KR20130037189A - 항 c―met 항체 및 그의 용도 - Google Patents

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Abstract

항 c-Met 항체 및 이를 포함하는 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물에 관한 것이다. 일 구체예에 따른 항 c-Met 항체 및 이를 포함하는 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물에 의하면, 암을 효율적으로 예방 또는 치료할 수 있다.

Description

항 C―MET 항체 및 그의 용도{Anti c-Met antibody and uses thereof}
항 c-Met 항체 및 이를 포함하는 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물에 관한 것이다.
c-Met은 간세포 성장 인자 (hepatocyte growth factor, HGF)의 수용체이며, HGF는 c-Met 수용체 티로신 키나제의 세포외 부위에 결합하여 다양한 정상세포와 종 양세포에서 분열, 운동, 형태발생, 혈관형성을 유발하는 사이토카인의 일종이다. c-Met은 세포 표면에 존재하는 대표적인 수용체 티로신 키나제(receptor tyrosine kinase)로 그 자체가 암유발 유전자이며 때로는 리간드인 HGF와 상관 없이도 암발생, 암전이, 암세포 이동, 암세포 침습, 신생혈관 생성 등과 같은 종양과 관련된 여러 가지 기작에 관여하기 때문에 최근 항암 타겟으로 주목받는 단백질이다.
특히 c-Met은 기존에 알려진 항암제의 작용 기작에서 약물 내성에 관여됨이 알려지면서 더욱 더 개인맞춤형 치료에 중요성이 인식되고 있다. EGFR (ERBB1)을 표적으로 하는 대표적인 항암 치료제인 얼비툭스(Erbitux) 또는 타세바(Tarceva)와 같은 약물은 암 발생 기작과 관련된 신호 전달을 차단함으로써 작동한다. 또한 유방암 치료제로 잘 알려진 허셉틴(Herceptin)은 ERBB2 (HER2)를 표적으로 세포의 증식에 필요한 신호 전달을 차단함으로써 작동한다. 그러나 상기 약물에 대한 내성이 있는 환자 중, c-Met 단백질의 과발현 등으로 항암제의 작동을 피해 세포의 증식을 유도하는 다른 신호 전달 기작이 활성화된다는 연구들이 최근 발표되고 있다. 이러한 이유로 인해, c-Met은 항암제와 관련하여 다수의 제약사들이 주목하고 있는 표적 분자가 되고 있다.
관련 기술은 c-Met의 작용을 저해하는 항체 치료제를 개시하고 있다. 그러나, 상기 관련 기술은, 항체가 원래의 구조를 가진 경우 c-Met 분자들이 이량체화(dimerization)가 되도록 유발함으로써, 암을 유발하는 문제점이 발견되었다.
c-Met의 작용을 저해하는 항체 치료제를 개시하는 다른 관련 기술은 c-Met의 리간드인 HGF c-Met에 결합하지 못하도록 저해하는 기능은 있으나, 항체 자체의 결합에 의해 리간드와 상관없이 c-Met을 이량체화시켜 오히려 암을 유발하는 신호가 전달되도록 하는 효능제(agonist)로 작용하는 부작용이 발견이 되었다.
또 다른 관련 기술은 c-Met의 이량체화를 방지하기 위해 원래는 효능제 (agonist)인 양팔 항체 (two-armed antibody)를 유전자 재조합 방식으로 변형시킨 c-Met에 대한 한팔 길항(one-armed antagonistic) 항체를 개시하고 있으며, 현재 이에 대한 임상시험 단계의 제품 개발이 진행되고 있다. 그러나 상기 관련 기술에서도 상기 항체는 화학요법과 병용치료일 경우에만 효과를 보이며, 항체를 단독으로 처리하는 경우에는 항암 효과가 크지 않은 것으로 확인되었다.
따라서, 종래 기술에 의하더라도, c-Met의 작용을 저해하는 새로운 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물의 개발이 여전히 요구되고 있다.
일 양상은 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공하는 것이다.
다른 양상은 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
일 양상은 서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H1, 서열번호 5의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H2 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H3로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 중쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역; 및
서열번호 7의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L1, 서열번호 8의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L2 및 서열번호 9의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L3으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 경쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체로서, 상기 서열번호 4 내지 서열번호 9는 각각 하기 일반식 Ⅰ 내지 일반식 Ⅵ으로 표시되는 아미노산 서열인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
일반식 Ⅰ
Xaa1-Xaa2-Tyr-Tyr-Met-Ser (서열번호 4)
일반식 Ⅱ
Arg-Asn-Xaa3-Xaa4-Asn-Gly-Xaa5-Thr (서열번호 5)
일반식 Ⅲ
Asp-Asn-Trp-Leu-Xaa6-Tyr (서열번호 6)
일반식 Ⅳ
Lys-Ser-Ser-Xaa7-Ser-Leu-Leu-Ala-Xaa8-Gly-Asn-Xaa9-Xaa10-Asn-Tyr-Leu-Ala (서열번호 7)
일반식 Ⅴ
Trp-Xaa11-Ser-Xaa12-Arg-Val-Xaa13 (서열번호 8)
일반식 Ⅵ
Xaa14-Gln-Ser-Tyr-Ser-Xaa15-Pro-Xaa16-Thr (서열번호 9)
상기 일반식 Ⅰ에서, Xaa1은 존재하지 않거나 Pro 또는 Ser이고, Xaa2는 Glu 또는 Asp이며,
상기 일반식 Ⅱ에서, Xaa3은 Asn 또는 Lys이며, Xaa4는 Ala 또는 Val이고, Xaa5는 Asn 또는 Thr이며,
상기 일반식 Ⅲ에서, Xaa6은 Ser 또는 Thr이고,
상기 일반식 Ⅳ에서, Xaa7은 His, Arg, Gln 또는 Lys이고, Xaa8은 Ser 또는 Trp이고, Xaa9은 His 또는 Gln이며, Xaa10는 Lys 또는 Asn이고,
상기 일반식 Ⅴ에서, Xaa11은 Ala 또는 Gly이며, Xaa12은 Thr 또는 Lys이고, Xaa13는 Ser 또는 Pro이며,
상기 일반식 Ⅵ에서, Xaa14은 Gly, Ala 또는 Gln이고, Xaa15는 Arg, His, Ser, Ala, Gly 또는 Lys이며, Xaa16는 Leu, Tyr, Phe 또는 Met이다.
일 구체예에 따르면, 상기 CDR-H1은 서열번호 22 내지 서열번호 24의 아미노산 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 폴리펩티드일 수 있고, 상기 CDR-H2는 서열번호 25 또는 서열번호 26의 아미노산 서열로 표시되는 폴리펩티드일 수 있으며, 상기 CDR-H3는 서열번호 27 또는 서열번호 28의 아미노산 서열로 표시되는 폴리펩티드일 수 있다.
일 구체예에 따르면, 상기 CDR-L1은 서열번호 29 내지 서열번호 33 및 서열번호 71의 아미노산 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 폴리펩티드일 수 있고, 상기 CDR-L2는 서열번호 34 내지 서열번호 36의 아미노산 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 폴리펩티드일 수 있으며, 상기 CDR-L3는 서열번호 13 내지 서열번호 16의 아미노산 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 폴리펩티드 또는 서열번호 37의 아미노산 서열로 표시되는 폴리펩티드일 수 있다.
다른 양상은 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H1, 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H2 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H3으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 중쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역; 및
서열번호 7의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L1, 서열번호 8의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L2 및 서열번호 9의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L3으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 경쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체로서, 상기 서열번호 7 내지 서열번호 9는 각각 하기 일반식 Ⅳ 내지 일반식 Ⅵ으로 표시되는 아미노산 서열인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
일반식 Ⅳ
Lys-Ser-Ser-Xaa7-Ser-Leu-Leu-Ala-Xaa8-Gly-Asn-Xaa9-Xaa10-Asn-Tyr-Leu-Ala (서열번호 7)
일반식 Ⅴ
Trp-Xaa11-Ser-Xaa12-Arg-Val-Xaa13 (서열번호 8)
일반식 Ⅵ
Xaa14-Gln-Ser-Tyr-Ser-Xaa15-Pro-Xaa16-Thr (서열번호 9)
상기 일반식 Ⅳ에서, Xaa7은 His, Arg, Gln 또는 Lys이고, Xaa8는 Ser 또는 Trp이고, Xaa9은 His 또는 Gln이며, Xaa10는 Lys 또는 Asn이고,
상기 일반식 Ⅴ에서, Xaa11은 Ala 또는 Gly이며, Xaa12은 Thr 또는 Lys이고, Xaa13는 Ser 또는 Pro이며,
상기 일반식 Ⅵ에서, Xaa14은 Gly, Ala 또는 Gln이고, Xaa15는 Arg, His, Ser, Ala, Gly 또는 Lys이며, Xaa16는 Leu, Tyr, Phe 또는 Met이다.
일 구체예에 따르면, 상기 경쇄 가변 영역은 서열번호 10 또는 서열번호 71의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L1, 서열번호 11의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L2 및 서열번호 13 내지 서열번호 16으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L3으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 경쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 것일 수 있다.
일 구체예에 따르면, 상기 중쇄 가변 영역은 서열번호 17의 아미노산 서열로 이루어지고, 상기 경쇄 가변 영역은 서열번호 18 내지 서열번호 21 및 서열번호 72로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나의 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있다.
용어, "c-Met" 또는 "c-Met 단백질"은 간세포 성장 인자와 결합하는 수용체 티로신 키나제를 의미한다. 상기 c-Met 단백질은 모든 포유류 종에서 유래하는 것일 수 있으며, 예컨대, 인간 c-Met (예컨대, NP_000236), 원숭이 c-Met (예컨대, Macaca mulatta, NP_001162100) 등과 같은 영장류 유래의 것, 또는 마우스 c-Met (예컨대, NP_032617.2), 래트 c-Met (예컨대, NP_113705.1) 등과 같은 설치류 유래의 것 등일 수 있다. 상기 단백질은 예를 들면, GenBank Aceession Number NM_000245에 제공된 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된 폴리펩티드, 또는 GenBank Aceession Number NP_000236에 제공된 폴리펩티드 서열에 의해 암호화된 단백질, 또는 그의 세포외 도메인을 포함한다. 수용체 티로신 키나제 c-Met은 예를 들면, 암발생, 암전이, 암세포 이동, 암세포 침투, 신생혈관 생성 과정 등의 여러 가지 기작에 관여한다.
일 구체예에 따르면, 상기 c-Met은 인간, 원숭이 등의 영장류, 마우스, 래트 등의 설치류 등을 포함하는 포유류로부터 유래된 것일 수 있다.
원하는 항원을 피면역 동물에게 면역시켜 생산하는 동물 유래 항체는 일반적으로 치료 목적으로 인간에 투여 시 면역거부반응이 일어날 수 있으며, 이러한 면역거부반응을 억제하고자 키메릭 항체(chimeric antibody)가 개발되었다. 키메릭 항체는 유전공학적 방법을 이용하여 항-아이소타입(anti-isotype) 반응의 원인이 되는 동물 유래 항체의 불변 영역을 인간 항체의 불변 영역으로 치환한 것이다. 키메릭 항체는 동물 유래 항체에 비하여 항-아이소타입 반응에 있어서 상당 부분 개선되었으나, 여전히 동물 유래 아미노산들이 가변 영역에 존재하고 있어 잠재적인 항-이디오타입(anti-idiotypic) 반응에 대한 부작용을 내포하고 있다. 이러한 부작용을 개선하고자 개발된 것이 인간화 항체이다. 이는 키메릭 항체의 가변 영역 중 항원의 결합에 중요한 역할을 하는 CDR(complementaritiy determining regions) 부위를 인간 항체 골격(framework)에 이식하여 제작된다.
인간화 항체를 제작하기 위한 CDR 이식(grafting) 기술에 있어서 가장 중요한 것은 동물 유래 항체의 CDR 부위를 가장 잘 받아들일 수 있는 최적화된 인간 항체를 선정하는 것이며, 이를 위하여 항체 데이터베이스의 활용, 결정구조(crystal structure)의 분석, 분자모델링 기술 등이 활용된다. 그러나, 최적화된 인간 항체 골격에 동물 유래 항체의 CDR 부위를 이식할지라도 동물 유래 항체의 골격에 위치하면서 항원 결합에 영향을 미치는 아미노산이 존재하는 경우가 있기 때문에, 항원 결합력이 보존되지 못하는 경우가 상당수 존재하므로, 항원 결합력을 복원하기 위한 추가적인 항체 공학 기술의 적용은 필수적이라고 할 수 있다.
일 구체예에 따르면, 상기 항체는 마우스 유래 항체, 마우스-인간 키메릭 항체 또는 인간화 항체일 수 있다.
일 구체예에 따르면, 상기 항체는 단일클론항체일 수 있다.
