KR20170073873A - 신규한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 박테리오파지 Vib-PAP-2 및 이의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 증식 억제 용도 - Google Patents
신규한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 박테리오파지 Vib-PAP-2 및 이의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 증식 억제 용도 Download PDFInfo
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Abstract
본 발명은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖는 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리한 포도비리대 박테리오파지 Vib-PAP-2(수탁번호 KCTC 12910BP), 및 이를 유효성분으로 포함하는 조성물을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염을 방지 및 처치하는 방법에 관한 것이다.
Description
본 발명은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 감염하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 사멸시킬 수 있는 자연으로부터 분리한 박테리오파지 및 이를 유효성분으로 포함한 조성물을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염을 방지 및 처치하는 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖는 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리한 포도비리대 박테리오파지 Vib-PAP-2(수탁번호 KCTC 12910BP), 및 상기 박테리오파지를 유효성분으로 포함하는 조성물을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 및 감염 후 처치 방법에 관한 것이다.
비브리오 속(Genus)에 속하는 비브리오 파라헤몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus) 균은 그람 음성 간균으로 인체에는 급성 식중독 및 장염을 일으키고 어류에는 비브리오병(Vibriosis)을 일으킨다. 어류에서의 비브리오병의 감염 증상은 매우 다양한데, 체색 흑화 증상을 보이기도 하고 체표 궤양(Skin ulcer)이 나타나기도 하며 때로는 지느러미의 발적 및 체표 발적 증상을 보이기도 한다. 또한 해부해 보면 간의 출혈이나 울혈이 관찰되기도 한다.
비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염에 의한 어류의 비브리오병은 그 발병 빈도가 높고 이로 인한 경제적 피해가 크기 때문에 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염을 예방하고 나아가 감염 처치에까지 활용될 수 있는 방안의 개발이 절실한 실정이다.
어류 양식 산업은 부족한 식량자원을 손쉽게 얻을 수 있다는 점에서 해마다 급속한 성장을 거듭하고 있다. 어류 양식장에서는 세균성 질병의 치료 방법으로서 과다하게 항균 화학요법제인 항생제가 사용되고 있는데, 이러한 결과로 다양한 약제에 대한 내성을 지닌 균이 빈번하게 발생하고 있어서, 어류 양식 어가에 상당한 경제적 손실을 입히고 있는 실정이다. 또한, 이러한 항생제의 과다한 사용은 국민 건강을 위협하고 나아가서는 양식 어류의 소비 심리를 위축시켜서 전반적인 수산업의 경쟁력 저하를 야기할 수 있다. 따라서 세균에 의한 어류 질병을 방지할 수 있고 또한 이들의 감염을 효과적으로 처치할 수 있는 항생제 외의 방법의 개발이 절실하다 할 수 있다. 특히, 최근 수산물의 식품으로서의 안전성이 주요 사회적 관심사가 되고 있기 때문에 그 방법이 친환경적이면 더욱 바람직하다.
최근 세균성 질환의 대처 방안으로 박테리오파지(Bacteriophage)의 활용이 크게 주목을 받고 있다. 특히 자연 친화적 방식의 선호로 인하여 박테리오파지에 대한 관심은 어느 때보다 높다고 할 수 있다. 박테리오파지는 세균에 감염하는 아주 작은 미생물로서 보통 파지(Phage)라고 줄여서 부르기도 한다. 박테리오파지는 박테리아에 감염(Infection)한 후 박테리아 세포 내부에서 증식을 하고, 증식 후 자손 박테리오파지들이 박테리아 밖으로 나올 때 숙주인 박테리아의 세포벽을 파괴하는 방식으로 박테리아를 사멸시키는 능력을 갖고 있다. 박테리오파지의 박테리아 감염 방식은 매우 특이성이 높아서 특정 박테리아에 감염할 수 있는 박테리오파지의 종류는 일부로 한정된다. 즉, 특정 박테리오파지는 특정 범주의 박테리아에만 감염할 수 있고 이로 인하여 특정 박테리오파지는 특정 박테리아만을 사멸시키며 다른 박테리아에는 영향을 주지 않는다. 이러한 박테리오파지의 세균 특이성은 목적으로 하는 세균에 대해서만 항균효과를 제공하고 환경이나 어류 내의 상재균들에는 영향을 초래하지 않는다. 통상적으로 기존의 항생제들은 여러 종류의 세균들에 대하여 동시에 영향을 끼쳤다. 그러나, 박테리오파지는 특정 세균에 대해서만 작동하므로 박테리오파지 사용에 의해서 체내 정상균총 교란 등이 발생하지 않는다. 따라서 그 사용이 항생제 사용에 비교하여 매우 안전하고 그 만큼 부작용 초래 가능성이 상대적으로 크게 낮다.
박테리오파지는 1915년 영국의 세균학자 Twort가 포도상구균(Micrococcus) 집락이 어떤 것에 의해 투명하게 녹는 현상에 대한 연구를 수행하면서 발견되었다. 또한, 1917년에는 프랑스의 세균학자 d'Herelle이 이질환자 변의 여과액 중에 적리균(Shigella dysenteriae)을 녹이는 작용을 가진 것이 있다는 것을 발견하고 이에 대한 연구를 통해 독립적으로 박테리오파지를 발견하였으며, 세균을 잡아먹는다는 뜻에서 박테리오파지라고 명명하였다. 이후 이질균, 장티푸스균, 콜레라균 등 여러 병원성 박테리아에 대한 박테리오파지가 계속적으로 발견되었다.
박테리아를 사멸시킬 수 있는 특별한 능력으로 인하여 박테리오파지는 발견 이후 박테리아 감염에 대응하는 효과적 방안으로 기대를 모았으며 관련하여 많은 연구들이 있었다. 그러나 Fleming에 의해 페니실린이 발견된 이후, 항생제의 보급이 일반화되면서 박테리오파지에 대한 연구는 일부 동유럽 국가들 및 구소련에 한정되어서만 명맥이 유지되었다. 그런데 2000년 이후에 항생제 내성균의 증가로 인하여 기존 항생제의 한계성이 나타나고, 기존 항생제의 대체 물질로의 개발 가능성이 부각되면서 다시 박테리오파지가 항-박테리아제로 주목을 받고 있다. 특히 최근 항생제 사용에 대한 정부 차원의 규제가 전 세계적으로 강화됨에 따라 박테리오파지에 대한 관심이 더욱 높아지고 있으며 산업적 활용 사례도 증가하고 있다.
앞에서 설명했듯이 박테리오파지는 세균에 대한 특이성이 매우 높다. 이러한 특이성으로 인하여 박테리오파지는 동일 종류에 속하는 세균들이라 할지라도 그 일부 주(Strain)에 대해서만 항균효과를 발휘하는 경우가 많다. 또한 대상 세균 주에 따라 발휘되는 박테리오파지의 항균력 세기 자체도 다를 수 있다. 이러한 이유로 특정 종류의 세균에 대하여 효과적 제어법을 확보하려면 다양한 종류의 유용 박테리오파지의 확보가 필요하다. 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대응하여 효과적인 박테리오파지 활용법을 개발하기 위해서도 당연히 다양한 유용 박테리오파지들(비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대하여 항균효과를 제공할 수 있는 여러 종류의 박테리오파지들)의 확보가 필요하고, 더 나아가 확보한 다양한 유용 박테리오파지들 중에서 항균력의 세기나 항균범위 측면에서 비교우위에 있는 박테리오파지의 선발도 필요하다.
이에, 본 발명자들은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 선택적으로 사멸시킬 수 있는 자연으로부터 분리된 박테리오파지를 이용하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염을 방지 또는 처치하는 데에 활용될 수 있는 조성물을 개발하고, 또 이 조성물을 이용하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염을 방지 또는 처치하는 방법을 개발하고자 노력한 끝에, 이에 적합한 박테리오파지를 자연으로부터 분리하고 이 분리된 박테리오파지를 타 박테리오파지와 구별하여 특정 지을 수 있도록 유전체(Genome)의 유전자 서열을 확보한 후 상기 박테리오파지를 유효성분으로 한 조성물을 개발한 다음 이 조성물이 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 및 처치에 효과적으로 활용될 수 있음을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.
