JPH07222590A - アルテロモナス ハネダイ のルシフェラーゼ遺伝子 - Google Patents

アルテロモナス ハネダイ のルシフェラーゼ遺伝子

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JPH07222590A
JPH07222590A JP6035450A JP3545094A JPH07222590A JP H07222590 A JPH07222590 A JP H07222590A JP 6035450 A JP6035450 A JP 6035450A JP 3545094 A JP3545094 A JP 3545094A JP H07222590 A JPH07222590 A JP H07222590A
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JP
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leu
glu
ser
asn
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Application number
JP6035450A
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English (en)
Inventor
Shuhei Yoshino
修平 善野
Shinji Shiraishi
慎治 白石
Kaoru Saigo
薫 西郷
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JNC Corp
Original Assignee
Chisso Corp
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Publication date
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Abstract

(57)【要約】 【目的】 発光細菌Alteromonas hane
daiルシフェラーゼ遺伝子を提供すること。 【構成】 配列の長さ2124の塩基配列を有するDN
Aからなるルシフェラーゼ遺伝子。この遺伝子は354
個のアミノ酸からなる分子量39,943のαサブユニ
ット蛋白質と327個のアミノ酸からなる分子量36,
895のβサブユニット蛋白質をコードしている。この
遺伝子を含有する組換えベクター、このベクターを含む
細菌。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は発光細菌アルテロモナス
ハネダイのルシフェラーゼ遺伝子、酵素蛋白、該遺伝
子を含む組換えベクター、および該組換えベクターを含
有する細菌に関する。
【0002】
【従来の技術】発光細菌ルシフェラーゼは、還元型フラ
ビンモノヌクレオチド(以下FMNH2 という)と長鎖
脂肪族アルデヒドを酸化し、酸化型フラビンモノヌクレ
オチド(以下FMNという)と長鎖脂肪族カルボン酸を
生成する反応を触媒する。この際、青緑色の光を発す
る。細菌ルシフェラーゼはαサブユニットとβサブユニ
ットからなるヘテロダイマーで、αとβのそれぞれのサ
ブユニットはluxA及びluxB遺伝子にコードされ
ている。本酵素は生体外で長鎖アルデヒドと還元型FM
Nの共存により発光反応を触媒する。還元型FMNは空
気中で即時に自動酸化されるため、一般的にはFMN還
元酵素を反応系に共存させ、ルシフェラーゼと共役反応
させて、連続発光させることが多い。長鎖アルデヒドと
してはデカナールが一般的に用いられる。このように細
菌ルシフェラーゼは生体外でたやすく発光反応を行なえ
る為、診断検査薬などの標識酵素として有用である。以
上のように、細菌ルシフェラーゼは発光反応を触媒する
為高感度検出に有用で、その遺伝子の取得により、大量
に本酵素を調製することが出来る。
【0003】細菌ルシフェラーゼはlux遺伝子のlu
xAとluxBにコードされている。今までに、数多く
の発光細菌のルシフェラーゼ遺伝子が単離され、その1
次構造が明らかにされている。〔Baldwin,T.
O.,T.Berends,T.A.Bunch,T.
F.Holzman,S.K.Rausch,L.Sh
amansky,M.L.Treat,and M.
M.Ziegler.1984.バイオケミストリー
(Biochemistry) 23:3663−36
67;Belas,R.,A.Mileham,D.C
ohn,M.Hilmen,M.Simon,and
M.Silverman.1982.サイエンス(Sc
ience) 218:791−793;Cohn,
D.H.,R.C.Ogden,J.N.Abelso
n,T.O.Baldwin,K.H.Nealso
n,M.I.Simon,and A.J.Mileh
am.1983.プロシーディング オブ ナショナル
アカデミー オブ サイエンス(Proc.Natl.
Acad.Sci.)USA 80:120−123;
Delong,E.F.,D.Steinhauer,
A.Israel,andK.H.Nealson.1
987.ジーン(Gene) 54:203−210;
Engebrecht,J.,K.H.Nealso
n,and M.Silverwan.1983.セル
(Cell) 32:773−781;Evans
J.F.,S.McCracken,C.M.Miya
moto,E.A.Meighen,and A.F.
Graham.1983.ジャーナル オブ バクテリ
オロジー(J.Bacteriol.)153:543
−545;Frackman,S.,M.Anhal
t,and K.H.Nealson.1990.ジャ
ーナル オブ バクテリオロジー(J.Bacteri
ol.)172:5767−5773;Mancin
i,J.A.,M.Boylan,R.R.Soly,
A.F.Graham,and E.A.Meighe
m.1988.ジャーナル オブ バイオロジカルケミ
ストリー(J.Biol.Chem.)263:143
08−14314;Szittner,R.,and
E.Meighen.1990.ジャーナル オブ バ
イオロジカルケミストリー(J.Biol.Che
m.)265:16581−16587.〕 しかしながら、アルテロモナス ハネダイのルシフェラ
ーゼ遺伝子に関しては報告されていない。
【0004】
【発明が解決しようとする課題】本発明者らは、鋭意研
究の結果、発光細菌Alteromonas hane
dai(ATCC33224)からルシフェラーゼ遺伝
子を単離し、その一次構造を明らかにすることに成功
し、また該遺伝子を大量に発現する大腸菌を作出するこ
とに成功し、本発明を完成するに至った。すなわち、本
発明の目的は上述の技術的事情にかんがみ、発光細菌
lteromonas hanedaiのルシフェラー
ゼ遺伝子および酵素を提供することであり、さらに該遺
伝子を含む組換えベクター、および該組換えベクターを
含む細菌を提供することである。
【0005】
【課題を解決するための手段】本発明は、つぎの(1)
〜(11)の構成を有する。 (1)配列番号1で表される塩基配列を含む、ルシフェ
ラーゼ・アルファ・サブユニットの遺伝子。 (2)配列番号2で表される塩基配列を含む、ルシフェ
ラーゼ・ベータ・サブユニットの遺伝子。 (3)配列番号3で表される塩基配列を含む前記第
(1)項記載のルシフェラーゼ・アルファ・サブユニッ
トの遺伝子。 (4)配列番号4で表される塩基配列を含む請求項2記
載のルシフェラーゼ・ベータ・サブユニットの遺伝子。 (5)塩基配列が配列番号5で表されるルシフェラーゼ
遺伝子。 (6)配列番号6で表されるアミノ酸配列を有するルシ
フェラーゼ・アルファ・サブユニット。 (7)配列番号7で表されるアミノ酸配列を有するルシ
フェラーゼ・べータ・サブユニット。 (8)塩基配列が配列番号1および配列番号2で表され
るDNAを含有する組換えベクター。 (9)配列番号3および配列番号4で表される塩基配列
を有する遺伝子がプラスミドベクターへ挿入された前記
(8)項記載の組換えベクター。 (10)配列番号1および配列番号2で表される塩基配
列を有するDNAを含む組換えベクターを含有する細
菌。 (11)塩基配列が配列番号1および配列番号2で表さ
れるDNAを含む組換えベクターで修飾されてなる細菌
を培養することからなる配列番号6および配列番号7で
表されるアミノ酸配列を含む酵素の製法。
【0006】本発明の構成と効果につき以下に詳述す
る。本発明の酵素遺伝子は、配列番号1と配列番号2で
表わされる配列に、それぞれ長さ1065と984のヌ
クレオチド鎖を含むのが特徴である。好ましく示す配列
としては、配列番号3および配列番号4で表わされるヌ
クレオチド鎖を含む。具体的には塩基配列が配列番号5
で表わされ、配列の長さが2124のDNAを示す。
