JPWO2010050470A1 - 組み換え微生物を用いたポリ乳酸の製造方法 - Google Patents
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Abstract
Description
「生分解性プラスチックハンドブック」、生分解性プラスチック研究会編、1995年、第178−197頁、(株)エヌ・ティー・エス発行)
a)配列番号2に示されるアミノ酸配列の130番目、325番目、477番目及び481番目のアミノ酸の少なくとも1以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
b)a)に規定されるタンパク質において、さらに130番目、325番目、477番目及び481番目以外の1若しくは数個のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1若しくは数個のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列、
及び、工程1)の培養物から前記ポリ乳酸を回収する工程2)
を含む、ポリ乳酸の製造方法。
b)a)に規定されるタンパク質において、さらに130番目、325番目、477番目及び481番目以外の1若しくは数個のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1若しくは数個のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列
(8)プロピオン酸及び/又は乳酸にCoAが転移される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号4に示されるアミノ酸配列、又は配列番号4に示されるアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、(7)に記載の組み換え微生物。
a)配列番号2に示されるアミノ酸配列の130番目、325番目、477番目及び481番目のアミノ酸の少なくとも1以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
b)a)に規定されるタンパク質において、さらに130番目、325番目、477番目及び481番目以外の1若しくは数個のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1若しくは数個のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列、
及び、工程1)の培養物から前記ポリ乳酸を回収する工程2)を含む、ポリ乳酸の製造方法である。以下、本発明で使用されるタンパク質、組み換え微生物、及び本発明の製造方法の諸条件について、説明する。
本発明で使用される「プロピオン酸及び/又はLAにCoAが転移される反応を触媒するタンパク質」は、適当なCoA基質からプロピオン酸及び/又はLAにCoAが転移される反応を触媒する活性を有するタンパク質である。かかる活性を有するタンパク質は、一般にプロピオニルCoAトランスフェラーゼ(PropionylCoA Transferase、PCT)と称されている。以下、本発明では、当該タンパク質をPCTと表すこととする。
本発明におけるポリヒドロキシアルカン酸の合成を触媒するタンパク質は、a)配列番号2に示されるアミノ酸配列の130番目、325番目、477番目及び481番目のアミノ酸の少なくとも1以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列、又はb)a)に規定されるタンパク質において、さらに130番目、325番目、477番目及び481番目以外の1若しくは数個のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1若しくは数個のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列からなるタンパク質である。a)で規定するタンパク質は、前記特許文献7に記載されている、シュードモナス・スピーシーズ(Pseudomonas sp.)61−3由来のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素のアミノ酸配列の一部を変異させたタンパク質であり、b)で規定するタンパク質は、a)で規定するタンパク質にその活性を失わない程度にさらに追加の変異が導入されたものである。なお、b)に規定するタンパク質に関連して使用される用語「数個」とは、1〜50個、好ましくは1〜25個、より好ましくは10個以下をいう。以下、本発明におけるポリヒドロキシアルカン酸の合成を触媒するタンパク質をPhaCmと表し、また特許文献7の記載を全て本明細書に取り込むこととする。
上記1)〜2)の各タンパク質は、それらをコードする核酸を微生物に導入して、当該微生物内でタンパク質に転写翻訳させて使用することが好ましい。微生物に導入される核酸は、ベクターに組み込まれた形態にあることが好ましい。
本発明における組み換え微生物としては、上記1)〜2)のタンパク質を発現している微生物、好ましくは上記1)〜2)のタンパク質を機能的に発現し得る核酸の導入によって形質転換された微生物である。好適な微生物としては、シュードモナス・エスピー(Pseudomonas sp.)61−3株などのシュードモナス(Pseudomonas)属細菌、R.ユートロファなどのラルストニア(Ralstonia)属細菌、バチルス・ズブチリス(Bacillus subtilis)などのバチルス(Bacillus)属細菌、大腸菌(Escherichia coli)などのエシェリヒア(Escherichia)属細菌、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属細菌、サッカロマイセス・セレビシー(Saccharomyces cerevisiae)などのサッカロマイセス(Saccharomyces)属酵母、カンジダ・マルトーサ(Candida maltosa)などのカンジダ(Candida)属酵母などを挙げることができる。中でも大腸菌、コリネバクテリウム属細菌、及びR.ユートロファが好ましく、特に好ましくは大腸菌、コリネバクテリウム属細菌である。