따라서 본 발명의 목적은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖는 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리한 포도비리대(Podoviridae) 박테리오파지 Vib-PAP-2(수탁번호 KCTC 12910BP)를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 감염하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 사멸시킬 수 있는 분리 박테리오파지 Vib-PAP-2를 유효성분으로 포함하는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염을 방지하는 데에 활용 가능한 조성물 및 이 조성물을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 감염하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 사멸시킬 수 있는 분리 박테리오파지 Vib-PAP-2를 유효성분으로 포함하는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염을 처치하는 데에 활용 가능한 조성물 및 이 조성물을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 처치 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 조성물들을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염 방지 및 처치 목적의 약욕제를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 조성물들을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염 방지 및 처치를 통한 사양 효과 제공 목적의 사료첨가제를 제공하는 것이다.
본 발명은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖는 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리한 포도비리대 박테리오파지 Vib-PAP-2(수탁번호 KCTC 12910BP), 및 이를 유효성분으로 포함하는 조성물을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 및 처치 방법을 제공한다.
박테리오파지 Vib-PAP-2는 본 발명자들에 의해 분리된 후 2015년 9월 22일자로 한국생명공학연구원 미생물자원센터에 기탁되었다(수탁번호 KCTC 12910BP).
또한, 본 발명은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염을 방지 또는 처치하는 데에 활용될 수 있는 박테리오파지 Vib-PAP-2를 유효성분으로 포함하는 약욕제 및 사료첨가제를 제공한다.
본 발명의 조성물에 포함되는 박테리오파지 Vib-PAP-2는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 효과적으로 사멸시키므로 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 의해 유발되는 질병의 예방(감염 방지)이나 치료(감염 처치)에 효과를 나타낸다. 따라서 본 발명의 조성물은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 의해 유발되는 대표적인 질병인 비브리오병에 대한 예방 및 치료 목적으로 활용될 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 명세서에서 사용된 “방지” 또는 “예방”이라는 용어는 (ⅰ) 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염의 방지; 및 (ⅱ) 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염에 의한 질병으로의 발전을 억제하는 것을 의미한다.
본 명세서에서 사용된 “처치” 또는 “치료”라는 용어는 (ⅰ) 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 의해 유발된 질환의 억제; 및 (ⅱ) 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 의해 유발된 질환의 병적 상태를 경감시키는 모든 행위를 의미한다.
본 명세서의 “분리” 또는 “분리된”은 자연 상태로부터 여러 실험 기법을 활용하여 박테리오파지를 분리하는 것과 타 박테리오파지와 구별하여 특정 지을 수 있는 특징들을 확보하는 일을 지칭하며, 이에 더하여 생물공학기술로 박테리오파지를 산업적으로 활용할 수 있게끔 증식시키는 것도 포함한다.
본 발명의 조성물에 포함되는 약제학적으로 허용되는 담체는 제제 시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토오스, 덱스트로오스, 수크로오스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산칼슘, 알지네이트, 젤라틴, 규산칼슘, 미세결정성 셀룰로오스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로오스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로오스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명의 조성물에는 박테리오파지 Vib-PAP-2가 유효성분으로 포함된다. 이때 포함되는 박테리오파지 Vib-PAP-2는 1× 101 pfu/㎖ 내지 1× 1030 pfu/㎖ 또는 1× 101 pfu/g 내지 1× 1030 pfu/g로 포함되며, 바람직하게는 1× 104 pfu/㎖ 내지 1× 1015 pfu/㎖ 또는 1× 104 pfu/g 내지 1× 1015 pfu/g로 포함된다.
본 발명의 조성물은 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화 됨으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수도 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질 중의 용액, 현탁액 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캡슐제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수도 있다.
본 발명의 조성물은 활용 방식에 따라, 이에 국한되지 않지만, 약욕제 및 사료첨가제로 구현될 수 있다.
이러한 활용 목적에서의 효율성을 높이기 위하여 다른 세균종에 대하여 항균활성을 제공할 수 있는 박테리오파지들이 본 발명의 조성물에 추가될 수 있다. 또한, 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대하여 항균활성을 갖는 다른 종류의 박테리오파지들도 추가될 수 있다. 비록 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대하여 항균활성을 갖는 박테리오파지라 하더라도 항균력의 세기나 항균범위 측면에서 차이가 있으므로 이들의 적절한 조합은 그 효과를 극대화 할 수 있다.
본 발명의 박테리오파지 Vib-PAP-2를 유효성분으로 포함하는 조성물을 이용한 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 및 처치 방법은 기존의 항생제 등의 화학물질에 기반을 둔 방식에 비하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대한 특이성이 매우 높다는 장점을 제공할 수 있다. 이는 다른 유용한 상재균에는 영향을 주지 않으면서도 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 또는 처치 목적으로 사용할 수 있음을 의미하며, 이의 사용에 따른 부작용이 매우 적다. 통상적으로 항생제 등의 화학물질을 사용하면 일반 상재균들도 피해를 함께 입게 되어 결과적으로 동물의 면역력 저하 등을 초래하여 다양한 부작용이 나타난다. 한편, 본 발명은 자연계에 이미 존재하는 박테리오파지를 분리하여 조성물의 유효성분으로 사용하기 때문에 매우 자연 친화적이라는 장점 또한 제공할 수 있다. 한편, 박테리오파지는 항균활성을 발휘할 수 있는 세균종이 같다 하더라도 항균효과 발휘에 있어 항균력의 세기나 항균범위[비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 속하는 여러 세균 주(Strain)의 측면에서 개별 세균 주에 대하여 박테리오파지의 항균활성이 발휘되는 범위. 통상적으로 박테리오파지는 같은 세균 종(Species)에 속하는 일부 세균 주(Strain)에 대하여 항균활성을 발휘할 수 있음. 즉, 같은 세균 종에 속한다 하더라도 개별 세균 주에 따라 박테리오파지에 대한 감수성에서 차이가 있을 수 있음] 측면에서 차이가 있으므로 본 발명은 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대한 항균력을 갖는 타 박테리오파지에 비교하여 차별적 항균효과를 제공할 수 있다. 이는 산업현장 활용 시에 그 효과에 있어 큰 차이를 제공한다.
도 1은 박테리오파지 Vib-PAP-2의 전자현미경 사진이다.
도 2는 박테리오파지 Vib-PAP-2의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대한 사멸능을 보여주는 실험 결과이다. 투명한 부분은 시험대상 박테리아가 용균되어 결과적으로 형성된 용균반이다.
도 2는 박테리오파지 Vib-PAP-2의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대한 사멸능을 보여주는 실험 결과이다. 투명한 부분은 시험대상 박테리아가 용균되어 결과적으로 형성된 용균반이다.
이하, 실시예에 의거하여 본 발명을 보다 구체적으로 설명하지만, 이들 실시예는 본 발명의 예시일 뿐이며 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예
1: 비브리오
파라헤몰리티쿠스
균을 사멸시킬 수 있는 박테리오파지의 분리
비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 사멸시킬 수 있는 박테리오파지의 선별에는 자연 환경으로부터 확보된 시료들을 이용하였다. 한편, 박테리오파지 분리에 사용된 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균은 한국생명공학연구원 미생물자원센터로부터 분양받아 사용하였다(분양번호 KCTC 2729).
박테리오파지 분리 과정을 상세히 설명하면, 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 1/1,000 비율로 접종한 LB(Luria-Bertani) 배지(트립톤, 10 g/L; 효모 추출물, 5 g/L; 염화 나트륨, 10 g/L)에 수집된 시료를 함께 첨가한 다음 37℃에서 3-4시간동안 진탕배양 하였다. 배양 후, 8,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상등액을 회수하였다. 회수된 상등액에 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 1/1,000 비율로 접종한 다음 37℃에서 3-4시간동안 또 다시 진탕배양 하였다. 박테리오파지가 시료에 포함되어 있었을 경우 박테리오파지의 수(Titer)가 증가될 수 있도록 이러한 과정을 총 5회 반복하였다. 5회 반복 후에 배양액을 8,000 rpm에서 20분간 원심분리 하였다. 원심분리 후, 회수된 상등액을 0.45 ㎛의 필터를 이용하여 여과를 실시해 주었다. 얻어진 여과액을 사용한 통상의 점적 실험(Spot assay)을 통하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 사멸시킬 수 있는 박테리오파지가 있는지를 조사하였다.
