KR101955071B1 - 무 판별용 snp 마커 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 무의 다양한 유전체를 계통 분류할 수 있고, 다른 품종과 계통을 구분할 수 있는 무 유전자원 분석을 위한 SNP 및 이의 용도에 관한 것으로, 구체적으로 17종의 무를 구별할 수 있는 702개의 SNP들 중, 무의 1번 내지 3번 염색체 상에 존재하는 199개의 SNP를 선발함으로써, 다양한 무 유전자원을 계통별, 종별로 용이하고 신속하게 구분할 수 있으며 유전체 구조를 분석할 수 있어 고품질의 무 개량품종 개발, 농수산물의 수출입 원산지 판별, 무 유전체 보유 및 유지 등에 유용하게 활용할 수 있는 효과가 있다.

Description

무 판별용 SNP 마커{SNP MARKERS FOR DISCRIMINATION OF RAPHANUS SATIVUS}
본 발명은 무의 다양한 유전체를 계통 분류할 수 있고, 다른 품종과 계통을 구분할 수 있는 무 유전자원 분석을 위한 SNP 및 이의 용도에 관한 것이다.
분자 유전학의 발전과 염기서열 분석 기술의 발전에 따라 식물종의 다양성을 유전체 수준에서 구별할 수 있게 되었으며, 이들 정보를 이용하여 개발된 분자 표지는 유전자원의 구분 및 평가에 매우 중요하다.
배추과에 속하는 무는 아시아에서 뿌리 채소로써 이용되는 작물로써, 형태적으로 다양한 뿌리 모양을 가지며, 생리적으로는 개화시기, 영양성분 등의 차이가 다양하여 고품질을 생산하기 위한 유전자원의 확보 또는 유지가 필수적인 작물로, 분자육종을 통한 무 신품종 육성을 위해서는 정확하며 범용성이 높은 분자표지의 개발이 필수적이다. 특히 무는 벼, 배추와 같은 주요 작물과 상응되는 식량 필수 작물이며, 따라서 경제적으로도 중요한 작물이므로, 여러 가지의 분자표지 발굴에 대한 연구가 보고되고 있다. 그러나 현재까지 개발된 생물의 종 및 품종을 식별하는 방법은 형태적 또는 이화학적 방법이 사용되어 왔으나, 상기 배추과에 속하는 무를 포함하는 작물은 염색체 구성이 복잡하여 분속지표가 확립되기 어렵기 때문에 거의 주관적으로 품종 및 종 판별이 이루어지고 있는 실정이다.
이에 발명자들은 무 유전자원 평가를 위해 유전체 서열을 기반으로 SNP 분자표지세트를 개발하고자 노력한 결과, 무 표준 유전체 및 16개의 재배종 및 야생무 유전체 분석 결과를 기반으로 서열 다형성을 탐색하고 SNP 분석에 적합한 199개의 분자표지를 선별함으로써 본 발명을 완성하게 되었다.
한국공개특허 제2013-022328호
따라서 본 발명의 목적은 다양한 종의 무를 구별할 수 있는 SNP 마커를 제공하고, 이를 이용하여 무의 종, 계통 또는 종자순도를 판별하는 것을 목적으로 한다.
상기 목적의 달성을 위해, 본 발명은 무(Raphanus sativus)의 종, 계통 또는 종자순도 판별을 위한 SNP 마커를 제공한다.
또한, 본 발명은 무의 종, 계통 또는 종자순도 판별을 위한 키트를 제공한다.
아울러, 본 발명은 무의 종, 계통 또는 종자순도를 판별하는 방법을 제공한다.
본 발명은 무의 종 또는 계통을 검출할 수 있는 SNP 마커에 관한 것으로, 본 발명읜 SNP 마커를 이용하여 다양한 무 유전자원을 계통별, 종별로 용이하고 신속하게 구분할 수 있으며 유전체 구조를 분석할 수 있어 고품질의 무 개량품종 개발, 농수산물의 수출입 원산지 판별, 무 유전체 보유 및 유지 등에 유용하게 활용할 수 있는 효과가 있다.
도 1은 본원발명의 SNP를 이용하여 구별할 수 있는 무의 종들을 나타낸 계통도이다.
도 2는 본원발명의 SNP를 이용하여 구별할 수 있는 무의 종들의 표현형을 확인한 도이다.
도 3은 본원발명의 SNP를 이용하여 구별할 수 있는 무의 종들의 모양을 나타낸 도이다.
도 4는 본원발명의 무 유전자원 평가용 SNP 분자표지 세트의 무 표준유전체 (염색체 9개) 상의 위치를 확인한 도이다.
본 발명은 무의 종 또는 계통을 검출할 수 있는 SNP 마커에 관한 것으로, 2013년에 보고된 R.raphanistrum 서열(Origin:USA, Accession:Moghe et al.(2014))을 기반으로, 재배종인 WK10039(Origin:Korea, Aceession: NIHHS(National Institute of Horticultural&Herbal science; WK10039)), WK10024(Origin:Europe, Accession: NIHHS(WK10024)), Long Scarlet(Origin: USA, Accession:NIAS(National Institute of Agricultural Science, Japan; JP27291)), DB102(Origin:Europe, Accession: Dongbu(Dongbu Farm Hannong, Co.Ltd, Korea)), DB104(origin:Korea, Accession: Dongbu), DB109(origin: China, Accession:Dongbu), DB110(origin:China, Accession:Dongbu), DB113(Origin:Japan, Accession:Dongbu), Aokubi(Origin:Japan, Accession: Kitashiba et al.(2014))및 Sayatori(origin:Japan, Accession: Kitashiba et al.(2014); 야생종인 Raphanistroides1(origin: Japan, Accession: RDA-GIC(Rural Development Administration-Genebank IT234955)), Raphanistroides2(origin: Japan, Accession: RDA-GIC(IT260989)), Raphanistroides3(origin: Japan, Accession: RDA-GIC(IT264026), Wild radish1(origin: Vietnam, Accession: RDA-GIC(IT182537)), Wild radish2(origin: India, Accession: RDA-GIC(IT32722)) 및 Wild radish3(origin:India, Accession: RDA-GIC(IT32723))에 대하여, SNP 다형성을 분석하였다. 이 중, 무의 9개의 염색체 중 1번 내지 3번에 존재하는 SNP 다형성 마커 199개를 선별하였다.
일반적으로 식물 품종을 식별하는 방법은 크게 재배시험을 통한 형태적 특성 검정 방법, 종 또는 품종 간 동위효소의 차이를 통한 검정 방법 및 DNA에 기초한 분자 마커를 이용한 검정 방법으로 나뉜다. 이 중 분자 마커를 이용한 검정 방법은 작물의 유전·육종연구에서 유전적 다양성과 계통 유연 관계 ff분석 그리고 식물 유전자원의 보존과 관리 등에 유용한 정보를 제공하고 있으며(Smith et al., 1997. Theor. Appl. Genet. 95: 163-173), 표현형에 근거한 전통적인 식별 방법에 비해 재배 환경 및 작물의 생장 단계에 영향을 받지 않아 객관적이며 재현성 또한 높다는 장점을 가진다.
한편 식량의 주요 작물이라고 할 수 있는 무는 아직까지 계통분류학이 완성되지 않고 있고 원산지, 품종 등 유전자원의 내역을 신속히 구별할 수 있는 분자마커가 부재한 상황이다.
이러한 점에서 본 발명자들은 SNP에 기초한 분자적 방법은 간편하고 신속한 방법으로 무의 다양한 품종, 계통, 원산지 등을 구분할 수 있는 분자마커를 발굴하였다.
따라서, 본 발명은 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 199개의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도 판별을 위한 SNP 마커를 제공한다.
본 발명의 SNP 마커는 무에 적용되며, 가장 바람직하게는 무의 종자에 적용되고, 종 또는 계통이 알려지지 않은 미지의 종자에 상기 SNP 마커를 적용하여, WK10039, WK10024, Long Scarlet, DB102, DB104, DB109, DB110, DB113, Aokubi; 야생종인 Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Wild radish1, Wild radish2 및 Wild radish3인지 확인 할 수 있어, 종자단계에서 부터 상기 무의 종 또는 계통을 구분할 수 있는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 명세서에서 용어, "뉴클레오타이드"는 단일가닥 또는 이중가닥 형태로 존재하는 디옥시리보뉴클레오타이드 또는 리보뉴클레오타이드이며, 다르게 특별하게 언급되어 있지 않은 한 자연의 뉴클레오타이드의 유사체를 포함한다.
또한, 본 발명의 SNP 염기 변이가 이중가닥의 gDNA(genomic DNA)에서 발견되는 경우, 상기한 뉴클레오타이드 서열에 대하여 상보적인 폴리뉴클레오타이드 서열도 포함하는 것으로 해석된다. 따라서 상보적인 폴리뉴클레오타이드 서열에서 SNP위치의 염기도 상보적인 염기가 된다.
