JP2534968B2 - フラビン還元酵素遺伝子 - Google Patents
フラビン還元酵素遺伝子Info
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Description
cens由来のフラビン還元酵素遺伝子、酵素、該遺伝子を
含む組換えベクター、および該組換えベクターを含有す
る細菌に関する。
は、還元型フラビンモノヌクレオチド(以下FMNH2
という)と長鎖脂肪族アルデヒドを基質として、酸素の
存在下、酸化型フラビンモノヌクレオチド(以下FMN
という)と長鎖カルボン酸とを生成し、その際に青色に
発光する反応を触媒する。細胞内において、この反応に
用いられる基質FMNH2 は、還元型ニコチンアミドア
デニンジヌクレオチド:フラビンモノヌクレオチド(N
ADH:FMN)還元酵素および還元型ニコチンアミド
アデニンジヌクレオチドリン酸:フラビンモノヌクレオ
チド(NADPH:FMN)還元酵素により、また長鎖
脂肪族アルデヒドは脂肪酸還元酵素複合体により供給さ
れる。最近、Spyrouらは、大腸菌からフラビン還元酵素
遺伝子を単離し、その一次構造を明らかにし、〔Spyro
u,G.,Haggard-Ljungquist,E.,Krook,M.,Jornvall,H.,Ni
lsson,E.,& Reichard,P.(1991)J.Bacteriol.173 3673-3
679〕に開示している。我々も、発光細菌 Vibrio fisch
eriのFMN還元酵素遺伝子をすでに単離し、その塩基
配列を決定した。さらに本遺伝子を大腸菌内に発現する
ことに成功している。[特願平03−351,717]
しかしながら、未だ発光細菌 Xenorhabdus luminescens
由来のフラビン還元酵素遺伝子の単離、および大腸菌で
の発現については報告されていない。FMNH2 は空気
中でたやすく、即時に自動酸化され、FMNに変換され
る。細菌ルシフェラーゼの発光能力を最大限に発揮させ
るためには、基質であるこのFMNH2 を常時供給し続
ける必要がある。その目的を達成するのに、最も大切な
のがFMN還元酵素である。この酵素は上述のように、
細菌ルシフェラーゼと共役し、ルシフェラーゼ反応の生
成物であるFMNをFMNH2 に変換する反応を触媒す
る為、反応系の中にルシフェラーゼとFMN還元酵素を
共存させることにより、発光反応を持続させることがで
きる。すなわち、細菌ルシフェラーゼが何回もターンオ
ーバーするため、大過剰の長鎖アルデヒドが反応系に存
在する限り、発光しつづける。以上のように、FMN還
元酵素は細菌ルシフェラーゼを最大限に生かす為に必須
であり、その遺伝子の取得により、大量に本酵素を調製
することが可能になる。
究の結果、発光細菌 Xenorhabdus luminescens(ATCC 2
9999)からフラビン還元酵素遺伝子を単離し、その一次
構造を明らかにすることに成功し、また該遺伝子を大量
に発現する大腸菌を作出することに成功し、本発明を完
成するに至った。すなわち、本発明の目的は上述の技術
的事情にかんがみ、発光細菌 Xenorhabdus luminescens
のフラビン還元酵素遺伝子および酵素を提供することで
あり、さらに該遺伝子を含む組換えベクター、および該
組換えベクターを含む細菌を提供することである。
〜(8)の構成を有する。
む、フラビン還元酵素遺伝子。
む前記第(1)項記載のフラビン還元酵素遺伝子。
ラビン還元酵素遺伝子。
を有するフラビン還元酵素。
NAを含有する組換えベクター。
する遺伝子がプラスミドベクターへ挿入された前記第
(5)項記載の組換えベクター。
するDNAを含む組換えベクターを含有する細菌。
NAを含む組換えベクターで修飾されてなる細菌を培養
することからなる配列番号4で表されるアミノ酸配列を
含む酵素の製法。
る。本発明の酵素遺伝子は、配列番号1で表される配列
の長さ702のヌクレオチド鎖を含むのが特徴である。
好ましく示す配列としては配列番号2で表されるヌクレ