상기 점적 실험은 다음과 같이 실시되었다. LB 배지에 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 1/1,000 비율로 접종한 다음 37℃에서 한밤동안 진탕배양 하였다. 이렇게 하여 준비된 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 배양액 3 ㎖(OD600이 1.5)을 LA(Luria-Bertani Agar) 평판배지(트립톤, 10 g/L; 효모 추출물, 5 g/L; 염화 나트륨, 10 g/L; 아가, 15 g/L)에 도말(Spreading)하였다. 도말한 평판 배지를 클린벤치(Clean bench)에서 약 30분 정도 방치하여 도말액이 건조되게 하였다. 건조 후 앞에서 준비한 여과액 10 μl를 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균이 도말된 평판 배지 위에 점적하였다. 이를 30분 정도 방치하여 건조시켰다. 건조 후 점적한 평판 배지를 37℃에서 하루 동안 정치 배양한 다음 여과액이 떨어진 위치에 투명환(Clear zone)이 생성되는가를 조사하였다. 투명환이 생성되는 여과액의 경우가 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 사멸 시킬 수 있는 박테리오파지가 포함되어 있다고 판단할 수 있다. 이러한 조사를 통하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대한 사멸능을 가진 박테리오파지를 포함한 여과액을 확보할 수 있었다.
비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대한 사멸능을 가진 박테리오파지의 존재가 확인된 여과액을 이용하여 순수 박테리오파지의 분리를 실시하였다. 순수 박테리오파지의 분리에는 통상의 용균반 분석(Plaque assay)을 이용하였다. 이를 자세히 설명하면, 용균반 분석에서 형성된 용균반 하나를 멸균된 팁을 이용하여 회수한 다음 이를 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 배양액에 첨가해 주어 4-5 시간 동안 37℃에서 함께 배양하였다. 배양 후 8,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상등액을 얻었다. 얻어진 상등액에 50분의 1의 부피로 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 배양액을 첨가해 준 다음 다시 37℃에서 4-5 시간 배양해 주었다. 박테리오파지의 수를 증가시키기 위하여 이러한 과정을 최소 5회 이상 실시한 다음 최종적으로 8,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상등액을 얻었다. 얻어진 상등액을 사용하여 다시 용균반 분석을 실시하였다. 통상 순수 박테리오파지의 분리가 상기 과정의 1회만으로는 달성되지 않기 때문에 1차 순수분리 과정에서 형성된 용균반을 이용하여 앞 단계를 전체적으로 다시 반복하였다. 이와 같은 과정을 최소 5회 이상 실시하여 순수한 박테리오파지를 포함한 용액을 확보하였다. 통상적으로 순수 박테리오파지의 분리는 형성된 용균반의 크기 및 모양이 모두 유사하게 될 때까지 반복하였다. 그리고 최종적으로는 전자현미경 분석을 통하여 박테리오파지의 순수 분리 여부를 확인하였다. 전자현미경 분석에서 순수 분리가 확인될 때까지 앞에 기술한 과정을 반복하였다. 전자현미경 분석은 통상의 방법에 따라 실시하였다. 이를 간단히 설명하면 다음과 같다. 순수한 박테리오파지를 포함한 용액을 구리 격자(Copper grid)에 묻히고 2% 우라닐 아세테이트(Uranyl acetate)로 역염색법(Negative staining)과 건조를 수행한 후 투과전자현미경을 통하여 그 형태를 관찰하였다. 순수 분리한 박테리오파지의 전자현미경 사진이 도 1에 제시되어 있다. 신규 확보된 박테리오파지는 형태적 특징으로 판단할 때 포도비리대(Podoviridae) 박테리오파지에 속함을 확인할 수 있었다.
이런 방식으로 확인된 순수 박테리오파지를 포함한 용액은 다음의 정제 과정을 거쳤다. 순수 박테리오파지를 포함한 용액 전체 부피의 50분의 1의 부피로 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 배양액을 첨가해 준 다음 다시 4-5 시간 배양하였다. 배양 후 8,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상등액을 얻었다. 충분한 수의 박테리오파지가 포함된 액을 얻기 위해 이러한 과정을 총 5회 반복하였다. 최종 원심분리로 얻어진 상등액을 0.45 μm의 필터를 이용하여 여과한 다음 통상의 폴리에틸렌 글리콜(Polyethylene Glycol; PEG) 침전 과정을 실시하였다. 구체적으로, 여과액 100 ㎖에 10% PEG 8000/0.5 M NaCl이 되게 PEG와 NaCl을 첨가한 다음 4℃에서 2-3시간 동안 정치한 후, 8,000 rpm에서 30분간 원심분리하여 박테리오파지 침전물을 얻었다. 이렇게 얻어진 박테리오파지 침전물을 완충액(Buffer; 10 mM Tris-HCl, 10 mM MgSO4, 0.1% Gelatin, pH 8.0) 5 ㎖로 부유시켰다. 이를 박테리오파지 부유액 또는 박테리오파지 액이라 지칭한다.
이렇게 하여 정제된 순수 박테리오파지를 확보할 수 있었고, 이 박테리오파지를 박테리오파지 Vib-PAP-2로 명명한 뒤, 2015년 9월 22일자로 한국생명공학연구원 미생물자원센터(수탁번호 KCTC 12910BP)에 기탁하였다.
실시예
2: 박테리오파지
Vib
-PAP-2의 유전체 분리 및 서열 분석
박테리오파지 Vib-PAP-2의 유전체를 다음과 같이 분리하였다. 유전체 분리에는 실시예 1에서와 같은 방법으로 얻어진 박테리오파지 부유액을 이용하였다. 먼저 부유액에 포함되어 있을 수 있는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 DNA와 RNA를 제거하기 위해, 박테리오파지 부유액 10 ㎖에 DNase I과 RNase A를 각각 200 U씩 첨가한 다음 37℃에서 30분간 방치하였다. 30분 방치 후에 DNase I과 RNase A의 활성을 제거하기 위해, 0.5 M 에틸렌디아민테트라아세트산(Ethylenediaminetetraacetic acid; EDTA) 500 μl를 첨가한 다음 다시 10분간 정치시켰다. 그리고 이를 추가로 10분간 65℃에 정치시킨 다음 박테리오파지 외벽을 와해시키기 위해 proteinase K(20 ㎎/㎖) 100 μl를 첨가한 후 37℃에서 20분간 반응시켰다. 그 후 10% 도데실 황산 나트륨염(Sodium dodecyl sulfate; SDS) 500 μl를 첨가한 다음 다시 65℃에서 1시간 동안 반응시켰다. 1 시간 반응 후, 이 반응액에 25:24:1의 구성비를 갖는 페놀(Phenol):클로로포름(Chloroform):이소아밀알코올(Isoamylalcohol)의 혼합액 10 ㎖을 첨가해 준 후 잘 섞어 주었다. 그리고는 이것을 13,000 rpm에서 15분간 원심분리하여 층이 분리되게 한 다음 분리된 층들 중에서 위층을 취하여 여기에 1.5 부피비의 이소프로필 알코올(Isopropyl alcohol)을 첨가한 다음 13,000 rpm에서 10분간 원심분리하여 유전체를 침전시켰다. 침전물을 회수한 후 침전물에 70% 에탄올(Ethanol)을 첨가한 다음 다시 13,000 rpm에서 10분간 원심분리하여 침전물의 세척을 실시하였다. 세척된 침전물을 회수하고 진공 건조 시킨 다음 100 μl의 물에 녹였다. 상기 과정을 반복하여 박테리오파지 Vib-PAP-2의 유전체를 다량 확보하였다.
이렇게 얻어진 박테리오파지 Vib-PAP-2 유전체에 대하여 Roche 454 GS Junior 기기를 이용한 차세대 염기서열 분석(Next generation sequencing analysis)을 실시하였다. 최종적으로 분석된 박테리오파지 Vib-PAP-2 유전체는 43,221 bp의 크기를 가지며, 전체 유전체 서열은 서열번호 1로 제시되어 있다.