【0007】配列の種類はゲノムDNAであり、発光細
Alteromonas hanedai(ATCC
33224)から単離されるものである。その配列の特
徴は配列番号5の塩基番号38から1099までの領域
に、354個のアミノ酸から成る分子量39,943の
ルシフェラーゼαサブユニットと配列番号5の塩基番号
1141から2121までの領域に、327個のアミノ
酸から成る分子量36,895のルシフェラーゼβサブ
ユニットをコードしていることである。本発明の酵素遺
伝子産物は、細菌ルシフェラーゼに由来する発光活性を
有し、たとえば、還元型FMNとデカナールを酸化する
発光反応を触媒する活性を有するものである。本発明の
酵素は、配列番号1,2,3,4および5の塩基配列か
ら予測される配列番号6および7で表されるアミノ酸配
列を有する蛋白質である。その蛋白質は354個のアミ
ノ酸からなる分子量39,943のルシフェラーゼαサ
ブユニットと327個のアミノ酸からなる分子量36,
895のルシフェラーゼβサブユニットとからなり、発
光細菌中で発光活性を有する。
【0008】本発明の組換えベクターは、塩基配列が配
列番号1および2で表されるDNAを含有する。すなわ
ち、本発明の組換えベクターは、配列番号1および2で
表される塩基配列を有するDNAと、機能的同等物を含
む。「機能的同等物」とは適当な宿主による発光細菌の
ルシフェラーゼ発光活性を有する酵素の産生において、
実質的に同じ結果を得るために実質的に同じ方法で使用
できるDNA断片のことである。すなわち、塩基配列が
異なっても、同一のアミノ酸配列を有する蛋白をコード
しえるDNA断片や若干の塩基配列の相違に伴う若干の
アミノ酸配列の違いがあるもののルシフェラーゼ発光活
性を有する蛋白をコードしえるDNA断片のことを意味
する。具体的には配列番号1および2の塩基配列や部位
特異的変異導入された配列番号1および2に由来する塩
基配列を示すことになる。たとえば、該塩基配列を含有
するDNA断片を挿入したプラスミドベクターなどであ
る。このベクターとしては、pUC(C.Yanisc
h−Perron,J.Vieira & J.Mes
sing,ジーン(Gene),33,110−115
〔1985〕)などが使用できる。
【0009】図3はルシフェラーゼ発現ベクターの構築
工程を示す。すなわち、ルシフェラーゼ遺伝子を有する
プラスミドpAH18からインサートDNAの一部に相
当する約3kbのXbaI/EcoRI断片をpUC1
3のXbaI/EcoRI切断部位に挿入し、発現ベク
ターpALF1を作製した。結果的にpALF1は大腸
菌のラクトースオペロンの1acプロモーターの支配下
にルシフェラーゼ遺伝子が配置されており、ルシフェラ
ーゼが発現されるようになっている。本発明の細菌は、
配列番号1および2で表される塩基配列を含有する組換
えベクターDNAを含む。本発明の細菌の特徴はルシフ
ェラーゼ発光活性を有する蛋白質を生産することであ
る。本発明の酵素の製法は、塩基配列が配列番号1およ
び2で表されるDNAを含む組換えベクター(発現ベク
ター)で修飾された細菌を培養し、配列番号6および7
で表されるアミノ酸配列を含む蛋白質を製造することで
ある。細菌としては、大腸菌など、培地としてはLB培
地などをあげることができる。以下、実施例にて本発明
で重要な遺伝子の単離とその同定に関する手順をのべ
る。
【0010】
【実施例】
実施例1Alteromonas hanedaiのluxA遺
伝子の単離 発光細菌Alteromonas hanedai(A
TCC33224)をPhotobacterium
培地で26℃、一晩振とう培養した。10000rpm
で遠心分離し集菌した後、トリス塩酸・EDTA緩衝液
(以下、TE緩衝液という)に菌体を懸濁した。37℃
で1時間リゾチーム処理した後、ドデシル硫酸ナトリウ
ム(以下SDSと略す)を添加して50℃で3時間プロ
テネースK処理をした。その後、フェノール処理を3回
行い、エタノール沈殿し、乾燥した後、TE緩衝液に溶
解し再度プロテネースK処理した。その後フェノール処
理3回後エタノール沈殿しゲノムDNAを回収した。
【0011】今までに明らかにされているルシフェラー
ゼαサブユニットのアミノ酸配列で保存されている領域
に対応する図1に示す合成オリゴヌクレオチド・プライ
マーLUX1とLUX2を用いてhanedai
ノムDNAを鋳型にしてPCR法〔Saiki,R.
K.,D.H.Gelfand,S.Stoffel,
S.J.Scharf,R.Higuchi,G.T.
Horn,K.B.Mullis and H.A.E
rlic(1988)サイエンス(Science)
239 487〕によりluxA遺伝子を増幅し、その
DNA断片をpUC8プラスミドDNA〔Hanna,
Z.,Fregeau,C.,Prefontain
e,G.,Brousseau,R.(1984)ジー
ン(Gene),30 247〕のHincII切断部
位に挿入した。
【0012】塩基配列の決定 〔Hattori,M.& Sakaki,Y.(19
86)アナリティカルバイオケミストリー(Anal.
Biochem.)152 232〕からhane
daiのluxA遺伝子であることを確認した。このプ
ラスミドDNAからluxA遺伝子部分のDNA断片を
PstI/EcoRIで切り出し、完全鎖長ルシフェラ
ーゼ遺伝子(luxA及びluxB)のスクリーニング
のプローブDNAとして用いた。プローブDNAの32
標識はランダム・プライミング法〔Feinberg,
A.& Vogelstein.B.(1983)アナ
リティカル バイオケミストリー(Anal.Bioc
hem.)132 6〕で行った。
【0013】実施例2 発光細菌遺伝子のラムダ・ファージライブラリーの作製 上記のゲノムDNAの50μgに10単位の制限酵素S
au3AIを37℃で作用させた。反応時間5,10,
20,30,45,60,90,120分で一部分取
し、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)を加えること
により反応を停止した。それぞれの一部をアガロースゲ
ル電気泳動にかけゲノムDNAの部分分解の度合を確認
した。各時間ごとの反応液を1本にまとめエタノール沈
殿回収した。それを少量のTE緩衝液に溶解後、アガロ
ースゲル電気泳動にかけ9〜23キロベース(kb)の
画分を電気溶出操作で回収した。9〜23Kb画分を含
むアガロースゲルから前記9〜23Kb画分のDNAを
透析チューブ内に電気泳動的に溶出し、フェノール処理
3回後エタノールで沈殿した。それを約200ng/μ
lになるようにTE緩衝液に溶解した。制限酵素Bam
HIであらかじめ切断してアルカリフォスファターゼ
(DNAの5′末端の脱リン酸化を触媒する酵素)で処
理されたEMBL3ファージDNAに、前記9〜23K
b画分のDNAをT4DNAリガーゼ(DNA鎖どうし
または、DNAとRNAの3′OHと5′P末端をホス
ホジエステル結合でつなぐ酵素)を用いて16℃で一晩
連結反応した。連結反応液をパッケージング抽出液と混
合し、22℃で2時間反応して組換えファージを得た。
このファージを遺伝子ライブラリーとした。
【0014】実施例3 完全長鎖のルシフェラーゼ遺伝子の単離 実施例2で作製の遺伝子ライブラリーのタイター測定
後、プレート当り1万個のファージがプラークを形成す
るようにまき、37℃で一晩培養した。4℃に2時間放
置後、それぞれのプレートに対して、ナイロンメンブレ
ン・フィルターで2枚づつファージをトランスファーし
た。
【0015】フィルターを変性し、中和後、紫外線照射
した。そして、バイブリダイゼーション液{20mlの
6×SET緩衝液〔20×SET緩衝液:3MのNaC
l,0.6Mのトリスー塩酸(pH8.0)、0.04
MのEDTA〕、10×Denhardt′s液(牛血
清アルブミン、ポリビニルピロリドン、Ficollの
各0.2W/V%溶液)、0.1W/V%SDS、サケ精子D
NA(熱変性したもの50μg/ml)}に入れ、68
℃で1時間保温した。さらに液を入れ替えて1時間保温
後、32P標識したhanedaiのluxAのプロ
ーブを加え65℃で一晩ハイブリダイゼーションした。
溶液を捨てフィルターを2×SET緩衝液で洗浄後、
0.2×SET緩衝液65℃で20分間振とうした。こ
の操作を2回繰り返した後、風乾しオートラジオグラフ
ィーにかけた。フィルターと現像したX線フィルムを重
ねインクマーカーの位置をフィルム上に写し取った。
【0016】一枚のプレートからできた二枚のフィルム
上でシグナルが重なると同定されたファージ(クロー
ン)を約1000個の組換えファージから1個得た。こ
のクローンをλAH18と名付けた。このインサートD
NAをpUC13プラスミドのSaII部位に挿入し、
pAH18を得た。このプラスミドDNAを鋳型とし
て、PCRクローンの塩基配列を基に調製した合成オリ
ゴヌクレオチドプライマー(20mer)を用いて、ジ
デオキシ法〔Hattori,M.& Sakaki,
