JPH11513889A - タンパク質翻訳のアンチセンス阻害のための組成物および方法 - Google Patents
タンパク質翻訳のアンチセンス阻害のための組成物および方法Info
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Abstract
(57)【要約】
キャップされた標的mRNAの翻訳を阻害する組成物および方法を提供する。本発明のアンチセンスオリゴマーは標的mRNAの5'キャップ領域を標的とし、オリゴヌクレオシド、PNA、または糖の2'位で修飾されたオリゴヌクレオチドを含む。好ましくは、前記オリゴマーは、リボソーム構築を妨害することを介して直接的にタンパク質翻訳を阻害する。
Description
【発明の詳細な説明】
タンパク質翻訳のアンチセンス阻害のための組成物および方法序
本出願は、1996年5月24日に出願されたアメリカ合衆国特許出願08/653,653の
一部継続出願であり、それは1995年5月12日に出願されたアメリカ合衆国特許出
願08/440,740の一部継続出願であり、それは1993年5月17日に出願され現在はア
メリカ合衆国特許No.5,514,788として公布されているアメリカ合衆国特許出願0
8/063,167の一部継続出願であり、それは1993年1月21日に出願されたアメリカ
合衆国特許出願08/007,997の一部継続出願であり、それは1992年9月2日に出願
され、現在は放棄されている、アメリカ合衆国特許出願07/939,855の一部継続出
願であり、それは1990年8月14日に出願され現在は放棄されているアメリカ合衆
国特許出願07/567,286の一部継続出願である。
アメリカ合衆国特許出願08/653,653は、1992年11月19日に出願されたアメリカ
合衆国特許出願07/927,506の一部継続出願でもあり、これは1990年8月16日に出
願されたアメリカ合衆国特許出願07/568,366の一部継続出願である。発明の属する分野
本発明は、タンパク質翻訳の妨害を介して遺伝子発現を阻害する方法に関する
。本発明は一般的に、遺伝子発現のアンチセンス阻害の分野に関連する。発明の背景
古典的な治療法は概して、疾患の原因となる機能あるいは疾患を増進させる機
能を緩和しようと、タンパク質の相互作用に焦点をあてたものであった。このよ
うな治療方法には多くの限界がある。最近、アンチセンス治療および診断アプロ
ーチが、安全でかつ効果的であることが証明されてきた。
アンチセンス方法論は、通例オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオシドで
ある比較的短いオリゴマーの、mRNAあるいはDNAに対する、これらの標的
核酸の正常、不可欠な機能が破壊されるような相補的ハイブリッド形成である。
ハイブリッド形成とは、RNAまたは一本鎖DNAに対するオリゴマー上の核塩
基の、ワトソン-クリック塩基対形成の法則に従った配列特異的水素結合である
。このような塩基対を構成するものは、互いに相補的であると言われる。
かなりの研究が、治療を目的としたアンチセンス剤としてのオリゴヌクレオチ
ドおよび他のオリゴマーの応用を目指している。オリゴヌクレオチドは、動物お
よび人間において疾患状態の治療に治療的成分としてすでに採用されている。ア
ンチセンスオリゴマーの組成物はウイルス性、真菌性、および代謝性の疾患に関
与する遺伝子の発現を調節できることが示されている。さらに、アンチセンスオ
リゴヌクレオチドはヒトに安全に投与され、ウイルスおよび細胞の遺伝子産物を
標的とした、1ダースあるいはそれ以上のアンチセンス薬剤の臨床試験が開始さ
れている。
本発明は、新規アンチセンス化合物および組成物を、選択されたmRNA標的
の翻訳を妨害する特定のアンチセンス化合物の使用に関する方法論と併せて提供
する。
ほとんどのアンチセンスアプローチは、mRNAの、AUGあるいは、頻度は
下がるが5'-非翻訳領域、5'-キャップ、3'-非翻訳領域、コーディングまたは他
の領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを利用する。Helene and
Toulme,Biochem.et Biophys.Acta 1990,1049,99-125。PCT公開WO91/17
755(Baker)およびPCT公開WO96/06621(Adams and Reynolds)に開示され
ているようにオリゴヌクレオチドに切断部分を備えることによって、あるいはP
CT公開WO94/22488(Baker)に開示されているように発生期のmRNAのキャ
ッピングを妨害することによって、mRNAの5'-キャップを標的とするアンチセ
ンスオリゴヌクレオチドをmRNA機能を妨害するのに用いることも知られてい
る。
多数のアンチセンスオリゴヌクレオチドがRNAse H活性を引きだすことが
見出されている。RNAse HとはRNA:DNAデュープレックスのRNA鎖を
切断する細胞性のエンドヌクレアーゼであり、それゆえこの酵素の活性化はRN
A標的の切断をもたらし、従ってアンチセンス阻害の効率を大いに増強し得る。
RNA標的の切断は、標的mRNAの量の減少を示すようなゲル電気泳動または
ノーザ
ンブロッティング、および/または切断産物の直接的な視覚化によって、型通り
に示すことができる。ホスホロチオエートオリゴデオキシヌクレオチドはRNA
se Hの基質であるが、PNA、オリゴヌクレオシド、および糖の2'位に一様に
修飾を受けているオリゴヌクレオチドなどのいくつかのアンチセンスオリゴマー
はRNAse Hを活性化しない。Kawasaki et al.,J.Med Chem.1993,36,831-
841。ホスホロチオエートオリゴデオキシヌクレオチドとして非常に活性な配列
は、Rase Hの基質とはならない類似体として作られた場合には不活性であるこ
とがしばしばである。たとえ標的に対するオリゴヌクレオチドの親和性がこのよ
うな修飾によって高まったとしても、このことはおそらく正しい。Helene and
Toulme,Biochem.et Biophys.Acta 1990,1049,109。
本発明において、標的mRNAの5'キャップ領域に特異的にハイブリッド形成
する特定の種類のアンチセンスオリゴマーに、標的mRNAのタンパク質への翻
訳を妨害する驚くべき活性があることを見出した。これらのオリゴマーにはペプ
チド-核酸(PNA)オリゴマー、オリゴヌクレオシド(MMI、アミド、ある
いはモルフォリノ骨格を有するものなど)および糖の2'位に修飾を受けているオ
リゴヌクレオチドが含まれる。これらのオリゴマーはRNAse H非依存的な様
式で作用し、標的mRNAの翻訳を直接阻害すると考えられている。これは、標
的mRNA上へのリボソームの構築の妨害を介して起こっていると考えられてい
る。発明の概要
本発明は、長さが8-25塩基であって、標的mRNAの5'キャップ領域に相補的
なアンチセンスオリゴマーと標的mRNAを接触させることによって、選択され
たキャップされた標的mRNAの翻訳を阻害する方法を提供する。オリゴマーは
、2'-修飾オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、あるいはペプチド核酸オ
リゴマーであり得る。好ましい2'修飾には、2'-OCH2CH2OCH3、2'-OC
H3、2'-OCH2CH2CH3、2'-OCH2CH2=CH2および2'-F修飾が含まれ
るが、2'-OCH2CH2OCH3がより好ましい。好ましいオリゴヌクレオチドに
は、モルフォリノ、アミドあるいはMMIヌクレオチド間結合を有するものが含
まれる。ペプチド-核酸オリゴマーも好ましい。
本発明において、特定の標的mRNAの5'キャップ領域に特異的にハイブリッ
ド形成する特定の種類のアンチセンスオリゴマーに、意外なことに標的mRNA
のタンパク質への翻訳を妨害する活性があることを見出した。これらのオリゴマ
ーにはペプチド-核酸(PNA)オリゴマー、オリゴヌクレオシド(アミド、モ
ルフォリノあるいはMMI骨格などの非リン骨格を有する)および2'修飾を受け
ているオリゴヌクレオチドが含まれる。これらのオリゴヌクレオチドは標的mR
NAの5'キャップ領域に特異的にハイブリッド形成するように設計されている。図面の簡単な説明
図1は、ICAM-1の5'キャップを標的とする2'修飾オリゴマーによるICA
M-1タンパク質レベルの減少を示す一連の線グラフである。図1Aは、ホスホジ
エステル化合物の活性を示し、図1Bはホスホロチオエート化合物を示す。
図2は、抗ICAM-1オリゴヌクレオマーISIS11158および11159にて処理
した細胞における、比較的大量のICAM-1転写産物の有意な増加を示すノーザ
ンブロットの棒グラフである。
図3は、E-セレクチンmRNAの5'キャップ領域を標的とする2'修飾オリゴマ
ーの、HUVECにおけるE-セレクチン発現を阻害する能力を示す線グラフで
ある。
図4は、ICAM-1の5'キャップ領域を標的とするオリゴヌクレオチドによる
、HUVECにおけるICAM-1発現の阻害を示す線グラフである。黒四角形は
ISIS11158;白ひし形はISIS-13884;黒円はISIS13886。
図5は、E-セレクチンの5'キャップ領域を標的とするオリゴヌクレオチドに
よる、HUVECにおけるE-セレクチン発現の阻害を示す線グラフである。白
四角形はISIS4764;白ひし形はISIS-11929;白円はISIS11205;白
三角形はISIS11928。
図6は、VCAM-1の5'キャップ領域を標的とするオリゴヌクレオチドによる
、HUVECにおけるVCAM-1発現の阻害を示す線グラフである。白四角形は
ISIS-13181;白ひし形はISIS13182;白円はISIS13183;白三角形は
ISIS5885。発明の詳細な説明
大多数の真核細胞およびウイルスのRNAおよびメッセンジャーRNAはその
5'末端に、成熟、安定性、および翻訳効率の程度を多様にするのに必要な独特の
化学構造を有することが認められた。一般的な構造上の特徴は、S.Cory and
JM Adams,J.Mol.Biol.1975,99,519-547に記載されている。キャップとは
、窒素7位がメチル化されているグアノシン残基である。これは、残基の5'ヒド
ロキシル基間の三リン酸結合を介して、RNAの最も5'側の転写されたヌクレオ
チドに結合している。
本発明に従うアンチセンスオリゴマーは、キャップされた標的mRNA転写産
物とその5'末端で特異的にハイブリッド形成する。好ましくは、オリゴマーは、
最初のヌクレオチドが5'キャップに隣接し、上に記載の三リン酸結合を介してキ
