KR20200110347A - 융합 단백질 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질에 관한 것이다. 상기 도메인은 아르기니노숙시네이트 신타제(ASS-1) 효소 도메인 또는 오르니틴 트랜스카바밀라제(OTC) 효소 도메인과 같은 효소 도메인일 수 있다. 본 발명은 또한 상기 융합 표적-결합 단백질을 포함하는 세포(예를 들어, 상기 융합 표적-결합 단백질을 발현하는 세포), 및 상기 융합 표적-결합 단백질을 암호화하는 핵산에 관한 것이다. 본 발명은 또한 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질에 관한 것이다. 본 발명은 상기 융합 표적-결합 단백질, 세포 또는 핵산을 사용하는 약학 조성물, 의학적 용도 및 치료 방법에 관한 것이다. 상기 단백질, 세포, 핵산 및 약학 조성물은 신경아세포종 또는 급성 골수성 백혈병과 같은 암의 예방 및/또는 치료에 사용될 수 있다.
Description
본 발명은 융합 표적-결합 단백질, 및 상기 단백질을 포함하는 세포에 관한 것이다. 본 발명은 또한 융합 표적-결합 단백질을 암호화하는 핵산에 관한 것이다. 본 발명은 개시된 상기 융합 표적-결합 단백질, 세포 또는 핵산을 사용하는 약학 조성물, 의학적 용도 및 치료 방법에 관한 것이다.
표적-결합 능력을 갖는 융합 단백질은 다양한 치료 용도에 사용되어 왔다. 가장 특히는, 키메라 항원 수용체(CAR)를 발현하도록 조작된 T 세포가 암의 치료에 사용되어 왔다. 그러나, 하기에서 더 논의되는 바와 같이, 의미있는 임상 가능성을 보여줌에도 불구하고, 상기 치료들은 보편적으로 효과적이지는 않았다.
전임상
및 임상 연구에서 CAR-T 실패
급성 및 소아 암 둘 다에 대한 세포독성 화학치료에서의 발전에도 불구하고, 많은 주요 암의 아형들이 여전히 극히 불량한 예후를 가짐은 분명하다. 면역 치료는 악성 암 세포를 직접 표적화하는 것에 대안적 접근방법을 제공하며, 표준 접근방법들의 정상 세포들에 대한 독성 부작용을 배제시킨다.
키메라 항원 수용체(CAR)-T 세포(CAR-T)는, 전형적으로 항체 단편(scFv)을 사용하여, 종양 세포 상의 표면 항원을 특이적으로 인식하도록 조작된 자기유래성 환자-유래된 T 세포이다. 소아 암을 성공적으로 치료하기 위해 CAR-T 세포를 이용하는 원리 증명은 항-CD19 CAR T 세포를 사용하여 신속하고 지속적인 관해를 경험한, 화학-내성인, 재발된 소아 B 급성 림프모구성 백혈병을 갖는 환자들에서 확증되었다. 고형 종양들 중에서, 아동의 가장 흔한 고형암인 신경아세포종이 선택되는 모델이었으며 CAR-T 세포 치료에 대한 고형 종양의 반응에 있어 매우 정보를 제공하는 것으로 입증되었다. 전임상 연구는 디시알로강글리오시드 2(GD2) 항원을 인식하는 CAR T 세포가 신경아세포종 세포를 사멸시키는 강력한 새로운 방법을 나타낼 수 있음을 시사한다. 신경아세포종이 고형 종양에 대한 CAR-T 세포 개발을 위한 패러다임이 되고 있지만, 전임상 모델 및 초기 상 시험들에서는 단지 제한된 항종양 효능만이 나타났다. 1 세대 항-GD2 CAR T 세포는 생체내에서 지속되지 못했으며 최소의 항종양 효과를 나타내었다. 2 세대 항-GD2-CAR T 세포(CD28 또는 4-1BB 공자극 도메인 함유)는 생체내에서 개선된 지속성을 나타내어 중간정도의 종양 관해를 이끌었으나, 신경아세포종의 존재하에서는 기능적으로 고갈되어 버렸다. 인간에서, 항-GD2 CAR T 세포에 대한 연구는, 다수의 상기 세포들의 주입에도 불구하고, CAR T 세포 수가 수주 이내에 낮아지거나 검출불가능하게 되고, 활동성 질환을 갖는 환자들의 대다수가 완전 관해에 이르지 못하였다는 핵심 관찰결과를 나타내었다. 중요하게, 낮은 수준의 CAR T 세포 지속성을 나타낸 환자들이 더 오래 생존하였다. 이러한 결과들은, 남아있는 신경아세포종 종양들 상에 대형 표적 항원 부하물의 존재에도 불구하고, 국소적 및 전신적 종양 미세환경이 CAR-T 세포의 지속성을 손상시킴을 시사한다.
CAR-T 치료는 또한 시험관내, 생체내, 및 사람에서 제한된 수의 다른 고형 종양들에 대해서도 검증되었다. 각각의 경우에서, 상기 악성종양에 대한 결과들은 ALL에서 항-CD19 CAR-T 세포들에 대해 확인된 흥미로운 데이터를 반복검증하지 못했다.
급성 골수성 백혈병
급성 골수성 백혈병은 성인들에서 가장 흔한 급성 백혈병이고 아동에서 두번째로 흔한 백혈병이다. 발병률은 연령에 따라 증가하며, 고 위험성 또는 재발된 질환을 갖는 환자의 경우 예후는 조혈 줄기세포 이식에도 불구하고 성인에서 12개월 미만의 생존율 하에 극히 불량하다. 노령 환자들 또는 동반 질환을 갖는 환자들의 경우, 표준 화학치료 요법은 효능이 거의 없어서 차선의 치료로 이끌고 치유를 달성할 수 없게 만든다. 소수의 효과적인 신약들이 AML에 대해 개발되었고, 따라서 면역치료는 상이한 접근방법의 가능성을 제공한다. CD33은 거의 보편적으로 MAL 아세포 상에서 발현되며, 면역독소-기반 치료제(겜투주맙(Gemtuzumab) 오조가마이신)에 대한 효과적인 표적인 것으로 입증되었다. 항-CD33 CAR-T 세포는 시험관내에서 AML 아세포에 세포독성이며 생체내에서 백혈병 존재량을 근절시킨다. 이러한 기반에서, 항-CD33 CAR T 세포에 대한 1상 임상시험이 중국에서 개시되었다(NCT018642902 및 NCT02958397). 화학치료-난치성 AML을 갖는 1명의 환자로부터의 보고서는 골수 AML 아세포의 감소를 보여주었다. 이러한 결과들은 항-CD33 CAR T 세포가 효과적일 수 있다는 원리증명을 제공한다. 그러나, 질환은 혈액 및 골수 둘 다에 측정가능한 CAR-T 세포가 잔류함에도 불구하고 CAR 주입 9주후에 재발되었다. 상기 결과는 CAR-T 세포가 백혈병 미세환경에 의해 불활성이 되었음을 시사한다(도피 메카니즘으로서 AML 아세포 상의 CD33 손실의 증거는 없음).
중피종, 난소암 및 췌장암
성인에서 거의 보편적으로 불량한 예후를 갖는 석면 관련 종양인 중피종은 세포 표면 당단백질 메소텔린을 발현한다. 메소텔린은 또한 난소암, 폐 선암 및 췌방암과 같은 상피암에서도 발현된다. 메소텔린은 SS1P와 같은 면역독소를 사용한 수동적 면역치료에 효과적이고 선택적인 표적인 것으로 입증되어 CAR T 기술의 개발을 위해 선택되어 왔다. 뮤린 모델에서, 항-메소텔린 CAR-T 세포는 명확하고 지속적인 항-종양 활성을 나타낸다. 항-메소텔린 CAR-T 세포는 또한 상기 종양들을 가진 환자들에게도 투여되었으며, 각각의 경우에서 제한된 반응들이 검출(PR, SD)되었음에도 종양들은 진행되었다. CAR-T 세포 지속성은, 세포가 단지 초기 또는 반복 투여일들 이내에 검출불가능해지면서 극히 불량하다. CAR-T 세포가 종양 내에 위치하고 따라서 표적 항원에 매우 근접한 경우에조차, 반응들은 약하게 유지되어 T 세포의 기능을 저하시키는 강한 면역억제 미세환경을 시사한다.
교모세포종
교모세포종은 성인 및 아동 둘 다에서 가장 파괴적인 뇌종양 중 하나로, 이때 환자들은 집중적인 화학치료 및 방사선치료 기반 요법들에도 불구하고 급속한 질환 진행 및 치료 실패를 빈번히 경험한다. 교모세포종은, 면역치료에 의해 표적화될 수 있는 종양-특이적 항원을 제공하는 상피 성장 인자 수용체 - EGFRvIII의 변이체를 발현한다. EGFRvIII는 또한 진행성 대장암의 대략 1/3에서 발현될 수 있다. 항-EGFRvIII CAR-T 세포는 동소 뮤린 이종이식에서 교모세포종의 질환 억제를 나타내었다. 그러나, 모든 경우에서, 뇌를 포함한 모든 장기내 CAR-T 세포의 검출가능한 수준에도 불구하고 종양은 계속 성장하여 뮤린 치사를 야기한다. 다시, 상기 데이터는 CAR-T 세포가 종양 미세환경에 의해 불활성화됨을 시시한다. 상기 근거에 기반한 1상 시험이 현재 진행중이다(NCT02844062, NCT02664363).
아르기닌 및 면역억제 미세환경
아르기닌은 세포 생존율, 증식 및 단백질 합성을 포함한 많은 세포 과정들을 위해 건강한 조직에 필요한 준필수 아미노산이다. 전신 아르기닌 수준은 원칙적으로 식이 섭취를 통해 유지되며, 그보다 덜한 정도로 '장-신장 축'에서 전구체로부터의 합성에 의해 유지된다. 세포 수준에서, 아르기닌은 수송체의 양이온 아미노산(CAT; SLC7A) 계열을 통해 세포외액으로부터 유입되고 요소 회로에 진입한다. 염증, 임신 및 암과 같은 높은 부담의 조건에서, 아르기닌 수준은 국소 조직 미세환경에서 및 전신적으로 제한적이 될 수 있다. 일부 조직 및 세포들은 아르기니노숙시네이트 신타제(ASS1) 및 오르니틴 트랜스카바밀라제(OTC)의 발현을 통해, 전구체들로부터 아르기닌을 재합성함으로써 스스로를 보호할 수 있다. 상기 효소들 중 적어도 하나의 발현이 결여된 세포는 아르기닌 영양요구성으로 알려진 상태인 세포외 아르기닌의 유입에 의존성이다.
이전의 연구들은 종양 부위에서 아르기나제의 억제가 생체내에서 불량한 CAR T 세포 활성 문제를 해결하는데 유리할 수 있음을 시사하였다.
첫 번째 양태에서, 본 발명은 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 제공한다. 간결함을 위해, 본 발명의 다양한 양태들 및 실시양태들에 따른 융합 표적-결합 단백질은 본원에서 "본 발명의 단백질"로 지칭될 것이다.
두 번째 양태에서, 본 발명은 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 포함하는 세포를 제공한다. 상기 세포는 상기 융합 표적-결합 단백질을 발현할 수 있다.
세 번째 양태에서, 본 발명은 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 암호화하는 핵산을 제공한다. 본 발명의 세 번째 양태에 따른 핵산은 발현되어 본 발명의 첫 번째 양태에 따른 융합 표적-결합 단백질 또는 본 발명의 두 번째 양태에 따른 세포를 생성할 수 있음을 인지할 것이다.
네 번째 양태에서, 본 발명은 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 제공한다.
다섯 번째 양태에서, 본 발명은 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 포함하는 세포를 제공한다. 상기 세포는 상기 융합 표적-결합 단백질을 발현할 수 있다.
여섯 번째 양태에서, 본 발명은 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 암호화하는 핵산을 제공한다. 본 발명의 여섯 번째 양태에 따른 핵산은 발현되어 본 발명의 네 번째 양태에 따른 융합 표적-결합 단백질 또는 본 발명의 다섯 번째 양태에 따른 세포를 생성할 수 있음을 인지할 것이다.
일곱 번째 양태에서, 본 발명은 본 발명의 첫 번째, 두 번째, 네 번째 또는 다섯 번째 양태에 따른 융합 표적-결합 단백질 또는 세포, 또는 본 발명의 세 번째 또는 여섯 번째 양태에 따른 핵산을 포함하는 약학 조성물을 제공한다.
여덟 번째 양태에서, 본 발명은, 약제로 사용하기 위한, 본 발명의 첫 번째 또는 네 번째 양태에 따른 융합 표적-결합 단백질을 제공한다.
아홉 번째 양태에서, 본 발명은, 약제로 사용하기 위한, 본 발명의 두 번째 또는 다섯 번째 양태에 따른 세포를 제공한다.
열 번째 양태에서, 본 발명은, 약제로 사용하기 위한, 본 발명의 세 번째 또는 여섯 번째 양태에 따른 핵산을 제공한다.
열한 번째 양태에서, 본 발명은, 약제로 사용하기 위한, 본 발명의 일곱 번째 양태에 따른 약학 조성물을 제공한다.
열두 번째 양태에서, 본 발명은, 대상에게 본 발명의 융합 표적-결합 단백질을 제공하는 것을 포함하는, 질환의 예방 및/또는 치료를 필요로 하는 대상에서 상기 질환을 예방 및/또는 치료하는 방법을 제공한다. 상기 융합 표적-결합 단백질은 본 발명의 첫 번째, 네 번째 또는 열한 번째 양태에 따른 것일 수 있다. 본 발명의 단백질은 본 발명의 두 번째 또는 다섯 번째 양태의 세포와 같은 본 발명의 세포의 일부로서 제공될 수 있다.
명세서의 다른 곳에서 더 논의되는 바와 같이, 본 발명의 융합 표적-결합 단백질, 세포, 핵산 및 약학 조성물은 암; 감염, 예를 들어, 바이러스 감염; 및 자가면역 질환으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 질병의 예방 및/또는 치료에 사용될 수 있다.
도 1은 바이러스 역가를 함유하는 융합 표적-결합 단백질의 최적화를 예시한다. 패널 A는 AMPHO Phoenix 세포의 상등액중에서 72 시간에 걸쳐 증가된 레트로바이러스 입자들의 농도를 보여준다. 패널 B는 융합 표적-결합 단백질 T 세포 형질도입 효율을 tCD34의 유세포분석 검출에 의해 평가하였음을 보여준다. AMPHO 세포주 상등액을 사용하여서는 PBMC의 형질도입 효율에 차이가 보이지 않았다.
도 2는 아르기는 경로 효소가 형질도입된 Jurkat 세포에서 활성을 나타냄을 보여준다. 패널 A는 유세포분석을 이용하여 tCD34의 발현을 측정함으로써 평가시, 단백질-효소 구조물이 고도의 순도로 생성될 수 있음을 보여준다. 패널 B는 형질도입된 세포에서 ASS-1 및 OTC의 발현의 증가를 예시한다. 패널 C는 형질도입 세포에서 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인의 그 기능을 수행하는 능력을 예시한다. 패널 D는 오르니틴의 시트룰린으로의 세포 이화작용(OTC에 의한)에 대한 연구의 결과를 보여준다. OTC 효소 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질("GD2-OTC"), 또는 ASS-1 및 OTC 효소 도메인을 둘 다 함유하는 융합 표적-결합 단백질("GD2-ASS-OTC")을 발현하는 세포에 의해 생성된 시트룰린의 양을 평가하고, OTC 효소 도메인을 갖지 않는 대조군 구조물("GD2"), 또는 ASS-1 효소 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질("GD2-ASS")을 발현하는 세포와 비교하였다. 패널 E는 마우스에서 종양 미세환경에서 아르기닌 전구체 아르기니노숙시네이트의 합성을 촉진하는 도메인(ASS-1)을 포함하는 구조물로 형질도입된 융합 표적-결합 단백질 T 세포의 지속성을 보여준다. 패널 F는 OTC 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2-OTC)가 OTC 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 갖지 않는 T 세포(GD2 단독)에 비해 상당히 증대된 지속성을 나타내었음을 보여준다.
도 3은 아르기닌 경로 효소가 인간 공여체 세포로부터의 PBMC에 형질도입될 수 있음을 예시한다. 패널 A는 유세포분석을 이용하여 tCD34의 발현을 측정함으로써, 상기 융합 표적-결합 단백질-효소 구조물이 PBMC에서 고도의 순도로 생성될 수 있음을 보여준다. 패널 B는 형질도입된 세포에서 ASS-1 및 OTC의 발현의 증가를 보여준다. 패널 C는 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 효소 도메인을 포함하는 구조물을 또한 함유하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포에서 공동억제 수용체 LAG-3, TIM-3 및 PD-1의 발현에 차이가 없었음을 보여준다. 패널 D는, tCD34의 유세포분석에 의해 검출된 바와 같은, 7일의 증식동안 측정된, 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 구조물로 형질도입된 PBMC의 지속성을 보여준다.
도 4는 ASS-1 및 OTC 효소 도메인이 저-아르기닌 종양 조건에서 상당한 대사 및 증식 이점을 제공함을 보여준다. 패널 A는, 배양 상등액의 ELISA로 검출된, 정상 아르기닌 배지 및 75% 아르기닌 고갈 배지 조건에서 배양시 시트룰린 대사를 증대시키는, ASS-1 효소 도메인(GD2-ASS) 및 OTC 효소 도메인(GD2-OTC)을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포를 보여준다. 패널 B는, 대조군 단백질을 발현하는 T 세포(ASS-1 또는 OTC를 갖지 않는 "GD2-BB")에 의한 용해에 대해 평가된 바와 같은, 본 발명의 융합 표적-결합 단백질을 발현하는 T 세포(ASS-1 도메인("GD2-ASS") 또는 OTC 도메인("GD2-OTC") 포함)에 의한 신경아세포종 및 골수성 백혈병 세포주의 특이적 세포 용해를 예시한다. 패널 C는 ASS-1 또는 OTC 효소 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포가 대조군(효소를 포함하지 않는 GD2)에 비해 저-아르기닌 조건에서 증식의 상당한 증가를 나타내었음을 보여준다. 그래프에 나타낸 조건은 정상 아르기닌(RPMI+10% FCS), 신경아세포종-유래 저-아르기닌 상등액(Lan-1 TCM), 또는 75% 아르기닌 고갈 배지이다.
도 5는 변형된 융합 표적-결합 단백질 T 세포가 생체내에서 증대된 항-종양 활성을 가지며 비-GD2 융합 표적-결합 단백질 T 세포에 적용될 수 있음을 보여준다. 패널 A는 GD2+ 종양 세포가 이식되고, ASS-1 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2-ASS) 및 함유하지 않는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2 단독)가 투여된 NOG-SCID 마우스의 상대 종양 부피를 보여준다. 상대 종양 성장률은 시간 경과에 따라 측정하였다. 패널 B는 GD2-ASS-1 및 GD2 단독 융합 표적-결합 단백질 T 세포와 함께 투여후 마우스의 생존 백분율을 보여준다. 패널 C는 50% 내지 75% AML 세포주 조건 배지(저-아르기닌) 또는 75% 아르기닌 고갈 배지에서 CD33 및 CD33-ASS-1 융합 표적-결합 단백질 T 세포의 생존율을 예시한다.
도 6은 생체내 아르기닌-고갈 조건에서 본 발명 세포의 증가된 지속성을 보여준다. 상기 지속성은 정맥내 투여된, 5x106 항-GD2 CAR-T Jurkat 세포(대조군 세포), 또는 GD2 표적 잔기 및 ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질(GD2-ASS)을 발현하는 Jurkat 세포, 또는 GD2 표적 잔기 및 OTC 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질(GD2-OTC)을 발현하는 세포가 이식된 NOG-SCID 마우스에서 입증되었다. GD2-ASS-1 및 GD2-OTC CAR T 세포는 비변형 GD2 CAR-T 구조물을 포함하는 대조군 세포에 비해 상당히 증대된 지속성을 나타내었다.
도 7은 아르기닌 경로 효소가 다양한 표적 결합 잔기를 포함하는 인간 공여체로부터의 PBMC에 형질도입될 수 있음을 보여준다. 웨스턴 블롯(Western blot)은 대조군에 비해 본 발명의 단백질로 형질도입된 PBMC 세포에서 ASS-1 및 OTC의 발현이 증가됨을 보여준다(패널 A). 패널 B는 유세포분석에 의해 평가된 LAG-3, TIM-3 및 PD-1의 발현을 보여준다.
도 8은 상이한 효과기 대 표적 비에서 K562 백혈병 세포의 존재하에 4 시간동안 배양된, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 도메인을 발현하는 CAR T 세포의 세포파괴 활성을 보여준다. 본 발명의 단백질을 포함하는 세포들은 세포파괴 활성을 유지한다.
도 9는 ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 항-GD2, 항-CD33, 항-메소텔린, 또는 항 EGFRvIII 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 CAR T 세포가 대조군 세포에 비해 저-아르기닌 종양 조건에서 상당한 대사 및 증식 이점을 제공함을 보여준다. 동일한 결합 도메인(즉, 항-GD2, 항-CD33, 항-메소텔린 또는 항 EGFRvIII)을 공유하나 효소 도메인들은 결여된 비변형 CAR-T 세포를 본 발명의 단백질을 발현하는 대조군 CAR T 세포로 사용하였다.
도 10은 종양 조정 배지(TCM)에서 배양된, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 GD2-결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 상당한 대사 및 증식 이점을 제공함을 보여준다(패널 A). 패널 B는 종양 조정 배지(TCM)에서 배양된, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 CD33-결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 또한 상당한 대사 및 증식 이점을 제공함을 보여준다.
도 11은 ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 CAR-T 세포(항-CD33-ASS-1 CAR-T 세포)가 백혈병을 가진 마우스의 골수로부터의 AML 제거율을 상당히 증대시킴을 보여준다. 상기 데이터는 NOG-SCID 마우스내에 이식된 HL-60 급성 골수성 백혈병(AML) 세포의 제거율과 관련된다.
도 12 패널 A는 GD2-결합 잔기 및 ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포로 처리된 신경아세포종 이종이식 마우스의 비장내에서의 본 발명 세포의 증가된 지속성을 예시한다. 항원 자극에 반응하여 증식하는 본 발명 세포의 개선된 능력이 패널 B에 나타나 있다.
도 13 패널 A는 CD33-결합 잔기, 및 ASS-1 도메인, OTC 도메인; 또는 ASS-1 도메인 및 OTC 도메인 중 하나를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포로 처리된 AML 이종이식 마우스의 비장내에서의 본 발명 세포의 증가된 지속성을 예시한다. 항원 자극에 반응하여 증식하는 본 발명 세포의 개선된 능력이 패널 B에 나타나 있다.
도 14는 본 발명 세포의 성공적인 렌티바이러스 생산에 사용된, 본 발명의 핵산을 포함하는 구조물의 세부사항을 나타낸다.
도 2는 아르기는 경로 효소가 형질도입된 Jurkat 세포에서 활성을 나타냄을 보여준다. 패널 A는 유세포분석을 이용하여 tCD34의 발현을 측정함으로써 평가시, 단백질-효소 구조물이 고도의 순도로 생성될 수 있음을 보여준다. 패널 B는 형질도입된 세포에서 ASS-1 및 OTC의 발현의 증가를 예시한다. 패널 C는 형질도입 세포에서 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인의 그 기능을 수행하는 능력을 예시한다. 패널 D는 오르니틴의 시트룰린으로의 세포 이화작용(OTC에 의한)에 대한 연구의 결과를 보여준다. OTC 효소 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질("GD2-OTC"), 또는 ASS-1 및 OTC 효소 도메인을 둘 다 함유하는 융합 표적-결합 단백질("GD2-ASS-OTC")을 발현하는 세포에 의해 생성된 시트룰린의 양을 평가하고, OTC 효소 도메인을 갖지 않는 대조군 구조물("GD2"), 또는 ASS-1 효소 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질("GD2-ASS")을 발현하는 세포와 비교하였다. 패널 E는 마우스에서 종양 미세환경에서 아르기닌 전구체 아르기니노숙시네이트의 합성을 촉진하는 도메인(ASS-1)을 포함하는 구조물로 형질도입된 융합 표적-결합 단백질 T 세포의 지속성을 보여준다. 패널 F는 OTC 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2-OTC)가 OTC 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 갖지 않는 T 세포(GD2 단독)에 비해 상당히 증대된 지속성을 나타내었음을 보여준다.
도 3은 아르기닌 경로 효소가 인간 공여체 세포로부터의 PBMC에 형질도입될 수 있음을 예시한다. 패널 A는 유세포분석을 이용하여 tCD34의 발현을 측정함으로써, 상기 융합 표적-결합 단백질-효소 구조물이 PBMC에서 고도의 순도로 생성될 수 있음을 보여준다. 패널 B는 형질도입된 세포에서 ASS-1 및 OTC의 발현의 증가를 보여준다. 패널 C는 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 효소 도메인을 포함하는 구조물을 또한 함유하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포에서 공동억제 수용체 LAG-3, TIM-3 및 PD-1의 발현에 차이가 없었음을 보여준다. 패널 D는, tCD34의 유세포분석에 의해 검출된 바와 같은, 7일의 증식동안 측정된, 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 구조물로 형질도입된 PBMC의 지속성을 보여준다.
도 4는 ASS-1 및 OTC 효소 도메인이 저-아르기닌 종양 조건에서 상당한 대사 및 증식 이점을 제공함을 보여준다. 패널 A는, 배양 상등액의 ELISA로 검출된, 정상 아르기닌 배지 및 75% 아르기닌 고갈 배지 조건에서 배양시 시트룰린 대사를 증대시키는, ASS-1 효소 도메인(GD2-ASS) 및 OTC 효소 도메인(GD2-OTC)을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포를 보여준다. 패널 B는, 대조군 단백질을 발현하는 T 세포(ASS-1 또는 OTC를 갖지 않는 "GD2-BB")에 의한 용해에 대해 평가된 바와 같은, 본 발명의 융합 표적-결합 단백질을 발현하는 T 세포(ASS-1 도메인("GD2-ASS") 또는 OTC 도메인("GD2-OTC") 포함)에 의한 신경아세포종 및 골수성 백혈병 세포주의 특이적 세포 용해를 예시한다. 패널 C는 ASS-1 또는 OTC 효소 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포가 대조군(효소를 포함하지 않는 GD2)에 비해 저-아르기닌 조건에서 증식의 상당한 증가를 나타내었음을 보여준다. 그래프에 나타낸 조건은 정상 아르기닌(RPMI+10% FCS), 신경아세포종-유래 저-아르기닌 상등액(Lan-1 TCM), 또는 75% 아르기닌 고갈 배지이다.
도 5는 변형된 융합 표적-결합 단백질 T 세포가 생체내에서 증대된 항-종양 활성을 가지며 비-GD2 융합 표적-결합 단백질 T 세포에 적용될 수 있음을 보여준다. 패널 A는 GD2+ 종양 세포가 이식되고, ASS-1 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2-ASS) 및 함유하지 않는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2 단독)가 투여된 NOG-SCID 마우스의 상대 종양 부피를 보여준다. 상대 종양 성장률은 시간 경과에 따라 측정하였다. 패널 B는 GD2-ASS-1 및 GD2 단독 융합 표적-결합 단백질 T 세포와 함께 투여후 마우스의 생존 백분율을 보여준다. 패널 C는 50% 내지 75% AML 세포주 조건 배지(저-아르기닌) 또는 75% 아르기닌 고갈 배지에서 CD33 및 CD33-ASS-1 융합 표적-결합 단백질 T 세포의 생존율을 예시한다.
도 6은 생체내 아르기닌-고갈 조건에서 본 발명 세포의 증가된 지속성을 보여준다. 상기 지속성은 정맥내 투여된, 5x106 항-GD2 CAR-T Jurkat 세포(대조군 세포), 또는 GD2 표적 잔기 및 ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질(GD2-ASS)을 발현하는 Jurkat 세포, 또는 GD2 표적 잔기 및 OTC 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질(GD2-OTC)을 발현하는 세포가 이식된 NOG-SCID 마우스에서 입증되었다. GD2-ASS-1 및 GD2-OTC CAR T 세포는 비변형 GD2 CAR-T 구조물을 포함하는 대조군 세포에 비해 상당히 증대된 지속성을 나타내었다.
도 7은 아르기닌 경로 효소가 다양한 표적 결합 잔기를 포함하는 인간 공여체로부터의 PBMC에 형질도입될 수 있음을 보여준다. 웨스턴 블롯(Western blot)은 대조군에 비해 본 발명의 단백질로 형질도입된 PBMC 세포에서 ASS-1 및 OTC의 발현이 증가됨을 보여준다(패널 A). 패널 B는 유세포분석에 의해 평가된 LAG-3, TIM-3 및 PD-1의 발현을 보여준다.
도 8은 상이한 효과기 대 표적 비에서 K562 백혈병 세포의 존재하에 4 시간동안 배양된, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 도메인을 발현하는 CAR T 세포의 세포파괴 활성을 보여준다. 본 발명의 단백질을 포함하는 세포들은 세포파괴 활성을 유지한다.
도 9는 ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 항-GD2, 항-CD33, 항-메소텔린, 또는 항 EGFRvIII 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 CAR T 세포가 대조군 세포에 비해 저-아르기닌 종양 조건에서 상당한 대사 및 증식 이점을 제공함을 보여준다. 동일한 결합 도메인(즉, 항-GD2, 항-CD33, 항-메소텔린 또는 항 EGFRvIII)을 공유하나 효소 도메인들은 결여된 비변형 CAR-T 세포를 본 발명의 단백질을 발현하는 대조군 CAR T 세포로 사용하였다.
도 10은 종양 조정 배지(TCM)에서 배양된, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 GD2-결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 상당한 대사 및 증식 이점을 제공함을 보여준다(패널 A). 패널 B는 종양 조정 배지(TCM)에서 배양된, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 CD33-결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 또한 상당한 대사 및 증식 이점을 제공함을 보여준다.
도 11은 ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 CAR-T 세포(항-CD33-ASS-1 CAR-T 세포)가 백혈병을 가진 마우스의 골수로부터의 AML 제거율을 상당히 증대시킴을 보여준다. 상기 데이터는 NOG-SCID 마우스내에 이식된 HL-60 급성 골수성 백혈병(AML) 세포의 제거율과 관련된다.
도 12 패널 A는 GD2-결합 잔기 및 ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포로 처리된 신경아세포종 이종이식 마우스의 비장내에서의 본 발명 세포의 증가된 지속성을 예시한다. 항원 자극에 반응하여 증식하는 본 발명 세포의 개선된 능력이 패널 B에 나타나 있다.
도 13 패널 A는 CD33-결합 잔기, 및 ASS-1 도메인, OTC 도메인; 또는 ASS-1 도메인 및 OTC 도메인 중 하나를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포로 처리된 AML 이종이식 마우스의 비장내에서의 본 발명 세포의 증가된 지속성을 예시한다. 항원 자극에 반응하여 증식하는 본 발명 세포의 개선된 능력이 패널 B에 나타나 있다.
도 14는 본 발명 세포의 성공적인 렌티바이러스 생산에 사용된, 본 발명의 핵산을 포함하는 구조물의 세부사항을 나타낸다.
본 발명은 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인(및/또는 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인)을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 발현하는 세포가 생체내에서 상당한 이점을 나타낸다는 본 발명자들의 인식을 기반으로 한다. 특히, 본 발명자들은 상기 단백질을 발현하는 세포가, 본 발명자들이 많은 선행 기술의 CAR-기반 치료법들의 실패에 기여한 것으로 생각하는 종양 미세환경과 연관된 면역억제 효과를 극복할 수 있음을 밝혀내었다.
본 발명의 단백질을 발현하는 세포들에 의해 나타난 특별한 이점들 중 하나는 종양 미세환경에서 상기 세포들의 증가된 지속성 및 증식이다. 상기 미세환경은 달리는 선행 기술의 CAR T 세포의 효과를 현저하게 감소시킬 수 있는 것으로 알려져 있다.
또한, 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 면역억제 종양 미세환경의 조건에서 증식하는 개선된 능력을 나타낸다. CAR을 발현하는 세포의 증식은 통상적으로 아르기닌-고갈 조건에 의해 현저하게 억제된다.
상기 이점은 둘 다, 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 수가 증가되고 상기 세포들이 종양 부위에서 오래 체류하게 되어 개선된 암세포 사멸을 가능하게 하는 개선된 치료를 가능하게 한다. 이와 관련하여, 본 발명의 단백질 및 세포에 관하여 이루어진 변형이 암세포를 사멸하는(세포독성 작용에 의해서든 아니면 특이적 세포 용해에 의해서든) 그들의 능력을 별로 손상시키지 않음을 유의하는 것은 중요하다.
따라서, 본 발명의 단백질 및 세포는 선행 기술의 CAR-기반 치료법들에 비해 개선된 치료제를 제공함을 인지할 것이다. 본원에 기술된 본 발명의 다양한 양태들 및 실시양태들은 상기 개선점들로부터 비롯되거나 상기 개선점들에 기여한다.
본 발명의 이해를 위해, 이제 본 발명을 하기의 정의와 관련하여 더 기술할 것이다. 간결함을 위해, 뒤에 나오는 단락들은 본 발명의 단백질의 맥락에서 특정 실시양태들만을 언급할 수 있으나, 맥락상 달리 요구되는 경우를 제외하고, 본 발명의 단백질과 관련하여 언급된 실시양태들은 본원에 개시된 본 발명의 다른 양태들 어느 것에나 사용될 수 있음을 인지할 것이다.
융합 표적-결합 단백질
융합 표적-결합 단백질은, 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 목적하는 생물학적 성질에 목적하는 특이성이 부여될 수 있게 하는 인공 융합 단백질이다. 간결함을 위해, 상기 단백질은 또한 본 개시내용에서 "단백질" 또는 "본 발명의 단백질"로도 지칭될 것이다. 상이한 유형의 세포들, 및 본 발명의 맥락에서 이들이 각각 제공할 수 있는 목적하는 생물학적 성질들이 명세서의 다른 곳에서 더 논의된다. 전형적으로, 융합 표적-결합 단백질 및 상기 단백질을 발현하는 세포의 의학적 용도의 맥락에서, 질환과 연관된 세포(예를 들어, 암세포 또는 감염 세포)에 대해 목표가 된 세포파괴 활성은 필요한 치료 유용성을 제공한다.
본 발명의 단백질은 적어도 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인 및/또는 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함한다. 상기 용어들은 본 명세서내 다른 곳에서 정의된다. 숙련가라면 상기 단백질이 또한 다양한 다른 선택적 도메인 또는 영역들을 포함할 수 있음을 인지할 것이다.
상기 융합 표적-결합 단백질의 상이한 부분들(표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인 및/또는 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인)은 2개 이상의 상이한 "공급원"으로부터 유래될 수 있다. 따라서, 상기 상이한 부분들은 2개 이상의 천연 분자, 예를 들어, 단백질로부터 유래될 수 있다. 또한, 상기 상이한 부분들은 상이한 기원하는 계 또는 종의 측면에서 상이한 공급원으로부터 유래될 수 있다.
본 발명의 맥락에서 특히 관심을 끄는 융합 표적-결합 단백질의 부류는 키메라 항원 수용체(CAR) 단백질이다. CAR은 결합 특이성을 제공하기 위해 항체 또는 그의 단편을 이용하고 필요한 특이적 생물 활성을 결정하기 위해 세포내 신호전달 영역을 이용한다. 다양한 상이한 세대의 CAR이 공지되어 있고, 이들 상이한 세대들은 각각, 본 개시내용의 맥락에서 달리 요구되지 않는 한, 본 발명의 융합 표적-결합 단백질의 적합한 예를 대표한다.
의혹을 피하기 위해, 본 발명의 단백질은 또한 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인 및/또는 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하도록 변형된 T 세포 수용체(TCR)를 포함하는 것으로 간주될 수 있다. 상기와 같은 실시양태에서, 표적 결합 잔기는 수용체의 TCR α 및 TCR β 쇄에 의해 제공될 수 있다. 표적 결합 잔기, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인 및/또는 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인은 상이한 공급원으로부터 유래하기 때문에, 상기 변형된 TCR은 본 발명의 목적을 위해 키메라 TCR이다.
본 발명의 단백질은 전형적으로 막관통 부분, CH2CH3 스페이서 부분, CD8 힌지 부분 및 CD8a 신호전달 부분으로 이루어진 군으로부터의 하나 이상을 포함하여 추가의 부분들을 더 포함한다.
본 발명의 예시적 단백질들의 아미노산 서열들은 서열번호 12 내지 23에 나타내었다. 상기 서열들 중 임의 서열을 포함하거나 그로 이루어지는 분자는 본 발명의 첫 번째 양태에 따른 단백질을 나타냄을 인지할 것이다. 서열번호 12 내지 23에 나타낸 임의의 단백질은 본 발명의 의학적 용도, 치료 방법 또는 약학 조성물에 사용될 수 있다.
본 발명의 예시적 단백질들의 서열들의 단편 또는
변이체
본 명세서는 다수의 예시적 단백질 및 핵산 서열을 포함한다. 융합 표적-결합 단백질 및 그를 암호화하는 핵산뿐 아니라, 상기 서열들은 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역 및 효소 도메인의 서열들을 포함한다.
맥락상 달리 요구되는 경우를 제외하고, 본 발명의 범위는 본원에 나타낸 특정한 예시적 서열들로 제한되지 않아야 함을 인지할 것이다. 특히, 전문적인 독자라면 예시적 서열들의 단편 또는 변이체도 또한 상기 예시적 서열들에 의해 제공된 필요한 활성을 제공할 수 있음을 인식할 것이다. 예시적 서열들의 상기 적합한 단편 또는 변이체들은 본 발명의 다양한 양태 및 실시양태들에서 사용될 수 있다.
따라서, 본 명세서에서 예시적 아미노산 또는 핵산 서열에 대한 언급은, 맥락상 달리 요구되는 경우를 제외하고, 상기 예시적 서열들의 기능성 단편 또는 변이체들을 또한 포함하는 것으로 간주되어야 한다. 예를 들어, 적합한 단편은 관련된 예시적 서열의 전장의 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 또는 적어도 95%를 차지할 수 있다. 실제로, 적합한 변이체는 예시적 서열의 전장의 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99%를 차지할 수 있다.