완전한 항체는 2개의 전장(full length) 경쇄 및 2개의 전장 중쇄를 가지는 구조이며 각각의 경쇄는 중쇄와 이황화 결합으로 연결되어 있다. 항체의 불변 영역은 중쇄 불변 영역과 경쇄 불변 영역으로 나뉘어지며, 중쇄 불변 영역은 감마(γ), 뮤(μ), 알파(α), 델타(δ) 및 엡실론(ε) 타입을 가지고, 서브클래스로 감마1(γ1), 감마2(γ2), 감마3(γ3), 감마4(γ4), 알파1(α1) 및 알파2(α2)를 가진다. 경쇄의 불변 영역은 카파(κ) 및 람다(λ) 타입을 가진다.
용어, "중쇄(heavy chain)"는 항원에 특이성을 부여하기 위해 충분한 가변 영역 서열을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 가변 영역 도메인 VH 및 3개의 불변 영역 도메인 CH1, CH2 및 CH3과 힌지(hinge)를 포함하는 전장 중쇄 및 이의 단편을 모두 포함하는 의미로 해석된다. 또한, 용어 "경쇄(light chain)"는 항원에 특이성을 부여하기 위한 충분한 가변영역 서열을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 가변 영역 도메인 VL 및 불변 영역 도메인 CL을 포함하는 전장 경쇄 및 이의 단편을 모두 포함하는 의미로 해석된다.
용어, “CDR(complementarity determining region)”은 면역글로불린의 중쇄 및 경쇄의 고가변 영역(hypervariable region)의 아미노산 서열을 의미한다. 중쇄 및 경쇄는 각각 3개의 CDR을 포함할 수 있다(CDRH1, CDRH2, CDRH3 및 CDRL1, CDRL2, CDRL3). 상기 CDR은 항체가 항원 또는 에피토프에 결합하는 데 있어서 주요한 접촉 잔기를 제공할 수 있다. 한편, 용어, "특이적으로 결합" 또는 "특이적으로 인식"은 당업자에게 통상적으로 공지되어 있는 의미와 동일한 것으로서, 항원 및 항체가 특이적으로 상호작용하여 면역학적 반응을 하는 것을 의미한다.
일 구체예에 따르면, 상기 항체는 scFv, (scFv)2, Fab, Fab' 및 F(ab')2로 이루어진 군으로부터 선택되는 항원 결합 단편일 수 있다.
용어, "항원 결합 단편"은 면역글로불린 전체 구조에 대한 그의 단편으로, 항원이 결합할 수 있는 부분을 포함하는 폴리펩티드의 일부를 의미한다. 예를 들어, scFv, (scFv)2, Fab, Fab' 또는 F(ab')2일 수 있으나, 이에 한정하지 않는다. 상기 항원 결합 단편 중 Fab는 경쇄 및 중쇄의 가변영역과 경쇄의 불변 영역 및 중쇄의 첫 번째 불변 영역(CH1)을 가지는 구조로 1개의 항원 결합 부위를 가진다. Fab'는 중쇄 CH1 도메인의 C-말단에 하나 이상의 시스테인 잔기를 포함하는 힌지 영역(hinge region)을 가진다는 점에서 Fab와 차이가 있다. F(ab')2 항체는 Fab'의 힌지 영역의 시스테인 잔기가 디설파이드 결합을 이루면서 생성된다. Fv는 중쇄 가변부위 및 경쇄 가변부위만을 가지고 있는 최소의 항체조각으로 Fv 단편을 생성하는 재조합 기술은 당업계에 널리 공지되어 있다. 이중쇄 Fv(two-chain Fv)는 비공유 결합으로 중쇄 가변부위와 경쇄 가변부위가 연결되어 있고 단쇄 Fv(single-chain Fv)는 일반적으로 펩타이드 링커를 통하여 중쇄의 가변 영역과 단쇄의 가변 영역이 공유 결합으로 연결되거나 또는 C-말단에서 바로 연결되어 있어서 이중쇄 Fv와 같이 다이머와 같은 구조를 이룰 수 있다. 상기 항원 결합 단편은 단백질 가수분해 효소를 이용해서 얻을 수 있고(예를 들어, 전체 항체를 파파인으로 제한 절단하면 Fab를 얻을 수 있고 펩신으로 절단하면 F(ab')2 단편을 얻을 수 있다), 유전자 재조합 기술을 통하여 제작할 수 있다.
일 구체예에 따르면, 상기 항 c-Met 항체는 서열번호 62의 아미노산 서열 (이 중에서 1번째부터 17번째까지의 아미노산 서열은 시그널 펩타이드임) 또는 서열번호 62의 18번째부터 462번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 68의 아미노산 서열 (이 중에서 1번째부터 20번째까지의 아미노산 서열은 시그널 펩타이드임) 또는 서열번호 68의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체; 서열번호 64의 아미노산 서열 (이 중에서 1번째부터 17번째까지의 아미노산 서열은 시그널 펩타이드임) 또는 서열번호 64의 18번째부터 461번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 68의 아미노산 서열 또는 서열번호 68의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체; 또는 서열번호 66의 아미노산 서열 (이 중에서 1번째부터 17번째까지의 아미노산 서열은 시그널 펩타이드임) 또는 서열번호 66의 18번째부터 460번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 68의 아미노산 서열 또는 서열번호 68의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체인 것일 수 있다.
다른 구체예에 따르면, 상기 항 c-Met 항체는 서열번호 62의 아미노산 서열 또는 서열번호 62의 18번째부터 462번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 70의 아미노산 서열 (이 중에서 1번째부터 20번째까지의 아미노산 서열은 시그널 펩타이드임) 또는 서열번호 70의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체; 서열번호 64의 아미노산 서열 또는 서열번호 64의 18번째부터 461번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 70의 아미노산 서열 또는 서열번호 70의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체; 또는 서열번호 66의 아미노산 서열 또는 서열번호 66의 18번째부터 460번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 70 또는 서열번호 70의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체인 것일 수 있다.
다른 구체예에 따르면, 상기 항 c-Met 항체는 서열번호 62의 아미노산 서열 또는 서열번호 62의 18번째부터 462번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 73의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체; 서열번호 64의 아미노산 서열 또는 서열번호 64의 18번째부터 461번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 73의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체; 또는 서열번호 66의 아미노산 서열 또는 서열번호 66의 18번째부터 460번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 73의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체인 것일 수 있다.
한 구체예에서, 상기 상기 항 c-Met 항체는 서열번호 66의 아미노산 서열 또는 서열번호 66의 18번째부터 460번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 68의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체 또는 서열번호 66의 아미노산 서열 또는 서열번호 66의 18번째부터 460번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 73의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체일 수 있다.
한편, 상기 서열번호 70의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드는 인간의 카파 불변영역으로 이루어진 경쇄이며, 서열번호 68의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드는 상기 서열번호 70의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드에서 36번 (kabat numbering에 따름, 서열번호 68 내 62번째 위치) 히스티딘 (histidine)이 티로신 (tyrosine)으로 치환된 형태의 폴리펩티드이다. 상기 치환으로 인하여, 일 구체예에 따른 항체의 생산량이 증가될 수 있다. 또한 상기 서열번호 72의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드는 상기 서열번호 68의 아미노산 서열 중 1번째부터 20번째까지의 시그널 펩타이드를 제외한 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드에서 kabat numbering에 의한 27e 위치(kabat numbering에 따름, 서열번호 68 내 32번째 위치; CDR-L1 내부)의 세린(Ser)이 트립토판(Trp)으로 치환된 것으로, 상기 치환으로 인하여, 일 구체예에 따른 항체의 활성(예컨대, cMet에 대한 결합친화도, c-Met 분해 활성 및 Akt 인산화 억제 활성 등)이 보다 증진될 수 있다.
상기 아미노산 서열에 있어서, 제시된 시그널 펩타이드는 한 예일 뿐이고, 시그널 펩타이드의 사용 여부 및 구체적인 아미노산 서열은 적절하게 변경 또는 조절할 수 있으며, 이는 관련 기술 분야의 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 결정할 수 있는 사항이라 할 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 71의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 제공되며, 이는 c-Met 항체의 경쇄 상보성결정영역 (CDR-L1)으로 유용하다. 또 다른 구체예에서, 서열번호 71의 경쇄 상보성결정영역, 서열번호 72의 경쇄 가변영역, 또는 서열번호 73의 경쇄를 포함하는 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 제공된다. 도 8b 및 9b에 나타낸 바와 같이, 상기 서열번호 71의 경쇄 상보성결정영역을 포함하는 항체는 보다 증진된 항-c-Met 활성 및 Akt 인산화 억제 활성을 나타냄을 확인할 수 있다.
다른 양상은 상기 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량; 및 약학적으로 허용되는 담체, 희석제 또는 부형제를 포함하는 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
일 구체예에 따르면, 상기 암은 편평상피세포암, 소세포폐암, 비소세포폐암, 폐의 선암, 폐의 편평상피암, 복막암, 피부암, 피부 또는 안구내 흑색종, 직장암, 항문부근암, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부갑상선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 만성 또는 급성 백혈병, 림프구 림프종, 위장암, 췌장암, 교아종, 경부암, 난소암, 간암, 방광암, 유방암, 결장암, 대장암, 자궁내막 또는 자궁암, 침샘암, 신장암, 전립선암, 음문암, 갑상선암, 및 두경부암으로 이루어진 군으로부터 선택되는 것일 수 있다.
상기 조성물이 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물로 제조되는 경우, 상기 조성물은 약학적으로 허용되는 담체, 희석제, 및/또는 부형제를 추가로 포함할 수 있다. 상기 조성물에 포함되는 약학적으로 허용되는 담체는 제제시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산 칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 상기 약학적 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다.
상기 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물은 경구 또는 비경구로 투여할 수 있다. 비경구 투여인 경우에는 정맥내 주입, 피하 주입, 근육 주입, 복강 주입, 내피 투여, 국소 투여, 비내 투여, 폐내 투여 및 직장내 투여 등으로 투여할 수 있다. 경구 투여시, 단백질 또는 펩타이드는 소화가 되기 때문에 경구용 조성물은 활성 약제를 코팅하거나 위에서의 분해로부터 보호되도록 제형화 되어야 한다. 또한, 상기 조성물은 활성 물질이 표적 세포로 이동할 수 있는 임의의 장치에 의해 투여될 수 있다.
상기 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다. 상기 조성물의 바람직한 투여량은 성인 기준으로 0.001-100 ㎎/kg 범위 내이다. 용어 "약학적 유효량" 또는 "치료적 유효량"은 암을 예방 또는 치료하는 데, 또는 혈관신생으로 인한 질환의 예방 또는 치료하는 데 효과를 나타내는 양을 의미한다.
상기 조성물은 당해 당업자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화함으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액, 시럽제 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 산제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다. 또한, 상기 조성물은 개별 치료제로 투여하거나 다른 치료제와 병용하여 투여될 수 있고, 종래의 치료제와는 순차적 또는 동시에 투여될 수 있다. 한편, 상기 조성물은 항체 또는 항원 결합 단편을 포함하므로, 면역 리포좀으로 제형화될 수 있다. 항체를 포함하는 리포좀은 당업계에 널리 알려진 방법에 따라 제조될 수 있다. 상기 면역 리포좀은 포스파티딜콜린, 콜레스테롤 및 폴리에틸렌글리콜-유도체화된 포스파티딜에탄올아민을 포함하는 지질 조성물로서 역상 증발법에 의해 제조될 수 있다. 예를 들어, 항체의 Fab' 단편은 디설파이드-교체 반응을 통해 리포좀에 접합될 수 있다. 독소루비신과 같은 화학치료제가 추가로 리포좀 내에 포함될 수 있다.
일 구체예에 따르면, 상기 항체는 c-Met 단백질의 길항제(antagonist) 작용을 하는 것일 수 있다.
용어 "길항제(antagonist)"는 표적물 (예를 들어, c-Met)의 생물학적 활성 중 하나 이상을 부분적으로나 완전히 차단, 억제 또는 중화시키는 모든 분자를 포함하는 개념으로 해석된다. 예를 들어, "길항제" 항체는 항체가 결합하는 항원 (예를 들어, c-Met)의 생물학적 활성을 억제시키거나 감소시키는 항체를 의미한다. 길항제는 리간드에 대한 수용체의 결합에 의해, 수용체 인산화(phosphorylation)를 감소시키거나, 리간드에 의해 활성화되었던 세포를 무능력화시키거나, 또는 사멸시키는 작용을 할 수 있다. 또한, 길항제는 수용체-리간드 사이의 상호 작용을 완전히 단절시키거나, 수용체의 3차 구조의 변화, 또는 감소 조절(down regulation)에 의해 상기 상호 작용을 실질적으로 감소시킬 수 있다.
또 다른 양상은 상기 항 c-Met 항체의 치료적 유효량을 암 치료를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 암 치료 방법을 제공한다. 상기 암 치료 방법은 상기 투여 단계 이전에 암 치료를 필요로하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다.
상기 암 치료 방법에 사용되는 항 c-Met 항체는 앞서 설명한 바와 같은 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물 형태로 제제화된 것일 수 있으며, 그 투여 방법은 상기에서 설명하였으므로, 이 둘 사이에 공통된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여, 그 기재를 생략한다.