ャップのメチル化されたグアノシンにつながっている、標的mRNAの5'末端の
最初の20ヌクレオチドのうち少なくとも一つを含む領域に結合するだろう。より
好ましくは、オリゴマーは標的mRNAの5'末端の最初の5ヌクレオチドのうち
少なくとも一つを含む領域に結合するだろう。本発明のオリゴマーは好ましくは
長さが約5から約50塩基である。長さが約8から25塩基のオリゴマーがより好ま
しい。
本発明に関しては、“オリゴマー”という用語は、オリゴヌクレオチド、オリ
ゴヌクレオチド類似体、オリゴヌクレオシド、またはオリゴヌクレチドを模倣す
る巨大分子を包含することを意図しており、これらのすべては、その上に位置す
る、相補的な塩基配列に特異的にハイブリッド形成することができるヘテロ環式
塩基(ヌクレオ塩基)を有する。この用語には、天然に存在する塩基、糖、および
糖(骨格)間結合を含むオリゴマー、ならびに同様に機能する天然には存在しな
い部分を有するオリゴマーも含まれる。このような修飾されたあるいは置換され
たオリゴマーは、例えば増強された細胞取り込み、ヌクレアーゼ存在下における
上昇した安定性および/または相補的な標的配列に対する上昇した親和性などの
特性のために、しばしば天然型よりも好ましい。標的に対するオリゴマーの親和
性は、オリゴマーと標的が解離する温度である、オリゴマー/標的対のTmを測
定することによって型通りに求められ、解離は分光光度計で検出する。Tmが高
いほど、標的に対するオリゴマーの親和性は大きい。
本発明に関して想定される好ましいオリゴマーの特定の例は、例えば短鎖ヘテ
ロ原子あるいはヘテロ環式の糖間結合などの非リン糖間結合を含むオリゴヌクレ
オチドである。最も好ましいのは、CH2-NH-O-CH2、CH2-N(CH3)-O-
CH2[メチレン(メチルイミノ)あるいはMMI骨格として知られている]、
CH2-O-N(CH3)-CH2、CH2-N(CH3)-N(CH3)-CH2、およびO-N(
CH3)-CH2-CH2骨格にこで、ホスホジエステルはO-P-O-CH2である)を
有するものである。これらおよび他の好ましい骨格は、WO92/20823およびアメ
リカ合衆国特許5,378,825に開示されているが、両方とも本発明の譲受人に譲渡
されており、本明細書の一部としてここに引用する。他の好ましい窒素含有骨格
は、De Mesmaeker et al.,Acc.Chem.Res.1995,28,366-374のアミド骨格で
ある。これらのうち、アミド-3とも呼ばれるCH2-CO-NR-CH2、およびア
ミド-4とも呼ばれるCH2-NH-CO-CH2がより好ましい。モルフォリノ骨格
構造を有するオリゴマー(Summerton,J.E.and Weller,D.D.,アメリカ合衆
国特許5.034,506)も好ましい。ペプチド-核酸(PNA)骨格などの他の好まし
い態様においては、天然のオリゴヌクレオチドのホスホジエステル骨格は、ポリ
アミド骨格に置き換えることができ、塩基はポリアミド骨格のアザ窒素原子に直
接または間接的に結合する(P.E.Nielsen,M.Egholm,R.H.Berg,O.Buch
ardt,Science 1991,254,1497)。
天然のホスホジエステル(P=O)骨格および/または修飾を加えた骨格の組
み合わせを用い得る。交互P=O/MMIまたはP=S/MMI骨格が、目下のと
ころ好ましい2つの態様である。
他の好ましいオリゴマーは、1つあるいはそれ以上の糖部分に、好ましくは2'
位に修飾を有するオリゴヌクレオチドである。適した2'修飾のいくつかの例には
、C1からC10の低級アルキル、置換低級アルキル、アルコキシアルコキシ、ア
ルカリールまたはアルアルキル;F;Cl;Br;CN;CF3;OCF3;O-、
S-、またはN-アルキル;SH、SCH3、OCN、nが1から約10であるよう
なO(CH2)nNH2などのアルキルアミン;nが1から約10であるようなO(CH2
)nCH3;または、オリゴマーの薬物動態学的なあるいは薬力学的な特性または
標的に対するオリゴマーの親和性を改善するような、またはオリゴマーを安
定化するような他の基がある。現在のところ、より好ましいオリゴマーには、M
MIおよびモルフォリノオリゴヌクレオチド、PNA、2'-F、2'-O-アルキル
、好ましくは2'-O-CH3および2'-O-CH2CH2CH3、および2'-アルコキシ
アルコキシオリゴヌクレオチド、最も好ましくは2'-OCH2CH2OCH3[2'-
O-(2-メトキシエチル)または2'-メトキシエトキシとしても知られている]が含
まれる。オリゴマーが前記の方法で一様に修飾されている必要はない。
修飾を加えたヌクレオ塩基を少なくとも一つ有するオリゴマーも、本発明に含
まれる。
本発明に従い用いられるオリゴマーの多くは、固相合成のよく知られる手法に
よって簡便に型通りに作り得る。このような合成のための機器は、Applied Bi
osystemsを含むいくつかの売手によって販売されている。固相あるいは液相合成
のための他のあらゆる手段もやはり用いることができ、オリゴマーの合成は型通
りに作業する者の能力の十分範囲内である。これらの手法を用いて2'-修飾オリ
ゴヌクレオチド、骨格に修飾を加えたオリゴマーおよび他のオリゴマーを調製す
ることは、よく知られている。
本発明の方法において、キャップされた標的mRNAをオリゴマーと接触させ
る。本発明に関しては、“標的”mRNAとは、その翻訳がアンチセンス相互作
用を介して特異的に阻害されるようなmRNAである。本発明のアンチセンスオ
リゴマーは、そのmRNA標的上の相補的なヌクレオチド配列と特異的にハイブ
リッド形成するように設計されている。“標的”または“標的領域”という用語
も、mRNAのこの配列、すなわちアンチセンスオリゴマーが相補的である特定
の領域を包含する。本発明に関しては、標的mRNAとオリゴマーを“接触させ
る”とは、前記標的mRNAを含むかあるいは含むと考えられる細胞懸濁液また
は組織サンプルに、インビトロまたはエクスビボのいずれかにおいてオリゴマー
を加えること、または標的mRNAを含むかあるいは含むと考えられる動物中の
細胞または組織にオリゴマーを投与することを意味する。オリゴマーは通例、液
体のキャリアー内にあるかあるいは、キャリアーに加えてさらに成分を含み得る
薬剤組成物の一部である。
“ハイブリッド形成”とは、本発明に関しては、ワトソン-クリック塩基対形
成としても知られる、相補的なヌクレオ塩基間の水素結合を意味する。グアニン
とシトシンは、その間で3つの水素結合を形成することが知られている相補的な
塩基の例である。アデニンとチミンは、その間で2つの水素結合を形成すること
が知られている相補的な塩基の例である。三本鎖形成、またはトリプレックス形
成は、RNA分子上のヘアピン領域など、標的の二本鎖領域に対するオリゴマー
のハイブリッド形成の特定の形態である。“特異的にハイブリッド形成可能な”
および“相補的な”とは、RNA標的とオリゴマーの間に安定かつ特異的な結合
が生じるような、十分な相補性の程度を示すのに用いられる用語である。オリゴ
マーは、特異的にハイブリッド形成可能であるために、その標的核酸配列と100
%相補的である必要はない。標的に対するオリゴマー結合が標的分子の正常機能
を妨害し、有用性の喪失の原因となる場合、および、特異的な結合が望まれるよ
うな条件下、すなわちインビボアッセイまたは治療的処置に関しては生理的な条
件下で、あるいはインビトロアッセイに関してはアッセイが行われる条件下で、
標的ではない配列に対するオリゴマーの非特異的な結合を避けるのに十分な程度
の相補性がある場合、オリゴマーは特異的にハイブリッド形成可能である。
本発明のオリゴマーは、キャップされた標的mRNAの5'キャップ領域と特異
的にハイブリッド形成可能であるように設計される。本明細書中で定義するよう
に、“5'キャップ領域”とは、前記標的mRNAの5'末端の最初の20塩基のうち
少なくとも一つを含む、前記標的mRNAの領域を表す。言い換えれば、ヌクレ
オチド番号1がキャップ構造に隣接する場合の、ヌクレオチド1-20のうちの少な
くとも一つである。
以下は、本発明の方法および組成物が効果的に用いられた実例である。本発明
はこれらの標的あるいはこれらの組成物に限定されない。ICAM-1
ヒト細胞間接着分子-1(ICAM-1)mRNA転写産物を標的とする多数のオ
リゴマーが、ヒト血管内皮細胞におけるICAM-1発現を減少させる活性に関し
て評価されている。ICAM-1は、血管内皮の表面に発現するいくつかの細胞接
着分子の一つであり、様々な免疫および炎症応答に関与する。ICAM-1は、炎
症伝達物質に応答して非内皮細胞にも発現する。ICAM-1の発現量の上昇は、
慢性関節リ
ウマチおよび乾癬のような多数の疾患状態において観察されており、ICAM-1
は治療的な関心の標的となった。ヒトICAM-1の発現を阻害するアンチセンス
オリゴヌクレオチドに関して、慢性関節リウマチ、潰瘍性大腸炎、クローン病、
乾癬および腎移植拒絶の防止といった様々な疾患状態にある患者における臨床試
験が現在進行中である。クローン病におけるこの薬剤ISIS2302の第2相試験
において有効性はすでに証明されている。Genetic Engineering News,March
1,1997,pg.1;New York Times,Friday,February 28,1997。
アンチセンスオリゴマーがICAM-1転写産物の5'キャップ領域を標的とする
場合は、よいアンチセンス活性にRNAse H活性は必要でないことが今では見
出されている。驚くべきことに、RNAse Hを活性化しない、あるいは少なく
ともRNAse H非依存的であるオリゴマーが、この領域を標的とする場合に意
外なことに活性であることが見出された。RNAse Hの基質にはならない、完
全に2'-修飾を加えたオリゴマーに関するデータを得た。標的領域はICAM-1
転写産物のヌクレオチド1-20であった(この場合、ヌクレオチド1はキャップ構
造に直接隣接している)。異なる9つのオリゴマーの用量反応分析を行い、同じ
領域を標的とするホスホロチオエートデオキシオリゴヌクレオチドであるISI
S3067(配列番号1;TCTGAGTAGCAGAGGAGCTC)と比較して、I
CAM-1細胞表面タンパク質発現の阻害に関する有効性を決定した。この化合物
は、以前にICAM-1発現の阻害に非常に有効であることが示されていた。WO
92/03139(Bennett et al.),J.Immunol.(1994)152:3530-3540。
研究したオリゴマーは、ホスホロチオエート(P=S)あるいはホスホジエス
