KR102288394B1 - 스타필로코커스 아우레우스 표면 결정인자에 대한 항체 - Google Patents

스타필로코커스 아우레우스 표면 결정인자에 대한 항체 Download PDF

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Abstract

스타필로코커스 아우레우스(Staphylococcus aureus)(에스. 아우레우스(S. aureus)) 표면 결정인자 항원에 대한 항체 및 이의 항원 결합 단편, 및 분비된 독소에도 결합하는 상기 항체 또는 결합 단편을 포함하는 이중특이적 항체를 개시한다. 상기 항체 및 항원 결합 단편을 이용하여 에스. 아우레우스를 검출, 진단 및 치료하는 방법을 또한 제공한다. 추가로, 상기 항체의 중쇄 가변 영역(VH) 및 경쇄 가변 영역(VL) 서열을 개시한다.

Description

스타필로코커스 아우레우스 표면 결정인자에 대한 항체{ANTIBODIES TO S. AUREUS SURFACE DETERMINANTS}
본 발명은 일반적으로 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococcus aureus)(에스. 아우레우스(S. aureus)) 표면 결정인자에 결합하는 항체 및 에스. 아우레우스의 분비 독소에 결합하는 항체에 관한 것이다. 본 발명은 또한 에스. 아우레우스 분비 독소에 결합하는 항체와 함께 에스. 아우레우스 표면 결정인자에 결합하는 항체의 조합물, 이러한 항체의 조합물을 포함하는 조성물, 및 이러한 항체 조합물을 투여하는 단계를 포함하는 에스. 아우레우스 관련 질병의 예방 방법에 관한 것이다.
스타필로코커스 아우레우스는 통상적으로 건강한 인간의 코 및 피부에 군집하는 그람 양성의 호기성인 응집체-형성 구균 박테리아이다. 개체군의 대략 20-30%는 임의의 소정 시점에 에스. 아우레우스로 군집화된다. 스타필로코커스 아우레우스 박테리아는 때때로 "스타프", "스타프. 아우 레우스" 또는 "에스. 아우레우스"라고도하며, 가벼운 감염(예를 들면, 여드름, 종기 및 다른 연조직 감염) 및 전신 감염(예를 들면, 폐렴, 패혈증, 골수염, 및 심장내막염)을 초래하는 기회 감염균으로 여겨진다.
점막 및 상피 장벽(피부)은 정상적으로 에스. 아우레우스에 대해 보호된다. 상처(예를 들어, 화상, 외상, 및 외과적 처치 등)로 인한 이들 천연 장벽의 파괴는 감염 위험성을 급격하게 증가시킨다. 면역계를 위협하는 질환(예를 들면, 당뇨병, 말기 신장 질환, 및 암)이 또한 감염 위험성이 증가한다. 기회종 에스. 아우레우스 감염은 다양한 질환이나 병태를 야기하여 심각해질 수 있고, 이의 비제한적인 예로는 균혈증, 봉와직염, 눈꺼풀 감염증, 식중독, 관절 감염증, 피부 감염증, 화상 피부 증후군, 독성 쇼크 증후군, 폐렴, 골수염, 심장내막염, 뇌수막염 및 농양 형성이 포함된다.
에스. 아우레우스는 세린-아스파르트산 반복 단백질 SdrC, SdrD, 및 SdrE, 응집 인자 단백질 ClfA 및 ClfB, 철 조절 표면 결정인자 단백질 IsdA, IsdB, IsdC, IsdE 및 IsdH, 에스. 아우레우스 단백질 A(SpA) 및 다당류 폴리-N-아세틸글루코사민(PNAG)을 포함한, 다수의 표면 결정인자 항원을 발현한다. 이들 표면 항원은 숙주 조직의 군집화, 숙주 면역 반응 회피, 및 박테리아 건강성에서 역할을 담당한다. ClfA, SpA, IsdA, IsdB, 및 IsdH에 대한 돌연변이는 에스. 아우레우스 병독성을 감소시키는 것으로 확인되었다.
IsdH와 같은 단백질은 일정 숙주 면역 반응, 예컨대 에스. 아우레우스가 감염을 일으키는 데 결정적인 과정인, 호중구 매개 식작용을 회피하기 위한 에스. 아우레우스의 능력에서 역할을 한다. IsdH는 철 제한 조건 하에서 활성화되어, 헤모글로빈 및 햅토글로빈-헤모글로빈 복합체에 결합한 후 헴을 추출해 세포질로 수송하는 데 작용하는, 복합체의 일부분이다. 3개의 N-말단 NEAr 트랜스포터(NEAT) 모티프가 IsdH 내에 존재하며, NEAT1의 확인된 구조는 이 모티프 내 일부 잔기가 리간드 결합에 관여함을 보여준다. 에스. 아우레우스의 IsdH-결핍 돌연변이체는 야생형과 비교하여 병독성이 감소된 것으로 확인되었고, 혈청 옵소닌 존재 하에서 인간 호중구에 의해 보다 신속하게 사로잡는다. IsdH의 보호 기전은 혈청 옵소닌 C3b의 가속된 분해로부터 기인하는 것으로 나타난다. 따라서, IsdH는 에스. 아우레우스 유기체의 항식작용 특성에서 역할을 한다.
ClfA는 피브리노겐에 결합하는 병독성 인자이다. ClfA의 이러한 기능은 에스. 아우레우스의 항식작용 특성에 더욱 기여하는 것으로 보인다. 또한, ClfA는 혈액 내 에스. 아우레우스 응집 및 생물질 표면에 생물막 형성을 촉진시킨다.
에스. 아우레우스는 또한 캡슐 다당류 및 단백질 독소를 포함하여, 몇몇 추가적인 병독성 인자를 발현한다. 에스. 아우레우스 감염과 종종 연관된 병독성 인자는 에스. 아우레우스의 대부분의 병원성 균주에 의해 생산되는 포어 형성 및 용혈성 세포외단백질인, 알파 독소(알파-헤모라이신 또는 Hla라고도 알려짐)이다. 이 독소는 감수성 세포, 예컨대 백혈구 세포, 혈소판, 적혈구, 말초 혈관 단핵구, 마크로파지, 케라티노사이트, 섬유아세포 및 내피 세포의 막에 헵타머 포어를 형성한다. 알파 독소 포어 형성은 종종 세포 기능이상 및 용해를 일으킨다. 또한 상피 및 내피 밀착 연결의 파괴 및 면역 조절장애를 초래할 수 있다.
최근에, 에스. 아우레우스는 미국에서 감염 관련 사망률의 주된 원인이고, 병원 감염의 주요 원인이다. 또한, 에스. 아우레우스에 대해 증가하는 항생제 내성이 문제를 더 악화시켰다. 따라서, 병용 항체 요법을 포함하여, 에스. 아우레우스 감염을 진단하고 치료하는 효과적인 대체 방법을 개발하는 것이 바람직하다.
각각의 내용을 본원에 참조하여 포함시키는, 미국 가출원 제61/440,581호 및 국제 특허 출원 제PCT/US2012/024201호(WO2012/109205로 공개됨)에 이전에 개시된 바와 같이, 에스. 아우레우스 알파 독소에 결합하는 항체는 쥣과동물 피부괴사 모델에서 CA-MRSA 질환의 심각성을 감소시키고 스타필로코커스 폐렴의 마우스 모델에서 박테리아 제거를 촉진시키는 것으로 확인되었다. 따라서, 이러한 항체는 다양한 에스. 아우레우스 관련 질환의 치료에 활용될 수 있다.
에스. 아우레우스 알파-독소에 결합하는 항체 이외에도, 본 발명은 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 대한 항체를 비롯하여, 이의 조합물을 제공한다. 본 발명은 이러한 항체를 포함하는 조성물 또는 이러한 항체의 조합물뿐만 아니라, 이러한 항체 또는 이러한 항체의 조합물을 이용해 에스. 아우레우스 연관 질환을 예방 및/또는 치료하는 방법을 제공한다. 에스. 아우레우스 알파-독소에 결합하는 항체를 이용하여 에스. 아우레우스 연관 질환을 예방 및/또는 치료하는 방법은 그 내용을 참조하여 본원에 편입시키는 미국 가출원 제61/440,581호 및 국제 특허 출원 제PCT/US2012/024201호(WO2012/109205로 공개됨)와 또한 그 내용을 본원에 참조하여 편입시키는 "에스. 아우레우스 연관 질환의 치료 방법"이라는 명칭으로 셀먼 등이 본 출원과 동시에 출원한 미국 가출원에 기술되어 있다.
본 발명은 또한 에스. 아우레우스 알파 독소에 결합하는 항체와 조합하여 에스. 아우레우스 표면 결정인자에 결합하는 항체와 같은, 항체의 특정 조합물을 제공하며, 이러한 조합물은 함께 상승적으로 작용한다. 본 발명은 또한 직접적인 숙주 세포 손상에 관여하는 에스. 아우레우스 분비 독소를 표적으로 하는 항체와 함께 숙주의 옵소닌에 의한 식작용 기능(opsonophagocytic function) 회피에 관여하는 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원을 표적으로 하는 항체를 조합하여 제공한다.
도 1은 에스. 아우레우스 균주 뉴만 및 USA300으로 검사 시, 대조군 항체 R347에 의해 유도된 옵소닌에 의한 식작용 사멸(OPK) 비율과 비교한 항-IsdH 항체 B11, 2F4 및 A7에 의해 유도된 OPK의 백분율을 도시한 도면이다.
도 2는 에스. 아우레우스 균주 ARC2081 및 USA300를 이용 시, 대조군 항체 R327과 비교한 항-IsdH 항체 B11, 2F4, A7 및 1C1의 결합을 도시한 도면이다.
도 3a는 대조군 항체 R347 및 Hp 간의 경쟁적 결합과 비교한, IsdH 상의 서브유닛 Neat-1과의 결합에 대한 항체 1C1 및 햅토글로빈(Hp) 간의 경쟁적 결합을 도시한 그래프이다. 도 3b는 대조군 항체 R347 및 Hp 간의 경쟁적 결합과 비교한, IsdH 상의 서브유닛 Neat-2와의 결합에 대한 항체 2F4 및 Hp 간의 경쟁적 결합을 도시한 그래프이다.
도 4a는 항체 1C1 존재 하에서 마우스 균혈증 모델에서 측정된 에스. 아우레우스 콜로니 형성 유닛(CFU)의 농도를 도시한 도면이다. CFU 농도는 log10[CFU/ml]로 기록하였다. 도 4b는 항체 A7 존재 하에서 마우스 균혈증 모델에서 측청된 에스. 아우레우스 CFU의 농도를 도시한 도면이다. CFU 농도는 log10[CFU/ml]로 기록하였다. 도 4c는 항체 IsdH00016의 존재 하에서 마우스 균혈증 모델에서 측정된 에스. 아우레우스 CFU의 농도를 도시한 도면이다. CFU 농도는 log10[CFU/ml]로 기록하였다. 도 4d는 항체 IsdH003의 존재 하에서 마우스 균혈증 모델에서 측정된 에스. 아우레우스 CFU의 농도를 도시한 도면이다. CFU 농도는 log[CFU/ml]로 기록하였다.
도 5는 항체 2F4의 존재 하에서 마우스 균혈증 모델에서 측정된 에스. 아우레우스 콜로니 형성 유닛(CFU)의 농도를 도시한 도면이다. CFU 농도는 log10[CFU/ml]로 기록하였다.
도 6은 에스. 아우레우스 균주 ARC2379(USA100), ARC2081(USA200) 및 BAA-1556(USA 300)에서 T0, T1hr, 및 T4hr의 시점에, 대조군 항체 R347과 비교한 최대 결합에 대한 백분율로 측정된, 2F4 결합을 도시한 도면이다.
도 7a는 에스. 아우레우스 균주 뉴만으로 검사 시, 대조군 항체 R347에 의해 유도된 OPK 백분율과 비교한, 항체 2F4에 의해 유도된 OPK 백분율을 도시한 도면이다. 도 7b는 에스. 아우레우스 균주 ARC634로 검사 시, 대조군 항체 R347에 의해 유도된 OPK 백분율과 비교한, 항체 2F4에 의해 유도된 OPK 백분율을 도시한 도면이다. 도 7c는 에스. 아우레우스 균주 ARC2081(USA200)로 검사 시, 대조군 항체 R347에 의해 유도된 OPK 백분율과 비교한 항체 2F4에 의해 유도된 OPK 백분율을 도시한 도면이다. 도 7d는 에스. 아우레우스 균주 BAA-1556(USA300)로 검사 시, 대조군 항체 R347에 의해 유도된 OPK 백분율과 비교한 항체 2F4에 의해 유도된 OPK 백분율을 도시한 도면이다.
도 8은 hulgGFc 포획 분석법으로 IsdH 및 Neat-2와의 친화성에 대해 2F4를 평가한 도면이다.
도 9a는 2F4 단독, 2A3 단독 또는 2F4 및 2A3의 조합을 처리한 후 장기 부하량 모델에서 측정된 에스. 아우레우스 균주 USA300(2.05e8의 초기 농도로 투여)의 신장 CFU 농도를 도시한 도면이다. CFU 농도는 log10[CFU/장기]로 기록하였다. 도 9b는 2F4 단독, 2A3 단독 또는 2F4 및 2A3의 조합을 처리한 후 장기 부하량 모델에서 측정한 에스. 아우레우스 균주 USA300(2.05e8)의 신장 CFU 농도를 도시한 도면이다. CFU 농도는 log10[CFU/장기]로 기록하였다.
도 10은 항-ClfA 항체가 고정된 피브리노겐과 ClfA의 결합을 억제함을 보여주는 도면이다. 항-ClfA 항체 23D6, 27H4, 11H10은 대조군 R347과 비교하여 높은 피브리노겐과의 결합 억제율을 보여준다.
도 11은 항-ClfA 항체가 인간 혈장에서 에스. 아우레우스 응집을 억제함을 도시한 도면이다. 대조군 R327, mAb 미처리 및 ClfA 단백질과 비교하여 에스. 아우레우스의 3종의 상이한 균주(NR S112, BAA 1556 및 UAMS-1)의 응집을 억제하는 항-ClfA 항체 23D6, 27H4, 11H10의 능력을 검사하였다. 항-ClfA 항체 11H10는 이 분석에서 최대로 넓은 균주 범위를 나타내었다.
도 12는 항-ClfA 항체 11H10이 항-ClfA 항체 23D6 및 27H4와 비교하여 ClfA 상의 다른 에피토프에 결합함을 보여주는 도면이다.
도 13은 항-ClfA 항체 11H10 및 항-AT 항체 LC10가 심장에서의 박테리아 부하량을 감소시킴을 보여주는 도면이다.
도 14는 쥣과동물 패혈증 모델에서 항-ClfA 항체 11H10의 효과를 도시한 도면이다.
도 15는 CA-MRSA USA300 공격한 쥣과동물 패혈증 모델(IV 치사 공격)에서 항-ClfA 항체 11H10, 항-AT 항체 LC10 및 항-ClfA 항체 11H10과 항-AT 항체 LC10의 조합의 효과를 도시한 도면이다.
도 16은 HA-MRSA USA100 공격한 쥣과동물 패혈증 모델(IV 치사 공격)에서 항-ClfA 항체 11H10과 항-AT 항체 LC10의 조합의 효과를 도시한 도면이다.
도 17은 HA-MRSA USA200 공격한 쥣과동물 패혈증 모델(IV 치사 공격)에서 항-ClfA 항체 11H10과 항-AT 항체 LC10의 조합의 효과를 도시한 도면이다.
도 18은 HA-MRSA USA100 공격한 쥣과동물 패혈증 모델(IV 치사 공격)에서 항-IsdH 항체 2F4와 항-AT 항체 LC10의 조합의 효과를 도시한 도면이다.
본 발명에 따른 일부 예시적인 실시양태를 구체적으로 언급할 것이며, 이들 중 일부 예는 첨부된 도면으로 예시한다.
본원은 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 결합하는, 인간, 인간화 및/또는 키메라 형태를 비롯하여, 이의 단편, 유도체/접합체 및 조성물, 및 에스. 아우레우스 분비 독소에 결합하는 항체를 개시한다. 이러한 항체들은 에스. 아우레우스를 검출 및/또는 시각화하는 데 유용할 수 있고, 따라서 진단 방법 및 분석에 유용할 수 있다. 본원에 기술된 항체는 또한 에스. 아우레우스 표면 결정인자를 방해하여서, 군집화 및 면역 회피를 방해하므로, 이들 항체를 치료 및 예방 방법에 유용하게 만든다. 유사하게, 본원에 기술된 항체는 에스. 아우레우스 분비 독소에 결합하여서, 에스. 아우레우스 감염의 병독성을 감소시킨다. 에스. 아우레우스 표면 결정인자 및 분비 독소 둘 모두를 표적으로 하는 조합된 항체들은 개별적으로 투여할 시 각 항체에 의해 획득되는 치료 또는 예방 효과를 증가시킬 수 있다.
에스. 아우레우스는 에스. 아우레우스 군집화, 면역 회피, 및 건강에 중요한 수많은 표면 결정인자 항원을 발현한다. 이러한 표면 결정인자는 SdrC, SdrD, SdrE, ClfA, ClfB, IsdA, IsdB, IsdC, IsdE, IsdH, SpA, FnbA 및 PNAG를 포함한다. 본원에 개시된 항체는 표면 결정인자 항원을 표적으로 할 수 있다.
에스. 아우레우스는 또한 다수의 분비 및 세포-회합 단백질을 생산하며, 이들 중 많은 것들, 예컨대 알파-독소(AT), 베타-독소, 감마-독소, 델타-독소, 류코시딘, 독성 쇼크 증후군 독소(TSST), 내독소, 코아귤라아제, 단백질 A, 피브리노겐 등 병인론에 관여한다. 알파 독소는 스타필로코커스 아우레우스의 병독성 인자 중 하나이고 다수의 병원성 에스. 아우레우스 균주에서 생산된다.
A. 에스. 아우레우스 표면 결정인자 및 분비 독소에 대한 항체
본원에서 사용하는 용어, "항체", "항체들"(면역글로불린이라고도 알려짐) 및 "항원-결합 단편"은 단일클론 항체(전장 단일클론 항체 포함), 다클론 항체, 2 이상의 상이한 에피토프 결합 단편(예를 들어, 이중특이적 항체)로부터 형성된 다중특이적 항체, 인간 항체, 인간화 항체, 카멜리드 항체, 키메라 항체, 단쇄 Fv(scFv), 단쇄 항체, 단일 도메인 항체, 도메인 항체, Fab 단편, F(ab')2 단편, 목적하는 생물학적 활성(예를 들면, 항원 결합 부분)을 나타내는 항체 단편, 이황화 결합 Fv(dsFv), 및 항-이디오타입(항-Id) 항체(예를 들면, 본원에 제공된 항체에 대한 항Id 항체), 인트라바디, 및 상기의 임의의 에피토프 결합 단편을 포함한다. 구체적으로, 항체는 면역글로불린 분자 및 면역글로불린 분자의 면역학적 활성 단편, 즉 1 이상의 항원 결합 부위를 함유하는 분자를 포함한다. 면역글로불린 분자는 임의의 이소타입(예를 들면, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA 및 IgY), 서브이소타입(예를 들면, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 및 IgA2) 또는 알로타입(예를 들면, Gm, 예를 들어, G1m(f, z, a 또는 x), G2m(n), G3m(g, b 또는 c), Am, Em, 및 Km(1, 2 또는 3))일 수 있다. 항체는 제한없이, 인간, 원숭이, 돼지, 말, 토끼, 개, 고양이, 쥐 등을 포함하는 임의의 포유동물 또는 다른 동물 예컨대 새(예를 들면, 닭)에서 유래할 수 있다.
일정 실시양태에서, 본 발명의 항체 또는 이의 면역특이적 단편은 항원 결합 도메인을 포함한다. 항원 결합 도메인은 항체마다 다양한 항체 가변 영역에 의해 형성된다. 천연 발생 항체는 2 이상의 항원 결합 도메인을 포함하며, 다시 말해서, 그들은 적어도 2가이다. 본원에서 사용하는 용어 "항원 결합 도메인"은 항원(예를 들면, 세포 표면 또는 가용성 항원) 상의 에피토프에 특이적으로 결합하는 부위를 포함한다. 항체의 항원 결합 도메인은 전형적으로 적어도 면역글로불린 중쇄 가변 영역의 일부분 및 적어도 면역글로불린 경쇄 가변 영역의 일부분을 포함한다. 이들 가변 영역에 의해 형성된 결합 부위는 항체의 특이성을 결정한다.
달리 특정하지 않으면, 본원에서 사용하는 "돌연변이"는 1 이상의 아미노산 또는 핵산의 부가, 결실, 치환(보존성 치환 포함) 또는 다른 변경을 포함한다. 달리 특정하지 않으면, "보존성 치환"은 제1 아미노산을 항체 또는 이의 항원 결합 단편(예를 들면, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 같은 전하, 구조, 극성, 소수성/친수성을 보유하고/하거나 알파 독소에 결합하여 에스. 아우레우스 병독성을 감소시키는 능력 등의 기능을 보존함)의 화학적, 물리적 및/또는 기능적 특성을 실질적으로 변경시키지 않는 제2 아미노산으로 치환하는 것을 의미한다. 보존성 치환은 또한 제1 핵산을 이전에 기술한 보존성 아미노산 치환을 코딩하는 제2 핵산으로 치환하는 것을 의미한다.
본원에 제공된 항체는 전장 또는 온전한 항체, 항체 단편, 천연 서열 항체 또는 천연 항체의 아미노산 변이체, 인간, 인간화, 번역후 변형, 키메라 또는 융합 항체, 면역접합체, 및 이의 기능성 단편을 포함한다. 항체는 Fc 영역이 변형될 수 있고, 일부 변형은 바람직한 이펙터 기능 또는 변경된 혈청 반감기를 제공할 수 있다.
항체의 가변 도메인, 상보성 결정 영역(CDR) 및 프레임워크 영역(FR) 내 아미노산의 넘버링은 달리 언급하지 않으면, [Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland(1991)]에 기재된 바와 같은 카밧 정의를 따른다. 이러한 넘버링 체계를 사용하면, 실제 선형 아미노산 서열은 가변 도메인의 FR 또는 CDR의 단축 또는 그로의 삽입에 상응하는 소수 또는 부가의 아미노산을 함유할 수 있다. 잔기의 카밧 넘버링은 소정 항체에 대해서 "표준" 카밧 넘버링 서열을 갖는 항체 서열의 상동성 영역에서 정렬하여 결정할 수 있다. 프레임워크 잔기의 최대 정렬은 흔히 Fc 영역에 대해 사용되는, 넘버링 체계에서 "스페이서" 잔기의 삽입을 필요로 한다. 또한, 임의의 소정 카밧 부위 번호에서 일정 개별 잔기의 정체는 종간 또는 대립유전자 분기에 기인하여 항체 사슬마다 다양할 수 있다.
일정 실시양태에서, 단리된 항체가 제공된다. 본원에서 사용되는 용어 "단리된 항체"는 천연 세포 환경에서 정상적으로 존재하는 분자 및 다른 항체가 실질적으로 없는 항체를 의미한다. 따라서, 일부 실시양태에서, 제공되는 항체는 그들이 상이한 다른 항원 특이성을 갖는 항체와 떨어졌을 경우 단리된 항체이다. 단리된 항체는 단일클론 항체이거나 또는 다클론 항체일 수 있다. 그러나, 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소의 에피토프, 이소폼 또는 변이체에 특이적으로 결합하는 단리된 항체는 다른 관련 항원, 예를 들면 다른 종(예를 들면, 스타필로코커스 종 상동체) 유래 항원에 대한 교차 반응성을 갖는다. 제공되는 단리된 항체는 1 이상의 다른 세포 물질이 실질적으로 없을 수 있다. 일부 실시양태에서, "단리된" 단일클론 항체의 조합이 제공되고, 상이한 조성물로 조합되고 상이한 특이성을 갖는 항체와 관련된다.
또한 개시된 항체 및 이 항체의 항원 결합 단편의 아미노산 서열을 코딩하는 단리된 핵산 서열을 개시한다. 뉴클레오티드 코드의 축퇴성으로 인해, 1 이상의 뉴클레오티드가 임의의 핵산 위치에 존재할 수 있으면서 여전히 동일한 아미노산을 코딩할 수 있다. 일부 실시양태에서, 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합하는 개시된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산 서열과 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 100%(또는 이 사이의 임의의 백분율) 동일한 아미노산을 코딩하는 핵산 서열을 제공한다. 추가 실시양태에서, 핵산 서열은 개시된 항체 및 이의 항원 결합 단편의 기능적 능력을 보유하는, 예를 들면, 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합하여 에스. 아우레우스 콜로니 성장, 옵소닌에 의한 식작용 회피 또는 분비 독소의 독성을 감소시키는, 아미노산 서열을 코딩한다.