본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명의 다음의 단계를 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도를 판별하는 방법을 제공한다:
a)시료로부터 핵산분자를 분리하는 단계;
b)서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열 이상의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 확인하는 단계.
본 발명의 시료는 종 또는 계통이 판별되지 않은 무 또는 무의 종자일 수 있다.
본 발명에서 용어 핵산분자”는 DNA (gDNA 및 cDNA) 그리고 RNA 분자를 포괄적으로 포함하는 의미를갖으며, 핵산 분자에서 기본 구성 단위인 뉴클레오타이드는 자연의 뉴클레오타이드뿐만 아니라, 당 또는 염기부위가 변형된 유사체(analogue)도 포함한다.
본 발명의 방법에서 출발물질이 gDNA인 경우, gDNA의 분리는 당업계에 공지된 통상의 방법에 따라 실시될 수 있다 (참조: Rogers & Bendich (1994)). 출발물질이 mRNA인 경우에는, 당업계에 공지된 통상의 방법에 총 RNA를 분리하여 실시된다 (참조: Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001); Ausubel, F.M. et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Willey & Sons(1987); 및 Chomczynski, P. et al., Anal. Biochem. 162:156(1987)). 분리된 총 RNA는 역전사효소를 이용하여 cDNA로 합성된다. 상기 총 RNA는 식물세포부터 분리된 것이기 때문에, mRNA의 말단에는 폴리-A 테일을 갖고 있으며, 이러한 서열 특성을 이용한 올리고 dT 프라이머 및 역전사 효소를 이용하여 cDNA을 용이하게 합성할 수 있다 (참조: PNAS USA, 85:8998(1988); Libert F, et al., Science, 244:569(1989); 및 Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001)).
본 발명의 방법에 있어서, 상기 단계 (b)는 특정 서열을 규명하는 데 이용되는 당업계에 공지된 다양한 방법을 응용하여 실시될 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 응용될 수 있는 기술은, 형광 인 시투 혼성화 (FISH), 직접적 DNA 서열결정, PFGE 분석, 서던 블롯 분석, 단일-가닥 컨퍼메이션 분석 (SSCA, Orita et al., PNAS, USA 86:2776(1989)), RNase 보호 분석 (Finkelstein et al., Genomics, 7:167(1990)), 닷트 블롯 분석, 변성 구배 젤 전기영동 (DGGE, Wartell et al., Nucl.Acids Res., 18:2699(1990)), 뉴클레오타이드 미스매치를 인식하는 단백질 (예: E. coli의 mutS 단백질)을 이용하는 방법 (Modrich, Ann. Rev. Genet., 25:229-253(1991)), 및 대립형-특이 PCR을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.
서열 변화가 단일-가닥 분자내 염기 결합의 차이를 초래하여, 이동성이 다른 밴드를 출현하게 하는 데, SSCA는이 밴드를 검출한다. DGGE 분석은 변성 구배 젤을 이용하여, 야생형 서열과 다른 이동성을 나타내는 서열을 검출한다. 다른 기술들은 일반적으로 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 프로브 또는 프라이머를 이용한다. 예를 들어, RNase 보호 분석에서, 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 리보프로브가 이용된다. 상기 리보프로브와 식물체로부터 분리한 DNA 또는 mRNA를 혼성화시키고, 이어 미스매치를 검출할 수 있는 RNase A 효소로 절단한다. 만일, 미스매치가 있어 RNase A가 인식을 한 경우에는, 보다 작은 밴드가 관찰된다.
혼성화 시그널(hybridization signal)을 이용하는 분석에서, 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 프로브가 이용된다. 이러한 기술에서, 프로브와 타깃 서열의 혼성화 시그널을 검출하여 직접적으로 SNP 변이체 여부를 결정한다.
본 명세서에서, 용어 "프로브"는 특정 뉴클레오타이드 서열에 혼성화될 수 있는 디옥시리보뉴클레오타이드 및 리보뉴클레오타이드를 포함하는 자연 또는 변형되는 모노머 또는 결합을 갖는 선형의 올리고머를 의미한다. 바람직하게는, 프로브는 혼성화에서의 최대 효율을 위하여 단일가닥이다. 프로브는 바람직하게는 디옥시리보뉴클레오타이드이다. 본 발명에 이용되는 프로브로서, 상기 SNP를 포함하는 서열에 완전하게 (perfectly) 상보적인 서열이 이용될 수 있으나, 특이적 혼성화를 방해하지 않는 범위 내에서 실질적으로 (substantially) 상보적인 서열이 이용될 수도 있다.
바람직하게는, 본 발명에 이용되는 프로브는 SNP 뉴클레오타이드인 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열의 어느 한 서열의 51번째 뉴클레오타이드를 포함하는 8-100 개의 연속 뉴클레오타이드를 포함하는 서열에 혼성화될 수 있는 서열을 포함한다.
보다 바람직하게는, 상기 프로브의 3'-말단 또는 5'-말단은 상기 SNP 염기에 상보적인 염기를 갖는다. 일반적으로, 혼성화에 의해 형성되는 듀플렉스 (duplex)의 안정성은 말단의 서열의 일치에 의해 결정되는 경향이 있기 때문에, 3'-말단 또는 5'-말단에 SNP 염기에 상보적인 염기를 갖는 프로브에서 말단 부분이 혼성화되지 않으면,이러한 듀플렉스는 엄격한 조건에서 해체될 수 있다. 혼성화에 적합한 조건은 Joseph Sambrook, et al.,Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.(2001) 및 Haymes, B. D., et al., Nucleic Acid Hybridization, A Practical Approach, IRL Press, Washington, D.C. (1985)에 개시된 사항을 참조하여 결정할 수 있다. 혼성화에 이용되는 엄격한 조건(stringent condition)은 온도, 이온세기 (완충액 농도) 및 유기 용매와 같은 화합물의 존재 등을 조절하여 결정될 수 있다. 이러한 엄격한 조건은 혼성화되는 서열에 의존하여 다르게 결정될 수 있다.
본 발명 방법의 단계 (b)는 대립형-특이 유전자 증폭 방법에 의해 실시될 수 있다. SNP가 유전자 증폭 방법에 적용되는 경우, 특히 SNAP (single nucleotide amplified polymophism)라 통칭된다. 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 이러한 유전자 증폭은 SNP 뉴클레오타이드인 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열의 어느 한 서열의 51번째 뉴클레오타이드를 포함하는 폴리뉴클레오타이드를 증폭할 수 있도록 제작된 프라이머쌍(primer pair)을 기본적으로 이용한다.
본 발명의 명세서에서 “프라이머(primer)”는 단일가닥의 올리고뉴클레오타이드로서, 적합한 조건 (4 가지의 상이한 뉴클레오사이드 트리포스페이트 및 DNA 또는 RNA 폴리머라아제와 같은 중합효소의 존재), 적합한 온도 및 적합한 버퍼하에서 주형-지시적 DNA 합성을 개시할 수 있는 개시점으로서 작용하는 것을 의미한다.
프라이머의 적합한 길이는 사용하고자 하는 프라이머의 특성에 의해 결정하지만, 통상적으로 15 내지 30bp의 길이로서 사용한다. 프라이머는 주형의 서열과 정확하게 상보적일 필요는 없지만 주형과 혼성복합체(hybridcomplex)를 형성할 수 있을 정도로 상보적이어야만 한다.
본 발명의 방법에 이용될 수 있는 증폭 기술은 PCR 증폭 (참조: Miller, H. I. (WO 89/06700) 및 Davey, C. et al. (EP 329,822)), 리가아제 연쇄 반응 (LCR, Wu, D.Y. et al., Genomics 4:560 (1989)), 중합효소 리가아제 연쇄 반응 (Barany, PCR Methods and Applic., 1:5-16(1991)), Gap-LCR (WO 90/01069), 리페어 연쇄 반응 (EP439,182), 3SR (Kwoh et al., PNAS, USA, 86:1173(1989)) 및 NASBA (U.S. Pat. No. 5,130,238)을 포함하나,이에 한정되는 것은 아니다. 가장 바람직하게는 PCR 증폭 단계에 따라 증폭한다. 증폭기술이 적용되는 경우에, 본 발명의 SNP 염기를 확인하기 위해 적합한 프라이머를 디자인하는 것이 중요하다.
본 발명의 바람직한 구현예에 의하면, 본 발명은 (ⅰ) 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51번째 뉴클레오타이드에 인접한 서열과 어닐링하며, (ⅱ) 3′말단의 뉴클레오타이드가 상기 SNP 뉴클레오타이드로부터 -1 위치의 뉴클레오타이드와 매칭되도록 디자인된 지노타이핑(genotyping) 프라이머를 이용하여 SNP 뉴클레오타이드의 염기 타입을 분석하는 방법을 제공한다.