적합한 변이체는 관련된 예시적 서열과 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 또는 적어도 95% 동일성을 공유할 수 있다. 실제로, 적합한 변이체는 관련된 예시적 서열과 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성을 공유할 수 있다.
단편 또는 변이체가 "기능성"인 것은 실시예에 기술된 분석법들을 포함하여 당해 분야의 숙련가에게 공지된 분석법들을 참고로 하여 실험적으로 평가될 수 있다.
아르기닌 또는 아르기닌 전구체
본 발명은 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질에 관한 것이다.
아르기닌(흔히 "Arg" 또는 "R"로 약칭됨)은 준필수 아미노산이다. 아르기닌은 174.2 g/몰-1의 분자질량을 가지며, 2-아미노-5-구아니디노펜타노산으로도 지칭될 수 있다.
본 개시내용의 맥락에서, 아르기닌 전구체에 대한 언급은 대사성 아르기닌이 유입되거나 이화되거나 재순환되는 일련의 화학 반응인 아르기닌 경로의 맥락에서 이해되어야 한다. 따라서, 아르기닌의 전구체는 본 발명의 목적에 있어서 직접 또는 간접적으로 아르기닌으로 전환되는 임의의 화합물을 포함하는 것으로 간주될 수 있다.
아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인
본 발명의 단백질은 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함한다. 상기 기능을 충족시키는 도메인의 능력, 즉, 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인의 능력은 임의의 적합한 수단 또는 분석법에 의해 조사할 수 있다.
숙련가라면 그 합성이 촉진될 화합물, 예를 들어, 아르기닌 또는 아르기닌 전구체와 관련하여 적합한 수단 또는 분석법이 선택될 수 있음을 인지할 것이다. 단지 예로서, 상기 필요한 합성을 촉진하는 도메인의 능력을 평가하는 적합한 분석법은 본 발명의 예시적 세포의 특성화와 관련하여 실시예에서 더 기술된다.
적합하게는, 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인은 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진할 수 있는 효소 도메인일 수 있다. 상기와 같은 실시양태에서, 상기 효소 도메인은 전장 효소 도메인, 또는 상기 도메인이 필요한 활성을 나타내는 한 상기 도메인의 단편 또는 변이체를 포함할 수 있다.
적합한 실시양태에서, 그 합성이 촉진되는 아르기닌 전구체는 아르기노숙시네이트이다. 상기와 같은 실시양태에서, 상기 합성을 촉진하는 도메인은 아르기니노숙시네이트 신타제(ASS-1) 효소 도메인; 및 아르기니노숙시네이트 신테타제(ArgG) 도메인으로부터 선택될 수 있다. 적합하게는, 상기 합성을 촉진하는 도메인은 아르기니노숙시네이트 신타제(ASS-1) 효소 도메인이다.
적합한 실시양태에서, 그 합성이 촉진되는 아르기닌 전구체는 아르기노숙시네이트이다. 아르기니노숙시네이트 리아제에 의해서와 같은 아르기니노숙시네이트의 촉매작용은 아르기닌을 생성한다. 상기와 같은 실시양태에서, 상기 합성을 촉진하는 도메인은 아르기니노숙시네이트 리아제(ASL) 효소 도메인; 및 아르기니노숙시네이트 리아제(ArgH) 효소 도메인으로부터 선택될 수 있다.
적합한 실시양태에서, 그 합성이 촉진되는 아르기닌 전구체는 시트룰린이다. 상기와 같은 실시양태에서, 상기 합성을 촉진하는 도메인은 오르니틴 트랜스카바밀라제(OTC) 효소 도메인; 오르니틴 디카복실라제(ODC1); 및 오르니틴 카바모일트랜스퍼라제(ArgF) 효소 도메인으로부터 선택될 수 있다. 적합하게는, 상기 합성을 촉진하는 도메인은 오르니틴 트랜스카바밀라제(OTC) 효소 도메인이다.
따라서, 적합한 실시양태에서, 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인은 ASS-1 도메인; OTC 도메인; ASL 도메인; OCD1 도메인; ArgG 도메인; ArgH 도메인; 및 ArgF 도메인으로 이루어진 군에서 선택된 효소 도메인을 포함한다. 상기 도메인은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인으로부터 선택될 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 단백질은 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 다수의 도메인들을 포함할 수 있다. 적합하게는, 상기 다수는 다수의 효소 도메인들을 포함할 수 있다. 상기 다수는 개별적 효소 도메인의 1개보다 많은 카피, 및/또는 여러 효소 도메인들의 조합을 포함할 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 따른 단백질은 ASS-1 도메인; OTC 도메인; ASL 도메인; OCD1 도메인; ArgG 도메인; ArgH 도메인; 및 ArgF 도메인으로 이루어진 군에서 선택된 효소 도메인들의 조합을 포함할 수 있다. 단지 예로서, 본 발명의 단백질은 ASS-1 도메인 및 OTC 도메인을 둘 다 포함할 수 있다.
아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 적합한 효소 도메인은 인간 효소 도메인일 수 있다. 상기와 같은 실시양태에서, 상기 효소 도메인은 ASS-1, OTC, ASL 또는 OCD1일 수 있다.
아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 적합한 효소 도메인은 천연 효소 도메인일 수 있다. 또는, 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 적합한 효소 도메인은 천연 도메인의 합성 활성을 재현할 수 있는 천연 효소 도메인의 단편 또는 유도체일 수 있다. 상기 단편 또는 유도체는 천연 도메인의 합성 활성의 50% 이상; 천연 도메인의 합성 활성의 60% 이상; 천연 도메인의 합성 활성의 70% 이상; 천연 도메인의 합성 활성의 80% 이상; 천연 도메인의 합성 활성의 90% 이상; 또는 천연 도메인의 합성 활성의 95% 이상인 합성 활성을 가질 수 있다. 실제로, 적합한 단편 또는 유도체는 그가 유래될 수 있는 천연 도메인보다 더 큰 합성 활성, 즉 천연 도메인의 합성 활성의 100% 이상의 합성 활성을 가질 수 있다.
본 개시내용의 목적을 위해 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 적합한 효소 도메인에 대한 추가의 세부사항은 하기에 나타낸다.
ASS-1 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ASS-1 효소 도메인의 한 예를 서열번호 1에 나타내었다.
또는, 서열번호 1에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ASS-1 효소 도메인으로 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 ASS-1 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기와 같은 실시양태에 사용할 수 있다. ASS-1 활성은 본 개시내용의 실시예 부분에서 기술된 분석법에 의해 평가할 수 있다.
ASS-1 활성의 적합한 수준은 서열번호 1에 의해 제공된 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 ASS-1 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
서열번호 1에 나타낸 ASS-1 효소 도메인의 적합한 단편은 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 1개를 제외한 전부, 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기 중 2개를 제외한 전부, 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 3개를 제외한 전부, 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 4개를 제외한 전부, 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 5개를 제외한 전부, 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 6개를 제외한 전부, 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 7개를 제외한 전부, 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 8개를 제외한 전부, 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 9개를 제외한 전부, 또는 서열번호 1에 나타낸 아미노산 잔기들 중 10개를 제외한 전부를 포함할 수 있다.
단지 예로서, 서열번호 1에 나타낸 서열의 적합한 변이체는 서열번호 1과 또는 상기에서 정의된 바와 같은 서열번호 1의 단편과 적어도 75% 동일성을 공유할 수 있다. 적합한 변이체는 서열번호 1 또는 그의 단편과 적어도 80% 동일성; 서열번호 1 또는 그의 단편과 적어도 85% 동일성; 서열번호 1 또는 그의 단편과 적어도 90% 동일성; 서열번호 1 또는 그의 단편과 적어도 95% 동일성; 서열번호 1 또는 그의 단편과 적어도 96% 동일성; 서열번호 1 또는 그의 단편과 적어도 97% 동일성; 서열번호 1 또는 그의 단편과 적어도 98% 동일성; 또는, 서열번호 1 또는 그의 단편과 적어도 99% 동일성을 공유할 수 있다. 본 발명의 CAR에 혼입되기에 적합하기 위해, 상기 변이체는 상기에 언급된 바와 같은 ASS-1의 합성 활성을 유지해야 한다.
적합한 ASS-1 효소 도메인은 서열번호 1의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 50%의 활성을 제공할 수 있다. 적합하게는, 상기 적합한 ASS-1 효소 도메인은 서열번호 1의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%의 활성을 제공할 수 있다. 적합하게는, 상기 효소 도메인은 서열번호 1의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 100%의 활성도 제공할 수 있다.
사실상, 적합한 ASS-1 도메인은 서열번호 1의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 110%의 활성을 제공할 수 있다. 적합하게는, 상기 적합한 ASS-1 도메인은 서열번호 1의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 120%, 적어도 130%, 적어도 140%, 적어도 150%, 적어도 160%, 적어도 170%, 적어도 180%, 적어도 190%의 활성을 제공할 수 있다. 적합하게는, 상기 효소 도메인은 서열번호 1의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 200%의 활성도 제공할 수 있다.
OTC 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 OTC 효소 도메인의 한 예를 서열번호 2에 나타내었다.
또는, 서열번호 2에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 OTC 효소 도메인으로 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 OTC 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기 실시양태에 사용할 수 있다. OTC 활성은 본 개시내용의 실시예 부분에서 기술된 분석법에 의해 평가할 수 있다.
OTC 활성의 적합한 수준은 서열번호 2에 의해 제공된 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 OTC 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
서열번호 2에 나타낸 OTC 효소 도메인의 적합한 단편은 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 1개를 제외한 전부, 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 2개를 제외한 전부, 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 3개를 제외한 전부, 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 4개를 제외한 전부, 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 5개를 제외한 전부, 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 6개를 제외한 전부, 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 7개를 제외한 전부, 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 8개를 제외한 전부, 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 9개를 제외한 전부, 또는 서열번호 2에 나타낸 아미노산 잔기들 중 10개를 제외한 전부를 포함할 수 있다.
단지 예로서, 서열번호 2에 나타낸 서열의 적합한 변이체는 서열번호 2와 또는 상기에서 정의된 바와 같은 서열번호 2의 단편과 적어도 75% 동일성을 공유할 수 있다. 적합한 변이체는 서열번호 2 또는 그의 단편과 적어도 80% 동일성; 서열번호 2 또는 그의 단편과 적어도 85% 동일성; 서열번호 2 또는 그의 단편과 적어도 90% 동일성; 서열번호 2 또는 그의 단편과 적어도 95% 동일성; 서열번호 2 또는 그의 단편과 적어도 96% 동일성; 서열번호 2 또는 그의 단편과 적어도 97% 동일성; 서열번호 2 또는 그의 단편과 적어도 98% 동일성; 또는, 서열번호 2 또는 그의 단편과 적어도 99% 동일성을 공유할 수 있다. 본 발명의 CAR에 혼입되기에 적합하기 위해, 상기 변이체는 상기에 언급된 바와 같은 OTC의 합성 활성을 유지해야 한다.
적합한 OTC 효소 도메인은 서열번호 2의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 50%의 활성을 제공할 수 있다. 적합하게는, 상기 적합한 OTC 효소 도메인은 서열번호 2의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90% 활성을 제공할 수 있다. 적합하게는, 상기 효소 도메인은 서열번호 2의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 100%의 활성도 제공할 수 있다.
사실상, 적합한 OTC 도메인은 서열번호 2의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 110%의 활성을 제공할 수 있다. 적합하게는, 상기 적합한 OTC 도메인은 서열번호 2의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 120%, 적어도 130%, 적어도 140%, 적어도 150%, 적어도 160%, 적어도 170%, 적어도 180%, 적어도 190%의 활성을 제공할 수 있다. 적합하게는, 상기 효소 도메인은 서열번호 2의 도메인에 의해 제공된 활성의 적어도 200%의 활성도 제공할 수 있다.
아르기노숙시네이트
리아제(
ASL
) 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ASL 효소 도메인의 한 예는 서열번호 30에 나타낸 핵산 서열에 의해 암호화된다.
또는, 서열번호 30에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ASL 효소 도메인을 암호화하는데 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 ASL 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기와 같은 실시양태에 사용할 수 있다.
ASL 활성의 적합한 수준은 서열번호 30에 의해 암호화된 단백질에 의해 제공되는 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 ASL 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
오르니틴
디카복실라제
(
ODC1
) 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ODC1 효소 도메인의 한 예는 서열번호 31에 나타낸 핵산 서열에 의해 암호화된다.
또는, 서열번호 31에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ODC1 효소 도메인을 암호화하는데 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 ODC1 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기와 같은 실시양태에 사용할 수 있다.
ODC1 활성의 적합한 수준은 서열번호 31에 의해 암호화된 단백질에 의해 제공되는 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 ODC1 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
아르기노숙시네이트
신테타제
(
ArgG
) 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ArgG 효소 도메인의 한 예는 서열번호 32에 나타낸 핵산 서열에 의해 암호화된다.
또는, 서열번호 32에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ArgG 효소 도메인을 암호화하는데 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 ArgG 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기와 같은 실시양태에 사용할 수 있다.
ArgG 활성의 적합한 수준은 서열번호 32에 의해 암호화된 단백질에 의해 제공되는 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 ArgG 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
아르기노숙시네이트
리아제(
ArgH
) 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ArgH 효소 도메인의 한 예는 서열번호 33에 나타낸 핵산 서열에 의해 암호화된다.
또는, 서열번호 33에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ArgH 효소 도메인을 암호화하는데 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 ArgH 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기와 같은 실시양태에 사용할 수 있다.
ArgH 활성의 적합한 수준은 서열번호 33에 의해 암호화된 단백질에 의해 제공되는 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 ArgH 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
오르니틴
카바모일트랜스퍼라제
(
ArgF
) 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ArgF 효소 도메인의 한 예는 서열번호 34에 나타낸 핵산 서열에 의해 암호화된다.
또는, 서열번호 34에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 ArgF 효소 도메인을 암호화하는데 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 ArgF 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기와 같은 실시양태에 사용할 수 있다.
ArgF 활성의 적합한 수준은 서열번호 34에 의해 암호화된 단백질에 의해 제공되는 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 ArgF 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
트립토판 또는 트립토판 전구체
본 발명은 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 단백질에 관한 것이다.
트립토판(흔히 "Trp" 또는 "W"로 약칭됨)은 비-극성 아미노산이다. 트립토판은 204.2 g/몰-1의 분자질량을 가지며, 2-아미노-3-(1H-인돌-3-일)프로파노산으로도 지칭될 수 있다.
본 발명의 목적에 있어서, "트립토판 전구체"는 트립토판 생성 연쇄반응에서 트립토판보다 선행하는 임의의 화합물인 것으로 간주될 수 있다.
트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인
본 발명의 단백질은 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함한다. 상기 기능을 충족시키는 도메인의 능력, 즉, 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인의 능력은 임의의 적합한 수단 또는 분석법에 의해 조사할 수 있다.
숙련가라면 그 합성이 촉진될 화합물, 예를 들어, 트립토판 또는 트립토판 전구체와 관련하여 적합한 수단 또는 분석법이 선택될 수 있음을 인지할 것이다. 단지 예로서, 상기 필요한 합성을 촉진하는 도메인의 능력을 평가하는 적합한 분석법은 본 발명의 예시적 세포의 특성화와 관련하여 실시예에서 더 기술된다.
적합하게는, 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인은 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진할 수 있는 효소 도메인일 수 있다. 상기와 같은 실시양태에서, 상기 효소 도메인은 전장 효소 도메인, 또는 상기 도메인이 필요한 활성을 나타내는 한 상기 도메인의 단편 또는 변이체를 포함할 수 있다.
적합한 실시양태에서, 그 합성이 촉진되는 트립토판 전구체는 인돌글리세롤 포스페이트이다. 상기와 같은 실시양태에서, 상기 합성을 촉진하는 도메인은 트립토판 신테타제(TRP5) 효소 도메인일 수 있다.
적합한 실시양태에서, 트립토판의 합성이 촉진된다. 상기와 같은 실시양태에서, 상기 합성을 촉진하는 도메인은 인돌아민 2,3-다이옥시게나제(IDO) 효소 도메인일 수 있다.
트립토판
신테타제
(
TRP5
) 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 TRP5 효소 도메인의 한 예는 서열번호 35에 나타낸 핵산 서열에 의해 암호화된다.
또는, 서열번호 35에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 TRP5 효소 도메인을 암호화하는데 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 TRP5 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기와 같은 실시양태에 사용할 수 있다.
TRP5 활성의 적합한 수준은 서열번호 35에 의해 암호화된 단백질에 의해 제공되는 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 TRP5 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
인돌아민
2,3-
다이옥시게나제
(IDO) 효소 도메인
본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 IDO 효소 도메인의 한 예는 서열번호 36에 나타낸 핵산 서열에 의해 암호화된다.
또는, 서열번호 36에 나타낸 서열의 단편 또는 유도체를 본 발명의 단백질에 혼입되기에 적합한 IDO 효소 도메인을 암호화하는데 사용할 수 있다.
본 발명의 단백질에 IDO 활성을 제공하는 임의의 효소 도메인을 상기와 같은 실시양태에 사용할 수 있다.
IDO 활성의 적합한 수준은 서열번호 36에 의해 암호화된 단백질에 의해 제공되는 수준과 동등할 수 있다. 또는, 더 낮거나 높은 수준의 IDO 활성을 제공하는 효소 도메인이 여전히 유리할 수 있다.
표적 결합
잔기
본 발명의 단백질은 표적 결합 잔기를 포함한다. 상기 표적 결합 잔기는 단백질의 결합 특이성을 제공하고, 따라서 표적 결합 잔기에 의해 인식되는 표적 분자가 발견되는 표적 구조물, 예를 들어, 세포에 대해 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 세포파괴 활성을 제공한다.
특히, 표적 결합 잔기는, 그 치료 유용성을 뒷받침하는 본 발명의 세포의 생물 활성(예를 들어, 세포파괴 활성, 또는 활성화에 반응한 세포 증식)의 특이성을 제공한다. 맥락상 달리 요구되는 경우를 제외하고, 본 개시내용에서 특이적 결합에 대한 언급은 결합이 일어나는 환경에서 가능한 상대물들을 식별하는 표적 결합 잔기의 능력에 대한 언급으로 이해될 수 있다. 다른 잠재적 표적이 존재하는 경우 한 특정 표적 분자와 상호작용하는 표적 결합 잔기는 그것이 상호작용하는 표적 분자에 "특이적으로 결합한다"고 한다. 일부 실시양태에서, 특이적 결합은 표적 결합 잔기와 그의 표적 분자 사이의 결합 정도를 검출하거나 측정함으로써 평가된다; 일부 실시양태에서, 특이적 결합은 결합 잔기-표적 분자 복합체의 해리 정도를 검출하거나 측정함으로써 평가된다; 일부 실시양태에서, 특이적 결합은 그 표적 분자와 또 다른 존재 사이의 대체 상호작용과 경쟁하는 표적 결합 잔기의 능력을 검출하거나 측정함으로써 평가된다. 일부 실시양태에서, 특이적 결합은 다양한 농도에 걸쳐 상기 검출 또는 측정을 수행함으로써 평가된다. 적합한 실시양태에서, 특이적 결합은 동족 및 비-동족 표적들 사이의 결합 친화성의 차이를 측정함으로써 평가된다. 예를 들어, 특이적인 표적 결합 잔기는 비-동족 표적에 대한 결합 친화성보다 약 3배, 4배, 5배, 6배, 7배, 8배, 9배, 10배 이상인 동족 표적 분자에 대한 결합 친화성을 가질 수 있다.
본 개시내용의 맥락에서, "특이성"은 그 표적 분자 결합 상대와 다른 잠재적 결합 상대를 식별하는 특정 표적 결합 잔기의 능력의 척도이다.
적합한 표적 결합 잔기는 임의의 목적하는 표적 분자에게로 유도될 수 있다. 표적 결합 잔기는, 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 세포파괴 활성을 유도하는 것이 바람직한 표적에 의해, 독점적으로 또는 광범위하게 발현된 표적 분자에게로 유도될 수 있다. 예를 들어, 표적 결합 잔기는 질환과 연관된 표적 분자에게로 유도될 수 있다. 적합하게는, 표적 결합 잔기는 암, 또는 감염과 연관된 표적 분자에게로 유도될 수 있다.
적합한 실시양태에서, 표적 결합 잔기는 GD2 표적 결합 잔기; CD33 표적 결합 잔기; 메소텔린 표적 결합 잔기; 및 EGFRvIII 표적 결합 잔기로 이루어진 군에서 선택된다.
상기 표적 결합 잔기의 예는 서열번호 3 내지 6에 나타내었다. 단편 또는 변이체(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5개 이상의 아미노산 잔기만큼 예시적 서열과 상이한)를, 상기 단편 또는 변이체가 표적 분자와 결합하는 능력을 유지하는 한, 대체 표적 결합 잔기로 사용할 수 있다.
제한하지 않고, 적합한 표적 결합 잔기는 항체, 또는 그의 단편(예를 들어, scFv) 또는 유도체; TCR, 예를 들어, TCRα쇄 또는 TCR β쇄; 및 압타머로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
GD2 표적 결합
잔기
GD2 표적 결합 잔기는, 강글리오시드 GD2로도 지칭될 수 있는 디시알로강글리오시드 2(GD2)에 결합할 수 있는 잔기이다. GD2 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 GD2 분자를 포함하는 표적, 예를 들어, GD2를 발현하는 세포에 대해 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 세포파괴 활성을 발휘하는 것이 바람직한 상황에서 사용하기에 적합하다.
GD2는 신경아세포종, 골육종 및 흑색종을 포함하여, 신경외배엽 기원의 암에 의해 발현된다. 그러므로, GD2 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질(예를 들어, CAR)은 임의의 상기 암, 및 특히 신경아세포종의 예방 및/또는 치료를 위한 의학적 용도에 본 발명의 단백질을 사용하는 것이 바람직한 상황에서 사용하기에 적합한 것을 인지할 것이다.
본 발명에 따른 단백질에 혼입되기에 적합한 GD2 표적 결합 잔기는 항-GD2 항체, 예를 들어, 항-GD2 단일클론 항체 또는 그의 항원 결합 단편 또는 유도체일 수 있다. 예를 들어, GD2 표적 결합 잔기는 항-GD2 scFv 항체 단편일 수 있다. 단지 예로서, scFv 항체 단편을 포함하는 적합한 GD2 표적화 도메인은 서열번호 3에 나타내었다.
서열번호 3에 나타낸 상기 scFv 항체 단편은 US 9,493,740 B2 호에 기술된 바와 같이, 14g2a scFv로도 지칭된다. 상기 단편은 US 9,777,068 B2 호에 개시된 ch14.18 항체로부터 유래되며, 다른 ch14.18 항체 단편 또는 변이체들도 본 발명의 단백질에 GD2 표적 결합 잔기로 사용될 수 있음을 인지할 것이다.
또는, 적합한 GD2 표적 결합 잔기는 항-GD2 압타머; 또는 그의 단편 또는 유도체로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
적합하게는, GD2 표적 결합 잔기는 GD2에 특이적으로 결합할 수 있다.
CD33 표적 결합
잔기
CD33 표적 결합 잔기는, CD33(시글렉(Siglec)-3으로도 알려져 있음)에 결합할 수 있는 잔기이다. CD33은 막관통 단백질이다. CD33 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 CD33 분자를 포함하는 표적, 예를 들어, CD33을 발현하는 세포에 대해 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 세포파괴 활성을 발휘하는 것이 바람직한 상황에서 사용하기에 적합하다.
CD33은 급성 골수성 백혈병(AML) 세포에 의해 발현된다. 그러므로, CD33 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 AML의 예방 및/또는 치료를 위한 의학적 용도에 본 발명의 단백질을 사용하는 것이 바람직한 상황에서 사용하기에 적합한 것을 인지할 것이다.
본 발명에 따른 단백질에 혼입되기에 적합한 CD33 표적 결합 잔기는 항-CD33 항체, 예를 들어, 항-CD33 단일클론 항체 또는 그의 항원 결합 단편 또는 유도체일 수 있다. 예를 들어, CD33 표적 결합 잔기는 항-CD33 scFv 항체 단편일 수 있다. 단지 예로서, scFv 항체 단편을 포함하는 적합한 CD33 표적화 도메인은 서열번호 4에 나타내었다.
서열번호 4에 나타낸 상기 scFv 항체 단편은 인간화 my96 클론 단일클론 항체로부터 유래된다. my96 항체에 대한 세부사항은 문헌[Leukemia. 2015 Aug;29(8):1637-1647]에 개시되어 있고, 서열번호 4의 scFv 단편에 대한 세부사항은 US20160096892A1(scFv가 서열번호 147로 개시되어 있음)에 개시되어 있다. 다른 my96 항체 단편 또는 변이체들도 본 발명의 단백질에 CD33 표적 결합 잔기로 사용될 수 있음을 인지할 것이다.
또는, 적합한 CD33 표적 결합 잔기는 항-CD33 압타머; 또는 그의 단편 또는 유도체로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
적합하게는, CD33 표적 결합 잔기는 CD33에 특이적으로 결합할 수 있다.
메소텔린
표적 결합
잔기
메소텔린 표적 결합 잔기는 메소텔린에 결합할 수 있는 잔기이다. 메소텔린은 MSLN의 산물인 40 kDa 단백질이다. 메소텔린 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 메소텔린 분자를 포함하는 표적, 예를 들어, 메소텔린을 발현하는 세포에 대해 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 세포파괴 활성을 발휘하는 것이 바람직한 상황에서 사용하기에 적합하다.
메소텔린은 많은 상이한 유형의 암들의 세포에 의해 발현된다. 메소텔린 발현 암으로는, 예를 들어, 난소암, 폐 선암 및 췌장암과 같은 상피암이 포함된다. 그러므로, 메소텔린 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 임의의 메소텔린 발현 암의 예방 및/또는 치료를 위한 의학적 용도에 본 발명의 단백질을 사용하는 것이 바람직한 상황에서 사용하기에 적합한 것을 인지할 것이다.
본 발명에 따른 단백질에 혼입되기에 적합한 메소텔린 표적 결합 잔기는 항-메소텔린 항체, 예를 들어, 항-메소텔린 단일클론 항체 또는 그의 항원 결합 단편 또는 유도체일 수 있다. 예를 들어, 메소텔린 표적 결합 잔기는 항-메소텔린 scFv 항체 단편일 수 있다. 단지 예로서, scFv 항체 단편을 포함하는 적합한 메소텔린 표적화 도메인은 서열번호 5에 나타내었다.
서열번호 5에 나타낸 상기 scFv 항체 단편은 SS1 항체로부터 유래된다. 상기 항체 및 그로부터 유도된 scFv에 대한 세부사항은 WO 2015/090230 A(뮤린 SS1 scFv의 아미노산 서열이 서열번호 279에 제공되어 있음)에 개시되어 있다. 다른 SS1 항체 단편 또는 변이체들도 본 발명의 단백질에 메소텔린 표적 결합 잔기로 사용될 수 있음을 인지할 것이다.
또는, 적합한 메소텔린 표적 결합 잔기는 항-메소텔린 압타머; 또는 그의 단편 또는 유도체로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
적합하게는, GD2 표적 결합 잔기는 GD2에 특이적으로 결합할 수 있다.
EGFRvIII
표적 결합
잔기
EGFRvIII 표적 결합 잔기는 상피 성장 인자 수용체 변이체 III(EGFRvIII)에 결합할 수 있는 잔기이다. EGFRvIII 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 EGFRvIII 분자를 포함하는 표적, 예를 들어, EGFRvIII를 발현하는 세포에 대해 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 세포파괴 활성을 발휘하는 것이 바람직한 상황에서 사용하기에 적합하다.
EGFRvIII는 다양한 상피 기원의 암에 의해 발현된다. 그러므로, EGFRvIII 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 EGFR을 발현하는 암, 예를 들어, 교모세포종 및 대장암의 예방 및/또는 치료를 위한 의학적 용도에 본 발명의 단백질을 사용하는 것이 바람직한 상황에서 사용하기에 적합한 것을 인지할 것이다. 특히, EGFRvIII 표적 결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 교모세포종의 예방 및/또는 치료에 사용하기에 적합하다.
본 발명에 따른 단백질에 혼입되기에 적합한 EGFRvIII 표적 결합 잔기는 항-EGFRvIII 항체, 예를 들어, 항-EGFRvIII 단일클론 항체 또는 그의 항원 결합 단편 또는 유도체일 수 있다. 예를 들어, EGFRvIII 표적 결합 잔기는 항-EGFRvIII scFv 항체 단편일 수 있다. 단지 예로서, scFv 항체 단편을 포함하는 적합한 EGFRvIII 표적화 도메인은 서열번호 6에 나타내었다.
서열번호 6에 나타낸 상기 scFv 항체 단편은 WO 2012/138475 A1(여기서, 139 항체의 인간 scFv는 서열번호 5로 개시되어 있고, 상기 scFv를 포함하는 CAR 구조물은 서열번호 11로 개시되어 있다)에 개시된 139 항체로부터 유래된다. 다른 139 항체 단편 또는 변이체들도 본 발명의 단백질에 메소텔린 표적 결합 잔기로 사용될 수 있음을 인지할 것이다.
대체 EGFRvIII 표적 결합 잔기가 MR1 항-EGFRvIII 항체로부터 유래될 수 있다. 상기 EGFRvIII 표적 결합 잔기의 한 예는 서열번호 41의 DAN 서열에 의해 암호화된 scFv(MR1로부터 유래)이다. 상기 대체 EGFRvIII 표적 결합 잔기는 서열번호 42, 서열번호 43 및 서열번호 44에 나타낸 본 발명의 예시적 단백질들에 혼입된다. 본 발명의 상기 예시적 단백질들은 실시예에 기술된 연구들에 사용되었다.
또는, 적합한 EGFRvIII 표적 결합 잔기는 항-EGFRvIII 압타머; 또는 그의 단편 또는 유도체로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
적합하게는, EGFRvIII 표적 결합 잔기는 EGFRvIII에 특이적으로 결합할 수 있다.
세포내
신호전달 영역
본 발명의 단백질은 적어도 하나의 세포내 신호전달 영역을 포함한다. 상기 세포내 신호전달 영역은 단백질을 발현하는 세포의 다른 생물 활성을 갖는 표적 분자에 상기 표적 결합 잔기를 커플 결합시키는 역할을 한다. 특히, 적합한 세포내 신호전달 영역은 상기 표적 결합 잔기를, 세포의 세포파괴 활성의 활성화 및/또는 활성화에 반응하여 증식하는 세포 능력을 갖는 그 표적 분자에 커플 결합시킬 수 있다.
실시예에 나타낸 바와 같이, 적합한 세포내 신호전달 영역은 표적 결합 잔기에 표적 분자가 결합하는 것에 반응하여 세포독성 또는 특이적 세포용해 활성을 활성화시킬 수 있다. 다르게는 또는 추가로, 적합한 세포내 신호전달 영역은 표적 결합 잔기에 표적 분자가 결합하는 것에 반응하여 활성화-유도된 세포 증식을 촉진할 수 있다.
적합한 실시양태에서, 세포내 신호전달 영역은 4-1BB 신호전달 영역; OX-40 신호전달 영역; CD28 신호전달 영역; ICOS 신호전달 영역; 및 CD3ζ 신호전달 영역으로 이루어진 군에서 선택된 영역을 포함한다.
본 발명에 따른 단백질은 다수의 세포내 신호전달 영역을 포함할 수 있음을 인지할 것이다. 적합하게는, 상기 다수는 개별적 세포내 신호전달 영역의 하나보다 많은 카피를 포함할 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 단백질은 4-1BB 신호전달 영역; OX-40 신호전달 영역; CD28 신호전달 영역; ICOS 신호전달 영역; 및 CD3ζ 신호전달 영역 중 하나 이상의 다수의 카피를 포함할 수 있다.
추가로 또는 다르게는, 본 발명의 단백질은 다수의 세포내 신호전달 영역들의 조합을 포함할 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 따른 단백질은 4-1BB 신호전달 영역; OX-40 신호전달 영역; CD28 신호전달 영역; ICOS 신호전달 영역; 및 CD3ζ 신호전달 영역으로 이루어진 군에서 선택된 세포내 신호전달 영역들의 조합을 포함할 수 있다. 단지 예로서, 본 발명의 단백질은 4-1BB 신호전달 영역 및 CD3ζ 신호전달 영역을 둘 다 포함할 수 있다.
적합한 4-1BB 신호전달 영역은, 세포의 활성화, 및/또는 세포의 기능, 예를 들어, 세포에 의한 사이토카인 방출 및/또는 세포에 의한 세포독성; 및/또는 세포의 증식 및/또는 지속성 중 적어도 하나를 촉진하는 상기 신호전달 영역을 포함하는 단백질을 발현하는 세포에 충분한 공자극 신호를 제공할 수 있는 영역이다. 상기 지속성은 생체내 또는 시험관내에서의 지속성일 수 있다. 지속성은, 특히, 면역억제 종양 미세환경의 조건 또는 상기 미세환경을 모방하는 조건에서 세포의 지속성일 수 있다. 예로서, 사이토카인 방출은 IFN-감마 및/또는 TNFα 및/또는 IL2로 이루어진 군으로부터의 하나 이상의 사이토카인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 4-1BB 신호전달 영역은 4-1BB의 전장 서열을 포함할 수 있다. 또는, 4-1BB 신호전달 영역은 전장 서열의 절두되고/되거나 변형된 형태를 포함할 수 있다. 단지 예로서, 적합한 4-1BB 신호전달 영역은 서열번호 7에 나타낸 아미노산 서열 또는 상기 서열의 일부분을 포함할 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질에 혼입되기 위한 4-1BB 신호전달 영역은 서열번호 7에 나타낸 아미노산 서열로 이루어질 수 있다.
적합한 실시양태에서, OX-40 신호전달 영역은, 세포의 활성화, 및/또는 세포의 기능, 및/또는 세포의 지속성 중 적어도 하나를 촉진하는 상기 신호전달 영역을 포함하는 단백질을 발현하는 세포에 충분한 공자극 신호를 제공할 수 있는 영역이다. 상기 지속성은 생체내 또는 시험관내에서의 지속성일 수 있다. 지속성은, 특히 면역억제 종양 미세환경의 조건 또는 상기 미세환경을 모방하는 조건에서 세포의 지속성일 수 있다.
적합하게는, OX-40 신호전달 영역은 OX-40의 전장 서열을 포함할 수 있다. 또는, OX-40 신호전달 영역은 전장 서열의 절두되고/되거나 변형된 형태를 포함할 수 있다. 단지 예로서, 적합한 OX-40 신호전달 영역은 서열번호 8에 나타낸 아미노산 서열 또는 상기 서열의 일부분을 포함할 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질에 혼입되기 위한 4-1 OX-40 BB 신호전달 영역은 서열번호 8에 나타낸 아미노산 서열로 이루어질 수 있다.
적합한 CD28 신호전달 영역은, 세포의 활성화, 및/또는 세포의 기능, 및/또는 세포의 지속성 중 적어도 하나를 촉진하는 상기 신호전달 영역을 포함하는 단백질을 발현하는 세포에 충분한 공자극 신호를 제공할 수 있는 영역이다. 상기 지속성은 생체내 또는 시험관내에서의 지속성일 수 있다. 지속성은, 특히 면역억제 종양 미세환경의 조건 또는 상기 미세환경을 모방하는 조건에서 세포의 지속성일 수 있다.
적합하게는, CD28 신호전달 영역은 CD28의 전장 서열을 포함할 수 있다. 또는, CD28 신호전달 영역은 전장 서열의 절두되고/되거나 변형된 형태를 포함할 수 있다. 단지 예로서, 적합한 CD28 신호전달 영역은 서열번호 9에 나타낸 아미노산 서열 또는 상기 서열의 일부분을 포함할 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질에 혼입되기 위한 CD28 신호전달 영역은 서열번호 9에 나타낸 아미노산 서열로 이루어질 수 있다.
ICOS 신호전달 영역은, 세포의 활성화, 및/또는 세포의 기능, 예를 들어, 세포에 의한 사이토카인 방출 및/또는 세포에 의한 세포독성; 및/또는 세포의 증식 및/또는 세포의 지속성 중 적어도 하나를 촉진하는 상기 신호전달 영역을 포함하는 단백질을 발현하는 세포에 충분한 공자극 신호를 제공할 수 있는 영역이다. 상기 지속성은 생체내 또는 시험관내에서의 지속성일 수 있다. 지속성은, 특히 면역억제 종양 미세환경의 조건 또는 상기 미세환경을 모방하는 조건에서 세포의 지속성일 수 있다.
적합하게는, ICOS 신호전달 영역은 ICOS(CD278로도 알려져 있음)의 전장 서열을 포함할 수 있다. 또는, ICOS 신호전달 영역은 전장 서열의 절두되고/되거나 변형된 형태를 포함할 수 있다. 단지 예로서, 적합한 ICOS 신호전달 영역은 서열번호 10에 나타낸 아미노산 서열 또는 상기 서열의 일부분을 포함할 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질에 혼입되기 위한 ICOS 신호전달 영역은 서열번호 10에 나타낸 아미노산 서열로 이루어질 수 있다. ICOS의 절두되거나 변형된 형태는 적어도 전장 ICOS 단백질의 잔기 180 내지 183에서 발견된 YMFM 모티프를 포함할 수 있다.
적합한 CD3ζ 신호전달 영역은 T 세포내에서의 기능성 반응(예를 들어, 사이토카인 방출(예, 인터페론-감마, TNFα 및/또는 IL2), 세포독성 및/또는 증식)을 활성화할 수 있는 영역이다.
적합하게는, CD3ζ 신호전달 영역은 CD3ζ의 전장 서열을 포함할 수 있다. 또는, CD3ζ 신호전달 영역은 전장 서열의 절두되고/되거나 변형된 형태를 포함할 수 있다. 단지 예로서, 적합한 CD3ζ 신호전달 영역은 서열번호 11 또는 서열번호 40에 나타낸 아미노산 서열 또는 상기 서열의 일부분을 포함할 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질에 혼입되기 위한 CD3ζ 신호전달 영역은 서열번호 11 또는 서열번호 40에 나타낸 아미노산 서열로 이루어질 수 있다.
