JP5885148B2 - 遺伝子組換えコリネ型細菌および含乳酸ポリエステルの製造方法 - Google Patents
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Description
[1] 含乳酸ポリエステル合成能力を本来有していないコリネ型細菌に、乳酸脱水素酵素遺伝子、プロピオニルCoAトランスフェラーゼ遺伝子、β−ケトチオラーゼ遺伝子、アセトアセチルCoAレダクターゼ遺伝子およびポリヒドロキシアルカン酸合成酵素遺伝子を含む含乳酸ポリエステル合成に関与する遺伝子群が導入されており、かつ99%以上の乳酸分率を有する含乳酸ポリエステル生産能を有する、遺伝子組換えコリネ型細菌。
[2] 乳酸脱水素酵素遺伝子が大腸菌属(Escherichia)に由来する、[1]の遺伝子組換えコリネ型細菌。
[3] プロピオニルCoAトランスフェラーゼ遺伝子がメガスフェラ属(Megasphera)に由来する、[1]または[2]の遺伝子組換えコリネ型細菌。
[4] β−ケトチオラーゼ遺伝子およびアセトアセチルCoAレダクターゼ遺伝子がラルストニア属(Ralstonia)に由来する、[1]〜[3]のいずれかの遺伝子組換えコリネ型細菌。
[5] ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素遺伝子がシュードモナス属(Pseudomonas)に由来する、[1]〜[4]のいずれかの遺伝子組換えコリネ型細菌。
[6] ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素遺伝子が変異型ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素をコードする遺伝子であり、該変異型ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素が配列番号10のアミノ酸配列において325番目のSerがThrに、及び481番目のGlnがLysに置換された二重変異を有する、[5]の遺伝子組換えコリネ型細菌。
[7] 含乳酸ポリエステル合成能力を本来有していないコリネ型細菌が、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属に属する細菌である、[1]〜[6]のいずれかの遺伝子組換えコリネ型細菌。
[8] コリネバクテリウム(Corynebacterium)属に属する細菌が、コリネバクテリウム・グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)である、[7]の遺伝子組換えコリネ型細菌。
[9] 含乳酸ポリエステル合成に関与する遺伝子群がコリネ型細菌の細胞表層タンパク質遺伝子用プロモーターの制御下にある、[1]〜[8]のいずれかの遺伝子組換えコリネ型細菌。
[10] コリネ型細菌の細胞表層タンパク質遺伝子用プロモーターが以下のいずれかの塩基配列を含む、[9]の遺伝子組換えコリネ型細菌:
(i)配列番号13に示される塩基配列;
(ii)配列番号13に示される塩基配列において、1から数個の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を有し、かつ宿主生物中で連結された遺伝子の転写調節活性を有する塩基配列;
(iii)配列番号13に示される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なDNAの塩基配列であって、かつ宿主生物中で連結された遺伝子の転写調節活性を有する塩基配列;または
(iv)配列番号13に示される塩基配列と95%以上の同一性を有する塩基配列からなりかつ宿主生物中で連結された遺伝子の転写調節活性を有する塩基配列。
[11] β−ケトチオラーゼ遺伝子、アセトアセチルCoAレダクターゼ遺伝子およびポリヒドロキシアルカン酸合成酵素遺伝子がオペロンを形成している、[1]〜[10]のいずれかの遺伝子組換えコリネ型細菌。
[12] 乳酸脱水素酵素遺伝子およびプロピオニルCoAトランスフェラーゼ遺伝子がオペロンを形成している、[1]〜[11]のいずれかの遺伝子組換えコリネ型細菌。
[13] [1]〜[12]のいずれかの遺伝子組換えコリネ型細菌を、炭素源を含む培地で培養する工程1)、および工程1)の培養物から含乳酸ポリエステルを回収する工程2)を含む、99%以上の乳酸分率を有する含乳酸ポリエステルの製造方法。
(1)乳酸脱水素酵素遺伝子
乳酸脱水素酵素は、ピルビン酸とNADH(還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド)を乳酸とNAD+(酸化型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド)にする可逆反応を触媒する活性を有するタンパク質である。以下、本明細書において、乳酸脱水素酵素を「LDH」と記載する。好ましくは、本発明においてLDHはD−LDHである。
プロピオニルCoAトランスフェラーゼは、適当なCoA基質からプロピオン酸及び/又は乳酸にCoAが転移される反応を触媒する活性を有するタンパク質である。以下、本明細書において、プロピオニルCoAトランスフェラーゼを「PCT」と記載する。
β−ケトチオラーゼは、2分子のアセチルCoAが縮合してアセトアセチルCoAが形成される反応を触媒するタンパク質である。以下、本明細書において、β−ケトチオラーゼを、「βKT」と記載する。
アセトアセチルCoAレダクターゼは、アセトアセチルCoAのNADP等の補酵素の存在下で生じる還元反応によって、D(−)−β−ヒドロキシブチリル−CoAが形成される反応を触媒するタンパク質である。以下、本明細書において、アセトアセチルCoAレダクターゼを、「AACoA−R」と記載する。
ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素は、ヒドロキシアシルCoAをモノマーとしてポリヒドロキシアルカン酸を合成する反応の触媒活性を有するタンパク質である。また、ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素は、ラクチルCoAをモノマーとしてポリ乳酸を合成する反応を触媒する。さらに、ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素は、ヒドロキシアシルCoAおよびラクチルCoAをモノマーとして、ヒドロキシアルカン酸−乳酸共重合体を合成する反応を触媒する。なお、本明細書において、「ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素」および「乳酸重合酵素」は相互互換的に使用される。
上記(1)〜(5)の遺伝子をコードするDNAを宿主生物(下記にて詳述するコリネ型細菌)に導入して、当該宿主生物内でタンパク質に転写翻訳させて使用する。宿主生物に導入されるDNAは、ベクターに組み込まれた形態にあることが好ましい。
本発明における遺伝子組み換えコリネ型細菌は、上記(1)〜(5)の遺伝子の導入によって形質転換されたコリネ型細菌である。本発明において、宿主生物として利用し得るコリネ型細菌としては、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属、アグロコッカス(Agrococcus)属、アグロマイセス(Agromyces)属、アースロバクター(Arthrobacter)属、オーレオバクテリウム(Aureobacterium)属、ブレビバクテリウム(Brevibacterium)属、セルロモナス(Cellulomonas)属、クラビバクター(Clavibacter)属、ミクロバクテリウム(Microbacterium)属、ラサイバクター(Rathayibacter)属、テラバクター(Terrabacter)属、ツリセラ(Turicella)属などに属する細菌が挙げられる。好ましくは、コリネバクテリウム属細菌である。さらに、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属細菌として、例えばコリネバクテリウム・グルタミカムATCC13032、コリネバクテリウム・グルタミカムATCC13869、コリネバクテリウム・グルタミカムATCC13870、コリネバクテリウム・グルタミカムATCC14067、コリネバクテリウム・カルナエATCC15991、コリネバクテリウム・アセトグルタミカムATCC15806等の菌株が挙げられ、好ましくはコリネバクテリウム・グルタミカムATCC13869、ATCC13032、およびATCC14067である。これらはAmerican Type CultureCollection(米国)より入手できる。
本発明において、含乳酸ポリエステルの製造は、上記(1)〜(5)の遺伝子が導入された遺伝子組み換えコリネ型細菌を、炭素源を含む培地で培養し、培養菌体又は培養物中に含乳酸ポリエステルを生成蓄積させ、該培養菌体又は培養物から当該含乳酸ポリエステルを回収することにより行われる。
大腸菌(E.coli JM109)からDNeasy Tissue Kit(Qiagen社)を用いてゲノムDNAを抽出後、乳酸脱水素酵素をコードする核酸(配列番号1)をPCRで増幅するために、BamHI認識配列を含むフォワードプライマー:5’−GGATCCGCCACCATGAAACTCGCCGTTTATAG−3’(配列番号14)と、SacI認識配列を含むリバースプライマー:5’−GAGCTCAAGATTAAACCAGTTCGTTCG−3’(配列番号15)のプライマーDNAを合成した。前記ゲノムDNAを鋳型として、iCycler(BioRad)を用い、KOD−Plus−DNAポリメラーゼ(1U)、PCRバッファー、1mM MgSO4、各プライマー15pmol、0.2mM dNTPs(全て東洋紡社)を含む反応液中、94℃2分を1サイクル、94℃で15秒、55℃で30秒、68℃で2分を1サイクルとするPCR反応を30サイクル行った後、約1kbpの増幅断片を回収し、BamHI及びSacIで消化して、LDHをコードするDNAフラグメントを得た。
実施例1で得られた形質転換体を、カナマイシン100μg/mL、クロラムフェニコール100μg/mL、2%グルコースを含むCM2G培地1.5mLに植菌し、30℃にて12時間培養を行った後、100mLの同培地に植菌し、30℃にて24時間培養した。得られた培養液を3,100rpm、15分間の条件で遠心して菌体を回収し、2%グルコースを含むMMTG培地100mLに植菌し、30℃にて72時間培養を行った。得られた培養液を3,100rpm、15分間の条件で遠心して菌体を回収し、10mMトリス塩酸緩衝液(pH7.5)に懸濁させてから再度同条件で遠心分離した後、2日間、凍結乾燥した。
(i)GPC
実施例2で回収されたポリマー約1mgにクロロホルムを1mL加え、これを0.2μmPTFEフィルター(ADVANTEC社)で濾過した溶液をサンプルとして、下記の条件でGPC測定を行った。
システム :Shimadzu Prominence GPC system
カラム :TSKgel−Super THZ−M(6.0mm×150mm)
溶離液 :CHCl3
流量 :0.8mL/分
温度 :40℃
検出 :10A refractive index detector
サンプル量:10μL
実施例2で回収されたポリマー約50μgを1mLのクロロホルムに溶解した溶液250μL、エタノール850μL、塩酸100μLをガラス製耐圧反応管で混合し、100℃のヒートブロック中で3時間、エタノリシス処理を行った。室温まで冷却後、0.65Mリン酸および0.9MNaClを含む溶液1mlと250mMリン酸溶液500μLを加えて混合し、pHを中性に調整した後、室温、1,200rpmで5分間の条件で遠心し、水層とクロロホルム層を分離した。クロロホルム層を採取し、モレキュラーシーブスにより脱水を行って、GC分析用サンプルとした。