상기 본 발명의 바람직한 구현예에서 증폭 반응액 중에 각각 상이한 색의 형광을 나타내도록 표지된 다이데옥시아데노신트리포스페이트(ddATP), 다이데옥시사이토신트리포스페이트(ddCTP), 다이데옥시구아노신트리포스페이트(ddGTP), 및 다이데옥시티미딘트리포스페이트(ddTTP)를 포함하여 증폭 반응시킨다.
상기와 같이 디자인한 지노타이핑 프라이머와, 반응기질로서 ddATP, ddCTP, ddGTP 및 ddTTP를 반응액에 포함시켜 증폭 반응시키면 지노타이핑 프라이머의 3‘말단으로부터 타깃 SNP 뉴클레오타이드와 매칭되는 1개의 염기만이 익스텐션(extension)되며, 익스텐션된 염기의 타입은 형광에 의해 용이하게 확인할 수 있다. 이러한 방법에 의해 SNP 뉴클레오타이드의 타입을 결정할 수 있다.
PCR에 의한 증폭 반응의 조건 및 사용되는 시약과 효소는 당업계에서 통상적으로 공지된 것을 사용할 수 있다.
본 발명의 또 다른 일 양태에 의하면, 본 발명은 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 51번째 뉴클레오타이드를 포함하는 폴리뉴클레오타이드를 증폭할 수 있도록 제작된 프라이머쌍을 포함하는 무의 종, 계통 또는 종자순도를 판별하는 키트를 제공한다.
본 발명의 바람직한 구현예에 의하면, 상기 프라이머쌍은 (ⅰ) 서열번호 1 내지 199 염기서열 중 어느 한 염기서열의 51 번째 뉴클레오타이드에 인접한 서열과 어닐링하며, (ⅱ) 3' 말단의 뉴클레오타이드가 상기 SNP 뉴클레오타이드로부터 -1 위치의 뉴클레오타이드와 매칭되는 지노타이핑 프라이머를 포함하는 것을 특징으로 하는 키트를 제공한다.
본 발명의 다른 바람직한 구현예에 의하면, 상기 키트에서 각각 상이한 색의 형광을 나타내도록 표지된, 다이데옥시아데노신트리포스페이트(ddATP), 다이데옥시사이토신트리포스페이트(ddCTP), 다이데옥시구아노신트리포스페이트(ddGTP), 다이데옥시티미딘트리포스페이트(ddTTP)를 더욱 포함하는 키트를 제공한다.
본 발명의 키트가 PCR 증폭 과정에 적용되는 경우, 본 발명의 키트는 선택적으로, PCR 증폭에 필요한 시약, 예컨대, 완충액, DNA 중합효소 (예컨대, Thermus aquaticus (Taq), Thermus thermophilus (Tth), Thermus filiformis, Thermisflavus, Thermococcus literalis 또는 Pyrococcus furiosus (Pfu)로부터 수득한 열 안정성 DNA 중합효소), DNA 중합 효소 조인자 및 dNTPs를 포함할 수 있다. 본 발명의 키트는 상기한 시약 성분을 포함하는 다수의 별도 패키징 또는 컴파트먼트로 제작될 수 있다.
본 발명의 또 다른 측면은 본 발명에 따른 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 마이크로어레이에 관한 것이다.
본 발명에 따른 마이크로어레이는 무의 종 또는 계통을 판별하기 위한 SNP를 이용하여 당분야의 당업자에게 알려져 있는 통상적인 방법에 의해 제조될 수있다.
예컨대, 상기 뉴클레오티드는 아미노 실란(amino-silane), 폴리-L-리신(poly-L-lysine) 및 알데히드(aldehyde)로 이루어진 군에서 선택되는 활성기가 코팅된 기판 상에 고정될 수 있다. 또한, 상기 기판은 실리콘 웨이퍼, 유리, 석영, 금속 및 플라스틱으로 이루어진 군에서 선택될 수 있다. 상기 폴리뉴클레오티드를 기판에 고정화시키는 방법은 파이조 일렉트릭(piezoelectric) 방식을 이용한 마이크로피펫팅법(micropipetting), 핀(pin) 형태의 스폿터(spotter)를 이용한 방법 등을 사용할 수 있다.
본 발명의 다른 측면은 본 발명에 따른 마이크로어레이를 포함하는 무의 계통, 종 또는 종자순도를 판별하는 키트에 관한 것이다.
본 발명에 따른 키트는 본 발명의 마이크로어레이 이외에 시료로부터 해당 SNP를 포함하는 DNA를 분리 및 증폭하는데 사용되는 프라이머 세트를 추가로 포함할 수 있다. 상기 적절한 프라이머 세트는 본 발명의 서열을 참조하여 당업자는 용이하게 설계할 수 있을 것이다.
한편, 본 발명에서 서열번호 1의 경우, 승인번호(Accession number) RS2CL7513s 또는 RS2CL7513s:8129 로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 185477번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종이 C (나머지 종에서는 A)를 가질 수 있다.
서열번호 2의 경우, 승인번호 COS0441 또는 COS0441:427로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP 위치는 1번 염색체의 272720번째 위치하고, SNP 서열은 G 또는 A이며, 상기 17개의 종 중에서, DB102, DB113, WK10024, R.raphanistrum는 A서열을 갖고, 나머지 13개의 종에서는 G를 가질 수 있다.
서열번호 3의 경우, 승인번호 RsHH025-1 또는 RsHH025-1:13109로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 염색체의 319352번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB109, DB113, wild radish3, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024, Aokubi 및 Sayatori 종에서 T, 나머지 8개 종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 4의 경우, 승인번호 COS1051 또는 COS1051:13165로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 367711번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB109, Raphanistroides1, Raphanistroides3, WK10024 및 Sayatori 종에서 C, 나머지 10개 종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 5의 경우, 승인번호 COS0520 또는 COS0520:10938로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 735490번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB113, wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024, Aokubi Sayatori 및 R.raphanistrum 종에서 C, 나머지 7개 종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 6의 경우, 승인번호 RS2CL4624s 또는 RS2CL4624s:17727로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 857859번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 WK10024 및 R.raphanistrum 종에서 T, 나머지 15개 종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 7의 경우, 승인번호 COS1177 또는 COS1177:8023로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 879041번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종에서 A, 나머지 16개 종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 8의 경우, 승인번호 RS2CL5888s 또는 RS2CL5888s:5546로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 1328615번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB109, wild radish2 및 WK10024, Aokubi 종에서 C, 나머지 10개 종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 9의 경우, 승인번호 RsSNP15451 또는 RsSNP15451:5892로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 1452466번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024, R.raphanistrum 종에서 G, 나머지 14개 종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 10의 경우, 승인번호 RSS3223 또는 RSS3223:9208로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 1561108번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102 및 WK10024에서 C이며, 나머지 15종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 11의 경우, 승인번호 COS0902 또는 COS0076:4130로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 1605465번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB113, Aokubi, Sayatori 및 WK10024에서 T이며, 나머지 13종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 12의 경우, 승인번호 RS2CL4654s 또는 RS2CL4654s:13965로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 2536410번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024에서 A이며, 나머지 16종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 13의 경우, 승인번호 COS0076 또는 COS0076:4130로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 3244739번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB113, Raphanistroides2, Sayatori, WK10039 종에서 A이고, 나머지 12종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 14의 경우, 승인번호 RSS3377 또는 RSS3377:9910로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 3457707번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024 종에서 A이고, 나머지 16종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 15의 경우, 승인번호 COS1086 또는 COS1086:6744로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 3548879번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB110, wild radish2, Raphanistroides1, AoKubi,Sayatori, WK10024, WK10039 종에서 T이고, 나머지 10종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 16의 경우, 승인번호 RSS2226 또는 RSS2226:8609로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 3935178번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB102, wild radish2, wild radish3, Sayatori, WK10024, R.raphanistrum 종에서 T이고, 나머지 10종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 17의 경우, 승인번호 RSS1865 또는 RSS1865:1754로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 4079438번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 wild radish2, wild radish3, Raphanistroides3, WK10024, R.raphanistrum 종에서 T이고, 나머지 12종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 18의 경우, 승인번호 RSS3654 또는 RSS3654:5459로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 4347300번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB102, wild radish2, wild radish3, WK10024 종에서 G이고, 나머지 12종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 19의 경우, 승인번호 RSS2390 또는 RSS2390:1444로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 4821487번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102 및 WK10024 종에서 C이고, 나머지 15종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 20의 경우, 승인번호 RSS1226 또는 RSS1226:1341로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 5080927번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Aokubi, WK10024, R.raphanistrum 종에서 A이고, 나머지 14종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 21의 경우, 승인번호 RSS2091 또는 RSS2091:3561로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 5108479번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB102, wild radish2, wild radish3, WK10024, R.raphanistrum 종에서 A이고, 나머지 11종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 22의 경우, 승인번호 COS0677 또는 COS0677:7379로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 5298629번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB110, wild radish1, wild radish2, wild radish3, Raphanistroides3, WK10024, R.raphanistrum 종에서 C이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 23의 경우, 승인번호 RS2CL7575s 또는 RS2CL7575s:40823로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 5743576번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 wild radish2, Raphanistroides2, Sayatori, WK10039 종에서 A이고, 나머지 13종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 24의 경우, 승인번호 RsSNP07017 또는 RsSNP07017:337로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 5847590번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 wild radish1, wild radish2, wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Sayatori, WK10039 종에서 T이고, 나머지 10종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 25의 경우, 승인번호 RSS0938 또는 RSS0938:1456로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 5967880번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB110, wild radish1, wild radish2, wild radish3, Sayatori, WK10039 종에서 G이고, 나머지 11종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 26의 경우, 승인번호 RSS0697 또는 RSS0697:12163로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 6173728번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB104, wild radish1, wild radish2, wild radish3, Sayatori, WK10039 종에서 A이고, 나머지 11종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 27의 경우, 승인번호 RsSNP12538 또는 RsSNP12538:1133로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 6221431번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, wild radish1, wild radish2, WK10024 종에서 C이고, 나머지 13종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 28의 경우, 승인번호 RS2CL6263s 또는 RS2CL6263s:1481로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 6282872번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB113, wild radish1, wild radish3, Raphanistroides1, Sayatori, WK10039 6종에서 C이고, 나머지 11종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 29의 경우, 승인번호 COS0821 또는 COS0821:5847로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 6638064번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB110, wild radish3, Aokubi, WK10024 5종에서 T이고, 나머지 12종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 30의 경우, 승인번호 COS0534 또는 COS0534:3862로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 6835566번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB110, wild radish1, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024, R.raphanistrum 7종에서 G이고, 나머지 10종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 31의 경우, 승인번호 RSS0492 또는 RSS0492:1221로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 7863329번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB109, DB110, DB113, wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024, R.raphanistrum 11종에서 G이고, 나머지 6종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 32의 경우, 승인번호 RSS0907 또는 RSS0907:7157로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 8062554번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB102, DB110, DB113, Sayatori, WK10024 6종에서 G이고, 나머지 11종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 33의 경우, 승인번호 RsSNP15440 또는 RsSNP15440:531로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 8179951번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB109, wild radish1, wild radish2, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024, R.raphanistrum 10종에서 T이고, 나머지 7종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 34의 경우, 승인번호 RSS2710 또는 RSS2710:8052로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 8452494번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB109, DB113, Aokubi, Sayatori, WK10024 6종에서 C이고, 나머지 11종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 35의 경우, 승인번호 COS1001 또는 COS1001:6528로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 8543902번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102에서 G이고, 나머지 16종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 36의 경우, 승인번호 RSS1254 또는 RSS1254:11562로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 9163457번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 14종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 37의 경우, 승인번호 COS0990 또는 COS0990:3543로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 9284679번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB109, DB113, WK10024에서 G이고, 나머지 14종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 38의 경우, 승인번호 RSS2969 또는 RSS2969:3557로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 9337778번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, WK10024, R. raphanistrum 에서 A이고, 나머지 14종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 39의 경우, 승인번호 RS2CL6356s 또는 RS2CL6356s:2330로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 9790485번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, WK10024에서 A이고, 나머지 15종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 40의 경우, 승인번호 RSS1909 또는 RSS1909:8576로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 10005369번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB110, DB113, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024에서 T이고, 나머지 11종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 41의 경우, 승인번호 RS2CL3579s 또는 RS2CL3579s:5019로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 10325567번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB113, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides1 Raphanistroides3, Sayatori, WK10024에서 T이고, 나머지 9종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 42의 경우, 승인번호 RS2CL7289s 또는 RS2CL7289s:3965로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 11191217번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 WK10024에서 G이고, 나머지 16종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 43의 경우, 승인번호 RSS3022 또는 RSS3022:3081로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 