JPWO2018051916A1

JPWO2018051916A1 - 有機酸の製造方法

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Publication number: JPWO2018051916A1
Application number: JP2018539683A
Authority: JP
Inventors: 誠久蓮沼; 真実松田
Original assignee: Kobe University NUC
Current assignee: Kobe University NUC
Priority date: 2016-09-14
Filing date: 2017-09-08
Publication date: 2019-06-27
Also published as: WO2018051916A1

Abstract

微細藻から二酸化炭素と光エネルギーを直接資源化して、効果的に有機酸を産生しうる、有機酸の製造方法を提供する。微細藻を３５〜４０℃の温度条件で培養する工程を含み、さらに炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンを含む系で微細藻を培養することで、微細藻の光合成と微細藻に取り込まれた炭素源により、効果的に有機酸を産生することができる。例えば有機酸のうちコハク酸は石油等を原料として産生されていたが、本発明の方法によりバイオマスを有効活用して有機酸を産生することができる。産生された有機酸は、食品、医薬品、その他各種分野において有効に利用される。

Description

本発明は、微細藻による有機酸の製造方法に関する。

本出願は、参照によりここに援用されるところの日本出願特願２０１６−１７９４６７号優先権を請求する。

コハク酸は有機酸に属し、ポリエステル、ポリアミド等のポリマー原料として用いられる。また、乳酸やコハク酸等の有機酸は、食品、医薬品、その他化学品の合成原料として広く用いられている。これら有機酸は、現在、化石資源由来の原料より、工業的に製造されているが、近年の化石資源枯渇への危惧や大気中の二酸化炭素（CO₂）増加という地球規模での環境問題の背景から、再生可能エネルギーの１つとして、デンプン及びセルロースなどの糖質系バイオマスからの生産が期待されている。

微細藻類は、水生生物であり、光を利用してCO₂から糖質エネルギーを生産することが可能である。水生であることから、食糧や土地利用との競合を回避することができ、バイオエネルギー生産に有望な生体システムとして注目されている。しかし、バイオベース化学品の製造に共通する課題は、大量生産を可能にし、そして価格を安くすることにある。このため、生産性効率向上が求められているが、微細藻類を利用する場合の大きな課題の１つが、細胞密度が低い点である。微細藻類の光合成評価システムが本発明者らにより開発され（非特許文献１及び２）、微細藻類の増殖性を決定する因子を特定及び強化することにより、細胞密度を増大させる方法を模索しており、各種検討が進められている。

微細藻類の増殖性に関し、シアノバクテリアの１種であるシネコシスティスPCC6803種（Synechocystis sp. PCC6803）において、フラボジアイロンタンパク質（Flavodiiron protein）であるFlv1及びFlv3のそれぞれを欠損させた場合、変動光下での細胞増殖及び光合成が阻止されたことが報告されている（非特許文献３）。

水性媒体中で微生物又はその処理物の存在下で、有機原料をコハク酸に変換する工程を含むコハク酸の製造方法について開示がある（特許文献１）。ここでは、水性媒体中のコハク酸アルカリ金属塩の濃度を特定の範囲とし、次いでアンモニア及び／又はアンモニウム塩を添加することにより、コハク酸の産生速度が高まることが開示されている。

化石資源を用いず、環境に優しい方法でより効率的に有機酸を製造する方法の開発が望まれている。

Hasunuma Tら, 2010, J Exp Bot 61: 1041-1051 Hasunuma Tら, 2013, J Exp Bot 64: 2943-2954 Allahverdiyeva Yら, 2013, PNAS 110: 4111-4116

国際公開WO2013/69786号公報

本発明は、化石資源を用いず、環境に優しく効果的な有機酸の製造方法を提供することを課題とする。

従来、微細藻を利用したバイオベース化学品（有機酸など）の製造にあたり、微細藻の培養は、生育面から好適と考えられる２５〜３０℃の温度条件で実施するのが一般的であった。本発明者らは、上記課題を解決するために鋭意検討を重ねた結果、微細藻を３５〜４０℃の温度条件で培養する工程を含むことで、微細藻からCO₂と光エネルギーを直接資源化して、細胞内代謝物である有機酸を回収することで効果的に有機酸を産生可能となり、その結果環境に優しく効果的な有機酸の製造方法を提供することができることを見出し、本発明を完成した。さらには、微細藻を炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンを含む水性媒体中で培養し、細胞内代謝物である有機酸を回収することによる。さらに、NADPH-O₂オキシドレダクターゼの機能及び／又はグリコーゲンからクエン酸回路に至る解糖系での律速酵素の機能が増強された微細藻を水性媒体中で培養し、細胞内代謝物である有機酸を回収することによる。

即ち、本発明は以下よりなる。
１．微細藻を３５〜４０℃の温度条件で培養する工程を含むことを特徴とする、微細藻からの有機酸の製造方法。
２．３５〜４０℃の温度条件での培養が、微細藻の培養の嫌気培養条件下で行われる、前項１に記載の製造方法。
３．３５〜４０℃の温度条件での培養が、微細藻の培養の嫌気的かつ暗所にての培養条件下で行われる、前項１に記載の製造方法。
４．微細藻を３５〜４０℃の温度条件で、２４時間以上、５日以内、培養する工程を含む、前項２又は３に記載の製造方法。
５．以下の（Ａ）及び（Ｂ）の工程を含む、前項１〜４のいずれかに記載の微細藻からの有機酸の製造方法：
（Ａ）炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンの含有量が20〜2000mMの水性媒体中で微細藻を培養する工程；
（Ｂ）前記（Ａ）の微細藻から産生された有機酸を回収する工程。
６．炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンの含有量が20〜2000mMの水性媒体が、（１）二酸化炭素の充填、及び／又は、（２）炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、重炭酸カリウム、炭酸マグネシウムより選択されるいずれか１種又は２種以上の炭酸塩の添加、による水性媒体である、前項５に記載の製造方法。
７．（１）二酸化炭素の充填、及び／又は、（２）炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、重炭酸カリウム、炭酸マグネシウムより選択されるいずれか１種又は２種以上の炭酸塩の添加が、微細藻の培養の嫌気培養条件下で行われる、前項６に記載の製造方法。
８．二酸化炭素の充填が、水性媒体中で飽和状態になるまで行われる、前項６又は７に記載の製造方法。
９．前記微細藻がシアノバクテリア及び／又はクラミドモナス属である、前項１〜８のいずれかに記載の有機酸の製造方法。
１０．シアノバクテリアが、シネコシスティス属である、前項９に記載の有機酸の製造方法。
１１．前記有機酸が、脂肪族ジカルボン酸である、前項１〜１０のいずれかに記載の有機酸の製造方法。
１２．前記有機酸が、コハク酸、乳酸、酢酸、フマル酸、2-ケトグルタル酸、リンゴ酸、クエン酸及びグルコン酸から選択されるいずれか１種又は２種以上である、前項１〜１０のいずれかに記載の有機酸の製造方法。
１３．微細藻が、PEPカルボキシラーゼ、ピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素及びホスフォグルコムターゼから選択される少なくとも１種の酵素機能が増強された微細藻である、前項１〜１２のいずれかに記載の有機酸の製造方法。
１４．微細藻が、NADPH-O₂オキシドレダクターゼの発現又は発現増強するように形質転換された微細藻である、前項１〜１３のいずれかに記載の有機酸の製造方法。