확보된 박테리오파지 Vib-PAP-2의 유전체 서열을 기반으로 Web상의 BLAST(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)를 이용하여 기존에 알려진 박테리오파지 유전체 서열과의 상동성(Similarity)을 조사해 보았다. BLAST 조사 결과, 박테리오파지 Vib-PAP-2의 유전체 서열은 비브리오 박테리오파지 VP93의 유전체 서열(Genbank Accession No. FJ896200.1)과 비교적 높은 상동성을 가지고 있는 것으로 확인되었다(Query coverage/identity: 95%/94%). 그러나 박테리오파지 Vib-PAP-2는 환형의 유전체를 가짐에 반하여 비브리오 박테리오파지 VP93은 선형의 유전체를 가져 서로 상이한 박테리오파지라 판단할 수 있었다. 또한, Web상의 NEBcutter V2.0(http://nc2.neb.com/NEBcutter2/index.php) 프로그램을 이용하여 박테리오파지 Vib-PAP-2의 유전체 서열과 비브리오 박테리오파지 VP93의 유전체 서열을 비교분석한 결과, 박테리오파지 Vib-PAP-2의 유전체를 단일 절단(Single cut)할 수 있는 제한효소의 종류가 8개(AhdI, BglI, BsaI, BseYI, BssHII, EarI, MscI, PsiI)인데 반하여, 비브리오 박테리오파지 VP93의 유전체를 단일 절단할 수 있는 제한효소의 종류는 10개(AcuI,,,,,,,,,)인 것으로 보아 서로 상이한 박테리오파지임을 다시 한번 확인할 수 있었다.
이러한 사실에 근거하여 박테리오파지 Vib-PAP-2는 기존에 보고된 바 없는 신규한 박테리오파지라고 판단할 수 있었다. 이러한 사실과 함께 통상적으로 박테리오파지의 종류가 다르면 제공할 수 있는 항균력의 세기 및 항균범위가 다르다는 사실로부터 박테리오파지 Vib-PAP-2는 기존에 보고된 다른 박테리오파지들과는 다른 항균효과를 제공해 줄 수 있다고 판단하였다.
실시예
3: 박테리오파지
Vib
-PAP-2의 비브리오
파라헤몰리티쿠스
균에 대한 사멸능 조사
분리된 박테리오파지 Vib-PAP-2의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대한 사멸능을 조사하였다. 사멸능 조사에는 실시예 1에서와 같은 방법으로 점적 실험을 통하여 투명환 생성 여부를 조사하였다. 사멸능 조사에 사용되어진 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균은 본 발명자들에 의해 분리되어 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균으로 동정된 것들로 총 14주이었다. 박테리오파지 Vib-PAP-2는 실험에 대상이 된 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 중 13주에 대하여 사멸능을 갖고 있었다. 대표적 실험 결과가 도 2에 제시되어 있다. 한편, 박테리오파지 Vib-PAP-2의 에드워드시엘라 타르다(Edwardsiella tarda), 비브리오 안길라룸(Vibrio anguillarum), 비브리오 익티오엔테리(Vibrio ichthyoenteri), 락토코커스 가르비에(Lactococcus garvieae), 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis), 스트렙토코커스 이니에(Streptococcus iniae), 및 에로모나스 살모니시다 (Aeromonas salmonicida)에 대한 사멸능 조사도 별도 실험으로 실시하였는데, 그 결과로 박테리오파지 Vib-PAP-2는 이들 균종들에 대해서는 사멸능을 갖고 있지 않았다.
이상의 결과로 박테리오파지 Vib-PAP-2는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대하여 특이적인 사멸능을 가지며, 다수의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 대하여 항균 효과를 발휘할 수 있음을 확인할 수 있었다. 이는 박테리오파지 Vib-PAP-2가 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 및 처치 목적의 조성물의 유효성분으로 활용 가능함을 의미한다.
실시예
4: 박테리오파지
Vib
-PAP-2의 비브리오
파라헤몰리티쿠스
균의 감염 예방에 대한
실험예
9 ㎖의 LB 배지를 담은 하나의 튜브에 1× 108 pfu/㎖ 수준의 박테리오파지 Vib-PAP-2 액 100 μl를 넣어주고, 다른 하나의 9 ㎖의 LB 배지를 담은 튜브에는 동량(100 μl)의 LB 배지만을 추가로 첨가하였다. 그 다음에 각 튜브에 600 nm에서 흡광도가 약 0.5 정도가 되도록 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 배양액을 넣어 주었다. 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 첨가한 후 튜브들을 37℃의 배양기에 옮겨 진탕배양하면서 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 성장 상태를 관찰하였다. 표 1에 제시된 바와 같이, 박테리오파지 Vib-PAP-2 액을 첨가해 준 튜브에서는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 성장 억제가 관찰된 반면에 박테리오파지 액을 첨가하지 않은 튜브에서는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 성장 억제가 관찰되지 않았다.
구분 | OD600 흡광도 값 | ||
배양 0분 | 배양후 60분 | 배양후 120분 | |
박테리오파지 액 미첨가 | 0.52 | 0.92 | 1.84 |
박테리오파지 액 첨가 | 0.53 | 0.31 | 0.15 |
이 결과로부터 본 발명의 박테리오파지 Vib-PAP-2가 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 성장을 저해하여 감염을 억제할 뿐만 아니라 사멸까지 시키는 능력이 있음을 확인할 수 있었고, 이로부터 박테리오파지 Vib-PAP-2가 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염을 방지하는 목적의 조성물 유효성분으로 활용될 수 있다고 결론지을 수 있었다.
실시예
5: 박테리오파지
Vib
-PAP-2를 이용한 비브리오
파라헤몰리티쿠스
균의 감염 예방 동물실험
농어(Sea bass)를 이용하여 박테리오파지 Vib-PAP-2의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염 예방 효과를 조사하였다. 농어 치어(체중: 5~7 g, 체장: 8~10 cm) 50마리를 한 그룹으로 하여 총 두 그룹으로 나눈 후 수조에서 분리 사육하면서 14일간 실험을 실시하였다. 수조의 주위환경은 통제하였고, 수조가 있는 실험실의 온도는 일정하게 유지시켰다. 실험 개시일로부터 실험군(박테리오파지 투여군)의 농어들에게는 1× 108 pfu/g의 박테리오파지 Vib-PAP-2를 포함하고 있는 사료를 통상적인 사료 급이 방식에 따라 급이하였다. 반면에 대조군(박테리오파지 미투여군)의 농어들에게는 박테리오파지 Vib-PAP-2가 포함되지 않은 동일 조성의 사료를 동일한 방식으로 급이하였다. 시험개시일로부터 7일째가 되는 날부터 2일간 실험군과 대조군 모두에 대하여 각 군에 급이하던 사료에 추가로 1× 108 cfu/g 수준으로 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 오염시킨 후에 이를 하루 2회씩 급이하여 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염을 유도하였다. 2일간의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 감염 유도 다음날(시험 개시일로부터 9일째가 되는 날)부터는 다시 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균 오염이 없는 각 군에 맞는 사료를 급이하였고, 이날부터 매일 모든 시험동물들을 대상으로 비브리오병 발생 상태를 조사하였다. 비브리오병 발생 상태 조사는 체색 흑화지수를 측정하는 방식으로 실시하였다. 체색 흑화지수 측정은 통상 사용되는 Dark Coloration(DC) score(정상: 0, 연한 흑화: 1, 진한 흑화: 2)를 측정하는 방식으로 실시하였다.
시험 결과는 표 2와 같았다.
날짜 | D9 | D10 | D11 | D12 | D13 | D14 |
대조군(박테리오파지 미투여) | 0.68 | 0.72 | 0.76 | 0.92 | 1.08 | 1.20 |
실험군(박테리오파지 투여) | 0.16 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
이 결과로부터 본 발명의 박테리오파지 Vib-PAP-2가 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 원인으로 하는 감염 질환의 예방에 매우 효과적이라는 것을 확인할 수 있었다.