11419251번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB104, Wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Aokubi, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 11종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 44의 경우, 승인번호 RSS0325 또는 RSS0325:2390로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 11553827번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB110, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024에서 T이고, 나머지 11종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 45의 경우, 승인번호 RsSNP09594 또는 RsSNP09594:3942로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 11920668번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB102, DB104, DB113, Wild radish3, Aokubi, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 46의 경우, 승인번호 RSS3496 또는 RSS3496:7293로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 12106595번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB110, DB113, Wild radish2, Aokubi, Sayatori, WK10024에서 A이고, 나머지 10종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 47의 경우, 승인번호 RSS0184 또는 RSS0184:2647로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 12513316번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 13종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 48의 경우, 승인번호 RSS1075 또는 RSS1075:3164로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 12691206번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Raphanistroides1, WK10024에서 A이고, 나머지 15종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 49의 경우, 승인번호 RS2CL4233s 또는 RS2CL4233s:788로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 12987878번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Raphanistroides2, WK10024에서 T이고, 나머지 15종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 50의 경우, 승인번호 RS2CL5860s 또는 RS2CL5860s:15931로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 13877680번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, WK10024에서 A이고, 나머지 15종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 51의 경우, 승인번호 COS1109 또는 COS1109:8455로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 14573633번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, Wild radish3, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayotori, WK10024에서 C이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 52의 경우, 승인번호 RSS1290 또는 RSS1290:6946로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 14591933번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB104, DB113, Wild radish3, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayotori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 8종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 53의 경우, 승인번호 Cf2(10) 또는 Cf2(10):1919로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 16177290번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB113, Wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Aokubi, Sayotori, WK10024에서 T이고, 나머지 8종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 54의 경우, 승인번호 COS1114 또는 COS1114:9353로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 18581541번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB109, DB113, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 9종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 55의 경우, 승인번호 RsSNP12367 또는 RsSNP12367:6730로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 19028555번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024에서 G이고, 나머지 15종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 56의 경우, 승인번호 RsSNP11846 또는 RsSNP11846:10636로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 20298229번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, WK10024에서 T이고, 나머지 14종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 57의 경우, 승인번호 RSS2328 또는 RSS2328:11940로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 21394114번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, WK10024에서 T이고, 나머지 14종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 58의 경우, 승인번호 COS0496 또는 COS0496:2161로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 22251880번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, Sayatori WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 11종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 59의 경우, 승인번호 RSS0982 또는 RSS0982:462로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 22297617번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 9종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 60의 경우, 승인번호 RS2CL2122s 또는 RS2CL2122s:5281로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 24306942번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB109, Raphanistroides1, WK10024에서 C이고, 나머지 13종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 61의 경우, 승인번호 RS2CL685s 또는 RS2CL685s:6418로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 24594931번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB109, DB113, Wild radish2, Wild radish3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum 에서 G이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 62의 경우, 승인번호 RSS3143 또는 RSS3143:6251로서, 무의 1번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 1번 염색체의 25344505번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides2, Sayatori, WK10039에서 G이고, 나머지 10종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 63의 경우, 승인번호 RsSNP07035 또는 RsSNP07035:571로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 482205번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 WK10024에서 A이고, 나머지 16종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 64의 경우, 승인번호 RS2CL3703s 또는 RS2CL3703s:516로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 677185번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB102, DB110, DB113, Aokubi, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 10종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 65의 경우, 승인번호 RS2CL4248s 또는 RS2CL4248s:546로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 1387913번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에서 DB109, DB110, DB113, Wild radish1, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 10종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 66의 경우, 승인번호 RSS3047 또는 RSS3047:2073로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 2248064번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 14종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 67의 경우, 승인번호 COS0803 또는 COS0803:9124로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 2781643번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, WK10039에서 T이고, 나머지 15종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 68의 경우, 승인번호 RsSNP08757 또는 RsSNP08757:3592로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 3029126번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB104, DB109, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides1, Sayotori, WK10024에서 A이고, 나머지 9종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 69의 경우, 승인번호 Rs1SSR7348 또는 Rs1SSR7348:1759로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 3567721번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long Scarlet, DB102, DB110, Raphanistroides1, Raphanistroides3, WK10024에서 T이고, 나머지 11종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 70의 경우, 승인번호 RSS1831 또는 RSS1831:979로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 3815419번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, Wild radish3, Raphanistroides3 , WK10024에서 T이고, 나머지 13종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 71의 경우, 승인번호 RsSNP07117 또는 RsSNP07117:1710로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 5095706번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB109, Raphanistroides3 , WK10024에서 T이고, 나머지 14종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 72의 경우, 승인번호 RSS3472 또는 RSS3472:3021로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 5165151번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB110, WK10024에서 A이고, 나머지 15종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 72의 경우, 승인번호 RSS3472 또는 RSS3472:3021로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 5165151번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB110, WK10024에서 A이고, 나머지 15종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 73의 경우, 승인번호 RSS2663 또는 RSS2663:1211로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 5516962번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, WK10024에서 C이고, 나머지 15종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 74의 경우, 승인번호 RsSNP10301 또는 RsSNP10301:940로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 5800197번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB104, DB113, Wild radish3, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024에서 T이고, 나머지 10종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 75의 경우, 승인번호 RSS0587 또는 RSS0587:666로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 5828566번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, Wild radish2, Raphanistroides3, AoKubi, Sayatori, WK10024에서 T이고, 나머지 9종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 76의 경우, 승인번호 RS2CL5422s 또는 RS2CL5422s:815로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 5864204번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB104, Wild radish1, Wild radish3, Raphanistroides3, AoKubi, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 7종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 77의 경우, 승인번호 COS0234 또는 COS0234:2831로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 5943355번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB109, DB113, Wild radish1, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 13종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 78의 경우, 승인번호 COS0392 또는 COS0392:3366로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 6110821번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, DB113, Wild radish2, Raphanistroides1, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 8종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 79의 경우, 승인번호 RS2CL6395s 또는 RS2CL6395s:9529로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 6714419번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB113, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides1, WK10039에서 A이고, 나머지 12종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 80의 경우, 승인번호 RSS2813 또는 RSS2813:5698로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 7143489번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에서 DB110, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Akubi, Sayatori, WK10039에서 G이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 81의 경우, 승인번호 RsSNP14966 또는 RsSNP14966:2066로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 7440610번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 WK10024에서 C이고, 나머지 16종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 82의 경우, 승인번호 COS0898 또는 COS0898:762로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 7939811번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 Long scarlet, DB102, WK10024에서 T이고, 나머지 14종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 83의 경우, 승인번호 RSS2642 또는 RSS2642:13024로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 9232787번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 WK10024에서 C이고, 나머지 16종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 84의 경우, 승인번호 COS0566 또는 COS0566:179로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 10393209번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB113, Raphanistroides3, WK10024에서 C이고, 나머지 14종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 85의 경우, 승인번호 RsSNP14791 또는 RsSNP14791:39108로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 11785692번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에서 DB102, DB110, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024에서 C이고, 나머지 11종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 86의 경우, 승인번호 RsSNP14778 또는 RsSNP14778:16970로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 11807834번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB102, Raphanistroides1, WK10024에서 T이고, 나머지 14종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 87의 경우, 승인번호 RS2CL3017s 또는 RS2CL3017s:3331로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 12092618번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에서 DB104, DB113, Wild radish2, Aokubi, Sayatori, WK10039에서 C이고, 나머지 12종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 88의 경우, 승인번호 COS0059 또는 COS0059:630로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 12657735번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB102, DB109, DB110, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 89의 경우, 승인번호 RsSNP13626 또는 RsSNP13626:738로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 13580793번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 C이고, 나머지 16종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 90의 경우, 승인번호 RSS2058 또는 RSS2058:8008로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 14551313번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에 DB104, DB109, DB113, Wild radish2, Wild radish3, Aokubi, Sayatori, WK10039에서 T이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 91의 경우, 승인번호 RSS1140 또는 RSS1140:9260로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 15161399번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB110, Raphanistroides1, Raphanistroides2, WK10024에서 G이고, 나머지 13종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 92의 경우, 승인번호 COS0388 또는 COS0388:2254로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 15168408번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 A이고, 나머지 16종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 93의 경우, 승인번호 COS0151 또는 COS0151:283로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 20441435번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB109, Wild radish2, Raphanistroides1. Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 94의 경우, 승인번호 RSS2540 또는 RSS2540:13780로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 20771416번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에 Wild radish2, Raphanistroides2, WK10024에서 A이고, 나머지 14종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 95의 경우, 승인번호 RsSNP09953 또는 RsSNP09953:10422로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 21035017번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB110, Wild radish3, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum 에서 A이고, 나머지 10종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 96의 경우, 승인번호 RsSNP05533 또는 RsSNP05533:319로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 22446367번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB113, Wild radish3, Raphanistroides3, WK10024에서 T이고, 나머지 10종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 97의 경우, 승인번호 RsSNP15595 또는 RsSNP15595:3672로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 22486307번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB102, DB109, DB110, Wild radish1, Wild radish2, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 10종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 98의 경우, 승인번호 COS0975 또는 COS0975:793로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 23966488번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 DB110, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi, WK10024에서 A이고, 나머지 11종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 99의 경우, 승인번호 RS2CL4762s 또는 RS2CL4762s:2890로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 23991769번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB110, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 11종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 100의 경우, 승인번호 RS2CL5541s 또는 RS2CL5541s:1056로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 24072056번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에 DB102, WK10024에서 A이고, 나머지 15종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 101의 경우, 승인번호 RS2CL2713s 또는 RS2CL2713s:1458로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 24600866번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 15종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 102의 경우, 승인번호 COS0993 또는 COS0993:17109로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 24744357번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, WK10024, Wild radish3에서 C이고, 나머지 13종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 103의 경우, 승인번호 COS0280 또는 COS0280:8438로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 25961727번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 WK10024, Wild radish2에서 A이고, 나머지 15종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 104의 경우, 승인번호 RSS1992 또는 RSS1992:2847로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 25970668번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 WK10024, Wild radish2, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 14종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 105의 경우, 승인번호 RSS1389 또는 RSS1389:8940로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 25994336번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, WK10024, Wild radish3, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024에서 T이고, 나머지 11종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 106의 경우, 승인번호 RSS1423 또는 RSS1423:1238로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 26191046번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB110, Wild radish1, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi_S, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 6종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 107의 경우, 승인번호 COS0260 또는 COS0260:1559로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 26646968번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB109, DB110, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 8종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 108의 경우, 승인번호 RsSNP14952 또는 RsSNP14952:2400로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 26737125번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB109, DB110, Wild radish2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024에서 A이고, 나머지 10종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 109의 경우, 승인번호 COS0451 또는 COS0451:6734로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 26813722번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB109, DB110, DB113, Wild radish1, Wild radish2, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024에서 T이고, 나머지 8종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 110의 경우, 승인번호 RsSNP13161 또는 RsSNP13161:9311로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 26992884번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB110, Raphanistroides1, WK10024에서 G이고, 나머지 14종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 111의 경우, 승인번호 COS0571 또는 COS0571:943로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 27922920번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 14종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 112의 경우, 승인번호 RsSNP07164 또는 RsSNP07164:289로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 27967542번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB109, DB113, Wild radish1, Wild radish2, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 9종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 113의 경우, 승인번호 COS0313 또는 COS0313:1387로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 28456601번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, Raphanistroides2, Aokubi_S, WK10024에서 G이고, 나머지 10종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 114의 경우, 승인번호 RSS2972 또는 RSS2972:9225로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 28521447번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 G이고, 나머지 16종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 115의 경우, 승인번호 RSS0530 또는 RSS0530:3168로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 28716447번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB109, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides2, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 10종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 116의 경우, 승인번호 RsSNP09734 또는 RsSNP09734:11637로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 28752962번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, Wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 11종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 117의 경우, 승인번호 COS0419 또는 COS0419:17503로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 28808135번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB102, Raphanistroides3, Sayatori, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 13종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 118의 경우, 승인번호 RPG(12) 또는 RPG(12):6676로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 29433915번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB113, Wild radish1, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 9종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 119의 경우, 승인번호 RSS1866 또는 RSS1866:9423로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 29791075번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, Wild radish2, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 6종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 120의 경우, 승인번호 RS2CL2407s 또는 RS2CL2407s:5180로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 31008540번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB110, DB113, Wild radish1, Wild radish3, Sayatori, WK10024, WK10039, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 7종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 121의 경우, 승인번호 RsSNP15545 또는 RsSNP15545:1405로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 31030622번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 DB102, DB113, Raphanistroides3, Aokubi_S, Sayatori, WK10024에서 A이고, 나머지 11종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 122의 경우, 승인번호 COS0686 또는 COS0686:4877로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 32161843번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 DB102, DB110, DB113, Wild radish2, Wild radish3, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 10종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 123의 경우, 승인번호 RsSNP04375 또는 RsSNP04375:652로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 32243680번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, DB113, Wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 5종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 124의 경우, 승인번호 RsHA031 또는 RsHA031:1747로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 32519596번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB109, DB110, Wild radish3, Raphanistroides2, WK10024에서 T이고, 나머지 12종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 125의 경우, 승인번호 RS2CL3052s 또는 RS2CL3052s:10022로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 38858400번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, Raphanistroides2, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 12종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 126의 경우, 승인번호 RSS1015 또는 RSS1015:274로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 39002066번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, WK10024에서 A이고, 나머지 14종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 127의 경우, 승인번호 COS0291 또는 COS0291:3818로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 39502102번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, Wild radish3, Aokubi_S, WK10024에서 A이고, 나머지 11종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 128의 경우, 승인번호 RS2CL1476s 또는 RS2CL1476s:2378로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 39655679번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Wild radish3, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 14종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 129의 경우, 승인번호 RsSNP15342 또는 RsSNP15342:3182로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 39672067번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 Wild radish3, WK10024에서 T이고, 나머지 15종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 130의 경우, 승인번호 RSS0957 또는 RSS0957:770로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 39964468번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB104, DB110, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024에서 G이고, 나머지 6종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 131의 경우, 승인번호 RSS2932 또는 RSS2932:5048로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 41863359번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 7종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 132의 경우, 승인번호 RsSNP09783 또는 RsSNP09783:545로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 41873898번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB113, Wild radish1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024에서 A이고, 나머지 8종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 133의 경우, 승인번호 RSS1264 또는 RSS1264:2668로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 42050601번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB104, DB109, DB113, Wild radish1, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024에서 G이고, 나머지 8종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 134의 경우, 승인번호 COS0699 또는 COS0699:7413로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 42135635번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Aokubi_S, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 7종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 136의 경우, 승인번호 RsSNP01484 또는 RsSNP01484:2723로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 42588315번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, Wild radish1, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024에서 G이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 137의 경우, 승인번호 RSS2715 또는 RSS2715:6998로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 43619246번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB102, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides2, Aokubi_S, Sayatori, WK10024에서 T이고, 나머지 10종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 138의 경우, 승인번호 COS0163 또는 COS0163:286로서, 무의 2번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 2번 염색체의 43731231번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB104, DB110, DB113, Wild radish2, Raphanistroides1, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 6종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 139의 경우, 승인번호 RSS0198 또는 RSS0198:1069로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 2138711번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 6종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 140의 경우, 승인번호 COS0881 또는 COS0881:6891로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 2423500번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 G이고, 나머지 16종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 141의 경우, 승인번호 RsSNP07531 또는 RsSNP07531:14513로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 2888842번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에 DB109, DB113, Aokubi_S, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 12종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 142의 경우, 승인번호 COS0722 또는 COS0722:4254로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 4110114번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 A이고, 나머지 16종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 143의 경우, 승인번호 RSS3784 또는 