微細藻を３５〜４０℃の温度条件で培養することで、より効果的に微細層から有機酸を産生することができる。さらに、炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンを含む水性媒体中で培養することで微細藻内のクエン酸回路を活性化することができる。本発明の有機酸の製造方法によれば、微細藻の光合成によって合成されたグリコーゲンと、水性媒体から取り込まれた炭素源とを有効活用して細胞内代謝物である有機酸を効果的に産生しうる。そして、NADPH-O₂オキシドレダクターゼの機能及び／又はグリコーゲンからクエン酸回路に至る解糖系での律速酵素の機能が増強された微細藻を水性媒体中で培養することで、より効果的に有機酸を産生することができる。その結果、化石資源を用いず、環境に優しく効果的に有機酸を製造することができる。

PCC6803（GT）を、３５、３７．５又は４０℃にて嫌気条件下で培養したときの、各温度におけるコハク酸の産生量を測定した結果を示す図である。（実施例１） PCC6803（GT）を、0〜500 mMの炭酸水素ナトリウム（NaHCO₃）を水性媒体に添加し、３７．５℃にて培養したときのコハク酸の産生量を測定した結果を示す図である。（実施例２）微細藻によるコハク酸の産生経路を示す図である。（実施例３） PCC6803（PEPox）の３７．５℃培養でのコハク酸の産生を測定した結果を示す図である。（実施例３） PCC6803（PEPox）及びPCC6803（WT）について、0〜500 mMの炭酸水素ナトリウム（NaHCO₃）存在下で培養したときのコハク酸の産生量を測定した結果を示す図である。（実施例４） PCC6803（PEPox）について、温度を変えて培養したときのコハク酸及び乳酸の産生量を測定した結果を示す図である。（実施例５） PCC6803（WT）について、温度及び炭酸水素ナトリウム濃度を変えて培養したときのりフマル酸、リンゴ酸及びグルコン酸の産生量を測定した結果を示す図である。（実施例６） PCC6803（WT）について、高密度培養したときのコハク酸の産生量を測定した結果を示す図である。（実施例７）微生物種としてクラミドモナス（Chlamydomonas reinhardtii）株について、温度を変えて培養したときのコハク酸の産生量を測定した結果を示す図である。（実施例８）

本発明は、微細藻を３５〜４０℃の温度条件で培養する工程を含むことを特徴とする、微細藻からの有機酸の製造方法に関する。

１．微細藻
本明細書において、「微細藻」とは、葉緑素（クロロフィル）を持ち、光合成を行う微生物をいう。微細藻は、光合成によって大気中のCO₂を固定化して糖類（例えば、グリコーゲン）を合成し、他方、水（H₂O）から酸素（O₂）を発生させ得る（「酸素発生型光合成」ともいう）。微細藻は、単細胞形態を有するものであってもよく、又はコロニー形態（例えば、フィラメント、シート又はボール）を有するものであってもよい。微細藻は、海洋又は淡水のいずれで繁殖するものであってもよい。

本発明の微細藻は、原核生物のシアノバクテリア（ラン藻類）及び真核生物（例えば、緑藻類、珪藻類、渦鞭毛藻、紅藻、プラシノ藻、ユーグレナ藻、真正眼点藻など）の何れであってもよい。シアノバクテリア（ラン藻類）としては、例えばシネコシスティス属（Synechocystis）、アルスロスピラ属（Arthrospira）、スピルリナ属（Spirulina）、アナベナ属（Anabaena）、シネココッカス属（Synechococcus）、サーモシネココッカス属（Thermosynechococcus）、ノストック属（Nostoc）、プロクロロコッカス属（Prochlorococcu）、ミクロシスティス属（Microcystis）、グロエオバクター属（Gloeobacter）などが挙げられる。真核生物としては、例えばクラミドモナス属（Chlamydomonas）、クロレラ属（Chlorella）、ドナリエラ属（Dunaliella）、ヘマトコッカス属（Hematococcus）、ボルボックス属（Volvox）、ボトリオコッカス属（Botryococcus）などの緑藻類；リゾソレニア属（Rhizosolenia）、ケトセロス属（Chaetoceros）、シクロテラ属（Cyclotella）、シリンドロテカ（Cylindrotheca）、ナビクラ属（Navicula）、フェオダクチラム属（Phaeodactylum）、タラシオシラ属（Thalassiosira）、フィッツリフェラ属（Fistulifera）などの珪藻類；アンフィジニウム属（Amphidinium）、シンビオジニウム属（Symbiodinium）などの渦鞭毛藻；シアニディオシゾン属（Cyanidioschyzon）、ポルフィリジウム属（Phorphyridium）などの紅藻；オストレオコッカス属（Ostreococcus）などのプラシノ藻；ユーグレナ属（Euglena）などのユーグレナ藻；ナンノクロロプシス属（Nannochloropsis）などの真正眼点藻などが挙げられる。例えば、微細藻類の微生物種としては、シネコシスティスPCC6803種（Synechocystis sp. PCC6803）、シネココッカスPCC7002種（Synechococcus sp. PCC7002）、アルスロルピラ・プラテンシス（Arthrospira platensis）（「スピルリナ（Spirulina）」とも称される）、スピルリナ・マキシマ（Spirulina maxima）、スピルリナ・サブサルサ（Spirulina subsalsa）、アナベナPCC7120種（Anabaena sp. PCC7120）、クラミドモナス（Chlamydomonas reinhardtii）、クラミドモナス種（Chlamydomonas sp.）、クロレラ・ブルガリス（Chlorella vulgaris）、クロレラ・ピレノイドーサ（Chlorella pyrenoidosa）、ドナリエラ・サリナ（Dunaliella salina）、ドナリエラ種（Dunaliella sp.）、ヘマトコッカス・プルビアリス（Hematococcus pluvialis）、ボルボックス・カルテリ（Volvox carteri）、ボトリオコッカス・ブラウニイ（Botryococcus braunii）、シクロテラ・クリプティカ（Cyclotella cryptica）、シリンドロテカ・フジフォルミス（Cylindrotheca fusiformis）、ナビクラ・サプロフィラ（Navicula saprophila）、フェオダクチラム・トリコルヌツム（Phaeodactylum tricornutum）、タラシオシラ・シュードナナ（Thalassiosira pseudonana）、フィッツリフェラ種（Fistulifera sp.）、アンフィジニウム種（Amphidinium sp.）、シンビオジニウム・ミクロアドリアチクム（Symbiodinium microadriaticum）、シアニディオシゾン・メロレ（Cyanidioschyzon merolae）、ポルフィリジウム種（Porphyridium sp.）、オストレオコッカス・タウリ（Ostreococcus tauri）、ユーグレナ・グラシリス（Euglena gracilis）、ナンノクロロプシス・オキュラタ（Nannochloropsis oculata）などが挙げられる。

