) tumor estomacal tejido normal estomacal DNA399979 (TAT361) tumor de mama tejido normal de mama DÍTA399979 (TAT361) tumor de colon tejido normal de colon DNA399979 (TAT361) tumor uterino te ido normal uterino DNA399979 (TAT361) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA399979 (TAT3S1) tumor neuroendócrino tejido normal neuroendócrino DNA399979 (TAT361) tumor pancreático tej ido normal pancreático DNA399979 (TAT361) tumor prostático tejido normal prostático DNA40594 (TAT362) tumor linfoide tejido normal linfoide DNA40594 (TAT362) tumor de colon tejido normal de colon Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a DNA336539 (TAT363) tumor de mama tej ido normal de mama DNA336539 (TAT363) tumor prostático tejido normal prostático DNA225930 (TAT364) tumor uterino tej ido normal uterino DNA225930 (TAT364) tumor ovárico tej ido normal ovárico DHA271250 (TAT366) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA271250 (TAT366) tumor de vejiga tejido normal de vejiga DNA271250 (TAT366) tumor ovárico tej ido normal ovárico DNA271250 (TAT366) tumor endometrial tejido normal endometrial DNA271250 (TAT366) tumor renal tejido normal renal - - DNA271250 (TAT366) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA210128 (TAT367) tumor prostático tejido normal prostático DNA210128 (TAT367) tumor renal tejido normal renal DNA210128 (TAT367) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA257955 (TAT368) tumor linfoide tejido normal linfoide DNA257955 (TAT368) tumor asociado con tejido normal tejido hematopoyét hematopoyético DNA266520 (TAT369) tumor de mama te ido normal de mama DHA2S6520 (TAT369) tumor prostático tejido normal prostático DNA327261 (TAT370) tumor de colon tejido normal de colon DNA327261 (TAT370) tumor renal tejido normal renal DMA327295 (TAT37X) tumor renal tej ido normal renal DNA327295 (TAT371) tumor endometrial tejido normal endometrial DNA327295 (TAT371) tumor ovárico tej ido normal ovárico DNA225786 (TAT372) tumor linfoide tej ido normal linfoide DNA225786 (TAT372 ) tumor de bazo tejido normal de bazo DNA225786 (TAT372) tumor pancreático tej ido normal pancreático DNA225786 (TAT372) tumor de colon tej ido normal de colon DNA225786 (TAT372) tumor rectal tejido normal rectal DNA22637 (TAT38O) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA22637 (TAT380) tumor tiroideo tejido normal tiroideo DNA226 7 (TAT380) tumor prostático tejido normal prostático DNA22637 (TAT380) tumor uterino tejido normal uterino D1ÍA226374 (TAT380) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA226374 (TAT380) tumor óseo tejido normal óseo - - DNA226374 (TAT38O ) tumor esofágico tejido normal esofágico DNA255788 (TAT381) tumor prostático tejido normal prostático DNA255788 (TAT381) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA255788 (TAT381) tumor de vejiga tejido normal de vejiga DNA327296 (TAT382) tumor uterino tejido normal uterino DNA327296 (TAT382) tumor mieloide tejido normal mieloide DNA327296 (TAT382) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA327296 (TAT382) tumor renal tejido normal renal DNA327296 (TAT382) tumor prostático tejido normal prostático DNA327296 (TAT382) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA327296 (TAT382) tumor tiroideo tejido normal tiroideo DNA96970 (TAT383) tumor de tejido liso tejido liso normal DNA9S970 (TAT383) tumor testicular tejido normal testicular DNA225790 (TAT384) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA225790 (TAT384) tumor de mama tejido normal de mama DNA225790 (TAT384) tumor uterino tejido normal uterino DNA225790 (TAT384) tumor pancreático tejido normal pancreático DÍÍA225790 (TAT384) tumor de vejiga tejido normal de vejiga DNA225790 (TAT384) tumor esofágico tejido normal esofágico DNA225790 (TAT384) tumor testicular tejido normal testicular DNA225790 (TAT384) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA225790 (TAT384) tumor de colon tejido normal de colon DNA92958 (TAT385) glioma tej ido normal glial Molécula Sobrerregulación de la expresión en: según se compara a DNA92958 (TAT385) tumor cerebral tejido normal cerebral - - DNA257716 (TAT38S) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA257716 (TAT38S) tumor renal tejido normal renal DNA226862 (TAT387) tumor cerebral tejido normal cerebral DNA2268S2 (TAT387) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA226862 (TAT387) tumor de mama tejido normal de mama DNA226862 (TAT387) tumor uterino tejido normal uterino DNA226862 (???387) tumor de tejido liso tejido liso normal DNA226862 (TAT387) tumor de colon tejido normal de colon DNA226862 (TAT387) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA226862 (TAT387) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA226862 (TAT387) tumor prostático tejido normal prostático DNA226862 (TAT387) tumor testicular tejido normal testicular DNA331165 (???388) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA331165 (TAT388) tumor pulmonar de te ido normal pulmonar de células pequeñas de células pequeñas DNA331167 (TAT389) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA3311S7 (TAT389) tumor pancreático tejido normal pancreático DNA331173 (TAT390) tumor pulmonar de tejido normal pulmonar de células pequeñas de células pequeñas DNA331X73 (TAT390) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA331171 (TAT391) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA331171 (TAT391) tumor pulmonar de tejido normal pulmonar de células pequeñas de células pequeñas DNA331171 (TAT391) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA22626S (TAT392) tumor adrenal tejido normal adrenal - - DNA226266 (TAT392) tumor uterino tejido normal uterino DNA226266 (TAT392) tumor de mama tejido normal de mama DNA199793 (TAT397) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA199793 (TAT397) tumor de mama tejido normal de mama DNA199793 (TAT397) tumor de te ido li tejido liso normal DNA199793 (TAT397) tumor ovárico tejido normal ovárico DNA199793 (TAT397) tumor prostático tejido normal prostático DNA210647 (TAT398) tumor de tejido li tejido liso normal DNA210647 (TAT398) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA210647 (TAT398) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA210647 (TAT398) tumor de colo tej ido normal de colon DNA332801 (TAT427) tumor de tejido li tejido liso normal DNA332801 (TAT427) tumor adrenal tejido normal adrenal DNA332801 (TAT427) tumor pulmonar tejido normal pulmonar DNA332801 (TAT427) tumor de colon tejido normal de colon DNA226884 (TAT399) tumor renal tejido normal renal DNA226884 (TAT399) tumor uterino tejido normal uterino DNA226884 (TAT399) tumor de colon tejido normal de colon DNA335916 (TAT423) tumor renal tejido normal renal DNA335916 (TAT423) tumor uterino te ido normal uterino DNA335916 (TAT423) tumor de colon tejido normal de colon EJEMPLO 6 : Identificación de Polipéptidos TAT que se Expresan Específicamente por las Células B. Al utilizar los análisis asociados de expresión de - - tejido GeneExpress® y GEPIS descritos en los Ejemplos anteriores, se han identificado varios polipéptidos TAT como expresados en la superficie de células B tanto normales como malignas. Por "específicamente expresado" en un cierto tejido o tipo celular, se entiende que el polipéptido se expresa por ese cierto tejido o tipo celular y no se expresa significativamente por cualquier otro tejido o tipo celular. Los polipéptidos TAT que se expresan específicamente en la superficie de las células B tanto normales como malignas son excelentes ebjetivos de polipéptido para el tratamiento de cánceres asociados con la célula B incluyendo, por ejemplo, linfornas de alto, intermedio o bajo grado (incluyendo el linfoma de célula B tal como, por ejemplo, el linforna de célula B asociado a la mucosa de tejido linfoide y al linfoma no de Hodgkin, linfoma de célula de corteza, linfoma de Burkitt, linfoma de zona marginal, linfoma difuso de célula grande, linfoma folicular, y linfoma de Hodgkin) y leucemias ( incluyendo leucemia linfocítica crónica) , mieloma múltiple, y otros cánceres hematológicos y/o asociados a la célula B. A este respecto, notamos que RITUXAN® (Genentech Inc. South San Francisco, Calfornia) es un anticuerpo que se enlaza al antígeno CD20 que se expresa específicamente en la superficie de las células B tanto mormales como msalignas y que se ha utilizado exitosamente para tratar el linfoma no de Hodgkin en humanos. Los siguientes son polipéptidos TAT que se han - - identificado como específicamente expresados en la superficie de células B tanto normales como malignas y, en consecuencia, serivirán como excelentes objetivos de polipéptido para el tratamiento de cánceres asociados a la célula B: TAT344 (DNA182432) y TAT368 (DNA257955) . EJEMPLO 7 : El uso de TAT como una sonda de hibridación El siguiente método describe el uso de una secuencia de nucleótidos que codifica TAT como una sonda de hibridación para i.e., el diagnóstico de la presencia de un tumor en un mamífero. El ADN que comprende la -secuencia de codificación de longitud total o el TAT maduro como se describe en la presente también puede emplearse como una sonda para la selección de ADMs homólogos (tal como aquellos que codifican las variantes de TAT que ocurren de manera natural) en las bibliotecas de ADNc de tejido humano o las bibliotecas genómicas de tejido humano. La hibridación y el lavado de los filtros que contienen ya sea ADNs de biblioteca se llevan a cabo bajo las siguientes condiciones altamente rigurosas . La hibridación de la sonda derivada de TAT radioetiquetada para los filtros se lleva a cabo en una solución de formamida al 50%, 5 x SSC, SDS al 0.1%, pirofosfato de sodio al 0.1%, fosfato de sodio 50 mM, pH 6.8, 2 x solución de Denhardt y sulfato de dextrano al 10% a 42°C durante 20 horas. El lavado de los filtros se - - llevó a cabo en una solución acuosa de 0.1 x SSC y SDS al 1% a 42°C. Los ADNs que tienen una identidad de secuencia deseada con el ADN que codifica TAT de secuencia nativa de longitud total pueden identificarse entonces utilizando técnicas estándar conocidas en la técnica. EJEMPLO 8 : Expresión de TAT en E. coli Este ejemplo ilustra la preparación de una forma no glicosilada de TAT mediante la expresión recombinante en E. coli . La secuencia de ADN que codifica TAT se amplifica inicialmente utilizando iniciadores PC seleccionados. Los iniciadores deben contener sitios de enzima de restricción que corresponden a los sitios de enzima de restricción en el vector de expresión seleccionado. Pueden emplearse una variedad de vectores de expresión. Un