Y.(1986)アナリティカル バイオケミストリー
(Anal.Biochem.)152 232〕で塩
基配列を決定した。
【0017】また、新たにその塩基配列を基に合成プラ
イマーを作製し、ジデオキシ法で塩基配列を決定した。
図2にその制限マップを示した。決定された塩基配列で
表される遺伝子は、配列番号5に示される通りで、21
24bpの長さで、luxA遺伝子及びluxB遺伝子
に対応し、塩基番号38〜1099までは354個のア
ミノ酸から成る分子量39,943のルシフェラーゼの
サブユニットを、塩基番号1141〜2121までは3
27個のアミノ酸から成る分子量36,895のルシフ
ェラーゼβサブユニットをそれぞれコードすると考えら
れた。
【0018】実施例4 ルシフェラーゼ遺伝子の発現ベクターの構築とその形質
転換株の調製(図3参照) 組換えプラスミドpAH18のDNAをXbaI及びE
coRIで消化し、3Kbの断片を回収し、プラスミド
pUC13のXbaI/EcoRI部位にT4DNAリ
ガーゼで連結反応した。その連結反応液の一部を大腸菌
D1210株に形質転換した。該形質転換株からプラス
ミドDNAを調製し、インサートDNAが3Kbのもの
を選択した。そのプラスミドをpALF1と名付けた。
pALF1はラクトースオペロン(lac)のプロモー
ターの支配下にルシフェラーゼ遺伝子を配置した形とな
っており、ルシフェラーゼを発現するように構築されて
いる。
【0019】実施例5 ルシフェラーゼの調製とその活性測定 この形質転換株の一晩培養液0.25mlをアンピシリ
ンを含有したLB液体(10ml)培地に植菌し、37
℃で2時間振とう培養後、最終濃度が1mMになるよう
にイソプロピル−β−D(−)−チオガラクトピラノシ
ド(IPTGと略す)を添加し、さらに3時間培養し
た。IPTG誘導処理した培養液3.0mlを1000
0rpmで遠心分離し上清を除く。菌体を50mMリン
酸カリウム・1mMジチオスレイトール緩衝液0.75
mlに懸濁し超音波破砕した。12000rpm、4℃
で30分間遠心分離し、その上清を細胞抽出液とした。
【0020】その細胞抽出液に対して、発光活性を調べ
た。ルシフェラーゼ発光の確認は、1mM FMN25
μl、細胞抽出液10μlを含む全量500μlの50
mMリン酸緩衝液pH7.0、25℃に10mg/ml
のNa2 2 4 溶液10μlを加えて還元状態とし、
これに500μlの空気飽和のデカナール溶液を急速に
加えて、暗室にて内眼で発光することを確認した。デカ
ナール溶液は、純デカナール10μlを0.5W/V%B
SA,0.05W/V%トリトンX−100を含む100
mlの50mMリン酸緩衝液(pH7.0)に加えて調
製した。また、この液体培養菌体に純デカナールを加
え、培養容器を振とうすると発光が認められた。以上の
結果からpAFL1のインサートDNAであるこの遺伝
子がルシフェラーゼ遺伝子であることが確認された。
【0021】
【発明の効果】本発明の酵素遺伝子は、発光細菌
anedaiのルシフェラーゼの遺伝子として初めて単
離されたものである。適当な宿主、例えば大腸菌を宿主
とすることにより、その大腸菌から大量に該酵素蛋白を
調製することができる。その発現ベクターを適当な宿主
たとえば、大腸菌に導入することにより、発光細菌のル
シフェラーゼを大量に発現する生物あるいは微生物を作
出することができ、さらにその遺伝子導入生物から抽出
することにより該還元酵素を大量に調製することができ
る。該還元酵素は上述した機能から、多くの測定法に応
用でき、たとえば診断薬や検査薬として有用である。
【0022】
【配列表】
【0023】配列番号:1 配列の長さ:1065 配列の型:核酸 鎖の数:1 トポロジー:直鎖 配列の種類:ゲノムDNA 起源 生物名:Alteromonas hanedai 株名:ATCC33224 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E
【0024】 配列 1 ATG AAJ TTK GGL AAK ATM TGR TTK QRS TAK CAJ CCL CCL GGL GAJ ACL 48 1 Met Lys Phe Gly Asn Ile Cys Phe Ser Tyr Gln Pro Pro Gly Glu Thr 16 49 CAK AAJ CAJ GTL ATG GAR WGZ TTK ATM WGZ XTY GGL GTL GCL QRS GAJ 96 17 His Lys Gln Val Met Asp Arg Phe Ile Arg Leu Gly Val Ala Ser Glu 32 97 GAJ XTY GGL TTK GAK ACL TAK TGG ACL XTY GAJ CAK CAK TTK ACL GAJ 144 33 Glu Leu Gly Phe Asp Thr Tyr Trp Thr Leu Glu His His Phe Thr Glu 48 145 TTK GGL XTY ACL GGL AAK XTY TTK GTL GCL GCL GCL AAK XTY XTY GGL 192 49 Phe Gly Leu Thr Gly Asn Leu Phe Val Ala Ala Ala Asn Leu Leu Gly 64 193 WGZ ACL AAJ ACL XTY CAJ GTL GGL ACL ATG GGL GTL GTL XTY CCL ACL 240 65 Arg Thr Lys Thr Leu Gln Val Gly Thr Met Gly Val Val Leu Pro Thr 80 241 GCL CAK CCL GTL WGZ CAJ XTY GAJ GAK GTL XTY XTY XTY GAK CAJ ATG 288 81 Ala His Pro Val Arg Gln Leu Glu Asp Val Leu Leu Leu Asp Gln Met 96 289 QRS AAJ GGL WGZ TTK AAK TTK GGL GTL GTL WGZ GGL XTY TAK CAK AAJ 336 97 Ser Lys Gly Arg Phe Asn Phe Gly Val Val Arg Gly Leu Tyr His Lys 112 337 GAK TTK WGZ GTL TTK GGL GTL AAK ATG GAJ GAK QRS WGZ GGL ATM ACL 384 113 Asp Phe Arg Val Phe Gly Val Asn Met Gly Asp Ser Arg Gly Ile Thr 128 385 CAJ QRS TTK CAK ACL ATG ATM ATM GAK GGL GTL AAJ ACL GGL WGZ ATM 432 129 Gln Ser Phe His Thr Met Ile Ile Asp Gly Val Lys Thr Gly Arg Ile 144 433 QRS QRS GAK GGL GAJ CAK ATM GAJ TTK CCL GAJ GTL GAJ GTL TAK CCL 480 145 Ser Ser Asp Gly Glu His Ile Glu Phe Pro Glu Val Glu Val Tyr Pro 160 481 ACL GCL TAK QRS AAJ GAJ XTY CCL ACL TGK ATG ACL GCL GAJ QRS GCL 528 161 Thr Ala Tyr Ser Lys Glu Leu Pro Thr Cys Met Thr Ala Glu Ser Ala 176 529 QRS ACL ACL GAJ TGG XTY GCL GAJ WGZ GGL XTY CCL ATG GTL XTY QRS 576 177 Ser Thr Thr Glu Trp Leu Ala Glu Arg Gly Leu Pro Met Val Leu Ser 192 577 TGG ATM ATM GGL ACL AAK GAJ AAJ AAJ GCL CAJ ATG GAJ XTY TAK AAK 624 193 Trp Ile Ile Gly Thr Asn Glu Lys Lys Ala Gln Met Glu Leu Tyr Asn 208 625 GAJ ATM GCL ATM GAJ CAK GGL CAK GAK ATM ACL AAJ ATM GAK CAK TGK 672 209 Glu Ile Ala Ile Glu His Gly His Asp Ile Thr Lys Ile Asp His Cys 224 673 ATG ACL TTK ATM TGK QRS GTL GAK AAK GAK QRS AAK AAJ GCL WGZ GAK 720 225 Met Thr Phe Ile Cys Ser Val Asp Asn Asp Ser Asn Lys Ala Arg Asp 240 721 GTL TGK WGZ GCL TTK XTY GCL AAK TGG TAK GAK QRS TAK GTL AAK