GCシステム :Shimadzu GC 2010
MSシステム :GC/MS−QP2010
カラム :NEUTRA−BOND−1(0.25mm×3000mm)
キャリアガス :He
ガス流量 :30.0mL/分
ディテクター温度 :310℃
インジェクター温度:250℃
カラムオーブン温度:100℃
カラム昇温 :8℃/min
サンプル量 :1μL
実施例2で回収されたポリマーを重水素化クロロホルムに溶解してサンプルとし、300MHzで1H−NMR(図2)を測定した。その結果、実施例2で回収されたポリマーは3ヒドロキシ酪酸と乳酸をモノマー単位として含むこと、乳酸の比が99%以上であることが判明した。
Claims (13)
- 含乳酸ポリエステル合成能力を本来有していないコリネ型細菌に、D−乳酸脱水素酵素遺伝子、プロピオニルCoAトランスフェラーゼ遺伝子、β−ケトチオラーゼ遺伝子、アセトアセチルCoAレダクターゼ遺伝子および乳酸重合酵素遺伝子を含む含乳酸ポリエステル合成に関与する遺伝子群が導入されており、かつ99%以上の乳酸分率を有する含乳酸ポリエステル生産能を有する、遺伝子組換えコリネ型細菌。
- 乳酸重合酵素遺伝子が、配列番号9に示される塩基配列と90%以上の配列同一性を有する塩基配列を含み、かつ、該乳酸重合酵素遺伝子にコードされる乳酸重合酵素が、配列番号10に示されるアミノ酸配列において325番目、481番目のアミノ酸に対応する位置のアミノ酸がそれぞれThr、Lysであるアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- 乳酸重合酵素遺伝子にコードされる乳酸重合酵素が、配列番号10のアミノ酸配列において325番目のSerがThrに、及び481番目のGlnがLysに置換された二重変異を有するアミノ酸配列を含む、請求項1又は2に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- D−乳酸脱水素酵素遺伝子が大腸菌属(Escherichia)に由来する、請求項1〜3のいずれか1項に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- プロピオニルCoAトランスフェラーゼ遺伝子がメガスフェラ属(Megasphera)に由来する、請求項1〜4のいずれか1項に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- β−ケトチオラーゼ遺伝子およびアセトアセチルCoAレダクターゼ遺伝子がラルストニア属(Ralstonia)に由来する、請求項1〜5のいずれか1項に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- 含乳酸ポリエステル合成能力を本来有していないコリネ型細菌が、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属に属する細菌である、請求項1〜6のいずれか1項に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- コリネバクテリウム(Corynebacterium)属に属する細菌が、コリネバクテリウム・グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)である、請求項7に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- 含乳酸ポリエステル合成に関与する遺伝子群がコリネ型細菌の細胞表層タンパク質遺伝子用プロモーターの制御下にある、請求項1〜8のいずれか1項に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- コリネ型細菌の細胞表層タンパク質遺伝子用プロモーターが以下のいずれかの塩基配列を含む、請求項9に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌:
(i)配列番号13に示される塩基配列;
(ii)配列番号13に示される塩基配列において、1から数個の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を有し、かつ宿主生物中で連結された遺伝子の転写調節活性を有する塩基配列;
(iii)配列番号13に示される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なDNAの塩基配列であって、かつ宿主生物中で連結された遺伝子の転写調節活性を有する塩基配列;または
(iv)配列番号13に示される塩基配列と95%以上の同一性を有する塩基配列からなりかつ宿主生物中で連結された遺伝子の転写調節活性を有する塩基配列。 - β−ケトチオラーゼ遺伝子、アセトアセチルCoAレダクターゼ遺伝子および乳酸重合酵素遺伝子がオペロンを形成している、請求項1〜10のいずれか1項に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- D−乳酸脱水素酵素遺伝子およびプロピオニルCoAトランスフェラーゼ遺伝子がオペロンを形成している、請求項1〜11のいずれか1項に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌。
- 請求項1〜12のいずれか1項に記載の遺伝子組換えコリネ型細菌を、炭素源を含む培地で培養する工程1)、および工程1)の培養物から含乳酸ポリエステルを回収する工程2)を含む、99%以上の乳酸分率を有する含乳酸ポリエステルの製造方法。
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