한편, 상기 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 투여할 수 있는 개체 또는 상기 암 치료 방법의 대상 환자는 모든 동물을 포함할 수 있으며, 예를 들어, 인간, 개, 고양이, 마우스, 등과 같은 포유류일 수 있으며, 경우에 따라서는 인간을 제외한 동물일 수 있다.
일 구체예에 따른 항 c-Met 항체 및 이를 포함하는 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물에 의하면, 암을 효율적으로 예방 또는 치료할 수 있다.
도 1은 원하는 CDR만 돌연변이된 huAbF46 항체의 scFv 라이브러리 유전자를 확보하기 위한 중복 확장 중합효소연쇄반응(overlap extension PCR) 방법의 예시를 나타낸 것이다.
도 2는 BrdU assay를 통해 일 구체예에 따른 huAbF46-H4-A1, huAbF46-H4-A2, huAbF46-H4-A3, huAbF46-H4-A5 항체의 작용성 부작용 정도를 확인한 결과이다.
도 3은 일 구체예에 따른 huAbF46-H4-A1, huAbF46-H4-A2, huAbF46-H4-A3, huAbF46-H4-A5 항체의 인 비트로 세포증식 분석을 수행한 결과를 그래프로 나타낸 것이다.
도 4는 Akt의 인산화 정도를 측정하여 일 구체예에 따른 huAbF46-H4-A1, huAbF46-H4-A2, huAbF46-H4-A3, huAbF46-H4-A5 항체의 작용성 부작용 정도를 확인한 결과이다.
도 5는 c-Met의 분해 정도를 측정하여 일 구체예에 따른 huAbF46-H4-A1, huAbF46-H4-A2, huAbF46-H4-A3, huAbF46-H4-A5 항체의 항암 효능을 확인한 결과이다.
도 6a 및 6b는 일 구체예에 따른 다양한 농도의 huAbF46-H4-A1 항체의 인 비보 항암 효능 분석을 이종 이식 U87MG 뇌암 또는 MKN45 위암 마우스 동물 모델을 대상으로 수행한 결과를 그래프로 나타낸 것이다.
도 7은 일 구체예에 따른 huAbF46-H4-A1(U6-HC7), huAbF46-H4-A1(IgG2 hinge) 및 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc) 항체의 인 비트로 세포증식 분석을 수행한 결과를 그래프로 나타낸 것이다.
도 8a 및 8b는 Akt의 인산화 정도를 측정하여 항체의 작용성 부작용 정도를 확인한 결과를 보여주는 것으로, 8a는 일 구체예에 따른 huAbF46-H4-A1(U6-HC7), huAbF46-H4-A1(IgG2 hinge) 및 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc) 항체의 Akt의 인산화 정도를 확인한 결과이고, 8b는 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc)와 L3-11Y의 Akt의 인산화 정도를 확인한 결과이다 (도 8a 및 8b에서 Y축은 상대적인 Akt 인산화 정도(%)를 나타낸다).
도 9a 및 9b는 항체의 c-Met의 분해 정도를 측정하여 항체의 항암 효능을 확인한 결과를 보여주는 것으로, 9a는 일 구체예에 따른 huAbF46-H4-A1(U6-HC7), huAbF46-H4-A1(IgG2 hinge) 및 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc) 항체의 c-Met의 분해 정도f를 확인한 결과이고, 9b는 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc)와 L3-11Y의 c-Met의 분해 정도를 확인한 결과이다 (도 9a 및 9b에서 Y축은 상대적인 총 c-Met 양(wt%)를 나타낸다).
도 10a 및 도 10b는 일 구체예에 따른 huAbF46-H4-A1(U6-HC7), huAbF46-H4-A1(IgG2 hinge) 및 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc) 항체의 인 비보 항암 효능 분석을 이종 이식 U87MG 뇌암 또는 MKN45 위암 마우스 동물 모델을 대상으로 수행한 결과를 그래프로 나타낸 것이다.
이하 하나 이상의 구체예를 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 하나 이상의 구체예를 예시적으로 설명하기 위한 것으로 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 1: c- Met 에 대한 마우스 항체 AbF46 의 생산
(1) 마우스의 면역화
하이브리도마 세포주의 개발에 필요한 면역화 된 마우스를 얻기 위하여, 5마리의 쥐에 한마리당 100 ㎍의 인간의 c-Met/Fc 융합 단백질(R&D Systems)과 동량의 완전 프로인드 어주번트(Freund's adjuvant)를 혼합하여 4-6 주된 BALB/c 마우스(Japan SLC, Inc.)의 복강 내에 주사하였다. 2주 후에 상기와 동일한 방법으로 항원(먼저 주사한 양의 절반)을 불완전 프로인드 어주번트(incomplete Freund's adjuvant)와 혼합하여 마우스의 복강 내에 주사하였다. 일주일 후 마지막 부스팅(boosting)이 수행되고 3일 후에 상기 마우스의 꼬리에서 채혈하여 혈청을 얻은 뒤 1/1000로 PBS에 희석하여 ELISA로 c-Met을 인지하는 항체의 역가가 증가됨을 확인하였다. 상기의 결과로 항체의 양이 충분하게 얻어지는 마우스를 선별하여 세포융합과정을 수행하였다.
(2) 세포 융합 및 하이브리도마의 제조
세포융합 실험 3일 전에 50 ㎍의 PBS에 인간의 c-Met/Fc 융합 단백질 혼합물을 BALB/c 마우스(Japan SLC, Inc.)의 복강 내에 주사하고, 면역화 된 마우스를 마취한 후 몸통의 좌측에 위치한 비장(spleen)을 적출하였다. 적출한 비장을 메쉬로 갈아서 세포를 분리하고, 배양배지(DMEM, GIBCO, Invitrogen)와 혼합하여 비장세포 현탁액을 만들었다. 상기 현탁액을 원심분리하여 세포층을 회수하였다. 상기 얻어진 비장세포 1 x 108 개와 골수종세포(Sp2/0) 1 x 108 개를 혼합한 다음 원심분리하여 세포를 침전시켰다. 원심분리된 침전물을 천천히 분산시키고, 배양배지(DMEM)에 들어있는 45 % 폴리에틸렌 글리콜(PEG)(1 ㎖)을 처리하고, 37 ℃에서 1분 동안 유지시킨 후, 배양배지(DMEM) 1 ㎖을 첨가하였다. 이후 배양배지(DMEM) 10 ㎖을 1분 동안 첨가하고, 37℃의 물에서 5분 동안 방치한 후 50 ㎖로 맞추어 다시 원심분리하였다. 세포 침전물을 분리배지(HAT 배지)에 1~2×105/㎖ 정도로 재현탁시키고, 96-웰(well) 플레이트에 0.1 ㎖씩 분주한 후 37℃ 이산화탄소 배양기에서 배양하여 하이브리도마 세포군을 제작하였다.
(3) c- Met 단백질에 대한 단일클론 항체를 생산하는 하이브리도마 세포의 선별
상기 (2)에서 제조된 하이브리도마 세포군 중에서 c-Met 단백질에만 특이적으로 반응하는 하이브리도마 세포를 선별하기 위하여 인간의 c-Met/Fc 융합 단백질과 인간의 Fc 단백질을 항원으로 이용한 ELISA 분석 방법을 통하여 스크리닝하였다.
마이크로타이터 플레이트에 인간의 c-Met/Fc 융합 단백질을 한 웰당 각각 50 ㎕ (2 ug/㎖)씩 가하여 플레이트 표면에 부착시키고, 반응하지 않은 항원은 세척하여 제거하였다. c-Met이 아닌 Fc에 결합되는 항체를 선별하여 제외시키기 위하여 인간의 Fc 단백질을 위와 동일한 방법으로 플레이트 표면에 부착시켰다. 상기 (2)에서 얻어진 하이브리도마 세포의 배양액을 각각 웰에 50 ㎕씩을 가하여 1 시간 동안 반응시킨 후 인산 완충용액-트윈 20(TBST) 용액으로 충분히 세척하여 반응하지 않은 배양액을 제거하였다. 여기에 염소 항-마우스 IgG-호스래디쉬 퍼옥시다제(goat anti-mouse IgG-HRP)를 가하여 1 시간 동안 실온에서 반응시킨 다음, TBST 용액으로 충분히 세척하였다. 이어서 퍼옥시다제의 기질용액(OPD)을 가하여 반응시키고, 그 반응정도는 엘리자 해독기(ELISA Reader)로 450 nm에서 흡광도를 측정하여 인간의 Fc에는 결합되지 않고, 인간의 c-Met 단백질에만 특이적으로 높은 결합력을 갖는 항체를 분비하는 하이브리도마 세포주들을 반복하여 선별하였다. 반복 선별을 통해 얻은 하이브리도마 세포주를 제한 희석(limiting dilution)하여 단일클론 항체를 생성하는 하이브리도마 세포주 1개의 클론을 최종적으로 얻었다. 최종 선별된 단일클론 항체 생산 하이브리도마를 한국 세포주 은행에 기탁하여 수탁번호 KCLRF-BP-00220를 부여받았다.
(4) 단일클론 항체의 생산 및 정제
상기 (3)에서 얻은 하이브리도마 세포를 무혈청 배지에서 배양하고 배양액으로부터 단일클론 항체를 생산 정제하였다.
먼저 10%(v/v) FBS이 포함된 배양배지(DMEM) 배지 50 ㎖에서 배양된 상기 하이브리도마 세포를 원심분리하여 세포 침전물을 20 ㎖ PBS로 2회 이상 세척하여 FBS가 제거된 상태에서 배양배지(DMEM) 배지 50 ㎖을 세포 침전물에 재현탁시킨 후 3일 동안 37℃ 이산화탄소 배양기에서 배양하였다. 이후 원심분리를 통해 항체를 생산하는 세포를 제거하고 항체들이 분비된 배양액을 분리하여 4℃에 보관하거나 바로 모아서 50 ㎖ 내지 300 ㎖의 배양액으로부터 친화성 칼럼(Protein G agarose column; Pharmacia, USA)을 장착한 AKTA 정제 기기(GE Healthcare)를 이용하여 항체를 순수 정제한 후 단백질 응집용 필터(Amicon)를 사용하여 PBS로 상층액을 치환하여 정제된 항체를 보관하고, 이후의 실험에 사용하였다.
실시예 2: c- Met 에 대한 키메릭 항체 chAbF46 의 제작
일반적으로 마우스 항체는 치료 목적으로 인간에게 주입되었을 때 면역거부반응(immunogenicity)을 보일 가능성이 높으므로, 이를 해결하기 위하여, 상기 실시예 1에서 제작된 마우스 항체 AbF46으로부터, 항원 결합에 관련된 변이 영역(variable region)을 제외한 불변 영역(constant region)을 인간 IgG1 항체의 서열로 치환하는 키메릭 항체 chAbF46을 제작하였다.
중쇄에 해당하는 염기 서열은 'EcoRI-signal sequence-VH-NheI-CH-TGA-XhoI'(서열번호 38)로, 경쇄에 해당하는 염기 서열은 'EcoRI-signal sequence-VL- BsiWI-CL-TGA-XhoI'(서열번호 39)로 구성되도록 각각 디자인하여 유전자를 합성하였다. 이후, Invitrogen 사의 OptiCHOTM Antibody Express Kit (Cat no. 12762-019)에 포함되어 있는 pOptiVECTM-TOPO TA Cloning Kit에 상기 중쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(서열번호 38)을, pcDNATM3.3-TOPO TA Cloning Kit(Cat no. 8300-01)에 상기 경쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(서열번호 39)을 각각 EcoRI(NEB, R0101S)과 XhoI(NEB, R0146S) 제한 효소를 사용하여, 클로닝함으로써, 키메릭 항체의 발현을 위한 벡터를 구축하였다.
상기 구축된 벡터는 각각 Qiagen Maxiprep kit (Cat no. 12662)을 이용하여 증폭되었으며, 상기 중쇄를 포함하는 벡터 및 경쇄를 포함하는 벡터는 4:1의 비율(80 ug:20 ug)로 293T 세포(2.5 x 107)에 2M CaCl2를 360 ul 첨가하여 트랜스펙션(transfection)하였다. 이후, 10% FBS가 첨가된 DMEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건 하에서 5시간 동안 배양한 다음, FBS가 첨가되지 않은 DMEM 배지로 48시간 동안 37℃, 5% CO2 조건 하에서 배양하였다.
상기 배양된 세포를 원심분리하여 상등액 각 100 ml을 취하고, AKTA Prime (GE healthcare)를 이용하여 정제하였다. AKTA Prime에 Protein A 컬럼(GE healthcare, 17-0405-03)을 설치하고 배양액을 5 ml/min의 유속으로 흘려준 후, IgG elution buffer(Thermo Scientific, 21004)로 용출하였다. 이를 PBS buffer로 교환하여 최종적으로 키메릭 항체 AbF46(이하, chAbF46로 명명함)을 정제하였다.