GCL 768 241 Val Cys Arg Ala Phe Leu Ala Asn Trp Tyr Asp Ser Tyr Val Asn Ala 256 769 ACL AAK ATM TTK AAK GAK QRS AAK CAJ ACL WGZ GGL TAK GAK TAK CAK 816 257 Thr Asn Ile Phe Asn Asp Ser Asn Gln Thr Arg Gly Tyr Asp Tyr His 272 817 AAJ GGL CAJ TGG WGZ GAK TTK GTL XTY AAJ GGL CAK ACL AAK QRS AAK 864 273 Lys Gly Gln Trp Arg Asp Phe Val Leu Lys Gly His Thr Asn Ser Asn 288 865 WGZ WGZ GTL GAK TAK QRS AAK GAJ ATM AAK CCL GTL GGL ACL CCL GAJ 912 289 Arg Arg Val Asp Tyr Ser Asn Glu Ile Asn Pro Val Gly Thr Pro Glu 304 913 GAJ TGK ATM QRS ATM ATM CAJ WGZ GAK ATM GAK GCL ACL GGL ATM ACL 960 305 Glu Cys Ile Ser Ile Ile Gln Arg Asp Ile Asp Ala Thr Gly Ile Thr 320 961 AAK ATM ACL TGK GGL TTK GAJ GCL AAK GGL QRS GAJ GAJ GAJ ATM GTL1008 321 Asn Ile Thr Cys Gly Phe Glu Ala Asn Gly Ser Glu Glu Glu Ile Val 336 1009 GCL QRS ATG ATM WGZ TTK ATG ACL CAJ GTL GCL CCL TTK XTY AAJ GAK1056 337 Ala Ser Met Gly Arg Phe Met Thr Gln Val Ala Pro Phe Leu Lys Asp 352 1057 CCL QRS *** 353 Pro Ser (ただし、塩基の3文字連鎖は、左側に5′末端を、右
側に3′末端を表わしている。この文字はヌクレオチド
配列を形成するプリン又はピリミジン塩基を表わす。ま
た、 A:アデニン、 G:グアニン、 C:シトシン、 J:AもしくはG、 K:TもしくはC、 L:A,T,CもしくはG、 M:A,CもしくはT、 T:チミン、 X:YがAもしくはGの場合はTまたはC、或いはYが
CもしくはTの場合はC、 Y:XがCの場合はA,G,CまたはT、或いはXがT
の場合はAまたはG、 W:ZがCもしくはTの場合はCまたはA、或いはZが
CもしくはTの場合はC、 Z:WがGの場合はA,G,CまたはT、或いはWがA
の場合はAまたはG、 GR:SがA,G,CまたはTの場合はTC、***は
TAA,TAGもしくはTGAを表す。)
【0025】配列番号:2 配列の長さ:984 配列の型:核酸 鎖の数:1 トポロジー:直鎖 配列の種類:ゲノムDNA 起源 生物名:Alteromonas hanedai 株名:ATCC33224 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E
【0026】 配列 1 ATG AAJ TTK GGL XTY TTK TTK XTY AAK TTK CAJ XTY GAK GGL ATG ACL 48 1 Met Lys Phe Gly Leu Phe Phe Leu Asn Phe Gln Leu Asp Gly Met Thr 16 49 QRS GAJ AAK ACL XTY GAK AAK ATG GTL QRS ATG GTL QRS XTY GTL GAK 96 17 Ser Glu Asn Thr Leu Asp Asn Met Val Ser Met Val Ser Leu Val Asp 32 97 GCL GAK GAJ TAK CAK TTK GAK ACL GTL XTY ATM TAK GAJ CAK CAK TTK 144 33 Ala Asp Glu Tyr His Phe Asp Thr Val Leu Ile Tyr Glu His His Phe 48 145 QRS AAJ QRS GGL ATM ATM GCL QRS CCL ATM ACL GCL GCL GGL TTK XTY 192 49 Ser Lys Ser Gly Ile Ile Ala Ser Pro Ile Thr Ala Ala Gly Phe Leu 64 193 XTY GGL XTY ACL AAK WGZ XTY CAK ATM GGL QRS XTY AAK CAJ GTL ATM 240 65 Leu Gly Leu Thr Asn Arg Leu His Ile Gly Ser Leu Asn Gln Val Ile 80 241 ACL ACL CAK CAK CCL GTL WGZ GTL GCL GAJ GAJ QRS QRS XTY XTY GAK 288 81 Thr Thr His His Pro Val Arg Val Ala Glu Glu Ser Ser Leu Leu Asp 96 289 CAJ ATG QRS GAJ GGL WGZ TTK ATM XTY GGL TTK QRS AAK QRS GAJ AAK 336 97 Gln Met Ser Glu Gly Arg Phe Ile Leu Gly Phe Ser Asn Ser Glu Asn 112 337 GAK TTK GAJ ATG GAK TTK TTK AAJ WGZ AAK XTY GCL QRS WGZ CAJ CAJ 384 113 Asp Phe Glu Met Asp Phe Phe Lys Arg Asn Leu Ala Ser Arg Gln Gln 128 385 CAJ TTK GAJ GCL TGK TAK GAK ATM ATM AAK GAJ GCL XTY ACL ACL GGL 432 129 Gln Phe Glu Ala Cys Tyr Asp Ile Ile Asn Glu Ala Leu Thr Thr Gly 144 433 TAK TGK CAK CCL CAJ AAK GAK TTK TAK GAK TTK CCL AAJ GTL QRS ATM 480 145 Tyr Cys His Pro Gln Asn Asp Phe Tyr Asp Phe Pro Lys Val Ser Ile 160 481 AAK CCL CAK TGK TTK QRS AAJ AAK GGL CCL AAJ CAJ TAK GTL GTL GCL 528 161 Asn Pro His Cys Phe Ser Lys Asn Gly Pro Lys Gln Tyr Val Val Ala 176 529 ACL QRS AAJ QRS GTL GTL GAJ TGG GCL GCL AAJ AAK GCL XTY QRS XTY 576 177 Thr Ser Lys Ser Val Val Glu Trp Ala Ala Lys Asn Ala Leu Ser Leu 192 577 ACL TTK AAJ TGG GAK GAK QRS XTY GCL GAK AAJ GAJ QRS TAK GCL ATG 624 193 Thr Phe Lys Trp Asp Asp Ser Leu Ala Asp Lys Glu Ser Tyr Ala Met 208 625 XTY TAK AAK GAJ ATM GCL ATG WGZ TAK GGL ATM GAK ATM QRS AAK GTL 672 209 Leu Tyr Asn Glu Ile Ala Met Arg Tyr Gly Ile Asp Ile Ser Asn Val 224 673 GAJ CAK CAJ XTY ACL GTL ATM GTL AAK XTY AAK GCL GAK GGL GAK XTY 720 225 Glu His Gln Leu Thr Val Ile Val Asn Leu Asn Ala Asp Gly Asp Leu 240 721 GCL WGZ GAK GAJ GCL AAJ GGL TAK XTY AAJ AAK TAK ATM GTL GAJ ACL 768 241 Ala Arg Asp Glu Ala Lys Gly Tyr Leu Lys Asn Tyr Ile Val Glu Thr 256 769 TAK CCL GAK ATM GAK CAK GTL GCL AAJ ATM AAK QRS ATM ATM GCL GAJ 816 257 Tyr Pro Asp Ile Asp His Val Ala Lys Ile Asn Ser Ile Ile Ala Glu 272 817 AAK GCL ATM GGL ACL GAR GCL GAJ TAK TAK GAK CAJ ATM AAJ XTY GCL 864 273 Asn Ala Ile Gly Thr Asp Ala Glu Tyr Tyr Asp Gln Ile Lys Leu Ala 288 865 GTL GAJ AAJ ACL GGL GTL AAJ AAJ ATM XTY XTY QRS TTK GAJ QRS ATG 912 289 Val Glu Lys Thr Gly Val Lys Lys Ile Leu Leu Ser Phe Glu Ser Met 304 913 AAJ GAK QRS AAK GAK GTL AAJ AAK ATM ATM AAK ATG GCL AAK GAK AAJ 960 305 Lys Asp Ser Asn Asp Val Lys Asn Ile Ile Asn Met Ala Asn Asp Lys 320 961 ATM QRS AAJ AAK ATM AAJ GCL *** 321 Ile Ser Lys Asn Ile Lys Ala (ただし、塩基の3文字連鎖は、左側に5′末端を、右