ejemplo de vector adecuado es pB 322 (derivado a partir de E. coli; ver Bolívar et al., Gene, .2:95 (1977)) que contiene genes para la resistencia a la ampicilina y tetraciclina . El vector se digiere con la enzima de restricción y se desfosforilata . Las secuencias amplificadas de PCR se ligan entonces al vector. El vector preferentemente incluirá secuencias que codifican para un gen de resistencia al antibiótico, un promotor trp, un conductor polyhis (incluyendo los primeros seis codones STII, la secuencia polyhis y el sitio de - - desdoblamiento de la eteroquinasa) , la región de codificación TAT, el terminador transcripcional lambda y un gen argU. La mezcla de ligación se utiliza entonces para transforma una cepa de E. coli seleccionada utilizando los métodos descritos por Sambrook et al., supra. Los transformantes se identifican por su capacidad para crecer en las placas LB y se seleccionan entonces las colonias resistentes al antibiótico. El ADM de plásmido puede aislarse y confirmarse mediante el análisis de restricción y la secuenciación de ADN. Los clones seleccionados pueden crecer durante la noche en un medio de cultivo liquido tal como ciado LB suplementado con antibióticos . El cultivo durante la noche puede utilizarse subsecuentemente para inocular un cultivo de escala más grande. Las células crecen entonces a una densidad óptica deseada durante la cual se inicia el promotor de expresión. Después de cultivar las células por varias horas más, las células pueden recolectarse mediante centrifugación. La bolita de célula obtenida por la centrifugación puede solubilizarse utilizando varios agentes conocidos en la técnica y la proteína TAT solubilizada puede purificarse entonces utilizando una columna quelante metálica bajo condiciones que permitan la unión hermética de la proteína. TAT puede expresarse en E. coli en una forma - - marcada poli-His, utilizando el siguiente procedimiento. El ADN que codifica a TAT se amplifica inicialmente utilizando iniciadores PCR seleccionados . Los iniciadores contendrán sitios de enzima de restricción que correspondan a los sitios de enzima de restricción en el vector de expresión seleccionado y otras secuencias útiles proporcionadas para la iniciación de la traslación eficiente y confiable, la rápida purificación en una columna de quelación metálica y retirar el proteolxtico con enteroquinasa . Las secuencias marcadas poli-His amplificadas por PCR se ligan entonces a un vector de expresión, que se utiliza para transformar un huésped de E. coli en base a la cepa 52 (W3110 fuhA(tonA) Ion galE rpoHts (htpRts) clp (laclq) . Los transformantes crecen primero en LB que contiene 50 mg/ml de carbenicilina a 30°C con sacudimiento hasta que se alcance un O.D.600 de 3-5. Los cultivos se diluyen entonces 50-100 veces en el medio CRAP (preparado al mezclar 3.57g de ( H4)2S04í 0.71 g de citrato de sodio-2H20, 1.07 g de KCl , 5.36 g de extracto de levadura Difco, 5.36 g de SF Sheffield hicasa en 500 mi de agua, así como 110 mM de MPOS, pH 7.3, 0.55% (w/v) de glucosa y 7 i* de MgS04) y crece por aproximadamente 20-30 horas a 30°C con sacudimiento. Se retiran las muestras para verificar la expresión mediante el análisis SDS-PAGE y el cultivo de volumen se centrifuga para hacer bolitas las células. Las bolitas de células se congelan hasta la purificación y - - repliegue . La pasta de E. coli desde O .5 hasta 1 1 de fermentaciones (bolitas de 6-10 g) se resuspende en 10 volúmenes (w/v) en 7 M de guanidina, 20 mM de Tris, amortiguador de pH 8. El sulfito de sodio sólido y el tetraionato de sodio se agregan para elaborar las concentraciones finales de 0.1 y 0.02 M respectivamente y la solución se agita durante la noche a 4°C. Esta etapa da como resultado una proteína desnaturalizada con todos los residuos de cisterna bloqueados mediante sulfitolización. La solución se centrifuga a 40,000 rpm en una Ultracentrífuga Beckman durante 30 minutos. El sobrenadante se diluyó con 3-5 volúmenes de amortiguador de columna de quelato metálico (6 M de guanidina, 20 mM de Tris, pH 7.4) y se filtró a través de filtros de 0.22 micrones para clarificar. El extracto clarificado se cargó en una columna de quelato metálica Quiagen Ni-NTA de 5 mi equilibrada con el amortiguador de columna de quelato metálico. La columna se lavó con amortiguador adicional conteniendo 50 mM de imidazol (Calbiochem, clase Utrol) , pH 7.4. La proteina se extrajo con amortiguador conteniendo 250 mM de imidazol. Las fracciones que contienen la proteína deseada se agrupan y se almacenan a 4°C. La concentración de la proteina se estima por su absorbencia a 280 nm utilizando el coeficiente de destrucción calculada en base a su secuencia de aminoácidos .
- - Las proteínas se repliegan al diluir la muestra lentamente en amortiguador de repliegue preparado en fresco que consiste de: 20 mM de Tris, pH 8.6, 0.3 M de MaCl, 2.5 M de urea, 5 mM de cisteina, 20 M de glicina y 1 mM de EDTA. Los volúmenes de repliegue se escogen de manera que la concentración final de la proteína se encuentra entre 50 hasta 100 microgramos/ml . La solución de repliegue se agita suavemente a 4°C durante 12-36 horas. La reacción de repliegue se enfría mediante la adición de TFA hacia una concentración final de o.4% (pH de aproximadamente 3) . Antes de la purificación adicional de la proteína, la solución se filtra a través de un filtro de 0.22 micrones y se agrega el acetonitrilo a la concentración final de 2-10%. La proteína replegada se cromatografía en una columna de fase inversa Poros Rl/H- utilizando un amortiguador movible de 0.1% de TFA con elusión con un gradiente de acetonitrilo desde 10 hasta 80%. Las alícuotas de las fracciones con una absorbencia ?280 se analizan sobre geles de poliacrilamida SDS y se agrupan fracciones que contienen la proteína replegada homogénea. Generalmente, las especies adecuadamente replegadas de la mayoría de las proteínas se eluyen a concentraciones más inferiores de acetonitrilo ya que aquellas especies son las más compactas con sus interiores hidrofóbicos protegidos a partir de la interacción con la resina de fase inversa. Las especies agregadas se eluyen - - usualmente a concentraciones de acetonitrilo mayores . Además para resolver las formas no plegadas de las proteínas a partir de la forma deseada, la etapa de fase inversa también retira endotoxina de las muestras. Las fracciones que contienen el polipéptido TAT replegado deseado se agrupan y se retira el acetonitrilo utilizando una corriente suave de nitrógeno dirigida a la solución. Las proteínas se formulan en 20 mM de Hepes, pH 6.8 con 0.14 M de cloruro de sodio y 4% de manitol mediante diálisis o mediante filtración de gel utilizando resinas de G25 Superfine (Pharmacia) equilibradas en el amortiguador de la formulación y filtradas de manera estéril . Ciertos de los polipéptidos TAT descritos en la presente se han expresado y purificado exitosamente utilizando esta(s) técnica (s). EJEMPLO 9 : Expresión de TAT en células de mamífero Este ejemplo ilustra la preparación de una forma potencialmente glicosilada de TAT mediante la expresión recombinante en células de mamífero . El vector, pRK5 (ver EP 307,247 publicada en Marzo de 1989) se emplea como el vector de expresión. Opcionalmente, el ADN TAT se liga en pRK5 con enzimas de restricción seleccionadas para permitir la inserción del ADN TAT utilizando métodos de ligación tales como se describen por Sambrook et al., supra. El vector resultante se llama - - pRK5-TAT. En una modalidad, las células huésped seleccionadas pueden ser 293 células (ATCC CCL 1573) que crecen para confluenciar en las placas de cultivo del tejido en el medio tales como DME suplementado con suero fetal de ternero y opcionalmente componentes nutrientes y/o antibióticos. Se mezclan aproximadamente 10 µg de ADN de pRK5-TAT con aproximadamente 1 µg de ADN que codifica al gen ARN VA [Thimmapaya et al., Cell, 31:543 (1982)] y se disuelve en 500 µ? de 1 m de Tris-HCl, 0.1 mM de EDTA, 0.227 M de CaCl2. A esta mezcla se agrega gota a gota, 500 µ? de 50 mM de HEPES (pH 7.35), 280 mM de NaCl, 1.5 mM de NaP04 y se deja un precipitado para formar durante 10 minutos a 25°C. El precipitado se suspende y se agrega a las 293 células y se deja reposar durante aproximadamente cuatro horas ' a 37°C. El medio de cultivo se deja de extraer y se agregan 2 mi de 20% de glicerol durante 30 segundos. Las 293 células se lavan entonces con un medio libre de suero, el medio fresco se agrega y las células se incuban durante aproximadamente 5 días . Aproximadamente 24 horas después de las transfecciones , el medio de cultivo se retira y se reemplaza con un medio de cultivo (solo) o medio de cultivo que contiene 200 µ??/p?? de 35S-cisteina y 200 µ??/t?? de 35S-metionina. Después de 12 horas de incubación, se recolecta -÷ 91 - el medio condicionado, se concentra en un filtro centrífugo y se carga en un 15% de gel SDS . El gel procesado puede secarse y exponerse a la película por un periodo seleccionado de tiempo para revelar la presencia del polipéptido TAT. Los cultivos que contienen células transfectadas pueden sufrir incubación adicional (en el medio libre de suero) y el medio se prueba en los bioensayos seleccionados . En una técnica alternativa, TAT puede introducirse temporalmente en las 293 células utilzando el método de sulfato de dextrano descrito por Somparyrac et al . , Proc . Nati . Acad. Sci . , 12_:7575 (1981) . Las 293 células crecen a la densidad máxima en un matraz giratorio y se agregan 700 g de ADN de pRK5-TAT. Las células se concentran primero desde el matraz giratorio mediante centrifugación y se lavan con PBS. El precipitado de dextrano de ADN se incuba en la bolita de célula durante cuatro horas . Las células se tratan con 20% de glicerol durante 90 segundos, se lavan con el medio de cultivo del tejido y se reintroducen en el matraz giratorio que contiene el medio de cultivo del tejido, 5 µg/ml de insulina bovina y 0.1 µg/ml de transferrina bovina. Después de aproximadamente cuatro días, el medio condicionado se centrífuga y se filtra para retirar las células y los desechos. La muestra que contiene TAT expresado puede concentrarse y purificarse entonces mediante cualquier método seleccionado, tal como la diálisis y/o cromatografía de - - columna . En otra modalidad, TAT puede expresarse en las células CHO. El pRK5-TAT puede transfectarse en las células CHO utilizando reactivos conocidos tales como CaP0 o DEAE-dextrano. Como se describió anteriormente, los cultivos celulares pueden incubarse y el medio reemplazarse con el medio