실시예 3: 키메릭 항체 chAbF46 으로부터 인간화 항체 huAbF46 의 제작
(1) 중쇄의 인간화( Heavy chain humanization )
H1-heavy 및 H3-heavy 2종의 디자인을 위하여, 우선 Ig Blast (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)를 통하여 마우스 항체 AbF46의 VH 유전자와 가장 상동성이 높은 인간의 생식선(germline) 유전자를 분석하였다. 그 결과, VH3-71이 아미노산 레벨에서 83%의 상동성을 가짐을 확인하였으며, 마우스 항체 AbF46의 CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3를 Kabat numbering으로 정의하고, 마우스 항체 AbF46의 CDR 부분이 VH3-71의 골격(framework)에 도입되도록 디자인하였다. 이때, 30번(S→T), 48번(V→L), 73번(D→N), 78번(T→L) 아미노산은 원래 마우스 AbF46 항체의 아미노산 서열로 back-mutation 하였다. 이후, H1은 추가로 83번(R→K)과 84번(A→T) 아미노산에 돌연변이를 주어 최종적으로 H1-heavy(서열번호 40)와 H3-heavy(서열번호 41)를 구축하였다. 상기 아미노산 번호는 Kabat numbering에 따른 것으로 VH3-71와 마우스 항체 AbF46에 공통적으로 적용된다.
H4-heavy의 디자인을 위하여 인간항체의 골격(framework) 서열을 찾아 본 결과, AbF46 항체의 마우스 골격 서열과 서열이 매우 유사함과 동시에, 기존의 가장 안정하다고 알려진 VH3 subtype을 사용하여 Kabat numbering으로 정의된 마우스 항체 AbF46의 CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3를 도입하였다. 이를 통하여 H4-heavy (서열번호 42)를 구축하였다.
(2) 경쇄의 인간화( Light chain humanization )
H1-light(서열번호 43) 및 H2-light(서열번호 44) 2종의 디자인을 위하여, Ig Blast (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)를 통하여, 마우스 항체 AbF46의 VL 유전자와 가장 상동성이 높은 인간 생식선 유전자를 분석하였다. 그 결과, VK4-1이 아미노산 레벨에서 75%의 상동성을 가짐을 확인하였으며, 마우스 항체 AbF46의 CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3를 Kabat numbering으로 정의하고, 마우스 항체 AbF46의 CDR부분이 VK4-1의 골격에 도입되도록 디자인하였다. 이때, H1-light는 36번(Y→H), 46번(L→M), 49번(Y→I) 3개의 아미노산을 back-mutation 하였으며, H2-light는 49번 아미노산(Y→I) 1개만을 back-mutation 하여 구축하였다.
H3-light(서열번호 45)의 디자인을 위하여, Blast (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)를 통하여 마우스 항체 AbF46의 VL 유전자와 가장 상동성이 높은 인간 생식선 유전자를 분석한 결과 중, 상기 VK4-1 이외에 VK2-40을 선정하였다. 마우스 항체 AbF46 VL과 VK2-40은 아미노산 레벨에서 61%의 상동성을 가짐을 확인하였으며, 마우스 항체 AbF46의 CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3를 Kabat numbering으로 정의하고, 마우스 항체 AbF46의 CDR부분이 VK4-1의 골격에 도입되도록 디자인하였다. 이때, H3-light는 36번(Y→H), 46번(L→M), 49번(Y→I) 3개의 아미노산을 back-mutation 하여 구축하였다.
H4-light(서열번호 46)의 디자인을 위하여, 인간항체의 골격(framework) 서열을 찾아 본 결과, 기존의 가장 안정하다고 알려진 Vk1 subtype을 사용하여 Kabat numbering으로 정의된 마우스 항체 AbF46의 CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3를 도입하였다. 이때, H4-light는 36번(Y→H), 46번(L→M), 49번(Y→I) 3개의 아미노산을 추가로 back-mutation 하여 구축하였다.
이후, Invitrogen 사의 OptiCHOTM Antibody Express Kit (Cat no. 12762-019)에 포함되어 있는 pOptiVECTM-TOPO TA Cloning Kit에 상기 중쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(H1-heavy; 서열번호 47, H3-heavy; 서열번호 48, H4-heavy; 서열번호 49)을 pcDNATM3.3-TOPO TA Cloning Kit 에 상기 경쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(H1-light; 서열번호 50, H2-light; 서열번호 51, H3-light; 서열번호 52, H4-light; 서열번호 53)을 각각 EcoRI(NEB, R0101S)과 XhoI(NEB, R0146S) 제한 효소를 사용하여, 클로닝함으로써, 인간화 항체의 발현을 위한 벡터를 구축하였다.
상기 구축된 벡터는 각각 Qiagen Maxiprep kit (Cat no. 12662)을 이용하여 증폭되었으며, 상기 중쇄를 포함하는 벡터 및 경쇄를 포함하는 벡터는 4:1의 비율(80 ug:20 ug)로 293T 세포(2.5 x 107)에 2M CaCl2를 360 ul 첨가하여 트랜스펙션(transfection)하였다. 이후, 10% FBS가 첨가된 DMEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건 하에서 5시간 동안 배양한 다음, FBS가 첨가되지 않은 DMEM 배지로 48시간 동안 37℃, 5% CO2 조건 하에서 배양하였다.
상기 배양된 세포를 원심분리하여 상등액 각 100 ml을 취하고, AKTA Prime (GE healthcare)를 이용하여 정제하였다. AKTA Prime에 Protein A 컬럼(GE healthcare, 17-0405-03)을 설치하고 배양액을 5 ml/min의 유속으로 흘려준 후, IgG elution buffer(Thermo Scientific, 21004)로 용출하였다. 이를 PBS buffer로 교환하여 최종적으로 인간화 항체 AbF46(이하, huAbF46로 명명함)을 정제하였다. 한편, 이후 실시예에서 사용한 인간화 항체 huAbF46의 중쇄, 경쇄 조합은 H4-heavy 및 H4-light이었다.
실시예 4: huAbF46 항체의 scFv 라이브러리 제작
huAbF46 항체의 중쇄 가변영역 및 경쇄 가변영역을 이용하여 huAbF46 항체의 scFv를 제작하기 위한 유전자를 디자인하였다. 각각의 중쇄 가변영역 및 경쇄 가변영역을 'VH-링커-VL'의 형태가 되도록 하고, 상기 링커는 'GLGGLGGGGSGGGGSGGSSGVGS'(서열번호 54)의 아미노산 서열을 가지도록 디자인하였다. 이렇게 디자인된 huAbF46 항체의 scFv를 코딩하는 폴리뉴클레오티드(서열번호 55)를 바이오니아에 의뢰하여 합성하였으며, 이를 발현시키기 위한 벡터를 서열번호 56에 나타내었다.
이후, 상기 벡터로부터 발현된 결과물을 분석하여, c-Met에 특이적인 결합력을 보임을 확인하였다.
실시예 5: 친화도 성숙( affinity maturation )을 위한 라이브러리 유전자의 제작
(1) 표적 CDR 의 선정 및 프라이머 제작
huAbF46 항체의 친화도 성숙(affinity maturation)을 위하여 6개의 상보성 결정 부위(complementary determining region, CDR)을 상기 제작된 마우스 항체 AbF46으로부터 'Kabat numbering'에 의하여 정의하였으며, 각각의 CDR은 하기 표 1과 같다.
 CDR 아미노산 서열
CDR-H1 DYYMS(서열번호 1)
CDR-H2 FIRNKANGYTTEYSASVKG(서열번호 2)
CDR-H3 DNWFAY(서열번호 3)
CDR-L1 KSSQSLLASGNQNNYLA(서열번호 10)
CDR-L2 WASTRVS(서열번호 11)
CDR-L3 QQSYSAPLT(서열번호 12)
항체 CDR의 무작위 서열 도입을 위하여 다음과 같이 프라이머를 제작하였다. 기존의 무작위 서열 도입 방식은 돌연변이를 주고자 하는 부위에 동일한 비율의 염기 (25% A, 25% G, 25% C, 25% T)가 도입되도록 N 코돈을 이용하였으나, 본 실시예에서는 huAbF46 항체의 CDR에 무작위 염기를 도입하기 위하여, 각 CDR의 아미노산을 코딩하는 3개의 야생형(wild-type) 뉴클레오티드 중 첫번째와 두번째 뉴클레오티드의 85%는 그대로 보존하고, 나머지 3개의 염기를 각각 5%씩 도입하는 방식을 취하였다. 또한, 세 번째 뉴클레오티드는 동일하게(33% G, 33% C, 33% T)가 도입되도록 프라이머를 디자인하였다.
(2) huAbF46 항체의 라이브러리 제작 및 c- Met 에 대한 결합력 확인
CDR의 무작위 서열 도입을 통한 항체 라이브러리 유전자의 구축은 상기 (1)과 같은 방법으로 제작된 프라이머를 이용하여 수행되었다. 주형으로 huAbF46 항체의 scFv를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 이용하여, 도 1에 나타낸 방법과 같이 2개의 PCR 절편을 제작하고, 이를 중복 확장 중합효소연쇄반응(overlap extension PCR) 방법을 통하여, 원하는 CDR만 각각 돌연변이된 huAbF46 항체의 scFv 라이브러리 유전자를 확보하여 제작된 6개의 CDR을 각각 표적으로 하는 라이브러리들을 구축하였다.
이렇게 제작된 라이브러리는 야생형과 각 라이브러리의 c-Met에 대한 결합력을 확인하였으며, 각각의 라이브러리는 야생형에 비하여 c-Met에 대한 결합력이 대부분 낮아지는 경향을 보였으나, 일부 c-Met에 대한 결합력이 유지되는 돌연변이들을 확인하였다.
실시예 6: 제작된 라이브러리로부터 친화도가 개선된 항체의 선별
상기 구축된 라이브러리로부터 c-Met에 대한 라이브러리의 결합력을 향상시킨 후, 각각의 개별 클론로부터 scFv의 유전자 서열을 분석하였다. 확보된 유전자 서열은 각각 하기 표 2와 같으며, 이를 IgG 형태로 변환하였다. 하기 클론 중에서, L3-1, L3-2, L3-3, L3-5으로부터 생산된 4종의 항체를 선별하여 후속 실험을 수행하였다.
클론 이름 도출된 라이브러리 CDR 서열
H11-4 CDR-H1 PEYYMS(서열번호 22)
YC151 CDR-H1 PDYYMS(서열번호 23)
YC193 CDR-H1 SDYYMS(서열번호 24)
YC244 CDR-H2 RNNANGNT(서열번호 25)
YC321 CDR-H2 RNKVNGYT(서열번호 26)
YC354 CDR-H3 DNWLSY(서열번호 27)
YC374 CDR-H3 DNWLTY(서열번호 28)
L1-1 CDR-L1 KSSHSLLASGNQNNYLA(서열번호 29)
L1-3 CDR-L1 KSSRSLLSSGNHKNYLA(서열번호 30)
L1-4 CDR-L1 KSSKSLLASGNQNNYLA(서열번호 31)
L1-12 CDR-L1 KSSRSLLASGNQNNYLA(서열번호 32)
L1-22 CDR-L1 KSSHSLLASGNQNNYLA(서열번호 33)
L2-9 CDR-L2 WASKRVS(서열번호 34)
L2-12 CDR-L2 WGSTRVS(서열번호 35)
L2-16 CDR-L2 WGSTRVP(서열번호 36)
L3-1 CDR-L3 QQSYSRPYT(서열번호 13)
L3-2 CDR-L3 GQSYSRPLT(서열번호 14)
L3-3 CDR-L3 AQSYSHPFS(서열번호 15)
L3-5 CDR-L3 QQSYSRPFT(서열번호 16)
L3-32 CDR-L3 QQSYSKPFT(서열번호 37)
실시예 7: 선별된 항체의 IgG 로의 변환
선별된 4종의 항체의 중쇄를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 'EcoRI-signal sequence-VH-NheI-CH-XhoI'(서열번호 38)로 구성되며, 중쇄의 경우 친화도 성숙 후에 항체의 아미노산이 변경되지 않았으므로, huAbF46 항체의 중쇄를 그대로 사용하였다. 다만, 힌지 영역(hinge region)은 인간 IgG1의 힌지가 아닌 U6-HC7 힌지(서열번호 57) 로 치환하였다. 경쇄는 'EcoRI-signal sequence-VL-BsiWI-CL-XhoI'로 구성되도록 각각 디자인하여 유전자를 합성하였으며, 친화도 성숙 후에 선별된 상기 4종 항체의 경쇄 가변영역을 포함하여 코딩하는 폴리뉴클레오티드(서열번호 58 내지 서열번호 61)를 바이오니아에 의뢰하여 합성하였다. 이후, Invitrogen 사의 OptiCHOTM Antibody Express Kit (Cat no. 12762-019)에 포함되어 있는 pOptiVECTM-TOPO TA Cloning Kit에 상기 중쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(서열번호 38)을, pcDNATM3.3-TOPO TA Cloning Kit(Cat no. 8300-01)에 상기 경쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(L3-1 유래 CDR-L3를 포함하는 DNA 절편: 서열번호 58, L3-2 유래 CDR-L3를 포함하는 DNA 절편: 서열번호 59, L3-3 유래 CDR-L3를 포함하는 DNA 절편: 서열번호 60, L3-5 유래 CDR-L3를 포함하는 DNA 절편: 서열번호 61)을 각각 EcoRI(NEB, R0101S)과 XhoI(NEB, R0146S) 제한 효소를 사용하여, 클로닝함으로써, 친화력 성숙된 항체의 발현을 위한 벡터를 구축하였다.