オチド鎖を含む。塩基配列が配列番号3で表される配列
の長さが1225のDNAであるが具体的に示すことが
できる。配列の種類は Genomic DNAであり、発光細
菌 Xenorhabdus luminescens(ATCC 29999)から単離さ
れるものである。その配列の特徴は塩基、塩基番号53
から751までの233個のアミノ酸からなる分子量2
6439の蛋白質をコードしている。本発明の酵素遺伝
子産物は、フラビン還元活性を有し、たとえば、FMN
還元活性を有するものである。本発明の酵素は、配列番
号1、2および3の塩基配列から予測される配列番号4
で表されるアミノ酸配列を有する蛋白質である。その蛋
白質は233個のアミノ酸からなり分子量26439の
ものであり、発光細菌中でフラビン還元活性を有する。
列番号1で表されるDNAを含有する。すなわち、本発
明の組換えベクターは、配列番号2で表される塩基配列
を有するDNAと、機能的同等物を含む。「機能的同等
物」とは適当な宿主による発光細菌のFMN還元活性を
有する酵素の産生において、実質的に同じ結果を得るた
めに実質的に同じ方法で使用できるDNA断片のことで
ある。すなわち、塩基配列が異なっても、同一のアミノ
酸配列を有する蛋白をコードしえるDNA断片や若干の
塩基配列の相違に伴う若干のアミノ酸配列の違いがある
もののFMN還元活性を有する蛋白をコードしえるDN
A断片のことを意味する。具体的には配列番号1の塩基
配列や部位特異的変異導入された配列番号1の塩基配列
を示すことになる。たとえば、該塩基配列を含有するD
NA断片をプラスミドベクターへ挿入されたものであ
る。このベクターとしては、pUC( C.Yanisch-Perro
n, J.Vieira &J.Messing, Gene, 33, 110-115 [1985] )
や pIN III ( Y.Masui, J.Coleman,M.Inouye, Experim
ental Manipulation of Gene Expression(ed.M.Inouy
e)、p.15Academic Press [1983] )などが使用できる。
図3は、その組換えベクター(発現ベクター)構築工程
を示す。すなわち、還元酵素遺伝子を有するファージD
NAλXS40からインサートの一部である約4kbの
SalI断片をpUC13のSalI切断部位に挿入
し、プラスミドpXS14を得る。pXS14プラスミ
ドDNAをHpaIとSmaIで消化し、約3kbの断
片をプラスミドから排出し、再び連結することにより、
発現ベクターpXFR1を作製する。結果的に、pXF
R1はlacのプロモーターの支配下にフラビン還元酵
素遺伝子が、配置されており、フラビン還元酵素が発現
されるようになっている。
基配列を含有する組換えベクターDNAを含む。本発明
の細菌の特徴はフラビン還元活性を有する蛋白質を生産
する。
号1で表されるDNAを含む組換えベクター(発現ベク
ター)で修飾された細菌を培養し、配列番号4で表され
るアミノ酸配列を含む蛋白質を製造することである。細
菌としては、大腸菌、枯草菌など、培地としてはLB培
地、YT培地などをあげることができる。
単離とその同定に関する手順をのべる。
菌のゲノミック・サザンブロッティング解析 大腸菌C600株をLB培地で37℃、一晩振とう培養
した。10000rpmで遠心分離し集菌した後、トリ
ス塩酸・EDTA緩衝液(以下、TE緩衝液という)に
菌体を懸濁した。37℃で1時間リゾチーム処理した
後、ドデシル硫酸ナトリウム(以下SDSと略す)を添
加して50℃で3時間プロテネースK処理をした。その
後、フェノール処理を3回し、エタノール沈殿し、乾燥
した後、TE緩衝液に溶解し再度プロテネースK処理し
た。その後フェノール処理3回後エタノール沈殿しゲノ
ムDNAを回収した。Spyrouらによって明らかにされて
いる大腸菌のフラビン還元酵素遺伝子(fre)のコーディ
ング領域を図1に示す合成オリゴヌクレオチド・プライ
マーFRE1とFRE2を用いてPCR法[Saiki,R.