실시예
6: 박테리오파지
Vib
-PAP-2를 이용한 비브리오
파라헤몰리티쿠스
균의 감염 질환
처치예
비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 의해 비브리오병이 유발된 농어에서의 박테리오파지 Vib-PAP-2의 처치 효과를 조사하였다. 농어 치어(체중: 5~7 g, 체장: 8~10 cm) 60마리를 한 그룹으로 하여 총 두 그룹으로 나눈 후 수조에서 분리 사육하면서 14일간 실험을 실시하였다. 수조의 주위환경은 통제하였고, 수조가 있는 실험실의 온도는 일정하게 유지시켰다. 실험 개시일로부터 5일째 되는 날부터 3일간 1× 108 cfu/g 수준으로 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균이 오염된 사료를 하루 2회씩 통상적인 사료 급이 방식으로 급이하였다. 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균이 오염된 사료 급이 마지막 날부터 비브리오병의 임상증상을 보이는 개체가 두 수조 모두에서 확인되었다. 3일간의 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균이 오염된 사료 급이 시행 다음날(시험 개시일로부터 8일째가 되는 날)부터 실험군(박테리오파지 투여군)의 농어들에게는 박테리오파지 Vib-PAP-2를 포함(1× 108 pfu/g)하고 있는 사료를 통상적인 사료 급이 방식에 따라 급이하였다. 반면에 대조군(박테리오파지 미투여군)의 농어들에게는 박테리오파지 Vib-PAP-2가 포함되지 않은 동일 조성의 사료를 동일한 방식으로 급이하였다. 시험 개시일로부터 8일째가 되는 날부터는 매일 모든 시험동물들을 대상으로 비브리오병 발생 상태를 조사하였다. 비브리오병 발생 상태 조사는 체색 흑화지수를 측정하는 방식으로 실시하였다. 체색 흑화지수 측정은 통상 사용되는 Dark Coloration(DC) score(정상: 0, 연한 흑화: 1, 진한 흑화: 2)를 측정하는 방식으로 실시하였다.
시험 결과는 표 3과 같았다.
날짜 | D8 | D9 | D10 | D11 | D12 | D13 | D14 |
대조군(박테리오파지 미투여) | 0.93 | 1.00 | 1.07 | 1.13 | 1.23 | 1.37 | 1.40 |
실험군(박테리오파지 투여) | 0.87 | 0.80 | 0.77 | 0.63 | 0.40 | 0.23 | 0.20 |
이 결과로부터 본 발명의 박테리오파지 Vib-PAP-2가 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 원인으로 하는 감염 질환의 처치에도 매우 효과적이라는 것을 확인할 수 있었다.
실시예
7: 사료첨가제 및 사료의 제조
박테리오파지 Vib-PAP-2 액을 이용하여 사료첨가제 1 g당 1× 108 pfu의 박테리오파지 Vib-PAP-2가 포함되도록 사료첨가제를 제조하였다. 사료첨가제의 제조 방법은 박테리오파지 액에 말토덱스트린을 첨가(50%, w/v)한 다음에 동결건조시켜 제조하였다. 최종적으로 고운 가루 형태로 분쇄하였다. 상기 제조 과정 중의 건조 과정에는 감압 건조, 가온 건조, 상온 건조도 대체 가능하다. 대조 실험을 위해, 박테리오파지가 포함되지 않은 사료첨가제도 박테리오파지 액 대신에 박테리오파지 액의 제조 시에 사용한 완충액(Buffer; 10 mM Tris-HCl, 10 mM MgSO4, 0.1% Gelatin, pH 8.0)을 사용하는 방식으로 제조하였다.
이렇게 제조된 2종의 사료첨가제 각각을 중량비로 250배의 양어용 생사료와 혼합하여 최종 2종의 사료를 제조하였다.
실시예
8:
약욕제의
제조
박테리오파지 Vib-PAP-2 액을 이용하여 약욕제 1 ㎖당 1× 108 pfu의 박테리오파지 Vib-PAP-2가 포함되도록 약욕제를 제조하였다. 약욕제의 제조 방법은 박테리오파지 액 제조 시에 사용하는 완충액 1 ㎖당 1× 108 pfu의 박테리오파지 Vib-PAP-2가 포함되도록 상기 박테리오파지 Vib-PAP-2 액을 첨가하여 잘 혼합해 주는 방식으로 제조하였다. 대조 실험을 위해, 박테리오파지가 포함되지 않은 약욕제로는 박테리오파지 액의 제조 시에 사용한 완충액 자체를 그대로 사용하였다.
이렇게 제조된 2종의 약욕제는 부피비로 1,000배의 물로 희석하여 최종적인 약욕제로 사용하였다.
실시예
9: 농어 사육에서의 사양 효과 확인
실시예 7 및 실시예 8에서 제조한 사료와 약욕제를 이용하여 농어 사육 시의 사양 결과 개선 여부에 대하여 조사해 보았다. 특히 본 조사는 폐사율 관점에서 실시되었다. 총 500 마리의 농어 치어(체중: 5~7 g, 체장: 8~10 cm)를 250 마리씩 한 그룹으로 총 2개 그룹(사료로 급이한 그룹-A; 약욕제로 처치한 그룹-B)으로 나누어 4주간 시험을 실시하였다. 각 그룹은 다시 125마리로 구성되는 소그룹으로 나누어지며 각 소그룹은 박테리오파지 Vib-PAP-2가 적용된 소그룹(소그룹-①) 및 박테리오파지가 적용되지 않은 소그룹(소그룹-②)으로 나누었다. 각 시험 소그룹의 농어는 일정 간격을 두고 위치한 격리된 각각의 수조에서 사육되었다. 각 소그룹은 다음의 표 4와 같이 구분되고 지칭되었다.
적용 | 소그룹 구분 및 표시 | |
박테리오파지 Vib-PAP-2 적용 |
박테리오파지가 적용되지 않음 |
|
사료로 급이한 그룹 | A-① | A-② |
약욕제로 처치한 그룹 | B-① | B-② |
사료 급이의 경우에는 실시예 7에서 설명한 사료 제조 방식에 따라 제조한 사료를 표 4의 구분에 따라 통상적인 사료 급이 방식을 따라 급이 하였으며, 약욕제 처치의 경우에는 실시예 8에서 설명한 약욕제 제조 방식에 따라 제조한 약욕제를 표 4의 구분에 따라 통상적인 약욕제 처치 방식에 따라 처치하였다.
시험 결과는 표 5에 제시되어 있다.
그룹 | 폐사개체수/시험개체수 | 폐사율(%) |
A-① | 3/125 | 2.4 |
A-② | 25/125 | 20.0 |
B-① | 8/125 | 6.4 |
B-② | 32/125 | 25.6 |
이상의 결과로 본 발명에 따라 제조된 사료의 급이와 본 발명에 따른 약욕제 처치가 농어 사육에서의 폐사율 감소에 효과가 있음을 확인할 수 있었다. 이로부터 본 발명의 조성물의 적용이 농어의 사양 결과 개선에 효과적이라는 결론을 내릴 수 있었다.
이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
SEQUENCE LISTING
<110> iNtRON Biotechnology, Co. Ltd.