テル(P=O)骨格のいずれかを有する、この配列の2'-メトキシ(2'-O-メチル
とも称される)、2'-プロポキシ(2'-O-プロピルとも称される)、2'-O-アリ
ル、2'-メトキシエトキシおよび2'-フルオロ類似体であった。表1に挙げるこれ
らの化合物を、HUVEC細胞におけるICAM-1タンパク質量を減少させる能
力に関して分析した。表1のすべての化合物が同じ配列の配列番号1を有する。
ホスホジエステル系列(図1A)では、2'-メトキシエトキシ(ISIS11158)
が最も効力があり、最も効力がないのは2'-O-アリル(ISIS12461)であっ
た。ホスホロチオエート系列では(図1B)、最も効力のあるオリゴマーはやは
り2'-メトキシエトキシ類似体(ISIS11159)であり、最も効力がないのは、
比較の目的で含めた2'-デオキシISIS3067であった。スクランブル対照は、
ISIS10588(P=Sデオキシ)、ISIS12344(P=O、2'-メトキシエトキシ
)およびISIS12345(P=S、2'-メトキシエトキシ)であった。
IC50(ICAM-1量の50%阻害に必要な濃度)を、これらの化合物のいくつ
かに関して計算した。ISIS3067(P=S、デオキシ)はおよそ20nMのIC50
を有することがわかった。2'-修飾を加えた化合物では、ISIS3224(P=S、
2'-メトキシ)がおよそ24nMのIC50を有し、ISIS11665(P=S、2'-F)が
およそ10nMのIC50を有し、ISIS11159(P=S、2'-メトキシエトキシ)が
およそ3nMのIC50を有していた。これらの化合物が好ましい。ホスホジエス
テル2'-メトキシエトキシ化合物ISIS11158はおよそ9nMのIC50を有して
いた。この化合物も好ましい。
オリゴマー処理したHUVECから全細胞RNAを単離し、分析して、ICA
M-1
タンパク質発現の阻害が、アンチセンスが促進する標的転写産物の分解に起因す
るかどうか決定した。驚くべきことに、ノーザンブロット分析は、抗ICAM-1
オリゴヌクレオチド(ISIS11158および11159)にて処理した細胞における、
比較的大量のICAM-1転写産物の有意な増加を示した。これは図2に示してあ
る。ICAM-1タンパク質発現は、これらのオリゴヌクレオチド濃度で完全に阻
害された。
ISIS11929は、別の細胞接着分子であるE-セレクチンを標的としたアンチ
センスオリゴヌクレオチドであり、本実験に対照として含めた。ISIS11929
にて細胞を処理してもICAM-1 mRNA量の増加をもたらさなかったが、E-
セレクチンmRNA量の増加をもたらした。
標的ICAM-1転写産物の翻訳に対するアンチセンスオリゴヌクレオチド処理
の効果を決定するために、ポリソームプロファイルを利用した。ICAM-1タン
パク質およびmRNA量を、ISIS11159またはISIS12345(対照)にて処
理した後に測定した。ICAM-1タンパク質の細胞表面発現を、処理細胞の小部
分のFACS分析によって求めたところ、ISIS11159は無処理の対照と比較
して、ICAM-1量を84%減少させることがわかった。スクランブル対照オリゴ
マーISIS12345はICAM発現をわずか3%減少させただけであった。残った
細胞の細胞質ゾル抽出物を調製し、ショ糖勾配遠心にて沈殿させた。勾配を分取
し、RNAを各画分から単離し1%変性アガロースゲル上で分析して、サブポリ
ソームおよびポリソームプールの満足の行く分離を示した。ノーザンブロッティ
ングによるICAM-1転写産物の分布決定は、対照オリゴマ-ISIS12345にて
処理した細胞あるいは無処理の対照細胞と比較して、ISIS11159にて処理し
た細胞にっいてのポリソームプロファイルにおいて有意な違いを示した。ISI
S11159が、大多数(67%)の全長ICAM-1転写産物がサブポリソーム画分(4
0S、60Sおよび80Sリボソーム画分)に局在するのを示したのに対し、対照の
ISIS12345処理、および無処理の細胞は、ポリソーム画分に大多数(それぞ
れ73%および69%)の全長ICAM-1転写産物を示した。これは、ISIS1115
9が標的mRNA上へのリボソームの構築を妨害することによって、翻訳を直接
妨害することを証明している。
5'キャップを標的とするペプチド-核酸(PNA)オリゴマーも、ICAM-1
発現を阻害することが示された。アルギニン3つを5'末端に加え、リジン1つを
3'末端に加えたPNAとして作った、配列番号1を短くした型であるPNAオリ
ゴマーISIS10535(配列番号2)を合成した。このオリゴマーをU937細胞に
エレクトロポレーションし、強力な用量-反応を得た。ISIS10535高用量では
ICAM-1はベースラインレベルより下にまで減少した。これらのエレクトロポ
レーション条件下では、ISIS10535は5μM以下のIC50を有し、ISIS3
067は20μMを越えるIC50を有していた。従って、ISIS10535が好ましい。E-セレクチン
白血球の血管内皮への接着および続く脈管外への移動に関与する、別の接着分
子が同定されている。これらの一つがE-セレクチンであり、内皮白血球接着分
子-1(ELAM-1)としても知られている。
ヒトE-セレクチンを標的とする2'-フルオロホスホロチオエートオリゴヌクレ
オチドの系列を合成し、E-セレクチンタンパク質発現を阻害する能力について
分析した。E-セレクチンメッセージの様々な領域(5'キャップ、5'UTR、A
UG、コーディング領域、イントロン、3'UTR)に相補的な、30を越えるオリ
ゴヌクレオチド配列の中では、飛び抜けて活性があるのは、ヒトE-セレクチン
mRNAの5'キャップ領域(ヌクレオチド1-20)を標的とするISIS9984(配
列番号3;GAAGTCAGCCAAGAACAGCT)であった。
これらの配列の類似体を、2'-デオキシ、2'-プロポキシ、あるいは2'-メトキ
シエトキシ修飾を施して合成した。これらの化合物を、HUVECにおけるE-
セレクチン発現を阻害する能力に関して分析した。図3に示すように、この実験
においてはデオキシホスホロチオエート化合物ISIS4764が10nM以下のIC5
0を有していた。2'Fホスホロチオエート類似体ISIS9984および2'-メトキシ
エトキシホスホジエステル類似体ISIS11929の両者は、これより十分下のI
C50を有しており、これら2つの化合物が好ましい。ヒトサイトメガロウイルス(HCMV)
ヒトCMVゲノムは、ヘルペスウイルスのうちそのゲノム構造の点で最も複雑
である。ヒトCMVの複製不全変異体が、2つのウイルス遺伝子、前初期複合体
(IE1/IE2)およびDNAポリメラーゼに関して単離されているのみである
。これらの遺伝子はヒトCMV遺伝子発現において主要な役割を持つことが知ら
れている。アンチセンス化合物設計の第1の標的としてこれらを選択した。
CMVにおける前初期転写の分子生物学は、真核細胞におけるあらゆる転写単
位のものと同様に十分解明されている。手短に言うと、主要な前初期転写産物(
IE1)の合成は、細胞特異的かつ分化特異的方法で作用すると知られている多
数の転写応答分子によって制御されている。IE1/IE2 mRNAは、mRNAの
異なるスプライシングによってIE1およびIE2タンパク質の両者をコードする
、豊富なキャップされたRNAである。IE1は、IE2遺伝子産物の発現と同様
にそれ自身の発現も制御している。前初期転写の開始段階では、IE1 mRNA
だけが細胞のRNAポリメラーゼによって合成される。IE2 mRNAは、この
感染初期の間にIE1 mRNAをプロセッシングすることによって作られる。I
E2タンパク質は、細胞およびウイルス起源の他の既知のトランス活性化タンパ
ク質と同様の方法で、多くのCMV早期および後期遺伝子を転写活性化すること
ができる。したがって、IE2タンパク質はCMV遺伝子発現の元スイッチの一
つであると考えられている。CMV IE2 mRNAを標的としたアンチセンス薬
剤が現在のところ臨床試験中で、AIDS患者におけるCMV網膜炎に対して活
性であることが示されている。
CMV IE1/IE2 mRNA転写産物の配列は既知である(Stenberg,R.M.
,Witte,P.R.and Stinski,M.F.,J.Virol.1985,56,665-675;Stenberg,R
.M.,Thomsen,D.R.,and Stinski.M.F.,J.Virol.1984,49:190-199)。m
RNAの5'末端は“G”で終わることが今では知られている(オリゴヌクレオチ
ド1-21を示す):
CMV IE1/IE2 mRNA 5'末端
5' pppGUCAGAUCGCCUGGAGACGCC 配列番号4
用量-作用実験を行い、CMV複製の阻害に関して活性なアンチセンス化合物
を同定した。完全な2'-メトキシのホスホロチオエートオリゴヌクレオチドであ
るISIS3300が活性であることがわかった。この化合物(配列番号5:TGG
CGTCTCCAGGCGATCTGA)はIE1/IE2転写産物の5'キャップ
領域(ヌ
クレオチド2-22)に相補的で、好ましい。配列番号5の類似体も、CMVに対す
る活性に関して分析した。これらのオリゴマーに関する修飾およびIC50を、対
応する対照と合わせて表2に示す:
表2において1μMまたはそれ以下のIC50を有するオリゴヌクレオチドが好ま
しい。
単一のCMVタンパク質を発現する、安定にトランスフェクトしたU373神経
芽腫細胞において、IE1およびIE2タンパク質産物の発現を阻害する能力に関
して、オリゴヌクレオチドを直接分析した。IE1は72kDのポリペプチド産物に
翻訳される。IE2は、55kD産物および86kd産物の2つのポリペプチド産物に異
なってスプライスされる。
ホスホロチオエート2'-メトキシ修飾をしたオリゴヌクレオチドの系列を、55k
D IE2産物を阻害する能力に関して分析した。5'キャップ領域を標的とするオ
リゴヌクレオチド(75nM、5μg/ml リポフェクチン)は、mRNA上の他の場
所を標的とするオリゴヌクレオチドよりも活性があることがわかった。
IE1/IE2 mRNAのヌクレオチド2-22を標的とするISIS3300は、この濃
度で55kD産物の合成を50%以上阻害した。ヌクレオチド1-21を標的とする、I
SIS6871(GGCGTCTCCAGGCGATCTGAC、配列番号6)は、
この産物の合成を65%以上阻害した。mRNAのヌクレオチド2-21を標的とする
、ISIS12659(GGCGTCTCCAGGCGATCTGA、配列番号7)は
、55kDの量をおよそ90%阻害し、さらに、ヌクレオチド7-26を標的とする、I