다양한 실시양태에서, 본원에 개시된 항체 또는 단편은 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소 폴리펩티드 또는 이의 항원성 단편에 특이적으로 결합할 수 있다. 일정 실시양태에서, 표면 항원은 SdrC, SdrD, SdrE, ClfA, ClfB, IsdA, IsdB, IsdC, IsdE, IsdH, SpA, FnbA 또는 PNAG이다. 추가 실시양태에서, 표면 항원은 IsdH이다. 다른 실시양태에서, 표면 항원은 ClfA이다. 일부 실시양태에서, 분비 독소는 알파 독소 또는 페놀-가용성 모듈린이다. 추가 실시양태에서, 분비 독소는 알파 독소이다. 본원에서 유용한 알파 독소 항체에 대한 일정 아미노산 및 핵산 서열은 미국 가출원 제61/440,581호 및 국제 특허 출원 제PCT/US2012/024201호(WO2012/109205로 공개됨)에 개시되어 있으며, 이들 각각의 내용을 전체로 참조하여 본원에 편입시킨다.
본원에 제공된 항체는 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원 또는 분비 독소 단백질에 특이적인 1 이상의 에피토프에 특이적으로 결합할 수 있고, 대체로, 다른 폴리펩티드에는 특이적으로 결합하지 않는다. 본원에서 사용하는 용어 "에피토프"는 항체에 의해 결합할 수 있는 펩티드, 서브유닛, 단편, 부분, 올리고머 또는 임의의 이의 조합을 의미한다.
일정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원 또는 분비 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 종 간에 보존된 에피토프에 결합될 수 있다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원 또는 분비 독소 또는 다른 박테리아 종 유래의 상동체 또는 동족체를 비롯하여, 이의 항원성 단편에 결합된다. 일부 실시양태에서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 표면 결정인자 항원 또는 분비 독소의 1 이상의 이소폼에 결합할 수 있다.
다양한 실시양태에서, 에피토프는 적어도 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원의 일부분으로 구성된다. 이들 표면 결정인자 항원은 SdrC, SdrD, SdrE, ClfA, ClfB, IsdA, IsdB, IsdC, IsdE, IsdH, SpA, FnbA 또는 PNAG를 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 항원은 IsdH이다. 다른 실시양태에서, 항원은 ClfA이다. 다른 실시양태에서, 에피토프는 적어도 에스. 아우레우스 분비 독소의 일부분으로 구성된다. 일부 실시양태에서, 분비 독소는 알포 독소 헵타머 복합체의 형성에 관여하는, 알파 독소이다.
특정화된 에피토프는 표적 항원의 아미노산 서열로부터 3개 이상의 인접한 아미노산 잔기를 포함하는 임의의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 에피토프는 표적 항원의 최대로 전체 아미노산 서열을 포함하여, 보다 긴 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 에피토프는 표적 항원의 아미노산 서열로부터 적어도 4개의 아미노산 잔기, 적어도 5개의 아미노산 잔기, 적어도 6개의 아미노산 잔기, 적어도 7개의 아미노산 잔기, 적어도 8개의 아미노산 잔기, 적어도 9개의 아미노산 잔기, 적어도 10개의 아미노산 잔기, 적어도 11개의 아미노산 잔기, 적어도 12개의 아미노산 잔기, 적어도 13개의 아미노산 잔기, 적어도 14개의 아미노산 잔기 또는 적어도 15개의 아미노산 잔기를 포함한다. 일정 다른 실시양태에서, 에피토프는 표적 항원의 아미노산 서열로부터 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 또는 15개의 인접하거나, 또는 비인접한 아미노산 잔기를 포함한다.
일정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 분비 독소에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체를 포함하는 조합물이 제공된다. 추가 실시양태에서, 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 결합하는 항체는 SdrC, SdrD, SdrE, ClfA, ClfB, IsdA, IsdB, IsdC, IsdE, IsdH, SpA, FnbA 또는 PNAG에서 선택된 항원에 결합한다. 추가의 실시양태에서, 표면 결정인자 항원은 IsdH이다. 일정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 분비 독소에 결합하는 항체는 알파 독소 및 페놀-가용성 모듈린에서 선택된 독소에 결합한다. 추가 실시양태에서, 분비 독소는 알파 독소이다.
일정 실시양태에서, 항체 또는 항체의 조합물은 수용액에 존재한다. 다른 실시양태에서, 항체 또는 항체의 조합물은 분말형 또는 동결건조형으로 존재한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 항체의 조합물은 치료 또는 진단 용도로 충분한 농도이다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 항체의 조합물은 멸균 용기 그릇 또는 용기에 존재한다.
일정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합할 수 있는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 모항체로부터 제조된다. 본원에서 사용하는 용어 "모항체"는 본원에서 정의한 바와 같은 변이체 또는 유도체 항체의 제조에 사용되는 아미노산 서열에 의해 코딩된 항체를 의미한다. 모 폴리펩티드는 천연 항체 서열(즉, 천연 발생 대립유전자 변이체를 포함하는, 천연 발생 항체 폴리펩티드) 또는 천연 발생 서열의 이미 존재하는 아미노산 서열 변형(예컨대 삽입, 결실 및/또는 치환)을 갖는 항체 서열을 포함할 수 있다. 모항체는 인간화 항체이거나 또는 인간 항체이다. 특정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소 항체 및 이의 항원 결합 단편은 모항체의 변이체이다. 본원에서 사용하는 용어 "변이체"는 모항체 서열로부터 1 이상의 아미노산 잔기(들)의 부가, 결실 및/또는 치환에 의해서 "모" 항체 또는 이의 항원 결합 단편 아미노산 서열과 그 아미노산 서열이 상이한 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 의미한다.
본 발명의 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소 항체 및 이의 항원 결합 단편은 1 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다. 항체의 항원 결합 부분은 항원에 특이적으로 결합하는 능력을 보유한 항체의 1 이상의 단편을 포함한다. 이들이 보유한 부분은 모항체 또는 모항체의 변이체로부터 유래된 중쇄 및/또는 경쇄 가변 영역을 포함할 수 있다.
B. 항-IsdH 항체
본원에서 사용하는 용어 "서열 동일성 비율(%)" 또는 "상동성"은 최대 서열 동일률을 얻기 위해, 서열을 정렬하고 필요하면 갭을 도입하고, 보존성 치환을 배제한 후 참조 서열 내 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드와 동일한 후보 서열 내 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드의 백분율로서 정의된다. 비교를 위한 서열의 최적 정렬은 수동적인 것외에도, 당분야에서 공지된 국지적 상동성 알고리즘 또는 이들 알고리즘을 사용하는 컴퓨터 프로그램(예를 들면, GAP, BESTFIT, FASTA, BLAST P, BLAST N 및 TFASTA)을 통해 얻을 수 있다.
일부 실시양태에서, 표면 항원 IsH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 아미노산과 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 100% 동일성을 갖는 중쇄 가변 영역(VH)을 포함한다. 일정 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열과 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 100% 동일성을 갖는 경쇄 가변 영역(VL)을 포함한다. 특정 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 아미노산 서열과 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 100% 동일성을 갖는 VH 및 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열을 포함하는 VL을 포함한다.
특정 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 및 VL을 포함하고, 여기서 VH 및 VL은 서열번호 80 및 81; 서열번호 82 및 83; 서열번호 84 및 85; 서열번호 86 및 87; 및 서열번호 88 및 89로 이루어진 군으로부터 선택된다. 일정 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 및 VL을 포함하고, 여기서 VH 및 VL은 서열번호 80 및 81에 상응한다. 실시예 7, 표 12는 항-표면 항원 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 형성하도록 임의의 조성으로 존재할 수 있는 본원에 제시된 바와 같은 대표적인 VH 및 VL 서열을 제공한다.
추가 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 아미노산 서열 내에 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 돌연변이(부가, 결실, 및 치환, 예컨대 보존성 치환 포함)를 갖는 VH 아미노산 서열을 포함한다. 다양한 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열 내에 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 돌연변이(부가, 결실, 및 치환, 예컨대 보존성 치환 포함)를 갖는 VL 아미노산 서열을 포함한다.
일정 실시양태에서, 표면 항원 IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 다음의 특징 중 1 이상을 갖는다:
(a) 약 100 nM 또는 그 이하, 약 90 nM 또는 그 이하, 약 80 nM 또는 그 이하, 약 70 nM 또는 그 이하, 약 60 nM 또는 그 이하, 약 50 nM 또는 그 이하, 약 40 nM 또는 그 이하, 약 20 nm 또는 그 이하, 약 10 nm 또는 그 이하, 약 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 또는 1 nm(또는 이 사이의 임의의 값)의 에스. 아우레우스 표면 항원에 대한 해리 상수(KD);
(b) 옵소닌에 의한 식작용 분석법으로 측정 시, 면역 세포에 의한 옵소닌에 의한 식작용을 회피하는 에스. 아우레우스의 회피 능력을 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 비율) 감소;
(c) 균혈증 모델로 측정 시, 에스. 아우레우스 콜로니 형성 유닛(CFU)의 농도를 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 비율) 감소; 또는
(d) 면역 세포 침윤, 박테리아 부하량(bacterial burden), 및 향염증성(pro-inflammatory) 사이토카인 방출 감소.
에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 특이적으로 결합하는 본 발명의 항체 및 이의 항원 결합 단편은 1 이상의 상보성 결정 영역(예를 들면, CDR1, CDR2 또는 CDR3 중 1 이상)을 포함하는 1 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 1 이상의 VH CDR(예를 들면, VH CDR1, VH CDR2 또는 VH CDR3)을 포함하는 VH를 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 1 이상의 VL CDR(예를 들면, VL CDR1, VL CDR2 또는 VL CDR3)을 포함하는 VL을 포함한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 1 이상의 VH CDR 및 1 이상의 VL CDR을 포함하는 VH를 포함한다.
본원에 개시된 CDR 영역은 각각의 CDR 영역이 독립적으로 선택되고 소정의 항체에 대해 임의의 다른 CDR 영역과 조합되듯이, 다양한 조합으로 조합될 수 있다. 일정 실시양태에서 VH 및/또는 VL CDR 서열은 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 형성하도록 임의의 조합으로 존재할 수 있다.
일부 실시양태에서, 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 IsdH에 특이적으로 결합하고 (a) 서열번호 90, 96, 102, 108 또는 114와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 91, 97, 103, 109 또는 115와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; 및/또는 (c) 서열번호 92, 98, 104, 110 또는 116과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 IsdH에 특이적으로 결합하고, (a) 서열번호 93, 99, 105, 111 또는 117과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (b) 서열번호 94, 100, 106, 112 또는 118과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및/또는 (c) 서열번호 95, 101, 107, 113 또는 119와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 (a) 서열번호 90, 96, 102, 108 또는 114의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1;(b) 서열번호 91, 97, 103, 109 또는 115의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; (c) 서열번호 92, 98, 104, 110 또는 116의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3; (d) 서열번호 93, 99, 105, 111 또는 117의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (e) 서열번호 94, 100, 106, 112 또는 118의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및 (f) 서열번호 95, 101, 107, 113 또는 119의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3과 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함한다.
특정 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함하고, 여기서 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 90, 91, 92, 93, 94 및 95; 서열번호 96, 97, 98, 99, 100, 및 101; 서열번호 102, 103, 104, 105, 106, 및 107; 서열번호 108, 109, 110, 111, 112, 및 113; 서열번호 114, 115, 116, 117, 118 및 119로 이루어진 군으로부터 선택된다. 추가의 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함하고, 여기서 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 90, 91, 92, 93, 94 및 95에 상응한다.
일부 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 상기 기술된 바와 같은 단리된 항체 또는 항원 결합 단편 중 임의의 하나에 상응하고, 하기 특징 중 1 이상을 갖는다:
(a) 약 100 nM 또는 그 이하, 약 90 nM 또는 그 이하, 약 80 nM 또는 그 이하, 약 70 nM 또는 그 이하, 약 60 nM 또는 그 이하, 약 50 nM 또는 그 이하 또는 약 40 nM 또는 그 이하, 약 20 nm 또는 그 이하, 약 10 nm 또는 그 이하, 약 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 또는 1 nm(또는 그 사이의 임의의 값)의 에스. 아우레우스 표면 항원에 대한 해리 상수(KD);
(b) 옵소닌에 의한 식작용 사멸 분석법으로 측정 시, 면역 세포에 의한 옵소닌에 의한 식작용을 회피하는 에스. 아우레우스의 능력을 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율)로 감소;
(c) 균혈증 모델로 측정 시, 에스. 아우레우스 콜로니 형성 유닛(CFU)의 수를 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율)로감소; 또는
(d) 면역 세포 침윤, 박테리아 부하량, 및 향염증성 사이토카인 방출 감소.
추가 실시양태에서, 본 발명은 상기 기술된 항-ClfA 항체 또는 항원 결합 단편 중 임의의 하나와 동일한 IsdH 에피토프에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
C. 항-ClfA 항체
일부 실시양태에서, 표면 항원 ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 132 또는 140의 아미노산 서열과 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 100%의 동일성을 갖는 중쇄 가변 영역(VH)을 포함한다. 일정 실시양태에서, ClfA에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 136 또는 144의 아미노산 서열과 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 100%의 동일성을 갖는 경쇄 가변 영역(VL)을 포함한다. 특정 실시양태에서, ClfA에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 132 또는 136의 아미노산 서열과 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 100%의 동일성을 갖는 VH, 및 서열번호 140 또는 144의 아미노산 서열을 포함하는 VL을 포함한다. 특정 실시양태에서, ClfA에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 및 VL을 포함하고, 여기서 VH 및 VL은 서열번호 132 및 140; 및 서열번호 136 및 144로 이루어진 군으로부터 선택된다. 실시예 7, 표 14는 항-표면 항원 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 형성하도록 임의의 조합으로 존재할 수 있는 본원에 제시된 바와 같은 대표적인 VH 및 VL 서열을 제공한다.
추가 실시양태에서, ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 132 또는 140의 아미노산 서열에 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 돌연변이(부가, 결실, 및 치환 예컨대 보존성 치환 포함)를 갖는 VH 아미노산 서열을 포함한다. 다양한 실시양태에서, ClfA에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 136 또는 144의 아미노산 서열에 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 돌연변이(부가, 결실, 및 치환 예컨대 보존성 치환)를 갖는 VL 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 (a) 서열번호 133 또는 141와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 134 또는 142와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; 및/또는 (c) 서열번호 135 또는 143과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 (a) 서열번호 137 또는 145와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (b) 서열번호 138 또는 146과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및/또는 (c) 서열번호 139 또는 147과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 (a) 서열번호 133 또는 141의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 134 또는 142의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; (c) 서열번호 135 또는 143의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3; (d) 서열번호 137 또는 145의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (e) 서열번호 138 또는 146의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및 (f) 서열번호 139 또는 147의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3과 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함한다.
특정 실시양태에서, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함하고, 여기서 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 133, 134, 135, 137, 138 및 139; 및 서열번호 141, 142, 143, 144, 145, 146 및 147로 이루어진 군으로부터 선택된다.
추가 실시양태에서, 본 발명은 상기 기술된 항-ClfA 항체 또는 항원 결합 단편 중 임의의 하나와 동일한 ClfA 에피토프에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
D. 항-알파 독소(AT) 항체
일부 실시양태에서, 분비 독소에 대한 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 아미노산 서열을 포함하는 VH를 포함한다. 일정 실시양태에서, 항-분비 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 아미노산 서열을 포함하는 VL을 포함한다. 또 다른 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 아미노산 서열을 포함하는 VH, 및 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 아미노산 서열을 포함하는 VL을 포함한다. 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 형성하도록 임의의 조합으로 존재하거나, 또는 본 발명의 mAb를 형성하도록 조합되어 존재할 수 있는 본원에 제시된 바와 같은 VH 및 VL 서열의 대표예에 대해서는 실시예 7, 표 7을 참조한다. 일부 실시양태에서, VH는 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62이다. 다양한 실시양태에서, VL은 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63이다.
본원에 기술하는 VH 및 VL 아미노산 서열을 코딩하는 일정 VH 및 VL 뉴클레오티드 서열은 실시예 7, 표 8에 나타내었다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 및 VL을 포함하고, 여기서 VH 및 VL은 서열번호 20 및 19; 서열번호; 22 및 21; 서열번호 24 및 23; 서열번호 26 및 25; 서열번호 28 및 27; 서열번호 41 및 42; 서열번호 43 및 44; 서열번호 45 및 46; 서열번호 47 및 48; 서열번호 47 및 48; 서열번호 49 및 50; 서열번호 51 및 52; 서열번호 51 및 52; 서열번호 53 및 54; 서열번호 55 및 56; 서열번호 57 및 58; 서열번호 59 및 60; 서열번호 61 및 58; 서열번호 62 및 58; 서열번호 62 및 63; 서열번호 79 및 63으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다.
일정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 항체 또는 단편은 표 7에 개시된 VH 및/또는 VL 서열 중 1 이상과 소정 비율의 동일성을 갖는 VH 및/또는 VL을 포함한다.
일부 실시양태에서, 항-분비 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 아미노산 서열과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율)의 동일성을 포함하는 VH 아미노산 서열을 포함한다. 일정 실시양태에서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 아미노산 서열에 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 돌연변이(부가, 결실, 및 치환, 예컨대 보존성 치환 포함)를 갖는 VH 아미노산 서열을 포함한다. 본원에서 사용하는 "보존성 치환"은 제1 아미노산을 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 화학적, 물리적, 및/또는 기능적 특성(예를 들면, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 동일한 전하, 구조, 극성, 소수성/친수성을 보유하고/하거나, 기능 예컨대 알파 독소에 결합하여 에스. 아우레우스 병독성을 감소시키는 능력을 보존함)을 실질적으로 변경하지 않는 제2 아미노산으로 치환하는 것을 의미한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62와 소정 비율의 동일성을 갖는 VH 아미노산 서열을 포함하고, 하기 특징 중 1 이상을 갖는다:
(a) 약 13 nM 또는 그 이하의 에스. 아우레우스 알파 독소에 대한 해리 상수(KD);
(b) 알파 독소 올리고머의 형성을 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의 백분율) 억제;
(c) (예를 들면, 세포 용해 및 용혈 분석으로 측정)로 알파 독소의 세포용해 활성을 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 비율) 감소; 또는
(d) 면역 세포 침윤, 박테리아 부하량, 및 향염증성 사이토카인 방출 감소(예를 들면, 동물 폐렴 모델에서).
일정 실시양태에서, 항-분비 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 아미노산 서열과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율)의 동일성을 포함하는 VL 아미노산 서열을 포함한다. 다양한 실시양태에서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 아미노산 서열에 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 돌연변이(부가, 결실 및 치환 예컨대 보존성 치환 포함)를 갖는 VL 아미노산 서열을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63과 소정 비율의 동일성을 갖는 VL 아미노산 서열을 포함하고, 하기 특징 중 1 이상을 갖는다:
(a) 약 13 nM 또는 그 이하의 에스. 아우레우스 알파 독소에 대한 해리 상수(KD);
(b) 세포 표면에 알파 독소의 결합을 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 억제하여 알파 독소 올리고머의 형성을 파괴;
(c) (예를 들면, 세포 용해 및 용혈 분석으로 측정)로 알파 독소의 세포용해 활성을 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 감소; 또는
(d) 면역 세포 침윤, 박테리아 부하량, 및 향염증성 사이토카인 방출 감소(예를 들면, 동물 폐렴 모델에서).
일부 실시양태에서, 단리된 항체 또는 항원 결합 단편은 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하고, (a) 서열번호 7, 10, 13 또는 69와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; 및/또는 (c) 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3.
특정 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편은 서열번호 7, 8 및 9; 서열번호 10, 11 및 12; 서열번호 13, 14 및 15; 서열번호 7, 17 및 18; 서열번호 7, 8 및 16; 서열번호 7, 8 및 65; 서열번호 7, 8 및 66; 서열번호 7, 8, 및 67; 서열번호 7, 8 및 78; 서열번호 69, 70 및 71; 서열번호 7, 8 및 72; 서열번호 69, 75 및 71; 서열번호 69, 75 및 76; 또는 서열번호 69, 70 및 71과 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1, VH CDR2 및 VH CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 (a) 서열번호 1 또는 4와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (b) 서열번호 2, 5, 73 또는 77과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및/또는 (c) 서열번호 3, 6, 64, 68 또는 74와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3을 포함한다.
특정 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 1, 2 및 3; 서열번호 4, 5 및 6; 서열번호 1, 2 및 64; 서열번호 1, 2 및 68; 서열번호 1, 73 및 74; 또는 서열번호 1, 77 및 74와 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 (a) 서열번호 7, 10, 13 또는 69의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; (c) 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3; (d) 서열번호 1 또는 4의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (e) 서열번호 2, 5, 73 또는 77의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 또는 (f) 서열번호 3, 6, 64, 68 또는 74의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3과 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함한다.
특정 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 7, 8, 9, 1, 2 및 3; 서열번호 10, 11, 12, 1, 2 및 3; 서열번호 13, 14, 15, 4, 5 및 6; 서열번호 7, 17, 18, 1, 2 및 3; 서열번호 7, 8, 16, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 65, 1, 2 및 64; 서열번호; 7, 8, 66, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 67, 1, 2 및 68; 서열번호 7, 8, 67, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 78, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 65, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 70, 71, 1, 2 및 68; 서열번호 7, 8, 72, 1, 73 및 74; 서열번호 69, 75, 71, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 75, 76, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 75, 76, 1, 77 및 74; 또는 서열번호 69, 70, 71, 1, 77 및 74와 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2, 및 VL CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, (i) 3개의 CDR을 포함하는 VH 사슬 도메인 및 3개의 CDR을 포함하는 VL 사슬 도메인을 포함하고, (ii) 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 조성물을 제공하고, 여기서 VH 사슬 도메인의 3개의 CDR은 (a) 서열번호 7, 10, 13 또는 69의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; 및 (c) 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3을 포함한다. 특정 실시양태에서, VH CDR1, VH CDR2 및 VH CDR3은 서열번호 7, 8 및 9; 서열번호 10, 11 및 12; 서열번호 13, 14 및 15; 서열번호 7, 17 및 18; 서열번호 7, 8 및 16; 서열번호 7, 8 및 65; 서열번호 7, 8 및 66; 서열번호 7, 8, 및 67; 서열번호 7, 8 및 78; 서열번호 69, 70 및 71; 서열번호 7, 8 및 72; 서열번호 69, 75 및 71; 서열번호 69, 75 및 76; 또는 서열번호 69, 70 및 71에 상응한다.
일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 분비 독소에 특이적으로 결합하고, (a) 서열번호 7, 10, 13 또는 69와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; 및 (c) 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3; (d) 서열번호 1 또는 4의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (e) 서열번호 2, 5, 73 또는 77의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및 (f) 서열번호 3, 6, 64, 68 또는 74의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3을 포함하고, 다음의 특징 중 1 이상을 갖는다:
(a) 약 13 nM 또는 그 이하의 알파 독소에 대한 해리 상수(KD);
(b) 알파 독소 단량체에 결합;
(c) 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율)로 알파 독소 올리고머의 형성 억제;
(d) 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율)(예를 들면, 세포 용해 및 용혈 분석으로 측정)로 알파 독소의 세포용해 활성을 감소; 또는
(e) 면역 세포 침윤, 박테리아 부하량 및 향염증성 사이토카인 방출을 감소(예를 들면, 동물 폐렴 모델에서).
일정 실시양태에서, 항체 또는 항체 단편은 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 특이적으로 결합하고, 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61, 62, 80, 82, 84, 86 또는 88의 아미노산 서열과 90% 이상의 동일성을 포함하는 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 63, 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열과 90% 이상 동일성을 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함한다. 추가 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 옵소닌에 의한 식작용을 회피하는 에스. 아우레우스의 능력을 50% 이상 감소시킨다. 추가 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 CFU의 농도를 50% 이상 감소시킨다. 다른 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 1 이상의 알파 독소 단량체가 서로 결합하는 것을 억제(예를 들면, 올리고머화 억제)하고/하거나, 에스. 아우레우스 병독성을 감소시킨다.
일부 실시양태에서, 단리된 항체 또는 항원-결합 단편은 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하고, (a) 서열번호 7, 10, 13 또는 69과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; 및/또는 (c) 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3을 포함한다.