<120> Novel Vibrio parahaemolyticus bacteriophage Vib-PAP-2 and its use
for preventing proliferation of Vibrio parahaemolyticus
<130> KP090440
<160> 1
<170> PatentIn version 3.2
<210> 1
<211> 43221
<212> DNA
<213> Vibrio parahaemolyticus bacteriophage Vib-PAP-2
<400> 1
gtcattaccc agttgagcaa tgatttcacg catcttatct gtgtctgaga tacggaagaa 60
gctcatccca gttgggaaaa gcgtccgtgt cagtttacta gcaaggttgt taaccaacat 120
agcaccgtga gattggaagt cgcgttgaag tgatacgcgc tctccgtctt tgttctcacg 180
tgtaaaaacg gtaggcactg tccagaaagc ataacgctct gaactcagag taacctcaga 240
gtcctcatac ttagcgaaca gagcctcgtg agtctcttga gtatgcatac agtaccttat 300
aatcctaagc ttgaactaac gtcagccatc ttgcgtttac gagttgtaag accaagagca 360
tcatcggctg ctagatttgc agaaccgcct gtctcaacct taactacgtc gtcaagagct 420
ttgttagctt ggagtgtgtt agcttcacgc attcgagtct gttcggcttc gaactgtttc 480
ttctgcgcat cagcttggcg gcgtgcttct cgtgccgcat ctttaccact atcgaatccc 540
atgtttcacc ttgtagtact tgagtctgta ctcgtactcg ccctgcttgt gagggatgag 600
cacccagtcc agacgttgtg ccttggcata gcgcataatc gcacggtaca tgtgatgtcc 660
gatattgtgg ttcgggagca cgtagcttaa tacaacgccc acgcctttac cactgatatg 720
cggtgtcgtg tacggtgctg ttatagcgca gccccctatt agaatgcctt tgtgatggat 780
acccatacac atgaacccat caactgagtc ggcaactgag tctctaaagt ctttagaggt 840
aataccccga gcgaactcag ggttgttgtg gtacgctagg tttgcgacaa ctcgcgcacc 900
tagcacagcc tttctacctg tgtagaattc tagagtataa tctgacactt cgtgtctctc 960
ctgttcgtgg gactttaaat tagcagaaga agaatggtga atctttaacc aactccagat 1020
tcagtgtacc cattggaggc atctcgatac cctcaaggtc agcacctgct tccaacgctg 1080
cgtcacggat aacctcaagt ggattctggt gctcagtata tagaatcacg aactgctcac 1140
gcaacacacg gtgcagttcg tcaacatcac aagcgtgagt cgcaactgaa tcatggattg 1200
gaatgatgtc accgtcaaag ttcaagatgg tcatcataag gtgtgagcta tctccttggt 1260
ggatgaagtt cggtgagata ccggatacag ctttctggcg gtggttacgc tcgtagtcga 1320
agttgtacag cacgacttgg ttgataccca tactgcgcac tttgacgcga gtctcgtggc 1380
ggttgcagta gcggttaatc accagaccac caagcaccgt cttccactgc aagtgatgtt 1440
ccatcggtac tcgctgacat acagctttga ggtaatccat accacgtgca gcggctggca 1500
tggcctcatt aatactgtca cgcatcagcg gtgatacgaa cgaacacagc ttgaacagtg 1560
tgtactcgtc tgtaccctcg taaccctcat cagcagcacc aaggaaaatg taatccgtgc 1620
agctacgtaa tgtggcagag tagaagtacg tcatcgttgg gcgcttggtc attgaacgtg 1680
tgatagggtt cagtgtccag taatgtgctt gcacgattgt ctcagggtca cgtagagcag 1740
ccttgatttt cgagtcagta cgctgcttaa catccatgta caggtcggcc ttggttaagt 1800
taccatccca gaataggttc gttagcttac cgccgattgg gtcacgtagc attgcagaga 1860
agtgctgacc accagagtta gtggcatcca aagctaccgc aatattcgac tcgtacttct 1920
cagggtcagg agagtctaga gcttcgatta gttggatact agccgcaagc atacaccaga 1980
attcatctgc gtctttgaag tcctcattat tcaacgggtc tttaacccac tcacggattg 2040
cgtcaagacg ttcctcagtc cacttggcac gttcttcgaa caatggctta tcaaaaccaa 2100
aacatgttgc cacttgtgct ttcagccaga atagaccacg cttacctagt ggcttcttac 2160
gcccaagcag cagcagcgcc ttttggatgt cagagccttg tgggttcaag tgtgatttga 2220
agtacaagcg gtaacgccag tcaacacagg tcgggaagta caacgcatct tcatccatga 2280
agcggcgaca caagtcaagc gtgatagcca actgacgaat ctgtgataca cgtttacgtt 2340
cctttgtgta ccactgacgc atctgggtct tccaaacctc aaacgcctct tggtcatcct 2400
cagaccagtc agccttgtca gtaccgtgta ggtggaactt aggctgtggt ttctggtggt 2460
ggcttgggat accaacgtca aagcccgtag ccttggcttg tagtactaag tcgtaaatac 2520
ttttgttcac gacgtaaggc acttcctgtg ctttgttcaa cgcttgacgg atacctgtcg 2580
cctgtttaaa cgcctcgttc acttcacgca aacgggaacg cttgatgtgt cggttcgagt 2640
acgtatggcg acggctcagg tcagttaagt aaccgccgtt gtaaatgtct tcgtgacgta 2700
ccggagggac aatcatcggt gggtagtgca ccatagtgtc ggcgtgctca agcacatccg 2760
agaacacacc ttgcagttct tcggctggct cagcgtacag caaacctttc gggccttgta 2820
cccattcaaa gataccagta tcgtgcacac actggagcaa caagcggcct acgttgaagc 2880
aggttgtgtt gtcccaaggg tcagtttcca gtttcacgtt cgcactagcg gcacggaacg 2940
tacgcaagat atgagattgg gaacgcgtct tgtgctcttt caagtattca tacactcggt 3000
tcatgtacgc aggtgcaacc acctcagcat tctgagctat gatttctgat tgcactgagc 3060
gacctagtga tgtaccgaga gattggatag acgacatccc caactcagtt gaggcaatgt 3120
tgttcagtag agtgtttaat gtcatcaccg tcagaacatc cgacgacact aaacggatat 3180
agccgcgata cttagcacca acgccacgag tcttagaggc tttcagctcg tcaattcggg 3240
cgctaacacc gtcatacgcc gcattaagca gacgctgcac aggtgttaac tcagtagcac 3300
gaccattctc caaggcatcc agcacagctt tgcggctgcg ctcgattgcc tcagtcttaa 3360
atgtttcttc aatgcgctct tgacgagcgg ctttttcttc gaatgtctca cgattcttgg 3420
tgacagacat aaacactcca atacattaca acgttgtttt caaattgcgc tgaatcataa 3480
gacgcagcaa cttgcgtttc tctttgtccg taatgccgag gtacagcttc cgtgctgtac 3540
cacttctacc tgattgaatg tgttgggcaa taactgcgta ctccctgtcc acattcacag 3600
gtgcttcatc tgcgaagatt aattccgcag acgctccacg atagttcgac atgcggcctc 3660
cggtttaccc tcaatcatca ctacgtcgag gtactcaatc gcaggatgtt tcacagttaa 3720
gtaactgcgg ctgtcgttag cgaacgtaca accacgaccg tacatacgga cgaccagtac 3780
ctcaccaccc atagggctgt gttcaatgaa gtcagctacg ctaaccgctt cctctgggaa 3840
accgcagtcg gtgaataccg gaatacgtcc gtattctagc acctcagcag cacgagcgcc 3900
agccatttgt ccgtagtagt cagcaccgaa ctcaggcttg atgatgtcct cactcacatg 3960
aataagcact tcacgtggtg acttaccacc cagttcaatt tgacctacgt ctttcgtgtt 4020
gcggtcagac gctaacgcaa taaacttagg caacgccata cccacatgct tcgcagcatc 4080
acggtacagg gcatctttca ctgctaggtt aaaggcattc atcaggtaat ggtcacgtag 4140
catttcagct agtgtgtcct taccgatacc cggtgggcca ttcagaatta aacatttaat 4200
cattgacctt tgctctccca atgtcgttgc atttgccagt aatgataagc cgtgtcaccg 4260
tccttagctt cacgactcat acgggcacac cattctgagg gtttctcacc actcgccatt 4320
attcttgctc cttagaacgc gcacgcattt tacgagcggc tgcacgacgg gcacgttctt 4380
tcttcgcacg agcagcacgc ttgtcttcct cagtcttatg accgggatac attaagccag 4440
ttccctcttt ctccgtgctt tcgaggtagt ctgctaggcg acgcagagca gggatgattt 4500
gctggtaatc cattttacca acaatccaac gccctacagc gtttgcaacc ttaccctcac 4560
ctgcattgca ggaacggcaa agtgcgccac gaatctctcc tgtctcgtgg ttgtggtcta 4620
caactacagc acctttagta ctgaactgta agtcattcaa gcacaggggg caagtgcccc 4680
cttgctcagc cccaagtttg cgcccaatgg ttcgtaactg ggcgcgagta acctttcgta 4740
aagtcttaga tgaactcatt agctagtgcc tccatatcca tatcttcctt aatctggttg 4800
aacgctgact gccacatatc gcggtcagtg tcgcgcagct caatcatggt ggcttctagt 4860
tgagcacgtg tctcaggttt gctgtccttg taccacaact ctaaggcacg ctcatacaac 4920