SIS12660(TGGATGGCGTCTCCAGGCGA、配列番号8)は55k
Dの合成を75%以上阻害した。
72kD IE1タンパク質産物を発現する安定トランスフェクタントにおいて、
ISIS3300(配列番号5)は72kDタンパク質の発現をおよそ75nMのIC50に
て阻害することがわかった。このオリゴマーのメトキシエトキシ類似体であるI
SIS11938は、およそ25nMのIC50を有していた。
このように、CMV IE1/IE2 mRNAの5'末端を標的とするアンチセンス
オリゴマーは、この転写産物の複数のタンパク質産物の合成を効果的に阻害し得
る。ICAM-1を標的とする別のオリゴマー
ヒトICAM-1の5'キャップ領域を標的とする別のオリゴマーを設計し、IC
AM-1発現を減少させる能力について分析した。これらのオリゴマーを表3に示
す。標的領域は標的とするICAM-1 mRNA上のヌクレオチド番号として与え
たが、この場合ヌクレオチド1(n.t.1)は5'キャップに直接に隣接する。これ
らのオリゴマーにおいて、オリゴマーの3'末端のヌクレオチドは、合成が容易で
あるため2'-デオキシヌクレオチドであった。オリゴマーの3'末端にない各シト
シン残基は、5-メチルシトシン残基であった。3'末端のヌクレオシドがシトシン
であれば、5-メチル化しなかった。表において、2'MOE=2'メトキシエトキシ
(2'-O-CH2CH2O-CH3)、MMI=メチレン(メチルイミノ)骨格である
。
ヒトICAM-1モノクローン性抗体mAb84H10(AMAC Inc.,Westbrook
ME)を用いたこと以外は実施例7に記載のように、ヒト臍帯脈内皮細胞(HU
VEC)におけるヒトICAM-1タンパク質発現を阻害する能力に関して、表3
に示すオリゴマーを分析した。Bennett et al.,(1990)J.Immunol.152:3530-3
540。
このアッセイにてホスホジエステル/2'-メトキシエトキシ(PO/2'MOE)
オリゴマーISIS13884および13886を分析した際には、ISIS13884はおよ
そ40nMのIC50を有することがわかった。ISIS13886は50nMの濃度までし
か分析しておらず、この低用量ではIC50は得られなかった。しかし、用量-反
応曲線を外挿法で推定すると、およそ60nMの推定IC50が得られた。これは図
4に示してある。ISIS13384および13886の両者ともに、本発明の好ましい態
様である。比較のために、ICAM-1メッセージの5'最末端を標的とする、ホス
ホジエステル2'-メトキシエトキシ化合物であるISIS11158は、同じ実験にお
いておよそ5nMのIC50を有していた。
ISIS14289-14292は、交互のMMI/P=O骨格を持つオリゴマーである。
ISIS14289(配列番号1)は20merで、ISIS14290、14291および14292はこ
の配列を漸次短くした型である。ISIS14293-14296は、交互のMMI/P=S
骨格を持つ対応するオリゴマーである。U937細胞内へのエレクトロポレーショ
ンによる輸送については4から40μMの、そしてHUVEC内へのリポフェクチ
ンによる輸送については6.2から200nMの範囲にある6つの濃度の各オリゴマー
にて処理した後、ICAM-1タンパク質の細胞表面発現を測定することによって
、これらのオリゴマーのアンチセンス活性(IC50)を求めた。“N.A.”は、
与えられた用量範囲ではIC50が得られなかったことを示す。結果を表4に示す
。
これらの結果は、MMIオリゴマーの取り込み条件は依然として最適化されてい
ないが、MMIオリゴマーはICAM-1発現を阻害することができるということ
を示唆している。この予備的データに基づくと、LIPOFECTINTM存在下
で得られたIC50に基づいて、ISIS14293、14294および14295が現在は好ま
しい。E-セレクチンを標的とする別のオリゴマー
ヒトE-セレクチンの5'キャップ領域を標的とする別のオリゴマーを設計し、
E-セレクチン発現を減少させる能力について分析した。これらのオリゴマーを
表5に示す。
実施例7に記載のELASAアッセイを用いてHUVECにおけるヒトE-セレ
クチン発現を減少させる能力に関して、これらのオリゴマーを分析した。このア
ッセイにおいて、ホスホロチオエートオリゴデオキシヌクレオチドISIS4764
はおよそ10nMのIC50を示した。同じ実験において、いずれも2'-メトキシエト
キシオリゴヌクレオチドであるISIS11929および11928は、2'-フルオロオリ
ゴヌクレオチドであるISIS11205と同様に、測定するには小さすぎる、すな
わち3nMより十分小さいIC50を与えた。50nMのオリゴマー濃度において、こ
れらの3つの化合物はE-セレクチン発現の事実上100%の阻害を与えた。これを
図5に示す。これらの化合物は、それゆえ非常に好ましい。同等の実験において
、ISIS4764は再度10nMのIC50を示した。P=S/2'Oメチルオリゴヌクレ
オチドISIS14043もまた、10nMのIC50を有していた。P=S/2'-O-プロ
ピル化合物のISIS9218は、25nMのIC50を示し、スクランブル対照のIS
IS14044は不活性であった。ISIS11929、11928、および11205は、測定する
には小さすぎる、すなわち3nMより十分小さいIC50を再度与えた。VCAM-1
血管細胞接着分子-1(VCAM-1)は、ICAM-1と同様に免疫グロブリン遺
伝子スーパーファミリーの一員である。ICAM-1およびE-セレクチンとも同
様に、VCAM-1は炎症刺激に応答して血管内皮細胞の管腔表面に誘導される。
Cybulsky et al.(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,88:7859-7863によ
って発表されたVCAM-1配列を用い、ヒトVCAM-1の5'キャップ領域を標的
とするオリゴマーの系列を設計し合成した。これらのオリゴマーを表7に示す。
これらのオリゴマーの中で、オリゴマーの3'末端のヌクレオチドは、合成を容易
にするために2'-デオキシヌクレオチドとした。
実施例7に記載のELASAアッセイおよびマウス抗ヒトVCAM-1モノクロー
ン性抗体(Genzyme Corp,Cambridge MA)を用い、HUVECにおけるVC
AM-1発現を阻害する能力に関して、これらのオリゴマーを分析した。Bennett
et al.,(1990)J.Immunol.152:3530-3540。このアッセイにおいて、ISIS1
3181、13182および12183はいずれも10nMより小さいIC50を示し、それゆえ非
常に好ましい。ホスホロチオエートオリゴデオキシヌクレオチド、ISIS5884
は、およそ10-12nMのIC50を示した。これを図6に示す。続く実験では、これ
らの化合物を再び分析し、ISIS14040および14041も分析した。再度、すべて
の化合物はおよそ10nMより小さいIC50を有しており、それゆえISIS14040
および14041は非常に好ましい。分析した6つすべての化合物が、100nMという
、試した最も高い用量で約85%以上のVCAM-1発現阻害を与えた。ISIS13
181は、この用量で一貫して100%のVCAM-1発現阻害をもたらした。
特定の好ましい態様に従い、特異性をもって本発明を記載したが、以下の実施
例は本発明を単に例証するのに役立つものであって、本発明をこれらの例に限定
することを意図するものではない。実施例 実施例1: オリゴヌクレオチド合成
修飾していないオリゴデオキシヌクレオチドを、ヨウ素による酸化を伴う標準
的なホスホルアミダイト化学を用い、自動DNA合成機(Applied Biosystems
model 380B)にて合成する。β-シアノエチルジイソプロピル-ホスホルアミダ
イトはApplied Biosystems(Foster City,CA)より購入する。ホスホロチ
オエートオリゴヌクレオチドに関しては、リン酸結合の炭素を段階的に硫黄置換
(thiation)するために、標準酸化ボトルを3H-1,2-ベンゾジチオール-3-オン1
,1-ジオキサイドの0.2Mアセトニトリル溶液で置換する。炭素の硫黄置換サイク
ルの待機段階を68秒に増やし、続けてキャッピング段階に進める。
2'-メトキシβ-シアノエチルジイソプロピル-ホスホルアミダイト(Chemgene
s,Needham MA)と、テトラゾールおよび塩基のパルス輸送後の待機段階を360
秒に増やすこと以外は非修飾オリゴヌクレオチド用の標準的なサイクルを用い、
2'-メトキシオリゴヌクレオヒドを合成する。Clen Research,
Inc.,sterling,VAなどの適切な2'-修飾アミダイトを用いるこの方法の修飾に
より、他の2'-アルコキシオリゴヌクレオチドを合成する。
2'-フルオロオリゴヌクレオチドを、Kawasaki et al.,J.Med.Chem.1993,3
6,831-841に記載のように合成する。手短に言うと、商業的に入手可能な9-β-D
-アラビノフラノシルアデニンを出発物質として利用し、2'-β-O-トリファイル
基のSN2置換によって2'-α-フルオロ原子を導入するという文献の手順を修飾し
て、保護したヌクレオシドN6-ベンゾイル-2'-デオキシ-2'-フルオロアデノシン
を合成した。このようにして、3',5'-ジテトラヒドロピラニル(THP)中間体
として並みの収量で、N6-ベンゾイル-9-β-D-アラビノフラノシルアデニンを
選択的に保護した。標準的な方法論を用いてTHPおよびN6-ベンゾイル基の脱
保護を達成し、標準的な方法を用いて5'-ジメトキシトリチル-(DMT)および
5'-DMT-3'-ホスホルアミダイト中間体を得た。
テトライソプロピルジシロキサニル(TPDS)保護した9-β-D-アラビノフ
ラノシルグアニンを出発物質として、さらに中間体ジイソブチリルアラビノフラ
ノシルグアノシンへの変換を用い、2'-デオキシ-2'-フルオログアノシンの合成
を達成した。ヒドロキシル基をTHPで保護した後、TPDS基の脱保護を行っ
てジイソブチリル ジ-THP保護したアラビノフラノシルグアノシンを作った。
粗生成物をフッ素にて処理した後、選択的なO-脱アシル化およびトリフル化を
行い、それからTHP基の脱保護を行った。標準的な方法論を用いて5'-DMT-
および5'-DMT-3'-ホスホルアミダイトを得た。
2',2'-アンヒドロ-1-β-D-アラビノフラノシルウラシルを70%フッ化水素-ピ
リジンにて処理するという文献の手順の修飾により、2'-デオキシ-2'-フルオロ
ウリジンの合成を達成した。標準的な手順を用いて5'-DMT-および5'-DMT-