GD2를
표적화하는
본 발명의 단백질
GD2를 표적화하는 본 발명의 단백질은 적합한 세포내 신호전달 영역(예를 들어, 4-1BB 세포내 신호전달 영역 및 CD3ζ 세포내 신호전달 영역)과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함할 수 있다. 상기 단백질은 ASS-1 도메인; 및/또는 OTC 도메인; 및/또는 ASL 도메인; 및/또는 OCD1 도메인; 및/또는 ArgG 도메인; 및/또는 ArgH 도메인; 및/또는 ArgF 도메인을 추가로 포함할 수 있다. 적합하게는, 상기 단백질은 ASS-1 도메인; 및/또는 OTC 도메인을 포함할 수 있다.
본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질이 그 치료적 유용성을 보여주는 많은 성질과 관련하여 특히 유용함을 밝혀내었다.
예를 들어, 본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 선행 기술에서 공지된 GD2 CAR-T 세포에 비해 필적하거나 개선된 생존율을 나타냄을 밝혀내었다.
유리하게, 본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 필적하는 대조군 CAR-T 세포에 비해 증가된 지속성을 나타낼 수 있음을 밝혀내었다. ASS-1 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 대조군 세포에 비해 특히 유리한 증가된 지속성을 나타낸다.
본 발명자들은 또한 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 종양 미세환경을 나타내는 조건(예를 들어, 실험적으로 아르기닌-고갈 조건)에서 대조군 CAR-T 세포에 비해 증가된 증식을 나타낼 수 있음을 밝혀내었다.
특히, OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 종양 미세환경을 나타내는 조건, 예를 들어, 아르기닌-고갈 조건에서 대조군 세포에 비해 증가된 증식을 나타낼 수 있다. 놀랍게도, ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 종양 미세환경을 나타내는 조건, 예를 들어, 아르기닌-고갈 조건에서 대조군 세포에 비해 증식에 훨씬 더 큰 증가를 나타낼 수 있다.
실시예에 나타낸 바와 같이, OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 아르기닌-고갈 조건과 같은 종양 미세환경의 조건에서 대조군 세포에 비해 증식에 5배 증가를 나타낼 수 있다.
훨씬 더 놀랍게, ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 아르기닌-고갈 조건과 같은 종양 미세환경의 조건에서 대조군 세포에 비해 증식에 10배 증가를 나타낼 수 있다.
본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 암세포와 관련하여 세포파괴 활성을 나타냄을 밝혀내었다. 단지 예로서, 본 발명자들은 ASS-1 도메인 또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 선행 기술에서 공지된 GD2 CAR-T 세포에 필적하는 특이적 세포파괴 활성을 나타낼 수 있음을 입증하였다.
유리하게, ASS-1 도메인 또는 OTC 도메인과 함께 GD2 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 증가된 지속성 및 증식에 더하여, 생체내 암 모델에서 수용체의 생존을 개선시키는 세포파괴 활성을 나타낼 수 있다.
상기 이점들은 본 명세서의 실시예 부분에서 더 논의된다.
GD2를 표적화하는 본 발명의 예시적 단백질의 아미노산 서열은 서열번호 12 내지 14에 나타내었다. 본 발명은 상기 특정 단백질들을 포함할 뿐 아니라, 상기 예시적 단백질들의 생물 활성(특히 세포파괴 활성 및 단백질 결합에 반응하여 증식을 촉진하는 능력)을 공유하는 상기 단백질들의 변이체들을 포함하는 것으로 간주되어야 한다. 상기 변이체들은 서열번호 12 내지 14의 단백질들 중 임의의 단백질과 적어도 80% 서열 동일성을 공유할 수 있다. 적합하게는, 상기 변이체들은 서열번호 12 내지 14의 단백질들 중 임의의 단백질과 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 서열 동일성을 공유할 수 있다.
메소텔린을
표적화하는
본 발명의 단백질
메소텔린을 표적화하는 본 발명의 단백질은 적합한 세포내 신호전달 영역(예를 들어, 4-1BB 세포내 신호전달 영역 및 CD3ζ 세포내 신호전달 영역)과 함께, 항-메소텔린 SS1 항체로부터 유래된 메소텔린 표적화 잔기를 포함할 수 있다. 상기 단백질은 ASS-1 도메인; 및/또는 OTC 도메인; 및/또는 ASL 도메인; 및/또는 OCD1 도메인; 및/또는 ArgG 도메인; 및/또는 ArgH 도메인; 및/또는 ArgF 도메인을 추가로 포함할 수 있다. 적합하게는, 상기 단백질은 ASS-1 도메인; 및/또는 OTC 도메인을 포함할 수 있다.
본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 메소텔린 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질이 그 치료적 유용성을 보여주는 많은 성질과 관련하여 특히 유용함을 밝혀내었다.
예를 들어, 본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 메소텔린 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 선행 기술에서 공지된 메소텔린 CAR-T 세포에 비해 필적하거나 개선된 생존율을 나타냄을 밝혀내었다.
유리하게, 본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 메소텔린 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 종양 미세환경을 나타내는 조건(예를 들어, 실험적으로 아르기닌-고갈 조건)에서 대조군 CAR-T 세포에 비해 증가된 증식을 나타낼 수 있음을 밝혀내었다.
OTC 도메인과 함께 메소텔린 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 종양 미세환경을 나타내는 조건, 예를 들어, 아르기닌-고갈 조건에서 대조군 세포에 비해 특히 증가된 증식을 나타낸다. 실시예에 예시된 바와 같이, 상기 증식의 특별한 증가는 OTC 도메인을 단독으로 또는 ASS-1 도메인과 함께 포함하는 본 발명의 단백질에 의해 입증된다. OTC 도메인과 함께 메소텔린 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 종양 미세환경에서 발견되는 조건들을 모방하는 조건에서 대조군 세포에 비해 증식에 약 4배 증가를 나타냄을 볼 수 있다.
실시예에 나타낸 바와 같이, ASS-1 도메인 및 OTC 도메인과 함께 메소텔린 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 아르기닌-고갈 조건과 같은 종양 미세환경의 조건에서 대조군 세포에 비해 증식에 3배보다 많은 증가를 나타낼 수 있다.
상기 이점들은 본 명세서의 실시예 부분에서 더 논의된다.
메소텔린을 표적화하는 본 발명의 예시적 단백질의 아미노산 서열은 서열번호 15 내지 17에 나타내었다. 본 발명은 상기 특정 단백질들을 포함할 뿐 아니라, 상기 예시적 단백질들의 생물 활성(특히 세포파괴 활성 및 단백질 결합에 반응하여 증식을 촉진하는 능력)을 공유하는 상기 단백질들의 변이체들을 포함하는 것으로 간주되어야 한다. 상기 변이체들은 서열번호 15 내지 17의 단백질들 중 임의의 단백질과 적어도 80% 서열 동일성을 공유할 수 있다. 적합하게는, 상기 변이체들은 서열번호 15 내지 17의 단백질들 중 임의의 단백질과 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 서열 동일성을 공유할 수 있다.
CD33을
표적화하는
본 발명의 단백질
CD33을 표적화하는 본 발명의 단백질은 적합한 세포내 신호전달 영역(예를 들어, 4-1BB 세포내 신호전달 영역 및 CD3ζ 세포내 신호전달 영역)과 함께, 항-CD33 my96 항체로부터 유래된 CD33 표적화 잔기를 포함할 수 있다. 상기 단백질은 ASS-1 도메인; 및/또는 OTC 도메인; 및/또는 ASL 도메인; 및/또는 OCD1 도메인; 및/또는 ArgG 도메인; 및/또는 ArgH 도메인; 및/또는 ArgF 도메인을 추가로 포함할 수 있다. 적합하게는, 상기 단백질은 ASS-1 도메인; 및/또는 OTC 도메인을 포함할 수 있다.
ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질은 그 치료적 유용성을 보여주는 많은 성질과 관련하여 특히 유용하다.
예를 들어, 본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 선행 기술에서 공지된 CD33 CAR-T 세포에 비해 필적하거나 개선된 생존율을 나타냄을 밝혀내었다.
유리하게, 본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 필적하는 대조군 CAR-T 세포에 비해 증가된 지속성을 나타낼 수 있음을 밝혀내었다. ASS-1 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 대조군 세포에 비해 특히 유리한 증가된 지속성을 나타낸다.
본 발명자들은 또한 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 종양 미세환경을 나타내는 조건(예를 들어, 실험적으로 아르기닌-고갈 조건)에서 대조군 CAR-T 세포에 비해 증가된 증식을 나타낼 수 있음을 밝혀내었다.
OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 종양 미세환경을 나타내는 조건, 예를 들어, 아르기닌-고갈 조건에서 대조군 세포에 비해 상당히 증가된 증식을 나타낸다. 본 발명자들은 또한 ASS-1 도메인 및 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 종양 미세환경을 나타내는 조건에서 대조군 세포에 비해 증식에 훨씬 더 큰 증가를 나타냄을 밝혀내었다.
실시예에 나타낸 바와 같이, OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 종양 미세환경을 나타내는 조건에서 대조군 세포에 비해 증식에 5배보다 많은 증가를 나타낸다. 훨씬 더 유리하게, ASS-1 도메인 및 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 동일한 조건하에서 대조군 세포에 비해 증식에 약 6배 증가를 나타낸다.
본 발명자들은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 암 세포와 관련하여 선행 기술에서 공지된 CD33 CAR-T 세포에 필적하는 세포파괴 활성을 나타냄을 밝혀내었다.
유리하게, ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포는 증가된 지속성 및 증식에 더하여, 생체내 암 모델에서 수용체의 생존을 개선시키는 세포파괴 활성을 나타낼 수 있다.
상기 이점들은 본 명세서의 실시예 부분에서 더 논의된다.
CD33을 표적화하는 본 발명의 예시적 단백질의 아미노산 서열은 서열번호 18 내지 20에 나타내었다. 본 발명은 상기 특정 단백질들을 포함할 뿐 아니라, 상기 예시적 단백질들의 생물 활성(특히 세포파괴 활성 및 단백질 결합에 반응하여 증식을 촉진하는 능력)을 공유하는 상기 단백질들의 변이체들을 포함하는 것으로 간주되어야 한다. 상기 변이체들은 서열번호 18 내지 20의 단백질들 중 임의의 단백질과 적어도 80% 서열 동일성을 공유할 수 있다. 적합하게는, 상기 변이체들은 서열번호 18 내지 20의 단백질들 중 임의의 단백질과 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 서열 동일성을 공유할 수 있다.
EGFRvIII를
표적화하는
본 발명의 단백질
EGFRvIII를 표적화하는 본 발명의 단백질은 적합한 세포내 신호전달 영역(예를 들어, 4-1BB 세포내 신호전달 영역 및 CD3ζ 세포내 신호전달 영역)과 함께, 항-EGFRvIII 139 항체로부터 유래된 EGFRvIII 표적화 잔기를 포함할 수 있다. 상기 단백질은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인; 및/또는 ASL 도메인; 및/또는 OCD1 도메인; 및/또는 ArgG 도메인; 및/또는 ArgH 도메인; 및/또는 ArgF 도메인을 추가로 포함할 수 있다. 특히, 상기 단백질은 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인을 포함할 수 있다.
본 발명자들의 결과는 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인과 함께 EGFRvIII 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 선행 기술에서 공지된 EGFRvIII CAR-T 세포에 비해 필적하거나 개선된 생존율을 나타냄을 입증한다.
본 발명자들은 ASS-1 도메인과 함께 EGFRvIII 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포가 종양 미세환경을 나타내는 조건(예를 들어, 실험적으로 아르기닌-고갈 조건)에서 대조군 CAR-T 세포에 비해 증가된 증식을 나타냄을 밝혀내었다. ASS-1 도메인과 함께 EGFRvIII 표적화 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 상기 세포는 상기와 같은 조건에서 대조군 세포에 비해 증식에 2배보다 많은 증가를 나타낸다.
상기 이점들은 본 명세서의 실시예 부분에서 더 논의된다.
EGFRvIII를 표적화하는 본 발명의 예시적 단백질의 아미노산 서열은 서열번호 21 내지 23에 나타내었다. 본 발명은 상기 특정 단백질들을 포함할 뿐 아니라, 상기 예시적 단백질들의 생물 활성(특히 세포파괴 활성 및 단백질 결합에 반응하여 증식을 촉진하는 능력)을 공유하는 상기 단백질들의 변이체들을 포함하는 것으로 간주되어야 한다. 상기 변이체들은 서열번호 21 내지 23의 단백질들 중 임의의 단백질과 적어도 80% 서열 동일성을 공유할 수 있다. 적합하게는, 상기 변이체들은 서열번호 21 내지 23의 단백질들 중 임의의 단백질과 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 서열 동일성을 공유할 수 있다.
본 발명의 단백질을 암호화하는 핵산
본 발명의 세 번째 양태는 본 발명의 단백질을 암호화하는 핵산을 제공한다. 상기 단백질은 본원에 기술된 본 발명의 임의의 양태 또는 실시양태에 따를 수 있다.
적합하게는, 본 발명의 따른 핵산은 DNA를 포함한다. 적합한 실시양태에서, 본 발명의 핵산은 RNA를 포함한다. 적합한 핵산은 필수적으로 DNA로 이루어질 수 있거나, 필수적으로 RNA로 이루어질 수 있거나, DNA와 RNA의 조합을 포함할 수 있음을 인지할 것이다.
본 발명의 단백질을 암호화하는 핵산의 예들은 서열번호 37 내지 39에 나타내었다. 상기 핵산 서열들은 다음과 같이 명세서에 나타낸 예시적 단백질들을 암호화하는 DNA 분자들이다:
코돈 축중은 본 발명의 해당 단일 단백질을 암호화하는 본 발명의 핵산의 서열들에 현저한 차이가 있을 수 있음을 의미함을 인지할 것이다.
단지 예로서, 본 발명의 적합한 핵산은 서열번호 37 내지 39에 나타낸 본 발명의 예시적 핵산들 중 하나와 적어도 70% 서열 동일성을 공유할 수 있다. 본 발명의 적합한 핵산은 서열번호 37 내지 39에 나타낸 본 발명의 예시적 핵산들 중 하나와 적어도 75% 서열 동일성; 적어도 80% 서열 동일성; 적어도 85% 서열 동일성; 적어도 90% 서열 동일성; 적어도 95% 서열 동일성; 적어도 96% 서열 동일성; 적어도 97% 서열 동일성; 적어도 98% 서열 동일성; 또는 심지어 99% 이상의 서열 동일성을 공유할 수 있다.
메소텔린을 표적화하는 본 발명의 단백질을 암호화하는 핵산 서열은, 표적 결합 잔기를 암호화하는 핵산 서열들 중 일부가 서열번호 28의 핵산 서열로 대체되는 것을 제외하고, 서열번호 37, 38 또는 39 중 어느 하나의 핵산 서열과 동일한 것일 수 있다.
CD33을 표적화하는 본 발명의 단백질을 암호화하는 핵산 서열은, 표적 결합 잔기를 암호화하는 핵산 서열들 중 일부가 서열번호 27의 핵산 서열로 대체되는 것을 제외하고, 서열번호 37, 38 또는 39 중 어느 하나의 핵산 서열과 동일한 것일 수 있다.
EGFRvIII를 표적화하는 본 발명의 단백질을 암호화하는 핵산 서열은, 표적 결합 잔기를 암호화하는 핵산 서열들 중 일부가 서열번호 29의 핵산 서열로 대체되는 것을 제외하고, 서열번호 37, 38 또는 39 중 어느 하나의 핵산 서열과 동일한 것일 수 있다.
본 발명의 단백질을 암호화하는 핵산은 벡터의 형태로 제공될 수 있다. 적합하게는, 상기 벡터는 바이러스 벡터, 예를 들어, 레트로바이러스 벡터 또는 렌티바이러스 벡터, 또는 트랜스포손일 수 있다. 레트로바이러스 및 렌티바이러스 접근방법은 둘 다 본 발명의 세포 생산에 성공적으로 사용되었다.
본 발명의 세포의 성공적인 렌티바이러스 생산에 사용된 구조물들에 대한 세부사항은 도 14에 나타내었다. 상기 구조물들은 본 발명의 핵산의 추가의 예를 제공한다.
본 발명의 세포
본 발명의 두 번째 양태는 본 발명의 첫 번째 양태에 따른 단백질을 포함하는 세포를 제공한다. 상기 세포는 상기 단백질을 발현할 수 있다. 상기 단백질은 본원에 기술된 본 발명의 첫 번째 양태의 임의의 실시양태에 따를 수 있다.
적합하게는, 본 발명의 두 번째 양태에 따른 세포는 세포-매개 면역 반응을 발휘할 수 있는 세포일 수 있다. 적합한 세포는, 예를 들어, 세포독성 작용에 의해 또는 특이적 세포 용해를 유도함으로써 세포파괴 활성을 발휘할 수 있다. 또한, 적합한 세포는 단백질의 그 상응하는 표적 분자에 대한 결합에 반응하여 증식할 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 두 번째 양태에 따른 세포는 T 세포; 및 자연 살해(NK) 세포로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
적합하게는, T 세포는 비-변이 자연 살해 T 세포(iNKT); 자연 살해 T 세포(NKT); 감마 델타 T 세포(gd T 세포); 알파 베타 T 세포(ab T 세포); 효과기 T 세포; 및 기억 T 세포로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
적합하게는, T 세포는 CD4+ 림프구; 및 CD8+ 림프구로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
상기 세포는 질환의 예방 및/또는 치료를 필요로 하는 대상으로부터 수득될 수 있다. 상기 세포는 상기 대상으로부터의 샘플로부터 취할 수 있다.
또는, 상기 세포는 건강한 공여 대상(본 개시내용의 목적을 위해 본 발명의 단백질 또는 세포로 치료될 질환에 걸리지 않은 대상으로 간주됨)으로부터 취할 수 있다.
적합한 세포는 또한 세포주들의 세포를 포함할 수 있음을 인지할 것이다.
인간 세포의 수집, 및 본 발명의 단백질과 같은 단백질에 의한 그의 형질전환을 위한 표준 기법들은 당해 분야의 숙련가들에게 공지되어 있다. 인간 T 세포의 레트로바이러스 형질도입, 형질도입 효율 측정, 및 자기 활성화 세포 분류에 의한 형질도입 T 세포의 분류에 바람직한 기법들은 실시예에서 더 기술된다.
본 발명 세포의 생물 활성
본 발명의 단백질을 포함하는 본 발명의 세포는 질환의 예방 및/또는 치료와 같은 용도에서 유리한 다수의 활성을 나타낸다.
상기 생물 활성들은, 본 발명의 세포로 하여금 선행 기술의 CAR-발현 세포의 경우에서보다 더 오래 그 치료 효과를 발휘하게 할 수 있는 세포파괴 활성(본 발명의 세포가 그 치료 효과를 발휘할 수 있는 수단을 나타냄) 및 증식(예를 들어, 활성화에 반응하여) 및 생체내 지속성과 같은 활성과 관련하여 더 고려될 수 있다.
상기 각각의 생물 활성들은 하기에서 더 기술한다. 본 발명의 단백질 및 세포에 의해 제공되는 이점들은 주로 상기 생물 활성들의 조합의 결과로 비롯됨을 인지할 것이다.
본 발명 세포의 생물 활성은 적합한 비교 세포를 참고로 하여 측정될 수 있다. 적합한 비교 세포의 예로는 단백질로 형질도입되지 않은 본 발명의 세포와 동일한 유형의 세포, 또는 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하지 않는 단백질로 형질도입된 본 발명의 세포와 동일한 유형의 세포가 포함된다.
본 발명 세포의 세포파괴 활성
본 발명의 목적에 있어서, 세포파괴 활성은 본 발명의 세포(예를 들어, 본 발명의 단백질을 발현하는 세포)가 다른 세포를 사멸시키는 임의의 활성을 포함하는 것으로 간주되어야 한다. 예로서, 다른 세포의 사멸은 본 발명 세포의 세포독성 작용에 의해, 또는 본 발명 세포에 의해 매개된 특이적 세포 용해에 의해 달성될 수 있다.
본 발명의 세포는 본 발명의 단백질의 표적 결합 잔기에 의해 결합된 표적 분자를 포함하는 표적 구조물에 대해 그의 세포파괴 활성을 발휘한다.
바람직하게, 본 발명 세포의 세포파괴 활성에 의해 사멸된 세포는 질환과 연관된 세포이다. 적합하게는, 질환과 연관된 세포는 암세포 또는 감염된 세포일 수 있다.
실시예에 나타낸 바와 같이, 본 발명자들은 본 발명의 세포(본 발명의 단백질을 포함하는)가 본 발명 단백질의 표적 결합 잔기에 의해 결합된 표적 분자를 발현하는 세포에 대해 특이적으로 유도되는 세포파괴 활성을 나타냄을 입증하였다. 본 발명의 세포에 대해 관찰된 세포파괴 활성의 정도는 선행 기술에서 기술된 단백질 발현 세포의 상기 활성 정도와 대략 비슷하다. 그러나, 본 발명의 세포에 의해 나타난, 개선된 증식 및/또는 지속성과 상기 유지된 세포파괴 활성의 조합은 선행 기술의 세포에 대해 주목되지 않은 이점들을 제공한다.
숙련가라면 본 발명의 세포 또는 적합한 비교 세포의, 세포파괴 활성이든 또는 특이적 세포 용해이든 세포파괴 활성을 평가할 수 있는 많은 적합한 분석법들을 알 것이다. 단지 예로서, 적합한 분석법들이 실시예에 기술되어 있으며, 여기서 상기 분석법들은 본 발명의 예시적 세포들의 특성화에 이용된다.
전문 독자라면 실시예에 나타낸 정보를 고려하여 본 발명의 세포가 본 명세서에 기술된 방식으로 질환의 예방 및/또는 치료에 치료적으로 사용하기에 적합하게 하는 세포파괴 활성을 나타냄을 인지할 것이다.
본 발명 세포의
지속성
치료 효과를 발휘하는 세포의 생체내 및 특히 대상내에서의 지속성은 질환의 효과적인 예방 및/또는 치료를 위해 중요하다. 앞에서 언급했듯이, 신경아세포종과 같은 종양 주변의 미세환경은 CAR T 세포와 같은 치료 세포에 특히 손상을 가한다. 상기 미세환경의 효과, 및 치료 세포가 상기 환경내에서 지속하지 못하는 상태는 많은 선행 기술의 치료와 관련하여 관찰된 실패들에 상당히 기여한 것으로 생각된다.
본 발명의 단백질을 포함하는 본 발명의 세포는 종양 미세환경에서 증가된 지속성을 나타낸다. 실시예에서 입증되는 상기 증가된 생체내 지속성은 본 발명 세포의 치료 효과가 선행 기술의 세포에 비해 연장되고 따라서 그 치료적 유용성이 증가될 수 있는 메카니즘을 나타낸다.
본 발명의 세포 또는 적합한 비교 세포의 지속성은 실험적으로 많은 상이한 방법들에 의해 평가될 수 있다. 단지 예로서, 세포 지속성은 해당 기간후에 수용체내에서 생존하여 유지되는, 원래 투여된 세포의 백분율과 관련하여 정의될 수 있다. 2개 이상의 세포 집단(예를 들어, 본 발명 세포의 집단 및 적합한 비교 세포의 집단) 사이에 유용한 비교가, 경과 시간이 각각의 세포 집단에 대해 대략 동일하다면, 임의의 해당 기간후에 이루어질 수 있음을 인지할 것이다. 즉, 본 발명자들은, 예를 들어, 실시예에 나타낸 바와 같이 본 발명의 세포 5x106 세포가 이식된 NOG-SCID 마우스의 경우에서, 세포 투여 17일 후에 이루어진 비교가 상기 계산에 적절함을 밝혀내었다. 관심있는 특정 실험 모델과 관련하여 다른 시점들을 이용할 수 있으며 세포에서의 지속성을 측정하는 다른 방법들이 당해 분야의 숙련가들에게 공지되어 있음을 인지할 것이다.
일정 기간후에 지속되는 본 발명 세포의 비율은 적합한 비교 세포의 상기 비율보다 적어도 5% 더 높을 수 있다. 실제로, 지속되는 본 발명 세포의 비율은 적합한 비교 세포의 상기 비율보다 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40%, 적어도 45%, 적어도 50%, 적어도 55%, 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 또는 적어도 95% 더 높울 수 있다. 일정 기간후에 지속되는 본 발명 세포의 비율은 적합한 비교 세포의 상기 비율보다 적어도 100% 이상 더 높을 수 있다.
일정 기간후에 지속되는 본 발명 세포의 비율은 원래 투여된 본 발명 세포의 총수의 10% 이하, 15% 이하, 20% 이하, 25% 이하, 30% 이하, 35% 이하, 40% 이하, 45% 이하, 50% 이하, 55% 이하, 60% 이하, 65% 이하, 70% 이하, 75% 이하, 80% 이하, 85% 이하, 90% 이하, 95% 이하, 또는 심지어 100% 이하일 수 있다.
본 발명의 세포는 적합한 비교 세포보다 더 오랜 기간동안 수용체내에서 지속될 수 있다. 본 발명의 세포는 적합한 비교 세포보다 5%까지 더 오래 수용체에서 지속될 수 있다. 본 발명의 세포는 적합한 비교 세포보다 10%까지 더 오래, 15%까지, 20%까지, 25%까지, 30%까지, 35%까지, 40%까지, 45%까지, 50%까지, 55%까지, 60%까지, 65%까지, 70%까지, 75%까지, 80%까지, 85%까지, 90%까지, 95%까지, 또는 심지어 100%까지 더 오래 수용체에서 지속할 수 있다.
본 발명의 세포와 같은 세포의 지속성을 평가할 수 있는 또 다른 방법은 세포가 수용체에서 생존하여 유지되는 시간 길이와 관련된 것이다. 적합하게는, 본 발명의 단백질을 포함하는 본 발명의 세포는 적어도 5일, 적어도 10일, 적어도 15일, 적어도 20일, 적어도 25일, 적어도 30일, 적어도 35일, 적어도 40일, 적어도 45일, 적어도 50일, 적어도 55일, 적어도 60일, 적어도 65일, 적어도 70일, 적어도 75일, 적어도 80일, 적어도 85일, 적어도 90일, 적어도 95일, 또는 적어도 100일 이상동안 수용체에서 생존한 채 유지될 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질을 포함하는 본 발명의 세포는 적어도 150일, 적어도 200일, 적어도 250일, 적어도 300일, 또는 적어도 350일 이상동안 수용체에서 생존한 채 유지될 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질을 포함하는 본 발명의 세포는 적어도 6 개월, 적어도 9 개월, 적어도 12 개월, 적어도 15 개월, 적어도 18 개월, 적어도 21 개월, 적어도 24 개월 이상동안 수용체에서 생존한 채 유지될 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질을 포함하는 본 발명의 세포는 적어도 1년, 적어도 2년, 적어도 3년, 적어도 4년, 적어도 5년, 적어도 6년, 적어도 7년, 적어도 8년, 적어도 9년, 또는 적어도 10년 이상동안 수용체에서 생존한 채 유지될 수 있다. 적합하게는, 본 발명의 단백질을 포함하는 본 발명의 세포는 적어도 10년, 적어도 15년, 적어도 20년, 적어도 25년, 적어도 30년, 적어도 35년, 적어도 40년, 적어도 45년, 적어도 50년 이상동안 수용체에서 생존한 채 유지될 수 있다.
본 발명 세포의 증식
상응하는 표적 분자에 대한 단백질의 결합을 통한 본 발명 세포의 활성화는 세포 증식을 유도한다. 이에 의해 치료 활성을 발휘할 수 있는 증가된 수의 세포 생산이 가능하게 된다. 그러나, 상기 세포 증식은 통상적으로 종양 미세환경에서 억제되며, 이것은 선행 기술에서 개시된 CAR T 세포 치료의 실패에 기여하였다.
본 발명의 세포는 선행 기술의 CAR T 세포와 관련하여 관찰된 것에 비해 현저히 개선된, 아르기닌-고갈 종양 미세환경내에서의 증식 능력을 나타낸다. 세포 증식은 종양 미세환경내에서 그의 치료적 세포파괴 활성을 나타낼 수 있는 본 발명의 세포 집단의 증식을 야기하므로, 상기 세포 증식은 매우 유리하다.
본 발명의 세포와 같은 세포의 증식은 실험적으로 많은 방법으로 평가될 수 있다. 단지 예로서, 세포 증식은 종양 미세환경을 모방한 조건에서 평가될 수 있다. 상기 조건은, 예를 들어, 종양 세포로 조정함으로써 아르기닌과 관련하여 고갈된 배양 배지의 사용을 포함할 수 있다. 상기와 같은 조건에서, 본 발명의 세포는, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 5% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 10% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 15% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 20% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 25% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 30% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 35% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 40% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 45% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 50% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 55% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 60% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 65% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 70% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 75% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 80% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 85% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 90% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 95% 더 높은 증식 속도를 나타낼 수 있다. 실제로, 본 발명의 세포는 동일한 실험 조건에서 적합한 비교 세포의 증식 속도보다 적어도 100% 이상 더 높은 증식 속도를 나타낼 수 있다.
또는, 세포의 증식은, 동일한 조건하에서 존재하는 비교 세포의 수와 비교하여 투여로부터 일정 기간후에 수용체에 존재하는 세포의 수와 관련하여 평가할 수 있다. 해당 시간 후에 수용체에 존재하는 본 발명의 세포의 수는, 본 발명의 세포 및 비교 세포가 둘 다 대략 동일한 양으로 투여되는 경우, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 5% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 10% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 15% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 20% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 25% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 30% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 35% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 40% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 45% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 50% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 55% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 60% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 65% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 70% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 75% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 80% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 85% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 90% 더 높거나, 적합한 비교 세포의 수보다 적어도 95% 더 높을 수 있다.
의학적 용도 및 치료 방법
본 발명의 단백질은, 특히 상기 단백질을 발현하는 본 발명의 두 번째 양태의 세포 형태로, 의학적 용도에 적절하다, 즉, 질환의 예방 및/또는 치료에 약제로 사용하기에 적절하다. 상기 의학적 용도는 본 발명의 다섯 번째, 여섯 번째 및 일곱 번째 양태의 주제이다.
질환의 예방은 대상이 아직 질환이 발생되지는 않았지만 앞으로 질환이 발생할 위험이 있는 것으로 확인된 경우에 필요할 수 있다. 적합하게는 상기 확인은 대상 또는 그 가족의 병력, 대상 또는 그 가족의 유전자 검사 결과, 또는 알고 있는 질환 유발 요인들에 노출 위험과 같은 세부사항을 기반으로 할 수 있다. 암의 경우, 예방은 전암성 질환의 증상 또는 특징을 나타내는 대상의 경우에서 바람직할 수 있다.
질환의 치료는 일단 대상이 이미 질환이 발생된 것으로 확인되면 필요할 수 있다. 확인시에 질환의 발생 단계는 유증상 또는 무증상일 수 있다. 상기 확인은 대상의 임상 평가, 대상이 나타내는 증상, 또는 대상에 의해 제공된 샘플(예를 들어, 악성종양, 감염원 또는 다른 병리학 지표의 존재를 확인할 수 있게 하는 생검물, 혈액 샘플 등)의 분석을 기반으로 할 수 있다.
본 발명의 여덟 번째 양태는 대상에게 본 발명의 단백질을 제공하는 것을 포함하는, 질환의 예방 및/또는 치료를 필요로 하는 대상에서 상기 질환을 예방하고/하거나 치료하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 단백질은 치료 효과량으로 제공된다. 상기 치료 효과량은 본 발명의 단백질의 단일 제공에 의해, 또는 본 발명 단백질의 다수 제공을 통해 점증적으로 달성될 수 있다.
본 발명의 단백질은 적합하게는 대상에게 직접 또는 간접적으로 제공될 수 있다. 직접적인 제공은 특히 단백질을 발현하는 세포의 형태로 상기 단백질을 대상에게 투여하는 것을 의미한다. 간접적 제공은 대상이 본 발명의 단백질을 발현하도록 유도하는 것을 의미한다. 본 발명의 단백질은 본 발명의 첫 번째 양태에 따른 단백질을 암호화하는 본 발명의 세번 째 양태의 핵산을 투여함으로써 대상에게 간접적으로 제공될 수 있음을 인지할 것이다.
단백질을 포함하는 세포는 암, 자가면역 질환 및 바이러스 감염과 같은 감염에 의해 야기된 질환을 포함하는 광범위한 질환들의 예방 또는 치료에 사용될 수 있음을 인지할 것이다. 적합하게는, 상기 질환은 본 발명의 단백질, 세포, 핵산 또는 약학 조성물을 사용하는 치료 방법을 의학적으로 이용하여 예방되고/되거나 치료될 수 있다.
암의 예방 및/또는 치료
특히, 본 발명의 단백질, 세포, 핵산 또는 약학 조성물은 암의 예방 및/또는 치료에 사용할 수 있다. 아르기닌-고갈 종양 미세환경에서 기능하고 지속되고 증식하는 본 발명 세포의 능력이 특히 유리한 것이 상기 용도에서이다.
본 발명의 단백질, 세포, 핵산 또는 약학 조성물을 사용하는 치료 방법을 의학적으로 이용하여 예방되고/되거나 치료될 수 있는 암의 적합한 예로는 신경아세포종; 중피종; 난소암; 유방암; 결장암; 수모세포종; 췌장암; 전립선암; 고환암; 급성 골수성 백혈병; 교모세포종; 골육종; 및 흑색종으로 이루어진 군에서 선택된 암들이 포함된다.
약학 조성물 및 제형
본 발명은 또한 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 포함하는 조성물을 제공한다. 특히, 본 발명은 해당 용량 또는 그의 분획으로 투여하기 위한 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 포함하는 단위 용량 형태 조성물과 같은 약학 조성물 및 제형을 제공한다. 상기 약학 조성물 및 제형은 일반적으로 하나 이상의 선택적인 약학적으로 허용되는 담체 또는 부형제를 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 조성물은 적어도 하나의 추가 치료제를 포함한다.
용어 "약학적 제형"은 그 안에 함유된 활성 성분의 생물 활성이 효과적이 되게 하는 형태이면서 제형이 투여되는 대상에게 허용되지 않게 독성인 추가의 성분을 함유하지 않는 제제를 말한다.
"약학적으로 허용되는 담체"는 대상에게 무독성인, 활성 성분이외의 다른, 약학 제형내 성분을 말한다. 약학적으로 허용되는 담체로는 완충제, 부형제, 안정화제 또는 보존제가 포함되나, 이로 한정되지는 않는다.
일부 실시양태에서, 담체의 선택은 부분적으로 본 발명의 특정 단백질, 세포 또는 핵산에 의해서 및/또는 투여 방법에 의해서 결정된다. 따라서, 다양한 적합한 제형들이 존재한다. 예를 들어, 약학 조성물은 보존제를 함유할 수 있다. 적합한 보존제는, 예를 들어, 메틸파라벤, 프로필파라벤, 나트륨 벤조에이트 및 벤즈알코늄 클로라이드를 포함할 수 있다. 일부 양태에서, 2개 이상의 보존제들의 혼합물을 사용한다. 보존제 또는 그의 혼합물은 전형적으로 전체 조성물의 약 0.0001 내지 약 2 중량%의 양으로 존재한다. 담체는, 예를 들어, 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A.Ed. (1980)]에 기술되어 있다. 약학적으로 허용되는 담체는 일반적으로 사용되는 투여량 및 농도에서 수용체에게 무독성이고, 다음을 포함하나 이로 한정되지는 않는다: 완충제, 예를 들어, 포스페이트, 시트레이트 및 다른 유기산; 아스콜브산 및 메티오닌을 포함한 산화방지제; 보존제(예를 들어, 옥타데실다이메틸벤질 암모늄 클로라이드; 헥사메토늄 클로라이드; 벤즈알코늄 클로라이드; 벤즈에토늄 클로라이드; 페놀, 부틸 또는 벤질 알콜; 알킬 파라벤, 예를 들어, 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜; 레조르시놀; 사이클로헥사놀; 3-펜타놀; 및 m-크레솔); 저분자량(약 10개 잔기 미만) 폴리펩티드; 단백질, 예를 들어, 혈청 알부민, 젤라틴 또는 면역글로불린; 친수성 중합체, 예를 들어, 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예를 들어, 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 히스티딘, 아르기닌 또는 라이신; 모노사카라이드, 다이사카라이드, 및 글루코스, 만노스 또는 덱스트린을 포함한 다른 탄수화물; 킬레이트화제, 예를 들어, EDTA; 당, 예를 들어, 슈크로스, 만니톨, 트레할로스 또는 솔비톨; 염-생성 상대-이온, 예를 들어, 나트륨; 금속 착체(예, Zn-단백질 착체); 및/또는 비-이온성 계면활성제, 예를 들어, 폴리에틸렌 글리콜(PEG).
완충제는 본 발명 조성물의 일부 실시양태에 포함된다. 적합한 완충제로는, 예를 들어, 시트르산, 나트륨 시트레이트, 인산, 인산칼륨 및 다양한 다른 산 및 염들이 포함된다. 일부 양태에서, 2개 이상의 완충제의 혼합물이 사용된다. 완충제 또는 그의 혼합물은 전형적으로 전체 조성물의 약 0.001 내지 약 4 중량%의 양으로 존재한다. 투여가능한 약학 조성물을 제조하는 방법은 공지되어 있다. 예시적인 방법은, 예를 들어, 문헌[Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott Williams & Wilkins; 21st ed.(May 1, 2005)]에 보다 상세히 기술되어 있다.