de cultivo (solo) o el medio que contiene una radiomarca tal como 35S-metionina . Después de determinar la presencia del polipéptido TAT, el medio de cultivo puede reemplazarse con el medio libre de suero. Preferentemente, los cultivos se incuban por aproximadamente 6 días y se recolecta entonces el medio condicionado. El medio que contiene TAT expresado puede concentrarse y purificarse entonces mediante cualquier método seleccionado. El TAT marcado de Epítope también puede expresarse en las células huésped CHO. El TAT puede subclonarse fuera del vector pR 5. El inserto del subclon puede someterse a PCR para fusionarse en la estructura con una marca de epítope seleccionada tal como una marca poli-his en un vector de expresión Baculovirus. El inserto TAT poli-his marcado puede subclonarse entonces en un vector SV40 impulsado que contiene un marcador de selección tal como DHFR para la selección de clones estables. Finalmente, las células CHO pueden transfectarse (como se describió anteriormente) con el vector SV40 impulsado. El marcamiento puede llevarse a cabo, como - - se describió anteriormente, para verificar la expresión. El medio de cultivo que contiene el TAT de poli-His expresado puede concentrarse y purificarse entonces por un método seleccionado, tal como mediante cromatografía por afinidad Ni2+-quelato. TAT también puede expresarse en las células CHO y/o COS mediante un procedimiento de expresión transitorio o en células CHO mediante otro procedimiento de expresión estable . La expresión estable en las células CHO se lleva a cabo utilizando el siguiente procedimiento. Las proteínas se expresan como una construcción IgG (inmunoadhesina) , en la cual las secuencias de codificación para las formas solubles (e.g., dominios extracelulares) de las proteínas respectivas se fusionan a una secuencia de región constante IgGl que contiene la articulación CH2 y los dominios CH2 y/o es una forma poli-His marcada. Después de la amplificación de PCR, los ADNs respectivos se subclonaron en un vector de expresión CHO utilizando técnicas estándar como se describe por Ausubel et al., Current Protocols of Molecular Biology (Protocolos Actuales de la Biología Molecular), Unidad 3.16, John Wiley y Sons (1997) . Los vectores de expresión CHO se construyen para tener sitios de restricción compatibles 5' y 3' del ADN de interés para permitir el movimiento conveniente de ADNcs . El vector que utiliza la expresión en células CHO como se - - describe por Lucas et al.. Nucí . Acids Res . 24:9 (1774-1779 (1996) y usos del promotor/mejorador para dirigir la expresión de ADNc de interés y el dihidrofolato de reductasa (DHFR) . La expresión de DHFR permite la selección para la mantenencia estable del plásmido siguiendo a la transfección. Se introdujeron doce microgramos del ADN del plásmido deseado en aproximadamente 10 millones de células CHO utilizando reactivos de transfección comercialmente disponibles Superfect® (Quiagen) , Dosper® o Fugene® (Boehringer Mannheim) . Las células crecieron como se describió por Lucas et al., supra . Aproximadamente células de 3 x 107 se congelaron en una ampolleta para crecimiento y producción adicional como se describe abajo. Las ampolletas que contienen el ADN de plásmido se disolvieron al colocarlas en un baño de agua y mezclarlas mediante agitadora vorticial . Los contenidos se pipetearon en un tubo centrifugo que contiene 10 mis del medio y se centrífugo a 1000 rpm durante 5 minutos. El sobrenadante se aspiró y las células se resuspendieron en 10 mi del medio selectivo (0.2 µp? de PS20 filtrado con 5% de 0.2 µ??? de suero bovino fetal diafiltrado) . Las células se alicuaron entonces en un centrifugador de 100 mi que contiene 90 mi del medio selectivo. Después de 1-2 días, las células se transfirieron en un centrifugador de 250 mi llenado con 150 mi del medio de crecimiento selectivo e incubado a 37°C. Después de otros 2- - - 3 días, se sembraron centrifugadores de 250 mi, 500 mi y 2000 mi con 3 x 105 células/ml. El medio celular se intercambió con medio fresco mediante centrifugación y resuspensión en el ' medio de producción. Aunque puede emplearse cualquier medio CHO adecuado, un medio de producción puede actualmente utilizarse como se describe en la Patente de E.U. No. 5,122,469, expedida en Junio 16 de 1992. Un centrifugador de 3 1 de producción se siembra a 1.2 x 106 células/ml. En el día 0, se determina por ejemplo, el pH del número de célula. En el día 1 inicia con el centrifugador que se muestrea y rocía con aire filtrado. En el día 2 se muestrea el centrifugador, la temperatura cambia a 33°C y se toman 30 mi de 500 g/1 de glucosa y 0.6 1 de 10% de antiespumante (e.g. 35% de emulsión de polidimetilsiloxano, Dow Corning 365 Medical Grade Emulsión) . A través de toda la producción, el pH se ajustó según fue necesario para conservarlo a alrededor de 7.2 Después de 10 días o hasta que cayó la viabilidad por debajo del 70%, el cultivo celular se recolectó mediante centrifugación y se filtró a través de un filtro de 0.22 µ??. El filtro se almacenó ya sea a 4°C o inmediatamente se cargó en las columnas para purificación. Para las construcciones de poli-His marcadas, las proteínas se purificaron utilizando una columna de Ni-NTA (Quiagen) . Antes de la purificación, se agregó imidazol al medio condicionado a una concentración de 5 mM. El medio - - condicionado se bombeó a otra columna Ni-NTA de 6 mi equilibrada en 20 mM de Hepes, pH 7.4, amortiguador que contiene 0.3 M de NaCl y 5 mM de imidazol a una tasa de flujo de 4-5 ml/min a 4°C. Después de cargar, la columna se lavó ocn amortiguador de equilibrio adicional y la proteína se eluyó con amortiguador de equilibrio que contiene 0.25 M de imidazol . La proteína altamente purificada se desaló en un amortiguador de almacenamiento que contiene 10 mM de Hepes, 0.14 M de NaCl y 4% de manitol, pH 6.8, con una columna G25 Superfine (Pharmacia) de 25 mi y se almacenó a -80 °C. Las construcciones de inmunoadhesina (que contienen Fe) se purificaron a partir del medio condicionado como sigue . El medio condicionado se bombeó en una columna Protein A (Pharmacia) de 5 mi ¦ la cual se había equilibrado con 20 mM de amortiguador de fosfato, pH 6.8. Después de cargar, la columna se lavó extensamente con amortiguador de equilibrio antes de la elución con 100 mM de ácido cítrico, pH 3.5. La proteína eluída se neutralizó inmediatamente al recolectar fracciones de 1 mi en tubos que contienen 275 µ? de 1 M de amortiguador Tris, pH 9. La proteína altamente purificada se desaló subsecuentemente en un amortiguador de almacén como se describió anteriormente para las proteínas poli-His marcadas. Se valoró la homogeneidad mediante geles de poliacrilamida de SDS y mediante la secuenciación aminoácida N-terminal por la degradación de Edman.
- - Ciertos de los polipéptidos TAT descritos en la presente se han expresado y purificado exitosamente utilizando esta(s) técnica (s). EJEMPLO 10: Expresión de TAT en Levadura El siguiente método describe la expresión recombinante de TAT en la levadura. Primero, los vectores de expresión de la levadura se construyen para la producción o secreción intracelular de TAT a partir del promotor ADH2/GAPDH . El ADN que codifica TAT y el promotor se insertan en sitios de enzima de restricción adecuado en el plásmido seleccionado para dirigir la expresión intracelular de TAT. Para la secreción, ADN codifica TAT puede clonarse en el plásmido seleccionado, junto con ADN que codifica al promotor ADH2/GAPDH, un péptido de señal TAT natural u otro péptido de señal de mamífero o por ejemplo, un factor alfa de levadura o secuencia de señal/conductora secretora invertasa y secuencias enlazadoras (si se necesitan) para la expresión de TAT. Las células de levadura, tales como la cepa de levadura AB110, pueden transformarse entonces con los plásmidos de expresión descritos arriba y cultivarse en el medio de fermentación seleccionado. Los supernadantes de levadura transformados pueden analizarse mediante precipitación con 10% de ácido tricloroacético y la separación mediante SDS-PAGE, seguida por teñido de los geles - 98 - con tinte Cooraassie Blue . El TAT recombinante puede aislarse y purificarse subsecuentemente al retirar las células de levadura desde el medio de fermentación mediante centrifugación y concentrar entonces el medio utilizando filtros de cartucho seleccionados . El concentrado que contiene TAT puede purificarse adicionalmente utilizando resinas de cromatografía de columna seleccionadas . Ciertos de los polipéptidos TAT descritos en la presente se han expresado y purificado exitosamente utilizando esta(s) técnica (s). EJEMPLO 11 ·. Expresión de TAT en Células de Insecto Infectadas con Baculovirus El siguiente método describe la expresión recombinante de TAT en células de insecto infectadas con Baculovirus . La codificación de secuencia para TAT se fusiona aguas arriba de una marca de epítope contenido dentro de un vector de expresión de baculovirus . Tales marcas de epítope incluyen marcas de poli-his y marcas de inmunoglobulina (como las regiones Fe de IgG) . Pueden emplearse una variedad de plásmidos, incluyendo plásmidos derivados a partir de plásmidos comercialmente disponibles tales como pVL1393 (Novagen) . Brevemente, la secuencia que codifica TAT o la porción deseada de la secuencia de codificación de TAT tal - - como la secuencia que codifica un dominio extracelular de una proteina de transmembrana o la secuencia que codifica la proteina madura si la proteina es extracelular se amplifica por PCR con iniciadores complementarios con las regiones 5' y 3' . El iniciador 5' puede incorporar flanquear los sitios de enzima de restricción (seleccionados) . El producto se digiere entonces con aquellas enzimas de restricción seleccionadas y se subclona en el vector de expresión. El baculovirus recombinante se genera mediante la co-transfección del plásmido anterior y el ADN del virus BaculoGold™ (Pharmingen) en células de Spodoptera frugiperda ("Sf9") (ATCC CRL 1711) utilizando lipofectina (comercialmente disponible por GIBCO-BRL) . Después de 4-5 días de incubación a 28°Cf los virus liberados se recolectaron y utilizaron para amplificaciones adicionales. La infección viral y la expresión de la proteina se lleva a cabo como se describe por O'Reilley et al . , Baculovirus expression vectors : A Laboratory Manual (Vectores de expresión de baculovirus: Un Manual de Laboratorio) oxford: Oxford Uriiversity Press (1994) . Los TAT poli-his marcados expresados pueden purificarse entonces, por ejemplo, mediante