3'-ホスホルアミダイトを得た。
2'-デオキシ-2'-フルオロウリジンのアミノ化によって2'-デオキシ-2'-フルオ
ロシチジンを合成し、続いて選択的な保護を行ってN4-ベンゾイル-2'-デオキシ
-2'-フルオロシチジンを作った。標準的な手順を用いて5'-DMT-および5'-D
MT-3'-ホスホルアミダイトを得た。
制御孔ガラスカラム(Applied Biosystem)から切り出し、濃塩化アンモニ
ウ
ム中、55℃で18時間脱ブロッキングしたあと、2.5倍量のエタノールと0.5MNa
Clから2回沈殿させることにより、オリゴヌクレオチドを精製する。
Martin,P.,Helv.Chim.Acta 1995,78,486-504に従い、2'-(2-メトキシエ
トキシル)-修飾したアミダイトを合成する。合成を容易にするために、最後のヌ
クレオチドはデオキシヌクレオチドとした。すべての2'-O-CH2CH2OCH3
シトシンは5-メチルシトシンとした。
5-メチルシトシンモノマーの合成:2,2'- アンヒドロ[1-(β-D-アラビノフラノシル)-5-メチルウリジン]:
5-メチルウリジン(リボシルチミン、Yamasa,Choshi,Japanから商業的に入
手可能)(72.0g、0.279M)、ジフェニル-炭酸塩(90.0g、0.420M)および炭
酸水素ナトリウム(2.0g、0.024M)をDMF(300mL)に加えた。撹拌し、発
生した二酸化炭素ガスが制御されたやり方で放出されるようにしながら、混合液
を熱して還流させた。1時間後、わずかに黒ずんだ溶液を減圧下で濃縮した。そ
の結果得られたシロップを、撹拌しながらジエチルエタノール(2.5L)に注ぎ
込んだ。生成物はガムを形成した。エーテルをデカントし、残渣を最少量のメタ
ノール(約400mL)に溶解した。溶液を新しいエーテル(2.5L)に注ぎ込み、
硬いガムを得た。エーテルをデカントし、ガムを真空乾燥機中で乾燥させ(1mm
Hgで60℃、24時間)、明るい黄褐色の粉末にまで粉々になった固体を得た(57g
、85%の粗収率)。この物質をそのまま、さらに続く反応に用いた。2'- O-メトキシエチル-5-メチルウリジン:
2,2'-アンヒドロ-5-メチルウリジン(195g、0.81M)、トリス(2-メトキシエ
チル)ほう酸塩(231g、0.98M)および2-メトキシエタノール(1.2L)を2Lの
ステンレススチール圧力容器に加え、あらかじめ熱しておいた160℃の油浴中に
置いた。155-160℃で48時間熱した後、容器を開け、乾燥し粉々になるまでMeO
H(200mL)と一緒に溶液を蒸発させた。熱したアセトン(1L)に残渣を懸濁
させた。不溶性の塩を濾別し、アセトン(150mL)で洗い、濾別物を蒸発させた
。残渣(280g)をCH3CN(600mL)に溶解し、蒸発させる。シリカゲルカラ
ム(3kg)をCH2Cl2/アセトン/MeOH(20:5:3)含有0.5% Et3NH中に
パックした。残渣をCH2Cl2(250mL)に溶解し、カラムにのせる前にシリカ
(150g)に吸着させた。生成物をパッキング溶媒にて溶出し、160g(63%)の生
成物を得た。2'- O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチルウリジン:
2'-O-メトキシエチル-5-メチルウリジン(160g、0.506M)をピリジン(250m
L)と一緒に蒸発させ、乾燥した残渣をピリジン(1.3L)に溶解した。塩化ジ
メトキシトリチル(94.3g、0.278M)の最初のアリコートを加え、混合液を室温
で1時間撹拌した。塩化ジメトキシトリチル(94.3g、0.278M)の2番目のアリ
コートを加え、反応液をさらに1時間撹拌した。それからメタノール(170mL)
を加えて反応を止めた。HPLCにより、およそ70%の生成物が存在することが
示された。CH3CN(200mL)にて溶媒を蒸発させ、粉々にした。残渣をCH
Cl3(1.5L)に溶解し、2x500mLの飽和NaHCO3および2x500mLの飽和Na
Clにて抽出した。有機相をNa2SO4で乾燥し、濾過して蒸発させた。275gの残
渣が得られた。0.5%Et3NHを含むEtOAc/ヘキサン/アセトン(5:5:1)にて
パックし溶出した3.5kgのシリカゲルカラムにて、残渣を精製した。純粋な画分
を蒸発させ、164gの生成物を得た。純粋でない画分からおよそ20g追加で得られ
、183g(57%)の総収量を得た。3'- O-アセチル-2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチルウ リジン:
2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチルウリジン(106g、
0.167M)、DMF/ピリジン(562mLのDMFと188mLのピリジンから調製した
3:1混合液750mL)および無水酢酸(24.38mL、0.258M)を合わせ、室温で24時
間撹拌した。反応は、まずtlcサンプルをMeOH添加で冷やし、tlcにてチェッ
クした。tlcで判断して反応が終了した時に、MeOH(50mL)を加え、混合液
を35℃で蒸発させた。残渣をCHCl3(800mL)に溶解し、2x200mLの飽和炭酸
水素ナトリウムおよび2x200mLの飽和NaClにて抽出した。水相を200mLのCH
Cl3にて逆抽出した。合わせた有機相を硫酸ナトリウムにて乾燥し、蒸発させて
122gの残渣(およそ90%の生成物)を得た。残渣を3.5kgのシリカゲルカラムに
て精製し、EtOAc/ヘキサン(4:1)を用いて溶出した。
純粋な生成物画分を蒸発させて96g(84%)を得た。3'- O-アセチル-2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチル-4- トリアゾールウリジン:
3'-O-アセチル-2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチル
ウリジン(96g、0.144M)をCH3CN(700m)に溶解して最初の溶液を調製し
、とっておいた。トリエチルアミン(189mL、1.44M)をトリアゾール(90g、1
.3M)のCH3CN(1L)溶液に加え、-5℃まで冷却し、高架式スターラーを用
いて0.5時間撹拌した。0-10℃に保った撹拌溶液にPOCl3を一滴ずつ、30分以
上の時間で加え、その結果得られた混合液をさらに2時間撹拌した。あとの溶液
に最初の溶液を一滴ずつ、45分以上の時間で加えた。その結果得られた反応混合
液を一晩、低温室に保管した。塩を反応混合液から濾別し、溶液を蒸発させた。
残渣をEtOH(1L)に溶解し、不溶性の固体を濾過で取り除いた。濾別したも
のを1x300mLのNaHCO3および2x300mLの飽和NaClにて洗い、硫酸ナトリウ
ムにて乾燥し、蒸発させた。残渣をEtOAcにて粉々にして、表題化合物を得た
。2'- O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチルシチジン:
3'-O-アセチル-2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチル-
4-トリアゾールウリジン(103g、0.141M)のジオキサン(500mL)およびNH4
OH(30mL)溶液を、室温で2時間撹拌した。ジオキサン溶液を蒸発させ、残
渣をMeOH(2x200mL)と共沸させた。残渣をMeOH(300mL)に溶解し、2
リットルのステンレススチール圧力容器に移した。NH3ガスで飽和させたMeO
H(400mL)を加え、容器を2時間、100℃に熱した(tlcは完全な変換を示した
)。容器の内容物を乾燥するまで蒸発させ、残渣をEtOAc(500mL)に溶解し
、飽和NaCl(200mL)で1回洗った。有機物を硫酸ナトリウム上で乾燥し、溶
媒を蒸発させて、85g(95%)の表題化合物を得た。N4-ベンゾイル-2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチルシ チジン:
2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチルシチジン(85g、0
.134M)をDMF(800mL)に溶解し、撹拌しながら無水安息香酸(37.2g、
0.165M)を加えた。3時間撹拌した後、tlcは反応がおよそ95%終了しているこ
とを示した。溶媒を蒸発させ、残渣をMeOH(200mL)と共沸させた。残渣を
CHCl3(700mL)に溶解し、飽和NaHCO3(2x300mL)および飽和NaCl(
2x300mL)にて抽出し、MgSO4上で乾燥し、蒸発させて残渣(96g)を得た。0
.5%Et3NHを含むEtOAc/ヘキサン(1:1)を溶出溶媒として用いる1.5kgの
シリカカラムにて、残渣をクロマトグラフィー分離した。純粋な生成物画分を蒸
発させて90g(90%)の表題化合物を得た。N4-ベンゾイル-2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチルシ チジン-3'-アミダイト:
N4-ベンゾイル-2'-O-メトキシエチル-5'-O-ジメトキシトリチル-5-メチル
シチジン(74g、0.10M)をCH2Cl2(1L)に溶解した。撹拌しながら、窒素
雰囲気下で、テトラゾールジイソプロピルアミン(7.1g)および2-シアノエトキ
シ-テトラ-(イソプロピル)亜リン酸塩(40.5mL、0.123M)を加えた。その結
果得られた混合液を室温で20時間撹拌した(tlcは反応が95%終了していること
を示した)。反応混合液を飽和NaHCO3(1x300mL)および飽和NaCl(3x30
0mL)にて抽出した。水性の洗液をCH2Cl2(300mL)にて逆抽出し、抽出液
を合わせてMgSO4上で乾燥させ、濃縮した。EtOAc/ヘキサン(3:1)を溶出
溶媒として用いる1.5kgのシリカカラムにて、得られた残渣をクロマトグラフィ
ー分離した。純粋な画分を合わせ、90.6g(87%)の表題化合物を得た。
本発明の譲受人に譲渡されており、本明細書中でそっくりそのまま援用されて
いるアメリカ合衆国特許5,378,825に従って、メチレン(メチルイミノ)骨格を
有するオリゴマーを合成する。合成は以下のように行う:(3'-CH=N-O-CH2-5')結合したオリゴヌクレオチド(オキシム結合した ダイマー)の合成
3'- デ(オキシホスフィニコ)-3'-(メチリジンニトリロ)-チミジリル-(3'→5')- チミジン
乾燥CH2Cl2中の3'-デオキシ-3'-C-フォルミル-5'-O-トリチルチミン(0.