특정 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편은 서열번호 7, 8 및 9; 서열번호 10, 11 및 12; 서열번호 13, 14 및 15; 서열번호 7, 17 및 18; 서열번호 7, 8 및 16; 서열번호 7, 8 및 65; 서열번호 7, 8 및 66; 서열번호 7, 8, 및 67; 서열번호 7, 8 및 78; 서열번호 69, 70 및 71; 서열번호 7, 8 및 72; 서열번호 69, 75 및 71; 서열번호 69, 75 및 76; 또는 서열번호 69, 70 및 71과 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1, VH CDR2 및 VH CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 (a) 서열번호 1 또는 4와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (b) 서열번호 2, 5, 73 또는 77과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및/또는 (c) 서열번호 3, 6, 64, 68 또는 74와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3을 포함한다.
특정 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 1, 2 및 3; 서열번호 4, 5 및 6; 서열번호 1, 2 및 64; 서열번호 1, 2 및 68; 서열번호 1, 73 및 74; 또는 서열번호 1, 77 및 74와 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 (a) 서열번호 7, 10, 13 또는 69의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; (c) 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3; (d) 서열번호 1 또는 4의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; (e) 서열번호 2, 5, 73 또는 77의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 또는(f) 서열번호 3, 6, 64, 68 또는 74의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3과 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3을 포함한다.
특정 실시양태에서, 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 7, 8, 9, 1, 2 및 3; 서열번호 10, 11, 12, 1, 2 및 3; 서열번호 13, 14, 15, 4, 5 및 6; 서열번호 7, 17, 18, 1, 2 및 3; 서열번호 7, 8, 16, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 65, 1, 2 및 64; 서열번호; 7, 8, 66, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 67, 1, 2 및 68; 서열번호 7, 8, 67, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 78, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 65, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 70, 71, 1, 2 및 68; 서열번호 7, 8, 72, 1, 73 및 74; 서열번호 69, 75, 71, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 75, 76, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 75, 76, 1, 77 및 74; 또는 서열번호 69, 70, 71, 1, 77 및 74와 동일하거나, 또는 이에 대해 각 CDR에 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2, 및 VL CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, (i) 3개의 CDR을 포함하는 VH 사슬 도메인 및 3개의 CDR을 포함하는 VL 사슬 도메인을 포함하고; (ii) 스타필로코커스 아우레우스 알파 독소 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 조성물을 제공하고, 여기서 VH 사슬 도메인의 3개의 CDR은 (a) 서열번호 7, 10, 13 또는 69의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; (b) 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; 및 (c) 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3을 포함한다. 특정 실시양태에서, VH CDR1, VH CDR2 및 VH CDR3은 서열번호 7, 8 및 9; 서열번호 10, 11 및 12; 서열번호 13, 14 및 15; 서열번호 7, 17 및 18; 서열번호 7, 8 및 16; 서열번호 7, 8 및 65; 서열번호 7, 8 및 66; 서열번호 7, 8, 및 67; 서열번호 7, 8 및 78; 서열번호 69, 70 및 71; 서열번호 7, 8 및 72; 서열번호 69, 75 및 71; 서열번호 69, 75 및 76; 또는 서열번호 69, 70 및 71에 상응한다.
일정 실시양태에서, 항-분비 독소 항체를 형성하기 위해 존재하는 CDR 서열의 조합은 표 9에 나타낸 바와 같이, 서열번호 7, 10, 13 또는 69를 포함하는 VH CDR1, 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75를 포함하는 VH CDR2, 및 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78을 포함하는 VH CDR3을 포함한다. 일부 실시양태에서, 표 9에 나타낸 바와 같이, VL CDR1은 서열번호 1 또는 4를 포함하고, VL CDR2는 서열번호 2, 5, 73 또는 77을 포함하며, VL CDR3은 서열번호 3, 6, 64, 68 또는 74를 포함한다.
본원에 개시한 바와 같이, 항체 및 이의 항원 결합 단편은 본원에 기술된 아미노산 서열과 실질적으로 동일한 1 이상의 아미노산 서열을 포함한다. 실질적으로 동일한 아미노산 서열은 보존성 아미노산 치환을 비롯해, 아미노산 결실 및/또는 삽입을 포함하는 서열을 포함한다.
E. 프레임워크 영역
중쇄 및 경쇄 각각의 가변 도메인은 1 이상의 프레임워크 영역(FR1, FR2, FR3, FR4 또는 다르게는 FW1, FW2, FW3, FW4)을 포함한다. 중쇄의 프레임워크 영역은 여기서 VH FR로 표시하는 한편, 경쇄의 프레임워크 영역은 VL FR로 표시한다. 일정 실시양태에서, 프레임워크 영역은 치환, 삽입 또는 다른 변경을 함유할 수 있다. 일정 실시양태에서, 이들 변경은 항체의 결합 친화성을 개선시키거나 또는 최적화시킨다. 변형시킬 수 있는 프레임워크 영역 잔기의 비제한적인 예에는 비공유적으로 직접 항원에 결합하고/하거나, CDR의 입체형태와 상호작용/이에 영향을 주고/주거나, VL-VH 계면에 참여하는 것들이 포함된다.
일정 실시양태에서, 프레임워크 영역은 "배선화(germlining)"의 목적을 위해서 1 이상의 아미노산 변화를 포함할 수 있다. 예를 들면, 선택된 항체 중쇄 및 경쇄의 아미노산 서열은 배선 중쇄 및 경쇄 아미노산 서열과 비교할 수 있고, 선택된 VL 및/또는 VH 사슬의 일정 프레임워크 잔기가 배선 배열과 상이한 경우(예를 들면, 파지 라이브러리를 준비하는 데 사용된 면역글로불린 유전자의 체세포 돌연변이 결과로서), 배선 배열로 선택된 항체의 변경된 프레임워크 잔기를 "역돌연변이"시키는 것이 바람직할 수 있다(즉, 선택된 항체의 프레임워크 아미노산 서열이 배선 프레임워크 아미노산 서열과 같도록 이를 변화). 프레임워크 잔기의 이러한 "역 돌연변이"(또는 "배선화")는 특이적 돌연변이를 도입하기 위한 표준 분자 생물학적 방법(예를 들면, 부위 지정 돌연변이유발법 또는 PCR-매개 돌연변이유발법)에 의해 수행될 수 있다. 일부 실시양태에서, 가변 경쇄 및/또는 중쇄 프레임워크 잔기를 역돌연변이시킨다. 일정 실시양태에서, 본원에 개시된 단리된 항체 또는 항원 결합 단편의 가변 중쇄는 역돌연변이된다. 일정 실시양태에서, 단리된 항체 또는 항원 결합 단편의 가변 중쇄는 적어도 1개, 적어도 2개, 적어도 3개, 적어도 4개 또는 그 이상의 역돌연변이를 포함한다.
일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 VH는 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62 내에 상응하는 VH 프레임워크 영역과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4를 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 상응하는 FR 영역과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 상응하는 FR과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함할 수 있다. 구체적으로, VH의 FR1, FR2, FR3 또는 FR4는 각각 VH 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 상응하는 FR1, FR2, FR3 또는 FR4와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 가질 수 있다.
일정 실시양태에서, 본원에서 제공되는 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 VL은 VL 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 FR 내에 상응하는 프레임워크 영역과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4를 포함한다. 일부 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 상응하는 FR과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 상응하는 FR과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 구체적으로, VL의 FR1, FR2, FR3 또는 FR4는 각각 VH 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 상응하는 FR1, FR2, FR3 또는 FR4와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 가질 수 있다.
일정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 분비 독소에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편은 VH 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4), 및/또는 VL 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 분비 독소에 특이적으로 결합하고, VH 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4), 및/또는 VL 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함하고, 여기서 항체는 하기 특징 중 1 이상을 갖는다:
(a) 약 13 nM 또는 그 이하의 알파 독소에 대한 친화성 상수(KD);
(b) 알파 독소 단량체에 결합;
(c) 알파 독소 올리고머의 형성을 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 억제;
(d) (예를 들면, 세포 용해 및 용혈 분석으로 측정 시) 알파 독소의 세포용해 활성을 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 감소; 또는
(e) 면역 세포 침윤, 박테리아 부하량 및 향염증성 사이토카인 방출을 감소(예를 들면, 동물 폐렴 모델에서).
일정 실시양태에서, 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88 내에 4개의 VH 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 VH FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4 영역을 포함하는, 에스. 아우레우스 IsdH 표면 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편을 제공한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 4개의 FR 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 상응하는 FR과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89 내에 4개의 VL 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 VL FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4 영역을 포함하는, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편을 제공한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 상응하는 FR 영역과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 상응하는 FR 영역과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 단리된 항체 또는 항원 결합 단편은 IsdH에 특이적으로 결합하고, VH 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함하고/하거나, VL 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88 내에 4개의 VH 프레임워크 영역의 상응하는 서열과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 VH FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4를 포함하는, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편을 제공한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 4개의 FR 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 상응하는 FR 영역과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89 내에 4개의 VL 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 VL FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4 영역을 포함하는, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편을 제공한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 상응하는 FR 영역과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 상응하는 FR 영역과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 단리된 항체 또는 항원 결합 단편은 IsdH에 특이적으로 결합하고, VH 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함하고/하거나, VL 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 서열번호 132 또는 140 내에 4개의 VH 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 VH FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4 영역을 포함하는, 에스. 아우레우스 ClfA 표면 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편을 제공한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 132 또는 140의 4개의 FR 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 132 또는 140의 상응하는 FR 영역과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 서열번호 136 또는 144 내에 4개의 VL 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 VL FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4 영역을 포함하는, ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편이 제공된다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 136 또는 144의 상응하는 FR 영역과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 136 또는 144의 상응하는 FR 영역과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 단리된 항체 또는 항원 결합 단편은 ClfA에 특이적으로 결합하고, VH 서열번호 132 또는 136의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함하고/하거나, VL 서열번호 136 또는 144의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 서열번호 132 또는 140 내에 4개의 VH 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 VH FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4 영역을 포함하는, ClfA에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 132 또는 140의 4개의 FR 영역의 상응하는 아미노산과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VH 서열번호 132 또는 140의 상응하는 FR 영역과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VH FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 서열번호 136 또는 144 내에 4개의 VL 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 약 65% 내지 약 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는 VL FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4 영역을 포함하는, IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 항원 결합 단편을 제공한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 136 또는 144의 상응하는 FR 영역과 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다. 일정 실시양태에서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 VL 서열번호 136 또는 144의 상응하는 FR 영역과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 VL FR 아미노산 서열(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
일정 실시양태에서, 단리된 항체 또는 항원 결합 단편은 ClfA에 특이적으로 결합하고, VH 서열번호 132 또는 140의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함하고/하거나, VL 서열번호 136 또는 144의 상응하는 FR과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VL FR(FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4)을 포함한다.
F. 항-알파 독소 항체 및 이의 항원 결합 단편을 코딩하는 뉴클레오티드 서열
상기 기술된 아미노산 서열 이외에도, 본원에 개시된 아미노산 서열에 상응하는 뉴클레오티드 서열을 추가로 제공한다. 일부 실시양태에서, 뉴클레오티드 서열은 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 코딩한다. 뉴클레오티드 서열은 실시예 7, 표 8에 제공된다. 따라서, 또한, 본원에 기술된 항체 또는 단편에 대한, FR 영역 및 CDR을 포함하는, VH 및 VL 영역을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열을 비롯하여, 세포(예를 들어, 포유동물 세포)에서 그들의 효과적인 발현을 위한 발현 벡터를 또한 제공한다.
본원은 또한 본원에 개시된 아미노산 서열을 코딩하는 것과 실질적으로 동일한 폴리뉴클레오티드를 개시한다. 실질적으로 동일한 서열은 다형성 서열, 즉, 대체 서열 또는 개체군 내 대립유전자일 수 있다. 실질적으로 동일한 서열은 또한, 침묵 돌연변이를 포함하는 서열을 포함하는, 돌연변이유발된 서열을 포함할 수 있다. 돌연변이는 1 이상의 잔기 변화, 1 이상의 잔기의 결실 또는 1 이상의 추가 잔기의 삽입을 포함할 수 있다. 실질적으로 동일한 서열은 또한 핵산 코드의 축퇴성에 기인하여, 본원에 개시된 아미노산 서열 내 임의의 소정 아미노산 위치에서 동일 아미노산을 코딩하는 다양한 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다.
본원은 또한 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 코딩하는 폴리뉴클레오티드와 고 엄격도 또는 저 엄격도 혼성화 조건 하에서 혼성화하는 폴리뉴클레오티드를 개시한다. 본원에서 사용하는 용어 "엄격도"는 2종 핵산 간 상동성 정도를 표시하기 위한 혼성화 실험의 실험 조건(예를 들면, 온도 및 염 농도)을 의미하며, 엄격도가 높을수록, 2종 핵산 간 상동율이 높다. 본원에서 사용하는 어구 "혼성화" 또는 이의 문법적 변이어는 저, 중 또는 고 엄격도 조건 하에서 또는 핵산 합성 조건 하에서 제2 핵산 분자에 제1 핵산 분자의 결합을 의미한다. 혼성화는 제1 및 제2 핵산 분자가 상보적인 경우, 제1 핵산 분자가 제2 핵산 분자에 결합하는 예를 포함할 수 있다.
엄격 혼성화 조건은 제한없이, 약 45 섭씨 온도에서 6X 염화나트륨/시트르산나트륨(SSC) 중에 필터-결합된 DNA와의 혼성화이후, 약 50-65 섭씨 온도에서 0.2X SSC/0.1% SDS 중에 1회 또는 그 이상 세척을 포함한다. 다른 엄격 조건은 약 45 섭씨 온도에서 6X SSC 중에 필터-결합된 DNA와의 혼성화 후, 약 65 섭씨 온도에서 0.1X SSC/0.2% SDS 중에 1회 이상 세척을 포함한다. 다른 공지된 엄격 혼성화 조건은 당분야의 숙련가에게 친숙하며 본원에 포함시킨다.
일정 실시양태에서, 본원에 개시된 핵산은 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산 서열을 코딩하거나, 또는 핵산은 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산 서열을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산에 엄격 조건 하에서 혼성화될 수 있다.
일정 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 서열은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61, 62, 80, 82, 84, 86 또는 88의 VH 아미노산 서열과 적어도 약 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합할 수 있는 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산 서열을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 일정 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 서열은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61, 62, 80, 82, 84, 86 또는 88의 아미노산 서열에 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 돌연변이(부가, 결실, 및 치환, 예컨대 보존성 치환 포함)를 갖는 아미노산 서열을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 서열은 서열번호 30, 32, 34, 36, 38, 120, 122, 124, 126 또는 128의 VH 뉴클레오티드 서열과 적어도 약 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합할 수 있는 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산 서열을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다.
일정 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 서열은 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 63, 81, 83, 85, 87 또는 89의 VL 아미노산 서열과 적어도 약 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합할 수 있는 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산 서열을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 일정 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 서열은 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 63, 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열에 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 돌연변이(부가, 결실, 및 치환, 예컨대 보존성 치환 포함)를 갖는 아미노산 서열을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 서열은 서열번호 29, 31, 33, 35, 37, 121, 123, 125, 127 또는 129의 VL 뉴클레오티드 서열과 적어도 약 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합할 수 있는 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산 서열을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다.
특정 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 서열은 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합할 수 있는 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산 서열을 코딩하고, VH 아미노산 서열과 적어도 약 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일하고, VL 아미노산 서열과 적어도 약 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 VH 및 VL 서열은 서열번호 20 및 19; 서열번호; 22 및 21; 서열번호 24 및 23; 서열번호 26 및 25; 서열번호 28 및 27; 서열번호 41 및 42; 서열번호 43 및 44; 서열번호 45 및 46; 서열번호 47 및 48; 서열번호 47 및 48; 서열번호 49 및 50; 서열번호 51 및 52; 서열번호 51 및 52; 서열번호 53 및 54; 서열번호 55 및 56; 서열번호 57 및 58; 서열번호 59 및 60; 서열번호 61 및 58; 서열번호 62 및 58; 서열번호 62 및 63; 서열번호 79 및 63; 서열번호 80 및 81; 서열번호 82 및 83; 서열번호 84 및 85; 서열번호 86 및 87; 서열번호 88 및 89로 표시된다.
개시된 폴리뉴클레오티드를 얻을 수 있고, 폴리뉴클레오티드의 뉴클레오티드 서열은 당분야에 공지된 임의 방법으로 결정된다. 예를 들면, 항체의 뉴클레오티드 서열이 기지이면, 항체를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 화학적으로 합성된 올리고뉴클레오티드로부터 조립할 수 있다. 여기에는 예를 들면, 항체를 코딩하는 서열의 일부분을 함유하는 중첩된 올리고뉴클레오티드의 합성, 이들 올리고뉴클레오티드의 어닐링 및 결찰, 및 이어서 PCR을 통한 결찰된 올리고뉴클레오티드의 증폭이 포함될 수 있다. 개시된 폴리뉴클레오티드는 또한 핵산의 임의의 적절한 공급원, 예컨대 항체 cDNA 라이브러리 또는 항체를 발현하는 임의의 조직 또는 세포 유래(예를 들면, 항체를 발현하도록 선택된 하이브리도마 세포 유래)의 단리된 cDNA 라이브러리로부터 생성될 수 있다.
G. 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 항체 또는 단편의 기능적 특징
일정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 표면 항원에 대한 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 표면 항원을 발현하는 에스. 아우레우스 세포의 생물학적 특성을 변경시킨다. 다양한 실시양태에서, 항체는 에스. 아우레우스 표면 항원에 결합하여, 숙주 세포에 의한 옵소닌에 의한 식작용을 강화시킨다. 추가 실시양태에서, 옵소닌에 의한 식작용은 옵소닌에 의한 식작용 사멸 분석법으로 측정 시, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 증가된다. 일부 실시양태에서, 마우스 균혈증 모델로 측정 시, 표면 결정인자 항원에 항체의 결합은 표면 항원과 표면 어드헤신 간의 상호작용을 방해하여, 숙주 세포에 존재하는 콜로니 형성 유닛(CFU)의 농도를 감소시킨다. 추가 실시양태에서, CFU 농도는 음성 대조군 항체의 존재시 또는 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 부재시 CFU 농도와 비교하여, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 감소된다. 예를 들면, 항-IsdH 항체는 CFU 농도를 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율) 감소시킨다. 일부 실시양태에서, 항-표면 항원 항체는 에스. 아우레우스에의 결합에 대해 햅토글로빈 및/또는 헤모글로빈과 경쟁하여, 헤모글로빈 내 철에 접근하여 활용하는 에스. 아우레우스의 능력을 억제시킨다. 일정 실시양태에서, 표면 항원에 대한 항체 또는 단편은 항체 부재시 에스. 아우레우스 결합과 비교하여, 햅토글로빈 및/또는 헤모글로빈에 결합하는 에스. 아우레우스의 능력을 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율)만큼 감소시킨다. 예를 들면, 항-IsdH 항체는 햅토글로빈 및/또는 헤모글로빈에 결합하는 에스. 아우레우스의 능력을 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%(또는 그 사이의 임의의 백분율)만큼 감소시킨다.
본원에서 사용하는 "옵소닌에 의한 식작용 사멸 분석법(opsonophagocytic killing assay; OPK)"은 기지 농도의 에스. 아우레우스 함유 조직 샘플에 항체를 부가한 후 시험관 내에서 숙주 조직에 유도된 식작용 사멸 비율을 측정하는 데 사용되는 임의의 분석법을 의미한다. CFU의 이러한 감소는 대조군 항체 존재 시에 관찰되는 OPK의 대조군 수준에 대해 정규화된다. 이 분석법은 보체 활성화 및 후속 식작용을 유도하는 표적 항체의 능력을 측정한다. 예를 들어, OPK는 10 ㎕의 항체 및 10 ㎕의 에스. 아우레우스(106 세포/ml)를 배합한 후, 10 ㎕의 인간 전골수구 백혈병(HL-60) 세포(107 세포/ml) 및 10 ㎕의 에스. 아우레우스에 대해 사전 흡착된 인간 혈청을 부가하는 것을 포함한다. 10 ㎕의 혼합물을 이어서 플레이팅(T0시에)한 후, 1% 사포닌을 이용해 세포를 용해(T60시에)하고, 에스. 아우레우스 CFU 농도를 결정할 수 있다. 사멸률은 다음과 같이 계산할 수 있다: 100 x(1-(T60/T0)), 여기서 T60은 분석 종료 시(즉, 60분에)의 CUF 농도를 의미하고, T0는 분석 시작 시 CFU 농도를 의미한다.
본원에서 사용하는 "균혈증 모델"은 CFU의 감소율로 표현되는, 에스. 아우레우스 박테리아 부하량에 대한 항체의 영향을 평가하기 위해 사용되는 에스. 아우레우스 감염에 대한 임의의 생체내 모델을 의미한다. 예를 들면, 균혈증 모델은 마우스에 항체를 주사한 후, 108 CFU의 에스. 아우레우스를 복강 주사하고, 다음으로 혈액을 채취하고, 대조군 항체를 주사한 후 CFU와 비교하여 CFU 농도를 측정하는 것을 포함한다.
일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 알파 독소 및/또는 알파 독소 발현 세포의 생물학적 특성을 변경시킨다. 일부 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 폴리펩티드에 결합하여 막 결합 및 알파 독소 단량체의 경막 포어(예를 들면, 알파 독소 헵타머)로의 조립을 억제하여 알파 독소의 생물학적 활성을 중화시킨다. 중화 분석은 일부 상황에서, 시판되는 시약을 이용해 당분야에 공지된 방법을 이용해 수행할 수 있다. 알파 독소의 중화는 종종 1×10-6 M 또는 그 이하, 1×10-7 M 또는 그 이하, 1×10-8 M 또는 그 이하, 1×10-9 M 또는 그 이하, 1×10-10 M 또는 그 이하 및 1×10-11 M 또는 그 이하의 IC50으로 측정된다. 용어 "억제 농도 50%"("IC50"으로 축약)는 억제제가 표적으로하는 분자(예를 들면, 경막 포어 헵타머 복합체를 형성하는 알파 독소의 올리고머화)의 소정 활성의 50% 억제에 필요한 억제제(예를 들면, 본원에 제공된 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편)의 농도를 의미한다. 보다 낮은 IC50 값은 대체로 보다 강력한 억제제와 상관된다.
일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 알파 독소의 1 이상의 생물학적 활성을 억제한다. 본원에서 사용하는 용어 "억제"는 활성의 완전한 차단을 포함하여, 생물학적 활성에서의 임의의 통계적으로 유의한 감소를 의미한다. 예를 들면, "억제"는 생물학적 활성에서 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 100% 또는 이 사이의 임의 비율의 감소를 의미할 수 있다. 일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 100% 또는 이 사이의 임의 비율만큼 알파 독소의 1 이상의 생물학적 활성을 억제한다.
일부 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 병원성 에스. 아우레우스에 의해 분비되는 알파 독소를 고갈시킬 수 있다. 일부 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스에 의해 분비되는 알파 독소를 적어도 약 20%, 적어도 약 30%, 적어도 약 40%, 적어도 약 50%, 적어도 약 60%, 적어도 약 70%, 적어도 약 80%, 적어도 약 90%, 적어도 약 95% 또는 약 100% 고갈 또는 이 사이의 임의 비율로 고갈을 얻을 수 있다. 특정 실시양태에서, 실제로 모든 검출 가능한 분비된 알파 독소는 에스. 아우레우스가 감염된 세포로부터 고갈된다.
일정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 감염 및/또는 알파 독소 발현 및 기능에 의해 생성되는 환경에 직접적으로 또는 간접적으로 반응하는 1 이상의 유도성 유전자의 발현을 억제할 수 있다. 특정 실시양태에서, 항-알파 독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 알파 독소 발현 및 기능에 의해 생성된 환경에 직접적으로 또는 간접적으로 반응하는 1 이상의 유도성 유전자의 발현을 적어도 20%, 적어도 30%, 적어도 40%, 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80% 또는 적어도 90% 또는 이 사이의 임의 비율만큼 억제한다.
H. 에스. 아우레우스 표면 항원 및 분비 독소에 대한 항체를 제조하는 방법
이하에 본원에 개시된 항체의 생산을 위한 예시적인 기술을 기술한다. 일부 실시양태에서, 재조합 또는 하이브리드 방법은 본원에 개시된 항체 또는 단편을 생산하는 데 사용될 수 있다. 다른 실시양태에서, 항체 또는 항체 단편은 당분야에 공지된 기술을 사용해 생성된 항체 파지 라이브러리로부터 단리될 수 있다. 당분야에 공지된, 항체를 제조하는 다른 기술을 또한 에스. 아우레우스 표면 항원 및 분비 독소에 대한 항체를 제조하는 데 사용할 수 있다.