제형은 수용액을 포함할 수 있다. 제형 또는 조성물은 또한 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산으로 치료되는 특정한 적응증, 질환 또는 병태에 유용한 하나보다 많은 활성 성분, 바람직하게는 각각의 활성이 서로 불리하게 영향을 미치지 않는 경우에 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산에 상보적인 활성을 갖는 활성 성분을 함유할 수 있다. 상기 활성 성분들은 적합하게는 의도한 목적에 효과적인 양으로 함께 존재한다. 따라서, 일부 실시양태에서, 약학 조성물은 다른 약학적으로 활성인 약제 또는 약물, 예를 들어, 화학치료제, 예를 들어, 아스파라기나제, 부설판, 카보플라틴, 시스플라틴, 다우노루비신, 독소루비신, 플루오로우라실, 겜시타빈, 하이드록시우레아, 메토트렉세이트, 파클리탁셀, 리툭시맙, 빈블라스틴, 및/또는 빈크리스틴을 추가로 포함한다.
일부 실시양태에서 약학 조성물은 본 발명의 CAR, 세포 또는 핵산을 질환 또는 병태를 치료하거나 예방하기에 효과적인 양으로, 예를 들어, 치료 효과량 또는 예방 효과량으로 함유한다. 일부 실시양태에서 치료 또는 예방 효능은 치료되는 대상의 주기적 평가에 의해 모니터링된다. 목적하는 투여량은 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 단일 볼루스 투여에 의해, 상기 단백질, 세포 또는 핵산의 다중 볼루스 투여에 의해, 또는 상기 단백질, 세포 또는 핵산의 연속 주입 투여에 의해 전달될 수 있다.
상기 조성물은 표준 투여 기법, 제형 및/또는 장치를 사용하여 투여될 수 있다. 세포의 투여는 자기유래성 또는 이종유래성일 수 있다. 예를 들어, 면역응답 세포 또는 전구세포는 하나의 대상으로부터 수득되고, 동일한 대상 또는 상이한 양립가능한 대상에게 투여될 수 있다. 면역응답 세포 또는 그 자손세포로부터 수득된(예를 들어, 생체내, 생체외 또는 시험관내에서 수득된) 말초혈은 카테터 투여, 전신 주입, 국소 주사, 정맥내 주사 또는 비경구 투여를 포함한 국소 주입을 통해 투여될 수 있다. 치료 조성물(예를 들어, 유전자 변형된 면역응답 세포를 함유하는 약학 조성물)을 투여할 때, 상기 조성물은 일반적으로 단위 투여량의 주사가능한 형태(용액, 현탁액, 유화액)로 제형화될 것이다.
제형은 경구, 정맥내, 복강내, 피하, 폐, 경피, 근육내, 비강내, 구강, 설하 또는 좌약 투여용 제형을 포함한다. 일부 실시양태에서, 세포 집단은 비경구 투여된다. 본원에서 사용되는 바와 같이, 용어 "비경구"는 정맥내, 근육내, 피하, 직장, 질 및 복강내 투여를 포함한다. 일부 실시양태에서, 세포는 정맥내, 복강내 또는 피하 주사에 의해 말초 전신 전달을 이용하여 대상에게 투여된다.
일부 실시양태에서 조성물은 멸균 액체 제제, 예를 들어, 일부 양태에서 선택된 pH로 완충될 수 있는, 등장성 수용액, 현탁액, 유화액, 분산액 또는 점성 조성물로 제공된다. 액체 제제는 통상적으로 겔, 다른 점성 조성물 및 고체 조성물보다 제조하기에 더 용이하다. 또한, 액체 조성물은 특히 주사에 의해 투여하기에 다소 더 편리하다. 다른 한편으로, 점성 조성물은 특정 조적에 더 긴 접촉 기간을 제공하도록 적절한 점도 범위내에서 제형화될 수 있다. 액체 또는 점성 조성물은 담체를 포함할 수 있으며, 상기 담체는, 예를 들어, 물, 식염수, 포스페이트 완충된 식염수, 폴리올(예를 들어, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 액체 폴리에틸렌 글리콜) 및 그의 적합한 혼합물을 함유하는 용매 또는 분산 매질일 수 있다.
멸균 주사 용액은 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 용매에, 예를 들어, 적합한 담체, 희석제 또는 부형제, 예를 들어, 멸균수, 생리 식염수, 글루코스, 덱스트로스 등과의 혼합물중에 혼입시켜 제조할 수 있다. 조성물은, 투여 경로 및 목적하는 제제에 따라서, 보조 물질, 예를 들어, 습윤제, 분산제 또는 유화제(예, 메틸셀룰로스), pH 완충제, 겔화 또는 점도 향상 첨가제, 보존제, 향미제 및/또는 색소를 함유할 수 있다. 일부 양태에서 적합한 제제를 제조하기 위해 표준 교과서를 찾아볼 수 있다.
항미생물 보존제, 산화방지제, 킬레이트화제 및 완충제를 포함하여 조성물의 안정성 및 멸균성을 증대시키는 다양한 첨가제가 첨가될 수 있다. 미생물 작용의 방지는 다양한 항균제 및 항진균제, 예를 들어, 파라벤, 클로로부탄올, 페놀 및 솔브산에 의해 보장될 수 있다. 주사가능한 약학적 형태의 연장된 흡수는 흡수를 지연시키는 약제, 예를 들어, 알루미늄 모노스테아레이트 및 젤라틴을 사용하여 이루어질 수 있다.
생체내 투여에 사용될 제형은 일반적으로 멸균성이다. 멸균성은, 예를 들어, 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 용이하게 달성될 수 있다.
용량 및 투여 요법
용량의 크기 또는 양
본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산은 1차 용량, 및 선택적으로 후속 용량들로 제공될 수 있다. 일부 실시양태에서, 상기 1차 또는 후속 용량은 다수의 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을, 대상의 체중 킬로그램 당 상기 세포 약 105 내지 약 106의 범위로, 및/또는 대상의 체중 킬로그램 당 상기 세포 약 105 또는 약 106 이하인 상기 세포의 수로 함유한다. 예를 들어, 일부 실시양태에서, 상기 1차 또는 후속 용량은 대상의 체중 킬로그램당 약 1 x 105, 약 2 x 105, 약 5 x 105, 또는 약 1 x 106 미만 또는 이하의 상기 세포를 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 1차 용량은 대상의 체중 킬로그램당 약 1 x 105, 약 2 x 105, 약 5 x 105, 또는 약 1 x 106, 또는 상기 값들 중 임의의 두 값 사이 범위내의 값의 상기 세포를 포함한다.
일부 실시양태에서, 예를 들어, 대상이 인간인 경우, 상기 1차 또는 후속 용량은 약 1 x 10 미만의 본 발명의 총 단백질, 세포 또는 핵산, 예를 들어, 약 1 x 106 내지 1 x 108 범위의 상기 세포, 예를 들어, 2 x 106, 5 x 106, 1 x 107, 5 x 107, 또는 1 x 108 또는 전체 상기 세포, 또는 상기 값들 중 임의의 두 값 사이 범위의 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 포함한다.
일부 실시양태에서, 상기 1차 또는 후속 용량은 대상의 m2 당 약 1 x 108 미만의 본 발명의 총 단백질, 세포 또는 핵산, 예를 들어, 대상의 m2 당 상기 세포 약 1 x 106 내지 1 x 108 범위, 예를 들어, 대상의 m2 당 상기 세포 2 x 106, 5 x 106, 1 x 107, 5 x 107, 또는 1 x 108, 또는 상기 값들 중 임의의 두 값 사이 범위의 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 포함한다.
특정 실시양태에서, 상기 1차 또는 후속 용량내 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수는 대상의 체중 킬로그램당 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산 약 1 x 106보다 크다, 예를 들어, 체중 킬로그램당 상기 세포 2 x 106, 3 x 106, 5 x 106, 1 x 107, 5 x 107, 1 x 108, 1 x 109, 또는 1 x 1010, 및/또는 대상의 m2 당 상기 세포 1 x 108, 또는 1 x 109, 1 x 1010, 또는 전체, 또는 상기 값들 중 임의의 두 값 사이의 범위이다.
일부 실시양태에서, 후속 용량으로 투여되는 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수는 본원의 임의의 실시양태에서 1차 용량으로 투여된 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수와 동일하거나 유사하다, 예를 들어, 대상의 체중 킬로그램당 상기 세포 약 1 x 105, 약 2 x 105, 약 5 x 105, 또는 약 1 x 106 미만 또는 이하이다. 일부 실시양태에서, 상기 후속 용량(들)은 대상의 체중 킬로그램 당 상기 세포 약 1 x 105, 약 2 x 105, 약 5 x 105, 또는 약 1 x 106, 또는 상기 값들 중 임의의 두값 사이 범위내의 값을 함유한다. 일부 실시양태에서, 상기 값들은 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수를 말한다. 일부 양태에서, 후속 용량은 1차 용량보다 크다. 예를 들어, 일부 실시양태에서, 후속 용량은 대상의 체중 킬로그램당 약 1 x 106보다 많은 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산, 예를 들어, 대상의 체중 킬로그램 당 약 3 x 106, 5 x 106, 1 x 107, 1 x 108, 또는 1 x 109의 상기 세포를 함유한다. 일부 실시양태에서, 상기 후속 용량의 양 또는 크기는 질환 존재량 또는 그의 징후, 및/또는 상기 질환 또는 병태의 하나 이상의 증상을 경감시키기에 충분하다. 일부 실시양태에서, 2차(또는 다른 후속) 용량은 대상의 생존을 개선시키기에, 예를 들어, 적어도 6 개월, 또는 적어도 1, 2, 3, 4 또는 5 년동안 대상의 생존, 비재발 생존 또는 무사건 생존을 유도하기에 효과적인 크기이다. 일부 실시양태에서, 후속 용량에서 대상의 체중 당 투여되는 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수 및/또는 투여되는 상기 세포의 수는 1차 용량에서 투여되는 수보다 적어도 2배, 5배, 10배, 50배 또는 100배 이상 더 크다. 일부 실시양태에서, 질환 존재량, 종양 크기, 종양 부피, 종양 질량 및/또는 종양 부하량 또는 벌크는 1차 용량 또는 2차(또는 다른 후속)용량의 투여 직전에 비해 후속 용량후에 적어도 약 50, 60, 70, 80, 90% 이상 감소된다.
다른 실시양태에서, 후속 용량에서 투여되는 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수는 1차 용량에서 투여되는 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수보다 낮다.
일부 실시양태에서, 추가의 용량 또는 용량들이 2차(또는 다른 후속) 용량의 투여후에 투여되도록, 다중 후속 용량들이 1차 용량후에 투여된다. 일부 양태에서, 상기 추가의 후속 용량 또는 용량들(즉, 3차, 4차, 5차 등)에서 대상에게 투여되는 세포의 수는 1차 용량, 2차 용량 및/또는 다른 후속 용량과 동일하거나 유사하다. 일부 실시양태에서, 추가의 용량 또는 용량들은 선행 용량들보다 크다.
일부 양태에서, 1차 및/또는 후속 용량의 크기는, 화학치료와 같은 선행 치료에 대한 대상의 반응, 대상에서의 질환 존재량, 예를 들어, 종양 부하량, 벌크, 크기 또는 정도, 전이의 정도 또는 유형, 단계, 및/또는 독성 결과, 예를 들어, CRS, 대식세포 활성화 증후군, 종양 용해 증후군, 신경독성, 및/또는 투여되는 세포 및/또는 재조합 수용체에 대한 숙주 면역 반응을 발생시키는 대상의 가능성 또는 발병과 같은 하나 이상의 기준에 기반하여 결정된다.
일부 양태에서, 1차 및/또는 후속 용량의 크기는 대상에서 질환 또는 병태의 존재량에 의해 결정된다. 예를 들어, 일부 양태에서, 1차 용량에서 투여되는 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수는 1차 용량 투여 직전에 대상에 존재하는 종양 존재량을 기반으로 결정된다. 일부 실시양태에서, 1차 및/또는 후속 용량의 크기는 질환 존재량과 반비례하여 상관된다. 일부 양태에서, 큰 질환 존재량의 맥락에서와 같이, 대상은 낮은 수의 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 투여받는다, 예를 들어, 대상 체중 킬로그램 당 약 1 x 106 미만의 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 투여받는다. 다른 실시양태에서, 더 낮은 질환 존재량의 맥락에서와 같이, 대상은 큰 수의 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 투여받는다, 예를 들어, 대상 체중 킬로그램 당 약 1 x 106보다 많은 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 투여받는다.
일부 양태에서, 후속 용량에서 투여되는 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수는 1차 용량 투여 후에 대상에 존재하는 종양 존재량을 기반으로 결정된다. 일부 실시양태에서, 예를 들어, 1차 용량이 질병 존재량을 감소시켰거나 특정 임계량 또는 임계 수준, 예를 들어, 독성 결과에 대한 위험이 증가된 수준 이하에서 그러한 경우, 후속 용량은, 예를 들어, 체중 킬로그램 당 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산 1 x 106보다 크고/크거나, 1차 용량보다 크다. 다른 양태에서, 1차 용량이 종양 존재량을 조금만 감소시켰거나 1차 용량이 종양 존재량에 검출가능한 감소를 야기하지 못한 경우, 후속 용량에서 투여된 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수는, 예를 들어, 약 1 x 106보다 낮다, 예를 들어, 1차 용량과 동일하거나 그보다 낮다.
일부 실시양태에서, 1차 용량에서 투여되는 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수는, 예를 들어, 면역 반응이 발생하기 전에 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 투여하기 위해서와 같이 대형 단일 용량의 세포가 투여되는 방법과 같은 다른 방법들에서 투여되는 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 수보다 낮다. 따라서, 일부 실시양태에서, 상기 방법은 더 큰 용량의 투여를 포함하는 다른 방법들에 비해 독성 또는 독성 결과를 감소시킨다.
일부 실시양태에서, 1차 용량은 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산을 독성 또는 독성 결과, 예를 들어, 사이토카인 방출 증후군(CRS), 중증 CRS(sCRS), 대식세포 활성화 증후군, 종양 용해 증후군, 3일 이상동안 약 38 ℃ 이상의 열 및 약 20 mg/dL 이상의 CRP의 혈장 수준, 및/또는 신경독성의 가능성을 야기하지 않거나 감소시키는 양으로 포함한다. 일부 양태에서, 1차 용량에서 투여되는 세포의 수는, 대상이 세포 투여후 독성 또는 독성 결과, 예를 들어, CRS, sCRS, 및/또는 CRS-관련 결과를 나타낼 가능성을 기반으로 결정된다. 예를 들어, 일부 실시양태에서, 대상에서 독성 결과의 발생 가능성은 종양 존재량을 기반으로 예측된다. 일부 실시양태에서, 상기 방법은 용량 투여전에 독성 결과 및/또는 질환 존재량을 검출하거나 평가하는 것을 포함한다.
일부 실시양태에서, 2차(또는 다른 후속) 용량은, 1차 투여후에 사이토카인-방출 증후군(CRS), 대식세포 활성화 증후군, 또는 종양 용해 증후군, 또는 신경독성을 발생시킬 임상 위험이 존재하지 않거나 지나갔거나 진정된 시점에, 예를 들어, 상기 사건들이 일반적으로 진정되었고/되었거나, 예를 들어, 특정 질환 또는 병태를 갖는 대상의 60, 70, 80, 90 또는 95%에서 일어날 가능성이 적은 임계 시간대 후에 투여된다.
용량 타이밍
일부 양태에서, 2차 또는 후속 용량의 타이밍은 1차 용량의 개시로부터 후속 용량의 개시까지로 측정된다. 다른 실시양태에서, 후속 용량의 타이밍은 1차 용량의 종료로부터, 또는, 예를 들어, 용량이 하루보다 많은 날 동안, 예를 들어, 2일 또는 3일 동안 투여되는 경우 본원에 기술된 분할 투약의 맥락에서, 1차 용량 투여일의 중간날로부터 측정된다.
일부 실시양태에서, 1차 용량과 다른 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 후속 용량이 투여되는지 여부는, 대상에서 1차 용량의 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산에 대한 면역 반응 또는 검출가능한 면역반응의 존재 또는 정도를 기반으로 결정된다. 일부 양태에서, 1차 용량의 세포와 상이한 수용체를 발현하는 세포를 함유하는 후속 용량이, 검출가능한 숙주 적응 면역 반응, 또는 확정되었거나 특정 수준, 단계 또는 정도에 도달한 면역 반응을 갖는 대상에게 투여될 것이다.
일부 실시양태에서, 상기 2차(또는 다른 후속) 용량은 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 2차 투여가 숙주 면역계에 의해 제거될 가능성이 있거나 제거될 것으로 예측되는 시점에 투여된다. 면역 반응을 발생시킬 가능성은 본원에 기술된 바와 같이 1차 용량의 투여후에 대상에서 수용체-특이적 면역 반응을 측정함으로써 결정된다.
예를 들어, 일부 실시양태에서, 대상은 1차(또는 다른 선행) 용량 후에 및 2차(또는 다른 후속) 용량 전에, 1차 용량후에 대상에서 면역 반응이 검출가능한지를 측정하기 위해 검사할 수 있다. 일부 상기와 같은 실시양태에서, 1차 용량에 대한 면역 반응의 검출은 2차 용량을 투여할 필요를 유발할 수 있다.
일부 양태에서, 대상으로부터의 샘플은, 1차 또는 선행 용량후에 대상에서, 본원에 기술된 바와 같이, 목적하는 노출의 감소가 있는지 또는 그보다 낮은지, 예를 들어, 세포의 특정 수 또는 농도보다 적은지를 측정하기 위해 검사할 수 있다. 일부 상기와 같은 실시양태에서, 세포에 대한 대상의 노출의 감소를 검출하는 것은 2차 용량을 투여할 필요를 유발할 수 있다.
일부 실시양태에서, 후속 용량은, 대상의 질환 또는 병태가 1차 또는 선행 용량에 반응하여 질환 존재량의 감소후 재발되지 않은 시점에서 투여된다. 일부 실시양태에서, 질환 존재량 감소는 하나 이상의 요인들, 예를 들어, 대상 또는 그의 체액 또는 장기 또는 조직에서 질환 세포의 부하량 또는 수, 종양의 질량 또는 부피, 또는 전이의 정도 또는 크기의 감소에 의해 나타난다. 상기 요인은 초기 치료 또는 투여에 반응하여 상기 요인의 감소후에 상기 요인이 이어서 증가하는 경우 재발된 것으로 간주된다.
일부 실시양태에서, 2차 용량은 질환이 재발된 시점에서 투여된다. 일부 실시양태에서, 상기 재발은 하나 또는 하나 이상의 요인들, 또는 일반적으로 질환 존재량에서의 재발이다. 일부 양태에서, 후속 용량은, 대상, 질환 존재량, 또는 그의 요인이 1차 또는 선행 투여후 측정되거나 도달한 최저점에 비해 재발되었지만 1차 용량 직전의 때에 비해 여전히 더 낮은 시점에 투여된다. 일부 실시양태에서, 대상은 질환 존재량 또는 그를 나타내는 요인이 변화되지 않은 시점에서, 예를 들어, 질환 존재량의 증가가 방지된 때에 후속 용량을 투여받는다.
일부 실시양태에서, 후속 용량은 숙주 적응 면역 반응이 검출되거나, 확정되었거나, 특정 수준, 정도 또는 단계에 도달했을 때 투여된다. 일부 양태에서, 후속 용량은 대상에서 기억 면역 반응의 발생후에 투여된다.
일부 양태에서, 1차 용량 투여와 후속 용량 투여 사이의 시간은 약 28 내지 약 35일, 약 29 내지 약 35일, 또는 약 35일보다 많다. 일부 실시양태에서, 2차 용량의 투여는 1차 용량 투여후 약 28일보다 많은 시점에서 이루어진다. 일부 양태에서, 1차와 후속 용량 사이의 시간은 약 28일이다.
일부 실시양태에서, 추가 용량 또는 용량들, 예를 들어, 후속 용량들은 2차 용량의 투여후에 투여된다. 일부 양태에서, 추가 용량 또는 용량들은 선행 용량 투여후 적어도 약 28일후에 투여된다. 일부 실시양태에서, 선행 용량후 약 28일 이전에는 용량이 투여되지 않는다.
일부 실시양태에서, 예를 들어, 하나 이상의 연속 용량이 대상에게 투여되는 경우, 상기 연속 용량들은 약 7, 약 14, 약 15, 약 21, 약 27 또는 약 28일 만큼 떨어질 수 있다. 일부 양태에서, 연속 용량은 선행 용량 21일 후에 투여된다. 일부 실시양태에서, 연속 용량은 선행 용량 투여후 14 내지 28일 사이에 투여된다.
임의의 실시양태에서, 상기 방법은 일부 경우에서 1차 또는 선행 용량 및 후속 용량(들)의 투여를 포함하고, 다른 경우에서 1차 또는 선행 용량을 이미 받은 대상에게 후속 용량(들)의 투여를 포함하지만 1차 또는 선행 용량 자체의 투여는 포함하지 않는다. 따라서, 상기 방법은 일부 경우에서 본 발명의 단백질, 세포 또는 핵산의 용량을 이미 받은 대상에게 통합 후속 용량을 투여하는 것과 같은 통합 치료의 투여를 포함한다.
일부 실시양태에서, 질환 존재량, 종양 크기, 종양 부피, 종양 질량 및/또는 종양 부하량 또는 벌크는 후속 용량 후에 1차 또는 선행 용량 또는 2차 또는 후속 용량의 투여 직전에 비해 적어도 약 50, 60, 70, 80, 90% 이상 감소된다.
본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 생산
숙련가라면 본 발명의 핵산과 같은 핵산이 단백질을 발현하는 형질도입 세포의 생산에 사용될 수 있는 적합한 방법을 인지할 것이다. 상기 방법은 본 발명의 단백질을 발현하는 본 발명의 세포의 생산에 사용될 수 있다.
단지 예로서, 본 발명의 세포 생산에 사용될 수 있는 적합한 프로토콜은 하기 실시예에서 더 기술한다.
본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 생산을 위한 방법의 다른 예도 당해 분야의 숙련가에게 익숙할 것이다. 제한하지 않고, 상기 방법들에는 본 발명의 핵산이 바이러스 또는 나노입자와 같은 수단에 의해 세포에 도입되는 방법이 포함된다.
실시예
본 발명의 단백질을 하기에서 더 논의하는 바와 같이, 예시적인 CAR을 참조하여 조사하였다.
1. CAR-함유 바이러스
역가의
최적화.
본 발명자들은 레트로바이러스 입자의 농도가, 도 1a에 나타낸 바와 같이, AMPHO Phoenix 세포의 상등액에서 72 시간동안 증가함을 밝혔다.
CAR-T 세포 형질도입 효율은 tCD34의 유세포분석 검출에 의해 평가하였다. 도 1b에 나타낸 바와 같이, 24 시간 또는 72 시간에 수집된 AMPHO 세포주 상등액을 사용하여 PBMC의 형질도입 효율에 차이는 보이지 않았다.
2. 아르기닌 경로 효소는 형질도입된
Jurkat
세포에서 활성을 나타낸다.
본 발명자들은 인간 T 림프구 세포(Jurkat 세포)의 불멸화 세포주에서 아르기닌 경로 효소의 역할을 조사하였다. 본 연구의 결과는 도 2에 나타내었다.
Jurkat 세포를 아르기닌 경로 효소 또는 대조군 CAR-T 구조물을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 구조물로 형질도입시켰다. 실험 목적을 위해, 본 발명의 세포 및 대조군 세포를 둘 다 GD2-결합 잔기를 포함하는 단백질을 발현하도록 형질도입시켰다. 생성된 단백질-효소 구조물의 순도는 유세포분석을 이용하여 tCD34의 발현을 측정함으로써 평가하였다. 결과는 상기 단백질-효소 구조물들이, 도 2a에 나타낸 바와 같이, Jurkat 세포에서 고도의 순도로 생성될 수 있음을 보여준다.
도 2b에 나타낸 바와 같이, 형질도입 세포(Jurkat가 1차 PBMC에 비해 더 높은 배경 ASS-1 발현을 가짐 주목)에서 ASS-1 및 OTC의 발현의 증가가 있었다.
본 발명자들은 형질도입 세포에서 아르기닌의 합성을 촉진하는 도메인의 그 기능을 수행하는 능력을 조사하였다.
ASS-1에 의한 시트룰린의 아르기노숙시네이트로의 이화작용을 평가하고, 대조군 구조물(ASS-1 도메인 비함유, GD2-CAR), OTC 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질(GD2-OTC), 및 ASS-1 및 OTC 도메인을 둘 다 함유하는 융합 표적-결합 단백질(GD2-ASS-OTC)과 비교하였다. GD2-ASS-형질도입 Jurkat 세포의 용해물을 시트룰린을 아르기니노숙시네이트로 직접 이화시키는 ASS-1 효소의 활성에 대해 비색 분석으로 검사하였다. 아르기닌의 합성을 촉진하는 ASS-1 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질은, 도 2c에 나타낸 바와 같이, GD2-ASS-1 융합 표적-결합 단백질이 대조군 융합 표적-결합 단백질 구조물을 함유하는 세포보다 훨씬 더 높은 ASS-1 활성을 가짐을 보여주었다.
OTC에 의한 오르니틴의 시트룰린으로의 이화작용을 평가하고, OTC 도메인을 함유하지 않는 대조군 구조물(GD2 단독), ASS-1 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질(GD2-ASS), 및 ASS-1 및 OTC 도메인을 둘 다 함유하는 융합 표적-결합 단백질(GD2-ASS-OTC)과 비교하였다. GD2-OTC-형질도입 Jurkat 세포의 용해물을 오르니틴을 시트룰린으로 직접 이화시키는 OTC 효소의 활성에 대해 비색 분석으로 검사하였다. OTC 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질(GD2-OTC), 및 ASS-1 및 OTC 도메인을 함유하는 융합 표적-결합 단백질(GD2-ASS-OTC) 구조물들은, 도 2d에 나타낸 바와 같이, 대조군 CAR 구조물을 함유하는 세포보다 훨씬 더 높은 OTC 활성을 가졌다.
본 발명자들은 종양 미세환경에서 아르기닌의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 구조물로 형질도입된 융합 표적-결합 단백질 T 세포의 지속성을 조사하였다.
NOG-SCID 마우스에게 5x106 융합 표적-결합 단백질 T 세포를 이식하였다. 재조합-PEG-아르기나제를 매주 2회 투여하여 재현가능한 저-아르기닌 미세환경을 야기하였다(아르기닌 ELISA로 학인). 마우스를 희생시키고 혈중 융합 표적-결합 단백질 T 세포의 백분율을 유세포분석으로 측정하였다. ASS-1 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2-ASS)는, 도2e에 나타낸 바와 같이, ASS-1도메인을 함유하지 않는 융합 표적-결합 단백질(GD2-CAR T 세포)에 비해 상당히 증대된 지속성을 나타내었다.
OTC 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2-OTC)는, 도 2f에 나타낸 바와 같이, OTC 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 함유하지 않는 T 세포(GD2-CAR T 세포)에 비해 상당히 증대된 지속성을 나타내었다.
3. 아르기닌 경로 효소는 인간 공여체로부터의
PBMC에
형질도입될 수 있다.
본 발명자들은 인간 공여체 세포로부터의 PBMC에서 아르기닌 경로 효소의 역할을 조사하였다. 본 연구의 결과는 도 3에 나타내었다.
PBMC를 아르기닌 경로 효소를 포함하는 융합 표적-결합 단백질 구조물로 형질도입시켰다. 생성된 CAR-효소 구조물의 순도를 유세포분석을 이용하여 tCD34의 발현을 측정함으로써 평가하였다. 결과는, 도 3a에 나타낸 바와 같이, 융합 표적-결합 단백질-효소 구조물이 PBMC에서 고도의 순도로 생성될 수 있음을 보여준다.
도 3b에 나타낸 바와 같이, 형질도입 세포에서 ASS-1 및 OTC의 발현의 증가가 있었다.
본 발명자들은 아르기닌의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 구조물을 또한 함유하는 CAR-T 세포에서 동시-억제 수용체 LAG-3, TIM-3 및 PD-1의 발현에 차이가 없었음을 밝혀내었다.
아르기닌의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 구조물로 형질도입된 PBMC의 지속성을 tCD34의 유세포분석으로 검출시 7일 증식동안 측정하였다. GD2-ASS-1 구조물은 GD2 단독 구조물과 유사한 지속성을 나타내었다. 도 3d에 나타낸 바와 같이, 시간경과에 따라 GD2-OTC 및 GD2-ASS-OTC 구조물은 유지되지 않았다. 상기 실험들은 항원이 존재하지 않는 정상 아르기닌 조건에서 수행하였다. 본 발명자들은 저-아르기닌 조건에서 및 항원의 존재하에서 생존 이점을 볼 수 있는 것으로 가정하였다. 생체내에서 일어나는 세포의 임의의 손실은 세포가 신체에서 생존하는 시간을 반영하는 투여 간격하에 본 발명의 세포를 환자에게 반복 투여함으로써 극복할 수 있다.
4. ASS-1 및 OTC는 저-아르기닌 종양 조건에서 상당한 대사 및 증식 이점을 제공한다.
정상 아르기닌(RPMI+10% FCS), LAN-1 신경아세포종 조정된 상등액, 및 75% 아르기닌 고갈 배지 조건에서 배양시 시트룰린 대사를 증대시키는, 아르기닌의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질 T 세포(GD2-ASS 및 GD2-OTC)의 능력을 배양 상등액의 ELISA에 의해 검출하였다. 종양-유래 저-아르기닌 조건하에서 GD2-ASS-1 융합 표적-결합 단백질 및 GD2-OTC 융합 표적-결합 단백질은, 도 4a에 나타낸 바와 같이, 대조군(아르기닌의 합성을 촉진하는 도메인 비함유, GD2 단독)에 비해 효소 발현 및 활성화와 일치하게 시트룰린 대사를 상당히 상향조절시켰다.
신경아세포종 세포주 및 골수성 백혈병 세포주 상에서 ASS-1 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질("GD2-ASS-BB") 및 OTC 도메인("GD2-OTC-BB") 융합 표적-결합 단백질 T 세포의 특이적 세포 용해를 대조군(GD2 단독: "GD2-BB")에 대해 평가하였다. 융합 표적-결합 단백질 T 세포를 상이한 효과기 대 표적 비에서 크로뮴 표지된 GD2+ LAN-1 신경아세포종 세포의 존재하에 4 시간동안 배양하였다. 모든 CAR-T 세포 구조물은 본 발명자들의 이전 데이터와 일치하게 신경아세포종 세포를 효과적으로(35 내지 45%) 사멸시킨다. ASS-1 및 OTC 첨가시 세포독성에 대한 손실은 보이지 않는다. 도 4b에 나타낸 바와 같이, 상기 세포파괴 활성의 특이성은, GD2-CAR T 세포(대조군이든 본 발명의 세포이든)가 골수성 백혈병 세포주(GD2-K562)의 최소 사멸을 나타내었다는 사실(<5% 특이적 용해)에 의해 입증되었다.
아르기닌의 합성을 촉진하는 도메인(ASS-1 또는 OTC)을 포함하는 CAR T 세포는 저-아르기닌 조건에서 증식의 상당한 증가를 나타내었다. CAR-T 세포는 정상 아르기닌(RPMI+10% FCS) 신경아세포종-유래 저-아르기닌 상등액, 또는 75% 아르기닌 고갈 배지에서 배양하였다. 96 시간후에 삼중수소화-티미딘 혼입에 의해 T 세포 증식을 측정하였다. CAR-T 세포는 본 발명자들의 이전 결과와 일치하게 저-아르기닌 조건에서 T 세포 증식의 감소를 나타내었다. ASS-1 도메인(GD2-ASS) 및 OTC 도메인(GD2-OTC)을 포함하는 구조물로 형질감염된 세포는, 도 4c에 나타낸 바와 같이, 대조군(GD2-CAR)에 비해 상기 조건들에서 증식의 상당한 증가를 나타내었다.
5. 변형된 CAR-T 세포는
생체내에서
항-종양 활성을 증대시켰으며 비-GD2 CAR-T 세포에 적용될 수 있다.
NOG-SCID 마우스에 GD2+ 종양 세포를 이식하였다. ASS-1 도메인을 포함하sm는 CAR-T 세포(GD2-ASS) 및 포함하지 않는 CAR-T 세포(GD2-CAR)를 꼬리 정맥 주사에 의해 투여하였다. 상대적 종양 성장을 시간 경과에 따라 측정하였다. GD2-ASS-1 CAR T 세포의 투여는, 도 5a에 나타낸 바와 같이, GD2-CAR T 세포에 비해 종양 성장의 감소를 유도하였다.
GS2-ASS-1 CAR T 세포의 투여는 또한, 도 5b에 나타낸 바와 같이, 개선된 뮤린 생존율을 유도하였다. 상기 도면에 나타낸 결과는 본 발명 세포의 세포파괴(및 따라서 치료) 활성뿐 아니라, 생체내에서 그의 개선된 지속성을 예시하는데, 그 이유는 상기 치료 활성이 대조군 세포보다 더 긴 기간에 걸쳐 관찰되기 때문이다.
CD33 및 CD33-ASS-1 CAR T 세포의 생존율을 평가하였다. CD33-ASS-1 CAR을 AML 세포주 조건 배지(저-아르기닌) 또는 50 내지 75% 아르기닌 고갈 배지에서 배양하였다. CD33-ASS-1 CAR은 CD33 CAR에 비해 저-아르기닌 조건에서 상당히 증대된 생존율을 나타내었다. 이를 예시하는 결과는 도 5c에 나타내었다.
6.
생체내
아르기닌-고갈 조건에서 본 발명 세포의
증가된
지속성
.
정맥내 투여된 5x106 항-GD2 CAR-T Jurkat 세포(대조군 세포), 또는 GD2 표적 잔기 및 ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 Jurkat 세포(GD2-ASS), 또는 GD2 표적 잔기 및 OTC 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포(GD2-OTC)가 이식된 NOG-SCID 마우스에서 본 발명 세포의 개선된 지속성을 입증하였다. 재현가능한 저-아르기닌 미세환경을 제공하기 위해(종양 미세환경을 모방하기 위해) 재조합-PEG-아르기나제를 마우스에게 매주 2회 투여하였다. 저-아르기닌 조건은 ELISA로 확인하였다(데이터 나타내지 않음). 17일 후에 마우스를 희생시키고 혈중 CAR-T 세포(대조군이든 본 발명의 세포이든)의 백분율을 유세포분석으로 측정하였다. GD2-ASS-1 및 GD2-OTC CAR-T 세포는 비변형 GD2 CAR-T 구조물을 포함하는 대조군 세포에 비해 상당히 증대된 지속성을 나타내었다. 상기 결과들은 도 6에 나타내었다.
7. 아르기닌 경로 효소는 다양한 표적 결합
잔기를
포함하는 인간 공여체로부터의
PBMC에
형질도입될 수 있다.
인간 공여체로부터의 PBMC(특히 T 세포)를, GD2, CD33, 메소텔렌 또는 EGFRvIII로 이루어진 목록에서 선택된 표적 결합 잔기와 함께 ASS-1 도메인 및/또는 OTC 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질로 형질도입시켰다. 웨스턴 블롯은 ASS-1 및 OTC의 발현이 대조군에 비해 본 발명의 단백질로 형질도입된 세포에서 증가됨을 보여준다(각각의 웨스턴 블롯의 왼쪽 칸). 상기 결과는 도 7a에 나타내었다.
LAG-3, TIM-3 및 PD-1(암 치료에 잠재적 중요성을 갖는 동시-억제 수용체들)의 발현을 또한 ASS-1 도메인; OTC 도메인; 또는 ASS-1 도메인 및 OTC 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 형질도입된 CAR-T 세포에서 유세포분석으로 평가하였다. 항-GD2, 항-CD33, 항-MESO 및 항-EGFRvIII CAR-T 세포에 대한 예들을 도 7의 패널 B에 나타내었다.
8. CD33
표적화
도메인을 발현하는 세포의 세포파괴 활성
ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 CD33 표적화 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현시켜 본 발명의 CAR-T 세포를 생성하였다. CAR T 세포를 상이한 효과기 대 표적 비에서 K562 백혈병 세포의 존재하에 4 시간동안 배양하였다. 모든 CAR-T 세포 구조물들이 백혈병 세포를 효과적으로(70 내지 90%) 특이적으로 사멸시켰다. 본 발명의 단백질에 의한 CD33 CAR-T 세포의 형질도입은, 도 8에 나타낸 바와 같이, CAR T-세포의 세포독성에 불리하게 영향을 미치지 않았다. 나머지 실시예에 나타낸 바와 같이, 증가된 지속성 및 증식을 또한 나타내면서, 세포파괴 활성을 유지하는 본 발명 단백질을 포함하는 세포의 능력은 그의 치료적 유용성을 예시한다.
9. 효소 변형은 저-아르기닌 종양 조건에서 상당한 대사 및 증식 이점을 제공한다.
세포들을 하기의 본 발명의 단백질 중 하나를 발현하도록 형질도입시켰다:
- GD2-결합 도메인 및 ASS-1 도메인을 포함하는 단백질
- GD2-결합 도메인 및 OTC 도메인을 포함하는 단백질
- GD2-결합 도메인 및 ASS-1 및 OTC 도메인 둘 다를 포함하는 단백질
- CD33-결합 도메인 및 ASS-1 도메인을 포함하는 단백질
- CD33-결합 도메인 및 OTC 도메인을 포함하는 단백질
- CD33-결합 도메인 및 ASS-1 및 OTC 도메인 둘 다를 포함하는 단백질
- 메소텔린-결합 도메인 및 ASS-1 도메인을 포함하는 단백질
- 메소텔린-결합 도메인 및 OTC 도메인을 포함하는 단백질
- 메소텔린-결합 도메인 및 ASS-1 및 OTC 도메인 둘 다를 포함하는 단백질
- EGFRvIII-결합 도메인 및 ASS-1 도메인을 포함하는 단백질
- EGFRvIII-결합 도메인 및 OTC 도메인을 포함하는 단백질
- EGFRvIII-결합 도메인 및 ASS-1 및 OTC 도메인 둘 다를 포함하는 단백질
상기 세포들을 저-아르기닌 조건(75% 아르기닌 고갈 완전 배지)에서 배양하였다. 동일한 결합 도메인을 공유하지만 효소 도메인이 결여된 비변형 CAR-T 세포(즉, 항-GD2, 항-CD33, 항-메소텔린 또는 항-EGFRvIII)를 대조군으로 사용하였다. 모든 세포의 증식을 96 시간후에 유세포분석으로 측정하였다.