K., D.H.Gelfand, S.Stoffel, S.J.Scharf, R.Higuchi,
G.T.Horn, K.B.Mullis and H.A.Erlic(1988) Science
239 487]により増幅し、そのDNA断片をpUC8プ
ラスミドDNA[Hanna,Z.,Fregeau,C.,Prefontaine,
G.,Brousseau,R.(1984)Gene, 30 247 ]のHincII切
断部位に挿入した。
の決定 [Hattori,M.& Sakaki,Y.(1986) Anal.Biochem. 152 2
32]から大腸菌fre 遺伝子であることを確認した。この
プラスミドDNAから大腸菌のfre 遺伝子部分のDNA
断片をHindIII /EcoRIで切り出し、サザンブ
ロット解析のプローブDNAとして用いた。プローブD
NAの32P標識はランダム・プライミング法[Feinber
g,A.& Vogelstein,B.(1983)Anal.Biochem. 132 6 ]で
行った。発光細菌Alteromonas hanedai, Vibrio harvey
i,Vibrio fischeri, Vibrio orientalisをPhotobacteri
um培地で26℃で、発光細菌Xenorhabdus luminescens
をLB培地で37℃で、それぞれ一晩振とう培養した。
上記の大腸菌のゲノムDNAの調製法と同様にして、各
種発光細菌のゲノムDNAも調製した。それぞれのゲノ
ムDNAをEcoRIかHindIII で完全消化し、ア
ガロース・ゲル電気泳動にかけ、サザンブロット解析
[Sambrook, J.,T.Maniatis andE.F.Fritsch (1989) Mo
lecular cloning : a laboratory manual, 2nd ed. Col
dSpring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.
Y.] した。ハイブリダイゼーションに用いるフィルター
は風乾後紫外線(UV)照射しDNAを固定した後、ハ
イブリダイゼーション液{20mlの6×SET緩衝液
〔20×SET緩衝液:3MのNaCl,0.6Mのト
リス−塩酸(pH8.0),0.04MのEDTA〕、
10×Denhardt’s液(牛血清アルブミン、ポ
リビニルピロリドン、Ficollの各0.2%溶
液)、0.1%SDS、サケ精子DNA(熱変性したも
の50μg/ml)}に入れ、68℃で1時間保温し
た。さらに液を入れ替えて1時間保温後、32P−標識し
た大腸菌freのプローブを加え50℃で一晩ハイブリ
ダイゼーションした。溶液を捨てフィルターを6×SE
T緩衝液で洗浄後、6×SET緩衝液55℃20分間振
とうした。この操作を2回繰り返した後、風乾しオート
ラジオグラフィーにかけた。その結果、EcoRIでは
5.0Kb、HindIII では4.0Kbのバンドが X
enorhabdus luminescensにのみ検出された。
9)をLB培地で37℃で一晩振とう培養した。100
00rpmで遠心分離し集菌した後、トリス塩酸・ED
TA緩衝液(以下、TE緩衝液という)に菌体を懸濁し
た。37℃で1時間リゾチーム処理した後、ドデシル硫
酸ナトリウム(以下SDSと略す)を添加し50℃で3
時間プロテネースK処理をした。その後、フェノール処
理を3回しエタノール沈殿し、乾燥した後、TE緩衝液
に溶解し再度プロテネースK処理した。その後フェノー
ル処理3回後エタノール沈殿しゲノムDNAを回収し
た。このゲノムDNAの50μgに100単位の制限酵
素HindIII を37℃で作用させた。反応時間120
分で反応をEDTA(エチレンジアミン四酢酸)を加え
ることにより停止し、エタノール沈殿し回収した。それ
を少量のTE緩衝液に溶解後、アガロースゲル電気泳動
にかけ4キロベース(Kb)付近の画分をDE8lペー
パーで回収した。1MのNaClでDE8lペーパーか