일부 실시양태에서, 항-IsdH 항체는 천연 에스. 아우레우스, IsdH, 돌연변이체 IsdH, IsdH의 변이체 또는 항원성 단편을 이용해 생성시킬 수 있다. IsdH를 발현하는 에스. 아우레우스 세포를 이용해 항체를 생성시킬 수 있다. 항-IsdH 항체를 생산하는 데 사용하기 위한, IsdH는 또한 표준 재조합 DNA 기술을 이용해 박테리아 또는 진핵생물 세포로부터 단리된 형태로 재조합적으로 생산할 수 있다.
분비 독소 또는 표면 항원, 예컨대 IsdH에 대한 다클론 항체는 당분야에 공지된 다양한 절차를 통해 생산될 수 있다. 예를 들어, IsdH 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편은 항원에 특이적인 다클론 항체를 함유하는 혈청의 생성을 유도하도록 관련 항원의 피하 또는 복강 주사를 통해 다양한 숙주 동물에 투여될 수 있다. 숙주 동물은 제한없이, 토끼, 마우스, 및 래트를 포함한다. 일부 실시양태에서, 다양한 보조제를 사용하여 숙주 종에 따라서, 면역학적 반응을 증가시킬 수 있고, 제한없이, 프로인트(완전 및 불완전), 미네랄 겔 예컨대 수산화알루미늄, 표면 활성 물질 예컨대 리소레시틴, 플루론 폴리올, 다음이온, 펩티드, 오일 에멀션, 키홀 림펫 헤모시아닌, 디니트로페놀, 및 잠재적으로 유용한 인간 보조제 예컨대 BCG(bacille Calmette-Guerin) 및 코리네박테리움 파븀이 포함된다. 당분야에 공지된 다른 보조제도 사용할 수 있다.
분비 독소 또는 표면 항원, 예컨대 IsdH에 대한 단일클론 항체는 하이브리도마, 재조합, 및 파지 디스플레이 기술 또는 이의 조합의 사용을 포함하여, 당분야에 공지된 광범위한 기술을 이용해 제조될 수 있다. 본원에서 사용하는 용어 "단일클론 항체"는 실질적으로 균질하거나, 또는 단리된 항체의 개체군에서 얻은 항체를 의미하며, 예를 들어서, 그러한 개체를 포함하는 개별 항체는 소량으로 존재할 수도 있는 가능한 천연 발생 돌연변이를 제외하고는 동일하다. 수식어 "단일클론의"는 임의의 특정 방법에 의한 항체의 생산을 요구하는 것으로 한정되는 것이 아니다. 단일클론 항체는 단일클론 포유동물, 키메라. 인간화, 인간, 도메인, 디아바디, 바시바디, 선형 및 다중특이적 항체를 포함한다.
본원에 개시된 항체가 생산되면, 면역글로불린 분자의 정제를 위한 당분야에 공지된 임의의 방법, 예를 들면, 크로마토그래피(예를 들어, 이온 교환, 친화성, 크기분급 컬럼 크로마토그래피), 원심분리, 차등 가용성 또는 단백질 정제를 위한 임의의 다른 기술을 통해 정제될 수 있다. 또한, 본 기술의 항체 또는 이의 단편은 항체 정제 및 후속 분석에서의 사용을 촉진하기 위해서 이종성 폴리펩티드 서열(에피토프 "태그" 및 다른 융합 단백질 예컨대 GST 융합체)에 융합될 수 있다.
일정 실시양태에서, 본원에 개시된 항체는 키메라 항체이다. 키메라 항체는 중쇄 및/또는 경쇄의 일부분이 특정 종에서 유래되거나 또는 특정 항체 부류 또는 하위부류에 속하는 항체의 상응하는 서열과 동일하거나, 또는 상동성인 한편, 사슬(들)의 다른 부류는 다른 종에서 유래하거나, 또는 다른 항체 부류 또는 하위부류에 속하는 항체의 상응하는 서열과 동일하거나, 또는 상동성인 항체와, 목적하는 생물 비인간 영장류(예를 들면, 긴꼬리 원숭이, 예컨대 바분, 레서스 또는 시노몰거스 원숭이)에서 유래된 가변 도메인 항원 결합 서열 및 인간 불변 영역 서열을 포함하는 "영장류화" 항체를 포함한다. 본원에 개시된 키메라 항체는 또한 당분야에 공지된 방법을 이용해 생산된, 인간화 항체를 포함한다.
다른 실시양태에서, 본원에 개시된 항체는 인간 항체이고 당분야에 공지된 방법으로 생성된다. 예를 들면, 완전한 인간 항체는 설치류 또는 다른 동물이 완전한 인간 항체를 생산하도록 설치류 또는 다른 동물에 기능성 인간 항체 유전자좌를 코딩하는 항체의 도입을 통해 생성될 수 있다. 다른 예에서, 인간 항체는 시험관 내 방법에서 유도될 수 있다. 적합한 예로는 제한없이, 파지 디스플레이, 리보솜 디스플레이, 효모 디스플레이, 및 당분야에 공지된 다른 방법이 포함된다. 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 인간 항체 또는 단편을 제조하는 방법의 부가적인 예에는 VelocImmune® 마우스 기술(Regeneron Pharmaceuticals)이 포함된다. 예를 들면, 미국 특허 제6,596,541호(이 전체를 참조하여 편입시킴)를 참조한다.
일정 실시양태에서, 본원에 개시된 항체의 프레임워크 서열을 배선 서열로 복귀, CDR을 배선으로 복귀, 및/또는 구조적 책임 제거가 바람직할 수 있다. 따라서, 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 특정 항체가 아미노산 수준에서 그 개별 배선 서열과 다른 경우, 항체 서열은 배선 서열로 역 돌연변이시킬 수 있다. 이러한 교정 돌연변이는 표준 분자 생물학적 기술을 이용해, 1, 2 또는 3 또는 그 이상의 위치 또는 돌연변이된 위치의 임의의 조합에서 발생될 수 있다.
일정 실시양태에서, 본원은 항체 단편 또는 이들 단편을 포함하는 항체를 포함한다. 항체 단편은 대체로 항원 결합 또는 이의 가변 영역인, 전장 항체의 일부분을 포함한다. 이러한 항체 단편의 예에는 Fab, Fab', F(ab')2, Fd 및 Fv 단편, 디아비다, 선형 항체, 단쇄 항체 분자를 포함하고, 다중특이적 항체는 이들 항체 단편에서 형성된 항체이다.
상기 기술된 인간, 인간화 및/또는 키메라 항체 이외에도, 본원에 개시된 항체는 또한 하기 중 1 이상을 포함하도록 더욱 변형될 수 있다: VL 도메인 및/또는 VH 도메인 및/또는 Fc 영역 내 1 이상의 아미노산 잔기 및/또는 폴리펩티드 치환, 부가 및/또는 결실, 및 번역후 변형. 결실, 삽입 및 치 환의 임의의 조합은 최종 구성체가 목적하는 특징을 보유하는 한, 최종 구성체에 도달하도록 만들 수 있다.
항체가 모이어티에 공유적으로 부착된 항체 접합체가 이들 변형에 포함된다. 항체에 부착하기 적합한 모이어티는 제한없이, 단백질, 펩티드, 약물, 표지, 및 세포독소를 포함한다. 항체에 대한 이들 변화는 에스. 아우레우스 감염 및 관련 질환 또는 질병의 검출, 진단, 및/또는 치료에 적합하므로 항체 특징(예를 들어, 생화학적, 결합 및/또는 기능적)을 변경하거나, 또는 적합화시키기 위해 만들 수 있다. 접합체를 형성하는 방법, 아미노산 및/또는 폴리펩티드 변화, 및 번역후 변형을 만드는 방법이 당분야에 공지되어 있다. 또한, 이들 변형에는 융합 단백질, 즉 이종성 단백질, 폴리펩티드 또는 펩티드에 융합된, 항체 또는 이의 단편이 포함된다.
일정 실시양태에서, 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 항체 또는 단편은 항체의 기능적 및/또는 약동학적 특성을 변화시키기 위해서 Fc 영역에 1 이상의 변경을 만든 변경된 Fc 영역("변이체 Fc 영역"이라고도 함)을 포함하도록 생산될 수 있다. 이러한 변경은 변경된 이펙터 기능, 감소된 면역원성, 및/또는 증가된 혈청 반감기를 만들 수 있다. 일정 실시양태에서, 항체의 이펙터 기능은 제한없이, Fc 아미노산에 아미노산 치환, 아미노산 부가, 아미노산 결실 및 번역후 변형(예를 들면, 당화)의 변화를 포함하여, Fc 영역 내 변화를 통해 변형될 수 있다.
일부 실시양태에서, 천연 Gc 항체에 대해 Fc 리간드(예를 들면, Fc 수용체 예컨대 C1q)에 대한 결합성이 변경된 Fc 변이체 항체를 제조한다. 결합성의 예에는 제한없이, 결합 특이성, 평형 해리 상수(Kd), 해리 및 회합 속도(각각 koff 및 kon), 결합 친화성 및/또는 결합활성이 포함된다.
일정 실시양태에서, 본원에 개시된 항체는 항체의 이펙터 기능을 변경하거나, 또는 표적 항원에 대한 항체의 친화성을 변경시키기 위해서 당화된다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 항체의 가변 영역 내 당화 패턴은 변화된다. 예를 들어, 비당화 항체를 만들 수 있다(즉, 항체가 당화가 결여됨). 당화는 예를 들면 표적 항원에 대한 항체의 친화성을 증가시키기 위해 변경될 수 있다. 이러한 탄화수소 변형은 예를 들면, 항체 서열 내에 1 이상의 당화 부위를 변화시켜 수행될 수 있다. 예를 들면, 당화 부위에서 당을 제거하여서 1 이상의 가변 영역 프레임워크 당화 부위를 제거시키는 1 이상의 아미노산 돌연변이를 만들 수 있다.
일정 실시양태에서, 본원에 개시된 항체는 당분야에 공지된 방법을 이용하여 다른 물질에 접합시키거나 또는 공유적으로 부착시킨다. 일부 실시양태에서, 부착된 물질은 검출 가능한 표지(본원에서는 리포터 분자라고도 함) 또는 고상 지지체이다. 항체에 부착하기 적합한 물질은 제한없이, 아미노산, 펩티드, 단백질, 다당류, 뉴클레오시드, 뉴클레오티드, 올리고뉴클레오티드, 핵산, 햅텐, 약물, 호르몬, 지질, 지질 조립, 합성 중합체, 중합성 미립자, 생물학적 세포, 바이러스, 형광단. 발색단, 염료, 독소, 햅텐, 효소, 항체, 항체 단편, 방사성동위원소, 고체 매트릭스, 반고체 메트릭스, 및 이의 조합을 포함한다. 항체에 다른 물질을 접합시키거나 또는 공유적으로 부착시키는 방법은 당분야에서 공지이다.
I. 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소 항체 또는 단편을 사용한 치료 방법
본원에 개시된 항체 및 단편은 에스. 아우레우스 감염 및 관련 증상 및 병태의 예방을 위해, 부가적인 의학적 제제 예컨대 항생제와 조합하거나, 또는 서로 조합하여, 개별적으로 투여될 수 있다(예를 들면, 알파 독소에 의해 유도되는 초염증을 치료하기 위함). 항체 및 항체 또는 단편은 만성 및 급성 병태, 예컨대 제한없이, 균혈증, 화상, 봉와직염, 피부괴사, 눈꺼풀 감염증, 식중독, 관절 감염증, 신생아 결막염, 골수염, 폐렴, 피부 감염증, 외과적 상처 감염, 화상 피부 증후군, 심장내막염, 뇌수막염, 농양 형성 및 독성 쇼크 증후군을 포함한, 광범위한 병태/질환을 치료하거나, 또는 예방하는 데 사용될 수 있다. 에스. 아우레우스 요법에 적합한 가능한 질환/병태에 대한 추가적인 상세한 설명을 이하에 제공한다.
일정 실시양태에서, 본원에 개시된 1 이상의 항체는 1 이상의 부가적인 치료제(예를 들면, 항생제)와 조합하여 투여될 수 있다. 조합하여 투여할 수 있는 항생제의 예에는 페니실린, 옥사실린, 플루클록사실린, 반코마이신 및 젠타마이신이 포함된다. 일정 실시양태에서, 항생제 및 본원에 개시된 1 이상의 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 이용한 병용 요법은 예를 들면, 항체 단독 요법과 비교하여, 숙주 조직에서 에스. 아우레우스 CFU 농도 감소, 옵소닌에 의한 식작용을 회피하는 에스. 아우레우스의 능력 감소, 및/또는 에스. 아우레우스 병독성 감소에 의해 치료 효능을 증가시킨다.
병용 요법(예를 들면, 1보다 많은 항체와의 치료 또는 예방)은 다수의 비중복 에스. 아우레우스 치료 표적을 제공하여 개별 요법 보다 혜택을 제공할 수 있다. 예를 들면, 분비 독소를 표적으로 하는 항체는 독소의 유해한 효과, 예컨대 알파 독소에 의해 유도된 초염증을 중화시킬 수 있다. 동시에, 표면 항원(예를 들면, IsdH)을 표적으로 하는 공동투여된 항체는 분비 독소를 표적으로 하는 항체에 의해 변경되지 않는, 에스. 아우레우스 콜로니 성장 및 옵소닌에 의한 식작용 회피를 억제할 수 있다. 병용 요법은 또한 요법이 그들 중 일부는 특정 항체에 대한 항원성 표적이 결여될 수 있는, 광범위한 에스. 아우레우스 균주 또는 돌연변이체에 대해 효과적임을 보장할 수 있다.
구체적으로 병용 요법은 표면 결정인자, 예컨대 SdrC, SdrD, SdrE, ClfA, ClfB, IsdA, IsdB, IsdC, IsdE, IsdH 또는 PNAG에 특이적으로 결합하는 1 이상의 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 분비 독소, 예컨대 알파 독소(AT)에 결합하는 1 이상의 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함할 수 있다. 특정 실시양태에서, 병용 요법은 IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 AT에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편; ClfA에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 AT에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편; IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 AT에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편; ClfA에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편; 또는 IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, ClfA에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 AT에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한다. 특정 실시양태에서, 병용 요법은 IsdH에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 AT에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함할 수 있고, 여기서 항-IsdH 항체 또는 이의 단편은 mAB 2F4의 VH 및/또는 VL 또는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VLCDR3을 포함할 수 있고, 항-AT 항체 또는 이의 단편은 mAB LC10의 VH 및/또는 VL 또는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VLCDR3을 포함할 수 있거나 또는 서열번호 130 및 서열번호 131을 포함할 수 있다.
특정 실시양태에서, 항-AT 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 표 7 또는 10에 열거된 임의의 항체의 VH 및/또는 VL 또는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VLCDR3을 포함하고, 항-IsdH 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 표 12에 열거된 임의의 항체의 VH 및/또는 VL 또는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VLCDR3을 포함할 수 있으며, 항-ClfA 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 표 14에 결거된 임의의 항체의 VH 및/또는 VL 또는 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VLCDR3을 포함할 수 있다.
다양한 실시양태에서, 본원에 개시된 항체, 항체의 조합, 및/또는 항체와 항생체의 조합은 에스. 아우레우스 감염을 처치하기 위해 치료적으로 또는 감염을 방지하기 위해 예방으로서 투여될 수 있다. 예를 들면, 병용 요법은 에스. 아우레우스 합병증을 예방하기 위한 수술 전에 또는 수술 동안 얻어진 에스. 아우레우스 감염을 치료하기 위한 수술 후에 투여될 수 있다.
에스. 아우레우스 감염을 치료하거나, 또는 예방으로서 사용하기 위한 약학 조성물을 또한 본원에서 제공한다. 일부 실시양태에서, 약학 조성물은 본원에 개시된 1 이상의 항체 및 약학적으로 허용되는 담체를 포함한다. 용어 "약학적으로 허용되는 담체"는 활성 성분의 효능 또는 생물학적 활성을 방해하지 않는 1 이상의 무독성 물질을 의미한다. 이러한 조제물은 염, 완충제, 보존제, 상용성 담체, 및 선택적으로 다른 치료제를 함유할 수 있다. 이러한 약학적으로 허용되는 조제물은 또한 인간에 투여하기 적합한 상용성 고상 또는 액상 충전제, 희석제 또는 캡슐화제를 함유할 수도 있다. 용어 "담체"는 약학적 투여를 용이하게 하기 위해 활성 성분과 배합되는, 유기 또는 무기 성분, 천연 또는 합성 성분을 의미한다.
본 기술의 치료 조성물은 특정 용량으로 제제화될 수 있다. 용량 계획은 최적의 목적 반응(예를 들면, 치료적 반응)을 제공하도록 조정될 수 있다. 예를 들면, 단일 볼러스가 투여될 수 있고, 몇몇 분배 용량이 시간 경과에 따라 투여되거나 또는 치료적 상황의 긴급 상태에 의해 지시된 바에 따라 비례적으로 감소되거나 또는 증가될 수 있다. 일부 실시양태에서, 선택된 용량은 정맥내, 근육내, 비내, 경구, 국소 도는 피하 전달에 적합하다. 단일 제형을 생산하기 위해 담체 물질과 배합될 수 있는 활성 성분의 양은 치료하려는 피험체, 및 특정 투여 경로에 따라서 다양하게 된다.
본원은 또한 에스. 아우레우스 감염을 치료하는 치료적 용도 또는 이러한 감염을 예방하기 위한 약학 키트를 개시한다. 일부 실시양태에서, 키트는 본원에 개시된 1 이상의 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 약학적으로 허용되는 담체를 포함하는 멸균된 치료적 액상 제제 또는 동결건조된 제제가 충전된 1 이상의 용기를 포함한다. 일부 실시양태에서, 액상 제제가 충전된 용기는 프리필드 시린지이다. 다른 실시양태에서, 멸균된 동결건조 분말 제제가 충전된 용기는 재구성 및 후속 투여에 적합하다. 일정 실시양태에서, 제제는 제한없이, 이종성 단백질, 이종성 폴리펩티드, 이종성 펩티드, 거대 분자, 소형 분자, 마커 서열, 진단 또는 검출제, 치료 모이어티, 약물 모이어티, 방사능 금속 이온, 제2 항체, 및 고상 지지체를 포함하는 1 이상의 다른 모이어티에 재조합적으로 융합되거나 또는 화학적으로 접합된 항체 및 이의 항원 결합 단편을 포함한다. 일정 실시양태에서, 제제는 멸균 액체로서 단일 용랑 바이알에 제제화된다. 일부 실시양태에서, 제제는 프리필드 시린지로 공급된다.
J. 에스. 아우레우스 감염와 연관된 질환
본원에 개시된 바와 같은 항체 및 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 감염과 연관된 질환을 검출, 진단, 예방 및/또는 치료하는 데 사용될 수 있다. 항체는 또한 에스. 아우레우스 감염과 연관된 질환의 1 이상의 증상을 완화 및/또는 예방하는 데 사용될 수도 있다.
본원은 또한, 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합을 포함하는 조성물을 이를 필요로하는 피험체에게 폐렴을 예방, 치료 또는 관리하는 데 효과적인 양으로 투여하는 단계를 포함하는, 피험체에서 폐렴을 예방, 치료 또는 관리하는 방법을 제공한다.
본원에서 사용하는 용어 "치료하다", "치료하는" 또는 "치료"는 치료적 처치 및 예방적 또는 방지적 수단을 의미하고, 여기서 목적은 원하지 않는 생리학적 변화 또는 장애, 예컨대 질환의 진행을 방지하거나, 또는 지연(완화)시키는 것이다. 유용하거나, 또는 바람직한 임상 결과는 제한없이, 증상의 완화, 질환도의 감소, 질환의 안정화(즉, 악화되지 않음) 상태, 질환 진행의 지연 또는 지체, 질환 상태의 완화 또는 경감을 포함한다. "치료"는 또한 치료를 받지 않을 경우 예상되는 생존과 비교하여 장기적인 생존을 의미할 수 있다. 치료를 필요로하는 개체는 이미 병태 또는 질병을 갖는 개체를 비롯하여 병태 또는 질병일 가질 경향이 있는 개체 또는 병태 또는 질병을 예방해야 하는 개체가 포함된다.
일부 실시양태에서, 이를 필요로하는 피험체에게 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 본 발명에 따른 이의 조합을 포함하는 조성물을 피부 감염 병태를 예방, 치료 또는 관리하기에 효과적인 양으로 투여하는 단계를 포함하는 피험체에서 피부 감염 병태를 예방하거나, 치료하거나, 또는 관리하기 위한 방법을 제공한다. 일정 실시양태에서, 피부 감염 병태는 피부괴사이다. 일부 실시양태에서, 피부 감염 병태는 피부의 에스. 아우레우스 감염을 포함한다. 일정 실시양태에서, 이 방법은 피부 감염 병태를 예방한다.
일부 실시양태에서, 본 발명은 이를 필요로하는 피험체에게 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합을 포함하는 조성물을, 투여하는 단계를 포함하는 투석 치료와 연관된 에스. 아우레우스 감염, 고위험 수술, 폐렴, 산소호흡기 관련 폐럼(VAP) 또는 사전 치료 또는 수술용 병원으로부터의 사전 방면 후 재감염을 예방하거나, 치료하거나, 또는 관리하기 위한 방법을 제공한다.
본원은 또한, 일부 실시양태에서, 이를 필요로 하는 피험체에게 세포 용해를 감소시키기에 유효한 양으로, 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 조성물을 투여하는 단계를 포함하는 에스. 아우레우스 감염과 연관된 병태를 예방하거나, 치료하거나, 또는 관리하기 위한 방법을 제공한다. 일정 실시양태에서, 이 방법은 에스. 아우레우스 감염과 연관된 병태를 예방한다. 일부 실시양태에서, 세포는 혈액 또는 폐 유래의 적혈구이다.
본원은 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합의 유효량을 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는 포유동물에서 에스. 아우레우스 연관된 패혈증의 심각성을 예방하거나, 또는 감소시키는 방법을 제공한다. 또한, 본 발명은 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합의 유효량을 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는 포유동물 피험체의 혈류 또는 심장내 에스. 아우레우스 박테리아 부하량을 감소시키는 방법을 제공한다. 본 발명은 또한 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합의 유효량을 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는 포유동물 피험체에서 에스. 아우레우스 박테리아 응집반응(agglutination) 및/또는 혈전색전성 병변 형성을 감소시키는 방법을 제공한다. 에스. 아우레웃 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합의 유효량을 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는 포유동물 피험체에서 에스. 아우레우스 박테리아 응집반응 및/또는 혈전색전성 병변 형성을 감소시키는 방법을 제공한다.
에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합의 유효량을 감염 사건 전에 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는 포유동물 피험체에서 에스. 아우레우스 연관 패혈정을 예방하는 방법을 제공한다. 본원에서 사용하는 용어 "감염 사건"은 피험체가 에스. 아우레우스 감염에 노출되거나 또는 노출될 수 있는 동안의 사건을 의미한다. 예시적인 감염 사건은 제한없이, 머리, 손, 팔, 다리, 몸통, 내부 장기(예를 들면, 심장, 뇌 ,장, 신장, 위, 폐, 간, 비장, 췌장 등), 뼈, 피부를 포함한, 신체의 임의 부분의 수술을 포함한다. 수술은 에스. 아우레우스로 쉽게 감염될 수 있는 상태, 예컨대 개복 수술 상처 및 장기를 제공한다. 추가적인 감염 사건은 개복 상처 또는 아니면 에스. 아우레우스 감염이 신체로 진입할 수 있는 혈류 접근을제공한다. 추가적인 감염 사건은 혈액 수혈, 약물 또는 불법 또는 합법 약물의 주사, 바늘 찔림, 문신 바늘, 정맥내(IV) 선의 삽입 및 유지, 외과적 배출관의 삽입 및 유지, 및 피부 파손 부위, 예를 들면 욕창(욕창성 궤양)을 포함한다.