側に3′末端を表わしている。この文字はヌクレオチド
配列を形成するプリン又はピリミジン塩基を表わす。ま
た、 A:アデニン、 G:グアニン、 C:シトシン、 J:AもしくはG、 K:TもしくはC、 L:A,T,CもしくはG、 M:A,CもしくはT、 T:チミン、 X:YがAもしくはGの場合はTまたはC、或いはYが
CもしくはTの場合はC、 Y:XがCの場合はA,G,CまたはT、或いはXがT
の場合はAまたはG、 W:ZがCもしくはTの場合はCまたはA、或いはZが
CもしくはTの場合はC、 Z:WがGの場合はA,G,CまたはT、或いはWがA
の場合はAまたはG、 GR:SがA,G,CまたはTの場合はTC、***は
TAA,TAGもしくはTGAを表す。)
【0027】配列番号:3 配列の長さ:1065 配列の型:核酸 鎖の数:1 トポロジー:直鎖 配列の種類:ゲノムDNA 起源 生物名:Alteromonas hanedai 株名:ATCC33224 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E
【0028】 配列 1 ATG AAG TTC GGA AAT ATT TGT TTT TCA TAT CAA CCG CCT GGT GAG ACT 48 1 Met Lys Phe Gly Asn Ile Cys Phe Ser Tyr Gln Pro Pro Gly Glu Thr 16 49 CAT AAA CAG GTA ATG GAT CGT TTT ATT CGA CTT GGC GTT GCT TCG GAA 96 17 His Lys Gln Val Met Asp Arg Phe Ile Arg Leu Gly Val Ala Ser Glu 32 97 GAA CTT GGC TTT GAT ACA TAC TGG ACT CTG GAG CAC CAT TTT ACT GAG 144 33 Glu Leu Gly Phe Asp Thr Tyr Trp Thr Leu Glu His His Phe Thr Glu 48 145 TTC GGT CTT ACT GGT AAC CTT TTT GTT GCT GCA GCA AAT CTA CTT GGC 192 49 Phe Gly Leu Thr Gly Asn Leu Phe Val Ala Ala Ala Asn Leu Leu Gly 64 193 CGA ACT AAA ACA CTG CAA GTT GGG ACG ATG GGG GTT GTA CTC CCT ACA 240 65 Arg Thr Lys Thr Leu Gln Val Gly Thr Met Gly Val Val Leu Pro Thr 80 241 GCT CAT CCA GTT CGA CAA CTA GAA GAT GTA TTG TTA TTG GAT CAA ATG 288 81 Ala His Pro Val Arg Gln Leu Glu Asp Val Leu Leu Leu Asp Gln Met 96 289 TCT AAA GGT CGT TTT AAT TTT GGC GTT GTT CGA GGT TTA TAC CAT AAA 336 97 Ser Lys Gly Arg Phe Asn Phe Gly Val Val Arg Gly Leu Tyr His Lys 112 337 GAT TTC AGG GTA TTT GGC GTC AAT ATG GAA GAC TCA CGC GGG ATA ACT 384 113 Asp Phe Arg Val Phe Gly Val Asn Met Gly Asp Ser Arg Gly Ile Thr 128 385 CAA AGC TTC CAT ACC ATG ATC ATT GAT GGC GTA AAA ACG GGA CGT ATA 432 129 Gln Ser Phe His Thr Met Ile Ile Asp Gly Val Lys Thr Gly Arg Ile 144 433 AGC TCA GAT GGG GAA CAT ATA GAG TTC CCA GAA GTT GAG GTA TAT CCA 480 145 Ser Ser Asp Gly Glu His Ile Glu Phe Pro Glu Val Glu Val Tyr Pro 160 481 ACA GCT TAT TCA AAG GAG CTC CCA ACG TGT ATG ACA GCG GAG TCA GCT 528 161 Thr Ala Tyr Ser Lys Glu Leu Pro Thr Cys Met Thr Ala Glu Ser Ala 176 529 AGC ACA ACG GAG TGG TTA GCT GAG CGG GGA TTG CCA ATG GTG CTT AGC 576 177 Ser Thr Thr Glu Trp Leu Ala Glu Arg Gly Leu Pro Met Val Leu Ser 192 577 TGG ATA ATT GGA ACC AAC GAG AAA AAA GCG CAA ATG GAA CTT TAT AAT 624 193 Trp Ile Ile Gly Thr Asn Glu Lys Lys Ala Gln Met Glu Leu Tyr Asn 208 625 GAA ATT GCG ATA GAG CAT GGT CAT GAT ATT ACT AAG ATT GAT CAT TGT 672 209 Glu Ile Ala Ile Glu His Gly His Asp Ile Thr Lys Ile Asp His Cys 224 673 ATG ACA TTT ATA TGC TCA GTG GAT AAT GAT AGT AAT AAG GCA CGT GAT 720 225 Met Thr Phe Ile Cys Ser Val Asp Asn Asp Ser Asn Lys Ala Arg Asp 240 721 GTA TGC CGT GCT TTT CTT GCT AAT TGG TAT GAC TCT TAT GTT AAT GCT 768 241 Val Cys Arg Ala Phe Leu Ala Asn Trp Tyr Asp Ser Tyr Val Asn Ala 256 769 ACC AAC ATA TTC AAT GAT AGC AAC CAA ACT CGT GGC TAT GAC TAT CAC 816 257 Thr Asn Ile Phe Asn Asp Ser Asn Gln Thr Arg Gly Tyr Asp Tyr His 272 817 AAA GGT CAG TGG AGA GAT TTT GTA CTA AAA GGT CAT ACA AAT AGC AAC 864 273 Lys Gly Gln Trp Arg Asp Phe Val Leu Lys Gly His Thr Asn Ser Asn 288 865 AGA CGT GTT GAT TAC AGT AAT GAA ATT AAC CCT GTA GGC ACA CCT GAA 912 289 Arg Arg Val Asp Tyr Ser Asn Glu Ile Asn Pro Val Gly Thr Pro Glu 304 913 GAA TGT ATT TCA ATT ATT CAA CGT GAC ATT GAT GCG ACC GGT ATT ACT 960 305 Glu Cys Ile Ser Ile Ile Gln Arg Asp Ile Asp Ala Thr Gly Ile Thr 320 961 AAT ATC ACC TGT GGG TTT GAA GCA AAT GGT AGT GAA GAG GAA ATA GTG1008 321 Asn Ile Thr Cys Gly Phe Glu Ala Asn Gly Ser Glu Glu Glu Ile Val 336 1009 GCT TCT ATG GGA CGG TTT ATG ACA CAA GTG GCT CCT TTT TTG AAA GAC1056 337 Ala Ser Met Gly Arg Phe Met Thr Gln Val Ala Pro Phe Leu Lys Asp 352 1057 CCT AGC TAG 353 Pro Ser ***