ポリ乳酸の製造は、前記の核酸が導入された組み換え微生物を、炭素源を含む培地で培養し、培養菌体又は培養物中にポリ乳酸を生成蓄積させ、該培養菌体又は培養物からポリ乳酸を回収することにより行われる。
1)組み換え微生物の作製
M.エルスデニ(M.elsdenii、ATCC17753)からDNeasy Tissue Kit(Qiagen社)を用いてゲノムDNAを抽出後、プロピオニルCoAトランスフェラーゼ(アクセッションNo.J04987)をコードする核酸をPCRで増幅するために、EcoRI認識配列を含むフォワードプライマーと、PstI認識配列を含むリバースプライマーのプライマーDNAを合成した。
M.エルスデニPCT用:
MePCTN:5’-atgagaaaagtagaaatcattac-3’
MePCTC:5’-ttattttttcagtcccatgggaccgtcctg-3’
C.プロピオニウムPCT用:
CpPCTN:5’-gggggccatgggaaaggttcccattattaccgcagatgag -3’
CpPCTC:5’-ggggggctcgagtcaggacttcatttccttcagacccat-3’
S.アウレウスPCT用:
SpctN:5’-gtgccatggaacaaatcacatggcacgac-3’
SpctC:5’-cacgaattcatactttatgaattgattg-3’
プラスミドpTV118N(宝酒造)をEcoRI及びPstIを用いて消化し、アルカリホスファターゼを用いて脱リン酸化した後、M.エルスデニ由来の前記DNAフラグメントを加えてライゲーションし、プロピオニルCoAトランスフェラーゼをコードするDNAを含む、約4.7kbpの組み換えプラスミドPTV118N M.E.−PCTを調製した。
得られた形質転換体の培養は、LB寒天培地上で形成したアクティブコロニーを100ml容三角フラスコに入った10mlのLB液体培地に植菌し、30℃でOD 0.6〜1.0まで振盪培養(オリエンタル技研工業(株)製IFM型,130rpm)して生育した前培養菌液を、500ml容三角フラスコに入った200mlの本培養用培地に1%容量接種し振盪培養を行った。
i)GPC
2)で回収されたポリマー約1mgにクロロホルムを1mL加え、これを0.2μmPTFEフィルター(ADVANTEC)で濾過した溶液をサンプルとして、下記の条件でGPC測定を行った。
カラム :TSKgel−Super THZ−M(6.0mm×150mm)
溶離液 :CHCl3
流量 :0.8mL/分
温度 :40°
検出 :10A refractive index detector
サンプル量:10μL
測定された分子量分布曲線を図2に示す。分子量較正曲線は標準ポリスチレンを用いて作成し、標準ポリスチレン分子量の換算値で分子量を表した。その結果、ポリマーの分子量(Mw)は22,000であった。
前述した培養法により200ml培養を行い、得られた培養液を50mlファルコンチューブで集菌(3000×g,5min,RT)後、−80℃で一晩凍結した。この凍結菌体を、凍結乾燥機(LABCONCO社製Model 77400型)にて2日間乾燥した。この乾燥菌体のうち100mgを耐圧試験管へ量り取り、クロロホルム1.6mlを添加して一晩室温で静置した。この菌体/クロロホルム溶液に、メタノール硫酸(メタノール:硫酸=17:3の混合液)1.6ml、内部標準100μl(安息香酸10mg/CHCl310ml)を添加し、95℃のウォーターバス中で3時間リフラックスすることでメチル化を行った。メチル化終了後のサンプルは室温に戻し、Φ18mmのディスポ試験管に移した。ここに、ミリQ水を800μl加え、約30秒撹拌した後、水層と溶媒層に分離するまで静置した。分離後、クロロホルム層をパスツールピペットで分取し、0.22μm PTFEフィルターで2ml容バイアルビンへろ過し、分析に供した。
122−1063: 120℃で5分間ホールド、5℃/1分で昇温、300℃で10分ホールド
上記条件での分析結果及び乳酸メチルのMSスペクトルを図3A〜Dに示す。なお、図3Dの結果のみ、クロロホルムを除去しないサンプルから取得されたものである。GC/MSの結果より、2)で回収されたポリマーはLAをモノマー単位として含むことが確認された。
2)で回収されたポリマーを重水素化クロロホルムに溶解してサンプルとし、300MHzで1H−NMR(図4)を測定した。その結果、2)で回収されたポリマーは乳酸をモノマー単位として含むことが判明した。
1)で作成した組み換えプラスミドPTV118N M.E.−PCT、PTV118N C.P.−PCT、及びPTV118N S.A.−PCTを用いて、大腸菌種W3110のコンピテントセルを形質転換した。
図7は上記ii)GC/MS分析からの乳酸誘導体の定量結果を示している。
実施例1で作製したプラスミドpTV118N‐PCT‐C1(ST/QK)に含まれるSTQKをコードする塩基配列を、下記のタンパク質をコードする塩基配列に置き換えた発現ベクターを作製した。当該発現ベクターの構成を纏めて図5に示す。