cromatografia de afinidad de Ni2+-quelato como sigue. Los extractos se prepararon a partir de células Sf9 recombinantes infectadas con virus como se describe por Rupert et al . , Nature, - - 362 : 175-179 (1993) . Brevemente, las células Sf9 se lavaron, se resuspendieron en amortiguador de sonicación (25 mi de Hepes, pH 7.9; 12.5 mM de MgCl2; 0.1 mM de EDTA; 10% de glicerol; 0.1% de NP-40; 0.4 M de KC1) y se sonicaron dos veces durante 20 segundos en hielo. Los sonicados se clarificaron mediante centrifugación y el sobrenadante se diluyó 50 veces en amortiguador de carga (50 mM de fosfato, 300 mM de NaCl, 10% de glicerol, pH 7.8) y se filtraron a través de un filtro de 0.45 µp?. Se preparó una columna de agarosa Ni2+-NTA (comercialmente disponible por Qiagen) con un volumen de lecho de 5 mi, se lavó con 25 mi de agua y se equilibró con 25 mi de amortiguador de carga. El extracto de célula filtrada se cargó en la columna a 0.5 mi por minuto. La columna se lavó para una baselina A28o con amortiguador de carga, en cuyo punto inició la recolección de la fracción. Después, la columna se lavó con un amortiguador de lavado secundario (50 mM de fosfato; 300 mM de NaCl, 10% de glicerol, pH 6.0), el cual eluye a la proteína de unión no especifica. Después de alcanzar de nuevo la baselina A28o, la columna se desarrolló con un gradiente de Imidazol de 0 hasta 500 mM en el amortiguador de lavado secundario. Se recolectaron y analizaron fracciones de un mi mediante SDS-PAGE y tintura de plata o Western blot con conjugado de Ni2+-NTA para fosfatasa alcalina (Qiagen) . Las fracciones que contienen el TAT Hisio marcado eluido se agrupan y dializan - - contra el amortiguador de carga . Alternativamente, la purificación del TAT de IgG marcado (o Fe marcado) puede llevarse a cabo utilizando técnicas de cromatografía conocidas, incluyendo por ejemplo, la Proteína A o la cromatografía de columna de la proteína G. Ciertos de los polipéptidos TAT descritos en la presente se han expresado y purificado exitosamente utilizando esta(s) técnica (s) . EJEMPLO 12 : Preparación de Anticuerpos que se enlazan a TAT Este ejemplo ilustra la preparación de anticuerpos monoclonales que pueden unirse específicamente a TAT. Las técnicas para producir los anticuerpos monoclonales se conocen en la técnica y se describen por ejemplo, en Goding, supra . Los inmunógenos que pueden emplearse incluyen TAT purificado, las proteínas de fusión que contienen TAT y células que expresan a TAT recombinante sobre la superficie celular. La selección del inmunógeno puede hacerse por el experto en la técnica sin experimentación indebida. Los ratones tales como Balb/c se inmunizaron con el inmunógeno TAT emulsionado en el adyuvante de Freund completo y se inyectaron subcutánea o intraperitonealmente en una cantidad a partir de 1-100 microgramos. Alternativamente, el inmunógeno se emulsificó en el adyuvante MPL-TDM (Rbi Immunochemical Research, Hamilton, MT) y se inyectó en las - - plantas de los patas posteriores del animal. Los ratones inmunizados se sobrealimentaron entonces 10 a 12 días después con inmunógeno adicional emulsionado en el adyuvante seleccionado. Las muestras de suero pueden obtenerse periódicamente desde los ratones mediante sangrado retro-orbital para probarse en los ensayos de ELISA para detectar anticuerpos anti-TAT. Después de que se ha detectado un titulo de anticuerpo adecuado, los animales "positivos" para los anticuerpos pueden inyectarse con una inyección intravenosa final de TAT. Tres a cuatro días después, los ratones se sacrifican y se recolectan las células del bazo. Las células del bazo se fusionan entonces (utilizando 35% de polietilen glicol) hacia una línea celular de mieloma taurino tal como P3X63AgU.l, disponible de ATCC, No. CRL 1597. Las fusiones generan células de hibridoma que pueden emplacarse entonces en placas de cultivo de tejido de 96 cavidades que contienen el medio HAT (hipoxantina, aminopterina y timidina) para inhibir la proliferación de células no fusionadas, de híbridos de mieloma e híbridos de células de bazo. Las células de hibridoma se clasificaron en un ELISA para la reactividad contra TAT. La determinación de "positivo" en la selección de células de hibridoma de los anticuerpos monoclonales deseados contra TAT se encuentra con el experto en la materia.
- - Las células de hibridoma positivas pueden inyectarse intraperitonealmente en ratones Balb/c singenéicos para producir ascitis que contienen los anticuerpos monoclonales anti-TAT. Alternativamente, las células de hibridoma puede crecer en los frascos de cultivo de tejido o botellas cilindricas. La purificación de los anticuerpos monoclonales producida en las ascitis pueden llevarse a cabo utilizando la precipitación de sulfato de amonio seguida por la cromatografía de exclusión de gel . Alternativamente, puede emplearse la cromatografía por afinidad en base a la unión del anticuerpo hacia la proteina A o la proteina G. Lós anticuerpos dirigidos contra ciertos de los polipéptidos TAT descritos en la presente se han producido con éxito utilizando esta(s) técnica (s). EJEMPLO 13 : Purificación de los Polipéptidos TAT Utilizando Anticuerpos Específicos Los polipéptidos TAT naturales o recorabinantes pueden purifcarse mediante una variedad de técnicas estándar en la materia de la purificación de la proteína. Por ejemplo, el polipéptido pro-TAT, el polipéptido TAT completo o el polipéptido pre-TAT se purifica mediante cromatografía de inmunoafinidad utilizando anticuerpos específicos para el polipéptido TAT de interés. En general, se construye una columna de inmunoafinidad mediante acoplar covalentemente el anticuerpo del polipéptido anti-TAT a una resina - - cromatogáficamente activada. Las inmunoglobulirías policlonales se preparan a partir de sueros inmunes ya sea mediante precipitación con sulfato de amonio o mediante purificación sobre la Proteína A inmovilizada (Pharmacia LKB Biotec nology, Piscataway, N.J.). De igual modo, los anticuerpos monoclonales se preparan a partir de fluidos de ascitis de ratón mediante precipitación o cromatografía con sulfato de amonio sobre la Proteína A inmovilizada. Una inmunoglobulina parcialmente purificada se enlaza covalentemente a una resina cromatográfica tal como la SEPHAOSE™ CnBr-activada (Pharmacia LKB Biotechnology) . El anticuerpo se acopla a la resina, la resina se bloquea y la resina de derivación se lava de acuerdo con las instrucciones de los fabricantes. Tal columna de inmunoafinidad se utiliza en la purificación del polipéptido TAT al preparar una fracción a partir de las células que contienen el polipéptido TAT en una forma soluble . Esta preparación se deriva mediante la solubilización de toda la célula o de una fracción subcelular obtenida via la centrifugación diferencial mediante la adición del detergente o mediante otros métodos conocidos en la materia. Alternativamente, el polipéptido TAT soluble que contiene una secuencia de señal puede sercretarse en una cantidad útil en la cual crecen las células . Una preparación que contiene el polipéptido TAT - - soluble se pasa sobre la columna de inmunoafanidad y la columna se lava bajo condiciones que permitan la absorbencia preferencial del polipeptido TAT {e.g., amortiguadores de alta resistencia iónica en la presencia de un detergente) . Entonces, la columna se eluye bajo condiciones que rompen la unión del anticuerpo/polipéptido TAT {e.g., un amortiguador de pH bajo tal como aproximadamente pH de 2-3 o una alta concentración de un chaotrope tal como la urea o ion de tiocianato) y se recolecta el polipeptido TAT. EJEMPLO 14 : Ensayo de Inactivación de Células Tumorales in vi tro Las células de mamífero que expresan el polipéptido TAT de interés pueden obtenerse utilizando técnicas estándar de expresión del vector y de clonación. Alternativamente, muchas líneas celulares de tumor que expresan polipéptidos TAT de interés se encuentran públicamente disponibles, por ejemplo, a través de la ATCC y pueden identificarse rutinariamente utilizando análisis estándar de ELISA o FACS. Los anticuerpos monoclonales de polipéptido anti-TAT (y sus derivados conjugados de toxina) pueden emplearse entonces en ensayos para determinar la capacidad deln anticuerpo para matar las células que expresan el polipéptido TAT in vitro. Por ejemplo, las células que expresan el polipéptido TAT de interés se obtienen como se describió antriormente y se enplacan en platos de 96 pozos. En un - - análisis el conjugado de anticuerpo/toxina (u otro anticuerpo desnudo) se incluye en toda la incubación de la célula durante un período de 4 días . En un segundo análisis independiente, las células se incuban durante 1 hora con el conjugadp de anticuerpo/toxin (o anticuerpo desnudo) y después se lavan y se incuban en ausencia del conjugado anticuerpo/toxina por un periodo de 4 días. La viabilidad de la célula se mide entonces utilizando el CellTiter-Glo Lumunescent Cell Viability Assay de P.romega (Cat#G7571) . Las células no tratadas sirven como control negativo. EJEMPLO 15 : Ensayo de Inactivación de Células Tumorales in vivo Para probar la eficacia de los anticuerpos monoclonales conjugados o no conjugados del polipéptido anti-TAT, se inyecta el anticuerpo anti-TAT intraperitonealmente en ratones 24 horas previo a recibir las células promotoras del tumor subcutáneamente en el costado . Las inyecciones de anticuerpo continúan dos veces por semana durante el resto del estudio. Se mide entonces el volumen del tumor dos veces por semana. La especificación escrita anterior se considera que es suficiente para capacitar a un experto en la técnica para practicar la invención. La presente invención no debe limitarse en alcance por la construcción depositada ya que la modalidad depositada se propone como una simple ilustración - - de ciertos aspectos de la invención y cualquier construcción que sea funcionalmente equivalente se encuentra dentro del alcance de esta invención. El depósito del material en la presente no constituye una admisión de que la descripción escrita contenida en la presente sea inadecuada para permitir la práctica de cualquier aspecto de la invención, incluyendo el mejor modo de la misma, ni se consideran como limitación al alcance de las reivindicaciones las ilustraciones especificas que se representan. Efectivamente, varias modificaciones de la invención además de aquellas mostradas como se describió en la presente, serán aparentes para aquellos expertos en la materia a partir de la descripción anterior y caen dentro del alcance de las reivindicaciones anexas .