상기 구축된 벡터는 각각 Qiagen Maxiprep kit (Cat no. 12662)을 이용하여 증폭되었으며, 상기 중쇄를 포함하는 벡터 및 경쇄를 포함하는 벡터는 4:1의 비율(80 ug:20 ug)로 293T 세포(2.5 x 107)에 2M CaCl2를 360 ul 첨가하여 트랜스펙션(transfection)하였다. 이후, 10% FBS가 첨가된 DMEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건 하에서 5시간 동안 배양한 다음, FBS가 첨가되지 않은 DMEM 배지로 48시간 동안 37℃, 5% CO2 조건 하에서 배양하였다.
상기 배양된 세포를 원심분리하여 상등액 각 100 ml을 취하고, AKTA Prime (GE healthcare)를 이용하여 정제하였다. AKTA Prime에 Protein A 컬럼(GE healthcare, 17-0405-03)을 설치하고 배양액을 5 ml/min의 유속으로 흘려준 후, IgG elution buffer(Thermo Scientific, 21004)로 용출하였다. 이를 PBS buffer로 교환하여 최종적으로 친화력 성숙된 4종의 항체(이하, huAbF46-H4-A1, huAbF46-H4-A2, huAbF46-H4-A3, huAbF46-H4-A5로 명명함)를 정제하였다.
 
실시예 8: 선별된 항체의 결합 친화도 분석
상기 실시예 7에서 제작된 4종의 항체 의 c-Met 항원에 대한 친화력을 Biacore(GE healthcare)를 사용하여 측정하였다. CM5 칩 상에 각각의 항체를 약 80~110RU만큼 고정시킨 후, 항원인 인간 c-Met 단백질을 100 nM부터 0.39 nM까지의 농도 범위 내에서 서로 다른 9개의 농도로 30 ul/min의 속도로 주입하여, 하기 표 3과 같이 kon 값과 koff 값을 구하고, 이로부터 KD 값을 계산하였다. huAbF46은 c-Met항원에 대하여 약 2.19 nM의 결합력을 보였으며, 친화도가 개선된 4종의 항체는 0.06 nM 내지 0.50 nM범위의 결합력을 보였다(표 3). 이는 scFv 형태에서 친화도가 개선된 항체들이 IgG 변환 후에도 최소 5배에서 최대 약 37배까지 친화도가 향상되었음을 보여준다.
항체 kon (1/Ms) koff (1/s) KD (nM)
huAbF46 3.29 x 105 7.23 x 10-4 2.19
huAbF46-H4-A1 7.39 x 105 4.53 x 10-5 0.06
huAbF46-H4-A2 5.02 x 105 2.53 x 10-4 0.50
huAbF46-H4-A3 4.19 x 105 1.43 x 10-4 0.34
huAbF46-H4-A5 5.72 x 105 2.40 x 10-4 0.42
실시예 9: 선별된 친화도 개선 항체의 인 비트로( in vitro ) 생물학적 활성 분석
(1) BrdU assay
친화도가 개선된 항체들에 있어서 안전성에 취약점이 있는지 여부를 확인하기 위해 BrdU assay를 수행하였다. 인간 폐암 세포인 NCI-H441 세포(ATCC Cat.# HTB-174)를 RPMI 1640 배지(Gibco)에 2 x 105 세포/ml로 현탁하여 현탁액을 100 ul씩 96-well tissue culture plate (Corning, Lowell, MA) 에 분주하였다. 24시간 동안 37℃에서 5% CO2의 조건으로 배양하고, 배지를 완전히 제거한 후에 항체를 희석한 RPMI 1640 배지로 교체하였다. 21시간 동안 37℃에서 5% CO2의 조건으로 배양한 후, 5-브로모-2'-디옥시우리딘(5-bromo-2'-deoxyuridine, BrdU)을 첨가하고 3시간을 추가로 배양한 뒤에 BrdU assay (Roche, Indianapolis, IN)를 수행하였다. 세포를 플레이트 상에서 denaturation/fixation한 후에 항-BrdU 항체를 넣고 1시간 후에 기질을 첨가하여 370 nm에서 ELISA spectraMax reader (Molecular Devices, Sunnyvale, CA)로 발색반응을 측정하였다. 비교 대상은 마우스 AbF46 항체의 작용성을 기준으로 하였다. 음성 대조군으로는 배지(media)만을 사용하였으며 (항체 무첨가), 작용제(agonist)로 잘 알려진 5D5 항체(ATCC Cat. # HB11895 하이브리도마 세포에서 분리 정제)를 양성 대조군으로 사용하였다.
그 결과, 도 2에서 보는 바와 같이, 상기 제작된 4종의 친화도 개선 항체 중 3종에서 작용성(agonism)의 부작용이 감소되는 것으로 나타나, 안전성이 개선된 것으로 나타났다(10 ug/ml의 처리 농도에서 각각 huAbF46-H4-A1 25%, huAbF46-H4-A2 28%, huAbF46-H4-A3 13%, huAbF46-H4-A5 21% 개선됨).
(2) 인 비트로( in vitro ) 세포증식 분석법
상기 실시예 5에서 제작된 4종의 친화도 개선 항체의 암세포 증식 억제에 의한 항암 효과를 확인하기 위하여, c-Met 분자를 세포 표면에 발현하는 MKN45 위암 세포(일본 암연구 세포주 은행, Japanese Cancer Research Bank, JCRB, Tokyo, Japan)를 이용한 인 비트로(in vitro) 세포증식 분석법을 수행하였다.
96-웰 플레이트에 웰당 1 x 104개의 MKN45 세포를 50 ㎕의 5% FBS/DMEM 배양액과 분주하고, 상기 제작된 항체 4종을 처리하지 않거나, 0.008, 0.04, 0.2 또는 1 ㎍/㎖의 농도로 50 ㎕를 처리한 후, 72시간 동안 배양한 다음, CellTiter-Glo
Figure pat00001
Luminescent Cell Viability Assay Kit (Promega, G7570)를 사용하여 leuminometer (PerkinElmer, 2104 Multilabel reader)로 세포의 수를 정량하였다.
도 3에 나타난 바와 같이, 실험 농도 중 최저 농도인 0.008 ㎍/㎖에서 친화도 개선 전 항체(huAbF46)의 상대적 세포 생존률이 77%이며, 친화도가 개선된 항체 huAbF46-H4-A1, huAbF46-H4-A2, 및 huAbF46-H4-A5는 각각 74, 73, 72%로 효능이 비슷하며, huAbF46-H4-A3는 66%로 효능이 확연히 증대됨을 관찰하였다. 또한, 최대 효능을 보이는 0.04 ㎍/㎖ 농도에서는 상기 항체 4종 모두가 5D5 항체의 생존률인 53% 이하의 수치를 보이는 것을 확인할 수 있었다. 따라서, 친화도 개선 결과, 대조군에 비해 효능과 안전성에서 확연히 개선됨을 확인할 수 있었다.
(3) Akt 인산화
Akt에 의해 조절되는 세포 작용들은 세포 증식, 세포 생존, 세포 크기 조절, 가용 영양분에 대한 반응성, 중간 대사과정, 혈관신생(angiogenesis), 조직침해(tissue invasion) 등을 포함한다. 이 모든 과정들은 암의 특징을 대표하는 것으로 수 많은 종양 발생 단백질(oncoprotein)과 종양 발생 억제물질(tumor suppressor)은 Akt 경로 상에서 상호 교차적으로 영향을 미치며, 신호전달과 고전적인 대사조절의 연결점에서 세포의 작용을 미세하게 조절하는 기능을 수행한다. 따라서, 이 Akt의 활성형인 인산화된 Akt의 정도가 높을수록 암세포가 더욱 활성형인 것으로 판단할 수 있다. 본 실시예에서는 친화도가 개선된 4종의 항체가 Akt의 인산화를 얼마나 저해할 수 있는지를 실험하였다.
상기 실시예 5에서 제작된 4종의 친화도 개선 항체의 작용성(agonism) 정도를 비교하기 위하여, Caki-1 세포(한국 세포주 은행)를 사용하여, Akt 단백질의 인산화 정도를 확인하였다. 음성 대조군으로는 마우스의 IgG를 사용하였으며, 작용제(agonist)로 잘 알려진 5D5 항체를 양성 대조군으로 사용하였다.
2 x 105 세포/ml 의 Caki-1 세포를 96-웰 플레이트에 분주한 후, 24시간 후에 무혈청 상태에서 각각 5 ug/ml의 항체를 30분 동안 처리하였다. 항체가 처리된 세포를 용해(lysis)시키고 PathScan phospho-AKT1 (Ser473) chemiluminescent Sandwich ELISA kit (Cell Signaling, cat.no #7134S)를 이용하여 Akt 인산화 정도를 측정한 후 분석하였다.
도 4에서 보는 바와 같이, 4종의 항체 모두 친화도 개선 전보다 Akt의 인산화를 더욱 저해하는 것을 확인할 수 있었다. 특히, huAbF46-H4-A1, huAbF46-H4-A2는 친화도 개선 전의 49%의 저해도를 보이는 것으로 나타나, 안전성 측면에서 확연히 개선된 것을 확인할 수 있었다.
(4) c- Met 의 분해 정도 확인
상기 실시예 5에서 제작된 4종의 친화도 개선 항체의 항암 효능을 확인하기 위하여, 항체와 결합된 c-Met 단백질의 분해 정도를 확인하였다. 이는 상대적인 총 c-Met량은 항체가 c-Met에 결합하여 내재화를 일으켜 c-Met의 분해(degradation)가 일어나는 것을 이용하여, 총 c-Met양의 증감을 파악하여 항체의 효능을 검사하는 것이다.
2 x 105 cells/ml MKN45 세포와 5 ug/ml의 항체를 96-웰 플레이트에 동시에 뿌려준 후, 24시간 동안 배양하였다. 이후, 항체가 처리된 세포를 용해(lysis)시키고 Human total HGF R/c-MET ELISA KIT (R&D systems, DYC358)를 이용하여 총 c-Met 양의 변화를 측정한 후 분석하였다.
그 결과, 도 5에서 보는 바와 같이, 4종의 친화도 개선 항체는 모두 huAbF46 항체에 비하여 c-Met 분해 정도가 증가함을 확인할 수 있었다. huAbF46-H4-A1는 huAbF46에 비하여 약 37% 정도 c-Met 분해 정도가 증가하였으며, huAbF46-H4-A2, huAbF46-H4-A3 및 huAbF46-H4-A5는 약 28% 정도 c-Met 분해 정도가 증가한 것을 확인하였다.
실시예 10: 선별된 친화도 개선 항체의 인 비보( in vivo ) 생물학적 활성 분석
상기 실시예 5에서 제작된 4종의 친화도 개선 항체의 항암 효능 개선 여부를 확인하기 위하여, U87MG 뇌암 세포(한국 세포주 은행) 또는 MKN45 위암 세포(일본 암연구 세포주 은행, Japanese Cancer Research Bank, JCRB, Tokyo, Japan)를 투여한 이종 이식 뇌암 또는 위암 마우스 동물 모델을 대상으로 인 비보(in vivo)에서 4종의 친화도 개선 항체의 투여에 의하여 종양의 크기가 감소되는지 여부를 확인하였다.
마우스 동물 모델은 5 x 106개의 U87MG 뇌암 세포 또는 MKN45 위암 세포 50 ㎕를 6주령의 웅성 BALB/C 누드 마우스(㈜ 오리엔트 바이오)에 피하주사하여 1주 경과 후에 암이 발생되는 마우스를 각 그룹당 12마리씩을 무작위 선별하여 실험에 사용하였다. 4종의 친화도 개선 항체는 암세포가 생성되고 정맥주사에 의해 10 mg/kg의 농도만큼 주 1회 마우스에 투여하였다. 또한, 대조군으로 마우스 AbF46 항체는 복강주사에 의해 10 mg/kg과 20 mg/kg의 농도로 주 2회 투여하였다.
도 6a 및 도 6b에서 나타낸 바와 같이, U87MG 뇌암 또는 MKN45 위암 마우스 동물 모델에서 두 항체 모두 확연한 종양 성장 억제 효능을 보였으며, 통계적으로 유의한 차이는 없었다.