99g、2mmol)およびAcOH(0.3ml)を室温で1時間撹拌した。溶媒を真空で
蒸発させ、保護された粗3'-デ(オキシホスフィニコ)-3'-(メチルイダイネニトリ
ロ)-チ
ミジリル-(3'→5')-3'-(t-ブチルジフェニル-シリル)チミジン生成物をTHF(
20ml)に溶解した。撹拌した溶液に室温でnBu4NFのTHF溶液(1M、5ml)
を加えた。1時間後、溶液をシリカゲルクロマトグラフィー(CH2Cl2:MeO
H;99:4、v/vで溶出)で精製し、3'-脱保護されたダイマーを得た。ダイマーを
無水MeOH(50ml)に溶解し、これにMeOH/Hcl溶液(0.14M、2.5ml)を加
えた。反応混合液を室温で15時間撹拌した。無水ピリジン(10ml)を上の溶液に
加え、溶媒を乾燥するまで蒸発させて粗オキシムダイマーを得た。粗生成物をシ
リカゲルクロマトグラフィー(CH2Cl2:MeOH;92:8、v/vで溶出)で精製し
、表題化合物3'-デ(オキシホスフィニコ)-3'-(メチルイダイネニトリロ)-チミジ
リル-(3'→5')-チミジン(0.87g、89%)をE/Z異性体の混合物として得た。2
つの幾何異性体を、逆相HPLC(Supelcosil LC18、5μ、H2O:CH3CN
勾配)で分離した。(表題化合物のZ-異性体)1H NMR(DMSO-d6)δ11
.28(brs、2、2NH)、7.39および7.78(2s、2、2C6 H)、6.92(d、1、T1H 3"
、J3',3"=6.7Hz)、6.15(偽t、1、T2H 1'、J1',2'=7.1Hz、J1',2"=
6.3Hz)、5.34(d、1、T2OH)、4.11-4.25(m、3、T2H 5',5"、T2-H 3')
。3.96(m、1、T2H 4')、3.90(m、1、T1H 4')、3.49-3.69(m、3、T1H 5' ,5"
、T1H 3')、2.06-2.31(m、3、T1H 2',2"、T2H 2',2")、1.73(s、6、2
CH 3)。C21H27N5O9・H2Oに関する分析予測されたもの:C、49.31;H、
5.72;N、13.69。判明したもの:C、49.32;H、5.57;N、13.59。(表題化
合物のE-異性体)1H NMR(DMSO-d6)δ11.3(2brs、2、2NH)、7.81
(s、1、C6 H)、7.52(d、1、T1H 3"、J3',3"=6.7Hz)、7.45(s、1、C6 H
)、6.10(偽t、1、T2H 1'、J1',2'=7.6Hz、J1',2"=6.4Hz)、6.04(d
d、1、T1H 1'、J1',2'=7.3Hz、J1',2"=3.4Hz)、5.36(d、1、T2OH)
、5.16(t、1、T1OH)、4.07-4.22(m、3、T2H 3',5',5"')、3.91(m、2、
T1T2H 4')、3.50-3.73(m、2、T1H 5',5",)、3.12(m、1、T1H 3')、2.0
5-2.44(m、4、T1T2H 2',2")、および1.76(s、6、2CH 3)。MS FAB:
M/z 494(M+H)+。ホスホルアミダイトを含む(3'-CH=N-O-CH2-5')結合したオリゴヌクレオ チドの合成
3'- デ(オキシホスフィニコ)-3'-(メチリジンニトリロ)-5'-O-(ジ-メトキシト リフ ェニルメチル)-チミジリル-(3'→5')-3'-O-(β-シアノエチルジイソプロピルア ミノホスフィリル)チミジン
Oligonucleotides Synthesis: a practial approach,Ed.M.J.Gait,IR
L Press,1984に記載の手順に従い、異性体ダイマーを5'末端ヌクレオチドのヒ
ドロキシル基でさらにジメチルオキシトリチル化し、続いてダイマーの3'末端の
ヒドロキシル基で3'-O-β-シアノエチルジイソプロピルホスホルアミダイト誘
導体に変換して、表題化合物を得た。1H NMR(CDCl3)δ8.77(br s、2
、2NH)、7.68(s、0.77、T1 C6 H E-異性体)、7.59(s、0.23、T1 C6 H
E-異性体)、6.3(ps t、1、T2CH 1')、6.14(m、0.77、T1 CH 1 E-
異性体)、6.08(m、0.23、T1CH 1 Z-異性体)、1.80および1.50(2S、6、2
、CH 3)および他のプロトン。31P NMR(CDCl3)150.77および150.38(
Z-異性体);150.57および150.38(E-異性体)。
治療上の価値をオリゴマーに特別に組み入れることが必要なので、そしてまた
そういう時には、保護してあるダイマーは簡便に保管し、自動DNA合成機(A
BI380B)を利用したカップリングに用いることができる。さらに、本明細書
の実施例に従い、オキシム結合ダイマーを、対応するヒドロキシルアミン結合を
持つダイマーに還元し、そしてこれは同様に、ヒドロキシルメチルアミンあるい
は他のヒドロキシアルキルアミン結合にアルキル化することができる。(3'-CH2-NH-O-CH2-5')結合したオリゴヌクレオチドの合成
3'- デ(オキシホスフィニコ)-3'-(メチレンイミノ)チミジリル-(3'→5')-チミ ジン
保護してあるダイマー3''-デ(オキシホスフィニコ)-3'-(メチルイダイネニト
リロ)チミジリル-(3'→5')-3'-O-(t-ブチルジフェニルシリル)チミジン(0.49g
、1mmol)の撹拌済み氷AcOH(5ml)溶液に、NaBH3CN(0.19g、3mmol)
をアルゴン下、室温で3つに分割して加えた。溶液の発泡が終わるまで、懸濁液
を1時間撹拌した。さらにNaBH3CN(0.19g、3mmol)を同様の方法で加え
、1時間撹拌し続けた。AcOHを減圧下で除いて3''-デ(オキシホスフィニコ)-
3'-(メチレンイミノ)チミジリル-(3'→5')-3'-O-(t-ブチルジフェニルシリル)
チミジンを得た。以前記載したようにnBu4NF/THFおよびHCl/MeOHを
用いてこのダイマーを脱保護することにより、表題化合物である、3-デ(オキシ
ホスフィニコ)-3'-
(メチレンイミノ)チミジリル-(3'→5')-チミジン(0.44g、90%)を白色粉末とし
て得た。このダイマーをHPLCでさらに精製(3-デ(オキシホスフィニコ)-3-(
メチルイダイネニトリロ)チミジリル-(3'→5')-チミジンダイマーについて記載
したのと同様に)して、分析上純粋なサンプルを得た。1H NMR(DMSO-d6
)δ11.23(br s、2、2NH)、7.83および7.49(2s、2、2C6 H)、6.82(t、
1、NHO)、6.14(偽t、1、T2H 1'、J1',2'=7.6Hz、J1',2"=6.5Hz)、
5.96(dd、1、T1H 1'、J1',2'=6.9Hz、J1',2"=4.3Hz)、5.28(s、1、T2
OH)、5.08(s、1、T1OH)、4.18(m、1、T2H 3')、3.89(m、1、T1H 4 '
)、3.54-3.78(m、5、T1T2H 5',5"、T2H 4')、2.76-2.94(m、2、T1H 3"
)、2.42(m、1、T1H 3')、2.0-2.17(m、4、T1、T2H 2',2")、1.77および
1.74(2s、6、2CH 3)。MS FAB:M/z496(M+H)+。C21H29N5O9・H2
Oに関する分析予測されたもの:C、49.12;H、6.09;N、13.64。判明したも
の:C、48.99;H、5.96;N、13.49。メチル化[3'-CH2-N(CH3)-O-CH2-5']結合したオリゴヌクレオチドの合 成
3'- デ(オキシホスフィニコ)-3-[メチレン(メチルイミノ)]チミジリル-(3'→ 5')-チミジン
3''-デ(オキシホスフィニコ)-3'-(メチルエネイミノ)チミジリル-(3'→5')-3'
-O-(t-ブチルジフェニルシリル)チミジンダイマー(0.99g、1mmol)の撹拌済
み氷AcOH(10ml)溶液に水性HCHO(20%、3ml)を加えた。溶液を5分
間、室温で撹拌し、これにNaBH3CN(0.19g、3mmol)をアルゴン下、室温
で3つに分割して加えた。NaBH3CN(0.19g)の添加をもう一度繰返し、溶
液をさらに1時間撹拌した。反応混合液を濃縮して粗3'-デ(オキシホスフィニコ
)-3'-[メチレン(メチルイミノ)]チミジリル-(3'→5')-3'-O-(t-ブチルジフェ
ニルシリル)チミジンダイマーを得たが、これを(nBu4NF/THF、HCl/Me
OH)脱保護することにより、表題化合物である、3'-デ(オキシホスフィニコ)-
3'-[メチレン(メチルイミノ)]チミジリル-(3'→5')チミジン(0.44g、87%)
を白色粉末として得た。3'-デ(オキシホスフィニコ)-3'-[メチレン(メチルイミ
ノ)]チミジリル-(3'→5')チミジンダイマーを分離用HPLCでさらに精製し、
分析上純粋なサンプルを得た。1H NMR(DMSO-d6)δ11.30および11.24
(2s、2、2NH)、7.82および7.50(2s、2、2C6 H)、6.15(偽t、1、T2H 1'、
J1',2'=6.3Hz、J1',2"=7.3Hz)、
6.00(偽t、1、T1H 1'、J1',2'=4.2Hz、J1',2"=6.1Hz)、5.31(m、1、
T2OH)、5.08(m、1、T1OH)、4.17(m、1、T2H 3')、3.88(m、1、T1H 4
)、3.57-3.83(m、5、T1T2H 5',5"、T2H 4')、2.69(m、2、T1H3")
、2.57(s、3、N-CH 3')、2.50(m、1、T1H 3')、2.05-2.14(m、4、T1T
2H 2',2")、1.79および1.76(2s、6、2CH 3)。MS FAB:M/z510(M+H)+
。
C23H31N5O9.H2Oに関する分析予測されたもの:C、50.09;H、6.31;N
、13.28。判明したもの:C、50.05;H、6.21;N、13.08。ホスホルアミダイト含有[3'-CH2-N(CH3)-O-CH2-5']結合したオリゴヌ クレオチドの合成
3'- デ(オキシホスフィニコ)-3'-[メチレン(メチルイミノ)]-5'-O-(ジメト キシトリフェニルメチル)チミジリル-(3'→5')-3'-O-(β-シアノエチルジイソ プロピルアミノホスフィリル)チミジン
Oligonucleotide Synthesis: a practial approach,Ed.M.J.Gait,IR
L Press,1984に記載されているように、全体の収率82%で、3'-デ(オキシホス
フィニコ)-3'-[メチレン(メチルイミノ)]チミジリル-(3'→5')チミジンダイマ
ーをトリチル化し、ホスフィチル化した。保護されているダイマーを、シリカゲ
ルカラムクロマトグラフィー(CH2Cl2:MeOH:Et3N;9:1:0.1、v/v)で精
製し、同質の画分をプールし、蒸発させて純粋な3'-デ(オキシホスフィニコ)-3'
-[メチレン(メチルイミノ)]チミジリル-5'-O-(ジメトキシトリフェニルメチ
ル)-(3'→5')-3'-O-(β-シアノエチルジイソプロピルアミノホスフィリル)チミ
ジンを、白色型として得た(それ自体でDNA合成に用いた)。生成物をジアス
テレオマーの混合物として単離した:31P NMR(CDCl3)δ149.62および1
49.11ppm;1H NMR(CDCl3)δ6.22(偽t、1、T2H 1'、J1',2'=J1',2 "
=6.7Hz)、6.16(偽t、1、T1H 1'、J1',2'=J1',2"=5.8Hz)、2.58、2.
56(2s、3、N-CH 3)、1.82、1.49(2s、6、2CH 3)、および他のプロトン
。
上の保護されているホスホルアミダイトを有するダイマーは、治療上の価値を
オリゴマーに特別に組み入れることが必要なので、そしてまたそういう時には、
上の保護されているホスホルアミダイトを有するダイマーは、自動DNA合成機
(ABI380B)を利用したカップリングに用いることができる。上記のメチル
イ
ダイネニトリロすなわちオキシム、およびメチレンイミノすなわちアミノヒドロ
キシダイマーを例とする、しかしそれらに限定はされない、本発明の他のダイマ
ーは、本実施例と同様に、対応するホスホルアミダイト誘導体に変換され、下記
の様な標準的な方法でオリゴヌクレオチドと合わせられる。オキシム結合ヌクレ
オチドダイマーを有するオリゴマーを、対応するヒドロキシルアミン結合ヌクレ
オシドダイマーを有するオリゴマーに還元する。他の実施例に記すように、CP
Gに結合したオリゴマーとして、あるいはCPGから取り外した後に還元は達成
される。
やはり本発明の譲受人に譲渡されており、本明細書中でそっくりそのまま援用
されているWO92/20823に従って、窒素を含む他の骨格を合成する。
アミド骨格を有するオリゴマーは、De Mesmaeker et al.,Acc.Chem.Res.