Claims (15)

  1. REIVINDICACIONES 1. Un anticuerpo aislado que se enlaza a un polipéptido que tiene al menos el 80% de la identidad de la secuencia de aminoácidos para: (a) el polipéptido mostrado en cualquiera de las
  2. Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) ; (b) el polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID N0S:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158) , con su péptido de señal asociado,- (d) un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS : 82-158) , que carece de su péptido de^ señal asociado; (e) un polipéptido codificado por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS : 1-81) ; o (f) un polipéptido codificado por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) . 2. Un anticuerpo aislado que se enlaza a un polipéptido que tiene: (a) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158); (b) la secuencia de aminoácidos mostrada en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82-158), que carece de su péptido de señal asociado; (c) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las
  3. Figuras 82-158 (SEQ ID NOS: 82-158), con su secuencia de péptidos de señal asociada; (d) una secuencia de aminoácidos de un dominio extracelular del polipéptido mostrado en cualquiera de las Figuras 82-158 (SEQ ID NOS:82~158), que carece de su secuencia de péptidos de señal asociada; (e) una secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos, mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81); o (f) una secuencia de aminoácidos codificada por la región de codificación de longitud total de la secuencia de nucleótidos mostrada en cualquiera de las Figuras 1-81 (SEQ ID NOS: 1-81) 3. El anticuerpo de la Reivindicación 2, que es un anticuerpo monoclonal .
  4. 4. El anticuerpo de la Reivindicación 2, que es un fragmento de anticuerpo.
  5. 5. El anticuerpo de la Reivindicación 2, que es un anticuerpo quimérico o humanizado.
  6. 6. El anticuerpo de la Reivindicación 2, que se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento.
  7. 7. El anticuerpo de la Reivindicación 2, que se conjuga a un agente citotóxico.
  8. 8. El anticuerpo de la Reivindicación 7 en donde el agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste de toxinas, antibióticos, isótopos radiactivos y enzimas nucleoliticas .
  9. 9. El anticuerpo de la Reivindicación 7 en donde el agente citotóxico es una toxina.
  10. 10. El anticuerpo de la Reivindicación 9 en donde la toxina se selecciona del grupo que consiste de maytansinoide y calicheamicina .
  11. 11. El anticuerpo de la Reivindicación 9 en donde la toxina es un maytansinoide.
  12. 12. El anticuerpo de la Reivindicación 2, que se produce en bacterias .
  13. 13. El anticuerpo de la Reivindicación 2, que se produce en células CHO.
  14. 14. El anticuerpo de la Reivindicación 2, que induce la muerte de la célula a la cual se enlaza.
  15. 15. El anticuerpo de la Reivindicación 2 que se marca de manera detectable.
MXPA05001933A 2002-08-19 2003-08-19 Composiciones y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores. MXPA05001933A (es)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US40480902P 2002-08-19 2002-08-19
US40564502P 2002-08-21 2002-08-21
US41319202P 2002-09-23 2002-09-23
US41900802P 2002-10-15 2002-10-15
US42684702P 2002-11-15 2002-11-15
US48495903P 2003-07-02 2003-07-02
PCT/US2003/025892 WO2004016225A2 (en) 2002-08-19 2003-08-19 Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor

Publications (1)

Publication Number Publication Date
MXPA05001933A true MXPA05001933A (es) 2005-04-28

Family

ID=31892380

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
MXPA05001933A MXPA05001933A (es) 2002-08-19 2003-08-19 Composiciones y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores.

Country Status (8)

Country Link
US (3) US20040241703A1 (es)
EP (1) EP1578371A4 (es)
JP (1) JP2006510735A (es)
KR (1) KR20050048615A (es)
AU (1) AU2003259913A1 (es)
CA (1) CA2495389A1 (es)
MX (1) MXPA05001933A (es)
WO (1) WO2004016225A2 (es)

Families Citing this family (112)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2266607A3 (en) 1999-10-01 2011-04-20 Immunogen, Inc. Immunoconjugates for treating cancer
US7097840B2 (en) 2000-03-16 2006-08-29 Genentech, Inc. Methods of treatment using anti-ErbB antibody-maytansinoid conjugates
US20100056762A1 (en) 2001-05-11 2010-03-04 Old Lloyd J Specific binding proteins and uses thereof
DE60234094D1 (de) 2001-05-11 2009-12-03 Ludwig Inst For Cancer Res Ltd Spezifische bindungsproteine und ihre verwendung
CA2458915A1 (en) * 2001-08-31 2003-03-13 Agensys, Inc. Nucleic acid and corresponding protein entitled 205p1b5 useful in treatment and detection of cancer
US7097850B2 (en) * 2002-06-18 2006-08-29 Surmodics, Inc. Bioactive agent release coating and controlled humidity method
EP1447413A3 (en) * 2003-02-14 2006-01-04 Research Association for Biotechnology Full-length human cDNA
CA2523600A1 (en) * 2003-04-28 2004-11-11 Wyeth Methods utilising g-protein coupled receptor 54
US8088387B2 (en) 2003-10-10 2012-01-03 Immunogen Inc. Method of targeting specific cell populations using cell-binding agent maytansinoid conjugates linked via a non-cleavable linker, said conjugates, and methods of making said conjugates
BR122018071808B8 (pt) 2003-11-06 2020-06-30 Seattle Genetics Inc conjugado
NZ579482A (en) 2004-06-01 2011-02-25 Genentech Inc Antibody drug conjugates and methods
NZ580115A (en) 2004-09-23 2010-10-29 Genentech Inc Cysteine engineered antibody light chains and conjugates
US20100111856A1 (en) 2004-09-23 2010-05-06 Herman Gill Zirconium-radiolabeled, cysteine engineered antibody conjugates
WO2006060533A2 (en) 2004-12-01 2006-06-08 Genentech, Inc. Conjugates of 1, 8-bis-naphthalimides with an antibody
GB0606954D0 (en) * 2006-04-06 2006-05-17 Randox Lab Ltd Method
WO2008018642A2 (en) * 2006-08-10 2008-02-14 Oncotherapy Science, Inc. Genes and polypeptides relating to breast cancers
CN101711284A (zh) * 2007-01-25 2010-05-19 达娜-法勃肿瘤研究所 抗egfr抗体在治疗egfr突变体介导的疾病中的用途
US9023356B2 (en) * 2007-03-15 2015-05-05 Ludwig Institute For Cancer Research Ltd Treatment method using EGFR antibodies and SRC inhibitors and related formulations
US20090011060A1 (en) * 2007-07-06 2009-01-08 Peter Koepke Campsiandra angustifolia extract and methods of extracting and using such extract
AU2008276140C1 (en) 2007-07-16 2021-01-28 Genentech, Inc. Anti-CD79b antibodies and immunoconjugates and methods of use
PE20090481A1 (es) 2007-07-16 2009-05-18 Genentech Inc Anticuerpos anti-cd79b e inmunoconjugados humanizados y metodos de uso
ES2609915T3 (es) 2007-08-14 2017-04-25 Ludwig Institute For Cancer Research Ltd. Anticuerpo monoclonal 175 direccionado al receptor de EGF y derivados y usos del mismo
US7879369B2 (en) 2007-09-18 2011-02-01 Selvamedica, Llc Combretum laurifolium Mart. extract and methods of extracting and using such extract
KR101607346B1 (ko) 2008-01-31 2016-03-29 제넨테크, 인크. 항-ｃｄ７９ｂ 항체 및 면역접합체 및 사용 방법
EP2448966B1 (en) 2009-07-03 2018-11-14 Avipep Pty Ltd Immuno-conjugates and methods for producing them
JP2013504585A (ja) 2009-09-09 2013-02-07 セントローズ， エルエルシー 細胞外標的化薬物複合体
US20110076232A1 (en) * 2009-09-29 2011-03-31 Ludwig Institute For Cancer Research Specific binding proteins and uses thereof
KR101961495B1 (ko) 2009-12-23 2019-03-22 아비펩 피티와이 리미티트 면역-컨쥬게이트 및 그 제조방법 ２
CA2793890C (en) 2010-04-15 2017-08-15 Spirogen Developments Sarl Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
KR101839163B1 (ko) 2010-06-08 2018-03-15 제넨테크, 인크. 시스테인 조작된 항체 및 접합체
CN106434676B (zh) 2010-11-12 2020-10-23 宾夕法尼亚大学托管会 共有前列腺抗原、编码所述抗原的核酸分子以及包含所述核酸分子的疫苗及其用途
CA2816426A1 (en) 2010-11-17 2012-06-07 Genentech, Inc. Alaninyl maytansinol antibody conjugates
EP2699597B1 (en) 2011-04-21 2016-06-01 Garvan Institute of Medical Research Modified variable domain molecules and methods for producing and using them b
JP5987053B2 (ja) 2011-05-12 2016-09-06 ジェネンテック， インコーポレイテッド フレームワークシグネチャーペプチドを用いて動物サンプルにおける治療抗体を検出するための多重反応モニタリングｌｃ−ｍｓ／ｍｓ法
EP2750713B1 (en) 2011-10-14 2015-09-16 Spirogen Sàrl Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
US9120111B2 (en) 2012-02-24 2015-09-01 Rain Bird Corporation Arc adjustable rotary sprinkler having full-circle operation and automatic matched precipitation
WO2013130093A1 (en) 2012-03-02 2013-09-06 Genentech, Inc. Biomarkers for treatment with anti-tubulin chemotherapeutic compounds
DK2831109T3 (en) 2012-03-28 2018-02-12 Gadeta B V COMBINATORY GAMMA-9-DELTA-2-T-CELL RECEPTOR CHAIN EXCHANGE
US9724427B2 (en) 2012-05-21 2017-08-08 Genentech, Inc. Anti-Ly6E antibodies and immunoconjugates and methods of use
US9156043B2 (en) 2012-07-13 2015-10-13 Rain Bird Corporation Arc adjustable rotary sprinkler with automatic matched precipitation
PT2906296T (pt) 2012-10-12 2018-06-01 Medimmune Ltd Conjugados de pirrolobenzodiazepina-anticorpo
ES2703151T3 (es) 2012-10-12 2019-03-07 Adc Therapeutics Sa Conjugados de anticuerpos de pirrolobenzodiazepinas
EP2906297B1 (en) 2012-10-12 2017-12-06 ADC Therapeutics SA Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
ME03486B (me) 2012-10-12 2020-01-20 Medimmune Ltd Pirolobenzodiazepini i njihovi konjugati
EP2906253B9 (en) 2012-10-12 2019-04-10 ADC Therapeutics SA Pyrrolobenzodiazepine - anti-psma antibody conjugates
CN105102004B (zh) 2012-10-12 2019-01-25 Adc疗法责任有限公司 吡咯并苯并二氮杂卓-抗cd22抗体结合物
ES2680153T3 (es) 2012-10-12 2018-09-04 Adc Therapeutics Sa Conjugados de anticuerpos anti-PSMA-pirrolobenzodiazepinas
US10260089B2 (en) 2012-10-29 2019-04-16 The Research Foundation Of The State University Of New York Compositions and methods for recognition of RNA using triple helical peptide nucleic acids
US9353150B2 (en) 2012-12-04 2016-05-31 Massachusetts Institute Of Technology Substituted pyrazino[1′,2′:1 ,5]pyrrolo[2,3-b]-indole-1,4-diones for cancer treatment
BR112015014669B1 (pt) 2012-12-21 2023-09-26 Medimmune Limited Compostos pirrolobenzodiazepinas, conjugados compreendendo os mesmos e uso destes para tratar uma doença proliferativa
CN105246894A (zh) 2012-12-21 2016-01-13 斯皮罗根有限公司 用于治疗增殖性和自身免疫疾病的非对称吡咯并苯并二氮杂卓二聚物
EP2968596B1 (en) 2013-03-13 2019-03-06 Medimmune Limited Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