실시예 11: 불변영역 및/또는 힌지영역이 치환된 huAbF46 - H4 -A1의 제조
선별된 4종의 항체 중에서, c-Met과의 결합친화도가 가장 높고, Akt 인산화 및 c-Met 분화 정도가 가장 낮은 것으로 측정된 huAbF46-H4-A1을 대상으로, 힌지영역 또는 불변영역 및 힌지영역이 치환된 항체를 제작하였다.
huAbF46-H4-A1의 중쇄 가변영역, U6-HC7 힌지 및 인간의 IgG1 불변영역으로 이루어진 중쇄 및 huAbF46-H4-A1의 경쇄 가변영역 및 인간의 카파(kappa) 불변영역으로 이루어진 경쇄로 이루어진 항체를 huAbF46-H4-A1(U6-HC7)으로, huAbF46-H4-A1의 중쇄 가변영역, 인간의 IgG2 힌지 및 인간의 IgG1 불변영역으로 이루어진 중쇄 및 huAbF46-H4-A1의 경쇄 가변영역 및 인간의 카파 불변영역으로 이루어진 경쇄로 이루어진 항체를 huAbF46-H4-A1(IgG2 hinge)로, huAbF46-H4-A1의 중쇄 가변영역, 인간의 IgG2 힌지 및 인간의 IgG2 불변영역으로 이루어진 중쇄 및 huAbF46-H4-A1의 경쇄 가변영역 및 인간의 카파 불변영역으로 이루어진 경쇄로 이루어진 항체를 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc)로 명명하였다. 또한, 한편, 상기 3종의 항체는 생산량 증대를 위하여 인간의 카파 불변영역으로 이루어진 경쇄의 36번 히스티딘 (histidine)을 모두 티로신 (tyrosine)으로 치환하였다.
상기 3종 항체를 제작하기 위해, huAbF46-H4-A1의 중쇄 가변영역, U6-HC7힌지 및 인간의 IgG1 불변영역으로 이루어진 폴리펩티드(서열번호 62)를 코딩하는 폴리뉴클레오티드(서열번호 63), huAbF46-H4-A1의 중쇄 가변영역, 인간의 IgG2 힌지 및 인간의 IgG1 불변영역으로 이루어진 폴리펩티드(서열번호 64)를 코딩하는 폴리뉴클레오티드(서열번호 65), huAbF46-H4-A1의 중쇄 가변영역, 인간의 IgG2 힌지 및 인간의 IgG2 불변영역으로 이루어진 폴리펩티드(서열번호 66)를 코딩하는 폴리뉴클레오티드(서열번호 67), 36번 히스티틴이 티로신으로 치환된 huAbF46-H4-A1의 경쇄 가변영역 및 인간의 카파 불변영역으로 이루어진 폴리펩티드(서열번호 68)를 코딩하는 폴리뉴클레오티드(서열번호 69)를 바이오니아에 의뢰하여 합성하였다. 이후, Invitrogen 사의 OptiCHOTM Antibody Express Kit (Cat no. 12762-019)에 포함되어 있는 pOptiVECTM-TOPO TA Cloning Kit에 상기 중쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편을, pcDNATM3.3-TOPO TA Cloning Kit(Cat no. 8300-01)에 상기 경쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편을 삽입하여, 상기 항체의 발현을 위한 벡터를 구축하였다.
상기 구축된 벡터는 각각 Qiagen Maxiprep kit (Cat no. 12662)을 이용하여 증폭되었으며, 상기 중쇄를 포함하는 벡터 및 경쇄를 포함하는 벡터는 4:1의 비율(80 ug:20 ug)로 293T 세포(2.5 x 107)에 2M CaCl2를 360 ul 첨가하여 트랜스펙션(transfection)하였다. 이후, 10% FBS가 첨가된 DMEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건 하에서 5시간 동안 배양한 다음, FBS가 첨가되지 않은 DMEM 배지로 48시간 동안 37℃, 5% CO2 조건 하에서 배양하였다.
상기 배양된 세포를 원심분리하여 상등액 각 100 ml을 취하고, AKTA Prime (GE healthcare)를 이용하여 정제하였다. AKTA Prime에 Protein A 컬럼(GE healthcare, 17-0405-03)을 설치하고 배양액을 5 ml/min의 유속으로 흘려준 후, IgG elution buffer(Thermo Scientific, 21004)로 용출하였다. 이를 PBS buffer로 교환하여 최종적으로 3종의 항체(huAbF46-H4-A1(U6-HC7), huAbF46-H4-A1(IgG2 hinge), huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc))를 정제하였다.
또한, huAbF46-H4-A1의 경쇄가변영역으로부터 kabat numbering의 27e로 정의된 아미노산인 세린 (Serine)을 트립토판 (Tryptophan)으로 치환하여 새로운 경쇄(서열번호 73)를 제작하였고, 앞서 기재한 방법으로 이를 huAbF46-H4-A1 (IgG2 Fc) 중쇄와 결합하여 항체를 제조하여, 이를 L3-11Y 라 명명하였다. 상기 실험예 8과 동일한 방법으로 항체 L3-11Y의 결합 친화도를 측정한 결과, KD(nM) 값이 0.01이하(<0.01)로 측정되었다.
실시예 12: 불변영역 및/또는 힌지영역이 치환된 huAbF46 - H4 -A1의 인 비트로( in vitro ) 생물학적 활성 분석
(1) 인 비트로( in vitro ) 세포증식 분석법
상기 실시예 11에서 제작된 3종 항체의 암세포 증식 억제에 의한 항암 효과를 확인하기 위하여, c-Met 분자를 세포 표면에 발현하는 MKN45 위암 세포(일본 암연구 세포주 은행, Japanese Cancer Research Bank, JCRB, Tokyo, Japan)를 이용한 인 비트로(in vitro) 세포증식 분석법을 수행하였다.
96-웰 플레이트에 웰당 1 x 104개의 MKN45 세포를 50 ㎕의 5% FBS/DMEM 배양액과 분주하고, 상기 제작된 항체 3종을 처리하지 않거나, 0.008, 0.04, 0.2 또는 1 ㎍/㎖의 농도로 50 ㎕를 처리한 후, 72시간 동안 배양한 다음, CellTiter-Glo
Figure pat00002
Luminescent Cell Viability Assay Kit (Promega, G7570)를 사용하여 leuminometer (PerkinElmer, 2104 Multilabel reader)로 세포의 수를 정량하였다.
도 7에 나타난 바와 같이, 상기 3종의 항체 huAbF46-H4-A1(U6-HC7), huAbF46-H4-A1(IgG2 hinge), huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc)는 0.04 ㎍/㎖ 이하의 농도로 처리하였을 때, 약 60% 정도의 수치를 보이는 것을 확인할 수 있었다.
(2) Akt 인산화
상기 실시예 11에서 제작된 3종의 친화도 개선 항체의 작용성 정도를 비교하기 위하여, Caki-1 세포(한국 세포주 은행)를 사용하여, Akt 단백질의 인산화 정도를 확인하였다. 음성 대조군으로는 마우스의 IgG를 사용하였으며, 작용제(agonist)로 잘 알려진 5D5 항체를 양성 대조군으로 사용하였다.
2 x 105 세포/ml 의 Caki-1 세포를 96-웰 플레이트에 분주한 후, 24시간 후에 무혈청 상태에서 각각 5 ug/ml의 항체를 30분 동안 처리하였다. 항체가 처리된 세포를 용해시키고 PathScan phospho-AKT1 (Ser473) chemiluminescent Sandwich ELISA kit (Cell Signaling, cat.no #7134S)를 이용하여 Akt 인산화 정도를 측정한 후 분석하여 그 결과를 도 8a에 나타내었다.
도 8a에서 보는 바와 같이, 3종의 항체 모두 18% 이하의 저해도를 보이는 것으로 나타나, 안전성 측면에서 확연히 개선된 것을 확인할 수 있었다.
또한, 상기의 방법으로 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc)와 항체 L3-11Y의 Akt 인산화 저해 정도를 측정하여 비교하였으며, 그 결과를 도 8b에 나타내었다. 도 8b에서 보여지는 바와 같이, 항체 L3-11Y는 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc)와 비교하여 동등 이상의 Akt 인산화 저해 활성을 나타내는 것으로 확인되었다.
(3) c- Met 의 분해 정도 확인
상기 실시예 11에서 제작된 3종의 친화도 개선 항체의 항암 효능을 확인하기 위하여, 항체와 결합된 c-Met 단백질의 분해 정도를 확인하였다. 2 x 105 cells/ml MKN45 세포와 5 ug/ml의 항체를 96-웰 플레이트에 동시에 뿌려준 후, 24시간 동안 배양하였다. 이후, 항체가 처리된 세포를 용해시키고 Human total HGF R/c-MET ELISA KIT (R&D systems, DYC358)를 이용하여 총 c-Met 양의 변화를 측정한 후 분석하여 그 결과를 도 9a에 나타내었다.
그 결과, 도 9a에서 보는 바와 같이, 3종의 항체는 모두 huAbF46 항체에 비하여 c-Met 분해 정도가 증가함을 확인할 수 있었다.
또한, 상기의 방법으로 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc)와 항체 L3-11Y의 c-Met 분해 정도를 측정하여 비교하였으며, 그 결과를 도 9b에 나타내었다. 도 9b에서 보여지는 바와 같이, 항체 L3-11Y는 huAbF46-H4-A1(IgG2 Fc)와 비교하여 동등 정도의 c-Met 분해 활성을 나타내는 것으로 확인되었다.
실시예 13: 불변영역 및/또는 힌지영역이 치환된 huAbF46 - H4 -A1의 인 비보( in vivo ) 생물학적 활성 분석
상기 실시예 11에서 제작된 3종 항체의 항암 효능 개선 여부를 확인하기 위하여, U87MG 뇌암 세포(한국 세포주 은행) 또는 MKN45 위암 세포(일본 암연구 세포주 은행, Japanese Cancer Research Bank, JCRB, Tokyo, Japan)를 투여한 이종 이식 뇌암 또는 위암 마우스 동물 모델을 대상으로 인 비보(in vivo)에서 3종 항체의 투여에 의하여 종양의 크기가 감소되는지 여부를 확인하였다.
마우스 동물 모델은 5 x 106개의 U87MG 뇌암 세포 또는 MKN45 위암 세포 50 ㎕를 6주령의 웅성 BALB/C 누드 마우스(㈜ 오리엔트 바이오)에 피하주사하여 1주 경과 후에 암이 발생되는 마우스를 각 그룹당 12마리씩을 무작위 선별하여 실험에 사용하였다. 3종 항체는 암세포가 생성되고 정맥주사에 의해 10 mg/kg의 농도만큼 주 1회 마우스에 투여하였다. 또한, 대조군으로 마우스 AbF46 항체는 복강주사에 의해 10 mg/kg과 20 mg/kg의 농도로 주 2회 투여하였다.
도 10a 및 도 10b에서 나타낸 바와 같이, U87MG 뇌암 또는 MKN45 위암 마우스 동물 모델에서 두 항체 모두 확연한 종양 성장 억제 효능을 보였으며, 통계적으로 유의한 차이는 없었다.