RSS3784:4561로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 4152724번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 C이고, 나머지 16종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 144의 경우, 승인번호 COS0727 또는 COS0727:2575로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 4441597번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 15종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 145의 경우, 승인번호 RS2CL7432s 또는 RS2CL7432s:2468로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 5188567번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에 DB102, Wild radish2, Raphanistroides2, WK10024에서 C이고, 나머지 13종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 146의 경우, 승인번호 RSS1161 또는 RSS1161:7466로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 5846000번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB102, DB113, Raphanistroides1, WK10024에서 T이고, 나머지 13종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 147의 경우, 승인번호 RSS1803 또는 RSS1803:2122로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 7185530번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에 WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 15종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 148의 경우, 승인번호 RsSNP11157 또는 RsSNP11157:31643로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 7277277번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 T이고, 나머지 16종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 149의 경우, 승인번호 RsSNP14725 또는 RsSNP14725:8319로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 8497413번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에 DB110, DB113, WK10039, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 13종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 150의 경우, 승인번호 RSS3574 또는 RSS3574:4600로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 11245262번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB109, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 11종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 151의 경우, 승인번호 RS2CL1398s 또는 RS2CL1398s:2157로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 11249703번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Aokubi_S, Sayatori, WK10024에서 C이고, 나머지 8종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 152의 경우, 승인번호 RSS2488 또는 RSS2488:2328로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 11505930번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB102, DB113, Sayatori, WK10024에서 G이고, 나머지 13종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 153의 경우, 승인번호 RS2CL6711s 또는 RS2CL6711s:3404로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 11792410번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 T이고, 나머지 16종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 154의 경우, 승인번호 RS2CL1086s 또는 RS2CL1086s:1283로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 12812633번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, Wild radish2, Wild radish3, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 9종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 155의 경우, 승인번호 COS0074 또는 COS0074:13649로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 12960047번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, Wild radish2, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 156의 경우, 승인번호 RSS0365 또는 RSS0365:10342로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 13214670번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Wild radish1, Raphanistroides1, WK10024에서 C이고, 나머지 14종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 157의 경우, 승인번호 RsSNP03656 또는 RsSNP03656:13439로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 13350170번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB113, Raphanistroides2, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 12종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 158의 경우, 승인번호 RsSNP12091 또는 RsSNP12091:1053로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 13514726번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 G이고, 나머지 16종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 159의 경우, 승인번호 COS0741 또는 COS0741:8022로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 13855794번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Sayatori, WK10024에서 G이고, 나머지 9종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 160의 경우, 승인번호 RsSNP12832 또는 RsSNP12832:12639로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 14045185번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 C이고, 나머지 16종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 161의 경우, 승인번호 RSS3536 또는 RSS3536:7543로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 15038468번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, WK10024에서 T이고, 나머지 14종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 162의 경우, 승인번호 COS0906 또는 COS0906:720로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 15594081번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB102, Wild radish1, Raphanistroides1, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 11종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 163의 경우, 승인번호 RSS0852 또는 RSS0852:4162로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 15633679번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB113, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 8종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 164의 경우, 승인번호 RsSNP12555 또는 RsSNP12555:11821로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 15642396번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB113, Raphanistroides1, Raphanistroides3, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 8종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 165의 경우, 승인번호 COS0514 또는 COS0514:1490로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 15825087번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB113, Raphanistroides2, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 11종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 166의 경우, 승인번호 RsSNP01876 또는 RsSNP01876:6949로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 15830547번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB113, Wild radish1, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, WK10024에서 A이고, 나머지 8종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 167의 경우, 승인번호 COS1183 또는 COS1183:313로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 15963888번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB102, DB113, Wild radish2, Aokubi_S, WK10024에서 G이고, 나머지 12종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 168의 경우, 승인번호 RSS0108 또는 RSS0108:136로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 16004999번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long Scarlet, DB102, Wild radish3, Raphanistroides2, WK10024에서 G이고, 나머지 12종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 169의 경우, 승인번호 RSS0699 또는 RSS0699:4836로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 16575656번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB102, WK10024에서 T이고, 나머지 15종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 170의 경우, 승인번호 RSS0134 또는 RSS0134:2121로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 17149703번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB113, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 10종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 171의 경우, 승인번호 RsSNP12348 또는 RsSNP12348:3409로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 17150991번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 G이고, 나머지 16종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 172의 경우, 승인번호 COS1132 또는 COS1132:5261로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 17696569번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB102, WK10024에서 T이고, 나머지 15종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 173의 경우, 승인번호 COS0183 또는 COS0183:1120로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 17882365번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB102, WK10024에서 G이고, 나머지 15종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 174의 경우, 승인번호 RsSNP11139 또는 RsSNP11139:9755로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 18039302번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 DB102, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 14종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 175의 경우, 승인번호 RsSNP01567 또는 RsSNP01567:22033로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 19483748번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB104, Wild radish2, WK10039에서 G이고, 나머지 13종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 176의 경우, 승인번호 RS2CL1544s 또는 RS2CL1544s:2285로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 19500287번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, Wild radish2, Wild radish3, WK10024에서 G이고, 나머지 12종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 177의 경우, 승인번호 RsSNP10559 또는 RsSNP10559:2071로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 20217052번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB104, WK10039, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 12종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 178의 경우, 승인번호 COS0994 또는 COS0994:24855로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 20520633번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에 DB102, Wild radish3, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 13종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 179의 경우, 승인번호 RSS0457 또는 RSS0457:5342로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 21246659번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 DB113, WK10024에서 C이고, 나머지 15종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 180의 경우, 승인번호 COS0206 또는 COS0206:5926로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 21924238번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB113, Wild radish1, Wild radish2, Raphanistroides1, Aokubi_S, WK10024에서 C이고, 나머지 8종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 181의 경우, 승인번호 COS0054 또는 COS0054:5684로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 21936212번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, Wild radish1, Wild radish2, Raphanistroides3, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 9종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 182의 경우, 승인번호 RsSNP07337 또는 RsSNP07337:3993로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 22560913번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, Raphanistroides2, Aokubi_S, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 12종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 183의 경우, 승인번호 RS2CL2369s 또는 RS2CL2369s:3182로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 22887516번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB110, Wild radish2, Sayatori, WK10024에서 G이고, 나머지 11종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 184의 경우, 승인번호 RsSNP15295 또는 RsSNP15295:12153로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 22974124번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 DB104, Wild radish1, WK10039, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 13종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 185의 경우, 승인번호 RsSNP10880 또는 RsSNP10880:2949로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 23596967번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에 DB102, WK10024, R. raphanistrum에서 C이고, 나머지 14종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 186의 경우, 승인번호 RS2CL1360s 또는 RS2CL1360s:13160로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 23632127번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB102, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 14종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 187의 경우, 승인번호 COS0564 또는 COS0564:19842로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 23830320번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, DB113, Wild radish1, Wild radish2, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 8종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 188의 경우, 승인번호 RSS3795 또는 RSS3795:4424로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 23865043번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 DB104, DB113, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Aokubi_S, WK10039에서 G이고, 나머지 11종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 189의 경우, 승인번호 RSS0678 또는 RSS0678:1958로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 23865043번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 A이며, 상기 17종 중에 DB110, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 14종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 190의 경우, 승인번호 COS1131 또는 COS1131:11229로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 25321435번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, Aokubi_S, WK10024에서 G이고, 나머지 14종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 191의 경우, 승인번호 RsSNP09233 또는 RsSNP09233:247로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 25526533번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에 WK10024에서 C이고, 나머지 16종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 192의 경우, 승인번호 RSS1458 또는 RSS1458:1332로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 25845613번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, Wild radish3, Raphanistroides1, WK10024에서 C이고, 나머지 10종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 193의 경우, 승인번호 RS2CL4186s 또는 RS2CL4186s:707로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 26135828번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 C이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB109, DB110, DB113, Sayatori에서 C이고, 나머지 11종에서 A를 가질 수 있다.