BR112015021965B1 (pt) 2013-03-13 2022-05-03 Medimmune Limited Conjugados e compostos de pirrolobenzodiazepinas, composição farmacêutica, uso dos mesmos para o tratamento de uma doença proliferativa e método de síntese dos ditos compostos
US20160031887A1 (en) 2013-03-13 2016-02-04 Medimmune Limited Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
WO2015023355A1 (en) 2013-08-12 2015-02-19 Genentech, Inc. 1-(chloromethyl)-2,3-dihydro-1h-benzo[e]indole dimer antibody-drug conjugate compounds, and methods of use and treatment
EP3054983B1 (en) 2013-10-11 2019-03-20 Medimmune Limited Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
EP3054986B1 (en) 2013-10-11 2019-03-20 Medimmune Limited Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
GB201317982D0 (en) 2013-10-11 2013-11-27 Spirogen Sarl Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
US9950078B2 (en) 2013-10-11 2018-04-24 Medimmune Limited Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
BR112016008146A2 (pt) 2013-10-21 2017-10-03 Genentech Inc Anticorpo isolado, ácido nucleico isolado, célula hospedeira, método de produção de um anticorpo, imunoconjugado, formulação farmacêutica, métodos para detectar um câncer, de identificação e de seleção de um paciente com câncer
EP3082874A2 (en) 2013-12-16 2016-10-26 Genentech, Inc. Peptidomimetic compounds and antibody-drug conjugates thereof
BR112016013258A2 (pt) 2013-12-16 2018-01-16 Genentech Inc composto conjugado anticorpo-droga, composição farmacêutica, método para tratar câncer e kit
AU2014364927A1 (en) 2013-12-16 2016-07-07 Genentech, Inc. Peptidomimetic compounds and antibody-drug conjugates thereof
US9884921B2 (en) 2014-07-01 2018-02-06 Pfizer Inc. Bispecific heterodimeric diabodies and uses thereof
EP3193940A1 (en) 2014-09-10 2017-07-26 Medimmune Limited Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
WO2016040825A1 (en) 2014-09-12 2016-03-17 Genentech, Inc. Anthracycline disulfide intermediates, antibody-drug conjugates and methods
GB201416112D0 (en) 2014-09-12 2014-10-29 Medimmune Ltd Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
KR20170052600A (ko) 2014-09-12 2017-05-12 제넨테크, 인크. 시스테인 가공된 항체 및 콘주게이트
MX2017003523A (es) 2014-09-17 2017-11-08 Genentech Inc Pirrolobenzodiazepinas y conjugados de anticuerpo-disulfuro de las mismas.
PL3262071T3 (pl) 2014-09-23 2020-08-10 F. Hoffmann-La Roche Ag Sposób stosowania immunokoniugatów anty-CD79b
BR112017011111A2 (pt) 2014-11-25 2017-12-26 Adc Therapeutics Sa conjugados de pirrolobenzodiazepina-anticorpo
KR20170086121A (ko) 2014-12-03 2017-07-25 제넨테크, 인크. 4급 아민 화합물 및 그의 항체-약물 접합체
GB201506411D0 (en) 2015-04-15 2015-05-27 Bergenbio As Humanized anti-axl antibodies
GB201506402D0 (en) 2015-04-15 2015-05-27 Berkel Patricius H C Van And Howard Philip W Site-specific antibody-drug conjugates
MA43345A (fr) 2015-10-02 2018-08-08 Hoffmann La Roche Conjugués anticorps-médicaments de pyrrolobenzodiazépine et méthodes d'utilisation
MA43354A (fr) 2015-10-16 2018-08-22 Genentech Inc Conjugués médicamenteux à pont disulfure encombré
MA45326A (fr) 2015-10-20 2018-08-29 Genentech Inc Conjugués calichéamicine-anticorps-médicament et procédés d'utilisation
US20190000969A1 (en) * 2015-12-22 2019-01-03 Abbvie Stemcentrx Llc Novel anti-upk1b antibodies and methods of use
GB201601431D0 (en) 2016-01-26 2016-03-09 Medimmune Ltd Pyrrolobenzodiazepines
GB201602356D0 (en) 2016-02-10 2016-03-23 Medimmune Ltd Pyrrolobenzodiazepine Conjugates
GB201602359D0 (en) 2016-02-10 2016-03-23 Medimmune Ltd Pyrrolobenzodiazepine Conjugates
WO2017165734A1 (en) 2016-03-25 2017-09-28 Genentech, Inc. Multiplexed total antibody and antibody-conjugated drug quantification assay
KR20180135481A (ko) 2016-04-21 2018-12-20 이매틱스 바이오테크놀로지스 게엠베하 흑색종 및 기타 암에 대한 면역요법
SG10202006117QA (en) 2016-04-21 2020-08-28 Immatics Biotechnologies Gmbh Immunotherapy against melanoma and other cancers
GB201607478D0 (en) 2016-04-29 2016-06-15 Medimmune Ltd Pyrrolobenzodiazepine Conjugates
US10918627B2 (en) 2016-05-11 2021-02-16 Massachusetts Institute Of Technology Convergent and enantioselective total synthesis of Communesin analogs
EP3458101B1 (en) 2016-05-20 2020-12-30 H. Hoffnabb-La Roche Ag Protac antibody conjugates and methods of use
US20170370906A1 (en) 2016-05-27 2017-12-28 Genentech, Inc. Bioanalytical analysis of site-specific antibody drug conjugates
CN109476648B (zh) 2016-06-06 2022-09-13 豪夫迈·罗氏有限公司 司维司群抗体-药物缀合物和使用方法
CA3026180A1 (en) 2016-06-10 2017-12-14 Gadeta B.V. Human leukocyte antigen restricted gamma delta t cell receptors and methods of use thereof
EP3496763A1 (en) 2016-08-11 2019-06-19 Genentech, Inc. Pyrrolobenzodiazepine prodrugs and antibody conjugates thereof
CN110139674B (zh) 2016-10-05 2023-05-16 豪夫迈·罗氏有限公司 制备抗体药物缀合物的方法
GB201617466D0 (en) 2016-10-14 2016-11-30 Medimmune Ltd Pyrrolobenzodiazepine conjugates
MX2019006448A (es) 2016-12-01 2020-02-05 Regeneron Pharma Anticuerpos anti-pd-l1 radiomarcados para imagenes de inmuno-pet.
US11180535B1 (en) 2016-12-07 2021-11-23 David Gordon Bermudes Saccharide binding, tumor penetration, and cytotoxic antitumor chimeric peptides from therapeutic bacteria
UA125198C2 (uk) 2017-02-08 2022-01-26 Ейдісі Терапьютікс Са Кон'югати піролобензодіазепін-антитіло
GB201702031D0 (en) 2017-02-08 2017-03-22 Medlmmune Ltd Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
ES2926144T3 (es) 2017-04-18 2022-10-24 Medimmune Ltd Conjugados de pirrolobenzodiazepina
JP7408396B2 (ja) 2017-04-20 2024-01-05 アーデーセー セラピューティクス ソシエテ アノニム 併用療法
WO2018229222A1 (en) 2017-06-14 2018-12-20 Adc Therapeutics Sa Dosage regimes for the administration of an anti-cd19 adc
HRP20220311T1 (hr) 2017-08-18 2022-05-13 Medimmune Limited Konjugati pirolobenzodiazepina
BR112020004307A2 (pt) 2017-09-20 2020-11-10 Ph Pharma Co., Ltd. análogos de tailanestatina
US10640508B2 (en) 2017-10-13 2020-05-05 Massachusetts Institute Of Technology Diazene directed modular synthesis of compounds with quaternary carbon centers
GB201803342D0 (en) 2018-03-01 2018-04-18 Medimmune Ltd Methods
GB201806022D0 (en) 2018-04-12 2018-05-30 Medimmune Ltd Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
GB201814281D0 (en) 2018-09-03 2018-10-17 Femtogenix Ltd Cytotoxic agents
EP3870235A1 (en) 2018-10-24 2021-09-01 F. Hoffmann-La Roche AG Conjugated chemical inducers of degradation and methods of use
CN113227119A (zh) 2018-12-10 2021-08-06 基因泰克公司 用于与含Fc的蛋白质进行位点特异性缀合的光交联肽
GB201901197D0 (en) 2019-01-29 2019-03-20 Femtogenix Ltd G-A Crosslinking cytotoxic agents
GB2597532A (en) 2020-07-28 2022-02-02 Femtogenix Ltd Cytotoxic compounds
WO2023147329A1 (en) 2022-01-26 2023-08-03 Genentech, Inc. Antibody-conjugated chemical inducers of degradation and methods thereof
WO2023147328A1 (en) 2022-01-26 2023-08-03 Genentech, Inc. Antibody-conjugated chemical inducers of degradation with hydolysable maleimide linkers and methods thereof