1995,28,366-374に従って合成する。アミド部分は、単純で有名な合成方法によ
って容易に入手でき、オリゴヌクレオチドの固相合成に必要な条件に適合する。
モルフォリノ骨格を有するオリゴマーは、アメリカ合衆国特許5,034,506(Su
mmerton and Weller)に従って合成する。
ペプチド-核酸(PNA)オリゴマーは、P.E.Nielsen et al.,Science 19
91,254,1497に従って合成する。実施例2: 細胞および細胞培養
HUVECはClonetics Corp.(San Diego CA)から購入し、10%ウシ
胎児血清(HyClone,Logan UTから)を補った、推奨されているEBM培地
にて培養した。細胞は継代2から10、80-90%コンフルエントで実験に用いた。実施例3: HUVECのオリゴヌクレオチド処理
2x105cells/mlを、37℃にあらかじめ温めておいたOPTI-MEM(Gibco
-BRL,Grand Island,NY)にて3回洗った。オリゴマーは、10μg/mlLI
POFECTIN試薬(Gibco-BRL)とあらかじめOPTI-MEM中で混ぜ
ておき、望ましい温度に連続的に希釈し、洗った細胞に加えた。基底および無処
理(オリゴマーなし)の対照細胞もLIPOFECTINにて処理した。細胞を
4時間、37℃でインキュベートし、この時点で培地を、TNF-αを添加したあ
るいは添加していない標準的な増殖培地と交換した。いくつかの実験では、サイ
トカイン培地を
1時間後に除き、標準培地と交換した。37℃でのインキュベーションは、表示し
てある時間まで続けた。実施例4: 蛍光活性化セルソーター(FACS)によるICAM-1タンパク質 発現の定量
0.25%トリプシンのPBS溶液にて短時間トリプシン処理することにより、細
胞をプレート表面から除いた。トリプシンの活性は2%ウシ血清アルブミン溶液
および0.2%アジ化ナトリウムのPBS溶液(+Mg/Ca)にて失活させた。細胞
を1000rpmで遠心して沈殿させ(Beckman GPR遠心機)、PBSに再懸濁し、
3μl/105cellsのICAM-1特異的抗体、CD54-PE(Becton Dickinson,M
ansfield MA)および0.1μgの対照共役抗体、IgG2b-PE(Pharmingen,Sa
n Diego CA)にて染色した。抗体を細胞と、暗所で穏やかにかき混ぜながら4
℃で30分間インキュベートした。細胞を洗い、それから0.5%ホルムアルデヒド
が入った0.3mlのFACSFLOWバッファー(Becton Dickinson)に再懸濁
した。それから、細胞表面ICAM-1の発現を、Becton Dickinson FACSc
an(San Jose,CA)を用いたフローサイトメトリーにて求めた。ICAM-1
発現は、対照の発現に占めるパーセントとして算出した。実施例5: 全RNA単離およびノーザン解析
全細胞RNAを、CATRIMOX-14界面活性剤(Iowa Biotechnology G
roup,Oakdale IA)を用いた細胞可溶化にて単離した。単離したRNAを、1.
1%ホルムアルデヒドを含む1.2%アガロースゲル上で分離し、それからナイロン
膜にトランスファーし、Stratagene UV crosslinker 2400(La Jolla CA
)を用いて膜にUV架橋させた。ブロットしたものを、QUICKHYB溶液(
Stradagene)中でcDNAプローブとハイブリッド形成させた。ブロットしたも
のを、0.1%SDSが入った2xSSCにて室温でそれぞれ10分間、2回洗い、
それから0.1%SDSが入った0.1xSSCにて65℃で30分間、1回洗った。実施例6: ポリソームプロファイル解析
PBSで洗った、およそ106個の沈殿した細胞を、0.3mlの冷やした可溶化バッ
ファー(0.5%NP-40、10mM Tris-Cl、pH7.4、140mM KCl、5mM MgC
l2、1mM DTT、100μg/mlシクロヘキシミド、およびPrime Rnase阻害剤)
中
に混和し、5分間、4℃でインキュベートした。核を1000xgで沈殿させ、その結
果得られた上清を、勾配バッファー(10mM Tris pH8.0、50mM KOAc、1m
M MgOAc、1mM DTT)に入った状態の、50%cushion(0.75ml)入り10か
ら35%(wt/vol)ショ糖直線勾配(4ml)の上に重層した。勾配をかけたものを
、Beckman SW55Tiローターを用いて35,000rpmで3時間、5℃で遠心した。25
0μlの画分を、Pharmacia UVモニターおよび画分収集機につないだIsco mod
el185密度勾配分取機を用いて集めた。集めた画分を、0.2%SDSでプロテイナ
ーゼK(0.2mg/ml)にて42℃、20分間処理し、フェノール抽出し、エタノール沈
殿した。沈殿させる前に、5から10μgのtRNAを各画分に加えた。沈殿したR
NAを1.2%変性アガロースゲルにのせ、標準的な臭化エチジウム染色およびノ
ーザンブロッティングの手法によって解析した。実施例7: E-セレクチン遺伝子発現に対する活性に関する、オリゴマーのE LISAスクリーニング
継代2から5の初代ヒト臍帯脈内皮(HUVEC)細胞を96穴プレートにまき
、コンフルエントに達するようにした。細胞をOpti-MEM(GIBCO、Gra
nd Island NY)で3回洗った。Opti-MEMを含む10μg/ml DOTMA溶液
(Bethesda Research Labs、Bethesda MD)で希釈した、増加する濃度の
オリゴマーにて、4時間、37℃で処理した。培地を除き、EGM-UV(Clonet
ics,SanDiego CA)とオリゴマーで置き換えた。腫瘍壊死因子αを培地に加
え(2.5ng/ml)、細胞をさらに4時間、37℃でインキュベートした。
E-セレクチン発現をELISAで求めた。細胞を、あらかじめ37℃に温めて
おいたDulbeccoリン酸緩衝生理食塩水(D-PBS)にて穏やかに3回洗った。
細胞を95%エタノールにて4℃で20分間固定し、D-PBSで3回洗い、2%BS
AのD-PBS溶液でブロックした。細胞を、2%BSAを含むD-PBSで0.5μ
g/mlに希釈したE-セレクチンモノクローン性抗体BBA-1(R&D Systems,
Minneapolis MN)にて1時間、37℃でインキュベートした。細胞をD-PBS
で3回洗い、結合したE-セレクチン抗体を、ビオチン化ヤギ抗マウスIgG(B
ethesda Research Laboratories,Gaithersberg、MD)をブロッキング溶液
で1:1000希釈したものと1時間、37℃でインキュベートすることにより検出す
る。細胞をD-PBSで3回洗い、それからβ-ガラクトシダーゼに共役したスト
レプトアビジン(Bethesda Research Laboratories)をブロッキング溶液で1
:1000希釈したものと1時間、37℃でインキュベートした。細胞をD-PBSで5
分間ずつ3回洗った。特異的なモノクローン性抗体に結合したβ-ガラクトシダ
ーゼの量を、プレートを3.3mMクロロフェノールレッド-β-D-ガラクトピラノ
シド、50mMリン酸ナトリウム、1.5mM MgCl2;pH=7.2の溶液中で2から15
分間、37℃で展開させることにより求めた。生成物の濃度を、ELISAマイク
ロタイタープレート読み取り機にて575nmにおける吸光度を測定することにより
求めた。実施例8: アンチセンスオリゴヌクレオチドによるHCMV複製阻害に関する ELISAアッセイ
ヒトサイトメガロウイルスmRNAに相補的なオリゴヌクレオチドを、HCM
V複製のELISAを基本とするアッセイにおいて抗ウイルス活性に関して分析
した。正常ヒト真皮の繊維芽細胞(Clonetics Corp.,San Diego CA)を無
血清培地(Clonetics)で培養し、96穴プレートにまくのに用いた。細胞がおよ
そ80%コンフルエントになったとき、オリゴヌクレオチドで前処理した。前処理
のおよそ20時間後に、培地(オリゴヌクレオチドを含む)を注意深く注ぎ捨て、
温めておいた繊維芽細胞基本培地(FBM、Clonetics)で細胞を2回洗った。
それからFBMで希釈した100μl/wellのCMVストックを細胞に感染させた。
プレートを37℃で2時間インキュベーとした。それから培地(ウイルスを含む)
を注意深く注ぎ捨て、新しい、あらかじめ温めておいたFBM培地、1穴あたり
100μlで置換した。プレートを37℃でしばらくインキュベートし、それからFB
Mで希釈した5μlのオリゴヌクレオチドを、各穴の培地に再び導入した。2日
後、細胞を再びオリゴヌクレオチドで同様に後処理した。6日目にプレートをE
LISA用に調製した。
ELISA用の調製の際、培地を注意深く注ぎ捨て、1穴あたり200μlの純粋
なエタノールで細胞を固定した。細胞を室温で30分間固定し、それからエタノー
ルを除き、プレートを風乾した。ELISAの前にプレートを1時間、2%BS
Aを含むPBSでブロックした。ブロッキング溶液を除き、1%BSAを含むP
BSで
1:2000に希釈した100μlの抗CMV抗体を加えた。細胞を抗体中、1時間、37℃
でインキュベートし、PBSで3回洗った。2次抗体であるビオチン化ヤギ抗マ
ウスIgG(Bethesda Research Labs、MD)を、1%BSAを含むPBSで1
:1000に希釈し、細胞と37℃で1時間、インキュベートした。それから細胞を洗
い、37℃で1時間、ストレプトアビジン-β-D-ガラクトシダーゼ中でインキュ
ベートした。10mlの50mMリン酸ナトリウム、1.5mM MgCl2に溶かした20mgの
クロロフェノールレッド-β-D-ガラクトピラノシドで色を展開した;プレート
を10分間震盪し、575nmにおける吸光度を読んだ。実施例9: U937細胞へのPNAのエレクトロポレーション
細胞をPBSで洗い、1x106cells/mlでPBSに再懸濁した。0.4mlの懸濁液
を、1200μF、140VにセットしたBTXエレクトロポレーター(San Diego
CA)でエレクトロポレーションした。細胞を氷上で冷やし、オリゴマーを加え
た。エレクトロポレーションの10分後に、あらかじめ温めておいた培地に細胞を
まき、5ng/mlのTNFαを用いて一晩、ICAM-1発現を誘導した。ICAM-
1発現を、実施例4と同様にFACSで定量した。実施例10: IE1およびIE2タンパク質産物の発現阻害のウエスタンブロット 解析
安定にトランスフェクトされたU373神経芽腫細胞を用いたが、それぞれ単一
のCMVタンパク質産物を発現する。細胞を6穴プレートに4.5x105cells/well
でまき、次の日に55-70%コンフルエントになるようにした。5μg/mlリポフェク
チンと一緒に75nMの濃度のオリゴヌクレオチドにて細胞をOPTIMEM中で
4時間処理した。細胞をオリゴヌクレオチドなしの培地でまき直し、一晩回復さ
せた。細胞を処理後16-20時間後に回収し、PBSで1回洗い、Laemmliバッフ
ァー(100μl/well)に懸濁し、5分間煮て、16%SDS-PAGEゲルにのせた
。ゲルを150Vで1.5時間流し、ウエスタンブロッティング用の膜にトランスファ
ーした。1次抗体は1:1000に希釈したIE55-72-86抗体(Virostat)で、2次
抗体は放射標識したヤギ抗マウスであった。バンドをPHOSPHORIMAG
ER(Molecular Dynamics、Sunnyvale CA)を用いて視覚化した。実施例11: MMIオリゴマーを用いたU937細胞へのエレクトロポレーション