항-GD2 세포의 경우에, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인의 부가는 비변형 대조군 CAR-T 세포에 비해 CAR-T 세포 증식을 상당히 증대시켰다. 실제로, GD2-OTC CAR T-세포는 GD2 단독 대조군 세포에 비해 증식에 5배 증가를 나타내었다. 또한, GD2-ASS/OTC CAR T 세포는, 도 9 패널 A에 나타낸 바와 같이, GD2-단독 CAR T 세포 대조군에 비해 증식에 10배 증가를 나타내었다.
항-CD33 CAR-T 세포의 경우에, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인의 부가는 비변형 대조군 CAR-T 세포에 비해 CAR-T 세포 증식을 상당히 증대시켰다. CD33-OTC CAR T-세포는 CD33 단독 대조군 세포에 비해 증식에 대략 5배 증가를 나타내었다. 또한, CD33-ASS/OTC CAR T 세포는, 도 9 패널 B에 나타낸 바와 같이, GD2-단독 CAR T 세포 대조군에 비해 증식에 6배 증가를 나타내었다.
항-메소텔린 CAR-T 세포의 경우에, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인의 부가는 비변형 대조군 CAR-T 세포에 비해 CAR-T 세포 증식을 상당히 증대시켰다. 메소텔린-OTC CAR T-세포는 CD33 단독 대조군 세포에 비해 증식에 대략 4배 증가를 나타내었다. 또한, 메소텔린-ASS/OTC CAR T 세포는, 도 9 패널 C에 나타낸 바와 같이, 메소텔린-단독 CAR T 세포 대조군에 비해 증식에 3.5배 증가를 나타내었다.
항-EGFRvIII CAR-T 세포에서, ASS-1 도메인의 부가는, 도 9 패널 D에 나타낸 바와 같이, 비변형 대조군 CAR-T 세포에 비해 대략 2.5배만큼 증식을 상당히 증대시켰다.
10. 효소 변형은 종양 조정 배지(
TCM
)에서 상당한 대사 및 증식 이점을 제공한다.
ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 GD2-결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포를 신경아세포종 종양 조정 배지에서 배양하였다. 상기 배지는 종양 세포의 작용으로 인해 저-아르기닌 조건을 갖는다. 효소 도메인이 없는 항-GD2 CAR-T 세포를 대조군 세포로 사용하였다.
배양된 세포의 증식을 96 시간후에 유세포분석으로 측정하였다. ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명 단백질의 첨가는, 도 10 패널 A에 나타낸 바와 같이, 비변형 대조군 CAR-T 세포에 비해 CAR-T 세포 증식을 상당히 증대시켰다.
ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인과 함께 CD33-결합 잔기를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포를 백혈병 종양 조정 배지(또한 저수준의 아르기닌을 함유함)에서 배양하였다. 이 경우에, 효소 도메인을 갖지 않는 항-CD33 CAR-T 세포를 대조군 세포로 사용하였으며, 세포 증식을 (다시) 96 시간후에 유세포분석으로 측정하였다.
ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 및 OTC 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질의 부가는 비변형 대조군 CAR-T 세포에 비해 CAR-T 세포 증식을 상당히 증대시켰다. OTC 도메인을 포함하는 CD33 CAR T-세포는 증식에 대략 4배 증가를 나타내었다. ASS-1 및 OTC 도메인을 포함하는 CD33 CAR T 세포는 비변형 대조군 CAR T 세포에 비해 증식에 대략 3.5배 증가를 나타내었다. 상기 결과들은 도 10 패널 B에 나타내었다.
11. 효소 변형은
생체내
항-종양 활성을 상당히 증대시킨다.
HL-60 급성 골수성 백혈병(AML) 세포를 NOG-SCID 마우스에 이식하였다. 백혈병을 갖는 마우스를, CD33-결합 잔기와, ASS-1 도메인, OTC 도메인, 또는 ASS-1 도메인 및 OTC 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포로 처리하였다. 효소 도메인이 결여된 항-CD33 CAR-T 세포(비변형 CAR-T 세포)를 대조군으로 사용하였다. 본 발명의 세포 또는 대조군 세포는 5x106 세포의 용량으로 정맥내 투여하였다.
도 11에 나타낸 바와 같이, ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 CAR-T 세포(항-CD33-ASS-1 CAR-T 세포)는 대조군 CAR-T 세포에 비해 골수로부터의 AML 제거율을 상당히 증대시켰다.
12. GD2 CART T 세포의 효소 변형은
생체내
항-종양 활성을 상당히 증대시킨다.
신경아세포종 이종이식 마우스를 GD2-결합 잔기 및 ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포로 처리하였다. 대조군 동물들에게는 GD2 CAR-T 세포(ASS-1 도메인 비함유)를 투여하거나 CAR-T 처리를 하지 않았다. 모든 동물들의 비장을 수거하고, 추출된 백혈구를 유세포분석으로 특성화하였다. 결과는 도 12의 패널 A에 나타내었으며, 세포수가 대조군 세포에 비해 본 발명의 세포에서 현저히 증가되었음을 예시한다. 상기 결과는 본 발명의 세포(ASS-1 도메인을 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는)가 대조군에 비해, 처리된 마우스의 비장에서 개선된 지속성을 가짐을 시사한다.
추출된 백혈구를 또한 항원 자극에 반응하여 증식이 일어나는 수용체에서 지속된 본 발명 세포의 능력을 조사하기 위해 생체외에서 신경아세포종 표적 세포(IMR32 세포주 또는 종양 세포)와 공배양하였다. 결과는 도 12의 패널 B에 나타내었다. 본 발명의 세포 수는 대조군보다 훨씬 더 높은 것을 볼수 있다. 상기 결과는 본 발명의 지속 세포가 대조군보다 더 큰 항원 자극에 반응하여 증식하는 능력을 유지함을 시사한다.
13. CD33 CART T 세포의 효소 변형은
생체내
항-종양 활성을 상당히 증대시킨다.
AML 이종이식 마우스를 CD33-결합 잔기와, ASS-1 도메인, OTC 도메인; 또는 ASS-1 도메인 및 OTC 도메인 중 하나를 포함하는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포로 처리하였다. 대조군에게는 CD33 CAR-T 세포(효소 도메인 비함유 - "-효소"로 나타냄)를 투여하거나 CAR-T 처리를 하지 않았다. 모든 동물들의 비장을 수거하고, 추출된 백혈구를 유세포분석으로 특성화하였다. 도 13의 패널 A에 나타낸 결과는 세포수가 대조군 세포에 비해 본 발명의 세포에서 현저히 증가되었음을 예시한다. 상기 결과는 본 발명의 세포가 AML의 맥락에서 (대조군에 비해) 처리된 마우스의 비장에서 개선된 지속성을 가짐을 시사한다.
추출된 백혈구를 또한 항원 자극에 반응하여 증식이 일어나는 수용체에서 지속된 본 발명 세포의 능력을 조사하기 위해 생체외에서 AML 표적 세포와 공배양하였다. 결과는 도 13의 패널 B에 나타내었다. 본 발명의 세포 수는, 특히 ASS-1 도메인을 갖는 본 발명의 단백질을 발현하는 세포의 경우에, 대조군보다 훨씬 더 높다. 상기 결과는 수용체내에서 지속된 본 발명의 세포가 대조군 세포보다 더 큰 항원 자극에 반응하여 증식하는 능력을 유지함을 시사한다.
본 발명 세포의 생산을 위한 프로토콜
본 발명의 세포는 레트로바이러스 및 렌티바이러스 형질도입 접근방법에 의해 성공적으로 생산하였다. 본 발명 세포의 레트로바이러스 생산을 위한 예시적인 프로토콜에 대한 세부사항을 하기에 나타낸다.
인간 T 세포의 레트로바이러스 형질도입
하기는 본 발명의 핵산으로 형질감염시켜 본 발명의 세포를 생산하기 위한 프로토콜을 제공한다.
제 -2일:
Pheonix
Ampho
세포의 해동
늦은 오후에 -80으로부터 Phoenix Ampho 세포(인간 세포의 형질도입을 위한 레트로바이러스 패키징 세포주)를 수득하고 배양한다. Phoenix Ampho 세포는 10% FCS, 1% L-글루타민(무항생제)을 함유하는 DMEM에서 성장시킨다. Phoenix Ampho 세포는 밀집도에 도달하지 않아야 한다. 전형적으로 30 ml의 배지에 각각의 T150 플라스크에 2 내지 3 x 10 6 Phoenix Ampho 세포를 넣는다. 제 0일에 약 30 내지 40 x 106 Phoenix Ampho 세포를 수득해야 한다.
제 1일
: Phoenix
Ampho
세포 준비
TryLE를 사용하여 Phoenix Ampho 세포를 트립신화시키고, 10% FCS 및 1% L-글루타민( 무항생제 )을 함유하는 30 ml DMEM에서 8x10 6 세포/플라스크로 Phoenix Ampho 세포를 준비한다(T150 플라스크에 대한 부피, 적절하게 규모조정). 세포를 밤새 배양한다(37 ℃/5% CO2).
제 2일
: Phoenix
Ampho
세포의 형질감염
Phoenix Ampho 세포는 형질감염 당일에 50 내지 80% 밀집도이어야 한다. 이어서, 상기 세포는 하기의 방법(T150 플라스크에 대한 것, 다른 플라스크를 사용하는 경우 적절하게 규모조정)에 의해 형질감염시켜야 한다.
1. Phoenix 세포의 각각의 T150 플라스크에, 12 ㎍의 플라스미드 DNA(즉, CAR 플라스미드) + 12 ㎍의 pCl ampho 플라스미드를 15 ml의 작은 병에 넣고, 피펫으로 조심스럽게 OptiMEM(깁코(Gibco))을 혼합하면서 1800 ㎕까지 만든다. 또 다른 15 ml의 작은 병에 1680 ㎕ OptiMEM을 첨가하고, Fugene이 튜브의 측면에 들러붙지 않고 OptiMEM으로 바로 진입하도록 120 ㎕ Fugene 6 형질감염 시약(상점에서 입수가능)을 첨가하고; 피펫으로 조심스럽게 혼합한다. 이어서, 플라스미드 DNA를 함유하는 튜브에 1800 ㎕의 OptiMEM/Fugene 혼합물을 첨가하고 피펫으로 조심스럽게 혼합한다. 실온에서 45 분동안 배양한다. 이에 의해 Fugene은 DNA가 음으로 하전된 Phoenix Ampho 세포 막을 가로질러 수송되도록 중성 전하를 갖는 DNA와의 복합체를 형성하게 된다.
2. Phoenix Ampho 세포 상의 배지를 10% FCS 및 글루타민을 함유하는 9 ml의 새 DMEM으로 매우 조심스럽게 교체한 다음 즉시 DNA/Fugene 복합체 또는 OptiMEM(mock 대조군에 대한)을 세포위에 덮어씌운다. 플레이트를 동서남북으로 움직여 조심스럽게 혼합시킨다.
3. 세포를 24 시간동안 배양한다(37 ℃/5% CO2).
제 2일
: T 세포의 활성화
T 세포는 활성화후 처음 48 시간에는 증식하지 않을 것이므로, 전형적으로 형질도입을 위해 필요한 만큼 많은(또는 세포 사멸의 경우 더 많이) T 세포를 활성화시킨다.
항-CD3/CD28 항체를 사용하는 방법:
1. 새로운 백혈구 원뿔체를 림프처리한다.
2. 세포를 계수하고 T 세포 배지(1% 인간 혈청, 10% FCS, P/S, L-글루타민 RPMI)에서 1x106/ml로 배양한다. 전형적으로 T150 플라스크당 200 ml.
3. 3000 U/ml의 IL-2를 첨가하고, 30 ng /ml의 OKT3(항-CD33)을 첨가하고, 30 ng/ml의 항-CD28 mAB(#MAB342-SP, R&D)를 첨가한다.
4. 37 ℃/5% CO2에서 48 시간동안 배양한다.
항-CD3/CD28
디나비드(dynabead)를
사용하는 방법:
1. 새로운 원뿔체를 림프처리한다. 세포를 계수하고 PBMC의 50%가 CD3+ T 세포인 것으로 추정한다.
2. 15 ml의 작은 병에 5% 인간 혈청, PBS ml 당 10x10 6 CD3+ T 세포로 세포를 재현탁한다.
3. CD3+ 세포 당 2개의 디나비드 ® 인간 T-활성화제 CD3/CD28을 첨가한다. 디나비드를 세척한다: 30 초동안 비드 바이알을 볼텍싱한다. 필요한 부피의 비드를 꺼내고 15 ml의 작은 병에 넣는다. 1 ml의 멸균 PBS를 첨가하고 피펫으로 잘 혼합한다. 작은 병을 디나비드 자석위에 둔다 - 디나비드는 작은 병의 가장자리에 들러붙을 것이다. 비드를 흩뜨리지 않고 상등액을 조심스럽제 제거한다. 작은 병을 자석에서 떼어내고 세척 단계를 반복한다. 디나비드를 소부피의 PBS 중의 T 세포에 첨가한다.
4. T 세포를 실온에서 적어도 1 시간동안 텀블러상에서 배양한다. T 세포는 이 단계동안 디나비드에 결합하여, CD3+ T 세포의 선별 및 동시에 활성화를 가능하게 할 것이다.
5. 세포를 디나비드 자석위에 두어 미결합 세포를 제거한다. 세포를 계수하고 IL-2 300 U/ml를 함유하는 T 세포 배지(1% 인간 혈청, 10% FCS, P/S, L-글루타민 RPMI)에서 1x10 6 /ml로 배양한다.
6. 37 ℃/5% CO2에서 48 시간동안 배양한다.
제 3일
: Phoenix
Ampho
배지 교체
Phoenix Ampho 세포는 플라스미드 DNA를 함유하는 레트로바이러스를 생성할 것이므로, 세포/상등액을 처리할 때 이것을 고려한다. 오토클레이브 백을 TC 후드 안에 두고 그 안에 레트로바이러스(세포/상등액)로 오염된 임의의 플라스틱을 둔다. 끝나면, 오토클레이브 백을 밀폐시키고 오토클레이브 통안에 둔다. 임의의 액체 폐기물은 폐기물 용기에 넣고 밀폐시킨다. 레트로바이러스 오염된 폐기물을 취하여 가능한 빨리 세척한다.
Phoenix Ampho 세포 상의 배지를 DMEM + 10% FCS + 2 mM L-글루타민(무항생제)의 새로운 21 ml /플라스크(T150 플라스크에 대한 부피, 적절하게 규모조정)로 조심스럽게 교체한다. 세포를 24 시간동안 더 배양한다.
제 4일
: 인간 T-세포의 형질도입
1. 2 ml의 레트로넥틴(30 ㎍/ml)(#T100B - 타카라 레트로넥틴(Takara RetroNectin)® 재조합 인간 피브로넥틴 단편)을 6-웰 플레이트(조직 배양물 처리되지 않음)의 필요한 수의 웰 각각에 첨가하고, 실온에서 3 시간동안 배양한다(또한 그 전날 준비하고 냉장고에서 밤새 코팅할 수 있다). 실험에서 mock-형질감염된 대조군용 웰을 포함시킬 것을 유의한다. 배양 플레이트를 레트로넥틴중에서 코팅시켜 T 세포 및 바이러스 입자를 공동-국소화시켜 세포의 효과적인 형질도입을 가능하게 한다.
2. 레트로넥틴을 제거하고(레트로넥틴은 고갈될 때까지 재사용할 수 있다), 2.5 ml의 멸균 PBS/2% BSA/ 웰로 30 분동안 웰을 차단한다. 차단 용액을 제거하고 웰을 2.5 ml의 멸균 PBS로 2회 세척한다(바이러스를 첨가할 준비가 될 때까지 마지막 PBS 세척액을 웰 상에 유지시킨다).
3. 일부 T 세포 배지를 예열한다.
4. 32 ℃에서 60 분동안 3160 rpm/2000g에서 빈 양동이를 사용하여 회전시켜 스핀펙션(spinfection)을 위해 원심분리기를 예열한다. 스핀펙션 준비가 되면 상기 과정을 중단할 수 있다.
5. Phoenix Ampho 세포로부터 레트로바이러스-함유 배양 상등액을 수거하고 회전시킨다(1500 rpm으로 5 분). 레트로바이러스 상등액을 새 튜브로 옮긴다. 일부의 사람은 0.45 ㎛ 필터를 사용하여 레트로바이러스를 여과하여 오염 Phoenix Ampho 세포를 제거하지만, 이것은 레트로바이러스 역가를 감소시킬 수 있다. 필요한 경우, 바이러스는 드라이아이스/에탄올 슬러리 상에서 급속 냉동시키고 -80 ℃에서 저장할 수 있지만, 매 냉동 해동에 따라 역가는 반감된다.
6. 스핀펙션 : 2 ml / 웰의 바이러스 상등액(또는 mock 상등액)을 레트로넥틴 -코팅된 웰에 첨가하고 32 ℃에서 2 시간동안 3160 rpm/2000g에서 회전시킨다.
7. 상기 회전이 종료되기 45 분전에, 형질도입될 T 세포를 준비한다. T 세포를 수거하고 계수한다. T 세포를 T 세포 배지 + IL2(1000 U/ml)에 1x10 6 으로 재현탁하고 15 내지 20 분동안 배양(37 ℃/5% CO2)하여 세포를 원심분리로부터 회수한다.
8. 바이러스가 회전이 완료되면, 상등액을 제거하고 웰을 PBS(2.5 ml/웰)로 1회 세척한다.
9. 바이러스/ 레트로넥틴 코팅된 플레이트로부터 PBS를 제거하고 형질도입될 T 세포( 2 ml /웰)를 첨가한다. 동서남북으로 흔들어 세포가 플레이트 위에 고르게 분포되게한다. 플레이트를 1300 rpm에서 5 분동안 회전시킨다.
10. 플레이트를 배양기(37 ℃/5% CO2)에 넣는다.
제 5일
: 형질도입된 T 세포 공급
추가 6 ml의 T 세포 배지 + IL2(100 IU/ml)를 T 세포의 각 웰에 첨가하고 배양기(37 ℃/5% CO2)에 다시 넣는다.
CAR 형질도입 효율 측정
세포를 형질도입시켜 본 발명의 세포를 생성하는 방법의 효율은 하기의 절차를 이용하여 측정할 수 있다.
CAR T 세포 형질도입 효율은 스핀펙션 4 일후에 측정한다. mock 및 CAR T 세포 웰로부터 샘플을 취하고 다음과 같이 염색한다:
1. FACS 완충제(10% FCS, PBS)로 1회 세척한다.
2. 50 ㎕의 FAC 완충제 중에서 CD34-APC(1 ㎕/샘플), CD4-FITC(2 ㎕/샘플) 및 CD8-PE(1 ㎕/샘플)로 염색한다.
3. 얼음위에서 20 분동안 배양한다.
4. FACS 완충제로 1회 세척한다.
5. 세포를 200 ㎕의 FACS 완충제에 재현탁하고 유세포분석(LSRII)으로 분석한다.
CD34 자기-활성화 세포 분류에 의한 본 발명 세포(예를 들어 CAR T 세포)의 분류
CAR-형질도입 세포(예를 들어, T 세포)를 다음과 같이 분류시킨다:
1. T 세포를 1500 rpm에서 5 분동안 회전시키고 상등액을 따라버린다.
2. 10 ml의 냉각 MACS 완충제에 세포를 재현탁하고 1500 rpm에서 5 분동안 회전하고 상등액을 따라버린다.
3. 세포를 300 ㎕의 냉각 MACS 완충제레 재현탁하고, 100 ㎕ FcR 차단제 및 100 ㎕ CD34 미세비드(밀테나이 바이오테크(Miltenyi Biotech) 130-046-702)를 첨가한다. 상기 양들은 10 8 세포까지에 적합하다 - 그보다 많은 경우, 그에 따라 규모를 확대한다.
4. 잘 혼합하고 냉장고(2 내지 8 ℃)에서 30 분동안 배양한다.
5. 50 ml 냉각 MACS 완충제에서 세척하고 1500 rpm에서 5 분동안 회전한 후 상등액을 따라버린다.
6. 세포를 500 ㎕ 냉각 MACS 완충제에 재현탁하고 세포 현탁액을 500 ㎕ 냉각 MACS 완충제로 미리 세정된 MS 컬럼상에 부하한다.
7. 세포를 중력 유동에 의해 적하시키고, 컬럼을 500 ㎕ 냉각 MACS 완충제로 3회 세척한다.
8. 컬럼을 자석에서 떼어내고, 1 ml 냉각 MACS 완충제로 플러싱하여 세포를 멸균 튜브에 수거한다.
9. 분류된 CAR T 세포를 원심분리하고, 정상 T 세포 배지(1% 인간 혈청, 10% FBS, P/S, L-글루타민, 100 U/ml IL-2, RPMI 1640)에 ml 당 1x106 CAR T 세포의 농도로 재현탁한다.
10. 다음 날 CD34 표면 항체 염색에 의해 CAR T 세포의 순도를 검사한다.
아르기노숙시네이트
신타제
(ASS-1) 또는
아르기노숙시네이트
신테타제
(
ArgG
) 효소 활성 - L-시트룰린 고갈을 측정하기 위한 분석
1. 샘플 당 5x106 세포를 펠릿화한다(기질 대조군이 없는 경우 5x106 세포 첨가시 충분한 세포 펠릿이 있다면).
2. 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제(0.1% 트리톤-X는 분자 실험실에서 4 ℃에서 50 ml 튜브에 보관한다)에 재현탁하고, 가끔 볼텍싱하면서 20 분동안 얼음 위에서 배양한다.
3. 4 ℃에서 20 분동안 13,000 rpm에서 샘플을 원심분리하여 세포 파편을 펠릿화한다.
4. 20 ㎕의 세포 용해물을 새 에펜도르프 튜브에 취하고 얼음 위에서 유지시킨다.
5. 각 샘플을 위해 새 에펜도르프 튜브를 취하고, 10 ㎕의 L-시트룰린(4 mM, pH 7.5), 10 ㎕의 L-아스파트산(4 mM, pH 7.5), 10 ㎕의 MgCl2(6 mM), 10 ㎕의 ATP(4 mM, pH 7.5), 40 ㎕의 트리스-HCl(20 mM) 및 20 ㎕의 세포 용해물을 첨가한다.
6. 효소 대조군이 없는 경우, 세포 용해물 대신 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다.
7. 기질 대조군이 없이 수행하는 경우, ASS-1 또는 ArgG 기질, 즉 L-시트룰린 및 L-아스파트산을 첨가하지 않는다. 대신 트리스-HCl(20 mM)로 100 ㎕의 최종 부피로 만든다.
8. 37 ℃에서 1.5 시간동안 샘플을 배양한다. ASS-1 또는 ArgG 효소 반응이 일어날 것이다.
9. 4 mM L-시트룰린 용액의 1:4 희석을 수행하여 1 mM L-시트룰린 용액을 제조함으로써 L-시트룰린 표준물을 제조한다. 에펜도르프 튜브에 10, 20, 30, 50, 80 및 100 ㎕의 L-시트룰린(1 mM)을 첨가하고, 멸균 증류수로 각각의 표준물을 100 ㎕까지 제조한다. 이에 의해 0, 10, 20, 30, 50, 80 및 100 nM의 L-시트룰린 농도가 달성된다. 블랭크 대조군을 포함시킨다.
10. 각각의 표준물에 10 ㎕의 L-아스파트산(4 mM, pH 7.5), 10 ㎕의 MgCl2(6 mM), 10 ㎕의 ATP(4 mM, pH 7.5), 및 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다. ASS-1 또는 ArgG 효소 활성 샘플내 L-시트룰린 농도를 보다 정확하게 측정하기 위해 ASS-1 또는 ArgG 효소 시약을 표준물에 첨가한다.
11. 37 ℃에서 1.5 시간후에, 80 ㎕의 정지 용액(인산 및 황산 각각의 3:1 혼합물) 및 20 ㎕의 3% 2,3 부탄다이온 모노옥심(당일에 멸균 중류수를 사용하고 지독한 냄새가 나므로 환기통에서 새로 제조한다)을 각 샘플 및 표준물에 첨가한다.
12. 볼텍싱 및 펄스 원심분리에 의해 튜브를 혼합한다. 모든 샘플 및 표준물들을 95 ℃에서 30 분동안 배양한다. 2,3 부탄다이온 모노옥심이 95 ℃에서 산성 조건하에 L-시트룰린과 반응할 때 황색/오렌지색이 나타날 것이다.
13. 튜브를 13000 rpm에서 1 분동안 원심분리하여 임의의 파편을 펠릿화한다. 이중으로, 50 ㎕의 상등액을 96-웰 평저 플레이트의 웰에 첨가한다.
14. 미세플레이트 흡광도 판독기를 사용하여 490 nm에서 흡광도를 판독한다.
오르니틴
트랜스카바밀라제
(OTC) 또는 오르니틴
카바모일트랜스퍼라제
(
ArgF
) 효소 활성 분석 - L-시트룰린 생성을 측정하기 위한 분석
1. 샘플 당 5x106 세포를 펠릿화한다(기질 대조군이 없는 경우 5x106 세포 첨가시 충분한 세포 펠릿이 있다면).
2. 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제(0.1% 트리톤-X는 분자 실험실에서 4 ℃에서 50 ml 튜브에 보관한다)에 재현탁하고, 가끔 볼텍싱하면서 20 분동안 얼음 위에서 배양한다.
3. 4 ℃에서 20 분동안 13,000 rpm에서 샘플을 원심분리하여 세포 파편을 펠릿화한다.
4. 20 ㎕의 세포 용해물을 새 에펜도르프 튜브에 취하고 얼음 위에서 유지시킨다.
5. 각 샘플을 위해 새 에펜도르프 튜브를 취하고, 25 ㎕의 L-오르니틴(50 mM, pH 8.0), 25 ㎕의 트라이에탄올아민(피펫으로 병에서 똑바로, 용액이 매우 점성이어서 피펫으로 천천히), 25 ㎕의 새로 제조한 카바밀 포스페이트(150 mM, pH 8.0), 및 10 ㎕의 SDW를 첨가한다.
6. 이어서, 20 ㎕의 세포 용해물을 각각의 튜브에 첨가한다. 효소 대조군이 없는 경우, 세포 용해물 대신 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다.
7. 기질 대조군이 없이 수행하는 경우, OTC 또는 ArgF 기질, 즉 L-오르니틴 및 카바밀 포스페이트를 첨가하지 않는다. 대신 SDW로 100 ㎕의 최종 부피로 만든다.
8. 37 ℃에서 1.5 시간동안 샘플을 배양한다. OTC 또는 ArgF 효소 반응이 일어날 것이다.
9. 4 mM L-시트룰린 용액(ASS-1 효소 활성 분석에 사용된 -20 ℃에서의 저장액)의 1:4 희석을 수행하여 1 mM L-시트룰린 용액을 제조함으로써 L-시트룰린 표준물을 제조한다. 에펜도르프 튜브에 10, 20, 30, 50, 80 및 100 ㎕의 L-시트룰린(1 mM)을 첨가하고, 멸균 증류수로 각각의 표준물을 100 ㎕까지 제조한다. 이에 의해 0, 10, 20, 30, 50, 80 및 100 nM의 L-시트룰린 농도가 달성된다. 블랭크 대조군을 포함시킨다.
10. 각각의 표준물에 25 ㎕의 L-오르니틴(50 mM), 25 ㎕의 트라이에탄올아민, 25 ㎕의 새로 제조한 카바밀 포스페이트(150 mM), 및 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다. OTC 또는 ArgF 효소 활성 샘플내 L-시트룰린 농도를 보다 정확하게 측정하기 위해 OTC 효소 시약을 표준물에 첨가한다.
11. 37 ℃에서 1.5 시간후에, 80 ㎕의 정지 용액(인산 및 황산 각각의 3:1 혼합물) 및 20 ㎕의 3% 2,3 부탄다이온 모노옥심(당일에 멸균 중류수를 사용하고 지독한 냄새가 나므로 환기통에서 새로 제조한다)을 각 샘플 및 표준물에 첨가한다.
12. 볼텍싱 및 펄스 원심분리에 의해 튜브를 혼합한다. 모든 샘플 및 표준물들을 95 ℃에서 30 분동안 배양한다. 2,3 부탄다이온 모노옥심이 95 ℃에서 산성 조건하에 L-시트룰린과 반응할 때 황색/오렌지색이 나타날 것이다.
13. 튜브를 13000 rpm에서 1 분동안 원심분리하여 임의의 파편을 펠릿화한다. 이중으로, 50 ㎕의 상등액을 96-웰 평저 플레이트의 웰에 첨가한다.
14. 미세플레이트 흡광도 판독기를 사용하여 490 nm에서 흡광도를 판독한다.
아르기니노숙시네이트
리아제(
ASL
) 또는 (
AgrH
) 효소 활성 분석 - L-
푸마레이트
생성 또는 아르기닌 생성을 측정하기 위한 분석
1. 샘플 당 5x106 세포를 펠릿화한다(기질 대조군이 없는 경우 5x106 세포 첨가시 충분한 세포 펠릿이 있다면).
2. 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제(0.1% 트리톤-X는 분자 실험실에서 4 ℃에서 50 ml 튜브에 보관한다)에 재현탁하고, 가끔 볼텍싱하면서 20 분동안 얼음 위에서 배양한다.
3. 4 ℃에서 20 분동안 13,000 rpm에서 샘플을 원심분리하여 세포 파편을 펠릿화한다.
4. 20 ㎕의 세포 용해물을 새 에펜도르프 튜브에 취하고 얼음 위에서 유지시킨다.
5. 각 샘플을 위해 새 에펜도르프 튜브를 취하고, 25 ㎕의 L-아르기니노숙신산(11.7 mM) 및 55 ㎕의 PBS를 첨가한다.
6. 이어서, 20 ㎕의 세포 용해물을 각각의 튜브에 첨가한다. 효소 대조군이 없는 경우, 세포 용해물 대신 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다.
7. 기질 대조군이 없이 수행하는 경우, ASL 또는 ArgH 기질, 즉 L-아르기니노숙신산을 첨가하지 않는다. 대신 SDW로 100 ㎕의 최종 부피로 만든다.
8. 37 ℃에서 1.5 시간동안 샘플을 배양한다. ASL 또는 ArgH 효소 반응이 일어날 것이다.
9. 4 mM L-푸마레이트 용액의 1:4 희석을 수행하여 1 mM L-푸마레이트 용액을 제조함으로써 L-푸마레이트 표준물을 제조한다. 에펜도르프 튜브에 10, 20, 30, 50, 80 및 100 ㎕의 L-푸마레이트(1 mM)를 첨가하고, 멸균 증류수로 각각의 표준물을 100 ㎕까지 제조한다. 이에 의해 0, 10, 20, 30, 50, 80 및 100 nM의 L-푸마레이트 농도가 달성된다. 블랭크 대조군을 포함시킨다.
10. 각각의 표준물에 25 ㎕의 L-아르기니노숙신산(11.7 mM) 및 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다. ASL 또는 ArgH 효소 활성 샘플내 L-푸마레이트 농도를 보다 정확하게 측정하기 위해 ASL 효소 시약을 표준물에 첨가한다.
11. 37 ℃에서 1.5 시간후에, 튜브를 13000 rpm에서 1 분동안 원심분리하여 임의의 파편을 펠릿화한다. 이중으로, 50 ㎕의 상등액을 96-웰 평저 플레이트의 웰에 첨가한다.
12. 미세플레이트 흡광도 판독기를 사용하여 2400 nm에서 흡광도를 판독한다.
13. 아르기닌 생성은 또한 HPLC 또는 아르기닌 ELISA를 제조사의 지시에 따라 사용하여 상기 단계 11에서 측정할 수도 있다. 세포 상등액 농도의 측정을 위해, 상기 프로토콜을 그에 따라 세포 용해물 대신 100 ㎕의 세포 상등액을 사용하여 변형시킬 수 있다.
트립토판
신타제
(
Trp5
) 효소 활성 분석 - 인돌 고갈 또는 트립토판 생성을 측정하기 위한 분석
1. 샘플 당 5x106 세포를 펠릿화한다(기질 대조군이 없는 경우 5x106 세포 첨가시 충분한 세포 펠릿이 있다면).
2. 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제(0.1% 트리톤-X는 분자 실험실에서 4 ℃에서 50 ml 튜브에 보관한다)에 재현탁하고, 가끔 볼텍싱하면서 20 분동안 얼음 위에서 배양한다.
3. 4 ℃에서 20 분동안 13,000 rpm에서 샘플을 원심분리하여 세포 파편을 펠릿화한다.
4. 20 ㎕의 세포 용해물을 새 에펜도르프 튜브에 취하고 얼음 위에서 유지시킨다.
5. 각 샘플을 위해 새 에펜도르프 튜브를 취하고, 80 ㎕의 인돌 용액(0.005 M), 400 ㎕ DL-세린 용액(0.2 M), 100 ㎕ 피리독살 포스페이트 용액, 20 ㎕ 글루타티온(0.05 M) 및 120 ㎕의 포스페이트 완충제(0.5 M, pH 7.8), 260 ㎕ 물을 첨가한다.
6. 이어서, 20 ㎕의 세포 용해물을 각각의 튜브에 첨가한다. 효소 대조군이 없는 경우, 세포 용해물 대신 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다.
7. 기질 대조군이 없이 수행하는 경우, Trp5 기질, 즉 인돌 및 세린 용액을 첨가하지 않는다. 대신 SDW로 1000 ㎕의 최종 부피로 만든다.
8. 37 ℃에서 1.5 시간동안 샘플을 배양한다. Trp5 효소 반응이 일어날 것이다.
9. 4 mM L-푸마레이트 용액의 1:4 희석을 수행하여 1 mM 인돌 용액을 제조함으로써 인돌 표준물을 제조한다. 에펜도르프 튜브에 10, 20, 30, 50, 80 및 100 ㎕의 인돌(1 mM)을 첨가하고, 멸균 증류수로 각각의 표준물을 1000 ㎕까지 제조한다. 이에 의해 0, 10, 20, 30, 50, 80 및 100 nM의 인돌 농도가 달성된다. 블랭크 대조군을 포함시킨다. 각각의 표준물에 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다.
10. 37 ℃에서 1.5 시간후에, 200 ㎕의 5% NaOH를 첨가한다. 4 ml의 톨루엔을 각각의 튜부에 첨가하고 원심분리하여 용액을 2개 층으로 분리시킨다.
11. 1 ml 이하의 톨루엔 층을 별도의 시험관에 피펫팅한다. 4 ml의 에탄올 및 2 ml의 p-다이메틸아미노벤즈알데하이드 용액(다음과 같이 제조함: 500 ml의 에탄올에 36 g를 용해시킨다. 180 ml의 진한 HCl을 첨가한다. 냉각되면 에탄올로 부피를 1 L가 되게한다)을 첨가한다. 60 분동안 색 변화가 일어나게 한다.
12. 미세플레이트 흡광도 판독기를 사용하여 550 nm에서 흡광도를 판독한다.
13. 트립토판 생성은 또한 HPLC 또는 트립토판 ELISA를 제조사의 지시에 따라 사용하여 상기 단계 10에서 측정할 수도 있다. 세포 상등액 농도의 측정을 위해, 상기 프로토콜을 그에 따라 세포 용해물 대신 100 ㎕의 세포 상등액을 사용하여 변형시킬 수 있다.
인돌아민
2,3-
다이옥시게나제
(IDO) 효소 활성 분석 - 키뉴레닌 생성을 측정하기 위한 분석
1. 샘플 당 5x106 세포를 펠릿화한다(기질 대조군이 없는 경우 5x106 세포 첨가시 충분한 세포 펠릿이 있다면).
2. 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제(0.1% 트리톤-X는 분자 실험실에서 4 ℃에서 50 ml 튜브에 보관한다)에 재현탁하고, 가끔 볼텍싱하면서 20 분동안 얼음 위에서 배양한다.
3. 4 ℃에서 20 분동안 13,000 rpm에서 샘플을 원심분리하여 세포 파편을 펠릿화한다.
4. 20 ㎕의 세포 용해물을 새 에펜도르프 튜브에 취하고 얼음 위에서 유지시킨다.
5. 각 샘플을 위해 새 에펜도르프 튜브를 취하고, 50 ㎕의 트라이클로로아세트산(30%)을 세포 용해물에 첨가한다. 볼텍싱하고 10,000 rpm에서 5 분동안 원심분리한다.
6. 상등액을 수거하고 동일 부피의 에를리히(Ehrlich) 시약(100 mg P-다이메틸벤즈알데하이드, 5 ml 아세트산)에 첨가한다.
7. 4 mM 키뉴레닌 용액의 1:4 희석을 수행하여 1 mM 키뉴레닌 용액을 제조함으로써 키뉴레닌 표준물을 제조한다. 에펜도르프 튜브에 10, 20, 30, 50, 80 및 100 ㎕의 키뉴레닌(1 mM)을 첨가하고, 멸균 증류수로 각각의 표준물을 1000 ㎕까지 제조한다. 이에 의해 0, 10, 20, 30, 50, 80 및 100 nM의 키뉴레닌 농도가 달성된다. 블랭크 대조군을 포함시킨다. 각각의 표준물에 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제를 첨가한다.
8. 미세플레이트 흡광도 판독기를 사용하여 492 nm에서 흡광도를 판독한다.
9. 키뉴레닌 생성은 또한 HPLC 또는 트립토판 ELISA를 제조사의 지시에 따라 사용하여 상기 단계 4에서 측정할 수도 있다. 세포 상등액 농도의 측정을 위해, 상기 프로토콜을 그에 따라 세포 용해물 대신 100 ㎕의 세포 상등액을 사용하여 변형시킬 수 있다.