한국세포주연구재단 KCLRFBP00220 20091006
<110> Samsung Electronics Co. Ltd <120> Anti c-Met antibody and uses thereof <130> DPP20125926KR <150> KR2011-101293 <151> 2011-10-05 <150> KR2012-0074691 <151> 2012-07-09 <160> 73 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> heavy chain CDR1 of AbF46 <400> 1 Asp Tyr Tyr Met Ser 1 5 <210> 2 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> heavy chain CDR2 of AbF46 <400> 2 Phe Ile Arg Asn Lys Ala Asn Gly Tyr Thr Thr Glu Tyr Ser Ala Ser 1 5 10 15 Val Lys Gly <210> 3 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> heavy chain CDR3 of AbF46 <400> 3 Asp Asn Trp Phe Ala Tyr 1 5 <210> 4 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> heavy chain CDR1 of c-Met antibody <220> <221> UNSURE <222> (1) <223> X is Pro or Ser <220> <221> UNSURE <222> (2) <223> X is Glu or Asp <400> 4 Xaa Xaa Tyr Tyr Met Ser 1 5 <210> 5 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> heavy chain CDR2 of c-Met antibody <220> <221> UNSURE <222> (3) <223> X is Asn or Lys <220> 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accgtcagtc 720 ttcctcttcc ccccaaaacc caaggacacc ctcatgatct cccggacccc tgaggtcaca 780 tgcgtggtgg tggacgtgag ccacgaagac cctgaggtca agttcaactg gtacgtggac 840 ggcgtggagg tgcataatgc caagacaaag ccgcgggagg agcagtacaa cagcacgtac 900 cgtgtggtca gcgtcctcac cgtcctgcac caggactggc tgaatggcaa ggagtacaag 960 tgcaaggtct ccaacaaagc cctcccagcc cccatcgaga aaaccatctc caaagccaaa 1020 gggcagcccc gagaaccaca ggtgtacacc ctgcccccat cccgggagga gatgaccaag 1080 aaccaggtca gcctgacctg cctggtcaaa ggcttctatc ccagcgacat cgccgtggag 1140 tgggagagca atgggcagcc ggagaacaac tacaagacca cgcctcccgt gctggactcc 1200 gacggctcct tcttcctcta cagcaagctc accgtggaca agagcaggtg gcagcagggg 1260 aacgtcttct catgctccgt gatgcatgag gctctgcaca accactacac gcagaagagc 1320 ctctccctgt ctccgggtaa atgactcgag 1350 <210> 49 <211> 1350 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleotide sequence of H4-heavy <400> 49 gaggttcagc tggtggagtc tggcggtggc ctggtgcagc cagggggctc actccgtttg 60 tcctgtgcag cttctggctt caccttcact gattactaca tgagctgggt 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aacgccattt aatctaagcg catcaccaac attttctggc gtcagtccac 2160 cagctaacat aaaatgtaag ctctcggggc tctcttgcct tccaacccag tcagaaatcg 2220 agttccaatc caaaagttca cctgtcccac ctgcttctga atcaaacaag ggaataaacg 2280 aatgaggttt ctgtgaagct gcactgagta gtatgttgca gtcttttgga aatacgagtc 2340 ttttaataac tggcaaaccg aggaactctt ggtattcttg ccacgactca tctccgtgca 2400 gttggacgat atcaatgccg taatcattga ccagagccaa aacatcctcc ttaggttgat 2460 tacgaaacac gccaaccaag tatttcggag tgcctgaact atttttatat gcttttacaa 2520 gacttgaaat tttccttgca ataaccgggt caattgttct ctttctattg ggcacacata 2580 taatacccag caagtcagca tcggaatcta gagcacattc tgcggcctct gtgctctgca 2640 agccgcaaac tttcaccaat ggaccagaac tacctgtgaa attaataaca gacatactcc 2700 aagctgcctt tgtgtgctta atcacgtata ctcacgtgct caatagtcac caatgccctc 2760 cctcttggcc ctctcctttt cttttttcga ccgaatttct tgaagacgaa agggcctcgt 2820 gatacgccta tttttatagg ttaatgtcat gataataatg gtttcttagg acggatcgct 2880 tgcctgtaac ttacacgcgc ctcgtatctt ttaatgatgg aataatttgg gaatttactc 2940 tgtgtttatt tatttttatg ttttgtattt ggattttaga aagtaaataa agaaggtaga 3000 agagttacgg aatgaagaaa aaaaaataaa caaaggttta aaaaatttca acaaaaagcg 3060 tactttacat atatatttat tagacaagaa aagcagatta aatagatata cattcgatta 3120 acgataagta aaatgtaaaa tcacaggatt ttcgtgtgtg gtcttctaca cagacaagat 3180 gaaacaattc ggcattaata cctgagagca ggaagagcaa gataaaaggt agtatttgtt 3240 ggcgatcccc ctagagtctt ttacatcttc ggaaaacaaa aactattttt tctttaattt 3300 ctttttttac tttctatttt taatttatat atttatatta aaaaatttaa attataatta 3360 tttttatagc acgtgatgaa aaggacccag gtggcacttt tcggggaaat gtgcgcggaa 3420 cccctatttg tttatttttc taaatacatt caaatatgta tccgctcatg agacaataac 3480 cctgataaat gcttcaataa tattgaaaaa ggaagagtat gagtattcaa catttccgtg 3540 tcgcccttat tccctttttt gcggcatttt gccttcctgt ttttgctcac ccagaaacgc 3600 tggtgaaagt aaaagatgct gaagatcagt tgggtgcacg agtgggttac atcgaactgg 3660 atctcaacag cggtaagatc cttgagagtt ttcgccccga agaacgtttt ccaatgatga 3720 gcacttttaa agttctgcta tgtggcgcgg tattatcccg tgttgacgcc gggcaagagc 3780 aactcggtcg ccgcatacac tattctcaga atgacttggt tgagtactca ccagtcacag 3840 aaaagcatct tacggatggc atgacagtaa gagaattatg cagtgctgcc ataaccatga 3900 gtgataacac tgcggccaac ttacttctga caacgatcgg aggaccgaag gagctaaccg 3960 cttttttgca caacatgggg gatcatgtaa ctcgccttga tcgttgggaa ccggagctga 4020 atgaagccat accaaacgac gagcgtgaca ccacgatgcc tgtagcaatg gcaacaacgt 4080 tgcgcaaact attaactggc gaactactta ctctagcttc ccggcaacaa ttaatagact 4140 ggatggaggc ggataaagtt gcaggaccac ttctgcgctc ggcccttccg gctggctggt 4200 ttattgctga taaatctgga gccggtgagc gtgggtctcg cggtatcatt gcagcactgg 4260 ggccagatgg taagccctcc cgtatcgtag ttatctacac gacgggcagt caggcaacta 4320 tggatgaacg aaatagacag atcgctgaga taggtgcctc actgattaag cattggtaac 4380 tgtcagacca agtttactca tatatacttt agattgattt aaaacttcat ttttaattta 4440 aaaggatcta ggtgaagatc ctttttgata atctcatgac caaaatccct taacgtgagt 4500 tttcgttcca ctgagcgtca gaccccgtag aaaagatcaa aggatcttct tgagatcctt 4560 tttttctgcg cgtaatctgc tgcttgcaaa caaaaaaacc accgctacca gcggtggttt 4620 gtttgccgga tcaagagcta ccaactcttt ttccgaaggt aactggcttc agcagagcgc 4680 agataccaaa tactgtcctt ctagtgtagc cgtagttagg ccaccacttc aagaactctg 4740 tagcaccgcc tacatacctc gctctgctaa tcctgttacc agtggctgct gccagtggcg 4800 ataagtcgtg tcttaccggg ttggactcaa gacgatagtt accggataag gcgcagcggt 4860 cgggctgaac ggggggttcg tgcacacagc ccagcttgga gcgaacgacc tacaccgaac 4920 tgagatacct acagcgtgag cattgagaaa gcgccacgct tcccgaaggg agaaaggcgg 4980 acaggtatcc ggtaagcggc agggtcggaa caggagagcg cacgagggag cttccagggg 5040 ggaacgcctg gtatctttat agtcctgtcg ggtttcgcca cctctgactt gagcgtcgat 5100 ttttgtgatg ctcgtcaggg gggccgagcc tatggaaaaa cgccagcaac gcggcctttt 5160 tacggttcct ggccttttgc tggccttttg ctcacatgtt ctttcctgcg ttatcccctg 5220 attctgtgga taaccgtatt accgcctttg agtgagctga taccgctcgc cgcagccgaa 5280 cgaccgagcg cagcgagtca gtgagcgagg aagcggaaga gcgcccaata cgcaaaccgc 5340 ctctccccgc gcgttggccg attcattaat gcagctggca cgacaggttt cccgactgga 5400 aagcgggcag tgagcgcaac gcaattaatg tgagttacct cactcattag gcaccccagg 5460 ctttacactt tatgcttccg gctcctatgt tgtgtggaat tgtgagcgga taacaatttc 5520 acacaggaaa cagctatgac catgattacg ccaagctcgg aattaaccct cactaaaggg 5580 aacaaaagct ggctagt 5597 <210> 57 <211> 13 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> U6-HC7 hinge <400> 57 Glu Pro Lys Ser Cys Asp Cys His Cys Pro Pro Cys Pro 1 5 10 <210> 58 <211> 435 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> polynucleotide encoding CDR-L3 derived from L3-1 clone <400> 58 gaattcacta gtgattaatt cgccgccacc atggattcac aggcccaggt cctcatgttg 60 ctgctgctat cggtatctgg tacctgtgga gatatccaga tgacccagtc cccgagctcc 120 ctgtccgcct ctgtgggcga tagggtcacc atcacctgca agtccagtca gagtctttta 180 gctagtggca accaaaataa ctacttggcc tggcaccaac agaaaccagg aaaagctccg 240 aaaatgctga ttatttgggc atccactagg gtatctggag tcccttctcg cttctctgga 300 tccgggtctg ggacggattt cactctgacc atcagcagtc tgcagccgga agacttcgca 360 acttattact gtcagcagtc ctacagccgc ccgtacacgt tcggacaggg taccaaggtg 420 gagatcaaac gtacg 435 <210> 59 <211> 435 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> polynucleotide encoding CDR-L3 derived from L3-2 clone <400> 59 gaattcacta gtgattaatt cgccgccacc atggattcac aggcccaggt cctcatgttg 60 ctgctgctat cggtatctgg tacctgtgga gatatccaga tgacccagtc cccgagctcc 120 ctgtccgcct ctgtgggcga tagggtcacc atcacctgca agtccagtca gagtctttta 180 gctagtggca accaaaataa ctacttggcc tggcaccaac agaaaccagg aaaagctccg 240 aaaatgctga ttatttgggc atccactagg gtatctggag tcccttctcg cttctctgga 300 tccgggtctg ggacggattt cactctgacc atcagcagtc tgcagccgga agacttcgca 360 acttattact gtgggcagtc ctacagccgt ccgctcacgt tcggacaggg taccaaggtg 420 gagatcaaac gtacg 435 <210> 60 <211> 435 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> polynucleotide encoding CDR-L3 derived from L3-3 clone <400> 60 gaattcacta gtgattaatt cgccgccacc atggattcac aggcccaggt cctcatgttg 60 ctgctgctat cggtatctgg tacctgtgga gatatccaga tgacccagtc cccgagctcc 120 ctgtccgcct ctgtgggcga tagggtcacc atcacctgca agtccagtca gagtctttta 180 gctagtggca accaaaataa ctacttggcc tggcaccaac agaaaccagg aaaagctccg 240 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420 agcaccaagg gcccatcggt cttccccctg gcaccctcct ccaagagcac ctctgggggc 480 acagcggccc tgggctgcct ggtcaaggac tacttccccg aaccggtgac ggtgtcgtgg 540 aactcaggcg ccctgaccag cggcgtgcac accttcccgg ctgtcctaca gtcctcagga 600 ctctactccc tcagcagcgt ggtgaccgtg ccctccagca gcttgggcac ccagacctac 660 atctgcaacg tgaatcacaa gcccagcaac accaaggtgg acaagaaagt tgagcccaaa 720 agctgcgatt gccactgtcc tccatgtcca gcacctgaac tcctgggggg accgtcagtc 780 ttcctcttcc ccccaaaacc caaggacacc ctcatgatct cccggacccc tgaggtcaca 840 tgcgtggtgg tggacgtgag ccacgaagac cctgaggtca agttcaactg gtacgtggac 900 ggcgtggagg tgcataatgc caagacaaag ccgcgggagg agcagtacaa cagcacgtac 960 cgtgtggtca gcgtcctcac cgtcctgcac caggactggc tgaatggcaa ggagtacaag 1020 tgcaaggtct ccaacaaagc cctcccagcc cccatcgaga aaaccatctc caaagccaaa 1080 gggcagcccc gagaaccaca ggtgtacacc ctgcccccat cccgggagga gatgaccaag 1140 aaccaggtca gcctgacctg cctggtcaaa ggcttctatc ccagcgacat cgccgtggag 1200 tgggagagca atgggcagcc ggagaacaac tacaagacca cgcctcccgt gctggactcc 1260 gacggctcct 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actacatgag ctgggtgcgt 180 caggccccgg gtaagggcct ggaatggttg ggttttatta gaaacaaagc taatggttac 240 acaacagagt acagtgcatc tgtgaagggt cgtttcacta taagcagaga taattccaaa 300 aacacactgt acctgcagat gaacagcctg cgtgctgagg acactgccgt ctattattgt 360 gctagagata actggtttgc ttactggggc caagggactc tggtcaccgt ctcctcggct 420 agcaccaagg gcccatcggt cttccccctg gcaccctcct ccaagagcac ctctgggggc 480 acagcggccc tgggctgcct ggtcaaggac tacttccccg aaccggtgac ggtgtcgtgg 540 aactcaggcg ccctgaccag cggcgtgcac accttcccgg ctgtcctaca gtcctcagga 600 ctctactccc tcagcagcgt ggtgaccgtg ccctccagca gcttgggcac ccagacctac 660 atctgcaacg tgaatcacaa gcccagcaac accaaggtgg acaagaaagt tgagaggaag 720 tgctgtgtgg agtgcccccc ctgcccagca cctgaactcc tggggggacc gtcagtcttc 780 ctcttccccc caaaacccaa ggacaccctc atgatctccc ggacccctga ggtcacatgc 840 gtggtggtgg acgtgagcca cgaagaccct gaggtcaagt tcaactggta cgtggacggc 900 gtggaggtgc ataatgccaa gacaaagccg cgggaggagc agtacaacag cacgtaccgt 960 gtggtcagcg tcctcaccgt cctgcaccag gactggctga atggcaagga 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caggaccgtc agtcttcctc 780 ttccccccaa aacccaagga caccctcatg atctcccgga cccctgaggt cacgtgcgtg 840 gtggtggacg tgagccacga agaccccgag gtccagttca actggtacgt ggacggcgtg 900 gaggtgcata atgccaagac aaagccacgg gaggagcagt tcaacagcac gttccgtgtg 960 gtcagcgtcc tcaccgttgt gcaccaggac tggctgaacg gcaaggagta caagtgcaag 1020 gtctccaaca aaggcctccc agcccccatc gagaaaacca tctccaaaac caaagggcag 1080 ccccgagaac cacaggtgta caccctgccc ccatcccggg aggagatgac caagaaccag 1140 gtcagcctga cctgcctggt caaaggcttc taccccagcg acatcgccgt ggagtgggag 1200 agcaatgggc agccggagaa caactacaag accacgcctc ccatgctgga ctccgacggc 1260 tccttcttcc tctacagcaa gctcaccgtg gacaagagca ggtggcagca ggggaacgtc 1320 ttctcatgct ccgtgatgca tgaggctctg cacaaccact acacgcagaa gagcctctcc 1380 ctgtctccgg gtaaatgact cgag 1404 <210> 68 <211> 240 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> polypeptide consisting of light chain of huAbF46-H4-A1(H36Y) and human kappa constant region <220> <221> SIGNAL <222> (1)..