本発明の方法に使用可能な微細藻は、野生型であってもよいし、有機酸を効果的に産生するように改変された微細藻であってもよい。改変の方法は、自体公知の方法や今後開発されるあらゆる方法を適用することができ、例えば遺伝子組換え等の手法により改変することができる。そのような微細藻として、例えば有機酸の産生を増強しうる酵素を過剰発現しうる遺伝子組換え微細藻が挙げられる。例えば、NADPH-O₂オキシドレダクターゼの機能及び／又はグリコーゲンからクエン酸回路に至る解糖系での律速酵素の機能が増強された微細藻を利用することができる。

本明細書において「NADPH-O₂オキシドレダクターゼ」とは、還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸（NADPH）を酸化型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸（NADP⁺）に変換し、かつO₂からH₂Oを生成することを触媒する酵素をいう。当該酵素は、微細藻類が保有する光合成光化学系Ｉにおいて、還元型フェレドキシンからの電子伝達によりNADP⁺からの変換により生じたNADPHを再度NADP⁺に変換し、かつ酸素から水を生成し得る。

本発明のNADPH-O₂オキシドレダクターゼとしては、例えば、フラボジアイロンタンパク質（以下「Flv」ともいう。）が挙げられる。フラボジアイロンタンパク質としては、例えば、Flv3、Flv1などが挙げられ、特に好適にはFlv3である。フラボジアイロンタンパク質は、上記微細藻に由来するものが挙げられる。Flv3及びFlv1は、光合成光化学系ＩにおけるO₂の光還元に関与している。例えば、Flv3としては、上記微細藻に由来するものが挙げられる。例えば、微細藻の形質転換のために、シネコシスティスPCC6803種（Synechocystis sp. PCC6803）由来のflv3遺伝子（sll0550：コード領域の塩基配列及びアミノ酸配列を配列番号１及び２に示す）が用いられ得る。本明細書において、例えばFlv3又はFlv1は、Flv3又はFlv1についてデータベースにて開示されたアミノ酸配列で特定されるほか、前記開示されたアミノ酸配列のうち１又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、本発明において必要な酵素活性を有するアミノ酸配列でも特定することができる。あるいはFlv3又はFlv1についてデータベースにて開示されたアミノ酸配列と例えば、70％以上の配列同一性を有し、本発明において必要な酵素活性を有するアミノ酸配列でも特定することができる。

本発明で用いられるNADPH-O₂オキシドレダクターゼに係る遺伝子は、上記フラボジアイロンタンパク質を発現しうる遺伝子をいい、具体的にはFlv3又はFlv1を発現しうる遺伝子をいい、特に好適にはFlv3を発現しうる遺伝子をいう。具体的には、データベースにて開示される塩基配列からなるDNAであっても良いし、当該DNAと相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件でハイブリダイズする遺伝子が挙げられる。ストリンジェントな条件とは、例えばMolecular Cloning, 2nd. Ed., Cold Spring Harbor Laboratory 1989, New Yorkの1.101〜1.104頁に開示される条件をいう。前記DNAにハイブリダイズしうる限り、配列特異的な結合がもたらされるので、このような機能性オリゴヌクレオチドも本発明のNADPH-O₂オキシドレダクターゼに係る遺伝子に包含される。

このような遺伝子は、例えば、開示される又は公知の塩基配列に基づいて設計したプライマーを用いて、各種生物から抽出したDNA、各種cDNAライブラリー又はゲノムDNAライブラリー等由来の核酸を鋳型とし、例えばPCR増幅を行うことにより、核酸断片として得ることができる。また、上記ライブラリーなどに由来する核酸を鋳型とし、本発明で発現又は発現しようとする酵素をコードする遺伝子の一部であるDNA断片をプローブとしてハイブリダイゼーションを行うことにより、核酸断片として得ることができる。あるいは遺伝子は、化学合成法等の当技術分野で公知の各種の核酸配列合成法によって、核酸断片として合成してもよい。遺伝子は、宿主微生物での発現を最適にするように、コドンが最適化されてもよい。コドンの最適化は、当業者が通常用いる任意の手段、装置を用いて実施することができる。

本明細書において、「NADPH-O₂オキシドレダクターゼの機能が増強された微細藻」とは、「NADPH-O₂オキシドレダクターゼの発現又は発現増強するように形質転換された微細藻」をいう。本明細書において、「NADPH-O₂オキシドレダクターゼの発現又は発現増強する」とは、NADPH-O₂オキシドレダクターゼに係る遺伝子の発現が増強されることをいう。本明細書において、NADPH-O₂オキシドレダクターゼに係る遺伝子の発現が増強される形態は、発明の微細藻においてこれら遺伝子の発現を増強する改変が行われる前に比べて、当該NADPH-O₂オキシドレダクターゼの生産量又は活性の増大が確認される形態であればよく、特に限定されない。遺伝子の発現を増強する改変は、自体公知の方法によっても良いし、今後開発されるあらゆる方法によっても良い。遺伝子の発現が増強されている実施形態としては、例えば、内因性のいずれかの遺伝子がより強力なプロモーター（構成的プロモーター又は誘導性プロモーターのいずれであってもよい）の制御下に連結された実施形態が挙げられる。また、追加的に内因性及び／又は外因性のいずれかの遺伝子が導入されている実施形態が挙げられる。追加的に導入されたいずれかの遺伝子は、好ましくは構成的プロモーターなど強力なプロモーターで作動可能に保持されている。発現の増強について、本明細書中においては「過剰発現」ともいう。