【0029】配列番号:4 配列の長さ:984 配列の型:核酸 鎖の数:1 トポロジー:直鎖 配列の種類:ゲノムDNA 起源 生物名:Alteromonas hanedai 株名:ATCC33224 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E
【0030】 配列 1 ATG AAA TTT GGA TTG TTT TTC CTC AAC TTT CAG CTA GAT GGT ATG ACT 48 1 Met Lys Phe Gly Leu Phe Phe Leu Asn Phe Gln Leu Asp Gly Met Thr 16 49 TCA GAA AAC ACT TTA GAT AAT ATG GTG AGC ATG GTG TCT CTT GTT GAT 96 17 Ser Glu Asn Thr Leu Asp Asn Met Val Ser Met Val Ser Leu Val Asp 32 97 GCT GAT GAA TAT CAT TTT GAT ACA GTA CTC ATA TAC GAA CAT CAT TTT 144 33 Ala Asp Glu Tyr His Phe Asp Thr Val Leu Ile Tyr Glu His His Phe 48 145 TCT AAA AGT GGC ATT ATA GCT TCA CCT ATT ACA GCG GCT GGT TTT TTA 192 49 Ser Lys Ser Gly Ile Ile Ala Ser Pro Ile Thr Ala Ala Gly Phe Leu 64 193 CTT GGA TTG ACT AAT AGG CTG CAT ATT GGC TCT TTA AAT CAA GTT ATT 240 65 Leu Gly Leu Thr Asn Arg Leu His Ile Gly Ser Leu Asn Gln Val Ile 80 241 ACA ACT CAC CAT CCA GTA CGT GTT GCC GAG GAA TCA AGT TTA TTA GAC 288 81 Thr Thr His His Pro Val Arg Val Ala Glu Glu Ser Ser Leu Leu Asp 96 289 CAG ATG TCT GAA GGT CGT TTC ATT CTG GGA TTC AGC AAT AGT GAA AAC 336 97 Gln Met Ser Glu Gly Arg Phe Ile Leu Gly Phe Ser Asn Ser Glu Asn 112 337 GAC TTT GAA ATG GAT TTC TTT AAA CGT AAT TTA GCA TCT CGG CAA CAG 384 113 Asp Phe Glu Met Asp Phe Phe Lys Arg Asn Leu Ala Ser Arg Gln Gln 128 385 CAA TTT GAA GCT TGT TAT GAC ATC ATT AAT GAG GCG TTG ACG ACT GGA 432 129 Gln Phe Glu Ala Cys Tyr Asp Ile Ile Asn Glu Ala Leu Thr Thr Gly 144 433 TAT TGC CAC CCT CAA AAT GAT TTT TAC GAT TTC CCT AAA GTG TCA ATA 480 145 Tyr Cys His Pro Gln Asn Asp Phe Tyr Asp Phe Pro Lys Val Ser Ile 160 481 AAC CCA CAT TGT TTT AGT AAA AAT GGG CCT AAG CAG TAT GTA GTA GCA 528 161 Asn Pro His Cys Phe Ser Lys Asn Gly Pro Lys Gln Tyr Val Val Ala 176 529 ACA AGT AAA AGT GTC GTT GAA TGG GCC GCT AAA AAT GCA TTG TCT CTG 576 177 Thr Ser Lys Ser Val Val Glu Trp Ala Ala Lys Asn Ala Leu Ser Leu 192 577 ACG TTT AAA TGG GAT GAT AGT CTT GCA GAT AAA GAA AGT TAT GCA ATG 624 193 Thr Phe Lys Trp Asp Asp Ser Leu Ala Asp Lys Glu Ser Tyr Ala Met 208 625 CTT TAT AAT GAA ATT GCG ATG CGT TAT GGT ATT GAC ATT TCA AAT GTA 672 209 Leu Tyr Asn Glu Ile Ala Met Arg Tyr Gly Ile Asp Ile Ser Asn Val 224 673 GAG CAC CAA CTT ACA GTC ATT GTC AAT TTG AAT GCT GAT GGT GAT TTA 720 225 Glu His Gln Leu Thr Val Ile Val Asn Leu Asn Ala Asp Gly Asp Leu 240 721 GCT CGC GAT GAA GCT AAG GGG TAC TTG AAA AAC TAT ATT GTT GAA ACA 768 241 Ala Arg Asp Glu Ala Lys Gly Tyr Leu Lys Asn Tyr Ile Val Glu Thr 256 769 TAT CCA GAC ATC GAT CAT GTG GCT AAA ATA AAT TCA ATC ATT GCA GAG 816 257 Tyr Pro Asp Ile Asp His Val Ala Lys Ile Asn Ser Ile Ile Ala Glu 272 817 AAC GCG ATT GGT ACT GAT GCC GAG TAT TAT GAC CAA ATT AAA CTA GCA 864 273 Asn Ala Ile Gly Thr Asp Ala Glu Tyr Tyr Asp Gln Ile Lys Leu Ala 288 865 GTT GAA AAA ACA GGA GTT AAA AAA ATT CTG TTA TCA TTT GAA TCC ATG 912 289 Val Glu Lys Thr Gly Val Lys Lys Ile Leu Leu Ser Phe Glu Ser Met 304 913 AAG GAT TCA AAT GAT GTT AAA AAT ATT ATT AAT ATG GCA AAT GAC AAA 960 305 Lys Asp Ser Asn Asp Val Lys Asn Ile Ile Asn Met Ala Asn Asp Lys 320 961 ATA TCT AAA AAT ATT AAG GCA TAG 321 Ile Ser Lys Asn Ile Lys Ala ***
【0031】配列番号:5 配列の長さ:2124 配列の型:核酸 鎖の数:1 トポロジー:直鎖 配列の種類:ゲノムDNA 起源 生物名:Alteromonas hanedai 株名:ATCC33224 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:38−1102,1141−2124 特徴を決定した方法:E