(20) <223> signal peptide <400> 68 Met Asp Ser Gln Ala Gln Val Leu Met Leu Leu Leu Leu Ser Val Ser 1 5 10 15 Gly Thr Cys Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser 20 25 30 Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser 35 40 45 Leu Leu Ala Ser Gly Asn Gln Asn Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln 50 55 60 Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Met Leu Ile Ile Trp Ala Ser Thr Arg 65 70 75 80 Val Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp 85 90 95 Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr 100 105 110 Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Arg Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr 115 120 125 Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe 130 135 140 Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys 145 150 155 160 Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val 165 170 175 Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln 180 185 190 Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser 195 200 205 Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His 210 215 220 Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys 225 230 235 240 <210> 69 <211> 758 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> polynucleotide encoding polypeptide consisting of light chain of huAbF46-H4-A1(H36Y) and human kappa constant region <400> 69 aattcactag tgattaattc gccgccacca tggattcaca ggcccaggtc ctcatgttgc 60 tgctgctatc ggtatctggt acctgtggag atatccagat gacccagtcc ccgagctccc 120 tgtccgcctc tgtgggcgat agggtcacca tcacctgcaa gtccagtcag agtcttttag 180 ctagtggcaa ccaaaataac tacttggcct ggtaccaaca gaaaccagga aaagctccga 240 aaatgctgat tatttgggca tccactaggg tatctggagt cccttctcgc ttctctggat 300 ccgggtctgg gacggatttc actctgacca tcagcagtct gcagccggaa gacttcgcaa 360 cttattactg tcagcagtcc tacagccgcc cgtacacgtt cggacagggt accaaggtgg 420 agatcaaacg tacggtggct gcaccatctg tcttcatctt cccgccatct gatgagcagt 480 tgaaatctgg aactgcctct gttgtgtgcc tgctgaataa cttctatccc agagaggcca 540 aagtacagtg gaaggtggat aacgccctcc aatcgggtaa ctcccaggag agtgtcacag 600 agcaggacag caaggacagc acctacagcc tcagcagcac cctgacgctg agcaaagcag 660 actacgagaa acacaaagtc tacgcctgcg aagtcaccca tcagggcctg agctcgcccg 720 tcacaaagag cttcaacagg ggagagtgtt gactcgag 758 <210> 70 <211> 240 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> polypeptide consisting of light chain of huAbF46-H4-A1 and human kappa constant region <220> <221> SIGNAL <222> (1)..(20) <223> signal peptide <400> 70 Met Asp Ser Gln Ala Gln Val Leu Met Leu Leu Leu Leu Ser Val Ser 1 5 10 15 Gly Thr Cys Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser 20 25 30 Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser 35 40 45 Leu Leu Ala Ser Gly Asn Gln Asn Asn His Leu Ala Trp Tyr Gln Gln 50 55 60 Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Met Leu Ile Ile Trp Ala Ser Thr Arg 65 70 75 80 Val Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp 85 90 95 Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr 100 105 110 Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Arg Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr 115 120 125 Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe 130 135 140 Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys 145 150 155 160 Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val 165 170 175 Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln 180 185 190 Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser 195 200 205 Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His 210 215 220 Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys 225 230 235 240 <210> 71 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> CDR-L1 of antibody L3-11Y <400> 71 Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ala Trp Gly Asn Gln Asn Asn Tyr Leu 1 5 10 15 Ala <210> 72 <211> 114 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> amino acid sequence of light chain variable region of antibody L3-11Y <400> 72 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ala Trp 20 25 30 Gly Asn Gln Asn Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys 35 40 45 Ala Pro Lys Met Leu Ile Ile Trp Ala Ser Thr Arg Val Ser Gly Val 50 55 60 Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 65 70 75 80 Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln 85 90 95 Ser Tyr Ser Arg Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile 100 105 110 Lys Arg <210> 73 <211> 220 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> amino acid sequence of light chain of antibody L3-11Y <400> 73 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ala Trp 20 25 30 Gly Asn Gln Asn Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys 35 40 45 Ala Pro Lys Met Leu Ile Ile Trp Ala Ser Thr Arg Val Ser Gly Val 50 55 60 Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 65 70 75 80 Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln 85 90 95 Ser Tyr Ser Arg Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile 100 105 110 Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp 115 120 125 Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn 130 135 140 Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu 145 150 155 160 Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp 165 170 175 Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr 180 185 190 Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser 195 200 205 Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys 210 215 220

Claims (22)

  1. 서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H1, 서열번호 5의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H2 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H3으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 중쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역; 및
    서열번호 7의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L1, 서열번호 8의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L2 및 서열번호 9의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L3으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 경쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하고,
    상기 서열번호 4 내지 서열번호 9는 각각 하기 일반식 Ⅰ 내지 일반식 Ⅵ으로 표시되는 아미노산 서열인 것인,
    항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편:
    일반식 Ⅰ
    Xaa1-Xaa2-Tyr-Tyr-Met-Ser (서열번호 4)
    일반식 Ⅱ
    Arg-Asn-Xaa3-Xaa4-Asn-Gly-Xaa5-Thr (서열번호 5)
    일반식 Ⅲ
    Asp-Asn-Trp-Leu-Xaa6-Tyr (서열번호 6)
    일반식 Ⅳ
    Lys-Ser-Ser-Xaa7-Ser-Leu-Leu-Ala-Xaa8-Gly-Asn-Xaa9-Xaa10-Asn-Tyr-Leu-Ala (서열번호 7)
    일반식 Ⅴ
    Trp-Xaa11-Ser-Xaa12-Arg-Val-Xaa13 (서열번호 8)
    일반식 Ⅵ
    Xaa14-Gln-Ser-Tyr-Ser-Xaa15-Pro-Xaa16-Thr (서열번호 9)
    상기 일반식 Ⅰ에서, Xaa1은 존재하지 않거나 Pro 또는 Ser이고, Xaa2는 Glu 또는 Asp이며,
    상기 일반식 Ⅱ에서, Xaa3은 Asn 또는 Lys이며, Xaa4는 Ala 또는 Val이고, Xaa5는 Asn 또는 Thr이며,
    상기 일반식 Ⅲ에서, Xaa6은 Ser 또는 Thr이고,
    상기 일반식 Ⅳ에서, Xaa7은 His, Arg, Gln 또는 Lys이고, Xaa8은 Ser 또는 Trp이고, Xaa9은 His 또는 Gln이며, Xaa10는 Lys 또는 Asn이고,
    상기 일반식 Ⅴ에서, Xaa11은 Ala 또는 Gly이며, Xaa12은 Thr 또는 Lys이고, Xaa13는 Ser 또는 Pro이며,
    상기 일반식 Ⅵ에서, Xaa14은 Gly, Ala 또는 Gln이고, Xaa15는 Arg, His, Ser, Ala, Gly 또는 Lys이며, Xaa16는 Leu, Tyr, Phe 또는 Met이다.
  2. 제1항에 있어서, 상기 CDR-H1은 서열번호 22 내지 서열번호 24의 아미노산 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 폴리펩티드인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  3. 제1항에 있어서, 상기 CDR-H2는 서열번호 25 또는 서열번호 26의 아미노산 서열로 표시되는 폴리펩티드인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  4. 제1항에 있어서, 상기 CDR-H3는 서열번호 27 또는 서열번호 28의 아미노산 서열로 표시되는 폴리펩티드인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  5. 제1항에 있어서, 상기 CDR-L1은 서열번호 29 내지 서열번호 33 및 서열번호 71의 아미노산 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 폴리펩티드인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  6. 제1항에 있어서, 상기 CDR-L2는 서열번호 34 내지 서열번호 36의 아미노산 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 폴리펩티드인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  7. 제1항에 있어서, 상기 CDR-L3는 서열번호 13 내지 서열번호 16의 아미노산 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 폴리펩티드 또는 서열번호 37의 아미노산 서열로 표시되는 폴리펩티드인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  8. 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H1, 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H2 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖는 CDR-H3으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 중쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역; 및
    서열번호 7의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L1, 서열번호 8의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L2 및 서열번호 9의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L3으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 경쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하고,
    상기 서열번호 7 내지 서열번호 9는 각각 하기 일반식 Ⅳ 내지 일반식 Ⅵ으로 표시되는 아미노산 서열인 것인
    항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편:
    일반식 Ⅳ
    Lys-Ser-Ser-Xaa7-Ser-Leu-Leu-Ala-Xaa8-Gly-Asn-Xaa9-Xaa10-Asn-Tyr-Leu-Ala (서열번호 7)
    일반식 Ⅴ
    Trp-Xaa11-Ser-Xaa12-Arg-Val-Xaa13 (서열번호 8)
    일반식 Ⅵ
    Xaa14-Gln-Ser-Tyr-Ser-Xaa15-Pro-Xaa16-Thr (서열번호 9)
    상기 일반식 Ⅳ에서, Xaa7은 His, Arg, Gln 또는 Lys이고, Xaa8은 Ser 또는 Trp이고, Xaa9은 His 또는 Gln이며, Xaa10는 Lys 또는 Asn이고,
    상기 일반식 Ⅴ에서, Xaa11은 Ala 또는 Gly이며, Xaa12은 Thr 또는 Lys이고, Xaa13는 Ser 또는 Pro이며,
    상기 일반식 Ⅵ에서, Xaa14은 Gly, Ala 또는 Gln이고, Xaa15는 Arg, His, Ser, Ala, Gly 또는 Lys이며, Xaa16는 Leu, Tyr, Phe 또는 Met이다.
  9. 제8항에 있어서, 상기 경쇄 가변 영역은 서열번호 10 또는 서열번호 71의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L1, 서열번호 11의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L2 및 서열번호 13 내지 서열번호 16으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나의 아미노산 서열을 갖는 CDR-L3로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 경쇄 상보성 결정 영역의 아미노산 서열을 포함하는 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  10. 제8항에 있어서, 상기 중쇄 가변 영역은 서열번호 17의 아미노산 서열로 이루어지고, 상기 경쇄 가변 영역은 서열번호 18 내지 서열번호 21 및 서열번호 72로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나의 아미노산 서열로 이루어진 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  11. 제8항에 있어서, 상기 항 c-Met 항체는 서열번호 62의 18번째부터 462번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 68의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체, 서열번호 64의 18번째부터 461번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 68의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체, 또는 서열번호 66의 18번째부터 460번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 68의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  12. 제8항에 있어서, 상기 항 c-Met 항체는 서열번호 62의 18번째부터 462번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 70의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체, 서열번호 64의 18번째부터 461번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 70의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체, 또는 서열번호 66의 18번째부터 460번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 70의 21번째부터 240번째까지의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  13. 제8항에 있어서, 상기 항 c-Met 항체는 서열번호 62의 18번째부터 462번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 73의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체, 서열번호 64의 18번째부터 461번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 73의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체, 또는 서열번호 66의 18번째부터 460번째까지의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열번호 73의 아미노산 서열을 갖는 경쇄로 이루어진 항체인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  14. 서열번호 71의 경쇄 상보성결정영역, 서열번호 72의 경쇄 가변영역, 또는 서열번호 73의 경쇄를 포함하는 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  15. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체는 단일클론 항체인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  16. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체는 마우스 유래 항체, 마우스-인간 키메릭 항체 또는 인간화 항체인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  17. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체는 scFv, (scFv)2, Fab, Fab' 및 F(ab')2로 이루어진 군으로부터 선택되는 것인 항원 결합 단편인 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  18. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 c-Met 단백질은 인간, 원숭이, 마우스, 및 래트로 이루어진 군으로부터 선택되는 단백질로부터 유래된 것인 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  19. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항의 항 c-Met 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량; 및 약학적으로 허용되는 담체, 희석제, 또는 부형제를 포함하는 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
  20. 제19항에 있어서, 상기 암은 편평상피세포암, 소세포폐암, 비소세포폐암, 폐의 선암, 폐의 편평상피암, 복막암, 피부암, 피부 또는 안구내 흑색종, 직장암, 항문부근암, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부갑상선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 만성 또는 급성 백혈병, 림프구 림프종, 위장암, 췌장암, 교아종, 경부암, 난소암, 간암, 방광암, 유방암, 결장암, 대장암, 자궁내막 또는 자궁암, 침샘암, 신장암, 전립선암, 음문암, 갑상선암, 및 두경부암으로 이루어진 군으로부터 선택되는 것인 약학적 조성물.
  21. 제19항에 있어서, 상기 항체는 c-Met 단백질의 길항제(antagonist) 작용을 하는 것인 약학적 조성물.
  22. 서열번호 71의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드.
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