서열번호 194의 경우, 승인번호 RSS3763 또는 RSS3763:5283로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 26913377번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB113, Wild radish1, Wild radish2, Raphanistroides2, WK10024, R. raphanistrum에서 G이고, 나머지 11종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 195의 경우, 승인번호 RSS2059 또는 RSS2059:1303로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 27095895번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 T이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB110, DB113, Wild radish2, Wild radish3, Aokubi_S, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 8종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 196의 경우, 승인번호 COS0303 또는 COS0303:639로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 27397636번째 위치하고, SNP의 서열은 C 또는 A이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, Wild radish2, WK10024, R. raphanistrum에서 A이고, 나머지 13종에서 C를 가질 수 있다.
서열번호 197의 경우, 승인번호 RSS2054 또는 RSS2054:2909로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 28077613번째 위치하고, SNP의 서열은 T 또는 C이며, 상기 17종 중에 Raphanistroides3, WK10024에서 C이고, 나머지 15종에서 T를 가질 수 있다.
서열번호 198의 경우, 승인번호 RSS1224 또는 RSS1224:13385로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 28530480번째 위치하고, SNP의 서열은 G 또는 T이며, 상기 17종 중에 Long scarlet, DB102, DB113, Aokubi_S, Sayatori, WK10024, R. raphanistrum에서 T이고, 나머지 10종에서 G를 가질 수 있다.
서열번호 199의 경우, 승인번호 RsSNP14142 또는 RsSNP14142:17874로서, 무의 3번 염색체에 위치하고, SNP의 위치는 전체 3번 염색체의 29041646번째 위치하고, SNP의 서열은 A 또는 G이며, 상기 17종 중에 DB113, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3, Raphanistroides2, Aokubi_S, WK10039에서 A이고, 나머지 10종에서 G를 가질 수 있다.
하기의 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세하게 설명한다. 그러나 하기 실시예는 본 발명의 내용을 구체화하기 위한 것일 뿐 이에 의해 본 발명이 한정되는 것은 아니다.
실시예 1 유전체 재분석용 재배종 및 야생무 탐색
국내 및 해외에서 수집한 48 품종 무의 핵 DNA를 추출하고 이를 18개의 InDel 분자표지를 이용하여 지노타이핑을 실시하였다. 이들의 지노타입을 바탕으로 UPGMA 클러스터링을 수행하였다. 이들 클러스터링 결과와 형태적 특성, 원산지를 바탕으로 17개의 무 재배종 및 야생종을 선별하였다. 이의 결과를 도 1 및 표 1에 나타내었다.
Type Name Origin Source
(Accession)1
Cultivated WK10039 Korea NIHHS (WK10039)
WK10024 Europe NIHHS (WK10024)
Long Scarlet USA NIAS (JP27291)
DB102 Europe Dongbu
DB104 Korea Dongbu
DB109 China Dongbu
DB110 China Dongbu
DB113 Japan Dongbu
Aokubi Japan Kitashiba et al. (2014)
Sayatori Japan Kitashiba et al. (2014)
Wild Raphanistroides1 Japan RDA-GIC (IT234955)
Raphanistroides2 Korea RDA-GIC (IT260989)
Raphanistroides3 Korea RDA-GIC (IT264026)
Wild radish1 Vietnam RDA-GIC (IT182537)
Wild radish2 India RDA-GIC (IT32722)
Wild radish3 India RDA-GIC (IT32723)
Raphanistrum USA Moghe et al. (2014)
실시예 2. 유전체 재분석 및 SNP 다형성 분석
선발된 17개의 무 재배종 및 야생종으로부터 DNA를 추출하고 Illumina HiSeq2000을 이용하여 25X이상의 샷건(shotgun) 서열을 생산하였다. 생산된 서열은 adaptor contamination, PCR duplicates 및 low quality 등의 기준으로 필터링하였다. 또한 Kitashiba 등이 2014년에 보고한 R. sativus cv. Aokubi와 cv. Sayatori, Moghe 등이 2013년에 보고한 R. raphanistrum 서열을 NCBI에서 다운로드하여 동일한 방법으로 필터링을 수행하였다. 필터링된 read들은 무 표준유전체 서열 Rs1.0에 BWA-MEM 0.7.9a를 이용하여 맵핑하고 SNP를 탐색하였다. 이때, SNP는 각 accession에서 homozygous한 것만을 선택하였다.
실시예 3. 무 유전자원 평가를 위한 SNP 탐색
상기 실시예 1 및 2를 통해 탐색된 대량의 SNP들 중, 무 유전자원 평가를 위한 SNP를 고르기 위해 다음과 같은 선발 기준을 임의로 정하였다. A. 일본 Plant Genome DataBase Japan (PGDB)에 등록된 각종 분자표지를 WK10039에 맵핑시켰을 때, 해당 분자표지 +1 과 -1 kb 사이에 존재하는 SNP; B. Raphanistrum 을 제외한 16개 품종/야생무에서 적어도 한 종 이상에서 polymorphism 이 존재하는 것; C. 특정 SNP 기준 +/- 50 bp 이내에 그 자신을 제외하고 다른 SNP가 한 개 이하인 것; 및 D. 각 SNP 당 다른 SNP갯수가 적은 것을 고르고, 그 수가 같은 경우 랜덤하게 선별하였다.
그 결과, 모두 702개의 분자표지가 선별되었다. 이들의 분포는 도 4와 같다. 본 발명에서는 17종의 무를 선별할 수 있는 702개의 SNP들 중, 무의 1번 내지 3번 염색체 상에 존재하는 199개의 SNP를 선발하였다.