ら前記画分のDNAを溶出し、フェノール処理3回後エ
タノールで沈殿した。それを約200ng/μlになる
ようにTE緩衝液に溶解した。制限酵素HindIII で
あらかじめ切断してアルカリフォスファターゼ(DNA
の5’末端の脱リン酸化を触媒する酵素)で処理された
pUCl8プラスミドDNA(プラスミドベクター)
に、前記画分のDNAをT4DNAリガーゼ(DNA鎖
どうしまたは、DNAとRNAの3’OHと5’P末端
をホスホジエステルを結合をつなぐ酵素)もって16℃
で一晩連結反応した。連結反応液をJM109大腸菌に
形質転換し得られた形質転換株を遺伝子ライブラリーと
した。
定後、プレート当り200コロニーになるようにニトロ
セルロースフィルター上にまかれた。37℃で一晩培養
しそれぞれのフィルターに対してレプリカを2枚とっ
た。2枚1組のレプリカフィルターは37℃で培養後ハ
イブリダイゼーションに用いた。フィルターは風乾後紫
外線(UV)照射しDNAを固定した後、ハイブリダイ
ゼーション液{20mlの6×SET緩衝液〔20×S
ET緩衝液:3MのNaCl,0.6Mのトリス−塩酸
(pH8.0),0.04MのEDTA〕、10×De
nhardt’s液(牛血清アルブミン、ポリビニルピ
ロリドン、Ficollの各0.2%溶液)、0.1%
SDS、サケ精子DNA(熱変性したもの50μg/m
l)}に入れ、68℃で1時間保温した。さらに液を入
れ替えて1時間保温後、32P−標識した大腸菌freの
プローブを加え50℃で一晩ハイブリダイゼーションし
た。溶液を捨てフィルターを6×SET緩衝液で洗浄
後、6×SET緩衝液55℃で20分間振とうした。こ
の操作を2回繰り返した後、風乾しオートラジオグラフ
ィーにかけた。フィルターと現像したX線フィルムを重
ねインクマーカーの位置をフィルム上に写し取った。1
枚のプレートからできた二枚のフィルム上でシグナルが
重なると同定されたコロニー(クローン)を形質転換株
100個から1つ得た。これをpXH3と名付けた。
でのサザンブロット解析での4.0Kbと同じサイズで
あった。pXH3プラスミドDNAに対して大腸菌fr
eをプローブとして各種6塩基認識制限酵素を用いて、
サザンブロット解析し、ハイブリダイゼーションする領
域を決定した。その付近をジデオキシ法[Hattori,M.&
Sakaki,Y.(1986) Anal.Biochem. 152 232]で塩基配列を
決定した。その結果、大腸菌freのコーディング領域
の3’側に対応する部分を含んでいることがわかった。
このpXH3はコーディングの5’側領域を欠いていた
ので、再度、完全鎖長クローンを単離する目的で、新た
に Sau3AI部分分解による遺伝子ライブラリーを作製
することにした。
9)をLB培地で37℃で一晩振とう培養した。100
00rpmで遠心分離し集菌した後、トリス塩酸・ED
TA緩衝液(以下、TE緩衝液という)に菌体を懸濁し
た。37℃で1時間リゾチーム処理した後、ドデシル硫
酸ナトリウム(以下SDSと略す)を添加し50℃で3
時間プロテネースK処理をした。その後、フェノール処
理を3回しエタノール沈殿し、乾燥した後、TE緩衝液
に溶解し再度プロテネースK処理した。その後フェノー
ル処理3回後エタノール沈殿しゲノムDNAを回収し
た。このゲノムDNAの50μgに10単位の制限酵素
Sau3AIを37℃で作用させた。反応時間5,1
0,20,30,45,60,90,120分で一部分
取し反応をEDTA(エチレンジアミン四酢酸)を加え
ることにより停止した。それぞれの一部をアガロースゲ
ル電気泳動にかけゲノムDNAの部分分解の度合を確認
した。各時間ごとの反応液を1本にまとめエタノール沈
殿回収した。それを少量のTE緩衝液に溶解後、アガロ
ースゲル電気泳動にかけ9〜23キロベース(Kb)の
画分を電気溶出操作で回収した。9〜23Kb画分を含
むアガロースゲルから前記9〜23Kb画分のDNAを
透析チューブ内に電気泳動的に溶出し、フェノール処理