이 방법들이 에스. 아우레우스 연관 패혈증의 예방을 제공하는 실시양태에서, 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합은 감염 사건의 적어도 1 시간 전에 적절하게 투여된다. 예를 들면, 수술(감염 사건) 전 적어도 1시간 전이다. 적절하게, 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합은 감염 사건 전, 적어도 6 시간, 적어도 12 시간, 적어도 18 시간, 적어도 24 시간, 적어도 30 시간, 적어도 36 시간, 적어도 42 시간, 적어도 48 시간 또는 그 보다 긴 시간 전에 투여된다. 실시양태에서, 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합은 감염 사건 전 적절하게 약 6 시간 ∼약 36 시간, 약 6 시간∼약 36 시간, 약 12 시간∼약 36 시간, 약 12 시간∼약 24 시간, 약 24 시간∼약 36 시간, 약 20 시간∼약 30 시간, 약 20 시간∼약 28 시간, 약 22 시간∼약 26 시간 또는 약 12 시간, 약 13 시간, 약 14 시간, 약 15 시간, 약 16 시간, 약 17 시간, 약 18 시간, 약 19 시간, 약 20 시간, 약 21 시간, 약 22 시간, 약 23 시간, 약 24 시간, 약 25 시간, 약 26 시간, 약 27 시간, 약 28 시간, 약 29 시간, 또는 약 30 시간, 또는 약 31 시간, 또는 약 32 시간, 또는 약 33 시간, 또는 약 34 시간, 또는 약 35 시간 또는 약 36 시간 전에 투여된다,
본원에서 사용하는 에스. 아우레우스 연관된 패혈증의 "예방"은 감염 사건 시에 에스. 아우레우스 연관 패혈증을 얻은 피험체의 위험성을 감소시키는 것을 의미한다. 적절하게, 에스. 아우레우스 연관 패혈증을 얻을 피험체의 위험성이 감염 사건 전에, 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합을 투여하지 않은 피험체와 비교하여 30% 이상 감소된다. 보다 적합하게 위험성은 적어도 40%, 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%만큼 감소되거나 또는 위험성은 감염 사건 전에, 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 투여하지 않은 피험체에 비하여 완전하게 제거된다.
포유동물 피험체에서 에스. 아우레우스 연관 패혈증의 심각성을 감소시키는 방법에서, 이러한 방법은 적합하게, 에스. 아우레우스 연관 패혈증의 증상을 나타내는 피험체에게 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합의 유효량을 투여하는 단계를 포함한다. 이러한 증상은 예를 들면, 오한, 혼란 또는 섬망, 발열 또는 낮은 체온(저체온증), 저혈압으로 인한 약간의 어지러움증, 빠른 심장박동, 몸을 떪, 피부 발진 및 따뜻한 피부를 포함할 수 있다.
본원에서 패혈증과 관련하여 사용되는 "심각성(severity)을 감소시키는"은 에스. 아우레우스 연관 패혈증을 얻은 피험체가 나타내는 증상을 감소시키는 것을 의미한다. 적합하게, 증상은 역시 에스. 아우레우스 연관 패혈증을 얻은 피험체가 나타내지만, 그 피험체는 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 이의 조합을 투여하지 않은 피험체의 증상과 비교하여 30% 이상 감소된다. 보다 적합하게, 증상은 감염 사건 전에 에스. 아우레우스 독소 또는 표면 결정인자에 면역특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 투여하지 않은 피험체와 비교하여 적어도 40%, 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%만큼 감소되거나 또는 증상이 완전하게 제거된다(즉, 피험체는 감염 및 패혈증이 치유됨).
에스. 아우레우스 감염에 의해 야기되는 일부 공통 병태의 비제한적인 예에는 화상, 봉와직염, 피부괴사, 눈꺼풀 감염증, 식중독, 관절 감염증, 폐렴, 피부 감염증, 외과적 상처 감염, 화상 피부 증후군 및 독성 쇼크 증후군이 포함된다. 또한, 외부 이물질 감염, 예컨대 혈관내 내선, 심박조율기, 인공 심장 판막 및 관절 임플란트에서 흔한 병원균이다. 에스. 아우레우스에 의해 야기되는 병태 또는 질환의 일부를 이하에 추가로 기술한다. 이하에 기술된 병태 및 질환의 전체 또는 일부는 병태 또는 질 환 상태의 매개인자 또는 감염의 성분으로서 분비 독소의 직접 작용이 관여되는 반면, 병태의 일부 또는 전체는 분비 독소의 간접적 또는 2차 작용이 포함된다(예를 들면, 병태와 관련된 주요 증상 또는 대부분의 증상을 야기하는 1차적인 병독성 인자로서 또는 세포 기능의 파괴 또는 세포 용해를 통해 질환이 추가로 진행되도록 작용하는 활성제로서).
a) 화상
화상 상처는 흔히 초기에는 소독된다. 그러나, 중간 내지는 심각한 화상은 일반적으로 감염에 대한 물리적 및 면역 장벽을 악화시켜서(예를 들면, 피부의 물집생성, 균열 또는 박리 등), 유체 및 전해질 손실을 야기하고 국소 또는 전신의 생리적 기능장애를 초래한다. 약화된 피부와 살아있는 박테리아의 접촉은 손상 부위에 혼합된 군집화를 일으킬 수 있다. 감염은 화상 표면 상에 비생존성 찌꺼기("딱지")에 국한되거나 또는 군집화가 전체 피부 감염으로 진행하여서 딱지 아래 살아있는 조직을 침입할 수 있다. 보다 심각한 감염은 피부 아래에 도달하여, 림프계 및/또는 혈액 순환계로 들어가서, 패혈증으로 발전된다. 에스. 아우레우스는 전형적으로 화상 상처 감염에 군집화되는 병원균 중에서 발견된다. 에스. 아우레우스는 육아 조직을 파괴할 수 있고 심각한 패혈증을 생성할 수 있다.
b) 봉와직염
봉와직염은 피부층 아래에 확산될 수 있는 표재성 감염으로 흔히 시작되는 피부의 급성 감염이다. 봉와직염은 에스. 파이오제네스(S. pyogenes)와 함께 에스. 아우레우스의 혼합 감염에 의해 가장 일반적으로 야기된다. 봉와직염은 전신 감염을 초래할 수 있다.
c) 피부괴사
피부괴사는 피하 조직 내 근막층에 걸쳐 쉽게 확산되는 피부 및 피하 조직의 감염이다. 이 병태는 피부의 상층 및/또는 하층이 괴사되도록 하고, 내부 조직 및 주변 조직으로 확산될 수 있다.
d) 괴사성 근막염
괴사성 근막염 "살파먹는 질환" 또는 "살파먹는 박테리아 증후군"이라고 한다. 괴사성 근막염은 다균성 감염(예를 들면, 혼합 박테리아 감염에 의해 야기되는 제I형) 또는 단균성 감염(예를 들면, 단일 병원성 박테리아 균주에 의해 야기되는, 제II형)에 의해 야기될 수 있다. 많은 유형의 박테리아가 괴사성 근막염을 일으킬 수 있으며, 이의 비제한적인 예에는 그룹 A 스트렙토코커스(예를 들면, 스트렙토코커스 파이로제네스(Streptococcus pyrogenes)), 스타필로코커스 아우레우스, 비브리오 불니피커스(Vibrio vulnificus), 클로스트리디움 퍼프린젠스(Clostridium perfringens), 및 박테로이데스 프라질리스(Bacteroides fragili)가 포함된다. 면역계가 악화되거나 또는 침체된 개체는 보다 더 피부괴사(예를 들면, 괴사성 근막염)를 앓을 수 있다.
역사적으로, 그룹 A 스트렙토코커스는 제II형 피부괴사성 감염의 대부분 사례의 원인으로 진단되었다. 그러나, 2001년 이래로, 메티실린 내성 스타필로코커스 아우레우스(MRSA)가 단균 괴사성 근막염의 원인으로서 높은 빈도로 관찰되었다. 감염은 중증(예컨대 수술 결과로서)이거나, 경미하거나, 또는 심지어는 분명하지 않을 수 있는, 국소적으로, 종종 외상 부위에서 시작된다. 일반적으로 환자는 피부의 외형이 과도하게 보여져서 극심한 통증을 호소하게 된다. 질환이 진행되면, 조직은 흔히 수시간 내에 부풀게 된다. 설사 및 구토가 또한 흔한 증상이다.
박테리아가 조직 내 깊숙히 존재하면, 염증의 징후는 감염 초기 단계에 명확하지 않을 수 있다. 박테리아가 깊이 존재하지 않으면, 염증 징후, 예컨대 홍조 및 팽창 또는 뜨거운 피부가 급속히 나타난다. 피부 색이 보라색으로 진행되고, 수포가 형성되며, 피부 조직의 후속 괴사(예를 들면, 사멸)가 수반될 수 있다. 괴사성 근막염이 있는 환자는 전형적으로 발열이 있고, 매우 아파보인다. 치료하지 않으면 사망률이 73% 정도로 높다.
e) 폐렴
에스. 아우레우스는 또한 스타필로코커스 폐렴의 원인으로 확인되었다. 스타필로코커스 폐렴은 폐 부종 및 염증을 일으켜서, 폐에 유체가 모이게 한다. 폐에 모인 유체는 산소가 혈류로 들어가는 것을 방해할 수 있다. 인플루엔자가 있는 개체는 박테리아성 폐렴이 발생될 위험성이 있다. 스타필로코커스 아우레우스는 이미 인플루엔자를 앓는 개체에서 박테리아 폐렴의 가장 흔한 원인이다. 스타필로코커스 폐렴의 일반적인 증상은 기침, 호흡 곤란, 및 발열을 포함한다. 부가적인 증상은 피로, 황색 또는 혈 객담, 및 호흡을 악화시키는 가슴 통증을 포함한다. 메티실린 내성 에스. 아우레우스(MRSA)는 점점 더 스타필로코커스 폐렴에서 확인된 균주로 진단되고 있다.
f) 외과적 상처 감염
외과적 상처는 흔히 신체 깊이 침투된다. 상처가 감염되면, 이러한 상처의 감염은 따라서 환자에게 심각한 위험을 제기한다. 에스. 아우레우스는 흔희 외과적 상처에서 감염 병인균이다. 에스. 아우레우스는 특히 침입성 수술 상처에 익숙하고, 봉합 상처는 극소수의 에스. 아우레우스 세포에 의해 감염될 수 있어서 정상 피부의 감염을 야기하는 데 필연적이다. 외과적 상처의 침입은 중증 에스. 아우레우스 패혈증을 초래할 수 있다. 에스. 아우레우스에 의한 혈류 침입은 내부 장기, 특히 심장 판막 및 뼈로의 파종 및 감염을 일으키고, 전신 질환, 예컨대 심장내막염 및 골수염을 야기한다.
g) 화상 피부 증후군
에스. 아우레우스는 "스타필로코커스 화상 피부 증후군", "독성 상피 괴사", "국소 수포성 농가진", "리터병" 및 "라이엘병"이라고도 하는 "화상 피부 증후군"의 주요한 병원균이다. 화상 피부 증후군은 흔히 소아에서 발생하며, 전형적으로 상피층 내에 탈피를 야기하는, 상피용해성 외독소(예를 들면, 종종 화상 피부 증후군 독소라고도 하는, 엑스폴리아틴 A 및 B)를 생산하는 에스. 아우레우스 균주의 번성에 의해 야기되는 발병에서 일어난다. 외독소 중 하나는 박테리아 염색체에 의해 코딩되고 나머지는 플라스미드에 의해 코딩된다. 외독소는 정상적으로는 피부의 과립층 및 유극층을 함께 유지하는, 데스모글레인-1을 절단하는 프로테아제이다.
이 박테리아는 초기에 오직 소수 병변을 감염시키지만, 독소가 세포간 연결부를 파괴하여, 상피층으로 확산되고, 피부의 외층으로 감염이 침투되게하여, 질환의 전형적인 특징인 박리를 일으킨다. 피부 외층의 탈피는 일반적으로 아래의 정상 피부로 밝혀졌지만, 과정 중 유체 손실은 적절하게 치료되지 않으면 영아에서 심각한 손상을 일으킬 수 있다.
h) 독성 쇼크 증후군
독성 쇼크 증후군(TSS)은 소위 "독성 쇼크 증후군 독소"를 생산하는 에스. 아우레우스 균주에 의해 야기된다. 이 질환은 임의 부위에서 에스. 아우레우스 감염에 의해 야기될 수 있지만, 흔히 탐폰을 사용하는 여성만의 질환으로서만 잘못되게 여겨진다. 이 질환은 독혈증 및 패혈증이 관여하고, 치명적일 수 있다.
독성 쇼크 증후군의 증상은 기초적인 원인에 따라서 다양하다. 박테리아 스타필로코커스 아우레우스 감염에 의한 TSS는 전형적으로 인사불성, 혼수상태, 및 다장기 기능부전으로 급속하게 진행될 수 있는, 저혈압, 권태 및 혼란을 수반하는 고발열이 있는, 그렇지 않으면 건강한 개체들에서 나타난다. 병의 초기 과정에서 흔히 보이는 특징적인 발진은 일광화상과 닮았고, 입술, 입, 눈, 손바닥 및 발바닥을 포함한, 신체의 임의 영역을 포함할 수 있다. 감염 초기 공격에서 생존한 환자에서, 10-14일 후, 발진 박리 또는 벗겨짐이 나타난다.
상기 언급한 바와 같이, 에스. 아우레우스 감염을 치료하는 데 통용되는 항생제의 수 증가로, 에스. 아우레우스의 다중 약물 내성 균주가 증가함으로 인해, 메티실린 내성 및 다중약물 내성 스타필로코커스 아우레우스의 감염을 더 이상 통제하거나, 또는 제거할 수 없다. 본원에 기술된 바와 같은 에스. 아우레우스 표면 결정인자 및 분비 독소에 대한 항체는 감염 심각성을 감소시키는 데 도움을 줄 수 있고, 또한 감염된 숙주에서 병원성 에스. 아우레우스를 제거, 방지(예방적으로) 또는 감소시키는데 도움을 줄 수 있을 것이다. 이러한 항체는 또한 에스. 아우레우스를 검출하는 데 사용될 수 있고, 환자 샘플에 존재하는 경우, 에스. 아우레우스 감염을 진단하는 데 사용될 수 있다.
K. 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 대한 항체 또는 단편을 사용하여 에스. 아우레우스를 검출하는 방법
다양한 실시양태에서, 본원에 개시된 항체는 개별적으로 또는 조합하여 샘플 내 에스. 아우레우스의 존재를 검출하는 데 사용될 수 있다.
일정 실시양태에서, 이 방법은 본원에 개시된 단리된 항체 또는 단편 중 하나를 시험 샘플과 접촉시키는 단계를 포함한다. 이어서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소에 결합하여 항원-항체 복합체를 형성한다. 추가 실시양태에서, 이 방법은 항원-항체 복합체를 검출 가능한 표지와 접촉시키는 단계를 포함하고, 여기서 검출 가능한 표지에 의해 생산된 신호는 샘플 내 에스. 아우레우스의 존재와 직접적으로 관련된다. 예를 들어, 검출 가능한 표지는 형광 증가가 샘플 내 에스. 아우레우스 또는 분비 독소의 높은 농도와 관련되도록, 항체-항원 복합체 내 항체 또는 항원에 결합하는 1 이상의 형광 마커를 포함할 수 있다.
다른 실시양태에서, 검출 가능한 표지는 항체 또는 이의 항원 결합 단편에의 결합에 대해 에스. 아우레우스 표면 항원 또는 분비 독소와 경쟁하고, 여기서 검출 가능한 표지에 의해 생산된 신호는 샘플 내 에스. 아우레우스 또는 분비 독소의 농도와 간접적으로 관련된다. 예를 들어, 검출 가능한 표지는 형광 감소가 샘플 내 에스. 아우레우스 또는 분비 독소의 높은 농도와 관련되도록, 항체 결합에 대해 표면 항원 또는 분비 독소와 경쟁하는 1 이상의 형광 마커를 포함할 수 있다.
일정 실시양태에서, 시험 샘플 내 검출 가능한 표지에 의해 생산된 검출 가능한 신호는 기지 농도의 항원 및 항체를 갖는 1 이상의 대조군 샘플 유래의 신호와 비교한다. 대조군 샘플을 이용하는 실시양태에서, 항체-항원 복합체는 검출 가능한 표지를 이용해 대조군 및 시험 샘플에서 검출되고, 샘플 간 검출 가능한 신호에서 임의의 통계적으로 유의한 차이는 시험 샘플 내 에스. 아우레우스 및/또는 분비 독소의 농도, 존재 또는 부재를 의미한다.
다른 실시양태에서, 항체의 조합을 이용해 샘플 내 에스. 아우레우스를 검출한다. 다양한 실시양태에서, 이 방법은 시험 샘플을 에스. 아우레우스 표면 항원에 대한 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 에스. 아우레우스 분비 독소에 대한 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 접촉시키는 단계를 포함한다. 항체 또는 단편의 조합은 이어서 에스. 아우레우스 표면 항원 및 분비 독소와 결합하여 2종의 항원-항체 복합체를 형성한다. 추가 실시양태에서, 이 방법은 항원-항체 복합체를 함유하는 시험 샘플을 1 이상의 검출 가능한 표지와 접촉시키는 단계를 포함하며, 검출 가능한 표지(들)에 의해 생산된 신호는 샘플 내 에스. 아우레우스의 존재와 직접적으로 관련된다. 예를 들어, 검출 가능한 표지(들)는 항체-항원 복합체 중 1 이상 내 항체 또는 항원과 결합하는 1 이상의 형광 마커를 포함하여서, 형광 증가가 샘플 내 에스. 아우레우스 및/또는 분비 독소의 높은 농도와 관련된다.
다른 실시양태에서, 1 이상의 검출 가능한 표지는 항체 또는 단편의 조합에의 결합에 대해 에스. 아우레우스 표면 항원 및/또는 분비 독소와 경쟁한다. 검출 가능한 표지(들)에 의해 생산된 신호는 따라서, 샘플 내 에스. 아우레우스의 농도와 간접적으로 관련된다. 예를 들면, 검출 가능한 표지(들)은 항체 결합에 대해 표면 항원 및/또는 분비 독소와 경쟁하는 1 이상의 형광 마커를 포함할 수 있고, 그 결과 형광 증가는 샘플 내 에스. 아우레우스 및/또는 분비 독소의 높은 농도와 관련된다.
일정 실시양태에서, 시험 샘플 내 검출 가능한 표지에 의해 생산된 검출 가능한 신호는 기지 농도의 항원 및 항체를 갖는 1 이상의 대조군 샘플 유래의 신호와 비교된다. 대조군 샘플을 이용하는 실시양태에서, 항체-항원 복합체는 검출 가능한 표지를 이용해 대조군 및 시험 샘플에서 검출되고, 샘플 간 검출 가능한 신호의 임의의 통계적으로 유의한 차이는 시험 샘플 내 에스. 아우레우스 및/또는 분비 독소의 농도, 존재 또는 부재를 의미한다.
일정 실시양태에서, 이러한 검출 방법은 환자 샘플 내 에스. 아우레우스의 존재를 검출하는 데 사용되고, 이 방법은 에스. 아우레우스 감염으로 환자를 진단하는 단계를 더 포함한다. 일부 실시양태에서, 이 방법은 자동화 또는 반자동화 시스템에 사용되도록 적합화된다.
일정 실시양태에서, 다앙?h 연구 및 진단 목적에 유용한 본원에 개시된 1 이상의 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 키트가 제공된다. 예를 들어, 이러한 캐트는 샘플에서 에스. 아우레우스를 검출하거나, 또는 에스. 아우레우스 분비 독소를 면역침강시키기 위해 사용될 수 있다. 단리 및 정제 목적을 위해, 키트는 비드(예를 들어, 세파로스 비드)에 커플링된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 함유할 수 있다.
본 출원에서, 단수의 사용은 달리 특별하기 언급하지 않으면 복수를 포함한다. 또한, 본 출원에서, "또는"의 사용은 달리 언급하지 않으면 "및/또는"을 의미한다. 또한, 용어 "포함하는"을 비롯하여, 이의 다른 형태 예컨대 "포함하다" 및 "포함되는"의 사용은 제한적이지 않다. 본원에 기술된 임의의 범위는 종결점 및 종결점 사이의 모든 값을 포함하는 것으로 이해한다.
본원에서 사용된 섹션 표제는 조직적인 목적으로만 사용되는 것이고, 기술된 주체를 한정하려는 것이 아니다. 제한없이, 특허, 특허 출원, 기사, 책, 및 논문을 포함하여, 본 출원에 인용된 모든 문헌 또는 문헌의 일부분은 임의의 목적을 위해 그 전체로 참조하여 본원에 명백하게 편입시킨다. 참조하여 편입시킨 공개물 및 특허 또는 특허출원이 본 멍세서에 포함된 발명을 반박하는 정도로, 본 명세서는 임의의 모순되는 물질을 대체할 것이다.
실시예
이하 실시예는 제한없이, 본 발명을 설명하기 위해 제공된다 .
실시예 1 - 재료 및 방법
실시예 2 내지 실시예 9에서 이용된 재료 및 방법을 이하에 제공한다.
용혈 활성의 중화
50 마이크로리터의 각 B 세포 하이브리도마 배양 상등액을 96웰 중에서 재조합 알파 독소-His(rAT-his, 0.1 ㎍/ml의 최종 농도)와 혼합한 후, 50 ㎕의 PBS 중 5% 토끼 적혈 세포(RBC)를 부가하였다. 대조군 웰은 AT가 없거나 또는 AT 단독의 배양 배지 및 RBC를 함유한다. 플레이트를 1시간 동안 37℃에서 항온반응시키고, 온전한 세포를 원심분리를 통해 펠렛화하였다. 50 ㎕의 상등액을 새로운 96웰 플레이트로 옮기고 분광광도계에서 A490을 측정하였다. 중화 활성은 RBC 및 rAT-his 단독을 이용한 용해에 대해 산출하였고, 다음과 같이 계산하였다: 억제율% = 100 x [100-(A490 nAT+ Ab) /(A490 nAT Ab 무함유)].
정제된 mAB를 이용한 억제를 또한 시험하였다. 항-AT mAb를 PBS 중 약 80 ㎍/mL로 96-웰 플레이트에 부가하고 50 ㎕의 최종 부피로 샘플을 PBS에서 연속적으로 희석(2배)하였다. 비특이적 IgG1(R347)을 이소타입 대조군으로 포함시켰다. 25 마이크로리터의 mAb 희석물을 96웰 둥근 바닥 플레이트 내에 약 0.1 ㎍/mL로 25 ㎕의 nAT(천연 알파 독소)와 혼합한 후, 50 ㎕의 5% RBC를 부가하였다. 용혈 활성의 억제는 상기와 같이 계산하였다.
A549 용해의 중화
A549 세포를 필수 아미노산, 글루타민 및 10% 태아 소 혈청이 보충된 RPMI 중에 5% CO2 37℃ 배양기에서 유지시켰다. 세포를 행크 안정화 배지로 1회 세척하고, 5% FBS가 보출된 RPMI에 50 ㎕ 이하로 104/웰로 플레이팅하여 20분간 37℃에 5% CO2 존재하에서 항온반응시켰다. 항-AT mAb를 RPMI 중 80 ㎍/mL로 96웰에 부가하고 샘플을 RPMI 중에서 연속적으로 희석(2배)하였다. 비관련 IgG1(R347)을 이소타입 대조군으로 포함시켰다. 개별적인 96웰 플레이트에서, 30 ㎕의 희석된 항체를 30 ㎕의 nAT(최종 농도, 5 ㎍/ml)와 혼합하였다. 각 웰에서 50 마이크로리터를 부착성 A549 세포가 함유된 플레이트로 옮겼다. nAT가 존재하거나, 또는 존재하지 않는 A549 세포의 대조군 웰을 3시간 동안 37℃에서 5% CO2 존재하에 항온반응시키고, 원심분리하였으며, 50 ㎕의 상등액을 새로운 96웰 플레이트로 옮겼다. 세포 용해는 제조하의 프로토콜에 따라서 사이토톡스 96 비방사능 분석 키트(Promega)를 이용해 락테이트 디히드로게나아제(LDH)의 방출로서 측정하였다. 배경 LDH값을 각 웰에서 빼고 LDH 방출 억제를 다음과 같이 계산하였다: 억제율% = 100 x [100-(A590 nAT+ Ab) /(A590 nAT Ab 무함유)].
THP-1 용해의 중화
THP-1 세포를 비필수 아미노산(Invitrogen), 2 mM 글루타민(Invitrogen) 및 10% 태아 소 혈청(Invitrogen)이 보충된 RPMI 배지(Invitrogen) 중에 5% CO2 37℃ 배양기에서 유지시켰다. 항-AT mAb를 RPMI 중 80 ㎍/mL로 96 웰 플레이트에 부가하였고, 샘플은 최종 부피 50 ㎕로 RPMI 중에서 연속 희석(2배)하였다. 비관련 IgG1(R347)을 이소타입 대조군으로 포함시켰다. 25 마이크로리터의 mAb 희석물을 최종 1.5 ㎍/mL로 25 ㎕의 천연 알파 독소(nAT)와 혼합한 후, 50 ㎕의 RMPI를 부가하고 96웰 중 THP-1 세포(10% FBS가 보충된 RPMI 중 106 세포/ml)를 세척하였다. 대조군 웰은 단독으로 또는 nAT와 함께 THP-1 세포로 구성된다. 플레이트는 3시간 동안 5% CO2 37℃ 배양기에서 항온반응시켰고, 원심분리하였으며, 50 ㎕의 상등액을 새로운 96웰 플레이트로 옮겼다. 세포 용해는 제조사의 지시에 따라서 사이토톡스 96 비방사능 분석 키트(Promega)를 이용해 락테이트 디히드로게나아제(LDH)의 방츨로 측정하였다. LDH 방출 억제는 상기 기술된 대로 계산하였다.