プロモーターとしては、微細藻にて機能する任意のプロモーターを使用することができる。例えば、微細藻がシアノバクテリア（ラン藻類）の場合、ラン藻に由来し得るsbDII、psbA3、psbA2、nirA、petE、nrsRS、nrsABCD、ndhF3、rbcL、rbcX、glnA、atp1、atp2、petF1などのプロモーターが挙げられる。

上記遺伝子を微細藻に導入するためのプラスミドベクターの一例は、pTCP2031Vベクターである。pTCP2031Vベクターは、psbA2（slr1311）プロモーター、並びにslr2030及びslr2031のコード領域の一部（相同組換え用プラットフォームとして）、及びクロラムフェニコール耐性カセットを含む組換えプラスミドなどが挙げられる（Satoh Sら, 2001, J. Biol. Chem. 276, 4293-4297；Horiuchi Mら, 2010, Biochem. J. 431, 135-140）。

組換え用構築物、例えば、上記のように作製された発現ベクター又は染色体組込み型ベクターを、宿主微細藻に導入し、形質転換微細藻を作製することができる。

形質転換微細藻（特にシアノバクテリア）の形質転換には、多くの場合、遺伝子相同組換え法が用いられ得る。遺伝子相同組換え法のために、例えば、pTCP2031Vベクターが好適に用いられ得る。形質転換のための発現ベクター又は複製可能なプラスミドの導入は、自体公知の方法又は今後開発されるあらゆる方法を適用することができる。例えば、エレクトロポレーション法、プロトプラスト-PEG法、マイクロインジェクション法、パーティクル・ガン法、リン酸カルシウム法、リポフェクション法、カルシウムイオン法などが挙げられる。

形質転換株は、遺伝子導入に用いられた発現ベクター又は染色体組込み型ベクターが有する選択マーカーなどを利用して選択される。宿主微生物それぞれに適した培地に、選択マーカーに応じた抗生物質又は薬剤を添加することができる。このような選択用培地として、微細藻の生育に適した任意の培地を使用することができる。例えば、BG-11寒天培地（例えば、Rippka Rら, 1979, J Gen Microbiol 111: 1-61に記載される：シアノバクテリアに用いられ得る）；HSM寒天培地及びTAP寒天培地（これらは、例えば、福澤ら、2009，低温科学，67:17-21に記載される：緑藻などの真核生物に用いられ得る）などが挙げられる。まずこの選択マーカーに基づき形質転換体の選抜を行い、次いで、目的とする遺伝子（すなわち、NADPH-O₂オキシドレダクターゼ遺伝子）又はその産物の発現を解析することにより、形質転換体の選抜を行うことができる。NADPH-O₂オキシドレダクターゼ発現産物は、例えば、ウエスタンブロット法によって確認することができる。

本明細書における解糖系での律速酵素の例として、ホスフォエノールピルビン酸カルボキシラーゼ（PEPカルボキシラーゼ：PEPC）、ホスフォグルコムターゼ（PGM：phosphoglucomutase）、ピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素（PFO）が挙げられる（図３参照）。

本明細書において、PEPカルボキシラーゼとは、炭酸固定経路のC₄経路でホスフォエノールピルビン酸とCO₂からオキサロ酢酸を合成する酵素をいう。本明細書において、ホスフォグルコムターゼ（PGM：phosphoglucomutase）とは、グリコーゲンの代謝において、グルコース-1-リン酸（G1P）とグルコース-6-リン酸（G6P）とを相互変換する酵素である。本明細書において、ピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素（PFO）とは、酸化還元酵素に分類され、解糖系におけるピルビン酸とアセチルCoAとを相互変換する酵素である。

２．水性媒体
上記において「水性媒体」とは、種培養及び／又は本培養に用いられる水溶液をいう。後述するように窒素源、無機塩などを含む水溶液であることが好ましい。具体的には、微細藻に応じて、人工又は天然の海水、あるいは淡水（例えば、蒸留水）を用いてもよい。例えば、BG-11培地（J Gen Microbiol 111: 1-61 (1979)）；HSM培地及びTAP培地（低温科学，67:17-21 (2009)）、Cramer-Myers培地（CM培地）等を使用することができる。具体的には、以下の表１に示す組成の培地を用いてもよい。

培養での有機酸の生産反応を効率的に行うために、水性媒体には、前記培地に炭素源として有機原料を添加しても良い。本培養に用いる有機原料は、前記微細藻が資化して増殖し得るものであれば特に限定されないが、通常、ガラクトース、ラクトース、グルコース、フルクトース、スクロース、サッカロース、デンプン、セルロース等の炭水化物；グリセロール、マンニトール、キシリトール、リビトール等のポリアルコール類等の発酵性糖質が用いられ、目的とする有機酸に応じて選択可能であり、一般的な有機原料から選択できる。例えば、グルコース、スクロース、又はフルクトースが好ましく、特にグルコース又はスクロースが好ましい。また、前記発酵性糖質を含有する澱粉糖化液、糖蜜なども使用され、前記発酵性糖質がサトウキビ、甜菜、サトウカエデ等の植物から搾取した糖液であってもよい。これらの有機原料は、単独でも組み合わせても使用できる。水性媒体には炭酸イオン、重炭酸イオン又CO₂を含有させることができる。

３．培養条件
微細藻の培養において、水性媒体のpHは、微細藻の増殖に適した任意のpH、例えば、pH 5〜10、好ましくは、pH 6〜9、より好ましくは、pH 6〜8に調整することができる。pHは、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、重炭酸カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カルシウム、水酸化マグネシウム等を添加することによって適宜調整することができる。

本発明は、３５〜４０℃の温度条件で培養する工程を含むことを特徴とする。本発明の有機酸は、微細藻を予め前培養し、その後光独立栄養や嫌気、暗所培養による本培養のステップを経て製造することができる。例えば、前培養の後、（ａ）本培養（光独立栄養）、（ｂ）本培養（嫌気、暗所）を経て培養することができる。本発明において、３５〜４０℃の温度条件での培養は、いずれの工程においても含めることができるが、好ましくは（ａ）本培養（光独立栄養）及び／又は（ｂ）本培養（嫌気、暗所）の工程で行うことができ、より好適には（ｂ）本培養（嫌気、暗所）の工程で行うことができる。
また、培養時間については、（ａ）本培養（光独立栄養）、（ｂ）本培養（嫌気、暗所）ともに、それぞれ１２時間以上、５日以内で行うことができるが、（ａ）本培養（光独立栄養）では、１２時間以上、３日以内が好ましく、（ｂ）本培養（嫌気、暗所）では、２４時間以上、５日以内が好ましい。