오르니틴
디카복실라제
(
ODC1
) 효소 활성 분석 - 폴리아민 생성을 측정하기 위한 분석
1. 샘플 당 5x106 세포를 펠릿화한다(기질 대조군이 없는 경우 5x106 세포 첨가시 충분한 세포 펠릿이 있다면).
2. 20 ㎕의 0.1% 트리톤-X + 프로테아제 억제제(0.1% 트리톤-X는 분자 실험실에서 4 ℃에서 50 ml 튜브에 보관한다)에 재현탁하고, 가끔 볼텍싱하면서 20 분동안 얼음 위에서 배양한다.
3. 4 ℃에서 20 분동안 13,000 rpm에서 샘플을 원심분리하여 세포 파편을 펠릿화한다.
4. 20 ㎕의 세포 용해물을 새 에펜도르프 튜브에 취하고 얼음 위에서 유지시킨다.
5. 폴리아민 생성은 HPLC 또는 폴리아민 ELISA를 제조사의 지시에 따라 사용하여 측정한다. 세포 상등액 농도의 측정을 위해, 상기 프로토콜을 그에 따라 세포 용해물 대신 100 ㎕의 세포 상등액을 사용하여 변형시킬 수 있다.
서열 정보
SEQUENCE LISTING
<110> Cancer Research Technology Limited
<120> Fusion Proteins
<130> P246716WO
<140> PCT/GB2018/053771
<141> 2018-12-24
<150> GB 1721833.0
<151> 2017-12-22
<160> 44
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 412
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary ASS-1 enzyme domain
<400> 1
Met Ser Ser Lys Gly Ser Val Val Leu Ala Tyr Ser Gly Gly Leu Asp
1 5 10 15
Thr Ser Cys Ile Leu Val Trp Leu Lys Glu Gln Gly Tyr Asp Val Ile
20 25 30
Ala Tyr Leu Ala Asn Ile Gly Gln Lys Glu Asp Phe Glu Glu Ala Arg
35 40 45
Lys Lys Ala Leu Lys Leu Gly Ala Lys Lys Val Phe Ile Glu Asp Val
50 55 60
Ser Arg Glu Phe Val Glu Glu Phe Ile Trp Pro Ala Ile Gln Ser Ser
65 70 75 80
Ala Leu Tyr Glu Asp Arg Tyr Leu Leu Gly Thr Ser Leu Ala Arg Pro
85 90 95
Cys Ile Ala Arg Lys Gln Val Glu Ile Ala Gln Arg Glu Gly Ala Lys
100 105 110
Tyr Val Ser His Gly Ala Thr Gly Lys Gly Asn Asp Gln Val Arg Phe
115 120 125
Glu Leu Ser Cys Tyr Ser Leu Ala Pro Gln Ile Lys Val Ile Ala Pro
130 135 140
Trp Arg Met Pro Glu Phe Tyr Asn Arg Phe Lys Gly Arg Asn Asp Leu
145 150 155 160
Met Glu Tyr Ala Lys Gln His Gly Ile Pro Ile Pro Val Thr Pro Lys
165 170 175
Asn Pro Trp Ser Met Asp Glu Asn Leu Met His Ile Ser Tyr Glu Ala
180 185 190
Gly Ile Leu Glu Asn Pro Lys Asn Gln Ala Pro Pro Gly Leu Tyr Thr
195 200 205
Lys Thr Gln Asp Pro Ala Lys Ala Pro Asn Thr Pro Asp Ile Leu Glu
210 215 220
Ile Glu Phe Lys Lys Gly Val Pro Val Lys Val Thr Asn Val Lys Asp
225 230 235 240
Gly Thr Thr His Gln Thr Ser Leu Glu Leu Phe Met Tyr Leu Asn Glu
245 250 255
Val Ala Gly Lys His Gly Val Gly Arg Ile Asp Ile Val Glu Asn Arg
260 265 270
Phe Ile Gly Met Lys Ser Arg Gly Ile Tyr Glu Thr Pro Ala Gly Thr
275 280 285
Ile Leu Tyr His Ala His Leu Asp Ile Glu Ala Phe Thr Met Asp Arg
290 295 300
Glu Val Arg Lys Ile Lys Gln Gly Leu Gly Leu Lys Phe Ala Glu Leu
305 310 315 320
Val Tyr Thr Gly Phe Trp His Ser Pro Glu Cys Glu Phe Val Arg His
325 330 335
Cys Ile Ala Lys Ser Gln Glu Arg Val Glu Gly Lys Val Gln Val Ser
340 345 350
Val Leu Lys Gly Gln Val Tyr Ile Leu Gly Arg Glu Ser Pro Leu Ser
355 360 365
Leu Tyr Asn Glu Glu Leu Val Ser Met Asn Val Gln Gly Asp Tyr Glu
370 375 380
Pro Thr Asp Ala Thr Gly Phe Ile Asn Ile Asn Ser Leu Arg Leu Lys
385 390 395 400
Glu Tyr His Arg Leu Gln Ser Lys Val Thr Ala Lys
405 410
<210> 2
<211> 354
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary OTC enzyme domain
<400> 2
Met Leu Phe Asn Leu Arg Ile Leu Leu Asn Asn Ala Ala Phe Arg Asn
1 5 10 15
Gly His Asn Phe Met Val Arg Asn Phe Arg Cys Gly Gln Pro Leu Gln
20 25 30
Asn Lys Val Gln Leu Lys Gly Arg Asp Leu Leu Thr Leu Lys Asn Phe
35 40 45
Thr Gly Glu Glu Ile Lys Tyr Met Leu Trp Leu Ser Ala Asp Leu Lys
50 55 60
Phe Arg Ile Lys Gln Lys Gly Glu Tyr Leu Pro Leu Leu Gln Gly Lys
65 70 75 80
Ser Leu Gly Met Ile Phe Glu Lys Arg Ser Thr Arg Thr Arg Leu Ser
85 90 95
Thr Glu Thr Gly Leu Ala Leu Leu Gly Gly His Pro Cys Phe Leu Thr
100 105 110
Thr Gln Asp Ile His Leu Gly Val Asn Glu Ser Leu Thr Asp Thr Ala
115 120 125
Arg Val Leu Ser Ser Met Ala Asp Ala Val Leu Ala Arg Val Tyr Lys
130 135 140
Gln Ser Asp Leu Asp Thr Leu Ala Lys Glu Ala Ser Ile Pro Ile Ile
145 150 155 160
Asn Gly Leu Ser Asp Leu Tyr His Pro Ile Gln Ile Leu Ala Asp Tyr
165 170 175
Leu Thr Leu Gln Glu His Tyr Ser Ser Leu Lys Gly Leu Thr Leu Ser
180 185 190
Trp Ile Gly Asp Gly Asn Asn Ile Leu His Ser Ile Met Met Ser Ala
195 200 205
Ala Lys Phe Gly Met His Leu Gln Ala Ala Thr Pro Lys Gly Tyr Glu
210 215 220
Pro Asp Ala Ser Val Thr Lys Leu Ala Glu Gln Tyr Ala Lys Glu Asn
225 230 235 240
Gly Thr Lys Leu Leu Leu Thr Asn Asp Pro Leu Glu Ala Ala His Gly
245 250 255
Gly Asn Val Leu Ile Thr Asp Thr Trp Ile Ser Met Gly Gln Glu Glu
260 265 270
Glu Lys Lys Lys Arg Leu Gln Ala Phe Gln Gly Tyr Gln Val Thr Met
275 280 285
Lys Thr Ala Lys Val Ala Ala Ser Asp Trp Thr Phe Leu His Cys Leu
290 295 300
Pro Arg Lys Pro Glu Glu Val Asp Asp Glu Val Phe Tyr Ser Pro Arg
305 310 315 320
Ser Leu Val Phe Pro Glu Ala Glu Asn Arg Lys Trp Thr Ile Met Ala
325 330 335
Val Met Val Ser Leu Leu Thr Asp Tyr Ser Pro Gln Leu Gln Lys Pro
340 345 350
Lys Phe
<210> 3
<211> 263
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary GD2 target binding moiety
<400> 3
Asp Ile Leu Leu Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Arg
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile His Lys Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu
100 105 110
Lys Arg Ala Asp Ala Ala Pro Thr Val Ser Ile Phe Pro Gly Ser Gly
115 120 125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Glu Val Lys Leu Gln Gln Ser Gly Pro Ser
130 135 140
Leu Val Glu Pro Gly Ala Ser Val Met Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly
145 150 155 160
Ser Ser Phe Thr Gly Tyr Asn Met Asn Trp Val Arg Gln Asn Ile Gly
165 170 175
Lys Ser Leu Glu Trp Ile Gly Ala Ile Asp Pro Tyr Tyr Gly Gly Thr
180 185 190
Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Lys Gly Arg Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys
195 200 205
Ser Ser Ser Thr Ala Tyr Met His Leu Lys Ser Leu Thr Ser Glu Asp
210 215 220
Ser Ala Val Tyr Tyr Cys Val Ser Gly Met Glu Tyr Trp Gly Gln Gly
225 230 235 240
Thr Ser Val Thr Val Ser Ser Ala Lys Thr Thr Pro Pro Ser Val Tyr
245 250 255
Gly Arg Val Thr Val Ser Ser
260
<210> 4
<211> 248
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary CD33 target binding moiety
<400> 4
Gly Ser Asn Ile Met Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser
1 5 10 15
Ala Gly Glu Lys Val Thr Met Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Val Phe
20 25 30
Phe Ser Ser Ser Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Ile Pro
35 40 45
Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser
50 55 60
Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
65 70 75 80
Leu Thr Ile Ser Ser Val Gln Ser Glu Asp Leu Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
His Gln Tyr Leu Ser Ser Arg Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu
100 105 110
Ile Lys Arg Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Ser Gly Gly
115 120 125
Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Val Val Lys Pro
130 135 140
Gly Ala Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr
145 150 155 160
Ser Tyr Tyr Ile His Trp Ile Lys Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Glu
165 170 175
Trp Val Gly Val Ile Tyr Pro Gly Asn Asp Asp Ile Ser Tyr Asn Gln
180 185 190
Lys Phe Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Thr Thr
195 200 205
Ala Tyr Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr
210 215 220
Tyr Cys Ala Arg Glu Val Arg Leu Arg Tyr Phe Asp Val Trp Gly Ala
225 230 235 240
Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
245
<210> 5
<211> 241
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary mesothelin target binding moiety
<400> 5
Met Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Glu Lys Pro Gly
1 5 10 15
Ala Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly
20 25 30
Tyr Thr Met Asn Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Glu Trp
35 40 45
Ile Gly Leu Ile Thr Pro Tyr Asn Gly Ala Ser Ser Tyr Asn Gln Lys
50 55 60
Phe Arg Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala
65 70 75 80
Tyr Met Asp Leu Leu Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe
85 90 95
Cys Ala Arg Gly Gly Tyr Asp Gly Arg Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Val Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Glu Leu Thr Gln Ser Pro Ala
130 135 140
Ile Met Ser Ala Ser Pro Gly Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Ser Ala
145 150 155 160
Ser Ser Ser Val Ser Tyr Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Ser Gly Thr
165 170 175
Ser Pro Lys Arg Trp Ile Tyr Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Val
180 185 190
Pro Gly Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Asn Ser Tyr Ser Leu Thr
195 200 205
Ile Ser Ser Val Glu Ala Glu Asp Asp Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln
210 215 220
Trp Ser Gly Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Ile
225 230 235 240
Lys
<210> 6
<211> 221
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary EGFRVIII target binding moiety
<400> 6
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Val Thr Ser Gly Phe Thr Phe Arg Lys Phe
20 25 30
Gly Met Ser Trp Val Arg Gln Thr Ser Asp Lys Arg Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Ser Ile Ser Thr Gly Gly Tyr Asn Thr Tyr Tyr Ser Asp Asn Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Glu Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Ser Ser Leu Lys Ser Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Arg Gly Tyr Ser Ser Thr Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Glu Leu Thr Gln Ser Pro Ala
130 135 140
Ser Leu Ser Val Ala Thr Gly Glu Lys Val Thr Ile Arg Cys Met Thr
145 150 155 160
Ser Thr Asp Ile Asp Asp Asp Met Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly
165 170 175
Glu Pro Pro Lys Phe Leu Ile Ser Glu Gly Asn Thr Leu Arg Pro Gly
180 185 190
Val Pro Ser Arg Phe Ser Ser Ser Gly Thr Gly Thr Asp Phe Val Phe
195 200 205
Thr Ile Glu Asn Thr Leu Ser Glu Asp Val Gly Asp Tyr
210 215 220
<210> 7
<211> 42
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary 4-1BB intracellular signalling region
<400> 7
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
1 5 10 15
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
20 25 30
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu
35 40
<210> 8
<211> 36
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary OX-40 intracellular signalling region
<400> 8
Arg Asp Gln Arg Leu Pro Pro Asp Ala His Lys Pro Pro Gly Gly Gly
1 5 10 15
Ser Phe Arg Thr Pro Ile Gln Glu Glu Gln Ala Asp Ala His Ser Thr
20 25 30
Leu Ala Lys Ile
35
<210> 9
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary CD28 intracellular signalling region with transmembrane
domain
<400> 9
Ile Glu Val Met Tyr Pro Pro Pro Tyr Leu Asp Asn Glu Lys Ser Asn
1 5 10 15
Gly Thr Ile Ile His Val Lys Gly Lys His Leu Cys Pro Ser Pro Leu
20 25 30
Phe Pro Gly Pro Ser Lys Pro Phe Trp Val Leu Val Val Val Gly Gly
35 40 45
Val Leu Ala Cys Tyr Ser Leu Leu Val Thr Val Ala Phe Ile Ile Phe
50 55 60
Trp Val Arg Ser Lys Arg Ser Arg Leu Leu His Ser Asp Tyr Met Asn
65 70 75 80
Met Thr Pro Arg Arg Pro Gly Pro Thr Arg Lys His Tyr Gln Pro Tyr
85 90 95
Ala Pro Pro Arg Asp Phe Ala Ala Tyr Arg Ser
100 105
<210> 10
<211> 38
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary ICOS intracellular signalling region
<400> 10
Cys Trp Leu Thr Lys Lys Lys Tyr Ser Ser Ser Val His Asp Pro Asn
1 5 10 15
Gly Glu Tyr Met Phe Met Arg Ala Val Asn Thr Ala Lys Lys Ser Arg
20 25 30
Leu Thr Asp Val Thr Leu
35
<210> 11
<211> 112
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary CD3 zeta intracellular signalling region
<400> 11
Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly
1 5 10 15
Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr
20 25 30
Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys
35 40 45
Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys
50 55 60
Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg
65 70 75 80
Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala
85 90 95
Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
100 105 110
<210> 12
<211> 1896
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary protein of the invention GD2 ASS+OTC
<400> 12
Met Pro Arg Gly Trp Thr Ala Leu Cys Leu Leu Ser Leu Leu Pro Ser
1 5 10 15
Gly Phe Met Ser Leu Asp Asn Asn Gly Thr Ala Thr Pro Glu Leu Pro
20 25 30
Thr Gln Gly Thr Phe Ser Asn Val Ser Thr Asn Val Ser Tyr Gln Glu
35 40 45
Thr Thr Thr Pro Ser Thr Leu Gly Ser Thr Ser Leu His Pro Val Ser
50 55 60
Gln His Gly Asn Glu Ala Thr Thr Asn Ile Thr Glu Thr Thr Val Lys
65 70 75 80
Phe Thr Ser Thr Ser Val Ile Thr Ser Val Tyr Gly Asn Thr Asn Ser
85 90 95
Ser Val Gln Ser Gln Thr Ser Val Ile Ser Thr Val Phe Thr Thr Pro
100 105 110
Ala Asn Val Ser Thr Pro Glu Thr Thr Leu Lys Pro Ser Leu Ser Pro
115 120 125
Gly Asn Val Ser Asp Leu Ser Thr Thr Ser Thr Ser Leu Ala Thr Ser
130 135 140
Pro Thr Lys Pro Tyr Thr Ser Ser Ser Pro Ile Leu Ser Asp Ile Lys
145 150 155 160
Ala Glu Ile Lys Cys Ser Gly Ile Arg Glu Val Lys Leu Thr Gln Gly
165 170 175
Ile Cys Leu Glu Gln Asn Lys Thr Ser Ser Cys Ala Glu Phe Lys Lys
180 185 190
Asp Arg Gly Glu Gly Leu Ala Arg Val Leu Cys Gly Glu Glu Gln Ala
195 200 205
Asp Ala Asp Ala Gly Ala Gln Val Cys Ser Leu Leu Leu Ala Gln Ser
210 215 220
Glu Val Arg Pro Gln Cys Leu Leu Leu Val Leu Ala Asn Arg Thr Glu
225 230 235 240
Ile Ser Ser Lys Leu Gln Leu Met Lys Lys His Gln Ser Asp Leu Lys
245 250 255
Lys Leu Gly Ile Leu Asp Phe Thr Glu Gln Asp Val Ala Ser His Gln
260 265 270
Ser Tyr Ser Gln Lys Thr Leu Ile Ala Leu Val Thr Ser Gly Ala Leu
275 280 285
Leu Ala Val Leu Gly Ile Thr Gly Tyr Phe Leu Met Asn Arg Arg Ser
290 295 300
Trp Ser Pro Thr Gly Glu Arg Leu Glu Leu Glu Pro Val Asp Arg Val
305 310 315 320
Lys Gln Thr Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu
325 330 335
Ser Asn Pro Gly Pro Gly Asn Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu
340 345 350
Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu His Ala Ala Arg Pro Asp Ile Leu Leu
355 360 365
Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly Asp Gln Ala Ser
370 375 380
Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Arg Asn Gly Asn Thr
385 390 395 400
Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu
405 410 415
Ile His Lys Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser
420 425 430
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu
435 440 445
Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser Thr His Val Pro
450 455 460
Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Arg Ala Asp
465 470 475 480
Ala Ala Pro Thr Val Ser Ile Phe Pro Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
485 490 495
Gly Gly Glu Val Lys Leu Gln Gln Ser Gly Pro Ser Leu Val Glu Pro
500 505 510
Gly Ala Ser Val Met Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Ser Ser Phe Thr
515 520 525
Gly Tyr Asn Met Asn Trp Val Arg Gln Asn Ile Gly Lys Ser Leu Glu
530 535 540
Trp Ile Gly Ala Ile Asp Pro Tyr Tyr Gly Gly Thr Ser Tyr Asn Gln
545 550 555 560
Lys Phe Lys Gly Arg Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr
565 570 575
Ala Tyr Met His Leu Lys Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr
580 585 590
Tyr Cys Val Ser Gly Met Glu Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr
595 600 605
Val Ser Ser Ala Lys Thr Thr Pro Pro Ser Val Tyr Gly Arg Val Thr
610 615 620
Val Ser Ser Ala Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro
625 630 635 640
Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe
645 650 655
Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val
660 665 670
Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe
675 680 685
Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro
690 695 700
Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr
705 710 715 720
Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val
725 730 735
Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala
740 745 750
Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg
755 760 765
Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly
770 775 780
Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro
785 790 795 800
Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser
805 810 815
Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln
820 825 830
Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His
835 840 845
Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys Lys Asp Pro Lys
850 855 860
Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala
865 870 875 880
Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly
885 890 895
Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile
900 905 910
Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val
915 920 925
Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe
930 935 940
Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly
945 950 955 960
Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg
965 970 975
Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln
980 985 990
Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp
995 1000 1005
Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys
1010 1015 1020
Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln
1025 1030 1035
Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly
1040 1045 1050
Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu
1055 1060 1065
Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala
1070 1075 1080
Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys
1085 1090 1095
Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Ser Ser Lys
1100 1105 1110
Gly Ser Val Val Leu Ala Tyr Ser Gly Gly Leu Asp Thr Ser Cys
1115 1120 1125
Ile Leu Val Trp Leu Lys Glu Gln Gly Tyr Asp Val Ile Ala Tyr
1130 1135 1140
Leu Ala Asn Ile Gly Gln Lys Glu Asp Phe Glu Glu Ala Arg Lys
1145 1150 1155
Lys Ala Leu Lys Leu Gly Ala Lys Lys Val Phe Ile Glu Asp Val
1160 1165 1170
Ser Arg Glu Phe Val Glu Glu Phe Ile Trp Pro Ala Ile Gln Ser
1175 1180 1185
Ser Ala Leu Tyr Glu Asp Arg Tyr Leu Leu Gly Thr Ser Leu Ala
1190 1195 1200
Arg Pro Cys Ile Ala Arg Lys Gln Val Glu Ile Ala Gln Arg Glu
1205 1210 1215
Gly Ala Lys Tyr Val Ser His Gly Ala Thr Gly Lys Gly Asn Asp
1220 1225 1230
Gln Val Arg Phe Glu Leu Ser Cys Tyr Ser Leu Ala Pro Gln Ile
1235 1240 1245
Lys Val Ile Ala Pro Trp Arg Met Pro Glu Phe Tyr Asn Arg Phe
1250 1255 1260
Lys Gly Arg Asn Asp Leu Met Glu Tyr Ala Lys Gln His Gly Ile
1265 1270 1275
Pro Ile Pro Val Thr Pro Lys Asn Pro Trp Ser Met Asp Glu Asn
1280 1285 1290
Leu Met His Ile Ser Tyr Glu Ala Gly Ile Leu Glu Asn Pro Lys
1295 1300 1305
Asn Gln Ala Pro Pro Gly Leu Tyr Thr Lys Thr Gln Asp Pro Ala
1310 1315 1320
Lys Ala Pro Asn Thr Pro Asp Ile Leu Glu Ile Glu Phe Lys Lys
1325 1330 1335
Gly Val Pro Val Lys Val Thr Asn Val Lys Asp Gly Thr Thr His
1340 1345 1350
Gln Thr Ser Leu Glu Leu Phe Met Tyr Leu Asn Glu Val Ala Gly
1355 1360 1365
Lys His Gly Val Gly Arg Ile Asp Ile Val Glu Asn Arg Phe Ile
1370 1375 1380
Gly Met Lys Ser Arg Gly Ile Tyr Glu Thr Pro Ala Gly Thr Ile
1385 1390 1395
Leu Tyr His Ala His Leu Asp Ile Glu Ala Phe Thr Met Asp Arg
1400 1405 1410
Glu Val Arg Lys Ile Lys Gln Gly Leu Gly Leu Lys Phe Ala Glu
1415 1420 1425
Leu Val Tyr Thr Gly Phe Trp His Ser Pro Glu Cys Glu Phe Val
1430 1435 1440
Arg His Cys Ile Ala Lys Ser Gln Glu Arg Val Glu Gly Lys Val
1445 1450 1455
Gln Val Ser Val Leu Lys Gly Gln Val Tyr Ile Leu Gly Arg Glu
1460 1465 1470
Ser Pro Leu Ser Leu Tyr Asn Glu Glu Leu Val Ser Met Asn Val
1475 1480 1485
Gln Gly Asp Tyr Glu Pro Thr Asp Ala Thr Gly Phe Ile Asn Ile
1490 1495 1500
Asn Ser Leu Arg Leu Lys Glu Tyr His Arg Leu Gln Ser Lys Val
1505 1510 1515
Thr Ala Lys Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys
1520 1525 1530
Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Leu Phe Asn Leu Arg
1535 1540 1545
Ile Leu Leu Asn Asn Ala Ala Phe Arg Asn Gly His Asn Phe Met
1550 1555 1560
Val Arg Asn Phe Arg Cys Gly Gln Pro Leu Gln Asn Lys Val Gln
1565 1570 1575
Leu Lys Gly Arg Asp Leu Leu Thr Leu Lys Asn Phe Thr Gly Glu
1580 1585 1590
Glu Ile Lys Tyr Met Leu Trp Leu Ser Ala Asp Leu Lys Phe Arg
1595 1600 1605
Ile Lys Gln Lys Gly Glu Tyr Leu Pro Leu Leu Gln Gly Lys Ser
1610 1615 1620
Leu Gly Met Ile Phe Glu Lys Arg Ser Thr Arg Thr Arg Leu Ser
1625 1630 1635
Thr Glu Thr Gly Leu Ala Leu Leu Gly Gly His Pro Cys Phe Leu
1640 1645 1650
Thr Thr Gln Asp Ile His Leu Gly Val Asn Glu Ser Leu Thr Asp
1655 1660 1665
Thr Ala Arg Val Leu Ser Ser Met Ala Asp Ala Val Leu Ala Arg
1670 1675 1680
Val Tyr Lys Gln Ser Asp Leu Asp Thr Leu Ala Lys Glu Ala Ser
1685 1690 1695
Ile Pro Ile Ile Asn Gly Leu Ser Asp Leu Tyr His Pro Ile Gln
1700 1705 1710
Ile Leu Ala Asp Tyr Leu Thr Leu Gln Glu His Tyr Ser Ser Leu
1715 1720 1725
Lys Gly Leu Thr Leu Ser Trp Ile Gly Asp Gly Asn Asn Ile Leu
1730 1735 1740
His Ser Ile Met Met Ser Ala Ala Lys Phe Gly Met His Leu Gln
1745 1750 1755
Ala Ala Thr Pro Lys Gly Tyr Glu Pro Asp Ala Ser Val Thr Lys
1760 1765 1770
Leu Ala Glu Gln Tyr Ala Lys Glu Asn Gly Thr Lys Leu Leu Leu
1775 1780 1785
Thr Asn Asp Pro Leu Glu Ala Ala His Gly Gly Asn Val Leu Ile
1790 1795 1800
Thr Asp Thr Trp Ile Ser Met Gly Gln Glu Glu Glu Lys Lys Lys
1805 1810 1815
Arg Leu Gln Ala Phe Gln Gly Tyr Gln Val Thr Met Lys Thr Ala
1820 1825 1830
Lys Val Ala Ala Ser Asp Trp Thr Phe Leu His Cys Leu Pro Arg
1835 1840 1845
Lys Pro Glu Glu Val Asp Asp Glu Val Phe Tyr Ser Pro Arg Ser
1850 1855 1860
Leu Val Phe Pro Glu Ala Glu Asn Arg Lys Trp Thr Ile Met Ala
1865 1870 1875
Val Met Val Ser Leu Leu Thr Asp Tyr Ser Pro Gln Leu Gln Lys
1880 1885 1890
Pro Lys Phe
1895
<210> 13
<211> 1521
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary protein of the invention GD2 ASS1
<400> 13
Met Pro Arg Gly Trp Thr Ala Leu Cys Leu Leu Ser Leu Leu Pro Ser
1 5 10 15
Gly Phe Met Ser Leu Asp Asn Asn Gly Thr Ala Thr Pro Glu Leu Pro
20 25 30
Thr Gln Gly Thr Phe Ser Asn Val Ser Thr Asn Val Ser Tyr Gln Glu
35 40 45
Thr Thr Thr Pro Ser Thr Leu Gly Ser Thr Ser Leu His Pro Val Ser
50 55 60
Gln His Gly Asn Glu Ala Thr Thr Asn Ile Thr Glu Thr Thr Val Lys
65 70 75 80
Phe Thr Ser Thr Ser Val Ile Thr Ser Val Tyr Gly Asn Thr Asn Ser
85 90 95
Ser Val Gln Ser Gln Thr Ser Val Ile Ser Thr Val Phe Thr Thr Pro
100 105 110
Ala Asn Val Ser Thr Pro Glu Thr Thr Leu Lys Pro Ser Leu Ser Pro
115 120 125
Gly Asn Val Ser Asp Leu Ser Thr Thr Ser Thr Ser Leu Ala Thr Ser
130 135 140
Pro Thr Lys Pro Tyr Thr Ser Ser Ser Pro Ile Leu Ser Asp Ile Lys
145 150 155 160
Ala Glu Ile Lys Cys Ser Gly Ile Arg Glu Val Lys Leu Thr Gln Gly
165 170 175
Ile Cys Leu Glu Gln Asn Lys Thr Ser Ser Cys Ala Glu Phe Lys Lys
180 185 190
Asp Arg Gly Glu Gly Leu Ala Arg Val Leu Cys Gly Glu Glu Gln Ala
195 200 205
Asp Ala Asp Ala Gly Ala Gln Val Cys Ser Leu Leu Leu Ala Gln Ser
210 215 220
Glu Val Arg Pro Gln Cys Leu Leu Leu Val Leu Ala Asn Arg Thr Glu
225 230 235 240
Ile Ser Ser Lys Leu Gln Leu Met Lys Lys His Gln Ser Asp Leu Lys
245 250 255
Lys Leu Gly Ile Leu Asp Phe Thr Glu Gln Asp Val Ala Ser His Gln
260 265 270
Ser Tyr Ser Gln Lys Thr Leu Ile Ala Leu Val Thr Ser Gly Ala Leu
275 280 285
Leu Ala Val Leu Gly Ile Thr Gly Tyr Phe Leu Met Asn Arg Arg Ser
290 295 300
Trp Ser Pro Thr Gly Glu Arg Leu Glu Leu Glu Pro Val Asp Arg Val
305 310 315 320
Lys Gln Thr Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu
325 330 335
Ser Asn Pro Gly Pro Gly Asn Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu
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gtcattgctc cctggaggat gcctgaattc tacaaccggt tcaagggccg caatgacctg 480
atggagtacg caaagcaaca cgggattccc atcccggtca ctcccaagaa cccgtggagc 540
atggatgaga acctcatgca catcagctac gaggctggaa tcctggagaa ccccaagaac 600
caagcgcctc caggtctcta cacgaagacc caggacccag ccaaagcccc caacacccct 660
gacattctcg agatcgagtt caaaaaaggg gtccctgtga aggtgaccaa cgtcaaggat 720
ggcaccaccc accagacctc cttggagctc ttcatgtacc tgaacgaagt cgcgggcaag 780
catggcgtgg gccgtattga catcgtggag aaccgcttca ttggaatgaa gtcccgaggt 840
atctacgaga ccccagcagg caccatcctt taccatgctc atttagacat cgaggccttc 900
accatggacc gggaagtgcg caaaatcaaa caaggcctgg gcttgaaatt tgctgagctg 960
gtgtataccg gtttctggca cagccctgag tgtgaatttg tccgccactg catcgccaag 1020
tcccaggagc gagtggaagg gaaagtgcag gtgtccgtcc tcaagggcca ggtgtacatc 1080
ctcggccggg agtccccact gtctctctac aatgaggagc tggtgagcat gaacgtgcag 1140
ggtgattatg agccaactga tgccaccggg ttcatcaaca tcaattccct caggctgaag 1200
gaatatcatc gtctccagag caaggtcact gccaaa 1236
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<211> 1062
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding OTC
<400> 25
atgctgttta atctgaggat cctgttaaac aatgcagctt ttagaaatgg tcacaacttc 60
atggttcgaa attttcggtg tggacaacca ctacaaaata aagtgcagct gaagggccgt 120
gaccttctca ctctaaaaaa ctttaccgga gaagaaatta aatatatgct atggctatca 180
gcagatctga aatttaggat aaaacagaaa ggagagtatt tgcctttatt gcaagggaag 240
tccttaggca tgatttttga gaaaagaagt actcgaacaa gattgtctac agaaacaggc 300
ttagcacttc tgggaggaca tccttgtttt cttaccacac aagatattca tttgggtgtg 360
aatgaaagtc tcacggacac ggcccgtgta ttgtctagca tggcagatgc agtattggct 420
cgagtgtata aacaatcaga tttggacacc ctggctaaag aagcatccat cccaattatc 480
aatgggctgt cagatttgta ccatcctatc cagatcctgg ctgattacct cacgctccag 540
gaacactata gctctctgaa aggtcttacc ctcagctgga tcggggatgg gaacaatatc 600
ctgcactcca tcatgatgag cgcagcgaaa ttcggaatgc accttcaggc agctactcca 660
aagggttatg agccggatgc tagtgtaacc aagttggcag agcagtatgc caaagagaat 720
ggtaccaagc tgttgctgac aaatgatcca ttggaagcag cgcatggagg caatgtatta 780
attacagaca cttggataag catgggacaa gaagaggaga agaaaaagcg gctccaggct 840
ttccaaggtt accaggttac aatgaagact gctaaagttg ctgcctctga ctggacattt 900
ttacactgct tgcccagaaa gccagaagaa gtggatgatg aagtctttta ttctcctcga 960
tcactagtgt tcccagaggc agaaaacaga aagtggacaa tcatggctgt catggtgtcc 1020
ctgctgacag attactcacc tcagctccag aagcctaaat tt 1062
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<211> 789
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding GD2 scFv
<400> 26
gatattctgc tcacacagac cccactctcc ctgcccgtgt cactcgggga tcaggctagc 60
atttcttgcc gctcatctca gtctctggtc caccggaatg ggaacacata cctccattgg 120
tacctccaga aacctggaca gagccctaaa ctgctcatcc acaaagtctc aaatcggttc 180
tccggcgtgc ccgatcgctt tagcggatcc ggatctggga ccgacttcac actgaaaatc 240
tcacgagtgg aggctgagga tctcggcgtc tacttctgta gtcagagtac ccacgtccca 300
cccctcacct ttggcgctgg aacaaaactg gagctgaaac gagccgatgc tgctcctacc 360
gtgtccatct ttcctggctc cgggggaggc gggagcggag gcgaagtgaa actccagcag 420
tctggccctt ctctcgtgga acctggcgct tctgtgatga tctcctgtaa ggcctctgga 480
tcttccttta ccggctacaa catgaactgg gtccggcaga acattggcaa atccctggaa 540
tggattggcg ccatcgatcc ttactacggc ggcacatcat acaatcagaa attcaagggg 600
cgagcaacac tcactgtcga caaatcttca tccaccgcct acatgcacct gaaatctctc 660
acatccgagg atagtgctgt ctactactgt gtctctggca tggaatactg gggacaggga 720
acttctgtca ccgtgtctag tgccaaaacc acacctccct ccgtgtacgg acgagtcact 780
gtctcatct 789
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<211> 744
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding CD33 scFv
<400> 27
ggatccaaca tcatgctgac ccagagccct agcagcctgg ccgtgtctgc cggcgagaaa 60
gtgaccatga gctgcaagag cagccagagc gtgttcttca gcagctccca gaagaactac 120
ctagcctggt atcagcagat cccaggccag agccctaagc tgctgatcta ctgggccagc 180
accagagaaa gcggcgtgcc cgatagattc accggaagcg gttctggcac cgacttcacc 240
ctgacaatca gcagcgtgca gagcgaggac ctggccatct actactgcca ccagtacctg 300