쥣과동물 폐렴 모델
감염 24시간 전에 10마리 7-9주령 C57BL/6J 마우스 그룹은 i.p. 주사를 통해 표시된 농도로 0.5 mL의 mAb를 투여받았다. 이어서 동물들을 이소플루오란으로 마취시키고 수직으로 유지시켰으며, 0,05 mL의 멸균된 PBS 중 에스. 아우레우스 박테리아 현탁액(1x108 CFU∼3x108 CFU)을 좌측 및 우측 콧구멍에 접종하였다. 동물들을 회복을 위해 반듯이 누운 위치로 케이지에 놓았고 실험 기간 동안 1일 2회 관찰하였다. 동물 생존은 최대 6일 동안 모니터링하였다.
다르게, 동물들을 박테리아 감염 48시간 후 CO2 흡입으로 안락시키몄다. 폐 및 신장을 멸균된 PBS로 옮기고, 균질화시키고 희석하였으며 박테리아 수측정을 위해 플레이팅하였다. 폐사율 실험의 통계적 유의성은 로그 순위 검정을 이용해 확인하였다. 장기로부터 박테리아 회수율의 유의성은 분산 분석 및 던네트 사후 검정법을 이용해 계산하였다.
피부괴사의 쥣과동물 모델
5마리의 6-8주령 암컷 BALB/c 마우스(Harlan) 그룹은 그들 등을 면도하고 그래프 상에 표시된 농도로 0.5 mL IgG를 복강 주사를 통해 투여받았다. 24시간 후, 마우스를 50 mL의 박테리아 현탁액(1×108 에스. 아우레우스)의 피하 주사를 통해 감염시켰다. 동물은 매일 동시에 측정되는 농양의 크기 및 감염 징후에 대해 1일 2회 모니터링되었다. 병변의 면적은 다음의 식을 이용해 계산되었다: A=L x W. 통계적 유의성은 분산 분석 및 던네트의 사후 검정법을 이용해 결정되었다.
패혈증의 쥣과동물 모델
박테리아 공격 용량의 조제물: 에스. 아우레우스 SF8300(USA300)은 Binh Diep(University California San Francisco)가 제공하였다. 박테리아는 250 rp에서 진탕하면서 50 mL의 트립신 대두 액체배지(TSB)에서 37℃에서 밤새 배양하였다. 밤샘 배양물로부터의 10 mL을 1 L의 신선한 TSB에 부가하였고, 진탕하면서 0.8의 600 nm의 광학 밀도(OD600)까지 37℃에서 박테리아를 성장시켰다. 박테리아를 4℃에서 15분간 8000 rpm에서 원심분리하여 회수하고 인산 완충 염수(PBS)로 세척하였다. 박테리아를 원심분리를 통해 회수하고 ∼2 x 1010 cfu/mL의 최종 박테리아 스톡 농도로 10% 글리세롤이 있는 PBS에 재현탁시켰다.
마우스 공격 및 생존: 8-9주령 암컷 BALB/c 마우스 그룹을 500 ㎕의 PBS 중 R347(45 mg/kg) mAb 또는 표시된 농도의 LC10으로 복강내(IP) 주사하였다. 이어서 200 ㎕의 박테리아 현탁액(동결 스톡 유래의, pH 7.2의 PBS에 희석된 5×107 cfu)으로 24시간 후 꼬리 정맥에 정맥내(IV)로 공격하였다. 마우스는 공격 후 14일 동안 생존에 대해 모니터링하였다. 통계 분석은 로그 순위 검정법으로 평가하였다: R347(대조군) 대 LC10(항-AT Ab) 면역된 동물.
심장 내 박테리아 부하량: 감염된 마우스를 감염 수 14시에 CO2로 안락사시켰다. 심장을 제거하고, 1 mL 냉 PBS 중 용해 매트릭스 A 튜브에서 균질화하였고, 박테리아 수측정을 위해 TSA 플레이트 상에 플레이팅하였다. 심장 조직 내 박테리아 부하량은 비쌍 양측 꼬리 스튜던트 t-검정법을 이용해 R347 및 LC10 mAB 간의 쌍대 비교로 분석하였다. 데이타는 p < 0.05이면 유의한 것으로 고려하였다.
혈액 내 박테리아 부하량: 동물들을 감염 후 8, 24, 48, 72, 및 144시간에 CO2로 안락사시켰다. 혈액은 심장 천자를 통해 채취하였고, 100 ㎕를 cfu 수측정을 위해 TSB 플레이트 상에 즉시 플레이팅하였다. 데이타는 단측 스튜던트 t 검정법을 통해 분석하였다. 값은 p < 0,05이면 LC10과 R347 mAb간에 통계적으로 상이한 것으로 고려하였다.
수용체 결합 분석
일정하게 교반하면서 4℃에서 o/n으로 500 mL의 용해 완충액(5 mM 인산염, 1 mM EDTA, pH 7.4) 중에 5 mL의 세척하고 팩킹된 토끼 적혈구 세포(RBC)와 항온반응시켜 적혈 세포 고스트를 준비하였다. 이 고스트를 이어서 15,000 x g에서 원심분리하여 제거하고 용해 완충액으로 3x 세척하였다. 이들을 이어서 PBS로 세척하고 3 mL의 최종 부피로 재현탁하였다.
세포막에 nAT의 결합을 평가하기 위해서, RBC 고스트를 PBS 중 대략 0.2의 OD600으로 희석하고 50 ㎕를 1/2-웰 96웰 플레이트(Costar) 상에 코팅하고 4℃에서 밤새 항온반응시켰다. 이어서 액체를 플레이트로부터 제거하고 이 웰을 4℃에서 2시간 동안 pH 7.4의 PBS 중 1% BSA 100 ㎕로 차단시켰으며 PBS로 3x 세척하였다. 20 몰 과량의 IgG를 3 ㎍/mL의 AT와 혼합하였고 50 ㎕를 차단된 플레이트에 부가하였다. 플레이트를 2시간 동안 4℃에서 항온반응시켰고 PBS로 3x 세척하였다. 바이오틴 표지된 토끼 항-AT IgG를 1 mg/mL로 웰에 부가하였고, 1시간 동안 4℃에서 항온반응시켰으며, 3x 세척하였고, 스트렙타비딘 퍼옥시다아제 접합체(1:30,000, Jackson Immunoresearch)와 항온반응시켰다. 웰을 3x 세척하였고, Sure Blue Reserve(KPL, Inc.)로 발색시켰다. 플레이트 판독기(Molecular Devices)로 A450을 판독하였고 AT 결합%를 계산하였다. AT 결합% = 100 x(A450 - AT + IgG/ A450 - AT 단독).
운동 속도 및 결합 상수(KD)의 측정
정제된 nAT에 항-AT IgG 항체의 결합에 대한 운동 속도 상수(kon, koff)는 BIAcore 3000 장비(BIAcore, Inc) 상에서 IgG-포획 분석 포맷을 적용하여 측정하였다. 간략하게, 래트 항-마우스-IgG를 제조사의 지시에 따라서 CM5 센서 칩 상에 고정하였다. 센서 칩 상에 포획 시약의 최종 표면 밀도는 본원에 기술된 바와 같이 대략 2500 반응 유닛(RUs)이었다. 기준 유세포 표면을 또한 동일한 고정 프로토콜을 이용하고, nAT를 생략하고 이 센서 칩 상에서 준비하였다. 항-AT IgG 항체는 nAT의 2배 연속 희석물과 함께 장비 완충액(0.01 M HEPES, pH 7.4, 0.15 M NaCl, 3 mM EDTA 및 0.005% P-20을 함유한 HBS-EP 완충액) 중에 20 nM로 준비하였다. nAT 연속 희석액은 장비 완충액중에서 약 0.78 nM∼약 50 nM로 제조하였다.
순차적인 접근법을 운동성 측정을 위해 이용하였다. 각 항-AT IgG는 50 ㎕/분의 유속으로 포획 및 기준 표면 상에 먼저 주사하였다. 포획된 IgG의 결합이 안정화되면, 단일 농도의 nAT 단백질을 50 ㎕/분의 유속으로 양 표면 상에 주사하였다. 얻어진 결합 반응 곡선을 이용하여 회합 층 데이타를 결정하였다. nAT의 주사 후, 이어서 회합 층 데이타를 수집할 수 있도록 10분간 장비 완충액으로 다시 바꾸었고 이어서 pH 1.5의 10 mM 글리신을 1분간 펄스하여 칩 상의 IgG 포획 표면을 재생하였다. 각 농도의 nAT의 이중 주사에 의한 결합 반응을 모든 항-AT IgG에 대해 기록하였다.
부가적으로, 몇몇 완충액 주사는 주사 시리즈 전체를 통해 배치하였다. "이중-기준화"라고 통상적으로 언급되는 주사 인공물 및/또는 비특이적 결합 상호작용에 대한 미가공 데이타 세트를 보정하기 위해 기준 세포 반응과 함께 선택 완충액 주사를 이용하였다(D.G. Myszka, Improving biosensor analysis. J. Mol. Recognit. 12(1999), pp. 279-284). 이어서 완전하게 보정된 결합 데이타를 검출되어야 하는, 질량 수송-제한 결합에 대해 보정하기 위한 용어를 포함하는 1:1 결합 모델(BIAevaluation 4.1 소프트웨어, BIAcore, Inc, Uppsala, Sweden)에 대해 적합화시켰다. 이들 분석은 운동 속도(on, off) 상수를 결정하였고, 이로부터 명확한 KD를 koff/kon로서 산출하였다.
에스. 아우레우스 감염된 폐에서 사이토카인 수준의 측정
7 내지 9주령 C57BL/6J 마우스를 1.5 x 108 cfu USA300(BAA-1556, ATCC)으로 비내 감염시키기 전 24시에 복강내 주사를 통해 2A3.1hu(완전한 인간 2A3.1) 또는 R347(45 mg/kg)를 처리하였다. 감염 수 4시간 및 24시간 후에, 마우스를 안락사시키고 폐를 1 mL의 PBS로 3x 씻어냈다. 기관지 폐포 세척액(BAL)을 -70℃에 보관하였다. 향염증성 사이토카인을 제조사의 지시서에 따라서 7 향염증성 II 마우스 사이토카인 키트(Mesoscale, Gaithersburg, MD)를 이용하여 정량하였다. 사이토카인 수준을 pg/mL로 표시하였다.
도트 블랏 분석
아미노산 40 내지 293이 내포된 중복 펩티드를 화학적으로 합성하였다(New England Peptide). AT1-50의 합성을 시도하였지만 성공적이지 않았다. 알파 독소(AT), AT 펩티드 및 AT 단편(1 ㎍)을 니트로셀룰로스 상에 찌고 PBS 중 블록커 카세인으로 10분간 차단하였다. 블랏을 이어서 실온에서 3시간 동안 2 ㎍/mL의 개별 IgG로 프로빙하였다. 블랏을 세척하고 알칼리 포스파타아제 접합된 염소 항-마우스 또는 염소 항-토끼 IgG(1:1000, Caltag Laboratories)와 1시간 동안 항온반응시키고 BCIP/NBT 막 포스파타아제 기질 시스템(KPL, Inc)을 이용해 발색시켰다.
실시예 2 - 표적 선택 및 타당성 검증
임상 단리주에 걸친 보존성 및/또는 공개된 백신 잠재성에 기초하여, 항체 표적으로서의 타당성 검증을 위해 13종의 표면 항원 및 4종의 분비 독소를 선택하였다. 이 그룹에 알파 독소 및 3종의 가용성 모듈린(PSM)이 포함된다. 또한 8종의 스타필로코커스 세포벽에 앵커링된 항원/어드헤신을 포함시켰다. 선택된 표적 중 5종은 에스. 아우레우스 및 에스. 에피더미디스(S. epidermidis)에서 상동성을 갖는다. 이들 표적은 영양소 획득, 생물막 형성, 및 세포 분열에 관여한다. 알파 독소에 대한 항체를 독소 활성 예컨대 조직 손상 및 면역 이상조절을 감소시키거나 또는 중화시키는 가설된 방법에서 표적으로 삼았다. 또한 에스. 아우레우스 군집화, 면역 회피, 및 건강성에 중요한 에스. 아우레우스 표면 결정인자(IsdH, SdrC, ClfB, ClfA 및 IsdB)를 표적으로 하였다. 항체 요법을 강화시키기 위해 고려되는 잠재적인 접근법은 옵소님 및 독소-중화 단일클론 항체를 배합하는 것을 포함한다.
동정된 표적에 대해 발생된 항체는 감소된 병독성 및/또는 감소된 군집화 및 면역 회피에 대해 시험관 내 및 생체 내 분석 둘 모두에서 평가하였다. 표적 적합성은 또한 쥣과동물 감염 모델에서 능동/수동 면역화를 통해 검증하였다.
실시예 3 - 항-IsdH 항체의 동정
동정된 주요 표적은 에스. 아우레우스 철 조절 표면 결정인자 H(IsdH)였다. IsdH는 B1b와 B2 β-시트 사이에 7개의 아미노산 루프를 포함하고. 이러한 7개 아미노산 루프는 IsdA 및 IsdB를 포함하여, 철 조절 표면 결정인자 패밀리의 몇몇 구성원 간에 보존적이다. 이 7개 아미노산 루프 내 돌연변이는 100배가 넘게 에스. 아 우레우스가 해모글로빈에 결합하는 능력을 감소시키고, 또한 식작용 사멸을 회피하는 에스. 아우레우스의 능력을 손상시킨다(Visai et al., J. Microbiology, 155(3): 667-679(2008)).
항-IsdH 단일클론 항체(mAB)는 VelocImmune mice®(Regeneron Pharmaceuticals) 및 파지 패닝(Dyax 또는 CAT 라이브러리)을 이용해 동정하였다. 59종 IgG 항체를 정제하였다(Dyax 라이브러리 유래 29종, CAT 라이브러리 유래 16종, 및 VelocImmune mice 유래 14종).
실시예 4 - 항-IsdH mAB 스크리닝 캐스캐이드
동정된 항-IsdH mAB는 시험관내에서 전체 세포 에스. 아우레우스 결합에 대해 ELISA를 통해 평가하였다. 또한, 항체는 에스. 아우레우스 햅토글로빈 결합의 억제에 대해 ELISA를 통해 스크리닝되었다. 이어서 항체는 옵소닌에 의한 식작용 사멸 분석법(OPK)(이하에 기술됨)으로 평가하였다. 4종의 에스. 아우레우스 단리주에 대해 옵소닌영향성인 11종 항-IsdH IgG 항체를 동정하였다. 5종 항-IsdH 항체는 마우스 감염 모델에서 생체 내 계대 후 에스. 아우레우스에 효과적으로 결합하였다(이하에 기술함). 이들 상위 5종 항-IsdH mAB(Dyax 라이브러리 유래 3종 및 CAT 라이브러리 유래 2종)는 항체 생산의 규모 확장, 친화성 시험, 및 후속 생체내 시험을 위해 선택되었다. 생체 내 시험은 균혈정 모델에서의 실험을 포함하였다(이하에 기술함). 항체 2F4는 균혈증 모델에서 CFU를 유의하게 감소시켰다. 5종의 항체를 이어서 특징규명하였고 병용 요법에서의 사용에 대해 평가하였다.
옵소닌에 의한 식작용 사멸(OPK) 분석법은 10 ㎕의 에스. 아우레우스(106 세포/ml), 10 ㎕의 단일클론 항체, 및 0.1% 젤라틴이 더해진 60 ㎕의 DMEM의 배합을 포함한다. 이 용액을 30분간 4℃에서 항온반응시켰다. 30분 후, 107 세포/ml로 10 ㎕의 인간 전골수구 백혈병(HL-60) 세포를 10 ㎕의 에스. 아우레우스에 대해 사전 흡착된 인간 혈청과 함께 부가하였다. T0 시점에, 10 ㎕의 용액을 플레이팅한 후 37℃에서 1500 rpm으로 진탕하면서 60분간 항온반응시켰다. T60 시점에, HL-60 세포를 1% 사포틴으로 용해시키고, 재플레이팅하였고, CFU 농도를 결정하였다. OPK 비율은 다음과 같이 산출하였다: 100 x(1-(T60/T0)), 여기서 T60은 분석 종료 시(즉, 60분에) CFU 농도를 의미하고 T0는 분석 시작 시 CFU 농도를 의미한다.
추가 실험 가치가 있는 4종 에스. 아우레우스 단리주에 대해 충분하게 옵소닌영향성이 있는 11종 단일클론 항-IsdH 항체를 동정하였다. 도 19는 에스. 아우레우스 균주 뉴만 및 USA300으로 검사 시, 대조군 항체 R347과 비교하여, 항체 B11, 2F4, 및 A7이 OPK 비율이 높음을 보여준다.
항체에 의해 표적이 되는 항원을 생체내에서 에스. 아우레우스가 발현하는지 여부를 확인하기 위해서, 마우스에서 생체 내 계대 후 항체 결합을 평가하였다. 마우스를 대략 5x108 CFU의 에스. 아우레우스로 복강내 공격하였다. 1 내지 6시간 후, 마우스를 방혈하여서 혈액을 얼음 냉각 사이트레이트에 모았다. 진핵생물 세포는 1% NP-40으로 용해시켰다. 용해된 세포를 인산염 완충 염수(PBS)로 3회 세척하고 초음파처리한 후, 완충액 중에 에스. 아우레우스 박테리아를 재현탁하였다(대략 0.5-10x106 CFU를 용해 및 재현탁 후 회수함). 항-IsdH 항체를 세포 용해물에 투여하였고, 항체 결합은 염색 및 FACS 분급을 통해 평가하였다.
생체내 계대 이후 11종 항-IsdH mAB 중 5종(1C1, 2F4, A7, IsdH003, 및 IsdH0016으로 표시)이 에스. 아우레우스에 결합하였다. 도 2는 에스. 아우레우스 균주 ARC2081 및 USA300에서, 대조군 항체 R347과 비교하여, 항체 B11, 2F4, A7, 및 1C1의 결합을 도시한다. 이 도면은 항체 2F4, A7, 및 1C1이 생체외에서 에스. 아우레우스에 결합함을 보여준다.
5종 항-IsdH mAB 중 2종(1C1 및 2F4)이 또한 IsdH에의 결합에 대해 햅토글로빈(Hp)과 경쟁하는 한편, 다른 3종은 그렇지 않았다. 도 3은 IsdH 상의 서브유닛 Neat-1과의 경쟁에 대해 항체 1C1이 Hp와 경쟁함을 보여준다. 고농도의 1C1(㎍/ml)은 대조군 항체 R327 존재 하에서 Hp 결합과 비교하여, IsdH와 Hp 결합의 감소와 관련된다. 유사하게, 도 3은 IsdH 상의 서브유닛 Neat-2에의 결합에 대해 Hp와 경쟁한다. 고농도의 2F4(㎍/ml)는 대조군 항체 R347 존재 하에서 Hp 결합과 비교하여, IsdH와 Hp 결합의 감소와 관련된다.
항체 1C1, 2F4, A7, IsdH003, 및 IsdH0016가 생체 내 투여시 효과적인지 여부를 평가하기 위해서, 마우스 균혈증 모델을 적용하였다. 마우스를 45, 15 또는 5 mg/kg의 단일클론 항체로 복강내 주사한 후, 밤새 회복되도록 하였다. 다음 날, 마우스를 대략 108 CFU의 에스. 아우레우스(뉴만 균주)로 복강내 감염시켰다. 대략 4 시간 후, 혈액을 채취하고 CFU 농도를 평가하였고, log[CFU/ml]로 측정하였다. 도 4는 항체 1C1, A7, IsdH003, 및 IsdH0016이 균혈증 모델에서 CFU 농도를 감소시키지 않았음을 보여준다. 그러나, 도 5는 항체 2F4 용량이 쥣과동물 균혈증 모델에서 CFU 농도를 감소시킴을 보여준다.
항체 2F4는 에스. 아우레우스의 다양한 균주와의 생체 외 결합에 대해 추가로 평가하였다. 마우스에서 생체 내 계대 및 추출 후 에스. 아우레우스의 25 단리주 중 23종에 이 항체가 결합하였다. 도 6은 균주 ARC2379(USA100), ARC2081(USA200) 및 BAA-1556(USA 300)에서 2F4 결합을 보여준다. 아래 표는 마우스에서 25종 에스. 아우레우스 균주의 생체 내 계대 후 결합 실험 결과를 나타낸다.
에스. 아우레우스 균주의 생체 내 계대 후 항체 2F4의 결합
Figure 112015054033139-pct00001
항체 2F4는 또한 에스. 아우레우스 임상 단리주 - 뉴만, ARC634(USA100), ARC2081(USA200), 및 BAA-1556(USA300)를 포함하는 OPK 분석법에서 평가하였다. 도 7은 2F4가 주요 에스. 아우레우스 임상 단리주에 대해 옵소닌영향성임을 보여준다.
2F4를 후속하여 hu IgGFc 포획 분석에서 Neat-2 서브유닛에 대한 IsdH의 친화성을 평가하였다. 3회 실험을 통해 평균낸 평균 친화성은 IsdH에 대한 KD가 3.66 nM이고 Neat-2에 대한 KD가 2.57 nM임을 밝혀주었다. 도 8
실시예 5 - 항-IsdH 및 항-AT 항체 병용 요법
알파 독소 및 IsdH는 에스. 아우레우스 감염 후 병인기전 동안 다른 역할을 한다. 전자는 분비 독소이지만, 후자는 군집화, 면역 회피, 및 박테리아 건강성에 중요한 표면 단백질이다. 이 2가지는 감염 동안 에스. 아우레우스에 의해 차등적으로 발현될 수 있다. 상이한 작용 방법을 갖는 단일클론 항체들의 조합은 강력하게 부가적이거나 또는 상승적인 효과를 생성할 수 있는 한편, 균주가 요법을 회피할 수 있는 위험성을 감소시킨다.
항-알파 독소 항체인 2A3을 항-IsdH 항체인 2F4와 조합하여 사용하는 것에 대해 평가하였다. 조합하여 투여시, 항체 2A3 및 2F4는 장기 부하 모델에서 상승적인 효과를 나타내었다. 도 9는 에스. 아우레우스 균주 USA300의 신장 분포가 단독 항체 또는 대조군 항체 R347과 비교하여 두 항체 모두가 존재 시 감소함을 보여준다.
이들 병용 요법 실험 결과는 에스. 아우레우스의 예방 또는 치료에 대한 병용 접근법이 효과적일 수 있음을 시사한다.
실시예 6 - 항-ClfA mAb는 ClfA 결합을 억제한다.
항-ClfA mAb는 시험관 내에서 고정화된 피브리노겐에 대한 ClfA의 결합을 억제한다. 병독성 인자로서 ClfA는 혈장에 존재하는 피브리노겐에 에스. 아우레우스 결합을 촉진하는 것으로 보고되었다. 이는 혈액 내 박테리아 응집반응을 일으킨다.
고정화된 피브리노겐에 대한 ClfA 결합을 억제하는 B 세포 하이브리도마 기술을 통해 생성된 3종의 항-ClfA mAb의 능력을 평가하였다. 항체 R347은 음성 대조군으로 사용하였다. 이 분석에서 각 항-ClfA mAb 활성은 50% 결합 억제를 촉진하는 데 필요한 농도인, IC50에서 계산하였다. 도 10에 도시된 바와 같이, 각 항체의 IC50과 함께, 항-ClfA 항체는 고정화된 피브리노겐에 대한 ClfA의 결합을 억제하였다.
실시예 7 - 항-ClfA mAb11H10은 3종의 상이한 임상 단리주가 있는 인간 혈장에서 에스. 아우레우스 응집을 억제한다.
인간 혈장에서 에스. 아우레우스 응집을 평가하기 위해서, 박테리아를 각 항-ClfA mAb와 항온반응시키고, 37℃에서 3분 항온반응 후 박테리아 응집반응을 시각적으로 조사하였다. 보다 정확한 비교를 위해서, 이 분석에서 mAb 활성은 응집을 억제하는 데 필요한 최소 농도에서 비교하였다. 11H10이 27H4 또는 23D6보다 효과적이었다(도 11). 또한, 응집 실험은 3종의 상이한 임상 단리주를 사용해 수행하였고, 11H10은 1 또는 2종 균주를 포괄하는 2종의 다른 항-ClfA mAb와 비교하여 이들 3종 단리주에 대해 억제를 나타냈다.