Family Cites Families (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5869053A (en) * 1988-03-04 1999-02-09 Cancer Research Campaign Technology, Ltd. 5T4 antigen from human trophoblasts
US6794135B1 (en) * 1996-03-26 2004-09-21 Oncomedx, Inc. Method for detection of 5T4 RNA in plasma or serum
CN1195851C (zh) * 1997-02-25 2005-04-06 科里克萨有限公司 用于前列腺癌免疫疗法的化合物及其用途
EP1717248A1 (en) * 1997-06-04 2006-11-02 Oxford Biomedica (UK) Limited Tumor targeted vector
US7037667B1 (en) * 1998-06-01 2006-05-02 Agensys, Inc. Tumor antigen useful in diagnosis and therapy of prostate and colon cancer
US7148035B1 (en) * 1998-11-18 2006-12-12 Oxford Biomedica (Uk) Limited Polypeptide
JP2003515323A (ja) * 1999-11-18 2003-05-07 オックスフォード バイオメディカ（ユーケイ）リミテッド 抗 体
US20030219806A1 (en) * 2000-02-22 2003-11-27 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Novel 18607, 15603, 69318, 12303, 48000, 52920, 5433, 38554, 57301, 58324, 55063, 52991, 59914, 59921 and 33751 molecules and uses therefor
US20020142377A1 (en) * 2000-02-22 2002-10-03 Glucksmann Maria Alexandra 18607, a novel human calcium channel
US20040146862A1 (en) * 2000-03-15 2004-07-29 Eos Biotechnology, Inc. Methods of diagnosis of breast cancer, compositions and methods of screening for modulators of breast cancer
US20070014801A1 (en) * 2001-01-24 2007-01-18 Gish Kurt C Methods of diagnosis of prostate cancer, compositions and methods of screening for modulators of prostate cancer
US20040029114A1 (en) * 2001-01-24 2004-02-12 Eos Technology, Inc. Methods of diagnosis of breast cancer, compositions and methods of screening for modulators of breast cancer
US7171311B2 (en) * 2001-06-18 2007-01-30 Rosetta Inpharmatics Llc Methods of assigning treatment to breast cancer patients
SE0102327D0 (sv) * 2001-06-28 2001-06-28 Active Biotech Ab A novel engineered superantigen for human therapy
GB0126378D0 (en) * 2001-11-02 2002-01-02 Oxford Biomedica Ltd Antigen
PT1472375E (pt) * 2002-01-08 2009-05-19 Novartis Vaccines & Diagnostic Produtos génicos expressos diferencialmente em células cancerígenas da mama e seus métodos de utilização
US7452675B2 (en) * 2002-01-25 2008-11-18 The Queen's Medical Center Methods of screening for TRPM4b modulators
GB0203419D0 (en) * 2002-02-13 2002-04-03 Oxford Biomedica Ltd Peptide
AR050642A1 (es) * 2004-09-10 2006-11-08 Wyeth Corp Anticuerpos anti-5t4 humanizados y conjugados anticuerpo anti-5t4/ calicheamicina

Also Published As

Publication number Publication date
US20070053835A1 (en) 2007-03-08
EP1578371A4 (en) 2009-05-20
EP1578371A2 (en) 2005-09-28
US20050064492A1 (en) 2005-03-24
JP2006510735A (ja) 2006-03-30
KR20050048615A (ko) 2005-05-24
US20040241703A1 (en) 2004-12-02
WO2004016225A8 (en) 2008-01-24
CA2495389A1 (en) 2004-02-26
AU2003259913A1 (en) 2004-03-03
WO2004016225A2 (en) 2004-02-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2009200399B2 (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
US8084200B2 (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
EP2153843B1 (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
MXPA05001933A (es) Composiciones y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores.
MXPA04010092A (es) Composiciones y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores.
US20090186409A1 (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
AU2002330015A1 (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
MXPA05012613A (es) Composiciones y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores de origen glial.
US20080096215A1 (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
ZA200506507B (en) Identification of cellular polypeptides differentially expressed by tumor cells
MXPA05002287A (es) 2 polipeptidos similares a achaete-scute y acidos nucleicos de codificacion, y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores.
AU2008201998B2 (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
MXPA04005945A (es) Composiciones y metodos para el diagnostico y tratamiento de tumores.
ZA200405011B (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor.
ZA200503798B (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
AU2007214325A1 (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
ZA200509531B (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumors of glial origin
ZA200501302B (en) Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor

Legal Events

Date Code Title Description
FA Abandonment or withdrawal