agcagccgga cctttggcgg aggcaccaag ctggaaatca agagaggcgg cggaggctca 360
ggcggaggcg gatctagtgg cggaggatct caggtgcagc tgcagcagcc aggcgccgag 420
gtcgtgaaac ctggcgcctc tgtgaagatg tcctgcaagg ccagcggcta caccttcacc 480
agctactaca tccactggat caagcagacc cctggacagg gcctggaatg ggtgggagtg 540
atctaccccg gcaacgacga catcagctac aaccagaagt tcaagggcaa ggccaccctg 600
accgccgaca agtctagcac caccgcctac atgcagctgt ccagcctgac cagcgaggac 660
agcgccgtgt actactgcgc cagagaagtg cggctgcggt acttcgatgt gtggggagcc 720
ggcaccaccg tgaccgtgtc atct 744
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<211> 723
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding Mesothelin scFv
<400> 28
atgcaggtac aactgcagca gtctgggcct gagctggaga agcctggcgc ttcagtgaag 60
atatcctgca aggcttctgg ttactcattc actggctaca ccatgaactg ggtgaagcag 120
agccatggaa agagccttga gtggattgga cttattactc cttacaatgg tgcttctagc 180
tacaaccaga agttcagggg caaggccaca ttaactgtag acaagtcatc cagcacagcc 240
tacatggacc tcctcagtct gacatctgaa gactctgcag tctatttctg tgcaaggggg 300
ggttacgacg ggaggggttt tgactactgg ggccaaggga ccacggtcac cgtctcctca 360
ggtgtaggcg gttcaggcgg cggtggctct ggcggtggcg gatcggacat cgagctcact 420
cagtctccag caatcatgtc tgcatctcca ggggagaagg tcaccatgac ctgcagtgcc 480
agctcaagtg taagttacat gcactggtac cagcagaagt caggcacctc ccccaaaaga 540
tggatttatg acacatccaa actggcttct ggagtcccag gtcgcttcag tggcagtggg 600
tctggaaact cttactctct cacaatcagc agcgtggagg ctgaagatga tgcaacttat 660
tactgccagc agtggagtgg ttaccctctc acgttcggtg ctgggacaaa gttggaaata 720
aaa 723
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<211> 768
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> sequence encoding EGFRvIII scFv
<400> 29
caggtacaac tccagcagtc tgggggaggc ttagtgaagc ctggagcgtc tctgaaactc 60
tcctgtgtaa cctctggatt cactttcaga aaatttggca tgtcttgggt tcgccagact 120
agtgacaaga ggctggaatg ggtcgcatcc attagtactg gcggttataa cacgtactat 180
tcagacaatg taaagggccg attcaccatc tccagagaga atgccaagaa caccctgtac 240
ctgcaaatga gtagtctgaa gtctgaggac acggccttgt attactgtac aagaggctat 300
tctagtacct cttatgctat ggactactgg ggccaaggga ccacggtcac cgtctcctca 360
agtggaggcg gttcaggcgg aggtggctct ggcggtggcg gatcggacat cgagctcact 420
cagtctccag catccctgtc cgtggctaca ggagaaaaag tcactatcag atgcatgacc 480
agcactgata ttgatgatga tatgaactgg taccagcaga agccagggga accccctaag 540
ttccttattt cagaaggcaa tactcttcgg ccgggagtcc catcccgatt ttccagcagt 600
ggcactggca cagattttgt ttttacaatt gaaaacacac tctcggaaga tgttggagat 660
tactactgtt tgcaaagctt taacgtgcct cttacattcg gtgatggcac caagcttgaa 720
aaagctctag agcagaaact gatctcggaa gaagatctgg cgaagccc 768
<210> 30
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding ASL
<400> 30
gacgccatcc cggccagaaa agccctggcc agtggcgggc gcgacactat ccgtgcggcc 60
aggcggaggt gagtgcgcgg cggccggatg ggcgggacgg gcgtggagga cgccgagcac 120
cgtggcgcgc gctcacgtcc gcgtccccaa gggctgcgct ccctcaagcg cagtgcccag 180
aactcggagc cagcccggcc cgggggaccc tgctggccaa ggaggtcgtc agtccggtct 240
tgtcttccag acccggagga ccgaagcttc cggacgacga ggaaccgccc aacatggcct 300
cggaggtgag tgggacctcg gggactccgg tcctcctagc ctccaaagga gagagtgggg 360
gcgccagacc tgcctcgggc caccctgctg ggaatcgccc tccaggaagc aattttgaaa 420
attacctagg aagcctgcac ccccagccct cccgggcgca tcatctggag cccagcagtc 480
acctttacca ggactcacca gtatccgcag gcagcccttg tggcaaaccc accaacccac 540
actactaggg gtagagtggc tctgccctca cctcacagtg atgcctgcct ggccaggaaa 600
agtggctccc aagccttcag ccttccaact cttccttcct tcttaccacg tgtcctcctg 660
tcaggtccca ccccacacca catcccttct cctgctagag caattgtccc tgtttataga 720
ataaagctca gcccctaagt gttcttgtcc ttgactgtgg catgtggaaa gagccaggaa 780
aaaggggacg tcgcctcgtg gctccagcaa ccctggtgcc tggtcccttc ctgtctcact 840
ggaccctgcc tcttagggtc agtggctcct ggcctctcct cctgaccact gagatgctgg 900
attcccaggc agaggttttc cttccttggg ccatagttga tttatctggc aatgggggta 960
ataatagctg tcggcctcac tctgtaaggc actagattat gaggccattg ctttggaccc 1020
ttcaggtgag aggggctgtt cgcctgatgc ttgatgaagg gaactccggg aagcaggagg 1080
tctgggttcc aggccctttt ggccttcatt agctagcaat tcacttcctc tttctcaatg 1140
ccctgcaagc tcagtgccct gcaagcttct gggtcatggc aggggggtag ggcctggact 1200
ttggagccaa acagacttgg tttctgtacc agtcacttga gccctttaaa cctctttcct 1260
catttgtgaa ataggggtaa tattgcccac ctcataaaag gccgtaataa catatgtgaa 1320
atccctagca cagggctgag caacagtagg tgctcaataa atggtggcta accacaacaa 1380
tactgatatt tctactttgg gaggccgagg cgggaggact gctgaagccc aggaattcca 1440
gaccagccag ggcaatgtaa tgagaccctg tctctacaaa aagattttga aaattaccca 1500
ggtgtggtgg cgtacacctg tagtctcaca ggaggcggag gcatgaggat tgcttgagcc 1560
caggagtttg agactgcagt gagcatgatc tcaccactgc actccagccc aggcaacaga 1620
gtgagatcca gtttcaaaaa aataaaaata aaaaaacctg gcaggcatgg tggctcacac 1680
ctgtaatccc agcactttgg gaggtcgagg tgggcagatc acctgaggtc aggagtttga 1740
gaccagcctg gccaacatgg tgaaaccccg tctctactaa aaatgcaaaa attagctggg 1800
tgtagtggtg ggtgcctgta gtcccagcta ttcgggaggc tgaggcagga gaatcgcttg 1860
aactcgggag gcggaggttg cagtgagctg agatcgcacc actgcactcc agcctgggcg 1920
acaaagcaag actccacctc aaaaaaagaa aaaaaaccca caagtcccaa aaccaaaact 1980
ggtatttccc atgtacattc gaccttaact gttgctcatt caacccagcc caactcagtg 2040
ccccatcccc tggccctgaa gagaccattc tggcccagat gtgtcctggc ttggagtagc 2100
accttctgct accacactag gcctccactc tcctcagtgc ccaaggggag gcacctcact 2160
ctgatctccc tgtggggtcc tcttatgcct gccagtaagg ataggagttt ggttctagag 2220
cagagtggtc tggcttccaa caagcccagt gttctaggtg acctcaggtt gccccaggcc 2280
ttcctgtagg ttggcactaa ttggtttggc tgcagctcca cttattaagt agttattttt 2340
attactaaca acctaggcag ggtggcccag gagcccgctg ggggaggcgg tgccaggctc 2400
ctggctgagg ggcaggctgg ccccaattct gactggctgg ctccagtgat caggaccagg 2460
gccccacgtg gtgctttgct ggagatctag gcttggtggg gcagctgtgg ggtaaggggc 2520
aggaccagct caaagatggg gtgggggcgg aggctgcctc tgcagggcag agtcctttgg 2580
cagtcgggac tgttgggcat agaggagtca gctcacagct cagggccaga gcactggaga 2640
ggtctctggg gtgcatacag gaaccaggag tggagctgaa gcatgtccta tcccctgcca 2700
gccctccctt agtaacagct ggcatttctc gagtccttcc tgagcaccag gcaccgtgtt 2760
atgtatgcaa tttgcaaata ttatctgatt aaatgctcac aataaggcta tcagagaggt 2820
actattatta tccttatctt attattatta ttattattat ttttaagaag gagtcttgct 2880
ctgtcgccca agctggagta caatggcgcc atctctgctc accgcaacct ctacctccag 2940
gattcaagtg attctcctgc ttcagactcc caagtggctg ggactacagc ttcctgccac 3000
cgcgcctggc taatgtttat atttttagta cagatgaggt ttcaccatgt tggccaggct 3060
gatctcgaac tcctgacctc aagcgatcca cctgcctggg cctcccaacc ctgagggttt 3120
ttgtttttgt ttttgttttg agacagagtc ttgctctgtc gcccaggctg gagtgcagtg 3180
gcacgatctc agctcactgc aagctccgcc tcccgggttc acgccattct cctgcctcag 3240
cctcccaagt agctgggact acaggcgccc aacaccccca tgcctggcta atttttttgt 3300
gtgtgttttc agtagagacg gagtttcacc atgttagcca ggatggtctc catctcctga 3360
cctcgtgatc tgcccacctc agcctcccaa agtgctagga ttataggtgt gagccaccac 3420
gcccagcccc tgaggtttaa taataggtgc caggccaggt ggttaataga agtctggggc 3480
attgtagggg gacagaggag gatatatgtc cccattggcc attgtagact cccttccaca 3540
aaaaggacgt cagtgaagtg acatgcccac ctctacccca ccctcctccc agtcctgggc 3600
actagggctg ctccccaggt gttctgtacc ccctccccac tctgtcccat gccctggcct 3660
ctgccctctt tcaaaacata gatgtggctg gcgcctaggc tcatgcctat aatctcagca 3720
ctttgggaag ctgaggctgg aggacagctt gagcccagga attcaagacc agcctgggca 3780
acatagtgag accctgtctc taccaattat tttattttat tttattttgt tcatttattt 3840
atttattttg agacagagtt ttgctctgtc acctaggctg gagtgcagtg gcgtgatctt 3900
ggctcactgc aacctccgcc tcccgggttc aagcgattct cctgcctcag cctcctaagt 3960
agctggaact acaggcgagt gccaccacgc ctggctaatt tttgtatttt tagtagagac 4020
caggtttcac catgttgacc aggatggtct ctgtctcctg acctcatgat ccacccacct 4080
tagccttcca aaatgctggg attacaggca tgagccacca ctcccagtcc tataaaattt 4140
taaaaaaatg tctgggtgtg gtggcgcatg cttgtagtcc caactattgg ggaggctgag 4200
gcaagaggat tggttgagac caggagtttg aggctgcagt gagctatgat ggtgccaccg 4260
cactccaacc tgggtaacaa agtgagaccc tgtgtctaaa aaagaattta aaggccgggt 4320
gtggtggctc acacccgtaa tcccaggact ttgggaggcc gaggtgggca gatcacgagg 4380
tcagattaag accatcctgg ctaacaaggt gaaaccacgt ctctactgaa aaaaaaaaat 4440
acaaaaaatt agccaggcat ggtggtgggc acctgtagtc ccagctactc aggaggctga 4500
ggcaggagaa tggcgtgaat ctgggaggtg gagcttgcag tgagccaaga tcctgccact 4560
gcactccagc ctgggtgaca aagagagact ccatctcaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaga 4620
attaaaaaag atttttttaa tgaacaaaac aggctcggca cagtggctca tgcctgtaat 4680
cccaagcact tcgggatgcc aaggtcaggg gatcacctga gatcaggagt tcgagaccag 4740
cctgaccaac atggtgaaac cccgtctcta ctaaaaatat aaaactcagc caggtgtggt 4800
ggcacacgcc tgaaattcca gctactcggg aggctgaggc aggaaaattg gcttgaagcc 4860
gggaggtgga ggttgcagtg agccgagatc acgccactgc actccagcct aggcaacaga 4920
gtgagactct atctcaaaga aaacgaacaa aacatagatg cctacatacc attcctctgc 4980
ccttggctcc tggggagtaa gggatcaccc agtgacctcc tagaaggcca gtgacaatgg 5040
ggggtgtcag ggtgcttttc agagccaagg gagtggtagg aattgggatc ttagtccagc 5100
tccaagctgt gagggagaga gttgcagggc acttaagctt ggtggagacc ctcaaggcct 5160
ctttgcctgt ccctgcagca aaggttctgg acaccagagc caagtccaga agccctggtg 5220
gaacaggggt gaaaagcata ggttctgact tcagactgct gggccgcagc cctggctatc 5280
ccaccccagg tgagagcagg ctgctctgtg cctcagtttc cccatcttca tagtggaatt 5340
gtattggtgc ctacccagag ggttgtgtca acaattagga tggcacctag caccttggtc 5400
agtggtggga aaggttccag aagttctgct gtggtcccag gggtgtctca ggccctgcca 5460
tcatctcctt ggaggggtgc catgtggtgg gaaagaaccc caacttcaag gccacacaca 5520
gtggctcatg cctgtaatcc tagcactttc agaggccaag atgggaggat cacctgaggt 5580
caggagttca agaccagcct ggccaacatg gtgaaacccc atctctacta atgatacaaa 5640
aattagctgg gtgtggtggc acgtgcctgt aatcccagct acttgggagt ctgaggcagg 5700
agaatctctt gaacctggga ggcagagttt gcagtgagct gagatggcac cactgtactc 5760
cagcctggcc gacaaagtga gactctgtct caaaaaaaaa aaaaaagaac ccaaactttt 5820
ggtgttcagc catgttccca tgctcactcc cagggtggtg actctgggaa ggtctcagcc 5880
tccttgtctg cccagttaga atgatctgat gcccctgcta ccatcagact tgataagttt 5940
cccaaagact ctttgcaaga agcactgttc tggagggtgg aggagagact aattgttctt 6000
gctctcctgg ccagagtggg aagctttggg gtggccggtt tgtgggtgca gtggacccca 6060
tcatggagaa gttcaacgcg tccattgcct acgaccggca cctttgggag gtggatgttc 6120
aaggcagcaa agcctacagc aggggcctgg agaaggcagg gctcctcacc aaggccgaga 6180
tggaccagat actccatggc ctagacaagg tacttgccgt ggcccaagcc ccacccaagg 6240
ccccttccct gtggccccag gctcccacca aatccctgag caaacagtgc agtgttgccc 6300
atctgtggtt tcacattgaa ctaattatat actcaagtgc tgtttaactg tgtgccttga 6360
tgactgcctc tctccatcct ttaatgaccc ctgtggccca catggctcat gggtaaaggt 6420
gtgctgggcc tgagatgccc cctcccaggg tgcgcttcca ggactcagct cctgggcagg 6480
gacagtcagt caccagggat agggtgggac caaggcaggg gctctcttgg ctgctgatgc 6540
ctgctcacct gaccccggca ttgctgctac ccactacagg tggctgagga gtgggcccag 6600
ggcaccttca aactgaactc caatgatgag gacatccaca cagccaatga gcgccgcctg 6660
aaggtacgac ccctggagcc ccaccgcttt ccttgcctcc cctctccacc ttgcccaggg 6720
ccactttgag cattagcacc attctgttta cttcgccatt ggcagacagc atgtgagacc 6780
tcaggacatg agccaggcac cctggctcat gcctataatc ctagcacttt gggaggctga 6840
ggtgggagga ttgcttgaga ccaggagttc gagaccagcc tgggcaacat aatgaggtcc 6900
cacagctaca aaaattaaaa aaagaaaaga aaaaaagaac aggcctcagc agaaatggcg 6960
agagatttgg ggaggacccg gagccctggg gtatggaggt aggttggcag ggctgatgag 7020
gaaaactgcc ctgcctgggt tgactcctct gggggtatag accgtgaccc tgggtctccc 7080
ttcacctcca ggagctcatt ggtgcaacgg cagggaagct gcacacggga cggagccgga 7140
atgaccaggt gctttagccc ctccaccccc tgctccgtgt tgtcccaacc ttgaggagcc 7200
cagggggcag ttagagttct gcagcggtcc tggctcctca gggaagcaac acatcggcct 7260
ccctgagcac catctcctcc ttgcacaggt ggtcacagac ctcaggctgt ggatgcggca 7320
gacctgctcc acgctctcgg gcctcctctg ggagctcatt aggaccatgg tggatcgggc 7380
agaggcgtga gtcctacagg gacacccagg gggcagacag aggtgtgatg gaagcctgaa 7440
caggagacct agggggcagg ggtgaacagc gtgggggtgc caggccctgg gggacagggg 7500
catcccagaa ctccaggatc gaggcagagc agccaggagt gggccatttc ctgcaggccc 7560
caatactccc atgccagtct agctcagcag gcagagaaga ctaacccttc gtggggctgg 7620
gtgcggtggc tcacgcctgt aatctcagca ctttgggagg ccgaggtggg tggatcacct 7680
gaggtcagga gttcgagacc agcctggcca acatgggaaa actctgtctc tactaaaaat 7740
acaaaaatta ggcaatgtgg tggtgtgcgc ctgtaatccc agctactcgg gagcctgagg 7800
cagaagaact gcttgaaccc gggaggagga ggttgcaatg agccgagatc gcgccattgc 7860
actccagcct gggctacaga gcgagactcc tgtctcaaaa aaaaagaaaa aaaaaaaaga 7920
aaactcacca tttgcagatt tgaaggcagg aagctaagcc aagcacagct agcttggctg 7980
tgcctggagc agccagagtc actccccaca ctgcctgtcc cccagatccc ccatcctaag 8040
cttcgcctcc ccatccagcc catctggcaa aagacagagc caaaggctgc ctcctgctgg 8100
cctcatttca ggctttggct tctgggacct ggtgtctttg ggactggatt tgttccttgc 8160
agacctggac gaagagctgc tgagaagtct ccatgtgttg tcagagaccc ctcctcttcc 8220
tcaactccct gtgacccctg ttgtgcagac ttgggggaaa acaagggcac aagaattgtc 8280
acccagcagg tggtgtgggg ctgctaggag gaacagggag tgtctgctac tgagttcagg 8340
gtttctttaa ttttttgttg ttgttgtttg ttgttgtttt tttttttttg agacagggtt 8400
ttgctctgtc acctagtctg gagtgtagtg gcgctatctg agctaactgc aaactctgcc 8460
tcctgggttc aagtgattct agtgcctcag cctcccaagt agctgagatt acaggtgtgc 8520
accaccatgt ccagctaatt tttgtatttt tttcagtaga gatgggtttt gccatgttga 8580
ccaggctggt cttgaactcc tgagctcagg tgatctgccc gcgtcggcct gccaaagtgc 8640
taggattaca cccataagcc actgcgctca gcttaatttt taaattttta actttttaaa 8700
ttgtctttag agatgagatc ctgctctgtc acctaggctg gagtgcaatg gcttggtaat 8760
agctcactgc agtctcaaac tcctggactc aaatgatcct cccacctcag ctttctgagt 8820
agctaggacc acaggtgtgc accacctgtg agacagagtc ttgctctgtt gcccaggctg 8880
gagtgcagtg gcgtgatctc cactcactgc aacctctgcc tcccaggttc acgccattct 8940
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ttttgtattt ttagtagaga cggggtttca ccatgttagc caggatggtc tcaatctccc 9060
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<213> Artificial Sequence
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tgcccgctgt gtttttgaca tgggggtgag tatacgtgac cctgttaggg aagggcggga 5100
cacaactgac aataactagt cttaattcta gagttaactt tttatggcag ttggttctgt 5160
attacatggg tttcagccta tctgctgcat acatttttgt tattagctgt ggatctggct 5220
gacttatttt cttgattcta ggctgaggtt ggtttcagca tgtatctgct tgatattggc 5280
ggtggctttc ctggatctga ggatgtgaaa cttaaatttg aagaggtaat ttagaacaaa 5340
actgtaatac tcagtagccg ttctaataaa ttcctttttg gaatatttca aaatttaagt 5400
gtcttaacta ataccacaat gggctgaagt gtcttggtgt gatattttga gtgatttctt 5460
tgtgctgtct gacattacac ttgataccat ttggttttct aaagtgtgaa tcagctttcc 5520
cagaagtctt ggataattgg ttacattgga aatcatggct cacacctgta atccagcact 5580
tggggaggcc aaggtggtag gatcacttga gcccaggagt ttgagaccag cctgggcaac 5640
acagtgagac cccatctcta caaaaaaaat tttaaaatta gcctggtgtg gtggcgggca 5700
cctgtaatcc cagctacttg gaaggctgag gtgggaggat cacttgagcc caggaggttg 5760
aggctgcagt gagccatgat catgccactg cactcagcct gggctacaga gtgagaccct 5820
gtctcaaaaa aaaaaaagaa aaagcatgtt gctgtgggct tcctagagaa tatgctgact 5880
gtagcacatc atcaccccaa atgtgctttg ctagacctat gcttcctctc cttaaaatac 5940
ttgaaatgtt tagtcactta ggaagttaag ccattatatt ggtgcttgaa tttataaaat 6000
atatccacat ggtttgttaa aatcatgacg taggcagaat aggattttta tcctgttggc 6060
atgtatttgt taaaatgttt tgacatcttg atgccttcct aggtagtagt tagttgcgta 6120
ctgttctttg ataaaaatca tacccataac atcctaaagg agatagggtg cctggagggg 6180
aatgaaaacg agccacctgg gatatgtagc ctggttttca gggagatgtt gatgtttttt 6240
tgcttttgtt actttaatga taaacctgtc tgttgatgcc tggtctcatg atgtcatgtc 6300
acaaggccct gtgatgttac tcccccatgt gaatttccca caatgaaggc tgctctttct 6360
tttctgtttc actctcttag atcaccggcg taatcaaccc agcgttggac aaatactttc 6420
cgtcagactc tggagtgaga atcatagctg agcccggcag atactatgtt gcatcagctt 6480
tcacgcttgc agttaatatc attgccaaga aaattgtatt aaaggaacag acgggctctg 6540
atggtatgta taaaggacga atcacttcat gtataactga aagctgatgc aaaaagtcat 6600
taagattgtt gatctgcctt tctagacgaa gatgagtcga gtgagcagac ctttatgtat 6660
tatgtgaatg atggcgtcta tggatcattt aattgcatac tctatgacca cgcacatgta 6720
aagccccttc tgcaaaaggt aatttctgag catactgtat aaaacaatta agaggactgg 6780
tcacaacacg tgtaattaag tagtacttcc tctctccgtc tctttatata gagacctaaa 6840
ccagatgaga agtattattc atccagcata tggggaccaa catgtgatgg cctcgatcgg 6900
attgttgagc gctgtgacct gcctgaaatg catgtgggtg attggatgct ctttgaaaac 6960
atgggcgctt acactgttgc tgctgcctct acgttcaatg gcttccagag gccgacgatc 7020
tactatgtga tgtcagggcc tgcgtggtaa gtaagccatg catgttgatg gtgctgccaa 7080
gaataggcac cttcttggat gtgtgcttct tgtctagacg aataagaaat tgtcttgcct 7140
aagattaaat atatatggat atttttccta agaaaagttt tagaaaagac tgatgagtgt 7200
atttctatgt aattggaata tatttaagtt catgccatgt gtcttgtggt ttccttatta 7260
ccaaaacggt gactgaagaa acgcttgctt tagaaataca ttgaattggc caggtgtgct 7320
ggctcacacc tgaaatcaca acacattggg aggccaaggc agaaggatca cttgagccca 7380
ggagttcgag cctgggcaac atagtgagac cctgtctcta caaaaaatta aaaaattagt 7440
tggccatggt agtgggcgcc tgtagtccca gctgcttggc taaggtgaga ggtttgcttg 7500
agcctgggag gttgaggctg cggtgagcta tgatagcacc attgtattcc agcctgagta 7560
acagagaaag accctgtctc agaaaaaaaa aaaatacatt gaattgtttc ctgatgggaa 7620
gtaaatactc tcatgcccag ttaggagtga gtcagggttt ttaatatgcc actttttctt 7680
tctcaggcaa ctcatgcagc aattccagaa ccccgacttc ccacccgaag tagaggaaca 7740
ggatgccagc accctgcctg tgtcttgtgc ctgggagagt gggatgaaac gccacagagc 7800
agcctgtgct tcggctagta ttaatgtgta gatagcactc tggtagctgt taactgcaag 7860
tttagcttga attaagggat ttggggggac catgtaactt aattactgct agttttgaaa 7920
tgtctttgta agagtagggt cgccatgatg cagccatatg gaagactagg atatgggtca 7980
cacttatctg tgttcctatg gaaactattt gaatatttgt tttatatgga tttttattca 8040
ctcttcagac acgctactca agagtgcccc tcagctgctg aacaagcatt tgtagcttgt 8100
acaatggcag aatgggccaa aagcttagtg ttgtgacctg tttttaaaat aaagtatctt 8160
gaaataatta ggcattggga cgtt 8184
<210> 32
<211> 1344
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding ArgG
<400> 32
atgacgacga ttctcaagca tctcccggta ggtcaacgta ttggtatcgc tttttctggc 60
ggtctggaca ccagtgccgc actgctgtgg atgcgacaaa agggagcggt tccttatgca 120
tatactgcaa acctgggcca gccagacgaa gaggattatg atgcgatccc tcgtcgtgcc 180
atggaatacg gcgcggagaa cgcacgtctg atcgactgcc gcaaacaact ggtggccgaa 240
ggtattgccg ctattcagtg tggcgcattt cataacacca ccggcggcct gacctatttc 300
aacacgacgc cgctgggccg cgccgtgact ggtaccatgc tggttgctgc gatgaaagaa 360
gatggcgtga atatctgggg tgacggtagc acctacaaag gaaacgatat cgaacgtttc 420
tatcgttatg gtctgctgac caatgctgaa ctgcagattt acaaaccgtg gcttgatact 480
gactttattg atgaactggg cggccgtcat gagatgtctg aatttatgat tgcctgcggt 540
ttcgactaca aaatgtctgt cgaaaaagcc tactccacag actccaacat gcttggtgca 600
acgcatgaag cgaaggatct ggaatacctc aactccagcg tcaaaatcgt caacccgatt 660
atgggcgtga aattctggga tgagagcgtg aagatcccgg cagaagaagt cacagtacgc 720
tttgaacaag gtcatccggt ggcgctgaac ggtaaaacct ttagcgacga cgtagaaatg 780
atgctggaag ctaaccgcat cggcggtcgt cacggcctgg gcatgagcga ccagattgaa 840
aaccgtatca tcgaagcgaa aagccgtggt atttacgaag ctccggggat ggcactgctg 900
cacattgcgt atgaacgcct gttgaccggt attcacaacg aagacaccat tgagcagtat 960
cacgcgcatg gtcgtcagtt gggccgtctg ctgtaccagg ggcgttggtt tgactcccag 1020
gcgctgatgc tgcgtgactc tctgcaacgc tgggttgcca gccagatcac tggtgaagtt 1080
accctggagc tgcgccgtgg gaacgattat tcaatcctga ataccgtctc agagaacctg 1140
acctacaagc cagagcgtct gacgatggaa aaaggcgact cggtgttctc gccagatgat 1200
cgtattggtc aattgaccat gcgtaacctg gatatcactg atacccgcga gaaacttttc 1260
ggttatgcca aaactggcct gctttcctcc tctgccgctt caggcgtgcc gcaggtggag 1320
aatctggaaa acaaaggcca gtaa 1344
<210> 33
<211> 1374
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding ArgH
<400> 33
atggcacttt ggggcgggcg ttttacccag gcagcagatc aacggttcaa acaattcaac 60
gactcactgc gctttgatta ccgtctggcg gagcaggata ttgttggctc tgtggcctgg 120
tccaaagccc tggtcacggt aggcgtgtta accgcagaag agcaggcgca actggaagag 180
gcgctgaacg tgttgctgga agatgttcgc gccaggccac aacaaatcct tgaaagcgac 240
gccgaagata tccatagctg ggtggaaggc aaactgatcg acaaagtggg ccagttaggc 300
aaaaagctgc ataccgggcg tagccgtaat gatcaggtag cgactgacct gaaactgtgg 360
tgcaaagata ccgttagcga gttactgacg gctaaccggc agctgcaatc ggcgctggtg 420
gaaaccgcac aaaacaatca ggacgcggta atgccaggtt acactcacct gcaacgcgcc 480
cagccggtga cgttcgcgca ctggtgcctg gcctatgttg agatgctggc gcgtgatgaa 540
agccgtttgc aggatgcgct taagcgtctg gatgtcagcc cgctaggctg tggcgcgctg 600
gcgggaacgg cctatgaaat cgaccgtgaa cagttagcag gctggctggg ctttgcttcg 660
gcgacccgta acagtctcga cagcgtttct gaccgtgacc atgtgttgga actgctttct 720
gctgccgcta tcggcatggt gcatctgtcg cgttttgctg aagatctgat tttctttaac 780
accggcgaag cggggtttgt ggagctttct gaccgcgtga cttccggttc atcattaatg 840
ccgcagaaga aaaacccgga tgcgctggag ctgattcgcg gtaaatgcgg ccgggtgcag 900
ggggcgttaa ccggcatgat gatgacgctg aaaggtttgc cgctggctta caacaaagat 960
atgcaggaag acaaagaagg tctgttcgac gcgctcgata cctggctgga ctgcctgcat 1020
atggcggcgc tggtgctgga cggcattcag gtgaaacgtc cacgttgcca ggaagcggct 1080
cagcagggtt acgccaacgc caccgaactg gcggattatc tggtggcgaa aggcgtaccg 1140
ttccgcgagg cgcaccatat tgttggtgaa gcggtggtgg aagccattcg tcagggcaaa 1200
ccgctggaag atctgccgct cagtgagttg cagaaattca gtcaggtgat tgacgaagat 1260
gtctatccga ttctgtcgct gcaatcgtgc ctcgacaagc gtgcggcaaa aggcggcgtc 1320
tcaccgcagc aggtggcgca ggcgattgct tttgcgcagg ctcggttagg gtaa 1374
<210> 34
<211> 1005
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding ArgF
<400> 34
atgtccgatt tatacaaaaa acactttctg aaactgctcg actttacccc tgcacagttc 60
acttctctgc tgacccttgc cgcacagctc aaagccgata aaaaaaatgg caaggaagta 120
cagaagctta ccggtaaaaa catcgcgctc atcttcgaaa aagactcgac tcgtacccgt 180
tgctctttcg aagttgccgc atttgaccag ggcgcgcgcg ttacctattt agggccgagc 240
ggcagccaga ttgggcataa agagtcaatt aaggacaccg cgcgggttct cgggcggatg 300
tatgacggca ttcagtatcg cggtcacggc caggaagtgg tcgaaacgct ggcgcagtat 360
gcgggcgtgc cggtgtggaa cgggctgacc aacgagttcc acccgaccca gctgctggcg 420
gacctgatga ccatgcagga gcacctgccg ggcaaggcgt ttaacgagat gacgctggtc 480
tacgcgggcg atgcgcgcaa caacatgggc aactcgatgc tggaagcggc ggcgctgacc 540
gggctggatc tgcgcctgtt ggccccgaaa gcctgctggc cggaagagag cctggtggcg 600
gagtgcagcg cgctggcgga gaagcacggc gggaaaatta ctctgacgga agacgtggcg 660
gcaggcgtta agggcgcgga ctttatctat accgacgtgt gggtgtcgat gggcgaggcc 720
aaagagaagt gggcagagcg gattgcgctg ctgcgcgggt atcaggtgaa cgcgcagatg 780
atggcgctga ccgacaaccc gaacgtgaag ttcctgcact gtctgccggc gttccatgac 840
gaccagacta cgctcggcaa gcagatggcg aaggagttcg atctgcacgg cgggatggag 900
gtgacggacg aggtgtttga gtcggcggcg agcatcgtgt tcgaccaggc ggaaaaccgg 960
atgcatacga ttaaggcggt gatgatggca acgcttgggg agtga 1005
<210> 35
<211> 2124
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding Trp5
<400> 35
atgtcagaac aactcagaca aacatttgct aacgctaaaa aagaaaacag gaacgccttg 60
gtcacattta tgaccgcagg ttacccaaca gtcaaagaca ctgtccctat tctcaagggt 120
ttccaggatg gtggtgtaga tatcatcgaa ttgggtatgc ccttctctga tccaattgca 180
gatggtccta caattcaatt atctaatact gtggctttgc aaaacggtgt taccttgcct 240
caaactctag aaatggtctc ccaagctaga aatgaaggtg ttaccgtacc cataatccta 300
atgggttact ataaccctat tctaaactac ggtgaagaaa gatttattca ggacgctgcc 360
aaggctggtg ctaatggttt tatcatcgtc gatttgccac cagaggaggc gttgaaggtc 420
agaaactaca tcaatgataa tggtttgagc ctgatcccac tagtggctcc ttctaccacc 480
gacgaaagat tggaattact atcgcatatt gccgattcgt ttgtctacgt tgtgtctaga 540
atgggtacta ctggtgttca aagttctgtg gccagtgatt tggatgaact catctctaga 600
gtcagaaagt acaccaagga tactcctttg gccgttgggt ttggtgtctc taccagagaa 660
catttccaat cagttggtag tgttgctgac ggtgtagtga ttggttccaa aatcgtcaca 720
ttatgtggag atgctccaga gggcaaaagg tacgacgttg ctaaggaata tgtacaggga 780
attctaaatg gtgctaagca taaggttctg tccaaggacg aattctttgc ctttcaaaaa 840
gagtccttga agtccgcaaa cgttaagaag gaaatactgg acgaatttga tgaaaatcac 900
aagcacccaa ttagatttgg ggactttggt ggtcagtatg tcccagaagc tcttcatgca 960
tgtctaagag agttggaaaa gggttttgat gaagctgtcg ccgatcccac attctgggaa 1020
gacttcaaat ccttgtattc ttatattggc cgtccttctt cactacacaa agctgagaga 1080
ttaactgagc attgtcaagg tgctcaaatc tggttgaaga gagaagatct taaccacacg 1140
ggatctcaca agatcaacaa tgctttagca caagttcttc tagctaaaag attaggcaag 1200
aagaacgtta ttgctgaaac cggtgctggt caacacggtg ttgccactgc cactgcatgt 1260
gctaaatttg gcttaacctg tactgtgttc atgggtgcag aagatgttcg tcgccaagct 1320
ttaaacgtct tcagaatgag aattctcggt gctaaagtaa ttgctgttac taatggtaca 1380
aagactctaa gagacgctac ttcagaggca ttcagatttt gggttactaa cttgaaaact 1440
acttactacg tcgtcggttc tgccattggt cctcacccat atccaacttt ggttagaact 1500
ttccaaagtg tcattggtaa agaaaccaag gaacagtttg ctgccatgaa caatggtaaa 1560
ttacctgacg cagttgttgc atgtgttggg ggtggttcca actctacagg tatgttttca 1620
ccattcgagc atgatacttc cgttaagtta ttgggtgtgg aagccggtgg tgatggtgta 1680
gatacaaagt tccactctgc tactctaact gccggtagac ctggtgtctt ccatggtgtc 1740
aagacttatg tcttgcaaga tagtgatggt caagtccatg atactcattc tgtttctgct 1800
gggttagact acccaggtgt cggtccagaa ttggcatatt ggaaatctac tggccgtgct 1860
caattcattg cagctactga cgctcaggct ctgcttggct ttaaattatt atctcaatta 1920
gaaggtatta ttcccgcttt ggaatcttct catgctgttt atggcgcttg cgaattggct 1980
aagacgatga agcctgatca acatttggtt atcaatattt ctggtagagg tgataaagat 2040
gtccaaagtg tcgctgaagt cttgccgaaa ttaggtccaa agataggttg ggatttgaga 2100
ttcgaagaag acccatctgc ctaa 2124
<210> 36
<211> 2124
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding IDO
<400> 36
atgtcagaac aactcagaca aacatttgct aacgctaaaa aagaaaacag gaacgccttg 60
gtcacattta tgaccgcagg ttacccaaca gtcaaagaca ctgtccctat tctcaagggt 120
ttccaggatg gtggtgtaga tatcatcgaa ttgggtatgc ccttctctga tccaattgca 180
gatggtccta caattcaatt atctaatact gtggctttgc aaaacggtgt taccttgcct 240
caaactctag aaatggtctc ccaagctaga aatgaaggtg ttaccgtacc cataatccta 300
atgggttact ataaccctat tctaaactac ggtgaagaaa gatttattca ggacgctgcc 360
aaggctggtg ctaatggttt tatcatcgtc gatttgccac cagaggaggc gttgaaggtc 420
agaaactaca tcaatgataa tggtttgagc ctgatcccac tagtggctcc ttctaccacc 480
gacgaaagat tggaattact atcgcatatt gccgattcgt ttgtctacgt tgtgtctaga 540
atgggtacta ctggtgttca aagttctgtg gccagtgatt tggatgaact catctctaga 600
gtcagaaagt acaccaagga tactcctttg gccgttgggt ttggtgtctc taccagagaa 660
catttccaat cagttggtag tgttgctgac ggtgtagtga ttggttccaa aatcgtcaca 720
ttatgtggag atgctccaga gggcaaaagg tacgacgttg ctaaggaata tgtacaggga 780
attctaaatg gtgctaagca taaggttctg tccaaggacg aattctttgc ctttcaaaaa 840
gagtccttga agtccgcaaa cgttaagaag gaaatactgg acgaatttga tgaaaatcac 900
aagcacccaa ttagatttgg ggactttggt ggtcagtatg tcccagaagc tcttcatgca 960
tgtctaagag agttggaaaa gggttttgat gaagctgtcg ccgatcccac attctgggaa 1020
gacttcaaat ccttgtattc ttatattggc cgtccttctt cactacacaa agctgagaga 1080
ttaactgagc attgtcaagg tgctcaaatc tggttgaaga gagaagatct taaccacacg 1140
ggatctcaca agatcaacaa tgctttagca caagttcttc tagctaaaag attaggcaag 1200
aagaacgtta ttgctgaaac cggtgctggt caacacggtg ttgccactgc cactgcatgt 1260
gctaaatttg gcttaacctg tactgtgttc atgggtgcag aagatgttcg tcgccaagct 1320
ttaaacgtct tcagaatgag aattctcggt gctaaagtaa ttgctgttac taatggtaca 1380
aagactctaa gagacgctac ttcagaggca ttcagatttt gggttactaa cttgaaaact 1440
acttactacg tcgtcggttc tgccattggt cctcacccat atccaacttt ggttagaact 1500
ttccaaagtg tcattggtaa agaaaccaag gaacagtttg ctgccatgaa caatggtaaa 1560
ttacctgacg cagttgttgc atgtgttggg ggtggttcca actctacagg tatgttttca 1620
ccattcgagc atgatacttc cgttaagtta ttgggtgtgg aagccggtgg tgatggtgta 1680
gatacaaagt tccactctgc tactctaact gccggtagac ctggtgtctt ccatggtgtc 1740
aagacttatg tcttgcaaga tagtgatggt caagtccatg atactcattc tgtttctgct 1800
gggttagact acccaggtgt cggtccagaa ttggcatatt ggaaatctac tggccgtgct 1860
caattcattg cagctactga cgctcaggct ctgcttggct ttaaattatt atctcaatta 1920