실시예 8 - 11H10에 대한 에피토프 결합
상기 기술된 바와 같이 23D6 및 27H4와 비교시 11H10의 상이한 특징을 고려할 때, 그 결합 특징을 추가로 조사하였다. 11H10이 23D6 및 27H4와 다른 에피토프에 결합하는지를 평가하기 위해서 에피토프 경쟁 결합을 Octet를 통해 실시하였다. 도 12에 도시한 바와 같이, 23D6 및 27H4는 ClfA에의 결합에 대해 경쟁하여서, 이들이 결합을 위한 ClfA 상의 공통 영역을 공유할 수 있음을 시사하였다. 그러나, 11H10과 23D6 또는 11H10과 27H4 사이에서는 경쟁이 존재하지 않아서, ClfA 상의 11H10 에피토프는 23D6 및 27H4에 대한 것과는 다름을 보여주었다.
실시예 9 - 항-ClfA mAb 11H10을 이용한 수동 면역은 치사 IV 공격 모델에서 효능을 나타낸다.
심장 내 박테리아 부하량
스타필로코커스 응집이 생체내에서 발생하는지 여부를 검사하기 위해서, 마우스를 먼저 USA300 단리주로 꼬리 정맥을 공격하였고, 박테리아 수는 감염 14시간 후 심장에서 측정하였다. 도 13에 도시한 바와 같이, 45 mg/kg으로 항-ClfA mAb 11H10의 복강내(IP) 예방적 투여는 심장 내 박테리아 cfu의 유의한 감소를 일으켰다(p=0.031). 이는 음성 대조군 R347과 비교하여 15 mg/kg의 11H10만이 심장에서 박테리아 부하량을 약하게 감소시키므로 용량 의존적이었다.
생존
IV 공격을 위한 USA300 공격 용량은 2주후에 20% 생존을 유도하도록 결정하였다. 동물 생존성을 증가시키는 항-ClfA mAb 11H10의 능력을 이 모델에서 조사하였다. 도 14는 11H10 주사가 감염 후 2주 동안 생존을 유의하게 증가시킴을 보여준다(45 mg/kg에서 p=0.0114, 및 15 mg/kg에서 p=0.0239).
실시예 10 - 치사 IV 공격 모델에서 항-ClfA mAB 11H10 및 항-AT Ab LC10 조합의 효능
6주령 암컷 BALB/c 마우스를 표시된 농도(500 ㎕ PBS에 희석)의 mAb로 복강내(IP) 수동 면역시켰고, 24시간 후 꼬리 정맥에 박테리아의 LD20 용량을 정맥내(IV) 공격하였다(200 ㎕ PBS). 생존은 감염 수 14일까지 모니터링하였다.
데이타는 로그 순위(만텔-콕스) 검정법으로 분석하였고, p 값은 = 0.05이면 통계적으로 유의한 것으로 간주하였다. 스타필로코커스 응집이 생체내에서 발생하는지 여부를 검사하기 위해서, 마우스를 먼저 CA-MRSA USA300, HA-MRSA-100 또는 HA-MSSA USA200 단리주로 꼬리 정맥에서 공격하였고, 박테리아 수를 감염 14시간 후에 심장 및 신장에서 측정하였다.
치사 IV 공격 모델에서 항-ClfA mAB 11H10 및 항-AT Ab LC10 조합의 조합물의 효능을 시험하였다. 도 15에 도시한 바와 같이, 항-ClfA mAb 11H10, 항-AT LC10 mAb, 및 항-ClfA mAb와 항-AT LC10 mAb의 조합의 예방적 투여는 심장(도 15b) 및 신장(15c)에서 박테리아 cfu의 유의한 감소를 일으켰다.
도 15는 또한 USA300 공격 용량릉 사용한 IV 공격 모델에서 조사한 바와 같이 동물 생존을 증가시키는 항-ClfA mAb 11H10, 항-AT mAb LC10 및 항-ClfA mAb 11H10와 항-At mAb LC10의 조합의 능력을 보여주었다. 도 15a는 두 항체의 조합이 대조군과 비교하고 항-ClfA mAb 및 항-AT mAb 단독과 비교하여 감염 수 2주 동안 생존에 대한 반응을 유의하게 증가시킴을 보여준다.
도 16 및 17은 HA-MRSA USA100 공격 용량(도 16) 및 HA-MSSA USA200 공격 용량(도 17)을 사용한 IV 공격 모델에서 조사한 바와 같이, 동물 생존을 증가시키는 항-ClfA mAb 11H10과 항-At mAb LC10의 조합의 능력을 추가적으로 보여준다.
실시예 11 - 치사 IV 공격 모델에서 항-IsdH mAb 2F4 및 항-AT Ab LC10 조합의 효능
실험은 실시예 10에서 상기 기술한 바와 같이 수행하였다.
치사 IV 공격 모델에서 항-IsdH mAb 2F4 및 항-AT Ab LC10 조합의 효능을 시험하였다. 도 18에 도시한 바와 같이, 항-IsdH mAb 2F4 및 항-At mAb LC10의 조합물은 HA-MRSA USA100 공격 용량을 이용한 IV 공격 모델에서 조사한 바와 같이 동물 생존율을 증가시켰다. 도 18은 이러한 조합이 R347 대조군과 비교하여 감염후 6일 동안 생존에 대한 반응이 유의하게 증가시켰음을 보여준다.
서열 표
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Figure 112015054033139-pct00004
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상기의 실시예 및 표는 본 발명의 예시를 위한 것이며 한정하려는 의도가 아니다. 본원에 개시된 장치 및 방법의 다른 실시양태는 본원에 개시된 장치 및 방법의 실시 및 명세서를 고려하여 당분야의 숙련가에게는 자명하다.
다음은 본 발명의 실시양태이다:
1. 스타필로코커스 아우레우스(에스. 아우레우스) IsdH 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서,
여기서 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 중쇄 가변 영역(VH) 및 경쇄 가변 영역(VL)을 포함하고, 이들 각각은 3개의 상보성 결정 영역(CDR1, CDR2, 및 CDR3)을 포함하며, 이때
a. VH CDR1은 서열번호 90, 96, 102, 108 또는 114의 아미노산과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고;
b. VH CDR2는 서열번호 91, 97, 103, 109 또는 115의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고;
c. VH CDR3은 서열번호 92, 98, 104, 110 또는 116의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고/하거나;
d. VL CDR1은 서열번호 93, 99, 105, 111 또는 117의 아미노산 잔기와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고;
e. VL CDR2는 서열번호 94, 100, 106, 112 또는 118의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고;
f. VL CDR3은 서열번호 95, 101, 107, 113 또는 119의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함한다.
2. 실시양태 1의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은
a. 서열번호 90, 96, 102, 108 또는 114의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VH CDR1;
b. 서열번호 91, 97, 103, 109 또는 115의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VH CDR2;
c. 서열번호 92, 98, 104, 110 또는 116의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VH CDR3;
d. 서열번호 93, 99, 105, 111 또는 117의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VL CDR1;
e. 서열번호 94, 100, 106, 112 또는 118의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VL CDR2; 및
f. 서열번호 95, 101, 107, 113 또는 119의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VL CDR3
을 포함한다.
3. 실시양태 1 또는 2의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 90, 91, 92, 93, 94 및 95; 서열번호 96, 97, 98, 99, 100 및 101; 서열번호 102, 103, 104, 105, 106 및 107; 서열번호 108, 109, 110, 111, 112 및 113; 및 서열번호 114, 115, 116, 117, 118 및 119로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열 세트에 상응한다.
4. 스타필로코커스 아우레우스(에스. 아우레우스) IsdH 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일하다.
5. 실시양태 4의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1∼10개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함한다.
6. 스타필로코커스 아우레우스(에스. 아우레우스) IsdH 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VL 아미노산 서열은 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일하다.
7. 실시양태 6의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VL 아미노산 서열은 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1∼10개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함한다.
8. 실시양태 1-7 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 아미노산 서열과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일하고, VL 아미노산 서열은 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일하다.
9. 실시양태 8의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 아미노산 서열에 상응하고, VL 아미노산 서열은 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 아미노산 서열에 상응한다.
10. 실시양태 1-8 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 및 VL은 서열번호 80 및 81; 서열번호 82 및 83; 서열번호 84 및 85; 서열번호 86 및 87; 및 서열번호 88 및 89로 이루어진 군으로부터 선택된다.
11. 실시양태 1-3의 어느 하나의 단리된 항체 또는 단편으로서, 여기서 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 90, 91, 92, 93, 94 및 95로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열 세트에 상응한다.
12. 실시양태 1 또는 2의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 4개의 VH 프레임워크 영역(FR1, FR2, FR3, FR4)을 포함하고, 이때 4개의 VH 프레임워크 영역은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 4개의 VH 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는다.
13. 실시양태 1 또는 2의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VL 아미노산 서열은 4개의 VL 프레임워크 영역(FR1, FR2, FR3, FR4)을 포함하고, 이때 4개의 VL 프레임워크 영역은 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 4개의 VL 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는다.
14. 실시양태 1 또는 2의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 4개의 VH 프레임워크 영역은 서열번호 80, 82, 84, 86 또는 88의 4개의 VH 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 가지며, 4개의 VL 프레임워크 영역은 서열번호 81, 83, 85, 87 또는 89의 4개의 VL 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는다.
15. 실시양태 1-14 중 어느 것의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, VH 및 VL은 서열번호 80 및 81에 상응한다.
16. 실시양태 1-15 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 다음 중 1 이상을 갖는다:
a. 약 70 nM 이하의 에스. 아우레우스 표면 항원에 대한 해리 상수(KD);
b. 옵소닌에 의한 식작용 사멸 분석으로 측정 시, 에스. 아우레우스의 옵소닌에 의한 식작용의 회피능을 50% 이상 감소시키는 능력; 또는
c. 균혈증 모델로 측정 시, 에스. 아우레우스 콜로니 형성 유닛(CFU)의 수를 50% 이상 감소시키는 능력.
17. 스타필로코커스 아우레우스(에스. 아우레우스) IsdH 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 다음 중 1 이상을 갖는다:
a. 약 70 nM 이하의 에스. 아우레우스 표면 항원에 대한 해리 상수(KD);
b. 옵소닌에 의한 식작용 사멸 분석법으로 측정 시, 에스. 아우레우스의 옵소닌에 의한 식작용 회피능을 50% 이상 감소시키는 능력;
c. 균혈증 모델로 측정 시, 에스. 아우레우스 콜로닝 형성 유닛(CFU)의 수를 50% 이상 감소시키는 능력;
d. 동물 장기 부하량 모델에서 측정 시, 면역 세포 침윤, 박테리아 부하량, 및 향염증성 사이토카인 방출을 감소시키는 능력.
18. 실시양태 1-16 중 어느 하나의 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 아미노산을 갖는 실시양태 17의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
19. 실시양태 1-18 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 조성물.
20. 실시양태 1-15 중 어느 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 단리된 핵산.
21. 스타필로코커스 아우레우스(에스. 아우레우스) ClfA 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서,
여기서 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 중쇄 가변 영역(VH) 및 경쇄 가변 영역(VL)을 포함하고, 이들 각각은 3개의 상보성 결정 영역(CDR1, CDR2, 및 CDR3)을 포함하며, 이때
a. VH CDR1은 서열번호 133 또는 141의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고;
b. VH CDR2는 서열번호 134 또는 142의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고;
c. VH CDR3은 서열번호 135 또는 143의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고/하거나;
d. VL CDR1은 서열번호 137 또는 145의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고;
e. VL CDR2는 서열번호 138 또는 146의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하고;
f. VL CDR3은 서열번호 139 또는 147의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함한다.
22. 실시양태 21의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은
a. 서열번호 133 또는 141의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VH CDR1;
b. 서열번호 134 또는 142의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VH CDR2;
c. 서열번호 135 또는 143의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VH CDR3;
d. 서열번호 137 또는 145의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VL CDR1;
e. 서열번호 138 또는 146의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VL CDR2; 및
f. 서열번호 139 또는 147의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 VL CDR3
을 포함한다.
23. 실시양태 21 또는 22의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 133, 134, 135, 137, 138 및 139; 및 서열번호 137, 138, 139, 145, 146 및 147로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열 세트에 상응한다.
24. 스타필로코커스 아우레우스(에스. 아우레우스) ClfA 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 서열번호 132 또는 140의 아미노산 서열과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일하다.
25. 실시양태 24의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 서열번호 132 또는 140의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1∼10개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함한다.
26. 스타필로코커스 아우레우스(에스. 아우레우스) ClfA 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VL 아미노산 서열은 서열번호 136 또는 144의 아미노산 서열과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일하다.
27. 실시양태 26의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VL 아미노산 서열은 서열번호 136 또는 144의 아미노산 서열과 동일하거나, 또는 이에 대해 1∼10개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함한다.
28. 실시양태 21-27 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 서열번호 132 또는 140의 아미노산 서열과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일하고, VL 아미노산 서열은 서열번호 136 또는 144의 아미노산 서열과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일하다.
29. 실시양태 28의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 서열번호 132 또는 140의 아미노산 서열에 상응하고, VL 아미노산 서열은 서열번호 136 또는 144의 아미노산 서열에 상응한다.
30. 실시양태 21-28 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 및 VL은 서열번호 132 및 136; 및 서열번호 140 및 144로 이루어진 군으로부터 선택된다.
31. 실시양태 21-23 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 단편으로서, 여기서 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 141, 142, 143, 144, 145, 146 및 147로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열 세트에 상응한다.
32. 실시양태 21 또는 22의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 아미노산 서열은 4개의 VH 프레임워크 영역(FR1, FR2, FR3, FR4)을 포함하고, 이때 4개의 VH 프레임워크 영역은 서열번호 132 또는 140의 4개의 VH 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는다.
33. 실시양태 21 또는 22의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VL 아미노산 서열은 4개의 VL 프레임워크 영역(FR1, FR2, FR3, FR4)을 포함하고, 이때 4개의 VL 프레임워크 영역은 서열번호 136 또는 144의 4개의 VL 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는다.
34. 실시양태 21 또는 22의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 4개의 VH 프레임워크 영역은 서열번호 132 또는 144의 4개의 VH 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 가지며, 4개의 VL 프레임워크 영역은 서열번호 136 또는 144의 4개의 VL 프레임워크 영역의 상응하는 아미노산 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 갖는다.
35. 실시양태 21-34 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로서, 여기서 VH 및 VL은 서열번호 140 및 144에 상응한다.
36. 실시양태 21-35 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 조성물.
37. 실시양태 21-35 중 어느 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 단리된 핵산.
38. 에스. 아우레우스 알파 독소(AT)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 조성물.
39. 실시양태 38의 조성물로서, 여기서 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원은 SdrC, SdrD, SdrE, ClfA, ClfB, IsdA, IsdB, IsdC, IsdE, IsdH, SpA, FnbA 및 PNAG로 이루어진 군으로부터 선택된다.
40. 실시양태 38 또는 39의 조성물로서, 여기서 표면 결정인자 항원은 IsdH이다.
41. 실시양태 40의 조성물로서, 여기서 IsdH에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 실시양태 1-18 중 어느 하나에 따른 항체 또는 이의 항원 결합 단편이다.
42. 실시양태 38 또는 39의 조성물로서, 여기서 표면 결정인자 항원은 ClfA이다.
43. 실시양태 42의 조성물로서, 여기서 ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 실시양태 21-35 중 어느 하나에 따른 항체 또는 이의 항원 결합 단편이다.
44. 실시양태 38-43 중 어느 하나의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은
a. 서열번호 7, 10, 13 또는 69과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1;
b. 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75와 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; 및
c. 서열번호 9, 12, 15, 16, 18, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78과 동일하거나, 또는 이에 대해 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 잔기 돌연변이를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3;
및/또는
d. 서열번호 1 또는 4의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1;
e. 서열번호 2, 5, 73 또는 77의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및
f. 서열번호 3, 6, 64, 68 또는 74의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3
을 포함한다.
45. 실시양태 38-43 중 어느 하나의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은
a. 서열번호 7, 10, 13 또는 69를 포함하는 VH CDR1;
b. 서열번호 8, 11, 14, 17, 70 또는 75의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2;
c. 서열번호 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 또는 78의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR;
d. 서열번호 1 또는 4의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1;
e. 서열번호 2, 5, 73 또는 77의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및
f. 서열번호 3, 6, 64, 68 또는 74의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3
을 포함한다.
46. 실시양태 38-45 중 어느 하나의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 7, 8, 9, 1, 2 및 3; 서열번호 10, 11, 12, 1, 2 및 3; 서열번호 13, 14, 15, 4, 5 및 6; 서열번호 7, 17, 18, 1, 2 및 3; 서열번호 7, 8, 16, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 65, 1, 2 및 64; 서열번호; 7, 8, 66, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 67, 1, 2 및 68; 서열번호 7, 8, 67, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 78, 1, 2 및 64; 서열번호 7, 8, 65, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 70, 71, 1, 2 및 68; 서열번호 7, 8, 72, 1, 73 및 74; 서열번호 69, 75, 71, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 75, 76, 1, 2 및 68; 서열번호 69, 75, 76, 1, 77 및 74; 서열번호 69, 70, 71, 1, 77 및 74의 아미노산 서열에 상응한다.
47. 실시양태 38-43 중 어느 하나의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 아미노산 서열과의 동일성이 90% 이상인 중쇄 가변 도메인을 포함하고/하거나 (iii) 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 아미노산 서열과의 동일성이 90% 이상인 경쇄 가변 도메인을 포함한다.
48. 실시양태 38-43 중 어느 하나의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 또는 62의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 가변 도메인을 포함하고, (iii) 서열번호 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 또는 63의 아미노산 서열을 갖는 경쇄 가변 도메인을 포함한다.
49. 실시양태 38-48 중 어느 하나의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2 및 VL CDR3은 서열번호 69, 70, 71, 1, 2 및 68의 아미노산 서열에 상응한다.
50. 실시양태 38-49 중 어느 하나의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 57의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 서열번호 58의 아미노산 서열을 갖는 경쇄 가변 도메인을 포함한다.
51. 실시양태 38-50 중 어느 하나의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Fc 변이체 영역을 더 포함한다.
52. 실시양태 51의 조성물로서, 여기서 AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 130 및 서열번호 131을 포함한다.
53. 실시양태 30 또는 40-41 중 어느 하나의 조성물로서, ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 더 포함한다.
54. 실시양태 53의 조성물로서, 여기서 ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 실시양태 21-35 중 어느 하나에 따른 항체 또는 이의 항원 결합 단편이다.
55. 시험 샘플에서 에스. 아우레우스의 존재를 확인하는 방법으로서, 시험 샘플을 실시양태 1-15 또는 21-34 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 검출 가능한 표지와 접촉시키는 단계를 포함한다.
56. 실시양태 55의 방법은
a. 시험 샘플을 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 접촉시키는 단계로서, 여기서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 결합하여, 제1 복합체를 형성하는 단계;
b. 상기 복합체를 검출 가능한 표지와 접촉시키는 단계로서, 여기서 검출 가능한 표지는 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 항원에 결합하여, 제2 복합체를 형성하는 단계; 및
c. 제2 복합체 내 검출 가능한 표지에 의해 생성된 신호를 기초로 시험 샘플 내 에스. 아우레우스의 존재를 검출하는 단계로서, 여기서 에스. 아우레우스의 존재는 검출 가능한 표지에 의해 생성된 신호와 직접적으로 상관되는 것인 단계
를 포함한다.
57. 실시양태 55의 방법은
a. 시험 샘플을 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 접촉시키는 단계로서, 여기서 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 결합하여, 제1 복합체를 형성하는 것인 단계;
b. 상기 복합체를 검출 가능한 표지와 접촉시키는 단계로서, 여기서 검출 가능한 표지는 항체 또는 이의 항원 결합 단편에의 결합에 대해 항원과 경쟁하여서 제2 복합체를 형성하는 것인 단계; 및
c. 제2 복합체의 검출 가능한 표지에 의해 생성된 신호를 기초로 시험 샘플 내 에스. 아우레우스의 존재를 검출하는 단계로서, 여기서 에스. 아우레우스의 존재는 검출 가능한 표지에 의해 생성된 신호와 간접적으로 상관되는 것인 단계
를 포함한다.
58. 실시양태 55-57 중 어느 하나의 방법으로서, 여기서 샘플은 환자 샘플이고, 방법은 환자를 에스. 아우레우스 감염으로 진단하는 단계를 더 포함한다.
59. 실시양태 55-58 중 어느 하나의 방법으로서, 여기서 방법은 자동화 시스템 또는 반자동화 시스템에 사용하도록 적합화된다.
60. 시험 샘플에서 에스. 아우레우스의 존재를 확인하는 방법으로서, 시험 샘플을 실시양태 19 또는 36의 조성물, 및 1 이상의 검출 가능한 표지와 접촉시키는 단계를 포함한다.
61. 실시양태 60의 방법은
a. 시험 샘플을 실시양태 13의 조성무로가 접촉시키는 단계로서, 여기서 조성물은 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원 및 에스. 아우레우스 분비 독소 폴리펩티드에 결합하는 것인 단계;
b. 시험 샘플을 1 이상의 검출 가능한 표지와 접촉시키는 단계로서, 여기서 1 이상의 검출 가능한 표지는 표면 결정인자 항원, 분비 독소, 또는 표면 결정인자 항원 또는 분비 독소에 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 결합하는 것인 단계; 및
c. 1 이상의 검출 가능한 표지에 의해 생성된 신호를 기초로 시험 샘플 내 에스. 아우레우스의 존재를 검출하는 단계로서, 여기서 에스. 아우레우스의 존재는 1 이상의 검출 가능한 표지에 의해 생성된 신호와 직접적으로 상관되는 것인 단계
를 포함한다.
62. 실시양태 60의 방법은
a. 시험 샘플을 실시양태 13의 조성물과 접촉시키는 단계로서, 여기서 조성물은 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원 및 에스. 아우레우스 분비 독소 폴리펩티드에 결합하는 것인 단계;
b. 시험 샘플을 1 이상의 검출 가능한 표지와 접촉시키는 단계로서, 여기서 1 이상의 검출 가능한 표지는 실시양태 13의 조성물 내 항체에의 결합에 대해 표면 결정인자 항원 또는 분비 독소와 경쟁하는 것인 단계; 및
c. 1 이상의 검출 가능한 표지에 의해 생성된 신호를 기초로 시험 샘플 내 에스. 아우레우스의 존재를 검출하는 단계로서, 여기서 에스. 아우레우스의 존재는 1 이상의 검출 가능한 표지에 의해 생성된 신호와 간접적으로 상관되는 것인 단계
를 포함한다.
63. 실시양태 60-62 중 어느 하나의 방법으로서, 여기서 샘플은 환자 샘플이고, 이 방법은 환자를 에스. 아우레우스 감염으로 진단하는 단계를 더 포함한다.
64. 실시양태 60-63 중 어느 하나의 방법으로서, 이 방법은 자동화 시스템 또는 반자동화 시스템에 사용하도록 적합화된다.
65. 환자에서 에스. 아우레우스 감염을 치료하는 방법으로서, 환자에게, 실시양태 1-18 또는 21-35 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 실시양태 19, 36 또는 38-54 중 어느 하나의 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
66. 환자에서 에스. 아우레우스 연관 패혈증의 심각성을 예방하거나 또는 감소시키는 방법으로서, 환자에게, 실시양태 1-18 또는 21-35 중 어늬 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 실시양태 19, 36 또는 38-54 중 어느 하나의 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
67. 환자에서 에스. 아우레우스 감염과 연관된 패혈증의 개시를 지연시키는 방법으로서, 환자에게, 실시양태 1-18 또는 21-35 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 실시양태 19, 36 또는 38-54 중 어느 하나의 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
68. 환자에서 에스. 아우레우스 감염과 연관된 패혈증의 개시를 예방하는 방법으로서, 환자에게 실시양태 1-18 또는 21-35 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 실시양태 19, 36 또는 38-54 중 어느 하나의 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
69. 환자에서 혈류 또는 심장 내 에스. 아우레우스 박테리아 부하량을 감소시키는 방법으로서, 상기 환자에게 실시양태 1-18 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 유효량을 투여하는 단계를 포함한다.
70. 환자에서 에스. 아우레우스 박테리아 응집반응 및/또는 혈전색전성 병변 형성을 감소시키는 방법으로서, 상기 환자에게 실시양태 1-18 중 어느 하나의 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 유효량을 투여하는 단계를 포함한다.