3回後エタノールで沈殿した。それを約200ng/μ
lになるようにTE緩衝液に溶解した。制限酵素Bam
HIであらかじめ切断してアルカリフォスファターゼ
(DNAの5’末端の脱リン酸化を触媒する酵素)で処
理されたEMBL3ファージDNAに、前記9〜23K
b画分のDNAをT4DNAリガーゼ(DNA鎖どうし
または、DNAとRNAの3’OHと5’P末端をホス
ホジエステルを結合をつなぐ酵素)もって16℃で一晩
連結反応した。連結反応液をパッケージング抽出液と混
合し、22℃で2時間反応して組換えファージとした。
このファージを遺伝子ライブラリーとした。
後、プレート当り1万個のファージがプラークを形成す
るようにまき、37℃で一晩培養した。4℃に2時間放
置後、それぞれのプレートに対して、ナイロンメンブレ
ン・フィルターで2枚づつphageをトランスファー
した。フィルターを変性し、中和後、紫外線照射した。
その後は実施例3に示したように、プレハイブリダイゼ
ーションを68℃1時間し、50℃で一晩ハイブリダイ
ゼーションした。洗浄も同様に6×SET、55℃で行
い、その後オートラジオグラフィーした。陽性クローン
を1個単離し、λXS40と名付けた。λXS40のフ
ァージDNAをSalI消化し、その消化物を70℃、
10分間処理した後エタノール沈殿した。それを少量の
TEに溶解し、pUC18のSalI消化物とT4DN
Aリガーゼを用いて連結した。そのDNA溶液を大腸菌
JM109株に形質転換した。形質転換株からプラスミ
ドDNAを調製し、pXH3インサートDNAをプロー
ブとして、Sal消化のサザンブロット解析を行った。
その結果、4.0Kbの断片のバンドが検出された。そ
の4.0Kbを含むプラスミドをpXS14と名付け
た。
て、pXH3の塩基配列を基に調製した合成オリゴヌク
レオチドプライマー(20mer)を用いて、ジデオキ
シ法[Hattori,M.& Sakaki,Y.(1986) Anal.Biochem. 15
2 232]で塩基配列を決定した。また、新たにその塩基配
列を基に合成プライマーを作製し、同様にして塩基配列
を決定した。図2にその制限マップと配列決定の戦略を
示した。pXH3及びpXS14から決定された塩基配
列は、配列番号3に示される通りで、1225bpの長
さで、塩基番号53〜751までの233個のアミノ酸
からなる分子量26439の蛋白質をコードすると考え
られた。そのコーディング領域は大腸菌のfreと比較
して、塩基レベルで67.0%、アミノ酸レベルで7
3.0%のホモロジーを有していた。
質転換株の調製(図3参照) 組換えプラスミドpXS14のDNAをHpaI及びS
maIで消化し、それぞれの酵素を失活後、T4DNA
リガーゼで連結反応した。その反応液の一部を大腸菌D
1210株に形質転換した。形質転換株からプラスミド
DNAを調製し、インサートDNAが約1Kbのものを
選択した。そのプラスミドをpXFR1と名付けた。p
XFR1はラクトースオペロン(lac)のプロモータ
ーの支配下にフラビン還元酵素遺伝子を配置した形とな
っており、フラビン還元酵素を発現するように構築して
ある。
ンを含有したLB液体(10ml)培地に植菌し、37
℃で2時間振とう培養後、最終濃度が1mMになるよう
にイソプロピル−β−D(−)−チオガラクトピラノシ
ド(IPTGと略す)を添加し、さらに3時間培養し
た。IPTG誘導処理した培養液3.0mlを1000
0rpmで遠心分離し上清を除く。菌体を50mMリン
酸カリウム・1mMジチオスレイトール緩衝液0.75
mlに懸濁し超音波破砕した。12000rpm、4℃
で30分間遠心分離しその上清を細胞抽出液とした。そ
の細胞抽出液に対して、酵素還元活性を測定し、その結
果を表1に示す。 フラビン還元活性:〔Jablonski,E. & DeLuca,M. (19
77) Biochemistry,16,2932〕の方法で行った。蛋白量は
バイオラッド製の蛋白分析キットを用いて色素結合法