【0032】 配列 10 20 30 40 50 5'-TAGTCTATCC CGGTTATATA AAATAAAGGA AATAATTATG AAGTTCGGAA 60 70 80 90 100 ATATTTGTTT TTCATATCAA CCGCCTGGTG AGACTCATAA ACAGGTAATG 110 120 130 140 150 GATCGTTTTA TTCGACTTGG CGTTGCTTCG GAAGAACTTG GCTTTGATAC 160 170 180 190 200 ATACTGGACT CTGGAGCACC ATTTTACTGA GTTCGGTCTT ACTGGTAACC 210 220 230 240 250 TTTTTGTTGC TGCAGCAAAT CTACTTGGCC GAACTAAAAC ACTGCAAGTT 260 270 280 290 300 GGGACGATGG GGGTTGTACT CCCTACAGCT CATCCAGTTC GACAACTAGA 310 320 330 340 350 AGATGTATTG TTATTGGATC AAATGTCTAA AGGTCGTTTT AATTTTGGCG 360 370 380 390 400 TTGTTCGAGG TTTATACCAT AAAGATTTCA GGGTATTTGG CGTCAATATG 410 420 430 440 450 GAAGACTCAC GCGGGATAAC TCAAAGCTTC CATACCATGA TCATTGATGG 460 470 480 490 500 CGTAAAAACG GGACGTATAA GCTCAGATGG GGAACATATA GAGTTCCCAG 510 520 530 540 550 AAGTTGAGGT ATATCCAACA GCTTATTCAA AGGAGCTCCC AACGTGTATG 560 570 580 590 600 ACAGCGGAGT CAGCTAGCAC AACGGAGTGG TTAGCTGAGC GGGGATTGCC 610 620 630 640 650 AATGGTGCTT AGCTGGATAA TTGGAACCAA CGAGAAAAAA GCGCAAATGG 660 670 680 690 700 AACTTTATAA TGAAATTGCG ATAGAGCATG GTCATGATAT TACTAAGATT 710 720 730 740 750 GATCATTGTA TGACATTTAT ATGCTCAGTG GATAATGATA GTAATAAGGC 760 770 780 790 800 ACGTGATGTA TGCCGTGCTT TTCTTGCTAA TTGGTATGAC TCTTATGTTA 810 820 830 840 850 ATGCTACCAA CATATTCAAT GATAGCAACC AAACTCGTGG CTATGACTAT 860 870 880 890 900 CACAAAGGTC AGTGGAGAGA TTTTGTACTA AAAGGTCATA CAAATAGCAA 910 920 930 940 950 CAGACGTGTT GATTACAGTA ATGAAATTAA CCCTGTAGGC ACACCTGAAG 960 970 980 990 1000 AATGTATTTC AATTATTCAA CGTGACATTG ATGCGACCGG TATTACTAAT 1010 1020 1030 1040 1050 ATCACCTGTG GGTTTGAAGC AAATGGTAGT GAAGAGGAAA TAGTGGCTTC 1060 1070 1080 1090 1100 TATGGGACGG TTTATGACAC AAGTGGCTCC TTTTTTGAAA GACCCTAGCT 1110 1120 1130 1140 1150 AGTCATTAAT ACATTTAATT AAATATAGTA AGGAAATATT ATGAAATTTG 1160 1170 1180 1190 1200 GATTGTTTTT CCTCAACTTT CAGCTAGATG GTATGACTTC AGAAAACACT 1210 1220 1230 1240 1250 TTAGATAATA TGGTGAGCAT GGTGTCTCTT GTTGATGCTG ATGAATATCA 1260 1270 1280 1290 1300 TTTTGATACA GTACTCATAT ACGAACATCA TTTTTCTAAA AGTGGCATTA 1310 1320 1330 1340 1350 TAGCTTCACC TATTACAGCG GCTGGTTTTT TACTTGGATT GACTAATAGG 1360 1370 1380 1390 1400 CTGCATATTG GCTCTTTAAA TCAAGTTATT ACAACTCACC ATCCAGTACG 1410 1420 1430 1440 1450 TGTTGCCGAG GAATCAAGTT TATTAGACCA GATGTCTGAA GGTCGTTTCA 1460 1470 1480 1490 1500 TTCTGGGATT CAGCAATAGT GAAAACGACT TTGAAATGGA TTTCTTTAAA 1510 1520 1530 1540 1550 CGTAATTTAG CATCTCGGCA ACAGCAATTT GAAGCTTGTT ATGACATCAT 1560 1570 1580 1590 1600 TAATGAGGCG TTGACGACTG GATATTGCCA CCCTCAAAAT GATTTTTACG 1610 1620 1630 1640 1650 ATTTCCCTAA AGTGTCAATA AACCCACATT GTTTTAGTAA AAATGGGCCT 1660 1670 1680 1690 1700 AAGCAGTATG TAGTAGCAAC AAGTAAAAGT GTCGTTGAAT GGGCCGCTAA 1710 1720 1730 1740 1750 AAATGCATTG TCTCTGACGT TTAAATGGGA TGATAGTCTT GCAGATAAAG 1760 1770 1780 1790 1800 AAAGTTATGC AATGCTTTAT AATGAAATTG CGATGCGTTA TGGTATTGAC 1810 1820 1830 1840 1850 ATTTCAAATG TAGAGCACCA ACTTACAGTC ATTGTCAATT TGAATGCTGA 1860 1870 1880 1890 1900 TGGTGATTTA GCTCGCGATG AAGCTAAGGG GTACTTGAAA AACTATATTG 1910 1920 1930 1940 1950 TTGAAACATA TCCAGACATC GATCATGTGG CTAAAATAAA TTCAATCATT 1960 1970 1980 1990 2000 GCAGAGAACG CGATTGGTAC TGATGCCGAG TATTATGACC AAATTAAACT 2010 2020 2030 2040 2050 AGCAGTTGAA AAAACAGGAG TTAAAAAAAT TCTGTTATCA TTTGAATCCA 2060 2070 2080 2090 2100 TGAAGGATTC AAATGATGTT AAAAATATTA TTAATATGGC AAATGACAAA 2110 2120 2130 2140 2150 ATATCTAAAA ATATTAAGGC ATAG-3'
【0033】配列番号:6 配列の長さ:354 配列の型:アミノ酸 配列の種類:タンパク質
【0034】 配列 10 N- Met Lys Phe Gly Asn Ile Cys Phe Ser Tyr Gln Pro Pro Gly Glu Thr 20 30 His Lys Gln Val Met Asp Arg Phe Ile Arg Leu Gly Val Ala Ser Glu 40 Glu Leu Gly Phe Asp Thr Tyr Trp Thr Leu Glu His His Phr Thr Glu 50 60 Phe Gly Leu Thr Gly Asn Leu Phe Val Ala Ala Ala Asn Leu Leu Gly 70 80 Arg Thr Lys Thr Leu Gln Val Gly Thr Met Gly Val Val Leu Pro Thr 90 Ala His Pro Val Arg Gln Leu Glu Asp Val Leu Leu Leu Asp Gln Met 100 110 Ser Lys Gly Arg Phe Asn Phe Gly Val Val Arg Gly Leu Tyr His Lys 120 Asp Phe Arg Val Phe Gly Val Asn Met Glu Asp Ser Arg Gly Ile Thr 130 140 Gln Ser Phe His Thr Met Ile Ile Asp Gly Val Lys Thr Gly Arg Ile 150 160 Ser Ser Asp Gly Glu His Ile Glu Phe Pro Glu Val Glu Val Tyr Pro 170 Thr Ala Tyr Ser Lys Glu Leu Pro Thr Cys Met Thr Ala Glu Ser Ala 180 190 Ser Thr Thr Glu Trp Leu Ala Glu Arg Gly Leu Pro Met Val Leu Ser 200 Trp Ile Ile Gly Thr Asn Glu Lys Lys Ala Gln Met Glu Leu Tyr Asn 210 220 Glu Ile Ala Ile Glu His Gly His Asp Ile Thr Lys Ile Asp His Cys 230 240 Met Thr Phe Ile Cys Ser Val Asp Asn Asp Ser Asn Lys Ala Arg Asp 250 Val Cys Arg Ala Phe Leu Ala Asn Trp Tyr Asp Ser Tyr Val Asn Ala 260 270 Thr Asn Ile Phe Asn Asp Ser Asn Gln Thr Arg Gly Tyr Asp Tyr His 280 Lys Gly Gln Trp Arg Asp Phe Val Leu Lys Gly His Thr Asn Ser Asn 290 300 Arg Arg Val Asp Tyr Ser Asn Glu Ile Asn Pro Val Gly Thr Pro Glu 310 320 Glu Cys Ile Ser Ile Ile Gln Arg Asp Ile Asp Ala Thr Gly Ile Thr 330 Asn Ile Thr Cys Gly Phe Glu Ala Asn Gly Ser Glu Glu Glu Ile Val 340 350 Ala Ser Met Gly Arg Phe Met Thr Gln Val Ala Pro Phe Leu Lys Asp Pro Ser *** -C