本明細書の（ａ）本培養（光独立栄養）において、「光独立栄養」とは一般的な意味で使用され、微細藻が光合成によってCO₂と水から糖を作り、これをエネルギー源として成長する仕組みをいう。光独立栄養時の光照射条件は自然光又は人工光のいずれであってもよく、その強さは、水性媒体中の藻体密度及び培養槽の深さ等によって、適宜調節することができる。例えば、30〜2000μmol photons m^-2 s^-1、好ましくは、30〜1000μmol photons m^-2 s^-1、より好ましくは、50〜600μmol photons m^-2 s^-1の自然光又は人工光が用いられ得る。上記範囲であると、微細藻が光合成を行って順調に増殖し得る。光照射は、連続的であっても周期的であってもよい。屋外の大規模培養については、コストを最小限にし、かつ人工照明の追加費用を回避するために、明／暗周期を設けてもよい。

本明細書の（ｂ）本培養（嫌気、暗所）において、「嫌気培養」とは、溶液中の溶存酸素濃度を低く抑えて培養することをいう。嫌気的条件とするために、例えば容器を密閉して無通気で反応させる、窒素ガス（N₂）等の不活性ガスを供給して反応させる、又はCO₂含有の不活性ガスを通気する等の方法を用いることができる。嫌気・暗所条件の工程で、有機酸は水性媒体中に排出される。

本明細書の（ｂ）本培養（嫌気、暗所）において、炭酸イオン、重炭酸イオン及び／又はCO₂が含有されていることが重要である。炭酸イオン、重炭酸イオンは、20〜2000 mM、好ましくは20〜500 mM、さらに好ましくは20〜150 mMが含有されているのが好適である。水性媒体への炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンの導入は、(1)CO₂の充填、及び／又は、(2)炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、重炭酸カリウム、炭酸マグネシウムより選択されるいずれか１種又は２種以上の炭酸塩の添加によることができる。CO₂を充填する場合は、飽和状態になるまで充填することができる。CO₂が飽和状態になることで、炭酸イオン濃度は20〜2000 mMとなる。

４．微細藻から産生された有機酸の回収
以上の様な方法で産生された有機酸は、必要に応じて、水性媒体から、自体公知の方法又は今後開発されるあらゆる分離、精製方法により分離、精製することができる。具体的には、限外ろ過膜分離、遠心分離、濃縮等により微細藻及びその産生物と分離した後、カラム法、晶析法等の公知の方法で精製し、乾燥させる事により、結晶として採取する方法等が挙げられる。本発明で、製造の対象となる有機酸としては、特に限定されるものではないが、クエン酸回路において産生される細胞内代謝有機酸であり、具体的には有機カルボン酸である。有機カルボン酸として、例えばコハク酸（succinic acid）、乳酸（lactic acid）、酢酸（acetic acid）、フマル酸（fumaric acid）、2-ケトグルタル酸（α-ketoglutaric acid）、リンゴ酸（malic acid）、クエン酸（citric acid）及びグルコン酸（gluconic acid）等が挙げられる。有機酸のうちコハク酸、フマル酸、2-ケトグルタル酸、リンゴ酸等の脂肪族ジカルボン酸が好適であり、特にコハク酸が好適である。

５．有機酸の製造
上記方法で微細藻から産生された有機酸を回収することで、化石資源を用いず、環境に優しく効果的に有機酸を製造することができる。すなわち、微細藻の光合成と微細藻に取り込まれた炭素源によりバイオマスから有機酸を産生可能となり、環境に優しく効果的に有機酸を製造することができる。水性媒体への炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンの供給は、例えば電気や鉄鋼等の製造工程において産業的に排出された大気中のCO₂を利用し、有効活用することができる。大気中のCO₂を有効活用できる点で、自然環境に対して優れた効果を有する。さらに、本発明の微細藻によれば、バイオマスとして使用される水性媒体は淡水のみならず海水を活用することができ、水資源の枯渇や耕作地の限界に左右されず安定的に有効活用することができる。

６．クエン酸回路
本発明は、微細藻を炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンの含有量が20〜2000 mMの水性媒体中で培養することを特徴とする、微細藻内クエン酸回路の活性化方法にも及ぶ。本発明の方法によれば、クエン酸回路が活性化され、その結果、細胞内代謝物である有機酸の産生が増強される。

以下に実施例を挙げて本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。

（実施例１）微細藻（シネコシスティス）による有機酸の産生
本実施例において、微細藻類の微生物種としてシネコシスティスPCC6803種（Synechocystis sp. PCC6803）グルコース耐性（GT）（Williams JGK, 1988, Methods Enzymol 167: 766-778）（以下、本実施例及び各実施例において「PCC6803（GT）」という。）を用いた。

（１）前々培養
BG-11寒天培地（1.5% Agarを含むBG-11）上で生育したPCC6803（GT）のコロニーを白金耳でとり、水性媒体（70 mL）に加え、pH7.8にて通気条件下、50μmol photons m^-2 s-¹で３０℃にて４〜５日間培養した。ここでは水性媒体として、BG-11液体培地（Rippka Rら, 1J Gen Microbiol 111: 1-61 (1979)）に17.6 mM NaNO₃, 20 mM Hepes-KOHを含む培養液を用いた。藻体密度は、Shimadzu UV mini spectrophotometer（紫外可視分光光度計：株式会社島津製作所製）を用いてOD₇₅₀により測定した。培養後のOD₇₅₀は1〜1.5であった。通気とは、特に言及しない場合は空気による通気を意味する。以下の実施例についても同様である。

（２）前培養
上記（１）で前々培養したPCC6803（GT）を、OD₇₅₀が0.1になるように水性媒体（150 mL）に加え、pH7.8にて通気条件下、50μmol photons m^-2 s-¹で３０℃にて４〜５日間培養した。ここでは水性媒体として、BG-11液体培地に17.6 mM NaNO₃, 20 mM Hepes-KOHを含む培養液を用いた。培養後のOD₇₅₀は1〜1.5であった。