〔Bradford, M. M. (1976) Anal. Biochem. 72,248-25
4〕により決定した。
はリボフラビン還元活性は、pUC13に比べて1ケタ
高い値を示した。この遺伝子がフラビン還元酵素をコー
ドすることが確認された。
habdus luminescensのFMN還元活性を有する酵素の遺
伝子としては、はじめて単離されたものである。適当な
宿主、例えば大腸菌を宿主とすることにより、その大腸
菌から大量に該酵素蛋白を調製することができる。その
発現ベクターを適当な宿主たとえば、大腸菌に導入する
ことにより、発光細菌のFMN還元活性を有する酵素を
大量に発現する生物あるいは微生物を作出することがで
き、さらにその遺伝子導入生物から抽出することにより
該還元酵素を大量に調製することができる。該還元酵素
は上述した機能から細菌ルシフェラーゼの発光反応を増
幅し、多くの測定法に応用でき、たとえば診断薬や検査
薬に有用である。
右側に3’末端を表わしている。この文字はヌクレオチ
ド配列を形成するプリン又はピリミジン塩基を表わす。
また、 A:アデニン、 G:グアニン、 C:シトシン、 J:AもしくはG、 K:TもしくはC、 L:A、T、CもしくはG、 M:A、CもしくはT、 T:チミン、 X:YがAもしくはGの場合はTまたはC、 或いはYがCもしくはTの場合はC、 Y:XがCの場合はA、G、CまたはT、 或いはXがTの場合はAまたはG、 W:ZがGもしくはAの場合はCまたはA、 或いはZがCもしくはTの場合はC、 Z:WがGの場合はA、G、CまたはT、 或いはWがAの場合はAまたはG、 QR:SがA、G、CまたはTの場合はTC、 ***はTAA、TAGもしくはTGAを表す。)
アミノ酸配列と合成オリゴヌクレオチド・プライマー。
ケンス・ストラテジーを示す。矢印は塩基配列を決定し
た方向を示す。ボックスで示したところが、酵素の構造
遺伝子部分に相当する。
子を含有する本発明の発現ベクターpXFR1の構築工
程を示す。白ボックスはフラビン還元酵素遺伝子のコー
ディング領域である。点線はpUCのベクター部分を、
黒ボックスは大腸菌のラクトースオペロンのプロモータ
ー部分を示す。
Claims (8)
- 【請求項1】 配列番号1で表される塩基配列を含む、
フラビン還元酵素遺伝子。 【配列表1】 - 【請求項2】 配列番号2で表される塩基配列を含む請
求項1記載のフラビン還元酵素遺伝子。 【配列表2】 - 【請求項3】 塩基配列が配列番号3で表されるフラビ
ン還元酵素遺伝子。 【配列表3】 - 【請求項4】 配列番号4で表されるアミノ酸配列を有
するフラビン還元酵素。 【配列表4】 - 【請求項5】 塩基配列が配列番号1で表されるDNA
を含有する組換えベクター。 【配列表1】 - 【請求項6】 配列番号2で表される塩基配列を有する
遺伝子がプラスミドベクターへ挿入された請求項5記載
の組換えベクター。 【配列表1】 - 【請求項7】 配列番号1で表される塩基配列を有する
DNAを含む組換えベクターを含有する細菌。 【配列表1】 - 【請求項8】 塩基配列が配列番号1で表されるDNA
を含む組換えベクターで修飾されてなる細菌を培養する
ことからなる配列番号4で表されるアミノ酸配列を含む
酵素の製法。 【配列表1】
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---|---|---|---|
JP5151076A JP2534968B2 (ja) | 1993-05-27 | 1993-05-27 | フラビン還元酵素遺伝子 |
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JP5151076A JP2534968B2 (ja) | 1993-05-27 | 1993-05-27 | フラビン還元酵素遺伝子 |
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