大腸菌W3110のコンピテントセルをpTV118N−PCT−C1を用いて形質転換し、得られた形質転換体の培養は、LB寒天培地上で形成したアクティブコロニーを100ml容三角フラスコに入った10mlのLB液体培地に植菌し、30℃でOD 0.6〜1.0まで振盪培養(オリエンタル技研工業(株)製IFM型, 130rpm)して生育した前培養菌液を、500ml容三角フラスコに入った200mlの本培養用培地に1%容量接種し振盪培養を行った。
Claims (12)
- プロピオン酸及び/又は乳酸にCoAが転移される反応を触媒するタンパク質、及び下記のa)又はb)のアミノ酸配列からなるポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質を有する組み換え微生物を、炭素源を含む培地で培養する工程1):
a)配列番号2に示されるアミノ酸配列の130番目、325番目、477番目及び481番目のアミノ酸の少なくとも1以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
b)a)に規定されるタンパク質において、さらに130番目、325番目、477番目及び481番目以外の1若しくは数個のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1若しくは数個のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列、
及び、工程1)の培養物から前記ポリ乳酸を回収する工程2)
を含む、ポリ乳酸の製造方法。 - プロピオン酸及び/又は乳酸にCoAが転移される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号4に示されるアミノ酸配列、又は配列番号4に示されるアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、請求項1に記載の製造方法。
- プロピオン酸及び/又は乳酸にCoAが転移される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号6に示されるアミノ酸配列、又は配列番号6に示されるアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、請求項1に記載の製造方法。
- ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号2に示されるアミノ酸配列の325番目及び481番目のアミノ酸がそれぞれ他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列である、請求項1に記載の製造方法。
- ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号2に示されるアミノ酸配列の325番目のSerがThrに、481番目のGlnがLysにそれぞれ置換されたアミノ酸配列である、請求項1に記載の製造方法。
- 前記タンパク質のいずれもが、微生物に導入された組み換え発現ベクターにコードされているタンパク質である、請求項1に記載の製造方法。
- プロピオン酸及び/又は乳酸にCoAが転移される反応を触媒するタンパク質、及び下記のa)又はb)のアミノ酸配列からなるポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質を有する組み換え微生物。
a)配列番号2に示されるアミノ酸配列の130番目、325番目、477番目及び481番目のアミノ酸の少なくとも1以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
b)a)に規定されるタンパク質において、さらに130番目、325番目、477番目及び481番目以外の1若しくは数個のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1若しくは数個のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列 - プロピオン酸及び/又は乳酸にCoAが転移される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号4に示されるアミノ酸配列、又は配列番号4に示されるアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、請求項7に記載の組み換え微生物。
- プロピオン酸及び/又は乳酸にCoAが転移される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号6に示されるアミノ酸配列、又は配列番号6に示されるアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、請求項7に記載の組み換え微生物。
- ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号2に示されるアミノ酸配列の325番目及び481番目のアミノ酸がそれぞれ他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列である、請求項7に記載の組み換え微生物。
- ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号2に示されるアミノ酸配列の325番目のSerがThrに、481番目のGlnがLysにそれぞれ置換されたアミノ酸配列である、請求項7に記載の組み換え微生物。
- 前記タンパク質をコードする遺伝子を有する組み換え発現ベクターが導入されていることを特徴とする請求項7に記載の組み換え微生物。
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