（３）本培養
（ａ）本培養（光独立利用）
上記（２）で前培養したPCC6803（GT）を、OD₇₅₀が0.4になるように水性媒体（70 mL）に加え、pH7.8にてCO₂通気条件下、120μmol photons m^-2 s-¹で３０℃にて３日間培養した。ここでは、水性媒体としてBG-11液体培地に5 mM NH₄Cl, 50 mM Hepes-KOHを含む培養液を用いた。培養後のOD₇₅₀は6〜7であった。培養後、フィルター（polytetrafluoroethylene膜、孔径1μm）濾過にてPCC6803（GT）を回収した。

（ｂ）本培養（嫌気、暗所）
上記（ａ）で回収したPCC6803（GT）を、OD₇₅₀が20になるように水性媒体（10 mL）に加えた。ここでは水性媒体として100 mM Hepes-KOH（pH7.8）を用いた。１０分間のN₂通気後、３５、３７．５又は４０℃にて嫌気条件下で培養を開始し、７２時間後にPCC6803（GT）を含む水性媒体を回収した。コントロールは３０℃とした他は同条件で培養を行った。

上記（ｂ）で回収した水性媒体を、各々14000g、４℃にて５分間遠心分離し、上清を回収し、0.45μm孔径Mini-UniPrep（GEヘルスケア・ジャパン株式会社製）を用いて濾過した。濾過液について、コハク酸の産生量を、高速液体クロマトグラフィー（HPLC）カラム（Aminex HPX-87H；Bio-Rad社製）及び屈折率検出器（RID-10A；株式会社島津製作所製）を備えたHPLCにより測定した。その結果、３５、３７．５又は４０℃にて培養した場合、３０℃で培養したときに比べて、コハク酸の産生量が1.5倍以上増加したことが確認された（図１）。

（実施例２）微細藻（シネコシスティス）による有機酸の産生
本実施例では、微細藻類を0〜500 mMの炭酸水素ナトリウム（NaHCO₃）を水性媒体に添加し、３７．５℃にて培養したときのコハク酸の産生量について確認した。炭酸水素ナトリウム（NaHCO₃）を添加する以外は、実施例１と同様に（１）〜（３）の工程について各々培養を行った。

上記（３）（ｂ）で回収した水性媒体について、各濃度の炭酸水素ナトリウム（NaHCO₃）を添加したときのコハク酸の産生量を、実施例１と同手法により測定した。その結果、何れの場合も３０℃で培養したときに比べて３７．５℃にて培養した場合にコハク酸の産生量が高く、NaHCO₃の添加により、さらに産生量が増加することが確認された（図２）。

（実施例３）PEPカルボキシラーゼ過剰発現微細藻による有機酸の産生１
本実施例では微細藻（シネコシスティス）のPEPカルボキシラーゼ過剰発現による有機酸の産生を確認した。本実施例では実施例１に示すPCC6803（GT）を用いて、遺伝子組換え操作によりPEPカルボキシラーゼ過剰発現株PCC6803（PEPox）を作製した。PCC6803（PEPox）の作製方法は以下のとおりである。微細藻によるコハク酸の産生経路を図３に示し、PEPカルボキシラーゼ作用点を示した。

３−１．rbcLターミネーター及びslr0168領域下流のコード領域の一部は、PCC6803（GT）から抽出したゲノムDNAから、プライマーセットとして、配列番号３及び４に示すオリゴヌクレオチド、配列番号５及び６に示すオリゴヌクレオチドを用いて、PCRにより増幅した。得られた増幅断片を、In-Fusion HD Cloning Kit（Clonetech社製、タカラバイオ株式会社より入手）を用いてPstI及びHindIII消化pBluescript II SK(+)(Agilent Technologies, Palo Alto, CA)に挿入し、 pBluescript-TrbcL-slr0168を得た。

配列番号３：5'-CCTCTAGAGTCGACCTGCAGGTTACAGTTTTGGCAATTAC-3'
配列番号４：5'-GCCAGCCCCAACACCTGACGCGTTTCCCCACTTAGATAAAAAATCC-3'
配列番号５：5'-TCTAAGTGGGGAAACGCGTCAGGTGTTGGGGCTGGC-3'
配列番号６：5'-TGATTACGCCAAGCTTCTAAGTCAGCGTAAATCTGACAATG-3'

３−２．カナマイシン耐性カセット及びrbcLプロモーターは、pCRII-TOPO (Invitrogen, Carlsbad, CA) 及びPCC6803（GT）のゲノムDNAからプライマーセットとして配列番号７及び８に示すオリゴヌクレオチド、配列番号９及び１０に示すオリゴヌクレオチドを用いて、PCRにより増幅した。得られた増幅断片を、In-Fusion HD Cloning Kit（Clonetech社製、タカラバイオ株式会社より入手）を用いて XhoI及びXbaI消化pBluescript-TrbcL-slr0168に挿入し、pBluescript-Km^r-PrbcL-TrbcL-slr0168を得た。

配列番号７：5'-CGGGCCCCCCCTCGAGCCGGAATTGCCAGCTGGGGC-3'
配列番号８：5'-TGGACTTTCTAATTAGAGCGGCCGCTCAGAAGAACTCGTCAAGA-3'
配列番号９：5'-TCTTGACGAGTTCTTCTGAGCGGCCGCTCTAATTAGAAAGTCCA-3'
配列番号１０：5'-CCGGGGATCCTCTAGACATATGGGTCAGTCCTCCAT-3'

３−３．slr0168領域上流のコード領域の一部は、PCC6803（GT）から抽出したゲノムDNAから、プライマーセットとして配列番号１１及び１２に示すオリゴヌクレオチドを用いて、PCRにより増幅した。得られた増幅断片を、In-Fusion HD Cloning Kit（Clonetech社製、タカラバイオ株式会社より入手）を用いて KpnI及びXhoI消化pBluescript-Km^r-PrbcL-TrbcL-slr0168に挿入し、pBluescript-slr0168-Km^r-PrbcL-TrbcL-slr0168を得た。

配列番号１１：5'-TATAGGGCGAATTGGGTACCATGACTATTCAATACACCCCCCTAG-3'
配列番号１２：5'-TACCGTCGACCTCGAGCACCAGACCAAAGCCGGGAATTTC-3'

３−４．pUC19（タカラバイオ）のNdeI部位（CATATG）にAatII及びEcoRIで消化されたCACATGを置き換え、合成DNAを挿入した。pBluescript-slr0168-Km^r-PrbcL-TrbcL-slr0168をKpnI及びHindIIIで消化した後、slr0168を含む断片は、上記作製したpUC19ベクターのKpnI/HindIII部位に挿入し、pSKrbcL-slr0168を作製した。