gaaggtatta ttcccgcttt ggaatcttct catgctgttt atggcgcttg cgaattggct 1980
aagacgatga agcctgatca acatttggtt atcaatattt ctggtagagg tgataaagat 2040
gtccaaagtg tcgctgaagt cttgccgaaa ttaggtccaa agataggttg ggatttgaga 2100
ttcgaagaag acccatctgc ctaa 2124
<210> 37
<211> 5691
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding exemplary CAR GD2 ASS1+OTC without MP71 vector
<400> 37
atgcctcgcg gctggacagc cctgtgcctg ctgtctctgc tgccatccgg cttcatgagc 60
ctggataata acggcacagc caccccagag ctgcctacac agggcacctt cagcaatgtg 120
tccacaaacg tgagctatca ggagaccaca accccttcta ccctgggatc cacaagcctg 180
caccccgtgt ctcagcacgg caacgaagcc accaccaaca tcaccgagac cacagtgaag 240
tttacctcca cctctgtgat tacctctgtg tacggaaata caaactccag cgtgcagtct 300
cagacatctg tgatctccac agtgtttaca acacctgcca atgtgtccac cccagagaca 360
accctgaagc ccagcctgtc tcctggaaat gtgtccgatc tgtctaccac ctccaccagc 420
ctggccacct ctcccaccaa gccctatacc tcctcttctc ccatcctgag cgatatcaaa 480
gccgagatca aatgcagcgg gattcgggaa gtgaaactga cacagggcat ctgcctggaa 540
cagaataaga catccagctg cgccgagttt aagaaagata gaggagaggg actggccagg 600
gtgctgtgtg gcgaagagca ggccgacgcc gatgccggcg cccaggtgtg ttccctgctg 660
ctggcccagt ctgaggtgcg cccccagtgc ctgctgctgg tgctggccaa tcggacagaa 720
attagcagca agctgcagct gatgaaaaaa caccagagcg atctgaaaaa gctgggcatc 780
ctggacttta ccgagcagga cgtggcctct caccagagct acagccagaa aacactgatc 840
gccctggtga ccagcggagc cctgctggcc gtgctgggca tcaccggata tttcctgatg 900
aataggcgca gctggagccc caccggcgaa cggctggagc tggagcctgt cgaccgagtg 960
aagcagaccc tgaactttga tctgctgaag ctggccggcg acgtggagtc caaccccggg 1020
ccagggaata tggccttacc agtgaccgcc ttgctcctgc cgctggcctt gctgctccac 1080
gccgccaggc cggatattct gctcacacag accccactct ccctgcccgt gtcactcggg 1140
gatcaggcta gcatttcttg ccgctcatct cagtctctgg tccaccggaa tgggaacaca 1200
tacctccatt ggtacctcca gaaacctgga cagagcccta aactgctcat ccacaaagtc 1260
tcaaatcggt tctccggcgt gcccgatcgc tttagcggat ccggatctgg gaccgacttc 1320
acactgaaaa tctcacgagt ggaggctgag gatctcggcg tctacttctg tagtcagagt 1380
acccacgtcc cacccctcac ctttggcgct ggaacaaaac tggagctgaa acgagccgat 1440
gctgctccta ccgtgtccat ctttcctggc tccgggggag gcgggagcgg aggcgaagtg 1500
aaactccagc agtctggccc ttctctcgtg gaacctggcg cttctgtgat gatctcctgt 1560
aaggcctctg gatcttcctt taccggctac aacatgaact gggtccggca gaacattggc 1620
aaatccctgg aatggattgg cgccatcgat ccttactacg gcggcacatc atacaatcag 1680
aaattcaagg ggcgagcaac actcactgtc gacaaatctt catccaccgc ctacatgcac 1740
ctgaaatctc tcacatccga ggatagtgct gtctactact gtgtctctgg catggaatac 1800
tggggacagg gaacttctgt caccgtgtct agtgccaaaa ccacacctcc ctccgtgtac 1860
ggacgagtca ctgtctcatc tgctgaacca aaatcctgtg acaaaacaca cacatgccca 1920
ccttgtcctg cccctgaact gctcggcgga ccttccgtct ttctgtttcc ccccaaaccc 1980
aaggatacac tcatgatttc taggaccccc gaagtcactt gtgtcgtggt cgatgtgtct 2040
cacgaggatc ctgaagtgaa attcaactgg tacgtggacg gagtcgaggt ccacaatgcc 2100
aaaacaaaac cccgggagga acagtacaat agcacctacc gagtcgtgtc cgtgctcacc 2160
gtcctccatc aggattggct gaacggcaaa gagtacaagt gtaaagtgag taacaaggct 2220
ctccccgctc ctattgaaaa aaccatctca aaagcaaaag gccagcctag ggagcctcag 2280
gtctacacac tgccaccctc acgggacgaa ctcaccaaaa atcaggtgtc cctcacttgc 2340
ctggtgaaag gcttctaccc ttccgatatc gctgtggaat gggagtcaaa tgggcagccc 2400
gaaaacaact acaaaacaac cccccctgtg ctcgattccg atggctcttt tttcctgtac 2460
tccaaactca ccgtggacaa atcacgctgg cagcagggga atgtcttttc ttgctccgtg 2520
atgcacgagg ccctccacaa tcattacacc cagaaatccc tctcactctc acccggcaaa 2580
aaggacccta aaaccacgac gccagcgccg cgaccaccaa caccggcgcc caccatcgcg 2640
tcgcagcccc tgtccctgcg cccagaggcg tgccggccag cggcgggggg cgcagtgcac 2700
acgagggggc tggacttcgc ctgtgatatc tacatctggg cgcccttggc cgggacttgt 2760
ggggtccttc tcctgtcact ggttatcacc ctttactgca aacggggcag aaagaaactc 2820
ctgtatatat tcaaacaacc atttatgaga ccagtacaaa ctactcaaga ggaagatggc 2880
tgtagctgcc gatttccaga agaagaagaa ggaggatgtg aactgagagt gaagttcagc 2940
aggagcgcag acgcccccgc gtacaagcag ggccagaacc agctctataa cgagctcaat 3000
ctaggacgaa gagaggagta cgatgttttg gacaagagac gtggccggga ccctgagatg 3060
gggggaaagc cgagaaggaa gaaccctcag gaaggcctgt acaatgaact gcagaaagat 3120
aagatggcgg aggcctacag tgagattggg atgaaaggcg agcgccggag gggcaagggg 3180
cacgatggcc tttaccaggg tctcagtaca gccaccaagg acacctacga cgcccttcac 3240
atgcaggccc tgccccctcg cggcagcggc gccaccaact tcagcctgct gaagcaggcc 3300
ggcgacgtgg aggaaaaccc tggccccatg tccagcaaag gctccgtggt tctggcctac 3360
agtggcggcc tggacacctc gtgcatcctc gtgtggctga aggaacaagg ctatgacgtc 3420
attgcctatc tggccaacat tggccagaag gaagacttcg aggaagccag gaagaaggca 3480
ctgaaacttg gggccaaaaa ggtgttcatt gaggatgtca gcagggagtt tgtggaggag 3540
ttcatctggc cggccatcca gtccagcgca ctgtatgagg accgctacct cctgggcacc 3600
tctcttgcca ggccctgcat cgcccgcaaa caagtggaaa tcgcccagcg ggagggggcc 3660
aagtatgtgt cccacggcgc cacaggaaag gggaacgatc aggtccggtt tgagctcagc 3720
tgctactcac tggcccccca gataaaggtc attgctccct ggaggatgcc tgaattctac 3780
aaccggttca agggccgcaa tgacctgatg gagtacgcaa agcaacacgg gattcccatc 3840
ccggtcactc ccaagaaccc gtggagcatg gatgagaacc tcatgcacat cagctacgag 3900
gctggaatcc tggagaaccc caagaaccaa gcgcctccag gtctctacac gaagacccag 3960
gacccagcca aagcccccaa cacccctgac attctcgaga tcgagttcaa aaaaggggtc 4020
cctgtgaagg tgaccaacgt caaggatggc accacccacc agacctcctt ggagctcttc 4080
atgtacctga acgaagtcgc gggcaagcat ggcgtgggcc gtattgacat cgtggagaac 4140
cgcttcattg gaatgaagtc ccgaggtatc tacgagaccc cagcaggcac catcctttac 4200
catgctcatt tagacatcga ggccttcacc atggaccggg aagtgcgcaa aatcaaacaa 4260
ggcctgggct tgaaatttgc tgagctggtg tataccggtt tctggcacag ccctgagtgt 4320
gaatttgtcc gccactgcat cgccaagtcc caggagcgag tggaagggaa agtgcaggtg 4380
tccgtcctca agggccaggt gtacatcctc ggccgggagt ccccactgtc tctctacaat 4440
gaggagctgg tgagcatgaa cgtgcagggt gattatgagc caactgatgc caccgggttc 4500
atcaacatca attccctcag gctgaaggaa tatcatcgtc tccagagcaa ggtcactgcc 4560
aaaggaagcg gagagggcag aggaagtctg ctaacatgcg gtgacgtcga ggagaatcct 4620
ggacctatgc tgtttaatct gaggatcctg ttaaacaatg cagcttttag aaatggtcac 4680
aacttcatgg ttcgaaattt tcggtgtgga caaccactac aaaataaagt gcagctgaag 4740
ggccgtgacc ttctcactct aaaaaacttt accggagaag aaattaaata tatgctatgg 4800
ctatcagcag atctgaaatt taggataaaa cagaaaggag agtatttgcc tttattgcaa 4860
gggaagtcct taggcatgat ttttgagaaa agaagtactc gaacaagatt gtctacagaa 4920
acaggcttag cacttctggg aggacatcct tgttttctta ccacacaaga tattcatttg 4980
ggtgtgaatg aaagtctcac ggacacggcc cgtgtattgt ctagcatggc agatgcagta 5040
ttggctcgag tgtataaaca atcagatttg gacaccctgg ctaaagaagc atccatccca 5100
attatcaatg ggctgtcaga tttgtaccat cctatccaga tcctggctga ttacctcacg 5160
ctccaggaac actatagctc tctgaaaggt cttaccctca gctggatcgg ggatgggaac 5220
aatatcctgc actccatcat gatgagcgca gcgaaattcg gaatgcacct tcaggcagct 5280
actccaaagg gttatgagcc ggatgctagt gtaaccaagt tggcagagca gtatgccaaa 5340
gagaatggta ccaagctgtt gctgacaaat gatccattgg aagcagcgca tggaggcaat 5400
gtattaatta cagacacttg gataagcatg ggacaagaag aggagaagaa aaagcggctc 5460
caggctttcc aaggttacca ggttacaatg aagactgcta aagttgctgc ctctgactgg 5520
acatttttac actgcttgcc cagaaagcca gaagaagtgg atgatgaagt cttttattct 5580
cctcgatcac tagtgttccc agaggcagaa aacagaaagt ggacaatcat ggctgtcatg 5640
gtgtccctgc tgacagatta ctcacctcag ctccagaagc ctaaatttta a 5691
<210> 38
<211> 4566
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding exemplary CAR of GD2 ASS1 without MP71 vector
<400> 38
atgcctcgcg gctggacagc cctgtgcctg ctgtctctgc tgccatccgg cttcatgagc 60
ctggataata acggcacagc caccccagag ctgcctacac agggcacctt cagcaatgtg 120
tccacaaacg tgagctatca ggagaccaca accccttcta ccctgggatc cacaagcctg 180
caccccgtgt ctcagcacgg caacgaagcc accaccaaca tcaccgagac cacagtgaag 240
tttacctcca cctctgtgat tacctctgtg tacggaaata caaactccag cgtgcagtct 300
cagacatctg tgatctccac agtgtttaca acacctgcca atgtgtccac cccagagaca 360
accctgaagc ccagcctgtc tcctggaaat gtgtccgatc tgtctaccac ctccaccagc 420
ctggccacct ctcccaccaa gccctatacc tcctcttctc ccatcctgag cgatatcaaa 480
gccgagatca aatgcagcgg gattcgggaa gtgaaactga cacagggcat ctgcctggaa 540
cagaataaga catccagctg cgccgagttt aagaaagata gaggagaggg actggccagg 600
gtgctgtgtg gcgaagagca ggccgacgcc gatgccggcg cccaggtgtg ttccctgctg 660
ctggcccagt ctgaggtgcg cccccagtgc ctgctgctgg tgctggccaa tcggacagaa 720
attagcagca agctgcagct gatgaaaaaa caccagagcg atctgaaaaa gctgggcatc 780
ctggacttta ccgagcagga cgtggcctct caccagagct acagccagaa aacactgatc 840
gccctggtga ccagcggagc cctgctggcc gtgctgggca tcaccggata tttcctgatg 900
aataggcgca gctggagccc caccggcgaa cggctggagc tggagcctgt cgaccgagtg 960
aagcagaccc tgaactttga tctgctgaag ctggccggcg acgtggagtc caaccccggg 1020
ccagggaata tggccttacc agtgaccgcc ttgctcctgc cgctggcctt gctgctccac 1080
gccgccaggc cggatattct gctcacacag accccactct ccctgcccgt gtcactcggg 1140
gatcaggcta gcatttcttg ccgctcatct cagtctctgg tccaccggaa tgggaacaca 1200
tacctccatt ggtacctcca gaaacctgga cagagcccta aactgctcat ccacaaagtc 1260
tcaaatcggt tctccggcgt gcccgatcgc tttagcggat ccggatctgg gaccgacttc 1320
acactgaaaa tctcacgagt ggaggctgag gatctcggcg tctacttctg tagtcagagt 1380
acccacgtcc cacccctcac ctttggcgct ggaacaaaac tggagctgaa acgagccgat 1440
gctgctccta ccgtgtccat ctttcctggc tccgggggag gcgggagcgg aggcgaagtg 1500
aaactccagc agtctggccc ttctctcgtg gaacctggcg cttctgtgat gatctcctgt 1560
aaggcctctg gatcttcctt taccggctac aacatgaact gggtccggca gaacattggc 1620
aaatccctgg aatggattgg cgccatcgat ccttactacg gcggcacatc atacaatcag 1680
aaattcaagg ggcgagcaac actcactgtc gacaaatctt catccaccgc ctacatgcac 1740
ctgaaatctc tcacatccga ggatagtgct gtctactact gtgtctctgg catggaatac 1800
tggggacagg gaacttctgt caccgtgtct agtgccaaaa ccacacctcc ctccgtgtac 1860
ggacgagtca ctgtctcatc tgctgaacca aaatcctgtg acaaaacaca cacatgccca 1920
ccttgtcctg cccctgaact gctcggcgga ccttccgtct ttctgtttcc ccccaaaccc 1980
aaggatacac tcatgatttc taggaccccc gaagtcactt gtgtcgtggt cgatgtgtct 2040
cacgaggatc ctgaagtgaa attcaactgg tacgtggacg gagtcgaggt ccacaatgcc 2100
aaaacaaaac cccgggagga acagtacaat agcacctacc gagtcgtgtc cgtgctcacc 2160
gtcctccatc aggattggct gaacggcaaa gagtacaagt gtaaagtgag taacaaggct 2220
ctccccgctc ctattgaaaa aaccatctca aaagcaaaag gccagcctag ggagcctcag 2280
gtctacacac tgccaccctc acgggacgaa ctcaccaaaa atcaggtgtc cctcacttgc 2340
ctggtgaaag gcttctaccc ttccgatatc gctgtggaat gggagtcaaa tgggcagccc 2400
gaaaacaact acaaaacaac cccccctgtg ctcgattccg atggctcttt tttcctgtac 2460
tccaaactca ccgtggacaa atcacgctgg cagcagggga atgtcttttc ttgctccgtg 2520
atgcacgagg ccctccacaa tcattacacc cagaaatccc tctcactctc acccggcaaa 2580
aaggacccta aaaccacgac gccagcgccg cgaccaccaa caccggcgcc caccatcgcg 2640
tcgcagcccc tgtccctgcg cccagaggcg tgccggccag cggcgggggg cgcagtgcac 2700
acgagggggc tggacttcgc ctgtgatatc tacatctggg cgcccttggc cgggacttgt 2760
ggggtccttc tcctgtcact ggttatcacc ctttactgca aacggggcag aaagaaactc 2820
ctgtatatat tcaaacaacc atttatgaga ccagtacaaa ctactcaaga ggaagatggc 2880
tgtagctgcc gatttccaga agaagaagaa ggaggatgtg aactgagagt gaagttcagc 2940
aggagcgcag acgcccccgc gtacaagcag ggccagaacc agctctataa cgagctcaat 3000
ctaggacgaa gagaggagta cgatgttttg gacaagagac gtggccggga ccctgagatg 3060
gggggaaagc cgagaaggaa gaaccctcag gaaggcctgt acaatgaact gcagaaagat 3120
aagatggcgg aggcctacag tgagattggg atgaaaggcg agcgccggag gggcaagggg 3180
cacgatggcc tttaccaggg tctcagtaca gccaccaagg acacctacga cgcccttcac 3240
atgcaggccc tgccccctcg cggcagcggc gccaccaact tcagcctgct gaagcaggcc 3300
ggcgacgtgg aggaaaaccc tggccccatg tccagcaaag gctccgtggt tctggcctac 3360
agtggcggcc tggacacctc gtgcatcctc gtgtggctga aggaacaagg ctatgacgtc 3420
attgcctatc tggccaacat tggccagaag gaagacttcg aggaagccag gaagaaggca 3480
ctgaaacttg gggccaaaaa ggtgttcatt gaggatgtca gcagggagtt tgtggaggag 3540
ttcatctggc cggccatcca gtccagcgca ctgtatgagg accgctacct cctgggcacc 3600
tctcttgcca ggccctgcat cgcccgcaaa caagtggaaa tcgcccagcg ggagggggcc 3660
aagtatgtgt cccacggcgc cacaggaaag gggaacgatc aggtccggtt tgagctcagc 3720
tgctactcac tggcccccca gataaaggtc attgctccct ggaggatgcc tgaattctac 3780
aaccggttca agggccgcaa tgacctgatg gagtacgcaa agcaacacgg gattcccatc 3840
ccggtcactc ccaagaaccc gtggagcatg gatgagaacc tcatgcacat cagctacgag 3900
gctggaatcc tggagaaccc caagaaccaa gcgcctccag gtctctacac gaagacccag 3960
gacccagcca aagcccccaa cacccctgac attctcgaga tcgagttcaa aaaaggggtc 4020
cctgtgaagg tgaccaacgt caaggatggc accacccacc agacctcctt ggagctcttc 4080
atgtacctga acgaagtcgc gggcaagcat ggcgtgggcc gtattgacat cgtggagaac 4140
cgcttcattg gaatgaagtc ccgaggtatc tacgagaccc cagcaggcac catcctttac 4200
catgctcatt tagacatcga ggccttcacc atggaccggg aagtgcgcaa aatcaaacaa 4260
ggcctgggct tgaaatttgc tgagctggtg tataccggtt tctggcacag ccctgagtgt 4320
gaatttgtcc gccactgcat cgccaagtcc caggagcgag tggaagggaa agtgcaggtg 4380
tccgtcctca agggccaggt gtacatcctc ggccgggagt ccccactgtc tctctacaat 4440
gaggagctgg tgagcatgaa cgtgcagggt gattatgagc caactgatgc caccgggttc 4500
atcaacatca attccctcag gctgaaggaa tatcatcgtc tccagagcaa ggtcactgcc 4560
aaataa 4566
<210> 39
<211> 4398
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding exemplary CAR of GD2 OTC without MP71 vector
<400> 39
atgcctcgcg gctggacagc cctgtgcctg ctgtctctgc tgccatccgg cttcatgagc 60
ctggataata acggcacagc caccccagag ctgcctacac agggcacctt cagcaatgtg 120
tccacaaacg tgagctatca ggagaccaca accccttcta ccctgggatc cacaagcctg 180
caccccgtgt ctcagcacgg caacgaagcc accaccaaca tcaccgagac cacagtgaag 240
tttacctcca cctctgtgat tacctctgtg tacggaaata caaactccag cgtgcagtct 300
cagacatctg tgatctccac agtgtttaca acacctgcca atgtgtccac cccagagaca 360
accctgaagc ccagcctgtc tcctggaaat gtgtccgatc tgtctaccac ctccaccagc 420
ctggccacct ctcccaccaa gccctatacc tcctcttctc ccatcctgag cgatatcaaa 480
gccgagatca aatgcagcgg gattcgggaa gtgaaactga cacagggcat ctgcctggaa 540
cagaataaga catccagctg cgccgagttt aagaaagata gaggagaggg actggccagg 600
gtgctgtgtg gcgaagagca ggccgacgcc gatgccggcg cccaggtgtg ttccctgctg 660
ctggcccagt ctgaggtgcg cccccagtgc ctgctgctgg tgctggccaa tcggacagaa 720
attagcagca agctgcagct gatgaaaaaa caccagagcg atctgaaaaa gctgggcatc 780
ctggacttta ccgagcagga cgtggcctct caccagagct acagccagaa aacactgatc 840
gccctggtga ccagcggagc cctgctggcc gtgctgggca tcaccggata tttcctgatg 900
aataggcgca gctggagccc caccggcgaa cggctggagc tggagcctgt cgaccgagtg 960
aagcagaccc tgaactttga tctgctgaag ctggccggcg acgtggagtc caaccccggg 1020
ccagggaata tggccttacc agtgaccgcc ttgctcctgc cgctggcctt gctgctccac 1080
gccgccaggc cggatattct gctcacacag accccactct ccctgcccgt gtcactcggg 1140
gatcaggcta gcatttcttg ccgctcatct cagtctctgg tccaccggaa tgggaacaca 1200
tacctccatt ggtacctcca gaaacctgga cagagcccta aactgctcat ccacaaagtc 1260
tcaaatcggt tctccggcgt gcccgatcgc tttagcggat ccggatctgg gaccgacttc 1320
acactgaaaa tctcacgagt ggaggctgag gatctcggcg tctacttctg tagtcagagt 1380
acccacgtcc cacccctcac ctttggcgct ggaacaaaac tggagctgaa acgagccgat 1440
gctgctccta ccgtgtccat ctttcctggc tccgggggag gcgggagcgg aggcgaagtg 1500
aaactccagc agtctggccc ttctctcgtg gaacctggcg cttctgtgat gatctcctgt 1560
aaggcctctg gatcttcctt taccggctac aacatgaact gggtccggca gaacattggc 1620
aaatccctgg aatggattgg cgccatcgat ccttactacg gcggcacatc atacaatcag 1680
aaattcaagg ggcgagcaac actcactgtc gacaaatctt catccaccgc ctacatgcac 1740
ctgaaatctc tcacatccga ggatagtgct gtctactact gtgtctctgg catggaatac 1800
tggggacagg gaacttctgt caccgtgtct agtgccaaaa ccacacctcc ctccgtgtac 1860
ggacgagtca ctgtctcatc tgctgaacca aaatcctgtg acaaaacaca cacatgccca 1920
ccttgtcctg cccctgaact gctcggcgga ccttccgtct ttctgtttcc ccccaaaccc 1980
aaggatacac tcatgatttc taggaccccc gaagtcactt gtgtcgtggt cgatgtgtct 2040
cacgaggatc ctgaagtgaa attcaactgg tacgtggacg gagtcgaggt ccacaatgcc 2100
aaaacaaaac cccgggagga acagtacaat agcacctacc gagtcgtgtc cgtgctcacc 2160
gtcctccatc aggattggct gaacggcaaa gagtacaagt gtaaagtgag taacaaggct 2220
ctccccgctc ctattgaaaa aaccatctca aaagcaaaag gccagcctag ggagcctcag 2280
gtctacacac tgccaccctc acgggacgaa ctcaccaaaa atcaggtgtc cctcacttgc 2340
ctggtgaaag gcttctaccc ttccgatatc gctgtggaat gggagtcaaa tgggcagccc 2400
gaaaacaact acaaaacaac cccccctgtg ctcgattccg atggctcttt tttcctgtac 2460
tccaaactca ccgtggacaa atcacgctgg cagcagggga atgtcttttc ttgctccgtg 2520
atgcacgagg ccctccacaa tcattacacc cagaaatccc tctcactctc acccggcaaa 2580
aaggacccta aaaccacgac gccagcgccg cgaccaccaa caccggcgcc caccatcgcg 2640
tcgcagcccc tgtccctgcg cccagaggcg tgccggccag cggcgggggg cgcagtgcac 2700
acgagggggc tggacttcgc ctgtgatttt tgggtgctgg tggtggttgg tggagtcctg 2760
gcttgctata gcttgctagt aacagtggcc tttattattt tctgggtgag gagtaagagg 2820
agcaggctcc tgcacagtga ctacatgaac atgactcccc gccgccccgg gcccacccgc 2880
aagcattacc agccctatgc cccacctcgc gacttcgcag cctatcgctc cagagtgaag 2940
ttcagcagga gcgcagacgc ccccgcgtac aagcagggcc agaaccagct ctataacgag 3000
ctcaatctag gacgaagaga ggagtacgat gttttggaca agagacgtgg ccgggaccct 3060
gagatggggg gaaagccgag aaggaagaac cctcaggaag gcctgtacaa tgaactgcag 3120
aaagataaga tggcggaggc ctacagtgag attgggatga aaggcgagcg ccggaggggc 3180
aaggggcacg atggccttta ccagggtctc agtacagcca ccaaggacac ctacgacgcc 3240
cttcacatgc aggccctgcc ccctcgcggc agcggcgcca ccaacttcag cctgctgaag 3300
caggccggcg acgtggagga aaaccctggc cccatgctgt ttaatctgag gatcctgtta 3360
aacaatgcag cttttagaaa tggtcacaac ttcatggttc gaaattttcg gtgtggacaa 3420
ccactacaaa ataaagtgca gctgaagggc cgtgaccttc tcactctaaa aaactttacc 3480
ggagaagaaa ttaaatatat gctatggcta tcagcagatc tgaaatttag gataaaacag 3540
aaaggagagt atttgccttt attgcaaggg aagtccttag gcatgatttt tgagaaaaga 3600
agtactcgaa caagattgtc tacagaaaca ggcttagcac ttctgggagg acatccttgt 3660
tttcttacca cacaagatat tcatttgggt gtgaatgaaa gtctcacgga cacggcccgt 3720
gtattgtcta gcatggcaga tgcagtattg gctcgagtgt ataaacaatc agatttggac 3780
accctggcta aagaagcatc catcccaatt atcaatgggc tgtcagattt gtaccatcct 3840
atccagatcc tggctgatta cctcacgctc caggaacact atagctctct gaaaggtctt 3900
accctcagct ggatcgggga tgggaacaat atcctgcact ccatcatgat gagcgcagcg 3960
aaattcggaa tgcaccttca ggcagctact ccaaagggtt atgagccgga tgctagtgta 4020
accaagttgg cagagcagta tgccaaagag aatggtacca agctgttgct gacaaatgat 4080
ccattggaag cagcgcatgg aggcaatgta ttaattacag acacttggat aagcatggga 4140
caagaagagg agaagaaaaa gcggctccag gctttccaag gttaccaggt tacaatgaag 4200
actgctaaag ttgctgcctc tgactggaca tttttacact gcttgcccag aaagccagaa 4260
gaagtggatg atgaagtctt ttattctcct cgatcactag tgttcccaga ggcagaaaac 4320
agaaagtgga caatcatggc tgtcatggtg tccctgctga cagattactc acctcagctc 4380
cagaagccta aattttaa 4398
<210> 40
<211> 342
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding an alternative CD3z
<400> 40
agagtgaagt tcagcaggag cgcagacgcc cccgcgtacc agcagggcca gaaccagctc 60
tataacgagc tcaatctagg acgaagagag gagtacgatg ttttggacaa gagacgtggc 120
cgggaccctg agatgggggg aaagccgcag agaaggaaga accctcagga aggcctgtac 180
aatgaactgc agaaagataa gatggcggag gcctacagtg agattgggat gaaaggcgag 240
cgccggaggg gcaaggggca cgatggcctt taccagggtc tcagtacagc caccaaggac 300
acctacgacg cccttcacat gcaggccctg ccccctcgct aa 342
<210> 41
<211> 786
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sequence encoding an alternative EGFRvIII target binding moiety
(EGFRvIII scFv sequence derived from MR1 antibody)
<400> 41
atggactgga tttggcgcat ccttttcctt gtcggcgctg ctaccggcgc gcattctcag 60
gtacaactcc agcagtctgg gggaggctta gtgaagcctg gagcgtctct gaaactctcc 120
tgtgtaacct ctggattcac tttcagaaaa tttggcatgt cttgggttcg ccagactagt 180
gacaagaggc tggaatgggt cgcatccatt agtactggcg gttataacac gtactattca 240
gacaatgtaa agggccgatt caccatctcc agagagaatg ccaagaacac cctgtacctg 300
caaatgagta gtctgaagtc tgaggacacg gccttgtatt actgtacaag aggctattct 360
agtacctctt atgctatgga ctactggggc caagggacca cggtcaccgt ctcctcaagt 420
ggaggcggtt caggcggagg tggctctggc ggtggcggat cggacatcga gctcactcag 480
tctccagcat ccctgtccgt ggctacagga gaaaaagtca ctatcagatg catgaccagc 540
actgatattg atgatgatat gaactggtac cagcagaagc caggggaacc ccctaagttc 600
cttatttcag aaggcaatac tcttcggccg ggagtcccat cccgattttc cagcagtggc 660
actggcacag attttgtttt tacaattgaa aacacactct cggaagatgt tggagattac 720
tactgtttgc aaagctttaa cgtgcctctt acattcggtg atggcaccaa gcttgaaaaa 780
gctcta 786
<210> 42
<211> 1283
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> amino acid sequence of an exemplary CAR of EGFRvIII (employing
the alternative EGFRvIII target binding moiety encoded by SEQ ID
NO: 41) including an ASS-1 domain
<400> 42
Met Pro Arg Gly Trp Thr Ala Leu Cys Leu Leu Ser Leu Leu Pro Ser
1 5 10 15
Gly Phe Met Ser Leu Asp Asn Asn Gly Thr Ala Thr Pro Glu Leu Pro
20 25 30
Thr Gln Gly Thr Phe Ser Asn Val Ser Thr Asn Val Ser Tyr Gln Glu
35 40 45
Thr Thr Thr Pro Ser Thr Leu Gly Ser Thr Ser Leu His Pro Val Ser
50 55 60
Gln His Gly Asn Glu Ala Thr Thr Asn Ile Thr Glu Thr Thr Val Lys
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500 505 510
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515 520 525
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> amino acid sequence of an exemplary CAR of EGFRvIII (employing
the alternative EGFRvIII target binding moiety encoded by SEQ ID
NO: 41) including an ASS-1 domain and an OTC domain
<400> 44
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980 985 990
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Gly Glu Glu Ile Lys Tyr Met Leu Trp Leu Ser Ala Asp Leu Lys
1355 1360 1365
Phe Arg Ile Lys Gln Lys Gly Glu Tyr Leu Pro Leu Leu Gln Gly
1370 1375 1380
Lys Ser Leu Gly Met Ile Phe Glu Lys Arg Ser Thr Arg Thr Arg
1385 1390 1395
Leu Ser Thr Glu Thr Gly Leu Ala Leu Leu Gly Gly His Pro Cys
1400 1405 1410
Phe Leu Thr Thr Gln Asp Ile His Leu Gly Val Asn Glu Ser Leu
1415 1420 1425
Thr Asp Thr Ala Arg Val Leu Ser Ser Met Ala Asp Ala Val Leu
1430 1435 1440
Ala Arg Val Tyr Lys Gln Ser Asp Leu Asp Thr Leu Ala Lys Glu
1445 1450 1455
Ala Ser Ile Pro Ile Ile Asn Gly Leu Ser Asp Leu Tyr His Pro
1460 1465 1470
Ile Gln Ile Leu Ala Asp Tyr Leu Thr Leu Gln Glu His Tyr Ser
1475 1480 1485
Ser Leu Lys Gly Leu Thr Leu Ser Trp Ile Gly Asp Gly Asn Asn
1490 1495 1500
Ile Leu His Ser Ile Met Met Ser Ala Ala Lys Phe Gly Met His
1505 1510 1515
Leu Gln Ala Ala Thr Pro Lys Gly Tyr Glu Pro Asp Ala Ser Val
1520 1525 1530
Thr Lys Leu Ala Glu Gln Tyr Ala Lys Glu Asn Gly Thr Lys Leu
1535 1540 1545
Leu Leu Thr Asn Asp Pro Leu Glu Ala Ala His Gly Gly Asn Val
1550 1555 1560
Leu Ile Thr Asp Thr Trp Ile Ser Met Gly Gln Glu Glu Glu Lys
1565 1570 1575
Lys Lys Arg Leu Gln Ala Phe Gln Gly Tyr Gln Val Thr Met Lys
1580 1585 1590
Thr Ala Lys Val Ala Ala Ser Asp Trp Thr Phe Leu His Cys Leu
1595 1600 1605
Pro Arg Lys Pro Glu Glu Val Asp Asp Glu Val Phe Tyr Ser Pro
1610 1615 1620
Arg Ser Leu Val Phe Pro Glu Ala Glu Asn Arg Lys Trp Thr Ile
1625 1630 1635
Met Ala Val Met Val Ser Leu Leu Thr Asp Tyr Ser Pro Gln Leu
1640 1645 1650
Gln Lys Pro Lys Phe
1655
Claims (51)
- 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질.
- 제 1 항에 있어서,
아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인이 효소 도메인을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 2 항에 있어서,
효소 도메인이 ASS-1 도메인; OTC 도메인; ASL 도메인; OCD1 도메인; ArgG 도메인; ArgH 도메인; 및 ArgF 도메인으로 이루어진 군에서 선택되는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 3 항에 있어서,
ASS-1 도메인이 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 3 항 또는 제 4 항에 있어서,
OTC 도메인이 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 3 항 내지 제 5 항 중 어느 한 항에 있어서,
ASL 도메인이 서열번호 30에 의해 암호화된 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 3 항 내지 제 6 항 중 어느 한 항에 있어서,
ODC1 도메인이 서열번호 31에 의해 암호화된 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 3 항 내지 제 7 항 중 어느 한 항에 있어서,
ArgG 도메인이 서열번호 32에 의해 암호화된 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 3 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 있어서,
ArgH 도메인이 서열번호 33에 의해 암호화된 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 3 항 내지 제 9 항 중 어느 한 항에 있어서,
ArgF 도메인이 서열번호 34에 의해 암호화된 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질.
- 제 11 항에 있어서,
트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인이 효소 도메인을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 11 항 또는 제 12 항에 있어서,
효소 도메인이 TRP5 도메인; 및 IDO 도메인으로 이루어진 군에서 선택되는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 13 항에 있어서,
TRP5 도메인이 서열번호 35에 의해 암호화된 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 13 항 또는 제 14 항에 있어서,
IDO 도메인이 서열번호 36에 의해 암호화된 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 1 항 내지 제 15 항 중 어느 한 항에 있어서,
표적 결합 잔기가 GD2 표적 결합 잔기; CD33 표적 결합 잔기; 메소텔린 표적 결합 잔기; 및 EGFRvIII 표적 결합 잔기로 이루어진 군에서 선택되는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 16 항에 있어서,
GD2 표적 결합 잔기가 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 16 항에 있어서,
CD33 표적 결합 잔기가 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 16 항에 있어서,
메소텔린 표적 결합 잔기가 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 16 항에 있어서,
EGFRvIII 표적 결합 잔기가 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 1 항 내지 제 20 항 중 어느 한 항에 있어서,
세포내 신호전달 영역이 4-1BB 신호전달 영역; OX-40 신호전달 영역; CD28 신호전달 영역; ICOS 신호전달 영역; 및 CD3ζ 신호전달 영역으로 이루어진 군에서 선택되는 영역을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 21 항에 있어서,
세포내 신호전달 영역이 4-1BB 신호전달 영역을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 21 항 또는 제 22 항에 있어서,
4-1BB 세포내 신호전달 영역이 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 21 항 내지 제 23 항 중 어느 한 항에 있어서,
세포내 신호전달 영역이 CD3ζ 도메인을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 24 항에 있어서,
CD3ζ 도메인이 서열번호 11 또는 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는, 융합 표적-결합 단백질. - 제 21 항 내지 제 25 항 중 어느 한 항에 있어서,
4-1BB 도메인 및 CD3ζ 도메인을 둘 다 포함하는 융합 표적-결합 단백질. - 제 1 항 내지 제 26 항 중 어느 한 항에 있어서,
서열번호 12 내지 23으로 이루어진 군에서 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 융합-표적 결합 단백질. - 제 1 항 내지 제 27 항 중 어느 한 항에 있어서,
약제로 사용하기 위한 융합-표적 결합 단백질. - 제 28 항에 있어서,
암의 예방 또는 치료에 사용하기 위한 융합 표적-결합 단백질. - 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 포함하는 세포.
- 제 30 항에 있어서,
융합 표적-결합 단백질이 제 1 항 내지 제 10 항 및 제 16 항 내지 제 27 항 중 어느 한 항에 정의된 바와 같은, 세포. - 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 포함하는 세포.
- 제 32 항에 있어서,
융합 표적-결합 단백질이 제 11 항 내지 제 27 항 중 어느 한 항에 정의된 바와 같은, 세포. - 제 30 항 내지 제 33 항 중 어느 한 항에 있어서,
약제로 사용하기 위한 세포. - 제 34 항에 있어서,
암의 예방 또는 치료에 사용하기 위한 세포. - 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 아르기닌 또는 아르기닌 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 암호화하는 핵산.
- 제 36 항에 있어서,
융합 표적-결합 단백질이 제 1 항 내지 제 10 항 및 제 16 항 내지 제 27 항 중 어느 한 항에 정의된 바와 같은, 핵산. - 제 36 항 또는 제 37 항에 있어서,
서열번호 38, 서열번호 39 또는 서열번호 37의 DNA 서열을 포함하는 핵산. - 표적 결합 잔기, 세포내 신호전달 영역, 및 트립토판 또는 트립토판 전구체의 합성을 촉진하는 도메인을 포함하는 융합 표적-결합 단백질을 암호화하는 핵산.
- 제 39 항에 있어서,
융합 표적-결합 단백질이 제 11 항 내지 제 27 항 중 어느 한 항에 정의된 바와 같은, 핵산. - 제 36 항 내지 제 40 항 중 어느 한 항에 있어서,
약제로 사용하기 위한 핵산. - 제 41 항에 있어서,
암의 예방 또는 치료에 사용하기 위한 핵산. - 제 1 항 내지 제 30 항 중 어느 한 항에 따른 융합 표적-결합 단백질; 및/또는 제 30 항 내지 제 35 항 중 어느 한 항에 따른 세포; 및/또는 제 36 항 내지 제 42 항 중 어느 한 항에 따른 핵산을 포함하는 약학 조성물.
- 제 43 항에 있어서,
약제로 사용하기 위한 약학 조성물. - 제 44 항에 있어서,
암의 예방 또는 치료에 사용하기 위한 약학 조성물. - 제 1 항 내지 제 29 항 중 어느 한 항에 따른 융합 표적-결합 단백질을 치료를 필요로 하는 대상에게 제공하는 것을 포함하는, 상기 대상에서 병태를 치료하는 방법.
- 제 45 항에 있어서,
융합 표적-결합 단백질이 제 37 항 내지 제 43 항 중 어느 한 항에 따른 핵산 서열의 세포 발현에 의해 제공되는, 방법. - 제 30 항 내지 제 35 항 중 어느 한 항에 따른 세포를 치료를 필요로 하는 대상에게 제공하는 것을 포함하는, 상기 대상에서 병태를 치료하는 방법.
- 제 36 항 내지 제 42 항 중 어느 한 항에 따른 핵산을 치료를 필요로 하는 대상에게 제공하는 것을 포함하는, 상기 대상에서 병태를 치료하는 방법.
- 제 46 항 내지 제 49 항 중 어느 한 항에 있어서,
암의 치료에 있어서의 방법. - 제 46 항 내지 제 50 항 중 어느 한 항에 있어서,
바이러스 감염의 치료에 있어서의 방법.
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