<110> catholic industry academic cooperation foundation <120> A seed purity checking SNP for radish <130> P-1 <160> 199 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL7513s;RS2CL7513s:8129 <400> 1 gcctgagagc accaacacct tgggcctcca attgctggac ccttgcgcag naaaagcttg 60 tttcagacaa gccaaagcct gtgtgatact cctctttctg g 101 <210> 2 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0441;COS0441:427 <400> 2 tctcatgccg aagtcgtcgc cagaagatct ctcctcaggt tcctttactg nttatagttt 60 gctgctttga ttatatagtt tgaattttat tgtaaaaatc g 101 <210> 3 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsHH025-1; RsHH025-1:13109 <400> 3 ctctactcgg gcaacttact tgctccttac aaccagtacc gagccctcta ncttgctgcc 60 gacaaatacg acattcctta tctccaagac gtttgccgcg a 101 <210> 4 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS1051;COS1051:13165 <400> 4 ctattctgcg ccgtggacag agctgagatc cctagcttcc tctctctcag nttctgcaga 60 aacttcacct cttccaacgc caatctgcaa tttcacccaa t 101 <210> 5 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0520;COS0520:10938 <400> 5 ctattctgcg ccgtggacag agctgagatc cctagcttcc tctctctcag nttctgcaga 60 aacttcacct cttccaacgc caatctgcaa tttcacccaa t 101 <210> 6 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL4624s;RS2CL4624s:17727 <400> 6 agaaacagac aagttcaaat aaaatcatat aaatgtctat gtatatttaa naactaatca 60 tgtgtattgt tgtaggcttg gatttggatt gtggaccgtt t 101 <210> 7 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS1177;COS1177:8023 <400> 7 gaacccaatt tccaacagaa acggagaaga agcaccacca ccggagaaga ngaggaggag 60 cgaaggcgga gacagaacga aacagagagc gacaaggagt a 101 <210> 8 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL5888s;RS2CL5888s:5546 <400> 8 ttcagagttt gtgcctactt atgaagataa agatggtgac tggatgctca ntggagatgt 60 tccatgggag taagtcctta tcatatatgt caaaaaaaaa a 101 <210> 9 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP15451;RsSNP15451:5892 <400> 9 gataacaata tatcactaac cgcaacacta taactaaata tttgtaaata ntaaaatacc 60 aattatctat actggccaaa ctaaattgac cagtaacgtt a 101 <210> 10 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3223;RSS3223:9208 <400> 10 atacacacac ttaaccaaaa ataaaaataa attggttacg ttaacttcca naacctccaa 60 ttagtttctc cagagaaagc tgtaagaaac tttcttattt t 101 <210> 11 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0902;COS0902:763 <400> 11 actaattgtg gtaaatttac tcttatcctt attagattta ttaatatctt naaatgcctg 60 ttagatgttg ttttcaacaa gtactaatag tatctttgtg a 101 <210> 12 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL4654s;RS2CL4654s:13965 <400> 12 tttgtcccct cttatctcaa gaacctgaag gaagcacaaa caacactaga nccagtcatc 60 atcatctcca acaatagaga ttgtacaaag acataataaa a 101 <210> 13 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0076;COS0076:4130 <400> 13 agatacaaac cttgagcaac tcttgcgatc tccttggcaa aaccagttga nacaaacttg 60 ttctctgtat ctatcactag tagagacatc ccagccttgt a 101 <210> 14 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3377;RSS3377:9910 <400> 14 tactgttttt caagtcattt gcaacttgac tcccggatat catcaggttt ntaatttgaa 60 cttgacctgt tttcataaca atttcttcct gagttcattc a 101 <210> 15 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS1086;COS1086:6744 <400> 15 ttgtttgacc aaggttgcgc cactgtcata gagcatgact ttggccacat nattcctaca 60 aagtctcctt ttattgatga gattaaagct tttcttaacc a 101 <210> 16 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2226;RSS2226:8609 <400> 16 ttctcctcat ccgcatctac acgcagaaca actgattttg ggattgatga ngactacagc 60 gagctagtga gagcagcgtc ggttaggagt ttaggacaca a 101 <210> 17 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1865;RSS1865:1754 <400> 17 ttctgtttgc atggagggct atcaccttct ctggatacac ttgataatat ncgaagcttg 60 gatcgcattc aggaggtatt ttaccttctt ctttgactgt c 101 <210> 18 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3654;RSS3654:5459 <400> 18 attactattt ttagctgact caagggttgt ggcaggagat ctttttgcag nagatagaga 60 agagctccta ctcttttgtc ttttgtaacg ttttggtgtt g 101 <210> 19 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2390;RSS2390:1444 <400> 19 acattgtcct ttgatggcgc agagggagca atgtctgcat catcttcacc nccagctgca 60 ttattttcaa catttgctgg agcttggtct acgctgtaca t 101 <210> 20 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1226; 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RsSNP10880:2949 <400> 185 gtgtttattt ttgaaagatt aatgttttag atgatagtta atacatttgt ntttattatt 60 aaaacattaa acaattgtaa gaataaccaa aatgattaac a 101 <210> 186 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL1360s; RS2CL1360s:13160 <400> 186 tctatcatgt ttggtaaagg aagtaccctt atggccgatg atgctgattc nagtgttggc 60 acttcgtttg gtgtgttccc tgtcatcacc atttcatcaa g 101 <210> 187 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0564; COS0564:19842 <400> 187 cctaaagttt acatatatta ataaatggca gtccactaaa gagaacagta ngatactaca 60 actatttagc caacagtaat agataaagga ggacaaagat a 101 <210> 188 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3795;RSS3795:4424 <400> 188 gaagaatgaa gaatcagatg cggtttaaat agtaggagta aagctgtttt ncttgctgat 60 gcttttgtgt tagtggtggg tccctgtctt tttcttctcc t 101 <210> 189 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS0678; RSS0678:1958 <400> 189 gcttgtggcc gtcgtaatag tgatatatct gtggacagct aaatattccg ntttccatgc 60 accttataat tagcccttgt aactaattgg tcaacatact a 101 <210> 190 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS1131; COS1131:11229 <400> 190 cacttaatct tgttaaactg tttctctatt cgtcttcgtc tgcaggggaa naagaaggaa 60 ggaaatgcgg cgaggtatat gaccaggtcg caggcactta a 101 <210> 191 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP09233; RsSNP09233:247 <400> 191 atttgaaact ttttttgaaa atattaccag aattgaaatg aaccccatta naaagcagat 60 ctagtttata cagatccgag agtatagaca atgtagagaa g 101 <210> 192 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1458; RSS1458:1332 <400> 192 aactatgttc ctgaaaagtt caagctctct actgcgttga tggatgttct ngggattgag 60 gttgaaacca ggccgagaat catcgctgcg atttggcatt a 101 <210> 193 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RS2CL4186s; RS2CL4186s:707 <400> 193 atgctagtac aatagatgat catgatgtca cttcctgata ttctaataga nacaaaagat 60 gatacggtac tttgatttca actgtaaaga cgacattaac t 101 <210> 194 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS3763; RSS3763:5283 <400> 194 tgatcattaa tttcccttac catatttctt gtcggagtcg acaagttctg natgaaccct 60 tgccgcttga tcttgctcgc catcttcttg tagttagtga c 101 <210> 195 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2059; RSS2059:1303 <400> 195 gattaagatt ggaactatac aaataattga ttattttgga tctatccttt ngtaaagttg 60 tagaataatg tcatgagtag tcgatcgtgg atgcgattta g 101 <210> 196 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> COS0303; COS0303:639 <400> 196 gccgaaaagg ctggtctttt atccttagcc gagaaatcag gtttctctct ntccaccatc 60 gagcgtctcg gactgctcac caaagccgag gagttcggcg t 101 <210> 197 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS2054; RSS2054:2909 <400> 197 tattgtgatt acagttaaac cataccaagt ccccttgctg ctacatcagt ngcagtcatt 60 atcgggcttc taccgctctt aaattctgac aagacacgat c 101 <210> 198 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RSS1224; RSS1224:13385 <400> 198 aaaatattaa atagaaaagt agttcaacct tatttaagta tattaatctt ntgttgcttc 60 catcaccaac cgtatcaatt aatttatttg agactaagaa c 101 <210> 199 <211> 101 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RsSNP14142; RsSNP14142:17874 <400> 199 ttcatgctaa atctaacatg gctaatctac ctacatagat atgatcgaga ngtcaatcat 60 ggtcactgct ctgcaatcaa gaggattctg agtggtgacg c 101

Claims (6)

  1. 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP(single nucleotide polymorphism) 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 200개의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 WK10039, WK10024, Long Scarlet, DB102, DB104, DB109, DB110, DB113, Aokubi, Sayatori, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3 및 Raphanistrum 로부터 선택된 무의 종 판별용 SNP 마커 조성물.
  2. 제 1 항에 따른 SNP 마커 조성물을 포함하는 무의 종 판별용 키트.
  3. (a) 시료로부터 분리된 핵산분자를 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP 폴리뉴클레오티드를 증폭할 수 있도록 제작된 프라이머쌍을 이용하여 증폭하는 단계;
    (b) 상기 (a)의 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 확인하는 단계;를 포함하는 WK10039, WK10024, Long Scarlet, DB102, DB104, DB109, DB110, DB113, Aokubi, Sayatori, Raphanistroides1, Raphanistroides2, Raphanistroides3, Wild radish1, Wild radish2, Wild radish3 및 Raphanistrum 로부터 선택된 무의 종을 판별하는 방법.
  4. 삭제
  5. 제 3 항에 있어서,
    상기 방법은 (i) 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP 뉴클레오타이드에 인접한 서열과 어닐링하고, (ii) 3' 말단의 뉴클레오타이드가 상기 SNP 뉴클레오타이드로부터 -1 위치의 뉴클레오타이드와 매칭되는 지노타이핑(genotyping) 프라이머를 이용하여 SNP 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 분석하는 것을 특징으로 하는 방법.
  6. 제 3 항에 있어서,
    상기 방법은 서열번호 1 내지 199로 표시되는 염기서열의 51번째 SNP 뉴클레오티드를 포함하는 8 내지 200개의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드에 결합할 수 있는 프로브를 이용하여 SNP 폴리뉴클레오티드의 염기타입을 분석하는 것을 특징으로 방법.
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KR20160082292A (ko) * 2014-12-30 2016-07-08 가톨릭대학교 산학협력단 무 유전자원 분석을 위한 분자표지 및 이의 용도

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Annaliese S. Mason et al. Molecular Ecology Resources (2015) Vol.15 pp.1091-1101
http://radish-genome.org (2015.10.01.)*
Jeong-Hwan Mun et al. Theor Appl Genet (2015) Vol.128 pp.259-272*

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