３−５．PEPカルボキシラーゼをコードするPEP（sll0920）は、PCC6803（GT）から抽出したゲノムDNAから、プライマーセットとして配列番号１３及び配列番号１４に示すオリゴヌクレオチドを用いて、PCRにより増幅した。得られた増幅断片を、In-Fusion HD Cloning Kit（Clontech社製、タカラバイオ株式会社より入手）を用いてNdeI/SalI消化pSKtrc-slr0168に挿入し、pSKtrc-slr0168/sll0920を得た。

配列番号１３：5'- AGGAAACAGACCCATATGAACTTGGCAGTTCCTGC -3'
配列番号１４：5'- AACCTGCAGGTCGACTCAACCAGTATTACGCA -3'

３−６．得られたプラスミドpSKtrc-slr0168/sll0920ベクター（sll0920コード領域を含む）によりPCC6803（GT）を形質転換した。コントロールとして、空ベクター（sll0920コード領域を含まないプラスミドpSKtrc-slr0168ベクター）での形質転換を行った。上記により形質転換され、sll0920が過剰発現するよう作製されたPCC6803（GT）をPCC6803（PEPox）ということとする。また、形質転換されていない野生型のPCC6803（GT）をPCC6803（WT）ということとする。

３−７．上記作製されたPCC6803（PEPox）及びPCC6803（WT）について、実施例１の（１）〜（３）（ａ）と同様の培養条件に基づいて、培養した。（３）（ｂ）の嫌気・暗所条件下での本培養において、100 mM又は200 mMのNaHCO₃を水性媒体に添加し、１０分間のN₂通気後、嫌気条件下で培養を開始し、７２時間後にPCC6803（PEPox）又はPCC6803（WT）を含む水性媒体を回収した。回収した水性媒体について、実施例１と同手法によりコハク酸の産生量を測定した。その結果、コハク酸はPEPカルボキシラーゼ過剰発現株PCC6803（PEPox）の方が高い産生能を示した（図４）。

（実施例４）PEPカルボキシラーゼ過剰発現微細藻による有機酸の産生２
本実施例では、微細藻（シネコシスティス）のPCC6803（WT）及び実施例３で作製したPCC6803（PEPox）について、0〜500 mMの各濃度のNaHCO₃を水性媒体に添加し、３７．５℃にて７２時間培養したときのコハク酸の産生量を測定した。各濃度のNaHCO₃を添加する以外は、実施例３と同様に各々培養した。

上記培養後、PCC6803（WT）又はPCC6803（PEPox）を含む水性媒体を回収した。回収した水性媒体について、実施例１と同手法によりコハク酸の産生量を測定した。その結果、100 mM以上の濃度のNaHCO₃を水性媒体に添加して培養した場合に、コハク酸はPEPカルボキシラーゼ過剰発現株PCC6803（PEPox）の方が高い産生能を示した（図５）。

（実施例５）PEPカルボキシラーゼ過剰発現微細藻による有機酸の産生３
本実施例では、実施例３で作製した微細藻（シネコシスティス）のPCC6803（PEPox）について、温度を変えて培養したときのコハク酸及び乳酸の産生量を測定した。

PCC6803（PEPox）、実施例１の（１）〜（３）ａと同手法で前々培養、前培養及び本培養（光独立利用）した。前記本培養後回収したPCC6803（PEPox）を、OD₇₅₀が20になるように水性媒体（10 mL）に加えた。ここでは水性媒体として100 mM Hepes-KOH（pH7.8）を用いた。本実施例ではNaHCO3は添加せず、培養温度を３０℃又は３７．５℃とし、７２時間嫌気、暗所条件下で発酵処理を行った。

上記培養後、PCC6803（PEPox）を含む水性媒体を回収した。回収した水性媒体について、実施例１と同手法によりコハク酸及び乳酸の産生量を測定した。コントロールとして、実施例３と同様に空ベクター（sll0920コード領域を含まないプラスミドpSKtrc-slr0168ベクター）で形質転換した株について同様の処理を行った。その結果、３７．５℃にて培養した場合、３０℃で培養したときに比べて、コハク酸及び乳酸の産生量に大きな違いが確認された（図６）。

（実施例６）野生株の温度条件及び炭酸水素ナトリウム濃度による有機酸の産生
本実施例では、微細藻（シネコシスティス）のPCC6803（WT）について、温度及び炭酸水素ナトリウム濃度を変えて培養したときのフマル酸、リンゴ酸及びグルコン酸の産生量をキャピラリー電気泳動質量分析（CEMS）で確認した。

PCC6803（WT）について、実施例１の（１）〜（３）ａと同手法で前々培養、前培養及び本培養（光独立利用）した。前記本培養後回収したPCC6803（WT）を、OD₇₅₀が20になるように水性媒体（10 mL）に加えた。ここでは水性媒体として100 mM Hepes-KOH（pH7.8）を用いた。本実施例では0、50、100、200、300又は500 mMのNaHCO₃を添加し、培養温度を３０℃又は３７．５℃とし、７２時間嫌気、暗所条件下で発酵処理を行った。

上記培養後、PCC6803（WT）を含む水性媒体を回収した。回収した水性媒体について、フマル酸、リンゴ酸及びグルコン酸の産生量をCEMSにて測定した。その結果、３７．５℃にて培養した場合、３０℃で培養したときに比べて、各有機酸の産生量が増加したことが確認された（図７）。

（実施例７）野生株の高密度培養による有機酸の産生
本実施例では、微細藻（シネコシスティス）のPCC6803（WT）について、高密度培養したときのコハク酸の産生量の違いを確認した。

PCC6803（WT）について、実施例１の（１）〜（３）ａと同手法で前々培養、前培養及び本培養（光独立利用）した。前記本培養後回収したPCC6803（WT）を、OD₇₅₀が20又は150になるように水性媒体（10 mL）に加えた。ここでは水性媒体として300 mM Hepes-KOH（pH7.8）を用いた。本実施例では100mMのNaHCO₃を添加し、培養温度を３７．５℃とし、７２時間嫌気、暗所条件下で発酵処理を行った。

上記培養後、PCC6803（WT）を含む水性媒体を回収した。回収した水性媒体について、実施例１と同手法によりコハク酸の産生量を測定した。その結果、OD₇₅₀が150にて培養した場合には、1.25g/Lのコハク酸を産生し、OD₇₅₀が２０℃で培養したときに比べて、コハク酸の産生量が3倍以上増加したことが確認された（図８）。

（実施例８）微細藻（クラミドモナス）による有機酸の産生
本実施例において、微細藻類の微生物種としてクラミドモナス（Chlamydomonas reinhardtii）株を用いた。以下「C. reinhardtii」という。