【0035】配列番号:7 配列の長さ:327 配列の型:アミノ酸 配列の種類:タンパク質
【0036】 配列 10 N- Met Lys Phe Gly Leu Phe Phe Leu Asn Phe Gln Leu Asp Gly Met Thr 20 30 Ser Glu Asn Thr Leu Asp Asn Met Val Ser Met Val Ser Leu Val Asp 40 Ala Asp Glu Tyr His Phe Asp Thr Val Leu Ile Tyr Glu His His Phe 50 60 Ser Lys Ser Gly Ile Ile Ala Ser Pro Ile Thr Ala Ala Gly Phe Leu 70 80 Leu Gly Leu Thr Asn Arg Leu His Ile Gly Ser Leu Asn Gln Val Ile 90 Thr Thr His His Pro Val Arg Val Ala Glu Glu Ser Ser Leu Leu Asp 100 110 Gln Met Ser Glu Gly Arg Phe Ile Leu Gly Phe Ser Asn Ser Glu Asn 120 Asp Phe Glu Met Asp Phe Phe Lys Arg Asn Leu Ala Ser Arg Gln Gln 130 140 Gln Phe Glu Ala Cys Tyr Asp Ile Ile Asn Glu Ala Leu Thr Thr Gly 150 160 Tyr Cys His Pro Gln Asn Asp Phe Tyr Asp Phe Pro Lys Val Ser Ile 170 Asn Pro His Cys Phe Ser Lys Asn Gly Pro Lys Gln Tyr Val Val Ala 180 190 Thr Ser Lys Ser Val Val Glu Trp Ala Ala Lys Asn Ala Leu Ser Leu 200 Thr Phe Lys Trp Asp Asp Ser Leu Ala Asp Lys Glu Ser Tyr Ala Met 210 220 Leu Tyr Asn Glu Ile Ala Met Arg Tyr Gly Ile Asp Ile Ser Asn Val 230 240 Glu His Gln Leu Thr Val Ile Val Asn Leu Asn Ala Asp Gly Asp Leu 250 Ala Arg Asp Glu Ala Lys Gly Tyr Leu Lys Asn Tyr Ile Val Glu Thr 260 270 Tyr Pro Asp Ile Asp His Val Ala Lys Ile Asn Ser Ile Ile Ala Glu 280 Asn Ala Ile Gly Thr Asp Ala Glu Tyr Tyr Asp Gln Ile Lys Leu Ala 290 300 Val Glu Lys Thr Gly Val Lys Lys Ile Leu Leu Ser Phe Glu Ser Met 310 320 Lys Asp Ser Asn Asp Val Lys Asn Ile Ile Asn Met Ala Asn Asp Lys Ile Ser Lys Asn Ile Lys Ala *** -C
【図面の簡単な説明】
【図1】細菌ルシフェラーゼαサブユニットの保存され
たアミノ酸配列と合成オリゴヌクレオチド・プライマ
ー。
【図2】本発明の酵素遺伝子の制限酵素地図を示す。矢
印で示したところが、酵素の構造遺伝子部分に相当す
る。 B BamHI X XbaI H HindIII S SalI luxA ルシフェラーゼαサブユニット遺伝子 luxB ルシフェラーゼβサブユニット遺伝子 矢印の方向は、転写の方向を示す。
【図3】本発明に係る発光細菌のルシフェラーゼ遺伝子
を含有する本発明の発現ベクターpALF1の構築工程
を示す。矢印はルシフェラーゼ遺伝子のコーディング領
域である。ボックスは大腸菌のラクトースオペロンのプ
ロモーター部分を示す。 luxA ルシフェラーゼαサブユニット遺伝子 luxB ルシフェラーゼβサブユニット遺伝子 lacP ラクトースオペロンのプロモーター 矢印の方向は、転写の方向を示す。
【符号の説明】 lacP ラクトースオペロンのプロモーター pUC13 プラスミド・ベクター pAH18 組換えベクター pALF1 発現ベクター BamHI 制限酵素 XbaI 制限酵素 HindIII 制限酵素 EcoRI 制限酵素 SalI 制限酵素
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 //(C12N 15/09 ZNA C12R 1:01) (C12N 1/21 C12R 1:19) (C12N 9/02 C12R 1:19) C12R 1:01)

Claims (11)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号1で表される塩基配列を含む、
    ルシフェラーゼ アルファ サブユニットの遺伝子。 【配列表1】
  2. 【請求項2】 配列番号2で表される塩基配列を含む、
    ルシフェラーゼ ベータ サブユニットの遺伝子。 【配列表2】
  3. 【請求項3】 配列番号3で表される塩基配列を含む請
    求項1記載のルシフェラーゼ アルファ サブユニット
    の遺伝子。 【配列表3】
  4. 【請求項4】 配列番号4で表される塩基配列を含む請
    求項2記載のルシフェラーゼ ベータ サブユニットの
    遺伝子。 【配列表4】
  5. 【請求項5】 塩基配列が配列番号5で表されるルシフ
    ェラーゼ遺伝子。 【配列表5】
  6. 【請求項6】 配列番号6で表されるアミノ酸配列を有
    するルシフェラーゼアルファ サブユニット。 【配列表6】
  7. 【請求項7】 配列番号7で表されるアミノ酸配列を有
    するルシフェラーゼベータ サブユニット。 【配列表7】
  8. 【請求項8】 塩基配列が配列番号1および配列番号2
    で表されるDNAを有する組換えベクター。
  9. 【請求項9】 配列番号3および配列番号4で表される
    塩基配列を有する遺伝子がプラスミドベクターへ挿入さ
    れた請求項8記載の組換えベクター。
  10. 【請求項10】 配列番号1および配列番号2で表され
    る塩基配列を有するDNAを含む組換えベクターを含有
    する細菌。
  11. 【請求項11】 塩基配列が配列番号1および配列番号
    2で表されるDNAを含む組換えベクターで修飾されて
    なる細菌を培養することからなる配列番号6および配列
    番号7で表されるアミノ酸配列を含む酵素の製法。
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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1925320A2 (en) 1998-03-27 2008-05-28 Prolume, Ltd. Luciferases, fluorescent proteins, nucleic acids encoding the luciferases and fluorescent proteins and the use thereof in diagnostics
WO2019081620A1 (en) * 2017-10-25 2019-05-02 Roche Diagnostics Gmbh IMPROVED MODIFIED / MUTANT BACTERIAL LUCIFERASES

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