tttactgcat ggtttttact aggcttcttc atctggatta tcctgtttat gtttgataac 4980
cgccatgtga tatgtatgca actgctccag ccagttgcga tactcaggga cagttacgac 5040
ttccataagg taggcgtatc cagaatcatc agcagaccga cgcaaccaaa gcatttcagc 5100
ctcagcgagt gggtcttggc gagaagcagc gtacttaccg acgacggcgt tagctactac 5160
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cccacacaac ttaccgtcta agcggtcaat gccacggatg ttatcggctg aatcccccat 5280
gagcatttgt gcccagaaga acgccgtacc gtgacctttg agtggcatgt tctccccctc 5340
gtaccacttc acataaccga agcgattgtc gattgtgcta gtgatagcga gtttctgctc 5400
ccagtacggg gcacgagtca tgcgcaaatc tttatcaccg gaactgataa gcccgttcgg 5460
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cactgagata ccatcaggat gctcatgcag tttcatgttc tgcacagctt gcttcaacat 5580
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atacaatgga cgcagacact taggcgagtt gctgtctgtg caatacacct cagcggtttt 5700
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caatgtctta acagttgcgg ctgcttgata caagtaaaag tccccatcaa ggatgaggac 5820
ttgacctgag tcaacgatag cgaactggtc gtccaaggca tccaagttta atccatgaat 5880
gcctgtcatg attacttatc cccagtctta atgtaataca gcatgtcctt tgccatgtcc 5940
ttaaagtctc ggtacgtgtc cggtacgaac tccataataa accacgtgac aaagattaga 6000
atgagaagcg acggcaacgc taagatgaac aagagcacca tcaggattcg acatagcttg 6060
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caccaagcta caagcaccaa gtcgatacta agcgccatga agtgtccaac gctaggagca 6180
acagccatag catgaatatc atacccaatg acggcaagta gtggtactgc cagaaaccgc 6240
ttaaaagcca cgcccacatt agtactcttg aatttatcaa cgacttcatt gaacttcttc 6300
tttaaccatt taaacattac ttttccttaa tacccaaaat tagggtattt cttttcaaac 6360
tcttggcgag taagacgctc ggccttaccc acatgaatac gctcacctgt taagacgatg 6420
gtggcttcct ctccatctaa cttgagattc cagccaccgt tgataaccca cagttccccg 6480
ttggtatcgt ctgtacacag cagtggtgac gcagcatcag ggaagtaggt caacattata 6540
ggtcagcttc cttaacgaac acaccgtcgc gcatttcgcc tttgcggtct ttgatttcac 6600
tgtaggcgaa gttcacacac tcatacaacg ttaggtcgta gtggtgcgca atgatgtaca 6660
gtgtacagta catacgacgt aggtgctcaa tagcaatcac agcgtctgct aatgattcct 6720
cattgtcgat gtcgtagtca tacagcgcac cgataatgtc cgacgtctga gcattcagcg 6780
taccgataat accagcgcgg ttcttctcag gggatagtgc cgctactgct tcaagttgtg 6840
ccagcatacg ggtgaagtca gaggtgttca ctacgtcttc gaagtcagca ccaagctgtg 6900
cagcaatgat gtcgagtact acgatggagt cgccgatacc atctttgagc aattcgaact 6960
tgcctttcac gatagcggta attacttcgt tcatttcttc tgacagcttg caagcctgag 7020
ccagcggtgt acagcctttc agaatgttac gagcaccagc ccactcgcgg attttaccga 7080
acaactcacg taagccctca ccgcagttgt atgctactac ttgaacttcc tgctcggcta 7140
cgttctgtgc ttgtttctca tccatttttc agttccttat cgtgggttga tgatttgatg 7200
gttggtcatg gtcttgaagt cttcaagcat aacaacgttg tcgtcgttca tgatgccaga 7260
gtactgtgcc atgtgagcgc cagcatcgcc gccgattact agcatgtagt tggtcatagc 7320
ccatgagcgg tacttctgtt taagaccacc ggacttgttg atgatgctca agcggtacac 7380
acgaggcaac actttgccac ggcggaatac cttaacggtc tgctctttgt agtccgtggt 7440
gatacgctcg atgtcggtct ggaacgaata cgctttctta atgcgttgtg caaattgagt 7500
gatgttcatt ctgtatcctc agttaagggg gcggcttgca ccgcccggtt agtgattaga 7560
ctgctggtgc gtccggcatt gttggcattg caggtgcatc aggcattgct gcttgagcgg 7620
ctgctgcatg gtctgcctgt gttggtgctg actcagcttt aggttcgtct gctggtggca 7680
ttggtaggcc accctcaagt agagcttgaa gtggtgaacc ctcgtagtcc acagctttca 7740
agatgtcttc ttgaatgaag ttcttagact tacctttatc atcagtaccg tcaatgtaca 7800
acgagtccca agtctcttta gtcgggttag accataggaa cacttggatt ttcgaagtgt 7860
caaactcagg tagcgtgata ggtgcacctg tttctgggtc gaacttagga agcggtgaca 7920
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tacggaaaca ttggttcaga ccttgagcaa ggtgcttcaa cgtaccagtg tagttcatac 8040
ggtcaaacag cttcttagcg tttgctttct cgtggttgct gactggcatc ttcaacgagc 8100
gaatgtaaac ttcttcacca ttcgggccgt agaaacagaa accaacacga acgttcagtg 8160
cagcagggcg accagttggt ttaccttggt gcgtcggtac aactttaccg tactcgatgt 8220
actcaatcat acgacagttg tatgccgctt tcggcaggac gattttctcg ccaccaccag 8280
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attggtctag tgggttaaat ggagtagtca ttaatattac ctcagtactg ttaggtttgt 8400
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ttcacaaatc catgctaggc tcggttcacc cgccgcgagg ttccacaccc tattactctc 8580
tcaactcgtc taatttagac aggtcgtaca taacaggaat gcaatcgtac ttcacacaca 8640
attcgattat cttatcgaca cgcccagtac gcgctgtacc gagcactaga ggataaccct 8700
gtacgaatgt atcaattgtg tatagatgcc ccttaatgaa gcgcatatca tctgtccaga 8760
cacgattcaa ttcacaatca aagtcagcta ctgcttcgtt catgttaggc ttacggctga 8820
acaagacatc aatctcaatg accggatgct taatcttgat accaccatac agcttctcat 8880
cgaagtcgct gtcacagttg tctgggtcat cagtgtaggc aaggaacact tcgctggcta 8940
tatcgagctg actcagcgta acgctcatac ctaccatcca gttgaacacc tcagcggtgc 9000
atgagtcagg gccgactgcc acaacgatgt cgaggtcttt tggtttgaag cctcgtgcca 9060
tatctcgcac cgccccacca gcaaccgcca cttcatatgg gcggttgata gtagagtgaa 9120
taagctgagt gatgtcacgc gctgcaatat ctaatacatg cttattcata cgagttccta 9180
tggtagttga gggatgatag ccacagcggt tgactgtgct tcgaattctt ccggtaggta 9240
cttctcaata ccgtcccaac cgtcagtcaa ctgtttaagc gtcttgaatt gctcaagtgc 9300
ttgacggtac acacgttcct gtgcacggcg ttcttcgtgc cacttctcgc tgcgaatctc 9360
atacgtttca taagctgact tatctttgag gtacgcttga tagattggtt cgtcggtgta 9420
gagaatacaa gtaccgtttg gtacacaagt tggtactgag ttgttatctt cgtcacggaa 9480
gtaatcccag atagtgccga tgtccttacc atcacggttc ttgatataca aatgcattga 9540
tgtggatttg ttcaaagctt ccggtcttag gccgctgaat tgaatcgcct ctgcaatacc 9600
tgatttagca taccaacgct gttggaacgc cgtgatagct agacgggcag cactagactt 9660
aggtgcggct ggcttaggat tcttggtctt ccagtcatcc atgatgtttt taaggattgc 9720
agtacgtttt tctttgttca atcggatagt agccatgtta ttttcctcgt ggttcgatgg 9780
tgcttagtag gtacacagcg aggtctaatc gctgcttagg tgataggtag aatgcagtca 9840
tcttacattc ctcaagttcg tgtgtgccgt cctcggacat agcgtcatgt atctctaaca 9900
cgatgtctcc actccagtgt tggtcatggg cgattaggtg ggcacagttt gattcatggt 9960
ggataaccac acgatgccaa tcgtcagggc atcgtaagcc accagcttgt gttaacttgc 10020
cacgataagg tgggttaacg tatggttcaa caggatggtt aacgattggc ataagtacct 10080
cttagtgaat gtgtgttttg ttgtacattg atgaacccat ttccgcagca gcagggaatg 10140
gtacgtcttt caagtgaccg tagttaggcc atagttgcag gatgcggtct ttagcacgct 10200