（１）前々培養
TAP寒天培地（1.5%Agarを含むTAP培地）上で生育したC. reinhardtiiのコロニーを白金耳でとり、水性媒体（70 mL）に加え、pH7.8にてCO₂通気条件下、100μmol photons m^-2 s-¹で３０℃にて4〜5日間培養した。培養後のOD₇₅₀は2.5〜3.5であった。ここでは水性媒体としてTAP培地を用いた。TAP培地の組成は表２に示した。

（２）前培養
上記（１）で前々培養したC. reinhardtiiを、OD₇₅₀が0.1になるように水性媒体（150 mL）に加え、pH7.8にてCO₂通気条件下、50μmol photons m^-2 s-¹で３０℃にて4〜5日間培養した。ここでは水性媒体としてTAP培地を用いた。

（３）本培養（光独立利用）
上記（２）で前培養したC. reinhardtiiを、OD₇₅₀が0.4になるように水性媒体（70 mL）に加え、pH7.8にてCO₂通気条件下、120μmol photons m^-2 s-¹で３０℃にて5日間培養した。ここでは水性媒体としてTAP培地を用い、1 mM、3 mM及び 5 mMの各濃度のNH₄Clを添加した。培養後のOD₇₅₀は3.5〜4.5であった。培養後、遠心分離（14000g、5分、４℃）でC. reinhardtiiを回収した。

（４）本培養（嫌気・暗所）
上記（３）で回収したC. reinhardtiiを、OD₇₅₀が20になるように水性媒体（10 mL）に加えた。ここでは水性媒体として100mM Hepes-KOH (pH7.8)を用いて３０℃又は３７．５℃で72時間培養した。密閉状態を維持したままC. reinhardtiiを含む水性媒体を回収した。

上記（４）で培回収した水性媒体を、各々14000g、４℃にて5分間遠心分離し、実施例１と同手法により上清を回収し、0.45μm孔径Mini-UniPrep（GEヘルスケア・ジャパン株式会社製）を用いて濾過した。濾過液について、実施例１と同手法により、コハク酸の産生量を測定した。その結果、何れの濃度のNH₄Clを添加した場合でも３７．５℃で培養したほうがコハク酸の産生量が高かった（図９）。NH₄Cl添加量は5 mMよりは1 mMの方が産生量が高かった。

以上詳述したように、微細藻を３５〜４０℃の温度条件で培養する工程を含む、本発明の方法で微細藻を培養することで、バイオマスを有効活用することができる。微細藻の光合成と微細藻に取り込まれた炭素源によりバイオマスから有機酸を産生することができる。さらに、NADPH-O₂オキシドレダクターゼの機能及び／又はグリコーゲンからクエン酸回路に至る解糖系での律速酵素の機能が増強された微細藻によれば、より効果的に細胞内代謝物である有機酸を回収することができる。水性媒体への炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンの供給は、例えば電気や鉄鋼等の製造工程において産業的に排出された大気中のCO₂を利用し、有効活用することができる。従来は、有機酸のうち例えばコハク酸等は石油等を原料として産生されていたが、その際にCO₂が排出されていたのに対し、本発明の方法によれば、有機酸の製造工程でCO₂を排出しないばかりか、大気中のCO₂を有効活用できる点で、自然環境に対して優れた効果を有する。さらに、本発明の微細藻によれば、バイオマスとして使用される水性媒体は淡水のみならず海水を活用することができ、水資源の枯渇や耕作地の限界に左右されず安定的に有効活用することができる。

製造された有機酸は、食品、医薬品、その他各種分野において有効に利用される。例えばコハク酸では医薬品の賦形剤、pH調整剤、食品として調味料、その他の食品添加物、工業的にはメッキ等にも利用される。また、炭酸ガスを発泡する入浴剤等の成分としても利用される。

Claims

微細藻を３５〜４０℃の温度条件で培養する工程を含むことを特徴とする、微細藻からの有機酸の製造方法。
３５〜４０℃の温度条件での培養が、微細藻の培養の嫌気培養条件下で行われる、請求項１に記載の製造方法。
３５〜４０℃の温度条件での培養が、微細藻の培養の嫌気的かつ暗所にての培養条件下で行われる、請求項１に記載の製造方法。
微細藻を３５〜４０℃の温度条件で、２４時間以上、５日以内、培養する工程を含む、請求項２又は３に記載の製造方法。
以下の（Ａ）及び（Ｂ）の工程を含む、請求項１〜４のいずれかに記載の微細藻からの有機酸の製造方法：
（Ａ）炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンの含有量が20〜2000mMの水性媒体中で微細藻を培養する工程；
（Ｂ）前記（Ａ）の微細藻から産生された有機酸を回収する工程。
炭酸イオン及び／又は重炭酸イオンの含有量が20〜2000mMの水性媒体が、（１）二酸化炭素の充填、及び／又は、（２）炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、重炭酸カリウム、炭酸マグネシウムより選択されるいずれか１種又は２種以上の炭酸塩の添加、による水性媒体である、請求項５に記載の製造方法。
（１）二酸化炭素の充填、及び／又は、（２）炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、重炭酸カリウム、炭酸マグネシウムより選択されるいずれか１種又は２種以上の炭酸塩の添加が、微細藻の培養の嫌気培養条件下で行われる、請求項６に記載の製造方法。
二酸化炭素の充填が、水性媒体中で飽和状態になるまで行われる、請求項６又は７に記載の製造方法。
前記微細藻がシアノバクテリア及び／又はクラミドモナス属である、請求項１〜８のいずれかに記載の有機酸の製造方法。
シアノバクテリアが、シネコシスティス属である、請求項９に記載の有機酸の製造方法。
前記有機酸が、脂肪族ジカルボン酸である、請求項１〜１０のいずれかに記載の有機酸の製造方法。
前記有機酸が、コハク酸、乳酸、酢酸、フマル酸、2-ケトグルタル酸、リンゴ酸、クエン酸及びグルコン酸から選択されるいずれか１種又は２種以上である、請求項１〜１０のいずれかに記載の有機酸の製造方法。
微細藻が、PEPカルボキシラーゼ、ピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素及びホスフォグルコムターゼから選択される少なくとも１種の酵素機能が増強された微細藻である、請求項１〜１２のいずれかに記載の有機酸の製造方法。
微細藻が、NADPH-O₂オキシドレダクターゼの発現又は発現増強するように形質転換された微細藻である、請求項１〜１３のいずれかに記載の有機酸の製造方法。