U937細胞を冷やしたOpti-MEM(Gibco-BRL、Grand Island、NY)
で1回洗い、4x106cells/mlで再懸濁した。オリゴマーを0.1mlの細胞に加え、
氷上で10分間インキュベートした。細胞を1mm間隔の電極(BTX、San Dieg
o、CA)に移し、0.75kV/cmでエレクトロポレーションした。細胞を室温で10
分間インキュベートし、あらかじめ温めておいた培地に移した。ICAM-1発現
を5ng/ml TNF-αで一晩誘導する前に、細胞を1.5時間休ませた。翌日、細胞
を抗ICAM-1-PE抗体(Pharmingen、San Diego CA)で染色した。
【手続補正書】
【提出日】1998年11月27日
【補正内容】
請求の範囲
1.インビトロでまたはヒトを除く動物においてキャップされた標的mRNAの
翻訳を阻害する方法であって、
キャップされた標的mRNAを、8−25塩基の長さであり、修飾された2’−
位を含むオリゴヌクレオチド;オリゴヌクレオシド;またはペプチド−核酸オリ
ゴマーからなる群から選択されるオリゴマーと接触させ;ここで前記オリゴマー
は、前記標的mRNAの5’末端の最初の20ヌクレオチドのうち少なくとも一
つを含む、前記標的mRNAの5’キャップ領域と特異的にハイブリッド形成す
ることができ;そして
標的mRNAの翻訳が阻害されるようにmRNA上へのリボソームの構築を妨害
する、
ことを含む方法。
2.修飾された2’位が2’−OCH2CH2OCH3、2’−OCH3、2’−O
CH2CH2CH3、2’−OCH2CH2=CH2、または2’−Fである、請求項
1記載の方法。
3.修飾された2’位が2’−OCH2CH2OCH3である、請求項2記載の方
法。
4.前記オリゴヌクレオシドがモルフォリノ、アミド−3、アミド−4、または
メチレン(メチルイミノ)ヌクレオシド間結合を少なくとも一つ含む、請求項1
記載の方法。
5.前記キャップされた標的mRNAがヒトICAM−1をコードする、請求項
1記載の方法。
6.前記キャップされた標的mRNAがヒトE−セレクチンをコードする、請求
項1記載の方法。
7.前記キャップされた標的mRNAがサイトメガロウイルスタンパク質をコー
ドする、請求項1記載の方法。
8.前記サイトメガロウイルスタンパク質がIE1またはIE2遺伝子産物であ
る、請求項7記載の方法。
9.前記オリゴマーが、前記標的mRNAの5’末端の最初の5ヌクレオチドの
うち少なくとも1つを含む前記標的mRNAの領域と特異的にハイブリッド形成
しうる、請求項1記載の方法。
10.RNAseH非依存的である、請求項1記載の方法。
11.キャップされた標的mRNAの翻訳を阻害する組成物であって、
8−25塩基の長さであり、修飾された2’−位を含むオリゴヌクレオチド;オ
リゴヌクレオシド;またはペプチド−核酸オリゴマーからなる群から選択される
オリゴマーを含み;前記オリゴマーは、前記標的mRNAの5’末端の最初の2
0ヌクレオチドのうち少なくとも一つを含むキャップされた標的mRNAの5’
キャップ領域と特異的にハイブリッド形成することができ、かつmRNA上にお
けるリボソームの構築を妨害することができることを特徴とする組成物。
12.前記オリゴヌクレオチドがモルフォリノ、アミド−3、アミド−4、また
はメチレン(メチルイミノ)ヌクレオシド間結合を少なくとも一つ含む、請求項
11の組成物。
13.オリゴマーが各3’−デオキシ糖部分上に2’−OCH2OCH2CH3修
飾を有する、請求項11記載の組成物。
14.キャップされた標的mRNAがICAM−1をコードし、かつオリゴマー
が配列番号1または配列番号2を有する、請求項13記載の組成物。
15.キャップされた標的mRNAがE−セレクチンをコードし、かつオリゴマ
ーが配列番号3を有する、請求項13記載の組成物。
16.キャップされた標的mRNAがCMVIE1/IE2mRNAであり、か
つオリゴマーが配列番号5、配列番号6、配列番号7または配列番号8を有する
、請求項13記載の組成物。
17.前記キャップされた標的mRANがヒトVCAM−1をコードする、請求
項1記載の方法。
18.前記オリゴヌクレオシドがメチレン(メチルイミノ)ヌクレオシド間結合
を少なくとも1つ含む、請求項4記載の方法。
19.オリゴマーが、各3’−デオキシ糖部分上に2’−OCH2CH2OCH3
、
2’−OCH3、2’−OCH2CH2CH3、2’−OCH2CH2=CH2、また
は2’−F修飾を有する、請求項11記載の組成物。
20.キャップされた標的mRNAがICAM−1をコードし、かつオリゴマー
が配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13また
は配列番号14を有する、請求項11記載の組成物。
21.キャップされた標的mRNAがVCAM−1をコードし、オリゴマーが配
列番号15を有する、請求項11記載の組成物。
22.前記オリゴヌクレオチドがメチレン(メチルイミノ)ヌクレオシド間結合
を少なくとも1つ含む、請求項12記載の組成物。
23.8−25塩基の長さの、修飾された2’−位を含むオリゴヌクレオチド;
オリゴヌクレオシド;またはペプチド−核酸オリゴマーからなる群から選択され
るオリゴマーを含む細胞であって、
前記オリゴマーは、前記標的mRNAの5’末端の最初の20ヌクレオチドのう
ち少なくとも一つを含むキャップされた標的mRNAの5’キャップ領域と特異
的にハイブリッド形成することができ、かつmRNA上におけるリボソームの構
築を妨害することができることを特徴とする細胞。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.6 識別記号 FI
A61K 31/70 627 A61K 31/70 627
48/00 48/00
// C07H 21/00 C07H 21/00
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L
U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF
,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,
SN,TD,TG),AP(GH,KE,LS,MW,S
D,SZ,UG),UA(AM,AZ,BY,KG,KZ
,MD,RU,TJ,TM),AL,AU,BA,BB
,BG,BR,CA,CN,CU,CZ,EE,GE,
GH,HU,IL,IS,JP,KP,KR,LC,L
K,LR,LT,LV,MG,MK,MN,MX,NO
,NZ,PL,RO,SG,SI,SK,TR,TT,
UA,US,UZ,VN,YU
(72)発明者 アンダーソン,ケビン・ピー
アメリカ合衆国カリフォルニア州92009,
カールズバッド,ラ・グラン・ヴィア
2772
(72)発明者 コンドン,トーマス・ピー
アメリカ合衆国カリフォルニア州92009,
カールズバッド,クサナ・ウェイ 6756
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.キャップされた標的mRNAの翻訳を阻害する方法であって、 キャップされた標的mRNAを、8-25塩基の長さであり、修飾された2'-位を含む オリゴヌクレオチド;オリゴヌクレオシド;またはペプチド-核酸オリゴマーか らなる群から選択されるオリゴマーと接触させ;ここで前記オリゴマーは、前記 標的mRNAの5'末端の最初の20ヌクレオチドのうち少なくとも一つを含む、前 記標的mRNAの5'キャップ領域と特異的にハイブリッド形成することができ; そして 標的mRNAの翻訳が阻害されるようにmRNA上へのリボソームの構築を妨害す る、 ことを含む方法。 2.修飾された2'位が2'-OCH2CH2OCH3、2'-OCH3、2'-OCH2CH2 CH3、2'-OCH2CH2=CH2、または2'-Fである、請求項1記載の方法。 3.修飾された2'位が2'-OCH2CH2OCH3である、請求項2記載の方法。 4.前記オリゴヌクレオシドがモルフォリノ、アミド-3、アミド-4、またはメ チレン(メチルイミノ)ヌクレオシド間結合を少なくとも一つ含む、請求項1記 載の方法。 5.前記キャップされた標的mRNAがヒトICAM-1をコードする、請求項 1記載の方法。 6.前記キャップされた標的mRNAがヒトE-セレクチンをコードする、請求 項1記載の方法。 7.前記キャップされた標的mRNAがサイトメガロウイルスタンパク質をコ ードする、請求項1記載の方法。 8.前記サイトメガロウイルスタンパク質がIE1またはIE2遺伝子産物であ る、請求項7記載の方法。 9.前記オリゴマーが、前記標的mRNAの5'末端の最初の5ヌクレオチドの うち少なくとも1つを含む前記標的mRNAの領域と特異的にハイブリッド形成 しうる、請求項1記載の方法。 10.RNAseH非依存的である、請求項1記載の方法。 11.インビトロで行われる、請求項1記載の方法。 12.インビボで行われる、請求項1記載の方法。 13.エクスビボで行われる、請求項1記載の方法。 14.キャップされた標的mRNAの翻訳を阻害する組成物であって、8-25塩基 の長さであり、修飾された2'-位を含むオリゴヌクレオチド;オリゴヌクレオシ ド;またはペプチド-核酸オリゴマーからなる群から選択されるオリゴマーを含 み;前記オリゴマーは、前記標的mRNAの5'末端の最初の20ヌクレオチドのう ち少なくとも一つを含むキャップされた標的mRNAの5'キャップ領域と特異的 にハイブリッド形成することができ、かつmRNA上におけるリボソームの構築 を妨害することができることを特徴とする組成物。 15.前記オリゴヌクレオチドがモルフォリノ、アミド-3、アミド-4、またはメ チレン(メチルイミノ)ヌクレオシド間結合を少なくとも一つ含む、請求項14の 組成物。 16.オリゴマーが各3'-デオキシ糖部分上に2'-OCH2OCH2CH3修飾を有 する、請求項14記載の組成物。 17.キャップされた標的mRNAがICAM-1をコードし、かつオリゴマーが 配列番号1または配列番号2を有する、請求項16記載の組成物。 18.キャップされた標的mRNAがE-セレクチンをコードし、かつオリゴマー が配列番号3を有する、請求項16記載の組成物。 19.キャップされた標的mRNAがCMV IE1/IE2 mRNAであり、かつ オリゴマーが配列番号5、配列番号6、配列番号7または配列番号8を有する、 請求項16記載の組成物。 20.前記キャップされた標的mRANがヒトVCAM-1をコードする、請求項 1記載の方法。 21.前記オリゴヌクレオシドがメチレン(メチルイミノ)ヌクレオシド間結合 を少なくとも1つ含む、請求項4記載の方法。 22.オリゴマーが、各3'-デオキシ糖部分上に2'-OCH2CH2OCH3、2'-O CH3、2'-OCH2CH2CH3、2'-OCH2CH2=CH2、または2'-F修飾を有 する、請求項14 記載の組成物。 23.キャップされた標的mRNAがICAM-1をコードし、かつオリゴマーが 配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13または配列番号 14を有する、請求項14記載の組成物。 24.キャップされた標的mRNAがVCAM-1をコードし、オリゴマーが配列 番号15を有する、請求項14記載の組成物。 25.前記オリゴヌクレオチドがメチレン(メチルイミノ)ヌクレオシド間結合 を少なくとも1つ含む、請求項15記載の組成物。
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