ccatgatgtc tttcacagcc agtgcagcct cacgccccac ttcttcgttc gcagcgtcta 10260
ggtacgcagc atcgtgaacg ttagtgatta gacatacttg gttgtcgtac cagttcttag 10320
caatcatgtg gcgcagaatc ataccgaacg caaccgccat gaggaagaac gcttcgcctt 10380
gacaccagta gttagcaagc tgtgtatcct tgtagtccat gactttctcc atgccacgac 10440
catcagcacg cttaacccaa cgctcaacct gacggaagct atagcgcata ccagcagggg 10500
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agttacccgg taagttacca gtgcgctcaa cttcatcacg gattacctga cggaacttag 10620
ccgtatcagg gaacagggct gcttcgttgt ctaggaacgc ttgagcgaac tcgacagtac 10680
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ctttgattgc agtacgcatt gacttccaca gagcgtggaa ctcgaagccc tcatcatgac 10800
agcgacggaa cacttcttcg tagtctaggt tctcttggaa cgcgagacgg tagcagtgca 10860
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cgttcgtatt ggcacggaat accttacgta agcccttgtt cttaccggac ttatagatta 11520
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cgtcaacagg gtcagtccag acctctttga ctctcagcac atggtcgtgt agctggtacg 11640
catcgacctt gacatacgtt ggtttgtcat agtgtacttt cttcttgtac ttaatcgggc 11700
caccgtaaag caacgccgac atgtggaagt cagaacccca gttgaagtca atttcttcgg 11760
gcatgtcgtc cggtaggtac gttctgaggc gagtggttag ctccgcaatc tcagcttcct 11820
gcaccgcttg gttcttctga gccactggca tgttcacgta cagaccgaac cactcacaga 11880
atgcaaagct cagtaaggca tccatacgtt cccaaacgag ggggaactta ccttgttcgg 11940
caagtgtcgc acactgacca tagaagcaca gggcggtgtt tgcaacgtca ccgttcggcc 12000
ctgcgaggta ctcatgcaag aggatggggt caatctcgga ggtaaggact ccttgttccc 12060
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ctctaccccc acgtcgaaga aagccctcaa atgaatctcg tgcgaattgt aagaaccatg 12240
aaacttcata agcggcgtta tgtgcaacga tgagccaaca gtcttcggga atgggtagcc 12300
actcagttgt tggagcgcca acgaaagcct ctcgtgagtt gtatcggaca ctgccgacgc 12360
tgccaatttc tgtagtgccg tctggctttt tgcggtcaac acggaacccc gactcaacaa 12420
tatagttgtc tggacagtac ggactggctt tactaccgtg atattcatgg ttctcagtct 12480
ccaagtctat aaataatacg ctactcatgt tctactccat cccaagccgc ccagaacatt 12540
ccgttcgact gtacttgttc accacgtaga cactttctaa tgcccttgcg acaccaacca 12600
tccagctcag cctgtccgat actgtgatag tagtgctcgt caccagtacg aacacattta 12660
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tgttcttagg tgtgctaagc cctcgcaagc cctcagtatc gttgttaagt ttacccatga 12900
acagtgccac atccagagca ccttgcacac caatcttaga ttgcttcaat gccgtcagcg 12960
gtgggtataa catgtcgtaa ccctcagcac tgaactgcat tgtaccgacc atcaggaagt 13020
cgtgctcaca agccagcgaa cgcagctcct gccacttcgc ttctaggttc tggtgttctg 13080
tctcagcagt accaccacgg atgtttgcca ccatgtcgat gattaccaca gcggggttca 13140
tttcttccac cagcgttgca atctgtggca tggtgattga gtgcgcatcc ttgacacgga 13200
tacgatgcca atcgcccacc tcggctaagt acagcggctc gaactgtccc tcgcggtgca 13260
gctcacgaat ctctgccagt gttttaccag ttgctgcttg gtagatacgt ggcacagttc 13320
gcacagccat tgattcgttc actagccaca ggataggtct gtcaccataa cgctcagggg 13380
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gaagctgacc aaagcggcgc aatttgagac cagcgccctc ttcattcgct gcaagtacgt 13560
cgtcgagtcc acggtcttcc catgaaaaca actcgttttg agtcttgaca ttatcaccga 13620
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catcgacact ggaatcgtca accgcttgca cttcatgcgt cagtgctttc atggttgcca 13800
gttcttcggg tgtgctctgc gtggcccgta atgaaaccat gctattgaat gccgcaaagt 13860
ctacttcgtc gtgctctggg taagtcttcc agtaaagacc aacccaacta agcagtgcgg 13920
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cagcttgacc acccatccca tgaatgtgtt ggccttgagt tggtaaagca ccagactgac 41640
gggcgtagtc tagtaccatc tgagctgcgt ccttggctag accgctgttt gccatagtct 41700
tgaccgcagt ctgaatatgg gcaggagcgt tcgccatgaa cacatcacgc gcttgtgccc 41760
acgcctcagc accaccagct agagtgtgta cttcattaac agtgcgttca gtgtttgaag 41820
cagcgttagc gaggtacgtt tcagctaagg tctttgcgta gccagcgtag ttgccgaggc 41880
gttcttggag gaacttctcg tcaatcaaag aggcatcacc ataacgcagt gcattaccca 41940
tagctcgctc tacgtcagca tcggtacagc ccgatacttg agcaagcatc tgtaagccag 42000
catcaactgc ggcgtcacct gtctgtaatg taatctgacc tgcggctggg tctgtttgct 42060
ctggttcagc aggaacttga ggttctggct gtggagcagc agcaggttgt ggttgattac 42120
ccagtacagg gtcgtcggct ggtgcaggtt gtggtgcagg gttctgcgtt ggttgtggtt 42180
gattagggac gtcagcaggt ttacccgctg ttggtacgcc cggtggaaga tttgtatctt 42240
gcattattga gtcaatcctt gctgttcaga caatagtgca gcagagccag catcaagtgc 42300
cataccggag gcaggggctt gagcagcagc ttcctcagcc gcctgtagct gttgcagctc 42360
ttgttctgtg tagaaaatct cagacgggtc aacaccatga cctgcgagga ttaggtcaat 42420
cactcggtca gggttggtac gttttgtagc ttgtgcaagt acagggagaa tcaagttaat 42480
atcgttcgca actagaccta gacgttgcac cacaatacta cggttgatag ccgcagtacc 42540
tacttgaatg tctaggctaa ccgcattagc ttgcagcagt gccagcagct caggtcgagc 42600
ctcaactgtc aggatgtgcg ctaacgggat atgcagaatc tcagcaagag tagcgtagat 42660
gccacccatg ttttcttctg cttcacgaac gttgttcttg atttcttctg ctgttacacg 42720
ttcagcatca cggacgttac cagtgtacat gaacgctcgt gccagctccg caagaaccat 42780
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accctcacca tcacctgcaa cgtactcacc agtctcagca tcattcaatg cgtcaacgtc 42900
agcagtactc ttaggcgaca cgaggttaac gactcgcatt gcttcaatct catacagagt 42960
cagtgcttga gttagctctg acacacgtgc gaacgcacct gcatggtctt ccacgtggcc 43020
acgaccataa tgctcaccag aaaccaagtt ccacaccgca gggatgtaag gacaaagctt 43080
ctcagggtaa acactaagtg tgccaacagg cttaccatca atctgttgag taatcacaaa 43140
aacgtcacca gcatcacgcg tctcgcgttg aatcttggtg tacaaccaaa catcagtggt 43200
agggtctgtg tatccggttg g 43221
Claims (5)
- 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖는 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리된 포도비리대 박테리오파지 Vib-PAP-2(수탁번호 KCTC 12910BP).
- 제1항의 박테리오파지 Vib-PAP-2를 유효성분으로 포함하는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 및 처치용 조성물.
- 제2항에 있어서, 상기 조성물은 약욕제 또는 사료첨가제 제조 용도로 사용되는 것을 특징으로 하는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균의 감염 방지 및 처치용 조성물.
- 제2항 또는 제3항에 의한 박테리오파지 Vib-PAP-2를 유효성분으로 포함하는 조성물을 사람을 제외한 동물에 투여하는 단계를 포함하는, 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 의한 감염을 방지 또는 처치하는 방법.
- 제4항에 있어서, 상기 조성물이 약욕제 또는 사료첨가제 용도로 사람을 제외한 동물에 투여되는 것을 특징으로 하는 비브리오 파라헤몰리티쿠스 균에 의한 감염을 방지 또는 처치하는 방법.
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