71. 실시양태 65-70 중 어느 하나의 방법은 항생제를 환자에게 투여하는 단계를 더 포함한다.
72. 실시양태 69의 방법으로서, 여기서 항생제는 페니실린, 옥사실린, 플루클록사실린 또는 반코마이신이다.
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Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 71 Asp Arg Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr Gly Met Asp Val 1 5 10 <210> 72 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 72 Asp Asn Tyr Ser Pro Thr Gly Gly Tyr Tyr Gly Met Asp Val 1 5 10 <210> 73 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 73 Lys Ala Ser Ser Leu Lys Ser 1 5 <210> 74 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 74 Gln Gln Tyr Glu Ser Tyr Trp Thr 1 5 <210> 75 <211> 16 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 75 Gly Ile Gly Thr Arg Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys Gly 1 5 10 15 <210> 76 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 76 Asp Lys Tyr Ser Pro Thr Gly His Tyr Tyr 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Sequence: Synthetic peptide <400> 97 Val Ile Gly Pro Ser Gly Gly Pro Thr Gln Tyr Ala Asp Ser Val Lys 1 5 10 15 Gly <210> 98 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 98 Trp Gly Gly Arg Tyr Ser Val Phe Glu Thr 1 5 10 <210> 99 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 99 Arg Ala Ser Gln Ser Val Arg Lys Asn Val Ala 1 5 10 <210> 100 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 100 Gly Ala Ser Thr Arg Ala Thr 1 5 <210> 101 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 101 Gln Gln Tyr Ser Ser Trp Pro Ala Phe 1 5 <210> 102 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 102 Arg Tyr Phe Met Gly 1 5 <210> 103 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 103 Ser Ile Tyr Ser Ser Gly Gly Tyr Thr Ser Tyr Ala Asp Ser Val Lys 1 5 10 15 Gly <210> 104 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 104 Arg Trp Arg Asp Gly Thr Phe Asp Tyr 1 5 <210> 105 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 105 Arg Ala Ser Gln Ser Val Arg Glu Tyr Leu Asn 1 5 10 <210> 106 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 106 Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser 1 5 <210> 107 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 107 Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Arg Phe Thr 1 5 <210> 108 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 108 Ser Tyr Pro 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119 Asn Ser Arg Asp Ala Arg Leu Asn Pro Tyr Ile Leu 1 5 10 <210> 120 <211> 354 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 120 gaagttcaat tgttagagtc tggtggcggt cttgttcagc ctggtggttc tttacgtctt 60 tcttgcgctg cttccggatt cactttctct ccttacatga tgcagtgggt tcgccaagct 120 cctggtaaag gtttggagtg ggtttcttct atctggcctt ctggtggcaa gacttattat 180 gctgactccg ttaaaggtcg cttcactatc tctagagaca actctaagaa tactctctac 240 ttgcagatga acagcttaag ggctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagagtgcgg 300 agggggggag ctactgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc aagc 354 <210> 121 <211> 324 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 121 gacatccaga tgacccagtc tccagccacc ctgtctgtgt ctccagggga aagagccacc 60 ctctcctgca gggccagtca gagtgttagc agcaacttag gctggtacca gcagaaacct 120 ggccaggctc ccaggctcct catctatggt gcatccacca gggccactgg tatcccaacc 180 aggttcagtg gcagtgggtc tgggacagag ttcactctca ccatcagcag cctgcagtct 240 gaagattttg caacttatta ctgtcagcag tatcagaact ggcccttgct cactttcggc 300 ggagggacca aggtggaaat caaa 324 <210> 122 <211> 357 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 122 gaagttcaat tgttagagtc tggtggcggt cttgttcagc ctggtggttc tttacgtctt 60 tcttgcgctg cttccggatt cactttctct aattactata tgtggtgggt tcgccaagct 120 cctggtaaag gtttggagtg ggtttctgtt atcggtcctt ctggtggccc tactcagtat 180 gctgactccg ttaaaggtcg cttcactatc tctagagaca actctaagaa tactctctac 240 ttgcagatga acagcttaag ggctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagatggggt 300 gggaggtact ctgtatttga aacctggggc caagggacaa tggtcaccgt ctcaagc 357 <210> 123 <211> 318 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 123 gacatccaga tgacccagtc tccagccact ctgtctgtgt ctccaggggg aagagccacc 60 ctctcctgca gggccagtca gagtgttaga aaaaacgtag cctggtatca gcagaaacct 120 ggccagcctc ccaggctcct catctatggt gcatccacca gggccactgg tgtcccagcc 180 aggttcagtg gcagtgggtc tgggacagag ttcactctca ccatcagcag gatgcagcct 240 gaagattttg tagtttatca ctgtcagcag tatagtagct ggccggcgtt cggccagggg 300 accatggtgg aaatcaac 318 <210> 124 <211> 354 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 124 gaagttcaat tgttagagtc tggtggcggt cttgttcagc ctggtggttc tttacgtctt 60 tcttgcgctg cttccggatt cactttctct cgttacttta tgggttgggt tcgccaagct 120 cctggtaaag gtttggagtg ggtttcttct atctattctt ctggtggcta tacttcttat 180 gctgactccg ttaaaggtcg cttcactatc tctagagaca actctaagaa tactctctac 240 ttgcagatga acagcttaag ggctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagacggtgg 300 cgagatggca cctttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc aagc 354 <210> 125 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 125 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctattggaga cagagtcacc 60 atctcttgcc gggcaagtca gagcgttaga gagtatctaa attggtatca acaaaaacca 120 gggaaagccc ctaaactcct gatctttgct gcatccagtt tgcagagtgg ggtcccatca 180 agattcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttatta ctgtcaacag agttacagta cccgattcac tttcggccct 300 gggaccaaag tggacatcaa a 321 <210> 126 <211> 372 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 126 caggtacagc tgcagcagtc aggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60 tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatccta tcagctgggt gcgacaggcc 120 cctggacaag ggcttgagtg gatgggaaag atcatcccta tctttggtac aacaaactac 180 gcgcagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggacg aatccacgag cactgcctac 240 atggaactga gcagcctgag atctgaggac acggccatat attactgtgc gagccccaat 300 cgaccctata acattggctg gcactactac tttgactact ggggcaaagg aaccctggtc 360 accgtctcct ca 372 <210> 127 <211> 330 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 127 cagtctgtgc tgactcagcc tgcctccgtg tctgggtctc ctggacagtc gatcaccatc 60 tcctgcactg gaaccagcag tgacgttggt ggttataact atgtctcctg gtaccaacaa 120 cacccaggca aagcccccaa actcatgatt tatgagggca gtaagcggcc ctcaggggtt 180 tctaatcgct tctctggctc caggtctggc aacacggcct ccctgacaat ctctgggctc 240 caggctgagg acgaggctga ttattactgc agctcatata caaccaggag cactcgagtc 300 ttcggcggag ggaccaagct gaccgtccta 330 <210> 128 <211> 378 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 128 gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60 tcctgtgcag cctctggatt cacctttagc agctatgcca tgagctgggt ccgccaggct 120 ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagct attagtggta gtggtggtag cacatactac 180 gcagactccg tgaagggccg gttcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240 ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtgt attactgtgc aagagatcag 300 gacgaaggta gagcgaacaa ctggtggatc ccccccgggg gtcgctgggg ccaggggaca 360 atggtcaccg tctcgagt 378 <210> 129 <211> 327 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 129 tcttctgagc tgactcagga ccctactctg tctgtggccc tgggacagac agtcagaatc 60 acatgccaag gagacagcct ccgaagatct tttgcaagtt ggtaccagaa gaagccagga 120 caggcccctg tacttctcat ctatggtcaa aataagcggc ccgcagggat cccagaccga 180 ttctctggct ccaggtcagg aaactcagct tcgttgacca tcacaggggc tcaggcggaa 240 gatgaggctg actattactg taattcccgc gacgccagac ttaaccctta tatactcttc 300 ggcggtggga ccaagctgac cgtccta 327 <210> 130 <211> 452 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 130 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser His 20 25 30 Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ser Gly Ile Gly Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys 50 55 60 Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Glu Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu 65 70 75 80 Gln 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Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr 290 295 300 Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn 305 310 315 320 Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro 325 330 335 Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln 340 345 350 Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val 355 360 365 Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val 370 375 380 Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro 385 390 395 400 Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr 405 410 415 Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val 420 425 430 Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu 435 440 445 Ser Pro Gly Lys 450 <210> 131 <211> 212 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 131 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Trp 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Asp Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Lys Gln Tyr Ala Asp Tyr Trp Thr 85 90 95 Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro 100 105 110 Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr 115 120 125 Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys 130 135 140 Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu 145 150 155 160 Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser 165 170 175 Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala 180 185 190 Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe 195 200 205 Asn Arg Gly Glu 210 <210> 132 <211> 122 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 132 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Val Phe Thr Phe Ser Ser Tyr 20 25 30 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Leu Ile Trp Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Asp Arg Gly Gly Gly Tyr Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp 100 105 110 Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 133 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 133 Ser Tyr Gly Met His 1 5 <210> 134 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 134 Leu Ile Trp Phe Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys 1 5 10 15 Gly <210> 135 <211> 12 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Ser 115 120 <210> 141 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 141 Ser Tyr Gly Ile Ser 1 5 <210> 142 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 142 Trp Ile Ser Ser Tyr Asn Gly Asn Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Leu Gln 1 5 10 15 Gly <210> 143 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 143 Ala Ala Arg Gly Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp 1 5 10 <210> 144 <211> 108 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 144 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Gly Ser 20 25 30 Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 35 40 45 Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 50 55 60 Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 65 70 75 80 Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro 85 90 95 Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 145 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 145 Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Gly Ser Tyr Leu Ala 1 5 10 <210> 146 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 146 Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr 1 5 <210> 147 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 147 Gln Gln Tyr Ser Ser Trp Pro Ala Phe 1 5 <210> 148 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 148 Ser Val Ile Asp Thr Ala Gly Asp Thr Tyr Tyr Pro Gly Ser Val Lys 1 5 10 15 Gly

Claims (72)

  1. 에스. 아우레우스 알파 독소(AT)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는, 환자에서의 에스. 아우레우스 연관 패혈증의 심각성을 예방 또는 감소시키거나, 또는 환자에서의 에스. 아우레우스 감염과 연관된 패혈증의 개시를 지연시키는데 사용되기 위한 조성물로서, 상기 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원이 ClfA이고, AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 a. 서열번호 69의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; b. 서열번호 70의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; c. 서열번호 71의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3; d. 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; e. 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및 f. 서열번호 68의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3를 포함하는 조성물.
  2. 에스. 아우레우스 알파 독소(AT)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는, 환자에서의 에스. 아우레우스 연관 패혈증의 심각성을 예방 또는 감소시키거나, 또는 환자에서의 에스. 아우레우스 감염과 연관된 패혈증의 개시를 지연시키는데 사용되기 위한 조성물로서, 상기 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원이 ClfA이고, ClfA에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 a. 서열번호 133 또는 141의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; b. 서열번호 134 또는 142의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; c. 서열번호 135 또는 143의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3; d. 서열번호 137 또는 145의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; e. 서열번호 138 또는 146의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및 f. 서열번호 139 또는 147의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편인 조성물.
  3. 제1항에 있어서, AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VH) 및 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VL)을 포함하는 조성물.
  4. 제1항에 있어서, AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 서열번호 130의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 및 서열번호 131의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄를 포함하는 조성물.
  5. 에스. 아우레우스 알파 독소(AT)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는, 에스. 아우레우스 감염을 치료 또는 예방하기 위한 조성물로서, 상기 에스. 아우레우스 표면 결정인자 항원이 ClfA이고, AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 a. 서열번호 69의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR1; b. 서열번호 70의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR2; c. 서열번호 71의 아미노산 서열을 포함하는 VH CDR3; d. 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR1; e. 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR2; 및 f. 서열번호 68의 아미노산 서열을 포함하는 VL CDR3를 포함하는 조성물.
  6. 제5항에 있어서, AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VH) 및 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VL)을 포함하는 조성물.
  7. 제5항에 있어서, AT에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 서열번호 130의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 및 서열번호 131의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄를 포함하는 조성물.






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Families Citing this family (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2673373B3 (en) 2011-02-08 2021-06-02 MedImmune, LLC Antibodies that specifically bind staphylococcus aureus alpha toxin and methods of use
KR102111171B1 (ko) 2011-06-10 2020-05-14 메디뮨 엘엘씨 항슈도모나스 ｐｓｌ 결합 분자 및 그의 용도
KR102184343B1 (ko) * 2011-11-07 2020-11-30 메디뮨 엘엘씨 항슈도모나스 ｐｓｌ 및 ｐｃｒｖ 결합 분자를 이용한 병용 요법
US9988439B2 (en) 2011-12-23 2018-06-05 Nicholas B. Lydon Immunoglobulins and variants directed against pathogenic microbes
WO2013096948A1 (en) 2011-12-23 2013-06-27 Lydon Nicholas B Immunoglobulins and variants directed against pathogenic microbes
PL2917360T3 (pl) * 2012-11-06 2020-06-29 Medimmune, Llc Przeciwciała dla determinant powierzchniowych S. aureus
KR102272744B1 (ko) 2012-11-06 2021-07-06 메디뮨 엘엘씨 에스.아우레우스 연관 질병의 치료 방법
AU2015271749B2 (en) * 2014-06-03 2018-03-01 Xbiotech Inc. Compositions and methods for treating and preventing Staphylococcus aureus infections
TWI719938B (zh) 2014-06-19 2021-03-01 美商麥迪紐有限責任公司 多重細菌感染之治療
WO2016023943A1 (en) * 2014-08-12 2016-02-18 Arsanis Biosciences Gmbh Predicting s. aureus disease
WO2016073860A1 (en) * 2014-11-06 2016-05-12 Medimmune, Llc Binding molecules specific for staphylococcus protein a and uses thereof
FR3033333A1 (fr) * 2015-03-06 2016-09-09 Commissariat Energie Atomique Procede et dispositif pour detecter en temps reel un compose secrete et la cible secretrice ainsi que leurs utilisations
WO2016166223A1 (en) * 2015-04-17 2016-10-20 Arsanis Biosciences Gmbh Anti-staphylococcus aureus antibody combination preparation
WO2017075188A2 (en) * 2015-10-30 2017-05-04 Medimmune, Llc Methods of using anti-alpha toxin antibody
CN105424930A (zh) * 2015-11-23 2016-03-23 天津科技大学 一种快速检测金黄色葡萄球菌的方法
WO2019067682A1 (en) * 2017-09-29 2019-04-04 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. BISPECIFIC ANTIGEN-BINDING MOLECULES BINDING TO TARGET STAPHYLOCOCCUS ANTIGEN AND COMPONENT COMPONENT, AND USES THEREOF
WO2020023644A2 (en) 2018-07-24 2020-01-30 Medimmune, Llc Antibody directed against s. aureus clumping factor a (clfa)
CA3115633A1 (en) 2018-10-09 2020-04-16 Medimmune, Llc Combinations of anti-staphylococcus aureus antibodies
WO2020076790A1 (en) 2018-10-09 2020-04-16 Medimmune, Llc Antibodies directed against staphylococcus aureus leukotoxins
CN113811544A (zh) 2019-03-13 2021-12-17 免疫医疗有限责任公司 减少定殖患者中的金黄色葡萄球菌感染
WO2020210650A1 (en) 2019-04-12 2020-10-15 Medimmune, Llc Neutralization of tgf-beta or alpha-v-beta-8 integrin for s. aureus infections
CN112538112B (zh) * 2019-09-20 2023-10-27 迈威(上海)生物科技股份有限公司 抗α-溶血素的抗体及其应用
KR102397684B1 (ko) * 2019-12-09 2022-05-13 (주)옵토레인 항체의 항원 결합 부위에 결합하는 펩티드 및 이를 이용한 분석 방법
KR102504175B1 (ko) * 2020-06-17 2023-02-28 (주)옵토레인 항체의 항원 결합 부위에 결합하는 펩타이드, 이를 이용한 약물 복합체, 바이오센서 및 분석 방법
KR102674098B1 (ko) * 2021-01-14 2024-06-12 (주)옵토레인 스위칭 펩티드 및 이를 이용한 멀티플렉스 면역분석 방법
KR102674109B1 (ko) * 2021-01-14 2024-06-12 (주)옵토레인 스위칭 펩티드, 이를 포함하는 면역분석 장치 및 이를 이용한 면역분석 방법
KR102674120B1 (ko) * 2021-01-18 2024-06-12 (주)옵토레인 스위칭 펩티드 및 이를 이용한 면역분석 방법

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2009539979A (ja) * 2006-06-12 2009-11-19 ナビ バイオファーマシューティカルズ ブドウ球菌感染症を治療および予防するための、α毒素の使用
WO2012109285A2 (en) * 2011-02-08 2012-08-16 Medimmune, Llc Antibodies that specifically bind staphylococcus aureus alpha toxin and methods of use

Family Cites Families (48)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US2017198A (en) * 1931-10-17 1935-10-15 Anglada Motor Corp Cuff valve engine
US20030044772A1 (en) * 1997-08-04 2003-03-06 Applied Molecular Evolution [Formerly Ixsys] Methods for identifying ligand specific binding molecules
US6596541B2 (en) 2000-10-31 2003-07-22 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Methods of modifying eukaryotic cells
US7396917B2 (en) * 2000-12-05 2008-07-08 Alexion Pharmaceuticals, Inc. Rationally designed antibodies
US7214786B2 (en) 2000-12-14 2007-05-08 Kovalic David K Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants and uses thereof for plant improvement
AT410798B (de) * 2001-01-26 2003-07-25 Cistem Biotechnologies Gmbh Verfahren zur identifizierung, isolierung und herstellung von antigenen gegen ein spezifisches pathogen
ATE524195T1 (de) * 2001-01-26 2011-09-15 Inhibitex Inc Monoklonale antikörper gegen das clfa-protein und verfahren zur verwendung bei der behandlung bzw. pr vention von infektionen
US7604799B2 (en) * 2003-06-06 2009-10-20 Medimmune, Llc EphA4 Antibodies
WO2005019267A2 (en) 2003-08-12 2005-03-03 Dyax Corp. Tie1-binding ligands
JP2008515774A (ja) * 2004-08-03 2008-05-15 ダイアックス コーポレイション ｈＫ１結合タンパク質
US20080050361A1 (en) 2004-10-25 2008-02-28 Heinrichs David E Staphylococcus aureas specific anti-infectives
KR20080113223A (ko) * 2006-03-06 2008-12-29 심포젠 에이/에스 호흡기세포 융합 바이러스 감염 치료용 재조합 폴리클로날 항체
US7910703B2 (en) 2006-03-10 2011-03-22 Zymogenetics, Inc. Antagonists to IL-17A, IL-17F, and IL-23P19 and methods of use
CA2667788A1 (en) * 2006-10-30 2008-12-18 The University Of Western Ontario Staphylococcus aureus specific anti-infectives
US9526774B1 (en) * 2006-11-06 2016-12-27 Microvax, Llc Methods and compositions for suppressing virulence of methicillin resistant Staphylococcus aureus
MX2010008423A (es) * 2008-01-31 2010-09-22 Trinity College Dublin Tratamiento de infecciones microbianas.
JP2011519974A (ja) * 2008-05-12 2011-07-14 ストロックス バイオファーマスーティカルズ，エルエルシー 黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓ）に特異的な抗体製剤
WO2010005513A2 (en) * 2008-06-30 2010-01-14 The Texas A&M University System Crystal structure of staphylococcus aureus clumping factor a in complex with fibrinogen derived peptide and uses thereof
WO2010042481A1 (en) * 2008-10-06 2010-04-15 University Of Chicago Compositions and methods related to bacterial eap, emp, and/or adsa proteins
US20120128673A1 (en) * 2009-05-20 2012-05-24 Schering Corporation Modulation of pilr receptors to treat microbial infections
WO2010151544A1 (en) * 2009-06-22 2010-12-29 Wyeth Llc Immunogenic compositions of staphylococcus aureus antigens
CN102666583B (zh) * 2009-07-15 2015-11-25 Aimm医疗股份公司 革兰氏阳性细菌特异性结合化合物
GB0913680D0 (en) * 2009-08-05 2009-09-16 Glaxosmithkline Biolog Sa Immunogenic composition
EP2284193A1 (en) * 2009-08-10 2011-02-16 Kenta Biotech AG Human monoclonal antibody against S. aureus derived apha-toxin and its use in treating or preventing abscess formation
EP2516467A2 (en) * 2009-12-23 2012-10-31 Emergent Product Development Seattle, LLC Compositions comprising tnf-alpha and il-6 antagonists and methods of use thereof
US8808699B2 (en) * 2010-04-05 2014-08-19 The University Of Chicago Compositions and methods related to protein A (SpA) antibodies as an enhancer of immune response
WO2012034067A1 (en) * 2010-09-09 2012-03-15 The University Of Chicago Methods and compositions involving protective staphylococcal antigens
US20120202047A1 (en) 2011-02-07 2012-08-09 Baker Hughes Incorporated Nano-coatings for articles
CA2845259A1 (en) * 2011-08-15 2013-02-21 The University Of Chicago Compositions and methods related to antibodies to staphylococcal protein a
EP2794905B1 (en) * 2011-12-20 2020-04-01 MedImmune, LLC Modified polypeptides for bispecific antibody scaffolds
NZ702285A (en) * 2012-04-26 2016-07-29 Univ Chicago Staphylococcal coagulase antigens and methods of their use
PL2917360T3 (pl) * 2012-11-06 2020-06-29 Medimmune, Llc Przeciwciała dla determinant powierzchniowych S. aureus
KR102272744B1 (ko) * 2012-11-06 2021-07-06 메디뮨 엘엘씨 에스.아우레우스 연관 질병의 치료 방법
EP2931314A4 (en) * 2013-02-15 2016-12-07 Immunomedics Inc CHIMERIC AND HUMANIZED ANTI-HISTON ANTIBODIES
US20160235832A1 (en) * 2013-10-15 2016-08-18 The Texas A&M University System Compositions and the Use of Fibrinogen Binding Motif Presence in EFB and COA for Vaccine Against Staphylococcus Aureus and Drug Delivery
WO2015106226A2 (en) * 2014-01-10 2015-07-16 University Of Rochester Diagnostic device and method for detection of staphylococcus infection
EP3096788B1 (en) * 2014-01-24 2019-07-31 Church, William, R. Antibody specific to staphylococcus aureus, therapeutic method and detection method using same
AU2015271749B2 (en) * 2014-06-03 2018-03-01 Xbiotech Inc. Compositions and methods for treating and preventing Staphylococcus aureus infections
TWI719938B (zh) * 2014-06-19 2021-03-01 美商麥迪紐有限責任公司 多重細菌感染之治療
WO2016073860A1 (en) * 2014-11-06 2016-05-12 Medimmune, Llc Binding molecules specific for staphylococcus protein a and uses thereof
WO2016166223A1 (en) 2015-04-17 2016-10-20 Arsanis Biosciences Gmbh Anti-staphylococcus aureus antibody combination preparation
WO2017075188A2 (en) * 2015-10-30 2017-05-04 Medimmune, Llc Methods of using anti-alpha toxin antibody
WO2017186928A1 (en) * 2016-04-29 2017-11-02 Curevac Ag Rna encoding an antibody
BR112018077540A2 (pt) * 2016-07-08 2019-10-01 Us Health vírus quimérico da dengue/zika como vacinas de zika vírus vivo atenuado
WO2020023644A2 (en) * 2018-07-24 2020-01-30 Medimmune, Llc Antibody directed against s. aureus clumping factor a (clfa)
WO2020076790A1 (en) * 2018-10-09 2020-04-16 Medimmune, Llc Antibodies directed against staphylococcus aureus leukotoxins
CA3115633A1 (en) * 2018-10-09 2020-04-16 Medimmune, Llc Combinations of anti-staphylococcus aureus antibodies
CN113811544A (zh) * 2019-03-13 2021-12-17 免疫医疗有限责任公司 减少定殖患者中的金黄色葡萄球菌感染

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2009539979A (ja) * 2006-06-12 2009-11-19 ナビ バイオファーマシューティカルズ ブドウ球菌感染症を治療および予防するための、α毒素の使用
WO2012109285A2 (en) * 2011-02-08 2012-08-16 Medimmune, Llc Antibodies that specifically bind staphylococcus aureus alpha toxin and methods of use

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Clin. Vaccine Immunol., Vol. 19, No. 10, pp. 1641-1650(2012.10.)
Microbiology, Vol. 155, No. 1, pp. 667-679(2009.03.01.)*
PNAS, Vol. 103, No. 45, pp. 16942-16947(2006.11.07.)

Also Published As

Publication number Publication date
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